【BLT小课堂】蛋白归一化在Western Blot中的应用

使用内参蛋白校正是目前比较成熟的一种手段。具体校正方法就是在各蛋白样品中选一种表达量保持一致的蛋白作为内参蛋白（一般是管家基因），将每个样品目的蛋白含量与内参蛋白含量相除，得到每个样品目的蛋白的相对含量。再进行样品与样品之间的比较。

例：

当前有三份蛋白样品S1、S2、S3，选择的内参基因为Control，需要检测目的蛋白Test在这三份样品中的相对表达量。

经过电泳、转膜、封闭、孵育、清洗等一系列实验操作后，获得一张蛋白印迹膜。用GelView 6000 Pro全自动化学发光成像系统或GelView 6000Plus智能图像工作站进行显影成像，获得的发光图。如图1所示：

图1

BioAnaly分析软件具有蛋白归一化分析功能，可以直接输出蛋白归一化结果，不需要进行额外的操作，方便快捷，如图2所示：

                                                       图2

最终得到实验结果如图3所示：

图3

如果仅看三个样品中目的蛋白的灰度值（如图3中蓝色数据条所示），会发现其发光强度基本一致。此时并不能判断目的蛋白的含量一致，因为内参蛋白的灰度值相差较大（如图3中橙色数据条所示），因此还需要通过内参蛋白进行校正，将内参蛋白的灰度值归一化，可得到三个样品中目的蛋白的真实灰度值，该结果才能比较准确地反映目的蛋白的含量。计算结果如图4所示：

图4

通过内参蛋白校正后发现待测蛋白在三个样品中的相对表达量呈梯度上升趋势。

总蛋白校正是一种新兴的实验策略。具体校正方法就是直接测量样品中总蛋白的含量（通过非特异性蛋白染料对泳道中所有蛋白进行染色测定），将每个样品目的蛋白含量与总蛋白含量相除，得到每个样品目的蛋白的相对含量。再进行样品与样品之间的比较。

例：

当前有四份蛋白样品S1、S2、S3、S4，需要检测目的蛋白Test在这四份样品中的相对表达量（本次实验中使用的非特异性荧光染料，可以对所有蛋白进行染色；二抗为FITC荧光标记）。

经过电泳、转膜、封闭、孵育、清洗等一系列实验操作后，获得一张蛋白印迹膜。

用GelView 6000Plus智能图像工作站的荧光模块进行荧光成像，结果如图5所示，泳道内所有蛋白均产生荧光，荧光强度可以代表样品总蛋白的含量：

图5

通过分析软件BioAnaly计算灰度值，得到实验数据，如图6所示：

图6

使用475nm的蓝光（不同荧光染料所需波长参照试剂的使用说明）激发目的蛋白Test，结果如图7所示：

图7

通过分析软件BioAnaly计算发光强度，得到实验数据，如图8所示：

图8

从上图可以看出，目的蛋白在S3中的发光强度最大，接近S2的2.5倍。然而经过蛋白归一化后，结果，如图9所示：

图9

我们不难发现目的蛋白在四份样品中表达量基本一致，所以我们说蛋白归一化是必须的。

相应的，BioAnaly分析软件也可以直接对总蛋白进行归一化分析。

总结

在Western Blot实验中，归一化处理是关键步骤，归一化以后才能进行蛋白浓度的对比。其中，内参蛋白校正由于其发展时间久、成本低等优点，受众多，积累了大量的使用经验，同时有丰富的试剂种类可供选择，对于常规实验对象的研究是很好的方法；总蛋白校正则是直接测得整个泳道（样本）内所有蛋白的含量，不用担心内参蛋白本身带来的误差，对于没有参考资料的新样本来说十分适合。所以，两者是相辅相成的，大家可以根据自己的实际情况进行选择。

除了选择合适的归一化方法以外，一台高灵敏度的光信号捕捉设备也是获得理想实验数据所必需的。博鹭腾公司在光子信号的高效率识别接收领域有着多年的研发经验，旗下的GelView6000系列产品配备了科研级冷CCD相机、多色荧光光源以及功能强大的BioAnaly分析软件，能对泳道内的蛋白做准确的定量和定性分析，完全兼容这两种归一化方法的需求，并且设备操作简便，5分钟即可上手，欢迎各位老师咨询试用。