自律,自由。
近期,在美国召开的分子病理学协会年会上,罗氏报告了一款正在研发的数字PCR仪。罗氏方面表示,公司计划使该系统通过欧盟 CE/IVD 的认证,在临床进行商业化推广,并计划在美国获得上市前申请(510k)豁免认证,以进行销售。
报告中,罗氏首席科学家和qPCR系统研发部经理Nick Newton介绍了这款新的数字PCR系统。该系统正处于原型研发阶段,共包含两部分仪器:一个小型桌面分区仪和一个较大的台式分析仪。整套系统还包括分析软件,可以在本地笔记本电脑或台式电脑上运行。从组成上来看,该系统与Bio-Rad 的QX200极度相似。
Newton表示,该系统需人工添加样本,每个PCR板上都有8条通道。毛细管作用会牵引样本沿着通道沉降到不同反应单元。将PCR板放置到分区仪上,仪器会向其添加硅油密封胶加速样本沉降,并密封反应单元,确保单个PCR反应的进行。分区仪将配置触摸屏装置,每个PCR板的分区约花费2分钟。基于该数字PCR系统,罗氏计划针对不同应用提供3种类型的芯片:含有3万个反应单元的通用芯片;含有2万个反应单元、可最大限度地增加上样量的高灵敏度芯片;含有10万个反应单元、减少上样量的高分辨率芯片。相比之下,Bio-Rad平台的芯片是将20 µL样品分成2万个反应单元。
此外,罗氏的数字PCR分析仪将全面整合热循环和分区成像的密封纳米板,可放置12块96孔板。研究人员还介绍,该系统最大的特点在于其更适合进行多靶点的混合检测(target multiplexing)。基因位点的扩增或缺失与多种遗传病相关,多通道检测技术将帮助研究人员检测更多靶点和多个参考基因。
对于罗氏研发的新数字PCR仪,相关人士认为,对比市面上现有的数字PCR平台和Bio-Rad的ddPCR平台,研究者们更希望能进行更大容量样本的分析,因为这样可以提高检测的灵敏度。另一种方法是将样本划分为10万个反应单元,这种方法在罕见突变和需要克隆扩增的混合靶点检测中非常具有吸引力。罗氏新款PCR仪或将代表数字PCR革新向前推进了一大步。
也有人指出,罗氏数字PCR仪的另一个潜在优势是可以使用通用的逆转录酶和混合反应体系,能够更好地优化针对基因变异的检测。此外,一款数字PCR仪最重要的是重复性,不仅是分析结果的重复性,还包括从样本制备到数据分析整个过程的重复性。Bio-Rad成功开发了一款稳定的分析流程,能够提供非常高的实验室间可重复性,这对诊断的可靠性非常重要。但罗氏的PCR仪是否能够匹敌QX200的卓越性能还有待考察。
业内人士认为,罗氏本次研发的新数字PCR仪将与Bio-Rad的QX200液滴数字PCR仪形成直接的竞争关系。多年以来,数字PCR领域主要有两个竞争者:Bio-Rad和RainDance Technologies。自2017年Bio-Rad收购RainDance之后,Bio-Rad则被公认为数字PCR领域的领导者。此外,也有多家国内外测序设备公司在数字PCR研发领域不懈努力。Fluidigm是最早投入芯片型数字PCR系统研发的公司,但其开发设计的芯片却限制了高度分区数字PCR检测的能力。Thermo Fisher Scientific公司通过价格低廉的QuantStudio 3D系统成功打开了市场。不少新公司也在寻找立足点,例如法国Stilla Technologies公司、波士顿Formulatrix公司和新加坡JN MedSys公司等。
与此同时,国内也有多家公司在数字PCR系统研发中取得了不俗的成绩。仅在2018年,领航基因研发的iScanner24生物芯片阅读仪获得浙江省食品药品监督管理局医疗器械产品注册证;新羿生物展示了国内第一套完全自主知识产权的数字PCR系统;卡尤迪发布了自主研发的数字PCR产品;臻准生物也发布了拥有自主知识产权的芯片式数字PCR系统AccuOne™。2017年,顺德永诺发布了拥有自主知识产权的微滴式数字PCR仪MiniDrop™。
由于定量的精确性和可靠性,数字PCR技术正成为撬动精准医学发展的新支点。随着临床对检测要求的不断提升,数字PCR作为新一代检测手段也将迎来新发展和新增长,在肿瘤治疗、液体活检等前沿生命科学研究、临床医学检验等领域实现突破性应用。
[来源:测序中国]
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