天朗气清,金风送爽的八月,第二届Illumina生殖与遗传系列高峰论坛终点站于13日在上海拉开帷幕,与郑州站和西安站不同的是,本站主题将高通量芯片及测序技术的应用从产前检测延伸到了儿童遗传学检测及咨询领域。
▲ 上海场会议现场
▲ 欢迎辞 Tom Berkovits 先生 Illumina亚太区市场发展部副主管
01 高通量测序技术在儿童遗传病应用—— 瓶颈、挑战和突破
▲ 讲者:余永国 博士
余博士风趣详实地通过病例分享肯定了新一代测序技术的优势 —— 辅助临床明确遗传学病因、精准医疗,推动着临床诊断进入新模式。但高通量分子诊断技术在临床应用中也面临一些瓶颈和挑战,如:针对复杂的临床患者如何选择不同的分子诊断方案,如何规范实验室报告、缺乏大数据分享、基因芯片和下一代测序技术的选择等,针对以上困难,余博士认为,首先作为临床医务工作者,需要加强临床遗传基本功,规范遗传咨询流程,普及遗传学科普知识;医疗机构需要壮大遗传咨询师及遗传咨询医师的队伍;联合多学会建立规范的学组共识;最后余博士倡导医院、检测机构共同努力搭建可视化共享的出生缺陷及重大遗传性疾病的遗传数据库,进行新技术的大样本探索。
02 医学外显子组测序在遗传病患儿诊断中的应用介绍
▲ 讲者:赵薇薇 教授
遗传因素是疾病发生的重要原因之一,据OMIM数据库统计,符合孟德尔遗传方式的疾病有8477种,其中表型有描述,基因明确的有5051种,如何针对发病率低,病种繁多,累计发病率高的遗传病进行检测,赵教授认为外显子测序能提供更精准的诊断。(医学外显子组技术是针对每个怀疑有遗传病的个体同时检测约5000个致病基因)从2009年至今金域分子遗传共收集患者及家系样本6万例,采用Illumina公司的TruSight One临床外显子 — Panel检测,突变检出率为37%。最后赵教授通过病例解析强调了高通量测序过程中质量控制、生物信息学分析中的过滤参数以及ACMG五分类法在变异注释时的重要性。
03 Genetic counseling: Tool to Convey Complex Information
▲ 讲者:Sucheta Bhatt 博士
Sucheta博士在这一站分享了更多有关儿童遗传疾病咨询的经验,她首先强调进行遗传咨询时首先获得病史及家族史的重要性,指导根据疾病的临床特征分析病因,如何提供遗传风险评估的专业意见,如何与临床医师紧密合作,以及如何在充分知情同意后帮助患者选择下一步诊断技术。随后Sucheta博士引入一个疑似Noonan综合征儿科病例,从问诊,搜集病史,到评估各项检测,再到与患者家人的咨询建议,把遗传咨询的流程及要点清晰地呈现给听众们。
04 高通量分子检测技术在出生缺陷三级防控中的应用
▲ 讲者:熊丽 博士 Illumina大中华区临床应用专家
出生缺陷是一个严重的公共卫生和社会问题备受关注,传统技术精度及通量受限,Illumina基因芯片和新一代测序为代表的高通量检测技术展现出实力。熊丽博士由出生缺陷三级防控入手,分别介绍各类分子诊断技术的应用范围:
一级预防:携带者筛查通过靶向测序技术得以实施;胚胎植入前遗传学筛查(PGS)采用低覆盖度全基因组测序优选二倍体胚胎。
二级预防:核型定位技术(Karyomapping)能够成为通用单基因病胚胎植入前遗传学检测解决方案;NIPT是新一代测序技术在临床广泛应用的典范,阳性预测值可高于90%;基因芯片技术作为核型分析的补充在染色体病的产前检测中广泛应用。
三级预防:目前国际多个研究项目正采用新一代测序技术进行新生儿筛查研究,而临床全外显子检测,全外显子或全基因组测序大大提高了检测力,也在逐步改变目前的遗传疾病低效诊疗模式。
05 案例讨论
▲ Sucheta Bhatt 等
上海站的压轴环节,是由Sucheta博士带来的遗传咨询典型案例讨论,30分钟时间内,两个曲折精彩的病例,现场新华医院余博士、上海国妇婴徐晨明博士等均参与分享了见解及咨询经验。两个案例一个先天性多发畸形,通过全基因组测序找到了致病基因,指导后续的检测及再发风险;另一个为重度发育迟缓,经家系外显子测序后仅找到临床意义不明(VOUS)的变异,在场同仁们探讨这类变异的咨询重点,随访需求以及数据库积累更新的重要性。余博士在点评时特别强调了中西方文化差异以及在中国临床遗传咨询需重视的沟通技巧,面对类似案例的咨询思路,操作流程建议,收获全场掌声不断。
后记:郑州,西安,上海,三场足迹让我们深深体会到了临床用户们对新一代测序的认可与需求:
8月9日 郑州
Illumina与安诺优达公司、郑大一附院联合举办的郑州站论坛,以“碰撞 · 融合 ·发展”为主题引入了高通量测序技术的遗传学热点应用。
8月12日 西安
Illumina与贝瑞和康公司联合举办的西安站引起了各个产前诊断中心同仁门的热切交流,将高通量测序技术带入了深入应用及临床转化的话题。
8月13日 上海
Illumina生殖与遗传高峰论坛的上海站主场,把学术与交流的主题从产前筛查、产前诊断、延伸到儿童遗传学检测,在众多专家们的学识碰撞及实战经验交流之间,赋予了高通量测序在遗传学领域应用更加明媚的前景。
不论是最为成熟的无创产前检测(NIPT),还是新兴引起广泛关注的植入前遗传学筛查(PGS),或是在遗传病检测实践中初步展露头角的产前CNV测序及遗传疾病外显子测序,医疗同行们对Illumina技术的愈加关注,通过各中心经验的分享,增添了对新技术的应用信心和期望。为此,Illumina从未停止过创新脚步,致力于通过科技的革新帮助更多用户改善检测流程,寻找遗传学答案,解开基因组学奥秘。
关于Illumina
Illumina公司通过解码基因组而改善人类健康。我们注重创新,这使我们成为DNA测序和芯片技术的全球领导者,并为科研、临床和应用市场的客户提供服务。我们的产品应用分布在生命科学、肿瘤学、生殖与遗传、农业及其他新兴市场领域。如欲了解更多信息,请访问Illumina中国官网。
[来源:Illumina]
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