作为全球最大的科学计算软件提供商BIOVIA公司在生命科学领域的核心产品,Discovery Studio是一款应用于生命科学预测领域的综合性分子模拟软件,集成了目前分子模拟领域的各种经典、先进算法,通过用户体验友好的操作界面以及高质量的图形显示,在计算生物学和药物设计领域都有着广泛的应用。Discovery Studio构建于BIOVIA Pipeline Pilot之上,为研究队伍的合作与信息共享提供了优秀的平台。
Discovery Studio 2017 R2是Discovery Studio软件的最新版本,由BIOVIA公司向全球正式发布。新版本的Discovery Studio在性能和效率上都得到了加强,并加入新方法,使其功能更加完善。
新特性简介:
■ 与最新发布的BIOVIA Pipeline Pilot 2017 R2相兼容;
■ 小分子设计:
· 新!新增Generate Analog Conformations模块,在给定以蛋白结合口袋为参照系具有明确3D几何构象的先导化合物时,可获得其同系化合物的3D几何构象,且可采用in-situ MM-GBSA对配体结合进行打分排序;
· 新!新增Set Up Relative FEP Calculation、Free Energy Perturpation (NAMD)、Analyze FEP Results模块,可基于自由能微扰(FEP)精确预测配体相对结合自由能;
■ 抗体理性设计
· Model Full Length Antibody模块支持双特异性抗体全长结构的模建;
· Model Full Length Antibody模块支持将抗体Fab区结构移植到抗体全长模板结构中以获得更合适的起始结构进行抗体建模;
· Antibody Modeling Cascade模块现支持将抗体Fab区模型嫁接到全长抗体结构模板中以获得更准确的抗体全长结构模型;
· Loop Refinement模块改进了looper算法,提高了loop区从头预测的准确性;
■ 力场
· 完全支持CHARMM力场的补丁机制;
· charmm36力场的更新;
■ 客户端
· 支持将分子以COLLAborative Design Activity (DAE)文件格式保存输出;
■ 第三方程序的更新
· CHARMm 40b1
· MODELER 9v17
· DMol3 2017 R2
· NAMD 2.10
· 支持CCDC GOLD 5.5
■ 数据库的更新
· Anitibody数据库
· BLAST数据库
若您想对以上新功能做进一步了解和获取更多Discovery Studio 2017 R2新功能信息,
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[来源:创腾科技有限公司]
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