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随着蛋白质组学的兴起，特别是质谱技术的快速发展，蛋白质组学研究中产生的数据规模越来越大。依靠简单的手工处理已经远远不能满足问题的需求,通过先进的计算机算法与软件工具来自动处理大批量的蛋白质组数据已经成为蛋白质组学研究的重要分支，这就是“计算蛋白质组学”(Computational Proteomics)。
“计算蛋白质组学”是以计算技术为主要手段，通过开发高效的算法和实用的软件工具来处理大规模的蛋白质实验或模拟数据，解决蛋白质组学研究中的蛋白质鉴定、翻译后修饰分析、蛋白质定量、蛋白质相互作用、蛋白质定位、蛋白质结构或蛋白质动力学等领域中的问题。我国的计算蛋白质组学与国际基本处于同步的发展态势，特别是最近十年内在中国蛋白质组学项目的驱动下，计算蛋白质组学的研究发展迅速。
为了推动计算技术在中国的蛋白质组研究中发挥出更加切实的作用，由中国科学院计算技术研究所主办的“首届中国计算蛋白质组学研讨会”将于2010年11月10日至11日在北京召开。
会议主题：计算蛋白质组学
研讨内容：质谱数据分析、蛋白质鉴定、翻译后修饰、蛋白质定量、蛋白质相互作用、蛋白质定位、蛋白质结构、蛋白基因组学等。
会议报告日程
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2010年11月10日星期三上午: 大会邀请报告(一)
Wednesday, November 10, 2010: Invited talks
地点: 中科院计算所一楼多功能报告厅
主持人: 王通 应万涛 | |||||||||||||||||
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时间
Time |
报告题目
Title |
报告人
Speaker |
报告人单位
Institution |
报告摘要页码
Abstract Page | |||||||||||||
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8:30-9:00 |
签到注册 |
参加培训的不需注册 |
(不收注册费) | ||||||||||||||
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9:00-9:10 |
首届中国计算蛋白质组学研讨会简介
Brief introduction to CNCP2010 |
贺思敏 |
中科院计算所 | ||||||||||||||
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9:10-9:20 |
欢迎词
Opening Ceremony |
所领导 |
中科院计算所 | ||||||||||||||
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9:20-9:40 |
合影
Photo |
全体 |
(计算所一楼大厅) | ||||||||||||||
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9:40-10:10 |
糖蛋白结构的质谱数据库 |
杨芃原 |
复旦大学 |
19 | |||||||||||||
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10:10-10:40 |
核心岩藻糖化蛋白质特异性发掘的系统解决方案
Establishment of a systematic method coupling consecutive MSn and software tools for charactering core-fucosylated glycoproteins |
应万涛 |
北京蛋白质组研究中心 |
20 | |||||||||||||
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10:40-11:10 |
利用串联质谱技术解析多糖结构
Glycan Structure Sequencing with Tandem Mass Spectrometry |
张凯中 |
加拿大西安大略大学 |
21 | |||||||||||||
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11:10-11:20 |
休息
Break | ||||||||||||||||
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11:20-11:50 |
解码细胞迁移过程中的信号通路网络
Deciphering the Signaling Network in the Leading Edge of the Migrating Cells |
汪迎春 |
中科院遗传与发育生物学研究所 |
22 | |||||||||||||
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11:50-12:20 |
信号通路分析辅助的功能蛋白质组学研究策略
Pathway analysis-assisted study strategy in functional proteomics |
王通 |
暨南大学 |
23 | |||||||||||||
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12:20-13:30 |
午餐
Lunch |
全体 | |||||||||||||||
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2010年11月10日星期三下午: 大会邀请报告(二)
Wednesday, November 10, 2010: Invited talks
地点: 中科院计算所一楼多功能报告厅
主持人: 谢鹭 陆豪杰 |
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时间
Time |
报告题目
Title |
报告人
Speaker |
报告人单位
Institution |
报告摘要页码
Abstract Page |
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1:30-2:00 |
利用稳定同位素代谢标记研究哺乳动物动态蛋白质组的数据处理平台
A data processing platform for mammalian proteome dynamics studies using stable isotope metabolic labeling |
关慎恒 |
美国加州大学旧金山分校 |
24 |
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2:00-2:30 |
大规模SILAC标记定量蛋白质组学研究中的数据分析
Data analysis in large scale quantitative proteomics study with SILAC approach |
徐平 |
北京蛋白质组研究中心 |
25 |
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2:30-3:00 |
体内终端氨基酸标记在定量蛋白质组学中的应用In vivo termini amino acid labeling for quantitative proteomics |
陆豪杰 |
复旦大学 |
26 |
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3:00-3:30 |
利用基于肽段计数的无标记定量技术揭示线粒体蛋白质组的功能特性
Quantitative Analysis of Mitochondrial Proteomes using Normalized Spectral Abundance Factor |
邓宁 |
浙江大学 |
27 |
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3:30-3:50 |
休息 Break |
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3:50-4:20 |
尿液蛋白质疾病标志物数据库
The urinary protein biomarker database |
邵晨 |
中国协和医科大学 |
28 |
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4:20-4:50 |
基于质谱数据发现小鼠基因组新蛋白质编码区域
The discovery of novel protein-coding features in mouse genome based on mass spectrometry data |
谢鹭 |
上海生物信息中心 |
29 |
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4:50-5:20 |
从新一代测序技术的组学到基于质谱仪的蛋白质组学 -- 华大基因的生物信息学
From NGS Genomics to MS-based Proteomics -- BGI's
bioinformatics activities |
张勇 |
深圳华大基因研究院 |
30 |
| ||||||||||||
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5:20-5:50 |
腾冲嗜热菌的多温度条件下的蛋白质组基因组学研究 |
赵屹 |
中科院计算所 |
31 |
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5:50-7:30 |
宴会
Banquet |
邀请专家 |
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2010年11月11日星期四上午: 大会邀请报告(三)
Thursday, November 11, 2010: Invited talks
地点: 中科院计算所一楼多功能报告厅
主持人: 邹汉法 孙瑞祥 |
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时间
Time |
报告题目
Title |
报告人
Speaker |
报告人单位
Institution |
报告摘要页码
Abstract Page |
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|
8:30-9:00 |
签到注册 |
未注册的人员 |
(不收注册费) |
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9:00-9:30 |
基于HCD谱图的肽段从头测序
De novo Sequencing of Peptides Using HCD Spectra |
董梦秋 |
北京生命科学研究所 |
32 |
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|
9:30-10:00 |
从未知基因组到可测定的蛋白质组：通过从头测序来研究依赖于pH值的N10细菌蛋白质组
From an unknown genome to a measurable proteome: Studying on the pH-dependent proteomes in N10 bacteria by denovo sequencing |
王全会 |
中科院北京基因组研究所 |
33 |
| ||||||||
|
10:00-10:30 |
利用质谱和同源数据库进行全蛋白测序
Complete Protein Sequencing with MS/MS and a Homologous Database |
马斌 |
加拿大滑铁卢大学 |
34 |
| ||||||||
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10:30-11:00 |
电子转运裂解质谱:特征发现与鉴定应用
Electron Transfer Dissociation: Characterization and Applications in Protein Identification |
孙瑞祥 |
中科院计算所 |
35 |
| ||||||||
|
11:00-11:20 |
休息
Break |
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11:20-11:50 |
基于质谱的蛋白质组学数据处理新方法和平台发展
Development of Methods and Platform for Data Processes in Mass Spectrometry Based Proteome Research |
邹汉法 |
大连化学物理研究所 |
36 |
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11:50-12:20 |
基于优化的肽质量指纹谱方法鉴定蛋白质混合物
Optimization-Based Peptide Mass Fingerprinting for Protein Mixture Identification |
余维川 |
香港科技大学 |
37 |
| ||||||||
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12:20-13:30 |
午餐 Lunch |
全体 |
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2010年11月11日星期四下午: 大会邀请报告(四)
Thursday, November 11, 2010: Invited talks
地点: 中科院计算所一楼多功能报告厅
主持人: 张红雨 付岩 | |||||||||||||
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时间
Time |
报告题目
Title |
报告人
Speaker |
报告人单位
Institution |
报告摘要页码
Abstract Page | |||||||||
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1:30-2:00 |
基于相关谱图对的非限制性修饰检测
Unrestrictive modification detection based on related spectral pairs |
付岩 |
中科院计算所 |
38 | |||||||||
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2:00-2:30 |
评价诱饵库设计，搜索策略，匹配误差和质量控制对鸟枪法蛋白质组学中肽段鉴定精确性的影响
Evaluation of the effect of decoy design, search strategy, mass tolerance and quality control method on the accuracy of peptide identifications in shotgun proteomics |
朱云平 |
北京蛋白质组研究中心 |
39 | |||||||||
|
2:30-3:00 |
BuildSummary : 一个基于目标-诱饵策略的蛋白质鉴定整合软件
BuildSummary: A software tool for assembling protein |
盛泉虎 |
上海生命科学研究院 |
40 | |||||||||
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3:00-3:30 |
冷冻电镜中的计算方法：图像数据处理和三维重构
Computational methods in cryo-electron microscopy: image data processing and 3D structure reconstruction |
张法 |
中科院计算所 |
41 | |||||||||
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3:30-3:50 |
休息
Break | ||||||||||||
|
3:50-4:20 |
DomainRBF: 一种对疾病相关蛋白质结构域进行优先排序的贝叶斯回归方法
DomainRBF: a Bayesian regression approach to the prioritization of associations between protein domains and human complex diseases |
江瑞 |
清华大学 |
42 | |||||||||
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4:20-4:50 |
蛋白质结构“字母表”设计
Designing Succinct Structural Alphabets |
卜东波 |
中科院计算所 |
43 | |||||||||
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4:50-5:20 |
蛋白质作为分子化石
Proteins as molecular fossils |
张红雨 |
华中农业大学 |
44 | |||||||||
|
5:20-5:30 |
会议总结 |
杨芃原 |
复旦大学 | ||||||||||
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5:30-7:00 |
晚餐
Supper | ||||||||||||
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