仪器信息网讯,2010年5月15日,蛋白质组数据处理暨全国生物质谱学术交流会”在云南省丽江市召开。大会除专家报告外,还特别邀请了安捷伦公司与沃特世公司作技术报告; AB SCIEX公司在大会召开同期举办了技术交流会。
AB SCIEX公司技术交流会
在技术交流会上,AB SCIEX中国公司产品经理刘麟博士作了“生物质谱在蛋白质和脂分析中的最新进展”的报告。在报告中,刘麟博士向大家介绍了AB SCIEX公司的QTRAP® 5500质谱系统,该系统采用AB SCIEX公司的全新质谱技术,将串联四级杆技术与创新的线性加速阱技术相结合,完美实现MIDAS技术方案,用于生物标志物验证与确认研究;可大规模筛选和验证通过其他各种技术方法鉴定的蛋白质或生物标志物。并且,该系统独有MRM3扫描模式,将蛋白质定量分析技术提高到很高的水平。刘麟博士表示,MRM3方法可应用于有机效分子、多肽、蛋白质标记物的定量分析,能够在更简单的样品制备和快速简单的液相色谱条件下,达到相似的LOQ’S。当用标准MRM定量方法分析具有高背景的噪音遇到干扰和困难时,MRM3就是一种有效的定量策略。
刘麟先生
刘麟先生还向与会者介绍了AB SCIEX公司的一款数据处理软件——LipidView software 1.0数据处理软件,该软件数据库中现存有44类约2300种脂分子,包含600种脂类特征碎片离子信息,并支持大量数据分析,支持AB SCIEX公司所有型号的LC/MS/MS数据。
厂商报告
报告题目:蛋白质组学的定性定量及数据统计的软件综合平台
报告人:安捷伦科技有限公司陈伟博士
陈伟博士
陈伟博士在报告中重点介绍到,针对蛋白质组学分析,安捷伦公司所提供了从样品前处理到仪器分析、数据处理到系统生物学解释的一体化解决方案。
陈博士向与会人员透露,将在2010年ASMS上推出的Mass Profiler Professional是专为质谱数据设计的动态的化学计量学软件包,具有先进的数据处理功能,可以分析多个质谱数据类型的统计学和数学模型。该软件可以让分析人员轻松的找到并鉴定出代谢组学、蛋白组学和其他分析应用的样品组之间的明显差异。
他还介绍了安捷伦公司的Spectrum Mill软件。由MassHunter工作站集成的Spectrum Mill软件可以使分析人员通过快速的数据库检索进行蛋白质和多肽的快速鉴定,而且还可以进行手动和自动的匹配确认分析。该软件具有出色的直观分析和报告功能,可支持无标记和稳定同位素标记的定量分析。
报告题目:高清质谱SYNAPT G2 HDMS在蛋白质组学及代谢组学中的应用
报告人:沃特世科技(上海)有限公司王灼维博士
王灼维博士
王灼维博士向大家介绍了SYNAPT G2 HDMS质谱分析系统——Waters公司的第二代基于高效离子淌度(Ion mobility)测量和分离技术的高性能四极杆-飞行时间质谱仪,该系统提供新一维的离子淌度分离技术,不仅能按质荷比不同将离子分离,同时可以根据离子的大小、形状、电荷等将其分离。从而从原有样品中获取更多未知信息,并且提高数据特异性。当UPLC与SYNAPT G2 HDMS联用时,则可以得到保留时间、质荷比、峰强度、迁移时间等的四维分离体系。
在此基础上,Waters公司开发的新型nanoUPLC 2D LC—RP/RP串联的分离技术,MSE质谱鉴定技术,相对于传统的SCX/RP分离技术,使色谱峰容量和蛋白质的鉴定结果进一步提高。保留时间的高度重现性及MSE获得的高精度一级和二级MS数据,使定量蛋白质组学的数据更为可信,并且可以进行不同样品间的非标记定量比较(label free)。同时,离子淌度分离功能可以将不同价态的肽段离子按迁移时间定位在不同区域,而且同一价态离子的b离子和y离子也能得到独立提取,这种技术使得蛋白质的鉴定率提高。并且,利用淌度功能可以对蛋白质的结构进行测定,已广泛应用于蛋白质间及其与金属、DNA等的相互作用研究中。
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