扩展数据分析软件工具增强了对2-D DIGE数据组的生物学解读能力

2005年8月12日英国Chalfont St Giles消息 ——通用电气医疗集团推出了DeCyderTM 扩展数据分析（Extended Data Analysis，EDA）1.0版，―个针对蛋白质组研究市场的先进的软件解决方案。它能对不同数据组进行联合分析，并通过检索公共和本地数据库对结果进行生物学解读。由于增强了新版DeCyder v6.5 DIGE 图像分析软件的分析能力，EDA对2-D DIGE实验分析非常有用。


“EDA v1.0是一个功能强大的，尖端的2-D DIGE 软件解决方案，它以一种便于使用的形式提供先进的统计学分析，”GE Healthcare全球市场经理Kumar Bala 说道，“这种有用的分析工具将促进对调控途径的更深入了解，并帮助蛋白质组学研究人员更快更精确地识别区别于正常组织样品和疾病组织样品、以及不同疾病状态和肿瘤类型间的差异蛋白质。”


DeCyder EDA采用多变量分析和高级的聚类分析方法，揭示由2-D DIGE实验所得到的实验数据的蛋白表达模式。该软件采用一个“数据组”（data set）作为2-D凝胶分析的基础，将匹配的蛋白点定义为蛋白图谱的一个点群（group），根据实验目的，每个数据组都能以不同方式被展示出来。


DeCyder EDA是进行生物学差异分析（Biological Variance Analysis，BVA）的一种理想工具，它能回答的问题有：


- 在一个特定的数据组中存在有多少个蛋白点群和样品类别？
- 是否有蛋白点表现出类似的表达模式，暗示着共调控作用？
- 是否有蛋白质或蛋白表达模式可能是某种生物学或疾病状态的特征？
- 是否有特定的蛋白质对开发非侵害性诊断或预后性症状检测有用？
- 通用电气医疗集团特别设计的DeCyder软件包是Ettan 2-D DIGE 技术平台的关键组件，可精确检测和匹配Ettan DIGE凝胶的多重荧光图像。