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用户测评 | 飞朔生物基于NGS全自动建库一体机的肿瘤伴随诊断检测方案

汉赞迪

2024/03/01 15:47

阅读:75

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在伴随诊断领域,高通量测序技术已经成为一种重要的检测手段。通过对患者样本进行基因组学分析,可以快速准确地筛查出患者体内存在的各种基因突变,为个性化治疗提供重要依据。然而,传统的手工实验操作往往繁琐耗时,容易出现误差,限制了伴随诊断技术的进一步应用。

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为了提高伴随诊断的检测效率,国内肿瘤个体化精准医学检测领域领先企业厦门飞朔生物技术有限公司(以下简称“飞朔生物”),基于汉赞迪NGS全自动建库一体机,搭建了高通量自动化肿瘤伴随诊断检测平台。

平台应用飞朔生物人EGFR/KRAS/BRAF/HER2/ALK/ROS1基因突变检测试剂盒(半导体测序法,国械注准20203400094),采用自主研发专利RingCap@环介连接扩增技术,以非小细胞肺癌(NSCLC)患者经福尔马林固定的石蜡包埋(FFPE)组织样本提取的DNA和RNA为模板,基于汉赞迪NGS全自动建库一体机进行文库构建,经二代测序和数据分析后得到EGFR/KRAS/BRAF/HER2/ALK/ROS1基因变异信息,用于吉非替尼片、盐酸埃克替尼片、克唑替尼胶囊的伴随诊断检测。
为确保检测全流程的质量和效率得到有效控制,汉赞迪专业的交付团队对该平台的自动化流程进行模块设计优化、台面合理布局,以匹配不同的建库通量,大幅提升文库构建效率,在满足获得高质量文库的前提下,可减少90%以上人工操作,解放实验人员双手。这样不仅提高了工作效率,也减少了人为误差的可能性,从而保证了结果的可靠性。

01 产品方案


1.1.自动化建库方案:汉赞迪NGS全自动建库一体机

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机器配置:

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1.2.检测方案飞朔生物人EGFR/KRAS/BRAF/HER2/ALK/ROS1基因突变检测试剂盒(半导体测序法)

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试剂组成:

Onco-DNA富集PCR反应条、Onco-RNA富集PCR反应条、Barcode 1-8连接反应条、Barcode 9-16连接反应条、Barcode 17-24连接反应条、Barcode 25-32连接反应条、RingCap-Taq酶(1#)、Onco DNA阴性对照、Onco RNA阴性对照、Onco DNA阳性对照、Onco RNA阳性对照
试剂盒特点:

  • 自主专利:核心专利RingCap®技术,文库构建只需要两步即可完成

  • 灵敏度高:灵敏度高达0.1%~1%

  • 检测快速:文库构建仅需3.5小时,从样本到报告仅需2个工作日

  • 检测全面:DNA及RNA共检,一次性可检13个基因,覆盖常见非小细胞肺癌中已批准上市的靶向药

  • 伴随诊断:2基因伴随诊断(EGFR、ALK),全面指导靶向治疗

  • 多平台适用:IonTorrent、IIIumina、MGI等均适用

  • 多样本适用:肿瘤组织样本、外周血、胸腹水均适用

02 检测流程

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03 台面布局

低通量:8个样本/次

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中高通量:48个样本/次

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04 质量分析

文库浓度定量分析显示,自动化建库均一性优于手工操作。

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文库片段分析峰图显示主峰明显,无杂峰。毛细管电泳结果显示文库主峰范围是200-300 bp。

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总而言之,NGS全自动建库一体机的高效运作不仅使得伴随诊断更为便捷,同时也为临床诊疗注入更多高效元素,其高效、精准、稳定的特点,在医学领域展现出巨大潜力和广阔前景。未来随着技术不断进步和创新,相信NGS全自动建库一体机将继续发挥重要作用,并推动医学领域迈向更加智能化、高效化的发展道路。

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