Opentrons NGS文库制备工作站

Opentrons NGS工作站自动化开源液体处理系统，帮您自动化解决NGS和PCR应用中样品制备、文库预处理、试剂分配、磁珠处理以及一般生化和基因组转移等工作。

该工作站可以使用市面上通用的试剂或基于磁珠的系统，实现了协议和工作流程的自动化，并以极低的成本达到实验的准确度和精确性。

该工作站可以应用于：

1、下一代测序(NGS)

2、样品和文库制备

3、基于磁珠的样本处理

4、一般液体处理和试剂分配

Opentrons NGS工作站包括硬件、试剂、耗材和NGS检测协议。您可以免费使用Opentrons协议设计器、Python API和协议库进行Protocol设计，该应用已经过Opentrons的全面测试和实验验证。

应用数据

下一代测序（NGS）工作流程可以采用通用的DNA制备试剂盒建库，可以在OT-2上完成样本归一化和汇集数据。以下为使用OT-2 NGS工作站进行DNA制备演示。

Opentrons OT-2甲板布局，配备了功能模块、实验器材和试剂。

方法说明

① Illumina DNA预处理

使用NEB制备8个相同的100ng Lambda DNA

培养和PCR在OT-2热循环仪模块上进行

使用的Barcodes是Illumina UD Indexes plate B

洗涤后扩增（4个循环）

进行量化、归一化并汇集成一个4nM的文库，在带有2x75流动池的MiSeq上测序

该实验可实现对24个Lambda复制片段和8个Promega公司的人类基因组DNA复制片段进行实验

② HyperPrep和NEBNext Ultra II

使用NEB制备8个相同的100ng Lambda DNA片段

培养和PCR在OT-2热循环仪模块上进行

使用的Barcodes是HyperPrep的KAPA Unique Dual Index Adapters和NEBNext Ultra II的NEB Multiplex Dual Index Primers Set 1

洗涤后扩增（4个循环）

进行量化、归一化并汇集成一个4nM的文库，在MiSeq上用2x75流动池进行测序

该实验可实现对24个Lambda复制片段和8个Promega公司的人类基因组DNA复制片段进行实验。用NEB片段酶对Lambda进行16分的片段化，对人类基因组DNA进行20分钟的片段化，然后用AMPure XP磁珠进行清洗。

数据展示

下方表格为在OT-2上进行的NGS样品库预处理的数据对比。

统一的样品Barcodes表示，这些饼状图按总体读数百分比展示了测序运行中的均匀样品Barcodes平衡。

问：Opentrons NGS工作站可以在任何套件上工作吗？

答：可以。它是一个开源的平台，可针对不同的检测需求进行适配。

问：Opentrons NGS工作站可以处理各种NGS液体类型吗？

答：OT-2可以准确和精确地处理各种NGS液体类型。参见我们的精度和准确度表。我们还为客户发布了OT-2上的粘性液体处理和OT-2上的挥发性液体处理等应用说明。

问：我可以在Opentrons平台上使用什么样的实验室器具？

答：开箱后，OT-2可以支持任何标准的、与自动化兼容的SBS孔板，以及各种快盖和螺旋盖试管，最高可使用我们的四合一试管架适配50mL的锥形管。你可以在我们的实验室器皿库中看到我们支持的全部实验室器皿类型。

问：你们支持创建实验器皿吗？

答：OT-2基本上可以与您现在使用的大部分实验室器皿一起使用。如果您需要使用与普通微孔板具有相同底座的定制实验器皿，您可以使用我们的实验器皿创建器在几分钟内创建一个您自己的定制实验器皿定义。或者，如果你有一些编码知识，你可以自己创建一个，并3D打印一个支架或适配器，就在甲板上使用它了。

问：我是否需要有编程基础才能使用Opentrons平台？

答：使用Opentrons平台无需编程基础。您可以使用Opentrons的协议设计工具创建协议。如果您有定制化需求，也可以随时联系您的客户经理，我们有专业的开发团队可以为您提供定制化服务。

问：我可以看到一个协议样本吗？

答：我们所有的协议都是开源的，可以在GitHub上免费访问。

访问链接：Opentrons · GitHub

问：我可以用OT-2处理微量移液吗？

答：您可以用我们的Opentrons 8通道P20 GEN2电子移液器或Opentrons单通道P20 GEN2电子移液器进行1-20µL精准移液。Opentrons移液器经过校准和工厂测试，设定值为1µL，并附有校准证书。然而，即使有测试和认证，通过自动空气移液处理低容量转移也需要测试和优化，以确保满足您的规格要求。