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【应用案例】超分辨率荧光成像揭示Trop2对非小细胞肺癌和正常细胞膜的变化

2023/03/07 14:26

阅读:83

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应用领域:
其他
发布时间:
2023/03/07
检测样品:
其他
检测项目:
超高分辨率显微镜
浏览次数:
83
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参考标准:
【应用案例】超分辨率荧光成像揭示Trop2对非小细胞肺癌和正常细胞膜的变化

方案摘要:

【应用案例】超分辨率荧光成像揭示Trop2对非小细胞肺癌和正常细胞膜的变化

产品配置单:

分析仪器

超高分辨显微镜iSTORM

型号: iSTORM 3CM

产地: 浙江

品牌: 力显智能科技

¥350万 - 500万

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赛乐微培养箱中实时监测细胞生长的智能监控助手

型号: 细胞智能监控助手赛乐微

产地: 浙江

品牌: 力显智能科技

¥4.97万 - 4.98万

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方案详情:

跨膜糖蛋白Trop2与许多上皮癌有关。它不仅在促进胎儿肺生长方面发挥作用,还参与肿瘤发生、恶性转化和肿瘤播散。然而,Trop2在分子水平上的详细分布仍然未知。本文使用直接随机光学重建显微镜揭示了Trop2在培养和原代肺癌细胞和正常细胞膜上的空间组织。所有类型的癌细胞都比正常细胞呈现更多的Trop2定位。通过SR-Teseller聚类分析,我们发现Trop2以簇的形式存在于所有膜上;然而,癌细胞产生的簇比正常细胞更多,由更多的分子组成。本研究结果揭示了膜Trop2的异质分布,突出了肺癌细胞与正常细胞之间膜Trop2聚集特征的显著差异,为进一步研究Trop2聚集在肺癌中的机制和功能奠定了基础。


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研究结果(节选)


1.Trop2在不同培养细胞上的高分辨率成像


NSCLC主要包含三种类型,每种类型中选择一种细胞作为代表:A549代表ADC,sk-MES-1代表SqCC,H460代表LCC。由于NSCLC是异质性原发性支气管上皮肿瘤,我们选择HBE细胞作为对照组。TIRF图像显示Trop2散射在所有细胞膜上,其中一些形成荧光斑点,但无法清晰区分(图1a-d)。然而,重建的dSTORM图像显著提高了分辨率(图1e-h)。我们观察到HBE细胞膜上只有少数Trop2,而在三种类型的NSCLC细胞膜上则有大量Trop2。此外,放大后的图片详细显示了Trop2的异质分布(图1i-l)。
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图 1.Trop2在不同细胞系上的dSTORM成像

四种细胞膜上Trop2的TIRF图像:(a)HBE,(b)A549,(c)H460和(d)SK-MES-1。(e–h)在这四个细胞膜上相应的重建的Trop2的dSTORM图像。(i-l)白色框框显示的 Trop2 dSTORM 图像的放大视图。比例尺:5 μm(e–h) 和 1 μm(i–l)


2.通过SR-Tesseler方法对Trop2进行聚类分析

除了获得Trop2的高分辨率图像外,使用合适的方法来定量分析蛋白质的空间分布同样重要。到目前为止,各种分析方法已被应用于超分辨率成像数据,例如Ripley's K函数,DBSCAN (基于密度的噪声空间聚类分析),H-SET [36](分层单发射器假设检验)和FOCAL (用于定位的快速优化聚类算法)。每种算法都有自己的优势和应用范围。在这里,我们使用了一种新的图形处理方法SR-Tesseler,它可以精确地分割定位并提取集群的信息。


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图 2. SR-Tesseler分析示意图


(a)在HBE细胞膜上重建的Trop2的dSTORM图像。细胞膜用红线圈出“ROI”。(b) 闪烁校正后的 dSTORM 图像。(c) 由许多多边形组成的沃罗诺伊图。(d) 对每个多边形的局部化密度进行阈值化提取的蓝色区域(e) 提取的簇(绿色)的定位密度高于对象的平均密度。(f-h) 图(c–e)框在中的多边形、对象和聚类的放大图像。比例尺:4 μm(a–e) 和 300 nm(f–h)。


3.Trop2 在原发性肺癌细胞上的显着簇分布

为了进一步探索和验证Trop2簇在原代细胞上的分布特征,我们选择人原发性肺腺癌细胞作为NSCLC的代表,配对原代正常肺上皮细胞作为对照。与培养细胞一致,dSTORM图像显示Trop2过度表达并在肺癌细胞上形成大簇,而在正常肺细胞上存在相对较少的蛋白质和小簇(图3a-f)。统计数据表明,Trop2在癌细胞上的定位密度几乎是正常细胞的两倍(图3g)。SR-Tesseler分析还证明了聚类特征的显著差异。癌细胞上的簇面积和簇数都远大于正常细胞上的簇面积和簇数(图3h-i)。此外,癌细胞具有更密集的簇,由200多个定位组成,而对于不超过100个定位的小簇,正常细胞占更大的比例(图3j)。结果与从A549和HBE细胞获得的结果一致。这些发现证实了Trop2与肺癌的肿瘤发生有关,其过表达和聚集分布可能使其成为肺癌诊断的良好标志物。


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图 3.原发性肺腺癌细胞和正常细胞上的 Trop2 分布通过 dSTORM 成像显示


(甲至乙)(a)原发性肺癌细胞和(b)正常肺细胞上的Trop2的TIRF图像。(c–d)同一细胞膜上的相应dSTORM图像。(e–f)图(c–d)白色框框的 dSTORM 图像的放大视图。比例尺:5 μm(c–d) 和 1 μm(e–f)。(g)Trop2在这两种细胞上的定位密度。(h) 不同细胞膜上的团簇标准化。(i) 每平方微米的团簇数(j) 团簇百分比。所有结果均来自五个独立实验中的十个细胞样品。采用双尾不配对t检验处理统计学意义。*P < 0.05,**P < 0.01,****P < 0.0001,ns 表示不显著。


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结论


综上所述,利用dSTORM观察了Trop2在NSCLC细胞和正常细胞(培养细胞和原代细胞)膜上的分布格局,并利用SR-Tesseler分析了其聚集特征。我们发现Trop2在癌细胞上的表达和聚集水平高于正常细胞,这表明Trop2在癌细胞中的过表达和聚集的共同特征,这将有助于早期癌症诊断。尽管Trop2簇存在于所有肺癌细胞中,但值得注意的是,不同种类的癌细胞之间的团簇性质不同。例如,A549和H460细胞具有相对更多的簇,而SK-MES-1细胞具有与HBE细胞相似的簇数。我们的研究结果为癌症相关蛋白(如Trop2)聚集的分子机制提供了新的见解,并有利于开发针对癌症中Trop2的新药。

文献等详见【阅读原文】↓↓↓

在本研究中,研究者主要借助STORM超分辨率显微镜来研究Trop2对非小细胞肺癌和正常细胞膜的变化,目前在国内,随机光学重建显微镜STORM已成功实现商用,有需要STORM成像技术进行实验研究的专家老师们,文末填写问卷即可预约获得 iSTORM 超高分辨率显微成像系统试拍服务~


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力显智能现已发布的超高分辨率显微成像系统 iSTORM,成功实现了光学显微镜对衍射极限的突破,使得在20纳米的分辨率尺度上从事生物大分子的单分子定位与计数亚细胞及大分子复合物结构解析生物大分子生物动力学等的研究成为现实,从而给生命科学、医学等领域带来重大突破。


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