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QIAcuity dPCR系统为肠道健康保驾护航

凯杰

2023/06/02 13:45

阅读:33

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炎炎夏日,高温高湿的环境正值 “四害”(蚊蝇鼠蟑)孳生与繁殖的高峰期。其中苍蝇喜欢在人/畜的粪尿、痰、呕吐物及尸体等处爬行觅食,这些行为使其成为病毒、细菌、原生动物和寄生虫的载体,当苍蝇落在食物等表面时,可通过排便等方式将病原微生物从其身体转移而来,进而为人类带来肠道疾病的风险与困扰。


2022年这篇发表在Environmental Science & Technology杂志上的文章[1],研究人员通过培养法(大肠杆菌培养)、RT-qPCR法(对22种肠道病原微生物(9种细菌、6种病毒、3种原生动物和4种寄生虫)的基因拷贝数进行量化,建立定量微生物风险评估模型)和基于QIAcuity dPCR系统的数字PCR法(检测大肠杆菌特异性基因ybbW,并使用大肠杆菌菌落形成单位 (CFU) 与大肠杆菌ybbW基因拷贝数的比率来估计其致病性),评估了莫桑比克首都马普托市蝇类携带的肠道病原微生物特征、当地公共现场卫生设施的升级是否可以降低卫生间入口和食物准备区域的苍蝇密度及卫生干预措施对食用受苍蝇污染食物的人年感染风险的影响。


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数据显示,卫生干预措施使卫生间入口处的苍蝇数量减少了69%,但在食物准备区域没有明显减少,半数 (23/46) 蝇类可培养大肠杆菌阳性,45% (79/176) 蝇类检出≥1个病原体基因。在干预措施前,对照组 (54%,30/56) 和干预组 (50%,17/34) 捕获的苍蝇中有一半检测到≥1个病原体基因,干预12个月后对照组 (43%,23/53) 和干预组 (27%,9/33) 检测到≥1个病原体基因。


结果表明,在这种情况下,苍蝇是肠道病原微生物传播的潜在重要机械媒介。卫生干预措施可能降低了某些病原微生物蝇媒肠道感染的风险,所以卫生系统的设计和服务提供应包括蝇类控制措施,以防止肠道病原微生物的传播。


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同时,人类是肠道病毒的天然宿主,肠道内拥挤着超过14万种病毒,其中诸如脊髓灰质炎病毒、柯萨奇病毒、埃柯病毒和新型肠道病毒,会通过粪-口、消化道等途径传播,引起脊髓灰质炎、结膜炎、心肌炎等疾病,损害身体健康。这些病毒从感染者的粪便排泄到污水系统中,经常在污水和地表水中被检测到,甚至在消毒后的自来水中也有报道,因此对水/污水消毒过程中肠道病毒的灭活机制有着广泛的研究。


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2023年这篇发表在Environmental Science & Technology杂志上的文章[2],研究人员使用三种不同的宿主细胞 (BGMK、RD 和 A549) 通过游离氯、紫外线 (UV) 照射和加热灭活方式评估了埃可病毒11 (E11) 的灭活动力学。同时基于QIAcuity dPCR系统,建立起RT-dPCR定量方案,用来量化E11与宿主细胞的结合能力。


数据显示,游离氯使E11灭活的部分原因是宿主细胞附着丧失,这在 BGMK细胞中最为明显,BGMK细胞缺乏附着受体CD55和脱衣壳受体关键亚基β2M,这可能会进一步促进此类细胞类型灭活动力学的差异性。


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结果表明,游离氯对肠道病毒灭活动力学依赖于宿主细胞,因此,使用具有不同受体谱的宿主细胞来评估肠道病毒的灭活动力学,可以更加全面地了解靶向病毒附着和/或脱衣壳的消毒剂的灭活能力。


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在公共卫生建设及病原微生物防治中,精准的技术手段有利于推动其前进的步伐和整体的有效性,而数字PCR技术做为更为精准的第三代PCR技术,具备高特异性、高灵敏性、高抑制剂耐受性等特点,高度贴合病原微生物及其功能基因的检测与定量需求。


QIAGEN QIAcuity数字PCR系统,基于纳米微孔板技术,采用集成式一体化设计理念、全自动无需值守、操作简单、支持多通道检测、具有多种规格和配置,可实现高通量、高灵敏检测,是病原微生物检测及定量的不二之选,同时更有超过680病原微生物检测Assay可供选择,全力为肠道健康保驾护航。


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参考文献:

  1. Drew Capone,et al. Urban Onsite Sanitation Upgrades and Synanthropic Flies in Maputo, Mozambique: Effects on Enteric Pathogen Infection Risks. Environmental Science & Technology. December, 2022. https://doi.org/10.1021/acs.est.2c06864

  2. Shotaro Torii, et al. Observed Kinetics of Enterovirus Inactivation by Free Chlorine Are Host Cell-Dependent. Environmental Science & Technology . January, 2023. https://doi.org/10.1021/acs.est.2c07048


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