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流式配色告别烦恼,四步策略轻松上手

Cytek Biosciences

2024/06/13 10:37

阅读:31

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流式实验中让许多人望而却步的莫过于多色配色,多色方案搭配没做好,就相当于房屋搭建地基没打牢。伴随着研究的深入,方案颜色越多,需要考虑到的细节更是千丝万缕,所以找准方向、理顺思路,才能起到事半功倍的效果。工欲善其事,必先利其器。全光谱流式细胞仪Cytek®Aurora的问世,让一管实现40+色的梦想照进现实,也让多色实验最让人头疼的配色门槛大大降低。这场来自Cytek®资深应用专家Laura Johnton的精彩讲座,用清晰的四步走策略带领我们从入门到精通,轻松打通多色流式实验关卡。


贯穿讲座的整体思路,从梳理标志物—筛选荧光素—设计方案—优化方案,流式多色方案搭配遵循四步走策略。


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第一步 梳理标志物

明确研究课题涉及到的目的细胞上的生物学标志物表达,包括骨架系别标记、细胞亚群或功能性标记、排除标记等,通过细化分群,精准定位到感兴趣的靶标细胞。其中抗原标志物的共表达情况,可以通过逻辑树或流式门控策略进行梳理。


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选择市面可用的试剂,信息获取渠道如试剂厂家官网说明书,相关研究领域发表的文献,Cytometry Part A杂志旗下专栏Optimized Multicolor Immunofluorescence Panels(OMIP)系列,Frontiers in immunology杂志发表的CD Maps一文,了解可用的试剂选择、推荐的抗体克隆号和样本制备的条件等。确定好目的细胞特异性抗原后,按照表达丰度将其归类到一类、二类和三类抗原,遵循强弱搭配原则匹配对应亮度适宜的荧光素。


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第二步 筛选荧光素

流式细胞仪的配置支持哪些荧光试剂呢?对于传统流式需要考虑激光器和滤光片可检测范围,而全光谱流式则只需要考虑激光器即可。以5激光的Cytek® Aurora全光谱流式细胞仪为例,其能够广泛兼容市面上传统和新型的荧光染料。全光谱流式搭载专利的Full spectrum profilingTM(FSPTM)技术,扫描荧光素发射光谱的完整指纹信息,也为仪器的光学灵敏度带来质的飞跃


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荧光素的筛选遵循3项标准:独特性、亮度、溢漏扩散


筛选标准1:荧光光谱的独特性。荧光发射光谱形状差异越大,就更容易被区分开,Cytek®相似指数(SimilarityTM Index)让这一判断变得有据可依。通过定量的数值0~1,代表着一对荧光组合光谱相似度从低到高,当相似指数>0.98,不建议荧光组合在一个方案中同时使用。


基于Cytek®复杂指数(ComplexityTM Index),能够全局性地预估所有荧光素组合在同一个方案中的适配性。以3激光Cytek®全光谱流式细胞仪运行14色cFluor® kit为例,复杂指数在7.89,这一数值就可以作为14色左右的方案优化的参考标准,数值越低说明方案搭配更好。


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筛选标准2:荧光素的亮度。衡量荧光素亮度的参数之一是染色指数,Cytek®测试了上百种荧光素在5激光Aurora全光谱流式细胞仪上的染色指数,从低到高进行了排序并录入到Cytek®荧光指南中,可以作为荧光素去匹配不同表达强度抗原时的参考标准。


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筛选标准3:荧光溢漏扩散。问题的“罪魁祸首”来自于荧光发射光谱的重叠,全光谱流式光谱拟合能够直观地追溯到问题的来源。溢漏扩散随着光谱重合度、荧光亮度、抗原表达丰度发生变化。为了简化这一概念的理解,SIR矩阵通过色块深浅可视化展示溢漏扩散的程度高低,矩阵行中的荧光素对列的溢漏扩散越大,则颜色越红。


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第三步 设计方案

方案搭配千头万绪,不知从何开始?Cytek® Cloud云端平台将上述提及的所有知识点精华都荟萃在Panel Builder小工具中,引导式的界面让新手也能快速掌握流式配色的秘诀。Cytek® Cloud平台集成了三个在线工具,Full Spectrum Viewer、Panel Builder和Experiment Builder,内置了目前已发表的所有OMIP方案库和Cytek® cFluor® kit方案。平台从多色配色到一键导出实验模板,实现方案设计到数据采集的无缝衔接。


目前Cytek® Cloud平台已面向所有Cytek®全光谱流式用户开放,欢迎访问:http://cloud.cytekbio.com免费注册您的专属账户(仅支持企业或教育邮箱)。


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第四步 优化方案

好方案追求的是所有感兴趣的细胞亚群都能够被清晰地分辨。优化方案前提需要保证完成抗体滴定、高质量单标制备和解析准确等步骤,通过细胞单标与多标管的分辨率平行对比,能够作为是否需要进行方案优化的直观判断依据。当问题锁定到荧光溢漏扩散时,借助SIR矩阵可以揪出带来spread的荧光素“元凶”,如果该荧光指标与受影响的指标属于非共表达,并不会影响目的细胞亚群的分辨率,就无需调整方案。


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在聆听这场讲座之前,也欢迎大家阅读:Cytek® 推出全新SpectroLearn™系列,助您轻松玩转多色方案设计(内附视频)一文,提前解锁全光谱流式方案设计小技能。

本文包含的所有内容及材料均归Cytek版权所有,受中国、美国和其他适用国家著作权法保护,未经Cytek书面许可,不得以任何方式复制、分发、展示、出版、修改、改编或用于其他商业用途,亦不得修改或删除本文中任何版权或其他声明。


关于Cytek

About Cytek /

Cytek Biosciences, Inc.(Nasdaq: CTKB)作为一家全球技术领先的生命科学技术公司,通过其受专利保护的全光谱分析(Full Spectrum Profiling™,FSP™)技术,提供高分辨率、高参数和高灵敏度的新一代细胞分析工具。Cytek的创新技术通过检测荧光信号的完整光谱信息,以实现更高水平更高灵敏度的多参数检测。Cytek的FSP™平台包括其核心仪器 ——Aurora和Northern Lights™分析系统、Aurora CS分选系统,Amnis®和Guava®品牌下的流式细胞仪和成像产品,以及试剂、软件和服务,为客户提供全面和完整的解决方案。Cytek总部位于美国加利福尼亚州Fremont,在全球设有分部和分销渠道。

更多的相关信息,请登录Cytek的官方网站:www.cytekbio.com和www.cytekbio.com.cn。

注:Cytek®, Tonbo Biosciences, cFluor®, Full Spectrum Profiling™, FSP™和Northern Lights™是Cytek Biosciences, Inc. 的商标或注册商标。Cytek®全光谱检测技术相关专利包括但不限于:US10739245B2,US11169076B2,US10788411B2。



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