如何正确获取离体根系图像

分析原理

       通过扫描仪将离体洗好的根系扫描获取图像，使用专业根系分析软件对根系图像分析，得到根系长度、平均直径、表面积、体积、根尖数等根系表型数据。分析的直接对象是图片，所以获取高质量的根系图片获得准确数据的基础。

         适用于DJ-GX02根系分析仪。

适用对象：

离体洗根后的植物根系

图像获取设备：

        仪器标配含有经过严格校准的扫描仪以保证图像的质量。每台扫描仪配有专用控制软件，用于参数设置和图像获取、保存。

       如果使用普通扫描仪，只有扫描头部位的光源，也就是下方照光，因为根系的立体结构，根系在背景板上会留下阴影，扫描出来的图像上，根系附近就有阴影，图像不够清晰，影响分析。

       双光源投射扫描，上方照光，下方扫描成像，得到根系的投影。由于光源来自于上方，没有根系的地方将是白色的背景，有根系的地方光受根系遮挡，根系呈现黑色，四周边界清晰，根与背景区分非常明显，对分析非常有利。

扫根成像：

      使用投射扫描时，需要将上光源的背景板取下，否则背景板将上光源遮挡，扫描的图像将一团黑。

        放置定位框，按照如图所示的方向，注意定位框凹陷一端(箭头所指)的位置。为了放置根盘直接压在上光源玻璃板上，随货配有增高垫，如左下图所示，放置在面板上。

洗好的根系放置在根盘内，随货配有3种不同尺寸的根盘，选择适合根系大小的，放入根系和清水，细小的根系在水中会分散开，便于成像。

 对于根系基部比较大的根系，比如树苗、玉米的根，可将根系分别剪下来，平铺到根盘中；

 如果一个根系上根的数量很大，可以分多次扫描，分析时将根盘的数据累加；

     扫描根系可以提前预览，保存只有根系的图像，抛弃根盘的区域，便于后面软件直接自动分析。

扫描参数的设置：

        扫描参数决定了扫描图像的质量，参数中最为关键的是分辨率，一般设置300ppi即可，满足绝大多数样品的成像需求；如果样品非常细小，可以选择更高的分辨率值，比如600ppi；设置是在成像控制软件界面。更高的分辨率意味着图像占的内存更大。

    图像扫描完成后，要保存到计算机硬盘中，选择jpg、tiff均可。建议先将所有根系的图像全部扫描完成后再进行图像分析，软件有批处理分析功能。

3副根系扫描图