长片段DNA回收全系列解决方案 ——基于脉冲场电泳技术，从百bp到百kb

长片段DNA回收全系列解决方案

——基于脉冲场电泳技术，从百bp到百kb

长片段DNA，即高分子量DNA（high molecular weight DNA，HMW DNA），目前在测序领域的应用备受关注。然而，提取后的长片段DNA容易断裂，现有的常规方法很难获得高纯度、高质量的HMW DNA。因此，长读长测序用户迫切需要找到一种有效回收HMW DNA的方法。

针对长片段DNA的特殊性，美国Sage Science公司推出了一系列基于脉冲场电泳技术的全自动DNA片段回收设备，涵盖了从数十个bp到2MB碱基范围内各种DNA片段的全自动回收，用户可以根据自己的需要选择最适合自己研究的设备。

• 1、几百bp-kb：全长转录组测序文库

型号： Blue Pippin、Pippin HT

“Blue Pippin的片段选择显著增加了神经元转录组的读取长度”

引自2023年《Cell》期刊文章：Alfonso-Gonzalez, Carlos, et al. "Sites of transcription initiation drive mRNA isoform selection." Cell 186.11 (2023): 2438-2455.

• 2、10-25kb：PacBio HiFi测序文库
  

型号： Blue Pippin 、Pippin HT、Sage ELF

PacBio HiFi测序对DNA文库的长度均一性要求较高，最佳片段范围为10-25kb。Sage Science产品中的Pippin HT、Blue Pippin、Sage ELF皆满足该测序要求，而且Sage ELF还可将一样本中不同长度的片段同时回收，最大限度利用样本。

Sage ELF同时精准回收一个样本中不同长度的片段

今年，Sage Science产品在原有功能基础上升级了全新“Range+T”回收模式，此模式的优点包括：（1）有效去除设置起点外的小片段DNA；（2）更精准控制回收片段的上限；（3）更细化调整文库分布的宽度。

Blue Pippin/Pippin HT全新“Range + T”模式，对HiFi文库的精细条件优化

不同样本的回收起点均设置为15kb，回收时间分别设置为13/15/17/20/30min，得到不同的文库分布宽度

• 3、10+kb：Nanopore常规测序文库
  

型号： Blue Pippin 、Pippin HT

Blue Pippin 、Pippin HT程序中自带的High Pass模式，即设定好回收的起点，系统可以自动回收起点以上的所有片段，干净彻底的去除小片段DNA，有效提高Nanopore测序效率和质量。

• 4、 50+kb以上 Nanopore超长（Ultra-long）测序文库

型号： HLS系列

Ultra-long DNA片段回收的一个重要应用是在ONT三代测序，可以最大发挥ONT测序长度长的优势。Sage Science公司针对超大片段文库的制备，推出了Sage HLS型号，最大可回收2Mb的DNA片段。下图所示PromethION同Sage HLS联用，N50最大可到143.3kb。

Sage HLS片段筛选后Nanopore测序，N50 高达 143.3 kb

• 5、长片段DNA样本质控
  

型号： Pippin Pulse脉冲场电泳仪

对于长片段DNA样本质控，Sage Science公司的Pippin Pulse脉冲场电泳仪使用简单，无特殊耗材，使用成本低，是实验室长片段DNA样本质控高性价比之选。

Sage Science是全球领先的研发制造Pippin系列全自动核酸电泳片段回收仪的生产厂家，拥有美国技术专利，各个型号产品可以高效完成不同长度范围的DNA片段的精准回收，广泛用于二代测序、三代测序以及多种分子生物学相关领域。

环亚生物科技有限公司作为美国Sage Science公司在中国区的独家代理商，自2011年以来将Sage Science的产品线引入国内，一直为国内用户提供专业的全自动核酸片段回收系统的安装测试、应用培训，技术支持与售后维护工作，赢得客户的一致好评与信任。环亚生物科技有限公司将一如既往的支持越来越多的Sage Science用户。

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