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【CNS前沿文献追踪】- 用小分子激活肿瘤免疫

北京德泉

2018/12/03 16:20

阅读:139

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   免疫检查点药物、CART等通过调节细胞间的互作改善免疫功能,发挥抗肿瘤作用。蛋白是细胞功能的基本单位,免疫细胞也是如此,此次整理分享的文章在免疫细胞内部做工作,cGAS-STING感知肿瘤的信号通路(肿瘤DNA激活cGAS,生成cGAMP,cGAMP激活STING,STING召集激酶TBK1,TBK1磷酸化转录因子IRF3生成IFN等细胞因子,IFN促进抗原提呈产生肿瘤特异的杀伤性T细胞),文章作者通过小分子激活STING,发挥抗肿瘤作用,具体内容如下:

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作者使用亲近闪烁检测法(ScintillationProximity Assay,SPA:化合物竞争性抑制靶点STING的149-379 C端与3H-cGAMP互作)进行高通量筛选,从GSK化合物库大概180万的化合物中筛选出了化合物1

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和cGAMP一样,化合物1在热诱导去蛋白折叠实验中可以稳定STING


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作者拿到了化合物1和STING C端复合物的晶体结构:STING以同源二聚体形式存在,2个化合物1分子结合到了STING上(标准配体cGAMP结合的口袋),每个分子对应结合同源二聚体的一个单体


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化合物1与STING的互作细节:2分子化合物1的N1-羟基苯乙基部分相互接近,不与蛋白相互作用(对药物与靶点相互作用贡献不大),所以作者用一个linker替换了这部分(linker的加入可稳定化合物在口袋内的取向,增强相互作用的同时避免了linker与蛋白不必要的互作),将两分子“化合物1”进行拼合,得到了化合物2


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作者又拿到了化合物2和STING复合物的晶体结构:和化合物1一样,结合到了相同的活性口袋

 

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化合物2和STING的互作细节;相较化合物1,化合物2和STING的亲和力显著增强


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前面用到的是STING的一部分(C端)研究互作,化合物2可与细胞THP-1的裂解物中全长的STING结合


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结构层面证明化合物2可与STING结合,开始功能层面的验证,化合物2可激活cGAS-STING通路(a),促进IRF3、STING的磷酸化;加入通路抑制剂BX785后,化合物2激活通路的作用消失(b)

 

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cGAS-STING通路激活后会分泌细胞因子,化合物2可促进细胞分泌IFNβ(c),加入通路抑制BX785后细胞因子分泌受抑制(d)


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前面从结构、功能两个层面证明了化合物2 的有效性,但复合物晶体结构这块有点问题,文献报道cGAMP激活后的STING呈“关闭”构象(二聚体两个单体相互接近),可作者拿到的化合物2-STING复合物晶体结构呈“打开”构象,与前人工作有不一致的地方,为排除复合物结晶对构象造成的影响,作者做了氢氘交换实验(hydrogen-deuterium exchange mass spectrometry) - STING在未结合配体状态(Apo)呈“打开”构象,226-236位氨基酸活泼氢交换明显;当结合cGAMP后呈“关闭”构象,226-236位氨基酸活泼氢交换很少;当化合物2与STING孵育后,226-236位氨基酸活泼氢交换亦很明显,暗示化合物2结合的STING呈“打开”构象,再结合前面的数据,暗示STING的的“关闭”构象并不是激活所必须的


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化合物库是葛兰素史克的,先导结构优化不会停止,作者又优化得到了化合物3


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In vivo实验:化合物3能显著提高野生型小鼠血清中细胞因子的含量,但对STING缺陷小鼠无此作用,暗示化合物3在体内通过STING促进细胞因子分泌

 

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In vivo:化合物3能够抑制肿瘤生长,延长小鼠存活时间,且此作用是CD8 T细胞依赖的,暗示化合物3通过调节免疫发挥抗肿瘤作用


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不愧是做药的,还做了化合物3的药代动力学曲线


这篇文章主体是药物化学,关注结构层面的东西,功能层面的实验用以辅助进行药物设计、验证。结构生物学为什么那么“牛”,通常都是大文章,因为生命活动是各种分子相互作用引起的,互作又是以结构为基础,弄清楚结构就能够设计干扰互作的分子,modify生命活动……


        Joshi M. Ramanjulu, G. Scott Pesiridis, Jingsong Yang, Nestor Concha, etal.Design of amidobenzimidazole STING receptor agonists withsystemic activity.[J] .Nature, 2018.

 

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