日前,来自美国梅奥诊所(Mayo Clinic)的研究人员设计了一款可识别肿瘤基因改变的软件——BIMA V3(Binary Indexing Mapping Algorithm,version 3),比其他常用基因测序程序速度快20倍,准确度高 25%。该研究结果刊登在近期的《生物信息学》(Bioinformatics)杂志上。
成对测序技术是一种复杂的昂贵的技术,可用来检测整个基因的改变。研究人员比较两种普通的测序校准程序,BIMA 在所有的项目测试中胜过 Burrows-Wheeler 校准仪和 Novoalign,在速度和可靠性检测中,BIMA V3 校准了对照组的基因组序列,比竞争者快 20 倍,准确度高 25%。而 BIMA 允许评价肿瘤基因组,只花费一小部分的时间,且仅需要几种普通的技术。
较早的 BIMA 版本已促进研究人员开发 T 细胞淋巴瘤,前列腺癌和子宫内膜癌。最新的版本建立在较早版本上,提高了速度和可靠性。
研究人员相信这个工具将能让人们更好地理解肿瘤基因组,更快地研究更多肿瘤样本,开发不同疾病的新型生物标志物,最终更好地治疗肿瘤患者。
更多
DS3000应用|微卫星不稳定性(MSI)分析在一胰腺癌切除术临床案例术后长期肿瘤基因型追踪分析中的应用
厂商
2021.06.04
直播预告 | 聚焦宠物食品质量安全
厂商
2022.06.25
#镜赛时刻 由你捕捉# 晒晒赛默飞,轻松赢取7款赛默飞新机和多种好礼!
厂商
2024.07.22
邀请函丨2024全国煤矿与煤化工环保产业大会,诚邀莅临!
厂商
2024.07.25