Tecan自动化平台：深度探索酵母基因组研究的得力武器

下一代测序（Next Generation Sequencing, NGS）彻底改变了基因组学研究领域，使全基因组测序比以往任何时候都更有效率。然而，典型的NGS工作流程是鲜有革新的，因为它面临着许多手动操作步骤及来自成本、通量以及结果变异性的诸多挑战。传统的手动样品制备方法不仅非常耗时，而且更易出错。面对这些挑战，TECAN自动化工作站提供了相应的解决方案，不仅提高了工作效率，而且保证了测序结果的准确可靠，堪称下一代测序中样本制备的“神兵利器”。 2011年，日本横滨RIKEN Omics科学中心(RIKEN Omics Science Center)的研究人员开发出一种新的基因表达分析技术，只需100 ng总RNA，就能准确定量的测定基因表达水平，这项技术被称为“HeliScopeCAGE”，它将RIKEN的CAGE*(Cap Analysis of Gene Expression, CAGE)与Helicos BioSciences的单分子测序仪HeliScope相结合，为稀有细胞群体的基因表达分析开启了大门。 HeliScopeCAGE的成功开发并没有让RIKEN的研究人员们高兴太久，因为长达3周（制备测序仪运行一次所需的48个样本）的复杂手工操作随时可能因为一个小小的失误而从头开始。幸运的是，在TECAN公司帮助下，他们成功构建了Freedom EVO 150-8全自动样本处理平台(如下图)，将样本制备时间成功缩短到8天/192标本，并可同时满足两台HeliScope的平行工作。通过流程的优化与改进，cDNA的产量和质量以及文库的质量都与手工操作相一致，并且测序结果也具有较高的重复性。 30年的创新和发展开创了基因组测序的新时代，测序技术从手工的一次一个样本发展到基于高通量测序仪的高度自动化技术，测序仪通量的提高对样本制备提出了更高的要求，TECAN作为全球领先的自动化平台及解决方案的制造商已经做好准备——Automation. That is what TECAN is for.

Tecan公司与今天正式发布新的全自动核酸提取与纯化工作站套餐：该套餐基于Tecan公司Freedom EVO自动化平台，配套老牌试剂厂商MACHEREY-NAGEL公司的核酸提取与纯化试剂盒，实现各种生物物质的全自动核酸提取与纯化。

美国‎佐治亚州健康科学大学GHSU细胞生物学和解剖学系的科学家们已经成功地在活的斑马鱼疾病模型上建立了高通量筛选体系。GHSU副教授Jeff Mumm博士使用帝肯Infinite® M1000多功能酶标仪，在活的斑马鱼模型上进行药物筛选的研究。 Infinite® M1000多功能酶标仪的Z轴聚焦功能以及卓越的信噪比（>500:1），使检测灵敏度提高了一个数量级，更重要的是能检测到相当微弱的信号。 Mumm博士说：“这一点非常重要，以β细胞的再生为例，幼体斑马鱼体内细胞数量相当少；虽然我们能研究成熟的斑马鱼，但是被筛选出来的成体斑马鱼的细胞数量远远少于幼体斑马鱼 ；因此对于幼体斑马鱼，我们需96孔板进行培养，但对于成体斑马鱼，我们却要用到6孔板。为了提高检测的稳定性，我们对两种不同荧光基团的比值进行测量——其中一种荧光基团与目标细胞种类相关，另一种荧光基团与环境中的对照细胞相关——我们得到了非常好的Z 值，Quad4 四光栅技术便是它的关键。” “使用了Infinite® M1000多功能酶标仪后，我们能够定量检测斑马鱼疾病模型中目标细胞的损失与再生，以及疾病相关信号通路中小分子诱导的变化； 更重要的是，Infinite® M1000多功能酶标仪高信噪比使得我们能够监测个体斑马鱼长达数天内的变化。 我们已经通过鉴别自发荧光基团、鉴定报告基团的多样性以及开发适用于高通量筛选的多孔板模式对实验体系进行了优化。 ” 最后，Mumm博士总结道：“Infinite® M1000帮助我们开发了这个简单，快速，低成本的自动化定量系统，该系统可广泛应用于以活的斑马鱼为模型、以荧光或发光信号为报告的高通量化合物筛选或遗传筛选。”

瑞士Tecan公司近期宣布与美国亚利桑那州凤凰城的转化基因组学研究所及同亚利桑那州立大学的生物设计研究所携手成功打造高通量蛋白质组学生物标记物发现及验证自动化工作站。该系统基于Tecan公司久负盛名的Freedom EVO 200自动化液体处理平台。