生物层干涉应用文集

Overview
迄今为止最新、突变最严重的新冠病毒变异株——奥密克戎（Omicron）于去年11月首次在南非被检测到，并在很短的时间内席卷全球。世卫组织紧急将其列为“值得关注的变异株”。现在几乎在所有国家都发现了相关病例，使其成为新发新冠感染的主流病毒株。

（图片源自网络）

现有新冠抗体药能否有效抵御Omicron？
北京大学生物医学前沿创新中心主任谢晓亮教授及其团队针对这一问题火速开展研究并给出答案，于12月底在《Nature》杂志在线首发[1]（该研究在12月初的时候已经在预印版发表[2]）。从11月24日报告Omicron算起，我们中国的科学家在短短2个星期内，就拿到了Omicron的抗药性的第一手资料！

多数上市的中和抗体药物都失效了
作者测试了以下上市的中和抗体活性：
1. 再生元中和抗体组合（REGN10933，REGN10987）
2. 礼来中和抗体组合（LY-CoV555, LY-CoV016（JS016)）
3. 阿斯利康的AZD7442 (AZD8895和AZD1061的组合)
4. GSK/Vir新冠抗体VIR-7831（S309）
5. 清华大学、深圳市第三人民医院安巴韦单抗注射液（BRII-196）
6. 北京大学DXP-604

病毒中和实验：9个抗体中，只有VIR-7831和DXP-604还有比较高的中和活性，但是也下降了2-4倍。

PS：VIR-7831，即S309，是不是很熟悉？2020年4月由华盛顿大学/GSK/Vir联合开发的新冠中和抗体[3]，这也是利用Octet®筛选发现的哟~

抗体与新冠RBD蛋白的结合是引发抗体中和活性的必要条件，也是筛选抗体的主要依据，那么这些抗体与Omicron的RBD的蛋白的亲和力如何呢？

Octet® R8分子互作分析系统检测结果，用proteinA传感器固化抗体，检测不同浓度的RBD蛋白。

可见，DXP-604和WT的RBD结合最强（5.06×10-11 M，解离了1600s），但是也保持了与Omicron和Beta突变株的高亲和力。而REGN10987仅与WT以及Beta突变株的RBD结合较强，但是完全不与Omicron结合。

Octet®的结果与病毒中和实验的结果高度一致，一方面说明Octet®检测亲和力的准确性，另一方面也说明，再厉害的变异株，也还是有中和抗体可以对付！

Octet®功不可没
Octet®在这篇文章中用来检测9种上市抗体和3种RBD蛋白的亲和力，共27对亲和力检测，每个反应6个浓度（含1个零浓度），共有162对反应，这个研究成果那么快能够发表，Sartorius的高通量Octet®功不可没~

在最后致谢部分，作者也感谢了赛多利斯Octet®的贡献（BLI即Biolayer Interferometry, Octet®的技术原理）。

陈老湿倍感荣幸~其实我们只是知识的搬运工~

针对Omicron中和抗体的筛选方向
魔高一尺，道高一丈。病毒虽然突变得非常快，但是现在的药物筛选评估手段来越来越先进。这篇文章就通过一种高通量酵母展示技术发现RBD蛋白上的6个表位，分别命名为ABCDEF。其中针对表位E和F（RBD上的两个位置）的中和抗体相对不容易发生免疫逃逸，而且还可以中和SARS病毒，说明这两个表位是比较保守的，针对EF表位的中和抗体的成药性可能更强一些，这为以后中和抗体的筛选指明了方向。

针对EF表位的抗体可以中和Omicron和SARS-CoV-1

中和抗体大多作为应急使用，预防还是要用疫苗。陈老湿相信大家最关心的是疫苗会不会失效呢？目前很多实验结果证明，虽然疫苗产生的中和抗体对Omicron活性下降，但仍然有效。而且陈老湿建议大家快去接种加强针吧！为什么呢？且听陈老湿下回解析。


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《生物层干涉应用文集》汇总了Octet®分子互作分析系统的29个经典应用案例，包括RNA、DNA、小分子化合物、先导化合物、膜蛋白、病毒、细菌、细胞等各类生物分子互作分析，并广泛涉及信号转导、结构生物学、分子垂钓、中药及天然产物、病毒学以及纳米材料等多个研究领域。

-参考文献-
1. Omicron escapes the majority of existing SARS-CoV-2 neutralizing antibodies.Nature
2. Omicron escapes the majority of existing SARS-CoV-2 neutralizing antibodies | bioRxiv
3. Cross-neutralization of SARS-CoV-2 by a human monoclonal SARS-CoV antibody.Nature