蛋白质是生理功能的执行者,是生命现象的直接体现者,对蛋白质结构和功能的研究将直接阐明生命在生理或病理条件下的变化机制。蛋白质组的研究不仅能为生命活动规律提供物质基础,也能为众多种疾病机理的阐明及攻克提供理论根据和解决途径。因此,蛋白质组学研究不仅是探索生命奥秘的必须工作,也能为人类健康事业带来巨大的利益。

蛋白质组学研究需用到二维电泳和质谱技术等多种关键技术,此外,随着蛋白质组学研究的发展,高通量和高精度的蛋白质相互作用检测、蛋白质芯片的发展等更多新技术也逐步发展起来。为帮助从事相关研究的用户梳理蛋白质组学研究技术及方法,仪器信息网特别策划了“蛋白组学新技术、新方法”专题。

赛默飞:蛋白质组学研究追求定量准确、深度分析及高通量

蛋白质组学应用倾向,一是作为常规手段越来越多的运用到生物学功能研究中,二是针对人群队列样本的多组学整合研究从而在大数据的指导下由相关性推导出新的诊断或是治疗靶点, 三是更加精细化的着眼于单细胞的研究。当定量准确、深度分析和更高通量得以同时实现,那么无疑就是占领了蛋白质组学研究的制高点。

布鲁克:基于捕集型离子淌度质谱的4D-蛋白质组学

基于质谱技术的蛋白质组学研究方法在生命科学研究的各个领域都取得了傲人的成果,提高蛋白质组学覆盖深度一直是科研工作者努力的方向之一,4D组学质谱平台timsTOF Pro的出现,让蛋白组学技术产生了革命性的变化。

Orbitrap Exploris 480 DIA实现高通量酵母蛋白质组定量

展示了 DIA 定量重现性好,missing values 少和 CV 小等优点。仅通过 90 min 的梯度 DIA 就能定量接近 30000 个肽段,3000 个蛋白, 实现高通量定量分析。

Orbitrap Exploris 480 实现高通量人蛋白质组定量分析

首先对 293T 细胞裂解液酶切肽段建立谱图库,鉴定到 87743 个肽段,6270 个蛋白,然后用 DIA 对 293T 细胞裂解液酶切跳段进行定量分析。

Q Exactive 高分辨质谱脂质轮廓谱表征用于食品组学研究中的不同食用植物油分类

Thermo Scientific Q Exactive 高分辨准确质谱是食品组学研 究中表征功能蛋白与活性小分子物质群的有力技术手段; • SIEVE 与 LipidSearch 软件为食品组学中小分子组学研究的 信息处理提供了高效的解决方案。

基于Orbitrap Eclipse质谱进行血浆蛋白质组高通量深度解析

精准医学研究中的大队列生物标志物研究对于分析方法提出了高通量和高稳定性的要求,利用Orbitrap Fusion Lumos质谱极佳的灵敏度和稳定性,我们发展了一种快速、稳定的高通量血浆蛋白质组研究策略。

使用ProSightPD进行top-down蛋白质鉴定

得益于Orbitrap质谱的高分辨率和高质量串联谱图,ProSightPD可精准测定蛋白质序列、蛋白翻译后修饰类型及位点

一小时蛋白质组:基于Q-OT-qIT质谱系统的蛋白组学快速鉴定

本文考察了 Q-OT-qIT 碎裂模式、检测方法、最大注入时间和自动增益控制等参数对蛋白质组快速分析的影响, 证明了不同采集方法间的互补性, 阐述了不同扫描参数对鉴定结果的影响。

定量蛋白质组学质谱采集技术进展

质谱是定量蛋白组学的主要工具。 近年来随着定量蛋白质组学研究的深入,传统质谱定量技术面临着复杂基质干扰、分析通量限制等诸多问题。

Orbitrap Exploris 480 一小时DDA鉴定DIA定量4000个Hela蛋白

它的理念是用二级碎片离子进行蛋白相对/绝对定量。DIA 扫描模式中,超高分辨质谱对特定质量范围内的所有母离子进行碎裂,采集所有母离子的碎片离子,并快速地依次扫描相邻的母离子宽口内的所有碎片离子。

TSQ Altis全新三重四极杆全面提升蛋白组学中的定量验证能力

得益于增强型主动离子管控技术(AIM+),TSQ Altis三重四极杆适用于复杂生物学样本中低丰度蛋白的分析,可以完成蛋白组学中的相对定量和绝对定量实验,全面提升了蛋白组学中的定量验证能力。此外,基于高分辨Orbitrap的蛋白质组学的发现型研究到基于TSQ Alits的蛋白质组学定量可以实现无缝对接,用于潜在生物标志物的发现、验证和确认。

高通量4D-蛋白质组学: dia-PASEF®和Evosep One结合的短梯度应用

布鲁克在ASMS 2020发布了高通量dia-PASEF@方案,即将Evosep One LC与timsTOF Pro再次联合,最大程度发挥Evosep One LC快速分离和timsTOF Pro扫描速度和稳定性的优势。英国牛津大学Roman Fischer教授采用高通量dia-PASEF@方案,进行血液蛋白质组学大队列研究,43天完成4300针连续进样,总共采集2.5亿张二级谱图,整个采集过程只需一次离子传输管清洗。

蛋白质组学解决方案

赛默飞为蛋白质组学研究提供包括创新的化学试剂、高效的分离产品、领先的色谱质谱技术、以及蛋白质组学数据处理软件产品的最先进和完整的解决方案,帮助科学家们大幅提高研究工作的效率,更有信心地面对蛋白质组学研究的挑战。

ACQUITY UPLC M-Class在蛋白质组学纳升级应用中的性能

ACQUITY UPLC M-Class系统能够在蛋白质组学应用中以纳升级流速运行,具有以下优势: 1.出色的色谱保留时间重现性、峰容量和灵敏度 2.无论是分析相对简单的样品还是较为复杂的胰蛋白酶酶切的肽混合物,都能展现优异的性能。

优化键合相及系统配置,提升蛋白组学研究中nanoLC的分离性能

本文首先将介绍柱上再聚焦对降低柱前扩散的积极影响,随后将对柱后传输管路和管路连接的扩散特性进行评估。

应用新型扫描型四极杆的DIA法进行系统生物学研究的方法优化

本文阐释了其采集原理,然后介绍了如何通过优化分析参数(例如上样量、扫描四极杆分离窗口、扫描速度和依赖m/z范围的碰撞能量梯度)在复杂蛋白质组学样品的分析中获得最佳的定性和定量覆盖率。

蛋白质组学的发展离不开高分辨质谱仪的进步,包括灵敏度的提高和扫描速度的加快。但是目前即使使用最新的超高分辨质谱,单针data-dependent acquisition (DDA)鉴定到的蛋白只能覆盖人蛋白质组的一半。
开发了新的化学蛋白质组学方法,并将其成功应用于生物学研究,包括药物靶标分析,新生蛋白质合成和蛋白质翻译后修饰,以及环境污染物的毒理分析。
涉及仪器:(化学分析仪器)-(质谱)-(液质联用(LC-MS))
自上而下的蛋白质组学(Top-down proteomics)是在完整蛋白质水平上对蛋白质组进行大规模表征的一种常用方法。此方法对于从同一基因衍生的各种蛋白质分子和蛋白质形式因基因水平发生变化、RNA水平的选择性剪接、以及蛋白质水平的PTMs进行高分辨率表征是非常有用的。

代谢组学、脂质组学在病毒研究中的应用

我们此次调研了基于Orbitrap超高分辨的代谢组学,脂质组学,以及药物治疗在病毒学研究中的应用。致敬白衣天使和深耕医学研究的学者。

Orbitrap高分辨质谱助力抗病毒单克隆抗体药物的发现和表征

我们整理了基于Orbitrap超高分辨质谱在抗病毒单克隆抗体药物中的应用,谨以此文致敬白衣天使和深耕医学研究的学者。

[重磅]探索新冠新疗法,蛋白质组学在行动

来自法兰克福大学医学病毒学研究所和歌德大学医学院团队利用一种新颖的蛋白质组学方法对新冠病毒进行研究,加速确证病毒致病性相关的生物途径以及寻找潜在的药物靶标,提出新冠治疗新疗法。

蛋白质组学技术在病毒研究中的应用

继病毒感染细胞的差异蛋白质组分析后,进行病毒感染宿主机体的差异及功能蛋白质组分析将是研究发展的趋势。

蛋白质组学在病毒入侵宿主中的研究

蛋白质组学方法与病毒学的结合促进了对病毒复制、抗病毒宿主反应和病毒对宿主防御的颠覆机制的深入研究。

【综述】蛋白质组学研究进展

蛋白质组学是研究一种基因组所表达的全套蛋白质的相关学科汇合的新兴体系,在短短三十年伴随着传统生物学发展而获得适宜的发展契机,研究工具和技术不断成熟,研究成果不断渗入生活各方面,提高了人类生命质量。

内容
    清风明月 2020-07-21

    越来越方便 0

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