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核酸碱基

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  • 浅谈小核酸的固相合成
    近年来由于核酸修饰和递送载体的突破,带来了变革性疗法的创新浪潮,其中被认为是继小分子药物、抗体药物之后第三代创新药物核酸药物迎来了爆发式增长,其优势在于广泛的可成药靶点、特异性强、安全性高、效果持久、开发成功率高和制造成本低等。寡核苷酸药物,即小核酸药物,是由十几个到几十个核苷酸串联组成的短链核酸,目前小核酸药物主要包括 RNAi 药物和 ASO 药物,作用于pre-mRNA或mRNA,通过干预靶标基因表达实现疾病治疗目的。目前小核酸药物大多通过亚磷酰胺三酯合成法进行合成。化学合成按照3'-5'的方向进行。常用的固相载体为可控微孔玻璃珠(CPG)或者聚苯乙烯微珠(PS beads),固相载体通过linker与初始核苷酸核糖的3'-OH共价结合,而核糖的2'-OH用诸如叔丁基二甲基硅基(TBDMS)的保护试剂进行保护,或是核糖的2端有甲氧基、F代、甲氧乙基等修饰,5'-OH则用双甲氧基三苯甲基(DMT)保护。此外,由于腺嘌呤、鸟嘌呤和胞嘧啶存在伯氨基团,也需要用酰基试剂(例如苯甲酰基)进行保护。固相合成每个循环主要包括四个步骤:脱保护、偶联、氧化和加帽。第一步 脱保护(Detritylation)使用溶解在二氯甲烷/甲苯中的二氯乙酸(DCA)或三氯乙酸(TCA)移除核糖5端的DMT基团,暴露5'-OH,以供下一步偶联。脱保护时间取决于流速和柱子尺寸,反应时间不够/脱保护剂酸性太弱会产生n-1杂质(与完整长度为n的寡核苷酸相比仅相差一个核苷酸);反应时间太长/脱保护剂酸性太强则导致序列中脱嘌呤的产生。反应完成后,用乙腈洗涤去除残留的脱保护剂,此步骤中乙腈含水量一般小于20ppm,乙腈需要使用较高流速去冲洗合成柱,脱保护试剂冲洗不干净导致n+杂质的产生。第二步 偶联(Coupling)合成目标的原料,亚磷酰胺保护核苷酸单体,与活化剂四氮唑混合,得到核苷亚磷酸活化中间体,它的3端被活化,5端羟基仍然被DMT保护,与溶液中游离的5端羟基发生偶联反应。为了保证较高的总产率,每个循环中都需要有较高的偶联效率。n-1杂质是偶联中最常见的杂质,它们是偶联效率低于100%的结果。与FLP相比,更高分子量的杂质(例如n+1)也存在于偶联步骤中,n+杂质的形成归因于活化剂四氮唑的弱酸性能移除一部分亚磷酰胺溶液中的DMT基团。第三步 氧化(Oxidation)偶联反应后新加上的核苷酸通过亚磷酯键(三价磷)与固相载体上的寡核苷酸链相连。亚磷酯键不稳定,易被酸、碱水解,在下一个循环的脱保护酸性环境中不稳定,因此需要被氧化成稳定的五价的磷。磷酸二酯键中的2-氰乙基保护基团可以使其在后续合成中更稳定。常用碘溶液将亚磷酰转化为磷酸三酯,得到稳定的寡核苷酸。此外通过将一个硫原子转移到P(三价)上也可以将其转化为P(五价),从而形成硫代磷酸酯键。氧化剂与固相载体的接触时间通常为1-4分钟。第四步 加帽(Capping)由于不可能达到100%的偶联效率,仍存在脱保护后没有反应的5'-OH活性基团(一般少于2%),如果不加处理,那这些基团在下一个循环中仍能发生偶联,产生n-1杂质。通常使用两种试剂(通常使用醋酸酐和N-甲基咪唑的混合液作为加帽试剂)来酰化5'-OH。经过以上四个步骤,一个核苷酸碱基被连接到固相载体的核苷酸上,再以酸脱去它的5'-羟基上的保护基团DMT,重复以上步骤,直到所有要求合成的碱基被接上去。核酸合成系统就是将上述一系列化学合成过程进行自动化,精准化可控制的设备。仪器主要由柱塞系统泵、试剂阀、单体阀、试剂循环阀、紫外检测器、电导率、惰性气体控制盒、压力监测器、合成柱及软件控制系统等多个部分组成。大规模寡核苷酸合成系统采用流穿合成技术,泵精度高,规模广泛,滞留体积低,适用于不同规模和类型的寡核苷酸。其以灵活简便的方式创建和转移方法,为工艺开发和优化提供支持,同时系统先进的数据处理能力和分析工具可高效监测和控制合成。英赛斯大规模核酸合成系统
  • 基因编辑技术,最后一块拼图补齐:线粒体中实现A到G碱基转换
    生物技术重大发现的历史时间表。图片来源:韩国基础科学研究所  科技创新世界潮韩国基础科学研究所(IBS)基因组工程中心研究人员开发了一种新的基因编辑平台,称为类转录激活因子效应相关脱氨酶(TALED)。TALED是能够在线粒体中进行A到G碱基转换的碱基编辑器。这一发现是长达数十年治愈人类遗传疾病之旅的结晶,而TALED,也被认为是基因编辑技术中最后缺失的一块拼图。研究成果发表在最新一期《细胞》杂志上。“基因剪刀”的魔力与缺憾从1968年第一个限制性内切酶的发现、1985年聚合酶链式反应的发明到2013年CRISPR介导的基因组编辑的示范,生物技术的每一个新突破发现都进一步提高了操纵DNA的能力。特别是,新近开发的CRISPR—Cas系统(“基因剪刀”)允许对活细胞进行全面的基因组编辑。这为通过编辑人类基因组中的突变来治疗以前无法治愈的遗传疾病开辟了新的可能性。虽然基因编辑在细胞的核基因组中取得了很大的成功,然而,科学家们在编辑拥有自己基因组的线粒体方面并不成功。线粒体,即所谓的“细胞的动力室”,是细胞中的微小细胞器,充当能量产生工厂。由于它是能量代谢的重要细胞器,如果基因发生突变,则会导致与能量代谢相关的严重遗传疾病。韩国IBS基因组工程中心主任金镇秀解释说:“由于线粒体DNA缺陷,出现了一些非常严重的遗传性疾病。例如,导致双眼突然失明的Leber遗传性视神经病变是由线粒体DNA中的简单单点突变引起的。”另一种线粒体基因相关疾病包括伴有乳酸性酸中毒和卒中样发作的线粒体脑肌病,它会缓慢破坏患者的大脑。一些研究甚至表明,线粒体DNA异常也可能是阿尔茨海默病和肌肉萎缩症等退行性疾病的原因。线粒体DNA可以编辑了线粒体基因组遗传自母系。线粒体DNA中有90个已知的致病点突变,总共影响至少5000人中的1人。由于向线粒体递送方法的限制,许多现有基因组编辑工具无法使用。例如,CRISPR—Cas平台不适用于编辑线粒体中的这些突变,因为引导RNA无法进入细胞器本身。另一个问题是缺乏这些线粒体疾病的动物模型。这是因为目前不可能设计出创建动物模型所需的线粒体突变。”金镇秀补充道,“缺乏动物模型使得开发和测试这些疾病的治疗方法变得非常困难。”因此,编辑线粒体DNA的可靠技术是基因组工程的前沿领域之一,为了征服所有已知的遗传疾病,必须探索这一前沿领域,世界上最优秀的科学家多年来一直在努力使其成为现实。2020年,由美国哈佛大学博德研究所和麻省理工学院刘如谦领导的研究团队创建了一种新的碱基编辑器,名为DddA衍生的胞嘧啶碱基编辑器,可从线粒体中的DNA进行C到T转换。这是通过创造一种称为碱基编辑的新基因编辑技术来实现的,该技术将单个核苷酸碱基转化为另一个碱基而不会破坏DNA。但是,这种技术也有其局限性。它不仅仅限于C到T转换,而且主要限于TC基序,使其成为有效的TC-TT转换器。这意味着它只能纠正90个已确认的致病性线粒体点突变中的9个,也就是10%。长期以来,线粒体DNA的A到G转换被认为是不可能的。研究第一作者赵兴义说:“我们开始思考克服这些限制的方法。因此,我们创建了一个名为TALED的新型基因编辑平台,可实现A到G的转换。我们的新碱基编辑器极大地扩展了线粒体基因组编辑的范围。这不仅可为建立疾病模型作出巨大贡献,还可为开发治疗方法作出巨大贡献。值得注意的是,其在人类mtDNA中能够进行A到G的转化可纠正90种已知致病性突变中的39种,约为43%。”研究人员通过融合三种不同的成分创造了TALED。第一个组分是转录激活子样效应子,它能够靶向DNA序列。第二个组分是TadA8e,一种用于促进A到G转化的腺嘌呤脱氨酶。第三个组分DddAtox,是一种使DNA更容易被TadA8e获取的胞嘧啶脱氨酶。TALED的一个有趣的方面是TadA8e在具有双链DNA的线粒体中执行A到G编辑的能力。这是一种神秘的现象,因为TadA8e是一种已知仅对单链DNA具有特异性的蛋白质。金镇秀说:“以前没有人想过使用TadA8e在线粒体中进行碱基编辑,因为它应该只对单链DNA具有特异性。正是这种跳出框框的思维方法真正帮助我们发明了TALED。”诺贝尔奖级别的成果研究人员推测,DddA tox允许通过瞬时解开双链来访问双链DNA。这个转瞬即逝的临时时间窗口允许TadA8e作为一种超快作用的酶,快速进行必要的编辑。除了调整TALED的组件外,研究人员还开发了一种能够同时进行A到G和C到T碱基编辑以及仅进行A到G碱基编辑的技术。研究团队通过创建包含所需mtDNA编辑的单个细胞衍生克隆来展示这项新技术。他们发现TALED既不具有细胞毒性,也不会导致mtDNA不稳定。此外,核DNA中没有不良的脱靶编辑,mtDNA中的脱靶效应也很少。研究人员现在的目标是通过提高编辑效率和特异性来进一步改善TALED,最终为纠正胚胎、胎儿、新生儿或成年患者中的致病mtDNA突变铺平道路。研究团队还专注于开发适用于叶绿体DNA中A到G碱基编辑的TALED,叶绿体DNA编码植物光合作用中的必需基因。基础科学研究所科学传播者苏威廉称赞道:“我相信这一发现的意义可与2014年获得诺贝尔奖的蓝色LED的发明相媲美。就像蓝色LED是让我们拥有高能效白光LED光源的最后一块拼图一样,预计TALED将迎来基因组工程的新时代。”
  • 核酸质谱之漫话二: 核酸质谱法鉴定结核病及其耐药性
    导读结核病是严重威胁人类健康的重要传染性疾病之一。如何准确快速诊断和鉴别诊断结核病及其耐药性,对指导临床开展早期精准有效治疗至关重要。本篇将主要介绍核酸质谱技术在鉴定结核病及其耐药性方面的内容……结核病是严重威胁人类健康的重要传染性疾病之一。来自世界卫生组织的数据显示:2021年全球有1060万例新发结核病患者,死亡近160万例,新增45万例耐多药/利福平耐药结核病患者;我国新发78万例结核病患者,新增耐多药/利福平耐药结核病患者约3.3万例,是全球结核病及耐药结核病高负担国家之一;肺外结核占所有结核病的15%~40%,因其容易导致器官或组织功能性损伤和器质性障碍而成为近年来结核病领域关注的重点(数据摘自《中国防痨杂志》)。因此,准确快速诊断和鉴别诊断结核病及其耐药性,对指导临床开展早期精准有效治疗至关重要。常见的结核病及其耐药性的诊断方法目前对诊断结核病及其耐药性的方法有:实时荧光定量PCR技术、恒温扩增技术、基因芯片/线性探针技术、基因测序技术和核酸质谱技术等。核酸质谱技术鉴定结核分枝杆菌的优势目前,核酸质谱技术可鉴定结核分枝杆菌复合群8个亚种和40个非分枝杆菌菌种及其亚种,合计48个分枝杆菌菌种和亚种,几乎覆盖了临床上分枝杆菌病的所有常见致病菌。而对于分枝杆菌的保守基因片段,核酸质谱技术可以针对基因的多态性进行设计和鉴定。其优势如下:01敏感度高:目前核酸扩增技术的结核分枝杆菌检测均基于IS6110、IS1081等位点进行扩增,选择其中的1个或2个,而核酸质谱技术可在此基础上增加其他位点的多肽性检测;02特异性高:核酸质谱可以用多基因结果验证,保证结核分枝杆菌检测的特异度;03耐药性检测方面应用范围广:几乎覆盖了目前常用的抗结核和抗分枝杆菌病的药物,检测针对性强、准确性高;04检测速度快:近百例样本同时进行检测分析,检测周期短于一代和二代测序,对少量样本也能进行多基因多位点检测。无需培养,实现单个核苷酸碱基的直接鉴定。核酸质谱技术鉴定结核分枝杆菌抗结核药物目前核酸质谱技术可检测结核分枝杆菌4种一线抗结核药物(异烟肼、利福平、吡嗪酰胺和乙胺丁醇)和常用的二线抗结核药物(氟喹诺酮类、链霉素等)的耐药基因型。药物的检测结果与表型药物敏感性(简称“药敏”)试验结果具有很好的一致性;并可根据耐药相关的基因多态性进行设计,从而获得相关的耐药基因突变结果。可用于检测常用一线、二线抗结核药物的耐药基因位点。如利福平和异烟肼等。* 利福平:利福平的耐药决定区集中了95%以上的临床耐药菌株。核酸质谱技术能够检测出此决定区的所有突变位点,以及区外的常见位点,从而较全面地预测利福平耐药性。同时,核酸质谱法检测的结果还会提示是低水平耐药还是高水平耐药,从而避免出现使用药敏方法检测时的遗漏。综上所述:对于结核病的诊断,我国主要通过患者的临床表现、影像学检查结果及免疫学检测结果进行综合分析,但缺点是检测时间长及准确率有待提高。近年来,分子诊断技术包括核酸质谱技术的迅速崛起和发展,为结核病的快速诊断提供了新的方法。东西分析经过数年的开发,基于飞行时间质谱技术平台开发出快速鉴定结核分枝杆菌及其抗结核药物的应用方案。基于用户的具体需求,通过核酸质谱这个快速及强有力的辅助诊断工具,东西分析可对结核分枝杆菌进行精确到种乃至亚种水平的鉴定,从而为临床提供早期精准诊断和治疗参考建议。对于阳性的检测结果,还可进一步进行耐药性检测。即根据检测结果,临床医生不仅能够进行高效精准的结核病诊断,还能够及时调整治疗药物,从而优化治疗方案。Ebio Reader 3700 Plus飞行时间质谱仪操作简单无需复杂的样品前处理。性能稳定长寿命固体激光器;飞行管随环境温度、湿度的变化小,保证检测的稳定 ;高效网筛离子源,提高仪器的灵敏度 ;PIE高压脉冲电源控制,实现离子的延迟推斥,提高整体仪器的分辨能力。软件智能基于神经网络聚合分类法的人工智能软件;拥有强大数据库,实现对菌种的实时鉴定;具备聚类分析功能,可进行T-test等数据分析;具有自建库功能,可根据用户实际情况建立自有菌种库 ;可根据用户具体需求,进行相应升级,用于疾病蛋白标志物和核酸基因分型的检测。应用范围广广泛用于临床、疾控、食品安全、农业、工业、出入境检疫等领域。往期回顾BREAK AWAY核酸质谱之漫话一:什么是核酸质谱
  • 快速解读DNA碱基序列技术问世
    日本研究人员在6日的英国《自然纳米技术》杂志网络版上发表论文说,他们开发出只需少量DNA(脱氧核糖核酸)就能快速解读其碱基序列的新技术。这将有助于提高基因诊断、犯罪侦破等工作效率。  日本大阪大学产业科学研究所田中裕行等研究人员利用能在真空中以千分之一秒速度喷射液体的喷雾器,将含有微量DNA的水溶液喷射到铜板上。为使水溶液更容易附着到铜板上,研究人员令铜板倾斜45度,喷射后再冷却铜板。这时,在细胞内呈螺旋状的DNA就会在铜板上伸展开并停留在铜板上。这样一来,研究人员利用“扫描隧道显微镜”就很容易观察DNA的碱基序列。
  • DNA碱基家族或许迎来第六名成员
    西班牙科学家在最新出版的《细胞》杂志上撰文指出,或许存在着第六种碱基&mdash &mdash 甲基腺嘌呤(mA),其主要作用是确定表观基因组的性质,并因此在细胞的生命过程中发挥重要作用。  脱氧核糖核酸(DNA)是遗传物质的主要组成成分,一般认为,它由A(腺嘌呤)、C(胞嘧啶)、G(鸟嘌呤)和T(胸腺嘧啶)四种碱基结合而成,这些碱基组合成数千种可能的排序,从而提供了遗传多样性,使得活体生物呈现出多种多样的面貌和功能。  上世纪80年代初,由这四种&ldquo 经典&rdquo DNA碱基组成的家族中迎来了第五名成员:甲基胞嘧啶(mC),其源于胞嘧啶。mC的出现引发了科学家们极大的关注,并获得了广泛的研究。上世纪90年代后期,mC被广泛看成是表观遗传机制的主要原因:它能够根据每个组织的生理需要,打开或关闭基因。而且,随着研究的进一步深入,科学家们现在知道,作为一种重要的表观遗传修饰,mC参与基因表达调控、X-染色体失活、基因组印记、转座子的长期沉默和癌症的发生。  据每日科学网4日报道,西班牙Bellvitge生物医学研究所表观遗传学和癌症生物学计划负责人、巴塞罗那大学遗传学教授曼奈· 埃特雷在《细胞》杂志上发表文章,描述了第六种碱基&mdash &mdash mA存在的可能性,他认为,这种碱基也帮助确定表观基因组,并因此在细胞生命过程中发挥着重要作用。  埃特雷在论文中表示:&ldquo 早在数年前,我们就知道,在我们生物学上的远亲&mdash &mdash 细菌的基因组内就存在mA,主要作用保护其免受其他生物体遗传物质的入侵,但当时科学家们认为,这一现象只出现在原始细胞内。&rdquo   埃特雷继续解释说:&ldquo 现在《细胞》杂志发表的三篇论文表明,藻类、蠕虫以及苍蝇都拥有mA,这些生物的细胞像人体细胞一样都是真核细胞,说明人体细胞内也可能拥有第六种碱基。研究表明,mA的主要功能是调控某些基因的表达,因此,构成了一种新的表观遗传标记。在我们所描述的这些基因组内,mA的浓度都很低,但随着拥有高灵敏度分析方法的发展,使得这项研究成为了可能。除此之外,mA可能也在干细胞和发育初期发挥重要作用。&rdquo   研究人员表示,他们接下来打算对相关数据进行确认,以厘清是否包括人在内的哺乳动物也拥有这第六种碱基以及其作用究竟是什么。
  • 我国科学家研发出检测DNA中第五种碱基的新技术
    DNA的基本元素包括腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、鸟嘌呤(G)、胞嘧啶(C)和脱氧尿嘧啶(dU),然而目前还无法从单碱基分辨率水平上检测dU,严重影响了对dU功能的理解。近期,我国科学家研发出在单碱基分辨率水平上精准检测dU的新技术,研究成果发表在《Journal of the American Chemical Society》期刊,标题为“UdgX-Mediated Uracil Sequencing at Single-Nucleotide Resolution”。  该方法被命名为Ucaps-seq法(UdgX cross-linking and polymerase stalling sequencing)。研究人员利用从耻垢分枝杆菌中发现的新型糖苷酶UdgX,特异性地识别和切除DNA中的dU,形成的缺口与对应的核糖形成共价键,从而将其捕获。由于DNA高保真聚合酶碰到UdgX标记的dU缺口能原地“停车”,研究人员利用的DNA高保真聚合酶这一特性进一步确认了dU的位置。最后,结合高通量测序技术将“停车”信号放大,从而在单碱基水平上精准定位dU在DNA乃至基因组上的位置。  Ucaps-seq法是国际上第一个酶法检测DNA中的dU碱基的技术,灵敏性好、特异性强、分辨率高,将大大推进核酸序列检测、遗传密码破译和人类对核酸的认知。  注:此研究成果摘自《Journal of the American Chemical Society》期刊原文章,文章内容不代表本网站观点和立场,仅供参考。   论文链接:https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.1c11269
  • 新型安全高效的单碱基编辑系统—TaC9-CBE
    近十年来,以 CRISPR 系统为代表的基因编辑技术迅猛发展,在包括农业、畜牧业和生物医药等各个领域的基础科研和应用中不断涌现出耀眼成果。2020年 CRISPR 技术因其强大的功能和影响力摘得诺贝尔化学奖。然而,随着研究的深入,其引起的 DNA 双链断裂和高脱靶效应等一系列副反应也逐渐走入人们的视野,CRISPR 技术的安全性开始备受关注。单碱基编辑技术以其高效和精确的基因编辑能力,成为目前最有希望治愈各种遗传疾病的明星工具。由 gRNA 与 Cas9-脱氨酶形成 RNP 复合物,gRNA 引导复合物结合在基因组目标位点,Cas9 负责解开 DNA 双链,并将靶向链切断,脱氨酶对非靶向单链 DNA(ssDNA)上的碱基进行脱氨,细胞修复过程中实现碱基转换。然而,单碱基编辑工具被发现具有明显的脱靶编辑效应,主要包括 Cas9 非依赖的 DNA 和 RNA 脱靶效应和 Cas9 依赖的 DNA 脱靶效应。通过对脱氨酶的修饰可大大降低蛋白对核酸链的非特异结合,从而最大限度地减少 Cas9 非依赖的脱靶效应。但由于 Cas9 蛋白本身存在的 Cas9 依赖性脱靶,人们依然对其临床应用的安全性表示担忧。尽管目前已有多种方法尝试解决这一问题,但都无法在保持目标效率的同时解决 Cas9 依赖性脱靶问题。2022年3月,中国科学院广州生物医药与健康研究院赖良学研究员与五邑大学邹庆剑副教授团队合作,首次将腺苷脱氨酶与转录激活因子样效应子(TALE)融合,开发了一种新型腺嘌呤碱基编辑系统——TaC9-ABE。该新型碱基编辑系统可以完全消除Cas9依赖性脱靶,而不影响任何靶向编辑效率。相关成果以:Elimination of Cas9-dependent off-targeting of adenine base editor by using TALE to separately guide deaminase to the target site 为题在线发表在 Cell Discovery 期刊上。TaC9-ABE单碱基编辑技术原理近日,该团队再次证实将 TALE 技术与 Cas9 技术结合起来,同样可以实现更加安全高效的胞嘧啶碱基编辑系统——TaC9-CBE。相关成果以:Eliminating predictable DNA off-target effects of cytosine base editor by using dual guiders including sgRNA and TALE 为题于在线发表在 Molecular Therapy 期刊上。TaC9-CBE单碱基编辑技术原理在 TaC9-ABE 和 TaC9-CBE 碱基编辑系统中,研究人员将脱氨酶与 nCas9 分离,脱氨酶与 TALE 连接,nCas9 与 gRNA 结合,由 TALE 和 gRNA 分别将两个效应器引导到 DNA 靶位点,同时发挥作用,实现靶位点的 A to G 或 C to T 的突变。如果 nCas9 被 gRNA 带到错误的位点,由于没有脱氨酶的存在,碱基转换就不能发生;同理,如果脱氨酶被 TALE 引导至错误的位点,由于没有 nCas9 的存在,不能形成单链 DNA,脱氨酶发挥不了作用,碱基转换也不能发生,这样就彻底地排除了发生 Cas9 依赖性脱靶的可能性。研究结果证实,TaC9-碱基编辑系统在保证高效但碱基编辑的同时,对 gRNA 依赖的脱靶位点以及 TALE 依赖的脱靶位点进行深度测序均未检测到脱靶现象。图3.各种CBE编辑器的Cas9依赖脱靶测试这项研究为基因编辑动植物的培育和人类遗传性疾病的基因治疗提供了一个安全的单碱基编辑工具。TaC9-ABE 论文中,中国科学院广州生物医药与健康研究院博士研究生刘洋和蓝婷、五邑大学周小青博士和广东工业大学博士研究生周继曾为论文共同第一作者。中国科学院广州生物医药与健康研究院赖良学研究员和五邑大学邹庆剑副教授为论文的共同通讯作者。TaC9-CBE 论文中,广东工业大学博士生周继曾、中国科学院广州生物医药与健康研究院博士生刘洋、硕士生魏愈惠和五邑大学硕士生郑淑文为论文共同第一作者。中国科学院广州生物医药与健康研究院赖良学研究员、五邑大学张焜教授和邹庆剑副教授为论文的共同通讯作者。论文链接:https://www.nature.com/articles/s41421-022-00384-4https://doi.org/10.1016/j.ymthe.2022.04.010
  • 迄今最全面人类基因组测序完成,比原图增加2亿碱基对和2000多个基因
    最新测序的完整的人类基因组图谱。图片来源:英国《新科学家》网站20年前,科学家宣布读取了一个人的全部脱氧核糖核酸(DNA),其实,他们漏掉了少许。现在,由于读取DNA方法的改进,科学家终于可以从头到尾读取人类的全部基因组了!据生物预印本网站(biorxiv)近日报道,美国科学家对全部人类基因组30.55亿个碱基对进行了测序,与此前结果相比,新结果增加了2亿个碱基对以及2000多个基因。人类拥有数万个基因,它们储存于DNA分子中,基因信息以4种碱基(C、G、T和A)的形式存在,两个碱基相互配对形成碱基对。科学家于1990年启动了人类基因组测序项目,并于2001年公布了首个人类基因组草图。但当时不得不将基因组分成小段读取,然后重新组装在一起,而这样无法将一些高度重复的片段放回原位。随后遗传学家继续改进,但重点还是放在提高现有序列的精确度,而非增加新序列,仍有约8%的序列缺失或错误。新版本基因组由“端粒到端粒”(T2T)联盟绘制。该联盟由加州大学圣克鲁斯分校的卡伦米加和国家人类基因组研究所的亚当菲利皮领导。研究人员选择从一个被称为CHM13的细胞系中读取DNA。该细胞系来自水泡状胎块——一种妊娠失败情况,可以在实验室中培养这种细胞。菲利皮说:“CHM13的独特之处在于,它不是任何人的基因组。”普通人类细胞的每段DNA都有两个副本,往往存在重大差异,一个来自母亲,另一个来自父亲,这使得对DNA精确测序变得更加困难,因为要搞清楚什么是测序过程中的失误、什么是真正的差异非常棘手。使用CHM13避免了这个问题,因为两个副本几乎完全相同。为组装基因组序列,研究团队利用了两种技术:一种是能读取非常长(超过100万个碱基对)片段的测序技术;另一种是精确度极高、能处理差别极小的片段(比如同一个基因的多个副本)的技术。2020年7月,该团队公布了完整的决定性别的人类X染色体。现在,他们公布了完整的人类基因组,新版本比上一个版本增加了近2亿个碱基对以及2226个新基因,是自人类参考基因组首次发布以来进行的最大改进。
  • 生命原来是这么出现的:科学家发现陨石撞击可产生DNA
    p  北京时间8月27日消息,据科学日报报道,一项最新研究指出陨石撞击古代海洋可能创造了核酸碱基和氨基酸。日本东北大学、日本国立材料科学研究所和日本广岛大学的研究人员在进行模拟陨石撞击古代海洋的撞击实验后发现了这一结果。 通过对撞击后恢复的产品的精确分析,研究小组发现无机化合物形成了核酸碱基和氨基酸。/pp style="TEXT-ALIGN: center"img style="WIDTH: 450px HEIGHT: 317px" title="d4a59c1c3702c65_jpg_600x600.jpg" border="0" hspace="0" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201508/noimg/c6dec13d-e146-418a-ad75-5bc60fda4dd1.jpg" width="450" height="317"//pp style="TEXT-ALIGN: center"  图1/pp  这项研究被发表在期刊《地球和行星科学快报》上。/pp  现代生命的所有遗传信息都以核酸碱基序列的形式存储在DNA里。然而,在前生命地球上利用无机化合物形成核酸碱基一直被认为是相当困难的。/pp  2009年科学家报告通过模拟陨石撞击形成了最简单的氨基酸和甘氨酸。这次,他们用碳酸氢盐取代了碳源,并用发射药火炮以1千米/秒的速度进行了高速撞击实验。/pp  他们发现形成了更具多样性的生命基本建构单元,包括两种核酸碱基和九种蛋白氨基酸。结果表明了遗传分子最初是如何在地球上形成的一种新途径。/p
  • 水中pH值(酸碱度)如何鉴别
    大家应该经常听到水的酸碱度值及ph值,其实pH值(酸碱度)是鉴别饮用水品质的一个重要并显著的科学指标。那么究竟健康的水,它的的ph为多少呢? 水,每个人都非常熟悉,也是每个人都离不开的,相关数据表明人体内约百分之八十均为水分。可见水直接影响人们健康! 世界卫生组织公布的《饮用水水质准则》表明:人体从水中吸收的矿物质至少不少于5%,最多可达20%。通常,饮用水的pH值与水中的矿物质有直接联系。天然矿物质含量越高越均衡的饮用水,pH值呈碱性 没有矿物质或外加人工矿物质的饮用水,pH值通常呈酸性。pH值(酸碱度)是鉴别饮用水品质的一个重要并显著的科学指标。 弱碱性的饮用水可以有效维护血液的弱碱状态,并中和多余的酸性物质。虽然我们至今仍然无法精确地测定酸性水对人体衰老过程的影响,但可以确信其对人类健康的影响是负面的。酸碱度(pH值)的相关标准:  生活饮用水卫生标准pH值:6.5-8.5(GB5749-85)   酸雨的pH值标准:5.6以下(国家酸雨观测标准 GB/T19117-2003)   排放污水的最低pH值标准:6.0(中国人民共和国国家污水综合排放标准 GB8987-1996)   外用服装pH值超出4-9为劣质产品,将可能损害人体健康。  简单的水测试,了解你喝的水的酸碱度。
  • 酸碱浓度计的维护保养方法
    酸碱浓度计是通过测量溶液电导率的方法间接地测得该溶液的浓度,已知在某一恒定温度时,低浓度电解质的电导率与该溶液的浓度成对应关系,浓度不变而溶液温度发生变化时,电导率也发生变化,即该溶液的浓度是电导率和温度的函数。其采用电导电极式传感器进行测量(浓度电极材料采用铂金),为避免电极极化,仪表产生高稳定度的正弦波信号加在电极上,流过电极的电流与被测溶液的浓度成正比,由前置放大器测量流过电极的电流并转换为电压信号,经程控放大、相敏检波和滤波后得到反映浓度值的电压信号 微处理器通过开关切换,对温度信号和浓度信号交替采样,经过运算和温度补偿运算后,转换并显示为25℃时被测量的浓度值和即时的温度值。酸碱浓度计的维护保养方法:1、仪器不消时应及时切断电源,并放置在清洁、无尘、枯燥的环境下。2、每次做完实验后,应将仪器的外表、酸碱浓度计电极接口和温度接口擦洁净并坚持枯燥形状。酸碱浓度计电极的维护:1、应经常清洗电极,确保其不受污染及梗塞。2、每次清洗完电极后,运用滤纸吸干电极外表的水珠,然后装入流通杯中。3、电极在不消时,应放置在枯燥的无灰尘的环境下。
  • 核酸质谱之漫话一: 什么是核酸质谱
    导读核酸质谱,顾名思义是一种能检测核酸的质谱,它是基于MALDI-TOF MS质谱发展起来的一种继PCR(核酸扩增技术)和NGS(高通量测试)之后的又一个分子诊断新平台。那么,核酸质谱在医疗领域它有哪些优势和应用呢,接下来一起了解下… 核酸质谱技术近年来核酸质谱已成为PCR和NGS之后的又一个分子诊断新平台。荧光定量PCR检测速度快,但通量有限,无法方便快捷地满足对于多基因数十个至数百个位点的检测需求;而高通量测序虽然通量极高,但其检测成本高、项目检测周期长、检测的数据也需专业的分析解读,技术门槛较高;而核酸质谱稳定准确的检测结果和较低的检测成本满足了对中等通量位点SNP及基因突变等定性和定量检测的需求,同时可以进行方便快捷的DNA甲基化及拷贝数变异(CNV)检测,更凸显其在基因检测领域的强大竞争力,从而成为生命科学特别是临床诊断领域快速发展的主力平台之一。生命遗传物质DNA分子由4种碱基——ATCG所构成的,而每种碱基的分子质量不同。核酸质谱这台高精度的“天平”,可区分单个碱基的质量差异(GATC)。当核酸发生变异的时候,不论是碱基替换还是修饰,都会改变DNA的分子质量。核酸质谱通过对这种质量变化的精确分析,可对其精准识别。核酸质谱既可以检测基因的多态性和基因的突变,也可以检测核酸的化学修饰,还能够对拷贝数变异和修饰水平等进行定量的分析。核酸质谱主要通过多重PCR+高通量芯片+飞行时间质谱来实现核酸检测。目前核酸分析所使用的质谱电离技术主要为基质辅助激光解析电离(MALDI),分子量检测范围可达到50万道尔顿,打破了以往质谱仅可进行小分子物质分析的限制,使得研究范围扩大到核酸、蛋白质等生物大分子,极大推进了基因组学和蛋白质组学的发展,给生物科学及医学领域带来了突破。核酸质谱可进行基因的单核苷酸多态性(SNP)、基因突变、DNA甲基化及拷贝数变异(CNV)分析,广泛应用于药物基因组学、肿瘤分析、肿瘤液态活检、病原体检测、遗传性疾病和甲基化研究等领域。迄今为止临床上还鲜有其他检测平台可以兼顾多种组学层次的检验分析。东西分析经过多年研发,继飞行时间质谱仪取得微生物鉴定医疗器械注册证书后,也同时在核酸质谱领域开发了多个应用并陆续开始生产转化,如多种食源性致病菌联检、军团菌检测、耐药基因位点检测、癌症早筛、冠状病毒检测和甲基化检测;并参与了多个相关国标和行业标准的制定工作。编者语从下期将陆续给大家带来东西分析开发的核酸质谱的多种应用介绍,如宫颈癌、甲状腺癌、多种食源性致病菌和呼吸道病毒联检等,敬请期待!
  • 核酸降解知多少
    导语在实验过程中,最心累的莫过于好不容易提取的核酸却降解了。那么核酸为什么会发生降解呢,我们又该如何预防呢?关于核酸降解,你了解多少呢?让我们一起对核酸降解一探究竟吧。 什么是核酸 核酸是一种高分子化合物,核苷酸是构成核酸的基本单位。核酸水解后得到许多核苷酸,核苷酸是组成核酸的基本单位,即组成核酸分子的单体。一个核苷酸分子是由一分子含氮的碱基、一分子五碳糖和一分子磷酸组成的。根据五碳糖的不同可以将核苷酸分为脱氧核糖核苷酸和核糖核苷酸。如果5-碳糖是核糖,则形成的聚合物是RNA;如果5-碳糖是脱氧核糖,则形成的聚合物是DNA。 核酸降解本质 核酸降解是DNA/RNA分子中的碱基和戊糖间的氮糖苷键,或磷酸二酯键在物理因素、化学因素和生物因素等作用下发生水解,使DNA/RNA链发生断裂。核苷磷酸化酶:能分解核苷生成含氨碱基和戊糖的磷酸酯酶。广泛存在于生物体内,催化的反应可逆。可在核苷水解酶作用下继续分解核苷成嘌呤碱、嘧啶碱和戊糖。核苷水解酶:主要存在于植物和微生物体内,只水解核糖核苷。 核酸降解原因 DNA降解的因素很多,主要分为物理因素,化学因素和生物因素。一、物理因素:温度,机械剪切力、核酸的反复冻融、高温煮沸及辐射等。二、化学因素:PH值,水解反应,氧化反应等。三、生物因素:酶解及微生物侵染等作用。一、物理因素的影响★ 温度:高温条件下,RNA不稳定,易加速磷酸二酯键的水解,使核酸降解;★ 机械剪切力:包括剧烈震荡、搅拌、细胞突然至于低渗溶液中,以及让溶液快速通过狭长的孔道;★ 核酸的反复冻融、高温煮沸及辐射等,均会导致核酸的降解。二、化学因素影响水解★ PH值:氢离子参与催化磷酸二酯键、糖苷键的水解,但糖苷键比磷酸二酯键更易被酸水解。过高或过低的PH值都易破坏复键。核酸(特别是RNA)在碱性溶液中十分容易降解;★ 氧化反应:会氧化碱基中的含氨杂环,使其变性,从而改变一级与二级的核酸构象;★ 苯酚在空气中被氧化生成醌,它能够产生自由基,直接用于DNA的分离,会使磷酸酯键断裂,造成DNA的降解。三、生物因素影响★ 酶解:核酸酶可以催化水解多聚核苷酸链中的磷酸二酯键,直接破坏核酸的一级结构,使其降解。1.核酸酶(磷酸二酯酶)核酸内切酶:在环境或生物体内具有识别双链DNA分子中特定核苷酸序列,并由此切割DNA双链的核酸内切酶统称为限制性核酸内切酶。作用方式从多聚核苷酸链中间开始,在某一个位点切断磷酸二酯键。如DNase,RNase等。核酸外切酶:核酸外切酶的作用方式是从多聚核苷酸链的一端(3' -端或5' -端)开始,逐个水解切除核苷酸。如蛇毒磷酸二酯酶,牛脾磷酸二酯酶等。2.核苷酸酶(磷酸单酯酶)专一性的磷酸单酯酶:3' -核苷酸酶,5' -核苷酸酶非专一性磷酸单酯酶。★ 微生物侵染:微生物会将DNA作为营养物质或是其分泌的化学物质含酶。 预防降解的方法 预防RNA降解的方法:★ 去除环境中RNase酶的污染或强有力地抑制其活性。★ 获取样品后最好立即提取RNA,若无条件立即实验,应于-80℃液氮中保存样品,提取时取出样品后立即在低温下研磨裂解细胞,以防RNA降解。★ 在总RNA提取分离的最初阶段,联合使用Rnase的特异抑制剂,尽可能的灭活胞内的Rnase的活性。★ 避免样品的反复冻融。★ 保证裂解液的质量,裂解液的用量不足,也会导致RNA降解。★ RNA提取后,放入-80℃保存,防止降解。预防DNA降解的方法:★ 简化操作步骤,缩短提取过程,以减少各种有害因素对核酸的破坏;★ 减少化学物质对DNA的降解,为避免过酸、过碱对DNA双链中磷酸二酯键的破坏;★ 防止基因组DNA的生物降解,主要是DNase降解基因组DNA,Dnase需要二价金属阳离子Mg2+等的激活,可用EDTA等金属离子整合剂整合Mg2+以抑制Dnase的活性;★ 减少物理因素对DNA的降解,物理降解因素主要包括机械剪切力(如剧烈震荡、搅拌等);★ 避免样品的反复冻融,可将DNA分装保存于缓存液中;★ 所有试剂应用无菌水配制,耗材经高温灭菌;★ 避免DNA的过高温处理等。
  • 生命科学|当“核酸”遇上“质谱”——多重分子诊断技术的下一站
    引言新冠病毒肺炎疫情的爆发,推动了国内分子诊断技术的高速发展,同时也使得“核酸”成为大家耳熟能详的词汇。当前的核酸分析技术,主要是基于荧光定量PCR(qPCR)的原理,虽然具有灵敏、准确、便捷的优势,但却通常只能对少于5个的靶标进行分析。不过这样相对有限的检测靶标数目,虽然在新冠检测等特定应用场景已经足够有效(即判断是否感染新冠),却难以应对一些复杂疾病的检测,如肿瘤、出生遗传缺陷、精-准用药的检测等。因为这些疾病通常都涉及到更多的基因变异情况,需要有具备更广泛的检测能力的技术。而核酸质谱技术,就是一个非常好的进行多重核酸分析的分子诊断平台。核酸质谱原理说到质谱的技术,领域内的人应该并不是完全陌生。顾名思义,质谱就是对“质量”进行精-确检测的精密设备,也是临床诊断领域快速发展的未来平台之一。质谱可以用来检测蛋白质和代谢物,也可以用来检测核酸。生命的遗传物质DNA分子是由4种碱基——ATCG所构成的,每种碱基的分子质量不同。核酸质谱犹如一把高精度的天平,可区分单个碱基的质量差异(GATC)(图1)。当核酸发生变异的时候,不论是碱基的替换还是修饰,都会改变DNA的分子质量,核酸质谱通过对这种质量变化的精确分析,就能够对其进行精-准的识别。通过这种方式,核酸质谱既可以检测基因的多态性和基因的突变,也可以检测核酸的化学修饰,还能够对拷贝数变异和修饰水平等进行定量的分析。图1 DNA分子碱基组成核酸质谱的优势相比传统的qPCR等分子诊断手段,核酸质谱拥有多重、准确、高通量的优势。这是由核酸质谱的检测原理和技术路线所决定的。首先,核酸质谱直接依据分子量的差异来进行检测,只要待测靶标扩增后的分子量不同,就可以相互区别开来,不会像传统的qPCR一样受到荧光通道数的限制。因此,核酸质谱通常能够实现30-50重乃至更多靶标的分析,而传统的qPCR方法单次检测通常小于5重。其次,由于采用了两步扩增反应,再加上对质量直接进行检测,因此核酸质谱具有极强的准确性和特异性,抗干扰能力强,适合于复杂背景下的低丰度靶标分析。最-后,核酸质谱检测速度极快,每个样本在质谱检测环节仅需数秒的时间,适合于大批量的样本的分析(图2)图2 集合PCR、芯片、质谱三大技术优势核酸质谱的应用核酸质谱的优势决定了它特别适合于复杂的、多靶标疾病的分子诊断。主要包括出生遗传缺陷、肿瘤、药物基因组、病原体多联检和耐药检测等。详见如下表: FPI得益于本身的优良性能和广阔的应用前景,核酸质谱受到了行业内越来越多的关注,可谓是分子诊断的“明日之星”。然而当前,国内的核酸质谱仍主要被进口品牌及其OEM厂商所垄断。由于其技术难度较大、产品功能复杂,国内能够布局该平台并掌握核心技术的厂家仍是寥寥。在这种情势下,聚光科技集团下属的聚致生物,已经完成开发了原生的、具有独立自主知识产权的核酸质谱系统,并同国内一些知名的分子诊断试剂研发企业进行合作,开拓这一极富前景的新领域,为健康事业做出新的贡献。
  • YSI最新推出的pH10笔式酸碱度/温度计
    准确、经济、便携式测量YSI 最新推出的pH10 笔式酸碱度/温度计 精巧、耐用,适用于各种测量场合。它的设计基于一个经济可靠的平台,可快速提供高准确度的酸碱度和温度值。简单耐用以及防水的设计,使其能够从容应对复杂而恶劣的野外测试环境。 其应用范围非常广泛,将涵盖那些需要使用小巧耐用的仪器在浅水中获得高精度pH和温度值的领域。· 城市污水处理厂过程和排放水· 企业污水处理厂过程和排放水· 在江河、湖泊、溪流、河口与海洋中的常规测量· 大学环境和野外研究项目 · 海水或淡水养殖· 教育系统· 教学设备· 水族馆、家庭型或商业型观赏鱼· 为水栽培/苗圃提供适宜的培养摄取和使用的水分析· 葡萄酒测量· 果汁测量,如西红柿、苹果、柚子和桔子等· 印刷厂-用于胶印的润湿液控制
  • 实验室中首次“撞”出构建生命的四种基本碱基
    大约40亿年前,地球上开始出现早期生命。目前较为流行的一种理论认为,是陨石或小行星等地外天体的撞击触发了关键的化学反应,从而产生了一些与生命有关的物质。现在,捷克科学院的研究人员在实验室中重演了这一过程:他们利用激光轰击黏土和化学物质汤,模拟一颗高速小行星撞击地球时的能量,最终生成了构建生命的至关重要的基本组件&mdash &mdash 形成RNA必需的4种碱基。  研究人员在发表于美国《国家科学院学报》上的论文中称:&ldquo 这些发现表明,地球生命的出现并非意外,而是原始地球及其周围环境条件的直接结果。&rdquo   实验并未证明地球生命就是由此诞生的,因为从这四种碱基到生命的出现,中间还有很多必不可少的神秘步骤,但这可能是这一过程的一个起点。  论文领导作者、捷克科学院海依罗夫斯基物理化学研究所的斯瓦托普卢克· 思维斯说,科学家们此前已经能够用其他方法制造这些RNA碱基,比如使用化学混合物和高压,但这是首次通过实验来检验&ldquo 撞击产生的能量可触发关键化学反应&rdquo 的理论。  据物理学家组织网12月9日(北京时间)报道,研究人员用一个长约152米的激光器产生的无形激光束,轰击名为甲酰胺的化学物质汤,这种液体据认为存在于我们的原始星球上。该激光的功率非常高,在不到十亿分之一秒时间内的输出相当于几个核电站,产生的能量高达十亿千瓦,甲酰胺样本的温度瞬间升高至4200摄氏度以上,从而发生了一系列化学反应。研究人员在最终产品中,发现了RNA的四种碱基&mdash &mdash A(腺嘌呤)、G(鸟嘌呤)、C(胞嘧啶)和U(尿嘧啶),其中前三种也是DNA的碱基。  专家对这项实验的重要性看法不一。美国佛罗里达州应用分子进化基金会的杰出生物化学家史蒂夫· 本纳说,这项研究意义重大,因为它生成了早期地球上可能存在的原始材料。但英国医学研究委员会分子生物实验室的约翰· 萨瑟兰认为,产生的碱基量太少了,没有什么价值。  总编辑圈点  科学家们一般相信,生命起源可以追溯到天外来客,如宇宙射线和小行星。虽然已有很多办法在实验室里制造出了生命的&ldquo 零件&rdquo ,但我们对于生命的发生史只能猜想,不能实证。除非我们找到一颗适合的行星,制造高能量的撞击,再等上几亿年,看看有没有生命诞生。假如有那本事,地球人早就移民过去了。研究生命的诞生史好像没什么用,但自己的身世来历,人类哪能不关心呢!
  • 科学家首次合成含6种碱基的生命:超越自然法则?
    p /pp  近日,美国生物合成领域专家弗洛伊德· 罗穆斯伯格(Floyd Romesberg)在《自然》杂志发表了一项新成果。他首次用实验室合成的X-Y碱基对和相应的氨基酸,在实验室内创造出了含ATGCXY六种碱基的全新生命体。/pp  这一成果打破了自然界的碱基束缚,创造出了自然界中不存在的全新生命体。然而,这一成果是否意味着人类开启了可以按照自己的需求打造生命体的全新时代?对此,专家有不同看法。/ppstrong  突破第一关/strong/pp  “整个研究很有深度和广度,这个研究团队在这个方面做了20多年的研究,很系统。” 法国巴黎第六大学生物所计算定量生物系独立课题组组长叶世欣告诉《中国科学报》记者。/pp  在基因中加入两个碱基,相当于将遗传密码子得到了扩充,也就是说,过去自然系统中的64个密码子,“理论上,扩充到了216个”。/pp  密码子通过编码形成氨基酸,研究发现自然系统中的64个密码子,形成20种氨基酸,并最终为地球生命的形成提供所需的蛋白质。/pp  64个密码子和20种氨基酸的组合形成了地球上这么多生命,如果216种密码子与其可能形成的氨基酸进行组合,理论上说,相当于“让细菌利用更多氨基酸来制作蛋白质”。/pp  一位不愿意透露姓名的基因研究专家告诉记者,能够拓展遗传密码本身具有重大的理论意义。人工氨基酸改造研究已有多年历史,但由于技术瓶颈和应用推广等问题一直较“小众”。而此成果让科学家感觉“看来突破第一关了”。/ppstrong  基因治疗新手段?/strong/pp  新的合成基因密码的出现,让人对基因治疗的未来有了新的期待。然而,合成的新基因密码是否会成为新的基因工具,从而为基因治疗提供全新手段?对此,科学家认为目前并不乐观。/pp  “完全合成的基因,到用于疾病治疗有很大距离。” 温州医科大学附属眼视光医院研究员谷峰告诉记者,自然界已有的天然工具用于基因治疗,目前都只能在很小的范围转化,如从细菌到人体转化的实现非常困难。/pp  谷峰介绍称,基因剪刀从细菌移植到哺乳细胞,常常存在效率不高,靶向性不够强甚至脱靶的问题。因而,完全合成的基因想发挥天然系统内的基因工具都难以完成的任务,科学家对此表示怀疑。/pp  “外来密码子效率有多高”“如何达到生产的标准”“如何解决靶向性问题”,这是相关研究人员关心的问题所在。/pp  “这一系统能否移植到动物上,如果动物能够实现就很有意思。”谷峰称,从大肠杆菌到动物是一个飞跃。”但这需要对这一系统做进一步的优化,才有可能把外来的基因放到希望的地方去,达到“指哪儿打哪儿”的效果。/ppstrong  效率是最大瓶颈/strong/pp  谷峰所担心的效率问题,也是叶世欣关注的焦点。/pp  “问题是现在的效率会很低,毕竟不是天然的密码子,所以虽然有更多的可能性,但在实施方面会有更多困难。”叶世欣所说的效率,是与自然系统中识别天然碱基的效率相对而言。/pp  以非常容易生产的绿色荧光蛋白(GFP)为例,应用人工合成的这种全新基因密码生产GFP蛋白质,效率是内源密码编辑蛋白质效率的10%,甚至更低。/pp  正是由于此,科学家才对该技术的应用前景保持十分冷静的态度,因为其仍是“十分基础的研究”。但这并不能否认该成果对于其他相关研究所具有的建设性意义。/pp  在叶世欣看来,一方面研究对合成生物学是一个巨大推动,有望让细菌体合成有更多化学性质的蛋白质。另一方面,在基础研究中,这一探索也将帮助科学家了解遗传密码的起源。/pp  “遗传密码,最早是从很简单的碱基、氨基酸开始,扩充过程中就会吸收新的元素,通过倒推这样的研究就会帮助我们探讨遗传密码的起源问题。”她说。/pp  有媒体报道称,未来或许如科幻电影中的“金刚狼”等生命体,通过这样的技术都可能会成为现实中存在的生命。/pp  不过专家表示,当前该研究是在细菌系统内进行,并不存在人们所担忧的会影响人类遗传密码等伦理问题。“将来如果把这种想法放入哺乳细胞中,可能伦理问题就是可以探讨的话题了。”叶世欣说。/pp/p
  • CEM Liberty全自动微波多肽合成系统在PNA合成上的成功应用
    PNA(肽核酸)是具有类多肽骨架的DNA类似物,PNA的主链骨架是由N(2-氨基乙基)-甘氨酸与核酸碱基通过亚甲基羰基连接而成的。PNA可以特异性地与DNA或RNA杂交,形成稳定的复合体。PNA由于其自身的特点可以对DNA复制、基因转录、翻译等进行有针对的调控,同时作为杂交探针大大提高了遗传学检测和医疗诊断的效率和灵敏度。PNA特异性地识别和结合互补核酸序列被引进用于医学、化学和生物学等多个学科研究,包括药物筛选、基因诊断、分子识别和生命起源等,展示了其独特的生化属性,成为了基因奥秘的探索者。 使用CEM公司生产的Liberty全自动微波多肽合成系统(多肽合成仪)可以非常快速高效的合成PNA。 有关PNA的合成,请咨询010-65528800,EMAIL:sales@pynnco.com, 或浏览我们的网站:www.pynnco.com 。 CEM Liberty全自动微波多肽合成系统
  • 使用酸碱浓度计前必须掌握的知识
    酸碱浓度计的分类:应用场合分类、仪器精度、读数指示、元器件类型分类;以及什么是实验室pH计、什么是工业pH计。  ⑴根据应用场合分类:可分为笔式PH计、便携式PH计、实验室PH计和工业PH计等。笔式pH计主要用于代替pH试纸的功能,具有精度低、使用方便的特点。便携式pH计主要用于现场和野外测方式,要求较高的精度和完善的功能。  ⑵据仪器精度分类:可分为0.2级、0.1级、0.02级、0.01级和0.001级,数字越小,精度越高。  ⑶根据读数指示分类:可分为指针式和数字显示式二种。指针式pH计现在已很少使用,但指针式仪表能够显示数据的连续变化过程,因此在滴定分析中还有使用。  ⑷根据元器件类型分类:可分为晶体管式、集成电路式和单片机微电脑式,现在更多的是应用微电脑芯片,大大减少了仪器体积和单机成本;但芯片的开发成本很贵。实验室pH计:实验室pH计是一种台式高精度分析仪表,要求精度高、功能全,包括打印输出、数据处理等等。工业pH计:工业pH计是用于工业流程的连续测量,不仅要有测量显示功能,还要有报警和控制功能,以及安装、清洗、抗干扰等等问题的考虑。
  • 瑞士万通推出新型玻璃酸碱电极Aquatrode plus
    龙年献瑞-瑞士万通推出新型Aquatrode plus 玻璃酸碱电极 瑞士万通 Aquatrode plus 玻璃酸碱电极采用了U头插拔式线缆设计,方便了电极的更换和存储。该款电极特别适合测定低离子浓度和低缓冲能力样品的pH测定和滴定,例如地表水,去离子水此类样品,由于离子浓度低,电导低,普通电极无法给出稳定的数据,而Aquatrode plus 玻璃酸碱电极给出完美的解决方案。该电极主要特点如下:• 为了更好的测定低离子浓度的溶液, Aquatrode plus 酸碱电极采用了特殊的玻璃膜,低阻抗设计。保证了即便是在低电导的困难样品中,都能够有迅速的响应时间(快速测定和终点滴定)。• 固定套管式隔膜设计,不仅降低了电阻,还保证了缓慢稳定的电极电解液渗流速度。使得pH测量或滴定准确而又快速。• 双液接隔膜设计,内参比液使用免维护凝胶电解液,外参比液可根据测量样品的性质灵活的更换不同类型的盐桥电解液。• U型电极头,防止因静电而产生的干扰• 除了以上优势, Aquatrode plus 酸碱电极采用了U头插拔式线缆设计,方便电极的存储和更换,这种设计结构增加了电极的灵活性。 关于瑞士万通: 1950年,瑞士万通发明了第一支复合pH电极。1954年,瑞士万通设计出第一台用于痕量分析的实用自动极谱仪。1956年,瑞士万通开发出第一支活塞型滴定管。1968年,在瑞士万通诞生世界首台数字化滴定仪,第一台数字化电子滴定管。……2007年,瑞士万通研发出首台智能型离子色谱仪。2010年,瑞士万通研制出世界首台紫外离子色谱。 Metrohm - 瑞士万通,是当今世界唯一全方位涵盖各类不同离子分析技术的国际化分析仪器公司。
  • 国产又一家核酸质谱试剂供应商,苏州维基dNTP修饰技术取得突破进展
    国产又一家核酸质谱供应商,  目前,常见的分子诊断技术主要有荧光定量 PCR 技术(qPCR)、高通量测序技术(NGS)等。随着 MALDI-TOF-MS 技术的发展,核酸质谱技术也应运而生。  核酸质谱技术可实现单个样本同时进行几十甚至几百种靶标检测,每日处理的样本数可达千例以上,且结果分析简单。核酸质谱技术的出现能够弥补 qPCR 通量低和 NGS 耗时长、报告解读复杂的不足,已经成为研究单核苷酸多态性 ( SNP ) 、基因插入 / 删除、基因选择性剪接、基因拷贝数变化、基因表达、基因组 DNA 甲基化、tRNA 和 rRNA 的转录后修饰等课题的有效检测手段。  在核酸质谱技术领域,笔者近日关注到一家创办于 2022 年的创新公司苏州维基基因科技有限公司(以下简称 " 苏州维基 ")。苏州维基由多位业内资深医学博士联合创办,围绕其多项独有的基因检测技术,为临床及实验室等多场景提供核酸质谱整体解决方案,包括相关实验室建设、仪器、项目选择、试剂开发、临床检测全流程服务。苏州维基作为新一代基因检测机构,致力于通过开发更经济、科学、灵敏度高的检测方法提供高稳定性、高性价比的检测服务。  复杂、多靶标诊断场景,核酸质谱具有极致性价比  20 世纪 80 年代出现的 MALDI-TOF-MS 技术打破了以往质谱仅可进行小分子物质分析的传统,使得核酸、蛋白质等生物大分子也可应用质谱进行研究,极大推进了基因组学、蛋白质组学的发展,并给生物及医学领域带来了革命性的突破。  核酸质谱是在 MALDI-TOF-MS 技术基础上发展出来的一种多重 PCR 分析检测系统,通过 " 多重 PCR+ 高通量芯片 + 飞行时间质谱 " 的技术路径,能够在保持高灵敏度、高特异性的情况下,同时具备检测多基因多位点、通量大、检测速度快及极致的性价比优势。  在基因检测中,常见的分子诊断技术包括 qPCR 和 NGS 技术。在 qPCR 检测中,受到荧光通道数量的限制,要实现更大通量的检测只能依靠反复检测 而利用 NGS 技术进行检测分析成本较高,且报告周期达 7 天。" 对于临床需求而言,检测位点在 20~30 个或者 100 以内的时候,核酸质谱是更契合的检测技术。" 苏州维基联合创始人林有升说。  核酸质谱能够直接依据分子量的差异进行检测。当核酸发生变异时,无论是碱基的替换或修饰,都会改变 DNA 的分子质量,因此,只要待测靶标扩增后的分子量不同,就能够进行精准识别。  核酸质谱适合 10~100 靶标位点的基因检测,与 Sanger 测序符合度超过 99%,且重复性好。据介绍,核酸质谱仪器及配套试剂成本较低,同时每孔可分析 50 个位点,一次可分析 96 个样本,单次检测时间为 8 小时,报告周期约为 3 天。  2018 年,中国核酸质谱医用专家共识协作组在中华医学杂志刊登《中国核酸质谱应用专家共识》,系统介绍了 MALDI-TOF-MS 技术的原理及应用等方面的内容,以提高核酸质谱在国内临床及实验室中的认知程度,推动其临床转化应用。目前,核酸质谱在临床中更适合用于复杂的、多靶标疾病的诊断,主要包括出生遗传缺陷、肿瘤、药物基因组、病原体多联检和耐药性检测等。  突破国产核酸质谱试剂多个瓶颈问题,修饰后 dNTP 分子量差别大于 15  受限于技术壁垒和政策变动等因素,长久以来,国内核酸质谱检测试剂依赖于进口,除了成本高外,更受到货期等其他方面的影响,进一步限制了核酸质谱技术的临床应用推进。" 核酸质谱的临床应用要关注多个方面,包括技术平台的灵敏度、特异性、通量、报告时长以及成本等。" 林有升说。  为了实现核酸质谱试剂的国产化,苏州维基对核酸质谱检测流程中的多个环节进行了技术优化。PCR 技术是核酸质谱的关键技术环节之一,苏州维基通过 LNA-Blocker 技术,阻遏阴性模板以提高检出率,同时依靠自主开发出多重 PCR 设计软件,设计出的 UEP 引物特异性良好,能够将扩增数量达到 100 对以上。  核酸质谱主要通过检测多重 PCR 反应的产物,即单碱基延伸的产物质量大小来进一步确定检测结果。目前,核酸质谱技术主要依赖单碱基延伸反应来进行操作,单碱基延伸的效率关系到核酸质谱的检测效率,而区分度则是能否成功检测的重要标准。  dNTP 修饰技术是单碱基延伸过程中的重要技术,目前国内市面上比较成熟的核酸质谱制剂中的 dNTP 最小分子量差异为 9.21 Da。在检测中,由于分子量差异过小,出现检测的 SNP 为 AT 突变时,不同峰区的区分度很低,或是由于峰高差异较大出现 " 鼓包峰 " 等情况,从而干扰结果判读,这也成为制约核酸质谱临床应用的技术瓶颈之一。  基于其多年的技术开发经验,苏州维基已经攻克核酸质谱 dNTP 修饰技术。据介绍,修饰后的 dNTP 具有良好的单碱基阻遏效果,同时表现出极高的链接效率,而在区分度上,使用该技术进行修饰的 dNTP 分子量差别大于 15,区分度较高,失败风险降低。  面对不同的检测场景,苏州维基也从技术层面进行了推进和解决,致力于扩大核酸质谱技术的临床应用。例如,通过搭建甲基化核酸质谱检测防污染方案,可降低 98% 的 PCR 产物污染,在不影响检测灵敏度的情况下,解决了在 DNA 甲基化检测中因 PCR 产物污染造成检测结果不准确的产业化难题。  另外,依靠核心团队多年深耕检测行业,苏州维基已经积累了数万例肿瘤样本 ctDNA 基因突变谱、DNA 甲基化谱、SNC、CNV、MSI 等数据,数万例肿瘤样本全基因组检测数据及数万例肿瘤样本 ctDNA 含量、片段大小、断裂点、GC RICH 等数据,为其进一步优化技术和产品开发打下坚实基础。  打造三种解决方案,通用试剂可适配常见核酸质谱仪  凭借对核酸质谱检测流程中的多个环节进行了技术优化,苏州维基依据临床使用场景计划以 LDT 模式打造三种解决方案:病原微生物基因检测、药物基因组检测(遗传基因检测)及肿瘤基因检测。  病原微生物基因检测将通过打造 39 种病原微生物联检试剂,来覆盖 91% 以上的呼吸道感染疾病 药物基因组检测将涵盖心脑血管疾病、自身免疫系统疾病、精神类疾病、感染性疾病用药药物基因检测及单基因遗传病致病基因检测,提高各类疾病用药安全性及疗效 针对肿瘤基因检测,目前苏州维基将聚焦于消化道肿瘤筛查血浆游离 DNA 甲基化检测,实现血浆游离 DNA 甲基化启动子区 CpG 岛甲基化谱绘制。  目前,苏州维基已经开发出了国产化的全血 / 拭子核酸纯化试剂、血浆游离 DNA 纯化试剂、多重化 PCR 扩增试剂、单碱基引物延伸试剂、PCR 产物阳离子纯化试剂以及多重 PCR 设计程序、UEP 引物设计程序两款软件。可以说,苏州维基已经走通了核酸质谱的全技术链条。  据介绍,苏州维基开发的核酸质谱通用试剂 "MASS GEL ™ " 能够适配市面上常见的核酸质谱仪。" 在转化率、扩增效率、得率、稳定性及操作步骤上,MASS GEL ™表现都十分优异。其转化率超过 98%,实验步骤简化至五个。" 林有升说。  " 随着核酸质谱国产化的快速发展,仪器成本和试剂成本不断降低,已接近 QPCR 仪器和试剂成本,表现出明显的成本优势。无论是从技术优势还是成本优势来看,核酸质谱都有潜力、有机会能够在临床应用中大显身手。" 林有升强调。关于苏州维基  苏州维基基因科技是一家致力于核酸质谱国产化临床应用试剂开发与应用的技术主导型公司,由多位生物学、医学博士创办,公司申请专利5项,产品覆盖药物基因组学检测、病原微生物核酸联检,核心技术有“LNA-Multiplex-PCR”,”核酸质谱防污染技术”,“核酸质谱高效延伸技术”,“dNTP修饰技术”。苏州维基通过持续的技术开发和优化,已有药物基因组和病原微生物多款产品经过性能验证,有数款技术打破国外技术垄断,为我国临床基因检测技术进步贡献自己的力量。
  • 核酸质谱快速检测新型冠状病毒变异株
    新型冠状病毒肺炎(Coronavirusdisease2019,COVID-2019)是由严重急性呼吸系统综合征冠状病毒(SARS-CoV-2)所引起的高传染性病毒疾病,对世界人口造成了灾难性影响,导致全球380多万人死亡,成为继1918年流感大流行以来影响最大的全球卫生危机。 新冠病毒不断变异的RNA病毒 作为单链结构的RNA病毒,新型冠状病毒的一大特点就是极其容易变异。随着感染人数的增加和疫情的持续,新型冠状病毒不断进化和变异,陆续产生多种新冠病毒变异株。世界卫生组织(WHO)根据新冠病毒变异株的传播力、致病力等将其分为VOCs(Variant of concern)和VOIs(Variant of interest)。新冠病毒VOCs的分类 新冠病毒VOIs的分类 目前市场对新冠病毒筛查主要采用荧光 PCR 方法,该方法检测灵敏度高,但成本也相对较高,并且单机通量小,容易被污染,制约了大规模病毒检测速度,对当前不同变异毒株区分荧光PCR方法存在一定难度。随着病毒感染多元化和疫情防控常态化的推进,市场急需一种更快速、准确、高通量的检测方法,用于满足大样本量的检测、基层的日常防控筛查,以及不同变异株的区分。 基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)主要用于分析包括蛋白质及核酸在内的生物大分子,该技术应用于核酸检测具有高通量、高灵敏、高准确率的特点。其主要工作原理是结合延伸分析法和碱基特异裂解分析法,将扩增后的核酸产物通过离子源使样品离子化,产生不同质荷比的离子,再经过质量分析器测定该样品中不同种类离子的分子量,按照从小到大的顺序依次排列从而得到一幅质量图谱,并根据检测项目不同给出相应的检测报告。该技术在遗传病筛查、肿瘤变异检测、甲基化检测、用药指导、病原体检测及功能医学健康管理等多个领域的应用日益深入,已经成为精准医学不可或缺的分子诊断技术。MALDI-TOF MS检测新型冠状病毒方法为通过特定引物扩增目标基因片段,再通过靶向位点探针特异性单碱基延伸,然后通过质谱技术检测延伸位点的碱基,判断病毒种类和变异类型。该方法灵敏度高、操作简单、成本低廉、人员需求低、通量高,可实现6小时384样本出报告,以后每1小时出384份样品报告。新冠病毒流行初期,Autof ms1000系统建立了完成病毒检测检测体系,对病毒毒株进行了精准检测(图3)。随着研究深入,Autof ms1000检测核酸的体系也日渐成熟,针对当前多变异毒株情况,研究人员通过合理设计扩增引物和探针,可实现单个样品,单芯片位点检测,一次区分当前所有可认知的新冠病毒变异株。随着疫情斗争的持续进行,病毒变异也不断发生,后续可能出现更多更复杂的病毒变异株,MALDI-TOF MS技术基于其检测原理,在大样本多病毒变异株检测方面的优势将日渐突出。随着人们对该技术的认知度的日渐加深,未来该技术在核酸检测方向的应用将出现更多的思路和方法,MALDI-TOF MS在临床应用领域中将会发挥更大的作用。
  • EZDO@(pH Meters ),酸碱分析,精准科技!——火爆促销 25%OFF
    1、ezdo@(ph meters )ph计,酸碱分析,精准科技!火爆促销 25%off!2、活动时间截止至2017年3月31日3、咨询及订购详情,请联系400-620-6333促销专线8。4、促销期间,所有客户实行相同价格(即折扣客户不享受特价商品折上折和积分)。 促销产品列表 货号名称规格包装促销价w6267-01-1eaw6267-01 防水笔型ph计测量类型:酸碱值 ph测量范围:0-14.0 ph测量精度:± 0.1+1digit 解析度:0.1ph 温度补偿:无1套1kit,成套234.00175.50w6267-02-1eaw6267-02 防水笔型ph计测量类型:酸碱值 ph测量范围:0-14.00 ph测量精度:± 0.01+1digit 解析度:0.01ph 温度补偿:0-70℃1套1kit,成套306.00229.50w6344-01-1eaw6344-01 防水笔型tds计测量类型:总固体容量(tds) 测量范围:0-19990ppm 测量精度:± 2%fs 解析度:10ppm 温度补偿:0-50℃1套1kit,成套247.50185.62w6344-02-1eaw6344-02 防水笔型tds计测量类型:总固体容量(tds) 测量范围:0-1999ppm 测量精度:± 2%fs 解析度:1ppm 温度补偿:0-50℃1套1kit,成套247.50185.62w6346-01-1eaw6346-01 防水笔型orp计测量类型:氧化还原电位(orp) 测量范围:± 1999mv 测量精度:± 2%fs 解析度:1mv 温度补偿:无1套1kit,成套441.00330.75w6273-01-1eaw6273-01 防水型电导率笔测量类型:电导率 测量范围:0-19990&mu s/cm 精确度:± 2%fs 解析度:10&mu s/cm 温度补偿:0-50℃1套1kit,成套247.50185.62w6273-02-1eaw6273-02 防水型电导率笔测量类型:电导率 测量范围:0-1999&mu s/cm 精确度:± 2%fs 解析度:1&mu s/cm 温度补偿:0-50℃1套1kit,成套247.50185.62w6273-03-1eaw6273-03 防水型电导率笔测量类型:电导率 测量范围:0-19.99ms/cm 精确度:± 2%fs 解析度:0.01ms/cm 温度补偿:0-50℃1套1kit,成套247.50185.62p7449-01-1eap7449-01 微电脑型笔式电导率/tds/盐度/温度测试计测量范围:电导率(0-2000&mu s,2.00-20.00ms)、总固体溶解量(0-1300ppm,1.30-13.00ppt) 盐度(0-1000ppm,1.00-12.00ppt) 精确度:电导率/总固体溶解量/盐度(± 2%fs)、温度(± 0.2℃+1digit) 解析度:电导率(1&mu s/0.01ms)、总固体溶解量(1ppm/0.01ppt)、盐度(1ppm/0.01ppt)、温度(0.1℃) 温度补偿:0-50℃自动 尺寸:195× 40× 36mm1套1kit,成套567.00425.25w7448-01-1eaw7448-01 微电脑型笔式ph/mv/温度测试计测量范围:酸硷值(-2~16.00)、氧化还原电位(-1000~1000mv)、温度(0~100 ℃) 精确度:酸硷值(± 0.01+1 digit)、 氧化还原电位(± 2 +1 digit)、温度(± 0.2 ℃+1 digit) 解析度:酸硷值(0.01ph)、氧化还原电位(1mv)、温度(0.1℃) 温度补偿:0 ~ 90℃ 尺寸:195× 40 × 36 mm 重量:135g1套1kit,成套522.00391.50h6341-01-1eah6341-01 掌上型ph/温度计主要功能:测量ph、温度 电极:复合式酸碱度塑胶电极,温度电极 酸碱值测量范围:0-14.00ph 温度测量范围:0-90℃ 酸碱值精确度:± 0.01+1digit 温度精确度:± 0.2℃+1digit1套1kit,成套666.00499.50h6341-02-1eah6341-02 掌上型ph/温度计主要功能:测量ph、温度 电极:三合一温度/酸碱度塑胶电极 酸碱值测量范围:0-14.00ph 温度测量范围:0-90℃ 酸碱值精确度:± 0.01+1digit 温度精确度:± 0.2℃+1digit1套1kit,成套666.00499.50h6341-04-1eah6341-04 掌上型orp计主要功能:测量氧化还原电位 电极:泛用型塑料orp电极 测量范围:± 1999mv 精确度:± 2%fs 解析度:0.1mv1套1kit,成套828.00621.00h6347-01-1eah6347-01 掌上型电导率/tds/盐度/温度仪电导率测量范围:0-199.9&mu s,200-1999&mu s,2.00-19.99ms,20.0-100.0ms 总固体溶解量测量范围:0.0-31.9ppm,132-1319ppm,1.32-13.19ppt,13.2-66.0ppt 盐度测量范围:0.0-99.9ppm,100-999ppm,1.00-9.99ppt,10.0-50.0ppt 温度测量范围:0-100℃1套1kit,成套927.00695.25w6277-01-1eaw6277-01 防水型笔式ph/电导度/tds/盐度/温度测试仪ph测量范围及精度:-2~16.00,± 0.01+1digit 电导度测量范围及精度:0.0-199.9&mu s,± 2% fs tds测量范围及精度:0-1300ppm,± 2% fs 盐度测量范围及精度:0.0-99.9ppm,± 2% fs 温度测量范围及精度:0~90℃,± 0.2℃+1digit1套1kit,成套1017.00762.75w6277-02-1eaw6277-02 防水型笔式ph/电导度/tds/盐度/温度测试仪ph测量范围及精度:-2~16.00,± 0.01+1digit 电导度测量范围及精度:0.0-199.9&mu s,± 2% fs tds测量范围及精度:0-1300ppm,± 2% fs 盐度测量范围及精度:0.0-99.9ppm,± 2% fs 温度测量范围及精度:0~90℃,± 0.2℃+1digit1套1kit,成套1215.00911.25p6345-01-1eap6345-01 笔式溶氧测试计溶氧量测量范围:0-20.00mg/l 氧气浓度测量范围:0-200.0% 温度测量范围:0-90℃ 溶氧量精确度:± 0.2+1digit 氧气浓度精确度:± 2%fs 温度精确度:± 0.2℃+1digit1套1kit,成套1080.00810.00f7362-01-1eaf7362-01 携带型余氯/总氯测试计测量范围:0 ~ 5.00 ppm 精确度:± 0.03+1 digit(<2.00 ppm时),± 3% fs +1 digit (>2.00 ppm时) 解析度:0.01 ppm 样品所需量:10ml 尺寸:70× 135× 65 mm 重量:168g(含电池)1套1kit,成套2097.001572.75t7366-01-1eat7366-01 携带型浊度计测量范围:0 ~ 19.99 ntu、20.0 ~ 199.9 ntu、200 ~ 1000 ntu 分辨率:0.01/0.1/1 精确度:± 3% + 1 digit (500 ntu时)、± 5% + 1 digit (500 ntu时) 尺寸:70× 135× 65mm 重量:168g(含电池)1套1kit,成套3150.002362.50b6275-02-1eab6275-02 台式酸度计(ph/mv/t)酸碱值:-2-16.00 氧化还原电位:± 2000mv 温度:0-100℃ 是否带搅拌功能:是1套1kit,成套2880.002160.00b6339-02-1eab6339-02 台式ph/溶氧量计酸碱值:-2-16.00 氧化还原电位:± 2000mv 溶氧量:0-20.00mg/l 氧气浓度:0-200.0% 温度:0-110℃ 是否带搅拌功能:是1套1kit,成套4320.003240.00b6337-02-1eab6337-02 台式ph/电导度计酸碱值:-2-16.00 氧化还原电位:± 2000mv 电导度:0.00-199.9&mu s,200-1999&mu s,2.00-19.99ms,20.0-100.0ms 总固体溶解量:0.0-131.9ppm 132-1319ppm 1.32-13.19ppt 13.2-66.0ppt 盐度:0.0-99.9ppm,100-999ppm,1.00-9.99ppt,10.0-50.0ppt 温度:0-90℃ 是否带搅拌功能:是1套1kit,成套3870.002902.50 ph计系列产品附件 货号名称规格包装价格p7371-01-1eap7371-01 泛用型塑料ph复合电极本体材质:塑料(pc) 参考系统:单透析膜,ag/agcl 透析孔:单陶瓷透析孔 填充液:胶状免填充 长度/直径:160mm/12mm 接头:bnc/y型 检测类型:常规使用,特别适合野外和现场,不适合高温高碱和对pc腐蚀的溶液1ea81.00p7371-02-1eap7371-02 塑壳平面ph复合电极本体材质:塑料(pc) 参考系统:单透析膜,ag/agcl 透析孔:环状铁氟龙 填充液:胶状免填充 长度/直径:160mm/12mm 接头:bnc/y 检测类型:平面敏感玻璃膜,适合固体或半固体湿润表面的ph测量1ea810.00p7371-03-1eap7371-03 泛用型玻璃ph复合电极本体材质:玻璃 参考系统:单透析膜,ag/agcl 透析孔:单陶瓷透析孔 填充液:kcl(4mol)+agcl 长度/直径:160mm/12mm 接头:bnc 检测类型:用于精密的ph测量,实验室常规使用:如地表水、自来水、海水、废水、及酸、碱、盐溶液,不适合粘稠性溶液和高碱性溶液1ea216.00p7371-04-1eap7371-04 耐用型玻璃ph复合电极本体材质:玻璃 参考系统:双透析膜,ag/agcl 透析孔:环状玻璃磨砂 填充液:胶状免填充 长度/直径:160mm/13mm 接头:bnc 检测类型:用于精密的ph测量,实验室常规使用 可以在浑浊液体或胶体溶液中使用,如牛奶、果酱、水性涂料、化妆品、土壤溶液、污水和淤泥等1ea540.00p7371-05-1eap7371-05 三合一玻璃ph复合电极本体材质:玻璃 参考系统:双透析膜,ag/agcl 透析孔:单陶瓷透析孔 填充液:kcl(4mol)+agcl 长度/直径:160mm/12mm 接头:bnc,2.5&phi /3.5&phi /rca 检测类型:用于精密的ph测量,实验室常规使用:如地表水、自来水、海水、废水、及酸、碱、盐溶液,不适合粘稠性溶液和高碱性溶液1ea720.00h6347-03-1eah6347-03 塑壳电导电极检测类型:常规使用,特别适合野外和现场,不适合高温高碱和对pc腐蚀的溶液,适用于h6347-011ea675.00b6337-03-1eab6337-03 玻璃电导电极检测类型:实验室常规使用,测量溶液的电导率或作电导滴定使用,适用于b6337-01/021ea720.00h6347-02-1eah6347-02 玻璃电导电极检测类型:实验室常规使用,测量溶液的电导率或作电导滴定使用,适用于h6347-011ea720.00b6339-03-1eab6339-03 玻璃溶氧电极类型:实验室常规使用,测量溶液的溶解氧使用1ea1350.00o7451-01-1eao7451-01 塑壳orp复合电极本体材质:塑料(pc) 参考系统:ag/agcl 测量范围:± 1999mv 透析孔:单陶瓷透析孔 填充液:胶状免填充 长度/直径:165mm/12mm 接头:bnc/y型 检测类型:实验室和现场常规使用,测量溶液的氧化还原电位一般用于氧化体系1ea720.00o7451-02-1eao7451-02 耐用型玻璃orp复合电极本体材质:塑玻璃 参考系统:双透析膜,ag/agcl 测量范围:± 1999mv 透析孔:环状玻璃磨砂 填充液:胶状免填充 长度/直径:160mm/13mm 接头:bnc/y型 检测类型:实验室常规使用,尤其适合对pc塑料有腐蚀的溶液,以及连续测试温度较高的场合 可以在浑浊液体或胶体溶液中使用,如牛奶、果酱、水1ea900.00b6339-06-1eab6339-06 温度电极类型:热敏电阻30k1ea261.00f7362-02-1eaf7362-02 余氯试片类型:每罐50片1ea198.00f7362-03-1eaf7362-03 总氯试片类型:每罐50片1ea198.00b6339-04-1eab6339-04 溶氧电极隔膜帽类型:1盒2个1ea135.00b6339-05-1eab6339-05 溶氧电解液类型:50ml1ea180.00
  • 利用荧光DNA探测分子 单个碱基突变也能被发现
    DNA序列中最轻微的变异也会影响深远,无论对研究还是医学应用,可靠识别这些序列都非常重要。据物理学家组织网近日报道,美国华盛顿大学和莱斯大学研究人员合作,开发出一种荧光DNA探测分子,能检查出一段目标DNA链中单个碱基的变化。而这些微小突变可能是造成某些疾病的根源,或耐抗生素细菌的原因。这一成果有助于诊断和治疗像癌症、肺结核这样的疾病。相关论文发表于7月28日的《自然· 化学》杂志网站上。  不同的DNA序列为不同生物设定了独特的基因标记。现代基因组学研究表明,仅一个碱基对的变化都足以引发严重的生物后果,可能决定了一种疾病能否被治愈,也解释了疾病的突发或某些疾病对常规抗生素治疗无效的原因。论文领导作者、华盛顿大学电力工程和计算机科学与工程副教授乔治· 塞利格说,比如造成肺结核的细菌有很强的耐药性,这种能力通常来自其基因序列中的少量突变。现在,人们已能预先查出这种突变。  &ldquo 我们真正改进了以往的方法。&rdquo 塞利格说,&ldquo 新方法不需要任何复杂的反应或添加酶,就只用DNA。这意味着无论温度及其他环境变量怎样变化,该方法都是稳定的,所以很适合用于低资源设置中的诊断。&rdquo   这种探测分子经过专门设计,采用了新的编程机制,能与一个可疑的DNA序列结合,对其双螺旋链生成互补的DNA序列。把含有两种序列的分子在盐水试管中混合,如果两条链的碱基对都是完好的,它们自然地匹配在了一起,探测分子会发出荧光 如果不发光,则意味着上面有碱基对发生了突变。与以往技术不同的是,探测分子会检查目标DNA双螺旋的两条链是否发生了突变,而不是一条,这使检验更加全面具体。  此外,探测分子由许多寡核苷酸构成,克服了合成上的局限,可以探测更长的DNA序列中更详细的变异信息,达到200个碱基对,而现有探测突变的方法只能检查20个。  目前,研究人员与华盛顿大学商业化中心一起对该技术提出了专利申请,他们希望把这种技术和诊断试纸结合用于疾病测试。
  • 核酸免扩增高敏检测新技术:临床诊断应用潜力巨大!
    近日,国际分析化学领域权威期刊Analytical Chemistry在线发表文章“Nucleic Acid Hybridization Enhanced Luminescence for Rapid and Sensitive RNA and DNA Based Diagnostics”。该论文提出了一种基于核酸杂交增强荧光用于高灵敏核酸检测的新策略。该成果由SIAT深圳市微纳生物传感重点实验室(筹)喻学锋研究员团队完成,材料界面中心金宗文、罗擎颖副研究员为该文章通讯作者。论文上线截图长寿命发射型核酸探针因其结构可编程、信背比高和灵敏度高等优势而广泛应用于生物化学分析。基于长寿命荧光核酸探针可实现荧光共振能量转移(FRET)的均相检测,但该技术常受到有效能量转移距离范围窄的局限。本研究提出了一种核酸杂交响应发光探针的新策略,可通过核酸杂交将DNA修饰的Lumi4-Tb复合物的光致发光(PL)增加20倍以上,适用于生理条件对各种核酸、蛋白质及其他生物小分子的高灵敏检测。本研究进一步通过PL寿命分析揭示了发光增强的可能机制:由于单链核酸链的柔性,碱基和磷酸基团可以与Tb(III)配位,降低Tb复合物的稳定性,导致初始PL较弱。而杂交后,双螺旋刚性结构抑制了Tb(III)与碱基或磷酸根之间的配位,使得发光增强。基于本机理,可针对不同靶标灵活设计DNA序列,在无需额外核酸扩增的前提下实现对DNA或RNA低至pM的检测,并且完全适用于真实样本分析,在临床诊断中的核酸检测方面显示出巨大的潜力。基于核酸增强发光的核酸高灵敏检测示意图该研究得到国家自然科学基金、广东省面上项目、中国博士后基金等的支持。全文获取链接:https://doi.org/10.1021/acs.analchem.2c02673
  • 辅助客户|得利特为宁夏客户开展关于酸碱值测定仪等仪器设备技术演讲
    实验室分析仪器是通过实物采样来进行测试,从而决定事物的本质及成分。在线分析是采用自动采样系统,将试样自动输入分析仪器中进行连续或间歇连续分析,通过现场检测,直接显示出本质及成分。与经典的化学分析或实验室一般的仪器分析相比,在线分析具有分析速度快、效率高、操作简单、自动化程度高、节省人力和试剂等特点,可实现连续监测和数据处理自动化,消除了人为产生的误差。 当然专业的仪器的使用还需要具体专业人员的讲解,才可以正式投入实验室中使用。 最近,得利特技术人员到宁夏客户公司进行绝缘油检测设备技术演讲。得利特指派技术工程师为客户进行详细的技术演讲 。 客户想要了解关于检测设备绝缘油管理与油液监测的具体细节,技术工程师对于该问题进行详细的阐述。会议中,还特别提到了各种绝缘油检测仪器的作用及维护方式,如A1041酸碱值测定仪、A1200界面张力仪、A1210析气性测定仪的具体性能。同样的,客户在会议中也提出了一些,他们在实际使用时会产生的疑问。得利特技术工程师耐心的作答。客户非常接受这些技术性知识的讲解,并且很认可我们公司仪器的性能。 演讲结束后,双方还去了客户的仪器室,进行了进一步的演练。具体关于产品的参数如下 :A1041酸碱值测定仪符合标准:GB/T264、GB7599-87、GB/T7304-2000、GB/T 18609-2001、D664—01、ASTM D664-2011。A1041采用电位滴定法原理。通过对滴定过程中的电极电位及滴定体积进行记录,找出等当点及对应的标准滴定溶液的体积,从而求出样品中酸碱值。A1041可准确检测变压器油、汽轮机油、抗燃油、柴油、汽油等石油产品的酸值;广泛应用在化工、电力、石油等行业,是当前石油产品酸值测定仪的换代产品。仪器特点:1、Windows操作平台,人机直接对话,操作便捷,具有工作站功能。2、滴定曲线实时显示,滴定曲线及结果与数据存贮和打印。3、采用**滴定单元,仪器测量精度高,稳定性好。4、自动清洗、自动定值加液。5、自动判别终点,自动滤除假终点,同时可以人工选择判断终点。技术参数:测量范围:大于0.01mgKOH/g精度:相对误差≤5%电位测量范围:0~±1999.5mv基本误差:0.1%FS ±0.5mv滴定管体积:10ml滴定管最小体积:0.01ml滴定管精度:±0.1%FS仪器成套性:主机、滴定单元、计算机(含操作软件)、打印机等。 得利特公司整合石化科学研究院,中国计量科学研究院,北京铁道科学研究院,计量总站等油品方面、仪器方面、设备方面的专家为技术班底,集思广益,推出系列精品润滑油分析检测仪器、燃料油分析检测仪器、润滑脂分析检测仪器等产品,得到用户的广泛赞誉。公司以雄厚的技术实力和客户就是上帝的宗旨为用户提供专业贴心的咨询培训服务,包括设备润滑咨询服务,设备润滑知识培训,润滑系统方案设计、实验室建设方案,第三方油品检测。确保客户解决设备润滑的相关问题!
  • Nature|天津工生所:新一代碱基编辑技术开发获进展
    碱基编辑(base editing,BE)作为前沿的基因组编辑技术,能够在基因组水平上实现精确、高效的单碱基编辑。该技术广泛应用于基础研究、基因治疗和细胞工厂构建等领域。常用的DNA碱基编辑器主要是通过将可编程的DNA结合蛋白(如Cas9)与碱基脱氨酶融合实现的,包括胞嘧啶碱基编辑器(CBE)、腺嘌呤碱基编辑器(ABE)以及糖基化酶碱基编辑器(GBE)等,可以实现C-to-T、A-to-G以及C-to-G等种类的碱基编辑。然而,这些碱基编辑器是针对C和A碱基的直接编辑,且所包含的脱氨酶可能导致非Cas9依赖的DNA或RNA脱靶。 中国科学院天津工业生物技术研究所研究员毕昌昊带领的合成生物技术研究团队,联合研究员张学礼带领的微生物代谢工程研究团队,开发了不依赖脱氨酶(deaminase-free,DAF)的碱基编辑器DAF-CBE和DAF-TBE,分别在大肠杆菌中实现C-to-A、T-to-A的碱基颠换,在哺乳动物细胞中实现C-to-G、T-to-G的碱基颠换编辑。 该研究通过定向进化改造了人源尿嘧啶糖基化酶(UNG)的两个突变体UNG(N204D)和UNG (Y147A),获得了两种高活性的DNA糖基化酶,分别可以作用于胞嘧啶碱基的CDG4和胸腺嘧啶碱基的TDG3。进而,研究将这两种DNA糖基化酶与nCas9(Cas9、D10A)融合,构建了CDG4-nCas9和TDG3-nCas9两种碱基编辑器,用于在大肠杆菌中进行C-to-A和T-to-A的编辑。实验结果显示,CDG4-nCas9和TDG3-nCas9在大肠杆菌中的编辑效率最高分别达到58.7%和54.3%。进一步,研究针对Homo sapiens密码子优化版本的CDG4-nCas9和TDG3-nCas9,在HEK293T细胞中实现了C-to-G和T-to-G的颠换编辑,编辑效率分别达到38.8%和48.7%。这两种编辑器的脱靶效果低于常用的胞嘧啶碱基编辑器(BE4max)和糖基化酶碱基编辑器(CGBEs)。因此,研究将这两个编辑器命名为DAF-CBE和DAF-TBE。此外,通过进一步的工程改造,该团队优化了CDG和TDG的空间位置,得到了DAF-CBE2和DAF-TBE2的新版本。它们的编辑窗口从原来的间隔序列(protospacer sequence)5'端移动到中间区域,且C-to-G和T-to-G的编辑效率分别提高了3.5倍和1.2倍。DAF-CBE和DAF-TBE实现了人诱导多功能干细胞(hiPSC)高效编辑。 综上所述,经过定向进化改造,该团队开发的DAF-CBEs和DAF-TBEs碱基编辑器在大肠杆菌和哺乳动物细胞中实现了高效的碱基颠换编辑,无需使用脱氨酶。与现有的引导编辑器(prime editing)或糖基化酶碱基编辑器(GBEs)相比,DAF-BEs具有相当的编辑效率、更小的尺寸和更低的脱靶率,这扩展了碱基编辑器的编辑类型,为工业菌株铸造和生物医药等领域的相关研究提供了新的技术工具。 近日,相关研究成果发表在《自然-生物技术》(Nature Biotechnology)上。研究工作得到国家重点研发计划、国家自然科学基金、天津市合成生物技术创新能力提升行动专项、中国科学院青年创新促进会和天津市自然科学基金的支持。论文链接DAF-BEs碱基编辑器的设计及进化
  • “千人”谭蔚泓获美化学会Florida成就奖
    化学生物传感与计量学国家重点实验室主任、国家千人计划入选者、湖南大学生物学院院长谭蔚泓教授日前获得美国化学会Florida成就奖。该奖自1952年成立以来,每年评出一位在化学教学、研究、或出版等领域有贡献的学者,以表彰其在化学前沿性研究领域所做出的杰出贡献。  德国《应用化学》杂志(Angewandte Chemie International Edition, 2012, DOI: 10.1002/anie.201206654)近日发表的官方文章报道了该消息,谭蔚泓教授及其研究小组在生物分析化学、化学生物学、分子工程、纳米技术和生物医学工程领域开展了一系列前沿交叉研究,取得了国际公认的研究成果:长期致力于“核酸适配体及生物医学应用”的研究,在基础理论研究和技术开发等方面取得了巨大的成就。提出并发展了用于纳米生物学研究的“FloDot”荧光纳米颗粒 发展了合成光磁多功能纳米粒子的新方法 发展了可从食品中检测出单个致病菌的高敏分析方法并研制了病菌检测样机,推动了纳米材料在分析化学和生物医学中的应用。提出了用核酸碱基基于分子工程原理合成了一系列新型核酸分子探针,发展了应用于生物传感器的发夹型核酸分子新探针 开发了比色成像方法、提出了锁糖环核酸修饰的新思路、发明了荧光超猝灭剂、通过将荧光放大高分子引入进行细胞成像的分子探针,实现了单个细胞内多个基因的同时检测。提出并合成了具有发夹结构的DNA单分子马达,首次实现了单个分子内化学能与机械能的转化 通过嵌入光敏性偶氮苯组分实现了DNA单分子马达的可逆光控转换操作,将光能高效地转变成机械力,为光能的利用提供了新思路 5)其研究小组在纳米光子学领域取得开创性成果,推动了纳米光子学的生物医学的应用和发展。
  • 纳米孔单分子检测技术新进展 有望大幅度降低DNA测序成本
    p style="LINE-HEIGHT: 1.75em" DNA测序能够从血液或唾液中分析测定基因全序列,预测罹患多种疾病的可能性,同时可以帮助患者精准治疗。但目前的DNA测序技术,昂贵的价格让普通大众望其项背。寻找低成本、快速的DNA测序技术,成为科学家们研究的热点,生物纳米孔单分子分析技术因其低成本、快速和无需荧光标记等优点被视为最具前景的DNA测序技术之一。/pp style="LINE-HEIGHT: 1.75em"  近期,华东理工大学化学与分子工程学院的龙亿涛科研团队在生物纳米孔超灵敏单核苷酸分辨领域取得独创性突破,该研究成果以华东理工大学作为独立研究单位,于4月25日在《Nature Nanotechnology》(自然-纳米技术)发表了题为“Discrimination of oligonucleotides of different lengths with a wild-type aerolysin nanopore”的研究论文。/pp style="LINE-HEIGHT: 1.75em"  生物纳米孔单分子分析技术的原理是通过电场力驱动单链DNA穿过纳米尺寸的孔道,由于不同的脱氧核苷酸通过纳米孔道时产生了不同阻断程度和阻断时间的电流信号,由此可根据电流信号读出每条DNA序列上的碱基信息。但在实际实验过程中,单链DNA穿过纳米孔的速度极快(约1微秒/碱基),造成了的电流阻断信号极小(皮安级),阻碍了纳米孔测序技术发展。/pp style="LINE-HEIGHT: 1.75em"  基于自主研制的超低电流检测装置,龙亿涛课题组首次使用野生型且无任何修饰的Aerolysin(气单胞菌溶素)生物孔,将单链DNA的过孔速度降低了三个数量级(2.0毫秒/碱基),从而极大地提高了电流检测的灵敏度,完成了对仅有单个碱基差异DNA分子的超灵敏识别,并实现了混合复杂体系的超灵敏检测和核酸外切酶“分步降解”单链DNA过程的实时观测。此外,该研究还通过改变检测体系的酸碱度,调节了气单胞菌溶素孔道内腔的电荷分布,同时结合单链DNA在孔内有效电荷数的计算,获得了纳米孔表/界面上电荷的分布信息,促进了对DNA与气单胞菌溶素孔道内腔表面氨基酸残基相互作用的深入理解。/pp style="LINE-HEIGHT: 1.75em"  据介绍,气单胞菌溶素来源于嗜水气单胞菌,主要存在于水生环境包括海水、湖泊、蓄水池和供水系统中,是一种天然的纳米蛋白孔,具有成本低、简单易得的特点。早在2006年,龙亿涛教授就发现气单胞菌溶素能够作为一种纳米蛋白孔,并具有实现高灵敏单分子检测的潜力。该论文的第一作者曹婵,于2011年进入龙亿涛课题组以来一直从事生物纳米孔的相关研究,通过大量的实验尝试和经验积累,实现了气单胞菌溶素纳米通道的成功制备和单分子信号的获取。/pp style="LINE-HEIGHT: 1.75em"  “这一独创性研究成果不仅进一步降低纳米孔单碱基分辨的成本,同时也将大大提高纳米孔DNA测序的精确度。”据龙亿涛介绍,未来,结合高带宽低噪音的电流检测仪器,气单胞菌溶素纳米孔有望实现单碱基直接分辨以及对DNA损伤的检测,这将大大推动DNA测序技术以及个性化医疗的发展。/ppbr//p
  • Revvity宣布与阿斯利康签订下一代碱基编辑技术的新许可协议
    根据非排他性协议,阿斯利康(AstraZeneca)有权使用专有基因编辑技术,帮助推进在细胞治疗方面的工作中国上海 – 2023年5月23日 – Revvity 有限公司 (NYSE: RVTY)近日宣布与阿斯利康 (AstraZeneca, LSE/STO/Nasdaq: AZN) 签订新的许可协议,基于Revvity的 Pin-point ™基因编辑系统技术,即一种具有强大安全性的下一代模块化基因编辑平台,可帮助阿斯利康推进其细胞治疗工作。Revvity生命科学资深副总裁Alan Fletcher博士表示:“我们的基本目标是将Pin-point™平台从临床前研究转化为临床研究,并最终影响患者的生活。本着这种精神,我们很高兴地宣布与阿斯利康签订非排他性协议,以支持其在治疗癌症和免疫介导疾病方面所进行的细胞疗法的研究。”Pin-point™技术介绍Pin-point系统及其碱基编辑技术旨在实现高效且精确的单基因和多基因编辑,而不会对细胞的生存能力或功能产生意外影响。与传统的CRISPR技术相比,后者会在DNA中产生双链断裂,而这种新的编辑系统使用修改后的Cas酶仅切割DNA的一条链。这项技术让基因破坏和碱基修复更具有可控性。Pin-point系统与其它碱基编辑系统的区别在于完全实现了模块化,可选择不同组件以实现针对具体基因编辑目标的最佳性能。目前Pin-point系统已经在T细胞和iPSC中展示了碱基编辑的能力,表明该技术在各种细胞类型和治疗指标中具有潜力。Revvity 还开发了全新的专有方法,利用碱基编辑机制来插入基因,例如通过在敲入CAR的同时敲除免疫标志分子来创建同种异体 CAR-T 细胞疗法。Pin-point 碱基编辑系统是Revvity公司细胞和基因疗法产品组合的一部分,该组合涵盖了基因调控和编辑、细胞分析、免疫测定以及优化的AAV和慢病毒载体开发和制造,以提高细胞基因疗法的特异性、有效性和安全性。解决方案涵盖从功能基因组学分析、有效载荷设计、QA/QC 和载体优化以及表征、自动化和工艺开发领域,助力客户实现其细胞和基因治疗研究、开发和制造目标。关于Revvity在Revvity,我们将“不可能”视为灵感,将“做不到”视为原动力。Revvity提供健康科学解决方案、前沿技术和专业服务,业务涵盖科研探索、开发、诊断、治疗的端到端全流程。依托在转化多组学技术、生物标志物鉴定、成像、疾病的预测、筛查、检测与诊断、信息学等领域的多年深耕,Revvity正以科技之能,突破人类潜能的边界。2022年Revvity的营业额超过30亿美元,全球拥有11,000多名员工,为制药和生物技术、诊断实验室、学术界和政府客户提供服务。公司是标准普尔500指数的成员,客户遍及全球190 多个国家和地区。
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