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扩增过程

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扩增过程相关的资讯

  • qPCR扩增曲线的自述
    大家好!首先跟大家做一个自我介绍:我是扩增曲线,来自荧光定量PCR,是用于描述qPCR动态进程的曲线,我有两种形态,一种是线性图谱:横坐标是循环数,纵坐标是荧光强度值;另一种是对数图谱:横坐标是循环数,纵坐标是荧光强度值的对数。大家根据我来确定Cq值,最终确定初始模板的含量。新冠疫情以来,我可是发挥了重要的作用,诊断技术的金标准,骄傲的很呢。在引物、模板、缓冲液、酶等都充足的理想状态下,PCR扩增产物理论上是呈2的倍数增长的,所以我应该是长这个样子的:▲ 图1. 理论的扩增曲线线性图谱但是呢,理想很美好,现实却很骨感,随着PCR循环数的增加,DNA聚合酶的失活、dNTP和引物的枯竭等诸多因素影响了PCR扩增效率,实际的我是长这样的:▲ 图2. 实际的扩增曲线线性图谱不过S型的曲线,曼妙的身材,我还是很满意的。大家也根据我将PCR进程分为4个时期,分别为基线期,指数增长期,线性增长期和平台期。我的特征还是很明显的:基线期平整;指数期起峰,陡度较大;线性期慢慢趋于平整;平台期基本平整。▲ 图3. 扩增曲线的各个时期如果大家在每次实验中都能遇到如此美丽的我,那就是“你好我好大家好”的欢快场景了。但是在实验过程中,大家可能会看到各种奇形怪状的我,分析不出原因,导致实验止步不前,因此茶饭不思,郁郁寡欢。其实主要还是大家对我不太了解。我,作为大家的科研小助手,单纯善良,心思简单,没有那么多套路的。之所以出现奇奇怪怪的我,都是有原因的。接下来可都是满满的干货吆!笔记要做起来了吆!一. 没有Cq值出现1. 反应循环数不够:一般设定在35个循环以上,也可根据实验情况增加循环数。2. 引物/探针设计不当或发生降解:优化引物/探针的设计;或通过PAGE电泳检测其完整性。3. 模板浓度低或降解导致:对未知浓度的样品应从系列稀释样本的最高浓度做起;同时样品制备时尽量避免引入杂质和反复冻融。二.Cq值偏大1. 模板浓度低:建议提高样本的上样量。2. 扩增效率低:反应条件不适宜或引物探针设计不当,建议通过绘制标准曲线确认扩增效率,同时对反应条件和引物探针设计进行优化。3. PCR产物太长:一般采用80-150bp的产物长度。如果扩增产物过长,建议用三步法程序扩增或优化引物。4. 反应体系中可能有PCR反应抑制物:建议将模板梯度稀释后加入反应体系,或者重新制备纯度更高的模板。三.扩增曲线末尾起跳,但没有完整扩增1. 可能存在污染:建议对样本进行复检。2. 如果是阴性对照,可能是引物二聚体或污染导致;如果是正常样本,说明浓度过低或者加样量不足。四.复孔重复性差1. 加样误差导致:定期校准移液器;同时可先配制除模板以外的其他试剂的预混液,然后进行分装再加入模板,其次加大模板上样体积,以上均可降低移液误差的影响。2. 模板浓度越低,重复性越差。建议提高模板量,使Ct值在15-30之间。现在大家对我的了解是不是又多了一些呢?是不是对qPCR实验又充满了信心呢?那就赶紧行动起来吧!Azure Cielo™ 实时荧光定量PCR系统,没有他就没有我那么多标致的图片,快快申请试用,感受它的魅力呀!▲ 图4. Azure Cielo™ 实时荧光定量PCR系统申请试用我们的仪器可以申请试用哦!关注“深蓝云生物科技”公众号,点击“云活动”→“试用中心”即可。图源:部分来源于网络,侵删
  • PCR扩增得率低或者无扩增?一篇干货解决所有问题
    PCR实验时,我们有时候会遇到目的基因得率低,或者根本扩不出来的情况,不管是PCR的实验王zhe,还是初级实验小白,都需要逐个排查问题,那么我们需要考虑哪些因素呢?今天这一篇干货,帮您彻底解决问题。首先考虑的问题,是不是DNA模板的问题呢? 如果模板质量太差?那么检查DNA模板的纯度和完整度,保证你的模板中不含有PCR抑制剂。在分离DNA时,尽量减少对DNA的切断或切刻。如有需要,可通过凝胶电泳检测模板DNA完整性。将DNA保存于分子级别的水或TE缓冲液 (pH 8.0)中,防止被核酸酶降解。 如果是模板浓度太低?建议使用DNA纯化试剂盒分离模板DNA时,应严格遵循试剂盒生产商的建议。查阅用户手册和疑难问题指南,改善较低的DNA质量。如果采用化学或酶促DNA纯化方案,应确保无PCR抑制剂残留,如苯酚、EDTA和蛋白酶K。使用70%乙醇再纯化或沉淀和洗涤DNA,去除可能会抑制DNA聚合酶的残留盐分或离子(如, K+, Na+等)。选择具有高合成能力的DNA聚合酶,这类聚合酶对土壤、血液和植物组织携带的常见PCR抑制剂具有较好的耐受性。 如果是DNA模板量不足?建议检查 DNA起始量 ,如有需要适当增加起始量。 选择具有高灵敏度 的DNA聚合酶用于扩增。适当增加PCR循环数。 如果需要扩增的目的片段比较复杂(如,高GC含量或含二级结构)?、建议选择具有相应的扩增试剂盒,比如适合高GC含量片段的PCR试剂盒。或者选择具有高合成能力的DNA聚合酶,这类酶对DNA模板的亲和力较高,geng适合扩增困难靶标。 使用 PCR添加剂或辅助溶剂 ,促进富含GC的DNA和具有二级结构的序列变性。增加 变性时间或温度 ,从而高效解离双链DNA模板。 如果目的片段太长?建议直接使用长片段设计的PCR试剂盒,或者确认所选DNA聚合酶的长片段扩增能力。使用专为 长片段PCR设计的DNA聚合酶。选择具有高合成能力的DNA聚合酶,这类酶能够在短时间内扩增长片段。降低退火和延伸温度,促进引物结合和提高酶热稳定性。根据扩增子长度,增加延伸时间。或者是引物的问题? 考虑引物浓度是不是不是最you的?建议预实验优化引物浓度(范围通常为0.1–1 μM)。对于长片段PCR和使用简并引物的PCR,最小起始浓度为 0.5μM。 引物设计有问题?可以使用多种引物设计软件比如Primer Premier等,或者使用在线 引物设计工具 。确保引物针对目的片段具有特异性。 确认引物与正确的目标DNA链互补。也许是其他试剂的问题? MgCl2 浓度太低?镁离子(Mg2+)作为DNA聚合酶活性的辅助因子,有助于聚合期间dNTP的结合。酶活性位点处的镁离子可催化引物的3′-OH与dNTP的磷酸基团间形成磷酸二酯键。此外, Mg2+ 能够稳定磷酸盐骨架上的负电荷,从而促进引物与DNA模板形成复合物。在PCR中,标准的 Mg2+ 终浓度范围为1–4 mM,建议优化滴定增量为0.5 mM。 Mg2+ 浓度过低会降低聚合酶活性,导致PCR产物较少或无PCR产物。另一方面, Mg2+ 浓度过高则会提高引物-模板复合物的稳定性,产生非特异性PCR产物,并增加由dNTP错误插入导致的复制错误。还有可能是PCR循环设置不理想呢? 变性效果不理想?建议优化DN变性时间和温度。变性时间短、温度低可能无法获得良好的双链DNA模板解离效果。相反,变性时间长、温度高可能会降低酶活性。 退火效果不理想?尽量使用 梯度热循环仪 ,以1–2°C增量逐步优化退火温度。最jia退火温度通常比最低引物Tm低 3–5°C。当使用 PCR 添加剂或辅助溶剂 时,应调整退火温度。使用指定DNA聚合酶在其最jia缓冲液中的 推荐退火温度 。DNA聚合酶不同,则引物对的退火温度也不同。 延伸效果不理想?选择适合于扩增子长度的延伸时间。在扩增长片段(如,10 kb)时,降低延伸温度(如,降至68°C)可保持酶活性。使用具有 高合成能力 的DNA聚合酶,在较短的延伸时间内也能实现 稳定的扩增 。 PCR循环数不合适?调整循环数(通常为23-35个循环),以获得合适的PCR产物得率。如果DNA起始量低于10拷贝,则将循环数增加至40。
  • 基因扩增仪 —— 小小身体,大大本领
    基因扩增仪 —— 小小身体,大大本领 别看它的样子小,其实本领真不少,明明可以靠颜值,偏偏选择拼“才华”,这位集“美貌”与“才华”于一体的成员就是我们的pc-96p梯度pcr仪。pc-96p 基因扩增仪是新一代快速实用的热循环仪,采用新一代半导体芯片技术,控温性能好,循环次数可达 100 万次以上,将定性 pcr产品的功能优化,强大的功能将满足更高要求的实验需求。便捷的软件操作ü 1024 x 768 像素高清8寸彩屏,程序显示、设置,一目了然,可轻松编辑、运行、保存程序ü 用户管理界面,可以注册独立账号,设置密码保护,方便保存实验程序ü 梯度计算器,为梯度pcr提供温度计算功能,省时省力ü block模式显示金属模块的温度变化,tube模式能模拟试管内试剂的温度变化ü 升级功能,软件扩展性强,可免费升级,满足未来实验技术发展需求 精确的温度控制ü 先进的半导体制冷技术和独特的 pid 温控技术,控温精度高、升降温速率快,温度均匀性更佳,减少样品台边缘效应ü 新一代半导体芯片技术,最快变温速率可达 5℃ /secü 6 个温区设计,精度优于传统梯度ü 拥有30℃的宽限梯度功能,满足苛刻的实验需求 三种运行功能ü 温度递增/递减范围设置为-9.9℃ ~ 9.9℃,满足touchdown实验需求ü 时间递增/递减范围设置为-599 s ~ 599 s,满足long pcr实验需求ü 梯度温度设置范围为 30℃~99.9℃,梯度可设置到30℃,满足梯度pcr实验 贴心的操作系统ü 热盖升温过程中,模块可保持在低温,提高扩增特异性ü 自动断电保护,恢复供电后自动执行未完成循环,保证扩增全过程安全运行ü 设定的程序支持机器内存和usb外存,也可通过usb导入程序 性能参数
  • 一个半小时就能检测6种病毒 恒温扩增技术大有可期
    p style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px "span style="text-indent: 2em "在近日召开的国务院联防联控机制新闻发布会上,中国工程院院士、清华大学医学院讲席教授程京介绍了一款基于恒温扩增芯片技术、一次能对6种呼吸道病毒进行快速检测的试剂盒。/spanspan style="text-indent: 2em " /span/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 500px height: 585px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202003/uepic/2184a4fc-0506-4778-9ee7-271a66c821bc.jpg" title="程京院士.png" alt="程京院士.png" width="500" height="585" border="0" vspace="0"//pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px "这款新型检测试剂盒具有2大优点:能对对6种呼吸道常见病毒进行一并检测;检测速度快,在1.5个小时就能完成所有检测。/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 397px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202003/uepic/10e81520-0028-44c9-9891-eedb826f1a53.jpg" title="微流控芯片.png" alt="微流控芯片.png" width="600" height="397" border="0" vspace="0"//pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px "临床应用方面,这款新型检测试剂可以非常好地帮助临床医务人员做出鉴别诊断,迅速区分哪些人是新冠病毒感染者,哪些是其他病毒感染者,把合并感染、交叉感染的情况加以区分 。/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px "截至目前,国家药品监督管理局共应急批准17个新冠病毒检测产品,其中新冠病毒核酸检测试剂11个,抗体检测试剂6个。在核酸检测产品中,9款核酸检测试剂盒均基于荧光定量PCR法。而程京院士团队合作研发的这款新冠病毒检测试剂盒为名单中唯一上榜的基于恒温扩增芯片法的试剂盒产品。span style="text-indent: 2em " /span/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 304px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202003/uepic/4e92bcbf-87d2-4dd1-888b-e00656870e92.jpg" title="国家药监局批准可以临床使用的新冠病毒检测试剂产品.png" alt="国家药监局批准可以临床使用的新冠病毒检测试剂产品.png" width="600" height="304" border="0" vspace="0"//pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px text-align: center "国家药监局批准可以临床使用的新冠病毒检测试剂产品/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px "荧光定量PCR技术想必大家并不陌生,那什么是恒温扩增技术?和荧光定量PCR相比又有哪些优势?/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px "大家知道,核酸扩增是核酸分子诊断的关键技术。strong根据核酸扩增反应中温度变化要求,可以将核酸扩增技术分为两大类:一类是PCR核酸扩增技术,另一类是核酸恒温扩增技术/strong。PCR技术是指通过控制温度的变化来实现DNA扩增的三个步骤:模板变性(如95℃)-引物杂交(如58℃)-DNA合成(如72℃)。这种温度变化的循环重复(如重复35次)过程通常由精密而复杂的仪器(PCR仪)来控制。核酸恒温扩增技术(Nucleic Acid Isothermal Amplification,NAIA)则是扩增反应的全过程均在同一温度下进行,不须像PCR反应那样需要经历几十个温度变化的循环过程。这一特点使得它们对扩增所需仪器的要求大大简化,反应时间大大缩短,因而具有巨大的应用价值,成为分子诊断行业发展中的热点。/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px "恒温扩增技术是继PCR技术后发展起来的一门新型的体外核酸扩增技术。strong目前主要的恒温扩增技术有:滚环核酸扩增、环介导等温扩增、链替代扩增、依赖核酸序列扩增和解链酶扩增。/strong/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px "strong滚环核酸扩增/strong(rolling circleamolification, RCA)是通过借鉴病原生物体滚环复制DNA 的方式而提出的,可分为线性扩增与指数扩增两种形式。/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px "strong环介导等温扩增/strong(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)。环介导等温扩增的六个区域设计四条引物,利用链置换型DNA聚合酶在恒温条件下进行扩增反应,可在15-60分钟内实现109-1010倍的扩增,反应能产生大量的扩增产物即焦磷酸镁白色沉淀,可以通过肉眼观察白色沉淀的有无来判断靶基因是否存在./pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px "strong链替代扩增/strong(strand displacement amplification,SDA),靶DNA序列经加热变性后,引物与其互补链DNA单链退火,在聚合酶作用下产生带HincⅡ识别位点的目的DNA序列,该双链DNA进入SDA循环。/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px "strong依赖核酸序列扩增/strong(Nucleicacidsequence-basedamplification,NASBA),是一种扩增RNA的新技术,是由一对引物引导的、连续均一的、体外特异核苷酸序列等温扩增的酶促反应过程。反应在42℃进行,可以在2h左右将模板RNA扩增约109倍,不需特殊的仪器。/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px "strong解链酶扩增(/strongHelicase-dependent amplification,HDA)是解旋酶解开双链DNA,单链DNA结合蛋白与单链结合,使模板处于单链状态并保护其完整性,引物与模板结合,然后在DNA 聚合酶作用下扩增。生成的dsDNA作为底物进入下一轮扩增。恒温扩增温度取决于所用的酶,可以60~65℃,也可以是37℃。/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px "诊断检测方法的建立,最终目的均是应用到实际检测中去。等温扩增技术无需复杂的仪器,不需要热变性与温度循环,同时具有简便、快速、灵敏度高、特异性强等优点,因此被寄予厚望。微流控芯片技术通过与等温扩增技术相结合,仅在一个芯片上即可完成核酸提取、扩增和检测等过程,具有快速、简便、结果直观和可进行高通量筛选等优点。随着相应的便携式装置的开发及费用的降低,等温扩增-微流控芯片技术必将成为下一代基因快速检测的发展方向。/p
  • 传统PCR OUT了!CRISPR等温扩增基因检测技术实现
    p  近日,中国科学院深圳先进技术研究院博士周文华等在CRISPR等温扩增基因检测技术领域取得新进展。相关工作“A CRISPR-Cas9-triggered strand displacement amplification method for ultrasensitive DNA detection”(《一种应用于核酸超敏检测的CRISPR-Cas9链取代扩增技术》)发表于国际刊物《自然-通讯》(Nat. Commun. 2018, 9, 5012)。论文共同第一作者是周文华和研究助理胡丽,通讯作者是研究员喻学锋。/pp  核酸分子检测已被广泛应用于精准医疗、食品安全检疫、公共安全监控等多个领域。尽管基于PCR(聚合酶链式反应)的核酸检测技术被广泛用于专业检测机构,但由于该技术操作复杂、仪器昂贵、以及涉及多重变温过程,并不适用于基层检测和家庭检测。为了克服PCR技术的缺点,一类不依赖变温的检测技术,即等温扩增检测技术得到广泛关注。然而,当前等温扩增技术在灵敏度、特异性和抗干扰度方面仍各自有着其内在缺陷,且成熟的等温扩增技术核心专利大多掌握在国外公司手中。因此,迫切需要开发出一种性能更优异,且具有完全自主知识产权的新的核酸等温扩增检测技术,以满足我国在核酸检测领域日益增长的需求。/pp style="text-indent: 2em "CRISPR/Cas9作为一种源自原核生物获得性免疫系统的基因定点编辑技术,自发现以来已吸引了大量科研关注和投资兴趣。然而,由于人体的复杂性和伦理方面的争议,基于CRISPR技术的临床基因治疗仍面临着诸多困难和挑战。另一方面,由于该技术操作简便、灵敏度高、抗干扰性强等优势,目前已开始在体外核酸分子的检测领域得到应用。但目前以CRISPR技术为基础的核酸检测手段仍依赖传统的PCR技术或等温扩增技术对靶分子进行扩增,其创新性和适用范围仍有待提高。/pp  针对这些现状,喻学锋课题组创新性地提出利用CRISPR系统效应蛋白Cas9在与靶核酸分子结合过程中独特的构象变化,作为链取代等温扩增反应的开关,高效启动针对靶核酸分子的指数倍扩增(简称CRISDA技术)。相比于传统PCR和其他等温扩增技术,CRISDA技术有着诸多独特优势。第一,该技术灵敏度高。基于CRISPR技术良好的抗干扰性,该技术可在复杂背景条件下,对aM(10-18M)浓度的靶核酸分子进行高效扩增检测。第二,CRISDA技术特异性强。通过在机理上的特殊优化,该技术很好地规避了在传统CRISPR基因编辑技术中普遍存在的脱靶效应,可实现对极低浓度的靶核酸分子进行单核苷酸多态性(SNP)检测。第三,CRISDA技术普适性极强。在针对不同靶位点的检测反应中,所需的扩增引物设计简单、无需优化,可迅速实现对新位点的检测反应体系开发。除此之外,该技术检测过程完全等温,并且在从室温到42oC的范围内均保持良好的扩增检测效果,可充分满足在实际检测中对新靶点的检测需求。目前,课题组已利用该技术成功检测出人基因组中乳腺癌相关的单核苷酸位点突变,并在野生型大豆中成功检测出万分之三的转基因大豆。/pp  同时,由于CRISDA技术所具有的独特优势和超越传统PCR技术的应用前景,以该技术为背景的“基于CRISPR-Cas系统的核酸高敏快速等温检测技术”项目在中科院首届“率先杯”未来技术创新大赛中,从数百个项目中脱颖而出,获得最终优胜奖,并已吸引了多家投资机构前来洽谈产业化事宜。目前,课题组正将该技术应用于突发或新型传染病的检测,如新型流感、非洲猪瘟等,并正积极开发相关检测试剂盒。/pp  该研究工作得到国家自然科学基金、深圳市科技计划国际合作研究、中科院前沿科学研究重点计划、深圳科技研究计划、英国利华休姆信托基金和香港研究资助局面上项目等的资助。/pp  a href="https://www.nature.com/articles/s41467-018-07324-5" target="_self"strong论文链接/strong/a/pp  img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201812/uepic/0d23d2ca-6349-469c-8baf-47725333d3c4.jpg" title="111.png" alt="111.png" style="text-align: center "//pp style="text-align: center "图1: 传统PCR技术与CRISDA检测技术对比。/pp style="text-align: center "  img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201812/uepic/d9f7eaaa-745e-48b5-b10a-1fee29f62f2d.jpg" title="222.png" alt="222.png" style="text-align: center "//pp style="text-indent: 2em "图2: 利用CRISDA技术对aM量级的靶分子进行特异性扩增检测。(a)扩增体系设计 和(b)利用CRISDA技术对合成的DNA片段进行特异性扩增检测。(c)利用CRISDA技术对来自人基因组的DNA片段进行特异性扩增检测。(d)利用CRISDA技术对人基因组的特定区域进行特异性扩增检测。br//pp  img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201812/uepic/0f10d157-8779-46d8-8160-16cfad36b63c.jpg" title="333.png" alt="333.png" style="text-align: center "//pp  图3: 利用CRISDA技术对aM量级的靶分子进行SNP扩增检测。(a)不同细胞株基因组中rs3803662位点的测序验证 (b)利用CRISDA技术对该SNP位点进行高灵敏度扩增检测。/p
  • CRISPR等温扩增基因检测技术取得新进展
    p style="text-indent: 2em text-align: justify "近日,中国科学院深圳先进技术研究院博士周文华等在CRISPR等温扩增基因检测技术领域取得新进展。相关工作“A CRISPR-Cas9-triggered strand displacement amplification method for ultrasensitive DNA detection”(《一种应用于核酸超敏检测的CRISPR-Cas9链取代扩增技术》)发表于国际刊物《自然-通讯》(Nat. Commun. 2018, 9, 5012)。论文共同第一作者是周文华和研究助理胡丽,通讯作者是研究员喻学锋。/pp style="text-indent: 2em text-align: justify "  核酸分子检测已被广泛应用于精准医疗、食品安全检疫、公共安全监控等多个领域。尽管基于PCR(聚合酶链式反应)的核酸检测技术被广泛用于专业检测机构,但由于该技术操作复杂、仪器昂贵、以及涉及多重变温过程,并不适用于基层检测和家庭检测。为了克服PCR技术的缺点,一类不依赖变温的检测技术,即等温扩增检测技术得到广泛关注。然而,当前等温扩增技术在灵敏度、特异性和抗干扰度方面仍各自有着其内在缺陷,且成熟的等温扩增技术核心专利大多掌握在国外公司手中。因此,迫切需要开发出一种性能更优异,且具有完全自主知识产权的新的核酸等温扩增检测技术,以满足我国在核酸检测领域日益增长的需求。CRISPR/Cas9作为一种源自原核生物获得性免疫系统的基因定点编辑技术,自发现以来已吸引了大量科研关注和投资兴趣。然而,由于人体的复杂性和伦理方面的争议,基于CRISPR技术的临床基因治疗仍面临着诸多困难和挑战。另一方面,由于该技术操作简便、灵敏度高、抗干扰性强等优势,目前已开始在体外核酸分子的检测领域得到应用。但目前以CRISPR技术为基础的核酸检测手段仍依赖传统的PCR技术或等温扩增技术对靶分子进行扩增,其创新性和适用范围仍有待提高。/pp style="text-indent: 2em text-align: justify "  针对这些现状,喻学锋课题组创新性地提出利用CRISPR系统效应蛋白Cas9在与靶核酸分子结合过程中独特的构象变化,作为链取代等温扩增反应的开关,高效启动针对靶核酸分子的指数倍扩增(简称CRISDA技术)。相比于传统PCR和其他等温扩增技术,CRISDA技术有着诸多独特优势。第一,该技术灵敏度高。基于CRISPR技术良好的抗干扰性,该技术可在复杂背景条件下,对aM(10-18M)浓度的靶核酸分子进行高效扩增检测。第二,CRISDA技术特异性强。通过在机理上的特殊优化,该技术很好地规避了在传统CRISPR基因编辑技术中普遍存在的脱靶效应,可实现对极低浓度的靶核酸分子进行单核苷酸多态性(SNP)检测。第三,CRISDA技术普适性极强。在针对不同靶位点的检测反应中,所需的扩增引物设计简单、无需优化,可迅速实现对新位点的检测反应体系开发。除此之外,该技术检测过程完全等温,并且在从室温到42oC的范围内均保持良好的扩增检测效果,可充分满足在实际检测中对新靶点的检测需求。目前,课题组已利用该技术成功检测出人基因组中乳腺癌相关的单核苷酸位点突变,并在野生型大豆中成功检测出万分之三的转基因大豆。/pp style="text-indent: 2em text-align: justify "  同时,由于CRISDA技术所具有的独特优势和超越传统PCR技术的应用前景,以该技术为背景的“基于CRISPR-Cas系统的核酸高敏快速等温检测技术”项目在中科院首届“率先杯”未来技术创新大赛中,从数百个项目中脱颖而出,获得最终优胜奖,并已吸引了多家投资机构前来洽谈产业化事宜。目前,课题组正将该技术应用于突发或新型传染病的检测,如新型流感、非洲猪瘟等,并正积极开发相关检测试剂盒。/pp style="text-indent: 2em text-align: justify "  该研究工作得到国家自然科学基金、深圳市科技计划国际合作研究、中科院前沿科学研究重点计划、深圳科技研究计划、英国利华休姆信托基金和香港研究资助局面上项目等的资助。/pp style="text-align: center "img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201812/uepic/32ba99f4-c48b-4ce7-af65-d3cb1a2f9940.jpg" title="1.png" alt="1.png"//pp style="text-indent: 2em text-align: center "图1: 传统PCR技术与CRISDA检测技术对比。/pp style="text-indent: 2em text-align: left " /pp style="text-align:center"img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201812/uepic/b631edb6-a6db-4c5c-88b5-21d9ca4cb583.jpg" title="2.png" alt="2.png"//pp style="text-indent: 2em text-align: justify "  图2: 利用CRISDA技术对aM量级的靶分子进行特异性扩增检测。(a)扩增体系设计;和(b)利用CRISDA技术对合成的DNA片段进行特异性扩增检测。(c)利用CRISDA技术对来自人基因组的DNA片段进行特异性扩增检测。(d)利用CRISDA技术对人基因组的特定区域进行特异性扩增检测。/pp style="text-indent: 2em text-align: left " /pp style="text-align:center"img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201812/uepic/89f1c732-cb1d-4b15-97bb-37f9e5aee8e8.jpg" title="3.png" alt="3.png"//pp style="text-indent: 2em text-align: justify "  图3: 利用CRISDA技术对aM量级的靶分子进行SNP扩增检测。(a)不同细胞株基因组中rs3803662位点的测序验证;(b)利用CRISDA技术对该SNP位点进行高灵敏度扩增检测。/p
  • PCR原理、PCR扩增影响因素及预防解决方案
    PCR简介聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)是利用一段DNA为模板,在DNA聚合酶和核苷酸底物共同参与下,将该段DNA扩增至足够数量,以便进行结构和功能分析的一种反应。PCR扩增原理核酸降解是DNA/RNA分子中的碱基和戊糖间的氮糖苷键,或磷酸二酯键在物理因素、化学因素和生物因素等作用下发生水解,使DNA/RNA链发生断裂。▲ 图一:PCR原理反应示意图▲ 图二:PCR反应过程中温度变化图实时荧光定量PCR原理通过荧光染料或荧光标记的特异性探针,对PCR产物进行标记跟踪,实时监控反应过程,结合相应软件可以对结果进行分析,通过标准曲线对未知模板进行定量分析,计算待测样本的初始模板浓度。▶ 初始DNA浓度越高,荧光达到某一值(阈值)时所需要的循环数越少(Cq值)。▶ Log浓度与循环数成线性关系,根据样品扩增到阈值的循环数与已知起始拷贝数的标准品作出的标准曲线对比就可以计算出该样品的起始拷贝数。影响PCR扩增的因素▶ 模板间的交叉污染。▶ PCR试剂的污染。▶ PCR产物的污染。防止污染的预防操作❶ 永远要设置NTC(No Template Control)对照,一个不含有模板DNA但含有PCR体系中所有其他成分的对照。如果不能在污染的第一时间发现,会导致后续一系列的数据无法使用。❷ 准备PCR体系的移液器要专用,千万不能用吸取过PCR产物的移液器去准备PCR体系。❸ 打开离心管前先离心,开管动作要轻,以防管内液体溅出。❹ 最好在加完其他反应成分再加入模板。❺ 实验结束后及时清理台面。出现污染后的解决办法❶ 更换试剂:更换新的试剂和水,用确保无污染的移液器分装备用。❷ 清洁所有可能的污染源:实验台面,离心机,门把手等。❸ 实验过程更加小心,采用前面提到的各种防止污染的方法。CieloTM实时荧光定量PCR系统Harness of the power of qPCR☑ 数据可靠性:连续1000次实验后,结果高度一致。☑ 应用灵活性:提供多种qPCR应用分析。☑ 流程智能化:中英文用户界面,触控操作,可多机联用。☑ 在线便捷性:主机可独立运行qPCR程序,数据可USB、Wi-Fi等网络传输。
  • Nat Genetics | 染色体碎裂驱动癌基因扩增
    2019年,BioArt曾解读Nature Reviews Cancer上的一篇观点文章(这篇观点文章是3月发表),讲述了染色体外DNA的(Extrachromosomal DNA,ecDNA)过去和未来(详见BioArt报道:特别推荐丨环状DNA的过去和未来),详细介绍了癌基因在ecDNA上扩增的重新发现的过程,强调ecDNA在肿瘤发病机制和加速癌症进化中的重要性。然而ecDNA的结构如何呢?同年11月21日,美国加州大学圣迭戈分校的Paul Mischel教授团队(注:Mischel正是Nature Reviews Cancer的通讯作者之一另外在2017年,Mischel团队曾发表一篇Nature文章揭示了染色体外癌基因扩增与肿瘤的关系)发表了Nature文章对ecDNA进行了详细解析,利用各种技术手段证明了ecDNA的存在形式是—环状,即ecDNA变成了eccDNA(详见BioArt报道:Nature亮点 | 吴思涵等首次解析肿瘤染色体外DNA的环状结构与功能)。功能上,eccDNA在癌症中扮演了重要的角色,尤其是原癌基因(详见BioArt报道:Nat Genet 丨ecDNA:在癌症基因组图谱上画出浓墨重彩的一笔);来源上,eccDNA不仅来自于染色体,甚至可以整回到染色体中(详见BioArt报道:再一篇!Nat Genetics报道染色体外环状DNA新功能:驱动神经母细胞瘤基因组重排),那么,还有一个问题,eccDNA是否有序列或位置特异性,表观遗传学领域大佬哈佛医学院张毅教授于今年10月20日在Nature上给出了否定的回答,并提到eccDNA可能是基因组DNA随机断裂产生片段的环化产物(详见BioArt报道:专家点评Nature | 突破!张毅团队揭秘染色体之外环状DNA的前世今生)。再回到癌症,基因扩增对于癌症的发展“功不可没”,其扩增可以分为染色体外扩增(如双微体,double minutes,DM)和染色体内扩增(如均匀染色区,homogeneously staining regions,HSR)。除了DM和HSR,还有一种是巨型标记染色体(giant marker chromosomes)或者新染色体(neochromosomes)。这些概念也说明了癌症基因扩增中演化的复杂性。尽管扩增演化中的部分形式的机制已经相对比较明确了,比如串联重复等,但大部分还是不甚清楚。2021年11月15日,德国科隆大学儿童医院Matthias Fischer在Nature Genetics上发表了文章Chromothripsis followed by circular recombination drives oncogene amplification in human cancer,利用小儿神经母细胞瘤的全基因组测序发现一种新型扩增,并命名为“地震扩增”(seismic amplification,注:这一术语原本属于地质学或者地震相关学科),这一扩增的特点为多重重排和不连续的拷贝数,并且在38种不同类型肿瘤的发生率为9.9%(在38种不同类型肿瘤共计2756例病人中,出现例数为274,占9.9%)。机制上,地震扩增起始于染色体碎裂,产生染色体外环状DNA,之后是环状重组,由此导致原癌基因拷贝数增加、表达升高,从而促进癌症的发生。首先,研究人员检测了79例神经母细胞瘤样本的全基因组数据,对其基因扩增进行了详细分析,并将经历过14次及以上内部重排的扩增子定义为“地震扩增”。根据这一定义,神经母细胞瘤中228个扩增子中有20个属于“地震扩增”,并且影响了79例样本中的19例。其热点区域主要有两个,2p24(内部有MYCN)和12q13/12q15(内部有CDK4和MDM2)。除了神经母细胞瘤,研究人员进一步分析了TCGA上37种不同类型癌症的2677个肿瘤样本,对其“地震扩增”进行了描述。由于染色体碎裂可产生大规模的基因重组,研究人员比对了染色体碎裂和“地震扩增”的区域,发现77.6%的地震扩增子与染色体碎裂区域至少部分重合,其中34.9%是完全重合。同时研究人员排除了断裂—愈合—染色体桥循环(breakage-fusion-bridge cycles)是地震扩增起始事件的可能性。之后,研究人员对重排和扩增事件进行了分析,描述了“地震扩增”的过程模型:1)一个或多个染色体区域发生染色体碎裂;2)将随机片段整合为环状DNA;3)发生环状重组事件(这些环状重组事件与肿瘤细胞高频突变有关);4)扩增区域或保留在双微体中、或以均匀染色区形式整合进染色体中、或形成新染色体。重要的是,“地震扩增”在肿瘤细胞中是稳定的,而非变化的。总之,该研究定义了一种复杂的基因扩增形式——“地震突变”,并描述了其扩增过程,为理解癌症基因组演化包括染色体外环状DNA提供了新的解读。原文链接:https://doi.org/10.1038/s41588-021-00951-7
  • 如何优雅的完成噬菌体的扩增和定量实验?实验汪必备! | 小奥课堂
    开学季又到了实验汪又要去“搬砖”了如何优雅的搬砖还不用求助师兄师姐当然是关注“小奥课堂”栏目啦今天小奥为各位介绍的 是一篇干货满满的 噬菌体展示方法实践手册 “噬菌体的扩增与定量” 这是一份难得的学霸笔记 请收好(收藏)! Part 1杂交瘤、单细胞克隆和噬菌体展示技术是抗体发现的三种主流技术,其中噬菌体展示技术作为诺奖级别的技术,在生物创新医药研发过程中有着十分重要的作用,极大的加快了抗体类药物研发的进程。噬菌体展示技术不仅在新的抗体和多肽的发现及优化过程中有着核心的作用,还能和传统的动物免疫技术相结合,与纳米抗体、全人源转基因小鼠发现平台进行有效对接,能够广泛用于抗体、抗体偶联药物和CAR-T/TCR-T等领域。本文将针对噬菌体展示技术的噬菌体增殖和扩增实验细节进行探讨、分享具体实验过程的经验,以其原理为根本来指导实验过程,以精益求精的实验过程,增加噬菌体展示技术在抗体发现过程中的成功率。Part 2 ——噬菌体文库 扩增及展示的基本原理 | 现在普遍应用的噬菌体展示抗体片段的体系称之为“3+3体系”(3为噬菌体的p3衣壳蛋白);3+3代表着p3衣壳蛋白有两个来源:噬菌粒(phagemid)M13KO7辅助噬菌体(Helper Phage)菌粒(phagemid)上的p3蛋白融合了抗体片段的基因,是文库多样性的关键;辅助噬菌体(Helper Phage)上的p3蛋白为噬菌体天然的p3蛋白。*噬菌粒是一种比较小的质粒载体,在大肠杆菌感受态中有较高的转化效率,并且能够在大肠杆菌中扩增。 含有噬菌粒的大肠杆菌被辅助噬菌体(Helper Phage)感染后,会利用大肠杆菌的酶系统、原料和能量进行扩增,最终包含噬菌粒的噬菌体从大肠杆菌释放出来,该子代噬菌体的p3衣壳蛋白会展示抗体片段。Part 3 ——在噬菌体扩增过程中 遇到的难题和对应的解决方案 | 噬菌体的建库过程实际上是抗体片段基因多样性的传递过程: 从血样中抗体基因的多样性传递到噬菌粒的过程,是噬菌粒文库构建的内容; 从噬菌粒的多样性传递到含有噬菌粒的大肠杆菌的多样性,是噬菌粒质粒电转大肠杆菌的内容; 从含有噬菌粒的大肠杆菌的多样性传递到噬菌体的多样性则是噬菌体扩增的内容,也是本文实验经验关注的问题。噬菌体的扩增最终目的是将噬菌粒中单一拷贝的抗体片段基因通过噬菌体的扩增过程变成10-100个拷贝,且这些拷贝基因能够在噬菌体表面的p3蛋白上展示出抗体蛋白片段。在噬菌体的扩增过程要使得文库的多样性得以保持和传递,需根据文库的初始大小确定在扩增过程中含有噬菌粒的大肠杆菌的数目和体积,对应加入的辅助噬菌体的多少进行有效感染,以及扩增后加入多少含有噬菌粒的噬菌体进行淘选等需要一一计算评估的问题,不同文库大小的噬菌体库在扩增过程中需要的扩增体积是不一样的。一份固化的实验方案很有可能会导致文库多样性的丢失。 要弄清楚这些问题,首先要具备以下几点基础的前置知识:(??以下内容全部划重点!!!)1. TG1大肠杆菌在OD600的读数:1OD代表的菌浓度为1e9个/ml。2. 噬菌体/辅助噬菌体在TG1处于对数生长期时有比较好的感染效率,TG1处于对数生长期的OD600值在0.4-0.8。3. TG1在对数生长期的生长速度是20分钟一代,需要密切关注TG1的生长,及时取菌进行实验。4. 辅助噬菌体和TG1的比值MOI在20:1时能够保证所有TG1被感染上。5. 含有噬菌粒的噬菌体能够感染正常的TG1大肠杆菌,并将噬菌粒留在TG1中并随着TG1的扩增进行扩增,在无辅助噬菌体的情况下无噬菌体的扩增。6. 噬菌粒质粒含有青霉素抗性,辅助噬菌体含有卡那霉素抗性。7. 含有噬菌粒的噬菌体可以通过感染正常的TG1,梯度稀释涂青霉素抗性的琼脂板进行滴度测定。8. 3+3模式下含有噬菌粒的噬菌体展示出p3融合抗体片段蛋白的效率比较低,只有5%-10%,在进行淘选时,加入的噬菌体的滴度应是文库多样性的100倍以上。 还有一个比较关键的问题是噬菌体作为一种病毒,很容易以气溶胶的形式扩散到空气中污染实验室的环境,从而感染F因子阳性的大肠杆菌。 (心疼一下生物汪,冒着生命危险搬砖啊!) 在噬菌体展示的相关实验需要在相对封闭的实验室进行以避免噬菌体对于大肠杆菌的污染,特别是在培养正常的TG1大肠杆菌时。噬菌体的灭活方式通常是紫外照射半小时以上。(合格的生物汪,是个莫得感情的病毒杀手!) Part 4 ——噬菌体扩增和定量 具体实验过程的分享 | 以下是以一个文库大小为1E9的噬菌体文库进行扩增的实验方案。*如果文库过大或者过小,可依比例增减扩增体积。 Day 1(搬砖秃头的第一天)1. 取含有噬菌粒的TG1菌种1ml (菌数目为1E10)加入含有100ml 2xYT-GA培养基250ml摇瓶中,使用奥豪斯摇床37度220rpm摇菌摇床至OD600为约0.5。2. 取OD600为约0.5的菌液20ml (菌数目为1E10),按照MOI为20:1加入pfu为2E11的辅助噬菌体M13 K07,37度220rpm振荡半小时进行感染。3. 取感染后菌液到50ml离心管使用奥豪斯离心机5816R 3200g离心10分钟,去除培养基,以除去培养基中的葡萄糖对噬菌粒中p3蛋白融合了抗体片段蛋白表达的抑制。4. 用2xYT-AK培养基重悬菌团,将培养基加至400ml,用1L摇瓶在30度220rpm过夜摇菌。 Day 2(搬砖秃头的第二天)5. 将400ml菌液均分至大的离心瓶中,使用奥豪斯离心机5816R 10000g离心10分钟,取上清,10000g再次离心10分钟,去除残留的菌体碎片。6. 取90ml PEG溶液加入400ml上清液中,在4℃孵育1小时并伴随着柔和的振荡,然后使用带低温控制功能的奥豪斯离心机5816R 4℃10000g离心1小时。7. 去上清,用10mlPBS重悬噬菌体后,加入2.5ml PEG溶液再次沉淀.8. 冰上孵育20分钟,然后使用带低温控制功能的奥豪斯离心机5816R 4℃ 10000g离心半小时。9. 去上清液,用吸水纸吸干残留的PEG溶液,加入1-2ml的PBS重悬噬菌体,进行滴度测定。滴度测定:1. 在分隔的实验室,取正常的TG1大肠杆菌加入2xYT的培养基中,使用奥豪斯摇床摇菌至OD600值为0.5,如未能及时使用,可放入4℃ 2小时以备用。2. 将步骤9中扩增噬菌体原液用PBS稀释1E5-1E7倍。3. 取10ul噬菌体稀释液加入490ul OD600为0.5的TG1大肠杆菌中,使用奥豪斯摇床 37℃ 220rpm振荡半小时进行感染。4. 取感染液50ul均匀涂抹在含有2xYT-GA的琼脂板中,晾干后放入37℃培养箱过夜。并将未感染TG1大肠杆菌涂抹琼脂板作为阴性对照。 Day 3(搬砖秃头的第三天)5. 数2xYT-GA的琼脂板中的克隆数,根据稀释倍数计算扩增噬菌体的滴度 噬菌体滴度(pfu/ml)=(克隆数*10*50/10ul)*稀释倍数6. 取1E11-1E12的噬菌体用于淘选。试剂配方:2xYT培养基:Yeast Extract 10.0 g/L+Tryptone 16.0 g/L+NaCl 5.0 g/L2xYT-GA培养基: 2xYT培养基+100 μg/ml 青霉素+ 1% (W/V)葡萄糖2xYT-AK培养基:2xYT培养基+100 μg/ml 青霉素+50 μg/ml卡那霉素PEG溶液:20% (w/v) PEG 6000, 2.5 M NaCl Part 5仪器推荐:(做科研民工的每一天都不孤单,因为有小奥陪伴)噬菌体作为一种病毒,很容易以气溶胶的形式扩散到空气中污染实验室的环境,需要封闭的实验室,实验室所有的仪器需单独使用。奥豪斯恒温轻负载培养摇床转速范围为100-12—rpm,体积集约,功能强大,可为您的样品提供优异的摇荡效果:此外,噬菌体展示实验的过程中会有不同体积、不同转速和需要4℃条件的离心步骤,如果以多 台离心机满足实验的需求会造成实验设备资产的空置,造成极大的浪费!!!奥豪斯5816R多功能离心机和可选转子为噬菌体相关实验提供便利,一台离心机满足所有实验需求!接下来,小奥带你乘坐“帮你省科研经费”这辆车教你正确薅奥豪斯的羊毛 德国原装进口功能强大、离心效果优异的奥豪斯Frontier™ 离心机家族 推出“买一赠一”促销活动促销型号如下微量高速离心机FC5515R(冷冻型号)微量高速离心机FC5515(非冷冻型号)全新紧凑型微量离心机FC5513现在上车,还来得及哦!详情请联系奥豪斯哦! 想了解更多关于奥豪斯Starter™ 系列产品信息?请进入「阅读全文」留下信息,我们的专业工程师将火速赶来,为您服务! ▼
  • 值得收藏的小工具:在线预测PCR扩增效率
    目前已开发多种工具可以进行PCR引物的设计,但大多数工具只考虑避免发夹结构形成、3' 末端核苷酸的选择、引物解链温度等问题,并没有考虑内在扩增子的特征以及没有预测给定扩增子和引物对的PCR扩增效率。Izaskun Mallona等人[1]使用了一种基于90个引物对组合的统计方法,扩增来自细菌、酵母、植物和人类的模板,扩增子大小在74到907bp 之间,以确定影响PCR效率的参数。最终开发了一个拟合数据的广义加法模型,并构建了PCR Efficiency在线分析工具(http://130.60.24.89/efficiency.html),允许从给定序列开始获得针对PCR 优化的寡核苷酸,并可以预测出扩增效率。有个这款小工具,还怕做不好PCR实验吗?现在快快试用我们的数字PCR系统和实时荧光定量PCR系统,你们就知道预测工具好不好用了。naica微滴芯片数字PCR系统naica微滴芯片数字PCR系统,以Sapphire芯片(全自动)或Opal(高通量)芯片为耗材,形成由25,000-30,000个微滴组成的单层二维阵列,该单层微滴阵列形成后直接进行PCR扩增实验。反应完成后对微滴进行三通道成像,从而对起始核酸浓度进行绝对定量。仅需2.5小时即可获取结果。Azure Cielo™ 实时荧光定量PCR系统Azure Cielo™ 实时荧光定量PCR系统来自于美国Azure Biosystems公司,配备高品质温度模块,采用光纤和CMOS的检测系统,高能LED的激发,提供高灵敏和可靠的数据。参考文献:[1] Izaskun M , Julia W , Egea-Cortines M . pcrEfficiency: a Web tool for PCR amplification efficiency prediction[J]. BMC Bioinformatics, 2011, 12(1):404.
  • 博奥晶典推出恒温扩增微流控芯片核酸分析仪
    [仪器信息网讯] 2014年3月19日,CBIFS第七届中国北京国际食品安全技术论坛于北京国家会议中心召开。本次论坛为期两天,共邀请到了60余位业内专家就食品安全的相关话题进行深入的探讨,展会吸引了700余名业内人士参加,40余家企业参展并展示自己的成果。在本次大会举办的食品安全快速检测专题论坛上,北京博奥晶典生物有限公司(以下简称:博奥晶典)的张岩博士对此次展出的微流控恒温扩增平台在论坛上作了技术演讲,向大家介绍这套平台在食品安全快速检测领域应用状况,为更好地了解其技术原理及优势,仪器信息网编辑在现场对博奥晶典的张岩博士进行采访。北京博奥晶典生物有限公司张岩博士  仪器信息网:贵公司这套快速检测平台主要采用什么技术?  张岩博士:恒 温扩增技术以及微流控芯片技术。博奥是国内唯一具备国际先进的微加工生产工艺的公司,微流控碟式芯片是博奥的专利技术,恒温扩增仪是我们第一款应用微流控芯片技术的扩增产品,微流控碟式芯片具有多指标并行检测、样品及试剂用量少的特点。博奥采用恒温扩增技术,因为恒温扩增反应不需要90度以上的高温变性过程,只是在50-60度之间反应,并且微流控芯片的结构设计有液封的效果,反应液的挥发并不严重,因此具有各检测孔反应均一、结果可控的优势。  晶芯RTisochipTM-A恒温扩增微流控芯片核酸分析仪及其微流控蝶式芯片  仪器信息网:此款微流控恒温扩增仪是否专门定位食品安全监测领域?相对传统实时荧光定量PCR技术,微流控恒温扩增仪在食品安全检测领域有何应用优势?  张岩博士:这个平台能够很好的满足食品安全快速检测的需要,是一个基于检测微生物的平台,同样也应用在临检,如呼吸道病原微生物检测,以及农业、奶制品、水质等病原微生物的检测。   大家都知道,传统方法检测食源性微生物呢,一次只能检一个指标,而微流控碟式芯片上的24个检测通道,可以进行多指标的并行检测。并且通道之间完全隔离,不接触空气,因此避免了交叉污染。另外,从实验成本控制角度来讲,碟式芯片上每个样品反应量仅需1.4&mu L,相应的试剂用量也减少到了几微升,更符合目前快速检测领域的需求。  恒温扩增技术在食品安全检测方面的实际应用主要都是用来定性,其多个引物的设计能带来更高的特异性,反应快, 实验操作也非常简单,因此很适合快速检测。关于这两种技术的优劣势比较,行业内人士也都比较了解,我这里就不多作介绍,我们的技术创新主要是微流控芯片, 或者说微流控与恒温扩增技术的结合。  仪器信息网:碟式芯片不同通道的多个引物之间是否会产生干扰?  张岩博士:每个反应池是独立的,微流控碟式芯片的设计能有效的避免交叉污染,在不同指标之间不存在干扰。对于同一个指标来说,不是多重PCR,而是针对一个序列的检测,当然在引物的设计过程中,我们必须要考察的就是待测序列的菌种特异性。  仪器信息网:引物是否存在变性的可能?在检测中是否有质控?  张岩博士:在检测中,我们有设定阳性和阴性对照,由于所有反应池里引物的包埋都是同时以同样的方式进行的,因此我们认为,如果阳性对照可以得到阳性结果,那么其他的引物也是能正常工作的。当然,也可以针对每一个反应池设置阳性对照,但根据我们的大量实验验证结果,这种设置不是必要的。   关于北京博奥晶典生物技术有限公司:   北京博奥晶典生物技术有限公司是依托于博奥生物集团有限公司/生物芯片北京国家工程研究中心成立的一家全资子公司,整合了旗下系统化生物芯片相关的仪器 平台、技术力量、服务团队等优质资源,致力于为生命科学领域的实验室建设提供创新、完善的整体解决方案。公司主营方向:从事以微流控技术为核心的生物芯片 相关仪器平台的搭建及服务,提供领先创新性的技术应用思路、实验室建设及运营、技术支持及培训的整体方案,涵盖了生命科学研究、生物(含食品)安全、临床 诊断等领域。  (撰稿人:傅晔)
  • 国产PCR核酸扩增仪10月热度榜(上),小编精心梳理
    小编整理了2023年10月国产PCR仪器热度榜单,收录了10月的热门国产PCR产品,供有采购此类仪器的用户参考。本篇是第1至5名。TOP1、普迈 Amplly全自动核酸提纯及荧光PCR分析系统品牌型号:安普利 | Anadas9850价格:100万 - 200万生产商:普迈精医科技(北京)有限公司产品介绍:全自动核酸提纯及荧光PCR分析系统是一个集成创新项目,基于临床大规模微量基因定量分析而推出的一种流水线式核酸检测平台,其利用仪器设备的高精度、高可靠性、高速度的特点,从标本录入开始到PCR定量出报告全程自动化,检测通量大,检测效率高,是目前国内、国际上检测速度最快的检测平台,同时充分考虑临床实验室检测特点,满足目前临床上日益增加的基因定量分析需求。充分考虑到临床实验室检测的特点,利用仪器设备的高精度、高可靠性、速度快的特点而推出的一个平台装备 全自动化,具有检测通量大,检测效率高,是目前国内、国际上检测速度最快的检测平台。产品特点:1、自动化程度高;全自动核酸提纯及荧光PCR分析系统从标本上样、模板制备、全程条码化管理,连接ILS系统,自动读取病人信息安排实验,自动打印报告可以直接从样本管中提取血清、血浆、分泌物等标本,多品种并行处理,减少交叉污染试剂、耗材自动条码录入,程序自动记忆,避免人工出错根据标本信息自动选择处理程序,减少人为错误。2、通量大,速度快;设备采用18只移液器并行处理,一次可处理96个标本,基因分离时间少于60分钟,大大提高了标本处理的通量与速度,内置两台全自动医用PCR分析系统,工作自动分配,检测速度快96个标本首次核酸定量分析检测时间小于2.5小时,之后每次96个标本分析周期小于1小时标本、试剂、耗材自动条码录入,无须人工干预,处理速度快。3、生物安全性好;内置全外排净化层流通风系统,设备采用过滤的净化层流通风系统,出风全外排,对实验室无污染全自动封闭操作,排除外界的污染,避免有害物质对人体的危害,采用带滤芯的一次性Tip头,避免交叉污染,标本与试剂移液器分离,避免交叉污染,自我清洁、气流自动控制。内置定时紫外消毒功能4、提取效率高,提取纯度高;龙门闭环结构,稳定可靠,运行精度高三维立体多重自检系统,仪器运行稳定可靠。5、重复性、稳定性好。专用的提取试剂和预置的提取程序并行,可消除操作过程中的不均一因素,使得每批之间的结果高度重复 6、ZD满足临床需求;满足临床的便利需求,可以直接从样本管中提取血清、血浆、分泌物等标本,而且可以并行处理,减少交叉污染,ZD满足临床多品种标本的检测,多种标本可同时上机,并行处理,适用临床多品种标本的检测,自动化程度高,避免了手工进行标本移液的操作步骤,减少交叉污染灵活的软件操作,全中文图文界面,处理速度快试剂、耗材自动条码录入,避免人工出错荧光PCR分析系统提供常用的多种波段的荧光选择,并可根据客户要求,选择2-6波段定制。7、操作简便,易上手。操作流程:1、开机,仪器自检2、在指定位置放入临床样本、试剂、耗材3、仪器运行4、分析报告5、清理仪器、关机产品参数:厂商简介:普迈精医科技(北京)有限公司(PRECISION MEDICINE TECHNOLOGY(Beijing)Co.LTD)是EVOQUA懿华在中国的合作伙伴,为实验室客户提供专业的科研检测设备解决方案。 我们了解科学仪器在全球的最前沿应用,汇集于专业的解决方案,传递给国内顶级科研及检测人员,辅助我们的客户取得事业进步和成功。TOP2、全自动医用PCR分析系统品牌型号:天隆科技 | Gentier 96 E/Gentier 96 R价格:30万 - 50万生产商:西安天隆科技有限公司产品介绍:Gentier 96E/96R全自动医用PCR分析系统是一款大通量、多靶标、高精度qPCR核酸检测设备。该款产品具有科学高效的温控系统与光电系统、强大易用的软件分析功能、人性化的操控方式等诸多优势,轻松实现下游多重基因检测、定量分析、SNP分析、 熔解曲线分析等应用。升温速率≥6.1°C/s温度均一性±0.1°C7s完成检测仪器特点01 所有通道同步检测多种常规的激发、检测通道,可兼容大多数荧光染料、探针类型,实现绝对定量、相对定量、基因分型等检测;Gentier 96E/96R FRET(荧光能量共振转移)通道的引入实现用户低荧光本底值、高灵敏度检测的需求,使检测更加便捷、专业、精准。02 多样化的操作方式在继承经典的外接电脑一对一操控的基础上,创造性地引入局域网内的远程操控、仪器的单机本地运行模式;内置10.4英寸触摸屏搭载自主研发的控制软件,实验设置、实验实时监控、仪器设置等操作更加便捷。 03 精准高效的温控系统基于Peltier效应的多枚半导体制冷片排布于Block下,温度的均匀性、准确性、升降温速率等均得到了明显提升,缩短实验周期;温度梯度功能的实现,省去以往对退火温度的反复摸索,提高实验效率。 04 科学合理的光学系统荧光激发光源采用高亮长寿命LED,荧光检测系统终身免维护;光学系统位于仪器顶部,运行时顶部激发、扫描,无需担心孔内灰尘对结果造成的不良影响;紧凑的光学系统内集成了6/4个荧光检测通道,实现多项技术突破;同时增加恒温控制,保证了荧光检测的精准性和稳定性;仅需7秒即可完成96孔位6/4种荧光通道的逐孔扫描,高效且无荧光边缘效应。厂商简介:西安天隆科技有限公司(以下简称:天隆科技)成立于1997年,是一家以市场为先导、产学研为基础、创新驱动为核心、品牌高度自主化的高科技企业。历经二十余年,天隆科技已逐步发展成由西安天隆、苏州天隆、无锡锐奇等多公司组成的跨区域企业集群。公司秉持科技服务大众,客户为中心的发展理念,始终致力于基因检测、分子诊断领域仪器及体外诊断试剂的研发、生产和整体解决方案的提供。TOP3、盘古(Pangaea)快速荧光定量PCR系统品牌型号:艾普拜 | Pangaea价格:面议生产商:北京深蓝云生物科技有限公司产品介绍:又准又快,盘古(Pangaea)快速荧光定量PCR系统集二十年国际品牌的经验,圆科学仪器中国智造梦。盘古(Pangaea)快速荧光定量PCR系统是其由资深国际团队设计和研发匠心打造的,具有国际水准、优异品质的PCR产品。采用马洛半导体精确控温和独特的光波导检测设计,保证数据的准确性和均一性,升温速度可达8.5°C/s,获得结果快速。国际化软件设计和操作规范,操作简易,数据可视化,支持中英文等多语言,带来前所未有的操作体验。▎ 技术特点• 精确的温控系统:马洛(Marlow)半导体控温:>50万次循环寿命,热转换效率高;温度均一性±0.15℃;温度准确性±0.1℃,保证数据准确性和均一性。• 一流的升降温速度:升温速度≥8.5℃/S,获得结果快速。• 采用光波导检测系统:显著降低背景噪音,无边缘效应。• 符合国际规范的操控软件:国际化软件设计和操作规范,操作简易,数据可视化。• 智能压力系统:兼容0.1ml和0.2ml的耗材。• 完美的电动控制:可实现全自动工作站,进行大规模全自动检测。▎ 优异性能• 一致性好使用探针法对FAM通道的模板(105 copies/μL)进行96孔检测;图中为20μL反应体系的96个孔重复。Cq=21.38±0.13。• 灵敏度高2倍浓度差异样品的区分:质粒DNA以2倍梯度进行稀释后扩增,每个梯度进行7个重复。结果显示出优秀的分辨率,灵敏度,重复性和数据的均一性。(CV0.5%),R2=0.998。• 11个数量级的动力学范围盘古快速荧光定量PCR系统线性范围检测。质粒DNA以10倍梯度稀释,共11个浓度梯度,使用HEX探针检测,R2=0.998。结果显示盘古具有宽广的动力学范围。• 卓越的6重检测能力盘古快速荧光定量PCR系统能够实现单管6重检测能力,经过验证的优异的滤光片组合设计最大程度地检测特定通道中特定染料的荧光信号,无荧光串扰。▎ 符合国际规范的CqMAN定量操作软件国际化软件设计和操作规范,操作简易,数据可视化,支持中英文等多语言。• 中英文一键切换,降低学习曲线。• 具有向导式窗口,可极大精简设置过程。• 支持先运行程序再进行孔板设置,节约实验时间。• 快速阴/阳性判别,直观可靠。• 实验设计、孔板布局、程序设置可独立或全部保存模板,进行快速运行实验。厂商简介:北京深蓝云生物科技有限公司致力于为用户提供新型生命科学研究仪器和分析产品以及优化的整体应用解决方案。 深蓝云生物配备着专业的技术支持和应用支持,依托国际领先的生命科学产品和解决方案,专注为用户提供分析产品和完善的售前咨询和售后服务。TOP4、实时荧光定量PCR仪品牌型号:杰莱美 | QX96M / QX96B / QX300 / QX400 / QX600价格:30万 - 50万生产商:四川杰莱美科技有限公司产品介绍:高精度的温度传感及控制系统:导热性能优良的合金加热槽内置3个独立校准的超高精度温度传感器,温度测量精度可达到±0.05°C,先进的PID温控算法可实现8.4°C/s升温速度的同时确保超调不超0.1°C、准确性±0.15°C、精度优于±0.1出众温控性能 高灵敏的光学系统:专业布局的高精密光学系统,与高效率的均衡宽光谱激发光源、高灵敏度的科研级图像传感器相结合,可快读检测微量样品极其微弱的荧光信号操作方式灵活:既可使用触摸屏独立控制设备完成实验,也可使用网线或WIFI控制设备,同时,仪器可无线传输指定格式的文件,实验结果自动传输到用户指定邮箱,可按客户命令自动关机方便易用的操作体验:既可以在触摸屏上实现单机操作,也可以通过网络连接PC端编辑运行程序,还可以通过运行程序移植,实现多台机器同时完成相同的检测程序可升级的无限远光路系统:增加或减少滤光片对光路路线没有任何影响,仪器只需增加或减少滤块就能实现荧光通道的增减,可根据用户需求灵活升级。厂家备有滤块库,质保期内用户可随时申请更换自己需要的滤块助力科研 品质服务极高的重复性:利用质粒特异性的基因序列,在20μl体现下进行96孔重复扩增,结果显示所有样本Ct值的标准差(SD)为0.07卓越的分辨率:利用探针法对不同浓度质粒DNA模板进行扩增的结果能清晰的区分2倍和1.5倍(置信区间99%)的质粒DNA模板差异宽广的线性检测范围:利用质粒特定基因进行10个浓度梯度(10个数量级)检测,回归系数 ≥0.999,扩增效率高厂商简介: 四川杰莱美科技有限公司成立于2016年,是一家专业致力于实验室科学仪器设备的研发、制造、销售、服务为一体的高新技术企业。其总部设立在成都,在北京、上海、广州、武汉等一二线城市均设有办事处,是全国多个政府部门及国家机构的合作伙伴。公司现有专业技术人员100余人,其中,博硕士以上学历占50%,本科以上学历占95%。公司已建立包括分子生物学、血清学、形态自动识别系统等在内的一整套研发、生产技术体系平台,拥有多个自主研发产品并同步发展,可以满足各知名高校、研究院所、政府检验实验室、大型医院的科研实验与信息化需求。TOP5、赛沛 GeneXpert全自动医用PCR分析系统(Infinity-80) 品牌型号:Cepheid | Infinity-80价格:200万 - 500万生产商:赛沛(上海)商贸有限公司产品介绍:Cepheid® GeneXpert® Infinity System 全自动医用PCR分析系统(Infinity-80)是一种全自动化、高处理量、按需随选、随机访问、封闭式的系统,完全集成实时、基于 PCR 的分子诊断检测技术,实际动手时间极少。是完整的一体化分子诊断系统,具有无与伦比的用户界面。可搭载16-80个独立的反应模块,系统通过独立运行的检测模块及具有专利的Xpert®试剂盒将样品制备与扩增和检测过程相结合,真正做到了“样本进,结果出”,让更多的检测场景成为可能。Infinity系统的灵活性还体现在能够根据客户需求提供16-80个样本检测通量,同时预留加急(STAT)模块,可解决紧急标本的检测问题。国内已有多款配套试剂上市,覆盖感染性疾病病原体、耐药性基因及肿瘤基因等领域,能够为临床及时提供检测依据,已广泛应用国内大型三甲医院。产品特点:试剂盒自动装填处理;减少人为因素影响结果高通量、无停机时间(2,000* 测试/ 天);达到工作效率模块化设计,灵活组合,可拓展性强,按需装配16 to 48 个模块;满足不同发展需求触摸屏界面,智能化人机交互与易用性创新的故障管理体系;售后维护简单方便支持全自动模式和手动模式废弃物自动化处理,生物安全性高搭载多款传染病检测菜单,不断拓展应用领域厂商简介:赛沛是一家总部位于美国加利福尼亚州Sunnyvale的分子诊断公司,致力于研发、生产、销售快速易用的分子诊断系统和试剂盒,帮助改善当前医疗状况。通过将高度复杂且耗时的手工操作自动化,赛沛为不同规模的机构提供解决方案,可以对微生物和遗传病进行复杂的基因检测。赛沛凭借强大的分子生物学平台,专注于各种需要快速检测结果并可为临床诊断提供依据的应用领域,如传染病和癌症防治领域。国产PCR2023年10月热度榜就介绍到这里,点击查看更多PCR产品。
  • 耶拿隆重发布TAdvanced基因扩增仪新产品
    仪器信息网讯 2014年9月25日,耶拿公司在上海举办了TAdvanced基因扩增仪新产品发布会暨高分辨原子光谱技术和ICP-MS新技术研讨会。  德国Biometra公司拥有近30年的PCR研发制造和专业服务经验,是欧洲最大的PCR生产商,其红色的TProfessional和TPersonal系列PCR仪,因稳定的性能、结实耐用的设计、超静音的表现在中国拥有大量的忠实用户群。2009年Biometra公司被德国耶拿公司全资收购,在更强大的平台上为客户提供高品质的产品和服务。  TAdvanced基因扩增仪作为德国Biometra PCR家族中的最新成员,于2014年慕尼黑上海生化展期间正式发布。耶拿生命科学部全球总裁Alexander Berka向与会者介绍了TAdvanced高品质性能。耶拿生命科学部全球总裁Alexander Berka  TAdvanced基因扩增仪具有铝合金样品槽,通过独特的设计和电子控制技术,实现银质样品槽才能达到的高效传热效果和快速的升降温速率,节省PCR扩增时间,并获得最佳的扩增效果。仪器拥有专门的恒温孵育功能模块,设置模块温度,热盖温度和孵育时间,即可作为金属孵育器使用。仪器特有静音技术,运行最大噪音不超过45dB。仪器设计有用户特异性快速启动功能。通过程序预览和快速启动功能,用户可快速启动各自曾使用过的程序。  耶拿生命科学部全球总裁Alexander Berka,耶拿中国区总经理赵泰,耶拿生命科学部中国区总经理诸建共同为TAdvanced基因扩增仪新产品揭幕。TAdvanced基因扩增仪新产品揭幕。左:耶拿生命科学部全球总裁Alexander Berka。中:耶拿中国区总经理赵泰。右:耶拿生命科学部中国区总经理诸建TAdvanced基因扩增仪  基因扩增仪新品发布会同期,耶拿公司召开了高分辨原子光谱技术和ICP-MS新技术研讨会。耶拿公司原子光谱资深应用专家杨静,耶拿公司ICP-MS资深应用专家高尔乐分别作了题为&ldquo 高分辨率原子光谱仪最新技术进展及应用&rdquo 和&ldquo 高灵敏度ICP-MS的最新技术与应用的报告&rdquo 。介绍了高分辨率的连续光源原子吸收ContrAA,PQ9000高分辨率ICP-OES以及aurora M90高灵敏度ICP-MS的技术特点及应用。耶拿公司原子光谱资深应用专家杨静耶拿公司ICP-MS资深应用专家高尔乐ContrAA700连续光源原子吸收光谱仪PQ9000高分辨率ICP-OESaurora M90高灵敏度ICP-MS
  • 快讯:908 Devices 和 Terumo BCT合作,为细胞扩增系统添加在线分析功能
    908 Devices是用于化学和生化分析的专用手持式和台式设备的先驱,与医疗技术公司 Terumo Blood and Cell Technologies (Terumo BCT) 宣布合作,对 Terumo BCT 的 Quantum Flex 中的关键工艺参数进行在线监测细胞扩增系统。两家公司的自动化技术的结合将通过提供对细胞疗法研发和生产中最大组成部分之一的监测和控制,帮助推进挽救生命的细胞和基因疗法的开发。细胞和基因治疗研发人员越来越多地寻求自动化来提高制造效率、简化工作流程并降低成本。但如今的质量控制要求研发人员在洁净室里花费数小时执行手动操作,且操作过程中不出现错误或污染,而不是仅在出现问题时才做出响应。908 Devices 正在将其在线葡萄糖和乳酸分析仪 MAVEN(图1) 引入 Terumo BCT 的 Quantum Flex,为细胞和基因治疗开发客户提供在线监测和控制细胞培养物中关键工艺参数的能力,而无需进入洁净室并执行手动采样。这有助于降低污染风险,节省操作员时间并提高他们对过程的理解。MAVEN能在线监测生物反应器中葡萄糖和乳酸的浓度,采用透析膜和生物(酶)传感器的技术原理,其中选择性透析膜在确保罐内无菌环境与非严格无菌的运输缓冲液体系不交叉的情况下实现只透过葡萄糖和乳酸小分子,通过缓冲液的运输到达测量单元,达到不采样分析的效果。而另一个技术核心,测量单元,使用的生物(酶)传感器对分析物具有高度特异性,低浓度下依旧可以保持有效的测量精度。图1:Maven“我们很自豪能与领先的细胞治疗技术创新者合作,以满足生物制药工艺集成的next level,”908 Devices首席执行官兼联合创始人Kevin J. Knopp说,“我们致力于提供设备,使科学家能够获得降低成本和加速进展的见解。”Terumo Blood and Cell Technologies是一家致力于医疗技术产品服务的公司,专注于血液成分、治疗性单采与细胞治疗技术领域的全球综合方案提供商,拥有QUANTUM FLEX细胞扩增系统、FINIA 灌装和完成系统、TSCD -Q无菌接管机等细胞治疗自动化生产设备。Terumo BCT 的 Quantum Flex 细胞扩增系统(图2)是一种紧凑且自动化的系统,旨在满足细胞治疗开发人员从工艺开发到临床生产的整个商业化过程的需求。Quantum Flex 有助于降低污染风险,并实现可重复性和可扩展的工艺规模。它与一系列悬浮细胞、贴壁细胞、病毒载体和外泌体相容。图2:Quantum Flex 细胞扩增系统Terumo BCT 细胞治疗技术全球商业主管 Kathie Schneider 表示:“将我们的 Quantum Flex 平台与 908 Devices 的在线监测相结合,将帮助细胞基因治疗减少耗时的手动步骤,从而减少生产成本和风险。我们将继续与行业专家合作,进一步提高我们的整体解决方案,以解决行业挑战。”
  • 等温扩增,下一个新冠检测“金标准”?获证仪器大盘点
    2022年,新冠病毒“卷土重来”,奥密克戎变异株侵袭国内多地,上海、吉林等地疫情尤为严重。奥密克戎变异株具有传播快、隐匿性强的特点,因而近期本土疫情点多、面广、频发。为控制疫情,提高疫情防控效率,居家新冠核酸快速检测自检已经成为了不可逆的趋势。今年,国家发布《区域新型冠状病毒核酸检测(新冠核酸快速检测)组织实施指南(第三版)》明确推出了“抗原筛查,核酸诊断”的监测模式。目前, 传统的聚合酶链式反应(PCR技术)是新冠病毒核酸检测的“金标准”,最主要用到的技术为荧光定量PCR技术,该方法的优势为灵敏度高、特异性强、稳定性好。但是由于PCR方法核酸检测集中采样接触易感染,需配套洁净实验室,工作繁琐且获取结果时间长,难以实现对病原的现场快速检测。新冠病毒抗原检测通过抗原和抗体结合反应在试纸条上检测,方便快检,通常30分钟内可出结果,能够实现现场快速检测。但抗原检测灵敏度低,易出现假阳性,无法代替核酸检测作为诊断标准。因此,在“抗原筛查,核酸诊断”的现行新冠检测方案之外,是否能找到一种既可靠、又快速的技术方法,以适配除“集采”和“居家自测”以外更多的现场检测场景,如社区门诊、发热门诊、海关等?等温扩增可能是最佳答案。核酸等温扩增技术是指在某一恒定温度、由特定酶作用完成靶标核酸扩增和相关信号检测的技术。相比于PCR技术,等温扩增技术无需热循环,能快速达到实验所需的温度,基于该技术开发的分子诊断系统具有操作简便、检测快速高效、仪器易小型化和易普及等多重优点。经过十多年的发展,目前已有多种等温扩增技术用于分子诊断领域,包括同时扩增和检测(SAT)、重组酶辅助扩增(RAA)、交叉引物放大(CPA)和LAMP离心盘微流控芯片(LAMP-chip)等。基于等温扩增技术的新冠核酸快速检测,将大大提升新冠核酸现场快速检测效率,是对现行新冠检测方案很好的补充。本文对我国用于新冠病毒检测的恒温扩增快检技术和产品进行梳理盘点,以飨读者。目前,已经有多款基于恒温扩增技术的新冠病毒检测产品上市。1、 上海速创全自动恒温核酸扩增分析仪全自动恒温核酸扩增分析仪MA3000(国械注准20213220473)上海速创诊断产品有限公司推出的全自动恒温核酸扩增分析仪MA3000,该产品是一款基于微流控生物芯片技术打造的集核酸提取、纯化、扩增、分析、报告于一体的全自动核酸检测平台。与公司的微流控生物芯片试剂相结合,可以实现多样本、多靶点的微生物病原体DNA/RNA检测。检测通量可达96样本/小时,检测时间在30-45分钟之间,强阳性样本最快可以15分钟出结果(5分钟核酸提取纯化,10分钟扩增出结果)。2、成都博奥晶芯恒温扩增微流控芯片核酸分析仪晶芯RTisochip™ -A 恒温扩增微流控芯片核酸分析仪(国械注准 20173401354) 恒温扩增微流控芯片核酸分析仪(型号:RTisochipTM-A)及配套碟式芯片是博奥研发的快速检测微生物核酸的新平台,博奥将微流控技术与恒温扩增技术结合,可提供 1×24、2×11、3×8三种不同型号的碟式芯片。 博奥同时自主研发和生产了呼吸道病原菌核酸检测试剂盒,与恒温扩增微流控芯片核酸分析仪一起通过国家药品监督管理局的创新审批,并获得三类医疗器械注册证。 性能指标3、上海仁度AutoSAT全自动核酸检测分析系统AutoSAT全自动核酸检测分析系统(国械注准20193220245)原理:采用SAT—RNA实时荧光恒温扩增检测技术,靶标RNA在RT酶作用下逆转录合成一条带T7启动子的双链DNA,T7 RNA聚合酶以这条双链DNA为模板进行转录,每个cDNA分子可以转录出100~1000个拷贝的RNA,合成出的RNA与分子信标结合,发出荧光,可以被荧光检测仪检测到。与此同时,新合成的RNA继续在RT酶和T7 RNA聚合酶的作用下循环逆转录和转录的过程。如此往复,以达到高效扩增的目的。检测通量:90分钟报告第一个样本结果,之后平均2分钟报告一个结果,8小时可检测200样本,24小时可检测500-700个样本;样本容量:可一次性放置80个样本并实现连续上样。4、上海伯杰一体化核酸快速检测系统BG-NOVA-X8一体化核酸快速检测系统(国械注准20213220715)伯杰医疗自主研发的BG-Nova-X8,集成CRISPR技术、磁珠提取、高精度机械臂,42℃恒温扩增检测,快速完成扩增反应,40分钟即可全自动出结果,2021年公司新型冠状病毒2019-nCoV核酸检测试剂盒(恒温CRISPR法)获批上市,国械注准20213400714。5、长光辰英Home Lab便携式恒温核酸扩增分析仪Home Lab便携式恒温核酸扩增分析仪长光辰英自主研发的Home Lab便携式恒温核酸扩增分析仪,基于光信号即时判读技术与环介导等温扩增技术(LAMP)结合,自动判读核酸检测结果。根据产品介绍,Home Lab分析仪搭配新冠核酸快速检测试剂盒(环介导等温扩增法),组成系统化快速检测方案,通过鼻拭子取样,12-30分钟内可完成4个样品的核酸检测,在感染早期即可进行病毒检测。目前,Home Lab分析仪已实现量产化生产,并于2021年末顺利通过了欧盟CE医疗许可认证。6、江苏奇天RAA快检平台系列仪器F1628 恒温核酸扩增分析仪原理:重组酶介导等温核酸扩增技术(Recombinase Aided Amplification)是一种全球领先的分子检测技术,简称RAA技术,该技术利用重组酶、单链结合蛋白、DNA聚合酶在等温(37℃)条件下进行核酸扩增,结合荧光探针实现即时检测,是一种精准、方便、快速的核酸检测技术,实现5-15分钟完成检测输出结果,灵敏度高达到1 拷贝/测试。2020年1月,奇天基因与中国疾病预防控制中心联合研制的新型冠状病毒(2019-nCoV)核酸等温扩增快速检测试剂盒, 实现了8-15分钟快速检测出结果。2021年,江苏奇天新型冠状病毒(2019-nCoV)核酸检测试剂盒(荧光RT-RAA法)获批上市,国械注准20213400656。7、杭州尤思达即时分子诊断系统新型冠状病毒(2019-nCoV)即时分子诊断系统系统基于交叉引物放大(CPA)原理,检测全流程时长约80分钟,通量为2个样本。今年以来,有更多等温扩增核酸检测仪研发成果被报道。据中科院苏州医工所官方网站报道,苏州医工所医学检验室尹焕才研究员联合马富强研究员及相关科研力量,在苏州医工所自主部署项目的支持下,开展了基于LAMP技术(Loop-mediated isothermal amplification,环介导等温扩增技术)的传染性病原体检测系统研制。从特异性引物筛选设计、LAMP反应核心酶研发、高灵敏反应体系构建、到配套便携式荧光检测仪器,进行了全链条部署研究,取得阶段性进展。半小时内完成测试,试剂可常温运输,无需冷链,便于居家、床旁及现场快速检测使用,已初步具备转产条件。呼吸道病原体快速检测系统构成4月,据有关媒体报道,香港理工大学研发的便携式新冠病毒检测仪,利用反转录恒温环状扩增法(RT-LAMP)及金纳米粒子(作为核酸扩增显示剂),已成功进行精准的新冠病毒检测。临床样本测试结果与反转录聚合酶连锁反应(RT-PCR)标准完全吻合。检测仪在25分钟内可以确认新冠病毒阳性样本,整个检测约40分钟内完成,结果亦可凭肉眼辨识。据介绍,检测仪可同时放置六个样本,撇除两个阳性及阴性对照样本之外,可同时检测最多四个样本。采集样本后,即可使用检测仪在现场进行检测,无需将样本送回实验室。香港理工大学研发的“便携式新冠病毒检测仪”
  • 西藏首家临床基因扩增检测实验室通过国家技术验收
    p  日前,记者从自治区人民医院了解到,在中组部医疗人才“组团式”援藏专家的帮助下,该院检验科临床基因扩增检测实验室顺利通过国家卫计委临检中心技术验收,本月21日,国家卫计委临检中心主任陈文祥教授将亲自为实验室颁发技术验收合格证书。这是西藏首家通过国家验收的临床基因扩增检测实验室。目前,该实验室已能开展乙肝病毒DNA检测、人乳头瘤病毒DNA检测,将根据临床需要进一步要开展其他检测。/pp  strong对照技术验收要求/strong/pp  strong提前逐条进行自我核查/strong/pp  随着精准医学和个体化医疗的发展,临床基因扩增检测技术(PCR实验)已成为临床检验领域最热门的技术。该技术对于实验室的技术能力及管理要求极高,临床风险也较高,早在2002年,我国就颁布了《医疗机构临床基因扩增检验实验室管理办法》,并于2010年进行修订,规定,临床机构基因扩增实验室必须经过技术验收,合法开展相关检测业务。/pp  北京协和医院检验科副主任、“组团式”援藏专家邱玲教授介绍,2010年,西藏自治区人民医院就已经开展相关检测,并筹备基因扩增检测实验室验收相关工作。为保证医疗安全,合法开展相关检测业务,2015年10月,在中组部医疗人才“组团式”援藏专家的积极推进和指导下,该院检验科临床基因扩增检测实验室向国家卫计委临检中心正式递交验收申请,并对照技术验收的38条要求逐条进行自我核查,补充了大量性能验证实验、对设备进行校准、进一步完善了人员技术档案等。/pp  strong现场技术验收/strong/ppstrong  实验室达到内地同等水平/strong/pp  据了解,日前,由国家卫计委临检中心主任陈文祥教授和重庆市临检中心主任廖璞教授组成的基因扩增检测实验室技术验收组对该实验室进行了现场验收。通过现场查看实验室布局、环境,核查各类文件及试验记录,审核现场操作过程及现场试验结果等,验收组一致认为,自治区人民医院基因扩增技术实验室已经达到了内地实验室同等水平,并在设备校准、性能验证等方面表现优异。最终,验收组确认实验室的各项管理要素及技术能力,宣布自治区人民医院检验科基因扩增技术实验室顺 利通过现场技术验收。据国家卫计委临检中心获悉,目前专家组已经对整改条款进行确认,正式宣布该实验室通过技术验收,并将于本月21日,由卫计委临检中心 主任陈文祥教授亲自颁发技术验收合格证书。/pp  据介绍,该实验室填补了我区该项领域的空白,对我区合法开展基因扩增检测业务,开展精准医学、个体化医学工作作出了积极贡献。邱玲透露,西藏自治区直属的临床检验中心也已正式获批成立,并挂靠自治区人民医院管理。/pp  strong根据临床需要/strong/ppstrong  将进一步扩大检测范围/strong/pp  自治区人民医院检验科副主任刘治娟介绍,此前,该实验室已开展过乙肝病毒DNA检测、人乳头瘤病毒DNA检测(16型、18型)等检测工作,一周检测标本 70—80个。下一步,该实验室将根据临床需要扩大检测范围,进一步拓展基因扩增检测技术,并增加检测量,合法开展更多临床项目,为传染性疾病、肿瘤及慢性病等疾病进行诊疗服务,如开展丙肝病毒RNA定量检测、沙眼衣原体DNA检测、结核杆菌基因检测等。/pp  相对传统检测方法,PCR检测更快速、更敏感也更精确。刘治娟举例,同样是结核病,如果采用病原学检测,仅结核杆菌培养就需要14天,而采用特定的基因扩增检测技术进行结核杆菌基因检测,一般只需要2小时的时间。/pp  PCR检测如此快速,在进行乙肝病毒检测时,是否还需要进行乙肝两对半检查呢?对此,刘治娟解释,乙肝五项检查的意义在于:检查是否感染乙肝及感染的具体情况,区分大三阳、小三阳,是用来判定是否感染乙肝或粗略估计病毒复制水平的初步检查,侧重于病情的诊断。而乙肝病毒PCR定量检测则为检测诊断提供了新手段,通过此项检测,可以指导选择对症药品,有效避免耐药和盲目用药 同时,可直接正确地测定体内病毒数目,有助于疗效的判定 还可以有效正确检测出乙肝 病毒是否变异,有助及时调整治疗方案,侧重于治疗效果的检验。两项检查都是临床乙肝检查中不可或缺的检查项目,各有各的检查意义,应该区别对待,正确使用。/ppbr//p
  • 140万!特色医学中心核酸扩增仪采购项目
    项目编号:2022-JY05-W1053项目名称:核酸扩增仪预算金额:140.0000000 万元(人民币)最高限价(如有):140.0000000 万元(人民币)采购需求:序号货物名称技术要求计量单位数量采购预算(万元)交货时间交货地点备注1核酸扩增仪技术标准及性能要求详见第二部分套4140.00自合同签订后90天内完成供货北京,招标人指定地点说明1.投标供应商须对所投包内所有产品和数量进行唯一报价,否则视为无效投标。2.投标报价应包括所有货物供应、运输、安装调试、技术培训、售后服务、备品备件和伴随服务等价格。3.投标供应商必须保证所投产品为全新、未使用过的产品。 合同履行期限:自合同签订后90天内完成供货本项目( 不接受 )联合体投标。
  • LLNL发明新型PCR技术 3分钟内完成片段扩增
    据物理学家组织网8月29日(北京时间)报道,美国能源部劳伦斯利弗莫尔国家实验室(LLNL)研究人员最近开发出一种核酸(DNA和RNA)快速扩增技术,使聚合酶链式反应(PCR)的速度大大加快,可在3分钟内将基因组片段扩增10亿倍,迅速识别出病原菌。疾病快速诊断有望很快成为现实。相关论文发表在最近出版的《分析师》杂志上。  PCR技术能让研究人员把一段DNA或RNA复制上百万副本,然后用于基因组测序、基因分析、遗传病诊断、亲子鉴定、法庭鉴定、确定疾病感染等。该过程一般需要1小时到几天时间。然而,快速诊断、应急反应或传染病监控往往要求PCR技术缩短到几分钟。  领导这项研究的工程师雷金纳德比尔和同事克服酶动力学和热动力学方面的限制,用多孔材料和绝热薄膜制造出一种设备,实现了极速热循环,能每秒钟加热或制冷45℃,一次热循环不超过2.5秒。比尔特别指出:“这种设备的独特之处还在于,它制冷的速度和加热一样快。”  开发出这种设备后,比尔和同事从10种商用酶中选出了2种,这2种酶的链式反应速度非常快,将一些参数略作调整,就能使反应更快。  他们用一种肠杆菌属的细菌测试了新的PCR设备迅速扩增DNA片段的能力,然后用一段严重急性呼吸道综合征(SARS)DNA片段演示了设备处理威胁公共健康病毒方面的效果。该设备完成对目标DNA30个周期(10亿倍)的PCR扩增,用时仅为2分18秒。  目前,研究小组正在开发一种实时探测设备。按照他们的设想,将来一台PCR仪器就能完成整个测试,从样本到结果只需10分钟。市场对这种设备的需求将是巨大的,除传统的公共卫生和医疗研究领域,一台简单实用的实时PCR设备在养殖、农业以及食品加工行业都非常有用,可用来保障食品安全。
  • 一文揽尽:荧光定量PCR扩增曲线哪个阶段最重要
    qPCR扩增曲线一般分成四个阶段:基线期、指数期、线性期和平台期。那么每个阶段PCR产物量的变化都有什么区别呢?哪个阶段最重要呢?小编这就一一道来。基线期PCR起始时,刚开始前几个循环的荧光信号还没有发生变化,接近一条直线,将其称之为基线,一般是3-15个循环。在基线期内,扩增的荧光信号被背景荧光信号所掩盖,无法判断PCR产物量的变化。指数期扩增的荧光信号高于背景荧光信号,扩增曲线起峰,开始进入指数期。在指数期内,每个循环积聚的产物准确加倍(假定100%反应效率)。该阶段的PCR反应具有高度特异性和精确度。因为所有试剂均充足,反应的动力学推动反应有利于扩增子加倍,所以产物出现指数级扩增。只有在这个阶段,Cq值与初始模板量的对数之间存在线性关系,所以在此阶段进行定量分析最合适。线性期(高变异性)随着PCR反应体系各成分的消耗,其中的一种或者多种成分限制反应,导致反应开始减缓,并且每个循环的PCR产物不再加倍,该阶段不再是指数级扩增。平台期反应停止,不再产生更多产物,并且如果放置时间够长,PCR产物将开始降解。因为每个样品具有不同的反应动力学,所以每支试管或每个反应将在不同的时间点进入平台期,最终的产物含量也各不相同。由于线性期和平台期的扩增产物已不再呈指数级的增加,PCR的产物量与初始模板量之间没有线性关系,所以也不能通过这两个阶段的PCR产物量计算出初始模板量。想要知道初始模板量的多少,还要依赖指数期的Cq值进行计算。▲ 图1. qPCR 反应的重要阶段如图所示,标准的扩增曲线是呈现S型的。曲线是否符合标准,不仅跟样本起始量、qPCR体系配制、反应程序等相关,更依赖于一套高品质的实时荧光定量PCR系统。对于实时荧光定量PCR系统来说,高度检测灵敏度、高度重复性和高度稳定性,是每一台qPCR仪的追求。高性能的Azure Cielo™ 实时荧光定量PCR系统完全符合以上要求,该系统来自美国Azure Biosystems公司,融合了高品质的帕尔特温度模块和基于光纤传输的光学检测系统,为您的科学研究提供高精准、高灵敏可靠结果。提供Azure Cielo-3通道和Azure Cielo-6通道,可根据实验需求灵活配置。同时配有10.3”触控系统,主机本身可独立运行、连接、远程交互,让您随时随地知悉实验进程和及时获得实验结果。▲ 图2. Azure Cielo™ 实时荧光定量PCR系统高度的灵敏度使用探针法,同时在Azure Cielo™ 实时荧光定量PCR系统和其他品牌产品上检测GAPDH基因,结果表明:A)Azure Cielo™ 实时荧光定量PCR系统对单拷贝基因的检出率更高。B)Azure Cielo™ 实时荧光定量PCR系统的Cq平均值要低于2个Cq。▲ 图3. 单拷贝基因检测对比(n=96)高度的重复性源于优异的孔间均一性。105拷贝数GAPDH模板,GAPDH引物扩增,96孔重复结果。Cq平均值=19.1,变异系数(Cv)=0.002。▲ 图4. 96孔重复扩增曲线 A)线性图 B)对数图 高度的稳定性稳定可靠的温度模块和光学系统,确保仪器连续运行1000轮qPCR实验,数据依然稳定可靠,重复性高度一致。对GAPDH进行检测并连续计算Cq值得出平均值和Cq值的标准偏差。Cq值=22.4+0.01。▲ 图5. 长时间连续工作数据稳定
  • 国产PCR核酸扩增仪10月热度榜(下),采购必备
    小编整理了2023年10月国产PCR仪器热度榜单,收录了10月的热门国产PCR产品,供有采购此类仪器的用户参考。本篇是第6至10名。TOP6、实时荧光定量PCR检测系统品牌型号:天隆科技 | Gentier 96E 价格:30万 - 50万生产商:西安天隆科技有限公司产品介绍:Gentier 96E是天隆科技专为满足高端用户的实验需求而量身定制的一款实时荧光定量PCR检测系统。该款产品具有科学高效的温控系统与光电系统、强大易用的软件分析功能、人性化的操控方式等诸多优势,可轻松实现下游多重基因检测、定量分析、SNP分析、熔解曲线分析等应用。目前广泛应用于各级医疗机构、大学及研究所、CDC、出入境检验检疫局、公安刑侦物证鉴定中心、兽医站、食品企业及乳制品厂等行业。 仪器特点升降温迅速,其中升降速率可达6.1℃/s;高亮免维护LED光源,荧光扫描迅速;10.4英寸全彩触摸屏,设备可脱离电脑独立运行,存储超过1000次实验数据;具有断电再来电时自动恢复实验功能,无需等待PC电脑及软件打开。检测通量96适用耗材0.2ml的96孔板、8联管、单管(透明、磨砂、乳白色均适用)荧光通道数6适用荧光素通道1:FAM、 SYBR Green I、SYTO 9、EvaGreen、LC Green通道2:HEX, VIC, TET, JOE通道3:ROX、Texas Red通道4:Cy5通道5:Alexa Fluor 680通道6:FRET适用探针Taqman探针,分子信标探针,蝎型探针,FRET探针等反应体系0~100μl线性范围1~1010 copies样本检测重复性Ct值CV≤0.5%样本线性/r/≥0.999操控方式单机运行:利用仪器10.4英寸触摸屏及软件系统可新建实验并运行。网络运行:(1)PC直连:仪器通过点对点网络与PC连接后,利用电脑上的应用软件实现实验设置、运行监控、数据分析等操作;(2)局域网接入:通过对仪器的网络参数进行设置,可将仪器接入本地局域网内,从而实现局域网内的任何一台电脑对仪器的运行监控、数据同步及分析等操作。自动样本仓样本仓可由触摸屏控制自动弹出/关闭弹出状态时可轻触样本仓自动关闭断电保护具有断电后再供电时实验自动恢复运行的功能,无需等待PC及软件打开数据传导可通过U盘导入、导出实验数据存储可存储超过1000次实验数据文件光学系统光源高亮长寿命免维护LED光源检测器光电二极管(PD)检测位置顶部激发、顶部扫描检测方式6个荧光通道同时逐孔扫描,无荧光边缘效应检测时长7秒内完成6个荧光通道96个孔位的全部检测激发光波长通道1:465nm 通道2:527nm 通道3:580nm 通道4:632nm 通道5:680nm 通道6:465nm检测光波长通道1:510nm 通道2:563nm 通道3:616nm通道4:664nm 通道5:730nm 通道6:616nm荧光线性r≥0.990荧光检测动态范围荧光检测动态范围可根据试剂调整温控系统热盖温度室温~110℃恒压力热盖兼容不同高度的耗材模块温度0℃~100℃模块控温原理Peltier效应,半导体制冷技术最大升/降温速率最大升温速率≥6.1℃/s 最大降温速率≥5.0℃/s温度均匀性±0.1℃温度准确性≤±0.1℃梯度温度宽度1℃~40℃梯度温度数12列特殊温度设置功能支持热学梯度PCR实验,长片段PCR(Long PCR),降落PCR(Touch Down PCR)软件功能分析功能定性分析、绝对定量分析、相对定量分析、终点荧光分析、熔解曲线分析、SNP分析等报告自定义功能预存多种行业实验报告模板全开放式万能报表功能,用户可自定义报告内容及形式权限管理功能管理员账号可对普通账号的“手动设置阈值”、“运行设置”、“运行实验”、“分析数据”等功能进行限定,实现对普通账号的仪器使用权限进行管理资源共享功能仪器与PC互联后,双方可通过上传、下载等操作实现实验数据同步共享运输锁功能自动检测运输锁状态,并进行锁定/解锁设置故障管理智能判断故障的类型并进行故障管理LIS功能可导出CSV、Excel、TXT等格式开放数据端口,同步支持与LIS系统互联其他信息操作系统Win XP、Win 7、Win10接口类型1个以太网口、1个前置USB、2个后置USB外形尺寸355mm×480mm×485mm(W×D×H)重量30kg输入电源AC220V,50Hz功耗900VA工作环境温度:10℃~30℃相对湿度:20%~85%备注:产品执行标准 YY/T 1173-2010 聚合酶链反应分析仪厂商简介:西安天隆科技有限公司(以下简称:天隆科技)成立于1997年,是一家以市场为先导、产学研为基础、创新驱动为核心、品牌高度自主化的高科技企业。历经二十余年,天隆科技已逐步发展成由西安天隆、苏州天隆、无锡锐奇等多公司组成的跨区域企业集群。公司秉持科技服务大众,客户为中心的发展理念,始终致力于基因检测、分子诊断领域仪器及体外诊断试剂的研发、生产和整体解决方案的提供。TOP7、伯乐CFX Opus 96实时荧光定量PCR仪品牌型号:伯乐 | CFX Opus 96价格:50万 - 100万生产商:伯乐生命医学产品(上海)有限公司(bio-rad)产品介绍:Bio-Rad新一代荧光定量PCR系统,大师之作,品质之选!CFX Opus 96系统是 Bio-Rad新一代实时荧光定量PCR (qPCR) 产品,它进一步提升卓越的温控性能,再配合Bio-Rad专有的精准光梭扫描系统,可使实验数据更加准确和可靠。全新的外观设计更加流畅且前卫;用户界面直观而友好,易于掌握;更多灵活的接入选项,使数据的管理和仪器的操控更加便捷。其主要特点及优势如下:一、精准的温控系统01 具有专利的轻量化样品槽模块,更优异的温控均一性,极大程度的减少边缘效应。02 具备动态温度梯度功能,可高效、快速优化PCR反应体系。二、可靠的光学系统01 光学系统逐一激发和检测每个反应孔的荧光信号,不仅具有更高的灵敏度,还能避免反应间的荧光交叉干扰,同时消除光程差,无需荧光校正。02 自动收集反应模块上所有反应孔的荧光信号,不必担心因编辑错误而丢失数据。03配备荧光共振能量转移(FRET)实验的通道,可扩展实验选择。三、功能强大的软件系统——CFX Maestro01 实现自动化统计学分析—轻松实现包括 t- 检验、方差分析在内的统计学分析。02 创建和导出可发表的图表—图表可注释 p 值,使用文本和箭头标识特定数据;可更改颜色,字体和图例;导出任何高质量的图片用于演示或文章发表。03 轻松整合PrimePCR Assays—利用预设计和验证的PrimePCR引物和反应板可以节省时间。04 简洁的无限多板合并分析、自动识别理想参考基因等多种实用功能。05 通过不同图表进行数据分析和可视化展示,可获得更多有意义的数据信息。06 提供中文和安全版本。四、灵活多样的连接方式CFX Opus 96 系统具有全新、易于使用的交互界面和连接选项,旨在无缝、灵活地集成到您的工作流程中。接入以太网或 WiFi 后,您可通过我们的 BR.io 云平台实现远程操作,也可以在通过PC端运行 CFX Maestro 软件操控设备;凭借灵敏的触摸屏,它还可以在独立模式下运行。该系统可以将您的数据发送到您联网的远程驱动器,或直接保存到USB储存设备。01 以太网连接或直接WiFi连接,实现完全无线的操控和数据存取。02 独立运行且直接将数据传输到USB存储设备或连接输出到个人电脑。03 可通过互联网将实验数据和各种通知直接发送到个人电子邮箱。04 新的网络驱动器数据存取功能还可以将数据直接保存到本地网络文件系统。五、伯乐云平台——BR.io与CFX Opus 系统无缝对接,无需专用电脑,充分利用您的仪器并尽量减少在实验室上的时间,让qPCR实验,随处可行。01 无需将电脑与仪器进行连接即可提供远程设置、仪器运行监视和数据管理功能。02 无需安装软件即可使用,可从任何计算机上访问BR.io云平台。通过云平台可以远程设置实验、运行状态和调取实验结果,从而极大程度的减少操作仪器的时间。03 可以将实验数据安全地存储在云端,然后在任何有网络的地方查看和分析您的数据。六、重新设计的人机交互界面01重新设计的主屏幕可让您轻松命名登录用户、查看仪器连接状态和仪器序列号、活动导航按钮。02通过创建用户配置文件灵活地管理您的文件,无论是否有密码。03直观的文件浏览结构,可以轻松查找文件,并通过公用文件夹共享文件。04不同文件显示不同图标,以便用户识别不同文件类型。05触摸屏非常灵敏,裸手、单/双层手套均能灵敏反馈。06点击时导航按钮的颜色变化以此响应反馈。07 触摸屏角度可调,12-55°本产品仅限科研使用,不作为临床诊断。Bio-Rad 是 Bio-Rad Laboratories, Inc. 在特定区域的商标。厂商简介:Bio-Rad Laboratories, 由 David Schwartz 先生和他的妻子化学家Alice Schwartz 于 1957 年创建,总部位于加州 Hercules。 一直致力于为医疗健康领域提供创新型的实用产品,以帮助生命科学研究人员加速科学探索进程,并促进医疗诊断实验室获得更快更好的研究成果。TOP8、Applied Biosystems ProFlex梯度PCR扩增仪品牌型号:Applied Biosystems | ProFlex价格:面议生产商:赛默飞世尔科技生命科学产品产品介绍:ProFlex™ PCR系统将Applied BiosystemsTM PCR仪所具备的可靠性和高性能与适合当今工作环境的灵活配置和控制特性相结合。具有最为灵活的模块配置,满足不断变化的现代化实验需求。 特点与优点允许多位用户使用——利用三个独立的控制模块同时运行三个实验方便的远程登录——利用免费的手机应用程序和Cloud云服务, 在任何地方连接您的仪器灵活的模块配置——可利用五种类型的加热模块进行优化和通量选择,可支持数字PCR系统适合当前的分析使用——带有热学模拟模式,方便您从旧仪器的轻松过渡使用简单——8.4英寸触摸屏界面简化了仪器控制 VeriFlex加热块 -优于温度梯度的新途径创新的VeriFlex加热块为ProFlex PCR系统提升了PCR功能。六块独立的peltier加热块最大化了PCR的多功能性和灵活性,具备两大重要优点:PCR优化 —— 每一块加热块可独立设置一个特定的温度值,在PCR优化过程实现了精确控温。运行更多实验 ——六块peltier加热块可同时运行多达6种不同的退火温度或同时运行6个引物对,运行多达六种不同的PCR反应。下载Instrument Connect,随手掌控您的PCRInstrument Connect是一款专为PCR实验设计的手机应用程序。您可以下载此程序至iPad、iPhone或Android移动设备上,随时随地了解仪器的运行状态,查看仪器何时可用或您的程序何时结束。此外,通过免费的Thermo Fisher Cloud平台,您还可以在电脑端设计和上传程序文件,并通过cloud分享给你的同事。我们全新的ProFlex PCR系统采用了卓越的创新设计,您可以从办公桌、隔壁实验室、在实验室会议过程中、从您的家中或在您日程安排的任何地方与之连接,检查您的运行状态或自动获取模块可用性通知。 * OpenArray芯片与QuantStudioTM 12K Flex qPCR系统兼容 ** 20k 芯片与 QuantStudioTM 3D数字PCR系统兼容TOP9、赛沛 GeneXpert实时荧光PCR系统GX-IV R2(4通道)品牌型号:Cepheid | GX-IV R2价格: 50万 - 100万生产商:赛沛(上海)商贸有限公司产品介绍:Cepheid® GeneXpert® Dx System 全自动医用PCR分析系统(GX-IV R2)是全自动一体化的核酸检测系统,可搭载1-4个独立的反应模块,采用非常经典的荧光定量PCR(qPCR)技术和微流控技术,将繁琐的核酸检测过程精简为“样本进,结果出”的简单操作,同时又保证了专业实验室水准的检测性能,定义了非专业场景下开展核酸检测的标准。目前已有多款配套检测试剂上市,覆盖感染性疾病病原体、耐药性基因及肿瘤基因等领域,能够即时为临床提供检测依据。产品多次被WHO等组织推荐使用。产品特点:“样本进,结果出”,全自动化流程;减少人为因素影响结果模块化设计,灵活组合,可拓展性强;满足不同发展需求机型美观紧凑,占地面积小,可满足检测场景需求创新的故障管理体系;售后维护简单方便反应物全程密闭自动化处理,生物安全性高搭载多款传染病检测菜单,不断拓展应用领域厂商简介:赛沛是一家总部位于美国加利福尼亚州Sunnyvale的分子诊断公司,致力于研发、生产、销售快速易用的分子诊断系统和试剂盒,帮助改善当前医疗状况。通过将高度复杂且耗时的手工操作自动化,赛沛为不同规模的机构提供解决方案,可以对微生物和遗传病进行复杂的基因检测。赛沛凭借强大的分子生物学平台,专注于各种需要快速检测结果并可为临床诊断提供依据的应用领域,如传染病和癌症防治领域。TOP10、自动基因扩增仪品牌型号:德国耶拿 | Biometra TRobot II价格:面议生产商:耶拿分析仪器(北京)有限公司产品介绍:无人值守 您的PCR实验自动完成自动基因扩增仪 Biometra TRobot II 可与自动化平台整合来实现无人值守的全自动工作流程, 适用于96孔和384孔的样品通量,运行快速、温控精准、运行稳定,三面的开盖方式可匹配各种机械臂实现样品板的轻松取放,加密的数据传输能确保数据的完整性,提供多级用户权限管理,具有断电自动重启、自检等功能,在高通量NGS、大规模群体研究、疾病的全基因组关联研究、高通量分子标记筛选、药物筛选等方面都有很好的应用。 精准温控 温控精准:秉承耶拿公司三十多年的 PCR 研发制造经验,采用先进的Peltier 帕尔贴半导体温控技术,具有超高的温度准确性和均一性,提供快速高效、可靠稳定的 PCR 扩增速度快:运行速度快,不仅节省实验时间,还可提高扩增产物的特异性 型号齐全:有常规通量 96 孔和高通量 384 孔样品槽可选,有快速镀金银槽和常规铝合金槽可选 平整易清洁:样品槽四周平整光滑,无沟槽,极易清洁,不易积灰智能热盖 由于自动化 PCR 仪需要与机械臂配合来实现自动取放样品板,而与人相比,机械臂的灵活性会稍逊一筹, 因此与普通 PCR 仪相比,如何保证机械臂能方便安全地取放样品板,是考察自动化 PCR 仪好坏的很重要的方面。 自动开盖:设计合理巧妙的弧形向上开盖方式,可轻松且安全地自动打开和关闭 PCR 热盖 三面开放:热盖打开后,形成完全敞开的空间,显露出完整的样品槽,既可以从仪器正面取放样品板, 也可以从仪器左右两个侧面取放样品板,实现和市面上各类自动机械臂的完美兼容使用,方便整合进整个自动化平台 防止蒸发:热盖温度达到设定温度后,模块才会升温,确保样品管上方温度始终高于样品温度。热盖垂直向下施压,整板受力均匀,根据 PCR 板的高低不同可精细调节热盖接触压力,不仅有效防止样品蒸发, 还为用户选择 PCR 板提供很大的开放性和灵活性,对耗材没有限制 安全制动:热盖带有安全感应框,碰到阻力会自行中断关盖程序,防止意外发生 经久耐用:无磨损的开关盖方式延长仪器使用寿命,并有助于整个自动化系统的稳定运行兼容多种自动化系统 耶拿公司不仅具有三十多年的 PCR 开发生产历史,还 拥有三十多年的自动化工作站研制经验,在自动化系统设计和整合方面提供专业的产品和服务。 安全取板:经过数十轮的 PCR 循环和热盖高压后,样品板往往会紧密贴合在样品槽中,如果机械臂直接去取板,很难轻易取出。耶拿的自动 PCR 仪,设计了专利性的样品板自动抬离装置,取板前可自动将 PCR 板轻缓平稳地抬离样品槽,方便机械臂抓取 PCR 板并将其 移出PCR 仪,避免卡板等意外的发生 兼容性好:基于合理的三面开放的开盖方式,智能安全的取板设计,以及低矮的仪器高度,占地面积小, 能很好地与各种自动化机器臂配合使用,搭建成全自动 PCR 平台 适用性强:可通过耶拿公司提供的标配软件 TSuite 来独立控制 PCR 仪的自动运行,也可通过预置的驱动 来兼容其他的自动化平台 TSuite 软件提供自动 PCR 仪的全面功能,如创建程序、控制仪器运行、生成仪器运行状态和操作步骤的详细文档等。加密的数据传输能确保数据的完整性,提供三级用户权限管理功能,符合 GMP 规范各种运行和维修日志文件符合 GMP的法规要求,在发生故障时,日志文件还有助于快速排查故障原因仪器可独立运行,因此可通过 TSuite 软件预先优化好 PCR 程序,再整合入自动化系统,简化实验优化过 程 PCR 仪上带有仪器运行指示灯,可通过灯的颜色和状态来直观便捷地了解仪器的状态,无需再去查看软 件界面,非常方便 耗材开放:可使用全裙边或半裙边的 PCR 板,可使用高缘板或低缘板,可使用封膜、硅胶垫或者塑料盖厂商简介:耶拿分析仪器(上海)有限公司成立于2004年,作为Endress+Hauser集团下属德国耶拿分析仪器股份公司的子公司,一直秉持品质非凡,技术领先,服务一流为宗旨。公司坐落于上海市漕河泾新兴技术开发区,从事化学分析仪器、环境检测仪器、生命科学仪器等测量仪器的研发设计、生产、销售和相关技术服务。先后在北京、上海、广州、成都、沈阳设立分公司及技术支持中心,并在省会及主要城市建立售前售后服务网络,为客户提供全方位的支持。国产PCR2023年10月热度榜就介绍到这里,点击查看更多PCR产品。
  • 上海应物所等发表核酸等温扩增技术研究综述论文
    近期,中国科学院上海应用物理研究所研究员樊春海与西安交通大学生命学院教授赵永席应邀在《化学评论》(Chemical Reviews)发表了关于核酸等温扩增技术的综述论文:Isothermal Amplification of Nucleic Acids(Chem. Rev., 2015, 115, 12491)。  核酸等温扩增技术是继PCR技术之后发展起来的一类新型核酸体外扩增技术,能在恒定温度下快速、高效地扩增靶标核酸序列。该技术操作简便、无需依赖专用仪器设备,反应条件温和,可应用于细胞表面甚至活细胞内部,在生物传感(核酸、蛋白质、多糖、细胞、小分子及离子检测)、疾病诊断及便携式医疗、细胞内成像和测序等多个学科领域都具有广泛的应用。  结合研究团队在核酸等温扩增领域的系列研究成果,该论文全面系统地总结了相关技术的发展现状,综述了此类方法在生化分析、生物医学、纳米技术等领域的多方面应用。作为在相关领域首篇全面系统的综述,该论文深入讨论了这一研究领域现存的关键问题和解决方案,并对其未来发展趋势和前景进行了展望,预期将对相关研究领域的发展起到积极的促进作用。上海应物所等发表核酸等温扩增技术研究综述论文
  • 进入食品安全监测领域的微流控恒温扩增仪
    [仪器信息网讯] 2014年5月7日-5月8日,CFAS 2014第三届中国食品与农产品质量安全检测技术国际论坛暨展览会于北京国家会议中心召开。本次会议为期两天,邀请学界与业界的院士、专家、学者、企业家,展会吸引了1500余名业内人士参加,100余家企业参展并展示自己的成果。在本次大会举办的进一步推动和促进国内外食品与农产品质量安全检测技术会上,北京博奥晶典生物有限公司(以下简称:博奥晶典)的成后龙全国产品经理对此次展出的微流控恒温扩增平台在论坛上作了技术演讲,向大家介绍这套平台在食品安全快速检测领域及农产品快速检测应用状况,为更好地了解其技术原理及优势,仪器信息网编辑在现场对博奥晶典的成后龙经理进行采访。 北京博奥晶典生物有限公司成后龙经理  仪器信息网:贵公司这套快速检测平台主要采用什么技术? 成后龙经理:这套平台结合了两个国际先进技术,一个是恒温扩增,一个是微流控芯片技术。恒温扩增技术,不需要传统扩增技术的温度变化,所有反应都在50-60度下完成。微流控芯片技术,是博奥的专利技术,而博奥也是国内唯一具有国际先进微加工工艺的公司。这种微流控碟式芯片具有多指标多样品并行检测、样品及试剂用量少的特点。不仅可以用于食品安全检测,农产品检测还可以应用在医学诊断等方面。   晶芯RTisochipTM-A恒温扩增微流控芯片核酸分析仪及其微流控蝶式芯片 仪器信息网:此款微流控恒温扩增仪是否专门定位食品安全监测领域?相比市场中其他仪器有什么优势?   成后龙经理:这个平台能够很好的满足食品安全快速检测的需要,是一个基于检测微生物的平台,同样也应用在临检,如呼吸道病原微生物检测,以及农业、奶制品、水质等病原微生物的检测。   恒温扩增和微流控芯片这两个顶尖技术相结合,博奥是国内第一家也是唯一一家。大家都知道,传统方法检测食源性微生物呢,一次只能检一个指标,而微流控碟式芯片上的24个检测通道,可以进行多指标多样品的并行检测。通道之间完全隔离,不接触空气,避免了交叉污染。另外,从实验成本控制角度来讲,碟式芯片上每个样品反应量仅需1.4&mu L,相应的试剂用量也减少到了几微升,更符合目前快速检测领域的需求。  恒温扩增技术在食品安全检测方面的实际应用主要都是用来定性,其多个引物的设计能带来更高的特异性,反应快, 实验操作也非常简单,因此很适合快速检测。并且微流控芯片的结构设计有液封的效果,反应液的挥发并不严重,因此具有各检测孔反应均一、结果可控的优势。关于这两种技术的优劣势比较,行业内人士也都比较了解,我这里就不多作介绍,我们的技术创新主要是微流控芯片, 或者说微流控与恒温扩增技术的结合。  仪器信息网:引物是否存在变性的可能?在检测中是否有质控? 成后龙经理:在检测中,我们有设定阳性和阴性对照,由于所有反应池里引物的包埋都是同时以同样的方式进行的,因此我们认为,如果阳性对照可以得到阳性结果,那么其他的引物也是能正常工作的。当然,也可以针对每一个反应池设置阳性对照,但根据我们的大量实验验证结果,这种设置不是必要的。 仪器信息网:在食品检测仪器这个大环境中,你们对恒温扩增仪如何定位? 成后龙经理:如今不管是国家还是我们百姓对食品安全这个问题越来越重视,信息来源也越来越多。食品检测仪器的重要性和多样新就体现出来了。我们博奥晶典的恒温扩增仪可以说是拥有与众不同的技术。微流控芯片可以一次性检测多个样本多个指标。恒温扩增,不需要温度变化。整个检测反应时间最快20分钟就可以出来。所以我们定位在多指标多样本的快速检测,定性分析和半定量分析上。   关于北京博奥晶典生物技术有限公司:   北京博奥晶典生物技术有限公司是依托于博奥生物集团有限公司/生物芯片北京国家工程研究中心成立的一家全资子公司,整合了旗下系统化生物芯片相关的仪器 平台、技术力量、服务团队等优质资源,致力于为生命科学领域的实验室建设提供创新、完善的整体解决方案。公司主营方向:从事以微流控技术为核心的生物芯片 相关仪器平台的搭建及服务,提供领先创新性的技术应用思路、实验室建设及运营、技术支持及培训的整体方案,涵盖了生命科学研究、生物(含食品)安全、临床 诊断等领域。
  • 快速通关有妙招!全自动封闭式核酸扩增分析仪提供海关检测新思路
    近日,北京新闻中心召开科技冬奥专场新闻发布会,重点介绍“科技冬奥”有关情况。本届冬奥会共有200余项技术,500多家单位,超过万名科研人员参与研发,为办好一届“简约、安全、精彩”的冬奥会提供有力保障。而其中也包含了海关科技人员的积极参与和贡献,由中国海关科学技术研究中心会同北京海关、石家庄海关、广州海关、宁波海关、青岛海关所属技术机构等10余家单位联合承担科技部国家重点研发计划“科技冬奥”重点专项项目“冬奥会口岸快速通关智能监管技术及装备”开发60余种传染病快速检测方法、17台套口岸监管装备,部分装备在冬奥会期间在10余个冬奥场馆和海关监管场所测试应用,有效助力了冬奥会口岸快速通关、智慧监管和疫情防控等工作。为进一步推动相关成果应用落地,《中国口岸科学技术》公众号将推出系列报道,对相关成果进行介绍,以供各界参考。全自动封闭式核酸扩增分析仪“科技冬奥”是2022年北京冬奥会赛场外最亮眼的主题,世界盛会不仅为大家呈现了精彩纷呈的体育赛事,也让全世界领略了科技带给北京冬奥会的独特魅力。在当今新冠疫情全球大流行的形势下,为确保北京冬奥会和冬残奥会的安全顺利举办,众多炫酷科技在本届冬奥会赛场内外大显身手,展现了我国科技创新的硕果。针对预防冬奥会期间输入性传染病口岸快速筛查的需求,国家重点研发计划 “科技冬奥”重点专项“冬奥会口岸快速通关智能监管技术及装备”项目,基于微流控芯片核酸检测技术,建立可快速检测25种传染病病原体的现场快速检测装备——全自动封闭式核酸扩增分析仪,由中国海关科学技术研究中心联合海关总署(北京)国际旅行卫生保健中心、北京中科生仪科技有限公司共同研发承担。该装备可在1小时内完成病原微生物样品的检测,对出入境人员、交通工具、运输设备、以及可能传播传染病的行李、邮包、货物等物品进行现场快速检测,迅速识别传染源,防止检疫传染病的传入或者传出。全自动封闭式核酸扩增分析仪及其配套检测卡目前,虽然有多种全自动核酸检测系统能够实现“样品进-结果出”,但具备全自动化核酸提取和实时荧光PCR精准检测能力的大多数仍是“实验室内”桌面型”设备,无法适应现场化的检测要求。CarryOn P1000Q采用高度集成化的设计理念针对以上短板,项目团队通过大量的研发和测试,将复杂的功能结构高度集成于比手掌略大的仪器上,采用快速升降温、超声控制、纯化温控、微型化多通道荧光检测、微流控液路驱动、锂离子蓄电池等模块,实现完善的使用功能和手持式的小型化设计。并采用了微流控技术的一体化芯片设计,将进行样本处理、核酸提取和纯化、荧光PCR反应的体系集成在8cm×6cm的芯片上,替代了传统意义上的实验室功能,使传统的核酸检测时间从3~4小时缩至1小时以内,突破了制约分子检测快速化的关键技术瓶颈,而且全封闭自动化检测过程解决了传统分子检测技术易发生环境交叉污染而难以在口岸现场应用的技术难题。简单的操作流程现场检测替代传统意义的实验室检测本系统凭借简单、便捷、快速的性能特点,全封闭无污染的反应过程以及精准、可靠、直观的实验结果,非常适合应用在冬奥会和冬残奥会等重大国际活动中。如得以最终应用,将大幅度简化通关流程,减少通关人员的等待时间,满足快速通关需求,解决大型国际活动现场快速筛查和确诊技术缺乏的问题。同时,有利于提高我国口岸传染病筛查的效率,更早、更准确地发现传染病携带者,识别传染病跨境传播风险,尽早进行传染病预警,以防止传染病发生扩散,维护国家公共卫生安全和人民健康。这将为疫情常态化下我国举办大型国际活动口岸疫情防控提供新的解决方案,在服务口岸现实需求的同时,也可充分展现口岸公共卫生检疫体系的高效性、准确性和人性化。
  • 科技冬奥:“全自动封闭式核酸扩增分析仪”为口岸快速通关提供新思路
    编者按:近日,北京新闻中心召开科技冬奥专场新闻发布会,重点介绍“科技冬奥”有关情况。本届冬奥会共有200余项技术,500多家单位,超过万名科研人员参与研发,为办好一届“简约、安全、精彩”的冬奥会提供有力保障。而其中也包含了海关科技人员的积极参与和贡献,由中国海关科学技术研究中心会同北京海关、石家庄海关、广州海关、宁波海关、青岛海关所属技术机构等10余家单位联合承担科技部国家重点研发计划“科技冬奥”重点专项项目“冬奥会口岸快速通关智能监管技术及装备”开发60余种传染病快速检测方法、17台套口岸监管装备,部分装备在冬奥会期间在10余个冬奥场馆和海关监管场所测试应用,有效助力了冬奥会口岸快速通关、智慧监管和疫情防控等工作。“全自动封闭式核酸扩增分析仪” “科技冬奥”是2022年北京冬奥会赛场外最亮眼的主题,世界盛会不仅为大家呈现了精彩纷呈的体育赛事,也让全世界领略了科技带给北京冬奥会的独特魅力。在当今新冠疫情全球大流行的形势下,为确保北京冬奥会和冬残奥会的安全顺利举办,众多炫酷科技在本届冬奥会赛场内外大显身手,展现了我国科技创新的硕果。针对预防冬奥会期间输入性传染病口岸快速筛查的需求,国家重点研发计划 “科技冬奥”重点专项“冬奥会口岸快速通关智能监管技术及装备”项目,基于微流控芯片核酸检测技术,建立可快速检测25种传染病病原体的现场快速检测装备——由中国海关科学技术研究中心联合海关总署(北京)国际旅行卫生保健中心、北京中科生仪科技有限公司共同研发承担。该装备可在1小时内完成病原微生物样品的检测,对出入境人员、交通工具、运输设备、以及可能传播传染病的行李、邮包、货物等物品进行现场快速检测,迅速识别传染源,防止检疫传染病的传入或者传出。“全自动封闭式核酸扩增分析仪”及其配套检测卡目前,虽然有多种全自动核酸检测系统能够实现“样品进-结果出”概念,但具备全自动化核酸提取和实时荧光PCR精准检测能力的大多数仍是“实验室内”“桌面型”设备,无法适应现场化的检测要求。CarryOn P1000Q采用高度集成化的设计理念 针对以上短板,项目团队通过大量的研发和测试,将复杂的功能结构高度集成于比手掌略大的仪器上,采用快速升降温、超声控制、纯化温控、微型化多通道荧光检测、微流控液路驱动、锂离子蓄电池等模块,实现完善的使用功能和手持式的小型化设计。并采用了微流控技术的一体化芯片设计,将进行样本处理、核酸提取和纯化、荧光PCR反应的体系集成在8cm×6cm的芯片上,替代了传统意义上的实验室功能,使传统的核酸检测时间从3~4小时缩至1小时以内,突破了制约分子检测快速化的关键技术瓶颈,而且全封闭自动化检测过程解决了传统分子检测技术易发生环境交叉污染而难以在口岸现场应用的技术难题。现场检测替代传统意义的实验室检测 本系统凭借简单、便捷、快速的性能特点,全封闭无污染的反应过程以及精准、可靠、直观的实验结果,非常适合应用在冬奥会和冬残奥会等重大国际活动中。如得以最终应用,将大幅度简化通关流程,减少通关人员的等待时间,满足快速通关需求,解决大型国际活动现场快速筛查和确诊技术缺乏的问题。同时,有利于提高我国口岸传染病筛查的效率,更早、更准确地发现传染病携带者,识别传染病跨境传播风险,尽早进行传染病预警,以防止传染病发生扩散,维护国家公共卫生安全和人民健康。这将为疫情常态化下我国举办大型国际活动口岸疫情防控提供新的解决方案,在服务口岸现实需求的同时,也可充分展现口岸公共卫生检疫体系的高效性、准确性和人性化。
  • 核酸等温扩增技术的应用现状与思考——马学军 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所中心实验室主任
    目前,传统的聚合酶链式反应,简称PCR技术,因其灵敏度高、特异性强和稳定性好被认为是病毒核酸检测的首选方法。PCR技术是一个热循环的过程,整个扩增检测时间较长,需要核酸扩增仪作为辅助工具,因此PCR反应始终受到电力、成本以及空间等因素的制约,难以实现对病原的现场快速检测。核酸等温扩增是在等温条件下的核酸扩增和检测技术,无需热循环仪,等温仪器体积小,实验操作简单,具有快速、准确和易普及等特点,适用于对检测速度要求极高的海关口岸和技术力量、基础薄弱的县乡级基层医疗机构(如发热门诊等),能在短时间内完成培训,使其具备核酸检测能力。本文拟回顾和评论目前国内外主要的核酸等温扩增技术及其在新型冠状病毒核酸检测中的应用现状,并分析核酸等温扩增技术目前应用存在的不足,展望和思考核酸等温扩增技术未来发展前景,供同行参考和批评指正。国外广泛应用的核酸等温扩增技术包括依赖核酸序列的扩增技术(Nucleic acid sequence-based amplification,NASBA)、环介导等温扩增技术(Loop-mediated amplification,LAMP)、重组酶聚合酶扩增技术(Recombinase polymerase amplification,RPA)和将上述等温扩增技术与Cas酶结合的新型检测方法如SHERLOCK(Specific high-sensitivity enzymatic reporter unlocking)和DETECTR(DNA endonuclease-targeted CRISPR trans reporter)等。基于Cas酶的核酸等温扩增技术:等温扩增技术仅对靶标进行高效扩增,还需要指示剂、荧光染料或荧光探针对扩增产物进行识别与报告,识别的特异性往往受到靶标序列及扩增特异性的影响,而造成结果不准确。Cas 酶检测系统作为一种高特异性的核酸序列识别与报告方法,与等温扩增技术相结合,可提高检测结果的准确性。基于Cas酶的附属活性,SHERLOCK和DETECTR两种等温检测方法已成功用于新冠病毒核酸检测。SHERLOCK 采用逆转录RPA和T7 RNA聚合酶对病原RNA靶标进行扩增,得到大量单链RNA产物,最后利用Cas13a在向导序列的介导下与靶序列结合时被激活的附属活性,对体系中的单链报告探针进行切割产生信号,从而对扩增产物进行特异性检测。DETECTR与SHERLOCK原理类似,不同在于其所使用的Cas酶为Cas12,可识别DNA靶标,只需一步逆转录LAMP 而无需转录过程即可对靶标进行检测。SHERLOCK和DETECTR的检测灵敏度均可达到10拷贝/μL,并且均可在1h内完成。但是两者都需要在扩增反应结束后开管进行扩增产物的转移,而且试纸条检测时也需要再次开管,这增大了产物污染的风险和操作难度。为了解决这一问题,一种基于Cas12b的检测方法STOP(SHERLOCK Testing in One Pot)被开发出来。该方法所采用的Cas12b可以在LAMP反应温度(65℃)下保持活性,因此可以无需在扩增结束后开管转移产物,降低了产物污染的风险。并且为了避免试纸条检测时的开管,Joung J 等采用了弹夹式试纸条检测管进行结果检测。国内自主研发主要的核酸等温扩增技术包括实时荧光核酸恒温扩增检测技术(Simultaneous Amplification and Testing,SAT)、重组酶介导扩增技术(recombinase-aid amplification,RAA)和交叉引发扩增技术(Cross-priming amplification,CPA)等。表1 国内等温扩增技术检测新冠病毒核酸试剂比较SAT-RNA捕获探针法:SAT技术配合AutoSAT全自动核酸分析系统可以实现8h内200个样本的高通量检测,可一次性放置80个样品并实现连续上样。SAT-RNA 技术利用RNA捕获探针和分子信标技术在 NASBA 技术的基础上进一步提高了检测的灵敏度和特异性,结合全自动分析系统简化了操作并且提高了检测通量,但是并未能从原理上克服 NASBA 技术反应时间长的问题。此外,该技术仍然需要预先对样本进行常规病毒核酸提取,因此,更适合于检疫检验部门在实验室环境下进行高通量的SARS-CoV-2核酸检测。荧光RT-RAA法:荧光RAA方法可用于检测口咽拭子、鼻咽拭子、鼻拭子、肺泡灌洗液、唾液等样本中的核酸,灵敏度高(注册检报告的灵敏度两批试剂盒可以达到137copies/mL,一批试剂盒达到45 copies/mL)。配套自动化核酸提取仪器和提取试剂盒,加入提取的核酸后,在8-15分钟内完成16个样本的检测,1个小时内完成96样品的全流程检测,检测结果可用便携式等温扩增荧光仪器自动判读。操作简便和快速,检测具有灵活性,可实现随到随检,适合在县级乡镇发热门诊和口岸检测机构进行快速筛查。CPA实时荧光法:逆转录CPA实时荧光法使用了一种一体化全自动核酸检测管。这种检测管整合了核酸提取和检测,通过温度改变熔化各种核酸提取试剂和检测反应试剂之间的有机隔层,控制整个提取和检测反应有序进行。CPA扩增产物采用分子信标进行检测,荧光信号由外部荧光检测设备检测。这种全自动检测管适合疫情暴发初期的现场筛查。LAMP芯片法:基于LAMP和离心碟式微流控芯片法用于包括新冠病毒在内的6种呼吸道病原体检测。该芯片上有24个反应单元和引物预载单元环形排列,反应单元之间由连接通道连接。六种病毒对应的引物分别预载在不同的引物预载单元内,进行检测时,经过核酸提取的样本与反应体系的混合液由加样孔加入,并在离心力的作用下均匀分布进入反应单元,芯片在63℃下反应1.5 h完成扩增,扩增产物采用钙黄绿素显色法进行检测,配合多芯片反应检测仪器,一次可检测16人份的样品。LAMP芯片法实现了多种呼吸道病原体的鉴别检测,适合于医疗机构对有呼吸道疾病指征的患者进行快速分诊处治。利用肉眼观察颜色变化来判读检测结果,虽然降低了对仪器设备的要求,适合在资源有限和经济不发达地区开展核酸检测,然而主观判断颜色变化存在较大个体差异,钙黄绿素等指示剂不具有靶标序列特异性,因此影响结果的准确性。此外,LAMP芯片法尚需传统的病毒核酸提取步骤,限制了检测速度,不适于现场快速检测。曾有文献报道 LAMP 反应体系抗干扰能力较强,可对只经过简单裂解的血样或只经过沸水浴处理的拭子样本直接进行扩增检测。如果能开发出直接检测热裂解咽拭子样本的新冠病毒核酸检测方法,将有利于现场快速检测。目前的核酸等温扩增技术在扩增检测速度、仪器小型化,试剂成本、可视化判读结果等方面比PCR技术有一定优势,但现场检测难以实现,样品前处理(核酸提取)成为主要制约因素。简单的样本处理法若能与等温扩增技术匹配,才能真正缩短检测周期,发挥出等温扩增快速、灵敏、便捷的特点。其次,如何实现单管闭管条件下的多重或多靶标等温扩增检测,并同时具有高灵敏度和特异性,也是亟待解决的技术难题,否则将限制等温扩增技术的应用范围。此外,虽然有些等温扩增POCT(Point-of-care test)技术实现了样品进、结果出的终极目标,解决了核酸提取和等温扩增多重检测难点,具有现场应用的前景,然而目前的产品通量偏低,成本偏高,时间偏长或灵敏度偏低,从而限制了其应用场景。目前Cas酶系统成为技术热点,但是Cas酶系统只是一种特异性的产物检测方法,Cas酶检测系统本身灵敏度不足,必须结合扩增反应才能实现靶标的检测,另外,Cas酶检测系统对报告探针的切割无选择特异性,实现单管多重检测面临技术挑战。• 核酸检测技术的未来发展方向是信息化,小型化,简单化和自动化。核酸等温扩增技术在病原检测中仍不能替代PCR技术,但是弥补了传统 PCR 检测技术设备依赖和检测周期长的不足,极具发展潜力,使得核酸等温扩增技术在现场快速检测、全自动一体化检测等方面展现出独特的应用前景,是传染性病原体核酸检测技术未来发展的方向。微流控芯片作为一种新型的反应和检测载体,可以与不同的等温扩增反应结合开发出小巧便携的床旁检测或即时检测平台,微流控芯片也可以将多重反应整合在一起,实现多样本或者多靶标同时检测。真正实现核酸等温扩增技术的现场应用,还需要考虑仪器的小型化或无仪器的可视化判读,可接受的检测成本,智慧数据传输(如智能手机)和电池驱动装置等。新型冠状病毒疫情在全球流行,由于各国防控情况不平衡,新型冠状病毒或将在相当长的一段时间内与人类共存甚至会成为长期存在的一种呼吸道传播病原体。建议在实际应用层面上可允许采取组合检测方式,如核酸等温扩增技术用于初筛,PCR技术用于复核,可以充分发挥两种技术的优势和特点,满足口岸快速排查,基层发热门诊快速分流的实际需求。同时,鉴于与国外同类技术比较,国内核酸等温扩增技术的原创性和核酸等温扩增新技术产业化方面差距明显,建议设立新技术研发专项,鼓励探索性和原创性研究,重点扶持具有中国自主知识产权的核酸检测新技术的研发和产业化。
  • “小海龟”爆发“大能量”,宝山这家企业推出商用化数字等温扩增系统
    龙年新春来临之际,宝山科创企业在研发创新方面下了一颗“金蛋”。宝山高新园“联东U谷”内的小海龟科技在上海正式推出数字等温扩增系统ISO Digital,标志着数字等温扩增技术进入商用化的新纪元。临近春节,在宝山高新园联东U谷的一幢小楼里,小海龟科技的研发中心实验室里仍然一片繁忙,这些年轻的技术才俊在计算机和实验室设备中专心致志,在反复多次的实验中获得各种数据。小海龟科技是一家立足于基因检测上游仪器与试剂开发的高新技术企业,2015年在宝山创办。小海龟科技的主要产品和服务包括:基因检测仪器、超多重技术及超高特异性聚合酶,并实现从基因检测仪器、超多重技术及超高特异性聚合酶的全链条技术创新。这次推出的数字等温扩增系统,既是小海龟科技自身发展的一次突破,也是为行业发展的一大贡献。小海龟科技推出的ISO Digital系统,成为能够真正大规模商用的数字等温扩增系统。小海龟科技CTO(首席技术官)表示:“这个系统主要聚焦于一些等温试剂盒开发公司,包括一些做等温基础试剂研究的,包括做一些等温产品应用开发的、做精准定量的等温产品的用户需求。另外还有许多做等温研究的科研客户,这款平台(ISO Digital)可以让广大做等温扩增或者数字等温研究的客户有一个标准化的(数字)等温平台直接使用,提高他们的研究效率,大大提高他们研究的成功率。”据了解,ISO Digital平台不仅兼容数字LAMP、RPA等主流的等温扩增技术,还兼容数字PCR(核酸分子定量检测)功能。因此,ISO Digital将切实推动生命科学和精准医学领域的发展,为科研人员和临床医生提供更为先进、高效的技术手段。小海龟科技的ISO Digital平台采用独创的固态油隔水技术,将试剂分隔到芯片上的2万多微腔室内,从而实现等温扩增反应的数字化,并确保每个样本从试剂混匀到液滴生成的时间的严格一致性。
  • 甲型流感疫苗毒株运抵武汉开始扩增培养(图)
    这是保存在干冰中的菌种盒,里面有甲型H1N1流感疫苗生产用毒株(6月17日摄)。6月17日,由卫生部批准、经由世界卫生组织提供的6支甲型H1N1流感疫苗生产用毒株运抵武汉生物制品研究所,并于当天上午在该所实验室进行扩增培养。7月底,将生产出疫苗原液,经过动物实验和临床I、II期实验后,国庆节前有望生产出疫苗。 6月17日,研究人员用移液枪将毒株进行稀释。6月17日,接种结束后,研究人员将毒株鸡胚放入孵箱进行培养。6月17日,研究人员对两支甲型H1N1流感疫苗生产用毒株进行接种培养。6月17日,研究人员将菌种盒通过一个两边有封闭门的“传递窗”,传送至对面的实验室。
  • 上海速创GBS恒温扩增芯片法试剂盒正式获批三类医械证
    继上海速创诊断全自动恒温核酸扩增分析仪获国家药监局三类医疗器械注册证(注册证号:国械注准20213220473号)之后,近日,公司B族链球菌核酸检测试剂盒(恒温扩增芯片法)又获批三类医疗器械注册证(注册证号:国械注准20223401433号)。产品规格48测试/盒、96测试/盒适用仪器上海速创诊断 全自动恒温核酸扩增分析仪(型号:MA3000)产品优势:易操作样本进-结果出 速度快全程检测≤1小时无污染提纯-扩增全封闭 结果准确临床阳性符合率≥97.40%阴性符合率≥98.20%适用人群01 妊娠35-37周进行GBS筛查02 本次妊娠有GBS菌尿03 既往新生儿GBS感染史04 在妊娠37周之前分娩 05 羊膜破裂超过18小时06 分娩体温超过38.0℃07 筛查距离分娩大于5周该试剂盒完全变革了现在PCR检测或培养镜检的范式,可在1小时內全自动地实现“样本进-结果出”的功能,为临床B族链球菌的诊断提供了更高效、更快速、更准确的检测手段。未来,速创诊断将继续秉承“科技为本、人才为先、追求卓越、创芯一流!”的理念,为打造微流控分子诊断领域第一品牌而不懈努力!
  • 荆杰博士团队研发“全自动免疫细胞体外扩增系统”,助力细胞类生物制品临床、科研应用
    第二届中国国际医学转化创新创业大赛总决赛已经落下帷幕,荆杰博士团队研发的“自动化无人细胞培养机器人系统”获得二等奖。据悉,荆杰博士团队拥有世界上首台全自动免疫细胞体外扩增系统的专利权,从而为免疫系统治疗的标准化及工业化奠定了基础。该系统可实现自动化的细胞培养和扩增,在培养细胞数量、所需时间、成本等方面大大优于传统的人工和半自动培养方法,具有规模化、标准化和低成本三大优势。与其他传统培养方式相比,扩增效果提高100-1000 倍,同时节省40-60%的培养液、生长因子和细胞因子,操作界面易操作,培养程序可优化。自动化细胞培养系统利用自主研发的,基于中空纤维管的灌注式生物反应器,细胞可以在模拟人体脉管结构的仿生环境中完成可控的生长代谢过程。赛尚推出的自动化台式ACCS-χ1 细胞培养系统能够为细胞、蛋白和病毒的规模化生产维持稳定、经济和可扩展的细胞培养。通过使用一次性耗材,ACCS-χ1 细胞培养系统显著减少了对空间和人工成本的需求,缩短细胞扩增的处理时间,并且大大降低了细胞污染或人为错误发生的可能性。据了解,浙江赛尚医药科技有限公司(以下简称“赛尚”)是由荆杰博士携自主知识产权在2011 年创立,公司主要生产全自动全封闭细胞培养系统设备及相关周边设备,提供自动化细胞体外培养系统(Automated Cell Culture System)的研发、生产、销售及相关细胞培养技术服务。主要解决细胞类生物制品在临床应用或实验研究中所面临的三个与规模化细胞培养密切相关的问题:劳动密集,耗时的重复细胞培养工作量;高成本的补充生长因子,长时间的细胞培养工作;细胞,病毒和抗体批次制备之间的差异。
  • 全新四通道高通量快速基因扩增仪 ——英国BIBBY 旗下PCRmax 产品
    AC-4是真正多模块完全独立控制的热循环仪。其软件功能包括最近使用程序;不需要浏览文件夹就可快速找到最常用程序;登陆用户的保护协议允许用户通过温度曲线监控每次程序运行状态。AC-4的主要特点 l 高灵活性-可选择任意组合的96孔和384孔模块。l 紧凑-节省宝贵的实验室空间,一个底座具有四个完全独立的模块,不存在网络问题或电缆连接需要。l 样品冷却-适合温度敏感的扩增反应,降低非特异性扩增。l 程序向导-帮您快速设定特定序列,模板源和扩增子长度的扩增。l 在程序运行结束后生成包括运行条件和仪器状态的报告l 温度梯度-各种模块都有,方便温度优化。l USB端口便于检索系统信息和保存和转移传输程序l Android系统10英寸平板操作界面-四核芯片保证出色的响应速度和良好的用户体验。AC-4操作界面采用10英寸的高端和易用平板操作界面,无论您一周做一点实验还是需要多模块仪器做高通量实验,控制界面都提供相同的感觉,操作无碍。关于语特 和 英国Bibby / 德国Miccra / 德国MCART/ 德国CAT / 瑞士Gerber Instruments ( www.youtoolinstru.cn.)广州语特仪器科技有限公司专注于搅拌器/分散乳化机等实验室样品制备等通用仪器, 熔点仪/光度计/冰点仪等分析仪器,以及PCR等生命科学仪器。 作为英国比比(Bibby )在中国南方的首代,广东,广西,四川,重庆,云南,海南,贵州和西藏是我司的服务范围。语特公司也是德国Miccra, MCART, 德国CAT,瑞士Gerber Instruments 在中国的首代。l 英国BIBBY 成立于上个世纪50年代,作为英国最大的实验室科学仪器生产商, 旗下有4个子品牌:Stuart,Techne,Jenway,Electrothermal. 专注于样品前处理等通用实验室仪器(如:熔点仪, 搅拌器, 混匀器,摇床, 培养箱,干浴器/氮吹仪,水浴,菌落计数器, 纯水蒸馏器),分子生物学研究设备(基因扩增仪PCR,荧光定量,杂交箱);分光光度计/超微量紫外等分析仪器,及平行反应工作站相关产品。 l 德国Miccra 成立于上个世纪,是德国乃至全球最专业的分散乳化专家。顶级分散乳化产品从实验室仪器,中试产品到工业设备, 分散头种类组合高达上百种;应用领域覆盖了化工,化妆品,制药,食品,环保等各大领域。l 德国CAT 成立于上个世纪50年代,是德国样品制备仪器方面的专家之一, 以”品质稳定”而闻名。其顶置式搅拌器种类多样,从手持式,教学用,到科研通用型,高粘度型,是CAT的代表产品线。l 瑞士Gerber Instruments 有超过120的历史,是专注于乳食品行业的典型代表。其产品冰点仪, 乳脂离心机, 食品专用PH计, 流出式粘度计等, 风靡欧洲及其它大陆国家。 l 德国MC.ART ,号称实验室小型“机器人”的提供者。其典型代表产品有:全自动分散乳化系统,自动抓取机器人,自动加液机器人,自动封装机器人,自动过滤机器人等实验室自动控制智能设备,以及实验室自动化的定制 。
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