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肿瘤数据分析软件相关的资讯

  • 诺禾致源获得国内首个基于肿瘤NGS数据分析软件的III类医疗器械注册证
    p style="text-align: justify " 近日,CFDA评审委员会批准天津诺禾致源生物信息科技有限公司(下文简称“诺禾致源”)配套的“人EGFR、KRAS、BRAF、PIK3CA、ALK、ROS1基因突变检测试剂盒(半导体测序法)”分析软件上市,这也是国内首个基于肿瘤NGS数据分析软件的III类医疗器械注册证。br/img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201809/uepic/0b7aa31e-a98f-4d98-8c49-a7859e09e5ec.jpg" title="1.jpeg" alt="1.jpeg"//pp/pp style="text-align: justify " “人EGFR、KRAS、BRAF、PIK3CA、ALK、ROS1基因突变检测试剂盒(半导体测序法)”于2018年8月13日获批上市,是基于多重PCR目标区域富集建库与半导体测序的技术体系开发,用于检测非小细胞肺癌患者肿瘤组织中与靶向治疗密切相关的六个基因的突变状态,全面提示患者治疗相关的敏感、潜在耐药及基因共突变信息,筛选适合接受靶向药物治疗的患者。/pp/pp style="text-align: justify " 分析软件主要是配合该已获批的“人EGFR、KRAS、BRAF、PIK3CA、ALK、ROS1基因突变检测试剂盒(半导体测序法)”在DA8600测序仪上使用,临床上用于对来源于人体的福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织样本经半导体测序法测序产出的基因测序数据(包括DNA数据和RNA数据)进行读取和分析,给出非小细胞肺癌相关基因EGFR、KRAS、BRAF、PIK3CA、ALK、ROS1的单核苷酸突变(SNV)、短序列插入或缺失(InDel)突变以及基因的融合(Fusion)信息,并出具检测报告。为临床对非小细胞肺癌选择肿瘤靶向药物治疗阶段提供参考。该分析软件适用于医院、第三方临床检测机构、科研院所和高校对需要进行FFPE样本中的DNA和RNA进行基因突变检测的人,样本分析流程图如下:br//pp style="text-align: center "img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201809/uepic/ff75a7cf-5aae-49d0-b7a8-9f12bebc8bc6.jpg" style="" title="2.jpeg"//pp style="text-align: center "img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201809/uepic/44b64b22-9f6e-42c6-a959-7ed150e13d72.jpg" style="" title="3.jpeg"//pp/pp/pp/pp style="text-align: justify " 软件的特点和优势主要体现在三个方面:(1)分析流程自动化。DA8600产生的数据可自动导入分析软件,搜集DNA的SNV和InDel的检测结果,对RNA数据进行融合(Fusion)基因检测,整合结果生成报告,从而实现测序数据的分析自动化。(2)系统实时监控。对计算机的CPU、内存和SWAP以及磁盘使用量实时检测,避免使用量过大而影响数据分析。(3)效率高。在确保与测序仪的连接速度 10MB/s情况下时,完成一个run的测序数据(文件大小10GB )分析需要的时间<2小时。/pp style="text-align: justify " 性能验证结果显示,对EGFR、KRAS、BRAF、PIK3CA的检测灵敏度可达100%,特异性均在99.24%以上;对于ALK、ROS1融合基因的检测灵敏度可达100%,特异性均在99.74%以上。/pp style="text-align: justify " 诺禾致源的“人EGFR、KRAS、BRAF、PIK3CA、ALK、ROS1基因突变检测试剂盒(半导体测序法)”分析软件的获批将提高检测数据分析的效率和准确度,简化报告出具过程,配合试剂盒使用,将使更多的NSCLC患者接受更全面、精准、快速的靶向治疗相关基因检测。同时,此次多基因检测试剂盒及配套的分析软件系统的获批,更是诺禾致源布局肿瘤NGS分子诊断领域的重要起点。此前,诺禾致源围绕该检测试剂盒进行了一系列的DNA提取备案等,结合此次多基因检测试剂盒和“癌症基因数据处理软件”的获批,诺禾致源实现了从核酸提取试剂盒、建库测序试剂盒、数据分析软件全流程的产品备案及注册,力图为医院提供一站式肿瘤NGS分子病理诊断整体解决方案。/ppbr//p
  • 精准医疗战略规划正在制定 利好大数据分析和肿瘤检测市场
    p  国家卫计委11月30日消息,目前我国正在制定“精准医疗”战略规划,或将纳入到“十三五”重大科技专项中。/pp  精准医疗主要由基因测序等顶尖技术构成,将改变现有的诊断、治疗模式,为医学发展带来一场变革。据透露,我国将研发一批国产新型防治药物和医疗器械,形成一批我国定制、国际认可的疾病诊疗指南、临床路径和干预措施,显著提升重大疾病防治水平,针对肿瘤、心脑血管疾病、糖尿病、罕见病分别制定8-10种精准治疗方案,并在全国推广。/ppstrong  政府高度重视/strong/pp  国家卫计委官员告诉中国证券报记者,本次制定的“精准医疗”战略规划,系国家卫计委会同国家科技部、中国科学院等中央部委,按照中央领导同志的批示,联合一批顶尖科学家研究制定的。/pp  据透露,国家相关部委获悉美国的精准医疗计划后,很快将这一计划专文上报国家高层,高层随即批示国家科技部牵头调研,国家科技部鼓励中国科学院北京基因组研究所在这一领域深入钻研。/pp  关于这项顶尖的科研计划,今年以来政策方连续推出举措:今年3月27日,我国发布了第一批肿瘤诊断与治疗项目高通量基因测序技术临床试点单位名单。4月15日,国家卫计委和科技部组织生物医药等领域专家,同中国科学院等部门共同研讨精准医学研究计划。5月10日,国务院发布《关于取消非行政许可审批事项的决定》,其中第31项是关于取消第三类医疗技术临床应用准入审批,取消的审批项目包括原来由国家卫计委负责的造血干细胞移植、基因芯片诊断、免疫细胞治疗等第三类医疗技术临床应用。/pp  据介绍,在精准医疗领域行动最快的是英国。英国政府2012年发起大型测序研究项目——“10万基因组计划”,即对英国国民医疗保健制度记录(NHS)中的10万名病人的完整基因组进行测序,目标是根据基因组学和临床数据制定个性化的癌症和罕见疾病疗法,并使NHS成为“世界上第一个将提供基因组医学作为日常护理一部分的主流健康服务体系”。迄今为止,英国已经对几百个基因组进行了测序,预计2016年测序完成1万个样本,到2017年完成10万个样本。/ppstrong  大数据分析护航/strong/pp  精准医疗要做到个性、高效及预防,前提是疾病的筛查和诊断。因此,开展精准医疗,首先是要发展基因测序和大数据应用。从精准医疗的过程来看,产业链可以简单分为诊断和治疗两个部分。诊断过程主要涉及分子诊断技术、大数据及云计算的应用,通过对单个患者相关样本的采集检测,并与数据库中相关疾病的资料进行比对,得出相关诊断结果。在治疗阶段则可以根据诊断的结果实行“量体裁药”。/pp  大数据分析将在精准医疗中发挥巨大作用。精准治疗实施的前提是基因测序技术,而基因测序后产生的数据则有赖于大数据的比对分析。一个完全测序的人类基因组包含100GB-1000GB的数据量,这在解读上有很大困难,需要专门的数据库进行数据信息的横向与纵向比对分析。国外很多公司都建立了自己的大型数据库并开发相关的软件进行快速数据分析。例如Myriad genetics公司拥有专有数据库来进行大数据的一体化分析,可用来解释不确定的遗传检测结果。Illumina公司开发出BaseSpace的云计算与存储平台。SevenBridges Genomics在人类基因组排序和分析中综合应用了云计算和NoSQL数据技术,推出EC2、S3和MongoDB等。/pp  A股上市公司荣之联(002642,股吧)凭借在高性能计算和大容量存储方面积累的技术优势,为华大基因设计、建设和维护位于深圳和香港的生物信息超算中心,成功地解决了基因测序形成的海量数据在并行计算和存储等方面的难题。目前,华大基因具备了每秒运行157万亿次的超级计算能力,数据存储量达12.6PB,基因测序能力位居全球第一。/pp  大数据比对分析后所得到的信息,可为个体化药物设计提供指导,实现“量体裁药”。目前众多预测性基因检测项目中最具有实际应用意义的是“药物基因型检测”,即针对人体发病基因片段设计靶向药物,并用大数据分析药物将要产生的反应、药效、敏感性以及副作用的情况,从而筛选出最佳治疗方法和个体化的给药方案。“量体裁药”将在很大程度上减少临床用药不当,提高疗效与降低医疗费用,为未来医学指明方向。/pp strong 肿瘤检测市场先行/strong/pp  国家卫计委医政医管局今年4月公布首批肿瘤高通量基因测序临床应用试点单位名单。意味着肿瘤病种的基因测序得到监管层首肯。/pp  达安基因控股孙公司广州达安临床检验中心及迪安诊断全资子公司杭州迪安医学检验中心入选首批试点单位名单。卫计委指出,将通过试点,做好高通量基因测序技术的验证与评价,逐步完善相关技术规范,提高高通量基因测序技术在肿瘤诊断与治疗方面的应用和管理水平。除上述两家外,入选首批试点的单位还包括中山大学附属肿瘤医院、深圳华大临床检测中心等。/pp  2006年我国第三次居民死亡原因抽样调查结果显示,30年来,乳腺癌死亡率上升了96%,而肺癌死亡率更是狂飙465%。根据《世界癌症报告》统计,2012年中国癌症发病人数为306.5万,约占全球发病的1/5 癌症死亡人数为220.5万,约占全球癌症死亡人数的1/4。对这类恶性疾病的治疗,一方面是加大治疗药物的研发突破,另一方面应从精准治疗角度进行治疗技术的突破。/pp  业内人士介绍,当前的肿瘤治疗正逐渐从宏观层面对“症”用药向更微观的对基因用药转变,实现“同病异治”或“异病同治”,精准治疗已经成为肿瘤治疗的公认趋向。鉴于肿瘤基因测序的市场广阔的前景,继无创产前测序争夺战开展数年后,国内多家基因公司开始进入肿瘤检测市场,开始争夺这块大蛋糕。/pp  此前,肿瘤个体化治疗仅由国家卫计委批准了中南大学湘雅医学检验所、北京博奥医学检验所和中国医科大学第一附属医院,三者皆为政府背景,开展进度缓慢。随着3月底国家卫计委公布了首批肿瘤高通量基因测序临床应用试点后,个别公司已先下手为强。华大基因旗下华大医学的进展最为快速,肿瘤检测即华大医学“生死战略”战略中的“死”战略之一。/pp  华大医学的肿瘤套餐已于近日出炉并正在推向市场,目标客户既包括健康人群、高危人群,也可辅助治疗、预后监控。此套餐涉及肿瘤种类是目前中国市场上最为全面的。健康、高危人群适用于“遗传性肿瘤筛查”,其中包括男性15种、女性16种常见肿瘤的筛查,乳腺癌、卵巢癌、肺癌等常见癌症均在套餐范围内 罹患肿瘤的患者则适用于个体化治疗套餐,定位于针对性用药、预后复发监控等。br//p
  • 扩展数据分析软件工具增强了对2-D DIGE数据组的生物学解读能力
    2005年8月12日英国Chalfont St Giles消息 ——通用电气医疗集团推出了DeCyderTM 扩展数据分析(Extended Data Analysis,EDA)1.0版,―个针对蛋白质组研究市场的先进的软件解决方案。它能对不同数据组进行联合分析,并通过检索公共和本地数据库对结果进行生物学解读。由于增强了新版DeCyder v6.5 DIGE 图像分析软件的分析能力,EDA对2-D DIGE实验分析非常有用。“EDA v1.0是一个功能强大的,尖端的2-D DIGE 软件解决方案,它以一种便于使用的形式提供先进的统计学分析,”GE Healthcare全球市场经理Kumar Bala 说道,“这种有用的分析工具将促进对调控途径的更深入了解,并帮助蛋白质组学研究人员更快更精确地识别区别于正常组织样品和疾病组织样品、以及不同疾病状态和肿瘤类型间的差异蛋白质。”DeCyder EDA采用多变量分析和高级的聚类分析方法,揭示由2-D DIGE实验所得到的实验数据的蛋白表达模式。该软件采用一个“数据组”(data set)作为2-D凝胶分析的基础,将匹配的蛋白点定义为蛋白图谱的一个点群(group),根据实验目的,每个数据组都能以不同方式被展示出来。DeCyder EDA是进行生物学差异分析(Biological Variance Analysis,BVA)的一种理想工具,它能回答的问题有:- 在一个特定的数据组中存在有多少个蛋白点群和样品类别?- 是否有蛋白点表现出类似的表达模式,暗示着共调控作用?- 是否有蛋白质或蛋白表达模式可能是某种生物学或疾病状态的特征?- 是否有特定的蛋白质对开发非侵害性诊断或预后性症状检测有用?- 通用电气医疗集团特别设计的DeCyder软件包是Ettan 2-D DIGE 技术平台的关键组件,可精确检测和匹配Ettan DIGE凝胶的多重荧光图像。
  • 达硕信息推出多款数据分析软件产品
    大连达硕信息技术有限公司(以下简称“达硕信息”)专注企业级数据的分析整合、深度挖掘与商业智能,掌握数据核心技术,提供专业化的数据处理软件产品,个性化的数据整体解决方案,以及平台级的数据整合服务。公司目前推出多款数据分析软件产品,欢迎试用。魔力TM复杂多变量数据智慧化处理软件系统 (ChemDataSolution)科学仪器数据因其高维、高通量与高复杂度的特征,价值密度大,但分析处理的困难度亦很高。食品快检与安全监测、工业过程分析与生物组学研究等众多领域所面临的在线与动态、快速与实时,以及模型共享与大数据分析等诸多问题,对智慧型数据挖掘与深度价值利用提出了现实的需求。与传统的多变量数据分析产品或仪器自带的软件相比,ChemDataSolution系统在复杂情形下的文件夹数据批载入、智能算法流、一键数据处理与多模型分析、同时模型构建、验证与预测、多线程与并行计算以及用户体验等各个方面具有开创性,是分析处理色谱和质谱,尤其是近红外等光谱数据的强大工具。主界面截图 (ChemDataSolution)该系统具有如下的特色与优势: 1、数据分析算法流算法流是指构造包含不同数据处理方法的数据整合与优化流程,设置算法参数,在实际的数据分析处理中,仅需往算法流中添加待分析数据即可获得最终结果,完整保留中间计算结果以备查验,实现更快速便捷,准确智能的分析模式。 2、一键处理与多模型处理因算法流思想可实现数据处理方法的逐级串联与优化整合,将训练集、验证集或预测集同时添加到算法流中,达到一键处理即获得所有分析结果的目的。 3、同步建模、验证与预测在算法流的使用中,用户可分别添加建模、验证与预测数据,系统先构造模型,然后再将验证与预测数据进行相同的预处理或特征选择操作,基于已构建的模型获得计算结果,同样可极大减少用户的操作步骤。 4、智能数据批载入与数据库数据载入是数据分析的基础,实现复杂情形下的数据批载入是实现智慧型数据分析的前提。通过研究不同类型数据结构,尤其是数据自动载入时可能遇到的各种情形,提出数据智能载入的整体解决方案,如数据类型与长度、数据与字符、数据分隔符、化学坐标处理、数据头文件、数据排列方式、数据载入后是否放入已经存在的数据文件中,以及多个数据文件的上述处理方式是否存在差别等。 5、用户体验ChemDataSolution实现了非常人性化的用户体验与功能,比如基于XML技术的参数预设值、保存与调用,用户偏好设置,自定义报表,特别是基于导航栏文件式的数据、图形、算法流与模型结果管理等。 代谢组学小分子化合物快速鉴定软件系统该系统由达硕信息与中国科学院大连化学物理研究所共同开发完成,是未知代谢物定性分析的不二选择。系统融合多级质谱的精确质量数与保留时间信息,实现未知代谢物的多层次鉴定分析。系统主要具有如下功能与特色: 1、完备的代谢标准化合物数据库系统以SOP的方法,在正、负二个电离模式,以及三个不同检测电压下,采用先进的AB SCIEX 5600+仪器,构建2,000个不同代谢物的LC-MSn数据库,同时包含高分辨精确一级和二级质谱,以及保留时间的信息。这也是系统的核心优势之一。 2、定性经验的传递基于LC-MSn分析的化合物鉴定,经验性极强,初学者或者研究生需要花费很大的时间与精力才能基本掌握;而且学生一旦毕业,其定性结果与经验又无法为实验室继续利用,导致学生循环往复,研究组的积累却很是有限。系统通过不同成员构建灵活的扩展库数据库、未知物数据库,本地与局域网互联互通,以及强大的数据库功能,达到这样的目标:“研究生毕业不要紧、定性知识留下来”,“新进实验室不要紧,站在师兄师姐的肩膀上”。 3、多层次定性分析除上述自建标准化合物数据外,系统集成HMDB、Metlin、LIPID MAPS以及MMCD网络数据库,用户可在系统直接批量搜索这些数据库,实现与自建数据库分析结果的比较、融合与定性结果相互补充、扩展。在此基础上,用户可实现自建标准化合物数据库、网络数据库、扩展数据库,以及未知物数据库的综合定性分析,并可在不同数据库所得到的结果间相互比较分析,以获得最可靠的鉴定结果。此外,系统通过先进的样本间数据校正、定性匹配算法、原始数据批载入,批量定性分析,快速丰富查询(如中性丢失等),以及优越的用户体验等功能,实现代谢小分子化合物的快速鉴定。主界面截图 (代谢小分子化合物快速鉴定软件系统)
  • 新型分析软件不断出现 让组学的数据分析不再抓狂
    与其他的组学学科相似,代谢组学的数据收集是个问题,但肯定不是研究人员面对的最大问题。大多数人都同意,更大的问题是弄清楚代谢组学数据集到底意味着什么。幸运的是,不断出现的分析工具正在帮助打破这个瓶颈。  研究人员逐渐懂得,如果你真的想要了解细胞行为,你需要研究代谢物。基因编码蛋白质,而蛋白质作用于小分子。这些分子的存在和丰度,被统称为代谢组(metabolome),反映和影响了健康、营养、免疫系统等。  与其他的组学学科相似,代谢组学的数据收集是个问题,但肯定不是研究人员面对的最大问题。大多数人都同意,更大的问题是弄清楚代谢组学数据集到底意味着什么。&ldquo 数据分析仍是个巨大的瓶颈,&rdquo 赛默飞世尔代谢组学的市场部经理Yingying Huang说。  幸运的是,不断出现的分析工具正在帮助打破这个瓶颈。  光谱图库  代谢组学的数据分析主要分为两个部分:峰值检出(peak picking)和峰值鉴定(peak identification)。峰值检出是利用代表不同条件(如健康和患病)的多个数据库进行筛选的过程,并鉴定出它们之间不同的光谱特征。在这些峰被发现之后,它们所代表的化合物必须被鉴定。  多个软件包可处理第一个问题,包括商业化工具(如安捷伦的MassHunter Profinder,布鲁克的ProfileAnalysis,赛默飞世尔的SIEVE&trade 和Waters的Progenesis QI)以及免费工具(MZmine和XCMS Online)。而一些图库正在开发或已被开发出,以解决第二个问题。  斯克里普斯研究所(Scripps Research Institute)代谢组学和质谱中心的主任Gary Siuzdak谈到,他的METLIN数据库目前列出了240,000种化合物,其中11,600种有MS/MS光谱数据。而人类代谢组数据库(HMDB)有近42,000种化合物,其中1,164种有MS和MS/MS数据。此外还有其他选择,包括ChemSpider和MassBank。  当然,我们不可能收集每个代谢产物的实验数据,加州大学戴维斯分校的Oliver Fiehn认为。目前有太多的代谢产物,而并非全部都有纯化形式作为标准品。&ldquo 在某些时候,你必须预测MS/MS图谱会怎么样,&rdquo 他说。  Fiehn解决这个问题的工具是LipidBlast,它包含200,000个预测的脂类光谱。&ldquo 这很难[做到],&rdquo Fiehn承认,因为与肽段不同,代谢物有各种形状、形式和大小。有了LipidBlast,用户能够将它们未知的图谱与图库进行比较,看看是否有hit,就像DNA研究人员利用BLAST将基因序列与GenBank比较。赛默飞世尔也有个类似的工具,叫LipidSearch&trade 。  阿尔伯塔大学(University of Alberta)的化学教授Liang Li最近推出了一个类似的项目,MyCompoundID.org,以扩展HMDB的用途。MyCompoundID的建立是从HMDB中抽取8,000种代谢物,并计算它们的质量以及经历76种可能的生物转化(如磷酸化、甲基化或D-核糖基化)后的预测光谱特征。这些结果将帮助研究人员缩小未知光谱特征的可能身份。  SWATH采集  代谢组学研究可能是靶向,也可能是非靶向的。对于前者,研究人员设定他们的仪器(通常是三重四级杆质谱仪)来扫描特定的代谢物。而对于后者,仪器扫描特定质量范围内的一切,但只收集高丰度离子的MS/MS碎片数据。  这种所谓的数据依赖的流程是为方便起见而设计的。不过Fiehn认为,它不尽如人意,有时研究人员发现样品之间的特定离子变化明显,但没有被碎裂,因为它是低丰度的。  最近,苏黎世联邦理工学院的Ruedi Aebersold介绍了这个问题的解决方案1,它已被AB SCIEX商业化。这种被称为SWATH&trade MS的策略避开了数据依赖处理,而支持数据非依赖的处理,即所有进入质谱仪的离子都被碎裂和分析。它逐步分析用户定义的分离窗口,重复,并通过计算整理出产生的碎片,从而覆盖很宽的质量范围。  2013年,华盛顿大学的化学家Gary Patti利用安捷伦的6520 Q-TOF质谱仪和定制的R package,在代谢物上应用了一种类似的方法2。据AB SCIEX的高级营销经理Fadi Abdi介绍,AB SCIEX如今正将SWATH技术应用在蛋白质组学上。  用户在TripleTOF质谱仪上收集高速的光谱数据,并利用MS/MS光谱图库来解释它,这与蛋白质组学的方法相似。&ldquo 在数据依赖的分析中,如果您没有触发您的分子,则无法识别它,&rdquo Abdi谈道。&ldquo SWATH允许您收集样品中所有可检测种类的数据,带来更为全面的定量覆盖。&rdquo   通路分析  在研究人员鉴定出有趣的代谢物后,他们需要找出它们在生物系统中的作用。这时就需要通路分析的工具。通路分析让研究人员能够将代谢物定位到已知的生化通路上,为可能的遗传角色及其他代谢物提供线索。  Fiehn的实验室写了一个通路分析的工具,名为MetaMapp,而大部分商业化的代谢组学数据分析包也包含通路分析。赛默飞世尔的SIEVE数据分析包中就有这样的模块,它关联到KEGG通路数据库,而Bruker Daltonics也即将推出它的Compass PathwayScreener工具。  不过,Metabolon(北卡罗来纳州的一家代谢组学服务供应商)的首席科学家Mike Milburn认为,仅仅将代谢物定位到已知的通路商,还不足以看清整幅图像。Metabolon已经完成了约3000项代谢组学研究,每年开展600-700项,半数是科研客户。这些经验使得他们能够看到其他研究人员难以获得的代谢鸟瞰图。  对许多研究人员而言,开始代谢组学流程所需的技能、专长和费用使得外包给Metabolon这样的公司更为常见。但是那些愿意自己承担重任的研究人员也会发现,他们并不缺少计算上的工具。  无论采用哪种方式,Bruker Daltonics代谢组学的市场部经理Aiko Barsch说,&ldquo 我会鼓励新客户进入代谢组学,因为那儿包含了那么多的信息。有那么多新东西有待发现。&rdquo
  • 岛津发布全新IMAGEREVEAL MS质谱成像数据分析软件
    p 近日,岛津公司宣布发布IMAGEREVEAL MS质谱成像数据分析软件。该软件可以不需要任何额外的时间或麻烦,即可从多种角度分析数据,从而简化了数据分析过程。它特别适合用于分析大数据集或者同时分析多组数据。岛津将在9月5日至7日举办的JASIS展会上展示这款软件。/pp style="text-align: center"img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201808/insimg/9aa35697-5099-45a4-9d58-757dd3bbe885.jpg" title="imagereveal_ms.jpg"//pp style="line-height: 1.5em " 质谱成像技术主要用于分析二维图像,这些图像显示了用质谱仪测定的物质的分布情况。近年来,在空间分辨率和质量精度方面的技术进步使得质谱产生了大量的数据,这对数据分析产生了极大的挑战。/pp style="line-height: 1.5em " IMAGEREVEAL MS质谱成像数据分析软件可以通过轻松搜索大量质谱成像数据的功能,从而获得所需信息来解决上述问题,这可显著提高研究效率。该软件包括六种类型的数据分析功能,具有不同的可用功能,具体取决于客户选择的许可证。数据转换器可用于分析非岛津质谱仪测量的数据。/pp style="line-height: 1.5em " IMAGEREVEAL MS软件起源于同九州大学医疗氧化还原导航创新中心的联合研究。自2006年以来,岛津通过提供一系列质谱系统和专门知识,作为合作伙伴参与了该项目。从2012年到2016年,岛津公司与三菱田边制药公司合作开发了质谱数据软件,该软件能够无缝分析从基质辅助激光解吸/电离质谱仪(MALDI-MS)上得到数据。所得到的原型均是IMAGEREVEAL MS软件研发的基础。/ppbr//p
  • 药物热分析讲座 第四部分:全自动软件流程 – 热分析数据分析的有力助手
    药物热分析讲座第四部分:全自动软件流程 – 热分析数据分析的有力助手率耐驰热分析学苑 No.16课程描述分析仪器的应用过程中,软件的作用越来越重要。对于分析软件,基本的要求是直观、操作简便、分析结果可靠。在热分析行业,耐驰公司提供的AutoEvaluation 和Identify毫无疑问是里程碑式的软件工具。它们提供的自动分析、自动识别和检索功能是业界绝无仅有的。对于DSC和TGA用户来说,这些工具不但节省时间,而且极大地减少了人为因素的干扰,使分析结果更为可靠。AutoEvaluation是业界第一个自动分析软件。它可以自动检测并分析热效应,无需人工干涉。例如可以使用此功能分析包含多个吸热、放热峰的DSC曲线。Identify是一个图谱检索和数据库系统。使用者通过几次鼠标点击就可以完成数据库检索。目前系统标配的数据库中包含了1200多条参考曲线,其中也包括了药物和有机物的数据。而且,Identify也可用于质量控制。本次课程将介绍如何使用这些软件工具,或者说NETZSCH的软件系统如何能帮助使用者提高日常测量的效率及可靠性。课程安排时间 2018年12月13日,星期四,10:00-11:00 上午,北京时间授课语言 中文设备软件 台式机、笔记本:在初次点击链接进入会议室时,链接会自动引导安装Go to Webinar软 件,并加入会议; 手机、平板电脑:需事先下载安装Go to Webinar客户端软件,后输入会议ID加入。
  • 麦克推出交互式数据分析软件MicroActive
    MicroActive-美国麦克仪器创新交互式数据分析软件 麦克仪器公司创新的MicroActive数据分析软件,允许用户以交互方式评介由麦克仪器公司的ASAP 、TriStar和Gemini气体吸附仪获得的等温线数据. 可直接处理吸附数据,用户可以方便地获得或排除数据,满足实验获得数据点的范围的需要。交互式数据处理,最大限度地减少指定计算参数使用对话框以及打开对话框需要的通道,用户可准确、高效地确定其材料的表面积和孔隙度。通过简单的移动计算条,可立即更新成新的图表。一键式访问重要参数,使用户能够专注于结果,而不是参数。不需要生成报告查看结果-界面显示交互式图表。 屏幕布局设计提供了一个用户友好的界面。可迅速在用户选择的实验数据界面和传统的高级或者基本界面转换。等温线可用线性刻度或者对数刻度显示,可用于任何计算模型。软件包含很多气体吸附模型-所有模型均使用等温线数据。数据报告包含等温线、BET比表面积、Langmuir比表面积、t-plot、BJH吸附和脱附曲线、Horvath-Kawazoe、DFT孔径和Dubinin。如有需求,请拨打400-630-2202或者登陆我们的网站:www.micromeritics.com.cn更多详细资料请登陆:http://www.micromeritics.com/Product-Showcase/MicroActive-Interactive-Data-Analysis-Software.aspx公司简介: 美国麦克仪器公司是世界上第一家将自动表面积分析仪、压汞仪以及沉降式粒度分析仪投放市场的公司。公司主营产品为研究级全自动比表面积与孔隙度分析仪、多站比表面积与孔隙度分析仪、快速比表面积与孔隙度分析仪、流动气体法比表面分析仪、程序升温化学吸附仪、化学吸附仪、压汞仪、高压吸附气体吸附仪、蒸汽吸附仪、密度测量、颗粒技术和颗粒形态分析仪等各种材料表征仪器。
  • 沃特世和PREMIER Biosoft合作推广多聚糖数据分析软件
    强强联手应对生物制药分析的苛刻要求 盐湖城, 犹他州 - 2010年5月24日沃特世公司(WAT:NYSE)今天宣布已经与PREMIER Biosoft国际公司(帕洛阿尔托,加州)达成协议:双方携手推广该公司的SimGlycan软件以及沃特世质谱分析方案,用于多聚糖和糖肽分析。根据协议,沃特世将继续销售和支持其多聚糖质谱分析方案,而PREMIER Biosoft公司则将其软件卖给将使用沃特世SYNAPTTM和XEVOTM质谱平台进行多聚糖和糖肽分析的客户。通过利用PREMIER Biosoft的SimGlycan数据分析软件来扩展沃特世分离科学产品、质谱仪和超高效液相(UPLC)色谱柱方案,可以帮助生物制药企业获取生物药物关键信息,这些信息对于了解该药物的稳定性和安全性至关重要。糖基化的重要性引起了FDA法规的关注和监管多聚糖是随蛋白质翻译后连接在生物药物如蛋白质、多肽或单克隆抗体上的支链多聚糖分子。细胞中多聚糖加成和成熟反应的最终结果是不均匀的生物药物修饰,而不同的糖基化形式可对生物药物的有效性和安全性产生不同的影响。因此确定生物药物的糖基化位点和多聚糖的糖型及数量对于评价药物的有效性和安全性是必须的,由于存在各种不同的复杂多糖结构,对分析技术提出了很高的要求。另一方面,糖基化的一致性与否通常被作为一个灵敏度很高的标志,以此来判断制药公司是否对生物药物生产过程进行了有效的控制。为此,美国食品药品监督管理局FDA和其它法规机构也提出了相应的指导原则,要求对蛋白质药物糖基化进行更为严格的控制,这将使生物制药行业针对分析技术进行更大的投入,以便更好地分析和了解复杂的生物治疗药物。 关于沃特世的UPLC多聚糖分析方案沃特世UPLC多聚糖分析方案由ACQUITY UPLC BEH多聚糖分析专用色谱柱配合带荧光检测器的ACQUITY UPLC系统组成,用于分析2-氨基苯甲酰胺(2-AB)或其它荧光试剂标记的生物药物经酶处理后得到的多聚糖混合物。UPLC多聚糖分析方案提供比HPLC方案更好的分析结果,具有重现性好、分离度高、灵敏度高且分析速度快的特点,能够帮助实验室分析检测多聚糖的同分异构体(质量数相同、但保留时间不同),进行不同种类多聚糖如高甘露糖、中性以及唾液酸化的多聚糖分析,并同时对相对丰度很低的多聚糖进行分析(相对于其它多聚糖来讲)。沃特世UPLC多聚糖分析方案配合沃特世质谱仪器使用可以对多聚糖结构进行确证。作为MS/MS数据分析的工具,SimGlycan软件可预测蛋白质分子上的多聚糖结构、对其进行评分并生成一个与得到的质谱图信息最接近的可能的多聚糖列表。SimGlycan数据库是一个巨大的包含8,553种多聚糖信息的关系型数据库,并持续不断地更新其它新发表的多聚糖信息,可支持糖肽和多聚糖分析。 关于PREMIER Biosoft国际公司(www.premierbiosoft.com )成立于1994年,由计算机科学家和生物学家领导,专注于制造用于生命科学研究的最尖端的直观软件。该公司的目标是研究生命科学中最新的创新型技术并将其转化为软件产品以辅助研究。关于沃特世公司(www.waters.com )50年来,沃特世公司(NYSE:WAT)通过提供实用且可持续的创新,实现了全球医疗保健、环境管控、食品安全、水质监测等领域的显著进步,为基于实验室的许多机构创造了商业价值。 沃特世的技术突破和实验室解决方案开创了分离科学、实验室信息管理、质谱技术和热分析的相互组合,为客户提供了一个持久成功的平台。 沃特世公司2009年的收入达15亿美元,员工人数达5,200人;公司正在帮助全球客户推进科研进程,并为其提供绝佳的操作体验。
  • 速来!活体成像小动物模型开发+数据分析干货分享,锁定iSAI2024
    动物模型在临床前抗肿瘤药物评价体系中发挥着重要的作用。肿瘤动物模型的建立为研究肿瘤发生与转移的机制、筛选和评价抗肿瘤药物的药效提供了有力的工具。一般啮齿类动物小鼠,因为其具有繁育速度快,成本低,可进行基因修饰等诸多优点,基于其构建的各类肿瘤模型构成了临床前治疗性药物筛选的主要工具,而小动物活体成像数据分析被称为连接医学影像与生物医学的重要桥梁。仪器信息网将于2024年6月6日举办“第一届小动物活体成像技术与前沿应用”主题网络研讨会(iSAI2024),全日程现已公布(点击查看)。精彩报告提前知晓!本文为【动物模型开发/数据分析篇】,大会当天将由上海南方模式生物科技股份有限公司经理/副研究员慈磊博士与中国科学院高能物理研究所高级工程师聂彬彬博士两位嘉宾分别就活体成像小动物模型的开发、动物脑成像数据分析及应用展开报告,欢迎踊跃报名参加在线直播!参会报名链接二维码:https://www.instrument.com.cn/webinar/meetings/sai240606.html ——03 动物模型开发/数据分析篇——关键词:基因工程小鼠、脑影像数据分析慈磊 经理/副研究员上海南方模式生物科技股份有限公司个人简介:南模生物工业客户部经理,副研究员,同济大学生物学博士,已授权发明专利5项,发表SCI论文10余篇。主要从事小鼠疾病模型构建以及药效评价研究,具有多年肿瘤以及自免类药效模型构建及CRO服务经验,目前负责主持南模生物各类抗肿瘤以及炎症类药物临床前研究项目。大会报告:活体成像小动物模型的开发与应用通过构建报告基因小鼠模型,利用小鼠特异性启动子调控荧光素酶报告基因的表达,结合光学成像系统实时采集小鼠发出的荧光信号,进而追踪活体小鼠中该内源基因的表达。该基因工程小鼠不仅有助于建立针对治疗药物的临床前筛选平台,还可以明确这些基因表达的细胞类型,具有基础科研和临床应用的双重价值。聂彬彬 高级工程师中国科学院高能物理研究所个人简介:中国科学院高能物理研究所,高级工程师,课题组长。中国图学会医学图像与设备专业委员会秘书长;中华医学会核医学分会神经学组委员;中国生物医学工程学会放射学会青年委员会委员。多年来主要从事医学影像数据分析方法的研究及应用工作,作为课题负责人承担了国家自然科学基金四项,中国科学院青年项目一项;作为主要参与人参与了中国科学院先导专项一项,973课题两项,发表SCI论文百余篇。其建立的动物脑成像数据分析平台能够对多种成像模态的猕猴,树鼩,大鼠,小鼠的脑成像数据进行不同的数据处理,该软件平台于2014年起通过邮件注册的方式对外发布,截至目前,已经有150余家国内外单位注册使用。大会报告:动物脑成像数据分析及应用磁共振成像技术和正电子发射断层成像技术能够对动物进行在体成像,能够在正常的生理状态下观察动物的脑结构形态、脑功能活动、脑白质纤维束形态及走向等等,在重大脑疾病的发病机理、药物评估中具有不可替代的作用。脑影像的数据分析是连接医学影像与生物医学的重要桥梁,该报告主要介绍了动物脑成像研究中常用的数据分析方法及应用示例。点击获取稿件提纲为帮助广大实验室用户及时了解小动物活体成像前沿技术、创新产品与解决方案,增强业内专家与仪器企业之间的交流学习,仪器信息网特别组织策划“小动物活体成像技术” 主题约稿活动。欢迎投稿,投稿文章一经采纳,将收录至【小动物成像技术】专题并在仪器信息网相关渠道推广。投稿邮箱:刘编辑liuld@instrument.com.cn电话联系:13683372576(同微信)。
  • 珀金埃尔默Genomics采用BioDiscovery软件为其基因组数据分析服务
    p  仪器信息网讯 BioDiscovery近日宣布 PerkinElmer Genomics采用BioDiscovery的NxClinical的软件为其基因组数据分析服务。/pp  该软件能够使PerkinElmer Genomics从全基因组测序、全外显子组测序和靶向面板中提供快速而准确的拷贝数变异信息。该产品集成了从微阵列和下一代测序技术中获得的拷贝数数据、序列变体和等位基因的变化,同时允许在单一平台无关的系统上对基因组变体进行联合分析和解释的特点。/pp  BioDiscovery总裁Soheil Shams在一份声明中表示:“作为遗传和基因组测试领域的领导者,PerkinElmer需要全面且独特的数据分析解决方案,比如利用分析NGS数据来进行CNV调用。NxClinical融合了多种技术和平台,能够解释从单个核苷酸到大拷贝数变化的基因组变异。”/pp  PerkinElmer Genomics的副总裁兼CSO Madhuri Hedge表示,PerkinElmer已经将NxClinical整合到其CNGnome测试管道中,用于检测整个基因组中的大量拷贝数变化,并对结果和整个工作流程的效率表示满意。”/pp  BioDiscovery还宣布,其软件工具旨在帮助临床研究人员,而不仅仅用于初级诊断。/pp  目前该交易的财务条款尚未披露。/pp /p
  • Molecular Devices 快来注册!变身酶标达人——MD第15期酶标仪应用操作/软件数据分析指导网络讲堂
    您是否刚接触酶标仪苦于不会操作?您是否在使用过程中碰到难题苦于无人指导?面对庞大的数据,您是否苦于不会通过软件进行有效处理及分析?如果您拥有了一台多功能酶标仪,您是否已经对其多种功能和应用都有开拓并好好利用? 如果您的回答是肯定的,如果您想变身酶标达人,那就快来注册参加Molecular Devices酶标仪应用操作/软件数据分析指导系列网络讲堂!每月一期,期期精彩! *会后我们将抽取5名全程听会的用户赠送一份精美小礼品*第15期: 轻松探索细胞通路研究那些事儿 日期:2016年7月27日,周三 时间:上午10:00-11:00(北京时间) 复制打开下方链接注册参加 http://go.moleculardevices.com/l/83942/2016-06-29/54fl85?cmp=70170000001DVf5本期导读: 细胞信号转导在诸如增殖、分化、程序性死亡、转化等细胞活动的调控中都扮演了至关重要的角色。信号转导调控的异常会导致很多人类疾病甚至癌症,但是多数情况下探索细胞的通路过程时需要借助于多种不同的检测工具(如酶标仪、Western Blot成像分析仪、流式细胞仪等)以及不同的方法(荧光成像,细胞活力、增殖和凋亡检测,Western Blot,DNA定量等)。 为了能够获得更完善和精确的信息,通常情况下,研究人员必须要借助于多种不同仪器来获取所需的结果,此过程需要学习多种不同的软件。想要轻松探索细胞通路的奥秘,且看如何仅利用Molecular Devices推出的SpectraMax i3x多功能微孔板检测平台和各种先进试剂,来进行细胞学相关信息全面收集。 主讲人:尹迪,产品经理 美谷分子仪器(上海)有限公司 产品咨询热线: 021-3372 1088 售前服务邮箱: info.china@moldev.com 售后服务邮箱: support.china@moldev.com 官方网站: www.MolecularDevices.com
  • 日本岛津推出基于AI开发算法的数据分析辅助软件
    日前,岛津制作所推出了三重四极杆液相色谱质谱联用仪(LC-MS/MS)用可选软件“Peakintelligence”,该软件搭载了利用AI(人工智能:Artificial Intelligence)开发的算法。 本产品可在利用LC-MS/MS与“一次代谢产物方法包”或“细胞培养分析方法包”※1进行分析时,自动检测出画面上频繁出现的峰※2。以前凭借操作员目视确认的工序交由软件完成,实现了研究现场的工作方式改革。本产品是与富士通株式会社、株式会社富士通研究所联合研究开发※3的。 被广泛应用于疾病早期发现和食品农残检测等各种用途的质谱分析仪,随着仪器的不断进步,所采集的数据量越来越庞大。因此,在对仪器采集的数据进行分析时的“峰积分”※4作业成为检测过程中的瓶颈。由于大量的峰检测需要目视确认,故难以做到全部自动化,往往需要花费很长时间的峰积分也成为了沉重的负担。此外,因人为失误或者习惯不同,导致每位操作员的操作精度也参差不齐,加之不能排除被人为篡改的可能性。在医疗和新药开发等生命科学类研究现场,“排除人为因素的高精度峰积分自动化”成为急需解决的课题。 自2016年起,岛津制作所与富士通、富士通研究所联合开展有效利用AI进行峰自动检测技术的研究。本公司承担“弥补teaching data※5不足部分的数据生成技术”研究,富士通与富士通研究所承担“学习熟练操作员分析技巧特征提取技术”研究,生成的7万个teaching data通过Deep Learning(深度学习)功能进行学习。联合研究结果显示,与熟练操作员的目视?手动处理相比,AI实现了误检测率7%,未检侧率9%的高精度检测,因此,此次“Peakintelligence”得以发售。 可选软件“Peakintelligence”虽然是为LC-MS/MS中的生命科学领域(一次代谢产物、细胞培养)而研发的,但将逐步扩大应对机型与应用领域。今后,我们仍将继续开展AI技术研发,利用AI技术,努力提高使用本公司产品的所有分析仪器用户的工作效率。※1 方法包:以产品的形式提供将分析条件与预处理程序等进行优化的“ready-to-use”特定用途分析相关信息。与在用户关注度高的领域有实际业绩的研究人员联合研发。※2 峰:表示从质谱分析仪采集的数据(图表)的波形(峰)。其高度和面积表示化合物的含量。※3 联合研究:开发时,从大阪大学研究生院工学研究科福崎英一郎教授、该研究生院信息科学研究科松田史生教授获得了研究人员需要的输入量和技术性建议。岛津制作所与大阪大学设置了“大阪大学岛津分析创新联合研究讲座”,推进以代谢组学为中心的分析技术的开发与应用。※4 峰积分:确定峰的起点和终点,定义峰的工序。一般的软件都是设置参数以期实现自动检测,但部分峰需要操作人员目视确认、校正。※5 teaching data:进行深度学习网络时的数据。录入网络的数据和与此相对应的预期输出为一组。在本技术中,为分析仪的输出数据和与此相对应的熟练操作员的峰积分结果的组合。新产品的特点1.与熟练操作员相媲美的AI算法分析精度AI开发的算法(搭载在本产品上)与现有软件的分析结果相比较,与熟练操作员分析的一致率前者为93.8%,后者为87%(1个样品中含100种分析对象化合物,分析14个样品的情况)。“Peakintelligence”可完成与熟练操作员相媲美的高精度峰积分。2. 分析时间缩短至三分之一同样的,AI开发的算法和现有软件,对在“峰自动检测与目视校正”上所花费的时间进行比较,在上述条件下,前者为6.3小时,后者为18.1小时。峰积分所需的时间缩短至三分之一。由于该作业需要耐心和注意力集中,所以,对操作员来说是一种巨大的负担。而如果使用“Peakintelligence”,不仅可以实现研究现场的工作方式改革,并且,用户也能更加专注于创造性工作。3. 第一次采用订阅版方式作为本公司的软件产品,第一次采用了订阅版方式。以一年为单位(定价250万日元)出售使用许可,用户可根据研究计划灵活利用。此外本公司还准备了90天的演示版使用许可。
  • 【我与近红外的故事】曾仲大:近红外数据分析之路
    p  span style="font-family: 楷体,楷体_GB2312,SimKai "strong随感:/strong“我与近红外的故事”征文近一年了,看过许多老师情真意切的表达,真是把乐趣融入到了近红外的研究与应用之中,也更加深切地感受到同行们对国内近红外发展的使命感和责任感。而自己与近红外的故事,几次动笔却都没能写下几个字。时间肯定不是借口,惰性真是害人啊。好在拖到春节,总算能静下心来了。就像与近红外的相遇相知,既是机缘巧合,更是某种必然吧。/span/pp  初识近红外,都是博士毕业一年以后的事了。那时已经在香港理工大学周福添教授课题组从事博士后研究一年多了,主要方向还是老本行-化学计量学基础算法研究,解决中药和代谢组学等复杂体系分析中的数据处理问题,从GC-MS,LC-MS到中药指纹与药物活性关系。一次Daniel MOK博士找到我,询问是否有意愿到陈新滋院士课题组从事中药质量分析与鉴别方面的工作,陈院士那时是理大副校长(后任香港浸会大学校长,现受聘中山大学教授、学委会主任),研究组的条件与学术水准自不必说,就这样幸运地开始了近二年的近红外数据分析之旅。/pp  对香港熟悉的朋友一定对其大街小巷的名贵中药材印象深刻,尤其是弥墩道,应该是内地赴港旅游人士的必经之地吧,一是去旺角购买电子产品的旅游大巴必定经过这里,另一方面则是这条大道两旁大大小小的中药材店。记得第一次见到时,很是疑惑哪来的那么多冬虫夏草、燕窝和野生人参?说回到陈院士负责的这个研究课题,由香港赛马会中药研究院提供500万研究经费,对包括上述中药,以及石斛、灵芝、阿胶等在内的30味名贵中药材进行质量鉴别分析和研究,目的是帮助那些大街小巷的药材经销店铺,中间批发商,甚至普通消费者,以快速、经济、简便的方法识别药材真假,甚至质量等级。这些药材大多价格不菲,若能够有效识别真假,其商用价值可想而知!顺便一提,香港赛马会中药研究院很多年前已经解散,个中原因无法深究,但在目前国家大力践行中医药研究开发与应用的今天,这也算是一件憾事吧,包括设想中的香港国际中医药中心。/pp  说到这里,近红外分析可以派上用场了!无论是十年前,还是十年后的今天,应没有什么分析技术比近红外更适合完成这项使命,综合考虑时间效率、分析成本,亦或是平衡多重因素影响下定性定量分析结果的准确性!记得当时我们使用的是FOSS公司的XDS快速含量分析仪(Type XM 1100 Series),以及Polychromix手持式近红外分析仪(Model: 1600-2400)。由于项目定位于实际应用,需要适应不同场合下的快速分析,对数据分析本身的要求同样也是比较高的,比如涉及模型传递,尽可能简化数据分析的过程及对使用者的要求,亦确保结果的准确可靠性。基于此编写了功能完备的近红外数据分析软件系统,一站式地完成近红外数据分析的完整流程,从各种各样的预处理方法到特征选择,再到定性定量模型的构建、评价与验证预测,以及模型传递等。/pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201706/insimg/137c0a6d-7548-46ef-beea-f984cce33ba7.jpg" title="2_副本.jpg"//pp style="text-align: center "中药质量分析与鉴别项目中用到的近红外分析仪 (图1和图2)。/pp  说实在的,那时对化学计量学的多元校正方法并不是特别熟悉,我的整个硕士和博士研究,都是多元分辨方向,也就是如何从中药和烟草等复杂体系分析的联用仪器数据中,发展“数学分离”的方法,获取化学纯组分的定性定量信息,即纯组分的光谱和色谱信息。幸运的是,得益于在梁逸曾教授研究组六年时间里耳濡目染的学习,比如许青松教授对统计分析的讲解,杜一平教授的QSAR研究等等,使得我无论对复杂数据的理解,还是化学计量学方法的应用与发展,都有足够基础支持我去解决近红外数据分析中遇到的各种问题。在香港的几年时间里,梁教授每年也都会利用假期去香港一段时间,与香港同行合作交流化学计量学及其应用方面的成果,更是继续指导我解决研究中遇到的实际难题。每每想到这些,总会浮现与恩师相处过程中的点点滴滴。至于上面提到的中药质量分析研究项目,我们对包括阿胶、珍珠、川贝母、藏红花、黄连在内的多味中药进行了深入分析研究,获得了非常不错的结果,陈院士对此也给予了很高的评价。很清楚地记得因此第一次上了电视新闻,是香港亚洲卫视针对我们使用近红外分析技术,如何快速识别真假中药,及其质量等级的采访报道。当然,这些研究很多也是和理工大学的同事,以及杨大坚教授(现任重庆市中药研究院院长)、董玮玮博士等一起完成的,我主要负责数据分析,以及数据软件产品开发与实现方面的工作。/pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201706/insimg/ac0a45a1-23c7-43bf-8467-f0cb1a6ccb8d.jpg" title="3_副本.jpg"//pp style="text-align: center "中药质量分析与鉴别项目交流会 (图3),及与日本Yukihiro Ozaki教授交流(图4)。/pp  离开香港后,很长一段时间内都没有与近红外分析有直接的关联。先是在Philip Marriott 教授课题组做research fellow,从事全二维色谱数据分析方面的工作,主要方向是全二维分离的模拟、预测,以及化学计量学新方法的发展。2012年回国后则作为引进人才,在中科院大连化物所许国旺教授研究组,从事代谢组学数据分析与高分辨LC-MSn数据处理新算法的研究等。看似这些工作与近红外分析不怎么挨着边,但老实说,同其他研究一样,数据分析也是一通百通的事!数据来源与数据结构可能不一样,数据背景与数据分析结果,以及数据处理方法亦可能存在差别,但数据分析的本质却是高度一致的,无论是色谱分离的模拟,亦或是代谢小分子标志物的发现!从这个意义上来说,也算是一直在这个圈子吧。/pp  近红外技术的发展,面临非常多的机会,无论从国内快检还是工业智能化的需要来看,还是从国外近红外发展的轨迹来看。然而近红外分析更广阔的应用,仍有一系列需要解决的难题,这其中当然包括仪器硬件的小型化、便携式,以及智能化与场景化。但从数据及数据分析的角度来说,快速、准确的模型构建,模型的通用性、更新及转换等仍是需要加以研究的内容。基于此,离开化物所后创办的大连达硕信息技术有限公司,第一个数据产品“魔力”,便专注近红外数据的分析,这也算是真正走在了近红外技术与数据分析的商业应用之路上。希望能够以智慧化、便捷化的方式,分析挖掘科学研究与工业应用中的海量数据。无论对于近红外分析的初入者,还是有了相当经验的人员,一旦采集到数据,便能快速得到好用的模型及结果,这也是目前非常欠缺的,主要原因就在于近红外数据分析的过程长,可变因素多,涉及的算法也很多,传统上要快速得到一个好用的模型并不容易。尽管大多数研究者并没有把数据分析提升到特别核心的位置,但其价值显而易见,甚至在某些方面可与硬件本身相得益彰,弥补硬件的物理劣势!/pp  另一方面,近红外分析以其简单方便的前处理,加上非常快速的数据采集方式,使得数据的获取,甚至大数据的积累顺理成章。然而即使对同一组数据,不同的研究者亦极有可能得到完全不同,甚至相反的分析结果或结论,即使在固定分析方法的情况下!这是一个容易被忽视,却又至关重要的问题,否则不管如何将近红外分析的硬件评价,以及实验测试全过程标准化,也无法得到可相互比较的结果。数据“横看成岭侧成峰”的魅力,不应是由于数据分析方法或人员的不同导致,而是数据背景的属性差异或者数据分析目的的不同产生。基于此,我们也正采用近红外数据分析的通用准则,使用粒子群等最优化的方法,开发全新的近红外数据分析软件产品,自动优选数据分析算法,以及方法的使用顺序,并全局优化方法的参数。这样我们获得数据后,只需按照标准化的流程一步一步走,便可获得最优的数据分析模型与模型结果。从而使得近红外数据的分析,如同实验分析一样,结果的重现性与可比性也就不再是个问题。避免像现在这样,往往是漫无目的的数据探索,耗费漫长时间也不一定能得到合适好用的模型!这无论在研究中,还是在工业生产中,都是需要花大力气迎接的挑战。在这一过程中,得到了袁洪福教授、吴海龙教授、邵学广教授、杜一平教授、褚小立教授、闵顺耕教授等诸多老师的大力支持与帮助。从老师们关切的眼神中,能读懂那份殷殷之情,也唯有努力做点事情,为国内近红外的发展做些有益的工作,方不负此情。/pp  近红外分析能做的事情很多,近红外数据分析如是,尤其站在移动互联时代,站在大数据分析挖掘的视角与高度。近红外有其自身特有的巨大优势-本身就是物联网中的一个绝佳传感器!从这个意义上来说,近红外分析代表着某种未来,只是通往未来的路上,还需要我辈站在前辈的肩膀上,不断付出智慧和汗水。/pp  “师者也,教之以事而喻诸德也。”,数据分析之路上,深深地烙上了梁逸曾教授的影响。亦师亦友者,感恩、深切缅怀您。/pp style="text-align: right "span style="font-family: 楷体,楷体_GB2312,SimKai "  2017年1月30日于浙江西湖/span/pp  strong个人简介/strong/pp/pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201706/insimg/e1424397-960a-4e21-a206-9245429e6328.jpg" title="1_副本.jpg"//pp  曾仲大,男,博士,现任大连达硕信息技术有限公司总经理。/pp  曾博士师承梁逸曾教授,2006年获得工学博士学位,主要从事化学计量学基础算法研究,以及色、质、光谱等分析技术在制药、烟草和代谢组学等复杂体系分析中的应用及其数据分析挖掘等。近年来在大数据的分析与应用方面亦有涉猎。/pp  曾博士先后工作于香港理工大学、澳洲RMIT大学、Monash大学,以及中国科学院大连化学物理研究所。迄今已发表SCI论文40余篇,在2013-2016近三年时间里,以第一作者或合作者在美国分析化学杂志发表7篇研究论文,同时获邀为TrAC等权威期刊撰写化学计量学及化学数据分析处理方面的综述。/pp  曾博士曾获得中国科学院大连化学物理研究所“所百人”引进人才计划,大连“海创工程”计划、高层次人才创新创业支持计划、新兴技术创新成长计划,以及国家人社部高层次海归人才创业计划的支持。公司主要提供复杂化学与生物数据分析服务,数据挖掘软件产品开发,以及个性化数据应用的整体解决方案。/pp  strong人生格言:/strong有志者,事竟成。/p
  • 直播预告 | 畅聊类器官数据分析
    类器官(Organoids)是利用成体干细胞或多能干细胞进行体外三维培养而形成的具有一定空间结构的组织类似物,结合高超的成像技术,彻底改变了人们对培养皿中生命活动的理解方式,在人类发展和疾病机制方面为研究人员提供更多见解。1个月前,伯桢生物携手复旦大学博士、徕卡显微镜工程师联合直播 ——「类器官成像那些事儿(上、下)」,深度解析类器官明场下拍摄技巧,类器官免疫组化免疫荧光拍摄技巧,和类器官高分辨率成像,不同组织来源类器官包埋注意事项等,收获热烈反响。12月8日,本周四19:00,伯桢生物将再次与我们合作,携手复旦大学博士和徕卡客户成功管理专家与各位学者共续「类器官成像那些事儿(番外篇)」。报名方式报名入口一:扫描下方二维码,预约报名直播内容抢先看畅聊类器官数据分析模块一如何实现类器官图像3D拍摄后处理模块二解析类器官成像及荧光信号定量分析模块三基因类器官拍摄后核分析及细胞空间分布解析附件模块如何在文章中展现一张科学,精 准,惊艳的图片。目前,活动进入到专家评审阶段,尽情期待!评委组专家简介曾艺中国科学院分子细胞科学卓 越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)研究员曾艺,研究员,博士生导师,中科院上海生科院生化与细胞所研究员。获国家“杰出青年基金”、上海市“优秀学科带头人”、谈家桢“生命科学创新奖”、腾讯“科学探索奖” 。长期研究成体干细胞命运决定的调控机制,在发现新的成体干细胞的身份、建立成体干细胞的体外扩增体系、发现干细胞微环境因子方面取得一系列国际领先的研究成果。担任 eLife 期刊编辑及Development、JBC 编委, 中国干细胞生物学会委员。章永春上海交通大学 长聘教轨副教授章永春,上海交通大学生命科学技术学院,长聘教轨副教授副教授,博士生导师,独立课题组组长,2020年入选上海市海外高层次人才引进计划项目。目前主持国家和上海市自然科学基金面上项目。先后于南开大学获得学士学位,美国罗切斯特大学获得博士学位,哥伦比亚大学从事博士后研究。目前课题组主要聚焦利用3D类器官、干细胞、转基因小鼠及多种分子生化手段研究消化道器官再生与癌症形成机理,探索开发肿瘤新型治 疗方案。课题组已在Nature、Cell Stem Cell等知名学术期刊发表多篇论文。熊春阳北京大学 教授熊春阳,北京大学工学院力学与工程科学系教授、博士生导师。1995年于北京大学力学系获得学士学位,2000年于北京大学力学系固体力学专业获得博士学位;2000-2002年在北大电子学系进行博士后研究,2002年留校工作至今。现为北京大学工学院力学与工程科学系教授、博士生导师,北京大学前沿交叉学科研究院兼职研究员,中国力学学会/生物医学工程学会生物力学专委会委员,中国生物医学工程学会类器官与器官芯片分会委员,中国力学学会流体力学专委会微纳尺度流动专业组委员。目前主要从事力学-材料-微纳米技术-生物医学的交叉研究,包括力生物学、力材料学、类器官工程、器官芯片等。已主持国家自然科学基金项目7项,纳米973项目子课题负责人1项,主持或参加其他国家或地方课题20余项。已发表SCI论文80余篇,申请国家发明专 利20余项。Emmanuel Enoch K. Dzakah (Ph.D.)伯桢生物技术总监,加纳University of Cape Coast研究生导师,中国博士后国际引进人才,中国博士后特别资助(站前)获得者,南方医科大学皮肤病医院博士后,中国科学技术大学博士,细胞与免疫学家,传染病学专家, 多年国际生物医药产业经验。研究成果包括成功制备以及生产疟疾, HIV等传染病的检测单抗与快速诊断试剂,衣原体与HIV-1共感染的机制研究,RNA 如何调控秀丽线虫的发育与寿命以及利用肿瘤类器官模型研究癌细胞起源与高频突变基因致癌效能,以第 一/通讯作者身份于国际权威期刊Genome Biology, J. Investigative Dermatology, J. Genetics and Genomics, Malaria Journal, BMC Microbiology 等发表系列研究论文。那洁清华大学 副教授那洁,清华大学医学院教授, 本科毕业于北京大学医学部获医学学士学位,于美国佛吉尼亚大学获细胞生物学博士,2002前往英国剑桥大学进行博士后研究,2005年获得英国医学研究学会干细胞事业发展研究员基金。2010年回国在清华大学医学院任教。主要研究方向为干细胞与再生医学,人类多能干细胞向心血管细胞、造血干祖细胞和免疫细胞分化的调控机制,应用这些细胞制作类器官模型, 研究人类器官发育和疾病机理,促进细胞治 疗等临床转化应用。获得科技部重大科学研究计划、国家自然科学基金等的资助。在Nature、Science等国际权威刊物发表干细胞、胚胎发育、类器官方面论文70篇,他引3000余次。曾获得教育部高等学校科学研究优秀成果奖(科学技术)一等奖。获得若干项国家专 利。为多个国际学术刊物的审稿人,国际干细胞研究学会会员,中国动物学会生殖生物学分会委员,中国细胞生物学学会,生理学会会员。蒋明浙江大学 研究员浙江大学医学院研究员,博士生导师。毕业于复旦大学生命科学学院,获得生物物理学博士学位。先后在美国罗切斯特大学、哥伦比亚大学进行研究工作。长期从事前肠起源的器官包括食管、胃和肺的干细胞在器官损伤再生及在肿瘤中的功能研究。以类器官结合动物模型,鉴定不同类型和起源的干细胞在参与损伤后再生以及在肿瘤形成过程中的作用,已发表一系列高水平SCI研究论文,包括Nature,Journal of Clinical Investigation、Developmental Cell和PNAS等多篇领域内顶 级期刊。承担科技部重 点专项和国家自然科学基金等研究课题。获得国家发明专 利1项。黄卫人深圳大学第 一附属医院 研究员黄卫人,二级教授,深圳大学第 一附属医院(深圳市第二人民医院)泌尿外科,国家重 点研发计划项目首席科学家。国家地方联合肿瘤基因组临床应用关键技术工程实验室执行主任,广东省泌尿生殖肿瘤系统与合成生物学重 点实验室副主任,深圳市医学基因重编程技术重 点实验室主任。主要从事泌尿系统肿瘤精 准医学及合成生物学应用基础研究,在包括Nature Methods、Nature Communications、Advance Science、Genome Biology、 ACS Synthetic Biology等杂志以通讯作者或者第 一作者发表SCI论文60余篇,相关成果获得深圳市自然科学奖二等奖1项,中华医学科技奖1项,获得发明专 利授权11项。高天龙徕卡生命科学部高级应用专员2007年毕业于中科院生化细胞所,后从事癌症相关的细胞免疫治 疗行业多年。2013年加入徕卡显微系统,负责生命科学领域的共聚焦、活细胞工作站、激光显微切割系统等高端显微成像系统的技术支持。了解更多:徕卡显微
  • 沃特世全新Symphony软件,实现自动化的常规LC-MS数据分析
    沃特世公司(纽约证券交易所代码:WAT)今日隆重推出Symphony Data Pipeline软件,这是一款专为实验室大规模数据采集和归档而开发的客户端-服务器应用程序。Symphony软件可自动化转移和转换海量LC-MS数据,从而加快分析工作流程、缩短分析时间并减少人为误差,将科学家们从单调繁琐却又不得不执行的数据文件管理任务中解放出来。“我们在老化色谱柱的同时就能无缝且自动化地将原始文件复制到远程文件存储位置,这个简单的步骤最大程度延长了我们用仪器进行分析的时间,”南安普敦大学蛋白质组学研究中心主任Paul Skipp博士说道,“以前,操作人员将数据复制到文件存储位置准备进行处理时,质谱仪可能有一到两个小时都处于空闲状态。如今我们实验室的三台SYNAPT质谱仪能够全天候不间断地生成数据,单这一点就已经是很大的进步。”Symphony Data Pipeline还可以从其它方面提高实验室效率。“Symphony Data Pipeline的模块化特性对我们而言极有价值。它能帮助我们快速开发和测试新的实验数据处理方法,包括实时QC方法、预测性错误检测方法以及用于确保数据完整性的工具,”伦敦帝国理工学院MRC-NIHR表型组学中心的信息学负责人Jake Pearce表示,“不仅如此,它还能将数据处理时间缩短好几个月,同时降低噪音并节省数千兆的文件存储空间。”借助Symphony软件,科学家们能够对沃特世MassLynx质谱软件采集到的UPLC-MS数据进行“个性化处理”。数据采集一旦完成,Symphony软件就将立刻开始处理数据文件,包括将数据文件移动至服务器、扣除背景噪音、对数据进行压缩、复制和重命名,或者对数据运行一系列可执行文件。用户还可以设计和执行自定义的数据处理任务组。这一系列操作(我们称之为流程)由操作员设置,无论是单台计算机、联网的多台计算机还是连接到实验室网络的多台计算机采集到数据,系统都将立即开始在后台运行这些操作。Symphony Data Pipeline软件可兼容Microsoft Windows 7(64位)专业版操作系统,沃特世即日就将面向全球供应该产品。在第64届美国质谱年会(德克萨斯州圣安东尼奥市)期间,沃特世公司于2016年6月4日(星期六)举行了质谱用户会议,期间,南安普敦大学的Paul Skipp博士在会上发表了以Symphony软件为主题的演讲。有关详细信息,请访问:www.waters.com/symphony 关于沃特世公司(www.waters.com)沃特世公司(纽约证券交易所代码:WAT)专注于为实验室相关机构开发和生产先进的分析和材料科学技术。50多年来,公司已开发出一系列分离科学、实验室信息管理、质谱分析和热分析技术。 原新闻请访问businesswire.com:http://www.businesswire.com/news/home/20160602005132/en/信息来源:沃特世公司###Waters、UPLC、MassLynx、SYNAPT和Symphony是沃特世公司的商标。Microsoft和Windows是微软公司的商标。
  • 近红外数据分析中的关键问题网络讲座顺利召开
    近红外数据分析中的关键问题网络讲座顺利召开 2016年8月30日上午,由华东理工大学、南开大学、大连达硕信息技术有限公司共同主办的网络讲座,在仪器信息网,以在线的方式顺利召开。讲座分别由杜一平教授、邵学广教授、曾仲大总经理担任主讲人,围绕近红外数据分析中关键性、经常性问题进行全面、深入阐述。 杜老师从近红外光谱数据预处理、变量选择、模型构建与结果验证等诸多方面,非常细致地介绍了整个建模过程中涉及的算法及算法原理、注意事项,以及普遍遇到的问题及解决方法。杜老师也提到,近红外数据分析绝非看似的那样简单,涉及对数据的理解、对算法的理解。同时不能只关注数学方法,更要记住我们是化学家!邵老师从大数据分析角度出发,阐述近红外数据分析,并延伸到近红外光谱的模型转移。大数据是国家关注的重点方向,企业信息化的推进,数据体量不断增大,需要基于大数据与云计算的手段方法提升效率,挖掘数据价值。近红外的模型转移则是现在生产型企业发展中遇到的,非常棘手的问题。不同厂家、不用仪器的数据和模型不能共享,很难实现数据融合。邵老师经过多年的研究与实践从方法到应用给大家进行了详细介绍。同时邵老师介绍了近红外模型转移中需要考虑和注意的问题,以及目前比较成熟的算法,为大家解决实际问题提供广阔思路。 曾老师则从近红外数据分析应用与软件系统实现的角度,阐述如何能更智慧地构建近红外分析模型,并结合大连达硕信息技术有限公司最新发布的魔力近红外数据分析产品(v2.0版),全面介绍系统如何实现智慧型近红外数据分析,包括批量文件夹数据载入,智能数据建模算法流,“随时”、“随时”数据建模,全面的建模方法比较,以及优异的用户体验等等。同时鼓励近红外同行们使用产品,支持国产软件发展。讲座后,三位老师延长预定时间,回答大家感兴趣的诸多问题。此次讲座得到了近红外分析和化学计量学同行的普遍关注,人气指数超过5,500,300余人报名参加。讲座结束后,大家通过各种途径表达对讲座的支持厚爱,效果很好,评价非常高。与此同时,大连达硕信息技术有限公司在讲座后,建立化学数据联盟微信群,一方面使与会者可更深入讨论近红外相关问题,推进行业发展,另一方面也广纳同行对联盟发展的意见与建议,促进联盟发展。 大连达硕信息是国家高新技术企业,专注化学与生物行业数据的整合分析与深度挖掘,辅助决策支持,公司全方位提供数据分析服务、数据处理产品,以及个性化数据应用整体解决方案,是我国化学与生物数据应用领域的排头兵。公司技术力量非常雄厚,在化学与生物数据分析领域积累非常丰富的经验,深受客户好评。
  • PerkinElmer发布云端数据分析管理平台Signals——支持精准医学完整工作流
    2015年10月28日,专注于人类健康和环境健康的全球领先供应商,珀金埃尔默公司今日宣布发布一款基于云的科学数据分析管理平台 SignalsTM,应用于医药领域的数据汇总分析。这个新产品集成了多方面的实验和临床研究数据,支持从数据采集到生物标志物发现一系列完整的精准医学分析流程。珀金埃尔默与多家顶尖医药企业合作开发的科学数据分析管理平台Signals?TM?, 旨在帮助研究人员更轻松地整合来自公司内部的及公共数据库,比如GEO 及 tranSMART中的实验和临床数据。现在,越来越多的制药公司开始从事精准医学的研究工作,珀金埃尔默的Signals? 也将支持更广泛的合作,提高科学家为患者开发药物的速度和效率。“珀金埃尔默的 SignalsTM 为新药研发提供了一个新的平台。”奥尔巴尼分子研究公司(AMRI)高级副总裁Christopher Conway说。我们已将这一平台整合到AMRI关键部门,位于纽约布法罗新药研发中心的高通量筛选平台,Signals? 科学数据分析管理平台将显着提高我们在多个数据来源迅速获取、管理、整合并分析大型复杂数据的能力,使我们能更好更快的进行药物研发工作。”珀金埃尔默的科学数据分析转化平台SignalsTM 的数据获取界面十分简洁,并拥有一个专门用于生物标志物识别和管理的研究数据模型。它简化了药企与他们在学术领域,生物技术领域及其它商业合作伙伴间的数据共享方式。“在过去,新药研发的研究人员无法直观地利用研究数据,这使得识别和描述生物标志物成为一件极具挑战性的工作。”珀金埃尔默信息部总裁 Karen Madden说。 “这个全新的分析管理能够加强研发和临床数据之间的紧密联系,确保患者与药物之间的最佳配对,从而保证促进人类健康”珀金埃尔默科学数据分析转化平台SignalsTM 提供了软件即服务(SaaS)模式,降低了药企IT部门的运营成本并为其提供了强大的灵活性和可扩展性。它与 TIBCO Spotfire 可视化分析平台无缝集成,使转化医学科学家更容易进行调用、整合并可视化分析数据。此外,研究人员还可以:存储结构化及非结构化数据,包括生物信息输出文件及科学家的分析工作流。轻松查询、提取、识别和存储样本实体信息,这些都是转化医学分析所需要的信息。对存储数据进行归一化或者其它一系列的数据预处理。更多信息请访问:www.perkinelmer.com/signals
  • 博奥生物生物芯片数据分析专题培训讲座开班
    博奥生物信息培训班第一期生物芯片数据分析专题培训讲座开班啦! 本次博奥生物举办的生物芯片数据分析培训讲座,以最优惠的价格为学员提供最实用的数据分析解决方案! 博奥生物芯片数据分析案例剖析及方案分享,让您思路更清晰! 为您提供免费软件应用等公共资源及操作指导,实用才是硬道理!培训讲座内容安排:2013.09.05课程描述上午:9:00-10:00生物芯片技术及应用简介1、生物芯片技术介绍及发展现状2、博奥生物芯片平台及相应的典型案例介绍上午:10:45-12:00生物芯片数据分析解决方案1、生物芯片常用数据分析手段介绍2、数据分析典型案例剖析及整体解决方案培训3、常用软件及公共资源分享下午:1:30-4:00常用生物信息软件实际操作培训1、生物芯片平台给出数据介绍2、实践培训:Mev、cytoscape、coexpress等经典的数据分析软件及绘图软件的培训下午:4:00-5:00参观博奥生物,探讨交流1、博奥生物芯片平台展厅介绍2、邀您探讨数据分析疑问,拓宽新的科研思路培训对象需要使用高通量技术特别是芯片技术进行科研的老师需要加强生物信息分析思路,并能使用常用软件进行数据分析的老师讲师介绍:赵建晴博士:博奥生物微阵列服务部研究科学家张杨工程师:博奥生物科技事业部生物信息应用工程师培训费用:800元/人(含午餐)优惠措施:1:在2013年08月25日前报名,可享受8折优惠。2:博奥生物的仪器用户可享受1名免费培训名额。3:相同单位报名超过1人的,从第2人起享受5折优惠。缴纳注册费账户信息:用户名:博奥生物有限公司开户行:中国银行北京上地支行 帐号:3376 5602 2586培训资料:包括培训教材、培训证书(生物芯片北京国家研究中心印)、培训学员通讯录、精美礼品一份。注意事项:学员自备笔记本电脑,为保证教学质量,每期仅招收20位学员。报名方式:请您填写客户培训回执表,发送到qiandu@capitalbio.com邮箱中,我们收到回执表后3天内给予回复。报到时间及住宿安排:请于2013年9月5日9点前报到,如需住宿请在回执表中注明,公司可代为安排宾馆,费用自理。具体路线:1、北京站-博奥生物:地铁2号线到东直门换乘城铁13号线到西二旗站下车,坐521路/205路/112路到生命科学园站下车。2、北京西站-博奥生物:步行至地铁军事博物馆馆站,地铁1号线复兴门站换乘地铁2号线,地铁2号线到西直门换乘城铁13号线到城铁西二旗站下车,坐521路/205路/112路到生命科学园站下车。3、机场大巴至回龙观下车,乘出租车到生命科学园。联系方式:联系人:杜倩电话:010-80726868转8246 15910764175邮箱:qiandu@capitalbio.com客户培训回执表:姓名:E-mail:单位:电话:地址:邮编:是否需要住宿: 是 否备注:如果需要住宿,请注明入住时间您感兴趣的领域:
  • 天津工生所建立无标定量MSE质谱数据分析流程
    超高效液相色谱-高分辨质谱(UPLC-HRMS)已经成为蛋白质组学、代谢组学以及药代动力学研究中的一项核心支撑技术,通过对不同生物样品的定量研究可以全面、精细地表征该生物体系的生理特性及预测功能。在用于蛋白质组学的质谱分析中,无标定量以其稳定性和安全性逐渐占据了主要地位。MSE方法是由Waters公司开发的应用在Q-TOF类型质谱仪器上的一种组学数据采集方法,作为一种数据独立获取(DIA)方式,它可以提高无标蛋白质定量的准确性和动态范围。但由于它特殊的输出格式形式,一些致力于分析数据依赖型(DDA)数据的常用开源软件不能对MSE 数据进行进一步的分析。  近日,中国科学院天津工业生物技术研究所水雯箐研究组成功建立了对基于MSE方法的无标定量蛋白质组学数据的新分析流程。在该研究中,结合开源软件Skyline和统计软件Diffprot建立起的工作流程,实现了对无标定量MSE质谱数据的定量分析。通过对磷酸化肽段和全细胞质蛋白质组定量数据的分析应用,验证了新开发流程的可靠性、稳定性、准确性和透明便捷的处理流程。另外,该研究创新性地发现改进后的新流程也可以应用于对小分子化合物的大规模定量分析,在蛋白质配体相互作用实验中,研究人员利用该新流程发现了针对药物靶点蛋白NDM1的新型小分子配体。  该研究获得国家自然科学基金和天津自然科学基金项目的支持,相关研究成果已经发表于Proteomics (2014,14:169&ndash 180),天津工生所和南开大学联合培养的研究生刘姗姗为第一作者。  无标定量MSE数据分析流程图
  • 热分析/红外光谱联用的数据分析方法 第6部分 在Origin软件中GS曲线、FGP曲线以及实时红外光谱图(EGS图)的作图法
    p  本文转载自微信公众号热分析与吸附,作者为中国科学技术大学丁延伟老师,并已获转载授权。/ppstrong  /strong在《热分析/红外光谱联用的数据分析方法第4部分 仪器分析软件中热重部分的数据处理与作图》和《热分析/红外光谱联用的数据分析方法第5部分 仪器分析软件中红外光谱部分的数据处理与作图》中以实验室在用的美国PerkinElmer公司的热重/红外光谱/气相色谱质谱联用仪为例简要介绍了在仪器的数据分析软件中与热重部分和红外光谱部分相关的数据处理与作图相关的内容,在本部分内容中将简要介绍在Origin软件中GS曲线、FGP曲线以及实时红外光谱图的数据处理与作图相关的内容。由于在Origin软件中不同时刻/温度下的三维红外光谱作图十分繁琐,将在本系列内容第7部分中进行介绍。/pp  为了保持本系列内容的完整性,以下介绍的大部分内容主要来自本公众号2019年10月6日发布的《在Origin软件中热分析/红外光谱联用的数据作图方法》一文,其中做了相应的修改并增加了实时红外光谱图(EGS图)的内容。/pp  1. GS曲线的作图法/pp  一般来说,在由红外光谱分析软件Timebase得到的Excel格式的文件中主要有EGP曲线(即通常所说的GS曲线)文件和不同时刻温度下的逸出气体红外光谱图(即EGS)文件,一共两个文件。/pp  GS曲线可以直接由导出的Excel格式的GS曲线文件得到,通常说的官能团剖面图(即FGP曲线)可以由EGS文件中导出。/pp  在Origin软件中对GS曲线的作图十分简单,在Origin软件中导入曲线所对应的Excel文件(图1至图3)。/pp style="text-align: center "img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202001/uepic/1db6881e-d64f-41b6-8671-0ae37784c440.jpg" title="图1.jpg" alt="图1.jpg"//pp style="text-align: center "图1/pp style="text-align: center "img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 500px height: 308px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202001/uepic/62609940-652e-42c0-967b-5e4165a0c4eb.jpg" title="图2.jpg" alt="图2.jpg" width="500" height="308" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: center "图2/pp style="text-align: center "img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 543px height: 750px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202001/uepic/54de575b-3929-471b-ad4f-c5b07c3b38ce.jpg" title="图3.jpg" alt="图3.jpg" width="543" height="750" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: center "图3/pp  选中A、B列,点击图4中plot选项,即可得到图5,即为EGP曲线。可以在图5中根据需要改变曲线的粗细、形状和颜色,在此不作详述。/pp style="text-align: center "img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202001/uepic/947a9618-194f-4302-aff3-fd6c2fa954a0.jpg" title="图4.jpg" alt="图4.jpg"//pp style="text-align: center "图4/pp style="text-align: center "img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 557px height: 464px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202001/uepic/e4ce67e8-3c64-471d-8782-d1ece89f1798.jpg" title="图5.png" alt="图5.png" width="557" height="464" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: center "图5/pp  2. 官能团剖面图(即FGP曲线)的作图法/pp  下面介绍由逸出气体红外光谱图(即EGS)文件得到FGP曲线的方法。通常在Timebase软件中,可以按照图6的方法,选中Save Time Resolved Data选项导出在实验过程中得到实验范围内不同时刻/温度的Excel格式的所有的红外光谱图。按照图1至图3的方法打开文件,得到如图7所示的界面。图7中,第1行“Long Name”中所对应的数值为温度值(即该行为温度行),1.98e+001即为19.8℃,其他以此类推。A列对应的为波数值(单位为cm-1),其他B、C、D...列所对应的为不同温度下的吸光值。也就是说,在图7中,由除A列以外的其他列作为纵坐标轴对A列按照图4的方法作图,可以得到在不同温度下的红外光谱图。另外,在图7中,如果选中温度行和特定的官能团(即特定的波数值)所对应的行进行作图,则可以得到FGP曲线。下面介绍FGP曲线的作图方法。/pp style="text-align: center "img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202001/uepic/f42afe19-16bd-432f-980f-506780617eab.jpg" title="图6.jpg" alt="图6.jpg"//pp style="text-align: center "图6/pp style="text-align: center "img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202001/uepic/16d2682f-cb11-4132-8b1b-3be6cd40f10c.jpg" title="图7.jpg" alt="图7.jpg"//pp style="text-align: center "图7/pp  按照图8的方法分别选中2358cm-1所对应的行和温度行,复制整行。br//pp style="text-align: center "img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202001/uepic/dcdf9257-47da-4d8b-ad2d-df3abf22d3cc.jpg" title="图8.jpg" alt="图8.jpg"//pp style="text-align: center "图8/pp  新建一个空白的Book文件,将温度行和对应波数(2358cm-1)的数值粘贴这两行,选中,点击Worksheet菜单下的Transpose选项(图9),将这两行转换为两列,转换后的表格如图10所示。删除图10中的第一行数据,按照图4的方法作图,即可得到CO2分子的特征官能团在2358cm-1处的FGP曲线(图11)。可以根据需要改变图中曲线的粗细、形状和颜色,在此不作详述。/pp style="text-align: center "img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202001/uepic/98c364bc-5af7-4f17-b010-d6c6e9ef31df.jpg" title="图9.jpg" alt="图9.jpg"//pp style="text-align: center "图9/pp style="text-align: center "img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202001/uepic/3fe819c4-81c9-4309-8fa2-eebc7492a9da.jpg" title="图10.jpg" alt="图10.jpg"//pp style="text-align: center "图10/pp style="text-align: center "img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202001/uepic/8c655662-483b-4efa-9b6e-86d7e8f314c3.jpg" title="图11.png" alt="图11.png"//pp style="text-align: center "图11/pp  3. 实时红外光谱图(EGS图)的作图法/pp  在本部分第2节中提到“在图7中,由除A列以外的其他列作为纵坐标轴对A列按照图4的方法作图,可以得到在不同温度下的红外光谱图。”也就是说,在导出的Excel格式的在实验温度/时间范围内的所有红外光谱文件中,选中A列和所对应的一列和/或多列时间/温度列即可得到不同温度/时刻下的实时红外光谱图。/pp  以下举例说明。图12是不同温度下的一水合草酸钙在加热过程中产生的气体产物的红外光谱图。图中第五行为不同的温度值,第A列为红外光谱的波数值。例如,需要比较第100℃、200℃、500℃和700℃下的红外光谱图的变化,则同时选中这些温度和波数(A列)所对应的列,复制并粘贴到新建的表格文件中,并定义相应列的名称(图13)。同时选中图13中A-E列,点击图4中plot选项,即可得到图14,即为不同温度下的红外光谱图。可以在图14中根据需要改变曲线的粗细、形状和颜色,在此不作详述。由图14可以看出,(1)样品在100℃时样品没有发生分解 (2)在200℃时产生了水,对应于结晶水的失去过程 (3)在400℃时产生了一氧化碳,少量一氧化碳被氧化为CO2 (4)700℃时的气体产物以CO2为主。/pp style="text-align: center "img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 220px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202001/uepic/a6b0f4c1-4385-4184-8530-572cc84c0cce.jpg" title="图12.jpg" alt="图12.jpg" width="600" height="220" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: center "图12/pp style="text-align: center "img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 557px height: 285px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202001/uepic/b989ef36-1508-4bde-b282-9029ef1766ff.jpg" title="图13.jpg" alt="图13.jpg" width="557" height="285" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: center "图13/pp style="text-align: center "img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202001/uepic/128d4fc6-623a-479c-9cdb-4f3865f22608.jpg" title="图14.png" alt="图14.png"//pp style="text-align: center "图14/ppbr//p
  • Molecular Devices 网络讲堂预告:快来注册!变身酶标达人——第七期MD酶标仪应用操作/软件数据分析指导网络讲堂
    您是否刚接触酶标仪苦于不会操作?您是否在使用过程中碰到难题苦于无人指导?面对庞大的数据,您是否苦于不会通过软件进行有效处理及分析?如果您拥有了一台多功能酶标仪,您是否已经对其多种功能和应用都有开拓并好好利用?如果您的回答是肯定的,如果您想变身酶标达人,那就快来注册参加Molecular Devices的酶标仪应用操作/软件数据分析指导系列网络讲堂吧!每月一期,期期精彩!本期是2014年最后一期,感谢大家连续7个月来的陪伴。2015年3月起我们将继续开展网络讲堂活动,为大家带来更多更全面的应用及指导!第七期:如何使用酶标仪成像功能进行细胞计数、细胞死活和荧光蛋白表达分析日期:2014年12月26日,周五时间:上午 10:00 -11:00(北京时间) 本期导读:随着酶标仪功能的发展,已经不止用于读取光信号值反映分子生化水平,还能通过拍摄明场或荧光通道的图片直观呈现细胞,便于判断当下的细胞状态(细胞数量、细胞形态、细胞生长饱和度、细胞死活等),以及获得精确到细胞级别的定量关系(细胞平均荧光值,总荧光值等),有助于研究人员掌握更全面的信息对分子生化过程进行更准确的判断。主讲人:张艺婷,应用科学家,酶标仪产品线,美谷分子仪器(上海)有限公司往期回顾:第一期:如何使用SpectraMax微孔读板机进行快速定量检测DNA和RNA第二期:如何使用MD酶标仪进行ELISA检测和使用SoftMax Pro软件进行数据处理第三期:荧光解读与活细胞荧光蛋白检测第四期:如何使用酶标仪化学发光功能检测细胞活性及萤光素酶报告基因第五期:时间分辨荧光检测技术特点、应用以及如何使用Molecular Devices微孔板读板机进行参数设置第六期:如何使用SpectraMax M5多功能微孔板读板机和IMAP荧光偏振检测平台进行激酶活性的分析若您希望注册参加在线讲座,请联系info.china@moldev.com询问。
  • 前六月进口近70亿元:光刻设备海关进口数据分析
    自美国提出终断该国企业与华为多年的芯片供应以来,研制中国自己的国产芯片提上了我国的发展日程,也是当前中国市场最为紧迫的一项技术,关于芯片技术发展的讨论不仅在专业领域盛行,也成为了普通民众议论的焦点所在。而芯片的制造离不开半导体设备,其中光刻设备是其中的重中之重。但长期以来,我国的光刻机依赖进口严重。2022年,美国出台《芯片法案》限制向中国大陆出口半导体设备。据《华尔街日报》报道,日本和荷兰已加入美国,努力限制向中国出口先进芯片制造设备(详情:日本、荷兰和美国联合起来限制向中国出口芯片制造设备 )。2月15日,就美日荷限制向中国出口相关芯片制造设备,中国半导体行业协会发表声明(详情:就美日 荷 限制向中国出口相关芯片制造设备,中国半导体行业协会发表声明 )。6月30日,荷兰政府发布公告,9月1日,先进半导体制造设备的额外出口管制措施将生效。从那时起,某些先进半导体制造设备的出口将受到国家授权要求的约束,限制中除了EUV光刻机,还包括了较为先进的DUV光刻机(详情:升级光刻机管制!荷兰发布先进半导体制造设备出口禁令)。此外,日本也限制了6类23种半导体制造设备出口,中国半导体行业协会发布严正声明表示,此次日本政府的出口管制措施将对全球半导体产业生态带来更大的不确定性(详情:中国半导体行业协会再发严正声明 )。日本和荷兰是光刻机的主要生产国家,上半年的种种措施出台为中国半导体产业增添了种种不确定性,为了解上半年光刻机的进口情况,仪器信息网特别对2023年1-6月,光刻机(商品编码84862031、84863031)进口数据进行了分析汇总,为大家了解中国目前光刻机市场做一个参考。需要注意的是,海关数据根据应用领域和原理将光刻机主要分为两类,包括制半导体器件或集成电路用的分步重复光刻机(84862031)和制造平板显示器用的分布重复光刻机(84863031)。2022-2023年1-6月光刻机进口额变化(单位:元)商品名称2022年2023年增幅制半导体器件或集成电路用的分步重复光刻机5245402082684285701030%制造平板显示器用的分布重复光刻机95803117664797902-93%2023年1-6月光刻机进口占比2023年1-6月进口额变化2022年1-6月进口额变化从近两年上半年的进口数据来看,制半导体器件或集成电路用的分步重复光刻机增长幅度较大,达到了30%的增幅,而用于制造平板显示器的分布重复光刻机出现了明显的暴跌,增幅为-93%,远低于去年同期。而从两类光刻机的占比来看,制半导体器件或集成电路用的分步重复光刻机明显占据主要市场份额。实际上,此前两类光刻机进口额接近(详情:前十月 进口额已达103亿元:光刻设备海关进口数据分析)。用于平板显示器的分布重复光刻机的进口额正经历着逐步暴跌的过程,这或许和国产替代有关。值得注意的是,今年上半年光刻设备进口额在六月份出现暴涨,单月进口额超34亿元,远高于去年同期和其他月。和去年上半年变化趋势相比,这一暴涨的变化趋势也颇为突兀明显。这可能和美日荷制裁升级有关,或因相关消息引发市场恐慌性抢购设备导致。制半导体器件或集成电路用的分步重复光刻机进口贸易伙伴分布制造平板显示器用的分布重复光刻机进口贸易伙伴分布制半导体器件或集成电路用的分步重复光刻机主要进口自荷兰和日本,其中荷兰进口额占比高达76.7%,日本占比21.9%。制造平板显示器用的分布重复光刻机不同于集成电路和半导体器件用光刻机,从其进口额分布可以看出,此类光刻机进口市场被日本企业牢牢把控。目前我国已成为世界平板显示器生产大国,拥有了一批巨头企业,市场广阔。制半导体器件或集成电路用的分步重复光刻机进口注册地分布制造平板显示器用的分布重复光刻机进口注册地分布那么这些光刻机主要销往何处?通过对进口数据的注册地进行分析发现,制半导体器件或集成电路用的分步重复光刻机主要“落脚地”是上海市、江苏省和北京市,这些地区也是我国经济较发达地区,近年来积极布局半导体产业,已经逐步形成了一批集成电路产业集群。而制造平板显示器用的分布重复光刻机主要“落脚地”是重庆市。据了解,在“十四五”期间,重庆将重点建设包括集成电路、新型显示、新型智能终端等在内的十类战略性新兴支柱产业。其中新型显示产业在重庆的十类战略性新兴支柱产业中排名第二,地位仅次于集成电路产业。近年来,重庆市新型显示产业政策持续出台,2017年达到峰值,为9条。2022年,重庆市共有2条相关政策公布。在当地政府支持下,近年来多个新型显示优质项目签约落地重庆,重庆正在通过显示面板领域重点项目投产和优质项目签约,进一步加快新型显示产线建设,让重庆新型显示产业的发展活力充沛。根据企查猫查询数据显示,近年来新型显示历年新注册企业数量稳定增长。截至2023年1月17日,重庆新型显示产业相关的注册企业超200家,其中2020年新注册企业数量创历史高峰,达43家,从新增企业数量来看,重庆市新型显示产业企业数量将继续保持上升态势。
  • 魔力-近红外数据智慧分析处理软件系统发布新版本
    2016年9月26日,由大连达硕信息技术有限公司独立开发,在近红外数据分析处理方面具有巨大优势的魔力软件系统,发布新版本(v2.0)。在原有v1.0版本的基础上,系统新增模型传递的功能,解决仪器标准化问题,并极大地提升系统的模型分析效率,改善用户体验。魔力软件v2.0版新增的模型传递功能,提供多个方法,有效校正不同仪器间的近红外数据变化与差异,达到仪器数据的标准化,从而提升定性定量分析结果的可比性与可用性;同时新版本在大数据量的文件载入、工程文件的保存与打开、内存的高效利用,以及用户体验等诸多方面做足文章,力争把该产品打造成近红外数据智慧分析处理的完整解决方案,在数据分析的智慧化,分析方法的全面性,以及用户使用的便捷性等各个方面,极大超越现有的软件系统,完美解决广大科研工作者与应用工程师在近红外分析中遇到的数据处理难题。 魔力软件系统在近红外数据分析处理中的显著优势,可概括为如下几个方面: 批量载入某一文件夹下多种类、复杂格式的数据多变量数据分析前,通常需将待分析的数据整合成数据矩阵形式。然而多重因素的影响导致数据分析工作者较难实现这个过程,比如不同样本产生的多个数据、样本分析条件差异导致的数据长度差异、数据类型的变化,以及数据中同时含有数字和字符等等。怎么办?魔力软件可快速解决!文件行,文件夹也可以! 一键构建算法流,快速、智能完成数据建模复杂多变量数据分析的流程长、方法多,传统逐步分析的策略费时、费力。魔力软件创新实现基于算法流的数据分析,即用户可任意构建包含多个数据分析方法的方法组合,进而达到建模中的一键处理、多模型处理、方法参数修改后的快速建模与快速重建模,是智慧型数据分析的创新发展。 数据分析过程中,任一阶段随时随地的数据建模数据分析的本质是“让数据开口说话”,告诉你数据背后的隐含内容。优异的数据分析流程应在数据分析的任意阶段,依据用户需求随心所欲地产生新数据、分析新数据、建立数据分析闭环。魔力软件就是这么做的:建立数据、图表、模型、结果间的任意流动,使得数据分析更加得心应手! 全面的数据预处理、变量选择、分类与回归建模方法不同的数据处理方法有不同的适应性,得到满意的数据分析模型或结果,可能需要对系列方法进行优化选择。魔力软件包括16大类、31小类的数据预处理方法,以提高数据质量;15大类、36小类的特征选择方法,优选变量;15个数据建模方法,用于探索性分析、分类与回归分析。有如此多方法的支持,不再为发文章而发愁,魔力软件:发文章的利器一枚! 优异的用户体验:数据库管理、工程式文件、使用向导、完美报表等魔力软件独创一键式的数据处理流程,同时模型训练、验证与预测,便捷的导航栏与工程式的文件管理,强大的数据操作与可视化功能,加上丰富的算法与智慧化的分析过程,带给您不一样的用户体验。一个字:爽!(魔力软件功能菜单)目前魔力软件系统的新版本已经全面开放试用,欢迎联系公司获取试用版。与此同时,公司推出促销大惊喜。凡是在2016年12月30号之前购买产品的企业单位,或者高校、科研院所,均可获得惊喜促销价。欢迎垂询。 已经购买魔力软件的用户,可获得免费升级服务;已经试用过魔力软件v1.0版本的用户,亦可重新申请试用v2.0新版本。 大连达硕信息是国家高新技术企业,专注化学与生物行业数据的整合分析与深度挖掘,辅助决策支持。公司全方位提供数据分析服务、数据处理产品,以及数据应用整体解决方案,是我国化学与生物数据应用领域的领头羊。公司技术力量非常雄厚,在化学与生物数据分析领域积累了非常丰富的经验,深受客户好评
  • 博奥生物第三期生物芯片数据分析专题培训讲座(广州站)
    本次博奥生物举办的生物芯片数据分析培训讲座,以最优惠的价格为学员提供最实用的数据分析解决方案!博奥生物芯片数据分析案例剖析及方案分享,让您思路更清晰!为您提供免费软件应用等等公共资源及操作指导,实用才是硬道理!培训讲座内容安排:2013.12.12课程描述 (学员需自备电脑)上午:9:00-10:00生物芯片技术及应用简介1、生物芯片技术介绍及发展现状2、博奥生物芯片平台及相应的典型案例介绍上午:10:15-12:00生物芯片数据分析解决方案生物芯片常用数据分析手段介绍4、数据分析典型案例剖析及整体解决方案培训下午:1:30-2:30常用生物信息软件介绍生物芯片平台给出数据介绍常用软件介绍及资源分享下午:2:45-4:00软件实际操作培训Mev、cytoscape、coexpress等经典数据分析软件及绘图软件的培训培训对象:需要使用高通量技术特别是芯片技术进行科研的老师需要加强生物信息分析思路,并能使用常用软件进行数据分析的老师培训费用:800元/人(含午餐)优惠措施:1:博奥生物的仪器用户所在单位可享受1名免费培训名额2:相同单位报名超过1人的,从第2人起享受5折优惠缴纳注册费账户信息(学员也可现场缴费):用户名:博奥生物有限公司 开户行:中国银行北京上地支行 帐号: 3376 5602 2586 【请在转账单备注中注明: × × (姓名)交付培训费3106】联系人:15910764175(杜女士),需要发票请说明。培训资料:包括培训课件、培训软件及操作视频、精美礼品。注意事项:学员自备笔记本电脑,为保证教学质量,每期仅招收20位学员培训地点及路线:地点:广东省农科院创新大楼一楼西厅会议室 (广州市天河区金颖路20号)路线:地铁3号线天河客运站方向至华师站E出口,在师大后门公交站2乘坐813路在农科院站下车,经过街天桥至马路对面,即为广东省农科院大院,进入大门左手边即为创新大厦报到时间及联系方式(博奥生物广州办事处):请您于2013年12月12日8点半前到会议室报到联系人:15918524295(于女士) 电话:020-34282504 报名方式:请您填写客户培训回执表,发送到邮箱:xinyu@capitalbio.com,我们收到回执表后2天内给予回复。客户培训回执表:姓名:E-mail:单位:电话:地址:邮编:您感兴趣的领域:是否需要住宿: 备注:如果需要住宿,请注明入住时间,公司可代为安排,费用学员自理
  • 刘文玉:从数据分析浅谈中国科学仪器的发展与机遇
    仪器信息网讯 2013年4月19日,中国科学仪器行业最高级别的峰会——“2013中国科学仪器发展年会(ACCSI 2013)”在京召开。其中,仪器信息网高级顾问刘文玉作了以《从数据分析浅谈中国科学仪器的发展与机遇》为题的大会报告。  该报告中从“2012年市场概览”、“2013年市场机会”、“创新与发展”、“紧跟信息时代步伐”四个方面介绍了中国科学仪器的发展与机遇。内容涵盖了国内外主流仪器市场份额比较、“科学仪器重大专项”解析、跨国企业的“本土化”战略、 “政府采购”、“大部制改革”、“市场竞争”、“售后服务”、“用户采购行为”及各部委利好仪器行业的相关政策等多个行业关键点。仪器信息网高级顾问 刘文玉  据介绍,近年来中国科学仪器的生产总值逐年上升,国内仪器行业的上市公司也取得了不错的业绩,其中2012年国内上市公司平均业绩增长12.9%。从仪器信息网市场研究中心给出的国内外主流仪器市场份额比较的数据可知,与进口仪器相比,目前国产主流仪器已经占了一定的市场份额,但是同时也看到,国产GC-MS、LC-MS/MS等高端仪器所占的市场份额还是很少。  通过国产主流仪器的厂商数量及国内外主流仪器核心技术差距的对比,刘文玉介绍到,当前国内企业的产品同质化严重,虽然我国已经有一些产品能和国外同类产品相竞争,但是在核心技术和核心部件方面还有很大的差距,需要“创新”。此外,刘文玉还从“科学仪器重大专项”出发,分析了目前我国科学仪器研发及产业化过程中存在的问题,如在国家重大专项支持项目中,有关核心部件的研发很少,产业化前景目前未知。  市场机会方面,刘文玉从质检系统、药检系统、环保部、农业部、第三方实验室等各方面介绍了中国科学仪器的机遇。其中,刘文玉还提到,2013年涉及国务院机构改革,其中最显著的变化——食品安全从“九龙治水”到食品药品监督管理总局,会否影响“十二五”计划的实施?这其中的变化与进程我们拭目以待。  据仪器信息网市场研究中心数据,获取仪器信息的第一大渠道就是网络,因此科学仪器行业要重视网络宣传,紧跟信息时代的步伐。此外,还应在市场研究、搭建合作和成果转化平台、重视人才培养和招聘等方面多下功夫。  在报告中,刘文玉还指出,科学仪器行业的“创新与发展”是一个值得研究的课题,中国的科学仪器未来要走怎样的路值得我们深思,或许中国的家电及汽车行业的发展模式能给一些参考。  最后,刘文玉特别强调,当前国内的一些科学仪器企业正在不断的壮大,未来的一切在于我们的“行动”、“理想”、“坚持”,并呼吁:为中国科学仪器的快速健康发展共同奋斗!2013中国科学仪器发展年会(ACCSI 2013)现场
  • 贝克曼库尔特收购Cytobank,拓展流式数据分析业务
    p style="text-indent: 2em "6月4日,贝克曼库尔特生命科学宣布收购strong在线流式数据分析网站Cytobank/strong。/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 400px height: 400px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201906/uepic/5dece831-c14b-44fd-b845-91ceee0ecbce.jpg" title="贝克曼.jpg" alt="贝克曼.jpg" width="400" height="400" border="0" vspace="0"//pp  Cytobank是一家位于加利福尼亚州的单细胞数据分析软件即服务(SaaS)公司。主营业务是为业界提供基于云和机器学习的软件平台,用于多参数单细胞数据分析,共享和归档。该平台能够在多个站点之间实现高效的多维多组学数据分析、可视化和协作,大大提高了研究效率。/pp  Cytobank公司的数据分析技术恰好可与贝克曼库尔特CytoFLEX LX 21色流式细胞仪联合使用,用以满足基础和临床研究科学家日益增长的高复杂性工作流程和数据分析需求。/pp  “我们很高兴将Cytobank创新性的软件解决方案添加到我们的流式细胞仪业务中,”贝克曼库尔特流式细胞仪业务部副总裁兼总经理Mario Koksch表示,“我们现在可以为制药/生物制药企业、学术临床科研机构客户提供更加标准化、更灵活的高端数据分析解决方案。”/pp  “Cytobank也很期待加入贝克曼库尔特,通过协作配合,帮助我们进一步开发Cytobank技术平台,为全球领先的科学家提供服务,”Cytobank总裁兼首席执行官David Craford表示。/pp  本次收购,Cytobank将成为丹纳赫生命科学平台下贝克曼库尔特生命科学事业部一员。据了解丹纳赫生命科学平台在2018年创造了约65亿美元的收入。/pp style="text-align: center "span style="color: rgb(192, 0, 0) "strong扫码关注3i生仪社,解锁更多生命科学仪器资讯!/strong/span/ppspan style="color: rgb(192, 0, 0) "strong/strong/span/pp style="text-align: center"img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201906/uepic/e47bd4ba-611b-48ed-9422-baa417f58186.jpg" title="640.jpg" alt="640.jpg"//ppbr//p
  • 沃特世在2014年国际质谱大会(IMSC)上推出用于小分子数据分析的Progenesis QI 2.0版
    新一代软件加强了控制能力,独具Pathway Mapping、Process Automation功能及改进的化合物数据库通道日内瓦—(美国商业资讯)—沃特世公司(纽约证券交易所代码:WAT)近日在瑞士日内瓦举行的第20届国际质谱大会上,推出了2.0版Progenesis? QI。该软件是一款用于液相色谱-质谱(LC-MS)小分子组学数据分析的新一代软件。 继六月份推出适用于蛋白质组大分子组学数据分析的2.0版Progenesis QI,沃特世今天发布的软件进一步完善数据平台。Progenesis QI和Progenesis QI蛋白组学软件将液相色谱-质谱(LC-MS)的数据分析速度和精度都提升至新水平,使用户能快速定量和鉴定样品中发生显著变化的小分子、脂质化合物和蛋白质。 Progenesis QI 2.0版的新功能包括:Pathway Mapping能促进将现有发现纳入生物学情境中的过程,从组学数据中获得尽可能多的信息;Workflow Automation能在没有人为干预的情况下,使软件在多个处理阶段自行运转,不仅节省了宝贵的时间,还能在夜间和周末持续运转;改进的化合物数据库通道,提高了成功鉴别化合物的机会;与EZInfo 3.0的扩展统计功能完美结合,具有双向的数据流,只需通过单一的菜单导向命令,就可实现灵活的数据挖掘。 沃特世全球营销和信息部门副总裁Rohit Khanna博士表示:“未进行深入了解的新发现是无用的。最新版本的Progenesis QI拥有改进的界面,使得软件的使用比以前更直观快速,让用户对他们的研究更有信心,并能更深入地理解获得的结果。” Progenesis QI 2.0版拥有基于研究人员的工作方式的灵活、直观易学的工作流程。它有着高度可视化的用户界面。扩展后的功能拓宽了在制药、健康科学、食品、环境和化学研究等诸多研究领域的应用。 如需了解更多有关Progenesis QI 2.0版软件的信息,请访问http://www.nonlinear.com/progenesis/qi/。更多Progenesis QI生物信息学软件的信息,请访问:http://www.waters.com/waters/zh_CN/Progenesis-QI-Software/nav.htm?cid=134790655&locale=zh_CN关于Progenesis QI软件2014年4月,在德国慕尼黑的Analytica Conference(分析研讨会)上,沃特世继收购组学数据分析软件领域的全球领导者Nonlinear Dynamics Ltd.之后,推出了Progenesis QI和Progenesis QI蛋白质组学软件。2014年6月,沃特世发布了用于蛋白质组学的2.0版Progenesis QI,扩充了信息学套装。Progenesis QI软件使研究人员能采用独特的方法分析并可视化LC-MS数据,准确定量和鉴定化合物和蛋白质。Progenesis QI软件支持所有常用的LC-MS数据格式,具有直观的导向性工作流程,能使用户能在宝贵的样品中快速、客观、可靠地找到目标化合物。Progenesis QI 2.0版拥有pathway mapping、process automation和改进的化合物数据通道等新功能,能提供增强的控制能力和功能。
  • BIOTREE 第一届2016组学数据分析美图秀
    p  /pp style="text-align: center "img title="大.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201612/insimg/6cc189f5-ba74-4d01-b40a-5e5b7b07d18d.jpg"//pp  无论是基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学或是脂质组学,组学的数据收集是科研人员面临的一个问题,但肯定不是最大问题。大多数人都同意,更大的问题是弄清楚组学数据集到底意味着什么。一年辛苦耕耘,在此2016年末之际,尽管组学数据分析仍存在巨大的瓶颈,但正所谓“高手在民间”,BIOTREE特此举办“span style="color: rgb(255, 0, 0) "strong第一届2016组学数据分析美图秀/strong/span”的活动,望各位生物达人热烈参与,相互切磋,共同进步!/pp  What' s Your New图?不要默默发光,快快加入秀出来!/pp  strong活动对象:/strong组学科研人员(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、脂质组学等)。限80名,注:为保证活动公平性,所有组学服务商业机构不得参加!/pp  strong作品要求:/strong不管您是用什么软件做出的组学数据分析图形,只要您觉得美,都可以提供给我们进行参赛,每人仅限提供1张参赛作品。作品范围不限,例如PCA / OPLS-DA / O2PLS得分图、载荷图、Permutation检验图,火山图,层次聚类热力图,GO分析图,代谢通路图,网络图等等。/pp  strong活动报名方法:/strong/pp  1、邮箱报名:a href="mailto:marketing@biotree.cn;zhangyanfang@biotree.cn"marketing@biotree.cnspan style="color: rgb(0, 0, 0) ";/spanzhangyanfang@biotree.cn/a/pp  2、BIOTREE微信公众号报名(请参考上图)/pp  3、电话报名:021-61531195/pp  strong报名提交内容:/strong/pp  A、报名者信息(姓名+单位+研究方向+联系电话+联系邮箱+邮寄地址)/pp  B、参赛作品简短介绍(研究意义,意境等,50字以内)/pp  C、1张参赛作品(矢量图或分辨率大于600dpi的图),主办方将压缩图片并加上水印(图作者和作品号)上传至投票平台/pp  D、请诚信参与本次活动,使用原创作品,禁止盗用他人图片/pp  E、后期将给参赛者提供作品集/pp  strong活动时间:/strong/pp  作品征集:2016年12月5日-12月31日/pp  作品评比(投票):2017年1月1日至1月16日(每人每天可投一票)/pp  投票截止日期:2017年1月16日24:00/pp  名单公布& 礼品发送:2017年1月17日-1月20日/pp  strong四大奖项:/strong/pp  BIOTREE将根据实际投票结果,评选出2016年度最佳New图,并赠予以下奖项 /pp  span style="color: rgb(255, 0, 0) "strong一等奖:/strong/spaniPhone 7(1名)/pp  span style="color: rgb(255, 0, 0) "strong二等奖:/strong/spaniPad Mini 4(1名)/pp  strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "三等奖/span/strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "span style="color: rgb(0, 0, 0) "(/span/spanTop 10):BIOTREE 2000元以内的培训班(2017年培训班)任选一个,可转赠(10名)/pp  strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "参与奖/span/strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "span style="color: rgb(0, 0, 0) "(/span/spanTop 20):BIOTREE定制U型枕 (前20名报名参赛者)/pp  获奖名单将于2017年1月17日于BIOTREE微信公众号公布;请获该奖项人员主动联系告知地址,方可安排快递奖品,有效期30天;strong联系热线/strong:021-61531195/pp  媒体赞助:/pp style="text-align: center "img title="p1.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201612/insimg/329ebf59-4caf-45f3-a8be-da33d090ecce.jpg"//pp style="text-align: center "img title="p2.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201612/insimg/89ba19e6-bc8f-431b-ba11-0dc2925d114a.jpg"//ppbr//p
  • 安捷伦宣布针对免疫肿瘤学、病毒学和疫苗开发市场推出自动化细胞分析工作流程
    2023年3月2日,北京——安捷伦科技公司(纽约证交所:A)近日宣布其 xCELLigence RTCA HT(实时细胞分析高通量)平台现已与 BioTek BioSpa 8全自动培养箱集成。为了响应市场需求,安捷伦将二者组合,实现了更高水平的自动化工作流程,为免疫肿瘤学领域的无标记高通量效价分析和疫苗市场的高通量病毒介导的细胞病变效应 (CPE) 检测提供了全新功能。制药研究人员要完成免疫肿瘤治疗的使命,面临着激烈的竞争,因此正在不断开发使临床研究加速成功的方法。同样,由于存在不断变化的公共卫生威胁,疫苗开发人员也面临着前所未有的压力。自动化工作流程可以提升候选药物筛选能力,是一种更快、更有效将研究转化为发现的手段。然而,许多现有的自动化工作流程解决方案仍然依赖大量的手动干预步骤,从而阻碍了通量并限制了方案开发的范围。配备 BioTek BioSpa 8 全自动培养箱的 xCELLigence 实时细胞分析高通量 (RTCA HT) 平台xCELLigence RTCA HT - BioSpa 8 的集成可为细胞增殖和细胞毒性提供无标记的非侵入性动力学结果,使研究人员能够分析多达八个 384 孔 板,从而提高通量并减少样品量。BioSpa 8 培养箱提供实时温度和 CO2/O2 控制,以及湿度监测功能。xCELLigence 仪器配备加热支架,因此可以保护细胞在从培养箱自动转移期间,免受不必要的扰动和培养条件的波动。用户友好的软件便于进行自动化检测和数据分析,使其成为真正无人值守的系统,此系统可用于鉴别对抗疾病的治疗方法,并为这一技术组合提供一定的自动化支持。安捷伦副总裁兼细胞分析事业部总经理 Todd Christian 说道:“这是免疫肿瘤治疗和疫苗开发的创新解决方案,表明安捷伦一直致力于抗击癌症和传染病。将我们的非侵入式实时细胞分析检测功能与生理条件的孵育培养结合,可提供简单的自动化工作流程,以提高生理条件下的通量和筛选灵活性。”范德堡大学医学中心范德堡疫苗中心副主任 Robert Carnahan 博士谈道:“xCELLigence RTCA HT 技术一直是促进高通量、快速和定量细胞病变效应 (CPE) 监测的关键,它是一种评估中和活性和效价的工具。我们能够绕过空斑或病灶形成实验中所需的众多动手、多步骤过程来测量病毒活性。”安捷伦提供包括用于实时细胞和代谢分析的工具,以及流式细胞仪、孔板和成像/显微镜平台,这些产品和服务有助于利用广泛的学科和方法进行药物发现。此次推出的这一全新集成解决方案展现安捷伦应对解决现实挑战的能力,兑现作为药物开发领域合作伙伴的承诺。关于安捷伦科技安捷伦科技有限公司(纽约证交所:A)是生命科学、诊断和应用化学市场领域的全球领导者,致力于为提高生活质量提供敏锐洞察和创新经验。安捷伦的仪器、软件、服务、解决方案和专家能够为客户最具挑战性的难题提供更可靠的答案。2022财年,安捷伦的营业收入为68.5亿美元,全球员工数为18,000人。如需了解安捷伦公司的详细信息,请访问 www.agilent.com。
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