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山豆根色满二氢黄酮对照

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山豆根色满二氢黄酮对照相关的资讯

  • 成都生物所发明判断大豆异黄酮糖苷水解的方法
    近日,中科院成都生物所发明的“一种判断大豆异黄酮糖苷是否水解或水解程度的方法”获得国家发明专利授权。  大豆异黄酮是大豆等豆科植物生长过程中形成的一类次生代谢产物,具有多种生理功能。它不仅参与调节植物的生长活动,还能对人体发挥有益的生理调节作用。天然大豆异黄酮苷类的分子结构并不是活性发挥的最佳状态,普遍认为苷元才是活性发挥的最佳状态。然而,在大豆中,大豆异黄酮主要是以染料木黄酮、大豆苷和黄豆苷糖苷形式存在的,它们对应的苷元染料木素、大豆苷元和黄豆苷元的含量很少。为了得到生物活性高的大豆异黄酮苷元,在工业上大多以大豆豆饼或豆粕为底物,采用酸水解或微生物转化的方法将糖苷转化为苷元。此前,判断大豆异黄酮糖苷是否水解及水解程度,通常是通过水解前后苷元含量的变化来判断的,此方法过程相对比较繁琐。  成都生物所发明的该种方法,通过商品豆粕经乙醇提取、提取液抽滤除杂质、减压蒸馏浓缩至无乙醇得水相、以水相为底物进行水解、用乙酸乙酯从水解液中萃取大豆异黄酮苷元、萃取液减压浓缩、浓缩相进行薄层层析、在紫外灯下观察层析结果,以此判断大豆异黄酮糖苷是否水解或水解的程度。该方法具有快速、准确等优点,具有良好的应用前景。
  • “秋天的第一片银杏”:银杏叶中黄酮的提取方法
    “银杏” 植物界的大熊猫明代诗人刘熠曾有诗《赠古泉上人》:“花深竹石迷过客,露冷莲塘问远公;尽日苔阶闲不扫,满园银杏落秋风”。自古以来,银杏就是文人墨客和寻常百姓们都喜爱的一种植物。银杏是我国的特有树种,是现存种子植物中最古老的孑遗植物之一,有植物界“活化石”的美誉,但由于银杏多年来已停止演化,野外种群已濒危并被列入濒危保护植物,目前仅在我国浙江、湖北、贵州等地还存在着少量的野生银杏。不过,随着多年来对这位“植物界的大熊猫”持续的人工栽培和保护,银杏已在全国遍地开花。每到深秋时刻,从北京潭拓寺到苏州天平山,从桂林海洋乡到西安古观音禅寺,扇形的金黄色银杏叶都会挂满枝头,层林尽染,为各地带来温暖多彩的秋日元素,描绘阳光下如诗如画般的金秋胜景。而银杏可不仅仅是颜值高,意境风雅这么简单;银杏叶中含有一种重要的提取物:银杏黄酮,也叫 Ginkgo biloba P.E.,它能够增加脑血管血液流量,改善脑血管血液循环功能,保护脑细胞,扩张冠状动脉,预防心绞痛及心肌梗塞,预防血栓形成,提高机体免疫能力;对冠心病、心绞痛、脑动脉硬化、老年性痴呆、高血压病人均十分有益;广泛应用于制药、保健品、日用品、化妆品等各个领域。而要想从银杏叶中提取黄酮,历史最久、经验最丰富、成本最低的方法就是溶剂提取法,使用乙醇溶液、丙酮水溶液或氢氧化钠水溶液进行粗提取,再经过脱脂、去银杏酚酸等精制工序得到黄酮精提物。但这种方法的最大问题是实验时间长,产品中有机溶剂易残留。使用传统的萃取仪器进行提取银杏叶黄酮提取物时,若使用 60% 乙醇溶液,为得到最大的提取率,80℃ 实验条件下最少需要提取三个小时。考虑到粗提取完成后还要进行的其他工序,若样品量较大,这个时长会极大拖慢研究效率。因此一款步琦的全自动化的萃取仪就可以通过优化实验流程和自动化极大缩短实验时间,通常来说可以将三个小时的提取时间缩短到两小时以下甚至一小时以下(具体取决于实验条件),并支持多个萃取位置同时进行方法相同或不同的实验并单独控制每个位置,支持多种不同溶剂以适配不同的分析物和不同的方法。固液萃取仪 E-800步琦公司的全自动化六位一体固液萃取仪 E-800 功能强大,仪器含有上下两个加热盘,可以根据客户所需的实验方法打开或关闭上加热盘。操作界面是 7 英寸的彩色触摸大屏,专有 APP 可在移动设备上进行萃取远程监视及数据处理,萃取报告可从设备中传输到移动设备及电脑软件,可接入 LIMS 系统;内置标准索氏萃取法、索氏热萃取法、热萃取法、连续萃取法、Twisselmann 萃取法五种方法。可以全自动实现真正的索式萃取法:即底部烧杯中的溶剂受热蒸发,被上部的冷凝器冷凝回落到萃取腔中与样品萃取,萃取腔中的溶剂慢慢积累,当达到液位后溶剂回流到底部的烧杯中,完成一次循环,反复多次,直至完成萃取过程。实验过程既可以设定萃取时间,也可以设定循环次数。E-800 提供的六个独立的萃取位置,可实现单独过程控制,也可同时运行不同的萃取方法、使用不同的萃取溶剂。每道拥有独立液位传感器,根据样品量调节的液位传感器,极大地改善索氏萃取法的循环时间。显著提高每天的萃取效率和样品处理量。E-800 拥有可重复使用的砂芯样品杯,可替代一次性的纸滤筒,节约实验成本;分析物保护系统可始终保证烧杯中只剩下极少量的溶剂,从而实现最佳的分析物回收率。整个萃取过程完全可见。玻璃组件可轻松取放和拆卸,以便进行清洁和在烘箱中去除污染物。E-800 的全自动系统,创新的法兰 Z- 密封系统,密封性良好,极大降低溶剂损失,配合高性能冷凝器,溶剂回收率最高可达 90% 以上,极大解决提取银杏叶黄酮这类实验过程中溶剂回收率低和样品中溶剂残留的问题。溶剂自动回收到可拆卸的溶剂回收瓶中,可重复使用,极大降低成本。而烧杯底部独特的磨砂设计可以防止溶剂爆沸。虽然人工栽培的银杏已经在金秋时节点缀了全国各地的大小城市,但作为一种仍不具备足够的野外生存能力的树种,银杏仍需我们长期持续的保护。研究银杏,从中提取黄酮等对人有益的天然产物,可以帮助我们更好地对它们进行保护。人类从大自然中汲取了许许多多的资源,合理适当的回馈自然,有益于人与自然的长期和谐共处。步琦作为实验室前处理设备领域的专家,愿持续提供更高效便捷、更人性化、更对自然友好的解决方案,助力研究人员进行各类天然产物的提取与分析,助力一个更美好的未来。
  • 我国从红三叶中提取异黄酮技术获得新进展
    中国科学院西北特色植物资源化学重点实验室药物化学成分研究组从红三叶中简便、高效提取异黄酮技术近日获得国家发明专利授权。据介绍,这为开发以异黄酮为有效成分的保健食品和医药品奠定了重要的技术基础。  这个实验室设立在中国科学院兰州化学物理研究所。据介绍,异黄酮是一种保健食品和医药品原料。近年来,国际上采用植物雌激素样物质替代激素治疗,特别是采用天然来源的异黄酮化合物治疗妇女更年期综合征、骨质疏松症、老年性痴呆等疾病取得了较大成效。  红三叶为豆科三叶草属的多年生草本植物,是一种优质牧草,我国民间以其花序及带花枝叶入药,用于镇痉、止咳、止喘,还可制成软膏治疗局部溃疡。研究发现,红三叶是少数几种含有4种雌激素样异黄酮的植物之一,具有大多数异黄酮6倍以上的雌激素样的活性,且具有双向调节作用。目前,红三叶异黄酮的提取物是国际上公认的治疗妇女更年期综合征疗效确切的植物药,其销量在美国多年来一直名列植物药前十位,我国每年均有大量出口。  课题组通过一步水解、水沉碱溶法、膜分离、柱层析等步骤,获得了高纯度的异黄酮系列产品。该方法采用膜分离技术进行纯化,一方面提高了产品中起药效作用的活性成分——异黄酮苷元的纯度 另一方面使大孔吸附树脂柱层析前的样品溶液得以净化,减轻了树脂的损害,延长了树脂的使用周期。此外,纳滤技术的应用使树脂柱层析前的样品溶液无需浓缩,可直接上样,简化了工序。  据介绍,该技术工艺简单,可适合工业化大生产,且制备过程中仅采用食用级乙醇为溶剂,具有安全、污染少、成本低的优点,为开发以异黄酮为有效成分的保健食品和医药品奠定了重要的技术基础,具有较高的社会效益和经济效益。
  • 战“痘”有方 | PerkinElmer发布猴痘病毒核酸检测试剂盒
    注意:该试剂盒仅供研究使用,且不在中国大陆销售。最近一段时间以来,除了大家日夜关注的新冠病毒疫情以外,另外一种传染性疾病——猴痘,时不时地就会登上热搜,出现在我们的眼前。猴痘(monkeypox)听上去是不是有些陌生?我们好像只听说过牛痘cowpox,还有一个英文很像的是天花(smallpox)。没错,他们都是亲戚,都属于正痘病毒属(orthopoxvirus)这个家族。猴痘其实也并不是一种新发现的病毒,世卫组织早在1970年,于非洲刚果第一次发现有人感染猴痘。而猴痘疫情也并不是很久没有出现了,美国2003年、2021年,英国2018、 2019、2021都有报道过猴痘。2022年5月初以来,已有20多个非地方性流行国家发现多例猴痘病例,且已出现人际传播。而这次特殊的一点是,出现了明显的社区传播。由于图片容易引起不适,这里就不放图了2022年7月1日,国家卫健委印发《猴痘防控技术指南(2022年版)》。指南介绍,猴痘是由猴痘病毒感染所致的一种病毒性人兽共患病,临床表现主要为发热、皮疹、淋巴结肿大。既往接种过天花疫苗者对猴痘病毒存在一定程度的交叉保护力,据WHO的数据,天花疫苗对猴痘病毒的保护率约为85%,而未接种过天花疫苗的人群对猴痘病毒普遍易感。指南指出,疾病控制旨在实现早发现、早报告、早诊断、早调查、早处置。各级各类医疗卫生机构日常接诊发热伴出疹病人时,应注意询问病例流行病学史,同时进行病原学筛查。针对近期国际上出现人际传播的猴痘病毒,PerkinElmer公司开发了对应的病原体核酸检测试剂盒,即PKamp Monkeypox Real-time PCR RUO Kit V1,该试剂盒基于多重实时荧光PCR技术,从纯化的核酸中定性检测猴痘病毒(MPXV)的核酸(DNA)。该试剂盒与天花病毒(VARV)和其他非天花正痘病毒(NVAR) 的DNA无交叉反应。正痘病毒属包含感染人类的四种病毒:天花病毒(variola,VARV)、猴痘病毒(monkeypox,MPXV)、牛痘病毒(vaccinia,VACV)(包括水牛痘,buffalopox)和牛痘病毒(cowpox,CPXV)。该试剂盒包含阳性和阴性对照,用于质控,确保报告结果的准确。另外,还添加了用于检测内源性基因RNase P的引物/探针组合,能够有效监测人类生物样本采集和核酸提取效率。特异性:针对猴痘病毒特异性F3L基因灵敏度:20拷贝/PCR反应自动化:与PerkinElmer自动化核酸检测流程完美兼容chemagen自动化核酸提取技术PerkinElmer通过结合自动化核酸提取和RT-PCR技术方面的专业知识,在提供高质量的自动化分子检测工作流程方面表现出色,这一点在新冠病毒核酸自动化检测方面得到了充分展现。在进行分子检测时,纯化的核酸质量是至关重要的,因为降解、杂质和酶抑制剂都会对最终检测数据的质量产生重大影响。PerkinElmer旗下chemagen自动化核酸提取技术完美解决了相关的问题挑战,可以高效地对目标核酸分子进行提取纯化,适用于荧光PCR检测和基因测序分析等下游应用。推荐使用chemagic™ 360全自动核酸提取仪搭配chemagic™ Viral DNA/ RNA 300 Kit H96 (货号:CMG-1033-S) 试剂盒对猴痘病毒进行提取纯化。Chemagic 360全自动核酸提取仪JANUS G3 PCR体系构建工作站基于液体驱动的移液系统,可提供超高精度的小体积加样,从容应对PCR体系构建过程中小体积移液需求;搭配灵活的4/8通道Varispan移液机械臂,间距可调,兼容不同规格的实验耗材;移液器腔体的连接管路可实时冲洗,避免气溶胶污染或者携带污染。JANUS G3 PCR体系构建工作站全自动化机器人整合系统(ARS)可实现样本从原始管上样、核酸提取到RT-PCR检测全流程的完全无人值守,更高通量根据提取仪数量的不同可达到几十块96孔板不等的连续工作。该系统整合了存储板栈、JANUS G3液体处理工作站、chemagic™ 360全自动核酸提取仪、封膜机以及主流荧光定量PCR仪,多台设备以机器人手臂为核心由中控软件统一控制,时序编排与控制软件管理设备间的协同工作,高通量样品进入流水线工作,可实现新冠病毒核酸提取与检测全流程无人值守,不仅有效提高样本检测效率,还保护实验人员免于感染风险。全自动化机器人整合系统(ARS)试剂盒信息试剂盒货号:SDX-62669试剂盒名称:PKamp™ Monkeypox Virus Real-time PCR RUO Kit V1试剂盒组成:试剂A酶混合液阴性对照MPXV试剂B1试剂盒包装规格:192测试/盒保存条件:-25℃~-15℃保存,有效期为24个月。阳性对照阳性对照货号:SDX-62670阳性对照品名:PKamp™ Monkeypox Virus V1 Positive Controls阳性对照包装规格:20次反应猴痘并没有那么可怕,但对其仍需重视,为潜在的传播风险做好预防、检测和治疗的准备。我们也在不断努力,践行我们的口号,INNOVATING FOR A HEALTHIER WORLD
  • 【瑞士步琦】黄酮类化合物的提取——“天然的保肝药” 都是怎么来的?
    “天然的保肝药” 都是怎么来的?水飞蓟素被成为“天然的保肝药”,是从菊科植物水飞蓟的干燥果实中提取而得到的一种黄酮木脂素类化合物。该类化合物具有清除自由基,抗脂质过氧化,保护肝细胞膜,促进肝细胞修复再生,抗肝纤维化,降血脂等效果。黄酮类化合物(flavonoids),原是指以2-苯基色原酮为骨架衍生的一类化合物的总称。现泛指两个苯环通过三个碳原子相互连接而成的一系列化合物的总称,即具有C6-C3-C6结构的一类化合物的总称。大量研究表明黄酮类化合物还具有降压、降血脂、抗衰老、提高机体免疫力、泻下、镇咳、祛痰、解痉及抗变态等药理活性。1介绍本文中将会介绍一种简便、可靠的方法,用来测定金盏菊中黄酮类化合物含量的应用。黄酮类化合物是多酚类次生代谢产物,对人体的生物利用度较低。一旦被吸收,黄酮类化合物被迅速代谢,产生具有抗炎、氧化、血栓形成、糖尿病和癌症特性的代谢物。黄酮类化合物存在于水果,蔬菜,谷物,树皮,根茎,花茶和葡萄酒中。在本文中,金盏菊粉末通过使用全频固液萃取仪 E-800 用索氏热萃取法提取,用紫外分光光度法测定黄酮类化合物的含量。2设备固液萃取仪 E-800 pro分析天平(精度 ±0.1mg)紫外/可见分光光度计(PerkinElmer Lambda 25)3样品和试剂样品:含花萼的金盏菊干粉,参考黄酮类含量:0.29%试剂:丙酮,六水氯化铝,甲醇 HPLC,六亚甲基四胺纯化物,无水硫酸钠,去离子水4实验流程黄酮类含量的测定包括以下步骤:分别用丙酮和酸水解同时提取和分解,形成黄酮类苷。黄酮类苷以结合态(黄酮苷)或自由态(黄酮苷元)形式存在,乙酸乙酯液液萃取黄酮类苷元,紫外/可见分光光度法测定黄酮类含量。1. 样品制备将萃取纸滤筒放入索氏萃取腔中称取 0.8g 均质样品到纸滤筒中在样品上加入 1.0mL 试剂在纸滤筒内加入 7.0mL 盐酸(浓度37%)2. 使用表1中参数设置用 E-800 进行提取表1:UniversalExtractor E-800 的索氏热萃取参数步骤_加热等级萃取方法索氏热萃取_溶剂丙酮_萃取10 cycles样品杯:11萃取腔: 3淋洗5 min11干燥AP, 2 min11溶剂体积 [mL]100_3. 液液萃取将提取液转移到 100ml 的容瓶中。将所得溶液 20ml 转移到分离漏斗中,加入 20ml 去离子水,用乙酸乙酯洗涤溶液,进行液-液萃取。收集有机相用 2x50mL 去离子水洗涤,用无水硫酸钠干燥后过滤有机相,将液体直接转移到 50ml 容量烧瓶中。4. UV / Vis分光光度法试验溶液:取 10.0 mL 原液,加入 1mL 氯化铝试剂,用 5% 冰醋酸在甲醇中稀释至 25.0mL。30 分钟后,测定测试溶液的吸光度,并在 425nm 处进行比较。5. 计算以金丝桃苷表示的黄酮百分比含量按式计算。金丝桃苷的吸光度为 500 (1%,d=1cm)5结果金盏菊样品被分成三份分析。测定的黄酮类化合物含量与参考值 0.29% 吻合较好。由于黄酮类化合物含量低,小的偏差导致较高的相对标准偏差。因此,定义了 5% 的相对标准偏差。结果如表2所示。表2:金盏菊提取物类黄酮含量测定结果6结论采用全频固液萃取仪 E-800 对金盏菊粉末中黄酮类化合物的含量进行测定,结果可靠,重复性好。与文献中描述的方法进行了比较。省略了提取过程中的费力步骤,获得更高的黄酮类化合物含量,残留损失较少,使用全自动萃取仪成功完成实验。步琦助力研究人员进行各类天然产物的提取与分析,提供更高效便捷、更人性化、更对自然友好的解决方案。▲E-800萃取仪7参考文献https://lpi.oregonstate.edu/mic/dietary-factors/phytochemicals/flavonoids#metabolism-bioavailability, 17.12.2020Chen A., Xiang W., Liu D., Liu C., Yang L., Determination of Total Flavonoids and ItsAntioxidant Ability in Houttuynia cordata, Complementary medicine researchJournal of Materials Science and Chemical Engineering, 4, 131-136, 2016.Williams R. J., Spencer J. P, Rice-Evans C., Flavonoids: antioxidants or signaling molecules?, Free Radical Biology and Medicine, 36, 838-849, 2004.Ph. Eur. Monograph on Caldendulae flos, 07/09:3000, corrected 10.1
  • 荧光定量PCR,你做对照了吗?
    前言吾日三省吾身,定量实验做对照了吗?在荧光定量PCR实验中遇到没有曲线、曲线异常等情况,我们总是会在第一时间去看阳性对照和阴性对照的扩增情况来分析原因。由此可见,实验中做对照的重要性不言而喻。在荧光定量PCR实验中,我们通常会按照如下的流程进行实验:样品采集,运输,样品处理,核酸提取,反转录(RNA 病毒),扩增 ,结果读取。为了提高实验结果的精准度,我们通常会通过设置对照的方式对检测的各个环节进行监控。阴性对照荧光定量PCR的灵敏度较高,对实验室的污染也非常敏感,阴性对照可以用来监控和发现污染的发生。常用的阴性对照包括以下几种:无模板对照(No Template Control, NTC)使用水代替荧光定量 PCR反应中的核酸,其它试剂按比例正常加入,用于监控扩增反应体系中的污染。正常情况下,NTC孔不会有扩增;当NTC出现扩增,则预示体系中有污染。在SYBR Green实验中,引物二聚体的形成也可能导致NTC出现扩增。阴性样本对照(Negative Sample Control)阴性样本对照指不含有目的基因或者靶序列的样本,也可以是样本保存液。和含有目的基因的样本一起进行核酸提取等过程。如果出现扩增,则说明实验过程中存在污染,结合NTC结果进行判断。无逆转录酶对照(No Reverse-Transcriptase Control, No RT)当进行RNA定量实验时,如果引物和探针设计在同一个外显子上,扩增有可能来源于未去除干净的DNA,此时可以设置无逆转录酶对照。无逆转录酶对照中不加逆转录酶。由于没有cDNA,DNA聚合酶无法扩增mRNA,则不应发生扩增。如果检测到扩增,则样本中可能含有未去除干净的DNA。阳性对照阳性对照必然是阳性的结果,用于排除假阴性。如果检测出来了这个样本不是阳性,则说明实验有问题,不可靠。阳性样本对照(Positive Sample Control)阳性内对照虽然可以在一定程度上反应核酸提取效率,但是却很难反馈提取流程中对核酸释放的效率。为了能更好的反映提取效率,可以选择已知阳性的样本或者保存在相似基质中已知浓度的病原体,作为单独的样本进行提取和后续的RT-PCR,通过Ct值评断实验流程。内参基因(Endogenous Control)内参基因可以用于反应样本本身的质量,比如拭子是否刮取到样本、RNA在运输和保存过程中是否有严重的降解等问题。内参基因一般选择在取样组织或细胞中均有足量表达的基因,且其表达量不受环境、实验处理条件和取样时间等因素影响,常用内参基因如表1所示。没有某个内参基因是万能的,内参基因需要根据样本类型和实验处理方式进行评估和选择。实验中通过内参基因的Ct值来判断取样和样本降解情况。在相对定量实验中,内参基因亦可用于对取样量进行均一化。▲ 表1: 已报道的部分物种qPCR内参基因扩增对照(Amplification Control)可使用含有扩增片段的质粒、假病毒或者基因组DNA/cDNA作为扩增阳性对照,监控荧光定量PCR的体系是否正常。当扩增对照没有扩增,或者Ct值大于预期,则说明定量PCR体系存在问题。内部阳性对照(Internal Positive Control, IPC)如果想监控每一份样本的整个实验过程,可以在提取之前在每个样本中加入一段外源DNA或RNA(不含目的片段),并在定量PCR时进行单管多重PCR,同时检测目的基因和这段序列。在每个样本中加入特定拷贝数的IPC,进而从该段序列的Ct值判断对应样品孔中的核酸富集和扩增效率。
  • 岛津成像质谱显微镜应用专题丨板蓝根可视化
    质谱成像技术揭示板蓝根中化学成分的空间分布 板蓝根(Isatidis Radix)为十字花科菘蓝属植物菘蓝(Isatis indigotica Fortune)的干燥根,具有清热、解毒、凉血、利咽等功效。作为清热解毒类的代表药物,板蓝根与广泛用于各类感冒的预防和治疗,在严重急性呼吸综合征(SARS)、甲型H1N1流感等疾病的防治中发挥了积极作用。新型冠状病毒肺炎(COVID-19)爆发以来,各版《诊疗方案》和“三药三方”中也不乏板蓝根的身影。板蓝根的抗病毒抗炎药效显著,但化学成分复杂,质量评价难度较高,因而一直是国内外研究的热点。 目前研究学者已经从板蓝根中分离得到近400个化合物,综合文献报道主要可归纳为生物碱、含硫化合物、苯丙素、核苷、氨基酸、有机酸、酚、黄酮、蒽醌、萜、醇、醛、酮、腈、酯、糖、甾醇、肽、鞘脂等19大类。研究药用植物化学成分的空间分布,有助于了解其形态学结构和功能。尽管板蓝根的化学成分研究已经十分深入,但其分子空间分布鲜见报道。质谱成像(mass spectrometry imaging,MSI)技术是近年新兴的分子成像技术,通过直接测定样品表面的离子信号获得其空间分布信息,具有非靶向、无需标记和多成分同时检测的优势。与光学图像采集技术结合后,既可观察到高分辨率的形态图像,又可对特定的分子进行鉴定和可视化分布分析,在生命科学领域显示出巨大的应用前景。本文首次采用高分辨质谱成像技术对板蓝根化学成分的空间分布进行分析。利用大气压基质辅助激光解吸电离-离子阱-飞行时间质谱(atmospheric pressure matrix assisted laser desorption combined with ion trap-time-of-flight mass spectrometry,AP-MALDI-IT-TOF/MS)扫描不同产地药材横切面,鉴定所含化合物,并观察化合物空间分布模式和富集位置,结合偏最小二乘回归(partial least squares regression,PLSR)算法,对不同样品进行分类。研究思路见图1。 图1 AP-MALDI-IT-TOF/MS成像技术揭示板蓝根中化学成分的空间分布 1. iMScope TRIO 成像质谱显微镜测试条件质谱成像技术在植物、动物、人体组织中的内源性成分和药物代谢组分的可视化检测方面发展迅猛,但在中药分析领域的应用才刚开始起步,且多用于新鲜采集的原植物或中药材。而真正用于市场流通和临床应用的中药材为干品,制备满足MSI测试需要的切片比较困难,故相关研究鲜见报道。在制备板蓝根干品冰冻切片时,其干燥、坚硬、易碎的结构带来了极大的挑战,故对冷冻切片的厚度、温度,切片固定方式,基质种类和添加方式等进行了详细的优化。板蓝根药材经明胶包裹冷冻后,先用双面碳导电胶贴牢后,再用冰冻切片机切制40 μm的组织切片,分别喷涂2, 5-DHAP溶液和1, 5-DAN溶液作为正、负离子的基质。主要质谱条件如下:激光照射直径:40 μm,像素间隔80 μm,扫描范围:m/z 100-500,m/z 500-1000。 2. 板蓝根中化合物的AP-MALDI-IT-TOF MSI可视化分布根据离子的准确质荷比、同位素丰度比,与对照品和液质一、二级数据比对,并结合文献检索和数据库搜查,初步鉴定了多个化合物类别118个质谱峰(见图2)。成像质谱显微镜将光学显微镜和质谱仪的优势整合,既可观察到形态图像,又可对分子进行鉴定和可视化分布分析,在软件上可简便且高精度地重叠观察光学显微镜图像与质谱分析图像,详细解析感兴趣区域。本文采用AP-MALDI-IT-TOF MSI技术首次揭示了板蓝根中化合物的空间分布, 图3和 图4展示了板蓝根横切面的木栓层、皮层、韧皮部、形成层、木质部及部分化合物在特定空间区域的分布。综合分析,板蓝根中化合物大多富集于营养储存的组织韧皮部,与之相比,水分输送组织木质部中集中分布的成分较少。 图2 板蓝根MALDI-IT-TOF MS成像化合物鉴别结果图3 板蓝根横切面光学图 (a) 和oxindole (b)、3-[2' -(5' -hydroxymethyl) furyl]-1(2H)-isoquinolinone-7-O-β-D-glucoside (c)、coniferin (d)、guanine (e)、histidine (f)、 proline (g)、arginine (h)、cyclo(L-Phe-L-Tyr) (i)等成分正离子质谱成像图 图4 板蓝根横切面光学图 (a) 和 isatindigoside F (b)、clemastanin B (c)、maleic acid (d)、malic acid (e)、citric acid (f)、sucrose (g)、isovitexin (h)、vanillin (i) 等成分负离子质谱成像图 3. PLSR法区分不同产地板蓝根药材将4个产地的各3批板蓝根药材分别划分到4个组。以样品横切面的AP-MALIDI-IT-TOF MSI数据为Y值,组别为X值,在正、负离子模式和m/z 100-500、m/z 500-1000两个扫描范围内,分别建立PLSR回归模型。由图5可见,在4个模型中,样品规格的预测值和实际值均呈现良好的相关关系,说明采用PLSR法可对不同产地的板蓝根进行准确的区分。 图5 MALDI-IT-TOF MS成像结合PLSR回归区分不同产地板蓝根样品 正离子m/z 100-500范围 (A)、负离子m/z 100-500范围 (B)、正离子m/z 500-1000范围(C)、负离子m/z 500-1000范围 (D) 本文相关内容由中国食品药品检定研究院的聂黎行研究员提供,详细研究内容已正式发表于Frontiers in Pharmacology - Ethnopharmacology, 2021, https://doi.org/10.3389/fphar.2021.685575。 文献题目《Microscopic Mass Spectrometry Imaging Reveals the Distributions of Phytochemicals in the Dried Root of Isatis indigotica》 使用仪器岛津iMScope TRIO 作者Li-Xing Nie1,2, Jing Dong3, Lie-Yan Huang2, Xiu-Yu Qian2, Shuai Kang2,4*, Zhong Dai2 and Shuang-Cheng Ma1,2*1 Chinese Academy of Medical Science & Peking Union Medical College, Beijing, China2 National Institutes for Food and Drug Control, National Medical Products Administration, Beijing, China3 Shimadzu China Innovation Center, Beijing, China4 College of Pharmacy, Hebei University of Chinese Medicine, Shijiazhuang, China
  • 压电位移台常用术语中英文对照表
    压电位移台常用术语中英文对照表Absolute accuracy : Deviation between the actual position and the desired one. If a stage has to move 100µm but it moves only 99.99µm (measured through an ideal scale), then the inaccuracy is 10nm. The permanent positioning error along an axis is designated as accuracy. Absolute accuracy is aff¬ected by calibration errors, linearity errors, hysteresis, Abbe errors and positioning noise. 绝dui精度:实际位置与所需位置之间的偏差。 如果一个平台必须移动 100µm,但它仅移动 99.99µm(通过理想标尺测量),则误差为 10nm。 沿轴的泳久定位误差称为精度。 绝dui精度受校准误差、线性误差、滞后、阿贝误差和定位噪声的影响。Backlash : Backlash is a positioning error occurring upon change of direction. Backlash can be caused by insufficiently preloaded thrust or inaccurate meshing of drive components, for example gear teeth. Piezoconcept’s flexure motion translation mechanism and piezo actuator designs are inherently backlash free. 齿隙:齿隙是在运动方向改变时发生的定位误差。 齿隙可能是由于预载推力不足或驱动部件(例如齿轮齿)啮合不准确造成的。 Piezoconcept 的弯曲运动平移机构和压电致动器设计本质上是无间隙的。Bandwidth : The frequency range to which the amplitude of the stage' s motion is dropped by 3dB. It reflects how fast the stage can follow the driving signal. 带宽:载物台运动幅度下降的频率范围为3dB。 它反映了平台能够以多快的速度跟随驱动信号。Drift : A position change over time, which includes the e¬ffects of temperature change and other environmental e¬ffects. The drift may be introduced from both the mechanical system and electronics. 漂移:位置随时间的变化,包括温度变化和其他环境影响的影响。 漂移可能来自机械系统和电子设备。Friction : Friction is defined as resistance between contacting surfaces during movement. Friction may be constant or speed dependent. Because they use flexure, the nanopositioners from Piezoconcept are friction free. 摩擦力:摩擦力定义为运动过程中接触表面之间的阻力。 摩擦力可以是恒定的或取决于速度的。 因为使用柔性连接,Piezoconcept 的纳米定位器是无摩擦的。Hysteresis : The positioning error between forward scan and backward scan. A closed-loop control is an ideal solution for this problem and is done by using a network of High Resolution silicon sensor to provide feedback signals. 滞后:前向扫描和后向扫描之间的定位误差。 闭环控制是该问题的理想解决方案,它通过使用高分辨率硅传感器网络提供反馈信号来完成。Linearity error : The error between the actual position and the first-order best fit line (straight line). Our nanopositioning products are calibrated with laser interferometry and the non linearity errors are compensated down to 0.02% of the full travel.线性误差:实际位置与一阶蕞佳拟合线(直线)之间的误差。 我们的纳米定位产品使用激光干涉仪进行校准,非线性误差补偿低至全行程的 0.02%。Orthogonality error : The angular off¬set of two defined motion axes from being orthogonal to each other. It can be interpreted as a part of crosstalk. 正交性误差:两个定义的运动轴相互正交的角度偏移。 它可以解释为串扰的一部分。Position noise : The amplitude of the stage shaking when it is on a static command. It is usually measured and specified with Peak-To-Peak value. It is a combination of the sensor noise, driver electronics noise and command noise, etc. The position noise of our stages is very limited due to the very high Signal-To-Noise ratio of the Silicon HR sensors we use. 位置噪声:在静态命令下载物台晃动的幅度。 它通常用峰峰值来测量和指定。 它是传感器噪声、驱动器电子噪声和命令噪声等的组合。由于我们使用的 Silicon HR 传感器具有非常高的信噪比,我们平台的位置噪声非常有限。Range of motion : The maximum dISPlacement of the nanopositioners. 运动范围(行程):纳米定位器的蕞大位移。Resolution : The minimum step size the stage can move. 分辨率:舞台可以移动的蕞小步长。Resonant frequency : Piezostage are oscillating mechanical systems characterized by a resonant frequency. The resonant frequency that we give is the lowest resonant frequency that can be seen on a nanopositioner. In general, the higher the resonant frequency of a system, the higher the stability and the wider working bandwidth the system will have. The resonant frequency of a piezostage is determined by the square root of the ratio of sti¬ness and mass. 谐振频率:压电级是以谐振频率为特征的振荡机械系统。 我们给出的共振频率是在纳米定位器上可以看到的蕞低共振频率。 一般来说,系统的谐振频率越高,系统的稳定性和工作带宽就越宽。 压电级的共振频率由刚度和质量之比的平方根决定。Silicon HR sensor : Piezoconcept use temperature compensated High-Resolution silicon sensors network for reaching highest long-term stability. This measuring device is capable of measuring position noise in the picometer range and its response is not dependent of the presence of pollutants, air pressure changes like other high-end sensors can be. Si-HR 传感器:Piezoconcept 使用温度补偿高分辨率硅传感器网络,以达到蕞高的长期稳定性。 该测量装置能够测量皮米范围内的位置噪声,并且其响应不依赖于污染物的存在,应对改变气压带来的影响与其他高端传感器一样。Step response time : The step response time is the time needed by the nanopositioner to do the travel from 10% of the commanded value to 90% of the commanded value. The step response time reflects the dynamic characteristics of the system and is relatively to the installation method and load of the stage.阶跃响应时间:阶跃响应时间是纳米定位器从指令值的 10% 到指令值的 90% 所需的时间。 阶跃响应时间反映了系统的动态特性,并且与位移台的安装方式和负载有关。更多详情请联系昊量光电/欢迎直接联系昊量光电关于昊量光电:上海昊量光电设备有限公司是国内知名光电产品专业代理商,代理品牌均处于相关领域的发展前沿;产品包括各类激光器、光电调制器、光学测量设备、精密光学元件等,涉及应用领域涵盖了材料加工、光通讯、生物医疗、科学研究、国防及更细分的前沿市场如量子光学、生物显微、物联传感、精密加工、先进激光制造等;可为客户提供完整的设备安装,培训,硬件开发,软件开发,系统集成等优质服务。相关技术文
  • 专家视角丨药物研发过程中的化学对照品探讨
    精准药物分析的工作,离不开稳定的分析系统和可靠的标准物质(标准品/对照品等)。标准物质具有复现、保存和传递量值的基本作用,对实现测量结果的溯源性,保证测量结果在时间与空间上的连续性与可比性,进而确保测量结果的准确可靠、有效与国际互认具有关键作用。 岛津为制药行业客户提供稳定可靠的标准品/对照品制备解决方案:制备液相系统(Prep LC)、质谱引导的制备液相系统(MS-trigger Prep LC),超快速制备纯化液相色谱系统(UFPLC)、制备超临界流体色谱(Prep SFC)。 超快速制备纯化液相色谱系统(UFPLC)可在线完成从分离、浓缩、纯化到回收的制备全过程。 2020年,中国药科大学药物分析系吴春勇博士于新药仿药CMC实操讨论群进行了精彩而全面的主题分享,并发表在“新药仿药CMC实操讨论”公众号,经过“新药仿药CMC实操讨论”的授权,在此分享吴春勇博士的《化学药物研发过程中的对照物探讨》。 概述案例 对于吴春勇博士的《化学药物研发过程中的对照物探讨》,新药仿药CMC实操讨论群也进行了较为热烈的探讨。PPT正文后续延申的讨论内容如下(基本按照时间先后顺序列出)。 沈晓斌博士(前FDA资深审评员,FDA报批咨询顾问):very nice.吴博士论述的非常全面、非常细。我们就说比如说在FDA做review的时候呢,我们个人不会接触那么全面,各种各样的方式,这个标准品的这个去就是抽点它的含量呀,就是拿到他的COA,通常不会把各种方法都是看过一遍的。 就是它这个PPT呢,把所有的东西都给想细细的捋了一遍,个人觉得就是这是一个对知识体系的全面的补充,有些东西,因为你以前没有接触过,你不会考虑那么细,当在FDA的时候你看到的是公司怎么做,然后你来评估他是否合理,是否可以接受,或者跟FDA的现有要求,来评估。 想要就说一点,FDA本身他不去说去该怎么去定量,这个标准品他只是负责审评,就是评审你(的资料),外界可以自己去建议你想要的方式,但是你要有足够多的科学依据,然后他(FDA)来评估是否可以接受,就是完全靠自己来论述清楚。 另外就是说国内看起来,这个我以前对国内这个没有太多的,而且也没有特别去关注,因为我这个工作最早才从FDA报批方面的东西,吴教授这个主题一讲,觉得国内在有些方面其实要求是似乎是比USP、FDA的要求更细更多一些,有一种感觉就是弯道超车已经超了,在有些方面实际上是做的更好。只不过,过去这些年,西方就是设定了这种既定的质量标准,那其他国家,就因为你要照着西方去做仿药嘛,你就必须根据他的规则来走,更多的是这方面的区别。 孙亚洲老师(长沙晶易首席科学家):意见1:研发人员买的非法定对照品,外标法测定杂质含量时,很多人直接采用了COA的赋值,也直接采用相应的测定结果订入了标准,有些不妥。包括批检验,最初的朔源需要是法定对照或者经过标定的对照品。 意见2:在吴博士的ppt中,对于非法定来源的如百灵威,sigma等买到的杂质对照品,拿到后是否需要再行进行研究工作或者分析一下是否存在风险,似乎没有提出来。这个问题建议大家是否深入思考一下。 群主补充:只有经过标化赋值且可溯源(过程,方法,验证)的,风险才是最低的。 群主补充:尽管杂质测定中,如5%的误差是可以接受的(这属于科学性的范畴);但不等同于对照品/标准品可以草率拿来,草率采用他人的赋值,这完全是两个范畴。也许某份杂质对照品中含水量10%,无机成分包括前处理过程带来的硅胶等30%,若草率定量,杂质的真实含量会被低估如40%。 沈晓斌博士:同意以上的观点。 群友1:通过药品杂质的公司购买的对照品,我们就碰到了,欧美的一家知名公司提供的对照品结构出现偏差,我们通过多次比对都无法拿到和代谢产物吻合的结果,多次交涉和讨论之后才发现该公司的产品是另外一个同分异构体。 吴春勇博士(中国药科大学药物分析系副教授):看来概率虽然小,这个问题还是客观存在的。 沈晓斌博士:提供化合物的公司没有责任和义务。使用者必须做该做的来证明给监管机构标准品的使用是合理的。 刘国柱博士(长沙晨辰医药创始人、技术总监):我请教吴博士一个问题,目前国内杂质对照品市场非常混乱,大部分购买的杂质对照品都是经几手倒卖才到厂家手里,对照品塑源存在问题,谱图与赋值真实性也存在问题,请问对此引入的风险有何看法? 群友2:在购买对照品的时候,在COA的同时能否得到该合成方法的信息,这个在技术层面上是有难度的。没有哪个合成公司愿意提供产品合成路线给对方的。 群友3:好多杂质对照品本身不稳定,需要在-20℃保存,有可能在运输过程中就发生了变化,拿到的第一时间应该进行确认,遇到好几次这种情况。 吴春勇博士:在现有的条件下,购买的商业化对照品全部自己赋值,实践上还是存在相当的困难,成本上也没法控制。所以我个人观点:1)尽量选择知名公司;2)自己对风险进行评估,尤其是校正因子与各国药典不同,或者结构上与待测药物的生色团类似,分子量相当,校正因子却有显著不同。 【插话:知名公司依旧有风险或风险大】 是的,分享的那个案例,购买公司是业界相当知名的! 群友4:购买杂质时能同时获得合成信息的可能性非常小,最多提供四大谱(还不带解谱的),那就需要公司内部有比较强大的解谱能力,有碰到过解谱结果和供应商提供的不一致的情况,所以购买“商业化”的杂质对照风险是很大,市场良莠不齐,缺乏有效的管控。 群友5:我们碰到问题的那家公司就是业界知名对照品公司,也有出失误的概率。 刘国柱博士:另请教吴博士及大家一个问题,目前国内许多企业对于杂质对照品的结构确证,很多时候都只做了质谱与NMR氢谱与碳谱,不做二维;而事实上不做二维NMR谱,NMR信号是无法归属的,从而不足以确定杂质结构,有可能确证的结构是错的;请问这个问题大家如何看待? 吴春勇博士:我个人只要做结构确认,一定做二维。 刘国柱博士:那我和您观点一致,强烈呼吁大家做结构确证一定要做二维。 购买的杂质对照品一般只提供质谱与NMR氢谱与碳谱,不做二维与结构解析;在此习惯引导下,国内许多企业自已做杂质结构确证也只做个质谱与NMR氢谱与碳谱,个人观点这是存在风险的做法。 代孔恩(安士研发总监):法规有明确规定必须这么表征,很多标准品量很小,做全应该不容易。【插话:情况多,复杂,没法一刀切】 黄常康博士(南京百泽医药创始人):有些杂质是定向合成的,或者是有文献数据的。我觉得根据实际情况来判断需不需要。不用二维定不了结构的,该做就做,有些简单的杂质,其实氢谱已经足够了,质谱只是多一个证据。 自己做的话,还需要加上做结构确证的杂质的钱,很多时候会差很多。 群友6:对照品的检测分析,既要有普遍性的,也要特殊性的,这个普遍性与特殊性的界点怎么界定,很难有一个文件化的说法。 以上讨论内容来源: 新药仿药CMC实操讨论公众号
  • 利用MALDI质谱成像技术揭示牡丹和芍药根的空间代谢组
    关键词:MALDI-MSI 质谱成像、Paeonia suffruticosa 牡丹、Paeonia lactiflora 芍药、Monoterpene glycoside 单萜苷、Spatial distribution 空间分布01 前言 芍药属植物具有较高的观赏价值和经济价值,以及重要的药用价值,引起园艺学家、植物学家和草药学家的极大关注。芍药属植物约有35种,其中牡丹 (Paeonia suffruticosa,PS)和芍药(Paeonia lactiflora ,PL)是两种主要的东方药草。牡丹和芍药同属,外形也极为相似,从植株形态上进行区分:牡丹,是小灌木,有木芍药之称;而芍药是多年生草本植物。在中国、日本和韩国,牡丹皮(牡丹的干燥根皮)和白芍(芍药的根部)是具有镇痛和抗炎活性的重要中药。尽管 PS 和 PL 的植物化学和药理作用的相似性和差异性已经被广泛研究,但其空间代谢组的比较几乎没有报道。空间代谢组学是代谢组学研究发展中的一个分支,它提供了组织结构和个体代谢物之间的直接联系。阐明PS和PL的空间代谢组差异在植物分类和药用植物质量控制等领域具有重要意义。02 摘要 2021年4月,中国药科大学天然药物与中药学院国家重点实验室李萍教授、李彬教授在 New Phytologist 期刊上发表了题目为:“Unveiling spatial metabolome of Paeonia suffruticosa and Paeonia lactiflora roots using MALDI MS imaging”的研究论文,本研究结合多基质和正负离子检测模式,对牡丹和芍药的根切片进行了高质量分辨率基质辅助激光解吸电离质谱成像(MALDI MSI)和 AP-SMALDI 串联质谱(MS/MS)成像,系统地研究了单萜糖苷类和丹皮酚苷类、单宁类、黄酮类、糖类、脂类等多种代谢产物的空间分布。利用 Li DHB 基质的串联质谱成像技术来准确区分芍药苷和芍药内酯苷两种结构异构体的组织分布。此外,参与没食子单宁生物合成途径的主要中间产物在根部成功定位和显示。03 结果 3.1MALDI MSI的PS和PL根代谢产物的原位分析采用高分辨率 MALDI MSI 和 MALDI MS/MS Imaging 相结合的方法,获得了 PS 和 PL 根横截面的综合代谢产物分布图,并进一步用 LC-MS/MS 进行了验证。代表性部位的质谱图从根的四个区域获得,包括木栓层、皮层、韧皮部和木质部(图1)。在正离子模式下,使用 DHB 基质,检测到两种主要特定类别的次级代谢物单萜糖苷类(monoterpene glycosides,MGs)和没食子单宁(gallotannins)。在 PS 和 PL 中均观察到共同的代谢物 MGs,如芍药苷/芍药内酯苷(m/z 519.1263,结构异构体)、氧化芍药苷(m/z 535.1212)、苯甲酰芍药苷(m/z 623.1525)、牡丹皮苷 A(m/z 653.1631)、牡丹皮苷 B/J(m/z 669.1580)、牡丹皮苷 E(m/z 565.1318)和苯甲酰氧芍药苷/牡丹皮苷 C (m/z 639.1475,同分异构体)。牡丹/芍药中生物合成的没食子单宁是没食子酸葡萄糖酯(即没食子酰葡萄糖,GGs)。如图1所示,观察到具有相邻峰间距为 152.01 Da 的 m/z 分布,表明母体分子上连续添加了没食子酸基团。在 PS 和 PL 中,检测到12个没食子酰基残基的取代产物(2GG-12GG,m/z 523.0485-2043.1581)。作者还发现了 PS 特有的成分—丹皮酚苷类(PGs),如牡丹酚甙(m/z 367.0790)、牡丹酚原甙和牡丹酚新甙(m/z 499.1212,同分异构体)。图1. 正离子模式下牡丹(左)和芍药(右)根横截面不同区域的 MALDI 质谱图3.2MALDI MSI比较PS和PL根单萜和丹皮酚苷类成分的空间分布图a中,通过 PS 和 PL 的横截面可以看到解剖结构中的物种多样性,PS 根木质部区域高度木质化;PS 韧皮部约占整个横切面的45-55%,PL 根的韧皮部仅占10-20%。图b中,可以看到 PS 和 PL 中单萜糖苷类的空间分布模式,芍药苷(m/z 519.1263,[M+K]+)及其衍生物主要分布在 PS 和 PL 的木栓层、韧皮部区域,PL 的木质部射线区,但在 PS 的木质部(木芯处)检测信号较低。此外,在图c中,可看到丹皮酚苷的空间分布,在 PS 根的木栓层和韧皮部中可以解吸出丹皮酚苷类化合物,如丹皮酚苷(m/z 367.0790)、牡丹酚原甙和丹皮酚新甙(m/z 499.1212,同分异构体)、丹皮酚苷A/B/C/D(m/z 651.1322,同分异构体)和丹皮酚苷E(m/z 661.1741),而 PL 的根中不存在丹皮酚苷类物质。图2 牡丹和芍药根的 MALDI 成像 (a. 甲苯胺蓝O染色的组织切片的光学图像;b. 单萜糖苷类(MGs)的离子图像;c. 丹皮酚苷(PGs)的离子图像)。3.3AP-SMALDI MS/MS成像分析结构异构体的空间分布由于存在高丰度 [M+K]+ 断裂困难、[M+Na]+ 丰度太低等问题,Li DHB 被应用于本实验 AP-SMALDI MS/MS 成像。如图3(a)所示,Li DHB 显示为产生芍药苷和芍药内酯苷的 [M+Li]+ 二级碎片的有效基质,其中两个差异片段 m/z 253.13(芍药内酯苷)和 m/z 255.11(芍药苷)被检测到。在 50μm 空间分辨率下进行 AP-SMALDI MS/MS 成像实验,并在 m/z 487.1777处检测到 [芍药苷/芍药内酯苷+Li ] + 的前体分子离子。前体分子离子和二级碎片离子的离子图像如图3(b)所示,显示了前体分子离子和最终产物离子的空间分布,在 PS 中,仅检测到 m/z 255.11,且主要在木栓层中观察到;在 PL 中检测到 m/z 255.11 和 m/z 253.13,二者分布趋势相似,且木栓层、韧皮部和木质部射线区的信号强度高于皮层和木质部维管束。通过 AP-SMALDI MS/MS 成像,芍药苷和芍药内酯苷的空间分布被清晰的呈现出来。作者使用 LC-MS 方法进一步验证 MALDI 成像结果,PS 和 PL 的根被人工分成木质部和木质部外两个部分。如图3(c)所示,LC-MS 结果与 MALDI 成像结果一致,在牡丹中仅检测到芍药苷;在芍药中,检测到了两者,并且在外层中观察到更高丰度的芍药苷和芍药内酯苷,因此,Li DHB 基质是可行的,以获得用于分辨异构体空间分布的不同片段。图3 MALDI MSI 及 LC-MS 验证。(a)前体物质m/z 487.18的串联质谱,分别来自芍药内酯苷和芍药苷。(b)像素大小为50μm的牡丹(PS,上)和芍药(PL下)根中芍药苷和/或芍药内酯苷的 MSI图。(c)用 LC-MS 从 PL 和 PS 根切片的不同部位相对定量芍药苷和/或芍药内酯苷。3.4MALDI MSI的PS及PL根部没食子单宁生物合成途径的空间分布分析下图4显示了在牡丹和芍药的根切片中显现的没食子酸生物合成途径和离子图像,在牡丹和芍药根中观察到总共13种参与没食子酸生物合成途径的代谢物,包括没食子酸、没食子酰葡萄糖、2GG -12GG。如图4所示,没食子酸(m/z 169.0142,[M-H]-)是合成没食子单宁的起始化合物。没食子酸主要分布于 PS 的木质部区域(木芯),广泛分布于 PL 的根部,形成层部位含量明显增高。β-葡萄糖苷作为没食子单宁的基本单元和主要的酰基供体,主要分布于 PS 的韧皮部,PL 的木质部射线和皮层。从 2GG-12GG 途径观察到没食子单宁空间分布的动态变化。2GG、3GG 主要分布于 PS 的木栓层和韧皮部区域,在 PL 中含量明显较低。4GG、5GG 主要分布在 PS 的木栓层、韧皮部和木质部中,PL 的木质部和韧皮部。其中,作为 6GG-12GG 合成的前体物质,5GG 相对均匀地分布于牡丹和芍药根中。从 6GG -12GG 的第二个序列中,复合单宁主要集中在 PS根的木质部导管区和PL的楔形木质部区域和皮层中,且覆盖面积呈明显下降趋势(尤其是 11GG 和 12GG )。图4 MALDI 质谱成像技术研究牡丹和芍药根中没食子单宁生物合成途径。(a)没食子单宁的生物合成途径。(b)从 PS (左)和 PL (右)根切片获得的参与没食子单宁生物合成途径的主要中间体的质谱成像图。3.5MALDI MSI比较PS和PL根中其他代谢物的空间分布槲皮素(m/z 303.0499,[M+H]+)主要存在于 PS 和 PL 的皮层中(图5)。单糖(m/z 219.0266,[M+K]+)、二糖(m/z 381.0794,[M+K]+)、三糖(m/z 543.1322,[M+K]+)和四糖(m/z 705.1850,[M+K]+)主要积累在 PS 的皮层和韧皮部以及 PL 的皮层和木质部射线区。脂质 PC(34:2) (m/z 796.5253,[M+K]+)和 PC(36:4) (m/z 820.5253,[M+K]+)主要分布于 PS 的根系形成层和 PL 的木质部射线区。图5 从牡丹(PS,左)和芍药(PL,右)根部切片中选取的类黄酮、糖类和脂类的离子图04 总结 本研究采用 MALDI MSI 结合 LC-MS 代谢物检测技术,系统表征了单萜和丹皮酚苷类、鞣质类、黄酮类、糖类和脂类等多种代谢产物(65种)的空间分布。用高分辨 MALDI MSI 研究了两种芍药科植物牡丹和芍药共同代谢物和特定代谢物在空间分布上的相似性和差异性,为代谢物的生物合成、运输和积累研究提供了重要信息。为了解决异构代谢物空间分布不明确的问题,作者进行了 MALDI 串联质谱成像,明确了芍药苷和芍药内酯苷的空间分布。本研究表明牡丹和芍药的皮以及中心部位都含有丰富的生物活性物质,能够为传统药材加工方法的改良提供直观的依据。此外,本研究还首次绘制了参与没食子单宁生物合成途径的前体以及中间体的空间分布图,可水解的单宁主要分布在木栓层、韧皮部等,其可能在不损害细胞质成分的情况下发挥保护作用,如对抗生物压力;鞣花鞣质倾向于在木质部区域积累,这可能与木质素具有共同的支持植物的功能。综上所述,高分辨率 MALDI MSI 提供了全面、准确的代谢物空间分布,为中药的深入研究、使用和加工方法的改良提供了独特的见解。文献地址:https://nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/nph.17393「科瑞恩特」独家代理质谱成像离子源在大中华区独家代理的两款质谱成像离子源,都可搭载Thermo ScientificTM Q ExactiveTM或Obitrap ExplorisTM系列质谱仪。AP-SMALDI 5AF高分辨自动聚焦3D快速质谱成像系统,常压操作环境,空间分辨率可达到3μm,独特3D检测模式可以检测凹凸不平的样品表面,快速检测模式可达18pixel/s,全像素检测大大提高检测灵敏度,高空间分辨率和高质量分辨率使样本中的分子化合物达到最佳成像效果。MALDI ESI InjectorTM 透射式超高分辨质谱成像系统,可以同时搭载MALDI离子源与ESI离子源,既可用于传统LC-MS/MS实验,也可用于质谱成像检测,通过双离子漏斗接口实现离子源快速切换,无需拆卸,操作便捷,并且接口可以进一步升级为MALDI-2和t-MALDI检测,大大提高空间分辨率和检测灵敏度。
  • JP摩根健康大会这四天:各大仪器公司都秀了啥?
    仪器信息网讯:旧金山当地时间2017年1月9日~12日(北京时间1月10日~13日),备受全球医药企业及仪器公司关注的第35届JP摩根健康大会(JP Morgan Health Conference)在美国西海岸城市旧金山如期举行。  作为医疗健康行业历史最悠久、规模最大的投资人会议, JPM每年都会吸引从跨国医药公司高管到生物技术创业者,从投资银行家到证券分析师等大量业内资深人员的参与,旧金山也成为许多合作的萌芽地。  第35届JP摩根健康大会的“秀场”上,各大上市或私营公司将有20~25分钟的演讲时间,以展示各自的产品及理念。当然,许多跨国仪器公司也会携最新技术/产品而来。JPM年会这四天,让我们看看各大仪器公司都秀了啥?  (丹纳赫、赛默飞、沃特世、布鲁克等跨国仪器公司出席大会并做演讲,演示内容尚未公开,因此暂不做统计。)  Day One  Illumina  在经历前几天Grail融资脱离与股票震荡之后,Illumina公司不负众望,在JP摩根健康大会第一天推出了新的系列产品——NovaSeq。令人振奋的是,最佳运行状态下的NovaSeq系列产品有望将人类全基因组的测序成本减少至100美元。这一巨大的变化将进一步把二代测序技术推向临床应用,在未来技术要求更高的大环境下继续助力精准医疗。  根据相关信息,NovaSeq系统有效整合了Illumina历代测序产品多种优势,能够以更低的成本和运行时间产出更高质量和数量的数据。Illumina首席执行官兼总裁Francis deSouza在大会上表示,Novaseq将成为Illumina发展历中的璀璨一页。  此外,新年“霸屏”的Illumina还在大会上宣布了三项合作,包括:与Bio-Rad(BIO)联手推出Illumina Bio-Rad单细胞测序解决方案 与IBM合作将Waston超级计算机整合到Illumina公司的BaseSpace和肿瘤测序流程中 和皇家飞利浦合作,将Illumina测序系统的遗传变异大规模分析测序系统融入飞利浦的IntelliSpace Genomics临床信息平台。  Qiagen  Qiagen在第一天宣布了一件重大新闻:收购生物信息学公司OmicSoft。OmicSoft推出的一套工具能够使研究人员分析和可视化数据,并可与其大型的,可公开获得的多组织数据集进行比较。Qiagen 表示,该收购将为其提供可扩展和灵活的软件架构解决方案,使其能够扩展生物信息学领域的产品。  同时,Qiagen还宣布已经向FDA提交了QuantiFeron TB Gold Plus测定和第四代Quantiferon结核病测试,并公布了其GeneReader NGS系统的增强功能。预计到2020年,QuantiFeron Gold测试销售将达3亿美元。  Day Two  10x Genomics  在2015年的摩根健康大会上以黑马之姿出现在公众视野的10X Genomics公司,在今年的大会上推出了与制药公司合作开发的“高清免疫学”新产品。该产品可搭载在Chromium系统上运行,应用于免疫肿瘤应用,为每个样品提供数百万T细胞受体的单细胞分辨率,使研究人员能够更好地了解免疫治疗反应。产品预计于2017年上半年开始上市,每个样品的成本为$ 1,200。  此外,10X Genomics公司CEO Serge Saxonov在演讲中表示,它已经与PerkinElmer签署了一项协议,结合使用各自的技术,共同提供自动化的下一代测序解决方案。  NanoString Technologies  继2016年第四季度收入令人失望之后,NanoString首席执行官Brad Gray在会议第二天介绍了该公司的合作伙伴关系,并宣布提供Digital Spatial Profiler和Hyb&Seq技术更新。  NanoString在去年的摩根大会上首次提出数字信号处理(DSP)技术结合Hyb&Seq测序技术概念,能够使研究人员通过观察肿瘤生物学被分析肿瘤区域来解决诸如肿瘤异质性的问题。Gray表示,公司在过去三个月中已经建立了八个不同的技术获取项目,每个项目大约有20个样本,每个项目的收入约为99,000美元。NanoString计划在2017年开发一个DSP样品制备仪器,将与Sprint,Max和Flex等其它三个nCounter系统兼容。  Bio-Rad Laboratories  Bio-Rad首席执行官兼总裁Norman Schwartz说,该公司计划于2017年年底推出一个自2014年收购GnuBio以来一直在开发的测序系统。该系统的问世象征着公司首次进军肿瘤学,产品最终将用于诊断,但其初始市场将是肿瘤学研究。  同一周,Bio-Rad还和Illumina在合作基础上推出了单细胞测序工作流程。该工作流程将Bio-Rad的ddSEQ单细胞分离器和SureCell WTA 3' 文库制备试剂盒与Illumina的测序系统实现了结合。  Day Three  Berry Genomics  贝瑞和康CEO周代星表示,2016上半年,公司在无创产前测试(NIPT)体外诊断和测试服务业务上的净利润约为1000万美元。尽管目前国内NIPT的样本检测终端价格在200美元到300美元之间,但随着2017年NIPT在中国市场的普及,这一块的整体规模有利可期。通过与医院开展相关合作,贝瑞和康也占领了大部分的市场份额。  此外,贝瑞和康还计划在2017年开展单基因无序检测,并在肿瘤学领域利用单分子扩增重测序技术(cSMART)评估循环肿瘤DNA,以应对结肠直肠癌的治疗。通过借壳天兴仪表,贝瑞和康近期还向A股发起了进军。  PerkinElmer  第三天的演示中,PerkinElmer CEO兼首席执行官Robert Friel展示了公司的最新信息,强调了其诊断业务的重要性和不断增长的市场份额。诊断占据了PerkinElmer 收入的30%和利润的45%。Friel表示,在这30%中,有60%来自生殖健康诊断,25%来自传染病诊断,其余15%来自肿瘤学诊断。据Friel介绍,PerkinElmer在2016年底有70%的新生儿筛查市场份额,目前诊断业务三个领域都提供了令人振奋的增长机会,将允许PerkinElmer相关业务继续以高位数增长。  Friel强调PerkinElmer正在开发的一种“不使用测序或PCR的分子NIPT技术”。该技术是PerkinElmer在2016年2月收购瑞典初创公司Vanadis Diagnostics时所得,主要用于群体筛选。目前正在进行beta测试,计划首先将其推广用于研究。市场化的测试可能会在2018年第一季度后广泛推出。  BGI  华大基因集团子公司华大基因研究执行董事徐迅在会议第三天分享了公司在生殖健康、癌症、长期测序、合成基因组学和生物信息学领域正在开发的新临床和研究产品,包括临床方面的无创产前基因检测技术(NIFTY)、新型桌面化测序系统BGISEQ-500等。徐迅表示,通过其癌症测序工作收集的数据,华大基因正在开发一种基于新抗原的T细胞治疗,计划在今年的黑色素瘤I期临床试验中进行测试。另外,华大基因还建立了一个合成酵母基因组,并开发了其核心技术,并启动合成基因组线虫和拟南芥开发项目。  Day Four  Luminex  JP摩根健康大会第四天,Luminex首席财务官Harriss Currie表示,该公司已经停止了下一代Aries平台(被称为Aries v2)的开发工作,以便将其资源用于开发下一代Nanosphere的Verigene平台(Project Atlas)。Luminex在2016年以7,700万美元收购了Nanosphere,这笔交易也为它赢得了Verigene平台的所有权。Currie指出,该公司的目标是在2017年为Verigene平台销售4500万美元,公司的总收入估计为2.95亿美元至3.05亿美元。  Exact Sciences  Exact Sciences首席执行官Kevin Conroy谈到公司计划利用其为Cologuard结肠直肠癌筛查测试开发的技术进入液体活检市场,同时预测公司第四季度和2016财年的收入高于预期。Conroy表示,公司与梅奥医疗的研究人员展开合作,在识别与不同癌症类型相关的甲基化标志物方面取得了重大进展,可以通过使用其技术通过液体活检进行分析。
  • 中科院动物所等揭示大熊猫对竹子黄酮类化合物的代谢规律及其肠道微生物适应性响应机制
    植物次生代谢产物(Plant secondary metabolites,PSMs)在植食性哺乳动物的觅食生态中起到重要作用。黄酮类化合物是一类重要的PSMs,在植物中广泛存在;具有显著的促进健康的作用,包括抗菌、抗病毒、增强免疫,以及心血管保护等功能。目前,对食源性黄酮类天然复合成分的整体代谢规律及其与动物肠道微生物的双向作用,尚缺乏清晰的认识;关于黄酮类化合物的生态学功能研究相对较少,特别是其对濒危野生动物的生理影响及动物对食物中黄酮类化合物的适应性演化机制鲜有研究。  大熊猫属于食肉目动物,具有食肉目动物的消化生理特征,但其食性特化为专性食竹。竹中具有丰富的黄酮类化合物。因此,大熊猫-竹子为研究食源性黄酮类化合物在植食性动物与植物之间的生态学功能提供了理想模型。  9月22日,中国科学院院士、中科院动物研究所研究员魏辅文团队联合成都大熊猫繁育研究基地,在Microbiome上发表了题为Multi-omics reveals the positive leverage of plant secondary metabolites on the gut microbiota in a non-model mammal的研究论文。该研究运用代谢组学、宏基因组学和体外培养等方法,在完整的年周期内同步采集野外大熊猫的可获得样本(食物和粪便);采集成都大熊猫繁育研究基地中圈养大熊猫的食物、粪便和血浆,剖析了大熊猫对黄酮类化合物的吸收代谢、利用偏好和生物转化,以及黄酮类化合物对大熊猫肠道微生物组成和功能的影响。主要研究结果如下:  大熊猫对黄酮类化合物的利用规律:利用代谢组学方法,在竹子中鉴定了97个黄酮类单体化合物;与竹笋相比,竹叶中含有更多种类和更高丰度的黄酮类化合物。因此,随着食笋和食叶的季节性转化,黄酮类物质的摄入存在显著的季节性差异。血浆靶向代谢组学检测发现,直接以原型化合物的形式进入血液的化合物仅有12种。食物与粪便代谢组的比较分析发现,大熊猫对食物源黄酮类化合物的利用在亚类和单体水平上均有不同的偏好性,对食物源中的38种单体具有较高的利用率,且粪便中有新的黄酮类单体化合物生成。  大熊猫肠道微生物适应性响应机制:粪便代谢组和宏基因组关联分析显示,PSMs-黄酮类化合物与肠道微生物的季节性具有显著的相关性。体外培养实验证明,黄酮类物质的季节性的差异摄入驱动了大熊猫肠道微生物的季节性变化,如野外大熊猫肠道微生物关键物种的变化(狭义梭菌属1,Clostridium sensu stricto 1),特别是对有益菌的生长促进作用,如益生菌丁酸梭菌(Clostridium butyricum)。食物中黄酮类摄入越高,大熊猫肠道微生物的多样性越低,微生物毒力因子的丰度也更低。宏基因组功能分析揭示了70%黄酮类化合物的吸收转化由肠道微生物参与完成,且肠道微生物也促进大熊猫对黄酮类物质的转化和利用偏好。  以上结果证明,在长期演化过程中,大熊猫季节性食物转化行为是大熊猫对竹中有益元素最大化利用的适应。其中,黄酮类化合物对维持大熊猫肠道微生态的动态平衡发挥重要作用。该研究拓展了关于大熊猫营养生态学的认识:有益的PSMs可以通过调控肠道微生物,正反馈调节宿主生理,从而影响大熊猫的觅食策略。此外,该研究也为圈养大熊猫管理提供了重要参考,即食物源黄酮类化合物是大熊猫重要的天然益生元,对大熊猫的临床健康管理,特别是肠道疾病的治疗具有广阔的应用前景。  该研究首次以非模式野生动物为模型,探索食源性黄酮类化合物的吸收代谢规律及其与肠道微生物的互作模式。从动物生态学的视角,应用多组学方法探讨有益的PSMs对植食性哺乳动物的生理作用。黄酮类化合物与肠道微生物的双向作用为探究动物-肠道微生物共演化提供了新思路。研究得到中科院战略性先导科技专项(B类)、国家自然科学基金的资助。
  • PerkinElmer推出Search Genius™ 软件
    PerkinElmer推出结合Microsoft SharePoint Framework使用的Search Genius&trade 软件 全球生命科学信息领导者发布使研究者能够在整个组织内更加轻松地搜索、保存和共享数据,从而提高生产力的应用程序 马萨诸塞州沃尔瑟姆 &ndash 2012年5月8日&mdash &mdash 专注于提高人类健康及其生存环境安全的全球领导者PerkinElmer公司于当日宣布推出专为Microsoft SharePoint平台设计的Search Genius&trade 应用程序。新系统为研究者提供了一个搜索、保存和共享在他们的整个组织内存储带非结构化数据,从而使企业范围内的知识适用于更有效率和效力的工作流程。 Search Genius 平台上一个功能强大的应用程序,使研究人员能够同时利用文本和结构化的方式搜索通过SharePoint框架和E-Notebook系统存储的报告和技术文档,也可进行互联网的全文搜索。借助于Search Genius平台,研究人员可以更容易地获得更广泛的权限,以访问此前难以访问的数据。这样可以更加广泛而全面地查看组织范围的信息资源,从而使研究人员能够更容易地利用新的和现有的项目。科学家还可以保存他们的搜索结果,并轻松创建记录他们的想法并促进合作的链接和注释。 &ldquo 生命科学研究人员,无论是在学术界还是在商业生物制药领域,全都逐步发现简单生成数据和分析并不足以提供成功所需的工作流程效率和生产力,&rdquo PerkinElmer的信息总经理Michael Stapleton说。&ldquo 找到与他们的近期和长期需求有关的信息,并且在整个组织内使用和共享的能力,逐步成为首要而持续的需求。&rdquo Search Genius 为研究人员提供了数据访问权限,使其更快地基于采集、整理和分析的能力制定决策,因此他们能够处理看起来并不重要或相关的分散信息。Search Genius平台利用Microsoft的FAST Search Server 2010为研究人员创建了一个并未与其他应用程序分离或隔离的创新解决方案。研究人员可以使用Search Genius 在Microsoft SharePoint 平台以及PerkinElmer的E-Notebook系统内部执行文本和结构化搜索,同时执行并记录他们的研究。 该应用程序还允许拓展搜索功能,使其包含任何可以利用FAST Search Server 2010为共享点索引的数据源,具体包括来自其他供应商和科学期刊的电子实验室记录本 (ELN)。完全集成到FAST Search Server 2010 for SharePoint 框架中,Search Genius系统无需额外的IT开支。Search Genius平台使研究人员能够轻松地保存搜索结果,而大多数网络搜索引擎是无法做到这一点的。这使其能够在包含多源文本和结构搜索到组织空间内整理研究理念。科学家还可以根据这些注释回顾研究灵感&mdash &mdash 而不仅仅是发现信息。 Search Genius应用程序的特性包括: ELN 内容、SharePoint内容和互联网综合搜索SharePoint 和 E-Notebook 内容结构化搜索注释和分享研究成果的功能轻松创建有趣内容的超链接直接访问SharePoint 框架或PerkinElmer的E-Notebook的权限全面集成SharePoint 2010 FAST框架,避免额外的IT开支 PerkinElmer 是一个为制药、生物技术和化工等行业提供发现、合作和知识型企业解决方案、桌面软件、科学数据库和咨询服务的领先供应商。公司为生物技术、医药发现和化工研究等提供企业解决方案、桌面软件、科学数据库以及专业服务,包括使客户能够更加有效地创建、分析和交流化学、生物和科学信息的软件、数据库和网站的软件、数据库和网站。请访问 www.perkinelmer.com/informatics,了解更多信息解决方案。 关于Perkin Elmer PerkinElmer(珀金埃尔默)公司是致力于改善人类及环境健康和安全的全球领导者。据报道,该公司2011年的收入约为19亿美元,拥有约7,000名员工,服务于全球超过150个国家和地区的客户,同时公司也是标准普尔500指数的成员。 更多信息请致电1-877-PKI-NYSE或登录我们的网站:www.perkinelmer.com. # # #媒体联系: Sarah Salbu企业公共关系专家PerkinElmer, Inc.电话: (781) 663-5782电邮: sarah.salbu@perkinelmer.com
  • 干豌豆染色变“鲜青豆” 食过量可致癌
    作坊的人员正在从桶里打捞浸泡好的青豆。  问题青豆(右)与干豆浸泡后的对比。  用水、防腐剂和染色剂,就能将干豌豆浸泡染成“青豆”,然后流向餐桌。这是藏身于南宁市中兴大桥南下塘坡的一家作坊的生财“秘方”。记者费尽周折摸清情况后,已分别向相关部门反映。  青豆作坊藏身民宅  在知情人的帮助下,10月27日下午,记者终于进入南宁市中兴大桥南下塘坡一座20多平方米的院落,只见一名女子正在挑选干豌豆――把颜色泛黄的豌豆和杂质挑选出来,旁边放着装有干豌豆的3个编织袋 另一名中年妇女也在挑选干豌豆,旁边也放着整袋的干豌豆。在院落的最里面,摆放着12个超过1米高的蓝色塑料桶,上面用塑料布、盆等物体遮挡,看不到桶里装着什么。  记者来到一居民楼顶暗中观察。半个小时后,看到那名中年妇女起身,来到塑料桶旁,打开桶上的遮盖物,桶里呈现出翠绿翠绿的水。妇女拿起塑料篮子,捞起一篮子青豆,用手捏一捏,然后又放回去,再查看另一个桶……  知情人说,每天下午4时开始,这两名妇女和两名男子在院子里挑选干豌豆,然后把豌豆放入盛好水、染料和添加剂的桶里,直到次日傍晚才取出。此时,干瘪的豌豆已经变成圆润饱满、色泽光亮的“新鲜青豆”。随后,只需冲洗清水,便可装入编织袋拿去出售。据了解,每天凌晨四五时许,该作坊的人员便将加工好的“青豆”,运到五里亭蔬菜批发市场(下称五里亭市场)销售。  当天,记者以一名购买者的身份,向挑选干豌豆的女子询问青豆售价,女子抬头示意,老板在对面的房间里。听说有人上门买青豆,男子走出来,嚷道“不卖,不卖。快走”。记者从男子口中得知,院落里的干豌豆全部购买于五一西路粮油市场。  记者来到粮油市场,一家批发黄豆的女老板问:“你买干豌豆也是泡青豆?”得到肯定答复后,女老板又说:“泡青豆必须用那种干瘪的干豌豆,否则不划算,不过我这里已经断货了。”  经寻找,记者在一家店铺里找到干瘪的干豌豆,以4.6元/公斤的价格购买了0.5公斤。  农贸市场青豆热销  10月28日凌晨4时的五里亭市场,正值交易繁忙期,货品批发商和打货商络绎不绝。据知情人介绍,“青豆”加工点老板一般会在这个时候拉货到市场蔬菜区 5栋旁摆卖。在5栋旁,记者发现,在此处摆卖“青豆”的摊点有5家,其中一个商贩就是记者前一天在下塘坡见到的一名男子。每家摆放出来的青豆,少则有6个编织袋,多则达13个编织袋,每袋重50公斤左右。  在第一个摊点,记者随手拿起几颗青豆观察,发现颜色异常,青中带黄,手感十分坚硬。记者用力剥开一颗青豆,在白炽灯光下,发现里面的胚胎是淡淡的黄色。“这颗豆染色不够彻底。”知情人说。记者又查看了其余4名商贩摆卖的青豆,发现大多数青豆均由干豌豆浸泡而成。  记者了解到,前来批发青豆的多是农贸市场摊贩,只有少部分是餐饮场所的采购人员,4元/公斤。两个多小时内,现场的所有青豆全部销售一空。而每公斤青豆在农贸市场的售价在6元至10元之间。当日,记者也购买了一些青豆。  记者将购买的青豆放入透明的矿泉水瓶中,然后加入自来水浸泡。起初,瓶子中的水的颜色并未发生变化,后来慢慢变绿。两个多小时后,瓶子里的水也变得翠绿翠绿的了。  “果绿”食用过量会致癌  商贩为何费尽周折把干豌豆浸泡成青豆呢?  记者用电子秤,从此前在五一西路粮油市场购买的干豌豆中称出100克,放入矿泉水瓶,再加入自来水浸泡。24小时后,记者用纸巾拭干湿豌豆表面的水,重新过秤,发现100克干豌豆已变成210.9克湿豌豆。100克干豌豆的成本为0.46元,210.9克湿豌豆可卖0.844元,也就是说,商贩浸泡1公斤干豌豆,投入4.6元,再加上少许的染色剂和添加剂费用,就可以赚将近4元钱。  知情人说:“受利益驱使,无良商贩做起了伤天害理的勾当――在浸泡豌豆的桶中加入染色剂‘果绿’和防腐剂焦亚硫酸钠等。另外,通过同样的程序,干黄豆也可以制作出“青豆”。  有关专家指出,色素可分为工业用和食用两种,若商贩用来浸泡“青豆”的是食用色素,则较为安全。但商贩自行“染豆”,一是技术和加工环境令人担忧,二是色素质量也不能保证。即使是使用色素泡“青豆”,色素的浓度和残留量也十分关键,一旦超标也会危害人体健康。  该专家还说,“果绿”为复合色素,是柠檬黄与亮蓝混合而成的人工着色剂,和“苏丹红”的危害一样,是国家明令禁止在农产品中添加的着色剂,食用过量会致癌。  已向有关部门反映  10月26日上午,记者把青豆加工窝点藏身民房的事情通过电话,反映到南宁市工商局五一工商所,接电话的一男子说:“加工窝点属于生产环节,请你联系质监部门进行查处。”  随后,记者拨通南宁市质量技术监督局食品科的电话,一名副科长说“你先联系办公室吧”。记者拨通这名副科长提供的电话后,质监局办公室一名女副主任接了电话。她说:“你写一份书面材料,或传真或邮寄过来,我们会根据实际情况做出安排,到时候再和你联系。”记者告诉对方:“我知道详细地点,你们如果去查,我可以带你们去,不用写书面材料了。”随后,女副主任又提供给记者稽查部门的电话。  27日下午5时许,记者又拨通了质监稽查部门的电话,接电话的女子也要求记者写一份书面材料。她说:“按规定,无证经营应该由工商部门查处,你写一份书面材料,我们领导研究后确定该由谁查处了再和你们联系。”  ■相关链接  如何辨别染色青豆  专家提醒市民,在挑选青豆时,不能轻信个大颜色鲜艳的。真正的青豆浸泡后不会掉色。市民购买青豆后,可以用清水浸泡一下。如果有未被染透的“青豆”,一剥开,里面的芽瓣是黄色的。此外,消费者购买青豆时,如果商贩是当场拨开的,会比较安全。
  • 中检院出版《化学药品对照品图谱集-质谱》分册
    《化学药品对照品图谱集》整理了600余种常用化学药品对照品各类谱图数据,从结构到性质对对照品进行了比较全面的描述。化学药品对照品是国家标准物质的重要组成部分,是依法实施药品质量控制的基础。药品标准物质的质量和水平,与医药工业的健康发展和公众安全用药休戚相关。首次结集出版的《化学药品对照品图谱》分为6本——总谱,质谱,红外、拉曼、紫外光谱,核磁共振,热分析,动态水分吸附。 《化学药品对照品图谱集-质谱》分册由中国食品药品检定研究院出版,全部质谱数据采集由岛津企业管理(中国)有限公司采用岛津产品完成,其中十种使用岛津GCMS,其余品种使用岛津LCMSMS。该书实际包含近700个常用化学药品对照品的二级质谱图,裂解规律及相关物性,是目前最全的化学药品对照品质谱图集,对药品生产企业、检验检测机构和高校科研院所人员有很好的参考价值。 关于岛津 岛津企业管理(中国)有限公司是(株)岛津制作所于1999年100%出资,在中国设立的现地法人公司,在中国全境拥有13个分公司,事业规模不断扩大。其下设有北京、上海、广州、沈阳、成都分析中心,并拥有覆盖全国30个省的销售代理商网络以及60多个技术服务站,已构筑起为广大用户提供良好服务的完整体系。本公司以“为了人类和地球的健康”为经营理念,始终致力于为用户提供更加先进的产品和更加满意的服务,为中国社会的进步贡献力量。 更多信息请关注岛津公司网站www.shimadzu.com.cn/an/ 。 岛津官方微博地址http://weibo.com/chinashimadzu。岛津微信平台
  • 上海科技大学--沈庆涛-- Self-capping of nucleoprotein filaments protects Newcastle Disease Virus genome
    p style="text-align: center "span style="text-align: center "/span/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 450px height: 300px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201907/uepic/cd6ae329-880e-403a-a610-3aa8e426bade.jpg" title="沈庆涛(07-16-16-30-28).jpg" alt="沈庆涛(07-16-16-30-28).jpg" width="450" height="300" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: center "span style="text-align: center "上海科技大学--沈庆涛/spanbr//pp  strong专家介绍:/strong/pp  沈庆涛以冷冻电子显微学作为主要手段,结合其它生物物理学手段,系统研究胞内运输中重要蛋白质的结构与功能以及病毒与宿主的互作。至今为止在国际众多著名期刊上发表高质量论文13篇,包含2篇Science,1篇Cell,1篇NSMB,1篇PNAS,2篇JCB,1篇eLife。/pp  沈庆涛获得第13批中组部青年千人计划和上海市浦江人才计划资助。/pp  沈庆涛目前担任中国生物物理学会监事,生物物理学学会冷冻电镜分会理事和膜生物学分会理事。/pp  strong报告简介:/strong/pp  The nucleoprotein (N) of non-segmented negative-sense RNA viruses such as Measles, Ebola and Newcastle disease viruses (NDV) enwraps viral genomic RNA and assembles into helical filaments, serving as the template for replication and transcription. Using cryo-Electron Microscopy, we identified and resolved NDV N forming a 4.8 Å resolution clam-shaped structure with two single-turn spirals packing in a back-to-back mode, which have not been reported before. More interestingly, this clam-shaped structure can function as a seed to assemble into double-headed filaments with two separate RNAs inside. Disruption of clam-shaped structure by transition mutation on loop interface (residues 114-120) yields a single-headed filament and exposes RNA 5’ end accessible to nuclease, which will abolish viral genome replication in minigenome analysis. Our data manifest a self-coating mechanism in which clam-shaped structure and derived double-headed filaments fully protect NDV viral genome and are new potential targets for drug design./pp  strong免费参会:/strong/pp  a href="https://www.instrument.com.cn/webinar/meetings/iCEM2019/" target="_blank" style="color: rgb(0, 176, 240) text-decoration: underline "span style="color: rgb(0, 176, 240) "https://www.instrument.com.cn/webinar/meetings/iCEM2019//span/a/ppbr//p
  • 听说抄袭我们的都火了?今天带来原创的杂质分离方法开发过程
    zui近月旭科技除了产品以外,我们发布的内容也越来越受到大家的喜爱,遭到了多家公众号的自主发布,热度也颇高,我们十分“欣慰”。我们的内容能够得到大家的喜欢,真的是我们zui高兴的事情。但是其发表的内容因为水印等问题,谱图截取并不完整,影响大家的观看体验。所以小编就来以正视听,将完整的谱图,以及zui完整的杂质分离方法开发过程分享给大家,我们一起变得更强!首先来看看需要分离的三个物质的结构式:01 分析目的要求开发一种合适的分析方法,使上述3种化合物在浓度1.0mg/mL的情况下分离度大于1.50。开始方法开发之前,di一件该做的事是什么呢?当然是去了解这几个物质的性质,尽可能的得到有关这些物质的信息,这样可以为后面工作节省zui多的时间。而对这三个物质得到的信息大致如下:三种物质极性比较强,水溶性比较好,在常规C18色谱柱保留太弱,基本上与溶剂峰重叠。结构式上主要是官能团的差异,分别为-NH2,-Br,-COOH,差异性很大。综合考虑,有两种方案:一是加离子对试剂,用反相C18色谱柱增强保留,进行分离;二是使用离子交换色谱柱进行分离。首先由于个人的习惯,离子交换色谱被我直接排除(离子色谱平衡比较慢,而且离子交换色谱柱非常容易出现重现性问题)。所以本实验采用C18添加离子对试剂的方法。考虑的实验过程中需要使用离子对试剂,且流动相pH需要大范围调整(可能用到碱性流动相),所以色谱柱选择月旭Xtimate C18(4.6×250mm,5μm)色谱柱,流速:1.0mL/min,柱温30℃,检测波长220nm。02 流动相优化及测试结果图谱2.1 初步尝试流动相:0.05mol/L庚烷磺酸钠+0.05mol/L磷酸二氢钾,PH=4.60。结果:化合物3保留时间2.6min,化合物1不出峰。估计是化合物1保留太强未洗脱下来。接下来,调整pH并增加有机相的比例,来加大洗脱能力。2.2 流动相:缓冲液(1.00g辛烷磺酸钠,10mM磷酸二氢钾至500mL水中,用磷酸调pH=2.30):甲醇=60:40。混合对照图谱如下:实验中将庚烷磺酸钠改为辛烷磺酸钠,增加有机相(甲醇)比例,结果三个物质分离良好,但是化合物1(19.9分钟)峰型太差,下一步优化化合物1的峰型。2.3 流动相:缓冲液(1.00g辛烷磺酸钠,10mM磷酸二氢钾至500mL水中,用磷酸调pH=2.30):乙腈=80:20。化合物1图谱:基于上一次实验,将有机相甲醇变为乙腈,通过改变选择性看是否峰型会有改善。结果发现并没有任何改善,而且发现这个方法中有机相只提供洗脱能力,不提供选择性改变作用。2.4 流动相:缓冲液(缓冲液:1.00g十二烷基磺酸钠,50mM氯化铵至500mL水,用磷酸调pH=1.80):甲醇=60:40。混合对照图谱:当时换成这个流动相的主要思路是,加十二烷基磺酸钠使保留更强,加氯化铵提高离子浓度,调pH至1.80强酸性使化合物1中-NH2官能团作用更弱,达到优化峰型的目的,但是效果很差。回头总结发现我们所有的目光都聚焦在三种物质的不同官能团上,导致越走越偏离分离的轨迹,这里,三个物质共同含有的官能团可能也是影响分离的主要因素,换了个角度后,豁然开朗了。推翻了之前的方案,将离子对试剂换为四丁基氢氧化铵,从头开始。2.5 流动相:缓冲液(4mL 10%四丁基氢氧化铵水溶液,1.36g磷酸二氢钾至500mL水中,用三乙胺调pH=9.30):乙腈=80:20。混合对照图谱:流动相中添加三乙胺和并将pH调成9.3目的是抑制化合物1的拖尾,但是结果发现三种物质没有分开。继续优化条件将pH值降低。2.6 流动相:缓冲液(4mL 10%四丁基氢氧化铵水溶液,1.36g磷酸二氢钾至500mL水中,用三乙胺调pH=7.00):乙腈=80:20。混合对照图谱:看到这结果是不是项目就OK了。但是既然是方法开发,方法重现性实验实验是必不可少的,需要用一根新色谱柱重现该色谱条件。结果问题就来了.....化合物1图谱:化合物1峰型一直分叉,zui终发现应该是色谱柱使用多种离子对试剂,造成色谱柱改性,新色谱柱不能重现结果。好吧,再开始。然后又是继续摸索。不得不说有时候运气也是成功的一部分,在一次流动相配置过程中,看到四丁基氢氧化铵试剂旁边还有一瓶四丁基溴化铵,突然我就冒出想法,用四丁基溴化铵试试,不知道结果会怎么样,说做就做。2.7 流动相:缓冲液(1.00g四丁基溴化铵,1.36g磷酸二氢钾,1.0mL三乙胺至500mL高纯水。用磷酸调节pH=7.10):乙腈=80:20。混合对照图谱:03 结果结果:分离度,峰型都满足要求,完美。当然还是需要重现方法的。三根新色谱柱重现结果:zui终色谱条件:色谱柱:月旭Xtimate C18(4.6*250mm,5μm)。流动相:缓冲液(1.00g四丁基溴化铵,1.36g磷酸二氢钾,1.0mL三乙胺至500mL高纯水。用磷酸调节pH=7.10):乙腈=80:20检测波长:220nm;柱温:30℃;流速:1mL/min;进样体积:10μL。搞定交差!04 实验小结在液相应用方法开发过程中,首先需结合需要分离的目的,确定思路,一个方法zui初的思路,是决定这个方法开发的效果,效率的zui根本因素;其次是细节,任何细节都有可能导致你实验的成功与否;zui后是运气,牛顿发现万有引力还有运气成分呢,说不定你是下一个。同时,在一个方法确定好之后,一定需要使用一根新的色谱柱来验证,因为在方法开发过程中,我们会使用到各种流动相条件,会对色谱柱一个改性,特别是使用离子对试剂的方法,否则后续的重现性问题会是一个非常头痛的事情。
  • JP摩根健康大会第二天:ThermoFisher、Qiagen、Human Longevity、Counsyl参加会议
    p  北美时间2016年1月11~15日,备受全球医药企业及投融资机构关注的第34届JP摩根健康大会(JP Morgan Health Conference)在旧金山举办,这是一场产业与资本融合的盛会,并将引领2016年乃至今后一段时期全球医药健康领域的发展与投资风向。如往年一般,各家公司都派出重量级阵营,公布上年度经营业绩,发布最新产品,给市场打入强心剂,以获得投资人的青睐。/pp  JPM年度健康大会第二天:Thermo Fisher、 Qiagen、 Human Longevity、 Counsyl参加会议/pp strong Thermo Fisher Scientific/strong/pp  Thermo Fisher Scientific CEO和主席Marc Casper在大会上探讨了以13亿美元高价收购Affymetrix背后的理论依据并进一步证实了这一举动对于Thermo Fisher Scientific的必要性。Marc Casper表示Affymetrix的系列产品与Thermo Fisher Scientific的商业布局十分契合。早在2014年,Thermo Fisher Scientific已经收购了Affymetrix的若干业务。Marc Casper告诉投资者Affy公司的微阵列技术在Thermo Fisher公司测序服务中扮演者重要角色,Affy公司电子生物科学技术中的流式细胞技术资产为Thermo Fisher的相关业务带来了更大的发展动力。/pp  更重要的是,Marc Casper发现了Affy公司巨大的海外发展空间,Affy现阶段的海外利润已经达到了总利润的61%。Marc Casper表示Affy将通过Thermo Fisher的全球战略而获得巨大的收益。/pp  虽然一些投资者对于阵列技术的增长表示十分担忧,Casper仍然表示他希望将其作为Affy业务的重要部分,在阵列技术增长放缓的大背景下促进Affy阵列业务的持续发展。/pp  strongQiagen/strong/pp  Qiagen CEO Peer Schatz突出表达了Qiagen的五个增长点:QIA综合平台、个性化健康服务、定量TB测试、生物信息学组合以及其最新的GeneReader作业平台。/pp  qiagen在周一指出,尽管由于来自伴随诊断和仪器销售下滑的原因,该公司2015年第四季度和年度初步收益均未达到分析师的预期,而新的QIAsymphony?销售却超过了公司的目标。QIAsymphony在活组织检查中起了至关重要的作用,使无细胞DNA检测实现自动化。Schatz指出Qiagen迄今为止有五个伴随诊断使用了液体活检,同时Schatz表示他相信其公司正在处理的液体活检样本比任何其他同行都多。/pp  Qiagen共计已经宣布了15个主要的伴随诊断,其中的若干项目为开发方案。Qiagen的医疗伙伴包括Eli Lilly(礼来制药厂),AstraZeneca(阿斯利康公司),Novartis(诺华公司),Bayer(拜耳公司)。他进一步指出CDx的收益低于公司收益的10%。Qiagen在欧洲卖出了超过12个的CDx测试以及4个食品以及药物管理局认可的伴随诊断。/pp  从商业的角度来看,虽然第四季度收益数据令人失望,Schatz说他看到了该公司在2016财年的增长底线可以达到6%。/pp  strongHuman Longevity/strong/pp  Human Longevity的CEO J. Craig Venter说至今为止该公司已经检测了超过20000人的基因组。为了实现截止至2020年完成100万人基因组测序的目标,该公司正在扩展其测序业务。/pp  本周,该公司发起了一个癌症测序服务,该服务包括肿瘤、生殖系外显子组和全基因组测序。另外,Human Longevity计划推出免疫测序和液体活检技术分析循环肿瘤细胞和循环肿瘤DNA。除此之外,Venter说该公司将发展个性化的癌症疫苗。/pp  Human Longevity正致力于开始通过基因信息预测个人年龄,声音以及面貌的模型。最终,Venter说该公司在Health Nucleus platform上取得了进展,Health Nucleus platform是一个集合了个人健康综合分析的基因组研究平台,该平台包括了全身医学成像和其他实验室医学测试。/pp strong Counsyl/strong/pp  Counsyl的CEO和创始人Ramji Srinivasan告诉投资者,Counsyl准备进入新的市场,目前正在开发液体活检实验。/pp  这个可以提供载体筛查、无创产前诊断以及一种遗传癌症筛选试验的分子诊断公司希望进一步拓展到生殖健康和肿瘤市场。/pp  Srinivasan说,该公司的测试量在2011年到2015年之间增长了9倍,有超过500000名患者进行测试.尽管数量在增加,但是在2011年其平均周转时间仍然从10.4天减少到6天。/ppbr//p
  • 化学药品研发中对照品(标准品)有关技术要求
    药物的质量研究与质量标准的制订是药物研发的主要内容之一,药品标准物质也是质量标准和质量研究中不可分割的一部分,是药品质量标准的物质基础。药品标准物质在新药研究中与产品定性、杂质控制及量值溯源密切相关,标准物质的运用贯穿于质量研究与质量标准的制订工作中。一、概述标准品、对照品系指用于药品鉴别、检查、含量测定的标准物质,即药品标准中使用的具有确定的特性或量值,用于对供试药品赋值、定性、评价测定方法或校准仪器设备的物质,其中标准品系指用于生物检定、抗生素或生化药品中含量或效价测定的标准物质。《药品注册管理办法》规定“中国药品生物制品检定所负责标定和管理国家标准物质”,“申请人在申请新药生产时,应当向中国药品生物制品检定所提供制备该药品标准物质的原材料,并报送有关标准物质的研究资料”。但在新药研究中,普遍存在对照品(标准品)的应用超前于中检所制备和标定的情况,鉴于新药研究的连续性以及标准物质在新药研究中涉及量值溯源、产品定性、杂质控制及其在药品质量控制中的重要性,标准物质的制备和标定与药品的质量研究、稳定性研究乃至药理毒理学研究中剂量的确定等临床前基础研究间存在密切关系,因此,药品对照品(标准品)的研究(制备与标定)也是药品审评的一项重要内容。二、对照品来源1、所用对照品(标准品)中检所已经发放提供,且使用方法相同时,应使用中检所提供的现行批号对照品(标准品),并提供其标签和使用说明书,说明其批号,不应使用其他来源者;如使用方法与说明书使用方法不同(如定性对照品用作定量用、效价测定用标准品用作理化测定法定量、UV法或容量法对照品用作色谱法定量等),应采用适当方法重新标定,并提供标定方法和数据;若色谱法含量测定用对照品用作UV法或容量法,定量用对照品用作定性等,则可直接应用,不必重新标定。2、申报临床研究时,如中检所尚无供应,为不影响注册进度,可先期与中检所接洽制备和标定,申报时提供标定报告、标签(应标明效价或含量、批号、使用效期)和使用说明书;也可与省所合作标定,申报时提供标准品或对照品研究资料,“说明其来源、理化常数、纯度、含量及其测定方法和数据”;标定有困难时,可使用国外药品管理当局或药典委员会发放的对照品(标准品)或国外制药企业的工作对照品(标准品),进行标准制订和其他基础性研究,但应提供其标签(应标明其含量)和使用说明书,能保证其量值溯源性;也可使用国外试剂公司(如sigma公司等)提供的对照品(标准品),但应提供试剂公司该批对照品(标准品)的检测报告(用作含量测定时,应有确定的含量数据),如为高纯度试剂,提供了国外试剂公司检测报告(用作含量测定时,应有确定的含量数据)时,也可使用,并应能保证其量值溯源性,但申请人应及时与中检所接洽对照品(标准品)的标定事宜,临床研究期间完成此工作。3、直接申报生产品种,如中检所尚无供应,可参照2中要求进行,并提供相应研究资料,但申请人在标准试行期间应与中检所接洽并完成的标定事宜。三、对照品(标准品)标定的技术要求1、创新药物应说明对照品(标准品)原料的制备路线、精制方法、质检报告,提供理化常数和纯度的测定数据及分析结果(包括相关图谱),提供标定方法的研究和验证资料(如与原料药质量研究项下相同,可不再提供)、含量测定数据及经统计分析得到的对照品(标准品)含量结果,并说明进行临床前药学研究、药理毒理学研究所用样品的含量是否用该批对照品(标准品)确定或可用该批对照品(标准品)进行量值溯源。纯度测定方法应选用色谱法,并采用两种以上不同分离机理或不同色谱条件并经验证的色谱方法相互验证比较,同时采用二极管阵列检测器或其它适宜方法检测HPLC法的色谱峰纯度,而后根据测定结果经统计分析确定对照品(标准品)原料的纯度。对于组份单一、纯度较高的药物,对照品(标准品)标定方法宜首选可进行等当量换算、精密度高、操作简便快速的容量法。可根据药物分子中所具有的官能团及其化学性质,选用不同的容量分析方法,但应符合如下条件:(1)反应按一个方向进行完全;(2)反应迅速,必要时可通过加热或加入催化剂等方法提高反应速度;(3)共存物不得干扰主药反应,或能用适当方法消除;(4)确定等当点的方法要简单、灵敏;(5)标化滴定液所用基准物质易得,并符合纯度高、组成恒定且与化学式符合、性质稳定(标定时不发生副反应)等要求。标定方法的选择要关注如下事项:(1)供试品的取用量应满足滴定精度的要求(消耗滴定液约20ml);(2)滴定终点的判断要明确,提供滴定曲线。如选用指示剂法,应考虑其变色敏锐,并用电位法校准其终点颜色;(3)为排除因加入其它试剂而混入杂质对测定结果的影响,或便于剩余滴定法的计算,可采用“将滴定的结果用空白试验校正”的办法;(4)要给出滴定度(采用四位有效数字)的推导过程。标定结果要根据3个以上实验室各不少于15组测定结果经统计分析,去除离群值和可疑值后的结果,并报告可信限。如该药物没有可进行等当量换算并符合要求的容量法时,可采用反复纯化的原料,色谱法确定纯度后扣除有关物质、炽灼残渣、水分和挥发溶剂等后的理论含量确定为标准品含量,以此为基准进行对照品(标准品)的换代和量值传递。用于抗生素微生物检定法的第一代基准标准品可参照上述方法标定,如为多组份抗生素,其组份比例应与拟上市产品组份比例一致或接近,或以其中某一组份纯品为基准标准品,但要注意标准品换代时量值传递的恒定。仅用于鉴别定性的化学对照品,注重其结构确证的研究资料,纯度和含量的要求一般可适当降低。杂质对照品,用作限度要求时,应提供其来源(合成路线)、结构确证的研究资料,应具备较高的纯度和含量,并提供纯度和含量的的测定结果,提供质量控制标准。2、其他类别药物用于抗生素微生物检定法的标准品须用上市国的国家标准品或原发厂的工作标准品为基准标准品进行标定。标定时采用的原料药应符合相应要求,并提供原料的制备路线、精制方法、质检报告,提供理化常数和纯度的测定数据及分析结果(包括相关图谱)。标定须用现行版中国药典附录收载的“抗生素微生物检定法”-三剂量法,并提供详细的方法学研究,包括检定菌和培养基的选择、剂量和剂距选择、缓冲液选择(如与质量研究项下相同,可不再提供)。每次标定结果均应照“生物检定统计法-量反应平行线测定法(3.3)”法进行可靠性测验及效价计算。对照品是质量标准的重要组成部分,从日常工作中发现,研发单位在对照品的制备、研究、标定、使用及保存过程中,仍存在部分问题。作为对照品,其研究工作的质量以及质量标准的高低直接影响新药研究的质量,对其提出技术要求是为了保证药品的质量控制与新药研究的结果准确有效,需重视起来。
  • 赛沛和BioGX宣布合作开发用于GeneXpert® 系统的猴痘PCR检测试剂盒
    赛沛和BioGX宣布合作开发用于GeneXpert系统的猴痘PCR检测试剂盒SUNNYVALE, Calif 和 BIRMINGHAM, Ala., 2022 年 6 月 27 日赛沛和 BioGX 于今天宣布两家公司将合作开 发 在 GeneXpert 系 统上运行的猴痘 PCR 检测试剂盒。在全球 180 个国家和地区拥有 超过40000 个 GeneXpert 系统的安装基数的背景下,该检测试剂 盒可以在需要可操作信息的多个环境中快速部署。据美国疾病控制与预防中心(CDC)称,猴痘十分罕见,在没有密切接触的人员之间不易发生传播。虽然猴痘对普通美国人群的威胁仍然较低 1,但对全世界的医疗服务提供者来说,制定应对计划十分重要。感染该病毒的主要症状之一是发热并发展为斑丘疹,通常表现为小而隆起的斑点。然而,还有很多其他疾病,如水痘、麻疹、细菌性皮肤感染、梅毒、疱疹和药物相关的过敏,也可能出现类似的症状。因此需要能够识别猴痘的分子检测。世界卫生组织推荐将PCR作为猴痘的首选实验室检测方法,检测使用合适的皮肤损伤样本2。“我们的开放性试剂盒项目使赛沛能够与外部伙伴合作,在需要时快速开发准确的检测方法。” 赛沛执行副总裁兼首席科学官 David H. Persing, M.D., Ph.D. 称,“赛沛从炭疽杆菌(炭疽)开始,到结核 分枝杆菌、H1N1 流感病毒、埃博拉病毒和 SARS-CoV-2 等,在快 速开发和提供应对突发公共卫生问题的检测方面有着悠久的历史。”BioGX 还成功地与政府机构和诊断伙伴合作,快速开发和制造用于检测新病原体的大规模分子检测方法。“我们之前与 CDC 合作开发并制造了一种用于 GeneXpert 研究的猴痘 / 正痘病毒多重检测方法 3,目前我们正在进入验证阶段”, BioGX 执行副总裁兼首席科学官 Michael Vickery, Ph.D. 称,“地区响应小组需要一种 PCR 检测方法,在他们怀疑疫情是由新病原 体引起时,该检测方法应快速且易于实施。”正在开发的产品,不用于诊断程序,未经任何监管机构审查。正在开发的产品可能会发生变化,并且尚未制定质量标准。参考文献:1. https://www.cdc.gov/poxvirus/monkeypox/index.html2. https://www.who.int/news-room/fact-sheets/detail/monkeypox3. Li D., Wilkins K., McCollum A.M., Osadebe L., Kabamba J., Nquete B., Likafi T., Balilo M.P., Lushima R.S., Malekani J., et al. Evaluation of the GeneXpert for human monkeypox diagnosis. Am. J. Trop. Med. Hyg. 2017 96:405-410. doi: 10.4269/ajtmh. 16-0567.- DOI https://www.ajtmh.Org/view/journals/tpmd/96/2/article-p405.xml 关于Cepheid赛沛位于 Sunnyvale, Calif.,是一家领先的分子诊断公司。赛沛致力于通过开发、制造和营销精确且易于使用的分子系统和检测来改善医疗服务。通过将高度复杂且耗时的手动程序自动化,该公司的、解决方案为任何规模的机构提供了一种更好的方式来对微生物和遗传疾病进行复杂的分子诊断检测。凭借其强大的分子生物学能力,该公司专注于那些最需要准确、快速和可操作检测结果的应用, 例 如 管 理 传 染 病 和 癌 症。有 关 更 多 信 息,请 访 问http://www.cepheid.com。 关于BioGXBioGX 是用于分子诊断的冻干实时 PCR 试剂的全球领先供应商。BioGX, Inc. 总部位于 Birmingham, Alabama 和 Dallas, TX,其全资子公司 BioGX B.V.,总部位于 Amsterdam, The Netherlands(统称为 “BioGX”),在经 ISO 13485 医疗器械开发和制造标准认证的cGMP 合规环境中运营。其专有的 Sample- Ready™ 技术是临床、食品安全、制药 QC 和水质分子检测等所有产品的核心。BioGX 的 60+ 多重实时 PCR 产品通过其全球分销网络在全球范围内销售。 有关更多信息,请访问 https://www.biogx.com。
  • 行稳致远 贝克曼库尔特扎根中国市场四十年初心如一
    近日,全球体外诊断领域领导者之一贝克曼库尔特正式迎来入华40周年。1983年在中国设立办事处至今,其本土化历程走过整整40周年。自创立起,贝克曼库尔特不断革新突破,专注于为世界各地的医疗机构及实验室提供创新和智慧的诊断解决方案,引领行业发展。来到中国后,贝克曼库尔特以本土需求为导向,助力中国体外诊断行业发展。丹纳赫中国诊断平台副总裁、贝克曼库尔特临床诊断全球副总裁、中国区总经理陈小穗表示:"贝克曼库尔特是首批进入中国的国际体外诊断公司,四十年来,我们不断增加对中国市场的投入,建立起了集本土生产、本土研发创新、本土合作、本土服务的全产业链。在四十周年之际,我们初心未改,整装待发,在中国这个全球重要战略市场之一,我们将秉持‘医疗探索不息,诊断一心一意'的使命,更好地立足本土、服务本土。"频频加码,与中国市场同频共振贝克曼库尔特与中国结缘于1978年,当年公司的创始人之一贝克曼博士带领一批顶尖科学家前往复旦大学和中国科学院进行学术交流,并赠送仪器,成为了贝克曼库尔特入华前的一次重要探路。1983年,贝克曼库尔特先后在北京、上海、福州、广州等地设立代表处和维修站,正式开启入华篇章。此后,我们便扎根于此,一路见证、并参与中国体外诊断行业成长。1997年,贝克曼库尔特在苏州建立试剂工厂,推开了本土化生产的大门。2015年,公司在苏州建立了仪器工厂和研发中心,将中国研发制造和本土化需求深度结合。今年,丹纳赫诊断平台中国研发制造基地也正式投产,在完成更多产品本土生产的同时,承接全球研发的需求,实现从"在中国为中国"到"在中国为全球"的转变。完整的产业链体系、稳定向好的经济形势、良好的营商环境等多重利好因素让中国市场展现出强劲韧性和充沛活力,为贝克曼库尔特提供了广阔发展的舞台。丹纳赫诊断平台中国研发制造基地三大落脚点,探索本土纵深发展中国的体外诊断行业在技术推动、老龄化程度加深、民众健康意识提升等因素的推动下,逐步驶入快车道,产业化程度迅速提高。贝克曼库尔特的本土化亦紧跟产业步伐往纵深发展。在丹纳赫"创升中国"战略的指引下,我们也获得了新的本土化驱动力,从本土生产、本土研发创新和本土合作三个维度出发,践行对中国市场的承诺。在本土生产方面,我们不断提升本土化生产能力,在实现了所有主要设备中国"智"造的同时,加速更多试剂国产的进程。新的研发生产基地也具备更先进的生产技术和自动化产线,达到了工业4.0的标准,能够充分应用自动化和智能化,以及绿色与可持续发展理念,实现创新和生产的一体化。在本土研发创新方面,我们积淀了多年的前沿技术和经验,持续打造契合产业演进方向和用户需求的产品和解决方案。顺应智能化趋势,贝克曼库尔特打造了全方位的数智化解决方案,通过智控、智研、智医三大平台,将数据分析融合于智慧实验室的建设中,充分挖掘数据背后的价值,提高检验数据的准确性和生产效率。叠加丹纳赫诊断平台的"协同效应",未来我们将拥有更强的创新势能。此外,我们也越来越多地开展开放式的本土化合作,从产品创新,流通领域的创新,商业模式的创新等各个方面展开。对贝克曼库尔特而言,我们通过与更多优质的本土企业合作,利用渠道和服务商的资源优势,探索满足各级医疗机构的解决方案。未来,我们也将继续深度参与本土医疗创新,与各方生态伙伴携手同行,赋能检验行业更高质量发展,并肩迈向健康中国2030。在实现"健康中国2030"和推进医疗改革的进程中,贝克曼库尔特很荣幸能成为其中的参与者和贡献者。中国市场充满活力和挑战,贝克曼库尔特把加速本土化进程作为快速响应中国客户多样化需求的有效解法。四十周年之际,我们期待与志同道合的国内优质企业一道,打造本土创新生态圈,共同书写贝克曼库尔特"中国故事"的新篇章。
  • 战胜新型冠状病毒可用之利器,从抗病毒药物筛选到疫苗开发(一)
    p style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "2020年新年伊始,武汉新型冠状病毒感染肺炎的疫情牵动着社会各界的心。在本次疫情爆发之际,安捷伦有幸向中科院武汉病毒研究所和中国疾病预防控制中心病毒病所捐赠xCELLigence RTCA系统。协助两家国家重点病毒科研单位用于病毒CPE(细胞病变效应),抗病毒药物和疫苗的研究,集中力量,快速突破,攻克技术难关,遏制病毒蔓延。/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 450px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202002/uepic/c322699d-d7ae-4d84-8ddf-2276c56dfb44.jpg" title="1.jpg" alt="1.jpg" width="600" vspace="0" height="450" border="0"//pp style="text-align: center "span style="text-indent: 2em "安捷伦技术支持王颖在受捐单位国家病毒病所仪器培训后和老师合影/span/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "xCELLigence RTCA实时细胞分析检测技术可满足研究人员尽可能少地接触病毒,并可以做到无需研究人员值守的病毒研究任务。有效保证研究过程中相关人员的安全,且不耽误研究进程,从而协助攻关专家,助力病毒研究。br/xCELLigence RTCA 实时细胞分析技术是一种独特的活细胞检测技术。该技术可实现无标记和持续性的跟踪记录病毒感染细胞过程中CPE的进展,为多种病毒学检测提供异常简易的实验流程,包括但不限于:病毒滴度测定、疫苗研发、中和抗体的检测与定量和抗病毒药物的开发等。 /pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 367px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202002/uepic/72ae799b-ea8c-46a0-b32c-c35a5354f48e.jpg" title="2.jpg" alt="2.jpg" width="600" vspace="0" height="367" border="0"//pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "strong一、病毒CPE和滴度研究/strong/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "美国加利福尼亚大学疾病研究中心的Reisen及其同事使用xCELLigence RTCA测定了西尼罗河病毒(WNV)和圣路易斯脑炎病毒(SLEV)的病毒滴度。未感染的对照细胞正常生长至汇合,并维持稳定的细胞指数。感染病毒的细胞显示出时间和剂量依赖性的细胞指数降低,表明细胞被感染后已完全裂解死亡(下图A和B的上图)。两种病毒均表现出CPE动力学,该动力学与病毒的已知效价相关。通过绘制CIT50(细胞指数降低50%所需的时间)与病毒滴度的曲线,可以突出显示这一点(下图A和B的下图)。使用这种类型的标准曲线,可以轻松确定未知浓度样品中的病毒滴度。 /pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 391px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202002/uepic/6c665f66-765c-4c77-977d-a74e3bfbf7b8.jpg" title="3.jpg" alt="3.jpg" width="600" vspace="0" height="391" border="0"//pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "图A和图B. 使用xCELLigence RTCA确定病毒滴度。 实时检测不同浓度WNV(图A上)和SLEV(图B上)诱导的Vero细胞的CPE细胞病变效应。水平线表示细胞指数已降至其初始值的50%(即在添加病毒之前)的点。达到这一点所需的时间称为“ CIT50”。通过CIT50与病毒浓度的关系绘制成一条标准曲线,可用于确定各种类型样品中的病毒浓度。数据摘自参考文献1。/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "strong二、疫苗研发及中和抗体检测和定量研究/strong/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "法国Sanofi Pasteur研究所使用xCELLigence RTCA进行登革热病毒CPE和疫苗研发的研究。研究人员先将Vero细胞接种到E-Plate孔板中,再加入不同稀释滴度的登革热病毒或者不同处理组的病毒。他们利用xCELLigence RTCA系统实时追踪记录病毒CPE的发作时间,以及整个过程。同时,通过绘制CITmed(细胞指数降低50%所需的时间)与抗体滴度的标准曲线,量化了阻断病毒CPE的中和抗体浓度。/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 359px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202002/uepic/4867c125-795b-4439-8d78-348c9aabcfb5.jpg" title="4.jpg" alt="4.jpg" width="600" vspace="0" height="359" border="0"//pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "图A. 登革热病毒感染后的细胞实时检测结果。xCELLigence RTCA实时检测被感染细胞与未感染的对照Vero细胞的生长曲线,被登革热病毒感染的Vero细胞的生长曲线呈现处明显的差异。同步使用成像法捕获Vero细胞倍登革热病毒感染后的生长状体。数据摘自参考文献3。br//pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "图a、图b和图c. 经典CCID50(cell culture infectious dose 50%)病毒滴度检测法与RTCA病毒滴度检测法的相关性。a)RTCA检测不同浓度病毒感染后的Vero细胞的生长曲线;b)通过病毒浓度梯度与CITmed间的关系绘制出标准曲线;c) 使用135个不同的登革热病毒样品,由不同技术人员在八个月内进行评估,比较使用RTCA方法和CCID50方法获得的病毒浓度的相关性。数据摘自参考文献3。/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "strongspan style="text-indent: 2em "三、抗病毒药物的研究/span/strong/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "span style="text-indent: 2em "苏黎世分子生命科学研究所的Urs Greber及其同事要确定一种可以减轻腺病毒对感染患者影响的药物。他们在筛选试验中使用了xCELLigence RTCA系统,在不同候选药物存在的情况下,用人腺病毒感染Hela细胞。他们发现其中最有效的是黄酮哌啶醇,一种已知能抑制细胞周期依赖性激酶Cdk9的半合成类黄酮化合物。如下图A所示,在没有药物的情况下,腺病毒感染细胞后会诱导CPE发作,阻抗信号降低至零(红色曲线)。但是,黄酮哌啶醇以剂量依赖性方式能够显著延迟或阻断病毒CPE的发作(蓝色和橙色曲线)。这些基于阻抗检测的结果同时通过显微镜分析也得到了证实(下图B)。/span/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 339px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202002/uepic/e4bfb7cc-95de-431c-b74a-87fcb6b77dae.jpg" title="5.jpg" alt="5.jpg" width="600" vspace="0" height="339" border="0"//pp style="text-align: center"br//pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "图A和图B. 监测黄酮哌啶醇的抗病毒活性。HeLa细胞接种约50小时后,在不同浓度的黄酮哌啶醇存在下,使用人腺病毒株C5感染细胞(图A)。黄酮哌啶醇对腺病毒具有广泛的保护作用。同步进行成像实验,使用人腺病毒D37感染WI38肺成纤维细胞,四小时后加入或不加入黄酮哌啶醇。在48小时后,可以清楚地看到该药物已经阻止了细胞病变的发生。数据摘自参考文献3。/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "strong四、杀病毒剂研究/strong/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "杀病毒剂可通过灭活固体表面(例如台面,门把手、手掌等)或液体悬浮液中存在的病毒来防止感染。比勒陀利亚大学的Venter及其同事使用xCELLigence RTCA系统用于评估杀病毒剂的功效。他们将市售的杀病毒剂与具有传染性的法氏囊病病毒(IBDV)孵育20分钟,再将该病毒连续稀释,并添加到预先接种Vero细胞的E-Plate孔板中。如下图所示,未经处理的病毒会引起细胞病变效应CPE,CPE的发作时间取决于病毒滴度,而使用杀病毒剂对IBDV预处理会后可以大大降低其感染能力。尽管结果显示10倍稀释的病毒依然可以诱导CPE,但是100倍或更大稀释倍数的IBDV对Vero细胞完全没有影响(图B)。通过大量实验研究,他们认为:“xCELLigence RTCA系统测定杀病毒剂功效的方法与传统杀病毒剂测定法所得结果完全一致,而且该方法可以更简洁快速,更精确地测定杀病毒剂的功效和及其自身的细胞毒性。”/pp style="text-align: center"img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202002/uepic/60fb8ab1-6076-4766-b228-b79741008c3b.jpg" title="6.jpg" alt="6.jpg"//pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "图A和图B. 使用杀病毒剂保护Vero细胞免受IBDV侵害。未用杀病毒剂预处理(图A)或使用杀病毒剂预处理(图B)的IBDV感染的Vero细胞。暴露于杀病毒剂后,只有最浓的病毒溶液仍然能够诱导CPE(细胞病变作用)。病毒浓度表示为稀释倍数(即101=10倍稀释,102=100倍稀释等)。数据摘自参考文献4。/pp style="text-indent: 2em "strong关于安捷伦/strong/pp style="text-indent: 2em "安捷伦科技公司(纽约证交所:A)是生命科学、诊断和应用化学市场领域的全球领导者,拥有50多年的敏锐洞察与创新经验,我们的仪器、软件、服务、解决方案和专家能够为客户最具挑战性的难题提供更可靠的答案。2019财年,安捷伦营业收入为56.1亿美元,全球员工数约为16,300人。/pp style="text-indent: 2em "strong关于安捷伦生物/strongbr//pp style="text-indent: 2em "安捷伦生物—原艾森生物,是生命科学研究高性能细胞分析平台的开发和商业化先驱。xCELLigence实时细胞分析技术和NovoCyte、Quanteon流式细胞仪广泛运用于新药研发、免疫治疗、疫苗研发、毒理学、安全药理学、质控和基础生命科学研究,目前,在全球范围内已安装3000多台仪器,并有2000多篇经同行专家评审的高水平学术文献中被引用。/p
  • Nature发文宣布改造影响因子重塑期刊评价体系(中英对照)
    当地时间7月27日,Nature在线发表题为“Time to remodel the journal impact factor”的社论,并以“Nature and the Nature journals are diversifying their presentation of performance indicators”为小标题,宣告Nature出版集团将重塑期刊评价方式,改造期刊影响因子。  1. Nature改造影响因子的英文原文及翻译  Time to remodel the journal impact factor  是时候改造论文的影响因子体系了!  Nature and the Nature journals are diversifying their presentation of performance indicators.  Nature也正在紧锣密鼓地筹划:重新塑造影响因子评价体系,让评价体系多样化。  Metrics are intrinsically reductive and, as such, can be dangerous. Relying on them as a yardstick of performance, rather than as a pointer to underlying achievements and challenges, usually leads to pathological behaviour. The journal impact factor is just such a metric.  Nature称期刊影响因子这种量化从本质上来说,过于简化,而且甚至在使用过程中还存在被滥用的风险。如果仅仅依靠期刊影响因子来衡量一篇文章的好坏,而不注重这篇文章所带来的潜在价值和引起的舆论影响,长此以往,这很容易导致一种病态行为。不得不说,期刊影响因子就是这么一种“病态”量化指标。  During a talk just over a decade ago, its co-creator, Eugene Garfield, compared his invention to nuclear energy. “I expected it to be used constructively while recognizing that in the wrong hands it might be abused,” he said. “It did not occur to me that ‘impact’ would one day become so controversial.”  正如在10年前那场演说中所预见的一样,影响因子的合伙创始人Eugene Garfield曾将影响因子与核能相媲美。他说道:“我希望它能发挥出建设性的作用,但我也知道它也有可能会被滥用。”但现在,他说道,我从来都没想到“影响因子”会引发如此大的争议。  As readers of Nature probably know, journal impact factors measure the average number of citations, per published article, for papers published over a two-year period. Journals do not calculate their impact factor directly — it is calculated and published by Thomson Reuters.  知道Nature 的读者都知道,期刊影响因子用来衡量过去两年期间所发表论文的平均引用数。这一数据不是由期刊中心直接计算给出的,而是由Thomson Reuters计算并发布的。  Publishers have long celebrated strong impact factors. It is, after all, one of the measures of their output’s significance — as far as it goes.  出版商们纷纷大肆宣扬其一路飙升的影响因子。不用说,大家也知道,对出版商而言,期刊影响因子就是评估其发行量的重要指标之一。  But the impact factor is crude and also misleading. It effectively undervalues papers in disciplines that are slow-burning or have lower characteristic citation rates. Being an arithmetic mean, it gives disproportionate significance to a few very highly cited papers, and it falsely implies that papers with only a few citations are relatively unimportant.  但是,影响因子本身就是一种比较原始的、粗暴的量化标准,因而常常带有一定的误导性。实际上,由于没有考虑到不同学科之间的差异性,它很容易低估那些“慢热”和“冷门”领域的文章。就单单依靠“算术平均”这一数值来进行评判,这显然是有问题的。对于那些“少而精”文章来说,在影响因子下所得到的影响力是严重不成比例的,同时,这也给读者发出了一个错误信息:低影响因子的文章也就是是不好、不重要的文章。  These shortcomings are well known, but that has not prevented scientists, funders and universities from overly relying on impact factors, or publishers (Nature’s included, in the past) from excessively promoting them. As a result, researchers use the impact factor to help them decide which journals to submit to — to an extent that is undermining good science. The resulting pressures and disappointments are nothing but demoralizing, and in badly run labs can encourage sloppy research that, for example, fails to test assumptions thoroughly or to take all the data into account before submitting big claims.  尽管大家都知道,影响因子天生就存在的缺陷,但依然受到了学术界得到热捧。大量科研工作者、经费管理者以及科研院校趋之若鹜,纷纷将其作为学术水平的评估指标,出版商(包括Nature)也不遗余力地宣传影响因子的作用。这样所带来的后果就是:研究者们开始利用影响因子的高低来选择投递哪一家期刊,这在很大程度上抹杀了“科学氛围”。其中不乏令人痛心的案例比比皆是,比如:一些道德败坏的科研机构甚至大力提倡“科研快餐”文化——在没有理论、实验做有力的支撑下,就开始胡编乱造,或者没有充分地把问题思考清楚,就完成了一篇“杰作”。  The most pernicious aspect of this culture, as Nature has pointed out in the past, has been a practice of using journal impact factors as a basis for assessment of individual researchers’ achievements. For example, when compiling a shortlist from several hundred job applicants, how easy it is to rule out anyone without a high-impact-factor journal in their CV.  这种方式最不利的方面,就是用期刊影响因子作为评价个体的研究成果已经成为一种习惯。例如,当从几百个求职者名单选人时,如果他们简历没有高影响因子期刊的成果,很容易就被去掉。  How to militate against such a metrics-obsessed culture?  如何防止痴迷于这种量化指标呢?  First, an approach that some have applied in the past and whose time has surely come. Applicants for any job, promotion or funding should be asked to include a short summary of what they consider their achievements to be, rather than just to list their publications. This may sound simplistic, but some who have tried it find that it properly focuses attention on the candidate rather than on journals.  首先,有一种已经经过时间检验的方法。任何求职、晋升或资金申请,当事人都要求提供一个简短总结。列出他们认为他们自己的重要工作,而不是只列出他们的作品。这听起来可能是简单的,但有些尝试它的人发现,我们需要将注意力集中在候选人,而不是在期刊上。这一点确实很难做到。  Second, journals need to be more diverse in how they display their performance. Accordingly,Nature has updated its online journal metrics page to include an array of additional bibliometric data.  第二,期刊需要多样化的展示,而不单只依靠影响因子。为此,Nature 已经更新了其在线杂志数据页,包括额外的许多新的计量数据。  As a part of this update, for Nature, the Nature journals and Scientific Reports, we have calculated the two-year median — the median number of citations that articles published in 2013 and 2014 received in 2015. The median is not subject to distortion by outliers. (The two-year median is lower than the two-year impact factor: 24, down from 38, for Nature, for example.) For details, seego.nature.com/2arq7om.  Nature的另一新变化是:他们表示,将公布2013、2014及2015近3年的发表论文的引用中位数。引用中位数的优点是,它将不会受到“超高人气”引用文章的影响,因此更加客观准确。(引用中位数往往低于影响因子,例如nature的影响因子是38,而引用中位数只有24.)有关详细信息,见于go.nature.com/2arq7om.。  Providing these extra metrics will not address the problem mentioned above of the diversity in citation characteristics between disciplines. Nor will it make much of a dent in impact-factor obsessions. But we hope that it will at least provide a better means of assessing our output, and put the impact factor in a better perspective.  提供这些额外的指标将不会解决我们提到的学科差异性问题。这也不会成为是困扰影响因子的一个难题。但我们希望它至少提供一个更好的方法来评估我们的成果,将影响因子改造得更好一些。  However, whether you are assessing journals or researchers, nothing beats reading the papers and forming your own opinion.  然而,无论你是评估期刊编辑还是研究人员,更重要的是,通过阅读论文形成自己的观点。而不是影响因子什么的鬼东西。  Nature,535,466,(28 July 2016)  doi:10.1038/535466a  2. Nature、Science等最强声音加入打击影响因子的行列  近日,PLoS、eLife、EMBO Press、Science Journals、Springer Nature、the Royal Society等多家主流出版集团的高层人员共同合作,在预印本网站bioRxiv上刊登了抵制影响因子的文章。文章明确指出了影响因子对个体文章和学者学术水平评价过程中的不利影响,并建议所有期刊采用新的评价体系——引用分布 (Citation Distribution),以更加合理真实的反应个体的工作情况,避免影响因子在学术评估中的不恰当使用。文以Science、Nature、eLife和PLoS的11个期刊为例,列出这11个期刊2013-2014年文章的引用分布情况,然后与2015年期刊影响因子进行对比。结果发现,在这些期刊中大多数论文的引用次数都低于所在期刊的影响因子。Nature 的影响因子为38.1,但是实际上却有多达74.8%的文章引用次数低于其影响因子,相似的情况也发生在Science和 PLos中,造成这种现象出现的原因是少数高引文章的存在拉高了整体文章的影响因子。  有人觉得这是站着说话不腰疼:  "呵呵,Nature,Science这帮人居然有脸来分析影响因子"  "大家快来看啦:PLoS,Science,Nature,EMBO四大贵族说它们觉得影响因子不好用啊喂"  有人为之欢呼雀跃,奔走相告:  "好棒耶,简直太及时了,我们得赶紧支持这个啊。@跟我一起正在发愁发论文的好基友"  有人则更加理性从容:  "这无疑是替代一度有用无奈现如今被滥用的影响因子的最佳选择"  当然不管面对多么严肃的事情,都始终少不了那些幽默派的身影。  "嗯,这是我今晚的思想盛宴,你们要不要来一碗?"  "什么?神圣的影响因子说被践踏就被践踏?  3. SCI被卖第二天,美国微生物学会(ASM)宣称放弃影响因子  上周《昨日SCI被237.3亿抛售》在科研界的朋友圈阅读达到近60万。可见大家对这次事情的重视程度。墙倒众人推,SCI被卖第二天,美国微生物学会(ASM)官网最新消息:ASM期刊总编和ASM领导层决定,以后将不在ASM期刊网站上公布影响因子(IFs)。  全文及其译文如下  Many scientists attempt to publish their work in a journal with the highest possible journal impact factor (IF). Despite widespread condemnation of the use of journal IFs to assess the significance of published work, these numbers continue to be widely misused in publication, hiring, funding, and promotion decisions .  很多科学家都尝试着将他们的文章发表在具有高的影响影子的期刊上,尽管使用影响因子来评估发表论文的重要性受到广泛的谴责,但影响因子仍被广泛滥用于出版、求职、项目申请和职务晋升等等各种科研环节.  There are a number of problems with this approach. First of all, the journal IF is a journal-level metric, not an article-level metric, and its use to determine the impact of a single article is statistically flawed since citation distribution is skewed for all journals, with a very small number of articles driving the vast majority of citations.  影响因子这种方法有很多问题,首先,期刊的影响因子是期刊水平的度量标准,而不是一篇文章水平的度量标准,将其用于决定一篇文章的影响力是存在统计缺陷的。由于所有期刊的引文是不均匀的,可能少数的文章高引推高了杂志的影响因子。  Furthermore, impact does not equal importance or advancement to the field, and the pursuit of a high IF, whether at the article or journal level, may misdirect research efforts away from more important priorities.  此外不论文章还是杂志,影响力也不等于领域的重要性或前沿性,追求高影响因子会误导大众,我们需要关注的是研究成果而不是关注其他更为重要的优先事项。  The causes for the unhealthy obsession with IF are complex. High-IF journals limit the number of their publications to create an artificial scarcity and generate the perception that exclusivity is a marker of quality. The relentless pursuit of high-IF publications has been detrimental for science.  人们不理性的痴迷于影响因子的原因是复杂的。高影响因子的期刊限制了出版物的数量造成人为的稀缺性观念,通过限制发文量提高杂志的质量。不懈追求高影响因子科学出版物是有害的。  This behavior is an example of the economic phenomenon known as the “tragedy of the commons”, in which individuals engage in a behavior that benefits them individually at the expense of communal interests.  这一行为在经济学中被称为“公地悲剧”。个人总是自发参与到那些有利于自己但不利于社会大众的行为中去。  Individual scientists receive disproportionate rewards for articles in high-IF journals, but science as a whole suffers from a distorted value system, delayed communication of results as authors shop for the journal with the highest IF that will publish their work, and perverse incentives for sloppy or dishonest work.  个别科学家因为在高影响因子杂志上发表文章而获得不成比例的奖励回报,于是科学作为一个整体,其价值受到了一种扭曲,结果被高影响因子杂志延迟发表,甚至导致了不正当或不诚实的工作的产生。  Since many investigators consider IFs in deciding where to submit their manuscripts, many journals list their IFs on their websites, and until now American Society for Microbiology (ASM) journals have been no exception.  因为许多研究人员以影响因子高低决定选什么杂志递交他们的文章,所以许多期刊将影响因子放在他们的网站上,甚至美国微生物学会(ASM)期刊也不例外。  ASM journals focus on publishing high-quality science that has been rigorously peer reviewed by experts and evaluated by academic editors. The primary mission of ASM is to advance microbial science. At the recent Journals Board meeting that took place during ASM Microbe 2016 in Boston, MA, the editors in chief and the ASM leadership decided to no longer advertise the IFs of ASM journals.  ASM期刊关注出版进行了严格同行评议和学术编辑评估的高质量科学成果。ASM的主要任务是促进微生物科学发展。2016年在波士顿ASM微生物的期刊董事会上,首席编辑和ASM领导已经决定不再宣传ASM期刊的影响因子。  Our goal is to avoid contributing further to the inappropriate focus on journal IFs. Although this action by itself may have little effect on a practice that is deeply entrenched in the biological sciences, we hope that removing IFs from ASM journal websites makes a statement of principle that will be emulated by other journals.  我们的目标是避免造成进一步不恰当的关注影响因子。虽然这个动作本身可能没有影响根深蒂固的生物科学实践,但是我们希望效仿其他期刊删除ASM杂志网站中的影响因子。  4. 墙倒众人推是商业炒作还是为了科研的未来,值得深思?  《科学通报》主编、中科院院士高教授说:“这就是正常的商业运作,对国内科研现状不会有什么影响。”为什么Nature、Science借此机会炒作。我们有理由相信这次Nature、Science可能是想推出自己的评价体系,插足影响因子市场,才大唱高调打击影响因子。  正所谓墙倒众人推,随着SCI被转手卖给新东家,新的科研评价体系纷纷趁此机会。期刊期望引文数(Journal Expected citations,标准化特征因子(Normalized Eigenfactor),期刊影响因子百分位(Journal Impact Factor Percentile),期刊规范化的引文影响力(JNCI),等等,抢滩登陆,一场群雄混战势必将要到来,至于最后到底是谁定鼎中原,那就有待时间的检验和广大科研群众的选择了。  中国科学院文献情报中心吴研究员说:汤森路透出售SCI等知识产权和科技业务,从本质上说是基于利润与市场的商业行为。知识产权与科技业务和汤森路透的金融、新闻业务相比,业务方向和利润贡献率均不理想。换句话说,汤森路透觉得这块业务不挣钱。当然,SCI等二次文献在中国的销售相当不错,但在国外却并不乐观 这与一次文献欧美占大头的销售的情况相左。如果未来中国对SCI的热情逐渐消退,这次35.5亿美元接手SCI等业务的Onex公司和霸菱亚洲投资基金公司,会不会难以出货呢?拭目以待。  随着Nature、Science这些强有力的对手登台亮相,这次影响因子之战注定越来越好看。  墙倒众人推是商业炒作还是为了科研的未来,值得深思?  附录Nature和Science,发行百年来一直是科学领域最具影响力的媒介  Nature 杂志由英国Nature 出版集团(Nature Publishing Group , NPG) 出版发行,该集团是麦克米兰出版有限公司(Macmillan Publisher Ltd) 的科学出版机构,总部设在伦敦,另在纽约、旧金山、华盛顿特区、东京、巴黎、慕尼黑等地设有办事处,是一个全球性的出版公司,在世界各地拥有大量的读者。NPG的品牌期刊是Nature 杂志,每周一期, 发行140 年来一直是科学研究领域最具影响力的媒介之一。Nature还有8种姊妹月刊: Nature genetics(1992 年创刊) , Nature Structural & molecular Biology (原名为Nature Structural Biology 1994 年创刊,2004 年1 月更名) , Nature Medicine ( 1995 年创刊) , Nature Biotechnology ( 原称Bio/ technology ,1983 年创刊, 1996 年更名) , Nature Neuroscience(1998 年创刊) , Nature Cell Biology (1999 年5 月创刊) , Nature Immunology ( 2000 年7 月创刊) 和Nature Materials (2002 年9 月创刊) , 这8 种月刊以发表原创性研究报告为主。随着发表原创性文章的系列期刊日益受到关注及互联网上信息容量的日益扩增,为了使科学家们能够更多地了解各个科学领域经过筛选的、最新的重要信息,NPG又发行了7种综述性期刊: Nature Reviews Genetics 、Nature Reviews Molecular Cell Biology 和Nature Reviews Neuroscience (均于2000 年10 月创刊) , Nature Reviews Cancer 和Nature Reviews Immunology (均于2001 年10 月创刊) , Nature Reviews Drug Discovery (2002 年1 月创刊)及Nature Reviews Microbiology (2003 年10 月创刊) 。这些期刊覆盖了自然科学的各个领域, 以最快的速度、最严格的标准自由发表这些领域里最高水平的论文, 不受任何政府和学术机构的影响。  美国的《Science》杂志为国际上著名的自然科学综合类学术期刊,在世界学术界享有盛誉,反映其被引文量的影响因子始终高居《SCI》收录的5700种科学期刊的前十位。据2001年最新统计,《Science》杂志年发表论文数901篇,被引用次数282431,影响因子为23.329,排名所有科学期刊的第8位。由于其独特的学术地位,国内许多科研院所为鼓励学术人员在该刊发表文章,都制定了优厚的奖励措施。《Science》杂志创刊于1880年,目前在全球拥有16.5万个订户,超过《Nature》杂志三倍。《Science》杂志具有新闻杂志和学术期刊的双重特点,每周除向世界各地发布有关科学技术和科技政策的重要新闻外,还发表全球科技研究最显著突破的研究论文和报告。《Science》杂志发表的论文涉及所有科学学科,特别是物理学、生命科学、化学、材料科学和医学中最重要的、最激动人心的研究进展。据统计,发表的论文中60%有关生命科学,40%是属于物理科学领域的(见附录1)。每年《Science》杂志还出版大约15期专辑,展示某一专门领域的最新成果,例如生物技术、寄生虫学、纳米技术、计算机技术等。除高水平的论文外,每期专辑还发表有关科技职业的专题文章和以不同国家、地区为对象的专栏。
  • 北京市粒度仪seminar圆满成功
    粒度检测应用培训会 粒度检测应用培训会是由奥法美嘉生物科技有限公司、美国Pss粒度仪中国卓越中心举办的高端培训会,旨在为广大客户企业提供一个全面了解粒度仪在各行业应用的平台,帮助客户培养专业的粒度仪运用团队。客户可以在培训会上与我司专业粒度仪专家深入探讨交流。 12月14日北京市粒度仪seminar圆满成功 12月14日,由奥法美嘉生物科技有限公司、美国Pss粒度仪中国卓越中心举办的北京市粒度仪seminar于北京京都信苑酒店取得圆满成功。 北京京都信苑五星级酒店 我司秉持认真、负责的态度,十分重视并认真安排了此次seminar,为给客户呈现高质量的研讨会议,我们将此次的会址选择了在北京京都信苑五星级酒店,除了制定了详细的议程之余,我们还请到了奥法美嘉 Particle Genius为广大客户做全面的粒度检测讲解。周全的准备只为恭候您的到来 此次seminar充分利用我司专业人才优势,为客户等多方面,带领与会嘉宾与各客户们对粒度检测进行了深入浅出的讲解。 Particle Genius正为客户做讲解 此次seminar上Particle Genius,为客户从 粒度知识、粒度仪原理、粒度仪在医药行业的应用与如何获得一个好的检测数据 等方面带领与会嘉宾与各客户们进行了深入浅出的讲解。 除此之外,Particle Genius还对客户提出的问题进行了详细的解答。客户们将在粒度检测行业的问题和疑问向专家提出,从问题中我们也不由得感慨广大企业客户们的专业与对待业务的严谨。此次的seminar可以说是一次互助的学习,我们从广大客户身上也学到了十分宝贵的经验,再次感谢能从百忙之中出席本次seminar的客户朋友们的支持与帮助。seminar现场此次北京市粒度仪seminar取得圆满成功请继续关注我们的下一次活动吧!上海奥法美嘉生物科技有限公司奥美的足迹遍布世界,我们由心出发,服务大家
  • 对照品如何保存,又应该如何使用?
    对照品系指用于鉴别、检查、含量测定的标准物质,包括杂质对照品,不包括色谱用的内标物质。在药品检验工作中我们常会用到一种用来检查药品质量的特殊参照物——药品标准物质(对照品)。它在药品检验中具有十分重要的地位。随着仪器分析的广泛使用,必将越来越多地使用药品标准物质。下面远慕生物就来介绍一下如何对对照品进行保存和使用:  (1)对照品应按说明书规定的条件妥善保存,一般置干燥阴凉处保存,某些对照品如维生素E等需避光低温保存。要注意对照品的使用期限,过期、变质的对照品不宜再使用。开瓶后建议短期内用完,避免开瓶后长期不用,同时,在重复使用过程中应尽量避免对照品的分解、污染或吸潮。  (2)使用中检所对照品时,应严格按说明书执行。一般情况下,供鉴别、检查用的对照品不能用于含量测定。红外鉴别用的对照品使用时应注意与样品在晶型上的差异,必要时可采用相同的方法对样品和对照品重结晶。例如氨苄西林钠具有多种不同的晶型,可用丙酮对样品和对照品重结晶后测定,以确保二者晶型和红外光谱图的一致。  (3)由中国药品生物制品检定所提供的对照品或国际对照品为法定对照品,以法定对照品作对照标化的原料可称为二级对照品或工作对照品。药品生产单位为节约成本,可使用工作对照品进行日常检验,但药品检验所必须使用法定的对照品,出具的检验报告书才具有法律效力。  (4)除另有规定外,对照品使用时应采用适宜的方法测定其水分的含量,按干燥品(或无水物)进行计算后使用,否则会造成含量测定结果偏高。对热稳定的对照品可直接干燥后使用;对热不稳定的对照品可同时另取一份作干燥失重,扣除水分后使用。此外,对照品若含有结晶水或盐基,使用时应注意其换算。  远慕生物提供以下服务:  1.中药提取物的定制研发和生产,中药提取物代加工相关服务。  2.中药高含量提取物的工业化高效分离及分离纯化生产  3.天然产物原料药和中间体的生产,定制(包括合成,半合成)
  • 中药质量辨别,岛津Nexera液相来帮忙
    宋代诗人葛绍体曾发出“满地翻黄银杏叶,忽惊天地告成功”这样的感叹,来赞美秋天银杏树的落叶。其实银杏树叶在春天也是别有一番滋味的,刚刚舒展开的一片片嫩绿树叶,就像一只只绿色蝴蝶,点缀在枝头翩翩欲飞,为这个季节增添了更多生机。 自古以来银杏叶不仅受到文人墨客的夸赞,更是受到医生们的喜爱。主要是因为银杏叶具有极高的药用价值,尤其是春天绿色的银杏叶。研究表明,银杏叶提取物中含有黄酮醇苷和萜类内酯等物质,可以扩张冠状动脉血管、改善脑循环,在治疗心脑血管疾病、神经系统疾病方面有显著疗效。经查阅NMPA(国家药品监督管理局)药品生产企业数据库,NMPA目前批准的银杏叶提取物制剂包括胶囊、颗粒、分散片、注射液等数十种,银杏叶提取物质量控制显得尤为重要,需要遵循相关标准要求。指纹图谱分析手段是中药分析领域进行宏观监测的有效措施,在国际范围内被认为是控制中药或天然药物质量最有效的手段之一。它可以全面的反应化合物所含的化学成分种类、数量以及相互之间比例关系,从而有效表征其内在质量。 2015年版《中国药典》中银杏叶提取物的鉴别主要考察萜类内酯,为了进一步提高药品质量标准,2020版药典标准公示稿中增订了银杏叶提取物【指纹图谱】鉴定项目,该方法参照《0512通则高效液相色谱法》进行测定,提供了常规液相色谱和超高效液相色谱两种分析方法,要求供试品指纹图谱中呈现17 个与对照提取物指纹图谱相对应的色谱峰,其中6 号峰与参照物峰保留时间相对应;全峰匹配,按中药色谱指纹图谱相似度评价系统计算供试品指纹图谱与对照提取物指纹图谱的相似度,应不得低于0.90。 采用岛津Nexera LC-40超高效液相色谱系统对银杏叶提取物指纹图谱进行研究,该方法分析时间短,精密度高,供试品和对照提取物的指纹图谱相似度达到0.927,满足药典规定。图1 银杏叶对照提取物指纹图谱图2 供试品和对照提取物指纹图谱相似度比较(S1:对照品 S2:供试品) 岛津全新的Nexera系列HPLC除了具备卓越的检测性能,还将分析智能和物联网完美结合,将使实验室管理变得更加直观,仪器状态确认更加简便,资源配置得以更加优化,未来将在智能化、高效化和自动化领域引领全新的行业标准。
  • 紧跟行业动态 加大中国知名度——JASIS2019视频访京都电子中国市场负责人竹内义清
    p style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.5em "span style="text-indent: 2em font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai "9月4日-6日,在日本幕张举办的2019分析及科学仪器展(JASIS2019)上,仪器信息网采访了京都电子中国市场负责人竹内义清先生。竹内义清对京都电子在本次展会上展出的新产品及公司未来发展的重点领域等内容做了详细介绍。/span/pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.5em "据竹内义清介绍,京都电子成立于1961年,距今已有58年的历史,公司主要的产品为电位滴定仪、水分仪、密度计、折光仪等,主要应用于石油行业、化工行业、饮料行业等。“目前除日本之外,京都电子在海外60多个国家有180余经销商和代理商共同进行产品推广。”他强调由于现在的制药行业非常重视美国FDA,京都电子紧跟行业动态针对性研发推出相应产品… … 具体采访内容请查看下方视频:/pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.5em " /pscript src="https://p.bokecc.com/player?vid=5A01F621E3BF86309C33DC5901307461&siteid=D9180EE599D5BD46&autoStart=false&width=600&height=490&playerid=5B1BAFA93D12E3DE&playertype=2" type="text/javascript"/scriptp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.5em "竹内义清表示京都电子主要覆盖许多行业领域:能源方面主要是燃油、汽油、润滑油等;石油化工主要为基本原料;材料方面有塑料、纤维、橡胶、涂料等;食品饮料行业有调料、添加剂、碳酸饮料;烟草行业;新能源行业有电池、正负极材料、电解液等。/pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.5em "在被问及针对中国市场公司下一步有哪些计划时,竹内义清表示目前京都电子在中国上海设立有分公司,并且整个中国市场都由其负责。根据目前的产品销售情况等信息,京都电子以后可能会着重提高其在中国的知名度和产品销售量,尤其中国西南和西北地区是京都电子日后加大推广力度的目标地区。/pp style="text-align: center "img style="" src="https://img1.17img.cn/17img/images/201909/uepic/3823309f-9025-40c8-abaf-579d126bb6b1.jpg" title="微信尾缀二维码01.png"//pp style="text-align: center "img style="" src="https://img1.17img.cn/17img/images/201909/uepic/6f91afbf-75e3-4b94-b429-4aa4da60935c.jpg" title="微信尾缀二维码02.png"//p
  • 超强基因"探照灯"CRISPR FISHer技术|西湖大学宋春青团队与申恩志团队最新成果《Cell Reserrch》
    让我们乘坐时光机,前往东晋的夏日夜晚。有一位名为车胤的少年,由于家境贫寒,会在黑暗的夜晚出门捕捉萤火虫。他把它们装在白色丝袋中,照亮书本。聚集在袋子里的萤火虫们不会知道,它们的光亮,点亮了车胤官至吏部尚书的平步青云之路,也促成了比喻学习勤奋的成语“囊萤夜读”。现在,我们返回1700年后的当下。与车胤的故事相似,西湖大学生命科学学院PI宋春青、申恩志的团队合作,在细胞微观维度上聚拢了“萤火虫”,研发出能够更自如、更灵活地照亮DNA这本浩瀚之书的基因“探照灯”——CRISPR FISHer技术。近日,他们的研究论文“CRISPR FISHer enables high-sensitivity imaging of nonrepetitive DNA in living cells through phase separation-mediated signal amplification”在Cell Research杂志在线发表、并被选为封面文章。CRISPR FISHer,即实现了活细胞单拷贝基因成像的标记系统(或称,基于相分离信号放大的高敏活细胞DNA元件示踪方法),是基于CRISPR技术而来。它具有追踪任何特定细胞固有或外源DNA序列的潜力,极大地拓宽了活细胞成像的应用范围,为生物学过程研究和生物医学诊断的进一步发展奠定了基础。原文链接:https://www.nature.com/articles/s41422-022-00712-z“基因剪刀”CRISPR:我可以照亮基因之书我们都知道,你之所以是你,我之所以是我,是由于我们每个人拥有着独一无二的基因组(指生物体所有遗传物质的总和)。基因组就像是一本特别的书,以基因片段为“字词”,记载着我们的个人信息,也将在我们的一生中发挥重要作用。CRISPR技术,是基因编辑技术的一种,常被比拟为“基因剪刀”。它能够针对性地对基因组之书的错误靶点进行剪切,在提供模板的情况下可以进行错误“纠正”——简要理解,就是找到错误的地方,“剪”掉错误的内容,然后“替换”成正确的字词。这得益于它的核心组成部分,gRNA和Cas9 蛋白。gRNA(也叫guide RNA,即向导RNA),是这把“剪刀”的导航,能够在基因组的“字词”海洋里找到出错的地方、规划抵达的路线;Cas9核酸内切酶,则是“剪刀”的刀锋,能沿着路线抵达指定位置,并一刀切下去。当然,以上是CRISPR技术最基础的应用方式,随着CRISPR基因编辑技术的发展,2013年,科学家们发现了CRISPR的另一种作用——“剪刀”丧失剪切功能(dCas9,即核酸酶失活形式的Cas9),但却带着“灯”(EGFP,增强绿色荧光蛋白)锁定并照亮基因组的“段落”;自此,CRISPR成像技术在基因成像领域崭露头角。这种带“灯”的CRISPR有什么用?比如,我们可以去观察基因本身,去看一个染色体的状态、记录染色体的运动,也就是当下“流行”的4D染色体研究;又比如,我们可以观察病毒DNA入侵细胞的过程;再比如,可以帮助我们研究癌症的原理,研究诸如染色体易位这样的异常染色体状态与癌症发生的关系;还有,我们可以观察携带基因的载体是否将DNA带到“目的地”,例如,实时动态追踪用于治疗遗传性视网膜疾病和脊髓性肌萎缩症的AAV载体是否承载了疗效基因……看到了这盏“灯”的强大作用后,很多科学家开始聚焦于基于CRISPR技术的活细胞成像研究。最初科学家通过增加向导RNA(即gRNA,“导航”)的量来招募更多的荧光蛋白(即“灯”)照亮局部位点,但是多个“导航”很难同时进入同一个细胞;与此同时,在细胞中游离的“灯”会产生很强的背景光亮,这就使得目标位点的光照分辨率变的很低。2016年,CRISPRainbow活细胞成像系统面世,它像一串彩虹色“霓虹灯”,能实现基因组不同位点的标记;2018年,又诞生了CRISPR-Sirius系统,一个“导航”能够携带更多个数的“灯泡”,从而实现更高分辨率的成像……CRISPR FISHer: 强大的“基因探照灯”,来了!较之在基因成像领域更传统、更广泛应用的DNA原位杂交技术(需要将细胞固定,DNA变性后才能实现,不能实时记录DNA的状态),基于CRISPR技术的“灯”可以在细胞中的靶位点DNA非变性的情况下,实现DNA在活细胞内的动态成像。然而,这样的“灯”目前能照亮、使我们能读到的,仅限于基因组的“书”中那些在同一页中重复出现的内容,也就是临近位置重复出现多次的DNA序列(即成簇存在的多拷贝位点)。而在我们人类的基因组的“书”中,大多数都是非重复的内容,即单拷贝基因。于是,超过65%的人类基因组序列利用现有的成像系统很难检测得到。也就是说,现在给基因“书”用的“灯”,不管怎么打造,总是不够“亮”,很难让我们看清书中那些处于细微处且只出现一次的“字词”。是否可以做出一盏更厉害的基因灯?有了这个理想,西湖大学宋春青实验室和申恩志实验室合作,历经近两年,最终,CRISPR FISHer诞生了。东晋少年车胤之所以聚拢萤火虫,是因为单只萤火虫的光很微弱,且它们分散在大自然中,无法照亮书页;但在聚集后,微弱之光便变强了。同样的,CRISPR FISHer系统,正是在先前版本的CRISPR成像系统上,聚拢了更多的“灯”,实现了在基因维度更强大的成像功能——因而,我们无惧所需照亮的基因“字词”之细小,能够阅读DNA书本的更多细节内容了。具体来说,该系统由dCas9蛋白,包含2个PP7配体的sgRNA(sgRNA-2×PP7)和foldon-GFP-PCP蛋白组成。在成像标记的过程中,dCas9(即“钝刀”的刀锋,上文所述的不会切割的Cas9蛋白)和sgRNA-2×PP7(可理解为导航兼连接支架)会首先在目标DNA序列位点稳定结合,并充当“种子”,使得foldon-GFP-PCP(即“灯”)和其余的sgRNA-2×PP7在目标DNA位点处快速聚集,从而通过相分离的方式最大化募集GFP荧光蛋白“灯”至标记位点(可以理解为形成更庞大的串联的结构,“刀锋-支架-灯”基础上,可以继续串联更多的“支架-灯”结构,形成“刀锋-支架-灯-支架-灯-支架-灯……”),同时大大降低细胞核背景中弥散的GFP信号(如图一)。图一随后,为了验证CRISPR FISHer系统的功能是否强大,研究团队开展了一系列验证实验。他们证实,CRISPR FISHer超越了已有“基因灯”的技术。在相同的拍摄条件下,CRISPR FISHer所标记的端粒荧光强度信噪比最高可以达到246,远远高于传统的成像系统(信噪比在2左右)(图二)。这说明,在照亮基因“书”的重复内容时,因为光更强,所以我们有机会看得更清楚了。图二之后他们证实,那些在书中仅仅出现一次的内容,也就是之前人类没法“看到”的那些单拷贝基因,现在也能看清了。团队发现,相对于对照组细胞呈现出的弥散绿色荧光信号,在CRISPR FISHer所标记的PPP1R2基因的细胞中可以明显的观察到2-4个荧光信号点(如图三a和图三b),这说明CRISPR FISHer系统是具备单拷贝基因成像标记能力的,并且在单拷贝基因的成像标记过程中表现出很好的特异性,能够“看到”基因“书”中的特定的、只出现一次的“字词”内容。最让研究团队兴奋的是,他们发现——当基因“书”被某些因素影响发生改变,成了不常规的“书”,比如,基因组不稳定性或染色体结构变异可诱导 DNA损伤和修复,有时会产生染色体外的DNA;或者,一些外源入侵者,例如病毒,可以感染细胞并将其基因组传递到细胞核中,导致细胞功能障碍和疾病的发生发展——这些时候,这盏“灯”依然能带着我们看清楚最新情况。图三从利刃到钝刀,他们致力于“透视”基因层面的人类病痛不知道千百年前,终于以萤虫之光照亮夜间学海之路的车胤,是否为此激动不已。总之对于创新了CRISPR FISHer活细胞单拷贝基因成像标记系统的宋春青团队和申恩志团队来说,他们对于打造一盏世界上前所未有的“灯”,去照亮、去看见那些在“黑暗”中的基因,等待已久。研究团队从有想法到最终实现,他们整整走了近两年。事实上,两年是往短了说的。这次之所以能够实现原创的突破性的基因成像技术,与研究者们关于CRISPR更早期、更长年累月的研究密不可分。早在2015年至2019年在麻省大学医学院RNA治疗研究所进行博士后研究时,宋春青接触了CRISPR技术,并且练就了如何在“利刃”CRISPR上玩出花的本领——也就是常规意义上的“基因剪刀”的基因编辑功用。正是基于“利刃”的研究经验,熟悉了CRISPR的基本原理,做“钝刀”灯,才会势如破竹。宋春青展望未来,CRISPR FISHer由于拥有能够追踪任何特定内源或外源DNA序列的潜力,将极大地拓宽了活细胞成像技术的应用范围,为生物学过程研究和生物医学诊断的发展奠定基础。换句话说,拥有了这盏超强基因“探照灯”,我们能够看到基因的更多动态,挖掘更多关于人类身体机理和疾病的“秘密”。西湖大学生命科学学院宋春青课题组2020级博士生吕欣原,博士后邓远,2020级博士生黄晓燕,和申恩志课题组2020级博士生李珍珍为该论文的共同第一作者。西湖大学生命科学学院宋春青研究员和申恩志研究员为该论文的共同通讯作者。Ref.1. Ain, Q., et al., Extrachromosomal Circular DNA: Current Knowledge and Implications for CNS Aging and Neurodegeneration. 2020. 21(7): p. 2477.2. Foxman, E.F. and A.J.N.R.M. Iwasaki, Genome-virome interactions: examining the role of common viral infections in complex disease.2011. 9(4): p. 254-264.3. Schwarzacher, T. and J.S.J.M.i.M.B. Heslop-Harrison, Direct fluorochrome-labeled DNA probes for direct fluorescent in situ hybridization to chromosomes. 1994. 28: p. 167.4. Qi, L.S., et al., Repurposing CRISPR as an RNA-guided platform for sequence-specific control of gene expression. 2013. 152(5): p. 1173-1183.5. Chen, B., et al., Dynamic Imaging of Genomic Loci in Living Human Cells by an Optimized CRISPR/Cas System. 2013. 155(7): p. 1479-1491.6. Ma, H., et al., Multiplexed labeling of genomic loci with dCas9 and engineered sgRNAs using CRISPRainbow. 2016.7. Ma, H., et al., CRISPR-Sirius: RNA scaffolds for signal amplification in genome imaging. 2018. 15(11).8. Sawada, H. and G.F. Saunders, Transcription of Nonrepetitive DNA in Human Tissues. 1974. 34(3): p. 516-520.9. Xu, H., et al., TriTag: an integrative tool to correlate chromatin dynamics and gene expression in living cells. 2020.10. Gu, B., et al., Transcription-coupled changes in nuclear mobility of mammalian cis-regulatory elements. 2018. 359(6379): p. 1050-1055.实验室招聘宋春青研究组主要通过CRISPR技术建立小鼠模型,运用细胞生物学、分子生物学及其生物信息学等手段来解析肝癌以及组织再生和衰老的分子机制。此外实验室聚焦于CRISPR相关的技术的改进、应用和遗传性疾病的修复。实验室主页:http://songlab.web.zhanhi.com/vip_songlab.html申恩志课题组主要集中于非编码核酸(non-coding RNA,ncRNA)的研究,ncRNA是转录组的主要组成部分,广泛参与细胞的一系列生物学过程,对生物体的功能调节起着至关重要的作用。例如,小非编码核酸siRNA、miRNA和piRNA(Piwi-interacting RNA)可以靶向调节基因的表达,进而确保生物体转录组的稳定和生殖发育的正常进行。以线虫和小鼠为模式生物,集中在系统研究piRNA的生物学功能和作用机制。实验室介绍:https://sls.westlake.edu.cn/Our_Faculty/202006/t20200617_5886.shtml实验室长期招聘科研助理、博士后和助理研究员,欢迎有志之士加盟!简历投递到 songlab@westlake.edu.cn shenenzhi@westlake.edu.cn。
  • Gene-π 数字PCR学堂—Drop-off方法检测基因缺失篇
    数字 PCR (dPCR)可以提供比传统qPCR更高的精准度和灵敏度,尤其是在肿瘤学应用中,dPCR能精准且可靠地检测到较低浓度样本中的稀有突变等。目前,使用Drop-off方法可以同时检测基因组内发生的多个序列插入、缺失或碱基突变,最大限度地提高单个检测中样本的数据输出,节省时间和检测成本。本文以naica微滴芯片数字PCR平台为基础,对使用Drop-off方法检测基因缺失进行阐述。首先,为大家介绍一下Drop-off方法原理:☑ Drop-off是指利用探针在一个反应中检测基因组序列的同源基因突变(包括核苷酸的缺失,插入和替换)。☑ Drop-off方法包括两个TaqMan 探针:一个与野生型序列互补而与突变位点不发生互补的Drop-off探针和一个与突变型和野生型基因都互补的Reference探针(如下图A)。☑ 当野生型等位基因存在时,Drop-off探针和Reference探针都将与目标序列杂交,产生双重阳性信号(如下图B,蓝色群)。相反,如果存在突变的等位基因,即使一个核苷酸的突变也会阻止Drop-off探针与之杂交,因此只有Reference探针与目标基因结合,从而得到一个阳性信号(如下图B,绿色群)。A.Drop-off和Reference探针及引物在目标基因上的示意图(FP:上游引物,RP:下游引物)B. Crystal Miner 2D图中显示来自双阳性野生型等位基因的荧光簇(天蓝色:蓝色和绿色)和突变等位基因的荧光簇(绿色)及阴性微滴簇(黑色)。Drop-Off探针仅和野生型序列互补,而跳过突变序列(图B,纵坐标的蓝色通道);Reference探针与突变和野生型等位基因进行互补(图B中横坐标的绿色通道)。野生型浓度CWT可以直接从双阳性微滴中PWT的比例得出。但是,Drop-off突变体浓度Cmut必须从确信包含突变等位基因的微滴比例Pmut中得出。由于野生型和突变等位基因可能被分配到同一个微滴里面,因此采用双阳性微滴对突变体进行定量是不准确的,只能通过排除双阳性微滴来确定Pmut(将突变阳性群体定义为对Reference探针呈阳性但对Drop-off探针呈阴性的微滴)。上文已对检测原理和检测方法进行了阐述,那么如何对Drop-off检测结果进行分析呢?1、使用高灵敏naica微滴芯片式数字PCR系统的蓝色和绿色两个通道对突变等位基因(MAF)进行绝对定量。2、使用Crystal Miner分析软件进行量化分析计算。A 、通过自主圈群功能选中三种微滴群体并进行命名-突变型阳性(绿色),双阴性(黑色),野生型双阳性(天蓝色:蓝色和绿色)。B、通过naica Crystal Miner软件获得Drop-off突变型的浓度Cmut(绿色),以及野生型浓度CWT(天蓝色)。C、计算MAF Drop-off突变,即MAF Drop-off=Cmut/(Cwt+Cmut)。(如想了解关于Cmut和Cwt详细计算方法,可点击链接:https://www.gene-pi.com/tutorial/drop-off-assay/)小提示:如果不排除双阳性的微滴并将其归为阴性微滴中, Drop-off突变体的MAF则会被低估,对于任何Cmut<100cp/µL,这一系数几乎是恒定的(例如在样品中CWT为500 cp/µL时,低估了25%)。保留双阳性微滴既不会降低测得的Drop-off突变体浓度的相对不确定性,也不会降低LOD。应用亮点:☑ 通过使用naica Crystal Miner圈群功能,可以对Drop-off突变进行精准定量。☑ 排除模棱两可的微滴,在不降低测量精度的前提下避免了低估Drop-off突变体的浓度。☑ 本次检测使用了naica微滴芯片数字PCR系统的蓝绿两个通道,第三个检测通道还可以添加一个内部对照或同时量化一个MAF点突变。如想学习更多Drop-off知识,可以通过以下方式获取Drop-off计算方法:http://www.cycloudbio.com/product/36748.htmlnaica微滴芯片数字PCR系统法国Stilla Technologies公司的naica微滴芯片数字PCR系统在进行核酸检测时具有独特的优势。该系统利用cutting-edge微流体创新型芯片—Sapphire芯片(或高通量Opal芯片)作为数字PCR过程的耗材。样品通过毛细通道网格以30,000个微滴的形式进入2D芯片中。3色荧光检测仪器,整个流程只需要2.5小时,并可进行数据的质控和结果追溯分析,获得的数据真实可靠。naica六通道微滴芯片数字PCR系统法国Stilla Technologies公司naica六通道微滴芯片数字PCR系统,源于Crystal微滴芯片式数字PCR技术,自动化微滴生成和扩增,每个样本孔可实现6荧光通道的检测,智能化识别微滴并进行质控,3小时内即可获得至少6个靶标基因的绝对拷贝数浓度。
  • 【涨知识】跟水质特征有关的哪些术语
    茂默科学以客户为本、合作共赢的理念,致力于帮忙客户提供整体实验方案。力求解决行业内客户对科学仪器选型难、维护难的处境。通过不断优化公司运作和提升服务质量,目前已赢得业内人士和广大客户广泛认可,拥有广泛而稳固的合作伙伴和客户群体。现介绍一些跟水质特征有关的术语。1 α系数 alpha factor在活性污泥污水处理设备中,混合液与清洁水中氧传递系数之比。2 氨的汽提 ammonia stripping通过碱化和曝气去除水中氨化合物的一种方法。3 半致死浓度 lethal concentration,LC50在一定时间的连续暴露下,使受试生物半数致死的毒物浓度。4 β系数 beta factor在活性污泥污水处理设备中,混合液中溶解氧饱和值与同一温度和气压下清洁水中溶解氧饱和值之比。5 测试组 test batch在遗传毒性测试中培养基、接种体和稀释系列的混合物。6 超载 surcharge在靠重力流动的污水管中,当满管后流量再增加时所造成的状况。这可能引起过量污水从检查井溢出。7 初级生物降解 primary biodegradation在微生物的作用下,化合物的结构发生变化,导致一些特性丧失。8 初级厌氧生物降解 primary anaerobic biodegradation由于厌氧微生物的作用,受试化合物仅发生结构改变,而未达到终矿化的生物降解阶段。9 粗滤池 roughing filter在有机物含量或水力负荷比正常情况高得多的条件下工作的生物滤池,用以降低高强度污染工业废水中易降解有机物的过高浓度。10 大型植物 macrophytes大型水生植物,包括挺水、沉水和浮水植物。11 淡水 fresh water含盐量低的天然水,或一般认为便于抽取和处理产生饮用水的水。12 氮平衡 nitrogen balance参见114,质量平衡。13 氮循环 nitrogen cycle自然界中氮及其化合物被利用和转化的循环过程。14 DNA损伤 DNA damage不影响细胞复制的各种DNA变化。15 点突变 point mutation;基因突变 gene mutation基因中单碱基对(核苷酸对)改变引起的突变,包括缺失、插入、移码突变、核苷酸序列的改变。16 毒性试验 toxicity test使某种物质在一定浓度下与特定的生物接触,以确定该物质对生物的毒性影响。16.1 流水毒性试验 flow-through toxicity test;动态毒性试验 dynamic toxicity test试验水体在连续流动情况下所进行的毒性试验。16.2 半静态毒性试验 semi-static toxicity test;定期更换受试液的毒性试验 toxicity test with intermittent renewal以较长时间间隔(如12 h或24 h)来分批更换大部分试液(大于95%)的毒性试验;或定期(一般每隔24 h)将受试生物转移到毒物浓度与起始相同的新配试液中的毒性试验。16.3 静态毒性试验 static toxicity test;不更换试液的毒性试验 toxicity test without renewal在试验周期内,不更换试液的毒性试验。17 对照组 control batch是试验过程的一部分,表明无待测物质存在时基质条件对检测系统的影响。注:在遗传毒性紫外致突变(umuC)试验中,对照组包括不含待测菌的培养基、只含蒸馏水和接种物的培养基、含接种体和溶剂的培养基等。18 多氯联苯 polychlorinated biphenyls,PCBs多氯取代的联苯类化合物的总称,也包括一氯联苯。19 反冲洗 backwashing用水以逆流方向清洗滤池的操作过程,常需辅以空气冲刷。20 腐、败 putrefaction有机物受厌氧微生物作用无控制地分解,并产生臭味。21 腐、败的 septic由于缺乏溶解氧而产生腐、败的现象。22 腐生的 saprobic与有机物腐、败有关的。23 腐殖污泥 humus sludge生物滤池脱落的微生物膜。通常在后沉淀池中分离出。24 附聚(作用) agglomeration絮凝体或悬浮颗粒物聚结形成更大的絮凝物或更易沉降、浮起的颗粒物。25 隔夜培养 overnight culture下午开始,培养过夜(通常约16 h),以备第二天早晨进行的预培养接种使用。26 光合作用 photosynthesis在有光的条件下生物借助光化学反应将二氧化碳和水合成有机物。27 哈森色标 Hazen number表示水色度的值。一个标准单位为每升水中1 mg铂[以六氯铂(Ⅳ)酸的形式存在],或2 mg六水氯化钴(Ⅱ)存在下所产生的颜色。28 含水层 aquifer由具有渗透性的岩石、砂或砾石构成的能够提供大量水的含水床或含水层。29 河段 reach有一定上游和下游界限的河道。30 核苷酸 nucleotide基因组的组成成分(腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧啶、胸腺嘧啶),通过糖和磷酸基团连接而形成核酸链,其顺序决定着基因组的遗传密码。31 核酸 nucleic acid重要的遗传物质,由核苷酸按一定的顺序连接而成的双螺旋结构,决定遗传编码。32 核糖核酸 ribonucleic acid,RNA构成遗传物质的重要组分之一。在RNA病毒中是基因组的组成成分。注:RNA与DNA不同,在核苷酸序列中,尿嘧啶(U)取代了胸腺嘧啶(T)(参见DNA,83)。33 后氯化 post-chlorination水(或废水)处理后再进行氯化。34 弧菌Vibrio sp.好氧、无孢子生殖的革兰氏阴性细菌,广泛分布于地表水中。某些种系致病菌,如霍乱菌、副溶血性弧菌。35 化学示踪剂 chemical tracer人为添加或天然存在于水中,用于示踪水流的化学物质。36 回流 recirculation经过初级或完全处理的部分废水,由处理系统的某一单元返回到前面单元的过程。37 汇水区 catchment area;汇水盆地 catchment basin水能自然地排到水道或某一点所形成的区域。38 混合液 mixed liquor在活性污泥曝气池或氧化沟内进行循环或曝气的活性污泥与污水的混合物。39 混合液悬浮固体 mixed liquor suspended solids,MLSS混合液中固体物质的总浓度,通常规定以干重计。40 活菌 viable bacteria具有代谢和(或)繁殖能力的细菌。41 活性炭处理 activated carbon treatment用活性炭吸附去除水和废水中溶解的或胶态的有机物的过程。例如用以改善水的味、臭和色。42 积水 ponding由于生物滤池滤料间隙堵塞,在池面上出现的水。43 基因组 genome细胞中编码遗传信息的所有遗传物质(核酸、DNA、RNA)。44 交叉连接 cross connection指管道之间的连接有可能使受污染水进入饮水供水系统,从而给公众健康带来危害。也用于描述不同配水系统之间的一种规范连接。45 接种 seeding人为引入合适的微生物而对生物系统进行接种。46 接种体 inoculum;接种材料 inoculation material向新鲜培养基中加入的微生物(或经预培养,处于指数生长期的菌悬液)。47 菌胶团膜 zoogloeal film含有大量细菌、原生动物和真菌的黏液基质,覆盖在成熟的生物滤池、慢速砂滤池滤料的润湿表面或污水管内壁。48 矿化作用 mineralization有机物完全分解成二氧化碳、水,以及其他元素的氢化物、氧化物和矿物盐。49 理想的自然群落 expected natural community在河道中仅有自然胁迫,而人为干扰较小的生物群落。50 磷平衡 phosphorus balance参见114,质量平衡。51 浓度-效应关系 concentration-effect relationship某种物质或几种物质混合物,在一定浓度梯度下,导致某种诊断标志物产生响应的剂量的相关性。注:在遗传毒性紫外致突变(umuC)试验中,umuC基因的诱导取决于受试样品中遗传毒物的浓度。52 排水区 drainage area水排至一点或多点的区域,区域边界由主管部门限定。53 培养基 culture medium支持微生物生长的液态或固态营养物质。54 贫营养水 dystrophic water含营养物甚少而含腐殖质浓度高的水。55 潜水面 water table静止的或自然流动的地下水的水面。在该水面下,除了不透水的地方外,蓄水层被水饱和。56 倾析 decantation悬浮固体沉淀或与高密度液体分离后倾出上清液。57 清洗生物 scouring organisms一些生物,例如蠕虫、昆虫幼虫和其他无脊椎动物,它们能通过摄食或移动以去除生物滤池滤料表面的细菌团膜(细菌块膜)。58 泉水 spring自然涌出地表的地下水。59 三级处理 tertiary treatment为进一步减轻污染影响,对经过初级和二级处理的污水进一步处理的过程。包括:深度物理处理、化学处理和生物处理。60 排水的深度处理 effluent polishing采用深度物理或生物方法对二级处理排水进行的三级处理。61 设定点 designated site(生物学分类的河流)在水体某一段中所选定的某个具体点,该点的水质能够代表该段水体的水质。62 生态系统 ecosystem通过不同组成的生物和其周围环境间的相互作用,形成物质循环和能量交换的系统。63 生态学 ecology研究生物及其相关环境之间相互关系的一门学科。64 生物降解 biodegradation在水介质中由于活生物的复杂作用引起的有机物的分子降解。65 生物降解阶段 biodegradation phase试验中从延滞期结束至达到大生物降解率的90%所经历的时间。66 生物矿化 biomineralization由生物活性引起的矿化作用。67 生物量 biomass给定水体中生命物质的总质量。68 (砂滤)生物膜 biofilm(of a sand filter)由活的、死的和垂死的生物在慢速砂滤池或其他生物滤池介质表面形成的膜。69 生物群 biota水生生物系统中的所有活的组分。70 生物指数 biotic index描述水体生物群的数值,用以表示水体的生物质量。71 受试样品 test sample经过所有前处理步骤(如离心、过滤、匀浆、pH调节和离子强度测定)的待测样品。72 熟化塘 maturation pond大型浅水池,用于进一步处理已经生物处理过的污水,并去除该过程中形成的固体。73 水文测量 hydrometry水流的测量与分析。74 水文地理学 hydrography研究与测量海洋、湖泊、河流和其他水域的一门应用科学。注:在一些国家中此术语等同于海洋物理化学。75 水文学 hydrology研究降水、径流或渗滤及储存、蒸发和再降这一水循环的应用科学。76 淘析 elutriation一种污泥调节工艺。用清洁水或污水厂的出水淘洗污泥,以减小污泥的碱度,特别是除去氨的化合物,从而减少混凝剂的需用量。77 停留期 retention period;滞留时间 detention time按规定的流速计算,水或废水在特定单元或系统内停留的理论时间。78 透光层 euphotic zone透光程度足以维持光合作用的上层水体。79 突变 mutation;染色体突变 chromosomal mutation生物体或病毒的遗传物质(DNA或RNA)永、久性地改变,通常是一个基因中,表现为遗传物质(一个或多个核苷酸)的缺失、易位、转导,导致遗传编码的改变,从而改变基因功能。80 推流系统 plug-flow system至少理论上(如果实际无法达到)在渠道横断面可达到充分混合,而沿水流方向又无混合或扩散的一种系统。81 脱落 sloughing菌胶团膜物质以腐质污泥的形式从生物滤池的滤料上连续脱离。82 春蜕膜 vernal sloughing;spring sloughing春季由于生物活动增强,从而使生物滤池中新的菌胶团膜滋生而旧生物膜大量脱落。83 脱氧核糖核酸 deoxyribonucleic acid,DNA构成除RNA病毒外所有生物基因组的遗传物质。与RNA不同的是,DNA核苷酸序列中含有胸腺嘧啶,而不是尿嘧啶。84 稳定期 plateau phase生物降解阶段结束到试验结束这段时间。85 稳定性 stability处理前后,废水或污泥抗腐、败的能力。86 稳定性试验 stability test;亚甲蓝试验 methylene blue test对经过生物处理污水的一种检验。试验时,向生物处理过的出水中加入亚甲蓝染料,在隔绝空气的条件下,通过染料褪色所需的时间评估水稳定性。87 污泥龄 sludge age在排泥率恒定的情况下,活性污泥处理厂排放全部活性污泥所需的天数。计算方法是用活性污泥厂污泥的总排放量除以每天排放的污泥量。88 污泥膨胀 sludge bulking活性污泥法处理系统中,通常由于丝状菌的存在,引起活性污泥体积膨胀和不易沉降的现象。89 污泥压滤 sludge pressing采用机械加压去除污泥中液体的方法,使之形成易于处置的固体物。90 无观察效应浓度 no observed effect concentration,NOEC统计学上略低于低观察效应浓度的实验浓度。91 稀释系列 dilution series预设受试样品与稀释基质(例如水或缓冲液)配比的一系列测试用混合物。92 延迟期 lag phase从试验开始到用于降解的微生物驯化适应和选择完成所经历的时间,此时化合物或有机物的降解程度达到大生物降解率的10%。93 沿岸带 littoral zone即水体边缘浅水带,阳光可直接透射到水底,根生植物占优势。94 盐跃层 halocline在分层的水体中,含盐浓度梯度大的一层。95 氧饱和值 oxygen saturation value与大气(天然系统)或纯氧(纯氧废水处理系统)处于平衡的溶解氧浓度。它随温度、氧分压和盐度而变化。96 养分去除 nutrient removal在水和废水处理中,专为除去含氮和含磷化合物而使用的生物、物理和化学方法。97 氧化沟(渠) oxidation ditch(channel)通常为若干平行沟渠在终点相连,形成闭合循环,装有曝气装置用于处理原污水或澄清污水的系统。98 氧亏 oxygen deficit在水系统中,实际溶解氧浓度与其饱和浓度值之差。99 氧平衡 oxygen balance参考114,质量平衡。100 遗传毒性 genotoxicity通常指由导致突变的物理或化学因素引起的基因组特异性改变的毒性效应。101 遗传毒性试验 genotoxicity test确定DNA损伤或DNA修复等遗传毒性作用的试验系统。102 引水 abstraction将水从任何水源永、久地或暂时地转移到其他地方,使其不再是该地区水资源的一部分,或者转移到该地区内的另一水源。103 英霍夫锥形管 Imhoff cone容积通常为1L,刻度接近尖端,可用来测定水中可沉降物体积的圆锥形透明容器。104 营养物的去除 nutrient removal在水和废水处理中,专为去除含氮和含磷化合物而使用的生物、物理和化学方法。105 umuC操纵子 umuC-operon调控umuC基因诱导的基因序列。106 umuC紫外致突变及化学修复 umuC UV mutagenesis and chemical repair在遗传毒性实验中,使用umuC基因研究受试菌株的DNA损伤。umuC基因的表达受到DNA损伤的诱导。107 油状膜 slick漂浮在海面或者其他水体上的一层物质,例如石油膜。108 预暴露 pre-exposure在添加化合物或有机物的实验条件下,对接种体进行预培养。目的是通过微生物的适应和选择,增强接种体对受试物的降解能力。109 预活化 pre-conditioning在适宜培养条件下对受试生物进行预培养。该过程中不添加化学药品或有机物质。微生物在此过程中适应实验中培养条件,可改善实验效果。110 预培养 pre-culture在适宜培养条件下培养(已活化的)微生物,以促进其适应实验中培养条件。是特定试验(如遗传毒性试验)的一部分。111 原生水 connate water与周围岩石或地层具有同一地质年代的间隙水。水质往往不良,不适于正常使用(例如饮用、工农业使用)。112 原种培养 stock culture一定条件下(如在适合的培养基中冻存)生物菌株的培养,目的是保持原有的特性,如核酸序列。113 真空过滤 vacuum filtration污泥经滤布,藉真空抽滤的一种脱水方法。114 质量平衡 mass balance在一确定系统内(例如湖泊、河流或污水处理厂),特定物质输入量和输出量(包括该物质在系统中的形成或分解)之间的相互关系。115 中温消化 mesophilic digestion污泥在20~40℃下的厌氧消化,在该温度范围内有利于微生物生长。116 中营养水 mesotrophic water天然的或由于营养累积形成的中等营养状态的水,介于贫营养和富营养之间。117 自养细菌 autotrophic bacteria;化能自养细菌 chemolithotrophic bacteria能利用无机物作为碳源和氮源而繁殖的细菌。118 总固体浓度 total solids concentration在一定条件下,已知体积的活性污泥烘干后的重量。119 大生物降解率 biodegradation maximum level试验中,一种化合物或有机物不再继续发生生物降解时的大生物降解程度(以百分率表示)。120 低可观察效应浓度 lowest observed effect concentration,LOEC与对照相比,观察到显著效应(p≤0.05)时受试物的低浓度。121 低无效应稀释度 lowest ineffective dilution,LID(一定稀释度下废水的毒性测试)试验中无抑制效应或不产生特定值以上效应的大浓度稀释值。122 终好氧生物降解 ultimate aerobic biodegradation在有氧条件下,化合物或有机物被微生物降解成CO2、H2O和元素形态的矿物盐,并同化成微生物的一部分。123 终需氧量 ultimate oxygen demand,UOD有机物完全矿化和氨氮、亚硝态氮氧化所需要的氧的理论计算值。124 终厌氧生物降解 ultimate anaerobic biodegradation在无氧条件下,化合物或有机物被微生物降解成CO2、CH4、H2O和元素形态的矿物盐,并同化成微生物的一部分。(来源:HJ 596.3-2010)
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