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雪胆乙素

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  • 三七、黄连、松叶等14个中药质量标准发布
    近日,四川省药品监督管理局发布14个中药标准的公告,包括百药煎、金樱子、川桐皮、松叶、雪胆、美洲大蠊、俄色叶、筠姜、开郁曲、三七、砂仁制地黄、水蛭、熊胆汁、黄连(雅连)。依据《中华人民共和国药品管理法》《四川省中药饮片标准制定工作管理办法》《省级中药饮片炮制规范修订的技术指导原则》和《四川省中药饮片标准研究技术指导原则》,14个中药标准经四川省药品监督管理局2021年第1次局长办公会议审议通过,现予发布,自2021年2月20日起实施。百药煎为五倍子、茶叶、酒糟经发酵加工而成,为灰黄色至黑褐色不规则小方块。表面有黄白色斑点,质坚硬,断面粗糙,气微,味酸、涩、微甘。金樱子为蔷薇科植物金樱子的干燥成熟果实。照清炒法(通则 0213)炒至微带黑色,呈倒卵形纵剖瓣及少量碎块。其外皮红褐色,有凸起的棕色小点,偶见焦斑,顶端有花萼残基,下部渐尖。内壁偶见坚硬的小瘦果,有淡黄色绒毛。质硬,气微,味甘、微涩。川桐皮为五加科刺楸属植物刺楸或毛叶刺楸的干燥树皮。呈片状或微卷曲的不规则块片,厚 6~10mm。外表面黑褐色或灰褐色,粗糙,多呈不规则鳞片状裂纹,并有地衣斑及菱形皮孔,其上密生大型瘤状的钉刺,钉刺扁圆锥形,纵向着生,高约 1cm,顶端锐尖或已全部除掉,仅留有钉刺痕迹。钉刺基部直径 0.5~1.5cm,较大的钉刺上可见环纹。内表面淡黄棕色至黄棕色,有斜网状细条纹。质脆,断面纤维性,略呈层片状。气微,味微辛,略有麻舌感。松叶为松科松属植物马尾松的鲜叶或干燥叶。全年可采,除去杂质,鲜用; 或除去杂质,干燥。前者习称“鲜松叶”,后者习称“干松叶”。鲜松叶呈细长针状,常两叶为一束,基部有灰白色至褐色叶鞘,叶鞘长约 1cm。针叶长 10~30cm,直径约 0.1cm,表面绿色,较光滑,背面呈半圆状隆起,两叶相对面较平坦,内陷呈细长纵沟,叶缘具细小锯齿。质柔软,不易折断。气微、味淡、微苦。干松叶呈细长针状,常两叶为一束,基部有淡棕色至黑褐色叶鞘,叶鞘长约1cm。针叶长10~30cm,直径约 0.1cm,表面淡绿色至棕褐色,较光滑,背面呈半圆状隆起,两叶相对面较平坦,内陷呈细长纵沟,叶缘具细小锯齿。质轻脆,易折断。气微、味淡、微苦雪胆为葫芦科雪胆属植物,长果雪胆、峨眉雪胆或巨花雪胆的块根。长果雪胆和巨花雪胆 呈不规则团块,表面棕褐色或黄褐色,多皱缩,切面黄棕色至黄白色,微粗糙,质坚实,微具蜡样光泽。气微,味极苦。美洲大蠊为蜚蠊科昆虫美洲大蠊的干燥体。捕捉后,置 55℃~65℃热水中淹死,漂洗,沥干后及时烘干。呈扁平长椭圆形,长 2.5~3.2cm,宽 1~1.4cm。前端较窄,后端略宽,背部红褐色,有光泽;四翅,翅发达,分前后翅,后翅在前翅下。前胸背板略圆,淡黄色,中部大斑赤褐色至黑褐色,其后缘中央向后延伸,其前缘有一淡黄色“T”形小斑,背板后缘与大斑同色;剥去前后翅,可见后胸背板二节;腹背板七节,黄棕色,近尾端呈红色。头小,三角状,隐藏于胸部之下,触角线状,多断落。胸部有足 3 对,易脱落。偶见无翅幼虫。质松脆,易碎。气腥,味微咸。俄色叶为蔷薇科植物变叶海棠(Malus toringoides(Rehd.)Hughes.)和花叶海棠(Malus transitoria(Batal.)Schneid.)的干燥叶及叶芽。呈皱缩状,小叶多破碎,完整者呈卵形或椭圆形,长 1~6cm,宽 1~4.3cm。先端渐尖或急尖,边缘钝锯齿或微锯齿,常具不规则 3~5 深裂,亦有不裂。上表面多为暗绿色或浅棕绿色,疏被柔毛;下表面多为灰绿色或灰棕色;被柔毛,叶脉尤甚;叶柄长 0.7~3cm,被柔毛。质脆。 切碎后,呈不规则碎片状。 气微香,味微苦。筠姜为姜科植物姜(Zingiber officinale Rosc.)的新鲜根茎经蒸制的炮制加工品。品呈扁平块状,具指状分枝,长 3~7cm,厚 0.3~2cm。表面黄白色或黄棕色,粗糙,皱缩,具纵皱纹和环节。分枝处常有鳞叶残存,分枝顶端有茎痕或芽。质坚硬,断面较平坦,黄白色至深棕色,透明角质样,内皮层环纹明显,维管束散在。气香、特异,味辛辣。开郁曲为清半夏、川芎、苍术、香附经发酵加工而成。呈不规则颗粒或团块状,表面棕黄色至棕褐色。微有香气,味甘、微辛。三七为五加科植物三七(Panax notoginseng(Burk.)F. H. Chen)的根及根茎。秋季花开前采挖,分开主根﹑支根及根茎。为不规则厚片,外表皮浅黄绿色﹑灰白色或灰褐色。体轻,质松脆,切面灰绿色、灰黄绿色或灰白色,木部微呈放射状排列。气微,味苦回甜。砂仁制地黄为玄参科植物地黄(Rehmannia glutinosa Libosch.)的炮制加 工品。为不规则的块片、碎块,大小、厚薄不一。质柔软而带韧性,不易折断,断面乌黑色,有光泽。表面附有众多灰棕色粉末,具有砂仁特异香气,味甜。水蛭为水蛭科动物蚂蟥 (Whitmania pigra Whitman)、水蛭(Hirudo nipponica Whitman)或柳叶蚂蟥(Whitmania acranulata Whitman)的干燥全体。夏、秋二季捕捉,用沸水烫死,晒干或低温干燥。呈不规则扁块状或扁圆柱形,略鼓起。表面棕黄色至棕褐色。断面松泡。粉末呈棕黄色至棕褐色。气微腥,略有焦香气。熊胆汁为熊科动物黑熊(Selenarctos thibetanus Cuvier)经胆囊手术的引流胆汁,滤过,即得。为黄色、黄棕色或黄绿色液体,气微腥,味极苦。黄连为毛茛科植物三角叶黄连(Coptis deltoidea C.Y.Cheng et Hsiao)的干燥根茎。习称 “雅连”。秋季采挖,除去须根和泥沙,干燥,撞去残留须根。本品呈不规则的薄片。外表皮灰黄色或黄褐色,粗糙,有细小的须根。切面或碎断面鲜黄色或红黄色,具放射状纹理,气微,味极苦。具体检测方法和实验参数详见附件。附件1-百药煎中药标准.pdf附件3-川桐皮中药标准.pdf附件2-金樱子中药标准.pdf附件4-松叶中药标准.pdf附件5-雪胆中药标准.pdf附件6-美洲大蠊中药标准.pdf附件7-俄色叶中药标准.pdf附件8-筠姜中药标准.pdf附件9-开郁曲中药标准.pdf附件10-三七中药标准.pdf附件11-砂仁制地黄中药标准.pdf附件12-水蛭中药标准.pdf附件13-熊胆汁中药标准.pdf附件14-黄连(雅连)中药标准.pdf
  • 化学蛋白质组学揭示高铁血红素-蛋白互作谱
    大家好,本周为大家分享一篇最近发表在Journal of The American Chemical Society上的文章,A Chemical Proteomic Map of Heme−Protein Interactions1。该文章的通讯作者是美国斯克利普斯研究所的Christopher G. Parker研究员。高铁血红素(heme)是人体中许多蛋白质的辅助因子,也是血液中氧气的主要转运体。最近的研究也证实了高铁血红素可以作为一种信号分子,通过与伴侣蛋白质结合而不是通过其金属中心反应来发挥其作用。然而,目前关于血红素结合蛋白的注释还不够完整。因此,本文采用化学蛋白质组学的方法去揭示人体中与高铁血红素发生互作的蛋白质谱。化学蛋白质组学是揭示蛋白质功能和发现药物靶标的重要工具。其中,最常用的是基于活性的蛋白质分析(Activity-based protein profiling,ABPP),通过结合活性分子探针标记及串联质谱分析,实现对靶标蛋白的鉴定。如图1b,本文设计了一个“全功能”活性分子探针(HPAP),共包含3个部分:1. Hemin母核,用于与靶蛋白非共价结合;2.光活化基团-双吖丙啶,可在UV光照下生成卡宾,促使分子探针与蛋白发生共价交联;3. 炔基,可在铜催化下与含有叠氮的试剂(荧光标签,生物素)发生点击化学反应,后两者组成FF-control。具体实验流程如下图1a所示,用HPAP处理不同细胞(In Situ)或不同细胞来源的蛋白质组(In vitro),HPAP中的hemin母核可与靶蛋白发生非共价结合,经UV光照,HPAP-蛋白间形成共价交联,再利用点击化学可将HPAP-蛋白与荧光素(TAMRA)或者生物素标签相连,用于后续的荧光成像(In-gel fluorescence)或者链霉亲和素纯化、LC-MS鉴别定量(MS-based I.D. and quantitation)。 图1. (a)使用基于高铁血红素的光亲和探针(HPAP)识别血红素结合蛋白的流程示意图。(b) HPAP、hemin和FF-control的结构;(c) HEK293T裂解物中与HPAP结合的蛋白的荧光成像;(d) hemin加入对HPAP与蛋白结合的影响。作者首先使用了SDS-PAGE去评估了HPAP标记蛋白的能力。如图1c所示,随着HPAP浓度的提高,胶图上条带颜色也逐渐加深,说明HEK293T细胞裂解液中与HPAP结合的蛋白在逐渐增加。如图1d所示,在10 μM HPAP的条件下,逐渐加入hemin,可以看到胶图上条带颜色逐渐变浅,说明hemin与HPAP之间发生了竞争,HPAP模拟了hemin与蛋白的结合过程。随后,作者又使用已知的hemin结合蛋白来确认HPAP捕获目标蛋白的能力。如图2所示,这些已知蛋白被HPAP成功的标记上,但由于hemin的加入,条带的颜色在逐渐变浅(TAMRA)。Western blot的结果显示,蛋白的总量并无太大变化,但hemin的竞争结合,导致与HPAP结合的蛋白量在下降。以上实验均说明,HPAP具有较好的选择性标记能力,能够模拟hemin与靶蛋白的结合,并以共价交联的方式标记在蛋白上。 图2. 用已知的高铁血红素结合蛋白确认HPAP捕获目标蛋白的能力。验证了方法的可行性后,作者将HPAP与定量蛋白质组学结合用于绘制高铁血红素-蛋白质互作谱。考察了多种细胞系,包括:人胚胎肾细胞(HEK293T)、人慢性髓系白血病细胞(K562)以及人原代外周血单个核细胞(PBMCs)。每种细胞系设置了两种实验形式:1)特异性结合实验(Enrichment):通过将HPAP识别出蛋白与FF-Control识别出的蛋白进行对比,排除非特异结合的干扰(图1b),如果同一蛋白通过HPAP富集到的量是FF-control富集到的量4倍以上,则认为该蛋白是HPAP特异性结合蛋白。2)竞争性结合实验(Competition):观察HPAP富集的蛋白在hemin和HPAP同时存在时富集到的量的变化,变化大于3倍且具有显著性差异(p<0.05)的蛋白被认为是HPAP与hemin竞争性结合的蛋白。最终确定的高铁血红素结合蛋白应满足以上两种实验的筛选标准(图3a)。如图3b-d所示,总共鉴定出378个的高铁血红素结合蛋白,其中214个来自HEK293T, 182个来自K562, 107个来自PBMC。尽管三种细胞类型之间的结合蛋白有一些重叠,但大多数靶点蛋白只存在于一种或两种细胞类型中(图3b),这暗示血红素在不同细胞中可能发挥不同的功能。其中,19个靶点蛋白是在UniProt上已经注释为高铁血红素的结合蛋白,剩余都是未揭示的结合蛋白。这些结合蛋白按照功能可划分为:转运蛋白,转录因子,支架蛋白和酶(图3c),根据代谢通路又可进一步划分(图3d)。作者最后对几个新发现的结合蛋白进行了验证,并选择IRKA1进行进一步的作用机制研究。IRKA1在调节炎症信号通路中起着关键作用,IRAK1被IRAK4磷酸化,然后自磷酸化,产生NFkB介导的炎症反应。经实验确认(图4),hemin是IRKA1的一种变构活化配体,可增强其酶活性,促进IRAK1的自磷酸化。 图3. 基于蛋白质组学的HPAP-蛋白互作分析。 图4. Hemin对IRKA1的调节作用。总之,本文设计开发了一种基于高铁血红素的光亲和探针,它可以与化学蛋白质组工作流程结合,以识别不同蛋白质组中的高铁血红素结合蛋白。利用该方法也可拓展至其他分子配体靶标蛋白的识别。 撰稿:刘蕊洁编辑:李惠琳原文:A Chemical Proteomic Map of Heme-Protein Interactions参考文献1. Homan, R. A., Jadhav, A. M., Conway, L. P., & Parker, C. G. (2022). A Chemical Proteomic Map of Heme-Protein Interactions. Journal of the American Chemical Society, 144(33), 15013–15019.
  • 蛋白质组学在病毒入侵宿主中的研究
    2020年初,一场突如其来的疫情打乱了大家的生活节奏。面对来势汹涌的疫情,全国上下正在积聚力量,全力战胜新型高致病性冠状病毒(2019-nCoV)。医护人员、解放军战士、志愿者们纷纷奔赴武汉,与疫魔竞速,守卫着国民的生命安全,致敬最美逆行者!同时疫情研究者一样没有停下自己的脚步,特别是在分子水平,我们调研了基于Orbitrap超高分辨的蛋白质组学和结构组学技术在病毒学研究中的应用,谨以此文致敬白衣天使和深耕医学研究的学者。Orbitrap技术促进病毒机理研究病毒与宿主共同进化,获得捕获和操纵宿主细胞过程进行复制的机制传播。同样,宿主细胞会通过部署防御机制或通过适应感染环境。在整个感染过程中,细胞严重依赖于时空调控的病毒-宿主蛋白-蛋白相互作用的形成。 蛋白质组学方法与病毒学的结合促进了对病毒复制、抗病毒宿主反应和病毒对宿主防御的颠覆机制的深入研究。而Orbitrap技术依靠其高灵敏度、高精度,高通量等特性在该方面表现出色。案例一:Orbitrap技术深度挖掘病毒-宿主蛋白质相互作用2019年Viruses杂志上发表了基于组学技术研究宿主变化的综述,质谱技术中基于亲和纯化分离蛋白质复合物随后进行MS分析(AP-MS)的方法可以用于分离病毒-病毒和病毒-宿主多蛋白复合物,可识别间接和直接的蛋白质相互作用,提供相互作用事件的瞬时信息,或跟踪单个病毒基因产物的过表达,以深入了解单个蛋白质的功能;表达蛋白质组学技术(定量蛋白质组学和翻译后修饰组学)可以研究病毒蛋白的组成,宿主在病毒入侵过程中蛋白质和翻译后修饰的动态变化。(Viruses 2019, 11, 878 doi:10.3390/v11090878)迄今为止,基于蛋白质组学方法的进展已经为识别数量惊人的病毒-宿主蛋白关联铺平了道路,科学家基于这些数据构建了包含了5000多种病毒成分和宿主细胞之间的非冗余蛋白相互作用数据库。这些有价值的信息库包括相互作用蛋白数据库、VirHostNet(http://virhostnet.prabi.fr/)、VirusMentha(Nucleic Acids Res. 2015 43(D1):D588–D592)、IntAct-MINT(Nucleic Acids Res. 2015 43(D1):D583–D587)和Uniprot。 案例二:Orbitrap技术揭示新型塞卡病毒宿主因子Pietro, Scaturro, Alexey, et al. Nature, 2018 寨卡病毒(ZIKV)最近成为全球健康问题,由于它的广泛传播和与严重的联系新生儿神经症状和小头症。然而,与致病性相关的分子机制关于ZIKV的大部分仍然未知。 技术路线:利用赛默飞 LTQ-Orbitrap和Orbitrap Q Exactive HF质谱进行全蛋白质组学和修饰蛋白质组学(实验路线见下图a),研究对象为神经细胞系SK-N-BE2和NPC细胞,表征细胞对病毒的反应,在蛋白质组和磷酸化蛋白质组水平上的变化,利用亲和蛋白组学方法鉴定ZIKV蛋白的细胞靶点。使用这种方法,找到了386个与zikv相互作用的蛋白质,导致宿主在神经发育受损,视网膜缺陷和不孕。此外,确定了寨卡病毒感染后1216个磷酸化位点存在上调或下调,来自AKT, MAPK-ERK和ATM-ATR信号通路中,为防范ZIKV感染扩散提供机制基础。在功能上,系统地理解了ZIKV诱导后的宿主的蛋白质和细胞通路水平的扰动,并对感染后细胞施加Rock抑制剂药物干预,利用非标定量蛋白质组学方法分析差异蛋白进行验证(下图热图),补充这一空白。技术路线图案例三:Orbitrap技术深入探寻寨卡病毒病毒与宿主的相互作用Etienne Coyaud, et al. Molecular & Cellular Proteomics,2018,技术路线技术路线:本文利用生物素识别以及IPMS亲和纯化结合MS 方法,研究寨卡病毒侵染后病毒与宿主细胞蛋白质的相互作用(技术路线见上图),实验结果揭示了1224个蛋白3033多肽形成的相互作用网络(见下图a)。相互作用包括多肽加工和质量控制、囊泡方面的作用运输,RNA处理和脂质代谢。40%的 作用都是以新报道的相互作用。通过数据挖掘分析,揭示过氧化物酶体在ZIKV感染中的关键作用。病毒宿主蛋白相互作用网络图 温馨提示:积极防护 保护自己 戴口罩 勤洗手
  • 奥素科技完成近亿元A轮融资|启动单细胞蛋白组学领域加速键
    1月2日,佛山奥素博新科技有限公司(以下简称奥素科技)宣布完成近亿元A轮融资。本轮融资由鲁信创投领投,老股东启明创投、线性资本、同创伟业等持续加码,凯乘资本(WinX Capital)担任财务顾问。本轮融资后,奥素科技将进一步加速在单细胞蛋白组学领域的商业化推广,提供差异化的产品和服务,填补实验室样本预处理、功能发现及验证等需求的空白,力争将中国制造的先进生命科学仪器推向全球市场。奥素科技成立于2021年,具有全球领先的有源数字微流控液滴操控平台,在两年多时间内已连续获得四轮融资,股东包括诸多顶级VC及知名产业投资人。公司推出的第一款商业化产品Boxmini™ SCP,是全球首款全流程微流控片上单细胞蛋白组学样本前处理工具,高效协助用户实现高通量、快速、精确的微量样本控制,一站式完成复杂的单细胞蛋白质样本前处理工作,且对无标记和TMT标记处理方案均可适配,产品推出后备受市场关注。对于本次融资,奥素科技创始人兼CEO马汉彬博士表示:“将消费电子半导体技术引入到生命科学领域,奥素团队已经完成了0到1的积累:特别是在单细胞蛋白质组学样本前处理应用场景,我们通过有源数字微流控微芯片上纳升样本精准操控及全流程集成能力,获得了海内外多位头部PI的认可并产生了对整个领域有促进意义的实验结果;在单细胞多组学、微生物及合成生物学等其他领域,奥素也将与不同的下游伙伴携手前行,加速新产品的开发及商业化落地。我们将在新老股东的支持下,利用产品技术优势,迅速开拓海内外市场,以单细胞蛋白质组学产品为突破点,通过开放式数字微流控共享平台打造半导体技术的生物芯片生态,让生命科学实验室及医疗检验自动化快速迈入消费电子时代。”此前,在仪器信息网第六届细胞分析网络大会(iCCA2023)的【单细胞分析技术】专题会场中,马汉彬研究员分享《 基于有源数字微流控的单细胞分选和操控系统》的主题报告。(详情点击)马汉彬 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所 研究员马汉彬研究员课题组也在2023年成功研发出了一套基于大面积薄膜晶体管开关阵列的有源数字微流控平台,在Analytical Chemistry发表并被选为当期的封面论文。(详情点击)本轮领投方,鲁信创投副总经理邱方表示:“鲁信创投作为国有控股的专业创投机构,一贯秉持以创业投资形式,支持我国自主的研究平台、仪器设备成果应用转化,将实现我国高水平科技自立自强的任务放在首位。奥素科技掌握有源数字微流控的核心底层技术,有潜力将实验室自动化推进到一个全新的局面,形成新的研究平台。公司推出的单细胞蛋白组学产品,为单细胞多组学等前沿研究提供先进工具,在包括鲁信已投企业在内的下游客户中引起强烈关注,体现出国产科学仪器的高水平自立自强,即将迎来新的局面。鲁信创投将支持奥素科技,打好科学仪器设备国产化攻坚战。”启明创投合伙人陈侃表示:“启明创投作为上轮领投方,已连续两轮增资奥素科技。公司凭借强大的研发能力和优秀的执行力,快速的推出了单细胞领域的尖刀产品,面向一片蓝海市场。我们对公司未来充满信心,继续助力公司海外市场的商业化,期待奥素科技将“中国智造”先进科学仪器推向世界。”线性资本董事总经理郑灿表示:“线性资本作为天使轮领投方,坚定认为投资要找到正确的人。我们亲眼见证了马汉彬博士从一名科研工作者向现代企业家的转变。马汉彬博士的为人、科学素养、前沿视野和企业家精神令我们印象深刻。在他带领下,公司首先推出了具有划时代意义的单细胞蛋白质组学解决方案,为全球蛋白组学领域研究再填一把火。我们本轮继续增持,推动奥素科技向先进科学仪器标杆企业迈进。”同创伟业北京医药基金合伙人郗砚彬表示:“我们始终认为,奥素科技的数字微流控芯片系统,有望成为下一代生命科学微反应器的关键载体,持续为科学研究、医药工业等提供创新解决方案。公司的单细胞蛋白组学产品,将蛋白组学研究推进到了切实可行的单细胞颗粒度,使客户能够不再受工具所限,以全新的角度验证所知和探索未知。我们本轮继续增持,期待奥素科技能够让先进技术在应用层面全面开花。”凯乘资本创始合伙人邹国文表示:“凯乘资本很荣幸连续第三轮担任奥素科技融资的财务顾问,见证了奥素从初创、一路飞速发展及商业化;作为数字微流控行业头部企业,奥素能够穿越市场周期,在不到三年的时间连续获得四轮融资,充分体现了资本端对公司的高度认可。期待奥素在下游领域的进一步拓展,成为世界领先的生命科学工具企业。”关于鲁信创投:鲁信创投是山东省鲁信投资控股集团有限公司控股的省内最大、国内具有重要影响力的专业创投机构,是国内资本市场首家上市的创投机构(股票代码:600783.SH)。成立20余年以来,管理运作各类基金已达40余只,基金规模约200亿元,覆盖医疗健康、军民融合、先进制造、电子信息、新能源、新材料等细分产业,境内外上市公司40余家,在医疗健康领域先后投资了思路迪、硅基仿生、中科新生命、爱博泰克、唯迈医疗、美东汇成、英赛斯、荣昌生物等一批优秀企业。
  • “海上升明月”——军事医学科学院蛋白质组学创新团队全景素描
    蛋白质组创新团队主要成员钱小红和应万涛正在实验室交流。  新华网消息:今年初,在国家科技奖励大会闭幕之际,记者慕名来到世界知名的科技&ldquo 硅谷&rdquo &mdash &mdash 北京中关村生命科学园,探访军事医学科学院蛋白质组学创新团队。园区内正在兴建的&ldquo 凤凰工程&rdquo &mdash &mdash 我国生命科学领域投资最大的基础设施。顺着环形道路向北步行200米左右,能见到一座坐西朝东、棕红色、斜切式、平卧地面的U形建筑,那正是记者要去的北京蛋白质组研究中心。U形建筑的西侧,耸立着一个高大的红色立体造型&ldquo P&rdquo ,这是蛋白质组学的首个英文字母。正面墙上,嵌着银色&ldquo proteome&rdquo (蛋白质组),这是人类历史上第一次将诞生仅十年的&ldquo proteome&rdquo 词汇镶入建筑物的墙中,形成国际上众多蛋白质组大师留影的背景。  U形建筑的中央,是一个长方形的荷花池,别有情趣。在夏天,沿着U形开口的方向,能够看到柳叶飞扬,芦苇飘香,流水潺潺,波光粼粼,候鸟栖息,鱼儿戏水的美景。那是科学家们心中的&ldquo 凤鸣湖&rdquo 。  步入中心大厅,记者看到,墙壁上挂满了相关领域世界著名科学家的照片和成就介绍。楼上楼下的实验室十分洁净,整齐划一,许多世界一流的实验设备在这里紧张运行。蛋白质组创新团队带头人之一杨晓明课题组。  梦想,瞄准最浩瀚的&ldquo 生命海洋&rdquo   生命是地球孕育的奇迹。  蝴蝶从卵变虫、成蛹、化蝶,变幻诡异。让科学家们意想不到的是,其幕后操盘者竟是蛋白质组,而非基因组。  &ldquo 今天的人类文明已经高度发达,但实际上,生命现象就像一个浩瀚的太平洋,而我们迄今仍在渤海湾里探索。&rdquo 作为团队带头人之一的杨晓明研究员说。  2003年,记录人类生命&ldquo 天书&rdquo 的基因组计划宣告完成,但&ldquo 蝴蝶迷案&rdquo 更加扑朔。全球科学家愈来愈意识到一项更艰巨、更宏大的任务&mdash &mdash 解读&ldquo 天书&rdquo ,即基因组功能的阐明已经摆在面前。人类经过百年跋涉,重返近代生命科学的发源地之一:蛋白质。这不仅关注个体,而是全面揭示数以万计的整体。  1838年,荷兰科学家发现了蛋白质。这是生物体内一种极为重要的高分子有机物,占人体干重的54%。&ldquo 蛋白质组&rdquo 一词,1995年最早由澳大利亚科学家正式提出,其含义是指一个基因组、一种生物或一种细胞组织所表达的全套蛋白质。  &ldquo 1998年初,我在科学海洋里寻觅更有效的研究工具与策略。机缘巧合之下,敏锐地关注到刚刚出现的蛋白质组学,并逐渐把精力投入到这个新兴领域。&rdquo 国际人类蛋白质组计划的奠基人和开拓者之一、中国科学院院士贺福初介绍说。  蛋白质是基因的编码产物,科学家将它们的关系,比作建筑材料与设计图纸。就人体而言,基因组固定,蛋白质组就能变幻出形态、功能各异的不同器官。由此可见,蛋白质组对进一步阐释&ldquo 生命天书&rdquo 的重要性不言而喻。蛋白质组创新团队主要成员之一张成岗课题组。  拼搏,为中国科学开辟&ldquo 新天地&rdquo   井冈山,被誉为&ldquo 红色摇篮&rdquo 。毛泽东领导的工农红军在这里开辟了&ldquo 农村包围城市&rdquo 的新道路。  明朝的闭关锁国政策,让领跑数千年的中国迅速落后于世界。当新兴的全球科技浪潮再次袭来,中国将如何应对?  2002年4月,人类蛋白质组计划开始孕育。贺福初院士在华盛顿筹备会议上提出了&ldquo 两谱两图三库&rdquo 的研究策略,阐述了人类肝脏蛋白质组计划暨&ldquo HLPP蓝图&rdquo ,打动了各国与会学者。他们接受邀请,来到北京香山继续研讨。2002年11月,第一届国际人类蛋白质组学大会在五四运动爆发的源头&mdash &mdash 法国凡尔赛召开,40岁的贺福初院士在这里当选为&ldquo HLPP&rdquo 首任执行主席,成为该领域全球科研大军统帅。时任国家科技部部长徐冠华说,这是首次由我国科学家牵头负责的重大国际合作计划。  &ldquo 酝酿之初争议非常大。&rdquo 贺福初院士回忆到。&ldquo 2002年,在华盛顿,论证中我们提出:蛋白质组计划必须按生物系统(如器官、组织、细胞)进行一种战略分工和任务分割。否则,就是一盘散沙。这个策略从华盛顿争到凡尔赛,争到蒙特利尔,然后再争到北京,后来是德国慕尼黑,一直在争。可现在,国际上不少科学家已逐步按照这个方式进行了。&rdquo   历史必将铭记,在华盛顿会议上,中国学者的发言激起了千层浪,来自世界各国的科学家议论纷纷,有赞赏、有疑惑、更有激辩,唯独没有无动于衷!军事强调服从,但科学包容争议。事实证明,中国科学家在蛋白质组学领域最终赢得国际尊重和广泛支持。  借助国际计划的东风,经过10多年发展,目前该团队已经拥有2位中国科学院院士,1位发展中国家科学院院士,5位入选国家&ldquo 千人计划&rdquo 、&ldquo 万人计划&rdquo 科学家,3位何梁何利奖获得者,7位国家973项目首席科学家,7位&ldquo 国家杰出青年基金&rdquo 获得者,6位中国青年科技奖获得者,20人次被军地评为科技金星、银星、新星,成为蛋白质组学领域中具有显著国际竞争力的精锐之师。3位科学家分别当选党的十六大、十七大、十八大全国代表;2人获全国百篇优博。  团队成员先后在《自然》《细胞》系列子刊及《科学》等国际顶级刊物上发表文章280余篇,影响因子合计1600余。2006年,他们荣获&ldquo 首届全军优秀科技群体&rdquo ,并于2004年-2009年获得国家自然基金委创新群体基金的连续资助,刚刚又获得了2013年度国家科技进步奖创新团队奖。团队带头人贺福初院士成为中国蛋白质组学的奠基人与开拓者,担任国际人类蛋白质组计划执委(全球8位),并当选为亚太人类蛋白质组组织主席。  2009年,该团队在国际蛋白质组学领域最权威杂志一期刊登3篇文章,创同一单位同期刊发数全球最高纪录。2011年,他们又在《自然》子刊连发两篇重大成果,引起广泛关注。2012年2月1日,《新闻联播》用1分11秒的时间播发张令强课题组联合香港、深圳专家在骨质疏松症治疗领域取得重大突破并在线发表于《自然医学》的好消息。2012年5月,《人类肝脏蛋白质组计划10周年专著》正式发表,这是世界上首次以大百科全书的方式出版人类组织器官的蛋白质组专著。  据统计,2010年底,贺福初院士课题组在蛋白质组学领域发文影响因子及引用累计排名跃居全球第4位;2012年4月《自然》出版集团宣布,张学敏院士课题组在《自然》系列刊物年度发文数位居亚洲所有高校、科研机构前50名。此外,该团队还获得国家自然科学二等奖4项、国家科技进步二等奖3项,省部级一等奖7项。包括诺贝尔奖获得者、美国总统首席科学顾问等在内的数百名国际知名专家纷纷到中心访问交流,寻求合作;在《科学》和《自然》等世界顶级刊物进行系列专题报道。  在军事医学科学院党委的大力支持下,该团队在人才队伍建设上不断探索,创立了&ldquo 固定+流动&rdquo 的用人机制、&ldquo 哑铃+候鸟&rdquo 的引智机制、&ldquo 聚变+裂变&rdquo 的育才机制。他们借助中组部&ldquo 千人计划&rdquo 、北京市&ldquo 海聚工程&rdquo 等政策,诚邀7名海外专家和国内200多位同行加盟,逐步建立了&ldquo 开放、流动、联合、竞争&rdquo 的高效运行机制,实践形成了&ldquo 求实、创新、卓越、和谐&rdquo 的团队精神,为军队实施国际化的科研战略担当起&ldquo 试验田&rdquo 。蛋白质组创新团队主要成员之一张令强课题组。  深度,探底&ldquo 将军之官&rdquo   &ldquo 肝者,将军之官。&rdquo   此段文字出自中国最早一部生命百科全书《黄帝内经》。  肝脏是人体的&ldquo 发电厂&rdquo 、&ldquo 化工厂&rdquo ,是免疫系统的&ldquo 摇篮&rdquo 、血液的&ldquo 源泉&rdquo 。肝脏相当于人体的&ldquo 国防总部&rdquo ,但因&ldquo 将军&rdquo 负担过重,其疾病同样触目惊心,仅中国就有9300万不同程度的肝病患者,综合治疗费用高达9000亿元。  &ldquo 如果以人类主要的150种疾病进行计算,大约有3000&mdash 15000种蛋白质具有成为药物靶标的可能,迄今用到的只有总量的1/30到1/6。&rdquo 团队主要成员周钢桥介绍说。究其原因,如同钓鱼那样,一般浅水鱼很容易钓到,而深水鱼很难甚至根本钓不到。  &ldquo 蛋白质组学技术的强大能力使其能竭泽而渔,就像把三峡水库彻底放干,常常漏网的小鱼、小虾、螃蟹、泥鳅、黄鳝等,尤其是深水中暗藏的大鱼,都将全部抓住一样,自然给制药界带来巨大前景。&rdquo 团队主要成员杨晓介绍说。  工笔是国画的一种技法,以细腻深入、生动全面著称。该团队采用工笔手法,描绘了整个肝脏数以万计的蛋白质分子群落的&ldquo 社会生活&rdquo 状况,这幅历史巨卷,同样为无数国际同行所折服,并在其它组织器官的蛋白质组研究中所借鉴和效仿。  2002年以来,围绕&ldquo 肝脏计划&rdquo 的全面执行,中国科学家领衔全球10余个国家和地区的100多个实验室共同展开了一幅壮丽画卷。目前,已经初步揭示了人类肝脏蛋白质组的整个&ldquo 太阳系&rdquo ,系统解析出一组、两谱、三图、三库&mdash &mdash 九大&ldquo 行星&rdquo ;鉴定蛋白质13000余种;构建了高可信肝脏蛋白质相互作用网络图;建立了人体首个器官蛋白质组数据库;发现了脂肪肝、肝细胞病毒感染、癌变以及转移相关的蛋白质标志物群、潜在药靶和候选药物;寻找到了一批与肝炎、肝癌等复杂疾病相关的易感基因。  鉴于中国的重要贡献,数位诺贝尔奖获得者、国际蛋白质组组织的历任主席等纷纷给予高度评价;该领域顶级权威期刊《分子细胞蛋白质组学》向世界专栏介绍中国的成就;国际蛋白质组学核心刊物《蛋白质组学》和《蛋白质组研究》分别出版中国蛋白质组学专刊和人类肝脏蛋白质组计划专刊,全面介绍中国在此领域的成就。蛋白质组学的未来&mdash &mdash 朱云平研究员正在给研究生讲解建设中的&ldquo 凤凰工程&rdquo 。  广度,向着&ldquo 登月之旅&rdquo 前进  2013年12月2日,全球瞩目的&ldquo 嫦娥三号&rdquo 踏上了登月之旅,&ldquo 玉兔&rdquo 的一小步,极大地增强了军事医学科学院蛋白质组学创新团队追求宏伟梦想的信心和勇气。早在创建之初,贺福初院士就将&ldquo 人类蛋白质组计划&rdquo 比喻为生命科学的&ldquo 登月之旅&rdquo ,激励更多的年轻人为之奋斗。  如果在十几年前提到蛋白质组学,恐怕知之者甚少,从事其研究者更是寥若星辰。但是,随着经济的迅速增长和开始建设创新性国家,政府逐步倾力推动基础科学发展。  1998年,我国第一个蛋白质组重大项目获得批准,从此拉开了该领域蓬勃发展的序幕。以贺福初、钱小红研究员为代表的一批科学家率先探索,成为我国蛋白质组学事业的先行者。  21世纪初,国家陆续启动了蛋白质组学首个973项目以及&ldquo 中国人类肝脏蛋白质组计划&rdquo ,这个新兴领域的星火已燎原于九州,逐渐从一支独秀发展成群雄并起、全国争锋的喜人形势。同时,数十位中国科学家开始担任国际组织领导、理事以及权威期刊编委,我国在该领域的世界话语权日益巩固。  山水之作,云雾染意,青松铸魂。  10多年来,在该团队的努力推动下,中国蛋白质组学研究朝气蓬勃,墨润之地,日新月异。从最初以建立技术平台,开展技术方法的研究、整合为主,到以高通量蛋白质组学研究技术平台为基础,深入研究关系我国人民健康的重大疾病问题和重要生命科学问题,在多个领域方向取得国际瞩目的突破性进展。&ldquo 在新兴的生命科学学科里,蛋白质组学是发展最快、成效最显著的领域之一。&rdquo 国家自然科学基金委生物学部原主任强伯勤曾这样评价。  在这幅山水巨卷中,中国科学家用线条一笔一笔勾勒描绘的青松已经漫山遍野,风声呼啸。近4年来,中国在该领域发文量直线上升,紧追美国,成就位居全国其他学科前列。  目前,随着研究工作的日积月累,深埋的&ldquo 石油&rdquo 开始井喷。发展和完善了一批具有自主知识产权的蛋白质组新技术新方法,技术能力成百上千倍地大幅提升,在国际蛋白质组学技术测评中名列前茅;筛选到一批与重大疾病防诊治相关的候选蛋白质标志物群、潜在药靶和候选药物,有望显著提高我国人群健康水平,大力推动生物医药的快速发展;制定一系列数据标准、开发新算法新软件,并逐渐为国际同行所采纳。  &ldquo 在人类蛋白质组计划中,我们抓住了机遇,一些领域和成果走在了世界前列,但整体水平仍有待提高。&rdquo 团队主要成员钱小红如是评价。据文献统计显示,与丹麦44.24、美国26.65的蛋白质组研究论文平均引用次数相比,我国在该领域发表成果的数量虽多,但9.48的篇均引用水平与欧美最高水平尚有差距。  &ldquo 成绩属于过去,未来任重道远。&rdquo 军事医学科学院高福锁政委说,&ldquo 在未来实现中国梦、强军梦的过程中,我们将以党的十八大提出的创新驱动发展战略为牵引,以刚刚获得的2013年度国家创新团队奖为新的起点,从零开始,埋头苦干,以更大的信心和勇气攀登世界科技高峰,为国家生物安全提供更好的技术支撑,为人类生命科学的蓬勃发展做出更大的创新贡献!&rdquo
  • 颠覆认知,重塑可能 | 全新Orbitrap Astral质谱仪在蛋白质组学应用中的进展
    2023年6月4日,ASMS会议中,赛默飞推出了基于全新质量分析器的Orbitrap Astral质谱仪,为生命科学质谱应用带来了未来的无限可能。蛋白质组学因其在理解生命科学中的重大意义及技术上对于质谱仪的高分辨率、高灵敏度、高质量精度以及定量准确性的全方位高要求,使得我们愈发得期待全新Orbitrap Astral质谱仪能够为蛋白质组学向更快、更深、更全面的发展提供帮助。而全新Orbitrap Astral质谱仪的表现如何呢?让我们用数据说话~在对于生命体的理解中,作为生命活动的最终执行者,蛋白质的重要性不言而喻;而蛋白的复杂性极高,在不同的物种、组织、细胞等层级中,它具有不同的时空表达特异性;在这些变化中,同样的蛋白可能会有不同的形态,而呈现中多种多样的功能;而这些变化可能发生在不同的细胞中,也可能发生在不同的细胞组分甚至是不同的蛋白复合物中。分析蛋白质的金标准技术是质谱技术,现代质谱技术应用于蛋白质组学的分析中,我们明确的有三个大的方向亟待改进:1. 检测通量,我们需要将检测的能力提升至上万个样品的大队列的水平;2. 更高的蛋白组覆盖度,我们期待在每次检测中都能够得到所分析样品更高的蛋白鉴定深度,从而鉴定与定量更多感兴趣的蛋白;3. 灵敏度,即在极低量的样品中如单细胞样品中即可获得最大蛋白组覆盖度的能力。赛默飞一直致力于多个质谱质量分析器的组合,期待它们能如同交响乐般的发出混合且和谐的声音,对于质谱仪而言,我们现在所使用的质谱仪无疑是非常强大的,以Orbitrap为例,它具有超高的分辨率、质量精度和动态范围,它一直支撑着我们走过了蛋白质组学的蓬勃发展的阶段,时代的脚步再一次来到了全新的Orbitrap Astral质谱仪,在这里,我们将在检测通量、蛋白组覆盖深度、灵敏度及精准定量等多个维度展示其超强悍的性能:图1:全新一代Orbitrap Astral质谱仪全面提升蛋白质组学分析能力首先,我们看检测通量的变化:现在我们的科学家们所拥有的的丰富的样品量与目前市面上的质谱所能提供的单日检测通量有着显著的矛盾,目前我们的质谱仪约能提供的单日最大检测通量约为48个样品,而Orbitrap Astral 创造历史的将这个值提升至每天180个样品,这使得蛋白质组学在分析中的限速步骤不再是质谱的通量;每天180个样品通量意味着我们的单个样品总梯度为8min,实际分离梯度为5.5min,超短的梯度能提供超过8000个protein group的鉴定深度!而如果使用略长的14.4min梯度,达到100SPD(单日检测样品量),可以得到单个样品9000个protein group的鉴定深度;而24min梯度60SPD,则可以得到单针超过10000个蛋白的鉴定;60min梯度就可以得到超过12000个蛋白的鉴定水平;超高的检测通量兼具鉴定深度,使得用户能更加游刃有余的根据其实验需求,在检测样品通量与样品鉴定深度之间寻求更好的平衡;更深的鉴定能力带来对于生物学功能的更深的认知,我们期待着全新一代Orbitrap Astral质谱仪带给我们更有趣的生物学发现!图2:全新一代Orbitrap Astral质谱仪兼具超高的检测通量与深度蛋白组覆盖能力(点击查看大图) TMT技术路线是定量蛋白质组学的重要方法之一,目前TMT的通量已经达到18-plex,而全新的Orbitrap Astral质谱仪,其结合了超高分辨率和动态范围的Orbitrap质量分析器与超高扫描速度及超高灵敏度的Astral质量分析器,分别执行一级与二级扫描,二级Astral质量分析器在m/z524时的分辨率约为8万分辨率(m/z130时分辨率约为5万),适用于分辨TMT的报告离子从而进行TMT定量。如果将TMT样品分为2个fraction,运行90min梯度,即可拿到8000个定量蛋白;按照TMT-18plex的通量,我们可以达到每天144个样品的检测通量;而如果我们使用4个fraction进行检测,则可以拿到超过10000定量蛋白。图3:全新一代Orbitrap Astral质谱仪为TMT定量检测注入全新动力(点击查看大图)其次,我们来关注蛋白组的覆盖度:更深的蛋白质组覆盖度一直是我们的追求,以目前的质谱技术,蛋白鉴定的最大深度在12000个蛋白附近,这个值与mRNA测序相当;其实我们如果想要使用质谱技术来实现目前的鉴定深度,要牵扯到很多步骤,一般需要进行离线分级后多针上机检测的操作,比如,我们可以首先运行一个77min的离线分离梯度,收集46个馏分,每个馏分33min梯度;消耗了34.5个小时,最终达到12000个蛋白的鉴定水平;人们用这种方法,这样的蛋白鉴定深度,得到了很多生物学信息,比如肿瘤细胞系的通路等,发现了很多关键蛋白;如果我们想把这样的技术路线用在真正的大规模研究上,它对机时的消耗过于巨大了,实验过程过于艰苦;而我们使用全新的Orbitrap Astral质谱仪,能够实现单针,60min色谱梯度的情况下,即可达到12000个蛋白的鉴定;那如果我们在Orbitrap Astral上也使用多次进样的方法,4.5小时我们就可以拿到超过15000个蛋白了,这也使得我们在历史上第一次无限接近于整个蛋白质组的鉴定深度。其一天内的鉴定通量达到了8个proteomes的水平,我们真正具备了处理大规模研究的能力。图4:全新一代Orbitrap Astral质谱仪为蛋白质组学带来前所未有的鉴定深度(点击查看大图) 在蛋白质组学中,除了常规的细胞裂解液样品,解决具有极大的动态范围的血液样品也是巨大的挑战。在180个SPD的通量下,未经高丰度去除的血浆样品可以达到600个蛋白的鉴定水平,若需要更深的覆盖度,经seer处理后的5个fraction长梯度可达到超过6000个蛋白鉴定深度。而使用30min梯度分析经富集的血浆样品(5个fraction单独进样),DIA方法更是能够重复定量样品里的4500多种蛋白。全新一代Orbitrap Astral质谱仪鉴定深度,使得我们的用户可以根据实验需要,在鉴定深度与通量之间寻求到平衡。图5:全新一代Orbitrap Astral质谱仪为血液样品研究带来新的可能(点击查看大图) 而后,我们来关注灵敏度:✦ ✦ ✦ ✦ 如今单细胞组学快速走进了人们的视野,要进行更深度、更高通量的单细胞蛋白质组学,对质谱的灵敏度提出了更高的要求。我们研究蛋白质组学,从来便是越深入越困难。而全新的Orbitrap Astral质谱仪,可以以极高的速率进行高动态范围的检测,同时兼具超高的灵敏度。在进行单细胞蛋白质组学的检测中,全新的Orbitrap Astral质谱使得我们可以以80个SPD的检测通量(18min梯度单针运行时间)的同时得到超过5000个蛋白的鉴定水平。这表明,使用全新的Orbitrap Astral质谱仪,我们可以在检测通量翻倍的同时,得到更高的蛋白鉴定能力,从而为单细胞蛋白质组学树立了新的标准。图6:全新一代Orbitrap Astral质谱仪为单细胞蛋白质组学树立新的标准(点击查看大图) 定量蛋白质组学不仅追求更高的鉴定能力,我们也同时迫切的需要更加精准的定量,从而为我们提供准确的差异蛋白信息,指导生物学研究。全新的Orbitrap Astral质谱仪具有在宽线性动态范围的基础上的精准的定量能力,如图7,在经过不同比例混样的样品比较中,Orbitrap Astral所产生的定量比值,均符合实际混样比例,提供了精准的定量比值。甚至即使是极低的拷贝数的蛋白(如200-3000个拷贝数),Orbitrap Astral也能提供精准的定量值。图7:全新一代Orbitrap Astral质谱仪展现了精准的定量性能(点击查看大图)在拥有了强劲的性能后,我们还需要仪器能够更加稳健的运行:在仪器的鲁棒性测试中,进行了超过2200次进样,其间的QC数据均表现出优异的鉴定稳定性与重现性。图8:全新一代Orbitrap Astral质谱仪拥有优异的稳定性与重现性(点击查看大图)总 结赛默飞全新划时代的蛋白质组学工作流,为您的蛋白质组学研究提供无缝衔接的全面支持。新的时代,无比期待!图9:赛默飞全新划时代的蛋白质组学工作流 了解Astral高分辨质谱仪应用详情,请点击“血浆蛋白质组学的新标准”
  • 郭天南及合作团队揭示奥密克戎感染宿主的蛋白质组学特征
    SARS-CoV-2的奥密克戎变异株最早报道于2021年11月,目前已成为世界范围内的主要感染株。奥密克戎在S蛋白的30多个突变导致其致病性和复制能力的下降,而传播力却明显增强。目前,宿主对奥密克戎的反应尚不明确。近期,西湖大学生命科学学院郭天南团队、浙江大学医学院附属杭州市西溪医院黄劲松团队协同国家传染病医学中心、上海市传染病与生物安全应急响应重点实验室、复旦大学附属华山医院感染科张文宏团队共同合作评估了奥密克戎变异株感染、SARS-CoV-2非奥密克戎株感染,非SARS-CoV-2呼吸道病毒(流感病毒及腺病毒)感染患者的血液蛋白质组学特征,并和健康受试者接种全程2针新冠疫苗前后的蛋白质组学特征进行了同步比较,相关成果于5月18日发表于Cell Discovery杂志。研究分析表明,在血液蛋白质组学的角度,接种疫苗后的奥密克戎株与非奥密克戎株宿主反应类似;同一般流感相比,具有显著的差异特征。在非重症肺炎患者中,接种疫苗后感染奥密克戎诱导的免疫反应与非奥密克戎株感染相似,炎症反应远超过健康对照病例,但没有流感和流感样病人严重。这可能是由于新冠疫苗为大部分患者提供了潜在的保护作用。但需要注意的是,本研究并没有分析重症肺炎患者,因此,奥密克戎株或流感病毒等在重症患者中引起的宿主炎症反应我们无法通过本研究评估。研究结果提示,奥密克戎株与流感的宿主免疫反应存在显著差异,接种疫苗可能是非重症奥密克戎株患者宿主炎症反应降低的原因之一。参考文献[1] BAO JF, SUN R, Ai JW, 等. Proteomic characterization of Omicron SARS-CoV-2 host response [J]. Cell Discovery. 2022[2] SHEN B, YI X, SUN Y, 等. Proteomic and Metabolomic Characterization of COVID-19 Patient Sera[J]. Cell, 2020, 182(1): 59-72.e15.
  • 蛋白质组学产业动态|Olink诉Alamar Biosciences侵犯专利
    蛋白质组学分析是当前生命科学界的热门领域。该领域取得的进展不仅增进了人们对基础生物学的理解,而且可以帮助阐释人类的健康和疾病状况。对蛋白质组的深入理解推动着新一波的研究和诊疗创新浪潮。这些创新的推动要求新的技术平台能够实现蛋白质组学分析的两个基本目标:能够尽可能深入地检测丰度极低的蛋白;以及能够在单个样本中分析数千种蛋白。2023年10月17日,仪器巨头赛默飞世尔科技就溢价74%(31亿美元)全资收购了蛋白质组学领域的领军企业Olink。而11月15日,Olink却向美国特拉华地区法院提交文件,诉Alamar Biosciences侵犯公司专利。根据公开资料,Olink声称Alamar侵犯的专利编号为US7,883,848(简称848专利)。那么,这家AlamarBiosciences公司是何来头?可以看到,Alamar由一群经验丰富的连续创业者于2018年创立。公司联合创始人兼CEO Dr.Yuling Luo以及联合创始人兼COO Dr.Steve Chen,此前曾一同创立了Advanced Cell Diagnostics (ACD),成功研发并商业化了全球领先的RNA原位杂交技术平台RNAscope,ACD也于2016年被Bio-Techne收购(对价3.25亿美元)。在ACD之前,Dr.Luo是Panomics(以前名为Genospectra,后来被Panomics收购)的联合创始人,这是一家生命科学公司,于2008年被Affymetrix收购。在Panomics,他担任过各种角色,包括副总裁、功能基因组学和首席科学官,并领导了所有旗舰产品的开发和推出。Alamar的主要技术平台是什么呢?Alamar的蛋白质组技术同时融合了独创的单分子检测技术NULISATM,以及抗体工程技术AttobodyTM。该技术平台将为生命科学和新药研究者提供一次样本同时检测超多重标志物(1000X)并同时实现超高灵敏度(aM级别)的解决方案。同时该技术也将为肿瘤无创早筛等临床未满足需求提供新的诊断工具。可以说,Alamar 的NULISA平台就是做的蛋白多重检测的,与Olink存在竞争,但目前Alamar的NULISATM只能做到250个target的检测,远不如Olink的5300+和SomaLogic的11k。Alamar在过去两年中成功融资多轮,比如2021年其完成8000万美元B轮融资,该轮融资由夏尔巴投资领投,Morningside Ventures和Samsara Biocapital跟投,老股东启明创投和Illumina Ventures持续投资。接下来,Olink的买主赛默飞将如何应对Alamar这一“后起之秀”的技术平台,我们拭目以待。
  • 阿蛋学仪器 | 百草师姐失恋了,原因竟然是......
    广州绿百草推出全新连载短篇小说【阿蛋学仪器】, 不定期的跟大家讲述关于学渣阿蛋在工作后不得不学习仪器知识的苦逼经历。夸张的剧情下都是以现实为原型,记得准时关注哦! 阿蛋学渣,毕业于某大学化学院。屌丝男一枚,无才无貌,不文艺也不爱运动,五音不全,唯一的爱好是LOL。 百草阿蛋的师姐,学霸。标准白富美,善良、有爱心。娇滴滴的外表下有着一颗女汉子的心。百草师姐失恋了,原因竟然是......时间:7月25日 5:30 pm 地点:实验室走廊安静的走廊,除了滴答滴答的手表声,就是阿蛋100/min的心跳声。 此刻的阿蛋,穿着西装白衬衣还用萝卜臣定了发型,渡步间思绪万千,不由自主变冷的双手与室外的39摄氏度的气温形成了强烈的对比。 " 噔噔噔......" 走廊传来了高跟鞋的声音。阿蛋在条件反射下秒变回了大家熟悉的脸孔,一脸懵逼地笑道 “ 机会终于来了 ”哼着小曲,满脸桃花。百草今天打扮的特别漂亮,花枝招展地向阿蛋走去。一步,一步,一步......距离越来越近,阿蛋的心跳也越来越快。 120、150、180,心要跳出来了!清风徐来,伴着甜蜜的香水味,阿蛋沉醉于现实与梦幻当中。而百草,完全没有注视到Chok爆的阿蛋,一笑而过......一脸懵逼的阿蛋,终于回过神来 “ 师姐̷ ”回眸一笑百媚生的百草向毫无存在感的阿蛋望去,春风无限的脸孔泛起了一丝丝惬意。“ 阿蛋,都怪我上次用信和的ultron es-ovm 蛋白相柱敲了你后脑,你看你五官都僵硬变形了。 ”“ 师姐,我̷我̷我向约你今晚8点半去看大树海棠...... ”百草蛾眉紧锁,“ 最近我的皮肤不好,要早点回家敷面膜美美哒,七夕和男朋友去看萤火虫。 ”七夕̷.男朋友̷.萤火虫.....百草相看莞尔后离开的瞬间,阿蛋发现她脸上有一些红点。 “ 你伤害了我还一笑而过, ” 阿蛋想死的心都有了,垂头丧气地,萦绕着他的除了男朋友一词还有就是百草脸上的红点。 时间:7月25日7:00 pm 地点:阿蛋的家阿蛋回家后为了让寂静的空间增加一些声音,便顺手打开了电视。电视响起了 中央电视台......中央电视台!!!“ 今天是7月27号,农历六月廿五,欢迎收看新闻联播节目。今天节目的主要内容有̷̷̷̷̷̷̷̷̷̷̷̷̷.在近日广东省食品药品监督管理局̷̷..面膜糖皮质激素̷̷̷出现红斑̷̷ ”“ 真相只有一个 面膜 ”阿蛋的手机突然响起了百草的专用铃声 “ 我的好人好人好人好人好人好人卡 ”“ 我的脸长了红疹̷..怎么办?他会不会和我分手̷̷ ”电视上又响起了音乐 丑八怪 能否别把灯打开 我要的爱 出没在漆黑一片的舞台......阿蛋温柔地说 “ 师姐你先别哭 。你最近是不是换了新的面膜? ”“ 我̷.在男朋友做微商的表姐那买了新的红酒面膜。”“ 师姐,那恐怕是鸦片面膜! ”“ 怎么可能!!!他说他表姐的面膜是进口最好的,超多好评,重点是打了折还是辣么贵!”“ 师姐,你相信我,我会证明给你看。我可以帮你变回美美哒~ ”“ 真的吗? ”“ 恩恩,你明天带一片面膜回来吧。 ” 时间:7月26日10:00 am 地点:实验室内第二天一早百草就到了实验室,焦急的等着阿蛋。“ 师姐师姐!你是在等我吗?真是太感动了!” 阿蛋一出现就猛奔百草面前。嘭~~!!!阿蛋的前脑突然间受到了硬物撞击!“啊~~痛死了”认真一看,百草师姐手里拿着一根Ecosil制备柱。“ 上次色谱柱敲一下你变聪明了,这次问题更大了,需要制备柱..... 另外重点是,你竟然敢迟到让我等这么久,看看你的黑眼圈,你说你昨天撸了几盘,拿了多少次五杀!!!”阿蛋委屈的摸了摸痛处,本想争辩,转身又想,善良的师姐是因为心情不好才会凶的,等我帮她解决了问题,她知道我为她付出这么多,一定会感动涕零,以身相许的!! “ 师姐冤枉啊,昨天我通宵查药典,今天一早我就去Lubex实验仪器耗材大超市买了各种实验用的耗材。看我的手臂多么的孔武有力,顶着一大箱东西So Easy!等一下我就让你知道你脸上红疹的原因。 ”“ 好了说正事了,我带来了面膜了,你要干嘛?”“ 师姐,昨天新闻说了很多商家在面膜等化妆品上违规添加了糖皮质激素,使用了含有糖皮质激素的面膜能够在短时间内达速效美白、嫩肤的作用,但是如果长期使用,人体皮肤会产生激素依赖症状,停用后反而会加重皮肤过敏,出现红斑、丘疹、毛细血管扩张等严重问题,我估计你的面膜含有违规添加的糖皮质激素,所以今天我们就来检测一下吧。 ” “ 我说了面膜是我男朋友介绍的,不可能有问题!!! ”“ 师姐,相信我,我会证明给你看的。”“ 这次我们是跟据中国药典GB/T 24800.2—2009的方法进行测定化妆品中糖皮质激素,使用薄层层析法和LC-MS法....... ”“ 师姐,根据上面的数据分析师姐你的红酒膜的确含有各种糖皮质激素,所以剩下的面膜你就不要再用了.......” 做完实验的阿蛋,自信满满的等待着百草的赞美。谁知一转身.......“ 呜呜~太过分,他竟然敢欺骗我让我毁容了!!!我要甩了他!!!”阿蛋用尽全身力气压抑住内心的亢奋,安慰百草。“ 师姐别伤心,只要停用面膜,过一段时间师姐又可以恢复美美哒的。别想渣男,好男人可是近在眼前呢。来吧,师姐,我愿意接受你的以身相许!”乐观的百草擦掉泪水,“ 师姐真的很感动!阿蛋你真是个好人!这是我送给你的七夕节礼物。 ”说完就一蹦一跳的走了。留下阿蛋在冰箱的冷风中凌乱。。。新换的中科美菱低温冰箱真的好冷!小编泥垢了!谁开的冰箱门!想知道阿蛋好不容易修好仪器后又有怎样的遭遇?记得持续关注广州绿百草微信公众号~我们会不定期推出续集哦~关注广州绿百草微信公众号,获取更多资讯!
  • 谁是蛋白质质谱与蛋白质组学领域世界第一牛人?
    俗话说:文无第一,如果非要整出个蛋白质质谱与蛋白质组学领域世界第一牛人,显然并不是一件容易的事,也注定是一件有争议的事。作为一个半路出家的准业内人,我就本着无知者无畏的革命精神,说一下我自己心目中的第一牛人:Ruedi Aebersold。  考虑到科学网的大多数网友对蛋白质组学并不了解,先简单科普一下,根据百度百科的定义:“蛋白质组学(Proteomics)一词,源于蛋白质(protein)与 基因组学(genomics)两个词的组合,意指“一种基因组所表达的全套蛋白质”,即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。” 1995年(也有1994,1996年之说)Marc Wikins首次提出蛋白质组(Proteome)的概念1,1997年, Peter James(就职于有欧洲MIT之称的瑞士联邦工学院(ETH))又在此基础上率先提出蛋白质组学的概念2。基因组学和蛋白质组学的概念又进一步催生了N多的各种各样的组学(omics),两者的诞生的发展,也使系统生物学成为可能,本文的主人公Ruedi Aebersold与Leroy Hood一起于2000年在美国西雅图创办了系统生物学研究所(ISB),该所的建立不但标志着系统生物学作为一门独立的学科的诞生(此句话貌似不靠谱,参见文后14楼的评论),也带动了包括蛋白质组学在内的多种组学的发展,当然各种组学的发展也同时促进了系统生物学的发展。尽管日本也于2000年在东京建立了系统生物学研究所,但是同为第一个吃螃蟹的,东京的这个所,无论是学术水平还是世界影响都无法和西雅图的那个系统生物学领域的麦加相提并论。闲话少叙,我之所以认为Ruedi Aebersold是蛋白质质谱与蛋白质组学领域世界第一牛人,是基于如下原因:  Ruedi Aebersold对蛋白质组学的最大贡献可谓是同位素代码标记技术(ICAT),现在这一蛋白组定量技术自从1999年在Nature上发表以来,该技术已世界广泛应用,该论文迄今(截至2013年1月11日)已被引用了近3000次。Web of Science的检索结果显示,蛋白组学领域迄今已经至少有超过10万篇论文发表,按照被引用次数排名,该论文位居第三位。有意思的是,被引用次数排第四位的是Ruedi Aebersold和另外一位牛人Mathias Mann(下面会介绍)于2003年发表在Nature上的有关蛋白质质谱与蛋白质组学的综述论文,迄今也已被引用近2800次。而引用次数排第一和第二的两篇论文的通讯作者并算不上是蛋白质质谱与蛋白质组学领域的,蛋白质组学仅仅是他们使用的工具,他们的影响也在这个领域之外。蛋白质组学领域,最重要的专业协会应该算是HUPO (国际人类蛋白质组组织), 最重要的专业会议也当属HUPO世界大会,Ruedi Aebersold曾获HUPO含金量最高的成就奖,他本人也经常是HUPO世界大会的分会主席或大会特邀报告人。当然Aebersold还获得了包括美国质谱协会(ASMS)大奖在内的许多专业大奖。可能有人会列出另外的自己心中的第一牛人(如上述的Mathias Mann),但Ruedi Aebersold无疑至少是领域内公认的前几位的世界级牛人。另外,顺便说一下德国马普所的Mathias Mann(其在丹麦首都也有实验室),Mann和Aebersold可谓是蛋白质组学领域的双子星座,都是该领域的顶级牛人,Mann发表的论文有多篇都在蛋白质组学领域被引用次数前10位,不少被引用次数都上千次。上述的Mann和Aebersold两人能在Nature发表综述论文也说明了他们的江湖地位。Aebersold和Mann所发表的论文总被引次数分别超过了5万和3万次,这个数字在世界所有领域都是惊人的。另外,Mathias Mann在蛋白质组学最大的贡献可以说是发明了蛋白质组体内标记技术SILAC3,这种技术与Ruedi Aebersold发明的ICAT已及另外一种标记iTRAQ是公认的应用最为广泛的蛋白质组学定量标记技术。  今年年近花甲的Ruedi Aebersold是世界蛋白质组学的开拓者之一,现在在上述的ETH的工作,和最早提出蛋白质组学Peter James在同一个大学。作为土生土长的瑞士人,Ruedi Aebersold是在2004年底、2005年初才开始在ETH全职工作的,可谓是瑞士的大海龟。Ruedi Aebersold此前在西雅图的ISB和华盛顿大学工作,作为ISB的元老和共同创办人,Ruedi Aebersold现在还是ISB的兼职教授,发表论文时也还署ISB地址。Mann和Aebersold都是欧洲人,现在又都致力于将蛋白质质谱与蛋白质组学应用到临床,尽管蛋白质组学已有十多年发展历史,现在最大的一个瓶颈可以说在基本无法应用到临床,现有的技术,对于临床应用而言,时间和经济成本都太高(无法高通量、检测成本太贵)。这一块硬骨头显然不是一般人能够啃得动的,需要从临床样品制备、质谱技术到数据分析都要有突破甚至革命性的创新,我很期待,也相信Mann和Aebersold有能力最终使蛋白质组学(尤其是基于此的生物标志物鉴定技术)应用到临床。  我国在蛋白质质谱与蛋白质组学领域在世界上最出名的无疑非贺福初莫属,贺福初的名字在国内搞蛋白质组学应该都知道他的名字,他的头衔很多(如将军、院士),我就不一一列举了,新年伊始他又多了一个牛头衔:万人计划中的科技领军人才。贺的工作和学术水平,我不熟悉,不敢评头论足。他的文章被引用次数最高的是发表在Cancer Research一篇论文,迄今已有126次,但并非是蛋白质组学领域。在蛋白质组学领域,他的被引次数(含自引)最高的论文是2007年发表在蛋白质组学顶级期刊MCP的文章4,迄今已有105次引用。蛋白质质谱领域,我国在世界上最出名的学者估计要数复旦大学的杨芃原了,他的被引用次数最高的一篇论文,是2005年发表在化学顶级期刊德国应用化学的文章5,迄今已被引用70次,杨芃原为该论文的共同通讯作者。我国在蛋白质组学目前被引用次数最高的是南开大学王磊(澳大利亚海归、长江学者)2007年发表在美国科学院院刊(PNAS)的论文6,迄今被引次数已经超过500次。  蛋白质质谱仪主要生产商Thermo Fisher(即原来的Finnegan), 最近新出了本挂历,这本特别的挂历上列了13位在蛋白质质谱与蛋白质组学领域的牛人,上述的Ruedi Aebersold和Mathias Mann都在之列,其余11位简单介绍、列表如下。姓 名工作单位主要贡献Richard D. Smith美国太平洋西北国家实验室1990年首次用三重四级杆质谱Top-down(自上而下)分析完整蛋白John Yates III美国Scripps研究所SEQUEST MS/MS数据库搜索程序Joshua Coon美国威斯康星大学麦迪逊分校发明了电子转移解离技术(ETD)Neil Kelleher美国西北大学Top-down蛋白质组学Kathryn Lilley英国剑桥大学蛋白质组学定量技术Pierre Thibault加拿大蒙特利尔大学应用生物质谱和蛋白质组学到细胞生物学Michael MacCoss美国华盛顿大学(西雅图)稳定同位素标记技术Albert Heck荷兰Utrecht大学基于质谱的结构生物学Catherine Costello美国波士顿大学HUPO前任主席,质谱技术发展及应用Alexander Makarov德国Thermo Fisher Scientific 生物质谱全球研发总监领导研发Orbitrap质谱仪Donald Hunt美国弗吉尼亚大学FT-MS and ETD  简单的说,上述13位世界级牛人都来自欧美,没有一位来自亚洲,也没有一位华人。我不知道以Ruedi Aebersold代表的上述牛人是如何炼成的,但可以肯定的是:他们不是欧美版的“百人”计划,也不是“千人”计划,更不是“万人”计划而“计划”出来的。网上的公开信息表明:Ruedi Aebersold除了在国际专业协会和期刊有学术兼职外,没有任何行政职务,就是一普通教授,但是这不妨碍他成为蛋白质质谱与蛋白质组学领域世界第一牛人。
  • 雪迪龙:近年业绩速增靠脱硫脱硝业务
    雪迪龙在最新公布的《投资者关系活动记录表》中透露,最近一两年公司业绩的快速增长,仍然依靠脱硫脱硝业务。  雪迪龙介绍,2015年底大型火电厂的脱硝工程基本全部实施完毕,订单增速肯定会下降,但中小机组的脱硝工程将逐步启动,来自中小机组的订单将会增加,脱硝订单会继续稳定的增长。  雪迪龙的主营业务为分析仪器仪表、环境监测系统、工业过程分析系统的研发、生产、销售以及运营维护服务。
  • 第六届中国蛋白质组学大会第一轮通知
    为了积极促进我国蛋白质组学的研究与发展,由中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会(CNHUPO)主办,北京蛋白质组研究中心和复旦大学共同承办的第六届中国蛋白质组学大会定于2009年7月28日—31日在江苏省泰州市召开。  一、会议安排  本届学术会议设有大会报告、分会(专题)报告和墙报三种形式。大会将邀请蛋白质组学及相关领域的国内外著名专家和教授作大会报告或专题报告,会议规模约600人左右。  会议同时举办与生物化学与分子生物学、蛋白质组学等研究领域相关的仪器、设备、试剂和新技术的展览、展示会。  大会安排于2009年7月28日举办蛋白质组学新技术培训,届时将邀请蛋白质组领域的国内、外知名专家授课。  二、会议议题  会议主要讨论蛋白质组学研究的现状及其进展,内容包括:疾病蛋白质组学,功能蛋白质组学,药物蛋白质组学,结构蛋白质组学,蛋白质化学,生物信息学,蛋白质修饰和相互作用,抗体相关技术,蛋白质组微分析、蛋白质芯片以及蛋白质组新技术新方法等研究领域。  三、会议语言  中文和英文  四、会议组织  组织单位  主办单位:中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会(CNHUPO)  承办单位:北京蛋白质组研究中心 复旦大学  主 席:贺福初院士  顾问委员会:(按姓氏汉语拼音顺序排列)  陈志南院士 强伯勤院士 饶子和院士 施蕴渝院士 汪尔康院士 王红阳院士  张玉奎院士  执行主席:钱小红 杨芃原  组织委员会  主 任:贺福初院士  副 主 任:杨芃原 杨晓明 钱小红  委 员:(按姓氏汉语拼音顺序排列)  陈志南院士 丁建平 高友鹤 何大澄 贺福初院士 李 明 梁宋平 刘斯奇 陆满晴 潘全威 钱小红  饶子和院士 施 前 王东根 杨芃原 杨晓明 杨秀荣 张先恩 张玉奎院士 甄 蓓  秘 书 长: 王东根  副秘书长:甄 蓓 施 前  学术委员会  主 任:饶子和院士  副 主 任:王红阳院士 张玉奎院士  委 员:(按姓氏汉语拼音顺序排列)  陈正军 陈志南院士 丁建平 高友鹤 何大澄 贺福初院士 李亦学 梁宋平 刘斯奇 刘银坤 钱小红  强伯勤院士 饶子和院士 施 前 施蕴渝院士 汪尔康院士 王红阳院士 杨芃原 杨晓明 张学敏   张玉奎院士 赵晓航 曾 嵘  甄 蓓  秘 书 长:钱小红  副秘书长:甄 蓓 施 前  秘书处  北京昌平区科学园路33号北京蛋白质组研究中心  电话:010-80705188 传 真:010-80705155  E-mail: cnhupo6@163.com  五、征文范围及要求(参照模版)  投稿论文收录入会议论文集,大会将组织优秀论文评选。参加会议代表将授予继续教育学分10分。  凡未在国内外公开刊物发表过的研究成果,均可投稿,具体要求如下:  征文范围:有关蛋白质组学及相关领域近年来研究的学术成果,以英文论文摘要形式投稿。  稿件要求:每篇论文摘要按正式发表论文要求撰写,限A4纸1页,使用Word软件撰写。文责自负。(参照模版)  字体要求:标题—Times New Roman四号加粗  作者—Times New Roman五号居中,拟作报告者请在其姓名下方划一横线。  注:大会报告幻灯片一律要求英文准备,  单位、地址、邮编、E-mail—Times New Roman小五号居中  摘要—Times New Roman五号  参考文献(Times New Roman五号)。  投稿方式:论文摘要请用E-mail附件传递,并在E-mail信中“主题”栏内写明“蛋白质组学会议” 若无上网条件请邮寄论文摘要一式两份,同时提交光盘(未提交者会议将不予录用)。  E-mail: cnhupo6@163.com  投稿地址:北京昌平区科学园路33号北京蛋白质组研究中心第六届中国蛋白质组学大会收  邮编:102206  截至日期:论文摘要投稿截至日期为2009年5月31日,以当地邮戳为准。  六、报到时间  2009年7月27日(参加培训的人员报到时间)、28-29日  七、会议注册费(国内代表)  2009年6月20日前注册:800元(人民币)/位(在读学生:500元/位)  2009年6月20日后注册:900元(人民币)/位(在读学生:600元/位)  技术培训费(与注册费一并交纳):100元(人民币)/位  八、重要时间提示  回执截止日期:2009年5月31日前(以当地邮戳为凭)  征稿截止日期:2009年5月31日前(以当地邮戳为凭)  会前注册时间:2009年6月20日前(以当地邮戳为凭)  九、交通指南  由于参会人员较多,大会组委会不安排车辆接送。请代表自行乘车抵达报到地点,望参会代表谅解。  十、注册须知  1.请与会代表携带本人身份证,学生代表需携带学生证。已交费代表请带好汇款凭证,以备核对。  2.注册代表权益:  正式代表和学生代表,可以参加会议组织的所有活动、注册费包括会务费、资料礼品费、会议安排旅游及7月29日—31日早餐、午餐和晚餐费用。  十一、会议地址和住宿宾馆   会议地址:江苏省泰州市扬子江药业集团海燕大酒店(江苏省泰州扬子江南路1号)   邮编:225300   住宿安排:海燕大酒店——标准间280元/天,单人间280元/天,  扬子江大酒店——标准间160元/天(距会场5分钟车程,会议期间班车接送)  十二、学术发言及证书登记  大会和分会发言及壁报交流的参会代表,请在注册当日(2009年7月27、28日)将报告材料或壁报资料(国际标准大小1.0m×1.2m)交至大会学术组,报告材料须为Powerpoint文件,一律要求英文准备,存储于移动硬盘、USB闪盘或光盘之中,大会提供笔记本电脑和幻灯放映设备,不接受个人电脑接入。如有特殊需求,请提前与大会学术组联系。大会发言鼓励使用英文,如有不便可使用中文。  论文被录用的参会代表可登记领取会议论文证书,所有参会代表可登记领取学分证书。  十三、旅游及定票须知  大会组委会设有旅游票务组专门负责参会代表的旅游及定票事宜。  组委会指定旅行社负责组织本次会议的会后(7月31日)旅游,会议期间请参会代表尽量不要安排旅游活动。旅游费用现场交纳并开具发票。军人和学生代表请携带相关证件,可享受门票优惠。  请参会代表至少提前两周提交返程票务预定单(附件二),否则组委会无法保证其预定。费用现场交纳,预订火车票须加收手续费,预订飞机票需向秘书组告知姓名及身份证号,不加收任何费用。  参会代表在注册报到时,须在旅游票务组登记确认自己的旅游和返程票务事宜,并交纳费用。会议期间如有问题,请随时与旅游票务组或大会秘书处联系。  十四、退费说明:  已交费的参会代表因个人原因不能参会或其他原因需要退款,请提前与会务组联系。退费原则:7月1日前退还所交款项的80%,7月1日~26日退还所交款项的50%,7月27日及以后恕不退款。(已预订火车票者扣除票价退票费和手续费后进行退费)  十五、联系方式  会议回执和论文发送或邮寄至:  第六届中国蛋白质组学大会会务组  电话:010-80705188 80705116 80705166  传真:010-80705155  E-mail:cnhupo6@163.com  地址:北京昌平区科学园路33号北京蛋白质组研究中心  邮编:102206  *请注明:“蛋白质组学大会”  注册费汇至:  帐 户:中国人民解放军62032部队  开户行:北京工商行永定路支行  帐 号: 0200004909008520585  * 务必注明:蛋白质组学大会*(汇款前请先打电话联系,汇款后将汇款凭据传真至我处,以确保汇款安全到帐)  十六 、附件  附件1:第一轮通知回执   附件2:返程票务预订单  附件3:论文摘要模板。  第六届中国蛋白质组学大会秘书处  二OO八年十二月一日  附件1  第六届中国蛋白质组学大会  第一轮通知 回 执  姓名: 性别: 职称: 联系电话:  工作单位: 传真:  通讯地址: 邮编:  E-mail: 参加会议: 是 □ 否 □  论文摘要题目:  所属专业:系统生物学□ 疾病蛋白质组学□ 功能蛋白质组学□  药物蛋白质组学□ 结构蛋白质组学□ 蛋白质化学□ 生物信息学□  蛋白质修饰和相互作用□抗体相关技术□ 蛋白质组微分析□ 蛋白质芯片□  蛋白质组新技术新方法□ 其他□  拟作报告形式: 大会报告 □ 分会报告 □ 墙报 □ 参加技术培训: 是 □ 否 □  住宿标准:  海燕大酒店  (四星)标准间单人间  280元/天280元/天  扬子江大酒店  (三星)标准间  160元/天  选择房间类型:  海燕大酒店 标准间□ 单人间□  扬子江大酒店 标准间□  入住时间: 月 日~ 月 日  参加会议者请将回执于2009年5月31日之前发送或邮寄至:  E-mail: cnhupo6@163.com  投稿地址:北京昌平区科学园路33号北京蛋白质组研究中心第六届中国蛋白质组学大会收  邮编:102206  附件2  返程票务预订单  返程日期航班号  (车次)目的地代表签字  备注  附件3  Identified the nonspecific binding proteins in depletion of Albumin and IgG from Human plasma  Wang Yundan1, Ning Yunshan1,3, Jiang Yin2, Deng Xinyu2, Fang Qinmei2, Hong Yanhua3,  Li Ming1,3  1 College of Biotechnology, Southern Medical University, Guangzhou, P. R. China, 510515  2 Beijing Institute of radiation Medicine, Beijing, P. R. China, 100850  3 Boang Antibody Company, Shanghai, P. R. China, 200233  tommy604@fimmu.com  Depletion of high abundant proteins in plasma samples was necessary for the further study of new biomarkers mining in HPPP. We used the high specific mouse mAb against human albumin and Protein G to remove Albumin and IgG respectively from human plasma in denatured condition and native condition. We observed the different capacity of depletion in the presence of chaos reagents, non-ionic detergent and high concentration of salts. In native condition, the elution proteins were separated by 2DE and 104 spots in the gel were excised and trypsin digested for tandem mass spectrum (MS/MS) analysis. The binding proteins including Albumin, IgG, Fibrinogen, Vitamin D binding protein, Alpha-1 antitrypsin, transferrin, Transthyretin, Proapolipoprotein, Keratin, Complement component 3. The remained spots are albumin and IgG fragments. In denatured condition, the capacity of depletion for albumin become lower but IgG not affected. The concentration of nonspecific binding proteins including the fragments of Albumin in elution sample was lower. The results may explain the relation between low non-specific binding and presence of albumin fragments in condensed plasma samples processed by MARC or MARS system using commercial buffer.  Keywords:  High abundant protein / Depletion / 2-DE / MS / Nonspecific / Human plasma protein / Monoclonal antibody / Denature  References  1. Huang, H. L., Stasyk T., Morandell, S., Mogg, M., et al., Electrophoresis 2005, 26, 2843-2849  2. Anderson, N. L., Polanski M., Pieper, R., Gatlin, T., et al., Molecular & Cellular Proteomics 2004 Apr 3(4):311-26.  3. Shen, Y. F., Kim, J. K., Strittmatter, E. F., Jacobs, J.M., et al., Proteomics 2005, 5,4034-4045  4. Omenn, G. S., States D. J., Adamski M., Blackwell T. W., et al., Proteomics 2005, 13, 3226-3245
  • 徕卡精准空间生物学解决方案 第一弹
    空间生物学背景介绍 空间生物学(Spatial Biology)是一门涉及生物组织内细胞和结构的空间排布以及它们在三维空间中相互关系和相互作用的学科。这种研究方法探索了细胞和组织在空间中的布局、分布和相互联系,以揭示生物体内的复杂生物过程和功能。 传统的生物学研究主要关注细胞和分子水平的功能和相互作用,但忽略了细胞和组织的空间信息。然而,细胞和组织在组织结构中的位置和相互关系对于其功能和行为至关重要。在组织内,相同类型的个体细胞可能因其微环境的变化而表现出不同的行为。转录组学和蛋白质组学方法,例如质谱、测序,通常只提供有限区域的信息,往往难以拼凑起来。相反,基于显微成像的技术可以使研究人员能够从整体上观察蛋白质和其他生物标志物,并在单个细胞水平上进行跟踪,以更好地理解整个组织全貌。 空间生物学研究的重要工具包括多色成像技术、高分辨率显微成像技术、3D图像重建和分析软件等。通过这些技术,研究者可以同时可视化和分析多种生物标志物或分子在组织中的空间分布,进而了解细胞类型的分布、细胞内信号传递的网络、细胞迁移和组织重塑等重要过程。 在医学研究中,空间生物学的应用极为广泛。例如,在癌症研究中,了解肿瘤内不同类型的细胞和细胞间的相互作用可以为癌症的早期诊断、治疗策略和预后评估提供重要信息。在神经科学中,通过揭示神经元的空间排布和连接方式,我们可以更好地理解大脑的功能和神经系统疾病的发生机制。在免疫学领域,研究细胞在淋巴器官或感染部位的空间分布和相互作用可以提供有关免疫应答的重要见解。 总而言之,空间生物学为我们提供了在细胞和组织层面深入研究生物系统的能力。通过空间分析和定量测量,我们能够更好地理解生物体内的结构和功能,促进疾病诊断和治疗的进步,并为药物开发和治疗策略的优化提供新的见解。通过空间生物学的研究,我们可以揭示生物体内的奥秘,并为解决重大生物医学问题做出贡献。 徕卡精准空间生物学解决方案 徕卡显微系统精准空间生物学解决方案提供从样本取材,到H&E成像、多色荧光成像、超多色荧光成像到图像分析,再到激光显微切割技术连接下游的精确分析技术(如质谱等),从整体到微观,覆盖基因组、蛋白组和代谢组学领域,解析生物体的结构、功能和疾病。 点击此处申请样机试用 相关产品 超多标组织成像分析整体解决方案 Cell DIVE AI图像分析软件 Aivia 徕卡显微咨询电话:400-630-7761 关于徕卡显微系统 徕卡显微系统的历史最早可追溯到19世纪,作为德国著名的光学制造企业,徕卡显微成像系统拥有170余年显微镜生产历史,逐步发展成为显微成像系统行业的领先的厂商之一。徕卡显微成像系统一贯注重产品研发和最新技术应用,并保证产品质量一直走在显微镜制造行业的前列。 徕卡显微系统始终与科学界保持密切联系,不断推出为客户度身定制的显微解决方案。徕卡显微成像系统主要分为三个业务部门:生命科学与研究显微、工业显微与手术显微部门。徕卡在欧洲、亚洲与北美有7大产品研发中心与6大生产基地,在二十多个国家设有销售及服务分支机构,总部位于德国维兹拉(Wetzlar)。
  • 德国元素开辟成果转化通道,助力产学结合
    正如二十大报告中反复强调的“必须坚持科技是第一生产力、人才是第一资源、创新是第一动力”。高等科研院校作为创新工作的第一阵地,却一致受制于机制以及市场信息匮乏的困扰,这也使得大量高新技术长期处于“酒香就怕巷子深”的难题当中。特别是在全球化的背景下,如何开辟成熟的成果转化通道,助力高质量的产学结合,一直都是各个国家科技发展相关政策中的重中之重。拥有125年悠久历史的百年老店——德国元素,为国内外相关科研院校提供可靠的无机碳硫氧氮氢分析仪,助力高质量的产学结合。汽车发动机为汽车提供动力,被称为汽车的“心脏”。而生产发动机零件的高端数控机床,对工艺性能要求极高。建立于1877年的德国达姆施塔特工业大学生产管理学院的工业机床技术系(PTW)则一直致力于开发用于未来生产中的一体化生产方案,通过与3D打印技术相结合,使得人们可以获得更加高效的生产环境。正因如此,PTW采购了两台来自于德国元素的 无机元素分析仪:inductar CS cube 红外碳硫仪和inductar ONH cube 氧氮氢分析仪,用于增材制造中金属粉末成分的分析,优化质控环节。Jana Harbig,达姆施塔特工业大学的研究助理来自于PTW的研究助理Jana&emsp14 Harbig给予了德国元素很高的评价:“感谢PTW使用来自于德国元素的仪器,QAMEA项目有潜力增加增材制造的正本效率和资源效率。”在国内,高等科研院所通过赋权的形式,帮助科研成果转化走出了最关键的一步。在这种模式下,创业公司,社会资本与高等科研院所紧密联系,避免了从实验室进入工程化阶段的死亡之谷。西北工业大学太仓长三角研究院作为科研领域的排头兵,多年来专注于核工业以及航空航天金属材料的研究,采购了来自于德国元素的无机元素分析仪:inductar CS cube 红外碳硫仪和inductar ONH cube 氧氮氢分析仪为其在材料元素分析方面的工作保驾护航。在科研成果转化链条中的另一端——需求端,相关企业对于科研产品的质量控制分析要求极高。正如《焦点访谈》采访德国元素的老客户江苏集萃先进金属材料研究所有限公司(INMAT)时所提到的,“在搭建中试平台中,需要在上面反复进行工程化、小批量精准验证”。INMAT采购了来自于德国元素的无机元素分析仪:inductar CS cube 红外碳硫仪和inductar ONH cube 氧氮氢分析仪用于高温合金中的碳硫氧氮氢分析。inductar CS cube 红外碳硫仪应用领域:黑色系金属合金,有色金属,有色金属,碳化物及陶瓷材料,地质矿物,电极材料的碳硫分析。特点:创新性坩埚设计,无需动力气清洁型燃烧(低灰尘和尘屑),无需外接吸尘器加热的除尘过滤器,配备了高效的风冷水冷装置可自由程序变化输出功率的感应炉 可自由程序变化的注氧流速燃烧过程可由光学摄像系统观察专利球夹设计,实现免工具维护inductar ONH cube 氧氮氢分析仪应用领域:黑色系金属合金,有色金属,有色金属,碳化物及陶瓷材料,地质矿物,氧氮氢分析。特点:无需配备石墨电极清扫刷进行清扫,提高做样效率可编程气体分流,通过睡眠模式进入省气模式无需配备动力气以及外置水冷机,可单坩埚完成测试,节省成本专利的球夹连接,实现免工具维护
  • 科研人员制备稳定钙钛矿纳米晶体,可使LED灯成本更低/寿命更长
    据外媒报道,发光二极管(LED)是照明行业的无名英雄。它们运行效率高,散发的热量少,持续时间长。现在,科学家们正在研究一种新材料以使LED在消费电子、医药和安全领域的应用变得更有效且寿命更长。来自美国能源部(DOE)阿贡国家实验室、布鲁克海文国家实验室、洛斯阿拉莫斯国家实验室和SLAC国家加速器实验室的研究人员报告称,他们已经为此类LED制备了稳定的钙钛矿纳米晶体。来自中国台湾地区的研究院也在这项研究中做出了贡献。钙钛矿是一类具有特殊晶体结构的材料,具有吸光和发光的特性,在一系列节能应用中非常有用,包括太阳能电池和各种探测器。虽然钙钛矿纳米晶体是一种新型LED材料的主要候选材料,但在测试中证明其不稳定。研究小组将纳米晶体稳定在多孔结构中,这种多孔结构被称为金属有机框架,简称MOF。基于地球上丰富的材料并在室温下制造,这些LED有朝一日可能会使成本更低的电视和消费电子产品以及更好的伽马射线成像设备,甚至是用于医学、安全扫描和科学研究的自供电X射线探测器。“我们通过将钙钛矿材料封装在MOF结构中来解决其稳定性问题,”DOE用户设施办公室Argonne的奈米材料中心(CNM)的科学家Xuedan Ma说道,“我们的研究表明,这种方法使我们能大幅提高发光纳米晶体的亮度和稳定性。”美国洛斯阿拉莫斯大学前J. R. Oppenheimer博士后Hsinhan Tsai补充称:“在MOF中结合钙钛矿纳米晶体的有趣概念已经以粉末形式被证明,但这是我们首次成功地将其集成为LED的发射层。”之前试图制造纳米晶体LED的尝试被纳米晶体降解回不需要的体积相所阻碍,这使其失去了纳米晶体的优势并削弱了它们作为实用LED的潜力。大块物质由数十亿个原子组成。像钙钛矿这样的材料在纳米阶段是由几个到几千个原子组成的,因此表现不同。在他们的新方法中,研究小组通过在MOF的矩阵中制造纳米晶体来稳定纳米晶体,就像网球被铁丝网夹住一样。他们使用框架中的铅节点作为金属前体,卤化物盐作为有机材料。卤化物盐的溶液中含有甲基溴化铵,它跟框架中的铅反应并在基体中的铅核周围组装纳米晶体。由于基质会使纳米晶体保持分离,所以它们不会相互作用和降解。这种方法是基于一种解决方案涂层的方法,比目前广泛使用的用于制造无机LED的真空处理要便宜得多。MOF稳定的LED可以制造出明亮的红色、蓝色和绿色光以及每种光的不同色调。洛斯阿拉莫斯国家实验室综合纳米技术中心的科学家Wanyi Nie说道:“在这项工作中,我们首次证明了在MOF中稳定的钙钛矿纳米晶体将创造出各种颜色的明亮、稳定的LED。我们可以创造不同的颜色、提高颜色纯度并提高光致发光量子产量,这是一种衡量材料发光能力的指标。”该研究小组使用先进光子源(APS)--DOE位于阿贡的科学用户设施办公室--进行时间分辨X射线吸收光谱分析,这项技术使他们能发现钙钛矿材料随时间的变化。研究人员能跟踪电荷在材料中移动的过程并了解光发射时发生的重要信息。“我们只能通过APS强大的单个X射线脉冲和独特的时间结构来实现这一点,”阿贡X射线科学部的小组负责人Xiaoyi Zhang说道,“我们可以追踪带电粒子在微小钙钛矿晶体中的位置。”在耐久性测试中,该材料在紫外线辐射、热和电场下表现良好且不会降解并失去其光探测和发光效率,这是电视和辐射探测器等实际应用的关键条件。
  • 干血斑分析技术进展与应用——基于干血斑的蛋白质分析技术
    干血斑(Dried Blood Spot, DBS)是一种微量血液采集、干燥和储存的生物采样技术。该技术由Robert Guthrie于1963年首次应用于新生儿苯丙酮尿症(PKU)筛查[1]。相比于临床检验中常用的液态血液基质,干血斑技术具有采血量少、操作简便、一般不需冷冻或冷藏、储存和运输成本低等优点,已应用于新生儿疾病筛查、流行病学样本分析、药物研发等领域。将干血斑应用于蛋白质研究,拓宽了蛋白质分析研究的生物样本采集形式,具有很好的临床研究和实际应用价值。本文重点讨论两种常见干血斑蛋白质分析技术及应用。1. 基于干血斑的蛋白分析技术1.1 酶联免疫吸附分析法原理:酶联免疫吸附分析法(ELISA)是指将可溶性的抗原或抗体结合到聚苯乙烯等固相载体上,利用抗原抗体特异性结合,进行免疫反应的定性和定量分析,具有灵敏、特异、及易于自动化操作等特点。根据免疫识别和信号输出方式的不同,ELISA可以分为双抗体夹心法、直接免疫竞争法和非直接免疫竞争法等。实验材料及分析仪器:研究人员可通过购买固相载体、抗体或抗原进行包被制备ELISA试剂盒或购买市售试剂盒。酶联免疫吸附测定试剂盒已成为实验中不可缺少的工具,目前国内外Elisa试剂盒生产厂家很多,如上海酶联生物、Abcam、BioVision等,科研人员可根据研究需求选择高质量的试剂盒品牌,以提升分析效率及结果有效性。干血斑处理:以干血斑HIV分析为例:用HIV阴性混合血液样本对阳性混合血液样本进行梯度稀释后,以固定体积点样至干血斑收集卡,室温下干燥。采用干血斑打孔设备获得一定直径的干血斑样片,用300 μL PBST(0.05% Tween20)室温静置洗脱,洗脱液经酶标仪测定样本吸光度值(OD值)。分析和结果处理:以标准曲线样品的浓度为横坐标,以测得的OD值为纵坐标,根据不同类型ELISA本身的特点拟合标准曲线(如竞争法和夹心法可以采用四参数拟合回归方程),选择R值大于0.99的拟合方式,并根据标准曲线计算样品浓度。分析仪器:酶标仪(MicroplateReader)即酶联免疫检测仪,是对酶联免疫检测(EIA)实验结果进行读取和分析的专业仪器。酶标仪可分为普通酶标仪和多功能酶标仪,普通酶标仪的主要功能一是充当分光光度计的角色,二是基于免疫反应的ELISA分析,价格相对较低;多功能酶标仪可实现吸光度、荧光强度、时间分辨荧光、荧光偏振和化学发光等多种检测模式拓展,满足生化分析、免疫检测、细胞研究、药物筛选和机制探索等众多领域检测需要。目前酶标仪市场常用的仪器品牌进口的有:伯腾、帝肯、美谷分子、珀金埃尔默和赛默飞等;国产的有:安图生物、奥盛和闪谱等。1.2 基于质谱技术的蛋白质分析技术基于质谱(Mass Spectrometry, MS)技术的蛋白质分析方法具有高通量、自动化程度高、分离能力强等特点,已逐渐成为蛋白质分析和鉴定的重要技术。原理:蛋白酶将样本中的蛋白质消化成肽段混合物,可采用鸟枪法(Shotgun)对蛋白组进行全谱分析,在最小限度分离蛋白质的同时实现复杂混合物中成千上万种蛋白质的鉴定和定量;或用液相色谱法(Liquid Chromatography, LC)对酶解肽段进行分离,经基质辅助激光电离(MALDI)或电喷雾电离(ESI)等软电离技术将其离子化,带电蛋白质离子通过质量分析器将具有特定质荷比的肽段离子分离,然后经检测器分析。质谱技术与干血斑技术的结合为蛋白质组学研究和蛋白生物标志物筛选提供了强有力手段。图1 基于质谱技术的蛋白质组学分析流程[2]样本处理:采用干血斑打孔设备获得一定直径的干血斑样片,转移至EP管中,加入少量水后用组织研磨器或匀浆机快速、彻底破碎干血斑样片,剧烈摇晃试管。后续处理与常规样本的蛋白提取相似:加入蛋白裂解液(如SDS、SDC、RIPA等),冰上裂解约半小时(辅以震荡),低温、高转速离心后取上清,得干血斑蛋白提取物。分析和结果处理:蛋白质组学数据分析和结果处理包括:①应用数据库搜库对蛋白进行鉴定并相对定量分析,借助如主成分分析、相关性分析、聚类分析等方法掌握数据的整体情况;②对蛋白的生物学功能进行注释,例如GO功能注释、KEGG注释等;③通过蛋白的生物学功能或参与的信号通路可以进一步筛选与研究目标相关的蛋白进行后续的分析。分析仪器:蛋白质组学分析主要使用高分辨液质联用系统进行。可进行蛋白质组学分析的液质联用系统目前以进口为主,常见仪器主要有布鲁克、赛默飞、沃特世和SCIEX的Q-TOF、Q-Orbitrap、Q-Trap质谱仪等。2. 干血斑蛋白分析应用实例分享2.1 采用ELISA法分析干血斑中HIV抗体1996年美国食品药品监督管理局(FDA)批准了以干血斑为载体的样本邮寄传递检测模式,并证明其可作为传统检测模式的良好补充,极大地推动了干血斑技术在传染性疾病分析中的应用。在我国,全国艾滋病检测技术规范(2020年修订版)第二章第4部分“常规HIV抗体或HIV抗体抗原联合检测方法”中指出:ELISA试验可使用血液(包含血清、血浆和干血斑)或尿液样本检测HIV抗体,也可联合检测HIV抗体抗原,说明干血斑在基于ELISA技术的HIV抗体检测中是可代替血浆、血清的生物样本基质,具有广阔的应用前景。近年来,相关专家多推荐受检者使用HIV自主采样包,根据说明采集干血斑样本,匿名寄至专业实验室,通过电话等方式获取结果。图2 RDA Spot公司的干血斑自主采样包(包含一次性采血针,消毒湿巾,样本采集卡,使用说明书及用于运输的特殊包装)图片来源:https://www.rdaspot.com/2.2 基于质谱技术的干血斑蛋白质组学分析研究人员建立了应用Thermo UltiMate 3000 RSLCnano纳升液相色谱联合Q Exactive HF-X质谱技术的干血斑蛋白质组学分析方法,并于2020年在Journal of Proteome Research中报道了该项工作[3]。由于全血中含有较多可溶性蛋白(如血红蛋白、白蛋白、纤维蛋白原等),研究人员为克服干扰、提高分析灵敏度,采用碳酸钠沉淀法(SCP)成功去除干血斑中可溶性蛋白并富集目标分析物疏水性蛋白。采用基于数据非依赖采集模式(DIA)的蛋白质组学分析方法,进行EMBL-EBI(针对人类蛋白GO功能分析的综合注释数据库)蛋白组学搜库分析,通过限定质谱扫描范围和延长离子累积时间等提高了分析方法的检测灵敏度。该研究最终在健康受试者干血斑样本中鉴定到1977种蛋白质,其中包含585种疾病相关蛋白。3. 小结与展望干血斑是一种先进的血液采集及保存技术,具有操作简单、对人体损伤小、便于运输和储存等优势,在临床快检中受到关注。干血斑技术与蛋白质研究的结合将有效推动蛋白质研究成果临床转化。随着分析技术的发展和相关研究的不断深入,前处理自动化仪器、高通量分析仪器和成熟的蛋白分析流程将成为干血斑蛋白质分析的有力工具,干血斑蛋白质分析定将在蛋白质分析中发挥重要作用,为高通量诊断、差异蛋白分析和疾病生物标志物挖掘等拓展新的技术平台。参考文献:[1] R. Guthrie, & Susi, A., A Simple phenylalanine method for detecting phenylketonuria in large populations of newborn infants., Pediatrics, 32 (1963) 338–343.[2] B. Kuster, M. Schirle, P. Mallick, R. Aebersold, Scoring proteomes with proteotypic peptide probes, Nature Reviews Molecular Cell Biology, 6 (2005) 577-583.[3] D. Nakajima, Y. Kawashima, H. Shibata, T. Yasumi, M. Isa, K. Izawa, R. Nishikomori, T. Heike, O. Ohara, Simple and sensitive analysis for dried blood spot proteins by sodium carbonate precipitation for clinical proteomics, Journal of proteome research, 19 (2020) 2821-2827.
  • 阿蛋学仪器 | 古龙版 绝杀色谱柱篇
    广州绿百草推出全新连载短篇小说【阿蛋学仪器】,不定期的跟大家讲述关于学渣阿蛋在工作后不得不学习仪器知识的苦逼经历。夸张的剧情下都是以现实为原型,记得准时关注哦!阿蛋学渣,毕业于某大学化学院。屌丝男一枚,无才无貌,不文艺也不爱运动,五音不全,唯一的爱好是LOL。 来来,我是一支柱子, 子子子子子子子子子子子子子子子子子子; 来来,我是一个烧杯, 杯杯杯杯杯杯杯杯杯杯杯杯杯杯杯杯; 来来,我是一段管路, 路路路路路路路路路路路路路路路路路路; 来来,我是一个屁可, 可可可可可可可可可可可可可可可可; 来来...... 日月无光,只有云,黑云。月黑杀人夜,风高放火时,阿蛋站在屋内,身上却散发着阵阵寒气...... 看了看手上的表,银灰色,时针正指着12,分针指着6,哦,对不起,表坏了阿蛋似乎等着某个人,而这个人迟迟没来,地上是留下的烟头,一些还留有忽明忽暗的火星,显然是刚刚留下的,如果每个烟头需要4分钟,那他已等了300分钟了 “难道他不来了?”“答~答~”, 脚步声。 老者, 一个孤独的老者, 头发零乱,衣衫褴褛。 但他不是乞丐。 因为眸子中的杀气, 让你知道这决不是一个乞丐。 “你是?”阿蛋窃窃的问道“工头”“是来招人的吗?”“你叫什么”“阿蛋”“会做什么?”来人一脸不耐烦。“HPLC”他懦懦的答道。“什么!你会HPLC”他心中一惊,脸上笼了一层寒气。迅速打量眼前这个青年,20岁上下,目光呆滞,怎么看也不象会HPLC的,“我只会HPLC”他的声音越来越小了“30年前,广东的胖##失踪以后,就再没人能做过HPLC了”老者暗想难道这就是偶们色谱界的救星?“你跟我来”说完,老者向前走去,阿蛋乖乖地跟在后面,生怕跟掉了。 西安路西, 三十米, 洋槐掩映着一条小路。 路是水泥路, 很多年没有修了。 路左扒开了一段, 散发着泥土的腥气。 路的尽头, 是一处铁锁罩着的大门。 并没有门卫。,门上悬着块匾额, 油漆已经斑驳了, 却依稀可辨“##检疫局”几个大字。 老者推门进去,两台深灰色的仪器正摆在迎面的石台上,屋内已是蛛网遍布,地面上方砖已开裂,石台上已布有青苔,“这仪器是510的泵,480的检测器,这泵流速可大可小,检测器你可以正放也可以倒着放,电脑也够牛,是最新的奔二处理器,它的电源很厉害,你不按它它就不亮!再看这柱子,色谱柱是最高级的进口原装柱,长30m,重2两七钱......”“这个柱子不能用!”阿蛋来到了实验室终于恢复了镇定“为什么?”老者吃惊的望着阿蛋“这是GC色谱柱” 阿蛋冷冷的说道“啊?你手未摸过,也没有拆开,你凭什么说它是GC色谱柱?”“HPLC柱和GC柱的区别,可看它们的内径和材质,HPLC粗而GC细,最关键一点,HPLC长度从来没有过30m长!”阿蛋盯着GC柱,信心满满。 “哈哈,果然是高手,说的这么专业,厉害!”老者无奈去拿HPLC柱子,只见他在房间的电灯开关上,左扭10下,又右扭了8下,这时一暗隔露了出来,只见一方形的一米见方的纸盒,打开后又是一个盒子,这样陆续拿掉10曾盒子,终于见到了一个小黑色盒子,老者使手掂了掂,感觉颇有分量。阿蛋忙凑前,只见上面写着几个镏金大字“高效液相专用色谱柱!” 阿蛋庄重接过这个盒子,小心翼翼拿出色谱柱,色谱柱,这可不是普通的柱子,长25公分,直径46毫米,重四两三钱,灰银色表面,刺目的光芒,它最奇异的功能是能分离化学样品,当年第十次色谱代表大会评比天下分离道具,此物排名第四! 阿蛋顿时茫然,暗想:不好,此老者宝物齐备,为何大老远招我前来,莫非有诈? 顿时一股凉汗袭来,一阵酥麻,阿蛋眼前一黑,昏了过去......就这样昏昏沉沉不知过了多少时日,阿蛋感觉到了光明,难道已来到了天堂?正纳闷时老者凑上前来,“阿蛋啊,你好点了吗,昨天你怎么自己看着柱子就晕倒了啊,以后不许抽那么多烟啊”阿蛋这时才明白,老人是救命恩人,昨天的疑虑打消了,问老者“您物品齐备,为何自己不做HPLC呢?”“都是该死的仪器,接柱子总漏夜啊!” “哦。原来是这样啊!”阿蛋拿出PEEK接头,和切管器,切掉了不锈钢接头,轻松扭上了PEEK接头,实验终于正常了!(做实验要注意管路接口问题哦:)想知道阿蛋后续又有怎样的遭遇?记得持续关注广州绿百草微信公众号~我们会不定期推出续集哦~关注广州绿百草微信公众号,获取更多资讯!
  • 首届中国计算蛋白质组学研讨会第一轮通知
    The First China Workshop on Computational Proteomics (CNCP2010)  2010年11月10日至11日, 北京  一.会议简介  随着蛋白质组学的兴起,特别是质谱技术的快速发展,蛋白质组学研究中产生的数据规模越来越大。依靠简单的手工处理已经远远不能满足问题的需求,通过先进的计算机算法与软件工具来自动处理大批量的蛋白质组数据已经成为蛋白质组学研究的重要分支,这就是“计算蛋白质组学”(Computational Proteomics)。  “计算蛋白质组学”是以计算技术为主要手段,通过开发高效的算法和实用的软件工具来处理大规模的蛋白质实验或模拟数据,解决蛋白质组学研究中的蛋白质鉴定、翻译后修饰分析、蛋白质定量、蛋白质相互作用、蛋白质定位、蛋白质结构或蛋白质动力学等领域中的问题。我国的计算蛋白质组学与国际基本处于同步的发展态势,特别是最近十年内在中国蛋白质组学项目的驱动下,计算蛋白质组学的研究发展迅速。  为了推动计算技术在中国的蛋白质组学研究中发挥出更加切实的作用,由中国科学院计算技术研究所主办的“首届中国计算蛋白质组学研讨会”将于2010年11月10日至11日在北京召开,为了更好地促进国内的学术交流,本会议不收取注册费,并对按时返回会议回执(10月8日前)的代表免费提供会议期间的餐饮。欢迎从事与计算技术和蛋白组学研究相关的科研人员和研究生参加。  二.研讨内容  会议主题:计算蛋白质组学  研讨内容:  质谱数据分析  蛋白质鉴定  翻译后修饰  蛋白质定量  蛋白质相互作用  蛋白质定位  蛋白质结构  蛋白基因组学等  三. 邀请专家  11月10日和11日两天全天为邀请专家作大会报告,本次会议不征文,只设邀请报告。确认参会的部分专家名单如下,报告题目将在第二轮通知中发布。  关慎恒 美国加州大学旧金山分校  曾嵘 中国科学院上海生命科学研究院  钱小红 北京蛋白质组研究中心  朱云平 北京蛋白质组研究中心  徐平 北京蛋白质组研究中心  应万涛 北京蛋白质组研究中心  刘斯奇 中科院北京基因组研究所  董梦秋 北京生命科学研究所  陈涉 北京生命科学研究所  张学工 清华大学  江瑞 清华大学  高友鹤 中国协和医科大学  邵晨 中国协和医科大学  杨芃原 复旦大学  陆豪杰 复旦大学  谢鹭 上海生物信息中心  邹汉法 中科院大连化学物理研究所  叶明亮 中科院大连化学物理研究所  何庆瑜 暨南大学  王 通 暨南大学  马斌 加拿大滑铁卢大学  余维川 香港科技大学  孙瑞祥 中科院计算所  付岩 中科院计算所  卜东波 中科院计算所  张法 中科院计算所  赵屹 中科院计算所  四.会前培训  为了使参会人员能够获得有关蛋白质组质谱数据分析的基本技能,同时了解到本学科发展的最新动态,我们有幸邀请到美国加州大学旧金山分校的关慎恒老师,他将为参会人员作如下内容的培训讲座。关于关老师的详细介绍,可参见:  http://ms-facility.ucsf.edu/staff/guan.html  11月8日上午:质谱技术与蛋白质组学基础  11月8日下午:蛋白质组信息学  11月9日上午:翻译后修饰与定量技术  11月9日下午 蛋白质定量与从头测序(De Novo)分析软件  关老师的技术培训讲座后还有来自中科院计算所在分析质谱数据方面富有经验的人员作数据库搜索、从头测序(De Novo)与蛋白质定量分析的算法与软件培训。从基础入手,手把手教如何分析质谱数据。推荐参加培训的人员带上个人笔记本电脑,可以实地实时操作软件,现场体会分析质谱数据的乐趣。  本培训自愿报名,培训费用学生为500元(报到时需提供学生证),其他人员为800元,培训费包含培训讲义资料、优盘、分析数据和软件、两天的工作餐等,培训费现场缴纳。  五.会议回执  请于10月8日前将本回执发送到CNCP2010@ict.ac.cn, 邮件标题为:  CNCP2010回执(姓名)。鉴于已经预订的会场座位有限,10月8日之后返回回执者,请见谅我们无法确保您的座位安排。姓名 性别 职称 电话 手机 E-mail 单位 2住宿选择: A.燕山酒店B.天创宾馆C.自行安排单人间还是合住: 是否参加11月8日和9日的两天培训 是否需协助预订返程票(如需要请提供信息) 预计到会时间11月 日 预计离会时间11 月 日   1. 如为学生,请注明硕士生/博士生  2. 燕山酒店: 四星,标准间约 450元/天,单人间约400元/天(均含早餐和上  网),距离会场约15分钟车程(有专车每天接送)   天创宾馆:标准间约198元/天(含早餐和上网,优先学生预订), 到会场步行约5分钟。  六.联系我们  会议网站: http://cncp2010.ict.ac.cn  联系邮件: CNCP2010@ict.ac.cn (尽量邮件联系)  联系电话: 010-62601352 任菲 刘玉东  会务组织: 中国科学院计算技术研究所pFind研发组
  • 第七届中国蛋白质组学大会第一轮通知
    为积极促进蛋白质组学的研究与发展,增进国际间合作交流,由中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会(CNHUPO)和国际蛋白质组学论坛(IFP)主办,北京蛋白质组研究中心、国际蛋白质组学论坛组委会及浙江大学共同承办的第七届中国蛋白质组学大暨第三届国际蛋白质组学论坛定于2011年4月15日—18日在浙江省杭州市召开。  一、会议安排  本届会议设有大会报告、分会(专题)报告和墙报三种形式。大会将邀请蛋白质组学及相关领域的国际著名专家和教授作大会报告或专题报告,会议规模约1000人左右。  拟邀请专家:路甬祥、陈 竺、沈 岩、饶子和、王红阳、贺福初  Roger Y. Tsien (诺贝尔奖获得者,UCSD, USA)  Eric Topel (美国科学院院士(IOM-NAS),TSRI, USA)  大会安排2011年4月15日上午举办“蛋白质组学新技术培训”,4月15日下午举办“国际蛋白质组学论坛” 4月16-18日召开“第七届中国蛋白质组学大会”。  会议同时举办与生物化学与分子生物学、蛋白质组学等研究领域相关的仪器、设备、试剂和新技术的展览、展示会。  二、会议议题   蛋白质组学与转化医学   蛋白质组与基因组的对接   蛋白质组信息学   可视化蛋白质组   药物蛋白质组学   人类蛋白质组计划   疾病蛋白质组学   功能蛋白质组学   蛋白质组新技术新方法  三、会议语言  英文  四、会议组织  组织单位  主办单位:中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会(CNHUPO)  国际蛋白质组学论坛(IFP)  承办单位:北京蛋白质组研究中心 国际蛋白质组学论坛 浙江大学  主 席:贺福初,Ping Peipei,段会龙  学术委员会  主 席:John Yates (TSRI, USA)  Ruedi Aebersold (ETH-IMSB)  秘 书 长:钱小红  秘书处  北京昌平区科学园路33号北京蛋白质组研究中心  联系人: 邓 宁 浙江大学  甄 蓓 北京蛋白质组研究中心  张雪莉 北京蛋白质组研究中心  电话:010-80705188 传 真:010-80705155  E-mail: cnhupo7@yeah.net  五、征文范围及要求(参照模版)  投稿论文收录入会议论文集,大会将组织优秀论文评选。参加会议代表将授予继续教育学分10分。  凡未在国内外公开刊物发表过的研究成果,均可投稿,具体要求如下:  征文范围:有关蛋白质组学及相关领域近年来研究的学术成果,以英文论文摘要形式投稿。  稿件要求:每篇论文摘要按正式发表论文要求撰写,300字以内,使用Word软件撰写。文责自负。(参照模版)  字体要求:标题—Times New Roman四号加粗  作者—Times New Roman五号居中,拟作报告者请在其姓名下方划一横线。  注:大会报告幻灯片一律要求英文准备,  单位、地址、邮编、E-mail—Times New Roman小五号居中  摘要—Times New Roman五号  参考文献(Times New Roman五号)。  投稿方式: http://IFProteomics.org投稿系统。系统将尽快开通。  E-mail: cnhupo7@yeah.net  截至日期:论文摘要投稿截至日期为2011年1月31日  六、报到时间  2011年4月14日(参加培训的人员报到时间)、15日  七、会议注册费(国内代表)  2011年1月20日前注册:1200元(人民币)/位(在读学生:900元/位)  2011年1月20日后注册:1400元(人民币)/位(在读学生:1100元/位)  技术培训费(与注册费一并交纳):200元(人民币)/位  八、注册须知  1.请与会代表携带本人身份证,学生代表需携带学生证。已交费代表请带好汇款凭证,以备核对。  2.注册代表权益:  正式代表和学生代表,可以参加会议组织的所有活动、注册费包括会务费、资料礼品费、会议安排旅游、4月16日—18日早中晚餐及4月15日晚餐费用。  九、会议地址和住宿宾馆   会议地址:浙江杭州 第一世界大酒店(浙江杭州萧山区湘湖路92号)   酒店电话:086-0571-83866888   住宿安排:浙江杭州 第一世界大酒店  五星:标准间480元/天,单人间480元/天  四星:标准间350元/天,单人间350元/天  十、学术发言及证书登记  大会和分会发言及壁报交流的参会代表,请在注册当日(2011年4月14、15日)将报告材料或壁报资料(国际标准大小1.0m×1.2m)交至大会学术组,报告材料须为Powerpoint文件,一律要求英文准备,存储于移动硬盘、USB闪盘之中,大会提供笔记本电脑和幻灯放映设备,不接受个人电脑接入。如有特殊需求,请提前与大会会务组联系。  论文被录用的参会代表可登记领取会议论文证书,所有参会代表可登记领取学分证书。  十一、退费说明  已交费的参会代表因个人原因不能参会或其他原因需要退款,请提前与会务组联系。退费原则:2011年4月1日前退还所交款项的80%,4月1日~13日退还所交款项的50%,4月13日及以后恕不退款。  十二、会后旅游  湘湖半日游:湘湖被誉为西湖的“姊妹湖”,横跨8000年的古文明。湘湖旅游度假区规划总面积51.7平方公里,恢复湖面7.5平方公里。“湘湖八景”在生态湘湖、文化湘湖的基础上,建立科学的湘湖生态系统,形成飞鸟禽鱼的乐园,营造出一处湘湖古越文化氛围。  具体旅游安排以会议第三轮通知为准。  十三、联系方式  会议网址:http://IFProteomics.org  http://www.cnhupo-congress.cn  大会会务组:  电话:010-80705188(学术) 80705166(招商)  传真:010-80705155  E-mail:cnhupo7@yeah.net  地址:北京昌平区科学园路33号北京蛋白质组研究中心  邮编:102206  *请注明:“蛋白质组学大会”  注册费汇至:  帐 户:中国人民解放军62032部队  开户行:北京工商行永定路支行  帐 号: 0200004909008520585  * 务必注明:蛋白质组学大会*(汇款前请先打电话联系,汇款后将汇款凭据传真至我处,以确保汇款安全到帐)  十四 、附件  附件:论文摘要模板.doc  第七届中国蛋白质组学大会秘书处  二O一O年六月一日
  • 雪迪龙新中标三大项目,订单金额增近两倍
    神华国华电力北京研究院有限公司一位工作人员周五透露,雪迪龙中标国华辽宁葫芦岛绥中、天津蓟县盘山和内蒙古鄂尔多斯准格尔电厂脱硝改造烟气监测系统集中招标项目。  据介绍,此次招标的是国华绥中电厂#1、#2机组,国华盘山电厂#2机组和国华准格尔电厂#4机组的脱硝改造烟气监测系统。上述四台机组共计将采购20套烟气连续监测系统(包括10套SCR入口NOx/O2监测分析系统、10套SCR出口NOx/O2监测分析系统)、10套氨逃逸监测系统和10套数据采集处理系统。由于项目进度原因,尚不能确定具体的中标金额。  一位熟悉雪迪龙的券商研究员分析,雪迪龙的脱硝监测设备销售收入占比较高,是公司的重要业务。2013年雪迪龙在手脱硝订单约3亿元,订单增速接近200%。  2012年,雪迪龙脱硝监测设备项目签订合同1.7亿元,较2011年增长344% 该项收入达8892万元,约占环境监测系统收入的40%。  上述研究员表示,雪迪龙属于环保监测仪器龙头公司,在烟气脱硫脱硝在线监测行业具备非常高的市场占有率。&ldquo 十二五&rdquo 后期,工业企业脱硝项目推进将使得监测需求逐渐释放。
  • 第一期蛋白质组学技术与应用高级培训班(第一轮通知)
    为进一步促进我国蛋白质组学技术发展及应用,北京蛋白质组研究中心、蛋白质组学国家重点实验室和中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会于2010年7月20-23日在北京中关村生命科学园联合举办“第一期蛋白质组学技术与应用高级培训班”。  北京蛋白质组研究中心(BPRC)于2004年成立,是蛋白质组学国家重点实验室的主体,是国家蛋白质组学研究基地和国际人类肝脏蛋白质组计划(HLPP)执行总部,建立了系统的具有国际先进水平的蛋白质组学技术平台,牵头承担着中国人类肝脏蛋白质组计划、国家973和863计划以及国家自然科学基金项目等100余重要科研项目。中心于2006年通过了ISO/IEC 17025(CNAS- CL01)实验室认可,以标准化的管理面向社会各界开放提供科研技术服务。  本期培训班由北京蛋白质组研究中心、军事医学科学院等国内从事蛋白质组学研究的一线专家授课,7月20-21日将就“蛋白质组学的技术与方法、实验难点与关键点、研究前沿与热点”等主题进行讲座,22-23日实验演示观摩。参加本期培训班的学员可以享受中心提供的技术服务优惠政策。  一、培训内容  (一)讲座  蛋白质组技术策略与应用概述 钱小红  蛋白质组研究中的样本制备技术 姜 颖  蛋白质组研究中的分离技术 张养军  蛋白质组研究中的鉴定技术 蔡 耘  蛋白质组研究中的数据分析技术 朱云平  SNP相关技术及应用 周钢桥  蛋白质相互作用研究技术与应用 王 建  疾病蛋白质组研究技术与应用 孙 薇  多肽组学研究进展 魏开华  蛋白质定量研究 徐 平  实验室参观:生物样本制备实验室、质谱鉴定实验室、蛋白质相互作用实验室。  (二)实验演示观摩(每项半天时间)  1、二维荧光差异凝胶电泳技术(2DE-DIGE)  在一块胶中使用三色荧光标记,同时对两个样品进行比较,大大减少了实验误差,提高了检测灵敏度和动态范围,自动分析软件简化分析流程。特别适用于入组标本例数较多,个体差异较大的差异蛋白质组比较研究。  2、色谱分离技术  结合分析型高效液相色谱、毛细管高效液相色谱以及与质谱的联用,重点介绍一般色谱系统的基本组成、各部件的基本功能、基本操作和应用中的问题及解决方法,全面了解高效液相色谱在蛋白质和多肽分离中的应用。  3、MALDI TOF/TOF质谱仪操作使用  主要包括:样品脱盐、基质配制、点靶、硬件检查与参数设置、样品表编辑、激光控制、手动采集、自动批量采集、仪器校正、二级谱采集、谱图平滑与基线处理、标峰、DataExplore操作、数据导出、数据库维护、仪器维护等。  4、液质联用质谱仪鉴定蛋白  液质联用(LC-ESI-MS)技术是针对蛋白质组学研究中复杂样本的最佳鉴定手段之一。反相HPLC连接纳升级的电喷雾离子源,以线性离子阱质谱作为手段,能够高效、准确、灵敏地连续鉴定。本期介绍实现最佳鉴定效果的关键:液相分离条件和质谱仪参数的设置,以及搜库技巧等。  二、培训特点  本次培训注重前沿技术分析,在系统梳理原理的基础上让学员掌握前沿技术 培训班在北京中关村生命科学园内举行,培训结合蛋白质组学理论讲解和实验现场演示,形成有效的技术支持 培训班针对具体技术问题可提供个性化实验设计。研讨班结束后颁发蛋白质组学培训证书。  三、时间和地点  报到:2010年7月19日9:00-18:00,20日9:00-10:00,北京海燕药业海诺康会馆(北京市昌平区生命园路16号,与北京蛋白质组研究中心隔湖相望)  讲座:2010年7月20-21日,北京海燕药业海诺康会馆  实验观摩:2010年7月22-23日,北京蛋白质组研究中心(北京市昌平区科学园路33号)  四、参加办法及培训费用  填写回执后Email/邮寄/传真至北京蛋白质组研究中心,提前注册截止日期:2010年6月18日,以银行汇款凭证为准。  培训费用包含会务费、培训资料和会期用餐。食宿统一安排,住宿费用自理,需住宿的请在回执中填写住宿信息。  (一)讲座  2010年6月18日前注册:每人1100元,学生900元   2010年6月18日后注册:每人1200元,学生1000元。  (二)实验演示观摩  2010年6月18日前注册:每人¥650元/项/半天,学生450元/项/半天   2010年6月18日后注册:每人¥700元/项/半天,学生500元/项/半天。  学生报到时须持学生证。  五、汇款信息  帐 号:0200004909200041055  账户名称:北京蛋白质组研究中心  开户银行:工商银行北京市永定路支行  注:汇款时请务必注明学员姓名、单位和“蛋白质组学培训班”字样。汇款后将汇款凭据传真至中心,或将扫描电子版发送至邮箱sky_proteomics@sina.com,以确保汇款安全到账。  六、联系方式  联系人及电话:注册:周建平(010)80705888 张雪莉(010)80705188  咨询:史冬梅(010)80727777-1520  传 真:(010)80705155  电子邮件:sky_proteomics@sina.com  通信地址:北京市昌平区科学园路33号(102206)  北京蛋白质组研究中心  蛋白质组学国家重点实验室  中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会
  • 五洲东方将参加“第七届中国蛋白质组学大会暨第三届国际蛋白质组学论坛”
    2011 年4 月15 日&mdash 18 日五洲东方公司将专程组织人员参加在浙江省杭州市举办的&ldquo 第七届中国蛋白质组学大会暨第三届国际蛋白质组学论坛&rdquo 。本届会议由中国生物化学与分子生物学会蛋白质组学专业委员会(CNHUPO)和国际蛋白质组学论坛(IFP)主办,北京蛋白质组研究中心、国际蛋白质组学论坛及浙江大学共同承办。  本届会议设有大会报告、分会(专题)报告和墙报三种形式。大会将邀请蛋白质组学及相关领域的国际著名专家和教授作大会报告或专题报告,会议规模约1000 人左右。会议主要讨论蛋白质组学研究的现状及其进展,内容包括:疾病蛋白质组学,功能蛋白质组学,药物蛋白质组学,结构蛋白质组学,蛋白质修饰和相互作用,生物信息学,抗体相关技术,蛋白质组微分析以及蛋白质组新技术新方法等研究领域。  本届会议在4 月15-17 日进行学术大会,在新技术推广会上五洲东方公司安排一个技术讲座,技术讲座详细信息如下:  时间:2011-4-15  12::45-13:50  主讲人:Mrs Wendy  职位 :CTO(Chief Technology Officer )of prospect Biosystem Inc.  题目 :The Biomarker discovery sulution  本届会议的展位号为:A5  五洲东方诚邀您的参与。
  • 孙士生:用糖蛋白质组学破译癌症的密码
    p  作为一名生长在齐鲁大地、深受儒家文化熏陶的青年学者,即便在海外求学多年,孙士生始终心系国家、情牵母校。伴随着时代的召唤,入选国家“千人计划”青年项目的孙士生毅然回到母校西北大学,希冀将他在美国掌握与研发的先进技术应用到西北这片广袤的大地上,以期为母校、为西北地区乃至为整个中国的科研水平真正实现与世界一流接轨尽一份力。br//pp  “在我看来,在西部地区开展工作有一定的好处及空间,这里受到的外界诱惑和干扰应该会相对少一些,这份安静其实对于基础科学研究颇有助益。”对于未来,“我将继续在自己擅长的方向——糖蛋白质组学和生物标志物发现研究领域开展前沿研究”,为破译人类癌症的密码贡献力量。在接受《中国科学报》记者采访时,孙士生这样表示到。/pp  和糖蛋白的缘分/pp  2005年本科毕业后,孙士生进入西北大学攻读研究生,并在那里获得了硕士和博士学位。/pp  “还在读大学的时候,我就对糖蛋白比较感兴趣。这个领域研究的人还比较少,但其实相当重要。当时教科书上关于糖蛋白的介绍还非常有限,从那时起我就开始注意搜集这方面的资料,没想到有一天还真的从事了这方面的研究。”孙士生回忆说。/pp  糖蛋白是被聚糖共价修饰的一类蛋白质,糖蛋白上的寡糖链与肽链中的特定氨基酸残基侧链以糖苷键共价连接.糖蛋白普遍存在于动物、植物,真核微生物和各种病毒表面,种类繁多,功能广泛。其中N-连接的糖链合成起始于内质网,完成于高尔基体。其整个合成和分解过程受到各种酶类的特异催化和精确调控。其主要生物学功能为细胞或分子的生物识别,如人类ABO血型和精卵结合过程 另外,受体蛋白、肿瘤细胞表面抗原等亦均属糖蛋白。/pp  近年来,科学界逐渐认识到,糖蛋白与很多疾病如感染、肿瘤、心血管病、肝病、肾病、糖尿病以及某些遗传性疾病等的发生、发展有关。再者,细胞表面的糖蛋白及糖脂可“脱落”到周围环境或进入血循环,它们可以作为相关组织或细胞异常的标志为临床诊断提供信息 患某些疾病时体液中的糖蛋白亦常有特异性或强或弱的改变,这些糖蛋白的发现和应用将有助于疾病诊断或预后的判断。/pp  读研伊始,孙士生从事的是生物芯片方面的研究,“后来因为参与一个糖芯片检测流感病毒宿主范围的项目,我有幸进入了糖蛋白的研究领域,或许这就是缘分吧”,孙士生说。/pp  2011年,从西北大学毕业后,孙士生选择前往美国约翰· 霍普金斯大学Dr. Hui Zhang实验室做博士后,继续从事糖蛋白质组的方法学和生物标志物发现研究。/pp  Dr. Zhang建立了经典分析糖蛋白方法,这在世界上属于蛋白质组学领域的权威。他所领导的实验室,有着很多国际前沿的技术和研究。有幸在这样的实验室工作,孙士生深觉受益匪浅。/pp  “在国外,感触比较深的一点是,国外做科研,比较强调原创性。在美国,张老师会说,这个领域已经有人在做,而且做得不错,我们应该选择一些新的领域去探索。很多学者认为别人没做过的研究会更困难,其实不然,正是因为没人做过,发挥的空间才会更大”。/pp  糖蛋白组学意义重大/pp  在美多年,孙士生所做的诸多研究也产生了不小的国际影响力。/pp  孙士生介绍说,随着蛋白质组学研究的日益成熟和规模化,蛋白翻译后修饰谱成为了新的研究焦点。蛋白糖基化修饰作为最重要、最普遍的蛋白质翻译后修饰之一,主要参与细胞间识别、调控、信号传导、免疫应答、细胞转化和疾病的发生发展。而系统高通量的糖蛋白质组研究方法是蛋白糖基化分析的基础。在美期间,他在Dr. Zhang建立的经典分析糖蛋白方法基础上,通过改变分析策略,创建了一种全面系统分析N-糖蛋白质组的新方法。该方法可广泛应用于肿瘤标记物筛查,蛋白抗体、病毒以及其他各种生物样品中的蛋白糖基化分析。同时,孙士生还建立了一些其他基于质谱分析的糖蛋白质组学新方法。/pp  在蛋白质组/糖蛋白质组学在疾病生物标记物和致病机理研究中的应用方面,孙士生也取得了一定的进展。他与合作者将蛋白质组/糖蛋白质组相关方法学成功应用于各种临床样本分析中。其应用范围包括:人流感病毒、艾滋病病毒(HIV)及其感染的细胞和宿主,不同年龄和性别的人唾液,肝癌细胞系和HCC病人血清,前列腺癌细胞系、组织和血清,卵巢癌细胞系和组织、肺癌细胞系模型和肾衰竭动物模型。/pp  “其中值得一提的是,我在博士后期间作为样本制备主要负责人之一参与了美国临床蛋白质组肿瘤分析(CPTAC)项目。我所在的实验室是全美参与此项目的五个核心实验室之一。在此项目中,我一直负责实验室内样品分析方法的建立,标准流程的制定,样品制备,质量监控和问题解决。目前已顺利完成本轮所有临床样本的蛋白质组和糖蛋白质组图谱的解析,其中蛋白质组的研究成果已在Cell杂志发表”,孙士生说。/pp  回国的“青年千人”/pp  梁园虽好,终非故土。在美国学习和工作多年后,孙士生最终选择回到西北大学,并在2017年顺利获得了中组部 “千人计划”青年项目的资助。/pp  “我选择回西北大学,很大程度上是出于对母校的热爱。这儿有我老师、同学和朋友的帮助和支持。有着悠久历史的西北大学近年来综合实力也在蒸蒸日上”,孙士生指出,西北大学学术氛围相对自由,对青年学者没有设置太多限制,“选择西北大学,也有这方面的考量。”/pp  回到母校后,孙士生希望能将本人所学,特别是他在糖蛋白质组学及新的肿瘤标志物发现等领域所积累的研究经验及学术成果服务于祖国,同时将母校建设的更好。/pp  展望未来,孙士生表示,他将继续致力于糖蛋白质组学新技术的开发并将其应用于新的生物标志物发现、致病机制研究和蛋白糖基化调控机制研究中。他已针对这些设想制定了详细的工作计划。/pp  孙士生表示,蛋白质组研究技术在癌症、早老性痴呆等人类重大疾病的临床诊断和治疗方面具有诱人的应用前景。糖类作为重要的生物大分子之一,参与各种重要的生物学过程。然而系统糖生物学研究包括系统的糖链解析、高通量的糖蛋白和糖脂分析等才刚刚起步:“在中国从事这方面的研究,必然会大有可为。”/ppbr//p
  • 南极雪样惊现微塑料!新污染物治理拉开序幕!
    据今日央视网报道,科研人员从南极洲最大的冰架——罗斯冰架沿线的不同地点采集了19个雪样本,在每个样本中都发现了微塑料,这可能意味着塑料污染对生态环境的破坏在加速,即便是被科研人员称为地球上“最干净”的地方——南极洲也无法幸免。科学家曾在该地区的深海沉积物、海洋和地表水中发现过微塑料,但在雪样中发现微塑料尚属首次。渐入人心的“微塑料”微塑料(Microplastics, MPs)是指粒径小于5 mm的塑料碎片,被认为是一类新污染物。微塑料这一概念早在2004年由英国普利茅斯大学的理查德汤普森(Richard Thompson)在《Science》上发表文章时提出。随后,由于其在海洋环境中的广泛存在以及对生物产生的各种确定的以及不确定的危害,得到了各界的广泛关注。近几年,随着科学家不断深入的研究,大气、土壤、陆地环境乃至生物体中相继检出微塑料,研究人员已开始尝试对微塑料样品进行更进一步的定性和定量分析。据相关媒体报道,不久前,南京医科大学夏彦恺教授团队联合中国科学院南京土壤研究所骆永明教授团队,首次在人体血栓样本中发现了一定数量和不同类型的微塑料和染料颗粒。据文献,这是第一次检测血栓中的微塑料,尽管只有一种颗粒被鉴定为LDPE(主要用于农用薄膜,医疗器械,药品和食品包装材料等)。随着微塑料的“渐入人心”,更多的新污染物逐渐走进大众视野。新污染物治理,蓄势待发9月27日,生态环境部发布了关于公开征求《重点管控新污染物清单(2022年版)(征求意见稿)》意见的通知。通知指出,按照《新污染物治理行动方案》(国办发〔2022〕15号)关于“2022年发布首批重点管控新污染物清单”的要求,生态环境部组织编制了《重点管控新污染物清单(2022年版)(征求意见稿)》,并公开征求意见。该《清单》共分为四大类,主要包括 14 种类新污染物:分类二级分类持久性有机污染物类1.全氟辛基磺酸及其盐类和全氟辛基磺酰氟(PFOS 类)2.全氟辛酸及其盐类和相关化合物1(PFOA 类)3.十溴二苯醚4.短链氯化石蜡5.六氯丁二烯6.五氯苯酚及其盐类和酯类7.三氯杀螨醇8.全氟己基磺酸及其盐类和相关化合物3(PFHxS 类)9.得克隆及其顺式异构体和反式异构体14.已淘汰类 (六溴环十二烷、氯丹、灭蚁灵、 六氯苯、滴滴涕、α六氯环己烷、β-六氯环己烷、林丹、硫丹原药及其相关异构体、多氯联苯) 有毒有害污染物类10.二氯甲烷11.三氯甲烷 环境内分泌干扰物类12.壬基酚 抗生素类13.抗生素 ACCSI同期会议——新污染物监测新技术论坛为了进一步助力我国新污染治理行动的进行,仪器信息网联合珀金埃尔默,将于ACCSI2022期间举办新污染物检测与监测新技术发展论坛,邀请了5位报告专家聚焦新污染物检测新技术,分享新污染物最新研究进展和检测技术!ACCSI2022 线下到场参会,实现与专家面对面互动交流!年会报名链接:https://www.instrument.com.cn/accsi/2022/嘉宾报告1:海洋环境中微塑料检测技术报告嘉宾:孙承君嘉宾简介:孙承君,2001年12月于美国加州大学圣芭芭拉分校获得博士学位,现任自然资源部第一海洋研究所研究员,主要从事海洋环境科学、海洋生物化学等方面的研究工作,获评山东省泰山学者海外创新人才和自然资源部科技领军人才。承担和完成包括国家重点基础研究计划973计划课题、国家自然科学基金等在内的多项国家和省部级项目,多次参与我国大洋和极地科考,近五年发表高水平学术论文60余篇,其中SCI论文50余篇,目前团队研究工作以海洋微塑料和海洋生物材料为主,在微塑料研究领域又较好的积累。嘉宾报告2:“eXXpedition环球航行”:全球海洋中的塑料污染状况研究报告嘉宾:Dr. Winnie Courtene-Jones嘉宾简介:Dr. Winnie Courtene-Jones是一位塑料污染研究方面的专家,2019年完成博士学位(深海生态系统中的微塑料),就职于普利茅斯大学国际海洋垃圾研究小组,曾以“eXXpedition环球航行” 组织科学项目领队的身份,开展全球海洋微塑料污染的研究,目前正参与“BIO PLASTIC RISK”生物塑料风险研究项目,调查研究可生物降解塑料的环境归趋,以及它们对生物和生态系统功能的相关影响。她的科学研究遍布各种陆地、海洋环境中的塑料污染情况,从海岸线到地球上一些最偏远的地方,包括深海和海洋环流。Dr Winnie Courtene-Jones在其研究领域发表了大量论文和技术报告,并在国际会议、英国和欧洲学术议会上发表演讲。嘉宾报告3:新污染物的转化与毒理报告嘉宾:曲广波嘉宾简介:研究员、博士生导师,现任职于中国科学院生态环境研究中心。主要研究方向为“新型污染物的转化与毒理”。研究成果以第一/通讯作者在Chemical Reviews、Chemical Society Reviews、Chem、Angewandte Chemie International Edition、Environmental Health Perspectives、ACS Nano、Environmental Science & Technology等期刊上。国家优秀青年基金获得者、中国科学院青年创新促进会优秀会员。2018年获第五届中国毒理学会优秀青年科技奖、2018年获“The 16th International Symposium on Persistent Toxic Substances Young Scientist Award”、 2021年获中国分析测试协会特等奖(排名第1)。中国毒理学会分析毒理专业委员会委员、中国环境诱变剂学会毒性测试与替代方法专业委员会委员、《环境化学》青年编委。嘉宾报告4:人体生物组织中PFAS的检测与研究报告嘉宾:Dr. Sabra Botch-Jones嘉宾简介:Sabra Botch-Jones是波士顿大学医学院—生物医学法医学研究生课程的法医毒理学家和助理教授,长期从事于法医毒理学和分析化学方面的研究,Sabra担任美国科学院标准委员会毒理学共识机构副主席,美国法医学会毒理学分会主席。她被州长查理贝克(Charlie Baker)任命为马萨诸塞州法医监督委员会成员。 嘉宾报告5:纳米材料检测和职业风险防护标准示例及应用研究报告嘉宾:郭玉婷嘉宾简介:郭玉婷,国家纳米科学中心中国科学院纳米标准与检测重点实验室高级工程师,全国标准化教育标准化工作组(筹)委员,从事纳米技术标准化及电感耦合等离子体质谱检测研究工作,主持制定五项国家标准,参编《纳米技术标准》书籍,发表多篇科技论文,参与两项国家重点研发计划和一项中科院战略性先导科技专项项目。报名现场,赢取珀金埃尔默定制礼品!
  • 蛋白质组学技术在病毒研究中的应用
    p style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "strongspan style="text-indent: 2em "仪器信息网讯/span/strongspan style="text-indent: 2em " 蛋白质组学是生命科学领域中的一门新兴学科,可以高通量的分析正常及病理条件下机体、组织、细胞或亚细胞成分中全部蛋白质,对不同空间、不同时间上动态变化的蛋白质组的整体进行比较,分析不同蛋白质组之间在表达数量、表达水平和修饰状态下的差异。蛋白质组学可以发现与疾病相关的特异性蛋白质,对病变相关蛋白的研究可以为探索病毒本身及其感染机制提供信息,且这些蛋白还可能作为疾病诊断潜在的生物标志和治疗的药物靶点。/span/pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "span style="color: rgb(0, 112, 192) "strong蛋白质组概念的提出及常用技术/strong/span/pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "蛋白质组(proteome)这一概念由Wilkins和Williams等在1994年首次提出,以它作为研究对象的蛋白质组学是后基因组时代产生和发展的一门新兴学科,其从整体上分析组织,细胞内动态变化的蛋白质组成、表达水平与翻译后修饰,探索蛋白质的功能及蛋白质之间相互作用与联系。/pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "蛋白质组学中对蛋白表达分析方面的研究应用较多的技术有双向凝胶电泳(two-dimensional electrophoresis,2-DE)、基于2-DE将其重复性和精确性加以改进的双向差异凝胶电泳(two-dimensional difference electrophoresis,2D-DIGE),以及对筛选到的差异表达蛋白进行快速精确鉴定的串联质谱技术(mass spectrometry,MS),其中质谱技术是蛋白质组学研究中的核心技术。/pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "在质谱技术中的基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrum,MALDI-TOFMS)是分析多肽和蛋白质混合物的主要方法,此外,使用标记的氨基酸在细胞中进行稳定同位素标记(stable-isotope labeling by amino acids in cell culture,SILAC) 是一种鉴定和定量病毒感染后细胞蛋白中表达差异的有效方法。蛋白质组学技术在病毒学中的应用有助于病毒感染及病毒宿主间的相互作用机制研究。/pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "span style="color: rgb(0, 112, 192) "strong蛋白组学技术在及其感染机制研究中的应用案例/strong/span/pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "病毒寄生于宿主细胞中,需要不断地适应和改变宿主的环境。他们能够编码多种多功能蛋白质,这些蛋白能与宿主蛋白发生一系列的相互作用以完成病毒的各种功能。目前,许多病毒的基因组已完成测序,但由于受到病毒影响而发生相应改变的宿主蛋白组、宿主蛋白翻译后修饰等还未被完成阐明。近年来,高通量技术的兴起,如基于质谱技术的定量或半定量蛋白组方法,已被广泛应用于病毒宿主相互作用的研究中。依托质谱技术的蛋白质组学飞速发展,不仅促进了病毒蛋白质组学研究的不断进步,同时也加快了对于病毒相关的宿主蛋白鉴定。今后相关研究数据仍会急速增加,这需要更加先进的生物信息学技术对数据进行处理,更全面地了解病毒感染过程。/pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "span style="color: rgb(255, 0, 0) "案例1: SARS(severe acute respiratory syndrome-associated coronavirus,SARS-CoV)冠状病毒研究中的蛋白组学技术/span/pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "SARS基因组的基因产物包括20多种蛋白质,据报道,有研究学者首次应用DIGE技术分析了SARS-CoV感染的Vero E6细胞,鉴定出355个在SARS-CoV感染后表达发生变化的蛋白,其中186个显著差异表达蛋白,为理解SARS-CoV的感染和致病机制提供了线索。对感染SARS-CoV的BHK21细胞进行SILAC定量分析及进一步功能分析表明,BAG3可以抑制SARS-CoV的复制。对感染病人的血清蛋白质组分析,有助于返现可用于病毒感染的诊断、预后及治疗的生物标记。/pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "span style="color: rgb(255, 0, 0) "案例2: 禽流感病毒(avian influenza virus,AIV)研究中的蛋白质组学技术/span/pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "据报道,研究学者利用2-DE技术筛选H9N2感染人源细胞系后不同时间点的差异表达蛋白,运用质谱技术鉴定到22种蛋白,主要包括细胞骨架蛋白、RNA加工途径相关蛋白和代谢相关蛋白等,其中表达差异显著的蛋白主要参与细胞骨架网络的构成。这些蛋白的鉴定有助于理解禽流感病毒在哺乳动物中的复制及其宿主之间的相互作用。/pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "span style="color: rgb(255, 0, 0) "案例3: 揭示新型寨卡病毒宿主因子的蛋白质组学技术/span/pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "寨卡病毒(ZIKV)是一种与登革热病毒,西尼罗河病毒和丙型肝炎病毒(HCV)有关的黄病毒,具有单链RNA基因组,编码多蛋白,共翻译和翻译后加工成三个结构蛋白,前体膜和包膜以及七种非结构蛋白。/pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "据报道,有研究学者使用人类神经前体细胞和神经细胞 SK-N-BE2 进行整合蛋白质组学方法,以表征细胞在病毒侵染后的蛋白质组和磷酸化蛋白质组变化,并使用亲和蛋白质组学来鉴定ZIKV蛋白的细胞靶标。通过亲和纯化结合液相色谱和串联质谱技术(AP-LC-MS / MS)鉴定与人SK-N-BE2神经母细胞瘤细胞中表达的10种ZIKV蛋白中的每一种相互作用的细胞蛋白和相关复合物,研究鉴定到了386种 ZIKV 相互作用蛋白、ZIKV 特异性和泛黄病毒活性相关的宿主因子,这些宿主因子已知与神经元发育、视网膜缺陷和不育相关。由此,相关论文作者绘制了神经元细胞中的ZIKV蛋白-宿主蛋白相互作用网络。此外,研究还分析确定了在 ZIKV 感染后特异性上调或下调的1,216个磷酸化位点,表明病毒感染引起基本信号传导通路为 ZIKV 感染引起的增殖停滞提供了新的见解。/pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "当前,span style="text-indent: 2em "通过比较蛋白质组学对病毒感染前后的蛋白表达图谱进行鉴定,进一步对病毒感染引起的差异表达蛋白进行功能分析和验证,探索其在病毒感染中的潜在作用机制、寻找病毒的作用靶标,为病毒的预防诊治提供理论依据和解决途径。 /span因此,在继病毒感染细胞的差异蛋白质组分析后,为更能反映真实的变化规律,更到位的解释病毒感染和致病机制,进行病毒感染宿主机体的差异及功能蛋白质组分析将是研究发展的趋势。/ppbr//ppbr//ppbr//pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "span style="text-indent: 2em "/spanbr//pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "strong参考文献:/strong/pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "董 书 伟 ,荔 霞 ,刘 永 明 ,等 .蛋 白 质 组 学 研 究 进 展 及 其 在 中 兽 医 学 中 的 应 用 探 讨 [J ] . 中 国 畜 牧 兽 医 , 2 0 1 2 , 3 9 (1 ) : 4 5 ~ 4 9 ./pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "Liu H.Advances of SARS-Cov genome[J].Journal of Chinese General Practice,2003,2(11):1~4./pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "Liu N,Song W,Wang P,et al.Proteomics analysis of diferen- tial expresion of celular proteins in response to avian H9N2vi- rus infection in human cels[J].Proteomics,2008,8(9):1851~ 1858./pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "Pietro S ,Alexey S , Haas D A , et al. An orthogonal proteomic survey uncovers novel Zikavirus host factors[J]. Nature, 2018./pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em " /ppbr//p
  • 【综述】蛋白质组学研究进展
    p style="text-align: center "img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201601/insimg/4a14f65e-cb82-47d8-87d5-ea4b0d204756.jpg" title="sss_56a5b6877c56c.jpg"//pp  1、蛋白质组和基因组br//pp  蛋白质组是指一种基因组所表达的全套蛋白质1,其英文为“proteome”。 有关蛋白质组的系统研究是蛋白质组学,英文为“proteomics”。基因组是生命体中全部基因的集合体,其英文为“genome”。有关基因组的系统研究是基因组学,其英文为“genomics”。 “proteome”和“proteomics”是由Marc Wilkins 及其同事于20世纪90年代初参照基因组和基因组学两个英文单词而创造出来的2。蛋白质组学是研发、利用、改进各种技术手段研究蛋白质组或在细胞某一生理通路中相关蛋白质集合的组成、结构、功能、代谢的一门新兴科学。/pp  基因决定蛋白质的水平,然而,蛋白质的水平分为转录水平和表达水平,mRNA只包含前者,后者则是由mRNA被翻译所实现,而在翻译过程中通常伴随对蛋白质功能和活性起至关重要的修饰过程,如糖基化、泛素化等3。通过研究蛋白质组学,可以获取蛋白定位与修饰的定性信息和相关定量数据,丰富认知蛋白质表达水平和相关蛋白作用,对了解生命复杂活动有更深更全的认识。/pp  2、蛋白质组的发展背景/pp  自二十世纪九十年代以来,传统生物学得以突飞猛进地发展,并取得瞩目成就,其中三个重要点彪炳史册,也促使传统生物学获得质的转变。/pp  第一 基因、表达序列标记(EST, expressed sequence tag)、蛋白质序列数据库的成长。细菌、酵母、线虫、果蝇的全部基因序列逐渐明了,甚至后来人类基因组计划也顺利告捷 其它的植物、动物、微生物也不断在探索。人们把已经掌握的基因分门别类地建立了序列数据库。/pp  第二 生物信息学的发展。易获取的浏览型生物信息工具层出不穷,这种免费的网页式数据库可以让我们从其中获得所需的特殊的物质结构,如蛋白质结构中的结构域和模体等。/pp  第三 寡核苷酸微阵列技术的发展。通过不同荧光标记的DNA样本同时与微阵列反应,形成不同荧光的现象,大幅提高Northern blot 的效率4。/pp  3、蛋白质组学分类/pp  蛋白质组学分类可有不同原则。/pp  根据蛋白质来源可分为植物蛋白质组学、动物蛋白质组学、微生物蛋白质组学。植物蛋白质组学是以来源于植物或与植物相关蛋白质为研究对象,分析其在植物发生、生长、调节、凋谢等生命过程中的作用、功能、代谢、结构等的体系。同理,动物蛋白质组学是以来源于动物或与动物相关蛋白质为研究对象,最重要的一大内容就是研究人类相关蛋白质。微生物蛋白质组学是以来源于微生物或与微生物相关蛋白质为研究对象。/pp  根据研究目的和阶段不同可分为结构蛋白质组学、表达蛋白质组学、功能蛋白质组学。结构蛋白质组学主要分析蛋白质大分子的多级结构形态,包括氨基酸顺序、二级结构、三级结构和四级结构 并着重于研究其共性结构特征和特殊功能基团 也是用于建立细胞内信号转导的网络图谱并解释某些特定蛋白表达对细胞产生特定的作用5。表达蛋白质组学是以经典蛋白质组技术如双向凝胶电泳和图像分析为方法着重于研究细胞内蛋白质表达过程及结果的体系3。功能蛋白质组学是以细胞内单一同种蛋白质功能体现、蛋白质之间、蛋白质与其他大分子之间相互作用关系为研究目的,研究和表述选定蛋白质,探明有关蛋白的修饰和信号转导通路,疾病机制或蛋白-药物作用关系3。/pp  根据研究内容,还可分为组成性蛋白质组学、差异显示蛋白质组学、相互作用蛋白质组学。组成性蛋白质组学是鉴定某个体系的蛋白质并阐述其翻译后修饰的特性。差异显示蛋白质组学又名比较蛋白质组学,是对重要生命过程或人类重大疾病进行生理、病理体系或过程的蛋白质表达比较。相互作用蛋白质组学则是研究蛋白质间相互作用,绘制某体系蛋白质作用网络图谱8。/pp  4、白质组学研究工具/pp  蛋白质组学研究的重要工具主要有四个。/pp  第一,蛋白质、表达序列标记(EST, expressed sequence tag)、基因序列数据库的建立与成熟 也可以说是生物信息学。因为蛋白质组学中所用的大多数技术所获得的数据通常都是高通量、高复杂度的,只有通过生物信息学分析才能对蛋白质的种类、结构和功能进行分析确定。/pp  第二,质谱(MS)技术。其将样品分子离子化,根据离子间质荷比的差异分离并确定质量,实现高灵敏度、高特异性。首先,质谱技术能准确测量高达100kDa的完整大分子蛋白质,其准确度和特异度比SDS-PAGE还要高。其次,质谱技术也能准确测量从蛋白质分解下来的多肽。最后,它还可以测定多肽的氨基酸顺序,即多肽测序4。现有三条途径,一是肽链质量图谱,二是串联质谱途径,三是联合途径7。其中一种较理想的技术平台是表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SEL-DI)技术,可分析疏水性蛋白质、pI过高或过低蛋白质、低分子量蛋白质( 25 000)和未经处理的样品中许多被掩盖的低浓度蛋白质,短时间内即可获得蛋白质的分子量、PI、特殊修饰位点等参数8。/pp  第三,能将MS数据与数据库中特异的蛋白质顺序匹配的软件。它是快速、特异地将第一和第二工具联系在一起的分析方式。/pp  第四,蛋白分析分离方法。通过蛋白分析分离方法可以简化蛋白复合物,同时产生不同蛋白质差异比较方法。普通的蛋白质分析分离方法包括1D-SDS-PAGE、高效液相色谱法(HPLC)、毛细管电泳(CE)、等点聚焦电泳(IEF)等。其中二维凝胶电泳如2D-SDS-PAGE是目前蛋白质组学中分离单一蛋白质的广泛应用方法。当然,多维分析分离方法是最理想的分离蛋白质和多肽的方法,譬如,离子交换液相色谱与反相高效液相色谱串联形成的分离系统是分离多肽混合物的有力方法4。/pp  5、白质组学的应用/pp  蛋白质组学原则性应用包括四个方面4:组成性应用、蛋白质表达模型、蛋白质网络图谱、蛋白质修饰图谱。组成性应用是指运用质谱及其相关技术将目的蛋白质按相关标准定性或定量地纳入蛋白质数据库,在此过程中研发相应技术的应用。蛋白质表达模型是指研究在生理或病理状态目的蛋白质在细胞内定位并表达情况,同时研究细胞在暴露物理、化学、药物等因素下蛋白质表达状况。蛋白质网络图谱是研究两种或两种以上蛋白质在生物体内组成结构、表达功能、调节控制间作用情况。蛋白质修饰图谱是探明蛋白质的修饰定位及修饰后功能表现。/pp  当然,蛋白质组学在生活中无处不在,疾病、食品、植物、药品等等。/pp  蛋白质组学在疾病中应用方向主要是发现新的疾病标志物,以探明疾病发生机制、发展变化,为治疗途径提供思路。Brea等利用双向电泳串联质谱技术,差异比较心源性脑栓塞患者和粥样硬化血栓性梗死患者各12例的血清蛋白,发现触珠蛋白相关蛋白和淀粉样蛋白A等蛋白质在粥样硬化血栓性梗死患者血清中显著升高9。/pp  蛋白质组学在食品中应用方向主要是检测食品中过敏源检测、鉴定食品成分等,也给食品科学研究提供了新的研究思路和技术3。李明云等优化了相应的试验条件,并将蛋白质组双向电泳相关技术引入大黄鱼肝脏蛋白质分析中,得到了较清晰的大黄鱼肝脏蛋白双向电泳图谱。/pp  蛋白质组学在植物中应用方向主要是植物群体遗传、环境信号应答与适应机制、植物组织器官、植物亚细胞等7。其中,如果研究的植物是农作物如棉花、马铃薯、水稻等,就可以简单地视作蛋白质组学在农业中的运用了。Chang等对玉米强制缺氧和低氧研究,发现低氧处理的效应不仅是氧气含量过低诱导增加糖酵解酶,通过质谱鉴定了46个相关蛋白质10。/pp  蛋白质组学在药品中应用方向主要是药物研发、药物作用机制、耐药机制、药物毒理学等。在对紫杉醇类药物抗癌作用研究中,Bauer等对乳腺癌复发患者进行紫杉醇类药物治疗后进行蛋白质组学分析,发现a-防卫素可作为预测该类药物治疗乳腺癌治疗作用的生物标记物11。/pp  6、展望/pp  蛋白质组学在短短30年间发展迅猛,渗入到生活的许多方面,也对保证人类生存质量和良性繁衍有重大作用。但其思路不开阔,技术高效性、灵敏性、特异性仍有待提高,应用普及度低,蛋白质分离、纯化技术研发,基因组学丰富度低是制约蛋白质组学及其相关技术发展的瓶颈。不过,相信随着物理技术和化学方法的不断发展,研究水平的深入,蛋白质组学会随着基因组学的发展得到更进一步地丰富。/pp  参考文献:/pp  1.诗,吕建新主编《分子生物学检验技术》第2版/pp  2.Pandey A, Mann M. Proteomics to study genes and genomics [J] Nature,2000,405(6788):837-846./pp  3.尹稳、伏旭、李平《蛋白质组学的应用研究进展》 [J]. 生物技术通报 2014年第1期/pp  4.aniel C. Liebler《Introduction to Proteomics》:1-13/pp  5.英超,党源,李晓艳,等. 蛋白质组学及其技术发展 [J]. 生物技术通讯,2010,21(1):139-144./pp  6.鑫《比较蛋白质组学研究与应用进展》[J]. 国际免疫学杂志 2006年5月第29卷第3期:156-159/pp  7.宇,荆玉祥,沈世华《植物蛋白质组学研究进展》 [J] 植物生态学报,2004,28(1):114-125/pp  8.ore LE,Pfeiffer R,Warner M,et al. Identification of biomarkers of arsenic exposure and metabolism in urine using SELDI technology . Biochem Mol Toxicol , 2005,19(3):176./pp  9.rea D,Sobrino T,Blanco M, et al. Usefulness of haptog lob in and serum amyloid A proteins as biomarkers for atherothrombotic ischemic stroke diagnosis confirmation [J]. Atherosclerosis,2009,205:561-567./pp  10.ng,W.W.,L.Huang,M.Shen,C.Webster,A.L.Burlingame& J.K.Roberts.2000.Patterns of protein synthesis and tolerance of anoxia in root tips of maize seedlings acclimated to a low oxygen environment,and identification of proteins by mass spectrometry.Plant Physiology,122:295~318./pp  11.er JA,Chakravanhy AB,Rosenbluth JM,et al.Identification of markers of taxane sensitivity using proteomic and genomic analyses of breast tumors from patients receiving neo-adjuvant paclitaxel and radiation[J].Clin Cancer Res,2010,16(2):681-690./ppbr//p
  • 德国元素elementar | 硝酸盐样品氮氧同位素分析解决方案
    2023年4月1-2日,第四届氮素生物地球化学循环学术论坛在北京大学成功举行。本次论坛以“氮循环与可持续发展”为主题,聚焦氮循环关键过程与机制、活性氮释放规律与效应、氮的可持续管理与政策、氮循环研究新技术与新方法等热点议题,促进土壤学、环境地理学、生态学、水科学、大气科学、海洋科学、管理学等学科交叉,增进氮素循环研究领域专家学者的深入交流。德国元素elementar参加了本次学术论坛,并推出硝酸盐样品氮氧同位素分析的最新解决方案EnvirovisION,吸引了与会人员的极大兴趣。EnvirovisION是环境样品分析的理想解决方案,通过isoprime visION与iso FLOW GHG结合的轻松操作,采用三价钛还原法分析硝酸盐样品,大大降低了样品预处理的技术门槛,同时保持了最高水平的精确度和准确性,避免了繁琐的样品多步处理、厌氧细菌培养的维护和剧毒化学品的使用。
  • 蛋白质组学研究进展与趋势
    1.蛋白质组学研究的研究意义和背景 随着人类基因组计划的实施和推进,生命科学研究已进入了后基因组时代。在这个时代,生命科学的主要研究对象是功能基因组学,包括结构基因组研究和蛋白质组研究等。尽管现在已有多个物种的基因组被测序,但在这些基因组中通常有一半以上基因的功能是未知的。目前功能基因组中所采用的策略,如基因芯片、基因表达序列分析(Serial analysis of gene expression, SAGE)等,都是从细胞中mRNA的角度来考虑的,其前提是细胞中mRNA的水平反映了蛋白质表达的水平。但事实并不完全如此,从DNA mRNA 蛋白质,存在三个层次的调控,即转录水平调控(Transcriptional control ),翻译水平调控(Translational control),翻译后水平调控(Post-translational control )。从mRNA角度考虑,实际上仅包括了转录水平调控,并不能全面代表蛋白质表达水平。实验也证明,组织中mRNA丰度与蛋白质丰度的相关性并不好,尤其对于低丰度蛋白质来说,相关性更差。更重要的是,蛋白质复杂的翻译后修饰、蛋白质的亚细胞定位或迁移、蛋白质-蛋白质相互作用等则几乎无法从mRNA水平来判断。毋庸置疑,蛋白质是生理功能的执行者,是生命现象的直接体现者,对蛋白质结构和功能的研究将直接阐明生命在生理或病理条件下的变化机制。蛋白质本身的存在形式和活动规律,如翻译后修饰、蛋白质间相互作用以及蛋白质构象等问题,仍依赖于直接对蛋白质的研究来解决。虽然蛋白质的可变性和多样性等特殊性质导致了蛋白质研究技术远远比核酸技术要复杂和困难得多,但正是这些特性参与和影响着整个生命过程。 传统的对单个蛋白质进行研究的方式已无法满足后基因组时代的要求。这是因为:(1) 生命现象的发生往往是多因素影响的,必然涉及到多个蛋白质。(2) 多个蛋白质的参与是交织成网络的,或平行发生,或呈级联因果。(3) 在执行生理功能时蛋白质的表现是多样的、动态的,并不象基因组那样基本固定不变。因此要对生命的复杂活动有全面和深入的认识,必然要在整体、动态、网络的水平上对蛋白质进行研究。因此在上世纪90年代中期,国际上产生了一门新兴学科-蛋白质组学(Proteomics),它是以细胞内全部蛋白质的存在及其活动方式为研究对象。可以说蛋白质组研究的开展不仅是生命科学研究进入后基因组时代的里程碑,也是后基因组时代生命科学研究的核心内容之一。 虽然第一次提出蛋白质组概念是在1994年,但相关研究可以追溯到上世纪90年代中期甚至更早,尤其是80年代初,在基因组计划提出之前,就有人提出过类似的蛋白质组计划,当时称为Human Protein Index计划,旨在分析细胞内的所有蛋白质。但由于种种原因,这一计划被搁浅。90年代初期,各种技术已比较成熟,在这样的背景下,经过各国科学家的讨论,才提出蛋白质组这一概念。 国际上蛋白质组研究进展十分迅速,不论基础理论还是技术方法,都在不断进步和完善。相当多种细胞的蛋白质组数据库已经建立,相应的国际互联网站也层出不穷。1996年,澳大利亚建立了世界上第一个蛋白质组研究中心:Australia Proteome Analysis Facility ( APAF )。丹麦、加拿大、日本也先后成立了蛋白质组研究中心。在美国,各大药厂和公司在巨大财力的支持下,也纷纷加入蛋白质组的研究阵容。去年在瑞士成立的GeneProt公司,是由以蛋白质组数据库“SWISSPROT” 著称的蛋白质组研究人员成立的,以应用蛋白质组技术开发新药物靶标为目的,建立了配备有上百台质谱仪的高通量技术平台。而当年提出Human Protein Index 的美国科学家Normsn G. Anderson也成立了类似的蛋白质组学公司,继续其多年未实现的梦想。2001年4月,在美国成立了国际人类蛋白质组研究组织(Human Proteome Organization, HUPO),随后欧洲、亚太地区都成立了区域性蛋白质组研究组织,试图通过合作的方式,融合各方面的力量,完成人类蛋白质组计划(Human Proteome Project)。2.蛋白质组学研究的策略和范围 蛋白质组学一经出现,就有两种研究策略。一种可称为“竭泽法”,即采用高通量的蛋白质组研究技术分析生物体内尽可能多乃至接近所有的蛋白质,这种观点从大规模、系统性的角度来看待蛋白质组学,也更符合蛋白质组学的本质。但是,由于蛋白质表达随空间和时间不断变化,要分析生物体内所有的蛋白质是一个难以实现的目标。另一种策略可称为“功能法”,即研究不同时期细胞蛋白质组成的变化,如蛋白质在不同环境下的差异表达,以发现有差异的蛋白质种类为主要目标。这种观点更倾向于把蛋白质组学作为研究生命现象的手段和方法。 早期蛋白质组学的研究范围主要是指蛋白质的表达模式(Expression profile), 随着学科的发展,蛋白质组学的研究范围也在不断完善和扩充。蛋白质翻译后修饰研究已成为蛋白质组研究中的重要部分和巨大挑战。蛋白质-蛋白质相互作用的研究也已被纳入蛋白质组学的研究范畴。而蛋白质高级结构的解析即传统的结构生物学,虽也有人试图将其纳入蛋白质组学研究范围,但目前仍独树一帜。3.蛋白质组学研究技术 可以说,蛋白质组学的发展既是技术所推动的也是受技术限制的。蛋白质组学研究成功与否,很大程度上取决于其技术方法水平的高低。蛋白质研究技术远比基因技术复杂和困难。不仅氨基酸残基种类远多于核苷酸残基(20/ 4), 而且蛋白质有着复杂的翻译后修饰,如磷酸化和糖基化等,给分离和分析蛋白质带来很多困难。此外,通过表达载体进行蛋白质的体外扩增和纯化也并非易事,从而难以制备大量的蛋白质。蛋白质组学的兴起对技术有了新的需求和挑战。蛋白质组的研究实质上是在细胞水平上对蛋白质进行大规模的平行分离和分析,往往要同时处理成千上万种蛋白质。因此,发展高通量、高灵敏度、高准确性的研究技术平台是现在乃至相当一段时间内蛋白质组学研究中的主要任务。当前在国际蛋白质组研究技术平台的技术基础和发展趋势有以下几个方面:3.1 蛋白质组研究中的样品制备 通常可采用细胞或组织中的全蛋白质组分进行蛋白质组分析。也可以进行样品预分级,即采用各种方法将细胞或组织中的全体蛋白质分成几部分,分别进行蛋白质组研究。样品预分级的主要方法包括根据蛋白质溶解性和蛋白质在细胞中不同的细胞器定位进行分级,如专门分离出细胞核、线粒体或高尔基体等细胞器的蛋白质成分。样品预分级不仅可以提高低丰度蛋白质的上样量和检测,还可以针对某一细胞器的蛋白质组进行研究。 对临床组织样本进行研究,寻找疾病标记,是蛋白质组研究的重要方向之一。但临床样本都是各种细胞或组织混杂,而且状态不一。如肿瘤组织中,发生癌变的往往是上皮类细胞,而这类细胞在肿瘤中总是与血管、基质细胞等混杂。所以,常规采用的癌和癌旁组织或肿瘤与正常组织进行差异比较,实际上是多种细胞甚至组织蛋白质组混合物的比较。而蛋白质组研究需要的通常是单一的细胞类型。最近在组织水平上的蛋白质组样品制备方面也有新的进展,如采用激光捕获微解剖(Laser Capture Microdissection, LCM) 方法分离癌变上皮类细胞。3.2 蛋白质组研究中的样品分离和分析 利用蛋白质的等电点和分子量通过双向凝胶电泳的方法将各种蛋白质区分开来是一种很有效的手段。它在蛋白质组分离技术中起到了关键作用。如何提高双向凝胶电泳的分离容量、灵敏度和分辨率以及对蛋白质差异表达的准确检测是目前双向凝胶电泳技术发展的关键问题。国外的主要趋势有第一维电泳采用窄pH梯度胶分离以及开发与双向凝胶电泳相结合的高灵敏度蛋白质染色技术,如新型的荧光染色技术。 质谱技术是目前蛋白质组研究中发展最快,也最具活力和潜力的技术。它通过测定蛋白质的质量来判别蛋白质的种类。当前蛋白质组研究的核心技术就是双向凝胶电泳-质谱技术,即通过双向凝胶电泳将蛋白质分离,然后利用质谱对蛋白质逐一进行鉴定。对于蛋白质鉴定而言,高通量、高灵敏度和高精度是三个关键指标。一般的质谱技术难以将三者合一,而最近发展的质谱技术可以同时达到以上三个要求,从而实现对蛋白质准确和大规模的鉴定。3.3 蛋白质组研究的新技术 做过双向凝胶电泳的人一定会抱怨它的繁琐、不稳定和低灵敏度等缺点。发展可替代或补充双向凝胶电泳的新方法已成为蛋白质组研究技术最主要的目标。目前,二维色谱 (2D-LC)、二维毛细管电泳 (2D-CE)、液相色谱-毛细管电泳 (LC-CE) 等新型分离技术都有补充和取代双向凝胶电泳之势。另一种策略则是以质谱技术为核心,开发质谱鸟枪法(Shot-gun)、毛细管电泳-质谱联用 (CE-MS)等新策略直接鉴定全蛋白质组混合酶解产物。随着对大规模蛋白质相互作用研究的重视,发展高通量和高精度的蛋白质相互作用检测技术也被科学家所关注。此外,蛋白质芯片的发展也十分迅速,并已经在临床诊断中得到应用。3.4 蛋白质组生物信息学 蛋白质组数据库是蛋白质组研究水平的标志和基础。瑞士的SWISS-PROT拥有目前世界上最大,种类最多的蛋白质组数据库。丹麦、英国、美国等也都建立了各具特色的蛋白质组数据库。生物信息学的发展已给蛋白质组研究提供了更方便有效的计算机分析软件;特别值得注意的是蛋白质质谱鉴定软件和算法发展迅速,如SWISS-PROT、Rockefeller大学、UCSF等都有自主的搜索软件和数据管理系统。最近发展的质谱数据直接搜寻基因组数据库使得质谱数据可直接进行基因注释、判断复杂的拼接方式。随着基因组学的迅速推进,会给蛋白质组研究提供更多更全的数据库。另外,对肽序列标记的从头测序软件也十分引人注目。4. 蛋白质组学发展趋势 在基础研究方面,近两年来蛋白质组研究技术已被应用到各种生命科学领域,如细胞生物学、神经生物学等。在研究对象上,覆盖了原核微生物、真核微生物、植物和动物等范围,涉及到各种重要的生物学现象,如信号转导、细胞分化、蛋白质折叠等等。在未来的发展中,蛋白质组学的研究领域将更加广泛。 在应用研究方面,蛋白质组学将成为寻找疾病分子标记和药物靶标最有效的方法之一。在对癌症、早老性痴呆等人类重大疾病的临床诊断和治疗方面蛋白质组技术也有十分诱人的前景,目前国际上许多大型药物公司正投入大量的人力和物力进行蛋白质组学方面的应用性研究。 在技术发展方面,蛋白质组学的研究方法将出现多种技术并存,各有优势和局限的特点,而难以象基因组研究一样形成比较一致的方法。除了发展新方法外,更强调各种方法间的整合和互补,以适应不同蛋白质的不同特征。另外,蛋白质组学与其它学科的交叉也将日益显著和重要,这种交叉是新技术新方法的活水之源,特别是,蛋白质组学与其它大规模科学如基因组学,生物信息学等领域的交叉,所呈现出的系统生物学(System Biology)研究模式,将成为未来生命科学最令人激动的新前沿。
  • 重磅!赛默飞31亿美元收购蛋白质组学公司Olink
    仪器信息网讯 10月17日,赛默飞与Olink官网均在官网公布最新消息:赛默飞以31亿美元收购下一代蛋白质组学解决方案企业Olink,双方董事会已批准该收购。赛默飞以每股普通股26.00美元的现金收购Olink的提议,相当于每股美国存托股 26.00美元的现金。这比Olink美国存托股票的上一个交易日收盘价溢价约74%。赛默飞将开始要约收购所有已发行的Olink普通股和所有美国存托股。该交易对Olink的估值约为31亿美元,其中包括约1.43亿美元的净现金。Olink有望在2024年实现超过2亿美元的收入。Olink为高级蛋白质组学的发现和开发提供了领先的解决方案,使生物制药公司和领先的学术研究人员能够快速有效地从蛋白质水平了解疾病。Olink的专有技术,接近延伸分析(PEA),为市场上安装的qPCR和下一代测序读出系统的庞大基础提供高通量蛋白质分析。该技术拥有5300多个经验证的蛋白质生物标志物靶标库,其应用力度非常大,发表了1400多篇科学出版物。Olink总部位于瑞典,业务遍及美洲、欧洲和亚太地区。赛默飞董事长、总裁兼首席执行官Marc N.Casper表示:“收购Olink突显了蛋白质组学对我们的客户继续推进生命科学研究和精准医学的深远影响。Olink经过验证的变革性创新与我们领先的质谱和生命科学平台高度互补。我们公司处于独特的地位,能够将这项技术带给客户,使他们能够有意义地加快发现和科学突破。我们期待着欢迎Olink的同事加入赛默飞世尔。”Olink首席执行官Jon Heimer表示:“Olink致力于通过加快下一代蛋白质组学的使用,并以前所未有的规模提供行业领先的数据质量,来提高对人类生物学的理解。赛默飞深厚的生命科学专业知识、全球影响力和经验证的卓越运营将为客户和同事带来重大机遇,同时也为我们的股东。”该交易预计将于2024年年中完成,受制于惯例的成交条件,包括收到适用的监管批准和完成投标报价。作为交易的一部分,Olink的最大股东Summa Equity AB以及另外的Olink股东和管理层(合计持有Olink 63%以上的普通股)已签订支持协议,同意对收购要约进行投标。赛默飞预计将利用手头现金和债务融资为此次收购提供资金。完工后,Olink将成为赛默飞世尔生命科学解决方案部门的一部分。
  • 溢价74%全资收购蛋白组学龙头Olink,赛默飞为什么如此青睐组学领域?
    2023年10月17日,赛默飞宣布以每股26美元的对价,以全现金的形式收购蛋白组学领域领导者Olink。对应Olink市值为31亿美元,对应2023年10月16日的收盘价溢价74%。此次收购完成后,Olink将成为赛默飞世尔生命科学解决方案部门的一部分。全球科学服务领域的领导者收购下一代蛋白质组学解决方案的领先服务商,一时间,市场一片哗然,灵魂三问涌上心头:1.赛默飞为什么选择重金押注组学领域?2.赛默飞为什么会选择Olink?3.赛默飞为什么会选择溢价74%收购?一、赛默飞为什么会选择重金押注蛋白质组学领域?原因只有一个:高增长!高增长!高增长!相比于日渐萎靡的生物制药市场,以蛋白质组学、代谢组学为代表的组学领域处于超高速增长的阶段。信立方研究表明,国内代谢组学年均增速达到50%以上,蛋白组学年均增速达到30%以上,而糖组学、脂质组学也处于快速成长的状态。根据景杰生物的招股书,中国蛋白质组学科研服务市场规模从 2016 年的1.2亿人民币规模扩大到2020年的5.8亿人民币规模,期间复合年增长率为49.1%。预计在未来,蛋白质组学科研服务市场持续扩大,以31.3%的复合年增长率在2025年达到22.6亿人民币规模。纷纷扰扰皆浮云,唯有增长暖人心。高增长才是赛默飞选择重金押注蛋白质组学领域的唯一原因。图1.1 中国蛋白质组学科研服务市场规模及预测(2016-2025E)数据来源:景杰招股书,仪器信息网产业研究部整理蛋白质组学领域的高速增长也得到了国家重大仪器平台数据的验证。仪器信息网产业研究部以“组学”、“液质联用仪”为关键词,遍历了2005年-2019年的国家重大仪器平台的数据,识别出232家应用液质联用仪从事组学研究的终端用户,其中包含大专院校121所,科研院所44所,其他企业单位67所。研究表明,2005年-2019年这14年间各大科研平台用于组学领域的液质数量呈逐步上升趋势,尤其是2018年开始迅速增加。图1.2 重大平台多组学液质联用仪启用时间分布情况数据来源:国家重大科学仪器平台,仪器信息网整理,2023年8月注:1、数据统计从2005年至2022年二、赛默飞为什么会选择Olink?原因也非常明确:蛋白质组学领先服务商(技术领先+市场地位领先)作为一家脱胎于瑞典乌普萨拉大学的新生代明星公司,从2021年首次于纳斯达克IPO以来,Olink业绩和股票都表现的相当亮眼,并成长为蛋白质组学的领先服务商。Olink掌握了平台邻位延伸分析技术(Proximity Extension Assay,PEA),依靠双抗体系统来测量蛋白质,可以在不牺牲特异性的情况下进行多重蛋白质测量。Olink市场领先的特异性和高动态范围及灵敏度使其在蛋白质组学研究市场中表现良好,并且适用于诊断开发及药物研发。图2.1 平台邻位延伸分析技术(Proximity Extension Assay,PEA)在蛋白组学领域,赛默飞已经布局了基于质谱的技术路线。从2005年推出第一台Orbitrap高分辨质谱以来,赛默飞持续提升质谱产品的分辨率、灵敏度、特异性和速度,成为蛋白质组学的标配产品。尤其是,2023年6月,赛默飞推出Orbitrap Astral质谱仪,既提供了无与伦比的灵敏度、动态范围和速度组合,又兼顾了精确定量,得到组学领域专业人士的青睐。图2.2 赛默飞质谱发展路径此次收购Olink,可以理解为是赛默飞对蛋白质组学领域发起了饱和式攻击,用高分辨质谱和PEA两条不同的实施路径覆盖这一高速增长的市场,提前锁定未来的市场机遇。三、赛默飞为什么会选择溢价74%收购?答案就是:高业绩增长+大市场前景。在过去的五年中,Olink实现了营收的稳健增长,从2019年的4600万美元发展到2022年的1.4亿美元,预期今年将达到2亿美元。图3.1 Olink近五年营收情况(2019-2023E)更重要的是,迅猛增长的客户群。当前,Olink 的生物制药和学术机构数量已超过 850 家,在生物制药领域,Olink 的客户群已从所有排名前 20 的机构扩大到排名前 40 的许多机构。截至 2023 年 8 月,引用 PEA 技术所发表的文章数量超过 1,363 篇。明确的科学实用性不断推动客户的快速采用和增长。图3.2 (左)引用 PEA 技术所发表的文章数量情况;(右)Olink 客户数量情况同时,Olink拥有从最广泛的发现(高复杂)到更有针对性的研究(中复杂)到后期临床试验和诊断(低复杂)的完整产品,这是一个从发现到临床应用的价值 350 亿美元的潜在市场机会。这才是赛默飞以74%高溢价收购Olink的关键。如需要了解更多关于组学、质谱的内容,欢迎订阅《液质在组学领域应用的市场研究报告(2023版)》。本报告由仪器信息网产业研究部打造,组学研究发展历程、组学研究产业链以及质谱(液质联用仪)在科研服务机构、基础科研用户的应用现状等维度进行市场研究。 【服务热线】: 15120049203 林先生【电子信箱】: survey@instrument.com.cn【特别福利】:扫码添加下方微信,可免费领取景杰生物、诺禾致源等公司年报及招股书资料《液质在组学领域应用的市场研究报告(2023版)》【报告目录】:第一章 概述1.1 组学概念1.2 单一组学分类1.2.1 基因组学1.2.2 转录组学1.2.3 蛋白组学1.2.4 代谢组学1.3 多组学技术1.4 组学技术的应用1.4.1 组学技术在医学领域的应用1.4.2 组学技术在生命科学领域的应用1.4.3 组学技术在食品领域的应用1.5 组学发展历程第二章 组学产业链研究2.1 组学产业链概览2.2 下游终端用户特征2.3 中游组学科研服务企业特征2.3.1 景杰生物2.3.2 华大基因2.4 上游仪器及试剂耗材厂商特征第三章 液质联用仪在组学领域的市场综合分析3.1 液质联用仪在组学领域的市场概况3.2 液质联用仪在组学领域主流品牌关键业务情况3.2.1 布鲁克3.2.2 赛默飞3.2.3 SCIEX第四章 液质联用仪在组学科研服务企业的情况分析4.1 主流组学科研服务企业业务布局一览4.2 主流组学科研服务企业拥有的液质联用仪一览4.3 质谱在组学服务机构的品牌分布情况第五章 组学领域液质在重大仪器平台的情况分析5.1 重大平台组学领域液质启用时间分布情况5.2 重大平台组学质谱省份分布情况5.3 重大平台组学液质联用仪品牌分布情况5.4 重大平台组学液质联用仪采购单位类型分布情况第六章 总结概述
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