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单细胞蛋白质表达定量分析系统

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  • Nature Communications |PiSPA平台:单细胞蛋白质组分析新工具

    近日,[b]科创中心生物与分子智造研究院分子智造研究所所长方群教授团队[/b]再出新成果!团队[b]开发了“点取式”单细胞蛋白质组分析(PiSPA)工作流程和基于纳升级微流控液滴操控机器人,实现了单细胞的精准捕获、前处理以及自动进样,并首次在单个哺乳动物细胞中实现了高达3000种蛋白质的超高定量深度[/b]。目前,相关研究成果以“ Pick-up single-cell proteomic analysis for quantifying up to 3000 proteins in a Mammalian cell ”为题在国际权威期刊《自然通讯》上发表。[b]这项成果也再次向我们证明了单细胞蛋白质组学在诊疗和预防、药物开发、癌症基因组学等精准医学研究中的应用潜力。[/b][align=center][img=,700,444]https://img1.17img.cn/17img/images/202402/uepic/a2bc5a12-447c-42f5-901c-d7cd2ada8821.jpg[/img][/align][align=center]团队自研的探针式微流控液滴操纵机器人系统[/align][color=#0070c0][b]更强大的单细胞蛋白质组分析工具:PiSPA工作流程[/b][/color]单细胞蛋白质组学技术是近年来生命科学领域研究的热点。因单个细胞中的蛋白质含量极微(仅约0.2 ng)且无法扩增,单细胞蛋白质组分析极具挑战性。目前传统蛋白质组分析技术仅能在每个细胞中鉴定1000种左右的蛋白质,而这在单细胞分析领域显得有些“力不从心”。此外,传统的样本前处理操作大多在微升级反应器中进行,在样品处理和转移的过程中会出现明显的样品损失,这会限制单细胞蛋白质组学的鉴定深度,难以满足生命科学研究的迫切需求。“想要突破单细胞蛋白质组学鉴定深度的障碍,有两种策略。一是在足够小的微反应器中进行样品前处理,利用微尺度效应提高反应效率;二是将所有操作整合在一起,降低样品损失,但这两种策略对技术与设备的要求都很高”,本项成果第一完成人王宇博士解释道,“我们利用微流控技术将商品化的内插管改造为阵列化的纳升级微反应器,解决了纳升级样品反应与自动进样的问题。PiSPA平台可自动完成细胞捕获、样品前处理、色谱分离、质谱检测、数据处理等操作,进一步降低了样品损失。”[align=center][img=,700,303]https://img1.17img.cn/17img/images/202402/uepic/63b80008-6467-4583-b1b7-147e9680c481.jpg[/img][/align][align=center]“点取式”单细胞蛋白质组分析流程示意图[/align][b]PiSPA工作流程使得高精度的液体操控、单细胞的精确处理以及先进的LC-TIMS-QTOF MS技术融为一体,重新定义了单细胞蛋白质组学分析。[/b]“在研究中,我们将该平台应用于三种哺乳动物细胞(HeLa、A549和U2OS细胞)的单细胞蛋白质组分析,以及HeLa细胞迁移过程中的细胞异质性研究中,均实现了超高深度定量分析”,王宇博士说。同时,迁移细胞的单细胞蛋白质组分析也证实了PiSPA平台具有识别细胞迁移关键分子以及有价值靶点的应用潜力。[align=center][img=,700,394]https://img1.17img.cn/17img/images/202402/uepic/b4d136ba-e078-4fc6-b59d-911f8f0abfcc.jpg[/img][/align][align=center]哺乳动物细胞的单细胞蛋白质组分析结果[/align][color=#0070c0][b]单细胞的定量深度:从3000+走向全蛋白质组测序[/b][/color]PiSPA平台集成了基于序控液滴(SODA)技术的自动化液滴操纵机器人,能够在“点取式”操作模式下实现纳升级的细胞分选、多步样品前处理和自动进样操作。相比于其他单细胞分析方法,[b]PiSPA平台的优势主要体现在与成像技术结合,能够灵活地选择任意单个细胞进行分析,目标细胞的捕获指向性强,具有很高的捕获准确性和成功率,并可保留目标细胞的表观和空间信息,显著增加了单细胞分析的信息维度[/b]。其次,PiSPA平台采用针对单细胞样品的“定制化”分析条件,实现了蛋白质鉴定深度的大幅提升,能够为生物医学研究提供更多有效的基础数据。这些优势对推动单细胞蛋白质组分析的实际推广应用具有重要意义。“目前的单细胞定量深度只是一个起点”,方群教授分享道,在该项研究中,可从单个哺乳动物细胞中可定量多达3000种蛋白质,约占人类基因编码蛋白质总数(约20,000种)的15%,其鉴定深度已经达到10年前单细胞转录组测序技术的相近水平。类比单细胞转录组测序技术的发展历史,可以预见当前已处于单细胞蛋白质组分析技术的爆发阶段,随着技术的快速革新,单细胞的定量鉴定深度还将得到史无前例的提升。“这意味着单细胞蛋白质组学技术已进入在广泛的生物医学研究领域中实际应用的阶段。”[align=center][img=,700,315]https://img1.17img.cn/17img/images/202402/uepic/0ff9f496-19a8-4d58-a0de-a5d54a37ad74.jpg[/img][/align][b]团队表示,未来,他们将进一步提高单细胞蛋白质组分析的鉴定深度和通量,以持续推进该技术实用化和应用拓展的水平[/b]。此外,在上述成果基础上,目前团队还在利用iChemFoundry平台的自动化机器人技术和机器视觉技术构建能够完成单细胞蛋白质组分析全部流程操作自动化的分析平台,很快会有新的成果发布,这些都将为人们了解生命活动中细胞异质性的变化带来更有力工具。[来源:浙大杭州科创中心][align=right][/align]

  • 无细胞蛋白表达系统优缺点详解

    [font=宋体][font=宋体]无细胞蛋白表达系统([/font][font=Calibri]Cell-Free Protein Expression System[/font][font=宋体])是一种基于原核和真核细胞提取物构建的体外蛋白表达系统。它具有许多优点,例如可以在短时间内生产大量的蛋白质,同时避免了细胞内的复杂调控机制和翻译后修饰等繁琐过程。因此,无细胞蛋白表达系统在生物制药、生物材料、生物燃料等领域具有广泛的应用前景。本文将详细介绍无细胞蛋白表达系统的优缺点。[/font][/font][font=宋体][b]一、无细胞蛋白表达系统的优点[/b][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri]1.[/font][font=宋体]高效性:无细胞蛋白表达系统具有高表达效率的优点,这是由于体外体系中不存在靶蛋白累积所需的细胞分裂和细胞复杂代谢反应。此外,由于无细胞蛋白表达系统不受到细胞毒性和免疫反应的限制,可以实现大规模的蛋白质表达。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri]2.[/font][font=宋体]灵活性:无细胞蛋白表达系统可以使用一系列不同的原核和真核细胞提取物作为反应体系,例如[/font][font=Calibri]E.coli[/font][font=宋体]、小麦胚芽和人类细胞等。这意味着可以根据不同的实验目的和需求进行合理的选择,以适应多样化的研究需要。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri]3.[/font][font=宋体]易操作性:无细胞蛋白表达系统非常容易操作。与传统的细胞表达系统相比,无细胞蛋白表达系统不需要细胞培养、生长和繁殖。此外,无细胞蛋白表达系统可以快速进行,通常只需要数小时至几天即可完成目标蛋白的表达。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri]4.[/font][font=宋体]简单纯化:由于无细胞蛋白表达系统可以避免有机溶剂和离子交换剂等复杂的步骤,从而使目标蛋白的纯化工作更加简便和迅速。例如,可以使用亲和柱、凝胶过滤和电泳分析等方法来快速分离和纯化蛋白质。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][b]二、无细胞蛋白表达系统的缺点[/b][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri]1.[/font][font=宋体]成本较高:尽管无细胞蛋白表达系统可以大规模进行蛋白质表达,但是所需的原核和真核细胞提取物通常需要较高的成本。此外,涉及到的一些试剂和设备也比较昂贵,使得无细胞蛋白表达系统在应用过程中存在一定的经济压力。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri]2.[/font][font=宋体]表达限制:由于无细胞蛋白表达系统缺乏复杂的代谢反应和细胞分化机制,因此它不适用于某些特定类型的蛋白。例如,它无法表达复杂的膜蛋白和困难的药物蛋白等。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri]3.[/font][font=宋体]不稳定性:无细胞蛋白表达系统通常具有一定的稳定性问题。由于缺乏细胞膜的保护,无细胞蛋白表达体系会更容易受到外部条件的影响,如温度、[/font][font=Calibri]pH[/font][font=宋体]、离子浓度等,从而导致蛋白质的不稳定性、聚集和降解等现象。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri]4.[/font][font=宋体]不适合复杂蛋白结构:无细胞蛋白表达系统对于复杂蛋白结构的模拟效果不佳。例如,膜蛋白、多肽和糖蛋白等复杂蛋白质可能会被无细胞蛋白表达系统无法很好地复制,从而限制了其应用范围。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体]无细胞蛋白表达系统具有高效、灵活、易操作、简单纯化等优点,但同时也存在着成本较高、表达限制、不稳定性和不适合复杂蛋白结构等缺点。在实际应用中,需要根据具体的研究目的和需求进行选择,并结合其他技术手段来弥补其不足之处。[/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=宋体]义翘神州提供[url=https://cn.sinobiological.com/services/cell-free-protein-synthesis-service][b]无细胞蛋白表达服务[/b][/url],服务优势:[/font][font=宋体]①快速、高效 ②高成功率 ③一致性 ④高难度抗体表达[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=宋体]详情可以咨询,具体[/font][font=Calibri]https://cn.sinobiological.com/services/cell-free-protein-synthesis-service[/font][/font]

  • 无细胞蛋白表达:优势及应用详解

    [font=宋体][font=宋体]无细胞蛋白表达是一种体外重组蛋白质表达技术也称为无细胞蛋白质合成技术([/font][font=Calibri]CFPS[/font][font=宋体]:[/font][font=Calibri]Cell-free protein synthesis[/font][font=宋体]),是指用含有蛋白合成必需的组分(核糖体,转运[/font][font=Calibri]RNA[/font][font=宋体],氨酰合成酶,启动[/font][font=Calibri]/[/font][font=宋体]延伸[/font][font=Calibri]/[/font][font=宋体]终止因子,三磷酸鸟苷,[/font][font=Calibri]ATP[/font][font=宋体],[/font][font=Calibri]Mg2+[/font][font=宋体]和[/font][font=Calibri]K+[/font][font=宋体])的细胞裂解物在体外进行蛋白合成。无细胞蛋白表达技术适用于制备各种类型的蛋白质,包括难表达蛋白质、毒性蛋白质、复杂蛋白质等。在药物研究、生物制造和生命科学等领域中得到广泛关注和应用,无论是研究、开发还是商业化应用过程。目前无细胞蛋白表达主要应用于药物研发领域,例如抗体制备和生物药物生产等。随着人工智能技术的不断发展,无细胞蛋白表达技术可以与人工智能算法结合,构建计算机辅助的高通量生产系统,实现个性化、精准的生物医学治疗。除此之外,还能够应用于其他领域,例如基因工程、环境保护和农业生产等。随着无细胞蛋白表达技术的不断发展和人工智能技术的不断进步,我们可以看到更多的新领域和新应用出现,给生物科技行业带来更多的机遇和挑战。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体] [/font][b][font=宋体]相较于传统的活细胞蛋白表达技术,无细胞蛋白表达技术具有以下几个显著的优势:[/font][/b][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri]1. [/font][font=宋体]更高的蛋白质表达量:传统的活细胞蛋白表达技术受限于细胞本身的多方面因素,其表达的蛋白质数量往往受到限制。而无细胞蛋白表达技术通过在体外底物浓度高的环境中进行合成反应,不但避免了传统活细胞表达所面临的方方面面的限制,还能够很好地控制反应体系,从而获得表达量更高的蛋白质。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri]2. [/font][font=宋体]更快的表达速度:传统活细胞蛋白表达需要细胞生长并达到最佳密度才能进行蛋白质表达,这个过程往往需要数天时间。而无细胞蛋白表达技术通常只需要数小时就能够完成蛋白质的表达,这个速度明显快于传统活细胞表达技术。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri]3. [/font][font=宋体]更精准的蛋白质合成:无细胞蛋白表达技术在体外进行蛋白质合成,能够精确控制底物浓度、反应温度、反应剂比例等参数,因此可以更加精准地合成定制的蛋白质,这对于研究和应用来讲具有重要意义。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri]4. [/font][font=宋体]更灵活控制:在无细胞蛋白表达技术中,可以使用分离的组分体系进行蛋白质的合成,可以控制底物和反应剂的比例,也可以在适当的反应条件下进行自定义的修饰,如蛋白质标记、药效分析等。这些优点使得无细胞蛋白表达技术更加灵活、可控,适用于更广泛的应用领域。[/font][/font][font=宋体] [/font][b][font=宋体] [/font][font=宋体]无细胞蛋白表达应用[/font][/b][font=宋体] [/font][font=宋体]无细胞蛋白表达技术是一种飞速发展的新型生物技术,具有广阔的应用前景和潜力。该技术可以快速、高效、经济地合成蛋白质,可广泛应用于医疗、制药、农业、生物材料等多个领域。[/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri]1. [/font][font=宋体]医疗领域:无细胞蛋白表达技术在医疗领域应用广泛,可以用于生产多种蛋白质药品,如单克隆抗体等。其中,单克隆抗体是一种重要的治疗药物,具有高度特异性和亲和力,可用于肿瘤、心血管疾病、自身免疫性疾病等疾病的治疗。传统单克隆抗体生产方法需要花费大量时间和成本,而无细胞蛋白表达技术则可以在短时间内大规模合成单克隆抗体,从而大大缩短生产周期,并且可以降低成本。此外,无细胞蛋白表达技术也可以用于疫苗研发。比如疟疾疫苗研究开发昂贵又耗时,目前利用[/font][font=Calibri]WGE[/font][font=宋体]系统可加速疫苗研发,并建立高通量疟原虫抗体筛查系统。[/font][font=Calibri]Stark[/font][font=宋体]等利用大肠杆菌的便携式冻干裂解物再水化,[/font][font=Calibri]1h[/font][font=宋体]内合成高致病性病原体土拉弗朗西斯菌亚种的生物偶联疫苗,与工程菌生产的疫苗相比,其可引发更高水平的病原体特异性抗体。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri]2. [/font][font=宋体]制药领域:是无细胞蛋白表达技术的一个重要应用领域。药物开发的成功率取决于药物分子对目标蛋白的亲和力,而目标蛋白对于专一的细胞表达系统和分类的组织或器官非常敏感。通过无细胞蛋白表达技术,研究人员可以在不依赖于细胞的情况下直接生产大量需要的蛋白质,为药物研发提供了更快更便捷的方法。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri]3. [/font][font=宋体]基础研究领域:利用无细胞蛋白质合成系统可以直接对表达产物进行核磁共振分析,目前已确定了数千个蛋白质的结构。可以通过合成蛋白质建立蛋白质阵列,解开基因产物的功能;应用核糖体展示和 [/font][font=Calibri]mRNA [/font][font=宋体]展示技术,更有利于实现高通量筛选,全面深入研究基因特征和功能。通过无细胞蛋白表达技术可以实现对大型蛋白质的生产和分析,同时也为基础研究打开了新的研究领域。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=宋体]目前义翘神州无细胞合成服务正在活动中,活动时间[/font][font=Calibri]2023[/font][font=宋体]年[/font][font=Calibri]10[/font][font=宋体]月[/font][font=Calibri]23[/font][font=宋体]日[/font][font=Calibri]-12[/font][font=宋体]月[/font][font=Calibri]31[/font][font=宋体]日。有需求的可以咨询或者进入义翘神州网进行查看。更多详情可以关注[/font][font=Calibri]https://cn.sinobiological.com/services/cell-free-protein-synthesis-service[/font][/font]

  • 蛋白质组,蛋白质组学及研究技术路线

    基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然,不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的蛋白质称为蛋白质组(proteome)。同理,不同细胞在不同生理或病理状态下所表达的蛋白质的种类也不尽相同。蛋白质是基因功能的实施者,因此对蛋白质结构,定位和蛋白质-蛋白质相互作用的研究将为阐明生命现象的本质提供直接的基础。生命科学是实验科学,因此生命科学的发展极大地依赖于实验技术的发展。以DNA序列分析技术为核心的基因组研究技术推动了基因组研究的日新月异,而以基因芯片技术为代表的基因表达研究技术为科学家了解基因表达规律立下汗马功劳。在蛋白质组研究中,二维电泳和质谱技术的黄金组合又为科学家掌握蛋白质表达规律再铸辉煌。蛋白质组学(proteomics)就是指研究蛋白质组的技术及这些研究得到的结果。蛋白质组学的研究试图比较细胞在不同生理或病理条件下蛋白质表达的异同,对相关蛋白质进行分类和鉴定。更重要的是蛋白质组学的研究要分析蛋白质间相互作用和蛋白质的功能。蛋白质组学的研究内容包括:1.蛋白质鉴定:可以利用一维电泳和二维电泳并结合Western等技术,利用蛋白质芯片和抗体芯片及免疫共沉淀等技术对蛋白质进行鉴定研究。2.翻译后修饰:很多mRNA表达产生的蛋白质要经历翻译后修饰如磷酸化,糖基化,酶原激活等。翻译后修饰是蛋白质调节功能的重要方式,因此对蛋白质翻译后修饰的研究对阐明蛋白质的功能具有重要作用。3.蛋白质功能确定:如分析酶活性和确定酶底物,细胞因子的生物分析/配基-受体结合分析。可以利用基因敲除和反义技术分析基因表达产物-蛋白质的功能。另外对蛋白质表达出来后在细胞内的定位研究也在一定程度上有助于蛋白质功能的了解。Clontech的荧光蛋白表达系统就是研究蛋白质在细胞内定位的一个很好的工具。4.对人类而言,蛋白质组学的研究最终要服务于人类的健康,主要指促进分子医学的发展。如寻找药物的靶分子。很多药物本身就是蛋白质,而很多药物的靶分子也是蛋白质。药物也可以干预蛋白质-蛋白质相互作用。在基础医学和疾病机理研究中,了解人不同发育、生长期和不同生理、病理条件下及不同细胞类型的基因表达的特点具有特别重要的意义。这些研究可能找到直接与特定生理或病理状态相关的分子,进一步为设计作用于特定靶分子的药物奠定基础。不同发育、生长期和不同生理、病理条件下不同的细胞类型的基因表达是不一致的,因此对蛋白质表达的研究应该精确到细胞甚至亚细胞水平。可以利用免疫组织化学技术达到这个目的,但该技术的致命缺点是通量低。LCM技术可以精确地从组织切片中取出研究者感兴趣的细胞类型,因此LCM技术实际上是一种原位技术。取出的细胞用于蛋白质样品的制备,结合抗体芯片或二维电泳-质谱的技术路线,可以对蛋白质的表达进行原位的高通量的研究。很多研究采用匀浆组织制备蛋白质样品的技术路线,其研究结论值得怀疑,因为组织匀浆后不同细胞类型的蛋白质混杂在一起,最后得到的研究数据根本无法解释蛋白质在每类细胞中的表达情况。虽然培养细胞可以得到单一类型细胞,但体外培养的细胞很难模拟体内细胞的环境,因此这样研究得出的结论也很难用于解释在体实际情况。因此在研究中首先应该将不同细胞类型分离,分离出来的不同类型细胞可以用于基因表达研究,包括mRNA和蛋白质的表达。LCM技术获得的细胞可以用于蛋白质样品的制备。可以根据需要制备总蛋白,或膜蛋白,或核蛋白等,也可以富集糖蛋白,或通过去除白蛋白来减少蛋白质类型的复杂程度。相关试剂盒均有厂商提供。蛋白质样品中的不同类型的蛋白质可以通过二维电泳进行分离。二维电泳可以将不同种类的蛋白质按照等电点和分子量差异进行高分辨率的分离。成功的二维电泳可以将2000到3000种蛋白质进行分离。电泳后对胶进行高灵敏度的染色如银染和荧光染色。如果是比较两种样品之间蛋白质表达的异同,可以在同样条件下分别制备二者的蛋白质样品,然后在同样条件下进行二维电泳,染色后比较两块胶。也可以将二者的蛋白质样品分别用不同的荧光染料标记,然后两种蛋白质样品在一块胶上进行二维电泳的分离,最后通过荧光扫描技术分析结果。胶染色后可以利用凝胶图象分析系统成像,然后通过分析软件对蛋白质点进行定量分析,并且对感兴趣的蛋白质点进行定位。通过专门的蛋白质点切割系统,可以将蛋白质点所在的胶区域进行精确切割。接着对胶中蛋白质进行酶切消化,酶切后的消化物经脱盐/浓缩处理后就可以通过点样系统将蛋白质点样到特定的材料的表面(MALDI-TOF)。最后这些蛋白质就可以在质谱系统中进行分析,从而得到蛋白质的定性数据;这些数据可以用于构建数据库或和已有的数据库进行比较分析。实际上像人类的血浆,尿液,脑脊液,乳腺,心脏,膀胱癌和磷状细胞癌及多种病原微生物的蛋白质样品的二维电泳数据库已经建立起来,研究者可以登录www.expasy.ch/www/tools.html等网站进行查询,并和自己的同类研究进行对比分析。Genomic Solution可以为研究者提供除质谱外的所有蛋白质组学研究工具,包括二维电泳系统,成像系统及分析软件,胶切割系统,蛋白质消化浓缩工作站,点样工作站等;同时还可以提供相关试剂和消耗品。LCM-二维电泳-质谱的技术路线是典型的一条蛋白质组学研究的技术路线,除此以外,LCM-抗体芯片也是一条重要的蛋白质组学研究的技术路线。即通过LCM技术获得感兴趣的细胞类型,制备细胞蛋白质样品,蛋白质经荧光染料标记后和抗体芯片杂交,从而可以比较两种样品蛋白质表达的异同。Clontech最近开发了一张抗体芯片,可以对378种膜蛋白和胞浆蛋白进行分析。该芯片同时配合了抗体芯片的全部操作过程的重要试剂,包括蛋白质制备试剂,蛋白质的荧光染料标记试剂,标记体系的纯化试剂,杂交试剂等。对于蛋白质相互作用的研究,酵母双杂交和噬菌体展示技术无疑是很好的研究方法。Clontech开发的酵母双杂交系统和NEB公司开发的噬菌体展示技术可供研究者选用。关于蛋白质组的研究,也可以将蛋白质组的部分或全部种类的蛋白质制作成蛋白质芯片,这样的蛋白质芯片可以用于蛋白质相互作用研究,蛋白表达研究和小分子蛋白结合研究。Science,Vol.293,Issue 5537,2101-2105,September 14,2001发表了一篇关于酵母蛋白质组芯片的论文。该文主要研究内容为:将酵母的5800个ORF表达成蛋白质并进行纯化点样制作芯片,然后用该芯片筛选钙调素和磷脂分子的相互作用分子。最后有必要指出的是,传统的蛋白质研究注重研究单一蛋白质,而蛋白质组学注重研究参与特定生理或病理状态的所有的蛋白质种类及其与周围环境(分子)的关系。因此蛋白质组学的研究通常是高通量的。适应这个要求,蛋白质组学相关研究工具通常都是高度自动化的系统,通量高而速度快,配合相应分析软件和数据库,研究者可以在最短的时间内处理最多的数据。

  • 【求助】日立F-4500荧光分光光度计是否能对细胞内EGFP进行定量分析?

    如题,立F-4500荧光分光光度计是否能对细胞内EGFP进行定量分析?我向Hela细胞中转入了绿色荧光蛋白,想对绿色荧光蛋白的表达量进行定量分析。不知道用荧光分光光度计是否可行?谢谢![color=red][I]疯子哥提示:由于你发的内容与GC无关,已经将其转到对应的版面,谢谢参与![/I][/color]

  • 带你领略ICP-MS的应用前沿——基于ICP-MS的蛋白质定量分析

    带你领略ICP-MS的应用前沿——基于ICP-MS的蛋白质定量分析

    [url=https://insevent.instrument.com.cn/t/yp][color=#3333ff]ICP-MS[/color][/url]技术是80年代发展起来的新的分析测试技术。它以将ICP的高温(8000K)电离特性与四极杆质谱计的灵敏快速扫描的优点相结合而形成一种新型的最强有力的元素分析、同位素分析和形态分析技术。该技术提供了极低的检出限、极宽的动态线性范围、谱线简单、干扰少、分析精密度高、分析速度快以及可提供同位素信息等分析特性。目前,在[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/yp][color=#3333ff]电感耦合等离子体质谱[/color][/url]技术上面的突破性技术已经越来越少,但在[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/yp][color=#3333ff]ICPMS[/color][/url]应用方面却在不断的扩大,比如应用[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/yp][color=#3333ff]ICP-MS[/color][/url]对蛋白质进行定量分析。一般来说蛋白质的定量分析主要借助于生物质谱,但是随着生命科学的迅猛发展,[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/yp][color=#3333ff]ICP-MS[/color][/url]凭借其诸多优点也开始进入并活跃在蛋白质分析领域。本文就带你走进[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/yp][color=#3333ff]ICP-MS[/color][/url]的应用前沿,领略下基于[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/yp][color=#3333ff]ICP-MS[/color][/url]蛋白质定量分析的几种相关技术。基于[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/yp][color=#3333ff]ICP-MS[/color][/url] 的蛋白质定量分析方法主要有以下几种,如下图所示,本文将一一叙述。[color=teal][/color][img=,538,358]http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2018/04/201804041432166086_2066_1615758_3.png!w538x358.jpg[/img]一、基于金属元素的蛋白质[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/yp][color=#3333ff]ICP-MS[/color][/url]定量技术[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/yp][color=#3333ff]ICP-MS[/color][/url]对蛋白的定量主要是通过测定金属元素的含量,再根据每种蛋白质所含金属的计量比,计算出蛋白质的绝对量。有文献利用65Cu作为稀释剂,采用[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/yp][color=#3333ff]ICP-MS[/color][/url]同位素稀释法法对含铜的蛋白进行绝对定量。[img=,578,314]http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2018/04/201804041433401796_21_1615758_3.png!w578x314.jpg[/img]二、基于硒元素的[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/yp][color=#3333ff]ICP-MS[/color][/url]蛋白质定量技术硒在体内主要通过硒蛋白发挥作用,人体血液中96%~98%的硒是和蛋白质结合的,一般以硒代半胱氨酸(Sec)、硒代甲硫氨酸的形式结合在蛋白质中。同位素稀释质谱[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/yp][color=#3333ff]ICP-MS[/color][/url] 定量法利用标记77Se 的硒代甲硫氨酸作为稀释剂,通过测定硒代甲硫氨酸77Se 和80Se 的丰度比从而进行定量。[img=,664,306]http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2018/04/201804041446313436_7795_1615758_3.png!w664x306.jpg[/img]三、基于硫元素的[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/yp][color=#3333ff]ICP-MS[/color][/url]蛋白质定量技术在[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/yp][color=#3333ff]ICP-MS[/color][/url] 可以测量的所有元素中,硫是最适合作为蛋白质定量分析的内标元素.这是由于S 是蛋白质中一种常见的元素,S 原子多以共价键稳定地存在于蛋白质分子中.蛋白质有两种氨基酸,即蛋氨酸和半胱氨酸含有硫元素。如果某种蛋白质已经由生物质谱鉴定,或者这种蛋白质分子的氨基酸序列和其中含有的S 原子数已知,那么就可以通过[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/yp][color=#3333ff]ICP-MS[/color][/url] 直接测定半胱氨酸或甲硫氨酸中硫的含量实现蛋白质的绝对定量。[img=,664,269]http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2018/04/201804041449050956_1648_1615758_3.png!w664x269.jpg[/img]四、基于磷元素[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/yp][color=#3333ff]ICP-MS[/color][/url] 测定的蛋白质定量技术磷是生物体中最重要的元素之一。磷酸化过程是调节蛋白质活性的重要过程,揭示蛋白质磷酸化修饰发生规律是理解生物体复杂多样的生物进程的一个重要前提。磷酸化蛋白在样本中含量低且动态范围广、蛋白质磷酸化水平不均一、磷酸化修饰类型多,这些特点决定了对磷酸化蛋白的研究具有挑战性。蛋白质分子中磷的测定可以对蛋白质的磷酸化状态提供重要信息。[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/yp][color=#3333ff]ICP-MS[/color][/url] 对元素的测定与分析物的结构无关,只与分析物中元素的含量有关,因此[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/yp][color=#3333ff]ICP-MS[/color][/url] 不仅能够鉴定蛋白质中磷的存在,而且可准确测定蛋白质的磷酸化程度。[img=,563,296]http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2018/04/201804041449182306_4389_1615758_3.png!w563x296.jpg[/img]五、基于元素标记的[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/yp][color=#3333ff]ICP-MS[/color][/url]蛋白质定量技术稀土金属元素的化学物理性质非常相近,在液相上能共金属元素的化学物理性质非常相近,在液相上能共洗脱。与硫、磷等元素相比,稀土金属元素在[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/yp][color=#3333ff]ICP-MS[/color][/url] 中质谱响应更强,受到的同量异位素干扰较少,更容易检测。因此,利用[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/yp][color=#3333ff]ICP-MS[/color][/url] 检测蛋白质标记的稀土金属从而进行蛋白质定量的方法具有很大的应用前景。将标记元素引入蛋白质的方法主要有两种:通过共价键直接将杂原子与特定氨基酸结合;通过配位化合物引入金属元素。标记时既可以标记蛋白质或肽的主链(N或C端) ,也可以标记其中的氨基酸(Cys、Met、Lys 等)。主要有碘、汞、稀土等。[img=,639,345]http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2018/04/201804041451025126_6783_1615758_3.png!w639x345.jpg[/img][img=,615,352]http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2018/04/201804041451027144_9325_1615758_3.png!w615x352.jpg[/img][url=https://insevent.instrument.com.cn/t/yp][color=#3333ff]ICP-MS[/color][/url] 作为元素的分析手段, 需要ESI-MS、MALDI-TOF 等生物质谱提供蛋白质结构信息,将元素定量分析的无机质谱和蛋白质结构分析的生物质谱有机地结合。基于分离技术的发展和其他质谱技术的辅助,蛋白质的[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/yp][color=#3333ff]ICP-MS[/color][/url] 定量技术在生物样本的蛋白质定量和蛋白质组学研究中会具有潜在广泛的应用价值。

  • 【转帖】质谱与蛋白质组学

    质谱与蛋白质组学蛋白质组学对一个细胞或组织所表达的蛋白质进行的系统分析,而质谱是它的关键性分析工具。在过去的两年中,标准蛋白质组技术中的进展增进了更高水平自动化和敏感性的蛋白质识别技术。另外,新的技术促成了鉴定蛋白质功能相关特性的里程碑性的进展,包括它们的定量和在蛋白质复合物中复杂情况。缩写2DE two-dimensional gel electrophoresis双向凝胶电泳CID collision-induced dissociation碰撞诱导的解离ESI electrospray ionization电喷雾离子化FT-ICR Fourier-transform ion cyclotron resonance傅里叶-变换离子回旋加速器共振ICAT isotope-coded affinity tagsIEF isoelectric focusing等电聚焦MALDI matrix-assisted laser desorption ionization基质辅助的激光解析离子化Q-TOF quadrupole-TOFRP reversed phase反向TOF time-of-flight飞行时间简介蛋白质组学的核心组成是系统识别一个细胞或组织中表达的每一个蛋白质,以及确定每个蛋白质的突出特征(比如,丰度、修饰状态以及在多蛋白质复合体中的复杂状态)。这些分析的技术包括分离蛋白质和肽的分离科学、识别和定量分析物的分析科学和数据管理和分析的生物信息学。它的初步工具包括使用IEF(等电点聚焦)/SDS-PAGE凝胶的高分辨率的双向凝胶电泳(2DE),结合质谱和数据库搜索来分离、识别和定量在一个复合样本中存在的个体蛋白质,最终识别被分离的蛋白质。一个常用的方法用在Fig1中用图解说明。此技术以及由此而来的变化(综述见[1])已经被用来识别和分类在复杂样本中存在的大量蛋白质,并在蛋白质组数据库中呈现它们,该过程我们这里称之为"描述蛋白质组学"比如,Shevchenko等[2]从2D凝胶上系统地鉴定了150个蛋白质。数目庞大的这样的数据库现在可以找到。同样的技术现在已经被作为普遍的发现工具来动态检测一个细胞或组织对外来或内部干扰反应而在蛋白质组中的改变。因为检测动态改变需要精确定量每个被检测成分,我们使用"定量蛋白质组学"来定义。在此报告中,我们总结了自1999年1月至2000年4月来报道的与蛋白质组学和质谱相关的最重要的进展。在核心质谱技术中的进展已经导致2DE为基础的蛋白质组学技术的进一步改进。它们同时又促进了传统凝胶为基础的方法的替代方法,诸如引入以同位素稀释理论为基础的精确蛋白质定量技术和蛋白质复合物的系统分析。蛋白质组分析的MS技术进展在此部分,我们总结了在MS设备、它们的控制和操作中的进展,以及比较质谱数据和序列数据库识别蛋白质所用的搜索工具的进展。随着新型质谱仪的引入,蛋白质组学研究现存类型的质谱仪性能已经显著改进了。在此综述期间最普遍使用的仪器是可以分为两类:单一阶段的质谱仪和串联质谱为基础的系统。单一阶段的质谱仪,最显著的是基质辅助的激光解吸电离(MALDI)飞行时间(TOF)仪器,被用于无数通过肽质谱图谱技术大规模蛋白质识别的项目中。此方法在鉴别表达自小一些的和完全测序的基因组的蛋白质特别成功[3,4]。串联质谱仪器诸如triple quadrpole、离子捕获(ion-trap)和近来引进的混合quadrupole飞行时间(Q-TOF)被常规应用于[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Yp][color=#3333ff]LC-MS[/color][/url]/MS或用电喷雾电离(ESI)来生成肽片段离子谱,以便通过搜寻序列数据库进行蛋白质鉴定。使用仪器控制程序来自动选择肽离子进行碰撞诱导的解离(CID)(数据依赖CID)的不断增多是这些MS/MS仪器的一个明显的趋势。一些新的构造的具有高潜能的质谱仪被引入到蛋白质组学研究中产生深刻影响。两个研究组近来一个MALDI离子源和一个混合Q-TOF耦联了起来[5,6]。Q-TOF提供的质量准确性和敏感性提升了数据库搜寻结果并同时使它成为MS/MS从头测序的当然仪器选择。MALDI Q-TOF构造提供了激动人心的机会进行自动化和高通量应用以及在一个样品盘上存档样品进行日后研究的可能。Medzihradszky等[7]描述了一个不同的混合仪器称之为MALDI TOF TOF。此设备享有许多MALDI Q-TOF的优点,另外能够进行高能量CID和非常快速的扫描速率。傅里叶-变换离子回旋加速器共振(FT-ICR)质谱对于蛋白质组学来说相对陌生。这些设备具有非常高的敏感性和分辨率,质量精确性可以达到1ppm。这些特征被用来在一次分析中测量和定量几百种蛋白质的完整的分子质量[8]。Goodlett等[9]表明FT-MS测量的一个肽的准确质量以及可以容易获得的限制因素能够通过序列数据库搜索被用来识别蛋白质。蛋白质组学如果没有软件工具来进行质谱数据和序列数据库的关联将变得几无可能。现存的数据库搜索程序已经变得越来越成熟和可以(从网络)可获得。另外,引入了新的算法。主要相关程序是Sequest[10],MASCOT[11],PeptedeSearch[12],PROWL[13]和Protein Prospector[14]。在它们中间,Sequest使用CID谱设置了蛋白质识别的实验室标准(benchmark),因为它与边界MS/MS数据工作得最好,并高度可信,可以从整个[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Yp][color=#3333ff]LC-MS[/color][/url]/MS实验中自动分析数据,并不需要任何使用者的破译工作。在所提的程序中,然而,只有Sequest不能在网络上搜索。MASCOT是一个新的、快速、网络可进入和多功能的程序,具有进行肽指纹分析、用部分破译或未破译的CID谱进行数据库搜索的功能。

  • 蛋白质相互作用组学分析技术

    为探究生物进程的分子机制,需要确定介导这个过程的蛋白质-蛋白质间的相互作用。研究蛋白质间相互作用的主要技术总结如下:一、酵母双杂交系统酵母双杂交系统是当前广泛用于蛋白质相互作用组学研究的一种重要方法。其原理是当靶蛋白和诱饵蛋白特异结合后,诱饵蛋白结合于报道基因的启动子,启动报道基因在酵母细胞内的表达,如果检测到报道基因的表达产物,则说明两者之间有相互作用,反之则两者之间没有相互作用。将这种技术微量化、阵列化后则可用于大规模蛋白质之间相互作用的研究。在实际工作中,人们根据需要发展了单杂交系统、三杂交系统和反向杂交系统等。Angermayr等设计了一个SOS蛋白介导的双杂交系统。可以研究膜蛋白的功能,丰富了酵母双杂交系统的功能。此外,酵母双杂交系统的作用也已扩展至对蛋白质的鉴定。二、噬茵体展示技术在编码噬菌体外壳蛋白基因上连接一单克隆抗体的DNA序列,当噬菌体生长时,表面就表达出相应的单抗,再将噬菌体过柱,柱上若含目的蛋白,就会与相应抗体特异性结合,这被称为噬菌体展示技术。此技术也主要用于研究蛋白质之间的相互作用,不仅有高通量及简便的特点,还具有直接得到基因、高选择性的筛选复杂混合物、在筛选过程中通过适当改变条件可以直接评价相互结合的特异性等优点。目前,用优化的噬菌体展示技术,已经展示了人和鼠的两种特殊细胞系的cDNA文库,并分离出了人上皮生长因子信号传导途径中的信号分子。三、等离子共振技术表面等离子共振技术(SurfacePlasmonResonance,SPR)已成为蛋白质相互作用研究中的新手段。它的原理是利用一种纳米级的薄膜吸附上“诱饵蛋白”,当待测蛋白与诱饵蛋白结合后,薄膜的共振性质会发生改变,通过检测便可知这两种蛋白的结合情况。SPR技术的优点是不需标记物或染料,反应过程可实时监控。测定快速且安全,还可用于检测蛋白一核酸及其它生物大分子之间的相互作用。四、荧光能量转移技术荧光共振能量转移(FRET)广泛用于研究分子间的距离及其相互作用;与荧光显微镜结合,可定量获取有关生物活体内蛋白质、脂类、DNA和RNA的时空信息。随着绿色荧光蛋白(GFP)的发展,FRET荧光显微镜有可能实时测量活体细胞内分子的动态性质。提出了一种定量测量FRET效率以及供体与受体间距离的简单方法,仅需使用一组滤光片和测量一个比值,利用供体和受体的发射谱消除光谱间的串扰。该方法简单快速,可实时定量测量FRET的效率和供体与受体间的距离,尤其适用于基于GFP的供体受体对。五、抗体与蛋白质阵列技术蛋白芯片技术的出现给蛋白质组学研究带来新的思路。蛋白质组学研究中一个主要的内容就是研究在不同生理状态下蛋白水平的量变,微型化,集成化,高通量化的抗体芯片就是一个非常好的研究工具,他也是芯片中发展最快的芯片,而且在技术上已经日益成熟。这些抗体芯片有的已经在向临床应用上发展,比如肿瘤标志物抗体芯片等,还有很多已经应用再眼就的各个领域里。六、免疫共沉淀技术免疫共沉淀主要是用来研究蛋白质与蛋白质相互作用的一种技术,其基本原理是,在细胞裂解液中加入抗兴趣蛋白的抗体,孵育后再加入与抗体特异结合的结合于Pansobin珠上的金黄色葡萄球菌蛋白A(SPA),若细胞中有正与兴趣蛋白结合的目的蛋白,就可以形成这样一种复合物:“目的蛋白—兴趣蛋白—抗兴趣蛋白抗体—SPA\|Pansobin”,因为SPA\|Pansobin比较大,这样复合物在离心时就被分离出来。经变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,复合物四组分又被分开。然后经Westernblotting法,用抗体检测目的蛋白是什么,是否为预测蛋白。这种方法得到的目的蛋白是在细胞内天然与兴趣蛋白结合的,符合体内实际情况,得到的蛋白可信度高。但这种方法有两个缺陷:一是两种蛋白质的结合可能不是直接结合,而可能有第三者在中间起桥梁作用;二是必须在实验前预测目的蛋白是什么,以选择最后检测的抗体,所以,若预测不正确,实验就得不到结果,方法本身具有冒险性。七、pull-down技术蛋白质相互作用的类型有牢固型相互作用和暂时型相互作用两种。牢固型相互作用以多亚基蛋白复合体常见,最好通过免疫共沉淀(Co-IP)、Pull-down技术或Far-western法研究。Pull-down技术用固相化的、已标记的饵蛋白或标签蛋白(生物素-、PolyHis-或GST-),从细胞裂解液中钓出与之相互作用的蛋白。通过Pull-down技术可以确定已知的蛋白与钓出蛋白或已纯化的相关蛋白间的相互作用关系,从体外传路或翻译体系中检测出蛋白相互作用关系。

  • 蛋白质检测仪有什么作用

    云唐蛋白质检测仪是一种用于测定食品、生物样品等中蛋白质含量的仪器设备。它在食品科学、生物学、医学和生化等领域具有重要作用,以下是其主要作用:  食品质量控制: 在食品工业中,蛋白质是食品的主要组分之一,其含量影响着食品的口感、质地、营养价值等。蛋白质检测仪可以用于监测食品样品中的蛋白质含量,确保产品的质量稳定性和一致性。  生物学研究: 在生物学研究中,蛋白质是细胞功能和结构的重要组成部分。蛋白质检测仪可以帮助研究人员测定生物样品(如细胞提取物、血清等)中蛋白质含量,从而深入了解细胞的生物学特性和疾病机制。  医学诊断: 在临床医学中,某些疾病的发展可能会导致血清蛋白质含量的改变。蛋白质检测仪可以用于测定血液和尿液中的蛋白质含量,帮助医生进行疾病诊断和监测。  药物研发: 药物研发过程中,蛋白质的定量分析是评估药物效果的重要环节。蛋白质检测仪可以用于分析药物与蛋白质的相互作用,评估药物对蛋白质的影响。  生化实验: 在生化实验室中,蛋白质检测仪常用于定量测定蛋白质样品,用于分析实验数据和评估实验结果的可靠性。  环境监测: 在环境科学领域,蛋白质检测仪可以用于监测水体、土壤等环境中蛋白质的含量,从而评估环境质量。

  • 杆状病毒-昆虫细胞表达系统的优势与局限性

    [b][font=宋体]前言[/font][/b][font=宋体]杆状病毒载体表达系统([/font][font=Calibri]Baculovirus [/font][font=宋体][font=Calibri]e[/font][/font][font=Calibri]xpression [/font][font=宋体][font=Calibri]vector system, BEVS[/font][font=宋体])自[/font][font=Calibri]1983[/font][font=宋体]年问世以来,已广泛应用于疫苗生产、基因治疗等领域。目前已有多种[/font][font=Calibri]BEVS[/font][font=宋体]衍生产品获批使用,如[/font][font=Calibri]HPV[/font][font=宋体]疫苗、流感疫苗和几款兽用疫苗等。[/font][font=Calibri]BEVS[/font][font=宋体]具有安全性高、操作简单、可以无血清培养等优点,但同时也面临表达不稳定和蛋白质糖基化水平低等挑战。本文总结了[/font][font=Calibri]BEVS[/font][font=宋体]的优势和局限性。[/font][/font][font=Calibri] [/font][b][font=宋体]杆状病毒载体表达系统的优势[/font][font=Calibri] [/font][/b][font=宋体][font=Calibri]1[/font][font=宋体]、安全性高:杆状病毒仅感染昆虫细胞,不感染其他脊椎动物,对人类健康没有不良影响。[/font][/font][font=宋体][font=Calibri]2[/font][font=宋体]、高效的蛋白质表达:[/font][font=Calibri]BEVS[/font][font=宋体]能够表达复杂或难以表达的蛋白质,例如各种酶类、寄生虫蛋白、糖蛋白等,并且能进行正确的蛋白质折叠和翻译后修饰。[/font][/font][font=宋体][font=Calibri]3[/font][font=宋体]、易于大规模生产:昆虫细胞可以在无血清的培养基中生长,并且易于扩大生产规模。此外,[/font][font=Calibri]BEVS[/font][font=宋体]不需要处理活病毒或潜在危险的病原体,降低了生产成本。[/font][/font][font=宋体][font=Calibri]4[/font][font=宋体]、应用广泛:广泛用于功能、晶体学和药物发现研究。[/font][/font][font=Calibri] [/font][b][font=宋体]杆状病毒载体表达系统的局限性:[/font][/b][font=Calibri] [/font][font=宋体][font=Calibri]1[/font][font=宋体]、表达不稳定:由于病毒的细胞毒性作用导致宿主细胞裂解,这可能影响最终的产物产量和蛋白质的稳定性。[/font][/font][font=宋体][font=Calibri]2[/font][font=宋体]、糖基化水平较低:昆虫细胞所产生的异源蛋白质的[/font][font=Calibri]N-[/font][font=宋体]糖基化图谱与哺乳动物细胞产生的不同,这可能影响蛋白质的稳定性、生物活性或免疫原性。[/font][/font][font=宋体][font=Calibri]3[/font][font=宋体]、潜在的免疫反应:[/font][font=Calibri]BEVS[/font][font=宋体]诱导的免疫反应可能产生炎症细胞因子和趋化因子,并激活补体途径,这也可能对蛋白质表达产生负面影响。[/font][/font][font=宋体][font=Calibri]4[/font][font=宋体]、基因组不稳定性:杆状病毒基因组可能存在不稳定性,影响长期表达和生产稳定性。[/font][/font][font=Calibri] [/font][font=宋体][font=宋体]尽管存在一些挑战,但[/font][font=Calibri]BEVS[/font][font=宋体]平台近年来已经得到了显著改进,包括病毒载体的优化、病毒基因组的修饰和宿主细胞的广泛应用,这些分子进步有助于增强[/font][font=Calibri]BEVS[/font][font=宋体]平台的多样性和应用潜力。[/font][/font][font=Calibri] [/font][font=宋体]义翘神州提供[/font][url=https://www.sinobiological.com/services/baculovirus-insect-protein-expression-service][u][font=宋体][color=#0026e5][font=宋体]杆状病毒[/font][font=Calibri]-[/font][font=宋体]昆虫蛋白表达的一站式服务[/font][/color][/font][/u][/url][font=宋体][font=宋体]。凭借优化的表达载体和更高滴度的病毒包装技术,义翘神州在杆状病毒[/font][font=Calibri]-[/font][font=宋体]昆虫细胞蛋白表达方面具有丰富的经验,特别是针对序列较长的蛋白、病毒类蛋白、激酶、胞内蛋白以及膜蛋白等。[/font][/font][font=Calibri] [/font][font=宋体]参考文献:[/font][font=Calibri]Hong M, Li T, Xue W, et al. Genetic engineering of baculovirus-insect cell system to improve protein production. Front Bioeng Biotechnol. 2022 10:994743. Published 2022 Sep 20. doi:10.3389/fbioe.2022.994743[/font][font=Calibri] [/font]

  • 蛋白质化学与蛋白质组学(推荐)

    蛋白质化学与蛋白质组学夏其昌 曾嵘 等编著2004年4月出版ISBN 7-03-012401-4/Q.133116开,平装,580页定价: 75.00元 本书系统论述了蛋白质化学基础理论和实验技巧,也反映了蛋白质组学研究的最新成果。内容包括:蛋白质的表征,蛋白质的组成分析和序列测定,与此相关的实验方法,包括各种色谱、电泳、质谱技术等,以及应用在蛋白质表征研究和基因工程产品的质检方面的实际范例。在蛋白质组学领域介绍了基本概念、样品制备、双向凝胶电泳的图像分析和定量分析、质谱等常规方法,并介绍了国际上最新的多维技术在研究中的应用;同时充分体现了生物信息学在蛋白质组研究中的重要性。 本书可作为生物学、医学、化学专业大学生,研究生和教学人员的参考书,也是从事生物化学、分子生物学、医学等领域中分离分析工作人员的参考书。

  • 质谱技术在肿瘤蛋白质标志物研究中的应用与发展

    20世纪基因组学研究取得的巨大成就为蛋白质组学的发展奠定了基础。蛋白质组学是从整体水平上分析生命体、组织或细胞的蛋白质组成及其活动规律的科学,以基因表达产物为研究对象,延伸了基因组学研究深度,更深层次地揭示了生命活动规律。蛋白质组学的研究内容主要包括蛋白质表达存在方式(修饰形式)的鉴定、结构与功能分析、蛋白质定位、蛋白质差异表达以及蛋白质间相互作用分析等[1]。目前蛋白质组学研究技术主要包括:二维电泳技术、蛋白质芯片技术、质谱技术等[2]。其中,二维电泳技术是早期蛋白质组学的重要技术之一,但是由于实验步骤多,耗时长,重复性差等特点,已经逐步被新型技术所取代。蛋白质芯片技术是将多种蛋白质纯品点于芯片表面,形成蛋白质矩阵进行免疫等标记反应,主要受限于很多蛋白质无法获得纯品而不能用于芯片制备。质谱技术由于灵敏度高、特异性强、分析范围宽等优点逐渐成为蛋白质组学的主要研究手段,可以对特定生命过程中的功能性蛋白质分子进行定性和定量检测,因此在基础科研和临床研究中得到了广泛的应用[3,4]。一、基于质谱的蛋白质组学技术1.基于质谱的蛋白质组学定性技术:蛋白质定性鉴定的基本原理在于:蛋白质组的基本序列已经通过基因组学信息获得,可以用来鉴定多肽的氨基酸序列,并且获得多肽与蛋白质的对应关系[1],即质谱提供的多肽碎片数据可以与蛋白质数据库自动匹配来确定多肽序列与蛋白质归属。基本技术策略分为:(1)自上而下(Top–down)策略[5],即完整蛋白质在质谱中进行分析,可以提供完整蛋白质的质量数,但是由于质谱仪受到质量分析范围的限制,此方法在常规实验室不易实现。(2)自下而上(Bottom–up)策略[6],即蛋白质被蛋白酶水解成多肽,然后对多肽进行质谱分析和碎裂。基于这条策略的大致步骤为:蛋白质样品首先经过酶解降解为多肽,然后对多肽进行色谱–质谱分离与鉴定,最后通过搜索引擎(MASCOT:http://www.matrixscience.com/server.html, SEQUEST:http://fields.scripps.edu/sequest等)在公共蛋白质组学数据库(SWISS–PORT: http://web.expasy.org/groups/swissprot, NCBI:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed等)中自动完成质谱数据的解析,确定多肽序列与蛋白质种类。该技术灵敏度高,特异性好,仪器自动化程度高,可以鉴定出生物样品中成千上万种蛋白质,被认为是大规模、高通量蛋白质定性检测的首选方法。2.基于质谱的蛋白质组学相对定量技术:对于大多数生命科学和医学研究来说,仅完成样品中蛋白质组的定性研究是远远不够的,还需要对蛋白质组进行定量分析。由于组学的研究对象是多个蛋白质,单次检测很难实现所有蛋白质的绝对定量,因此蛋白质组学定量多为相对定量检测。蛋白质组学定量的质谱技术包括谱图计数、质谱峰强度定量、同位素定量技术等。其中使用同位素作为内标定量的方法是目前质谱定量的最佳手段,即对整体蛋白质组进行同位素标记,并使用每一种天然蛋白质与同位素蛋白质的比值进行相对定量分析。主要分为细胞层面标记和蛋白质层面标记两种技术路线:(1)细胞层面标记的细胞培养氨基酸稳定同位素标记(stable isotope labeling with amino acids in cell culture,SILAC)方法[7]:即在两种细胞样品中分别加入轻重同位素标记的培养基,经过传代培养后,两种细胞样品中的全部蛋白质中分别嵌合了轻重同位素,可以在质谱上根据同位素的不同质荷比直接判断样品来源并进行定量比对。(2)蛋白质层面标记:使用含有同位素的小分子与样品全部蛋白质直接标记,如同位素标记相对和绝对定量技术(isobaric tags for relative and absolute quantification,iTRAQ)[8]、同位素编码亲和标记(isotope–coded affinity tag,iCAT) [9]、18O标记[10]等方法,此类方法使用带有稳定同位素的小分子与特定氨基酸侧链反应,使得多个样品可以分别连接含有不同同位素个数(多至8个)的小分子,从而产生一级数据相同但是二级数据不同的质谱谱图,通过二级谱图强度比对进行多个样品的定量分析。3.基于质谱的目标蛋白质绝对定量技术:质谱技术对目标蛋白质的绝对定量检测主要通过质谱多反应监控技术与同位素多肽内标技术联用来实现[11]。该方法首先选定目标蛋白质的一个或多个多肽,合成序列相同但含有稳定同位素的多肽作为内标,定量加入样品中,通过监测特定多肽及其同位素多肽的质谱峰强度进行比对和计算获得目标蛋白质的定量值。质谱多反应监控技术通过进行母离子筛选与子离子筛选等二次选择过程,筛选出目标蛋白质,而非目标蛋白质由于无法通过筛选达到检测器,极大降低了噪音干扰。因此,此方法针对性强,本底噪音低,是目前质谱技术中定量能力最好的一种,可以控制变异系数小于15%,检测限低至纳克每毫升,适合血液、组织等临床样品的定量检测[11]。二、质谱技术发现肿瘤蛋白质标志物质谱技术作为一项强有力的研究工具在科学研究中发挥着巨大的作用,特别在肿瘤相关研究中,目前已经获得美国食品药品监督管理局(Food and Drug Administration,FDA)批准的肿瘤标志物包括多种蛋白质前列腺特异性抗原(prostate–specific antigen, PSA), 癌胚抗原(carcinoembryonic antigen CEA), 人类表皮生长因子受体2(human epidermal growth factor receptor 2,Her–2), 人绒毛膜促性腺激素(human chorionic gonadotropin, HCG), 糖类抗原CA125等,均揭示了蛋白质与肿瘤发生发展密切相关。这些已有成果极大促进了质谱技术在肿瘤蛋白质标志物研究中的应用,并取得了标志性进展。例如:美国约翰霍普金斯大学的Chan课题组发现了新型卵巢癌蛋白质标志物,他们使用表面增强激光解析电离质谱技术(surface enhanced laser desorption and ionization time–of–flight mass spectrometry, SELDI–TOF MS)技术对503个妇女的血清进行了蛋白质组学的分析[12],在随后的大量临床验证中最终确定CA125、β2微球蛋白,转铁蛋白,甲状腺运载蛋白和载脂蛋白A1的联合检测可以作为卵巢癌的新型临床诊断指标。2009年9月该试剂盒OVA1(商品名称:http://ova–1.com)获得了美国FDA的认证,进入临床使用,被认为是国际肿瘤蛋白质标志物研究的重要标志性成果。同时,肿瘤仍然是国际上致死率最高的疾病之一,缺乏早期检测技术和有效治疗方案,临床中还存在着大量问题需要解决,新型标志物的研发迫在眉睫。由于肿瘤蛋白质标志物研究的难度大,风险高,因此近十年来仅有几例试剂盒获得了美国FDA批准,进入临床使用。大量标志物研究还停留在论文研究水平,其中临床问题、研究思路和技术方案的选择直接关系到研究的成功与否。1.临床问题选择:在肿瘤蛋白质标志物研究中,临床问题的选择是研究核心。在肿瘤研究中,需要解决的临床问题往往包括肿瘤早期检测、肿瘤分期检测、治疗方案与药物选择、疗效评估等多个方面。研究者需要根据不同肿瘤的临床情况,具体分析并凝练不同肿瘤的主要临床问题。例如,对于病程发展快、五年存活率低、没有有效手术或化疗手段的肿瘤,早期诊断是研究重点,如胰腺癌、卵巢癌、肺癌等;对于病程发展慢、手术效果明显的肿瘤,肿瘤的愈后与复发是需要关注的问题,如前列腺癌、肠癌等;还有一些肿瘤有特殊的检测需求,如乳腺癌虽然有临床有效的雌激素受体(estrogen receptor,ER),孕激素受体(progesterone receptor,PR),HER2等基因标志物,可以进行药物靶点治疗,但是三阴性乳腺癌的检测还缺乏有效的标志物与治疗方案。因此,在肿瘤蛋白质标志物研究实验开展之前,明确临床问题,并以此确定临床样品入组标准,是研究成功的核心基础。2.研究思路设计:不同于基础科学实验,临床实验需要在大量样本中进行实验结果的验证,因此肿瘤蛋白质标志物研究往往包括新型标志物发现和验证两部分。标志物发现实验是在疾病组和对照组之间进行蛋白质组学分析,鉴定样本中的未知蛋白质组并进行相对定量比较,分析数据选择出在两组样本中差异最大的一个或几个蛋白质作为新型标志物的候选物。随后,标志物验证实验在大量未知样本中进行蛋白质候选物的定量检测,使用发现实验中建立的区分标准进行判读,计算检测灵敏性(sensitivity)和特异性(specificity)。有效的蛋白质标志物研究往往需要发现与验证的两步设计思路来相互保证。3.技术方案选择:根据蛋白质标志物研究的两步设计思路,发现实验中使用基于质谱的蛋白质组学定性技术与相对定量技术对样本中的大量未知蛋白质进行分析,获得标志物候选物名单。验证实验中根据已有名单,进行目标蛋白质(非蛋白质组学)的精确定量检测。这几种质谱技术的配合使用,可以满足不同实验情况和目的,最终实现新型蛋白质标志物的成功研发。三、展望质谱技术是现阶段蛋白质组学研究的核心技术,具有灵敏度高、特异性强、分析通量大等优势,特别是其与同位素内标的联合使用,大大提高了质谱定量能力,因此在多种肿瘤标志物研究中取得了突破性进展并被广泛应用。目前,大量肿瘤蛋白质标志物候选物已经通过使用质谱技术被从血液、组织、体液中筛选出来,预计在完成大规模临床验证后可以作为新型标志物在临床使用,促进肿瘤检测水平的发展。同时值得注意的是,质谱技术还不具备进行蛋白质组的绝对定量能力。相对于免疫等传统蛋白质检测技术,仪器昂贵,操作复杂,自动化程度低,这些因素决定了质谱目前适用于蛋白质的临床研究,但不适用于蛋白质的临床检验,这是质谱技术面临的重要挑战之一。参考文献[1]何华勤. 简明蛋白质组学[M]. 北京:中国林业出版社, 2011:1,76,85-95,119,125-138.[2]RuediA, MatthiasM. Mass spectrometry-based proteomics[J]. Nature, 2003, 422(13):198-207.[3]甄艳, 施季森. 质谱技术在蛋白质组学研究中的应用[J]. 南京林业大学学报:自然科学版, 2011, 35(1):103-108.[4]孙瑞祥, 付岩, 李德泉,等. 基于质谱技术的计算蛋白质组学研究[J]. 中国科学E辑信息科学, 2006, 36(2):222-234.[5]WhiteleggeJ,HalgandF,SoudaP, et al. Top-down mass spectrometry of integral membrane proteins [J]. Expert Review Proteomics, 2006, 3(6):585-596.[6]ChaitBT. Mass spectrometry:bottom-up or top-down? [J]. Science, 2006, 314(5796):65-66.[7]TranDT, AdhikariJ, FitzgeraldMC. StableIsotope Labeling with Amino Acids in Cell Culture (SILAC)-based strategy for proteome-wide thermodynamic analysis of protein-ligand binding interactions [J]. Mol Cell Proteomics, 2014,13(7):1800-1813.[8]DytfeldD, KandarpaM, StrahlerJR, et al. Proteomic Profiling of Multiple Myeloma (MM) Cells Using iTRAQ and Label-Free Quantitative Proteomics for the Prediction of Complete or near Complete Response (CR/nCR) In Frontline Treatment with Lenalidomide, Bortezomib, and Dexamethasone [J]. Blood, 2010, 116(21):271-272.[9]García-SantamarinaS, BoronatS, DomènechA, et al. Monitoring in vivo reversible cysteine oxidation in proteins using ICAT and mass spectrometry [J]. Nat Protoc,2014,9(5):1131-1145.[10]MirzaSP, GreeneAS, OlivierM. 18O labeling over a coffee break:a rapid strategy for quantitative proteomics [J]. J Proteome Res, 2008,7(7):3042-3048.[11]曹冬, 张养军, 钱小红. 基于生物质谱的蛋白质组学绝对定量方法研究进展[J]. 质谱学报, 2008, 29(3):185-190.[12]ZhangZ, BastRC, YuY,et al. Three biomarkers identified from serum proteomic analysis for the detection of early stage ovarian cancer[J]. Cancer Res,2004,64(16), 5882-5890.

  • 蛋白质泛素化:基本概念、蛋白大小与泛素化蛋白组学的应用

    [font=宋体][font=宋体]泛素化是一种细胞内的蛋白质标记系统,蛋白质泛素化是指将小的蛋白质泛素共价地连接到其他蛋白质分子上的过程。泛素([/font][font=Calibri]ubiquitin[/font][font=宋体])是一种高度保守的蛋白质,其结构由[/font][font=Calibri]76[/font][font=宋体]个氨基酸残基组成。泛素连接到目标蛋白质上的过程,经历了泛素激活、泛素转移和靶蛋白接受三个主要步骤。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体]蛋白质泛素化具有多种特点,例如它是高度选择性的,不同蛋白质泛素化的位置和数量可以影响其功能;它是可逆的,通过去泛素化反应可以调控蛋白质的泛素化状态;它还是动态调控的,受到多种因素的调控,如细胞信号通路和环境刺激。[/font][b][font=宋体]泛素化蛋白大小:[/font][/b][font=宋体] [/font][font=宋体][font=宋体]蛋白泛素化是指将小蛋白颗粒泛素([/font][font=Calibri]Ubiquitin[/font][font=宋体])与其他蛋白质共价结合的修饰过程。 泛素化修饰通常会导致泛素共价连接在蛋白质的赖氨酸残基上形成多重泛素链。 这种蛋白质泛素化增加了蛋白质的分子量,因为每个泛素分子的质量大约为[/font][b][font=Calibri]8.5[/font][font=宋体]千达尔顿([/font][font=Calibri]kDa[/font][/b][font=宋体][b])[/b]。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体] [/font][b][font=宋体]泛素化蛋白质组学在许多领域有重要的应用,主要包括:[/font][/b][font=宋体] [/font][font=宋体]①疾病机制研究:泛素化是一种广泛存在于细胞中的蛋白质修饰方式,参与了细胞的生长、分化、修复和调控等多个生命活动。泛素化蛋白质组学的研究可以帮助我们了解泛素化修饰的生物学功能和调控机制,为疾病发生机制和治疗策略的研究提供重要线索。例如,在癌症、代谢综合征、神经退行性疾病等疾病中,则会出现异常泛素化。[/font][font=宋体]②药物研发:通过分析药物对泛素化蛋白质的影响,可以评估药物的效力和选择性,为药物研发提供指导。[/font][font=宋体]③临床诊断:泛素化蛋白质组学鉴定与定量分析技术可以揭示细胞调控的机制,通过分析泛素化蛋白质的组学数据,可以确定泛素化修饰在细胞信号转导、蛋白质降解和细胞周期调控等过程中的重要作用。此外,通过比较病态和正常样品中泛素化蛋白质的差异,可以鉴定与疾病发生发展相关的泛素化修饰靶点,并进一步理解疾病的分子机制。因此,这些技术也可用于临床诊断。[/font][font=宋体]④蛋白质降解调控:在癌症、神经退行性疾病和免疫相关疾病等病症中,蛋白质降解调控出现异常。而泛素化蛋白组在调控蛋白质降解中发挥重要作用。通过与泛素连接,目标蛋白质被送入蛋白酶体或蛋白酶体样体中进行降解。这个过程是细胞清除异常、老化或受损蛋白质的重要途径。[/font][font=宋体]⑤高通量技术应用:高通量泛素化蛋白质组学鉴定与定量分析技术的发展包括质谱鉴定和抗体鉴定两种方法。质谱鉴定技术利用质谱仪的高灵敏度和分辨率,能够鉴定泛素化修饰的蛋白质及其泛素化位点。抗体鉴定技术则通过特异性抗体的使用,可以富集和鉴定泛素化修饰的蛋白质。这些技术为全面了解泛素化在细胞中的作用机制和调控网络提供了可能。[/font][font=宋体]总的来说,泛素化蛋白质组学在多个领域都有重要的应用价值,推动了我们对生命过程的深入理解以及疾病治疗的创新发展。[/font][font=宋体] [/font][font=宋体]更多详情关于[url=https://cn.sinobiological.com/resource/protein-review][b]蛋白资源[/b][/url]详情可以参看:[/font][url=https://cn.sinobiological.com/resource/protein-review][u][font=宋体][color=#0000ff][font=Calibri]https://cn.sinobiological.com/resource/protein-review[/font][/color][/font][/u][/url][b][font=宋体] [/font][font=宋体][font=宋体]义翘神州:蛋白与抗体的专业引领者,欢迎通过百度搜索[/font][font=宋体]“义翘神州”与我们取得联系。[/font][/font][/b]

  • 【热点】蛋白质组学研究

    人类基因组计划的顺利实施,使生命科学研究的重心正逐渐转到生物功能的整体研究。基因组学由于自身的局限性,它不能回答诸如:蛋白质的表达水平和表达时间,翻译后修饰以及蛋白质与蛋白质或与其他生物分子的相互作用等问题。作为基因研究的重要补充,蛋白质组学在蛋白质的水平上定量的、动态的、整体的研究生物体。蛋白质组(Proteome)概念是最早是由澳大利亚学者Wilkins和Williams于1994年提出的,即基因所能表达的全部蛋白质,更为清楚的表达是细胞或组织或机体在特定时间和空间上表达的所有蛋白质。具体说它是对不同时间和空间上发挥功能的特定的蛋白质组群进行研究,进而在蛋白质的水平上探索其作模式、功能机理、调节调控以及蛋白质组群内的相互作用,从而为临床诊断、病理研究、药物筛选、新药开发、新陈代谢途径研究等提供理论依据和基础。 详情请见:[url=http://www.instrument.com.cn/hot/HA_56.htm]热点应用:蛋白质组学研究[/url]

  • 【热点】蛋白质组学研究

    人类基因组计划的顺利实施,使生命科学研究的重心正逐渐转到生物功能的整体研究。基因组学由于自身的局限性,它不能回答诸如:蛋白质的表达水平和表达时间,翻译后修饰以及蛋白质与蛋白质或与其他生物分子的相互作用等问题。作为基因研究的重要补充,蛋白质组学在蛋白质的水平上定量的、动态的、整体的研究生物体。蛋白质组(Proteome)概念是最早是由澳大利亚学者Wilkins和Williams于1994年提出的,即基因所能表达的全部蛋白质,更为清楚的表达是细胞或组织或机体在特定时间和空间上表达的所有蛋白质。具体说它是对不同时间和空间上发挥功能的特定的蛋白质组群进行研究,进而在蛋白质的水平上探索其作模式、功能机理、调节调控以及蛋白质组群内的相互作用,从而为临床诊断、病理研究、药物筛选、新药开发、新陈代谢途径研究等提供理论依据和基础。 详情请见:[url=http://www.instrument.com.cn/hot/HA_56.htm]热点应用:蛋白质组学研究[/url]

  • 重组蛋白表达:原理、系统、步骤及应用详解

    [font=宋体]在现代生命科学研究中,[url=https://cn.sinobiological.com/resource/protein-review/protein-production][b]重组蛋白表达技术[/b][/url]扮演着至关重要的角色。通过将外源基因导入宿主细胞,并使其表达特定蛋白,我们能够获取大量高纯度的重组蛋白,为疾病治疗、药物研发和生物工程等领域提供了强有力的支持。本文将介绍重组蛋白表达的原理、表达系统、生产步骤以及应用前景。[/font][font=宋体][b]一、重组蛋白表达的原理[/b][/font][font=宋体][font=宋体]重组蛋白表达是利用[/font][font=Calibri]DNA[/font][font=宋体]重组技术,将目标基因(外源基因)导入宿主细胞中,并通过宿主细胞的生物机制使其表达出特定蛋白。其主要步骤包括:[/font][/font][font=宋体][font=宋体]基因克隆:将目标基因经过[/font][font=Calibri][url=https://insevent.instrument.com.cn/t/jp][color=#3333ff]PCR[/color][/url][/font][font=宋体]扩增后,与表达载体连接,形成重组质粒。[/font][/font][font=宋体]转染或转化:将重组质粒导入宿主细胞中,可以使用化学方法、电穿孔或者嗜热菌等方式进行转染或转化。[/font][font=宋体]表达蛋白:重组质粒进入宿主细胞后,融合到宿主细胞的染色体中,随后遵循细胞的转录和翻译机制,表达出目标蛋白。[/font][font=宋体] [/font][b][font=宋体]二、常见的重组蛋白表达系统[/font][/b][font=宋体]大肠杆菌表达系统:大肠杆菌是常用的重组蛋白表达宿主细胞之一。其优点在于生长快速、易于培养,并且能够产生大量的蛋白。此外,大肠杆菌的遗传工具和代谢途径也被广泛研究,提供了便利。[/font][font=宋体]酵母表达系统:酵母表达系统包括酿酒酵母和毕赤酵母。这些酵母细胞具有真核细胞的特点,能够进行正确的蛋白折叠和修饰。同时,酵母细胞也可以进行大规模培养和高表达,适用于一些复杂蛋白的表达。[/font][font=宋体]昆虫细胞表达系统:昆虫细胞表达系统常用于大规模蛋白表达。昆虫细胞具有真核细胞的优势,能够对蛋白进行正确的折叠和修饰,适合于表达大量需求复杂结构的重组蛋白。[/font][font=宋体]哺乳动物细胞表达系统:哺乳动物细胞的表达系统可用于高效表达复杂蛋白和进行蛋白质研究。哺乳动物细胞具有真核细胞特点,能够进行正确的蛋白质修饰和折叠,并且在一些特殊情况下需要考虑到人类蛋白的免疫原性。[/font][font=宋体] [/font][font=宋体][b]三、重组蛋白生产步骤[/b][/font][font=宋体] [/font][font=宋体]细胞中有两个蛋白生产阶段:转录和翻译,被称为分子生物学的中心法则。换言之,转录和翻译步骤属于重组蛋白表达步骤。[/font][font=宋体] [/font][font=宋体]为了生产重组蛋白,基因被分离并克隆到表达载体中。重组蛋白的生产需要蛋白表达系统、蛋白纯化系统和蛋白识别系统。[/font][font=宋体] [/font][font=宋体][b]获取重组蛋白的基本步骤:[/b][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri]1.[/font][font=宋体]目标基因的扩增。[/font][/font][font=宋体][font=Calibri]2.[/font][font=宋体]插入克隆载体。[/font][/font][font=宋体][font=Calibri]3.[/font][font=宋体]亚克隆到表达载体中。[/font][/font][font=宋体][font=Calibri]4.[/font][font=宋体]转化到蛋白表达宿主中[/font][font=Calibri]([/font][font=宋体]细菌[/font][font=Calibri]([/font][font=宋体]大肠杆菌[/font][font=Calibri])[/font][font=宋体]、酵母细胞、哺乳动物细胞或杆状病毒[/font][font=Calibri]-[/font][font=宋体]昆虫细胞系统[/font][font=Calibri])[/font][font=宋体]。[/font][/font][font=宋体][font=Calibri]5.[/font][font=宋体]重组蛋白鉴定试验[/font][font=Calibri](Western blot[/font][font=宋体]或荧光[/font][font=Calibri])[/font][/font][font=宋体][font=Calibri]6.[/font][font=宋体]大规模生产。[/font][font=Calibri]([/font][font=宋体]大规模发酵[/font][font=Calibri])[/font][/font][font=宋体][font=Calibri]7.[/font][font=宋体]分离和纯化。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体]需要考虑多种因素:[/font][font=宋体][font=Calibri]1.[/font][font=宋体]选择哪个宿主系统?[/font][/font][font=宋体][font=Calibri]2.[/font][font=宋体]如何分离和纯化重组蛋白?[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体]选择适当的表达宿主或使用正确的纯化方法并不容易,应考虑目标重组蛋白的性质。下面列出了一些重要因素:[/font][font=宋体] [/font][font=宋体]? 膜结合[/font][font=宋体]? 溶解度[/font][font=宋体]? 单或多结构域[/font][font=宋体][font=宋体]? 大小[/font][font=Calibri]([/font][font=宋体]分子量[/font][font=Calibri])[/font][/font][font=宋体]? 表达位置[/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=宋体]对于大多数没有足够经验来表达和分离重组蛋白的人来说,重组蛋白的生产是非常耗时的。许多生物公司为各种不同规模的重组蛋白表达提供良好的服务:[/font][font=Calibri]https://cn.sinobiological.com/services/recombinant-protein-expression-service[/font][font=宋体],例如义翘神州[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][b]四、重组蛋白表达技术的应用前景[/b][/font][font=宋体]药物研发:重组蛋白表达技术被广泛应用于药物研发领域,用于生产重组蛋白药物。这些药物包括多肽类、蛋白类和抗体类药物,如生长因子、抗体药物和血液制剂等。通过重组蛋白表达技术,我们可以获得高效纯度的药物,满足临床上的需求。[/font][font=宋体]生物工程:重组蛋白表达技术被广泛应用于生物工程领域,用于生产特定的蛋白产品。这些产品可以应用于食品、化妆品、工业发酵等领域,如酶制剂、生物染料和生物材料等。[/font][font=宋体]疾病治疗:通过重组蛋白表达技术,我们能够合成特定的蛋白,用于疾病的治疗和诊断。例如,利用重组抗体技术,可以开发出用于癌症治疗和免疫治疗的抗体药物。[/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=宋体]详情可以关注:[/font][font=Calibri]https://cn.sinobiological.com/resource/protein-review/protein-production[/font][/font]

  • 国家蛋白质科学上海设施/国家蛋白质科学中心(上海)(筹)公开招聘自动化控制系统工程师

    国家蛋白质科学上海设施/国家蛋白质科学中心(上海)(筹)公开招聘自动化控制系统工程师国家蛋白质科学研究上海设施是国家重大科技基础设施,是国家级蛋白质科学研究平台;在设施建设基础上,依托中国科学院上海生命科学研究院,委托生物化学与细胞生物学研究所(简称SIBCB)负责筹建成立并管理国家蛋白质科学中心(上海)(筹), 负责设施的运行管理。中心在筹建期间,办公地点设于生化与细胞所(上海市岳阳路320号);中心在建成运行期间,办公地点设于浦东新区张江高科技园区中区西部(上海市海科路333号)。中心定位于:支撑国家蛋白质上海设施建设的建设,衔接该设施的运行;聚集培养生命科学与生物技术特别 是蛋白质研究的人才,提升国家蛋白质研究能力;进而促进我国蛋白质基础研究的飞跃发展。中心将立足于国家生命科学与生物技术及相关研究领域雄厚的研究基础和创新实力,成为兼具蛋白质科学研究、技术及成果的转化、集成和应用平台的国家级的重要科学研究单元。国家蛋白质科学中心(上海)(筹)现因工作扩展的需要,公开招聘自动化控制系统工程师一名。一、岗位职责:参与国家蛋白质科学中心(上海)(筹)在上海同步辐射光源5线6站的建设、运行和管理,充分理解同步辐射光束线站的工作内容和线站用户的实际需求,完成线站自动化控制程序的设计、开发和维护。二、任职条件:1、本科以上学历,有丰富的 Unix/Linux 平台下的工作经验,熟悉 Unix/Linux 工作环境,习惯于在 Unix/Linux 平台下工作。有大量的源代码的阅读经验。2、有丰富的 C/C++ 开发经验。熟悉 Socket 编程和多线程编程。3、良好的英文表达能力。能独立完成项目调研,设计和开发工作。4、有以下背景或经验者优先考虑:有大型系统开发经验者和硬件开发经验者;有软件界面开发经验者;有网络程序开发经验者;熟悉 Tcl/Tk 语言者;有 Unix/Linux 系统管理经验者。5、具有良好的人际关系和团队协作精神,工作努力,作风踏实,责任心强。6、身体健康,能长期稳定工作。 三、招聘方式及程序 1、应聘材料:([back=whi

  • 国家蛋白质科学上海设施/国家蛋白质科学中心·上海(筹)诚聘生物大分子晶体学线站运行管理员、冷冻电镜系统管理员、流式细胞分选等岗位工作人员

    国家蛋白质科学上海设施/国家蛋白质科学中心·上海(筹)生物大分子晶体学线站运行管理员、冷冻电镜系统管理员等岗位招聘启事国家蛋白质科学研究上海设施是国家重大科技基础设施,是国家级蛋白质科学研究平台;在设施建设基础上,依托中国科学院上海生命科学研究院,委托生物化学与细胞生物学研究所(简称SIBCB)负责筹建成立并管理国家蛋白质科学中心•上海(筹), 负责设施的运行管理。中心位于浦东新区张江高科技园区中区西部(上海市浦东新区海科路333号),临近上海科技大学、中国科学院药物研究所、上海高等研究院等科研机构。中心定位于:支撑国家蛋白质上海设施建设的建设,衔接该设施的运行;聚集培养生命科学与生物技术特别是蛋白质研究的人才,提升国家蛋白质研究能力;进而促进我国蛋白质基础研究的飞跃发展。中心将立足于国家生命科学与生物技术及相关研究领域雄厚的研究基础 和创新实力,成为兼具蛋白质科学研究、技术及成果的转化、集成和应用平台的国家级的重要科学研究单元。国家蛋白质科学中心•上海(筹)现因工作需要,公开招聘生物大分子晶体学线站运行管理员、冷冻电镜系统管理员、自动化控制工程师、软件工程师、流式细胞分选技术员等岗位。一、岗位详情:岗位一: 生物大分子晶体学线站工作人员 4名。(一) 岗位职责:参与蛋白质科学研究中心•上海(筹)在上海同步辐射光源参与生物大分子晶体学线站的运行、维护和管理工作,参与线站的用户服务和技术支持工作;参与5线6站相关的科学研究工作。(二) 任职条件:1、物理、光学、光学工程、结构生物学等专业背景,硕士或以上学历。2、具备基本的生物大分子晶体结构衍射数据收集和数据处理的基本知识;有同步辐射光源生物大分子晶体学线站衍射数据收集经验,束线设计和建造经验者,以及同步辐射线站其他相关工作经验者优先。3、具有良好的人际关系和团队协作精神,工作努力,作风踏实,责任心强。4、身体健康,能长期稳定工作。岗位二:自动化控制系统工程师 1名(一) 岗位职责:参与国家蛋白质科学中心(上海)(筹)在上海同步辐射光源5线6站的建设、运行和管理,充分理解同步辐射光束线站的工作内容和线站用户的实际需求,完成线站自动化控制程序的设计、开发和维护。(二) 任职条件:1、本科以上学历,有 Unix/Linux 平台下的工作经验,熟悉Unix/Linux 工作环境,习惯于在 Unix/Linux 平台下工作。有大量的源代码的阅读经验。2、有丰富的 C/C++ 开发经验.熟悉 Socket 编程和多线程编程。3、良好的英文表达能力。能独立完成项目调研,设计和开发工作。4、有以下背景或经验者优先考虑:有大型系统开发经验者和硬件开发经验者;有软件界面开发经验者;有网络程序开发经验者;熟悉 Tcl/Tk 语言者;有 Unix/Linux 系统管理经验者。5、具有良好的人际关系和团队协作精神,工作努力,作风踏实,责任心强。6、身体健康,能长期稳定工作。岗位三:冷冻电镜系统管理员 A 1名(一) 岗位职责:负责电镜负染及冷冻样品制样,样品检测、用户服务。参与中心电镜(包括200 kV TF20及120kV T12)的日常管理,用户培训、技术支持等。(二) 任职条件:1. 具有生物、医学或物理等相关专业的本科或以上学位,有电镜操作或生物电镜样品制样经验者优先考虑;2.有工作热情,乐于学习新技术,有较强的动手能力;3.为人诚实、乐于助人,具有良好的沟通能力、服务精神和团队协作精神;4. 具有良好的中英文口头表达和写作能力;5. 身体健康,能长期稳定工作。岗位四:冷冻电镜系统管理员 B 1名(一) 岗位职责:负责用户项目的合作及服务研究。可以独立应用TITAN Krios及TF20电镜,进行cryo-EM single particle及cryo-ET的数据收集、处理和结构分析,或可独立开展高压冷冻、超薄切片服务等。参与中心电镜(包括300 kV TITAN Krios,200 kV TF20及120kV T12)的日常管理,用户培训、技术支持等。(二) 任职条件:1.应聘者有3年或以上冷冻透射电镜使用经验,具有独立完成cryo-EM single particle及cryo-ET的数据收集、处理和结构分析的能力和经验;或者可以独立开展高压冷冻、超薄切片服务等;2. 具有生物物理学或相关专业的硕士或以上学位,有SCI第一作者论文;具有良好的中英文口头表达和写作能力;3.有工作热情,乐于学习新技术,有较强的动手能力;4.为人诚实、乐于助人,具有良好的沟通能力和团队协作精神;5. 身体健康,能长期稳定工作。 岗位五: 软件工程师 1名(一) 工作职责:1、 编写或依据设计说明书,落实代码的实现工作,确保系统设计的合理性、可扩充性和代码编写的规范性。2、 对接受的开发任务进行评估,细化分配任务,制定软件开发阶段的具体技术实施计划。解决项目中的关键问题和技术难题。3、 根据要求协助进行需求分析及确认工作。执行单元测试、集成测试及回归测试,查出并解决软件在存的缺陷并保证其质量可靠。4、 进行项目相关技术文档的编写工作。5、 辅助保障项目的质量监控和进度管理。6、 完成上级交办的其他工作。(二) 任职条件:1、 计算机相关专业,本科以上学历。2、 熟练掌握Java语言,掌握SQL语言和数据库应用开发。3、 熟练使用JavaScript、Ajax、Jquery客户端脚本技术,有高通量数据开发经历者优先,有Android及IOS开发经验者优先。4、 善于分析项目要求,对系统框架设计有独立解决方案;能独立进行需求需求分析、设计及代码编写工作,具有较强的逻辑思维能力,问题缺陷分析处理能力。5、 责任心、事业心强,能承受工作压力,具备良好的沟通协调能力,良好的合作意识和团队协作精神,愿意分担其它工程项目职责。岗位六: 流式细胞分选技术员 1名(一) 岗位职责:1. 主要负责荧光激发细胞分选仪的操作、管理服务及样品制备;2. 负责流式细胞仪的操作,用户培训和技术支持;3. 负责普通荧光显微镜的操作、管理服务及技术支持,保证设备正常运行及日常维护;4. 参与并协调系统公共行政事务(如预算、采购、预约系统等),与中心相关职能部门对接;收集整合系统宣传信息,与中心宣传对接。(二) 任职条件:1. 生物学相关专业,硕士或以上学历;2. 掌握流式细胞分选技术,有流式、显微镜理论及操作基础,能熟练操作显微镜相关的中小型仪器;3. 具有良好的独立工作能力、创新工作精神;工作积极主动,具有团结奉献精神,乐于学习和接受新事物;4. 为人诚实

  • 国家蛋白质科学上海设施/国家蛋白质科学中心·上海(筹)生物大分子晶体学线站运行管理员、冷冻电镜系统管理员、流式细胞分选工作人员等岗位招聘

    国家蛋白质科学上海设施/国家蛋白质科学中心·上海(筹)生物大分子晶体学线站运行管理员、冷冻电镜系统管理员、流式细胞分选工作人员等岗位招聘启事国家蛋白质科学研究上海设施是国家重大科技基础设施,是国家级蛋白质科学研究平台;在设施建设基础上,依托中国科学院上海生命科学研究院,委托生物化学与细胞生物学研究所(简称SIBCB)负责筹建成立并管理国家蛋白质科学中心•上海(筹), 负责设施的运行管理。中心位于浦东新区张江高科技园区中区西部(上海市浦东新区海科路333号),临近上海科技大学、中国科学院药物研究所、上海高等研究院等科研机构。中心定位于:支撑国家蛋白质上海设施建设的建设,衔接该设施的运行;聚集培养生命科学与生物技术特别是蛋白质研究的人才,提升国家蛋白质研究能力;进而促进我国蛋白质基础研究的飞跃发展。中心将立足于国家生命科学与生物技术及相关研究领域雄厚的研究基础 和创新实力,成为兼具蛋白质科学研究、技术及成果的转化、集成和应用平台的国家级的重要科学研究单元。国家蛋白质科学中心•上海(筹)现因工作需要,公开招聘生物大分子晶体学线站运行管理员、冷冻电镜系统管理员、自动化控制工程师、软件工程师、流式细胞分选技术员等岗位。一、岗位详情:岗位一: 生物大分子晶体学线站工作人员 4名。(一) 岗位职责:参与蛋白质科学研究中心•上海(筹)在上海同步辐射光源参与生物大分子晶体学线站的运行、维护和管理工作,参与线站的用户服务和技术支持工作;参与5线6站相关的科学研究工作。(二) 任职条件:1、物理、光学、光学工程、结构生物学等专业背景,硕士或以上学历。2、具备基本的生物大分子晶体结构衍射数据收集和数据处理的基本知识;有同步辐射光源生物大分子晶体学线站衍射数据收集经验,束线设计和建造经验者,以及同步辐射线站其他相关工作经验者优先。3、具有良好的人际关系和团队协作精神,工作努力,作风踏实,责任心强。4、身体健康,能长期稳定工作。岗位二:自动化控制系统工程师 1名(一) 岗位职责:参与国家蛋白质科学中心(上海)(筹)在上海同步辐射光源5线6站的建设、运行和管理,充分理解同步辐射光束线站的工作内容和线站用户的实际需求,完成线站自动化控制程序的设计、开发和维护。(二) 任职条件:1、本科以上学历,有 Unix/Linux 平台下的工作经验,熟悉Unix/Linux 工作环境,习惯于在 Unix/Linux 平台下工作。有大量的源代码的阅读经验。2、有丰富的 C/C++ 开发经验.熟悉 Socket 编程和多线程编程。3、良好的英文表达能力。能独立完成项目调研,设计和开发工作。4、有以下背景或经验者优先考虑:有大型系统开发经验者和硬件开发经验者;有软件界面开发经验者;有网络程序开发经验者;熟悉 Tcl/Tk 语言者;有 Unix/Linux 系统管理经验者。5、具有良好的人际关系和团队协作精神,工作努力,作风踏实,责任心强。6、身体健康,能长期稳定工作。岗位三:冷冻电镜系统管理员 A 1名(一) 岗位职责:负责电镜负染及冷冻样品制样,样品检测、用户服务。参与中心电镜(包括200 kV TF20及120kV T12)的日常管理,用户培训、技术支持等。(二) 任职条件:1. 具有生物、医学或物理等相关专业的本科或以上学位,有电镜操作或生物电镜样品制样经验者优先考虑;2.有工作热情,乐于学习新技术,有较强的动手能力;3.为人诚实、乐于助人,具有良好的沟通能力、服务精神和团队协作精神;4. 具有良好的中英文口头表达和写作能力;5. 身体健康,能长期稳定工作。岗位四:冷冻电镜系统管理员 B 1名(一) 岗位职责:负责用户项目的合作及服务研究。可以独立应用TITAN Krios及TF20电镜,进行cryo-EM single particle及cryo-ET的数据收集、处理和结构分析,或可独立开展高压冷冻、超薄切片服务等。参与中心电镜(包括300 kV TITAN Krios,200 kV TF20及120kV T12)的日常管理,用户培训、技术支持等。(二) 任职条件:1.应聘者有3年或以上冷冻透射电镜使用经验,具有独立完成cryo-EM single particle及cryo-ET的数据收集、处理和结构分析的能力和经验;或者可以独立开展高压冷冻、超薄切片服务等;2. 具有生物物理学或相关专业的硕士或以上学位,有SCI第一作者论文;具有良好的中英文口头表达和写作能力;3.有工作热情,乐于学习新技术,有较强的动手能力;4.为人诚实、乐于助人,具有良好的沟通能力和团队协作精神;5. 身体健康,能长期稳定工作。 岗位五: 软件工程师 1名(一) 工作职责:1、 编写或依据设计说明书,落实代码的实现工作,确保系统设计的合理性、可扩充性和代码编写的规范性。2、 对接受的开发任务进行评估,细化分配任务,制定软件开发阶段的具体技术实施计划。解决项目中的关键问题和技术难题。3、 根据要求协助进行需求分析及确认工作。执行单元测试、集成测试及回归测试,查出并解决软件在存的缺陷并保证其质量可靠。4、 进行项目相关技术文档的编写工作。5、 辅助保障项目的质量监控和进度管理。6、 完成上级交办的其他工作。(二) 任职条件:1、 计算机相关专业,本科以上学历。2、 熟练掌握Java语言,掌握SQL语言和数据库应用开发。3、 熟练使用JavaScript、Ajax、Jquery客户端脚本技术,有高通量数据开发经历者优先,有Android及IOS开发经验者优先。4、 善于分析项目要求,对系统框架设计有独立解决方案;能独立进行需求需求分析、设计及代码编写工作,具有较强的逻辑思维能力,问题缺陷分析处理能力。5、 责任心、事业心强,能承受工作压力,具备良好的沟通协调能力,良好的合作意识和团队协作精神,愿意分担其它工程项目职责。岗位六: 流式细胞分选技术员 1名(一) 岗位职责:1. 主要负责荧光激发细胞分选仪的操作、管理服务及样品制备;2. 负责流式细胞仪的操作,用户培训和技术支持;3. 负责普通荧光显微镜的操作、管理服务及技术支持,保证设备正常运行及日常维护;4. 参与并协调系统公共行政事务(如预算、采购、预约系统等),与中心相关职能部门对接;收集整合系统宣传信息,与中心宣传对接。(二) 任职条件:1. 生物学相关专业,硕士或以上学历;2. 掌握流式细胞分选技术,有流式、显微镜理论及操作基础,能熟练操作显微镜相关的中小型仪器;3. 具有良好的独立工作能力、创新工作精神;工作积极主动,具有团结奉献精神,乐于学习和接受新事物;4. 为人诚实,工作认真踏实、积极主动,责任心强,善于团队合作;5. 良好的英文文献阅读和理解能力;6. 身体健康,能长期稳定工作。二、薪酬福利:我

  • 国家蛋白质科学上海设施/国家蛋白质科学中心·上海(筹)诚聘生物大分子晶体学线站运行管理员、冷冻电镜系统管理员、流式细胞分选等岗位工作人员

    国家蛋白质科学上海设施/国家蛋白质科学中心·上海(筹)生物大分子晶体学线站运行管理员、冷冻电镜系统管理员等岗位招聘启事国家蛋白质科学研究上海设施是国家重大科技基础设施,是国家级蛋白质科学研究平台;在设施建设基础上,依托中国科学院上海生命科学研究院,委托生物化学与细胞生物学研究所(简称SIBCB)负责筹建成立并管理国家蛋白质科学中心•上海(筹), 负责设施的运行管理。中心位于浦东新区张江高科技园区中区西部(上海市浦东新区海科路333号),临近上海科技大学、中国科学院药物研究所、上海高等研究院等科研机构。中心定位于:支撑国家蛋白质上海设施建设的建设,衔接该设施的运行;聚集培养生命科学与生物技术特别是蛋白质研究的人才,提升国家蛋白质研究能力;进而促进我国蛋白质基础研究的飞跃发展。中心将立足于国家生命科学与生物技术及相关研究领域雄厚的研究基础 和创新实力,成为兼具蛋白质科学研究、技术及成果的转化、集成和应用平台的国家级的重要科学研究单元。国家蛋白质科学中心•上海(筹)现因工作需要,公开招聘生物大分子晶体学线站运行管理员、冷冻电镜系统管理员、自动化控制工程师、软件工程师、流式细胞分选技术员等岗位。一、岗位详情:岗位一: 生物大分子晶体学线站工作人员 4名。(一) 岗位职责:参与蛋白质科学研究中心•上海(筹)在上海同步辐射光源参与生物大分子晶体学线站的运行、维护和管理工作,参与线站的用户服务和技术支持工作;参与5线6站相关的科学研究工作。(二) 任职条件:1、物理、光学、光学工程、结构生物学等专业背景,硕士或以上学历。2、具备基本的生物大分子晶体结构衍射数据收集和数据处理的基本知识;有同步辐射光源生物大分子晶体学线站衍射数据收集经验,束线设计和建造经验者,以及同步辐射线站其他相关工作经验者优先。3、具有良好的人际关系和团队协作精神,工作努力,作风踏实,责任心强。4、身体健康,能长期稳定工作。岗位二:自动化控制系统工程师 1名(一) 岗位职责:参与国家蛋白质科学中心(上海)(筹)在上海同步辐射光源5线6站的建设、运行和管理,充分理解同步辐射光束线站的工作内容和线站用户的实际需求,完成线站自动化控制程序的设计、开发和维护。(二) 任职条件:1、本科以上学历,有 Unix/Linux 平台下的工作经验,熟悉Unix/Linux 工作环境,习惯于在 Unix/Linux 平台下工作。有大量的源代码的阅读经验。2、有丰富的 C/C++ 开发经验.熟悉 Socket 编程和多线程编程。3、良好的英文表达能力。能独立完成项目调研,设计和开发工作。4、有以下背景或经验者优先考虑:有大型系统开发经验者和硬件开发经验者;有软件界面开发经验者;有网络程序开发经验者;熟悉 Tcl/Tk 语言者;有 Unix/Linux 系统管理经验者。5、具有良好的人际关系和团队协作精神,工作努力,作风踏实,责任心强。6、身体健康,能长期稳定工作。岗位三:冷冻电镜系统管理员 A 1名(一) 岗位职责:负责电镜负染及冷冻样品制样,样品检测、用户服务。参与中心电镜(包括200 kV TF20及120kV T12)的日常管理,用户培训、技术支持等。(二) 任职条件:1. 具有生物、医学或物理等相关专业的本科或以上学位,有电镜操作或生物电镜样品制样经验者优先考虑;2.有工作热情,乐于学习新技术,有较强的动手能力;3.为人诚实、乐于助人,具有良好的沟通能力、服务精神和团队协作精神;4. 具有良好的中英文口头表达和写作能力;5. 身体健康,能长期稳定工作。岗位四:冷冻电镜系统管理员 B 1名(一) 岗位职责:负责用户项目的合作及服务研究。可以独立应用TITAN Krios及TF20电镜,进行cryo-EM single particle及cryo-ET的数据收集、处理和结构分析,或可独立开展高压冷冻、超薄切片服务等。参与中心电镜(包括300 kV TITAN Krios,200 kV TF20及120kV T12)的日常管理,用户培训、技术支持等。(二) 任职条件:1.应聘者有3年或以上冷冻透射电镜使用经验,具有独立完成cryo-EM single particle及cryo-ET的数据收集、处理和结构分析的能力和经验;或者可以独立开展高压冷冻、超薄切片服务等;2. 具有生物物理学或相关专业的硕士或以上学位,有SCI第一作者论文;具有良好的中英文口头表达和写作能力;3.有工作热情,乐于学习新技术,有较强的动手能力;4.为人诚实、乐于助人,具有良好的沟通能力和团队协作精神;5. 身体健康,能长期稳定工作。 岗位五: 软件工程师 1名(一) 工作职责:1、 编写或依据设计说明书,落实代码的实现工作,确保系统设计的合理性、可扩充性和代码编写的规范性。2、 对接受的开发任务进行评估,细化分配任务,制定软件开发阶段的具体技术实施计划。解决项目中的关键问题和技术难题。3、 根据要求协助进行需求分析及确认工作。执行单元测试、集成测试及回归测试,查出并解决软件在存的缺陷并保证其质量可靠。4、 进行项目相关技术文档的编写工作。5、 辅助保障项目的质量监控和进度管理。6、 完成上级交办的其他工作。(二) 任职条件:1、 计算机相关专业,本科以上学历。2、 熟练掌握Java语言,掌握SQL语言和数据库应用开发。3、 熟练使用JavaScript、Ajax、Jquery客户端脚本技术,有高通量数据开发经历者优先,有Android及IOS开发经验者优先。4、 善于分析项目要求,对系统框架设计有独立解决方案;能独立进行需求需求分析、设计及代码编写工作,具有较强的逻辑思维能力,问题缺陷分析处理能力。5、 责任心、事业心强,能承受工作压力,具备良好的沟通协调能力,良好的合作意识和团队协作精神,愿意分担其它工程项目职责。岗位六: 流式细胞分选技术员 1名(一) 岗位职责:1. 主要负责荧光激发细胞分选仪的操作、管理服务及样品制备;2. 负责流式细胞仪的操作,用户培训和技术支持;3. 负责普通荧光显微镜的操作、管理服务及技术支持,保证设备正常运行及日常维护;4. 参与并协调系统公共行政事务(如预算、采购、预约系统等),与中心相关职能部门对接;收集整合系统宣传信息,与中心宣传对接。(二) 任职条件:1. 生物学相关专业,硕士或以上学历;2. 掌握流式细胞分选技术,有流式、显微镜理论及操作基础,能熟练操作显微镜相关的中小型仪器;3. 具有良好的独立工作能力、创新工作精神;工作积极主动,具有团结奉献精神,乐于学习和接受新事物;4. 为人诚实,工作认真踏实、积极主动,责任心强,善于团队合作;5. 良好的英文文献阅读和理解能力;6. 身体健康,能长期稳定工作。二、薪酬福利:我单位将为入职员工提供有

  • 国家蛋白质科学上海设施/国家蛋白质科学中心·上海(筹)诚聘生物大分子晶体学线站运行管理员、冷冻电镜系统管理员、流式细胞分选等工作人员

    国家蛋白质科学上海设施/国家蛋白质科学中心·上海(筹)生物大分子晶体学线站运行管理员、冷冻电镜系统管理员等岗位招聘启事国家蛋白质科学研究上海设施是国家重大科技基础设施,是国家级蛋白质科学研究平台;在设施建设基础上,依托中国科学院上海生命科学研究院,委托生物化学与细胞生物学研究所(简称SIBCB)负责筹建成立并管理国家蛋白质科学中心•上海(筹), 负责设施的运行管理。中心位于浦东新区张江高科技园区中区西部(上海市浦东新区海科路333号),临近上海科技大学、中国科学院药物研究所、上海高等研究院等科研机构。中心定位于:支撑国家蛋白质上海设施建设的建设,衔接该设施的运行;聚集培养生命科学与生物技术特别是蛋白质研究的人才,提升国家蛋白质研究能力;进而促进我国蛋白质基础研究的飞跃发展。中心将立足于国家生命科学与生物技术及相关研究领域雄厚的研究基础 和创新实力,成为兼具蛋白质科学研究、技术及成果的转化、集成和应用平台的国家级的重要科学研究单元。国家蛋白质科学中心•上海(筹)现因工作需要,公开招聘生物大分子晶体学线站运行管理员、冷冻电镜系统管理员、自动化控制工程师、软件工程师、流式细胞分选技术员等岗位。一、岗位详情:岗位一: 生物大分子晶体学线站工作人员 4名。(一) 岗位职责:参与蛋白质科学研究中心•上海(筹)在上海同步辐射光源参与生物大分子晶体学线站的运行、维护和管理工作,参与线站的用户服务和技术支持工作;参与5线6站相关的科学研究工作。(二) 任职条件:1、物理、光学、光学工程、结构生物学等专业背景,硕士或以上学历。2、具备基本的生物大分子晶体结构衍射数据收集和数据处理的基本知识;有同步辐射光源生物大分子晶体学线站衍射数据收集经验,束线设计和建造经验者,以及同步辐射线站其他相关工作经验者优先。3、具有良好的人际关系和团队协作精神,工作努力,作风踏实,责任心强。4、身体健康,能长期稳定工作。岗位二:自动化控制系统工程师 1名(一) 岗位职责:参与国家蛋白质科学中心(上海)(筹)在上海同步辐射光源5线6站的建设、运行和管理,充分理解同步辐射光束线站的工作内容和线站用户的实际需求,完成线站自动化控制程序的设计、开发和维护。(二) 任职条件:1、本科以上学历,有 Unix/Linux 平台下的工作经验,熟悉Unix/Linux 工作环境,习惯于在 Unix/Linux 平台下工作。有大量的源代码的阅读经验。2、有丰富的 C/C++ 开发经验.熟悉 Socket 编程和多线程编程。3、良好的英文表达能力。能独立完成项目调研,设计和开发工作。4、有以下背景或经验者优先考虑:有大型系统开发经验者和硬件开发经验者;有软件界面开发经验者;有网络程序开发经验者;熟悉 Tcl/Tk 语言者;有 Unix/Linux 系统管理经验者。5、具有良好的人际关系和团队协作精神,工作努力,作风踏实,责任心强。6、身体健康,能长期稳定工作。岗位三:冷冻电镜系统管理员 A 1名(一) 岗位职责:负责电镜负染及冷冻样品制样,样品检测、用户服务。参与中心电镜(包括200 kV TF20及120kV T12)的日常管理,用户培训、技术支持等。(二) 任职条件:1. 具有生物、医学或物理等相关专业的本科或以上学位,有电镜操作或生物电镜样品制样经验者优先考虑;2.有工作热情,乐于学习新技术,有较强的动手能力;3.为人诚实、乐于助人,具有良好的沟通能力、服务精神和团队协作精神;4. 具有良好的中英文口头表达和写作能力;5. 身体健康,能长期稳定工作。岗位四:冷冻电镜系统管理员 B 1名(一) 岗位职责:负责用户项目的合作及服务研究。可以独立应用TITAN Krios及TF20电镜,进行cryo-EM single particle及cryo-ET的数据收集、处理和结构分析,或可独立开展高压冷冻、超薄切片服务等。参与中心电镜(包括300 kV TITAN Krios,200 kV TF20及120kV T12)的日常管理,用户培训、技术支持等。(二) 任职条件:1.应聘者有3年或以上冷冻透射电镜使用经验,具有独立完成cryo-EM single particle及cryo-ET的数据收集、处理和结构分析的能力和经验;或者可以独立开展高压冷冻、超薄切片服务等;2. 具有生物物理学或相关专业的硕士或以上学位,有SCI第一作者论文;具有良好的中英文口头表达和写作能力;3.有工作热情,乐于学习新技术,有较强的动手能力;4.为人诚实、乐于助人,具有良好的沟通能力和团队协作精神;5. 身体健康,能长期稳定工作。 岗位五: 软件工程师 1名(一) 工作职责:1、 编写或依据设计说明书,落实代码的实现工作,确保系统设计的合理性、可扩充性和代码编写的规范性。2、 对接受的开发任务进行评估,细化分配任务,制定软件开发阶段的具体技术实施计划。解决项目中的关键问题和技术难题。3、 根据要求协助进行需求分析及确认工作。执行单元测试、集成测试及回归测试,查出并解决软件在存的缺陷并保证其质量可靠。4、 进行项目相关技术文档的编写工作。5、 辅助保障项目的质量监控和进度管理。6、 完成上级交办的其他工作。(二) 任职条件:1、 计算机相关专业,本科以上学历。2、 熟练掌握Java语言,掌握SQL语言和数据库应用开发。3、 熟练使用JavaScript、Ajax、Jquery客户端脚本技术,有高通量数据开发经历者优先,有Android及IOS开发经验者优先。4、 善于分析项目要求,对系统框架设计有独立解决方案;能独立进行需求需求分析、设计及代码编写工作,具有较强的逻辑思维能力,问题缺陷分析处理能力。5、 责任心、事业心强,能承受工作压力,具备良好的沟通协调能力,良好的合作意识和团队协作精神,愿意分担其它工程项目职责。岗位六: 流式细胞分选技术员 1名(一) 岗位职责:1. 主要负责荧光激发细胞分选仪的操作、管理服务及样品制备;2. 负责流式细胞仪的操作,用户培训和技术支持;3. 负责普通荧光显微镜的操作、管理服务及技术支持,保证设备正常运行及日常维护;4. 参与并协调系统公共行政事务(如预算、采购、预约系统等),与中心相关职能部门对接;收集整合系统宣传信息,与中心宣传对接。(二) 任职条件:1. 生物学相关专业,硕士或以上学历;2. 掌握流式细胞分选技术,有流式、显微镜理论及操作基础,能熟练操作显微镜相关的中小型仪器;3. 具有良好的独立工作能力、创新工作精神;工作积极主动,具有团结奉献精神,乐于学习和接受新事物;4. 为人诚实

  • 国家蛋白质科学上海设施/国家蛋白质科学中心·上海(筹)诚聘生物大分子晶体学线站运行管理员、冷冻电镜系统管理员、流式细胞分选等岗位工作人员

    国家蛋白质科学上海设施/国家蛋白质科学中心·上海(筹)生物大分子晶体学线站运行管理员、冷冻电镜系统管理员等岗位招聘启事国家蛋白质科学研究上海设施是国家重大科技基础设施,是国家级蛋白质科学研究平台;在设施建设基础上,依托中国科学院上海生命科学研究院,委托生物化学与细胞生物学研究所(简称SIBCB)负责筹建成立并管理国家蛋白质科学中心•上海(筹), 负责设施的运行管理。中心位于浦东新区张江高科技园区中区西部(上海市浦东新区海科路333号),临近上海科技大学、中国科学院药物研究所、上海高等研究院等科研机构。中心定位于:支撑国家蛋白质上海设施建设的建设,衔接该设施的运行;聚集培养生命科学与生物技术特别是蛋白质研究的人才,提升国家蛋白质研究能力;进而促进我国蛋白质基础研究的飞跃发展。中心将立足于国家生命科学与生物技术及相关研究领域雄厚的研究基础 和创新实力,成为兼具蛋白质科学研究、技术及成果的转化、集成和应用平台的国家级的重要科学研究单元。国家蛋白质科学中心•上海(筹)现因工作需要,公开招聘生物大分子晶体学线站运行管理员、冷冻电镜系统管理员、自动化控制工程师、软件工程师、流式细胞分选技术员等岗位。一、岗位详情:岗位一: 生物大分子晶体学线站工作人员 4名。(一) 岗位职责:参与蛋白质科学研究中心•上海(筹)在上海同步辐射光源参与生物大分子晶体学线站的运行、维护和管理工作,参与线站的用户服务和技术支持工作;参与5线6站相关的科学研究工作。(二) 任职条件:1、物理、光学、光学工程、结构生物学等专业背景,硕士或以上学历。2、具备基本的生物大分子晶体结构衍射数据收集和数据处理的基本知识;有同步辐射光源生物大分子晶体学线站衍射数据收集经验,束线设计和建造经验者,以及同步辐射线站其他相关工作经验者优先。3、具有良好的人际关系和团队协作精神,工作努力,作风踏实,责任心强。4、身体健康,能长期稳定工作。岗位二:自动化控制系统工程师 1名(一) 岗位职责:参与国家蛋白质科学中心(上海)(筹)在上海同步辐射光源5线6站的建设、运行和管理,充分理解同步辐射光束线站的工作内容和线站用户的实际需求,完成线站自动化控制程序的设计、开发和维护。(二) 任职条件:1、本科以上学历,有 Unix/Linux 平台下的工作经验,熟悉Unix/Linux 工作环境,习惯于在 Unix/Linux 平台下工作。有大量的源代码的阅读经验。2、有丰富的 C/C++ 开发经验.熟悉 Socket 编程和多线程编程。3、良好的英文表达能力。能独立完成项目调研,设计和开发工作。4、有以下背景或经验者优先考虑:有大型系统开发经验者和硬件开发经验者;有软件界面开发经验者;有网络程序开发经验者;熟悉 Tcl/Tk 语言者;有 Unix/Linux 系统管理经验者。5、具有良好的人际关系和团队协作精神,工作努力,作风踏实,责任心强。6、身体健康,能长期稳定工作。岗位三:冷冻电镜系统管理员 A 1名(一) 岗位职责:负责电镜负染及冷冻样品制样,样品检测、用户服务。参与中心电镜(包括200 kV TF20及120kV T12)的日常管理,用户培训、技术支持等。(二) 任职条件:1. 具有生物、医学或物理等相关专业的本科或以上学位,有电镜操作或生物电镜样品制样经验者优先考虑;2.有工作热情,乐于学习新技术,有较强的动手能力;3.为人诚实、乐于助人,具有良好的沟通能力、服务精神和团队协作精神;4. 具有良好的中英文口头表达和写作能力;5. 身体健康,能长期稳定工作。岗位四:冷冻电镜系统管理员 B 1名(一) 岗位职责:负责用户项目的合作及服务研究。可以独立应用TITAN Krios及TF20电镜,进行cryo-EM single particle及cryo-ET的数据收集、处理和结构分析,或可独立开展高压冷冻、超薄切片服务等。参与中心电镜(包括300 kV TITAN Krios,200 kV TF20及120kV T12)的日常管理,用户培训、技术支持等。(二) 任职条件:1.应聘者有3年或以上冷冻透射电镜使用经验,具有独立完成cryo-EM single particle及cryo-ET的数据收集、处理和结构分析的能力和经验;或者可以独立开展高压冷冻、超薄切片服务等;2. 具有生物物理学或相关专业的硕士或以上学位,有SCI第一作者论文;具有良好的中英文口头表达和写作能力;3.有工作热情,乐于学习新技术,有较强的动手能力;4.为人诚实、乐于助人,具有良好的沟通能力和团队协作精神;5. 身体健康,能长期稳定工作。 岗位五: 软件工程师 1名(一) 工作职责:1、 编写或依据设计说明书,落实代码的实现工作,确保系统设计的合理性、可扩充性和代码编写的规范性。2、 对接受的开发任务进行评估,细化分配任务,制定软件开发阶段的具体技术实施计划。解决项目中的关键问题和技术难题。3、 根据要求协助进行需求分析及确认工作。执行单元测试、集成测试及回归测试,查出并解决软件在存的缺陷并保证其质量可靠。4、 进行项目相关技术文档的编写工作。5、 辅助保障项目的质量监控和进度管理。6、 完成上级交办的其他工作。(二) 任职条件:1、 计算机相关专业,本科以上学历。2、 熟练掌握Java语言,掌握SQL语言和数据库应用开发。3、 熟练使用JavaScript、Ajax、Jquery客户端脚本技术,有高通量数据开发经历者优先,有Android及IOS开发经验者优先。4、 善于分析项目要求,对系统框架设计有独立解决方案;能独立进行需求需求分析、设计及代码编写工作,具有较强的逻辑思维能力,问题缺陷分析处理能力。5、 责任心、事业心强,能承受工作压力,具备良好的沟通协调能力,良好的合作意识和团队协作精神,愿意分担其它工程项目职责。岗位六: 流式细胞分选技术员 1名(一) 岗位职责:1. 主要负责荧光激发细胞分选仪的操作、管理服务及样品制备;2. 负责流式细胞仪的操作,用户培训和技术支持;3. 负责普通荧光显微镜的操作、管理服务及技术支持,保证设备正常运行及日常维护;4. 参与并协调系统公共行政事务(如预算、采购、预约系统等),与中心相关职能部门对接;收集整合系统宣传信息,与中心宣传对接。(二) 任职条件:1. 生物学相关专业,硕士或以上学历;2. 掌握流式细胞分选技术,有流式、显微镜理论及操作基础,能熟练操作显微镜相关的中小型仪器;3. 具有良好的独立工作能力、创新工作精神;工作积极主动,具有团结奉献精神,乐于学习和接受新事物;4. 为人诚实

  • MSI1在人小细胞肺癌细胞系中的表达及MSI1低表达

    MSI1在人小细胞肺癌细胞系中的表达及MSI1低表达

    MSI1在人小细胞肺癌细胞系中的表达及MSI1低表达细胞模型的构建实验方法与步骤 细胞的复苏 1.复苏前的准备:打开水浴锅,设置温度37℃;紫外线将超净台消毒30 min;配置完全培养基。 2.将要复苏的H69、H446细胞从液氮取出,用一次性PE手套包裹冻存管,迅速放入水浴锅中震荡,使其快速融化。 3.在15 mL离心管中加入5 mL完全培养基及融化的细胞悬液,900 r/min离心8分钟,弃去上清,得到细胞沉淀。 4.在25 cm2的培养瓶中加入5 mL完全培养基,并用1 mL培养基将沉淀的细胞重悬并加入准备好的培养瓶中,放入CO2恒温培养箱中继续培养。 细胞的传代 1.选取在悬浮培养瓶中生长至90%的H69细胞,用移液枪将细胞悬液移入15 mL离心管中,选取在贴壁培养瓶中生长至90%的H446细胞,用PBS溶液将细胞吹至漂浮,并移入15 mL离心管中,两种细胞均900 r/min离心8分钟,弃掉上清。 2.分别在3个25 cm2培养瓶中加入5 mL完全培养基,在细胞沉淀中加入3 mL培养基并充分吹打混匀,将3 mL细胞悬液平均放入3个培养瓶中并混匀,放入培养箱中继续培养。 MSI1低表达细胞模型的构建1.从-80℃冰箱取出慢病毒载体冰上融化,将慢病毒用空白培养基稀释为滴度2×108,充分混匀,准备好病毒感染增强液。2.将25 cm2悬浮培养瓶中H69细胞移入15 mL离心管中并用移液枪充分吹打混匀,取其中500 μL放入细胞计数仪中计数,取出1.2×106个细胞置入新的离心管中,加入空白培养基至6 mL。3.在12孔板中以MOI=10的病毒滴度进行感染,培养16 h。4.16 h后将细胞悬液离心,换成不加双抗的完全培养基继续培养,72 h后观察荧光。5.待细胞生长至状态良好,加入1 μg/mL嘌呤霉素筛选至90%以上细胞均产生荧光。荧光实时定量PCR(Q-PCR)检测MSI1在mRNA水平的表达 总RNA的提取分别将细胞离心,PBS缓冲液清洗2次,900 r/min离心8 min,得到细胞沉淀。分别加入1 mL Trizol,用移液枪吸打至细胞完全破裂,加入200 μL氯仿,震荡30 s,室温静置10 min,以有效分离无机相和有机相,随后4℃,12,000 g/min离心15 min。将上清移至高压过的1.5 mL离心管中,加入与上清等体积的异丙醇,轻柔颠倒震荡数次,室温静置10 min,随后4℃,12,000 g/min离心10 min。弃去上清,加入75%无水乙醇,4℃,12,000 g/min离心5 min。弃去上清,沉淀置于冰上自然干燥,但不可完全干燥。用30 μL DEPC水溶解总RNA。用NanoDrop One超微量分光光度计进行定量和纯度检测,用1%琼脂糖凝胶电泳进行完整性检测。 cDNA的合成逆转录体系试剂名称使用量模板RNAMonScriptTM 5*RT111 All-in-One MixMonScriptTM dsDNaseNuclease-Free Water1 μg4 μL1 μLup to 20 μL将混合液轻柔吹打混匀,瞬时离心,37℃ 2 min,55℃ 15 min,85℃ 5 min,得到cDNA。 Q-PCR检测MSI1 mRNA的表达GAPDH引物序列:Forward primer:Reverse primer:5’-GGTCGGAGTCAACGGATTTG-3’5’-ATGAGCCCCAGCCTTCTCCAT-3’MSI1引物序列:Forward primer:Reverse primer:5’-GAACCATCCCGTCCTGTATCA-3’5’-GAAACCATGAAGCCCCAACC-3’Q- PCR反应体系:Q-PCR反应体系试剂名称使用量cDNAForward primerReverse primerMonAmpTM Chemhs qPCR MixLow ROXNuclease-Free Water50 ng0.2 μL0.2 μL5 μL0.1μLup to 10 μLQ-PCR反应程序: Q-PCR反应程序反应步骤反应温度反应时间循环次数预变性95℃10 min1变性95℃10 s40退火55-65℃10 s延伸72℃30 s溶解曲线溶解曲线按仪器默认溶解曲线 结果采用t检验,用Graphpad prism5计算MSI1在mRNA水平的表达量。 Western blot检测MSI1在蛋白水平的表达总蛋白的提取将对数生长期的H69-NC、H69-shMSI1细胞移入15 mL离心管中,900 r/min离心8 min,并用PBS溶液洗涤2次,以去除培养基中血清影响。分别加入含PMSF的蛋白裂解液100 μL,与细胞充分混匀。4℃裂解1小时后,4℃,12000 g/min离心15 min,将上清移至新的离心管中,得到细胞总蛋白。 BCA法测定蛋白浓度 将Solution A和Solution B以50:1的体积比配置BCA工作液,充分混匀。将2 mg/mL蛋白标准品等比稀释,最小浓度为125 μg/mL,并分别与配置好的200 μL BCA工作液混匀,铺入96孔板中。37℃孵育30 min,测定波长562 nm处OD(光密度值)值,并绘制蛋白标准曲线。取适量H69-NC、H69-shMSI1细胞总蛋白,20:1稀释后,与200 μL BCA工作液混合均匀。37℃孵育30 min,用酶标仪测定波长562 nm处OD值,根据标准曲线计算出样品中的蛋白浓度。Western blot检测MSI1蛋白的表达 分别收集对数生长期的H69-NC、H69-shMSI1细胞总蛋白,加入相应体积4×SDS Loading Buffer,沸水浴煮5 min,分别取40 μg细胞总蛋白,在提前配制的10% SDS-PAGE分离胶电泳。电泳结束后,将蛋白转至PVDF膜上。用含5%脱脂牛奶的封闭液 37℃封闭1.5 h。弃去封闭液,用TBST缓冲液洗3次,每次10 min,加入MSI1兔单克隆抗体(1:1000),并以GAPDH为内参,加入GAPDH鼠单克隆抗体(1:5000);4℃孵育过夜,次日用TBST缓冲液洗膜3次,每次10 min。在敷有MSI1抗体的膜上加入辣根酶标记山羊抗兔IgG(1:5000),在敷有GAPDH抗体的膜上加入辣根酶标记山羊抗鼠IgG(1:5000),37℃敷育1 h,TBST 缓冲液洗膜3次,每次10 min。用增敏化学发光底物试剂检测,暗室曝光显影。在GAPDH表达量相同的情况下比较MSI1的表达情况。多次重复,应用ImageJ计算出各个蛋白条带的灰度对比,结果采用t检验,并应用Graphpad prism5作出柱状图。 MSI1在人小细胞肺癌细胞系中高表达 提取人正常肺上皮细胞BEAS-2B、小细胞肺癌细胞H446、H69的RNA,利用Q-PCR检测MSI1在正常肺上皮及小细胞肺癌细胞系中的表达情况,结果如图2-1显示,MSI1在小细胞肺癌细胞系H446、H69中的表达远远高于正常肺上皮细胞。https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2022/10/202210102201428158_6718_5389809_3.png1 MSI1 mRNA在小细胞肺癌细胞系中的表达(**代表与正常肺上皮细胞相比,小细胞肺癌细胞MSI1表达量增高具有统计学意义,P0.01)。 MSI1低表达细胞模型的构建本实验选取人小细胞肺癌细胞系H69细胞,使用慢病毒感染技术敲低MSI1的表达,同时设置对照组除外病毒本身对细胞产生的影响,待细胞状态良好使用嘌呤霉素筛选,然后在荧光显微镜下观察如图2-2,可见H69-NC、H69-shMSI1细胞均产生绿色荧光,表明人小细胞肺癌H69细胞慢病毒感染成功。https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2022/10/202210102201428036_9359_5389809_3.png MSI1低表达细胞模型的构建。应用shMSI1慢病毒载体感染H69细胞,利用嘌呤霉素筛选,并在荧光显微镜下观察。 荧光实时定量PCR(Q-PCR)检测MSI1的mRNA表达水平提取对数生长期的H69-NC、H69-shMSI1细胞的RNA,并测量RNA浓度及完整性,用1%琼脂糖凝胶电泳检测完整性可见,RNA有三条带,从上到下依次为28S rRNA、18S rRNA和5S rRNA,且28S rRNA的亮度是18S rRNA的两倍。用NanoDrop One超微量分光光度计测定人总RNA的A260/A280的值为2.00左右,A260/A230的值为2.30左右,说明提取的RNA质量和完整性很好,可以用于后续试验。利用Q-PCR技术检测各细胞内MSI1 mRNA相对表达量,结果如图2-3所示,与对照组相比,H69-shMSI1组MSI1 mRNA表达量明显降低(P0.01),抑制率约为75%。https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2022/10/202210102201434330_8277_5389809_3.png MSI1在RNA水平的表达(***代表与对照组相比,H69-shMSI1组MSI1 mRNA表达量下降具有统计学意义,P0.001)。 Western blot检测MSI1蛋白表达水平将BSA标准品(2 mg/mL)进行等比稀释,最低浓度为125 ug/mL,并应用BCA蛋白质浓度测定试剂盒测定在波长562 nm下的OD值,以OD值为纵坐标,对应蛋白质浓度(μg/mL)为横坐标,绘制标准蛋白曲线如图2-4所示。https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2022/10/202210102201435248_4142_5389809_3.png图2-4 标准蛋白曲线分别提取H69-NC、H69-shMSI1细胞的总蛋白质,利用Western blot技术检测各细胞内MSI1蛋白的表达情况。结果如图2-5所示,与对照组相比,MSI1蛋白表达在H69-shMSI1细胞中明显降低。表明MSI1低表达细胞模型构建成功。ahttps://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2022/10/202210102201437240_855_5389809_3.pngbhttps://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2022/10/202210102201434999_3303_5389809_3.png图2-5 MSI1蛋白水平表达:(a)MSI1蛋白表达条带;(b)MSI1蛋白的相对表达量。(*表示与对照组相比,H69-shMSI1组MSI1蛋白表达下降具有统计学意义,P0.05)。首先验证MSI1在小细胞肺癌细胞系中的表达情况,利用Q-PCR技术检测在RNA水平,MSI1在肺正常上皮细胞及小细胞肺癌细胞系中的表达,结果显示,MSI1在小细胞肺癌细胞中的表达明显高于正常肺上皮细胞。随后以人经典型小细胞肺癌细胞系H69细胞为研究对象,构建MSI1低表达细胞模型,应用shMSI1慢病毒载体感染H69亲本细胞,同时设置对照组除外病毒本身对细胞产生的影响,利用Q-PCR及Western blot验证MSI1在RNA及蛋白水平的表达,结果显示,H69-shMSI1组MSI1的mRNA及蛋白的表达明显降低。表明MSI1低表达细胞模型构建成功,可以用于后续实验。

  • 蛋白表达FAQ常见问题解析

    [font=宋体][font=宋体]原核表达(这里是指[/font] [font=宋体]大肠杆菌表达系统[/font] [font=宋体])是目前常用的重组蛋白表达方式之一,操作相对简便,要求较低。相对哺乳动物表达系统更加经济节约。但是也常常遇到一些问题,比如原核表达蛋白表达量低?蛋白不表达?蛋白表达不在上清易形成包涵体等情况。本文主要根据实验经验总结[/font] [font=宋体]原核蛋白表达[/font] [font=宋体]的两个问题蛋白为什么不表达和蛋白表达为什么不在上清,并提出针对性的解决方案,帮助我们提高实验的成功率。原核表达[/font][font=Calibri]FAQ[/font][font=宋体]主要内容如下:[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体]一、蛋白表达为什么不在上清?[/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=宋体]蛋白在大肠杆菌中的表达部位:细胞质中、细胞周质中、细胞外。[/font] [/font][font=宋体]蛋白在细胞周质中表达:细胞周质是指革兰氏阴性菌中、位于内膜和外膜之间的结构部分。周质中表达的蛋白质,分离纯化简单,而且周质中的氧化环境有利于蛋白质的正确折叠,但是蛋白产量很低。[/font][font=宋体]蛋白在胞外表达:胞外分泌是使大肠杆菌中的外源蛋白分泌到培养基中。[/font][font=宋体]途径:[/font][font=宋体]①用大肠杆菌细胞固有的途径,使真正属于分泌的蛋白直接分泌到胞外培养基中。大肠杆菌在正常情况下只有极少的蛋白可以分泌到胞外,且不是特别有效。[/font][font=宋体]②诱导大肠杆菌细胞的外膜发生有限的渗漏,从而使细胞内的蛋白向胞外培养基中分泌。[/font][font=宋体] [/font][font=宋体]二、蛋白的分泌表达优点[/font][font=宋体][font=Calibri]1[/font][font=宋体]、一些可被细胞内蛋白酶所降解的蛋白质分泌到周质或培养基中可增加其稳定性;[/font][/font][font=宋体][font=Calibri]2[/font][font=宋体]、有些在细胞内表达时无活性的蛋白分泌表达时能够按适当的方式进行准确折叠,增加到蛋白的活性;[/font][/font][font=宋体][font=Calibri]3[/font][font=宋体]、 由于蛋白质信号肽和编码序列间被切割,所以分泌蛋白产物不含氨基酸起始密码子[/font][font=Calibri]ATG[/font][font=宋体]所编码的甲硫氨酸,而甲硫氨酸会影响许多蛋白的活性。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体]三、如何提高蛋白的可溶性?[/font][font=宋体]重组蛋白在大肠杆菌中大量表达时,很容易在胞内形成不可溶的包涵体,为后期的纯化、复性带来麻烦,而且复性所得到的蛋白活性很低甚至没有活性。因此,提高重组蛋白在大肠杆菌中的可溶性表达是十分必要的。[/font][font=宋体] [/font][font=宋体]四、蛋白为什么不表达?[/font][font=宋体]真核基因在原核细胞中的的特点[/font][font=宋体]①使用原核启动子[/font][font=宋体][font=宋体]原核细胞[/font][font=Calibri]RNA[/font][font=宋体]聚合酶能识别真核基因启动子。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=宋体]②真核基因要置于原核载体[/font][font=Calibri]SD[/font][font=宋体]序列后[/font][/font][font=宋体][font=宋体]从真核[/font][font=Calibri]DNA[/font][font=宋体]转录的[/font][font=Calibri]mRNA[/font][font=宋体]缺乏结合原核核糖体的[/font][font=Calibri]SD[/font][font=宋体]序列,不能启动翻译过程。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=宋体]③使用[/font][font=Calibri]cDNA[/font][/font][font=宋体][font=宋体]真核基因中含有内含子,而原核细胞缺乏转录后加工体系,[/font][font=Calibri]mRNA[/font][font=宋体]中内含子不能切除,不能形成成熟的[/font][font=Calibri]mRNA[/font][font=宋体],也就不能表达真核蛋白。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体]④表达无需糖基化等修饰的蛋白[/font][font=宋体]原核细胞缺乏真核细胞所特有的蛋白翻译后的修饰系统,不利于表达需要糖基化、磷酸化修饰才有活性的真核蛋白。[/font][font=宋体] [/font][font=宋体]⑤真核基因必须切除信号肽序列[/font][font=宋体]蛋白具有信号肽序列的真核基因在真核细胞内先表达成蛋白前体,在其穿越细胞膜向外分泌时,会被细胞膜上信号肽识别序列切除而分泌到细胞外。但是在原核细胞内表达时,不但影响蛋白的表达,同时由于大肠杆菌缺乏加工处理体系,不能正确切除信号肽,而表达的分泌蛋白的前体没有实物活性,常聚集在胞内。[/font][font=宋体] [/font][font=宋体]五、影响原核表达的因素[/font][font=宋体][font=Calibri]1[/font][font=宋体]、翻译起始位点[/font][/font][font=宋体]现在大部分的表达载体都提供起始位点,所以它已经把起始密码子与核糖体结合位点的距离进行了优化,一般情况下不需要自己再添加,不过还是要留意载体图谱上是否注明有起始密码子和终止密码子。[/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri]2[/font][font=宋体]、[/font][font=Calibri]GC[/font][font=宋体]含量[/font][/font][font=宋体][font=宋体]表达序列中的[/font][font=Calibri]GC[/font][font=宋体]含量超过[/font][font=Calibri]70%[/font][font=宋体]的时候可能会降低蛋白在大肠杆菌中的表达水平。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri]3[/font][font=宋体]、[/font][font=Calibri]mRNA[/font][font=宋体]二级结构[/font][/font][font=宋体][font=宋体]在起始密码子附近的[/font][font=Calibri]mRNA[/font][font=宋体]二级结构可能会抑制翻译的起始或者造成翻译暂停从而产生不完全的蛋白。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri]4[/font][font=宋体]、密码子的偏爱性[/font][/font][font=宋体]如果外源基因密码子的使用频率和宿主菌高效表达的基因密码子的使用频率差异较大,翻译时核糖体在稀有密码子处就会产生停顿,这不仅降低蛋白质的合成效率,导致新生肽链的错误折叠而影响延伸,甚至会停止翻译。[/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri]5[/font][font=宋体]、质粒载体的选择[/font][/font][font=宋体]构建质粒载体时,要考虑质粒上的元件包括启动子,多克隆位点,终止密码子,融合标签,复制子,筛选标记基因等因素。[/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri]6[/font][font=宋体]、基因或者蛋白的大小[/font][/font][font=宋体][font=宋体]一般来说小于[/font][font=Calibri]10kd[/font][font=宋体]和大于[/font][font=Calibri]100kd[/font][font=宋体]的蛋白都是难以表达的。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri]7[/font][font=宋体]、外源基因对宿主有毒性[/font][/font][font=宋体]外源基因在宿主内会抑制宿主菌的生长甚至导致宿主死亡,表观的现象:宿主菌在诱导后菌体量上升缓慢或不在生长。[/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri]8[/font][font=宋体]、基因突变(移筐突变)[/font][/font][font=宋体]碱基的突变、插入或缺失对阅读框的影响,可能会导致表达的蛋白质结构改变,或蛋白质合成过早终止。[/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=Calibri]9[/font][font=宋体]、培养诱导条件[/font][/font][font=宋体][font=宋体]培养基成分([/font][font=Calibri]C/N[/font][font=宋体])及培养条件(温度、诱导时机、诱导剂,浓度、诱导时间)也是影响蛋白表达的。[/font][/font][font=宋体] [/font][font=宋体][font=宋体]更多关于[url=https://cn.sinobiological.com/resource/protein-review/protein-expression][b]蛋白表达[/b][/url]详情可以关注:[/font][font=Calibri]https://cn.sinobiological.com/resource/protein-review/protein-expression[/font][/font][font=Calibri] [/font]

  • 【转帖】蛋白质组学的标准化

    【转帖】蛋白质组学的标准化

    由于人类基因序列的建立已经接近完成,人们认识到生物科学届的下一项任务将是表征基因组的产物——其中绝大部分是蛋白质。作为正在兴起的研究领域,蛋白质组学将其研究目标定位于:鉴定和测量在一个细胞或组织中的所有蛋白质,这样做的预期是,将能发现那些能够成为疾病生物标志物(biomarker)或药物靶标的候选蛋白质。经证明,这是一项令人望而生畏的工作,难度之一在于,25,000个基因中的每一个都会产生拼接、翻译后修饰,最后表达的蛋白质数量将会大大增加。另一个增加难度的因素是蛋白质的浓度范围太广——通常为许多个数量级——并且很可能大多数人们感兴趣的都是那些低丰度的蛋白。  目前,已有大量的技术和实验方法用于解决蛋白质组学的问题。其中应用最广泛的是“自下而上”的方法。用蛋白质水解酶(典型的为胰蛋白酶)将细胞提取液或溶胞产物中的所有蛋白质酶解,接着用反相液相色谱(LC)分离,然后在线引入电喷雾源的质谱。一种参考的液相色谱-串联质谱([url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Yp][color=#3333ff]LC-MS[/color][/url]-MS)流程通常为:多肽离子在母离子扫描中被分离,其中几个最强的离子将被自动碎裂,将母离子质量和子离子/碎片质量都输入搜索引擎,和数据库中的蛋白按照多肽和碎片质量去匹配,匹配的结果将生成记录、即完成了蛋白质的鉴定。获得一个、几个或所有蛋白质的定量信息,可以有几种做法:比如通过谱图计数和峰强度测量的非标记方法(Label free) 通过引入稳定同位素标记标签 或用重同位素标记蛋白中的一个或几个肽(“蛋白典型多肽”) [1]对于复杂样品,如人体液或胞溶产物,潜在需要分析的蛋白质数量将非常庞大。在一个特定状态下一个细胞典型地会表达几千种蛋白质,每个蛋白质将产生多达几十个多肽,而每一个多肽在质谱中又以多种带电状态存在。因此,单个蛋白质组学样本就包含500, 000多种类别或者更多。为了减少分析问题的复杂性,通常在进行[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Yp][color=#3333ff]LC-MS[/color][/url]分析前利用一维或二维凝胶电泳[2]、溶液中的等电聚焦[3]或多维高效液相色谱(HPLC)[4]技术,将样本预分离成多馏分(prefractionation)。[img]http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2009/12/200912311320_193276_1615922_3.jpg[/img]

  • 生物质谱技术在蛋白质组学中的应用

    一、 前言基因工程已令人难以置信的扩展了我们关于有机体DNA序列的认识。但是仍有许多新识别的基因的功能还不知道,也不知道基因产物是如何相互作用从而产生活的有机体的。功能基因组试图通过大规模实验方法来回答这些问题。但由于仅从DNA序列尚不能回答某基因的表达时间、表达量、蛋白质翻译后加工和修饰的情况、以及它们的亚细胞分布等等,因此在整体水平上研究蛋白质表达及其功能变得日益显得重要。这些在基因组中不能解决的问题可望在蛋白质组研究中找到答案。蛋白质组研究的数据与基因组数据的整合,将会在后基因组研究中发挥重要作用。目前蛋白质组研究采用的主要技术是双向凝胶电泳和质谱方法。双向凝胶电泳的基本原理是蛋白质首先根据其等电点,第一向在pH梯度胶内等电聚焦,然后转90度按他们的分子量大小进行第二向的SDS-PAGE分离。质谱在90年代得到了长足的发展,生物质谱当上了主角,蛋白质组学又为生物质谱提供了一个大舞台。他们中首选的是MALDI-TOF,其分析容量大,单电荷为主的测定分子量高达30万,干扰因素少,适合蛋白质组的大规模分析。其次ESI为主的LC-MS联机适于精细的研究。本文将简介几种常用的生物质谱技术,并着重介绍生物质谱技术在蛋白质组学各领域的应用。二、 生物质谱技术1.电喷雾质谱技术(ESI)电喷雾质谱技术( Electrospray Ionization Mass Spectrometry , ESI - MS) 是在毛细管的出口处施加一高电压,所产生的高电场使从毛细管流出的液体雾化成细小的带电液滴,随着溶剂蒸发,液滴表面的电荷强度逐渐增大,最后液滴崩解为大量带一个或多个电荷的离子,致使分析物以单电荷或多电荷离子的形式进入气相。电喷雾离子化的特点是产生高电荷离子而不是碎片离子, 使质量电荷比(m/ z) 降低到多数质量分析仪器都可以检测的范围,因而大大扩展了分子量的分析范围,离子的真实分子质量也可以根据质荷比及电荷数算出。2.基质辅助激光解吸附质谱技术(MOLDI)基质辅助激光解析电离(MOLDI)是由德国科学家Karas和Hillenkamp发现的。将微量蛋白质与过量的小分子基体的混合液体点到样品靶上,经加热或风吹烘干形成共结晶,放入离子源内。当激光照射到靶点上时,基体吸收了激光的能力跃迁到激发态,导致蛋白质电离和汽化,电离的结果通常是基体的质子转移到蛋白质上。然后由高电压将电离的蛋白质从离子源转送到质量分析器内,再经离子检测器和数据处理得到质谱图。TOF质量分析器被认为是与MALDI的最佳搭配,因为二者都是脉冲工作方式,在质量分析过程中离子损失很少,可以获得很高的灵敏度。TOF质量分析器结果简单,容易换算,蛋白质离子在飞行管内的飞行速度仅与他的(m/z)-1/2成正比,因此容易通过计算蛋白质离子在飞行管内的飞行时间推算出蛋白质离子的m/z值。与传统质量分析器相比,更易得到高分辨率和高测量精度;速度快,离子飞行时间仅为几个μs和约100μs之间;质量范围宽,可以直接检测到几十万道尔顿的单电荷离子。飞行时间质量分析器被认为是21世纪最有应用前景的质量分析器。3.傅立叶变换-离子回旋共振质谱(FT-ICR MS)傅立叶变换-离子回旋共振质谱法(FT-ICR MS)是离子回旋共振波谱法与现代计算机技术相结合的产物。傅立叶变换-离子回旋共振质谱法是基于离子在均匀磁场中的回旋运动, 离子的回旋频率、半径、速度和能量是离子质量和离子电荷及磁场强度的函数, 当对离子施加与其回旋频率相同的射频场作用时, 离子将同相位加速到一较大的半径回旋, 从而产生可被接受的类似电流的信号。傅立叶变换-离子回旋共振质谱法所采用的射频范围覆盖了欲测定的质量范围,所有离子同时被激发, 所检测的信号经过傅立叶变换, 转换为质谱图。其主要优点有:容易获得高分辨;便于实现串极质谱分析;便于使用外电离源并与色谱仪器联用。此外,他还有灵敏度高,质量范围宽,速度快,性能可靠等优点。4.快原子轰击质谱技术(FABMS)快原子轰击质谱技术( Fast Atom Bomebardment Mass Spectrometry , FABMS) 是一种软电离技术,是用快速惰性原子射击存在于底物中的样品,使样品离子溅出进入分析器,这种软电离技术适于极性强、热不稳定的化合物的分析,特别适用于多肽和蛋白质等的分析研究。FABMS能提供有关离子的精确质量,从而可以确定样品的元素组成和分子式。而FABMS -MS 串联技术的应用可以提供样品较为详细的分子结构信息,从而使其在生物医学分析中迅速发展起来。三、蛋白质的分析鉴定随着质谱技术的发展,分子量的测定已从传统的有机小分子扩展到了生物大分子。MALDI-MS技术以其极高的灵敏度、精确度在蛋白质分析中得到了广泛的应用。该技术不仅可测定各种疏水性、亲水性和糖蛋白的分子量,还可直接测定蛋白质混合物的分子量。这可认为是蛋白质分析领域的一项重大突破。蛋白质组的研究是从整体水平上研究细胞或有机体内蛋白质的组成及其活动规律。质谱技术作为蛋白质组研究的三大支撑技术之一,除了用于多肽,蛋白质的分子量测定外,还广泛的应用于肽指纹图谱测定及氨基酸序列测定。肽指纹图谱(Peptide Mass Fingerprinting, PMF)测定是对蛋白酶解或降解后所得多肽混合物进行质谱分析的方法。质谱分析所得肽断与多肽蛋白数据库中蛋白质的理论肽断进行比较,判断出所测蛋白是已知还是未知。由于不同的蛋白质具有不同的氨基酸序列,不同蛋白质所得肽断具有指纹特征。采用肽指纹谱的方法已对酵母、大肠杆菌、人心肌等多种蛋白质组进行了研究。对肽序列的测定往往要应用串连质谱技术,采用不同的技术选择特定质核比的离子,并对其进行碰撞诱导解离,通过分析肽段的断裂情况推导出肽序列。四、后转录修饰的蛋白质的检测和识别在蛋白质组的研究中,蛋白质和多肽的序列分析已不局限于阐明蛋白质的一级结构,对翻译后的修饰的进一步分析也是蛋白质化学的一项重要任务。这种修饰对于蛋白质的功能非常重要,如:细胞识别中的蛋白质相互作用,信号传导和蛋白质定位。1. 蛋白质的糖基化糖蛋白在细胞内部,细胞膜和细胞外均有发现,实际上大部分蛋白质是糖蛋白。对糖蛋白的检测和分析发现,糖蛋白中糖组分的结构和功能具有多样性。糖蛋白中的糖通常是不同种类的,而且是由一些可控数量的单糖组成。糖基化的多样性与细胞周期,细胞分化和发展的状态有关。在蛋白组时代中,蛋白质的修饰会引起其理化性质的改变,因此是不容忽视的。从1D或2D凝胶得到的糖基化蛋白的识别,一般是进行MALDI-MS指纹分析, 或是对MALDI-PAD或ESI-MS/MS得到的碎片谱进行分析。对完整的糖蛋白的研究是非常困难的,所有已知的离子化技术都有其局限性。目前,人们主要研究糖肽,其好处之一就是质量减小了,这就会得到更好的分辨率,而且糖肽仍保留了糖基化位点。将分离的糖蛋白用不同的蛋白酶消化后就可进行糖肽的研究。一旦糖肽被识别出,就可以用串连质谱(ESI-MS/MS)来阐明肽序列。当蛋白的序列已知时,计算质量差就可推出其上附着的寡糖的质量。要将糖部分从糖蛋白中释放出来,可用化学切割或酶切割(流程图见图1)。目前,连有结构专一性糖苷酶的质谱在提供序列,分支和链接数据方面是最有力的技术。对于N糖基化常用的糖苷内切酶有PNGase-F, PNGase-A, EndoF和EndoH。化学切割也可以用来释放O-连接和N-连接的多糖,但经常出现的缺点是他会完全破坏所有的肽键,因而丢失了关于糖附着位点的信息。而且这些切割不能从糖肽中连续释放单糖。用肼的化学切割可以除去两种类型的糖基化。在60℃可专一性的释放O-连接的糖,而在95℃能释放N-连接的糖。释放O-原子更常用的方法是用碱进行β消除。通常,糖基中加入金属离子在MALDI和ESI中离子化。用MALDI-MS分析糖类的一个好的选择是将之与其他一些化合物混合,这样可以进一步提高灵敏度和分辨率。不同的质谱方法可以产生多糖的源后裂解(PSD)和碰撞诱导解离 (CID)谱,这可以给出有关糖的序列,分支及糖间的连接等信息。2. 蛋白质的磷酸化蛋白质中氨基酸的磷酸化在生命系统中起重要的作用。磷酸化经常作为分子开关控制不同过程蛋白质的活性,如新陈代谢,信号传导,细胞分裂等过程。因此,蛋白质中磷酰氨基酸的识别在蛋白质分析中是一项重要的工作。已知的磷酰氨基酸的类型有四种:1.O-磷酸盐,通过羟氨酸的磷酸化形成的,如丝氨酸,苏氨酸,酪氨酸。2.N-磷酸盐,通过精氨酸,赖氨酸或组氨酸中的氨基的磷酸化形成的。3.乙酰磷酸盐,通过天冬氨酸或谷氨酸的磷酸化形成的。4.S-磷酸酯,通过半胱氨酸的磷酸化形成的。

  • 7月17日一起揭秘用于定量蛋白质组学的革新性解决方案

    7月17日一起揭秘用于定量蛋白质组学的革新性解决方案

    http://img3.17img.cn/bbs/upfile/images/20100518/201005181701392921.gif用于定量蛋白质组学的革新性解决方案—配备http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2014/06/201406201436_502607_2507958_3.jpg采集技术2.0 的http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2014/06/201406201438_502608_2507958_3.jpg系统讲座时间:2014年7月17日 12:00 主讲人:靳文海 博士 AB SCIEX中国区应用支持经理,组学和科研市场 Shi Yang , AB Sciex 全球食品安全市场发展经理http://img3.17img.cn/bbs/upfile/images/20100518/201005181701392921.gif【简介】 具备http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2014/06/201406201436_502607_2507958_3.jpg采集技术 2.0 的全新http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2014/06/201406201438_502608_2507958_3.jpg系统在每一次运行中可捕获每一个可检测到的蛋白和肽段,从而深入洞察蛋白质组 AB SCIEX http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2014/06/201406201436_502607_2507958_3.jpg 采集模式采用非数据依赖的采集方法,通过检测样品肽段的碎片信息重新唤起了蛋白质组学领域对全面数据的兴趣,目的是为了获取定量MS/MS数据。该方法使得靶向蛋白质组学实验的分析能力提高30倍以上,同时减少90%的研究时间。现在,凭借提高动态范围的http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2014/06/201406201438_502608_2507958_3.jpg系统,研究人员可以更深入地研究复杂样品。结合创新的可变化的窗口采集与SWATH 2.0处理软件,使得定量分析能力得到了显著提高。 通过早期试验对比,拥有 http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2014/06/201406201436_502607_2507958_3.jpg 2.0独有技术的http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2014/06/201406201438_502608_2507958_3.jpg系统与其它分析仪器相比,已被证明能够定量分析90%以上的肽段,同时CVs小于20%(该阈值通常判断LC/MS定量分析数据是否在较好的限定范围内)。性能和数据完整性方面的进步可预期使得大规模的生物学实验,例如基因组学和转录组学的整合更加容易。-------------------------------------------------------------------------------1、报名条件:只要您是仪器网注册用户均可报名参加。2、报名并参会用户有机会获得100元京东卡一张哦~3、报名截止时间:2014年7月17 日 11:30 4、报名参会:http://simg.instrument.com.cn/meeting/images/20100414/baoming.jpg

  • 蛋白质组学研究的一般工具与方法【含质谱】

    蛋白质组学研究的一般工具与方法随着人类基因组计划取得巨大的成功和许多物种基因组测序的完成,仅仅靠基因组的序列来试图阐明生命现象是远远不够的,因此,研究重心已经开始从揭示生命的所有遗传信息转移到在分子整体水平对功能的研究上,生命科学已实质性地跨入了后基因组时代。   尽管现在已经有多个物种的基因组被测序,但这些基因组中通常有一半以上基因的功能是未知的。目前功能基因组研究中所采用的策略,如微阵列法(microarray)(Wodicka et al., 1997)、基因芯片(gene chips)(Ramsay et al., 1998)、基因表达序列分析(SAGE)(Velculescu et al., 1995)等,都是从细胞中mRNA的角度来考虑的。但事实上,从DNA、mRNA到蛋白质存在三个层次的调控,mRNA自身也存在着贮存、转运和降解等问题,从mRNA角度考虑,实际上仅包括了转录水平调控,并不能全面代表蛋白质表达水平。实验也证明,组织中mRNA丰度与蛋白质丰度的相关性并不好,尤其对于低丰度蛋白质来说,相关性更差。蛋白质复杂的翻译后修饰,蛋白质的亚细胞定位或迁移,蛋白质-蛋白质相互作用则几乎无法从mRNA水平来判断(曾嵘,夏其昌,2002)。新生肽链合成后存在多种加工、修饰过程,蛋白质间也存在类似于mRNA分子内的剪切、拼接,研究证明基本元件“intein”广泛存在于蛋白质中(Perler et al., 1997)。基因与其编码产物蛋白的线性对应关系只存在于新生肽链而不是最终的功能蛋白质中。   蛋白质是生理功能的执行者和生命现象的直接体现者,对蛋白质结构和功能的研究将直接阐明生命在生理或病理条件下的变化机制;蛋白质本身的存在形式和活动规律,如翻译后修饰、蛋白质间相互作用及蛋白质构象等问题,仍依赖于直接对蛋白质的研究来解决。因此要对生命的复杂活动有全面和深入的认识,必然要在整体、动态、网络的水平上对蛋白质进行研究(钱小红,贺福初,2003)。      蛋白质组学研究中常用的技术体系   方法学上,二维凝胶电泳-质谱仍然是目前最流行和可靠的技术平台(Rabilloud et al., 2000)。其一般过程是:细胞或组织样品——样品制备——二维凝胶电泳(2D-PAGE)分离蛋白质——计算机辅助分析2D-PAGE图象——对感兴趣的蛋白质进行酶解——质谱分析——数据库检索——蛋白质鉴定——分析蛋白质在细胞与组织中的表达情况。   2-D PAGE   样品制备   2D-PAGE 的操作流程基本上实现了程序化。但是,样品制备是一个非常关键与复杂的过程。成功的2D-PAGE取决于对样品中蛋白质有效的抽提和它的溶解性。与核酸不同,目前没有一种通用的方法适用于所有的蛋白质,来源不同的蛋白质都受到自身蛋白质制备方法的挑战。   正确的样品制备方法从收集样品开始时就要防止样品的裂解和被蛋白水解酶降解(Rabilloud et al., 2000)。要尽可能溶解更多的蛋白,并且在2D-PAGE过程中保持它的溶解性,阻止蛋白质的人为修饰。在样品制备过程中,各个实验室也通过实验建立了更为可行的方法。目前通过建立分步提取方法可以有效地提取出更多的蛋白质(兰彦等,2001)。另一种对蛋白质采用预分离的方法称为“多间隔电解法(multi-compartment-electrolyser)”,采用这种方法后,分辨率和胶的质量均明显改善(Herbert et al., 2000)。   但是,由于生物样品的多样性和复杂性,目前所采用的样品制备方法具有局限性。其它物质对蛋白质样品制备存在干扰。核酸通过与蛋白质结合,增加样品黏度而干扰等点聚焦(IEF)分离的效果。当然,通过实验探索,采取一些措施可以减轻它的干扰。例如,在样品制备过程中加入非特异性的核酸酶或RNase与DNase的混合物,在等电聚焦时将每个胶条的电流限制在50mA以内通常可以消除其影响。脂类物质的影响可以通过利用有机溶剂的方法将其去除,但是这常常会导致蛋白质的不可逆沉淀。除了蛋白质的降解之外,糖基化是蛋白质的最重要的人工修饰,样品中的尿素在这一过程中起着非常重要的作用。样品中的尿素在降解的过程中会形成能够与蛋白质的氨基反应的氰酸盐,这种结果会导致蛋白质带有更多的正电荷。所以,在2D-PAGE中要用新鲜的尿素溶液,在等电聚焦过程中要控制温度不能太高(Beranova-Giorgianni, 2003)。但是,目前还没有一种简单有效的方法来去除样品中的多糖。   样品分离和分析   样品制备完成后运用IEF和SDS-PAGE电泳对它进行分离,常采用银染和考马斯亮兰染色即可观察到具有许多蛋白质斑点的凝胶图像。等电聚焦电泳与SDS-PAGE的具体操作步骤已经实现了程序化,均有详细操作流程参考,但是由于样品的不同,不同样品的具体条件还需要试验探索。第二相SDS-PAGE运行结束,染色完毕后,利用计算机软件对凝胶图像进行分析,如PD-QUEST软件,LIPS,HERMES,GEMINI等,对凝胶图像上的蛋白质斑点进行匹配,对图像进行数字化处理等分析(贾宇峰等,2001),对感兴趣的蛋白质采用质谱分析。   低丰度蛋白质的检测   低丰度蛋白在蛋白质组学研究中常常是人们非常感兴趣的,因为细胞或组织中的一些生物活性物质,如细胞分泌的一些活性物质,受体等表达量都非常低。按照一般电泳的上样量,这些小分子是根本看不到的,但如果单纯地增加上样量,细胞或组织中的大量表达的蛋白就会将其覆盖,而且上样量过大也会影响电泳结果。所以对这些低丰度的样品可以进行富集,富集的方法可以通过层析,如亲和层析,离子交换层析等方法,还可以通过利用样品等电点性质等方法将pH范围相近的蛋白质富集(Santoni et al., 2000; Beranova-Giorgianni, 2003)。

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