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全自动琼脂糖凝胶电泳分析仪

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全自动琼脂糖凝胶电泳分析仪相关的论坛

  • 琼脂糖凝胶电泳——给新手

    做了一小段时间的琼脂糖凝胶电泳, 有一些体会给新手们参考, 不当之处也请专家们指正.1. 加热时, 一定要煮沸, 以保证琼脂糖的完全溶解.2. 待溶液冷却至不烫手, 感觉温暖舒适时加EB. 一定要在通风柜里.3. 倒胶时, 可用干净的纸巾拭去气泡.4. 胶凝固后先倒入些电泳缓冲液以方便取梳子.5. 保证缓冲液淹过胶的边沿, 边沿部分常高出1-2mm.6. 有时需要大的上样孔, 可用胶带把几个相邻的梳齿粘在一起, 这种情况下, 尽量让胶液冷一些再倒胶.7. 如果只是为了看一下结果(不需要照相), 同一块胶可重复用1-3次. 有一次我跑了4遍, 条带很弱, 用加了EB的缓冲液(约10ul EB in 50ml 缓冲液)泡半小时后就如正常了.8. 要保存胶到第二天用, 可以保鲜膜包裹后放入4 度冰箱.9. TAE 电泳缓冲液也可重复使用, 至少10次没有问题.10. 为了防止电泳时两极缓冲液槽内pH和离子强度的改变,可在每次电泳后合并两极槽内 的缓冲液,混匀后再用。

  • 【分享】琼脂糖凝胶电泳技术

    电泳基本原理 迁移率(或泳动度)是指带电颗粒在单位电场强度下泳动的速度,可用下列公式计算: U =υ/E =(d/t)/(V/l) =dl/Vt U为迁移率(cm2•V-1•min-1);υ为颗粒泳动速度(cm•s-1);E 为电场强度( V•cm-1);d为颗粒泳动的距离(cm);l为滤纸有效长度(cm);V为实际电压(V);t为通电时间(s或min)。通过测量d, l, V, t, 即可计算出被分离物质的迁移率。 1迁移率单位= 10-5 cm2•V-1•min-1在确定的条件下,某物质的迁移率为常数,是该物质的化学特征常数。 颗粒带净电荷多,直径小而接近于球形,则在电场中泳动速度快,反之则泳动速度慢。 迁移率还与分子的形状,介质粘度,颗粒所带电荷有关,迁移率与颗表面电荷成正比,与介质粘度及颗粒半径成反比。 影响琼脂糖电泳迁移的主要因素 电场强度 溶液的pH值 溶液的离子强度 电渗现象 温度的影响 支持物的影响 按分离原理分类: 1.区带电泳 2.移界电泳 3.等速电泳 4.聚焦电泳 按有无固体支持物分类 1. 纸上电泳 2. 醋酸纤维素膜电泳 3. 薄层电泳 4. 非凝胶性支持物区带电泳(支持物有:淀粉、纤维素粉、玻璃粉、硅胶) 5. 凝胶支持区带电泳(淀粉凝胶、聚丙稀酰胺凝胶、琼脂糖凝胶) 影响琼脂糖电泳迁移的主要因素 DNA的大小 DNA的构象 琼脂糖浓度 缓冲液 不同构像质粒 缓冲液 TAE:乙酸盐缓冲液 TBE:硼酸盐缓冲液 TPE:磷酸盐缓冲液 实验操作 1. 用胶带将洗净、干燥的水平板的边缘封住,形成一个胶模并水平放置。 2. 按水平板的长×宽×0.5cm胶厚,量取0.5×TBE,并按0.7%的浓度称取agarose琼脂糖,在微波炉或电炉上加热至全熔(清澈透明)。 3. 等凝胶温度降至大约50-60以下时,加入1 mg/L溴化乙锭(EB)至终浓度为0.5ug/mL ;摇匀并轻快地倒入水平板中,除掉气泡,插入梳子。 4. 凝固后,将梳子轻轻拔出。 5.去掉胶带,将水平板放入加有0.5×TBE电泳缓冲液的电泳槽中,并且使电泳缓冲液高出凝胶约1mm。 6.在parafilm膜上依次加: ddH2O 6ul,上样Buffer 2ul ,DNA 4ul 分别混匀后点样,记录点样次序。 7. 在水平板两边的点样孔中分别加入6 μ l的λΔΝΑ/EcoRI+HindIII marker。 8. 盖好电泳槽盖子,选择适当的电泳电压(≤5V/cm)及电泳方向(DNA阴极阳极),开始电泳。 9. 当色素接近胶的先端,停止电泳,样品在紫外灯下观察、成像℃

  • 琼脂糖凝胶电泳常见问题与解决办法

    一、凝胶制备1. 微波炉溶解琼脂糖时,胶液沸腾冲溢出三角锥瓶微波炉加热时胶液可能发生剧烈沸腾,(1)总液体量不宜超过三角锥瓶的50%容量。(2)2%以上胶液设置中火加热。 (3)胶液剧烈沸腾时,停止加热,移开三角锥瓶,请戴上防热手套,小心摇动三角锥瓶,然后再次加热,胶液沸腾直至胶液清澈,保证琼脂糖完全溶解。 2. 琼脂糖电泳图像背景模糊不清:琼脂糖没有完全溶解会造成电泳图像背景模糊不清。完全溶解的琼脂糖胶液清澈,三角锥瓶内壁应没有粘附琼脂糖颗粒。 3.加热后水分蒸发,如需要应加入热的蒸馏水,补足到原来的重量,摇匀。 二、电泳1. DNA条带模糊,拖尾。 (1)DNA降解。避免核酸酶污染。 (2)DNA上样量过多。减少凝胶中DNA上样量。 (3)电泳缓冲液陈旧:电泳缓冲液多次使用后,离子强度降低,pH值上升,缓冲能力减弱,从而影响电泳效果。建议经常更换电泳缓冲液。 (4)电泳条件不合适。电泳时电压不应超过20 V/cm,温度<30℃,巨大DNA链,温度应<15℃,核查所用电泳缓冲液是否有足够的缓冲能力。 (5)DNA样含盐过高。泳前通过乙醇沉淀去除过多的盐。 (6)有蛋白污染。电泳前抽提去除蛋白。 (7)DNA变性。电泳前勿加热,用20 mM NaCl缓冲液稀释DNA。[/c

  • 凝胶电泳仪简介

    凝胶电泳(英语:Gel electrophoresis)或称胶体电泳 是一大类技术,被科学工作者用于分离不同物理性质(如大小、形状、等电点等)的分子。凝胶电泳通常用于分析用途,但也可以作为制备技术,在采用某些方法(如质谱(MS)、聚合酶链式反应(PCR)、克隆技术、DNA测序或者免疫印迹)检测之前部分提纯分子。凝胶电泳仪 - 使用方法凝胶电泳被广泛用于分子生物学、遗传学和生物化学:1.大的DNA或者RNA分子通常利用琼脂糖凝胶电泳(agarose gel electrophoresis)分离,也可以使用聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)。2.蛋白质的凝胶电泳通常在加入十二烷基硫酸钠的聚丙烯酰胺凝胶中进行(SDS-PAGE),或者非变性凝胶电泳,或二维电泳。 SDS-PAGE 蛋白质凝胶电泳图。 3.毛细管电泳  4.酶谱法(zymography) 5.变性梯度胶凝电泳(Denaturing Gradient Gel Electrophoresis,DGGE) 琼脂糖和聚丙烯酰胺可以制成各种形状、大小和孔隙度。琼脂糖凝胶分离DNA片度大小范围较广,不同浓度琼脂糖凝胶可分离长度从200bp至近50kb的DNA片段。琼脂糖通常用水平装置在强度和方向恒定的电场下电泳。聚丙烯酰胺分离小片段DNA(5-500bp)效果较好,其分辩力极高,甚至相差1bp的DNA片段就能分开。聚丙烯酰胺凝胶电泳很快,可容纳相对大量的DNA,但制备和操作比琼脂糖凝胶困难。聚丙烯酰胺凝胶采用垂直装置进行电泳。目前,一般实验室多用琼脂糖水平平板凝胶电泳装置进行DNA电泳。 琼脂糖主要在DNA制备电泳中作为一种固体支持基质,其密度取决于琼脂糖的浓度。在电场中,在中性pH值下带负电荷的DNA向阳极迁移,其迁移速率由下列多种因素决定:1、 DNA的分子大小。度琼脂糖凝胶中的迁移速率与DNA分子量对数成反比,分子越大则所受阻力越大,也越难于在凝胶孔隙中蠕行,因而迁移得越慢。 2、 琼脂糖浓度 一个给定大小的线状DNA分子,其迁移速度在不同浓度的琼脂糖凝胶中各不相同。DNA电泳迁移率的对数与凝胶浓度成线性关系。凝胶浓度的选择取决于DNA分子的大小。分离小于0.5kb的DNA片段所需胶浓度是1.2-1.5%,分离大于10kb的DNA分子所需胶浓度为0.3-0.7%, DNA片段大小间于两者之间则所需胶浓度为0.8-1.0%。 3、 DNA分子的构象DNA分子处于不同构象时,它在电场中移动距离不仅和分子量有关,还和它本身构象有关。相同分子量的线状、开环和超螺旋DNA在琼脂糖凝胶中移动速度是不一样的,超螺旋DNA移动最快,而开环双链DNA移动最慢。如在电泳鉴定质粒纯度时发现凝胶上有数条DNA带难以确定是质粒DNA不同构象引起还是因为含有其他DNA引起时,可从琼脂糖凝胶上将DNA带逐个回收,用同一种限制性内切酶分别水解,然后电泳,如在凝胶上出现相同的DNA图谱,则为同一种DNA。

  • 琼脂糖预制胶高压快速电泳试剂盒使用方法

    琼脂糖预制胶高压快速电泳试剂盒使用方法

    [font=宋体][size=10.5000pt]琼脂糖预制胶电泳试剂盒是一种非常适合核酸[/size][/font][font=宋体][size=10.5000pt]PCR[font=宋体]实验、酶切反应实验等的一种可以直接进行核酸凝胶电泳实验的试剂盒,电泳实验效率大大提高,可以节约大量时间。[/font][/size][/font][font=宋体][size=10.5000pt][font=宋体]此款琼脂糖电泳试剂盒跟其它琼脂糖试剂盒有区别,因此使用方法也有一些区别,不需要再四处采购琼脂糖、核酸染料、电泳液和[/font]loading buffer[font=宋体]等试剂;而且琼脂糖预制胶是经过核酸染料预染的,既不用进行繁琐的制胶,也不用电泳液染色或后染色,即开即用;再加上配备的高压快速电泳液,电泳速度远远快与传统的[/font][font=Calibri]TAE[/font][font=宋体]或[/font][font=Calibri]TBE[/font][font=宋体]电泳液。[/font][/size][/font][img=,519,396]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2020/07/202007101051212160_1649_3880864_3.jpg!w519x396.jpg[/img][font=宋体][size=10.5000pt]使用方法:[/size][/font][font=宋体][size=10.5000pt]1. [/size][/font][font=宋体][size=10.5000pt][font=宋体]在低温条件下高压快速电泳有时会有结晶析出,请[/font]65[font=宋体]℃水浴加热溶解,用去离子水稀释[/font][font=Calibri]100[/font][font=宋体]倍,用作电泳液,倒入电泳槽中。本产品配置的电泳液可重复使用两三次,如果大电泳槽次数更多。[/font][/size][/font][font=宋体][size=10.5000pt]2. [/size][/font][font=宋体][size=10.5000pt][font=宋体]取出琼脂糖凝胶,剪刀剪开,标签面即孔突出面朝上,公测端为负极,放入高压快速电泳液中,没过胶面[/font]1mm[font=宋体],如有孔内有气泡,设法除去。[/font][/size][/font][font=宋体][size=10.5000pt]3. [/size][/font][font=宋体][size=10.5000pt][font=宋体]在[/font]DNA[font=宋体]样品中加入[/font][font=Calibri]1μl[/font][font=宋体]的[/font][font=Calibri]6[/font][font=宋体]× [/font][font=Calibri]loading buffer[/font][font=宋体]混匀,用[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/9p][color=#3333ff][url=https://insevent.instrument.com.cn/t/9p][color=#3333ff]移液器[/color][/url][/color][/url]将混合液缓慢加入凝胶加样孔,同时加入[/font][font=Calibri]Marker[/font][font=宋体]。[/font][/size][/font][font=宋体][size=10.5000pt]4. [/size][/font][font=宋体][size=10.5000pt][font=宋体]开启电源,红色为正极,黑色为负极,注意[/font]DNA[font=宋体]样品有负极向正极电泳移动。[/font][/size][/font][font=宋体][size=10.5000pt]5. [/size][/font][font=宋体][size=10.5000pt]根据迁移距离及指示剂迁移的位置,判断是否终止电泳。[/size][/font][font=宋体][size=10.5000pt]6. [/size][/font][font=宋体][size=10.5000pt][font=宋体]电泳完毕,关电源,将凝胶放在成像仪中观察电泳条带及其位置,并与[/font]Marker[font=宋体]比较被扩增产物的大小。[/font][/size][/font][font=宋体][size=10.5000pt][font=宋体]以上是德晟琼脂糖预制胶电泳试剂盒的具体使用方法以及在高压快速电泳时需要注意的一些小细节,虽然与其他试剂盒相比也一些差异,但是在核酸[/font]PCR[font=宋体]或者酶切反应等对分辨率要求不高的实验中,是非常适合的,而且省去了大量时间和金钱成本。[/font][/size][/font]

  • DNA酶切及凝胶电泳 怎样跑胶

    第一节 概 述一. DNA的限制性内切酶酶切分析限制性内切酶能特异地结合于一段被称为限制性酶识别序列的DNA序列之内或其附近的特异位点上,并切割双链DNA。它可分为三类:Ⅰ类和Ⅲ类酶在同一蛋白质分子中兼有切割和修饰(甲基化)作用且依赖于ATP的存在。Ⅰ类酶结合于识别位点并随机的切割识别位点不远处的DNA,而Ⅲ类酶在识别位点上切割DNA分子,然后从底物上解离。Ⅱ类由两种酶组成: 一种为限制性内切核酸酶(限制酶),它切割某一特异的核苷酸序列; 另一种为独立的甲基化酶,它修饰同一识别序列。Ⅱ类中的限制性内切酶在分子克隆中得到了广泛应用,它们是重组DNA的基础。绝大多数Ⅱ类限制酶识别长度为4至6个核苷酸的回文对称特异核苷酸序列(如EcoRⅠ识别六个核苷酸序列:5'- G↓AATTC-3'),有少数酶识别更长的序列或简并序列。Ⅱ类酶切割位点在识别序列中,有的在对称轴处切割,产生平末端的DNA片段(如SmaⅠ:5'-CCC↓GGG-3');有的切割位点在对称轴一侧,产生带有单链突出末端的DNA片段称粘性未端, 如EcoRⅠ切割识别序列后产生两个互补的粘性末端。5'…G↓AATTC…3' →5'… G AATTC…3'3'…CTTAA↑G …5' →3'… CTTAA G…5'DNA纯度、缓冲液、温度条件及限制性内切酶本身都会影响限制性内切酶的活性。大部分限制性内切酶不受RNA或单链DNA的影响。当微量的污染物进入限制性内切酶贮存液中时,会影响其进一步使用,因此在吸取限制性内切酶时,每次都要用新的吸管头。如果采用两种限制性内切酶,必须要注意分别提供各自的最适盐浓度。若两者可用同一缓冲液,则可同时水解。若需要不同的盐浓度,则低盐浓度的限制性内切酶必须首先使用,随后调节盐浓度,再用高盐浓度的限制性内切酶水解。也可在第一个酶切反应完成后,用等体积酚/氯仿抽提,加0.1倍体积3mol/L NaAc和2倍体积无水乙醇,混匀后置-70℃低温冰箱30分钟,离心、干燥并重新溶于缓冲液后进行第二个酶切反应。DNA限制性内切酶酶切图谱又称DNA的物理图谱,它由一系列位置确定的多种限制性内切酶酶切位点组成,以直线或环状图式表示。在DNA序列分析、基因组的功能图谱绘制、DNA的无性繁殖、基因文库的构建等工作中,建立限制性内切酶图谱都是不可缺少的环节,近年来发展起来的RFLP(限制性片段长度多态性)技术更是建立在它的基础上。构建DNA限制性内切酶图谱有许多方法。通常结合使用多种限制性内切酶,通过综合分析多种酶单切及不同组合的多种酶同时切所得到的限制性片段大小来确定各种酶的酶切位点及其相对位置。酶切图谱的使用价值依赖于它的准确性和精确程度。在酶切图谱制作过程中,为了获得条带清晰的电泳图谱,一般DNA用量约为0.5-1μg。限制性内切酶的酶解反应最适条件各不相同,各种酶有其相应的酶切缓冲液和最适反应温度(大多数为37℃)。对质粒DNA酶切反应而言, 限制性内切酶用量可按标准体系1μg DNA加1单位酶,消化1-2小时。但要完全酶解则必须增加酶的用量,一般增加2-3倍,甚至更多,反应时间也要适当延长。二. 凝胶电泳琼脂糖或聚丙烯酰胺凝胶电泳是分离鉴定和纯化DNA片段的标准方法。该技术操作简便快速,可以分辨用其它方法(如密度梯度离心法)所无法分离的DNA片段。当用低浓度的荧光嵌入染料溴化乙啶(Ethidium bromide, EB)染色,在紫外光下至少可以检出1-10ng的DNA条带,从而可以确定DNA片段在凝胶中的位置。此外,还可以从电泳后的凝胶中回收特定的DNA条带,用于以后的克隆操作。琼脂糖和聚丙烯酰胺可以制成各种形状、大小和孔隙度。琼脂糖凝胶分离DNA片度大小范围较广,不同浓度琼脂糖凝胶可分离长度从200bp至近50kb的DNA片段。琼脂糖通常用水平装置在强度和方向恒定的电场下电泳。聚丙烯酰胺分离小片段DNA(5-500bp)效果较好,其分辩力极高,甚至相差1bp的DNA片段就能分开。聚丙烯酰胺凝胶电泳很快,可容纳相对大量的DNA,但制备和操作比琼脂糖凝胶困难。聚丙烯酰胺凝胶采用垂直装置进行电泳。目前,一般实验室多用琼脂糖水平平板凝胶电泳装置进行DNA电泳。琼脂糖主要在DNA制备电泳中作为一种固体支持基质,其密度取决于琼脂糖的浓度。在电场中,在中性pH值下带负电荷的DNA向阳极迁移,其迁移速率由下列多种因素决定:1、DNA的分子大小:线状双链DNA分子在一定浓度琼脂糖凝胶中的迁移速率与DNA分子量对数成反比,分子越大则所受阻力越大,也越难于在凝胶孔隙中蠕行,因而迁移得越慢。2、琼脂糖浓度一个给定大小的线状DNA分子,其迁移速度在不同浓度的琼脂糖凝胶中各不相同。DNA电泳迁移率的对数与凝胶浓度成线性关系。凝胶浓度的选择取决于DNA分子的大小。分离小于0.5kb的DNA片段所需胶浓度是1.2-1.5%,分离大于10kb的DNA分子所需胶浓度为0.3-0.7%, DNA片段大小间于两者之间则所需胶浓度为0.8-1.0%。

  • 单细胞凝胶电泳 标准操作规程(

    关键词:单细胞凝胶电泳目的:为便于各室单细胞凝胶电泳试验结果的可比性背景知识:略原理:在细胞核中,DNA是环状附着在核基质上,细胞裂解过程中,核基质被溶解、抽提,DNA的结构则未发生变化。如果DNA链上存在缺口,则使DNA超螺旋变的松弛,DNA环向外展,同时由于暴露了阴电荷,在电场力的作用下,松动的DNA环向阳极迁移,但是由于这种松动的DNA环一端仍附着于核DNA,其迁移距离受到限制,因此尾长并不总是真实反映链缺口的多少。实际应当依靠尾长与尾部的荧光强度同时来进行分析。主体内容:操作步骤见下文主要参考文献:略操作步骤:1. 分离制备单细胞悬液:(1) 体外培养的细胞株:用胰酶消化,吹打成单细胞悬液(2) 体内脏器细胞:处死动物,取出脏器,于Hanks’液中制备成单个细胞悬液。2. 胶板制备:(1) 取20~50μl于56℃水浴中保温的0.5%普通熔点琼脂糖,铺于磨沙载玻片上,形成底胶。(2) 取100~150μl 0.5%普通熔点琼脂糖加在底胶上,再于其上加盖玻片,4℃冷凝10分钟。(3) 取下盖片,取50~100μl于37℃水浴中保温的1.0%的低熔点琼脂糖与50~100μl细胞悬液(105个细胞/ml)混匀,立即铺片,加上盖玻片,4℃冷凝10分钟。(4) 去掉盖玻片,取70~100μl于37℃水浴中保温的0.5%的低熔点琼脂糖铺片,加盖玻片,4℃冷凝。3. 细胞裂解与电泳:(1) 将制备好的胶板去掉盖玻片后,浸于4℃预冷的细胞裂解液中,4℃裂解1小时。(2) 取出胶板,放入电泳槽中,浸泡在电泳液中解旋20分钟。(3) 4℃电泳20分钟(25V,300mA)。4. 中和与染色:(1) 电泳结束,将胶板浸泡于中和液中,每次15分钟,共中和两次,注意更换中和液。(2) 取出胶板,置于染色架上,滴加5μg/ml的PI,暗处染色20分钟。(3) 蒸馏水脱色15分钟。5. 镜检和分析:(1) 在荧光显微镜下观察,绿光激发吸收滤片590nm。必要时照相记录。(2) 记数观察的细胞,记录彗星细胞出现的频率,用目镜测微尺测头长与全长,计算核DNA迁移距离。* * * * *使用两层凝胶法,经裂解、DNA解旋、电泳和中和得到湿琼脂糖凝胶片。将湿琼脂糖凝胶片置于冰冷无水乙醇中脱水10分钟,后置于空气中自发干燥。每人制备2张琼脂糖凝胶片。全部操作在采血后8小时内完成,操作过程中注意避光。脱水干燥的琼脂糖凝胶片装于含有干燥剂的载片盒中运回实验室。使用50μl 30μM的溴乙锭溶液染色、照相。使用单细胞凝胶电泳软件分析所有照片,每人随机测量100个以上细胞的尾长和olive尾矩,以尾长和olive尾矩的算术均数代表个体DNA损伤情况。

  • 【原创大赛】琼脂糖方法交流

    【原创大赛】琼脂糖方法交流

    琼脂糖凝胶电泳是分子实验的基础,方法步骤也再熟悉不过了,把它下来主要是和大家一起分享自己的操作习惯和通过图片展示一下操作环境,并一起讨论实验中遇到的问题。一 简单概述琼脂糖凝胶电泳时用琼脂糖作支持介质的一种电泳方法,因为琼脂糖凝胶具有网络状的结构,小分子可以顺利通过,而大分子在通过时会受到阻力,从而把大分子和小分子分离来。在电泳时,分子移动速度与分子大小和分子所带电荷有关,分子越大移动速度也慢。蛋白质是高分子物质,因此不适用于凝胶电泳,现今凝胶电泳被广泛应用于类似核酸的小分子的研究中。二 实验操作总结1准备好各种试剂和设备,设备包括电泳槽,电泳仪,微波炉,三角瓶,搅拌器,制胶槽和梳子,电子秤,量筒;试剂包括电泳缓冲液TAE,琼脂糖,核酸染料。2 根据制胶的大小和浓度,称量相应重量琼脂糖,加入对应体积的缓冲液,混匀,用微波炉加热至琼脂糖完全溶解,此时溶液澄清,无游离状物质漂浮于液体中。http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2015/08/201508062230_559545_3030887_3.jpghttp://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2015/08/201508062228_559542_3030887_3.jpghttp://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2015/08/201508062230_559549_3030887_3.jpg3 加热溶解后冷却,期间加入核酸染料,一点即可。4冷却至不烫手即可导入到制胶槽中。冷却的目的是防止琼脂糖溶液温度过高是制胶槽和梳子变形。倒入制胶槽后,赶走胶上的气泡,插上梳子。http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2015/08/201508062230_559547_3030887_3.jpg5等待十分钟左右至胶凝固,拔掉梳子。注意的是经常有人拔梳子时吧点样孔破坏,所以拔梳子时手掌先压住电泳槽,然后拿住梳子两边,快速向上用力将梳子拔出,这样能较好的避免点样孔的损失。6胶制好后,点样。点样分为干点和湿点两种,干点是不在缓冲液中点,直接在外界中操作;湿点是将胶放入缓冲液中点样,样品点样前先加入Ladding Buffer,Ladding Buffer目的是帮助样品沉淀,有时干点可不加,但是湿点的时候最好要加。7电泳,将点样后的胶放入电泳槽中,注意电极方向,根据电泳槽大小设置电泳时间和电压。http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2015/08/201508062230_559548_3030887_3.jpghttp://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2015/08/201508062230_559546_3030887_3.jpg8成像。电泳完后,在琼脂糖凝胶显色系统中拍照保存,进行后续实验。http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2015/08/201508062229_559544_3030887_3.jpg9 分析。从上面的图片可以看出有些带相对较亮,有些带相对较弱,可能与DNA浓度有关。另外有些带似乎有拖带,可能是引物二聚体。不过总体还说结果还算可以,带型清晰可变。三 写在后面的话总的来说步骤有些多,但是并不是很复杂,也没有很难的技术要点,但是根据成相系统拍摄出来的照片效果显色,一个同样的样品,有时因为制胶的原因,呈现的效果完全不一样,这可能与胶的溶解和加入染料的量、电泳条件等等有关,因此琼脂糖凝胶电泳时需不断总结经验,做出来的胶图才能很漂亮。

  • 【求助】琼脂糖凝胶用途

    [em09511]请问各位,琼脂糖凝胶在什么地方运用比较多啊?我们公司自主研发了琼脂糖系列凝胶。有谁需要试用的吗?我可以提供样品。

  • 琼脂糖凝胶电泳注意事项

    1.体系配制时候最关键的几个试剂一定要确定它们还有效、或者还没被污染:引物,酶,超纯水。这些东西最好自己收好,写上个人的名字放好,冰盒上记得带上橡皮筋,这样就不会因为别人翻冰箱时候把你的冰盒碰散了,试剂都碰掉。否则,你的试剂被污染了,到时候阴性对照狂出条带,再去找污染源很麻烦。而且配置体系时候要注意保持实验区的干净,事先可用小喷壶进行酒精喷雾,固定空气中的DNA,而且全程要戴手套,避免污染体系。2.pcr体系要摸准,最好用人家都做得很多的老体系来上手。3.要想得到漂亮的电泳图,可以在PCR开始时候就把胶倒上(前提是你的PCR总时间在1.5小时左右,并且1.5小时候之后你还在实验室.),让凝胶凉着,这样凝胶的上样孔会比较规则,胶体里面的其本身的孔径也会较规则。如果你要第二天再跑胶,千万记得把PCR完毕的样本放入4℃保存。第二天做时候建议把胶凉上25分钟左右。4.电泳上样时候建议使用排枪上样,不仅快速而且样本加到胶孔里的速度一致。当然,排枪上样最好选用进口枪头,国产枪头就不要想了。5.不管电泳室使用的频率高还是低,我都建议每次电泳时候更换电泳液,避免出现“︿”形条带。

  • 琼脂糖凝胶电泳注意事项

    1.体系配制时候最关键的几个试剂一定要确定它们还有效、或者还没被污染:引物,酶,超纯水。这些东西最好自己收好,写上个人的名字放好,冰盒上记得带上橡皮筋,这样就不会因为别人翻冰箱时候把你的冰盒碰散了,试剂都碰掉。否则,你的试剂被污染了,到时候阴性对照狂出条带,再去找污染源很麻烦。而且配置体系时候要注意保持实验区的干净,事先可用小喷壶进行酒精喷雾,固定空气中的DNA,而且全程要戴手套,避免污染体系。2.pcr体系要摸准,最好用人家都做得很多的老体系来上手。3.要想得到漂亮的电泳图,可以在PCR开始时候就把胶倒上(前提是你的PCR总时间在1.5小时左右,并且1.5小时候之后你还在实验室.),让凝胶凉着,这样凝胶的上样孔会比较规则,胶体里面的其本身的孔径也会较规则。如果你要第二天再跑胶,千万记得把PCR完毕的样本放入4℃保存。第二天做时候建议把胶凉上25分钟左右。4.电泳上样时候建议使用排枪上样,不仅快速而且样本加到胶孔里的速度一致。当然,排枪上样最好选用进口枪头,国产枪头就不要想了。5.不管电泳室使用的频率高还是低,我都建议每次电泳时候更换电泳液,避免出现“︿”形条带。

  • 【求助】求助:DEAE琼脂糖凝胶 FF能不能用来分离?

    我想要用葡聚糖凝胶色谱来分离纯化半刀豆球蛋白分子量是104000,它本身会结合葡萄糖,那用葡聚糖凝胶色谱还能不能分来,如果不行的话,琼脂糖凝胶可以不?琼脂糖凝胶我还没有用过,所以不知道DEAE琼脂糖凝胶 FF能不能用来分离,谢谢大家了!

  • 【实验】脉冲场凝胶电泳

    脉冲场凝胶电泳1)高分子量DNA琼脂糖凝胶块制备和加工1.收集10ml全血,加入30ml细胞裂解液。置冰浴中至少20min直至红细胞完全溶解。2.2000r/min离心10min,移去红色上清液,再次用细胞裂解液洗涤细胞,然后用PBS重悬细胞。3.稀释单细胞悬液并取一小份用Neubauer腔计数细胞。4.用PBS重悬细胞,以达到40μl PBS中含1百万个细胞比例(1百万个二倍体哺乳动物大约含有基因组DNA 10μg)5.用PBS配制2%浓度低熔点琼脂糖溶液并保持在50℃。6.将等体积(各1ml)细胞悬液与琼脂糖溶液于室温下混匀,立即倒入凝胶块模具中。7.静置20min让琼脂糖固化,用无菌塑料杯(通常用作划菌)将凝胶块自模具中取出并置入蛋白酶缓冲液中,加入2mg/ml的蛋白酶K。8.将带有凝胶块的蛋白酶K缓冲液于50℃保持2~3天。每个盛有50ml蛋白酶缓冲液的Falcon管可容纳多达100个凝胶块。9.蛋白酶K消化后,可将凝胶块保留在此缓冲液或0.5mol/L EDTA溶液中保存于4℃。10. 此外,继续将凝胶块用高压消毒过的TE缓冲液冲洗数遍的步骤。11. 将凝胶块放入装有TE及0.04mg/ml PMSF溶液的Falcon试管中,灭活残留的蛋白酶K。12. 室温下用TE溶液漂洗凝胶块数次,将凝胶块放入另一干净的试管,可直接用于酶切反应或用0.5mol/L EDTA,(pH8.0)4℃保存凝胶块。13. 若用EDTA保存凝胶块,取出后应用TE溶液室温下漂洗30 min×2次。2)大小标准物的制备 l λ多联体1.以TE缓冲液悬浮λ多联体(Boehringer MA宝灵曼公司产品),浓度为4μg/40μl。2.用等体积TE配制的2%低熔点琼脂糖(温度保持在45℃)混匀。3.移去混合液注入预冷的凝胶块模具中。4.室温下用TE及100 mmol/L NaCl溶液温育2天。l 酵母染色体1.从YPD(酵母提取物,蛋白胨和葡萄糖)培养基瓶皿中挑选单一克隆加入10ml YPD预培养的肉汤中,30℃下剧烈震荡生长24小时,然后加入200ml YPD肉汤,剧烈振荡24~48h(产量大约100块)。2.4000×g转速,离心10min,然后用50mmol/L EDTA/10 mmol/L Tris-HCl(pH7.5)溶液悬浮。3.仍以4000×g转速离心10min,再用SCE[1 mol/L 山梨醇,0.1mol/L枸椽酸钠,pH5.8及10 mmol/L EDTA (pH7.5)]溶液重悬。4.取稀释后的细胞悬液用Neubauer腔计数。5.溶液短暂离心后,再用SCE重悬细胞,使40μl SCE溶液中含5×107个细胞(相当于80μl体积的模块中含有5×107个细胞)。6.溶液与0.1mg/ml酵母扣糖酶100T和100mmol/Lβ-巯基乙醇混匀,37℃保温15~30min。7.细胞悬液与等体积的SCE配制的2%低熔点琼脂糖凝胶混匀,保持在50℃。8.将混合物移注入预冷的凝胶块模具中。9.凝胶块用含10 mmol/L二硫苏糖醇的SCE溶液37℃下振荡温育1~2小时。10. 将凝胶块移入蛋白酶缓冲液中,加入2mg/ml蛋白酶K,50℃温育48h。11. 用50 mmol/L EDTA/10 mmol/L Tris-HCl(pH7.5)溶液洗涤凝胶块3次,每次20min。12. 凝胶块可用此混合液于4℃保存或不用漂洗直接装载入凝胶中。3)琼脂糖凝胶块中DNA的限制性内切酶消化1.应使用消毒溶液及戴无菌手套以免DNA降解。2.在Falcon试管中用1×TE溶液漂洗凝胶块20min 3次,以去除EDTA。3.混合:酶反应缓冲液(高、中或低盐缓冲液),100 mmol/L亚精胺(只用于高盐缓冲液状态),10~20单位的内切酶。20单位的内切酶就足以过夜完全消化10μg DNA。4.设立一个除内切酶成分外含有混合物各组分的阴性对照,以检查是否有非特异性DNA降解。5.将琼脂糖凝胶块加入反应混合溶液中:通常用消毒过的手术刀或套环将凝胶块移入。6.若两种内切酶所需缓冲液条件一致,可以同时或先后用两种不同的酶进行消化(先用低盐缓冲液的酶消化,再调整盐浓度)。倘若首次消化的酶要求50℃条件,在第二个酶消化时要换缓冲液。7.若要进行部分消化,则首先在同一温度和反应时间用1:10稀释的酶进行尝试。4)凝胶电泳1.将0.8%的琼脂糖在0.25×TBE中熔化后冷却至50~60℃,立即注入凝胶框架中,并插入梳子。2.凝胶固化后小心地拔出齿梳,用2把无菌手术刀将DNA凝胶块上样。若用不同内切酶消化凝胶块,则取不同样品时应将手术刀片烧灼后冷却。将DNA大小标志物上样至凝胶的两旁。3.用1%液态低熔点琼脂糖凝胶(0.25×TBE配制)密封狭槽。4.若有气泡存在,用注射器驱赶气泡。5.一旦密封的低熔点琼脂糖已固化(大约10min),可将凝胶搁入腔室,并用电泳缓冲液覆盖过胶面。6.应设定合适的电压及转换时间(参考《分子医学技术》84页表8.1)并开始电泳。两个不同电泳方向的电流应相等。7.电泳结束后,凝胶用0.25×TBE配制成的EB(0.4μg/ml)染色。8.用泵自槽中排除缓冲液,续以双蒸水冲洗电泳槽。9.凝胶成像:DNA在曝光的过程中可能会形成缺口。10. 用0.25mol/L HCl漂洗凝胶30min,让DNA脱嘌呤,并有利于转移。11. 凝胶用碱(变性溶液中)变性20min,两次,续以中性溶液1~5min。12. 采用标准Southern印迹方案将DNA转印至尼龙膜上。一般来说,印迹PFGE凝胶的时间较普通凝胶印迹时间长(约48h)。

  • 【原创】PFGE脉冲场凝胶电泳技术

    脉冲场凝胶电泳以其重复性好、分辨力强而被誉为细菌分子分型技术的“金标准”。它可以用于的分子DNA的分离,其分辨范围可达10Mb。PFGE选用识别稀有酶切位点的限制性内切酶切割基因组DNA,获得的DNA大片段在外加脉冲电场的低浓度琼脂糖凝胶中分离,产生数量有限的DNA条带。其原理是DNA分子在脉冲电场中随着电泳方向的改变不断改变其分子构象,挤过凝胶间隙。小的DNA分子比大的分子重新定向快,在凝胶中移动快,从而使小分子DNA片段与大片段相分离,同时较大的DNA片段也能被有效分离,在凝胶上按染色体片段长度的不同而呈现出电泳带型。

  • 对电泳胶上的斑点做定量,用凝胶成像分析系统好,还是用薄层扫描仪好?

    我在做一个课题,将糖类用琼脂糖凝胶电泳分离后,染色,再定量。现在的问题是到底用凝胶成像系统准确些,还是用薄层扫描仪效果好些?看国外的文献,用的是一种叫做“光密度计”的设备,国内难以找到。我的老板曾去相关实验室访问,他说对方用的是薄层扫描仪。我在想是否凝胶成像系统会更好些。不知各位高人有无好的建议给我?

  • 琼脂糖电泳步骤之超级基础篇

    琼脂糖电泳步骤之超级基础篇一、电泳前准备准备内容作用1.刷干净电泳制胶的梳子,板子,槽子,蒸馏水洗净晾干防止不必要的重复污染,减少外来的污染。梳子干净有利于梳孔的形成。2.检查电泳槽,根据情况更换buffer排除电泳槽的电极接触不良,确保buffer的缓冲能力,减少污染。3.根据DNA的分离范围选择合适的胶浓度并记录达到较好的分离效果,防止样过快跑出胶或者是过慢浪费时间。4.计算agarose的用量和制胶 buffer的用量记录,胶最终越薄越好。实验记录备查 二、制胶步骤注意事项1.称量agarose和bufferBuffer不要用成H2O,称量相对准确2.融胶,加热到胶产生大量的气泡时,拿出摇匀,继续加热到完全溶解,拿出摇匀,再加热到沸腾。非常热,小心烫手,另外注意不要加热过度使胶冲出瓶子。因此注意选择起码为胶体积2倍以上的瓶子。保证胶混匀和完全溶解,减少可能因此引起的胶中孔径不均匀影响分离效果。3.倒胶,可用水浴的办法使胶冷却到60度左右,即手可以握住瓶子的温度,沿着制胶板的一侧,缓缓地一次性倒入。梳子最好是预先放好并固定的,注意梳孔的体积能点的下所有的样。用枪头赶掉气泡。制胶的桌面相对水平。倒胶时尽量减少气泡的产生。EB如果在制胶时加入,在60度左右时加入,使终浓度为0.5ug/ml。不宜过低,染色成像不明显;不宜过高,导致背景太深。摇匀要沿着瓶壁摇动,尽量减少气泡产生的可能性。高浓度胶例如2%以上的EB很难摇匀,而且凝的速度也相对快,强烈建议跑完胶之后再用EB染色。4.室温凝胶30分钟过程中不要碰到梳子,尽量保持胶的位置不移动。时间不宜过久,导致胶干燥变形;不宜过短,影响胶内部孔径形成。5.拔梳子,放入电泳槽。缓缓地将梳子垂直从梳孔拔出,尽可能使梳子是同时从各个胶孔拔出的。暂时不用的胶最好放入电泳槽电泳液中浸泡。电泳液要浸没胶1mm。 三、上样电泳[

  • ChampGel™全自动凝胶成像分析系统

    ChampGel™全自动凝胶成像分析系统

    ChampGel 全自动凝胶成像分析系统产品详细描述http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2014/08/201408261531_511710_2925070_3.jpg性能特点:①采用高分辨率高灵敏度CCD,可轻松获得高质量图像,特别适用于高通量电泳凝胶的拍摄和分析。②最新一代密闭式自动控制暗箱结构紧凑,配有各种波长光源,功能强大。③可应用于各种紫外线和蓝光激发样品的拍摄,如:EB、GoldView、GeneFinder、SYBR Green、TLC等;可见光激发样品,如:银染胶、考染胶、菌落、抑菌圈、微孔板、斑点杂交、胶片、物体切片等。④LANE 1D软件可对各种凝胶电泳、克隆计数、微孔板、抑菌圈、抗生素效价、物体切片图像进行计算和分析。所有数据、图像、图形均可导出至Excel、Word、粘贴板等软件或其他文件中。产品广泛服务于世界各地科研机构 ChampGel系列全自动凝胶成像分析系统已被世界各地众多科研机构所采用,如:Northwestern University Feinberg School of Medicine、Department of Pathology and Immunology in University of Chicago、中科院生物物理研究所、北京大学、清华大学、中国医学科学院肿瘤研究所、上海交通大学、中山大学等。其优异的性能、先进的配置和低廉的价格获得了使用者的一致好评。强大的拍摄和分析功能http://www.bioon.com.cn/ewebeditor/fckup/2014/7/20140721143946304319.jpg;计数指标及配置表:http://www.bioon.com.cn/ewebeditor/fckup/2014/7/20140721142817765164.jpg

  • 【原创大赛】DNA聚丙烯酰胺凝胶电泳操作分享(仅代表个人实验习惯)

    【原创大赛】DNA聚丙烯酰胺凝胶电泳操作分享(仅代表个人实验习惯)

    同样是电泳,但是DNA聚丙烯酰胺凝胶电泳和琼脂糖电泳在操作上有很大的区别。相比之下,琼脂糖凝胶操作简单很多,只需要准备好制胶槽和梳子,融好胶后加一点核酸染料后,倒入制胶槽,然后点样,电泳,即可显示,时间大概在1个小时左右就可以了。而DNA聚丙烯酰胺凝胶电泳,先要洗板子,然后用乙醇擦板子,用硅化剂和反硅化剂擦,再制胶,然后预电泳,期间要插梳子,缓冲液热了后,点样电泳,电泳完后,下板子染色15分钟,最后显色。这一系列步骤听下来都有些复杂,所以有必要把该方法整理下来,标注好实验关键点。以下自己对聚丙烯酰胺凝胶电泳的实验总结,虽然步骤大体上和其他网上搜的一致,但是不同实验室甚至个人对于一个实验操作都会有不同,所以我把自己的拿出来和大家一起分享,重点在于一些小细节操作。一 聚丙烯酰胺凝胶的制备根据分离DNA片段的大小及需凝胶的容积,配制聚丙烯酰胺凝胶.1玻璃板清洗:NaOH溶液浸泡玻璃板一定时间,想要快的话可以用开水浸泡,将剥离板上的胶铲除,用去污剂(洗洁精也可)和清水清洗干净,最后用双蒸水冲洗两遍,垂直放置,晾干(清洗短长板的工具要分开)。2 用滤纸蘸取95%乙醇擦拭长短板,5分钟待乙醇挥发后。分别用脱脂棉蘸取硅化剂和反硅化剂均匀擦拭长短板。2.固定玻璃板:5分钟之后,把两个封条分别置于长板处理面两侧,短板处理面向下盖到长板上,两侧用夹子固定,准备好梳子,调整板子的平衡,使板子和台面保持水平。3配制胶溶液(5%): 原胶: 8.34ml;尿素: 45ml; 5xTBE:15ml;双蒸水:6.66ml; 尿素在室温难溶解,这一部分胶先配好在55℃水浴中预热,溶解完后过滤,制胶时再加入TEMED: 30ul;过硫酸铵: 200ul4灌胶:缓缓地使胶溶液倒入两板间,等胶溶液布满整个板子时,倒插梳子,用夹子夹紧使梳子和玻璃博间没有缝隙从而防止点样时串样,整个过程不要产生气泡。5.凝固:灌完胶后,放于室温让其自然凝固,观察胶边沿出现折射线就表明胶以凝固。二 聚丙烯酰胺凝胶电泳1.固定玻璃板于电泳仪:取掉玻璃板上的夹子,拔下梳子,除去长板点样处的胶,用清水冲洗干净玻璃板,短板向里固定于电泳仪支架上,即凹口板面向电泳液。2.插梳子:取5xTBE200ml稀释到1000ml制成1xTBE。向电泳仪下端槽内倒1xTBE约500ml,向上槽倒1xTBE,使液面高于短板上沿。用10ml的枪吸打缓冲液吹除插梳子除的废胶,插好梳子,点3ul 上样缓冲液,观察点样孔是否串样,如串样再调试梳子。3 预电泳:打开变压器,调节电压为1800V,功率100W,电流100A,预电泳大约40min至玻璃板热。4 样品变性:12ul体积的样品中加入6ulLoading Buffer,沸水浴5min,迅速放于冰上冷却。5电泳: 吸取3-4ul 变性后的样品,按顺序点样。调节电压为1800V,功率100W,电流80A,电泳大约1h。6 卸玻璃板。电泳完毕,关掉电泳仪,放出缓冲液,取下玻璃板,卸下短板、梳子、封条,只留下长板和上面的胶。http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2015/08/201508042043_559121_3030491_3.jpg三 聚丙烯酰胺凝胶电泳的显色----银染1.洗胶:把长板置于双蒸水中清洗一次。2.染色: 染色液 硝酸银: 1.5g(0.1%);37%甲醇:2.25ml;加双蒸水至1.5L。把长板放在染色液中15分钟。3 洗胶:从染色液中拿出长板后,于双蒸水中清洗一次,该步骤动作要迅速。4.显色:显色液 碳酸钠: 45g(0.03g/ml); 37%甲醛: 2.25ml(0.15%);硫代硫酸钠:300ul(10mg/ml);加双蒸水至1.5L。把清洗干净的胶板置于盛有显色液的塑料盘中显色。显色时间根据条带和背景颜色深浅调整,达到DNA条带清晰的目的。5.终止显色:在水龙头下冲洗板子,防止胶被烧而无法读带。7.干胶:胶板置于室温自然干燥。http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2015/08/201508042043_559120_3030491_3.jpg上图是自己按操作跑的板子,所有的实验操作都需带好手套,口罩,注意实验安全。板子读完后拍照保存,及时泡于NaOH溶液中。对于同一个实验每个实验室在有些步骤上会不同,所以本文也仅限拿出来分享而已。

  • 【资料】电泳知识介绍(二)凝胶电泳仪器的发展

    凝胶电泳仪器的发展 电泳系统虽然只是作为生化分离分析所必需的常规仪器,但它的进展与其他大型仪器设备一样,同样是非常迅速的。从1809年的第一次电泳实验所用的雏型装置到1946年第一台商品自由移界电泳系统问世经历了一个多世纪。但此后的50多年电泳仪器的发展却极其迅猛,特别是电泳介质由流动相改为凝胶后,各种各样的凝胶电泳装置便层出不穷以适应各种研究工作和生产实践的需要。

  • 电泳仪分类

    根据电泳仪原理、电泳仪功能、电泳仪的使用方法、电泳仪的用途不同可以为:琼脂糖凝胶电泳、毛细管电泳、凝胶电泳、聚丙烯酰胺凝胶电泳、醋酸纤维薄膜电泳、高效毛细管电泳、琼脂糖电泳、SDS-PAGE凝胶电泳、蛋白质电泳、血清蛋白电泳、dna电泳、血红蛋白电泳、蛋白质双向电泳、免疫电泳、等电聚焦电泳、单细胞凝胶电泳、蛋白质凝胶电泳、质粒电泳、对流免疫电泳、变性电泳等。电泳仪分类:1、毛细管电泳仪:其主要部件有0~30kV可调稳压稳流电源,内径小于100μm(常用50~75μm)、长度一般为30~100cm的弹性石英毛细管、电极槽、检测器和进样装置。检测器有紫外/可见分光检测器、激光诱导荧光检测器和电化学检测器,前者最为常用。进样方法有电动法(电迁移)、压力法(正压力、负压力)和虹吸法。成套仪器还配有自动冲洗、自动进样、温度控制、数据采集和处理等部件。 2、常规电泳仪:其组成部件为可调稳压稳流电源,垂直电泳槽,水平电泳槽,电极连接线,支持体【非凝胶性支持体区带电泳(支持体有:①淀粉②纤维素粉③玻璃粉,硅胶等) ;凝胶支持体区带电泳支持体有:①淀粉液②聚丙烯酰胺凝胶③琼脂(糖)凝胶】;陶瓷板,抽水泵,输水管,冰水曹等部件组成。3、其他电泳仪:Tiselius或微量电泳、显微电泳、等电点聚焦电泳技术、等速电泳技术、密度梯度电泳等。是一种非支持体的电泳仪也称为自由电泳法的发展并不迅速,因为其电泳仪构造复杂、体积庞大,操作要求严格,价格昂贵等很少使用。毛细管电泳仪、凝胶电泳仪、垂直电泳仪、微电泳仪、高压电泳仪、水平电泳仪、高效毛细管电泳仪、双向电泳仪、bio rad 电泳仪、脉冲场电泳仪、伯乐电泳仪、北京六一电泳仪上海巴玖均可提供!

  • 毛细管凝胶电泳技术

    毛细管凝胶电泳技术

    毛细管电泳技术(Capillary Electrophoresis, CE)又称高效毛细管电泳(HPCE)或毛细管分离法(CESM),是一类以毛细管为分离通道、以高压直流电场为驱动力,根据样品中各组分之间迁移速度和分配行为上的差异而实现分离的一类液相分离技术,迅速发展于80年代中后期,它实际上包含电泳技术和色谱技术及其交叉内容,是分析科学中继高效液相色谱之后的又一重大进展。http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2013/08/201308081111_456810_2646159_3.jpg1987年,Cohen发表了毛细管凝胶电泳的工作。当电泳从凝胶板上移到毛细管中以后,发生了奇迹般的变化:分析灵敏度提高到能检测一个碱基的变化,分离效率达百万理论塔板数;分析片段能大能小,小到分辨单个核苷酸的序列,大到分离Mb的DNA;分析时间由原来的以小时计算缩减到以分、秒计算。CE可以说是经典电泳技术与现代微柱分离技术完美结合的产物。 一.毛细管凝胶电泳的原理 不同分子所带电荷性质、多少不同,形状、大小各异。一定电解质及PH的缓冲液或其它溶液内,受电场作用,样本中各组分按一定速度迁移,从而形成电泳。电泳迁移速度(v)可用下式表示:v=uE其中E为电场强度(E=V/L,V为电压,L为毛细管总长度)。u为电泳淌度。毛细管凝胶电泳是将板上的凝胶移到毛细管中作支持物进行的电泳。凝胶具有多孔性,起类似分子筛的作用, 溶质按分子大小逐一分离。凝胶粘度大, 能减少溶质的扩散, 所得峰形尖锐, 能达到CE中最高的柱效。电流通过导体时产生焦耳热。传统平板凝胶电泳的最大局限性在于其无法克服两端高电压带来的焦耳热所产生的负面影响。焦耳热可使筛分介质内部出现温度、粘度及分离速度的不均一,影响迁移、降低效率、使区带变宽。由于这种负面影响与电场强度成正比,所以极大地限制了高电压的引入。也难以提高电泳速度。毛细管电泳使样品在一根极细的柱子中进行分离。细柱可减小电流,使焦耳热的产生减少;同时又增大了散热面积,提高散热效率,大大降低了管中心与管壁间的温差,减少了柱子径向上的各种梯度差,保证了高效分离。因此可以加大电场强度,达到100~200V/cm,全面提高分离质量。在进行分析时将毛细管内充满了凝胶,毛细管两端通高压电,使凝胶内带电分子移到毛细管相反电荷的一端。因为不同分子的大小对电荷比不同,就以不同的速率在管中移动,达到毛细管终点也有快有慢。毛细管电泳即依此探测、分离不同分子。 二.毛细管凝胶电泳的特点 1.所需样品量少、仪器简单、操作简便。2.分析速度快,分离效率高,分辨率高,灵敏度高。3.无需核酸染料,安全无毒。4.无需制胶,省时省力。5.无需照胶,杜绝人工分析结果误差。6.自动出结果,包括片段大小和样品浓度,软件可输出电泳峰图、凝胶电泳图、DNA片段碱基差异分析、相对定量分析。http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2013/08/201308081111_456811_2646159_3.jpg三.毛细管凝胶电泳的应用1.PCR条件的优化及多重PCR的检测2.高分辨率的检出,相差1-4bp的DNA片段的差异,及相同长度不同序列的差异3.动态检测酶切体系的进程4.评估基因组DNA质量高低5.HLA分型6.STR分析7.质粒的纯度分析8.DNA/DNA杂交9.DNA/蛋白互作

  • 水平凝胶电泳仪特色及参数说明

    [b]凝胶水平电泳仪[/b]和[b]进口水平电泳仪[/b]非常经济的低缓冲量,非常适合超大规模样品检测或高分辨率分离实验的[b]水平电泳仪,[url=http://www.f-lab.cn/electrophoresis/me-10.html]水平凝胶电泳仪[/url][/b][url=http://www.f-lab.cn/electrophoresis/me-10.html]FP-ME-10-20[/url]专业为克隆或PCR实验而设计,适合大规模的凝胶电泳实验和超高分辨率的分离,也适合样品转移到膜层上进行进一步分析。[b]水平凝胶电泳仪[/b]特色具有三种凝胶盘尺寸:200x200mm,200x250mm和200x100mm兼容多通道[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/9p][color=#3333ff][url=https://insevent.instrument.com.cn/t/9p][color=#3333ff]移液器[/color][/url][/color][/url]的凝胶卡可一次性使用40个样品,单个凝胶可加载440个样品电泳液冲洗消耗少兼容多道[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/9p][color=#3333ff][url=https://insevent.instrument.com.cn/t/9p][color=#3333ff]移液器[/color][/url][/color][/url]单个铸造电泳槽安全可靠方便样品加载电泳指示功能凝胶灌胶无需夹具,弹簧[b]水平凝胶电泳仪参数[/b]体积:W395xL230xH90mm凝胶卡尺寸: W200xL200mm, W200xL100mm 最大样品:200@W200xL200mm, 450@W200xL100mm 缓冲液容积:1200ml建造:注塑铸造,耐用防漏电极:99.99%铂金电极,可更换而抗腐蚀更多凝胶电泳仪请浏览官网:[url]http://www.f-lab.cn/electrophoresis.html[/url]

  • 做电泳实验需要知道的基础知识

    [b]*样品制备[/b][list][*]样品必须完全溶解于上样缓冲液,否则不能在凝胶中移动。样品太浓可能产生假相。[*]样品缓冲液包含盐类(维持样品)、甘油(增加重量从而使样品下沉至点样孔)、以及示踪染料(以便监测电泳进程)。[*]样品缓冲液可以分装成小部分冻存。[*]缓冲液加到凝胶上之后才能点样。[*]样品缓冲液中的示踪染料可以指示什么时候终止电泳。两种最常用的染料是漠酚蓝(BPB) 与二甲基苯青FF 。[/list][b]*标准分子质量[/b][list][*]标准分子质量应同时电泳,用来检测电泳进展以及分析结果。[*]使用相适应的标准分子质量。[*]胶连同分子质量标准物一起拍照。标上各条带的大小。[*]标准分子质量有带标记的与不带标记的两种。标记可以是荧光、发光体或者放射性元素。如果手边没有带标记的标准物,可以将染色后的胶与事后标记的印迹相比较。[*]在每一块胶的同一泳道点上标准物。把标准物加在第一个泳道,就能知道胶的方向。[*]点上正对照与负对照。[/list][b]*样式[/b][list][*]琼脂糖凝胶一般以水平方向进行电泳,而聚丙烯酰胺凝胶则是以垂直方向进行电泳。潜水型胶是一种水平方向胶,凝胶被浸淹在电泳槽的底部。[*]凝胶可以制成多种大小。测序胶必须制成大胶,但是对于大多筛选与转移用胶,甚至包括双向凝胶来说,只要不是把分子量相近的条带区分割,小型胶就可以了。[*]毛细管电泳利用开口狭小的毛细管来进行DNA 、蛋白质和其他小分子的自动高效分离。分离是与检测分析相连,就像色谱仪器一样。只有专门实验室才有毛细管电泳设备。[/list][b]*凝胶[/b][list][*]聚丙烯酰胺VS 琼脂糖。尽管凝胶电泳可以在滤纸、醋酸纤维素、淀粉或者其他基质上进行,大多数研究者还是只采用聚丙烯酰胺或琼脂糖凝胶。两种都是多孔性胶,像分子筛样起作用(聚丙烯酰胺或者琼脂糖的百分比越高孔越小)。理论上,任何一种都可以用来分离DNA 、RNA 或者蛋白质。但是,聚丙烯酰胺在低百分比浓度时很软,难以用手操作。一般采用高百分比浓度,用以分析蛋白质和小核苷酸。[*]低百分比琼脂糖凝胶相对较硬,易于操作,用来分离目的分子,如DNA和RNA或者巨大的蛋白质和蛋白质复体。[*]胶的浓度必须与片断大小相适应。[*]每次切去胶的同一小角。这样,万一胶掉落、翻转或在转移过程中放置凝胶,都能给定位做参考。[/list][b]*缓冲液[/b][list][*]大多数电泳缓冲液配成高浓度母液,在电泳前稀释。[*]每一种缓冲液在某一电流时会有特定的电压。要认识每一种缓冲液的特性,这样,出错时,就马上可以注意到。[/list][b]*电源[/b][list][*]电源输出有几种模式:稳压(mV) 、稳流(安培,或者简称安)以及稳功率(瓦特,瓦) 。许多型号允许设定程序,在各种模式之间自动转换。这样可以使用最佳的电压( 在电泳过程中可能发生变化)同时不超出容量。[*]不是所有的电源输出装置都相同,所以不能简单地将电泳装置接到任意装置上。要清楚你需要什么电流或者电压,然后找出需要的装置。[*]大多数实验室都有不止一个电源装置用于测序胶(要求高电压)、电泳转移(要求高电流)以及用于琼脂糖和聚丙烯酰胺电泳(使用大范围的电压)的装置。很少有电源装置能同时满足所有的要求。[*]变性蛋白胶与DNA和RNA胶中的样品会从负极(阴极)移到正极(阳极) 。用红色导线接正极(+),黑色导线接负极(一)。可以用同一个电源输出装置同时进行几块胶的电泳,但是没问过其他人前不要这样做,因为电泳条件会发生变化。[*]设置闹钟提醒自己察看胶。特别是当你要察看低分子质量的分子时,样品很容易跑出胶进入缓冲液中。[*]接触任何东西前,确信电泳装置必须处于断电状态。如果电源没被切断,不要进行任何操作! 电流效应[/list][b]固定[/b][list][*]凝胶是否需要固定取决于用途。需要染色的胶一般需要固定,而用于转移的胶则不需要固定。[/list][b]*干燥[/b][list][*]通过出去胶上的水,胶基质变薄。干燥之后的胶在放射自显影后条带更清晰。[*]在凝胶干燥仪上干燥一块胶不需1小时。凝胶干燥仪可以加热,从而加快干燥过程。[/list][b]*染色[/b][list][*]DNA与RNA的染色可以通过在电泳前把染料加到样品中完成,也可以在事后染色。[*]蛋白质胶在电泳后染色。[/list][b]*记录[/b][list][*]凝胶经溴化乙锭染色后的Polaroid照片与蛋白质凝胶的35 mm照片是最常用的记录方式。[*]数字记录与分析系统最常使用,所有数据可以直接用来演示。[*]各种转移的记录方式取决于体系与实验。例如,放射自显影与化学发光结果可以记录在X射线胶片上,而信号可用光密度计定量。[/list][b]*确定分子质量[/b][list][*]蛋白质的分子质量可用SDS-PAGE确定,而DNA与RNA的分子质量可以由琼脂糖凝胶电泳来确定。对某一分子而言,其分子质量的对数与其Rf(相对迁移距离)存在线性关系。以标准物的迁移距离对其分子质量的对数作图,得到标准曲线,而样品的Rf 值一也就是分子质量一可以由图外推得到。1.制胶,胶的浓度应最适宜分离分子质量相近的分子。同时电泳分子质量标准物,其范围涵盖有目的分子的大致大小。2.跑胶,防止染料前沿跑出胶的边际。3.胶染色,拍照。如果样品是放射性标记的,你可以使用放射性标记的标准物或者把胶与放射自显影胶片相比较。4.测定从样品孔到每一标准条带的距离。计算每个数值的对数,画到常规图纸的Y 轴上。X 轴上是迁移的距离(以厘米计最方便)。对大多数标准物条带应该得到一条盲线。5.把样品迁移距离画到图上。外推标准曲线,确定分子质量。[/list]

  • 全自动稀有样品核酸提取仪

    全自动稀有样品核酸提取仪

    [img=,257,264]http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2017/06/201706301258_01_3194653_3.png[/img]Aurora全自动核酸提取系统采用专利SCODA( Synchro-nous Coefficient of Drag Alteration)电泳DNA操作技术,从具有挑战性的样品中浓缩和纯化DNA.SCODA根据DNA的物理特性选取长的带电聚合物(而非通过其其化学性质或化合物亲合力分离DNA).因此,系统可提供卓越的污染物排斥.此外,Aurora系统可从单一样本中提取高达100倍浓度,从几百分子到100微克的DNA.可高效稳定地纯化提取核酸和蛋白,尤其适合珍贵样品、低生物质低丰度样品、土壤、环境等各类型难提取样品的提取. 产品特征电泳纯化高分子量DNA的提取低生物量和严重抑制样品处理样品成本为零,适合低通量样品处理宏基因组学/NGS/光学测绘/单分子测序应用应用领域生命科学研究土壤与环境农业生物技术法医学 技术参数样品处理时间:2-4小时,样品盐度60%DNA / RNA片段大小: 500 nt RNA,300 bp - 50 kb DNA,可扩展到1Mb污染物抑制: 10-50,000X2产量: 60 uL 该系统避免了研磨、匀浆等传统方法的费力、耗时、低效等诸多缺点,通过非机械过程直接从环境样品,细胞提取物,或带电泳插头的琼脂糖中回收完整的高纯大片段DNA。DNA提取缓冲液、DNA凝胶柱可用于进行后续的克隆,归档,光学标测,或PCR、测序等遗传分析。系统可从至多5毫升稀释裂解液或洗出液中提取核酸,回收低生物质样品包括沉积物,土壤,苔原,和水样中的微量核酸。系统还可净化商业试剂盒受污染洗脱液,提高样品利用率,并无缝对接到现有的工作流程中.

  • 【转帖】核酸电泳的指示剂与染色剂

    指示剂 核酸电泳常用的指示剂有溴酚兰和二甲苯青及银染色.溴酚兰在碱性液体中 呈紫兰色,在0.6%、1%、1.4%和2%琼脂糖凝胶电泳中,溴酚兰的迁移率分别与1Kb、 0.6Kb、0.2Kb和0.15Kb的双链线性DNA片段大致相同.二甲苯青的水溶液呈兰色,它在 1%和1.4%琼脂糖中电泳时,其迁移速率分别与2Kb和1.6Kb的双链线性DNA大致相似.  指示剂一般与蔗糖、甘油或聚蔗糖400组成载样缓冲液.载样缓冲液的作用有①增加样 品密度,使其比重增加,以确保DNA均匀沉入加样孔内.②在电泳中形成肉眼可见的指 示带,可预测核酸电泳的速度和位置.③使样品呈色,使加样操作更方便.染色剂 核酸电泳后,需经染色后才能显现出带型,最常用的是溴化乙锭染色法,其 次是银染色.  溴化乙锭(ethidium bromide,EB)是一种荧光染料,EB分子可嵌入核酸双链的碱基对 之间,在紫外线激发下,发出红色荧光.根据情况可在凝胶电泳液中加入终浓度为 0.5ug/ml的EB,有时亦可在电泳后,将凝胶浸入该浓度的溶液中染色10~15min.琼脂 糖凝胶EB染色,肉眼可见核酸电泳带,其DNA量一般5ng,当溴化乙锭太多,凝胶染 色过深,核酸电泳带看不清时,可将凝胶放入蒸馏水浸泡30min后再观察.  银染色液中的银离子(Ag+)可与核酸形成稳定的复合物,然后用还原剂如甲醛 使Ag+还原成银颗粒,可把核酸电泳带染色黑褐色.主要用于聚丙烯酰胺凝胶电泳染色. 也用于琼脂糖凝胶染色.其灵敏度比EB高200倍.但银染色后,DNA不宜回收.来源:生命经纬

  • 【资料】常用电泳缓冲液

    【资料】常用电泳缓冲液

    [img]http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2008/12/200812230808_125658_1643419_3.jpg[/img]说明:①tbe溶液长时间存放后会形成沉淀物,为避免这一问题,可在室温下用玻璃瓶保存5×溶液,出现沉淀后则予以废弃。以片都以1×tbe作为使用液(即1:5稀释浓贮液)进行琼脂糖凝胶电泳。但0.5×的使用液已具备足够的缓冲容量。目前几乎所有的琼脂糖胶电泳都以1:10稀释的贮存液作为使用液。进行聚丙烯酰胺凝胶垂直槽的缓冲液槽较小, 故通过缓冲液的电流量通常较大,需要使用1×tbe以提供足够的缓冲容量。②碱性电泳缓冲液应现用现配。③tris-甘氨酸缓冲液用sds聚丙烯酰胺凝胶电泳。2×sds凝胶加样缓冲液:100mmol/l trishcl(6.8)200mmol/l二硫苏糖醇(dtt)4%sds(电泳级)0.2%溴酚蓝20%甘油不含dtt的2×sds凝胶加样缓冲液可保存于室温,应在临用前取1mol/l贮存液现加于上述缓冲液中。

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