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质谱流式细胞技术数据分析

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  • 上海交通大学丁显廷/林关宁团队提出单细胞质谱流式技术数据分群方法的基准分析框架
    2019年,上海交通大学丁显廷教授和林关宁教授团队联合在Genome Biology上发表了题为“A Comparison Framework and Guideline of Clustering Methods for Mass Cytometry Data”的文章。 该文章从准确性(precision)、一致性(coherence)和稳定性(stability)三个层面由浅入深地阐明了不同单细胞质谱流式技术(CyTOF)细胞族群分析方法的优劣及其适用场景。这是国际一线杂志第一次报道中国大陆学者在单细胞质谱流式技术数据标准化和分析方法学方面的工作。相比传统荧光标记的流式细胞术,CyTOF技术采用金属同位素标记抗体,避免了荧光重叠和自荧光消除的问题,可在单细胞水平同时测量数百万细胞中近百种蛋白质的表达量。这种同时获取高维度蛋白质的超强能力使得CyTOF技术在药物优化、疫苗开发和疾病标记发现方面具有重要的应用价值。然而,迄今为止CyTOF技术的数据标准化、样本和数据的质量控制、分析方法学,主要还是基于欧美学者提出的Accense,PhenoGraph和Xshift等分析方法。虽然这些分析方法已被广泛应用于不同的领域和临床研究,但是很多研究者对于采用哪个方法能更好地分析个体化的数据仍然存在疑惑。在这篇文章中,研究人员在三类异源(骨髓细胞、肌肉组织、结肠组织)6个单细胞组学的数据集上对目前经典的无监督和半监督细胞分群方法进行了基准分析和深度比较。在准确性(precision)分析上,根据四种内部评价指标(Accuracy,F-measure, NMI和ARI)讨论了不同方法对细胞进行分群的准确性;在一致性(coherence)分析上,利用三种外部评价指标(DB,CH和XB)探讨了细胞分群方法揭示细胞数据内部本质结构的能力;在稳定性(stability)分析方面,研究了随细胞采样数量变化,不同方法的准确性和识别出的细胞亚群数量的鲁棒性。此外,这篇文章还讨论了分群方法的分群分辨率,发现PhenoGraph和Xshifit能够识别出更细粒度的亚群(亚群数量偏多),而DEPECHE倾向于识别粗粒度的亚群(亚群数量偏少)。图1 CyTOF数据细胞分群方法的选择决策树综合上述框架的分析结果,这篇文章为单细胞质谱流式分析领域的研究者,特别是初学者以及没有生物信息学基础的研究者,提供了细胞分群方法的选择决策树。图2 聚类方法的稳定性分析上海交通大学生物医学工程学院个性化医学研究院是中国最早建立起单细胞质谱流式技术的单位之一,并已初步实现技术向临床应用的转化,先后利用单细胞痕量蛋白分析技术完成了寄生虫耐药、银屑病、结肠癌、肺结核方面的相关临床应用研究。刘晓博士、宋炜宸博士生是论文的第一作者。丁显廷教授和林关宁教授是论文的通讯作者。相关研究得到国际人类表型组计划、国家传染病重大专项、上海市高峰高原学科建设计划、国家自然科学基金等项目的支持。
  • 质谱流式细胞术及其在精准医学中研究进展
    质谱流式细胞术及其在精准医学中研究进展张浩1,2,3, 韩国军1,2,31北京大学跨学部生物医学工程系;2北京大学口腔医院;3 北京大学医学部医学技术研究院。质谱流式细胞术(Mass Cytometry)是近年来应用最为广泛的单细胞技术之一种。其将流式细胞技术与质谱分析技术结合在一起,用金属同位素代替荧光标记特异性抗体或探针,并利用质谱来定量同位素标签,可以在单细胞水平完成多种生物标志物的检测分析,包括核酸、蛋白质及其它小分子。其具有高通量、高灵敏度和高稳定性等优点,尤其适合于肿瘤、免疫、血液、药物和遗传学等学科的研究。当前新冠病毒COVID-19对人体免疫系统造成严重侵害,质谱流式技术能够更深入、全面的分析人体免疫系统的各种细胞亚型及其比例的变化,并预测临床病程的变化趋势,对于早期诊断、治疗与病理研究具有重要意义。 (一) 质谱流式细胞术发展历史图 1美国斯坦福大学医学院Garry Nolan 实验室中三台质谱流式仪器: CyTOF 1, CyTOF 2,CyTOF 3 (Helios)和BD公司荧光流式细胞仪LSR II。[1]质谱流式细胞术从最初的分析方法学概念到单细胞仪器装置、最终在基础生物学与临床医学中取得重要的应用,经过近二十年的发展历程。图1为2015年美国斯坦福大学医学院免疫学与微生物学系Garry Nolan教授实验室中三台不同型号CyTOF质谱流式仪与BD公司荧光流式细胞仪同时使用的照片。回顾质谱流式细胞术的发展历史,有三位重要的科学家作出了杰出的贡献。如图2中所示,首先2002年清华大学张新荣教授在学术期刊Analytical Chemistry中第一次提出元素标记策略用于电感耦合等离子体质谱的生物大分子检测的方法学研究[2];2009年加拿大多伦多大学的Scott Tanner教授在学术期刊Analytical Chemistry中首次发布质谱流式细胞仪(Cytometry for Time of Flight,CyTOF)的研究工作[3],并成立DVS Sciences公司将传统流式细胞术与电感耦合等离子体质谱相结合,推出了首台商用质谱流式分析仪器。2011年斯坦福大学Garry Nolan教授首次将质谱流式技术成功应用于临床血癌免疫性疾病的单细胞的表型与磷酸化蛋白信号通路研究[4],开创了质谱流式医学应用的新篇章。2014年,DVS Sciences公司和质谱流式技术被美国Fluidigm公司收购,随后分别于与2015年和2017年陆续推出了Helios质谱流式系统和Hyperion组织成像系统以及700多种相关抗体和预设计标记试剂盒。目前为止,全球已经安装超过200台质谱流式细胞仪,中国拥有30台以上。并且,已经有50多个临床试验使用了质谱流式细胞术,这表明高通量、高灵敏、高稳定的质谱流式时代已经来临。图2 质谱流式细胞术三位主要奠基人:图A左一为清华大学张新荣教授;图A右一为加拿大多伦多大学Scott Tanner教授; 图B第一排右一为美国斯坦福大学Garry Nolan。(二) 质谱流式细胞术原理质谱流式细胞术主要工作原理是通过重金属同位素标记抗体或探针,然后识别细胞表面或内部信号,被标记的细胞以细胞悬液形式进入雾化器,随后样品在等离子体内发生汽化,产生离子云、离子在四级杆内根据质荷比进行筛选,然后在时间飞行器中通过已知强度的电场加速后到达检测器,而其到达检测器的飞行时间与离子质量有关。最后将原子质量谱的数据转换为细胞表面或内部的信号分子数据,并通过专业计算机分析软件对获得的数据进行降维处理分析,从而得到细胞外部表型和内部信号网络的数据结果。图3 质谱流式细胞术金属稳定同位素标记探针。包括标记单克隆抗体分子的稀土同位素;标记细胞编码的贵金属同位素;标记细胞周期的卤素[1]。北京大学韩国军教授首次建立了48种稳定同位素单克隆抗体统一标记策如图3所示,并定量分析了镧系、钇、铟、钯同位素间的CyTOF质谱干扰。系统性的建立了标准方法用于同位素标记抗体定量分析、抗体活性与选择性验证、以及抗体细胞染色浓度优化等,被多个国际质谱流式实验室作为同位素抗体标记标准手册使用。与传统流式技术相比,质谱流式细胞术主要有以下优势:① 前者使用荧光基团偶联抗体或分子,后者主要通过金属同位素进行标记,因为细胞中不含或很少含有这些金属同位素,因此背景信号较低,检测数据可靠性较高;② 传统荧光流式采用激光器和光电倍增管作为检测手段,最多可同时检测通道数不足20个,而质谱流式细胞术使用ICP-MS作为检测手段,不仅提高了检测通道数,可同时检测100个左右参数,而且避免了通道信号之间的串色干扰,无补偿或补偿非常小,使方案设计更加容易。③ 除可以在单细胞水平进行自身多参数分析以外,还可以检测分析一些金属治疗药物的分布及代谢情况,比如顺铂类化疗药物等。但质谱流式细胞术当前也存在一些问题,比如样本采集速度慢,每秒最多约1000个事件;测量不同样本之间需要程序清洁,导致每个样本平均测样时间延长;由于样本被气化,所以无法进行前向散射和侧向散射测量,也不能分选回收细胞进行后续实验等。(三)质谱流式细胞术的应用3.1 细胞表型鉴定与信号通路检测质谱流式细胞术非常适合对复杂的细胞表型进行深层次分析,可以区分在疾病发展过程中发挥不同作用的相似细胞,这对疾病的个体化治疗具有重要意义。Su等人通过对结直肠癌患者血液中的T细胞群进行质谱流式分析,展示了患者个体及不同患者之间 T 细胞亚群的表型多样性[5]。此外,Lelieveldt等用HSNE进行数据分析,在免疫细胞中发现了稀有细胞群[6]。分析细胞因子可以为研究免疫激活状态提供新的视角。Vendrame 等人利用 CyTOF评估细胞因子对自然杀伤 (NK) 细胞的影响,发现白介素 (IL)-12/IL-15/ IL-18刺激可显著增加NK细胞中γ干扰素 (IFN‐γ)的表达[7]。Doyle等对丙型肝炎病毒(HCV)感染患者的肝脏和外周血中的浆细胞样树突状细胞(pDCs)进行了研究,证明肝脏pDC具有多功能性,能够在慢性HCV感染期间产生大量的IFN-γ 和其他免疫调节因子[8]。随着检测细胞因子的报道不断增多,CyTOF将可能成为免疫细胞功能研究中不可或缺的工具。细胞受外界刺激后,细胞内信号网络会做出相应反应。使用靶向磷酸化蛋白的金属螯合抗体,CyTOF能够检测单个细胞内的信号通路。Shinko等人为临床血样提供了磷酸化信号蛋白染色的优化方案[9]。厦门大学周大旺教授团队应用 CyTOF质谱流式细胞仪发现了Hippo信号通路中转录共激活因子TAZ在调节 CD4+初始T细胞分化为Th17细胞和Treg细胞的过程中发挥着关键调控作用及其重要机理[10]。 3.2细胞周期鉴定、RNA和蛋白质的共同检测细胞周期改变是肿瘤进展、生物发育和免疫调节的重要方面。Behbehani 等人开发了一种新的CyTOF方法来描绘细胞周期阶段,分别使用IdU、磷酸化视网膜母细胞瘤抗体、细胞周期蛋白 B1抗体、细胞周期蛋白 A 抗体和磷酸化组蛋白H3抗体来标记S、G0、G1、G2、和 M 期细胞[11]。并利用这种细胞周期鉴定方法,研究展示了介导急性髓性白血病化疗敏感性的细胞周期差异[12]。为了能够在单细胞分辨率下同时检测 RNA 和蛋白质,Frei 等人开发了 RNA 邻近连接技术 (PLAYR)[13]。PLAYR包括杂交、连接、滚环扩增和检测四个阶段。针对目标RNA设计两个相邻区段的探针,与目标RNA结合后再与Backbone和Insert两个探针进行杂交,随后Backbone和Insert探针连接成一个环,做为后续滚环扩增的模板,与带有金属标签的探针杂交后就可以扩增并检测了。PLAYR的优势在于可以同时兼容蛋白检测,在实验过程中,可以先用抗体对胞内外蛋白进行标记,然后在用PLAYR流程对RNA进行原位标记和扩增。我们可以根据表面Marker对细胞进行亚群分析,深入研究每个亚群中信号通路、转录因子的激活及其相关基因的表达。并且利用PLAYR监测脂多糖刺激后PBMCs中8个细胞因子mRNA和18个蛋白表位的变化,揭示了每个细胞的功能能力与其蛋白标记物表达之间的相关性。3.3 质谱流式细胞术成像Geisen 等人使用 CyTOF 对组织样本进行成像以获得蛋白质空间组学[14]。他们提出的IMC (Imaging Mass Cytometry)技术使用分辨率为 1 μm 的激光光斑进行烧蚀、雾化、电离,并通过惰性气流传送到质谱检测器。IMC 被认为是具有里程碑意义的发展,因为它在亚细胞分辨率下将细胞间相互作用和的空间信息联系在一起,并能同时分析多达50种参数。自推出以来,IMC 正迅速被应用于各个研究领域。Damond 等人使用 IMC 对4例非糖尿病患者、4例首发1型糖尿病患者和4例长期1型糖尿病患者的胰岛进行研究,描述了人类1型糖尿病的进展,并发现在发病之前β胰岛素细胞表型已经发生改变[15]。另一类元素标记的单细胞成像技术是利用二次离子质谱SIMS(Secondary Imaging Mass Spectrometry),图4为北京大学韩国军教授利用NanoSIMS 50L质谱对Hela单细胞核中新生成的DNA与RNA的时空分析[16]。图4 基于二次离子质谱的高分辨Hela细胞核成像技术与人工智能机器学习数据分析。3.4 新冠肺炎检测及治疗 Silvin等人对COVID-19 患者外周血进行单细胞CyTOF及RNA测序,发现血浆内钙结合蛋白水平和非典型单核细胞减少可以鉴别严重的COVID-19患者[17]。Schrepping等人对全血和外周血单个核细胞进行RNA测序和单细胞蛋白质组学分析,揭示了SARS-CoV-2感染后免疫系统的反应[18]。而Rendeiro等人利用质谱流式细胞术进行空间成像,研究包括SARS-CoV-2 感染在内的人类急性肺损伤的细胞组成和空间结构。从而使我们能够从结构、免疫学和临床角度提出生物学上可解释的肺病理图谱,为理解COVID-19和一般的肺损伤病理学提供了重要的基础[19]。(四)总结质谱流式细胞术相较传统荧光流式细胞技术具有可以同时检测更多参数不需补偿、方案设计简单、灵敏度高等优点。其多参数检测的特征尤其适合对细胞表型、细胞因子、信号通路等进行深层次分析,适用于肿瘤、免疫系统疾病、传染病、血液病、药物临床试验、预后评估等方面研究。但质谱流式细胞术也存在采样较慢、清洁费时、成本较高等问题,因此还需研究人员根据自己的实验目的及需求进行选择。参考文献:1. Han GJ, Spitzer MH, Bendall SC, et al. Metal‐isotope‐tagged monoclonal antibodies for high‐dimensional mass cytometry[J]. Nat Protoc, 2018 13(10):2121-2148. DOI: 10.1038/s41596-018-0016-7.2. C. Zhang, Z. Y. Zhang, B. B. Yu, J. J. Shi, X. R. Zhang. Application fo the biological conjugate between antibody and colloid Au nanoparticle as analyte to inductively coupled plasma spectrometry. Anal.Chem. 20023. Bandura DR, Baranov VI, Ornatsky OI, et al. Mass cytometry: technique for real time single cell multitarget immunoassay based on inductively coupled plasma time - of - flight masss pectrometry[J]. Anal Chem, 2009 81(16):6813-22. DOI: 10.1021/ac901049w.4. Bendall SC, Simonds EF, Qiu P, et al. Single‐cell mass cytometry of differential immune and drug responses across a human hematopoietic continuum[J]. Science, 2011 332(6030):687-96. DOI: 10.1126/science.1198704.5. Di J, Liu M, Fan Y, et al. Phenotype molding of T cells in colorectal cancer by single‐cell analysis[J]. Int J Cancer. 2020 146(8):2281‐2295. DOI:10.1002/ijc.32856.6. van Unen V, Hollt T, Pezzotti N, et al. Visual analysis of mass cytometry data by hierarchical stochastic neighbour embedding reveals rare cell types[J]. Nat Commun. 2017 8(1):1740. DOI:10.1038/s41467-017-01689-9.7. Vendrame E, Fukuyama J, Strauss‐Albee DM, et al. Mass cytometry analytical approaches reveal cytokine‐induced changes in natural killer cells[J]. Cytometry B Clin Cytom. 2017 92(1):57‐67. DOI:10.1002/cyto.b.21500.8. Doyle EH, Rahman A, Aloman C, et al. Individual liver plasmacytoid dendritic cells are capable of producing IFNalpha and multiple additional cytokines during chronic HCV infection[J]. PLoS Pathog. 2019 15(7):e1007935. DOI:10.1371/journal.ppat.1007935.9. Shinko D, Ashhurst TM, McGuire HM, et al. Staining of phosphorylated signalling markers protocol for mass cytometry[J]. Methods Mol Biol. 2019 1989:139‐146. DOI:10.1007/978-1-4939-9454-0_10.10. Geng J, Yu S, Zhao H, et al. The transcriptional coactivator TAZ regulates reciprocal differentiation of TH17 cells and Treg cells[J]. Nat Immunol, 2017 18(7):800-812. DOI: 10.1038/ni.3748. 11. Behbehani GK, Bendall SC, Clutter MR, et al. Single‐cell mass cytometry adapted to measurements of the cell cycle[J]. Cytometry A. 2012 81(7):552‐566. DOI:10.1002/cyto.a.22075.12. Behbehani GK, Samusik N, Bjornson ZB, et al. Mass cytometric functional profiling of acute myeloid leukemia defines cell‐cycle and immunophenotypic properties that correlate with known responses to therapy[J]. Cancer Discov. 2015 5(9):988‐1003. DOI:10.1158/2159-8290.CD-15-0298.13. Frei AP, Bava FA, Zunder ER, et al. Highly multiplexed simultaneous detection of RNAs and proteins in single cells[J]. Nat Methods. 2016 13(3):269‐275. DOI:10.1038/nmeth.3742. 14. Giesen C, Wang HA, Schapiro D, et al. Highly multiplexed imaging of tumor tissues with subcellular resolution by mass cytometry[J]. Nat Methods. 2014 11(4):417‐422. DOI:10.1038/nmeth.2869.15. Damond N, Engler S, Zanotelli VRT, et al. A map of human type 1 diabetes progression by imaging mass cytometry[J]. Cell Metab. 2019 29(3):755‐768.e5. DOI:10.1016/j.cmet.2018.11.014.16. Coskun. A. F., Guojun Han, Ganesh S. et al. Nanoscopic subcellular imaging enabled by ion beam tomography, Nature Communications, 2021, 12(789)17. Silvin A, Chapuis N, Dunsmore G, et al. Elevated Calprotectin and Abnormal Myeloid Cell Subsets Discriminate Severe from Mild COVID-19[J]. Cell, 2020 182(6):1401-1418.e18. DOI: 10.1016/j.cell.2020.08.002.18. Schulte-Schrepping J, Reusch N, Paclik D, et al. Severe COVID-19 Is Marked by a Dysregulated Myeloid Cell Compartment[J]. Cell, 2020 182(6):1419-1440.e23. DOI:10.1016/j.cell.2020.08.001. 19. Rendeiro AF, Ravichandran H, Bram Y, et al. The spatial landscape of lung pathology during COVID-19 progression[J]. Nature, 2021 593(7860):564-569. DOI:10.1038/s41586-021-03475-6. 【作者简介】张浩 博士 2020级北京大学口腔医学技术专业科研型博士,导师韩国军教授。硕士就读于山东大学口腔医院(导师刘少华教授),从事血管瘤临床治疗及泡沫硬化剂的改良研究,发表SCI论文4篇。目前师从韩国军教授,主要从事口腔鳞癌单细胞质谱研究及质谱病理诊断新方法研究。韩国军 研究员北京大学跨学部生物医学工程系研究员、博士生导师,北京大学口腔医院双聘博士生导师。2013年毕业于清华大学化学系(导师张新荣教授),2013至2020年在美国斯坦福大学医学院Mass Cytometry创始人Garry Nolan课题组从事新一代质谱流式相关技术与临床医学应用研究。曾获教育部自然科学一等奖,并在Nature Communications、Nature Protocols、Cell Reports、Angew Chem、Anal Chem、Cytometry等发表论文20余篇。目前主要从事质谱新技术在临床医学中应用研究,与北京大学口腔医院、北京大学第三医院、北京大学第一医院开展单细胞质谱流式临床精准医学研究。点击查看流式细胞仪专场Webinar预告(点击报名)专家约稿招募:若您有生命科学相关研究、技术、应用、经验等愿意以约稿形式共享,欢迎邮件投稿或沟通邮箱:liuld@instrument.com.cn微信/电话:13683372576扫码关注【3i生仪社】,解锁生命科学行业资讯!
  • 从科研到临床,质谱流式那些事儿|第五届流式细胞网络会议iCFCM2023
    2001年,科学家提出了一种使用过渡元素标记抗体,并利用抗体和待测样品的免疫结合,最终通过ICP质谱或ICP发射光谱进行检测的方法,由此开启了质谱流式的纪元。质谱流式技术(Mass Cytometry)也称为飞行时间流式细胞仪 (CyTOF),融合了流式细胞仪的实验平台和元素质谱,结合了传统流式技术高效的单细胞研究能力和飞行时间质谱的全谱高分辨率优势。本届流式细胞网络大会特别设立【质谱流式技术及应用】分会场,来自多家知名高校、科研院所、医疗机构专家交流关于质谱流式技术在基础科研、临床医学中的应用进展。 部分精彩报告预览 报告题目:质谱组织成像技术结合MHC四聚体染色观测抗原特异性T细胞报告嘉宾:付国厦门大学 医学院 教授【摘要】 抗原特异性T细胞在抗病毒和抗肿瘤免疫反应中发挥着至关重要的作用。它们的数量,分布和功能是重要的检测指标,特别是它们在组织原位的状态可以帮助研究人员对免疫反应进行评估。现有的免疫荧光显微镜观察方法可检测的通道数目有限,无法提供高维度的分析。我们尝试利用质谱组织成像技术的高维度特点结合MHC四聚体对抗原特异性T细胞进行原位染色和检测,初步证明了这种方法的可行性和应用价值。报告题目:质谱流式技术--从基础科研到临床应用报告嘉宾:季庆华 浙江普罗亭健康科技有限公司 技术总监【摘要】 质谱流式技术作为一种全新的流式技术,采用了金属同位素来标记抗体,并通过飞行时间质谱来检测金属同位素的含量。每种金属同位素作为一个检测通道,通道之间互不干扰,避免了补偿计算的误差,可实现数百万个细胞的超多参数同步检测,可以帮助临床更深入地了解机体的免疫状态,辅助疾病的诊断及疗效检测,指导临床治疗方案。报告题目:单细胞蛋白检测系统研制及临床应用报告嘉宾:丁显廷 上海交通大学 特聘教授【摘要】 蛋白是生命活动的物质基础。在单细胞水平开展多重功能蛋白的精密测量,能够揭示细胞间异质性,还能充分利用稀有珍贵生物临床样本,是体外诊断、精准医学、生命基础科研、新药创制等领域不可或缺的基础技术能力。单细胞的痕量蛋白捕获富集、微量精准特异检测、高维蛋白互作分析,是单细胞蛋白研究领域三个必不可少、紧密关联、层层递进的研究方向。捕获富集需要材料科学和微纳制造的创新、微量定量检测需要分析化学和机械工程的攻关、互作分析需要生命科学和临床医学的基础。报告将讨论近期的一些科研进展和临床应用。报告题目:质谱流式技术在CAR-T细胞治疗中的最新应用进展及样本制备、数据分析技巧分享报告嘉宾:原丽华 中国科学院苏州纳米技术与纳米仿生研究所 高级工程师【摘要】 质谱流式技术作为新一代的单细胞蛋白质组学工具可以在更高维度上对免疫系统进行解析,已经应用在肿瘤免疫、感染免疫等众多领域。在CAR-T细胞治疗回输后免疫系统重建评估和免疫监测方面也可提供有效的临床信息,帮助改善临床转归。本次报告结合我们在质谱流式样本制备、上机检测、数据分析和后期维护中的一些体会和大家做一个分享。报告题目:Integrated Spatial Multi-Omics Analysis Reveals Regional Features and cGAS Pathway Involvement in HCC Response to Combined TACE and ICB Treatment: A Clinical Trial Study报告嘉宾:盛剑鹏 浙江大学 特聘研究员/副研究员【摘要】 Hepatocellular carcinoma (HCC) remains a significant clinical challenge due to the complex tumor microenvironment and limited responses to treatments. In this clinical trial study, we developed a comprehensive spatial multi-omics framework, encompassing spatial proteomics, spatial transcriptomics, single-cell RNA sequencing (scRNA-seq), and bulk transcriptomics, for HCC clinical trials involving combined Transarterial Chemoembolization (TACE) and Immune Checkpoint Blockade (ICB) treatments. This approach enabled the identification of opposing regional and interactional features influencing HCC response to TACE and ICB therapies. We observed that responsive and non-responsive features coexist before treatment, but successful TACE and ICB therapy enrich regional anti-tumor features through the cyclic cGAS pathway after treatment. Furthermore, we employed a Graphical classification model based on spatial similarity to predict HCC response to the combined treatment. Our findings provide valuable insights into the complex interactions and pathways that determine HCC treatment outcomes, paving the way for improved therapeutic strategies and personalized medicine. 此外,浙江普罗亭健康科技有限公司也将在本会场围绕质谱流式细胞仪从科研应用到临床应用的发展进程。以上仅为部分报告嘉宾预告,更多精彩内容请查看会议页面:https://www.instrument.com.cn/webinar/meetings/icfcm2023/ iCFCM 2023 交流群 温馨提示:1) 报名后,直播前助教会统一审核,审核通过后,会发送参会链接给报名手机号。填写不完整或填写内容敷衍将不予审核。2) 通过审核后,会议当天您将收到短信提醒。点击短信链接,输入报名手机号,即可参会。会议海报
  • 3i流式快讯|普罗亭质谱流式细胞分析仪获批医疗器械注册证
    8月28日,浙江普罗亭健康科技有限公司的质谱流式细胞分析仪PLT-MC601正式获得浙江省药品监督管理局批准的医疗器械许可证(浙械注准:20232221601)。普罗亭质谱流式细胞分析仪PLT-MC601诞生于2010年的质谱流式细胞技术(Mass Cytometry, CyTOF)采用带有金属同位素标签的抗体对细胞进行标记,通过飞行时间质谱分析各细胞上的标签组成,进行细胞表型和功能的深入研究。避免了荧光流式的计算补偿带来的误差和复杂的配色方案,可实现单细胞级多参数同步检测。对比传统流式技术,质谱流式技术主要特点包括:金属标签,采用金属同位素代替荧光基团做标签系统,增强抗体信号强度超高通道,检测范围从80-209amu,可同时检测单个细胞130个抗体通道高准确性,飞行时间质谱的应用,避免串色现象带来的补偿算法误差金属编码技术,质谱流式可支持10种以上的标本同时检测,大幅提高检测通量
  • 宸安生物与欧易/鹿明生物达成战略合作,推进质谱流式细胞技术发展与应用
    7月29日,上海鹿明生物科技有限公司(简称“鹿明生物”)与上海宸安生物科技有限公司(简称“宸安生物”)在宸安生物上海总部正式完成战略合作签约仪式。此次战略合作致力于推进以质谱流式细胞技术为核心的单细胞蛋白质组学科研技术服务及临床诊断平台布局,运用优势系统加速临床诊断研究及创新药物研究,本次鹿明生物与宸安生物合作也将进一步联合助力临床专家和创新药企研发。图 | 鹿明生物与宸安生物签约仪式签约伊始,鹿明生物总经理舒烈波博士及宸安生物创始人&CEO王宇翀博士就目前转化医学、临床诊断以及单细胞领域的发展做了深入的探讨,期望通过单细胞技术的力量解决复杂生物学问题,助力各种用户在科学研究、制药/生物技术、临床诊断上取得突破性的成果。舒烈波博士表示:“我们希望通过相互合作,用自己的品牌,用国产的品牌,为中国生命科学提供服务。”同时王宇翀博士也表示:“独行者步疾,携行者路远。通过互相的支持和合作,将自身的产品和服务不断提升,迈上新台阶。”图 | 签约现场深入探讨现场掠影近几年单细胞技术飞速发展,将生物学的科学认知从宏观层面提升到“单细胞”维度,为转化研究、治疗诊断带来革命性的突破。质谱流式细胞技术(Mass Cytometry)结合了传统流式技术高效的单细胞研究能力和飞行时间质谱的全谱高分辨率优势,采用金属标记抗体与待测抗原结合,实现了单细胞水平的高通量分析,能够同时获得单个细胞的多种参数,识别不同靶蛋白,成为新一代高通量单细胞蛋白质组研究利器。与单细胞转录组测序相比,质谱流式技术能够直接获得蛋白水平的信息,捕获更丰富的生物信息。质谱流式能够更灵活、更准确、更快速地对单细胞多组学信息进行分析,目前已应用于免疫分型、稀有亚群鉴定、生物标志物发现、患者分层、疗效预测、疾病进展检测、T细胞抗原筛选和疫苗研发等方向,所涉及的生命科学领域包括肿瘤免疫、感染免疫、自身免疫、神经免疫、免疫衰老、血液系统疾病和新生抗原等。图 | 签约后,舒博与王博开箱仪式助力质谱流式单细胞蛋白质组学鹿明生物继2022年4月推出基于布鲁克tims TOF Pro2 4D蛋白质组质谱平台的单细胞蛋白质组后,再度推出基于质谱流式平台的新一代高通量单细胞蛋白质组技术服务。鹿明生物与宸安生物达成战略合作,引进Starion星瀚质谱流式系统,具有高通量高分辨率超高速的特点,可实现在单细胞分辨率下同时对数十种目标蛋白的深度分析。由此进一步丰富欧易集团单细胞多组学技术服务产品线,实现了单细胞转录组、单细胞蛋白质组、质谱流式细胞技术,以及空间多组学等全方位检测分析,为科研工作者提供全面深入的科研技术服务。图 | 鹿明生物与宸安生物签约仪式本次签约仪式现场实时报道,观看签约现场更多精彩及开箱全程~宸安生物是一家领先的单细胞精准诊断科技公司,专注于自主研发质谱流式技术平台,通过高通量单细胞蛋白组学与人工智能算法的结合,深度解析免疫系统个体化差异和动态变化,为复杂疾病的生物学机制解析、疾病的精准分型、伴随诊断和创新治疗提供科研和临床级的产品和服务。上海鹿明生物科技有限公司是欧易生物旗下从事蛋白质组及代谢组质谱检测业务的专业质谱组学服务公司。以“鹿明质谱”服务品牌,携手母公司,实现了中心法则上、中、下游多层组学的串联,从基因组、转录组、表观组、微生物组,到蛋白质组、代谢组,为客户提供全面的创新多组学技术服务。经过多年发展,鹿明生物建立起了单细胞蛋白质组学、4D-DIA/LFQ/PRM、iTRAQ/TMT、DIA、PRM、修饰蛋白组等蛋白质组学技术平台,空间代谢组学、全谱代谢组、靶向代谢组、拟靶向代谢组、脂质组、精准靶向等代谢组学技术平台,以及相应的大数据整合分析平台。通过持续的设备引进、技术开发、流程优化、人才汇聚、管理提升,建立起了成熟的质量标准、严格的质控体系以及科学的服务流程,广泛服务生命科学基础研究、疾病标志物发掘、疾病分型诊断、精准用药、药代药动、药物表征等多个领域。
  • 会议通知|细胞生物学前沿技术交流会(流式细胞分析分选技术专场)
    细胞生物学前沿技术交流会(流式细胞分析分选技术专场)通 知近年来,生命科学前沿深入研究和公共健康领域应用的迫切需求都对相关仪器技术、实验方法的迭代更新起到了极大的推动作用,尤其是交叉学科不断融合,促进了包括流式细胞分析分选技术在内的细胞生物学研究手段的快速发展,全光谱流式、质谱流式、成像流式、纳米流式、拉曼流式等创新技术层出不穷,流式细胞技术在生命科学基础研究、医学临床诊断等领域的发展和应用场景越来越广泛,运用方案越来越深入。兹定于2023年4月13-14日在上海召开“细胞生物学前沿技术交流会(流式细胞分析分选技术专场)”。本次会议由中国科学院上海生命科学大型仪器区域中心主办,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心公共技术中心承办,旨在邀请流式前沿领域的技术专家向与会人员详细介绍各类技术的原理、技术特点及应用场景,拓展科研人员在技术方向上的认知,促进这些前沿技术为更多从事科研、研发及检测人员所灵活、高效、高质运用。现将有关事宜通知如下:一、会议时间与地点会议时间:2023年4月13-14日会议地点:上海市徐汇区岳阳路320号新生化大楼312报告厅二、会议内容会议将围绕多种类型、不同技术路线的分选技术(成像型光谱流式细胞分选、空气激发型光谱流式细胞分选、拉曼细胞分选)和分析技术(质谱流式细胞分析、在体流式细胞分析、成像型流式细胞分析、微流控单细胞分析、纳米流式分析)等前沿流式相关技术的技术特点及运用场景展开介绍与讨论交流。为支持国产仪器自主创新,会议还将优先推介国产流式细胞分析分选设备。三、会议日程2023年4月13日时 间内 容报告人主持人09:00-09:05区域中心领导致欢迎辞09:05-09:20相关主管部门领导致辞09:20-09:50高通量流式拉曼细胞分选仪及应用马 波中科院青岛生物能源与过程所研究员张文娟09:50-10:20拉曼分选技术前沿——细胞表型探索新工具李 备中科院长春光机所研究员10:20-10:35茶歇10:35-11:05循环细胞的活体无创光学动态监测魏勋斌北京大学教授张文娟11:05-11:35“图鉴不同,像由心选”BD高速图像光谱流式分选技术钱 璟碧迪医疗器械(上海)有限公司高级产品应用经理11:35-13:30午餐,自由讨论与交流13:30-14:00全光谱流式原理与分选技术的应用冯定龙Cytek华东区高级技术经理边 玮14:00-15:30谱康光谱流式细胞仪技术及应用杨 凡谱康医学应用技术支持15:30-15:45茶歇15:45-16:15空气激发型光谱分选技术用于高活性细胞分选及单细胞分选应用李 凌赛默飞世尔科技(中国)有限公司高级技术应用经理边 玮16:15-16:45全光谱流式前沿技术和应用曾令武索尼生命科学高级市场经理16:45-18:00自由讨论与交流2023年4月14日时 间内 容报告人主持人09:30-10:00纳米尺度生物颗粒的精准表征利器 — 纳米流式检测技术颜晓梅厦门大学特聘教授边 玮10:00-10:30新一代单细胞靶向蛋白质组学平台——Starion星瀚流式质谱系统刘浥坤上海宸安生物科技有限公司高级应用科学家 10:30-10:45茶歇10:45-11:15基于流式光片的斑马鱼高通量三维成像技术研究李 辉中科院苏州医工所研究员边 玮11:15-11:45“功能为王”-单细胞功能高通量深度表征平台开启单细胞多组学研究新篇章朱 凯PhenomeX资深应用科学家 11:45-13:30午餐,自由讨论与交流13:30-14:00新概念柔性流式细胞分选技术及其应用张 萍德国美天旎全国科研应用经理俞珺璟14:00-14:30Namocell 微流控单细胞分选技术的原理和应用陈科立Namocell经理14:30-15:00成像增强型流式细胞分析结合AI图像技术用于细胞表型和形态研究应用李 凌赛默飞世尔科技(中国)有限公司高级技术应用经理15:00-17:00自由讨论与交流四、报名方式本次会议免注册费用。请参会人员扫描下方二维码填写会议回执,并于2023年4月11日中午12点前提交反馈,以便会务组安排相关事宜。五、会议联系方式姜颖文:15721565165,jiangyingwen@sibcb.ac.cn何 钧:13611699686,jun.he@sibcb.ac.cn中国科学院上海生命科学大型仪器区域中心中国科学院分子细胞科学卓越创新中心公共技术中心2023年4月6日
  • 流式细胞仪新品盘点|光谱流式、成像流式正在成为技术发展潮流
    ——2022上半年生命科学仪器新品盘点系列今年上半年BD率先将光谱流式细胞术与CellView™ 图像技术融合推出看点十足的新品,或将定义细胞分选的新标准、新潮流;赛默飞则是在Attune NxT流式细胞仪的基础上增加了明场成像功能,实现高速、高分辨率巧妙融合;国产流式细胞仪也在今年实现了3激光“零”的突破,为临床用户带来更自由、更灵活的解决方案。为了方便大家熟悉了解这3款流式细胞新品的看点与亮点,小编特别进行了一期简评,供大家学习交流。碧迪:光谱流式细胞术与图像技术结合 重新定义细胞分选标准2022年6月2022年6月,全球领先的医疗科技公司BD(Becton Dickinson)率先将光谱流式细胞术与可分选成像相结合推出新品BD FACSDiscover™ S8 细胞分选仪。区别于传统流式细胞术,该新品所采用的光谱流式细胞术能够捕获样品制备发出的全光谱信号,让科学家使用更多参数对细胞进行分类。同时采用突破性BD CellView™ 图像技术,该技术曾登上过《科学》杂志的封面,可捕获流经系统的单个细胞的图像,并根据每个细胞的详细显微图像分析以高速分选对它们进行分选。通过整合光谱流式细胞术与实时空间和形态学信息,将细胞分析和分选的能力扩展到新维度,使科学家能够进行高参数实验,同时快速查看和分选具有特定、可视化感兴趣特征的细胞,这一进步填补了生物医学研究中长期存在的空白。BD FACSDiscover™ S8 细胞分选仪小编简评:新品FACSDiscover™ S8细胞分选仪代表了BD流式细胞仪创新和领先地位的新篇章,通过将高参数光谱流式细胞仪的功能与前所未有的细胞图像及其内部运作相结合,能够以前无法识别的细胞进行分选,该新品正在定义细胞分选的新标准、新维度。赛默飞: 声波聚焦与高速相机结合 推出全新图像增强流式分析仪2022年1月2022年1月,赛默飞世尔科技发布了新一代Attune CytPix成像型流式细胞仪,Attune CytPix是在Attune NxT流式细胞仪的基础上增加了明场成像功能,既保留了传统流式高速、高参数、大数据分析的优势,又增加了明场观察细胞形态、活性等信息。Attune CytPix成像型流式细胞仪应用声波聚焦专利技术,上样速度相比传统流式细胞仪快10倍。此外,采用专利抗堵设计,大细胞、黏细胞均可轻松上样。赛默飞 Attune CytPix成像型流式细胞仪小编简评:Attune CytPix流式细胞仪是一款图像增强型的流式细胞仪,将声波聚焦流式细胞术与高速相机相结合。用户能够从细胞中收集高性能的荧光流式数据,同时捕获高分辨率的明场图像,从而将图像与流式数据进行匹配,以便更好地了解细胞形态和质量。层浪科技:国产3激光“零”的突破2022年2月2022年2月,北京层浪生物科技有限公司推出国产首台3激光14色16通道流式细胞仪LongCyte,采用全新专利设计的光路系统、电路系统以及信号处理系统,可配置红(638nm)蓝(488nm)紫(405nm)三个激光器;标配自动进样器,适配96孔板(U、V、平底)、流式管、EP管等;强大的软件系统,提供细胞因子、报告编辑、质控监测、LIS连接等功能;可视化用户体验,可深度观察流动室液流状态。依托3激光14色流式细胞仪LongCyte,临床和科研端可用的试剂种类和荧光染料种类更加丰富,能够在仪器上开展的项目更多,实验方案也会更自由、更灵活,兼容性更强。目前,该仪器26种型号已经获得CE认证、NMPA注册批准。层浪科技 LongCyte流式细胞仪小编点评:LongCyte流式细胞仪实现了国产3激光“零”的突破,将国产流式细胞仪技术推向更高水平,为临床用户带来更自由、更灵活的解决方案。中生医疗:新一代高性能智能流式细胞仪2022年6月针对科研检测领域,中生(苏州)医疗科技有限公司于今年6月推出新一代高性能智能流式细胞仪SinoCyte,搭载了全新椭圆光斑激光器和全新WDM分光模块,进一步提高检测灵敏度和稳定性。此外,中生流式细胞仪SinoCyte最高可配置3个激光器,18个检测参数,全自动的检测流程,采集与分析同步进行,大大提高了工作效率。中生医疗 SinoCyte流式细胞仪小编点评:中生流式细胞仪SinoCyte操作简单高效,检测结果精确,代表着中生医疗针对科研检测的高端流式细胞仪迈出重要一步,希望中生医疗能够源源不断为用户带来高品质、高性价产品。后记:BD作为流式细胞行业领头羊,一举一动都备受业界关注,本次新品FACSDiscover™ S8细胞分选仪首次融合了高参数光谱流式技术与细胞图像技术,引起了业内广泛关注,或成为未来流式细胞仪市场的新导向。此外,该新品也是BD首次应用光谱流式技术,在一定程度上说明了光谱流式新技术正被主流制造商认可。而从赛默飞发布的新一代Attune CytPix成像型流式细胞仪可看出,高速、高分辨率图像技术正成为未来流式细胞仪发展的又一新潮流。国产流式细胞仪也取得长足进步。层浪科技推出的桌面式LongCyte流式细胞仪在技术上实现了3激光14色,外观上呈现为桌面型,极大地节约了宝贵的实验室空间。中生医疗面向科研领域用户推出的高性能流式细胞仪SinoCyte,是国产流式细胞仪走向科研市场的节点性动作。
  • 贝克曼库尔特生命科学 CytoFLEX LX 流式细胞仪实现高度复杂的细胞分析
    美国印第安纳波利斯 2017 年 3 月 20 日讯——贝克曼库尔特生命科学事业部勇往直前,不断拓展其专利设备 —— CytoFLEX 流式细胞仪技术的多参数性能。最新型 CytoFLEX LX 设备配备多达 6 根激光和 21 个荧光通道,它能够传输更多的参数,同时,还具备优异的荧光灵敏度,以及高端研究人员所需的纳米颗粒检测功能。两年前,贝克曼库尔特推出了 CytoFLEX 流式细胞仪,短短两年时间里,我们就通过以下三个系统提供了 47 项配置:CytoFLEX、CytoFLEX S,以及如今的 CytoFLEX LX。拥有 CytoFLEX LX 系列后,平台的创新激发光和检测功能的优势进一步凸显,最高可对细胞 23 项参数的分析,满足了研究人员对于高内涵需求。在 CytoFLEX LX 诞生之前,超高端研究人员只能借助体积庞大、操作复杂且昂贵的仪器进行研究工作,以研发和分析高内涵、多参数数据,这令他们苦不堪言:很多实验室都需要招聘经过高度专业培训的专职设备操作人员,不仅如此,他们发现这些系统在使用方面还存在诸多难题。而如今,CytoFLEX LX 成为了这些高端研究人员的福音,它具备易用、易维护的特点,确保更多的研究人员能够轻松使用该系统,帮助他们在研究方面更上一层楼。此外,对于那些曾经共用实验室资源进行这些复杂实验的实验室来说,如今,他们终于可以如释重负,腾出精力去考虑如何利用自身的台式系统加速工作进度。由于 CytoFLEX 能够最大程度降低光损失,这就为荧光灵敏度建立了新标准,因此,弱阳性细胞群都能够被轻松检测到。它能够测量低至十个分子的荧光,以及粒径小至 0.2 微米的颗粒。拥有了 CytoFLEX LX 之后,研究人员可以测量两个散射参数,以及利用 5 根荧光检测多达 19 个荧光标记物,亦可在 6 根激光激活的条件下,检测多达 21 个荧光标记物。该系统的光学设计正处于专利申请中,这项设计能够优化激发光以及针对 6 根激光的光收集效率,这 6 根激光的波长分别为:375、405、488、561、638 和 808 nm。波分复用 (WDM) 检测模块(亦处于专利申请中)拥有纯带通设计,可提供从 4 色至 21 色的各种配置,并包含完整的可插拔光学滤波片。CytExpert 2.0 版本软件现已上市贝克曼库尔特目前已推出 CytoFLEX 数据获取软件的最新版本 —— CytExpert 2.0 版本,而全新 CytoFLEX LX 仪器上就搭载了该最新版软件。该软件的工作流和创新型工具能够简化复杂流式应用设置工作。通过创新型补偿库,无论用户身处实验室还是远程作业,均可轻松设置多色应用。运用 CytExpert 2.0 版软件,研究人员可以在不同时间、多个系统中对比和再现实验数据,,而 CytExpert 2.0 软件也会令他们满怀信心地获取针对特定应用领域的精准、标准化的检测结果。此外,针对高通量实验室的需求,该系统还包括微孔板分析功能,以及与前端自动化系统对接的功能,例如,贝克曼库尔特的全新 Biomek i 系列移液平台。该软件还提供确保符合法规 21CFR11 条款规定的工具,例如,用户管理、审计追踪以及电子签名等。“我们在拓展 CytoFLEX 技术方面取得的辉煌成就,预示着贝克曼库尔特流式细胞术将开辟新纪元,”贝克曼库尔特流式细胞设备全球营销总监 Sharlene Wright 说道。“随着CytoFLEX LX 的发布,贝克曼库尔特如今扩展了这款革命性技术的检测性能,从而进军高度复杂的研究市场。这款 LX 仪器结构精巧、紧凑,并具备高度精密的系统,能够传输高品质、高内涵多参数数据,为研究流式细胞开辟了新的篇章。”—— 仅用于科研用途。不可用于临床诊断。贝克曼库尔特、个性化标识和贝克曼库尔特产品以及服务标记均系贝克曼库尔特公司在美国和其他国家的商标或注册商标。贝克曼库尔特商贸(中国)有限公司 生命科学部总部地址:上海市长宁区福泉北路518号2座5楼产品咨询热线:400 821 8899售后服务热线:400 885 5355 / 800 820 5355联系邮箱:apls@beckman.com
  • IVD领域首台|宸安生物流式细胞质谱仪获医疗器械批准
    2023年3月28日,宸安生物的Polaris Starion M1.0流式细胞质谱仪正式获得江苏省药品监督管理局医疗器械注册证(注册证编号:苏械注准20232220387),成为全球第一台可用于体外诊断的流式细胞质谱仪,是流式质谱技术迈向临床诊疗的重要里程碑。专家寄语 王建祥教授中国医学科学院北京协和医学院血液病医院血液学研究所副所院长流式细胞质谱仪是非常高效强大的分析工具,它是结合了流式细胞术和质谱分析的技术,可以在单细胞水平一次进行多指标的检测,因此,流式质谱无疑会助推血液病的诊断技术。宸安生物的流式细胞质谱仪获批上市、取得医疗器械注册证,这也是血液系统疾病诊断的一个里程碑,它会进一步提高血液系统疾病诊断的准确率和快速性。朱平教授第四军医大学西京医院主任医师解放军风湿病专科研究所所长自身免疫性疾病发生发展过程中涉及的免疫学机制十分复杂,需要强大的工具来进行研究和诊断。流式细胞质谱仪具有在单细胞水平上一次检测多个标志物的优势,有潜力成为临床免疫学科先进的研究工具和诊断工具,特别是在单细胞分辨率下解析免疫疾病发病机制,将有力促进临床免疫的发展。宸安生物流式细胞质谱仪取得临床器械注册证,是我们国产高端医疗器械发展的一项重大成果,它开拓了我们临床诊断工具的新高度,我期待在未来利用流式质谱仪为疾病的精准诊疗提供新见解。诊断级流式细胞质谱仪有哪些特点?流式细胞质谱仪是结合流式细胞试剂方法学和质谱硬件技术的高性能分析平台。使用质量标签标记的抗体,并通过高速飞行时间质谱来获取高分辨率、高灵敏度、高通量的数据,从而实现对单个细胞或微球的多参数分析。此次获批的产品为Polaris Starion M1.0,具有全球同类产品中领先的性能和稳定性:强大且简单拥有巨大的检测通道数,灵敏度全球领先,可轻松实现单次40指标以上的单细胞高维分析,通道之间无干扰,无需配色补偿,项目开发简便快速,轻松实现超越现有方法学的检测性能。标准、稳定经过临床试验的充分验证,在相同检测项目上与现有方法学数据高度一致;自带内标校准,确保定量结果在平台全生命周期的稳定可靠。具有简单且标准化的工作流程,一键校准,操作系统支持多人多权限同时登录,针对不同临床应用场景搭配成熟分析模板。更低的使用成本对于多指标应用场景,由于无需选择特殊波段荧光素,并且无需拆分多次进样,流式质谱的试剂成本相较现有方法学具有显著优势;另外,宸安生物开发了多样本编码技术,可大幅降低样本前处理复杂性,同时进一步降低试剂用量。关于宸安生物宸安生物致力于为用户提供强大易用的单细胞解决方案,通过高通量单细胞组学技术和先进算法,提供高分辨生命科学研究工具和临床诊断平台。
  • 视频回放|第五届流式细胞技术网络大会iCFCM2023
    流式细胞仪作为最重要的细胞研究工具之一,在生命科学基础研究、临床诊断等领域有重要应用,并在新型疗法、生物制药等研发过程中扮演越来越重要的角色。近年来,全光谱流式、质谱流式、影像流式、微流控等一系列细胞分析与分选创新技术层出不穷,实验室用户对流式技术的运用越来越深入、多元,应用场景不断丰富和扩大。为促进广大流式细胞仪用户间的学术与技术交流,仪器信息网网络讲堂于2023年10月16日举办第五届流式细胞术网络会议,大会为期3.5天,开设多个主题会场,聚焦流式细胞仪新技术、新应用,共吸引近2000流式人参会。应广大用户要求,会议主办方经征得报告嘉宾同意,特剪辑整理会议视频回放特辑,供从业人员观看学习。【流式技术进展与应用主题约稿】为帮助广大实验室用户及时了解前沿技术进展、创新产品与解决方案,仪器信息网特此约稿。欢迎投稿,投稿文章将于话题专栏展示并在仪器信息网相关渠道推广,投稿邮箱:liuld@instrument.com.cn,关于征稿内容要求也可邮件咨询或电话联系:13683372576(同微信)。(部分报告内容不便回放,敬请谅解!)碧迪医疗流式卫星会回放地址报告题目报告专家/寓见未来:科学发现 Real简单彭汝琴 碧迪医疗器械(上海)有限公司 助理产品经理/BD FACSymphony A5 SE-双模驱动,更全面满足流式多色需求游莉芳 碧迪医疗器械(上海)有限公司 产品专家/BD Rhapsody HT Xpress超通量单细胞平台:通量百万级,使用随心意!朱春苗碧迪医疗器械(上海)有限公司 产品专员/BD FlowJo实用技巧分享魏道河 碧迪医疗生物科学部卓越中心 产品应用专员会场一:流式新技术新产品免抽血动态监测循环(肿瘤)细胞的光学活体流式细胞仪魏勋斌 北京大学医学技术研究院 副院长/教授高维流式数据分析一站式服务吴永强 贝克曼库尔特生命科学 高级技术支持/阻抗流式单细胞表征新方法 王文会 清华大学 副教授基于微流控芯片技术的新型流式细胞分选仪胡玲娜 美天旎生物科技有限公司 科研技术支持团队负责人从技术参数角度看流式细胞仪发展趋势王策中国科学院苏州生物医学工程技术研究所 研究员质谱流式与组织成像质谱流式技术:应用与进展单川Standard BioTools 中国 资深应用专家/细胞电学流式分析方法与仪器赵阳中国科学院微电子研究所 副研究员会场二:免疫学研究应用/免疫评估的临床应用与展望汪峰 华中科技大学同济医学院附属同济医院 副主任/副研究员Amnis量化成像流式仪器特点与特色应用分享薛斐 Cytek产品应用工程师/从布鲁氏菌病谈免疫功能监控李智伟 新疆维吾尔自治区人民医院 副主任/副主任技师免疫细胞精细分型的标准化解决方案楼丽霞 贝克曼库尔特生命科学 市场拓展主管流式细胞术进行免疫细胞精细分型在实体肿瘤精准医疗中的应用进展肖琳 中国医学科学院肿瘤医院 主管技师Bio-Rad ZE5流式细胞分析仪—多色高速高通量,多样应用,“无限”可能罗尧 伯乐生命医学产品(上海)有限公司 产品专员全光谱流式技术特点及实例分享俞珺璟 中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所) 细胞分析技术平台副主任/高级工程师会场三:淋巴瘤/血液病诊断流式细胞术在CAR-T研究和临床治疗中应用专家共识解读王卉 河北燕达陆道培医院 检验科副主任(副院长级)/免疫精细分型在血液疾病中的应用石静 安捷伦生物(杭州)有限公司 临床产品应用专家外周血成熟淋巴细胞增多的血液肿瘤筛查 朱明清 苏州大学附属第一医院 高级实验师/副教授会场四:流式平台建设及管理科研院所大型仪器流式平台的建立、管理及开放共享策略丁宇波 中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所) 高级工程师国产流式细胞仪发展探讨张雷 中生(苏州)医疗科技有限公司 产品经理医学实验室流式公共平台构建、管理以及服务模式探讨苏芳 中山大学孙逸仙纪念医院 主管技师流式细胞术公共平台建设管理刘春春 清华大学 高级工程师公共服务平台流式细胞仪质量控制徐晓雪 首都医科大学 副主任技师流式细胞仪的功能性维护丁熙来 西湖大学 流式平台主管流式平台结合高通量测序等细胞分子生物学平台建设等思路与管理经验王铁山 北京中医药大学北京中医药研究会场五:流式荧光技术及应用细胞因子的临床意义及检测进展杨晓莉 解放军总医院第三医学中心检验科 主任流式细胞因子及受体检测在临床疾病中免疫状态变化中的应用岳保红 郑州大学第一附属医院 检验科副主任/教授流式细胞术在临床检验中的应用及发展幸雯 中国康复研究中心北京博爱医院 主管技师会场六:质谱流式技术及应用质谱组织成像技术结合MHC四聚体染色观测抗原特异性T细胞付国 厦门大学 医学院 教授质谱流式技术--从基础科研到临床应用季庆华 浙江普罗亭健康科技有限公司 技术总监《单细胞蛋白检测系统研制及临床应用》丁显廷 上海交通大学 特聘教授质谱流式技术在CAR-T细胞治疗中的最新应用进展及样本制备、数据分析技巧分享原丽华 中国科学院苏州纳米技术与纳米仿生研究所 高级工程师Integrated Spatial Multi-Omics Analysis Reveals Regional Features and cGAS Pathway Involvement in HCC Response to Combined TACE and ICB Treatment: A Clinical Trial Study盛剑鹏 浙江大学 研究员iCFCM2024第六届流式细胞分析技术网络大会,明年不见不散!(提前招商赞助请联系13683372576 同微信)
  • 福建医科大单一采购1套质谱流式细胞仪
    p  近日,福建医科大学质谱流式细胞仪采购项目拟采用单一来源采购方式进行采购。/pp  据悉,质谱流式细胞仪主要用于对单个细胞的多参数分析(30个以上),且通道间没有互相干扰。可对骨髓、外周血等复杂细胞群体的免疫表型、信号通路、细胞功能等方面进行全面、精细、深入的研究分析 可以应用于细胞生物学、分子生物学、免疫学、血液学、药物研发、临床诊断等方面的研究。/pp  本次拟采购的质谱流式细胞仪主要用于临床肿瘤样本的免疫细胞亚群分析及新治疗靶点的筛选和鉴定。传统的基于荧光的流式细胞仪受到荧光基因发射光谱重叠等物理限制,所能检测的通道数量有限(不超过20个,一般少于12个),无法满足对免疫细胞亚群的精细分析 由于不同通道的信号之间相互干扰(串色),检测时需要计算和调节补偿,检测通道有限和串色问题所需的样本量大,无法达到对肿瘤组织浸润的免疫细胞亚群精细分析的需求。/pp  质谱流式细胞仪利用金属元素作为检测的手段,实现对单个细胞的多参数分析且通道间没有相互干扰,所需样本量少,可对肿瘤组织、外周血等复杂细胞群体的免疫表型、信号通路、细胞功能等方面进行全面、精细、深入的研究分析。/pp  该项目拟定的唯一供应商为Fuildigm公司。据了解,Fuildigm是全球唯一一家拥有质谱与流式细胞仪联用技术专利的公司,目前市场中尚无其他合适替代产品,因此该项目“必须采用单一来源方式采购该设备”。/p
  • 【新品速递】索尼发布旗舰级全光谱流式细胞分析仪ID7000
    p style="text-align: justify text-indent: 2em "span style="color: rgb(112, 48, 160) "strong2019年6月24日,索尼宣布推出旗舰级全光谱流式细胞分析仪ID7000TM,以精简的操作流程实现超过40色荧光的多色流式分析。/strong/span/pp style="text-align: justify text-indent: 2em "span style="color: rgb(112, 48, 160) "strong/strong/span/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 370px height: 286px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201906/uepic/bb64b792-02fb-4082-be5a-d2161c342ba5.jpg" title="微信图片_20190626115355.jpg" alt="微信图片_20190626115355.jpg" width="370" height="286"//pp style="text-align: center "strongSony ID7000/strong/pp style="text-align: justify text-indent: 2em "ID7000搭载索尼创新的全光谱技术,可配备多达span style="color: rgb(112, 48, 160) "strong7个激光和188个检测器/strong/span,允许研究者从混合细胞群体中检测微弱信号和稀有细胞群体,将当今细胞分析技术所能达到的边界大大拓展。/pp style="text-align: justify text-indent: 2em "span style="text-indent: 2em "目前市场上流式细胞分析仪最多可实现同时30色的多色分析,而索尼ID7000的推出一举将此数字大幅度提升至span style="text-indent: 2em color: rgb(112, 48, 160) "strong超过40色/strong/span,而针对每个细胞所能获得的信息量理论值更是提升多达span style="text-indent: 2em color: rgb(112, 48, 160) "strong16,000多倍/strong/span。面对高度异质性的样本ID7000可以全面呈现细胞信息,为研究人员带来深入科学洞见,推动科学研究加速进展。/span/pp style="text-align: justify " 索尼ID7000一项重大突破是将单台流式细胞仪的光学检测器数量提升至188个,这项数字超过当今市场上其他厂家任何一台流式细胞仪产品的3倍以上,其强大的信息收集和处理能力将为研究人员呈现丰富而全面的细胞信息。/pp style="text-align: center "strongspan style="background-color: rgb(255, 192, 0) "主要特征/span/strong/pp style="text-align: justify "span style="color: rgb(112, 48, 160) "strong1. 索尼原创全光谱技术支持超40色荧光信号同时检测/strong/span/pp style="text-align: justify "①7激光188个检测器一次性呈现大量信息。/pp style="text-align: justify "ID7000可配备多达7个激发光,包括深紫外 (320nm), 紫外 (355nm), 紫色 (405nm), 蓝色(488nm), 黄绿色 (561nm),红色 (637nm)及红外 (808nm),用户可根据需求灵活选配3激光到7激光配置。188个检测器覆盖从360nm到920nm光谱范围,更宽的光谱范围可提供更为精确和全面的细胞信息。其中320nm深紫外激光的加入令研究人员更容易检测到微弱的细胞自发荧光信号,同时为市场上即将出现新型荧光素的检测做好准备, 为未来实现更多颜色的超多色流式分析创造先决条件。/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 518px height: 310px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201906/uepic/65cd0952-af73-4116-821d-4da6cdb86a8c.jpg" title="002.jpg" alt="002.jpg" width="518" height="310"//pp style="text-align: justify "②索尼原创的全光谱数据解析算法,提升样本数据处理速度/pp style="text-align: justify "高达188个检测器为用户快速方便地获取关于细胞样本的大量数据,而另一方面索尼通过改进的光谱拆分算法令用户可以快速、高效地处理这些数据,免调补偿的算法令用户摆脱传统流式上数据分析主观性强、操作复杂的困扰。/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 445px height: 411px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201906/uepic/64755aab-09b5-4ef4-82c8-0c330cd6fef5.jpg" title="003.jpg" alt="003.jpg" width="445" height="411"//pp style="text-align: justify "span style="color: rgb(112, 48, 160) "strong2. 大为精简的超多参数分析工作流程/strong/span/pp style="text-align: justify "①光谱参照库(Spectral Reference Library)/pp style="text-align: justify "ID7000内置了一大特色功能,允许用户利用参光谱参照库(Spectral reference library)存储、搜索和选择光谱信息。在传统流式平台上,增加检测颜色的数量通常会带来补偿调节方面的麻烦,给用户增加很多不必要的工作量。而从光谱库中随时调用光谱则大大简化了创建实验、采集和分析数据的难度,在这种情况下实验可以被自动执行,为用户节约很多时间,因而令多色分析实验变得更加精简流畅。/pp style="text-align: justify "② 自发荧光探测器(Autofluorescence Finder)/pp style="text-align: justify "不同样本管之间可能各自含有不同水平的自发荧光,这些水平不一的本底荧光信息给多色流式实验造成不可忽视的障碍,尤其是当要检测的样本量巨大时,而自发荧光探测器功能则能帮助用户识别并扣除多种自发荧光信号所带来的干扰,利用光谱拆分算法为研究者带来更高保真度的数据以及更为精确的视觉化解读。/ppbr//pp style="text-align: justify "span style="color: rgb(112, 48, 160) "strong3. 自动上样器确保高度一致性的检测结果/strong/span/pp style="text-align: justify "全新升级的自动上样器功能进一步提升,低残留、样本搅拌及制冷功能,将细胞损伤降至最低,从而带来长时且稳定的分析效果。br//pp style="text-align: justify "① 整合主动式搅拌功能/pp style="text-align: justify "ID7000整合了上样针主动搅拌的功能,同时支持进程内(in-process)搅拌,使得细胞样本在采样过程中被搅拌而处于悬浮混匀状态从而提升样本检测一致性。此外,自动上样器增加制冷功能,降低了样本检测中的不确定性并阻止样本由于温度变化而降解,更进一步确保了样本检测的一致性。/pp style="text-align: justify "② 软件设计和自动化功能实现无人看管式操作/pp style="text-align: justify "在样本检测中气泡、堵塞及样本体积过少是用户经常遇到的问题,这常常导致仪器报错及检测中断。ID7000优化的软件设计及自动化功能可以自动监控和处理以上情形,从而真正做到无人看管式操作。/pp style="text-align: justify "③ 自动上样器灵活兼容多种上样装置/pp style="text-align: justify "标准及深孔的96孔板和384孔板高通量上样,同时支持24管架(12x75mm 5mL管)/ppbr//ppbr//pp style="text-align: justify "span style="font-size: 12px "i* 本产品仅供研究使用,不可用于临床诊断与治疗。br//i/span/pp style="text-align: justify "span style="font-size: 12px "i* 本产品是Class 1激光产品(JIS标准)。/i/span/pp style="text-align: justify "span style="font-size: 12px "i* ID7000是归属于索尼的商标。/i/span/ppbr//pp style="text-align: center "span style="text-decoration: underline " /spanbr//pp style="text-align: center "strongspan style="text-decoration: underline "更多生命科学仪器新鲜资讯,扫码关注span style="text-decoration: underline color: rgb(192, 0, 0) "【3i生仪社】/span/span/strong/ppstrongspan style="text-decoration: underline "span style="text-decoration: underline color: rgb(192, 0, 0) "/span/span/strong/pp style="text-align: center"img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201906/uepic/50f9ba53-b0d8-499b-84a1-00a917b5f258.jpg" title="新 公号icon.jpg" alt="新 公号icon.jpg"//ppstrongspan style="text-decoration: underline "span style="text-decoration: underline color: rgb(192, 0, 0) "/span/span/strongbr//p
  • 一招鲜!质谱流式细胞仪采购“无觅处”
    p span style="FONT-FAMILY: times new roman" strong仪器信息网讯/strong 中国政府采购网在2015年12月和2016年6月分别发布了同一则“福建医科大学单一来源采购质谱流式细胞仪”的公示信息,该项目拟定的唯一供应商是Fluidigm/富鲁达(上海)仪器科技有限公司。/span/ppspan style="FONT-FAMILY: times new roman"  据仪器信息网编辑了解,Fuildigm是全球唯一一家拥有质谱与流式细胞仪联用技术专利的公司。“由于采购内容无其他合适替代产品,只有唯一的供应商提供服务,符合《中华人民共和国政府采购法》第三十一条规定,可以采用单一来源方式采购该设备。”虽然价格方面稍高(具体可查询招标网站信息或与供应商联系),但由于其在单细胞分析等生命科学研究方面的技术进展,质谱流式细胞仪目前已在国内多家院校和科学研究所得到应用。/span/p
  • 全谱直读 | 谱育科技EXPEC 7910 质谱流式细胞仪,问世首秀@BCEIA
    布局生命科学与诊断新赛道基于流式细胞分析技术应用解决细胞功能分析研究问题谱育科技在BCEIA 2021重磅发布 质谱流式细胞仪、全光谱流式细胞仪 2款生命科学新品。特邀 张新荣教授 现场新品揭幕及专题报告。张新荣,清华大学化学系教授、博士生导师,BCEIA大会副主席、中国分析测试协会副理事长、中国仪器仪表学会分析仪器分会副理事长等。EXPEC 7910 ICP-QTOF 质谱流式细胞仪 更快、更高、更强的ICP-MSEXPEC 7910青出于蓝而胜于蓝谱育科技ICP-MS产品系列不断开拓创新从ICP-MS 到 ICP-MSMS再到全新推出的高速、高分辨、高能力的ICP-QTOF技术平台将ICP-MS质谱技术推向了新的制高点垂直电感耦合等离子体技术从单质量分辨到全通的带宽连续可调四极杆技术反射式飞行时间质谱技术三位一体,技胜一筹● ● ●EXPEC 7910 质谱流式细胞仪基于ICP-QTOF技术的质谱流式细胞仪,全谱直读质谱分析,整合特有的垂直炬管、90°偏转离子光学、多模式四极杆、全新一代碰撞反应池、垂直引入反射式TOF等优势技术,获得超乎想象的更多、更快、更全的测量信息,解决了生命科学单细胞研究中多元素同时分析的需求。颠覆性的垂直炬管设计(VIP)分析高挥发性有机物和高盐样品时,垂直炬管比传统的水平炬管具有更高的耐受性和等离子体稳定性,炬管和离子接口的使用寿命更长。直角离子光学(RIO)高效离子传输,彻底消除中性粒子干扰,提高信噪比。多模式四极杆(MMQ)高稳定性纯钼四极杆,具有单质量分辨、段扫描、全通多种工作模式。瀑布流式高效碰撞反应池(DFC)第三代碰撞反应池,瀑布流式进气设计,碰撞和反应截面更大,干扰消除更彻底。高压缩比矩形离子整形光学系统(ISO)创新设计,高效压缩离子束,提高离子利用率和传输效率。oa-TOF质量分析器垂直引入反射式飞行时间质量检测器,更高分辨率,更高灵敏度,更快速度。应用方向EXPEC 7910 ICP-QTOF 在多元素纳米颗粒分析、质谱流式细胞分析、生物组织成像、微区全元素分析、大气单颗粒元素分析等前沿科学方向,能够提供更优异的信息量和准确度,为地质、冶金、环境、生命科学等领域提供更强、更专业的元素分析解决方案。多元素纳米颗粒分析质谱流式细胞分析生物组织成像大气单颗粒全元素分析
  • “与应用共成长” 谱育首款质谱流式细胞仪重磅发布——2021质谱新品大探秘
    随着质谱技术的发展和应用逐渐成熟,全球范围内质谱仪器销售增速迅猛,进入快速发展期。2021年,中国市场各厂商的质谱产品推陈出新,从新品类型来看,主要集中于Orbitrap、飞行时间、三重四极杆型高分辨质谱。另一方面,国产制造商不断制造“惊喜”,一直有新“玩家”入场,包括莱伯泰科、苏州医工所、迪谱诊断、中元汇吉等。为更全面展现2021年中国市场推出的质谱新产品、新技术,仪器信息网特别策划MS GO:2021质谱新品大探秘的系列视频采访,向广大用户带来最新最前沿的质谱新产品速报。跟随仪器信息网的镜头,可以看到2021年多家国产厂商的质谱产品扎堆发布,品类囊括了ICP-MS、ICP-TOF、GC-MS、GCMS/MS、小质谱以及核酸质谱等,可以说是你方唱罢我登场,好不热闹。 质谱流式细胞仪是新兴的流式细胞分析技术,利用金属同位素标签替代荧光标签,并利用质谱对标签进行定量。业内人士评论道,质谱流式技术通过结合质谱和流式细胞技术,大大增强了评估复杂细胞系统和过程的能力,弥补了荧光流式的不足。其高通量、高灵敏度和高稳定性的特点尤其适合于免疫、肿瘤、血液、药物和遗传学等学科的研究。经过十五年的技术积累,谱育科技在高端质谱仪器研发和产业化创新方面做出了一系列的突破。2021年谱育在ICP-MS三重四极杆质谱仪的基础上带来了其首款电感耦合等离子体-飞行时间质谱仪,即EXPEC 7910 ICP-QTOF。此次发布的EXPEC 7910质谱流式细胞仪搭载了ICP-QTOF技术平台,该系统集“垂直电感耦合等离子体技术”、“从单质量分辨到全通的带宽连续可调四极杆技术”、“反射式飞行时间质谱技术”三大核心技术于一体,测量信息更多、更快、更全,更适于解决生命科学单细胞研究中多元素同时分析的需求。谱育科技技术总工姚继军博士介绍到,ICP-QTOF的目标应用领域是肿瘤细胞筛查、 肿瘤诊断相关的药物研发等生命科学的相关研究。不仅如此,该系统还可为多元素纳米颗粒分析以及大气单颗粒元素分析等前沿科学研究提供解决方案。采访的最后,姚继军博士也提到,今后谱育将充分发挥千人研发团队的实力,针对用户的建议以最快速度进行仪器的研发迭代,与此同时谱育也致力于开发更多特色的应用解决方案并深入拓展不同的应用领域。挥发性有机物(VOCs)是臭氧和颗粒物的重要前体物,对VOCs的管控已成为“十四五”空气质量考核的重要指标之一。因此要求各地方政府部门对VOCs实施细致管控、精准溯源、科学治污。但VOCs监测存在污染来源广泛、成分复杂、扩散速度快、波及范围广等难点,这也对监测仪器提出了更高要求。基于此,谱育还带来了一款直接进样的化学电离飞行时间质谱仪TRACE 8000,该系统以化学电离(CI)源为主要电离方式的直接进样质谱,实现了VOCs的快速监测,并且具有较高的灵敏度。谱育科技技术副总工马乔博士介绍到,系统搭载试剂离子切换技术,可以采用质子转移反应、电荷转移反应等多种电离方式。此外,系统支持标准机柜安装,也可灵活放置于实验台面或地面,配合多流路采样装置,可打造全覆盖的分布式监测预警系统,实时监测空气、水、固定污染源中VOCs的变化情况,实现园区重点管控因子的源头防控及敏感区域的污染预警。点击收看完整采访视频:
  • 450万!清华大学全光谱流式细胞分析仪采购项目
    一、项目基本情况项目编号:清设招第2022021号项目名称:全光谱流式细胞分析仪预算金额:450.0000000 万元(人民币)采购需求: 包号名称数量是否允许进口产品投标01全光谱流式细胞分析仪1套是设备用途介绍 :主要用于细胞学和微颗粒分析使用,可测量细胞大小,内部颗粒的形状,可检测细胞表面和细胞内抗原,细胞内DNA含量和荧光蛋白表达等。可对群体细胞在单细胞水平上进行分析,在短时间内检测分析大量细胞,并收集、储存和处理数据,进行多参数定量分析。简要技术指标 :1. 光路系统:主机配置488nm、640或637nm、405nm、355nm和561nm五根固态激光器;2. 液流系统:配备高通量自动式上样器;3.全光谱信号检测:每个激光器对应独立的分光模块,对荧光素可检测范围可覆盖365nm - 829nm范围;4.数据处理:可对多色荧光光谱进行拆分,具有更小的扩散误差和更高的精确度合同履行期限:交货时间:合同签订后3个月内本项目( 不接受 )联合体投标。
  • Nature:成像质谱流式细胞术发现肿瘤微环境特征预测肺癌结果
    来自麦吉尔大学和多伦多大学等研究人员已经开发出一种方法,可以仅通过一个微小肿瘤组织样本来预测肺癌患者在手术后的发展状况。研究人员将成像质谱流式细胞术与深度学习技术相结合,分析了400 多名来自肺腺癌患者的肺癌样本的肿瘤微环境。肿瘤微环境已被确定为影响治疗进展的异质性来源。通过在空间和单细胞水平上表征肿瘤微环境,研究人员揭示了与临床特征(如生存率)相关的不同细胞状态和特征。正如他们在Nature杂志上报道的那样,他们使用了人工智能来识别肿瘤微环境的某些特征来高精度地预测疾病进展。  Fig. 1: IMC defines the spatial landscape of LUAD.  “总的来说,这些数据表明空间分辨的单细胞转录组在未来可能具有非常大的价值,有助于为个性化的围手术期护理计划提供有价值的信息,以最大限度地减少那些能被治愈的人在治疗过程中产生的毒副作用,或提高那些会复发的人的治愈率”,麦吉尔大学的共同资深作者 Daniela Quail 和 Logan Walsh 以及拉瓦尔大学的 Philippe Joubert 领导的研究人员在论文中写道。研究人员使用 Fluidigm(现为 Standard BioTools)企业的成像质谱流式细胞技术系统,分析了 1996 年 2 月至 2020 年 7 月期间收集的 426 名肺腺癌患者的小组织核心样本。他们使用 35 重抗体组来识别各种细胞他们样本的成分,包括癌细胞本身以及基质细胞、适应性和先天性免疫细胞。研究人员总共检测到超过 160 万个细胞,并发现了 14 个不同的免疫细胞群。他们特别关注免疫细胞群与患者的临床数据之间的关联。例如,肥大细胞与延长生存期有关,虽然它们在非吸烟者和患有早期疾病的患者中更为常见。研究人员进一步注意到某些免疫细胞的频率与特定临床亚组之间的联系—例如,CD4 阳性辅助性 T 细胞在女性患者的样本中富集,她们往往会有更好的总体存活率,而老年患者的肿瘤内 CD8 较少- 阳性 T 细胞。与此同时,他们探索了肿瘤微环境中不同的细胞表型如何与生存相关,例如,发现 H1F1-α 阳性中性粒细胞将会产生不利于生存的环境。观察具有相似局部细胞类型组成的区域(邻近细胞),研究人员进一步指出,不同的组织结构与生存差异有关。例如,富含 B 细胞的邻近细胞与存活显着相关,尤其是 CN-25 邻近细胞,它也富含 CD4 阳性辅助性 T 细胞。通过应用深度学习方法,研究人员发现他们生成的空间信息可以改善对临床结果的预测。他们报告说,创建的模型(包括空间信息)预测进展的准确率高达 95.9%,而基线评分的准确率为 75%,而且他们仅仅使用了一个 1 mm²的肿瘤样本。此外,研究人员使用成像质谱流式细胞术分析了 60 名原发性肺腺癌患者的单独验证队列,并在数据集中发现该模型以 94% 的准确度预测进展。研究人员将他们模型的预测能力追溯到六个标记的组合:CD14、CD16、CD94、αSMA、CD117 和 CD20。总体来讲,准确率为 93.3%,精密度和召回率为 95.6%。研究人员写道:“我们的研究结果代表了对使用临床和病理变量的现有预测工具的重要进步,并且可以更有效地利用不断增长的围术期辅助系统来改善癌症结果。”  来源:  1.Sorin, M., Rezanejad, M., Karimi, E. et al. Single-cell spatial landscapes of the lung tumour immune microenvironment. Nature (2023). https://doi.org/10.1038/s41586-022-05672-3.  2.基因网
  • 贝克曼库尔特收购Cytobank,拓展流式数据分析业务
    p style="text-indent: 2em "6月4日,贝克曼库尔特生命科学宣布收购strong在线流式数据分析网站Cytobank/strong。/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 400px height: 400px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201906/uepic/5dece831-c14b-44fd-b845-91ceee0ecbce.jpg" title="贝克曼.jpg" alt="贝克曼.jpg" width="400" height="400" border="0" vspace="0"//pp  Cytobank是一家位于加利福尼亚州的单细胞数据分析软件即服务(SaaS)公司。主营业务是为业界提供基于云和机器学习的软件平台,用于多参数单细胞数据分析,共享和归档。该平台能够在多个站点之间实现高效的多维多组学数据分析、可视化和协作,大大提高了研究效率。/pp  Cytobank公司的数据分析技术恰好可与贝克曼库尔特CytoFLEX LX 21色流式细胞仪联合使用,用以满足基础和临床研究科学家日益增长的高复杂性工作流程和数据分析需求。/pp  “我们很高兴将Cytobank创新性的软件解决方案添加到我们的流式细胞仪业务中,”贝克曼库尔特流式细胞仪业务部副总裁兼总经理Mario Koksch表示,“我们现在可以为制药/生物制药企业、学术临床科研机构客户提供更加标准化、更灵活的高端数据分析解决方案。”/pp  “Cytobank也很期待加入贝克曼库尔特,通过协作配合,帮助我们进一步开发Cytobank技术平台,为全球领先的科学家提供服务,”Cytobank总裁兼首席执行官David Craford表示。/pp  本次收购,Cytobank将成为丹纳赫生命科学平台下贝克曼库尔特生命科学事业部一员。据了解丹纳赫生命科学平台在2018年创造了约65亿美元的收入。/pp style="text-align: center "span style="color: rgb(192, 0, 0) "strong扫码关注3i生仪社,解锁更多生命科学仪器资讯!/strong/span/ppspan style="color: rgb(192, 0, 0) "strong/strong/span/pp style="text-align: center"img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201906/uepic/e47bd4ba-611b-48ed-9422-baa417f58186.jpg" title="640.jpg" alt="640.jpg"//ppbr//p
  • 流式进展|清华大学王文会团队: 基于阻抗流式细胞术的单细胞样本“一步式”分选除盐质谱预处理系统
    原标题:清华大学王文会团队: 基于阻抗流式细胞术的单细胞样本“一步式”分选除盐质谱预处理系统——01——研究背景单细胞质谱检测技术为单细胞化学特性分析提供了一种强有力的免标记分析手段,并在癌症分析、药物刺激、免疫分析等临床应用中展现出潜在价值。然而单细胞质谱往往需要进行必要的预处理操作,如将目标细胞从混合细胞群体样本中分离出来以提高质谱检测的准确性;除盐操作去除细胞常见缓冲液中的非挥发性盐,降低基质效应提高质谱检测灵敏度。目前这些预处理往往是通过多种设备或手动操作完成,效率较低;开发有效的一步式预处理方法对于单细胞质谱分析意义重大,但目前这方面的研究较为缺乏。为此,清华大学的王文会教授团队提出一种基于阻抗流式细胞术IFC的“一步式”分选除盐质谱预处理系统,经过处理的细胞样本可直接兼容现有的免标记质谱流式、液滴微萃取等单细胞质谱分析手段。研究工作以“Microfluidic Impedance Cytometry Enabled One-Step Sample Preparation for Efficient Single Cell Mass Spectrometry”为题发表在期刊Small上,并被选为Frontispiece。本工作基于IFC原理设计微流控芯片结构,结合压电驱动实现一步式单细胞分选除盐操作,将目标细胞从细胞群中分离出来的同时实现其外基质的置换。经实验验证,系统的分选效率99%、除盐效率99%,并被证实了在癌细胞和血细胞的分离、癌变细胞与正常细胞的分离与质谱检测方面的功能。图1. 基于阻抗流式细胞术的“一步式”分选除盐质谱预处理系统示意图——02——研究内容本工作中搭建了具有四层结构的微流控芯片,如图1所示。利用IFC进行细胞的电学及尺寸特性表征实现不同细胞的识别,待其流经分选区域时由压电执行单元对目标细胞进行分选,通过合适的流速配比,执行单元将目标细胞推至作为下鞘液的质谱兼容的挥发性盐溶液中,同时实现样本的分选与除盐。芯片采用两套电极,其中第1套用于单细胞电学表征,第2套用于表征确认除盐效率。图2. 微流控芯片结构及其工作流程示意图以商用均一性较好的6 μm和10 μm直径的PS微球对系统的分选效率进行了表征。在约9000个样本的实验中,系统展现出了99.53%的分选成功率,同时样本中的10 μm微球纯度由2.48%提升至92.23%,实现了约37倍的富集效率,如图3所示。此外在模拟血液中CTCs分离的实验中,在HeLa癌细胞与人体外周血单核细胞PBMC的混合样本中分选出HeLa细胞,其纯度由15.78% 提升至87.34%,展示出巨大的临床应用潜能。图3. 微流控系统的分选性能评估从定量的角度,以270 mM NaCl溶液作为样本液、去离子水作为下鞘液为例验证了系统的除盐效率,单次分选操作引入的NaCl物质的量仅为0.77±0.16 pMol,即使在300 cells/s的分选通量下除盐效率也能够达到99.62%;同时在实际的细胞样本测试中可以看出,未经除盐的样本信号被完全淹没,而经过该系统除盐后的能够清晰分辨单细胞的典型代谢与脂质峰,证实了系统优秀的除盐性能。图4. 微流控系统的除盐性能评估该系统进一步用于正常乳腺上皮细胞MCF-10A和癌变的乳腺癌细胞MDA-MB-468的分选与检测。通过双频点的锁相检测,分别表征了两类细胞的电学特性,并据此进行了分选操作,结果表明MCF-10A细胞的纯度由 10.64% 提升至77.78%,展现出了约7.31 倍的富集效率。此外将收集到的细胞样本直接与免标记质谱流式装置级联实验,同时表征了两类细胞的代谢特征,结果表明,部分显著差异表达的代谢和脂质可能是致使细胞电学特性差异的原因,充分验证了系统在多模表征与临床分析中的应用价值。图5. 正常细胞与癌变细胞的电学与代谢特性表征分析——03——总结展望本工作提出的基于IFC的一步法单细胞样品质谱预处理方法极大地方便单细胞质谱分析,突破了复杂操作和不必要的损耗。作为一个独立的样品制备模块,本微流控系统能够兼容多种质谱分析方法,为高效的质谱样品制备提供新的范式,进而为单细胞的多模态(如电学特性、代谢特征)表征提供新的思路。论文信息Microfluidic Impedance Cytometry Enabled One-Step Sample Preparation for Efficient Single-Cell Mass Spectrometry ;Junwen Zhu, Siyuan Pan, Huichao Chai, Peng Zhao, Yongxiang Feng, Zhen Cheng, Sichun Zhang, Wenhui Wang * (王文会,清华大学);Small, 2024, https://doi.org/10.1002/smll.202310700作者简介本工作的完成单位为清华大学精密仪器系、精密测试技术与仪器全国重点实验室。精仪系王文会教授为通讯作者,精仪系博士研究生朱焌文为第一作者。清华大学张四纯教授、程振助理研究员、清华大学博士生潘思远、柴惠超、赵鹏、丰泳翔为论文工作做出了重要贡献。本研究得到了国家自然科学基金的资助。【相关阅读】有望提高2个数量级微流控介电泳分离通量!清华大学王文会Advanced Materials封面成果速递https://www.instrument.com.cn/news/20240604/722338.shtml 3i流式KOL|清华大学王文会教授团队在阻抗流式细胞术上取得系列进展https://www.instrument.com.cn/news/20231030/689623.shtml
  • 【FCM指南与共识】流式细胞术的临床应用专家共识
    文章来源:中华检验医学杂志, 2023,46(08):792-801.作者:国家医学检验临床医学研究中心(中国医科大学附属第一医院) 中华医学会检验医学分会 国家卫生健康委临床检验中心 中华检验医学杂志编委会摘要流式细胞术在临床血液及免疫相关疾病的精准诊治中具有重要作用。随着流式细胞仪普及程度的不断提高,临床实验室开展流式细胞术检测,服务临床诊疗的能力和水平也逐渐提升。为适应流式细胞术临床应用的进展和需求,加强质量控制,结合近年来国内外相关领域研究进展,对2013年发表的《流式细胞术的临床应用共识》进行更新,制定此共识。随着医学的进步及疾病精准化诊治需求的增加,我国临床实验室流式细胞仪的普及水平得到提高,开展流式细胞术检测服务临床诊疗的能力和水平亦不断提升。为适应流式细胞术临床应用的进展和临床检验需求的更新,我们延续2013年《流式细胞术临床应用的建议》[ 1 ]的编写初衷,并在此前版本的基础上,经专家组讨论,适时对相应内容进行修订和扩增。本共识由国家医学检验临床医学研究中心、中华医学会检验医学分会、国家卫生健康委临床检验中心及中华检验医学杂志编委会组织专家进行讨论撰写并发布。一、流式细胞仪及器材的准备(一)流式细胞仪的选择2017年12月,我国颁布《流式细胞仪》国家行业标准[ 2 ],规定了流式细胞仪的产品分类、技术要求、试验方法及使用方法等。在临床检验工作中,应选择有临床注册证的流式细胞仪,满足检测灵敏度和收集速率等的要求;根据检测项目所需参数,确定适宜激光器和检测器,使其检测参数与临床使用的荧光抗体匹配;考虑操作的简便性和兼容性,以及未来可升级满足新检测需求的空间;兼顾临床实验室场地、仪器维护、人员培训、试剂和耗材供应稳定性、售后服务等因素。(二)流式细胞仪的设置1.仪器质控:流式细胞仪的仪器性能与检测结果准确与否密切相关。为保证仪器运转正常,每日开机流程后应运行仪器的质控微球等,保证仪器处于最佳性能状态,变异系数小于仪器软件中的可接受范围。如有可接受范围外的偏离,应及时进行校准和维修。2.仪器维护:(1)环境温湿度可影响激光器、光纤和棱镜等光学元件,使用时可参考仪器说明书推荐的温湿度,推荐室温18~25 ℃;(2)灰尘可损伤激光器和光学元件,降低检测的灵敏度,日常工作中注意仪器的整洁,清洁频率依据环境而定;(3)使用1%的次氯酸或75%医用乙醇每日清洁进样针,宜定期(或按需)清洁流动室,避免黏性大和聚集成团的细胞堵塞进样针;(4)过滤器影响荧光信号的稳定性和压缩空气的供应,在需要时排除气泡并定期更换;(5)鞘液桶、废液桶需维持密闭性,定期清洁和更换;(6)电脑数据定期备份,存储数据不超过硬盘的一定容量,避免损坏和拖慢系统性能;(7)定期对仪器性能进行全面评估、校准和保养,并应出具书面报告。3.补偿设置:传统的多色流式细胞仪存在荧光溢漏,合适的补偿是获得可靠数据的关键[ 3 , 4 , 5 ]。(1)补偿对照可以使用新鲜血细胞制品(更贴近待检测细胞)和商品化的荧光微球(操作简便)。使用荧光微球建立的补偿,宜用待检细胞进行优化;(2)如流式细胞仪具备“自动补偿”功能,可采用自动补偿进行条件设置并进一步手动优化;(3)同一通道检测的相似荧光,建立补偿时不能互相替代,如PE-Cy5、PerCP、PerCP-Cy5.5等,应分别建立补偿;(4)补偿设置的染色处理过程宜与待测项目一致,细胞膜染色和经过固定、破膜的胞浆(或胞核)染色会有不同,建议分别设置补偿;(5)补偿矩阵并非永久适用,当建立新的实验或仪器性能出现允许范围外的变化,应重新建立补偿。(三)移液器、离心机、标本前处理系统等的维护及定期校准上述仪器除日常清洁维护,应按照实验室认可标准(例如ISO15189)的相关要求,定期对不同量程的移液器、离心机和标本前处理系统的性能进行全面评估和校准,并出具书面报告。共识1 临床检测选用的流式细胞仪应有国家有关机构核发的注册证。建议根据临床实验室及流式细胞术检测项目的特点,选择技术性能符合使用要求的流式细胞仪,宜同时考虑相关技术培训及售后服务等。流式细胞仪的使用应注意每次检测过程中的仪器质量控制,应按要求进行维护保养和校准评估。流式细胞术检测相关的器材也应注意日常清洁维护和定期校准评估。推荐强度:强烈建议。二、流式细胞术检测试剂(一)荧光抗体的选择和搭配流式细胞术使用的抗体应符合国家相关标准[ 6 ]。在搭配多色抗体组合时需要考虑[ 5 ]:(1)流式细胞仪的检测通道特性:根据流式细胞仪的配置,选择可使用的荧光抗体;(2)荧光染料本身的强弱、荧光标记物的稳定性、荧光素分子大小、荧光抗体克隆号等,例如同一荧光标记物,不同克隆号抗体对某些抗原的检测效果也会出现差异[ 7 , 8 ];(3)待测抗原表达强弱:弱表达抗原选择强荧光标记,强表达抗原可选择弱荧光标记;(4)尽量避免光谱重叠多的荧光染料搭配如PE-Cy5和APC等,对细胞共表达的抗原进行染色时,尽量避免选用串色和荧光溢漏大的通道[ 5 ]。(二)抗体的滴定设置通过抗体滴定计算染色指数(stain index,SI),判断荧光染色后阴性群和阳性群的分离效果,是确定最佳抗体使用浓度的重要方法。SI计算公式为:[中位荧光强度(median fluorescent intensity,MdFI)阳性群-MdFI阴性群]/(2× rSD阴性群)[ 5 ]。SI受荧光强度、抗原表达强度、抗体结合力及流式细胞仪设置等影响[ 5 ]。在更换抗体或抗体批号之前,宜进行抗体滴定以确定最佳浓度,避免因抗体浓度不合适,导致弱表达抗原检测不到或强抗原超出检测限。(三)对照的设置和选择选择适宜的对照是流式细胞术检测中正确获取和分析数据的基础[ 5 ]。“荧光减一”(fully stained minus one fluorochrome或fluorescence minus one,FMO)对照是目前确定阴性和阳性细胞群cutoff值的最佳对照,对于弱阳性或阳性细胞比较少的情况尤为适用,可排除交叉干扰等;同型对照可评估Fc受体或蛋白的交叉反应,排除非特异性染色。生物品对照如血液制品质控,可根据制品的cutoff值来确定检测样品的阴阳性。(四)其他试剂红细胞裂解是流式细胞术检测血液白细胞或骨髓有核细胞时不可或缺的过程[ 9 , 10 ],宜选择相应品牌的裂解液或自行配制。由于裂解液可对粒细胞和单核细胞等造成不同的影响,也会影响染色的效果[ 9 , 10 ],建议根据检测目的不同进行比对,择优选用。细胞的稀释、洗涤和重悬需使用缓冲液或稀释液[ 11 , 12 , 13 ],宜依据反应的最适pH值(如中性)、副作用(如磷酸盐缓冲液会导致一些激酶反应的抑制)、可能的络合作用、对光谱的吸收以及成本等进行选择[ 13 ]。日常工作中可选用商品化的缓冲液或PBS,依据检测目的确定是否添加胎牛血清/牛血清白蛋白,以及是否加入叠氮化钠用于保存。此外,细胞培养基和医用生理盐水等也可用作稀释液和缓冲液。不同于细胞表面(细胞膜)的染色,对细胞内(细胞浆或细胞核)的分子进行染色,需要经过“固定”(如甲醛等),保持目标抗原的位点和结构,再通过“破膜”(如Triton-X)使抗体进入细胞。不同品牌破膜剂对细胞内染色有不同程度的影响,建议根据检测效果进行比对,择优选用[ 14 ]。共识2 流式细胞术检测中,建议合理选择和搭配所需荧光抗体,通过滴定确定抗体使用的最佳浓度,并合理选择和设置对照;染色过程中,选择适宜的红细胞裂解液、缓冲液以及固定破膜剂。推荐强度:强烈建议。 三、标本的采集、存储、运输及制备(一)外周血标本(1)患者准备:流式细胞术检测同其他项目外周血采集无异,因脂血等会对检测结果造成影响,采血前尽量清淡饮食;(2)抗凝剂选择:同时进行白细胞分类和流式细胞术检测时,建议使用乙二胺四乙酸盐(EDTA)抗凝真空管进行标本采集,室温保存,尽快送检[ 15 ]。如进行T细胞功能的检测如IFN-γ分泌时,因EDTA可螯合钙离子,影响T细胞激活效果,建议采用肝素钠等抗凝。(二)其他标本骨髓标本、造血干细胞采集物的抗凝剂选择可以参照外周血。脑脊液标本一般不需要抗凝剂,渗出液性质的浆膜腔积液常有凝块,建议抗凝处理。因体液标本久置会导致细胞破裂,影响细胞计数、分类等检测结果,所以需要尽快送检。一般要求在采集后立即送检[ 16 ],如使用特殊保存剂,可以适当延长送检时间[ 17 ]。样品应离心浓缩调整细胞浓度后进行染色。对于淋巴结等组织标本,一般不需要抗凝剂,活检取材后应尽快送检。标本可经过物理研磨法和酶消化法获得单细胞悬液,调整细胞浓度后进行细胞染色。体外培养的细胞(如胞内细胞因子染色时,需刺激后加入蛋白转运抑制剂),根据细胞储存状态(冻存与否)、细胞特性(贴壁或悬浮),进行复苏或消化、洗涤,调整细胞浓度后染色。(三)标本制备流式细胞术标本的制备,需考虑新鲜度和检测项目的要求。(1)细胞浓度:一般不建议超过1×106 cells/ml(参照试剂说明书);(2)全血体积:一般建议50~400 μl[ 18 ];(3)活细胞染料:常规新鲜外周血可以不使用活细胞染料,但造血干细胞计数、白血病微小残留病(minimal residual disease,MRD)筛选与监测等,建议添加活细胞染料如7-AAD等,以去除死细胞的干扰;(4)细胞染色、固定与破膜:需考虑细胞膜染色、细胞浆染色和细胞核染色的区别,选择相应适宜的固定破膜剂;(5)染色温度:一般室温染色即可[ 18 ],但造血干细胞染色、使用某些固定破膜剂时,要求在融冰或4 ℃完成;一些特殊项目(如中性粒细胞吞噬二氢罗丹明辅助诊断慢性肉芽肿)需经过37 ℃孵育;(6)染色时间:受荧光抗体和染色体积影响,一般建议10~30 min[ 18 ]。根据目的抗原的位置分布不同(细胞膜、细胞浆和细胞核),染色时间不同,可依据说明书及检测需求,探索最优染色时间。另外,如染色体积在200 μl以上,可适当延长抗体孵育时间[ 18 ]。共识3 建议根据检测标本的种类及实验需求的差异,选择适宜的抗凝剂,采样后应尽快送检;样品制备时确保细胞浓度在合理的范围内,根据检测项目的特性,选择最优的染色方法和染色条件。推荐强度:建议执行。四、流式细胞术的临床应用(一)淋巴细胞亚群分析淋巴细胞亚群分析是目前流式细胞术临床应用范围最广泛的项目,可获得淋巴细胞亚群,包括CD3+总T细胞、CD3+CD4+辅助T细胞(Th)、CD3+CD8+细胞毒性T细胞(Tc)、CD3-CD19+B淋巴细胞和CD3-(CD16+CD56)+NK细胞的相对百分比(%)和细胞绝对值(cells/μl),在临床诊治中发挥了重要作用。国家卫生健康委员会发布的《流式细胞术检测外周血淋巴细胞亚群指南》[ 19 ](该行标处于修订过程中),以及《流式细胞术分析外周血淋巴细胞亚群在儿科的临床应用共识(2019版)》[ 20 ]和《TBNK淋巴细胞检测在健康管理中的应用专家共识》[ 21 ]等,对此项目的开展及应用具有重要的指导意义。(二)免疫细胞精细分型1.淋巴细胞:(1)T细胞:对T细胞的精细分型,根据细胞表面标记区分T细胞,如调节性T细胞(Treg)、滤泡辅助性T细胞(Tfh)、Th1、Th2、Th9、Th17和Th22[ 22 ],初始(naive)、效应(effector)、效应记忆型(effector memory)和中央记忆型(central memory)亚群、活化细胞亚群等[ 22 , 23 , 24 , 25 ]。(2)B细胞:根据CD27、IgD、CD24、CD38、CD5等表达,可以将B细胞分为不同亚群[ 23 , 26 , 27 , 28 , 29 ]。(3)NK细胞:根据CD16和CD56表达的不同,可以将NK细胞细分为不同亚群 [ 23 , 30 , 31 ]。目前精细分型的方案并未统一, 表1 汇总了文献报道的常见淋巴细胞精细分型方案,可供参考。2.髓系细胞:(1)粒细胞:根据CD45和SSC,CD13和CD16以及CD66、CD123、CD203c、HLA-DR等的表达不同,可以将粒细胞分为中性粒细胞、嗜酸性粒细胞和嗜碱性粒细胞[ 23 , 30 ]。(2)单核细胞:根据CD45和SSC,CD13、CD14和CD16的表达不同,可以将单核细胞分为不同亚群[ 23 , 30 ]。(3)树突状细胞(dendritic cell,DC):使用系列抗原(lineage:CD3、CD14、CD16、CD19和CD56)排除T细胞、B细胞、NK细胞、单核、粒细胞等,再根据CD123、HLA-DR、CD11c、CD1c、CD141等的不同表达,可以将DC细胞分为不同亚群 [ 23 , 30 , 32 ]。(4)髓源抑制细胞(myeloid-derived suppressor cell,MDSC):根据CD14、CD15、CD11b、HLA-DR、CD33等指标的表达,可以将MDSC分为3个不同亚群 [ 33 , 34 ]。 表1 汇总了文献报道的常见髓系细胞精细分型方案,可供参考。(三)白血病免疫表型分析及微小残留病监测1.白血病免疫表型分析:(1)急性白血病:对于急性白血病免疫分型,2013版《流式细胞术临床应用的建议》[ 1 ]及《四色流式细胞术用于急性白血病免疫分型的中国专家共识(2015年版)》[ 35 ]均有详细介绍。在上述《建议》和《共识》中,对白血病免疫表型分析均主要推荐采取“2步法”,但对于某些跨系别表达的抗原或是混合表型的白血病,可能会因为检测抗原不足导致漏检的现象。国家卫生健康委发布的《儿童急性淋巴细胞白血病诊疗规范(2018年版)》[ 36 ]和《儿童急性早幼粒细胞白血病诊疗规范(2018年版)》[ 37 ],对于急性白血病免疫分型,建议使用多色流式细胞仪,至少检测上述《诊疗规范》提及的35个CD分子,视情况增加更多抗原检测,同时检测的CD分子越多,准确性相对越高。(2)慢性淋巴细胞白血病(Chronic lymphocytic leukemia,CLL)/非霍奇金淋巴瘤:流式细胞术检测的抗原可以参考《流式细胞术在非霍奇金淋巴瘤诊断中的应用专家共识(2017版)》[ 38 ]。但是对于B淋巴细胞,由于慢淋/非霍奇金淋巴瘤的细胞可能来源于淋巴结的多个结构部位[如DLBCL分为生发中心型GCB型、非生发中心non-GCB型和活化B细胞样(ABC)型],需注意其免疫表型的多样性[ 39 ];对于T细胞,如出现异常免疫表型或TCRVβ的单克隆,需要与病毒感染等鉴别。(3)霍奇金淋巴瘤(Hodgkin lymphoma,HL):对于HL,因背景含有大量表型相对正常的淋巴细胞,寻找低比例的Reed-Sternberg细胞存在一定困难。Reed-Sternberg细胞在免疫表型上可以表现为CD45-CD30+CD15+CD71+CD40+CD95+CD3-CD19-等免疫学特征,需要与其他一些表达CD30+的肿瘤细胞进行鉴别[ 40 ],多色流式细胞术在HL中具有一定的辅助诊断价值,HL最终诊断需要结合组织病理学。2.白血病微小残留病(MRD)监测:(1)急性白血病MRD监测:基于白血病相关免疫表型(leukemia-associated immunophenotype,LAIP,根据非白血病细胞的表达背景来定义)和/或细胞“异于正常(different from normal,DFN)”的表型,可以鉴定出异常的细胞群,进行MRD细胞监测[ 41 ]。急性白血病MRD监测可以参考已发表的中国专家共识[ 42 , 43 ]。(2)慢性淋巴细胞白血病/淋巴瘤MRD监测:典型的CLL免疫表型为CD19+CD5+CD23+CD22+CD200+CD43+CD79blow/-且CD10-FMC7-CD103-CD20lowsIgMlow[ 44 ],可用于CLL诊断和MRD监测。上述表型可以通过固定的MRD组合进行监测,推荐方案包括CD5/CD19/CD20/CD38/CD81/CD22/CD79b/CD43等[ 44 , 45 ],需注意美罗华(Rituximab,利妥昔单抗)治疗会使CD20出现假阴性,鉴于CD200在CLL和其他CD5+淋巴瘤如套细胞淋巴瘤中的作用,也可推荐CD200[ 46 ]和CD160[ 47 ]作为CLL的MRD监测指标。对于免疫表型不典型的淋巴瘤等进行MRD监测,需结合其初发时的免疫表型特征。淋巴瘤的分布具有异质性(如可能涉及外周血、骨髓、淋巴结、肝脏、脾脏等),当采样不同时,MRD监测结果可能也不一致。目前,骨髓是使用最广泛的MRD监测标本,但脾脏、肝脏和淋巴结中的MRD监测亦可在疾病复发中起重要作用[ 45 ]。(3)多发性骨髓瘤MRD监测:可参考已经发表的相关共识进行检测[ 42 ]。MRD监测需要获取足够的细胞数,确定检测的最低检出限(limit of detection,LOD)和最低定量限(lower limit of quantification,LLOQ),推荐固定和规律的取样时间进行MRD监测 [ 45 ]。(四)细胞因子检测通过流式细胞术检测细胞因子,主要包括2类方法:(1)基于流式微球阵列技术(Cytometric beads array,CBA),可检测血清、血浆或体液等标本中细胞因子水平。其原理为样品中细胞因子与细胞因子抗体预包被的微球及荧光标记检测抗体结合,形成“双抗体夹心”复合物。此方法使用标本量少,2个荧光检测通道可以同时检测多种细胞因子。(2)可检测激活后胞内细胞因子如IFN-γ等表达,用于评估免疫细胞的功能等。此方法需要新鲜肝素抗凝外周血或分离获得的外周血单个核细胞,使用刺激剂激活细胞,并用阻断剂阻断胞内蛋白质转运,使得刺激产生的细胞因子聚集在细胞内。细胞膜抗原染色后,再使用固定破膜剂固定及破膜对胞内细胞因子如IFN-γ等进行染色。(五)其他临床应用项目流式细胞术临床应用的部分项目如红细胞和血小板检测、HLA-B27检测、DNA倍体、凋亡、细胞周期和细胞增殖等已经在2013版[ 1 ]做过详尽介绍,CD34+造血干细胞计数、PNH筛选等临床项目,可以参照已经发布的应用指南或专家共识[ 48 , 49 ]。共识4 对于淋巴细胞亚群检测等项目,建议参照我国已经发布应用指南或专家共识执行;免疫细胞精细分型项目,建议实验室根据自己的仪器配置等,优化方案,依据临床需求有序开展;对于白血病/淋巴瘤免疫表型分析及MRD筛查等项目,建议依据细胞分化谱系、分化阶段的免疫表型特征和白血病相关免疫表型(LAIP)等进行检测和分析。推荐强度:建议执行。五、数据和报告(一)数据获取、分析和存储1.数据获取和分析:流式细胞术获取的文件数据量大,数据获取分析需要足够的软件和硬件支持(建议高于8GB的RAM或更高配置)[ 4 ]。细胞(或颗粒物)获取需设置合理的阈值,去除碎片及粘连等,再通过散射光及荧光信号的结合,识别不同的细胞群,基于合理的对照,并结合各系别细胞不同的特异性CD分子,手动(或自动)设门,展示出细胞的特性[ 4 , 50 , 51 ]。随着多参数流式细胞仪和新型流式细胞仪等的出现,产生大量和高维空间数据,手工分析费时、具有一定的主观性且容易遗漏一些新的细胞参数,所以需要使用高维数据分析技术,如t分布随机邻位嵌入(t-Distributed Stochastic Neighbor Embedding,t-SNE)等[ 4 , 50 ],以及借助人工智能分析的帮助,补充人工分析的不足。但上述高维分析方法不能取代人工分析,人工检验仍然是一种作为质量控制的良好方法[ 4 ]。2.数据存储:原始数据的保存对数据回顾分析、备查、可溯源再分析以及临床科研等具有重要意义。数据常以包含补偿矩阵(或列表)以及检测通道特征(如荧光标记)的FCS和/或LMD格式存储[ 4 ],分析后的数据或报告以PDF或word方式存储。数据至少保存2年,或根据相关规定尽可能保存更久[ 18 ]。(二)报告书写及发放报告中应包括实验室名称、患者的姓名和门诊或住院号(唯一识别号)、年龄、性别、标本采集的日期和时间、标本类型、检测项目、参考区间等。报告和结果的发布,应准确无误,包含标本接收时间、发布者(检验者和审核者)信息、报告发布时间及适当的解释说明;标本质量不适于检验或可能影响检验结果时(如凝血、溶血、脂血等)应在报告中说明,应该遵循相应规章制度,联系医生并作相应记录[ 52 , 53 ]。共识5 流式细胞术数据的获取和分析,建议依据获取数据的类型及体量,合理选择人工和/或数字化技术进行分析,做好原始数据的储存;实验室发放的报告应信息完整,建议合理发布审核信息及结果解释说明等。推荐强度:建议执行。六、流式细胞术临床应用的质量控制要点(一)实验室质控实验室须通过内部质量保证(internal quality assurance,IQA)和外部质量保证(external quality assurance,EQA)程序进行认证。标本检测宜由具备质量保证(quality assurance,QA)、验证(verification)、能力测试(proficiency testing)、标准化技术培训以及适当基础设施的实验室来进行[ 45 ]。质量控制(quality control,QC)程序,旨在建立和监测仪器性能、试剂、方法和结果,以确保检测系统在使用当天和一段时间内正常工作。如果质量控制程序结果超出可接受范围,所采取的纠正措施应记录在案。质量保证则是从检测的三个阶段,即遵循检验前、检验中和检验后相应程序,制定相应的质量控制和质量保证程序,保证结果的可靠[ 54 ]。(二)仪器质控流式细胞仪的性能与检测结果准确与否密切相关[ 54 ]。仪器的质量控制,应使用仪器厂商等提供的质控微球,如线性/性能验证微球、补偿微球等按照相应说明完成[ 54 ]。为保证仪器运转正常,每日开机流程后,运行仪器的日常质控。仪器质控项目还包括系统和检测的灵敏度、特异性、基线评估、检测线性、校准和优化等,完成不同仪器比对,并需关注仪器光学配件的性能优化、电压和补偿设置、激光功率和电流等,并做好维护保养记录等[ 54 , 55 ]。仪器质控的运行,可确保仪器处于最佳性能状态,变异系数小于仪器软件中的可接受范围,如超出可接受范围的偏离,应及时进行校准和维修。(三)项目质控1.项目论证:需要完成对检测试剂(抗体)、用量和染色能力(染色指数)的验证;检测平台(单、双平台)的验证;方法或仪器的比对、项目相关的电压和补偿设置;参考区间的设置和验证等[ 54 , 55 ]。2.项目开展:(1)标本:标本的正确采集和及时处理是项目检测质量控制的关键步骤。外周血和骨髓等需要选择合适的抗凝剂,最常使用的有EDTA、肝素、ACD 等[ 54 ]。对于组织(如淋巴结)和穿刺标本,建议加入培养基如RPMI转运,不建议使用PBS(可导致标本细胞的快速退化),不建议使用固定剂(可对组织细胞造成毒性,抑制细胞的活性,影响检测结果)。对于脑脊液等体液标本,采集后尽快转运,也可加入培养基转运。(2)试剂:项目检测过程中涉及到的所有试剂如缓冲液、红细胞裂解液等均应事先进行验证;单克隆抗体相较其他试剂需要更严格的验证,如抗体的特异性、反应性、鉴别阴阳性细胞的能力等,可使用商品化质控品(如室内质控血)、实验室标本(如外周血)和室间质控品等进行染色,评估抗体的浓度及染色指数。为节省时间、减少加样错误、抗体量标准化等使用混合抗体(多个抗体混合在一起)时,抗体的保存时间需要实验室自行探索建立,做好初始质控和使用过程中(每几天或每周)的验证,确保检测结果无误,做好相应记录[ 54 ]。(3)项目质控:有商品化质控品(有阴阳性之分、正常异常之分或有检测值高低之分)的检测项目,应完成质控品可接受范围的测试或验证,以及质控月度回顾;无商品化质控品的项目,宜按照相关要求进行比对[ 52 , 55 ],比对分为3个级别:有室间质控品的项目、与其他实验室比对项目、与临床诊断符合性(回顾性的质控)项目[ 55 ]。(4)项目标准化:一些国际协作组推荐部分检测项目的标准化方案,理想情况是检测项目可以实现标准化,质量有保证,实验室间可比,结果具有重复性[ 56 ],但由于实验室选择的流式细胞仪配置差异大,检测方案不同,且项目越复杂实验室自建比例越高,目前标准化存在一定难度[ 57 ]。(四)人员质控流式细胞术样品的检测过程,目前主要以人员手工操作为主,由检测人员分析数据、出具报告并解释说明相关结果。因此流式细胞术从业人员应进行规范化培训,获得相应的资格证书,在工作中需接受继续教育并不断学习,应至少每年一次进行人员的能力评估和人员间的比对,还需综合考虑人员的工作量,以保证检测分析质量[ 57 ]。检测结果宜由具备丰富的临床经验和知识背景的人员对结果进行解释。由于流式细胞术可受到多种因素的影响,其质量控制也应从以下方面重点考虑和执行:(1)样品和试剂处理:严格遵照SOP进行样品处理、核查试剂完整性、建立QC流程、应用滴度良好的抗体、选择合适的对照作为每一个测试的参考。(2)流式细胞仪:包括仪器维护和日常QC测试、使用相应质控微球进行校准等。(3)数据分析:建议数据分析由合格的人员执行[ 58 ]。共识6 流式细胞术检测的质量控制应贯穿始终,包括检验前的标本、试剂和仪器,检验中的染色、数据获取和数据分析,检验后的报告发放和结果解释,重视人员质控。推荐强度:强烈建议。七、生物安全1.检验前生物安全:用于流式细胞术检测的实验室应达到生物安全二级实验室的标准,配备相应的必需设施,注意实验室生物安全。因采集的标本具有潜在传染性,应将所有样品放入有盖的采样管,放置到安全、密封的容器用于转运[ 18 ]。2.检验中生物安全:流式细胞术操作过程中可能有液滴飞溅和喷洒(涡旋气溶胶、离心等),所有人员应做好生物安全防护,正确佩戴手套、穿着工作服等,离开实验室宜换手套和洗手[ 18 ]。建议所有工作都在生物安全柜(BSC I或Ⅱ级)中完成。如果条件不允许,建议可能产生液滴或气溶胶的程序(如涡旋、打开真空管等)应在生物安全柜中执行。标本离心时宜将标本置于密闭容器内,避免产生气溶胶,如出现离心意外,应遵循生物安全管理规定处理[ 18 ]。建议尽量使用仪器配置的转盘上样,使用密封罩隔绝标本和人员,如使用手动上样,应做好人员的安全防护。3.检验后生物安全:检测后标本应依据相关规定或是标本稳定性确定保存时间[ 52 ],之后按照当地规定进行高压灭菌或焚化[ 18 ]。按照仪器维护要求,执行清洁程序,关机后废液及其他耗材按当地要求和实验室规定规范处理。共识7 流式细胞术检测的生物安全应从检验前的环境和标本运输,检验中的人员、标本染色处理、上机检测和检验后的标本保存、医疗耗材的处理等全过程考虑。推荐强度:建议执行。流式细胞术的临床应用越来越广泛,除经典的免疫功能及白血病免疫表型等相关检测外,其在生殖、移植配型、微生物等领域亦有广泛应用,限于篇幅不展开介绍。流式细胞技术的飞速发展,高端流式细胞仪的普及应用及流式细胞仪自动化程度的不断提升,使得我们能够基于流式细胞术获得多参数、多维度的数据,为临床疾病的诊治提供更多的信息和支撑。最后,专家组讨论起草的本共识,侧重于流式细胞术在临床的应用,从仪器和试剂选择、标本采集、主要项目的临床应用、数据和报告、质量控制和生物安全等7方面阐述,虽已经尽可能涵盖检测的全流程,但由于流式细胞术的应用广泛,仍不可避免存在一些疏漏和不足,请同行专家提出宝贵意见,本共识也会适时增补修订。执笔人:王维维(上海交通大学医学院附属新华医院),沈立松(上海交通大学医学院附属新华医院)专家组成员(按姓氏汉语拼音排序):崔巍(中国医学科学院肿瘤医院),潘柏申(复旦大学附属中山医院),彭明婷(国家卫生健康委临床检验中心),尚红(国家医学检验临床医学研究中心,中国医科大学附属第一医院),沈立松(上海交通大学医学院附属新华医院),王蓓丽(复旦大学附属中山医院),王建中(北京大学第一医院),王维维(上海交通大学医学院附属新华医院),张子宁(国家医学检验临床医学研究中心,中国医科大学附属第一医院)参考文献(略)
  • 300万!武汉大学全光谱流式细胞分析仪采购项目
    项目编号:GXTC-A1-22130377项目名称:武汉大学全光谱流式细胞分析仪预算金额:300.0000000 万元(人民币)最高限价(如有):300.0000000 万元(人民币)采购需求:序号货物名称主要功能数量交货期质保期交货地点是否接受进口产品1全光谱流式细胞分析仪测量细胞大小、内部颗粒的性状,还可以检测细胞表面和细胞浆抗原、细胞因子、细胞内DNA、RNA含量等;它可对群体细胞在单细胞水平进行分析,在短时间内检测分析大量细胞,并收集、储存和处理数据,从同一个细胞无需滤光片即可轻松对20多及以上个荧光标志物进行同时检测,全面统计其表达水平。1台合同签订后90日内本项目免费质量保证期要求不低于贰年。免费质量保证期从货物供货、安装、调试正常且经采购人确认验收合格之日起算。武汉大学泰康医学院(基础医学院)接受2配套附件:质控微球1盒合同履行期限:交货期:合同签订后90日内本项目( 不接受 )联合体投标。
  • 中科院分子细胞卓越中心俞珺璟博士:流式细胞技术平台发展与使用心得分享
    生命科学基础研究与人类健康和社会经济发展密切相关,在科学和经济社会领域中的重要性日渐增强。Science 曾发布125 个挑战全球科学界的重要基础问题,其中涉及生命科学的问题约占 54%。生命科学研究过程离不开各类科学仪器的帮助,今年,仪器信息网特别策划话题:“生命科学技术平台经验分享”,邀请高校、科研院所公共技术平台的老师分享技术心得和经验,方便生命科学领域研究人员了解相关技术进展、学习仪器使用方法。本篇为中国科学院分子细胞科学卓越创新中心细胞分析技术平台副主任俞珺璟撰写,俞老师根据多年工作经验,详细介绍了流式细胞术的发展,并分享了长期工作中仪器使用的心得体会。以下为供稿内容:流式细胞术最初诞生于20世纪60年代末,发展之初主要应用于计数和评估颗粒的大小。随着硬件和软件的不断升级发展以及各种荧光试剂的迭代更新,流式细胞术作为一种能够对细胞群、细胞亚群及单个细胞或者颗粒进行多参数、快速的定性/定量的分析手段,已经被深入应用于细胞生物学、免疫学、病毒学、肿瘤生物学、传染病检测、食品和环境监控及生物制药等多个研究领域。流式细胞技术部门作为中国科学院分子细胞科学卓越创新中心细胞分析技术平台的一个重要分支,从成立最初的只有一台2激光4色流式细胞检测仪和2激光7色流式细胞分选仪发展至今已经具备了高低不同配置的流式细胞检测仪8台、流式细胞分选仪7台、高活性全自动磁珠分选仪1台(http://sjzx.sibcb.ac.cn/Cn/Index/pageView/catid/32.html/list/48 ),最大程度地满足中心及周边乃至全国科研院所在流式细胞仪方面的实验需求。平台流式的建设和发展与流式技术的不断更新、科研方向的转变是息息相关的。现就平台在流式方面的使用心得进行分享及对未来流式潜在的需求做一些展望。一、流式细胞检测传统流式细胞仪的硬件系统通常由一个或者多个激光器组成的光照系统、二向色镜以及带通/长通滤光片组成的分光光学器件、高灵敏度光电倍增管(PMT)或雪崩光电二极管组成的检测系统组成。传统流式细胞仪内一个激光器可以搭配2个或多个PMT通道,一个PMT对应一个检测通道,接收发射光谱的峰值信号。激光器越多检测通道越多,可检测荧光信号也越多。平台根据中心各课题组的实验需求配置了不同型号的基于传统检测原理的流式细胞检测设备。1.1 细胞內源荧光蛋白或自发荧光的流式细胞检测细胞内源荧光蛋白或自发荧光的检测主要包括三个方面的应用:1.细胞系转染质粒后阳性比例的检测;2.组织来源带有内源性荧光标记蛋白的细胞比例情况,例如细胞示踪实验;3.细胞自发荧光的测定,比如细胞富含某类化合物,而该类化合物具有较强的自发荧光,可以作为该类细胞的识别标志物。这三类实验基本只用单色或者两色的流式设备配置就可以开展实验。通常转染了只带有GFP标签蛋白的质粒细胞进行流式检测时,只需有488nm激光器,但是如果有mCherry之类的荧光蛋白,必需要有561激光器进行激发。如果带有GFP和mCherry两种融合荧光蛋白的小鼠组织来源细胞进行实验时,要注意两种荧光蛋白的表达水平,尤其是mCherry表达强而GFP表达弱时,mCherry的荧光溢漏会影响GFP通道,所以要利用合适的单荧光样品管作为单染管进行补偿调节。对于一些自发荧光的细胞,例如富含维生素A的细胞类型,可以用405nm激光器激发,450/50带通滤光片进行收集。对于这些荧光蛋白检测的实验,平台需要配备405nm/488nm/561nm的流式检测设备即可。1.2 常规细胞生理健康的流式细胞检测细胞凋亡、倍型、周期是流式平台做的最多的和细胞生理健康相关的实验。细胞凋亡实验一般会采用PI/Annexin V-FITC双指数染色,只有488nm激光器的设备就可以满足实验需求,但是如果有488nm/561nm独立光斑的仪器就可以省略调补偿的过程。细胞倍型一般会采用Hoechst 33342进行染色,以区分单倍体、二倍体等。Hoechst和双链DNA结合后最大激发波长为350nm,最大发射波长为461nm,因此需要配备了355nm激光器的设备,450/50带通滤光片收集。细胞周期一般会采用PI染色的方法,488nm或者561nm激光器都可以激发。因此,对于细胞生理健康的检测,如果使用上述染料基本配备355nm/488nm/561nm激光器的流式检测设备即可。1.3 多色流式细胞检测平台在多色流式细胞检测上主要围绕免疫细胞、造血干细胞、成体干细胞等的分型鉴定。多色流式检测从配色方案设计、设备选择、样品制备、上机和数据分析,过程相对更为复杂。因此,平台配备了4激光12色,4激光14色,5激光18色,5激光19色,5激光28色等多参数流式细胞仪,以满足各种实验需求。在实验过程中,如果多色实验,补偿调节依然是许多用户困惑的地方。如何获得正确的补偿矩阵是保证后期样品数据分析准确性的前提。现在的流式细胞分析仪基本都具备自动调节补偿的功能,因此可以用样品来确定各检测通道的电压后,用补偿微球进行补偿调节可以避免细胞阳性群不明显的困扰。随着仪器光路结构/检测器、电子元器件和分析软件的不断迭代,光谱流式技术的实用性得到了发展。在2005年的时候,Robinson等人提出了可以通过使用棱镜或光栅系统进行分光,配合32通道PMT或CCD检测器阵列可实现500-800nm波长范围内的全光谱信号检测技术。与棱镜分光相比,光栅分光系统可以通过单缝衍射原理对复合荧光实现均匀色散分光,在保证荧光信号真实性的基础上确保所有波段的荧光信号可以同时到达PMT检测器阵列中,实现全光谱信号检测的时空一致性,确保染料光谱的真实性。全光谱流式细胞仪可以跨越所有激光线,检测到可见光波长范围内(360-920nm波长)的全光谱信息,获得每一种荧光的整个发射光谱信息,最后利用WLSM算法(最小加权二乘法)对多个光谱进行拆分,获得每个单一荧光探针的完整光谱信号,从而避免使用传统的补偿计算矩阵,收集到更加全面与准确的荧光信号。因此,通过引入光谱流式技术,可以避免传统流式实验中高参数实验的补偿困扰。比如,通过光谱流式,平台已经实现了小鼠肠道23色免疫细胞分析方案、28色肿瘤免疫细胞亚群分析实验等。但是值得注意的是,光谱流式需要正确的光谱信息,比如样品固定会影响光谱信号,所以固定前后需要建立不同的荧光光谱库。1.4 高通量流式细胞检测流式分析上样方式除了传统的5ml流式管上样外,现在的注射泵和蠕动泵进样方式还可以支持1.5ml EP管上样。而对于一些高通量筛选的时候,尤其是悬浮细胞,利用高通量上样器可以很好地解决这类实验数据采集问题。尤其是带有声波聚焦技术的出现,可以将待测细胞精确聚焦在样本流的中心位置,每个细胞样本都可以准确地聚焦在激光检测区,即使在高流速1ml/min进样速度也能保证信号的变异系数较小,数据质量更高。同时伴随注射泵式的上中下三点混匀模式和推入式进样可以最大限度避免细胞堵塞,从而实现提高样本通量的同时,保证读取样品速度及获取的数据质量和精度。平台配备这种高通量流式检测设备可以提升科研的效率,有效节约科研工作者的时间成本。二、流式细胞分选2.1 传统流式细胞分选常规流式细胞分选早期是基于空气激发原理,此类流式分选仪低压高频的分选特点保证样品分选速度快,对分选后细胞的活性保持得更好。但是它需要手动校准光路和液路,对仪器操作者的技术要求很高,对环境条件的要求也比较苛刻。随着技术发展,现在大型仪器平台都会配备基于石英杯激发原理的流式分选仪,因为是固定光路,只需对仪器进行基本的质控校准和液滴延迟校准,使得分选仪开机工作变得相对简便。加电式的分选模式基本对细胞的活性都会有损伤,所以在分选速度、纯度和活性三者之间如何进行条件优化也是对仪器操作者的一种考验。对激光器的配置要求可以根据实验需求来决定。以我们平台为例,因为有大量的分选实验涉及单倍体细胞的分选,需要使用核酸染料Hoechst 33342,以区别不同倍型细胞中处于不同减数分裂时期的细胞,因此需要功率可调的355nm激光器进行激发,保证此类核酸染料的激发效率。根据DNA浓度和DNA构型,使用450/50(Hoechst Blue)和670/30 (Hoechst Red)带通滤光片双指数显示获取数据。但是核酸染料的使用也往往造成管路、流动室等位置会有样品或染料残留,需要更多的维护时间和人力成本,同时不可避免地减少了可使用机时。因此从平台的用户群角度出发,可以将355nm激光器和405nm激光器分开配置到两台设备,这样可以兼顾保证核酸染料用户群和多色分选用户群的使用需求,也最大程度地避免了两类样品的交叉污染。2.2 芯片式流式细胞分选芯片式流式分选仪最大的特点在于“分选芯片-喷嘴一体化”代替传统的石英杯与喷嘴,因此避免了因流动室或喷嘴支架无法更换造成的样品残留和污染。更换了新的芯片后,可以真正将样本在流动室中的残留率降低到零,这种设计对细胞移植和生物危害性样本分选等对交叉污染零容忍的分选应用更为友好。传统流式细胞分选仪在实验前须对仪器进行一系列复杂的调试步骤,包括光路校准,液流断点优化、侧液流校准和液滴延迟计算等,对仪器操作人员的依赖性更大,普通用户短时间内难以掌握。微流体芯片分选仪已经实现了上述所有调试和校准步骤自动化,并能在分选过程中对液滴状态进行实时监控和自动调节,简化了仪器操作过程,保证了每日仪器状态的稳定性,而且还能匹配不同规格的微流体芯片(70um,100um,130um)可以适用于更多的细胞类型。校准模式中还设计了大液滴模式,液流会更加稳定,更加适用于大细胞和多孔板(96或者384孔板)的分选。鉴于这种芯片式流式分选的特性,平台中一些抗体的单克隆筛选,384孔板测序建库,原代神经细胞等实验会借助这种分选平台进行。2.3 磁珠分选免疫磁珠分选主要基于细胞表面抗原能与连接有磁珠的特异性单抗相结合,在外加磁场中,通过抗体与磁珠相连的细胞被吸附而滞留在磁场中,而没有这种表面抗原的细胞由于不能与连接着磁珠的特异性单抗结合而没有磁性,先被洗脱下来,撤离了磁场后,带有抗体的细胞再被洗脱下来。因此,可以快速地分选得到阴选和阳选的细胞。作为一种功能较为独立的分选设备,磁珠分选主要应用于简单抗体标记的细胞分选和稀有细胞样品前期的富集,提高目的细胞的比例,可以帮助缩短在后期的流式细胞分选的时间提高获取细胞的纯度。分选后细胞纯度高、活性大,通过阳选,还能有效去除细胞碎片。但是对于一些需要内源蛋白标记的细胞还不能通过这种技术实现快速的分选。三、流式平台管理心得和未来可提升空间第一、 在流式使用方面,日常的维护是必不可少的,特别是使用频率特别高或者使用核酸染料样品较多的设备,可以将仪器维护频率提高到一周一次大清洗,同时在每一个用户实验结束后配合使用高浓度clean液-Rinse液-去离子水的冲洗流程,最大程度地保证管路和流式室的清洁,保证仪器正常的使用状态。第二、 对流式技术人员的要求日渐提升,除了会日常的开关机、维护、指导学生上机实验外,需要技术人员对不同样品的特性有更多的认知,判断其数据采集或分选过程中结果不如预期的潜在关键所在,此外还需要具备简单故障排除和硬件故障断定的能力,以缩短流式维修时间成本。第三、 平台设备需要密切结合用户群的实验特性、使用频次、科研目的等关键指标进行合理的配置,同时也要关注平台的技术空白和短板,予以填补和提升。第四、 随着对外泌体、病毒、细菌、亚细胞结构如线粒体等天然纳米颗粒检测需求的提升,可识别直径小于100nm颗粒的纳米级流式细胞术因其在外泌体研究、囊泡运输、纳米药物开发等方面的应用,可以作为纳米尺度小颗粒检测的金标准。第五、 随着光谱分析技术的提升,解决了光谱数据实时解析的问题后,整合了空气激发、低压高频、全自动校准、生物安全等功能的全光谱流式细胞分选仪势必在高参数高速流式分选中发挥更重要的作用。最后,国产流式技术团队在整机开发、配套试剂、技术能力、科研应用、售后服务等方面的不断提升,例如国产光谱流式、国产质谱流式在科研平台的落地化比例逐年上升。作者简介:俞珺璟 细胞分析技术平台副主任/高级工程师俞珺璟,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学和细胞生物学研究所)细胞分析技术平台副主任,博士,高级工程师。2004-2009中国科学院生物物理研究所获博士学位;2007-2009年美国密苏里州Stowers Institute for Medical Research访问学者;2010-2018在中国科学院生物物理所感染与免疫重点实验室从事细胞生物学及天然免疫学相关研究;2018年9月加入中科院生物化学和细胞生物学研究所细胞分析平台,副主任,主要负责流式平台仪器运维、大型仪器理论及实操培训,承担院级功能开发研制项目等,曾作为特邀主编,编撰《流式细胞术实验手册》,已在线发表于Bio-Protocol。2021年被评选为"中国科学院关键技术人才"。相关阅读:细胞生物学研究的利器——仪器平台负责人经验谈点击进入话题页面
  • Coherent相干公司光泵半导体激光器(OPSL)在流式细胞应用领域占据主导地位
    近日,Coherent 相干公司紧凑型连续可见光激光器Sapphire出货量已突破 50000 台。Sapphire是全球首款可产生488 nm的商用化固态激光器,采用相干公司独有的光泵半导体激光(OPSL)技术, 取代了传统的笨重、高能耗气体激光器。 相干公司 Sapphire 光泵半导体激光器 光泵半导体激光器具有灵活可调的波长、可扩展的功率、高效的倍频转换、优异的光束质量等多种优势, 无论是在使用成本、可靠性和使用寿命等方面都极具竞争力。 数十年来,光泵半导体激光(OPSL)技术已在医学诊断、生物成像和其他生命科学应用领域的各种仪器中得到广泛应用。其典型的应用实例包括流式细胞仪、共聚焦显微镜、高通量基因测序、病毒检测等。流式细胞仪领域一直都非常活跃,它的应用涉及免疫学、药物研究,以及用作一线临床诊断工具。随着越来越多研究机构以及临床实验室对多参数流式细胞仪的使用,进一步增加可同时分析的参数数量,加快仪器开发速度并降低总体使用成本益发重要。增加可分析参数的数量能够推动免疫学和细胞生物学等领域开展更复杂的实验。在临床应用领域,这能够让一些数据更加具体,从而为越来越普及的“个性化医疗”(尤其是肿瘤医疗)提供支持。很显然,激光波长的数量是所能测量参数最大数量的制约因素之一。相干公司即插即用的小型化光泵半导体(OPSL)OBIS系列激光器可提供的波长不仅已基本覆盖整个可见光光谱,还把波长带宽拓展到了近红外及更重要的紫外波段,拓展了流式细胞仪多参数测量的能力。 对用于流式细胞仪的激光器而言,还有一个重要趋势是,多波长的激光引擎在临床仪器中的应用越来越普及。相干公司集成化的光引擎OBIS CellX,将4种波长的激光器以及其相关的电子元件、光束整形器和光学聚焦器件都封装在一个模块内,简化并加速了仪器制造商开发新仪器的过程,缩短了产品上市的时间,降低了开发成本。同时,集成化光引擎的这些优势使仪器制造商能够专注于荧光染料化学和可带来优势的其他关键领域的开发(如创新的数据分析技术及其他功能)。相干公司用于生命科学领域的激光器
  • 北京大学白玉副教授最新成果:多维度有机质谱流式细胞仪实现单细胞中蛋白质和代谢物同时分析
    p style="margin: 0px 0px 14px background: white text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "strong仪器信息网讯/strong span style="text-indent: 2em "近日,北京大学白玉副教授团队在常压质谱免疫分析平台工作的基础上,设计并拓展质谱探针,利用基于狄恩流的微流控芯片实现单细胞排列,结合纳升电喷雾-高分辨质谱(nanoESI-HRMS),搭建了多维度有机质谱流式细胞分析平台。/span/pp style="margin: 0px 0px 14px background: white text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "span style="text-indent: 2em "/span/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 331px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202011/uepic/e034a7c1-bb38-4c40-8a79-225f9e1d02e2.jpg" title="1.jpg" alt="1.jpg" width="600" height="331" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: center text-indent: 2em line-height: 1.75em "多维度有机质谱流式分析平台/pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "该平台能够高通量地对单细胞水平的蛋白质和代谢物等多维度信息进行同时获取。相关成果2020年10月21日在 Angewandte Chemie International Edition 在线发表(Multi-Dimensional Organic Mass Cytometry: Simultaneous Analysis of Proteins and Metabolites on Single Cells,Angew. Chem. Int. Ed., 2020, DOI: 10.1002/anie.202009682)。strong style="text-indent: 2em "span style="text-indent: 2em color: rgb(0, 112, 192) "(/spanspan style="text-indent: 2em color: rgb(0, 112, 192) "a href="https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/anie.202009682" target="_blank"点击链接了解论文详情/a)/span/strong/pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "单细胞中内容物体积少、含量低、种类多、分析窗口有限,使得高灵敏、高信息覆盖度、快速、高通量的单细胞分析面临重大挑战。通过单次测量实现多维度、多参数的单细胞定量信息获取,对于细胞分型、鉴定以及单细胞水平的疾病相关分子机制研究具有重要意义。单细胞测序技术方兴未艾,但针对单细胞中蛋白质和代谢物的分析技术仍非常有限,尤其是大量蛋白质和代谢物的同时分析尚未见报道。荧光流式细胞术可对单细胞中多种蛋白质进行分析,然而光谱带宽重叠问题限制了其同时测定的通道数。以CyTOF为代表的质谱流式细胞仪可实现单细胞中40余种蛋白质的同时定量分析,但其依赖于ICP-MS仪器,且ICP-MS无法提供细胞内源物质结构信息,极大地限制了方法的检测对象;有机质谱的结构鉴定能力强、质量分辨率高,可实现单细胞中小分子代谢物的分析。基于有机质谱建立流式细胞分析新方法,从而获取单细胞中蛋白组、代谢组等多组学信息,在单细胞异质性相关研究具有不可替代的分析优势。/pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "该工作中设计并合成了一系列基于罗丹明质量标签的质谱探针,对单细胞表面的CA125、CEA、EpCAM、CD24、CD44和CD133等重要的蛋白标志物进行标记;标记的细胞利用基于迪恩流的微芯片实现单细胞排列,并利用nanoESI-HRMS实现单细胞检测。离子化过程中可实现质量标签的高效解离和细胞内容物的有效释放,从而确保了单细胞中蛋白质和代谢物信息的同时获取。该质谱流式分析平台成功实现了单细胞水平6种目标蛋白质及84种代谢物的同时检测,证实了蛋白质和代谢物在细胞个体间的显著差异性。/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 753px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202011/uepic/834f3be8-504e-4692-8549-7d4e4e92ea8e.jpg" title="2.jpg" alt="2.jpg" width="600" height="753" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: center line-height: 1.75em text-indent: 2em "A2780细胞质谱流式分析结果/pp style="line-height: 1.75em text-align: justify text-indent: 2em "基于该多维度有机质谱流式细胞分析平台所获取的信息,工作首次同时利用蛋白质及代谢物信息作为细胞分型依据,在5种肿瘤细胞的PCA分析中获得了更好的鉴定和分型结果。在利用Ward’s法得到的聚类结果中,相比于利用单一的蛋白质或代谢物信息,使用蛋白质和代谢物的综合信息能够获得更高的分型灵敏度和特异性。单细胞分析方法在干细胞研究、细胞耐药性研究以及癌症治疗等方面具有重要意义,该流式平台还成功实现了肿瘤细胞耐药异质性分析,其结果有望为分子水平的耐药性细胞研究或癌症干细胞研究提供分析依据。/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 590px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202011/uepic/6dfdd07e-01d8-40ed-aed8-bd47e0c1d11b.jpg" title="3.jpg" alt="3.jpg" width="600" height="590" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: center text-indent: 2em line-height: 1.75em "细胞分型和肿瘤耐药差异性结果图/pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "该论文第一作者为15级博士研究生徐姝婷。工作得到国家自然科学基金委和科技部国家重点研发计划和北京市自然科学基金重点项目的资助。/pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "研究学者:/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 200px height: 250px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202011/uepic/38d36728-c2e0-4fc5-8087-cbb4d275ac50.jpg" title="白玉.jpg" alt="白玉.jpg" width="200" height="250" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: center "北京大学副教授 白玉/pp style="line-height: 1.75em "研究领域与研究兴趣:/pp style="line-height: 1.75em "  1.超灵敏质谱分析新方法研究;/pp style="line-height: 1.75em "  2.单细胞质谱分析;/pp style="line-height: 1.75em "  3.新型纳米分离介质在复杂体系分离分析中的应用;/pp style="line-height: 1.75em "  4.常压敞开式质谱离子化技术及其仪器研发;/pp style="line-height: 1.75em "  5.疾病相关的代谢组学研究。/pp style="text-align: justify text-indent: 2em line-height: 1.75em "strong点击了解白玉课题组网页:/stronga href="https://www.chem.pku.edu.cn/PAAL/" target="_blank"https://www.chem.pku.edu.cn/PAAL//a/ppbr//p
  • 单细胞质谱流式技术解析生物材料体内免疫应答
    p style="text-align: justify " span style="color: rgb(0, 112, 192) "strong span style="text-indent: 2em "前言:质谱流式细胞仪(CyTOF)/span/strong/span/pp style="text-indent: 2em "质谱流式细胞技术的核心融合了流式细胞技术与质谱技术。目前质谱流式细胞技术采用的仪器是CyTOF(Cytometry by Time-Of-Flight),其原理简单来说是利用质谱原理对单细胞进行多参数检测的流式技术,既继承了传统流式细胞仪的高速分析的特点,又具有质谱检测的高分辨能力。span style="text-indent: 2em "传统流式细胞技术和质谱流式细胞技术相比,主要有两点不同:1.标签系统的不同,前者主要使用各种span style="text-indent: 2em color: rgb(0, 112, 192) "strong荧光基团作为抗体的标签/strong/span,span style="text-indent: 2em color: rgb(0, 112, 192) "strong后者则使用各种金属元素作为标签/strong/span;2.检测系统的不同,strongspan style="text-indent: 2em color: rgb(0, 112, 192) "前者使用激光器和光电倍增管作为检测手段/span/strong,而span style="text-indent: 2em color: rgb(0, 112, 192) "strong后者使用ICP质谱技术/strong/span作为检测手段。/span/pp style="text-align: justify text-indent: 2em "近日,浙江大学医学院欧阳宏伟教授课题组在strong《Applied Materials Today》在线发表最新论文“Single-cell mass cytometry reveals in vivo immunological response to surgical biomaterials”/strong。该研究运用strong单细胞质谱流式技术/strong分析了两种生物材料(聚丙烯补片和丝素补片)在软组织修复过程中的系统性免疫反应特征,比较了两组外周血免疫细胞的比例以及与免疫细胞中激活、迁移相关的功能标志物表达情况,显示丝素补片具有更好的生物相容性。/pp style="text-align: justify "  生物材料已经在临床被广泛应用,如腹部疝修复使用的补片,软骨修复中使用的支架,肌腱重建中使用的人工韧带等等。然而,strong生物材料植入体内后会引起体内的免疫应答,严重的免疫反应(异物反应)会造成一系列的并发症:疼痛、感染、组织粘连等,使得治疗失败甚至需要二次手术。/strong2016年,业界某巨头公司大量疝修复补片产品因考虑到复发率或再次手术率高等因素被其安全团队召回1。因此,strong生物材料的临床前安全评估和临床监测非常重要/strong。但是,目前检测生物材料的检测方法大多是体外实验不能精准模拟体内复杂的环境 或是聚焦于局部免疫反应而缺乏对全身系统性免疫的评估,因此未能准确评估生物材料的安全性,不能有效预测和规避不良后果。/pp style="text-align: justify "  strong单细胞质谱流式是一项通过使用金属标记抗体,质谱检测信号的新型流式技术,近年来已经被广泛应用于细胞分化、肿瘤检测、药物筛选等多个研究领域。/strong它具有高通量、高分辨率的特点:在单细胞水平上可同时分析超过40种细胞标志物,可同时检测上百个通道,可用来分析评估复杂细胞系统中细胞亚群和功能标志物表达情况。因此,单细胞质谱流式技术可以作为深度解析生物材料体内免疫应答的“利器”。/pp style="text-align: justify "  该研究以外科常见疝修复手术应用的聚丙烯补片和丝素补片为例,首次利用单细胞质谱流式技术评估了这两种生物材料在小鼠腹部缺损模型中引起的系统免疫反应(图1)。结果显示:与聚丙烯补片相比,丝素补片组的外周血中巨噬细胞,单核细胞,中性粒细胞,CD4+ T 细胞,以及CD8+ T 细胞比例更低,免疫细胞比例更接近于对照组 并且免疫细胞激活、迁移相关的功能性标志物 (CD115, CD27, and CD62L)也相对低表达。同时,丝素补片组材料植入处的免疫细胞(巨噬细胞和中性粒细胞)浸润要显著性低于聚丙烯补片组。此外,作者还发现丝素补片组具有较轻的组织粘连和更好的组织修复效果(图2)。这表明系统性免疫应答特征(免疫细胞比例和功能标志物表达情况)可以体现生物材料在体内异物反应的程度,或可作为预测并发症发生和组织修复情况的依据。/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 340px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201906/uepic/8feb1c54-1ba4-4f70-8807-a919671ac9d8.jpg" title="1.jpg" alt="1.jpg" width="600" height="340" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: center "  图1:运用单细胞质谱流式技术解析材料植入体内后的系统性免疫反应/pp style="text-align: justify "  /pp style="text-align: center"img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201906/uepic/0a7c1d2f-8d2f-4680-8a85-2d2d5bacfee4.jpg" title="2.jpg" alt="2.jpg"//pp style="text-align: center "图2:两种生物材料植入后的组织粘连和组织修复情况/pp style="text-align: justify "  该研究提出了基于单细胞质谱流式的一种高通量高分辨率的生物材料体内系统性免疫应答评估策略,这可为生物材料的临床前安全评估和临床应用监测提供有效手段,为进一步筛选和开发免疫调控性生物材料提供新思路和新方法。/pp style="text-align: justify "  植入性医疗器械的快速发展促进人们对医疗服务的要求日益提高,生物材料的安全问题越来越受到重视。生物材料的成分、磨损、代谢、降解产物等带来的风险可以通过不断发展的新型高通量检测技术进行评估。/pp style="text-align: justify "  近期浙江大学医学院欧阳宏伟教授实验室基于单细胞质谱流式技术,结合HLLA-seq及生物材料-基因作用图谱策略(NGA),将从单细胞水平、整个机体水平建立起一套完善、系统的评价系统,为生物材料的临床使用保驾护航。/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 567px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201906/uepic/c95b96ea-40c8-4450-a6cf-4bffc9db1862.jpg" title="3.jpg" alt="3.jpg" width="600" height="567" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: justify "  /pp style="font-size: inherit font-weight: normal padding: 0px margin: 0px font-family: ' Microsoft YaHei' line-height: 40px white-space: normal text-align: center background-color: rgb(255, 255, 255) "a href="https://www.instrument.com.cn/netshow/SH104342/C325581.htm" target="_blank" style="color: rgb(0, 112, 192) text-decoration: underline "span style="color: rgb(0, 112, 192) "strongHelios® 质谱流式细胞仪系统/strong/span/a/pp style="text-align: justify text-indent: 2em "Helios™ 质谱流式系统具有高效简洁的工作流程以及广泛的适用性,通过独创的金属标签抗体技术,标记细胞表面及胞内蛋白,实现单细胞的多参数检测,可以对单细胞进行全面的表型、信号通路及功能研究。/ppbr//p
  • 国家药监局:血液病流式细胞学人工智能分析软件性能评价审评要点
    血液病流式细胞学人工智能分析软件性能评价审评要点本要点旨在指导注册申请人对血液病流式细胞学人工智能分析软件注册申报资料中非临床评价部分的准备及撰写,同时也为技术审评部门提供参考。本要点是对血液病流式细胞学人工智能分析软件申报资料的一般要求,申请人需依据产品的具体特性确定其中内容是否适用。若不适用,需具体阐述理由及相应的科学依据,并依据产品的具体特性对注册申报资料的内容进行充实和细化。本要点是供注册申请人和技术审评人员使用的指导性文件,但不包括审评审批所涉及的行政事项,亦不作为法规强制执行,需在遵循相关法规的前提下使用本指导原则。如果有能够满足相关法规要求的其他方法,也可以采用,但是需要提供详细的研究资料和验证资料。本要点是在现行法规和标准体系以及当前认知水平下制定的,随着法规和标准的不断完善,以及科学技术的不断发展,本要点的相关内容也将进行适时的调整。一、适用范围血液病流式细胞学分析,与细胞形态学、细胞遗传学、分子遗传学等一起,用于血液病的辅助诊断、鉴别诊断、预后判断、治疗监测、免疫监测、造血干细胞移植相关检测等。样本类型可为血液或骨髓、淋巴结、脑脊液、及其他适用样本类型。血液病流式细胞学人工智能分析软件,指通过人工智能算法帮助医生分析多参数流式细胞学技术/流式细胞仪产生的结构化数据,如数据文件或图形文件等进行血液病辅助体外诊断的软件,通常用于定性或定量分析,可以是软件组件或独立软件。通过对结构化数据的人工智能算法分析,用途包含:(一)基础分析:通过单一的人工智能算法辅助流式细胞学数据的可视化,从而辅助流式诊断人员进行自动设门和分析。(二)高阶分析:通过多个人工智能算法组合使用(如集成学习算法和卷积神经网络算法组合使用),实现自动设门辅助血液疾病诊断(良/恶性、白血病亚型分类、淋巴瘤分型等)、化疗后的微小残留病监测等。产品在医疗机构、医学实验室使用,其结果供执业医师参考。软件作为血液病流式细胞学辅助诊断工具,其提示的诊断结果不能作为临床诊断决策的唯一依据。产品管理类别:独立软件分类编码:21-04-02(计算机辅助诊断/分析软件)软件组件分类编码:22-01-08(流式细胞分析仪器)应注意本要点主要适用于辅助决策类的人工智能医疗器械,按照第三类管理,其他类别的产品可根据其适用性参照执行。关于人工智能医用软件分类的判定,可参照《人工智能医用软件产品分类界定指导原则》。产品名称:建议依据医用软件通用名称要求,按“特征词1(如有)+特征词2(如有)+特征词3(如有)+核心词”结构编制。具体到该类产品,建议体现处理对象和临床用途,如血液病(具体病种)+流式细胞学辅助分析/检测软件,可参考《医疗器械分类目录》、《医用软件通用名称命名指导原则》中的品名举例或已批准的同类产品进行命名。如为软件组件,则产品名称体现医疗器械名称,如“多参数流式细胞仪”,但在适用范围体现人工智能算法类型,在产品说明书体现使用限制等相关内容。本要点基于《人工智能医疗器械注册审查指导原则》的基本框架要求,其中关于人工智能医疗器械的的术语定义、相关要求参照上述指导原则。二、产品简介该类软件的分析对象基于流式细胞仪产生的标准化的结构化数据文件或图形文件等。产品的工作原理:产品为独立软件或软件组件,采用人工智能算法对流式细胞仪数据进行处理(如:数据特征提取、数据通过函数图形化以及自动设门、决策分析等),实现对流式细胞仪数据、对细胞分类及定量结果进行分析,达到辅助诊断的功能。主要结构及组成:结构组成明确交付内容和功能模块,其中交付内容包括软件安装程序、授权文件、外部软件环境安装程序等软件程序文件,功能模块包括客户端、服务器端(若适用)等,若适用注明选装、模块版本。服务器端:负责接收并处理请求,对请求进行数据处理,调用人工智能算法(如PCA、t-SNE、SVM等)对数据进行处理并输出分析结果。把用户请求的数据结果返回给浏览器。客户端:将服务器端分析结果呈现到用户界面。用户 可在用户界面端进行自动设门、细胞分群、辅助分类、辅助诊断、报告管理、检索查询、用户管理、查看日志等功能操作。预期使用环境:申报产品主要使用环境为医疗机构、医学实验室。三、基本要求在满足相关法规、规章、指导原则、标准的前提下,还应重点关注下列内容:(一)综述资料详细描述该产品的算法名称,选择该算法的依据和权威文献,数据处理的在流式细胞分析流程中的节点及辅助决策功能及功能实现方法,描述配套使用流式细胞仪器设备(厂家、型号、注册证号及主要参数设置:包括激光数、通道设置等)及仪器质量控制参数(仪器校准、电压补偿等)、配套使用的流式细胞检测试剂(名称、厂家、注册证号等),描述数据产生的样本类型。人工智能医疗器械从成熟度角度可分为成熟和全新两种类型,其中成熟是指安全有效性已在医疗实践中得到充分证实的情形,全新是指未上市或安全有效性尚未在医疗实践中得到充分证实的情形。人工智能医疗器械的算法、功能、用途若有一项为全新则属于全新类型,反之属于成熟类型。在资料中应当说明采用算法的成熟程度,采用全新算法的,应当在综述资料中详细说明。阐述软件研发背景,包括对辅助决策功能的介绍,目前该血液病临床诊断参考标准、诊疗指南和分型依据。申报产品数据处理标准和分型依据应与临床标准一致。(二)非临床资料1.产品技术要求及检验报告性能指标应包括“所分析的数据类型”、“分析速度”、“临床功能”等,如数据处理、数据分析、诊断提示等。其他要求请参照《医疗器械软件注册审查指导原则(2022年修订版)》。2.软件研究资料按照《医疗器械软件注册审查指导原则(2022年修订版)》、《医疗器械网络安全注册审查指导原则(2022年修订版)》、《人工智能医疗器械注册审查指导原则》的要求,提交研究资料。明确发布版本号。提交的研究资料主要包含软件研究资料、算法研究资料、网络安全研究资料。研究资料内容应涵盖申报产品适用范围中描述的全部内容。2.1风险管理软件安全性级别越高,其生存周期质控要求越严格,注册申报资料越详尽,同时由于全新类型的潜在未知风险多于成熟类型,故需结合成熟度予以综合考虑。人工智能医疗器械的软件安全性级别可基于产品的预期用途、使用场景、核心功能进行综合判定,其中预期用途主要考虑用途类型、重要程度、紧迫程度等因素,使用场景主要考虑使用场合、疾病特征、适用人群、目标用户等因素,核心功能主要考虑功能类型、核心算法、输入输出、接口等因素。参考YY/T 0316、GB/T 42062和YY/T 0664等标准进行风险管理。风险管理活动应当基于软件的预期用途、使用场景、核心功能予以实施,并贯穿软件全生命周期过程。申请人重点考虑如下风险因素:此类产品算法风险包括算法选择风险、算法训练及验证的风险等,主要包括算法选择依据不充分,算法训练使用的数据质量不高,数据代表性不足或数据量不够,由于样本前处理、流式细胞仪光路信号校准和质控,流式细胞分析过程或流式荧光试剂标记发生错误等原因产生,造成过拟合和欠拟合导致的泛化能力不足,数据扩增(如适用)和数据偏移等造成的假阴性和假阳性错误等;使用中的风险主要包括未经培训的人员使用,以及样本采集、处理、仪器校准等错误,造成的假阴性和假阳性错误。其中假阴性即漏诊,可能导致后续诊疗活动延误,特别是要考虑快速进展疾病的诊疗活动延误风险,而假阳性即误诊,可能导致后续不必要的诊疗活动。以算法特性为核心重点关注其泛化能力,以模型/数据为基础重点关注其质控情况,同时从风险管理角度兼顾算力不足与失效的影响。注册申请人应结合人工智能医疗器械的预期用途、使用场景、核心功能开展风险管理活动,采取风险控制措施将风险降至可接受水平,并贯穿于人工智能医疗器械全生命周期过程。此外,进口人工智能医疗器械还需考虑中外差异风险,如人种、流行病学特征、临床诊疗规范等差异。2.2需求规范提供软件需求规范文档,明确软件的功能、性能、接口、用户界面、运行环境、网络安全、数据采集等需求。数据采集需考虑数据来源的合规性、充分性和多样性,数据分布的科学性和合理性,数据质控的充分性、有效性和准确性。数据应来源于分布于不同地域的机构且不少于3家,确保数据应当具备高度的多样性。机构应使用软件说明书中的分析流程采集数据,如明确的样本来源、仪器设备、样本处理(前处理、单细胞悬液的制作、荧光抗体试剂的选择等)。数据分布的科学性和合理性,应考虑包括但不限于疾病构成(如分型、分级、分期)、人群分布(如高危人群、患者,性别、年龄)等情况。算法性能需结合产品预期用途,综合考虑分析速度、敏感性、特异性、重复性与再现性、泛化性等性能指标的适用性及其要求。同时还需考虑因梯度消失(如适用)、梯度爆炸(如适用)、过拟合和欠拟合等影响算法性能的因素。使用限制需考虑产品禁用、慎用等场景,准确表述产品使用场景,提供必要警示提示信息。2.3软件性能研究提供产品性能研究资料以及产品技术要求的研究和编制说明,给出软件相关的功能性、安全性指标的确定依据。注册申请人需在软件研究资料中提交GB/T 25000.51自测报告,亦可提交自检报告或检验报告代替自测报告。产品技术要求中各指标依据产品自身特点确定。2.4算法研究资料根据《人工智能医疗器械注册审查指导原则》提交算法研究资料。逐项提交每个人工智能算法或算法组合的算法研究报告。2.4.1算法基本信息明确算法的名称、类型、结构、输入输出、流程图、算法框架、运行环境等基本信息以及算法选用依据。其中,算法类型从学习策略、学习方法(基于模型的算法和基于数据的算法)、可解释性(白盒算法和黑盒算法)等角度明确算法特性。算法结构部分应明确算法的层数、参数规模等超参数信息。流程图应包含输入示例、学习方法示意图输出示例。算法框架应明确所用人工智能算法框架的基本信息,包括名称、类型(自研算法框架、现成算法框架)、型号规格、完整版本、制造商等信息。若基于云计算平台,应明确云计算的名称、服务模式、部署模式、配置以及云服务商的名称、住所、服务资质。运行环境应明确算法正常运行所需的典型运行环境,包括硬件配置、外部软件环境、网络条件;若使用人工智能芯片应明确其名称、型号规格、制造商、性能指标等信息。算法选用依据详述算法或算法组合选用的理由和基本原则。2.4.2算法风险管理结合预期用途、使用场景、和核心功能、算法成熟度、网络安全等因素,此类产品的软件安全性级别为严重级别。提供算法风险管理资料,若无单独文档可提供软件风险管理资料,并注明算法风险管理所在位置。2.4.3算法需求规范提供算法需求规范文档,若无单独文档可提供软件需求规范,并注明算法需求所在位置。2.4.4数据收集2.4.4.1提供数据来源合规性声明,列明数据来源机构的名称、所在地域、数据收集量、伦理批件(或科研合作协议)编号等信息。2.4.4.2数据采集建议参考2.2需求规范的要求,提供数据采集操作规范文档,包括数据采集方案和数据采集标准操作规程。数据采集主要由临床机构实施,应明确流式细胞分析流程的全部信息(包括全流程质控标准、panel设计、仪器和试剂的标准化SOP等)、明确样本及样本处理要求、样本的来源与分布、样本质量要求(样本保存时限、质量判断标准)、采集设备要求(应包含流式细胞仪型号、通道数量、注册证号、设备质控及补偿调节方式、数据的基本处理方式等)、流式抗体试剂要求(厂家、注册证号等)、数据质量要求、采集过程、数据脱敏、数据转移等要求。采集过程应对样本数据进行编号并加密,方案中应包含编号规则。关于数据集采集方面建议明确偏倚的控制方法,如: (1)为了保证研究对象的代表性,可从目标人群中随机抽样、多中心,保证样本量要足够大。 (2)为了保证研究对象选择的质量,研究设计中应有明确、具体的诊断标准、纳入标准和排除标准。 (3)检测标本尽量保持试验条件的前后一致性,注意试剂质量、仪器性能、样本保存和操作规定。 建议通过限制、配比、标准化、随机化、分层分析和多元分析等进行控制。2.4.4.3数据整理明确数据清洗/预处理程序,对数据处理中应用的软件进行简述,并以附件的形式提交数据处理中各软件的软件研究资料。数据整理基于原始数据库考虑数据清洗、数据预处理的质控要求。数据清洗需明确清洗的规则、方法、结果,数据预处理需明确处理的方法、结果。数据整理所用软件工具均需明确名称、型号规格、完整版本、制造商、运行环境,并进行软件确认。2.4.4.4数据标注明确标注人员和仲裁人员的资质要求和培训内容,标注人员和仲裁人员应为相关专业资质的人员,数据应经过2人或以上进行标注,标注方式建议给出依据。简述标记系统信息,给出数据/图像界面截图,详细介绍标注过程、标注对象和标注标准(注意与临床诊断标准的一致性)等。明确标注过程质控、标注质量评估、数据安全保证等要求,明确室内质控、室间质评等要求。应当注意标注数据的质量评估,可抽选一定比例数据由有资质的非标注人员结合临床进行综合诊断评估。提供原始数据库、基础数据库、标注数据库、扩增数据库(如有),关于疾病构成的数据分布情况,包括适用人群、数据来源机构、采集设备、样本类型等因素。若数据来自公开数据库,提供公开数据库的基本信息(如名称、创建者、数据总量等)和使用情况(如数据使用量、数据质量评估、数据分布等)。2.4.4.5数据集构建明确各数据集划分的方法及依据。训练集应当保证样本分布具有均衡性,根据预期用途,训练样本应涵盖不同血液病样本类型、不同分群类型等。调优集应保证样本分布符合临床实际情况,如阳性比例,不同类型比例、不同临床分型比例等均应符合临床实际情况。训练集、调优集、测试集的样本应两两无交集并通过查重予以验证。如适用,进行数据扩增验证时,应当明确扩增的方式、方法、倍数,并考虑数据扩增对软件的影响及风险。列表比较扩增数据库与标注数据库的差异,论证扩增数据库样本量的充分性以及分布的合理性。2.4.5算法训练依据适用人群、数据来源机构、采集设备、样本类型等因素,提供训练集、调优集(若有)关于疾病构成的数据分布情况。算法训练基于训练集、调优集进行训练和调优,应明确算法训练所用的评估指标、训练方式、训练目标、调优方法,提供ROC曲线或混淆矩阵等证据(如:迭代次数-训练CountIOU曲线和迭代册数-召回率曲线)证明训练目标满足医疗要求,提供训练数据量-评估指标曲线(如迭代次数-Loss曲线)等证据以证实算法训练的充分性和有效性。应当提供人工智能学习算法常用的评估函数来评估算法训练的质量。2.4.6算法性能评估基于测试集对算法设计进行评估,确认软件算法性能的效率、敏感性、特异性,性能应满足算法设计要求。算法验证:算法性能评估应包括软件对样本满意度评价的能力测试、泛化能力的测试、压力测试(指采用罕见或特殊的真实数据样本开展的算法性能测试)、对抗测试、重复性与再现性测试、诊断敏感性与特异性测试、分析效率测试、算法性能影响因素分析、性能评估结果比较分析、偏差报告等研究。应以该软件和临床综合诊断的一致性进行比较.评价细胞分群的准确性。通过样本量估算确定测试集中阴、阳性样本和压力样本的样本量,提供测试集关于疾病构成(包括年龄和血液病类型、白细胞分化抗原种类)、数据来源的数据分布情况。明确对抗样本的选择原则;明确性能评估的可接受标准和标准制定依据。提交测试报告和结果图示例。若使用第三方数据库开展算法性能评估,提供第三方数据库的基本信息(如名称、创建者、数据总量等)和使用情况(如测试数据样本量、评估指标、评估结果等)。还应提交第三方数据库数据样本来源和本分析软件在产品技术要求、说明书中要求的流式细胞分析流程的一致性评价(包含样本要求、处理方式、流式细胞荧光抗体试剂的选择、流式细胞仪、荧光及电压补偿方式、应用的函数等),应提交符合要求的流式细胞仪数据。算法的确认:此类产品均需按照GCP的要求开展临床试验。临床试验的机构应具备该软件要求的流式细胞分析流程所需的人员、试剂及仪器设备,临床试验应以该软件和临床综合诊断的一致性进行比较,确保其产生的流式细胞仪数据与该软件说明书和技术要求的一致性。2.4.7算法可追溯性分析提供算法可追溯性分析报告,即追溯算法需求、算法设计、源代码(明确软件单元名称即可)、算法测试、算法风险管理的关系表。若无单独文档可提供软件可追溯性分析报告,需注明算法可追溯性分析所在位置。(三)产品说明书和标签样稿明确该产品适用范围,明确流式细胞学人工智能分析的全流程质控标准、适用的流式细胞分析设备、设备参数设置、适用的试剂及试剂盘设计、样本处理方法和本软件适用的标准化SOP等。明确软件报告内容。对产品带来的假阳/假阴性风险进行提示。根据算法性能综合评价结果,对产品的适用范围、使用场景、核心功能进行必要限制,并在说明书中明确产品使用限制和必要警示提示信息。明确数据采集设备和数据采集过程相关要求。若产品采用人工智能黑盒算法,根据算法影响因素分析报告,在说明书明确产品使用期限、使用限制和必要的警示提示信息。明确人工智能算法的算法性能评估总结(测试集基本信息、评估指标与结果)、临床评价总结(临床数据基本信息、评价指标与结果)、决策指标定义(或提供决策指标定义所依据的临床指南、专家共识等参考文献)等信息。若采用基于数据的人工智能算法,说明书还应补充算法训练总结信息(训练集基本信息、训练指标与结果)列明算法训练总结和算法性能评估总结以及临床评价总结。对于软件安全性级别为严重级别的产品,需提供用户培训材料。
  • 浙江省“尖兵”研发攻关计划项目“流式质谱细胞分析技术”启动会暨实施方案研讨会顺利召开!
    近日,浙江省重点研发计划—“尖兵”研发攻关计划项目“流式质谱细胞分析技术”启动会暨课题实施方案研讨会在谱育科技顺利召开,来自项目组的五个课题承担单位汇报人和专家组成员参加了会议。大会以线上、线下相结合的形式进行,邀请到的专家有浙江大学化学系潘远江教授、浙江大学公共医学院院长陈光弟教授、清华大学张新荣教授、浙江大学控制科学与工程学院周建光教授。项目组汇报谱育科技承担课题质谱流式细胞分析仪的研制工作,是整个项目的重头戏。谱育科技 副总经理刘立鹏,对大家的到来表示欢迎,同时也感谢大家对谱育科技的信任与支持。谱育科技 副总经理俞晓峰针对谱育科技承担的质谱流式细胞分析仪的研制任务,着重从研究内容与技术路线、研究目标等方面进行了汇报。浙江省疾病预防控制中心理化毒理所汤鋆副所长和谱育科技李锐经理对螯合金属聚合物标记试剂进行汇报。浙江大学附属第一医院特聘研究员盛剑鹏对国产质谱流式细胞分析仪在肿瘤患者免疫状态变化研究中的应用进行汇报。浙江大学附属邵逸夫医院高级工程师王燕忠对承担课题:国产质谱流式细胞分析仪在检测和评估人群免疫状态中的应用研究方案做汇报。西湖实验室副研究员/西湖欧米研发总监许路昂对国产质谱流式细胞分析仪在辅助白血病治疗的应用研究方案做汇报。专家组意见 专家组认真听取了项目组关于实施方案的汇报,建议针对知识产权情况,重点加强离子传输、探针设计开发等创新,聚焦亮点成果的产出,进一步细化实施方案,加强各课题间的联系。并进行充分讨论,一致认为:1该项目所提交的论证材料齐全,符合论证要求;2该项目目标明确,实施方案和技术路线可行,任务清晰合理,年度计划具体、可操作性强,符合项目任务书要求;3预期成果与考核指标基本明确,可考核性强;同意通过实施方案论证。研讨结束后,与会专家一行参观了谱育科技研发及实用实验室,对国产高端科学仪器实现进口替代充满信心,也非常期待质谱流式细胞分析仪的研制和推广。尖兵计划谱育科技牵头承担的“流式质谱细胞分析技术”项目属于浙江省科学技术厅择优委托的“尖兵计划”榜单项目。浙江省科技厅规定:择优委托原则上应由建有相关领域的重点实验室、工程技术研究中心、企业研究院等省级及以上创新平台申报,其依托单位应为在国内省内有明显优势,创新实力和协同攻关能力强,有基础、有条件在相关领域取得重大关键核心技术突破的优势单位。申报高新产业类择优委托项目的,其依托企业原则上应为高新技术企业,且上年研究开发费占营业收入比重一般应不低于3.0%。“流式质谱细胞分析技术”可以实现对单细胞进行多参数同时检测能力的扩展,在肿瘤免疫治疗、肿瘤微环境、免疫学、干细胞和药物药理等领域表现出强大的分析能力和广阔的应用前景。面向未来发展,谱育科技紧紧围绕“自主研发、持续创新、深度定制”的公司战略,加快攻克关键核心技术,强化科技自立自强,力争成为中国高端科学仪器产业链链主。通过政企用研学协同创新机制打造具备国际竞争力的产业链生态,助力浙江高水平创新型省份和科技强省建设,充分发挥科技创新在高质量发展建设共同富裕示范区中的支撑引领作用。
  • 细胞样本处理自动化、标准化成流式分析“刚需”——访陆军军医大学生物医学分析测试中心主任万瑛教授
    仪器信息网讯自20世纪70年代以来,随着流式细胞技术水平的不断提高,其应用范围也日益广泛。目前,流式细胞分析已普遍应用于免疫学、血液学、肿瘤学、细胞生物学、细胞遗传学、生物化学等临床医学和基础研究领域,在生物学和医学研究、药物开发、临床检测和环境监测中均发挥着重要作用。近年来,流式细胞仪的标准化也取得了一定的进展,包括检测技术标准化以及数据分析标准化等。近日,仪器信息网在ACCSI2021现场采访了陆军军医大学生物医学分析测试中心主任万瑛教授,请他分享流式细胞术多色化发展以及多色流式样本处理标准化的进展。流式细胞术多色发展成“刚需”流式细胞术多色化发展的原因,主要是来自细胞生物学家的需求。细胞生物学家们在更细致地描述细胞表型,区分稀有细胞群体,筛选新的未知表型,解构复杂的细胞系统,实现节约稀有样本,提升通量等方面都有需求。与此同时,细胞学研究深度和广度的提升对于流式细胞仪参数数量或检测数据维度提出更高的要求,那么基于流式细胞仪硬件多参数能力的提升和新型荧光标记技术的快速发展,自然而然地对多色流式参数提升有了更大的需求。万瑛教授表示,从20世纪70年代流式细胞技术问世之初只能做单色水平分析,到2020年可最多实现60色的水平,流式多色技术的发展取得了很大的进展。多色流式的进展也为数据分析带来了变革,随着数据参数的增多,也从传统的级联分析方法(先根据目标细胞类型选择参数,再进行分析)转变为降维分析方法(使用全部参数进行降维计算,将细胞群体所有异质性展现在二维平面上,再进行分析)。多色流式发展趋势一览实现流式样本制备标准化、高通量化意义重大关于流式细胞的样品制备,万瑛认为该过程中因为人为操作因素会可能导致数据差异化影响,因此他长期专注于实现流式样品标准化制备不受人为因素干扰的研究。随之而来的,也会对一些标准品进行深入研究。他认为这方面的研究会对流式样本全自动制备过程,以及流式的精准检测在临床上广泛推广有很重要的发展意义。据万瑛教授介绍,样本处理是多色流式标准化的关键环节。他的团队针对样本处理中离心洗涤的缺点,设计了一种全新的基于液流速度梯度的细胞洗涤技术。和同类技术相比,该技术具备洗涤效率高、细胞丢失少、状态影响小、重复性好的优势。结合自动化移液技术,可实现样本处理全过程的自动化、标准化和高通量化,为多色流式标准化提供了新的技术选择。
  • 百人集聚共话流式前沿技术与应用|细胞生物学前沿技术交流会(流式细胞分析分选技术专场)在上海顺利召开
    仪器信息网讯(报道编辑:刘立东)2023年4月13-14日,由中国科学院上海生命科学大型仪器区域中心主办,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心公共技术中心承办的“细胞生物学前沿技术交流会(流式细胞分析分选技术专场)”在上海顺利召开。会议通知发出后,得到了领域内众多专家学者的积极响应和热情支持,来自全国各科研院所、高校、政府实验室以及企事业单位的专业技术人员、研究人员﹑企业CEO、产品经理、博士后以及在读研究生等百余人相聚上海。仪器信息网受邀参加本次会议,并进行相应报道。会议为期两天,交流形式包括主旨报告与讨论交流,邀请了流式前沿领域的技术专家分享共计15个报告,旨在向与会人员详细介绍各类技术的原理、技术特点及应用场景,拓展科研人员在技术方向上的认知,促进前沿技术为更多从事科研、研发及检测人员所灵活、高效、高质运用。会议现场 致辞环节 会议特别邀请了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心副主任/中国科学院上海生命科学大型仪器区域中心管委会副主任/分子细胞卓越中心公共技术中心主任赵允研究员与上海市科学技术委员会研发基地建设与管理处副处长张露璐开场致辞,会议由中科院分子细胞卓越中心科技条件处处长/中科院上海生命区域中心管委会办公室主任/分子细胞卓越中心公共技术中心常务副主任张文娟主持。中国科学院分子细胞科学卓越创新中心副主任/中国科学院上海生命科学大型仪器区域中心管委会副主任/分子细胞卓越中心公共技术中心主任赵允研究员致辞会议伊始,赵允首先对来自全国各地的老师和同学表示热烈的欢迎和衷心的感谢。近年来随着生命科学研究与公共卫生健康领域应用的的不断发展,都对科学仪器创新技术的发展应用起到极大的推动作用,尤其是交叉学科不断融合,促进了包括流式细胞分析分选技术在内的细胞生物学研究手段的快速发展。所谓“工欲善其事,必先利其器”,如果没有新技术的普及、新技术的进步和相关新技术的深入研究,科研也无法推进。本次会议有幸邀请到了来自全国各地的专家相聚上海进行现场交流,希望借助本次细胞生物学前沿技术交流会,聚焦于流式细胞分析技术领域,使参会人员进一步了解该项技术的前沿动态与最新进展。最后,预祝本次会议取得圆满成功。上海市科学技术委员会研发基地建设与管理处副处长张露璐致辞近几年,上海持续进行具有全球影响力的科技创新中心建设工作,其中科学仪器技术创新也是科技创新的重要组成部分,不仅对于上海而言至关重要,对于长三角地区乃至全国而言都能起到很好的辐射支撑效应。张露璐对中科院分子细胞卓越中心在大型仪器共享以及国产仪器研发方面的工作表示充分肯定,中心不仅在上海甚至在全国范围也处于领先地位。一方面,上海市科委近几年对于科学仪器共享平台的建设发展,包括生化细胞领域的进展工作非常重视。流式细胞分析仪器技术在细胞生物学研究中的作用不可或缺,希望通过在本次大会,国内外流式仪器厂商与技术专家皆从各自的角度对流式细胞技术的发展和应用进行深入的探讨。另一方面,基于国家大力推进发展基础研究战略政策,以及国产仪器技术与进口技术仍存在一定差距,希望国产仪器厂商能够在各个方面迅速提高自身能力,加强上海相关的国产仪器替代工作。中科院分子细胞卓越中心科技条件处处长/中科院上海生命区域中心管委会办公室主任/分子细胞卓越中心公共技术中心常务副主任张文娟主持致辞环节 报告环节 报告分两日进行,报告嘉宾们就拉曼流式、全光谱流式、质谱流式、成像流式、纳米流式、无创在体流式等创新技术分别阐述介绍,并围绕流式细胞技术在生命科学基础研究、医学临床诊断等领域广泛的应用场景展开精彩分享。报告环节分别由张文娟、细胞分析技术平台主任边玮、副主任俞珺璟担任主持嘉宾。细胞分析技术平台主任边玮、细胞分析技术平台副主任俞珺璟报告嘉宾:马波 中国科学院青岛生物能源与过程研究所 研究员报告题目:《高通量流式拉曼细胞分选仪及应用》报告嘉宾:李备 中国科学院长春光学精密机械与物理研究所 研究员报告题目:《拉曼分选技术前沿——细胞表型探索新工具》报告嘉宾:魏勋斌 北京大学 教授报告题目:《循环细胞的活体无创光学动态监测》报告嘉宾:钱璟 碧迪医疗器械(上海)有限公司 高级产品应用经理报告题目:《“图鉴不同,像由心选” BD高速图像光谱流式分选技术》报告嘉宾:冯定龙 Cytek 华东区高级技术经理报告题目:《全光谱流式原理与分选技术的应用》报告嘉宾:杨凡 谱康医学 应用技术支持报告题目:《谱康光谱流式细胞仪技术及应用》报告嘉宾:李凌 赛默飞世尔科技 (中国) 有限公司 高级技术应用经理报告题目:《空气激发型光谱分选技术用于高活性细胞分选及单细胞分选应用》报告嘉宾:曾令武 索尼生命科学 高级市场经理报告题目:《全光谱流式前沿技术和应用》报告嘉宾:颜晓梅 厦门大学 特聘教授报告题目:《纳米尺度生物颗粒的精准表征利器—纳米流式检测技术》报告嘉宾:刘浥坤 上海宸安生物科技有限公司 高级应用科学家报告题目:《新一代单细胞靶向蛋白质组学平台——Starion 星瀚流式质谱系统》报告嘉宾:李辉 中科院苏州医工所 研究员报告题目:《基于流式光片的斑马鱼高通量三维成像技术研究》报告嘉宾:朱凯 PhenomeX 资深应用科学家报告题目:《“功能为王”-单细胞功能高通量深度表征平台开启单细胞多组学研究新篇章》报告嘉宾:张萍 德国美天旎 全国科研应用经理报告题目:《新概念柔性流式细胞分选技术及其应用》报告嘉宾:陈科立 Namocell 经理报告题目:《Namocell 微流控单细胞分选技术的原理和应用》报告嘉宾:李凌 赛默飞世尔科技 (中国) 有限公司 高级技术应用经理报告题目:《成像增强型流式细胞分析结合AI图像技术用于细胞表型和形态研究应用》 自由讨论环节 会议期间,各位报告嘉宾与参会人员在现场展开了热烈的讨论交流,与技术人员就仪器需求、应用解决方案等内容进行了沟通交流。现场交流参会嘉宾合影会议现场,国产流式仪器厂商星赛生物、长光辰英、谱康医学、上海宸安生物以及进口厂商碧迪医疗器械 (上海)、Cytek、赛默飞世尔科技 (中国)、PhenomeX、德国美天旎、索尼生命科学、Namocell等进行了展示宣传。本次大会加强了流式业内的深入交流,也为流式技术的进一步发展起到积极推进作用。(报道编辑:刘立东 KOL主页)现场仪器厂商掠影
  • 流式研发快讯|实时阻抗流式细胞分析仪研究取得进展
    实时阻抗流式细胞分析仪(piRT-IFC)研发进展单细胞电学特性生物传感与分析技术为单细胞生物物理学研究提供了新维度。该技术已被证明在全血分析、肿瘤细胞分型和免疫细胞状态评估方面具有重要的应用潜力。然而,现有的电学检测方法难以实现高通量实时性分析,限制了需要大量系统实验的单细胞电学特性研究的开展。 近日,中国科学院微电子研究所健康电子中心研究员黄成军、副研究员赵阳团队,在单细胞电学特性流式分析方法及高通量实时分析仪器研究方面取得重要进展。该团队提出了快速并行物理拟合求解器,仅需0.62 毫秒即可在线求解出单个细胞膜比电容和细胞质电导率。与传统求解器相比,在不损失准确度的前提下,速度提升了27000倍,且不需要任何数据预采集和预训练过程,进一步实现了基于物理模型信息的实时阻抗流式细胞分析仪(piRT-IFC)(图1)。该技术可在50分钟内实时表征高达100902个单细胞,具有高稳定性、高通量、实时化和全流程自动化等特点。作为示范应用,该团队对药物处理后HL-60中性粒细胞脱粒现象这一典型的快速变化的生物过程进行实时表征分析。与普遍采用的神经网络辅助加速方法对比研究表明,piRT-IFC具有速度快、准确度高和泛化能力强的优势,具备广泛的应用潜力。 相关研究成果以piRT-IFC: Physics-informed real-time impedance flow cytometry for the characterization of cellular intrinsic electrical properties为题,发表在《微系统与纳米工程》(Microsystem and Nanoengineering)上。该研究由微电子所和计算技术研究所合作完成。研究工作得到科学技术部、国家自然科学基金委员会、北京市和中国科学院的支持。近年来,该课题组面对单细胞物理特性检测存在敏感机理不明和技术实现困难等关键技术瓶颈,开创性提出了基于微流控技术的“交叉压缩通道”敏感新原理和单细胞电学模型,建立了基于微流控芯片的单细胞电学特性高通量定量检测方法,检测参数包括细胞膜比电容和胞浆电导率,通量比膜片钳等常规方法高10000倍,并进一步研发出实时高通量单细胞电学特性流式分析仪(图2)。仪器入选中国科学院自主研制科学仪器名录,与首都医科大学宣武医院、首都医科大学附属北京胸科医院、计算所等单位合作,成功用于脑卒中动物模型、癌症病人样本、药物模型等领域的多种细胞的分析,为肿瘤/脑卒中等精准诊断、药物筛选等提供了有力工具,并发现了新型标志物,验证了相关药物候选分子的作用、获得授权专利。论文链接 图1. 实时阻抗流式细胞分析仪(piRT-IFC)原理样机、核心微流控芯片、设备交互界面、典型结果和自动化实时数据处理流程 图2. 基于微流控芯片技术的单细胞电学特性活体单细胞分析仪(左)及核心微流控芯片(右)
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