当前位置: 仪器信息网 > 行业主题 > >

全自动蛋白质定量检测仪

仪器信息网全自动蛋白质定量检测仪专题为您提供2024年最新全自动蛋白质定量检测仪价格报价、厂家品牌的相关信息, 包括全自动蛋白质定量检测仪参数、型号等,不管是国产,还是进口品牌的全自动蛋白质定量检测仪您都可以在这里找到。 除此之外,仪器信息网还免费为您整合全自动蛋白质定量检测仪相关的耗材配件、试剂标物,还有全自动蛋白质定量检测仪相关的最新资讯、资料,以及全自动蛋白质定量检测仪相关的解决方案。

全自动蛋白质定量检测仪相关的资讯

  • 310万!全自动蛋白质表征分析系统等采购项目
    项目编号:OITC-G220290791项目名称:ZYCGR22011901仪器平台(第二批)科研设备采购项目预算金额:310.0000000 万元(人民币)最高限价(如有):280.0000000 万元(人民币)采购需求:包号货物名称数量是否允许采购进口产品预算金额(万元)最高限价(万元)1全自动蛋白质表征分析系统1套是1801652毛细管电泳仪1台是130115合同履行期限:详见项目需求。本项目( 不接受 )联合体投标。
  • 148万!Protein Simple中标上海交通大学全自动多功能蛋白质表达定量分析系统国际招标采购项目
    一、项目编号:0705-2340JDBXTXDK/04/学校编号:招设2023A00021(招标文件编号:0705-2340JDBXTXDK/04)二、项目名称:上海交通大学全自动多功能蛋白质表达定量分析系统国际招标三、中标(成交)信息供应商名称:香港福萊得科技有限公司供应商地址:香港干诺道中137-139号三台大厦12楼全层中标(成交)金额:148.8366000(万元)四、主要标的信息序号 供应商名称 货物名称 货物品牌 货物型号 货物数量 货物单价(元) 1 香港福萊得科技有限公司 全自动多功能蛋白质表达定量分析系统 ProteinSimple Jess 1 USD 220000
  • 云唐仪器|食品蛋白质检测仪可快速准确检测奶粉中蛋白质含量
    【山东云唐*新品推荐YT-Z12T】云唐仪器|食品蛋白质检测仪可快速准确检测奶粉中蛋白质含量→点击此处进入客服在线咨询优惠专区。山东云唐专业厂家自主研发生产农药残留检测、食品安全检测、植物生理等仪器仪表,品质保障,价格实惠,售后无忧,欢迎新老客户来电咨询!山东云唐智能让诚信为高质量发展护航,我们将努力提供更卓越的产品质量和更人性化的售后服务给广大客户,为社会创造更大的价值。云唐仪器|食品蛋白质检测仪可快速准确检测奶粉中蛋白质含量  随着科技的不断发展,食品蛋白质检测仪在食品安全检测领域发挥着越来越重要的作用。其中,对于奶粉中蛋白质含量的快速准确检测,食品蛋白质检测仪更是扮演着至关重要的角色。本文将详细介绍食品蛋白质检测仪的工作原理、优势及其在奶粉蛋白质含量检测中的应用。  食品蛋白质检测仪在奶粉蛋白质含量检测中具有显著的优势。首先,它大大提高了检测效率。相较于传统的检测方法,如Kjeldahl法、Lowry法等,食品蛋白质检测仪能够在短时间内完成大量样品的检测,从而满足现代化生产线上对奶粉质量监控的需求。其次,仪器具有高度的准确性。通过精确的光电测量和荧光检测技术,食品蛋白质检测仪能够确保测量结果的准确性,避免因人为因素或操作不当导致的误差。此外,食品蛋白质检测仪还具有操作简便、自动化程度高等特点,使得检测过程更加便捷高效。  在奶粉蛋白质含量检测中,食品蛋白质检测仪的应用具有重要意义。奶粉作为婴儿成长发育的重要营养来源,其蛋白质含量直接影响到婴儿的健康状况。因此,对奶粉中蛋白质含量的准确检测显得尤为重要。食品蛋白质检测仪能够快速、准确地检测出奶粉中的蛋白质含量,为奶粉生产厂家提供及时、可靠的质量监控手段。同时,对于消费者而言,了解奶粉中蛋白质的含量有助于他们选择合适的奶粉产品,为婴儿的健康成长提供保障。  此外,食品蛋白质检测仪还可以用于奶粉生产过程中的质量控制。在奶粉生产过程中,通过定期对原料、半成品和成品的蛋白质含量进行检测,可以及时发现生产过程中的问题,采取有效措施进行调整和改进,确保奶粉产品质量的稳定性和可靠性。同时,食品蛋白质检测仪还可以用于奶粉产品的批次管理和追溯,确保产品的质量和安全可追溯。  总之,食品蛋白质检测仪在奶粉蛋白质含量检测中发挥着重要作用。它不仅能够提高检测效率和准确性,为奶粉生产厂家提供及时、可靠的质量监控手段,还能为消费者选择合适的奶粉产品提供有力支持。随着科技的不断进步和食品安全意识的提高,食品蛋白质检测仪将在食品安全检测领域发挥更加重要的作用,为保障人们的饮食安全贡献力量。
  • 沃特世推出新型质谱采集模式,推动蛋白质组学和脂类组学研究发展
    沃特世质谱技术研究人员Bob Bateman和John Hoyes荣获HUPO科学技术奖 沃特世公司(纽约证券交易所代码:WAT)近日于国际人类蛋白质组研究组织(HUPO)第15届国际大会上推出全新的数据采集模式SONAR™ ,该模式专为Xevo G2-XS四极杆飞行时间(QTof)质谱仪(MS)而开发,提供全新的非数据依赖型采集(DIA)方案获取MS/MS数据。这项技术能够帮助分析科学家们提升实验室工作效率,同时让他们对生成的结果更有信心。借助SONAR数据采集模式,科学家们只需执行一次进样即可完成复杂样品中脂质、代谢物和蛋白质的定量和鉴定,免去了采用MS/MS方法分析时通常需要额外进行方法开发的麻烦。 沃特世在HUPO国际大会期间隆重介绍了这一新型MS采集模式。会议同时表彰了沃特世公司的高级质谱技术专家Bob Bateman和John Hoyes为推动质谱技术发展所作的杰出贡献。在现代蛋白质组学实验中,基于DIA的质谱技术是分析人员获取包含大量数据的样品谱图时常用的一项技术。随着蛋白质组学和脂类组学研究的不断发展,科学家们越来越追求针对性更强的实验,来定量分析特定的肽和蛋白质,这就需要进行额外的方法开发和重复分析。面对越来越复杂的样品,沃特世新推出的SONAR数据采集模式能够提供更丰富的信息,同时提升数据的清晰度。 沃特世公司的组学业务开发高级经理David Heywood表示:“如今的蛋白质组学研究已十分成熟,科学家们已经能够收集到蛋白质的大部分相关信息。现在,他们希望实现的目标是先针对某种蛋白质或特定的肽提出假设,然后采用靶向MS/MS定量方法就这种假设观点展开研究,而无需额外开发新的方法或实验。现在,借助SONAR数据采集模式,科学家们可以完成一站式分析并具有更高的选择性。这种模式可兼容高速UPLC分离,工作流程更加高效,通过一次进样即可完成更准确的定性和定量分析。” 沃特世科学家荣获HUPO国际大会表彰此次HUPO国际大会还向沃特世公司的技术研究顾问Bob Bateman和质谱技术总监兼首席科学家John Hoyes颁发了HUPO科学技术奖,以表彰他们为推动蛋白质组学研究技术发展与开发QTof质谱仪所作出的杰出贡献。 HUPO执行委员会在颁奖辞中表示:“QTof串联质谱仪在其问世初期对蛋白质组学的发展产生了巨大影响,这类质谱仪与纳升级液相色谱(LC)联用后,能够在蛋白质组分析中表现出无与伦比的性能。”Waters(Micromass)Q-Tof™ 质谱仪自1996年进入市场以来不断进行技术创新,继上一次集成离子淌度分离技术之后,此次又增添了全新的SONAR MS数据采集模式。 SONAR为MS数据采集模式带来有效的性能提升SONAR在选择性方面实现的提升主要得益于质谱仪四极杆的运行方式。在SONAR模式下,四极杆并不会始终保持打开状态传输所有离子,而是扫描指定的质量范围,每次扫描可捕获200张谱图。这种四极杆运行方式让SONAR能够兼容快速的超高效液相色谱(UltraPerformance Liquid Chromatography,UPLC)分离,从而提高实验室分析通量。过去可能会发生色谱共洗脱的化合物现在可以通过四极杆实现分离并单独记录下来,数据库的搜索效率将随之得到提高。SONAR通过一次进样即可同时采集定量和定性数据。 HUPO国际大会于9月18日至22日在台北国际会议中心召开,期间将举办多场以SONAR技术为主题的研讨会。 SONAR数据可整合至Waters Progenesis和Symphony™ 软件分析工作流程,还可兼容Skyline等第三方软件包。由MassLynx软件控制的Waters Xevo G2-XS QTof质谱仪现已整合SONAR模式。 关于沃特世公司(www.waters.com)沃特世公司(纽约证券交易所代码:WAT)专注于为实验室相关机构开发和生产先进的分析和材料科学技术。50多年来,公司开发出一系列分离科学、实验室信息管理、质谱分析和热分析技术。
  • ProteinSimple蛋白质研究的创新技术用户会成功举办
    2013年4月27日,蛋白质研究的创新技术用户交流会在太原举行,作为蛋白质创新技术的领导者,美国ProteinSimple公司在Western Blot领域拥有众多的仪器用户,因此本次活动受到了用户的大力支持和热情参与,来自农科院、疾控、医院、检验检疫、高校、研究所等共有50余人参加了本次会议。  Western blot堪称蛋白质研究中的经典方法,30年来其操作步骤几乎没变过,依然是跑胶-转膜-封闭-孵育-检测。近两年,各大公司陆续推出了Western blot方面的新仪器,如新型转印系统,确实能省时省力不少,但仍然不能完全克服研究人员在今天面临的挑战。Western blot仍存在重复性差、实验耗时长、无法准确定量等问题。而在这方面,美国proteinsimple公司一直是行业的技术领导者。本次会议围绕着这些问题对化学发光凝胶成像、多色荧光成像、全自动Western blot仪器、纳米级超灵敏蛋白检测系统等方面展开详细介绍。   原Alpha Innotech公司创立于1992年,总部位于美国加州,2005年上市,在数字化凝胶成像领域有20多年的成功历史,用户超过20000个,引用的文献近10000篇,在中国拥有大量忠实用户。Alpha在凝胶成像领域处于领先地位,是高端多色荧光和化学发光技术的全球领导者,2003年率先开发出世界上最高分辨率的真正16bit超级化学发光、荧光、可见光成像系统。2009年被美国ProteinSimple公司收购。  ProteinSimple公司最近推出了一种Simple Western全自动蛋白质分析系统,彻底改变了整个Western blot。此分析在一台名为Simon的仪器上开展,Simon将所有实验步骤自动化,无需制胶跑胶,无需转膜,自动一抗二抗孵育,自动检测,3个多小时自动获得结果。让研究人员从繁重的劳动中解放出来,同时避免了可能影响实验重复性的人为因素。  NanoPro 1000超微量蛋白分析系统为蛋白功能和信号通路研究提供了一个全新的研究方案。传统的蛋白研究方法需要成千上万的细胞,而NanoPro 1000系统每次分析仅需要25个细胞。  并可对超微量珍贵样品的信号转导蛋白之特性直接检测,适用各种样品。  关于美国ProteinSimple公司  简称PS公司,总部位于美国硅谷,是世界一流的生命科学仪器制造商,专注于蛋白质研究分析领域,在美国加州、加拿大多伦多、加拿大渥太华等地设有生产和研发部门,同时在全球多地设有办事处。PS公司重视中国市场的发展,在北京、上海广州和武汉设有办事处和技术服务中心,为用户提供完善的技术支持和售后服务。
  • 聚焦自动化蛋白质组学智慧实验室建设,睿科集团与青莲百奥达成战略合作
    从相加到相乘,合力推动蛋白质组学的医学转化和药物研发2023年2月7日,睿科集团(厦门)股份有限公司与北京青莲百奥生物科技有限公司(下称:“青莲百奥”)战略合作签约仪式在厦举行,双方将共同建设自动化蛋白质组学智慧实验室,为构建诊、疗蛋白质生物标志物在临床端和药企端落地转化,提供自动化完整的解决方案。未来双方将以药物研发及医学转化为主要方向,以蛋白质组学样本前处理自动化设备、智慧实验室的建设为核心,打造新一代蛋白质组学产业链,有效推动蛋白质组学在临床医学的转化。青莲百奥CEO李京丽(左)与睿科集团董事长林志杰签署合作协议并合影留念本次战略合作青莲百奥将以最新的研发成果低丰度富集磁珠解决方案和蛋白质组学全流程全智能样本处理智能机器人、一键式大数据处理的核心算法融合打造的新一代蛋白质组学平台为依托,针对智能实验设备及智慧实验室等可持续发展合作项目作报告演讲,开展技术交流,共同探讨相关领域的应用开发。低丰度磁珠富集解决方案血液低丰度富集磁珠试剂盒蛋白质组学全流程全自动样本智能处理机器人BioLadder生物信息可视化云平台大数据处理核心算法青莲百奥CEO李京丽表示:“在当前的生物医学研究和临床诊断中,蛋白组拥有基因所无法比拟的许多优势并迎来了快速发展期。同时,蛋白组复杂程度高,面临着低丰度的蛋白检出率低、自动化程度低等挑战。青莲百奥与睿科集团在系统开发、硬件设计制造、解决方案等方面优势互补,联手打造蛋白质组学完整解决方案,为临床精准诊疗提供技术支撑。”青莲百奥CEO李京丽致辞睿科集团董事长林志杰表示:“一个人可以跑得很快,但是一群人才能跑得更远,睿科集团于去年并购新拓仪器、与安捷伦签署战略合作,聚势谋远,共绘智慧实验室新蓝图。同样,睿科和青莲百奥怀着相同的初心,我们相信所有的出发点都应基于用户需求,我们携手加速新技术、新产品、新方案开发与应用,以科技驱动精准诊疗!”睿科集团董事长林志杰致辞会议双方进行技术探讨参观睿科智慧展厅及睿科集团下辖的第三方检测服务公司——厦门鉴科检测技术有限公司与会嘉宾合影(从左往右依次为:睿科生化销售经理马军胜、青莲百奥COO孙龙钦、青莲百奥CEO李京丽、睿科董事长林志杰、睿科生化销售总监汪纪波、睿科生化销售经理廖文甲)如果说相加是一种力量的积蓄,那么相乘便是一种共生共长、共荣共进的合力。未来,睿科集团与青莲百奥将持续发挥各自优势,相加相乘、协同精进,为检验检测实验室的现代化建设创造更多可能!关于睿科集团睿科集团是一家专注于检验检测行业效能提升的自动化、智能化实验室整体解决方案供应商。公司核心业务覆盖环境检测、食品安全、药品分析、生命科学、医疗健康五个领域,致力于为客户提供优秀的产品和一站式解决方案服务。关于青莲百奥青莲百奥是一家基于蛋白质组学研究的创新性、平台型CRO企业,致力于临床样本的蛋白质标志物发现和检测,聚焦于低丰度、超微量的血液、外泌体、显微切割等样品类型。全力打造新一代蛋白质组学平台,以临床问题为导向、以源头创新为核心驱动力,为诊、疗蛋白质生物标志物在临床端和药企端落地转化,提供完整的解决方案。
  • 恒美-食品中蛋白质检测仪减少人工操作-新品
    点击了解更多产品详情→食品中蛋白质检测仪 食品中蛋白质检测仪是一种高效、精确、可靠的检测设备,对奶粉的检测有着重要的帮助。首先,蛋白质检测仪可以准确地测定奶粉中的蛋白质含量,确保奶粉的营养成分符合标准。其次,蛋白质检测仪可以检测奶粉中是否含有过量的添加剂或有害成分,如三聚氰胺等,从而确保奶粉的安全性。 此外,食品中蛋白质检测仪还可以检测奶粉的质量和纯度,确保奶粉的品质符合市场需求和消费者期望。因此,蛋白质检测仪在奶粉生产和质量控制中起着重要的作用,有助于提高奶粉的质量和安全性,保障消费者的健康和权益。 另外,食品中蛋白质检测仪还具有高效、自动化的特点,可以大幅度提高奶粉生产企业的生产效率和生产能力。通过蛋白质检测仪检测奶粉的过程,可以减少人工操作,降低人为误差的发生,提高检测的精度和准确性。此外,蛋白质检测仪还具有数据处理和分析功能,可以对检测结果进行统计和分析,为奶粉生产企业提供更全面、更准确的质量控制数据和方案。因此,蛋白质检测仪在奶粉生产和质量控制中的应用前景广阔,有望成为奶粉生产企业的必备设备和核心技术。
  • 多肽药物质控丨当混合多肽遇见蛋白质测序仪
    在多肽类药物的生产质控中,氨基酸序列的测定是必不可少的检测项目。对于常规组成单一的合成多肽药物来说,氨基酸序列的分析较为简单,可通过Edman降解法或质谱法进行测定,其中Edman降解法被认为更加直接可靠。但对于组成复杂的混合多肽药物来说,比如,醋酸格拉替雷(Glatiramer acetate,简写为GA),由于多肽组成形式复杂多变,可能具有超过一万亿个不同序列的独特多肽,如果对每种多肽成分的氨基酸序列进行精确测定,似乎既不可能,其实也无必要,我们需要考虑新的方法对混合多肽进行整体表征。 n 快速了解醋酸格拉替雷醋酸格拉替雷是一种人工合成的多肽类制剂,由Glu(谷氨酸)、Ala(丙氨酸)、Tyr(酪氨酸)和Lys(赖氨酸)四种氨基酸随机聚合而成,原研药由以色列药厂TEVA研发制造(商品名Copaxone),于1996年获美国FDA核准用于治疗多发性硬化症(MS),其2020年全球销售额达到13.37亿美元,2021年7月,TEVA的“醋酸格拉替雷注射液”在中国的上市申请获得受理。多发性硬化症是一种常见的以中枢神经系统炎性脱髓鞘为主要特征的自身免疫性疾病,临床表现包括视物模糊,感觉、运动异常,智能、情感等高级功能障碍,在中青年人群中多发,且有较高致残率。醋酸格拉替雷被认为是通过改变造成MS发病机制的免疫过程而起作用的,其疗效与耐受性在临床上获得了十足的肯定。 醋酸格拉替雷是一种由Tyr、Lys、Glu、Ala随机聚合而成的多肽混合物(CAS号:147245-92-9) 醋酸格拉替雷的第一个仿制药Glatopa (由Sandoz 公司和 Momenta公司共同开发)于2015年上市,由于原研药的专利到期,未来将有更多的仿制药上市。 n 醋酸格拉替雷的合成与质量评估在醋酸格拉替雷的生产过程中,通过聚合及解聚反应,可以将其分子量控制在一个较窄的范围(平均分子量4700~11000 Da)。生产工艺的改变以及所用试剂的变化都有可能使药物的组分比例发生变化。利用Edman降解法,通过监测N端每一个循环的4种氨基酸的组成比例以及变化趋势,可以对药品质量进行评估。 岛津解决方案 l 蛋白质测序仪对醋酸格拉替雷进行质量评价的原理Edman降解法是进行N端氨基酸序列分析的经典方法,岛津以其为原理设计的全自动蛋白质测序仪(以下简称PPSQ),由液相系统和可执行自动化Edman降解反应的主机组成,将氨基酸从多肽链的N端依次切割下来,通过色谱的保留时间判定氨基酸种类,结果直接可靠。PPSQ除了对N端氨基酸序列进行定性分析外,利用液相色谱稳定的定量能力,还可以对多肽特定循环氨基酸的摩尔生成量及组成比例进行定量分析。 岛津在售蛋白质测序仪PPSQ-51/53A Edman降解反应图解 l 样品前处理取适量稀释后的样品加入经聚凝胺处理的玻璃纤维膜上,干燥后安装到PPSQ反应器上进行分析。实验仅作示例,共测试了3个批次的原研药Copaxone以及4个批次的某在研仿制药,每个批次测试N端前6个循环。 反应器构造图 l 实验结果 1)N端氨基酸组成定性分析醋酸格拉替雷原研药每个循环均检测到Glu、Ala、Tyr、Lys等4种氨基酸,这与药品由Glu、Ala、Tyr、Lys等4种氨基酸随机聚合而来,结果一致。 醋酸格拉替雷原研药Copaxone与某在研仿制药N端氨基酸分析色谱图示例(1-6循环)(黑色:原研药Copaxone;红色:某在研仿制药;DTT、DMPTU、DPTU为试剂峰) 2)各循环中每种氨基酸的相对摩尔含量的分析根据仪器自动生成的氨基酸生成量,计算每种氨基酸的摩尔含量,例如,Glu的相对摩尔含量为: 根据氨基酸的相对摩尔含量,绘制各循环中各氨基酸生成量的趋势图,如下。 醋酸格拉替雷Copaxone 与某在研仿制药N端前6个循环相对氨基酸水平分析(纵坐标:相对摩尔含量;横坐标:循环数) 3)原研药与某在研仿制药的比较从趋势图来看,仿制药各循环氨基酸生成量趋势,与原研药整体相似,但GA仿制药-批次1的Glu的相对含量略低,GA仿制药-批次4的各循环Tyr的相对含量略高,批次1中Glu的偏低与批次4中Tyr的偏高是否正常,需要对原研药进行多批次实验,以判断是否超出正常范围。GA仿制药-批次2及GA仿制药-批次3的Tyr生成量趋势与其他样品有明显不同,提示仿制药生产工艺可能存在与原研不同的地方。 结 语通过醋酸格拉替雷N端各氨基酸生成量的趋势变化的分析比较,可为仿制药的开发及生产质控提供参考,醋酸格拉替雷N端相对氨基酸水平分析亦可作为醋酸格拉替雷仿制药与原研药一致性评价的依据。这也为我们今后分析类似混合蛋白或多肽药物提供了参考思路。 参考文献:J. Andersona, C. Bell, et al., Demonstration of equivalence of a generic glatiramer acetate (Glatopa™ ), Journal of the Neurological Sciences 359 (2015) 24–34 撰稿人:顿俊玲 *本文内容非商业广告,仅供专业人士参考。
  • 重磅!史上首次定量检测完整的人类蛋白质组
    重磅!史上首次定量检测完整的人类蛋白质组在一项新的研究中,来自瑞士苏黎世联邦理工学院(ETH Zurich)和美国系统生物学研究所等机构的研究人员开发出人类SRMAtlas(Human SRMAtlas),即靶向识别和可重复地定量预测的人类蛋白质组中所有蛋白质的高度特异性质谱检测方法汇编目录,包括许多剪接变异体、非同义突变和翻译后修饰。利用一种被称作选择性反应监控(selected reaction monitoring, SRM)的技术,研究人员利用166174种已被充分了解的化学合成蛋白特征性肽(proteotypic peptide)开发出这些检测方法。相关研究结果发表在2016年7月28日那期Cell期刊上,论文标题为“Human SRMAtlas: A Resource of Targeted Assays to Quantify the Complete Human Proteome”。论文第一作者为来自美国系统生物学研究所的Ulrike Kusebauch博士。论文通信作者为来自美国系统生物学研究所的Robert Moritz教授和来自瑞士苏黎世联邦理工学院的Ruedi Aebersold。SRMAtlas资源在http://www.srmatlas.org网站上可以免费获取,将有助于公平地开展重点的、假设驱动的和大型蛋白质组规模的研究。研究人员期待这一资源将极大地加快基于蛋白质的实验室生物学发展从而有助理解疾病转化和健康轨迹,这是因为如今在理论上能够鉴定和定量检测出任何样品中的任何人类蛋白。能够可靠地和可重复性地检测任何组织或细胞类型的人类蛋白质组中的任何一种蛋白在理解系统层次的性质以及正常生理下和患病时的特异性途径方面引发变革。在Moritz教授实验室中,研究团队能够利用SRM方法产生并验证了一种由高度特异性地靶向蛋白质组检测方法组成的汇编目录,而且通过这种广泛获取的、灵敏的和强健的靶向质谱方法SRM,能够定量检测20,277种已被标注的人类蛋白中的99.7%。这种人类SRMAtlas提供明确的检测坐标来确定性地鉴别生物样品中蛋白质特征性的肽。尽管2003年,人们成功地了完成人类基因组计划(Human Genome Project),构建出所有人类基因的目录,但是大多数蛋白质研究仍然聚焦在在绘制出人类基因组图谱之前科学家们研究的蛋白中相对较小的一部分蛋白上。若要超越这种停滞不前的蛋白质-基因组学研究方法,就应需要为几乎每种人类蛋白开发高度特异性的检测方法。利用人类SRMAtlas等资源,测量任何一种人类蛋白质的前景如今变成现实。如今,人类SRMAtlas提供已经过验证的质谱检测方法,这些检测方法是基于一种统一的一致的检测人类蛋白质组中几乎每种蛋白的过程开发出的SRM技术而开发的。这些检测方法可快速地用于系统生物学和生物医学研究中以便高度灵敏地和高度选择性地鉴定和定量检测任何一种人类蛋白,以及指导完整的蛋白质图谱绘制来了解它们的生物学功能。个人化医学奖依赖于分子特征来监控人们的健康状态,提供信号来鉴定健康轨迹发生的变化,以及首先在临床试验随后在临床实践中提供信息来让合适的患者匹配正确的药物。这种人类SRMAtlas计划稳步地将蛋白组学推到前沿,并且为蛋白质组学在癌症登月计划(Cancer Moonshot)中发挥较大的作用添砖加瓦。
  • “鸟枪法(shotgun)”定量蛋白质组学技术介绍
    p  简介:/pp  1999年,Yates研究组提出“鸟枪法”(shotgun),其基本技术路线是针对液体或SDS-PAGE条带的复杂混合物用酶(Trypsin)酶解成肽段混合物,然后对肽混合物进行多维毛细管液相色谱分离和串联质谱分析以及数据库检索,从而确定蛋白质的种类,可同时鉴定成百上千种蛋白质。他们把这种思路称为多维蛋白质鉴定技术,即Mud PIT(multidi-mensional protein identification technology)。与传统的双向电泳技术相比具有灵敏度更高,动态检测范围更广等特点。/pp  鸟枪法(shotgun)可以分析全细胞裂解样品和组织抽提物,也可以分析亚细胞分级组分、分离的细胞器等其他亚蛋白质组。如果样品已经过稳定同位素标记。根据不同标记的信号强度比例就可以精确确定化学上具有均一性的蛋白在不同样品中的相对丰度,这种多重分析可以利用在谱图上产生前后次序的质量标记得以完成。质谱分析以前在样品中加入同位素标记的某种质量校准肽,通过对此肽的相对定量就可以获得绝对定量的信息。实现目的肽段的绝对定量,而这一性质可以被充分应用以提供临床诊断的标准值或阈值。/pp  差异蛋白质的定量研究是基于肽段水平而非完整的蛋白质,成为该技术最大的技术特色,该技术实现了样品分离与鉴定直接联合,完全自动化操作,可以用于各种蛋白质混合物的蛋白质组学分析,如血清、组织、各种体液以及尿液等。/pp  技术路线:/pp  鸟枪法为基因组测序,是先将基因组打断,分段测序, 然后利用计算机重组在一起。从而确定一段的基因序列。/pp  鸟枪法在蛋白质组研究中的应用方式与此相类似,首先将蛋白质混合物酶解成肽段的混合物, 利用质谱进行分析确定该肽段的氨基酸序列,然后计算机根据设定好的运算法则根据肽段的信息在理论蛋白质数据库中检索出这些蛋白质,从而确定该混合物中的蛋白质成分。/pp style="text-align: center "img title="1.gif" style="float: none " src="http://img1.17img.cn/17img/images/201709/insimg/130ae366-baaa-4006-9cf4-2c70b8441925.jpg"//pp style="text-align: center "img title="2.gif" style="float: none " src="http://img1.17img.cn/17img/images/201709/insimg/fe437d70-d969-4f29-a6c9-4e8e1d3e7b65.jpg"//pp  分析目标:/pp  寻找差异表达蛋白,并分析蛋白功能。/pp  Gene ontology分析/pp  GO数据库包含了基因参与的生物过程,所处的细胞位置,发挥的分子功能三方面功能信息,并将概念粗细不同的功能概念组织成DAG(有向无环图)的结构。Gene Ontology是一个使用有控制的词汇表和严格定义的概念关系,以有向无环图的形式统一表示各物种的基因功能分类体系,从而较全面地概括了基因的功能信息,纠正了传统功能分类体系中常见的维度混淆问题。在基因表达谱分析中,GO常用于提供基因功能分类标签和基因功能研究的背景知识。利用GO的知识体系和结构特点,旨在发掘与基因差异表达现象关联的单个特征基因功能类或多个特征功能类的组合。/pp  对于每一种表达趋势的基因,选择性的进gene ontology功能分析。对差异表达的所有基因向gene ontology数据库的各节点映射。计算每个节点的基因数目,并结合整个数据库的基因作为背景分部,对于每个节点,得到一个2x2的表格,使用超几何分布检验基因在每个GO节点的富集或贫乏程度。/pp  Pathway enrichment分析/pp  找出差异表达基因在生物学通路中的位置,以阐明其生物学功能以及不同基因之间的相互作用。/pp  1)把差异表达基因定位在生物学通路(Pathway)上。/pp  2)统计分析,确定差异基因可否可以代表某些生物学通路/pp  优点:信息量大,样本量低,检测低丰度蛋白更多,相对定量/pp  应用领域:/pp  1)差异蛋白组分析(疾病早期诊断、疗效监测)/pp  2)细胞差异性分析(如正义转染vs空载、目标基因RNAi vs空载)/pp  3)疾病标志检测(肿瘤标志物,如无血清培养后的分泌蛋白质组)/pp  4)治疗检测(术前vs术后)/pp  5)药物开发(给药vs对照)/pp  6)癌症研究(原位肿瘤细胞系vs转移)/pp  Shotgun法可以检测动态范围10000:1内的低丰度肽段,是目前蛋白质组学研究最主要的技术路线。 现已成功应用于中大规模蛋白质的分离鉴定,不再依赖于双向凝胶电泳。/pp  因大部分蛋白质在酶解后总有部分肽段是可用质谱鉴定的,因此,多维蛋白质鉴定技术弥补了碱性、疏水蛋白质、相对分子量极大和极小蛋白质在分离和鉴定方法上的不足。/pp  该方法可达到对低丰度蛋白、极端等电点、分子量、完整膜蛋白具有与其他蛋白有相同的灵敏度。 如鸟枪法可鉴定出10个跨膜域以上的膜蛋白,而2DE仅能检测出2~4个跨膜域的。/pp  Shotgun法可实现自动化、快速、高通量的蛋白组学分析。/pp  但Shotgun法数据冗余复杂,需要专业人员进行分析。/pp  在医学领域,Shotgun技术可用于以下方面:/pp  除血清血浆外,还可用于研究体液及组织的蛋白组/pp  分泌蛋白组/pp  大脑皮层神经元细胞蛋白组/pp  新生物标记物的发现/pp  疫苗研究,分析感染源的表面蛋白质,从而发现潜在的抗原。如,在分析人类疟疾致病源plasmodium falciparum时,发现了大量潜在的抗原, 目前这些抗原的特性巳经被评估出来。/pp  发现新的药靶。如,研究发现甲硫氨酸氨基肤酶是肿瘤生长抑制因子bengmide的分子作用靶点。/pp  部分参考文献:/pp  1)A proteomics approach to discovering natural products and their biosynthetic pathways, Stefanie B Bumpus, Bradley S Evans, Paul M Thomas, Ioanna Ntai1, Neil L Kelleher, Nature Biotechnology,27,951-956,2009/pp  2)High-throughput generation of selected reaction-monitoring assays for proteins and proteomes, Paola Picotti, Oliver Rinner, Robert Stallmach, Franziska Dautel, Terry Farrah, Bruno Domon, Holger Wenschuh, Ruedi Aebersold, Nature Methods 7, 43-46 (6 December 2009)/pp  3)Large-scale analysis of the yeast proteome by means of multidimensional protein identification technology, M.P. Washburn, D. Wolters and J. R. YatesNature Biotechnology, 19, 242-247, 2001/pp  4)Comparison of alternativeanalyticaltechniques for the characterisationof thehuman serumproteomein HUPO Plasma ProteomeProject, XiaohaiLi, Xiaohong Qian etc. Proteomics, 5, 3423–3441,2005/pp  5)An Automated Multidimensional Protein Identification Technology for Shotgun Proteomics, Dirk A. Wolters, Michael P. Washburn, and John R. Yates, Anal. Chem., 73 (23), 5683-5690, 2001/pp /p
  • 见微知著|睿科液体处理工作站助力蛋白质组学前处理自动化
    随着高通量、高灵敏度、高分辨率生物质谱技术的出现,蛋白质组学技术取得飞速发展,蛋白质组学(Proteomics)是蛋白质(protein)与 基因组学(genomics)两个词的组合体,表示“一种基因组所表达的全套蛋白质”,即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。蛋白质组学研究,就是要把一个基因组表达的绝大多数蛋白质或一个复杂的混合体系中绝大多数蛋白质进行精确的定量和鉴定。蛋白质组本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征,包括蛋白质的表达水平,翻译后的修饰,蛋白与蛋白相互作用等,由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生,细胞代谢等过程的整体而全面的认识。蛋白质组学研究主要包括蛋白质分离、鉴定与生物信息学分析,其中样品中蛋白质的分离至关重要,会直接影响后续的分析结果。对比传统的柱层析分离方式,磁珠法提取蛋白质能轻松实现高通量和多样品平行处理。磁珠法提取蛋白质与提取核酸原理类似,都需经过“结合-洗涤-洗脱”等过程,蛋白纯化后,还需经过裂解、二硫键还原、酶解等多步预处理才能将蛋白样品裂解为可检测的肽段,这些过程同样涉及多次移液、加热、震荡等步骤。Vitae 100全自动液体处理工作站● 睿科Vitae 100全自动液体处理工作站整合移液、磁吸、震荡、加热功能于一体,可全自动完成磁珠法蛋白纯化,可替代蛋白酶解实验过程中大部分手工操作,实现高通量、高效率、高一致性的蛋白纯化。Vitae 100配置了可选4或8通道的空气注射泵移液器,机械定位准确至0.05mm,高通量提取时准确性、均一性均优于手工操作。另外Vitae 100创新性的整合了“磁吸-加热-震荡”三合一模块,节省盘面空间,减少移液步骤,利用自动化操作来减少人为实验操作带来的误差,提升实验结果的稳定性,减少污染的可能性,同时利用自动化精准的时间控制和操作,来优化实验流程,提高实验室运行效率。▲蛋白质组学自动化前处理解决方案睿科生化科技公司睿科生化科技公司是睿科集团旗下专注研发生产生命科学领域样品前处理设备的高科技企业。公司提供自动化的生物样品前处理设备,服务于生物/药物分析、分子诊断、临床检测、蛋白组学、代谢组学等领域。公司核心团队拥有10多年丰富的行业经验,掌握自主核心技术,系统化架构和集成式开发,可提供灵活的定制化服务,为客户提供个性化的产品和服务。
  • 吉大· 小天鹅“蛋白质快速检测仪”产品入围国家质检总局专用仪器设备采购项目
    吉大&bull 小天鹅&ldquo 蛋白质快速检测仪&rdquo 产品入围国家质检总局专用仪器设备采购项目 2010年6月1日, 中机国际招标公司发布公告,我公司&ldquo GDYN-200S 蛋白质快速检测仪产品&rdquo 成功入围 &ldquo 国家质 检总局2010年专用仪器设备采购项目&rdquo 进入终评。该仪器适于牛奶(包括纯奶、核桃、燕麦、 红枣牛奶、牛初乳等)、奶粉、豆浆粉和鸡蛋等样品中蛋白质的快速定量测定。公司以&ldquo 速测 万物利害 志保天人安康&rdquo 为企业使命,根据国家标准及市场需求,以吉林大学为技术依托, 自主创新了系列现场专用仪器和快速检测方法,为食品安全监管、卫生疾控检验、水质现场 分析、室内空气测定等部门和领域提供了有效的技术装备,为保障我国食品安全、水资源保 护以及室内空气治理等作出了积极贡献。 吉大· 小天鹅入围产品 包号 包号/品目 币种 投标名称 投标价格 (元) 第8包-C: 快速真蛋白质分析仪 长春吉大&bull 小天鹅仪器有限公司 人民币 GDYN-200S 168,000.00
  • 重大突破:史上首次定量检测完整的人类蛋白质组
    在一项新的研究中,来自瑞士苏黎世联邦理工学院(ETH Zurich)和美国系统生物学研究所等机构的研究人员开发出人类SRMAtlas(Human SRMAtlas),即靶向识别和可重复地定量预测的人类蛋白质组中所有蛋白质的高度特异性质谱检测方法汇编目录,包括许多剪接变异体、非同义突变和翻译后修饰。利用一种被称作选择性反应监控(selected reaction monitoring, SRM)的技术,研究人员利用166174种已被充分了解的化学合成蛋白特征性肽(proteotypic peptide)开发出这些检测方法。相关研究结果发表在2016年7月28日那期Cell期刊上,论文标题为“Human SRMAtlas: A Resource of Targeted Assays to Quantify the Complete Human Proteome”。论文第一作者为来自美国系统生物学研究所的Ulrike Kusebauch博士。论文通信作者为来自美国系统生物学研究所的Robert Moritz教授和来自瑞士苏黎世联邦理工学院的Ruedi Aebersold。  SRMAtlas资源在http://www.srmatlas.org网站上可以免费获取,将有助于公平地开展重点的、假设驱动的和大型蛋白质组规模的研究。研究人员期待这一资源将极大地加快基于蛋白质的实验室生物学发展从而有助理解疾病转化和健康轨迹,这是因为如今在理论上能够鉴定和定量检测出任何样品中的任何人类蛋白。  能够可靠地和可重复性地检测任何组织或细胞类型的人类蛋白质组中的任何一种蛋白在理解系统层次的性质以及正常生理下和患病时的特异性途径方面引发变革。在Moritz教授实验室中,研究团队能够利用SRM方法产生并验证了一种由高度特异性地靶向蛋白质组检测方法组成的汇编目录,而且通过这种广泛获取的、灵敏的和强健的靶向质谱方法SRM,能够定量检测20,277种已被标注的人类蛋白中的99.7%。这种人类SRMAtlas提供明确的检测坐标来确定性地鉴别生物样品中蛋白质特征性的肽。  尽管2003年,人们成功地了完成人类基因组计划(Human Genome Project),构建出所有人类基因的目录,但是大多数蛋白质研究仍然聚焦在在绘制出人类基因组图谱之前科学家们研究的蛋白中相对较小的一部分蛋白上。若要超越这种停滞不前的蛋白质-基因组学研究方法,就应需要为几乎每种人类蛋白开发高度特异性的检测方法。利用人类SRMAtlas等资源,测量任何一种人类蛋白质的前景如今变成现实。如今,人类SRMAtlas提供已经过验证的质谱检测方法,这些检测方法是基于一种统一的一致的检测人类蛋白质组中几乎每种蛋白的过程开发出的SRM技术而开发的。这些检测方法可快速地用于系统生物学和生物医学研究中以便高度灵敏地和高度选择性地鉴定和定量检测任何一种人类蛋白,以及指导完整的蛋白质图谱绘制来了解它们的生物学功能。  个人化医学奖依赖于分子特征来监控人们的健康状态,提供信号来鉴定健康轨迹发生的变化,以及首先在临床试验随后在临床实践中提供信息来让合适的患者匹配正确的药物。这种人类SRMAtlas计划稳步地将蛋白组学推到前沿,并且为蛋白质组学在癌症登月计划(Cancer Moonshot)中发挥较大的作用添砖加瓦。
  • 纯牛奶、奶粉蛋白质快速检测仪面世
    新华网长春2月17日电(记者宗巍)由中国计量科学研究院和长春吉大小天鹅仪器有限公司联合自主研发的纯牛奶奶粉蛋白质快速检测仪近日面世,该检测仪能够快速、有效地检测出纯牛奶和奶粉中真实蛋白质的含量。   据介绍,这种检测仪通过特异显色剂与蛋白质氮反应后浓度的变化,测定纯牛奶和奶粉中蛋白质,  它的优点在于检测结果不受三聚氰胺、尿素等非蛋白质氮的干扰,能真实反映出样品中蛋白质的含量。与传统的检测方式相比,它的测定时间也大大缩短,测定一个样品只需10分钟左右。  该仪器适用于乳品质检站、畜牧水产品检测站、出入境检验检疫局、工商、卫生等部门。目前已投放市场,下一步计划将检测范围从奶制品扩大到饲料等领域。
  • 干血斑分析技术进展与应用——基于干血斑的蛋白质分析技术
    干血斑(Dried Blood Spot, DBS)是一种微量血液采集、干燥和储存的生物采样技术。该技术由Robert Guthrie于1963年首次应用于新生儿苯丙酮尿症(PKU)筛查[1]。相比于临床检验中常用的液态血液基质,干血斑技术具有采血量少、操作简便、一般不需冷冻或冷藏、储存和运输成本低等优点,已应用于新生儿疾病筛查、流行病学样本分析、药物研发等领域。将干血斑应用于蛋白质研究,拓宽了蛋白质分析研究的生物样本采集形式,具有很好的临床研究和实际应用价值。本文重点讨论两种常见干血斑蛋白质分析技术及应用。1. 基于干血斑的蛋白分析技术1.1 酶联免疫吸附分析法原理:酶联免疫吸附分析法(ELISA)是指将可溶性的抗原或抗体结合到聚苯乙烯等固相载体上,利用抗原抗体特异性结合,进行免疫反应的定性和定量分析,具有灵敏、特异、及易于自动化操作等特点。根据免疫识别和信号输出方式的不同,ELISA可以分为双抗体夹心法、直接免疫竞争法和非直接免疫竞争法等。实验材料及分析仪器:研究人员可通过购买固相载体、抗体或抗原进行包被制备ELISA试剂盒或购买市售试剂盒。酶联免疫吸附测定试剂盒已成为实验中不可缺少的工具,目前国内外Elisa试剂盒生产厂家很多,如上海酶联生物、Abcam、BioVision等,科研人员可根据研究需求选择高质量的试剂盒品牌,以提升分析效率及结果有效性。干血斑处理:以干血斑HIV分析为例:用HIV阴性混合血液样本对阳性混合血液样本进行梯度稀释后,以固定体积点样至干血斑收集卡,室温下干燥。采用干血斑打孔设备获得一定直径的干血斑样片,用300 μL PBST(0.05% Tween20)室温静置洗脱,洗脱液经酶标仪测定样本吸光度值(OD值)。分析和结果处理:以标准曲线样品的浓度为横坐标,以测得的OD值为纵坐标,根据不同类型ELISA本身的特点拟合标准曲线(如竞争法和夹心法可以采用四参数拟合回归方程),选择R值大于0.99的拟合方式,并根据标准曲线计算样品浓度。分析仪器:酶标仪(MicroplateReader)即酶联免疫检测仪,是对酶联免疫检测(EIA)实验结果进行读取和分析的专业仪器。酶标仪可分为普通酶标仪和多功能酶标仪,普通酶标仪的主要功能一是充当分光光度计的角色,二是基于免疫反应的ELISA分析,价格相对较低;多功能酶标仪可实现吸光度、荧光强度、时间分辨荧光、荧光偏振和化学发光等多种检测模式拓展,满足生化分析、免疫检测、细胞研究、药物筛选和机制探索等众多领域检测需要。目前酶标仪市场常用的仪器品牌进口的有:伯腾、帝肯、美谷分子、珀金埃尔默和赛默飞等;国产的有:安图生物、奥盛和闪谱等。1.2 基于质谱技术的蛋白质分析技术基于质谱(Mass Spectrometry, MS)技术的蛋白质分析方法具有高通量、自动化程度高、分离能力强等特点,已逐渐成为蛋白质分析和鉴定的重要技术。原理:蛋白酶将样本中的蛋白质消化成肽段混合物,可采用鸟枪法(Shotgun)对蛋白组进行全谱分析,在最小限度分离蛋白质的同时实现复杂混合物中成千上万种蛋白质的鉴定和定量;或用液相色谱法(Liquid Chromatography, LC)对酶解肽段进行分离,经基质辅助激光电离(MALDI)或电喷雾电离(ESI)等软电离技术将其离子化,带电蛋白质离子通过质量分析器将具有特定质荷比的肽段离子分离,然后经检测器分析。质谱技术与干血斑技术的结合为蛋白质组学研究和蛋白生物标志物筛选提供了强有力手段。图1 基于质谱技术的蛋白质组学分析流程[2]样本处理:采用干血斑打孔设备获得一定直径的干血斑样片,转移至EP管中,加入少量水后用组织研磨器或匀浆机快速、彻底破碎干血斑样片,剧烈摇晃试管。后续处理与常规样本的蛋白提取相似:加入蛋白裂解液(如SDS、SDC、RIPA等),冰上裂解约半小时(辅以震荡),低温、高转速离心后取上清,得干血斑蛋白提取物。分析和结果处理:蛋白质组学数据分析和结果处理包括:①应用数据库搜库对蛋白进行鉴定并相对定量分析,借助如主成分分析、相关性分析、聚类分析等方法掌握数据的整体情况;②对蛋白的生物学功能进行注释,例如GO功能注释、KEGG注释等;③通过蛋白的生物学功能或参与的信号通路可以进一步筛选与研究目标相关的蛋白进行后续的分析。分析仪器:蛋白质组学分析主要使用高分辨液质联用系统进行。可进行蛋白质组学分析的液质联用系统目前以进口为主,常见仪器主要有布鲁克、赛默飞、沃特世和SCIEX的Q-TOF、Q-Orbitrap、Q-Trap质谱仪等。2. 干血斑蛋白分析应用实例分享2.1 采用ELISA法分析干血斑中HIV抗体1996年美国食品药品监督管理局(FDA)批准了以干血斑为载体的样本邮寄传递检测模式,并证明其可作为传统检测模式的良好补充,极大地推动了干血斑技术在传染性疾病分析中的应用。在我国,全国艾滋病检测技术规范(2020年修订版)第二章第4部分“常规HIV抗体或HIV抗体抗原联合检测方法”中指出:ELISA试验可使用血液(包含血清、血浆和干血斑)或尿液样本检测HIV抗体,也可联合检测HIV抗体抗原,说明干血斑在基于ELISA技术的HIV抗体检测中是可代替血浆、血清的生物样本基质,具有广阔的应用前景。近年来,相关专家多推荐受检者使用HIV自主采样包,根据说明采集干血斑样本,匿名寄至专业实验室,通过电话等方式获取结果。图2 RDA Spot公司的干血斑自主采样包(包含一次性采血针,消毒湿巾,样本采集卡,使用说明书及用于运输的特殊包装)图片来源:https://www.rdaspot.com/2.2 基于质谱技术的干血斑蛋白质组学分析研究人员建立了应用Thermo UltiMate 3000 RSLCnano纳升液相色谱联合Q Exactive HF-X质谱技术的干血斑蛋白质组学分析方法,并于2020年在Journal of Proteome Research中报道了该项工作[3]。由于全血中含有较多可溶性蛋白(如血红蛋白、白蛋白、纤维蛋白原等),研究人员为克服干扰、提高分析灵敏度,采用碳酸钠沉淀法(SCP)成功去除干血斑中可溶性蛋白并富集目标分析物疏水性蛋白。采用基于数据非依赖采集模式(DIA)的蛋白质组学分析方法,进行EMBL-EBI(针对人类蛋白GO功能分析的综合注释数据库)蛋白组学搜库分析,通过限定质谱扫描范围和延长离子累积时间等提高了分析方法的检测灵敏度。该研究最终在健康受试者干血斑样本中鉴定到1977种蛋白质,其中包含585种疾病相关蛋白。3. 小结与展望干血斑是一种先进的血液采集及保存技术,具有操作简单、对人体损伤小、便于运输和储存等优势,在临床快检中受到关注。干血斑技术与蛋白质研究的结合将有效推动蛋白质研究成果临床转化。随着分析技术的发展和相关研究的不断深入,前处理自动化仪器、高通量分析仪器和成熟的蛋白分析流程将成为干血斑蛋白质分析的有力工具,干血斑蛋白质分析定将在蛋白质分析中发挥重要作用,为高通量诊断、差异蛋白分析和疾病生物标志物挖掘等拓展新的技术平台。参考文献:[1] R. Guthrie, & Susi, A., A Simple phenylalanine method for detecting phenylketonuria in large populations of newborn infants., Pediatrics, 32 (1963) 338–343.[2] B. Kuster, M. Schirle, P. Mallick, R. Aebersold, Scoring proteomes with proteotypic peptide probes, Nature Reviews Molecular Cell Biology, 6 (2005) 577-583.[3] D. Nakajima, Y. Kawashima, H. Shibata, T. Yasumi, M. Isa, K. Izawa, R. Nishikomori, T. Heike, O. Ohara, Simple and sensitive analysis for dried blood spot proteins by sodium carbonate precipitation for clinical proteomics, Journal of proteome research, 19 (2020) 2821-2827.
  • 安捷伦公司大力支持亚太地区蛋白质学会(APPA)第三次学术会议及中英蛋白质学术会
    安捷伦公司大力支持亚太地区蛋白质学会(APPA)第三次学术会议及中英蛋白质学术会议 2011年5月6-9日,亚太地区蛋白质学会(APPA)第三次学术会议及中英蛋白质学术会议在世博之城上海隆重召开。本届会议由&ldquo 亚太地区蛋白质科学联合会(Asia Pacific Protein Association, APPA)和国际蛋白质学会(The Protein Society)主办、中国生化学会蛋白质专业委员会(The Chinese Protein Society)承办。本次会议以&ldquo Proteins and Beyond&rdquo 为主题,诚邀国内外蛋白质组学领域众多顶尖专家学者,围绕业内热点问题成功举行了一次高端学术盛宴,会议议题主要围绕蛋白合成/质控、蛋白翻译后修饰、蛋白相互作用、蛋白工程、蛋白定量、疾病蛋白质组学与药物发现、生物制药等热门领域。 安捷伦公司作为会议的主赞助商以及蛋白质组学领域的重要方案供应商,在本届会议上再次为广大用户呈现其蛋白质组学全面、完备、专业的解决方案。针对蛋白定量这一行业热点课题,安捷伦公司凭借其最新超高灵敏度6490三重四极杆质谱技术、灵活强大的软件功能以及高通量全自动样品前处理技术在这一应用上具有突出及独特的优势。 在5月8日下午的大会学术报告专场,来自安捷伦公司的蛋白质组学应用工程师陶定银博士为在场听众进行了题为《安捷伦6490三重串联四级杆质谱仪在超痕量蛋白定量分析中的应用》的精彩报告:全新一代安捷伦6490三重串联四级杆质谱仪集多种高精技术于一体,与不同流速范围的液相色谱仪&ldquo 无缝&rdquo 匹配,在纳流、微流及常规流速范围内均可提供高灵敏、高重现的超痕量蛋白定量分析结果。配合安捷伦的全自动样品前处理机器人,使用户彻底摆脱繁冗的手工处理,获得重现性优异的分析结果。Agilent 6490创新型串联质谱简介1.概况 2010年5月24日 安捷伦科技公司在美国犹他州盐湖城举行的第58届美国质谱年会上推出了基于iFunnel技术的6490三重四极杆液质联用系统。 iFunnel是一种革命性的大气压离子进样技术,可以在大多数应用上极大提高灵敏度。与旧型号相比,6490系统减少了25%的占地面积,但灵敏度却提高了10倍以上。革新产品6490展示了其尖端应用能力,即检测灵敏度可达到10-21mol(Zeptomol)及ppq级别,这种水平的灵敏度过去只能在昂贵的加速器质谱系统上实现。2.应用价值与意义 6490的尖端性能为富于高灵敏度挑战的分析工作带来的新的成功可能。比如环境领域通常要求灵敏度在ppt级别;制药/生物医药等领域,有时需要做到微小剂量、吸入药物检测和干血斑点分析等等。常规分析中这种高灵敏度也为临床、食品安全和蛋白质/肽定量分析带来了新机遇,而且全面提高了耐受性和样品制备效率。有关安捷伦6490三重四极杆质谱更多信息,请参考:http://www.chem.agilent.com/en-US/Products/Instruments/ms/Pages/6490.aspx有关安捷伦蛋白质组学方案更多信息,请参考:http://www.chem.agilent.com/zh-cn/solutions/proteomics/pages/default.aspx关于安捷伦科技 安捷伦科技(NYSE: A)是全球领先的测试测量公司,是化学分析、生命科学、电子和通信领域的技术领导者。公司18,500名员工为世界上100多个国家的客户提供服务。安捷伦2010财政年度的业务净收入为54亿美元。了解有关安捷伦科技的详细信息,请访问:www.agilent.com.cn 。
  • 食品奶粉蛋白质检测仪维护周期是多久
    食品奶粉蛋白质检测仪维护周期是多久,食品奶粉蛋白质检测仪的维护周期并不是固定的,因为它取决于多种因素,如设备的使用频率、环境条件、操作人员的维护意识等。然而,一般来说,为了确保设备的准确性和可靠性,建议定期进行以下维护和检查:日常清洁:每天或每次使用后,应对设备进行清洁,去除样品残留和灰尘。这有助于保持设备的卫生和准确性。定期检查:每周或每月进行一次全面的检查,包括设备的各个部件、连接线、电源等。确保所有部件都处于良好的工作状态,没有损坏或磨损。校准:根据设备的使用情况和制造商的建议,定期进行校准。校准是确保设备测量准确性的关键步骤。更换耗材:如果设备使用耗材(如过滤器、灯源等),应按照制造商的建议定期更换。软件更新:如果设备有软件支持,定期检查并更新软件,以确保设备具有最新的功能和修复任何已知的问题。具体来说,维护周期可能因设备型号、制造商和使用环境而异。因此,建议参考设备的用户手册或联系制造商以获取更具体的维护建议。此外,为了确保设备的长期稳定运行,建议对操作人员进行培训,使他们了解设备的操作和维护要求。同时,建立设备维护记录,以便跟踪设备的维护历史和性能变化。
  • CEM 真蛋白质快速测定仪“全国征询合作伙伴”活动正式启动
    CEM SPRINT 真蛋白质快速测定仪,进入二十一世纪的蛋白质检测,不受&ldquo 三聚氰胺&rdquo 、&ldquo 皮革奶&rdquo 影响的创新性检测方法。经大量实验证明,SPRINT&ldquo 真蛋白质&rdquo 测量结果不受皮革奶影响,欢迎相关乳制品厂家、研究机构与培安公司合作,共同探讨真蛋白质检测方法。 皮革奶简介 皮革奶是是用皮革水解蛋白生产出来的乳制品,这是一种类似于三聚氰胺的物质,加入到乳制品中的目的是提高产品蛋白含量。&ldquo 皮革奶&rdquo 的毒害就出在这个&ldquo 皮革水解蛋白&rdquo 上,它是利用皮革厂制作服装、皮鞋之后剩下的下脚料甚至是动物毛发等物质,经过水解提炼而成的一种粉状物,因其蛋白含量较高,故而被称为&ldquo 皮革水解蛋白粉&rdquo 。中国农业部发出2011年安全检测计划文件,要求各地除要检测三聚氰胺外,还要严格检测皮革水解蛋白和碱类物质。 皮革奶的主要添加物,皮革水解物的主要成分是皮革水解蛋白,而劣质水解蛋白的生产原料主要来自制革工厂的边角废料。制革边角废料中含有重铬酸钾和重铬酸钠。用这种原料生产水解蛋白,重铬酸钾和重铬酸钠自然就被带入产品中,被人体吸收。食品专家介绍,皮革水解物主要添加的食品是乳与乳制品及含乳饮料,作用是增加蛋白质含量量。也就是说这又是一种类似于三聚氰胺的物质,而它与三聚氰胺的不同之处在于,皮革水解物的检测难度比三聚氰胺更大,轻则关节疏松重则死亡。长期食用将致癌。 CEM SPRINT真蛋白质检测仪简介 CEM SPRINT&mdash 目前世界上唯一的真蛋白质快速测仪,诞生于2007年,2008年获IFT创新奖,2009年获美国总统绿色化学挑战奖,该仪器采用了生命科学领域的iTAG&ldquo 蛋白质氨基酸分子标签&rdquo 技术,这项技术可以给蛋白质贴上&ldquo 标签&rdquo ,提供一种在样品中直接测量真蛋白质含量的手段。 它的主要特点如下: 1.直接测量&ldquo 真蛋白质&rdquo ,而非总氮含量; 2.所有类型样品检测(液体、固体、粉末状、奶油、肉类、坚果类、谷物、种子等); 3.测量时间只需两分钟;全自动操作,无需有经验的化学家; 4.对&ldquo 三聚氰胺&rdquo 、&ldquo 皮革水解蛋白&rdquo 等非法添加剂,不会产生错误的蛋白质测量结果,精确性和准确度等优于凯氏定氮法; 5.测量过程无需校准,直接测量; 6.无需危险化学试剂,相比目前的检测方法,具有更低的操作成本。 更多详情,请联系培安公司:电话:北京:010-65528800 上海:021-51086600Email: sales@pynnco.com网站:www.pynnco.com
  • 赛默飞为蛋白质组学用户量身打造的全新一站式工作流
    作为后基因组时代的重要组成部分,蛋白质组学经过二十几年的发展,已经逐渐走向成熟。蛋白质组学流程复杂,有较高的操作和实验技能的要求。其完整的实验步骤一般包括实验设计、样品前处理(蛋白提取、定量、酶解、脱盐等)、LC-MS/MS分析、数据库检索、生物信息学分析等多重步骤,而针对蛋白质组学步骤中繁琐耗时或者实验的稳定性、通量等用户的关注热点,赛默飞推出全新的为所有的蛋白质组学用户量身打造的一站式工作流,以满足用户对高通量定性定量蛋白质组学的全部需求。△图1:满足高通量定性定量蛋白质组学需求的一站式工作流(点击查看大图)赛默飞AccelerOme自动化样品前处理平台在蛋白质组学中,最为困扰大家的当属样品样品的前处理制备过程,样品制备过程繁琐、耗时,欠缺标准化的处理步骤使得蛋白质组学在不同的操作人员、不同的实验室之间重复性较差。针对这个痛点,赛默飞推出了全新的全自动的蛋白质组学样品制备平台AccelerOme(如图2)。△图2:全自动的蛋白质组学样品制备平台(点击查看大图)AccelerOme可完成蛋白样品的还原烷基化、酶解、TMT标记、脱盐、多肽定量等多步操作(如图3),其具有强大的鲁棒性的硬件,搭配现成的预配置的试剂以及直观的端到端软件,使标准化的蛋白质组学制备流程走进万千实验室,解放双手。 △图3:AccelerOme自动化样品前处理平台在蛋白质组学全流程中的作用(点击查看大图)△点击视频了解AccelerOme操作全流程其中,AccelerOme的强大的适配软件,支持使用者们从实验设计到数据分析的全流程。在蛋白质组学以及生物制药的HCP、药代动力学实验中,可帮助实验人员更加简便快速的获得高质量的、可重复的样品。全新的&mu PAC&trade Neo HPLC色谱柱在LC-MS/MS检测中,我们希望低流速的纳升液相能够提供更加稳健的表现和更高的日均检测通量。为此,赛默飞于去年发布了全新的低流速液相Vanquish Neo,与之相匹配的,这次我们推出了全新的50 cm &mu PAC&trade Neo HPLC色谱柱。全新色谱柱优势★与普通的填充柱不同,全新的50 cm &mu PAC&trade Neo HPLC色谱柱为微柱蚀刻技术,不同的色谱柱一致性强 ★同时低背压设计,50cm色谱柱,300nl/min流速下,背压仅110-150 bar;★还可灵活适配于不同的工作流程,其可适配15-120min色谱梯度及5-500ng大范围的上样量。全新的50 cm &mu PAC&trade Neo HPLC色谱柱,在具有极其出色的性能的同时,兼具高度的鲁棒性及更长的使用寿命(如图4)。 △图4:全新的50 cm &mu PAC&trade Neo HPLC色谱柱多针上样结果(从2月开始使用,间隔进行QC测试,共进行近500针QC测试)(点击查看大图)Proteome Discoverer&trade 3.0软件搭配CHIMERYS&trade 搜索引擎好马配好鞍,除了前述的全新的自动化样品前处理平台、全新的色谱柱以及性能及其出色的Vanquish Neo低流速色谱仪和Orbitrap系列质谱仪器,本次全新一站式蛋白质组学工作流,还将推出升级版软件Proteome Discoverer&trade 3.0以及全新的智能搜索引擎CHIMERYS&trade 。全新的CHIMERYS搜索算法是赛默飞与蛋白质组学人工智能领域的领导者MSAID&trade 合作的全新一代为解析混合谱而设计的人工智能算法,这种ge命性的算法可以大大提升DDA数据中被识别的PSMs数,从而实现在鉴定数目上的性能断层的巨大飞跃。 △图5:CHIMERYS搜索引擎可以在复杂的混合谱中识别出更多的PSMs(点击查看大图) △图6:与前代软件相比,CHIMERYS搜索引擎在鉴定量上带来性能断层的飞跃(点击查看大图)CHIMERYS搜索引擎目前可支持的工作流程包括肽段与蛋白的鉴定、非标记定量(LFQ)、TMT(包括TMT Pro)标记的定性与定量需求,未来也将支持翻译后修饰等需求。赛默飞全新一站式工作流,为蛋白质组学用户量身打造,可满足用户对高通量定性定量蛋白质组学的全部需求。赛默飞与各位科学工作者们一起,在蛋白质组学的领域里,扬帆起航,乘风破浪!结语✦如需合作转载本文,请文末留言。
  • 请查收!您的全自动高通量蛋白纯化方案已发布!
    在绿色生物制造和合成生物学等研究领域中,高质量的蛋白分离和纯化是研究目的蛋白结构和功能的重要步骤。传统的分离纯化方法通量低、耗时长、均一性差,全自动高通量蛋白纯化系统在生命科学研究和生物制药领域已开始广泛运用,从样本前处理工序,到不同类型的蛋白纯化流程,可实现多管线自动化平行实验,具有稳定的工艺流程,可极大提高实验效率,节约时间和人力成本;同时还可以进行数据交互,实现样本溯源和实验数据管理。今天小贝给大家整理了几种常见好用的蛋白纯化方案助力您的科学研究。磁珠捕获特异性标签蛋白,因其纯化步骤精简成熟被广泛应用,图1是磁珠纯化流程示意图。小贝为您量身定制蛋白纯化全流程自动化方案:使用Biomek i系列液体工作站,整合核酸/蛋白提取仪,实现高效高通量自动化蛋白纯化,极大节省实验时间和科研精力。图1 磁珠纯化流程图2 Biomek i系列液体处理工作站展示图Biomek i系列液体工作站配置96通道和灵活8通道加样器,适配各种商品化试剂盒和用户自配试剂,轻松实现试剂分装和高通量样本纯化。同时工作站支持多设备整合,可进行后期无限升级,添加离心机、酶标仪等设备助力全流程自动化实验。图3 磁珠纯化方法截图及纯化结果高通量磁珠法蛋白纯化模块可以通过结合核酸/蛋白提取仪实现极简快速蛋白纯化,也可以通过自动化液体工作站结合磁力架完成。使用该功能时仅需要通过软件的简易命令行即可完成,如图3所示,工作站机械抓手会根据纯化流程将Binding Buffer、Beads、Washing Buffer等试剂自动搬运到指定位置,使用磁套进行磁珠转运,单次可以完成96个样本纯化,浓度稳定在0.5-0.8mg/ml,96孔板纯化时间约60min,节省枪头成本,省时省力。图4 亲和层析柱蛋白纯化法实验流程RoboColumn是一种小型色谱柱,用于抗体、蛋白质、多肽等的全自动平行色谱分离,其纯化流程如图4所示。高通量的RoboColumn ALP 与Biomek i系列液体工作站相结合,配置Span8固定针,可实现多通道自动化的平行层析实验流程,显著缩短工艺开发时间;同时还可以进行数据追踪,实现样本溯源,减少重复工作。图5 RoboColumn ALP模块结构及Span8固定针示意图W1:废液槽;B1:收集板载架;C1:柱载架Biomek液体工作站可以实现台面整合RoboColumn ALP模块,通过软件流程式编辑方法,控制ALP板位自动位移,实现液体收集,轻松完成蛋白纯化,图6展示了软件控制ALP板位收集液体的方法以及RoboColumn纯化结果,实验中1.56mg蛋白上样,经0.1M Gly-HCl(pH2.7)洗脱回收得到蛋白含量1.31mg,纯化得率达到84%,8通道操作时间约为80min。图6 调用RoboColumn方法界面及纯化结果展示图7 PhyTip法自动化纯化关键流程PhyTip为枪头式分散固相亲和色谱柱,采用枪头式装置,纯化树脂被填充于枪头尖端,由自动化液体处理工作站加载PhyTip,可以实现单通道到96通道灵活样品数纯化,其纯化流程如图7所示,可对微克级到毫克级的蛋白进行纯化。图8 PhyTip实物图、PhyTip纯化方法及结果展示图Biomek液体工作站与枪头式纯化色谱柱相结合,利用工作站加载PhyTip让纯化流程变得如移液流程一样简单!如图8所示,加样器加载PhyTip,分别在平衡液、蛋白样品、洗杂液和洗脱液中混匀即可完成高通量蛋白纯化,单次可处理96个样品,收集10mL菌液使用PhyTip(40uL填料),纯化后经BCA蛋白定量测定蛋白含量稳定在400ug左右,优于手工对照实验340ug的结果,96孔板操作时间约为90min。小 结
  • Seer 公司 Max Mahoney:高深度无偏蛋白质组学新技术,开启肿瘤早筛新纪元
    蛋白质组学的发展方兴未艾,是后基因组时代重点关注的热点领域,新思路,新技术层出不穷,应用领域和场景不断拓展。Seer公司就是在这种大背景下诞生的一家科技新锐,为全球同行开启了一扇通向——大规模,高深度,无偏蛋白质组学的大门。本次采访,让我们聚焦Seer公司技术体系在肿瘤早筛领域的应用。  Seer公司提供的Proteograph™XT平台利用经过特殊制作的纳米粒子磁珠,在跨数十个数量级丰度之间,非特异性地结合各类蛋白,无需额外去除高丰度蛋白,再利用高性能的质谱技术,达到高精度测量。在兼顾深度,增强蛋白组分析通量的情况下,实现对大规模血液蛋白的可重复性定量分析,创造了无偏差高通量探寻生物标记物的机会。  Max Mahoney 是 Seer 公司最早的员工之一,参与设计开发了数个专利的纳米颗粒和ProteographTM系统,先后担任全球高级应用科学家、区域商业负责人等职。Max更是助力中国蛋白质组学发展的老朋友。2022年初,在他的中国之行中,见证了Seer公司和应脉医疗“蛋白质组学新技术和应用卓越创新中心”在上海揭幕,全程指导完成了中国第一台、第二台Seer ProteographTM 系统的安装、调试、培训、样品测试、质谱检测、数据分析等全部流程。2023年,Max亚洲之行,让我们一起聆听对他的采访。  Seer是蛋白质组学行业领头企业,于2020年在纳斯达克上市。作为Seer公司最早的核心员工之一,你能不能简单介绍一下公司及发展历程?  MAX:Seer的经历非常传奇,而且方兴未艾。公司成立于2017年,是一家非常年轻的企业。公司的愿景和目标是:推动蛋白质组学发生革命性变革。Seer的设备和检测试剂本身就非常强大,能让人类从前所未有的全新角度理解蛋白质组,所以极具竞争力。2020年12月底公司完成了首台设备的交付及安装。2022年初推出了第一款商业可用的解决方案,不仅限于美国,也在全球市场进行销售。预计在2024年初会有大量成果发表。  近年来癌症早期筛查的创新技术飞速涌现,蛋白质组学在癌症早期筛查方面具备怎样的潜力?与其它组学相比有哪些优势?  MAX:其实,癌症筛查这个概念已经存在很多年了,但是直到二、三十年前都是被动进行的。意思是,患者感觉身体有异样或者不舒服了才会寻求诊断和治疗。早期癌症筛查的出现从根本上改变了人类对癌症的认知以及后续治疗。随着精准医学的推广,人类终于有能力在疾病最终成型前就检测到它,再针对特定患者类型制定具体的治疗方案。基因组学的发展,实现了海量基因组数据的获得,驱动肿瘤早筛取得前所未有的进步。接下来,蛋白质组学的研究跟基因组学类似,我们已经能够利用海量数据充分理解血清或血浆的蛋白质组,理解器官的蛋白质组。未来,这项技术会从根本上改变我们看待以及管理人类健康的方式。  但蛋白质组却会根据身体状况而改变,所以它提供的是一个动态的指标,动态缩影。让大家能实时掌握自己的健康状况。直到5年前,蛋白质组内容的易获得性才得到大幅提升。现在,大规模蛋白质组研究已经不是遥不可及的幻想,已经成为了现实。我坚信,当人类可以彻底了解蛋白质组,我们对于人体健康的认知也会发生根本性变革。  2022年9月,应脉医疗宣布在中国市场取得了重大成绩,SEER全球总部与应脉医疗的研发团队合作,成功突破了5,000个血浆蛋白的检测数量。这项成就对于癌症早期筛查会产生怎样的推动作用?Seer在这方面还有哪些战略部署?  MAX:首先,无论是对于单一样本还是组群样本,5,000这个数字都是一个巨大的成就。但这还只是刚刚起步。Seer平台潜力无限。通过Seer与应脉的合作,无偏发现蛋白质组学领域的样本数量将持续提升。也许几年之后再回看现在,5,000都显得微不足道。通过赋能以Seer为代表的核心技术,结合后端的质谱检测设备,样本数量会持续增长。而且不仅仅是蛋白质组,像蛋白质存在形式,蛋白质的翻译后修饰,蛋白质间相互作用等其它类型的样本数量都会进一步增长。  随着样本数量增加,人类对于生物复杂性的理解也会被刷新,未来进展本质上将取决于对数据的利用能力。生物知识已经有了,问题是怎么能更容易地获得内容,这也是Seer和应脉医疗合作要解决的问题。在5,000蛋白质样本的基础上,通过大规模研究,这个上限会不断突破,7,000,1万,甚至2万,数据库正在不断扩充。  Seer产品的技术原理是什么?如何助力科研人员打通痛点难点?  MAX:Seer是基于沃尔曼效应(Vroman Effect) 对蛋白冠加以利用,Seer采用多种纳米颗粒,用不同颗粒形成不同蛋白冠,以此获得信息,达成新的生物学见解。  近年来,新的蛋白质分析技术不断涌现。Seer的技术受到高度关注。Seer的独特优势在于何处?  MAX:优势很多。首先就是无偏检测平台。这是种基于理论假设的研究方式。研究人员不需要知道目标蛋白质或目标肽就可以进行研究。传统的定向研究法要求必须对研究对象有一定的假设,或有一定的背景知识。相比之下,Seer技术使用纳米颗粒为基础的无偏平台,对蛋白质组的动态范围进行全范围取样。不但能了解与你所研究的疾病相关联的已知信息,更重要的是能发现从未与任何疾病建立联系的未知新信息。而且这些发现的前提是,不需要知道筛查目标的机制或生物学原理。我们的平台是一个真正的发掘性平台,一个真正能为研究人员赋能的发现工具。  Seer技术的第二大优势是对检测样本的物种和样本类型不加区分。也就是说,检测对象适用于任何生物体液。血浆、血清、脑髓液、尿液、条件介质等各类生物体液与Seer技术的纳米颗粒组合都兼容。检测对象也不限于一个物种,不限于人类。猪、老鼠的血浆跟人类很相似,都可以作为样本物种或样本类型。Seer平台的无偏发现特质,与多物种、多类型体液取样能力相结合,一定会成为改变游戏规则的核心技术,助力全球的研究人员和企业。  Seer的ProteographTM是一个高创新、全自动化的系统,这款产品的特征是什么?临床上的主要应用是什么?  MAX:Seer作为一个高端平台,提供的是一个真正的终端到终端的解决方案。  自从Seer进入中国市场以来,很多科学家对它产生了极大的兴趣。现在公司也正在推出新产品。新产品有什么新特征呢?  MAX:Seer的最新产品Proteograph XTTM十分值得期待,是基于近年来的客户反馈完成的。在保留了之前全部优势的基础上,通量提升2.5倍,综合成本进一步下降,对于大队列客户更加友好。  只要Seer这家公司还存在一天,研发就是我们的立身之本。我们推出第一款商业可行的解决方案后,一直在收集客户反馈,开发最新产品。现在我们非常期待在中国市场推出最新产品。
  • 河北农业大学373.40万元采购超纯水器,定氮仪,蛋白质纯化,离心机,水活度分析仪,紫外分光光度,色谱检测器,液相色谱仪,PCR
    基本信息 关键内容: 超纯水器,定氮仪,蛋白质纯化,离心机,水活度分析仪,紫外分光光度,色谱检测器,液相色谱仪,PCR 开标时间: 2021-09-01 09:00 采购金额: 373.40万元 采购单位: 河北农业大学 采购联系人: 苗老师 采购联系方式: 立即查看 招标代理机构: 方大国际工程咨询股份有限公司 代理联系人: 齐育萱 代理联系方式: 立即查看 详细信息 海洋生物资源高值化利用服务平台设备采购项目(进口)招标公告 河北省-保定市 状态:公告 更新时间: 2021-08-10 招标文件: 附件1 海洋生物资源高值化利用服务平台设备采购项目(进口) 招标公告 发布时间: 2021-08-10 一、项目基本情况 项目编号: FDBD-HW-2021-012 项目名称: 海洋生物资源高值化利用服务平台设备采购项目(进口) 采购方式: 公开招标 预算金额: 3734000.00 最高限价: 1包最高限价:2232000.00元 2包最高限价:1502000.00元 采购需求: 1包:全自动微量凯氏定氮仪、实时荧光定量PCR、电泳仪、电转仪(电穿孔仪)、高速冷冻离心机、质构仪、蛋白质纯化系统、示差折光检测器、荧光检测器 2包:分析型液相色谱仪、新鲜度分析仪、超纯水机、光学显微镜、小垂直板电泳槽、小型转印槽、基础电泳仪电源、冷热台、紫外可见分光光度计、水分活度仪。#detail#招标公告#_#pdf#_#7666969a-ba72-4d92-8dd7-2385dca0715f 合同履行期限: 合同签订生效后120日历天内 本项目(是/否)接受联合体投标: 0 二、申请人的资格要求 1.满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定; 2.落实政府采购政策需满足的资格要求: / 3.本项目的特定资格要求: 接受进口产品投标;所投产品为进口产品时,投标人需具备《海关进出口货物收发货人报关注册登记证书》;投标人为代理商时,需提供制造商同意其在本次投标中所投产品(1包:蛋白质纯化系统、实时荧光定量PCR、全自动微量凯氏定氮仪,2包:分析型液相色谱仪)的正式专项授权书,或制造商在国内的总代理商对所投产品(1包:蛋白质纯化系统、实时荧光定量PCR、全自动微量凯氏定氮仪,2包:分析型液相色谱仪)的正式专项授权书(总代理商需提供有效授权证明文件) 三、获取招标文件 时间: 2021年08月11日至 2021年08月17日, 9:00-12:00-12:00-17:00(北京时间,法定节假日除外) 地点: 河北省公共资源交易服务平台(http://www.hebpr.gov.cn/hbjyzx/)自主下载文件,并及时查看有无澄清和更正 方式: 其它 售价: 0 四、提交投标文件截止时间、开标时间和地点 2021年09月01日09点00分(北京时间) 地点: 本次招标采用全流程电子化形式在河北省公共资源交易服务平台递交;线下地点为:保定市公共资源交易中心第5开标室 四、响应文件提交 截止时间: 2021年09月01日09点00分 五、开启 时间: 2021年09月01日09点00分 地点: 本次招标采用全流程电子化形式在河北省公共资源交易服务平台递交;线下地点为:保定市公共资源交易中心第5开标室 五、公告期限 自本公告发布之日起5个工作日。 六、公告期限 自本公告发布之日起3个工作日。 六、其他补充事宜 七、其他补充事宜 1、本公告发布媒体:中国河北政府采购网、河北省公共资源交易服务平台。 2、本项目采用全流程电子招投标,各投标人请按照“河北省公共资源交易平台”(网址:http://www.hebpr.cn/)首页“信息动态”中“采购代理机构及投标人进行注册登记的通知”的要求办理相关市场主体注册手续,并办理数字证书CA(CA咨询电话4007073355),已注册、已办理数字证书CA的无须重新办注册或办理。完成注册并办理CA后,投标人凭CA秘钥登录电子交易系统自行下载所参加项目的采购文件和时间场地信息文件,采购文件格式(.bdzf)。在“保定市公共资源交易综合信息平台”中【业务管理-交易文件下载】菜单中搜索计划参与项目,并从系统中直接下载招标文件(必须在系统中获取),下载成功则视为报名参与成功。若经开标现场查验投标人未在网上下载招标文件,该单位将不能进入评审阶段,后果自负。具体操作可参考“河北省公共资源交易信息平台”(网址:http://www.hebpr.cn/)中的《投标人投标操作手册》技术支持电话:4009980000。投标人请随时关注平台,如本项目有信息变动,投标人延误自行负责。 3、河北省公共资源交易服务平台中市场主体在企业资质、法人、业绩、企业基本账户等重要信息发生变更时,应在投标确认前及时对河北省公共资源交易服务平台中主体信息进行修改更新,并选择审核地点,携带证明材料进行修改确认,否则视为无效变更。投标确认后至交易项目结束前,限制修改企业名称、企业基本账户信息,如特殊原因造成信息变化的,及时向河北省公共资源交易中心提交证明资料,未及时变更或资料无效从而影响响应的,责任自负。 七、对本次招标提出询问,请按以下方式联系。 八、对本次招标提出询问,请按以下方式联系。 1.采购人信息 名 称: 河北农业大学 地址: 保定市灵雨寺街289号 联系方式: 苗老师 0312-7526518 2.采购代理机构信息 名 称: 方大国际工程咨询股份有限公司 地 址: 保定市北二环5699号大学科技园3号楼南侧3层302 联系方式: 齐育萱 17692331906 3.项目联系方式 项目联系人: 齐育萱 电 话: 17692331906 × 扫码打开掌上仪信通App 查看联系方式 基本信息 关键内容:超纯水器,定氮仪,蛋白质纯化,离心机,水活度分析仪,紫外分光光度,色谱检测器,液相色谱仪,PCR 开标时间:2021-09-01 09:00 预算金额:373.40万元 采购单位:河北农业大学 采购联系人:点击查看 采购联系方式:点击查看 招标代理机构:方大国际工程咨询股份有限公司 代理联系人:点击查看 代理联系方式:点击查看 详细信息 海洋生物资源高值化利用服务平台设备采购项目(进口)招标公告 河北省-保定市 状态:公告 更新时间: 2021-08-10 招标文件: 附件1 海洋生物资源高值化利用服务平台设备采购项目(进口) 招标公告 发布时间: 2021-08-10 一、项目基本情况 项目编号: FDBD-HW-2021-012 项目名称: 海洋生物资源高值化利用服务平台设备采购项目(进口) 采购方式: 公开招标 预算金额: 3734000.00 最高限价: 1包最高限价:2232000.00元 2包最高限价:1502000.00元 采购需求: 1包:全自动微量凯氏定氮仪、实时荧光定量PCR、电泳仪、电转仪(电穿孔仪)、高速冷冻离心机、质构仪、蛋白质纯化系统、示差折光检测器、荧光检测器 2包:分析型液相色谱仪、新鲜度分析仪、超纯水机、光学显微镜、小垂直板电泳槽、小型转印槽、基础电泳仪电源、冷热台、紫外可见分光光度计、水分活度仪。#detail#招标公告#_#pdf#_#7666969a-ba72-4d92-8dd7-2385dca0715f 合同履行期限: 合同签订生效后120日历天内 本项目(是/否)接受联合体投标: 0 二、申请人的资格要求 1.满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定; 2.落实政府采购政策需满足的资格要求: / 3.本项目的特定资格要求: 接受进口产品投标;所投产品为进口产品时,投标人需具备《海关进出口货物收发货人报关注册登记证书》;投标人为代理商时,需提供制造商同意其在本次投标中所投产品(1包:蛋白质纯化系统、实时荧光定量PCR、全自动微量凯氏定氮仪,2包:分析型液相色谱仪)的正式专项授权书,或制造商在国内的总代理商对所投产品(1包:蛋白质纯化系统、实时荧光定量PCR、全自动微量凯氏定氮仪,2包:分析型液相色谱仪)的正式专项授权书(总代理商需提供有效授权证明文件) 三、获取招标文件 时间: 2021年08月11日至 2021年08月17日, 9:00-12:00-12:00-17:00(北京时间,法定节假日除外) 地点: 河北省公共资源交易服务平台(http://www.hebpr.gov.cn/hbjyzx/)自主下载文件,并及时查看有无澄清和更正 方式: 其它 售价: 0 四、提交投标文件截止时间、开标时间和地点 2021年09月01日09点00分(北京时间) 地点: 本次招标采用全流程电子化形式在河北省公共资源交易服务平台递交;线下地点为:保定市公共资源交易中心第5开标室 四、响应文件提交 截止时间: 2021年09月01日09点00分 五、开启 时间: 2021年09月01日09点00分 地点: 本次招标采用全流程电子化形式在河北省公共资源交易服务平台递交;线下地点为:保定市公共资源交易中心第5开标室 五、公告期限 自本公告发布之日起5个工作日。 六、公告期限 自本公告发布之日起3个工作日。 六、其他补充事宜 七、其他补充事宜 1、本公告发布媒体:中国河北政府采购网、河北省公共资源交易服务平台。 2、本项目采用全流程电子招投标,各投标人请按照“河北省公共资源交易平台”(网址:http://www.hebpr.cn/)首页“信息动态”中“采购代理机构及投标人进行注册登记的通知”的要求办理相关市场主体注册手续,并办理数字证书CA(CA咨询电话4007073355),已注册、已办理数字证书CA的无须重新办注册或办理。完成注册并办理CA后,投标人凭CA秘钥登录电子交易系统自行下载所参加项目的采购文件和时间场地信息文件,采购文件格式(.bdzf)。在“保定市公共资源交易综合信息平台”中【业务管理-交易文件下载】菜单中搜索计划参与项目,并从系统中直接下载招标文件(必须在系统中获取),下载成功则视为报名参与成功。若经开标现场查验投标人未在网上下载招标文件,该单位将不能进入评审阶段,后果自负。具体操作可参考“河北省公共资源交易信息平台”(网址:http://www.hebpr.cn/)中的《投标人投标操作手册》技术支持电话:4009980000。投标人请随时关注平台,如本项目有信息变动,投标人延误自行负责。 3、河北省公共资源交易服务平台中市场主体在企业资质、法人、业绩、企业基本账户等重要信息发生变更时,应在投标确认前及时对河北省公共资源交易服务平台中主体信息进行修改更新,并选择审核地点,携带证明材料进行修改确认,否则视为无效变更。投标确认后至交易项目结束前,限制修改企业名称、企业基本账户信息,如特殊原因造成信息变化的,及时向河北省公共资源交易中心提交证明资料,未及时变更或资料无效从而影响响应的,责任自负。 七、对本次招标提出询问,请按以下方式联系。 八、对本次招标提出询问,请按以下方式联系。 1.采购人信息 名 称: 河北农业大学 地址: 保定市灵雨寺街289号 联系方式: 苗老师 0312-7526518 2.采购代理机构信息 名 称: 方大国际工程咨询股份有限公司 地 址: 保定市北二环5699号大学科技园3号楼南侧3层302 联系方式: 齐育萱 17692331906 3.项目联系方式 项目联系人: 齐育萱 电 话: 17692331906
  • 腐竹蛋白质含量不达标?这款快速检测仪可帮大忙,但是很多企业不知道!
    在腐竹相关的新闻中,常常可以看到某“腐竹蛋白质含量不达标”。原来,腐竹等豆制品中的蛋白质来源于豆制品中含大豆蛋白质的原料,蛋白质属于质量指标。《非发酵豆制品》(GB/T 22106-2008)中规定,腐竹中蛋白质最低限量为45.0 g/100g;其他豆制品中蛋白质最低限量为43.0 g/100g。造成蛋白质含量不达标的原因,一方面可能是企业为节约成本没有严格按照配方投料,降低了含蛋白质原料的比例(这个原因往往会让企业得不偿失);另外,很有可能是因为大豆原料蛋白质含量不确定,不均匀,而企业把关不严(或者说缺乏有效工具),使用了蛋白质含量未达标的原料造成。然而,很多豆制品生产企业并不知道有一款仪器可以帮忙,它是一款便携式无损检测仪器,坚固、手提即可,只需要一分钟就能检测出大豆蛋白质含量,满足大豆采购商的要求。有了对原料蛋白质含量的控制,控制腐竹的蛋白质含量超过国标最低限就不是靠经验了,而是靠数据监控。另外,收购商也可以很好地根据检测结果给原料大豆定价,令原料供应者心服口服。而大豆供应商也可以根据这款仪器测定自家产品的品质,从容应对想压低收购价的收购商。一分钟可显示检测结果(水分含量,含油量,蛋白质和水溶蛋白含量)仪器已经有了众多用户(包括海外用户)这款仪器不仅仅可以用于豆制品企业采购大豆,也可用于大豆质量分级。大豆 GB 1352-2023中规定,大豆质量指标应符合表1规定,对其水分含量有要求,高油大豆质量指标应符合表2规定,对脂肪含量有要求,高蛋白大豆质量指标应符合表3规定,不同等级的蛋白质含量要求不同。延伸阅读:九旬院士的近红外创业路——访陈星旦院士初衷不改 实现近红外技术产业化——“创新100”走访广东星创众谱仪器有限公司
  • 定量蛋白质组学揭示内质网应激作用下蛋白质的构象变化
    大家好,本周为大家分享一篇发表在Analytical Chemistry上的文章Quantitative Structural Proteomics Unveils the Conformational Changes of Proteins under the Endoplasmic Reticulum Stress1,文章的通讯作者是来自美国佐治亚理工学院的Ronghu Wu助理教授。在真核细胞中,内质网(endoplasmic reticulum,ER)负责蛋白质组中40%蛋白质的合成和成熟。蛋白质合成或折叠过程中的变化都将影响内质网的稳态,进而导致未折叠蛋白的积累和蛋白分泌效率的降低。在过去几十年的研究中,内质网应激反应被广泛研究,但是内质网应激反应后蛋白质折叠状态的变化却没有被深入研究。基于丰度的蛋白质组学方法不能直接用于分析蛋白质状态的变化,在这篇文章中,作者整合了半胱氨酸(cysteine,Cys)共价标记、选择性富集和定量蛋白质组学,称为半胱氨酸靶向共价蛋白绘制(cysteine targeted covalent protein painting,Cys-CPP),用于研究蛋白质组范围内的蛋白质结构和变化(图1A)。  使用CPP分析蛋白质结构,需要一种具有高反应活性的探针。作者设计了一种针对半胱氨酸的探针,其中包含半胱氨酸反应基团、用于富集的生物素部分和用于生成半胱氨酸特异性识别位点标签的可裂解连接部分(图1B)。以变性处理后的蛋白样品作为蛋白质展开形式的参考,计算肽段在原始样本和变性样本中的比例从而获得宝贵的蛋白质结构信息。  图1.利用半胱氨酸反应探针定量分析人细胞蛋白质组中半胱氨酸暴露率的原理。(A)Cys-CPP的一般工作流程。(B)半胱氨酸残基与探针之间的反应。富集后,进行紫外裂解,在修饰的半胱氨酸上留下一个小标记,用质谱进行位点特异性分析。  半胱氨酸暴露率Rexpo通过每条肽段在原始样本和变性样本中的比值进行计算。结果显示:(1)半胱氨酸的暴露率和溶剂可及性呈现正相关(图2C) (2)在丝氨酸和苏氨酸等极性氨基酸残基旁边的半胱氨酸具有相对较高的暴露率,这与人们普遍认为亲水残基更有可能暴露在蛋白质表面的观点一致 (3)甘氨酸和脯氨酸附近的半胱氨酸具有更高的暴露率,这是因为这两种氨基酸通常出现在蛋白质的转角和环结构中,对半胱氨酸的空间位阻较小 (4)半胱氨酸暴露率与其有/无序区(图2D)或所处二级结构(图2E)的相关性分析均表明,较低的暴露率与更稳定和结构化的局部环境有很好的相关性。这些数据结果共同证明目前的方法可以准确地测得半胱氨酸暴露率,并为蛋白质结构提供有价值的信息。  图2.HEK293T细胞中半胱氨酸暴露率的分析。(A) VAHALAEGLGVIAC#IGEK(#代表标记位点)的串联质谱样本。报告离子的强度使我们可以准确定量一个半胱氨酸的暴露率(左框为报告离子强度的放大视图)。(B)蛋白CCT3中被定量半胱氨酸的定位和暴露率演示(PDB代码:6qb8)。(C−E)比较不同的溶剂可及性(C)、预测无序区(D)和二级结构(E)的半胱氨酸暴露率。  衣霉素(Tunicamycin,Tm)可抑制 N-糖基化并阻断 GlcNAc 磷酸转移酶 (GPT)。由于蛋白质的N-糖基化经常发生在共翻译过程中,在蛋白质折叠的调节中起着至关重要的作用,所以衣霉素会引起细胞内质网中未折叠蛋白的积累并诱导内质网应激。基于此,作者用衣霉素对细胞进行处理,计算并对比了衣霉素处理样本和正常样本中的半胱氨酸暴露率。正如预期的那样,Tm处理样本中许多半胱氨酸的暴露率升高,且Tm对于蛋白质不稳定区域的作用尤为显著。根据Tm处理样本和正常样本之间半胱氨酸暴露率的差值,作者将所有位点划分为5个部分,在Tm处理下,近三分之一的半胱氨酸定位区域没有明显的结构变化(差值在-0.05~0.05之间),而28%的位点则高度暴露(差值0.15)(图3B)。对这两种蛋白质进行基因本体(GeneOntology,GO)功能富集分析(图3C),结果显示:差值在-0.05~0.05之间的蛋白通常是糖异生或折叠过后具有良好结构区域的蛋白,而差值0.15的蛋白则是与囊泡转运相关的蛋白。这表明抑制N-糖基化主要影响经典分泌途径中的蛋白质,与预期相符。  图3.利用Tm抑制蛋白质N-糖基化对蛋白质折叠影响的系统研究。(A)Tm处理和对照样品之间半胱氨酸暴露率的比较。(B) 不同暴露率变化范围内的蛋白质数量。(C)在具有高度展开或稳定区域半胱氨酸的蛋白之间进行GO功能富集分析。  由于Tm对于预先存在的、折叠良好的蛋白质所产生的影响可能远小于对新合成蛋白的影响,分别研究Tm对这两种蛋白的影响是必要的。作者通过将目前的方法Cys-CPP与细胞培养中氨基酸的稳定同位素标记(pSILAC)结合(图4A),探究了细胞中已存在蛋白和新合成蛋白在内质网应激作用下的不同变化。结果显示:(1)抑制N-糖基化对新合成蛋白的去折叠影响比对已存在蛋白的影响更显著(图4C) (2)N-糖基化除了调节蛋白质的二级结构外,在蛋白质三级或四级结构的形成中起着更重要的作用(图4D)。  图4. 抑制N-糖基化对新合成蛋白和已存在蛋白折叠状态影响的研究。(A)量化新合成蛋白和已存在蛋白折叠状态变化的实验设置。(B) 经Tm处理和未经处理的细胞中新合成和已存在蛋白质的重叠。括号内为每组蛋白质数。(C)不同蛋白质组中暴露率的分布。(D) 在有或没有Tm处理的细胞中、在不同的二级结构下,新合成和已存在蛋白之间半胱氨酸暴露率的差值分布。  本文通过设计一种半胱氨酸靶向探针,定量半胱氨酸残基的暴露率,系统地研究了蛋白质的结构以及结构的变化。结果表明,半胱氨酸暴露率与蛋白质局部结构的相关性非常好。利用该方法,作者研究了Tm引起的内质网应激反应下细胞中蛋白质的结构变化。此外,通过将Cys-CPP与pSILAC结合,研究了在内质网应激反应下原有蛋白和新合成蛋白的结构变化差异,并详细分析了内质网应激对蛋白质去折叠的影响,深入和准确地了解内质网应激下的蛋白质结构变化,有助于深入了解蛋白质的功能和细胞活性。  参考文献:[1] Yin K, Tong M, Sun F, et al. Quantitative Structural Proteomics Unveil the Conformational Changes of Proteins under the Endoplasmic Reticulum Stress[J]. Analytical Chemistry, 2022,
  • 赛默飞质谱仪推动Nature报告的蛋白质组学突破性进展
    加州圣何塞(2011年2月5日)- 世界领先的科学服务商赛默飞世尔,今天宣布Thermo Scientific质谱仪持续推动蛋白质组学研究中的突破性进展,这一点由权威杂志Nature和Nature Methods近期的出版文章得以证实。Thermo Scientific质谱仪系统凭借其独特的功能,在10月2日至11月6日近一个月内出版的14篇重要文章中扮演了重要角色。&ldquo 短期内出版的大量重要文章中均使用Thermo Scientific质谱仪,这表明我们在蛋白质组学的关键性挑战中提供了领先的技术,&rdquo 赛默飞世尔科技分析仪器部的首席技术主管,Ian Jardine说道。&ldquo 例如,很多研究者都开始享受最新Thermo Scientific Orbitrap Elite组合质谱仪的超高分辨率和速度带来的优势,极大丰富了从top-down蛋白质组学实验中获得的信息。&rdquo 在这些文章中,Thermo Scientific离子阱、三重四极杆和以Orbitrap为基础的质谱仪用于推动蛋白质组学中的重要进展:提高大规模top-down蛋白质组学研究中产生的信息量,提高同量异序标记方法的定量准确性,提高糖蛋白质组学效率,并加速目标定量研究的步伐。举例如下:Mapping intact protein isoforms in discovery mode using top-down proteomics(《使用top-down蛋白质组学绘制研究模式下的完整蛋白质亚型》)是目前出版的最为成功的大规模top-down蛋白质组学研究文章。作者提出一种四维方法,采用Orbitrap EliteTM 和Thermo Scientific LTQ FT质谱仪在液相色谱(LC)时间尺度上,将分离能力和蛋白质组覆盖率提高了20倍。MS3 eliminates ratio distortion in isobaric multiplexed quantitative proteomics(《MS3减少同位素标签的多元定量蛋白质组学实验中的比率失真》)提出一种方法,可提高同位素标签实验定量数据的精确性。作者采用Thermo Scientific LTQ Orbitrap Velos质谱仪实现三级裂解(MS3),以减少同量异序离子的干扰。Gas-phase purification enables accurate, multiplexed proteome quantification with isobaric tagging(《气相纯化利用同位素标签记实现准确的多元蛋白质定量》)一文提出一种方法,当使用同位素标签定量时可以减少干扰并提高结果。作者使用LTQ Orbitrap VelosTM质谱仪的电子转移解离(ETD)功能,减少母离子的电荷数。一旦电荷减少,离子之间的m/z不再重叠,因为在定量时不再彼此干扰。Nature是一本出版最前沿研究的国际周刊,根据2010年期刊引证报告(Thomson Reuters, 2011),它是世界上被引用最多的多学科科学期刊。虽然大部分科学期刊都是专注于某个领域,而Nature是极少数出版一系列科学领域原创性研究文章的期刊之一。欲了解更多赛默飞世尔科技质谱信息,请登录:http://www.thermo.com.cn/ms 。赛默飞世尔科技蛋白质组学应用专题:http://www.thermo.com.cn/proteomics。 关于赛默飞世尔科技赛默飞世尔科技(纽约证交所代码: TMO)是科学服务领域的世界领导者。我们的使命是帮助客户使世界更健康、更清洁、更安全。公司年销售额120亿美元,员工约39000人。主要客户类型包括:医药和生物技术公司、医院和临床诊断实验室、大学、科研院所和政府机构,以及环境与过程控制行业。借助于Thermo Scientific、Fisher Scientific和Unity&trade Lab Services三个首要品牌,我们将创新技术、便捷采购方案和实验室运营管理的整体解决方案相结合,为客户、股东和员工创造价值。我们的产品和服务帮助客户解决在分析领域所遇到的复杂问题与挑战,促进医疗诊断发展、提高实验室生产力。欲了解更多信息,请浏览公司网站:www.thermofisher.com
  • 基于离子淌度质谱对完整蛋白质形态进行非标记定量
    大家好,本周为大家分享一篇发表在Analytical Chemistry上的文章,Improved Label-Free Quantification of Intact Proteoforms Using Field Asymmetric Ion Mobility Spectrometry [1],文章的通讯作者是美国俄克拉荷马大学的Luca Fornelli教授。完整proteoforms的非标记高通量定量方法的应用对象通常为从整个细胞或组织裂解物中提取的0 - 30 kDa质量范围内蛋白质。然而当前,即使通过高效液相色谱或毛细管电泳实现了proteoforms的高分辨率分离,可鉴定和定量的proteoforms的数量也不可避免地受到固有的样品复杂性的限制。近年来,随着质谱技术的发展,自上而下蛋白质组学质谱(top-down proteomics)研究中蛋白质的鉴定数量大大提升,生成了包含数万种proteoforms的数据集,但在proteoforms的量化能力方面并没有得到相应的性能提升。为克服这一问题,本文中作者通过应用场不对称离子迁移谱法(Field asymmetric ion mobility spectrometry, FAIMS)对大肠杆菌中的proteoforms进行了非标记定量。由此产生的改进允许在单次LC-MS实验中采用多个FAIMS补偿电压(Compensation voltages, C.V.),而不会增加整个数据采集周期。与传统的非标记定量实验相比,FAIMS的应用在不影响定量准确性的情况下,大大增加了鉴定和定量的proteoforms数量。首先,作者优化了质谱stepped-C.V.数据采集方法对Orbitrap Eclipse性能的影响,并从中筛选出了最优条件(−40、−20、0 V组合)。所有最新的基于Orbitrap的质谱仪(包括Exploris platform和Orbitrap Ascend)都可以采用single time-domain transients(即单次微扫描)在top down FTMS实验中生成高质量的质谱图。作者认为这对于在单次LC - MS2运行期间应用多个C.V.值的采集策略特别有益。接下来,作者应用该方法对大肠杆菌中的蛋白质进行了检测,并与传统的LC - MS2 DDA采集方法进行了比较(图1)。如图所示,每个C.V.值下的总离子流图都不同,且这一额外的分离导致在LB(Luria broth)和M9(醋酸钠处理)样品中鉴定到的proteoforms的数量显著提升。  图1. 样本制备方法和proteoforms鉴定结果总结虽然在LC-FAIMS和LC-only数据集中,大多数鉴定到的proteoforms质量都小于15 kDa,但其中约20%的质量大于18 kDa甚至高达33.3 kDa(图2)。对已鉴定的proteoforms列表的深入分析表明,达到鉴定低丰度proteoforms的关键参数之一是在串联质谱(MS2)中有足够的时间注入离子。  图2. A. FAIMS和非FAIMS鉴定到的proteoforms的质量分布。B. 鉴定到的proteoforms与注射时间之间的关系。最后,作者采用ProSight PD v 4.2 (Proteineous, Inc)进行了基于MS1的非标定量,结果显示基于FAIMS的数据集在LB样品(蓝色)和M9样品中检测到的差异表达的proteoforms均有所增加(图3)。作者评估了两个数据集之间的差异(使用和不使用FAIMS采集数据),以验证FAIMS的应用是否会对量化准确性产生不利影响,结果只有1个proteoform显示相互矛盾的丰度趋势。这种差异是由于该蛋白和一个共流出蛋白之间质谱峰几乎完全重叠造成的。它们具有非常接近的单同位素质量,这样高水平的信号干扰可以很容易地干扰基于MS1的量化。启用FAIMS可以使MS1谱图简化,因为两种proteoforms可以富集在两种不同的C.V. 值下。  图3. 大肠杆菌proteoforms无标记定量结果分析。作者将LC - FAIMS - MS2数据集与通过BUP在类似样品上获得的非标定量结果进行比较,得出两个主要的结论:1. BUP仍然对蛋白质组提供了更深层次的定量表征 2. BUP提供了与单个基因相关的所有产物的整体丰度水平信息 而TDP方法表明,给定的UniProt accession可以由多个差异表达的proteoforms组成,可能具有不同的行为(即在给定条件下,一些被上调,另一些被下调)。这一额外的信息可能具有潜在的生物学意义,但在基于BUP的定量分析中可能会被遗漏。本文描述的基于FAIMS的定量数据采集方法与PEPPI(Passively eluting proteins from polyacrylamide gels as intact species)蛋白分离技术完全兼容,产生0 - 30 kDa的组分,并且可以方便地根据待分析蛋白的平均质量调整质谱参数(C.V.值),未来在更大的蛋白质定量方面具有广阔的应用前景。  撰稿:张颖  编辑:李惠琳  原文:Kline JT, Belford MW, Huang J, Greer JB, Bergen D, Fellers RT, Greer SM, Horn DM, Zabrouskov V, Huguet R, Boeser CL, Durbin KR, Fornelli L. Improved Label-Free Quantification of Intact Proteoforms Using Field Asymmetric Ion Mobility Spectrometry. Anal Chem. 2023 Jun 13 95(23):9090-9096.  李惠琳课题组网址www.x-mol.com/groups/li_huilin  参考文献  1.Kline JT, Belford MW, Huang J, Greer JB, Bergen D, Fellers RT, Greer SM, Horn DM, Zabrouskov V, Huguet R, Boeser CL, Durbin KR, Fornelli L. Improved Label-Free Quantification of Intact Proteoforms Using Field Asymmetric Ion Mobility Spectrometry. Anal Chem. 2023 Jun 13 95(23):9090-9096.
  • 岛津倾情助力2018年靶向蛋白质组学国际研讨会
    日前,由中国科学院上海药物研究所主办、岛津企业管理(中国)有限公司赞助的“2018年靶向蛋白质组学国际研讨会”在上海顺利举行。该研讨会首次在中国举办,此前在美国、德国、瑞士、西班牙、巴西、印度、日本等世界各地成功举办,拥有国际一流的讲师团队,受到广泛欢迎。 本次研讨会 以“靶向蛋白质组学”(Targeted Proteomics)为主题,围绕1. 靶向蛋白质组学方法的建立及其意义;2. 蛋白质组学数据采集技术DIA/SWATH在靶向蛋白质组学中的应用;3关于靶向蛋白质组学策略在生物、医药、科研领域的应用培训等主要议题展开了深入探讨。2018年靶向蛋白质组学国际研讨会现场 目前在蛋白质组学领域出现了不同的靶向蛋白质组学策略,可以在许多样品中对预定的蛋白质子集进行检测和定量,具有高度的灵敏性和重现性。本次会议针对这些靶向蛋白质组学技术,如何建立、如何应用、如何解决实验中遇到的问题,进行了系统性讨论。 Ruedi Aebersold教授、Brendan MacLean教授、Michael MacCoss教授、Christina Ludwig教授、Ben Collins教授、Yansheng Liu 教授等资深蛋白质组学专家在现场或通过视频的方式,先后为参会代表进行演讲、分享经验,提供最新的技术动态信息。刘巧霞博士介绍岛津蛋白定量分析解决方案 岛津分析中心刘巧霞博士作了题为“岛津助力构建食品药品蛋白定量检测平台--蛋白前处理、定量分析全套解决方案”的报告,介绍了基于nSMOL技术和Skyline软件的曲妥珠单抗LC-MS/MS定量分析方法,利用nSMOL选择性酶切技术可以快速筛选单抗特征肽段并减少基质干扰,提高检测的准确度和灵敏度;在食品检测方面刘博士首先介绍了利用全自动在线蛋白酶切系统Perfinity iDP与三重四极杆质谱联用定量检测奶粉中α-酪蛋白,将常规的过夜酶切缩短到4分钟,并实现完全在线酶切,脱盐和分析。最后刘博士还介绍了借助Skyline软件,利用岛津三重四极杆质谱定性定量检测牛肉中的猪肉掺假,为肉类品种鉴定提供准确快速解决方案。关于岛津 岛津企业管理(中国)有限公司是(株)岛津制作所于1999年100%出资,在中国设立的现地法人公司,在中国全境拥有13个分公司,事业规模不断扩大。其下设有北京、上海、广州、沈阳、成都分析中心,并拥有覆盖全国30个省的销售代理商网络以及60多个技术服务站,已构筑起为广大用户提供良好服务的完整体系。本公司以“为了人类和地球的健康”为经营理念,始终致力于为用户提供更加先进的产品和更加满意的服务,为中国社会的进步贡献力量。
  • 我国开发定量蛋白质组学数据解析软件
    中科院计算所究团队与董梦秋实验室合作,成功开发了定量蛋白质组学数据解析软件,用计算方法排除干扰信号的影响、提高肽段和蛋白质的定量准确度并对每个定量值进行准确性评价。  基于质谱的定量蛋白质组学是现代生物学技术的生长点之一,用于测量复杂生物体系中蛋白质及其翻译后修饰在不同条件下的丰度变化,是研究蛋白质功 能和药物作用机制的重要工具。已有的定量软件往往不能有效排除干扰信号,定量值的计算方法有待完善,而且缺乏准确性评价,致使输出结果&ldquo 鱼龙混杂&rdquo ,引起 的假阳和假阴两方面的困扰都比较严重。  为了更好地解决问题,开发者研究了几百个可疑定量值的原始质谱图和色谱图数据,找原因、攒经验,充分挖掘肽段的质谱、色谱信号特点以及从肽段定量到蛋白 质定量的方法,灵活应用各种组合和统计算法,建立了一整套非常细致的数据分析流程。为了验证软件的性能,董梦秋实验室的同学通过轻重SILAC或 14N/15N标记哺乳动物细胞或细菌,从10:1到1:10按不同比例混合得到14套标准样品,产生了14套测试数据集。 测试结果表明,定量结果的准确性明显超过定量蛋白质组学领域的两个主流软件Census和MaxQuant,主要表现在输出的非数比值数目(即 不能定量的部分)占总比值数目的0.01&ndash 0.5%,远低于Census的MaxQuant的对应比例2.5&ndash 10.7%和 1.8&ndash 2.7%;Census和MaxQuant输出了许多不准确结果,其定量值的标准差是软件的1.3&ndash 2倍;给出了肽段和蛋白质定量比值的置信区 间,而Census和MaxQuant没有准确性评价。目前,该研究工作得到了科技部、基金委、中科院和北京市政府的资助。
  • 中山大学李惠琳:非变性质谱技术推动蛋白质结构研究,助力新药研发
    蛋白质是生命的物质基础,通过与不同生物分子间的相互作用在生物体内执行着各项重要工作,其功能与结构直接相关。因此,解析蛋白质及其复合物高阶结构对于深入理解蛋白质功能、生理现象及药物研发具有重要意义。过去的60余年,随着X-射线晶体衍射(X-ray)、核磁共振(NMR)以及冷冻电镜(cryoEM)等技术的出现和不断发展,蛋白质结构解析取得了长足发展。然而,如何在分析蛋白质时使其保持近似自然生理环境的非变性状态,对其动态、异质性、相互作用等属性的研究是结构生物学领域的热点和难点。  质谱技术的不断发展使其在蛋白质结构表征领域发挥了越来越重要的作用。非变性质谱(native MS)兴起于20世纪90年代,是一种可以分析蛋白高阶结构的生物质谱方法。与传统的破坏蛋白质立体结构和弱相互作用力的方法不同,非变性质谱采用质谱兼容的近生理pH值的溶液体系(主要为醋酸铵)和更温和的电离方式,使生物大分子在气相中能够最大程度地保持自然折叠状态、非共价相互作用和相关的生物学功能。因此,非变性质谱可以提供分子质量、寡聚态、构象(折叠vs 去折叠)、异质性、配体结合、靶蛋白-小分子亲和力以及复合物中蛋白亚基的相互作用网络关系等更具生物学意义的重要信息,为蛋白质“序列-结构-功能”关系提供分子基础,已成为结构生物学不可或缺的互补工具,在生物制药、蛋白一配体、蛋白一蛋白复合物结构分析等诸多领域具有广泛应用。  近年来,蛋白质结构研究领域经历着剧烈的技术迭代。2021年人工智能(AI) AlphaFol2横空出世,将蛋白质3D结构预测的精度从60%提升到90%以上,在给传统结构解析技术带来冲击的同时,也为结构质谱的发展提供了契机。  未来,非变性质谱技术的发展需要简化样品处理,提升仪器的灵敏度、分析通量和鲁棒性,实现内源性蛋白复合物样本的直接或原位分析,推动其在生物医药表征、蛋白多聚态等领域的更广泛应用。非变性质谱技术与离子消度(MS)、自上而下串联解离(top-down)、电荷检测质谱(CDMsS)等创新联用技术和方法的不断开发及完善,将极大地提升结构信息的广度、丰富度及精确度,补充生物物理学方法缺失的结构信息。同时,非变性质谱与cryoEM1、氢完交换质谱(HDX-MS)、交联质谱等技术联用将更加常态化,这些实验数据与AI结构预测算法的进一步整合将有效解决蛋白及蛋白复合物结构预测存在的精度问题,推动结构生物学发展,助力新药研发。  此外,非变性质谱技术的应用发展将更加关注:1)蛋白复合物结构一功能关系的研究,通过与计算机模拟(MD)、HDX-Ms、cryoEM等技术联用,揭示标志物蛋白在人类疾病发展过程中的作用,推动靶向药物设计和精淮医疗 2)通过研究小分子与靶蛋白的相互作用获取二者结合的亲和力信息,加速靶向药物筛选 3)翻译后修饰(PTMS)、突变等因素导致的蛋白高度异质性及其对蛋白或亚基折叠动力学、构象及构象变化、结合计量比等造成的结构和功能影响 4)蛋白与其他生物分子(配体、DNAA/RNA、金属离子等)之间的相互作用。  李惠琳,中山大学药学院教授,博士生导师。主要从事生物大分子质谱新技术的开发及应用,其研究主要侧重于1)开发整合结构质谱技术,并对蛋白质机器结构、功能和动态变化及靶向药物作用分子机制进行深入研究2)开发middle-down/top-down蛋白质组学技术,探索蛋白翻译后修饰在生命过程中的调控机制。承担国家自然科学基金项目3项,荣获美国质谱学会颁发的Postdoctoral Career Development Award (2014) ,入选珠江人才计划(青年拔尖人才,2019),其研究成果发表在Nature Chemistry, Analytical Chemistry, J. Am.Soc.Mass Spectrom.等杂志。  "非变性质谱技术研究与应用"专栏共收录7篇论文,既介绍了非变性质谱技术的样品制备、离子源、质量分析器、联用技术等基础内容,也涵括了样品提取、样品引入、离子化及电荷操控等方式,以及在蛋白结构及构象解析、蛋白・蛋白相互作用等领域的应用,代表了国内非变性质谱技术的发展现状。希望本专栏能成为《质谱学报》广大读者颇有价值的科技文献,同时也希望更多的学者加入到非变性质谱研究领域,推动我国结构质谱技术的创新发展。
  • 融智生物:蛋白定量检测有望成为临床质谱的新突破点
    临床质谱成为精准医疗新方向临床检验需求的提升不断推动着检验技术的发展。生化、免疫等传统检验技术虽然具有自动化程度高、检测速度快的优势,但是已经不能满足临床对于检验方法灵敏度、特异性、多指标联检等的需求。近年来,临床质谱逐渐进入临床,由于其本身具有高灵敏度、高特异性、多指标联检等的优势,可以提高现有检验项目的精准度,也可以作为生化、免疫技术的有力补充,更好地指导临床诊断,有望成为精准医疗的新方向。所谓临床质谱,是指针对临床上特定分子的检测需求,结合了质谱仪器、试剂、耗材及样本前处理的一整套解决方案的统称。临床质谱技术目前在新生儿遗传代谢病筛查、维生素检测、药物浓度监测、激素检测、微生物鉴定、微量元素检测等多个临床场景应用广泛,主要集中在临床小分子代谢物的定量检测以及蛋白、核酸等大分子的定性检测方面,鲜见对于蛋白标志物的定量检测。MALDI-TOF质谱:临床大分子检测利器临床小分子代谢物的检测主要采用的是三重四极杆串联质谱技术(LC-MS/MS),这也是一段时间内临床质谱的主流技术。随着生命科学的进展,以及质谱技术的发展,能用于蛋白质、多肽、核酸等生物大分子检测的基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术越来越受到人们的关注。MALDI-TOF MS的工作原理是用一定强度的激光照射样品与基质形成的共结晶薄膜,基质从激光中吸收能量,与样品之间发生电荷转移使得样品分子电离。离子在高压电场作用下加速进入飞行管中,小离子飞得快,先到达探测器,大离子飞得慢,后到达探测器,从而得出检测结果。图 MALDI-TOF MS工作原理示意图由于其“软电离”的工作原理,MALDI-TOF MS非常适用于蛋白质、多肽、核酸等生物大分子的检测。临床质谱新高地——蛋白定量质谱目前常用的临床蛋白标志物的检测主要采用化学发光、免疫等方法,这些方法普遍存在依赖于抗体、抗干扰能力差、检测通量低、成本高等问题;串联质谱应用于蛋白质的检测虽然具有灵敏度、准确度、特异性高的优势,但是由于临床样本基质复杂,样本前处理繁琐,较难实现自动化,其对蛋白标志物的检测仍然停留在大规模蛋白标志物的筛选即科研层面,真正能用到一线临床蛋白标志物检验的质谱尚未出现。也就是说,临床质谱的蛋白定量检测目前仍然是一块空白的区域。MALDI-TOF MS在众多质谱中原理较简单、操作简便、对样本要求较低,是最容易实现自动化的一类临床质谱类型,这对于临床质谱的蛋白定量检测而言是一项巨大的优势。然而,上一代的MALDI-TOF MS由于重现性较差(SD>30%),不能满足临床定量的要求,所以其应用集中在定性检测方面,临床上我们所熟知的微生物质谱、以及近两年热门的核酸质谱都是MALDI-TOF MS在临床上的定性应用场景。随着技术的更新迭代,如今MALDI-TOF MS也能实现临床定量检测应用了。融智生物自主研发的新一代的MALDI-TOF MS平台——QuanTOF新一代宽谱定量飞行时间质谱,通过速度和空间同步聚焦、靶板和离子探测器同时接地、极高频率数据采集等专利技术的改进,首次实现在宽质量范围内(10-1,000,000Da)具有高的检测灵敏度和分辨率,且仪器的重现性达到SD<5%,完全能够满足临床定量的性能要求。图 QuanPRO蛋白定量质谱解决方案依托于高性能的QuanTOF质谱平台,融智生物正在朝蛋白定量检测方向积极布局,已经推出了包含试剂盒、全自动前处理仪器、质谱仪、数据处理软件在内的QuanPRO蛋白定量质谱全流程解决方案,可以一站式解决临床蛋白定量检测的面临的挑战,为临床疾病蛋白标志物的筛查提供更加快速、准确、经济的新方法。未来,临床蛋白标志物的快速筛查将是QuanTOF除微生物鉴定、核酸检测以外的一个重要的应用领域。
Instrument.com.cn Copyright©1999- 2023 ,All Rights Reserved版权所有,未经书面授权,页面内容不得以任何形式进行复制