创新数据非依赖性采集用于复杂基质目标蛋白质的定量分析
数据非依赖性采集(DIA)是随着定量蛋白质组学而建立的质谱扫描技术。 DIA 能够获得扫描范围内所有母离子及二级子离子信息,不会造成低丰度离子信息的丢失,同时突破了高分辨质谱二级定量的通量限制。 本研究基于静电场轨道阱 Q-qIT-OT 三合一质谱,发展了经典 DIA 方法以及 WiSIM-DIA 和 Full MS-DIA两种全新 DIA 方法,并对 Hela 细胞全蛋白中添加的 10 条低浓度肽段进行定量分析,考察方法的线性、重现性和灵敏度。 结果表明,3 种方法的定量限均低至 amol (14 ~435 amol),并展示出良好的线性和定性确证可靠性。 其中,WiSIM-DIA 基于超高分辨一级监测定量,与经典 DIA 优势互补 Full MS鄄DIA 的选择窗口仅 3 amu,能够直接进行搜库鉴定,实现了数据依赖性采集(DDA)和 DIA 的统一,摆脱了 DIA 依赖于 DDA 建立谱图库的局限性。