当前位置: 仪器信息网 > 行业主题 > >

单细胞微滴制备系统

仪器信息网单细胞微滴制备系统专题为您提供2024年最新单细胞微滴制备系统价格报价、厂家品牌的相关信息, 包括单细胞微滴制备系统参数、型号等,不管是国产,还是进口品牌的单细胞微滴制备系统您都可以在这里找到。 除此之外,仪器信息网还免费为您整合单细胞微滴制备系统相关的耗材配件、试剂标物,还有单细胞微滴制备系统相关的最新资讯、资料,以及单细胞微滴制备系统相关的解决方案。

单细胞微滴制备系统相关的资讯

  • 如何制备*单细胞悬液,几个小TIPS包教包会
    时下细胞研究很火的科研技术当属单细胞测序,但此技术对细胞悬浮液的总量以及活性都有一定的要求,因此制备高质量的单细胞悬浮液成为实验成功的关键点。单细胞测序涉及的细胞类型多种多样,如肠、肺、PBMC、胚胎、神经、乳腺、干细胞等,而其中样本的处理消化亦是重中之重,样本前处理与后续的分析结果有着莫大的关联。如何在上机前得到最*的悬液呢?这里和大家分享一些制备*单细胞悬液的小tips。1、在样本采集过程中,建议采用无菌样品处理方式,包括使用不含核酸酶的试剂和耗材;2、实体组织需要先处理,传统组织处理方法有机械法,包括网搓法、研磨法。机械法一般适用样本类型为脾脏、淋巴结、胸腺;另外较温和的方法有酶解法(使用胰蛋白酶类、胶原酶、溶菌酶、弹性蛋白酶以及一些商业化包装的组合酶),适用样本类型有肝脏、肾脏、心脏、肺脏、脊髓、脑、肠道、皮肤、肿瘤等。3、如果您使用的是10x Genomics相关仪器和平台,可以从官网查看10x Genomics不同样本单细胞悬液制备官方建议或者利用关键词查询与自己样本类型相同的已发表的单细胞测序文献。对于如何获得高质量的样品,10X公司建议在单细胞悬液制备过程中,细胞重悬的缓冲液选用无Ca2+、Mg2+和EDTA的1× PBS,并用0.04% non-acetylated BSA清洗两次(300rcf,5min),选择其他缓冲液或培养基可能会对结果产生不同程度的影响。4、细胞在处理过程受到外界环境影响,其基因表达谱可能会出现一些变化;有些细胞对环境极为敏感,可能会死亡裂解,造成RNA降解从而造成检测中的背景细胞升高,进而影响所获得的数据质量。实验过程中需要尽量避免细胞死亡,不断优化细胞处理条件,加快实验流程的进度,减小对细胞的影响。5、单细胞悬液制备过程中出现的细胞团、细胞碎片或纤维等杂质会增加微流体芯片的堵塞风险。如果存在细胞碎片和大团块,请将样品通过40 µm Flowmi 细胞过滤器,细胞悬液体积损失小。 图源:10x Genomics 的Protocol《 Fresh Frozen Human Peripheral Blood Mononuclear Cells for Single Cell RNA Sequencing》图源:《10x GenomicsSingle Cell Protocols——Cell Preparation Guide》相关产品Bel-Art Flowmi 40微米 细胞过滤器,适用于1000微升移液管(50个/包)
  • 新品速递|华大智造发布DNBelab C4单细胞测序文库制备试剂盒
    单细胞测序技术的发展日新月异,单细胞的研究已进入超高通量、超大数据研究阶段。华大智造自主研发的DNBelab C系列高通量单细胞RNA文库制备试剂盒(简称DNBelab C4)发布,助力突破单细胞研究门槛高、费用高的瓶颈,加速细胞分辨率下生命科学和医学新一轮的变革与发展,拥抱千万单细胞时代的到来。目前,应用华大智造DNBelab C4和DNBSEQ测序平台已开展百万单细胞项目十余项,发表SCI文章十余篇。2022年3月22日,国际顶级学术期刊《自然》(Nature)发表了基于华大智造单细胞利器DNBelab C4和DNBSEQ测序平台的科研应用。该研究助力科学家精确得到诱导全能干细胞(8CLC),并且通过细胞图谱分析证明了发育得到组织的多样性,证明了8CLC的全能性,最终获得了人类体外诱导的全能干细胞。这一研究的突破,正是得益于单细胞测序技术的进步与应用。在过去,研究人员可能要对成千上万个细胞进行处理和培养,才能获得全能干细胞,成功的概率只有不到百分之十五。基于华大智造自主开发的DNBelab C4,结合DNBSEQ测序平台,科学家可以以高灵敏度和高准确性的方法进行多维的单细胞分析,快速得到具有重要发育潜能的细胞,并研究这些细胞的发育去向。 利用8CLC发育的畸胎瘤组织充分证明8CLC的全能性 口袋里的单细胞实验室 每套试剂盒均带有一个小巧便携的DNBelab C4装置,无需电源,不需安装和维护,只需轻轻一拉便可实现单细胞液滴生成,堪称“可装进口袋的单细胞实验室”,简化了仪器的操作难度,并降低了单细胞研究的门槛。高效的磁珠捕获系统华大智造DNBelab C4采用自主设计的捕获磁珠,平均单个磁珠表面修饰有107条捕获序列,能够高效捕获目的分子;同时引入了自主研发的多磁珠识别技术,可有效提高细胞捕获效率以及获取细胞的完整信息。目前,DNBelab C4已经应用于人、鼠、猴、猪等十几个物种,超200种不同类型样本的单细胞转录组研究;单次实验有效捕获细胞数量1,000~12,000个,多胞率(Multiplet Rate)8%,每个细胞基因个数平均数4,000(细胞系),每个细胞UMI中位数15,000个(细胞系)。投入细胞捕获效率捕获细胞数多胞率UMI中位数/细胞(细胞系)平均基因个数/细胞(细胞系)5,000~30,00030~60%1,000~12,0008%15,000-30,0004,000单细胞研究一站式平台华大智造为单细胞测序提供一站式平台,包括自动化文库制备系统MGISP-100、MGISP-960和基因测序仪MGISEQ-2000、DNBSEQ-T7等,全面支持单细胞组学研究的快速展开。其中,自动化建库平台的搭建,有助力于节省人力、提高通量、减少操作失误。现已有部分研究机构和测序服务机构采用了该一站式平台进行了单细胞测序应用,测序结果表现优异。作为生命科技核心工具的提供者,在单细胞领域,华大智造致力于为所有生命科学实验室提供便携、经济、用户友好的单细胞组学全流程产品,助力行业开启规模化单细胞研究新时代。华大智造正在开展服务商认证,首批已认证三家服务商。
  • 实验室达人的秘密武器|高压均质机与单细胞悬液制备仪实用指南
    实验室中的科研人就如同探索未知的勇士,他们借助着各种精密仪器,探寻着各种神奇奥秘。当我们在追求科研的精准与效率时,两款设备不容忽视—那就是高压均质机和单细胞悬液制备仪。它们如同实验室中的得力助手,以其独特的功能为实验工作提供了极大的便利性,同时也解决了部分操作时的难题。想要获取更多的研究思路和手段吗?那就让我们一起走近这两款设备,感受它们为科研带来的无限可能。一、高压均质机:高压均质机这一看似普通的设备,实则蕴含着巨大的能量。利用高压和剪切力,将物料进行均质化处理,使得原本不均匀的混合物变得细腻均匀。在食品、化工、医药等领域,高压均质机都发挥着不可替代的作用。在实验室中,科研人员可以利用高压均质机对样品进行预处理,提高实验的准确性和可靠性。 高压均质机 JXNANO-5高压均质机应用领域:制药行业中制备脂肪粒、载药型乳液均质、脂质体、纳米混悬剂和微胶囊等 生物工程产品的细胞破碎、胞内外物质的提取和均质 精细化工、碳纳米管、石墨烯、导电浆料、电阻浆料的生产和制备 个人护理品-脂质纳米的均质分散 食品和工业产品的均质和乳化,提高产品稳定性 高压均质机产品优势:①结构特点:单支陶瓷柱塞驱动,出料流量精准控制。可选配柱塞润滑装置,密封使用寿命更长。②均质压力:最大设计压力2000bar/200MPa/29000psi,选用卫生级数字隔膜压力表。③均质流量:最小样品量15ml,特别适合昂贵的药剂生产。自动吸料,无需进料设备。④部件技术:均质阀座组件可采用氧化锆、钨钢、金刚石、司太立等材质,单/双面加工,双面使用,使用寿命加倍。二级阀分散乳化,使物料分布更加均匀一致。⑤节能技术:设备变频控制,接入220V市电即可使用,进口品牌部件设备更稳定,更低的能耗,更高的能效比。二、单细胞悬液制备仪:单细胞悬液制备仪是实验室中另一款不可或缺的设备。应用于流式细胞术/单细胞测序/原代细胞培养等实验。另外单细胞悬液制备仪在肿瘤研究 心血管研究 干细胞研究 免疫研究 神经科学研究等研究领域的应用也很广泛,主要目的时为科研人员提供了更多实验便利。单细胞悬液制备仪 JX-CKSM-4WK样品范围:人类及小鼠肿瘤组织/正常组织,哺乳动物软组织,植物愈伤及根尖组织。产品应用:单细胞测序(Single-Cell RNASeq)多色流式分析(Multicolor Flow Cytometry)质谱流式细胞计数(Mass Cytometry)原代细胞分离培养(Primary Cell Isolation And Culture)细胞治疗CAR-T组织高利用率、单细胞化过程高效、单细胞高产出1、操作简易,制备流程全自动,仅需30min即可获取大量单细胞悬液2、自动控温,保护样品活力,细胞活性可达85%以上3、多种消化方案,针对不同样品选择不同程序,针对不同组织均有配套试剂盒4、针对临床穿刺样本,使组织的利用率达到100%,细胞产量可达10万个以上5、针对原代细胞培养样本,在15min内完成组织到单细胞过程,降低细胞逆境时间,提高细胞存活率6、针对组织单细胞测序,快速完成单细胞化处理,获得高产且活率在85%以上的单细胞,以小鼠组织为例:在实验室的日常工作中,高压均质机和单细胞悬液制备仪的使用频率很高。科研人员通过操作这些设备,不仅能够提高实验效率,还能够减少人为误差,保证实验结果的准确性。同时,这些设备还具有操作简便、性能稳定、便于清洁等优点,使得科研人员能够更加专注于实验本身,而不是被繁琐的清洗和操作所困扰。净信小贴士:目前任何设备都不是万能的。在使用高压均质机和单细胞悬液制备仪时,科研人员也需要注意一些细节问题。例如,要定期对设备进行维护和保养,确保设备的正常运行;在操作过程中,要严格按照操作规程进行,避免因为操作不当而导致设备损坏或实验结果失真。
  • 363万!中国海洋大学多功能酶标仪、单细胞悬液制备仪等设备采购项目
    项目编号:SDSHZB2023-058项目名称:中国海洋大学多功能酶标仪、单细胞悬液制备仪等设备采购项目预算金额:363.0000000 万元(人民币)采购需求:本项目预算总金额为363万元,共分为5个包,其中:A1包:多功能酶标仪等设备(接受进口产品),预算金额:109万元;A2包:移动式小动物麻醉机等设备(接受进口产品),预算金额:51.5万元;A3包:全自动无创血压测量系统等设备(接受进口产品),预算金额:72万元;A4包:液晶数码生物显微镜等设备(接受进口产品),预算金额:44万元;A5包:冷冻切片机等设备采购(接受进口产品),预算金额:86.5万元。合同履行期限:详见附件本项目( 不接受 )联合体投标。获取招标文件时间:2023年03月18日 至 2023年03月24日,每天上午8:00至11:30,下午13:00至16:00。(北京时间,法定节假日除外)地点:青岛市市北区敦化路138号甲西王大厦24楼23A01室或者邮件报名方式:以下方式二选一:(1)现场报名:须携带加盖单位公章的营业执照副本复印件及现金,按照上述时间、地点获取招标文件。(2)邮件报名:有意参加本次采购活动的投标人填写项目名称、项目编号、包号、公司名称、联系人、联系电话、邮箱、营业执照扫描件及标书费汇款底单发送至shzbqdb@163.com,邮件名称命名为:中国海洋大学多功能酶标仪、单细胞悬液制备仪等设备采购项目-“投标单位名称”。未按规定报名的投标人其报名无效。开户银行:兴业银行青岛市北支行,开户名:山东盛和招标代理有限公司,银行账号:522130100100053768,提交标书费须从投标人基本账户或一般账户转出,电汇时须备注2023-058-包号、资金用途注明标书费。未按规定报名的投标人其报名无效,本项目实行资格后审,获取招标文件成功不代表资格后审通过,招标文件售后不退。售价:¥300.0 元,本公告包含的招标文件售价总和对本次招标提出询问,请按以下方式联系。1.采购人信息名称:中国海洋大学地址:青岛市崂山区松岭路238号联系方式:崔老师 0532-667819792.采购代理机构信息名称:山东盛和招标代理有限公司地址:青岛市市北区敦化路138号甲西王大厦24楼23A01室联系方式:孙萌、张蕾、肖颖梦 0532-67737979 3.项目联系方式项目联系人:孙萌、张蕾、肖颖梦电话:0532-67737979
  • 美谷分子发布DispenCell 单细胞分离系统新品
    DispenCell专为快速、简单、温和地分离单细胞而开发,可应用于细胞株开发、CRISPR编辑的细胞筛选、稀有细胞分离、单克隆抗体筛选和单细胞基因组学等多种单细胞分离场景。基于阻抗技术的分离方式可以更加温和的处理细胞样品,小于0.1psi的分离压力让自动分离也能拥有高细胞活率。DispenSoft软件可提供即时可追溯的克隆性证明图谱,搭配CloneSelect Imager FL高通量单克隆验证系统,在第0天即可准确检测到单细胞并验证单克隆性。DispenCell主机紧凑小巧,可放置在生物安全柜等无菌环境中,软件操作界面简单直观,易于学习和使用。1. 温和高效DispenCell可实现对细胞样品更加轻柔的处理,小于0.1psi的分离压力与手动移液相当,但效率更高(~5min/96孔板)。分离过程无激光照射,保证细胞的完整性,因此,细胞活性和生长得以保持。2. 克隆性证明DispenSoft单细胞分析软件可提供即时和可追溯的克隆性证明图谱,允许用户在细胞分配后立即检查克隆性。3. 基于阻抗的分离吸头DispenCell 配有一个检测细胞通过的感应吸头,随着每个细胞的通过将触发一个独特的信号并被软件记录。无菌一次性分离吸头可确保清洁的单细胞分离,且无交叉污染,经认证不含动物源产品和细胞毒性材料。4. 小巧、简单、易用DispenCell体积小巧,可放置在生物安全柜等无菌环境中工作。仪器和软件操作简单,易于设置,无需清洁和校准,样品制备简单,易于学习和快速上手使用。简化工作流程的组合解决方案单细胞分离和单克隆验证在很多应用中都至关重要!例如细胞株开发过程,不仅需要分离和处理大量的单细胞,还需要验证单克隆性并形成证据来用于最终申报。CloneSelect Imager FL 和 DispenCell 的组合,能够提供高效的过程以及可信的证据,在第 0 天即可自信地验证单克隆性。CloneSelect Imager FL 单克隆验证系统全新的 CloneSelect Imager FL,在标准白光成像基础上,增加了高对比度多通道荧光技术,可在第 0 天准确的检测到单细胞并验证单克隆性。通过比较汇合度分析来识别和验证基因编辑。• 数字化记录单细胞证据,以便提交给监管机构• 在多个时间点对细胞进行非侵入式成像,以监测克隆形成• 使用高分辨率白光成像进行筛选• 通过动态分析提供实时结果• 可进行自动化整合
  • 华大智造单细胞赛道再发力!发布单细胞液滴生成仪及组学新品
    7月29日,在第十二届细胞产业大会的单细胞多组学与临床应用分论坛上,华大智造重磅发布其在单细胞领域的两款最新产品,单细胞液滴生成仪 DNBelab C-TaiM 4(泰山),以及单细胞表观组学产品scATAC建库试剂盒。单细胞液滴生成仪 DNBelab C-TaiM 4(左)及单细胞表观组学产品scATAC建库试剂盒(右)这是华大智造继DNBelab C系列高通量单细胞转录组建库试剂盒产品后,单细胞组学全流程产品家族补充的重要产品,更为完善的产品组合也将更好地赋能全球生命科学实验室开启规模化、标准化的单细胞多组学研究。两款新品加持单细胞测序全流程本次上新的单细胞液滴生成仪DNBelab C-TaiM 4 (以下简称TaiM4)的命名灵感来源自“泰山”,传递了华大智造不断攀登技术极限的理念。TaiM 4能为细胞或细胞核的分离和标签提供稳定的动力。该仪器配备4个独立控制的微流控通路,同时兼容单细胞ATAC文库和3’ RNA文库制备需求,支持1-4个样本的灵活上样。它延续了华大智造单细胞产品小巧轻便、即开即用的优点,适用于2500米以下的海拔实验环境。此外,该设备在单细胞ATAC文库制备过程中的细胞核分离、标记过程仅需6分钟;在单细胞3’RNA文库制备过程中的细胞核分离、标记过程仅需9分钟。华大智造单细胞液滴生成仪DNBelab C-TaiM 4另外一款上新产品是DNBelab C系列高通量单细胞ATAC文库制备试剂盒套装及配套的微流控载片。和DNBelab C-TaiM4 单细胞液滴生成仪配套使用,可以完成数万细胞核的ATAC文库制备。试剂盒套装包含液滴生成使用的百万级标签磁珠、自主开发的液滴生成油、以及适配华大智造测序仪的文库制备试剂等。该产品基于精密压力驱动微流控技术,污染率低,可完成高质量单细胞ATAC文库的制备和数据产出。可用于免疫组学、肿瘤、神经科学、发育生物学等领域的单细胞研究。两篇Nature 科研应用表现不俗值得一提的是,scATAC建库试剂盒已经在科研应用中牛刀小试,早期试用的结果已用于2篇Nature文章中,产品数据表现不俗。一站式平台 助力单细胞多组学标准化、规模化华大智造作为生命科技核心工具缔造者,能够为单细胞测序全流程提供独一无二的一站式平台。其中,针对细胞/细胞核制备环节,华大智造提供小鼠多组织解离试剂盒和50+物种组织解离方案指南;此外,已经发布的DNBelab C系列3’ RNA建库产品,已经产出了 30000+例样本数据,覆盖了40多种物种类型和300多种组织类型,重磅预告了不同物种组织的3’ RNA数据表现白名单,并展示了部分数据;在数据分析环节,提供配套的单细胞高通量、高精度多模态分析平台,不仅能够对单细胞测序数据进行简单的质控,还支持更多功能的分析和多组学数据的整合。华大智造产品市场中心总监汪婧婧博士在发布会现场表示:“华大智造在单细胞领域,除了为科研人员提供单细胞建库产品和基因测序产品MGISEQ-2000、DNBSEQ-T7、DNBSEQ-T20外,还能够提供自动化文库制备系统MGISP-100,将复杂的单细胞文库制备过程转移到自动化平台一键运行,为单细胞行业引入了全新的自动化概念,这将开启单细胞湿实验标准化时代的到来,我们也坚信单细胞多组学标准化、规模化时代终将来临。”汪婧婧博士华大智造产品市场中心总监单细胞产品家族图自动化建库流程图在单细胞产品领域,华大智造通过其率先发布的DNBelab C系列产品,已收获了众多企业及科研用户的好评。在过去的一年时间里,国内已有9个企业认证成为华大智造单细胞产品服务商,终端使用客户数量100多家。在科研产出上,基于华大智造单细胞测序平台,已累计产出高质量文章50多篇,其中包括2篇Nature,1篇Cell,其中有21篇文章IF>10,充分证明了该单细胞平台性能的优越性。小结:单细胞技术是当前测序领域最火的技术之一,相关公司超过50家,其中不乏众多国产企业。作为国内基因测序上游龙头企业,华大智造并非在单细胞领域走的最快的,但其追赶之势十分迅猛,加上本身先天平台优势,大有后来者居上的势头。如其所言:“未来,华大智造将进一步深耕单细胞组学领域,发挥自身在基因测序设备领域、实验室自动化领域的优势,为规模化的科学研究、为单细胞组学全面进入临床及精准健康研究,提供更为优质、标准的系列产品组合,赋能单细胞多组学标准化、规模化时代”。
  • 液滴微流控流式细胞仪技术|CTC单细胞miRNA原位多重检测
    在液体活检的研究中,基于表面上皮标志物(EpCAM和CK)的循环肿瘤细胞(CTC)检测策略应用较为广泛,但存在局限性。研究表明,CTC中的肿瘤相关miRNA与癌症的发生和发展具有高度相关性,具有成为肿瘤表征和鉴定标志物的潜力。目前,高通量地针对单个CTC在活细胞水平开展原位分析,并进一步实现多个miRNA的同步分析,是颇具挑战性的工作。然而,新型的二维纳米材料——金属有机框架(MOF)因结构可控、功能多样的特性,为研究人员提供了活细胞探针载体的新思路。   近日,中国科学院深圳先进技术研究院陈艳团队联合清华大学深圳国际研究生院谭英团队、香港理工大学杨莫团队,提出了新型的2D MOF纳米传感器集成的液滴微流控流式细胞仪(Nano-DMFC),可应用于CTC单细胞miRNA的原位多重检测。相关研究成果以2D MOF Nanosensor-Integrated Digital Droplet Microfluidic Flow Cytometry for In Situ Detection of Multiple miRNAs in Single CTC Cells为题,发表在Small上。   本研究开发了一种新型的2D MOF纳米传感器集成的液滴微流控流式细胞仪(Nano-DMFC),突破了活细胞中核酸原位分析的技术瓶颈,高通量地实现了样本中单个CTC活细胞miRNA的原位、多重、定量分析。该纳米传感方案以金属有机框架MOF为猝灭剂,双色荧光染料标记DNA探针为供体,首次合成了用于双重miRNAs检测的生物功能化MOF荧光共振能量转移(FRET)纳米探针。该2D MOF纳米传感器修饰了两种乳腺癌靶向多肽序列,以增加肿瘤细胞靶向和内体逃逸能力。集成2D MOF纳米传感器的数字液滴微流控流式细胞仪,可实现单个乳腺癌细胞中双重miRNA标志物(miRNA-21和miRNA-10a)的原位检测。   纳米传感器集成的液滴微流控流式细胞仪由三部分组成——单细胞液滴发生器、纳米探针微注射单元和液滴荧光检测单元。Nano-DMFC系统首先产生单细胞液滴,然后2D MOF纳米传感器被精确地微注射到每个单细胞液滴中,在活细胞水平实现单个肿瘤细胞中的双重miRNA表征。在单个肿瘤细胞内存在目标miRNA时,MOF纳米片上的染料标记的ssDNA与其靶标形成杂交双链DNA(dsDNA),dsDNA和MOF之间的相互作用减弱,使dsDNA从MOF表面分离,最终触发荧光的恢复。不同类型的miRNA在单个细胞中产生不同的荧光信号。最后,研究使用光纤集成的液滴流式检测装置,在纳米探针孵育后对液滴中的信号进行检测和分析,从而实现对单细胞中双重miRNA的检测。实验结果表明,Nano-DMFC平台能够以双重miRNA为靶标在仿生样本(含有10,000个阴性上皮细胞)中检测出10个阳性CTC细胞,同时在加标血液样本的回收实验中表现出良好的重复性。该平台验证了以miRNA为标志物的CTC检测新策略。Nano-DMFC系统作为小型化、高度集成、操作简易的活细胞miRNA分析平台,为探究肿瘤细胞异质性和鉴定细胞亚型提供了新思路,并在临床研究中具有癌症早期诊断和术后监测的潜力。   研究工作得到国家自然科学基金、广东省粤港联合创新领域项目、深圳市科技创新委员会和香港研究资助局等的支持。   论文链接   A、同时检测miR-21和miR-10a的MOF-PEG-peps纳米复合材料传感器的制备方案;B、Nano-DMFC系统中的样品处理单元和miRNA检测单元,可实现单细胞液滴包裹、纳米传感器微注射、单个CTC细胞多重miRNA荧光检测。 在液体活检的研究中,基于表面上皮标志物(EpCAM和CK)的循环肿瘤细胞(CTC)检测策略应用较为广泛,但存在局限性。研究表明,CTC中的肿瘤相关miRNA与癌症的发生和发展具有高度相关性,具有成为肿瘤表征和鉴定标志物的潜力。目前,高通量地针对单个CTC在活细胞水平开展原位分析,并进一步实现多个miRNA的同步分析,是颇具挑战性的工作。然而,新型的二维纳米材料——金属有机框架(MOF)因结构可控、功能多样的特性,为研究人员提供了活细胞探针载体的新思路。
  • 环球公司成功举办单细胞RNA测序和液滴微流控技术交流会
    2011 年,《自然方法》杂志( Nature Methods )将单细胞测序列为年度值得期待的技术之一,2013 年,《科学》杂志(Science)将单细胞测序列为年度最值得关注的六大领域榜首,表明单细胞测序已成为科研热点。应广大客户的强烈需求,2017年6月6日-8日,环球分析测试仪器有限公司携手英国Dolomite Bio公司在北京、上海和广州成功举办单细胞RNA测序和液滴微流控技术交流会,会议的主要内容包括:1、液滴微流控技术应用在单细胞研究的优势2、高通量单细胞RNA测序实验中遇到的问题3、B细胞和T细胞、FACS分选等应用介绍4、现场演示Dolomite Bio公司的产品会议现场,Dolomite Bio公司的技术专家Muriel博士演示了单细胞制备的整个实验过程,现场所有客户均被邀请亲自体验了实验过程,客户对实验结果非常满意,并对Dolomite Bio系统通量高、应用灵活、开放的特点给予了极大的肯定。 北京会议现场 客户体验实验 上海会议现场 广州会议现场
  • 大连华微推出新产品:无极通量“阵列式单细胞超高通量柔性筛选系统”
    —“HW—TORNADO龙卷风”系列大连华微生命科技有限公司(Dalian Life Huawei Technology Co., Ltd.)(以下简称大连华微),是一家拥有自主知识产权,集研发、生产、销售及服务为一体的微流控系统一站式解决方案供应商。大连华微推出“HW—TORNADO龙卷风”系列单细胞液滴制备、混匀、检测、柔性操控与分选综合控制系统,引起业内客户高度关注。“HW—TORNADO龙卷风”系列产品,全球业内具有特色的“N×”阵列式并行模块单元结构,可积木式定制扩展,针对细胞、细菌、酶、病毒、蛋白、线虫等尺寸在0.1微米至2000微米范围的活性生物颗粒,实现高通量筛选:5亿×N个液滴/日(N=1,2,4,8,16…选用阵列数,理论上速度可任意增加);对尺寸在100纳米至2毫米米范围的生物颗粒进行液滴包裹、检测、分析及筛选,可删除空液滴,实现单个液滴只包含一个细胞、菌、酶(或其它生物颗粒);多频激光(405/488/532/561/638等)可根据用户需求配置,共聚焦实时协同作业,并可实现灵活的更换和快速升级;触摸屏软件,智能识别,实现自动化的操作处理;系统可根据客户需求定制生物芯片,实现液滴检测、混匀,以及无损操控与筛选。 大连华微成立伊始,就定位于世界前沿科技的研发与生产,其自主研发的“细胞、菌、酶液滴高通量制备、检测及柔性筛选系统”秉持民族品牌,已经发展5个系列数十种型号,成为业内知名、拥有完全自主知识产权的单细胞液滴自动化控制产品。公司本次重磅推出的:阵列式100%单细胞-巨高通量柔性筛选系统“HW—TORNADO龙卷风”系列,支持全面广泛的应用及科研需求,涵盖单细胞基因测序、基因编辑、细菌分选、药物筛选、疾病诊断、酶活筛选、基因文库构建等多个重要领域。 近一两年,国内出现很多仿制的实验室DIY型“分选系统”——依靠国外成型的功能组件、电源、信号控制部件搭接而成,智能程度低、可靠性差、误差不可控,分选过程对生物颗粒活性影响不可逆,且操作繁琐。最重要的:如果采购这种DIY型“产品”,一旦其进口电源、主控功率部件出现故障或损坏,DIY供应者无法修复,只有更换,且更换成本极高(至少需要RMB十万元以上,维修周期超过两个月,如西方限制进口则无法继续使用)。华微产品源于元器件级别的自主研发,客户众多,质量经过中科院、三甲医院、985高校等高端客户应用及检验,产品可靠性、柔性控制的性能远优于上述DIY型“产品”。华微产品除保修一年外,部件还终身享受成本价格换修(最贵的单个元件更换,不高于前述DIY供应者换修价格的三分之一),维修周期一般不超过一周,自主研发产品不存在受西方限制的核心组件,可大幅节省客户后续使用成本,这是拥有自主核心技术的底气。大连华微生命科技有限公司,依靠自有专利技术,立足独立研发民族品牌,致力于国际前沿领域的微流体控制科技产品的研发与生产,历经十年的探索磨砺,为中国乃至世界的业内客户带来全新的选择。未来公司将一如既往地重视创新科研,与广大华微客户一起携手进步,共同推动着中国生命科学的发展,做世界细分领域有话语权的中国高科技民族企业。关于华微生命科技:大连华微生命科技有限公司,坐落于素有中国“浪漫之都”之称的海滨城市大连高新区火炬路,是大连市第六批“海创工程”企业;成立伊始,就定位于世界最前沿科技的研发与生产,提供生物技术、生命科学、医疗健康、环境保护等领域的专业设备、耗材、服务,以及相关完整解决方案。
  • 高效构建hiPSC系的全自动化神器,单细胞可视化分选培养系统,让单细胞培养不再复杂!
    人类诱导多能干细胞 (hiPSC) 是一类通过基因编辑技术(如 CRISPR-Cas9)对已经高度分化的人体细胞重新逆分化得到的多能性干细胞。hiPSC的出现为科学家构建复杂的疾病模型和推进药物发现提供了有利的工具。 然而,传统的hiPSC细胞系的构建与培养过程往往操作复杂且耗时耗力。特别是从异质编辑细胞池中构建的克隆hiPSC系的培养受到了传统细胞培养方法的桎梏,很难构建一个高效的hiPSC构建与培养工作流程。此外,现有的单细胞分离和培养方法通常对细胞的处理条件苛刻,操作步骤繁琐,不能充分保证单克隆性。 为应对hiPSC细胞系构建与培养过程中的诸多挑战,IotaSicences公司采用了以GRID技术为核心的高度自动化的单细胞可视化分选培养系统isoCell来构建 hiPSC系的分选与培养平台,并在不同培养基条件下对hiPSC进行了单细胞分选与培养研究。图1 单细胞可视化分选培养系统isoCell实物图 以isoCell为核心的hiPSC细胞分选与培养平台 isoCell是一款基于GRID技术的高度自动化细胞分选与培养平台。GRID是指在细胞培养基上采用FC40液体分隔出的网格小室,体积小,光学透明度高,可以容纳细胞在内生长,且各个小室之间物质不流通。isoCell系统配备了荧光和成像系统,用于在整个克隆工作流程中记录 GRID 小室的图像(见下图)。isoCell 可自动执行所有液体处理步骤,包括构建 GRID、将单细胞注射到GRID小室中以及交换培养基和收获单克隆集落。并且,isoCell可在整个工作流程中自动检测每一个 GRID 小室,并确保每一个单克隆hiPSC细胞系来源于单个细胞。 图2 GRID实物图 材料与方法 在分别铺了Laminin-521、Vitronectin-N和iMatrix 细胞培养基质的60毫米培养皿上制备的GRID网格以待使用。制备hiPSC的单细胞悬浮液,并使用 isoCell全自动地将细胞铺在GRID上(种植)。 使用isoCell自带的显微镜鉴定每个GRID室并标记每个包含单个细胞(第 0 天)的室,将该培养皿放入培养箱培养。在第3天,将标记的含有单个细胞的GRID小室加满600 nl培养基。从第5天开始,每天观察标记单细胞的GRID小室,并对选中的GRID小室补充培养基。最后,使用isoCell观察并标记构成了hiPSC单细胞群落的GRID小室,使用isoCell全自动收获标记的GRID小室中的hiPSC细胞(通常在 6-8 天之间)。 图3 以isoCell为核心的hiPSC细胞分选与培养平台工作流程图 高效的hiPSCS细胞分选与培养平台 按照上述的工作流程,利用三种不同的培养基质(包括 VTN-N、LMN-521 和 iMatrix)构建并培养了两个独立的hiPSC细胞系,并评估所得细胞的克隆效率。如图4所示,两个不同的hiPSC测试系在不同培养基质条件下,均在GRID室中显示出非常高的克隆效率,这表明采用GRID小室低容量培养方法和细胞的自动化温和处理可产生非常适合单细胞高效生长的培养环境。 图4 GRID中的单细胞 hiPSC 克隆效率(克隆效率表示培养第5天时单细胞长成细胞群落数占第0天单细胞数的百分比) 结论 以isoCell构建的hiPSC细胞分选与培养平台可以对hiPSC细胞进行全自动化且温和地单细胞分选与培养。通过isoCell特有的GRID小室网格技术与可视化分选相结合,可以确保每一个单克隆hiPSC细胞系均来自单个细胞,且isoCell的分选与培养条件温和,hiPSC单克隆细胞系成活率高。 单细胞可视化分选系统isoCell的优势:- 全自动化流程- 操作条件温和,对单细胞无损伤- 全培养、分析流程可追踪- 单细胞分离效率高达100%- 单克隆细胞系构建成活率高- 直接转移到PCR管或96孔板- 结构紧凑,体积小 单细胞可视化分选培养系统-isoCell已在Cell、Advanced Science、Small Methods、Nature Communications等知名期刊发表多篇文章,如下摘引了近年五篇具有代表性的文献和大家分享。 Soitu C, Stovall‐Kurtz N, Deroy C, et al. Jet‐Printing Microfluidic Devices on Demand[J]. Advanced Science, 2020, 7(23): 2001854.Gangoso E, Southgate B, Bradley L, et al. Glioblastomas acquire myeloid-affiliated transcriptional programs via epigenetic immunoediting to elicit immune evasion[J]. Cell, 2021, 184(9): 2454-2470. e26.Deroy C, Nebuloni F, Cook P R, et al. Microfluidics on Standard Petri Dishes for Bioscientists[J]. Small Methods, 2021, 5(11): 2100724.Deroy C, Wheeler J H R, Rumianek A N, et al. Reconfigurable microfluidic circuits for isolating and retrieving cells of interest[J]. ACS Applied Materials & Interfaces, 2022, 14(22): 25209-25219.Oliveira N M, Wheeler J H R, Deroy C, et al. Suicidal chemotaxis in bacteria[J]. Nature Communications, 2022, 13(1): 7608. 样机体验 为更好地服务中国科研工作者,Quantum Design 中国也建立了样机演示实验室,将为大家提供为专业的售前、销售、售后技术支持,欢迎各位老师垂询! 用户名单 用户评价 路易莎埃姆斯,研究科学家:The Native Antigen Company(LGC 临床诊断集团旗下公司) “使用 isoCell 进行单细胞克隆工作从一开始就简单可靠,并且已无缝地融入我们的流程中。 该程序对细胞很温和,我们看到非常好的存活率,可以筛选大量克隆。 我们收到的客户服务是优质的。”
  • Dolomite Bio成功举办高通量单细胞转录组测序和单细胞液滴包裹技术交流会
    随着科学的发展,科学家们发觉许多群体细胞,完整个体水平的研究只是研究多种类细胞,多个细胞共同作用的“平均值”,淹没了细胞个体之间的差异。因此,针对单个细胞的研究技术,单细胞基因组学研究(Single Cell Genomics Study)成为生物学研究迫切的方向,并成为再生医学,发育生物学,肿瘤研究,免疫学研究必不可少的关键研究手段。 Dolomite Bio公司基于其已有的单细胞RNA测序模块系统和μEncapsulator单细胞包裹模块系统取得良好的销售业绩及客户反馈。2017年11月,Dolomite Bio公司隆重推出Nadia高通量单细胞建库仪,可平行运行1/2/4/8个样品, 每个样品18min内可生成6000个单细胞库;专为DropSeq方案设计;使用一次性试剂盒,防止污染;自动检测试剂盒状态,触摸屏控制,全自动运行。同时,添加Innovate新方法开发平台,可以使用自己的试剂,开发新的方法,可调节液滴大小、频率、温度、搅拌和时间等参数,一旦条件摸索成功,可通过Nadia高通量单细胞建库仪在相同条件下平行运行2/4/8个样品。 2018年4月24日-27日, Dolomite Bio公司在北京、上海、深圳和澳门成功举办了Nadia高通量单细胞转录组测序技术交流会,会议现场Dolomite Bio公司CEO Mark Gilligan先生详细介绍了液滴微流控技术应用在单细胞研究的优势,高通量单细胞RNA测序实验中遇到的问题以及B细胞和T细胞、FACS分选等应用,并现场利用Nadia单细胞建库仪和Innovate新方法开发平台演示了单细胞库制备的整个实验过程。现场部分客户被邀请亲自体验了实验过程,客户对实验结果非常满意,并对Nadia通量高、操作简单、Innovate灵活开放的特点给予了极大的肯定。清华大学会场中科院学术会议中心会场华大基因会场澳门大学会场Mark给客户演示Nadia样机
  • 华微发布海风系列I型_单细胞捕获孵育_定向进化_滴内PCR新品
    创新点:海风HW-SeaBreeze 芯片实验室。可实现单细胞柔性捕获、液流/液滴精准控制、滴内PCR、无标记筛选、器官芯片、仿生环境建立等操作。关键技术:(1)研究对象——直径0.1-2000um生物颗粒:细胞/细菌/病毒/线虫;(2)单核液滴——高通量,绝对单细胞液滴制备, 可删除空液滴及多核液滴;(3)精准控温——恒温孵育:微流培养池/器官芯片 液滴数字PCR);(4)柔性操控——保持活性;液滴/液流,电场/气压/激光多场景控制 (5)多类筛选——支持 拉曼/影像/阻抗等无标记筛选,荧光标记筛选(6)器官芯片——液滴/液流 ,液/气/氧/温/光/电/时:多维精准控制 (7)耗材定制——芯片内生物存活7日,按需定制, 价格远低进口■ 应用领域:细胞培养、药物开发、器官芯片、肿瘤细胞医疗、仿生微环境、文库、单细胞(菌)液滴包裹/操控/筛选、单亲克隆、滴内PCR、定向进化等。海风系列I型_单细胞捕获孵育_定向进化_滴内PCR
  • 流式进展|清华大学王文会团队: 基于阻抗流式细胞术的单细胞样本“一步式”分选除盐质谱预处理系统
    原标题:清华大学王文会团队: 基于阻抗流式细胞术的单细胞样本“一步式”分选除盐质谱预处理系统——01——研究背景单细胞质谱检测技术为单细胞化学特性分析提供了一种强有力的免标记分析手段,并在癌症分析、药物刺激、免疫分析等临床应用中展现出潜在价值。然而单细胞质谱往往需要进行必要的预处理操作,如将目标细胞从混合细胞群体样本中分离出来以提高质谱检测的准确性;除盐操作去除细胞常见缓冲液中的非挥发性盐,降低基质效应提高质谱检测灵敏度。目前这些预处理往往是通过多种设备或手动操作完成,效率较低;开发有效的一步式预处理方法对于单细胞质谱分析意义重大,但目前这方面的研究较为缺乏。为此,清华大学的王文会教授团队提出一种基于阻抗流式细胞术IFC的“一步式”分选除盐质谱预处理系统,经过处理的细胞样本可直接兼容现有的免标记质谱流式、液滴微萃取等单细胞质谱分析手段。研究工作以“Microfluidic Impedance Cytometry Enabled One-Step Sample Preparation for Efficient Single Cell Mass Spectrometry”为题发表在期刊Small上,并被选为Frontispiece。本工作基于IFC原理设计微流控芯片结构,结合压电驱动实现一步式单细胞分选除盐操作,将目标细胞从细胞群中分离出来的同时实现其外基质的置换。经实验验证,系统的分选效率99%、除盐效率99%,并被证实了在癌细胞和血细胞的分离、癌变细胞与正常细胞的分离与质谱检测方面的功能。图1. 基于阻抗流式细胞术的“一步式”分选除盐质谱预处理系统示意图——02——研究内容本工作中搭建了具有四层结构的微流控芯片,如图1所示。利用IFC进行细胞的电学及尺寸特性表征实现不同细胞的识别,待其流经分选区域时由压电执行单元对目标细胞进行分选,通过合适的流速配比,执行单元将目标细胞推至作为下鞘液的质谱兼容的挥发性盐溶液中,同时实现样本的分选与除盐。芯片采用两套电极,其中第1套用于单细胞电学表征,第2套用于表征确认除盐效率。图2. 微流控芯片结构及其工作流程示意图以商用均一性较好的6 μm和10 μm直径的PS微球对系统的分选效率进行了表征。在约9000个样本的实验中,系统展现出了99.53%的分选成功率,同时样本中的10 μm微球纯度由2.48%提升至92.23%,实现了约37倍的富集效率,如图3所示。此外在模拟血液中CTCs分离的实验中,在HeLa癌细胞与人体外周血单核细胞PBMC的混合样本中分选出HeLa细胞,其纯度由15.78% 提升至87.34%,展示出巨大的临床应用潜能。图3. 微流控系统的分选性能评估从定量的角度,以270 mM NaCl溶液作为样本液、去离子水作为下鞘液为例验证了系统的除盐效率,单次分选操作引入的NaCl物质的量仅为0.77±0.16 pMol,即使在300 cells/s的分选通量下除盐效率也能够达到99.62%;同时在实际的细胞样本测试中可以看出,未经除盐的样本信号被完全淹没,而经过该系统除盐后的能够清晰分辨单细胞的典型代谢与脂质峰,证实了系统优秀的除盐性能。图4. 微流控系统的除盐性能评估该系统进一步用于正常乳腺上皮细胞MCF-10A和癌变的乳腺癌细胞MDA-MB-468的分选与检测。通过双频点的锁相检测,分别表征了两类细胞的电学特性,并据此进行了分选操作,结果表明MCF-10A细胞的纯度由 10.64% 提升至77.78%,展现出了约7.31 倍的富集效率。此外将收集到的细胞样本直接与免标记质谱流式装置级联实验,同时表征了两类细胞的代谢特征,结果表明,部分显著差异表达的代谢和脂质可能是致使细胞电学特性差异的原因,充分验证了系统在多模表征与临床分析中的应用价值。图5. 正常细胞与癌变细胞的电学与代谢特性表征分析——03——总结展望本工作提出的基于IFC的一步法单细胞样品质谱预处理方法极大地方便单细胞质谱分析,突破了复杂操作和不必要的损耗。作为一个独立的样品制备模块,本微流控系统能够兼容多种质谱分析方法,为高效的质谱样品制备提供新的范式,进而为单细胞的多模态(如电学特性、代谢特征)表征提供新的思路。论文信息Microfluidic Impedance Cytometry Enabled One-Step Sample Preparation for Efficient Single-Cell Mass Spectrometry ;Junwen Zhu, Siyuan Pan, Huichao Chai, Peng Zhao, Yongxiang Feng, Zhen Cheng, Sichun Zhang, Wenhui Wang * (王文会,清华大学);Small, 2024, https://doi.org/10.1002/smll.202310700作者简介本工作的完成单位为清华大学精密仪器系、精密测试技术与仪器全国重点实验室。精仪系王文会教授为通讯作者,精仪系博士研究生朱焌文为第一作者。清华大学张四纯教授、程振助理研究员、清华大学博士生潘思远、柴惠超、赵鹏、丰泳翔为论文工作做出了重要贡献。本研究得到了国家自然科学基金的资助。【相关阅读】有望提高2个数量级微流控介电泳分离通量!清华大学王文会Advanced Materials封面成果速递https://www.instrument.com.cn/news/20240604/722338.shtml 3i流式KOL|清华大学王文会教授团队在阻抗流式细胞术上取得系列进展https://www.instrument.com.cn/news/20231030/689623.shtml
  • 性价比谁与争锋?大连华微新推单细胞分选仪仅售36.8万
    性价比谁与争锋?大连华微新推单细胞分选仪仅售36.8万——“HW-cyclone旋风系列2023”单细胞液滴制备与分选系统,破茧而出!大连华微生命科技,推出“HW-cyclone旋风系列”单细胞液滴制备与分选系统(2023款),单激光(基础版)售价36.8万!此消息一出,业内哗然!单细胞分选设备平均百万的售价,被大连华微靠自研专利技术,砍掉三分之二!这——还没完!单细胞液滴制备与分选相应耗材:华微生命的微流控芯片,更是达到惊人的低价:RMB200-600元/片,仅为进口单价的1/10—1/5;一次性管线耗材,低至人民币10元+/次……单细胞领域,注定又是一场腥风血雨!西方人说:技术,不能让中国人掌握!似曾相识,像中国高铁一样,只要研发起步不落后于西方,中国民族企业就能靠自己的智慧,以“铁杵磨针”的韧性不辍耕作,就能捅破高科技那层“窗户纸”,而核心技术一旦被中国企业掌握,就能创造物美价廉的高性价比产品,让全球客户都买得起、用得上!而性价比——是中国制造在高科技领域:靓丽的标签!图1 大连华微生命科技推出的“HW-cyclone旋风系列”单细胞液滴制备与分选系统这么低的售价,能和国外百万以上的产品pk么?性能如何?功能是否拉跨?和流式技术对比,细胞活性怎么样?带着这些疑问,让我们走近这个被预言为“2023年性价比新高度”的“HW-cyclone旋风系列”单细胞液滴制备与分选系统。一、结构 (1)基于用户显微镜的开放式研发体系,包括:“HW-cyclone旋风系列”单细胞液滴制备与分选系统、显微镜、进样驱动装置(注射泵或压力泵)、微流控芯片等部分组成,不仅大幅降低采购成本,更方便改造、升级甚至用户自行设计(变更)各流程环节,个性化科研,才能让灵感迅速转化为科技成果。此外,系统的1+N积木式结构,以及客户常用的注射泵、压力泵等传统进样方式,与客户科研习惯具有良好的兼容性。从源头(细胞进样悬液),至最终分选成果收集,全流程低成本管线通路(含微流控芯片),可一次性或多轮使用,“一次抛”方式杜绝了污染与交叉影响;“多次抛”常见于相同试剂重复实验或高效教学环节,并可大幅降低成本。图2 大连华微生命科技推出的“蓝晶系列”单细胞液滴包裹与分选类微流控芯片二、功能针对单个细胞、细菌、病毒、线虫、细胞团等1-100um粒径范围的生物颗粒,进行液滴包裹、检测、按阈值分选等操作。 (1)单细胞微滴包裹(微滴批量制备)(2)细胞检测: 荧光标记 无标记技术(高级版)(3)细胞分选(以下方式任选其一): 电场力分选 磁场力分选 流体驱动柔性分选(4)特色技术(均高端机型/版) 单细胞液滴包裹时空滴删除功能 液滴切分功能 液滴再注液功能 连环分选(分选后再分选) 一分三路分选 分选后捕获(培养、扩增) 多种类单核1+1分选(5)升级扩展 升级至多激光/多通道, 扩展至影像传感、拉曼检测等检测方式; 增配单细胞自动植板系统(96/384孔板,单孔入单滴); 升级至疾风、暴风、飓风、龙卷风等大连华微高端系列; 根据客户想法,升级为其它个性化微流控方式三、价格(直销)(1)单激光分选系统(单通道基础版):36.8万元RMB;(2)微流控芯片(通用款或批量型):200-800元RMB;(3)管线通路耗材:10-30元/实验;(4)生物显微镜、泵、试剂、PC电脑等均可客户自备。 (提醒用户:长期实验使用,请重点考量耗材成本)四、系统原理(1)单细胞液滴包裹原理 针对细胞、细菌等1-100um粒径的生物颗粒,基于两相不相溶液体,在“十”、“T”、“Y”等形式液路中的通道交叉口,利用剪切力,生成均一的液滴,实现微观下细胞个体之间的分离。 (2)分选原理有别于流式分选技术对细胞极大伤害性的高压鞘液,本产品采用低液压驱动,肿瘤细胞等敏感生物颗粒几乎不会收到液压方面的伤害。基于电磁场、介电力、流体驱动等方式,针对单个细胞在分叉通道处,根据实时检测参数,施力向不同的分支驱动液滴,实现分选,其中电场力、介电力驱动效率高达:1000个细胞/分钟;五、功能及参数 (1)单细胞液滴包裹:1,000—50,000 drop/min (2)电场力/磁场力/介电力分选:1,000 drop/min (3)无标记分选:100 drop/min上述分选通量,无法与流式细胞仪(每秒数万个)相提并论,原因之一:降低的速度,极弱的液压推动,就是为了——细胞活性!如果流式分选针对某种细胞分选的活率为30%,华微采用的弱压驱动分选原理,使细胞分选活率达到流式的2至3倍(60%-90%),其分选成果符合单细胞基因测序的活率要求。尤其针对肿瘤细胞等脆弱样本,细胞保活的优势明显。原因之二:匹配单细胞植板流程。从另一个角度,如果下一环节是单细胞孔板滴注,那么,针对秒级的板孔间喷嘴移动,超过5Hz的分选速度,对整个系统的单细胞植板效率影响不大。六、活性因采用柔性低压力驱动方案(1-30PSI可调,压强可低至流式1/70),以及从头至尾的液滴全流程包裹策略,且细胞无需沾染电荷,故活性远优于流式分选技术,分选后细胞活率60-99%表1 常见流式分选设备喷嘴与压力配置表七、耗材微 流控芯片(液滴制备、液滴分选、特定功能定制芯片);管 线耗材(管路、夹具、连接件等),价格低廉,成本可忽略。大连华微生命科技,产品源于元器件级别的自主研发,客户众多,质量经过中科院、中国农科院、三甲医院、中国海洋大学、华东理工大学、江南大学等985/211高校,及其它众多客户应用及检验,性能稳定,价格低廉,拥有更亲民的性价比。公司创始研发团队包括:五位北京大学校友、两位原中科院资深工程师、多位国内985/211高校毕业生,并与中科院大连化物所、大连理工大学、大连交通大学、大连医科大学等合作单位的多位教授、博士或其它科研人员,进行长期合作。大连华微生命科技,是中国单细胞液滴分选领域的“清晨耕耘者”,(国内未发现比华微更早的商业化产品研发&制造商),用“十年磨一剑”描述毫不为过——在2013年,创始人就申请了多项发明专利,攻克多项西方对我国的“卡脖子”技术,并历经无数次改进优化,并实现了国产化。2021年,大连华微生命科技携手大连医大附属医院(三甲)、大连交通大学,以源于企业创始人专利技术的“单细胞柔性分选技术”,入选“2021年大连市重点科技计划项目”,并喜报频传,两年来不断获取新成果(预计2024年实现商业化,敬请期待)。大连华微的每一次技术革新,或能提高性能,或大幅降低成本,都承载着华微人潜心研发、敢于挑战未来科技的创业精神,我们将一如既往,不辍耕作,在单细胞细分领域不断探索,致力于全球业内的前沿科技研发,为中国民族工业添砖加瓦。企业简介:大连华微生命科技有限公司(Dalian Life Huawei Technology Co., Ltd.)(以下简称大连华微),科技型企业,是一家拥有自主知识产权,集研发、生产、销售及服务为一体的微流控系统一站式解决方案供应商,依靠自有专利技术,立足独立研发民族品牌,致力于微流体控制科技产品的研发与生产,历经十年的探索磨砺,为中国乃至世界的业内客户带来全新的选择。未来公司将一如既往地重视创新科研,与广大华微客户一起携手进步,共同推动着中国生命科学的发展,做世界细分领域有话语权的中国高科技民族企业。
  • 多功能单细胞显微操作系统2023年度用户峰会 暨FluidFM 技术应用研讨会圆满落幕
    2023年5月18日-19日,由北京大学生命科学学院,蛋白质科学研究(北京)国家重大科技基础设施北京大学基地,Quantum Design中国子公司,瑞士Cytosurge公司共同举办的多功能单细胞显微操作系统2023年度用户峰会暨FluidFM 技术应用研讨会圆满落幕。本次会议共有北京大学、清华大学、中国科学院、中国医学科学院等高校和科研单位的50余名老师和学生参加,旨在为来自世界各地的研究人员、学者搭建一个良好的交流平台,展示他们借助多功能单细胞显微操作系统FluidFM技术取得的创新性成果,为参会人员提供更多的启迪。会议邀请了瑞士Cytosurge公司首席商务官、Quantum Design中国子公司的应用科学家详细介绍了单细胞基因编辑、活细胞单细胞测序Live-Seq、生物力学等领域的前沿应用。同时,也邀请了来自北京大学、苏黎世联邦理工学院(ETH)和瑞士联邦理工学院(EPFL)的科学家就FluidFM技术应用于单细胞粘附力测定、Temporal transcriptomics through Live-seq和Pick and place of neuronal cells and spheroids using FluidFM for the construction of neuronal networks等话题做了相关专题报告及学术探讨,得到了与会老师的一致认可。另外,本次会议还发布了FluidFM技术应用的全新进展,即活细胞单细胞测序Live-Seq技术的样本制备方案。这将给国内Cytosurge单细胞显微操作系统的用户打开一扇全新的应用之门,为火热的单细胞测序技术添砖加瓦。会议现场精彩瞬间:翌日,来自北京大学的覃思颖老师和Quantum Design中国子公司的应用科学家胡西博士为来自全国各地的老师同学进行了上机演示和实操,现场就一些关键技术问题展开了热烈的交流。会议加深了老师们对Quantum Design中国公司的了解,拓展了对FluidFM技术应用的新思路。
  • “力”所能及——多功能单细胞显微操作系统FluidFM BOT在单细胞力学实验中的创新应用
    瑞士Cytosurge公司的多功能单细胞显微操作系统FluidFM BOT,是将原子力系统、微流控系统、纳米位移台系统合为一体的单细胞操作系统,能够在单细胞水平上为研究者提供很大的便利,可应用于单细胞力谱、单细胞质谱、单细胞基因编辑、细胞系构建、药物研发、医疗等领域。本文将从单细胞实验方法和多功能单细胞显微操作系统FluidFM BOT结构出发,详细介绍多功能单细胞显微操作系统FluidFM BOT在单细胞力学实验中的应用。 一. 单细胞实验方法简介 在细胞生物学实验中,由于细胞的异质性,每个细胞互相之间都存在一定差异,因此在单细胞层面研究细胞性质可以获得更加准确的结果。近年来,多种单细胞研究技术不断涌现,应用于医学诊断、组织工程和药物筛选等领域。 对于细胞力学测定,原子力显微镜(AFM)能够对单个细胞或生物分子进行高分辨成像和力谱测定,但是细胞与探针的结合过程不可逆,无法实现连续、快速的检测。 对于细胞分离/分选技术,可选的有玻璃细管、光镊、流式细胞分选和磁珠分选等方法,然而有的从表面分离细胞时容易损伤细胞,有的无法从同类细胞群中分离出单个细胞。 对于细胞注射与提取,可选用纳米喷泉探针、纳米针和碳纳米管等,然而这些方法无法实现飞升以下量的含量注射,且注射时间较长。 多功能单细胞显微操作系统FluidFM BOT,针对细胞力学测量、分离/分选、注射与提取等应用,在结合以上技术的优势的同时克服了这些技术固有的问题,是一套多功能的单细胞研究系统,在单细胞研究领域发挥着巨大作用。 二. 多功能单细胞显微操作系统FluidFM BOT结构 简单来说,多功能单细胞显微操作系统FluidFM BOT是AFM与微流控的结合,主要由AFM扫描头、压力控制器与微流控探针组成(图1)。AFM扫描头装载于倒置显微镜上,整体结构大致与普通AFM相同,主要区别是探针中间有微流通道,后端连接液体池,前端探针有一小孔,用于液体的流入流出。微流通道内径小于细胞,防止细胞进入堵塞;探针则有多种不同孔径和不同的弹性,可根据不同应用以及不同样本更换所需探针。图1 FluidFM BOT系统图示。(a)微流控系统与AFM的结合应用;(b)(c)(d)探针的特殊设计。 三. 单细胞力学应用 传统AFM用于单细胞力学测量时,需要对探针进行一定处理以粘附细胞,后再与需要和细胞相互作用的表面、分子或其他细胞相结合,有时会产生多个细胞粘附,且反复测力会导致细胞被破坏,使得每次测量都必须准备新的探针,实验效率较低。 多功能单细胞显微操作系统FluidFM BOT通过将AFM与微流控相结合,使单细胞力学实验更高效,更简洁。对于已经结合在表面的固定细胞,可根据细胞尺寸安装适用的探针,从上方接触需要测量的细胞,通过微流控系统施加负压吸起细胞,获得力-距离曲线;也可以吸取悬浮细胞,与表面或其他固定细胞接触后,测量力-距离关系。这种方法能够提供远比蛋白结合牢固的多的吸附力,能够将细胞牢固的固定在探针上面,因此能够用于直接从基质上分离;另一方面,由于没有生物处理,这种方法不会改变任何细胞表面的通路,从而能够得到接近细胞原生的数据。 单个细胞测量完成后可移动探针至细胞板其他孔内,施加正压将其释放,再回到实验孔吸取下一个细胞,意味着单个探针可以进行多次测量。 细胞粘附是许多生理过程的重要步骤,细胞粘附力的测定可以为组织形态发生、胚胎发育、肿瘤、免疫反应和微生物膜等研究提供重要信息。多功能单细胞显微操作系统FluidFM BOT支持真核和原核细胞与细胞板/培养皿表面、抗菌/粘性/抗体包被的表面或其他细胞的粘附力测量(图2)。图2 不同细胞在不同环境下的粘附力-距离曲线。(a)探针接近、暂停、吸取并拉伸细胞的过程中探针偏转随时间的变化;(b)Hela细胞与纤连蛋白包被的表面的粘附力-距离曲线;(c)不同接触时间下大肠杆菌与PLL表面的粘附力-距离曲线;(d)大肠杆菌与PLL表面的分离距离与接触时间的关系;(e)酿脓链球菌与玻璃表面的粘附力-距离曲线,表示多个球菌的连续分离;(f)单个细胞与单细胞层的粘附力-距离曲线。 Sankaran等人[1]使用多功能单细胞显微操作系统FluidFM BOT来研究在共价和非共价的表面整合素受体对细胞粘附力的影响。通过测定发现两者均可有效增加细胞的粘附能力,并且效果近似(图3)。图3使用FluidFM BOT测定共价键与非共价键的整合素受体之间RGD的区别。(a)实验示意图;(b)粘附力测定前后示意图;(c)粘附力-距离曲线;(d)大粘附力。 多功能单细胞显微操作系统FluidFM BOT还可用于测量细胞的应力以研究细胞骨架的性质。Sancho等人[2]将10μm的小胶球吸附于探针上,之后使用探针去压细胞直到探针压力达到2 nN,通过压痕曲线来分析细胞骨架变化。通过对比发现过量表达MSX1的细胞硬度显著高于普通细胞(图4)。图4 使用FluidFM BOT测定HUAEC中MSX1过表达对细胞骨架的影响。(d)实验示意图;(e)吸附10μm珠子;(f)下压时空白细胞的力学谱线;(g)下压时MSX1过表达细胞的力学谱线,凹陷更深、斜率更高,表示其刚度相对更高;(h)胶体压痕法的测量结果。 四. 其他应用 多功能单细胞显微操作系统FluidFM BOT可用于细胞内注射与提取(图3),通过力学测量,可以控制探针刺入细胞质或细胞核内进行飞升别含量的液体注射或提取。此外,FluidFM BOT系统还可用于细胞分离以及细胞延展性研究。图5 FluidFM BOT系统的细胞内注射过程。(a)探针对准细胞;(b)探针刺破细胞膜,注入含荧光染料的目标液体;(c)探针与细胞分离,注射完成。 多功能单细胞显微操作系统FluidFM BOT克服了现有单细胞技术的短板,将多种单细胞应用相结合,高通量、高效率地获取单细胞层面的详细数据,研究多种细胞性质,尤其适合应用于医疗、单细胞生物学、单细胞质谱、单细胞基因编辑、药物研发等领域。 多功能单细胞显微操作系统FluidFM BOT在Quantum Design中国子公司与北大生科院共建实验室成功安装,为了更好的服务客户,Quantum Design中国子公司提供样品测试、样机体验机会,还等什么?赶快联系我们吧! 电话:010-85120277/78 邮箱:info@qd-china.com,期待与您的合作! 参考文献:[1]. Cell Adhesion on Dynamic Supramolecular Surfaces Probed by Fluid Force Microscopy-Based Single-Cell Force Spectroscopy, ACS Nano 2017, 11, 4, 3867–3874.[2]. A new strategy to measure intercellular adhesion forces in mature cell-cell contacts. Sci Rep 7, 46152 (2017).
  • 青岛能源所发布首台单细胞拉曼分选及测序耦合系统
    p  10月20日,在第二十届全国分子光谱学学术会议暨2018年光谱年会上,中国科学院青岛生物能源与过程研究所发布了自主研发的单细胞拉曼分选及测序耦合系统(RACS-SEQ)。该系统无需标记即可获知细胞种系发生、生理状态及所处的微环境变化等关键表型,并在单细胞水平精度对接表型组与基因组。/pp  RACS-SEQ通过拉曼组(Ramanome)分析原理、拉曼光镊液滴单细胞分选(RAGE)、流式微液滴单细胞拉曼分选(RADS)等关键器件的创新,在单细胞水平实现了非标记式拉曼表型识别与功能分选,为单细胞生物学研究提供了崭新的整体解决方案。该系统以免标多维的表型组识别、精准快捷的单细胞获取,以及高效低噪的核酸扩增等为三大特色,具有单细胞拉曼成像、表型组识别、功能分选以及测序文库制备等四大功能。此外,系统还包括拉曼光镊液滴单细胞分选芯片、单细胞全基因组扩增试剂盒、单细胞拉曼耐药性快检试剂盒等附件。/pp  RACS-SEQ搭载了自主研发的“拉曼组分析三部曲”智能信息系统。拉曼组自动化采集反馈软件(RamLIS)可快速、准确、智能化地获取单细胞拉曼光谱信息 智能化拉曼组分析统计软件(RamEX)可一站式完成在线数据处理与挖掘 高性能拉曼组数据库与搜索引擎(RamDB)通过多层次/易扩展的多维表型组数据库及拉曼组搜索引擎,实现了全景式、自动化、高通量的细胞功能识别。在此基础上,通过耦合独创的RAGE分选模块,直接对接单细胞测序。RAGE在溶液中的拉曼测量与分选,不仅充分保留了细胞活性,还大幅提高了基因组文库的质量(单个细菌细胞全基因组覆盖度可达95%以上)。/pp  RACS-SEQ对不同尺寸与形状的细胞具良好兼容性,而且操作便捷。该系统将服务于微生态大健康、海洋资源与监测、生物安全、工业生物技术等广泛领域的研究与应用。br//pp style="text-align: center "img title="W020181023318107646929.jpg" alt="W020181023318107646929.jpg" src="https://img1.17img.cn/17img/images/201810/uepic/0ccfab4e-e684-4f48-b1da-a473c088dbd9.jpg"//pp style="text-align: center "  青岛能源所发布首台单细胞拉曼分选及测序耦合系统/pp/p
  • Dolomite Bio隆重推出Nadia单细胞测序自动包裹仪
    随着科学的发展,科学家们发觉许多群体细胞,完整个体水平的研究只是研究多种类细胞,多个细胞共同作用的“平均值”,淹没了细胞个体之间的差异。因此,针对单个细胞的研究技术,单细胞基因组学研究(Single Cell Genomics Study)成为生物学研究迫切的方向,并成为再生医学,发育生物学,肿瘤研究,免疫学研究必不可少的关键研究手段。 英国Dolomite Bio公司基于其已有的单细胞RNA测序系统和μEncapsulator细胞包裹系统取得良好的销售业绩及客户反馈。2017年11月,Dolomite Bio公司隆重推出Nadia单细胞自动制备仪,可平行运行1,2,4,8个样品, 每个样品18min内可生成6000个单细胞库;专为DropSeq方案设计;使用一次性试剂盒,防止污染;自动检测试剂盒状态,触摸屏控制,全自动运行。同时,添加Nadia创新平台,可以使用自己的试剂,开发新的方法,可调节液滴大小、频率、温度、搅拌和时间等参数,一旦条件摸索成功,可通过Nadia单细胞自动制备仪在相同条件下平行运行2,4,8个样品。 Nadia单细胞自动制备仪及其创新平台的问世,为单细胞研究者提供了更多、更灵活的研究手段,相信将在很大程度上推进肿瘤、免疫和发育生物学的研究在真正的单细胞水平取得更大的进展!
  • 微生物所开发出新型微滴反应筛选技术及单细胞分析应用
    p style="text-indent: 2em "微生物所strong微生物资源前期开发国家重点实验室/strong杜文斌研究组和黄力研究组共同开发了一种新型的strong微流控界面纳升注射技术/strong(Interfacial Nanoinjection, INJ),该技术可以将传统的生化反应体系微缩在一个纳升体积的油包水微液滴体系中完成。/pp  strongspan style="color: rgb(0, 112, 192) "界面纳升注射(INJ)具有诸多显著优势/span/strong/pp  针对这一技术创新,团队申请了多项中国发明专利和美国专利,并研制了基于INJ技术的小型桌面系统。/pp style="text-align: center"img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201910/uepic/fe470173-c411-4a4f-857f-952adad6e8d5.jpg" title="界面纳升注射(INJ)系统.jpg" alt="界面纳升注射(INJ)系统.jpg"//pp style="text-align: center "界面纳升注射(INJ)系统/pp  该系统和国外同类产品如美国Labcyte公司的Echo超声纳升移液系统、以及美国TTP Labtech公司的mosquito HTS微量筛选系统相比,strong在仪器成本、耗材成本、最小液滴体积、流式细胞仪兼容性、操作的灵活性、以及污染控制等方面,均具有显著优势,/strong适用于各类单细胞微体积反应分析,也可应用于其他微体积反应分析,在微生物培养筛选、合成生物学、药物筛选、蛋白结晶条件筛选等方面均具有应用潜力。/pp  在性能方面,INJ系统通过高精密度的微体积控制实现不同试剂组分的纳升体积分步添加,兼容96和384孔板,可以在预先填装矿物油的孔板上,按照程序设定加入纳升样品或试剂液滴,用于实现高通量筛选。利用低成本探针可以精确加注的最小体积达到1 nL,当加样体积为5 nL时,体积标准偏差小于11 %。加注的液滴通过离心可以沉降到孔板底部并融合,液滴的融合效率最高,达到99%以上。利用多次加注样品、试剂的方法,可以实现多步反应和浓度梯度配置。系统加注的体积精确性、线性和重现性良好。/pp strongspan style="color: rgb(0, 112, 192) " FACS-INJ单细胞分析流程和应用/span/strong/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 281px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201910/uepic/7cc806a5-55aa-475f-a110-69b3c5038b70.jpg" title="杜文斌-流式细胞分选+界面纳升注射技术图示.jpg" alt="杜文斌-流式细胞分选+界面纳升注射技术图示.jpg" width="600" height="281" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: center "span style="text-align: center "FACS-INJ单细胞分选分析流程/span/pp  strong单细胞分析是一项变革性技术/strong,在单细胞基因组异质性研究及复杂微生物群落中稀有微生物种群多样性研究等领域应用广泛。然而,如何进一步降低单细胞分析的成本,提高可靠性和效率,仍然面临重大挑战。流式细胞荧光激活细胞分选(FACS)是目前最高效的单细胞分选技术,可实现病毒、细菌、真菌和动物细胞的多参数检测和分选 利用荧光标记,可对不同类型的细胞进行有效的区分,分选成功率高。研究团队将INJ与FACS平台相结合,建立了FACS-INJ单细胞分选分析流程,应用覆盖了单细胞表型分析、基因型分析、基因表达分析以及全基因组扩增测序。/pp  研究团队首先利用FACS-INJ系统实现了strong病原菌微生物单细胞耐药基因的PCR筛查和单细胞药敏表型筛查/strong。经优化,多孔板可预先装载纳升体积的PCR引物或不同浓度的抗生素液滴。PCR筛查体积缩小到500 nL,试剂消耗和成本和常规体系相比降低至原先的1/40,耐药检测的体积控制在200 nL,试剂消耗和成本和常规体系相比降低至原先的1/1000,时间从 12小时缩短至5小时,这对于大幅降低临床病原检测的成本,实现脑脊液、房水等难获取微量样品的耐药基因和表型筛查具有重要意义。/pp  其次,FACS-INJ系统还可用于strong动物细胞的单细胞基因表达分析/strong。以小鼠巨噬细胞RAW264.7在细菌胞外多糖处理前后的炎症反应为例,通过荧光激活流单细胞式分选处理前后的小鼠巨噬细胞,基于一步法反转录实时荧光PCR扩增,在单细胞水平解析了次黄嘌呤鸟嘌呤转磷酸核糖基酶(HPRT)基因(看家基因)和白介素1β(IL-1β)基因(炎症反应)表达水平的变化。/pp  最后,团队与北京大学黄岩谊课题组合作,建立了strong基于FACS-INJ的微生物全基因组扩增测序流程/strong,以获得未培养微生物的全基因组信息。流程包括流式分选微生物单细胞、单细胞裂解、酸碱中和、MDA扩增和建库测序。以热泉来源的古菌硫化叶菌(Sulfolobus sp. A20)菌株为模型,将单细胞扩增的体积优化至360nL,硫化叶菌全基因组覆盖度达到80%以上。在纳升级微液滴中实现西南印度洋未培养单细胞微生物全基因组DNA的MDA扩增与测序,拼接后获得15个单细胞基因组,大小在0.1~3.7Mb大小。该方法获得的微生物基因组污染度较传统的MDA扩增方法显著降低( 5%),显著提高了微生物单细胞基因组数据质量。平台也适用于肿瘤、胚胎等动物细胞的全基因组扩增测序,对肿瘤细胞的单细胞测序的覆盖度达到60-80%。/pp  上述研究工作近期作为特邀论文在线发表在Small上。微生物研究所助理研究员贠娟莉博士、郑小伟博士、徐鹏博士为论文共同第一作者,杜文斌研究员、黄力研究员和北京大学黄岩谊教授为论文共同通讯作者。该研究该研究得到了中国大洋协会大洋十三五重点项目、中科院战略性先导科技专项(B类),中国科学院重点部署项目、中国科学院前沿科学重点研究项目、国家自然科学基金面上项目和优青项目等支持。/pp  论文出处:/pp  Yun, J.L.sup#/sup Zheng, X.W.sup#/sup Xu. P.sup#/sup Zheng, X. Xu, J.Y. Cao, C. Fu, Y.S. Xu, B.X. Dai, X. Wang, Y. Liu, H.T. Yi, Q.L. Zhu, Y.X. Wang, J. Wang, L. Dong, Z.Y. Huang, L.* Huang, Y.Y.* Du, W.B.* Interfacial Nanoinjection-based Nanoliter Single-cell Analysis, Small, 2019, doi:10.1002/smll.201903739./pp  a href="https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/smll.201903739" target="_self" style="text-decoration: underline font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai color: rgb(255, 0, 0) "strongspan style="font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai color: rgb(255, 0, 0) "查看原文戳这里/span/strong/a/pp  strongspan style="font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai "杜文斌/span/strongspan style="font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai ",男,中科院微生物研究所研究员。2007年于浙江大学化学系,获博士学位。2007-2011年于美国芝加哥大学化学系从事博士后研究工作。2013年11月加入中科院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室。主要从事微流控芯片技术及新型分析微生物技术与应用研究。已发表论文60余篇,申请中国和美国专利30余项,授权20多项。主持国家优秀青年科学基金项目,国家重点研发计划 “数字诊疗装备研发”项目,中国科学院前沿科学重点研究项目等。/span/p
  • MALDI质谱成像首次用于单细胞3D化学成像
    近日,美国爱荷华州立大学的研究人员,用高空间分辨率基质辅助激光解吸电离(MALDI)- 质谱成像(MSI)来绘制和可视化了新受精的斑马鱼胚胎单细胞中磷脂类——磷脂酰胆碱(PC)、磷脂酰乙醇胺(PE)以及磷脂酰肌醇(PI)的三维空间分布。这是MALDI-MSI首次应用于单个细胞的三维化学成像。相关研究成果已经发表在Scientific Reports上。斑马鱼(Danio rerio)原产于东南亚,是一种小型热带观赏鱼。由于体外受精和光学透明,受精斑马鱼胚胎可在发育的所有阶段进行观察和操作。此外,斑马鱼很容易获得,价格低廉,健壮,易于护理,并且每周可以产下数百个卵。这些独特的遗传特点与实验胚胎优势相结合,使得斑马鱼成为研究早期发育的理想选择。斑马鱼已被广泛用作脊椎动物系统模型,用于研究脂质代谢、脂质在疾病中的作用以及胚胎发育中的脂质动力学。最近,Fraher等人使用LC-MS法进行脂质组学研究,结果显示胆固醇、磷脂酰胆碱(PC)和甘油三酯是斑马鱼胚胎中最丰富的脂质。他们证明,在调动到胚胎体之前,脂质在蛋黄内被加工。电喷雾电离质谱(DESI-MS)也被用于直接的MS分析和单个斑马鱼胚胎中脂质的成像、跨胚胎发育(受精后0,24,48,72和96小时)。研究人员对斑马鱼中的代谢组学和脂质组学研究非常感兴趣,因为这些化合物具有关键的生物学功能,例如作为能量储存源、参与细胞信号传导、并作为细胞膜的必要成分。探索如何调节代谢物和脂质是理解生物系统中发生的生物途径和发育过程的关键。传统分析方法研究小代谢物和脂质需要大量的样品制备、费力的提取、衍生化以及先期对目标化合物的了解。由于样品制备方案和仪器的发展,质谱成像(MSI)已成为这些研究中广泛使用的分析工具。MSI可实现生物分子空间分布的二维可视化,而无需提取、纯化、分离或标记分析物。此外,单个MSI实验可以同时检测许多不同类别的化合物,包括未知物,这使得其可以高分辨率和高通量方式直接对生物分子进行细胞或亚细胞作图。由于生物学在三维生物体中发生,3D成像对生命科学中的许多挑战产生了值得注意的影响并不奇怪。最近,使用质谱成像对完整生物分子进行成像已扩展到3D分析,以确定组织样本、琼脂平板和3D细胞培养物中的体积分子分布。使用质谱法最常见的3D成像方法包括收集样品的连续部分,使用传统的二维质谱成像分别分析每个部分,然后使用计算方法从多个二维集合堆叠和重建最终的3D成像MS数据集等步骤。美国爱荷华州立大学的研究小组(以下简称“研究小组”)开发了高空间分辨率的基质辅助激光解吸电离(MALDI)-MSI,分辨率低至5μm,并将其用于植物代谢物的细胞或亚细胞水平成像。在这里,研究小组利用这种高空间分辨率呈现了新受精的个体斑马鱼胚胎的3D MALDI-MSI。这是用MALDI获得的单个细胞的3D MSI的首次演示,揭示了各种脂质化合物的亚细胞水平定位。(a)受精斑马鱼胚胎在单细胞阶段的奇数编号光学图像。 (b)PE(22:6-16:0)在m / z 762.509和(c)PI(18:0-20:5)在m / z 883.535处的假彩色二维MALDI-MS图像。 通过覆盖所有2D图像,右侧显示投影图像。 所有物种均被检测为去质子化的[M-H] - 。在此分析中,研究小组通过获取62个连续横截面组织切片交替的正离子和负离子模式的MS成像数据,对单个斑马鱼受精卵进行3D MALDI-MSI。这可以对单个细胞中全面的脂质种类进行3D可视化。研究结果显示,所有三种磷脂类都存在于胚盘内的对称分布,以及蛋黄的边界,但每种都显示出不同的区域;PE显示在胚盘中心高度丰富的异质亚细胞区域,除了胚盘外,PC分子种类存在于蛋黄内部,而蛋黄中的PE和PI种类大多不存在。另外,还比较了四种不同的归一化方法以确定当将2D MSI与3D体积重建进行比较时,这些方法中的哪一种可以提供更具代表性的结果。此外,在不同细胞阶段(1-,2-,4-,8-和16-细胞阶段)获得胚胎的全扫描MSI和MS / MS,以研究斑马鱼成长早期阶段磷脂分布的变化。TOF-SIMS已报道被用于单个细胞的3D MSI,特别是结合深度剖析作为实现z方向信息的方式。然而,由于显著的碎裂,可以通过TOF-SIMS分析的高质量化合物主要限于外源性药物化合物。该研究小组所述的研究工作首次证明高分辨率MALDI-MSI可应用于单个细胞的三维化学成像,他们未来的研究将集中在揭示胚胎发育的细节,具有更高的空间分辨率和小代谢物的可视化,以及荧光显微镜的多模态成像等。在MALDI质谱成像方面,融智生物于2017年推出QuanTOF质谱成像系统,该系统集合了新一代宽谱定量飞行时间质谱平台QuanTOF,拥有5,000-10,000Hz长寿命半导体激光器,自主开发的数据采集软件。2018年7月,融智生物宣布实现可达500像素/秒的成像速率,提升MALDI-TOF MS成像速率达10倍以上,普通样本成像只需几十分钟,使得质谱成像实现了“立等可取”。 经过进一步的研发,目前QuanTOF质谱成像系统已经实现高达1000像素/秒的成像速率,5-10微米的高空间分辨率,且仍然保持了极高的灵敏度,使得质谱成像真正可使用于临床病理分析、术中分析等应用。
  • “小贝开讲”之单细胞流式分选技术
    时间:2018年11月29日 19:30 - 20:30内容简介:在特异的组织或细胞群中,实际存在大量的细胞类型,且每种细胞类型拥有大相径庭的细胞谱系和功能。而由这些细胞有机构成的组织、器官和生物个体或微生物群落,才是发挥完整的生物学功能的基础。单细胞研究(Single-cell Analysis)作为一种系统生物学研究方法,可以弥补传统方法存在的缺陷,在单细胞水平对生物信息进行解析。流式单细胞分选技术由于其高通量、多参数、低成本等特性一直作为单细胞分离的 zui jia 方法。本讲座给大家介绍了流式单细胞分选的上下游连接以及分选中主要注意环节。主讲人简介:宋兴辉浙江大学医学院公共技术平台副主任浙江大学医学院公共技术平台副主任,主持课题多项,曾在国内外期刊上发表多篇文章
  • 170万!南京农业大学全自动单细胞滴定分选系统采购项目
    项目编号:ZF20220513(采购代理机构内部编号:0667-221JIBEP8411)项目名称:资环学院全自动单细胞滴定分选系统采购预算金额:170.0000000 万元(人民币)采购需求:序号货物名称数量单位预算金额币种简要技术要求1全自动单细胞滴定分选系统1套1,700,000.00(免税)人民币(1) 高精度X、Y、Z移动平台:工作台等设计可实现高速运行,保证分配器的准确位置,重复移动精度≤3μm(2) 清视觉采集系统:可识别低于4μm颗粒,双模式照明,水平安装≥320万像素CMOS相机(3) 可进行超微量移液工作:移液体积从300pl到1ul,可自定义,移液体积CV小于2%,液滴产生速度500滴/秒。合同履行期限:合同签订后120天内完成本项目本项目( 不接受 )联合体投标。
  • 碧迪医疗与NanoString达成战略合作|联合推动单细胞空间多组学在华应用
    2022年12月1日,上海——今日,全球领先的医疗技术公司碧迪医疗与全球空间生物学的先锋NanoString联合宣布,将在单细胞空间多组学领域开启战略合作,结合双方优势,为国内基础科研、临床研究和生物医药研发提供一站式的技术工具和服务。此次合作将把国际领先的单细胞多组学和空间组学技术相结合,着眼于面向未来的科研和临床应用场景,打造端到端的全链路解决方案。单细胞多组学能够帮助科研和临床工作者,进行转录组、蛋白组、免疫组库和混样的研究;而空间组学则更进一步引入了空间分布及结构这一视角。两者的结合,将能够揭示生命复杂性的更多细节,可广泛应用于肿瘤、免疫、病毒、脑科学、生殖、牙科、骨科、肾病、椎间盘退变、感染性疾病等诸多生命健康的关键领域,同时在植物学、海洋生物、水稻花序早期发育等多个领域也正在发挥越来越重要的作用。@碧迪医疗大中华区生物科学事业部副总裁王彤表示:碧迪医疗拥有BD Rhapsody™这一目前全球唯一真正可在同一次实验中同时获得多组学数据的平台,以及分析试剂盒、磁珠、数据分析软件等系列解决方案。我们期待与NanoString强强联手,为我们的客户提供更全面、更高维、更深层的一站式解决方案。双方共同开拓更广阔的应用范例和市场,为中国的基础科研、临床研究和医药研发贡献力量。@NanoString中国总经理苏忠美女士表示:作为生命科学领域专注科研发现和转化研究的领先创新科技公司和工具方案供应商,目前NanoString主要提供nCounter®荧光条码多靶标表达分析系统和GeoMx® Digital Spatial Profiler(DSP)空间多靶标分析系统,来帮助研究人员探索和绘制生物学全视角图景。碧迪医疗的单细胞多组学解决方案,与NanoString的技术产品极具互补性。我们期待与碧迪医疗的合作,促进研究人员在加快生物标记的发掘和疾病机理的深入剖析等领域的研究工作,进而在转化医学与临床应用中扮演越来越重要的角色。合作双方将以BD Rhapsody™单细胞多组学和NanoString空间组学产品为核心整体解决方案,充分发挥产品和技术互补优势,在市场宣传与教育、服务商的建立和支持、区域渠道开发、重点客户维护、技术方案研发、新兴应用领域开发等多维度开展全面互信的合作。单细胞多组学平台BD Rhapsody™BD Rhapsody™ 单细胞多组学分析系统能够对成千上万个单细胞的蛋白与基因进行数字定量,提供灵活的定制化Panel及标准化应用方案,以满足不同的实验需求,其独特的混样技术可有效节约时间与成本。系统组成包括:BD Rhapsody™ 扫描仪BD Rhapsody™ 上样台BD Rhapsody™ cartridge(微孔板)分子标签试剂和文库制备全转录组检测试剂盒/靶向RNA检测试剂盒/定制试剂盒Abseq蛋白检测试剂盒多样本混样检测试剂盒VDJ检测试剂盒单细胞测序数据分析软件BD SeqGeq
  • 中科院能源所利用单细胞拉曼分选-测序耦合系统 首次精确到一个细菌细胞的环境菌群scRACS-Seq
    摘要:2021年5月,中国科学院青岛生物能源与过程研究所荆晓艳博士等人应用星赛生物的RACS-Seq®单细胞拉曼分选-测序耦合系统,以及相应的RAGE芯片和单细胞分析试剂盒(包括环境样品中微生物单细胞提取与制备、稳定同位素饲喂细胞、单细胞核酸裂解与扩增等环节)在美国微生物学会会刊《mSystems》在线发表题为“One-Cell Metabolic Phenotyping and Sequencing of Soil Microbiome by Raman-Activated Gravity-Driven Encapsulation (RAGE)”的文章。单细胞拉曼分选耦合测序(RACS-Seq)是剖析环境菌群功能机制的重要手段,但拉曼分选后单个细菌细胞基因组的覆盖度通常低于10%,极大限制了其应用。近日,中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心基于星赛生物的RACS-Seq®单细胞拉曼分选-测序耦合系统,以及相应的RAGE芯片和单细胞分析试剂盒(包括环境样品中微生物单细胞提取与制备、稳定同位素饲喂细胞、单细胞核酸裂解与扩增等环节),首次实现了精确到一个细菌细胞、全基因组覆盖度达93%的环境菌群scRACS-Seq,为环境微生物组原位代谢功能研究提供了一个强有力的新工具。土壤是地球上最重要的生态系统之一,土壤微生物组的代谢活动支撑着农业与畜牧业,也在地球元素循环、全球气候变化中起着关键性作用。同时,土壤菌群也是地球上最多样与最复杂的微生物组之一,而其中大部分微生物尚难以培养,因此,单个细胞精度的拉曼分析-分选-测序(Single-cell RACS-Seq,简称scRACS-Seq)策略,是剖析土壤等环境菌群之代谢机制的重要手段。然而针对环境菌群的scRACS-Seq一直以来存在两大瓶颈,一是难以无损、快速地获取具有特定拉曼表型的单个细胞;二是难以获得高覆盖度的单细胞基因组数据。这已经成为scRACS-Seq技术体系在复杂菌群中得以广泛应用的关键瓶颈。针对这一业界共性难点问题,单细胞中心荆晓艳、公衍海和徐腾等组成的联合攻关小组,基于前期发明的RAGE-Seq技术(Raman-activated Gravity-driven Encapsulation and Sequencing Xu, et al, Small, 2020,点击查看),从液相拉曼分析稳定同位素底物饲喂的土壤菌群出发,将特定拉曼表型的细菌单细胞精准分离并包裹到皮升级液滴中,进而耦合下游基因组测序。结果表明:(i)土壤菌群中细胞代谢活跃的低丰度物种(如Corynebacterium spp., Clostridium spp., Moraxella spp., Pantoea spp. 和 Pseudomonas spp.等)可经耦合重水饲喂与标记的RAGE-Seq精准地识别和分选,其单细胞基因组覆盖率可高达〜93%;(ii)同样,基于RAGE-Seq,含类胡萝卜素的土壤微生物细胞(如Pantoea spp., Legionella spp., Massilia spp., Pseudomonas spp., 和Pedobacter spp.等)能实现单个细胞分辨率、高基因组覆盖度的代谢重建,从而完整、深入地挖掘其类胡萝卜素合成途径;(iii)这些“原位”合成类胡萝卜素的土壤微生物细胞中,既有代谢活跃的,也相当部分是惰性的,表明基于纯培养的策略势必错失这些代谢惰性的功能微生物,因此“原位”、单细胞精度的功能细胞识别和分离,对于全面、客观的菌群功能剖析和资源挖掘具有重要意义。精确到一个细胞的拉曼分析-分选-测序(scRACS-Seq)此外,该工作还通过组分与状态均精确可控的人工菌群,建立了系统且严格的scRACS-Seq质量评价与控制体系。基于该体系,发现该技术能将不同拉曼表型的细菌单细胞从菌群中快速、精准分离,在保证单细胞拉曼光谱质量的同时,分选准确性达100%。此外,以来自于靶标细胞周围水相的空液滴为阴性对照,发现靶标细胞序列中被菌群中其他细胞DNA污染的概率极低。上述工作定量证明了scRACS-Seq的灵敏度、特异性和可靠性。借助星赛生物的RACS-Seq®单细胞拉曼分选-测序耦合系统,以及相应的RAGE芯片和单细胞分析试剂盒(包括环境样品中微生物单细胞提取与制备、稳定同位素饲喂细胞、单细胞核酸裂解与扩增等环节),scRACS-Seq可以在复杂菌群中以单个微生物细胞的分辨率建立新陈代谢与基因组的联系,从而精确回答“谁在做什么,为什么”。该系统广谱适用于细菌、古菌、真菌和动植物细胞,正服务于涵盖各种复杂生态系统的研究和应用。
  • 中科院青岛生物能源所发布首台单细胞拉曼分选及测序耦合系统(RACS-SEQ)
    2018年10月20日,中国科学院青岛生物能源与过程研究所单细胞中心在第二十届全国分子光谱学学术会议暨2018年光谱年会,发布了自主研发的单细胞拉曼分选及测序耦合(RACS-SEQ)系统。  RACS-SEQ系统通过拉曼组(Ramanome)分析原理、拉曼光镊液滴单细胞分选(RAGE)、流式微液滴单细胞拉曼分选(RADS)等关键器件的创新,在单细胞水平实现了非标记式拉曼表型识别与功能分选,为功能单细胞研究提供拉曼表型组与基因组的整体解决方案,以免标多维的表型组识别、精准简捷的单细胞获取,以及高效低噪的核酸扩增等为系统的三大创新特色,具有单细胞拉曼成像、单细胞表型组识别、单细胞功能分选,以及单细胞测序文库制备等四大功能。  RACS-SEQ搭载了智能信息系统,自动化采集软件(RamLIS)可快速、准确地获取单个细胞内部所有化合物的拉曼光谱信息,一站式分析软件(RamEX)可进行在线式数据处理与挖掘,通过结合多层次/易扩展的多维表型数据库及搜索引擎(RamDB),实现了全景式、自动化、高通量地识别与分析细胞功能。同时,通过耦合独创的光镊液滴分选系统,对任何尺寸与形状的细胞均具有良好的兼容性,分选后的功能单细胞可直接对接测序环节,进行全基因组/目标基因的解析,无需任何外源标记即可获知细胞的种系发生、生理状态,以及所处的微环境变化等关键信息,已在微生态大健康、海洋资源与监测、生物安全、工业生物技术等领域进行应用示范。
  • 2023第一站:单细胞显微操作系统落户西湖大学!助力单细胞测序等研究高效发展
    多功能单细胞显微操作系统——FluidFM OMNIUM,是瑞士Cytosurge公司研发推出的一款将原子力系统、显微成像系统、微流控系统、活细胞培养系统融为一体的单细胞显微操作平台,其核心技术——FluidFM技术采用了纳米级中空探针,轻松实现单个细胞水平、fL级别超高精度、自动化的细胞操作。近日,Quantum Design中国公司在西湖大学完成了单细胞显微操作系统FluidFM的安装工作,并对用户进行了相关知识和设备操作的全面培训。该设备的顺利验收,将助力西湖大学在基因编辑、细胞系构建、活细胞单细胞测序等研究方向取得更进一步的发展。西湖大学单细胞显微操作系统FluidFM理论培训现场西湖大学单细胞显微操作系统FluidFM上机操作培训现场西湖大学单细胞显微操作系统FluidFM培训现场:实验细节的热烈讨论 西湖大学单细胞显微操作系统FluidFM培训现场:西湖大学于珍珍老师独立上机操作演示 FluidFM OMNIUM单细胞显微操作系统由瑞士cytosurge公司自主研发推出的,该技术打开了传统细胞实验手段无法触及领域的大门,突破了单细胞研究、药物开发、细胞系开发中的障碍,主要功能包括单细胞提取、单细胞分离、单细胞注射、单细胞力谱等。深度应用于CRISPR基因组编辑、单克隆细胞系开发、病毒学、神经科学和生物力学等领域。FluidFM OMNIUM单细胞显微操作系统落户中国后,已经助力中国的科研工作者发表了多篇优异的文章:&bull W. Chen, O. Guillaume-Gentil, P. Y. Rainer, C. G. Gä belein, W. Saelens, V. Gardeaux, A. Klaeger, R. Dainese, M. Zachara, T. Zambelli, J. A. Vorholt & B. Deplancke. Live-seq enables temporal transcriptomic recording of single cells. (2022) Nature. &bull Y. Cui, X. Lyu, L. Ding, L. Ke, D. Yang, M. Pirouz, Y. Qi, J. Ong, G. Gao, P. Du & R.I. Gregory. Global miRNA dosage control of embryonic germ layer specification. (2021) Nature.&bull Y. Guo, F. Mei, Y. Huang, S. Ma, Y. Wei, X. Zhang, M. Xu, Y. He, B.C. Heng, L. Chen & X. Deng. Matrix stiffness modulates tip cell formation through the p-PXN-Rac1-YAP signaling axis. (2021) Bioactive Materials. 瑞士Cytosurge单细胞显微操作系统FluidFM OMNIUM外观图 Quantum Design中国与瑞士Cytosurge公司已达成大中华区的合作协议。Quantum Design中国专业、成熟的售后团队,具备超卓的Cytosurge系列FluidFM OMNIUM产品售后服务能力。“不仅提供先进的产品,还提供先进的售后服务”这将是Quantum Design中国区别于其他科研仪器供应商的重要特征,也正成为越来越多科学工作者选择Quantum Design中国的重要原因。 FluidFM OMNIUM产品已在国内各大高校和科研单位落户,在相关生命科学领域尤其是单细胞水平研究方面发挥着极其重要的作用。国内FluidFM用户已遍布北京大学、西湖大学、上海交通大学医学院附属儿童医院、中国海洋大学、山东中医药大学、五邑大学(粤港澳大湾区实验室)等。
  • 诱导多能干细胞克隆效率低?这台温和、自动化的单细胞分选系统帮您搞定,分离效率高达100%!
    人类诱导多能干细胞(hiPSCs)是一类可用于疾病建模、药物开发和组织工程领域的多能诱导干细胞。与CRISPR-Cas9等功能强大的基因编辑技术结合后,可根据不同患者的特性进行疾病相关遗传变异的研究和识别。 然而,培养hiPSCs的步骤较为繁琐,细胞对异常的处理和操作非常敏感,任何操作的问题都有可能导致细胞和遗传毒性应激的积累,进而导致不良分化和多能性丧失。基因编辑建立单细胞衍生的hiPSC克隆过程中常用的技术往往过于复杂或粗暴,导致单细胞克隆效率低下。此外,它们在确保衍生培养物单克隆性方面存在局限性。为此,英国iotaSciences公司推出了可实现100%单细胞分离的isoPick单细胞可视化分选系统,有效解决了培养hiPSCs单克隆过程中的困难。 如右上图所示,单细胞可视化分选系统isoPick采用纳升级的网格式单细胞腔室技术(GRID技术),可实现高通量、高自动化的单细胞可视化分选;确保分选所得的单细胞样品中只有一个单细胞,结果可验证、可追踪;分选过程非常温和,能够确保更高的单细胞存活率,达到更佳的克隆生长效果。单细胞可视化分选系统isoPick可全自动进行单细胞的分选、拾取并转移1.5 µ l至200 µ l的液体至PCR管或96孔板中。 使用isoPick从GRIDs内分选hiPSC单细胞置于Laminin-521,Vitronectin-N, Synthemax和iMatrix (Laminin-511)4种不同基质且含有培养基的96孔板中。以第7-10天内的时间计算得出的单细胞克隆效率可以发现,无论使用的包被基质或hiPSC细胞系,平均克隆效率均70%(上图),明显高于其他通常使用的方法(包括FACS),表明isoPick对敏感单细胞的温和处理,能够确保细胞的高存活率和更好的克隆生长效果。 isoPick使用户能够以快速、高效、自动化的方式从多样、异质的细胞群体中分离单个细胞。GRID腔室非常适合用于观察和记录单个细胞的分离过程。 用户可将单个细胞分离并直接置入96孔板用于细胞克隆。相比传统方法,这种方法用简单的线性工作流程,显著提高了细胞分离与克隆效率,操作流程高度自动化,可以将样品无缝衔接单细胞组学的后续操作。单细胞可视化分选系统的优势:全自动化流程操作非常简单 对细胞无损伤结果可追踪分离效率高达100%直接转移到PCR管或96孔板结构紧凑,体积小巧文献举例: 单细胞可视化分选系统相关文献发表于Cell、Advanced Science、Small Methods、Nature Communications 等期刊,如下摘引了近年三篇具有代表性的文献和大家分享。Soitu C, Stovall‐Kurtz N, Deroy C, et al. Jet‐Printing Microfluidic Devices on Demand[J]. Advanced Science, 2020, 7(23): 2001854.Gangoso E, Southgate B, Bradley L, et al. Glioblastomas acquire myeloid-affiliated transcriptional programs via epigenetic immunoediting to elicit immune evasion[J]. Cell, 2021, 184(9): 2454-2470. e26.Deroy C, Nebuloni F, Cook P R, et al. Microfluidics on Standard Petri Dishes for Bioscientists[J]. Small Methods, 2021, 5(11): 2100724.Deroy C, Wheeler J H R, Rumianek A N, et al. Reconfigurable microfluidic circuits for isolating and retrieving cells of interest[J]. ACS Applied Materials & Interfaces, 2022, 14(22): 25209-25219.Oliveira N M, Wheeler J H R, Deroy C, et al. Suicidal chemotaxis in bacteria[J]. Nature Communications, 2022, 13(1): 7608.样机体验: 为更好地服务中国科研工作者,Quantum Design 中国引进了单细胞可视化分选系统-isoPick样机,将为大家提供为专业的售前、销售、售后技术支持,欢迎各位老师参观试用!
  • 强强联手 I 达普生物星海单细胞测序系统入驻百奥智汇,开启超高性价比单细胞服务通道
    NEWS近日,百奥智汇对实验步骤进行优化,完成了星海单细胞平台数据实测。高质量数据新鲜出炉,正式推出“海量单细胞测序性价比之王”——星海单细胞服务平台。平台简介百奥智汇星海单细胞服务平台依托于达普生物单细胞建库系统,以经验丰富的实验团队强势赋能搭建而成。对星海单细胞实验过程进行了全面的探索和优化,最终确定了多种样本类型的最佳实验运行条件,保证平台数据稳定产出。平台优势01 高 数据质量高质量数据稳定产出,数据可重复性高,为研究提供强大的数据支持。02 低 检测成本单个细胞检测成本低于1元,有效降低技术使用门槛。03 高 灵活性单次上样1~4个样本,灵活配置,更适合临床样本。04 高 运行效率单次实验油包水时间为7.5min,一天内可完成建库过程,为科研提速。高质量实测数据秉承科学严谨的态度,百奥智汇坚持“每推新品,必先测试”的原则,对平台的各项技术参数进行了详细的评估,现将高质量实测数据展示如下:物种类型:人物种类型:小鼠物种类型:大鼠以上实验结果表明,由星海单细胞服务平台产出的数据质量优异,在细胞检出、基因检出、细胞分群等维度均有很好的表现,足以满足数据深度挖掘的需求,且涉及了人、小鼠、大鼠等多物种的多种组织类型,可为各个研究领域的老师提供技术保障。 新品让利大促销除了在性能上的保证,百奥智汇也特别推出针对“星海单细胞服务平台”的让利促销活动,即日起,只需8000元即可实现一个样本的单细胞测序,包括组织解离、建库、测序(100G数据量)和基本分析。Tips:本次活动为限时促销,欢迎扫描以下二维码尽快锁定优惠名额,并于6个月内完成送样检测。
  • 温和细胞分选,开启单细胞测序成功的第一步!
    随着单细胞测序技术的快速发展,科研工作者们可对每个独一无二的单细胞进行分析,认识到细胞间的异质性,深入了解如胚胎发育早期的分化特征、肿瘤微环境中的非均质性、罕见循环肿瘤细胞的转录组等等以往传统高通量测序方法难以攻克的领域。单细胞分析的应用已进入百花齐放的时代,涵括神经生物学、癌症、免疫学、微生物学、胚胎发育、临床诊断等多个领域。单细胞测序分析的第一步,即是单细胞样品的制备,同时确保其生物完整性不被破坏。高质量的样品制备影响着后续单细胞分析成功与否。高活性、无细胞碎片且均一的单细胞悬液可使测序结果在完整性、真实性、数据可重复性得到提升。最常见细胞分离的方法可用MACS磁珠或流式细胞仪进行目的细胞分选与富集。单细胞测序流程利用流式细胞分选法富集目的细胞群体缩小研究范围,对单细胞群体可进一步精细化解读。尤其在研究罕见细胞族群,单细胞测序前先以流式细胞分选富集稀有细胞,可大大增加实验数据真实性与可靠性。现今已有愈来愈多单细胞测序研究结合流式细胞分选,筛选目的细胞、过滤死细胞减少样本中無效细胞的比例,提高单细胞文库构建的成功率以及后续的数据质量,让单细胞测序更有深度与广度分析实验数据,推动进一步研究范畴。传统高压液滴分选仪分选单细胞传统液滴式流式细胞分选(Droplet cell sorter),将目的细胞利用适宜的荧光标记。经荧光染色或标记的单细胞悬液,被高压压入流动室内,在鞘液的包裹和推动下,细胞被排成单列,以一定速度从流动室喷口喷出。通过相应荧光检测及充电,获得目的细胞,实现单细胞分离。然而操作过程中,分选的细胞相继受到高压、充电带有电荷、减压的刺激,常导致分选的目的细胞在分类过程中的损伤和溶解,活细胞回收率不高;即使回收的活细胞也因分选过程受刺激影响细胞基因转录图谱表现,无法维持其生物完整性。传统高压液滴分选仪进行单细胞分选Adapted from Technologies for Single-Cell IsolationInt. J. Mol. Sci. 2015, 16美天旎MACSQuant Tyto 革命性的细胞分选仪专利的微芯片技术,精准地控制阀门开合以进行细胞分选,该仪器的特性在于整个分选过程在一次性使用的全封闭样本舱(cartridge) 中进行,且无需鞘液、避免了样本污染和残留风险。上样简单、自动进行分选设置,无需操作人员进行高强度与长时间的培训就能轻松操作。由于实际分选过程都在样本舱进行,不会损失珍贵的样本材料;阳性和阴性分选组份均可在无菌洁净操作台内轻松回收。细胞不会受到高压、电荷及减压刺激,不同于传统的液滴分选仪,这种温和的分选方法可最大保持细胞活性和功能,即使经过多次分选,细胞活性也不会受影响,充分表明这种阀门介导的分选机制具有温和性质。美天旎MACSQuant Tyto细胞分选仪与样本舱功能示意图。A. 美天旎MACSQuant Tyto细胞分选仪;B. 样本舱;C.独特微芯片技术的分选示意图。单细胞测序前,使用美天旎MACSQuant Tyto细胞分选仪(MQ Tyto)进行目的细胞分选富集。分选过程不受到高压、电荷、减压与剪切力刺激,作用温和不影响细胞生物功能完整性,维持细胞基因转录图谱表现,提高细胞存活率与回收率。位于美国加州大学(University of California, Irvine- UCI)的Dr. Kai kessenbrock研究团队致力于研究机体正常组织内环境稳态和乳腺癌中的细胞通讯。他们在单细胞水平上系统性分析研究乳腺干细胞微环境(stem cell niche)中细胞通讯的机制和乳腺上皮組織内的异质性,进一步加深对早期肿瘤发生过程中系统性变化的理解;最终目的是开发用于早期检测的生物标记物以及改善乳腺癌的治疗策略。Dr. Kai kessenbrock团队在FVB小鼠取出小鼠乳腺组织,分别以美天旎MACSQuant Tyto细胞分选仪(MQ Tyto)与传统液滴式流式细胞分选(Droplet cell sorter)分离乳腺上皮细胞(CD49f+/EpCAM+)后,标记建库并进行单细胞测序;比较两种不同的流式细胞方法分选后,所获得的测序数据真实性与可靠性,也进行分选后的细胞培养,观察细胞存活与功能。小鼠乳腺上皮细胞分离与单细胞建库 (Data kindly provided by Quy Nguyen, UCI)1. MQ Tyto可有效分选出不同乳腺上皮细胞亞型(Luminal 1, Luminal 2, Basal-like subtypes),基因转录图谱完整呈现。聚类分析与差异基因热图展示2. 经由MQ Tyto分选,每个单细胞可捕获更多的mRNA数量(UMI),获得更多可分析的基因数(Genes);显示MQ Tyto保留了细胞的完整性。质控图3. 传统液滴式流式(Droplet cell sorter)细胞分选后细胞应激基因表现明显上调。这主要是来自于细胞分选操作过程中所受到的外力刺激,而非原始组织环境细胞的真实表现。应激基因表现量展示4. 细胞分选后,持续培养七天乳腺上皮细胞并形成乳腺球(mammosphere formation)进行计数。结果显示MQ Tyto组形成更多的乳腺球,表示其MQ Tyto分选后的上皮细胞维持其功能性与高存活率。综上,利用MQ Tyto对目的细胞进行分离与富集,作用温和不影响细胞生物功能完整性,维持细胞基因转录图谱表现,提高细胞存活率与回收率,开启单细胞测序成功的第一步。
  • 3D细胞培养分析技术微孔板制备的新视角
    阿斯利康中国创新研究中心(ICC)的科学家们开发了一项新技术,利用Tecan 全自动液体处理工作站Freedom EVO进行细胞培养微孔板自动化温控制备,进而完成药物候选化合物筛选。该研究团队在BD Matrigel&trade 加样前使用琼脂预涂微孔板,从而顺利地在96孔微孔板上实现3D细胞培养分析。 中国创新研究中心(ICC)是阿斯利康在中国上海张江高科技园区投建的研发基地。该中心于2007年正式投入使用,专注于调查研究影响亚洲人口健康的各类疾病,其中包括:胃癌、肝癌以及肺癌。该中心采用国际一流的先进技术解析这些癌症的遗传机理,并在临床上识别及确证相关的生物标记物和药物靶标。 由Yi Gu博士带领的细胞科学研究部门正在对这些疾病开展一项药物研究项目,希望通过筛选多种化合物来确定候选药物。3D细胞检测分析是该项目组基于采用BD Matrigel (BD Biosciences)作为细胞培养底物进行的二次药筛技术其中的一种。Matrigel是从EHS (Engelbreth-Holm-Swarm)小鼠肉瘤的可溶性基底膜抽提得到的细胞外蛋白凝胶复合物,能够诱导克隆细胞在标准细胞培养基表面通过不同方式生长(图1)。这些非均相构成诱发了克隆体的形成,非常适用于研究肿瘤细胞之间的粘附、生长、迁移及转移。由于克隆细胞很好地模仿了人体组织的生长与成型过程,因此研究人员能够在药筛最初期识别正确的化合物。 手工制板存在着明显的两个缺陷:容易出错且耗费时间,而通过使用全自动液体处理工作站Freedom EVO来提高检测通量并改善结果的一致性,无疑是最好的解决方案。这一自动化平台早已成熟应用于化合物梯度稀释和其他大量细胞检测实验中,可以在保持原有应用的基础上快速且低成本地修改应用程序。 ICC资深自动化科学家William Shi解释说:&ldquo 历来此类3D细胞检测都是在6孔板上进行的,由于样本需求量大且Matrigel底物处理比较复杂,因此手工制板十分困难。并且,这种6孔板型无法与大量试剂需求和大批量化合物筛选工作相匹配,因此我们开始着手不断寻找高性价比的方法。另一点很重要的是,Matrigel的异质组分具有较大表面张力且在微孔内分布不均,其低剂量加样非常困难,因此分析6孔板上的实验结果已经极其困难,更别提在96孔板内检测分析了。为了解决这一问题,我们先在微孔板上预涂一层薄薄的琼脂,然后再进行Matrigel加样。这种方法虽然解决了Matrigel的表面张力问题,却带来了如何平衡在50℃以下琼脂凝固与4℃以上Matrigel过度粘稠这两种物质的复杂加样问题。&rdquo 后来我们选用了全自动化液体处理工作站Freedom EVO,其中选配了多个温控载架,使得盛装琼脂和Matrigel的液槽一直保持适宜的温度,非常便于加样。整个加样过程都是由自动化系统的液体处理机械臂(LiHa)上的单通道完成,通过多次洗液注液循环实现预热或预冷,避免加样针堵塞。加样初期通过机械臂的多次注液将预热琼脂(55℃左右)加入提前预热的96孔板内,这样可以将琼脂冷却的可能性降到最低点,从而减少琼脂的用量,降低实验成本。随后,微孔板在载板架上经室温冷却15-20分钟,使得琼脂在加入Matrigel前得以凝固。 采用这种解决方案后,能在短短90分钟内完成6块微孔板的加样制备,而传统手工处理一天仅能完成3-4块微孔板的加样,两者形成鲜明对比。制备好的微孔板质量在使用自动化加样技术后也有了很大提升,避免了人工制板常出现的批对批、板对板、甚至孔对孔的误差问题。William总结道:&ldquo 这种高度一致性对药物筛选来说至关重要,高质量的实验结果数据有助于我们加快药物研发进程,Freedom EVO自动化平台独具的灵活性使得这一切能够轻松实现!&rdquo 更多关于Tecan Freedom EVO液体处理工作站的信息请访问以下网站或询问当地Tecan员工/经销商:www.tecan.com/freedomevo 更多关于阿斯利康中国创新研究中心的信息,请访问以下网站:en.astrazeneca.com.cn BD和Matrigel是美国BD公司(Becton, Dickinson and Company)的注册商标。Corining是美国康宁公司(Corining)的注册商标。关于帝肯: 瑞士帝肯www.tecan.com是全球领先的生命科学与生物制药、法医和临床诊断领域自动化及解决方案供应商。公司成立于1980年,总部设在瑞士Mä nnedorf,分别在瑞士、北美和奥地利设有自己的研发和生产基地,目前公司主要经营的产品有三大类:全自动化液体处理平台( Liquid Handling&Robotics )、多功能酶标仪(Multimode Reader)和OEM组件;销售服务网络遍布世界52个国家,客户覆盖制药企业、生物技术公司、科研院所、法医、医院、血站系统和疾病控制中心(CDC)等。其液体处理技术已拥有行业经验30年,在全球处于领先地位,备受世界领先生命科学实验室的青睐。 帝肯(上海)贸易有限公司是瑞士帝肯集团公司亚太区总部,2008年4月成立于上海浦东。帝肯(上海)目前拥有一支专业的售前和售后服务团队,在科研、医院、血站和CDC领域构建了良好的经销网络,并以&ldquo 力求比客户期望做得更好&rdquo 的服务理念,给广大终端用户提供专业的服务。 欲知更多详情,请联系帝肯上海市场部:Libby ZhuTel: 021 2206 3206 / 010 8511 7823Fax: 021 2206 5260 / 010 8511 8461helpdesk-cn@tecan.com www.tecan.com
Instrument.com.cn Copyright©1999- 2023 ,All Rights Reserved版权所有,未经书面授权,页面内容不得以任何形式进行复制