配体

p　　核酸适配体是一类功能类似抗体的分子，抗体在生活和科研当中使用非常广泛，它的全球年产值接近1000亿美金，目前有关抗体的制药厂商很多，我们去医院检查也会用到抗体。但是抗体有很多缺点，它比较大，不稳定，生产复杂。当有东西能克服这些缺点，一定会广受关注。核酸适配体就是这样一类分子，它的功能类似抗体，但是具有分子比较小和稳定性好等优势。这个领域发展非常迅速，在中国该领域论文发表数量和增速均超过美国，非常专业的会议居然有超过150人的参会者。/pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201709/insimg/55801177-a2d6-424c-9aa3-af7ceb7c28cb.jpg" title="1.jpg" style="width: 600px height: 268px " width="600" vspace="0" hspace="0" height="268" border="0"//pp style="text-align: center "strong第二届中国核酸适配体学术研讨会合影（2014年4月合肥、中国科大）/strong/ppspan style="color: rgb(31, 73, 125) "strong课程概述/strong/span/pp该课程相对完整地介绍了什么是核酸适配体、有何优势、有何应用；国内外的研究现状如何，产业化前景如何，目前发展的瓶颈是什么；如何获得核酸适配体，国内的主要研究团队，交流平台和学习资源；适配体相关学术会议，以及筛选技术培训班，以及我们的研究兴趣，进展和提供的服务等。/pp除了介绍专业知识，也贯穿了一些科研的方法等。所以，即便你并不从事核酸适配体研究，也能从中借鉴一些研究的思路和方法。/ppspan style="color: rgb(31, 73, 125) "strong适合人群/strong/span/pp从事生命科学、材料科学、分析化学等领域的科研工作者、刚入门和核酸适配体筛选者。/ppspan style="color: rgb(31, 73, 125) "strong课程目录/strong/spanbr//pp课时1 核酸适配体 课程简介/pp课时2 作者简介/pp课时3 核酸适配体相关的几个概念/pp课时4 什么是核酸适配体/pp课时5 核酸适配体的研究现状/pp课时6 核酸适配体的产业化/pp课时7 核酸适配体的优势/pp课时8 核酸适配体发展的瓶颈/pp课时9 核酸适配体的应用/pp课时10 核酸适配体的筛选/pp课时11 核酸适配体国内的研究团队/pp课时12 国内的交流平台/pp课时13 我们的研究及进展/pp课时14 筛选服务与合作/pp课时15 课程的未来/ppspan style="color: rgb(31, 73, 125) "strong课程评价 /strong/spanbr//ppimg src="http://img1.17img.cn/17img/images/201709/insimg/14a0cd1a-6251-4b4b-9d8c-ab50f45f7c47.jpg" title="1.jpg" style="width: 600px height: 436px " width="600" vspace="0" hspace="0" height="436" border="0"//ppspan style="color: rgb(255, 0, 0) "strong资源地址/strong/span/ppspan style="color: rgb(0, 0, 0) "在网易云课堂搜索核酸适配体即可。/span/pp微信公众号：aptamer 定期发布核酸适配体的科研资料，愿景是通过这个平台来连接国内相关领域的研究者，大家一起交流相互学习。/ppspan style="color: rgb(31, 73, 125) "strong作者简介/strong/spanbr/span style="color: rgb(0, 0, 0) "/spanspan style="color: rgb(31, 73, 125) "/span/pp罗昭锋老师的本职工作是中科大生命科学实验中心的高级实验师，科研方向：核酸适配体筛选机理和快速筛选方法以及数字PCR技术。教学方面：有《文献管理与信息分析》等课程。br//p

p style="line-height: 1.5em text-indent: 2em margin-bottom: 10px "核酸适配体（Aptamer）或核酸适体是一类具有特异性识别功能的单链DNA或者RNA核酸分子，利用指数富集的配体进化技术（SELEX）从特定的寡核苷酸库中筛选出来，能与靶分子特异性结合。/pp style="text-align: center line-height: 1.5em text-indent: 0em margin-bottom: 10px " /pp style="text-align: center "img width="410" height="378" title="微信截图_20190606160018.png" style="width: 410px height: 378px max-height: 100% max-width: 100% " alt="微信截图_20190606160018.png" src="https://img1.17img.cn/17img/images/201906/uepic/426c56c7-c51c-4b49-9e26-31b977b0e733.jpg" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: center line-height: 1.5em text-indent: 0em margin-bottom: 10px "核酸适配体和蛋白肽链结合的示意图/pp style="text-align: center line-height: 1.5em text-indent: 0em margin-bottom: 10px "图片来源：http://aptamer.icmb.utexas.edu/images/aptamer-rre_rev.jpg/pp style="line-height: 1.5em text-indent: 2em margin-bottom: 10px "从1990年第一篇核酸适配体的文章发表，距今已经近30年的时间。最早是由Craig Tuerk 和Larry Gold在Science发表了相关研究成果，预测T4DNA polymerase可作为蛋白质配体，并首次提到SELEX；同一年，Ellington,A.D.和Szostak，J.E.affinity命名aptamer，确认RNA有完整的配体结合位点，预测保守序列区的结合和催化功能；1992年Bock LC、John Toole JJ首次筛选凝血酶ssDNA，ssDNA不存在生理作用，但却具有抑制凝血酶催化纤维蛋白凝结的功能。至今，已经有2000多种靶标被报道。/pp style="text-align: center line-height: 1.5em text-indent: 0em margin-bottom: 10px " /pp style="text-align: center "img width="450" height="335" title="SELEX.png" style="width: 450px height: 335px max-height: 100% max-width: 100% " alt="SELEX.png" src="https://img1.17img.cn/17img/images/201906/uepic/31663c3a-6e25-410b-81d7-4a33b6e73d08.jpg" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: center line-height: 1.5em text-indent: 0em margin-bottom: 10px "类似“达尔文进化理论”的SELEX/pp style="line-height: 1.5em text-indent: 2em margin-bottom: 10px "span style="color: rgb(255, 0, 0) "strong适配体和抗体/strong/span/pp style="line-height: 1.5em text-indent: 2em margin-bottom: 10px "人们常将核酸适配体和抗体进行比较，是因为两者具有很多相似之处。两者都具有亲和性和特异性，都可与靶向目标特异性结合，并因此特性应用于生物医学领域。/pp style="line-height: 1.5em text-indent: 2em margin-bottom: 10px "随着筛选技术研究的发展，越来越多的把分子获得高亲和力的、高特异性的适配体，具有广泛的应用前景，特别是分子识别检查的领域。与成熟的抗体实验相比，目前适配体可以补充抗体性能的不足，但是不能完全取代抗体。/pp style="line-height: 1.5em text-indent: 2em margin-bottom: 10px "strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "为什么核酸适配体备受研究人员关注？/span/strong/pp style="line-height: 1.5em text-indent: 2em margin-bottom: 10px "核酸适配体之所以受到广大研究人员的关注，是因为其“可以做抗体不能做的事”。核酸适配体的作用本质是核酸分子折叠形成特定三维结构而与生物靶标高亲和力、高特异性结合，具有与单克隆抗体相似的亲和力与特异性，同时又具有抗体无法媲美优点。/pp style="line-height: 1.5em text-indent: 2em margin-bottom: 10px "strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "核酸适配体的优点/span/strong/pp style="line-height: 1.5em text-indent: 2em margin-bottom: 10px "strongspan style="color: rgb(84, 141, 212) "核酸适配体的优点包括：/span/strong/pp style="line-height: 1.5em text-indent: 2em margin-bottom: 10px "strongspan style="color: rgb(84, 141, 212) "亲和力高，特异性强；/span/strong/pp style="line-height: 1.5em text-indent: 2em margin-bottom: 10px "strongspan style="color: rgb(84, 141, 212) "易于制备，可通过化学合成制备、改造与标记，可在体外筛选，可高通量获得；免疫原性和毒性低；/span/strong/pp style="line-height: 1.5em text-indent: 2em margin-bottom: 10px "strongspan style="color: rgb(84, 141, 212) "目标靶范围广，包括离子、小分子、多肽、蛋白质、细胞、组织切片等；/span/strong/pp style="line-height: 1.5em text-indent: 2em margin-bottom: 10px "strongspan style="color: rgb(84, 141, 212) "化学结构稳定，不易受pH、温度等环境因素影响而变性；/span/strong/pp style="line-height: 1.5em text-indent: 2em margin-bottom: 10px "strongspan style="color: rgb(84, 141, 212) "容易修饰，可操作性强。/span/strong/pp style="line-height: 1.5em text-indent: 2em margin-bottom: 10px "strongspan style="color: rgb(84, 141, 212) "以上这些优点使其在生物医学领域具有广阔的应用前景，因此在基础研究及应用研究领域均呈现了快速发展的趋势/span/strongspan style="color: rgb(84, 141, 212) "。/span/pp style="line-height: 1.5em text-indent: 2em margin-bottom: 10px "strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "核酸适配体的广泛应用前景/span/strong/pp style="line-height: 1.5em text-indent: 2em margin-bottom: 10px "核酸适配体在分析化学、蛋白质组学、临床医学、药物研发及基因调控等领域已经成为重要的研究工具。/pp style="line-height: 1.5em text-indent: 2em margin-bottom: 10px "span style="color: rgb(84, 141, 212) "（1）发现新靶标及生物标记物/span/pp style="line-height: 1.5em text-indent: 2em margin-bottom: 10px "作为亲和分子，用于复杂液相样品中差异分子的鉴定和肿瘤细胞及完整微生物的差异分子鉴定；/pp style="line-height: 1.5em text-indent: 2em margin-bottom: 10px "span style="color: rgb(84, 141, 212) "（2） 作为已知靶标的生物探针/span/pp style="line-height: 1.5em text-indent: 2em margin-bottom: 10px "可代替抗体进行免疫组化、ELONA、便携式生物传感器、可视化检测试剂及体内成像等方面的应用，在以上多个方面尤其是便携式生物传感器方面的研究已经取得很大进展；/pp style="line-height: 1.5em text-indent: 2em margin-bottom: 10px "span style="color: rgb(84, 141, 212) "（3）适配体药物/span/pp style="line-height: 1.5em text-indent: 2em margin-bottom: 10px "一是本身作为生物技术药物及药物解毒剂，具有脱靶效应优势；二是作为靶向药物的导向分子(Aptamer-guided drug,AGD)，用于精准医疗领域。2005年FDA已批准上市了第一个核酸适配体药物，商品名为Macugen；/pp style="line-height: 1.5em text-indent: 2em margin-bottom: 10px "span style="color: rgb(84, 141, 212) "（4）蛋白质组学/span/pp style="line-height: 1.5em text-indent: 2em margin-bottom: 10px " 在蛋白组学的研究中，用核酸适配体制备成的核酸配基阵列具有抗体芯片和2-D胶不可比拟的优势，成为备受青睐的一项工具。/pp style="line-height: 1.5em text-indent: 2em margin-bottom: 10px "span style="color: rgb(255, 0, 0) "strong核酸适配体面临的问题与挑战/strong/span/pp style="line-height: 1.5em text-indent: 2em margin-bottom: 10px "核酸适配体发展将近30年的时间，但仍有很多问题，阻碍了其实际应用的脚步。/pp style="line-height: 1.5em text-indent: 2em margin-bottom: 10px "例如体内表现很差，在血液中易被降解；核酸分子结构太小，肾清除速度快，作为药物时药物动力学性能差；核酸适配体作为核酸分子探针，化学作用力非常有限，增加了不易被结合的靶标分子的时候筛选难度，且灵敏度不够高；利用适配体发现靶标时，缺乏高通量筛选及鉴定的方法；作免疫组化应用时，可用的特异性适配体还较少，临床应用不受认可，亟待推广等等问题。/pp style="line-height: 1.5em text-indent: 2em margin-bottom: 10px "strongspan style="background-color: rgb(198, 217, 240) "有研究人员笑称，研究这么久，却没有成熟的产品，很怕会失业。当然，即便道路长且阻，研究人员也从未放弃，始终积极寻求突破。/span/strong/pp style="line-height: 1.5em text-indent: 2em margin-bottom: 10px "span style="color: rgb(255, 0, 0) "strong“春天”不远，未来可期/strong/span/pp style="line-height: 1.5em text-indent: 2em margin-bottom: 10px "2019年5月25日，在谭蔚泓院士的支持下，北京核酸适配体交叉技术学会成立，这是核酸适配体研究领域的第一个学术组织，聚集了北京各大高校、科研院所的研究人员，共同致力于核酸适配体的发展。/pp style="line-height: 1.5em text-indent: 2em margin-bottom: 10px "有人说，核酸适配体的“春天”就要到来。过去十年，越来越多的科学家积极投身到核酸适配体的研究中来，使得该领域得到了迅猛发展。希望通过科学工作者们辛勤的付出，核酸适配体能够早日实现从基础研究到实际应用的跨越，真正迎来“春天”。/p

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核酸适配体(以下简称&ldquo 适配体&rdquo )是一类具有特殊功能的单链DNA或RNA分子，类似抗体。1990年美国三个实验室同步建立了获得适配体的方法。适配体不仅在基础研究、食品安全、环境监测等多个领域具有广阔的应用前景，目前也已有基于该技术的药物上市，同时还有十余个基于适配体的药物处于临床阶段。适配体相对于抗体而言，具有分子量更小、可体外合成、易于保存和修饰等诸多优点，获得广泛的重视。　　近年来，该领域取得快速发展。中国在该领域也发挥着越来越重要的作用，年度发表的SCI论文数已经超过美国，成为该领域发展最快的国家。但筛选技术依然是制约适配体广泛应用的瓶颈。主要技术难题包括如何快速获得特定靶标的适配体、小分子适配体筛选、功能性适配体筛选以及复杂样本中特定靶标的适配体筛选等，另外，对于筛选机理的认识尚需进一步提高。　　为推动中国在该领域的发展，促进相关领域研究人员的交流与合作，推动信息共享，避免重复研究，我们于2011年11月在安徽合肥成功举办首届中国核酸适配体学术研讨会暨核酸适配体筛选技术培训班，取得良好效果。为了进一步推动国内核酸适配体方面的研究和加强国内同行学术交流，我们定于2014年4月14日至18日举办第二届中国核酸适配体学术研讨会暨核酸适配体筛选技术培训班。本次会议内容包括两部分，前两天(4月14-15日)为学术交流，第三至五天(16-18日)为筛选技术培训。学术交流将邀请国内外该领域的一流专家做报告。技术培训将由军事医学科学院、中科院化学所、首都师范大学、北京理工大学、中国科学技术大学等一线专家亲自指导。　　我们真切地希望通过这次交流与合作，能够推动国内该领域的研究进程，实现交流、合作与共赢。欢迎国内从事该领域研究的学者参会，并进行学术交流。　　会议主题　　适配体筛选技术、筛选机理以及相关的基础研究 适配体的应用技术 适配体技术的产业化。本次会议主要关注于核酸适配体的筛选技术及相关基础研究，探讨筛选机理，交流筛选方法，开展筛选技术培训。同时也将积极探索适配体应用技术的产业化，并探讨和建立相关实验室的合作机制。　　会议日程　　2014年4月13日，全天报到　　2014年4月14-15日，大会学术报告　　2014年4月16-18日，筛选技术培训　　组委会　　谭蔚泓 邵宁生 滕脉坤 娄新徽 胡兵 罗昭锋　　学术委员会成员(按拼音排序)　　崔华 邓兆祥 樊春海 杜权 方晓红 光寿红 李少华 梁好均 刘杰 娄新徽 罗昭锋 屈锋 单革 上官棣华 邵宁生 谭蔚泓 滕脉坤 王光辉 王成龙 王均 吴缅 吴清发 谢剑炜 杨朝勇 杨宪斌 杨振军 余兴龙　　会议地点　　学术会议在中国科学技术大学西校区生命科学楼一楼报告厅举行 　　适配体筛选培训在中国科学技术大学西校区生命科学楼三楼生命科学实验中心进行。　　会议住宿　　本次会议安排的住宿酒店有两个，供与会代表选择。　　柒加壹商务酒店 位于科大西区旁，会议期间房价168元/天。位于黄山路和肥西路交叉口，与会场的直线距离约150米。房价宽敞，标准间和单间均为25平米，提供早餐，24小时提供热水，免费拨打国内长话市话，免费上网。　　德力华商务酒店 位于科大西区旁，与柒加壹商务酒店相隔一条马路。会议期间房价169元/天。与会场的直线距离约180米。房价宽敞，标准间和单间均为30平米，提供早餐，24小时提供热水，免费拨打国内长话市话，免费上网。　　会议注册须知　　拟参会代表请填写附件一的会议回执填写好，并发送至biotech@ustc.edu.cn，如果需要参加培训班，请同时填写附件二。　　参会代表注册费：学者1200元，学生900元。核酸适配体筛选技术培训费：4800元(3天培训的试剂材料及仪器测试等费用)。会务费和培训费可以通过现场缴费或银行转账。由于培训班名额有限，请尽早确认。　　账户信息　　单位名称：中国科学技术大学　　开 户 行：中行合肥南城支行　　账 号：4933 00021 7080 94001　　备 注：适配体会务费 或 适配体培训　　会议服务事宜：　　会务总负责：罗昭锋 0551-6360 3215，13956009879　　会务组成员：欧惠超0551-6360 3215，186 5655 6163　　张海燕 0551-6360 0425，139 6670 8479，　　何海辉 0551-6360 7335，180 5517 4540，　　程晓蕾 0551-6360 7335　　会议联系email：biotech@ustc.edu.cn　　举办单位：中国科学技术大学　　军事医学科学院　　湖南大学　　首都师范大学　　北京理工大学　　中科院化学所　　北京大学　　清华大学　　北京生物化学与分子生物学学会　　中国生命科学大型仪器共享平台联席会　　2014年01月12日

引言准确预测蛋白质-配体(在本文的语境中，配体意指小分子有机化合物)的结合构象是计算生物学中的一项重要任务。一方面，它有助于人们理解蛋白质与内源小分子或药物分子的互作机制。另一方面，在药物设计或药物筛选(无论是单个蛋白-多个配体的正向筛选，还是单个配体-多个蛋白的逆向筛选)的过程中，也离不开对复合物构象的准确预测：这是准确计算蛋白质-配体结合稳定性(亲和力)的必要条件。对于给定蛋白和给定配体分子，依据是否已知结合口袋(也称配体结合位点)可以将复合物构象预测任务分为两类：口袋未知的盲对接(blind docking)任务和口袋已知的局部对接(local docking)任务。其中，盲对接任务是更普遍的、更富有挑战性的任务。在传统的对接流程中，这一任务又被划分为几个子任务：先借助口袋搜索算法确定可能的结合位点(即，转化为局部对接任务) 再利用构象生成(采样)方法生成大量可能的复合物构象，并依据打分函数评价各个构象(即，进一步确定配体的位置、朝向，以及各个键对应的扭转角) 挑选出打分值最优者作为最终结果。但是，对接过程面临着打分函数不够准确、构象搜索空间巨大导致计算耗时过长等挑战。比如，对于后者，文献[1]计算结果表明：对于单个配体复合物的盲对接任务而言，借助GNINA和Glide这两款传统的对接软件，生成百万量级的复合物构象并从中挑选最优者，平均耗时分别约为150 s和1500 s。在巨型分子库的(如ZINC 15数据库，含有约数十亿个化合物分子[2])虚拟筛选过程中，使用传统方法逐一对接每个分子在计算速度上是不可接受的。而数据驱动的机器学习方法为优化各个子任务的准确性和计算效率带来希望。此外，同样基于机器学习方法，部分研究者发展出“端到端”的、更为直接的对接流程：训练一个拟合自由能面(free energy landscape)的模型，无需将原有的对接任务划分为多个子任务，以蛋白质与配体的三维结构为输入，输出即为可能的复合物构象。参照Anfinsen提出的蛋白质折叠热力学假说，可以设想：如果存在一个能量函数，能够将复合物在三维空间下的所有状态映射到它对应的自由能，那么可以将复合物构象预测问题转化为该能量函数的最优化问题[3]。这是机器学习拟合自由能面的出发点。与传统的对接方法相比，这样的方法也同样可能在准确性和计算效率等指标上得到提升。本文将针对口袋搜索、构象生成、打分函数、自由能面建模这四个方向：整理相应的评价体系，包括常用的评价指标或测试集 挑选并简要介绍部分具有代表性的机器学习模型 结合模型评估实验讨论当前模型或评价体系存在的不足以及未来可能的发展方向。1.机器学习口袋搜索 1.1 评价体系目前存在两种描述蛋白质-配体结合口袋的方式。其中一种方法借助蛋白质表面的点云(surface points)来描述。这种方法被称作以配体为中心(ligand-centric)的方法。另一种方法则借助蛋白质上的原子来描述，那些蛋白质上的、与配体重原子距离小于一定阈值的重原子被定义为配体结合原子。这种方法被称作以蛋白质为中心(protein-centric)的方法。这两种描述方法相应地衍生出两类评价指标。对于前者，通常以配体原子中心距(预测的口袋中心与配体任意原子的距离，distance between the center of the predicted site to any atom of the ligand，DCA)、配体中心距(预测的口袋中心与配体中心的距离，distance between the center of the predicted site to the center of the ligand，DCC)、体素交并比(预测的口袋体积与配体所占据的空间体积的交并比，discretized volume overlap，DVO)等指标来衡量[4][5]。直观上，在这三个指标中：DCA最为宽松(只需大致判断配体位置)，DCC更为严格(额外考察了配体大小)，DVO最为严格(额外考察了配体构象)。但在多数文献中，常使用DCA和DCC这两个指标，并以4 Å作为预测成功与否的阈值[4]。对于后者，Yan等人以原子水平的交并比(Intersection over Union)来衡量[6]。具体地，计算预测的配体结合原子与标注的配体结合原子的交集与并集的比值。这也是机器学习目标检测任务中的常用指标。1.2 模型方法目前发展的大多数口袋搜索算法，都是以搜索蛋白质表面点云为目标。例如Krivák等人于2015年提出的P2Rank[7]：刻画蛋白质Connolly点云中各个点的物化特征，并使用随机森林模型对每个点进行可靶性预测，最后对点聚类得到口袋预测结果。以DCA为评价标准，P2Rank在多个数据集上表现优于传统方法Fpocket。Krivák等人后续还提供了P2Rank的网络服务[8]，并对多种方法口袋搜索方法进行了更加全面的总结和比较，其中包括Jiménez等人于2017年开发的、使用3D网格(体素)刻画结合位点的DeepSite[9]。值得一提的是，在Krivák等人的结果中(测试数据集为COACH420、HOLO4K，评价指标DCC)，DeepSite表现不及Fpocket 而在Jiménez等人的结果中(测试数据集CHEN251，评价指标DCC、DVO)，DeepSite表现显著优于Fpocket。最近，Yan等人另辟蹊径，以鉴定蛋白质上的配体结合原子为目标，发表了PointSite方法[6]，并声称其在多个数据集上(包括COACH420、HOLO4K、CHEN251等等，以原子水平的交并比为评价指标)取得了SOTA。Yan等人将口袋搜索问题转化为计算机视觉领域的点云分割问题 此处的点以蛋白质上的原子表示，以充分挖掘原子之间的键连特征。此外，作者还指出：将PointSite方法引入到其它口袋搜索方法如FPocket、P2Rank中(具体而言，使用点云分割的结果对后者的预测结果进行过滤)，可以进一步提升配体结合位点的鉴定效果。1.3 讨论从以上几种方法的评估实验中可看出，模型在不同测试数据集上的相对表现可能存在差异，因此需要建立一套统一的、合适的数据集进行测试。另外，在训练数据集的准备过程中，将未鉴定到配体结合的位点直接划分为负样本也值得考量。2.2在具体使用建议上，最近有研究将口袋搜索方法引入到完整的对接流程中[10][11]，相较于FPocket、P2Rank等方法，PointSite表现最优。　　2. 机器学习构象生成 2.1 评价指标对于构象生成模型而言，需要考察所生成构象的多样性和准确性，由此分别衍生出两类指标：覆盖率(COV，coverage)和匹配程度(MAT，matching metrics)。针对测试集中的每一个构象：查看是否能够在生成的构象集合里找到RMSD值小于给定阈值的构象(如果能，则表示该模型能够覆盖当前测试构象)，可以计算得到覆盖率 计算生成的构象集合与当前测试构象的最小RMSD值，取平均可以得到匹配程度的值。以上是从测试集的角度衡量模型表现(召回率) 相应地，将测试集构象与生成集构象在计算中对调，则可判断模型的准确率。目前常见的测试数据集包括GEOM-QM9和GEOM-Drugs[12]。2.2 模型方法构象生成模型沿着两个思路发展：直接生成各个原子的3D坐标 先生成原子对距离、二面角等中间参数，再将分子3D坐标还原。对于前者，技术难点在于保证模型对于输入分子的旋转-平移不变性(整体改变分子坐标，得到的构象是相同的，也即对齐过程)。对于后者，则可能生成不合法的中间参数(比如违反三角几何关系)，或者中间参数的误差在训练过程中不断累积，影响分子3D坐标重构，需要进行后续的力场优化 但这是目前大多数方法所选取的道路。此处简要介绍最近发展的GeoDiff模型[13]和DMCG模型(Direct Molecular Conformation Generation)[14]。Xu等人于2022年提出GeoDiff，使用扩散模型直接生成原子坐标。GeoDiff在GEOM-Drugs数据集上测试集覆盖率可达约89%、匹配程度约0.86 Å，并且经过力场优化之后可以进一步提升模型表现。作者指出：在逆向扩散过程中(生成过程)，如果某一时刻T的密度函数具有旋转-平移不变性，且逆向生成的条件概率函数具有旋转-平移不变性，则T时刻以前任意时刻的密度函数也具有旋转-平移不变性。同年， Zhu等人提出基于变分自编码器的DMCG模型，在GEOM-QM9和GEOM-Drugs数据集上均取得最优(对于后者，覆盖率约96%，匹配程度约0.70 Å)。作者指出：模型除了满足旋转-平移不变性外，对于对称结构还应当满足置换不变性(交换对称原子的坐标，得到的构象是相同的)。为此，计算任意旋转-平移操作以及对称原子置换操作下的两个结构的距离最小值，并将其引入损失函数中，以满足以上两种不变性。消融实验表明，如果不考虑这一项损失，则覆盖率将下降约20个百分点，匹配程度将提高约0.3 Å。2.3 讨论今年3月，Zhou等人[15]基于RDKit设计了一种简单的生成算法：使用RDKit分别采样二面角、采样几何片段、采样能量并生成相应的构象，随后按照能量大小进行聚类。在GEOM-QM9和GEOM-Drugs两个数据集上，与GeoDiff、DMCG等深度学习方法相比，该算法几乎在所有指标上取得SOTA。作者认为，目前的测试基准不足以覆盖实际应用中(如分子对接中)涉及的构象生成任务。　　事实上，生成足够的分子构象不会降低测试构象集上的匹配程度和覆盖率(召回率)，但可能降低生成构象集的相应指标(查准率)。而Zhou等人(包括Zhu等人的DMCG)并未在文中给出关于后者的模型评价，因此模型的实用性仍有待考察。另外，目前的构象生成方法均以单个配体的势能极小值作为优化目标，针对(已知口袋的)复合物中配体的构象生成模型仍有待开发。最后，GeoDiff模型与DMCG模型的发展也启示我们挖掘任务目标中蕴含的性质(对称性、不变性)，在模型训练中引入合适的归纳偏置。　　3. 机器学习打分函数3.1 评价指标Su等人[16]于2019年建立了一套打分函数的基准测试数据集CASF-2016。CASF-2016及其前身CASF-2013已被广泛用于评估打分函数的表现。同时，Su等人设计了四类指标分别考察打分函数的打分能力、排名能力、对接能力和筛选能力。打分能力通常以Pearson相关系数来衡量：考察天然蛋白复合物的计算打分值与实验结合常数的对数之间的线性相关性。排名能力通常以Spearman等级相关系数或Kendall等级相关系数来衡量：对于同一蛋白、不同配体的多个天然蛋白复合物结构，考察计算打分值给出的排名与实验结合常数给出的排名之间的匹配程度。对接能力以对接成功率衡量：对于单个复合物，在天然配体结合构象和一系列计算生成的诱饵分子构象(decoy)中，若计算打分最高者与真实结合构象的RMSD小于2 Å，则认为对接成功 对于多个复合物，进一步计算对接成功率。筛选能力以筛选成功率衡量：在天然配体和一系列其它配体分子中，计算打分前1%(5%、10%)结果里包含天然配体的比例。由此可见，打分能力直接以实验数据作为参考，是评估打分函数是否可靠的基本测试。排名能力是对打分能力的补充。打分能力越好，排名能力通常也越好 反之则未必成立(存在对实验结合常数进行非线性拟合的打分函数)。对接能力测试将计算生成的构象引入测试集中，因此更贴近实际对接操作、对于打分函数的选择更具参考意义。需要指出的是，对接能力测试给出的结果通常只能代表该打分函数的对接能力上限，在CASF-2016的测试中可能呈现分数虚高的情形(在测试中能够以90%的成功率在top-1中挑选出天然配体构象，但在实际应用中却不能达到这一表现)。这主要归结于实际应用中计算生成的构象不够充分。筛选能力涉及多种配体的对接，因此可视为对排名能力和对接能力的综合考察。3.2 模型方法针对打分函数的机器学习方法，前人已给出详尽的综述[17][18][19]。本文将展开介绍经典的ΔVinaRF20打分函数[20]，以及最近发展的DeepDock[21]和RTMScore[22]。ΔVinaRF20由Wang等人于2016年提出，在CASF-2013、CASF-2016测试集上的各指标中均排名靠前[16][20]。具体地，在CASF-2016测试集上，ΔVinaRF20在打分能力和排名能力两个指标上分别以0.82和0.75取得最优，在对接能力上以89.1%(top1)仅次于Autodock Vina(90.2%)，在正向筛选能力以42.1%(top1)取得最优、逆向筛选能力以15.1%(top1)位居第五(次于最优方法ChemPLP@GOLD约2.4%)。Wang等人指出：机器学习打分函数与经典的打分函数在这些指标中各有所长，前者长于打分，后者长于对接和筛选。因此作者拟结合二者优点：一方面对训练集进行数据增强，将计算生成的诱饵结构引入训练集中(同时计算估计亲和力作为标签)，以提高机器学习打分函数的对接和筛选能力 另一方面使用随机森林方法对AutoDock Vina中的打分函数进行参数化修正(使用Δ-machine learning方法，类似残差拟合)。Méndez-Lucio等人于2021年提出的DeepDock方法在CASF-2016的正向筛选和逆向筛选能力评估中分别以43.9%和23.9%取得SOTA，但DeepDock给出的打分值与实验结合常数的对数之间不存在相关性(在训练过程中未引入实验结合常数的相关信息)。DeepDock方法使用二维分子图刻画配体、多面体网格点刻画蛋白质口袋(参考了MaSIF的编码框架[23])，分别学习蛋白质口袋与配体原子的节点表示 随后两两组合配体和靶蛋白的节点形成节点对，使用混合密度函数拟合节点对的距离分布(概率密度函数)。作者指出：相较于通过最小化距离误差来学习节点对距离的平均值，混合密度函数能够学习训练集中节点对多个可能的距离，从而更好地刻画构象预测任务中的多值特性。在DeepDock的基础上，Shen等人从两方面进行改进得到RTMScore：一方面，使用无向图编码蛋白质口袋残基，在编码过程中满足对于输入复合物坐标的旋转不变性 另一方面使用Graph Transformer模型以学习更深层次的特征。作者声称RTMScore在CASF-2016测试集上的对接能力和筛选能力达到SOTA，相较DeepDock得到大幅提升：对接成功率达到98.6%，正向筛选成功率达73.7%，逆向筛选成功率达38.9%。3.3 讨论DeepDock等方法的发展展现了图模型在捕获蛋白质-配体互作的潜力，以及直接拟合蛋白残基-配体原子距离似然函数的有效性。事实上，距离似然函数不仅能作为打分函数评估当前构象，还能够作为某种“势能面曲线”指导构象优化。此外，这些新近提出的DeepDock等方法有待更广泛的测试验证。在其它论文的评估实验中[24]，RTMScore在对接能力中依旧表现最优。但考虑到缺少打分能力、排名能力等测试数据，后续仍需要更多的测试评估(尤其是将打分函数整合到完整的对接流程中)以验证这些方法的可靠性。　　4. 机器学习自由能面4.1 评价体系拟合自由能面的模型直接处理盲对接任务，生成复合物构象。其中存在两类评价指标。一类指标评估计算准确性。通常以预测复合物(如果模型给出多个可能的构象，则选取打分值top-1者)中配体重原子RMSD小于2 Å所占的比例来衡量模型对接能力。一般以2 Å作为对接成功与否的判断阈值[10]。还有通过配体质心距离小于2 Å(或5 Å)所占的比例来考察模型是否能够找到正确的结合口袋。此外，为判断生成的配体构象在化学上是否合理，Corso等人额外考察了配体构象中存在位阻冲突(steric clash，配体内部重原子之间的距离是否小于0.4 Å)的比例。另一类指标评估计算效率 这在大型分子数据库的虚拟筛选过程中同样不可忽视。以对接一个分子所需的平均CPU(如果可能，使用并行加速)或GPU时间来衡量。4.2 模型方法拟合蛋白质-配体自由能面的机器学习方法最近得到逐步发展，代表性的方法包括EquiBind[1]、TANKBind[25]、DiffDock[10]。Stärk等人于2022年提出基于图几何深度学习的EquiBind方法，在机器学习方法直接预测蛋白质-配体结合构象这一问题中做出开创性贡献。该方法以随机的配体分子构象(比如使用RDKit生成的构象)作为输入，无需经过大规模的构象采样即可在约0.1 s的时间内给出复合物结构。由此给出的结构在寻找结合口袋的能力上与传统方法(如QuickVina-W)相当(配体质心距小于2 Å的比例均约40%)，但在配体结合构象的预测上却表现不佳(配体RMSD小于2 Å的比例约6%，不及QuickVina、GLIDE等方法所达到的约20%)。虽然可以在该结构的基础上结合传统方法进一步微调配体位置和构象，但将增加预测所需的时间成本至数十秒或数百秒。同年，Lu等人提出TANKBind。相较于EquiBind，在保留推理速度(约0.5秒)的同时，TANKBind在配体构象预测上取得和传统方法相当的结果(配体RMSD小于2 Å的比例约19%)，口袋预测能力则获得较大提升(配体质心距小于2 Å的比例约56%)。不同于EquiBind对整个蛋白质进行编码的方法，TANKBind采用P2Rank寻找口袋位置，随后针对该位置的蛋白质区块(由半径20 Å内的残基构成)，拟合蛋白质残基与配体原子的距离。此外，受AlphaFold2的启发，TANKBind将三角几何约束引入残基与配体原子的距离建模中。消融实验表明，三角几何约束可以显著提升模型表现：配体RMSD小于2 Å的比例提升约15%，配体质心距小于2 Å的比例提升约12%。同年十月， Corso、Stärk等人提出DiffDock模型。该模型在对接准确性上首次实现了对传统对接模型的大幅超越。在holo态的蛋白晶体对接结果中，配体重原子RMSD小于2 Å所占的比例可达到38.2%，约为传统方法的两倍。这一结果对应于40次采样，消耗计算时间约40秒。与DeepDock想法类似，DiffDock使用生成模型来学习构象的概率分布并建立了一套相应的“扩散”方法(构象采样方法)。4.3 讨论今年2月，Yu等人[11]重新设计实验，考察了DiffDock等机器学习模型在盲对接任务中的哪一阶段领先传统方法、领先到何种程度。作者将盲对接任务拆分为口袋搜索和局部对接两个子任务，设计了三组实验：完全使用DiffDock等模型完成盲对接 使用其它方法搜索口袋(如前文所述的PointSite、P2Rank)，使用Uni-dock[26](一种基于AutoDock Vina 1.2的GPU加速对接方法)局部对接 使用DiffDock搜索口袋，使用Uni-dock局部对接。结果表明：DiffDock方法在口袋搜索中效果更佳(相较于PointSite等方法而言，引入了配体分子的结构信息)，但与ground truth、即表中的GT pocket相比仍存在提升空间 口袋确定，传统对接手段得到的结果优于DiffDock等机器学习模型。作者进一步指出：给定口袋下预测蛋白质-配体构象的机器学习方法是后续发展的方向(正如机器学习构象生成中所讨论的) 对于端到端的模型比较实验中，需要更审慎地评估传统方法的表现。另外，随着蛋白质结构预测方法的发展，评估模型在apo态蛋白质上的对接表现是有必要的，也是更符合实际情形的。事实上，目前几种模型所使用的训练集均为holo态蛋白(缺乏足够数量的与holo态对应的apo态蛋白结构)。为泛化模型的对接能力至apo态蛋白结构，通常采取折中方案：假定apo态与holo态的主链变动不大，而在模型编码过程中只使用主链碳原子的信息。DiffDock论文中首次评估了各种方法在ESMFold给出的蛋白质结构上的对接能力。结果显示，各模型的对接表现均显著下降(对于DiffDock而言，配体重原子RMSD小于2 Å所占的比例从38.2%下降至20.3%)。机器学习方法建模对接过程中蛋白质的结构变化仍然道阻且长。将分子动力学模拟过程中产生的动态信息引入模型中也许是一种可能的突破方向[27]。最后，正如AlphaFold2可作为打分函数评估蛋白质结构是否合理[3]，DiffDock等拟合自由能面的模型，其在打分函数的各项评价指标中表现如何也值得进一步探究。　　参考文献　　[1] Equibind: Geometric deep learning for drug binding structure prediction　　[2] Artificial intelligence–enabled virtual screening of ultra-large chemical libraries with deep docking　　[3] State-of-the-Art Estimation of Protein Model Accuracy Using AlphaFold　　[4] A Critical Comparative Assessment of Predictions of Protein-Binding Sites for Biologically Relevant Organic Compounds　　[5] Improving detection of protein-ligand binding sites with 3D segmentation　　[6] PointSite: A Point Cloud Segmentation Tool for Identification of Protein Ligand Binding Atoms　　[7] P2RANK: Knowledge-Based Ligand Binding Site Prediction Using Aggregated Local Features　　[8] P2Rank: machine learning based tool for rapid and accurate prediction of ligand binding sites from protein structure　　[9] DeepSite: protein-binding site predictor using 3D-convolutional neural networks　　[10] DiffDock: Diffusion Steps, Twists, and Turns for Molecular Docking　　[11] Do Deep Learning Models Really Outperform Traditional Approaches in Molecular Docking?　　[12] GEOM, energy-annotated molecular conformations for property prediction and molecular generation　　[13] GeoDiff: a Geometric Diffusion Model for Molecular Conformation Generation　　[14] Direct Molecular Conformation Generation　　[15] Do Deep Learning Methods Really Perform Better in Molecular Conformation Generation?　　[16] Comparative Assessment of Scoring Functions: The CASF-2016 Update　　[17] Machine-learning methods for ligand-protein molecular docking　　[18] Protein–Ligand Docking in the Machine-Learning Era　　[19] From machine learning to deep learning: Advances in scoring functions for protein–ligand docking　　[20] Improving scoring-docking-screening powers of protein–ligand scoring functions using random forest　　[21] A geometric deep learning approach to predict binding conformations of bioactive molecules　　[22] Boosting Protein–Ligand Binding Pose Prediction and Virtual Screening Based on Residue–Atom Distance Likelihood Potential and Graph Transformer　　[23] Deciphering interaction fingerprints from protein molecular surfaces using geometric deep learning　　[24]: A fully differentiable ligand pose optimization framework guided by deep learning and a traditional scoring function　　[25] TANKBind: Trigonometry-Aware Neural NetworKs for Drug-Protein Binding Structure Prediction　　[26] Uni-Dock: GPU-Accelerated Docking Enables Ultralarge Virtual Screening　　[27] Pre-Training of Equivariant Graph Matching Networks with Conformation Flexibility for Drug Binding　　本文作者：ZF责任编辑：WFZ

2021年3月17日，Aptamer Group宣布与快速诊断制造商Mologic建立商业合作关系。该合作伙伴关系将致力于为Aptamer Group的AptaDx SARS-CoV-2侧向快速测试提供CE注册。实验室样品的初步测试分析表明，其极好的灵敏度能够检测到每毫升低至1000的病毒颗粒，进一步临床验证正在英国纽卡斯尔东北的新冠肺炎综合中心进行，随后将进行CE注册。与Mologic合作将有助于加速Aptamer Group的诊断产品向市场的发展，并通过Mologic为最终的商业化提供制造能力。Aptamer Group也正在与其他全球制造商进行讨论，获取更大的产能，期望可以达到每个月数百万个测试。Aptamer Group的SARS-CoV-2 快速诊断试剂将是第一个基于适配体的商业化的产品。适配体基于核酸合成，与特异靶标有亲和力，通过固相合制备，易于扩大生产，具有高成本效益。与标准的基于蛋白质的试剂相比，适体的生产具有明显的成本优势，从而可以在全球范围内大规模开发和提供测试，包括向中低收入国家/地区提供。内行从业人士曾咨询过报价，1g适配体约1万元，也就是 10元/mg，这还是没有扩大生产的成本。那么，究竟什么是核酸适配体？核酸适配体（Aptamer）是一段寡核苷酸序列（DNA或RNA），是一种类似抗体的分子，能够识别特定的靶标分子，通常是利用体外筛选技术——指数富集的配体系统进化技术（Systematic evolution of ligands by exponential enrichment，SELEX），从核酸分子文库中得到的寡核苷酸片段。与抗体相比，核酸适配体具有分子量小、生产成本低、存储和运输简单、无批间差异、可以快速放大，以及质控简单等这样一系列优势。作为类似抗体的平台型技术，具有非常广泛的用途。但目前来看，核酸适配体产业远不及抗体产业那么成熟。尽管中国的科研团队第一时间获得了新冠病毒S蛋白和N蛋白的适配体，领跑全球，但在产品推出方面依然落后于抗体产品。Aptamer Group推出首款基于适配体的商业化的产品，将是对核酸适配体产业化的极大鼓舞，推动未来核酸适配体产业布局和发展。

p style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "span style="text-indent: 2em "4月1日，由中国科学技术大学罗昭锋发起，仪器信息网联合主办的strong“核酸适配体在新冠疫情中的应用”专题网络研讨会/strong成功举办。本次会议报名人数高达1707人，出席1380人，出席率达80.8%，会议取得圆满成功。/spanbr//pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "核酸适配体因其“可以做抗体不能做的事”，而受到广大研究人员的关注。如今，核酸适配体在分析化学、蛋白质组学、临床医学、药物研发及基因调控等领域已经成为重要的研究工具。/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "面对新型冠状病毒疫情，strong如何充分发挥核酸适配体的作用？如何通过各方通力协作，加快产品开发速度？如何完善核酸适配体产业链？核酸适配体产业如何布局和发展？/strong24位来自全球核酸适配体领域的顶尖科学家针对上述问题作了精彩报告。/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 167px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202004/uepic/03845238-73cb-4814-a39a-74113182d001.jpg" title="核酸适配体.png" alt="核酸适配体.png" width="600" height="167" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: center "span style="text-indent: 2em "报告专家/span/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "span style="color: rgb(255, 0, 0) "strong以下是部分回放视频：/strong/span/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "strong报告一、会议介绍及新冠蛋白核酸适配体的筛选 罗昭锋(中国科学技术大学)/strong/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "a href="https://www.instrument.com.cn/webinar/video_112188.html" target="_self" style="text-decoration: underline color: rgb(0, 112, 192) "span style="color: rgb(0, 112, 192) "strong回放链接/strong/span/a/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "介绍了核酸适配目前在全球的发展状况，与抗体比较的优缺点。在新冠肺炎疫情下，团队在最短时间内获得了N蛋白与S蛋白的适配体。分析核酸适配体目前遇到的瓶颈，推荐大家在筛选的时候需要考虑应用的条件，尽可能在复杂体系中进行筛选，并具体以N蛋白和S蛋白适配体筛选为例，分析了遇到的问题以及具体的解决方法。最后深入分析了目前适配体产业链发展遇到的问题。当下需要在获得优质适配体的基础上，开发出能真正走向实用的产品。最后，提出了在整个产业链上不同环节开发者之间的合作框架，希望借此机会推进不同团队之间的合作。/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "strong报告二、Functional nucleicacids as biosensors towards better human health:accomplishments andchallenges 李应福(McMasterUniversity（加拿大）) /strong/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "介绍了如何进行COVID-19蛋白的检测，通过control line、IgG和IgM三条检测线的变化进行结果判断，具有操作简单，快速以及灵敏度高等特点，并阐明了核酸适配体领域的现状以及本身对于功能性核酸生物传感器的成就，并且对于核酸适配体的应用发展提出了一些针对性意见，提出未来核酸适配体的重心应当集中到适配体的实际应用上，我们不仅要得到了好的核酸适配体，更需要好用的核酸适配体，同时提出我们在进行核酸适配体的医学应用研究时，我们应当与医生和临床密切的联系，让医生参与到我们的研究当中来。/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "strong 报告三、Rapid directdetection at single virion level and differentiation of infectious fromnoninfectious virus using DNA aptamer-nanopore 陆艺(Universityof Illinois at Urbana-Champaign) /strong/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "span style="color: rgb(255, 0, 0) "stronga href="https://www.instrument.com.cn/webinar/video_112189.html" target="_self"回放链接/a/strong/span/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "介绍了DNA酶的产品开发和DNA纳米孔传感器，在point-of-care检测中，在不需要预处理情况下提高选择性和灵敏度，快速检测传染性病毒和非传染性病毒。介绍了团队从基础研究到实际应用中发展，例如将POC用于用药监测，选择合适有疗效的窗口，改进药物疗效；缩短研发时间，应用到现有的仪器中，比如血糖仪中试纸条的钠离子和锂离子检测，实现产品化；细胞内和体内成像剂，将此应用近红外光热激发DNA酶-金纳米在活细胞里金属离子的成像，目前已经通过光调节适配体传感器时空控制活细胞线粒体中的ATP成像以及活细胞里面看到钠离子成像。将DNA酶和荧光蛋白结合从而看到一些小分子。报告了一种简单的方法，无需任何预处理即可在单个病毒颗粒水平上快速（ 30min）检测和区分环境或生物样本中的传染性和非传染性人类腺病毒。/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "strong报告四、核酸适配体体外诊断中的应用与挑战 林振宇(福州大学) /strong/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "span style="color: rgb(0, 112, 192) "stronga href="https://www.instrument.com.cn/webinar/video_112190.html" target="_self"回放链接/a/strong/span/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "介绍了体外诊断的三种方法，基于抗原抗体的免疫诊断，基于酶的生化诊断，基于核酸的分子诊断。结合实验室基础，重点介绍了免疫诊断和基于核酸适配体分子诊断，并比较了两者的优缺点，进一步分析了核酸适配体在体外诊断中的机遇与挑战，及免疫分析检测的优点。就目前新冠病毒疫情而言，免疫体外诊断存在严重的假阴性及假阳性问题，如何在病毒含量低的时候，实现快速检测。这对于核酸适配体而言，既是机遇，也是挑战。/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "strong报告五、核酸适配体自动化筛选方案解决方案 孙梅（赛默飞世尔科技（中国）有限公司） /strong/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "span style="color: rgb(0, 112, 192) "stronga href="https://www.instrument.com.cn//webinar/video_112202.html" target="_self"回放链接/a/strong/span/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "介绍了核酸适配体的背景、自动化selex筛选的步骤原理，磁珠法自动化加速selex的筛选，磁珠法的工作流程及方案，进一步介绍了kingfisher转移磁珠等，kingfisher flex，kingfisher presto，dynabeads磁珠，筛选所要用的试剂等产品。/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "strong报告六、基于核酸适配体的生物医学信息获取 羊小海(湖南大学) a href="https://www.instrument.com.cn//webinar/video_112191.html" target="_self" /a/strong/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "span style="color: rgb(0, 112, 192) "stronga href="https://www.instrument.com.cn//webinar/video_112191.html" target="_self"回放链接/a/strong/span/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "介绍了基于核酸适配体的生物医学信息获取，从纳米材料、信号转换、靶标识别构建生物功能化纳米探针，开展细胞与活体层面信息获取的系列研究工作。重点阐述了通过aptamer筛选获取探针，检测模式和探针设计(夹心、竞争、激活、裂开型、多价结合及药物）对探针的影响。/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "strong报告七、新冠肺炎临床诊疗的困境与挑战 王晶、段静思(安徽医科大学) /strong/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "介绍了新冠在临床的病程进程，临床症状、病理改变等。主要阐述了实验室的诊断方法、重症及危重症预警两方面。各种不同体外诊断检测的解析，不同检测方法与临床症状的矛盾，分析了核酸检出率低的原因可能在于人为因素，主要为采样位置、时间、连续性、样本保存、运输、技术问题、病毒变异、PCR技术等。此外，在诊断过程中还存在着各种问题，如病毒载量，病毒分型，只有更好解决这些问题，才能为临床提供一个更好的诊断依据。当前的治疗，缺乏有效治疗药物，只能提供支持性辅助治疗。最后，从临床的角度对科研提出一些研究方向。 /pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "strong报告八、Detectionof target byARP-PCR 林俊生(国立华侨大学) a href="https://www.instrument.com.cn//webinar/video_112192.html" target="_self" /a/strong/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "span style="color: rgb(0, 112, 192) "stronga href="https://www.instrument.com.cn//webinar/video_112192.html" target="_self"回放链接/a/strong/span/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "介绍了ARP-PCR用于检测的方法（aptamer-based regionally protected PCR)，此方法结合了PCR的信号放大和aptamer的特异性。报告以结合FSHa的适配体A6为原型介绍了结合位点的判断，用干实验（电脑软件预测）和湿实验（分子生物学试验方法，例如斑点杂交，pull-down等），找到结合位置，用酶降解不结合分子以及分子的不结合区域，进行PCR扩增放大特异性的位点。使用恒温扩增代替RT-qPCR，可以on-site检测待测物。/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "strong报告九、基于机器学习的新冠病毒核酸适体筛选 宋彦龄(厦门大学) /strong/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "stronga href="https://www.instrument.com.cn//webinar/video_112193.html" target="_self"回放链接/a/strong/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "介绍了基于机器鉴定的适配体筛选新方法。针对新冠病毒，选择靶标：S蛋白的RBD结构域，筛选过程加入ACE2竞争辅助筛选，期望获得的适配体与RBD的结合区域与ACE2的结合区域相同。提出基于结构域、家族大小、结构稳定性的多维度综合分析策略，实验对高通量测序大数据中核酸适配体的快速、准确甄定。获得了系列针对SARS-CoV-2的受体结合域（RBD）的高亲和适配体并进行了截短优化，获得的CoV2-RBD-1C和CoV2-RBD-4C适体对RBD的Kd值分别为5.8 nM和19.9 nM。使用分子动力学模拟的相互作用模型及ACE1的竞争实验表明，两条适体可能在SARS-CoV-2 RBD对ACE2的结合上具有部分相同的结合位点。其筛选的适配体为SARS-CoV-2提供了新型识别探针，并且有可能将助力SARS-CoV-2的防控及治疗，同时为深入研究新冠病毒感染机制提供了一个新的分子识别工具。目前文章已经发表。/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "strong报告十、适配体相关探针研制及其在病毒检测中的应用 何治柯(武汉大学) /strong/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "span style="color: rgb(0, 112, 192) "stronga href="https://www.instrument.com.cn//webinar/video_112194.html" target="_self"回放链接/a/strong/span/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "介绍了配合探针与量子点探针两个方面的研究，分享了配合物探针中的核酸分子‘光开关’相关应用：可以替代EB用于核酸检测。核酸分子‘光开关’与量子点结合可用于核酸和蛋白的检测，实现传感与诊断，也用于药物筛选。核酸分子‘光开光’对活病毒双荧光标记用于胞内核酸示踪研究，实现多重荧光标记，10-15min可检测到病毒。其单个艾滋病病毒脱壳过程示踪研究，在科技日报上被称为2016年中国病毒学界重大发现。在量子点探针研制及其病毒检测中的应用：主要讲了实现合成低毒CdTe量子点，一步合成DNA-CdTe：Zn2+量子点；Mucin 1适配体功能量子点成功实现靶向肿瘤。量子点用于病毒的检测实现可视化、多病毒同时检测，也朝着双色一体化发展。目前适配体功能化探针已用于癌症标志物检测与成像，量子点信标已成功应用于单个艾滋病毒RNA的标记与成像。 /pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "strong报告十一、超灵敏单分子微阵列技术(SiMoA)在COVID-19研究中的应用潜能 李朝辉(郑州大学) a href="https://www.instrument.com.cn//webinar/video_112195.html" target="_self" /a/strong/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "span style="color: rgb(0, 112, 192) "stronga href="https://www.instrument.com.cn//webinar/video_112195.html" target="_self"回放链接/a/strong/span/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "介绍了超灵敏单分子微阵列技术（SiMoA）原理，开发出基于微珠的数字式ELISA。新的ELISA相对于传统ELISA，检测的灵敏度提高了1000倍、需要样本变得极低（10-50微升），且可应用与抗原抗体 MiRNA 、外泌体、 CTC与生物小分子的检测，具有极其广阔的应用前景。基于SiMoA已发展了针对近40种肿瘤标志物的超灵敏检测，针对已开发的20余种标志物测定方法的临床样品测定正在进行中，SiMoA平台用于检测新冠病毒蛋白具有巨大优势。/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "strong报告十二、适配体在新冠中潜在的应用 廖世奇(甘肃省医学科学研究院) /strong/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "span style="color: rgb(0, 112, 192) "stronga href="https://www.instrument.com.cn//webinar/video_112196.html" target="_self"回放链接/a/strong/span/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "介绍了适配体在新冠中的潜在应用，从五个方面着手：1、新冠的已有检测技术2、新冠需要的检测技术3、适配体的优势方面；4、新冠问题和拟解决的思路：问题主要是快速准确的确定和检测传染源以及病人病程检测监控。针对这个问题，思考利用分子信标、电化学检测和信标配基等方法快速检测和将蛋白信号转化为核酸，通过适配体形成检测信号的转换和统一监测，形成完整检测。5、目前面临的困难和机会。/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "strong报告十三、框架核酸拓扑适配体增强膜蛋白识别 左小磊(上海交通大学)/strong /pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "span style="text-indent: 2em "介绍了框架核酸拓扑适配体的构成，框架核酸是一类人工设计的结构核酸；尺寸、形貌和力学特性可程序性调控；为分子识别提供结构支撑和微环境调控。且显著增强核酸适配体的分子识别结合强度。已经成功将拓扑适配体成功用于捕获循环肿瘤细胞；目前的结果显示，拓扑适配体，可用于多种细胞的捕获，随着适配体数量的增强，结构的复杂程度越高，分子的结合强度越高，捕获效率也会显著提高，且捕获效率高于常规核酸适配体。/span/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "strong报告十四、基于功能(寡)核苷酸的治疗药物与检测试剂研发 杨振军(北京大学) /strong/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "span style="color: rgb(0, 112, 192) "stronga href="https://www.instrument.com.cn//webinar/video_112199.html" target="_self"回放链接/a/strong/span/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "介绍了主要的研究方向：1.化学修饰的小核酸药物研究；2.基于核酸适配体的疾病检测新技术研究；3.环核苷酸类信使分子化学生物学研究；4.核苷类抗病毒药物研究。利用基于氢键/π-π作用的中性胞苷脂材DNCA包载G-4核酸适配体有效转染入胞，在给药剂量大大降低的情况下表现出明显的抗肿瘤作用；在DNCA包载下，发现G-4核酸适配体AS1411和TBA的选择性抗耐药肿瘤细胞作用，并初步探究了作用机制；AS1411和TBA磷硫代、loop拓展，获得了高效抗肿瘤且主要靶标蛋白不同的修饰物；初步构建了基于cRGD的G-4核酸适配（修饰物）靶向递送系统，考察其在动物体内的实体瘤靶向性。基于课题组的突破性核酸递送系统和修饰策略，研发功能寡核苷酸(核酸适配体、反义核酸、siRNA)及环二核苷酸)类精准治疗药物，可能为新冠肺炎病毒感染患者的治疗提供新的选择，也可能会开发出更高效、更精确的临床所亟需的核酸适配体类病毒检测试剂盒，早日实现此类药物和诊断制剂的临床广泛应用，助力未来各类疫情的防控。 /pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "strong报告十五、核酸适配体在生物传感及POCT诊断中的应用 杜衍(中国科学院长春应用化学研究所) /strong/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "span style="color: rgb(0, 112, 192) "stronga href="https://www.instrument.com.cn//webinar/video_112200.html" target="_self"回放链接/a/strong/span/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "介绍了COVID-19新冠病毒的检测手段、在新冠肺炎攻关项目相关的阶段性进展以及适配体对于靶细胞的识别和检测，同时提出未来适配体检测方面的应用需要把目光投向病毒、细胞、细菌等具有重要检测意义的物质这一观点。阐述动力学竞争的适配体传感器，通过在平衡竞争状态下的互补链替换法和非状态下的动力学竞争法来进行检测，另外基于动力学竞争的适配体比率传感器和无需构型转变的适配体传感器进行了简单的说明。认为POCT检测除了利用电化学的电化学信号和血糖仪的电子信号等分析手段，还需要寻求更有效的信号传导探针和实现基因和血清学检测一体化。/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "strong报告十六、如何应对aptamer亲和力测定中的挑战 张玺（应用专家） a href="https://www.instrument.com.cn//webinar/video_112203.html" target="_self" /a/strong/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "span style="color: rgb(0, 112, 192) "stronga href="https://www.instrument.com.cn//webinar/video_112203.html" target="_self"回放链接/a/strong/span/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "介绍了关于aptamer全球课题组的研究情况：中国拥有全球研究适配体最大规模的团队。分析适配体应用情况：目前可应用到临床的aptamer药物比较少，FDA批准的aptamer的药物仅有一个，很多处于临床阶段，但目前核酸适配体处于快速发展阶段。介绍一些适配体亲和力检测过程中的一些挑战：如何在复杂液体中检测、通量需求等。介绍aptamer用于检测时的优势，与SERS纳米探针亲和力测定检测原理；介绍CRISPR-Cpf RNA识别机制研究的基本情况与实验原理；介绍aptamer在复杂液体中检测靶分子的实验与对比情况。/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "strong报告十七、核酸适配体在临床中的应用 罗阳(重庆大学) /strong/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "span style="color: rgb(0, 112, 192) "stronga href="https://www.instrument.com.cn//webinar/video_112201.html" target="_self"回放链接/a/strong/span/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "介绍了基于适配体检测论文的概况(以荧光检测为主)，适配体与抗体的优缺点以及适配体的应用范围。以及从多篇文献角度讲述现关于适配体的应用：核酸、小分子、蛋白、微生物、细胞、外泌体的检测，并分析了适配体检测的问题、意义、不足，同时阐述了适配体临床应用的局限性、运用前景、和实验室的优势。建立简单、易普及的筛查和检测手段是减少新冠病毒疫情传播的重要手段。然而，目前研发的基于核酸检测产品均受到检测时间的限制，而基于抗原抗体免疫反应的快速检测试剂盒需要制备高特异性的抗体，为突发疫情的及时监测和隔离带来困难。核酸适配体的临床应用能够在时间、成本及特异性上均能够避免上诉缺陷，为疫情的应急检测发挥巨大作用。/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "strong报告十八、内置样品处理器件的光谱快检技术 杜一平(华东理工大学) a href="https://www.instrument.com.cn//webinar/video_112198.html" target="_self" /a/strong/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "span style="color: rgb(0, 112, 192) "stronga href="https://www.instrument.com.cn//webinar/video_112198.html" target="_self"回放链接/a/strong/span/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "碱基胸腺嘧啶(T)与汞离子形成T-Hg2+-T结构，可使标记四甲基罗丹明的SERS探针适配体的拉曼信号显著降低，利用这一特点制备了一种高灵敏、高选择性的汞离子检测探针。主要的研究方向是实用化，将技术投向应用，以光谱快检仪器为例，样品处理装置，光谱分析软件为主。分析了检测容易出现的问题，如何提高灵敏度，选择性。针对低含量样品检测，提出固相萃取光谱分析及其具体做法，和使用的主要仪器：膜固相萃取装置，光纤光谱仪等。用三个例子讲述了这项技术:SPES 光气的检测，膜固相萃取荧光检测苯并比，SPES检测伏马毒素。分析了SPES的优缺点，思考了新冠肺炎检测及合作思路。/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "strong报告十九、细胞与分子传感器及其在生物医学中的应用 吴春生(西安交通大学) /strong/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "介绍了生物传感系统及其发展，讲解嗅觉味觉等基本原理，以及其转到途径；再介绍LAPS单细胞传感器，原理和仪器系统的构架，并结合适配体开发新的传感器，包括分子传感器和DNA传感器。最后希望开发出能检测多种海洋生物毒素的仪器，运用到适配体，达到现场快检的目的。/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "strong报告二十、 适配体-有机电化学晶体管（Apatmer-OECT）传感器 冀健龙(太原理工大学) /strong/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "介绍了适配体-有机电化学晶体管（Apatmer-OECT）传感器，报告详细介绍了OECT与适配体生物传感器，OETC高灵敏度生物传感，OECT器件制备关键问题三个方面；Aptamer常规的传感方法有FRET，CV or EIS，Goldnanoparticles，OECT；介绍了Aptamer常规的传感方法，主要是电化学方法；介绍了电化学方法的基本原理以及一般进行信号放大的方法。/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "strong报告二十一、化学修饰核酸适配体用于肿瘤识别和治疗 谈洁（湖南大学）a href="https://www.instrument.com.cn//webinar/video_112197.html" target="_self" /a/strong/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "span style="color: rgb(255, 0, 0) "stronga href="https://www.instrument.com.cn//webinar/video_112197.html" target="_self"回放链接/a/strong/span/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "介绍了化学修饰核酸适配体用于肿瘤分子识别，实验引入化学修饰丰富核酸适配体的空间构象，核酸适配体设计二茂铁基和三氟甲基修饰核苷酸，硝基修饰人工碱基对化学修饰。研究了化学修饰核酸适配体调控蛋白活性：识别三阴性乳腺癌细胞膜上的整合素α3β1，从而抑制整合素α3β1介导的细胞迁移；自组装化学修饰核酸胶束，核酸二茂铁部分发生芬顿反应改变核酸从疏水变为亲水同时导致胶束尺寸变化，构建尺寸可变的胶束体系同时满足药物在肿瘤边缘的富集和肿瘤中心的渗透，研究了体内评估，表明胶束体系在活体中具有EPR效应，同时具有良好的肿瘤治疗能力。/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "strong报告二十二、新冠病毒的检测现状与核酸适传感器产品化机遇 代昭（天津工业大学） /strong/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "介绍了目前新冠病毒的现状，阐述了核酸检测、抗体检测和抗原检测的各个特点。若能以新冠病毒作为靶标，使用核酸适体开发出荧光生物传感器，则可以极大的简化检测步奏，提高检测准确性。未来的功能化产品方向（1.快筛试剂盒 2.无采样或被动采样可视化检测产品 3.智能警示与防护设备）。/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "a href="https://www.instrument.com.cn/webinar/Video/Video/Collection/10509" target="_self" style="color: rgb(255, 0, 0) text-decoration: underline "strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "“核酸适配体在新冠疫情中的应用”网络研讨会精彩视频回放合集。/span/strong/a/p

手性制药是医药行业的前沿l域，在手性药物获得的诸多方法中，z理想的是催化不对称合成，它具有手性增殖、高对映选择性，易于实现工业化的优点，选择y种好的手性催化剂及配体可使手性增殖10万倍。百灵威精心为您挑选Solvias系列产品，在不对称氢化，消旋体拆分，生物催化，偶联反应中应用广泛，并且供货稳定，可提供公斤j大包装定制以及高通量筛选（HTS）设计合理的实验（DOE），加速您的实验进程，满足科研和生产的不同需求。■ Solvias 系列产品百灵威与美g有名工厂STREM合作，引进113种具有*权的Solvias手性膦配体及催化剂系列产品，在高校有机合成实验室、医药研发中心及药物研究所中有着广泛的应用。产品优势您的收获创新性好，90%以上配体为*产品更多选择，创新研发，优化反应条件及工艺选择性高(ee90%以上)，收率z高可达99%纯化更简单，成本更低，项目进程更快产品纯度高，底物适用广应用在多种基团功能化■ 特色系列介绍Josiphos 配体产品（二茂铁基双膦配体，七大优势配体类别之y），通过实验验证：活性高、用量更少应用在多种催化反应、适用底物广对映选择性高、纯化更简单Josiphos 配体96-3650 Solvias Josiphos Ligand KitReferences:1. Chimia 53, 1999, 275. 5. Angew. Chem. Int. Ed., 39, 2000, 1992.2. Solvias AG, unpublished. 6. Chimia 51, 1997, 300.3. J. Am. Chem. Soc., 116, 1994, 4062. 7. EP 744401, 1995.4. Org. Lett. 2, 2000, 1677 8. Adv. Synth. Catal. 343, 2000, 68. J. Am. Chem. Soc.,122, 2000, 5650. 9. J. Organomet. Chem. 621, 2001, 34.Solvias 产品列表：■ 手性膦配体15-0038395116-70-815-0042352655-61-915-0043910134-30-415-0044192138-05-915-0045167709-31-115-0074552829-96-615-0108505092-86-415-01091044553-58-315-0112145214-57-915-0113145214-59-115-01171133149-41-315-0156133545-24-115-0157133545-25-215-0158256390-47-315-0159256235-61-715-0162868851-47-215-0164868851-50-715-0178133545-16-115-0179133545-17-215-0483321921-71-5■ 二茂铁类膦配体26-0240494227-35-926-0244494227-36-026-0245847997-73-326-0246793718-16-826-0248494227-37-126-0252210842-74-326-0253831226-39-226-0650246231-79-826-0955914089-00-226-09561016985-24-226-0960292638-88-126-0965166172-63-026-0975158923-11-626-1000167416-28-626-1001158923-07-026-1101162291-01-226-1120494227-32-626-1130494227-30-426-1150360048-63-126-1153851308-47-926-1310388079-60-526-1315388079-58-126-1320494227-31-526-1555494227-33-7■ 手性金属催化剂44-0442849921-25-144-0443212133-11-445-0172511543-00-345-0173507224-99-945-017445-017645-017745-017899143-48-345-041545-0750908128-78-945-0752908128-76-745-076645-077046-0270359803-53-546-0272614753-51-446-0290172418-32-577-5009880262-14-677-5010583844-38-677-5019880262-16-877-5020405235-55-4■ 套包装96-3650Solvias Josiphos Ligand Kit96-3651Solvias Walphos Ligand Kit96-3652Solvias MandyPhosTM Ligand Kit96-3655Solvias (R)-MeO-BIPHEP Ligand Kit96-3656Solvias (S)-MeO-BIPHEP Ligand Kit96-6651Solvias cataCXium Ligand Kit for C-X coupling reactions更多产品信息请点击查询

p 核酸适配体是一个正在飞速发展的领域。根据国外4家市场调查公司发布的数据，该领域的未来五年的年复合增长率高达36.3%。为推动国内核酸适配体产业的发展。2017年11月19日，首届核酸适配体产业化资本对接会在安徽合肥隆重举行。本次会议致力于帮助希望创业的科研团队与投资人提供面对面交流的机会，让中国不仅成为核酸适配体论文产出大国，更要成为产业大国。/pp 这次会议得到了合肥经济技术开发区的大力支持。经开区管委会副主任孙余洲先生到会并发表了热情洋溢的致辞，欢迎各位专家到经开区创业，共同建立合肥核酸适配体产业园。来自经开区科技局的副局长邹春森博士介绍了经开区的创业环境和政策等。随后中科大罗昭锋老师通过详实的数据、以生动活泼的语言介绍了什么是核酸适配体及其发展前景。/pp style="text-align: center "img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201711/insimg/f0062185-8557-4733-92a2-ec6c4c8811b9.jpg" title="1.jpg"//pp style="text-align: center "报告：从全球文献看核酸适配体未来趋势/pp style="text-align: center "a href="http://www.instrument.com.cn/webinar/video_103997.html" target="_self" title=""img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201711/insimg/7080325f-1a5d-4ec0-bc32-4b3d292f99f0.jpg" title="4.jpg"//a/pp 随后共有来自高校及科研院所的19位专家介绍了各自的产业化项目，包括产品，发展规划，资金需求等。受益于近两年核酸药物利好的驱动，多家创业团队已经获得了投资。/pp style="text-align: center "img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201711/insimg/9932cb10-ab88-4608-85d4-1a023f23b8a2.jpg" title="2.jpg"//pp style="text-align: center "投资人代表与燕山大学刘老师进行沟通/pp style="text-align: center "img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201711/insimg/7bc5f78d-e379-486b-8f60-2cfe22185ffb.jpg" title="3.jpg"//pp style="text-align: center "投资人代表与江苏大学老师进行现场沟通/pp 会议中有中信医疗健康股权投资基金管理（上海）有限公司，安徽云邦投资管理有限公司，上海碧云天生物科技有限公司，安徽中科新源投资管理有限公司，海恒创投，合肥市招商局，合肥市天使基金，启迪投资，5F创咖，赛智投资等共20多家投资机构参会。 /pp 核酸适配体整个产业刚刚起步，技术壁垒较高，竞争较小，先入优势明显。可喜的是，国内该领域已有部分公司初具雏形。其中昂普拓迈、生工生物、上海伯豪、湖南大学、南京大学等多家单位还为国内提供核酸适配体筛选技术服务。这将进一步推动该领域的发展和成熟。从全球范围来看，核酸适配体产业处于起飞阶段，风口即将到来。/ppbr//p

为促进核酸适配体领域的交流与合作，推动适配体领域的发展，定于2016年11月4日至9日，在安徽合肥市，中国科学技术大学召开第三届中国核酸适配体学术研讨会暨筛选技术培训班，欢迎相关领域的研究者，以及相关产业领域的专家与学者参加会议。 核酸适配体（Aptamer）是一类单链的DNA或RNA小分子，分子量通常在5-25kD之间。功能类似抗体，能够与各种不同的靶标结合。与抗体相比，核酸适配体具有多方面的优势，如无需使用动物、分子量小、可以化学合成、质控简单、性质稳定、易于修饰、靶标比抗体更广泛等等，因此近年来，核酸适配体获得了广泛关注，特别是在中国。继2011年中美在SCI期刊上发表的Aptamer论文数持平之后，近几年中国在该领域的论文数大幅超越美国，成为全球该领域发表论文数最多的国家。2016年至今，来自中国的论文数更是达到了全球该领域总论文数的50%以上。 对于这样一个快速发展的领域，国际上依然存在很多的问题。首先一点是筛选依然是这个领域的瓶颈问题。尽管近年来不断有新的筛选技术建立起来，但没有一个方法能够轻易被重现。这说明筛选机理我们并没有了解清楚，所有的筛选探索依然是在黑暗中摸索。与此对应，好用的核酸适配体数量非常少，约有40%的已发表论文使用6个明星适配体完成的，这种明星适配体的存在，反映了优质适配体的短缺。在适配体应用方面，也存在重复性差、抗干扰能力差、传感器再生困难等一系列问题。另外，在产业化方面，依然缺乏成功的案例。目前为止，仅有一例基于核酸适配体的药物经美国FDA批准上市，其它领域适配体的应用产业化规模仍较小。 经过多年的研究，我们认为适配体领域要想取得突破，需要整合各方面的力量，针对适配体筛选和应用的瓶颈问题进行多学科的交叉合作研究。我们热情欢迎有志于在核酸适配体领域做出贡献的科技工作者，积极参加第三届中国核酸适配体学术研讨会及筛选技术培训班，共同探讨该领域的重要科学问题，并通过信息和资源共享，以及切实的合作，推动该领域向前发展。 会议主题 1、核酸适配体筛选机理 2、核酸适配体应用与产业化 会议日程 2016年11月4日，全天报到 2016年11月5-6日，大会学术报告 2016年11月7-9日，筛选技术培训 组委会邵宁生 胡兵 娄新徽 罗昭锋 学术委员会成员（按拼音排序）崔华 邓乐 邓兆祥 杜权 樊春海方晓红 光寿红 郭磊 何军林 胡兵 李根喜 李少华 梁好均 廖世奇 林金明 刘杰 刘亚青 娄新徽 罗昭锋 屈锋 单革 上官棣华 邵宁生 石超 谭蔚泓 滕脉坤 汪海林王成龙 王家海 王均 王丽华 王周平 吴缅 吴清发 谢剑炜 杨朝勇 杨荣华 杨宪斌 杨振军 叶邦策 余兴龙 袁荃 曾令文 赵肃清 左小磊 会议地点 学术会议在中国科学技术大学西校区生命科学楼一楼报告厅举行； 适配体筛选培训在中国科学技术大学西校区生命科学楼三楼生命科学实验中心进行。 注册费用及截止日期 会议注册在官方网站（http://www.aptamer.club）进行，请在10月21日之前完成注册。会议摘要请在10月10日之前提交。由于不同单位财务要求不同，转账前请咨询本单位财务人员。也可以报到时现场现金缴费或者刷卡缴费（现场缴费无法享受提前缴费的优惠）。参会代表可以自行选择参加学术交流和技术培训，为便于会务安排，学术交流费用在10月10日（含）之前缴费予以优惠（具体汇款日期以汇款凭据为准），具体费用详见下表：参会代表学术交流（10月10日之前缴费）学术交流（10月10日之后缴费）学生8001000学者12001500企业人士15001800 核酸适配体筛选技术培训班收费情况请参考网站（http://www.aptamer.club）会议信息说明。为保证培训班的培训效果，请所有参加培训班的学员填写一份学员情况表（网址：https://www.sojump.hk/jq/9518593.aspx，或者扫右侧二维码），以便我们根据大家的具体情况安排培训内容。汇款说明：由于具体会务工作由安徽万盛会议服务有限公司承办。会务费请汇至以下账户账户名：安徽万盛会议服务有限公司开户行：徽商银行合肥经济开发区支行账 号：1022001021000805490备 注：适配体会务费 或 适配体培训 会议交通 会议交通详见会议网站说明 http://www.aptamer.club/dct/page/65583 会议酒店 住宿安排详见会议网站说明 http://www.aptamer.club/dct/page/65584， 建议优先选择前面两家酒店。 会议服务事宜：会务总负责：罗昭锋 0551-6360 3215，13956009879会务组成员：欧惠超 0551-6360 3215，186 5655 6163张海燕 0551-6360 0425，139 6670 8479，何海辉 0551-6360 7335，180 5517 4540，程晓蕾 0551-6360 7335会议联系email：biotech@ustc.edu.cn 举办单位：军事医学科学院、中国科学技术大学、湖南大学、首都师范大学、北京理工大学、中科院化学所、北京大学、清华大学、北京生物化学与分子生物学学会、中国生命科学大型仪器共享平台联席会2016年7月20日

p仪器信息网讯2018年11月10-11日，第四届中国核酸适配体学术研讨会在安徽合肥成功召开。此次大会为期两天，共37位核酸适配体专家进行报告，征集到73篇会议摘要，吸引了来自全国140多家高校及科研院300余位学者参会交流。参会人数及参会单位数、投稿数量、大会报告数量均创历届新高。/pp style="text-indent: 2em text-align: left "第四届中国核酸适配体学术研讨会由军事医学研究院、中国科学技术大学、首都师范大学等联合举办。会议主旨为努力实现凝聚共识，合力突破。希望在充分交流的基础上，对该领域存在的核心问题、限制性问题达成共识，然后集中攻关，突破瓶颈，从而推动适配体研究和产业的快速发展。目前中国在核酸适配体领域的SCI论文已经占据全球一半，有着全球最大规模的研究团队。/pp style="text-indent: 2em "img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/d1260bf3-d5ed-48fb-8439-96995c5f0d76.jpg" title="1.JPG" style="text-indent: 2em "/span style="text-indent: 2em "。/span/pp style="text-align: center "图1 大会现场图/pp style="text-align: center "img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/3b981f38-d491-4c10-9bb0-e543a29891e9.jpg" title="2.JPG"//pp style="text-align: center " 图2 大会现场图/pp style="text-align: center "img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/80939303-01cf-49a0-b48e-ee44afc09a09.jpg" style="" title="3.JPG"//pp style="text-align: center "图3 邵宁生研究员致辞/pp style="text-indent: 2em "大会伊始，大会发起人军事医学科学院邵宁生作大会致辞，希望参会学者积极交流，探索未来的发展方向，共同克服该领域存在的问题，推动该领域的持续深入发展。并提议今后核酸适配体学术研讨会将每两年举办一届，会议地点定在安徽合肥。/pp style="text-indent: 2em text-align: left "img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/a370b2af-b371-4d46-8a4a-b771039706ad.jpg" title="培训班合影.jpg" alt="培训班合影.jpg"//pp style="text-indent: 2em text-align: center "第四届中国核酸适配体学术研讨会大会合影/pp /ppstrong大会报告百花齐放（部分报告展示）/strong/pp style="text-indent: 2em "本次研讨会的报告主题包括：核酸适配体筛选技术及筛选机理；核酸适配体的结构与功能关系（基础研究）；核酸适配体模拟、计算与优化（生物信息学）；核酸适配体改造、靶向及药物 ；核酸适配体应用及产业化挑战等一些核心问题进行深入探讨。/pp style="text-align: center "img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/e0605a61-53e1-457d-8147-febbe1a22a8b.jpg" title="4.JPG" alt="4.JPG"//pp style="text-align: center "核酸适配体领域的文献信息分析/pp style="text-align: center "罗昭锋 中国科学技术大学 /pp style="text-indent: 2em "主办负责人罗昭锋作大会首个报告，报告中对全球核酸适配体领域的发展概况做了一个综合分析，主要包括该领域全球近年的发展情况、发展动向，主要研究机构以及重要的科研团队。通过各国发表核酸适配体（Aptamer）相关论文的数量变化，被引用情况，综合分析各国在该领域未来的发展趋势。其次，分析了全球专利以及产业发展情况。全球主要的核酸适配体企业，研发方向和主要产品等。最后针对核酸适配体过去发展的情况以及相关数据，分析了未来的发展趋势，并指出目前该领域曾在的两个瓶颈性的问题。一是适配体筛选的瓶颈性问题并没有完全克服，所获得的适配体数量太少；二是适配体与结构功能关系的研究基础非常薄弱，有待研究方法的突破。一项技术从实验室走向应用，需要经过漫长的努力。相信在广大科研工作者的共同努力下，随着各项技术瓶颈的逐步突破，核酸适配体产业一定会得到快速发展。/pp style="text-align: center "img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/fe35ca68-a34d-426f-b268-c871bb59939d.jpg" title="5.JPG" alt="5.JPG"//pp style="text-align: center "核酸适配体研究领域的几个关键性技术问题及其探索/pp style="text-align: center "娄新徽 首都师范大学/pp style="text-indent: 2em "会议发起人之一的娄新徽在报告中围绕如何建立标准化的核酸适配体传感器产业化研发流程的思路，介绍了其课题组近期在核酸适配体体外筛选、表征技术和核酸适配体生物传感器研发这三个技术环节的探索性工作。其中核酸适配体筛选技术环节将介绍一种快速富集核酸适配体文库的简单方法；在表征技术环节介绍一种具有普适性的电化学核酸适配体解离常数测定技术；在核酸适配体生物传感器环节将介绍一种设计结构开关型核酸适配体的简单方法以及关于传感器长期稳定的影响因素的研究。/pp style="text-indent: 2em text-align: center " img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/d4290c46-b9f7-40d9-a850-038bf3ebacf8.jpg" title="6.JPG" alt="6.JPG"/ /pp style="text-align: center " In vitro selection of catalytic DNA for detecting metal ions/pp style="text-align: center "刘珏文 加拿大滑铁卢大学 /pp style="text-indent: 2em "刘珏文报告中介绍了其滑铁卢大学课题组分离出的一套新的RNA切割DNA酶，这种DNA酶对各种过渡金属离子以及生理上重要的金属离子具有高度特异性。我们的工作始于一系列新的依赖于镧系元素的DNA酶，显示出有趣的金属结合特性。我们还开发了硫代磷酸酯（PS）修饰的DNA酶，用于募集嗜硫金属，如Cd2 +和Cu2 +。还使用Ag +直接选择高活性DNA酶，这项研究增加了我们对RNA裂解反应的机制理解。最后，我们获得了Na + - 和Ca2 + - 特异性DNA酶，并显示了Na +结合适体的生化证据。大多数DNA酶被制成荧光生物传感器，用于金属离子，其浓度可低至十亿分之一。/pp style="text-align: center "img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/2a9b8c04-aeda-48ef-8013-fc9d05f1c3c7.jpg" title="7.JPG" alt="7.JPG"//pp style="text-align: center "中性胞嘧啶核苷脂质材料包载转染核酸药物研究/pp style="text-align: center "杨振军 北京大学 /pp style="text-indent: 2em "杨振军课题组前期利用D-/L-异核苷(IsoNA)修饰siRNA及核酸适配体，提高了基因沉默效率或靶蛋白结合力，更清楚理解核酸蛋白选择性识别及结合模式，构建了核酸适配体修饰物介导的几种更高效的体内外肿瘤靶向检测和治疗制剂 以胱氨酸骨架阳离子脂质体包载双肽-siRNA缀合物，能够以避开溶酶体降解途径跨膜转运，发现在此基础上的基于酸敏感PEG及cRGD的制剂体内肿瘤靶向性明显提高；近期设计合成了基于中性胞嘧啶核苷脂质材料(DXCA)等，发现其能够以氢键及π-π堆积作用转染反义核酸及G-4链体核酸适配体入胞, 低浓度(~100 nM)给药情况下，发现了更高活性的反义核酸磷硫代修饰物及可以选择性抑制耐药肿瘤细胞生长的核酸适配体修饰物, 初步探讨了相关作用机制。该研究成果在核酸药物及基因编辑研究领域具有广阔的应用前景。/pp style="text-align: center "img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/6ddead75-595b-49a6-bf69-5ca0a6bd96bd.jpg" title="10.JPG" alt="10.JPG"//pp style="text-align: center "基于NMR的核酸结构确定与分子识别/pp style="text-align: center "曹春阳 上海有机所/pp style="text-indent: 2em "适配体大部分属于小核酸，在溶液中,它们可能以多种构象存在，导致利用结晶等技术难以获得结构信息，这对进一步序列筛选、优化造成一定的困难。但它们与靶标分子结合之后，一般以单一的构象存在，相关的特异性分子识别对适配体序列的优化与碱基结构的改造具有一定的指导意义。曹春阳报告中以实验室类似课题成果为例，展示如何以核磁共振二维谱、三维谱等技术确定序列较短的DNA或者RNA分子三维结构，如何利用分子间NOE、如何结合同位素标记、蛋白质结晶、荧光标记等技术开展它们与靶标分子、与配体小分子特异性相互作用机制研究，以期为国内适配体相关的课题研究同行提供一定的技术帮助。/pp /pp style="text-align: center " img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/4a72f0b0-491b-45b7-98ee-d27e4bfceeb9.jpg" title="11.JPG" alt="11.JPG"//pp style="text-align: center "核酸适体引导的长余辉纳米探针设计及其生物分析应用/pp style="text-align: center "袁荃 湖南大学 /pp style="text-indent: 2em "袁荃课题组在核酸适体引导的长余辉纳米探针设计及其超低背景生物分析应用方面开展了大量的研究工作。其通过离子掺杂合成了系列尺寸和发光可调控的镓锗酸锌长余辉纳米颗粒，并且在该纳米颗粒表面修饰核酸适体构建了长余辉纳米探针，该探针能特异性识别肿瘤组织，实现了无背景肿瘤靶向成像。通过控制合成反应条件，实现了锗酸锌长余辉纳米棒的尺寸和光学性质的调控[3]，并且构建了核酸适体修饰的长余辉纳米探针，实现了癌症病人血清中溶菌酶的检测。/pp style="text-align: center "img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/346cc002-f64c-4158-92a5-e24cb5f57bad.jpg" style="" title="12.JPG"//pp style="text-align: center "基于核酸适配体的定量分析化学研究及进展/pp style="text-align: center "董益阳 北京化工大学 /pp style="text-indent: 2em "北京化工大学董益阳报告中介绍了其研究组陆续开发的UVmag-SELEX、适配体微阵列、侧流试纸条、纳米可视化、小分子微热泳、native高分辨质谱等前沿技术。并分别实现了有机磷农药适配体的筛选、适配体表征芯片的制作、真菌毒素的快速检测、微污染物的定量分析、抗生素-适配体复合物的精准确证及化学计量比的研究，为现代基于核酸适配体的定量分析化学研究应用提供了新的技术手段，为进一步促进我国核酸适配体技术的发展也奠定了良好的工作基础。/pp style="text-align: center "img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/7cfa5943-b22a-45a9-b469-2763807c3f4e.jpg" style="" title="13.jpg"//pp style="text-align: center "毛细管电泳高效筛选核酸适配体进展/pp style="text-align: center "屈锋 北京理工大学 /pp style="text-indent: 2em "屈锋课题组基于毛细管电泳多分析模式，建立了毛细管区带电泳，毛细管在线反应电泳，双靶同步筛选等高效筛选模式。在SELEX流程中，基于毛细管电泳技术应用，实现蛋白亲和力快速评价，蛋白质和核酸高效一步快速反应及复合物分离，多轮筛选次级库的亲和力表征。 利用所建立的毛细管电泳法，可通过1-3轮筛选获得高亲和力和特异性的蛋白质的核酸适配体，筛选周期在10-30天（含高通量测序）。/pp style="text-align: center "img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/132dad7f-bcdd-4b47-8f6f-8400b908cea4.jpg" style="" title="14.JPG"//pp style="text-align: center "食品危害物适配体传感器与产品研究/pp style="text-align: center "王周平 江南大学 /pp style="text-indent: 2em "王周平课题组在前期筛选完成鼠伤寒沙门氏菌、单增李斯特菌、福氏志贺氏菌、宋内氏志贺氏菌、化脓链球菌、无乳链球菌、副溶血性弧菌、金黄色葡萄球菌黄金亚种、蜡样芽胞杆菌、致泻性大肠杆菌、大肠杆菌O157等食源性致病菌适配体，玉米赤霉烯酮、呕吐毒素、T-2毒素、黄曲霉毒素B1、黄曲霉毒素B2，伏马菌素B1、棒曲霉素、大田软海绵酸、石房蛤毒素、河豚毒素、金黄色葡萄球菌肠毒素A、金黄色葡萄球菌肠毒素C1等生物毒素适配体的基础上，通过适配体序列剪裁、结构优化、修饰等，获得了性能优异的系列食品危害物适配体探针，结合磁分离富集、上转换发光纳米探针、时间分辨荧光纳米探针等，发展了一批食品危害物适配体传感器，研制了一批试纸条、试剂盒产品，并对其性能进行了系统评估。/pp style="text-align: center "img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/77fa17d6-cced-4b8d-ade4-23ca89f7c8fa.jpg" style="" title="15.jpg"//pp style="text-align: center "适配体的筛选及其生物医学应用/pp style="text-align: center "裴仁军 中科院苏州纳米所 /pp style="text-indent: 2em "裴仁军介绍了课题组在针对小分子和肿瘤细胞的适配体筛选的几个进展。在适配体的生物医学应用方面，其借助电纺技术构建生物相容性良好的壳聚糖纳米纤维，并利用抗粘附分子CBMA对血细胞的非特异吸附控制及循环肿瘤细胞CTC的适配体对CTC的特异识别作用进行界面设计，实现CTC的高效特异性捕获。利用适配体对肿瘤细胞的靶向作用，发展靶向的大分子磁共振造影剂，用于肿瘤的活体成像。进一步地发展适配体靶向的肿瘤治疗核酸药物。/pp style="text-align: center "img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/2986a489-b589-46d6-819f-61e414af0796.jpg" title="16.jpg" alt="16.jpg"//pp style="text-align: center "基于蛋白相互作用的基因调控/pp style="text-align: center "梁好均 中国科学技术大学 /pp style="text-indent: 2em "梁好均报告中介绍了，其课题组利用失去核酸内切酶活性的Cas9（dCas9）能够作为可编程的转录因子实现细胞内的转录调控这一特性，设计了一种原位检测蛋白质相互作用的体系。将待测蛋白对分别与dCas9和激活因子连接形成融合蛋白，可相互作用的蛋白对能够将激活因子牵引至转录起始位点附近，从而激活靶标基因的转录。通过报道基因的表达，验证了ALK4蛋白和FKBP16蛋白之间的相互作用；且当加入小分子FK506时，该蛋白对之间的相互作用被破坏，从而终止转录激活。/pp style="text-align: center "img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/41d7e321-01f3-4864-8d12-cf029d9f2102.jpg" style="" title="17.JPG"//pp style="text-align: center "抗生素适配体的优化和应用研究/pp style="text-align: center "周楠迪 江南大学 /pp style="text-align: left text-indent: 2em "周楠迪课题组对部分常用的抗生素，包括链霉素、庆大霉素、妥布霉素、氧氟沙星、甲硝唑、磺胺嘧啶等进行了单链DNA适配体的筛选，尝试并比较了几种不同SELEX技术的特点，获得了具有高亲和力、高特异性的适配体序列。在此基础上，采用了基于结构分析的适配体截短策略，成功地实现了对适配体序列的截短优化。目前得到的最短序列是妥布霉素适配体序列，长度仅为15个核苷酸，与已有报道的最短序列凝血酶适配体长度相同，经验证该适配体的应用特性良好。该截短策略可进一步应用于其它适配体序列的截短优化。同时，以适配体为识别元件，结合多样化的信号放大策略构建了众多类型的抗生素传感器，检测限达到几个nM水平甚至数十pM水平。抗生素检测试纸的研制为适配体在快速检测中的应用展现了良好的前景/pp style="text-align: center "img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/14bc7fa7-2826-43de-8974-8d6d7fc0909b.jpg" style="" title="20.JPG"/ /pp style="text-align: center "功能核酸的裁剪艺术/pp style="text-align: center "许文涛 中国农业大学 /pp style="text-indent: 2em "许文涛报告从核酸序列决定结构、结构决定功能，我们从序列裁剪、结构重组和功能变化三个层面探讨了功能核酸的结构与功能的关系。分析FNA序列的空间结构、确定配体的特定结合位点是裁剪其他冗余核苷酸的第一步，其课题组的工作是希望通过研究FNA-target在不同相中的相互作用，对功能核酸的结合位点、协同性和多功能性等方面的结构裁剪进行新的探索。此外，总结了裁剪FNA结构用来进行目标检测、目标定位、信号生成或放大、生物传感器的建立和药物传递的各种情形及基于稳定性、灵敏度和多样性的裁剪技术的生物传感检测技术的最新研究进展，以便为设计一些基于FNA裁剪的检测技术提供指导。/ppbr//pp style="text-align: center "img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/6d9bec8c-4db9-4fa2-bf5d-d53b508c4fdc.jpg" style="" title="21.jpg"//pp style="text-align: center "利用双链DNA分子力钳测定核酸适配体折叠能量/pp style="text-align: center "瞿昊 合肥工业大学 /pp style="text-indent: 2em "瞿昊课题组以亚相干长度的双链DNA分子作为“力钳”对适配体进行拉伸，并通过延时凝胶电泳的方法测定了整个核酸分子的总能量，包括适配体的拉伸能量和双链DNA分子力钳的弯曲能量。基于前期对双链DNA弯曲能量精确测量和描述的工作，利用数值方法计算出凝血酶适配体HD22的折叠能量为 4.2 kBT（~10.4 KJ/mol，其中kB为玻尔兹曼常数，T为室温25℃）。此研究为测量平衡状态下的适配体折叠能量提供了简便易行的方法，对适配体性能稳定性的判定和适配体构象的模拟等研究都具有重要意义。/pp style="text-align: center "img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/ef61c60a-4daa-43e9-b0fa-014db1192035.jpg" style="" title="22.JPG"//pp style="text-align: center "类CAR多价适配体的构建及其初步应用/pp style="text-align: center "邵宁生 军事医学科学院/pp style="text-indent: 2em "邵宁生报告了其课题组最新的研究成果：以靶向免疫分子的多种适配体为主体，构建了一个类CAR多价适配体，能发挥CARs系统激活T细胞、靶向肿瘤细胞的作用，从而作为一种多价功能化的核酸药物制剂，能够与T细胞一起实现类似CAR-T的作用，发挥杀伤肿瘤细胞的功能。他们选取了分别与小鼠CD28和CTLA-4这两个免疫靶点结合的RNA适配体——CD28Apt7与Del60，并根据碱基互补配对的原则，在一个相对稳定的3WJ核酸骨架序列上，通过退火搭接的方法组装上 CD28适配体的二聚体和CTLA-4适配体的四聚体。同时在骨架上标记叶酸，以靶向上皮来源的肿瘤细胞，整个聚体结构称为X聚体。实验结果证明CD28Apt7和Del60分别可以与小鼠CD28蛋白和CTLA-4蛋白结合，同时组装好的X聚可以同时与小鼠CD28和CTLA-4蛋白结合。CFSE增殖实验证实，X聚体可以刺激T细胞增殖。同时X聚体可起到封闭B7.1分子对CTLA4靶点的作用，ELISA证实X聚体能够逆转B7.1分子对T细胞上清的IL-2的分泌抑制作用。共聚焦以及流式细胞仪实验均证实X聚体不仅结合T细胞，还能靶向人H460肺癌细胞及小鼠结肠癌MC38细胞。体外肿瘤细胞与T淋巴细胞混合培养，加入的X聚体可以有效激活T细胞，使T细胞增殖并杀伤小鼠黑色素瘤B16细胞。该研究为肿瘤的免疫治疗提供了一种新的思路。/pp style="text-align: center "img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/32e3d10b-0d87-4781-a913-cd2a75d779a7.jpg" style="" title="23.jpg"/ /pp style="text-align: center "海洋生物毒素特异适配体的筛选验证与改造优化/pp style="text-align: center "王梁华 第二军医大学 /pp style="text-indent: 2em "王梁华报告了其课题组利用筛选得到了源自海洋生物等多种毒素的高亲和力、强特异性的核酸适配体。并通过计算模拟、分子对接与动力学分析，解析了毒素与适配体结合的结构基础；建立了优化适配体序列及结构策略；引入了生物膜层干涉技术与表面等离子体共振等，并发现PTX的适配体，能阻断其溶血作用。利用单链DNA连接酶环化PTX的适配体，通过计算模拟环化的适配体，发现并不改变适配体结构，并能保持其抑制PTX的溶血作用。/pp style="text-indent: 2em "其课题组初步建成了海洋生物毒素核酸适配体筛选平台，所获得的核酸适配体在海洋生物毒素的快速检测、实时监测，以及防护、中毒诊治等方面，可以作为分子识别元件，解决海洋生物毒素难侦、难防、难治等问题，满足降低国防、海洋作业等中由毒素引发的减员失能的重大需求。/pp style="text-align: center "img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/7cc808dc-7e0e-418d-9d5b-ef8bdd568b16.jpg" style="" title="24.JPG"//pp style="text-align: center "利用琼脂磁珠快速筛选核酸适配体及检测制备靶分子——在生物医药中的应用/pp style="text-align: center "廖世奇 甘肃省医学科学研究院 /pp style="text-indent: 2em "廖世奇课题组通过复合靶标-肿瘤血清核酸适配体的筛选、适配体肿瘤检测技术的建立，肿瘤血清标志物组检测技术建立等，发现利用琼脂磁珠全自动筛选适配体技术及检测制备靶分子技术在临床检测-亚健康检测监控中，具有一定的技术优势和突破；并在基因工程制药领域上，利用琼脂磁珠快速筛选及检测制备蛋白技术，推演从未知蛋白阳性克隆的筛选，蛋白制备到菌种保存，纯化发酵蛋白等等原技术障碍的突破。表示核酸适配体在生物医药中非常具有应用前景。/pp style="text-align: center "img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/990ceaf4-0dfa-472c-8809-ab41e342cfb1.jpg" style="" title="25.jpg"/ /pp style="text-align: center "A Novel Small RNA-Cleaving Deoxyribozyme with a Short Binding Arm/pp style="text-align: center "于涵洋 南京大学 /pp style="text-indent: 2em "于涵洋报告了一种新的RNA裂解脱氧核酶，称为10-12opt，具有同样小的催化基序和异常短的结合臂。该脱氧核酶含有14个核苷酸的催化核心，其优先催化UN二核苷酸连接处的RNA切割。他们发现，该酶左结合臂仅含有三个核苷酸并与RNA底物形成两个经典碱基对。突变分析表明，切割位点下游的3个核苷酸的核糖核苷残基不能形成典型的碱基配对以获得最佳催化作用，并且该核碱基可能参与其羰基O6原子的催化作用。其课题组实验结果表明这种新的RNA切割脱氧核酶形成了独特的催化结构而不是8-17，并且该序列空间可能包含可以在位点特异性切割RNA的DNA分子的其他方式。/pp style="text-align: center "img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/0da1f723-4d0d-4dcb-8e43-21dab4006bf1.jpg" style="" title="26.jpg"//pp style="text-align: center "基于核酸适配体的分子识别新策略：从生物传感到POCT检测/pp style="text-align: center "杜衍 中科院长春应用化学研究所 /pp style="text-indent: 2em "杜衍课题组利用微纳米材料的放大和增强功能，将微纳米材料用作探针载体或用作基底修饰材料，围绕新型高灵敏电化学/比色适配体生物传感器的开发，开展了一系列系统的研究工作。致力于发展更实用、可靠以及普适的适配体传感新方法、新原理。通过蛋白质改性以及融合技术，设计出具有信号传导功能的蛋白质，并通过生物传感技术将传统的生物检测信号如荧光信号等转化为绒毛膜促性腺激素（human chorionic gonadotropin，hCG）蛋白的信号，用价格低廉的商品化验孕试纸达到检测生物标志物的目的。/pp style="text-align: center "img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/96c6ef05-2e63-4c35-8592-92d61444d8c5.jpg" style="" title="30.jpg"//pp style="text-align: center "四链DNA调控的可开关适配体传感器与智能逻辑电路/pp style="text-align: center "李涛 中国科学技术大学/pp style="text-indent: 2em "李涛课题组设计了一种能够避免自身二聚行为的双分子i-motif，并将其与劈开的ATP适配体一起连接到三臂和四臂枝状DNA纳米结构上，以i-motif折叠来调控ATP与适配体作用，从而构建了一种pH开关的ATP传感分子器件；在此基础上，他们将设计的双分子i-motif和也可以采用DNA链置换反应，来实现ATP的可逆抓捕和释放，从而构建可逆的ATP纳米传感器；在以上实验中，我们发现ATP适配体可以很好的绑定G-四链体配体硫磺素（ThT），研究表明，ThT可以被包裹在平行或反平行双链中G?A或G?G摆动碱基对之间，ATP适配体在ThT诱导下正是形成了类似结构，从而表现出很强的结合ThT能力。进一步地，我们把G-四链体、i-motif及ATP适配体等序列包埋到DNA枝状结构的双链手臂中，加入K+、H+、ATP等外部刺激，诱导DNA枝状结构的手臂发生解旋，以凝胶电泳和荧光光谱对此过程进行检测，从而构建能够识别细胞环境的智能DNA逻辑电路，并应用于疾病相关的miRNA和基因检测方面。/pp style="text-align: center "img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/45a0e641-1629-4847-9b15-87addc49b87b.jpg" style="" title="27.JPG"//pp style="text-align: center "适配体和分子印迹-SERS生物探针的构建及肿瘤标志物的靶向可视化拉曼成像/pp style="text-align: center "吕永琴 北京化工大学 /pp style="text-indent: 2em "吕永琴课题组建立了以纳米金探针和芯片为基础的高灵敏度多肿瘤标志物的检测体系，合成了针对肺癌的蛋白质肿瘤标志物（CEA、NSE和ProGRP）和microRNA检测的核酸适配体-SERS纳米生物探针，通过表面增强拉曼光谱技术，实现肺癌多种标志物的联合检测，提高了肺癌检测的准确率。同时，研发了温度敏感和pH敏感的分子印迹-SERS纳米探针，作为“人工抗体”用于肿瘤标志物的主动靶向检测，检测限为10-14 mol/L。通过改变外界条件，即可实现目标肿瘤标志物的选择性捕获和释放，大大简化了操作。分子印迹-SERS纳米生物探针成功实现了活细胞内内源性肿瘤标志物表皮生长因子受体（EGFR）和基质金属蛋白酶9（MMP-9）的靶向拉曼检测和可视化成像。/pp style="text-align: center "img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/b2b8385a-bed8-4fb7-8c69-c76d35ce346f.jpg" style="" title="28.JPG"//pp style="text-align: center "基于适配体的表面增强拉曼光谱痕量检测技术及应用/pp style="text-align: center "黄青 中科院合肥物质科学研究院 /pp课题组致力于发展基于适配体(Aptamer)的SERS痕量检测技术，通过在一些SERS活性高的纳米材料和结构上修饰合适的、具有特殊拉曼信号的适配体，可以高效、特性地捕获环境中的污染物。报告介绍了他们最近对不同污染物（如多氯联苯、汞离子等）所发展的基于适配体SERS检测方法，即在制备多种纳米粒子/纳米阵列上进行适配体功能化修饰，并通过对来自适配体的拉曼光谱信号与其构象关系进行测量和分析，从而可以对水中污染物进行进行快速、特异性和半定量的痕量检测。/pp style="text-align: center "img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/608d310e-2340-49fd-ac66-c1ec9279351d.jpg" style="" title="31.JPG"//pp style="text-align: center "基于SELEX技术的新发现/pp style="text-align: center "邴涛 中国科学院化学研究所 /pp style="text-indent: 2em "邴涛报告了其课题组基于可待因核酸适配体序列，发现了一种由G-四链体和G?GC三链组成的新型三-四链结构，这拓宽了人们对于核酸结构的认识，在基因调控和DNA组装等领域具有应用潜力；基于细胞-SELEX技术发现了识别异源二聚体蛋白核酸适配体，这为特异性识别蛋白复合物探针的筛选提供了新的策略，为其原位检测提供了新的探针；基于轴突-SELEX技术发现了可以实现神经细胞轴突成像和靶向探针，可用SH-SY5Y细胞所形成的三维神经网络的成像，并用于人脑组织切片中神经突的成像。/pp style="text-align: center text-indent: 0em "img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/b5a76795-6d0e-4b7d-803d-1bd60e540a77.jpg" style="" title="32.JPG"//pp style="text-align: center text-indent: 0em "基于特殊核酸适配体的电化学生物传感设计及应用/pp style="text-align: center text-indent: 0em "冯凌燕 上海大学 /pp style="text-indent: 2em "冯凌燕报告中介绍了以特殊核酸构象的多种适配体在电化学传感器方面的设计，实现了针对ATP小分子、恶性疟原虫乳酸脱氢酶（pfLDH）、血管内皮生长因子(VEGF)蛋白及癌细胞的特异性识别及检测。我们在功能化石墨烯电极表面实现适配体传感器的设计；利用传统界面修饰方法，对比起和“点击化学”方法修饰的优劣；进一步将适配体识别功能与逻辑门计算相结合，在表面构建“三明治”结构的核酸适配体，利用电化学分子整流实现电信号放大，构建多级电子逻辑门连接，以期把复杂环境中的多目标物检测信号简化为“0”或“1”的智能逻辑判断模式，为传感器信号处理提供新思路。/pp style="text-align: center "img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/eb2f0ff5-a603-444c-a429-6f844d51d334.jpg" style="" title="33.JPG"//pp style="text-align: center "基于单分子收集的核酸适配体筛选技术/pp style="text-align: center "罗昭锋 中国科学技术大学 /pp style="text-indent: 2em "罗昭锋实验室一直在探索高效的核酸适配体筛选方法。一是朝向自动化方向发展，二是朝高通量的方向发展。他提出一种基于一体式数字PCR系统，结合流式分选技术，进行核酸适配体筛选的方案。将单个核酸适配体分子，包裹到液滴中，进行不对称PCR扩增，并向液滴中加入靶标分子，如果靶标分子与液滴中的适配体有相互作用，就会产生荧光增强。我们通过流式分选技术，直接分选出有荧光增强效应的液滴，即可直接获得高亲和力的单克隆核酸适配体分子。报告中还介绍了他们成功搭建的装置，可以实现了单个液滴的分选。同时利用已获得小分子核酸适配体对系统可行性进行验证。该系统不仅可以用于核酸适配体的高通量筛选和鉴定，将来有可能将细菌或者酶分子包裹到液滴中，通过细菌的产物或者酶催化的产物实现筛选，或者筛选有催化活性的核酸适配体分子。因此，该系统将来有可能在合成生物学、分子进化，以及功能核酸适配体的筛选方面获得广泛的应用。/pp style="text-indent: 2em "br//ppstrong会议模式新颖/strong/pp style="text-indent: 2em "本次会议，主办方探索尝试了一种新型交流互动方式，报告期间，参会者可以通过基于微信的平台进行提问，每场报告结束，主持人将高质量的问题投影到大屏幕上，报告人可以根据大会屏幕上的提问，进行回答，大大提高了报告交流效率。同时，所有问题，经过了主持人的筛选，因此问题质量也很高。/pp style="text-align: center "img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/eff8a203-d0d9-4f61-8f58-841681a79184.jpg" style="" title="DSC04852.JPG"//pp style="text-align: center "img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/c369d3a7-b309-4671-9e8e-b263d4da23b5.jpg" style="" title="DSC04968.JPG"//pp style="text-align: center "网络提问答疑/pp style="text-align: center "img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/571bfdfe-dc51-44a9-94a7-88d4339bd06d.jpg" style="" title="DSC04692.JPG"//pp style="text-align: center "网络征集建议/pp style="text-indent: 2em "主办方力求所有的与会者能够更方便、更高效地交流，力图使会议真正成为同行们相互交流的平台、思想碰撞的平台、相互合作的平台和共同进步的平台。中国第四届核酸适配体学术研讨会的大会讨论环节主题为：如何更好得促进核酸适配体领域的发展。并通过弹幕的方式集思广益，并将与会者的建议一一展示在大会上进行交流探讨。/pp style="text-align: center "img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/98b4ce00-1ea6-423b-81eb-195b42d4ce15.jpg" title="DSC04666.JPG" alt="DSC04666.JPG"//pp style="text-align: center "现场网络投票/pp style="text-indent: 2em "为在行业内建立统一的计量标准以促进整个行业研究的合作共赢，在大会讨论环节，大家就核酸适配体产业化各环节的权重等问题进行了讨论和投票。这将为适配体团队之间的合作提供一个可以参考的标准。/pp style="text-indent: 2em "br//ppstrong墙报展示及优秀墙报评选/strong/pp style="text-indent: 2em text-align: left "利用网络平台对所有的墙报进行无记名投票，并对获得优秀墙报的作者发放纪念品。span style="text-indent: 2em "为了估计参与，还设置了“最佳评委奖”，即如果某位投票人选出的三份最佳墙报，与最终获奖的三份墙报一致，则给予奖励。这样鼓励积极参与，也锻炼了参与者的评判能力。/span/pp style="text-align: center "img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/0863dad5-6077-4856-a2be-d631f220f0ff.jpg" title="DSC04893.JPG" alt="DSC04893.JPG"/ /pp style="text-align: center "墙报展示/pp style="text-indent: 2em "br//ppbr//pp style="text-indent: 2em "为了帮助更多的实验室掌握核酸适配体筛选技术，11月12-14日，举办了第四期核酸适配体筛选技术培训班，共有50多位来自不同实验室的代表参加了培训。培训期间，还推出了针对小分子的筛选试剂盒。该试剂盒的推出，降低了核酸适配体的筛选难度，节约各实验室的时间成本和宝贵的科研经费，提升筛选效率。相信在未来1到2年时间内，一定会有大量的核酸适配体被筛选出来，这将进一步推动核酸适配体产业的发展。/pp style="text-align: center "img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/12518c90-e8f5-47cd-ad56-23c7aff30d18.jpg" style="" title="培训班合影1.jpg"//pp style="text-align: center "培训班师生合影/pp style="text-indent: 2em "核酸适配体领域发展到今天，限制性因素主要是基础性的问题，我们无法跨越，也无法视而不见。中国在这方面已经有了深厚的基础，有了全球最大的研究团队，已成为这个领域最重要的力量。我们有理由相信在中国科学家的努力下，核酸适配体领域一定会得到稳步的发展。/pp style="text-indent: 2em "br//p

p /ppstrong仪器信息网讯/strong 2017年11月18日于安徽合肥召开的首届核酸适配体战略研讨及产业化资本对接会，为期两天，首天的学术报告与战略研讨会圆满落下帷幕。共有21位专家带来每人15分钟的精炼又精彩的报告，紧凑的报告结束后大家争相提问交流，讨论激烈，学术灵感相互碰撞。该会议吸引了来自全国重点高校及科研院所140余位学者参会。可以看到，一大批科学家开始将目光转向核酸适配体的应用，希望用自己多年潜心研究的技术造福人类。/ppstrong背景解读/strong/pp 核酸适配体（aptamer）是通常通过指数富集系统配体进化（ＳＥＬＥＸ）筛选获得的，与靶标具有高亲和力和特异性结合的单链ＤＮＡ 或ＲＮＡ。核酸适配体（aptamer）被誉为是化学“抗体”，与通常所说的抗体功能相似但组成不同。抗体是由氨基酸组成的蛋白质分子，核酸适配体则是由单链DNA或RNA组成的核酸分子。与抗体相比，核酸适配体具有分子量小、可以化学合成、质控简单、性质稳定可以耐受反复热变性，易于修饰，筛选无需使用动物，免疫源性低以及可以高通量筛选等诸多优势。并且可以广泛应用在疾病治疗、疾病诊断、靶标发现、生物传感、分子成像、靶向治疗、食品安全、环境检测、基础科研等多个领域。随着该领域的研究逐步走向成熟，市场需求会迅速增加，其广泛的应用前景普遍被大家看好。尤其核酸药物已经成为生物医药领域的前沿和热点，被广泛地认为极有可能在未来10 年内为制药领域带来革命性的变化，形成现代制药的第三次浪潮。/ppstrong会议初衷/strong/pp 会议发起人之一同时也是会议组织者罗昭锋老师表示：核酸适配体的发展需要各界的共同努力，尤其在核酸适配体基础研究方面，仍然有一些问题需要克服。大家的工作进展，以及大家走过的坑，以及目前工作中的困难点在哪里？砍断别人的脚不能使自己走的更快，同样别人重复走100遍你走过的坑，也不会对你的研究有帮助。而交流各自进展，分享经验，分析碰到的问题，探讨该领域存在的瓶颈问题。希望中国的科研工作者能够，集中精力，攻克最重要的问题，而不是只被文章牵着鼻子走。希望经过各位与会专家总结的问题，能够指引未来几年国内高领域的发展方向，减少低水平的重复，做真正重要的研究。推动核酸适配体产业发展，并探讨产业化过程中面临的各种问题，希望通过本次会议充分的交流，推动核酸适配体领域的健康发展，推进核酸适配体产业化进程。/ppstrong有态度的会议模式/strong/pp 会议原定为80人以内研讨会，但会议主题新颖，干货满满，会场逐渐爆满，曾两度更改会场。正式会议时，共有140多人参会，会场甚至有老师全程站着听报告。第一天的会议共21位报告人，每人15分钟的的报告时间，报告结束提问环节为秒杀模式即若倒计时10秒无人提问则直接进入下一个报告。但每位报告结束后总有与会老师争相提问交流，反而常是因时间限制不得不打断正酣的讨论进入下一位报告。/ppimg src="http://img1.17img.cn/17img/images/201711/insimg/a707037c-94d1-4271-a150-dccd8240e05a.jpg" title="1.jpg"//pp 据罗昭锋老师称，会议如此设置，一则因为报名做报告交流的老师越来越多，时间被迫压缩；二则也希望报告老师带来的报告聚焦核酸适配体领域的重要科学问题及遇到的实际瓶颈难题而非完全是已发表的工作和成果，着重学术探究，解决难题，借鉴相互经验，互通有无，避免弯路；三则希望有留出会后自由讨论的环节，供大家自由报告，自由进行讨论。/pp 最后的自由讨论环节采用扫描二维码后进行网上提问并指定回答者，后主持人将问题整理公布，请被指定老师作答，未指定回答者问题进行抢答，无人抢答的问题最后交给三位资深专家也同为发起人的邵宁生教授，杨振军教授，娄新徽教授等进行回答补充。/ppstrong会议实况小览/strong/pp 今天会议主要聚焦于探讨：核酸适配体领域的重要科学问题，并探讨这些重要科学问题的解决方案，促进相关研究团队的合作，将有限的科研资源用来解决最重要的问题。/pp style="text-align:center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201711/insimg/5bb005a2-6aab-43b5-b310-87e744dee23a.jpg" title="2.jpg"//pp style="text-align: center "会议现场实况图/pp style="text-align:center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201711/insimg/3d09b2cf-57f2-493e-8b86-87ea97b5478f.jpg" title="3.jpg"//pp style="text-align: center "中国科技大学罗昭锋带来报告：从全球文献看核酸适配体的未来趋势/pp style="text-align: center "img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201711/insimg/d2022145-423c-4927-9e92-d2704f939f07.jpg" title="4.jpg"//pp style="text-align: center "北京大学医学部药学部杨振军带来报告：核酸适配体研究中的关键科学问题探讨/pp style="text-align: center "img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201711/insimg/ceba58e3-1280-4605-9c7e-8d557e2c6dd8.jpg" title="5.jpg"//pp style="text-align: center "首都师范大学娄新徽带来报告：核酸适配体传感器的界面效应及技术挑战/pp style="text-align: center "img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201711/insimg/361bda98-f600-4176-97eb-78fc289050fa.jpg" title="6.jpg"//pp style="text-align: center "北京理工大学屈锋带来报告：蛋白质的核酸适配体筛选进展及策略/pp style="text-align: center "img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201711/insimg/5b3da8d4-3752-4fe7-b3ed-406e3612fc99.jpg" title="7.jpg"//pp style="text-align: center "台湾中兴大学生医工程所洪振义带来报告：MARAS适配体筛选方法及基于适配体之多重检测/pp style="text-align: center "img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201711/insimg/e67ae653-8097-4456-8b52-a9deb5c9600f.jpg" title="8.jpg"//pp style="text-align: center "江南大学食品学院王周平带来报告：食品安全危害物核酸适配体应用进展/pp style="text-align: center "img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201711/insimg/c99bc245-55a7-40eb-8b8b-93baa0d0ee10.jpg" title="9.jpg"//pp style="text-align: center "同济大学附属上海市皮肤病医院朱全刚带来报告：基于适配体介导的靶向给药系统研究进展/pp style="text-align: center "img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201711/insimg/41ef5640-b4b9-4a43-95a7-85ef51c27edc.jpg" title="10.jpg"//pp style="text-align: center "北京师范大学化学学院李晓宏带来报告：核酸适配体作为结构信标分子的机制探讨/ppstrong会议总结：领域存在的问题/strong/pp 经过一天的研讨，专家们认为该领域的问题主要有：筛选还不够简便，需要进一步开发高通量、快速、低成本的下一代筛选技术；深入理解核酸适配体发挥功能的机理，理解不同条件下适配体可能表现不同，或无法重现的问题；核酸适配体结构研究同样是这个领域的额瓶颈之一；目前的筛选方法耗时费力，样品需求量大，解析周期长等。与会老师期待有新的技术出现，可以更灵敏满足监测适配体结构的变化。另外，对于适配体作为药物使用，药物的递送也是这里非常关键的问题。而核酸适配体作为传感器，界面问题，也是必须克服的问题。/ppstrong会议反馈：高效、紧凑、干货满满/strong/pp 本次会议无疑是成功的并且高效的，会议报告精炼，讨论精彩激烈，全程吸引着与会老师的注意力。会后，多位老师发言笑称：这是我所有参会经历中听会最认真的一次。/pp 明天的核酸适配体产业资本对接会相信同样会有很多惊喜！/ppbr//pp附录：a href="http://www.instrument.com.cn/webinar/news_8540.html" target="_self" title=""《Aptamer中文译名倡议书》/a/ppbr//pp br//p

p　　为促进核酸适配体领域的交流与合作，推动适配体领域的发展，定于2018年11月9日至14日，在安徽合肥市召开第四届中国核酸适配体学术研讨会暨筛选技术培训班，欢迎相关领域及相关产业领域的专家与学者参会。其中，10-11日举办学术研讨会，12-14日举办筛选技术培训班。/pp　　核酸适配体(Aptamer)是一类单链的DNA或RNA小分子，分子量通常在5-25kD之间。功能类似抗体，能够与各种不同的靶标结合。与抗体相比，核酸适配体具有多方面的优势，如无需使用动物、分子量小、可以化学合成、质控简单、性质稳定、易于修饰、靶标比抗体更广泛等等，因此近年来，核酸适配体获得了广泛关注，特别是在中国。继2011年中美在SCI期刊上发表的Aptamer论文数持平之后，近几年中国在该领域的论文数大幅增长，成为全球该领域发表论文数最多的国家。2016年以来，来自中国的论文数更是达到了全球该领域SCI总论文数的50%以上。/pp　　2018年8月11日，美国FDA批准了第一个RNAi的药物，这也是FDA批准的第七个寡核苷酸类药物。由于核酸类药物面临很多共性的问题，如靶向递送、稳定性等问题，因此这些寡核苷酸药物的上市，也给适配体药物的前景带来了希望的曙光。/pp　　面对美好的前景，我们依然需要正视核酸适配体领域面临的挑战。譬如到目前为止，优质的核酸适配体数量非常少，约有40%的已发表的SCI论文使用6个明星适配体完成的，这种现状反映了优质适配体极度短缺，也说明筛选技术依然是一个瓶颈，筛选效率的低下依然制约着这个领域的发展。另外，适配体结构与功能关系等基础研究依然缺乏。我们对核酸适配体结构与功能之间的关系缺乏深入的了解，这导致在适配体应用方面，存在重复性不佳、抗干扰能力差、传感器再生困难等一系列问题时，我们很难给出合理的解释和改进建议。这里既有核酸结构研究历史时间短的问题，也有结构研究技术效率低下的问题。/pp　　在产业化方面，目前为止，仅有一例基于核酸适配体的药物经美国FDA批准上市，其它领域适配体应用的产业化规模仍较小。/pp　　因此，我们认为适配体领域要想取得突破，需要整合各方面的力量，针对适配体筛选和应用的瓶颈问题进行多学科的交叉合作研究。本次会议将会全面展示近两年中国在适配体领域取得的进展，并将深入探讨该领域面临的机遇和挑战。会议形式除了大会报告，还将设置墙报、10分钟短报告等多样化的形式，并将借鉴现代化的教学手段，引入实时现场互动，促进大家的交流，努力将会议效率最大化。/pp　　面对核酸适配体的美好未来，我们热情欢迎有志于在核酸适配体领域做出贡献的科技工作者，积极参加第四届中国核酸适配体学术研讨会，共同探讨该领域的重要科学问题，并通过信息和资源共享，以及切实的合作，推动该领域向前发展。/pp　　为帮助计划进入核酸适配体筛选领域的实验室，减少盲目摸索的时间，本次会议将在12-14日举办为期三天的核酸适配体筛选技术培训，相对于前几期培训班，本次将增加固定文库筛选小分子Aptamer、乳浊液PCR、筛选后优化、高通量测序数据分析等实用技术内容(详见会议网站关于培训班课程的介绍)。欢迎计划从事适配体筛选的实验室参加。/pp　strong　会议主题/strong/pp　　本次研讨会我们将针对该领域的一些核心问题进行深入探讨。主要包括：/pp　　1、 核酸适配体筛选技术及筛选机理/pp　　2、 核酸适配体的结构与功能关系(基础研究)/pp　　3、 核酸适配体应用及产业化挑战/pp　　4、 核酸适配体模拟、计算与优化(生物信息学)/pp　　5、 核酸适配体改造、靶向及药物 (应用)/ppstrong　　会议日程/strong/pp　　2018年11月9日，14：00-22：00报到/pp　　2018年11月10-11日，大会学术报告/pp　　2018年11月12-14日，核酸适配体筛选技术培训班/pp　　组委会/pp　　邵宁生 娄新徽 罗昭锋/pp　　学术委员会成员(按拼音排序)/pp　　邴涛 陈爱亮 崔华 邓乐 邓兆祥 董益阳 杜权 樊春海 方晓红 葛宏华 郭磊 韩跃武 何军林 李根喜 李少华 栗坤 李健 李运超 梁好均 廖世奇 林金明 刘杰 刘细霞 刘亚青 娄新徽 卢春霞 陆涛峰 罗昭锋 裴仁军 屈锋 瞿昊 上官棣华 邵宁生 石超 孙红光 谭蔚泓 唐卓 汪海林 王成龙 王家海 王开宇 王丽华 王梁华 王鲁梅 王珊 王苏鸣 王周平 吴文学 谢剑炜 许丹科 杨朝勇 杨荣华 杨宪斌 杨振军 叶邦策 于涵洋 袁荃 曾令文 张佩琢 张强 张子羿 赵国华 赵强 赵肃清 周楠迪 朱泽策 朱志 左小磊/ppstrong　　注册费用及截止日期/strong/pp　　会议注册在官方网站(http://aptamer2018.csp.escience.cn)进行，会议注册请在10月31日之前完成注册。会议摘要请在10月15日之前通过在线投稿提交。参会代表可以自行选择参加学术交流和技术培训，为便于会务安排，学术交流和技术培训费用在10月15日(含)之前缴费予以优惠(具体汇款日期以汇款凭据为准)。由于不同单位财务要求不同，转账前请咨询本单位财务人员。也可以报到时现场现金缴费或者刷卡缴费(现场缴费无法享受提前缴费的优惠)。具体费用详见下表：/pp　strong　学术交流会务费/strongbr//ptable border="1" cellspacing="0" cellpadding="0"tbodytr class="firstRow"td width="74" valign="top" style="padding: 0px 7px border: 1px solid windowtext border-image: none background-color: transparent "p style="text-align: center line-height: 18px margin-top: auto "span style="color: black font-family: "参会代表/span/p/tdtd width="205" valign="top" style="border-width: 1px 1px 1px 0px border-style: solid solid solid none border-color: windowtext windowtext windowtext rgb(0, 0, 0) padding: 0px 7px border-image: none background-color: transparent "p style="text-align: center line-height: 18px margin-top: auto "span style="color: black font-family: "学术交流strong（span10/span月span15/span日之前缴费）/strong/span/p/tdtd width="227" valign="top" style="border-width: 1px 1px 1px 0px border-style: solid solid solid none border-color: windowtext windowtext windowtext rgb(0, 0, 0) padding: 0px 7px border-image: none background-color: transparent "p style="text-align: center line-height: 18px margin-top: auto "span style="color: black font-family: "学术交流（span10/span月span15/span日之后缴费）/span/p/td/trtrtd width="74" valign="top" style="border-width: 0px 1px 1px border-style: none solid solid border-color: rgb(0, 0, 0) windowtext windowtext padding: 0px 7px border-image: none background-color: transparent "p style="text-align: center line-height: 18px margin-top: auto "span style="color: black font-family: "学生/span/p/tdtd width="205" valign="top" style="border-width: 0px 1px 1px 0px border-style: none solid solid none border-color: rgb(0, 0, 0) windowtext windowtext rgb(0, 0, 0) padding: 0px 7px background-color: transparent "p style="text-align: center line-height: 18px margin-top: auto "span style="color: black font-family: "800/span/p/tdtd width="227" valign="top" style="border-width: 0px 1px 1px 0px border-style: none solid solid none border-color: rgb(0, 0, 0) windowtext windowtext rgb(0, 0, 0) padding: 0px 7px background-color: transparent "p style="text-align: center line-height: 18px margin-top: auto "span style="color: black font-family: "1000/span/p/td/trtrtd width="74" valign="top" style="border-width: 0px 1px 1px border-style: none solid solid border-color: rgb(0, 0, 0) windowtext windowtext padding: 0px 7px border-image: none background-color: transparent "p style="text-align: center line-height: 18px margin-top: auto "span style="color: black font-family: "学者/span/p/tdtd width="205" valign="top" style="border-width: 0px 1px 1px 0px border-style: none solid solid none border-color: rgb(0, 0, 0) windowtext windowtext rgb(0, 0, 0) padding: 0px 7px background-color: transparent "p style="text-align: center line-height: 18px margin-top: auto "span style="color: black font-family: "1300/span/p/tdtd width="227" valign="top" style="border-width: 0px 1px 1px 0px border-style: none solid solid none border-color: rgb(0, 0, 0) windowtext windowtext rgb(0, 0, 0) padding: 0px 7px background-color: transparent "p style="text-align: center line-height: 18px margin-top: auto "span style="color: black font-family: "1600/span/p/td/trtrtd width="74" valign="top" style="border-width: 0px 1px 1px border-style: none solid solid border-color: rgb(0, 0, 0) windowtext windowtext padding: 0px 7px border-image: none background-color: transparent "p style="text-align: center line-height: 18px margin-top: auto "span style="color: black font-family: "企业人士/span/p/tdtd width="205" valign="top" style="border-width: 0px 1px 1px 0px border-style: none solid solid none border-color: rgb(0, 0, 0) windowtext windowtext rgb(0, 0, 0) padding: 0px 7px background-color: transparent "p style="text-align: center line-height: 18px margin-top: auto "span style="color: black font-family: "1600/span/p/tdtd width="227" valign="top" style="border-width: 0px 1px 1px 0px border-style: none solid solid none border-color: rgb(0, 0, 0) windowtext windowtext rgb(0, 0, 0) padding: 0px 7px background-color: transparent "p style="text-align: center line-height: 18px margin-top: auto "span style="color: black font-family: "2000/span/p/td/tr/tbody/tablepstrong　　技术培训收费**/strongbr//ptable border="1" cellspacing="0" cellpadding="0"tbodytr class="firstRow"td width="74" valign="top" style="padding: 0px 7px border: 1px solid windowtext border-image: none background-color: transparent "p style="text-align: center line-height: 18px margin-top: auto "span style="color: black font-family: "参会代表/span/p/tdtd width="205" valign="top" style="border-width: 1px 1px 1px 0px border-style: solid solid solid none border-color: windowtext windowtext windowtext rgb(0, 0, 0) padding: 0px 7px border-image: none background-color: transparent "p style="text-align: center line-height: 18px margin-top: auto "span style="color: black font-family: "技术培训（span10/span月span15/span日之前缴费）/span/p/tdtd width="227" valign="top" style="border-width: 1px 1px 1px 0px border-style: solid solid solid none border-color: windowtext windowtext windowtext rgb(0, 0, 0) padding: 0px 7px border-image: none background-color: transparent "p style="text-align: center line-height: 18px margin-top: auto "span style="color: black font-family: "技术培训（span10/span月span15/span日之后缴费）/span/p/td/trtrtd width="74" valign="top" style="border-width: 0px 1px 1px border-style: none solid solid border-color: rgb(0, 0, 0) windowtext windowtext padding: 0px 7px border-image: none background-color: transparent "p style="text-align: center line-height: 18px margin-top: auto "span style="color: black font-family: "学生span//span学者/span/p/tdtd width="205" valign="top" style="border-width: 0px 1px 1px 0px border-style: none solid solid none border-color: rgb(0, 0, 0) windowtext windowtext rgb(0, 0, 0) padding: 0px 7px background-color: transparent "p style="text-align: center line-height: 18px margin-top: auto "span style="color: black font-family: "4900/span/p/tdtd width="227" valign="top" style="border-width: 0px 1px 1px 0px border-style: none solid solid none border-color: rgb(0, 0, 0) windowtext windowtext rgb(0, 0, 0) padding: 0px 7px background-color: transparent "p style="text-align: center line-height: 18px margin-top: auto "span style="color: black font-family: "5600/span/p/td/trtrtd width="74" valign="top" style="border-width: 0px 1px 1px border-style: none solid solid border-color: rgb(0, 0, 0) windowtext windowtext padding: 0px 7px border-image: none background-color: transparent "p style="text-align: center line-height: 18px margin-top: auto "span style="color: black font-family: "企业人士/span/p/tdtd width="205" valign="top" style="border-width: 0px 1px 1px 0px border-style: none solid solid none border-color: rgb(0, 0, 0) windowtext windowtext rgb(0, 0, 0) padding: 0px 7px background-color: transparent "p style="text-align: center line-height: 18px margin-top: auto "span style="color: black font-family: "6800/span/p/tdtd width="227" valign="top" style="border-width: 0px 1px 1px 0px border-style: none solid solid none border-color: rgb(0, 0, 0) windowtext windowtext rgb(0, 0, 0) padding: 0px 7px background-color: transparent "p style="text-align: center line-height: 18px margin-top: auto "span style="color: black font-family: "7800/span/p/td/tr/tbody/tablep　　** 如果同一人之前参加过培训，本次可以享受半价优惠。/pp　　** 我们制作的培训课程视频，包含全部课程内容。如果参加培训时购买，仅需2000元。如果不参加培训，单独购买培训视频，价格为5200元。/pp　　汇款说明：由于具体会务工作由安徽万升会议服务有限公司承办。会务费请汇至以下账户/pp　　单位：安徽万升会议服务有限公司/pp　　账号：34050148860800000454/pp　　开户银行：中国建设银行股份有限公司合肥市钟楼支行/pp　　备 注：适配体会务费/pp　　strong会议地点/strong/pp　　本次会议在合肥白金汉爵大酒店举行。/pp　strong　会议交通/strong/pp　　会议交通详见会议网站说明。/pp　　strong会议住宿/strong/pp　　会务组在酒店预留了房间，均为正常有窗房，可选双人标间、双人单间和双人标间-合住(表示与他人合住一个双人标间)，如果需要会务组代为预订，请在会议网站注册后进行酒店预订，入住时支付房费。/pp　　strong会议服务事宜：/strong/pp　　会议联系人：方晓娜 136 5560 3422/pp　　会务总负责：罗昭锋 0551-6360 3215，139 5600 9879/pp　　会务组成员：欧惠超 0551-6360 3215，186 5655 6163/pp　　张海燕 0551-6360 0425，139 6670 8479/pp　　会议联系email：aptamers@163.com/pp style="text-align: right "　　举办单位：军事医学科学院、中国科学技术大学、北京大学、首都师范大学、湖南大学、北京理工大学、中科院化学所、清华大学、北京生物化学与分子生物学学会、中国生命科学大型仪器共享平台联席会/pp style="text-align: right "　　承办单位：中国科学技术大学生命科学实验中心/pp style="text-align: right "　　2018年8月6日/pp /p

邀 请 函尊敬的各位专家：您好！核酸适配体研究和应用是生物医药、疾病诊疗、食品安全分析、环境污染监测等领域研究热点。我国科技部“十四五”重点研发计划中有多个专项涉及了核酸适配体的筛选与应用研究。核酸适配体的产业化应用前景广阔。为进一步推动核酸适配体研究、应用及产业化发展，北京理化分析测试技术学会北京核酸适配体交叉技术专业委员会，拟举办第三届北京核酸适配体交叉技术学术年会暨产业推动会。大会诚挚邀请京内外核酸适配体科研人员及企业同仁注册参会，共同探讨核酸适配体的研究和应用、机遇与挑战，以加强核酸适配体相关研究人员的交流协作，共同推动核酸适配体研究与应用的深入发展。会议安排如下：一、会议时间2023年11月25-26日二、会议地点北京辽宁饭店（北京市西城区德胜门外大街1号）三、会议组织单位会议主办：北京理化分析测试技术学会北京核酸适配体交叉技术专业委员会会议协办：北京食品学会现代营养与健康检测专业委员会北京市科学技术协会青年人才托举工程会议承办：中国农业大学“功能核酸”青年科学家创新团队北京理化分析测试技术学会四、学术交流范围 1. 核酸适配体筛选与智能设计 2. 核酸适配体生物传感与检测 3. 核酸适配体靶向递送与诊疗 4. 核酸适配体药物设计 5. 新型核酸适配体挖掘 6. 核酸适配体结构与修饰 7. 其它功能核酸相关研究五、会议报告内容屈 锋 教授 北京理工大学报告题目：毛细管电泳高效筛选多尺度靶标的核酸适配体方法杨振军 教授 北京大学报告题目：新型核酸药物制剂体内靶向递送及作用机制研究娄新徽 教授 首都师范大学报告题目：小分子靶标核酸适配体亲和力和特异性评价的若干问题分析杨先达 研究员 中国医学科学院、北京协和医学院报告题目：新型双特异性适配体对于抗肿瘤免疫的增强作用陈爱亮 研究员 中国农业科学院报告题目：基于智能手机和集成微流控芯片的POCT核酸检测-用于肉类掺假鉴别研究许文涛 教授 中国农业大学报告题目：多能性功能核酸王 蒙 研究员 北京市农林科学院报告题目：基于功能核酸的生物毒素快检技术李晓宏 教授 北京师范大学报告题目：高效特异性纳米酶的构建与应用龙 峰 教授 中国人民大学报告题目：光纤嵌入式光流控芯片及其应用研究张力勤 研究员 北京大学报告题目：核酸适体功能化筛选策略何军林 研究员 军事医学研究院报告题目：适配体药物研发前景杨宪斌 教授 总经理 圣诺医药报告题目：修饰核酸适配体筛选技术栾云霞 研究员 北京市农林科学院报告题目：核酸适配体在农产品安全品质检测和前处理中的应用邴 涛 研究员 中国科学院报告题目：核酸适体单轮筛选与液体活检瞿 昊 教授 合肥工业大学报告题目：核酸适配体高效筛选、优化及应用的基础“方法学”问题探索李 灏 教授 济宁医学院报告题目：基于筛选新策略和截短优化的适配体应用彭池方 教授 江南大学报告题目：适配体-侧流层析分析方法新进展杨 宇 研究员 上海交通大学报告题目：基于功能核酸的精准肿瘤免疫治疗乐 涛 教授 重庆师范大学报告题目：适配体荧光传感器研究与应用戴建远 副教授 四川大学报告题目：基于新型DNA环路和DNA纳米材料的核酸适配体传感研究李相阳 副教授 北京农学院报告题目：DNA/银纳米簇研究现状及抗菌材料制备及性能研究郭明璋 副教授 北京工商大学报告题目：合成生物学细胞传感系统在食品安全检测中的应用杨 歌 助理研究员 中国医学科学院报告题目：抗呼吸道合胞病毒的核酸适配体筛选与应用田晶晶 讲师 南京农业大学报告题目：核酸微纳米花递送黄酮糖苷的靶向协同肥胖预防刘 梅 助理研究员 中国医学科学院皮肤病医院报告题目：基于核酸适配体的乳腺肿瘤分子分型研究六、参会与报告邀请欢迎领域内专家、学者及企业同仁参会，会议注册方式微信小程序（扫描下方二维码）或邮箱发送参会回执。普通代表注册费1800 元/人，学生注册费1200 元/人。会议交通费、食宿费自理。七、缴费方式银行转账、现场POS机刷卡或现金。收款单位：北京理化分析测试技术学会开户银行：华夏银行北京紫竹桥支行账 号：4043200001801900001154备 注：核酸适配体+参会代表姓名八、交通指南机场-酒店北京首都国际机场-北京辽宁饭店出租车：27公里，约43分钟地铁：乘坐首都机场大巴公主坟线到马甸桥（东）站下车到达酒店北京大兴国际机场-北京辽宁饭店出租车：66公里，约1小时地铁：乘坐大兴机场线到草桥站，换乘地铁19号线到北太平庄站下车坐公交或步行1.3公里到达酒店北京南站-北京辽宁饭店出租车：25公里，约35分钟（马甸桥西南侧下桥）北京西站-北京辽宁饭店出租车：16公里，约25分钟（马甸桥西南侧下桥）九、组委会联系方式联系人：许老师、朱老师电话：18801066003邮箱：zhulongjiao@outlook.com主办单位：北京理化分析测试技术学会北京核酸适配体交叉技术专业委员会承办单位：北京理化分析测试技术学会中国农业大学“功能核酸”青年科学家创新团队二〇二三年十月三十日2023年第三届北京核酸适配体交叉技术学术年会参会回执.docx

为期五天的第三届中国核酸适配体学术研讨会暨筛选技术培训班于11月9日顺利落下帷幕。本次会议共有33个大会报告，来自中国大陆、香港和美国等地的250多位学者参加学术研讨会，比上届会议多出一百多人。另有40多人参加了为期三天的核酸适配体筛选技术培训班。 与上一届会议相比，中国在适配体领域的研究水平有了明显的提升。特别是从研究的深度以及适配体的产业化角度都有了显著的进步。不仅有更多的人开始关注并从事筛选工作，在筛选机理研究方面也取得了重要进展，使得筛选速度和筛选成功率上都有了巨大的进步。在从事适配体应用的报告中，人们也不再仅仅局限于建立一个新方法，而是进一步将检测方法推向应用。这次会议中，我们欣喜地看到，已有一些成型的基于适配体的产品。这将极大地推动我国适配体领域的产业化发展。另外，还有多家公司开始介入到适配体筛选以及产业化进程中来。 会议期间，与会代表还就aptamer中文译名进行了研讨。译名不统一，影响学术交流。目前aptamer的中文译名有多种，例如，核酸适配体，核酸适体，核酸适配子等。根据来自搜索引擎，三大中文数据库，国家基金委获资助的项目，已出版的中文图书，以及历届会议中大家的使用习惯等途径统计得到的数据显示，核酸适配体已经成为多数人都接受的中文译名，而且适配体能够表达“适应”“配合”这样的含义，与aptamer的前缀apta- 部分也能很好地对应起来。核酸适体 在台湾和香港地区使用较多，总体使用频率略低于核酸适配体。而核酸适配子使用人数较少。组委会提醒各位学者，关注aptamer的中文译名问题。 这次会议也暴露出一些问题。在核酸适配体的整个产业链当中，从实验室的检测方法开发到实际的应用，其实有较大的差异。目前来看，将核酸适配体推向实际产业应用的产品还为数甚少。而这种应用场景的转化，将会面临多种挑战，有来自基质变化带来的影响，也有界面变化的影响，有环境改变对适配体结构以及稳定性的影响。如何克服这些问题，这将是适配体应用无法回避的问题。 核酸适配体要想真正发展成一个产业，需要建立一个完整的生态系统。这个系统中，不仅需要筛选得到大量的核酸适配体，需要做方法开发，还需要有产品开发经验的团队，将实验室的方法进一步开发成实际场景中可以使用的产品，也需要有企业来真正推进产业化，开拓市场。 就目前的情况而言，核酸适配体产业才是刚刚起步，这个领域要想繁荣发展，需要更多人加入进来。我们也希望通过会议，整合资源，促进强强联合，实现优势互补。只有当这个领域出现一些重要的产品，才会有更多的资本进入这个领域，核酸适配体产业才会迎来快速发展。历届会议报告及照片参见：中国核酸适配体学术研讨会暨筛选技术培训班

2023年11月25日，由北京理化分析测试技术学会核酸适配体交叉技术专业委员会主办，北京市食品学会现代营养与健康检测专业委员会、北京市科学技术协会青年人才托举工程共同协办，中国农业大学“功能核酸”青年科学家创新团队、北京理化分析测试技术学会共同承办的第三届北京核酸适配体交叉技术学术年会暨产业推动会在京成功举办。来自各大科研院所、企业的专家、学者近百余人齐聚本次会议，首日现场座无虚席，共同交流探讨核酸适配体的研究和应用、机遇与挑战，推动核酸适配体研究与应用的深入发展。会议现场本次会议特别邀请了北京理工大学屈锋教授、北京大学杨振军教授、首都师范大学娄新徽教授、中国农业科学院陈爱亮研究员、中国农业大学/“功能核酸”青年科学家团队负责人许文涛教授、中国人民大学/先进环境与健康检测技术中心负责人龙峰教授、中国科学院杭州医学研究所邴涛研究员、江南大学彭池方教授、圣诺生物医药技术（苏州）有限公司总经理杨宪斌博士等31位专家老师带来精彩报告。会议首日，共计20位老师分别作了精彩的主题报告。北京核酸适配体交叉技术学会理事长屈锋教授为现场观众介绍了北京理化分析测试技术学会历届会议的基本情况，并作了题为《毛细管电泳高效筛选多尺度靶标的核酸适配体方法》的报告分享。报告分享了多种基于毛细管电泳的筛选策略以及如何根据不同蛋白、不同目标物的特点进行不同的策略设计，详细介绍了适配比筛选的模式和效率。屈锋北京核酸适配体交叉技术学会秘书长许文涛教授作了题为《多能性功能核酸》的报告，本次报告分享了他从早期的PCR研究到功能核酸技术的思考，他表示“在思维里，所有的技术都能交叉，而交叉促进了进步。”许文涛首都师范大学娄新徽教授作了题为《小分子靶标核酸适配体亲和力和特异性评价的若干问题分析》的报告，本次报告聚焦到了小分子靶标核酸适配体亲和力和特异性的评价技术，以及分享了在研究过程中发现的一些亲和力和特异性评价的普遍性问题。娄新徽 中国农业科学院陈爱亮研究员作了题为《基于智能手机和集成微流控芯片的POCT核酸检测-用于肉类掺假鉴别研究》的报告，报告分享了陈研究员通过等温扩增技术、荧光技术以及离心式微流控技术三者的结合实现了对食品肉类的快速检测。陈爱亮 北京大学杨振军教授作了题为《新型核酸药物制剂体内靶向递送及作用机制研究》的报告，他表示RNA体内递送的重点是要解决肝以外的递送，并分享了在探索体内递送机制过程中发现的药物新靶标。杨振军 中国人民大学龙峰教授作了题为《光纤嵌入式光流控芯片及其应用研究》的报告，报告指出通过关键核心技术的突破，已经发展了具有完全自主知识产权的多款智能化光学分析仪器，可以实现靶标物“小、快、灵、准”的检测。龙峰 中国科学院邴涛研究员作了题为《核酸适体单轮筛选与液体活检》的报告，在核酸适体筛选与表征、标志物的发现与甄别、即用型核酸适体验证、单细胞核酸适体组学以及液体活检应用平台这五个方面进行了介绍。邴涛江南大学彭池方教授作了题为《适配体-侧流层析分析方法新进展》的报告，报告分享了通过选择关键碱基杂交和设计辅助杂交片的方式解决了靶标与互补序列竞争力匹配度差的问题；通过两款设计解决了靶标与适配体结合效率低的问题；通过CRIPR酶识别长短链转换和荧光纳米猝灭的方式解决了竞争型LFA“turn on”模式缺乏的问题。彭池方 圣诺生物医药技术（苏州）有限公司总经理杨宪斌博士作了题为《修饰核酸适配体筛选技术》的报告，他提出“想搞定适配体的修饰应该从刚开始做的时候就引进一些功能性的基团”，同时也从产业化的角度为核酸适配体的发展提供了很好的建议。杨宪斌 北京理工大学黄渊余教授作了题为《核酸药物递送与疾病防治》的报告，报告针对核酸药物高效入胞、快速逃逸以及长效作用等关键科学问题，探求了疾病诊疗的新方案。黄渊余 合肥工业大学瞿昊教授作了题为《核酸适配体高效筛选、优化及应用的基础“方法学”问题探索》的报告，报告从核酸适配体的研究现状、定向演化高效发掘、动态构型性能优化以及超灵敏生物传感系统五方面进行了介绍。瞿昊 凯莱英医药集团(天津)股份有限公司何军林研究员作了题为《适配体药物研发前景》的报告，报告讲述了适配体-靶互作机制以及适配体的药物研发。何军林 北京师范大学李晓宏教授作了题为《高效特异性纳米酶的构建与应用》的报告。李晓宏 中国医学科学院、北京协和医学院杨先达研究员作了题为《双特异性适配体对于抗肿瘤免疫的增强作用》的报告。报告指出PD-1/Nucleolin双特异性适配体是提升免疫疗效的新策略，并具有一定的应用潜能。杨先达北京市农林科学院栾云霞研究员作了题为《核酸适配体在农产品前处理和快速检测中的应用》的报告，她指出前处理是农产品检测的重要环节。栾云霞重庆师范大学乐涛教授做了题为《基于适配体荧光传感器研究与应用》的报告，他表示“在快检领域困扰我们的是抗体”。乐涛 济宁医学院李灏教授做了题为《基于筛选新策略和截短优化的适配体应用》的报告，强调要通过筛选本身提高适配体的稳定性和真实性，并介绍了在适配体筛选策略的开发、适配体优化以及在食品安全领域、疾病诊断、环境检测等领域应用的主要工作。李灏吉林大学孙春燕教授做了题为《功能核酸荧光生物传感器设计及在食品安全检测中的应用》的报告，主要介绍了在核酸适配体荧光生物传感器和DNA酶荧光生物传感器的主要工作。孙春燕 北京农学院李相阳副教授做了题为《DNA/银纳米簇研究现状及抗菌材料制备及性能研究》的报告，报告在基于核酸适体的银纳米簇制备及优化、DNA银纳米簇可视化抗菌材料的制备及性能两方面进行了详细介绍。李相阳 北京大学张力勤研究员做了题为《核酸适体功能化筛选策略》的报告，他认为现有的筛选方法不够完美，并对两大平台：新药物形式开发平台、药物新靶点发现平台的研究工作做了详细介绍。张力勤

金属纳米团簇是一类由几个到数百个金属原子组成，尺寸一般小于2 nm的新型无机材料。纳米团簇确定的组成和结构、高的比表面以及不饱和配位点，使其成为一种在原子/分子水平研究催化反应构效关系的理想模型。铜团簇(Cu NCs)由于较低的成本和丰富的自然储量，在实际应用中具有广阔的前景。然而，Cu NCs生长机制的不确定性和结晶过程的复杂性阻碍了对其特性的深入理解和开发。特别是，配体效应对Cu NCs的结构和性质具有重要影响，然而其在原子/分子水平上的调控机制仍然不清楚。 　　前期孙晓岩研究员带领的团簇化学与能源催化研究组利用基于质谱技术的离子-分子反应方法，探究了高价态铁氧物种活化甲烷的本证活性并揭示了其生成甲二醇的微观机理(J. Phys. Chem. Lett. 2023, 14, 1633-1640)。受气相反应的启发，并结合质谱技术的优势，该团队将质谱应用于凝聚相团簇中，来探究配体效应对Cu NCs生长、结构、性质以及反应活性的调控规律。 　　研究人员通过化学还原法成功合成了三种不同配体(2-巯基苯并咪唑、2-巯基苯并噻唑和2-巯基苯并恶唑)保护的相同核数的Cu6 NCs(Cu6-1，Cu6-2和Cu6-3)，这三种仅有微小差异的配体结构为精准对比配体效应提供了良好的模型(图1)。团队首先利用实时监测质谱技术探究了配体对Cu6 NCs合成过程的影响，发现团簇的生长过程经历“尺寸聚焦-热力学平衡-氧化刻蚀”三个阶段，由于配体的作用，使得这三个过程在时间维度上出现了显著差异，因此，通过质谱对团簇尺寸聚焦过程的准确监测能够为实现多种Cu NCs的精准合成提供重要思路。针对Cu团簇难以获得晶体结构的问题，团队利用碰撞诱导解离(CID)质谱技术进一步解析和对比了三种配体对团簇结构及稳定性的影响(图2)。基于碎片离子与O2的反应，并结合密度泛函理论计算，推导出Cu团簇催化燃料电池阴极氧还原反应(ORR)的活性位点，并筛选出Cu6-3可能具有较高的ORR活性。这项工作不仅为质谱技术研究团簇的配体效应提供了基本的见解，也为凝聚相中精准设计高活性的Cu基纳米催化剂提供了重要的思路。图1. 三种不同配体Cu6团簇的合成与表征 图2. 三种不同配体Cu6团簇结构和多级质谱分析 　　相关工作近日发表在Small上。青岛能源所博士生张丽丽为论文第一作者，孙晓岩研究员为通讯作者。该工作得到了山东能源研究院科研创新基金和山东省自然科学基金等项目的支持。

p　　北京理化分析测试技术学会 核酸适配体交叉技术学会会议通知(第二轮)/pp　　2019年05月25日/pp　　核酸适配体研究和应用是生物医学和药学基础研究、生物传感检测、食品安全分析、环境污染监测等领域的研究热点,具有广阔的应用前景。为加强北京地区核酸适配体研究人员的交流协作,推动核酸适配体研究的深入发展,搭建核酸适配体技术开发及成果转化平台,在谭蔚泓院士的支持与鼓励下,经过北京地区有关学者数次研讨,拟成立北京核酸适配体交叉技术学会,并召开第一届北京核酸适配体交叉技术学术年会。/pp　　大会将邀请国内知名核酸适配体领域专家作专题学术讲座,并针对适配体筛选及应用领域相关疑难问题进行学术交流。本次会议旨在为北京地区核酸适配体相关领域研究人员提供相互学习、相互交流、加强合作、增进友谊的平台,我们诚挚地欢迎各位专家同行及青年学生踊跃参会。/pp　strong　一、会议主题/strong/pp　　1.选举产生北京核酸适配体交叉技术学会第一届理事,召开理事会一届一次会议。/pp　　2.举办北京核酸适配体交叉技术学会第一届学术年会。/pp　　strong二、学术委员会(按姓名拼音首写字母排序)/strong/pp　　主 任: 谭蔚泓 院 士/pp　　委 员: 方晓红 郭 磊 何军林 蒋兴宇 鞠煜先 梁子才 廖世奇 龙亿涛/pp　　娄新徽 罗昭锋 裴仁军 屈 锋 上官棣华 邵宁生 孙佳姝 王梁华/pp　　王周平 杨朝勇 杨先达 杨振军 袁 荃 张丽华 张学记/pp　　秘 书: 邴 涛/pp　　strong三、会议时间与地点/strong/pp　　会议时间:2019年O5月25日,08:30-O9:30报到,09:30-17:30开会/pp　　会议酒店:北京理工大学国际教育交流大厦/pp　　会议地址:北京市海淀区北三环西路甲66-1号/pp　strong　四、会议费用标准及报名方式/strong/pp　　1、会务费:参会代表每人交会务费500元,学生200元。会议交通、食宿费自理。/pp　　北京核酸适配体交叉技术学会第一届理事会理事请于O5月25日O8:30前报到、注册。/pp　　2、报名方式:参会者请填写报名表(附件2),为便于会务组织及安排,请参会代表/pp　　将报名回执表E-mail至会务组。/pp　　3、缴费方式/pp　　银行转账、现场POS机刷卡或现金。/pp　　收款单位: 北京理化分析测试技术学会/pp　　开户银行: 华夏银行北京紫竹桥支行/pp　　账 号: 4043200001801900001154/pp　　纳税识别号: 5111000050O3038760/pp　　备 注: 会议注册费/pp　strong　五、联系方式/strong/pp　　联系人: 王蒙18601922335/pp　　吕雪飞 1512OO53393/pp　　陈爱亮 13811661539/pp　　电子邮件: apatamerbj@163.com/pp　　附 件:/pp　　1.会议日程/pp　　2.参会回执表/pp style="text-align: center "img title="21.png" style="max-height: 100% max-width: 100% " alt="21.png" src="https://img1.17img.cn/17img/images/201905/uepic/498737bd-519e-40b7-9384-1b8cf9e9926f.jpg"//pp style="line-height: 16px "img style="margin-right: 2px vertical-align: middle " src="/admincms/ueditor1/dialogs/attachment/fileTypeImages/icon_pdf.gif"/a title="核酸适配体会议二轮通知.PDF.pdf" style="color: rgb(0, 102, 204) font-size: 12px " href="https://img1.17img.cn/17img/files/201905/attachment/ccc782f7-cea7-4046-89e6-7115c88590bc.pdf"核酸适配体会议二轮通知.PDF.pdf/a/ppimg title="3.png" src="https://img1.17img.cn/17img/images/201905/uepic/ced4af36-9cac-447a-9c49-632badf391ce.jpg"//pp img title="4.png" style="max-height: 100% max-width: 100% " alt="4.png" src="https://img1.17img.cn/17img/images/201905/uepic/e0fbbc82-7304-4026-87f3-9d8abcf25d62.jpg"//p

合肥工业大学成功研发出一种快速无标记的核酸适配体体外筛选方法，通过这一方法筛选的核酸适配体，对金属离子表现出高度的亲和力和特异性，提供了性能优良的金属离子亲和物质，从而实现了对重金属超标的快速实时检测。该成果论文近日发表在国际纳米材料领域顶级学术期刊之一《美国化学学会纳米》上。　　传统方法对金属离子的检测，需要借助质谱等大型仪器设备，成本高昂费时费力难以普及。如何摆脱对大型仪器的依赖，实现对金属离子的快速实时检测，关键就是找寻能够特异性识别并结合特定金属离子的“亲和物质”。由于金属离子在生物体内不会引起免疫反应，能够特异性结合金属离子的“标准”亲和物质——单克隆抗体非常难以生产，使用指数富集的配基系统进化技术等传统的筛选方法，仍需要对靶标进行化学标记或者修饰，这一要求对于金属离子和小分子靶标十分困难，且容易改变其结构和性质。　　合肥工业大学生物与医学工程学院瞿昊博士，通过使用乳液聚合酶链式反应和荧光激发细胞筛选两项技术，成功研发了以金属离子为特定靶标的核酸适配体高效筛选的革新方法。这一筛选方法无需对靶标进行任何标记或修饰，同时筛选周期短，非常适用于针对金属离子和小分子靶标的核酸适配体筛选。通过这一方法，瞿昊通过3—4轮筛选便获得了适用于二价汞离子的核酸适配体，其结合强度较传统核酸适配体提高了30倍，并首次获取了适用于二价铜离子的核酸适配体。　　“这一筛选方法可适用于所有金属离子和小分子靶标，将为针对其他离子和小分子靶标的核酸适配体的筛选工作提供非常高效的平台。”瞿昊说，这一成果突破了生物传感器领域匮乏性能优良的亲和物质这一瓶颈，不仅可以应用在金属污染治理上，同时在生物技术、医疗保健等领域具有广阔的应用前景。

2012 年 10 月30日 （中国， 上海）--专注于提高人类健康及其生存环境安全的全球领先企业珀金埃尔默（PerkinElmer ）公司10月参加了由中国生物物理学会分子生物物理专业委员会和美国生物物理学会于14-18 日在北京友谊宾馆举办的2012 蛋白质－配体弱相互作用研究的技术与方法国际研讨会。PerkinElmer公司的Tim Cloutier 博士于15日做大会发言，与来自国内外的与会者一起分享PerkinElmer Enspire 多模式微孔板检测系统与无标记检测方案。Tim Cloutier 博士说：&ldquo PerkinElmer EnSpire（(CorningEpic).）是世界上第一个多模式多孔板检测仪器。它可用于96和384微孔板，以非介入检测技术在活细胞中识别和表征多个G蛋白偶联型受体（GPCR）通路活性。此外，EnSpire第一次提出了无标记和标记技术在基于细胞和生化分析的正交校验检测方案。在活细胞中，成功地动态监测的细胞内的的质量重分布（DMR），我们无标记检测技术是一个综合性的多功能的工具，能够生成的生理相关的表型数据为G蛋白偶联受体的研究。此外，还可以检测配体依赖性反应的蛋白质：蛋白质和蛋白质的小分子，生物分子的相互作用。非常类似于低通量的SPR技术。 EnSpire无标记，从而提供了一个快速KD亲和力的高通量检测方案，可以是在先于BiaCore检测之前，提供了高通量的预筛方案。&rdquo 我们先进的无标记检测产品，为您解决GPCR的问题，为您的研究带来划时代的飞跃。欲了解更多产品信息，请访问我们的官方网站www.perkinelmer.com/EnSpireLabelfree产品样本下载 PerkinElmer生命科学与技术部

人肾上腺素受体是G蛋白偶联受体，是重要的药物靶标。目前已知肾上腺素受体有三类（α1, α2和β）九种亚型（α1A, α1B, α1D, α2A, α2B, α2C, β1, β2和β3）。2007年，β2肾上腺素受体的非激活这是第一个人源G蛋白偶联受体的晶体结构，是G蛋白偶联受体结构解析的重大突破。2011年，β2肾上腺素受体和G蛋白的复合物结构获得解析，该工作获得了2012年诺贝尔化学奖。这些结构的解析极大地推动了人们对G蛋白偶联受体（特别是β肾上腺素受体）机理的理解。然而，三类肾上腺素受体偶联的G蛋白不同：α1, α2和β类分别偶联Gq、Gi和Gs。通过序列比对，也可以发现三类受体的配体结合口袋也有明显区别。对肾上腺素受体下游信号选择的多样性以及配体的亚型选择性的理解，一直受制于缺乏α类受体的三维精细结构。2019年12月3日，上海科技大学赵素文和钟桂生课题组在Cell Reports上共同发表两篇论文，报道了两个α类受体的三个晶体结构，阐释了肾上腺素受体多样性和配体特异性的机理。在“Structural Basis of the Diversity of Adrenergic Receptors”一文中，作者通过解析α2A受体与部分激动剂和抑制剂的复合物结构，辅助细胞信号实验和计算生物学，分析阐明了在肾上腺素受体家族中序列多样性是如何导致功能多样性的。α2A受体的两个结构整体非常相似，而配体结合口袋的多个残基（包括在肾上腺素受体中不保守的F4127.39）则发生了剧烈的构象变化。通过观察结构和突变实验，研究人员解释了影响配体选择性的重要氨基酸F4127.39的功能：F4127.39是配体结构口袋的“盖子”，它与口袋中的另外三个芳香氨基酸一起形成了一个芳香笼来结合配体中的正电基团，使配体结合时空间和能量效应俱佳。突变F4127.39会使α2A受体的完全激动剂和部分激动剂均丧失效力。α2A受体具有双重药理学效应：激动剂浓度较低时，α2A受体主要和Gi偶联；激动剂浓度较高时，与GS的偶联占据更主导的地位。相应地，在临床中，α2A受体部分激动剂的效果比完全激动剂要好，如用于降压的可乐定(Clonidine)和用于ICU镇静（在我国也广泛用于手术麻醉）的右美托咪定(Dexmedetomidine)都是α2A受体的部分激动剂。为了更好地理解α2A受体的部分激活性(partialagonism)，研究人员对多个已知的α2A受体完全激动剂和部分激动剂进行了分子对接，他们发现可以用配体与Y3946.55形成氢键与否，来区分α2A受体的部分激动剂和完全激动剂。作者还发现了三个氨基酸（Y3946.55，I13934.51和K14434.56，第一个位于配体结合口袋，后两个位于G蛋白结合口袋）对α2A受体的G蛋白选择性具有重要作用。精心设计的三个突变体Y3946.55N，I13934.51A和K14434.56A，在细胞信号实验中对部分激动剂的刺激均表现出Gi通路的偏好性，而Gs通路的活性遭到削弱甚至完全被抑制。图1：α2A受体中对配体结合（紫色）和G蛋白通路偏好性（红色）起关键作用的残基而在“Molecular mechanism for ligand recognition and subtype selectivity of α2C adrenergic receptor”文章中，作者展示了α2C受体的三维结构，并通过分子对接、功能实验等手段揭示了α2亚型受体的结构特异性，为相关药物研发提供了分子基础。通过将α2C受体与α2A受体的结构进行对比和巧妙的嵌合体设计，作者发现α2C与α2A的结构主要差异存在于胞外域。在α2C受体口袋边沿，D206ECL2-R409ECL3-Y4056.58形成氢键-盐桥互作网络，特异地影响了α2C受体选择性拮抗剂JP1302和OPC-28326的作用。而在α2A受体口袋上方，由Y98ECL1、R187ECL2、E189ECL2和R4057.32形成的互作网络直接遮盖了部分入口，使得JP1302和OPC-28326这些较大的分子可能被阻挡在外。细胞信号实验结果也显示，破坏Y98ECL1-R187ECL2-E189ECL2-R4057.32互作网络并添加D206ECL2-R409ECL3-Y4056.58相互作用得到的α2A嵌合体对JP1302和OPC-28326有着很好响应。图2：α2CAR-RS79948复合物的结构和决定α2肾上腺素受体亚型选择性的胞外域这两篇文章很好地阐述了肾上腺素受体的多样性和α2受体的配体选择性，为基于精细三维结构的下一代α2受体药物开发奠定了基础。在这两篇论文中，均使用珀金埃尔默的EnVision微孔板检测仪对GPCR的cAMP实验进行定量测定。同时，在α2受体的配体结合实验中，珀金埃尔默提供了从放射性受体拮抗剂、耗材(UniFilter GF/B)到放射性微孔板检测仪MicroBeta的整体解决方案。珀金埃尔默为中国科学家药物研发加油助力。扫描下方二维码，或点击文末“阅读原文”，即可查看论文原文。

手性配体的结构对过渡金属催化的不对称反应活性和立体选择性有着至关重要的影响。近年来，汤文军教授带领课题组在烯烃的氢酯化反应（Reppe反应），大位阻的手性联硼酸酯试剂，不对称偶联构建轴手性联芳基结构，钯催化的去芳化环化反应构建多种桥联多环骨架的衍生物等方面取得喜人成果，研究成果多次发表于Angew. Chem. J. Am. Chem. Soc.等知名期刊。默克大讲堂第一期，我们很荣幸邀请到汤文军教授讲解膦配体研发中的设计思想及其在催化中的应用。课程主题：膦配体促进的药物绿色合成工艺主讲嘉宾：汤文军教授课程简介：结构独特的P-手性单膦和双膦配体设计思想基于手性膦配体的高效不对称催化和氢化反应开发膦配体促进的药物合成新进展 默克大讲堂三大课程板块生物大讲堂为您带来生物领域的前沿技术和基础研究，涵盖核酸分子、细胞培养、蛋白印记、抗体和生物标记物检测的解决方案。化学大讲堂为您带来化学、材料方面的科研动态和先进技术，讲解创新化学产品和技术在实际药物研发和工业生产中的应用。 分析化学大讲堂为您带来分析化学相关的行业应用与案例解读，包括溶剂与试剂、样品前处理、标准物质、气液相色谱柱和水质分析等。 三月 & 四月课程表时间课程主题主讲嘉宾第一期3月25日化学大讲堂：膦配体促进的药物绿色合成工艺汤文军教授第二期4月8日生物大讲堂：cTnI等超低丰度蛋白标志物的检测方法陈成涌第三期4月15日分析化学大讲堂：2020版药典更新解析-化药篇殷承华第四期4月22日生物大讲堂：3D细胞培养及检测应用解读崔晓语第五期4月29日化学大讲堂：基于动态键的刺激响应型交联诱导荧光材料姜宇副教授

科技部新闻发言人11月8日表示，今年9月，美国《科学》杂志刊登的“中国的科研文化”一文，涉及中国基础研究科研经费分配问题，科技部认为与事实不相符合。　　清华大学生命科学学院院长施一公和北京大学生命科学学院院长饶毅今年9月在美国《科学》杂志发表“中国的科研文化”一文，讨论目前中国科研基金分配体制及科研文化问题。他们认为，尽管近年来中国研究经费持续以20%的比例增长，但这种增长没有对中国的科学和研究起到应有的强大的促进作用，现行的科研基金分配体制甚至在某种程度上阻碍了中国创新能力的发展。　　资料图片：图为作者之一清华大学生命科学学院院长施一公。(图片来源：科学网)　　资料图片：图为作者之一北京大学生命科学学院院长饶毅。(图片来源：科学网)　　科技部新闻发言人表示，我国基础研究科研项目经费在支持方向上分为两类，一类是以资助科学家自由探索为主的基础研究，例如国家自然科学基金，支持的面广，项目数多 另一类是以国家重大需求为目标的基础研究项目，例如国家重点基础研究计划(973计划)等，是根据经济社会发展方向和重大科学问题所部署的前瞻性重点基础研究任务，由科学家申报，经过公正、公开的评审程序来确定，所有项目都在网上公示，项目所获支持力度一般比较大，项目数少，竞争性强。此类项目在规划、立项、评审和验收等各个环节，按照国际通常办法，都建立了由各学科领域高层专家所组成的专家委员会，参与项目全过程的评审和监督管理。　　科技部新闻发言人表示，近年来，973计划在农业、信息、材料、能源、人口与健康、资源环境、综合交叉和科学前沿等领域，解决了一批重大科学技术问题，为经济社会发展提供了重要的科技支撑。例如：超导材料科学，脑结构与功能的可塑性，太赫兹重要辐射源及探测，量子通信与量子计算，诱导性多能干细胞培育活体小鼠、化学复合驱采油、高强度钢等一批世界瞩目的重大基础研究成果，大大提高了我国基础研究领域的原始创新能力，也为世界科学事业作出了贡献。这些成就凝结着承担科研任务和参与规划、立项、评估、管理的一大批科学家、科技管理人员的辛勤汗水和求实奉献的精神，我们诚挚感谢他们为我国基础研究所作的杰出贡献。　　科技部新闻发言人表示，“中国的科研文化”一文的两位作者施一公教授、饶毅教授，都被聘为国家973计划项目首席科学家，饶毅教授也是国家863计划项目课题负责人，他们都承担了我国基础研究和前沿技术领域的科研项目，国家通过多个渠道对他们在科研经费和条件保障上给予了大力支持。　　科技部新闻发言人表示，科技部作为国家科学技术的行政管理部门，与各科研机构、学术机构、院校、企业、各学术领域科学家、科研人员等联系和反映问题的渠道是畅通的。我们热忱欢迎所有关心我国科技事业发展的人们，就所关心的问题向我们了解情况、交换意见、提出建议。我们重申对任何违反科学道德、科研诚信、违规违纪的不端行为，采取零容忍态度，有举必查，查实必究，绝不姑息。

p style="margin-top: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em "核酸适配体研究和应用是生物医学和药学基础研究、生物传感检测、食品安全分析、环境污染检测等领域的研究热点，具有广阔的应用前景。/pp style="margin-top: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em "为加强北京地区核酸适配体研究人员的交流协作，推动核酸适配体研究的深入发展，搭建核酸适配体技术开发及成果转化平台，在谭蔚泓院士的支持与鼓励下，经过北京地区有关学者数次研讨，于2019年5月25日成立了北京理化分析测试技术学会北京核酸适配体交叉技术分会，并选举产生第一届理事会。/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 450px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201905/uepic/56e6d6fe-cd15-4753-b85e-325fd316d679.jpg" title="1.jpg" alt="1.jpg" width="600" height="450" border="0" vspace="0"//pp style="margin-top: 10px line-height: 1.5em text-align: center text-indent: 0em "第一届理事会合影/pp style="margin-top: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em "同日，在北京理工大学国际教育交流大厦召开了第一届北京核酸适配体交叉技术学术年会。谭蔚泓院士发来视频致辞，祝贺理事会成立，预祝学术年会举办成功。strong本次会议旨在为北京地区核酸适配体相关领域研究人员提供相互学习、相互交流、加强合作、增进友谊的平台。学术年会吸引了京内、外150余位相关领域的专家学者和青年学生参加。/strong/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 400px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201905/uepic/e6941310-b5bb-49ec-8b35-2e04049985c3.jpg" title="2.jpg" alt="2.jpg" width="600" height="400" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: center "会议现场/ppspan style="text-indent: 2em "/span/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 400px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201905/uepic/85f1407b-4e55-48de-9719-f6a554e800a3.jpg" title="3.jpg" alt="3.jpg" width="600" height="400" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: center "北京理工大学屈锋教授主持会议开幕式/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 467px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201905/uepic/3d925305-1303-4c0b-bba8-7fa81b37f7df.jpg" title="4.jpg" alt="4.jpg" width="600" height="467" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: center text-indent: 0em "span style="text-indent: 2em "谭蔚泓院士视频致辞/span/pp style="margin-top: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em text-align: left "军事医学研究院邵宁生研究员、中国医学科学院杨先达研究员、北京大学杨振军教授、北京化工大学董益阳教授、中国农业大学许文涛副教授、北京理工大学屈锋教授、中科院化学研究所上官棣华研究员、北京师范大学李晓宏教授、中科院生态环境研究中心赵强研究员、中国人民大学龙峰教授等十位适配体领域的专家先后做了精彩的报告分享，报告内容丰富，涉及了核酸适配体筛选、应用以及面临的困难和问题。/pp style="text-align:center"img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201905/uepic/eba6ca97-a7b8-419d-bda0-13057ae2e094.jpg" title="5.png" alt="5.png" width="600" height="237" border="0" vspace="0" style="text-align: center text-indent: 2em max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 237px "//pp style="text-align:center"img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201905/uepic/6e217049-ed0f-4fcd-9007-92c602425963.jpg" title="6.png" alt="6.png" width="600" height="237" border="0" vspace="0" style="text-align: center text-indent: 2em max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 237px "//pp style="text-align:center"img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201905/uepic/9460c7d7-9e3a-4241-9a04-ebd46e05365e.jpg" title="7.png" alt="7.png" width="600" height="239" border="0" vspace="0" style="text-align: center text-indent: 2em max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 239px "//pp style="text-align:center"img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201905/uepic/b5bad1d6-68fe-4395-9c0c-6902b06e38e2.jpg" title="8.png" alt="8.png" width="600" height="242" border="0" vspace="0" style="text-align: center text-indent: 2em max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 242px "//pp style="text-align:center"img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201905/uepic/1fc11f02-77f6-4410-95d2-124a16e84a91.jpg" title="9.png" alt="9.png" width="600" height="233" border="0" vspace="0" style="text-align: center text-indent: 2em max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 233px "//pp style="margin-top: 10px line-height: 1.5em text-align: center text-indent: 0em "大会报告嘉宾/pp style="margin-top: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em "大会还设立了“快闪”环节， 9位青年学者、博士生和硕士生同台，每人7分钟展演自己的核心研究内容。/pp style="margin-top: 10px line-height: 1.5em text-align: center text-indent: 0em "img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 408px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201905/uepic/f7c638dc-ecd1-4d94-8c2c-20b18706e906.jpg" title="10.png" alt="10.png" width="600" height="408" border="0" vspace="0"//pp style="margin-top: 10px line-height: 1.5em text-indent: 0em text-align: center "青年人的7分钟“快闪”报告/pp style="margin-top: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em "大会最后，特别邀请了理实国际集团王颖董事长作“构建生态圈，推动大健康产业”的主题发言。报告全面介绍了科技成果产业化需解决的各环节问题，并为核酸适配体领域的产业化发展提出意见和建议。/pp style="text-align: center "img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 400px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201905/uepic/15851d0f-c5fb-4f04-ad1d-b10a49aa753a.jpg" title="11.jpg" alt="11.jpg" width="600" height="400" border="0" vspace="0"//pp style="margin-top: 10px line-height: 1.5em text-indent: 0em text-align: center "理实国际集团董事长王颖发言/pp style="margin-top: 10px line-height: 1.5em text-indent: 0em "img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 400px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201905/uepic/9f709b0c-c697-44f5-b1e0-1f6f410ac8a8.jpg" title="12.jpg" alt="12.jpg" width="600" height="400" border="0" vspace="0"//pp style="margin-top: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em text-align: center "全体与会人员合影/p

有科研&ldquo 国家队&rdquo 之誉的中国科学院(下称中科院)，刚遭遇了已下拨科研经费被部分收回的尴尬。　　2013 年 11 月 6 日，中科院力学研究所向各个课题负责人下发通知，宣布 2013 年所有院拨项目按 5% 比例对到款经费进行调减。实际上， 2014 年要过&ldquo 紧日子&rdquo 的不仅力学所一家，调减经费是中科院各个研究所的统一行动。　　这种控制科研经费的举措还在延续。一位中科院人士向记者透露：&ldquo 2014 年预算刚下来，先导专项核减的比较多。&rdquo 先导科技专项是中科院提出的一项战略行动计划,目标是在事关中国全局和长远发展的重要科技领域形成重大创新突破和集群优势。　　收紧科研经费的信号在数月前已有显现。 2013 年 8 月 20 日，财政部教科文司司长赵路一行拜访科技部，科研经费是双方会谈的一项重要议题。赵路在会谈中透露，当前财政收支矛盾十分突出， 2014 年科技预算安排要从严从紧。　　本轮科研预算从紧的背景是国务院要求中央国家机关各部门对 2013 年一般性支出统一按5%比例压减。尽管如此，由于重点压减的项目为办公楼和业务用房建设及修缮支出、会议费、办公设备购置费、差旅费、车辆购置和运行经费、公务接待费、因公出国(境)经费等，像先导科技专项这样直接涉及科技经费的调整，出乎很多科研界人士的意料。　　近年来，中国科研经费一直处于高速增长通道。自 2004 年始，研究与试验发展(R&D)经费连续八年实现 20% 以上的年增长。直到 2012 年，这一增长数字回落到 18.5%。　　然而，一个尴尬的现实是，高投入未能带来高质量的产出。　　随着科研经费的高速增长，科研成果数量确实增加，但成果质量提升有限。英国诺丁汉大学当代中国研究学院副教授曹聪分析，研究并没有带来多少真正意义上的创新技术与产品，中国还没有出现像苹果那样的创新企业，多数中国企业的核心技术仍旧主要依赖国外。世界银行的一份报告指出， 2009 年中国在专利和技术许可等知识产权上的逆差高达 100 亿美元。　　导致这一结果的原因，著名海归生物学家施一公、饶毅曾撰文指出，中国的科研经费分配所存在的严重问题减缓了中国潜在的创新步伐。　　2013 年 10 月 22 日，财政部一份关于《国家科技资金分配与使用情况的报告》将科研经费存在的问题归纳为，长期计划经济下的科技管理体制缺乏有效的统筹协调 政府与市场的关系没有理顺 科研项目管理改革跟不上市场经济体制改革进程和经费规模快速增长的需要 科技评价导向不合理。　　2014 年，中国科研经费的增速放缓成为大概率事件。与此同时，科研经费分配体制改革再次蹒跚上路。　　科研生态圈　　中国科学技术协会在 2008 年进行的一项调查显示，科研人员对课题申报资助制度公正性的评价总体偏低，44.5% 的科研人员认为政府科研经费、基金的分配公正性一般，21% 的人认为&ldquo 不太公正&rdquo 。　　当下中国的科技领域，行政化力量在科研经费的配置中仍起主导作用。中国的科技经费配置发展大概可分为三个时期。初期，以前苏联为模板，走计划发展道路。科研机构和高等院校遵循&ldquo 皇粮分配制&rdquo 的规则来获得科研经费，几乎没有竞争的成分。　　第二段时期的历史节点在 1985 年，科技体制开始改革，财政科技拨款的初始配置渠道逐渐形成了&ldquo 以竞争性的科研项目为主导，以财政事业拨款为辅&rdquo 的局面。至 2002 年，财政拨款的科研项目(纵向科研经费)全面实施课题制管理，逐步形成了以课题组为中心的科研立项模式。随后，企业、学校等平行单位的横向科技计划也纷纷效仿推行课题制，并制定类似的经费管理办法。　　第三个时期为近十年，财政科技拨款体制又经历了新一轮的调整。尤其是 2006 年，科技部和财政部联合出台《关于改进和加强中央财政科技经费管理的若干意见》，中央政府设立了一系列新的科研拨款渠道，以改变过去 20 年间过分依赖竞争性项目机制的状况。　　2014 年来临，科学界普遍的看法还是，科研管理及科研经费分配行政化依然是中国科研经费体制最大的弊病。　　中国科研计划的制定，通常由相关政府部门出台原则、指导思想、优先领域和项目指南，然后，从项目申报、审核、评估、立项、检查、中期评估、监督与管理，以及项目鉴定验收直至组织推广应用，形成一个长过程的行政管理链。公共科研经费投入分为国家、地方和单位几个层次，形成多部门、多层次构成的纵横交织的科技计划管理体系。　　弊端由此显现。由政府各部门主导设立的一些经费规模为几千万元到几亿元的巨型项目，每年会针对特定研究领域和项目颁发申请指南，由政府官员任命的专家委员会负责编写指南。　　对此，施一公和饶毅联名在美国权威期刊《科学》(Science)上以社论形式发文分析，专家委员会的主席们常听从官员们的意见，并与他们合作。这些指南表面上勾画了&ldquo 国家重大需求&rdquo ，但由于指南中具体而狭隘的描述，基本可以毫无悬念地猜出经费预定给谁。　　身兼官员和研究课题的人员，获取项目也更容易。科研院所、高校本身是行政化机构，&ldquo 从校长到课题负责人同时是行政管理人员又是学术带头人，这导致科研项目难以去权力化。&rdquo 中国政法大学法学院博士张力说。　　以国家重大需求为目标，自上而下地组织研究项目，不仅是中国也是世界的科研趋势。而在中国发生变形，施、饶两人认为，这一科研经费分配的严重问题部分归结于体制，部分归结于文化。压抑了创新，也让每个人都清楚：与个别官员和少数强势科学家搞好关系最重要，因为他们主宰了经费申请指南制定的全过程。　　文化中的一些不利因素也在科学界发酵。中科院上海神经科学研究所所长蒲慕明认为，问题在很大程度上是由于部分科学家缺乏自律造成的。例如，在项目评审中，被评者事先起草评审意见供评审专家修改，而评审专家一般只是简单地修改一些语句而已。&ldquo 除非科学家自己在参与评审过程中能够严于律己，否则任何经费分配体制都无法运行好。&rdquo 蒲慕明曾如此表示。　　在施、饶两人眼中，中国的科研圈是这样一幅图景：现行体制的既得利益者拒绝真正意义上的改革 部分反对当下科研文化的人，因为害怕失去未来获得经费的机会，选择了沉默 其他希望有所改变的人则持等待和观望的态度，不愿承担改革可能失败的风险。　　有效资助　　2006 年财政部的一次调研显示，中央财政科技经费中，通过竞争方式下拨的比例接近 80%，远高于西方国家水准。为此，中央政府设立了一系列新的科研拨款渠道，以改变过去 20 年间过分依赖竞争性项目机制的状况。　　当前科技拨款机制主要分为两类，分别是以稳定资助为原则的制度性、计划指令性拨款，即根据预算，从中央财政划拨到各个拥有公立科研机构的部门，由部门自主决定配置方式，经由各层体系层层划拨至下属机构的研究者。　　还有就是基于一定期限的科研项目竞争性拨款。竞争性拨款是一种打破部门界限，采取专家评议、择优支持的方式，有固定的期限，少则若干月，多则四五年。现实情况是，&ldquo 比如，教育部下达一部分保障性拨款，到院校内部，难以调配，还是需要校内竞争。目前并没有更好的取代办法&rdquo 。清华大学公共管理学院助理教授汝鹏称。　　美国也是政府部门提供的科研经费占绝大部分，其中竞争性拨款也占比较高，但其能够保障稳定资助的实施。例如，国立卫生研究院(NIH)2010 年的经费预算为 312 亿美元，其中 20% 左右用于资助 NIH 所属的 24 个研究机构。在这些机构中供职的 6000 多名科研人员不用每年都去申请项目，只是每四年经过一次评估，如果研究做得不好，实验室会缩减规模直至被关掉。　　竞争性过度，会从整体上导致低效竞争过多，科研人员要花费太多的精力在经费申请上。为此，科技部颁布了一系列国家科技计划经费管理办法。比如，有工资性收入的科研人员，不再允许从课题经费中开支工资性费用，增设了非编制人员的劳务费和专家咨询费等。　　对这样的改革，国内科研人员并不是都满意。例如，砍掉与他们的收入直接相关的人员费。对此，科技部科研条件与财务司司长张晓原辩驳为，这实际是收入分配制度改革的问题，科研经费承担不起这一使命。　　三张改革牌　　各方面的改进，在一定程度上有所收获，科研人员对到手的课题经费比之前要谨慎得多。然而，从源头看，科研经费改革的一条重要路径是，在稳定支持经费和竞争性经费之间找到一个合理的比例至关重要。　　理想的科研经费分配结构是在两种资助模式间取得平衡。美国东华盛顿大学商务与公共管理学院副教授李宁表示，这个比例取决于国家战略，稳定支持经费应资助那些直接服务于国家战略目标的研究项目。　　矛盾在于，如果简单地提高稳定支持经费的占比，也可能会影响科研人员的创新动力，形成新的&ldquo 大锅饭&rdquo 。中国科学技术发展战略研究院常务副院长王元认为，核心问题就是国家给科研单位的使命是什么?要把科研经费的投入和科研机构的绩效考核、评价机制的变化结合起来，而&ldquo 这是一个很大的系统工程，不是简单的财政拨款制度，涉及的问题相当多&rdquo 。　　国内正在尝试改革的另一条路径，是从经费申请和使用者两方面入手，对科研经费与个体和单位利益的关联加大制约力度。纵向科研计划在逐步施行更为严格的经费预算和审查制度，降低使用的随意性，提高使用效率。　　比如，预算的精细度和合理性直接与未来预算是否被削减、削减多少相关。中科院化学研究所一位副研究员告诉记者，现在国家项目的经费预算严格多了，&ldquo 普遍会削减 10%-20% 的申请额度&rdquo 。而且一个课题预算已经细化到，如每年多少人次出差，什么职称、目的地等。　　这条路径的问题是，严格的预算和审查制度，降低了科研经费使用中必要的灵活性，特别是探索性较强的科研工作，受牵制较多 高强度的过程监督，也给科研人员带来了较大的工作负担，使他们疲于应付各类检查、评估，降低了科研效率。　　细节处也多有纰漏。《事业单位会计制度》中，会计科目设置与科研项目预算科目设置并不太一致。科研人员凭经验完成预算编制，财务人员很少能参与其中，致使预算编制不科学、不合理，失去了预算的严密性与严肃性。同时，国内纵向科技计划种类较多，在项目经费支出运算科目上也不统一，进一步增加了预算编制、执行和审计的难度。　　&ldquo 要求我们在科学上出成果是应该的 还要求我们懂财务知识，而且各个机构发布的财务审计标准、预算标准各不相同，都要去了解。感觉很累。&rdquo 上述化学所副研究员说。　　严格的监管也意味着成本的增加。从 2010 年开始，科技部针对项目同质化的现象，通过技术手段查重，然后请同行专家评审。科技部部长万钢表示，这个方法是有效，但成本很高。　　况且，科研经费监管是一项专业性很强的工作，必须由专业机构和人员承担，否则无法判断所发现问题是源自制度本身还是制度执行中产生的问题，也无法轻易发现制度漏洞并加以弥补。　　美国科学基金会总监察长办公室作为一个专业监管机构，负责调查和处理资助项目经费使用中的造假、浪费、滥用以及其他不端行为。该机构 80 多位工作人员都具有科研背景或者法律、会计、审计等从业资格。与之相比，中国国家自然科学基金委员会的监督审计部门不足 10 人，大多也没有会计和审计专业背景。　　除了实施科研投入的源头调控，还有加强对经费申请和使用者的监管，科技部已经在试打第三张牌&mdash &mdash 增加项目评审的透明度。　　万钢告诉记者，目前科研项目评审，所有过程全都录音录像，做到可申诉、可查询、可追溯，整个过程都在网上进行，全都进行痕迹管理，在追溯过程中不留漏洞。　　近邻韩国，已构建了高度透明的科技经费流通渠道。政府研发经费直接拨付到科研单位，科研项目实施和成果评价的权力掌握在独立的非政府组织手中，韩国政府对研发经费实行多重管理监督，多个单位都可对科研经费进行监督，普通公民也可以上网查阅科技主管部门的项目计划书和资金拨款情况。　　从 2013 年底起，科技部会同有关部门共建一个科研信息共享平台，以避免科研领域多头部署、重复支持、相互封闭的现象。同一个研究团队在不同的科技计划中，提出目标相似而又处于同一研发阶段的项目申报，获得不止一个科技计划的支持，这样的事时有发生。　　同时，科技部还计划推行科技报告制度，把结题验收后的项目放到网上。 2013 年 11 月 1 日，科技报告服务系统征求意见版已公开发布，提供了 1000 份免费科技报告。这样既有利于科研人员共享科研成果，又促进技术交流。　　在第十二届全国人大常委会第五次会议上，财政部部长楼继伟透露了另一项改革举措，&ldquo 最根本的要求，我们认为要强化科研项目经费的法人负责制，而不是课题组专家负责制，这是体制上的问题。&rdquo 具体而言，法人责任体现在编制预算时提供的服务、实施预算中的监管、调整预算中的快速核准以及对单位人员的信用管理上。　　这一步如何走，或将引发整个科技体制的改革。

大家好，本周为大家介绍一篇发表在Proc. Nat. Acad. Sci. U.S.A上的文章，HDX-MS performed on BtuB in E. coli outer membranes delineates the luminal domain’s allostery and unfolding upon B12 and TonB binding1，文章作者是华盛顿大学的Tobin R. Sosnick。　　TonB-依赖的转运体(TBDTs)广泛存在与革兰氏阴性菌的外膜上，通过其摄取营养。但TBDTs转运时的机制尚不明确，尤其是可供底物通过的跨膜β-桶孔径打开时的结构变化机理。BtuB是一种典型的大肠杆菌TBDT，其功能和生物物理环境都得到了广泛的研究。目前推测BtuB在行使转运功能时，其通道孔径形成需要BtuB与底物维生素B12结合，其N-端7个残基(称为“Ton box”)产生较大的构象转变，从β-桶中甩出进入胞质并与下游蛋白TonB发生相互作用。但孔径形成的过程具体机理存在两个具有争议的猜想：力依赖模型认为，TonB通过将BtuB从β-桶拽出到胞质，并从膜内侧将能量传递给BtuB，这些力可能重塑塞区并导致孔径形成 而非力依赖模型则认为孔径的形成跟BtuB自身保守的Ionic Lock(IL，即R14和D316间的盐桥)相互作用有关，当B12存在时只需要IL解锁TonB就能与BtuB结合产生成孔运动。晶体学研究捕捉到了Apo BtuB、BtuB:B12和BtuB:B12:TonBCTD的结构(图1)，但晶体学研究一来存在晶体堆积导致其结构与溶液态蛋白结构产生一定差异的问题，二来静态的结构“截图”无法提供动态变化过程信息。因此，本文选择氢氘交换质谱法(HDX-MS)解析BtuB和配体结合时产生结构动态变化过程，以深入推测该过程的具体机制。　　图1. BtuB腔体结构域与两个配体结合事件的构象响应模型。　　该实验共设有4组，包括：Apo BtuB、BtuB + B12、BtuB + TonB和BtuB + B12 + TonB。作者对BtuB + B12的HDX速率及保护因子(PF)进行了分析(图2)：其中，N-端2-29残基(包括Ton box在内及IL中的R14)、pre-SB3区域属于快速氘代区域，SB1、SB2、SB3属于中速氘代区，其他区域属于慢速氘代区。　　图2. HDX速率分区并映射至结构。　　随后作者分析了Apo BtuB、BtuB + B12的HDX-MS实验数据(图3)。其中IL区域及其相连的Fisrt Strand区域的HDX变化情况最为显著(氘代上升)，从氘代动力学图中我们可以看到添加B12后该区域的氘代速率从较慢的水平转变为较快的水平，这说明B12的结合足以使得IL区域发生较大的构象变化，该现象呼应了TonB从较为紧凑的结构转变为较为动态/溶剂可及性高的结构。除此之外，N-端前5个残基区域经历了轻微的氘代上升 底物结合区SB1、SB2和SB3经历了一定程度的氘代下降，而SB3的前端经历了一定的氘代上升。　　图3. BtuB + B12和Apo BtuB的HDX比较。　　接着作者也考察了BtuB + TonB和BtuB + B12 + TonB的HDX-MS结果(图4)。结果发现，只加TonB时BtuB的IL区域并未发生较大的HDX变化，而同时添加B12和TonB的BtuB IL区产生了明显的氘代变化，这些现象进一步证实了BtuB的Ton box发生结构改变是B12结合后IL解锁产生的效应。这些实验结果支持非力依赖型假说机制，即B12结合后通过別构效应使得IL处的盐桥打破，使得Ton box区被释放至胞质中，进一步跟下游蛋白结合从而打开通道孔径。　　图4. 不同组别的IL区域的HDX氘代动力学图。　　本文通过HDX-MS实验解决了大肠杆菌离子通道家族中一蛋白BtuB配体相关的动态调控机制，通过实验的方法验证了非力依赖机制假说。本文选取的体系及蛋白样品较为巧妙，实验设计合理，实验证据充分，行文逻辑严密，为离子通道的动态调控机制提供了见解，是HDX-MS方法优势的典型体现。　　撰稿：罗宇翔　　编辑：李惠琳　　原文：HDX-MS performed on BtuB in E. coli outer membranes delineates the luminal domain’s allostery and unfolding upon B12 and TonB binding　　李惠琳课题组网址：https://www.x-mol.com/groups/li_huilin　　参考文献　　1. Zmyslowski, A. M. Baxa, M. C. Gagnon, I. A. Sosnick, T. R., HDX-MS performed on BtuB in E. coli outer membranes delineates the luminal domain's allostery and unfolding upon B12 and TonB binding. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2022, 119 (20).

免疫疗法(immunotherapy)是在机体免疫功能低下或亢进时，利用生物学、化学、物理学手段人为地增强或抑制机体的免疫功能来对抗癌细胞的一种方法，但存在靶向不良反应、缺乏实时监测技术和反应不可持续等问题。 近期，青岛科技大学袁勋教授课题组设计了一种基于超小金纳米团簇(NC)的诊疗探针，并将其用于近红外二区窗口(NIR-II)荧光成像指导的光学治疗和光激活癌症免疫治疗。 该设计的关键是采用具有单线氧（1O2）可切割功能的连接分子将原子精确且具有近红外二区荧光（NIR-II PL）特性的Au44MBA26 NCs与小分子免疫抑制剂NLG919偶联，获得肿瘤诊疗探针Au44MBA26-NLG NCs（图1）。 图1 Au44MBA26 NCs的结构及近红外光激活机制。 该探针(Au44MBA26-NLG)由具有精确的原子结构和NIR-II发射性能的Au44MBA26 NCs(MBA表示水溶性4-巯基苯甲酸)通过单线态氧(1O2)切割的连接子与免疫检查点抑制剂NLG919偶联而成。 在近红外光照射下，Au44MBA26-NLG不仅可以对肿瘤进行NIR-II PL成像以指导肿瘤治疗，还可以利用光热特性进行癌症光热治疗(PTT)以及利用光生成的1O2进行光动力治疗(PDT)，并释放NLG919以用于癌症免疫治疗。 图2瘤内注射AU、MBA、-NLG后不同时间点的4T1荷瘤小鼠NIR-11PL图像。（左）图3 Au44MBA26-NLG在肿瘤部位的荧光强度（右）图4 局部开窗区域的荧光强度分布(Rois)。 实验结果表明，由Au44MBA26-NLG调节的多重效应可促进效应T细胞的增殖和活化，提高全身抗肿瘤T淋巴细胞(T细胞)的免疫力，显著抑制活体小鼠的原发和远端肿瘤的生长。 综上所述，该研究能够为NIRII PL成像指导的光学治疗和光激活癌症免疫治疗提供一个新型高效的纳米诊疗平台。 图4 Au44MBA26-NLG NCs探针用于NIR-II荧光成像引导的肿瘤光疗（PTT/PDT）和光激活免疫治疗示意图。目前，这篇论文已经被《ACS Nano》期刊正式接收，想要查看完整英文版全文的读者，可以复制下方链接获取。https://doi.org/10.1021/acsnano.3c02370 值得一提的是，在上述研究中，研究团队选择了由北京睿光科技有限责任公司与医学影像的专业团队联合开发的国产活体荧光成像系统——NirVivo系列小动物活体荧光成像系统，并将此作为实验的核心仪器之一。NirVivo系列小动物活体荧光成像系统目前，该系统拥有三个型号可供选择，分别是NirVivo-lite、NirVivo-Pro和NirVivo-MIX，可以对可见光、近红外一区及近红外二区谱段开展生物自发光和荧光成像实验，拥有完整的自主知识产权，配置灵活，操作简洁，成像效果好。 可覆盖400-1700nm全谱段成像； 采用-80℃深度制冷科学级成像器件，可实现5分钟以上曝光； 高度集成的软硬件系统，可实现一键自动采集，提高实验效率； 宽视场和显微视野可选，可实现局部区域显微荧光成像；

PNAS：清华大学王新泉等人解析IL-33与受体作用的结构机制2013-08-27 来源：生物360 作者：koo 196 0 收藏(1) 添加到书签-- IL-33是IL-1家族的一个重要成员，在宿主防御及疾病的先天和适应性免疫反应中发挥着多效活性。IL-33通过它的配体结合主要受体 ST2 和IL-1受体辅助蛋白（IL-1RAcP）来发送信号，这两种受体均为IL-1受体家族成员。为了阐明IL-33与它的受体之间的相互作用，来自清华大学生命科学学院等机构的研究人员确定了分辨率为 3.27 的 IL-33 与 ST2 胞外域构成复合物的晶体结构。采用结构诱变和结合分析，得到的结构分析结果确定了 ST2 特异性识别IL-33的分子机制。研究人员将之与IL-1家族中的其他配体-受体复合物进行结构比较，证实表面电荷互补至关重要地决定了IL-1主要受体的配体结合特异性。结合晶体学和小角度X射线散射研究揭示， ST2 在 D3 结构域和 D1D 2模块之间具有柔性铰链，而 IL-1RacP 在溶液中以一种游离状态显示刚性构象。 ST2 的分子灵活性提供了关于IL-1主要受体与配体结合时结构域层次构象变化的结构认识。IL-1RacP 的刚性则解释了它为何不能直接配体的原因。小角度X射线散射分析溶液中IL-33&ndash ST2 &ndash IL-1RacP复合物的结构，结果与 IL-1&beta &ndash IL-1RII&ndash IL-1RacP 和 IL-1&beta &ndash IL-1RI&ndash IL-1RacP 的晶体结构相似。这些研究结果阐明了IL-33结构与功能的关系，支持并扩展了IL-1家族中配体-受体组装和激活的普遍模型。清华大学生命科学学院的王新泉（Xinquan Wang）教授和台湾国立成功大学的王淑莺（Shuying Wang）助理教授是这篇论文的共同通讯作者。王新泉教授的主要研究方向为结构生物学。利用X-射线晶体学为主要研究手段，结合冷冻电子显微镜学和其他生物化学技术，研究生物大分子的结构与功能关系。研究目标目前集中在细胞因子特异结合并激活其受体分子，以及病原体逃避宿主免疫攻击的结构机理。

半个多世纪以来，具有异质结结构的半导体器件已经给人们的生活带来了革命性的变化。发展纳米材料的合成技术，制备具有纳米尺寸的“半导体－半导体异质结构”材料不仅是合成化学所面临的挑战，同时也是发展新型功能纳米材料的一个重要途径。 在国家自然科学基金委、科技部以及中科院的资助下，化学所胶体、界面与化学热力学院重点实验室高明远课题组在具有特殊结构和形貌的纳米材料的合成发面开展了系列研究工作，曾先后报道了具有核壳结构的CdTe纳米线（Langmuir, 2005, 21, 4205-4210），超长CdTe纳米管（Angew. Chem. Int. Ed., 2006, 45, 6462–6466，VIP论文）及具有异质结构的SiO2/Fe3O4磁性微球（Advanced Materials, in press）的制备与性质研究。 最近，该课题组在系统研究工作基础上，与国家纳米中心的唐智勇教授及北京交通大学光电子技术研究所联合报道了纳米尺寸的Cu2S-In2S3异质结构材料的制备与形貌控制机理研究（J. Am. Chem. Soc., 2008, 130, 13152-13161）。他们证明了导体硫化铜纳米颗粒可以催化硫化铟纳米晶体的生长，形成具有“半导体－半导体异质结构”的纳米材料，而类似的催化作用之前只在金属类纳米颗粒中被观察发现。他们的研究还表明在硫化铟纳米材料的形成过程中，由铜、铟前体化合物与反应介质十二硫醇的相互作用所导致的凝胶化现象可直接影响纳米材料的晶体生长动力学。据此，通过对凝胶化过程的控制，他们成功地实现了具有异质结构的火柴形及泪滴形的Cu2S-In2S3纳米材料以及铅笔形In2S3纳米材料的制备。 实际上，纳米材料的液相合成一般都离不开表面配体的参与，而表面配体分子发挥作用的前提是可以与纳米材料中的金属离子形成足够强的配位作用，以硫醇类的表面配体为例，大量的实验工作都证明它们可以同金属离子形成复杂的络合物（Angew. Chem. Int. Ed., 2006, 45, 6462–6466 Chem. Mater., 2004, 16, 3853- 3859），而在有机介质中，这种络合作用往往可以导致体系的凝胶化。因此，利用表面配体与金属离子的配位作用所导致的凝胶化对纳米材料的生长，及得到的纳米材料的结构与形貌进行控制具有重要的普适意义，而且必将成为纳米材料合成研究中一个值得关注的重要发展方向。

短波红外和中波红外波段是两个重要的大气窗口。在该波段范围内，碲化汞胶体量子点表现出良好的光响应。此外，胶体量子点具有易于液相加工制备以及与硅基工艺兼容等优势，因此有望显著降低红外光电探测器的成本。然而，目前胶体量子点红外光电探测器在比探测率、响应度等核心性能方面与传统块体半导体红外探测器相比仍存在一定差距。有效地调控掺杂和迁移率等输运性质是提升量子点红外光电探测器性能的关键。据麦姆斯咨询报道，近期，北京理工大学光电学院和北京理工大学长三角研究院的科研团队在《光学学报》期刊上发表了以“高载流子迁移率胶体量子点红外探测器”为主题的文章。该文章第一作者为薛晓梦，通讯作者为陈梦璐和郝群。在本项工作中，采用混相配体交换的方法将载流子迁移率提升，并且实现了N型、本征型、P型等多种掺杂类型的调控。在此基础之上，进一步研究了输运性质对探测器性能的影响。与光导型探测器相比，光伏型探测器不需要额外施加偏置电压，没有散粒噪声，拥有更高的理论灵敏度，因此是本项工作的研究重点。同时，使用高载流子迁移率的本征型碲化汞量子点薄膜制备了短波及中波红外光伏型光电探测器。实验过程材料的合成：Te前驱体的制备在氮气环境下，称量1.276 g（1 mmol）碲颗粒置于玻璃瓶中，并加入10 ml的三正辛基膦（TOP）中，均匀搅拌至溶解，得到透明浅黄色的溶液，即为TOP Te溶液。碲化汞胶体量子点的合成在氮气环境下，称量0.1088 g（0.4 mmol，氮气环境下储存）氯化汞粉末置于玻璃瓶中，并加入16 ml油胺（OAM），均匀搅拌并加热至氯化汞粉末全部溶解。本工作中合成短波红外和中波红外碲化汞胶体量子点的反应温度分别为65℃和95℃。使用移液枪取0.4 mL的TOP Te溶液，快速注入到溶于油胺的氯化汞溶液中，反应时间分别为4 min和6 min。反应结束后加入20 ml无水四氯乙烯（TCE）作为淬火溶液。碲化银纳米晶体颗粒的合成在氮气环境下，称量0.068 g（0.4 mmol）硝酸，并加入1 mL油酸（OA）和10 mL油胺（OAM）中，均匀搅拌30 min。溶解后，注入1 mL TOP，快速加热至160℃并持续30-45 min。然后向反应溶液中注入0.2 mL TOP Te（0.2 mmol），反应时间为10 min。碲化汞胶体量子点的混相配体交换混相配体交换过程包括液相配体交换和固相配体交换。选择溴化双十二烷基二甲基铵（DDAB）作为催化剂，将碲化汞胶体量子点溶在正己烷中，取4 ml混合溶液与160 μL β-巯基乙醇（β-ME）和8 mg DDAB在N,N-二甲基甲酰胺（DMF）中混合。之后向溶液中加入异丙醇（IPA）进行离心，倒掉上清液，将沉淀物重新溶解在60μL DMF中。固相配体交换是在制备量子点薄膜后，用1,2-乙二硫醇（EDT）、盐酸（HCL）和IPA（体积比为1:1:20）溶液对已成膜的碲化汞胶体量子点表面进行处理。碲化汞胶体量子点的掺杂调控在调控碲化汞胶体量子点的掺杂方面，Hg²⁺可以通过表面偶极子稳定量子点中的电子，所以选择汞盐（HgCl₂）来调控量子点的掺杂状态。在液相配体交换结束后，向溶于DMF的碲化汞胶体量子点溶液中加入10 mg HgCl₂得到本征型碲化汞胶体量子点，加入20 mg HgCl₂得到N型碲化汞胶体量子点。材料表征采用混相配体交换的方法不仅可以提高载流子迁移率还可以通过表面偶极子调控碲化汞胶体量子点的掺杂密度。液相配体交换前后中波红外碲化汞胶体量子点的TEM图像如图1（a）所示，可以看到，进行液相配体交换后的碲化汞胶体量子点之间的间距明显减小，排列更加紧密。致密的排列可以提高碲化汞胶体量子点对光的吸收率。混相配体交换后的短波红外和中波红外碲化汞胶体量子点的吸收光谱如图1（b）所示，从图1（b）可以看出，短波红外和中波红外碲化汞胶体量子点的吸收峰分别为5250 cm⁻¹和2700 cm⁻¹。利用场效应晶体管（FET）对碲化汞胶体量子点的迁移率和薄膜的掺杂状态进行测量，把碲化汞胶体量子点沉积在表面有一层薄的SiO₂作为绝缘层的Si基底上，基底两侧的金电极分别作为漏极和源极，Si作为栅极，器件结构如图1（c）所示。通过控制栅极的极性和电压大小，可以使场效应晶体管分别处于截止或导通状态。图1（d）是N型、本征型和P型中波红外碲化汞胶体量子点的场效应晶体管转移曲线。利用FET传输曲线的斜率计算了载流子的迁移率μFET。图1 （a）混相配体交换前后碲化汞胶体量子点的透射电镜图；（b）短波红外和中波红外碲化汞胶体量子点的吸收光谱；（c）碲化汞胶体量子点薄膜场效应晶体管测量原理图；（d）在300K时N型、本征型和P型中波红外碲化汞胶体量子点的场效应晶体管转移曲线测试结果。分析与讨论碲化汞胶体量子点光电探测器的制备光伏型探测器不需要施加额外的偏置电压，没有散粒噪声，理论上会具有更好的性能，借鉴之前文献中的报告，器件结构设计为Al₂O₃/ITO/HgTe/Ag₂Te/Au，制备方法如下：第一步，在蓝宝石基底上磁控溅射沉积50 nm ITO，ITO的功函数在4.5~4.7 eV之间。第二步，制备约470 nm的本征型碲化汞胶体量子点薄膜。第三步，取50 μL碲化银纳米晶体溶液以3000 r/min转速旋转30 s，然后用HgCl₂/MEOH（10 mmol/L）溶液静置10 s后以3000 r/min转速旋转30 s，重复上述步骤两次。在这里，Ag⁺作为P型掺杂层，与本征型碲化汞胶体量子点层形成P-I异质结。最后，将器件移至蒸发镀膜机中，在真空环境（5×10⁻⁴ Pa）下蒸镀50 nm Au作为顶层的电极。高迁移率光伏型探测器的结构图和横截面扫描电镜图如图2（a）所示。能级图如图2（b）所示。制备好的探测器的面积为0.2 mm × 0.2 mm。图2 （a）高迁移率碲化汞胶体量子点P-I异质结结构示意图及扫描电镜截面图 （b）碲化汞胶体量子点P-I异质结能带图。器件性能表征为了探究高载流子迁移率短波红外和中波红外光伏型探测器的光电特性，我们测试了器件的I-V曲线以及响应光谱。图3（a）和（b）分别是高迁移率短波红外和中波红外器件的I-V特性曲线，可以看到短波红外和中波红外探测器的开路电压分别为140 mV和80 mV，这表明PI结中形成了较强的内建电场。此外，在零偏置下，高迁移率短波红外和中波红外器件的光电流分别为0.27 μA和5.5 μA。图3（d）和（e）分别为1.9 μm（300 K） ~ 2.03 μm（80 K）的短波红外器件的响应光谱和3.5 μm（300 K） ~ 4.2 μm（80 K）的中波红外器件的响应光谱。比探测率D*和响应度R是表征光电探测器性能的重要参数。R是探测器的响应度，用来描述器件光电转换能力的物理量，即输出信号光电流与输入光信号功率之比。图3 （a）300 K时短波红外I-V曲线；（b）80 K时中波红外I-V曲线；（c）短波红外及中波红外器件的比探测率随温度的变化；（d）短波红外器件在80 K和300 K时的光谱响应；（e）中波红外器件在80 K和300 K时的光谱响应；（f）短波红外和中波红外器件的响应度随温度的变化。图3（e）和（f）给出了探测器的比探测率D*和响应度R随温度的变化。可以看到，短波红外器件在所有被测温度下，D*都可以达到1×10¹¹ Jones以上，中波红外器件在110 K下的D*达到了1.2×10¹¹ Jones。应用此外，本工作验证高载流子迁移率的短波红外和中波红外量子点光电探测器在实际应用，如光谱仪和红外相机。光谱仪实验装置示意图如图4（a）所示，其内部主要是一个迈克尔逊干涉仪。图4（b）和（c）为使用短波红外和中波红外量子点器件探测时有样品和没有样品的光谱响应结果。图4（e）和图4（f）为样品在短波红外和中波红外波段的透过率曲线。对于短波红外波段，选择了CBZ、DDT、BA和TCE这四种样品，它们在可见光下都是透明的，肉眼无法进行区分，但在短波红外的光谱响应和透过率不同。对于中波红外波段，选择了PP和PVC这两个样品。在可见光下它们都是白色的塑料，但在中波红外光谱响应和透过率不同。图4（d）为自制短波红外和中波红外单点相机的扫描成像。，短波相机成像可以给出材质信息。中波红外相机成像则是反应热信息。以烙铁的中波红外成像为例，我们可以清楚地了解烙铁内部的温度分布。在可见光下，硅片呈现不透明的状态使用自制的短波红外相机成像后硅片呈现半透明的状态。图4 （a）利用高载流子迁移率探测器进行响应光谱测量的原理示意图；（b）和（c）分别是在有样品和没有样品两种模式下用自制探测器所探测到的光谱响应；（d）自制短波红外和中波红外光电探测器的单像素扫描成像结果图；（e）TCE、BA、DDT和CBZ在短波红外模式下的透光率，插图为四种样品的可见光图像；（f）PVC和PP在中波红外模式下的透光率，插图为两种样品的可见光图像。结论综上所述，采用混相配体交换的方法，将量子点薄膜中的载流子迁移率提升到了1 cm²/Vs，相较于之前的研究提升了2个量级。并且通过加入汞盐实现了对量子点薄膜的掺杂调控，分别实现了P型、本征型以及N型多种类型的量子点薄膜。同时，基于本征型高迁移率量子点制备了短波红外和中波红外波段的光伏型光电探测器。测试结果表明，提升量子点的输运性质，有效的提升了探测器的响应率、比探测率等核心性能，并且实现了光谱仪和红外相机等应用。本项工作促进了低成本、高性能量子点红外光电探测器的发展。这项研究获得国家自然科学基金（NSFC No.U22A2081、No.62105022）、中国科学技术协会青年托举工程（No.YESS20210142）和北京市科技新星计划（No.Z211100002121069）的资助和支持。论文链接：https://link.cnki.net/urlid/31. 1 252.o4.20230925.0923.016