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  • 【我与近红外的故事】曾仲大:近红外数据分析之路
    p  span style="font-family: 楷体,楷体_GB2312,SimKai "strong随感:/strong“我与近红外的故事”征文近一年了,看过许多老师情真意切的表达,真是把乐趣融入到了近红外的研究与应用之中,也更加深切地感受到同行们对国内近红外发展的使命感和责任感。而自己与近红外的故事,几次动笔却都没能写下几个字。时间肯定不是借口,惰性真是害人啊。好在拖到春节,总算能静下心来了。就像与近红外的相遇相知,既是机缘巧合,更是某种必然吧。/span/pp  初识近红外,都是博士毕业一年以后的事了。那时已经在香港理工大学周福添教授课题组从事博士后研究一年多了,主要方向还是老本行-化学计量学基础算法研究,解决中药和代谢组学等复杂体系分析中的数据处理问题,从GC-MS,LC-MS到中药指纹与药物活性关系。一次Daniel MOK博士找到我,询问是否有意愿到陈新滋院士课题组从事中药质量分析与鉴别方面的工作,陈院士那时是理大副校长(后任香港浸会大学校长,现受聘中山大学教授、学委会主任),研究组的条件与学术水准自不必说,就这样幸运地开始了近二年的近红外数据分析之旅。/pp  对香港熟悉的朋友一定对其大街小巷的名贵中药材印象深刻,尤其是弥墩道,应该是内地赴港旅游人士的必经之地吧,一是去旺角购买电子产品的旅游大巴必定经过这里,另一方面则是这条大道两旁大大小小的中药材店。记得第一次见到时,很是疑惑哪来的那么多冬虫夏草、燕窝和野生人参?说回到陈院士负责的这个研究课题,由香港赛马会中药研究院提供500万研究经费,对包括上述中药,以及石斛、灵芝、阿胶等在内的30味名贵中药材进行质量鉴别分析和研究,目的是帮助那些大街小巷的药材经销店铺,中间批发商,甚至普通消费者,以快速、经济、简便的方法识别药材真假,甚至质量等级。这些药材大多价格不菲,若能够有效识别真假,其商用价值可想而知!顺便一提,香港赛马会中药研究院很多年前已经解散,个中原因无法深究,但在目前国家大力践行中医药研究开发与应用的今天,这也算是一件憾事吧,包括设想中的香港国际中医药中心。/pp  说到这里,近红外分析可以派上用场了!无论是十年前,还是十年后的今天,应没有什么分析技术比近红外更适合完成这项使命,综合考虑时间效率、分析成本,亦或是平衡多重因素影响下定性定量分析结果的准确性!记得当时我们使用的是FOSS公司的XDS快速含量分析仪(Type XM 1100 Series),以及Polychromix手持式近红外分析仪(Model: 1600-2400)。由于项目定位于实际应用,需要适应不同场合下的快速分析,对数据分析本身的要求同样也是比较高的,比如涉及模型传递,尽可能简化数据分析的过程及对使用者的要求,亦确保结果的准确可靠性。基于此编写了功能完备的近红外数据分析软件系统,一站式地完成近红外数据分析的完整流程,从各种各样的预处理方法到特征选择,再到定性定量模型的构建、评价与验证预测,以及模型传递等。/pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201706/insimg/137c0a6d-7548-46ef-beea-f984cce33ba7.jpg" title="2_副本.jpg"//pp style="text-align: center "中药质量分析与鉴别项目中用到的近红外分析仪 (图1和图2)。/pp  说实在的,那时对化学计量学的多元校正方法并不是特别熟悉,我的整个硕士和博士研究,都是多元分辨方向,也就是如何从中药和烟草等复杂体系分析的联用仪器数据中,发展“数学分离”的方法,获取化学纯组分的定性定量信息,即纯组分的光谱和色谱信息。幸运的是,得益于在梁逸曾教授研究组六年时间里耳濡目染的学习,比如许青松教授对统计分析的讲解,杜一平教授的QSAR研究等等,使得我无论对复杂数据的理解,还是化学计量学方法的应用与发展,都有足够基础支持我去解决近红外数据分析中遇到的各种问题。在香港的几年时间里,梁教授每年也都会利用假期去香港一段时间,与香港同行合作交流化学计量学及其应用方面的成果,更是继续指导我解决研究中遇到的实际难题。每每想到这些,总会浮现与恩师相处过程中的点点滴滴。至于上面提到的中药质量分析研究项目,我们对包括阿胶、珍珠、川贝母、藏红花、黄连在内的多味中药进行了深入分析研究,获得了非常不错的结果,陈院士对此也给予了很高的评价。很清楚地记得因此第一次上了电视新闻,是香港亚洲卫视针对我们使用近红外分析技术,如何快速识别真假中药,及其质量等级的采访报道。当然,这些研究很多也是和理工大学的同事,以及杨大坚教授(现任重庆市中药研究院院长)、董玮玮博士等一起完成的,我主要负责数据分析,以及数据软件产品开发与实现方面的工作。/pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201706/insimg/ac0a45a1-23c7-43bf-8467-f0cb1a6ccb8d.jpg" title="3_副本.jpg"//pp style="text-align: center "中药质量分析与鉴别项目交流会 (图3),及与日本Yukihiro Ozaki教授交流(图4)。/pp  离开香港后,很长一段时间内都没有与近红外分析有直接的关联。先是在Philip Marriott 教授课题组做research fellow,从事全二维色谱数据分析方面的工作,主要方向是全二维分离的模拟、预测,以及化学计量学新方法的发展。2012年回国后则作为引进人才,在中科院大连化物所许国旺教授研究组,从事代谢组学数据分析与高分辨LC-MSn数据处理新算法的研究等。看似这些工作与近红外分析不怎么挨着边,但老实说,同其他研究一样,数据分析也是一通百通的事!数据来源与数据结构可能不一样,数据背景与数据分析结果,以及数据处理方法亦可能存在差别,但数据分析的本质却是高度一致的,无论是色谱分离的模拟,亦或是代谢小分子标志物的发现!从这个意义上来说,也算是一直在这个圈子吧。/pp  近红外技术的发展,面临非常多的机会,无论从国内快检还是工业智能化的需要来看,还是从国外近红外发展的轨迹来看。然而近红外分析更广阔的应用,仍有一系列需要解决的难题,这其中当然包括仪器硬件的小型化、便携式,以及智能化与场景化。但从数据及数据分析的角度来说,快速、准确的模型构建,模型的通用性、更新及转换等仍是需要加以研究的内容。基于此,离开化物所后创办的大连达硕信息技术有限公司,第一个数据产品“魔力”,便专注近红外数据的分析,这也算是真正走在了近红外技术与数据分析的商业应用之路上。希望能够以智慧化、便捷化的方式,分析挖掘科学研究与工业应用中的海量数据。无论对于近红外分析的初入者,还是有了相当经验的人员,一旦采集到数据,便能快速得到好用的模型及结果,这也是目前非常欠缺的,主要原因就在于近红外数据分析的过程长,可变因素多,涉及的算法也很多,传统上要快速得到一个好用的模型并不容易。尽管大多数研究者并没有把数据分析提升到特别核心的位置,但其价值显而易见,甚至在某些方面可与硬件本身相得益彰,弥补硬件的物理劣势!/pp  另一方面,近红外分析以其简单方便的前处理,加上非常快速的数据采集方式,使得数据的获取,甚至大数据的积累顺理成章。然而即使对同一组数据,不同的研究者亦极有可能得到完全不同,甚至相反的分析结果或结论,即使在固定分析方法的情况下!这是一个容易被忽视,却又至关重要的问题,否则不管如何将近红外分析的硬件评价,以及实验测试全过程标准化,也无法得到可相互比较的结果。数据“横看成岭侧成峰”的魅力,不应是由于数据分析方法或人员的不同导致,而是数据背景的属性差异或者数据分析目的的不同产生。基于此,我们也正采用近红外数据分析的通用准则,使用粒子群等最优化的方法,开发全新的近红外数据分析软件产品,自动优选数据分析算法,以及方法的使用顺序,并全局优化方法的参数。这样我们获得数据后,只需按照标准化的流程一步一步走,便可获得最优的数据分析模型与模型结果。从而使得近红外数据的分析,如同实验分析一样,结果的重现性与可比性也就不再是个问题。避免像现在这样,往往是漫无目的的数据探索,耗费漫长时间也不一定能得到合适好用的模型!这无论在研究中,还是在工业生产中,都是需要花大力气迎接的挑战。在这一过程中,得到了袁洪福教授、吴海龙教授、邵学广教授、杜一平教授、褚小立教授、闵顺耕教授等诸多老师的大力支持与帮助。从老师们关切的眼神中,能读懂那份殷殷之情,也唯有努力做点事情,为国内近红外的发展做些有益的工作,方不负此情。/pp  近红外分析能做的事情很多,近红外数据分析如是,尤其站在移动互联时代,站在大数据分析挖掘的视角与高度。近红外有其自身特有的巨大优势-本身就是物联网中的一个绝佳传感器!从这个意义上来说,近红外分析代表着某种未来,只是通往未来的路上,还需要我辈站在前辈的肩膀上,不断付出智慧和汗水。/pp  “师者也,教之以事而喻诸德也。”,数据分析之路上,深深地烙上了梁逸曾教授的影响。亦师亦友者,感恩、深切缅怀您。/pp style="text-align: right "span style="font-family: 楷体,楷体_GB2312,SimKai "  2017年1月30日于浙江西湖/span/pp  strong个人简介/strong/pp/pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201706/insimg/e1424397-960a-4e21-a206-9245429e6328.jpg" title="1_副本.jpg"//pp  曾仲大,男,博士,现任大连达硕信息技术有限公司总经理。/pp  曾博士师承梁逸曾教授,2006年获得工学博士学位,主要从事化学计量学基础算法研究,以及色、质、光谱等分析技术在制药、烟草和代谢组学等复杂体系分析中的应用及其数据分析挖掘等。近年来在大数据的分析与应用方面亦有涉猎。/pp  曾博士先后工作于香港理工大学、澳洲RMIT大学、Monash大学,以及中国科学院大连化学物理研究所。迄今已发表SCI论文40余篇,在2013-2016近三年时间里,以第一作者或合作者在美国分析化学杂志发表7篇研究论文,同时获邀为TrAC等权威期刊撰写化学计量学及化学数据分析处理方面的综述。/pp  曾博士曾获得中国科学院大连化学物理研究所“所百人”引进人才计划,大连“海创工程”计划、高层次人才创新创业支持计划、新兴技术创新成长计划,以及国家人社部高层次海归人才创业计划的支持。公司主要提供复杂化学与生物数据分析服务,数据挖掘软件产品开发,以及个性化数据应用的整体解决方案。/pp  strong人生格言:/strong有志者,事竟成。/p
  • 超级站,如何运维和数据分析?
    面对日益严重的大气复合型污染问题,我国从2010 年开始着手开展灰霾监测超级站建设,截止到2015年已投入建设二十多个,并预计 “十三五”期间,超级站的数量可超100个。目前,“三区十群”超级站正逐渐从省级监测中心和省会城市向有条件的地级市延伸;科学研究正逐渐向区域立体监测业务网络拓展。随着各地区超级站建设能力的增强和超级站数量的急剧增加,一系列问题迎面而来。面对如此庞大数量的监测仪器,该如何运维,保证数据的准确性?对输出的数据结果,该如何进行有效数据分析,及时、准确、全面地反映环境质量及发展趋势?  中科光电作为大气超级站的整体供应商及运维服务商,能为客户定制一系列完备的运维和数据分析方案,将高质量地保证超级站正常业务运行,确保监测数据有效输出,实现数据价值最大化。超级站运营维护服务  超级站运维现状  我国环境监测体系人员队伍建设不足,无力进行相关的研究及设备监管工作,使得投入无产出,资源大量无端浪费。同时多样化的环境指标所带来的环境监测设备品牌多、商家多、服务水平参差不一、管理人员联系困难、费用管理困难等问题日益突出。  超级站运维需求  理想的超级站运营维护服务应通过专业化、标准化的服务理念及流程,对超级站进行唯一的服务接口、统一的质量要求、统一的维护资料、长期稳定可靠的服务管理,为各有需求单位提供定制化的服务,保证环境监测数据的真实可靠。  超级站运维管理流程  超级站运维内容  总的来说,超级站运维包括常规维护和重点专项维护,每一项维护内容包括:  系统宏观检查  日常巡检  站房系统维护  采样专项维护  设备专项维护  预防性检修  针对性检修超级站数据分析服务  超级站数据分析服务现状  我国全指标、多样化的环境空气监测工作起步较晚,监测数据开发利用不足。一般情况下,监测部门只是将监测结果上报管理部门,而忽视了监测数据的加工整理和开发利用,从而缺少针对性强的监测数据分析,造成环境管理部门真正需要的信息少,对区域环境质量的变化解释不清,找不出存在的主要环境问题。  超级站数据分析服务需求  高质量的环境监测数据分析工作应具备以下方面:  一)说清现状。通过综合分析数据如实反映环境质量现状和污染来源的真实情况。  二)深度分析。最大限度的发挥各种监测数据的应用价值,集结有效数据,说清污染特征、污染来源及污染变化趋势,为环境污染的预警预测提供有效的数据支撑。  三)突出特色。对汇总数据进行特色加工形成监测报告,让管理机关等不同层面的人得到其想要的结果。  四)提出建议。站在全局的角度去思考,找出存在的问题,分析问题的形成原因,从开展环境管理和发展区域经济的影响因素方面分析原因,针对存在的问题提出相应的合理可行的建议。只有做到以上几点才能实现环境监测的根本目的。  超级站数据分析服务流程   自成立以来,中科光电以专业化、标准化的环境咨询服务队伍,为各有关部门提供定制化的第三方运营维护服务及综合数据分析服务,保障超级站数据准确输出,基于准确数据,说清区域污染过程、污染特征、污染来源及污染趋势,立志成为中国最权威的超级站运营维护团队和环境质量数据咨询服务团队。
  • 还不会使用远程数据分析系统?进来看
    随着云计算和远程工作的普及,远程数据分析系统成为了许多企业和组织进行数据分析的工具。这种系统可以让用户在任何地点通过互联网连接到远程服务器,使用强大的计算能力和数据处理功能进行数据分析。下面是一个关于远程数据分析系统使用方法的简要介绍。   1、获取访问权限。通常,用户需要向系统管理员或相关部门申请账号和访问权限。一旦获得了访问权限,用户就可以通过远程登录方式连接到远程服务器。   2、了解系统的基本操作和功能。远程数据分析系统通常提供了一系列工具和功能,用于数据导入、清洗、转换、分析和可视化。用户可以通过学习系统的文档、教程或参加培训来熟悉系统的操作方法。   3、在开始进行数据分析之前,用户需要准备好要分析的数据。这可能涉及到从本地计算机或其他数据源导入数据到远程服务器中。该系统通常支持多种数据格式,如CSV、Excel、数据库等。用户可以使用系统提供的导入工具或编写脚本来导入数据。   4、一旦数据导入完成,用户就可以开始进行数据分析了。它通常提供了丰富的分析工具和函数库,包括统计分析、机器学习、数据挖掘等。用户可以根据自己的需求选择合适的工具和方法进行数据分析。同时,系统也通常提供了交互式的编程环境,如Python、R等,使用户可以编写自定义的分析代码。   5、在进行数据分析过程中,用户还可以使用系统提供的可视化工具来展示和呈现分析结果。这些可视化工具可以帮助用户更好地理解数据和分析结果,并与他人分享分析成果。   6、用户需要保存和分享分析结果。本系统通常支持将分析结果导出为各种格式,如图像、报告、数据文件等。用户可以选择合适的导出方式,并将结果保存到本地计算机或其他存储设备中。此外,用户还可以通过系统内部的分享功能或其他协作工具与团队成员共享分析结果。   总结起来,远程数据分析系统是一种强大的工具,可以帮助用户在任何地点进行高效的数据分析。通过获取访问权限、了解系统操作、准备数据、选择合适的分析工具、展示和分享结果,用户可以充分利用它进行数据分析工作,并取得良好的分析成果。
  • 药物热分析讲座 第四部分:全自动软件流程 – 热分析数据分析的有力助手
    药物热分析讲座第四部分:全自动软件流程 – 热分析数据分析的有力助手率耐驰热分析学苑 No.16课程描述分析仪器的应用过程中,软件的作用越来越重要。对于分析软件,基本的要求是直观、操作简便、分析结果可靠。在热分析行业,耐驰公司提供的AutoEvaluation 和Identify毫无疑问是里程碑式的软件工具。它们提供的自动分析、自动识别和检索功能是业界绝无仅有的。对于DSC和TGA用户来说,这些工具不但节省时间,而且极大地减少了人为因素的干扰,使分析结果更为可靠。AutoEvaluation是业界第一个自动分析软件。它可以自动检测并分析热效应,无需人工干涉。例如可以使用此功能分析包含多个吸热、放热峰的DSC曲线。Identify是一个图谱检索和数据库系统。使用者通过几次鼠标点击就可以完成数据库检索。目前系统标配的数据库中包含了1200多条参考曲线,其中也包括了药物和有机物的数据。而且,Identify也可用于质量控制。本次课程将介绍如何使用这些软件工具,或者说NETZSCH的软件系统如何能帮助使用者提高日常测量的效率及可靠性。课程安排时间 2018年12月13日,星期四,10:00-11:00 上午,北京时间授课语言 中文设备软件 台式机、笔记本:在初次点击链接进入会议室时,链接会自动引导安装Go to Webinar软 件,并加入会议; 手机、平板电脑:需事先下载安装Go to Webinar客户端软件,后输入会议ID加入。
  • 达硕信息推出多款数据分析软件产品
    大连达硕信息技术有限公司(以下简称“达硕信息”)专注企业级数据的分析整合、深度挖掘与商业智能,掌握数据核心技术,提供专业化的数据处理软件产品,个性化的数据整体解决方案,以及平台级的数据整合服务。公司目前推出多款数据分析软件产品,欢迎试用。魔力TM复杂多变量数据智慧化处理软件系统 (ChemDataSolution)科学仪器数据因其高维、高通量与高复杂度的特征,价值密度大,但分析处理的困难度亦很高。食品快检与安全监测、工业过程分析与生物组学研究等众多领域所面临的在线与动态、快速与实时,以及模型共享与大数据分析等诸多问题,对智慧型数据挖掘与深度价值利用提出了现实的需求。与传统的多变量数据分析产品或仪器自带的软件相比,ChemDataSolution系统在复杂情形下的文件夹数据批载入、智能算法流、一键数据处理与多模型分析、同时模型构建、验证与预测、多线程与并行计算以及用户体验等各个方面具有开创性,是分析处理色谱和质谱,尤其是近红外等光谱数据的强大工具。主界面截图 (ChemDataSolution)该系统具有如下的特色与优势: 1、数据分析算法流算法流是指构造包含不同数据处理方法的数据整合与优化流程,设置算法参数,在实际的数据分析处理中,仅需往算法流中添加待分析数据即可获得最终结果,完整保留中间计算结果以备查验,实现更快速便捷,准确智能的分析模式。 2、一键处理与多模型处理因算法流思想可实现数据处理方法的逐级串联与优化整合,将训练集、验证集或预测集同时添加到算法流中,达到一键处理即获得所有分析结果的目的。 3、同步建模、验证与预测在算法流的使用中,用户可分别添加建模、验证与预测数据,系统先构造模型,然后再将验证与预测数据进行相同的预处理或特征选择操作,基于已构建的模型获得计算结果,同样可极大减少用户的操作步骤。 4、智能数据批载入与数据库数据载入是数据分析的基础,实现复杂情形下的数据批载入是实现智慧型数据分析的前提。通过研究不同类型数据结构,尤其是数据自动载入时可能遇到的各种情形,提出数据智能载入的整体解决方案,如数据类型与长度、数据与字符、数据分隔符、化学坐标处理、数据头文件、数据排列方式、数据载入后是否放入已经存在的数据文件中,以及多个数据文件的上述处理方式是否存在差别等。 5、用户体验ChemDataSolution实现了非常人性化的用户体验与功能,比如基于XML技术的参数预设值、保存与调用,用户偏好设置,自定义报表,特别是基于导航栏文件式的数据、图形、算法流与模型结果管理等。 代谢组学小分子化合物快速鉴定软件系统该系统由达硕信息与中国科学院大连化学物理研究所共同开发完成,是未知代谢物定性分析的不二选择。系统融合多级质谱的精确质量数与保留时间信息,实现未知代谢物的多层次鉴定分析。系统主要具有如下功能与特色: 1、完备的代谢标准化合物数据库系统以SOP的方法,在正、负二个电离模式,以及三个不同检测电压下,采用先进的AB SCIEX 5600+仪器,构建2,000个不同代谢物的LC-MSn数据库,同时包含高分辨精确一级和二级质谱,以及保留时间的信息。这也是系统的核心优势之一。 2、定性经验的传递基于LC-MSn分析的化合物鉴定,经验性极强,初学者或者研究生需要花费很大的时间与精力才能基本掌握;而且学生一旦毕业,其定性结果与经验又无法为实验室继续利用,导致学生循环往复,研究组的积累却很是有限。系统通过不同成员构建灵活的扩展库数据库、未知物数据库,本地与局域网互联互通,以及强大的数据库功能,达到这样的目标:“研究生毕业不要紧、定性知识留下来”,“新进实验室不要紧,站在师兄师姐的肩膀上”。 3、多层次定性分析除上述自建标准化合物数据外,系统集成HMDB、Metlin、LIPID MAPS以及MMCD网络数据库,用户可在系统直接批量搜索这些数据库,实现与自建数据库分析结果的比较、融合与定性结果相互补充、扩展。在此基础上,用户可实现自建标准化合物数据库、网络数据库、扩展数据库,以及未知物数据库的综合定性分析,并可在不同数据库所得到的结果间相互比较分析,以获得最可靠的鉴定结果。此外,系统通过先进的样本间数据校正、定性匹配算法、原始数据批载入,批量定性分析,快速丰富查询(如中性丢失等),以及优越的用户体验等功能,实现代谢小分子化合物的快速鉴定。主界面截图 (代谢小分子化合物快速鉴定软件系统)
  • 麦克推出交互式数据分析软件MicroActive
    MicroActive-美国麦克仪器创新交互式数据分析软件 麦克仪器公司创新的MicroActive数据分析软件,允许用户以交互方式评介由麦克仪器公司的ASAP 、TriStar和Gemini气体吸附仪获得的等温线数据. 可直接处理吸附数据,用户可以方便地获得或排除数据,满足实验获得数据点的范围的需要。交互式数据处理,最大限度地减少指定计算参数使用对话框以及打开对话框需要的通道,用户可准确、高效地确定其材料的表面积和孔隙度。通过简单的移动计算条,可立即更新成新的图表。一键式访问重要参数,使用户能够专注于结果,而不是参数。不需要生成报告查看结果-界面显示交互式图表。 屏幕布局设计提供了一个用户友好的界面。可迅速在用户选择的实验数据界面和传统的高级或者基本界面转换。等温线可用线性刻度或者对数刻度显示,可用于任何计算模型。软件包含很多气体吸附模型-所有模型均使用等温线数据。数据报告包含等温线、BET比表面积、Langmuir比表面积、t-plot、BJH吸附和脱附曲线、Horvath-Kawazoe、DFT孔径和Dubinin。如有需求,请拨打400-630-2202或者登陆我们的网站:www.micromeritics.com.cn更多详细资料请登陆:http://www.micromeritics.com/Product-Showcase/MicroActive-Interactive-Data-Analysis-Software.aspx公司简介: 美国麦克仪器公司是世界上第一家将自动表面积分析仪、压汞仪以及沉降式粒度分析仪投放市场的公司。公司主营产品为研究级全自动比表面积与孔隙度分析仪、多站比表面积与孔隙度分析仪、快速比表面积与孔隙度分析仪、流动气体法比表面分析仪、程序升温化学吸附仪、化学吸附仪、压汞仪、高压吸附气体吸附仪、蒸汽吸附仪、密度测量、颗粒技术和颗粒形态分析仪等各种材料表征仪器。
  • 新型分析软件不断出现 让组学的数据分析不再抓狂
    与其他的组学学科相似,代谢组学的数据收集是个问题,但肯定不是研究人员面对的最大问题。大多数人都同意,更大的问题是弄清楚代谢组学数据集到底意味着什么。幸运的是,不断出现的分析工具正在帮助打破这个瓶颈。  研究人员逐渐懂得,如果你真的想要了解细胞行为,你需要研究代谢物。基因编码蛋白质,而蛋白质作用于小分子。这些分子的存在和丰度,被统称为代谢组(metabolome),反映和影响了健康、营养、免疫系统等。  与其他的组学学科相似,代谢组学的数据收集是个问题,但肯定不是研究人员面对的最大问题。大多数人都同意,更大的问题是弄清楚代谢组学数据集到底意味着什么。&ldquo 数据分析仍是个巨大的瓶颈,&rdquo 赛默飞世尔代谢组学的市场部经理Yingying Huang说。  幸运的是,不断出现的分析工具正在帮助打破这个瓶颈。  光谱图库  代谢组学的数据分析主要分为两个部分:峰值检出(peak picking)和峰值鉴定(peak identification)。峰值检出是利用代表不同条件(如健康和患病)的多个数据库进行筛选的过程,并鉴定出它们之间不同的光谱特征。在这些峰被发现之后,它们所代表的化合物必须被鉴定。  多个软件包可处理第一个问题,包括商业化工具(如安捷伦的MassHunter Profinder,布鲁克的ProfileAnalysis,赛默飞世尔的SIEVE&trade 和Waters的Progenesis QI)以及免费工具(MZmine和XCMS Online)。而一些图库正在开发或已被开发出,以解决第二个问题。  斯克里普斯研究所(Scripps Research Institute)代谢组学和质谱中心的主任Gary Siuzdak谈到,他的METLIN数据库目前列出了240,000种化合物,其中11,600种有MS/MS光谱数据。而人类代谢组数据库(HMDB)有近42,000种化合物,其中1,164种有MS和MS/MS数据。此外还有其他选择,包括ChemSpider和MassBank。  当然,我们不可能收集每个代谢产物的实验数据,加州大学戴维斯分校的Oliver Fiehn认为。目前有太多的代谢产物,而并非全部都有纯化形式作为标准品。&ldquo 在某些时候,你必须预测MS/MS图谱会怎么样,&rdquo 他说。  Fiehn解决这个问题的工具是LipidBlast,它包含200,000个预测的脂类光谱。&ldquo 这很难[做到],&rdquo Fiehn承认,因为与肽段不同,代谢物有各种形状、形式和大小。有了LipidBlast,用户能够将它们未知的图谱与图库进行比较,看看是否有hit,就像DNA研究人员利用BLAST将基因序列与GenBank比较。赛默飞世尔也有个类似的工具,叫LipidSearch&trade 。  阿尔伯塔大学(University of Alberta)的化学教授Liang Li最近推出了一个类似的项目,MyCompoundID.org,以扩展HMDB的用途。MyCompoundID的建立是从HMDB中抽取8,000种代谢物,并计算它们的质量以及经历76种可能的生物转化(如磷酸化、甲基化或D-核糖基化)后的预测光谱特征。这些结果将帮助研究人员缩小未知光谱特征的可能身份。  SWATH采集  代谢组学研究可能是靶向,也可能是非靶向的。对于前者,研究人员设定他们的仪器(通常是三重四级杆质谱仪)来扫描特定的代谢物。而对于后者,仪器扫描特定质量范围内的一切,但只收集高丰度离子的MS/MS碎片数据。  这种所谓的数据依赖的流程是为方便起见而设计的。不过Fiehn认为,它不尽如人意,有时研究人员发现样品之间的特定离子变化明显,但没有被碎裂,因为它是低丰度的。  最近,苏黎世联邦理工学院的Ruedi Aebersold介绍了这个问题的解决方案1,它已被AB SCIEX商业化。这种被称为SWATH&trade MS的策略避开了数据依赖处理,而支持数据非依赖的处理,即所有进入质谱仪的离子都被碎裂和分析。它逐步分析用户定义的分离窗口,重复,并通过计算整理出产生的碎片,从而覆盖很宽的质量范围。  2013年,华盛顿大学的化学家Gary Patti利用安捷伦的6520 Q-TOF质谱仪和定制的R package,在代谢物上应用了一种类似的方法2。据AB SCIEX的高级营销经理Fadi Abdi介绍,AB SCIEX如今正将SWATH技术应用在蛋白质组学上。  用户在TripleTOF质谱仪上收集高速的光谱数据,并利用MS/MS光谱图库来解释它,这与蛋白质组学的方法相似。&ldquo 在数据依赖的分析中,如果您没有触发您的分子,则无法识别它,&rdquo Abdi谈道。&ldquo SWATH允许您收集样品中所有可检测种类的数据,带来更为全面的定量覆盖。&rdquo   通路分析  在研究人员鉴定出有趣的代谢物后,他们需要找出它们在生物系统中的作用。这时就需要通路分析的工具。通路分析让研究人员能够将代谢物定位到已知的生化通路上,为可能的遗传角色及其他代谢物提供线索。  Fiehn的实验室写了一个通路分析的工具,名为MetaMapp,而大部分商业化的代谢组学数据分析包也包含通路分析。赛默飞世尔的SIEVE数据分析包中就有这样的模块,它关联到KEGG通路数据库,而Bruker Daltonics也即将推出它的Compass PathwayScreener工具。  不过,Metabolon(北卡罗来纳州的一家代谢组学服务供应商)的首席科学家Mike Milburn认为,仅仅将代谢物定位到已知的通路商,还不足以看清整幅图像。Metabolon已经完成了约3000项代谢组学研究,每年开展600-700项,半数是科研客户。这些经验使得他们能够看到其他研究人员难以获得的代谢鸟瞰图。  对许多研究人员而言,开始代谢组学流程所需的技能、专长和费用使得外包给Metabolon这样的公司更为常见。但是那些愿意自己承担重任的研究人员也会发现,他们并不缺少计算上的工具。  无论采用哪种方式,Bruker Daltonics代谢组学的市场部经理Aiko Barsch说,&ldquo 我会鼓励新客户进入代谢组学,因为那儿包含了那么多的信息。有那么多新东西有待发现。&rdquo
  • 聚光科技数据分析平台重拳出击大气光化学污染
    夏季将至,又到了一年中臭氧污染的高发季。根据监测数据显示,2019年5月期间,全国367个监测臭氧的城市中超过半数城市均出现八小时滑动平均浓度超标,O?已成为影响空气质量达标的重要指标。2019年5月全国臭氧监测城市8小时滑动平均浓度超标情况(数据来自真气网)  夏季强辐射有助于O?生成,而O?是光化学烟雾(污染)的核心污染物。当光化学烟雾发生时,大气呈淡蓝色,可降低大气能见度,具有强氧化性,会刺激人的眼睛和呼吸道。光化学污染来袭,O?成为限制优良天数的重要指标。  大气光化学污染的生成给大气环境质量提升带来更多挑战,如何科学防治大气光化学污染,往往面临以下痛点:污染现状不明… … 污染特征?变化规律?污染成因不明… … 本地生成?区域传输?臭氧生成控制区?管控无措… … VOCs优控组份?重点行业?重点企业?如何评估减排效果?  针对国内光化学污染防控项目需求,聚光科技依据我国《环境空气臭氧污染来源解析技术指南(试行)》,结合专业分析工具和先进计算模型,推出光化学数据分析平台,重拳出击大气光化学污染。聚光科技光化学数据分析平台  该数据分析平台处于国内领先水平,核心模块与国内顶级科研团队合作开发,算法准确权威。目前拥有30多项功能,能满足客户最迫切的分析需求。重拳出击大气光化学污染提升“气质”妥妥的重拳第一式 全面监测,摸清现状  系统集成区域环境中各光化学污染因子浓度,结合气象条件分析重点时段污染状况,摸清臭氧污染现状。  通过获得O?本地生成与区域传输贡献占比,量化O?本地及传输贡献占比。监测因子时间序列图传输贡献重拳第二式 控制区判定,最优削减方案制定  聚光科技通过与北京大学专业团队合作,将观测到的O?及其前体物浓度、气象参数和其他光化学参数等输入基于观测的模型,绘制EKMA曲线,通过帮助客户判断本地O?生成过程为VOCs控制还是NOx控制,来制定高效减排策略。经验动力学模拟方法(EKMA曲线)重拳第三式 OFP排名,识别重点管控物种  通过臭氧生成潜势(OFP)表征不同VOCs组分生成O?的潜能,通过OFP排名,识别需要重点管控的VOCs物种。臭氧生成潜势(OFP)排名潜势VOCs组分OFP占比重拳第四式 追因溯源,制定管控方案  基于受体模型和VOCs源示踪物,定量解析对VOCs贡献的主要源类。解决客户管控无措或管控无着力点的困境,为客户提供清晰明了的O?及其前体物管控建议。VOCs源类浓度和占比变化时间序列图VOCs来源解析终极拳 效果评估—管控策略的有效性  通过阶段性总结,评估管控措施实施后O?污染改善效果,帮助客户提出管控行动方案调整建议,进而实现更高效的管控。  聚光科技大气光化学数据分析平台实际应用效果显著,具备丰富的项目经验和应用案例。截至目前,该平台已为浙江、海南、四川和上海等多地提供数据分析服务。
  • BIOTREE 第一届2016组学数据分析美图秀
    p  /pp style="text-align: center "img title="大.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201612/insimg/6cc189f5-ba74-4d01-b40a-5e5b7b07d18d.jpg"//pp  无论是基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学或是脂质组学,组学的数据收集是科研人员面临的一个问题,但肯定不是最大问题。大多数人都同意,更大的问题是弄清楚组学数据集到底意味着什么。一年辛苦耕耘,在此2016年末之际,尽管组学数据分析仍存在巨大的瓶颈,但正所谓“高手在民间”,BIOTREE特此举办“span style="color: rgb(255, 0, 0) "strong第一届2016组学数据分析美图秀/strong/span”的活动,望各位生物达人热烈参与,相互切磋,共同进步!/pp  What' s Your New图?不要默默发光,快快加入秀出来!/pp  strong活动对象:/strong组学科研人员(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、脂质组学等)。限80名,注:为保证活动公平性,所有组学服务商业机构不得参加!/pp  strong作品要求:/strong不管您是用什么软件做出的组学数据分析图形,只要您觉得美,都可以提供给我们进行参赛,每人仅限提供1张参赛作品。作品范围不限,例如PCA / OPLS-DA / O2PLS得分图、载荷图、Permutation检验图,火山图,层次聚类热力图,GO分析图,代谢通路图,网络图等等。/pp  strong活动报名方法:/strong/pp  1、邮箱报名:a href="mailto:marketing@biotree.cn;zhangyanfang@biotree.cn"marketing@biotree.cnspan style="color: rgb(0, 0, 0) ";/spanzhangyanfang@biotree.cn/a/pp  2、BIOTREE微信公众号报名(请参考上图)/pp  3、电话报名:021-61531195/pp  strong报名提交内容:/strong/pp  A、报名者信息(姓名+单位+研究方向+联系电话+联系邮箱+邮寄地址)/pp  B、参赛作品简短介绍(研究意义,意境等,50字以内)/pp  C、1张参赛作品(矢量图或分辨率大于600dpi的图),主办方将压缩图片并加上水印(图作者和作品号)上传至投票平台/pp  D、请诚信参与本次活动,使用原创作品,禁止盗用他人图片/pp  E、后期将给参赛者提供作品集/pp  strong活动时间:/strong/pp  作品征集:2016年12月5日-12月31日/pp  作品评比(投票):2017年1月1日至1月16日(每人每天可投一票)/pp  投票截止日期:2017年1月16日24:00/pp  名单公布& 礼品发送:2017年1月17日-1月20日/pp  strong四大奖项:/strong/pp  BIOTREE将根据实际投票结果,评选出2016年度最佳New图,并赠予以下奖项 /pp  span style="color: rgb(255, 0, 0) "strong一等奖:/strong/spaniPhone 7(1名)/pp  span style="color: rgb(255, 0, 0) "strong二等奖:/strong/spaniPad Mini 4(1名)/pp  strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "三等奖/span/strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "span style="color: rgb(0, 0, 0) "(/span/spanTop 10):BIOTREE 2000元以内的培训班(2017年培训班)任选一个,可转赠(10名)/pp  strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "参与奖/span/strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "span style="color: rgb(0, 0, 0) "(/span/spanTop 20):BIOTREE定制U型枕 (前20名报名参赛者)/pp  获奖名单将于2017年1月17日于BIOTREE微信公众号公布;请获该奖项人员主动联系告知地址,方可安排快递奖品,有效期30天;strong联系热线/strong:021-61531195/pp  媒体赞助:/pp style="text-align: center "img title="p1.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201612/insimg/329ebf59-4caf-45f3-a8be-da33d090ecce.jpg"//pp style="text-align: center "img title="p2.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201612/insimg/89ba19e6-bc8f-431b-ba11-0dc2925d114a.jpg"//ppbr//p
  • 近红外数据分析中的关键问题网络讲座顺利召开
    近红外数据分析中的关键问题网络讲座顺利召开 2016年8月30日上午,由华东理工大学、南开大学、大连达硕信息技术有限公司共同主办的网络讲座,在仪器信息网,以在线的方式顺利召开。讲座分别由杜一平教授、邵学广教授、曾仲大总经理担任主讲人,围绕近红外数据分析中关键性、经常性问题进行全面、深入阐述。 杜老师从近红外光谱数据预处理、变量选择、模型构建与结果验证等诸多方面,非常细致地介绍了整个建模过程中涉及的算法及算法原理、注意事项,以及普遍遇到的问题及解决方法。杜老师也提到,近红外数据分析绝非看似的那样简单,涉及对数据的理解、对算法的理解。同时不能只关注数学方法,更要记住我们是化学家!邵老师从大数据分析角度出发,阐述近红外数据分析,并延伸到近红外光谱的模型转移。大数据是国家关注的重点方向,企业信息化的推进,数据体量不断增大,需要基于大数据与云计算的手段方法提升效率,挖掘数据价值。近红外的模型转移则是现在生产型企业发展中遇到的,非常棘手的问题。不同厂家、不用仪器的数据和模型不能共享,很难实现数据融合。邵老师经过多年的研究与实践从方法到应用给大家进行了详细介绍。同时邵老师介绍了近红外模型转移中需要考虑和注意的问题,以及目前比较成熟的算法,为大家解决实际问题提供广阔思路。 曾老师则从近红外数据分析应用与软件系统实现的角度,阐述如何能更智慧地构建近红外分析模型,并结合大连达硕信息技术有限公司最新发布的魔力近红外数据分析产品(v2.0版),全面介绍系统如何实现智慧型近红外数据分析,包括批量文件夹数据载入,智能数据建模算法流,“随时”、“随时”数据建模,全面的建模方法比较,以及优异的用户体验等等。同时鼓励近红外同行们使用产品,支持国产软件发展。讲座后,三位老师延长预定时间,回答大家感兴趣的诸多问题。此次讲座得到了近红外分析和化学计量学同行的普遍关注,人气指数超过5,500,300余人报名参加。讲座结束后,大家通过各种途径表达对讲座的支持厚爱,效果很好,评价非常高。与此同时,大连达硕信息技术有限公司在讲座后,建立化学数据联盟微信群,一方面使与会者可更深入讨论近红外相关问题,推进行业发展,另一方面也广纳同行对联盟发展的意见与建议,促进联盟发展。 大连达硕信息是国家高新技术企业,专注化学与生物行业数据的整合分析与深度挖掘,辅助决策支持,公司全方位提供数据分析服务、数据处理产品,以及个性化数据应用整体解决方案,是我国化学与生物数据应用领域的排头兵。公司技术力量非常雄厚,在化学与生物数据分析领域积累非常丰富的经验,深受客户好评。
  • 博奥生物生物芯片数据分析专题培训讲座开班
    博奥生物信息培训班第一期生物芯片数据分析专题培训讲座开班啦! 本次博奥生物举办的生物芯片数据分析培训讲座,以最优惠的价格为学员提供最实用的数据分析解决方案! 博奥生物芯片数据分析案例剖析及方案分享,让您思路更清晰! 为您提供免费软件应用等公共资源及操作指导,实用才是硬道理!培训讲座内容安排:2013.09.05课程描述上午:9:00-10:00生物芯片技术及应用简介1、生物芯片技术介绍及发展现状2、博奥生物芯片平台及相应的典型案例介绍上午:10:45-12:00生物芯片数据分析解决方案1、生物芯片常用数据分析手段介绍2、数据分析典型案例剖析及整体解决方案培训3、常用软件及公共资源分享下午:1:30-4:00常用生物信息软件实际操作培训1、生物芯片平台给出数据介绍2、实践培训:Mev、cytoscape、coexpress等经典的数据分析软件及绘图软件的培训下午:4:00-5:00参观博奥生物,探讨交流1、博奥生物芯片平台展厅介绍2、邀您探讨数据分析疑问,拓宽新的科研思路培训对象需要使用高通量技术特别是芯片技术进行科研的老师需要加强生物信息分析思路,并能使用常用软件进行数据分析的老师讲师介绍:赵建晴博士:博奥生物微阵列服务部研究科学家张杨工程师:博奥生物科技事业部生物信息应用工程师培训费用:800元/人(含午餐)优惠措施:1:在2013年08月25日前报名,可享受8折优惠。2:博奥生物的仪器用户可享受1名免费培训名额。3:相同单位报名超过1人的,从第2人起享受5折优惠。缴纳注册费账户信息:用户名:博奥生物有限公司开户行:中国银行北京上地支行 帐号:3376 5602 2586培训资料:包括培训教材、培训证书(生物芯片北京国家研究中心印)、培训学员通讯录、精美礼品一份。注意事项:学员自备笔记本电脑,为保证教学质量,每期仅招收20位学员。报名方式:请您填写客户培训回执表,发送到qiandu@capitalbio.com邮箱中,我们收到回执表后3天内给予回复。报到时间及住宿安排:请于2013年9月5日9点前报到,如需住宿请在回执表中注明,公司可代为安排宾馆,费用自理。具体路线:1、北京站-博奥生物:地铁2号线到东直门换乘城铁13号线到西二旗站下车,坐521路/205路/112路到生命科学园站下车。2、北京西站-博奥生物:步行至地铁军事博物馆馆站,地铁1号线复兴门站换乘地铁2号线,地铁2号线到西直门换乘城铁13号线到城铁西二旗站下车,坐521路/205路/112路到生命科学园站下车。3、机场大巴至回龙观下车,乘出租车到生命科学园。联系方式:联系人:杜倩电话:010-80726868转8246 15910764175邮箱:qiandu@capitalbio.com客户培训回执表:姓名:E-mail:单位:电话:地址:邮编:是否需要住宿: 是 否备注:如果需要住宿,请注明入住时间您感兴趣的领域:
  • 赛默飞世尔和Sage-N Research联合提供完整蛋白质组学数据分析解决方案
    2008年8月20日,服务科技,世界领先的赛默飞世尔科技和高通量蛋白质组数据分析解决方案领先者 Sage-N Research Inc.经过五年合作,推出了在蛋白质组学分析领域内的最新产品---为企业Linux市场特殊设计的第一个蛋白质组学软件平台。  SORCERER™ 企业版软件产品来自Sage-N Research Inc.是一种可升级的软件套件,可在高性能的Linux系统上实现完全自动化、高容量的蛋白质组分析,该Linux系统包括刀片服务器和传统的Linux集群。SORCERER™ 是专门为生物医药企业和集中化的实验室里的数据中心设计的,这些实验室必须快速处理各个研究领域(如癌症,干细胞和神经退行性疾病)日益增长的来自质谱的蛋白质组学数据。  SORCERER企业版平台可作为主要的独立的数据分析系统,通过Web界面可支持数以百计的蛋白质组学研究人员使用。它也可以与Thermo Fisher Scientific最近发布的基于Windows的Proteome Discoverer软件进行无缝链接。高通量蛋白质组学研究实验室可将这两个互补性的产品作为一个整合系统,既可对SORCERER平台个性化定制后端的分析工具和底部的接口,也可以对Proteome Discoverer平台个性化定制前端的交互环境。SORCERER企业版是我们最新推出的下一代Proteomics 2.0分析软软件,侧重于蛋白质修饰(如最新的裂解方式电子转移解离裂解)和定量。”Sage-N Research Inc.蛋白质解决方案副总监James Candlin 说,“我们很高兴能与Thermo Fisher Scientific继续进行技术合作,向世界上高效能的蛋白质组学实验室提供具有创新性、世界一流的分析解决方案。  “我们一直致力于为高通量的顾客提供高质量的解决方案和最先进一流的产品,这些产品来自企业内部或与技术领先的伙伴合作开发。”Thermo Fisher Scientific 的蛋白质组学营销总监Andreas Hühmer说,“我们很高兴能够与Sage-N Research Inc.一直进行成功的合作,向市场提供业界领先的产品。”  SORCERER企业版软件为Thermo Scientific的SEQUEST Clusters的用户提供了一个方向标,这些用户需要增加一些高级的数据分析功能,如蛋白质定量或数据库搜索的翻译后修饰分析。该软件目前正在促销中。  有关SORCERER企业版的软件可以直接咨询Sage-N Research Inc.,也可以向2008年人类蛋白质组大会的34展台的Thermo Fisher Scientific咨询。请致电:900-810-5118或400-650-5118,电邮sales.china@thermofisher.com 或者访问www.thermo.com, http://www.SageNResearch.com/. SEQUEST是华盛顿大学的注册商标 Sorcerer是Sage-N研究所的商标 Windows是微软公司的注册商标   Thermo Scientific是Thermo Fisher Scientific,的一部分,是全球科学服务领域的领导者. -------------------------------------------------------------------------------- 关于赛默飞世尔科技(Thermo Fisher Scientific)   Thermo Fisher Scientific(赛默飞世尔科技)(纽约证交所代码:TMO)是全球科学服务领域的领导者,致力于帮助客户使世界更健康、更清洁、更安全。公司年销售额超过100亿美元,拥有员工约33,000人,在全球范围内服务超过350,000家客户。主要客户类型包括:医药和生物公司,医院和临床诊断实验室,大学、科研院所和政府机构,以及环境与工业过程控制装备制造商等。公司借助于Thermo Scientific和Fisher Scientific这两个主要的品牌,帮助客户解决在分析化学领域从常规的测试到复杂的研发项目中所遇到的各种挑战。Thermo Scientific能够为客户提供一整套包括高端分析仪器、实验室装备、软件、服务、耗材和试剂在内的实验室综合解决方案。Fisher Scientific为卫生保健,科学研究,以及安全和教育领域的客户提供一系列的实验室装备、化学药品以及其他用品和服务。赛默飞世尔科技将努力为客户提供最为便捷的采购方案,为科研的飞速发展不断地改进工艺技术,提升客户价值,帮助股东提高收益,为员工创造良好的发展空间。欲了解更多信息,请登陆:www.thermofisher.com,或www.thermo.com.cn(中文)。
  • 紫外可见光谱分析仪——为化学与生物化学实验带来快速、准确且可靠的数据分析
    SE-3607紫外可见光谱分析仪是博源光电基于自主研发的光谱分析技术为PASCO公司全新打造的重磅产品。它是一款UV-VIS宽波长范围且易于使用的紫外可见光谱仪,可为化学和生物化学在实验教学中提供快速,准确和性能可靠的常规分析。借助USB通讯和跨平台的光谱分析软件,UV-VIS紫外可见光谱仪改善了实验室成员之间的协作方式,使其在平板电脑,iPad和Chromebook上分析从电脑上采集的数据成为了可能。石英光纤等附件可用于扩展光谱仪的功能,从而可用于测量发射光谱,各类光源或激光器。特征• 测量范围:180nm - 1050nm• 直观跨平台的软件操作• 软件内置常规分析工具• 自动切换亮暗,一键式校准• 清晰的标记指示比色皿的正确放置应用• 溶液浓度的测定• 鉴定未知物质• 测量反应速率或衰减速率• 比色法(例如BCA,Bradford,Lowry)• 合成化合物的纯度测试• 平衡常数的确定• 摩尔吸收系数的测定• 品质测试(例如,发酵培养基,食品掺假,品质保证水平)光谱仪经过严格设计,可在快节奏的实验教学中提供最佳性能• 结构紧凑,体积适中• 高灵敏度CMOS检测器可加快分析速度• 内部排水结构设计,减少液体滴落和溢出造成损坏的风险• 隔离式光路结构,可确保随时间变化的精度(±1 nm)• USB连接及跨平台,支持实验室设备和学生自带设备• 兼容常规长度为1厘米的方形和圆形比色皿在可见光,UVA,UVB和UVC区域的提供宽波长范围检测,为常规应用提供了出色的独立解决方案• 吸光度动态变化• 纯化蛋白质分析• 平衡常数的测定• 核酸纯度测试• DNA和RNA的检测• 分析提取或合成的化合物• 核酸浓度的测定• 用于蛋白质定量的比色测定法(例如Bradford,BCA,Lowry)• 分光光度法测定化学和生化化合物光谱仪集成了易于使用的光谱仪软件该免费软件与大多数学生设备兼容,使实验组可以轻松快速地共享和查看其数据。 跨平台光谱分析软件还可以作为免费的功能齐全的应用程序使用,它具有以下功能,从而提高了分析效率:• 易于使用的菜单导航• 自动切换亮暗,一键式校准• 自动显示和存储样品数据• 进行扫描平均和数据平滑• 直观的数据重命名以优化数据跟踪• 光谱图将可见光的波长与颜色相关联• 内置的Beer-Lambert定律与线性拟合用于测定浓度• 可打印光谱和数据图• 将数据导出为.csv文件或.png屏幕截图,以便在Excel,SPARKvue或Capstone软件中进行进一步分析软件包含四种预置的分析模式吸光度分析模式使用“吸光度分析模式”对溶解在乙醇中的合成乙酰水杨酸样品进行分析。样品的吸收光谱表明样品在237nm 和313 nm处有较强的吸收光谱。使用“吸光度分析模式”可获得合成的乙酰水杨酸样品的吸收光谱。 浓度分析模式:浓度与吸光度(Beer-Lambert定律)使用“浓度分析模式”中的Beer-Lambert定律确定纯化蛋白的浓度。在“吸光度分析模式”屏幕中选择目标波长后,分析了五种已知浓度的蛋白质标准品(BSA)。应用线性拟合以创建标准曲线,并且测定未知蛋白质的浓度确定为0.215 mmol / L。使用Beer-Lambert定律在“浓度与吸光度”显示中确定纯化蛋白的浓度。时间分析模式:时间与吸光度(动态分析)使用“时间分析模式”随时间测量酚酞在NaOH中的褪色。对于具有不同浓度的NaOH的样品,随时间测量与酚酞相关的波长的吸光度。 下面提供了包含0.3M NaOH的酚酞样品的结果。使用“时间分析模式”随时间测量酚酞在NaOH中的褪色。光分析模式:波长与光强附加的石英光纤套件用于分析紫外可见光谱中各种光谱源的强度。氦元素光谱在下面使用“光分析模式”显示。可以将采集到的光谱(例如上面的氦光谱)与“光分析模式”屏幕中的预加载参考光谱进行比较。了解更多的产品详情和资讯信息,请登陆博光商城www.brolight.cn
  • 《中国气相色谱仪市场数据分析报告(2019年~2020年H1)》正式发布
    气相色谱法至今已有50多年的发展历史,现在已成为一种成熟且应用广泛的分离复杂混合物的分析技术。其中,气相色谱仪由于适用性、分离能力及样品回收率等方面的优势,更是受到广大分析测试领域人员的欢迎。近年来,我国对气相色谱仪的需求有增无减,整个气相色谱市场迎来发展的最佳时机。尽管2020年新冠疫情肆虐,但气相色谱仪市场并未受到影响。为了更系统的了解近年来我国气相色谱仪的市场情况,仪器信息网特别对相关网站气相色谱仪中标信息以及海关总署“气相色谱仪”的进出口数据进行了统计分析,并整理成了《中国气相色谱仪市场数据分析报告(2019年~2020年H1)》。《中国气相色谱仪市场数据分析报告(2019年~2020年H1)》介绍了气相色谱仪技术发展情况,同时详细分析了近两年我国气相色谱各领域、各地区中标情况以及各品牌中标情况,并详细分析了气相色谱仪进出口情况。报告链接 报告节选:仪器信息网将政府部门进行了分类,从这些单位采购情况来看,其中****部门采购率最高,占比为****;其次为****和****,占比分别为****和****;****紧随其后,占比****;****和****占比比较接近,分别为****和****。根据2020年上半年中标统计数据显示,2020上半年公开发布的国内气相色谱仪中标总金额为****亿元人民币,相较于2019年上半年的****亿元同比增长****;上半年中标数量为****台,相较于2019上半年的****台同比增长****。由数据可以看出。。。。。。2020年上半年,我国共进口气相色谱仪****台,与同期相比,数量增长****;进口额共****亿元,与同期相比增长约****。整体来看。。。。。。 。。。。。。报告目录:第一章 气相色谱仪概况….11.1气相色谱仪……11.2气相色谱技术进展及未来发展趋势……11.3 近三年气相色谱仪新品……21.4气相色谱技术应用进展……91.5 气相色谱市场基本情况……10第二章 气相色谱仪招中标分析……122.1 2019年气相色谱仪中标情况分析……122.1.1 2019年气相色谱仪各季度中标情况分析……122.1.2 2019年气相色谱仪采购单位地域情况分析……132.1.3 2019年气相色谱仪采购单位性质情况分析……142.1.4 2019年气相色谱仪各品牌中标情况分析……152.2 2020上半年气相色谱仪中标情况分析……182.2.1 2020上半年气相色谱仪各月份中标情况分析……192.2.2 2020上半年气相色谱仪采购单位地域情况分析……192.2.3 2020上半年气相色谱仪采购单位性质情况分析……202.2.4 2020上半年各品牌气相色谱仪中标情况分析……20第三章 气相色谱仪进出口分析……223.1中国气相色谱仪进口规模及情况分析……223.1.1 2019年及2020上半年气相色谱仪各月份进口情况分析……223.1.2 2019年及2020上半年气相色谱仪进口企业注册地情况分析……233.1.3 2019年及2020上半年进口气相色谱仪货源地情况分析……243.2 中国气相色谱仪出口规模及情况分析……253.2.1 2019年及2020上半年气相色谱仪各月份出口情况分析……253.2.2 2019年及2020上半年气相色谱仪出口发货地情况分析……263.2.3 2019年及2020上半年气相色谱仪出口国情况分析……27第四章 总结……29如对本报告感兴趣,可通过以下邮箱zhangyy@instrument.com.cn 联系我司相关人员,咨询报告相关细节!!
  • 默克与美国大数据公司Palantir合作建立半导体数据分析平台Athinia
    默克与Palantir合作建立半导体制造数据分析平台Athinia  德国材料巨头默克公司(Merck)正与美国大数据公司Palantir Technologies组建一家合资企业,以汇集半导体制造业芯片制造商及其供应商的数据并分析,解决当前面临的半导体短缺问题。  这家名为Athinia的公司将总部设在美国,由默克公司首席科技官Laura Matz担任首席执行官。它将利用人工智能和大数据的结合来帮助解决客户面临的半导体挑战。Athinia是一个安全的数据分析平台,新平台将处理IC制造从气体和沉积材料到光刻和光刻胶化学品供应的数据。该协作工具将把晶圆厂运营商和化学品与材料供应商联系起来,使他们能够安全地共享和分析晶圆厂数据,目标是在美国芯片制造商寻求提高集成电路产量的同时,帮助供应链合理化以提高效率,从而解决当前供应链中断的问题。协作分析平台还将提高供应链的透明度,帮助保证材料供应,防止材料供应影响芯片制造。    默克正通过其电子材料子公司——北美业务部门EMD electronics采取行动,EMD Electronics将监督针对半导体和显示器行业的计划。默克公司表示,到2025年,将在亚利桑那州、加利福尼亚州、宾夕法尼亚州和得克萨斯州的工厂为其美国业务投资10亿美元。Matz拒绝透露为创建Athinia投入了多少资金,也拒绝透露该公司是否有任何芯片制造商、材料供应商或研究机构与该平台签约。她说:“我们现在才刚刚起步,2022年将有第一批采用者。”“芯片短缺需要全行业的合作来解决消费者目前面临的供应链问题,”这家德国公司电子部门首席执行官Kai Beckmann在一份声明中表示。“我们正在美国投资,以扩大我们的生产能力。”  Athinia的计划是将多家材料供应商(包括默克的竞争对手)与半导体制造商一起引入,让他们共享、汇总和分析数据,以提高效率。这些数据将使用Palantir的大数据专业技术保密。  Palantir由Peter Thiel和其他人于2003年创建,并以Gotham、Metropolis和Foundry平台而闻名。Palantir Gotham被美国情报机构和美国国防部的反恐分析人员使用。Palantir Metropolis 供银行和金融界使用,而Palantir Foundry则供公司客户使用,典型客户包括Merck, Airbus and Fiat-Chrysler,后者现在是Stellantis的一部分。  “材料供应商和半导体制造商已经看到产量受到的影响越来越大,”Matz说,他还说,前沿工艺十分灵敏,以至于标称规格的材料可以产生可变化的产量。“传统参数不一定能预测晶圆厂工艺的相互作用,”她补充道。“这项服务的一个关键方面是隐私,Athinia将通过对数据进行编码和匿名来提供隐私。与Athinia合作的结果是,公司将更快地获得更好的数据。”  Athinia平台由Palantir Foundry提供支持,使用户能够构建和分析来自不同来源的数据,生成强有力的建议并支持运营决策,同时帮助确保敏感数据按照适用的数据隐私规则、法规和规范进行处理。
  • 沃特世和PREMIER Biosoft合作推广多聚糖数据分析软件
    强强联手应对生物制药分析的苛刻要求 盐湖城, 犹他州 - 2010年5月24日沃特世公司(WAT:NYSE)今天宣布已经与PREMIER Biosoft国际公司(帕洛阿尔托,加州)达成协议:双方携手推广该公司的SimGlycan软件以及沃特世质谱分析方案,用于多聚糖和糖肽分析。根据协议,沃特世将继续销售和支持其多聚糖质谱分析方案,而PREMIER Biosoft公司则将其软件卖给将使用沃特世SYNAPTTM和XEVOTM质谱平台进行多聚糖和糖肽分析的客户。通过利用PREMIER Biosoft的SimGlycan数据分析软件来扩展沃特世分离科学产品、质谱仪和超高效液相(UPLC)色谱柱方案,可以帮助生物制药企业获取生物药物关键信息,这些信息对于了解该药物的稳定性和安全性至关重要。糖基化的重要性引起了FDA法规的关注和监管多聚糖是随蛋白质翻译后连接在生物药物如蛋白质、多肽或单克隆抗体上的支链多聚糖分子。细胞中多聚糖加成和成熟反应的最终结果是不均匀的生物药物修饰,而不同的糖基化形式可对生物药物的有效性和安全性产生不同的影响。因此确定生物药物的糖基化位点和多聚糖的糖型及数量对于评价药物的有效性和安全性是必须的,由于存在各种不同的复杂多糖结构,对分析技术提出了很高的要求。另一方面,糖基化的一致性与否通常被作为一个灵敏度很高的标志,以此来判断制药公司是否对生物药物生产过程进行了有效的控制。为此,美国食品药品监督管理局FDA和其它法规机构也提出了相应的指导原则,要求对蛋白质药物糖基化进行更为严格的控制,这将使生物制药行业针对分析技术进行更大的投入,以便更好地分析和了解复杂的生物治疗药物。 关于沃特世的UPLC多聚糖分析方案沃特世UPLC多聚糖分析方案由ACQUITY UPLC BEH多聚糖分析专用色谱柱配合带荧光检测器的ACQUITY UPLC系统组成,用于分析2-氨基苯甲酰胺(2-AB)或其它荧光试剂标记的生物药物经酶处理后得到的多聚糖混合物。UPLC多聚糖分析方案提供比HPLC方案更好的分析结果,具有重现性好、分离度高、灵敏度高且分析速度快的特点,能够帮助实验室分析检测多聚糖的同分异构体(质量数相同、但保留时间不同),进行不同种类多聚糖如高甘露糖、中性以及唾液酸化的多聚糖分析,并同时对相对丰度很低的多聚糖进行分析(相对于其它多聚糖来讲)。沃特世UPLC多聚糖分析方案配合沃特世质谱仪器使用可以对多聚糖结构进行确证。作为MS/MS数据分析的工具,SimGlycan软件可预测蛋白质分子上的多聚糖结构、对其进行评分并生成一个与得到的质谱图信息最接近的可能的多聚糖列表。SimGlycan数据库是一个巨大的包含8,553种多聚糖信息的关系型数据库,并持续不断地更新其它新发表的多聚糖信息,可支持糖肽和多聚糖分析。 关于PREMIER Biosoft国际公司(www.premierbiosoft.com )成立于1994年,由计算机科学家和生物学家领导,专注于制造用于生命科学研究的最尖端的直观软件。该公司的目标是研究生命科学中最新的创新型技术并将其转化为软件产品以辅助研究。关于沃特世公司(www.waters.com )50年来,沃特世公司(NYSE:WAT)通过提供实用且可持续的创新,实现了全球医疗保健、环境管控、食品安全、水质监测等领域的显著进步,为基于实验室的许多机构创造了商业价值。 沃特世的技术突破和实验室解决方案开创了分离科学、实验室信息管理、质谱技术和热分析的相互组合,为客户提供了一个持久成功的平台。 沃特世公司2009年的收入达15亿美元,员工人数达5,200人;公司正在帮助全球客户推进科研进程,并为其提供绝佳的操作体验。
  • Molecular Devices 快来注册!变身酶标达人——MD第15期酶标仪应用操作/软件数据分析指导网络讲堂
    您是否刚接触酶标仪苦于不会操作?您是否在使用过程中碰到难题苦于无人指导?面对庞大的数据,您是否苦于不会通过软件进行有效处理及分析?如果您拥有了一台多功能酶标仪,您是否已经对其多种功能和应用都有开拓并好好利用? 如果您的回答是肯定的,如果您想变身酶标达人,那就快来注册参加Molecular Devices酶标仪应用操作/软件数据分析指导系列网络讲堂!每月一期,期期精彩! *会后我们将抽取5名全程听会的用户赠送一份精美小礼品*第15期: 轻松探索细胞通路研究那些事儿 日期:2016年7月27日,周三 时间:上午10:00-11:00(北京时间) 复制打开下方链接注册参加 http://go.moleculardevices.com/l/83942/2016-06-29/54fl85?cmp=70170000001DVf5本期导读: 细胞信号转导在诸如增殖、分化、程序性死亡、转化等细胞活动的调控中都扮演了至关重要的角色。信号转导调控的异常会导致很多人类疾病甚至癌症,但是多数情况下探索细胞的通路过程时需要借助于多种不同的检测工具(如酶标仪、Western Blot成像分析仪、流式细胞仪等)以及不同的方法(荧光成像,细胞活力、增殖和凋亡检测,Western Blot,DNA定量等)。 为了能够获得更完善和精确的信息,通常情况下,研究人员必须要借助于多种不同仪器来获取所需的结果,此过程需要学习多种不同的软件。想要轻松探索细胞通路的奥秘,且看如何仅利用Molecular Devices推出的SpectraMax i3x多功能微孔板检测平台和各种先进试剂,来进行细胞学相关信息全面收集。 主讲人:尹迪,产品经理 美谷分子仪器(上海)有限公司 产品咨询热线: 021-3372 1088 售前服务邮箱: info.china@moldev.com 售后服务邮箱: support.china@moldev.com 官方网站: www.MolecularDevices.com
  • 前六月进口近70亿元:光刻设备海关进口数据分析
    自美国提出终断该国企业与华为多年的芯片供应以来,研制中国自己的国产芯片提上了我国的发展日程,也是当前中国市场最为紧迫的一项技术,关于芯片技术发展的讨论不仅在专业领域盛行,也成为了普通民众议论的焦点所在。而芯片的制造离不开半导体设备,其中光刻设备是其中的重中之重。但长期以来,我国的光刻机依赖进口严重。2022年,美国出台《芯片法案》限制向中国大陆出口半导体设备。据《华尔街日报》报道,日本和荷兰已加入美国,努力限制向中国出口先进芯片制造设备(详情:日本、荷兰和美国联合起来限制向中国出口芯片制造设备 )。2月15日,就美日荷限制向中国出口相关芯片制造设备,中国半导体行业协会发表声明(详情:就美日 荷 限制向中国出口相关芯片制造设备,中国半导体行业协会发表声明 )。6月30日,荷兰政府发布公告,9月1日,先进半导体制造设备的额外出口管制措施将生效。从那时起,某些先进半导体制造设备的出口将受到国家授权要求的约束,限制中除了EUV光刻机,还包括了较为先进的DUV光刻机(详情:升级光刻机管制!荷兰发布先进半导体制造设备出口禁令)。此外,日本也限制了6类23种半导体制造设备出口,中国半导体行业协会发布严正声明表示,此次日本政府的出口管制措施将对全球半导体产业生态带来更大的不确定性(详情:中国半导体行业协会再发严正声明 )。日本和荷兰是光刻机的主要生产国家,上半年的种种措施出台为中国半导体产业增添了种种不确定性,为了解上半年光刻机的进口情况,仪器信息网特别对2023年1-6月,光刻机(商品编码84862031、84863031)进口数据进行了分析汇总,为大家了解中国目前光刻机市场做一个参考。需要注意的是,海关数据根据应用领域和原理将光刻机主要分为两类,包括制半导体器件或集成电路用的分步重复光刻机(84862031)和制造平板显示器用的分布重复光刻机(84863031)。2022-2023年1-6月光刻机进口额变化(单位:元)商品名称2022年2023年增幅制半导体器件或集成电路用的分步重复光刻机5245402082684285701030%制造平板显示器用的分布重复光刻机95803117664797902-93%2023年1-6月光刻机进口占比2023年1-6月进口额变化2022年1-6月进口额变化从近两年上半年的进口数据来看,制半导体器件或集成电路用的分步重复光刻机增长幅度较大,达到了30%的增幅,而用于制造平板显示器的分布重复光刻机出现了明显的暴跌,增幅为-93%,远低于去年同期。而从两类光刻机的占比来看,制半导体器件或集成电路用的分步重复光刻机明显占据主要市场份额。实际上,此前两类光刻机进口额接近(详情:前十月 进口额已达103亿元:光刻设备海关进口数据分析)。用于平板显示器的分布重复光刻机的进口额正经历着逐步暴跌的过程,这或许和国产替代有关。值得注意的是,今年上半年光刻设备进口额在六月份出现暴涨,单月进口额超34亿元,远高于去年同期和其他月。和去年上半年变化趋势相比,这一暴涨的变化趋势也颇为突兀明显。这可能和美日荷制裁升级有关,或因相关消息引发市场恐慌性抢购设备导致。制半导体器件或集成电路用的分步重复光刻机进口贸易伙伴分布制造平板显示器用的分布重复光刻机进口贸易伙伴分布制半导体器件或集成电路用的分步重复光刻机主要进口自荷兰和日本,其中荷兰进口额占比高达76.7%,日本占比21.9%。制造平板显示器用的分布重复光刻机不同于集成电路和半导体器件用光刻机,从其进口额分布可以看出,此类光刻机进口市场被日本企业牢牢把控。目前我国已成为世界平板显示器生产大国,拥有了一批巨头企业,市场广阔。制半导体器件或集成电路用的分步重复光刻机进口注册地分布制造平板显示器用的分布重复光刻机进口注册地分布那么这些光刻机主要销往何处?通过对进口数据的注册地进行分析发现,制半导体器件或集成电路用的分步重复光刻机主要“落脚地”是上海市、江苏省和北京市,这些地区也是我国经济较发达地区,近年来积极布局半导体产业,已经逐步形成了一批集成电路产业集群。而制造平板显示器用的分布重复光刻机主要“落脚地”是重庆市。据了解,在“十四五”期间,重庆将重点建设包括集成电路、新型显示、新型智能终端等在内的十类战略性新兴支柱产业。其中新型显示产业在重庆的十类战略性新兴支柱产业中排名第二,地位仅次于集成电路产业。近年来,重庆市新型显示产业政策持续出台,2017年达到峰值,为9条。2022年,重庆市共有2条相关政策公布。在当地政府支持下,近年来多个新型显示优质项目签约落地重庆,重庆正在通过显示面板领域重点项目投产和优质项目签约,进一步加快新型显示产线建设,让重庆新型显示产业的发展活力充沛。根据企查猫查询数据显示,近年来新型显示历年新注册企业数量稳定增长。截至2023年1月17日,重庆新型显示产业相关的注册企业超200家,其中2020年新注册企业数量创历史高峰,达43家,从新增企业数量来看,重庆市新型显示产业企业数量将继续保持上升态势。
  • 天津工生所建立无标定量MSE质谱数据分析流程
    超高效液相色谱-高分辨质谱(UPLC-HRMS)已经成为蛋白质组学、代谢组学以及药代动力学研究中的一项核心支撑技术,通过对不同生物样品的定量研究可以全面、精细地表征该生物体系的生理特性及预测功能。在用于蛋白质组学的质谱分析中,无标定量以其稳定性和安全性逐渐占据了主要地位。MSE方法是由Waters公司开发的应用在Q-TOF类型质谱仪器上的一种组学数据采集方法,作为一种数据独立获取(DIA)方式,它可以提高无标蛋白质定量的准确性和动态范围。但由于它特殊的输出格式形式,一些致力于分析数据依赖型(DDA)数据的常用开源软件不能对MSE 数据进行进一步的分析。  近日,中国科学院天津工业生物技术研究所水雯箐研究组成功建立了对基于MSE方法的无标定量蛋白质组学数据的新分析流程。在该研究中,结合开源软件Skyline和统计软件Diffprot建立起的工作流程,实现了对无标定量MSE质谱数据的定量分析。通过对磷酸化肽段和全细胞质蛋白质组定量数据的分析应用,验证了新开发流程的可靠性、稳定性、准确性和透明便捷的处理流程。另外,该研究创新性地发现改进后的新流程也可以应用于对小分子化合物的大规模定量分析,在蛋白质配体相互作用实验中,研究人员利用该新流程发现了针对药物靶点蛋白NDM1的新型小分子配体。  该研究获得国家自然科学基金和天津自然科学基金项目的支持,相关研究成果已经发表于Proteomics (2014,14:169&ndash 180),天津工生所和南开大学联合培养的研究生刘姗姗为第一作者。  无标定量MSE数据分析流程图
  • “国产科学仪器腾飞行动”发布国产好仪器调研数据分析用户需求核心问题分析
    仪器信息网讯 4月18日,在仪器信息网主办的2014中国科学仪器发展年会&mdash &mdash 国产科学仪器发展论坛上,仪器信息网编辑部作&ldquo 从国产好仪器调研数据分析用户需求核心问题分析&rdquo 报告(以下简称:分析报告)。  分析报告的数据均来自于&ldquo 国产科学仪器腾飞行动&rdquo 核心项目&ldquo 国产好仪器&rdquo ,&ldquo 国产好仪器&rdquo 申报并通过初审的仪器为142台(从属86家企业),对此142台仪器进行线上、线下调研,截止2014年3月12日,共收取问卷1967份,剔除无效问卷后,保留992份有效调研问卷。分析报告首先介绍&ldquo 国产科学仪器腾飞行动&rdquo 的进展状况 然后对992份有效问卷展开深入的数据分析,以揭示用户对国产仪器整体认识和期盼。  分析报告显示96%以上的用户表示国产仪器能够满足其工作需要。用户对国产仪器总体满意度为97%,质量满意度为85%,售后服务满意度为78%,70%以上的用户愿意向朋友推荐其心目中满意的国产仪器 用户期望国产仪器软件能够提高可靠性,降低控制程序方面的意外故障,进一步美化软件界面,增强软件的功能和数据库 用户对国产仪器在自动化、人机工程设计方面尤为关注 用户也期望企业能在售后服务中增加一些增值服务。  分析报告揭示了用户需求,并提供了国产仪器发展的一些思路:提高软件可靠性设计能力 推进可靠性工程在仪器中的应用 提高仪器人性化工程设计 增加售后服务附加值 加强用户和厂商之间的联系紧密度。  最后,报告向听众简单地介绍了&ldquo 国产科学仪器腾飞行动&rdquo 的下一步工作计划:&ldquo 国产好仪器&rdquo 项目方面,继续进行&ldquo 国产好仪器&rdquo 及企业调研工作,将在上半年公示&ldquo 国产好仪器&rdquo 名单,汇总国产仪器发展用户意见 在宣传推广方面,出版中、英文&ldquo 国产好仪器&rdquo 手册,与各大媒体联手推广&ldquo 国产好仪器&rdquo ,参加各种国内外专业展会推广 以各种形式结合其他资源助力国产科学仪器腾飞,召开国产科学仪器发展系列小型研讨会,协调各方资源、建言献策,对接政府采购决策单位,举办走进高校等仪器使用单位系列活动。
  • 直播预告 | 畅聊类器官数据分析
    类器官(Organoids)是利用成体干细胞或多能干细胞进行体外三维培养而形成的具有一定空间结构的组织类似物,结合高超的成像技术,彻底改变了人们对培养皿中生命活动的理解方式,在人类发展和疾病机制方面为研究人员提供更多见解。1个月前,伯桢生物携手复旦大学博士、徕卡显微镜工程师联合直播 ——「类器官成像那些事儿(上、下)」,深度解析类器官明场下拍摄技巧,类器官免疫组化免疫荧光拍摄技巧,和类器官高分辨率成像,不同组织来源类器官包埋注意事项等,收获热烈反响。12月8日,本周四19:00,伯桢生物将再次与我们合作,携手复旦大学博士和徕卡客户成功管理专家与各位学者共续「类器官成像那些事儿(番外篇)」。报名方式报名入口一:扫描下方二维码,预约报名直播内容抢先看畅聊类器官数据分析模块一如何实现类器官图像3D拍摄后处理模块二解析类器官成像及荧光信号定量分析模块三基因类器官拍摄后核分析及细胞空间分布解析附件模块如何在文章中展现一张科学,精 准,惊艳的图片。目前,活动进入到专家评审阶段,尽情期待!评委组专家简介曾艺中国科学院分子细胞科学卓 越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)研究员曾艺,研究员,博士生导师,中科院上海生科院生化与细胞所研究员。获国家“杰出青年基金”、上海市“优秀学科带头人”、谈家桢“生命科学创新奖”、腾讯“科学探索奖” 。长期研究成体干细胞命运决定的调控机制,在发现新的成体干细胞的身份、建立成体干细胞的体外扩增体系、发现干细胞微环境因子方面取得一系列国际领先的研究成果。担任 eLife 期刊编辑及Development、JBC 编委, 中国干细胞生物学会委员。章永春上海交通大学 长聘教轨副教授章永春,上海交通大学生命科学技术学院,长聘教轨副教授副教授,博士生导师,独立课题组组长,2020年入选上海市海外高层次人才引进计划项目。目前主持国家和上海市自然科学基金面上项目。先后于南开大学获得学士学位,美国罗切斯特大学获得博士学位,哥伦比亚大学从事博士后研究。目前课题组主要聚焦利用3D类器官、干细胞、转基因小鼠及多种分子生化手段研究消化道器官再生与癌症形成机理,探索开发肿瘤新型治 疗方案。课题组已在Nature、Cell Stem Cell等知名学术期刊发表多篇论文。熊春阳北京大学 教授熊春阳,北京大学工学院力学与工程科学系教授、博士生导师。1995年于北京大学力学系获得学士学位,2000年于北京大学力学系固体力学专业获得博士学位;2000-2002年在北大电子学系进行博士后研究,2002年留校工作至今。现为北京大学工学院力学与工程科学系教授、博士生导师,北京大学前沿交叉学科研究院兼职研究员,中国力学学会/生物医学工程学会生物力学专委会委员,中国生物医学工程学会类器官与器官芯片分会委员,中国力学学会流体力学专委会微纳尺度流动专业组委员。目前主要从事力学-材料-微纳米技术-生物医学的交叉研究,包括力生物学、力材料学、类器官工程、器官芯片等。已主持国家自然科学基金项目7项,纳米973项目子课题负责人1项,主持或参加其他国家或地方课题20余项。已发表SCI论文80余篇,申请国家发明专 利20余项。Emmanuel Enoch K. Dzakah (Ph.D.)伯桢生物技术总监,加纳University of Cape Coast研究生导师,中国博士后国际引进人才,中国博士后特别资助(站前)获得者,南方医科大学皮肤病医院博士后,中国科学技术大学博士,细胞与免疫学家,传染病学专家, 多年国际生物医药产业经验。研究成果包括成功制备以及生产疟疾, HIV等传染病的检测单抗与快速诊断试剂,衣原体与HIV-1共感染的机制研究,RNA 如何调控秀丽线虫的发育与寿命以及利用肿瘤类器官模型研究癌细胞起源与高频突变基因致癌效能,以第 一/通讯作者身份于国际权威期刊Genome Biology, J. Investigative Dermatology, J. Genetics and Genomics, Malaria Journal, BMC Microbiology 等发表系列研究论文。那洁清华大学 副教授那洁,清华大学医学院教授, 本科毕业于北京大学医学部获医学学士学位,于美国佛吉尼亚大学获细胞生物学博士,2002前往英国剑桥大学进行博士后研究,2005年获得英国医学研究学会干细胞事业发展研究员基金。2010年回国在清华大学医学院任教。主要研究方向为干细胞与再生医学,人类多能干细胞向心血管细胞、造血干祖细胞和免疫细胞分化的调控机制,应用这些细胞制作类器官模型, 研究人类器官发育和疾病机理,促进细胞治 疗等临床转化应用。获得科技部重大科学研究计划、国家自然科学基金等的资助。在Nature、Science等国际权威刊物发表干细胞、胚胎发育、类器官方面论文70篇,他引3000余次。曾获得教育部高等学校科学研究优秀成果奖(科学技术)一等奖。获得若干项国家专 利。为多个国际学术刊物的审稿人,国际干细胞研究学会会员,中国动物学会生殖生物学分会委员,中国细胞生物学学会,生理学会会员。蒋明浙江大学 研究员浙江大学医学院研究员,博士生导师。毕业于复旦大学生命科学学院,获得生物物理学博士学位。先后在美国罗切斯特大学、哥伦比亚大学进行研究工作。长期从事前肠起源的器官包括食管、胃和肺的干细胞在器官损伤再生及在肿瘤中的功能研究。以类器官结合动物模型,鉴定不同类型和起源的干细胞在参与损伤后再生以及在肿瘤形成过程中的作用,已发表一系列高水平SCI研究论文,包括Nature,Journal of Clinical Investigation、Developmental Cell和PNAS等多篇领域内顶 级期刊。承担科技部重 点专项和国家自然科学基金等研究课题。获得国家发明专 利1项。黄卫人深圳大学第 一附属医院 研究员黄卫人,二级教授,深圳大学第 一附属医院(深圳市第二人民医院)泌尿外科,国家重 点研发计划项目首席科学家。国家地方联合肿瘤基因组临床应用关键技术工程实验室执行主任,广东省泌尿生殖肿瘤系统与合成生物学重 点实验室副主任,深圳市医学基因重编程技术重 点实验室主任。主要从事泌尿系统肿瘤精 准医学及合成生物学应用基础研究,在包括Nature Methods、Nature Communications、Advance Science、Genome Biology、 ACS Synthetic Biology等杂志以通讯作者或者第 一作者发表SCI论文60余篇,相关成果获得深圳市自然科学奖二等奖1项,中华医学科技奖1项,获得发明专 利授权11项。高天龙徕卡生命科学部高级应用专员2007年毕业于中科院生化细胞所,后从事癌症相关的细胞免疫治 疗行业多年。2013年加入徕卡显微系统,负责生命科学领域的共聚焦、活细胞工作站、激光显微切割系统等高端显微成像系统的技术支持。了解更多:徕卡显微
  • 扩展数据分析软件工具增强了对2-D DIGE数据组的生物学解读能力
    2005年8月12日英国Chalfont St Giles消息 ——通用电气医疗集团推出了DeCyderTM 扩展数据分析(Extended Data Analysis,EDA)1.0版,―个针对蛋白质组研究市场的先进的软件解决方案。它能对不同数据组进行联合分析,并通过检索公共和本地数据库对结果进行生物学解读。由于增强了新版DeCyder v6.5 DIGE 图像分析软件的分析能力,EDA对2-D DIGE实验分析非常有用。“EDA v1.0是一个功能强大的,尖端的2-D DIGE 软件解决方案,它以一种便于使用的形式提供先进的统计学分析,”GE Healthcare全球市场经理Kumar Bala 说道,“这种有用的分析工具将促进对调控途径的更深入了解,并帮助蛋白质组学研究人员更快更精确地识别区别于正常组织样品和疾病组织样品、以及不同疾病状态和肿瘤类型间的差异蛋白质。”DeCyder EDA采用多变量分析和高级的聚类分析方法,揭示由2-D DIGE实验所得到的实验数据的蛋白表达模式。该软件采用一个“数据组”(data set)作为2-D凝胶分析的基础,将匹配的蛋白点定义为蛋白图谱的一个点群(group),根据实验目的,每个数据组都能以不同方式被展示出来。DeCyder EDA是进行生物学差异分析(Biological Variance Analysis,BVA)的一种理想工具,它能回答的问题有:- 在一个特定的数据组中存在有多少个蛋白点群和样品类别?- 是否有蛋白点表现出类似的表达模式,暗示着共调控作用?- 是否有蛋白质或蛋白表达模式可能是某种生物学或疾病状态的特征?- 是否有特定的蛋白质对开发非侵害性诊断或预后性症状检测有用?- 通用电气医疗集团特别设计的DeCyder软件包是Ettan 2-D DIGE 技术平台的关键组件,可精确检测和匹配Ettan DIGE凝胶的多重荧光图像。
  • 速来!活体成像小动物模型开发+数据分析干货分享,锁定iSAI2024
    动物模型在临床前抗肿瘤药物评价体系中发挥着重要的作用。肿瘤动物模型的建立为研究肿瘤发生与转移的机制、筛选和评价抗肿瘤药物的药效提供了有力的工具。一般啮齿类动物小鼠,因为其具有繁育速度快,成本低,可进行基因修饰等诸多优点,基于其构建的各类肿瘤模型构成了临床前治疗性药物筛选的主要工具,而小动物活体成像数据分析被称为连接医学影像与生物医学的重要桥梁。仪器信息网将于2024年6月6日举办“第一届小动物活体成像技术与前沿应用”主题网络研讨会(iSAI2024),全日程现已公布(点击查看)。精彩报告提前知晓!本文为【动物模型开发/数据分析篇】,大会当天将由上海南方模式生物科技股份有限公司经理/副研究员慈磊博士与中国科学院高能物理研究所高级工程师聂彬彬博士两位嘉宾分别就活体成像小动物模型的开发、动物脑成像数据分析及应用展开报告,欢迎踊跃报名参加在线直播!参会报名链接二维码:https://www.instrument.com.cn/webinar/meetings/sai240606.html ——03 动物模型开发/数据分析篇——关键词:基因工程小鼠、脑影像数据分析慈磊 经理/副研究员上海南方模式生物科技股份有限公司个人简介:南模生物工业客户部经理,副研究员,同济大学生物学博士,已授权发明专利5项,发表SCI论文10余篇。主要从事小鼠疾病模型构建以及药效评价研究,具有多年肿瘤以及自免类药效模型构建及CRO服务经验,目前负责主持南模生物各类抗肿瘤以及炎症类药物临床前研究项目。大会报告:活体成像小动物模型的开发与应用通过构建报告基因小鼠模型,利用小鼠特异性启动子调控荧光素酶报告基因的表达,结合光学成像系统实时采集小鼠发出的荧光信号,进而追踪活体小鼠中该内源基因的表达。该基因工程小鼠不仅有助于建立针对治疗药物的临床前筛选平台,还可以明确这些基因表达的细胞类型,具有基础科研和临床应用的双重价值。聂彬彬 高级工程师中国科学院高能物理研究所个人简介:中国科学院高能物理研究所,高级工程师,课题组长。中国图学会医学图像与设备专业委员会秘书长;中华医学会核医学分会神经学组委员;中国生物医学工程学会放射学会青年委员会委员。多年来主要从事医学影像数据分析方法的研究及应用工作,作为课题负责人承担了国家自然科学基金四项,中国科学院青年项目一项;作为主要参与人参与了中国科学院先导专项一项,973课题两项,发表SCI论文百余篇。其建立的动物脑成像数据分析平台能够对多种成像模态的猕猴,树鼩,大鼠,小鼠的脑成像数据进行不同的数据处理,该软件平台于2014年起通过邮件注册的方式对外发布,截至目前,已经有150余家国内外单位注册使用。大会报告:动物脑成像数据分析及应用磁共振成像技术和正电子发射断层成像技术能够对动物进行在体成像,能够在正常的生理状态下观察动物的脑结构形态、脑功能活动、脑白质纤维束形态及走向等等,在重大脑疾病的发病机理、药物评估中具有不可替代的作用。脑影像的数据分析是连接医学影像与生物医学的重要桥梁,该报告主要介绍了动物脑成像研究中常用的数据分析方法及应用示例。点击获取稿件提纲为帮助广大实验室用户及时了解小动物活体成像前沿技术、创新产品与解决方案,增强业内专家与仪器企业之间的交流学习,仪器信息网特别组织策划“小动物活体成像技术” 主题约稿活动。欢迎投稿,投稿文章一经采纳,将收录至【小动物成像技术】专题并在仪器信息网相关渠道推广。投稿邮箱:刘编辑liuld@instrument.com.cn电话联系:13683372576(同微信)。
  • 博奥生物第三期生物芯片数据分析专题培训讲座(广州站)
    本次博奥生物举办的生物芯片数据分析培训讲座,以最优惠的价格为学员提供最实用的数据分析解决方案!博奥生物芯片数据分析案例剖析及方案分享,让您思路更清晰!为您提供免费软件应用等等公共资源及操作指导,实用才是硬道理!培训讲座内容安排:2013.12.12课程描述 (学员需自备电脑)上午:9:00-10:00生物芯片技术及应用简介1、生物芯片技术介绍及发展现状2、博奥生物芯片平台及相应的典型案例介绍上午:10:15-12:00生物芯片数据分析解决方案生物芯片常用数据分析手段介绍4、数据分析典型案例剖析及整体解决方案培训下午:1:30-2:30常用生物信息软件介绍生物芯片平台给出数据介绍常用软件介绍及资源分享下午:2:45-4:00软件实际操作培训Mev、cytoscape、coexpress等经典数据分析软件及绘图软件的培训培训对象:需要使用高通量技术特别是芯片技术进行科研的老师需要加强生物信息分析思路,并能使用常用软件进行数据分析的老师培训费用:800元/人(含午餐)优惠措施:1:博奥生物的仪器用户所在单位可享受1名免费培训名额2:相同单位报名超过1人的,从第2人起享受5折优惠缴纳注册费账户信息(学员也可现场缴费):用户名:博奥生物有限公司 开户行:中国银行北京上地支行 帐号: 3376 5602 2586 【请在转账单备注中注明: × × (姓名)交付培训费3106】联系人:15910764175(杜女士),需要发票请说明。培训资料:包括培训课件、培训软件及操作视频、精美礼品。注意事项:学员自备笔记本电脑,为保证教学质量,每期仅招收20位学员培训地点及路线:地点:广东省农科院创新大楼一楼西厅会议室 (广州市天河区金颖路20号)路线:地铁3号线天河客运站方向至华师站E出口,在师大后门公交站2乘坐813路在农科院站下车,经过街天桥至马路对面,即为广东省农科院大院,进入大门左手边即为创新大厦报到时间及联系方式(博奥生物广州办事处):请您于2013年12月12日8点半前到会议室报到联系人:15918524295(于女士) 电话:020-34282504 报名方式:请您填写客户培训回执表,发送到邮箱:xinyu@capitalbio.com,我们收到回执表后2天内给予回复。客户培训回执表:姓名:E-mail:单位:电话:地址:邮编:您感兴趣的领域:是否需要住宿: 备注:如果需要住宿,请注明入住时间,公司可代为安排,费用学员自理
  • 岛津发布全新IMAGEREVEAL MS质谱成像数据分析软件
    p 近日,岛津公司宣布发布IMAGEREVEAL MS质谱成像数据分析软件。该软件可以不需要任何额外的时间或麻烦,即可从多种角度分析数据,从而简化了数据分析过程。它特别适合用于分析大数据集或者同时分析多组数据。岛津将在9月5日至7日举办的JASIS展会上展示这款软件。/pp style="text-align: center"img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201808/insimg/9aa35697-5099-45a4-9d58-757dd3bbe885.jpg" title="imagereveal_ms.jpg"//pp style="line-height: 1.5em " 质谱成像技术主要用于分析二维图像,这些图像显示了用质谱仪测定的物质的分布情况。近年来,在空间分辨率和质量精度方面的技术进步使得质谱产生了大量的数据,这对数据分析产生了极大的挑战。/pp style="line-height: 1.5em " IMAGEREVEAL MS质谱成像数据分析软件可以通过轻松搜索大量质谱成像数据的功能,从而获得所需信息来解决上述问题,这可显著提高研究效率。该软件包括六种类型的数据分析功能,具有不同的可用功能,具体取决于客户选择的许可证。数据转换器可用于分析非岛津质谱仪测量的数据。/pp style="line-height: 1.5em " IMAGEREVEAL MS软件起源于同九州大学医疗氧化还原导航创新中心的联合研究。自2006年以来,岛津通过提供一系列质谱系统和专门知识,作为合作伙伴参与了该项目。从2012年到2016年,岛津公司与三菱田边制药公司合作开发了质谱数据软件,该软件能够无缝分析从基质辅助激光解吸/电离质谱仪(MALDI-MS)上得到数据。所得到的原型均是IMAGEREVEAL MS软件研发的基础。/ppbr//p
  • 贝克曼库尔特收购Cytobank,拓展流式数据分析业务
    p style="text-indent: 2em "6月4日,贝克曼库尔特生命科学宣布收购strong在线流式数据分析网站Cytobank/strong。/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 400px height: 400px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201906/uepic/5dece831-c14b-44fd-b845-91ceee0ecbce.jpg" title="贝克曼.jpg" alt="贝克曼.jpg" width="400" height="400" border="0" vspace="0"//pp  Cytobank是一家位于加利福尼亚州的单细胞数据分析软件即服务(SaaS)公司。主营业务是为业界提供基于云和机器学习的软件平台,用于多参数单细胞数据分析,共享和归档。该平台能够在多个站点之间实现高效的多维多组学数据分析、可视化和协作,大大提高了研究效率。/pp  Cytobank公司的数据分析技术恰好可与贝克曼库尔特CytoFLEX LX 21色流式细胞仪联合使用,用以满足基础和临床研究科学家日益增长的高复杂性工作流程和数据分析需求。/pp  “我们很高兴将Cytobank创新性的软件解决方案添加到我们的流式细胞仪业务中,”贝克曼库尔特流式细胞仪业务部副总裁兼总经理Mario Koksch表示,“我们现在可以为制药/生物制药企业、学术临床科研机构客户提供更加标准化、更灵活的高端数据分析解决方案。”/pp  “Cytobank也很期待加入贝克曼库尔特,通过协作配合,帮助我们进一步开发Cytobank技术平台,为全球领先的科学家提供服务,”Cytobank总裁兼首席执行官David Craford表示。/pp  本次收购,Cytobank将成为丹纳赫生命科学平台下贝克曼库尔特生命科学事业部一员。据了解丹纳赫生命科学平台在2018年创造了约65亿美元的收入。/pp style="text-align: center "span style="color: rgb(192, 0, 0) "strong扫码关注3i生仪社,解锁更多生命科学仪器资讯!/strong/span/ppspan style="color: rgb(192, 0, 0) "strong/strong/span/pp style="text-align: center"img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201906/uepic/e47bd4ba-611b-48ed-9422-baa417f58186.jpg" title="640.jpg" alt="640.jpg"//ppbr//p
  • 刘文玉:从数据分析浅谈中国科学仪器的发展与机遇
    仪器信息网讯 2013年4月19日,中国科学仪器行业最高级别的峰会——“2013中国科学仪器发展年会(ACCSI 2013)”在京召开。其中,仪器信息网高级顾问刘文玉作了以《从数据分析浅谈中国科学仪器的发展与机遇》为题的大会报告。  该报告中从“2012年市场概览”、“2013年市场机会”、“创新与发展”、“紧跟信息时代步伐”四个方面介绍了中国科学仪器的发展与机遇。内容涵盖了国内外主流仪器市场份额比较、“科学仪器重大专项”解析、跨国企业的“本土化”战略、 “政府采购”、“大部制改革”、“市场竞争”、“售后服务”、“用户采购行为”及各部委利好仪器行业的相关政策等多个行业关键点。仪器信息网高级顾问 刘文玉  据介绍,近年来中国科学仪器的生产总值逐年上升,国内仪器行业的上市公司也取得了不错的业绩,其中2012年国内上市公司平均业绩增长12.9%。从仪器信息网市场研究中心给出的国内外主流仪器市场份额比较的数据可知,与进口仪器相比,目前国产主流仪器已经占了一定的市场份额,但是同时也看到,国产GC-MS、LC-MS/MS等高端仪器所占的市场份额还是很少。  通过国产主流仪器的厂商数量及国内外主流仪器核心技术差距的对比,刘文玉介绍到,当前国内企业的产品同质化严重,虽然我国已经有一些产品能和国外同类产品相竞争,但是在核心技术和核心部件方面还有很大的差距,需要“创新”。此外,刘文玉还从“科学仪器重大专项”出发,分析了目前我国科学仪器研发及产业化过程中存在的问题,如在国家重大专项支持项目中,有关核心部件的研发很少,产业化前景目前未知。  市场机会方面,刘文玉从质检系统、药检系统、环保部、农业部、第三方实验室等各方面介绍了中国科学仪器的机遇。其中,刘文玉还提到,2013年涉及国务院机构改革,其中最显著的变化——食品安全从“九龙治水”到食品药品监督管理总局,会否影响“十二五”计划的实施?这其中的变化与进程我们拭目以待。  据仪器信息网市场研究中心数据,获取仪器信息的第一大渠道就是网络,因此科学仪器行业要重视网络宣传,紧跟信息时代的步伐。此外,还应在市场研究、搭建合作和成果转化平台、重视人才培养和招聘等方面多下功夫。  在报告中,刘文玉还指出,科学仪器行业的“创新与发展”是一个值得研究的课题,中国的科学仪器未来要走怎样的路值得我们深思,或许中国的家电及汽车行业的发展模式能给一些参考。  最后,刘文玉特别强调,当前国内的一些科学仪器企业正在不断的壮大,未来的一切在于我们的“行动”、“理想”、“坚持”,并呼吁:为中国科学仪器的快速健康发展共同奋斗!2013中国科学仪器发展年会(ACCSI 2013)现场
  • PerkinElmer发布云端数据分析管理平台Signals——支持精准医学完整工作流
    2015年10月28日,专注于人类健康和环境健康的全球领先供应商,珀金埃尔默公司今日宣布发布一款基于云的科学数据分析管理平台 SignalsTM,应用于医药领域的数据汇总分析。这个新产品集成了多方面的实验和临床研究数据,支持从数据采集到生物标志物发现一系列完整的精准医学分析流程。珀金埃尔默与多家顶尖医药企业合作开发的科学数据分析管理平台Signals?TM?, 旨在帮助研究人员更轻松地整合来自公司内部的及公共数据库,比如GEO 及 tranSMART中的实验和临床数据。现在,越来越多的制药公司开始从事精准医学的研究工作,珀金埃尔默的Signals? 也将支持更广泛的合作,提高科学家为患者开发药物的速度和效率。“珀金埃尔默的 SignalsTM 为新药研发提供了一个新的平台。”奥尔巴尼分子研究公司(AMRI)高级副总裁Christopher Conway说。我们已将这一平台整合到AMRI关键部门,位于纽约布法罗新药研发中心的高通量筛选平台,Signals? 科学数据分析管理平台将显着提高我们在多个数据来源迅速获取、管理、整合并分析大型复杂数据的能力,使我们能更好更快的进行药物研发工作。”珀金埃尔默的科学数据分析转化平台SignalsTM 的数据获取界面十分简洁,并拥有一个专门用于生物标志物识别和管理的研究数据模型。它简化了药企与他们在学术领域,生物技术领域及其它商业合作伙伴间的数据共享方式。“在过去,新药研发的研究人员无法直观地利用研究数据,这使得识别和描述生物标志物成为一件极具挑战性的工作。”珀金埃尔默信息部总裁 Karen Madden说。 “这个全新的分析管理能够加强研发和临床数据之间的紧密联系,确保患者与药物之间的最佳配对,从而保证促进人类健康”珀金埃尔默科学数据分析转化平台SignalsTM 提供了软件即服务(SaaS)模式,降低了药企IT部门的运营成本并为其提供了强大的灵活性和可扩展性。它与 TIBCO Spotfire 可视化分析平台无缝集成,使转化医学科学家更容易进行调用、整合并可视化分析数据。此外,研究人员还可以:存储结构化及非结构化数据,包括生物信息输出文件及科学家的分析工作流。轻松查询、提取、识别和存储样本实体信息,这些都是转化医学分析所需要的信息。对存储数据进行归一化或者其它一系列的数据预处理。更多信息请访问:www.perkinelmer.com/signals
  • 沃特世在2014年国际质谱大会(IMSC)上推出用于小分子数据分析的Progenesis QI 2.0版
    新一代软件加强了控制能力,独具Pathway Mapping、Process Automation功能及改进的化合物数据库通道日内瓦—(美国商业资讯)—沃特世公司(纽约证券交易所代码:WAT)近日在瑞士日内瓦举行的第20届国际质谱大会上,推出了2.0版Progenesis? QI。该软件是一款用于液相色谱-质谱(LC-MS)小分子组学数据分析的新一代软件。 继六月份推出适用于蛋白质组大分子组学数据分析的2.0版Progenesis QI,沃特世今天发布的软件进一步完善数据平台。Progenesis QI和Progenesis QI蛋白组学软件将液相色谱-质谱(LC-MS)的数据分析速度和精度都提升至新水平,使用户能快速定量和鉴定样品中发生显著变化的小分子、脂质化合物和蛋白质。 Progenesis QI 2.0版的新功能包括:Pathway Mapping能促进将现有发现纳入生物学情境中的过程,从组学数据中获得尽可能多的信息;Workflow Automation能在没有人为干预的情况下,使软件在多个处理阶段自行运转,不仅节省了宝贵的时间,还能在夜间和周末持续运转;改进的化合物数据库通道,提高了成功鉴别化合物的机会;与EZInfo 3.0的扩展统计功能完美结合,具有双向的数据流,只需通过单一的菜单导向命令,就可实现灵活的数据挖掘。 沃特世全球营销和信息部门副总裁Rohit Khanna博士表示:“未进行深入了解的新发现是无用的。最新版本的Progenesis QI拥有改进的界面,使得软件的使用比以前更直观快速,让用户对他们的研究更有信心,并能更深入地理解获得的结果。” Progenesis QI 2.0版拥有基于研究人员的工作方式的灵活、直观易学的工作流程。它有着高度可视化的用户界面。扩展后的功能拓宽了在制药、健康科学、食品、环境和化学研究等诸多研究领域的应用。 如需了解更多有关Progenesis QI 2.0版软件的信息,请访问http://www.nonlinear.com/progenesis/qi/。更多Progenesis QI生物信息学软件的信息,请访问:http://www.waters.com/waters/zh_CN/Progenesis-QI-Software/nav.htm?cid=134790655&locale=zh_CN关于Progenesis QI软件2014年4月,在德国慕尼黑的Analytica Conference(分析研讨会)上,沃特世继收购组学数据分析软件领域的全球领导者Nonlinear Dynamics Ltd.之后,推出了Progenesis QI和Progenesis QI蛋白质组学软件。2014年6月,沃特世发布了用于蛋白质组学的2.0版Progenesis QI,扩充了信息学套装。Progenesis QI软件使研究人员能采用独特的方法分析并可视化LC-MS数据,准确定量和鉴定化合物和蛋白质。Progenesis QI软件支持所有常用的LC-MS数据格式,具有直观的导向性工作流程,能使用户能在宝贵的样品中快速、客观、可靠地找到目标化合物。Progenesis QI 2.0版拥有pathway mapping、process automation和改进的化合物数据通道等新功能,能提供增强的控制能力和功能。
  • 精准医疗战略规划正在制定 利好大数据分析和肿瘤检测市场
    p  国家卫计委11月30日消息,目前我国正在制定“精准医疗”战略规划,或将纳入到“十三五”重大科技专项中。/pp  精准医疗主要由基因测序等顶尖技术构成,将改变现有的诊断、治疗模式,为医学发展带来一场变革。据透露,我国将研发一批国产新型防治药物和医疗器械,形成一批我国定制、国际认可的疾病诊疗指南、临床路径和干预措施,显著提升重大疾病防治水平,针对肿瘤、心脑血管疾病、糖尿病、罕见病分别制定8-10种精准治疗方案,并在全国推广。/ppstrong  政府高度重视/strong/pp  国家卫计委官员告诉中国证券报记者,本次制定的“精准医疗”战略规划,系国家卫计委会同国家科技部、中国科学院等中央部委,按照中央领导同志的批示,联合一批顶尖科学家研究制定的。/pp  据透露,国家相关部委获悉美国的精准医疗计划后,很快将这一计划专文上报国家高层,高层随即批示国家科技部牵头调研,国家科技部鼓励中国科学院北京基因组研究所在这一领域深入钻研。/pp  关于这项顶尖的科研计划,今年以来政策方连续推出举措:今年3月27日,我国发布了第一批肿瘤诊断与治疗项目高通量基因测序技术临床试点单位名单。4月15日,国家卫计委和科技部组织生物医药等领域专家,同中国科学院等部门共同研讨精准医学研究计划。5月10日,国务院发布《关于取消非行政许可审批事项的决定》,其中第31项是关于取消第三类医疗技术临床应用准入审批,取消的审批项目包括原来由国家卫计委负责的造血干细胞移植、基因芯片诊断、免疫细胞治疗等第三类医疗技术临床应用。/pp  据介绍,在精准医疗领域行动最快的是英国。英国政府2012年发起大型测序研究项目——“10万基因组计划”,即对英国国民医疗保健制度记录(NHS)中的10万名病人的完整基因组进行测序,目标是根据基因组学和临床数据制定个性化的癌症和罕见疾病疗法,并使NHS成为“世界上第一个将提供基因组医学作为日常护理一部分的主流健康服务体系”。迄今为止,英国已经对几百个基因组进行了测序,预计2016年测序完成1万个样本,到2017年完成10万个样本。/ppstrong  大数据分析护航/strong/pp  精准医疗要做到个性、高效及预防,前提是疾病的筛查和诊断。因此,开展精准医疗,首先是要发展基因测序和大数据应用。从精准医疗的过程来看,产业链可以简单分为诊断和治疗两个部分。诊断过程主要涉及分子诊断技术、大数据及云计算的应用,通过对单个患者相关样本的采集检测,并与数据库中相关疾病的资料进行比对,得出相关诊断结果。在治疗阶段则可以根据诊断的结果实行“量体裁药”。/pp  大数据分析将在精准医疗中发挥巨大作用。精准治疗实施的前提是基因测序技术,而基因测序后产生的数据则有赖于大数据的比对分析。一个完全测序的人类基因组包含100GB-1000GB的数据量,这在解读上有很大困难,需要专门的数据库进行数据信息的横向与纵向比对分析。国外很多公司都建立了自己的大型数据库并开发相关的软件进行快速数据分析。例如Myriad genetics公司拥有专有数据库来进行大数据的一体化分析,可用来解释不确定的遗传检测结果。Illumina公司开发出BaseSpace的云计算与存储平台。SevenBridges Genomics在人类基因组排序和分析中综合应用了云计算和NoSQL数据技术,推出EC2、S3和MongoDB等。/pp  A股上市公司荣之联(002642,股吧)凭借在高性能计算和大容量存储方面积累的技术优势,为华大基因设计、建设和维护位于深圳和香港的生物信息超算中心,成功地解决了基因测序形成的海量数据在并行计算和存储等方面的难题。目前,华大基因具备了每秒运行157万亿次的超级计算能力,数据存储量达12.6PB,基因测序能力位居全球第一。/pp  大数据比对分析后所得到的信息,可为个体化药物设计提供指导,实现“量体裁药”。目前众多预测性基因检测项目中最具有实际应用意义的是“药物基因型检测”,即针对人体发病基因片段设计靶向药物,并用大数据分析药物将要产生的反应、药效、敏感性以及副作用的情况,从而筛选出最佳治疗方法和个体化的给药方案。“量体裁药”将在很大程度上减少临床用药不当,提高疗效与降低医疗费用,为未来医学指明方向。/pp strong 肿瘤检测市场先行/strong/pp  国家卫计委医政医管局今年4月公布首批肿瘤高通量基因测序临床应用试点单位名单。意味着肿瘤病种的基因测序得到监管层首肯。/pp  达安基因控股孙公司广州达安临床检验中心及迪安诊断全资子公司杭州迪安医学检验中心入选首批试点单位名单。卫计委指出,将通过试点,做好高通量基因测序技术的验证与评价,逐步完善相关技术规范,提高高通量基因测序技术在肿瘤诊断与治疗方面的应用和管理水平。除上述两家外,入选首批试点的单位还包括中山大学附属肿瘤医院、深圳华大临床检测中心等。/pp  2006年我国第三次居民死亡原因抽样调查结果显示,30年来,乳腺癌死亡率上升了96%,而肺癌死亡率更是狂飙465%。根据《世界癌症报告》统计,2012年中国癌症发病人数为306.5万,约占全球发病的1/5 癌症死亡人数为220.5万,约占全球癌症死亡人数的1/4。对这类恶性疾病的治疗,一方面是加大治疗药物的研发突破,另一方面应从精准治疗角度进行治疗技术的突破。/pp  业内人士介绍,当前的肿瘤治疗正逐渐从宏观层面对“症”用药向更微观的对基因用药转变,实现“同病异治”或“异病同治”,精准治疗已经成为肿瘤治疗的公认趋向。鉴于肿瘤基因测序的市场广阔的前景,继无创产前测序争夺战开展数年后,国内多家基因公司开始进入肿瘤检测市场,开始争夺这块大蛋糕。/pp  此前,肿瘤个体化治疗仅由国家卫计委批准了中南大学湘雅医学检验所、北京博奥医学检验所和中国医科大学第一附属医院,三者皆为政府背景,开展进度缓慢。随着3月底国家卫计委公布了首批肿瘤高通量基因测序临床应用试点后,个别公司已先下手为强。华大基因旗下华大医学的进展最为快速,肿瘤检测即华大医学“生死战略”战略中的“死”战略之一。/pp  华大医学的肿瘤套餐已于近日出炉并正在推向市场,目标客户既包括健康人群、高危人群,也可辅助治疗、预后监控。此套餐涉及肿瘤种类是目前中国市场上最为全面的。健康、高危人群适用于“遗传性肿瘤筛查”,其中包括男性15种、女性16种常见肿瘤的筛查,乳腺癌、卵巢癌、肺癌等常见癌症均在套餐范围内 罹患肿瘤的患者则适用于个体化治疗套餐,定位于针对性用药、预后复发监控等。br//p
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