多重呼吸道病原体快速核酸检测

7月28日，英诺特生物科创板IPO上市，股票代码688253，发行价26.06元/股，开盘后市值一度超46亿元。英诺特是一家专注于 POCT 快速诊断产品研发、生产和销售的高科技生物医药企业，公司紧紧扎根 POCT 快速检测领域，以呼吸道病原体检测和多种病原体联合检测为特色，以急门诊，尤其是儿童急门诊检测作为切入点，致力于打造中国呼吸道病原体快速联合检测领导品牌。1）政策加码 POCT市场快速扩张近年来，国家加大了对国内体外诊断企业的扶持力度，出台了《“十三五”生物产业发展规划》《国家突发急性传染病防治“十三五”规划(2016-2020 年)》等多项鼓励政策以推动行业发展。随着分级诊疗的推进及医疗资源下沉，我国即时检测（下称“POCT”）行业快速发展。根据统计，我国POCT市场规模从2015年的43亿元增长至2019年的112亿元，年复合增长率达到27.04%。未来预计将继续以超过20%的增速增长，到2024年，行业规模将达到290亿元。作为POCT行业的细分领域，我国呼吸道病原体检测市场也保持快速增长态势。近年来，在分级诊疗体系不断推进、检测范围扩大、早诊早治趋势凸显等因素驱动下，我国呼吸道病原体检测试剂市场规模由2013年的1.78亿元增长至2019年的12.97亿元，复合增长率达到39.24%；我国呼吸道病原体检测试剂需求量由2013年的875万人份增长至2019年的4942万人份，复合增长率达到33.45%。2）深耕研发 拥有多个国内独家品种近年来，英诺特深耕快检产品的研发销售，同时也逐步提升研发投入。截至报告期末，公司拥有研发人员 75 名，占员工总数的19.43%。2020年初新型冠状病毒肺炎疫情发生后，公司快速响应，开展对新冠病毒检测产品的研发攻关，在短时间内克服多个技术难题，并于 2020 年 2 月 22 日通过国家药监局应急通道审批，获得国内首批新型冠状病毒 IgM/IgG 抗体检测试剂盒注册证，并随后参与了 3 项新型冠状病毒抗体检测试，剂盒国家标准的制定，后续陆续取得了包括 FDA 的 EUA 授权在内的多个海外市场准入许可，支援全球抗疫，是唯一一家被中共中央、国务院、中央军委授予“全国抗击新冠肺炎疫情先进集体”的体外诊断试剂生产商。另外，对呼吸道病原体感染的临床症状和体征较为相似但治疗方法截然不同的特点，英诺特重点发展呼吸道病原体联合检测产品，掌握多种联检技术，拥有多个国内独家品种，通过一个产品、一次检测快速准确地鉴别多种病原体，帮助医生尽早确定治疗方法和用药方案。针对呼吸道疾病在儿童中更为高发，且更易造成严重并发症的特点，公司将儿童急门诊作为呼吸道病原体检测产品的切入点。报告期内，公司以全血呼吸道五联检测卡、流感病毒三联检测卡、病毒血清五联检测卡、呼吸道病原体九联间接免疫荧光试剂盒等多个独家联检产品为代表的呼吸道病原体检测产品成功进入了包括首都医科大学附属北京儿童医院、首都儿科研究所附属儿童医院、复旦大学附属儿科医院等在内的众多区域性重点儿童医院，并获得其认可。经过多年发展，英诺特现已构建起了免疫层析平台、间接免疫荧光平台、液相免疫平台、核酸分子检测平台、基因重组蛋白工程平台以及细胞和病原体培养平台 6 大技术平台，基于技术平台进行专业分工提升研发的广度和深度。 公司同时开展多个在研项目，与现有产品形成了良好的互补，为公司未来新产品的持续推出、产品结构的优化提供保障。截至本招股意向书签署日，公司取得了16 项发明专利，拥有 71 项医疗器械产品注册/备案证，其中三类医疗器械注册证 56 项。未来，公司将以客户应用场景需求为中心，不断对标国际一流企业，实现产品线的丰富与覆盖。公司计划依托在呼吸道特别是儿科领域建立的市场网络优势，切入肠道疾病检测领域、过敏检测领域，夯实公司在儿科领域的优势地位。

为进一步加强医疗质量安全管理，持续提升医疗质量安全管理科学化、精细化水平，构建优质高效的医疗质量管理与控制体系，国家卫生健康委制定并发布了10项《2021年国家医疗质量安全改进目标》。在此基础上，医政医管局组织各专业国家级质控中心围绕本专业医疗质量安全的薄弱环节和关键点，提出了2021年质控工作改进目标（共33项）。其中，在感染性疾病专业提出了“提高呼吸道病原核酸检测率”的目标。 肺结核：经呼吸道传播的乙类传染病结核病是由结核分枝杆菌感染人体后引起的慢性传染病，人体除头发和指甲外都可以发生结核病。其中，肺脏是最常被侵犯的器官，如被侵犯就叫肺结核。肺结核是我国法定报告的乙类传染病，其主要通过呼吸道传播，1名传染性肺结核患者若不加以治疗，1年平均可感染10-15名健康人。根据世界卫生组织2020年10月14日发布的最新全球结核病年度报告，我国2019年新发结核病患者数约83万例，位居全球第三位；利福平耐药结核病患者数约6.5万例，占全球利福平耐药肺结核患者的14%，位居全球第二位，是全球结核感染负担最重的国家之一。 结核病的早期快速诊断是预防和控制结核病蔓延的关键《“十三五”全国结核病防治规划》要求：到2020年全国结核病患者病原学诊断率达到50%以上，东中部地区和西部地区分别有80%和70%的县（市、区）具备开展结核病分子生物学诊断的能力。为进一步遏制结核病流行，推进健康中国建设，2019年5月国家卫生健康委、国家发展改革委、教育部、科技部、民政部、财政部、国务院扶贫办和国家医保局联合制定了《遏制结核病行动计划（2019—2022 年）》，并指出：结核病的早期快速诊断是预防和控制结核病蔓延的关键。 结核分枝杆菌核酸检测阳性为确诊病例2017年11月，新的《肺结核诊断》行业标准正式发布，明确将结核分枝杆菌核酸检测阳性列为确诊病例，该标准的发布为结核病的确诊提供了新的手段。2020年全球结核病报告数据显示，2019年我国结核病病原学阳性率为47%，在原有的传统痰涂片和痰培养确诊病例的基础上有了大幅提升。 迪澳恒温核酸检测系统优选方案该系统是“十二五”国家科技重大专项成果转化产品，主要通过bst聚合酶及特异性引物在恒温条件下（63℃）对标本中结核分枝杆菌复合群核酸片段进行特异性扩增，扩增产物（dna）与核酸染料结合后发出荧光信号，通过恒温扩增荧光检测仪实时读取荧光信号，根据仪器给出的扩增曲线和出峰时间判断结果，可以快速对人痰标本中的结核分枝杆菌复合群dna进行定性检测。其优势在于：l 结果准确敏感性高，病原学阳性率为64%，远高于痰涂片和痰培养，优于传统pcr；特异性高（96.26%），与痰培养相当。l 安全性高专用收集管全封闭提取痰液样本，无病原体暴露，降低感染风险。l 操作简便，结果快速痰液样本无需特殊处理；耗时短，70min即可获得检测结果。l 通量高、便携检测通量：1-48个，最多可一次性检测46个样本；仪器轻巧，携带方便，移动后无需进行荧光校准，直接检测。l 智能化自动上传数据，无缝接入医院lis、his系统；自动实时监控、判读、出报告。 小结：此次医政医管局提出“提高呼吸道病原核酸检测率”的目标，重点指出：提高呼吸道病原核酸检测率，助力快速明确病因，合理使用抗菌药物，实现呼吸道传染病的早发现、早隔离、早报告和早治疗。结核病作为常见的呼吸道传染病，其早期快速诊断是防控的关键。迪澳恒温核酸检测系统是国家“十二五”重大传染病专项课题成果，因其“安全、准确、快速、便携、联网”，被纳入国家结核病参比实验室的推荐检测方法，已经服务于全国多个省市的结核病防控工作，并在疫情应急防控中也得到了很好的应用，可有效助力提高呼吸道病原核酸检测率。

国家重点研发计划是当前我国最高级别的研发项目。3月16日，由安图生物牵头的“十四五”国家重点研发计划“超多重病原体核酸即时检测系统研发”项目启动实施。“超多重病原体核酸即时检测系统研发”项目是“十四五”国家重点研发计划“诊疗装备与生物医用材料”重大专项的重要组成部分。该专项以诊疗装备和生物医用材料的重大战略性产品为重点，系统加强核心部件攻关，突破一批引领性前沿技术，加快推进我国医疗器械领域创新链与产业链和服务链的整合，为促进我国医疗器械整体进入国际先进行列提供科技支撑。据安图生物副总经理、安图仪器总经理刘聪介绍，超多重病原体核酸即时检测在临床上需求迫切，而在全球范围内，兼具快速、超多重、高灵敏的核酸即时检测的产品严重缺乏，国内更是几近空白，其主要原因在于传统微流控难以实现复杂试剂流程的精准、快速操控。“超多重病原体核酸即时检测系统研发”项目，通过产、学、研深度融合和联合攻关，旨在打破国外垄断，突破传统流体控制对泵阀、管路、机械臂及复杂通道结构的依赖，攻克多项关键技术，建立自主知识产权，开发超多重一体化全集成核酸即时检测系统，可在呼吸道、胃肠道、脑膜炎、血流感染等领域开展快速核酸检测，提升我国对重大传染、感染性疾病的监测和应对能力，更好地服务临床检验。

成人呼吸道感染类型多样，不同感染类型及不同基础疾病患者病原谱各具特点，在临床常规诊疗过程中，应以患者临床症状体征为基础，联合应用影像学、传统微生物学、免疫学和分子生物学等检测技术，依据相应检测标准做出快速、精准诊断。分子生物学诊断技术在临床的应用目前仍有较多问题亟待解决，尤其是对临床结果的正确解读。不同检测技术所提供的结果具有不同临床意义，如何做到合理应用是所有相关临床医生和检测工作者共同思考的问题。于2023年8月在《协和医学杂志》最新发布的《成人呼吸道感染病原诊断核酸检测技术临床应用专家共识（2023）》参考国内外指南及文献， 分析了实时荧光聚合酶链反应(polymerase chain reaction，PCR)技术、等温扩增技术、数字PCR技术、核酸即时检测技术和病原体高通量测序技术的临床应用场景、技术特点和性能验证要求，以及该类技术在成人急性上呼吸道感染、气管支气管炎、社区获得性肺炎、医院获得性肺炎/呼吸机相关肺炎、慢性阻塞性肺疾病急性加重、肺结核和免疫功能受损人群呼吸道感染中的应用，供临床借鉴参考。其中数字PCR作为新兴的核酸检测技术，第一次被写入呼吸道病原检测的专家共识中，为不同的应用场景提供了更多的选择。共识内容摘要一、不同核酸检测技术性能特征和应用场景的比较PCR：聚合酶链反应 TAT：检验结果回报时间。说明和补充: 数字PCR除了检出限远低于其它检测方法外，能够精准定量的优势让它还可以用来做疗效评估。此外，随着技术的发展，以新羿生物D50为代表的新机型能够实现高通量的检测，检测时间缩短到了1h左右。二、核心推荐意见PCR：聚合酶链反应；mNGS：宏基因组高通量测序。说明和补充: 相较于实时荧光PCR，数字PCR更适合多靶标呼吸道病原体核酸检测。随着数字PCR仪器自动化水平和检测通量的升级，它也可以用于门急诊，住院患者和大规模人群筛查。三、成人呼吸道感染病原体核酸检测技术应用建议PCR：聚合酶链反应；mNGS：宏基因组高通量测序；tNGS：多重病原靶向测序；BALF：支气管肺泡灌洗液；ESBL：超广谱β-内酰胺酶；HIV：人免疫缺陷病毒。说明和补充: 数字PCR可以实现对上表中各种感染类型病原体的检测，并且可以做到单个样本的检测数量更少、样本量要求更低以及对病原体的精准定量。总结分子诊断技术在呼吸道感染性疾病，尤其是全球应对新型冠状病毒大流行中发挥了重要作用，高灵敏度和高特异度的核酸扩增试验(nucleic acid amplification tests，NAATs)已成为诊断新冠病毒感染的参考标准。随着基因组学、工程学和纳米科学等前沿学科的交叉融合快速发展，NAATs 呈现出多种多样的检测方法和日新月异的技术手段，以PCR为基础发展出的实时荧光PCR、多重PCR、数字PCR和等温扩增技术，以及高通量测序、基因芯片、核酸质谱、生物传感器等检测技术，在大型实验室批量检测或现场核酸即时检测(point-of-care testing, POCT)中得以广泛应用。除呼吸道病毒外，一些系统还能检测细菌性肺炎的常见病原体及特定耐药基因。不同检测技术所提供的结果具有不同临床意义，联合应用可进一步提高病原学检测的灵敏度和特异度，更好的解释患者的病程发展并进行治疗监测。其中数字PCR以其灵敏度高(检出限 1copies/mL)、同时检测靶标较多(病原体数个~数十个)、用时短和定量准确等优点，被推荐用于“直接定量检测呼吸道标本中病原体个数，适用于低浓度样本、低丰度基因或突变基因的检测，和其他核酸检测方法的检测限标定”，以及对“造血干细胞及实体器官移植后患者 ”进行病毒(包括巨细胞病毒和其他呼吸道病毒)的定量、动态检测。应用场景包括“定量检测，疗效评估，环境检测，参考品或标准品定标”。

由于传播途径多样、影响范围广泛，症状发展迅速，传染病仍然是世界范围内引起人类大量死亡的重要原因。21世纪以来多次严重疫情给我们留下深刻印象：一是2003年的“非典”（SARS），二是2009年的甲型H1N1流感（人感染猪流感），再有就是现在席卷全球的新型冠状病毒肺炎疫情。因此，传染病的防控一直是医学科学工作者面临的巨大挑战。其中，对病原体进行快速准确的鉴定是传染病精准防控的基础。中国医学科学院病原生物学研究所彭俊平研究员自2000年起即深耕于病原体检测技术方法及基因组学、耐药机制相关的研究工作。近日，仪器信息网特别采访了彭俊平研究员，与他就核酸质谱技术在病原体检测领域的应用现状及前景进行了深入交谈。中国医学科学院病原生物学研究所 彭俊平研究员“国内最早开展核酸质谱病原体检测研究的团队之一”随着各项科学技术的进步，病原体检测技术也在不断发展，由病原分离、电镜观察、免疫学检测等传统生物学方法发展到PCR技术、芯片技术、测序技术、质谱技术等分子生物学方法。“因为引起疾病的病原体种类繁多，单一的平台技术不能解决所有问题，所以，我们的主要工作是利用各种平台技术对病原体进行筛查。”彭俊平介绍到，“多年来我们课题组一直致力于搭建一个病原体组合筛查技术体系，这也是我国在传染病防控领域的一个重要工作。另外，我们利用多重PCR反应结合飞行时间质谱技术（以下简称：核酸质谱）在病原体检测领域开展了10多年的工作，这也是我们多年来的一个重点发展方向。”核酸质谱是什么？彭俊平为笔者解答到，核酸质谱其实是基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TOF）在核酸水平的应用，是一种将多重PCR反应与质谱结合的复合技术。此前，MALDI-TOF主要应用于蛋白质水平的微生物鉴定研究，应用发展不过30多年，而MALDI-TOF在核酸水平的相关应用则是近些年提出的概念，应用发展时间就更短。最初，MALDI-TOF在核酸研究领域开展的应用是SNP基因分型，其首先通过PCR扩增含有SNP的基因组片段，再通过检测核酸分子在真空管中的飞行时间而获得样品分析物的精确分子量，从而检测出SNP位点信息。因为MALDI-TOF本身的高灵敏度和高通量等特点，使其非常适合应用于SNP多位点的筛查。而MALDI-TOF在病原体检测领域的研究则鲜少有报道。彭俊平课题组是国内最早开展核酸质谱病原体检测研究的团队之一。“我们是在2009年引进的这个技术平台，正好是H1N1全球大流行的时候，当时核酸质谱的技术水平还不足以帮助我们开展相关工作，因此我们就开始自己开发方法。”核酸质谱病原体检测的原理是利用MALDI-TOF检测多重PCR反应的产物，即单碱基延伸的产物质量大小，来判定检测靶基因的有无，从而进一步判定样本中目标病原体的有无。与传统的病原体检测技术相比，核酸质谱在灵敏度、检测通量以及操作简便性等方面均有一定优势。此外，核酸质谱检测的核酸序列均来源于公共数据库，不需要依赖其他的数据库。 “开发了7种人冠状病毒的检测方法，成功申请专利”经过多年的技术摸索，彭俊平团队利用核酸质谱在病原体检测领域做出了很多成果。最近其团队开发了7种人冠状病毒的检测方法，并申请了发明专利。目前，已知可以感染人的冠状病毒共有7种，其中包括2003年的“非典”SARS冠状病毒、2012年在中东地区出现的MERS冠状病毒以及2019年12月爆发的严重性呼吸系统综合征冠状病毒SARS-Cov-2。彭俊平介绍到，课题组是从2012年开始开展人冠状病毒的检测技术研究，其中一部分工作内容就是利用核酸质谱进行检测应用。该部分成果是与岛津公司合作开发的，利用一步法多重反应PCR与MALDI-TOF质谱联用鉴定7种人冠状病毒与新型冠状病毒的重要突变位点。“本次合作中我们将多重PCR反应从两步法改进为一步法，既缩短了实验时间，又减少了人为操作的工作。而且我们改进的方法适用于所有的RNA病毒，可以说是摸索出了一种通用的解决方案。”彭俊平介绍到，“和岛津合作成果的应用价值很明确，我非常期待未来该方法的推广。接下来我们也将继续和岛津合作在MALDI-TOF平台上开发出更多病原体检测解决方案，并合力推动核酸质谱在临床领域的应用。”笔者追问到目前国际上核酸质谱在病原体检测领域的应用现状如何？彭俊平坦言道，国际上相关的成果并不多，而团队于2009年就开展了相关研究，可以说是走在了国际前列。不过，目前核酸质谱病原体检测的应用还以科研阶段为主，临床应用正处于拓展阶段。此外，彭俊平也谈到他认为核酸质谱走向临床所面临的瓶颈，一是MALDI-TOF本身的硬件设备比较贵；其次，基于MALDI-TOF平台提供给临床应用的成熟方法不多。因此，核酸质谱这样的技术平台想要真正推广到临床，首先需要提供“一揽子”的解决方案，这样应用场景就会被打开。不过，彭俊平也观察到，无论国内还是国外，越来越多的团队和厂商开始关注这一领域，相信核酸质谱的临床应用情况将在短短几年之内得到很大的改变。最后彭俊平表示，未来核酸质谱病原体检测值得重点关注的方向有呼吸道感染疾病、腹泻性疾病和性传播疾病等，其涉及的病原体种类繁多，是核酸质谱可以“大展身手”的方向。后记：采访中彭俊平反复提到“病原体的组合筛查技术体系”，他也为笔者解释到，为了获取更全面的生物信息，往往需要多种技术平台共同解决问题，而不是希望用一个技术平台去解决所有的问题。回到MALDI-TOF这一技术来说，总有人拿质谱与NGS测序相比较，其实它们的应用场景和目标都不一样，发展核酸质谱也并不是为了替代测序技术。事实上，核酸质谱只需要在中高通量的检测中建立并巩固其“王者地位”，在此基础上能够再提升灵敏度和分辨率等性能，就为自身的发展开辟了新天地。

流感病毒、呼吸道合胞病毒、肺炎支原体等多种病原体的流行，直接拉动了呼吸道多联检测需求的增加。据人民日报健康客户端记者不完全统计，截至目前，已有圣湘生物、中帜生物、英诺特等多家公司的呼吸道联检产品，获得国家药监局的注册认证。仅2023年，就有明德生物、创澜生物等公司生产的至少4种3重呼吸道多联检测产品获批。此外，博拓生物、明德生物等企业也在加速布局，部分呼吸道多联检测产品已在注册流程中。目前，北京、上海、湖北武汉等多地医院检验科均推出了呼吸道联检项目，联检项目数量不一，分为3重联检、6重联检、13重联检等，覆盖甲型流感病毒、新冠病毒、呼吸道合胞病毒、肺炎支原体等常见病原体。此外，部分电商平台也推出了呼吸道病毒“居家快检”服务，同样能够对多种呼吸道病毒进行快速检测。部分电商平台推出呼吸道病毒“居家快检”服务，能够对多种呼吸道病毒进行检测。张爽 摄“不少患者到医院就诊之前，就做了这种多重联检。检查结果是有参考价值的，我们会再结合症状等具体情况判断，只要能够保证准确度，在临床也有推广价值，有助于早期明确病因，对症治疗。”北京佑安医院感染综合科主任医师李侗曾在接受人民日报健康客户端记者采访时表示。多位受访专家表示，目前医院呼吸道多重联检价格较高。人民日报健康客户端记者咨询了北京、江苏南京、四川成都、陕西西安等多家开展呼吸道多联检测的医院，根据检测数量的不同，一次多联检测价格在500～1000元不等。“早上8：30之前做完呼吸道6重联检，当天下午就能够拿到结果，患者需要进行咽拭子采样。”北京市怀柔区一家医院的检验科工作人员表示，“目前，急诊、发热门诊、儿科都有部分患者进行检查。”根据观研报告2023年发布的《中国呼吸道病原体检测行业发展趋势研究与投资前景分析报告》，我国2025年呼吸道病原体检测市场规模有望突破600亿元关口。由于近期流行的呼吸道病原体较多，相比于单项检测产品，多联检测产品的优势也在凸显。人民日报健康客户端记者在采访中了解到，呼吸道多联检测产品包括核酸、抗原、抗体等检测方式。“检测是准确用药的前提，呼吸道疾病的暴发带动检测需求大幅增长，为检测试剂企业带来订单弹性。”华鑫证券分析师胡博新表示，“多联检测更符合呼吸道疾病的快速诊断需求，是未来发展趋势，同时，多联检测的研发周期长，注册认证壁垒高，更具有定价优势。对比新冠、心肌等单项检测产品，呼吸道多联抗原检测产品具有更长的成长周期。”

近日，安图生物甲型流感病毒/乙型流感病毒/呼吸道合胞病毒核酸检测试剂盒（PCR-荧光探针法）、人偏肺病毒核酸检测试剂盒（PCR-荧光探针法）获国家药品监督管理局颁发的医疗器械注册证。　　流感疫情有“抬头”趋势　　11月1日，在2022年“世界流感日”科普宣传与学术会议上，多位专家在会上提醒，应格外关注今年冬天的呼吸道传染病疫情。中国工程院院士钟南山表示，全球仍然面临着新冠疫情和流感疫情叠加流行的风险，特别是今年冬季。中国科学院院士董晨表示，目前全球仍面临较高的流感和新冠肺炎等呼吸道传染病叠加流行的风险，呼吸道传染病的防控任重而道远。　　流行性感冒是由流感病毒引起的一种急性呼吸道传染病，每年的秋冬季进入流行高峰。孕妇、婴幼儿、老年人和慢性基础疾病患者等高危人群，患流感后出现严重疾病和死亡的风险较高。据世界卫生组织监测数据显示，今年以来全球流感发病数大幅上升，报告病例数较过去两年明显增多。　　提高病原学检出率势在必行　　由于呼吸道感染的临床表现无特异性，因此临床早期诊断是非常关键的。但呼吸道感染较为复杂，多表现为病原体混合感染，症状和流行特点较为相似，传统手段无法精准检测。核酸检测以其灵敏度高、特异性强、时效性好等优势，可快速鉴别诊断病原体，对于辅助临床用药具有重要的意义。　　可搭载安图生物全自动化核酸检测平台实现随到随检　　安图甲型流感病毒/乙型流感病毒/呼吸道合胞病毒核酸检测试剂盒（PCR-荧光探针法）、人偏肺病毒核酸检测试剂盒（PCR-荧光探针法）搭载全自动核酸提纯与实时荧光PCR分析系统，实现随到随检，能够快速明确病原体，指导临床个性化用药。　　全自动检测，操作简便，提高生物安全。　　随到随测，检测灵活。　　缩短TAT时间，检测时长约100min。　　多项目自由组合方案，1管样本，可随意组合检测多种病原体。　　配备急诊模式，适合门急诊检测。　　2~8℃保存，易于储存与运输。　　目前，安图生物已获注册证的呼吸道检测产品：新型冠状病毒2019-nCoV核酸检测试剂盒（PCR-荧光探针法）、人副流感病毒核酸检测试剂盒（PCR-荧光探针法）、安图甲型流感病毒/乙型流感病毒/呼吸道合胞病毒核酸检测试剂盒（PCR-荧光探针法）、人偏肺病毒核酸检测试剂盒（PCR-荧光探针法），可搭载全自动核酸检测平台，是呼吸道分子检测的新利器。　　未来，安图生物还将推出多项呼吸道疾病核酸检测产品，为临床提供更全面、更快速、更精准的呼吸道病原体解决方案，助力呼吸道疾病的防控和诊疗。

传染性疾病严重威胁人类健康，波及面广，破坏力大，现有快速诊断方法主要包括：免疫检测和核酸检测。其中，核酸作为最先能被检测到的标志物，在医院等医疗机构中应用已十分广泛。然而，在医院等就诊场所以及人员密集地区的交叉感染现象时有发生。就诊前的居家检测或就诊地快速筛查，能够精准切断传播途径，减少交叉感染的发生，助力传染性疾病的防控，为精准分级诊疗等提供重要的方法和手段。 针对上述核酸快速检测需求，长期聚焦于高灵敏分子诊断技术的尹焕才研究员联合马富强研究员及相关科研力量，在苏州医工所自主部署项目的支持下，开展了基于LAMP技术（Loop-mediated isothermal amplification，环介导等温扩增技术）的传染性病原体检测系统研制。从特异性引物筛选设计、LAMP反应核心酶研发、高灵敏反应体系构建、到配套便携式荧光检测仪器，进行了全链条部署研究，取得阶段性进展。半小时内完成测试，试剂可常温运输，无需冷链，便于居家、床旁及现场快速检测使用，已初步具备转产条件。 下一步，团队将进一步挖掘LAMP及相关产业化技术，以产品实现为目标，推动灵敏度等核心技术指标的提升，开展临床试验和注册办证，以期开发出具有自主知识产权的等温扩增系列化产品，推动分子诊断技术及产品的应用“重心下移”，助力我国传染性疾病的防控。呼吸道病原体快速检测系统构成以FluA为靶标的试剂灵敏度测试以FluA为靶标的试剂批内重复性测试

2021年6月2日-6月4日，由中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所，中国医促会分子诊断学分会主办的全国第七届病原体核酸检测新技术高级培训班在江西南昌召开。来自全国疾控系统、海关、医院、大学和研究所等单位在分子诊断领域经验丰富的专家、业务骨干及相关医疗器械公司的行业精英等600余人通过线上线下方式参加了此次会议。天隆科技携带“天隆智造”家族成员：新晋颜值担当——GeneRotex 48全自动核酸提取仪，实力担当——Gentier 96E全自动医用PCR分析系统，便携小可爱——Gentier mini便携式荧光定量PCR分析系统，贴心小助手——GeneMix 48全自动样品处理系统亮相此次会议，吸引了众多专家及同道驻足展位交流，感受天隆“品牌赋能智造”的魅力！本次大会还为大家准备了精美太阳伞，高级笔记本，通过扫码关注，即可获得礼品相送。你关注了吗？新品专场介绍GeneRotex 48/GeneMix 48本次会议中，天隆科技市场推广部产品经理朱君带来《自动化高灵敏核酸检测设备在感染性疾病诊断中的应用》汇报。大体系高灵敏全自动核酸提取仪——GeneRotex 48是天隆科技专为大体积样本或多样本混检而量身定制的最新方案，助力IVD行业各位“打工人”更快、更准、更便捷完成核酸提取。天隆科技推出的全自动样品处理系统——GeneMix 48，可一次实现48个采样管的开关盖、样品分杯、蛋白酶K/内参添加等功能，全程自动化，有效提高工作效率，将您从繁琐机械操作中解放出来，并且5重安全措施可有效保障人员安全。手把手教学大会最后在江西省疾病预防控制中心为各位老师提供了手把手教学环节。天隆科技技术服务经理孙良玉为大家现场演示了GeneRotex 48和Gentier 96E的操作流程，针对各位老师的疑点和难点问题，进行了详细解答、交流和讨论。天隆产品的便捷及精准、带教人员的专业与耐心受到了各位参会老师的一致好评。大咖现场论道# 许文波中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所研究员/所长许教授在呼吸道病毒感染的检测策略中提到，病毒溯源在疫情防控中至关重要，工作人员需要提高病毒检测分析能力，从而实现病毒溯源的重要工作。# 董小平中国疾病预防控制中心研究员/主任董教授在Current situation of COVID-19 in China的报告中讲到，目前国内疫情主要是输入感染者或污染物品引起的聚集性病例，防控策略要采取从入关到社区的闭环式管理。同时通过流行病学证据及病毒学证据寻找可能由进口冷冻食品的外包装引起的“物传人”证据。而对于暴发/聚集性疫情，推荐采用核酸检测技术进行全员筛查、大规模筛查以及基于风险评估的重点筛查。# 朱凤才江苏省疾病预防控制中心主任医师/副主任朱主任重点为大家介绍了新冠疫苗的相关知识。他讲到由于疫苗种类差异、个体化免疫应答差异、病毒突变等因素，免疫功能低下的癌症和器官移植者更容易发生“突破性感染”。此外，突破性感染还可能与性别和年龄相关，女性和60岁以上可能是突破性感染的高危人群。目前COVID-19疫苗突破性感染无法避免，但病例具有症状轻、康复周期短、诱导的中和抗体水平高的特征，疫苗可有效降低感染率并预防重症。为预防突变性疫苗感染，可能仍需群体免疫、维持标准防护措施，快速接种对应疫苗来实现。本次培训班介绍了新冠及其他病原体检测的最新研究进展，分析了分子诊断新技术发展和应用的挑战和趋势。未来，天隆科技会继续坚持自主创新，不断丰富产品链，为分子诊断从业者提供多样解决方案，助力病原体核酸检测水平提升，守护人类健康！

8月末，华大基因基因检测在感染性疾病方面取得了新突破，推出了一款名为“PTseqTM呼吸道感染病原微生物靶向高通量基因检测”的产品，重新定义病原测序产品的应用方向，将重点放在呼吸系统感染的核心需求上，积极推动了感染性疾病的精准诊疗发展。呼吸道感染是临床最常见的感染性疾病之一，其病原组成复杂多样，约50％的患者很难明确病原体。因此，进行及时准确的病原学诊断，尽早确定目标病原并进行针对性用药治疗，是改善患者预后、降低病死率和后遗症发生率的关键。因此，华大基因积极研发基因检测产品，帮助医疗机构实现呼吸道感染病原体的精准诊断。华大基因基因检测推出的这款产品利用了国产自主测序平台、专利引物设计系统以及独有的污染校正算法，基于tNGS技术进行检测。它不仅具备了测序技术的广谱性优势，还兼具了多重PCR技术的高灵敏度优势，同时也具备了检测性能与高性价比。其检测范围涵盖了268种靶标，包括227种病原微生物、30种耐药基因和11种毒力基因。它不仅能够覆盖95%以上的呼吸道感染常见核心病原体，还可以进行重点耐药基因和毒力基因的鉴定。华大基因基因检测产品能够全方位地帮助患者制定个体化的抗感染治疗方案，降低耐药性的发生风险，助力呼吸道感染的精准诊疗。此外，华大基因基因检测产品具有高性价比、省时省力的特点，聚焦患者核心需求，可以一步到位进行DNA病原体+RNA病原体检测，价格远低于mNGS检测技术。从收到合格样本到报告出具，整个检测流程只需不到18小时。基于华大基因mNGS产品PMseq®十年检测积累的大数据，这款华大基因基因检测产品采用靶向高通量测序（tNGS）技术，使其在有效性和性价比之间取得了平衡，提升精准防控感染的技术可及性，为更多呼吸道感染患者精准诊疗提供另一种选择，普惠大众。这款产品将成为华大基因病原微生物检测产品体系的有力补充，推动感染性疾病的精准诊疗发展。一直以来，华大基因基因检测利用先进的测序技术，致力于为患者提供更加精准、高效和经济的感染性疾病诊断产品。通过提供准确的病原检测结果和个体化的治疗方案，华大基因基因检测产品为患者提供更优的治疗选择，帮助医疗机构更有效地应对呼吸道感染等感染性疾病。该产品的发布，为未来的感染性疾病诊疗研究提供了更广阔的空间。

呼吸道病毒感染由于其高致病率及致死率，成为世界各国人民发病和死亡的主要原因之一。引起上呼吸道感染的病毒种类较多，尤其是甲型流感病毒新型H5N1（FluA-H5N1）、甲型流感病毒新型H1N1（FluA-H1N1）、乙型流感病毒（FluB）、冠状病毒（SARS-CoV）、中东呼吸综合征冠状病毒（MERS-CoV）、新型冠状病毒（2019-nCOV）等病毒在近一个世纪以来的多次大规模流行，给人类的生命健康和社会经济带来巨大伤害。这些上呼吸道感染的病毒引起的感染症状和季节性流行病毒特点相似，为避免造成群聚传染，快速鉴别呼吸道病原体的检测显得尤为重要。据麦姆斯咨询报道，近期，拱北海关技术中心等科研机构于《热带医学杂志》发表研究性论文，将RT-qPCR技术和数字微流控技术相结合，建立一种基于数字微流控RT-qPCR芯片技术的上呼吸道易感病毒多靶标快速检测方法。实现一种以少量样品同时快速检测多个呼吸道病原体的检测技术。该方法满足了目前市场对呼吸道病原体的高诊断率的需求，同时还为精准医疗提供了新的检验手段。为实现一个芯片多个项目的检测功能，研究人员将6个引物（2019-nCOV-N引物、2019-nCOV-Orf1引物、FluA-M1引物、FluB-HA引物、SARS-65引物、MERS-62引物）和相应探针分别预存到芯片的各个反应点中，并向反应点添加引物预存液，而后将芯片置于风干干燥箱中干燥，接着将干燥好的芯片取出进行封装处理。图1 数字微流控芯片结构示意图：芯片设置6个反应点，从左往右依次是预存的2019-nCOV-N引物、2019-nCOV-Orf1引物、FluA-M1引物、FluB-HA引物、SARS-65引物和MERS-62引物为了验证该数字微流控RT-qPCR芯片的检测性能，研究人员使用TE缓冲液将阳性质粒10倍稀释为10 pg/μL至0.01 fg/μL的浓度梯度，并根据RT-qPCR反应体系和反应程序，完成各单项目的引物、探针在AGS4800实时荧光定量PCR仪上的检测下限检测。同样，对相应浓度的质粒使用数字微流控芯片完成实时荧光RT-qPCR反应。如图2所示，6种引物在AGS4800实时荧光定量PCR仪上均可检出对应的阳性质粒，对于10 pg/μL的质粒均可在20个循环之前检出，且45个循环内无非特异性扩增。图2 检测试剂测试结果此外，FluA、FluB、SARS-CoV、MERS-CoV、2019-nCOV这5个检测项目使用PCR仪的25 μL体系最低可检出0.01 fg/μL的质粒，而数字微流控RT-qPCR芯片法每个反应最低可检出0.1 fg/μL的质粒，与PCR仪2 μL体系灵敏度相同。根据公式，质粒拷贝数浓度 =（质粒浓度×摩尔系数）/（质粒长度×碱基对平均分子量），分别计算2种方法中的每个反应的质粒拷贝数可得知，上述2种方法在2~25μL的体系下检出限均为12~15拷贝/反应，检测下限基本一致（图3）。图3 数字微流控RT-qPCR芯片的检测下限测试结果最后，为明确该数字微流控RT-qPCR芯片的检测灵敏度和特异性，研究人员同时使用数字微流控RT-qPCR芯片和RT-qPCR仪检测20个临床标本（包含新冠病毒2例，甲型流感8例，乙型流感6例）的5项呼吸道病毒项目，共计100个测试反应，见表1。结果显示微流控芯片除样品7出现一次对甲型流感病毒漏检外，其余阳性样品均检出对应病毒，对于20个样品的5种病毒的总灵敏度为94%，总特异性为100%。Kappa值 = 0.962，两个检测方法具有高度一致，并且差异有统计学意义（P 0.05）。表1 PCR仪和微流控芯片检测临床样本结果汇总综上所述，该研究将多个RT-qPCR检测项目与数字微流控检测芯片结合，建立了在一次反应中同时检测多个项目的数字微流控RT-qPCR芯片。该数字微流控芯片RT-qPCR法可以以最少的样本量快速检测多个项目，自动化程度更高，可以提高上呼吸道病毒检测的效率，提高应对大规模疫情的快速反应能力。论文链接：http://www.rdyz.cbpt.cnki.net/WKD/WebPublication/paperDigest.aspx?paperID=2d5c44d8-8305-4cbb-9dca-0c8aba6fc75d

近日，继在北京、广州陆续开通“居家快检”服务之后，美团买药又在上海市浦东区、宝山区等地开通试点服务，可一次性检测甲流、乙流、肺炎支原体等12种常见的呼吸道感染病毒或细菌。多联检测有利于实现对呼吸道感染的精准诊疗，符合未来发展趋势。《证券日报》记者了解到，目前，多家体外诊断上市公司纷纷加快了在多种呼吸道病原联合检测领域的布局。快速鉴别多种病原体由于感染不同呼吸道病原体的临床症状和体征较为相似，例如：发热、咳嗽或头痛等，但病理、病程和治疗方法却存在显著差异，因此，鉴别呼吸道的病原体对患者来说十分关键。呼吸道多联检测能够快速鉴别多种呼吸道病原体，在临床上具有重要意义。已有上市公司推出了相关产品或服务。金域医学基于不同检测平台，开展了呼吸道病原体核酸6项、呼吸道多种病原体核酸检测18项及上呼吸道多种病原体靶向测序107种等检测项目。金域医学证券部相关负责人向《证券日报》记者表示：“主要考虑到幼龄儿童频繁感染且采样困难，一次无创采样可同时检测多种病原体，这样不仅解决诊断时效性、辅助明确致病病原体及指导用药问题，还能缓解患者不断往返医院的麻烦和焦虑情绪。”“如果患者同时感染了新冠病毒和肺炎支原体，传统的单病原体检测方法大多只能检测到其中一种病原体，而多联检测可以同时检测出多种病原体，不仅避免了多次检测的麻烦，还能对症下药，大幅提高病人诊疗效率。”一名体外诊断业内人士告诉《证券日报》记者。记者在走访中了解到，目前呼吸道疾病多联检测主要应用于医院、社康中心等场景。深圳市福田区万春堂连锁药房相关工作人员告诉《证券日报》记者：“现在药店有新冠病毒抗原检测试剂盒可以购买，但没有呼吸道多联检测产品，多联检测过程中需要专业人员，在附近的社康中心可以做这项检测。”企业推进多联检测布局在试剂盒研发方面，华大基因方面向《证券日报》记者表示，公司研发的多联检测相关试剂盒已获得国内NMPA和欧盟CE准入资质，检测靶标包括甲型流感病毒、乙型流感病毒等在内的18个病原体。凯普生物自主研发的“甲、乙型流感病毒及新型冠状病毒2019-nCoV核酸检测试剂盒（荧光PCR法）”已获得CE证书，目前暂未取得国内注册证，相关专利“一种新冠病毒、甲乙流感及呼吸道合胞病毒检测试剂盒”已获得国家知识产权局授予发明专利权。此外，明德生物研发的甲、乙型流感病毒及新冠三联检产品也正在注册中。在应用端，美团买药“居家快检”实现了呼吸道多联检测应用场景的延伸。据了解，“居家快检”项目有经过培训的专业送检人员，用户下单成功后，半小时左右会有送检员带着采样盒上门收集样本，完成消毒、封签等环节后，将样本送往实验室进行检测，大概3个小时，检测报告可在小程序查询。华鑫证券研报认为，尽管多联检测的研发周期长，注册认证壁垒高，但其更符合呼吸道疾病的快速诊断需求，是未来发展趋势。

近日，中国农业科学院作物科学研究所作物分子育种技术和应用创新团队鉴定了RfxCas13d靶向RNA引发“反式切割”活性的基本特征，研制出基于RfxCas13d、LwaCas13a、LbCas12a与AsCas12a的多套核酸检测工具，并研发出田间实时可视化灵敏定性定量检测方法，为动植物病原体检测提供了高效、低成本的开发途径，具有广阔的技术开发场景与应用价值。相关研究结果在线发表在《中国科学：生命科学（Science China-Life Sciences）》上。 据谢传晓研究员介绍，植物真菌性病害、细菌性病害及病毒性病害严重危害作物生产与品质安全，如禾谷镰孢菌和拟轮枝镰孢菌是玉米穗粒腐、茎腐病、小麦赤霉病的罪魁祸首；水稻黑条矮缩病毒则通过灰飞虱在水稻、小麦和玉米宿主之间迁移传播，严重威胁水稻、小麦和玉米生产。建立快速、准确、灵敏及便携的病原体诊断技术，可为病害的早期预警与绿色防控提供重要依据。 　　针对以上植物病害病原体，团队成员研制了多套基于CRISPR-Cas12a和CRISPR-Cas13系统“反式切割”活性的病原体核酸诊断技术。通过优化样本处理方法，可实现田间实际样本粗提物稀释液的灵敏检测，且可利用小型手持式荧光仪或试纸条进行田间现场定性读取结果。此外，以禾谷镰孢与拟轮枝镰孢菌复合侵染为样本，建立了基于Cas12/Cas13联合应用的复合检测，实现了一个检测能诊断判读多种病原，进一步拓展了检测工具的应用场景与潜力。此外，该系列检测方法还可应用于食品安全质量检验、动植物检疫、转基因检测、动植物群体的基因分型与基因表达检测等，具有重要的应用价值。 　　该研究得到国家自然科学基金和中国农科院科技创新工程等项目资助。

2021年12月，齐碳科技通过5年的自主研发，成功推出国内首台商业化的纳米孔基因测序仪QNome-3841，并宣布首个生产基地竣工，正式开启纳米孔基因测序国产化时代。2022年6月，齐碳科技发布纳米孔基因测序仪QNome-3841hex，标志着国产纳米孔基因测序仪开始了矩阵化发展，这也为灵活测序场景提供全新的解决方案，将更好地满足市场应用的多元需求。 2023年8月，齐碳隆重推出自主研发的中通量纳米孔基因测序平台QPursue，该平台涵盖纳米孔基因测序仪QPursue-6k和QPursue-6khex及其配套芯片QCell-6k，代表着国内纳米孔基因测序技术的最前沿水平，标志着国产纳米孔基因测序仪向中高通量进阶。齐碳秉承从上游推动行业发展的理念和对前沿技术的探索精神，保持开放、合作的态度，期待和产业同仁携手共进，探索国产纳米孔基因测序技术在多场景中的优势和广阔的市场前景，构建纳米孔基因测序的生态平台，共同为中国医疗健康事业的稳健发展贡献智慧和力量。

全国第七届病原体核酸检测新技术高级培训班将于2021年6月1-5日在江西省南昌市（中共江西省委滨江宾馆）采用线上线下结合形式召开。本次培训由中国医促会分子诊断学分会和中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所共同主办，江西省疾病预防控制中心承办，《中华实验和临床病毒学杂志》编辑部、《Biosafety and Health》编辑部、《病毒学报》编辑部、《Biomedical and Environmental Sciences》编辑部、《China CDC Weekly》编辑部和《Zoonoses》编辑部共同协办。北京深蓝云生物科技有限公司将携带相关产品亮相在此次会议，我们将在5号展位恭候您的参观咨询。本次培训班主要培训目的是为了跟踪分子检测技术在新冠病毒等病原体应用的最新进展，推广成熟的核酸检测技术，促进相关技术人员的学术交流，提高专业人员的相关知识和技术水平，培养基因检测专业高品质人才。数字PCR技术（Digital PCR)作为新一代核酸分子绝对定量技术。相较于qPCR，数字PCR可直接数出含有DNA分子的微分区的个数，通过泊松分布算法对起始样品进行绝对定量。具有灵敏度高、精确度高、对抑制物的耐受度高等优势。在感染性疾病中病原体检测和传染病预防监测中，数字PCR技术可针对病原微生物核酸拷贝数直接定量，从而实现灵敏、精准、快速、特异性地鉴定和分型，同时实现难培养和不能培养的病原微生物的快速检测。基于naica微滴芯片数字PCR系统，深蓝云提供全自动封闭式的三色和六色荧光通道高灵敏数字PCR检测病原体解决方案，无需标准品和标准曲线，只需一步上样，将PCR反应体系分成～30000个纳升级单层平铺的微滴阵列，实现核酸的单分子扩增，通过泊松分布获得核酸的拷贝数，是真正的绝对定量检测方法，具备高灵敏度、高精准度、高分辨力、高耐受力等技术特征。在保持高特异、快速检测的同时，实现全自动化、全封闭，确保环境和样本安全。同时深蓝云提供病原体数字PCR检测试剂，快速、特异、高灵敏的区分感染何种病原体，有助于病原体的早期鉴定，降低误诊、漏诊的发生概率，提供自动质控和原始结果可视化回溯功能，排除假阳性结果，同时由于不同病原体的治疗方案不同，同样有助于患者的临床治疗和地方流行性传播的预防。工作流程温馨提示：会议注册本次培训班采用线下和线上结合教学，学员代表、嘉宾等参会人员可通过微信扫描会议二维码或者复制链接（http://m.jxruishi.cn/col.jsp?id=123）进入在线注册页面，按要求逐项填写注册信息。线下参会学员注册截止日期为2021年5月25日，请合理安排时间完成注册。* 注意事项：1、本次会议线下参会名额有限且不接受现场报名。且会议房间有限，请参会代表尽快完成注册并做好房间预订，线下参会注册截止时间为5月25日24点。2、未在大会平台预订住宿的参会代表，组委会将不负责预留房间，请自行解决。3、若注册时选择住房登记后因故不能参会，或行程发生变化请与会务组老师联系，避免造成不必要的损失。4、关于学分证获取。本次培训班学分证是各省市疾控中心定向推荐学员参加学习并参加考试且成绩合格（60分）后方可获得学分证。本次考试为线上平台形式，请在考试平台开放时间段内登陆并完成考试。5、会议视频有回放，回放有效期为30天。6、如有学员想咨询讲者相关问题，会议期间请在直播页面“Q&A”中用“咨询讲者姓名+问题”格式发送内容，讲者将酌情选择问题回复，问答统一整理后发布在平台首页“Q&A”版块内。深蓝云展台产品展示naica下一代数字PCR平台naica全自动微滴芯片数字PCR系统，以Sapphire芯片（全自动）或Opal（高通量）芯片为耗材，形成由25,000-30,000个微滴组成的单层二维阵列，该单层微滴阵列形成后直接进行PCR扩增实验。反应完成后对微滴进行三通道成像，从而对起始核酸浓度进行绝对定量。仅需2.5小时即可获取结果。▲ naica微滴芯片数字PCR系统Echo正倒置一体显微镜Echo正倒置一体显微镜兼具正置和倒置显微镜的功能，方便小巧，一机多能，可以非常便利地通过旋转实现正倒置配置的切换；无传统目镜设计，拥有明场，相衬，荧光，偏光等观察方式，可兼容活细胞观察，病理切片，免疫组化，免疫荧光，荧光原位杂交等。▲ Echo正倒置一体显微镜Azure Cielo™ 实时荧光定量PCR系统Azure Cielo™ 实时荧光定量PCR系统来自于美国Azure Biosystems公司，配备高品质温度模块，采用光纤和CMOS的检测系统，高能LED的激发，提供高灵敏和可靠的数据。▲ Azure Cielo™ 实时荧光定量PCR系统

感染性疾病是由病原微生物（细菌、病毒、真菌、寄生虫等）引起的疾病的统称。据统计感染性疾病死因占全部死因的25%以上，是当今世界严重威胁人类健康的重大疾病。长期以来感染性疾病的诊断和疗效监测一直依靠形态学、免疫学、分子生物学以及病原体分离培养等方法，这些方法各有优缺点，在感染性疾病的辅助诊断中发挥着重要作用。近年来新兴的病原体宏基因组高通量测序（metagenomic next-generation sequencing，mNGS）技术，是指采用高通量测序技术对特定临床样本中所有核酸进行测序，并通过生物信息学分析判断样本中是否存在病原体的检测方法。与传统基于分离培养的病原体检测技术相比，该技术从理论上讲能够无偏倚的检测各类微生物（如：病毒、细菌、真菌、寄生虫等），包括难以培养的病原体以及新发病原体。mNGS技术是一个开放的分析和诊断系统，对于mNGS技术所检测的病原体数量未有明确规定，根据不完全统计，开展相关检测服务的机构已纳入的病原体有近万种，包括细菌、病毒、真菌和寄生虫等，为疑难危重症及罕见病原体感染的诊断提供了有效的技术手段。在特定的临床应用场景下，具有临床意义。针对mNGS的临床应用，目前已有多个临床专家共识。结合该技术的特点，我中心对相关产品的临床应用、设计开发、验证确认等方面进行了专题研究，现将当前的几点考虑总结如下。一、关于产品预期临床使用场景基于mNGS技术的产品与常规的病原体检测产品相比，具有检测过程较为复杂、易受到人源基因的干扰、检测时间较长、结果解读专业要求高、检测成本高等特点，一般用于传统检验方法未能给出明确病原学结果从而影响患者准确诊疗的感染性疾病、新发突发传染病、危急重症或排除其他发热疾病。推荐临床通过拟诊先行传统微生物检验及常规分子生物学产品检测常见病原体，不盲目使用mNGS技术。在必要或紧急情况下，如危急重症、群体性感染事件等，可考虑与常规方法同步进行检测。对常规微生物学检查容易明确的病原体不建议进行mNGS检测。从临床角度，mNGS结果不能单独作为病原学确诊或排除的证据。适用场景举例如下：（一）患者表现为发热或发热症候群，病因未明确（符合不明原因发热定义），考虑感染或不除外感染，但规范性经验抗感染治疗无效，在应用常规技术检测的基础上，开展mNGS产品检测。（二）各种原因导致患者急危重症表现，不除外感染所致，或考虑继发或并发危及生命的严重感染，在常规检测的基础上，开展mNGS产品检测。（三）免疫受损患者疑似继发感染，常规病原学检查未能明确致病原或/和规范性经验抗感染治疗无效，建议进一步完善常规病原学检测的同时，或在其基础上，开展mNGS产品检测。（四）疑似局部感染，病原学诊断未明确、不及时处理则后果严重时，在常规检测的基础上，开展mNGS产品检测。（五）高度疑似感染性疾病，但病原学诊断未明确且常规抗感染治疗无效，建议进一步完善常规病原学检测、处理原发感染灶，调整经验抗微生物治疗方案的同时开展mNGS检测。（六）慢性感染，或慢性疾病不除外感染，尤其是二者临床表现相似、难以鉴别时，病情严重或抗感染治疗疗效不佳需要明确病因，建议在完善常规检测、调整经验治疗的同时开展mNGS产品检测。（七）其他患者疑似特殊病原体感染或从相关流行病学角度考虑需要进行mNGS产品检测。二、关于产品的检测样本及适应证mNGS产品在目前的临床应用研究中涉及多种适应证，如：中枢神经系统感染、血流感染、局灶性感染、呼吸道感染、感染性腹泻等,对于具有相关临床症状的病例，应在按照现有诊疗流程进行标准化诊疗的基础上开展检测。针对患者感染部位不同，采集的样本类型也不同，产品适用的样本类型主要包括：静脉血、脑脊液、痰液、肺泡灌洗液、胸腔积液、腹水、组织、局灶穿刺物、粪便等多种类型。对于样本的采集，应注意以下两个方面，一是，对于无菌体液，如静脉血、脑脊液、胸腔积液、腹水等，需按照严格的无菌操作采集样本，采集的样本须置于无菌容器内；二是，对于有菌部位的样本，如痰液、肺泡灌洗液、咽拭子等，应标明样本的采集部位，在样本采集过程中应尽量避免引入该部位的正常菌群，以免干扰后续检测结果。采集的样本应尽量选取感染部位的体液或组织，可提高检测结果的可信度。若感染部位的样本采集难度较大，可选择外周血液样本，但有可能会降低检测结果的准确性。产品适用的样本类型推荐优先选择无菌采集的样本。关于不同适应证适用的样本类型举例见表1。表1.产品适应证与适用的样本类型举例三、关于产品检测病原体种类范围mNGS产品检测原理为对临床样本中存在的病原体核酸进行无偏倚的检测，从产品检测的技术角度考虑，除新发病原体外，产品的检测范围不应局限为某一种或某几种常见病原微生物，应为产品适应证、适用样本中所有可报告的病原微生物。产品所检测的病原微生物受几个方面的影响，一是产品配套使用的参考数据库及生信分析过程涵盖的病原体种类，如数据库中未涵盖某种病原体基因组参考序列，则该类病原体不在该产品的检测范围之内；二是检测样本类型、核酸提取等会直接影响产品病原体的检测种类，不同的样本类型可能检出的病原体会存在差别，如脑脊液样本检出的病原体主要以中枢神经系统感染的病原体为主，而粪便样本检出病原体主要为消化系统感染的病原体。不同的核酸提取方式对病原体的检出种类也会产生影响，如核酸提取过程未考虑破壁，则产品可能不适用于具有厚细胞壁的病原体检测；三是产品检测的目标物是否包括不同类型的核酸靶标，如产品检测的靶标仅为DNA，则RNA病毒不在该产品的检测范围之内。相关产品的申请人应依据产品设计、适用的样本类型、适应证等多个方面综合考虑产品预期用途，确定合理的病原体检测范围。四、关于产品配套使用的数据库mNGS产品检测结果，除了产生可用于比对的微生物短片段序列外，还存在大量人源、环境微生物、试剂含有的微生物等背景核酸序列，必须依靠生物信息学手段对其进行筛选、过滤、比对，最终给出微生物物种注释。结果分析过程中，数据库的使用是必需的，而且是影响mNGS产品检测结果准确性的重要因素。目前相关产品在选择配套使用的数据库时，一般会存在两种情况，一种为直接选择公共数据库，如：NCBI nr/nt database、NCBI RefSeq database等；另一种为自建数据库，对公开数据库中基因组序列进行挑选、整理、分类，然后通过程序软件将收集到的基因组序列整理成适用于本产品的微生物及人源序列比对数据库。针对成熟的产品，建议根据产品特点及临床需要，使用临床应用级的自建数据库。在数据库的构建、使用和管理方面应注意以下问题：（一）需要考虑数据库的全面性以及纳入物种在分类学上的代表性，对于同一种微生物，往往存在具有遗传差异的不同亚型或株，所以在选择基因组时，应考虑到微生物的遗传多样性，尽可能选取具有高度代表性的不同亚型或株的高质量基因组。（二）无论所选择的参考基因组的来源如何，申请人需要考虑其注释的准确性及序列的完整性，防止注释错误、命名错误或者代表性不足临床相关微生物列入库。（三）申请人应在有必要的基础上，对纳入库中的微生物的潜在的临床意义进行注释，让结果解读人员对检测的微生物有基本的认识和判断。（四）由于病原体在自然状态下是不断发生进化变异的，致病性也是动态变化的，所以需要及时（或定期）对参考数据库中的基因组信息及临床致病证据进行更新。（五）当数据库发生可能影响病原体判读结果的更新后，应对更新后的数据库进行验证与确认。（六）应构建全面的人源基因序列数据库，并评估最新版国际人类参考基因组和用于构建人源基因序列数据库所选择的参考基因组差异，进而评价人源基因序列数据库的代表性，人源基因序列数据库用于在生信分析过程中过滤人源基因数据。（七）mNGS检测产品检测过程中一些样本中会存在背景菌序列、环境微生物及实验室残留微生物，这些基因序列可造成测序污染，导致假阳性结果产生；另外，一些样本（例如呼吸道样本）会存在定植微生物，因此，针对产品需要构建检测背景库用于过滤污染序列、区分背景病原体和致病性病原体。五、关于测序数据要求人体不同的样本类型单位体积含有的细胞数量有巨大的差异，最终的测序数据由微生物序列和人源基因组序列组成，不同的人源细胞含量、病原微生物感染的类型和病原体含量的高低都会影响测序数据中目标微生物序列占比，如组织样本的人源细胞含量比较高，测序所得的序列数据中相应微生物的占比可能较少，因此，mNGS产品在不同的样本类型中，产品分析灵敏度会存在差异。该类产品可通过增加测序数据量来提高待检出的微生物数据量，或通过富集微生物含量以提升微生物序列的占比，从而提高微生物的检出率。一般而言，在一定范围内随着测序数据量的增加，产品的灵敏度会有所提升。因此，为了保证产品具有满足临床要求的灵敏度，针对某一样本类型，应保证一定的测序数据量。产品在设计上，一般分为去除宿主人源基因与未去除宿主人源基因两种设计，去除宿主人源基因后，产品产生的相应数据量会大大减少。在缺乏有效的人源宿主去除步骤的情况下，单个样本检测所需的数据量应充分评估并设立合理的指标要求。测序模式一般为单端测序和双端测序，双端测序所花费的经济成本及时间均高于单端测序，如产品设计选择单端测序，为确保序列比对的准确性，避免因同源错配导致的序列比对错误，可参考相关专家共识的要求，如测序序列单端读长当前建议不少于50bp。为了保证数据分析的可靠性，产品检测的下机数据应有一定的质量要求。下机数据经拆分后即得到每个样本的测序数据，需要进行数据质量过滤，包括过滤测序接头、低质量序列、低复杂度序列、重复序列等，将获得的高质量读长序列作为微生物鉴定的输入数据。一般而言，数据应达到以下指标：Q30碱基数量占比80%、接头污染比例不超过1%、有效序列长度不小于50bp、数据的有效比对率应大于70%等。六、关于产品阳性判断值的研究产品阳性判断值的研究，主要是为了区分真阳性、真阴性，以及判断实验过程中污染的微生物等。基于mNGS技术的产品，阳性判断值应包含度量标准，例如检测结果中能够比对到数据库中的微生物的序列数、对某种微生物的基因组覆盖度等，可通过ROC曲线分析的方法对产品的阳性判断值进行研究。在阳性判断值研究过程中应注意，胞内菌和厚壁微生物检出率低，因此即使在检测报告中某种/某些胞内菌/厚壁菌检出序列数不高，也要考虑其为致病病原体的可能。七、关于产品检测结果的报告用于临床辅助诊断的mNGS报告应包括测序总序列数、检测病原微生物列表、检出病原特异序列数量、检测病原范围、覆盖度、测序深度、检测方法及检测技术说明。需要注意的是，检测结果仅代表临床样本中检出或未检出某微生物的核酸片段，不能明确该物种与感染的关系，即使阴性结果也需结合临床表现及其他检查结果进行综合判断。对于胞内菌和厚壁微生物的检测，因技术原因存在一定的偏倚，如对于胞内感染菌因释放到体液中含量较少而导致检测敏感性偏低，对具有较厚细胞壁的病原微生物如真菌感染，可能由于核酸提取效率较低，相对检出率低，导致临床检出率和敏感性较低。因此即使在检测结果中某种胞内菌/厚壁菌检出序列数不高，也要考虑其为致病病原体的可能。mNGS信息量大，临床应用过程中，检验机构依据检测结果出具检验报告时，有些情况下不可能在结果中列举出所有检测到的病原体，对于罕见病原体、胞内菌等，可能因检出序列数少、微生物丰度低，在报告中未能列举，如果临床有疑似特殊病原体的感染，应该可以追溯原始数据库进行查询。八、关于产品验证与确认的考虑基于mNGS技术的产品，因其预期用途涵盖的病原体的种类非常广，产品验证与临床试验应对检测范围内的病原体进行有充分覆盖度、有充分代表性的性能评价。产品临床试验在入组人群上，应与产品临床适用人群一致。在对比方法选择上，应选择临床参考方法作为对比方法，临床参考方法应综合病原体分离培养、患者的影像学检查结果、基于宿主反应的检测结果等。同时，由mNGS获得致病病原体后，临床上会针对病原体进行精准治疗，治疗后患者的临床表现和治疗效果的随访结果也可以作为临床试验对比方法的证据。临床试验过程中，应关注试验体外诊断试剂对一些对于胞内感染菌、具有较厚细胞壁的病原微生物等的临床性能研究。参考文献：1.宏基因组分析和诊断技术在急危重症感染应用的专家共识[J].中华急诊医学杂志,2019(02):151-155.2.宏基因组学测序技术在中重症感染中的临床应用专家共识(第一版)[J].中华危重病急救医学,2020,32(05):531-536.3.《中华传染病杂志》编辑委员会.中国宏基因组学第二代测序技术检测感染病原体的临床应用专家共识[J].中华传染病杂志,2020,38(11):681-689.4.中华医学会检验医学分会.高通量宏基因组测序技术检测病原微生物的临床应用规范化专家共识[J].中华检验医学杂志,2020,43(12):1181-1195.5.宏基因组高通量测序技术应用于感染性疾病病原检测中国专家共识[J].中华检验医学杂志,2021,44(02):107-120.6.中华医学会检验医学分会.宏基因组测序病原微生物检测生物信息学分析规范化管理专家共识[J].中华检验医学杂志,2021,44(09):799-807.7.Charles Y. Chiu and Steven A. Miller Clinical metagenomics Nature Reviews Genetics 2019,20, 341-355.8.fda. Infectious Disease Next Generation Sequencing Based Diagnostic Devices:Microbial Identification and Detection of Antimicrobial Resistance and Virulence Markers(Draft)

瑞典卡罗林斯卡研究所科学家开发了一种使用DNA纳米球检测病原体的新方法，旨在简化核酸和病原体检测技术。这一最新研究有望催生一种低成本的检测方法，在不同情况下简单、快速地识别各种核酸。相关论文发表于最新一期《科学进展》杂志。新方法将分子生物学(DNA纳米球生成)和电子学(基于电阻抗的定量)相结合，产生了一种开创性的检测工具。为此，团队修改了一种名为环介导等温扩增技术(LAMP)的DNA扩增反应，如果样本中存在病原体，就会产生1—2微米的DNA纳米球。然后，这些纳米球被引导通过微小的通道，并在穿过两个电极时被识别出来。该系统紧凑高效，能在1小时内检测出多达10个目标分子，非常灵敏且快速。在新冠疫情期间，基于蛋白质的诊断方法被广泛采纳，但这些方法需要耗时开发高质量的抗体。相比之下，基于核酸的方法更容易开发，灵敏度更高且更灵活。这种检测方法有望加快新诊断试剂盒的推出。这些试剂盒将能大规模生产的电子产品与冻干试剂相结合，或成为一种廉价、可广泛部署和可扩展的检测方法。研究人员表示，快速准确地检测出遗传物质是诊断的关键，尤其在新型病原体出现时。目前，他们正在积极探索将这项技术整合到环境监测、食品安全、病毒和抗微生物耐药性检测等领域，并为其申请了专利。

全国第七届病原体核酸检测新技术高级培训班将于2021年6月1-5日在江西省南昌市采用线上线下结合形式召开。本次大会由中国医促会分子诊断学分会和中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所共同主办，江西省疾病预防控制中心承办，中华实验和临床病毒学杂志》编辑部、《Biosafety and Health》编辑部、《病毒学报》编辑部、《Biomedical and Environmental Sciences》编辑部，《China CDC weekly》编辑部和《Zoonoses》编辑部共同协办。本次大会特邀请来自全国疾控系统、研究所、海关、医院和大学在分子诊断领域经验丰富的专家授课，介绍检测新冠及其他病原体的研究进展，分子诊断新技术发展和应用的挑战和趋势。展台信息睿科生化科技（广州）有限公司展位号：34号时间：2021年6月1-5日地点：江西省南昌市中共江西省委滨江宾馆会议日程新冠疫情全球防控策略、疫苗、诊断、治疗和基础研究进展新冠病毒的核酸和免疫学检测进展及质量控制新冠病毒的变异、流行病学和公共卫生措施干预分子诊断技术在其它重要病原体的应用进展分子诊断新技术实验现场培训产品介绍#01Vitae 100全自动核酸提取纯化仪可广泛用于分子诊断、临床检验、和分子生物学研究等领域，提供核酸自动化解决方案的同时，兼备PCR体系构建功能。#02Vitae 200全自动液体处理工作站应用于各类生物学实验室及生产厂家，可根据客户的特定需求进行定制化升级， 包括1+8通道模块、震荡模块、加热制冷模块、6-15盘位选择、软件特定开发等。#03Vitae M96全自动移液工作站 一款高效、精准、高性价比的96通道全自动移液工作站，可以进行板复制、逐列梯度稀释、Elisa实验、客户定制等功能。

会议预告目前，呼吸系统感染仍然是儿科常见的感染性疾病之一。但儿童免疫系统发育不完善,往往导致呼吸系统感染性疾病症状隐匿、不典型且临床诊断困难。儿童呼吸系统感染性疾病病原学研究的相对滞后更造成临床上抗菌药物使用的不合理。因此，及时准确地进行病原学诊断，是临床选择合理治疗方案从而有效控制病情的关键。为进一步加强儿童呼吸系统病原学检测的临床认识，提高儿童呼吸系统感染性疾病的诊疗水平，普及呼吸道系统病原学检测新技术，同时加强临床医师、检验科医师以及院感医师等医务人员的交流与合作，由中华医学会杂志社和《中华儿科杂志》编辑委员会主办，华中科技大学同济医学院附属同济医院儿科承办的“儿童呼吸道非细菌病原学检测及诊断论坛”将于2021年 7月30日-8月1日在湖北省武汉洪广大酒店举行。特邀专家报告会议期间，天隆科技有幸邀请到华中科技大学同济医学院附属同济医院鲁艳军教授就《核酸检测技术在儿童呼吸道感染中的应用》开展专题讲座，探讨核酸检测技术在儿童呼吸系统感染性疾病病原学诊断的应用与发展。报告题目《核酸检测技术在儿童呼吸道感染中的应用》报告时间7月31日 15:10-15:40演讲嘉宾鲁艳军 教授副主任医师 硕士研究生导师华中科技大学同济医学院附属同济医院博士毕业于华中科技大学同济医学院，一直工作于同济医院检验科分子诊断与遗传室，从事各种疾病的分子诊断及咨询。参与多项国家自然基金和省级课题等的研究工作，累计发表SCI论文20余篇，参与编写《实验诊断临床指南》。先后利用基因测序平台、基因芯片平台，建立了多种感染性疾病、遗传病及个体化用药分子诊断方法。目前担任中西医结合检验分会分子诊断专业专业委员会委员和妇幼保健检验医学专业委员会委员。

分子诊断是指在人体之外，应用分子生物学方法，检测患者体内遗传物质结构或表达水平的变化，通过对人体样本(血液、体液、组织等)进行检测而获取临床诊断信息，进而判断疾病或机体功能的技术。而检测人体样本的关键步骤之一，是样本中的核酸（DNA和RNA）提取与纯化，核酸的质量直接决定了检测结果的有效性和准确性。新羿生物作为国内数字PCR行业领导者，搭建了以数字PCR、荧光定量PCR两大技术平台为核心的，包括从样本采集、核酸提取到试剂检测等一整套“高灵敏”检测整体解决方案，其中多款核酸提取产品经大量临床样本验证，现隆重推出：┃新冠病毒核酸提取新速度（目录号：#11022 #11023）为更好地应对新冠病毒的快速检测需求，进一步提升检测效率，新羿生物针对新冠病毒检测最常用的拭子样本，研发出病毒核酸快速提取纯化试剂， 经过不断的产品性能优化，可实现12min 完成病毒RNA提取纯化。产品特点操作简单：无需蛋白酶K，使用方便提取纯度高：对PCR扩增无抑制提取时间短：自动化提取，12min 完成拭子样本提取纯化提取效率高且对PCR反应无抑制┃病原体核酸提取：感染性疾病诊断急先锋（目录号：11004# 11005# 11019# 11020#）病原微生物是指可以侵犯人体，引起感染甚至传染病的微生物，包括真菌、细菌、病毒等。鉴定病原微生物的种类，判断病原微生物的感染程度，对于疾病诊断和治疗具有重要意义。病原检测样本类型十分复杂，涉及血清、血浆、脑脊液、肺泡灌洗液、痰液、胸腹水及组织等多种类型样本。如何充分裂解样本并高效提取病原核酸，是首要解决的问题。为此，新羿生物推出了病原体系列核酸提取试剂，以解决不同样本的核酸提取问题。产品特点试剂裂解性能优异：无需额外预处理，可从多种微生物中提取核酸。提取物兼容性好：所得核酸可直接进行qPCR、数字 PCR实验用于临床疾病诊断等。适用样本类型多：基质较为复杂的样本、血液、保存液、脑脊液、肺泡灌洗液、痰液、培养基中微生物（细菌、真菌）等样本。┃订购信息

以色列本-古里安大学和美国麻省理工学院的研究人员开发出一种高敏感度，节约成本的技术，只需在24小时之内，就能快速完成空气、土壤、水和农产品中的细菌性病原体检测。　　根据这项研究的领导者，正在本-古里安大学扎克伯格水研究所攻读博士学位的以斯拉奥洛夫斯基博士介绍，“现场样本中快速可靠的病原体检测对于公共卫生、安全和环境监测是至关重要的。目前在食品、水或临床应用上使用的方法需要依赖实验室以及花费大量的时间培养技术，比如在乳品业、废水和径流处理这样的活动中，需要在环境样本中实时监测病原体。　　这项发表在《水、空气&土壤污染》期刊网络版上的研究，定义了一个准确的、价格低廉的、高通量的以及快速的替代方法来检测不同环境样本中的病原。“这是首次在种类广泛的环境样本类型中，全面评估病原体浓度的研究，通过标准(或传统)方法，利用完整的并行测试，实现多病原检测。　　“我们能够在24小时内准确地确定土壤样品中的沙门氏菌，而传统的方法需要四到五天，而且需要分类，”以斯拉奥洛夫斯基博士说。“我们还成功地确定了一种致命的感染，铜绿假单胞菌，存在于气溶胶中，是国内污水处理系统中的产生的。结果表明，我们开发的技术提供了一种广泛的方法，在具有挑战性的环境样品中的快速，高效，可靠地检测出相对低浓度的致病微生物。　　为了评估这项技术，各种类型的环境样本，包括气溶胶，各种土壤类型，废水和蔬菜表面(番茄)，被同时侵入了沙门氏菌或铜绿假单胞菌。研究人员选择了这些病原是因为他们是主要的致病病原，在环境中有着较高的生存潜能，而且在浓度低的时候很难被准确地检测出来。　　“当这个方法应用于没有侵入病原的现场样本时，我们的方法显著优于标准方法，能够在收到样本一天之内检测出病原，” 以斯拉奥洛夫斯基博士说。“由于这个集中而且经济的检测程序告诉我们在一天之内重点检测哪里，因此我们不需要花费几天时间来检测数以百计的样本和子样本。”　　这个快速检测方法同时使用了两种技术，一个是用于微生物检测的进化的“MPN-type enrichment”技术，再加上广泛用于分子生物学用于实时监测DNA扩增的“qPCR”技术。　　“我们大大缩短了之前的方案，也不再使用任何名牌昂贵的试剂对DNA进行提纯和净化，也不用增加工作流程，从原始样品很容易地进行到qPCR实验，” 以斯拉奥洛夫斯基博士说。　　土壤、水和蔬菜样本的检测是高度敏感的(低至每一个细胞的测试)，研究人员认为需要额外的步骤来进一步提高检测水平，使得这项技术能够反映出气溶胶中的低病原浓度(特别是低浓度感染剂量)。　　研究人员推荐今后用这种方法来检测其他病原，如军团菌，金黄色葡萄球菌和空肠弯曲杆菌，其中第二个病菌是食源性疾病的最常见原因。

据新加坡媒体日前报道，新加坡研究人员研发出一种病毒检测芯片，可一次性快速检验上万种病原体。　　据介绍，这种病毒检测芯片由新加坡基因组研究所的研究团队研制，通过快速分析病患DNA样本，可在24小时内详细检测出患者感染何种病毒或细菌。　　研究人员表示，这种检测芯片可以一次性检测高达7万种病毒和细菌等病原体，其中包括最新出现的H7N9禽流感病毒。　　相比之下，传统的病毒或细菌测试方法，一般针对某一种特定的病原体进行测试，难以同时检测多种病原体。　　研究人员说，这种新的检测手段可以尽快明确病因，减少确诊时间，并且成本也不高。目前这种病毒检测芯片还只用于实验用途，研究人员希望该芯片通过相关部门批准后尽快投入市场。

p style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em "span style="color: rgb(0, 112, 192) "strong事件回顾/strong/span/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em "12月末，湖北省相关部门的消息称，12月以来，武汉是持续开展流感及疾病监测，发现病毒性肺炎病例27例，均诊断为病毒性肺炎/肺部感染。调查发现，此次肺炎病理大部分为华南海鲜城经营者户。武汉官方表示，不明原因肺炎不能断定为SARS。2019年12月31日，国家卫健委专家组地大武汉开展相关调查研究工作。/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em "截至2020年1月3日，武汉市卫健委通报不明原因病毒性肺炎共发现44例，未发现明显的人传人证据，已排除流感、禽流感、腺病毒感染等常见呼吸道疾病。/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em "1月5日，不明原因肺炎病例数量增至59例。排除传染性非典型肺炎（SARS）和中东呼吸综合征（MERS）。/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em "1月7日，实验室检出一种新型冠状病毒，获得该病毒的全基因组序列，经核酸检测方法共检出新型冠状病毒阳性结果15例，从1例阳性病人样本中分理处该病毒。/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em "1月8日，已有8名不明原因病毒性肺炎患者于1月8日治愈出院。/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em "1月9日，专家介绍初步鉴定结果：病毒性肺炎病理的病原体或为新型冠状病毒。/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em "span style="color: rgb(0, 112, 192) "strong病原学鉴定过程/strong/span/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em "据武汉不明原因的病毒性肺炎疫情初步评估专家组组长、中国工程院院士徐建国介绍，本次病原学鉴定工作主要是通过实验室采用基因重组测序、核酸检测、病毒分离等方法对病人的肺泡灌洗液、咽拭子、血液等样本记性病原学检测。/pp style="text-align: center"img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202001/uepic/c0d3c859-77e9-4360-8835-156361c93d0b.jpg" title="核酸提取仪.jpg" alt="核酸提取仪.jpg"//pp style="text-align: center "核酸提取仪/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 386px height: 281px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202001/uepic/31271e60-58c2-47f2-bc62-d94d73e4f610.jpg" title="微信截图_20200109142209.png" alt="微信截图_20200109142209.png" width="386" height="281" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: center "基因测序仪/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em "除上述生物学检测手段，还利用电镜对致病病毒进行形态学观察，并观察到典型的冠状病毒形态。/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 389px height: 300px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202001/uepic/f11a19fc-898c-4b85-b5e8-caa9ded68404.jpg" title="f6f5e25f-5f04-4aa3-a1dc-67140fcc0feb.jpg" alt="f6f5e25f-5f04-4aa3-a1dc-67140fcc0feb.jpg" width="389" height="300" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: center "扫描电镜/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em "对病原的分离和致病性鉴定等科学研究，还需数周时间。下一阶段将结合病原学研究、流行病学调查和临床表现进行专家研判。/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em "span style="color: rgb(0, 112, 192) "strong何为冠状病毒/strong/span/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em "徐建国还介绍道，冠状病毒是一类主要引起呼吸道、肠道疾病的病原体。这类病毒颗粒的表面有许多规则排列的突起，整个病毒颗粒就像一顶帝王的皇冠，因此得名“冠状病毒”。冠状病毒除人类以外，还可感染猪、牛、猫、犬、貂、骆驼、蝙蝠、老鼠、刺猬等多种哺乳动物以及多种鸟类。目前为止，已知的人类冠状病毒共有六种。其中四种冠状病毒在人群中较为常见，致病性较低，一般仅引起类似普通感冒的轻微呼吸道症状。另外两种冠状病毒——严重急性呼吸综合征冠状病毒和中东呼吸综合征冠状病毒，也就是我们简称的SARS冠状病毒和MERS冠状病毒，可引起严重的呼吸系统疾病。引起此次疫情的新型冠状病毒不同于已发现的人类冠状病毒，对该病毒的深入了解需要进一步科学研究。/p

近日，国家临检中心发布全国下呼吸道感染宏基因组（DNA和RNA）高通量测序室间质评预研活动结果报告。本次接受报名的实验室 131 家，实际收到 122 家有效回报结果。如图 1 所示，基于评分方法，122 家实验室所得成绩分布如下：100 分的实验室 11 家，80~99分（含 80 分）的实验室 40 家，60~79 分（含 60 分）的实验室 22 家，低于 60分（不含 60 分）的实验室 49 家。按照≥80 分为合格的标准，合格率为 41.8%（51/122）。本次质评预研活动从检测分析敏感性、特异性、报告解读等多个方面考核了国内实验室检测常规呼吸道标本中 DNA 和 RNA 病原体的能力。总体而言，各实验室的检测流程存在较大差异，检测水平参差不齐。通过对回报数据的分析，发现主要存在以下问题：（一）检测流程差异大，质量保证不完善1. mNGS 检测流程差异大且存在变化从 122 家实验室的检测流程来看，mNGS 检测方法呈现两个特点：（1）复杂多样。各实验室的微生物破壁方式、DNA 和 RNA 提取、富集、文库制备、测序平台、微生物比对算法、公共数据库和背景微生物数据库等均有较大不同；（2）存在变化。与 2021 年下呼吸道宏基因组测序 EQA 相比，绝大多数实验室两次参评报告的检测方法均有所不同，调整的环节包括核酸提取试剂、文库构建试剂、序列比对软件及数据库组成等各个方面。2. 质量保证尚不完善参与本次预研活动的 122 家实验室中，26.2%（32/122）的实验室未使用阳性质控，3.3%(4/122)的实验室未使阴性质控，27.0%（33/122）的实验室未使用内参，11.5%（14/122）的实验室尚未完成性能确认工作。全面验证过分析敏感性（最低检测限）、精密度（重复性和再现性）、分析特异性等基本性能指标的实验室仅占 76.2%（93/122）。由于 mNGS 检测流程的差异，以及实验室流程存在不确定性，以及各实验室质量保证的不完善，使得 mNGS 实验室检测的质量存在一定问题。目前 mNGS12检测均为自建方法，标准操作流程（SOP）的建立和性能确认的完成是开展临床服务的前提条件，完善的室内质量控制是保证实验室日常检测质量的有效手段，此外，实验室需明确，SOP 不应随意改变，如确需变更，应先进行相应的性能确认。（二）假阴性和假阳性问题与 2020 年开展的宏基因组 EQA 相比，本次 EQA 在细菌真菌检测的基础上，增加了实验室对 DNA 病毒和 RNA 病毒检测能力的考察。整体而言，实验室对各类病原体的检测能力依次为真菌细菌DNA 病毒RNA 病毒。实验室的假阴性结果主要集中在 RNA 病毒的漏检，这可能与 RNA 病毒不稳定、基因组远小于细菌和真菌和实验操作中（去宿主、珠磨破壁）造成 RNA 病毒损失有关。（三）实验室结果解读能力有待提高实验室依据病例信息未能做出准确诊断的原因有两个层面：一是检出效果不理想，未检测到病原体因而无法报告的错误类型占比较少，在 2022S10-2022S13样本中分别占 5.7%（7/122）、4.1%（5/122）、4.1%（5/122）和 0.8%（1/122），当检出的假阳性微生物较多时，也会干扰准确病原体判断；二是报告解读能力不足，在 2022S10-2022S13 样本中，分别有 36.8%（45/122）、22.1%（27/122）、20.5%（25/122）和 10.7%（13/122）的实验室检测到了真正的病原体，但没有依据病例信息做出准确的临床诊断。在混合感染病例样本漏报病原体和其他单病原体感染样本中多报其他微生物，都反映出对不同类型病原体感染的临床特点和微生物致病情况等相关知识的匮乏。因此，在结果报告时，多学科专家（临床医学家、微生物学家以及生信分析专家等）的共同参与将有助于 mNGS 检测结果的正确解读。成绩合格的实验室（按单位名称拼音排序）：阿吉安（福州）基因医学检验实验室安徽省感染病诊断中心安徽医科大学第一附属医院感染科实验室北京大学人民医院检验科北京善通医学检验实验室有限公司北京圣诠基因医学检验实验室北京予果医学检验实验室有限公司成都圣元医学检验实验室重庆基拯医学检验所有限公司大连医科大学附属第一医院国家基因检测技术应用示范中心复旦大学附属儿科医院分子医学中心复旦大学附属中山医院精准医学中心甘肃省妇幼保健院检验科广东省中医院病理科-基因联合实验室广西医科大学第二附属医院遗传与基因组医学中心广州达安基因高通量测序实验室广州华银医学检验中心有限公司广州微远医学检验实验室广州金域医学检验实验中心有限公司杭州迪安医学检验中心有限公司杭州杰毅医学检验实验室有限公司杭州求臻医学检验实验室有限公司华中科技大学同济医学院附属同济医院检验科华中科技大学协和深圳医院检验医学中心吉林大学第一医院基因诊断中心济南爱新卓尔医学检验实验室江门市中心医院检验科解放军总医院第八医学中心呼吸与危重症医学部研究所陆军军医大学第一附属医院感染病科实验室南昌大学第一附属医院精准医学中心南京格致医学检验实验室山东大学齐鲁医院检验科陕西佰美医学检验实验室上海儿童医学中心转化所感染研究室上海交通大学医学院附属瑞金医院临床微生物科上海探洇医学检验实验室有限公司深圳市第二人民医院中心实验室沈阳市第十人民医院中心实验室天津华大医学检验所天津金匙医学检验实验室微岩医学科技（北京）有限公司武汉凯德维斯医学检验实验室武汉康圣达医学检验所有限公司粤北人民医院检验科长沙博奥医学检验实验室浙江大学医学院附属第一医院检验科浙江洛兮医学检验实验室中国医科大学附属第一医院检验科中南大学湘雅二医院感染科实验室中南大学湘雅二医院临床分子诊断中心中山大学附属第一医院检验科

p　　2018年1月19日，国家自然科学基金委员会医学科学部组织由中科院院士赵国屏研究员任组长的11位微生物学、病原学、感染病学及免疫学领域专家，对国家自然科学基金重大项目“动物源病原体的发现及其对人类致病性研究”(项目批准号：81290340)进行结题验收。基金委医学科学部孙瑞娟副主任及相关工作人员参加会议。/pp　　许多野生动物是重要人类传染病病原体的自然宿主，这些病原体一旦接触并感染人类，可能引起严重疾病，形成重大公共卫生事件。研究发现，人们熟知的艾滋病毒(HIV)来自非洲的黑猩猩和大猩猩 登革病毒(Dengue virus)来自埃及伊蚊和白纹伊蚊 严重急性呼吸道综合症(SARS)也称“非典型肺炎”冠状病毒(SARS-CoV)、中东呼吸综合症冠状病毒(MERS-CoV)、埃博拉病毒(Ebola virus)据证都来自蝙蝠 寨卡病毒(Zika Virus)来自非洲伊蚊等蚊虫 来自禽类、猪、马等的流感病毒也可以导致人类罹患流感等等。对动物尤其是野生动物携带微生物和寄生虫等情况进行基础性、前瞻性调查及相关研究，将会对人类传染病的预警及防控提供可靠的理论指导。国家自然科学基金委员会服务国家重大战略需求，于2012年正式立项重大项目，资助我国优秀的科学家团队对动物源性病原体进行了前沿研究。/pp　　重大项目验收会首先听取项目负责人徐建国院士及五个课题负责人石正丽、梁国栋、张永振、曹务春、徐建国研究员对项目及课题结题情况的汇报，在充分交流的基础上，对项目结题情况进行认真评价。专家组认为，项目组经过五年努力，在标本采集、微生物及病原体的发现与鉴定、微生物的进化与致病性等多个方面，取得一批重大研究成果，形成一系列重要论文 研究过程培养了一批高水平专业人才，提升了我国科学家在该领域的学术地位 也支撑了我国相关的重要战略研究和科普宣传，已经并将进一步形成重要的社会影响。具体成果包括：(1)发现和鉴定了一批新的病原体，并在相关技术上取得创新突破。在国际上率先发现和命名了4种新的病原体 在我国首次发现20种新的病原体 发现9种过去认为非致病微生物的致病性 发现已知病原体的新基因型24个、新动物宿主4个，分离和命名了新的细菌10种，利用宏基因组技术发现1640余种新病毒。(2)通过研究病原体与动物宿主关系，提升了对潜在病原体野外宿主谱的认识。发现喜马拉雅旱獭携带已经存在千年的喜马拉雅型蜱传脑炎病毒和喜马拉雅旱獭甲肝病毒。首次揭示了我国蝙蝠、蜱、蚊、喜马拉雅旱獭、秃鹫、广西猕猴等野生动物的病毒谱或细菌谱。(3)前瞻性地提出我国存在潜在新发传染病的风险，主要包括西尼罗病毒、寨卡病毒、SARS样冠状病毒、山羊无形体、艾尔博特埃希菌等的感染。(4)在病原微生物学基础认识上，获得若干具有重要理论意义的创新。主要包括：①获得了SARS病毒可能来源于蝙蝠的更有说服力的证据 ②重新界定无脊椎动物RNA病毒圈，可能会带来病毒分类学的重大变化 ③发现节肢动物可能是RNA病毒进化的“心脏” ④发现RNA病毒从单链进化为双链的新机制等。(5)大量研究成果发表在权威学术期刊及核心期刊上，包括Nature(《自然》)，Science(《科学》)，New England Journal of Medicine(《新英格兰医学杂志》)，Lancet Infectious Diseases(《柳叶刀?传染病》)，Nature Medicine(《自然?医学》)，Annals of Internal Medicine(《内科学年鉴》)，eLife(《e生命》)，PNAS(《美国科学院院刊》)，PLOS Pathogens(《科学公共图书馆?病原体》)等。(6)培养了一批专门人才，研究成果已获得省部级自然科学一等奖一项、科技进步一等奖一项。部分成果已在中央电视台等国内外重要媒体进行报道。/p

p　　2月11日，香港理工大学宣布该校的研发团队历经四年成功研制出全球最全面的全自动多重传染性呼吸道病原体诊断系统，该系统可以在一小时内、在同一个测试中检测出30至40种病原体，包括新发现的2019新型冠状病毒、SARS冠状病毒、MERS冠状病毒、甲型流感病毒、禽流感病毒和人类呼吸道合胞病毒等。/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 500px height: 294px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202002/uepic/24a55050-9f12-45a0-81e8-b6b49c508c0b.jpg" title="微信图片_20200212114803.png" alt="微信图片_20200212114803.png" width="500" height="294" border="0" vspace="0"//pp　　据悉，该系统由全自动快速检测仪和多重微流检测元件组成，利用聚合酶链反应技术(PCR)，从核酸提取、扩增、检测到分析全程实现自动化。除采集样本外，测试毋须人手操作，每次测试成本只需二三百港元。系统采用的微流控和生化技术正申请专利，可以极高的特异性同时区分各种病原体。/pp　　据研究团队介绍，医护人员需先从怀疑患者的鼻咽中提取样本，再将样本放入微流体试剂盒，并置于检测仪中，等候约一小时后，电脑便可生成报告。/pp　　研究团队负责人、香港理工大学应用生物及化学科技学系客座教授刘乐庭绍说，该系统克服了现有技术局限，能显著提高检测灵敏度，从而确保测试结果的可靠性，而且该技术可以大幅降低微流控滤芯的生产成本，希望能尽快找到厂家进行量产。/pp　　据悉，该项研究并非特别为这次疫情而做，现在他们拥有多部仪器，可以借给公立医院使用，至于量产要看未来有多少资金资助。/p

一、项目基本情况项目编号：[231101]HHSC[GK]20230008项目名称：黑河市中心实验室突发急性传染病病原体快速检测能力建设项目采购方式：公开招标预算金额：21,353,000.00元采购需求：合同包1(黑河市中心实验室突发急性传染病病原体快速检测能力建设项目):合同包预算金额：21,353,000.00元品目号品目名称采购标的数量（单位）技术规格、参数及要求品目预算(元)最高限价(元)1-1其他医疗设备病毒载量仪2(台)详见采购文件3,400,000.00-1-2其他医疗设备微生物飞行质谱鉴定仪1(台)详见采购文件3,000,000.00-1-3其他医疗设备流式细胞仪1(台)详见采购文件1,500,000.00-1-4其他医疗设备全自动HIV病毒载量检测系统2(台)详见采购文件1,200,000.00-1-5其他医疗设备原子荧光分光光度计1(台)详见采购文件500,000.00-1-6其他医疗设备液相色谱-原子荧光联用仪1(台)详见采购文件700,000.00-1-7其他医疗设备三重四级杆质谱仪1(台)详见采购文件3,200,000.00-1-8其他医疗设备全自动氮吹浓缩仪1(台)详见采购文件200,000.00-1-9其他医疗设备色度仪1(台)详见采购文件10,000.00-1-10其他医疗设备浊度仪1(台)详见采购文件10,000.00-1-11其他医疗设备测汞仪1(台)详见采购文件500,000.00-1-12其他医疗设备超纯水制备系统1(台)详见采购文件450,000.00-1-13其他医疗设备气相色谱仪1(台)详见采购文件468,000.00-1-14其他医疗设备自动洗板机1(台)详见采购文件35,000.00-1-15其他医疗设备均质器1(台)详见采购文件30,000.00-1-16其他医疗设备荧光定量PCR（分析纯）2(台)详见采购文件3,600,000.00-1-17其他医疗设备全自动免疫印迹仪1(台)详见采购文件150,000.00-1-18其他医疗设备数字PCR1(台)详见采购文件2,400,000.00-本合同包不接受联合体投标合同履行期限：自合同签订之日起6个月二、获取招标文件时间： 2023年12月14日 至 2023年12月21日 ，每天上午 00:00:00 至 12:00:00 ，下午 12:00:00 至 23:59:59 （北京时间,法定节假日除外）地点：公告期内凭用户名和密码，登录黑龙江省政府采购管理平台(http://hljcg.hlj.gov.cn/)，选择“交易执行-应标-项目投标”，在“未参与项目”列表中选择需要参与的项目，确认参与后即可方式：在线获取售价： 免费获取三、对本次招标提出询问，请按以下方式联系。1.采购人信息名称：黑河市疾病预防控制中心地址：黑河市电业街132号联系方式：0456-61037372.采购代理机构信息名称：黑河市政府采购中心地址：黑河市通江路10号联系方式：0456-26661843.项目联系方式项目联系人：郭睿电话：0456-2666184

细菌必须经过培养之后才能进行物种鉴定，这是一直以来我们的认知。法国马赛地中海感染研究所的研究可能会改变我们的看法。尿样是临床实验室中处理最多的样品之一。以作者所在的马赛大学医院为例，细菌学实验室每年能收到大约62050份尿样，约占所有分析生物样品的17%（中国医院的尿样肯定比这个数字多得多）。而事实上，尿路感染在细菌感染中很普遍。快速鉴定引起尿路感染的病原体十分重要，可以避免感染性休克等致命并发症。由于细菌需要培养后才能进行鉴定，常规方法需要24至48小时才能准确识别存在于尿样中的病原体。在这个时差内，患者通常会接受不必要的广谱治疗，显然，这会影响微生物群和细菌耐药性。减少接收样本和诊断之间的延迟时间，可以帮助患者更快地使用上恰当的药物，从而防止细菌耐药的发生。基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)目前已经成为临床实验室病原体鉴定的重要工具，它能对细菌进行快速而可靠的鉴定，有潜力成为尿液病原体直接鉴定的工具。研究团队使用被感染的尿液样本创建了MALDI-TOF质谱参考数据库，建立了使用该数据库来直接识别尿液中病原体的新方法。该方法使用少量样品(1mL)和低细菌计数，即可快速鉴定多种尿路病原体，且无需事先培养。研究人员收集了1000个感染尿样的MALDI-TOF质谱，用于创建参考数据库。并将使用参考数据库的鉴定结果与标准数据库进行比较，对参考数据库进行评估。结果显示，使用参考数据库可以正确诊断500个受感染的单杆菌样本中的近90%，而使用标准数据库可以正确诊断50%。对肠杆菌科、金黄色葡萄球菌、腐生葡萄球菌、铜绿假单胞菌、粪肠球菌和屎肠球菌的鉴定有了很大的提高，但对表皮葡萄球菌的鉴定却没有得到很大的改善。显而易见地，创建适合特定类型临床样本的数据库对于提高病原体鉴定的准确率和速度具有非常重要的意义。总之，研究人员开发的方法能够快速鉴定尿液中的病原菌，方案可以用于需要快速诊断的特定患者群体，例如肾移植患者或新生儿。目前，临床上所用的病原鉴定方法仍然需要先培养，然后进行微生物质谱鉴定。虽然病原体直接鉴定距离真正临床应用还有很远的距离，但是这项研究给临床病原体鉴定带来了新思路。融智生物QuanTOF新一代宽谱定量飞行时间质谱平台，集核糖体蛋白与核酸（RNA、DNA）检测于一机，新一代的MALDI-TOF MS（QuanTOF）不仅能鉴定细菌、真菌，对于病毒鉴定也游刃有余，同样可以为临床病原体鉴定提供新的思路。QuanTOF新一代宽谱定量飞行时间质谱平台参考文献：Direct identification of pathogens in urine using a specific MALDI-TOF spectra database. doi:10.1128/JCM.01678-18

p style="text-align: center "img title="1.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201708/insimg/1dcefe7e-5719-404e-9ba2-4e136fe75ea3.jpg"//pp　　原因不明的感染一向是医学上的难题。在电视剧《外科风云》中，在病原检测不出的情况下，医生只能凭借经验尝试治疗。/pp　　现在，医务人员有了一种新的利器--基于二代基因测序的病原快检技术。这种技术自进入中国以来，已经在众多疑难感染患者的诊断中到关键性作用。其中，就包括一位来自菲律宾的船员。/pp　　strong生死时速，基因科技“秒揪”病原/strong/pp　　今年7月中旬，唐山万航国际船务有限公司的一名菲律宾籍船员从唐山启程。北京协和医院、华大基因和华北理工大学附属医院联手解决了他的疑难感染，使他得以平安地踏上归国之旅。/pp　　6月2日，这名船员在船上发生头痛、左半身偏瘫的症状。货轮就近停靠在唐山，患者先在曹妃甸当地医院就诊，后转至华北理工大学附属医院神经内科一病区。/pp　　主治医生毛文静回忆，患者来院的时候出现发热，左侧瞳孔散大、反射差，左侧手臂完全无力，意识也在逐步丧失，情况危重。腰穿检测结果显示，患者的脑脊液中白细胞含量高、糖类含量低，液体呈微黄色。“感觉上像是结核性脑膜脑炎。”毛医生说，“当即就把结核药用上了。”/pp　　但医院使用常规的方法，始终没有找到结核菌，因此一直采取多种抗菌药物并用的保守治疗方案。在6月12日，神经内科主任刘斌教授请来北京协和医院的关鸿志教授，对患者进行会诊。/pp　　在此之前，从2014年起，协和医院神经科与华大基因研究院合作，在国内首先开展脑脊液二代测序研究，用于中枢神经系统感染性疾病的病原体筛查。关鸿志教授正担任此项目的负责人。他提出建议：试试使用二代基因测序技术进行的病原快检。/pp　　6月22日下午，天津华大基因交付病原组收到了患者脑脊液样本。这项检测一般需要2-3天，此次由于感染危重，华大做了加急处理，30个小时左右就完成了检测流程。23日晚上，检测报告出炉，样本中检出了结核分枝杆菌。/pp　　获得了明确的病原信息后，医院立即调整了治疗方案，一改之前多管齐下的保守用药，集中火力向结核发起反攻。7月中旬，该患者病情好转、出院回国，继续进行抗结核治疗。/pp style="text-align: center "img title="2.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201708/insimg/9916b637-dd25-4a61-9af6-f20282836eba.jpg"//pp style="text-align: center "strong菲律宾船员的治疗团队与技术人员，从左到右依次为：华大基因天津交付李媛，北京协和医院关鸿志，华北理工大学附属医院刘斌、李世英、毛文静/strong/pp　　strong广谱病原检测，“十年沉疴”一朝解决/strong/pp　　现在，利用二代测序技术进行的病原快检，比传统的涂片技术范围更广，比病原培养更加快速。同时，这项技术的检测范围与病原数据库的大小一致，突破了临床上以往“怀疑什么，检测什么”的限制，是对抗不明原因感染的新利器。/pp　　在二代测序技术普及之前，一旦出现症状不典型的感染，往往需要依赖医务人员的经验，通过涂片、培养等方式进行针对性检查，常造成病情贻误。关鸿志说：“以前在颅内感染中，可能有50%的病人--甚至更多的病人，是诊断不清的。试验性治疗治好了就治好了，治不好那就??”/pp　　关鸿志讲到，有位内蒙古的患者从2007年起持续头疼、发热，十年间辗转多家医院，都没有得到确诊，按照各种感染治疗也未痊愈，经常需要靠输液来降低颅压，生活十分痛苦。/pp　　十年后，这位患者的治疗终于迎来转机。2016年12月，华大基因和协和医院等多个单位发起了针对不明病因脑炎脑膜炎的多中心研究，该患者最初就诊的医院作为中心之一，重新关注起这个“老”病例。今年5月，该患者的样本送到华大基因进行检测，结果竟然为脑囊虫病。协和医院针对脑囊虫进行血清学筛查，很快证实病因。现在，经过对症治疗，该患者已经基本痊愈。/pp　　“二代测序的方法，不会说怀疑你是什么感染就查什么感染。它会把你脑脊液里的核酸都测一遍，再看看这些核酸分别属于哪种细菌、哪种病毒，包括哪种虫子。” 关鸿志说。/pp　　strong二代测序病原快检将助力民生/strong/pp　　更广、更快、更准确，是二代基因测序病原快检技术的优势。例如，华大基因的技术可以同时检测2700多种病原微生物和寄生虫，只要每毫升样本液体中有100到1000个核酸片段的拷贝，就能检测出来，鉴定的种属准确率大于99%。/pp　　华大基因是中国最早利用基因测序技术进行病原检测的单位之一。早在2003年，华大基因就和相关单位合作，完成了中国第一例SARS病毒的基因组测序，并向全国防治非典型肺炎指挥部捐赠30万人份自行研制的SARS病毒诊断试剂盒。/pp　　利用基因测序技术进行病原快检，不但要求一定的测序能力，还需要完整的病原数据库建设、算法匹配和分析运算能力、精确解读的能力。这项技术在国外已经趋于成熟，相关的科研项目已经在国内开展，“技术科普”和整个行业正当风口。/pp　　天津华大基因交付病原组的李媛说：“到今天，临床的检测了1276例，送检单位主要集中在北京和上海。”统计显示，华大收到的样本中八成以上来自北京的医院。这些医院最先从各个方面接触到这项技术，并对合适的患者加以应用。/pp　　不过，关鸿志分析，最需要这项技术的可能是三四线城市的非三甲医院，这些医院用传统方法检测病原的能力更低。普及成本较低、广谱高效的二代测序病原检测技术，减少不明感染的无效经验治疗带来的“折腾”，能够有效地为诊断、为患者、为医患关系减负，具有重要的民生和社会意义。/p

日前，中国检验检疫科学研究院(无锡)人体携带病原体研究室在无锡检验检疫局挂牌成立，这标志着我国人体携带病原体研究领域取得了新的拓展。该研究室的成立将为整合检验检疫系统的科研资源，加强科研与检验检疫一线需求的联系，深入推进“科技兴检”战略发挥重要的作用。该研究室落户无锡，是基于无锡检验检疫局在人体携带病原体方面丰富的科研资源和良好的技术储备。　　据了解，人体携带病原体研究室将致力于病原体检测前沿技术的研究，以及新发、变异传染病原等各类致病病原体的检测及拦截，进一步提高保障国门安全的能力。