摘要: 过去,研究人员为了确保凝胶结果完美需要进行辛苦的工作:通过不断重复进行保存凝胶,或者凝胶存档(a record of the gel)的工作,在记录他们辛辛苦苦得来的凝胶结果上花费了许多时间和精力。然而今天的我们已经不再需要如此手工化的操作了,我们可以利用许多商品化的凝胶成像系统快速而准确的记录下实验结果,并且可以方便地获得分析和组织实验的数据。而且凝胶成像系统也已经不仅仅是作为一种凝胶记录的手段,普遍应用于蛋白、DNA的凝胶记录中了,更是一种印迹分析,数据获得的方式 Introduction 过去,研究人员为了确保凝胶结果完美需要进行辛苦的工作:通过不断重复进行保存凝胶,或者凝胶存档(a record of the gel)的工作,在记录他们辛辛苦苦得来的凝胶结果上花费了许多时间和精力。然而今天的我们已经不再需要如此手工化的操作了,我们可以利用许多商品化的凝胶成像系统快速而准确的记录下实验结果,并且可以方便地获得分析和组织实验的数据。而且凝胶成像系统也已经不仅仅是作为一种凝胶记录的手段,普遍应用于蛋白、DNA的凝胶记录中了,更是一种印迹分析,数据获得的方式。 不管是什么用途,刚开始的时候凝胶成像系统的组件都是相似的。Alpha Innotech的产品经理Hanh Lee就曾说,“表面上看来,所有的凝胶成像系统看上去和操作起来很相似:它们都有一个相机、一个黑暗的‘围栏’与获取和分析凝胶图片的软件。”但是,更深入的进行了解,你就会发现大部分凝胶成像系统提供了不同的产品特性来满足不同科学研究的需要。 要挑选一个合适的凝胶成像系统,各人需要根据目前的预算和将来研究需要来决定,市场上有众多的类型和型号可供选择,但是大家要务必记住经常留意最新的产品动向——快速发展的光学技术和成像分析软件也许能实现你以前想都不敢想的方便操作。 A range of specifications for far-ranging needs 首先值得一提的当然是分别在在2004年和2006年获得凝胶成像分析系统生命科学产业奖的Bio-Rad公司的产品,Bio-Rad公司提供了各种不同的产品特性满足客户的不同科学研究需要。例如,Bio-Rad公司的ChemiDoc XRS系统就是为高分辨率的化学发光和荧光成像用途设计的。该系统的特点包括:1.3兆的超级冷却CCD照相机、一个紧密不透光的暗室、一个滑行的透射仪、一个的由软件控制变焦、聚焦、光圈、实时成像和动态平场处理的伸缩镜头。该公司还提供另外一种更基础用途的型号Gel Doc XR,主要用于快速高分辨率成像,但没有化学发光成像功能。该系统包含一个暗室、一个1.4兆像素的CCD照相机、UV和白光照明、琥珀色滤光玻片和UV防护罩。Gel Doc XR系统也可以升级为ChemiDoc XRS系统,两种系统都包含了图像获取和分析软件 ——Quantity One。虽然像ChemiDoc XRS等系统的高科技特性对于新用户来说听起来有点不习惯,但是Bio-Rad公司的CCD成像技术产品经理Jill Raymond表示,“Bio-Rad的凝胶成像系统的关键特点就是设计的简易性——几乎能满足所有顾客的需要。” Bio-Rad公司还提供两种分辨率更高和灵敏度更好的凝胶成像系统型号:VersaDoc Model 4000和VersaDoc Model 5000。VersaDoc Model 4000系统具备一个3.2兆像素的CCD相机,提供了最佳的分辨率。该系统尤其适用于蛋白组分析,例如可以利用Quantity One 1-D分析软件来估计蛋白样品的分子量和数量,也可以利用PDQuest 2-D分析软件来分析蛋白表达产物的差异。 VersaDoc Model 5000系统则运用了高级的量子效应、蓝光增强的CCD相机,该相机通过过冷光源(supercooled)来优化低亮度情况下的图片成像。通过Quantity One 1-D分析软件就能轻松估计样品的丰度差异。 知名的Alpha Innotech公司在科学研究和预算要求方面也提供了广泛的,可供选择的产品, 比如目前相对新型和高端的产品——FluorChem SP,这是一种可以用于化学发光、荧光、和可见光应用的产品。 Alpha Innotech公司宣称通过FluorChem SP,希望能设定近期发展起来的电子致冷型CCD(cooled CCD camera)相机技术的行业标准,包括分辨率、灵敏度、动态范围和性能等方面的标准。而且Alpha Innotech也相信他们公司提供的相机产品的规格有着其他公司不能比拟之处:高分辨率(科学研究级的CCD)、4兆象素、低信噪比、低暗电流(dark current)、绝对的和可调的制冷温度(用于更高端的系统)。 除了4兆象素的分辨率外,FluorChem SP还提供了Alpha Innotech公司的AlphaEaseFC软件。其特有的算法通过三维图像轮廓成像、图像锐化和降低信噪比等技术改进了成像分辨率。AlphaEaseFC软件提供了可以简单易用的单击完成1D泳道分析、2D点密度、MW/Rf(分子量/迁移率)计算、克隆和细胞计数、微量滴定盘分析、芯片分析、物距测量和凝胶评分等功能。 另一方面,Alpha Innotech公司也提供给用户一种经济实惠的选择——入门级的AlphaDigiDocRT 2产品,这是一种实时的凝胶成像系统,只要具备一台电脑(通过USB连接)、一台UV透射仪就能使用。当然这是一种stand-alone版的成像产品,也就意味着它不具备一些昂贵的系统提供的许多图像分析选项。 AlphaDigiDocRT 2具有高达8兆的分辨率(8位灰度或者24位彩色成像)、在软件控制下具有4倍的光学变焦和自动聚焦等性能。该系统还包含了AlphaEaseFC图像获取软件,用于控制变焦、自动聚焦、分辨率和曝光时间,含有自动图像增强和数据管理工具,除此之外AlphaDigiDocRT 2外形小巧,经济实惠,是小型和拥挤的实验室的理想选择之一。 The importance of upgradeability 假如你现在就需要一台凝胶成像系统,虽然目前你们实验室很小并且预算很紧,或者你不需要很多花俏的凝胶成像系统的功能,但是预知将来可能会需要更多复杂的性能的时候,最好购买一台能允许你升级到满足你将来需要的凝胶成像系统。 有一些公司提供了这种服务,比如Alpha Innotech公司——任何顾客购买了带有DE-500操作室的入门级凝胶成像系统,就对系统进行升级而不需要买一套全新的系统。另外以上提到的Bio-Rad公司的GelDoc XR 和ChemiDoc XRS也是可升级的系统。 除此之外,Kodak公司的分子成像系统就其高级市场专员Allison Sova的表述:“Kodak公司的Gel Logic的凝胶成像系统家族使得研究者能选择目前所需要的性能,并且可以将来可以经济而简易的升级系统以满足将来的需要。简单的来说,Kodak公司提供给研究者更大的灵活性来满足他们实验室对成像能力不断增加的要求”,也是一种可以升级的系统。 Kodak’s Gel Logic 100是Kodak公司的基础型成像系统,它包含一个1兆象素的数码CCD相机、一个Gel Logic成像操作室、一个溴化乙锭带通滤波器。并且Kodak公司award-winning Molecular Imaging软件提供了其他成像系统所没有的特性,该软件可以在Mac操作系统或者Windows操作系统中使用。假如Gel Logic 100系统还不能满足你的需要,Kodak公司还提供了完整系列的数码凝胶成像和印迹成像系统——DNA 和 RNA凝胶成像,或者蛋白凝胶、印迹、或者平板成像等。 比如Gel Logic 2200数码成像系统,Gel Logic 2200数码成像系统是Kodak公司顶级的凝胶成像系统。 Gel Logic 2200运用了2.2兆像素致冷型CCD相机,适用于更高灵敏度的化学发光和低亮度荧光检测,该系统还整合了白光和紫外光光源。Kodak公司称,该系统能检测皮摩尔至飞摩尔水平的荧光信号,达到与放射性自显影胶卷一样的灵敏度。 另外,大范围生产凝胶成像系统的厂商还有Syngene——Synoptics公司的一个分公司。Synoptics公司的Paru Oatey说“基本上你可以根据研究需要和经费预算来选择相机、光源和滤光镜等配置,这将确保不会在一个系统中不需要的部件上花费多余的钱。” InGenius是Syngene公司的低预算型凝胶成像产品,可以根据选择不同的相机达到不同的分辨率。InGenius系统小巧易用,包括一个暗室,一个0.3-2兆像素的CCD相机(视型号而定)。 G Box是该公司的另一个高端产品,一个更先进的凝胶成像和分析系统。该系统可以根据不同的应用选择三种不同分辨率的CCD相机,可以选择自动伸缩镜头或者手工镜头,电脑驱动或者手动滤光选择器,根据不同用途的光源选择,符合人体工程学外形设计的暗室。Syngene公司最近推出了一款高分辨率的G Box型凝胶成像产品——G Box Chemi XT16,该系统具有一个超致冷型、低噪音、高分辨率的4兆像素的CCD相机,适合灵敏的化学发光用途。除了自带的暗箱外,系统还包括安置在头顶的白光和紫外光透射光源。每一台
各位大虾,小弟想请教凝胶成像系统知识,请问有没有比较详细的资料,最好是关于原理方面的。谢谢
关于凝胶成像系统请专家多发言
请问PCR凝胶成像系统安装的房间可以有窗户吗?做实验时需要做什么防护措施吗?谢谢
要采购低温冰箱,荧光PCR仪,高压灭菌锅,凝胶成像仪,显微成像系统等,哪几家公司(国外)的性价比高且结实耐用啊,求高手指点。
随着分子生物学研究逐步普及,凝胶成像系统在国内的需求在不断增长 不管是什么用途,凝胶成像系统的组件都是相似的。都有一个拍摄系统、一个带有特殊光源的暗箱与获取和分析凝胶图片的软件组成。”但是,大部分凝胶成像系统提供了不同的产品特性来满足不同科学研究的需要。快速发展的电子技术、光学技术和成像分析软件使成像操作越趋人性化。 国产的凝胶成像系统主要由上海天呈科技有限公司的touching1000,性价比非常高。 目前进口产品主要有Bio-Rad公司的产品,ChemiDoc XRS系统就是为高分辨率的化学发光和荧光成像用途设计的。该系统的特点包括:1.3兆的超级冷却CCD照相机、一个紧密不透光的暗室、一个滑行的透射仪、一个的由软件控制变焦、聚焦、光圈、实时成像和动态平场处理的伸缩镜头。另外一种更基础用途的型号Gel Doc XR,主要用于快速高分辨率成像,但没有化学发光成像功能。该系统包含一个暗室、一个1.4兆像素的CCD照相机、UV和白光照明、琥珀色滤光玻片和UV防护罩。Gel Doc XR系统也可以升级为ChemiDoc XRS系统,两种系统都包含了图像获取和分析软件 ——Quantity One。Bio-Rad公司还提供两种分辨率更高和灵敏度更好的凝胶成像系统型号:VersaDoc Model 4000和VersaDoc Model 5000。VersaDoc Model 4000系统具备一个3.2兆像素的CCD相机,提供了最佳的分辨率。该系统尤其适用于蛋白组分析,例如可以利用Quantity One 1-D分析软件来估计蛋白样品的分子量和数量,也可以利用PDQuest 2-D分析软件来分析蛋白表达产物的差异。 知名的Alpha Innotech公司在科学研究和预算要求方面也提供了广泛的,可供选择的产品,比如目前相对新型和高端的产品——FluorChem SP,这是一种可以用于化学发光、荧光、和可见光应用的产品。高分辨率(科学研究级的CCD)、4兆象素、低信噪比、低暗电流(dark current)、绝对的和可调的制冷温度(用于更高端的系统)。Alpha Innotech公司的AlphaEaseFC软件,其特有的算法通过三维图像轮廓成像、图像锐化和降低信噪比等技术改进了成像分辨率。AlphaEaseFC软件提供了可以简单易用的单击完成1D泳道分析、2D点密度、MW/Rf(分子量/迁移率)计算、克隆和细胞计数、微量滴定盘分析、芯片分析、物距测量和凝胶评分等功能。
附件图表是从国外网站拉过来的。因为数字成像技术的日新月异,凝胶成像系统是生化仪器设备中发展最快的仪器之一。凝胶成像即有简单的扫描型成像系统,也有高端的快速化学发光成像、微阵列读数。这个附件图表为大家提供了几个主要品牌入门型凝胶成像系统的比较。购买入门型的系统,主要考虑的是:1、暗盖还是暗箱系统:对于有暗房的用户来说,选择暗盖系统能减少预算;对没有暗房的用户来说,则需购买暗箱系统。2、成像平台:CCD摄像头是一种很成熟的技术,但在基础型的应用中常被数码相机取代。对于这一层次的成像平台而言,最需要注意的两个要素是灰度级别和分辨率。3、电脑连接:至少要保证图像采集和数据保存可以方便的进行。4、是否可以升级。平心而论,某些国产的成像系统也已经做得不错了。[img]http://www.instrument.com.cn/bbs/images/affix.gif[/img][url=http://www.instrument.com.cn/bbs/download.asp?ID=11953]几个主要品牌的比较pdf文件[/url]BlackBox
http://zwx.hzau.edu.cn/attachments/image/equipment/14.JPG1、 接通外接电源,按下灯箱后面的开关,打开电脑; 2、 小心放入凝胶到样品仓,并将凝胶位置放正:将清水漂洗后的凝胶放到样品仓中适当的位置,放入的过程中不要碰到仓门的任何位置; 3、 打开电脑上的“GeneSnap from SynGene”图标,将光源选项改为“upper white”,然后点击照相按钮,调节曝光时间,通过软件上的焦距、光圈和远近按钮调节到最清晰的图片,然后关紧仓门; 4、 将光源选项改为“Transilluminator”,点击照相按钮,调节曝光时间,通过软件上的焦距、光圈和远近按钮调节到最清晰的图片。再次点击照相按钮成像,点击软件界面上的“File”选项,选择“save image”项,保存所拍图片; 5、 关闭软件界面; 6、 关闭灯箱后面的电源开关,关闭电脑和外接电源; 7、 如实登记凝胶成像系统的使用情况。注意事项 1、 不要戴手套触摸电脑鼠标、键盘及其它位置; 2、 不要戴手套触摸仓门和灯箱电源开关; 3、 不要戴手套触摸外接电源开关; 4、 原则上除了灯箱内部以外,凝胶成像系统其它部分严禁戴手套触摸; 5、 严格如实登记制度。
凝胶成像系统包括成像系统和分析凝胶图片的软件系统。我们在选购时需要分别从这两个部分来考察凝胶成像系统的功能参数。 如果您主要用它来拍普通核酸胶或蛋白胶,那么几乎市场上所有的成像仪都可以很好的满足您的需求。这时除了价格这个决定因素外,能比较的也就是一些操作是否简便等不太重要的指标了。 但是对于准备做化学发光的用户,他们需要对敏感度要求高,同时还要求比较宽的动态范围。因为要想捕获到微弱的化学发光,需要上佳的CCD相机和镜头。 一般来说,CCD相机的冷却温度和背景噪音息息相关,温度越低,噪音就越低。因此,-25℃的绝对制冷温度是对相机的第一个要求(更低的温度,噪音降低效果不明显,而量子效率又会受很大影响);另外,较大的像素能够提供更高的捕光效率;所以对于相同大小的CCD芯片,需要注意像素的尺寸。 镜头的参数就简单了,由于我们只需要观察近距离的样品,而且一般可以调整样品位置(有些厂家甚至提供电动样品升降平台),所以基本无需选择长镜头或者变焦镜头;但是,由于我们需要检测微弱的化学发光,镜头的光圈则至关重要,一般F值越小,其通光量越大,而且成平方反比关系,因此我们一般需要选择光圈F值尽量小的镜头。另外,如果镜头是电动的,我们可以省却打开机箱,反复手工调整光圈和聚焦等的烦恼。 其他我们需要考虑的包括光源、滤光片和暗箱等部件。光源的种类和发光的均一度,滤光片的数量和暗箱的遮光效果等均在我们的考虑范围之内。当然,一般如果成像仪的CCD和镜头配置不错,一般这些部件也不会太差。 在选择凝胶成像系统时,我们关注的问题通常有以下一些方面:
凝胶成像分析系统用途j用于对各种电泳凝胶图像的采集、保存和分析;基本功能140万像素CCD,电动变焦,智能化分析暗箱,具有开门断紫外线,自动延时关断,变焦镜头保护,RS232接口,触摸软键,可通过鼠标实现CCD设置和变焦镜头调整的遥控功能;配备中文界面图像软件,确保对图像的“观察,拍摄,分析”过程一气呵成,同时兼容tif,jpg,bmp,gif等图像格式;具有开门防护,延时关断,漏电保护等功能;具有“自动曝光、自动白平衡”性能,其方便性远远优于数码相机,以及模拟CCD;具有强制激发紫外透射光的功能;拍摄范围:4.5-6(cm)~20-20(cm);图像观察:支持TWAIN接口,达到“实时浏览”的效果,可全屏显示,通过鼠标设置CCD关于图片亮度、黑白对比度、∮值等参数,也可以通过鼠标激活变焦镜头驱动串口,获得对观察谱带的放大,缩小,变焦等操作;图像处理:具有添加文字,箭头,图形注释,旋转,缩放,亮度,弧度,对比度的自动、手动调整及图片颜色的调整,负向及3D模拟显示等;图像分析:配合使用凝胶分析软件,可获得诸如泳道,条带的自动,手动识别,谱带分子量,灰度值,样品量,百分比浓度,迁移率等自动计算结果;主要特点ABS模具外壳,流线型设计,大方美观;进口低照度高分辨率数字CCD,便于捕捉弱带,实时浏览,全屏显示,操作简单;配有进口6倍变焦镜头,光圈F1.2~16,遥控电动变焦智能控制,便于凝胶的缩放观察;采用多层镀膜滤光镜组,有效滤除背景干扰噪声;超薄(透射)磷屏转换板和反射白光板;抽屉式操作台,便于对凝胶的各种操作(配备专用剥胶装置)配有品牌计算机和打印机基本参数紫外光源:透射波长:302nm反射波长:254nm、365nm、透射面积:250*210mm外形尺寸及重量外形尺寸(L*W*H):47*38*81cm重量:26.3kghttp://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2012/04/201204181016_361982_2470658_3.jpg
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1、是不是像素越高,产品就越好? 像素是要针对成像设备来看的,比如数码相机与CCD的像素就不具备可比性,其次CCD本身的质量比单纯的像素高低更重要。对于同级别CCD最重要的指标是其大小,也就是CCD尺寸,尺寸越大其本身价值就成几何倍地增长。 2、配件紫外反射灯源的主要用途为何? 紫外反射灯源使用并不广泛,主要是提供非透明材质的DNA跑胶载体如纸层析等的成像需要而使用。由于比较常用的还是透明的琼脂糖凝胶与聚丙烯酰胺凝胶,透射光源完全可以满足,因此将紫外反射光源作为选配件不列入标配中。 3、能否在凝胶成像上直接切胶? 领成tocan凝胶成像可以,如需直接切胶,首先按系统中间的观察窗,打开装有进口防紫外玻璃的观察窗口,然后打开左右两侧专为割胶所设计的小门,即可进行切胶操作。 4、如何调节焦距 聚焦 光圈以获得高质量的图片? 三个最重要的可调参数分别是焦距 聚焦和光圈。其中焦距调节清晰度,聚焦调节图像大小,光圈调节明暗。一般先把光圈调节到适宜的亮度后,再调节聚焦将图像放到最大,最后调解焦距,在图像较大的情况下焦距比较容易调节到最清晰状态,然后再把图像缩放在适宜大小后成像即可。
凝胶成像系统包括成像系统和分析凝胶图片的软件系统。我们在选购时需要分别从这两个部分来考察凝胶成像系统的功能参数。 如果您主要用它来拍普通核酸胶或蛋白胶,那么几乎市场上所有的成像仪都可以很好的满足您的需求。这时除了价格这个决定因素外,能比较的也就是一些操作是否简便等不太重要的指标了。 但是对于准备做化学发光的用户,他们需要对敏感度要求高,同时还要求比较宽的动态范围。因为要想捕获到微弱的化学发光,需要上佳的CCD相机和镜头。 一般来说,CCD相机的冷却温度和背景噪音息息相关,温度越低,噪音就越低。因此,-25℃的绝对制冷温度是对相机的第一个要求(更低的温度,噪音降低效果不明显,而量子效率又会受很大影响);另外,较大的像素能够提供更高的捕光效率;所以对于相同大小的CCD芯片,需要注意像素的尺寸。 镜头的参数就简单了,由于我们只需要观察近距离的样品,而且一般可以调整样品位置(有些厂家甚至提供电动样品升降平台),所以基本无需选择长镜头或者变焦镜头;但是,由于我们需要检测微弱的化学发光,镜头的光圈则至关重要,一般F值越小,其通光量越大,而且成平方反比关系,因此我们一般需要选择光圈F值尽量小的镜头。另外,如果镜头是电动的,我们可以省却打开机箱,反复手工调整光圈和聚焦等的烦恼。 其他我们需要考虑的包括光源、滤光片和暗箱等部件。光源的种类和发光的均一度,滤光片的数量和暗箱的遮光效果等均在我们的考虑范围之内。当然,一般如果成像仪的CCD和镜头配置不错,一般这些部件也不会太差。 在选择凝胶成像系统时,我们关注的问题通常有以下一些方面:1、像素越高是不是成像更清晰,产品就越好? 像素是要针对成像设备来看的,其实CCD本身的质量比单纯的像素高低更重要。对于同级别CCD来说,最重要的指标是CCD的尺寸大小,尺寸越大其本身价值就成几何倍地增长。 2. CCD和CMOS有什么区别,哪种芯片更好? CCD和CMOS在制造上的主要区别是CCD是集成在半导体单晶材料上,而CMOS是集成在被称做金属氧化物的半导体材料上。 从原理上,CMOS的信号是以点为单位的电荷信号,而CCD是以行为单位的电流信号,前者更为敏感,速度也更快,更为省电。 但CCD制造工艺较复杂,采用CCD的摄像头价格都会相对比较贵。事实上经过技术改造,目前CCD和CMOS的实际效果的差距已经减小了不少。而且CMOS的制造成本和功耗都要低于CCD不少,所以很多摄像头生产厂商采用的CMOS感光元件。 在成像方面,相同像素下CCD的成像通透性、明锐度都很好,色彩还原、曝光可以保证基本准确。而CMOS的产品往往通透性一般,对实物的色彩还原能力偏弱,曝光也都不太好,由于自身物理特性的原因,CMOS的成像质量和CCD还是有一定距离的。但由于CMOS低廉的价格以及高度的整合性,因此在摄像头领域还是得到了广泛的应用。 现在高级的CMOS并不比一般CCD差,但是CMOS工艺还不是十分成熟,普通的CMOS 一般分辨率低而成像较差。 目前的情况是,许多低档入门型的数码相机使用廉价的低档CMOS芯片,成像质量比较差。普及型、高级型及专业型数码相机使用不同档次的CCD,个别专业型或准专业型数码相机使用高级的CMOS芯片。代表成像技术未来发展的X3芯片实际也是一种CMOS芯片。 CCD与CMOS孰优孰劣不能一概而论,但一般
凝胶成像系统统一 UVP(GDS8000)是目前最新型的图象拍摄、分析和处理系统。广泛应用于 DNA 凝胶,蛋白质凝胶,X—光片,细菌平板等的扫描和分析。为保证本系统正常工作,请使用者严格遵守以下操作规则。 1、在熟悉仪器的基本性能和相关老师的指导下,开机使用。
求助各位,关于PHARMACIA凝胶成像系统的详细资料,我们以前购买的这个仪器,但说明书丢了,现在需要用到其参数之类的资料,有哪位高人有关于此仪器的信息,麻烦提供,非常感谢
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谁有UVP 凝胶成像系统的电子版中文手册啊?有的话给我传一份,或者发送到我的邮箱里,我将赠送1000积分给提供资料的人。我的邮箱是zhwaisw@163.com
美国Alpha Innotech 的凝胶电泳成像系统的camera卡的驱动,使用的是Chemilmager TM IS 4400软件,仪器上写的是 Multilmage Light cabinet ,需要的驱动是仪器上那个卡的驱动,叫着 ITI Image capture device,请使用相同仪器的兄弟姐妹们给我发过来一个吧,愁死了,仪器没法用了
凝胶成像定义 凝胶成像即:对DNA或RNA胶 进行切胶、拍照、观察、分析 ,的实验室类仪器, 凝胶成像系统可以应用于分子 量计算,密度扫描,密度定量, PCR定量等生物工程常规研究。凝胶成像应用范围 总体上来说凝胶成像可应用于:凝胶成像系统可以用于:蛋白质、核酸、多肽、氨基酸、多聚氨基酸等其他生物分子的分离纯化结果作定性分析 (1)分子量定量 对于一般常用的DNA胶片,利用分子量定量功能,通过对胶上DNA Marker条带的已知分子量注释,自动生成拟合曲线,并以它衡量得到未知条带的分子量。通过这种方法所得到的结果较肉眼观察估计要准确很多。 (2)密度定量 一般常用的测定DNA(脱氧核糖核酸)和RNA(核糖核酸)浓度的方法是紫外吸收法,但它只能测定样品中的总核苷酸浓度,而不能区分各个长度片段的浓度。利用凝胶成像系统和软件,先将DNA胶片上某一已知其DNA含量的标准条带进行密度标定以后,可以方便的单击其他未知条带,根据与已知条带的密度做比较,可以得到未知DNA的含量。此方法也适用于对PA GE蛋白胶条带的浓度测定。 (3)密度扫描 在分子生物学和生物工程研究中,最常用到的是对蛋白表达产物占整个菌体蛋白的百分含量的计算。传统的方法是利用专用的密度扫描,但利用生物分析软件结合现在实验室常规配备的扫描仪或者直接用白光照射的凝胶成像就能完成此项工作。 (4)PCR定量 PCR定量主要是指,如果PCR实验扩增出来的条带不是一条,那么可以利用软件计算出各个条带占总体条带的相对百分数。就此功能而言,与密度扫描类似,但实际在原理上并不相同。PCR定量是对选定的几条带进行相对密度定量并计算其占总和的百分数,密度扫描时并对选择区域生成纵向扫描曲线图并积分。
我在做一个课题,将糖类用琼脂糖凝胶电泳分离后,染色,再定量。现在的问题是到底用凝胶成像系统准确些,还是用薄层扫描仪效果好些?看国外的文献,用的是一种叫做“光密度计”的设备,国内难以找到。我的老板曾去相关实验室访问,他说对方用的是薄层扫描仪。我在想是否凝胶成像系统会更好些。不知各位高人有无好的建议给我?
美国Alpha Innotech 的凝胶电泳成像系统的camera卡的驱动,使用的是Chemilmager TM IS 4400软件,仪器上写的是 Multilmage Light cabinet ,需要的驱动是仪器上那个卡的驱动,叫着 ITI Image capture device,请使用相同仪器的兄弟姐妹们给我发过来一个吧,愁死了,仪器没法用了
最近刚开始了解凝胶成象系统 希望各位指导一下另想了解一下CCD照相的光圈大小对成象有哪些影响
Introduction 过去,研究人员为了确保凝胶结果完美需要进行辛苦的工作:通过不断重复进行保存凝胶,或者凝胶存档(a record of the gel)的工作,在记录他们辛辛苦苦得来的凝胶结果上花费了许多时间和精力。然而今天的我们已经不再需要如此手工化的操作了,我们可以利用许多商品化的凝胶成像系统快速而准确的记录下实验结果,并且可以方便地获得分析和组织实验的数据。而且凝胶成像系统也已经不仅仅是作为一种凝胶记录的手段,普遍应用于蛋白、DNA的凝胶记录中了,更是一种印迹分析,数据获得的方式。 不管是什么用途,刚开始的时候凝胶成像系统的组件都是相似的。Alpha Innotech的产品经理Hanh Lee就曾说,“表面上看来,所有的凝胶成像系统看上去和操作起来很相似:它们都有一个相机、一个黑暗的‘围栏’与获取和分析凝胶图片的软件。”但是,更深入的进行了解,你就会发现大部分凝胶成像系统提供了不同的产品特性来满足不同科学研究的需要。 要挑选一个合适的凝胶成像系统,各人需要根据目前的预算和将来研究需要来决定,市场上有众多的类型和型号可供选择,但是大家要务必记住经常留意最新的产品动向——快速发展的光学技术和成像分析软件也许能实现你以前想都不敢想的方便操作。 A range of specifications for far-ranging needs 首先值得一提的当然是分别在在2004年和2006年获得凝胶成像分析系统生命科学产业奖的Bio-Rad公司的产品,Bio-Rad公司提供了各种不同的产品特性满足客户的不同科学研究需要。例如,Bio-Rad公司的ChemiDoc XRS系统就是为高分辨率的化学发光和荧光成像用途设计的。该系统的特点包括:1.3兆的超级冷却CCD照相机、一个紧密不透光的暗室、一个滑行的透射仪、一个的由软件控制变焦、聚焦、光圈、实时成像和动态平场处理的伸缩镜头。该公司还提供另外一种更基础用途的型号Gel Doc XR,主要用于快速高分辨率成像,但没有化学发光成像功能。该系统包含一个暗室、一个1.4兆像素的CCD照相机、UV和白光照明、琥珀色滤光玻片和UV防护罩。Gel Doc XR系统也可以升级为ChemiDoc XRS系统,两种系统都包含了图像获取和分析软件 ——Quantity One。虽然像ChemiDoc XRS等系统的高科技特性对于新用户来说听起来有点不习惯,但是Bio-Rad公司的CCD成像技术产品经理Jill Raymond表示,“Bio-Rad的凝胶成像系统的关键特点就是设计的简易性——几乎能满足所有顾客的需要。” Bio-Rad公司还提供两种分辨率更高和灵敏度更好的凝胶成像系统型号:VersaDoc Model 4000和VersaDoc Model 5000。VersaDoc Model 4000系统具备一个3.2兆像素的CCD相机,提供了最佳的分辨率。该系统尤其适用于蛋白组分析,例如可以利用Quantity One 1-D分析软件来估计蛋白样品的分子量和数量,也可以利用PDQuest 2-D分析软件来分析蛋白表达产物的差异。 VersaDoc Model 5000系统则运用了高级的量子效应、蓝光增强的CCD相机,该相机通过过冷光源(supercooled)来优化低亮度情况下的图片成像。通过Quantity One 1-D分析软件就能轻松估计样品的丰度差异。 知名的Alpha Innotech公司在科学研究和预算要求方面也提供了广泛的,可供选择的产品,比如目前相对新型和高端的产品——FluorChem SP,这是一种可以用于化学发光、荧光、和可见光应用的产品。 Alpha Innotech公司宣称通过FluorChem SP,希望能设定近期发展起来的电子致冷型CCD(cooled CCD camera)相机技术的行业标准,包括分辨率、灵敏度、动态范围和性能等方面的标准。而且Alpha Innotech也相信他们公司提供的相机产品的规格有着其他公司不能比拟之处:高分辨率(科学研究级的CCD)、4兆象素、低信噪比、低暗电流(dark current)、绝对的和可调的制冷温度(用于更高端的系统)。 除了4兆象素的分辨率外,FluorChem SP还提供了Alpha Innotech公司的AlphaEaseFC软件。其特有的算法通过三维图像轮廓成像、图像锐化和降低信噪比等技术改进了成像分辨率。AlphaEaseFC软件提供了可以简单易用的单击完成1D泳道分析、2D点密度、MW/Rf(分子量/迁移率)计算、克隆和细胞计数、微量滴定盘分析、芯片分析、物距测量和凝胶评分等功能。 另一方面,Alpha Innotech公司也提供给用户一种经济实惠的选择——入门级的AlphaDigiDocRT 2产品,这是一种实时的凝胶成像系统,只要具备一台电脑(通过USB连接)、一台UV透射仪就能使用。当然这是一种stand-alone版的成像产品,也就意味着它不具备一些昂贵的系统提供的许多图像分析选项。 AlphaDigiDocRT 2具有高达8兆的分辨率(8位灰度或者24位彩色成像)、在软件控制下具有4倍的光学变焦和自动聚焦等性能。该系统还包含了AlphaEaseFC图像获取软件,用于控制变焦、自动聚焦、分辨率和曝光时间,含有自动图像增强和数据管理工具,除此之外AlphaDigiDocRT 2外形小巧,经济实惠,是小型和拥挤的实验室的理想选择之一。 The importance of upgradeability 假如你现在就需要一台凝胶成像系统,虽然目前你们实验室很小并且预算很紧,或者你不需要很多花俏的凝胶成像系统的功能,但是预知将来可能会需要更多复杂的性能的时候,最好购买一台能允许你升级到满足你将来需要的凝胶成像系统。 有一些公司提供了这种服务,比如Alpha Innotech公司——任何顾客购买了带有DE-500操作室的入门级凝胶成像系统,就对系统进行升级而不需要买一套全新的系统。另外以上提到的Bio-Rad公司的GelDoc XR 和ChemiDoc XRS也是可升级的系统。 除此之外,Kodak公司的分子成像系统就其高级市场专员Allison Sova的表述:“Kodak公司的Gel Logic的凝胶成像系统家族使得研究者能选择目前所需要的性能,并且可以将来可以经济而简易的升级系统以满足将来的需要。简单的来说,Kodak公司提供给研究者更大的灵活性来满足他们实验室对成像能力不断增加的要求”,也是一种可以升级的系统。 Kodak’s Gel Logic 100是Kodak公司的基础型成像系统,它包含一个1兆象素的数码CCD相机、一个Gel Logic成像操作室、一个溴化乙锭带通滤波器。并且Kodak公司award-winning Molecular Imaging软件提供了其他成像系统所没有的特性,该软件可以在Mac操作系统或者Windows操作系统中使用。假如Gel Logic 100系统还不能满足你的需要,Kodak公司还提供了完整系列的数码凝胶成像和印迹成像系统——DNA 和 RNA凝胶成像,或者蛋白凝胶、印迹、或者平板成像等。 比如Gel Logic 2200数码成像系统,Gel Logic 2200数码成像系统是Kodak公司顶级的凝胶成像系统。 Gel Logic 2200运用了2.2兆像素致冷型CCD相机,适用于更高灵敏度的化学发光和低亮度荧光检测,该系统还整合了白光和紫外光光源。Kodak公司称,该系统能检测皮摩尔至飞摩尔水平的荧光信号,达到与放射性自显影胶卷一样的灵敏度。 另外,大范围生产凝胶成像系统的厂商还有Syngene——Synoptics公司的一个分公司。Synoptics公司的Paru Oatey说“基本上你可以根据研究需要和经费预算来选择相机、光源和滤光镜等配置,这将确保不会在一个系统中不需要的部件上花费多余的钱。” InGenius是Syngene公司的低预算型凝胶成像产品,可以根据选择不同的相机达到不同的分辨率。InGenius系统小巧易用,包括一个暗室,一个0.3-2兆像素的CCD相机(视型号而定)。 G Box是该公司的另一个高端产品,一个更先进的凝胶成像和分析系统。该系统可以根据不同的应用选择三种不同分辨率的CCD相机,可以选择自动伸缩镜头或者手工镜头,电脑驱动或者手动滤光选择器,根据不同用途的光源选择,符合人体工程学外形设计的暗室。Syngene公司最近推出了一款高分辨率的G Box型凝胶成像产品——G Box Chemi XT16,该系统具有一个超致冷型、低噪音、高分辨率的4兆像素的CCD相机,适合灵敏的化学发光用途。除了自带的暗箱外,系统还包括安置在头顶的白光和紫外光透射光源。每一台G Box系统都提供了GeneTools分析软件,该程序能使许多单调乏味的工作自动完成,例如分子量分析和点带匹配等。
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凝胶成像分析系统用途http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2012/05/201205280927_368829_2523132_3.jpg*用于对各种电泳凝胶图像的采集、保存和分析。基本功能*140万像素CCD,电动变焦,智能化分析暗箱,具有开门断紫外线,自动延时关断,变焦镜头保护,USB接口,触摸软键,可通过鼠标实现CCD设置和变焦镜头调整的遥控功能;*配备中文界面图像软件,确保对图像的“观察,拍摄,分析”过程一气呵成,同时兼容tif,jpg,bmp,gif等图像格式;*具有开门防护,延时关断,漏电保护等功能;*具有“自动曝光、自动白平衡”性能,其方便性远远优于数码相机,以及模拟CCD;拍摄范围:4.5*6(㎝)~20*20(㎝);图像观察:支持TWAIN接口,达到“实时浏览”的效果,可全屏显示,通过鼠标设置CCD关于图片亮度、黑白对比度、∮值等参数,也可以通过鼠标激活变焦镜头驱动串口,获得对观察谱带的放大,缩小,变焦等操作;图像处理:具有添加文字,箭头,图形注释,旋转,缩放,亮度,弧度,对比度的自动、手动调整及图片颜色的调整,负向及3D模拟显示等;图像分析:配合使用凝胶分析软件,可获得诸如泳道,条带的自动,手动识别,谱带分子量,灰度值,样品量,百分比浓度,迁移率等自动计算结果;
专家介绍:大部分凝胶成像系统提供了不同的产品特性来满足不同科学研究的需要。凝胶成像分析软件功能介绍:凝胶图象剪辑处理,标记,自动寻找凝胶条带,与公用的标准条带或自选的标准条带比较,条带(泳道)迁移路径的校正,核酸、蛋白的处理,计算相应的数值,详细的分析结果可输出成EXCEL格式,根据需要编辑。另外一种更基础用途的型号Gel Doc XR,主要用于快速高分辨率成像,但没有化学发光成像功能。该系统包含一个暗室、一个1.4兆像素的CCD照相机、UV和白光照明、琥珀色滤光玻片和UV防护罩。Gel Doc XR系统也可以升级为ChemiDoc XRS系统,两种系统都包含了图像获取和分析软件 ——Quantity One。该系统尤其适用于蛋白组分析,例如可以利用Quantity One 1-D分析软件来估计蛋白样品的分子量和数量,也可以利用PDQuest 2-D分析软件来分析蛋白表达产物的差异。不管是什么用途,凝胶成像的组件都是相似的。都有一个拍摄系统、一个带有特殊光源的暗箱与获取和分析凝胶图片的软件组成。”但是,快速发展的电子技术、光学技术和成像分析软件使成像操作越趋人性化。随着分子生物学研究逐步普及凝胶成像系统在国内的需求在不断增长。
■凝胶成像分析系统用途*用于对各种电泳凝胶图像的采集、保存和分析。基本功能http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2012/04/201204261622_363546_2523132_3.jpg*140万像素CCD,电动变焦,智能化分析暗箱,具有开门断紫外线,自动延时关断,变焦镜头保护,USB接口,触摸软键,可通过鼠标实现CCD设置和变焦镜头调整的遥控功能;*配备中文界面图像软件,确保对图像的“观察,拍摄,分析”过程一气呵成,同时兼容tif,jpg,bmp,gif等图像格式;*具有开门防护,延时关断,漏电保护等功能;*具有“自动曝光、自动白平衡”性能,其方便性远远优于数码相机,以及模拟CCD;拍摄范围:4.5*6(㎝)~20*20(㎝);图像观察:支持TWAIN接口,达到“实时浏览”的效果,可全屏显示,通过鼠标设置CCD关于图片亮度、黑白对比度、∮值等参数,也可以通过鼠标激活变焦镜头驱动串口,获得对观察谱带的放大,缩小,变焦等操作;图像处理:具有添加文字,箭头,图形注释,旋转,缩放,亮度,弧度,对比度的自动、手动调整及图片颜色的调整,负向及3D模拟显示等;图像分析:配合使用凝胶分析软件,可获得诸如泳道,条带的自动,手动识别,谱带分子量,灰度值,样品量,百分比浓度,迁移率等自动计算结果;主要特点*ABS模具外壳,流线型设计,大方美观;*进口低照度高分辨率数字CCD,便于捕捉弱带,实时浏览,全屏显示,操作简单;*配有进口6倍变焦镜头,光圈F1.2~16,遥控电动变焦智能控制,便于凝胶的缩放观察;*采用多层镀膜滤光镜组,有效滤除背景干扰噪声;*超薄(透射)磷屏转换板和反射白光板;*抽屉式操作台,便于对凝胶的各种操作基本参数 外形尺寸及重量■紫外光源: ■外形尺寸(L×W×H):450×415×853㎝ 透射波长:300nm; ■重量:26.3kg 反射波长:254nm、365nm■透射面积:200×200㎜
电泳是一个分子生物学实验室最常做的实验之一,而记录电泳结果是电泳完毕必须的,不同的实验室,不同的时间段,记录这种实验结果的方式并不相同。这里就讲讲我所使用过的记录电泳结果的方式。上大学做毕业论文的时候,实验室超有钱,什么仪器都有,电泳之后,记录电泳结果用的是进口的凝胶成像系统,牌子已经记不得了,只记得不是每个人都让用的,要专门的人帮忙照呢,那个时候似乎还不流行用电脑连接凝胶成像的仪器,我们那时候是用相纸打印的,据说那个相纸一卷很贵的,每次都让我们省着用。后来上了研究生,实验室却没有原来的有钱了,这里记录电泳结果用的是数码相机,把跑好的凝胶放在紫外上,上面罩上个黑罩子,然后把照相机往上面一方,咔嚓一照,出来一张红色的电泳照片。http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2012/12/201212141959_412590_1306303_3.jpg如果不这样做呢,还有一种办法,就是去公用的凝胶成像系统上去照,那也似乎是个很高级的进口的凝胶成像系统,但是也不连接电脑,需要自己带个软盘,把照片拷出来,一个软盘只能拷贝一张照片。http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2012/12/201212142000_412591_1306303_3.jpg后来,实验室渐渐的比以前有钱了,并且国产的凝胶成像系统也开始流行起来,有个老师推荐了一台,也就2-3万块钱,效果还不错,也可以连接电脑了,再不用用软盘拷贝了,照出来的照片效果也不错。当时,这时候进口的凝胶成像系统也都连接电脑了。http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2012/12/201212142001_412592_1306303_3.jpg
电泳时胶回收切胶的注意事项: 1. 电泳的buffer和gel都是新制的,切胶的台子清理干净,刀片最好洗净灭菌,总之一句话就是保证切下的带没有外源dna污染。 2. 切胶是要把整个目的片断所在位置的胶全部回收。为了减少胶的体积,可以用相对比较薄的胶来做,只要够点样即可,也可采用薄而宽的梳子来跑胶。 3. 关于防护,在一般有机玻璃后就足够了,戴上防护面具以保护眼睛,如果戴树脂眼镜就可以了。要是非常害怕紫外照射,或者对于胶有特殊要求,例如要求不含EB,可以采用点marker和带刻度的尺子一起照相的方法来确定目的条带在胶上的位置进行切胶。 4. 按照正常程序点marker跑胶,然后切下有marker的胶,EB染色,紫外灯下与带刻度的尺子一起照相。由于要回收的带与marker间的相对位置已知,根据尺子来衡量未染色胶上目的带的位置即可。如果觉得很难判断,可以直接在marker边点少量的样,这样位置就容易确定了。 凝胶成像分析系统的使用和注意事项: 凝胶成像分析系统:可以应用在蛋白电泳凝胶,DNA凝胶,样品进行图象采集并进行定性和定量分析,样品包括:EB、SYBR Green、SYBR Gold、Texas Red、GelStar、Fluoroscecin、 Radiant Red等染色的核酸监测;以及Coomassie Blue、SYPRO Orange、各种染色的蛋白质凝胶如考染等。(或UV,EB和有色及可见样品成像) 使用注意事项: • 注意开机顺序,先开凝胶成像系统,再打开电脑进入软件。 • 紫外凝胶照相时要防止EB 污染仪器,凝胶成像系统的门不能用污染的手套接触,进行软件操作时同样不能被污染的手套接触。凝胶成像仪推荐 • 在使用紫外光源照相的过程中,不可以打开凝胶成像系统前面板。 • 照相后经废胶取出,并用较软的纸擦拭干净。 • 调焦时要轻,动作不要剧烈。 • 环境电压 不稳定 时,请使用稳压电源。使用过程中如遇断电,请及时将仪器电源关闭,直至重新来电。 • 使用时,请先打开仪器的电源开关,再打开电脑开关并打开软件( Quantity One )。 • 保持观测室内环境干燥,及时将遗留在观测板上的水或其他液体檫干(可使用软质纸,一般卷纸即可)。 • 观测用 EB (溴乙锭)染色的凝胶时,注意不要污染仪器表面。千万不要用手直接接触凝胶,或戴着接触过凝胶的手套去接触仪器的门和观测台的把手。 • 使用仪器时,要将门及观测台关紧,否则将无法正常使用紫外灯。 • 尽可能不要将电脑连接到因特网或局域网上,同时在电脑上安装杀毒软件(推荐使用正版软件),做到专机专用。 • 较长时间不用仪器时,请将仪器用防尘罩盖上。 • 为延长灯管的使用寿命,请观测好凝胶后及时关闭光源(仪器自身有 15 分钟的自动保护程序)。 转自上海思伯明仪器设备www.springsci.com.cn
转载法国VL凝胶成像及分析系统操作指南一、图像摄取:1. 启动电脑系统,打开灯箱开关;2. 双击显示屏上的Bio-cap图标,进入图像摄取主画面;3. 放入要摄取图像的样品(胶片、电泳胶等),按下步分别摄像;A、 核酸凝胶样品(要用紫外光板的),先移动CCD至暗箱到右边,单击画面的“integration time”钮,调整爆光时间,CCD上的光圈、焦距并配合主画面上的“adjustment”钮下的对比度及亮度调节钮,至出现清晰画面为止;B、 除核酸凝胶样品外的所有样品(要用白光板的),移动CCD至暗箱至左边,单击画面上的“read time”钮,调整CCD上的光圈,焦距及主画面“adjustment”钮下的对比度及亮度调节钮至清晰画面出现为止,必要时,可打开暗箱的开关以增加照明度;4. 单击“Freeze”钮,固定所摄到的图像,同时可开闭灯箱开关;5. 单击“保存”。并输入图像编号,按“确定“钮,图像存入文件夹即可完成图像保存工作。6. 如要打印图像,先打开热敏打印机开关,单击“热敏打印机”钮,图像即可输出。图像分析:A、 启动电脑系统;B、 双击显示屏上的“Bio-capt”,“Bio-1D++”或“Bio-2D”图标,进入主画面;C、 打开文档,从“Vlimage”中调出所要分析的图像,按需要分析的内相应分析(可借用“?!”钮启动帮助功能工作)D、 分析工作完成后,关闭主画面即可退出图像分析程序。二、注意事项:1. 保持内室环境清洁,干燥;2. 保持灯箱光板干净(特别是用了核酸电泳胶后);3. 光板上不要用硬、尖物拖、划以防止出现划痕影响图像观察。