自动测序分析仪

工欲善其事，必先利其器。　　作为基因组学的核心技术，DNA测序技术是当下应用最广泛的生命科学技术之一。基因测序仪不仅用于科研，也正在成为精准医学的重要工具。基因测序技术不断推陈出新，从1986年第一台商用DNA测序仪的推出，到现在三代测序仪崭露头角，小编目前了解到的基因测序仪有55台。本篇文章将重点梳理历代DNA测序平台，为行业相关从业人员理清思路。一代测序仪　　公司1：ABI(现属于赛默飞)ABI370A(第一台商品化的平板电泳全自动测序仪)ABI3700ABI310ABI3100ABI3130/3030XLABIPrism3700ABI3730(测序金标准)ABI3500　　公司2：MolecularDynamics(现属于GE)MegaBACE1000　　公司3：IlluminaGenomeAnalyzerGenomeAnalyzerIIx　　公司4：中盾安民GA118-16A遗传分析仪（网上有说此款测序仪为二代测序仪产品，小编查了此款测序仪的原理，觉得把它归纳为一代测序仪比较合适。若归纳错误，还望读者指正。）二代测序仪　　公司1：RocheGenomeSequencer20（图片暂未找到）454GenomeSequencerFLX　　公司2：IlluminaHiSeq系列HiSeq2000HiSeq2500HiSeq3000/HiSeq4000　　Miseq系列MiSeqMiSeqDxMiSeqFGx　　HiSeqX系列HiSeqXTen/HiSeqXFive　　NextSeq系列NextSeq500NextSeq550　　NovaSeq系列NovaSeq5000/NovaSeq6000　　　　Illumina其他测序系统MiniSeq系统iSeq100　　公司3：ABI(现属于赛默飞)　　SOLiD系列ABISOLiD™ 5500基因测序系统SOLiD5500XL　　公司4：iontorrent(现属于赛默飞)IonProtonIonTorrentIonPGM　　公司5：华大基因华大智造MGISEQ-200华大智造MGISEQ-2000华大智造MGISEQ-T7　　公司6：凯杰GeneReader　　公司7：华因康HYK-PSTAR-IIA　　公司8：中科紫鑫BIGIS基因测序仪　　公司9：达安基因DA8600　　公司10：博奥生物BioelectronSeq4000　　公司11：贝瑞和康NextSeqCN500　　公司12：安诺优达NextSeq550AR三代测序仪　　公司1：HelicosHeliScope　　公司2：PacificBiosciencesPacBioRS/PacBioRSⅡPacBioSequel　　公司3：OxfordNanoporeTechnologyMinIONGridIONX5PromethIONMinIT测序分析仪　　公司4：10XGenomicsChromiumTMSingleCellImmuneProfilingSolution平台　　公司5：瀚海基因GenoCare　　基因测序仪汇总列表　　基因测序技术不断推陈出新，期待国内外厂商能够继续带给我们更多惊喜，全家福能够增添更多成员。品牌名称仪器名称仪器类型上市年份ABI（赛默飞）ABI370A一代1986ABI（赛默飞）ABI3700一代ABI（赛默飞）ABI310一代1996ABI（赛默飞）ABI3100一代2000ABI（赛默飞）ABI3500一代ABI（赛默飞）ABIPrism3700一代1998ABI（赛默飞）ABI3730一代2002ABI（赛默飞）ABI3130一代2004ABI（赛默飞）ABI3130XL一代2004中盾安民GA118-16A遗传分析仪一代MolecularDynamics（GE）MegaBACE1000一代Solexa（Illumina）GenomeAnalyzer一代2006Solexa（Illumina）GenomeAnalyzerIIx一代Roche454GenomeSequencer20二代2005Roche454GenomeSequencerFLX二代2007IlluminaHiSeq2000二代2010IlluminaHiSeq2500二代2012IlluminaHiSeq3000二代2015IlluminaHiSeq4000二代2015IlluminaMiSeq二代2011IlluminaMiSeqDx二代2013IlluminaMiSeqFGx二代2015IlluminaHiSeqXFive二代2015IlluminaHiSeqXTen二代2014IlluminaNextSeq500二代2014IlluminaNextSeq550二代2015IlluminaNovaSeq5000二代2017IlluminaNovaSeq6000二代2017IlluminaMiniSeq系统二代2016IlluminaiSeq100二代2018ABI（赛默飞）SOLiD™ 5500二代2007ABI（赛默飞）SOLiD™ 5500XL二代iontorrent（赛默飞）IonProton二代2012iontorrent（赛默飞）IonTorrent二代2010iontorrent（赛默飞）IonPGM二代2010华大基因MGISEQ-200二代2014华大基因MGISEQ-2000二代2014华大基因MGISEQ-T7二代2018凯杰GeneReader二代2014华因康HYK-PSTAR-IIA二代2015中科紫鑫BIGIS二代2015达安基因DA8600二代博奥生物BioelectronSeq4000二代2015贝瑞和康NextSeqCN500二代2015安诺优达NextSeq550AR二代2017HelicosHeliScope三代2008PacificBiosciencesPacBioRS三代2010PacificBiosciencesPacBioRSⅡ三代2013PacificBiosciencesPacBioSequel三代2015OxfordNanoporeMinION三代2014OxfordNanoporeGridIONX5三代2017OxfordNanoporePromethION三代2016OxfordNanoporeMinIT测序分析仪三代2019瀚海基因GenoCare三代201710XGenomicsChromiumTMSingleCellImmuneProfilingSolution平台三代2017若有疏漏，欢迎拍砖~———————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————仪器信息网生命科学官微“3i生仪社”上线啦！定期更新干货资讯，欢迎扫码关注！

p　　对很多人来说，基因测序仪都是一个很陌生的名词。然而，如果你感受过独步世界的中国高铁技术，见证过中国发射的量子卫星，还听说过独占世界超算排行榜长达五年的中国超级计算机，那么处于全球领先地位的中国基因测序仪也绝对值得一探究竟。/pp　　人们常说，19世纪是蒸汽机的世纪，20世纪是汽车和计算机的世纪，而21世纪则是生命科学的世纪。生命科学研究将在医疗健康、体育运动、农业养殖、司法刑侦、太空探索等众多方面广泛而深远地改造人类生活。作为生命科学研究最核心的基础性工具，基因测序仪已经成为当前中美全面科技竞争的重要领域。/pp　　strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "什么是基因测序/span/strong/pp　　基因测序技术是基因组学研究的核心技术，是现代生命科学研究中最广泛应用的重要技术。你可能还不知道，地球上几乎所有你能看见和看不见的生命形式都是由基因编码而成的。塞满商场的人类、卖萌为生的熊猫，爬过阳台的甲虫、各类叫不上名字的树木花草以及数万亿和我们亲密接触的细菌、微生物，都是由DNA编码的生命体。/pp style="text-align: center"img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201908/uepic/a458d63e-538a-4d26-b3cd-50c2933870ba.jpg" title="1.jpg" alt="1.jpg"//pp　　每一个生命都像是执行一段代码的程序，而DNA正是生命的源代码。相应地，破解生命源代码的技术，就是DNA测序。/pp　　strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "发现双螺旋——让测序成为可能/span/strong/pp　　如果说测序技术的进步是发掘矿藏的过程，那么还需要先行者告诉我们矿藏的方向和位置。完成这项任务的，正是科学界的两位顶尖人物——沃森和克里克。/pp style="text-align: center"img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201908/uepic/d812d00c-25b0-471a-91bf-31490093244a.jpg" title="2.jpg" alt="2.jpg"//pp style="text-align: center "span style="font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai "双螺旋结构的发现者James Watson和Francis Crick/span/pp　　1953年，沃森和克里克发现了DNA双分子螺旋结构，人类对生命的认识有了重大的突破，即：“生命是序列的，生命是数据的。”生命体的全基因组包含了其全部遗传信息，这些信息是A-T、C-G四种碱基两两配对后排列成的长链。这些碱基的排列信息可以被读取出来，以1010001的二进制形式存储在计算机中 可见，生命的密码是一组可以被数据化的碱基排布序列。因此，测定DNA序列就成为解读遗传信息的先决条件和整个生命科学研究的重要基础。/pp　　可以说，正是DNA双螺旋结构的发现，带动了DNA测序技术的大发展，开启了人类历史上方向明确而历时长久、道路曲折、投入巨大、进展惊人的探索。/pp　　strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "测序技术发展的四个阶段/span/strong/pp　　DNA双螺旋的发现，让破解生命源代码的DNA测序在原理上成为可能，现在我们就来回顾测序技术的具体发展，其主要经历了四个阶段。因篇幅所限，这篇文章将为你展示前两个阶段。/pp　　strong阶段1：从“前直读”到“直读”/strong/pp　　1964年，即DNA螺旋被发现11年后，康奈尔大学的研究者第一次分析了酵母的核苷酸序列。这次研究标志着一个新时代的开始。不过，正如承载生命信息的大分子经历了从RNA到DNA的历程，最开始的测序方法是用来测定RNA序列的，实验用不同的RNA酶对RNA模板进行“消化”(digestion)，并根据反应后产物中可能重叠的序列间接推导可能的完整序列。这种测序技术流程繁琐，推导复杂，很难重复，验证还更为困难。不仅如此，在试图测定双链且更加稳定的DNA时，这种方法没能获得成功。/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 305px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201908/uepic/f6459ef0-726f-4dab-805d-2c1b3ea314e1.jpg" title="3.jpg" alt="3.jpg" width="600" height="305" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: center "span style="font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai "直读法示例/span/pp　　在技术的发展史上，新技术的出现就像制作一个木桶，每一块木板都代表一种必须具备的基础条件，任意一块板的缺失都不构成一个木桶，同时，木板之间还需要彼此适应和融合。直接读取DNA序列的测序技术(即“直读法”)，正是这样一个木桶。它是在分子克隆技术、凝胶电泳技术、放射自显影三种技术全部成熟之后才出现的。在这三种技术的基础之上，直接读取DNA序列的SBC和SBS测序法问世。“直读法”的最大突破在于不再需要间接推导，而是可以直接在凝胶上按顺序直观读出测序模板，判断DNA分子每个碱基位置上为T-C还是A-G。/pp　　SBC与SBS这两种方法在原理上相似，但具体操作有诸多不同。SBC法使用化学试剂，有较强的毒性，且技术复杂较难掌握，成功率不高。相比之下，SBS法使用酶试剂，具有操作简便、结果稳定、准确性高且重复性好等特点。更有意思的是，运用SBS法的设备相对简单，可以实验室自制或采用通用设备，还有使用方便的标准化试剂盒，因此很快风靡全球相关实验室。SBS法由英国科学家桑格(Frederick Sanger)于1975年率先发明，因此也被称为Sanger法。这种直读法的发明也为DNA测序的数字化和自动化奠定了基础/pp style="text-align: center"img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201908/uepic/dc28748a-368f-4144-8805-8b14db973ec8.jpg" title="4.jpg" alt="4.jpg"//pp style="text-align: center "span style="font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai "Sanger电泳法跑胶结果示例图/spanbr//pp　　strong阶段2：从手工到自动化/strong/pp　　上世纪80年代以前，分子生物学这门学科一直都被戏称为“现代技术、手工操作”，直到DNA测序技术出现，分子生物学才有了第一种实现自动化和信息化的技术。此后测序技术在几十年发展历程中不断吸收其他领域新技术(如物理领域的纳米技术及激光技术、化学领域的荧光标记核苷酸技术、生化领域的毛细管电泳分析、信息领域高密度芯片等技术)并将它们融为一体的成果，形成了现代科学研究技术中的强力工具。/pp　　1986年，加州理工学院的胡德(Leroy Hood)发明了以四种荧光物质标记测序反应产物的“四色荧光法”，这些荧光物质在不同波长的激光下呈现不同颜色。这项技术成为广受欢迎的SBS测序法(Sanger测序法)走向自动化的关键突破。　　/pp style="text-align: center"img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201908/uepic/c56d19b1-381e-4039-89b4-c54f701e45ec.jpg" title="5.jpg" alt="5.jpg"//pp style="text-align: center "span style="font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai "四色荧光法原理示意图和自动测序仪的四色荧光“峰图”/spanbr//pp　　这种方法将测序效率提高了数倍，读长达到500nt(nt：nucleotide 核苷酸，是衡量单链核酸的长度单位)，分辨率大为提高 而且，这是测序技术发展史上首次真正彻底抛弃了放射性物质的使用。测序效率也称为“通量“，是指单台设备一次反应所获取的序列数据量。/pp　　另外，还有一个与通量同样重要的概念——“读长”：测序仪的测序原理是将目标DNA大量复制，然后用酶将这些DNA长链切断，并分别对每一小段测序，最后将这些片段拼接还原成完整的长链。读长就是指测序仪能读出的每一个DNA片段的长度。这两个概念很重要，后面还会经常提到。/pp　　据此，美国ABI公司在1986年推出了第一台商品化的平板电泳全自动测序仪——ABI 370A。此后，该公司又推出了多种改进型，在读长、通量、准确性方面都有很大提高，这种自动化测序仪成为划时代的国际“人类基因组计划(HGP)”得以启动的重要技术依据。/pp　　尽管这一代测序仪为“人类基因组计划”做出了突出贡献，但只实现了测序过程的自动化，在自动测序之前的细菌克隆、手工制胶、手工加样等操作都需要消耗大量的人力。一组数据可以说明问题：在“人类基因组计划”冲刺阶段，华大在6个月的时间里完成了50万次成功的测序反应，共消耗了1500万个形状大小与医用“针头”类似的移液器吸头。/pp　　span style="color: rgb(0, 0, 0) "未完待续，详见下期：/spanstrongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "爆发式的进步/span/strong/pp　　span style="color: rgb(255, 0, 0) "strong小贴士/strong/span/pp　　strong1.人类基因组计划(Human Genome Project, HGP)/strong/pp　　人类基因组计划是一项规模宏大，跨国跨学科的科学探索工程。其宗旨在于测定组成人类染色体(指单倍体)中所包含的30亿个碱基对组成的核苷酸序列，从而绘制人类基因组图谱，并且辨识其载有的基因及其序列，达到破译人类遗传信息的最终目的。基因组计划是人类为了探索自身的奥秘所迈出的重要一步，是继曼哈顿计划和阿波罗登月计划之后，人类科学史上的又一个伟大工程。/pp　　这一计划于1990年正式启动。美国、英国、法国、德国、日本和我国科学家共同参与了这一预算达30亿美元的人类基因组计划。2001年，人类基因组工作草图发表。2003年4月14日，六国首脑共同宣布人类基因组测序胜利完成。/pp　　strong2.测序效率与读长/strong/pp　　测序效率也称为“通量”，是指单台设备一次反应所获取的序列数据量。测序仪的测序原理是将目标DNA大量复制，然后用酶将这些DNA长链切断，分别对每一小段测序，最后根据片段首尾重合的部分，拼接还原成完整的长链。读长就是指测序仪能读出的每一个DNA片段的长度。/pp　　strong3.SBC与SBS/strong/pp　　这两种方法的原理相似，但具体操作有诸多不同。SBC法使用化学试剂，有较强的毒性，且技术复杂较难掌握，成功率不高。相比之下，SBS法使用酶试剂，具有操作简便、结果稳定、准确性高且重复性好等特点。且运用SBS法的设备相对简单，可以实验室自制或采用通用设备，还有使用方便的标准化试剂盒，因此很快风靡全球相关实验室。/p

从安吉丽娜&bull 朱莉进行乳腺癌基因检测、个性化DNA检测被美国《时代》杂志评为年度最佳发明，到转基因食品大讨论，再到复旦大学日前关于曹操家族DNA的研究成果&hellip &hellip 今天，&ldquo 基因&rdquo 已当之无愧地成为一个全民话题。　　2003年，人类绘制成功第一幅基因组工程(HGP)草图。10年来，由中国完成的基因测序物种目前已占全球一半以上，然而，专家表示，增强创新能力依然是我国基因组学发展的当务之急。　　&ldquo 买枪打鸟&rdquo 亟待转型　　作为全球最大的基因测序与分析研究中心，华大基因已完成近600个物种基因组测序和28200多个变异基因组研究。　　&ldquo 测绘基因序列就像绘制元素周期表，是一切生命科学研究的必备工具和新科学发现的创新源头。&rdquo 在接受《中国科学报》采访时，华大基因杨碧澄博士说。　　而测序技术的升级换代无疑为基因组学发展提供了强大的驱动力。从最初的手动测序仪到第一代ABI自动测序仪、第二代数百万个碱基大通量平行测序，再到第三代单分子实时DNA测序，绘制各种生物基因蓝图的成本和时间不断缩减。在此过程中，我国DNA测序应用能力也随之大幅提升。　　然而专家指出，目前国内测序仪器基本仍依赖进口。&ldquo 如果我国基因组学研究总停留在用别国进口的&lsquo 枪&rsquo 来&lsquo 打鸟&rsquo 的阶段，怎么能够指望超越别人?&rdquo 中科院北京基因组所副所长于军质疑说。　　在中科院院士赵国屏看来，我国测序仪原创能力不强与几千年来看不起雕虫小技的观念不无关系，这导致国家对技术创新的重视程度不如知识创新。　　综合创新 沃土待培　　&ldquo DNA测序是一门非常有用的技术，它对科学发展的意义超过航空母舰对现代战争的意义。&rdquo 于军说。　　相关技术已经给美国带来科学史上空前的经济价值。24年来，HGP及其相关研究已给美国带来9650亿美元的经济效益和50多万个就业机会。　　而巨大的经济收益正是以应用为基础。DNA测序已在临床上大放异彩，同时，测序技术也在农业、工业、养殖业等领域大显身手。&ldquo 以基因测序为基础的选择性育种可以加速新品种的培育周期、提高品种质量与多样性。&rdquo 杨碧澄说。　　而动物基因结构研究不仅有助于了解决定动物各性状的控制基因以培育新品系，还可以辅助人类疾病机理研究、开发新药。微生物基因组研究则可以用于循环经济、环境生态等多个方面。　　可以说，基因测序创新能力体现着一个国家的综合创新能力。对此，赵国屏表示，我国基因测序在一些技术和方法上虽然也有突破，但创新&ldquo 短板&rdquo 依然存在。　　&ldquo 基因测序方面的综合创新不仅需要科学研究之间的交叉，还需要科学、技术、工程之间的互动，中国在这方面的土壤还很差。&rdquo 赵国屏感慨说。　　在他看来，国内过分强调SCI文章和第一作者单位，不利于展开学科交叉和跨领域合作。同时，基因组学从研发到产业的上中下游转化链之间的角色定位、评价方式以及支持方式等都有待进一步厘清。　　未来之路 创新为先　　&ldquo 知道DNA组序列仅是知道遗传本质的第一步，未来新物种基因测序仍会继续增多，测序质量仍有待在现有草图基础上继续提高，研究层次上进一步向系统生物学与合成生物学方向发展。&rdquo 赵国屏说。　　赵国屏认为，生命科学从技术突破到应用要经过两个产业化过程：一是为技术创新提供相应的综合配套手段，其目的是为科研服务 二是为民用服务。当前，基因测序两个产业化过程已并驾齐驱。　　&ldquo 在这个过程中，要让基因组学研究与医、农、工相互结合，用于指导实践和进一步发展。&rdquo 赵国屏说。　　从十几年前&ldquo 搭别人的车&rdquo ，完成1%的人类基因组计划，到&ldquo 十二五&rdquo 期间的&ldquo 万种微生物计划&rdquo 、&ldquo 千种动植物基因计划&rdquo 等生物工程，近20年来，随着国家科研投入增多，我国从事基因组学研究的人才创新队伍日益扩大，这些无疑都是未来中国基因测序创新的底蕴。

当前，基因测序仪的主要生产企业有Illumina、Life technologies、Pacific Biosciences等。近日，仪器信息网编辑随机采访了基因测序仪用户，所采访用户涉及高校、科研院所、测序公司的实验室等，共计3名用户，其中A用户使用Life technologies 公司产品ABI 3730XL，主要应用于PCR产物测序，质粒和细菌人工染色体的末端测序 B用户使用Illumina公司推出的 hiseq-2000，主要应用基因组组装、重测序、外显子测序、转录组测序以及小RNA测序的研究 C用户使用Pacific Biosciences公司研发生产的PacBio RSI，主要应用于基因组从头测序，检测DNA修饰。仪器信息网所采访的产品涵盖了第一、第二和第三代基因测序仪。ABI 3730XL测序仪Illumina hiseq-2000测序仪PacBio RSI 测序仪　　仪器价格：一代更比一代高　　在采访中了解到，用户A所使用的ABI 3730XL测序仪购于2010年，当时购买的价格是100万元人民币左右，这是一款第一代测序仪，其基于毛细管电泳和荧光标记技术进行测序。　　用户B使用的第二代测序仪Illumina hiseq-2000于2011年购买，价格约为75万美元，其采用可逆终止法的边合成边测序技术。　　用户C使用的PacBio RS I测序仪是一款第三代测序仪，其利用DNA单分子的直接测序的原理进行测序。该仪器于2012年购进，当时购买价格约为100万美元。　　用户开机率：普遍较高　　A用户来自测序公司，每天都收到来自其他单位的测序样本，因此使用频率非常高，几乎每天都开机，　　B用户来自科研机构，该仪器作为平台仪器，为单位所在的整个科研系统服务，两年中都是满负荷使用。　　C用户来自高校，仪器主要为高校内部系统提供服务，1年中使用频率较高。　　测序速率，读长，通量都可以满足需求　　相比之下，ABI 3730XL测序仪的测序速度在第一代基因测序仪中是最高的。但是，由于其依赖于电泳分离技术，所以速率方面难以进一步升级，96样本的测序运行时间约为1小时40分钟。每天的数据通量可以达到600000bp，主要适合于基因测序和基因分型研究。　　Illumina hiseq-2000测序仪作为第二代测序仪，测序速率大大提升，每天最高可以产生75Gb的数据。可以实现De Novo从头测序，DNA重测序等各种测序目标。　　PacBio RSI的测序速度可以达到每分钟60个碱基，从样品制备到获得碱基序列的全部流程可在1天内完成。每天可获得的数据是200Mb mappable data。能够完成各种测序目标。　　读长方面，ABI 3730XL的准确读长可以达到800bp。Illumina hiseq-2000测序仪读长可以达到2× 100bp。PacBio RSI目前可以获得1300bp的平均读长。　　前处理环节：第三代测序仪优势明显　　用户表示，ABI 3730XL和Illumina hiseq-2000虽然与同类仪器相比建库准备实验相对方便，但仍需花费较长时间和大量人力。但作为第三代测序平台的PacBio RSI测序仪，利用DNA单分子的直接测序的原理，无需进行文库制备，可直接从DNA片段获得测序数据，从样本制备到获得测序结果，所需的时间还不到一天。并且与传统标准方法相比，所需的DNA量也相当少，用量可低至不到500ng。　　收费售后服务：用户满意度高　　Illumina、Life technologies的售后服务获得了用户的一致认可，用户认为，其服务&ldquo 响应速度快，专业性高，解决问题十分彻底&rdquo 。　　基因测序仪的产品生产商相对较少，过了免费的质保服务期之后，用户需要承担高额的售后服务费用，但几名用户对此并未产生不满，ABI 3730XL的用户表示，&ldquo 我们认为一年10万元的售后费用物有所值。&rdquo 　　改进意见：配套试剂耗材应降价　　尽管ABI 3730XL在速度和成本方面都已达到了极限，但与二三代测序仪相比，其通量较低，成本较高，并且由于其对电泳分离技术的依赖，速度成本难以进一步提升。尽管如此，ABI 3730XL用户认为，ABI 3730XL方法可靠，并且已形成规模化，将继续发挥重要作用。　　使用Illumina hiseq-2000的用户认为，该仪器的配套试剂价格过高，另外读长还有待增加，并且希望建库准备实验可以实现自动化。　　PacBio，RSI的用户表示，这台仪器的不足之处主要在于试剂耗材价格过高，通量还有待提高。另外，PacBio RSI系统可购买升级包，将原有系统转化成最新的PacBio RSII，但是，升级耗资巨大也是令用户头痛的问题。　　附：基因测序仪简介　　DNA测序技术是现代生物学研究中重要的研究手段之一。成熟的DNA测序技术始于20世纪70年代中期。1977年，Maxam和Gilbert报道了通过化学降解测定DNA序列的方法。同一时期，Sanger发明了双脱氧链终止法。20世纪90年代，荧光自动测序技术将DNA测序带入自动化测序时代。目前，基因测序仪已发展到第三代，Illumina、Life technologies(ABI)等公司共同占据着全球基因测序仪市场。 撰稿编辑：乔峰

项目编号：QXZB-2022-1159B项目名称：四川大学华西第四医院核酸质谱分析仪+高通量二代基因测序仪采购项目预算金额：685.0000000 万元（人民币）采购需求：1.采购项目名称：四川大学华西第四医院核酸质谱分析仪+高通量二代基因测序仪采购项目；2.数量、简要技术需求或服务要求：具体详见招标文件第六章。合同履行期限：政府采购合同签订生效后90个日历天内，完成交货、安装调试、培训。本项目( 不接受 )联合体投标。

一、项目基本情况项目编号：0722-2022FE4137SZF-2（深职院：CGXM-2022-001781）项目名称：全自动核酸分析仪预算金额：90.0000000 万元（人民币）最高限价（如有）：90.0000000 万元（人民币）采购需求：为进一步深化产教融合,建立全球领先的生物医药生产实训基地，建成深圳乃至粤港澳大湾区生物医药高端技术技能人才的培养培训基地，中试服务和产品工程转化的技术转移中心，新药研发以及产品试制中心，为生物医药、生命健康等产业集聚发展提供强有力的技术支撑和人才支撑，特申请购置“全自动核酸分析仪”项目。本项目拟够的全自动核酸分析仪能分离和分析多种核酸，还能够自动快速高质量完成生物大分子的质控检测实验，在分子克隆、功能基因鉴定、基因组和表达谱分析、宏基因组测序等研究中，需要对单重或多重PCR产物、酶切或完整质粒、gDNA、total RNA、cRNA,、单链RNA、二代测序建库样本等样本中的核酸的完整性，片段大小，浓度和纯度进行分析，传统电泳耗时良久，操作繁琐，操作和结果记录过程中存在人为失误的可能性，降低结果的准确性和重复性，影响项目进展速度，并且会使用对人体有害的化学物质。而基于全自动核酸分析仪的高分辨率、快速准确、无污染的特点。可以有力的促进基地项目的开展，提升研究成果的质量，促使大量研究成果的产出，并进一步促进新的纵向及横向项目的申请，同时可以培养高层次高技能人才，并助力相关学科进一步发展，从而进一步提升我校科研总体水平和科技影响力。合同履行期限：交货期：合同签订后60个日历日内交货，产品的附件、备品备件及专用工具、技术文件和资料等应随产品一同交付。本项目( 不接受 )联合体投标。

2015年下一代测序技术(NGS)取得了长远的进步。技术的进步使研究人员可以获得更长读长的序列，配合生物信息学，将获得更丰富的基因组信息。　　根据最新的DeciBio市场报告显示，测序仪器市场规模已达24亿，预计到2019年将增长到45亿。临床客户是这一增长的主要推动力，科研市场则受单细胞测序、群体遗传学和NGS应用的驱动。本文回顾了几家主要的测序仪制造商在过去一段时间里的动向，并对2016年进行展望。　　PacBio的逆转：Sequel测序仪　　过去几年，PacBio公司对RSII测序系统读长、通量、生物信息分析和应用等方面做了大量的改进工作。然而，该仪器的价格高达69.5万美元，体积大也阻碍它的广泛采用。　　Sequel测序仪的推出标志着PacBio的逆转，与RS II系统相比，它的测序通量提高了7倍，价格下降到35万美元，体积只有约1/3。　　2015年PacBio预期售出10台Sequel测序仪，大部分卖给了罗氏公司，罗氏准备使用Sequel来开展临床测序。西奈山伊坎医学院的伊坎基因组学及多尺度生物学研究所(Icahn Institute for Genomics and Multiscale Biology)和贝勒医学院也都订购了Sequel。　　华盛顿大学基因组学教授Shendure说，如果Sequel性能继续提升，其低成本和长读长测序的优势，将有助于科研人员进行更全面的突变研究。Sequel将大有作为。该仪器甚至可提供“铂金品质的基因组”，他将此定义为接近人参考基因组的质量。　　英国癌症研究所基因组组长James Hadfield说，如果PacBio继续改善装载效率并降低测序成本，它会成为一个真正的竞争对手。“如果能用PacBio的仪器花费5000美元得到基因组，那真的很棒”，尽管这个价格仍然比Illumina公司基因组测序的价格贵，但它能提供更大的长度范围和结构信息。　　罗斯林研究所ARK基因组中心主任Mick Watson预测，未来一年Illumina公司的测序仪结合PacBio公司Sequel测序仪的使用，将会产生更多全基因组测序结果，可深度了解结构变异和短读长技术测不到的基因组区域，例如，HLA区域、重复元件和着丝粒。另外，他补充说，由于长读长在观察结构变异上的优势，“人们将开始使用Sequel测序癌症基因组。”　　然而，博德研究所的Chad Nussbaum说，Sequel的成功将取决于数据的质量，目前尚没有公开相关数据。　　Oxford Nanopore公司：MinIon试用　　Oxford Nanopore公司去年推出了MinIon纳米孔测序仪早期试用计划。自那时起，该计划已经扩大，几个团体发表了大量研究，证明了MinIon协助基因组装配，以及在标准实验室外快速测序微生物基因组和环境样本的潜力。　　美国NASA约翰逊太空中心的研究人员计划在2016年把MinIon带到太空，测序国际空间站的样本。一些研究者认为，MinIon可用于即时检测(POCT)，例如，快速检测以诊断一个未知感染，对疾病暴发如西非埃博拉暴发的实时分析。　　Oxford公司能否超越PacBio公司仍然有待观察。Watson说，PacBio公司有客户群和成熟的技术。MinIon和即将推出的PromethIon仍处于发展阶段，但Oxford公司的技术有巨大的潜力。　　华大基因的战略变化　　6月，华大基因基于CompleteGenomics的技术推出了一款高通量测序仪Revolocity。当时，Complete Genomics公司的CEO Cliff Reid介绍，Revolocity每年可测序1万个人类基因组，等同于Illumina公司的HiSeq X Ten。尽管华大基因计划2016年上半年才交付Revolocity测序仪，但它已经提前有了三个客户：荷兰奈梅亨大学医学中心、澳大利亚健康服务公司Mater和英国癫痫协会。　　但在11月，华大基因搁置了该测序系统的商业化。Reid将辞去Complete Genomics公司CEO的职务，华大基因把重心放在了桌面测序仪BGISEQ-500上，计划使其通过中国食品药品监督管理局的认证。这是继王俊离开后华大基因经历的另一次大变动。　　Watson推测，Revolocity可能过于复杂，不利于商业化。　　赛默飞：改善服务　　赛默飞(Thermo Fisher Scientific)公司基于其Ion Torrent技术，推出了一款新的NGS系统——Ion S5，专注于“即插即用”的靶向测序。该公司还根据其AmpliSeq技术开发了靶向panels，特别是针对癌症领域。展望未来，靶向测序可能成为赛默飞有利可图的方向，它正努力实现扩大Proton测序仪规模的目标。　　DeciBio的市场报告中写道，由于PII芯片面临的技术难关，赛默飞所占的市场份额有所滑落。随着公司将重心从增加通量转变为改善服务临床客户的工作流程，其发展将以每年约17%的速率增长。　　对2016年的预测　　展望2016年，单细胞测序技术的进展，10X Genomics公司的技术潜能，和大规模测序项目产生的基因组数据都让研究人员们兴奋。　　Shendure说：“捕获、区室化和标记的技术进步非常快速，可以告诉我们哪些序列来自同一个细胞”。这些技术包括10XGenomics的技术，可以快速分析上千个单细胞表达谱的Drop-Seq技术，Shendure实验室正在开发的可创造数千个标记的DNA池的CPT-seq技术。　　Hadfield谈到了单细胞基因组学、基因组定向和自动化。他说：“这些技术使我们能构思更复杂的实验，是我期待的下一次技术革命”。　　若干临床测序项目正在进行中。Shendure说：“监管方面的挑战已经越来越明显。最重要的找到最适合患者的方法，2016年这方面一定会有所进展”。　　另外，Illumina公司依然是NGS市场的主导者，但由于MiSeq和NextSeq测序仪的销售不佳，其第三季度的收益不如预期。专家预测2016年Illumina公司会有重大创新。

p　　为了解近年来基因测序仪的技术发展趋势、市场发展行情、基因测序仪各品牌在市场中的占有率以及重点应用领域等内容，同时，为各基因测序仪厂商在以后的仪器销售和市场推广活动中做指导，仪器信息网特组织了“中国基因测序仪市场调研”活动。此次调研，面对的调研对象包括仪器信息网相关注册用户、基因测序仪制造、应用领域专家以及部分基因测序仪生产厂商等。br/　　《中国基因测序仪市场研究报告(2017版)》内容包含了基因测序仪产业概述、新品盘点、主要制造商地区分布及仪器主要模块简介、基因测序仪销售情况分析、销量与份额分析（品牌）、营销渠道分析、市场发展趋势、产业研究总结。br/ /pp　　《中国基因测序仪市场研究报告(2017版)》的完成得到了广大用户、企业以及业内专家的大力支持。在前期调研过程中，咨询了业内相关专家20余位，超过200家2016采购了基因测序仪的实验室用户单位参与了此次基因测序仪的调研，在此，谨对他们表示最衷心的感谢！/ppbr//pp class="l-28 P_left10"span style="font-size: 18px "strong报告目录/strong/span/pp第一章 基因测序仪产业概述1br/1.1 基因测序仪定义及分类1br/1.2 不同类型基因测序仪销量份额3br/1.3 基因测序仪使用单位分布5br/1.4基因测序产业链结构6br/1.5 基因测序仪产业概述7br/第二章 2016年上市基因测序仪新产品8br/第三章 基因测序仪主要制造商地区分布及仪器主要模块简介10br/3.1 主要基因测序仪生产企业生产基地分布10br/3.2 第二代基因测序仪主要模块11br/第四章 中国市场基因测序仪销售情况分析12br/4.1 第一代基因测序仪销售情况分析12br/4.2 第二代基因测序仪销售情况分析14br/4.3 第三代基因测序仪销售情况分析16br/4.4 2016售价分析17br/第五章 基因测序仪销量与份额分析（品牌）19br/5.1 主要品牌基因测序仪销量及市场份额19br/第六章 基因测序仪营销渠道分析21br/6.1 基因测序仪营销渠道现状分析21br/6.2 基因测序仪营销渠道特点及其发展趋势22br/第七章 基因测序仪市场发展趋势23br/7.1 2017-2022年基因测序仪市场预测23br/7.2 2017-2022年基因测序仪销量（台）份额预测24br/第八章 基因测序仪产业研究总结27/ppbr//pp　　如果您想看全《中国基因测序仪市场研究报告（2017版）》报告，欢迎来电洽谈报告购买事宜（价格：仪信通会员20,000元，非仪信通会员30,000元），联系电话010-51654077转销售部/ppbr//ppspan style="font-size: 18px "strong报告节选/strong/spanbr//ppspan style="font-size: 18px "strong第一章 基因测序仪产业概述/strong/span/ppstrong1.1 基因测序仪定义及分类/strong/pp　　基因测序仪是应用基因测序技术来进行DNA序列测定的分子生物学研究仪器。它经历了三代技术革新。/ppstrong第一代基因测序技术/strong/pp　　传统的化学降解法、双脱氧链终止法以及在它们的基础上发展来的各种DNA 测序技术统称为第一代DNA 测序技术。/pp　　第一代测序技术在分子生物学研究中发挥过重要的作用, 如人类基因组计划( human genome project HGP)主要基于第一代DNA测序技术。目前基于荧光标记和Sanger的双脱氧链终止法原理的荧光自动测序仪仍被应用在刑侦、医疗等领域。/pp....../ppstrong1.2 不同类型基因测序仪销量份额/strongbr//ppstrong图略/strong/ppstrong图1.2 2016年不同类型基因测序仪销量份额（台）/strong/pp来源：抽样统计，2017年6月/pp　　我们通过对相关企业的长期跟踪调研，同时统计分析了超过200家2016年购买基因测序仪的用户。2016年国内基因测序仪销量在......台。/pp　　Sanger法是基因诊断的金标准，第一代基因测序仪在全国各地的公安机关、开展产前诊断业务的医院的市场需求量很大，后来在国家“十一五规划”的政策支持下，......。根据公安部统计，截止2016年6月12日，全国公安机关有DNA实验室......个、DNA测序仪......台。/pp　　本次调研结果显示：测序成本低、通量高、速度快的第......代基因测序仪占据2016年市场的主流，占比为......。Illumina为了通过CFDA认证进入中国医疗市场，为贝瑞和康与安诺优达贴牌生产基因测序仪，贝瑞和康2015年获得CFDA认证，2016年12月成功借壳天兴仪表上市。安诺优达的NextSeq 550AR在2017年3月通过了CFDA的认证。华大基因的基因测序仪技术来自2013年对Complete Genomics的全资收购，现在的主要产品为BGISEQ-500和BGISEQ-50。BGISEQ-500目前还没通过CFDA的批准，根据2016年11月5日，华大基因在第十一届国际基因组学大会（ICG-11）上透漏，BGISEQ-500的订购量已经超过了......台。如果一台......万计算，总销售额......亿人民币，占了其年营业额的一半以上。但......。/pp　　第三代基因测序仪国内市场是Picific Biosciences的天下，2016年相关采购单位包括中国医学科学院病原生物学研究所......。/pp注：报告中所有的市场数据以及图表的统计结果所基于的时间、地点范围：采购时间是2016年，采购地点发生在中国大陆。/ppstrong1.3 基因测序仪使用单位分布/strong/ppstrong表1.1 基因测序仪使用单位一览表/strong/ppimg src="http://img1.17img.cn/17img/images/201708/insimg/b0ef1957-e123-44ba-b84a-c77632b387f8.jpg" title="7.jpg"//pp来源：仪器信息网产业研究部，2017年6月/ppbr//ppstrong图1.3 2016年基因测序仪在不同使用单位的市场份额/strong/ppstrong图略br//strong/pp来源：抽样统计，2017年6月/ppstrong1.4基因测序产业链结构/strong/ppimg src="http://img1.17img.cn/17img/images/201708/insimg/c6c2c7ec-273f-4bb1-b68c-19f89fdc7a13.jpg" title="3.jpg"//ppstrong图1.4基因测序仪产业链结构图/strong/pp来源：仪器信息网产业研究部，2017年6月/ppstrong1.5 基因测序仪产业概述/strong/pp....../pp　　由于受上游原材料价格波动影响较小，其发展主要取决于中下游市场需求。/pp　　基因测序仪主要中下游用户为医院、公安局、基因测序公司、科研院校等。因此，基因测序仪产业的发展与中国整体研发投入及宏观政策和经济发展有直接关系。/ppspan style="font-size: 18px "strong第三章 基因测序仪主要制造商地区分布及仪器主要模块简介/strong/span/ppstrong3.1 主要基因测序仪生产企业生产基地分布/strong/ppstrong表3.1 主要基因测序仪生产企业生产基地/strong/ptable width="100" cellspacing="0" cellpadding="0" border="0"tbodytr style=" height:19px" class="firstRow"td style="border: 1px solid windowtext background: rgb(141, 180, 226) none repeat scroll 0% 0% padding: 0px 7px word-break: break-all " width="56" nowrap="" height="19"p style="line-height:150%"span style="font-family:' 微软雅黑' ,' sans-serif' "生产企业/span/p/tdtd style="border-width: 1px 1px 1px medium border-style: solid solid solid none border-color: windowtext windowtext windowtext currentcolor -moz-border-top-colors: none -moz-border-right-colors: none -moz-border-bottom-colors: none -moz-border-left-colors: none border-image: none background: rgb(141, 180, 226) none repeat scroll 0% 0% padding: 0px 7px " width="43" nowrap="" height="19"p style="line-height:150%"span style="font-family:' 微软雅黑' ,' sans-serif' "生产基地/span/p/td/trtr style=" height:19px"td style="border-width: medium 1px 1px border-style: none solid solid border-color: currentcolor windowtext windowtext -moz-border-top-colors: none -moz-border-right-colors: none -moz-border-bottom-colors: none -moz-border-left-colors: none border-image: none background: white none repeat scroll 0% 0% padding: 0px 7px " width="56" valign="top" nowrap="" height="19"p style="line-height:150%"span style="font-family:' 微软雅黑' ,' sans-serif' "Illumina/span/p/tdtd style="border-width: medium 1px 1px medium border-style: none solid solid none border-color: currentcolor windowtext windowtext currentcolor background: white none repeat scroll 0% 0% padding: 0px 7px " width="43" nowrap="" height="19"p style="line-height:150%"span style="font-family:' 微软雅黑' ,' sans-serif' "美国/span/p/td/trtr style=" height:19px"td style="border-width: medium 1px 1px border-style: none solid solid border-color: currentcolor windowtext windowtext -moz-border-top-colors: none -moz-border-right-colors: none -moz-border-bottom-colors: none -moz-border-left-colors: none border-image: none background: white none repeat scroll 0% 0% padding: 0px 7px " width="56" valign="top" nowrap="" height="19"p style="line-height:150%"span style="font-family:' 微软雅黑' ,' sans-serif' "赛默飞/span/p/tdtd style="border-width: medium 1px 1px medium border-style: none solid solid none border-color: currentcolor windowtext windowtext currentcolor background: white none repeat scroll 0% 0% padding: 0px 7px " width="43" nowrap="" height="19"p style="line-height:150%"span style="font-family:' 微软雅黑' ,' sans-serif' "美国/日本/span/p/td/trtr style=" height:19px"td style="border-width: medium 1px 1px border-style: none solid solid border-color: currentcolor windowtext windowtext -moz-border-top-colors: none -moz-border-right-colors: none -moz-border-bottom-colors: none -moz-border-left-colors: none border-image: none background: white none repeat scroll 0% 0% padding: 0px 7px " width="56" valign="top" nowrap="" height="19"p style="line-height:150%"span style="font-family:' 微软雅黑' ,' sans-serif' "Pacific Biosciences/span/p/tdtd style="border-width: medium 1px 1px medium border-style: none solid solid none border-color: currentcolor windowtext windowtext currentcolor background: white none repeat scroll 0% 0% padding: 0px 7px " width="43" nowrap="" height="19"p style="line-height:150%"span style="font-family:' 微软雅黑' ,' sans-serif' "美国/span/p/td/tr/tbody/tablep style="line-height:150%"span style="font-size: 16px line-height:150% font-family:' 微软雅黑' ,' sans-serif' "....../span/pp来源：上述企业，仪器信息网产业研究部，2017年6月/ppstrong3.2 第二代基因测序仪主要模块/strong/ppstrong图3.1略/strong/pp图3.1显示的是第二代基因测序仪的硬件总体结构及其主要模块。/ppspan style="font-size: 18px "strong第四章 中国市场基因测序仪销售情况分析/strong/span/ppstrong4.1 第一代基因测序仪销售情况分析/strong/ppstrong表4.1 2016年第一代基因测序仪部分采购单位、型号、金额/strong/ptable cellspacing="0" cellpadding="0" border="1"tbodytr class="firstRow"td style="border-width: 1px medium medium 1px border-style: solid none none solid border-color: rgb(79, 129, 189) currentcolor currentcolor rgb(79, 129, 189) background: rgb(79, 129, 189) none repeat scroll 0% 0% padding: 0px 7px " width="272" valign="top"pstrongspan style="font-size:13px font-family:' 微软雅黑' ,' sans-serif' color:white"单位/span/strong/p/tdtd style="border-width: 1px medium medium border-style: solid none none border-color: rgb(79, 129, 189) currentcolor currentcolor -moz-border-top-colors: none -moz-border-right-colors: none -moz-border-bottom-colors: none -moz-border-left-colors: none border-image: none background: rgb(79, 129, 189) none repeat scroll 0% 0% padding: 0px 7px " width="100" valign="top"pstrongspan style="font-size:13px font-family:' 微软雅黑' ,' sans-serif' color:white"品牌型号/span/strong/p/tdtd style="border-width: 1px 1px medium medium border-style: solid solid none none border-color: rgb(79, 129, 189) rgb(79, 129, 189) currentcolor currentcolor background: rgb(79, 129, 189) none repeat scroll 0% 0% padding: 0px 7px " width="145" valign="top"pstrongspan style="font-size:13px font-family:' 微软雅黑' ,' sans-serif' color:white"金额（万元）/span/strong/p/td/trtrtd style="border-width: 1px medium 1px 1px border-style: solid none solid solid border-color: rgb(79, 129, 189) currentcolor rgb(79, 129, 189) rgb(79, 129, 189) -moz-border-top-colors: none -moz-border-right-colors: none -moz-border-bottom-colors: none -moz-border-left-colors: none border-image: none padding: 0px 7px " width="272" valign="top"pstrongspan style="font-size:13px font-family:宋体"河源市妇幼保健院/span/strong/p/tdtd style="border-width: 1px medium border-style: solid none border-color: rgb(79, 129, 189) currentcolor padding: 0px 7px " width="100" valign="top"pspan style="font-size:13px"Life 3500DX/span/p/tdtd style="border-width: 1px 1px 1px medium border-style: solid solid solid none border-color: rgb(79, 129, 189) rgb(79, 129, 189) rgb(79, 129, 189) currentcolor -moz-border-top-colors: none -moz-border-right-colors: none -moz-border-bottom-colors: none -moz-border-left-colors: none border-image: none padding: 0px 7px " width="145" valign="top"pspan style="font-size:13px"159.875/span/p/td/trtrtd style="border-width: medium medium medium 1px border-style: none none none solid border-color: currentcolor currentcolor currentcolor rgb(79, 129, 189) -moz-border-top-colors: none -moz-border-right-colors: none -moz-border-bottom-colors: none -moz-border-left-colors: none border-image: none padding: 0px 7px " width="272" valign="top"pstrongspan style="font-size:13px font-family:宋体"咸宁市公安局/span/strong/p/tdtd style="border: medium none padding: 0px 7px " width="100" valign="top"pspan style="font-size:13px"Life 3500xl /span/p/tdtd style="border-width: medium 1px medium medium border-style: none solid none none border-color: currentcolor rgb(79, 129, 189) currentcolor currentcolor -moz-border-top-colors: none -moz-border-right-colors: none -moz-border-bottom-colors: none -moz-border-left-colors: none border-image: none padding: 0px 7px " width="145" valign="top"pspan style="font-size:13px"220/span/p/td/trtrtd style="border-width: 1px medium 1px 1px border-style: solid none solid solid border-color: rgb(79, 129, 189) currentcolor rgb(79, 129, 189) rgb(79, 129, 189) -moz-border-top-colors: none -moz-border-right-colors: none -moz-border-bottom-colors: none -moz-border-left-colors: none border-image: none padding: 0px 7px " width="272" valign="top"pstrongspan style="font-size:13px font-family:宋体"成都市高新区成都市公安局高新技术产业开发区分局/span/strong/p/tdtd style="border-width: 1px medium border-style: solid none border-color: rgb(79, 129, 189) currentcolor padding: 0px 7px " width="100" valign="top"pspan style="font-size:13px"3500xL/span/p/tdtd style="border-width: 1px 1px 1px medium border-style: solid solid solid none border-color: rgb(79, 129, 189) rgb(79, 129, 189) rgb(79, 129, 189) currentcolor -moz-border-top-colors: none -moz-border-right-colors: none -moz-border-bottom-colors: none -moz-border-left-colors: none border-image: none padding: 0px 7px " width="145" valign="top"pspan style="font-size:13px"278/span/p/td/trtrtd style="border-width: medium medium 1px 1px border-style: none none solid solid border-color: currentcolor currentcolor rgb(79, 129, 189) rgb(79, 129, 189) padding: 0px 7px " width="272" valign="top"pstrongspan style="font-size:13px font-family:宋体"广州市公安局越秀区分局/span/strong/p/tdtd style="border-width: medium medium 1px border-style: none none solid 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style="font-size:13px font-family:' 微软雅黑' ,' sans-serif' color:white"地区/span/strong/p/tdtd style="border-width: 1px 1px medium medium border-style: solid solid none none border-color: rgb(79, 129, 189) rgb(79, 129, 189) currentcolor currentcolor background: rgb(79, 129, 189) none repeat scroll 0% 0% padding: 0px 7px " width="284" valign="top"pstrongspan style="font-size:13px font-family:' 微软雅黑' ,' sans-serif' color:white"台数/span/strong/p/td/trtrtd style="border-width: 1px medium 1px 1px border-style: solid none solid solid border-color: rgb(79, 129, 189) currentcolor rgb(79, 129, 189) rgb(79, 129, 189) -moz-border-top-colors: none -moz-border-right-colors: none -moz-border-bottom-colors: none -moz-border-left-colors: none border-image: none padding: 0px 7px " width="284" valign="top"pstrongspan style="font-size:13px font-family:宋体"广东/span/strong/p/tdtd style="border-width: 1px 1px 1px medium border-style: solid solid solid none border-color: rgb(79, 129, 189) rgb(79, 129, 189) rgb(79, 129, 189) currentcolor -moz-border-top-colors: none -moz-border-right-colors: none -moz-border-bottom-colors: none -moz-border-left-colors: none border-image: none padding: 0px 7px " width="284" valign="top"br//td/trtrtd style="border-width: medium medium 1px 1px border-style: none none solid solid border-color: currentcolor currentcolor rgb(79, 129, 189) rgb(79, 129, 189) padding: 0px 7px " width="284" valign="top"pstrongspan style="font-size:13px font-family:宋体"北京/span/strong/p/tdtd style="border-width: medium 1px 1px medium border-style: none solid solid none border-color: currentcolor rgb(79, 129, 189) rgb(79, 129, 189) currentcolor padding: 0px 7px " width="284" valign="top"br//td/tr/tbody/tablep....../ppstrong表4.3 2016年第二代基因测序仪部分采购单位、型号、金额/strong/ptable cellspacing="0" cellpadding="0" border="1"tbodytr class="firstRow"td style="border-width: 1px medium medium 1px border-style: solid none none solid border-color: rgb(79, 129, 189) currentcolor currentcolor rgb(79, 129, 189) background: rgb(79, 129, 189) none repeat scroll 0% 0% padding: 0px 7px " width="272" valign="top"pstrongspan style="font-size:13px font-family:' 微软雅黑' ,' sans-serif' color:white"单位/span/strong/p/tdtd style="border-width: 1px medium medium border-style: solid none none border-color: rgb(79, 129, 189) currentcolor currentcolor -moz-border-top-colors: none -moz-border-right-colors: none -moz-border-bottom-colors: none -moz-border-left-colors: none border-image: none background: rgb(79, 129, 189) none repeat scroll 0% 0% padding: 0px 7px " width="100" valign="top"pstrongspan style="font-size:13px font-family:' 微软雅黑' ,' sans-serif' color:white"品牌型号/span/strong/p/tdtd style="border-width: 1px 1px medium medium border-style: solid solid none none border-color: rgb(79, 129, 189) rgb(79, 129, 189) currentcolor currentcolor background: rgb(79, 129, 189) none repeat scroll 0% 0% padding: 0px 7px " width="145" valign="top"pstrongspan style="font-size:13px font-family:' 微软雅黑' ,' sans-serif' color:white"金额（万元）/span/strong/p/td/trtrtd style="border-width: 1px medium 1px 1px border-style: solid none solid solid border-color: rgb(79, 129, 189) currentcolor rgb(79, 129, 189) rgb(79, 129, 189) -moz-border-top-colors: none -moz-border-right-colors: none -moz-border-bottom-colors: none -moz-border-left-colors: none border-image: none padding: 0px 7px " width="272" valign="top"pstrongspan style="font-size:13px font-family:宋体"广东省妇幼保健院/span/strong/p/tdtd style="border-width: 1px medium border-style: solid none border-color: rgb(79, 129, 189) currentcolor padding: 0px 7px " width="100" valign="top"pspan style="font-size:13px"NextSeq CN500/span/p/tdtd style="border-width: 1px 1px 1px medium border-style: solid solid solid none border-color: rgb(79, 129, 189) rgb(79, 129, 189) rgb(79, 129, 189) currentcolor -moz-border-top-colors: none -moz-border-right-colors: none -moz-border-bottom-colors: none -moz-border-left-colors: none border-image: none padding: 0px 7px " width="145" valign="top"pspan style="font-size:13px"336/span/p/td/trtrtd style="border-width: medium medium medium 1px border-style: none none none solid border-color: currentcolor currentcolor currentcolor rgb(79, 129, 189) -moz-border-top-colors: none -moz-border-right-colors: none -moz-border-bottom-colors: none -moz-border-left-colors: none border-image: none padding: 0px 7px " width="272" valign="top"pstrongspan style="font-size:13px font-family:宋体"清华大学/span/strong/p/tdtd style="border: medium none padding: 0px 7px " width="100" valign="top"pspan style="font-size:13px"Illumina/span/p/tdtd style="border-width: medium 1px medium medium border-style: none solid none none border-color: currentcolor rgb(79, 129, 189) currentcolor currentcolor -moz-border-top-colors: none -moz-border-right-colors: none -moz-border-bottom-colors: none -moz-border-left-colors: none border-image: none padding: 0px 7px " width="145" valign="top"pspan style="font-size:13px"297.27/span/p/td/trtrtd style="border-width: 1px medium 1px 1px border-style: solid none solid solid border-color: rgb(79, 129, 189) currentcolor rgb(79, 129, 189) rgb(79, 129, 189) -moz-border-top-colors: none -moz-border-right-colors: none -moz-border-bottom-colors: none -moz-border-left-colors: none border-image: none padding: 0px 7px " width="272" valign="top"pstrongspan style="font-size:13px font-family:宋体"汕头大学医学院/span/strong/p/tdtd style="border-width: 1px medium border-style: solid none border-color: rgb(79, 129, 189) currentcolor padding: 0px 7px " width="100" valign="top"pspan style="font-size:13px"Illumina/span/p/tdtd style="border-width: 1px 1px 1px medium border-style: solid solid solid none border-color: rgb(79, 129, 189) rgb(79, 129, 189) rgb(79, 129, 189) currentcolor -moz-border-top-colors: none -moz-border-right-colors: none -moz-border-bottom-colors: none -moz-border-left-colors: none border-image: none padding: 0px 7px " width="145" valign="top"pspan style="font-size:13px"225/span/p/td/trtrtd style="border-width: medium medium 1px 1px border-style: none none solid solid border-color: currentcolor currentcolor rgb(79, 129, 189) rgb(79, 129, 189) padding: 0px 7px " width="272" valign="top"pstrongspan style="font-size:13px font-family:宋体"复旦大学附属华山医院/span/strong/p/tdtd style="border-width: medium medium 1px border-style: none none solid border-color: currentcolor currentcolor rgb(79, 129, 189) -moz-border-top-colors: none -moz-border-right-colors: none -moz-border-bottom-colors: none -moz-border-left-colors: none border-image: none padding: 0px 7px " width="100" valign="top"pspan style="font-size:13px"QIAGEN GmbH /spanspan style="font-size:13px font-family:宋体"德国/spanspan style="font-size:13px" /span/p/tdtd style="border-width: medium 1px 1px medium border-style: none solid solid none border-color: currentcolor rgb(79, 129, 189) rgb(79, 129, 189) currentcolor padding: 0px 7px " width="145" valign="top"br//td/tr/tbody/tablep style="line-height:150%"span style="font-size: 16px line-height:150% font-family:' 微软雅黑' ,' sans-serif' "....../spanbr//pp来源：招标网络，2017年6月/pp　　此次调研结果显示，2016年第二代基因测序仪国内总销量为......台。事业单位与企业单位占比约为......。/ppstrong4.3 第三代基因测序仪销售情况分析/strong/ppstrong表4.4 2016年第三代基因测序仪部分采购单位品牌台/strong/ptable cellspacing="0" cellpadding="0" border="1"tbodytr style=" height:31px" class="firstRow"td style="border-width: 1px medium medium 1px border-style: solid none none solid border-color: rgb(79, 129, 189) currentcolor currentcolor rgb(79, 129, 189) background: rgb(79, 129, 189) none repeat scroll 0% 0% padding: 0px 7px " width="272" valign="top" height="31"pstrongspan style="font-size:13px font-family:' 微软雅黑' ,' sans-serif' color:white"单位/span/strong/p/tdtd style="border-width: 1px medium medium border-style: solid none none border-color: rgb(79, 129, 189) currentcolor currentcolor -moz-border-top-colors: none -moz-border-right-colors: none -moz-border-bottom-colors: none -moz-border-left-colors: none border-image: none background: rgb(79, 129, 189) none repeat scroll 0% 0% padding: 0px 7px " width="100" valign="top" height="31"pstrongspan style="font-size:13px font-family:' 微软雅黑' ,' sans-serif' color:white"品牌/span/strong/p/tdtd style="border-width: 1px 1px medium medium border-style: solid solid none none border-color: rgb(79, 129, 189) rgb(79, 129, 189) currentcolor currentcolor background: rgb(79, 129, 189) none repeat scroll 0% 0% padding: 0px 7px " width="145" valign="top" height="31"pstrongspan style="font-size:13px font-family:' 微软雅黑' ,' sans-serif' color:white"台数/span/strong/p/td/trtrtd style="border-width: 1px medium 1px 1px border-style: solid none solid solid border-color: rgb(79, 129, 189) currentcolor rgb(79, 129, 189) rgb(79, 129, 189) -moz-border-top-colors: none -moz-border-right-colors: none -moz-border-bottom-colors: none -moz-border-left-colors: none border-image: none padding: 0px 7px " width="272" valign="top"pstrongspan style="font-size:13px font-family:宋体"中国医学科学院病原生物学研究所/span/strong/p/tdtd style="border-width: 1px medium border-style: solid none border-color: rgb(79, 129, 189) currentcolor padding: 0px 7px " width="100" valign="top"pspan style="font-size:13px"Pacific Biosciences/span/p/tdtd style="border-width: 1px 1px 1px medium border-style: solid solid solid none border-color: rgb(79, 129, 189) rgb(79, 129, 189) rgb(79, 129, 189) currentcolor -moz-border-top-colors: none -moz-border-right-colors: none -moz-border-bottom-colors: none -moz-border-left-colors: none border-image: none padding: 0px 7px " width="145" valign="top"pspan style="font-size:13px"1/span/p/td/tr/tbody/tablep....../pp来源：综合统计，2017年6月/ppstrong4.4 2016售价分析/strong/ppstrong表4.5基因测序仪企业和产品售价/strong/ptable cellspacing="0" cellpadding="0" border="1"tbodytr class="firstRow"td style="border-width: 1px medium medium 1px border-style: solid none none solid border-color: rgb(79, 129, 189) currentcolor currentcolor rgb(79, 129, 189) background: rgb(79, 129, 189) none repeat scroll 0% 0% padding: 0px 7px " width="187" valign="top"pstrongspan style="font-size:13px font-family:' 微软雅黑' ,' sans-serif' color:white"企业/span/strong/p/tdtd style="border-width: 1px 1px medium medium border-style: solid solid none none border-color: rgb(79, 129, 189) rgb(79, 129, 189) currentcolor currentcolor background: rgb(79, 129, 189) none repeat scroll 0% 0% padding: 0px 7px " width="359" valign="top"pstrongspan style="font-size:13px font-family:' 微软雅黑' ,' sans-serif' color:white"单台价格范围（元）/span/strong/p/td/trtrtd style="border-width: 1px medium 1px 1px border-style: solid none solid solid border-color: rgb(79, 129, 189) currentcolor rgb(79, 129, 189) rgb(79, 129, 189) -moz-border-top-colors: none -moz-border-right-colors: none -moz-border-bottom-colors: none -moz-border-left-colors: none border-image: none padding: 0px 7px " width="187" valign="top"pstrongspan style="font-size:13px font-family:' 微软雅黑' ,' sans-serif' "Illumina/span/strong/p/tdtd style="border-width: 1px 1px 1px medium border-style: solid solid solid none border-color: rgb(79, 129, 189) rgb(79, 129, 189) rgb(79, 129, 189) currentcolor -moz-border-top-colors: none -moz-border-right-colors: none -moz-border-bottom-colors: none -moz-border-left-colors: none border-image: none padding: 0px 7px " width="359" valign="top"br//td/trtrtd style="border-width: medium medium 1px 1px border-style: none none solid solid border-color: currentcolor currentcolor rgb(79, 129, 189) rgb(79, 129, 189) padding: 0px 7px " width="187" valign="top"pstrongspan style="font-size:13px font-family:' 微软雅黑' ,' sans-serif' "赛默飞/span/strong/p/tdtd style="border-width: medium 1px 1px medium border-style: none solid solid none border-color: currentcolor rgb(79, 129, 189) rgb(79, 129, 189) currentcolor padding: 0px 7px " width="359" valign="top"br//td/tr/tbody/tablep......br//pp来源：仪器信息网产业研究部，2017年6月/ppspan style="font-size: 18px "strong第五章 基因测序仪销量与份额分析（品牌）/strong/span/ppstrong5.1 主要品牌基因测序仪销量及市场份额/strong/ppstrong图5.1 2016年主流企业销量市场份额/strong/ppstrong图略/strongbr//pp来源：抽样统计，2017年6月/pp　　2016年中国基因测序仪市场规模......台，销售总额为......亿人民币左右。总的来说，国内基因测序仪市场现在的格局是基本被国外厂商垄断，并且从长期来看，这种局面很难打破。/pp　　但因为基因测序仪技术门槛较高，参与市场竞争的企业较少，2016年中国市场上有产品销售的厂商大概10多家。包括：凯杰、Pacific Biosciences、赛默飞、Illumina、华大基因、华因康、中科紫鑫、贝瑞和康、安诺优达、达安基因等。/ppspan style="font-size: 18px "strong第七章 基因测序仪市场发展趋势/strong/span/pp　　通过分析2011-2016年国内基因测序仪市场的有关数据，往后几年的预测还结合了以下几点原因，即《“十三五”生物产业发展规划》中涉及的我国将着力发展的四大基因领域。/pp....../p

p style="text-align: center "　　img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201812/uepic/aab48e25-87ad-48f7-bf9a-b2ebac0fa992.jpg" title="蛋白.jpg" alt="蛋白.jpg" style="text-align: center width: 522px height: 348px " width="522" height="348"//pp style="text-indent: 2em "蛋白质是生物功能的主要载体。许多无法从基因层面解释的疾病，蛋白质可以给出我们想要的答案，为此，蛋白质组学应运而生。科学家们预测，随着人类基因组测序工作的完成，21世纪生命科学的研究重心或将从基因组学转移到蛋白质组学。蛋白质组学是后基因组时代生命科学研究的核心内容，想要深入了解蛋白质，进一步认识生命活动和疾病发生的分子机制，首先要有合适的蛋白质测序技术做支撑。为完善蛋白质测序技术科学家做出了许多尝试，如Edman降解，荧光染色、质谱测序等。然而已有的测序方法都存在各种技术不足与应用局限性，不利于蛋白质组学在整个生命科学和生物医学研究中的应用推广。br//pp　　近日，strong瑞士苏黎世联邦理工学院分子生物学研究所的Ben C Collins博士和Ruedi Aebersold博士在Nature Biotechnology发表了蛋白组学平行测序的评论文章“Proteomics goes parallel”/strong，小编将文章进行了翻译整理分享给大家。/pp style="text-align: center"img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201812/uepic/29198ff0-12dc-4a8b-9f43-a535e065d874.jpg" title="1.png" alt="1.png"//pp style="text-indent: 2em "目前，蛋白质组测序技术尚不如基因组学和转录组学那么强大。核酸测序技术的表现之所以令人印象深刻，是因为它能利用荧光作为读数进行短寡核苷酸的大规模平行测序。在这个问题上，strongSwaminathan等证明了肽类也可以进行平行荧光测序/strong。他们的创新方法将经典的蛋白质测序技术与核酸光学测序系统进行了整合。虽然该方法仍需进一步优化，但这让我们看到了一种普遍可行、可靠和真正通用的蛋白组学测序技术的发展前景。/pp　　蛋白质对于生命系统来说是必不可少的，它们可以作为化学催化剂、结构成分以及生理过程的媒介，能够准确识别和量化蛋白质的研究技术可极大地促进人们对生物学的理解。如今，蛋白质组已经可以由转录组被预测或推断出来。有充分的研究证据表明，蛋白质与mRNA水平之间的联系是复杂的，通过一种组学来预测另一种是不精确、不可靠的。那么，strong为什么在许多情况下，人们会优先选择通过mRNA预测蛋白，而不是直接进行蛋白质测序呢/strong?答案在于两种组学测序技术的发展和物质本身的可检测性。目前，生物学家可以通过已有的核心技术和商业公司获得基本完整的转录组信息及分析结果，而蛋白组分析仍只限于专业实验室研究使用，在通量、稳定性和重现性方面还不能达到转录组分析水平。/pp　　第一代DNA测序仪绘制了具有突破性意义的基因组图谱，其原理是对分离DNA片段进行连续测序。尽管该仪器采用了自动化技术，但整个测序过程也是缓慢而昂贵的。只有开发可平行测序数百万个核酸片段，能够高通量、高覆盖率、低成本生成完整基因组图谱的方法，才能进行广泛的基因组分析。这些具有商业价值的测序技术已经改变了生物医学研究，并成为实验生物学研究的中流砥柱。/pp　　虽然“自上而下”的蛋白质组学研究方法正在逐步发展，但传统的蛋白质定量和测序仍是采用“自下而上”的方法进行。正如基因测序原理一样，这些方法是通过检测酶促反应切割蛋白质产生的肽链，以分析蛋白组成。在20世纪50年代，Pehr Edman发明了一种通过循环化学反应测定肽链氨基酸序列的方法，被称为Edman降解。该方法通过异硫氰酸苯酯与可接近的氨基偶联，然后从肽链的N-末端释放氨基酸并生成新N端，不断重复这一过程，对释放的氨基酸进行鉴定就可以得到肽链的氨基酸序列。strongEdman降解过程缓慢，需要大量的高纯度肽/strong，尽管如此，直到20世纪90年代早期，所有已知的蛋白质序列都是使用该方法确定的。/pp　　20世纪90年代，随着质谱(MS)技术逐渐成为蛋白质测序的首选方法，Edman降解在该领域退居二线。质谱是通过检测质荷比和肽段的断裂模式来推断蛋白质组成和定量。因具有先进、强大和多样化特点，MS已经被广泛应用。仿效基因组学技术的发展路径，MS已经从特定寡聚体的人工测序发展到高通量的肽链自动测序，并发展到通过独立数据分析进行多肽的平行测序，如SWATH-MS。虽然这些方法的通量、准确性和重现性都很出色，但想要与基因组分析一样，实现相似的大样本队列常规、完整的蛋白质组量化目标仍难以实现。/pp　　随着当前数据独立采集MS检测系统的不断发展，最终取得与基因组学研究技术相似性能的蛋白测序技术也有可能实现。此外，要深入了解蛋白质组的复杂性，也需要颠覆性的新技术。虽然蛋白质的纳米孔测序技术显示了很好的发展前景，但StimaaNet等研发的肽荧光测序方法有着明确的常规应用途径，可以看作是这类颠覆性技术最先进的一个例子。strong肽荧光测序方法堪称跨越时代的结合，它将几乎被遗忘的Edman降解，与为下一代DNA测序开发的大规模平行荧光成像技术进行了整合/strong(图1)。/pp style="text-align: center"img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201812/uepic/462c7540-6c36-4ddd-8cd7-7b62240980c2.jpg" title="2.jpg" alt="2.jpg"//pp style="text-align: center "span style="color: rgb(127, 127, 127) "图1. Swaminathan等人所描述的肽荧光测序/span/pp style="text-indent: 2em "复合肽混合物，最有可能来源于酶或化学切割的蛋白质提取物，每种氨基酸残基都有不同的荧光标记(左)。在这种情况下，我们描述了一种双色方案，其中赖氨酸和半胱氨酸残基用不同的荧光标记。利用氨基硅烷的的酰胺键将标记肽的C末端固定在玻璃板。然后通过Edman降解和荧光成像(中)对肽进行N-末端氨基酸残基切割的迭代循环。在每个位置(即肽)的荧光强度被跟踪为Edman循环的函数。荧光强度下降模式为肽的部分序列提供了注释，得到的荧光信号可以与蛋白质序列数据库进行匹配和评分，推断样本中最有可能存在的一组蛋白质(右)。/pp　　肽荧光测序的第一步是在特定的氨基酸侧链上进行荧光标记，并将其C端固定在测序系统的流通槽中，以生成测序底物阵列。然后将固定化肽平行地进行Edman降解，在每一步降解后对固定化底物的集合进行成像。与经典的Edman降解不同，该方法在每个步骤对消除的苯硫代内酰脲-氨基酸结合物进行了鉴定，降解步骤仅用于测定由消除标记氨基酸引起的荧光强度下降。基于该原理开发的软件工具，可以将观察到的荧光信号与蛋白序列数据库结合起来，进而推导出每种固定化底物的序列，也就是肽链的序列。/pp　　strong该研究已经证明肽荧光测序的可行性/strong。具体而言，作者(i)描述了在严格条件下，与Edman降解兼容的成像系统 (ii)测定了模型肽中荧光标记的赖氨酸或半胱氨酸残基的精确位置 (iii)描述了该系统中误差和低效的来源 (iv)研究了从更复杂蛋白质组鉴别蛋白质的潜力，并提供了一种从观察到的荧光信号推断肽序列的计算框架 (v)从含有多个丝氨酸残基的肽中定位特定的磷酸化丝氨酸残基。/pp　　Swaminathan等人开发的肽荧光测序方法是令人兴奋的，因为它开辟了一条通向肽的新研究路径，strong并使高通量、高重现性和潜在低成本的蛋白质组测序成为可能/strong。strong该方法的一个显著优点是，它整合了其他研究方法的优势，如Edman降解、大规模DNA平行测序和基于MS的蛋白序列数据库检索计算框架/strong。这种策略或有助于加快相关研究方法从证明概念到常规适用的转化速度。此外，该方法产生的数据与基因组学和转录组学的大规模平行先导数据有相似之处。MS蛋白组学技术在技术和计算方面仍存在较大的门槛，应用较为缓慢，与基于MS的蛋白组学技术相比，该方法有助于加速更多的生物体使用肽荧光测序技术。/pp　　正如Swaminathan等人所指出的，strong在新方法发挥其全部潜力之前，还必须克服一些技术和概念上的挑战/strong。这些问题主要源于Edman降解的性质和人类蛋白质组的复杂性，包括以下内容：(i)尽管在研究中每个降解步骤的产率为91-97%，但可检测的肽链长度也是有限的 (ii)由于测序产率与蛋白序列本身有关，具有挑战性的序列，如富含脯氨酸的蛋白序列，可能会影响荧光信号的清晰度 (iii)可被荧光标记的功能基团仅限于肽链中可产生化学反应的基团，主要是氨基、羧基和巯基，因此荧光信号代表的信息量也会受限制 (iv)经修饰的残基通常不能被识别，除非经过特异荧光标记，这种特殊标记仅对氨基酸进行小部分修饰 (v)人类细胞蛋白质组的动态范围较大(~107)，每种蛋白质也会通过酶消化产生大量的肽(~102)，每个细胞会表达大量的开放阅读框(~104)，在不考虑蛋白质多样性的前提下，这已经构成了巨大的分析挑战。对于肽荧光测序来说，满足这些挑战需要提高底物复用(substrate multiplexing)的水平，但目前尚未实现。/pp　　虽然作者开发的系统目前仅限于分析相对简单的混合物样本，但发展前景很好，是一种值得尝试的蛋白质测序方法。/p

安捷伦科技发布用于加速新一代测序技术样品和文库质量控制的自动化电泳系统 2011 年 11 月 7 日，加利福尼亚圣克拉拉市 &mdash 安捷伦科技公司（纽约证交所：A）发布了安捷伦 2200 TapeStation自动化电泳系统，以实现新一代测序流程中样品和文库质量控制的自动化。2200 TapeStation配合预包装的即用型 ScreenTape 试剂耗材，能够简化和加快新一代测序工作流程中的质量控制。 安捷伦副总裁液相分离业务部总经理 Patrick Kaltenbach 称：&ldquo 我们对此次发布非常期待。TapeStation 功能多样，更不用说可直接使用的 ScreenTape试剂耗材,仅需要 2 微升样品便可进行高灵敏度分析，毋庸置疑，TapeStation 是进行样品和文库质量控制的最佳工具。&rdquo 安捷伦 2200 TapeStation 兼容 16 联条式样品卡和 96 孔板，是一款能够快捷测定生物样品质量的台式自动化系统。客户只需简单地将样品和 ScreenTape 消耗品载入一体式 2200 TapeStation 仪器中，每个样品仅需约 1 分钟即可轻松获得蛋白质、RNA 和 DNA 样品的完整分析结果。 今年年初被安捷伦收购的 Lab901 的共同创立人、ScreenTape 系列产品的创始人 Joel Fearnley 说道：&ldquo TapeStation 系统凭借其自动化、简便性和可扩展通量的独特性能，将成为核心研究实验室在基因表达、DNA 片段分析、蛋白质分离和新一代测序中进行样品质量控制的理想之选。对于这些应用，TapeStation 和 ScreenTape 能够快速得到结果，并且数据重现性出色，不论通量大小，单个样品的成本都相同。&rdquo 新的 TapeStation 和 ScreenTape 产品进一步壮大了安捷伦现有电泳产品线，包括安捷伦 2100 生物分析仪。该生物分析仪是第一款通过微流体进行生物样品分析的商业化仪器，也是在芯片、qPCR 和新一代测序工作流程中对 RNA 和 DNA 进行质量控制的业内领先产品。 安捷伦还提供业内一流的用于新一代测序的 SureSelect 靶向序列捕获系统，它是溶液型杂交捕获技术，由安捷伦与麻省理工学院-哈佛大学博德研究所最先研发成功。与安捷伦 2200 TapeStation 系统类似，SureSelect能够简化新一代测序的工作流程，便于研究人员仅对感兴趣的基因组区域进行测序。。 了解更多信息，请访问 www.agilent.com/genomics/TapeStation。 关于安捷伦科技 安捷伦科技（纽约证交所：A）是全球领先的测量公司，是化学分析、生命科学、电子和通讯领域的技术领导者，公司的 18500 名员工为 100 多个国家的客户提供服务。在 2010 财政年度，安捷伦的业务净收入为 54 亿美元。要了解安捷伦科技的信息，请访问：www.agilent.com.cn。 编者注：更多有关安捷伦科技公司的技术、企业社会责任和行政新闻，请访问安捷伦新闻网站：www.agilent.com.cn/go/news。

二代测序技术的发展对测序数据的处理分析提出了很高的要求。目前二代测序数据分析软件很多，但是绝大多数软件仅能完成单一的分析功能(例如：仅进行序列比对或变异读取或功能注释等) ，如何能正确高效地选择整合这些软件已成为迫切需求。　　来自中国医学科学院，北京协和医学院等处的研究人员设计了一套基于 perl 语言和 SGE 资源管理的自动化处理流程来分析 Illumina 平台基因组测序数据。该流程通过自动化并行脚本控制流程的高效运行，一站式输出分析结果和报告，简化了数据分析过程中的人工操作，大大提高了运行效率。相关文章公布在《遗传》杂志上。　　二代测序技术(Next-generation sequencing)大幅度降低了测序的时间和成本，使得大规模测序逐渐成为常规的实验室研究和临床检测手段。测序产生的数据量急剧增加，如何高效地分析这些数据，已成为迫切需要解决的问题。目前，分析序列信息的生物信息学软件纷繁复杂，但基本上每个软件只能完成单一的分析功能，实现一个完整的分析流程则需要对众多软件进行整合，而手动串联的效率往往不尽人意 同时，这些软件需要在Linux工作环境下以命令行运行，要求用户具备较好的计算机背景 另外，即便一些实验室完成了分析流程的构建，他们往往不会公开许多细节，新用户仍然要从头建起。　　针对这一问题，研究人员希望能通过构建经典的二代测序数据分析流程，并实现各个环节的高效自动化管理和分析，减轻研究者前期的工作负担，促进相关领域进一步对基因组测序研究项目的顺利开展。　　研究人员为此设计了一套基于 perl 语言和 SGE 资源管理的自动化处理流程来分析 Illumina 平台基因组测序数据。该流程以测序原始序列数据作为输入，调用业界标准的数据处理软件(如：BWA，Samtools，GATK，ANNOVAR 等)，最终生成带有相应功能注释、便于研究者进一步分析的变异位点列表。　　这一流程通过自动化并行脚本控制流程的高效运行，一站式输出分析结果和报告，简化了数据分析过程中的人工操作，大大提高了运行效率。用户只需填写配置文件或使用图形界面输入即可完成全部操作，为广大研究者分析二代测序数据提供了便利的途径。　　目前测序数据处理软件很多，研究人员综合考虑了适用性和效率，整合出了一套标准的数据处理流程。具体来说，获得 FASTQ格式的原始测序数据后，需要数据进行以下处理： (1)使用BWA 软件把这些短序列和参考基因组进行对比，确定短序列在基因组上的位置，把短序列组装成完整的人类参考基因组 (2)使用 Samtools 软件把这些短序列调整成按一定顺序(1-22，X，Y，其他)排列的序列，并进行数据格式的转换 (3)使用 Picard 软件把测序产生的冗余信息和噪声去掉 (4)使用 GATK 寻找样本测序数据与参考基因组的差异，列出这些差异点 (5)使用 Annovar对这些变异位点进行功能注释，得到一个易于理解的变异位点列表。　　这一项目成功整合了一系列二代测序数据分析软件，形成了一套经典的数据分析流程。这一流程通过并行化设计和自动化处理，一方面简化了操作成本、缩短了数据分析周期，另一方面也使本流程可以引入更完善的数据校验步骤，增强结果的可信度。　　流程针对Illumina 平台双端测序数据开发，满足了大部分处理需求，并对其他用户提供了一个很好的参考，后续研究人员还将根据用户需求对该自动化流程进行持续维护。　　随着二代测序技术的逐步发展，二代测序已经广泛应用于科研和临床研究。这一流程提高了二代测序数据分析的入门和运转效率，其必将在二代测序相关基因组学研究中，促进广大科研人员工作的高效进行。

p　　“生物过程是动态的，要想彻底了解生物过程需要用动态测量手段来观察。” Yehuda Brody说到。他是麻省理工学院和哈佛大学(剑桥，MA)博莱尼实验室的一位三年级博士后研究员，近几年他一直从事单细胞基因表达动力学的可视化测量研究。现在，他专注于诱变过程动力学研究，他和同事已经开发出一种新的DNA测序方法，span style="color: rgb(255, 0, 0) "strong能够分析单细胞在生命周期里的突变积累过程。/strong/span这种创新方法是Paul Blainey博士在SLAS2018报告的。/pp　　从我们出生的那一刻起，体细胞突变在我们的身体中就不断发生。大多数时候它们是无害的。但在人的一生中，它们会增加，并与许多年龄相关的疾病有关，包括神经变性、器官衰竭和癌症。据Brody说，科学家们长久以来研究了在功能基因组学中突变的影响，重点研究了突变的后果。这个领域已经得到长足的发展，人们已经开始探索突变诱变的起源：首先是什么机制引起突变，细胞是如何处理DNA中的损伤的。Brody说这是思维的一个重要转变。“通过观察突变的过程，而不仅仅是后果，我们可以专注于减少累积突变的数量，以防止它们和与它们相关的疾病。”/pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201805/insimg/6a243885-15c3-490e-9461-7a4a9bed3750.jpg" title="brody.jpg" width="150" height="179" border="0" hspace="0" vspace="0" style="width: 150px height: 179px "//pp style="text-align: center "strongYehuda Brody博士/strong/pp　　确定突变原因的一种方法是研究它们的模式。Blainey认为，这些模式越精确，就越有可能溯源，找出突变的原因。正如他所解释的，这是一个非常复杂的过程：“DNA的损伤可能来自体外，也可能来自体内。例如，环境中可能有破坏性的化学物质，但是突变还是会自然地发生。此外，还有不同的DNA修复机制，它可以消除一些突变和进化选择，这使得基于功能效应的不同突变更丰富或更少。因为有这么多的事情发生在一起，很难追溯。这需要对这些不同的生物和化学过程进行非常详细的分析和大量的理解，来看清整个过程的全貌。”/pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201805/insimg/b73744ca-4578-438d-9672-97593a1fcac0.jpg" title="Blainey.jpg" width="150" height="195" border="0" hspace="0" vspace="0" style="width: 150px height: 195px "//pp style="text-align: center "strongPaul Blainey博士/strong/pp　　单细胞基因组测序的常规方法，如微流体，具有高错误率和高成本缺陷，限制了它们的广泛使用。2016，对于这些复杂的系统，徐和他的同事发布了一个简单、稳定的替代方案。但是，尽管增加了可用性，当用于体细胞突变分析时，下一代测序(NGS)还是有它的局限性。/pp　　首先，体细胞突变是比较罕见的。据Blainey介绍，典型的预期速率约为10-11至10-8个碱基多态性(SNP)，每个碱基对应每一个细胞分裂，而NGS普遍的错误率约为10-5SNP每碱基对。简单地说，NGS不够精确，无法检测体细胞突变。/pp　　Brody指出，目前的方法的另一个局限是，当我们使用单细胞测序时，我们对细胞的相互作用和时间没有任何了解。“我们的目标是开发一种方法来观察突变发生的时间和地点，以获得突变的一些上下文，并获得干净的定量和定性数据，以显示突变真正来自何处。”/pp　　span style="color: rgb(79, 129, 189) "strong更细致的观察/strong/span/pp　　研究人员解释说，单细胞DNA的全基因组测序通常有两种方式：要么从一个细胞开始，就有一个基因组拷贝，放大，然后测序。要么把这个细胞扩增成一个群，然后对细胞群进行测序。/pp　　Blainey说，Brody的工作代表了超越这些传统方法来提高数据质量和获得时间信息的努力。他说：“这和其他人做的非常不同，你必须仔细观察，甚至把它看成是单细胞方法。”/pp　　这种新颖的方法从一个单一的创建细胞，允许生长几代的小群体开始。然后从种群中提取单个细胞并进行亚克隆，以产生代表原始种群中每一个谱系的细胞群。然后从亚克隆细胞的DNA测序。“然后，”Blainey说，“当我们进入数据集来调用新变体时，我们利用了样本之间的谱系关系的先验估计。因为我们知道细胞之间的关系，我们知道它的历史，我们可以取一个特定的细胞并追踪它，看看每一步在何处和何时发生变化。“布洛迪把它比作显微镜，观察单个细胞周期的特定时间点的突变。/pp　　strongspan style="color: rgb(79, 129, 189) "潜在应用/span/strong/pp　　Blainey认为，这种“谱系测序”不仅是基础诱变研究的基础工具，而且可能具有实际应用。他给出的一个例子是理解暴露于致癌物质如环境化学物质或吸烟引起的突变生物学。“我们真的试图在这些致癌物、突变、细胞生物学和最终的癌症发生率之间作出定量和详细的联系。” Brody希望利用这种方法，“25年或30年后，我们可以开发降低突变率的疗法，预防癌症等与年龄有关的疾病。”/pp　　Blainey发现的另一个潜在应用是减少DNA损伤疗法如烷化剂、拓扑异构酶抑制剂和顺铂的有害作用。这些药物通过破坏肿瘤细胞DNA的速度比快速分裂的细胞更快修复细胞，最终杀死细胞。由于正常细胞不能像肿瘤细胞那样快速复制，所以它们的突变少，可以更容易地耐受治疗。真的可以吗?正如Blainey指出的，接受这种治疗的人通常会发展成继发性恶性肿瘤。“我不认为当你应用DNA损伤治疗方法时，对病人正常细胞的突变负担有很好的理解，部分原因是缺乏分析它的工具。我认为重要的是考虑这种疗法对未来癌症的风险。Brody的方法可以提供一个工具，以非常详细的方式研究突变的问题。”/pp　　strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "这种观察诱变的方法有助于预测谁将受益于DNA损伤的化疗，通过应用遗传操作来观察特定的遗传背景对顺铂等药物的反应。/span/strong根据Blainey的说法，“如果我们更清楚地知道，作为剂量的函数，你在给定的化疗中有多少突变，也许我们能找到一个你能获得很多疗效的甜点，但是你还没有达到最大的突变数量。”/pp　　找到甜点可能需要个性化的方法。麻省理工学院的研究人员已经表明，修复DNA的能力在个体之间是不同的。“我们的方法可能有助于预测这一点。”Blainey说。/pp　　strongspan style="color: rgb(79, 129, 189) "下一步是什么?/span/strong/pp　　Brody认为潜在应用的其他领域包括体外受精、干细胞研究、其他与年龄有关的疾病和环境暴露。他对未来的合作感到兴奋，但现在，他说，主要目标是分享他们的概念为这种类型的分析，希望通过了解效用，其他人会对应用该方法感兴趣。“我们不仅要展示如何做到这一点，而且要展示什么是可能的，并希望鼓励其他人开发更多的方法来使用它。”/pp　　Blainey同意上述说法。“一切都必须从某处开始。对于技术开发来说，你通常会从一个初步的想法开始，然后在很长一段时间内，会有很多进一步的改进，真正提高了一种新方法的性能和适用性。”/p

下一代测序（Next Generation Sequencing, NGS）彻底改变了基因组学研究领域，使全基因组测序比以往任何时候都更有效率。然而，典型的NGS工作流程是鲜有革新的，因为它面临着许多手动操作步骤及来自成本、通量以及结果变异性的诸多挑战。传统的手动样品制备方法不仅非常耗时，而且更易出错。面对这些挑战，TECAN自动化工作站提供了相应的解决方案，不仅提高了工作效率，而且保证了测序结果的准确可靠，堪称下一代测序中样本制备的&ldquo 神兵利器&rdquo 。 2011年，日本横滨RIKEN Omics科学中心(RIKEN Omics Science Center)的研究人员开发出一种新的基因表达分析技术，只需100 ng总RNA，就能准确定量的测定基因表达水平，这项技术被称为&ldquo HeliScopeCAGE&rdquo ，它将RIKEN的CAGE*(Cap Analysis of Gene Expression, CAGE)与Helicos BioSciences的单分子测序仪HeliScope相结合，为稀有细胞群体的基因表达分析开启了大门。 HeliScopeCAGE的成功开发并没有让RIKEN的研究人员们高兴太久，因为长达3周（制备测序仪运行一次所需的48个样本）的复杂手工操作随时可能因为一个小小的失误而从头开始。幸运的是，在TECAN公司帮助下，他们成功构建了Freedom EVO 150-8全自动样本处理平台(如下图)，将样本制备时间成功缩短到8天/192标本，并可同时满足两台HeliScope的平行工作。通过流程的优化与改进，cDNA的产量和质量以及文库的质量都与手工操作相一致，并且测序结果也具有较高的重复性。 30年的创新和发展开创了基因组测序的新时代，测序技术从手工的一次一个样本发展到基于高通量测序仪的高度自动化技术，测序仪通量的提高对样本制备提出了更高的要求，TECAN作为全球领先的自动化平台及解决方案的制造商已经做好准备&mdash &mdash Automation. That is what TECAN is for.如需了解更多Tecan公司Freedom EVO液体处理工作站详细配置、应用方案及脚本程序等，请点击http://www.instrument.com.cn/netshow/SH100992/DownLoadlist.asp?id=194616下载相关研究论文或咨询当地Tecan 员工/经销商。您也可登录www.tecan.com/freedomevo了解更多产品信息。 关于帝肯： 瑞士帝肯www.tecan.com是全球领先的生命科学与生物制药、法医和临床诊断领域自动化及解决方案供应商。公司成立于1980年，总部设在瑞士Mä nnedorf，分别在瑞士、北美和奥地利设有自己的研发和生产基地，目前公司主要经营的产品有三大类：全自动化液体处理平台( Liquid Handling&Robotics )、多功能酶标仪（Multimode Reader）和OEM组件；销售服务网络遍布世界52个国家，客户覆盖制药企业、生物技术公司、科研院所、法医、医院、血站系统和疾病控制中心（CDC）等。其液体处理技术已拥有行业经验30年，在全球处于领先地位，备受世界领先生命科学实验室的青睐。 帝肯（上海）贸易有限公司是瑞士帝肯集团公司亚太区总部，2008年4月成立于上海浦东。帝肯（上海）目前拥有一支专业的售前和售后服务团队，在科研、医院、血站和CDC领域构建了良好的经销网络，并以&ldquo 力求比客户期望做得更好&rdquo 的服务理念，给广大终端用户提供专业的服务。 欲知更多详情，请联系帝肯上海市场部：Libby ZhuTel: 021 2206 3206 / 010 8511 7823Fax: 021 2206 5260 / 010 8511 8461helpdesk-cn@tecan.com www.tecan.com

p　　span style="color: rgb(0, 112, 192) "什么叫做单细胞基因测序(Single-Cell Sequencing)?/span/pp　　一句话说，就是单个细胞水平上对基因组进行测序。2013年，自然杂志把年度技术授予了单细胞a title="" href="http://www.instrument.com.cn/application/SampleFilter-S01-T000-3-1-1.html" target="_self"span style="color: rgb(255, 0, 0) "基因测序/span/a(Single Cell Sequencing)，认为该技术将改变a title="" href="http://www.instrument.com.cn/application/SampleFilter-S01-T000-3-1-1.html" target="_self"span style="color: rgb(255, 0, 0) "生物界和医学界/span/a的许多领域。/pp　　span style="color: rgb(0, 112, 192) "我们为什么要进行单细胞基因测序?/span/pp　　传统的测序方法，无论是基因芯片或者二代基因测序技术(Next Generation Sequencing，NGS)都需要从超过10万个细胞中提取一大堆(bulk)DNA或者RNA，而提供的信息是一大堆细胞的平均值。但是传统的方法，对于理解人体细胞的多样性有着明显的局限性。/pp　　在人体的每一个组织中，比如说，肾脏组织，拥有着大量不同的细胞类型，每一种细胞类型有着独特的起源和功能。每一个细胞的谱系和发展的状态又决定了每个细胞如何和周围的细胞和环境如何反应，把基因测序应用到单个细胞层面，对于我们理解细胞的起源，功能，变异等有着至关重要的作用。/pp　　关于二代基因测序已经详细在我们的前期两篇深度报告中进行了介绍，在本篇报告中，我们将详细解读单细胞基因测序，以及该技术对癌症，辅助生殖以及免疫学等领域带来的新的突破。/pp　　strong一、单细胞基因测序行业：刚启程，面临引爆点/strong/pp　　BCC Research的一项分析报告指出，2014年全球单细胞分析(Single-cell Analysis)的市场达5.4亿美金，预测将从2015年的6.3亿美金增长到2020年的16亿美金，复合增长率达21%。根据GENReports的报告，关于单细胞分析的文章发表在过去的几年也有着爆发性的增长。/pp style="text-align: center "　　图2：单细胞分析的文章发表数量/pp style="text-align: center "img title="1.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201603/noimg/006c9fd7-a2cd-46b2-a028-18b51b5ea3cd.jpg"//pp style="text-align: center "　　资料来源：GEN，民生证券研究院/pp　　其中，传统的单细胞基因组学主要是由基因芯片和PCR主导的，随着二代基因测序的成本以超摩尔定律下降，目前单细胞基因组学逐渐由二代基因测序技术接棒。/pp　　和qPCR在90年代的发展一样，目前所有的刺激因素(高度的科研兴趣，生物医药巨头公司的关注等)正在解锁这个市场，单细胞基因测序行业正面临引爆点。/pp　strong　二、单细胞基因测序的基本流程：单细胞分离--基因组扩增--测序和分析/strong/pp　　单细胞测序，简单地说，主要经过如下的步骤：单细胞的分离--DNA/RNA的提取和扩增(全基因组扩增和全转录组扩增)---测序以及后续的分析和应用。/pp style="text-align: center "　　图3：单细胞测序的步骤/pp style="text-align: center "img title="2.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201603/noimg/782ee757-3c06-4a1b-9103-4c7336ac2929.jpg"//pp style="text-align: center "　　资料来源：Recent advances and current issues in single-cell/pp style="text-align: center "sequencing of tumors，民生证券研究院/pp　　2.1 单细胞的捕捉和分离/pp　　单细胞测序的第一步是单细胞的分离和提取，目前的方法主要有如下几种方法：流式细胞术，激光捕获显微切割技术以及微流控技术。/pp style="text-align: center "　　图4：单细胞分离的三种方式：流式细胞术，激光捕获显微切割以及微流控技术/pp style="text-align: center "img title="3.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201603/noimg/ea66e087-c9b2-4930-a4d3-50025543fe8b.jpg"//pp style="text-align: center "　　资料来源：Technologies for Single-Cell Isolation，民生证券研究院/pp　　1)流式细胞术 (Flow Cytometry)/pp　　是指通过对于悬浮于流体中的细胞或者其他颗粒进行定量分析和分选的技术。在各种流式细胞仪中，大家主要讨论的是荧光活化细胞分类计FACS(Fluorescence Activated Cell Sorting)系统分离单细胞。定量原理：待测细胞经特异性荧光染料染色后，加入样品管中，经过测量区，由染色后的细胞在激光照射下的荧光产生的电信号来进行定量分析 分选原理：通过流束形成含有细胞的带电液滴来实现的。/pp　　2)激光捕获显微切割技术Laser Capture Microdissection(LCM)/pp　　LCM技术可以在显微镜直视下快速、准确获取所需的单一细胞亚群，甚至单个细胞，从而成功解决了组织中细胞异质性问题。其基本原理是通过一低能红外激光脉冲激活热塑模-乙烯乙酸乙烯酯(EVA)膜，在直视下选择性地将目标细胞或组织碎片粘到该膜上。/pp　　3)微流控技术(Microfluidics)/pp　　微流控技术是一种用于精确控制微量液体的技术。微流控芯片是实施该技术的平台，通常通过细微的管道对液体实施操控，微流控对液体的操控尺度, 刚好适合于单细胞样品的处理操作。/pp　　2.2 全基因组扩增 (Whole Genome Amplification. WGA)/ 全转录组扩增 (Whole Transcriptome Amplification，WTA)：单细胞测序的难点/pp　　2.2.1 主要的三种全基因组扩增技术，各有优势/pp　　由于在单细胞中的DNA和RNA的数量非常小(几个pg)，用传统的测序仪无法检测，所以科学家们必须首先对这些分子进行扩增，同时尽量的减少错误。目前的全基因组扩增技术主要有三种：简并寡核苷酸引物PCR扩增(DOP-PCR)，多重置换扩增(MDA) 和基于多次退火和成环的扩增循环(MALBAC)。/pp　　1)基于PCR技术的全基因组扩增技术，例如DOP-PCR(简并寡核苷酸引物PCR扩增)/pp　　DOP-PCR是一种部分随机引物法, 其引物构成为3& #8242 -ATGTGG-NNNNNN-CCGACTCGAG-5& #8242 ；主要 利用3& #8242 端ATGTGG这6个在人体中分布频率极高的碱基作为引导, 以6个碱基的随机序列来决定特异的扩增起始位点，从而达到扩增整个基因组的目的。/pp　　2)多重置换扩增(MDA)/pp　　MDA是一种等温的链置换扩增反应, 其使用随机的6碱基引物在多位点和模板链结合, 接着利用 phi29DNA 聚合酶很强的模板结合和置换能力实现对全基因组的扩增。/pp style="text-align: center "　　图5：DOP-PCR和MDA全基因组扩增技术简介/pp style="text-align: center "img title="4.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201603/noimg/d9b0aef0-e3b1-4c63-8313-c20796064bb3.jpg"//pp style="text-align: center "　　资料来源：Single-cell genome sequencing: current state/pp style="text-align: center "of the science，民生证券研究院/pp　　3)MALBAC(Multiple annealing and looping-based amplification cycles)基于多次退火和成环的扩增循环/pp　　通过采用特殊引物，使得扩增子的结尾互补而成环，从而达到近乎线性的扩增,该技术是哈佛大学谢晓亮教授团队发明的。/pp style="text-align: center "　　图6：MALBAC全基因组扩增的示意图/pp style="text-align: center "img title="5.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201603/noimg/83e2f828-d990-4b9c-afd6-bd692fc52888.jpg"//pp style="text-align: center "　　资料来源：Single-cell sequencing by Doug Brutlag，民生证券研究院/pp　　表1：三种类型的全基因组扩增方式比较/pp style="text-align: center "img width="600" height="302" title="QQ截图20160302115018.jpg" style="width: 600px height: 302px " src="http://img1.17img.cn/17img/images/201603/noimg/297e4e6e-a134-4101-a297-456cd703c3af.jpg" border="0" vspace="0" hspace="0"//pp style="text-align: center "　　资料来源：Single-Cell Sequencing Technologies: Current and Future，/pp style="text-align: center "民生证券研究院/pp　　Navin 在研究报告中指出(来源：Cancer genomics: one cell at a time)，对于检测CNV(Copy Number Variation)的时候，DOP-PCR以及MALBAC较有优势，另一方面， MDA方法一般用来检测点突变。Gawad et al., (2015)更是指出，三种全基因组扩增技术并没有明显的胜者，具体方法的使用取决于研究的目的。/pp　　2.2.2 全转录组扩增/pp　　一个哺乳动物的单细胞大约含有10pg的RNA，其中mRNA大约在0.1-0.5pg，并不能满足目前测序平台的要求，所以需要进行全转录组扩增技术。/pp　　单细胞中提取的RNA首先经过逆转录出cDNA，然后对逆转录生成的cDNA进行扩增。目前主要的转录组扩增技术主要包括如下几种：传统的PCR，改进的PCR，T7-in vitro 体外转录组扩增以及Phi29聚合酶扩增。/pp　　三. 单细胞测序的主要应用：癌症，辅助生殖以及免疫学领域/pp　　当单细胞被分离，细胞内的DNA/RNA被提取和扩增后，二代基因测序(Next Generation Sequencing)可以用来进行后续的测序。当把基因测序应用于单个细胞层面，在下游应用领域有着先天独到的优势。/pp　　3.1单细胞基因测序技术有助研究癌症起因和治疗/pp　　首先谈一下癌症的异质性：中晚期的肿瘤或由一系列的肿瘤克隆组成，每一种克隆有着独立的变异，形态和药物反应。对于肿瘤克隆精准的诊断非常重要，因为一个占据原发性肿瘤5.1%的亚克隆种群在复发的时候可能成为主要的致病因素。/pp style="text-align: center "　　图7：肿瘤的异质性/pp style="text-align: center "img title="6.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201603/noimg/88b49609-3a47-4577-ad2a-7e9b36b6a4dc.jpg"//pp style="text-align: center "　　资料来源：Illumina，民生证券研究院/pp　　实体瘤由一系列不同的细胞组成，包括癌症纤维细胞，内皮细胞，淋巴细胞，巨噬细胞等。同时，实体瘤由多个肿瘤克隆亚种群构成，使得临床样本的分析更加复杂。当多个肿瘤克隆同时存在时，标准方法检测的要么是平均信号要么是主要的克隆群体(并不一定是最致病的)的信号。/pp　　而同时，肿瘤的异质性和癌症产生抗药性以及转移密切相关，所以，单细胞测序开始用来检测肿瘤内基因异质性，对于癌症起因以及后续治疗的研究非常关键和重要。/pp　　例如，Navin et al.(2011), 利用单细胞基因测序的方法(流式细胞术提取细胞-全基因组扩增-NGS)，在某个乳腺癌肿瘤组织中检测了100个乳腺癌细胞的CNVs，覆盖度大约6%，发现了三种完全不一样的克隆亚种群。/pp　　除了肿瘤细胞，单细胞基因测序同样可以应用于循环肿瘤细胞(Circulating tumor cells)和外周血播散肿瘤细胞DTC(disseminated tumor cells)，该部分内容将在后续的研究报告中深入讨论。/pp　　3.2 单细胞基因测序助力辅助生殖/pp　　PGS(Pre-implantation Genetic Screening)是胚胎注入前遗传学筛查，主要是通过检测胚胎的23对染色体结构、数目，来分析胚胎是否有遗传物质异常 PGD(Pre-implantation Genetic Diagnosis)，主要用于检测胚胎是否携带遗传缺陷的基因，关于PGS/PGD的介绍，请参考我们之前的行业深度《基因+大数据的颠覆：从癌症基因测序到辅助生殖》。/pp　　PGD过程中，目前主要有三种方式获得活检材料：1)卵子的第一极体和第二极体 2)培养至第3天胚胎卵裂期的卵裂球细胞(一般取1-2个细胞) 3)培养第5天左右的囊胚细胞。/pp　　例如，牛津大学的Dr.Dagan Wells团队，通过对囊胚细胞进行单细胞基因测序，选择健康的胚胎植入。另外，谢晓亮教授团队通过对女方卵细胞极体细胞进行测序，结合胚胎选择，选择正常的胚胎移植。/pp style="text-align: center "　　图8：卵母细胞减数分裂产生极体的过程/pp style="text-align: center "img title="7.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201603/noimg/a1c2724b-0f2c-4b27-9eca-d304dccd613c.jpg"//pp style="text-align: center "　　资料来源：Genome Analyses of Single Human Oocytes，民生证券研究院/pp style="text-align: center "　　(注：其中PB1和PB2是第一极体和第二极体)/pp　　3.3 单细胞基因测序打开免疫报多样性研究之门/pp　　用单细胞基因测序分析免疫细胞的原因是现存的多样的病原体导致了免疫细胞的高度异质性，传统的检测方法，取样来自一大堆细胞，低估了单个免疫细胞的多样性，所以我们需要更加精确检测单个免疫细胞的遗传物质，从而理解机体复杂的免疫机制。正如开篇提到的Juno收购的单细胞基因测序公司AbVitro致力于T细胞和B细胞的基因测序。/pp　　图9展示了对单个T细胞受体基因测序(TCR Sequencing)的流程。TCR & #945 和& #946 mRNA经过逆转录，扩增，重叠延伸，目的基因被选择性地进行PCR扩增以及后续的分析。/pp style="text-align: center "　　图9：TCR Sequencing过程/pp style="text-align: center "img title="8.png" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201603/noimg/04e7c357-80bd-4709-89dc-92ee07a28fa9.jpg"//pp style="text-align: center "　　资料来源：Pairing of T-cell receptor chains via emulsion PCR，/pp style="text-align: center "Illumina，民生证券研究院/pp　　四. 单细胞基因测序未来的发展之路/pp　　在目前来看，单细胞基因测序还处在非常初级的阶段，也面临很多技术的挑战，包括：如何高效的分离细胞，全基因组无偏差的扩增，以及下游的数据分析等。但各大生物医药巨头都已经目光锁定了这个方向，除了今年初Juno收购AbVitro(单个T细胞和B细胞进行基因测序)，去年八月BD公司收购了单细胞测序公司Cellular Research。Illumina也通过和Clontech合作，推出了单细胞RNA测序服务。/pp　　我们认为，未来的基因测序一定朝着更精准，更微观的方向前进，如今，单细胞测序正面临着一场革命，在单个细胞层面让我们在前所未有的水平理解基因组学，表观基因组学和转录组学的多样性。/pp　　背景案例：/pp　　2016年1月，肿瘤免疫疗法的领头羊公司Juno宣布以1.25亿美金的股票和现金收购波士顿的一家单细胞测序公司：AbVitro Inc.。 AbVitro公司的技术起源于哈佛大学George Church的实验室，AbVitro的技术包括对单个T细胞和B细胞进行基因测序，帮助科学家们理解T细胞受体(T cell receptor & #945 和& #946 链的基因的复杂性。/pp　　图：Juno收购AbVitro之后的布局/pp style="text-align: center "img title="9.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201603/noimg/6ef1eca1-dc46-4600-9c6d-d95f77a85f9e.jpg"//p

全自动碳硫分析仪、元素分析仪的概述南京第四分析仪器有限公司成立于1976年，是国内金属分析仪器的首创厂家。专业生产高频红外碳硫分析仪红外碳硫分析仪 红外分析仪 碳硫分析仪 金属元素分析仪 金属材料分析仪 电脑多元素分析仪 钢铁分析仪 化验设备 理化分析仪 元素分析仪 多元素分析仪 材料分析仪 铝合金分析仪 铁合金分析仪 矿石分析仪 铁矿石分析仪 有色金属分析仪 合金钢分析仪 不锈钢分析仪 铜合金分析仪 铸铁分析仪 铸造分析仪 炉前快速碳硅分析仪 碳硅当量仪 铁水分析仪等，分析仪器的种类很多，欢迎来电垂询，电话：025-57332233 57330555 传真：025-57552266 QR-5型全自动电脑碳硫分析仪采用中国国标法测定（碳采用气体容量法、硫采用碘量法）原理设置而成，品牌电脑控制，配备电子天平实现了不定量称样测定，Windows界面下的全中文菜单式操作，并可贮存8条工作曲线，使用进口传感器，确保数据精密采集。检测结果可自动或手动打印，碳可显示到小数点后面三位、硫可显示到小数点后面四位，其精度已优于中国国标。QR-5型全自动电脑碳硫分析仪主要技术参数测量范围：碳：0.010～6.000%硫：0.003～2.000%测量时间：45秒测量精度：符合GB223.69-2008，GB223.68-1997标准QR-5型全自动电脑碳硫分析仪主要特点采用气体容量法定碳，碘量法定硫。碳、硫测定均为全自动；利用微机系统进行智能程序控制，精密数据采集；Windows界面下的中文菜单操作；碳硫元素同时可保存八条标样曲线，测试结果长时间大容量保存，并具有自动、手动两种打印方式，且可任意查询分析数据；配套电子天平，实现不定量称样。全自动碳硫分析仪、元素分析仪的概述南京第四分析仪器有限公司成立于1976年，是国内金属分析仪器的首创厂家。专业生产高频红外碳硫分析仪红外碳硫分析仪 红外分析仪 碳硫分析仪 金属元素分析仪 金属材料分析仪 电脑多元素分析仪 钢铁分析仪 化验设备 理化分析仪 元素分析仪 多元素分析仪 材料分析仪 铝合金分析仪 铁合金分析仪 矿石分析仪 铁矿石分析仪 有色金属分析仪 合金钢分析仪 不锈钢分析仪 铜合金分析仪 铸铁分析仪 铸造分析仪 炉前快速碳硅分析仪 碳硅当量仪 铁水分析仪等，分析仪器的种类很多，欢迎来电垂询，电话：025-57332233 57330555 传真：025-57552266 QR-5型全自动电脑碳硫分析仪采用中国国标法测定（碳采用气体容量法、硫采用碘量法）原理设置而成，品牌电脑控制，配备电子天平实现了不定量称样测定，Windows界面下的全中文菜单式操作，并可贮存8条工作曲线，使用进口传感器，确保数据精密采集。检测结果可自动或手动打印，碳可显示到小数点后面三位、硫可显示到小数点后面四位，其精度已优于中国国标。QR-5型全自动电脑碳硫分析仪主要技术参数测量范围：碳：0.010～6.000%硫：0.003～2.000%测量时间：45秒测量精度：符合GB223.69-2008，GB223.68-1997标准QR-5型全自动电脑碳硫分析仪主要特点采用气体容量法定碳，碘量法定硫。碳、硫测定均为全自动；利用微机系统进行智能程序控制，精密数据采集；Windows界面下的中文菜单操作；碳硫元素同时可保存八条标样曲线，测试结果长时间大容量保存，并具有自动、手动两种打印方式，且可任意查询分析数据；配套电子天平，实现不定量称样。

谱育科技成立5周年 诚意之作始终以客户为中心重磅打造一系列新品，敬请期待！谱育出品，必属精品全自动水质分析实验室面对越来越多的水质检测需求，针对传统实验室手工检测“效率低、投入大、安全风险高、数据质量不可控”等问题，谱育科技率推出了“全自动水质分析实验室”系列产品，通过一体化信息管理，标准化、全自动、大通量、快速监测等手段，能够“自动、快速、精准”地检测高锰酸盐指数、重金属、TP、TN、COD、NH3-N等因子，实现从分样-前处理-分析-报表的全流程自动化。根据“全自动水质分析实验室”理念，谱育科技推出了“全自动水质COD分析仪”和“全自动总磷总氮分析仪”两大新品，分析方法完全符合相关国家或行业标准方法，通过水质分析自动化，有效缩短了分析检测周期，数据质量全流程在线可控、数据全流程可溯源，大幅度提升了水质分析的检测效率和数据质量。全自动水质COD分析仪全自动总磷总氮分析仪全自动分析仪特点全自动系统集成了开盖/关盖、取样、前处理、分析、质控、数据报告全自动水质分析功能，精准高效，避免误差，免去手工检测的一系列烦恼。高通量可实现复杂工序多位并行处理，单台分析仪器每天可处理上百个样品量，满足高峰时期大批量的样品检测需求。信息化全过程对样品信息进行智能记录，自动、实时采集检测过程中的样品信息、仪器设备状态、监测数据等，自动质控并生成检测报告。全自动水质COD分析仪，从开关盖，加试剂，混匀，清洗、排空，生成报告，不仅涵盖了全流程自动化的特点，同时，还具备光程范围更宽泛，测量范围更宽广，不同比色皿产生的误差极小等优点，可广泛适用于综合排放、农林养殖、公共卫生等领域。全自动总磷总氮分析仪，支持总磷总氮同批次检测，全自动化执行分析检测任务，批次水样同步质控，每一个测量值都可溯源，实时掌握样品检测状态、设备运行状态，操作维护便捷，可广泛适用于有色、浑浊、清澈样品检测。 全自动分析系列产品● 全自动高锰酸盐指数分析系统基于智能机械臂技术平台，实现高锰酸盐指数的自动化检测，检测方法完全符合地表水、地下水、饮用水等相关的国家标准。● 全自动重金属分析系统基于ICP-MS/ICP-OES分析技术，满足70多种元素ppt级痕量检测需求。通过搭配石墨全自动消解、自动过滤等辅配系统，满足水质、土壤、食品、药品、血液等有毒有害限值元素国家法规标准分析检测要求。

近日，赛默飞世尔科技正式推出CE-IVD认证的Ion Torrent™ Genexus™ Dx一体化测序仪，这是一个全自动化的二代测序(NGS)平台，周转时间非常快速，仅需一天就能对检测样本提供结果。该系统专为临床实验室设计，并经过充分的验证，使用户能够在一台仪器上进行全自动化的诊断检测和临床研究。随着CE-IVD的正式认证，Genexus Dx全自动化一体化二代测序(NGS)平台将在世界范围内为更多临床医生和患者提供更加高效、更加可靠的基因组精准检测结果。赛默飞临床二代测序与肿瘤学事业部总裁Garret Hampton表示：“二代测序(NGS)技术已成为精准医学治疗的重要工具，任何医院或医疗机构——无论是大型医院还是社区医院，都能借助高度自动化、使用简便的Genexus Dx一体化测序仪，将NGS技术实现院内本地化开展，使临床医生能够更快地获得及时、全面的基因组分析结果。有了这些结果就可以帮助临床医生为患者做出决策，其中包括治疗方案的选择。”为了让临床医生能够更加快速地获得NGS检测结果，为临床精准医学治疗提供快速全面可靠的决策依据，赛默飞已经在Genexus一体化测序系统上开发出众多经临床验证的、从样本到报告全工作流程完整的检测项目，包括用于全面的基因组分析和血液肿瘤学的检测。Ion Torrent™ Genexus™ Dx一体化测序仪能够对 DNA、RNA 和 cfTNA等样本的应用实现全自动化的流程，从NGS文库制备、模板制备、测序、原始数据分析，到变异注释和出具报告。作为Ion Torrent™ Genexus™ 系统的一部分，从样本的核酸提取、纯化和定量开始，该NGS平台将靶向测序的所有工作流程步骤实现自动化，且该系统经过全面验证，可在一天内快速提供结果。赛默飞早在2019年推出了用于研究（RUO版本）的IonTorrent™ Genexus™ 一体化高通量测序系统，这是第一个可以在24小时内实现从样本到结果的一体化集成NGS平台。该平台的自动化工作流程能最大限度地减少人工操作，进而最大限度的降低了用户干预和人为错误的可能性，使所有实验室都可以轻松简单的开展应用NGS技术。

作为国内第一家全面掌握纳米孔测序技术并将之推向商业化的企业，齐碳持续技术研发、扩充产品矩阵，不断解锁更多应用场景，让这项高精尖的技术产生更多的现实生产力。目前，已经形成了以基因测序仪为核心，配套有试剂、芯片及软件的测序平台。此外还有实验室自动化、生信分析等应用支撑产品，形成了完整的基因测序全链条解决方案。今年3月，齐碳重磅发布了全新迭代升级的K2体系，带来了更准、更稳、更高效的测序体验。单次准确率从90%跃升至97%，Consensus 准确率（70x）从Q40提升至Q50，不仅 Homopolymer 分辨能力大幅提升，还实现了高精度短序列测序，同时上样量也大幅减少。8月18日，齐碳时隔一年再发新品，重磅推出自主研发的中通量纳米孔基因测序平台QPursue，从低通量QNome测序平台扩展到中通量测序平台QPursue，不仅展现了齐碳强劲的研发实力和创新能力，也代表着国内纳米孔基因测序技术的最前沿水平。未来，齐碳科技将持续深耕，不断提升测序性能、降低测序成本，充分挖掘纳米孔测序技术的优势潜能，推动纳米孔测序技术迭代和产业化应用，加速纳米孔基因测序仪国产化时代进程！

p style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "　　我们正在迈进一个人类健康科技蓬勃发展的大好时代，新技术的诞生掀起了精准医疗的革命。strong下一代测序(NGS)/strong技术使科学家能够快速、低成本地对整个基因组进行“测序”，使医生能够更早、更有效且以更低的成本发现和治疗疾病。在测序领域，大众常把目光放在测序仪上，其实测序前的质控工作同样至关重要。/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "　　安捷伦自1999年推出第一台基因样本质控设备，多年来不断完善产品性能，拓展应用场景，丰富产品线。目前，安捷伦在测序质控市场占有量很大，业务开展得非常成功。无论是从客户资源、市场拓展还是产品技术，安捷伦在测序质控市场的优势地位毋庸置疑。/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "　　为了解全球测序产业前景及安捷伦对于NGS领域的布局和市场策略，仪器信息网特别专访了安捷伦副总裁兼生物分子分析事业部总经理Kevin Corcoran先生。/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 400px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201912/uepic/3e7f240d-cbaa-466f-a868-79c2e731a07f.jpg" title="1 Kevin Corcoran.jpg" alt="1 Kevin Corcoran.jpg" width="600" height="400" border="0" vspace="0"//pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-align: center "Kevin Corcoranbr//pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-align: center "安捷伦副总裁/生物分子分析事业部总经理/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "　　安捷伦生物分子分析事业部(biomolecular analysis division,B.A.D),隶属于安捷伦诊断和基因组学事业部(diagnostics and genomics division，DGG)，主要负责安捷伦二代测序全流程设备的研发和生产。/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "　　strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "全球NGS产业周期性放缓 中国市场潜力巨大/span/strong/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "　　人们习惯将测序技术区分为一代、二代或者三代测序技术。事实上，除了一代经典的Sanger测序技术，二代和三代仅是测序原理不同，而非代际关系。尽管三代测序技术已经出现，但短读长的二代测序仍是主流。且由于二代测序和三代测序技术具有互补性，这两类技术将在一定时期内长期共存。/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "　　前几年，基因测序技术在中国掀起投资狂潮，行业年平均增速达15%~18%。近期，二代测序市场增速放缓到11%左右，Kevin表示这与全球经济形势的变化有关。“和其他行业一样，基因测序行业的发展总会出现周期性的波动。”/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "　　的确，对于任何新技术来说，前期一定会出现高速增长，一旦到达某一阶段，增速会放缓，基因测序也不例外。已在基因测序行业从业31年的Kevin表示：“从宏观看来，基因测序市场增长放缓只是暂时现象，未来，该领域一定会出现回升，最终会回到高速增长的状态。”/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "　　据Kevin介绍，北美基因测序市场已经非常成熟，北美地区的医院已经开始大量使用基因测序仪，医院对质控设备需求很大。“北美和欧洲是安捷伦BAD最大的市场，但市场增速在放缓。”/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "　　Kevin曾在PacBio担任重要职位，他带领的PacBio在中国市场战绩辉煌。根据据Kevin的市场经验，虽然中国在基因测序领域仍处于起步阶段，但其已然成为增长潜力最大的地区。“所以，在2020年，安捷伦会把目标聚焦在具有强大潜力的中国市场。”/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "　　strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "全自动化Magnis BR是病理科利器/span/strong/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "　　据Kevin对中国市场的了解，“中国市场对新技术具有极大的包容性，对新技术的吸收能力非常强。”“在中国，一旦一项新技术开始应用，它接下来的发展将会非常迅速。”/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "　　上个月，安捷伦在第九届中国病理年会上隆重推出了又一个让人惊艳的创新产品——NGS全自动文库制备系统Magnis BR。/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 500px height: 547px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201912/uepic/d0b41b4c-5cc2-4ab3-8b44-2d96dbf48549.jpg" title="2 Magnis BR二代测序文库制备系统.jpg" alt="2 Magnis BR二代测序文库制备系统.jpg" width="500" height="547" border="0" vspace="0"//pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-align: center "Magnis BR二代测序文库制备系统/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "　　Magnis BR是安捷伦燃石医学强强联合，共同打造的全自动化的NGS文库制备系统，也是安捷伦面向临床病理学市场主推的产品。Magnis BR解决了二代测序前端大量的样本制备和文库构建环节的人工操作，能够将1天的人工前处理工作缩短至9个小时，且过程全自动化，操作简单。/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "　　随着靶向药物的推出，很多优质的医院都会逐渐开展二代测序检测。而NGS是一项技术含量高、操作复杂的技术，需要实验人员较高的素养，而病理科真正能够操作NGS的人员并不多。Magnis BR 解决了这一用户痛点。“只需按一下按钮，就可以完成测序，大大减轻实验人员的负担。技术人员可以在一天内完成培训并上岗。”/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "　　此外，对于晚期癌症病人来说，时间显得异常宝贵。能否在短时间内拿到准确的检测报告对于病理科医生来说是一个至关重要的考量因素。“通常，一个样本的测序工作流程需要一到两周时间才能出结果，而利用Magnis BR可以在三天内完成。”/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "　　DNA文库制备工作一直是NGS工作流程中最复杂、变数最大的步骤之一。从长远来看，临床诊断是NGS文库制备系统最重要的市场。构建NGS工作流程的临床应用，是安捷伦在二代测序领域的重要战略布局。/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "　　strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "BAD产品线丰富 涵盖几乎所有细分/span/strong/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "　　近几年，安捷伦通过收购、整合其他的公司的产品，不断扩充、完善产品线，覆盖基因测序几乎所有细分领域的用户。除了上文介绍到的Magnis BR二代测序文库制备系统，B.A.D部门还有生物分析仪、TapeStation系统、片段分析等几个重要仪器产品。/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "　strong　2100生物分析仪/strong。2100生物分析仪能进行DNA、RNA和蛋白质量控制和定量分析，其RNA完整值是行业内目前公认的RNA完整性的金标准。“该设备以微流控芯片技术为核心，可用于电泳分离，同时对每一个片段的大小进行精确测定和浓度定量，还能进行细胞荧光参数的流式分析，分辨率很高。”该设备于1999年上市，目前，全球装机量已接近10000台。/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "　　strongTapeStation系列/strong。该系列当前有两种型号产品——4200和4150。4150 TapeStation系统于2018底年上市，是用于DNA和RNA样品质量控制的自动化解决方案。该系统一大特点是全自动化、灵活量和cfDNA的质控应用。此外，TapeStation推出了DNA完整性参数，是目前很多客户评估DNA完整性的参考标准。/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "　　strong片段分析产品线/strong。2018年初，安捷伦以2.5亿美元收购以高通量平行毛细管电泳而闻名的AATI公司，获得高分辨率毛细管电泳解决方案，从此获得能够满足高、甚至超高通量毛细管应用的能力。该产品线不仅是针对毛细管电泳，还可以解决二代测序、三代测序中的样本质控问题。/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 400px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201912/uepic/ac249924-8e03-47b3-ba95-aeca144437e3.jpg" title="3 Kevin Corcoran展示2100生物分析仪（右）和4150 TapeStation（左）系统芯片.jpg" alt="3 Kevin Corcoran展示2100生物分析仪（右）和4150 TapeStation（左）系统芯片.jpg" width="600" height="400" border="0" vspace="0"//pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-align: center "Kevin Corcoran 展示2100 生物分析仪(右)和4150 TapeStation(左)系统芯片/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "　　“我们计划开发出这样一个整合基因测序解决方案，这个方案包括样本质控、Magnis BR自动化建库、测序仪、生物信息分析软件等，涵盖整个基因测序工作流程，为临床肿瘤学研究提供整体解决方案。”Kevin向我们透露，预计2021年后，安捷伦会推出一款可以整合安捷伦现有产品线的二代基因测序仪。/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "br//pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "　　strongspan style="font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai "受访人介绍：/span/strong/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "span style="font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai "　　Kevin Corcoran现任安捷伦副总裁及生物分子分析事业部(B.A.D)总经理，该部门负责为下一代测序(NGS)工作流程和其他应用研究并提供解决方案。生物分子分析事业部负责所有遗传分析仪器和耗材相关的研发应用，也负责安捷伦诊断与基因组集团(Diagnostics and Genomics Group)基于NGS的集成临床工作流程解决方案项目。/span/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "span style="font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai "　　Kevin在生命科学领域拥有超过30年的经验。在加入安捷伦之前，他曾任太平洋生物科学公司(PacBio)市场开发高级副总裁。在PacBio工作的11年里，Kevin担任了重要的领导职务，并推动了两个PacBio SMRT测序平台的研发和商业发布取得成功。Kevin还曾担任美国应用生物系统公司的副总裁兼总经理，以及加盟美国林克斯(Lynx Therapeutics)公司的首席执行官。/span/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "span style="font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai "　　Kevin持有加州州立大学东湾分校的计算机科学学士学位。他和妻子Janet住在加州利弗莫尔的葡萄园中，他们喜欢骑双人自行车和打高尔夫球。此外，Kevin还是一个狂热的摩托车爱好者，在圣克拉拉经常可以看到他开着一辆宝马摩托车。/span/pp style="margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-indent: 2em "a href="https://www.instrument.com.cn/zc/134.html" target="_self"strongspan style="font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai color: rgb(255, 0, 0) "基因测序设备专场/span/strong/a/p

一、项目基本情况1.项目编号：HXJC2024HG/047项目名称：崖州湾国家实验室大型仪器设备采购项目2(第一部分)预算金额：896.000000 万元（人民币）采购需求：本次招标采购共分为2个包，每包遴选出1家符合要求的供应商，为采购人提供仪器设备的供货服务。具体分包情况如下表：包号设备名称单位数量是否可采购进口产品（是/否）是否需要授权函（是/否）核心产品（是/否）最高投标限价（万元）1步入式植物培养室套2是是是4662小麦小区收割机台2是是是430 注：符合条件的供应商可以投1包或多包，并分包编制投标文件。合同履行期限：第1包：合同签订后7个月内供货并安装完毕。第2包：合同签订后10个月内供货并安装完毕。本项目( 不接受 )联合体投标。2.项目编号：HXJC2024FG/041项目名称：崖州湾国家实验室油菜基因组三代测序及分析服务采购项目预算金额：400.000000 万元（人民币）采购需求：本次招标拟择优选择1家合格的供应商，根据采购人要求，为采购人提供油菜基因组三代测序及分析服务，具体服务内容如下：（1）Survey建库测序分析项目序号项目类型单价最高限价子项目1Survey提取建库100元/样子项目2Survey测序1100元/样子项目3Survey信息分析700元/样 （2）油菜样本的PacBio HiFi测序组装项目序号项目类型单价最高限价子项目1三代提取和建库1800元/库子项目2PacBio Revio测序12000元/样子项目3基因组组装和挂载8000元/样 （3）基因组注释及泛基因组构建项目序号项目类型单价最高限价子项目1基因组注释4000元/样子项目2泛基因组构建2000元/样 合同履行期限：自合同签订后两年。本项目( 不接受 )联合体投标。3.项目编号：HXJC2024FG/042项目名称：崖州湾国家实验室单细胞测序服务采购项目预算金额：340.000000 万元（人民币）采购需求：本次招标拟择优选择1家合格的供应商，根据采购人要求，为采购人提供单细胞测序分析技术服务。合同履行期限：自合同签订后360日内。本项目( 不接受 )联合体投标。二、获取招标文件时间：2024年06月13日 至 2024年06月20日，每天上午9:00至11:30，下午13:30至16:00。（北京时间，法定节假日除外）地点：中招联合招标采购平台（http://www.365trade.com.cn）。方式：线上购买电子版招标文件，详见“特别告知”。售价：￥600.0 元，本公告包含的招标文件售价总和三、对本次招标提出询问，请按以下方式联系。1.采购人信息名 称：崖州湾国家实验室　　　　　地址：三亚市崖州区还金路8号　　　　　　　　联系方式：余老师 13301296867　　　　　　2.采购代理机构信息名 称：北京华夏京诚咨询有限公司　　　　　　　　　　　　地　址：北京市海淀区西直门北大街甲43号金运大厦B座802室　　　　　　　　　　　　联系方式：王建保、刘雅萌、高宏鹏、马建军010-82582703-805/816/809　　　　　　　　　　　　3.项目联系方式项目联系人：王建保、刘雅萌、高宏鹏、马建军电　话：　　010-82582703-805/816/809

详细信息 怀宁县人民医院采购质谱仪、测序仪等设备 安徽省-安庆市-怀宁县 状态：公告 更新时间： 2023-01-29 怀宁县人民医院是一所集医疗、教学、科研、预防、保健为一体的“二级甲等综合性医院”。医院配置了神经外科手术显微镜、关节镜手术系统、椎间孔镜手术系统、眼科激光诊断仪、眼底激光治疗仪、超乳玻切一体机、C臂全数字化平板探测器心血管造影系统Optima IGS530等设备。 近日，怀宁县人民医院就“安庆市精准医学中心设备采购（二次）项目”发布公开招标公告，预算金额为1100万元。该项目的潜在投标人应在安庆市公共资源交易中心平台获取招标文件，并于2023年02月06日10点00分（北京时间）前递交投标文件。 1 项目基本情况 项目编号：CG-HN-2022-177 FS34082220220785号 项目名称：安庆市精准医学中心设备采购（二次）项目 资金来源：财政资金 预算金额：1100.00万元 最高限价：1100.00万元 采购需求：高通量基因测序仪、单通道微阵列芯片扫描仪、双通道微阵列芯片扫描仪、基因分析仪、恒温扩增微流控芯片核酸分析仪、三重四级杆质谱分析系统、数字PCR平台、全自动医用PCR分析系统等配套设备。 包别划分：一个包 评标办法：综合评分法 合同履行期限：设备采购安装自合同签订之日起20日历天，试剂、耗材采购期限5年。 本项目不接受联合体投标。 2 申请人的资格要求 1.满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定； 2.落实政府采购政策需满足的资格要求：本项目符合财政部、工业和信息化部制定的《政府采购促进中小企业发展管理办法》第六条第（二）因确需使用不可替代的专利、专有技术，基础设施限制，或者提供特定公共服务等原因，只能从中小企业之外的供应商处采购的； 3.本项目的特定资格要求：投标人如为生产厂家，应具备《医疗器械经营许可证》、《医疗器械生产许可证》（须在有效期内）；如为代理商或经销商投标，应具有《医疗器械经营许可证》(须在有效期内)； 4.具有合法有效的营业执照。 3 获取招标文件 时间：2023年01月13日至2023年01月20日， 每天上午8:00至12:00，下午14:30至17:30（北京时间，法定节假日除外） 地点：安庆市公共资源交易中心平台（aqggzy.anqing.gov.cn） 方式：（1）投标人须登录安庆市公共资源交易中心平台查询、获取招标文件。首次登录须在安徽省公共资源交易市场主体库（ http://61.190.70.20/ahggfwpt-zhutiku/dengludenglu）办理入库手续，办理入库不收取任何费用。安徽省公共资源交易市场主体库使用相关问题（如系统登录、信息登记、录入及提交、数字证书关联等）请拨打服务电话：010-86483801 转 5-2（工作日）。 CA 数字证书有关问题请拨打服务电话：安徽 CA 客服400-880-4959（工作日）。 市场主体招标环节和投标环节系统使用服务电话：400-998-0000（8:00-21:00）。 （2）投标人登录安庆市公共资源交易中心平台获取招标文件及其它资料（含澄清和补充说明等）。如在招标文件获取过程中遇到系统问题，请拨打技术支持服务热线400-9980000，QQ：4008503300。 售价：免费。 1 提交投标文件截止时间、开标时间 和地点 2023年02月06日10点00分（北京时间） 地点：安庆市公共资源交易平台 开评标方式：全流程电子化交易，在线开标 1 对本次招标提出询问，请按以下 方式联系 1.采购人信息 名 称：怀宁县人民医院 地 址：怀宁县高河镇独秀大道166号 联 系 人：陈海军 联系方式：0556-46484192 2.采购代理机构信息 名 称：怀宁县项目咨询管理有限公司 地 址：怀宁县高河镇育儿路143号 联 系 人：凌晨晨 联系方式：0556-4967801 3.项目联系方式 项目联系人：陈海军 电 话：0556-46484192 × 扫码打开掌上仪信通App 查看联系方式 基本信息 关键内容：微流控芯片,基因测序仪,核酸蛋白分析,液质联用仪,生物芯片,PCR 开标时间：2023-02-06 10:00 预算金额：1100.00万元 采购单位：怀宁县人民医院 采购联系人：点击查看 采购联系方式：点击查看 招标代理机构：怀宁县项目咨询管理有限公司 代理联系人：点击查看 代理联系方式：点击查看 详细信息 怀宁县人民医院采购质谱仪、测序仪等设备 安徽省-安庆市-怀宁县 状态：公告 更新时间： 2023-01-29 怀宁县人民医院是一所集医疗、教学、科研、预防、保健为一体的“二级甲等综合性医院”。医院配置了神经外科手术显微镜、关节镜手术系统、椎间孔镜手术系统、眼科激光诊断仪、眼底激光治疗仪、超乳玻切一体机、C臂全数字化平板探测器心血管造影系统Optima IGS530等设备。 近日，怀宁县人民医院就“安庆市精准医学中心设备采购（二次）项目”发布公开招标公告，预算金额为1100万元。该项目的潜在投标人应在安庆市公共资源交易中心平台获取招标文件，并于2023年02月06日10点00分（北京时间）前递交投标文件。 1 项目基本情况 项目编号：CG-HN-2022-177 FS34082220220785号 项目名称：安庆市精准医学中心设备采购（二次）项目 资金来源：财政资金 预算金额：1100.00万元 最高限价：1100.00万元 采购需求：高通量基因测序仪、单通道微阵列芯片扫描仪、双通道微阵列芯片扫描仪、基因分析仪、恒温扩增微流控芯片核酸分析仪、三重四级杆质谱分析系统、数字PCR平台、全自动医用PCR分析系统等配套设备。 包别划分：一个包 评标办法：综合评分法 合同履行期限：设备采购安装自合同签订之日起20日历天，试剂、耗材采购期限5年。 本项目不接受联合体投标。 2 申请人的资格要求 1.满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定； 2.落实政府采购政策需满足的资格要求：本项目符合财政部、工业和信息化部制定的《政府采购促进中小企业发展管理办法》第六条第（二）因确需使用不可替代的专利、专有技术，基础设施限制，或者提供特定公共服务等原因，只能从中小企业之外的供应商处采购的； 3.本项目的特定资格要求：投标人如为生产厂家，应具备《医疗器械经营许可证》、《医疗器械生产许可证》（须在有效期内）；如为代理商或经销商投标，应具有《医疗器械经营许可证》(须在有效期内)； 4.具有合法有效的营业执照。 3 获取招标文件 时间：2023年01月13日至2023年01月20日， 每天上午8:00至12:00，下午14:30至17:30（北京时间，法定节假日除外） 地点：安庆市公共资源交易中心平台（aqggzy.anqing.gov.cn） 方式：（1）投标人须登录安庆市公共资源交易中心平台查询、获取招标文件。首次登录须在安徽省公共资源交易市场主体库（ http://61.190.70.20/ahggfwpt-zhutiku/dengludenglu）办理入库手续，办理入库不收取任何费用。安徽省公共资源交易市场主体库使用相关问题（如系统登录、信息登记、录入及提交、数字证书关联等）请拨打服务电话：010-86483801 转 5-2（工作日）。 CA 数字证书有关问题请拨打服务电话：安徽 CA 客服400-880-4959（工作日）。 市场主体招标环节和投标环节系统使用服务电话：400-998-0000（8:00-21:00）。 （2）投标人登录安庆市公共资源交易中心平台获取招标文件及其它资料（含澄清和补充说明等）。如在招标文件获取过程中遇到系统问题，请拨打技术支持服务热线400-9980000，QQ：4008503300。 售价：免费。 1 提交投标文件截止时间、开标时间 和地点 2023年02月06日10点00分（北京时间） 地点：安庆市公共资源交易平台 开评标方式：全流程电子化交易，在线开标 1 对本次招标提出询问，请按以下 方式联系 1.采购人信息 名 称：怀宁县人民医院 地 址：怀宁县高河镇独秀大道166号 联 系 人：陈海军 联系方式：0556-46484192 2.采购代理机构信息 名 称：怀宁县项目咨询管理有限公司 地 址：怀宁县高河镇育儿路143号 联 系 人：凌晨晨 联系方式：0556-4967801 3.项目联系方式 项目联系人：陈海军 电 话：0556-46484192

p　　2015年将成为我国精准医疗的元年，基因测序作为精准医疗的前端，行业面临爆发性的增长机遇，同时在实际操作中也面临一定的挑战。/pp　　strong第一部分：基因测序被关注的原因/strong/pp　　测序技术和大数据分析能力的发展使得精准医学成为可能。精准医学是以患者的个人基因组信息为基础为病人量身设计出最佳治疗方案，和传统的循证医学相比，精准医学有望成为治疗效果最大化和副作用最小化的一门定制医疗模式。/pp　　1.1 基因测序的价格以超摩尔定律下降，使得基因测序经济性推广成为可能/pp　　现在人类全基因组测序成本已经降到1000 美元以下，未来这一数字还将继续下降 /pp　　2008年，二代测序技术NGS的出现和推广，让测序成本开始加速下降，并明显超过摩尔定律的预测。/pp　　基因测序技术成本迅速下降(每兆碱基)/pp style="TEXT-ALIGN: center"img title="1.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201509/noimg/a6c641c7-d6db-431b-af6a-49af3e77a612.jpg"//pp　　1.2 大数据分析工具的出现和进步，使得基因测序能够进入现实应用领域/pp　　针对大量基因组数据，大数据处理能力提升也为分析和解读基因数据提供支持，测序技术及大数据分析能力的不断提升将会推动精准医学进入快速增长的轨道。/pp　　1.3 传统医学需要突破，精准医疗的政策风口助推基因测序发展/pp　　政策风口： 2015年2月，习近平总书记批示科技部和国家卫生计生委，要求国家成立中国精准医学战略专家组。/pp　　2015年3月11日，科技部召开国家首次精准医学战略专家会议，并决定在2030年前在精准医疗领域投入600亿元。2015年1月，国家公布了产前筛查与诊断高通量测序试点单位，4月公布了肿瘤诊断与治疗高通量基因测序试点单位，表明了政府推动精准医疗发展的决心。/pp　　5 月14 日，国务院颁布《关于取消非行政许可审批事项的决定》，再取消49项非行政许可审批事项，不再保留“非行政许可审批”这一审批类别。与医药相关的包括：第31 项：第三类医疗技术临床应用准入审批 第52 项：国家食品药品监督管理总局负责的药品行政保护证书的核发。取消非行政许可审批，松绑第三类医疗技术临床应用，变事前审批为事中事后监管。预计未来，由省级卫生计生行政部门负责的第二类医疗技术实施准入审批也将逐步取消。轻审批，重监管的趋势明确。/pp　　strong第二部分：基因测序的特点及发展趋势/strong/pp style="TEXT-ALIGN: center"img title="2.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201509/noimg/d7321229-b7cb-441b-a964-03fe0312ea7b.jpg"//pp　　2.1、二代测序仍然是基因测序最主流的技术/pp　　目前基因测序技术已经发展到第三代(也有把纳米孔外切酶测序成为第四代)。/pp　　第一代DNA测序技术用的主要是1975年由桑格(Sanger)和考尔森(Coulson)开创的链终止法。/pp　　第二代DNA测序技术(NGS)目前使用最为广泛，以Roche公司的454技术、Illumina公司的Solexa，Hiseq技术和Life公司的Solid技术为标志。/pp　　第三代DNA技术(TGS)以PacBio公司的SMRT和Oxford Nanopore Technologies的纳米孔单分子测序技术为代表，测序过程无需进行PCR扩增。/pp　　strong二代测序在5-10年内仍然是基因测序的主流方法/strong/pp　　二代测序技术凭借其高通量、低成本和高准确度取代第一代测序技术成为测序市场的主流。由于第三代DNA测序技术目前面临测序成本高和测序结果准确度相对较低的市场化瓶颈，因此TGS仪器大规模商业化仍然需要较长的时间。/pp　　NGS各环节对测序结果有重要影响：NGS测序流程包括样本收集、基因提取、文库构建、基因测序和数据分析，各环节的准确性对测序结果有重要影响，比对数据库的规模直接影响数据分析结果的准确性。/pp style="TEXT-ALIGN: center"img title="3.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201509/noimg/3e5f1910-517c-4007-a608-4fa6ba4de265.jpg"//pp　　2.2、二代测序技术可能成为未来分子诊断的核心平台/pp　　二代测序技术兼具通量和准确度优势，有望引领分子诊断方法革新/pp　　常用的分子诊断技术包括聚合酶链式反应(PCR)、转录介导的扩增(TMA)、荧光原位杂交(FISH)、基因测序、以及基因芯片技术。/pp　　基因检测主要技术的细分市场增速概况(全球)/pp style="TEXT-ALIGN: center"img title="4.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201509/noimg/6ac0fc24-6e75-428a-b6eb-49ea5d6ed5df.jpg"//pp　　分子诊断仪器产品的研发，瓶颈不在于技术而在于政策对创新产品的鼓励，国家目前已开辟创新通道，受理审批周期也在大大的缩短。/pp　　不同发展阶段的分子诊断技术都有其特定的应用场景，随着NGS 成本的下降，商业模式的丰富，传统的分子诊断方法将受到挑战。二代测序技术兼具通量和准确度优势，更为快速、低廉，极大地拓宽了基因测序的应用范围，尤其促进了分子诊断方法的革新。/pp　　strong第三部分：基因测序产业格局 投资机会及挑战分析/strong/pp　　3.1 基因测序产业格局概览/pp　　基因测序市场的细分领域，包括了仪器、耗材、测序服务、数据处理、终端应用等多个方面，如下图所示。/pp style="TEXT-ALIGN: center"img title="5.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201509/noimg/6b0b91b7-4cf6-4e1f-a7ca-0eab0a02b1af.jpg"//pp　　上游：仪器试剂耗材/pp　　中游：测序服务(样品制备、检测和分析)，信息分析(大数据存储、解读、共享)/pp　　下游：终端用户(应用场景)/pp　　3.2 上游：仪器技术壁垒最高且形成寡头垄断格局，试剂耗材国内企业有一定机会/pp　　二代测序市场主流测序平台主要是四大家：Illumina、Ion Torrent/Life Technologies (2014年被Thermo Fisher收购)、454 Life Sciences/Roche、 Pacific Biosciences。/pp　　Genomeweb 2013 度年全球测序仪器市场调查显示：Illumina 占据了全球测序仪器市场71%的份额，Life technologies 则排名第二分得16%的市场份额，罗氏和PacBio 则以10%和3%分列第三和第四位。前两家测序仪公司的全球市场占有率接近90%，基因测序仪行业已经形成寡头垄断的格局。/pp　　国内的三大家华大基因、达安基因、贝瑞和康和仪器供应商合作，已经在仪器和试剂层面均获得注册证。从盈利模式角度看，仪器未来不排除出现免费赠送，主要赢利点从试剂耗材及服务端获得，因此国内企业在试剂和服务端突破的可能性最大。/pp　　测序试剂、耗材、检测项目的开发，国内企业已经开始有所布局。/pp　　2014年7月，华大基因的新一代测序产品也获得了CFDA的批准，包括BGISEQ-100、BGISEQ-1000，以及胎儿染色体非整倍体(T21、T18和T13)检测试剂盒。/pp　　2014年11月5日，国家食品药品监督管理总局批准了达安基因的基因测序仪和胎儿染色体非整倍体21三体、18三体和13三体检测试剂盒(半导体测序法)医疗器械注册。/pp　　2015年4月，贝瑞和康的基因测序仪(NextSeq CN500)，以及胎儿染色体非整倍体(T13/T18/T21)检测试剂盒已通过国家食品药品监督管理总局(CFDA)的批准。NextSeq CN500基因测序仪是贝瑞和康与Illumina公司合作，为满足中国临床需求而设计制造的一款新型高通量的基因测序仪。/pp　　3.3 中游：第三方测序服务机构和生物信息分析(数据分析)，数据分析是目前行业发展的瓶颈环节/pp　　Illumina推出HiSeq系列高通量测序仪后，终端的数据分析成为行业发展的瓶颈。由于数据库是决定检测比对结果准确度和精确度的重要因素之一，因此是数据分析软件提供商主要的竞争壁垒之一。/pp　　strong测序服务——中国成为全球“测序工厂”/strong/pp　　测序服务技术壁垒较低，主要面向科研市场，国家缺乏准入标准和质量控制规范，众多碎片化的小企业呈现疯狂生长的状态，仅提供一代测序服务的企业就有上百家。/pp　　在二代测序方面，2010 年高通量测序平台中国拥有量仅次于美国，如今二者的差距很可能已经非常小。/pp　　全世界规模最大的基因组研究中心有多个在中国，其中华大基因(BGI)拥有世界上最多的新一代测序仪，产能约占全球的10%-20%(按illumina，Life 等销总量计算)。/pp　　国内主要第三方基因测序机构覆盖的基因检测相关服务/pp style="TEXT-ALIGN: center"img title="6.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201509/noimg/fa6f668d-23b5-4dc4-b135-344357da6730.jpg"//pp　　测序服务本身壁垒较低，未来会出现超大规模的第三方检测工厂，出现基因测序界的富士康，实现规模效应。/pp　　科技服务仅约10亿元的外包市场，企业未来转型的出口是健康管理、医院、独立体检中心。因此有越来越多的科技服务测序公司在转向做第三方医学检验所。/pp　　临床测序有三个主体，第三方医学检验所、医院和体检中心，前者更加市场化，未来发展空间较大。/pp　　strong生物信息分析——挑战与机遇并存/strong/pp　　基因测序所生成的原始数据并不能反映任何有价值的信息，必须通过专业人员进行分析和解读。现今的生物信息分析涉及的数据存储、解读、及共享是整个基因测序行业目前面临的最大难题，主要原因一是来自于数据量的庞大，二是源于数据的复杂性。/pp　　目前这一市场份额基数较小，蕴含着巨大的市场潜力。关注国内企业在这方面的的机会。/pp　　数据解读已被全球公认为是比测序还要重要的环节，分析和解读可能会成为中国企业的优势。但短期只能烧钱看不到回报，门槛是数据库，这是限制企业数量和规模的主要原因。/pp　　生物信息的所有权和应用领域，目前仍以科研为主，商业化应用瓶颈在于伦理和政策，但随着市场培育的加快，政府和保险的参与，基因组信息未来将归个人所有，政府负责建立数据中心和安全中心，授权个人对数据的使用权。/pp　　数据解读服务的市场格局将分为两大阵营：(1)、自行解读，有仪器研发和实力较强的大企业或科研机构会自己解读 (2)外包解读，中小企业、科研人员、医生个人则会交由第三方公司进行数据分析，因此市场对差异化的个性化的服务需求会增加，此类公司会越来越多。外包解读将催化产业不断涌现出各种创新服务模式。/pp　　至于数据库的建设，更看好通过市场化的竞争，由企业投资整合资源来积累数据的途径。/pp　　解读服务发展的催化剂在需求，落脚点在市场教育。数据库如果不用那就只是个数据库而已，没有附加价值。而医生和患者认识的基因越多，到更大平台去解读和挖掘数据的需求就越大，想要发现已知或未知疾病机理的欲望就越强烈，未来买单的将是保险公司。/pp　　3.4下游：二代基因测序的应用领域及其挑战/pp　　3.4.1 未来市场容量/pp style="TEXT-ALIGN: center"img title="8.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201509/noimg/efc92dca-dce1-4303-86e6-98083533e049.jpg"//pp　　根据Illumina的测算，基因测序的市场规模有200 亿美元左右。/pp　　其中，肿瘤学120 亿美元、生命科学50 亿美元(包括生命科学工具、复杂病症，农业基因以及影响因子和宏基因组)、生育和基因健康20 亿美元(孕妇和新生儿童的检测，以及基因健康)、其他应用10 亿美元。/pp　　目前，我国基因测序市场中，产前基因检测较为著名，如以国家规定的3500 元/次的费用计，按照我国每年2000 万左右的新生儿计算，产前基因检测市场能达到七百亿元人民币。/pp　　具体来看：/pp　　strong生育健康领域(应用相对成熟)/strong/pp　　新生儿出生缺陷不仅给家庭带来了沉重的复单，而且已经成为严重影响我国经济发展和人口素质的重要问题。一些特定的遗传性疾病往往在出生一定时间后才会表现出明显症状，因此初生儿早期的基因筛查能够帮助尽快在医学上进行早期干预，达到及早发现、及早治疗的效果。目前新一代测序技术在生育健康领域主要应用在以下方面。/pp　　●无创产前检测(NIPT)/pp　　无创产前检测即胎儿染色体非整倍体无创基因检测，是一种基于大规模平行基因组测序技术的高科技检测手段。这种检测只需抽取孕妇少量静脉血，分离其中的胎儿游离DNA，通过高通量二代测序技术平台测序，并对测序结果进行生物信息学分析，即可判断胎儿是否换染色体非整倍体疾病。该技术是国际人类基因组学研究成果被成功孵化的应用技术之一，在欧美等发达国家普遍开展。该法操作简单，易行，安全，准确，孕妇早期就可进行，更具有无创的特点，不会导至流产、胎儿宫内感染等不良后果。/pp　　无创产前检查不仅可以筛查唐氏综合症(21三体)，还可以筛查爱德华氏综合症(18三体)、帕特氏综合症(13三体)以及提示其他非整倍体型遗传病。/pp　　●胚胎植入前遗传学诊断(PGD)/pp　　也就是第三代“试管婴儿”，主要用于检查胚胎是否携带具有遗传缺陷的基因。它是在试管婴儿技术基础上出现的，精子卵子在体外结合形成受精卵并发育成胚胎后，在其植入子宫前进行基因检测，以便使试管婴儿避免一些遗传疾病。通过DNA检测技术对胚胎的染色体异常或者遗传性疾病进行诊断，选择无异常的胚胎植入母体，从根本上提高 “试管婴儿”的妊娠成功率，降低自然流产率，提高妊娠质量，并且可大大提高出生后婴儿的质量。/pp　　●新生儿单基因遗传病检测/pp　　单基因病是指由一对等位基因控制的疾病或病理性状。常见的单基因病有短指症、地中海贫血症、白化病、苯丙酮尿症、色盲、血友病、C6PD(葡萄糖-6-磷酸脱氢酶)缺乏症等。已知的单基因病的致病基因及遗传方式大部分已经明确，早起单基因遗传病大部分通过染色体核型分析进行检测，染色体和性分析不可避免的缺点是分辨率低，对技术人员的经验依赖度高，对于微小缺失或者基因突变导至的遗传病不能进行检测。现在通过先进的二代高通量测序技术可以对上千种由于基因变异(基因突变、平衡异位、微缺失等)导至的遗传病进行检测，并且可以在早期通过胎儿的脱落细胞或者绒毛膜进行检测，在产前确认胎儿是否患有遗传病，为遗传病携带者或者已经生育遗传儿的家庭提供明确的遗传咨询和产前检测，从而做到优生，提高人口素质。/pp　　strong肿瘤的个体化治疗/strong/pp　　肿瘤的发生发展中，基因的改变在其中居于中心地位，致癌基因的异常表达和抑癌基因失活，是肿瘤细胞无限制生长的分子基础。肿瘤临床表现多种多样，且发病率逐年升高，迄今尚无简单的治疗方法或使用单一药物能治愈所有的肿瘤。询证医学、诊疗规范化和个体化已经成为肿瘤治疗的公认趋向。/pp　　基因测序技术对于肿瘤个体化治疗主要有两方面应用：一是检测患者携带的肿瘤基因，二是检测肿瘤靶向药的靶点。/pp　　strong药物研发领域应用(CRO及医药公司)/strong/pp　　新一代测序技术早期主要应用在肿瘤和传染病治疗领域，现在越来越多的使用在新兴生物药的开发和疫苗生产。目前药物研发部门使用的各种高通量技术，例如基因芯片、代谢组学建模、酵母双杂、蛋白质组学、高通量化学筛选、电子杂交定位，有望被新一代测序技术替代或作为补充。/pp　　strong个人DNA信息咨询/strong/pp　　近几年兴起的直接面向用户(direct to consumer)的个人DNA信息咨询产业其实是基因检测市场化产物，基本模式是利用互联网和快递寄送，将检测试剂盒送至用户手中，再由其将采集的唾液及送回公司，并从中提取用户的DNA，检测结果也可直接从网上查询获取。/pp　　3.4.2 在应用领域主要趋势及挑战/pp　　业界认为，基因测序技术应用市场的先后顺序：无创产前筛查(NIPT)、癌症的个体化用药、癌症早筛、人人基因组、检测与筛查。/pp　　其中，植入前胚胎遗传学诊断(PGS/PGD)30 亿市场、产前筛查与诊断(NIPT)160 亿市场、肿瘤诊断与治疗千亿市场。此外，目前已经试点的方向，并不能说明技术已经很成熟，相反有些还很不成熟，需要通过很长时间的试点来积累样本和数据。未来可能的试点方向包括，免疫系统疾病、移植类疾病配型检测、传染病检测、公共卫生领域等都有可能。/pp　　strong生育健康领域/strong/pp　　NIPT 作为公认的第一个产业化项目，市场格局基本形成华大和贝瑞占90%的市场份额，包括108 家试点单位及其他中小医院。/pp　　NIPT进入壁垒目前只是渠道/pp　　1、测序成本和客户体验，如果成本降到目前的1/10，或客户体验有颠覆性改变，都能形成替代，但短期还看不到 /pp　　2、测序服务上，主要是产科医院的渠道壁垒。/pp　　strong肿瘤诊断领域/strong/pp　　目前的第二大应用，未来有可能成为第一大应用领域，个性化用药、靶向治疗、早诊是必然的发展方向，空间很大，但短期内还达不到无创的市场高度。/pp　　(1)肿瘤是多基因病，没有标准的用药方案，需要个性化治疗，并且机理尚未厘清，医院更倾向于自己做，不容易商业化。/pp　　(2)从基于组织到基于血液的肿瘤诊断，对医生而言需要有至少五年的市场培育过程，病种的增加则受制于样本量的积累。/pp　　(3)肿瘤的早诊，技术上，血液循环肿瘤细胞DNA(ctDNA)和循环肿瘤细胞(CTC)目前通过测序的检出率还很低，需求取决于人们保健意识的发展程度，未来可能成为健康保险的一个重要产品。/pp　　其他/pp　　其他应用领域主要的挑战：耳聋基因的筛查(检出率低，假阴性高)、罕见病筛查(无有效干预手段)、地中海贫血、靶向药物伴随诊断(尚无标准)。/pp　　2C 端的应用的挑战，需要有一个较长的市场教育和科普过程，并且受限于伦理和法律。/p

p　　高通量测序平台产生的读取数据大多比较短，容易丧失遗传学变异的相位信息，但有时候了解这样的信息是至关重要的。怎样才能拼接好这些短序列呢?这是测序分析进入的一个新阶段。/pp　　定相(Phasing)分析旨在确定测序读取彼此是如何连接的。对于人们广泛使用的短读取测序而言，定相分析一直比较困难。一般的定相方法依赖于计算机模拟，主要是与大型数据库或者参考基因组进行比较。也有一些新的高通量测序技术，尝试将单分子分配到标有条码的孔中。不过这些方法都存在这样或那样的缺陷。/pp　　瑞典皇家理工学院的Afshin Ahmadian带领研究团队开发了一种新的定相技术。他们开发了包括微珠和条码寡核苷酸的乳化PCR系统，通过单分子测序实现可靠的相位分析。这项研究发表在近期的Nature Communications杂志上。/pp　　乳化PCR(emulsion PCR)是一种在乳化溶液中进行的高通量PCR技术。该技术主要是把水相PCR溶液与油混合，建立微小的悬浮水滴乳液。每个液滴都是一个PCR“反应器”，可以实现平行的多重反应体系。/pp　　研究人员构建了一个连有微珠的引物文库，微珠上标记了条码序列。随后他们把微珠和单分子DNA放在一起，让目标序列与条码相连。“条码可以帮助我们确定一段序列是处于上游还是下游，”文章共同作者，David Redin说。/pp　　研究人员在四种已知基因组的细菌混合物和真实生物学样本中，验证了这一技术的有效性。研究表明，该技术用于短读取的测序平台，可以帮助人们研究复杂的样本，不损失长DNA的相位信息。/pp　　虽然乳化PCR需要一些经验和技巧，对初学者来说有一定的挑战。但这是一种比长读取测序还要精确的高通量技术，能够真正达到单分子分辨率，而且不受样品复杂性的影响。这一技术能够准确检测高度类似的序列区域，比如不同细菌的rRNA。/ppbr//p

中国医科院基础医学所基因测序和分析仪等采购项目中标公告　　采购项目名称： 中国医科院基础医学所基因测序和分析仪等采购项目　　项 目 编 号： GC-HG110431　　招 标 内 容： 科研仪器包号设备名称台（件）数1基因测序和分析仪12流式细胞仪23荧光显微镜及图像分析系统1解剖灌注台1全自动轮转式切片机1全自动细胞存活及细胞计数仪1　　招标公告发布日期： 2011年11月8日　　开 标 日 期： 2011年11月29日　　定 标 日 期： 2011年11月29日　　中标供应商名称：　　第二包：北京希尔诚兴业科技有限责任公司(丰台区小屯路10号，中标金额 4,595,500元)　　第三包：北京中润汇宝科技发展有限公司(海淀区羊坊店路6号天洋大厦B座6层，中标金额1,285,094元)　　合同履行日期： 2011年12月　　第一包因有效投标人不足三家做废标处理。　　评标委员会成员名单： 李利民、高宇辉、王荣福、王连元、汤宁、刘世亮、王友斌　　采购人名称： 中国医科院基础医学所　　地址：东城区东单三条5号　　联系电话： 65256546　　采购中心地址： 北京市西城区西安门大街22号院1号楼　　邮政编码： 100017　　项目联系人： 方宁　　联系电话： 83086361　　相关供应商对中标结果有异议的，可自本公告发布之日起七个工作日内书面提出。　　联系部门：办公室 联系电话：83087286　　感谢本项目所有投标人对中央国家机关政府集中采购工作的支持。　　特此公告。　　中央国家机关政府采购中心　　2011年12月5日

p　　近日，由深圳迈瑞生物医疗电子股份有限公司生产的516台全自动化学发光免疫分析仪〔注册号：国械注准20173400696(CL-2000i)、注册号：国械注准20153401280(CL-1000i)〕主动召回。/pp　　召回原因：由于部分产品的反应杯压头在使用过程中存在潜在脱落的风险。/pp　　深圳迈瑞生物医疗电子股份有限公司报告，由于部分产品的反应杯压头在使用过程中存在潜在脱落的风险，深圳迈瑞生物医疗电子股份有限公司对其生产的全自动化学发光免疫分析仪〔注册号：国械注准20173400696(CL-2000i)、注册号：国械注准20153401280(CL-1000i)〕主动召回。召回级别为三级。涉及产品的型号、规格及批次等详细信息见《医疗器械召回事件报告表》。/pp style="text-align: left "　　附件：医疗器械召回事件报告表/pp style="text-align: right "　　2018年4月8日/pp style="text-align: center"/pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201804/insimg/0bc56055-1ccb-412f-8efc-da82dd66b6ac.jpg" title="2018-04-10_135851.jpg"//pp style="text-align: center "br//p

近日发表在《自然方法》杂志上的一篇新论文中，美国加利福尼亚大学圣克鲁斯分校（UCSC）的研究人员介绍了有史以来第一种使用“泛转录组”分析全基因组RNA测序数据的方法。分析一个人的基因表达需要将他的RNA图谱映射到一个标准参照物，以深入了解基因在多大程度上“开启”并在体内发挥功能。但当参照物不能提供足够的信息来进行准确映射时，研究人员可能会遇到问题，这被称为参照偏差。由UCSC生物分子工程副教授本尼迪克特帕特恩领导的一组科学家发布了一个工具包，允许研究人员将个人的RNA数据映射到一个更丰富的参照物上，解决参考信息的偏差，并带来更准确的映射。研究人员表示，泛基因组和转录组的结合在此前从未真正完成过，这是第一次有人尝试将泛基因组作为RNA测序图谱的标准特征。该工具将帮助世界各地致力于通过RNA测序分析了解基因表达的研究人员。“有了这个工具包，我们正在利用从泛基因组获得的更多样化的数据来改进基因表达数据的测量，这一点在个体之间可能会有很大的差异。”帕特恩说，“这样做的目的是让人们在关注基因表达的研究中感受到更多样化的数据的影响，从而更好地分析细胞模型、有机体模型和其他研究应用。”绘制RNA测序数据以了解基因表达可能很困难，因为RNA序列是由细胞机制拼接而成的，这意味着一组RNA数据可能来自基因组的非连接区域，这使得将它们正确地与参照物对齐成为一种挑战。这些剪接点在人类群体中因人而异并不统一，也很难知道RNA来自哪个单倍型。利用新的开源工具，研究人员可获取个体RNA的拼接片段，绘制它们在泛基因组上的排列位置，确定数据属于哪种单倍型，并分析基因表达。

01 珀金埃尔默 BioQule NGS 系统6月6日，PerkinElmer宣布推出仅供研究使用的 (RUO) BioQule NGS 系统——一种自动化台式NGS建库解决方案，该系统一次最多可制备 8 个样品的文库。BioQule NGS 系统将自动热循环、通过光学量化的集成质量控制和强大的液体处理技术整合到一个设备中，使研究人员能够生成高质量的 NGS 文库，在需要基因组分析的各种应用中产生可靠、可重复的结果。BioQule NGS系统内置的定量模块可对其自身生成的文库进行自动定量。BioQule NGS系统使用的方法程序和试剂盒是预开发和预验证的，整个系统可以由用户直接安装、设置和运行，无需专门供应商的支持。02 罗氏诊断-AVENIO Edge System全自动NGS建库工作站去年11月，罗氏诊断中国宣布重磅推出AVENIO Edge System全自动NGS建库工作站，这是目前市场上唯一集文库制备、靶向探针捕获和文库质控于一体，实现“样本进，结果出”的NGS建库工作站，在提升检测质量、简化运行程序及改善管理效率等方面享有显著优势和价值，开创行业新标准。03 华大智造-肿瘤自动化建库系统MGISP-100MGISP-100自动化样本制备系统是由华大智造自主研发的一款专注于二代测序领域的自动化工作站，具有功能全面、经济高效、运行稳定、可拓展性强的特点，适用于广大中小型实验室采用。系统采用集成化设计，覆盖实验全流程，预置高精密移液系统、PCR仪、磁珠纯化模块、温控设备等功能模块，以及全面的防污染设置，支持定制化开发。整套系统建库时间短，可对样本进行批量自动化操作，省去了繁琐的重复步骤，能有效减少人为误差，提高NGS文库制备的稳定性和诊断精度，有效降低总成本，全面提升实验室整体工作效率。04安捷伦-Magnis NGS Prep全自动系统2019年，安捷伦发布二代测序(NGS)文库制备系统——Magnis NGS Prep全自动系统。该系统专为分子实验室设计，系统设计简单，只需按一下按钮就可以进行复杂的DNA测序分析。全自动Magnis NGS Prep系统能够分析混合基因组分和复杂基因突变，包括由于福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)导致的DNA降解。Magnis系统为NGS文库制备提供了一套完整的解决方案。该系统尽可能的缩短了复杂NGS建库时间，实现操作完全自动化。05 微岩医学-PathoLab 自动化提取建库系统微岩医学自主研发的PathoLab 自动化提取建库系统，适配多样本类型，4h即可完成24通量样本的核酸提取和文库构建操作，完美适配一张测序芯片。仪器兼备全外排通风、顶端过滤及封膜设置，适配定制化无菌试剂盒，层层防止外部污染，确保检测结果高准确度！且兼具安全性、报警功能及进度条提示等人性化操作界面，可全面提升实验室整体工作效率！06杰毅生物-NGSmaster病原宏基因组一站式建库仪杰毅生物通过数年的研发推出了NGSmasterTM全自动一站式建库仪，涵盖了核酸提取、文库构建、文库纯化等所有NGS上机测序前的所有工作，样本在一个封闭式空间操作，最大程度降低了操作空间的气溶胶污染宏基因组项目，对于后期的解读帮助很大。07 思路迪-ANDiS自动化封闭式建库仪思路迪自动化封闭式建库仪ANDiS 400采用集成化设计，覆盖NGS文库制备全流程，预置高精度移液系统，温控设备，二维码扫描仪，微电脑控制系统等功能模块；搭配全封闭设计卡盒，实现全自动化文库制备。该仪器还可提高NGS文库制备的稳定性和诊断精度，有效降低总成本，全面提升了实验室整体工作效率。ANDiS 400目前的应用范围广泛，其配套建库卡盒可覆盖国内外实体肿瘤临床指南推荐检测的基因变异，可应用于肺癌、胃肠癌、乳腺癌、卵巢癌等多个瘤种的靶向治疗免疫治疗及化疗用药指导。08 燃石-全自动文库制备系统Magnis BR2019年，燃石在中国病理年会卫星会上发布了一款新产品——NGS全自动文库制备系统Magnis BR。Magnis BR是中国首款可支持探针捕获法的NGS全自动文库制备系统，在检测通量上的灵活性以及检测流程的自动化程度上均超越了既有的NGS自动化解决方案。09 墨卓生物-NOVA—MobiNova-100高通量单细胞建库系统墨卓MobiNova-100单细胞测序建库系统，基于分子标签（barcode）的单细胞识别，利用独家专利的标签和油包水技术，通过优化微流控芯片的设计和仪器控制，在液滴生成时稳定实现细胞分离和微球、试剂、细胞的共包裹达到较高的细胞捕获率。DBS-LibPrep是一台自动化建库仪，是以数字化微流体技术为核心的文库制备系统，将温度控制、磁珠控制、PCR等操作有机结合起来，让每个实验室迈入无人值守的文库制备新时代。针对不同的建库试剂盒流程，衡芯生物可以为客户提供自主研发和生产的DBS-LibPrep建库芯片，下图是DBS-LibPrep芯片和芯片上不同的反应区。

测序技术在几十年发展历程中不断吸收其他领域的技术，如物理领域的纳米技术和激光技术，化学领域的荧光标记核苷酸技术，生化领域的毛细管先用分析技术和信息领域的高密度芯片技术，并将他们融为一体，形成了现代科学研究中的强力工具。测序技术和生物信息学得迅速发展进一步扩大了基因测序在临床诊断领域的应用，其在家庭和消费级基因检测领域的应用落地持续发展推进。NGS关键技术在国外企业手中 国产企业艰难发力自2010年开始，中国整个基因测序行业的市场规模一直处在高速发展阶段，中位同比增速达40%。据估计，2020年国内基因测序市场规模近140亿元。考虑到国内人口数量带来的巨大红利，基因测序产业在中国发展潜力巨大。基因测序仪是基因检测产业链上游仪器平台，对仪器设备研发企业来说，实际创造大量利润的却是与设备配套的耗材和试剂。垄断测序仪与配套试剂耗材的企业具有“绝对话语权”。2014年Illumina试剂提价，曾导致华大基因利润急速下滑，年底其净利润增长率为-79.3%，可见上游设备生厂商对中游服务提供商的影响力之巨大。与其余仪器设备不同，由于研发技术门槛较高，上游基因测序仪厂家数量很少。据统计，目前全球范围内的 NGS 基因测序仪不足 8000 台，分布于 60 多个国家和地区，其中 Illumina 公司的 HiSeq 2000、Genome Analyser 2x、MiSeq 和 NextSeq 等测序平台市场份额占比高达 83.9%；赛默飞的 SOLiD、Ion Torrent 和 Ion Proton 等测序平台市场份额占到 9.9%；Roche 公司的 454 平台市场份额占比 5.3%。Illumina 和 Thermo Fisher 设备占比超过 90%，上游基因测序设备制造已形成垄断。近年来，国产企业开始发力基因测序上游，涉足基因测序仪器研发。出现诸如华大智造、真迈生物、中科紫鑫、塞纳生物、齐碳科技等几家具有自主研发能力的国产基因测序仪企业。其中华大智造无疑是佼佼者。华大智造DNBSEQ-T7基因测序仪（原名MGISEQ-T7） 国产华大基因在2013年反向收购美国测序上市公司CG，之后设立华大智造专注国产基因测序仪研发。近几年华大智造发展迅猛，市场占有率不断提高，据华大智造，公司占据了中国二代测序(NGS)35%的市场份额。但下游应用企业平台迁移成本巨大，目前国产二代测序厂商发展依然面临巨大压力。二代测序辉煌十载 三代测序引领未来DNA测序技术起源于上世纪70年代，Sanger提出了双脱氧核苷酸末端终止法，同年A.M.Maxam和W.Gilber也提出了化学酶解法，第一代测序技术诞生。2005年，454 Life Sciences公司开发出全球第一台商业化边合成边测序测序仪，第二代测序仪诞生，由此拉开了基因产业发展的序幕。2008年，Helicos Biosciences推出了首台单分子测序仪，标志第三代测序技术来临。尽管三代测序未来前景可期，当前全球基因测序行业的基石依然还是第二代基因测序仪。单分子实时测序和纳米孔测序这两种技术在当下长读长测序领域占据主导地位。SMRT 和纳米孔测序技术分别于 2011 年和 2014 年商业化发布，目前 SMRT 技术的主要拥有者为 Pacific Biosciences，纳米孔测序技术则由牛津纳米孔领衔，中国的齐碳科技也于 2020 年 9 月发布了首款自主研发的纳米孔测序仪 QNome-9604。赛默飞、Illumina势均力敌 Miseq系列为最大赢家进入21世纪，基因测序技术已经进入遍地开花的阶段，层出不穷的新应用接踵而至，而基因测序仪也已经开始进入寻常百姓家，为广大科研单位和企事业单位提供了坚实可靠的仪器工具。根据全国大型共享科学仪器平台显示，全国有近600台基因测序仪可供共享借用。其中北京、上海成为共享数量最多的地区，超共享基因测序仪总量三成。仪器信息网对北京地区的共享基因测序仪用户单位、仪器型号及学科领域进行了分析。测序仪应用学科领域分布共享测序仪单位包括北京大学、中国农业大学、清华大学这样的高校，也包括中国检验检疫科学研究院、北京市心肺血管疾病研究所、北京生命科学研究所等科研机构，亦有公安部物证鉴定中心等政府部门。其中测序仪在生物学领域的研究与应用占比最高，为41.2%，其次是医学领域，占比为27.1%。此外还包括农学、林学、畜牧兽医、法医等基因测序科研和典型应用领域。共享测序仪品牌分布有意思的是，在北京地区所有共享基因测序仪品牌中，赛默飞占比略超测序巨头Illumina，以41.9%的占比险胜位居第一。Illumina以39.5%的占比紧随其后，位列第二。赛默飞旗下Life Technologies早年生产的SOLiD 4、Ion Torrent、3500XL、Ion PGM等成为测序仪的经典机型，在应用市场颇受用户认可。共享测序仪型号分布共享基因测序仪型号近30种，多为二代测序，一代测序也有部分。共享数量最多的前十个型号分别为MiSeq、Hiseq 2000、3130XL、PyroMark、3500、Ion Torrent、GeXP、3500XL、3730和NextSeq 500。Miseq系列基因测序仪在共享单位中使用量最多，能占到15.5%，用目前一句潮流的话来说，Illumina的Miseq系列基因测序仪是YYDS（永远的神）。MiSeq采用可逆链终止物和合成测序法，于2018年正式在中国发布，也是Illumina唯二拥有的NMPA测序仪产品之一。单个仪器上整合了扩增、测序和数据分析的新一代测序仪，每次运行能产生超过1 Gb的数据，且占地面积仅为2平方英尺。具有革命性的流程和准确性，这让它成为快速且经济高效的遗传分析的理想平台。Hiseq2000是Illumina于2010年推出的二代测序仪。其测序原理与Genome Analyzer II测序系统相似，仍采用可逆终止法的边合成边测序技术。该技术通过将基因组DNA的随机片断附着到光学透明的表面，这些DNA片断通过延长和桥梁扩增，形成了具有数以亿计cluster的Flowcell，每个cluster具有约1000拷贝的相同DNA模板，然后用4种末端被封闭的不同荧光标记的碱基进行边合成边测序。这种新方法确保了高精确度和真实的一个碱基接一个碱基的测序，排除了序列方面的特殊错误，能够测序同聚物和重复序列。Hiseq 2500是Hiseq 2000的升级版。3130xL-3730xL是赛默飞旗下Life Technologies 早年发布的一代基因测序仪产品。采用桑格-毛细管电泳测序法，具有高读长，准确度一次性达标率高，能很好处理重复序列和多聚序列。但其通量低，样品制备成本高，使之难以做大量的平行测序。其余型号不再作一一分析。需要说明的是，许多共享的基因测序仪采购年份较久远，甚至有2002年采购并启用的仪器设备，所以以上数据不能代表现今测序市场的份额占比，结果仅供读者参考。附：基因测序仪专场

全自动啤酒分析仪、全自动啤酒分析测定仪、啤酒分析仪、啤酒成分分析仪促销3个月啤酒分析仪、全自动啤酒分析仪、啤酒成分分析仪、进口啤酒分析仪、全自动啤酒分析仪为了感谢广大客户对德国Funke Gerber全自动啤酒分析仪产品质量的肯定，现对Fermento型全自动啤酒分析仪现实促销优惠出售，欢迎新老客户前来选购。活动时间2014年8月1号-2014年11月1号啤酒分析仪介绍：Fermento啤酒分析仪是在实践中深受好评的新一代全自动啤酒分析仪。这款彻底改良后的仪器突出的特点是不锈钢外壳明显变小，同时配备了带有五个按键、操作方便的大型显示屏，两分钟之内就能同时完成酒精度、真正浓度、外观浓度、原麦汁浓度和密度的检测，测量精度达0.01%。啤酒样品仅需预先除气，全部测量结果可通过显示器、打印机以及一个串行口输出（RS232）。 仪器的校准采用一种已知内容物含量的参比啤酒进行，该仪器能够存储20种参比啤酒（例如：皮尔森啤酒、麦芽啤酒和强烈啤酒等）的数据，您仅需将各种参比啤酒的指标输入仪器，所有内容物质（酒精、原麦汁浓度和浸出物等）的校准便可一步完成。全自动啤酒分析仪技术参数测量范围 酒精： 0 － 15 %原麦汁浓度：0 － 20 %真正浓度： 0 － 10 %外观浓度： 0 － 10 %密度： 0.95 － 1.05g/cm3测量时间 2分钟左右（包括进样）样品体积 每次测量约12 - 20 ml左右脱过气的啤酒样品处理速度：快速模式可达100个每小时，精确模式为60个每小时样品量：10ml 全自动啤酒分析仪界面： 仪器带有一个打印机平行接口，可以连接标准打印机。在标准配置中也已经包含了一个打印机，另外仪器还带有RS232接口。电源：230/115V ，50/60HZ，180W尺寸：30x24x33 cm (W x H x D)啤酒分析仪重量：大约5kg联系人：张先生 地址： 南京市秦淮区刘家岗84号[210006] 电话： 025-87163873 18913964277 传 真： 025-87163873 Email：suhua1985@126.com 公司网址：http://mingao.instrument.com.cn

2013年2月28日，由Life Technologies主办的2013年大中华区测序与基因分析高峰论坛(Genetic Analysis Solution Summit)在深圳隆重召开。这次一年一度的会议，汇集了最尖端的基因测序仪器及技术，来自海内外各地相关领域的专家和学者汇聚一堂，在此次大会上各抒己见，对测序和基因分析的热点话题进行了分享和讨论。　　2013年，既是DNA双螺旋结构被发现60周年，也是PCR被发明30周年。此次论坛便以这两个划时代的发现作为主题，纪念这些划时代的突破。Life Technologies旗下的Ion Torrent在此次会议上发布了最新Ion Torrent ProtonTM的数据。另外，不同领域的13位国内外嘉宾纷纷分享了使用Ion Torrent PGMTM(Personal Genome Machine，个人化操作基因组测序仪)在来自植物、细菌、心血管和肿瘤等领域的例子。而Ampliseq试剂盒在使用中显现出快速、准确、高效、定制等优势，受到研究人员的一致好评。PGM所具备的快速、精准、可定制的特点，也在科研领域显示出了不可估量的应用潜力。　　除了Ion Torrent 以外，Life Technologies旗下Applied Biosystems另一款全新产品也在此次会议上闪亮登场。Life Technologies高级产品经理Giambattisa Selvaggi在此次会议上隆重推出今年将要推出的QuantStudioTM 3D。作为今年的全新产品，QuantStudio TM 3D在一次运转中可以读取多达2万个数据，满足了大多数数字PCR应用的需求。此外，以芯片为基础的平台也最大程度地避免了DNA的丢失和样品的污染，为科研的准确性和效率提供保障。　　会议上，来自全球各地下一代测序领域的专家云集一堂，交流了在使用Ion Torrent和QuantStudio产品后的心得和成果。会上内容精彩，互动热烈，在场听众对Life Technologies的产品表现出了浓厚的兴趣和好感。　　来自海内外的学者嘉宾欢聚一堂，合影留念 　　Life Technologies大中华区销售总监Dale Patterson先生在大会讲话　　　　会场内学者云集，全神贯注　　 　　Life Technologies大中华区市场部总监赵瑞林博士为大会开幕致辞　　 　　到会学者嘉宾在Ion Torrent 样机前合影