组氨酸单盐酸盐单水化合

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  • 使用共价标记质谱区分组氨酸互变异构体
    大家好,本周为大家分享一篇发表在Anal Chem.上的文章,Distinguishing Histidine Tautomers in Proteins Using Covalent Labeling-Mass Spectrometry [1]。该文章的通讯作者是来自马萨诸塞大学阿默斯特分校的Richard W. Vachet教授。组氨酸是人体蛋白质结构中的重要组成氨基酸,研究发现,组氨酸具有Nδ-H和Nε-H两种互变异构体,通过两种互变异构体的转换,可以在蛋白质中介导质子转移。目前常使用2D NMR技术进行区分,但操作相对繁复。共价标记质谱是一种研究蛋白质结构的有力方法,具有操作简单,灵敏度高,结构分辨率高等优点。在本文中,作者尝试以焦碳酸二乙酯(DEPC)为标记试剂,采用共价标记质谱区分组氨酸互变异构体。组氨酸侧链的咪唑上具有两个氮原子,其中一个氮上的孤电子对参与芳香环π键的组成,而另一个氮原子仍保留孤对电子,更容易与DEPC等亲电子试剂反应。而组氨酸的两个互变异构体中都只有一个保留孤对电子的氮原子,且该氮原子位置不同,Nδ-H互变异构体中的Nε2与DEPC反应,而Nε-H互变异构体中的为Nδ1。因此以DEPC标记组氨酸以区分两个互变异构体的方法是可行的(图1)。图1. DEPC 结构及其与两种不同组氨酸互变异构体的反应 为了测试DEPC 标记区分两种互变异构体的能力,作者以几种含组氨酸的肽,在确保DEPC仅标记组氨酸条件下进行实验。以Fmoc-DGHGG-NH2为例子,该肽在N端包括一个Fmoc基团以确保仅标记组氨酸。采用等度洗脱来最大限度地利用LC分离两种异构体,并确保流动相组成不影响肽段电离效率,从而可以更好地量化每个互变异构体的比率。结果发现,在11.4和13.6分钟洗脱的峰具有相同的m/z值(图2)。根据串联MS数据,发现这两个峰代表着组氨酸上成功标记DEPC的单一物质(图3)。并且,这些同量异位离子的串联质谱不同,表明这两种物质为带有不同组氨酸互变异构体的物质。作者将先洗脱出的物质命名为修饰物质1,后洗脱出的为修饰物质2。根据MS/MS数据,两者的主要区别为修饰物质2具有更加丰富的羧基化a3离子(a3*)。图2. 未标记(蓝色迹线)和 DEPC 标记(红色迹线)肽 Fmoc-DGHGG-NH 2的提取离子色谱图。DEPC浓度比肽浓度高10倍,反应1分钟图3. 两种修饰的His异构体的串联质谱。(a)来自图2中的色谱图的修饰物质 1 的串联质谱。(b)来自图2中的色谱图的修饰物质2的串联质谱。标有星号 (*) 的产物离子包含羧基化产物此外,在重复实验中,作者发现物质2与物质1的丰度比为3.9± 0.2。而研究发现,在中性pH条件下,游离氨基酸Nε-H 互变异构体与 Nδ-H 互变异构体的比接近于4:1。因此,两物质的峰面积比表明物质1可能为 Nδ-H 互变异构体,而物质2可能为 Nε-H 互变异构体。结合以上发现,并考虑肽解离途径等因素,作者对两物质质谱图谱差异做出推测。当物质2为Nε-H互变异构体侧链时,DEPC 标记在Nδ1上,有利于肽通过bx-yz途径解离,随后通过bx-ax途径损失CO,因此物质2富含a3*离子。当物质1为Nδ-H 互变异构体时,DEPC 标记在Nε2上,肽通过组氨酸途径解离,并形成了稳定五元环,因此优先形成更稳定的b3*离子(图4)。以上发现进一步证明了Fmoc-DGHGG-NH2中物质1为 Nδ-H 互变异构体,物质2为 Nε-H 互变异构体。根据丰度比以及肽解离途径不同,作者在其他模型肽标记实验中也成功区分两互变异构体。由于组氨酸的pKa在一定程度上会影响互变异构体的比例,因此两互变异构体的丰度比可能会略有变化。总之,以上结果表明,DEPC共价标记质谱可以识别两个组氨酸互变异构体。图4. DEPC 标记的含组氨酸肽 CID 过程中两种异构体的肽片段化途径。左侧通路为物质1(Nδ-H互变异构体),右侧通路为物质2(Nε-H互变异构体)之后,作者还进一步研究了不同DEPC浓度对实验的影响。结果发现,在 DEPC 浓度范围超过一个数量级时,Fmoc-DGHGG-NH2的两种修饰形式的比率基本在4左右保持恒定,其他模型肽的比率略有不同(图5),但随着 DEPC 浓度的增加,给定肽的标记比率保持不变。在质谱可以确认互变异构体结构的肽中,Nε-H互变异构体总是丰度相对更高,洗脱相对较晚。此外,作者发现当组氨酸不是位于N末端残基时,Nε-H 互变异构体的an */bn *比率总是比Nδ -H 互变异构体的更高。但是,若组氨酸残基位于肽的N末端时,在质谱中观察不到b1和a1离子,将对结果造成影响。图 5. 在 DEPC 浓度增加时选择肽的两种修饰形式的标记比率。(a) Fmoc-DGHGG-NH2;(b) Ac-IQVYSRHPAENGK(Ac);(c) Ac-VEADIAGHGQEVLIR;(d) Ac-LFTGHPETLEK(Ac)。MS/MS 用于通过测量an /bn离子的比率来确认每个互变异构体总而言之,作者成功使用DEPC共价标记质谱区分肽与蛋白质中的组氨酸互变异构体,利用丰度比与洗脱时间,以及CID期间的肽解离模式,区分两种互变异构体。利用该方法,作者团队已经确定了几种蛋白质组氨酸互变异构体比率,并且相对于2D NMR方法,该方法更简单、更快、更精确,有利于探索蛋白质中组氨酸残基周围的局部结构,提供高分辨率的结构信息。[1]Pan X, Kirsch ZJ, Vachet RW. Distinguishing Histidine Tautomers in Proteins Using Covalent Labeling-Mass Spectrometry. Anal Chem. 2022 Jan 18 94(2):1003-1010.
  • 药用辅料解决方案
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组氨酸单盐酸盐单水化合相关的仪器

  • 测量原理OTT ecoN使用硝酸盐在特定波长下的分光度方法,该方法由光度计测量,然后转换为硝酸盐浓度的测定。传感器由关键光学元件组成,包括氙气闪光灯光源、透镜系统、滤波器和光电二极管。硝酸盐浓度与通过介质的剩余光强度成正比。OTT ecoN传感器使用212nm光的吸收来检测NO3-N。结合254nm和360nm处光谱的吸收程度,用于修正有机化合物和浊度的影响。氙气闪光灯充当宽带光源,光束首先通过初始透镜系统,接着通过光路中的测量介质(水),然后通过第二个透镜系统,最后由三个探测器接收。这三个探测器是配备波长特定滤波器的光电二极管。波长为212nm的光束根据测量介质中的硝酸盐含量衰减。光路前的参考二极管确定未衰减的光输出,用以补偿光源输出的波动或衰弱。在254nm和360nm波长下测得的额外衰减,也使OTT ecoN能够补偿水中有机物的干扰和浊度影响。应用行业湖泊和水库溪流地下水含水层硝酸盐增减变化研究学术研究监管监督湿地管理仪器特点● 智能光学技术,提供可靠稳定的数据● 浊度和溶解有机物干扰的补偿技术● 防污刮刷设计,降低污染物造成噪声数据的可能性● 镜片上的纳米涂层可减少生物污染,延长使用寿命● 无需每年进行工厂校准,从而降低维护成本● 使用超纯水即可验证零点● 集成 RS485 和以太网接口● 支持web服务,无需安装软件即可访问和管理仪器● 精密高质量不锈钢结构,坚固耐用● 根据水质不同,选用不同光学路径长度的型号
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  • Fractogel®介质为基于合成甲基丙烯酸酯的聚合物小球,提供优良的压力稳定性,从而能够采用高流率。视您的应用而定,我们可提供中等大小的M型填料(粒度40-90 µm)和较小的S型填料(粒度20-40 µm)。Fractogel®介质的独特组成,是纯化策略的有力工具。触手是长线形的聚合物链,携带功能配位体。全部触手与Fractogel®介质的羟基以共价键连接。该构型提供了高表面积,使生物分子不受空间位阻,与可及的配位体结合。许多配位体可用于各种层析应用(包括离子交换、亲和、疏水性相互作用和分子筛)。优点:- 更佳的产品收率官能团与目标分子之间的空间位阻最小,更易接触。与常规方法相比,触手介质提供了更高的结合力,特别是对于大型蛋白质、抗体、病毒和质粒。由于目标分子的结合更紧密,使用Fractogel®离子交换介质的捕获步骤,常比其他介质更高效,从而有更大的总收率。- 更安全的产品与基于碳水化合物的介质不同,Fractogel®介质不易为微生物降解。因此,内毒素污染风险大大减少。此外,Fractogel®介质可以多次清洁,也延长了其使用寿命。- 更低的运行费用由于Fractogel®介质的优良化学耐受性,循环次数可以很高。介质寿命极长,更换频率降至最低,从而减少了运行费用。分类:- 用于离子交换层析的Fractogel®介质可以实现从各种来源(例如细胞培养上清液、微生物表达系统、血浆等)中分离天然和重组蛋白质;有效地纯化肽和低分子量物质;DNA、内毒素和HCP,获得优良的对数减少值;安全去除病毒;很适合于有效纯化单克隆抗体。E.g., Fractogel® EMD TMAE, Fractogel® EMD TMAE Hicap, Fractogel® EMD DEAE, Fractogel® EMD SO3, Fractogel® EMD SE Hicap, Fractogel® EMD COO-, etc.- 用于金属螯合亲和层析的Fractogel®介质Fractogel® EMD Chelate选择亚氨基二乙酸作为功能亲和配基,非常适合于金属离子配位作用。金属离子的自由配位点,被用来与各种蛋白质和肽结合。适合于分离重组、组氨酸标签蛋白质;可应用于肽的分离、柱内的在位复性。- Fractogel® EMD BioSEC分子筛填料Fractogel® EMD BioSEC是基于交联聚甲基丙烯酸的分子筛层析填料,机械稳定性强,化学稳定性好,适合生产规模,可应用于精致纯化。更多信息,e.g., 详细参数,填料、预装柱货号信息等,可参见本页面核心参数 – 样本下载中的资料手册。
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  • 连华科技硝酸盐氮测定仪LH-NO33H型功能特点:1.浓度直读:快速、准确测定水中硝酸盐氮含量,浓度直读;2.液晶显示屏:高清晰度彩色液晶显示屏,人性化操作提示,使用更简单;3.数据打印:热敏打印设计,可打印实验数据及存储的数据,使全部实验过程简单、准确易操作;4.比色方式:管比色设计,使测定更加简便;5.配备耗材:配备完善的专业耗材试剂,测量更加准确、方便、快捷;6.显示模式:大、小字体显示模式自由切换,显示数据更清晰,参数更详细;技术参数:主机仪器名称硝酸盐氮测定仪产品型号LH-NO33H测定范围(0-100)mg/L(分段)检出限0.02mg/L准确度±10%光学稳定性≤±0.005A/20min光源寿命10万小时曲线数量99条(90条常规曲线,9条拟合曲线)存储数量1.2万个显示屏3.5寸高清晰彩色液晶显示屏操作界面全中文显示比色方式ф25mm比色管比色打印机热敏行式打印机数据通讯口USB接口、红外(选配)环境温度(5-40)℃环境湿度相对湿度≤85%RH(无冷凝)额定电压AC220V±10%/50Hz额定功率20W
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组氨酸单盐酸盐单水化合相关的耗材

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