推荐厂家
暂无
暂无
雷公藤红素(celastrol)主要来源于卫矛科雷公藤属的雷公藤Tripterygium wilfordii Hook. f.,同时也存在于南蛇藤、独子藤等植物中[1],蜂蜜中也有发现[2]。雷公藤多生于背阴多湿的山坡、山谷、溪边灌木林中,主要分布于中国东南沿海等地,朝鲜、日本亦有少数分布。雷公藤始载于《本草纲目拾遗》,在我国具有悠久的药用历史,以根入药,味苦、辛,性凉,有大毒,具有祛风、解毒、杀虫的功效。现代医学研究发现,雷公藤对肿瘤、类风湿关节炎、系统性红斑狼疮、免疫性肾病等多种疾病的治疗效果显著,是较为可靠的免疫抑制类中药,被称为“中草药免疫剂”[3]。从雷公藤根部提取出的雷公藤总苷包含多种活性单体成分,其药理活性良好,素有“中草药激素”之称[4]。雷公藤红素是首个从雷公藤根皮中分离得到的天然活性产物,是一种具有醌甲基结构的去甲木栓烷型五环三萜(图1),具有抗肿瘤、抗炎、抗风湿、抗肥胖等作用,常用于治疗各种肿瘤、类风湿关节炎、2型糖尿病等[5-6]。 图片 文献计量学是一门定量分析知识载体的交叉科学,是集数学、统计学、文献学为一体,注重量化的综合性知识体系。通过使用CiteSpace软件对文献进行可视化分析,能够准确把握研究现状,探索新的研究方向。雷公藤红素自2007年被Cell杂志列为最有可能、最值得开发为现代药物的5种天然化合物之一以来[7],备受关注。本研究采用文献计量学方法,对现存的中英文有关雷公藤红素文献进行可视化处理,旨在呈现相关知识的结构、规律和分布等情况,形成对雷公藤红素的全面认知,有利于解读当前雷公藤红素的研究现状和未来发展趋势,帮助研究者更清晰、透彻地理解雷公藤红素发展现状,并为该领域的今后研究提供有价值的参考依据。 1 资料与方法 1.1 数据来源 在中国知网(China National Knowledge Infrastructure,CNKI)数据库和Web of Science(WOS)数据库,分别以“雷公藤红素”和“celastrol”为检索词进行文献检索,检索年限为2000年1月1日—2023年6月30日,分别得到中文文献744篇、英文文献1 254篇。 1.2 数据筛选 人工剔除掉数据库中的重复文献、图书、报纸文章、会议论文、成果报告以及不相关的内容。 1.3 数据可视化 将CNKI及WOS的文献分别以Refwork及文本格式导出,并以download_*.txt命名。使用CiteSpace 6.1.R4对得到的数据进行去重、格式转化。设置CiteSpace的参数:(1)时间分区(time slicing):时间段为2000年1月1日—2023年6月30日,时间切片为1;(2)节点类型(node types):分别选择“作者(author)”“研究机构((institution)”“关键词(keyword)”进行分析;(3)阈值选择(selection criteria):g-index(k=25),Top N=50,Top N%=10.0%;(4)剪切方式(pruning):“作者”“研究机构”分析选择“pathfinder”“pruning sliced networks”,“关键词”分析选择再加上“pruning the merged network”。对转化的数据进行可视化分析,探究其发文量、作者共现性、研究机构共现性、关键词共现性、关键词爆发时间、关键词聚类、研究方向等。 2 结果与分析 2.1 发文趋势 分析相关论文的发文趋势有助于了解该学科的研究现状、成长速度及未来发展方向。本研究旨在深入了解雷公藤红素的发展状况,通过对CNKI和WOS数据库中的中英文文献进行系统统计,时间跨度覆盖了2000年1月1日—2023年6月30日,筛选去重后获得了中文文献674篇、英文文献1 147篇。从图2中可以清晰地观察到,近20年来雷公藤红素相关文献的年发文量经历了不同的阶段,整体趋势呈现出稳定增长,同时英文文献的数量明显高于中文文献。具体而言,可将发文量的变化分为3个主要阶段。第1阶段跨越了2000—2007年,这一时期的发展相对平稳,研究逐渐积累。第2阶段,从2008—2017年,呈现了渐进的增长态势,显示了雷公藤红素领域受到持续关注并逐渐成熟。第3阶段自2018—2022年,是一个迅猛增长的时期,且为该领域的广泛研究爆发期。需要注意的是,由于本研究截至2023年6月30日,数据统计仅覆盖到112篇,因此出现下降趋势,但并不影响前述趋势的有效性。第2阶段的增长可能与2007年Cell杂志将雷公藤红素列为最有可能也最值得开发为现代药物的5种天然化合物之一,引发广泛关注有关[7]。总地来看,雷公藤红素相关文献的年发文量呈现出上升的趋势,背后的原因可能是随着中医药现代化进程的发展推动,中医药的认可度不断提升,相关领域的研究与应用蓬勃发展。作为具有巨大潜力的天然活性成分,雷公藤红素受到越来越多研究者的关注和探索。这一趋势有望在未来继续,为该领域的研究提供有力支持。 图片 2.2 国家、机构、作者分析 2.2.1 国家分布情况 分析文献作者所在国家的分布情况有助于了解各国对雷公藤红素的研究热度,同时也有助于研究雷公藤红素的植物基原和国家影响因素。全球范围内,共有59个国家和地区参与雷公藤红素的研究,发文量前12的国家见图3。中国的发文量远超其他国家和地区,这可能是因为雷公藤红素主要来源于雷公藤或南蛇藤的根皮、茎和叶,且雷公藤属于中国传统中药,故相较于其他国家,中国对雷公藤红素的研究投入相对更多,也更关注其潜在应用和价值。此外,美国和韩国也在雷公藤红素研究中发挥了重要作用,分别贡献了220篇和63篇文献。这表明雷公藤红素的研究具有国际性的合作和影响,不仅受到中国的关注,还在全球范围内也引起了广泛兴趣。综上所述,各国在雷公藤红素研究领域的贡献不仅反映了该领域的热度,还反映了雷公藤红素作为一种有潜力的天然活性成分的国际重要性。 图片 2.2.2 作者合作网络 在CNKI数据库中,共有674篇文献涵盖了503位作者,其中发文最多的作者是张振海(7篇)。作者合作网络见图4-A,共包含503个节点和638条连线,密度为0.005 1。张振海、陈彦和瞿鼎等作者构成了1个核心的合作团队,专注于雷公藤红素给药系统及抗癌药理作用的研究。总体而言,其他作者尚未形成规模较大且完整的合作研究团队,这可能不利于雷公藤红素研究的协作发展。在WOS数据库中,共有1 147篇文献涵盖了405位作者,其中发文最多的作者是Gao Wei(17篇),主要关注雷公藤红素的生物合成研究。作者合作网络如图4-B所示,包含405个节点和371条连线,密度为0.004 5。Gao Wei、Su Ping和Huang Luqi等作者构成了另1个核心合作团队,在研究雷公藤红素药理作用的同时,更加侧重雷公藤红素的生物合成研究。总体上看,其他作者合作研究团队已有雏形,预示着雷公藤红素的研究具有巨大的发展潜力和希望。 图片 2.2.3 机构合作网络 CNKI数据库中发文量最多的机构是南京中医药大学(7篇)和南京中医药大学附属中西医结合医院(7篇),其次是苏州大学附属第一附属医院(6篇)。推测可能是由于江苏省为雷公藤主要产地之一,且该地机构对雷公藤红素研究较为重视。中文文献研究机构合作网络见图5-A,包含409个节点和211条连线,说明尚未形成完善的合作机构团队,机构间的合作研究较少,有待加强各机构间的团队合作以推动相关研究。WOS数据库中发文量最多的机构是Chinese Academy of Sciences(56篇),其次是Sichuan University(30篇)、China Academy of Chinese Medical Sciences(29篇)。英文文献研究机构合作网络见图5-B,包括405个节点和371条连线,密度为0.004 5。英文文献发表机构间的合作在上述机构的带领下,形成了庞大且完整的机构合作网络,有利于机构间的相关经验交流与合作互补,进而促进雷公藤红素的研究发展。 图片 2.3 关键词分析 关键词是文献的总结凝练,通过分析关键词能够快速地了解论文主旨,有效掌握研究热点和研究方向。 2.3.1 关键词共现分析 对CNKI数据库中雷公藤红素相关文献的关键词进行可视化共现分析,结果如图6-A所示。该关键词共现图谱中包含276个节点和403条连线,排名前30的高频关键词见表1。通过分析共现图谱和高频关键词可知,与雷公藤红素相关的前5高频关键词为凋亡、雷公藤、细胞凋亡、雷公藤甲素、增殖,出现频率分别为41、34、30、24、19次。这表明药理作用、活性成分、化合物来源均是当下研究的热点。出现频率前30的关键词可分为6个大类。(1)药理作用:药理作用是雷公藤红素研究的重点内容,相关高频关键词共有17个,包括药理作用、作用机制、多发性骨髓瘤、凋亡、细胞凋亡、增殖、乳腺癌、小胶质细胞、胶质瘤、抗肿瘤、肝癌、细胞增殖、细胞周期、内皮细胞、巨噬细胞、成纤维细胞、代谢组学。说明中文文献中药理作用研究的热点是抗肿瘤、抗炎、抗风湿。(2)化学成分:探究雷公藤红素相类似的化学成分是对雷公藤红素研究的拓展,相关高频关键词有5个,包括雷公藤红素、雷公藤甲素、含量测定、化学成分和雷公藤次碱。雷公藤甲素、雷公藤次碱与雷公藤红素均为雷公藤总苷的组成成分,具有相似的化学结构和药理活性,可以为新药源的开发提供思路。(3)植物基原:植物基原的探寻是雷公藤红素研究工作的重要部分,相关高频关键词有3个,包括雷公藤、昆明山海棠、南蛇藤。雷公藤红素主要来自于雷公藤,探究雷公藤红素的植物基原可以拓展其获取途径,选取质最优、量最大的基原植物进行培养,丰富雷公藤红素资源。(4)研究方法:研究方法的选择对研究结果有巨大影响,相关高频关键词有2个,包括分子对接、综述。说明前人对雷公藤红素的总结阐述较多,倾向于用分子对接的方法进行研究。(5)中药:雷公藤红素主要来源于中国传统药材雷公藤,相关高频关键词有2个,包括中药、中医药。表明雷公藤红素研究的背景与传统中药的关联。(6)给药系统:雷公藤红素的给药系统是近年来的新兴热点,对应的相关高频关键词为体外释放。雷公藤红素具有良好的抗肿瘤、抗风湿、抗炎活性,但其人体吸收率较低。以何种方式更好地利用雷公藤红素,成为目前亟待解决的问题。 图片 图片 对WOS数据库中雷公藤红素相关文献的关键词进行可视化分析,如图6-B所示,该关键词共现图谱包括204个节点和294条连线,节点数量较中文文献略少,排名前30的高频关键词见表2。通过分析共现图谱和高频关键词可知,英文研究中频率前5的关键词是activation、celastrol、expression、apoptosis、NF-κB,出现频率分别为213、187、184、179、143次。说明英文文献同样注重雷公藤红素的药理作用。可以大致分为5个大类。(1)药理作用:药理作用是雷公藤红素研究的重点内容,相关高频关键词共有21个,包括activation、expression、apoptosis、NF-κB、growth、inhibition、cells、oxidative stress、inflammation、cancer、induction、mechanisms、obesity、rheumatoid arthritis、down regulation、pathway、disease、cancer cells、proliferation、therapy、autophagy。说明英文文献中涉及的雷公藤红素药理作用主要包括抗肿瘤、抗肥胖、抗炎、抗风湿。与中文文献相比,英文文献雷公藤红素相关药理作用关键词更多,种类也更丰富。除此之外,英文文献与通路相关的高频关键词多于中文文献,说明对雷公藤红素在细胞层面通过信号通路对机体产生影响的研究更多。(2)化学成分:化学成分是雷公藤红素研究的基础,相关高频关键词有4个,包括celastrol、triptolide、identification、triterpene。相较于中文文献稍少,但是提到了雷公藤红素所属的三萜类成分。同时中文文献侧重报道雷公藤红素的含量测定,而英文文献侧重于雷公藤红素的检测鉴定。(3)研究方法:研究方法的选择是雷公藤红素研究中必不可少的一环,出现3个高频关键词,分别为in vitro、design、mice。相较于中文文献采用软件手段的分子对接和综述,英文文献更倾向于使用动物实验相关研究手段,2种研究方式各有优劣,应取长补短。(4)给药系统:给药系统是雷公藤红素近年来的研究热点,出现1个相关高频关键词,为nanoparticles。相较于中文文献报道的体内释放,英文文献显示已经形成较成熟的纳米给药系统。(5)植物基原:植物基原是雷公藤红素探究的重要部分,出现1个相关高频关键词,为Tripterygium wilfordii,与国内研究相比,国外在植物基原方面研究较少,这可能是因为中药材雷公藤主产于中国,国内研究有地理优势和历史渊源。这些关键词共现和高频关键词分析有助于更深入地了解英文文献中对雷公藤红素研究的关注点和趋势,为未来的研究提供了重要线索。 图片 2.3.2 关键词热点聚类分析 将关系较为紧密的关键词进行聚类分析,有助于将研究热点可视化呈现。“聚类#”后的数字越小,说明该类研究的规模越大。本研究将CNKI检索到的与雷公藤红素相关的关键词进行可视化聚类分析,见图7-A。此聚类模块值(Q)=0.762 5,Q>0.5,平均轮廓值(S)=0.980,S>0.7,说明聚类结果合理显著。将7个聚类模块分为3大类。(1)药理作用:该大类包含了聚类#0(凋亡)、聚类#2(增殖)、聚类#5(抗肿瘤)、聚类#6(抑制作用)4个小聚类,主要反映了雷公藤红素在抗肿瘤药理作用方面的研究。研究表明雷公藤红素对肺癌、肝癌、胃癌、宫颈癌、乳腺癌、卵巢癌、黑素瘤、神经胶质瘤等多种肿瘤细胞具有良好的抑制作用[8]。Ni等[9]发现,雷公藤红素能够下调抗凋亡蛋白B淋巴细胞瘤-2(B-cell lymphoma-2,Bcl-2)和生存素(survivin)的表达,并有效阻断p65亚基的核转位,通过上调p27表达、调控核因子-κB(nuclear factor-κB,NF-κB),诱导肿瘤细胞周期阻滞和凋亡,从而达到抗肿瘤作用。梁柳春等[10]发现,雷公藤红素还有抗炎及免疫抑制、抗肥胖、神经保护等药理作用。(2)药物资源:该大类包括聚类#1(雷公藤)、聚类#3(中药)。雷公藤甲素主要来源于雷公藤和南蛇藤等传统中药,这些药材一直以来都在中医药中有着重要的地位。(3)化学成分:该大类包括聚类#4(雷公藤甲素),是雷公藤总苷的主要成分之一,雷公藤总苷被称为“中草药激素”,其组成成分还包括雷公藤晋碱和雷公藤次碱等萜类活性成分,具有治疗类风湿性关节炎、糖尿病肾病、紫癜性肾炎、系统性红斑狼疮等疾病的功效[11]。这些聚类分析结果有助于更清晰地了解雷公藤红素研究的热点和不同方向,为未来的研究提供了重要的指导。 图片 将WOS数据库中雷公藤红素相关文献关键词进行可视化聚类分析,见图7-B,Q=0.766 9,Q>0.5,S=0.893,S>0.7,说明聚类结果合理显著,具有实际意义。将10个聚类分为药理作用、药物资源2大类。(1)药理作用:该大类包括聚类#0(oxidative stress)、聚类#1(extracellular vesicles)、聚类#2(rheumatoid arthritis)、聚类#3(endoplasmic reticulum stress)、聚类#4(expression)、聚类#5(breast cancer)、聚类#7(inhibition)、聚类#9(activation)、聚类#10(growth)。这些关键词反映了英文文献中对雷公藤红素药理作用的研究广泛。研究表明,雷公藤红素在抗肿瘤、抗炎、抗风湿等领域有着丰富的研究内容。与中文文献相比,英文文献在雷公藤红素药理作用领域的研究范围更广泛,研究方向更多元化。(2)药用植物资源:该大类包括聚类#6(Tripterygium wilfordii)和聚类#8(Tripterygium wilfordii Hook. f.),二者含义相同,均代表雷公藤,为其拉丁名的不同写法。这表明中英文文献在药物资源领域研究报道均较为深入,同时药物基原在国内外均有较高关注度。 2.3.3 聚类热点时间分析 为了更好地展示不同时间段的热门研究方向,将图7-A的中文关键词聚类图转化为关键词聚类时间线图(图8)时间线图聚焦于不同聚类在时间维度上的分布,有利于发现不同时期的研究热点。由图8可知,2007年以前以雷公藤红素的聚类#5(抗肿瘤)和聚类#6(抑制作用)研究为主;2007年以后,聚类#0(凋亡)、聚类#1(雷公藤)、聚类#2(增殖)、聚类#3(中药)、聚类#4(雷公藤甲素)相关研究逐渐增多,且聚类#0(凋亡)的研究持续时间较长,表明这一方向的研究在不同时期都备受关注。将图7-B的英文关键词聚类图转化为关键词聚类时间线图(图9)。由图9可知,在2007年以前,WOS数据库中雷公藤红素相关的研究数量和方向较CNKI数据库更多,如聚类#10(growth)和聚类#9(activation),且全部11个聚类研究持续性均较好。总体上相较于雷公藤红素相关中文文献关键词聚类时间线图,英文的时间线图聚类更多,分布更密集,每个聚类持续时间更长。这些时间线图提供了关于雷公藤红素研究的时间演变趋势的重要信息,有助于更全面地了解不同时期的研究热点和发展方向。 图片 图片 2.3.4 关键词突现分析 关键词突现分析是将某段时间内频次变化高的关键词筛选出来,展现关键词出现的起止年份以及突变强度,可以清晰地表现出研究热点和发展趋势,预测雷公藤红素未来发展情况。WOS数据库中的雷公藤红素研究突现关键词更全面,更具有代表性,故以WOS数据库中英文研究关键词突现图为例分析雷公藤红素研究热点的变化。如图10所示,共包含25个突现关键词。其中强度最大的是“triterpene”,为10.7,持续时间为2010—2014年。2007年雷公藤红素被Cell期刊列为最有可能也是最值得开发为现代药物的5种天然化合物之一,其主要药效基团是位于A/B环上的醌甲基等结构。雷公藤红素所属三萜类化合物存在于大多数植物体内,具有多种生物活性,这也可能是“triterpene”关键词强度很高的原因之一。 图片 持续时间最长的突现关键词是“cancer cells”,从2009年持续到2018年。这说明雷公藤红素自被发现以来,其抗肿瘤作用一直备受关注,作为热点研究方向经久不衰。同时突现关键词中还有“heat shock”“kappa b activation”“inhibitor”等与抗肿瘤相关。雷公藤红素已被发现对肺癌、肝癌、胃癌、宫颈癌、乳腺癌、卵巢癌、黑素瘤、神经胶质瘤等多种肿瘤细胞具有良好的抑制作用。“drug delivery”和“delivery”分别成为2018年和2019的突现关键词,说明在雷公藤红素药理作用研究较为完善的基础上,大量学者开始关注给药系统的研究。尽管雷公藤红素具有良好的药理活性,但其口服生物利用度较低,毒性较大,导致其临床应用受到限制,因此给药系统成为近年来新的研究热点。靶向叶酸受体和线粒体的载体雷公藤红素聚酰胺-胺树枝状聚合物、透明质酸包被的线粒体靶向脂质体、尺寸可控的雷公藤红素纳米颗粒等相关研究陆续出现,能够在降低雷公藤红素自身毒性、提高口服生物利用度的同时,丰富雷公藤红素给药系统[12-14]。这些研究进展为雷公藤红素更广泛的应用提供了可能性。 2.4 高被引文献分析 文献引用量是反映当前研究情况和未来发展方向的重要指标。CNKI数据库中引用次数排名前10的雷公藤红素相关文献见表3。其中被引频次最多的是出自《中华肿瘤杂志》的“雷公藤红素抑制血管生成的实验研究”,被引170次,该研究通过测定雷公藤红素对血管内皮细胞株增殖的影响,观察其对血管内皮细胞株迁移、小管形成和鸡胚尿囊膜血管生成的影响,发现雷公藤红素可以抑制血管内皮细胞的增殖、迁移和小管形成,并具有抑制鸡胚尿囊膜血管生成的作用,该研究说明雷公藤红素具有明显抑制血管生成的作用。抗肿瘤作为雷公藤红素最重要的药理作用之一,除了被引频次第1的文献外,被引频次第2、5的文献“雷公藤红素抑制血管内皮细胞株增殖的体外研究”和“雷公藤红素对U937细胞Notch 1、NF-κB信号蛋白通路的调控作用”都与抗肿瘤作用相关,说明雷公藤红素抑制肿瘤生长的作用及其机制一直是研究的重点方向。 图片 被引频次排第4的文献是出自《中华结核和呼吸杂志》的“雷公藤红素抑制支气管哮喘小鼠气道炎症的实验研究”,共被引用61次。该研究发现雷公藤红素可减少哮喘模型小鼠肺组织炎性细胞浸润,降低肺组织干细胞因子蛋白表达强度,证实雷公藤红素具有支气管抗炎作用。另外2篇文献“雷公藤红素对小鼠的免疫抑制作用及其对IL-6 mRNA表达影响的研究”和“雷公藤红素对类风湿关节炎滑膜成纤维细胞中RANKL、OPG及炎性因子表达的影响”同样涉及雷公藤红素的抗炎作用和作用机制。 出自《中草药》的“HPLC法测定雷公藤及其片剂中雷公藤红素”一文中建立了快速高效的雷公藤红素HPLC测定方法,为进一步研究雷公藤红素的化学成分提供了理论基础。“环境胁迫对雷公藤中雷公藤红素含量的影响”则探讨了水分、光照、土壤氮含量的轻度胁迫对雷公藤幼苗中雷公藤红素含量的影响,为提高雷公藤药材品质提供参考。“雷公藤红素的研究进展”为综述性论文,内容丰富广泛,涵盖了雷公藤红素提取工艺、含量分析、药理活性等多项内容。该文被引量较多,较为经典,对雷公藤未来的研究具有参考意义。 WOS数据库中引用量前10的英文文献如表4所示。被引频次最多的文献是2010年在Cancer and Metastasis Reviews杂志发表的“Regulation of survival,proliferation,invasion,angiogenesis,and metastasis of tumor cells through modulation of inflammatory pathways by nutraceuticals”,被引用170次。该研究探索了饮食与健康之间的联系,对饮食习惯预防癌症进行着重分析,讨论包含雷公藤红素在内的香料、豆类、水果、坚果、蔬菜等食物通过调节炎症途径影响肿瘤细胞的生存、增殖、侵袭、血管生成和转移。该文献阐述了肿瘤形成的原因和抑制肿瘤的方式,有助于更好地理解雷公藤红素的抗肿瘤作用。值得一提的是,英文文献被引频次第2、4、5、6、8、10亦与雷公藤红素抗肿瘤的药理作用相关,且多数提到了抗肿瘤通路,说明雷公藤红素抗肿瘤研究一直是一个备受关注且不断深入的研究热点。 图片 “Treatment of obesity with celastrol”揭示了雷公藤红素通过增强瘦素敏感性,抑制食物摄入,阻断能量消耗的减少,从而显著减轻了高瘦素血症饮食诱导的肥胖小鼠体质量,该文献被引频次排名第3位。肥胖一直是人类长期面临的问题之一,也是雷公藤红素未来研究方向之一。“Celastrols as inducers of the heat shock response and cytoprotection”被引342次,该研究发现雷公藤红素能够刺激基因转录,该功能类似于热应激的动力学激活热休克转录因子,从而对致命细胞应激表现出细胞保护作用。该研究表明雷公藤红素有望成为一类新的热休克反应调节剂。排名第5的文献“Chemical and biological approaches synergize to ameliorate protein-folding diseases”被引313次,该研究证明通过使用小分子蛋白稳定调节因子,可以增强先天细胞蛋白稳态,有望改善功能性蛋白失
[size=15px][font=宋体]金黄色葡萄球菌([/font][font=&]Staphylococcus aureus[/font][font=宋体])是医院感染最常见的病原体,已成为全球主要的公共卫生威胁之一。随着“超级细菌”耐甲氧西林金黄色葡萄球菌([/font][font=&]MRSA[i][/i][/font][font=宋体])的出现和迅速传播,治疗金黄色葡萄球菌感染变得愈发困难,临床上迫切需要发现新的超级抗生素来应对超级细菌的威胁。[/font][font=&][/font][/size] [size=15px][font=宋体][b]天然产物雷公藤红素[i][/i]在体外和体内均能有效对抗[/b][/font][b][font=&]MRSA[/font][font=宋体],且雷公藤红素靶向Δ[/font][font=&]1-[/font][font=宋体]吡咯啉[/font][font=&]-5-[/font][font=宋体]羧酸脱氢酶(Δ[/font][font=&]1-Pyrroline-5-Carboxylate Dehydrogenase[/font][font=宋体],[/font][font=&]P5CDH[/font][font=宋体])发挥抗[/font][font=&]MRSA[/font][font=宋体]作用。机制上,[/font][font=宋体]雷公藤红素通过与[/font][font=&] P5CDH [/font][font=宋体]结合诱导氧化应激[i][/i]并抑制[/font][font=&] DNA [/font][font=宋体]合成。[/font][/b][font=宋体]这项研究的结果表明雷公藤红素是一种有前途的先导化合物,并证实[/font][font=&] P5CDH [/font][font=宋体]是开发抗[/font][font=&] MRSA [/font][font=宋体]新型药物的潜在靶点。[/font][/size] [size=15px][b][font=&]1[/font][font=宋体]、雷公藤红素在体外表现出对抗[/font][font=&] MRSA [/font][font=宋体]的强效活性[/font][font=&][/font][/b][/size] [size=15px][font=宋体]作者首先通过[/font][b][font=宋体]体外实验[/font][/b][font=宋体]发现雷公藤红素对[/font][font=&]MRSA USA300[/font][font=宋体]表现出显著的抗菌活性,最低杀菌浓度([/font][font=&]MBC[/font][font=宋体])为[/font][font=&]8μg mL ?1[/font][font=宋体],在浓度为[/font][font=&]1[/font][font=宋体]和[/font][font=&]2 μg mL[/font][font=&]?[/font][font=&]1[/font][font=宋体]时,雷公藤红素完全抑制了菌株的生长,根据[/font][font=&]MBC[/font][font=宋体]和[/font][font=&]MIC[/font][font=宋体]值确认雷公藤红素是一种很有前途的抗[/font][font=&] MRSA[/font][font=宋体]药物[/font][font=宋体]。[/font][font=&][/font][/size] [align=center] [/align] [size=15px][b][font=&]2[/font][font=宋体]、雷公藤红素在不同感染模型中表现出潜在的治疗能力[/font][font=&][/font][/b][/size] [size=15px][font=宋体]作者通过[/font][b][font=宋体]体内实验[/font][/b][font=宋体]评估雷公藤红素在[/font][font=&]3[/font][font=宋体]种不同感染模型(大蜡螟幼虫模型和两种小鼠感染模型)中的治疗能力,发现雷公藤红素提高了被[/font][font=&]MRSA USA300[/font][font=宋体]感染的大蜡螟幼虫的存活率,改善小鼠的[/font][font=&]MRSA[/font][font=宋体]皮肤感染,提高[/font][font=&]MRSA[/font][font=宋体]菌血症[i][/i]模型的存活率。这些结果表明雷公藤红素具有优异的体内抗[/font][font=&]MRSA[/font][font=宋体]活性[/font][font=宋体]。[/font][font=&][/font][/size] [align=center][img=图片,1,]data:image/svg+xml,%3C%3Fxml version='1.0' encoding='UTF-8'%3F%3E%3Csvg width='1px' height='1px' viewBox='0 0 1 1' version='1.1' xmlns='http://www.w3.org/2000/svg' xmlns:xlink='http://www.w3.org/1999/xlink'%3E%3Ctitle%3E%3C/title%3E%3Cg stroke='none' stroke-width='1' fill='none' fill-rule='evenodd' fill-opacity='0'%3E%3Cg transform='translate(-249.000000, -126.000000)' fill='%23FFFFFF'%3E%3Crect x='249' y='126' width='1' height='1'%3E%3C/rect%3E%3C/g%3E%3C/g%3E%3C/svg%3E[/img][/align][align=center] [/align] [size=15px][b][font=&]3[/font][font=宋体]、多组学分析发现新型抗[/font][font=&] MRSA [/font][font=宋体]靶点[/font][font=&][/font][/b][/size] [size=15px][font=宋体]接着研究人员[/font][b][font=宋体]通过转录组学、蛋白质组学和代谢组学分析了[/font][font=&]MRSA[/font][font=宋体]治疗后的细胞变化[/font][/b][font=宋体],揭示了雷公藤红素抗[/font][font=&]MRSA[/font][font=宋体]活性的可能靶点,多组学分析表明雷公藤红素上调应激反应[i][/i]和氧化磷酸化,而下调氨基酸和核苷酸、天冬氨酸、谷氨酸和嘧啶代谢的生物合成。这些代谢通路与[/font][font=&]Δ1-[/font][font=宋体]吡咯啉[/font][font=&]-5-[/font][font=宋体]羧酸脱氢酶([/font][font=&]P5CDH, [/font][font=宋体]由[/font][font=&]rocA[/font][font=宋体]基因编码)相关。因此,作者推测[/font][font=&]P5CDH[/font][font=宋体]是抗菌药物开发的潜在靶点 [/font][/size] [size=15px][b][font=&]4[/font][font=宋体]、[/font][font=&]P5CDH [/font][font=宋体]是一个潜在的抗菌靶点[/font][font=&][/font][/b][/size] [size=15px][b][font=宋体]为了进一步确定[/font][font=&]P5CDH[/font][font=宋体]作为潜在的抗菌靶点,作者构建了[/font][font=&]MRSA USA300 rocA[/font][font=宋体]敲除菌株和补充菌株(Δ[/font][font=&]:: rocA [/font][font=宋体])[/font][/b][font=宋体],发现[/font][font=&]rocA[/font][font=宋体]缺失显著损害细菌生长,而补充菌株在生长方面与[/font][font=&]WT[/font][font=宋体]相同。此外,突变后雷公藤红素对[/font][font=&]MRSA[/font][font=宋体]的[/font][font=&]MIC[/font][font=宋体]由[/font][font=&]1[/font][font=宋体]变为[/font][font=&]8[/font][font=宋体]μ[/font][font=&]g mL[/font][font=&]?[/font][font=&]1[/font][font=宋体],而补充[/font][font=&]rocA[/font][font=宋体]基因后又恢复到[/font][font=&]1[/font][font=宋体]μ[/font][font=&]g mL[/font][font=&]?[/font][font=&]1[/font][font=宋体],说明雷公藤红素的抗菌活性部分是通过抑制[/font][font=&]P5CDH[/font][font=宋体]来实现的[/font][/size] [size=15px][b][font=&]5[/font][font=宋体]、雷公藤红素与[/font][font=&]P5CDH[/font][font=宋体]直接结合[/font][font=&][/font][/b][/size] [size=15px][b][font=宋体]由于蛋白质组学分析中雷公藤红素并没有显著影响[/font][font=&]P5CDH[/font][font=宋体]的表达,因此研究推测雷公藤红素通过靶向[/font][font=&]P5CDH[/font][font=宋体]并影响其功能来发挥抗菌活性。[/font][/b][font=宋体]接着通过分子对接、[/font][font=&]BLI[/font][font=宋体]、[/font][font=&]CETSA[/font][font=宋体]、圆二色谱和酶活性测定,证实雷公藤红素能够直接结合影响[/font][font=&]P5CDH[/font][font=宋体],影响其酶活 [/font][/size] [size=15px][b][font=&]6[/font][font=宋体]、[/font][font=&]K205A[/font][font=宋体]和[/font][font=&]E208A[/font][font=宋体]是[/font][font=&]P5CDH[/font][font=宋体]与雷公藤红素的关键结合位点[/font][font=&][/font][/b][/size] [size=15px][font=宋体]接着,[/font][b][font=宋体]作者采用了分子对接和定点诱变技术揭示雷公藤红素结合位点[/font][/b][font=宋体]。分子对接成功预测出[/font][font=&]3[/font][font=宋体]个结合位点,分别为[/font][font=&]Lys205[/font][font=宋体]([/font][font=&]K205A[/font][font=宋体])、[/font][font=&]Glu208[/font][font=宋体]([/font][font=&]E208A[/font][font=宋体])和[/font][font=&]Asp209[/font][font=宋体]([/font][font=&]D209A[/font][font=宋体])。随后,作者构建了三个突变质粒并表达相关蛋白。[/font][b][font=&]BLI[/font][font=宋体]分析显示[/font][font=&]K205[/font][font=宋体]和[/font][font=&]E208[/font][font=宋体]突变后雷公藤红素结合能力显著降低,且不再抑制其酶活,表明[/font][font=&]K205[/font][font=宋体]和[/font][font=&]E208[/font][font=宋体]是结合的关键残基[/font][/b][/size] [size=15px][b][font=&]7[/font][font=宋体]、雷公藤红素促进氧化损伤[/font][font=&][/font][/b][/size] [size=15px][font=宋体]有文献报道[/font][font=&]P5CDH[/font][font=宋体]通过影响[/font][font=&]P5C-Pro[/font][font=宋体]循环的平衡进而对产生[/font][font=&]ROS[/font][font=宋体]至关重要,[/font][b][font=宋体]作者推测雷公藤红素可能通过氧化损伤发挥抗菌作用。通过对[/font][font=&]WT [/font][font=宋体]或[/font][font=&] Δ:: rocA [/font][font=宋体]组、[/font][font=&]Δ rocA[/font][font=宋体]组菌株采用雷公藤红素或乙醛酸([/font][font=&]P5CDH[/font][font=宋体]抑制剂)[/font][/b][font=宋体],发现雷公藤红素扰乱[/font][font=&]P5C-Pro[/font][font=宋体]循环的平衡。此外,[/font][font=&]ΔrocA[/font][font=宋体]、雷公藤红素或抑制剂处理组的[/font][font=&]ROS[/font][font=宋体]水平升高。其中,雷公藤红素治疗组[/font][font=&]ROS[/font][font=宋体]升高最为显著,可能是因为雷公藤红素是一种多途径抗菌剂,可以通过多种方式刺激[/font][font=&]ROS[/font][font=宋体]生成。结果表明氧化损伤是雷公藤红素重要的抗菌机制[/font][/size] [size=15px][b][font=&]8[/font][font=宋体]、雷公藤红素诱导细菌死亡[/font][font=&][/font][/b][/size] [size=15px][font=宋体]为研究雷公藤红素处理后[/font][font=&]MRSA[/font][font=宋体]死亡情况,作者用[/font][font=&]DAPI[/font][font=宋体]标记细胞中的[/font][font=&]DNA[/font][font=宋体],在[/font][font=&]ΔrocA[/font][font=宋体]、雷公藤红素或抑制剂处理组均观察到染色体凝聚,提示有细菌死亡发生,特别是雷公藤红素处理的细菌出现了凋亡小体形成和萎缩等细菌死亡形态学特征。在[/font][font=&]TUNEL[/font][font=宋体]染色实验中,与未接受药物处理的[/font][font=&]WT[/font][font=宋体]细胞相比,雷公藤红素处理的[/font][font=&]WT[/font][font=宋体]细菌荧光较强,提示有[/font][font=&]DNA[/font][font=宋体]双链断裂出现 [/font][/size] [size=15px][b][font=&]9[/font][font=宋体]、雷公藤红素抑制[/font][font=&]DNA[/font][font=宋体]合成[/font][font=&][/font][/b][/size] [size=15px][font=宋体]前面多组学结果发现雷公藤红素影响谷氨酸和嘧啶代谢的生物合成,该过程与[/font][font=&]DNA[/font][font=宋体]合成密切相关,[/font][b][font=宋体]作者推测雷公藤红素可能通过抑制[/font][font=&]DNA[/font][font=宋体]合成发挥抗[/font][font=&]MRSA[/font][font=宋体]活性。[/font][/b][font=宋体]结果显示,用雷公藤红素或抑制剂和[/font][font=&]ΔrocA[/font][font=宋体]组处理的细菌中[/font][font=&]NADP+/NADPH[/font][font=宋体]比率降低,表明[/font][font=&]5-[/font][font=宋体]磷酸核糖的合成受到抑制。[/font][font=&]Asp[/font][font=宋体]是嘌呤和嘧啶合成的重要前体,作者发现[/font][font=&]Glu[/font][font=宋体]和[/font][font=&]Asp[/font][font=宋体]的减少。此外,作者观察到[/font][font=&]DNA[/font][font=宋体]含量下降。考虑到[/font][font=&]DNA[/font][font=宋体]能够影响蛋白质的表达,作者也观察到[/font][font=&]ΔrocA[/font][font=宋体]、雷公藤红素或抑制剂处理组的蛋白质含量均显著降低,表明[/font][font=&]P5CDH[/font][font=宋体]能够影响蛋白质的合成。总之,雷公藤红素可以抑制[/font][font=&]DNA[/font][font=宋体]合成来对抗[/font][font=&]MRSA[/font][/size] [size=15px][b][font=宋体]总结[/font][font=&][/font][/b][/size] [size=15px][font=宋体]该研究表明,雷公藤红素对标准和临床耐甲氧西林金黄色葡萄球菌菌株表现出强大的抗菌活性,并且耐药性发展水平较低。这种抗菌活性的机制被认为是基于与[/font][font=&]P5CDH[/font][font=宋体]的竞争性结合,从而激活多种途径。雷公藤红素是开发用于对抗耐甲氧西林金黄色葡萄球菌相关感染的新型抗生素药物的有希望的候选药物[/font][/size]
1、雷公藤红素抑制CML细胞增殖作者首先进行了网络药理学分析,以评估在治疗CML方面最有效的天然产物。通过对3882种天然产物进行了网络药理学分析,发现从传统中药“雷公藤”(Tripterygium wilfordii)根皮中提取的五环三萜雷公藤红素在抑制CML方面排名第一。为了验证网络药理学筛选的可靠性,作者在CML细胞中进行细胞活力测定。选择18β-甘草次酸作为阴参,因为它与雷公藤红素的结构最相似,但在3882 种天然产物中预测得分不高,选择17-AAG(HSP90抑制剂,已有文章报道HSP90是雷公藤红素的靶点)和TKI 药物伊马替尼作为阳参。结果表明雷公藤红素、17-AAG和伊马替尼均能有效抑制CML细胞增殖,而18β-甘草次酸几乎不影响细胞生长。作者进一步开展细胞实验,发现雷公藤红素对K562和K562T315I细胞表现出抗增殖活性,诱导细胞凋亡。尽管对雷公藤红素的研究很深入,但尚未系统地鉴定出雷公藤红素在CML中的直接蛋白质靶点,尤其是在耐药性CML细胞中 雷公藤红素抑制CML细胞增殖2、雷公藤红素处理后 K562T315I 细胞的转录组和蛋白质组学分析接着,作者通过RNA 测序发现富集的通路包括铁死亡、蛋白水解调节、响应p53介导的DNA损伤等。作者还进行了蛋白质组学分析雷公藤红素对K562T315I细胞中蛋白质表达水平的调节,下调蛋白主要富集于DNA和RNA代谢途径以及 DNA损伤反应,以及蛋白质加工途径。MCODE分析发现“对DNA损伤刺激的反应”和“对未折叠蛋白的反应”分别是最具特征性的途径。雷公藤红素与其已知靶标HSP90的相互作用可能是“对未折叠蛋白的反应”上调的关键贡献事件。而目前尚未有报道称雷公藤红素的直接蛋白质靶标与“对DNA损伤刺激的反应”途径有关( 雷公藤红素处理后 K562T315I 细胞的定量蛋白质组学分析3、雷公藤红素处理后 K562T315I 细胞的CETSA-MS分析作者接着检测了K562T315I细胞中celastrol处理后可溶性蛋白质水平的变化,在雷公藤红素处理后鉴定了178种差异溶解蛋白质,主要位于DNA中心区域,包括细胞核和线粒体,更具体地说是在DNA损伤位点。此外,“分子伴侣复合物”中溶解度降低,这可能是由于雷公藤红素和HSP90之间的互作所致 雷公藤红素处理后 K562T315I细胞的CETSA-MS分析4、雷公藤红素诱导 K562T315I 细胞DNA损伤对 K562T315I细胞经雷公藤红素处理后总蛋白和可溶性蛋白水平变化的系统分析表明,雷公藤红素主要诱导K562T315I细胞中的DNA损伤和未折叠蛋白反应。因此,作者进行了实验来验证这些观察结果。结果显示雷公藤红素显著诱导γ-H2AX(DNA损伤的常见标志物)的表达,并降低DNA损伤修复相关蛋白FANCD2水平,彗星试验进一步证实了雷公藤红素促进的DNA损伤( 雷公藤红素诱导 K562T315I细胞DNA损伤5、雷公藤红素在K562T315I细胞中的靶点鉴定然后,作者在细胞裂解物中开展质谱耦合等温剂量反应-细胞热位移分析(MS-ITDR-CETSA)实验,以确定雷公藤红素的直接蛋白质靶标,特别是那些参与DNA损伤反应的蛋白质靶标。在检测到的3393种蛋白质中,有12种蛋白质表现出热稳定性的显著变化,代表了最有潜力且可信度高的靶标蛋白质。值得注意的是,雷公藤红素的已知靶标HSP90 (HSP90AA1和HSP90AB1) 的热稳定性仅表现出很小的变化,并且没有超过阈值。对这12个潜在靶标和定量蛋白质组学以及CETSA-MS分析的差异蛋白进行PPI分析,发现 YY1均为最紧密相关的蛋白质。因此,YY1与所有这些DEP/DSP的关联节点数量最多,并且可能是与DNA损伤相关的最重要的靶标。现有研究表明,YY1作为转录因子,可以调节参与DNA修复和细胞存活的各种蛋白质的表达,以响应DNA损伤。此外,HMCES已被确定为通过屏蔽脱碱基位点来保护基因组完整性免受氧化碱基损伤的关键蛋白。因此,作者继续通过蛋白质印迹结合细胞热位移分析(WB-CETSA)验证了celastrol与YY1和HMCES的互作。同样,报道的阳性对照HSP90蛋白也显示出明显的热稳定性增加( 雷公藤红素在K562T315I细胞中的靶点鉴定6、雷公藤红素与YY1和HMCES相互作用的验证为了进一步验证celastrol与YY1和HMCES的直接相互作用,合成了可点击炔烃标签功能化celastrol探针(Cel-P),该探针保留了celastrol对K562T315I细胞的抑制活性。利用该探针开展Pulldown实验发现Cel-P 能够成功地从细胞中拉下HMCES和HSP90蛋白,但由于尚不清楚的原因,在蛋白质印迹膜上的下拉样本中未检测到YY1。随后,表达并纯化重组YY1(rYY1)蛋白,发现随着Cel-P浓度的增加,rYY1的标记以剂量依赖性方式增加 雷公藤红素与YY1和HMCES相互作用的验证7、雷公藤红素通过靶向YY1和HMCES诱导DNA损伤在验证了celastrol与YY1和HMCES之间的相互作用后,作者继续在K562T315I细胞中敲低 YY1或HMCES。结果显示YY1或HMCES的敲低显著增加了DNA损伤的发生率,同时影响细胞生长,增强细胞对celastrol的敏感性。此外,与HMCES相比,YY1敲低对细胞的影响更为显著,表明YY1发挥着更为重要的作用。对接分析显示,与HMCES相比,celastrol对YY1的亲和力略强,且Celastrol与YY1上的Leu132和Val316形成氢键,与HMCES的Glu127、Arg130和Arg137形成氢键 雷公藤红素通过靶向 YY1 和 HMCES 诱导 DNA 损伤鉴于YY1在雷公藤红素诱导的DNA损伤反应中发挥关键作用,作者对YY1蛋白进行了进一步实验。发现YY1过表达对细胞生长没有显著影响,但减轻了雷公藤红素引起的细胞死亡和DNA损伤,且通过裂解的PARP1和Caspase-3水平发现YY1表达与雷公藤红素诱导的细胞凋亡呈负相关。使用双荧光素酶报告基因发现雷公藤红素显著抑制了YY1的转录活性,BLI结合试验发现celastrol 可以与 rYY1 结合(图8)。图8 YY1在雷公藤红素诱导的 K562T315I细胞DNA损伤和细胞死亡中起关键作用总结研究使用多组学方法对雷公藤红素的作用机理进行了系统研究,利用蛋白质组范围的无标记靶标反卷积方法MS-CETSA来识别雷公藤红素的蛋白质靶标。研究不仅验证了雷公藤红素通过靶向HSP90来诱导未折叠蛋白反应,而且还发现它通过直接靶向耐药 K562T315ICML 细胞中的YY1和HMCES来诱导DNA损伤(图9)。研究有助于更好地理解雷公藤红素的多方面机制。研究提供了一种有效的系统药理学工作流程范例,该范例集成了网络药理学分析、蛋白质丰度和溶解度测量以及 MS-CETSA,以揭示任何天然产物或活性化合物的作用机理。