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遗传分析系统

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遗传分析系统相关的资讯

  • 赛默飞推出采用最新毛细管电泳技术的遗传分析系统
    p  5月22日,赛默飞世尔科技宣布推出最新的毛细管电泳(CE)系统,该技术主要是为Sange测序和片段分析提供低通量、cartridge-based系统。Applied Biosystems™ SeqStudio™ 遗传分析系统可用于肿瘤学研究、基因组编辑、物种鉴定和人体细胞系鉴定等应用,能够支持日益增长的追求经济性和易用性的CE平台的需求。br//pp style="text-align: center "img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201705/insimg/c04800fe-65d7-4d53-b5b4-49dbca56fd71.jpg" title="未标题-1.jpg"//pp style="text-align: center "SeqStudio遗传分析系统/pp  新的SeqStudio遗传分析系统采用独特的一体式盒式cartridge,结合毛细管阵列,聚合物储存器和阳极缓冲液,极大地简化了实验准备和实际操作时间。此外,该系统其他创新功能允许客户访问个性化协议,直观的触摸屏和连接到Thermo Fisher Cloud,可用于远程设置和监控以及轻松的数据分析和协作。/pp  “采用CE系统的Sanger测序是40周年庆典推出的新品,是测序科技的金标准。帮助发现新的生物学发现,并在2003年用于完成人类基因组计划。” 赛默飞世尔科技公司遗传分析副总裁兼总经理Kim Kelderman说。“SeqStudio遗传分析仪是一款为研究人员提供真正即插即用功能的智能和先进系统。/pp  此前,SeqStudio遗传分析系统已经在北美、欧洲、中东、非洲、日本和中国地区选择部分用户使用,在该系统上已经有超过2000个组合的运行结果。该系统将于2017年下半年向全球用户供应。/pp  “我积极推荐新的CE系统,它降低了毛细管电泳平台的运行成本,并且容易操作。” MRC Holland首席执行官Jan Schouten表示。“该系统可以处理一个完整的微量滴定板样品,并具有足够的容量用于中低通量遗传实验室。”/pp  SeqStudio遗传分析系统将在2017年5月27日至30日在丹麦哥本哈根举行的年度欧洲人类遗传学协会(ESHG)大会上首次展出。/pp  更多信息,请访问www.thermofisher.com/seqstudio。/ppbr//p
  • 遗传分析技术验证出遗骨正是理查三世
    2014年12月2日| GenomeWeb记者报道 纽约(GenomeWeb)——近日,由莱斯特大学研究人员领导的一支国际合作研究团队通过使用家谱数据和遗传分析,验证出在英国停车场下发现的一具遗骨确实属于理查三世国王,从而成功解决一项搁置超过500年的法医案例。 “掌握任何已知历史人物的遗传数据都足以让人兴奋,更何况是一位英国国王。”对本项研究提供了部分资助的威康信托基金会文化与社会部门负责人Simon Chaplin说道,“这一信息的发现丰富了现有的理查三世的研究资料,并进一步提示我们,研究人类遗体能帮助我们了解历史。我们期待,在将来我们能够了解更多关于理查三世的故事。” 理查三世于1483年即位,并在两年后的博斯沃思战役中去世,是最后一位在战争中死去的英国国王。历史记录表明,理查三世的遗体被运送至莱斯特,并埋葬在名为Grey Friars的中世纪教堂中。但是,1538年该修道院被解散,其中的大部分建筑也在随后的年代里逐渐拆除。 尽管有传闻称理查三世的遗体被挖出并丢入莱斯特的Soar河中,但大多数历史学家仍相信他仍安稳地躺在修道院曾经矗立的位置。不过他的墓地的精确位置仍不知晓。 2012年,在Grey Friars教堂原址处发掘出了一具遗骨,其考古学断代及放射性碳测定年代的结果均显示该遗骨可能属于理查。对该遗骨进行的进一步分析表明它属于一位30至34岁的男性,并有着严重的脊柱侧弯及多处战争伤处——所有这些均与这位国王的已知信息相一致。 为了一劳永逸地证实该遗骨(在发掘出时被命名为1号遗骨)确实属于理查三世,莱斯特大学的研究团队对这位国王的现有亲属及亲属的遗体进行了DNA分析,对包括线粒体全基因组(属于母系遗传)和Y染色体标记(属于父系遗传)在内的多个关键遗传标志进行了研究。 科学家们首先使用芯片DNA杂交方法对1号遗骨的Y染色体SNP位点进行了研究,之后,研究人员使用靶向PCR扩增方法,将特定扩增产物在Ion Torrent PGM平台上进行测序以作进一步分型,并使用Promega PowerPlex Y23系统分析获得了一个STR单倍型。 当将实验发现与对已知的5位理查三世的父系亲属的分析进行对比时,研究人员并未发现遗传相关性。不过鉴于假父系的可能性,在理查三世与其后代间的所有世代中据估计有高达16%的假父系可能,研究人员认为这一结果并不能作为决定性因素。 研究人员注意到,假母系的可能性显然要比假父系可能性低很多。随后,研究团队对1号遗骨的线粒体DNA(mtDNA)进行了检测,并分别与理查三世的母系19和21代的两位个体的样本进行了比对。 他们首先对两位亲属的mtDNA对照区域使用Sanger测序法对双链进行了平行双重测序,并发现在同一个体或个体间的平行双样间不存在序列差异。 依研究团队在Nature Communications中所述,1号遗骨的DNA分别交由两个专门从事古代DNA分析的不同实验室进行独立提取,随后对其mtDNA对照区域上的三个高度可变区进行测序。他们还提到,他们另外还对PCR克隆产物进行了Sanger测序,除了两处可认为是古代DNA中常见的DNA损伤模式外,并未观察到序列差异。 在1号遗骨与理查的后代间,研究人员发现了一处完美匹配,且研究人员发现其在研究的遗传时间周期内在所有母系亲属中均保持一致。 为了测定完整mtDNA的相似性,研究人员随后对这三份样品均进行了线粒体全基因组测序。对于现代样品,通过两轮平行双重长链PCR对其完整线粒体基因组进行了扩增,随后使用Ion Torrent PGM进行了测序。 同时,研究人员使用了芯片DNA杂交捕获方法对1号遗骨的mtDNA序列进行了全基因组测序,从16组提取制得了24个测序文库,其中探针是根据两位现代亲属的mtDNA序列而设计的。 研究表明,在1号遗骨与一位理查的亲属之间存在完美的全基因组序列匹配,与另一位亲属也只有1个碱基的差异,因而可认为在所研究的时间周期内母系亲属个体间这些序列保持一致。而与含26127份欧洲全mtDNA对照区域序列的数据库与1832份英伦诸岛样品的数据库进行的比较表明,这种mtDNA的完美匹配不太可能是由于偶然因素造成的。 最后,研究团队还对1号遗骨进行了瞳孔颜色及发色的DNA分型,结果表明有96%的可能性为蓝色瞳孔,77%的可能性为金发,这与理查三世留存的早期肖像相一致。 “我们的文章囊括了对发掘自莱斯特Grey Friars原址的1号遗骨所做的所有遗传及宗谱分析鉴定,并首次将所有证据线索综合起来从而得到了这具遗骸的鉴定结果。”Nature Communications研究工作的首席作者Turi King说道,“即使在我们最保守的分析中,仍然有着压倒性的证据表明这确实是理查三世国王的遗骸,从而解决了这一超过500年的寻人案例。” “这些证据结合起来共同证实了遗骸属于理查三世。”资深作者Kevin Schurer提到,“母系后代的三角测量尤为重要。考虑到非亲生的发生率,Y染色体谱系中断并不令人非常惊讶,不过这会产生一系列关于继承权的有趣的推测问题。” 正如文章作者所指出的,在理查三世登基前几年发生的一起或数起假父系事件可能引发对理查三世死后人们对大不列颠王室合法性的怀疑。
  • GA118-16A型DNA遗传分析仪
    table width="633" cellspacing="0" cellpadding="0" border="1" align="center"tbodytr style=" height:25px" class="firstRow"td style="border: 1px solid windowtext padding: 0px 7px " width="132" height="25"p style="line-height:150%"span style=" line-height:150% font-family:宋体"成果名称/span/p/tdtd colspan="3" style="border-color: windowtext windowtext windowtext currentcolor border-style: solid solid solid none border-width: 1px 1px 1px medium border-image: none 100% / 1 / 0 stretch padding: 0px 7px " valign="bottom" width="501" height="25"p style="text-align:center line-height:150%"strongspan style=" line-height:150% font-family:宋体"GA118-16A/span/strongstrongspan style=" line-height:150% font-family:宋体"型DNA遗传分析仪/span/strong/p/td/trtr style=" height:25px"td style="border-color: currentcolor windowtext windowtext border-style: none solid solid border-width: medium 1px 1px border-image: none 100% / 1 / 0 stretch padding: 0px 7px " width="132" height="25"p style="line-height:150%"span style=" line-height:150% font-family:宋体"单位名称/span/p/tdtd colspan="3" style="border-color: currentcolor windowtext windowtext currentcolor border-style: none solid solid none border-width: medium 1px 1px medium padding: 0px 7px " width="501" height="25"p style="line-height:150%"span style=" line-height:150% font-family:宋体"北京中盾安民分析技术有限公司/span/p/td/trtr style=" height:25px"td style="border-color: currentcolor windowtext windowtext border-style: none solid solid border-width: medium 1px 1px border-image: none 100% / 1 / 0 stretch padding: 0px 7px " width="132" height="25"p style="line-height:150%"span style=" line-height:150% font-family:宋体"联系人/span/p/tdtd style="border-color: currentcolor windowtext windowtext currentcolor border-style: none solid solid none border-width: medium 1px 1px medium padding: 0px 7px " width="168" height="25"p style="line-height:150%"span style=" line-height:150% font-family:宋体"荣海博/span/p/tdtd style="border-color: currentcolor windowtext windowtext currentcolor border-style: none solid solid none border-width: medium 1px 1px medium padding: 0px 7px " width="161" height="25"p style="line-height:150%"span style=" line-height:150% font-family:宋体"联系邮箱/span/p/tdtd style="border-color: currentcolor windowtext windowtext currentcolor border-style: none solid solid none border-width: medium 1px 1px medium padding: 0px 7px " width="172" height="25"p style="line-height:150%"span style=" line-height:150% font-family:宋体"ronghaibo2006@163.com/span/p/td/trtr style=" height:25px"td style="border-color: currentcolor windowtext windowtext border-style: none solid solid border-width: medium 1px 1px border-image: none 100% / 1 / 0 stretch padding: 0px 7px " width="132" height="25"p style="line-height:150%"span style=" line-height:150% font-family:宋体"成果成熟度/span/p/tdtd colspan="3" style="border-color: currentcolor windowtext windowtext currentcolor border-style: none solid solid none border-width: medium 1px 1px medium padding: 0px 7px " width="501" height="25"p style="line-height:150%"span style=" line-height:150% font-family:宋体"□正在研发 □已有样机 □通过小试 □通过中试 √可以量产/span/p/td/trtr style=" height:25px"td style="border-color: currentcolor windowtext windowtext border-style: none solid solid border-width: medium 1px 1px border-image: none 100% / 1 / 0 stretch padding: 0px 7px " width="132" height="25"p style="line-height:150%"span style=" line-height:150% font-family:宋体"合作方式/span/p/tdtd colspan="3" style="border-color: currentcolor windowtext windowtext currentcolor border-style: none solid solid none border-width: medium 1px 1px medium padding: 0px 7px " width="501" height="25"p style="line-height:150%"span style=" line-height:150% font-family:宋体"□技术转让 □技术入股 □合作开发 √其他/span/p/td/trtr style=" height:141px"td colspan="4" style="border-color: currentcolor windowtext windowtext border-style: none solid solid border-width: medium 1px 1px border-image: none 100% / 1 / 0 stretch padding: 0px 7px " width="633" height="141"p style="line-height:150%"strongspan style=" line-height:150% font-family: 宋体"成果简介:/span/strong/pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201803/insimg/1da4f19a-806e-455f-b816-291eb41038d8.jpg" title="35.jpg" style="width: 400px height: 272px " width="400" vspace="0" hspace="0" height="272" border="0"//pp style="text-indent:28px line-height:150%"span style=" line-height:150% font-family:宋体"GA118-16A/spanspan style=" line-height:150% font-family:宋体"型DNA遗传分析仪是基于激光激发荧光技术结合毛细管电泳技术的DNA分析设备,包含激光激发系统、多样本光谱影像检测光路系统、激光光束空间精确定位系统、分光光路精密调整系统、带有全自动排气泡功能的高压流体注射系统、基于半导体制冷的恒温箱系统以及高精度三维进样系统等几大模块。该设备是由北京中盾安民分析技术有限公司经过十余年刻苦攻关,研制出的我国第一个自主知识产权的GA118-16A型DNA遗传分析仪,填补了国内空白。/span/pp style="line-height:150%"strongspan style=" line-height:150% font-family: 宋体"主要技术指标:/span/strong/pp style="text-indent:28px line-height:150%"span style=" line-height:150% font-family:宋体"检测方式:激光诱导荧光CCD自动收集/span/pp style="text-indent:28px line-height:150%"span style=" line-height:150% font-family:宋体"检测波长范围:Sp=530~650nm/span/pp style="text-indent:28px line-height:150%"span style=" line-height:150% font-family:宋体"DNA/spanspan style=" line-height:150% font-family:宋体"分离方式:毛细管电泳;通道数:N=16/span/pp style="text-indent:28px line-height:150%"span style=" line-height:150% font-family:宋体"分辨力:5色荧光实时检测;分辨力R≯1bp/span/pp style="text-indent:28px line-height:150%"span style=" line-height:150% font-family:宋体"进样方式:自动进样;定位精度ΔP<0.3mm/span/pp style="text-indent:28px line-height:150%"span style=" line-height:150% font-family:宋体"最大检测通量:片段长度<500bp时,En 16(个样品/小时)/span/pp style="text-indent:28px line-height:150%"span style=" line-height:150% font-family:宋体"检测过程温控指标:温控范围:室温~65℃;温控精度ΔT<0.2℃ /span/pp style="text-indent:28px line-height:150%"span style=" line-height:150% font-family:宋体"法医DNA数据采集预处理软件V1.0:/span/pp style="text-indent:28px line-height:150%"span style=" line-height:150% font-family:宋体"DNA/spanspan style=" line-height:150% font-family:宋体"图谱数据实时采集、分析和显示;空间校正、光谱校正功能及校正效果的自动评价;DNA数据文件自动生成;样品运行自动规划;仪器平台自动监测,关键部件可手动控制。/span/p/td/trtr style=" height:37px"td colspan="4" style="border-color: currentcolor windowtext windowtext border-style: none solid solid border-width: medium 1px 1px border-image: none 100% / 1 / 0 stretch padding: 0px 7px " width="633" height="37"p style="line-height:150%"strongspan style=" line-height:150% font-family: 宋体"应用前景:/span/strong/pp style="text-indent:28px line-height:150%"span style=" line-height:150% font-family:宋体"GA118-16A/spanspan style=" line-height:150% font-family:宋体"型DNA遗传分析仪主要应用于DNA分析,目前已经广泛应用于国内法医DNA检验领域,在北京、上海、河南、贵州、江西、福建等二十余省市广泛应用,累计实际检测DNA案件和DNA数据库样本超过100余万份,实现销售收入约5400万元。/span/pp style="text-indent:28px line-height:150%"span style=" line-height:150% font-family:宋体"在不久的将来,随着精准医学推进,该设备还有望在医学诊断领域发挥重要作用。/span/p/td/trtr style=" height:72px"td colspan="4" style="border-color: currentcolor windowtext windowtext border-style: none solid solid border-width: medium 1px 1px border-image: none 100% / 1 / 0 stretch padding: 0px 7px " width="633" height="72"p style="line-height:150%"strongspan style=" line-height:150% font-family: 宋体"知识产权及项目获奖情况:/span/strong/pp class="MsoListParagraph" style="margin-left:44px line-height:150%"strongspan style=" line-height:150% font-family:宋体"/span/strongspan style=" line-height:150% font-family:宋体"/span/pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201803/insimg/ce7c3bd4-dd9f-4e83-9c26-4a4a14b5347b.jpg" style="" title="013.jpg"//pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201803/insimg/0bcf99fd-f51e-4555-b858-1a4baf6b0073.jpg" style="" title="014.jpg"//pp class="MsoListParagraph" style="margin-left:44px line-height:150%"span style=" line-height:150% font-family:宋体"/spanbr//pp style="text-indent:28px line-height:150%"br//p/td/tr/tbody/tablepbr//p
  • 140万!石家庄市第四医院遗传分析仪采购
    项目编号:HBDR-Z20220309项目名称:石家庄市第四医院医疗设备(三)采购项目预算金额:1400000最高限价(如有):1400000采购需求:B包: 遗传分析仪1台合同履行期限:自合同签订之日起30日历天本项目不接受联合体投标。
  • Life Tech遗传系统业务总裁离职加入Solulink
    相关新闻:Life Tech基因测序业务CEO辞职   2013年8月28日,新兴生命科学设备公司Solulink宣布,John L. "Kip" Miller加入其公司董事会。Miller拥有丰富的商业运作背景以及丰富的生命科学研究和诊断市场经验,他的加入有助于Solulink公司HybriLink&trade 技术的商品化。  在此之前,Miller供职于Life Tech公司担任遗传系统业务总裁一职。2008-2011年,Miller供职于Invitrogen公司担任生物发现业务高级副总裁(2008年Invitrogen与Applied Biosystems合并更名为Life Technologies)。在加入Invitrogen之前,Miller曾在BD公司担任过多个职位,包括BD生物科学研究细胞分析业务副总裁/总经理、BD抗体业务副总裁/总经理以及美洲地区销售和服务副总裁。  Miller拥有密歇根州立大学包装工程学士学位。(编译:刘玉兰)
  • The Scientist:2015四大技术突破(成像、光遗传学、单细胞分析、CRISIPR)
    p  12月24日,The Scientist评选出了“Top Technical Advances 2015”,成像、光遗传学、单细胞分析以及基因编辑技术CRISIPR入选。那么,我们就一起看看这四大技术在过去的一年中都取得了哪些进展吧。/pp  strong成像/strong/pp  今年,a title="" style="color: rgb(255, 0, 0) text-decoration: underline " href="http://www.instrument.com.cn/application/SampleFilter-S01-T000-1-1-1.html" target="_self"span style="color: rgb(255, 0, 0) "生命科学/span/a的成像领域打破了过去的壁垒,科学家们通过显微镜学方法越来越深入的观察到了生命组织。/pp  Spectrometer-free vibrational imaging by retrieving stimulated Raman signal from highly scattered photons. Science Advances./pp style="text-align: center "img width="500" height="281" title="1.jpg" style="width: 500px height: 281px " src="http://img1.17img.cn/17img/images/201512/noimg/550d29a2-5d13-4f9b-80da-ed1514392728.jpg" border="0" vspace="0" hspace="0"/ /pp  在过去的十年里,一种称作为体内振动光谱成像(vibrational spectroscopicimaging)的技术一直被用来捕捉一些活体组织中蛋白质、脂类、核酸和其他分子的活动。尽管这一技术可在无需荧光标记的条件下显影组织,但它仍然太慢而无法适用于大多数的研究和a title="" style="color: rgb(255, 0, 0) text-decoration: underline " href="http://www.instrument.com.cn/application/SampleFilter-S01-T000-1-1-1.html" target="_self"span style="color: rgb(255, 0, 0) "临床应用/span/a。/pp  10月30日,Purdue大学的科学家们报告称,他们利用体内振动光谱成像技术大大提高了收集图片的速度(从分到秒)。新技术最关键的改进是不再需要收集分子振动信号的光谱仪。取而代之的是,这一改进的技术在光子进入组织前会对其进行颜色编码。/pp  该研究的通讯作者 Ji-Xin Cheng 说:“我们的想法是在将光子发送到组织前,用不同的兆赫频率进行颜色编码。通过这样的方式,我们能够在几十微妙内收集漫射光子,并通过编码频率和光颜色之间的一一对应检索光谱。”/pp  Whole-animal functional and developmental imaging with isotropic spatial resolution. Nature Methods./pp style="text-align: center "img width="500" height="281" title="2.jpg" style="width: 500px height: 281px " src="http://img1.17img.cn/17img/images/201512/noimg/b0bb94ab-9898-4818-9de9-d2b62801551e.jpg" border="0" vspace="0" hspace="0"//pp  同一个月,发表在《Nature Methods》上的一项研究中,霍华德休斯医学研究所Philipp Keller领导的研究小组发明的一款新型显微镜让科学家们能够更加清晰、全面的观察活体动物的生物过程。/pp  这款显微镜能够产生完整的、不透明生物体的图像,包括斑马鱼或果蝇的胚胎,在三个维度都有足够的分辨率,每个细胞都能展现出明显的结构。更重要的是,它能够观察到胚胎发育过程中细胞的移动,还能够监测大脑活动。研究人员用它记录了果蝇神经系统发育的过程,最终共有10,000个细胞。/pp  strong光遗传学/strong/pp  All-Optical Interrogation of Neural Circuits. Journal of Neuroscience ./pp style="text-align: center "img width="500" height="281" title="3.jpg" style="width: 500px height: 281px " src="http://img1.17img.cn/17img/images/201512/noimg/f53a88eb-91d0-4b20-b9af-9dabdc4fbcc1.jpg" border="0" vspace="0" hspace="0"//pp  今年11月,MIT的Edward Boyden和斯坦福大学的Karl Deisseroth因他们在光遗传学领域的工作获得了表彰。光遗传学技术是指通过光线来操控神经元,科学家们一直在不断的改进这一技术。/pp  本月前,在芝加哥举行的神经科学学会会议上,Deisseroth等人提出了全光电生理学(all-optical electrophysiology)的升级版。哈佛大学Adam Cohen和他的团队开发出了一种reporter,当引入到细胞中去时,在电压发生改变的情况下会发出红外线。Cohen与Boyden一起,将电压指示器与一种响应蓝光的膜通道一起导入到了细胞中,这使得研究人员能够用蓝光开启细胞,用红外线记录它们的活动。/pp  Natural light-gated anion channels: A family of microbial rhodopsins for advanced optogenetics. Science./pp  今年6月,发表在《科学》杂志上的一项研究中,研究人员在海藻中发现了一种紫红质通道蛋白(channelrhodopsin),与先前开发的工程通道相比,它能够更快地抑制神经元活动。科学家们还开发出了一种对在光遗传学控制下神经元作出即时反馈的方法,维持它们的活性在一个理想的状态。这一“神经恒温器”(neuro thermostat)可在24小时内控制细胞的firing rate常数。/pp  strong单细胞分析/strong/pp  Droplet Barcoding for Single-Cell Transcriptomics Applied to Embryonic Stem Cells. Cell/pp  Highly Parallel Genome-wide Expression Profiling of Individual Cells Using Nanoliter Droplets. Cell/pp style="text-align: center "img width="400" height="400" title="4.jpg" style="width: 400px height: 400px " src="http://img1.17img.cn/17img/images/201512/noimg/21d86143-27bf-4226-8414-b90e7a49c325.jpg" border="0" vspace="0" hspace="0"//pp  近年来,单细胞分析蓬勃发展,研究成果不断涌出,技术也越来越精准。今年,通过单细胞分析,科学家们鉴定出了一个新的细菌们,检测了小鼠肠道内最珍贵的细胞类型。5月,发表在《细胞》杂志上的两项研究使单细胞转录组学有了一个相当大的飞跃,并行检测的细胞数量从约100增加到了几千。/pp  哈佛大学的Marc Kirschner和Steve McCarrol实验室开发出了一些高通量技术,能够在样本进入到搅拌器中去之前,快速、轻松、廉价地赋予每个细胞独特的遗传条形码。研究小组希望他们的技术将能够帮助生物学家们更深入地发现和分类机体中的细胞类型,绘制出大脑一类复杂组织中的细胞多样性图谱,更好地了解干细胞分化,以及获得更多有关疾病遗传学的认识。/pp  两个研究小组各自开发了一些方法利用微珠将大量不同的DNA条形码同时传送到几十万纳米大小的液滴中。两种方法都利用了微流体装置来将细胞和微珠一起装入这些液滴中。这些液滴是在一个小型装配线上生成,沿着一根头发宽的槽道流动。微珠条形码附着到每个细胞的一些基因上,因此科学家们可以一批次测序所有的基因,追踪每个基因的来源细胞。/pp  strongCRISPR/strong/pp  我们熟知的基因编辑工具CRISPR不断带来新的研究成果,在许多研究人员利用CRISPR的同时,其他一些人则专注于改进这一技术。/pp  Photoactivatable CRISPR-Cas9 for optogenetic genome editing. Nature Biotechnology./pp style="text-align: center "img title="5.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201512/noimg/153730c1-5f84-484b-a957-9d99a4d6fd77.jpg"//pp  6月15日,发表在《Nature Biotechnology》上的一项研究中,科学家们结合CRISPR与光遗传学构建出了一种系统:一种光激活的新型Cas9核酸酶使得研究人员能够在空间和时间上更好地控制RNA引导的核酸酶的活性。/pp  研究人员通过首先将Cas9蛋白分成两个失活的片段构建出了paCas9。随后他们让每个片段连接一个光控开关蛋白Magnet。当受到蓝光照射时,两个Magnet蛋白结合到一起,分开的Cas9片段随之结合重建出了RNA引导的Cas9核酸酶活性。重要的是,这一过程是可逆的:当切断光线时,paCas9核酸酶会再度分裂,核酸酶活性终止。/pp  Rationally engineered Cas9 nucleases with improved specificity. Science./pp  Cas9酶是基因编辑系统中一个非常关键的组成部分,而脱靶效应一直是CRISPR技术需要克服的重大技术问题。11月30日,发表在《科学》杂志上的一项研究中,麻省理工学院-哈佛医学院Broad研究所CRISPR大神张锋的研究小组又取得了一项突破性的成果。研究人员通过创建了3个新版本的Cas9酶大大降低了CRISPR/Cas9系统的脱靶效应 有效改善了这一技术的最大局限性之一。/pp  In vivo genome editing using Staphylococcus aureus Cas9.Nature./pp style="text-align: center "img width="450" height="281" title="6.jpg" style="width: 450px height: 281px " src="http://img1.17img.cn/17img/images/201512/noimg/48e6fc4c-b79f-4a44-bdb7-88bcca74d8dc.jpg" border="0" vspace="0" hspace="0"//pp  4月1日,发表在《自然》杂志上的一项研究中,张锋研究小组还鉴别出了一种更小的Cas9核酸酶版本。最常使用的Cas9酶源自化脓性链球菌(SpCas9),因太大而无法装入到腺病毒载体中。这项研究中介绍了一种来自金黄色葡萄球菌的Cas9核酸酶(saCas9),它比SpCas9小25%,从而为腺病毒的包装问题提供了一个解决方案。并未参与这项研究的杜克大学的 Charles Gersbach 说:“真正让人兴奋的是saCas9在体内真的能发挥作用。”/pp  Epigenome editing by a CRISPR-Cas9-based acetyltransferase activates genes from promoters and enhancers. Nature Biotechnology./pp  同月6日,Gersbach和同事们也在《Nature Biotechnology》发表了他们的研究成果。研究人员结合一种组蛋白乙酰转移酶与Cas9构建出了一种表观遗传编辑器。他们破坏了Cas9切割DNA的能力,转而利用它作为一种自动引导装置到达基因组中的正确位点,并通过组蛋白乙酰化来启动基因。/pp  span style="font-size: 14px "备注:本文部分内容参考自生物通网站。/span/p
  • Science | 空间组学开启新时代 – 樊荣团队发布空间分辨的表观遗传分析新技术
    空间转录组测序在去年一月被Nature Methods选定为年度创新生物学技术以来,已经成为了组织样本基因表达和组学分析的最前沿利器。但是现有的多种空间组学技术基本局限于对转录组的研究。2020年底,耶鲁大学的樊荣教授团队首次报道了利用组织样本原位编码方法同时分析空间转录组和蛋白组。以此开启的空间多组学分析 (spatial multi-omics)成为了今年 Nature 杂志看好的2022年最值得期待的七个技术领域之一。但是到目前为止, 还没有任何技术能够实现对基因表达机制方面的高空间分辨率的分析。染色质状态决定基因组功能,并以细胞类型特异性的方式进行调节。同时,细胞在组织中的组织方式与它们的功能之间又存在很强的相互联系。因此空间分辨的表观遗传测序技术 (spatial epigenomics)将为这个最前沿的空间组学领域开启另一个全新的篇章。近日,耶鲁大学樊荣教授团队在Science上在线发表了题为Spatial-CUT&Tag: Spatially resolved chromatin modification profiling at the cellular level 的最新空间组学技术Spatial-CUT&Tag (第一作者邓彦翔博士)。Spatial-CUT&Tag技术能够在空间和全基因组水平上观察组织发育的表观遗传机制,实现了与发育和疾病相关的表观遗传调节的空间映射,是科学和医学应用领域的一项重大突破。图1 Spatial-CUT&Tag总体设计和实验流程在樊荣团队的研究中,研究人员专注于最重要的表观遗传变化之一,组蛋白修饰。Spatial-CUT&Tag利用微流控技术将组织进行空间二维编码,并与CUT&Tag技术进行结合,实现了全基因组尺度的空间组蛋白修饰分析。在对小鼠胚胎的空间表观遗传测序中,成功分辨出小鼠胚胎各个器官,测序结果与单细胞表观遗传数据进行比较,数据质量达到相同水平,同时与ENCODE数据库中bulk ChIP-seq测序数据进行比对,也实现了很好的匹配。图2 小鼠胚胎器官发育的空间表观遗传分析利用Spatial-CUT&Tag技术,首次实现直接在产后小鼠大脑中以高空间分辨率观察到特定的组蛋白修饰特征。通过亚型分析发现,H3K27me3在产后小鼠大脑中也可以控制或维持大脑皮质层的形成,与其在小鼠胚胎大脑中的作用相一致。图3 产后小鼠大脑组织空间表观遗传分析樊荣团队进一步测试把荧光染色成像后的小鼠嗅觉球组织切片做Spatial-CUT&Tag测序,然后关联空间表观遗传组到单个细胞核,首次证明可以在组织样品里原位获得单细胞表观遗传组测序数据。Spatial-CUT&Tag作为一项基于NGS的全新空间组学技术,实现了对于组织环境中表观遗传机制的全基因组图谱分析。Spatial-CUT&Tag作为一个全新的起点,可以在不同组织上实现更多类似的发现。从长远来看,樊荣团队希望利用该技术了解不同疾病状态的表观遗传起源,开发针对表观遗传的药物,开辟一条全新的疾病治疗途径。樊荣团队目前正在开发更多空间组学技术。原文链接http://doi.org/10.1126/science.abg7216
  • “迅数”红细胞微核智能分析系统助力遗传毒理研究
    2016年10月27日至28日,由中国毒理学会与深圳市疾控中心共同举办的中国毒理学会第五次中青年学者科技论坛在广东省深圳市顺利召开。会议继承了前几届的传统,以发掘中青年科技人才,培养毒理学后备队伍为导向,全面促进了中青年科技学者在学术科研方面的交流与合作。迅数科技与北京慧荣和、北京科力怡达等展商参加了会议。会议现场  迅数作为此次会议的参展商,向与会的专家学者展示了全自动菌落计数仪以及红细胞微核智能分析系统等产品,期间中国毒理学会孙祖越理事长亲临迅数展台,详细询问微核产品的功能。“迅数”红细胞微核智能分析系统专为遗传毒理大数据设计,适用于姬姆萨(Giemsa)染色的哺乳动物骨髓或外周血红细胞微核试验,可在极短时间内批量抓取2000个PCE细胞,自动识别计算微核细胞率并利用回检系统进行精度复核。孙理事长以及与会代表在看完产品演示之后表示高度赞赏。迅数产品以其精致大气的设计和优质可靠的性能给来访的参会代表留下深刻的印象并流露出一定的购买意向。迅数展位  为期两天的中青年学者科技论坛圆满落幕,但迅数科技不会停止前进的脚步,将以更积极的姿态为实验室工作人员提供优质可靠技术与完善售后服务而不断努力,继续创造新的精彩。
  • 【Seminar】naica® 六色微滴芯片数字PCR系统进行表观遗传学和基因编辑检测
    对于珍贵的生物样本来说,使用有限的生物样本获取更多的数据结果,能够帮助科研学者和诊断人员获得更全面的信息,同时降低运行成本,提高工作效率。11月18日,法国Stilla Technologies公司将举办naica六色微滴芯片数字PCR系统线上Seminar,本次Seminar邀请了Eugène Marquis癌症中心学者分享数字PCR在肿瘤基因PIK3CA突变检测方面的研究进展,免疫表型中心学者进行数字PCR在表观遗传学和基因编辑领域的应用研究报告;同时,还将举办线上naica数字PCR实验培训,届时欢迎大家前来学习。【关于Stilla Technologies】法国Stilla Technologies是总部位于巴黎的欧洲生物创新技术公司,具有跨学科专业知识的全球团队,利用先进的微流体化学,分子生物学和计算机科学等技术,拥有80多项全球专利,致力于提供突破性且灵活的naica系统来加速下一代基因检测的开发。为全球的研究人员和临床医生提供高精度的遗传分析解决方案来改善健康状况。【关于深蓝云】北京深蓝云生物科技有限公司作为法国Stilla Technologies公司在中国的数字PCR技术示范与服务中心,在北京和苏州建有标准PCR实验室,致力于为用户提供新型生命科学研究仪器和分析产品以及优化的整体应用解决方案。深蓝云生物配备着专业的技术支持和应用支持,依托生命科学产品和解决方案,专注为用户提供分析产品和完善的售前咨询和售后服务。naica六通道微滴芯片数字PCR系统法国Stilla Technologies公司naica六通道微滴芯片数字PCR系统,源于Crystal微滴芯片式数字PCR技术,自动化微滴生成和扩增,每个样本孔可实现6荧光通道的检测,智能化识别微滴并进行质控,3小时内即可获得至少6个靶标基因的绝对拷贝数浓度。
  • 西农产品质量安全服务协会立项《水产动物线粒体DNA序列遗传多样性分析操作规程》团体标准
    各有关单位:根据《广西农产品质量安全服务协会团体标准管理办法》的相关规定,协会组织专家对《水产动物线粒体DNA序列遗传多样性分析操作规程》团体标准进行讨论评审,符合立项条件,现批准立项。同时欢迎与本标准有关的高校、科研机构、技术机构及相关企业单位或个人加入本标准的起草制定工作,有意参与本团体起草制定工作的人员请与协会联系。联系人:高工电话:15177796006邮箱:664987261@qq.com广西农产品质量安全服务协会2023年4月20日
  • 基因测序催生的“金领”职业 遗传咨询师
    随着基因组检测技术的迅猛发展,人们对疾病的认知提升到一个新的高度。对遗传物质的正确解读可为疾病的防治提供重要的信息,由此产生了一门新的学科——遗传咨询,新兴的金领职业“遗传咨询师”正在受到妇幼医生、儿科医生、生命科学院毕业生、分子诊断实验室、医院及第三方检验科室工作人员等群体的追捧。  《瞭望东方周刊》:解码遗传咨询师  不仅在医疗界受追捧,遗传咨询行业还受到了央级期刊的关注。日前,《瞭望东方周刊》以《解码遗传咨询师》为题详细解析了我国遗传咨询行业的发展现状。《瞭望东方周刊》以典型的孕前检测遗传咨询为例,强调了遗传咨询师的重要性。然而遗传咨询绝不仅限于孕前检测和产前诊断,遗传咨询技术应用极为广泛,遗传咨询所针对的人群也不尽相同。可以是婴幼儿群体和育龄成人,例如对于新生儿代谢缺陷疾病的生化遗传检查;也可以是成年群体,比如各种用药筛选的诊断,常见的如肿瘤用药 甚至可以是健康群体,比如针对某些常见隐形遗传疾病的筛查,以及其他领域的特殊群体,如亲子鉴定、法医学鉴定等。  遗传咨询师是产业发展的必然,也是人类健康所需  随着人类基因组计划的完成,基因行业的发展可谓是日新月异。随着基因二代测序技术的兴起与成熟,测序成本大幅减低,基因测序因此从单纯的科研走向了大规模临床应用,迎来了广阔的市场空间。2014年,基因测序设备领域龙头企业Illumina将人类全基因测序的价格降低至1000美金,今年我国一些企业也开始推出自主研发测序系统,目的是降低测序成本,构建良好的行业生态系统。  与如火如荼的行业生态相比,目前基因消费市场还处于冰海之中,基因测序临床化还存在很多疑点,主要表现在:不了解什么是基因测序?看不懂基因测序结果报告?读懂了检测报告也不知道接下来该怎么做?基因检测要真正惠及全人类,这些问题必须要解决。那么解决这些问题,需要一群专业人士的帮助,他们就是传说中的遗传咨询师。  遗传咨询师的角色  遗传咨询师作为揭秘基因密码的专业人士,是链接临床门诊和遗传诊断实验室的桥梁。遗传咨询师必须具有丰富的专业知识、长期工作积累的经验、优秀的沟通能力等。遗传咨询师的工作包括:根据用户的家族史、医疗史和检测目的,给出最适合客户的基因检测产品建议 综合检测报告和所有能获得的信息,评估疾病发生或复发的几率 进行疾病遗传、检测、管理、预防等知识的传授 帮助受试者做出正确的选择,理性面对致病风险,同时疏导检测结果对受试者可能产生的心理问题。  我国培训体系已建立:遗传咨询分会已举办四届遗传咨询师培训班  遗传咨询行业在美国已有很多年,但在中国才刚刚开始。基于基因测序技术的迅猛发展以及巨大的临床需求,2015年2月9日中国遗传学会成立了中国遗传学会遗传咨询分会(简称遗传咨询分会),由著名遗传学家贺林院士出任主任委员。今年8月,贺林院士带领团队与美国两大权威遗传咨询机构的代表——美国遗传咨询师认证行会(ABGC)代表委员、美国遗传咨询认证委员会(ACGC)代表委员在波士顿进行了正式的官方会谈,商讨建立了中美双方在遗传咨询领域的官方合作机制。这意味着我国将出现一批与国际标准接轨的经过专业培训的认证遗传咨询师。  自成立遗传咨询分会以来,我国举办了四届遗传咨询师培训班。2015年4月22日由中国遗传学会遗传咨询分会主办,复旦大学生命科学院承办的第一届遗传学会遗传咨询师培训班在上海正式开班。此次培训班面向医院的医生、从事临床诊断的实验室人员(出生缺陷和遗传病、遗传综合症、复杂疾病、儿科、产科、肿瘤等科室)、检验师、相关科研和教学工作者,共开设三门课程,分别是医学遗传学(基础篇),临床医学遗传咨询(各论篇)和遗传检测分析与诊断方法,共8天,72个学时。内容涉及遗传病、出生缺陷、复杂多基因病、个体化用药和基因组转化医学等各方面,并详细介绍基因组时代可用于基因检测和分子诊断的多种技术手段,特别是利用新一代测序仪和基因芯片进行全基因组SNP、CNV、基因表达和突变分析等,同时,进行分子诊断临床实践、报告解读以及遗传咨询等情景案例教学。  2015年7月14日,中国遗传学会遗传咨询分会在中国遗传学会遗传咨询分会主席贺林院士的牵头下,联合了国家辅助生殖与优生工程技术研究中心暨山东大学附属生殖医院于济南开办了第二届遗传学会遗传咨询师培训班。此次培训班在第一次成功开班的基础上,引进了美国和香港中文大学遗传咨询师培训课程和教学模式,实现与国外相关领域的全面接轨,以主题演讲、病例讨论、学术互动等形式,使学员们通过本次培训,可以获得最新的医学遗传知识,掌握处理存在遗传病风险的患者及其家庭的医学策略,理解包括单基因病、多基因病在内的分子机制,并能解释疾病的遗传机制,理解分子遗传方法的原理,建立发现致病基因的科学策略。  2015年11月5日中国遗传学会遗传咨询分会第三届遗传咨询师培训班(初级班)在美丽的广西南宁市(邕城)盛大开幕。此次培训班面向具有临床资质的临床医生 医学院或生命科学院本科毕业生 分子诊断实验室,医院及第三方检验科室初级职称者 从事相关专业的科研教学、临床检验、遗传诊断,遗传咨询工作经历2年以上者。  2015年11月7日由遗传咨询分会主办,中国医科大学附属盛京医院承办的第四届遗传学会遗传咨询师培训班在辽宁沈阳市盛大开幕。内容包括遗传咨询基础理论、遗传咨询临床应用、遗传咨询检测技术和遗传咨询政策法规四个部分。此次培训班将在之前成功开班的基础上,进一步完善培训课程和教学模式,在7天的集中培训后,还设立了3个月的远程培训。远程培训的课件邀请ABGC的授课老师设计,包含多种临床案例的遗传咨询,汇聚了北美遗传咨询师教学的精华案例,使国内的遗传咨询培训第一次和北美遗传培训同步。  记者了解到,遗传咨询分会目前正在筹备下一届遗传咨询师培训班的召开,这意味着我国遗传咨询师培训体系已全面拉开。  结语  高通量测序技术的发展,为遗传病和癌症的预防、诊断和治疗带来了福音。在这些高新技术进入临床实践应用的过程中,逐渐暴露出目前医疗体制和医疗环境的不足,规范指南的缺乏,相关机构和技术人员短缺等问题。其中,最主要的问题体现在临床一线遗传咨询师的短缺和相关知识,尤其是对检测报告的解读、遗传学诊断和临床处理策略方面相关知识的匮乏。因此,加速增加遗传咨询师的培训、认证、岗位设定等内容迫在眉睫。随着国家的高度重视和支持力度的迅速增加,遗传咨询正成为基因测序转向临床应用必不可少的一环。
  • 595万!长三角地区叶菜类蔬菜遗传育种农业农村部重点实验室高效液相色谱串联质谱分析仪等采购项目
    1.项目编号:NJDCX-2022090715012.项目名称:长三角地区叶菜类蔬菜遗传育种农业农村部重点实验室建设项目仪器设备采购(第一批)3.采购方式:公开招标4.预算金额:人民币595万元整分包一预算:人民币390万元整分包二预算:人民币205万元整5. 最高限价:分包一最高限价:人民币330万元整分包二最高限价:人民币205万元整投标人可参加全部或部分分包的投标,但只能中选其中一个分包。如果投标人在2个或以上分包综合得分排序均第一,则推荐其为预算金额较大的分包为第一中标候选人,其它分包不再被推荐为第一中标候选人。6. 采购需求:农业农村部重点实验室体系是国家农业科技创新体系的重要组成部分,是凝聚和培养优秀农业科技人才,组织行业科技创新,开展学术交流的重要基地,是农业科技创新的主力军。南京国家现代农业产业科技创新中心管理办公室为提升实验室硬件、软件水平,利用细胞学、分子生物学与传统育种学相结合,提高以小白菜、甘蓝为主叶菜类蔬菜有重点目标性状的改良,创新叶菜类蔬菜种质材料,突破长三角地区叶菜类蔬菜品种抗逆性、抗病性等育种水平,实现优质、绿色叶菜产品周年生产市场需要,拟购置仪器设备一批,分包一高效液相色谱串联质谱分析仪;分包二封膜仪、小型核酸蛋白提取纯化仪、KASP荧光分析仪、差示扫描量热仪、超滤系统、冷冻干燥机、气相色谱系统、液相色谱系统。7.交货期限:合同签订生效后,国产设备及进口设备(非免税)一个月内全部设备、材料运抵现场,并安装、调试结束,验收合格,交付采购人使用。8.本项目不接受联合体投标。
  • 890万!中国海洋大学流式细胞分选仪、蓝色种业遗传与表型大数据处理系统等采购项目
    一、项目基本情况项目编号:SDSHZB2023-551项目名称:中国海洋大学流式细胞分选仪、蓝色种业遗传与表型大数据处理系统等采购项目预算金额:890.0000000 万元(人民币)采购需求:本项目分为2个包,预算总金额为890万元,其中:A1包:流式细胞分选仪及超速离心机(接受进口产品),预算金额:490万元;A2包:蓝色种业遗传与表型大数据处理系统(接受进口产品),预算金额:400万元。合同履行期限:详见附件本项目( 不接受 )联合体投标。二、获取招标文件时间:2023年08月16日 至 2023年08月22日,每天上午8:00至11:30,下午13:00至16:00。(北京时间,法定节假日除外)地点:青岛市市北区敦化路138号甲西王大厦24楼23A01房间或邮件报名方式:以下方式二选一:(1)现场报名:须携带加盖单位公章的营业执照副本复印件及现金,按照上述时间、地点获取招标文件。(2)邮件报名:有意参加本次采购活动的投标人填写项目名称、项目编号、包号、公司名称、联系人、联系电话、邮箱、营业执照扫描件及标书费汇款底单发送至shzbqdb@163.com,邮件名称命名为:中国海洋大学流式细胞分选仪、蓝色种业遗传与表型大数据处理系统等采购项目-报名-“投标单位名称”。开户银行:兴业银行青岛市北支行,开户名:山东盛和招标代理有限公司,银行账号:522130100100053768,提交标书费须从投标人基本账户或一般账户转出,电汇时须注明2023-551-包号、资金用途注明标书费。未按规定报名的投标人其报名无效,本项目实行资格后审,获取招标文件成功不代表资格后审通过,招标文件售后不退。售价:¥300.0 元,本公告包含的招标文件售价总和三、对本次招标提出询问,请按以下方式联系。1.采购人信息名 称:中国海洋大学     地址:青岛市崂山区松岭路238号        联系方式:崔老师0532-66781979      2.采购代理机构信息名 称:山东盛和招标代理有限公司            地 址:青岛市市北区敦化路138号甲西王大厦24楼23A01房间            联系方式:孙萌、肖颖梦0532-67737979            3.项目联系方式项目联系人:孙萌、肖颖梦电 话:  0532-67737979
  • 《细胞》发表史上最全癌症遗传风险图谱
    p  由西安交大计算机科学与技术系、陕西省医疗健康大数据工程研究中心教授王嘉寅团队与圣路易斯华盛顿大学、哈佛大学—麻省理工学院Broad研究所、贝勒医学院、梅奥临床医学院等13家世界顶级研究机构历时近三年合作完成了迄今为止最全面的癌症遗传风险图谱,相关成果近日发表于《细胞》。/pp  该研究基于33种常见癌症类型、共计1万多名肿瘤患者的多组学大数据,全面应用了目前最优的生物信息学分析和实验手段,优化设计了面向多组学的数据处理流程,累计分析了超过14.6亿个候选基因变异,首次系统性报道了871个罕见易感/疑似易感变异和拷贝数变异,且较大比例地存在与基因表达异常、丧失异质性等体细胞突变的耦合。这些结果为下游研究特别是遗传变异分类和检测奠定了基础。同时,大数据分析明确展示了不同癌症类型的一些病例具有共同或类似癌症遗传风险的关键证据,这些共性模式及其与体细胞突变的相互作用能够为异癌同治提供临床辅助决策依据。/pp  现代肿瘤学研究理论认为,肿瘤的发生、发展是肿瘤患者的内因和外因耦合作用的结果,其内因主要是癌症遗传风险。基于多组学大数据,挖掘癌症遗传风险,不仅是肿瘤研究的前沿领域和热点方向,而且能够广泛应用于肿瘤风险筛查、肿瘤分子预警、肿瘤精准体检和早诊。而基于大数据绘制癌症遗传风险图谱是癌症遗传风险图谱研究的热点和难点,风险图谱是临床辅助决策的重要基线之一。/pp 论文题目:Pathogenic Germline Variants in 10,389 Adult Cancers/p
  • 华大基因人类遗传与疾病研究技术实现新突破
    中国经济网记者今日从华大基因获悉,华大基因正推出一种新型人类基因组区域捕获技术,即超级序列捕获技术(简称Allinone),该技术主要通过对特定群体设计探针集,从基因组水平上对人类全基因组的外显子区域、群体特异的tagSNP(标签SNP)区域和MHC区域(人类白细胞抗原系统区域)实现同步捕获,然后再进行高通量测序分析。 据悉,Allinone所捕获的这些DNA区域与人类疾病的发生发展紧密关联,且具有简便、经济、高效、覆盖范围广等优点,因此该技术将成为人类遗传和疾病研究领域的一种新型高效的基因组研究工具。 据了解,Allinone探针集将会覆盖整个基因组的5%-10%,不但可以捕获基因编码区域,还可以捕获很多非编码区域。目前广泛应用的外显子测序技术可以捕获基因编码区,但是基因组中的很多功能区域是非编码的,这些非编码区虽然不能够转录信使RNA,但是能够调控遗传信息的表达,所以了解非编码区域的遗传信息将提供更加完整的基因表达控制信息,而Allinone平台可轻松解决这个问题。 Allinone探针集覆盖了群体特异的tagSNP区域,所以通过该技术可以高效、快捷的了解群体的特异性变异情况,这对复杂疾病研究具有非常重要的意义。单核苷酸多态性(SNP)是人类基因组中最丰富的遗传变异,其中少量的标签SNP(挑选出的SNP集合)就能够提供与全部SNP位点大致相同的图谱信息。由于各种群之间存在遗传差异性,所以每个种群也拥有代表该种群基因图谱的标签SNP,只需通过这些标签SNP便可以对大量样本或整个种群的变异情况进行研究。 Allinone目标捕获区域还整合了华大基因最近研发的MHC区域捕获探针集,即可对人类MHC区域实现高度覆盖及有效富集。MHC区域广泛参与免疫应答的诱导与调节,与已发现包括自身免疫疾病、癌症、多种复杂疾病等至少百余种疾病密切相关。由于该区域和多种复杂疾病的发生以及人类免疫系统活动具有密切关系,因此Allinone对该区域的覆盖无论对人类疾病的机理研究还是药物研发都具有非常重要的意义。 华大基因执行院长王俊称:“目前,我们已经开始使用中国疾病患者的样本对汉族人群的Allinone捕获技术进行测试评估。只要建立一个‘种群特异性’的参考基因组,就可以应用Allinone捕获技术对其他更多的样本进行重测序研究。除了针对汉族人群的Allinone,华大基因还将针对世界其它主要人群设计及推出相应人群的Allinone研究工具,从而推动全世界的基因组学研究的快速发展。” 华大基因研究人员高玉池表示:“目前,我们所研发的Allinone的总体目标区域大小为180M左右,可以广泛应用于以汉族人群或汉族近缘群体为研究对象的基因组学研究。”对该技术的测试评估结果表明,目标区域覆盖度达到97%以上,检测的SNP位点与高深度全基因组测序结果一致性率在99.5%以上。此外,华大基因还在研发更加多样化的高级信息分析内容,以更好的解释基因组数据的生物学意义。高玉池表示:“我们相信Allinone凭借其数据全面性、操作灵活性、高性价比等多方面优势将成为人类疾病基因组学、表型-基因型关联研究及其它人类遗传学研究的最佳工具。”
  • 赛默飞推出三项针对遗传研究的创新技术
    新型酶实现扩增子测序最高NGS准确度,Hi-Q化学过程提高Ion PGM系统中的SNP和Indel检测性能2015年1月13日,中国上海 —— 近日,科学服务领域的世界领导者赛默飞(以下简称:赛默飞)Thermo Fisher Scientific推出了三项针对遗传研究的创新技术为遗传研究提供助力:用于加强Ion PGM系统中单核苷酸多态性 (SNP) 和插入缺失 (Indel) 检测性能的新型酶,用于基因遗传性耳聋研究的引物组,以及对其靶向捕获引物设计热门网站AmpliSeq Designer的升级。这些新产品在美国人类遗传学协会 (ASHG) 2014年度会议中首次亮相,会议于10月18日至22日在圣地亚哥会议中心举行。为进一步表现该新型酶的性能,赛默飞于会议期间还举办了主题为“从研究到临床——Ion Torrent测序为遗传研究中的下一代测序带来新突破”的教育研讨会,彰显使用新型酶(包含在Ion PGM Hi-Q测序试剂盒中)获取的初步研究成果以及该产品的巨大潜力。使用新型酶(包含在Ion PGM Hi-Q测序试剂盒中)获取的初步研究成果表现出该产品的巨大潜力,这些成果将在今天的赛默飞世尔午餐教育研讨会中揭晓,主题为“从研究到临床——Ion Torrent测序为遗传研究中的下一代测序带来新突破”。在内部测试期间,我们赛默飞使用Hi-Q测序试剂盒在Ion PGM系统上进行了10次完整测序,并将性能表现和对手其他系统的进行了对比。两个平台均运行AcroMetrix肿瘤热点质控品,该质控品使用特征明确的基因组背景并结合了多种合成COSMIC变体。这些测试表明,Hi-Q测序试剂盒在Ion PGM平台的化学过程比市场上其他的主流平台表现出更高的SNP准确度。不仅如此,该研究还显示,Ion PGM系统与Hi-Q试剂盒搭配使用能够:将扩增子测序中的Indel误差降低43%(较之前使用的Ion PGM测序酶);使特定已知变体检出率达到94.1%,测试中其他平台为高于竞争平台的91.3%;使反映碱基正确识别能力的阳性预测值 (PPV) 达到99.8%,测试中其他平台相比竞争产品的98%更加准确。“我们的新型Hi-Q酶能读取更清晰的二级结构,从而提供更强的信号和更高的准确度,”负责赛默飞世尔生命科学解决方案业务生物信息产品的高级主管Mike Lelivelt说,“通过使用包含500个以上已知癌症变异大量真值的受控样品,我们得以真实地比较针对靶向癌症测序的平台准确度。” 赛默飞世尔还推出了Ion AmpliSeq听觉丧失研究引物组,它使研究人员可以靶向研究与这种以极端的遗传异质性闻名的疾病相关的63个基因。根据实际研究需要,用户可以在每块Ion 318芯片上运行6到8个样品。 另外,Ion AmpliSeq Designer靶向捕获引物设计网站经过扩展可支长达375碱基对的定制扩增子设计。Ion AmpliSeq 375碱基长度设计是对高质量DNA进行遗传病相关种系突变测序的理想选择。为了满足不同测序应用的需要,仍会供应上至175及275碱基对的定制扩增子设计。Ion PGM系统、Ion PGM Hi-Q测序试剂盒与Ion AmpliSeq引物组仅用于研究目的,不用于诊断程序。 关于赛默飞世尔科技赛默飞世尔科技(纽约证交所代码:TMO)是科学服务领域的世界领导者。公司年销售额170亿美元,在50个国家拥有员工约50,000人。我们的使命是帮助客户使世界更健康、更清洁、更安全。我们的产品和服务帮助客户加速生命科学领域的研究、解决在分析领域所遇到的复杂问题与挑战,促进医疗诊断发展、提高实验室生产力。借助于Thermo Scientific、Life Technologies、 Fisher Scientific和Unity? Lab Services四个首要品牌,我们将创新技术、便捷采购方案和实验室运营管理的整体解决方案相结合,为客户、股东和员工创造价值。欲了解更多信息,请浏览公司网站:www.thermofisher.com。 赛默飞世尔科技中国赛默飞世尔科技进入中国已超过30年,在中国的总部设于上海,并在北京、广州、香港、台湾、成都、沈阳、西安、南京、武汉等地设立了分公司,员工人数超过3800名。为了满足中国市场的需求,现有8家工厂分别在上海、北京、广州和苏州运营。我们在全国共设立了6个应用开发中心,将世界级的前沿技术和产品带给国内客户,并提供应用开发与培训等多项服务;位于上海的中国创新中心结合国内市场的需求和国外先进技术,研发适合中国的技术和产品;我们拥有遍布全国的维修服务网点和特别成立的中国技术培训团队,在全国有超过2000名专业人员直接为客户提供服务。我们致力于帮助客户使世界更健康、更清洁、更安全。欲了解更多信息,请登录www.thermofisher.cn。
  • 第二届Illumina生殖与遗传系列(上海站) 暨“高通量时代的产前及儿童遗传学检测及咨询”圆满落幕
    p style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201708/insimg/48b312a7-ca0e-4a6f-8e23-01dfa60db6ed.jpg" title="1.jpg"//pp  天朗气清,金风送爽的八月,第二届Illumina生殖与遗传系列高峰论坛终点站于13日在上海拉开帷幕,与郑州站和西安站不同的是,本站主题将高通量芯片及测序技术的应用从产前检测延伸到了儿童遗传学检测及咨询领域。/pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201708/insimg/ac293152-ba14-4335-b3dd-c90fc79b813b.jpg" title="2.jpg"//pp style="text-align: center "▲ 上海场会议现场/pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201708/insimg/a2589c8d-c3ec-4008-9981-527ee23d4f81.jpg" title="3.jpg"//pp style="text-align: center "▲ 欢迎辞 Tom Berkovits 先生 Illumina亚太区市场发展部副主管br//ppstrongspan style="color: rgb(31, 73, 125) "span style="font-size: 18px "01/span/span/strongspan style="color: rgb(31, 73, 125) "span style="font-size: 18px "/span strong高通量测序技术在儿童遗传病应用—— 瓶颈、挑战和突破/strong/span/pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201708/insimg/296b5673-b3cf-4af9-b3e5-5aa61a0345e3.jpg" title="4.jpg"//pp style="text-align: center "▲ 讲者:余永国 博士/pp  余博士风趣详实地通过病例分享肯定了新一代测序技术的优势 —— 辅助临床明确遗传学病因、精准医疗,推动着临床诊断进入新模式。但高通量分子诊断技术在临床应用中也面临一些瓶颈和挑战,如:针对复杂的临床患者如何选择不同的分子诊断方案,如何规范实验室报告、缺乏大数据分享、基因芯片和下一代测序技术的选择等,针对以上困难,余博士认为,首先作为临床医务工作者,需要加强临床遗传基本功,规范遗传咨询流程,普及遗传学科普知识;医疗机构需要壮大遗传咨询师及遗传咨询医师的队伍;联合多学会建立规范的学组共识;最后余博士倡导医院、检测机构共同努力搭建可视化共享的出生缺陷及重大遗传性疾病的遗传数据库,进行新技术的大样本探索。/ppspan style="color: rgb(31, 73, 125) "strongspan style="font-size: 18px "02/span 医学外显子组测序在遗传病患儿诊断中的应用介绍 /strong/spanbr//pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201708/insimg/1bcb91ab-2ebc-4549-9d05-768e5ddf784e.jpg" title="5.jpg"//pp style="text-align: center "▲ 讲者:赵薇薇 教授/pp  遗传因素是疾病发生的重要原因之一,据OMIM数据库统计,符合孟德尔遗传方式的疾病有8477种,其中表型有描述,基因明确的有5051种,如何针对发病率低,病种繁多,累计发病率高的遗传病进行检测,赵教授认为外显子测序能提供更精准的诊断。(医学外显子组技术是针对每个怀疑有遗传病的个体同时检测约5000个致病基因)从2009年至今金域分子遗传共收集患者及家系样本6万例,采用Illumina公司的TruSight One临床外显子 — Panel检测,突变检出率为37%。最后赵教授通过病例解析强调了高通量测序过程中质量控制、生物信息学分析中的过滤参数以及ACMG五分类法在变异注释时的重要性。/ppspan style="color: rgb(31, 73, 125) font-size: 18px "strong03/strong/spanspan style="color: rgb(31, 73, 125) "strong Genetic counseling: Tool to Convey Complex Information/strong/span/pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201708/insimg/77eb1cdb-b1d8-4e8d-b5cd-d55ff7e54375.jpg" title="6.jpg"//pp style="text-align: center "▲ 讲者:Sucheta Bhatt 博士/pp  Sucheta博士在这一站分享了更多有关儿童遗传疾病咨询的经验,她首先强调进行遗传咨询时首先获得病史及家族史的重要性,指导根据疾病的临床特征分析病因,如何提供遗传风险评估的专业意见,如何与临床医师紧密合作,以及如何在充分知情同意后帮助患者选择下一步诊断技术。随后Sucheta博士引入一个疑似Noonan综合征儿科病例,从问诊,搜集病史,到评估各项检测,再到与患者家人的咨询建议,把遗传咨询的流程及要点清晰地呈现给听众们。/ppspan style="color: rgb(31, 73, 125) font-size: 18px "strong04/strong/spanspan style="color: rgb(31, 73, 125) "strong 高通量分子检测技术在出生缺陷三级防控中的应用/strong/span/pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201708/insimg/9a168f3a-2870-47b9-aea8-e80396b2fff4.jpg" title="7.jpg"//pp style="text-align: center "▲ 讲者:熊丽 博士 Illumina大中华区临床应用专家/pp  出生缺陷是一个严重的公共卫生和社会问题备受关注,传统技术精度及通量受限,Illumina基因芯片和新一代测序为代表的高通量检测技术展现出实力。熊丽博士由出生缺陷三级防控入手,分别介绍各类分子诊断技术的应用范围:br//pp  一级预防:携带者筛查通过靶向测序技术得以实施;胚胎植入前遗传学筛查(PGS)采用低覆盖度全基因组测序优选二倍体胚胎。/pp  二级预防:核型定位技术(Karyomapping)能够成为通用单基因病胚胎植入前遗传学检测解决方案;NIPT是新一代测序技术在临床广泛应用的典范,阳性预测值可高于90%;基因芯片技术作为核型分析的补充在染色体病的产前检测中广泛应用。/pp  三级预防:目前国际多个研究项目正采用新一代测序技术进行新生儿筛查研究,而临床全外显子检测,全外显子或全基因组测序大大提高了检测力,也在逐步改变目前的遗传疾病低效诊疗模式。/ppspan style="color: rgb(31, 73, 125) font-size: 18px "strong05/strong/spanspan style="color: rgb(31, 73, 125) "strong 案例讨论/strong/span/pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201708/insimg/54d054ce-945a-40b8-a8b2-bf866014a8d4.jpg" title="8.jpg"//pp style="text-align: center "▲ Sucheta Bhatt 等/pp  上海站的压轴环节,是由Sucheta博士带来的遗传咨询典型案例讨论,30分钟时间内,两个曲折精彩的病例,现场新华医院余博士、上海国妇婴徐晨明博士等均参与分享了见解及咨询经验。两个案例一个先天性多发畸形,通过全基因组测序找到了致病基因,指导后续的检测及再发风险;另一个为重度发育迟缓,经家系外显子测序后仅找到临床意义不明(VOUS)的变异,在场同仁们探讨这类变异的咨询重点,随访需求以及数据库积累更新的重要性。余博士在点评时特别强调了中西方文化差异以及在中国临床遗传咨询需重视的沟通技巧,面对类似案例的咨询思路,操作流程建议,收获全场掌声不断。br//ppstrong后记:/strong郑州,西安,上海,三场足迹让我们深深体会到了临床用户们对新一代测序的认可与需求:/ppstrong8月9日 郑州/strongbr//pp  Illumina与安诺优达公司、郑大一附院联合举办的郑州站论坛,以“碰撞 · 融合 · 发展”为主题引入了高通量测序技术的遗传学热点应用。br/strong8月12日 西安/strongbr//pp  Illumina与贝瑞和康公司联合举办的西安站引起了各个产前诊断中心同仁门的热切交流,将高通量测序技术带入了深入应用及临床转化的话题。br/strong8月13日 上海/strongbr//pp  Illumina生殖与遗传高峰论坛的上海站主场,把学术与交流的主题从产前筛查、产前诊断、延伸到儿童遗传学检测,在众多专家们的学识碰撞及实战经验交流之间,赋予了高通量测序在遗传学领域应用更加明媚的前景。 br//pp  不论是最为成熟的无创产前检测(NIPT),还是新兴引起广泛关注的植入前遗传学筛查(PGS),或是在遗传病检测实践中初步展露头角的产前CNV测序及遗传疾病外显子测序,医疗同行们对Illumina技术的愈加关注,通过各中心经验的分享,增添了对新技术的应用信心和期望。为此,Illumina从未停止过创新脚步,致力于通过科技的革新帮助更多用户改善检测流程,寻找遗传学答案,解开基因组学奥秘。/ppspan style="color: rgb(255, 192, 0) "strong关于Illumina/strong/spanbr/Illumina公司通过解码基因组而改善人类健康。我们注重创新,这使我们成为DNA测序和芯片技术的全球领导者,并为科研、临床和应用市场的客户提供服务。我们的产品应用分布在生命科学、肿瘤学、生殖与遗传、农业及其他新兴市场领域。如欲了解更多信息,请访问Illumina中国官网。/p
  • 金领职业“遗传咨询师”受追捧,第三届遗传咨询师培训班盛大开幕
    p  随着基因组检测技术的迅猛发展,人们对疾病的认知提升到一个新的高度。对遗传物质的正确解读可为疾病的防治提供重要的信息,由此产生了一门新的学科——遗传咨询,新兴的金领职业“遗传咨询师”正在受到妇幼医生、儿科医生、生命科学院毕业生、分子诊断实验室、医院及第三方检验科室工作人员等群体的追捧。/pp  基于遗传咨询巨大的临床需求,中国遗传学会遗传咨询分会第三届遗传咨询师培训班(初级班)于11月5日在美丽的广西南宁市(邕城)盛大开幕。这是中国遗传学会遗传咨询分会继上海和济南成功开班后,再次联合广西妇幼保健院和广西出生缺陷预防控制研究所,在南方地区继续扩大遗传咨询师队伍。/pp  开幕式由广西妇幼保健院院长郑陈光主持。中国遗传学会遗传咨询分会主任委员贺林院士、委员陈少科、傅松滨、龚瑶琴、沈亦平、顾问马端、赵彦艳,秘书王磊、梁波出席了开幕式。/pp style="TEXT-ALIGN: center"img style="WIDTH: 450px HEIGHT: 281px" title="1.jpg" border="0" hspace="0" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201511/noimg/2cb9f120-22fc-441c-bce6-e04e40708aca.jpg" width="450" height="281"//pp style="TEXT-ALIGN: center"  strong贺林院士致辞/strong/pp  贺林院士首先在开幕致辞中对中国遗传学会遗传咨询分会第三届遗传咨询师培训班(初级班)成功开班表示祝贺,对广西妇幼保健院和广西出生缺陷预防控制研究所的支持表示感谢,对来自全国各地的培训学员表示欢迎,并向热忱投身于遗传咨询工作的同仁们表示敬意。/pp style="TEXT-ALIGN: center"img style="WIDTH: 450px HEIGHT: 281px" title="2.jpg" border="0" hspace="0" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201511/noimg/d1a91ca3-f9fd-4f6d-846a-a2c89a139c79.jpg" width="450" height="281"//pp style="TEXT-ALIGN: center"  strong广西妇幼保健院院长郑陈光主持开幕式/strong/pp  接着郑院长代表广西妇幼保健院向百忙之中抽空参与教学的专家、教授们表示感谢,向远道来到邕城(南宁市)参加培训的学员表示欢迎,并介绍了广西妇幼保健院遗传代谢中心实验室的相关情况,广西妇幼保健院遗传科目前主要从事产前筛查、产前诊断技术服务以及新生儿遗传代谢病筛查、诊治工作,接收来自全区各地医疗机构递送的标本进行检测,是广西首批获得新生儿疾病筛查中心许可、产前诊断技术机构许可的机构。/pp  随后大会举行揭牌仪式,中国遗传学会遗传咨询分会授权广西妇幼保健为遗传咨询师培训机构,这是继山东大学辅助生殖医院之后授权的又一遗传咨询师培训机构。/pp style="TEXT-ALIGN: center"img style="WIDTH: 450px HEIGHT: 281px" title="3.jpg" border="0" hspace="0" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201511/noimg/418934c2-9e7b-4d52-aa40-70622868d345.jpg" width="450" height="281"//pp style="TEXT-ALIGN: center"  strong揭牌仪式:贺林院士(左)和郑陈光院长(右)/strong/pp style="TEXT-ALIGN: center"img style="WIDTH: 450px HEIGHT: 281px" title="4.jpg" border="0" hspace="0" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201511/noimg/362314af-782b-42cb-af73-39b553054904.jpg" width="450" height="281"//pp style="TEXT-ALIGN: center"  strong参加揭牌仪式后培训班成员的合影留念/strong/pp  此次培训班面向具有临床资质的临床医生 医学院或生命科学院本科毕业生 分子诊断实验室,医院及第三方检验科室初级职称者 从事相关专业的科研教学、临床检验、遗传诊断,遗传咨询工作经历2年以上者。课程分为遗传咨询基础理论、遗传咨询临床应用、遗传咨询检测技术和遗传咨询政策法规四个部分,历时7天,邀请到了多位国内一流的遗传及临床专家授课,包括贺林、傅松滨、高媛、龚瑶琴、顾学范、管敏鑫、贺光、黄尚志、李金明、李亦学、廖世秀、卢大儒、马端、秦胜营、沈亦平、孙树汉、唐北沙、王红艳、王慧君、邢清和、徐湘民、杨正林、尹爱华、袁慧军、赵彦艳等(按音序排列)在内的院士、长江学者、杰青、973首席及各领域临床遗传学专家。/pp style="TEXT-ALIGN: center"img style="WIDTH: 450px HEIGHT: 281px" title="5.jpg" border="0" hspace="0" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201511/noimg/5d9550a2-7f6f-4cbe-b599-928908f4ebee.jpg" width="450" height="281"//pp style="TEXT-ALIGN: center"  strong贺林院士在做精彩报告/strong/pp  揭牌仪式后,贺林院士以“遗传咨询的价值和意义 ”为题的做了精彩报告。/pp  首先他介绍了中国遗传学会遗传咨询分会的组建和官网网址(a title="" href="http://www.cbgc.org.cn/" target="_self" textvalue=""http://www.cbgc.org.cn//a),对比了中美遗传咨询师现状,总结了目前国内开展的遗传咨询课程,分析了中国遗传咨询走势与前景,强调现在形势急迫急需遗传咨询 /pp  随后,他分享了今年8月代表遗传咨询分会访问美国两大权威遗传咨询机构——美国遗传咨询师认证行会(ABGC)与美国遗传咨询认证委员会(ACGC)委员代表的经历,表示要向美国取经,合作共进,并同遗传咨询师培训机构建立了合作关系,因此此次培训班将会引进北美的教学资源,更大程度地同国际接轨。/pp  最后,他再次阐述了他所倡导的新医学的概念,即“旧医学+(基因)组学+遗传咨询”。由于现有的医术水平很难看清疾病深层的问题,我国出生缺陷率居高不下,肿瘤、高血压、糖尿病等多种疾病发病率呈显著上升趋势。为了解决这一难题,世界启动了人类基因组计划,由此所带来了扑面而来的海量信息和数据。贺林院士呼吁业界同仁及全体学员把握新医学的机遇,利用遗传咨询这一强大的工具,将大数据与临床疾病特征有机结合,帮助人类更好地和病魔作斗争。/pp style="TEXT-ALIGN: center"img style="WIDTH: 450px HEIGHT: 281px" title="6.jpg" border="0" hspace="0" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201511/noimg/c9a304b9-4092-4ebd-8540-6fc185d0b996.jpg" width="450" height="281"//pp style="TEXT-ALIGN: center"  strong沈亦平教授在做报告/strong/pp  第二个授课的是沈亦平教授,他是美国哈佛大学医学院病理系助理教授、美国波士顿儿童医院遗传诊断实验室、Claritas Genomics公司研发部主任。沈教授多年来从事遗传病基因诊断研究和实践,致力于为遗传病患者提供最佳的分子诊断和遗传咨询服务。作为美国医学遗传学专家委员会委员(FACMG),他对美国遗传咨询的体系非常了解。他以美国遗传咨询模式及经验为主题,重点向学员讲解了遗传咨询的发展和定义、遗传咨询的操作内容,对象和原则,还有遗传咨询师的培养及需具备的素质,通过分析美国遗传咨询师的状况及资源,讨论如何开展中国的遗传咨询服务。/pp  学员们通过本次培训,不仅可以获得最新的医学遗传学知识,掌握处理存在遗传病风险的患者及其家庭的医学策略,理解包括染色体疾病、单基因疾病、多基因疾病在内的分子机制,还能将理论知识应用于实践,更好地解决临床问题。/pp  strong附:第三届遗传咨询师培训班(初级班)培训日程/strong/pp style="TEXT-ALIGN: center"img style="WIDTH: 500px HEIGHT: 794px" title="7.jpg" border="0" hspace="0" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201511/noimg/0086d71b-fce2-4657-a10c-f6cd99aaa11b.jpg" width="500" height="794"//pp style="TEXT-ALIGN: center"img style="WIDTH: 500px HEIGHT: 794px" title="8.jpg" border="0" hspace="0" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201511/noimg/73abf21f-a3b5-4bf7-a285-49a11af7282c.jpg" width="500" height="794"//pp  span style="FONT-SIZE: 14px"备注:日程仅供参考,具体以现场参加培训班安排日程为准。/span/p
  • 青岛基因检测平台将建成 能揪出30多种遗传病
    人体基因被称为世上最神秘的东西,在众多疾病背后很多都是基因在“捣乱”。12月13日 ,记者探访岛城基因神秘基地——市妇儿中心遗传科,了解了一些基因背后的故事:每个人体内都有隐藏的致病基因,有的基因传男不传女 、有的基因让人“防不胜防”,明明父母都很正常 ,到了孩子身上却发生了突变等 。作为山东半岛唯一一家基因检测中心,市妇儿中心从今年2月份率先开设耳聋患者检测点,今年年底将建成全市基因检测平台,可以揪出30多种先天性遗传病基因,提前预防或提供治疗方案。  有的基因在“潜伏”  病例:新生宝宝13天离世只因父母体内藏有“隐性致病基因”  记者从市妇儿中心了解了几个有关基因背后的故事。新新(化名)出生那天,全家人都守在病房外焦急而充满期望地等待,终于盼到孩子抱出来了 ,大家却越看越觉得奇怪:孩子反应有点慢,四肢张力也不够,而且医生检查发现,新新的肌张力竟然不断在下降。  全家人慌了 ,孩子的这些异常表现也引起了新生儿科冯主任的注意,经验丰富的他看完后脑子里瞬间出现了一个病症:“难道是脊肌萎缩症?”  脊肌萎缩症,起病于婴儿期,儿童期或青少年期,其特征是由脊髓前角细胞与脑干内运动核进行性变性引起的骨骼肌萎缩。新新的血液样本被紧急送入医院遗传科主任俞冬熠手中,通过基因检测结果确认就是这种遗传病。  父母都很正常,好好的孩子怎么会得这种基因遗传病呢?之后孩子的父母也接受检测发现,原来他们体内同时带着这种“隐性致病基因”,两个隐性致病基因结合在一起,成为造成孩子疾病的有害基因。  脊肌萎缩症最恐怖的地方在于,它会让全身越来越软,器官越来越衰竭,只能眼睁睁地看着体内突变基因将身体一点点侵蚀。从出生到去世,新新只坚持了 13天。  俞主任说,这个孩子的父母如果再想生宝宝的话,还有1/4的几率会遗传到这种基因,所以下一个孩子还得提前做好检查。  有的基因“重男轻女”  病例:从脚软到头,他只能慢慢等待死亡  人体体内有3万多个基因,这些基因们各有各的性格,比如有的基因“重男轻女”思想很严重,喜欢传男不传女,不过,这个基因可不是什么好基因。  前段时间,俞主任见到了患者小兵(化名),虽然已经6岁,但小兵还是不会走路,只能由爸爸背着来到医院。不是小兵不努力,只因为他得了一种“怪病”。小兵的父亲向医生描述:小时候孩子好好的,学走路学得也快,去年的一天,自己爬楼梯,走着走着忽然摔倒了,扶起来再走又摔倒了,孩子当时说脚没劲。小兵父亲当时也没多想,以为休息一下就好了,没想到孩子这病却越来越厉害了 。“刚开始是脚没劲,后来到了小腿 、后来又到大腿,到现在几乎已经走不了了,说实在用不上劲。”  “进行性肌营养不良的特点就是这样,先从下肢开始无力,再慢慢上移,最终整个人只能坐在轮椅上了。”俞主任解释,进行性肌营养不良也是一种基因遗传病,主要是由于 X染色体基因突变所致,也就是说,小兵的妈妈肯定是这种基因的携带者,她将基因传到了儿子身上 。  “这种基因有个特点是传男不传女,男孩患病几率为50% ,女孩染色体有病变但大多不患病。但这种基因也让人很无奈,没有好的治疗手段,一般患者在20岁左右就会因呼吸衰竭死亡。”俞主任解释。  有的基因很“脆弱”  病例:喜欢被爸爸高高抛起,听力却越来越差  孩子们都爱被爸爸高高地抛起,再被有力地接住,因为爸爸的力量大,被他用手高高抛起后感觉特别开心。但3岁的西西(化名)命运却跟别的孩子不一样,他也喜欢被爸爸高高抛起,但自己的听力却越来越差。父母跟他说什么,他得反应好半天,因为他实在听不清,到医院检查才知道,孩子这是聋了 。俞主任从孩子体内查出有“一巴掌致聋”基因。  “这种基因的特点是很脆弱,说话声音太大或者受到什么撞击,都有可能让它出现,造成耳聋。”俞主任详细介绍说:“‘一巴掌致聋基因’临床表现为大前庭水管综合征,一旦患者头部受到撞击,或感冒、发烧,都将诱发耳聋,具体地说,在幼儿时期被大人高高抛起或被打一巴掌、受到大分贝声音刺激,这类人都可能耳聋。”  有的基因让人“防不胜防”  病例:父母基因都正常,到了孩子身上却突变了  基因,可不是你想掌控就能掌控的,有时候它也会发发脾气,明明很正常却非要变得不正常,这种“变态”基因出现在了 12岁的男孩小海(化名)身上 。  小海今年12岁,非常聪明、学习也很好,但他却是个侏儒症孩子,四肢就是不发育,和几岁的小朋友一样。小海的妈妈想再生一个孩子,去医院做基因检测,结果显示一切正常。  “当时查出父母完全正常,只是因为在精子、卵子结合或者受精卵形成过程中,位点上发生了突变,小海就变成这样了 。”俞主任说,但若小海将来要生宝宝,他身上的显性致病基因就会有1/2的几率传给下一代,所以到时小海一定得做好筛查才行。  数字  体内基因你了解多少  基因:基因(遗传因子)是遗传的物质基础,是DNA(脱氧核糖核酸)分子上具有遗传信息的特定核苷酸序列的总称,是具有遗传效应的DNA分子片段。基因通过复制把遗传信息传递给下一代,使后代出现与前一代相似的性状。可能很多人觉得一出生就患有的病才是遗传病,其实不然。有些基因造成的遗传病会随着人体增长 、年龄增大慢慢呈现出来。  3万:人体内共有3万个基因,通过复制 、表达、修复,完成生命繁衍、细胞分裂和蛋白质合成等重要生理过程,基因是生命的密码,记录和传递着遗传信息。  8个:目前,人类已经发现的单基因遗传病有3000多种,每个正常人身上都隐藏着八九个有害基因,如果在特定情况下,这种有害基因会出现给人体带来疾病,所以说“人无完人”这个词是有道理的。  1/50:脊肌萎缩症(也称软瘫),因染色体基因发生突变而导致。其实它的人体携带率很高,达到了1/50。  7%:为什么现在先天性耳聋发病率这么高,其实最重要的是先天性耳聋的基因携带率太高了,达到7%,也就是说100个人中就有7个人身上携带着这种基因。如果带有这种隐性致病基因的两个人结合在一起,就给了致病基因结合的机会,就有可能生出耳聋宝宝。  调查 现能诊断6种遗传病但检查的人不多  市妇儿中心遗传科从2007年开展基因检测项目,目前能诊断出6种基因遗传病。但采访中记者了解到,大家对基因检测的意识依然不够强,专门开展的耳聋基因检测去的人也不是很多。  被检测聋儿中6成有致病基因  耳聋是残疾病种中发病率最高的一种,岛城的耳聋宝宝人数居高不下,但现在通过专门的耳聋基因检测芯片,既能确诊患者又能筛查出携带者,确实能有效阻止更多耳聋宝宝的出生。为此从今年2月份开始,市妇儿中心遗传科专门开设了耳聋患者检测点,开展耳聋患者基因检测项目。既可以对聋人进行基因检测,确诊是属于哪种致病基因,并提出治疗指导意见,也可以在耳聋父母怀孕前对他们体内基因进行筛查,通过筛查从而避免很多耳聋宝宝的出生。  记者从市妇儿中心了解到,目前来做耳聋基因检测的不多,到目前为止仅有100多例,其中一半是10岁以下的耳聋患儿。不过即便在这50名耳聋患儿中,也有六成患儿被查出体内带有耳聋致病基因。“虽然做检测的人数不多,但这个比例已经让人非常吃惊了。如果更多人能来做检测,这个数据还会更多。”俞主任介绍。  据了解,目前发现导致耳聋的基因有三种:先天性耳聋基因、“一针致聋”基因和“一巴掌致聋”基因,只要能提前筛查或者及时检测就能避免耳聋宝宝的出生或者避免疾病出现。  今年,北京市曾对当地20839名听力残疾人做基因筛查,结果显示,近15%聋人因先天基因致聋,其中60%的耳聋由父母遗传导致,70%至80%可通过检测发现致聋基因突变。针对这种情况,目前北京、江苏省将于明年正式开展新生儿耳聋基因筛查,这项筛查将更大力度对所掌握监控地区耳聋发病情况,提前发现、提前预防,降低耳聋发病率。提到青岛市目前的耳聋情况,专家也都期盼着,什么时候也能开展这样的大型筛查,从源头切断基因遗传。  大多数人没有基因检测意识  除了耳聋基因外,脊肌萎缩症、智力低下、软骨发育不全、男子少精弱精还有进行性肌营养不良,这是目前市妇儿中心遗传科能诊断的6种遗传疾病。但从2007年正式开展基因检测项目到现在,真正来做诊断的人却不多。  “多数情况是,前一个出生的孩子查出有遗传疾病,为了放心,再要二胎时他们就会来做筛查、检测。这时候的基因检测相当于一个‘保卫者’,为生一个健康宝宝保驾护航。”俞主任说,有的人在检测中发现孩子没有再出现这样的基因问题就彻底放心了,有的确实提前发现后采取了果断措施,避免了先天性遗传病宝宝的出生。  但仍有很多人对基因检测的意识还是不到位。俞主任无奈地告诉记者:“做基因检测的人少,一来是因为大家的基因检测意识还不够,只做症状诊断,而没有采取基因诊断。另外有些医护人员也不知道青岛也能做基因诊断,有的患者专门跑到北京、上海等别的地方做。”  对于耳聋基因的检测和预防,这方面岛城技术已经相当成熟,如果在每个阶段,市民能提高自己的保健意识,就能避免更多耳聋宝宝的出生。如果市民家中有聋人,这几方面一定要做好了,最好去做个检查。  耳聋父母怀孕前。不管双方都是耳聋人还是其中一方是,在准备要宝宝前,先去做个基因检测,看看体内是否“潜伏”着致病基因。  妊娠期查基因。在妊娠期,对胎儿进行聋病易感基因筛查,推测胎儿听力是否正常,减少聋儿的出生概率。  给孩子做听力基因筛查。有些孩子开始是正常的,但体内可能会隐藏着“一针致聋”或者“一巴掌致聋”基因,通过检测如果真的存在这种基因,就可以避开危险因素。  基因检测平台能测出30多种基因遗传病  “多数疾病诊断目前只能停留在临床表现阶段,其实很多疑难杂症真正的原因出现在基因上。”俞主任说,今年年底前医院将进一步引进基因分析仪等设备,调试完毕后初步建成全市规模化基因检测平台。届时能被诊断出的疾病将增加到30多种,血友病、脆骨症、视网膜母细胞瘤、苯丙酮尿症等疑难杂症都逃不过。  同时,不仅能将遗传疾病诊断出来,还能筛查出致病基因的携带者并提前预防。另外,目前基因检测尚未全面开展,检测的价格也比较高,俞主任说:“下一步对价格这方面看看能否有所调整,让更多有需要的人都能有这种意识,提前来做基因检测。”  值得一提的是,建成这个规模化的全市基因检测平台后,不仅能为有遗传病患者的家庭提供便利,正常人也能去做基因筛查。“比如说可以通过筛查看看体内是不是有导致高血压、糖尿病的基因,如果有就得提前注意,防止疾病发生。”俞主任说。  不过,因为每个人体内都含有隐性致病基因,如果查到双方都带有高携带率隐性基因,那就得提前做检测,避免那1/4的几率发生,从而避免生出遗传病宝宝,也可以避免两个带有相同致病基因的人在一起。  揭秘 “三部曲”揪出致病基因  人体中有 3万多个基因,怎样从众多基因中快速找出那个致病基因?遗传科主管技师李朔简单介绍,其实揪出这些致病基因有三部曲,两天时间就够了。  “先从血液中提取出基因组,这时里面藏了3万多个基因,根据前期检查找到怀疑致病的基因条。但这部分的基因量太少了,想要做分析研究根本不够。我们可以对这一部分基因进行复制,从两边慢慢扩增到发病点。这样,有了足够的基因就能对他们进行分析了。分析基因主要看它们的序列,对照着正常的基因序列,看看它们的排序是多了还是少了、是短了还是长了,之后确定这种情况是属于自身基因突变还是属于遗传来的致病基因。如果是遗传的因素,那就得对他们的父母进行筛查,确保下一个宝宝会正常。”  据了解,揪出致病基因的时间一般为两天,有的可能会三天左右。从时间上看,还是很快的。  相关链接 有些基因其实很有意思  随着人类对基因的研究越来越多,有人发现了一些有意思的基因。  特殊基因决定睡眠时间:爱睡懒觉的人要有好借口了,因为睡懒觉可能和遗传有关。据媒体报道,欧洲一项研究发现,体内有一种名为“ABCC9”基因的人每天需要比没有这种基因的人多睡半小时。总计有1万多人参加了这项研究,研究人员比对他们的睡眠时间以及血液样本的DNA分析报告后发现,人对于睡眠的需求差异很大。  基因决定你的压力大小:研究人员基林费尔南德斯教授发现,携带压力基因的人,他们大脑中负责调解情感的“原始”区域变得异常活跃。来自欧洲神经系统科学团体年会上的消息称,大约一半的人携带“压力基因”,那意味着很多人害怕出乱子,容易感受到压力。
  • 2021年诺奖热门:光遗传学背后的科学家们
    光可被细菌、藻类等低等生命和人类等高等动物通过视紫红质系统而感知。20世纪70年代后,几种细菌和藻类通道视紫红质的发现为光控系统的诞生奠定了基础。光遗传学最初由米森伯克于2002年首次实现并于2005年由迪塞罗斯(也译作代塞尔罗斯)和博伊登进一步完善,其应用极大地增强了对大脑功能的理解。 光遗传学可使科学家借助光来精确开闭特异神经元从而达到操纵神经元活性和动物行为的目的。光遗传学技术已被证明是在细胞和系统层面研究健康和病理大脑活性的一个非常强大且有用的工具。文章系统介绍了光遗传学诞生的历史背景、重大事件、发展过程、应用领域及重要价值等。 光对生命具有举足轻重的地位,“万物生长靠太阳”。对大部分植物而言,它们借助光合作用合成营养物质并释放出氧气,而动物则依靠这些营养物质和氧来维持生存。此外,光还可以指导细菌和植物的向光性,控制植物生长和开花时间。 对于人类和其他动物而言,借助光来观察和感知这个 “光明” 世界。该过程由 “眼睛” 完成,称为视觉。大部分视觉健康的人都可通过眼睛清晰地观察到这个世界,看到周围的花花草草和五光十色的世界。那么,我们是如何观察到这些事物的呢?文艺复兴后,人们对光的本质进行探索,从而对光的成像机制有了新认识,自然对视觉形成机制也产生浓厚兴趣。 视紫红质 视觉研究可追溯到18世纪。荷兰科学家列文虎克(Antonie Philips van Leeuwenhoek)借助显微镜观察眼视网膜结构,鉴定出视网膜色素上皮细胞(retinal pigment epithelium,RPE)、视杆细胞和视锥细胞等,并推测这些细胞与视觉形成相关。1851年,德国解剖学和生理学家缪勒(Heinrich Müller,1820—1864)首次报道视网膜视杆细胞显红色这一现象 [1]。遗憾的是,缪勒错误地认为红色由血液造成。尽管如此,缪勒仍被看作视觉生理研究的先驱。缪勒在视觉生物学领域作出诸多贡献,如首次描述视网膜神经胶质细胞,这类细胞也因此获名“缪勒细胞”。 博尔(Franz Boll,1849—1879)是一位德国生理学家,对视觉形成具有浓厚兴趣。1876年11月,博尔也观察到红色视杆细胞,并认定红色源于其含有一类特殊物质,纠正了缪勒早期的错误。博尔还发现视杆细胞的红色受光影响,光照可导致红色褪去,而在暗处又重新恢复,进一步说明红色物质与视觉形成相关。遗憾的是,博尔的早逝(年仅30岁)使研究没有进一步开展。 1877年1月,博尔的同胞、另一位德国著名生理学家屈内(Wilhelm Friedrich Kühne,1837—1900)进一步纠正博尔的不足,认定视网膜感光物质应为紫红色,并创造 “视紫红质(rhodopsin)” 一词。屈内还取得另一项重大发现,即胆酸可使视杆细胞内的视紫红质释放到溶液里,并基于这一原理首次从牛视网膜完成视紫红质的纯化 [2],屈内也因此成为视觉生理领域的奠基人之一(图1)。虽然已确定视紫红质参与视觉形成,但具体分子机制仍不清晰,直到20世纪30年代才有突破。图1 视紫红质的发现 视黄醛循环 1931 年, 美国眼科专家尤德金(Arthur Yudkin,1892—1957)开始对视网膜成分进行分析,发现其含有一种维生素A样物质。其实,人们很早就知道维生素A缺乏可影响视觉形成,最常见的一种疾病叫夜盲症,但对维生素A如何参与视觉却知之甚少。 1932 年, 美国生理学家瓦尔德(George Wald, 1906—1997)来到德国瓦伯格(Otto Heinrich Warburg,1931年诺贝尔生理学或医学奖获得者)实验室开始全面研究视紫红质。瓦尔德首先借助光谱分析法证明青蛙、绵羊、牛等完整视网膜中存在维生素A,接着使用氯仿提纯视紫红质,化学显色反应表明所含物质与维生素A非常相似。 为进一步证实结论,瓦尔德加入瑞士著名科学家卡雷尔(Paul Karrer,1937年诺贝尔化学奖获得者)的实验室,而卡雷尔分离并确定了维生素A的结构。经过3个月研究,瓦尔德最终确定视紫红质中确实含有维生素A,从而表明视紫红质包含两部分:视蛋白(opsin)和维生素A [3]。随后,瓦尔德又加入德国海德堡迈耶霍夫(Otto Fritz Meyerhof,1922年诺贝尔生理学或医学奖获得者)实验室继续开展视觉形成研究。 一次偶然事件为研究带来重大契机!当时正逢假期,许多实验室人员都去度假,恰在此时运抵300只青蛙。实验室助理原本想丢弃,而瓦尔德则主动要求留下来用作实验材料。瓦尔德从青蛙视网膜提取到足够量的视紫红质,进一步分析后惊奇地发现所含的维生素A与卡雷尔所得维生素A尽管大部分性质相似,但仍有些许差异,因此将这种物质重新命名为视网膜色素(retinene)。瓦尔德还发现视网膜色素与维生素A之间可发生转变,并通过后来详细的结构分析确定了两者间的差异,因此视网膜色素更名为视黄醛,而维生素A则称为视黄醇 [4]。 20世纪50年代,瓦尔德和同事经过近20年探索,最终解析出视觉形成的 “视黄醛循环” 机制:静息状态下,视杆细胞内视蛋白与11-顺视黄醛结合形成视紫红质;光线照射可使11-顺视黄醛发生异构化转变为全反式视黄醛,从而与视蛋白分离,这个过程激活视蛋白,启动下游信号转导最终到达大脑视觉中心;全反式视黄醛可被运输到视网膜色素上皮细胞内经过几步化学反应重新生成11-顺视黄醛;11-顺视黄醛回到视杆细胞再次与视蛋白结合形成视紫红质,从而完成一次视觉感知过程(图2)。瓦尔德的发现很好地诠释了视黄醛参与视觉形成的机制,因此他分享了1967年诺贝尔生理学或医学奖。图2 瓦尔德与视黄醛循环 后续研究还揭示了视蛋白作用机制。视蛋白是一种G-蛋白偶联受体(G protein coupled receptor,GPCR)。光通过改变视黄醛结构而激活视蛋白后,可进一步使异三聚体G蛋白激活,从而使磷酸二脂酶活化,催化cGMP水解为5’-GMP而减少cGMP含量;细胞内受cGMP调控的离子通道关闭,导致细胞膜电位出现变化,最终传导至视觉中心而实现光的感知。 从这个过程可以看出,哺乳动物视紫红质的作用机制较为复杂,作为机体视觉感知过程尚可接受,如果将它们应用到其他系统则困难重重,因此有必要寻找更简单的感光系统 [5]。 细菌感光 最初认为只有高等动物才存在视觉系统,但这一观念在20世纪60年代发生改变。1967年,德裔美国生理学家斯托克尼乌斯(Walther Stoeckenius,1921—2013)成为加州大学旧金山分校的教授,重点研究生物膜(如红细胞膜和线粒体膜)结构 [5]。由于生物膜材料获取比较困难,具有电子显微镜背景的斯托克尼乌斯决定用生物化学方法研究盐生盐杆菌(Halobacterium halobium)细胞膜组成。随后两位新同事的到来壮大了实验室的力量。 厄斯特黑尔特(Dieter Oesterhelt,也译作奥斯特黑尔特)是一位训练有素的德国化学家,跟随吕南(Feodor Lynen,1964年诺贝尔生理学或医学奖获得者)获得博士学位,由于学术休假的缘故来到美国;布劳罗克(Allen Blaurock)是一位刚毕业的英国生物物理学家,原来在国王学院威尔金斯(Maurice Wilkin,1962年诺贝尔生理学或医学奖获得者)实验室从事X射线衍射研究 [6]。 厄斯特黑尔特和布劳罗克借助X射线衍射技术观测细菌细胞膜紫色组分时,意外观察到一种清晰的衍射图像,说明其含有一种高度有序的生物分子。厄斯特黑尔特还观察到紫色物质在添加有机溶剂后颜色变黄。此时,布劳罗克回忆起在国王学院研究青蛙视网膜过程中也观察到类似的颜色变化,这一提示促使厄斯特黑尔特大胆假设该物质可能也是视紫红质。为证实这一假说,首先需解答的问题是其含不含视黄醛。 从细菌中寻找视黄醛这一近乎疯狂的想法促使厄斯特黑尔特立即启动验证工作。借鉴青蛙视紫红质的研究方法,厄斯特黑尔特发现细菌的紫色物质具有类似的物理和化学性质,并且还含有视黄醛。基于这些特性,厄斯特黑尔特和斯托克尼乌斯于1971年确定这是一种新型视紫红质,根据来源将其命名为细菌视紫红质(bacteriorhodopsin,BR)(图3)[7]。图3 细菌视紫红质 斯托克尼乌斯经过进一步研究后发现,细菌视紫红质是一种光依赖的离子通道。更大的突破在1975年,英国剑桥大学分子生物学实验室的亨德森(Richard Henderson,2017年诺贝尔化学奖获得者)解析了细菌视紫红质的三维结构,从而对视紫红质的作用有了更深入的认识。 1972年,重组DNA技术的发明为生命科学带来一场革命,同时也积极推动了细菌视紫红质研究的发展。研究人员将细菌视紫红质转入宿主细胞,结果发现光照可引起氢离子外流,从而证明其为一种光控的氢离子通道。1977年,研究人员在细菌中又发现另一种视紫红质——卤视紫红质(halorhodopsin),后续证明其介导氯离子细胞内流 [8]。 一系列的研究表明,即使简单如细菌这样的单细胞生物也存在 “视觉系统”,标志着一个新领域——低等生物视紫红质的诞生,从而促使科学家去寻找其他视紫红质。 藻类趋光 班贝格(Ernst Bamberg)是一位德国生物物理学家,从20世纪70年代开始研究细菌视紫红质的生物学功能,并利用体外实验证实BR是一种光激活氢离子通道。随着基因工程技术的发展和完善,生命科学的研究模式发生根本性改变,膜蛋白研究不再需要繁琐困难的提取过程,只需将外源基因在特定宿主细胞表达即可。 90年代,已加入德国法兰克福马普研究所的班贝格与从美国回来不久的德国电生理学家纳格尔(Georg Nagel)决定合作,共同研究细菌视紫红质在完整细胞中的生物功能。1995年,他们合作将细菌视紫红质基因成功转入非洲爪蟾卵母细胞,进一步精确证实光激活质子泵的电压依赖性 [9]。2001年,他们进一步在非洲爪蟾卵母细胞中证实卤视紫红质是一种氯离子通道(图4)。班贝格与纳格尔的合作一方面建立了视紫红质功能研究平台,另一方面也初显光遗传学雏形,即将外源视紫红质在靶细胞表达。图4 藻类视紫红质 19世纪,绿藻(Chlamydomonas)等藻类就被发现具有向光性和受光调控的特性,但对这些现象背后的原因知之甚少。直到20世纪80年代,大量事实表明藻类也长 “眼睛”,即细胞膜存在感光物质,称为 “光受体”。 80年代初,德国生物物理学家赫格曼(Peter Hegemann)在博士就读期间就决定研究光受体。赫格曼和学生以莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)为材料,借助电生理实验表明光的确可诱导藻类细胞产生电流 [10]。赫格曼决定采用生物化学方法将光受体蛋白纯化后研究其性质。遗憾的是,十余年辛苦努力最终以失败告终。根本原因在于光受体是一种膜蛋白,含量低、稳定性差且异质性高,这些都是蛋白质纯化的大忌。赫格曼不得不转换研究思路来解决这个难题。 2001年,绿藻基因组测序的完成为问题的解决带来转机。赫格曼通过全面搜索和比对绿藻基因组数据库,从中发现两个候选基因与细菌视紫红质具有较高同源性。 为加快研究进程,赫格曼决定寻求合作。他在获悉纳格尔的研究工作后,积极沟通并与其达成合作协议。赫格曼小组负责克隆两种绿藻视紫红质候选基因,并将其送给纳格尔开展功能研究;纳格尔则将基因转入人肾胚细胞HEK293并实现正确表达。功能研究表明,它们的活性均受光调控,并且介导阳离子如钠离子、钙离子等的摄入(图4),因此将其分别命名为通道视紫红质(channelrhodpsin,ChR)1和2 [11-12]。与ChR1相比,ChR2光激活时间更短,且离子通透性更强,因此更适合于研究。更为重要的是,赫格曼还推测这些通道视紫红质不仅可在普通细胞表达,而且也可在神经元中表达并影响电生理活性。这一论断直接催生了光遗传学。 至此,研究人员已经鉴定出三类光控视紫红质,分别是细菌视紫红质(介导氢离子输出)、通道视紫红质(介导阳离子输入)和卤视紫红质(介导氯离子输入)。它们在神经功能研究方面具有何种应用价值呢?这要从神经兴奋说起。 神经兴奋 大脑是神经系统的中枢,是机体最复杂和最神秘的器官。知觉、运动、兴奋、情感、语言、学习和记忆等过程基本都在大脑特异区域完成。大脑由上百亿神经元(亦称神经细胞)构成,这些神经元之间通过特定方式实现彼此间交流,以达到协调控制机体各种行为的目的。神经元活性受电信号影响。 正常情况下,神经元细胞膜内外两侧阴阳离子分布不均匀(这种现象称为极性):膜内钾离子浓度远高于膜外,膜外钠离子浓度又远高于膜内,最终形成一个外正内负的状态。未受刺激时(静息状态),规定膜外电位为0,则哺乳动物神经元膜内电位为负值,约-70mV,称为静息电位;外界刺激可导致离子通道打开,由于离子移动而引起膜两侧离子浓度发生变化,电位差也随之改变。如果-70mV向0方向改变,则称去极化(电位为0意味着内外无离子浓度差距,极化消失);相反,-70mV向更大负值变化则称超极化(意味着离子分布不均匀加剧)。 一般而言,去极化伴随神经元激活,而超极化则意味着神经元抑制,因此通过改变神经元细胞膜内外离子分布可实现精准控制神经元活性的目的。 1979年,美国索尔克研究所著名科学家、DNA双螺旋提出者之一克里克(Francis Crick,1962年诺贝尔生理学或医学奖获得者)在《科学美国人》发表一篇文章 [13],对脑科学未来的发展进行展望。古典神经生物学家通常采用电极刺激大脑特定区域神经元的方式来影响行为,克里克认为这种方法破坏性大且精确性不高,比如无法准确区分不同的神经元,这些因素导致所得结果准确性差。 为此,克里克提出应开发一种精确控制神经元活性的方法,允许研究根据需要只对特定神经元打开或关闭,同时不影响非相关神经元。具有分子生物学背景的克里克进一步指出可以对神经元细胞进行遗传改造,从而使它们可对外界信号(如光刺激)产生精准性应答。这一理念建立了光遗传学的思想雏形。 尽管光控细胞行为的理念已经提出,但真正实现则需要有可行的工具。2002年,这一想法终于首次变为现实。 神经光控 米森伯克(Gero Andreas Miesenböck)是一位奥地利神经科学家,跟随鲁斯曼(James Edward Rothman,2013年诺贝尔生理学或医学奖获得者)开展博士后研究。他主要借助荧光系统来检测神经元内囊泡运输,因而对光产生浓厚兴趣。 1999年,米森伯克建立自己的实验室,开始独立的科研生涯,目光锁定神经生物学。米森伯克对整个神经生物学领域一知半解,可以说有点 “门外汉” 的味道,但是恰恰这个因素反而使他在光遗传学方面首先完成突破,因为他不会受主流观点所羁绊。生命科学研究的基本策略在于首先控制某种因素(干预),然后依据结果确定因果关系,如敲除特定基因后动物出现某种表型异常(如个子变矮),据此可认为该基因参与了某个过程(如肢体发育)。 然而,由于神经系统自身的复杂性,长期以来神经生物学家主要依赖形态观察,而缺乏更多有效的干预手段。米森伯克想改变这一现状,他完全从一个生物学家的视点来看待这个问题,因此想为神经元安装一套感光系统(遗传学操作),然后借助光照(光学)来达到控制神经元的目的 [14]。为尽快实现这一目标,米森伯克邀请鲁斯曼的另一位学生、自己的师弟泽梅尔曼(Boris Valery Zemelman)加入团队,启动光控神经元活性的研究计划(图5)。图5 米森伯克(左)和泽梅尔曼(右) 当时可用的感光系统主要是动物视紫红质,而哺乳动物过于复杂的光转导过程自然使米森伯克望而却步,不得不寻找其他替代品。幸运的是,他们在果蝇中找到一个简单系统,该系统只需三种蛋白参与,分别为视紫红质抑制蛋白-2(arrestin-2)、视紫红质(rhodopsin)和G蛋白a亚基(G protein alpha subunit)。他们为该系统杜撰一个名称 “chARGe”,之所以这样命名,原因在于 “charge” 还有另一层含义 “电荷”,说明该系统目的在于通过影响离子(带电荷的原子或原子团)运动而改变动作电位。 整个实验主要有两个关键步骤:首先将三种基因转入体外培养皿中生长的海马神经元;其次测试光照转基因神经元后动作电位的变化情况。2002年初,米森伯克小组首次在体外证明光照可控神经元的活性 [15],从而开启神经生物学研究的新篇章。 然而,果蝇chARGe系统在应用中存在诸多缺陷。首先需要三种蛋白,因此无论从转基因效率还是三者协调能力都将大打折扣;其次尽管可产生动作电位,但时间长、幅度小,不易观察和操作;最后,实验体系不稳定,产生的动作电位无规律,实验重复性差,从而也就意味着难以真正实现精确调控。 为解决这些不足,米森伯克小组对其进行改进。他们选择哺乳动物离子通道如P2X2和TRPV1等替代chARGe系统,这些通道蛋白都是单组分,因此大大降低实验难度,增加精准度。然而,这些通道蛋白活性本身并不受光调控,而是与配体如ATP和capsaicin等结合相关。米森伯克借鉴博士后工作期间的灵感,成功设计出光照影响二者结合的实验体系,从而达到光控神经元活性的目的 [16]。 但是,该系统也存在一些缺陷,如稳定性差(间接作用引起)等,还有一大不足在于这些离子通道都是哺乳动物蛋白,因此外源基因和自身基因之间存在互相干扰,这种现象称为系统不正交,从而为精准调控带来巨大难题。 2004年,美国加州大学伯克利分校克拉默(Richard Kramer)小组进一步对钾离子通道实现改造,最终也达到光控哺乳动物神经元活性的目的 [16]。然而,这些改进整体而言效果有限,因此迫切需要成分少、速度快、强度高、正交好的光控系统。藻类通道视紫红质恰好满足所有这些要求,因此,2002和2003年先后发表的藻类ChR文章立刻吸引了众多科学家的目光,激发他们快速加入该领域。 光遗传学 迪塞罗斯(Karl Alexander Deisseroth)是一位美国精神病学家和神经科学家,1998年获得斯坦福大学神经科学博士学位,主要研究神经元突触活动影响细胞基因表达的机制,而该研究对理解大脑的记忆功能具有十分重要的意义。 博士毕业后,迪塞罗斯最初想成为一名神经外科医生,因此在斯坦福医学院完成实习和精神科住院医师培训。然而,当他在精神分裂症患者治疗过程中体会到明显的无力感后,毅然决然改变选择,转向探索大脑的工作机制,以洞悉严重抑郁症、精神分裂症和孤独症等的发病过程,以期找到治疗良策。 随后,迪塞罗斯进入著名神经生物学家钱永佑(Richard Tsien)实验室继续博士后工作,并在这里结识了毕业于麻省理工学院拥有物理和电气工程背景的博伊登(Edward S. Boyden)。由于志趣相投,他们很快就成为科研挚友,并决定联合开发一种精准控制神经元行为的工具(图6)。他们最初设想采用磁控策略,未获成功。稍后博伊登将目光转向光控,对视紫红质产生浓厚兴趣,并获得细菌卤视紫红质质粒。 遗憾的是,因其他事宜这一计划未能实施。后来博伊登被米森伯克2002年发表的文章所深深触动,决定重拾光控神经元的研究计划。不久他又读到赫格曼发表的ChR2文章,很快就构思出一个完美的研究计划。图6 迪塞罗斯(左)和博伊登(右) 2004年2月,博伊登建议迪塞罗斯从纳格尔那里借ChR2质粒。3月,迪塞罗斯与纳格尔达成合作协议,获得ChR2质粒使用权。质粒到达后,两人立即着手实验,但对实验能否成功仍然没有把握。 首先,ChR2在神经元能否高表达?其次,神经元是否也不需要视黄醛辅助?需要的话将无形增加系统复杂性。第三,外源ChR2能否产生足够电流而引发动作电位?最后,即使一切都顺利,会不会被其他实验室抢先发表?因为许多研究人员已经意识到光控的可行性。尽管有这些考量,但当务之急则是加快研究进程。 迪塞罗斯通过优化基因转染程序而使ChR2在海马神经元完美表达且正确定位于细胞膜,从而解除第一个担心;博伊登检测到表达外源ChR2的神经元电在不添加视黄醛的前提下,蓝光照射可在50 ms内引起足够阳离子流入,产生明显去极化效应。2015年1月,斯坦福大学本科生张峰(Feng Zhang)加入迪塞罗斯实验室,进一步构建出包含ChR2的病毒载体,大大增加了转染效率,电生理实验又进一步证实其高效的光控活性 [17]。 为取得发现优先权,他们于2005年4月19日迅速将论文提交到美国《科学》杂志,却被以 “没有在神经元中取得关于ChR2功能新发现” 的理由拒稿。5月5日,他们将文章转投英国《自然》杂志,也同样被拒稿。但幸运的是,稿件随后被转到《自然-神经科学》杂志,并最终被接收,于2005年8月在线发表 [18]。这篇文章也被看作光遗传学领域真正意义上的开山之作。 随后几个月,多家实验室先后发表文章证实光控神经元活性的可行性,包括日本的 Hiromo Yawo 实验室、美国凯斯西储大学的Lynn Landmesser和 Stefan Herlitze 的实验室,美国韦恩州立大学的潘卓华实验室(潘卓华的故事,详见“华裔光遗传学发明者不该被遗忘的故事”)。由于天然ChR2在实际应用中仍存在诸多不足,研究人员在此基础上对其进行改造。他们通过采取点突变的策略制备得到一系列新型ChR2变体,极大地丰富了光遗传学工具箱。2006年初,迪塞罗斯首次提出光遗传学一词 [19],用以描述联合光学和遗传学操作实现对特定神经元活性(或动物行为)精准控制的技术。 行为光控 体外光控神经元活性仅影响动作电位,而更大的挑战在于能否通过影响体内神经元动作电位进而控制生物行为。该领域的首个突破来自米森伯克实验室。已知果蝇存在逃跑反应,当它们感知周围存在威胁时会触发大脑特定神经元动作电位变化,进一步影响其他神经元活性并实施逃跑行为——飞走。 米森伯克的学生利马(Susana Lima)将光控蛋白基因转入特定神经元,随后的光照就会造成果蝇逃跑反应启动。然而,该实验体系存在一个明显的漏洞——果蝇本身对光线也非常敏感,单纯光照也可引起正常果蝇逃离。为区分果蝇的逃跑行为源于直接光控还是视觉感知引起的间接效应,米森伯克小组进一步将转基因果蝇头部去除以消除它们的视觉系统(果蝇仍可存活一定时间)。这些无头果蝇胸部仍保留神经元,光照后它们仍然呈现逃跑反应 [20],因而证实光确实直接控制神经元活性。 相对于低等动物果蝇,小鼠的精准行为光控就困难重重。首先,他们需要保证视蛋白只在特定神经元如参与睡眠、记忆或焦虑等表达。为此,他们分离得到神经元特异性启动子序列,将其连接到ChR2基因上游,从而保证ChR2只在这类神经元表达。其次,需要解决光照到达的问题。为此他们设计了一套设备,有效解决了这一难题。 2005年,迪塞罗斯小组开始尝试光控动物行为实验。他们首先成功制备下丘脑睡眠相关神经元特异启动子的ChR2转基因小鼠,然后将该小鼠放置于黑暗房间并处于睡眠状态,进一步蓝光刺激可唤醒小鼠,而正常小鼠则没有这种应答 [21]。随后,多个研究小组证实在动物水平上可实现光照控制行为的目的(图7)。图7 光遗传学动物[14,25] 重大应用 光遗传学通过融合光学和遗传学的操作技术,实现对大脑特定神经元的精准时空控制。时间方面,控制精度可达毫秒量级;而空间方面,则可针对单一类型细胞。这一优势使光遗传学在探索大脑行为机制和部分疾病治疗方面具有得天独厚的优势。今天,全世界有上千家实验室在使用光遗传学技术研究大脑行为及其他科学问题。 在基础研究方面,神经生物学家借助光遗传学对许多大脑功能,如学习、记忆、新陈代谢、饥饿、睡眠、奖励、动机、恐惧、嗅觉和触觉等过程有了更为清晰的理解和认识 [22],并且揭示众多新机制,如个体特定状态下(如焦虑、风险规避等)大脑回路复杂行为的产生过程。 光遗传学技术还揭示帕金森病、阿尔茨海默病、癫痫等神经系统疾病发生的新机制,从而为药物研发提供重要靶点,同时也为新药筛选和测试提供重要技术平台 [23]。临床应用方面,光遗传学有望在失明等疾病治疗方面发挥重要作用。 未来几年,随着光遗传学技术的发展和完善,其价值将得到进一步体现,有望从根本上提升对神经系统以及非神经系统相关生理和病理过程的理解和认识,为部分疾病的治疗带来新突破。最近,光遗传学还在非人类灵长类动物中开展相关研究,从而给未来临床应用带来更大期望。当然,光遗传学本身涉及转基因过程,因此安全性和有效性问题尚待进一步评估。 光遗传学在几年内已经发展成为一种最先进的技术,并给神经生物学带来一场革命 [24]。2010年,光遗传学被《自然-方法学》评为 “年度方法”,还被《科学》杂志评为十年重大突破 [25-26]。这项技术突破使我们能够解决以前无法想象的生物学问题。 光遗传学被认为是自20世纪50年代以来神经科学领域最重大的进展之一,可与脑电极使用、功能性磁共振成像相媲美。光遗传学还直接推动2013年美国启动脑科学计划,大约耗资3亿美元,旨在开发治疗阿尔茨海默病、自闭症、精神分裂症和创伤性脑损伤等神经疾病的药物或技术。 光遗传学的成就已得到学术界广泛认可。许多作出卓越贡献的科学家,如厄斯特黑尔特、班贝格、纳格尔、赫格曼、米森伯克、泽梅尔曼、迪塞罗斯和博伊登等都先后获得多项科学大奖,包括欧洲脑科学奖(2013年)[24]、美国科学突破奖(2014年)和加拿大加德纳奖(2018年)[27]等。可以预见,部分科学家还有望分享诺贝尔奖。由于神经生物学一直是诺贝尔生理学或医学奖青睐的重点领域(10年内平均1~2项),光遗传学获诺贝尔奖也仅仅是时间问题。 科学启示 通过光遗传学的发展历程,我们还可以得到如下启示: 第一,微生物王国蕴藏着无尽宝藏。从限制性内切酶的发现及应用(1978年诺贝尔生理学或医学奖和1980年诺贝尔化学奖),到耐高温DNA聚合酶的使用(1993年诺贝尔化学奖),到视蛋白在光遗传学的价值,再到今天基因编辑技术——CRISPR-Cas9系统,无一不是将微生物成分借助基因工程应用到哺乳动物。毫不夸张地说,基因工程及相关技术的快速发展,微生物至少有一半以上的贡献。 第二,基础科学对技术革新意义重大。没有上百年来对光受体孜孜不倦的研究,没有20世纪70年代细菌视紫红质的发现和功能研究,没有藻类ChR的基因克隆,就不会有光遗传学的诞生,因此,强化基础研究对新技术的发明和完善具有十分重要的意义。 第三,技术进步对科学发展的推动作用。在知识日新月异的今天,许多科学问题的解决一方面依赖思维拓展,另一方面需要技术推进。尽管光遗传学的临床应用尚需时日,但这种技术手段对脑功能研究发挥了无法替代的作用,成为推动神经科学发展的重要工具。 本文原载于《自然杂志》2019年第3期,《知识分子》获权转载。 主要参考资料 [1] WOLF G. 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  • 科学家开发出一种新方法能快速纠正遗传性的基因突变 从而有望治疗多种人类遗传性疾病
    人类诱导多能干细胞(hiPSCs)允许对遗传性疾病进行体外研究,并且拥有个体化干细胞治疗的潜力,基因编辑技术(能够精确修饰特异性目标位点)代表了不同hiPSC应用的宝贵工具,这在单基因疾病中特别有用,其能帮助分析未知突变的功能,或创造遗传纠正且来自患者机体的hipsCs。近日,一篇发表在国际杂志Stem Cell Reports上题为“Simultaneous high-efficiency base editing and reprogramming of patient fibroblasts”的研究报告中,来自赫尔辛基大学等机构的科学家们通过研究开发了一种新方法,其能精确且快速地纠正培养的患者机体细胞中的遗传改变。这种新方法能从患不同遗传性疾病患者2-3毫米的皮肤活检组织中产生遗传性纠正的自体多能干细胞,而纠正后的干细胞对于研究非常有必要,其对于开发治疗有关疾病的新型疗法也非常重要。这种新方法基于此前研究人员在干细胞和基因编辑领域的突破性研究(包括获得诺贝尔奖的技术),第一项技术就是诱导多能干细胞的开发,即来自分化细胞的ipsCs,其于2012年获得了诺尔贝生理学或医学奖。而另一项技术则是CRISPR-Cas9基因魔剪的创新,其于2020年也获得了诺贝尔奖。研究者所开发的新方法结合了这些技术来纠正引发遗传性疾病的基因突变,同时还能创造出功能齐全的新型干细胞。研究人员的长期目标就是产生具有治疗特性的自体细胞,使用来自患者机体纠正的细胞就能帮助避免来自供体的器官和组织移植所产生的免疫挑战。目前有超过6000种已知的遗传性疾病,其都是由不同的基因突变所致,其中一些疾病目前是利用来自健康供体所捐赠的细胞或器官移植来进行治疗(如果合适供体有的话)。所纠正的干细胞。图片来源:Sami Jalil研究者Kirmo Wartiovaara教授表示,我们所开发的新系统在纠正DNA错误方面要比老方法更快且更加精准,同时也减少了不必要变化的风险。在完美的状况下,如今研究人员已经达到了100%的功效,尽管研究人员需要记住的一点是,对培养的细胞进行修正距离已经证实的治疗应用还非常遥远,这或许就是一个非常积极的开始。综上,本文研究结果表明,研究者所开发的新方法能够产生几十个基因编辑的hipsC单克隆细胞系,其具有前所有为的效率和稳定性,同时还能大大减少细胞培养所花费的时间,并能降低其在体外发生改变的风险。原始出处:Sami Jalil,Timo Keskinen,Rocío Maldonado, et al.Simultaneous high-efficiency base editing and reprogramming of patient fibroblasts, Stem Cell Reports (2021). DOI:10.1016/j.stemcr.2021.10.017
  • 2012年密理博非常纯水日之中科院遗传所
    2012年8月29日,北京昊诺斯科技有限公司在中国科学院遗传所举行了默克密理博非常纯水日活动,活动中,所里各实验室的老师均可以免费取水,并且我们的工作人员还免费为大家讲解水机日常维护与实际操作,使客户更为直观的了解到水机正常工作状态、处理异常情况以及日常维护的方法,使得老师们对我们的产品和服务更加认可,我们的水机在遗传所的覆盖面非常广,大家对密理博的水机认知度也比较高,此次活动我们还展示了密理博的瓶装水,大家也是很有兴趣。同时,我们还展示了制造厂商北京鼎昊源科技有限公司生产的多种自产仪器,有研磨仪、离心机、混匀仪、磁力搅拌器等,还有新产品全自动凝胶染色工作站,也使老师们产生了浓厚的兴趣。活动中,凡是前来咨询的老师我们都赠送了精美礼品一份,此次活动得到了老师们的一致好评。活动圆满结束,同时也感谢各位老师的配合和支持!北京昊诺斯科技有限公司系致力于为生命科学、生物检测、生物工程、药物研发等领域提供先进的实验室仪器设备及多层次服务的高科技公司。我们代理的国外产品绝大部分是专业领域内的世界一流品牌。主要包括:美国ThermoFisher Sorvall(索福),Heraeus(贺利氏)品牌的离心机、培养箱、生物安全柜、超低温冰箱等各类产品;美国Millipore纯水、超滤、层析系统、流式细胞仪、完整性测试仪、生物反应器、多功能液相芯片平台;日本Malcom全自动核酸抽提系统、微量紫外可见荧光分光光度计;波兰HTL移液器;美国CARR生物制药设备;韩国ADAM自动细胞计数器;美国ThermoFisher全自动工业分析系统及水质分析系统;美国ThermoFisher Barnstead品牌液氮罐、摇床、马弗炉等产品;加拿大Avestin高压均质机;德国美天旎;西班牙Telstar系列冻干机;意大利PBI公司及瑞士IBS公司生物安全和微生物检测类产品。我们的代理权绝大多数为直接与生产厂家签约代理协议的独家或一级代理,这意味着我们销售的代理产品将得到生产厂家及我们的双重支持与售后服务。我们的库存备有大量的备品备件及现货以服务用户,这意味着在中国这样广大的用户区域内用户将可以就近联系我们,更加及时更加充分地享受到更有保障的服务。同时我们还销售同一集团公司下属的北京鼎昊源科技有限公司生产的多种自产仪器,如:各种离心机系列,凝胶成像系列,金属浴系列,混合仪系列,磁力搅拌器系列,PCR仪及封板机,原位杂交工作站,研磨仪等。我们愿尽最大的努力为实验室提供更加先进的产品、更加可信的服务。 我们相信凭借一流品牌的技术与服务基础,我们将与科技研发的实验室一起为民族产业共创美好的明天!
  • 国内首家专注细胞分子遗传医学检测机构落户海南
    11月11日,海南主健细胞分子遗传医学检验中心法医物证鉴定所在海口市成立。这是国内首家专注于细胞分子遗传医学检测的医疗机构,鉴定能力将达到国家级司法鉴定机构要求。  海南主健细胞分子遗传医学检验中心拥有国家妇幼分子遗传医学检测项目基础数据库、分析与评价系统、数据管理系统与报告系统等完整的技术体系,拥有DNA测序平台、实时荧光定量PCR平台、微珠液相杂交生物芯片平台等目前国际一流的分子医学检验设备,形成了完备的高通量分子检测技术平台,可以满足人体物证鉴定的需要。  据海南省司法厅司法鉴定处处长王满怀介绍,海南目前拥有司法鉴定机构17家,其中法医类司法鉴定机构有9家。王满怀表示,该鉴定所成立后,将朝着国家级鉴定机构的目标建设。今后,该省居民可以足不出岛即可享受到国际先进水平的检验技术,遗传医学检验服务将面向华南地区。  据悉,法医物证鉴定,俗称人体物证鉴定,也叫DNA鉴定。其主要内容包括个体识别、亲子鉴定、种族和种属认定等。由正规司法鉴定机构出具的人体物证鉴定证明是公安司法部门认定事实的重要依据,对保障刑侦和诉讼活动顺利进行起到重要作用。
  • 对4500万美国人研究发现:40%疾病由遗传引发,25%由环境造成
    p style="text-indent: 2em "span style="text-indent: 2em "据英国《每日邮报》1月14日报道,美国strong哈佛大学/strong的科学家们通过对strong4500万美国人进行长达24年的跟踪调查/strong,研究哪些疾病是由基因引起的,而哪些疾病更容易受到环境的影响,是迄今为止同类研究中规模最大的研究。/span/pp style="text-align: center"img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201901/uepic/c3ecca16-6445-44e3-b73b-35eb2a461d1d.jpg" title="00.jpg" alt="00.jpg" width="300" height="200" border="0" vspace="0" style="width: 300px height: 200px "//pp style="text-indent: 2em "span style="text-indent: 2em "据其最新发表在《自然遗传学》(Nature Genetics)期刊上的研究结果显示,在strong调查研究的560种疾病中,疾病中40%是由遗传导致,而至少有25%的疾病是由环境造成的,其中,认知问题与遗传基因关系最为密切,而眼疾则受环境的影响最为严重/strong。/span/pp  一般来说,大多数疾病是先天基因与后天环境相互作用的结果。strong环境可以改变基因排序方式,基因可以影响人们身体对环境的反应/strong。而每个人的DNA都是独一无二的,所处的环境更是独一无二且不断变化的。而基因与环境的相互作用也因疾病而异。/pp  哈佛大学的研究人员通过保险信息数据库收集了4500万人的数据,将基因数据、疾病诊断以及诸如身高、体重等生命医学统计数据与受试者的邮政编码进行了比较,从而推测出社会经济地位等环境对于疾病的影响。尽管所有信息对他们的分析都很重要,但strong受试者中5.6万对双胞胎的数据为他们的研究提供了一些最为关键的信息/strong。尤其是同卵双胞胎,可以为遗传学家观察不同环境下相同DNA发生的变化提供难得的机会。/pp  哈佛大学的科学家们开始研究哪些因素对哪些疾病影响最大。通过对6000多粒遗传性疾病研究发现,遗传性疾病均是由某些基因序列缺失而导致的基因缺陷。而在研究检测的疾病中,包括strong肌肉骨骼疾病、认知疾病、眼部疾病、呼吸系统疾病和生殖疾病等,有近40%的疾病由遗传导致。/strong/pp  该研究团队共对560种疾病进行了研究,发现至少strong有25%的疾病是由环境造成/strong的。其中,42种眼病中,有27种是由环境因素引起的 除眼病外,呼吸系统疾病是与环境因素联系最密切的疾病 生殖障碍受环境影响最小。在认知疾病中,五分之四是遗传的 而结缔组织疾病,如类风湿关节炎等,受DNA影响最小。/pp  通过遗传倾向性,还可以预测每人每月在医疗保健上约60%的花费。因为,遗传因素甚至可能改变环境因素(社会经济地位),从而进一步改变疾病风险。总的来说,环境因素对疾病的预测能力弱于遗传因素。/pp  但环境因素对疾病风险的影响极大。该研究显示,社会经济地位影响了145种不同的疾病,其中,肥胖最易致病。研究结果也表明,气候变化已经并将继续对人们的健康产生重大影响。气温变化使117种不同疾病的风险发生变化,甚至高于空气污染的风险。/pp  该研究的作者帕特尔博士表示:“我们研究的核心问题是‘先天与后天的关系’。这种大规模分析的价值在于,它将揭示基因相对于共同的大环境在许多疾病中的影响,将有助于疾病更好的预防和治疗。”/p
  • 安捷伦科技创造出一款独具特色的细胞遗传学工具
    安捷伦科技将 CGH 和 SNP 分析结合到同一芯片上,创造出一款独具特色的细胞遗传学工具 2010 年 10 月 11 日,北京&mdash &mdash 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)今日推出 SurePrint G3 Human CGH+SNP 芯片平台,这一创新型的系统能够同时分析染色体拷贝数改变和不改变的染色体畸变。该系统可以帮助科研人员研究发育性疾病以及多种癌症的遗传机理。 这是目前市场上唯一检测杂合性丢失和单亲二倍体(LOH/UPD)的双色 CGH 分析平台,分辨率可达 5 至 10兆碱基。 贝勒医学院分子人类遗传学系主任 Arthur Beaudet 博士说,&ldquo 我们终于拥有一款芯片,它不仅具有最佳的拷贝数检测能力,可以覆盖所有外显子,而且还具有 SNP 分析能力,可以检测由 UPD 或近亲结婚引起的杂合性缺失 [LOH]。&rdquo 安捷伦 CGH 芯片产品经理 Anniek De Witte 表示,&ldquo 我们将 SNP 探针加入到已经被广泛使用的 安捷伦CGH 芯片设计中,开发出一款可以同时有效检测拷贝数变化及无拷贝数变化的 LOH/UPD 的强大工具,进而获得更详细和完整的基因组畸变图谱,对此我们相当兴奋。相比我们以前推出的 CGH 芯片,这一新产品的分辨率、准确性和灵敏度同样出色,绝不会让研究者失望。&rdquo 安捷伦 SurePrint G3 CGH+SNP 芯片提供目录版和定制版,与我们目前的芯片形式类似。您可通过安捷伦免费的eArray在线工具或eArray XD 单机版轻松完成定制芯片的设计。 SurePrint CGH+SNP 4x180K 和 2x400K 两款型号的芯片均可检测大约 60000 个 SNP,因此,检测整个基因组的 LOH/UPD 时分辨率可达到约 5 至 10 兆碱基。4x180K芯片上的约 120000 个 CGH 探针,由包括细胞遗传学芯片国际标准联合会 (ISCA,http://isca.genetics.emory.edu) 推荐的8x60K 检测芯片中所有的探针以及额外的 60000 个骨架探针组成。2x400K 芯片上的约 300000 个 CGH 探针覆盖了基因组最重要的区域,侧重于基因和外显子。 SurePrint G3 CGH+SNP 芯片使用与现有的CGH单一检测芯片相同的高通量工作流程,因此能够简单高效地应用于细胞遗传学研究。安捷伦的Genomic Workbench软件采用创新算法,利用 CGH 探针计算拷贝数变化,通过 SNP 探针测定等位基因特异性拷贝数以及定位 LOH/UPD 区域,弥补了现有芯片分析的不足。该软件可以同时分析 CGH 和 SNP 数据,计算QC参数,并以此确保高可信度的数据评估。 关于安捷伦 SurePrint CGH+SNP 芯片的更多信息,请访问www.agilent.com/genomics/cgh_snp关于安捷伦科技公司 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)是全球领先的测量公司,是化学分析、生命科学、电子和通信领域的技术领导者。公司的 18,500 名员工在 100 多个国家为客户服务。在 2009 财政年度,安捷伦的业务净收入为 45 亿美元。要了解更多安捷伦科技的信息,请访问:www.agilent.com.cn
  • Cell:神奇的母亲表观遗传修饰
    父母将基因传给他们的后代,帮助他们适应生活。这说起来简单,但随着近年来研究的深入,表明现实更加复杂,父母所赋予的不仅仅是基因。马普免疫生物学和表观遗传学研究所的Asifa Akhtar实验室最新一项研究表明,效的表观遗传修饰也从一代传给了下一代。这一发现公布在Cell杂志上。我们人类的母亲花了九个月时间生下孩子,之后又要花费数年的时间抚养和养育孩子,教他们如何执行基本的和高级的生存任务。而果蝇产下卵子,让它们自行发育,这看起来果蝇像是不负责任的父母,抛弃了自己的孩子。但是Asifa Akhtar实验室进行的研究表明,果蝇妈妈其实也为果蝇宝宝提供了有关生命周期编码的生命使用手册来确保后代的成功,这就是表观基因组。从基因组到表观基因组我们从父母那里获得遗传信息。但是,即使人体中的所有细胞都包含相同的DNA,它们也会表达不同的基因来实现不同的功能。 DNA包裹在组蛋白周围,形成称为核小体的单个重复单元。许多核小体结合在一起形成位于所有细胞核中的“染色质”。表观遗传修饰(例如向组蛋白中添加化学基团)会导致染色质组织发生变化,从而触发基因激活(也就是“表达”)或基因沉默。表观遗传学代表了附加的信息层,可以帮助细胞确定激活哪些基因。尽管我们的细胞具有通用的基因组,但它们具有不同的“表观基因组”。来自母亲的传代信息传递母体的生殖细胞,卵母细胞和精子在受精过程中融合形成新的生物。科学家们认为,大多数表观遗传标记在每一代之间被删除。而表观遗传复位使得每个新个体都可以重新读取所有基因。最新研究发现,一种特殊的组蛋白修饰,即H4K16ac上组蛋白H4的乙酰化作用,是从母亲的卵母细胞到年轻胚胎的传代遗传。“H4K16ac是一种表观遗传修饰,通常与基因的激活有关。但是,我们知道基因在卵母细胞或胚胎生命的前三个小时都没有表达。这提出了一个问题:H4K16ac在这个早期阶段如何完成修饰的?”Akhtar说。为了研究该组蛋白标记在早期果蝇发育中的功能,研究小组进行了全基因组分析。结果他们发现H4K16ac在其基因激活开始之前的早期发育阶段就“标记”了许多DNA区。母亲的表观遗传信息对胚胎发育至关重要当母亲未能将此标记传递给她的孩子时,H4K16ac对后代的重要性就变得显而易见。科学家利用遗传方法和转基因果蝇设计了实验,从果蝇母体内去除MOF酶——已知MOF负责H4K16ac修饰物的沉积。值得注意的是,当科学家研究没有H4K16ac信息的后代时,他们发现在正常条件下以H4K16ac标记的基因现在不再正取表达,其染色质组织受到严重破坏。大多数未能获得母亲H4K16ac指示的胚胎随后死于灾难性的发育缺陷。从果蝇到人类的教训Akhtar表示:“果蝇妈妈甚至在受孕之前就已经通过表观遗传学确保了后代的生存,这一事实令人着迷。”接下来,研究人员转向哺乳动物,发现雌性小鼠还通过卵母细胞将H4K16ac组蛋白修饰传递给子代。这就提出了一种有趣的可能性,即人类也可能将母亲的H4K16ac用作成功胚胎发育的“蓝图”。情况是否如此以及该蓝图可能编码哪些信息,还有待未来进一步的研究。
  • 【飞诺美色谱】罕见遗传性疾病的救星——寡核苷酸药物
    新冠疫情促使mRNA技术快速发展的同时也使人们开始高度关注核酸药物这一领域。核酸药物包括反义核酸(ASO)、小干扰RNA(siRNA)、微小RNA(miRNA)、小激活RNA(saRNA)、信使RNA(mRNA)、适配体(aptamer)、核酶(ribozyme)、抗体核酸偶联药物(ARC)等,是基因治疗的一种形式。除mRNA药物外,其他几种核酸药物,基本上都是由100个以内的核糖核苷酸或脱氧核糖核苷酸单链或双链组成,所以也称为寡核苷酸药物。与mRNA药物编码产生目的蛋白不同的是,寡核苷酸药物主要是通过碱基互补配对原则与DNA、mRNA或者pre-mRNA配对,通过基因沉默、非编码RNA抑制、基因激活等一系列机制来调节基因表达。已上市寡核苷酸药物化学结构(Nature reviews drug discovery)寡核苷酸药物对比于小分子药物及蛋白药物,具有多方面的优势,首先可根据目标靶点设计碱基序列,靶点明确、特异性强;其次寡核苷酸药物从转录后水平进行治疗,可选择的靶点丰富,特别是能覆盖蛋白质不可成药的靶点以及开发由基因缺陷导致的遗传性疾病的相关靶点;另外寡核苷酸药物由于序列短,可采用化学合成方法,完成目标序列的装配,并结合生物学测试筛选有效序列,能够避免盲目开发,节省研发时间。但是寡核苷酸药物在研发中也面临着诸多挑战。寡核苷酸在细胞外稳定性低,易被核酸酶降解,加上分子量及负电荷的因素,难以进入细胞,因此在研发过程中,使其保持稳定的结构以及能够有效递送的传递载体是主要考虑的两个因素。寡核苷酸核酸分子的改造主要包括磷酸骨架,碱基以及糖环的修饰,在改造中需要考虑多个因素,包括稳定性、药代动力学、碱基配对的亲和力等,最重要的是能够保留被功能酶及功能蛋白所识别的功能。因此,在前期研发过程中,需要对寡核苷酸进行精确的结构表征及定量。丹纳赫生命科学旗下SCIEX 的高分辨质谱ZenoTOF&trade 7600系统具有一系列对寡核苷酸进行分析的方案,可进行寡核苷酸的分子量分析并进行杂质检测,可对寡核苷酸进行碱基序列鉴定。由于Zeno TOF 7600具有EAD和CID两种互补的碰撞模式,不但能产生丰富的离子碎片信息,还会保留完整的核酸低丰度修饰信息。寡核苷酸分子量及碱基序列的检测高分辨质谱ZenoTOF&trade 7600系统另外,高分辨质谱ZenoTOF&trade 7600系统还能实现对寡核苷酸的定量分析,线性范围可达 5 ng/mL – 10000 ng/mL,可以完成寡核苷酸药物在研发阶段的药代及多种代谢产物同时鉴定及定量分析。在研发阶段,对于采用同一种仪器进行鉴定及定量,可避免定量方法转移时造成的方法优化时间浪费,可帮助用户加快研发进度。艾杰尔-飞诺美寡核苷酸定量分析前处理试剂盒高分辨质谱对寡核苷酸进行定量分析在寡核苷酸药物种类中,反义寡核苷酸由于是单链,分子量小,递送较其他寡核苷酸容易,且反义寡核苷酸功能多样,可上调或下调基因表达,成为研发罕见遗传性疾病药物中最关注的种类。为了帮助研究人员开发这类针对罕见遗传性疾病患者的ASO疗法,FDA还发布了指导这类ASO疗法非临床检测的指南。在已上市的寡核苷酸药物中,大部分都是用于治疗罕见遗传性疾病的反义寡核苷酸药物,特别是杜氏型肌营养不良,已经上市了针对不同基因位点的四款产品。药品名治疗疾病药物种类上市时间Fomivirsen巨细胞病毒视网膜炎反义寡核苷酸1998.8(已退市)Pegaptanib年龄相关性黄斑变性核酸适配子2004.12Mipomersen纯合性家族性高胆固醇血症(hoFH)反义寡核苷酸2013.1(已退市)Defibrotide肝静脉闭塞反义寡核苷酸2016.3Eteplirsen杜氏型肌营养不良(DMD基因外显子51)反义寡核苷酸2016.9Nusinersen脊髓性肌萎缩症 (SMN2基因外显子7)反义寡核苷酸2016.12Patisiran遗传性甲状旁腺素淀粉样变性小干扰RNA2018.8Inotersen遗传性甲状旁腺素淀粉样变性反义寡核苷酸2018.10Waylivra家族性乳糜微粒血症综合征反义寡核苷酸2019.5Givosiran急性肝卟啉症小干扰RNA2019.11Golodirsen杜氏型肌营养不良(DMD基因外显子53)反义寡核苷酸2019.12Viltolarsen杜氏型肌营养不良(DMD基因外显子53)反义寡核苷酸2020Lumasiran原发性高草酸尿症I型小干扰RNA2020Inclisiran成人高胆固醇血症及混合性血脂异常小干扰RNA2020Casimersen杜氏型肌营养不良(DMD基因外显子45)反义寡核苷酸2021.2.25已上市的寡核苷酸药物(根据网上资料整理)由此可见,对罕见病的诊断也非常重要,很多罕见遗传病是由几十甚至上百种突变引起的,而且不同区域的患者可能存在不同的基因变异位点,NGS是现在进行高通量基因检测的重要手段。丹纳赫生命科学旗下Integrated DNA Technologies(IDT)公司(中文名称:埃德特)是全球领先的NGS试剂供应商,其外显子捕获产品Exome Research Panel V2特别适合进行遗传性疾病的全外显子组测序,助力遗传性疾病的诊断。V2由 415,115 条单独合成且经过质控检验的 xGen Lockdown 探针组成。探针组跨越人基因组的 34 Mb 目标区域(19,433 个基因),并且覆盖 39 Mb 的探针空间(即由探针覆盖的基因组区域)。探针是使用全新的“捕获感知”(capture-aware) 算法进行设计的,并进行了专有的脱靶分析,确保实现完整的设计覆盖度。探针组中的所有探针均严格按照 ISO 13485 标准进行生产。每条探针均经过质谱法和双定量测量检验,确保探针的质量及在探针库中具有适当的代表性。IDT Exome Research Panel试剂盒
  • 解开中枢神经系统自身免疫性炎症谜团 Nature子刊发现关键的表观遗传机制
    炎症是机体对抗感染及组织损伤反应的一个重要组成部分,但失控的炎症可导致各种疾病发生,并促进癌症形成。  报道:炎症是机体对抗感染及组织损伤反应的一个重要组成部分,但失控的炎症可导致各种疾病发生,并促进癌症形成。由德克萨斯大学MD安德森癌症中心领导的一项新研究,有可能会让罹患多发性硬化症(MS)和其他炎症性疾病的患者受益。这项研究描述了一个叫做Trabid的蛋白质调控因子,是导致多发性硬化症患者中枢神经系统自身免疫性炎症这一谜团中一个重要的部分。研究结果发表在Nature Immunology杂志上。 文章作者,德克萨斯大学MD安德森癌症中心免疫学教授Shao-Cong Sun表示,“我们的研究结果阐明了调控细胞因子基因IL-12和IL-23的一个表观遗传机制,确定了Trabid是炎症性T细胞反应的一个免疫调控因子。Trabid似乎通过控制组蛋白去甲基化酶Jmjd2d的命运调控了组蛋白修饰。”细胞因子是一些对细胞信号传导极为重要的小蛋白,IL-12和IL-23是炎症介质,与一些炎症性疾病有关联。孙少聪认为,Trabid和Jmjd2d有可能是治疗多发性硬化症一类炎症性疾病的潜在治疗靶点。“由于慢性炎症是一个重要的癌症风险因子,未来的研究将会探究Trabid和Jmjd2d是否也在癌症形成中起作用。”研究人员说,IL-12和IL-23一类的促炎症细胞因子连接了一些先天反应和免疫反应,与一些自身免疫性疾病和炎症性疾病相关。先天免疫系统,也称作非特异性免疫系统,其包括一系列的细胞及相关机制,可以非特异性方式保护宿主抵御其他生物的感染。“包括树突状细胞和巨噬细胞在内先天免疫系统细胞,对适应性免疫反应的性质和强度起重要的调控作用。它们能够识别微生物组件,包括各种受体,这些受体可触发细胞内信号传导事件影响这些细胞的功能。先天免疫系统细胞异常生成促炎症细胞因子也可以导致一些自身免疫和炎症性疾病。”这一研究发现,删除树突状细胞中Trabid的蛋白质编码基因Zranb1,可抑制IL-12和IL-23表达,破坏炎症性T细胞分化。这一过程保护了研究小鼠免于自身免疫炎症。
  • 基因测序揭示12种癌症的遗传易感性(含具体数据)
    p  12月22日《Nature Communications》杂志上的一项研究阐述了12种癌症的遗传性,意外发现胃癌遗传概率与乳腺癌等同,同时还揭示了乳腺癌易感基因BRCA1和BRCA2突变对其他癌症的影响。/pp  strong12种癌症的遗传性(遗传性易感性)/strong/pp  长期以来,众所周知癌症的部分风险因素为遗传,且遗传突变在不同肿瘤中的重要性也不一致。华盛顿大学医学院研究人员析了4000多个癌症病例的基因信息,以研究癌症的遗传性。这些4000多个病例均来自美国国立卫生研究院(NIH)组织的癌症基因组图谱项目。/pp  过去的癌症基因组研究主要是比较健康组织与癌变组织的测序结果,帮助研究人员确定哪些基因在癌症的发展过程中扮演重要的角色,但这种分析不能区分遗传突变是天生的还是后天形成的。/pp  为了梳理癌症的遗传分量,研究人员在该研究中加入了包含患者胚胎信息的正常细胞相关测序数据的分析。患者生殖细胞系来自于父母,可揭示先天性的遗传信息,判断与癌症相关的突变是否与生俱来。/pp  本文资深作者,华盛顿大学McDonnell基因研究所医学教授Li Ding博士说,“总体而言,我们已经知道卵巢癌和乳腺癌有一个重要的遗传因素,但其他类型的癌症,如急性髓系白血病、肺癌等的遗传性小一些。”/pp  研究人员在所有的分析病例中寻找已知的与癌症相关的罕见生殖系突变。若出生时其中一个亲本的一个基因中的一个拷贝发生了突变,来自另一个亲本的正常拷贝通常可将该缺陷掩盖,但携带这种突变的个体更容易受到“第二次攻击”,随着年龄的增长,正常拷贝的基因发生突变的风险值越高。/pp  在与癌症相关的已知的114个基因中,研究人员发现了12种癌症的种系突变,但突变频率取决于癌症的类型。研究人员专注于一种称为“截断(truncation)”的突变类型,因为大部分的截短基因(truncated gene)是不发挥功能的。这12种癌症的遗传性如下表所示:/pp style="text-align: center "img width="600" height="400" title="201512231615324365.jpg" style="width: 600px height: 400px " src="http://img1.17img.cn/17img/images/201512/noimg/adc72687-e812-4bef-99f5-8a4b4285ae2e.jpg" border="0" vspace="0" hspace="0"//pp style="text-align: center "  strongLUNG1为肺鳞状细胞癌,LUNG2为肺腺癌/strong/pp  在本次调查中,19%的卵巢癌病例携带罕见的生殖系“截断”突变,相比之下,仅有4%的急性髓系白血病患者携带这种突变,同时研究人员发现胃癌患者携带这种突变的概率为11%,与乳腺癌患者相当。该研究结果可提高癌症风险基因检测的准确性。/pp  strong乳腺癌易感基因BRCA1和BRCA2可能影响其他癌症的形成/strong/pp  BRCA1和BRCA2基因对DNA修复很重要,且一直以来被认为与乳腺癌风险相关,但该研究揭示了这两个基因可能有更广泛的影响。/pp  “我们发现大量的BRCA1和BRCA2基因生殖系’截断’突变发生于乳腺癌以外的肿瘤,包括胃癌和前列腺癌”,Ding说,“这表明我们应注意这两个基因可能潜在地参与了其他类型癌症的发展。BRCA1基因发生生殖系截断突变的患者,90%的BRCA1截断突变在肿瘤组织中扩增,且与癌症类型无关。”/pp  对已知乳腺癌风险高的女性进行BRCA1和BRCA2基因检测可提供重要的预防信息。例如,当基因型正常时乳腺癌遗传风险值不会升高,但如果其中一个基因发生了一些可使另外一个基因失效的突变,那么乳腺癌风险会大大增加。/pp  突变的类型多种多样,基因测序还可揭示这些基因突变的许多未知结果,且目前这些突变对癌症风险的影响也是无法预测的。为了弄清临床实践中的灰色地带,Ding及其同事俄亥俄州立大学计算机生物学和生物信息学家Jeffrey Parvin博士和华盛顿大学医学教授Feng Chen博士研究了BRAC1基因中意义不明确的68个种系非截断突变体。对于每一种突变,研究人员均测试了BRAC1蛋白如何执行其DNA修复的功能,结果发现其中6个突变体表现出了完全截断效应——使基因完全失效,且这些突变在肿瘤中含量非常丰富,在癌症发展中可能扮演着不同的角色。/pp  Ding表示,“揭示这六个未知突变的临床意义非常重要(实际上它们是导致基因功能丧失的突变)。但同时我想强调结果的对比性,许多类型的突变(至少在我们的研究中)是中性的,我们想将其识别出来使卫生保健提供者能给患者提出更好的建议。但将此研究结果纳入临床之前还需更多的研究来证实。”/p
  • 中国帕金森病遗传因素特征研究,测序技术是关键
    记者2月15日从中南大学湘雅医院获悉,该院神经内科、国家老年疾病临床医学研究中心(湘雅医院)教授唐北沙科研团队于2月10日在《npj-帕金森病》(npj Parkinson's Disease)上发表原创性论文“基于全基因组测序的全基因组关联研究鉴定了中国帕金森病人群的风险基因位点”,这是首个大型中国帕金森病人群全基因组关联研究,揭示了中国帕金森病的遗传因素特征。唐北沙和西湖大学教授杨剑为论文并列通讯作者,湘雅医院神经内科博士研究生潘宏旭、副教授刘振华为共同第一作者,湘雅医院为第一单位兼第一通讯单位。PD是常见的神经变性疾病之一,病因和发病机制仍不清楚,主要认为与年龄老化、环境因素和遗传因素及其相互作用有关。遗传因素在PD中的作用越来越得到重视。截至目前,世界上已发表多个PD全基因组关联研究成果,揭示了90余个风险基因位点;但对人口众多、人口日趋老龄化的中国人群而言,PD人群的遗传背景仍不明确。为系统解析中国PD人群的遗传因素特征,唐北沙牵头联合众多国内专家,构建了中国帕金森病及运动障碍疾病多中心数据及协作网(PD-MDCNC),建立了大型中国PD病例-对照的临床队列;应用全基因组测序技术在发现队列完成了首个全基因组关联研究,随后利用多重PCR扩增子捕获测序技术在验证队列进行了验证研究。最终,该团队鉴定了1个新的PD风险基因位点,明确了53个与中国PD相关的风险基因位点,其中12为全基因组显著相关的风险基因位点、5个为中国PD人群特异性风险基因位点;绘制了中国PD人群易感基因变异谱;基于全基因组数据,发现中国PD人群的遗传度为0.18,稍低于欧洲血统人群(为0.22)。该研究还利用中国PD人群相关风险基因位点构建了多基因风险预测模型,发现携带多个风险基因位点的人群PD发病风险是没有携带风险基因位点的3.9倍,可为PD高危人群的早期预警、早期筛查、早期诊断提供指导。该研究得到了首都医科大学宣武医院教授陈彪、上海交通大学医学院附属瑞金医院教授刘军、北京医院教授陈海波、广东省人民医院教授王丽娟以及新加坡南洋理工大学教授Jia Nee Foo、美国国立卫生研究院教授Andrew B Singleton各团队的大力支持,也得到了PD-MDCNC平台的有力支持,得到国家重点研发计划、国家自然科学基金重点项目等基金资助。论文审稿人认为,该研究采用两阶段设计,利用全基因组测序技术进行了中国PD人群的全基因组关联研究,研究思路严谨,报告了新的风险基因位点与中国PD人群遗传因素特点,对帕金森病遗传因素研究做出了重要贡献。
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