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测序电泳槽

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测序电泳槽相关的资讯

  • 水平电泳仪金秋大促
    金秋开学礼,cleaver电泳系统福利促销第一弹!!!通用实验科技(中国)有限公司-英国cleaver水平电泳系统金秋十月大促销 促销日期:2018年10月16号-2018年11月1日为答谢新老用户一直以来对cleaver产品的信任和支持,在此金风送爽,丹桂飘香的金秋十月,我司对生命科学类实验室仪器-水平电泳系统现进行如下大力促销,cleaver水平电泳系统主要是用于核酸样本的快速检测,第一弹福利产品详情如下: multiSUB Mini水平电泳槽 multiSUB Midi水平电泳槽 multiSUB Choice水平电泳槽型号:MSMINIDUO 型号:MSMIDIDUO 型号:MSCHOICETRIO秒杀价:2300元/台 秒杀价:2500元/台 秒杀价:2700元/台 更多产品特点和细节可咨询客服:400-821-3360温馨提示:促销期间按照订单付款顺序发货,先到先得,售完即止,此促销活动全年仅此一次!!!莫失良机!!!公司背景通用实验科技(中国)有限公司(Labcare Scientific China Limited)是一家专注于通用实验室配件耗材、设备仪器和工程项目服务的高科技公司。我们依托团队在生命科学和化学分析仪器行业的专业背景以及在材料系统筛选和加工生产及质量管理领域丰富的经验,在欧洲、北美和亚太地区都设立了代表处。致力于专业、严格地筛选了大量国内外直接原厂生产商作为协议供应商,以委托制造式进行并实现全球采购。通过专业的库存和物流管理体系,致力于为目标地域的生命科学和化学分析实验室用户提供质优价廉的各种通用实验室配件耗材、仪器设备和服务。
  • GE推出全新一代预制胶水平蛋白电泳系统
    作为世界上第一个在western blot实验中使用的化学发光试剂,AmershamTM ECL品牌自1990年推出以来,一直不断地进行着技术的改良,为科研工作者提供着高品质的western blot检测产品。继2010年10月18日最新推出ECL prime化学发光检测试剂盒,AmershamTM ECL家族再度创新,于2011年6月,荣耀推出全新一代预制胶水平蛋白电泳系统,为您的电泳实验助力! AmershamTM ECLTMGel system预制胶水平蛋白电泳系统由Amersham ECL预制胶及Amersham ECL电泳槽组成。预制胶结合独特水平设计的电泳槽,方便用于高质量的蛋白电泳分离。Amersham ECL预制胶稳定性好,可用于分离复杂蛋白样品,实现高质量、可重复的电泳结果:无需灌胶,省时方便预制胶保质期长达12个月实验更安全,避免了灌胶时接触丙烯酰胺实验结果更稳定性,预制胶为高质量、可重复的电泳保驾护航Amersham ECL电泳槽独特水平设计,使得电泳操作更加方便:上样更轻松仅需200ml电泳缓冲液特殊设计有效避免缓冲液漏液配合预制胶,完成8x7.5cm电泳分离详情请询当地销售代表及经销商
  • 日立高新推出DS3000紧凑型毛细管电泳测序仪
    p dir="ltr" style="text-align: justify text-indent: 2em "2020年9月1日,日立高新宣布,DS3000紧凑型毛细管电泳(CE)测序仪将在日本、中国、韩国发售。日立DS3000由日立高新技术公司和普洛麦格公司合作开发。/pp dir="ltr" style="text-align: center text-indent: 0em " img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202009/uepic/cf02a272-e697-4cf7-8c8a-6ca36228236c.jpg" title="图片1.png" alt="图片1.png"//pp dir="ltr" style="text-align: center text-indent: 0em "span style="color: rgb(0, 112, 192) "strong紧凑型毛细管电泳测序仪 日立DS3000/strong/span/pp dir="ltr" style="text-align: justify text-indent: 2em "DNA测序仪用于遗传分析研究:包括对病毒、微生物和人类在内的所有生物体所拥有的遗传信息进行分析。该仪器用于自动读取和分析包含生物遗传信息的DNA碱基序列。尤其是新一代测序仪,可以一次性分析大量的基因序列,现已被广泛应用。然而,在制药、食品工业和大学中的小规模研究机构中,还需要能够在短时间内以相对较低的成本进行基因样品分析。 紧凑型第一代CE测序仪可以满足这些研究机构的需求,并且有望实现稳定的需求。/pp dir="ltr" style="text-align: justify text-indent: 2em "日立DS3000 CE测序仪以日立高科技多年来开发的毛细管和激光辐照技术,以紧凑的形式提供了世界一流的高性能和高速处理。 该产品还具有环保设计,可帮助减少产品使用过程中的CO2排放量-价值链中占CO2排放量最多的阶段,为客户带来的环境负荷较小。/pp dir="ltr" style="text-align: justify text-indent: 2em "日立DS3000 CE测序仪可以小巧的样式提供了世界一流的高性能和高速处理,得益于日立高新多年来开发的毛细管和激光辐照技术。该产品还采用了环保设计,可减少产品在使用过程中的二氧化碳排放量。/pp dir="ltr" style="text-align: justify text-indent: 2em "strong日立DS3000的主要优点如下:/strong/pp dir="ltr" style="text-align: justify text-indent: 2em "1. 节省空间,设计方便/pp dir="ltr" style="text-align: justify text-indent: 2em "DS3000配有触摸屏,用户可以一目了然地查看状态;简化了测量设置过程,使基因分析更容易;它具有紧凑的设计,占地面积远远小于传统型号,从而节省了空间并易于使用;此外,远程监控系统允许远程访问设备,并且通用PC可以用于输出报告和运行辅助分析软件,从而降低了设备的成本。/pp dir="ltr" style="text-align: justify text-indent: 2em "2. 减少维修/pp dir="ltr" style="text-align: justify text-indent: 2em "设备内部的耗材采用盒式系统,便于安装。此外,输送系统是无泵的,从而无需常规的清洁工艺,减少了维护时间和成本。相比于更换复杂且昂贵的传统光源,新型激光二极管(LD)光源的发光速度更快、使用寿命更长。/pp dir="ltr" style="text-align: justify text-indent: 2em "br//pp dir="ltr" style="text-align: justify text-indent: 2em "日立DS3000有望被用于大学的核心设施和小型研究实验室等场所,因为它是一个易于使用,可操作的CE测序仪,它是一种易于使用的可操作CE测序仪,可用于验证已被下一代测序仪分析的大量基因序列数据以及进行人类鉴定中使用的片段分析等工作。/pp dir="ltr" style="text-align: justify text-indent: 2em "通过开发该产品,日立高新可进一步扩大生物/医疗保健市场的DNA测序业务,这是一个重点领域。日立高新将继续利用“分析技术”,迅速把握客户的先进需求,在生物/医疗、安全/安保等领域创造具有高附加值解决方案。/pp dir="ltr"br//p
  • 中南大学湘雅二医院799.75万元采购基因测序仪,毛细管电泳仪,PCR
    详细信息 中南大学湘雅二医院临床分子诊断中心2023年第四批试剂及配套产品入围遴选项目遴选公告 湖南省-长沙市-天心区 状态:公告 更新时间: 2023-11-13 招标文件: 附件1 中南大学湘雅二医院临床分子诊断中心2023年第四批试剂及配套产品入围遴选项目遴选公告 项目概况 中南大学湘雅二医院临床分子诊断中心2023年第四批试剂及配套产品入围遴选项目 招标项目的潜在投标人应在华新项目管理集团有限公司(长沙市天心区书院路9号保利国际B3栋1805室)获取招标文件,并于2023年12月06日 09点00分(北京时间)前递交投标文件。 一、项目基本情况 项目编号:HXCG-HN-2311009 项目名称:中南大学湘雅二医院临床分子诊断中心2023年第四批试剂及配套产品入围遴选项目 预算金额:799.750000 万元(人民币) 采购需求: 目录序号 目录名称 参数用途或功能描叙 规格 最高限价 入围数量 预估年使用金额(万元) 1 胎儿染色体非整倍体(T21、T18、T13)检测试剂盒 无创产前筛查(NIPT)项目 各规格 474元/人份 1 96.8 胎儿染色体非整倍体(T21、T18、T13)检测试剂盒 无创产前筛查NIPT升级版(全因1.0) 750元/人份 染色体拷贝数变异检测试剂盒 无创产前筛查(NIPT)项目 660元/人份 配套产品(采购限价及采购需求详见第三章) 2 药物测序反应通用试剂盒 用于指导临床精准用药的基因检测 各规格 120元/基因 1 150 配套产品(采购限价及采购需求详见第三章) 3 家族性非溶血性黄疸致病基因UGT1A1变异检测试剂盒 需采用PCR扩增及一代测序,适用UGT1A1基因的外显子区域微小变异检测 各规格 416元/人份 1 545.4 遗传性甲状腺素运载蛋白相关的淀粉样变性致病基因TTR变异检测试剂盒 需采用PCR扩增及一代测序,适用TTR基因的外显子区域微小变异检测 416元/人份 遗传病基因qPCR检测试剂盒 需采用荧光定量PCR,适用于特定区域的拷贝数变异检测 208元/人份 遗传病基因外周血mRNA异常剪接检测试剂盒 需采用逆转录PCR及一代测序,适用于剪接位点的可变剪接检测 624元/人份 单基因遗传病致病基因变异检测1项检测试剂盒 配套试剂需采用PCR扩增及一代测序,适用于某1个特定变异位点检测或仅含有1个外显子的基因的外显子区域微小变异检测 104元/人份 单基因遗传病致病基因变异检测2项检测试剂盒 配套试剂需采用PCR扩增及一代测序,适用于2个特定变异位点检测或仅含有2个外显子的基因的外显子区域微小变异检测 208元/人份 单基因遗传病致病基因变异检测3项检测试剂盒 配套试剂需采用PCR扩增及一代测序,适用于3个特定变异位点检测或含有3个外显子的基因的外显子区域微小变异检测 312元/人份 单基因遗传病致病基因变异检测4项检测试剂盒 配套试剂需采用PCR扩增及一代测序,适用于4个特定变异位点检测或含有4个外显子的基因的外显子区域微小变异检测 416元/人份 单基因遗传病致病基因变异检测5项检测试剂盒 配套试剂需采用PCR扩增及一代测序,适用于5个特定变异位点检测或含有5个外显子的基因的外显子区域微小变异检测 520元/人份 单基因遗传病致病基因变异检测6项检测试剂盒 配套试剂需采用PCR扩增及一代测序,适用于6个特定变异位点检测或含有6个外显子的基因的外显子区域微小变异检测 624元/人份 单基因遗传病致病基因变异检测7项检测试剂盒 配套试剂需采用PCR扩增及一代测序,适用于7个特定变异位点检测或含有7个外显子的基因的外显子区域微小变异检测 728元/人份 单基因遗传病致病基因变异检测8项检测试剂盒 配套试剂需采用PCR扩增及一代测序,适用于8个特定变异位点检测或含有8个外显子的基因的外显子区域微小变异检测 832元/人份 单基因遗传病致病基因变异检测9项检测试剂盒 配套试剂需采用PCR扩增及一代测序,适用于9个特定变异位点检测或含有9个外显子的基因的外显子区域微小变异检测 936元/人份 单基因遗传病致病基因变异检测10项检测试剂盒 配套试剂需采用PCR扩增及一代测序,适用于10个特定变异位点检测或含有10个外显子的基因的外显子区域微小变异检测 1040元/人份 单基因遗传病致病基因变异检测11项检测试剂盒 配套试剂需采用PCR扩增及一代测序,适用于11个特定变异位点检测或含有11个外显子的基因的外显子区域微小变异检测 1144元/人份 脊髓小脑共济失调(SCA)动态突变9项检测试剂盒 通过PCR扩增及毛细管电泳,适用于脊髓小脑共济失调共九型的多核苷酸重复变异检测 936元/人份 脊髓小脑共济失调(SCA)动态突变3检测试剂盒 通过PCR扩增及毛细管电泳,适用于脊髓小脑共济失调1、2、3型共三型的多核苷酸重复变异检测 312元/人份 单基因遗传病临床全外显子组检测试剂盒 配套试剂需采用探针捕获法,适用于单基因遗传病的临床全外显子组变异检测 1600元/人份 基于高通量测序的染色体结构变异检测试剂盒(CNV-Seq) 配套试剂需采用探针捕获法,适用于染色体的拷贝数变异检测 880元/人份 遗传性肿瘤相关基因检测试剂盒 配套试剂需采用探针捕获法,适用于由BRCA1等基因胚系变异所致的遗传性肿瘤基因变异检测 1200元/人份 智力障碍(含自闭症)相关基因检测试剂盒 配套试剂需采用探针捕获法,适用于智力障碍相关基因胚系变异检测 1200元/人份 单病种相关基因检测试剂盒 配套试剂需采用探针捕获法,适用于肌营养不良、癫痫等某一特定单基因病的相关基因胚系变异检测 1200元/人份 单系统遗传病相关基因检测试剂盒 配套试剂需采用探针捕获法,适用于神经系统、心血管系统等某一特定系统遗传病的相关基因胚系变异检测 1440元/人份 线粒体基因组检测试剂盒 配套试剂需采用探针捕获法,适用于线粒体环基因的变异检测 960元/人份 21-羟化酶缺乏症CYP21A2基因检测试剂盒 配套试剂需采用特异性长片段扩增及探针捕获法,适用于CYP21A1基因的变异检测 1200元/人份 常染色体显性多囊肾病PKD1、PKD2基因检测试剂盒 配套试剂需采用特异性长片段扩增及探针捕获法,适用于PKD1及PKD2基因的变异检测 1200元/人份 全外显子测序携带者夫妻联合筛查检测试剂盒 配套试剂需采用探针捕获法,适用于夫妻的单基因遗传病临床全外显子的变异携带筛查 3120元/人份 遗传性肿瘤基因筛查检测试剂盒 配套试剂需采用探针捕获法,适用于遗传性肿瘤相关基因变异携带筛查 960元/人份 遗传性心血管基因筛查检测试剂盒 配套试剂需采用探针捕获法,适用于心血管系统遗传病相关基因变异携带筛查 960元/人份 阿尔兹海默病基因筛查检测试剂盒 配套试剂需采用探针捕获法,适用于阿尔茨海默病相关基因变异携带筛查 960元/人份 帕金森病基因筛查检测试剂盒 配套试剂需采用探针捕获法,适用于帕金森病相关基因变异携带筛查检测 960元/人份 骨质疏松基因筛查检测试剂盒 配套试剂需采用探针捕获法,适用于骨质疏松相关基因变异携带筛查 960元/人份 遗传性糖尿病基因筛查检测试剂盒 配套试剂需采用探针捕获法,适用于遗传性糖尿病相关基因变异携带筛查 960元/人份 单基因病扩展性携带者筛查检测试剂盒 配套试剂需采用探针捕获法,适用于特定数目(100-500个)单基因病致病基因变异携带筛查 960元/人份 新生儿遗传病基因筛查检测试剂盒 配套试剂需采用探针捕获法,适用于新生儿遗传病相关基因变异携带筛查 960元/人份 遗传性易栓症基因筛查检测试剂盒 配套试剂需采用探针捕获法,适用于遗传性易栓症相关基因变异携带筛查 960元/人份 高精度临床全外显子组检测检测试剂盒 配套试剂需采用探针捕获法,适用于与疾病关系明确的7000多个基因的全外显子组变异检测 1440元/人份 配套产品(采购限价及采购需求详见第三章) 注:按目录序号确定入围供应商,各供应商须对目录序号所有产品进行响应,不得拆分,否则将取消其申请资格。 合同履行期限:3年 本项目( 不接受 )联合体投标。 二、申请人的资格要求: 1.满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定; 2.落实政府采购政策需满足的资格要求: 按相关政策执行 3.本项目的特定资格要求:1)所投货物若纳入医疗器械管理的,供应商须具有医疗器械生产或经营许可证(或相应的备案凭证),且生产范围或经营范围必须包含体外诊断试剂。2)接受生产企业(境外产品国内总代理视同为生产企业)或具备有效授权委托书的经营企业参与。同一目录序号下同一生产厂家只能授权一家代理商参加遴选,生产厂家与其授权货物代理商不得同时参与同一目录序号遴选,否则其相应申请均无效。4、单位负责人为同一人或者存在控股、管理关系的不同单位,不得同时参加同一目录序号的申请。5、与采购人存在利害关系可能影响入围公正性的法人、其他组织或者个人,不得参加申请。6、被“信用中国”网站列入失信被执行人和重大税收违法案件当事人名单的或被“中国政府采购网”网站列入政府采购严重违法失信行为记录名单(处罚期限尚未届满的),不得申请。7、符合法律、行政法规规定的其他条件。 三、获取招标文件 时间:2023年11月13日 至 2023年11月27日,每天上午9:00至12:00,下午14:00至17:00。(北京时间,法定节假日除外) 地点:华新项目管理集团有限公司(长沙市天心区书院路9号保利国际B3栋1805室) 方式:持报名资料到指定地点购买。(报名所需资料详见其他补充事宜) 售价:¥400.0 元,本公告包含的招标文件售价总和 四、提交投标文件截止时间、开标时间和地点 提交投标文件截止时间:2023年12月06日 09点00分(北京时间) 开标时间:2023年12月06日 09点00分(北京时间) 地点:华新项目管理集团有限公司(长沙市天心区书院路9号保利国际B3栋1805室) 五、公告期限 自本公告发布之日起5个工作日。 六、其他补充事宜 1、供应商获取遴选文件时必须提供以下资格证明资料(一式一份,装订成册)(注:报名资料除法定代表人身份证明和授权委托书须提供原件外,其它资料须提交复印件并加盖公司公章): ①法定代表人身份证明、法定代表人委托授权书(附被授权委托人身份证); ②营业执照(具有统一信用代码); ③提供试剂生产厂商信息表(格式见公告附件)(提供纸质版以及电子档,电子档(需提供试剂信息一览表excel格式)请在报名前将此表格发送至邮箱3585232829@qq.com,邮件备注“中南大学湘雅二医院临床分子诊断中心2023年第四批试剂及配套产品入围遴选项目 +公司名称报名资料”); ④本公告供应商资格要求中所规定的证明材料。(具体要求详见公告附件) 本公告同时在中国政府采购网(http://www.ccgp.gov.cn/)、中南大学湘雅二医院(http://www.xyeyy.com/3/29/index.htm)发布,公告附件在中国政府采购网下载。 七、对本次招标提出询问,请按以下方式联系。 1.采购人信息 名 称:中南大学湘雅二医院 地址:湖南省长沙市人民中路139号 联系方式:黄老师 联系电话:0731-85294138 2.采购代理机构信息 名 称:华新项目管理集团有限公司 地 址:长沙市天心区书院路9号保利国际B3栋1805室 联系方式:项目联系人:罗婷、康心旭、彭晓坤、粟瑀 电 话:0731-85163777 3.项目联系方式 项目联系人:罗婷、康心旭、彭晓坤、粟瑀 电 话: 0731-85163777 1.公告附件-中南大学湘雅二医院临床分子诊断中心2023年第四批试剂及配套产品入围遴选项目.docx × 扫码打开掌上仪信通App 查看联系方式 基本信息 关键内容:基因测序仪,毛细管电泳仪,PCR 开标时间:2023-12-06 09:00 预算金额:799.75万元 采购单位:中南大学湘雅二医院 采购联系人:点击查看 采购联系方式:点击查看 招标代理机构:华新项目管理集团有限公司 代理联系人:点击查看 代理联系方式:点击查看 详细信息 中南大学湘雅二医院临床分子诊断中心2023年第四批试剂及配套产品入围遴选项目遴选公告 湖南省-长沙市-天心区 状态:公告 更新时间: 2023-11-13 招标文件: 附件1 中南大学湘雅二医院临床分子诊断中心2023年第四批试剂及配套产品入围遴选项目遴选公告 项目概况 中南大学湘雅二医院临床分子诊断中心2023年第四批试剂及配套产品入围遴选项目 招标项目的潜在投标人应在华新项目管理集团有限公司(长沙市天心区书院路9号保利国际B3栋1805室)获取招标文件,并于2023年12月06日 09点00分(北京时间)前递交投标文件。 一、项目基本情况 项目编号:HXCG-HN-2311009 项目名称:中南大学湘雅二医院临床分子诊断中心2023年第四批试剂及配套产品入围遴选项目 预算金额:799.750000 万元(人民币) 采购需求: 目录序号 目录名称 参数用途或功能描叙 规格 最高限价 入围数量 预估年使用金额(万元) 1 胎儿染色体非整倍体(T21、T18、T13)检测试剂盒 无创产前筛查(NIPT)项目 各规格 474元/人份 1 96.8 胎儿染色体非整倍体(T21、T18、T13)检测试剂盒 无创产前筛查NIPT升级版(全因1.0) 750元/人份 染色体拷贝数变异检测试剂盒 无创产前筛查(NIPT)项目 660元/人份 配套产品(采购限价及采购需求详见第三章) 2 药物测序反应通用试剂盒 用于指导临床精准用药的基因检测 各规格 120元/基因 1 150 配套产品(采购限价及采购需求详见第三章) 3 家族性非溶血性黄疸致病基因UGT1A1变异检测试剂盒 需采用PCR扩增及一代测序,适用UGT1A1基因的外显子区域微小变异检测 各规格 416元/人份 1 545.4 遗传性甲状腺素运载蛋白相关的淀粉样变性致病基因TTR变异检测试剂盒 需采用PCR扩增及一代测序,适用TTR基因的外显子区域微小变异检测 416元/人份 遗传病基因qPCR检测试剂盒 需采用荧光定量PCR,适用于特定区域的拷贝数变异检测 208元/人份 遗传病基因外周血mRNA异常剪接检测试剂盒 需采用逆转录PCR及一代测序,适用于剪接位点的可变剪接检测 624元/人份 单基因遗传病致病基因变异检测1项检测试剂盒 配套试剂需采用PCR扩增及一代测序,适用于某1个特定变异位点检测或仅含有1个外显子的基因的外显子区域微小变异检测 104元/人份 单基因遗传病致病基因变异检测2项检测试剂盒 配套试剂需采用PCR扩增及一代测序,适用于2个特定变异位点检测或仅含有2个外显子的基因的外显子区域微小变异检测 208元/人份 单基因遗传病致病基因变异检测3项检测试剂盒 配套试剂需采用PCR扩增及一代测序,适用于3个特定变异位点检测或含有3个外显子的基因的外显子区域微小变异检测 312元/人份 单基因遗传病致病基因变异检测4项检测试剂盒 配套试剂需采用PCR扩增及一代测序,适用于4个特定变异位点检测或含有4个外显子的基因的外显子区域微小变异检测 416元/人份 单基因遗传病致病基因变异检测5项检测试剂盒 配套试剂需采用PCR扩增及一代测序,适用于5个特定变异位点检测或含有5个外显子的基因的外显子区域微小变异检测 520元/人份 单基因遗传病致病基因变异检测6项检测试剂盒 配套试剂需采用PCR扩增及一代测序,适用于6个特定变异位点检测或含有6个外显子的基因的外显子区域微小变异检测 624元/人份 单基因遗传病致病基因变异检测7项检测试剂盒 配套试剂需采用PCR扩增及一代测序,适用于7个特定变异位点检测或含有7个外显子的基因的外显子区域微小变异检测 728元/人份 单基因遗传病致病基因变异检测8项检测试剂盒 配套试剂需采用PCR扩增及一代测序,适用于8个特定变异位点检测或含有8个外显子的基因的外显子区域微小变异检测 832元/人份 单基因遗传病致病基因变异检测9项检测试剂盒 配套试剂需采用PCR扩增及一代测序,适用于9个特定变异位点检测或含有9个外显子的基因的外显子区域微小变异检测 936元/人份 单基因遗传病致病基因变异检测10项检测试剂盒 配套试剂需采用PCR扩增及一代测序,适用于10个特定变异位点检测或含有10个外显子的基因的外显子区域微小变异检测 1040元/人份 单基因遗传病致病基因变异检测11项检测试剂盒 配套试剂需采用PCR扩增及一代测序,适用于11个特定变异位点检测或含有11个外显子的基因的外显子区域微小变异检测 1144元/人份 脊髓小脑共济失调(SCA)动态突变9项检测试剂盒 通过PCR扩增及毛细管电泳,适用于脊髓小脑共济失调共九型的多核苷酸重复变异检测 936元/人份 脊髓小脑共济失调(SCA)动态突变3检测试剂盒 通过PCR扩增及毛细管电泳,适用于脊髓小脑共济失调1、2、3型共三型的多核苷酸重复变异检测 312元/人份 单基因遗传病临床全外显子组检测试剂盒 配套试剂需采用探针捕获法,适用于单基因遗传病的临床全外显子组变异检测 1600元/人份 基于高通量测序的染色体结构变异检测试剂盒(CNV-Seq) 配套试剂需采用探针捕获法,适用于染色体的拷贝数变异检测 880元/人份 遗传性肿瘤相关基因检测试剂盒 配套试剂需采用探针捕获法,适用于由BRCA1等基因胚系变异所致的遗传性肿瘤基因变异检测 1200元/人份 智力障碍(含自闭症)相关基因检测试剂盒 配套试剂需采用探针捕获法,适用于智力障碍相关基因胚系变异检测 1200元/人份 单病种相关基因检测试剂盒 配套试剂需采用探针捕获法,适用于肌营养不良、癫痫等某一特定单基因病的相关基因胚系变异检测 1200元/人份 单系统遗传病相关基因检测试剂盒 配套试剂需采用探针捕获法,适用于神经系统、心血管系统等某一特定系统遗传病的相关基因胚系变异检测 1440元/人份 线粒体基因组检测试剂盒 配套试剂需采用探针捕获法,适用于线粒体环基因的变异检测 960元/人份 21-羟化酶缺乏症CYP21A2基因检测试剂盒 配套试剂需采用特异性长片段扩增及探针捕获法,适用于CYP21A1基因的变异检测 1200元/人份 常染色体显性多囊肾病PKD1、PKD2基因检测试剂盒 配套试剂需采用特异性长片段扩增及探针捕获法,适用于PKD1及PKD2基因的变异检测 1200元/人份 全外显子测序携带者夫妻联合筛查检测试剂盒 配套试剂需采用探针捕获法,适用于夫妻的单基因遗传病临床全外显子的变异携带筛查 3120元/人份 遗传性肿瘤基因筛查检测试剂盒 配套试剂需采用探针捕获法,适用于遗传性肿瘤相关基因变异携带筛查 960元/人份 遗传性心血管基因筛查检测试剂盒 配套试剂需采用探针捕获法,适用于心血管系统遗传病相关基因变异携带筛查 960元/人份 阿尔兹海默病基因筛查检测试剂盒 配套试剂需采用探针捕获法,适用于阿尔茨海默病相关基因变异携带筛查 960元/人份 帕金森病基因筛查检测试剂盒 配套试剂需采用探针捕获法,适用于帕金森病相关基因变异携带筛查检测 960元/人份 骨质疏松基因筛查检测试剂盒 配套试剂需采用探针捕获法,适用于骨质疏松相关基因变异携带筛查 960元/人份 遗传性糖尿病基因筛查检测试剂盒 配套试剂需采用探针捕获法,适用于遗传性糖尿病相关基因变异携带筛查 960元/人份 单基因病扩展性携带者筛查检测试剂盒 配套试剂需采用探针捕获法,适用于特定数目(100-500个)单基因病致病基因变异携带筛查 960元/人份 新生儿遗传病基因筛查检测试剂盒 配套试剂需采用探针捕获法,适用于新生儿遗传病相关基因变异携带筛查 960元/人份 遗传性易栓症基因筛查检测试剂盒 配套试剂需采用探针捕获法,适用于遗传性易栓症相关基因变异携带筛查 960元/人份 高精度临床全外显子组检测检测试剂盒 配套试剂需采用探针捕获法,适用于与疾病关系明确的7000多个基因的全外显子组变异检测 1440元/人份 配套产品(采购限价及采购需求详见第三章) 注:按目录序号确定入围供应商,各供应商须对目录序号所有产品进行响应,不得拆分,否则将取消其申请资格。 合同履行期限:3年 本项目( 不接受 )联合体投标。 二、申请人的资格要求: 1.满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定; 2.落实政府采购政策需满足的资格要求: 按相关政策执行 3.本项目的特定资格要求:1)所投货物若纳入医疗器械管理的,供应商须具有医疗器械生产或经营许可证(或相应的备案凭证),且生产范围或经营范围必须包含体外诊断试剂。2)接受生产企业(境外产品国内总代理视同为生产企业)或具备有效授权委托书的经营企业参与。同一目录序号下同一生产厂家只能授权一家代理商参加遴选,生产厂家与其授权货物代理商不得同时参与同一目录序号遴选,否则其相应申请均无效。4、单位负责人为同一人或者存在控股、管理关系的不同单位,不得同时参加同一目录序号的申请。5、与采购人存在利害关系可能影响入围公正性的法人、其他组织或者个人,不得参加申请。6、被“信用中国”网站列入失信被执行人和重大税收违法案件当事人名单的或被“中国政府采购网”网站列入政府采购严重违法失信行为记录名单(处罚期限尚未届满的),不得申请。7、符合法律、行政法规规定的其他条件。 三、获取招标文件 时间:2023年11月13日 至 2023年11月27日,每天上午9:00至12:00,下午14:00至17:00。(北京时间,法定节假日除外) 地点:华新项目管理集团有限公司(长沙市天心区书院路9号保利国际B3栋1805室) 方式:持报名资料到指定地点购买。(报名所需资料详见其他补充事宜) 售价:¥400.0 元,本公告包含的招标文件售价总和 四、提交投标文件截止时间、开标时间和地点 提交投标文件截止时间:2023年12月06日 09点00分(北京时间) 开标时间:2023年12月06日 09点00分(北京时间) 地点:华新项目管理集团有限公司(长沙市天心区书院路9号保利国际B3栋1805室) 五、公告期限 自本公告发布之日起5个工作日。 六、其他补充事宜 1、供应商获取遴选文件时必须提供以下资格证明资料(一式一份,装订成册)(注:报名资料除法定代表人身份证明和授权委托书须提供原件外,其它资料须提交复印件并加盖公司公章): ①法定代表人身份证明、法定代表人委托授权书(附被授权委托人身份证); ②营业执照(具有统一信用代码); ③提供试剂生产厂商信息表(格式见公告附件)(提供纸质版以及电子档,电子档(需提供试剂信息一览表excel格式)请在报名前将此表格发送至邮箱3585232829@qq.com,邮件备注“中南大学湘雅二医院临床分子诊断中心2023年第四批试剂及配套产品入围遴选项目 +公司名称报名资料”); ④本公告供应商资格要求中所规定的证明材料。(具体要求详见公告附件) 本公告同时在中国政府采购网(http://www.ccgp.gov.cn/)、中南大学湘雅二医院(http://www.xyeyy.com/3/29/index.htm)发布,公告附件在中国政府采购网下载。 七、对本次招标提出询问,请按以下方式联系。 1.采购人信息 名 称:中南大学湘雅二医院 地址:湖南省长沙市人民中路139号 联系方式:黄老师 联系电话:0731-85294138 2.采购代理机构信息 名 称:华新项目管理集团有限公司 地 址:长沙市天心区书院路9号保利国际B3栋1805室 联系方式:项目联系人:罗婷、康心旭、彭晓坤、粟瑀 电 话:0731-85163777 3.项目联系方式 项目联系人:罗婷、康心旭、彭晓坤、粟瑀 电 话: 0731-85163777 1.公告附件-中南大学湘雅二医院临床分子诊断中心2023年第四批试剂及配套产品入围遴选项目.docx
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    1、让凝胶电泳变得更快,更漂亮方法改进:将电泳电压进行定时变化,例如可以在开始时将电泳电压调节至 100V,大约 15min。使条带的确可以因为自身片段大小不同而产生较大差别的泳动速度,从而将片段分离,然而现在的分离或许会间距较小,从而图片很不漂亮,或者不易观察.可以紧接着进行 120V-130V 的电压进行较小差 异电泳,但是由于电泳电压较大,可以避免过大的片段残存在胶孔不易泳动的情况.结果:这样两个电压进行配合电泳,便可以得到非常漂亮的电泳条带,并且可以节省 1/5-2/5 左右 的时间.2、RNA 电泳如何得出漂亮的条带方法改进:1.电泳槽,制胶器,梳子等的清洗:去污剂浸泡过夜——自来水冲洗干净——ddH20 冲洗——3%H2O2 灌满浸泡过夜——灭活的 0.1%DEPC水冲洗干净——超净台内紫外线照射过夜. 2.烧瓶,烧杯,药匙,量筒等制胶器械的清洗:0.1%DEPC 水浸泡过夜后高压消毒灭活,烘箱烘干.或 者 ddH20 清洗干净, 超净台内紫外线照射过夜. 3.电泳缓冲液必须是 RNase free . 4.预电泳 5-10min 减少了非特异 RNA 条带的出现,有利于分离和纯化,同时可根据电泳仪是否冒泡判断电 泳仪装置是否有误. 5.样品是在电泳缓冲液液略低于胶表面而不是在高过胶面时加进齿槽,避免了加样 时 RNA 的扩散,加样后 RNA 从齿槽逸出造成 RNA 的弥散及定位不良等现象. 6.电泳 3-5min 让 RNA 进入凝胶后再加电泳缓冲液液高过表面,确保了加到每个槽中的 RNA 量及定位的准确性,从而有利于 DNA 的鉴定和纯化.3、如何提高 SDS-PAGE 的分辨率方法改进:借鉴 Tricine-SDS-PAGE 中添加甘油或者尿素来提高分辨率的成功经验,在普通的 SDS-PAGE 中加入约 13%的甘油,同样可以提高分辨率,有效防止小分子量蛋白的弥散.只要把原来 配方中的水换成 60%的甘油,就可以了.结果:加入甘油之后,条带较细,分得更开.4、改进一点点,我们能得到更加美观的 SDS-PAGE 胶方法改进:所做的改进很简单却很有效,加完分离胶后,用移液枪吸取酒精(浓度没有特别要求, 干净无污染就好)加到分离胶上至覆盖界面,静置片刻后放到 37℃恒温箱中可加速胶的凝固.待到分 离胶完全凝固之后倒去上层的酒精,就可以看到齐平漂亮的界面啦!改进二:脱色 背景:给染色结束的 SDS-PAGE 胶脱色往往需要比较长的时间,否则会由于脱色不完全而导致条 带不清晰,影响到拍照的效果.方法改进:改进的方法很简单易行——取一张我们常常随身携带的面巾纸,打个结放入盛有脱色液 的大培养皿里放到脱色摇床上,这样一来,原来过夜脱色达到的效果现在只需要短短的 3,4 个小时就 可以轻松实现了. PS:希望大家这个时候用的面巾纸是质量比较好不容易掉屑的...
  • 安捷伦发布加速新一代测序技术样品和文库质量控制的自动化电泳系统
    安捷伦科技发布用于加速新一代测序技术样品和文库质量控制的自动化电泳系统 2011 年 11 月 7 日,加利福尼亚圣克拉拉市 &mdash 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)发布了安捷伦 2200 TapeStation自动化电泳系统,以实现新一代测序流程中样品和文库质量控制的自动化。2200 TapeStation配合预包装的即用型 ScreenTape 试剂耗材,能够简化和加快新一代测序工作流程中的质量控制。 安捷伦副总裁液相分离业务部总经理 Patrick Kaltenbach 称:&ldquo 我们对此次发布非常期待。TapeStation 功能多样,更不用说可直接使用的 ScreenTape试剂耗材,仅需要 2 微升样品便可进行高灵敏度分析,毋庸置疑,TapeStation 是进行样品和文库质量控制的最佳工具。&rdquo 安捷伦 2200 TapeStation 兼容 16 联条式样品卡和 96 孔板,是一款能够快捷测定生物样品质量的台式自动化系统。客户只需简单地将样品和 ScreenTape 消耗品载入一体式 2200 TapeStation 仪器中,每个样品仅需约 1 分钟即可轻松获得蛋白质、RNA 和 DNA 样品的完整分析结果。 今年年初被安捷伦收购的 Lab901 的共同创立人、ScreenTape 系列产品的创始人 Joel Fearnley 说道:&ldquo TapeStation 系统凭借其自动化、简便性和可扩展通量的独特性能,将成为核心研究实验室在基因表达、DNA 片段分析、蛋白质分离和新一代测序中进行样品质量控制的理想之选。对于这些应用,TapeStation 和 ScreenTape 能够快速得到结果,并且数据重现性出色,不论通量大小,单个样品的成本都相同。&rdquo 新的 TapeStation 和 ScreenTape 产品进一步壮大了安捷伦现有电泳产品线,包括安捷伦 2100 生物分析仪。该生物分析仪是第一款通过微流体进行生物样品分析的商业化仪器,也是在芯片、qPCR 和新一代测序工作流程中对 RNA 和 DNA 进行质量控制的业内领先产品。 安捷伦还提供业内一流的用于新一代测序的 SureSelect 靶向序列捕获系统,它是溶液型杂交捕获技术,由安捷伦与麻省理工学院-哈佛大学博德研究所最先研发成功。与安捷伦 2200 TapeStation 系统类似,SureSelect能够简化新一代测序的工作流程,便于研究人员仅对感兴趣的基因组区域进行测序。。 了解更多信息,请访问 www.agilent.com/genomics/TapeStation。 关于安捷伦科技 安捷伦科技(纽约证交所:A)是全球领先的测量公司,是化学分析、生命科学、电子和通讯领域的技术领导者,公司的 18500 名员工为 100 多个国家的客户提供服务。在 2010 财政年度,安捷伦的业务净收入为 54 亿美元。要了解安捷伦科技的信息,请访问:www.agilent.com.cn。 编者注:更多有关安捷伦科技公司的技术、企业社会责任和行政新闻,请访问安捷伦新闻网站:www.agilent.com.cn/go/news。
  • 君意东方携新型电泳产品出彩亮相慕尼黑
    p style="text-indent: 2em "2018年10月31日至11月2日,第九届慕尼黑上海分析生化展(analytica China 2018)在上海新国际博览中心E1-E4馆举行。大会吸引近1000家中外企业参展,各行业先锋企业携前沿技术创新齐聚一堂,引领行业新高度。/pp style="text-indent: 2em "君意东方携新品电泳仪器产品亮相慕尼黑。秉承“为客户提供高标准、规范化、专业品质的产品和服务”的发展宗旨,君意开发制造了各种实验用途的电泳仪器,现已形成品种丰富、规格齐全的JY系列电泳产品。/pp style="text-indent: 2em "此次会展君意东方全方位展示了其电泳产品安全、高效、便利、快捷的优点。/pp style="text-align: center"img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/fcb6d325-67bf-45b0-95e4-9d7394ddc98d.jpg" title="微信图片_20181106165223.jpg" alt="微信图片_20181106165223.jpg"//pp style="text-align: center "strong君意东方JY系列电泳仪/strongbr//pp style="text-indent: 2em "君意东方JY系列电泳仪为触摸按键,具有多功能保护和迭配功能,采用微处理智能控制且具有自动记忆功能。/pp style="text-align: center"img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/b37f58fa-bd26-4f45-800a-c0ca46de16f2.jpg" title="微信图片_20181106165255.jpg" alt="微信图片_20181106165255.jpg"//pp style="text-align: center "strong君意东方电泳槽产品展示/strongbr//pp style="text-align: center"img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201811/uepic/63f3e62d-7dd4-420d-8d19-4bcd84c973df.jpg" title="微信图片_20181106165251.jpg" alt="微信图片_20181106165251.jpg"//pp style="text-align: center "strong工作人员向参展会员讲解产品的特点/strongbr//pp style="text-indent: 2em "产品不但涵盖常规的核酸、蛋白电泳,还具有国内企业独领风骚的脉冲场电泳、变性梯度电泳等系统,以及与电泳配套的仪器设备,如快速成像仪、凝胶成像分析系统等。/pp style="text-indent: 2em "据介绍,君意东方的宗旨是为顾客提供高标准、规范化、专业品质的产品和服务,未来将继续为电泳过程的优化提供优秀的解决方案。/p
  • 苏州大学附属第一医院630.00万元采购基因测序仪,流式细胞仪,毛细管电泳仪
    详细信息 苏州大学附属第一医院关于4K荧光胸腔镜系统等设备的招标公告 江苏省-苏州市-姑苏区 状态:公告 更新时间: 2023-10-17 苏州大学附属第一医院关于4K荧光胸腔镜系统等设备的招标公告 2023年10月17日 16:12 公告信息: 采购项目名称 4K荧光胸腔镜系统等设备 品目 其他医疗设备 采购单位 苏州大学附属第一医院 行政区域 江苏省 公告时间 2023年10月17日 16:12 获取招标文件时间 2023年10月17日至2023年10月24日每日上午:08:30 至 11:30 下午:13:00 至 17:00(北京时间,法定节假日除外) 招标文件售价 ¥.05 获取招标文件的地点 苏州市干将西路1296号(深业姑苏中心)1幢17层 开标时间 2023年11月07日 15:00 开标地点 开标室1 预算金额 ¥630.000000万元(人民币) 联系人及联系方式: 项目联系人 卫康01 项目联系电话 15995885894 采购单位 苏州大学附属第一医院 采购单位地址 江苏省苏州市十梓街188号 采购单位联系方式 0512-67780793 代理机构名称 苏州市卫康招投标咨询服务有限公司 代理机构地址 苏州市干将西路120号3幢401室 代理机构联系方式 卫康01 项目概况 4K荧光胸腔镜系统等设备招标项目的潜在投标人应在苏州市干将西路1296号(深业姑苏中心)1幢17层(苏州市卫康招投标咨询服务有限公司)获取招标文件,并于2023年11月7日15点00分(北京时间)前递交投标文件。 一、项目基本情况 项目编号:JSZC-320000-SZWK-G2023-0042号 项目名称:4K荧光胸腔镜系统等设备 预算金额:第一标段200万元、第二标段170万元、第三标段120万元、第四标段140万元 最高限价:无 1.采购需求: 标段 名称 数量 预算价(万元) 简要说明 是否接受进口产品投标 1 4K荧光胸腔镜系统 1套 200 摄像系统主机1套、摄像头1套、医用内窥镜光源系统1套、胸腔镜3根、医用≥32寸监视器1台、专用设备台车1台 否 2 流式细胞仪 1套 170 配置三根激光器,分别为488nm蓝色固体激光器,638±5nm红色固态激光器,405nm紫色固态激光器。且最少可同时检测10色荧光,12个参数。三根固态激光器功率≥40mW 是 3 毛细管电泳基因分析仪 1套 120 可应用于DNA序列测定,片段分析,适用的检测项目至少包括HLA基因分型、药物相关基因检测、人类STR基因分型检测、肿瘤基因突变检测等 否 4 基因测序仪 1套 140 毛细管电泳方法,光学系统可同时采集至少4色荧光信号 否 2.售后服务要求:整体提供不低于三年的免费原厂售后服务。 3.合同履行期限:合同签订后60天内送货到位并完成安装调试。 4.本项目不接受联合体投标。 二、申请人的资格要求: 1.满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定: (1)具有独立承担民事责任的能力; (2)具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度; (3)具有履行合同所必需的设备和专业技术能力; (4)有依法缴纳税收和社会保障资金的良好记录; (5)参加政府采购活动前三年内,在经营活动中没有重大违法记录; (6)法律、行政法规规定的其他条件。 2.落实政府采购政策需满足的资格要求: 无 3.本项目的特定资格要求: 具有医疗器械经营资格; 三、获取招标文件 时间:2023年10月17日至2023年10月24日,每天上午08:30至11:30,下午13:00至17:00(北京时间,法定节假日除外)。 地点:苏州市干将西路1296号(深业姑苏中心)1幢17层(苏州市卫康招投标咨询服务有限公司)。 方式: 提供以下材料现场获取 (1)营业执照副本复印件; (2)法人授权委托书; (3)医疗器械经营资格证明材料复印件; 上述材料每页均须加盖单位公章。 售价:工本费人民币伍佰元整,售后不退。 四、提交投标文件截止时间、开标时间和地点 时间:2023年11月7日15点00分(北京时间) 地点:苏州市干将西路1296号(深业姑苏中心)1幢17层 五、公告期限 自本公告发布之日起5个工作日。 六、其他补充事宜 1.本次采购的有关信息将在以下网站上发布:江苏政府采购网、中国政府采购网。 2.未依照采购公告要求依法获取采购文件的供应商,视为未参加该项政府采购活动,不具备对该政府采购项目提出质疑的法定权利。但因供应商资格条件或获取时间设定不符合有关法律法规规定等原因使供应商权益受损的除外。 3.单位负责人为同一人或者存在直接控股、管理关系的不同供应商,不得参加同一合同项下的政府采购活动。 4.本项目为非专门面向中小企业采购项目,所属行业为工业行业。 5.为采购项目提供整体设计、规范编制或者项目管理、监理、检测等服务的供应商,不得再参加该采购项目的其他采购活动。 6.根据《关于贯彻执行绿色采购、促进残疾人就业和支持监狱企业发展有关政策的通知(苏财购〔2019〕10号)》的通知规定,本次采购的产品不属于《节能产品政府采购品目清单》范围内强制或优先采购的产品。本次采购的产品不属于《环境标志产品政府采购品目清单》范围内优先采购的产品。 七、对本次招标提出询问,请按以下方式联系。 1.采购人信息 名称:苏州大学附属第一医院 联系人:张永刚 联系电话:0512-67780793 地址:苏州市姑苏区平海路899号 2.采购代理机构信息 名称:苏州市卫康招投标咨询服务有限公司 地 址:苏州市干将西路1296号(深业姑苏中心)1幢17层 联系人:周依雯、齐一豪 联系方式:0512-69165616、69165625 3.项目联系方式 项目联系人:周依雯、齐一豪 电 话:0512-69165616、69165625 苏州市卫康招投标咨询服务有限公司 2023年10月17日 × 扫码打开掌上仪信通App 查看联系方式 基本信息 关键内容:基因测序仪,流式细胞仪,毛细管电泳仪 开标时间:2023-11-07 15:00 预算金额:630.00万元 采购单位:苏州大学附属第一医院 采购联系人:点击查看 采购联系方式:点击查看 招标代理机构:苏州市卫康招投标咨询服务有限公司 代理联系人:点击查看 代理联系方式:点击查看 详细信息 苏州大学附属第一医院关于4K荧光胸腔镜系统等设备的招标公告 江苏省-苏州市-姑苏区 状态:公告 更新时间: 2023-10-17 苏州大学附属第一医院关于4K荧光胸腔镜系统等设备的招标公告 2023年10月17日 16:12 公告信息: 采购项目名称 4K荧光胸腔镜系统等设备 品目 其他医疗设备 采购单位 苏州大学附属第一医院 行政区域 江苏省 公告时间 2023年10月17日 16:12 获取招标文件时间 2023年10月17日至2023年10月24日每日上午:08:30 至 11:30 下午:13:00 至 17:00(北京时间,法定节假日除外) 招标文件售价 ¥.05 获取招标文件的地点 苏州市干将西路1296号(深业姑苏中心)1幢17层 开标时间 2023年11月07日 15:00 开标地点 开标室1 预算金额 ¥630.000000万元(人民币) 联系人及联系方式: 项目联系人 卫康01 项目联系电话 15995885894 采购单位 苏州大学附属第一医院 采购单位地址 江苏省苏州市十梓街188号 采购单位联系方式 0512-67780793 代理机构名称 苏州市卫康招投标咨询服务有限公司 代理机构地址 苏州市干将西路120号3幢401室 代理机构联系方式 卫康01 项目概况 4K荧光胸腔镜系统等设备招标项目的潜在投标人应在苏州市干将西路1296号(深业姑苏中心)1幢17层(苏州市卫康招投标咨询服务有限公司)获取招标文件,并于2023年11月7日15点00分(北京时间)前递交投标文件。 一、项目基本情况 项目编号:JSZC-320000-SZWK-G2023-0042号 项目名称:4K荧光胸腔镜系统等设备 预算金额:第一标段200万元、第二标段170万元、第三标段120万元、第四标段140万元 最高限价:无 1.采购需求: 标段 名称 数量 预算价(万元) 简要说明 是否接受进口产品投标 1 4K荧光胸腔镜系统 1套 200 摄像系统主机1套、摄像头1套、医用内窥镜光源系统1套、胸腔镜3根、医用≥32寸监视器1台、专用设备台车1台 否 2 流式细胞仪 1套 170 配置三根激光器,分别为488nm蓝色固体激光器,638±5nm红色固态激光器,405nm紫色固态激光器。且最少可同时检测10色荧光,12个参数。三根固态激光器功率≥40mW 是 3 毛细管电泳基因分析仪 1套 120 可应用于DNA序列测定,片段分析,适用的检测项目至少包括HLA基因分型、药物相关基因检测、人类STR基因分型检测、肿瘤基因突变检测等 否 4 基因测序仪 1套 140 毛细管电泳方法,光学系统可同时采集至少4色荧光信号 否 2.售后服务要求:整体提供不低于三年的免费原厂售后服务。 3.合同履行期限:合同签订后60天内送货到位并完成安装调试。 4.本项目不接受联合体投标。 二、申请人的资格要求: 1.满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定: (1)具有独立承担民事责任的能力; (2)具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度; (3)具有履行合同所必需的设备和专业技术能力; (4)有依法缴纳税收和社会保障资金的良好记录; (5)参加政府采购活动前三年内,在经营活动中没有重大违法记录; (6)法律、行政法规规定的其他条件。 2.落实政府采购政策需满足的资格要求: 无 3.本项目的特定资格要求: 具有医疗器械经营资格; 三、获取招标文件 时间:2023年10月17日至2023年10月24日,每天上午08:30至11:30,下午13:00至17:00(北京时间,法定节假日除外)。 地点:苏州市干将西路1296号(深业姑苏中心)1幢17层(苏州市卫康招投标咨询服务有限公司)。 方式: 提供以下材料现场获取 (1)营业执照副本复印件; (2)法人授权委托书; (3)医疗器械经营资格证明材料复印件; 上述材料每页均须加盖单位公章。 售价:工本费人民币伍佰元整,售后不退。 四、提交投标文件截止时间、开标时间和地点 时间:2023年11月7日15点00分(北京时间) 地点:苏州市干将西路1296号(深业姑苏中心)1幢17层 五、公告期限 自本公告发布之日起5个工作日。 六、其他补充事宜 1.本次采购的有关信息将在以下网站上发布:江苏政府采购网、中国政府采购网。 2.未依照采购公告要求依法获取采购文件的供应商,视为未参加该项政府采购活动,不具备对该政府采购项目提出质疑的法定权利。但因供应商资格条件或获取时间设定不符合有关法律法规规定等原因使供应商权益受损的除外。 3.单位负责人为同一人或者存在直接控股、管理关系的不同供应商,不得参加同一合同项下的政府采购活动。 4.本项目为非专门面向中小企业采购项目,所属行业为工业行业。 5.为采购项目提供整体设计、规范编制或者项目管理、监理、检测等服务的供应商,不得再参加该采购项目的其他采购活动。 6.根据《关于贯彻执行绿色采购、促进残疾人就业和支持监狱企业发展有关政策的通知(苏财购〔2019〕10号)》的通知规定,本次采购的产品不属于《节能产品政府采购品目清单》范围内强制或优先采购的产品。本次采购的产品不属于《环境标志产品政府采购品目清单》范围内优先采购的产品。 七、对本次招标提出询问,请按以下方式联系。 1.采购人信息 名称:苏州大学附属第一医院 联系人:张永刚 联系电话:0512-67780793 地址:苏州市姑苏区平海路899号 2.采购代理机构信息 名称:苏州市卫康招投标咨询服务有限公司 地 址:苏州市干将西路1296号(深业姑苏中心)1幢17层 联系人:周依雯、齐一豪 联系方式:0512-69165616、69165625 3.项目联系方式 项目联系人:周依雯、齐一豪 电 话:0512-69165616、69165625 苏州市卫康招投标咨询服务有限公司 2023年10月17日
  • 潍坊:电泳漆槽液溶剂量气相色谱测定通过鉴定
    近日,潍坊局科技工作又传喜讯,由潍坊市产品质量监督检验所承担完成的国家局立项项目《阳极聚丁二烯电泳漆槽液溶剂含量气相色谱测定方法研究》顺利通过国家局组织的成果鉴定。经严格评审,与会专家一致认为该研究项目用气相色谱法直接测定水基型涂料中有机溶剂的含量,方法简便、快速、准确,填补了国内测定阳极聚丁二烯电泳漆槽液溶剂含量气相色谱检验方法的空白,这标志着该研究项目取得了成功。   电泳涂料是一类新型的低污染、省能源、节资源、起着保护和防腐蚀作用的涂料,具有涂膜平整、耐水性和耐化学性好等特点,容易实现涂装工业的机械化和自动化,这种技术解决了人们要求的降低或完全消除使用涂料时释放的易燃有毒有机溶剂的问题。阳极聚丁二烯电泳漆槽液中的溶剂含量一般在0.5%~2%之间,这种槽液是使用前将电泳漆用一定量的水和溶剂搅拌均匀后配制而成。该溶液是一种胶体,溶剂含量少,难分离,用一般的化学方法难以检测。但溶剂的含量直接影响电泳漆的施工和漆膜的性能,该项目的完成为保证涂料产品质量、促进涂料产业的健康发展和技术进步提供了技术支持。  近几年,潍坊市局高度重视科研工作,不断加大科技投入,科技工作取得了显著成效,潍坊局今年已有3个国家局科研项目通过鉴定,三个项目通过市级科技成果鉴定。三年来潍坊市局共对55个项目进行立项,每年投入50多万元用于科研专项经费,出资近8万元对在科研工作中取得优异成绩的人员进行了奖励。到目前为止,已有30项科技成果通过了省(国家总局)、市(省局)科技成果鉴定。5个项目被省局立项,14个项目被国家局立项。同时,科技成果转化明显提高,科技工作呈现出良性发展势头,对质监事业的发展起到了积极的推动和支撑作用。
  • 药典委:0542 毛细管电泳法标准草案的公示
    2022年底,国家药典委员会发布《中国药典》(2025年版)编制大纲的通知。《通知》显示,到2025年,全面完成新版《中国药典》编制工作。符合中医药特点的中药标准进一步完善,化学药品、生物制品、药用辅料和药包材标准达到或基本达到国际先进水平,药品质量控制和安全保障水平明显提升。近日,国家药典委员会公布了一批方法通则的修订草案,涉0512高效液相色谱法标准草案、毛细管电泳法标准草案、0931溶出度与释放度测定法标准草案、分析仪器确证指导原则标准草案、光学分析法标准草案、扫描电子显微镜法标准草案等。  其中,0542 毛细管电泳法标准草案,是参考 ICH Q4B 附录 11 毛细管电泳法,对《中国药典》 0542 毛细管电泳法进行修订。  此次修订调整了部分内容和实验参数,主要修订内容如下: 1. 原理部分进行详述,增加了毛细管电泳法的理论描述和计算公式; 2. 仪器的一般要求中增订了需要给出具体规定的毛细管电泳法条件,以及试验过程中需要注意的相关事项; 3. 分离模式部分中对毛细管区带电泳、毛细管凝胶电泳、毛细管等电聚焦电泳和胶束电动色谱等四种方法进行详 2023 年 9 月 2 / 2 述,包括原理、条件优化、仪器参数等内容; 4. 增加定量内容,对定量的相关要求和结果计算进行描述; 5. 对个别文字表述进行规范。关于0542 毛细管电泳法标准草案的公示编号:Fg2023-0162号  我委拟修订0542毛细管电泳法。为确保标准的科学性、合理性和适用性,现将拟修订的0542毛细管电泳法公示征求社会各界意见(详见附件)。公示期自发布之日起三个月。请认真研核,若有异议,请及时来函提交反馈意见,并附相关说明、实验数据和联系方式。相关单位来函需加盖公章,个人来函需本人签名,同时将电子版上传至【公示反馈】附件中。   公示期满未回复意见即视为对公示标准草案无异议。0542毛细管电泳法修订说明.pdf0542毛细管电泳法公示稿(第一次).pdf
  • 信阳市疾病预防控制中心1197.10万元采购ICP-AES,基因测序仪,气相色谱仪,液相色谱仪,电泳...
    基本信息 关键内容: ICP-AES,基因测序仪,气相色谱仪,液相色谱仪,电泳仪,流动注射分析 开标时间: null 采购金额: 1197.10万元 采购单位: 信阳市疾病预防控制中心 采购联系人: 方先生 采购联系方式: 立即查看 招标代理机构: 海隆工程咨询有限公司 代理联系人: 张女士 代理联系方式: 立即查看 详细信息 信阳市疾病预防控制中心疾控机构实验室能力提升项目竞争性磋商公告 河南省-信阳市 状态:公告 更新时间: 2021-11-10 信阳市疾病预防控制中心疾控机构实验室能力提升项目竞争性磋商公告 发布时间:2021/11/10 分(北京时间)前提交响应文件。 一、项目基本情况 1、采购项目编号:信财磋商采购-2021-125 2、采购项目名称:信阳市疾病预防控制中心疾控机构实验室能力提升项目 3、采购方式:竞争性磋商 4、预算金额:11971000元; 最高限价:11971000元 序号 包号 包名称 包预算(元) 包最高限价(元) 1 一包段 信阳市疾病预防控制中心疾控机构实验室能力提升项目一包段 2500000 2500000 2 二包段 信阳市疾病预防控制中心疾控机构实验室能力提升项目二包段 2345000 2345000 3 三包段 信阳市疾病预防控制中心疾控机构实验室能力提升项目三包段 2053000 2053000 4 四包段 信阳市疾病预防控制中心疾控机构实验室能力提升项目四包段 2373000 2373000 5 五包段 信阳市疾病预防控制中心疾控机构实验室能力提升项目五包段 2700000 2700000 5、采购需求:(包括但不限于标的的名称、数量、简要技术需求或服务要求等) (1)磋商内容:本次采购共5个包段(详细内容见磋商文件)。 一包段:主要为高通量基因测序仪、全自动药敏检测仪; 二包段:主要为脉冲场凝胶电泳仪、致病菌质谱测定仪、病原菌分子分型数据处理终端; 三包段:主要为多病原检测系统、荧光偏振仪、自动血培养仪、倒置显微镜、解剖镜、组织破碎仪、全自动化学发光测定仪; 四包段:主要为电感耦合等离子发射光谱质谱仪、全自动尿碘分析仪、全自动二次热解分析仪、气相色谱仪、流动注射分析仪; 五包段:主要为高效液相质谱联用仪。 (2)交货期:合同签订后60日历天内供货并安装完毕/包段 (3)交货地点:采购人指定地点 (4)质量:符合国家相关规定及要求。 (5)质保期:1年(技术参数中有特殊要求的,以技术参数要求为准) 6、合同履行期限:/ 7、本项目是否接受联合体:否。 8、是否接受进口产品:是。其中二包段的脉冲场凝胶电泳仪、三包段的多病原检测系统、五包段的高效液相质谱联用仪均为进口产品。 二、申请人的资格要求 1、满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定。 2、落实政府采购政策需满足的资格要求:节约能源、保护环境、扶持不发达地区和少数民族地区、促进中小微企业、监狱企业及残疾人福利性单位发展等政府采购政策。 3、本项目的特定资格要求: (1)供应商具有独立法人资格,持有有效的营业执照。 (2)提供2020年度的财务审计报告(若是新注册公司还未有财务审计报告可不提供)。 (3)提供2021年1月1日以来已依法缴纳税收的凭据及已依法缴纳社会保险的凭据;依法免税或不需要缴纳社会保障资金的投标人,应提供相应承诺。 (4)近三年内在经营活动中无重大违法记录,未处于被责令停业、投标资格被取消或者财产被接管、冻结和破产状态(提供承诺书)。 (5)单位负责人为同一人或者存在直接控股、管理关系的不同投标人,不得参加同一合同项下的招标采购活动(提供承诺书)。 (6)投标人应提供通过“信用中国”(www.creditchina.gov.cn)、“中国执行信息公开网”(http://zxgk.court.gov.cn/shixin/)和“中国政府采购网”(www.ccgp.gov.cn)渠道查询企业信用记录,在“信用中国”网站被列入重大税收违法案件当事人名单、政府采购严重违法失信行为记录名单的、“中国执行信息公开网”网站被列入“失信被执行人”的和“中国政府采购”网站被列入政府采购严重违法失信行为记录名单的投标人,其投标将被否决(投标人应在招标公告发布后对本单位信用信息进行查询并将查询结果附在投标文件中)。 (7)本次招标采用资格后审。供应商各潜在投标人在本项目中可以同时投报5个标段,但只能按标段先后顺序中2个标段。中标后不允许分包和转包。 三、获取采购文件 1、时间:2021年11月11日至2021年11月17日,每天上午00:00至12:00,下午12:00至23:59(北京时间,法定节假日除外)。 2、地点:登陆“信阳市公共资源交易中心(www.xyggzyjy.cn)”网站,凭办理的企业身份认证锁(CA 数字证书)登陆会员系统进行网上投标。 3、方式: 3.1 供应商注册:投标企业首先登陆“全国公共资源交易平台(河南省﹒信阳市)(www.xyggzyjy.cn)”网站进行交易主体注册,按网站公告通知有关要求填报企业信息并上传有关原件扫描件至诚信库,不需携带原件到信阳市公共资源交易中心进行审核。供应商应对所上传材料的真实性、合法性、有效性负责,其上传的信息将全部对外公示,接受社会监督。 3.2 办理CA数字证书:完成企业诚信库注册后,必须办理CA数字证书方可在网上办理招投标相关业务。供应商根据信阳市公共资源交易网通知公告栏目中《关于信阳市公共资源交易平台数字证书(CA)互认系统正式上线运行的通知》要求,自行选择CA数字证书服务商,线上、线下办理CA数字证书。 3.3 磋商文件获取方式:供应商凭CA数字证书登陆会员系统后,即可按网上提示免费下载磋商文件及资料(操作程序详见信阳市公共资源交易中心网站下载中心栏目里投标人操作手册)。磋商文件(*.XYZF格式)下载后需使用“信阳市响应文件制作工具软件”打开(该工具软件可在“全国公共资源交易平台(河南省﹒信阳市)(www.xyggzyjy.cn)”网站下载中心栏目内下载或在磋商文件文件领取页面下载)。 3.4 请供应商下载磋商文件后及时关注系统业务菜单(“答疑澄清文件领取”,“控制价文件领取”)内该项目是否有新的答疑澄清文件或控制价文件。如有请直接下载,不再另行通知。 4、售价:0元 四、响应文件提交 1、截止时间:2021年11月22日9时30分(北京时间) 2、地点:信阳市公共资源交易中心(www.xyggzyjy.cn) 3、投标人必须在投标截止时间前通过信阳市公共资源交易中心电子招投标系统上传电子投标文件(.XYTF格式)。上传的电子投标文件应使用投标人CA数字证书认证并加密。 4、加密电子投标文件逾期上传的招标人不予受理。 五、响应文件开启 1、时间:2021年11月22日9时30分(北京时间)。 2、地点:信阳市公共资源交易中心第二开标室(市博物馆正门对面)。 六、发布公告的媒介及招标公告期限 本次招标公告在《河南省政府采购网》、《中国政府采购网》、《河南省电子招标投标公共服务平台》、《全国公共资源交易平台(河南省﹒信阳市)》上发布。公告期限为五个工作日。其他网站所转载的信息招标人和代理机构皆不予认可。 七、其他补充事宜 1、各投标人应在响应文件递交截止时间前上传加密的电子响应文件(*.XYTF)到会员系统的指定位置。上传的电子响应文件应使用投标人CA数字证书认证并加密。上传时必须得到交易系统“上传成功”的确认回复后方为上传成功。请投标人在上传前务必认真检查上传响应文件是否完整、正确。 2、本项目采用“不见面开标”交易方式,不见面开标大厅网址为http://www.xyggzyjy.cn:8088/BidOpening,投标人无需寄送和递交非加密的电子响应文件,无需到现场参加开标会议,无需到达现场提交原件资料。 3、投标人应当在投标截止时间前,使用投标人CA数字证书登录不见面开标大厅,在线签到并准时参加开标活动,并在规定时间内完成响应文件解密、答疑澄清等。 4、逾期解密或者没有准时在线参加开标活动导致的一切后果投标人自行承担。 5、不见面开标服务的具体事宜,请查阅信阳市公共资源交易中心网站首页—下载中心—信阳市不见面开标大厅系统操作手册。 特别提示:投标人在线签到时,应如实准确的填写授权委托人的联系电话,开评标当天请务必保证电话保持畅通。 八、凡对本次采购提出询问,请按以下方式联系 1.采购人信息 名称:信阳市疾病预防控制中心 地址:信阳市羊山新区新二十四大街22号 联系人:方先生 联系方式:0376-6575066 2.采购代理机构信息 名称:海隆工程咨询有限公司 地址:郑州市郑东新区金水东路与心怡路交汇处雅宝东方国际广场2号楼 联系人:张女士 联系方式:17596999059、0371-55894666 3.项目联系方式 项目联系人:张女士 电话:17596999059、0371-55894666 4.监督单位:信阳市财政局政府采购管理科 联系人:张先生 监督电话:0376-6312702E × 扫码打开掌上仪信通App 查看联系方式 基本信息 关键内容:ICP-AES,基因测序仪,气相色谱仪,液相色谱仪,电泳仪,流动注射分析 开标时间:null 预算金额:1197.10万元 采购单位:信阳市疾病预防控制中心 采购联系人:点击查看 采购联系方式:点击查看 招标代理机构:海隆工程咨询有限公司 代理联系人:点击查看 代理联系方式:点击查看 详细信息 信阳市疾病预防控制中心疾控机构实验室能力提升项目竞争性磋商公告 河南省-信阳市 状态:公告 更新时间: 2021-11-10 信阳市疾病预防控制中心疾控机构实验室能力提升项目竞争性磋商公告 发布时间:2021/11/10 分(北京时间)前提交响应文件。 一、项目基本情况 1、采购项目编号:信财磋商采购-2021-125 2、采购项目名称:信阳市疾病预防控制中心疾控机构实验室能力提升项目 3、采购方式:竞争性磋商 4、预算金额:11971000元; 最高限价:11971000元 序号 包号 包名称 包预算(元) 包最高限价(元) 1 一包段 信阳市疾病预防控制中心疾控机构实验室能力提升项目一包段 2500000 2500000 2 二包段 信阳市疾病预防控制中心疾控机构实验室能力提升项目二包段 2345000 2345000 3 三包段 信阳市疾病预防控制中心疾控机构实验室能力提升项目三包段 2053000 2053000 4 四包段 信阳市疾病预防控制中心疾控机构实验室能力提升项目四包段 2373000 2373000 5 五包段 信阳市疾病预防控制中心疾控机构实验室能力提升项目五包段 2700000 2700000 5、采购需求:(包括但不限于标的的名称、数量、简要技术需求或服务要求等) (1)磋商内容:本次采购共5个包段(详细内容见磋商文件)。 一包段:主要为高通量基因测序仪、全自动药敏检测仪; 二包段:主要为脉冲场凝胶电泳仪、致病菌质谱测定仪、病原菌分子分型数据处理终端; 三包段:主要为多病原检测系统、荧光偏振仪、自动血培养仪、倒置显微镜、解剖镜、组织破碎仪、全自动化学发光测定仪; 四包段:主要为电感耦合等离子发射光谱质谱仪、全自动尿碘分析仪、全自动二次热解分析仪、气相色谱仪、流动注射分析仪; 五包段:主要为高效液相质谱联用仪。 (2)交货期:合同签订后60日历天内供货并安装完毕/包段 (3)交货地点:采购人指定地点 (4)质量:符合国家相关规定及要求。 (5)质保期:1年(技术参数中有特殊要求的,以技术参数要求为准) 6、合同履行期限:/ 7、本项目是否接受联合体:否。 8、是否接受进口产品:是。其中二包段的脉冲场凝胶电泳仪、三包段的多病原检测系统、五包段的高效液相质谱联用仪均为进口产品。 二、申请人的资格要求 1、满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定。 2、落实政府采购政策需满足的资格要求:节约能源、保护环境、扶持不发达地区和少数民族地区、促进中小微企业、监狱企业及残疾人福利性单位发展等政府采购政策。 3、本项目的特定资格要求: (1)供应商具有独立法人资格,持有有效的营业执照。 (2)提供2020年度的财务审计报告(若是新注册公司还未有财务审计报告可不提供)。 (3)提供2021年1月1日以来已依法缴纳税收的凭据及已依法缴纳社会保险的凭据;依法免税或不需要缴纳社会保障资金的投标人,应提供相应承诺。 (4)近三年内在经营活动中无重大违法记录,未处于被责令停业、投标资格被取消或者财产被接管、冻结和破产状态(提供承诺书)。 (5)单位负责人为同一人或者存在直接控股、管理关系的不同投标人,不得参加同一合同项下的招标采购活动(提供承诺书)。 (6)投标人应提供通过“信用中国”(www.creditchina.gov.cn)、“中国执行信息公开网”(http://zxgk.court.gov.cn/shixin/)和“中国政府采购网”(www.ccgp.gov.cn)渠道查询企业信用记录,在“信用中国”网站被列入重大税收违法案件当事人名单、政府采购严重违法失信行为记录名单的、“中国执行信息公开网”网站被列入“失信被执行人”的和“中国政府采购”网站被列入政府采购严重违法失信行为记录名单的投标人,其投标将被否决(投标人应在招标公告发布后对本单位信用信息进行查询并将查询结果附在投标文件中)。 (7)本次招标采用资格后审。供应商各潜在投标人在本项目中可以同时投报5个标段,但只能按标段先后顺序中2个标段。中标后不允许分包和转包。 三、获取采购文件 1、时间:2021年11月11日至2021年11月17日,每天上午00:00至12:00,下午12:00至23:59(北京时间,法定节假日除外)。 2、地点:登陆“信阳市公共资源交易中心(www.xyggzyjy.cn)”网站,凭办理的企业身份认证锁(CA 数字证书)登陆会员系统进行网上投标。 3、方式: 3.1 供应商注册:投标企业首先登陆“全国公共资源交易平台(河南省﹒信阳市)(www.xyggzyjy.cn)”网站进行交易主体注册,按网站公告通知有关要求填报企业信息并上传有关原件扫描件至诚信库,不需携带原件到信阳市公共资源交易中心进行审核。供应商应对所上传材料的真实性、合法性、有效性负责,其上传的信息将全部对外公示,接受社会监督。 3.2 办理CA数字证书:完成企业诚信库注册后,必须办理CA数字证书方可在网上办理招投标相关业务。供应商根据信阳市公共资源交易网通知公告栏目中《关于信阳市公共资源交易平台数字证书(CA)互认系统正式上线运行的通知》要求,自行选择CA数字证书服务商,线上、线下办理CA数字证书。 3.3 磋商文件获取方式:供应商凭CA数字证书登陆会员系统后,即可按网上提示免费下载磋商文件及资料(操作程序详见信阳市公共资源交易中心网站下载中心栏目里投标人操作手册)。磋商文件(*.XYZF格式)下载后需使用“信阳市响应文件制作工具软件”打开(该工具软件可在“全国公共资源交易平台(河南省﹒信阳市)(www.xyggzyjy.cn)”网站下载中心栏目内下载或在磋商文件文件领取页面下载)。 3.4 请供应商下载磋商文件后及时关注系统业务菜单(“答疑澄清文件领取”,“控制价文件领取”)内该项目是否有新的答疑澄清文件或控制价文件。如有请直接下载,不再另行通知。 4、售价:0元 四、响应文件提交 1、截止时间:2021年11月22日9时30分(北京时间) 2、地点:信阳市公共资源交易中心(www.xyggzyjy.cn) 3、投标人必须在投标截止时间前通过信阳市公共资源交易中心电子招投标系统上传电子投标文件(.XYTF格式)。上传的电子投标文件应使用投标人CA数字证书认证并加密。 4、加密电子投标文件逾期上传的招标人不予受理。 五、响应文件开启 1、时间:2021年11月22日9时30分(北京时间)。 2、地点:信阳市公共资源交易中心第二开标室(市博物馆正门对面)。 六、发布公告的媒介及招标公告期限 本次招标公告在《河南省政府采购网》、《中国政府采购网》、《河南省电子招标投标公共服务平台》、《全国公共资源交易平台(河南省﹒信阳市)》上发布。公告期限为五个工作日。其他网站所转载的信息招标人和代理机构皆不予认可。 七、其他补充事宜 1、各投标人应在响应文件递交截止时间前上传加密的电子响应文件(*.XYTF)到会员系统的指定位置。上传的电子响应文件应使用投标人CA数字证书认证并加密。上传时必须得到交易系统“上传成功”的确认回复后方为上传成功。请投标人在上传前务必认真检查上传响应文件是否完整、正确。 2、本项目采用“不见面开标”交易方式,不见面开标大厅网址为http://www.xyggzyjy.cn:8088/BidOpening,投标人无需寄送和递交非加密的电子响应文件,无需到现场参加开标会议,无需到达现场提交原件资料。 3、投标人应当在投标截止时间前,使用投标人CA数字证书登录不见面开标大厅,在线签到并准时参加开标活动,并在规定时间内完成响应文件解密、答疑澄清等。 4、逾期解密或者没有准时在线参加开标活动导致的一切后果投标人自行承担。 5、不见面开标服务的具体事宜,请查阅信阳市公共资源交易中心网站首页—下载中心—信阳市不见面开标大厅系统操作手册。 特别提示:投标人在线签到时,应如实准确的填写授权委托人的联系电话,开评标当天请务必保证电话保持畅通。 八、凡对本次采购提出询问,请按以下方式联系 1.采购人信息 名称:信阳市疾病预防控制中心 地址:信阳市羊山新区新二十四大街22号 联系人:方先生 联系方式:0376-6575066 2.采购代理机构信息 名称:海隆工程咨询有限公司 地址:郑州市郑东新区金水东路与心怡路交汇处雅宝东方国际广场2号楼 联系人:张女士 联系方式:17596999059、0371-55894666 3.项目联系方式 项目联系人:张女士 电话:17596999059、0371-55894666 4.监督单位:信阳市财政局政府采购管理科 联系人:张先生 监督电话:0376-6312702E
  • 药典委公示微生物全基因组测序技术指导原则标准草案
    11月29日,国家药典委员会官方网站公示了关于微生物全基因组测序技术指导原则标准草案,公示时间为3个月。详情如下:编号:Fg2022-0216号我委拟制定微生物全基因组测序技术指导原则,为确保标准的科学性、合理性和适用性,现将拟制定标准公示征求社会各界意见(详见附件)。公示期自发布之日起3个月。请认真研核,若有异议,请及时来函提交反馈意见,并附相关说明、实验数据和联系方式。相关单位来函需加盖公章,个人来函需本人签名,同时将电子版发送至指定邮箱。联系人:朱冉、陈蕾电话:010-67079581 010-67079566电子邮箱:zhuran@chp.org.cn通信地址:北京市东城区法华南里11号楼 国家药典委员会办公室邮编:100061国家药典委员会2022年11月29日附件:微生物全基因组测序技术指导原则公示稿.pdf微生物全基因组测序技术指导原则起草说明.pdf微生物全基因组测序技术指导原则 本指导原则对全基因组测序技术用于药品微生物控制给予通用性技术规定,为药用原料、辅料、制药用水、中间产品、终产品、包装材料、环境、设备和人员等药品全生命周期质量控制中微生物精准鉴定、溯源分析和风险识别等提供指导。微生物全基因组测序(Microbial whole-genome sequencing)是指利用高通量测序技术对微生物个体的整个基因组序列进行测定,获取遗传信息的过程。高通量测序技术主要包括:边合成边测序、半导体测序、DNA (Deoxyribonucleic acid, DNA)纳米球测序、连接酶测序等第二代测序技术(又称下一代测序,Next Generation Sequencing)和基于单分子测序(Single Molecule Sequencing)的第三代测序技术。第二代测序技术的基本原理主要是利用物理或酶切的方法将待测样本的基因组打断到1kb以内的DNA片段,在其两端连接特定接头序列后,固定于测序介质中,通过核酸扩增技术,如聚合酶链式反应、等温扩增技术等将待测样本放大收集成库,然后进行平行循环测序。当需要获得微生物样本基因组精细图、完成图时,可采用能够实现大片段测序读长的第三代测序技术。第三代测序技术的基本原理主要有:采用荧光标记脱氧核糖核苷酸,用光学镜头实时记录DNA合成过程中新引入脱氧核糖核苷酸的荧光变化,通过不断地重复合成、成像、淬灭等过程进行单分子荧光测序;或采用电泳技术驱动单个分子逐一通过纳米孔,通过检测不同碱基的电信号,进行单分子纳米孔测序。本指导原则以目前发展成熟、应用较为广泛的第二代测序技术为主要技术手段,对实验室的一般要求、全基因组测序的主要技术指标、技术流程、影响测序结果的主要因素、方法学考察和应用指导等方面进行通用性技术规定。一、实验室的一般要求1.实验场地及人员 开展微生物全基因组测序的实验环境应具备分子生物学实验室的基本条件,并符合相应级别的生物安全等级要求。实验区域一般应设置:试剂储存和准备区、样本制备区、扩增区、核酸测序及分析区,各个区域在物理空间上相互独立,并标识明确;另外,根据使用仪器的功能,相关区域可适当合并。应单向流进入各工作区域,按照试剂储存和准备区、样本制备区、扩增区、核酸测序及分析区的先后顺序进行实验操作。实验区域应定期进行清洁消毒。实验人员应具备分子生物学和微生物学专业背景,或经专业培训。2. 实验仪器实验室一般应具备高通量核酸测序仪、核酸扩增仪、片段分析仪、核酸定量仪、生物安全柜、混匀器、高速离心机、水浴或加热模块、冰箱、微量加样器等分子生物学检验常用仪器设备。影响测序质量的仪器设备应定期进行性能确认和维护,以保证仪器处于良好的运行状态。3. 实验试剂除另有规定外,所有实验使用的试剂均应不含DNA和DNA降解酶,宜大体积配制、小体积分装,并保证试剂的无菌性,必要时可采用高压灭菌或0.22 μm孔径滤膜过滤除菌。用于核酸扩增的相关试剂应避免反复冻融。关键试剂应制定质量控制程序,以确保试剂质量。采用适宜的商品化试剂或试剂盒进行核酸提取、文库构建和核酸测序时,应按照说明书操作,并符合说明书中的质量控制要求。二、全基因组测序的主要技术指标1. 测序通量测序通量是指单次测序可获得序列信息的基因片段数量或可测定的DNA (以碱基表示)数量。核酸测序仪器的测序通量直接关系到测序输出的数据量。微生物的基因组DNA较小,但不同种属之间变化幅度较大,如:葡萄球菌属、埃希菌属、假单胞菌属、沙门菌属等常见细菌的基因组DNA大小约3~6 Mbp;酵母菌的基因组DNA大小约12~16 Mbp;典型致病霉菌的基因组DNA通常大于30 Mbp。在进行微生物全基因组测序时,应根据待测样本基因组大小、样本数量等实际需求,选择适宜测序通量的测序仪器和配套试剂,保证测序结果的准确性。2. 碱基识别质量碱基识别质量是衡量碱基正确识别的概率(通常以数字值直接表示)。碱基识别质量与碱基识别错误率之间的关系为:Q=-10lg P(Q为碱基识别质量,P为碱基识别错误率)。Q=20代表碱基识别正确率≥99%;Q=30代表碱基识别正确率≥99.9%。高通量测序仪器应能自动判读碱基识别质量。三、 技术流程 全基因组测序的一般流程包括:测序样本的获得、测序文库的构建、全基因组测序和数据分析等。1. 测序样本的获得 全基因组测序主要用于待测微生物的核酸序列测定。待测微生物应进行分离纯化,以获得生长状态稳定的纯培养物,可参考“微生物鉴定指导原则”(通则9204)。分离纯化后的纯培养物应采用适宜的方法,可参考“细菌DNA 特征序列鉴定法”(通则1021),获得浓度、纯度和完整性良好的基因组测序样本。2. 测序文库的构建 测序文库是指将基因组样本随机打断后,在其两端加入特定接头序列(adapters),并经过大规模平行扩增,形成的DNA片段集合。测序文库中样本的核酸浓度、纯度、片段的大小分布等因素,都会影响测序输出的数据量和碱基识别质量。应对构建的测序文库进行纯化、定量、均一化处理,使文库中各待测样本的浓度保持均等;必要时,采用凝胶电泳或毛细管电泳等方法检测文库的质量。3. 全基因组测序 将测序文库中的待测样本固定在测序介质中,通过特定接头序列,将测序引物与待测核酸序列进行结合。加入底物脱氧核糖核苷酸,在DNA聚合酶作用下,使结合在待测核酸序列上的测序引物进行延伸,并利用信号收集器采集信号,包括但不限于光信号、电信号或离子信号等,通过信号分析软件对采集到的信号进行分析,获得待测样本的碱基序列信息,以及物理通量、有效通量、测序读长、测序深度、碱基识别质量等参数。4. 数据分析 采用适宜的序列分析方法和软件,对得到的核酸测序下机数据进行序列拼接,最终获得待测微生物样本的全基因组序列信息。四、 影响测序结果的主要因素 1. 待测样本核酸质量 应采用适宜的方法提取待测样本的基因组DNA,并保证提取的基因组DNA 在适宜的浓度和纯度范围内,无蛋白、多糖等污染。一般情况下,核酸浓度宜不低于10 ng/μl,A260/A280比值宜在1.8~2.0之间。核酸浓度较低,或发生降解等导致质量不佳的情况,可导致基因组DNA片段化不完全,影响文库质量,进而影响测序深度和测序结果。2. 测序文库质量 应对测序文库进行质量控制。当测序文库中包含多个待测样本时,不同样本的核酸浓度应基本一致,保证测序后的输出数据量均匀稳定。推荐采用荧光分析法定量检测不同样本的基因组DNA浓度,测序文库制备完成后,采用适宜的稀释倍数,确定上机测序文库的浓度。3. 测序深度 测序深度是指待测样本中某个指定核苷酸被检测的次数。一般高通量测序仪器输出的测序深度指待测样本基因组序列中核苷酸被检测次数的平均值。测序深度与基因组覆盖率之间是正相关,测序深度越大,重复测序次数越多,待测样本基因组覆盖率越大,测序带来的错误率也会随着测序深度的提高而降低。一般而言,基因组测序深度应不少于50倍;建立全基因组序列参考数据库时,测序深度应不少于100倍。4. 碱基识别质量 碱基识别质量是评价测序结果准确率的重要因素。根据核酸测序仪器的正常运行参数,单个样本的核酸测序的结果应保证Q20≥80%或Q30≥70%;也即测序数据中80%及以上的碱基正确率大于99%,或者70%及以上的碱基正确率大于99.9%。五、 方法学考察 除考察影响测序结果的主要因素,包括:待测样本核酸质量、测序文库质量、测序深度、碱基识别质量等,还应进行相应的分析方法学考察;可在测序过程中增加已知序列的参考品,评估测序仪器性能,以保证全基因组测序结果的准确性和重现性。六、 应用指导 微生物全基因组序列能够提供全面丰富的遗传信息,通过全基因组序列的比对分析,可以实现待测微生物,包括:标准菌株、模式菌株、质控菌株、生产检定用菌(毒)种、益生菌等,以及从药用原料、辅料、制药用水、中间产品、终产品、包装材料和环境等中检出污染微生物等的精准鉴定、溯源分析以及风险评估等。精准鉴定当基于常规生化筛选、表型和基因型鉴定方法无法获得待测微生物样本准确的鉴定信息时,可利用全基因组测序技术获得更加精准的鉴定结果或遗传变异信息等。全基因组序列分析还对研究微生物的系统进化具有重要价值,有助于新种或亚种的发现和遗传分类单元的系统发育解析,提高对新种或亚种的生物学认识。溯源分析当出现无菌试验结果阳性、培养基灌装等模拟工艺失败、生产过程严重异常事件时,如常规基因型鉴定方法无法提供足够的分辨力,可在获得菌种鉴定信息的基础上,采用全基因组测序技术对目标微生物以及相关环节中分离的同种微生物进行全基因组序列的同源性分析,结合污染调查信息,实现目标微生物的溯源分析风险评估全基因组序列包含了微生物菌株全部的遗传信息,基于全基因组数据分析还能够用于毒力、耐药以及其他基因的功能分析与表型预测,为开展微生物的风险评估分析提供参考依据。起草单位:上海市食品药品检验研究院联系电话:1800677839复核单位:中国食品药品检定研究院、天津市药品检定研究院、辽宁省药品检验检测院参与单位:浙江现代生物技术发展中心、中国工业微生物菌种保藏中心
  • 北京六一发布北京六一DYCZ-20H型 DNA序列分析电泳仪新品
    ☆多用途,高通量,优良的性价比☆一次电泳加样量 204 个,可用排枪☆多板制胶,一致性强☆开盖断电,保证安全☆专利设计,全优质 PMMA 制造,晶莹剔透产品特点1. 上样量达到 204 个且可用排枪加样。2. 可用于引物筛选,重复性好,省时省力。3. 上槽缓冲液 800ml, 下槽缓冲液 900ml, 可满足两块胶电泳的缓冲能力,与传统仪器相比省近一倍缓冲液,省去了每次电泳后调节 PH 值的繁琐工作。产品规格外形尺寸(mm):408×160×167试样格:102 齿,厚 1.0mm,2 条凝胶面积(mm):316×90创新点:☆多用途,高通量,优良的性价比☆一次电泳加样量 204 个,可用排枪☆多板制胶,一致性强☆开盖断电,保证安全☆专利设计,全优质 PMMA 制造,晶莹剔透北京六一DYCZ-20H型 DNA序列分析电泳仪
  • 6项基因测序相关国标出炉 涉基因提取、纯化、捕获、高通量测序等
    p  近日,国家市场监督管理总局(国家标准化管理委员会)批准了501项国家标准。其中6项标准规定了包括strong核酸提取、核酸纯化、核酸检测、高通量测序、目标基因捕获等方法或试剂盒质量评价规范/strong。/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 207px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201909/uepic/f1dcb8ec-9e38-452e-8fcf-83903cd80e93.jpg" title="微信图片_20190927151454.png" alt="微信图片_20190927151454.png" width="600" height="207" border="0" vspace="0"//pp  这6项标注分别是strong核酸检测试剂盒质量评价技术规范(标准号:GB/T 37871-2019)、个体鉴定的高通量测序方法(标准号:GB/T 37870-2019)、目标基因区域捕获质量评价通则(标准号:GB/T 37872-2019)、合成基因质量评价通则(标准号:GB/T 37873-2019)、核酸提取纯化方法评价通则/strongstrong(标准号:GB/T 37874-2019)、核酸提取纯化试剂盒质量评价技术规范(GB/T 37875-2019)/strong。/pp  strongspan style="color: rgb(0, 112, 192) "1. 核酸提取纯化试剂盒质量评价技术规范/span/strongstrongspan style="color: rgb(0, 112, 192) "(GB/T 37875-2019)/span/strong/pp  该标准由中国计量科学研究院、北京康为世纪生物科技有限公司起草,规定了核酸提取纯化试剂盒的评价指标和评价方法。/pp  评价指标:产量、纯度、完整度、重复性、再现性、批间差异和细菌内毒素残留。/pp  评价方法/pp  产量:紫外分光光度法、荧光法/pp  纯度:对多糖、蛋白质、多酚、异硫氰酸等残留杂质采用紫外分光光度法 对残留核酸采用琼脂糖凝胶电泳法检测。/pp  完整度:琼脂糖凝胶平板电泳法/pp  细菌内毒素残留:光度测定法/pp  仪器:微量紫外分光光度计、微量移液器、平板电泳仪、凝胶成像系统/pp style="text-indent: 2em "a href="http://(GB/T 37875-2019)(http://c.gb688.cn/bzgk/gb/showGb?type=online&hcno=3101B767728F9C1349E4CE2E431AF84E)" target="_self" style="color: rgb(255, 0, 0) text-decoration: underline "strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "详情请点击此处/span/strong/a/pp  strongspan style="color: rgb(0, 112, 192) "2. 个体鉴定的高通量测序方法/span/strongstrongspan style="color: rgb(0, 112, 192) "(标准号:GB/T 37870-2019)/span/strong/pp  标准结合核酸生物技术和高通量测序技术,对人体样本的STR位点和SNP位点进行鉴定。该标准由深圳华大生命科学研究院、中国计量科学研究院、深圳华大智造科技有限公司、深圳华大基因科技有限公司、深圳基因产学研资联盟起草。/pp  具体包括选择分子遗传标记位点、DNA提取、文库制备与DNA测序、位点分型及结果分析整个流程操作及仪器、试剂。/pp  仪器:PCR仪、高通量测序仪、离心机、漩涡震荡机、冰箱。/pp style="text-indent: 2em "a href="http://(http://c.gb688.cn/bzgk/gb/showGb?type=online&hcno=729A515C8246ADF310B3D2E94E843D24)" target="_self" style="color: rgb(255, 0, 0) text-decoration: underline "strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "详情请点击此处/span/strong/a/pp strongspan style="color: rgb(0, 112, 192) " 3. 目标基因区域捕获质量评价通则(标准号:GB/T 37872-2019)/span/strong/pp  该标准规定了基于液相捕获技术的目标基因区域捕获质量评价的术语、质量要求和评价方法。适用于高通量基因测序对人类基因组DNA样本进行目标基因区域捕获的质量评价,不适用于单分子测序。/pp  标准由深圳华大生命科学研究院、中国计量科学研究院、深圳华大智造科技有限公司、深圳华大基因科技有限公司、深圳华大临床检验中心有限公司、艾吉泰康生物科技(北京有限公司)起草。/pp  测序质量要求包括平均测序深度、测序覆盖度、捕获特异性。评价方法包括文库制备、高通量测序、数据过滤、序列比对。/pp style="text-indent: 2em "a href="http://(http://c.gb688.cn/bzgk/gb/showGb?type=online&hcno=D30847645D9A4E6B36D79257F8A46D74)" target="_self"strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "详情请点击此处/span/strong/a/pp  strongspan style="color: rgb(0, 112, 192) "4. 合成基因质量评价通则(标准号:GB/T 37873-2019)/span/strong/pp  该标准规定了合成基因相关的术语和定义、质量要求和评价方法。适用于100bp~20kb片段长度的生物基因合成。/pp  该标准由深圳华大生命科学研究院、中国计量科学研究院、深圳华大基因科技有限公司、青岛华大基因研究员起草。/pp  合成基因质量要求/pp  纯度:在pH值为7.0-8.5条件下,OD260/OD280在1.8~2.0,且OD260/OD230 2.0./pp  总量:一般不低于1μg./pp  完整性:电泳条带明亮大小与目标条带一致,且亮度集中程度高。/pp  序列一致性:与设定基因序列完全匹配/pp  仪器:紫外分光光度计、凝胶成像系统、电泳仪、微波炉、微量移液器/pp style="text-indent: 2em "a href="http://(http://c.gb688.cn/bzgk/gb/showGb?type=online&hcno=F6657ACDAB4112EDBC1E2B5455AC98C7)" target="_self"strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "详情请点击此处/span/strong/a/pp  strongspan style="color: rgb(0, 112, 192) "5. 核酸提取纯化方法评价通则(标准号:GB/T 37874-2019)/span/strong/pp  该标准由中国科学院北京基因组研究所、中国计量科学研究院起草。标准规定了核酸提取纯化方法评价的指标参数和评价方法。包括常规的新鲜动植物组织样本、细胞样本、血液样本、唾液样本和分辨样本等。/pp  规定的参数指标包括DNA完整度、总RNA 完整度、提取产量、DNA纯度、RNA 纯度。/pp  仪器:水平电泳仪、凝胶成像系统、微量移液器、荧光定量仪、紫外分光光度仪。/pp style="text-indent: 2em "a href="http://(http://c.gb688.cn/bzgk/gb/showGb?type=online&hcno=27E460FBEE9D8C005E88A14303347EAF)" target="_self"strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "详情请点击此处/span/strong/a/pp strongspan style="color: rgb(0, 112, 192) " 6. 核酸检测试剂盒质量评价技术规范(标准号:GB/T 37871-2019)/span/strong/pp  本标准规定了核酸检测试剂盒质量评价的术语和定义、评价要求、评价指标和评价方法等,适用于核酸检测试剂盒产品和服务,但不适用于高通量测序的核酸检测试剂盒。/pp  该标准由中国计量科学研究院、北京康为试剂生物科技有限公司、北京市医疗器械检验所起草。/pp  核酸检测试剂盒分为定量和定性检测试剂盒。定量检测试剂盒的评价指标包括线性、准确度、分析特异性、定量限、检出限、重复性。定性检测试剂盒的评价指标包括准确度、分析特异性、检出限、重复性。/pp style="text-indent: 2em "a href="http://(http://c.gb688.cn/bzgk/gb/showGb?type=online&hcno=A95B2D758535933A2FFBE427584A44AE)" target="_self" style="color: rgb(255, 0, 0) text-decoration: underline "strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "详情请点击此处/span/strong/a/p
  • 安捷伦发布电泳仪新品——4200 TapeStation 系统
    p  安捷伦近日发布4200 TapeStation 系统电泳仪,此台仪器可一次性分析96个DNA样品。/pp  安捷伦电泳营销和支持部经理Knut Wintergerst先生解释说:“此款产品是我们继2200 TapeStation system之后的又一款新品,可以满足下一代测序实验室高通量和高质量的需求。”Knut Wintergerst先生特别指出,“样品质量会直接影响测序数据的保真性。而数据的高保真是非常重要的,比如,可以帮助研究者使用这些数据来诊断基于DNA的疾病。”/pp  4200 TapeStation system能实现所有测序工作流程中样品点对点的质量控制,无论是测量1个样品还是96个样品,而且单个样品的分析成本保持不变。/pp  安捷伦TapeStation系统使用方便,因为它们采样一系列预装好的RNA、DNA和基因组DNA样品的试剂盒,安捷伦的试剂包现在有D5000和HS D5000试剂盒,此两个试剂盒可以分析最多可达5000碱基对的DNA片段。/pp/p
  • 电泳微流控芯片:生物分析的里程碑
    电泳微流控芯片是一种结合了电泳和微流控技术的创新型生物分析工具。该技术整合了微流体学的优势,通过微小尺度的通道、电场和高度灵活的流动控制,实现了对生物分子的高效分离、检测和分析。——技术原理——电泳原理:在电解质溶液中,位于电场中的带电离子在电场力的作用下,以不同的速度向其所带电荷相反的电极方向迁移的现象。电泳微流控芯片技术可以分为两种主要类型:毛细管电泳和芯片上电泳。毛细管电泳利用单根毛细管作为分离通道,而芯片上电泳则将电泳所需的缓冲液、电极等组件集成到一个微流控芯片上,实现设备的微小化和自动化。这种集成化设计使得电泳微流控芯片具有高通量、高效率、低样品消耗和快速分离等优点。电泳微流控芯片的原理主要基于电场驱动下的带电粒子在微尺度流道中的迁移与分离。具体来说,电泳微流控芯片利用微加工技术在芯片上构建微米级的流道,这些流道用于容纳电泳缓冲液。当在芯片两端施加电场时,缓冲液中的带电粒子(如DNA、蛋白质等)会根据其电荷和电场方向发生迁移。不同带电粒子由于其电荷、质量和形状的差异,在电场中的迁移速度会有所不同,从而实现粒子的分离。——应用领域——电泳微流控芯片的应用领域非常广泛,涵盖了多个重要的科学和工业领域。以下是其主要的应用领域:1、生物医学:在生物医学领域,电泳微流控芯片技术主要用于DNA片段、多肽、蛋白质等生物分子的分离和分析。它被认为是后基因时代中最有希望攻克蛋白质研究、基因临床诊断等科学难题的分离分析手段之一。此外,电泳微流控芯片技术也被用于PCR反应,可以大大简化操作步骤,显著提高检测效率。2、新药物合成与筛选:电泳微流控芯片技术在新药研发过程中发挥着重要作用。它可以用于药物分子的分离和筛选,从而加速新药的研发进程。3、食品和商品检验:电泳微流控芯片技术可以用于食品中添加剂、污染物等的检测和分析,确保食品的安全和合规性。同时,它也可以用于商品的质量控制和检验。4、环境监测:在环境监测领域,电泳微流控芯片技术可用于水、土壤、空气等环境样本中有害物质的检测和分析,为环境保护和污染治理提供科学依据。5、刑事科学:电泳微流控芯片在法医学中具有重要的应用,特别是在DNA分离、检测和分析方面,对于个体身份的鉴定和犯罪现场的物证分析具有重要意义。6、其他科学领域:此外,电泳微流控芯片技术还广泛应用于军事科学、航天科学等其他重要科学领域,为这些领域的研究和发展提供了强大的技术支持。——优势——1、高分辨率和快速分离:微流控芯片中的通道尺寸小,因此具有较高的分辨率和更快的分离速度。这使得它能够在短时间内准确地分离和识别出各种生物分子,如DNA、蛋白质等。2、低样品和试剂消耗:由于微流控芯片中的流体通道尺寸微小,所需的样品和试剂量大大减少。这既降低了分析成本,也减少了生物样本的浪费,对于珍贵的生物样本尤其重要。3、高通量分析能力:微流控芯片可以并行处理多个样品,实现高通量分析。这大大提高了分析效率,使得在短时间内能够处理更多的样本,适用于大规模的生物分子分析任务。4、易于集成和自动化:电泳微流控芯片可以与其他技术(如质谱联用)实现联合分析,进一步提高分析的准确性和灵敏度。此外,微流控芯片技术易于实现自动化,减少了人为操作的误差,提高了分析的准确性和可靠性。5、微型化和便携性:电泳微流控芯片采用微型化设计,使得整个分析系统更加紧凑和便携。这使得它可以在现场进行实时分析,无需复杂的实验室设备,为现场检测和即时分析提供了便利。保利微芯公司简介保利微芯科技有限公司隶属中国保利集团公司,由保利置业集团有限公司投资,设计研发微流控生物芯片,公司具备技术先进的微流控生物芯片设计制造能力,已形成创新性的、技术领先的微流控芯片整体解决方案。可以承接国内外芯片设计、应用公司的微流控芯片生产订单,为即时诊断(POCT)、基因测序、环境保护、食品安全和科学研究等应用领域的客户提供有核心竞争力的高性价比芯片产品。
  • 生命科学 | 毛细管电泳原理及其在临床诊断中的应用
    前言蛋白质是生命活动的直接执行者,参与生命的几乎所有过程,包括遗传、发育、生殖、物质和能量的代谢、应激等,因此通过分析蛋白质结构和性质的异常就可以获得机体的受损或病变情况。但蛋白质分子结构与性质复杂多样,如何有效的分离和分析生物体中的各个蛋白质一直面临着严峻的技术挑战。毛细管电泳(ce)技术的出现,给解决这一挑战提供了新的途径,它能够从电荷、分子量等不同维度对蛋白分子进行高效的分离分析,因此得到了广泛的应用和发展。毛细管电泳技术的原理毛细管电泳法是以毛细管为分离通道,以高压直流电场为驱动力,依据样品中各组分之间淌度和分配行为上的差异而实现分离的电泳分离分析方法(图1)。图1 毛细管电泳技术的原理毛细管两端分别浸入在电泳缓冲液中,并且两端连接着高压电源。当高压电源施加稳定的高压时,毛细管内产生了电渗流,使得毛细管内液体整体向负极移动。同时由于进入到毛细管中样本所含组分的荷质比不同,不同物质在毛细管中的迁移速度则不同。不同片段依次经过检测窗时被光检测模块所检测,从而实现了不同组分的分离以及定性、定量检测的目的。毛细管电泳技术的优势相比于hplc等传统的分析分离手段,毛细管电泳技术拥有如下的主要优点(图2):1.分离效率高,分析速度快:由于毛细管能抑制溶液对流,并具有良好的散热性,允许在很高的电场下(可达400v/cm以上)进行电泳,因此可在很短时间内完成高效分离。2.操作模式多,分析方法开发灵活:只要更换毛细管填充溶液的种类、浓度、酸度或添加剂等,就可以用同一台仪器实现多种分离模式。3.适合于微量样品的分析:毛细管内径极小(20-75um),进样为纳升级或纳克级,非常适合于稀少样品的检测分析。4.应用范围广:毛细管电泳在生命科学领域有广泛应用。在核酸检测方面,可用于一代测序或基因片段分析;而在蛋白质检测方面,可应用药物分析和临床诊断。图2 毛细管电泳的主要优势毛细管电泳在临床诊断中的应用作为一种高效的生物大分子分离分析技术,毛细管电泳在临床诊断领域的主要应用如下:1.多发性骨髓瘤:进行血清蛋白电泳、血清免疫分型的检测,是多发性骨髓瘤筛查和诊断的重要依据。2.地中海贫血:进行血红蛋白电泳检测,是地中海贫血筛查的重要手段。3.糖尿病:进行糖化血红蛋白检测,相比传统hplc等方法,能够排除异常血红蛋白的干扰。 聚拓生物聚拓生物为聚光科技集团成员企业,其自主研发的clincap 1000全自动毛细管电泳仪是专门为临床检验而设计的,具有全自动、高分辨的毛细管电泳仪可满足多种临床蛋白分析项目,为临床提供精准可靠的检测结果。系首款获得医疗器械认定的国产同类产品。
  • “100家实验室”专题:访农科院农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程实验室
    为广泛征求用户的意见和需求,了解中国科学仪器的市场情况和应用情况,仪器信息网自2008年6月1日开始,对不同行业有代表性的“100家实验室”进行走访参观。近日,仪器信息网工作人员参观访问了本次活动的第四十一站:中国农业科学院农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程开放实验室。  农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程,是由原国家发展计划委员会投资约1.4亿元,以中国农业科学院为依托单位建立的我国农业及生物领域目前唯一的一个国家重大科学工程,该工程下辖开放实验室(以下简称“实验室”)于2003年11月竣工并投入使用。它是我国农业科学基础研究与应用基础研究领域能力建设的重大进步和标志性工程。实验室作为国家级开放实验室,曾经接待过多位国家领导人的参观及48个国家的农科院院长的访问。   实验室外景  实验室实验员赵新先生热情接待了仪器信息网到访人员,并详细介绍了实验室情况。“建立之初,国家重大科学工程仪器设备共69类468台(套),购置费8053.38万元,具有多功能、高通量、高效率、自动化、网络化和简单化等特点。各类仪器先进性与实用性相结合,大、中、小型仪器设备相配套。日前我们又购置了一些新仪器。”  “实验室的仪器大致可归到以下四类:基因组学技术平台、蛋白质组学技术平台、分析检测技术平台以及实验室常用设备。”  “基因组学技术平台是实验室中仪器设备最为完善的平台,拥有多台先进仪器,还能提供EST文库构建测序服务、Shotgun文库构建服务、DNA片段分析技术服务以及ROCHE公司超高通量基因组测序系统。”   Applied Boisystrns公司全自动3730XL DNA测序仪  (图注:实验室现有3台该仪器。) Roche公司454高通量基因测序仪  (图注:该仪器为实验室最近购置,是最新的基因组测序仪,尤其适合检测植物基因组,还可检测小RNA。仪器使用非常简便,只需要一步简单的全基因组样品制备过程,就可以在短时间内快速获得大量的碱基信息,且准确率达到99%以上。)  Applied Boisystrns公司7900高通量实时荧光定量PCR仪  (图注:该仪器在此类仪器中是最为先进的,具有超高的检测灵敏度及最低的试剂用量需求,全自动化操作,可实现多次收集信号。这款仪器在定机之初就必须选择应用板孔,该实验室的是适用于384孔板样品的。目前全北京就只有两台该仪器,除了这一台外,另一台在ABI公司当展品。此外,实验室还拥有ABI公司的7000型以及7300型实时荧光定量PCR仪各一台。7000实时荧光定量PCR仪是型号较老的仪器,仪器的程序设置不太人性化,灵活性也不够高,只能在整个升温程序的最后一步收集信号,但该仪器的预定情况较好,经常连续工作,几乎不关机。)  BIO-RAD公司iCycler荧光定量PCR仪  (图注:该仪器拥有优秀的控制与分析软件,具有操作、分析及维护简便易行的特点。相关附件为定量PCR试剂盒以及光学级PCR管。这款荧光定量PCR的程序设计比较灵活,收集数据也可分步设置,使用者都说好用。)  GENETIX公司Qpix2机器人挑取克隆系统  (图注:该仪器是挑取克隆菌落的高效自动化设备,它可在短时间内完成挑取克隆、复制、点膜等工作,适用于cDNA文库构建,它的活动机械臂上配有高像素摄像头,可以用图像定位自动搜寻符合要求的菌落并将其从大盘培养基上挑取到96孔或384孔板上。)  “基因组学技术平台还有三台大型的机器人系统,分别是:Beckman公司Multimek384自动化工作站和FX自动化工作站以及Roche公司的MagNA Pure LC自动DNA提取仪。”  Beckman公司Multimek 384自动化工作站  (图注:该仪器是连续自动加样系统,是个单臂的机器人,配有一个384头的移液器,用于液体加样的操作,可以精确地移取、混合液体样品。)  Roche公司的MagNA Pure LC自动DNA提取仪  (图注:该仪器可以快速的提取细胞、组织中的DNA或RNA,在提取的过程中可以有效的防止交叉污染。)  Beckman公司FX自动化工作站  (图注:该仪器是加样机器人,用于液体样品的加样及混合。FX为双臂机器人,同时装有8个单头和1个96头移液器,适用于各类标准或非标容器。)  “蛋白质组学技术平台也是装备比较齐全的技术平台,可提供从样本制备、样品标记、双向电泳分离、图像获取、图像分析到自动挖胶、酶切和点质谱靶等一整套技术的平台。整个过程从图像分析开始全部实现自动化,足以满足蛋白质组学大量研究工作的需求。其中,双向电泳技术是蛋白质组学研究领域中重要的样品分析手段。”  GE公司AKTA purifier蛋白质纯化层析系统  (图注:该仪器适用于各种层析技术,专门分离和纯化各类生物分子。据悉,该实验室拥有4台AKTA purifier系列仪器,型号分别为purifier100、purifier 10+、basic 10。)  GE公司双向电泳系统  (图注:左侧是专门用来跑第一项的(IEF),可设定多个程序,一般水化胶条和等电点聚焦可以一起做,能保证恒温20℃,总时长需要30小时以上 它的相关配件是水化盘,平衡盘,带电极的陶瓷条,每件东西都是价值不菲。右侧呈现的是双向电泳的电泳槽+电源+循环冷水浴,其中电泳槽+电源是GE品牌的,电泳槽可是跑24㎝胶条的,里面是铂金电极丝;电源可预先设定程序,实现倒计时或正计时,并且可以同时提供两台电泳槽的用电;和它们相配套的是注胶模具、上下玻璃板、上槽和胶架,其中玻璃板是经过特殊加工的,每块板价值上千元。整套双向电泳的使用成本较高。)  GE公司UMAX PowerLook 1120 白光扫描仪  (图注:该仪器成像效果很好,可扫描真彩和灰度两种胶图,储存格式为tif,操作便捷,带有分析软件,可根据同一样品的重复试验胶所扫描的灰度胶图的不同判断出蛋白含量的变化,根据蛋白的变化就可以进一步判断植物生长过程中的各种性状变化所引起的植物内在变化;它的配套设施比较简单,就是进口无尘纸,这种纸擦拭扫描仪玻璃表面时几乎不留下纸屑和杂物。)  Typhooe荧光成像系统  (图注:这一台仪器是用来扫描荧光的,可以是经过荧光标记的普通植物组织,也可以是电泳胶;价格高于30万美元 该仪器日常保养和维护比较简单。)  GE公司Ettan Spot Picker全自动斑点切割系统  (图注:该仪器也叫做“挖胶仪”,跑完电泳做完对比分析之后用来挖胶点。可移动机械臂上带有摄像头,系统可根据图像资料寻找需要挖的胶点并把挖到的胶点放进96孔板或者其他型号的板子里,以供后面质谱分析使用。)  DeCyder专业蛋白凝胶图像分析软件  (图注:该软件能快速处理大量2-D蛋白电泳凝胶图像。据了解,该软件价格不菲。)  Bruker公司Autoflex基质辅助激光解析飞行时间质谱仪(MALDI-TOF)  “分析检测技术平台包含各类分析仪器,例如液质联用仪、气质联用仪、毛细管电泳仪、超高效液相色谱仪、激光共聚焦显微镜、近红外品质分析仪、核磁共振油份分析仪等仪器,可提供常规的分析测试服务。”   分析检测技术平台的部分仪器  “实验室常用设备很多,包括电穿孔系统、脉冲场电泳仪、超速离心机、冷冻干燥机、电洗脱仪、半干转印仪、超声波细胞破碎仪、真空浓缩仪、自动分液系统、氮吹仪、全自动流动微波多肽合成系统、超滤系统等仪器。”  部分实验室常用设备  “整个重大科学工程实验室的仪器设备面向全国开放,提供DNA测序、蛋白质测序、文库构建、蛋白质组平台科研合作等服务。实验室建有网上预约系统,该预约系统几经改版,已比较人性化,用户在网上就可预约仪器设备,非常方便。目前,仪器的预约情况良好。”  赵新实验员为仪器信息网工作人员介绍仪器  附录1:中国农业科学院作物科学研究所  http://www.icscaas.com.cn/  附录2:农科院作物研究所农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程开放实验室  http://www.genomics.net.cn/
  • 安捷伦科技收购Lab901——扩展分子生物学应用的电泳产品线
    安捷伦科技收购Lab901&mdash &mdash 扩展分子生物学应用的电泳产品线 2011 年2 月28 日,北京 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)今日宣布已收购位于英国爱丁堡的Lab901 公司,该公司是一家领先的电泳仪器和消耗品公司,其自动化电泳产品可用于DNA、RNA 和蛋白质分析。收购的财务细节尚未披露。 Lab901 公司主要开发和销售TapeStation 台式电泳仪、ScreenTape 塑料消耗品和相关的试剂。他们的客户包括传统制药、生物制药研发和质量控制领域的科学家,以及学术和政府科研机构。Lab901 成立于2001年,拥有大约45 名员工。 &ldquo 随着Lab901 卓越的技术和人才队伍的加入,安捷伦现在可以满足客户所有的电泳生命科学应用需求,涵盖半自动化到96 孔板兼容型工作流程&rdquo 安捷伦液相分离业务部副总裁Patrick Kaltenbach 说道,&ldquo Lab901 ScreenTape 系统将与安捷伦现有的2100生物分析仪平台以及G7100 毛细管电泳系统相结合,为广泛应用提供多功能、自动化并且可扩展的全套凝胶电泳解决方案。&rdquo Lab901 的ScreenTape 系统是一种快速、便捷的台式自动化凝胶电泳系统。客户只需将样品和ScreenTape 消耗品载入紧凑型TapeStation 仪器中,每个样品仅需不到1 分钟,即可轻松获得蛋白质、RNA 和DNA 样品的完整分析结果。 凭借其自动化、易用性和可扩展的独特性能,该系统将成为新一代测序和基因表达工作流程中样品质量控制,以及核心实验室中蛋白质电泳和DNA 片段分析的理想之选。在这些应用中,获取结果所需的时间以及数据的重现性至关重要。 &ldquo 我们早就意识到两家公司之间强烈的协同优势,&rdquo 将与其他员工一起加入安捷伦科技的Lab901 前CEO Joel Fearnley 说道,&ldquo Lab901 的创新技术、杰出产品和经验丰富的团队与安捷伦的文化和开拓性历史完美契合。我们期待着为全球客户提供一流产品的尖端组合,满足他们所有的电泳需求。&rdquo TapeStation 和ScreenTapes 系统将进一步完善安捷伦强大的电泳产品线。安捷伦2100 生物分析仪发布于1999 年,是首台利用微流控技术分析生物样品的商业化仪器。如今,它已成为市场领先的用于微阵列芯片、qPCR 和新一代测序工作流程中RNA 和DNA 质量控制(QC)的必有设备。安捷伦刚刚延长了该平台的芯片供货协议,并将继续为其开发新的应用。 2009 年发布的安捷伦 G7100 毛细管电泳系统是市场上功能最全面的台式电泳平台之一。它能够与UV(紫外吸收)、LIF(激光诱导荧光)、MS(质谱)、CCD(非接触电导检测器)等各种检测器相兼容。特别是G7100 能够与安捷伦广泛的质谱产品无缝整合,使其成为小分子、蛋白质和代谢组学研究和验证的不二之选。 关于安捷伦科技 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)是全球领先的测量公司,同时也是通信、电子、生命科学和化学分析领域的技术领导者。公司的 18500名员工为 100多个国家的客户提供服务。在2010 财政年度,安捷伦的业务净收入为54 亿美元。要了解安捷伦科技的信息,请访问:www.agilent.com.cn。
  • 日本完成中药材“甘草”基因组测序
    p  日本理化学研究所、千叶大学、高知大学和大阪大学等组成的一个研究小组宣布,他们对中药材“甘草”进行了全基因组测序,成功取得了推测的全部基因94.5%的基因信息。/pp  甘草是一种豆科植物,广泛应用于各种中药中,是重要的中药原料。它具有改善肝功能、治疗消化性溃疡、抗炎症及止疼止咳等多种功效。甘草根部富含的主要成分甘草甜素的甜度是砂糖的150倍,可用作非糖基甜味料,具有预防代谢综合征的作用。同时甘草也是医药、化妆品、天然甜味料的重要原料,需求量极大。对其进行基因组测序,不但可根据其基因组信息高效育种,还可对有效药用成分甘草甜素遗传基因进行深入研究,以期实现生物合成。/pp  研究小组选择甘草中质量最好的“乌拉尔甘草”进行全基因组测序。通过对获得的基因信息进行分析,发现了34445个蛋白质遗传基因代码。研究小组用甘草的基因组信息,与其他豆科植物的基因组信息及全基因组进行了分析比较,结果发现了药效成分之一、异黄酮的生物合成相关基因群的一部分形成基因簇。研究小组进一步对生物合成相关的含有酶基因的基因家族深入分析,发现了其遗传结构和遗传表达。/pp  目前,日本90%的医生使用中药来治疗疾病,使用量逐年增加。现日本甘草等中药材85%从中国进口,为了满足不断扩大的市场需求,该研究对日本甘草的分子育种栽培、改进中药材功效,以及深入研究生产药效成分所必需的有用遗传基因具有重要意义。/ppbr//p
  • 中国农业科学院采购432台仪器设备
    中国农业科学院研究生院实验室仪器设备购置项目招标公告  招标编号: 0722-1261-FE425WJO  1. 中国农业科学院研究生院(以下简称“采购人”)已自筹资金,用于执行“中国农业科学院研究生院实验室仪器设备购置项目”,并计划将其中一部分资金用于支付本次招标后所签订的实验室仪器设备的采购合同。中国远东国际招标公司(以下简称招标代理)受采购人的委托,对其所需的实验室仪器设备拟以国内公开招标的方式进行采购。  2. 设备具体情况如下:包名称品目号仪器名称数量单位第一包实验室设备1-1超净工作台3台1-2涡流混合器3台1-3高压灭菌锅1台1-4干式金属浴1台1-5移液器-1240支1-6移液器-280支1-7核酸蛋白检测仪10台1-8恒流泵10台1-9大容量恒温振荡器5台1-10生化培养箱4台1-11低温保存箱6台1-12低温冰柜3台1-13冰箱3台1-14多用途水平电泳槽10台1-15电转电泳槽2台1-16垂直板电泳槽10台1-17免疫电泳槽5台1-18测序槽6台1-19水生模式动物养殖与繁殖系统设备1套1-20脱色摇床5台1-21磁力搅拌器15台 总计432   3. 本项目不接受进口产品投标。  4. 中国远东国际招标公司兹邀请合格的投标人针对上述设备整包进行投标,但不接受拆分包的投标,有兴趣的投标人可从招标代理得到进一步的信息和查看招标文件。  5. 招标文件于2012年5 月25 日起至2012年6 月14 日(节假日除外)上午10:00AM到下午4:00PM(北京时间)在中国远东国际招标公司出售,每包售价为人民币500元 该费用售后不予退还。若邮寄,需另加人民币100元(RMB100.00)。招标代理将不对邮寄过程中可能发生的延误或丢失负责。本次招标文件恕不提供电子版。  6. 所有投标文件都应附有投标总金额1%的投标保证金,并要求于2012年6 月15 日9:30AM(北京时间)前递交,超过该日期及时间的投标将被拒绝。任何以邮递方式的投标,采购人及招标代理机构将不对任何因投标延误而导致的废标承担责任。  7. 兹定于2012年6 月15 日9:30AM(北京时间)准时开标。届时请参加投标的代表出席开标仪式。  8. 递交投标文件及开标地点:  中国农业科学院研究生院 地址:北京市海淀区中关村南大街12号中国农业科学院研究生院办公楼二层第二会议室  9. 本次评标采用综合评分法。  招标代理机构:中国远东国际招标公司  地址:北京市朝阳区和平街东土城路甲9号 (建达大厦正对面)  邮编:100013  联系人:隋欣、邢慧慧  电话:0086-10-64291720ext. 232、633,64234102  传真:0086-10-64204400  户 名:中国远东国际招标公司 帐 号:4047200001819100030941  开户行:华夏银行东直门支行 行 号:734  采购人信息:中国农业科学院研究生院  地址:北京是海淀区中关村南大街12号  邮编:100081  电话:010-82106618  中国远东国际招标公司  2012年5月25日
  • 三代测序技术相关仪器工艺创新概述
    DNA 测序是一种确定 DNA 分子中碱基(A、T、C 和 G)顺序的技术,在生物学、医学、法医学和其他领域有着广泛的应用,例如基因组学、遗传学、分子生物学、疾病诊断和个性化医疗。 DNA 测序技术自 1970 年代以来经历了多次革命性的发展,从第一代测序到第二代测序,再到第三代测序。这些测序技术在原理、方法、优势和局限性方面有着显著的差异。本文将对基于这三代测序技术的相关仪器工艺创新进行概述,并比较其特点和应用。  一、第一代测序仪  基于桑格测序方法,该方法使用链终止双脱氧核苷酸(ddNTP)生成不同长度的DNA片段,通过电泳分离并通过荧光检测。 代表性仪器是 Applied Biosystems 及其 3730xl DNA 分析仪。 工艺创新主要有自动毛细管电泳、荧光标记和碱基识别算法的开发 。  a. 自动毛细管电泳:通过向填充有凝胶或聚合物基质的细毛细管施加电场来分离不同长度的 DNA 片段的过程。 DNA 片段根据其大小和电荷在毛细管中迁移,较小的片段比较大的片段移动得更快。 毛细管电泳系统可以自动并行加载、进样、分离和检测多个样品,从而提高 DNA 测序的通量和效率 。  b. 荧光标记:将荧光染料附着到链终止核苷酸 (ddNTP) 上的过程,用于在测序反应中生成 DNA 片段。 荧光染料根据 ddNTP 的碱基类型(A、T、C 或 G)发出不同颜色或波长的光。 荧光信号由毛细管电泳末端的激光和相机或扫描仪检测 。  c. 碱基识别算法:分析毛细管电泳产生的荧光信号并确定 DNA 片段中碱基序列的过程。 碱基检出算法使用各种方法来校正信号中的噪声、伪影和错误,例如峰检测、峰对齐、峰归一化、峰反卷积和质量评分。 碱基检出算法以各种格式输出序列数据,例如色谱图、跟踪文件或 FASTA 文件 。  二、第二代测序仪  基于大规模并行边合成边测序 (SBS),它使用修饰的核苷酸或探针,在每个循环后终止 DNA 合成(或允许可逆终止终止子、可切割探针)。 DNA 分子通过聚合酶链式反应 (PCR) 或桥式 PCR 在固体表面或乳液液滴中进行扩增,并通过光学或化学检测进行测序。 代表性仪器主要有Illumina的基因组分析仪、HiSeq和MiSeq平台 罗氏及其 454 平台 以及 Ion Torrent 及其个人基因组机器和 Proton 平台。 工艺创新主要有测序反应的小型化、光学/化学检测方法和核苷酸化学方法。  a. 测序反应小型化:减少第二代测序仪中 DNA 样本和测序反应的大小和体积的过程,涉及使用微流体装置或显微孔阵列来限制 DNA 分子,并通过聚合酶链式反应 (PCR) 或桥式 PCR 对其进行扩增,减少了所需的 DNA 量并增加了测序反应的密度。  b. 光学/化学检测方法:测量第二代测序仪中 DNA 合成过程中碱基掺入所产生的光或化学信号的过程,涉及使用荧光标记的核苷酸或探针,根据碱基类型发出不同的颜色或强度。 光学/化学检测方法根据测序平台和化学成分而有所不同,通常遵循以下步骤:  i. 在测序反应中,DNA 模板与引物和 DNA 聚合酶杂交。  ii. 测序反应提供标记的核苷酸或探针,它们在每个循环后终止 DNA 合成或允许可逆终止(例如可逆终止子、可切割探针)。  iii. 根据碱基配对规则将标记的核苷酸或探针添加到DNA模板的互补链上。  iv. 荧光信号或化学信号(例如 pH 值变化)由高分辨率相机或扫描仪捕获并转换为数字数据。  v. 通过计算分析信号以确定碱基身份和序列。  c. 核苷酸化学方法:涉及使用修饰核苷酸或探针影响第二代测序仪中 DNA 合成的过程。 它基于互补碱基配对的原理,其中A与T配对,C与DNA中的G配对。 核苷酸化学方法根据测序平台和化学方法的不同而有所不同,通常遵循以下步骤:  i. 在测序反应中,DNA 模板与引物和 DNA 聚合酶杂交。  ii. 测序反应提供经过修饰的核苷酸或探针,它们在每个循环后终止 DNA 合成或允许可逆终止(例如可逆终止子或可裂解探针)。  iii. 根据碱基配对规则将修饰的核苷酸或探针添加到DNA模板的互补链上。  通过光学/化学方法检测修饰的核苷酸或探针,然后通过化学或酶促步骤去除或灭活,从而允许下一个循环进行。  三、第三代测序仪  基于单分子实时(SMRT)测序,不需要扩增或终止DNA分子。 通过监测将荧光标记的核苷酸或探针掺入互补链的 DNA 聚合酶的活性,对 DNA 分子进行测序。 代表性仪器主要有 Pacific Biosciences 及其 PacBio RS II 和 Sequel 平台 Oxford Nanopore Technologies 及其 MinION、GridION 和 PromethION 平台 以及 Ultima Genomics 及其 Ultima 平台。 工艺创新主要有使用零模波导(ZMW)、纳米孔或纳米通道来限制和观察单个 DNA 分子 使用磷酸化核苷酸或纳米孔接头来实现连续测序 以及使用人工智能来提高碱基识别准确性。  a. 零模波导 (ZMW)、纳米孔和纳米通道是三种类型的纳米结构,可以限制和观察单个 DNA 分子以进行第三代测序。  i. ZMW 是金属薄膜中的纳米级孔径,可产生高度受限的光学观察空间。 当激光照射在金属薄膜上时,只有少量的光可以进入ZMW并激发内部的荧光分子。 这样可以检测通过 DNA 聚合酶掺入 DNA 链的单个荧光标记核苷酸或探针。 Pacific Biosciences 在其 SMRT 测序技术中使用 ZMW。  ii. 纳米孔是膜上的纳米级孔,可在膜上产生电势差。 当 DNA 分子穿过纳米孔时,它会破坏离子电流并产生反映 DNA 碱基序列的特征信号。 纳米孔可以是生物的(例如蛋白质孔)或合成的(例如固态孔)。 Oxford Nanopore Technologies 在其 MinION、GridION 和 PromethION 测序平台中使用了纳米孔 。  iii. 纳米通道是表面上的纳米级凹槽,为 DNA 分子拉伸和排列创造了一个有限的空间。 当荧光染料应用于 DNA 分子时,可以通过显微镜对它们进行成像,并且可以通过将荧光图案映射到参考基因组来确定它们的序列。 纳米通道可以通过多种方法制造,例如蚀刻、光刻或模制。 Ultima Genomics 在其 Ultima 测序平台中使用了纳米通道。  b. 磷酸化核苷酸和纳米孔接头是两种类型的修饰核苷酸或探针,可对单个 DNA 分子进行连续测序。  i. 磷酸化核苷酸是荧光标记的核苷酸,其磷酸基团上连接有可移除的接头。 连接体可防止焦磷酸盐的释放,否则会终止 DNA 合成。 连接子还允许在每个掺入循环后裂解荧光染料,从而可以在多个循环中重复使用相同的 ZMW。 Pacific Biosciences 在其 SMRT 测序技术中使用了磷酸化核苷酸 。  ii. 纳米孔接头是具有发夹结构和条形码序列的合成寡核苷酸。 这些接头连接到 DNA 分子的两端,形成可以多次通过纳米孔的环状 DNA 分子。 条形码序列允许对同一 DNA 分子的重复读取进行识别和比对,从而提高准确性和共识质量。 Oxford Nanopore Technologies 在其 MinION、GridION 和 PromethION 测序平台中使用 Nanopore 适配器 。  c. 人工智能是计算机科学的一个分支,它使用机器学习、深度学习、神经网络和其他方法来执行需要人类智能的任务,例如自然语言处理、图像识别、语音识别和决策。 人工智能通过以下方式提高第三代测序中的碱基检出准确性:  i. 使用来自不同测序平台和化学物质的原始信号和相应序列的大型数据集来训练神经网络。  ii. 开发可以纠正原始信号中的噪声、伪影和错误的算法,例如信号漂移、同聚物错误、插入/删除错误和碱基修饰。  iii. 实施可以利用多个来源信息的方法,例如参考基因组、共识序列、质量评分和元数据。  iv. 优化方法,适应不同的测序条件,例如读长、覆盖深度、测序速度和样品质量。  d. 用于第三代测序中碱基检出的人工智能方法的一些示例:  i. DeepNano:一种深度循环神经网络,使用原始电流信号执行碱基识别。  ii. Guppy:一种基于神经网络的软件工具,使用原始电流信号执行 Oxford Nanopore MinION 读取的碱基识别。  iii. DeepMod:一种双向循环神经网络,使用原始电流信号进行碱基识别和碱基修饰检测。  iv. NanoMod:一种卷积神经网络,使用原始电流信号进行碱基修饰检测。  v. Megalodon:一种软件工具,可使用原始电流信号读取执行碱基识别、碱基修饰检测和选择性剪接检测。  vi. DeepSimulator:一种深度卷积生成对抗网络,模拟 Oxford Nanopore MinION 从参考基因组中读取的内容。  vii. Clairvoyante:一种多任务卷积神经网络,使用原始信号强度值对 Pacific Biosciences SMRT 读取执行变体识别。  viii. IsoPhase:一种深度卷积神经网络,使用原始信号强度值读取执行单倍型感知亚型重建。  ix. DeepIso:一种深度卷积神经网络,使用原始信号强度值读取进行异构体量化。  总之,第一代、第二代和第三代测序是DNA的三种不同读取方法,在原理、方法、优势和局限性方面有着显著的差异。第一代测序是基于桑格测序方法,使用链终止双脱氧核苷酸(ddNTP)生成不同长度的 DNA 片段,并通过电泳分离和荧光检测,工艺创新主要有自动毛细管电泳、荧光标记和碱基识别算法的开发。第二代测序是基于大规模并行边合成边测序 (SBS),使用修饰的核苷酸或探针,在每个循环后终止或可逆终止 DNA 合成,并通过光学或化学检测进行测序,工艺创新主要有测序反应的小型化、光学/化学检测方法和核苷酸化学方法。第三代测序是基于单分子实时(SMRT)测序,不需要扩增或终止 DNA 分子,而是通过监测将荧光标记的核苷酸或探针掺入互补链的 DNA 聚合酶的活性进行测序,工艺创新主要有使用零模波导(ZMW)、纳米孔或纳米通道来限制和观察单个 DNA 分子;使用磷酸化核苷酸或纳米孔接头来实现连续测序;以及使用人工智能来提高碱基识别准确性。这三代测序技术各有优缺点,适用于不同的目标和场景。选择合适的测序技术需要考虑多种因素,例如读长、准确性、速度、成本和样品质量。随着科技的进步,DNA 测序技术仍在不断发展和改进,为生命科学领域带来新的机遇和挑战。
  • 解读基因测序流动槽、工作流程与文库制备试剂盒
    p style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201711/insimg/e1b53786-6e16-4afb-80d3-15282f1c3af7.jpg" title="2.jpg" style="width: 600px height: 446px " width="600" vspace="0" hspace="0" height="446" border="0"//ppspan style="font-family: 微软雅黑, Microsoft YaHei "  在今年年初的J.P. 摩根大通医疗保健大会(J.P. Morgan Healthcare Conference)上,Illumina发表了堪称地表上最强的测序仪NovaSeq。全新的测序架构所带来的超高通量,让Illumina的总裁兼CEO Francis deSouza自信地宣示,百元基因组时代的来临已指日可待。从一月产品发布到Q3 财报公布时, Illumina已经出货近200台NovaSeq到客户手中。br/ br/  无可匹敌的超高通量,是吸引许多客户眼球的第一元素。年初S2 流动槽最先上市,一个流动槽每次运行可达到28-33亿数量的reads / clusters。在双S2流动槽同时运行的情况下,使用2x150 bp读长,一次NovaSeq测序可以在一天半内解码16个人类基因体(平均30x覆盖深度)。10月中推出的S4流动槽,更将通量翻了三遍。一个S4流动槽每次运行可达到80-100亿数量的reads / clusters,所以双S4流动槽运行可以在不到两天内解码48个人类基因体(6万亿硷基通量)。S4的强大功能,将加速大规模基因组研究计画,对临床研究提供关键性的突破。如同哥伦比亚大学基因组医学研究所主任David B. Goldstein所言,NovaSeq系列所激发的研究规模和成本,都是一年前无法想像的。这全新系列的可扩展测序机不只帮助基因组医学走向更大规模的研究,也能推动实现如液态活检、肿瘤深度全基因组分析、和大数量单细胞测序等需要高覆盖深度或高强度的测序应用普及化。br/ br/  NovaSeq高通量的可扩展性,满足不同产量的测序应用,也是其受到许多用户青睐的关键。除了可以选择S2 或S4流动槽,以及自由设定单槽或双槽同时运行之外,与S4同时推出的NovaSeq Xp工作流程让NovaSeq系统的灵活度更上一层楼。NovaSeq Xp工作流程的流动槽上样栈与试剂,让用户可以将文库直接上样到流动槽的单个通道中。由于每个通道的文库独立不混杂,用户可以根据通道来划分样本和项目。NovaSeq Xp工作流程带来更大的自由度,例如每个通道使用96个样本索引,每个流动槽一次可以测序384各样本。这样高度的多样本测序(multiplexing)也顺带减低了每个样本DNA所需的起始量。用户可以自由决定使用标准工作流程来混合各种文库类型在一个流动槽裡,或是利用NovaSeq Xp工作流程裡的上样栈实行新颖的样本索引方法,最佳化有效地利用地表上最高通量的测序仪。br/ br/  NovaSeq 6000系统支援所有文库制备方法,例如全基因组测序(WGS)、靶向重测序(targeted resequencing)、RNA测序(RNA sequencing)、和甲基化测序(methylation sequencing)。用户可以在BaseSpace Sequencing Hub上找到NovaSeq产生的范例Illumina文库测序结果。br/br/  更多关于NovaSeq系统规格和NovaSeqXp工作流程的细节,可以参考Illumina网站上的白皮书:br/https://www.illumina.com/content/dam/illumina-marketing/documents/products/datasheets/novaseq-6000-system-specification-sheet-770-2016-025.pdfbr/ br/  除了NovaSeq S4流动槽和Xp工作流程,Illumina在10月推出的创新产品还包含了Nextera DNA Flex,一款全新的高性能全基因组测序(WGS)文库制备试剂盒。Illumina了解在NGS测序技术不断进步下,文库制备的技术也要跟上脚步,一起加速基因组医学爆发性地前进。目前许多实验室在NGS流程的文库制备阶段仍然遭遇瓶颈。多数文库制备流程以及前后的多个步骤,耗时又耗工。文库制备前需要DNA提取、定量和片段化,而文库制备后的步骤包括文库质量评估、文库浓度定量和归一化。这让许多实验室都要延误不少时间在文库制备流程,才能开始测序过程。br/ br/  Nextera DNA Flex的核心技术为Bead-Linked Transposome (BLT),将Nextera的转座体(transposome)链接在磁珠上。BLT的On-Bead Tagmentation整合了DNA片段化(fragmentation)、片段接头化(adapter ligation)、和文库定量归一化(library normalization)的步骤,减少手动接触点并节省文库制备时间到2. 5小时。搭配Flex Lysis Reagent Kit的细胞裂解试剂,Nextera DNA Flex允许直接加入样本如血液、唾液、乾血纸片、和微生物菌株。直接加入样本进一步省去了样本制备的繁琐步骤,不需要辅助设备和试剂来提取DNA。从而将文库制备的整体周转时间,从样本到上测序机,缩短到三小时以内。Nextera DNA Flex的简约有助于自动化流程的使用。br/br/  除了是Illumina产品线中最快且最简化的文库制备流程,Nextera DNA Flex的On-Bead Tagmentation提供了比in-solution tagmentation更均值的DNA片段化反应。当样本DNA起始量超过BLT的饱和点(大约是100ngDNA),过多的DNA便无法被片段化。不同于其他种文库制备方法,这样的化学特性使得Nextera DNA Flex片段化结果不会受到DNA定量的准确度影响。当DNA量介于100-500ng 之间,Nextera DNA Flex制备后的文库片段长度和上样量几乎是固定的。用户可以利用Nextera DNA Flex的广泛样本DNA起始量,灵活支持各种类型的基因组测序,简化日常操作。 br/ br/  BLT与样本DNA饱和后带来的均匀文库片段长度和上样量,也提升了基因组测序覆盖度的均一性。不管是人类或非人类基因体,文库DNA片段均匀地覆盖在高与低的GC区域,没有偏好性。这样的通用特性让Nextera DNA Flex应用范围广泛,支持人类或其他大型/複杂基因组以及扩增子和微生物、寄生虫或真菌物种的测序,并且与Illumina各款测序仪完全兼容。用户可以在BaseSpace Sequencing Hub上找到Nextera DNA Flex应用在不同动植物和细菌基因体所产生的文库和在不同Illumina测序仪上的结果。br/br/  更多关于Nextera DNA Flex的全新技术BLT原理、快速与整合的流程、以及全基因组测序表现和TruSeq Nano与Nextera XT的比较,请参考Illumina网站上的白皮书:br/https://www.illumina.com/content/dam/illumina-marketing/documents/products/datasheets/nextera-dna-flex-data-sheet-770-2017-011.pdfbr/br/  另外两份白皮书详尽讨论Nextera DNA Flex的文库制备成果:/span/ppspan style="font-family: 微软雅黑, Microsoft YaHei "br//span/ppspan style="font-family: 微软雅黑, Microsoft YaHei "strong人类基因体/strongbr/https://www.illumina.com/content/dam/illumina-marketing/documents/products/appnotes/nextera-dna-flex-human-genomes-application-note-770-2017-018.pdfbr/br/strong微生物基因体/strongbr/https://www.illumina.com/content/dam/illumina-marketing/documents/products/appnotes/nextera-dna-flex-small-genomes-application-note-770-2017-019.pdfbr/ br/  今年十月份发布的这些新产品,NovaSeq S4流动槽、NovaSeq Xp工作流程(预计十二月份开始接受订购)、和Nextera DNA Flex文库制备试剂盒,再度展现Illumina的创新能力,并帮助加速基因组医学迈向大规模、高性能的全基因组研究之路。br//span/pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201711/insimg/8ccfe1a5-9088-43fc-b096-b005ae6f42b3.jpg" title="1.jpg"//ppspan style="font-family: 微软雅黑, Microsoft YaHei "strong作者简介/strongbr/br/庄涵宇博士br/Illumina高级经理,生物信息和基因组应用合作br/Han-Yu Chuangbr/Senior Manager, Bioinformatics and Genomics Applications Partnerships, Illumina Inc./span/p
  • 赛默飞推出采用最新毛细管电泳技术的遗传分析系统
    p  5月22日,赛默飞世尔科技宣布推出最新的毛细管电泳(CE)系统,该技术主要是为Sange测序和片段分析提供低通量、cartridge-based系统。Applied Biosystems™ SeqStudio™ 遗传分析系统可用于肿瘤学研究、基因组编辑、物种鉴定和人体细胞系鉴定等应用,能够支持日益增长的追求经济性和易用性的CE平台的需求。br//pp style="text-align: center "img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201705/insimg/c04800fe-65d7-4d53-b5b4-49dbca56fd71.jpg" title="未标题-1.jpg"//pp style="text-align: center "SeqStudio遗传分析系统/pp  新的SeqStudio遗传分析系统采用独特的一体式盒式cartridge,结合毛细管阵列,聚合物储存器和阳极缓冲液,极大地简化了实验准备和实际操作时间。此外,该系统其他创新功能允许客户访问个性化协议,直观的触摸屏和连接到Thermo Fisher Cloud,可用于远程设置和监控以及轻松的数据分析和协作。/pp  “采用CE系统的Sanger测序是40周年庆典推出的新品,是测序科技的金标准。帮助发现新的生物学发现,并在2003年用于完成人类基因组计划。” 赛默飞世尔科技公司遗传分析副总裁兼总经理Kim Kelderman说。“SeqStudio遗传分析仪是一款为研究人员提供真正即插即用功能的智能和先进系统。/pp  此前,SeqStudio遗传分析系统已经在北美、欧洲、中东、非洲、日本和中国地区选择部分用户使用,在该系统上已经有超过2000个组合的运行结果。该系统将于2017年下半年向全球用户供应。/pp  “我积极推荐新的CE系统,它降低了毛细管电泳平台的运行成本,并且容易操作。” MRC Holland首席执行官Jan Schouten表示。“该系统可以处理一个完整的微量滴定板样品,并具有足够的容量用于中低通量遗传实验室。”/pp  SeqStudio遗传分析系统将在2017年5月27日至30日在丹麦哥本哈根举行的年度欧洲人类遗传学协会(ESHG)大会上首次展出。/pp  更多信息,请访问www.thermofisher.com/seqstudio。/ppbr//p
  • 测序技术简史(一)| 从发现双螺旋开始
    p  对很多人来说,基因测序仪都是一个很陌生的名词。然而,如果你感受过独步世界的中国高铁技术,见证过中国发射的量子卫星,还听说过独占世界超算排行榜长达五年的中国超级计算机,那么处于全球领先地位的中国基因测序仪也绝对值得一探究竟。/pp  人们常说,19世纪是蒸汽机的世纪,20世纪是汽车和计算机的世纪,而21世纪则是生命科学的世纪。生命科学研究将在医疗健康、体育运动、农业养殖、司法刑侦、太空探索等众多方面广泛而深远地改造人类生活。作为生命科学研究最核心的基础性工具,基因测序仪已经成为当前中美全面科技竞争的重要领域。/pp  strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "什么是基因测序/span/strong/pp  基因测序技术是基因组学研究的核心技术,是现代生命科学研究中最广泛应用的重要技术。你可能还不知道,地球上几乎所有你能看见和看不见的生命形式都是由基因编码而成的。塞满商场的人类、卖萌为生的熊猫,爬过阳台的甲虫、各类叫不上名字的树木花草以及数万亿和我们亲密接触的细菌、微生物,都是由DNA编码的生命体。/pp style="text-align: center"img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201908/uepic/a458d63e-538a-4d26-b3cd-50c2933870ba.jpg" title="1.jpg" alt="1.jpg"//pp  每一个生命都像是执行一段代码的程序,而DNA正是生命的源代码。相应地,破解生命源代码的技术,就是DNA测序。/pp  strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "发现双螺旋——让测序成为可能/span/strong/pp  如果说测序技术的进步是发掘矿藏的过程,那么还需要先行者告诉我们矿藏的方向和位置。完成这项任务的,正是科学界的两位顶尖人物——沃森和克里克。/pp style="text-align: center"img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201908/uepic/d812d00c-25b0-471a-91bf-31490093244a.jpg" title="2.jpg" alt="2.jpg"//pp style="text-align: center "span style="font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai "双螺旋结构的发现者James Watson和Francis Crick/span/pp  1953年,沃森和克里克发现了DNA双分子螺旋结构,人类对生命的认识有了重大的突破,即:“生命是序列的,生命是数据的。”生命体的全基因组包含了其全部遗传信息,这些信息是A-T、C-G四种碱基两两配对后排列成的长链。这些碱基的排列信息可以被读取出来,以1010001的二进制形式存储在计算机中 可见,生命的密码是一组可以被数据化的碱基排布序列。因此,测定DNA序列就成为解读遗传信息的先决条件和整个生命科学研究的重要基础。/pp  可以说,正是DNA双螺旋结构的发现,带动了DNA测序技术的大发展,开启了人类历史上方向明确而历时长久、道路曲折、投入巨大、进展惊人的探索。/pp  strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "测序技术发展的四个阶段/span/strong/pp  DNA双螺旋的发现,让破解生命源代码的DNA测序在原理上成为可能,现在我们就来回顾测序技术的具体发展,其主要经历了四个阶段。因篇幅所限,这篇文章将为你展示前两个阶段。/pp  strong阶段1:从“前直读”到“直读”/strong/pp  1964年,即DNA螺旋被发现11年后,康奈尔大学的研究者第一次分析了酵母的核苷酸序列。这次研究标志着一个新时代的开始。不过,正如承载生命信息的大分子经历了从RNA到DNA的历程,最开始的测序方法是用来测定RNA序列的,实验用不同的RNA酶对RNA模板进行“消化”(digestion),并根据反应后产物中可能重叠的序列间接推导可能的完整序列。这种测序技术流程繁琐,推导复杂,很难重复,验证还更为困难。不仅如此,在试图测定双链且更加稳定的DNA时,这种方法没能获得成功。/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 305px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201908/uepic/f6459ef0-726f-4dab-805d-2c1b3ea314e1.jpg" title="3.jpg" alt="3.jpg" width="600" height="305" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: center "span style="font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai "直读法示例/span/pp  在技术的发展史上,新技术的出现就像制作一个木桶,每一块木板都代表一种必须具备的基础条件,任意一块板的缺失都不构成一个木桶,同时,木板之间还需要彼此适应和融合。直接读取DNA序列的测序技术(即“直读法”),正是这样一个木桶。它是在分子克隆技术、凝胶电泳技术、放射自显影三种技术全部成熟之后才出现的。在这三种技术的基础之上,直接读取DNA序列的SBC和SBS测序法问世。“直读法”的最大突破在于不再需要间接推导,而是可以直接在凝胶上按顺序直观读出测序模板,判断DNA分子每个碱基位置上为T-C还是A-G。/pp  SBC与SBS这两种方法在原理上相似,但具体操作有诸多不同。SBC法使用化学试剂,有较强的毒性,且技术复杂较难掌握,成功率不高。相比之下,SBS法使用酶试剂,具有操作简便、结果稳定、准确性高且重复性好等特点。更有意思的是,运用SBS法的设备相对简单,可以实验室自制或采用通用设备,还有使用方便的标准化试剂盒,因此很快风靡全球相关实验室。SBS法由英国科学家桑格(Frederick Sanger)于1975年率先发明,因此也被称为Sanger法。这种直读法的发明也为DNA测序的数字化和自动化奠定了基础/pp style="text-align: center"img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201908/uepic/dc28748a-368f-4144-8805-8b14db973ec8.jpg" title="4.jpg" alt="4.jpg"//pp style="text-align: center "span style="font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai "Sanger电泳法跑胶结果示例图/spanbr//pp  strong阶段2:从手工到自动化/strong/pp  上世纪80年代以前,分子生物学这门学科一直都被戏称为“现代技术、手工操作”,直到DNA测序技术出现,分子生物学才有了第一种实现自动化和信息化的技术。此后测序技术在几十年发展历程中不断吸收其他领域新技术(如物理领域的纳米技术及激光技术、化学领域的荧光标记核苷酸技术、生化领域的毛细管电泳分析、信息领域高密度芯片等技术)并将它们融为一体的成果,形成了现代科学研究技术中的强力工具。/pp  1986年,加州理工学院的胡德(Leroy Hood)发明了以四种荧光物质标记测序反应产物的“四色荧光法”,这些荧光物质在不同波长的激光下呈现不同颜色。这项技术成为广受欢迎的SBS测序法(Sanger测序法)走向自动化的关键突破。  /pp style="text-align: center"img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201908/uepic/c56d19b1-381e-4039-89b4-c54f701e45ec.jpg" title="5.jpg" alt="5.jpg"//pp style="text-align: center "span style="font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai "四色荧光法原理示意图和自动测序仪的四色荧光“峰图”/spanbr//pp  这种方法将测序效率提高了数倍,读长达到500nt(nt:nucleotide 核苷酸,是衡量单链核酸的长度单位),分辨率大为提高 而且,这是测序技术发展史上首次真正彻底抛弃了放射性物质的使用。测序效率也称为“通量“,是指单台设备一次反应所获取的序列数据量。/pp  另外,还有一个与通量同样重要的概念——“读长”:测序仪的测序原理是将目标DNA大量复制,然后用酶将这些DNA长链切断,并分别对每一小段测序,最后将这些片段拼接还原成完整的长链。读长就是指测序仪能读出的每一个DNA片段的长度。这两个概念很重要,后面还会经常提到。/pp  据此,美国ABI公司在1986年推出了第一台商品化的平板电泳全自动测序仪——ABI 370A。此后,该公司又推出了多种改进型,在读长、通量、准确性方面都有很大提高,这种自动化测序仪成为划时代的国际“人类基因组计划(HGP)”得以启动的重要技术依据。/pp  尽管这一代测序仪为“人类基因组计划”做出了突出贡献,但只实现了测序过程的自动化,在自动测序之前的细菌克隆、手工制胶、手工加样等操作都需要消耗大量的人力。一组数据可以说明问题:在“人类基因组计划”冲刺阶段,华大在6个月的时间里完成了50万次成功的测序反应,共消耗了1500万个形状大小与医用“针头”类似的移液器吸头。/pp  span style="color: rgb(0, 0, 0) "未完待续,详见下期:/spanstrongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "爆发式的进步/span/strong/pp  span style="color: rgb(255, 0, 0) "strong小贴士/strong/span/pp  strong1.人类基因组计划(Human Genome Project, HGP)/strong/pp  人类基因组计划是一项规模宏大,跨国跨学科的科学探索工程。其宗旨在于测定组成人类染色体(指单倍体)中所包含的30亿个碱基对组成的核苷酸序列,从而绘制人类基因组图谱,并且辨识其载有的基因及其序列,达到破译人类遗传信息的最终目的。基因组计划是人类为了探索自身的奥秘所迈出的重要一步,是继曼哈顿计划和阿波罗登月计划之后,人类科学史上的又一个伟大工程。/pp  这一计划于1990年正式启动。美国、英国、法国、德国、日本和我国科学家共同参与了这一预算达30亿美元的人类基因组计划。2001年,人类基因组工作草图发表。2003年4月14日,六国首脑共同宣布人类基因组测序胜利完成。/pp  strong2.测序效率与读长/strong/pp  测序效率也称为“通量”,是指单台设备一次反应所获取的序列数据量。测序仪的测序原理是将目标DNA大量复制,然后用酶将这些DNA长链切断,分别对每一小段测序,最后根据片段首尾重合的部分,拼接还原成完整的长链。读长就是指测序仪能读出的每一个DNA片段的长度。/pp  strong3.SBC与SBS/strong/pp  这两种方法的原理相似,但具体操作有诸多不同。SBC法使用化学试剂,有较强的毒性,且技术复杂较难掌握,成功率不高。相比之下,SBS法使用酶试剂,具有操作简便、结果稳定、准确性高且重复性好等特点。且运用SBS法的设备相对简单,可以实验室自制或采用通用设备,还有使用方便的标准化试剂盒,因此很快风靡全球相关实验室。/p
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    一. 测序仪对比测序技术代表仪器读长通量准确度成本Sanger法ABI 3730xl DNA Analyzer500-800bp0.096Gbp/天99.99%0.24美分/bpIlluminaHiSeq X Ten System150bp1800Gbp/运行99.9%0.01美分/bp华大智造MGISEQ-2000200bp(单端)或2×150bp(双端) 60Gbp/运行 99.9% 0.015美元/bpRoche 454GS FLX+ System700bp0.7Gbp/运行99.9%0.02美元/bpABI SOLiDSOLiD System 5500xl75bp120Gbp/运行99.94%0.13美分/bpPacBioSequel II System10kb60Gbp/运行99%0.15美元/bpNanoporeMinION Device100kb30Gbp/运行90%0.02美元/bpHelicosHeliScope Single Molecule Sequencer25-50bp28Gbp/运行80%未知  1. ABI 3730xl DNA Analyzer图源自thermofisher官网  1.1. 相关原理   DNA测序:基于Sanger法的原理,利用DNA聚合酶在体外DNA复制过程中随机掺入带有荧光标记和终止子的双脱氧核苷酸(ddNTPs),从而得到不同长度的DNA片段。这些片段经过电泳分离后,通过激光激发和CCD检测,得到每个碱基发出的荧光信号,从而确定DNA的碱基序列。   片段分析:基于荧光检测的原理,利用不同颜色的荧光染料标记不同长度或类型的DNA片段,如微卫星、SNP、AFLP等。这些片段经过电泳分离后,通过激光激发和CCD检测,得到每个片段发出的荧光信号,从而确定片段的大小或等位基因。  1.2. 主要组成  ABI 3730xl DNA Analyzer仪器是一种高通量的DNA测序和片段分析的平台,它可以同时使用48或96根毛细管进行电泳分离和荧光检测。   测序仪主机:包含电泳系统、自动进样系统、激光系统、光学系统、温控系统、聚合物输送系统等多个模块,用于控制仪器的运行和数据的采集。   计算机工作站:预装用于仪器控制、数据收集和样品文件自动分析的软件,如Data Collection Software、Sequencing Analysis Software、SeqScape Software、GeneMapper Software等。   毛细管阵列:提供预组装的48根或96根毛细管阵列,它们与业界标准的96孔和384孔板配合使用。毛细管为内部无涂层毛细管,可提供300次的运行质保。   DNA测序试剂和耗材:包括BigDye Terminator循环测序试剂盒、GeneScan分子量标准品、片段分析标准品、POP-7聚合物分离胶等。  1.3. 主机模块   电泳系统:负责将DNA片段在毛细管中进行电泳分离,根据不同长度的DNA片段在电场中的迁移速度不同,将它们按照从小到大的顺序排列。电泳系统由高压电源、电泳缓冲液、毛细管阵列等组成。  o 高压电源:提供高达30kV的电压,使DNA片段在电场中迁移。  o 电泳缓冲液:提供电导性和pH稳定性,使DNA片段在毛细管中顺利运行。  o 毛细管阵列:提供预组装的48根或96根毛细管,它们与业界标准的96孔和384孔板配合使用。毛细管为内部无涂层毛细管,可提供300次的运行质保。   自动进样系统:负责将样品从96孔或384孔板中自动吸取,并注入到毛细管阵列中。自动进样系统由进样针、进样泵、进样阀等组成。  o 进样针:用于从样品板中吸取样品,并通过进样阀将样品注入到毛细管中。  o 进样泵:用于控制进样针的吸取和释放动作,以及进样量的大小。  o 进样阀:用于控制进样针与毛细管之间的连接和断开,以及进样时间的长短。   激光系统:负责将激光光束照射到毛细管阵列的出口处,激发荧光信号。激光系统由激光器、光纤、光学开关等组成。  o 激光器:提供单波长、505nm、固态、长寿命的激光光源,用于激发荧光染料。  o 光纤:用于将激光光束从激光器传输到毛细管阵列上。  o 光学开关:用于控制激光光束的开启和关闭,以及激光功率的大小。   光学系统:负责将荧光信号收集并转换为电信号。光学系统由滤光片、透镜、CCD相机等组成。  o 滤光片:用于选择不同颜色的荧光信号,并过滤掉背景噪声。  o 透镜:用于聚焦和放大荧光信号,并将其投射到CCD相机上。  o CCD相机:用于将荧光信号转换为数字化的电信号,并传输给计算机工作站进行数据采集和分析。   温控系统:负责控制仪器的温度,保证测序的稳定性和可靠性。温控系统由温度传感器、风扇、加热器等组成。  o 温度传感器:用于监测仪器内部和外部的温度,并反馈给温控器进行调节。  o 风扇:用于散热和通风,维持仪器的适宜温度。  o 加热器:用于加热和保温,防止仪器的过冷。   聚合物输送系统:负责将聚合物分离胶从储存瓶输送到毛细管阵列中,作为电泳介质。聚合物输送系统由压力罐、气压调节器、流量计等组成。  o 压力罐:用于储存聚合物分离胶,并提供一定的压力,使聚合物分离胶能够流动。  o 气压调节器:用于控制压力罐的气压,以及聚合物分离胶的流速。  o 流量计:用于测量聚合物分离胶的流量,以及毛细管中的胶量。  2. HiSeq X Ten System图源自Illumina官网  HiSeq X Ten System是Illumina公司的产品。Illumina是一家生物技术公司,它的测序仪是基于桥式PCR和荧光检测的技术,也是目前最流行的二代测序平台之一。它的测序仪有多个系列,如NovaSeq、HiSeq、MiSeq、MiniSeq等,它们的核心技术原理是相同的,但在通量、读长、准确度、成本等方面有所不同。  2.1. 相关原理   文库构建:将待测DNA打断成小片段,并在两端加上特殊的接头(Adaptor),这些接头包含与流通池表面探针互补的序列(P5/P7)、用于区分不同文库的索引(Index)、以及用于测序引物结合的序列(Rd1 SP/Rd2 SP)。文库构建后需要进行质量检测和定量。   聚集体生成:将文库DNA片段注入到流通池中,并与表面探针杂交结合。然后进行桥式PCR扩增,使每个DNA片段形成一个聚集体。聚集体生成后需要进行温度变化和化学处理,使其单链化并去除P5端的DNA链,只留下P7端的DNA单链。   边合成边测序:将带有荧光染料和可逆终止子的四种dNTPs逐一加入到流通池中,并利用DNA聚合酶将它们连接到聚集体的DNA链上。每次只能加入一个碱基,然后用激光激发荧光信号,并用CCD相机记录每个聚集体发出的荧光信号,从而确定碱基序列。然后用化学剂去除荧光染料和可逆终止子,使下一个碱基可以继续加入。重复这个过程,直到完成所有的测序循环。   数据分析:将CCD相机收集到的荧光信号转换为原始数据(BCL文件),并进行质量控制和过滤,去除低质量的聚集体和信号。然后根据索引将不同文库的数据分离,并进行碱基识别(Base calling),将荧光信号转换为碱基序列(FASTQ文件)。最后根据不同的测序目的,进行后续的数据分析,如比对、变异检测、表达量计算等。  2.2. 主要组成   流通池(Flow cell):是一个微型的玻璃芯片,它的表面覆盖了数亿个固定在不同位置的寡核苷酸探针,这些探针与文库DNA片段的接头互补,可以通过杂交结合。流通池内部有多个通道,每个通道可以进行不同的测序反应。   聚集体(Cluster):是指通过桥式PCR在流通池表面扩增形成的由相同DNA片段组成的簇,每个聚集体可以发出荧光信号,从而被检测为一个读长(Read)。聚集体的密度和质量会影响测序的效率和准确度。   荧光染料(Fluorescent dye):是指用于标记不同碱基的四种荧光分子,它们分别对应A、T、C、G四种碱基,并发出不同颜色的光。荧光染料还带有可逆终止子,可以控制每次只加入一个碱基。   激光器(Laser):是指用于激发荧光染料发光的光源,它可以提供单波长、固态、长寿命的激光光束。   CCD相机(CCD camera):是指用于捕捉和记录荧光信号的设备,它可以将荧光信号转换为数字化的电信号,并传输给计算机进行数据分析。   计算机系统(Computer system):是指用于控制测序仪运行和处理数据的设备,它预装了用于仪器控制、数据收集和样品文件自动分析的软件,如BaseSpace Sequence Hub、Sequencing Analysis Software等。  3. MGISEQ-2000图源自华大智造官网  MGISEQ-2000测序仪是一种基于荧光检测的第二代测序技术,可以实现高通量、高精度、低成本的基因组测序。  3.1. 相关原理  o DNA测序:基于双端测序的原理,利用DNA聚合酶在体外DNA复制过程中随机掺入带有荧光标记和终止子的双脱氧核苷酸(ddNTPs),从而得到不同长度的DNA片段。这些片段经过桥式扩增后,形成单分子簇,然后通过四色荧光检测,得到每个碱基发出的荧光信号,从而确定DNA的碱基序列。  o 片段分析:基于荧光检测的原理,利用不同颜色的荧光染料标记不同长度或类型的DNA片段,如微卫星、SNP、AFLP等。这些片段经过桥式扩增后,形成单分子簇,然后通过四色荧光检测,得到每个片段发出的荧光信号,从而确定片段的大小或等位基因。  3.2. 主要组成  o 测序仪主机:包含流体控制系统、温控系统、激光系统、光学系统、信号采集系统等多个模块,用于控制仪器的运行和数据的采集。  § 流体控制系统:负责控制样品和试剂的输送,以及测序反应的进行。流体控制系统由进样针、进样泵、进样阀等组成。  § 进样针:用于从样品板中吸取样品,并通过进样阀将样品注入到芯片上。  § 进样泵:用于控制进样针的吸取和释放动作,以及进样量的大小。  § 进样阀:用于控制进样针与芯片之间的连接和断开,以及进样时间的长短。  § 温控系统:负责控制仪器和芯片的温度,保证测序的稳定性和可靠性。温控系统由温度传感器、风扇、加热器等组成。  § 温度传感器:用于监测仪器和芯片内部和外部的温度,并反馈给温控器进行调节。  § 风扇:用于散热和通风,维持仪器和芯片的适宜温度。  § 加热器:用于加热和保温,防止仪器和芯片的过冷。  § 激光系统:负责将激光光束照射到芯片上,激发荧光信号。激光系统由激光器、光纤、光学开关等组成。  § 激光器:提供单波长、532nm、固态、长寿命的激光光源,用于激发荧光染料。  § 光纤:用于将激光光束从激光器传输到芯片上。  § 光学开关:用于控制激光光束的开启和关闭,以及激光功率的大小。  § 光学系统:负责将荧光信号收集并转换为电信号。光学系统由滤光片、透镜、CCD相机等组成。  § 滤光片:用于选择不同颜色的荧光信号,并过滤掉背景噪声。  § 透镜:用于聚焦和放大荧光信号,并将其投射到CCD相机上。  § CCD相机:用于将荧光信号转换为数字化的电信号,并传输给计算机工作站进行数据采集和分析。  § 信号采集系统:负责对数字化的电信号进行滤波、校准、分段、碱基识别等处理,最终生成测序结果。信号采集系统由数据采集卡、数据处理软件等组成。  § 数据采集卡:用于将CCD相机传输的电信号接收并转换为数字信号,以及进行一定的滤波和校准处理。  § 数据处理软件:用于对数字信号进行进一步的分段、碱基识别、质量评估等处理,以及生成测序结果文件。  o 计算机工作站:预装用于仪器控制、数据收集和样品文件自动分析的软件。  o 芯片:芯片是MGISEQ-2000测序仪的核心部件,它是一种微流控芯片,上面有数百万个微孔,每个微孔都可以进行单分子簇测序,实现高通量的数据产出。芯片有不同的规格和类型,如单端测序芯片、双端测序芯片、片段分析芯片等,可以根据不同的需求选择合适的芯片。  4. GS FLX+ System图源自罗氏官网  GS FLX+ System测序仪是一种基于焦磷酸测序(Pyrosequencing)技术的二代测序平台,它可以提供高通量、高准确度和超长读长的DNA测序服务。  4.1. 相关原理   文库构建:将待测DNA打断成小片段,并在两端加上特殊的接头(Adaptor),这些接头包含与DNA捕获珠表面探针互补的序列(A/B)、以及用于测序引物结合的序列(P1/P2)。文库构建后需要进行质量检测和定量。   乳液PCR:将文库DNA片段与DNA捕获珠混合,并加入油相形成乳液滴。每个乳液滴中只包含一个DNA捕获珠和一个文库DNA片段。然后进行PCR扩增,使每个DNA捕获珠上形成一个单分子聚集体。乳液PCR后需要进行破乳液和洗涤处理,去除多余的油相和PCR试剂。   PTP装载:将经过乳液PCR处理后的DNA捕获珠注入到PTP中,并使每个微孔中只有一个DNA捕获珠。然后进行温度变化和化学处理,使聚集体单链化并去除A端的DNA链,只留下B端的DNA单链。   边合成边测序:将带有荧光染料和可逆终止子的四种dNTPs逐一加入到PTP中,并利用DNA聚合酶将它们连接到聚集体的DNA链上。每次只能加入一个碱基,然后用激光激发荧光信号,并用CCD相机记录每个聚集体发出的荧光信号,从而确定碱基序列。然后用化学剂去除荧光染料和可逆终止子,使下一个碱基可以继续加入。重复这个过程,直到完成所有的测序循环。   数据分析:将CCD相机收集到的荧光信号转换为原始数据(SFF文件),并进行质量控制和过滤,去除低质量的聚集体和信号。然后进行碱基识别(Base calling),将荧光信号转换为碱基序列(FASTA/FASTQ文件)。最后根据不同的测序目的,进行后续的数据分析,如比对、变异检测、表达量计算等。  4.2. 主要组成   测序仪主机:包含电泳系统、自动进样系统、激光系统、光学系统、温控系统、聚合物输送系统等多个模块,用于控制仪器的运行和数据的采集。   计算机工作站:预装用于仪器控制、数据收集和样品文件自动分析的软件,如Data Collection Software、Sequencing Analysis Software等。   PicoTiterPlate(PTP):是一个微型的塑料板,它的表面覆盖了数百万个微孔,每个微孔可以容纳一个DNA捕获珠(DNA Capture Bead),并进行单分子测序反应。   DNA捕获珠(DNA Capture Bead):是一种直径约28微米的磁性珠子,它的表面覆盖了数千个固定在不同位置的寡核苷酸探针,这些探针与文库DNA片段的接头互补,可以通过乳液PCR(Emulsion PCR)扩增形成单分子聚集体(Single Molecule Cluster)。   荧光染料(Fluorescent dye):是指用于标记不同碱基的四种荧光分子,它们分别对应A、T、C、G四种碱基,并发出不同颜色的光。荧光染料还带有可逆终止子,可以控制每次只加入一个碱基。   激光器(Laser):是指用于激发荧光染料发光的光源,它可以提供单波长、固态、长寿命的激光光束。   CCD相机(CCD camera):是指用于捕捉和记录荧光信号的设备,它可以将荧光信号转换为数字化的电信号,并传输给计算机进行数据分析。  4.3. 主机组成   电泳系统:是指用于将带有荧光染料和可逆终止子的四种dNTPs逐一加入到PTP中,并利用DNA聚合酶将它们连接到聚集体的DNA链上的系统。每次只能加入一个碱基,然后用激光激发荧光信号,并用CCD相机记录每个聚集体发出的荧光信号,从而确定碱基序列。   自动进样系统:是指用于将经过乳液PCR处理后的DNA捕获珠注入到PTP中,并使每个微孔中只有一个DNA捕获珠的系统。然后进行温度变化和化学处理,使聚集体单链化并去除A端的DNA链,只留下B端的DNA单链。   激光系统:是指用于激发荧光染料发光的光源,它可以提供单波长、固态、长寿命的激光光束。   光学系统:是指用于捕捉和记录荧光信号的设备,它可以将荧光信号转换为数字化的电信号,并传输给计算机进行数据分析。   温控系统:是指用于控制PTP板和反应液的温度,以保证测序反应的稳定性和效率的系统。   聚合物输送系统:是指用于将不同类型和浓度的聚合物溶液输送到PTP板中,以提供不同阶段所需的反应条件和试剂的系统。  5. SOLiD System 5500xl图源自thermofisher官网  SOLiD System 5500xl测序仪是一种基于连接法测序(Sequencing by Ligation)技术的二代测序平台,它可以提供高通量、高准确度和中等读长的DNA测序服务。  5.1. 相关原理   文库构建:将待测DNA打断成小片段,并在两端加上特殊的接头(Adaptor),这些接头包含与DNA捕获珠表面探针互补的序列(P1/P2)、以及用于测序引物结合的序列(Rd1 SP/Rd2 SP)。文库构建后需要进行质量检测和定量。   乳液PCR:将文库DNA片段与DNA捕获珠混合,并加入油相形成乳液滴。每个乳液滴中只包含一个DNA捕获珠和一个文库DNA片段。然后进行PCR扩增,使每个DNA捕获珠上形成一个单分子聚集体。乳液PCR后需要进行破乳液和洗涤处理,去除多余的油相和PCR试剂。   FlowChip装载:将经过乳液PCR处理后的DNA捕获珠注入到FlowChip中,并使每个微孔中只有一个DNA捕获珠。然后进行温度变化和化学处理,使聚集体单链化并去除P1端的DNA链,只留下P2端的DNA单链。   边连接边测序:将带有荧光探针和可逆终止子的四种dNTPs逐一加入到FlowChip中,并利用DNA连接酶将它们连接到聚集体的DNA链上。每次只能加入一个碱基对,然后用激光激发荧光信号,并用CCD相机记录每个聚集体发出的荧光信号,从而确定碱基对序列。然后用化学剂去除荧光探针和可逆终止子,使下一个碱基对可以继续加入。重复这个过程,直到完成所有的测序循环。   数据分析:将CCD相机收集到的荧光信号转换为原始数据(BCL文件),并进行质量控制和过滤,去除低质量的聚集体和信号。然后进行碱基识别(Base calling),将荧光信号转换为碱基对序列(FASTQ文件)。最后根据不同的测序目的,进行后续的数据分析,如比对、变异检测、表达量计算等。  5.2. 主要组成   测序仪主机:包含电泳系统、自动进样系统、激光系统、光学系统、温控系统、聚合物输送系统等多个模块,用于控制仪器的运行和数据的采集。   计算机工作站:预装用于仪器控制、数据收集和样品文件自动分析的软件,如Data Collection Software、Sequencing Analysis Software等。   FlowChip:是一个微型的玻璃芯片,它的表面覆盖了数百万个微孔,每个微孔可以容纳一个DNA捕获珠(DNA Capture Bead),并进行单分子测序反应。   DNA捕获珠(DNA Capture Bead):是一种直径约28微米的磁性珠子,它的表面覆盖了数千个固定在不同位置的寡核苷酸探针,这些探针与文库DNA片段的接头互补,可以通过乳液PCR(Emulsion PCR)扩增形成单分子聚集体(Single Molecule Cluster)。   荧光探针(Fluorescent probe):是指用于标记不同碱基对的四种荧光分子,它们分别对应A/T、T/A、C/G、G/C四种碱基对,并发出不同颜色的光。荧光探针还带有可逆终止子,可以控制每次只加入一个碱基对。   激光器(Laser):是指用于激发荧光探针发光的光源,它可以提供单波长、固态、长寿命的激光光束。   CCD相机(CCD camera):是指用于捕捉和记录荧光信号的设备,它可以将荧光信号转换为数字化的电信号,并传输给计算机进行数据分析。  5.3. 主机组成   电泳系统:是指用于将带有荧光探针和可逆终止子的四种dNTPs逐一加入到FlowChip中,并利用DNA连接酶将它们连接到聚集体的DNA链上的系统。每次只能加入一个碱基对,然后用激光激发荧光信号,并用CCD相机记录每个聚集体发出的荧光信号,从而确定碱基对序列。   自动进样系统:是指用于将经过乳液PCR处理后的DNA捕获珠注入到FlowChip中,并使每个微孔中只有一个DNA捕获珠的系统。然后进行温度变化和化学处理,使聚集体单链化并去除P1端的DNA链,只留下P2端的DNA单链。   激光系统:是指用于激发荧光探针发光的光源,它可以提供单波长、固态、长寿命的激光光束。   光学系统:是指用于捕捉和记录荧光信号的设备,它可以将荧光信号转换为数字化的电信号,并传输给计算机进行数据分析。   温控系统:是指用于控制FlowChip板和反应液的温度,以保证测序反应的稳定性和效率的系统。   聚合物输送系统:是指用于将不同类型和浓度的聚合物溶液输送到FlowChip板中,以提供不同阶段所需的反应条件和试剂的系统。  6. Sequel II System图源自PACB官网  Sequel II System测序仪是一种基于单分子实时测序(Single Molecule Real-Time Sequencing,SMRT)技术的三代测序平台,它可以提供高通量、高准确度和超长读长的DNA测序服务。  6.1. 相关原理   文库构建:将待测DNA打断成小片段,并在两端加上特殊的接头(Adaptor),这些接头包含用于测序引物结合的序列(P1/P2)。文库构建后需要进行质量检测和定量。   SMRT Cell装载:将文库DNA片段与DNA聚合酶混合,并注入到SMRT Cell中,并使每个微孔中只有一个DNA聚合酶。然后进行温度变化和化学处理,使文库DNA片段与测序引物结合,并形成环状结构。   边合成边测序:将带有荧光核苷酸的四种dNTPs逐一加入到SMRT Cell中,并利用DNA聚合酶将它们连接到环状DNA链上。每次只能加入一个碱基,然后用激光激发荧光信号,并用CCD相机记录每个微孔发出的荧光信号,从而确定碱基序列。然后用化学剂去除环状DNA链上的碱基,使下一个碱基可以继续加入。重复这个过程,直到完成所有的测序循环。   数据分析:将CCD相机收集到的荧光信号转换为原始数据(BAM文件),并进行质量控制和过滤,去除低质量的信号。然后进行碱基识别(Base calling),将荧光信号转换为碱基序列(FASTQ文件)。最后根据不同的测序目的,进行后续的数据分析,如比对、变异检测、表达量计算等。  6.2. 主要组成   测序仪主机:包含电泳系统、自动进样系统、激光系统、光学系统、温控系统、聚合物输送系统等多个模块,用于控制仪器的运行和数据的采集。   计算机工作站:预装用于仪器控制、数据收集和样品文件自动分析的软件,如Data Collection Software、Sequencing Analysis Software等。   SMRT Cell 8M:是一个微型的玻璃芯片,它的表面覆盖了数百万个微孔,每个微孔可以容纳一个DNA聚合酶(DNA Polymerase),并进行单分子测序反应。   荧光核苷酸(Fluorescent nucleotide):是指用于标记不同碱基的四种荧光分子,它们分别对应A、T、C、G四种碱基,并发出不同颜色的光。荧光核苷酸在被DNA聚合酶催化加入到DNA链上时,会释放出荧光信号,并被去除。   激光器(Laser):是指用于激发荧光核苷酸发光的光源,它可以提供单波长、固态、长寿命的激光光束。   CCD相机(CCD camera):是指用于捕捉和记录荧光信号的设备,它可以将荧光信号转换为数字化的电信号,并传输给计算机进行数据分析。  6.3. 主机组成   电泳系统:是指用于将带有荧光核苷酸的四种dNTPs逐一加入到SMRT Cell中,并利用DNA聚合酶将它们连接到环状DNA链上的系统。每次只能加入一个碱基,然后用激光激发荧光信号,并用CCD相机记录每个微孔发出的荧光信号,从而确定碱基序列。   自动进样系统:是指用于将文库DNA片段与DNA聚合酶混合,并注入到SMRT Cell中,并使每个微孔中只有一个DNA聚合酶的系统。然后进行温度变化和化学处理,使文库DNA片段与测序引物结合,并形成环状结构。   激光系统:是指用于激发荧光核苷酸发光的光源,它可以提供单波长、固态、长寿命的激光光束。   光学系统:是指用于捕捉和记录荧光信号的设备,它可以将荧光信号转换为数字化的电信号,并传输给计算机进行数据分析。   温控系统:是指用于控制SMRT Cell板和反应液的温度,以保证测序反应的稳定性和效率的系统。   聚合物输送系统:是指用于将不同类型和浓度的聚合物溶液输送到SMRT Cell板中,以提供不同阶段所需的反应条件和试剂的系统。  7. MinION Device图源自Oxford官网  MinION Device测序仪是一种基于单分子实时测序(Single Molecule Real-Time Sequencing,SMRT)技术的三代测序平台,它可以提供高通量、高准确度和超长读长的DNA和RNA测序服务。  7.1. 相关原理   文库构建:将待测DNA或RNA打断成小片段,并在两端加上特殊的接头(Adaptor),这些接头包含用于测序引物结合的序列(P1/P2)。文库构建后需要进行质量检测和定量。   SMRT Cell装载:将文库片段与DNA聚合酶混合,并注入到SMRT Cell中,并使每个微孔中只有一个DNA聚合酶。然后进行温度变化和化学处理,使文库片段与测序引物结合,并形成环状结构。   边合成边测序:将带有荧光核苷酸的四种dNTPs逐一加入到SMRT Cell中,并利用DNA聚合酶将它们连接到环状DNA链上。每次只能加入一个碱基,然后用激光激发荧光信号,并用CCD相机记录每个微孔发出的荧光信号,从而确定碱基序列。然后用化学剂去除环状DNA链上的碱基,使下一个碱基可以继续加入。重复这个过程,直到完成所有的测序循环。   数据分析:将CCD相机收集到的荧光信号转换为原始数据(FAST5文件),并进行质量控制和过滤,去除低质量的信号。然后进行碱基识别(Base calling),将荧光信号转换为碱基序列(FASTQ文件)。最后根据不同的测序目的,进行后续的数据分析,如比对、变异检测、表达量计算等。  7.2. 主要组成   测序仪主机:是一个小巧的USB设备,它可以连接到任何电脑或笔记本,并通过软件进行控制和数据传输。   SMRT Cell:是一个微型的塑料芯片,它的表面覆盖了数千个微孔,每个微孔可以容纳一个DNA聚合酶(DNA Polymerase),并进行单分子测序反应。   荧光核苷酸(Fluorescent nucleotide):是指用于标记不同碱基的四种荧光分子,它们分别对应A、T、C、G四种碱基,并发出不同颜色的光。荧光核苷酸在被DNA聚合酶催化加入到DNA链上时,会释放出荧光信号,并被去除。   激光器(Laser):是指用于激发荧光核苷酸发光的光源,它可以提供单波长、固态、长寿命的激光光束。   CCD相机(CCD camera):是指用于捕捉和记录荧光信号的设备,它可以将荧光信号转换为数字化的电信号,并传输给电脑进行数据分析。  7.3. 主机组成   电泳系统:是指用于将带有荧光核苷酸的四种dNTPs逐一加入到SMRT Cell中,并利用DNA聚合酶将它们连接到环状DNA链上的系统。每次只能加入一个碱基,然后用激光激发荧光信号,并用CCD相机记录每个微孔发出的荧光信号,从而确定碱基序列。   自动进样系统:是指用于将文库片段与DNA聚合酶混合,并注入到SMRT Cell中,并使每个微孔中只有一个DNA聚合酶的系统。然后进行温度变化和化学处理,使文库片段与测序引物结合,并形成环状结构。   激光系统:是指用于激发荧光核苷酸发光的光源,它可以提供单波长、固态、长寿命的激光光束。   光学系统:是指用于捕捉和记录荧光信号的设备,它可以将荧光信号转换为数字化的电信号,并传输给电脑进行数据分析。  8. HeliScope Single Molecule Sequencer  HeliScope Single Molecule Sequencer测序仪是一种基于荧光测序原理的单分子测序平台,它可以直接对DNA进行测序,无需进行PCR扩增或文库构建。  8.1. 相关原理   文库准备:将待测DNA打断成小片段,并在每个小片段(约200bp)的末端加上poly-A尾。   芯片装载:将文库DNA片段与固定在芯片上的poly-T引物进行杂交,并精确定位,使每个微孔中只有一个DNA模板。   边合成边测序:将带有荧光探针和可逆终止子的四种dNTPs逐一加入到芯片中,并利用DNA聚合酶将它们连接到DNA链上。每次只能加入一个碱基对,然后用激光激发荧光信号,并用CCD相机记录每个微孔发出的荧光信号,从而确定碱基对序列。然后用化学剂去除荧光探针和可逆终止子,使下一个碱基对可以继续加入。重复这个过程,直到完成所有的测序循环。   数据分析:将CCD相机收集到的荧光信号转换为原始数据(BCL文件),并进行质量控制和过滤,去除低质量的信号。然后进行碱基识别(Base calling),将荧光信号转换为碱基对序列(FASTQ文件)。最后根据不同的测序目的,进行后续的数据分析,如比对、变异检测、表达量计算等。图源自portorford.info|  8.2. 主要组成   测序仪主机:是一个大型的设备,它可以连接到电脑或服务器,并通过软件进行控制和数据传输。   测序芯片:是一个微型的玻璃芯片,它的表面覆盖了数亿个微孔,每个微孔可以容纳一个DNA模板,并进行单分子测序反应。   荧光探针:是指用于标记不同碱基的四种荧光分子,它们分别对应A、T、C、G四种碱基,并发出不同颜色的光。荧光探针在被DNA聚合酶催化加入到DNA链上时,会释放出荧光信号,并被去除。   激光器:是指用于激发荧光探针发光的光源,它可以提供单波长、固态、长寿命的激光光束。   CCD相机:是指用于捕捉和记录荧光信号的设备,它可以将荧光信号转换为数字化的电信号,并传输给电脑进行数据分析。  二. 测序原理和发展   测序技术的概念和原理:介绍什么是测序技术,它是如何工作的,以及它的主要分类和特点 。   测序技术的发展历史:回顾测序技术的发展过程,从第一代测序技术(如Sanger法)到第二代测序技术(如Illumina法)再到第三代测序技术(如Nanopore法) 。   测序技术的应用领域:介绍测序技术在生命科学中的各种应用,如基因组学、转录组学、表观遗传学、微生物组学、个体化医疗等 。   测序技术的挑战和未来:分析测序技术面临的主要挑战,如数据量、数据质量、数据分析、数据存储、数据共享等 ,以及展望测序技术的未来发展方向和趋势 。  1. 基本概念   读长(read length):读长是指测序得到的DNA片段的长度,一般来说,读长越长,越有利于拼接基因组和发现结构变异。在这方面,三代测序技术(如Nanopore和PacBio)具有明显的优势,它们可以测定长达数十kb甚至Mb级别的读长,而二代测序技术(如Illumina和Roche 454)的读长一般在数百bp到数千bp之间,Helicos的读长则最短,只有25-50bp。   准确度(accuracy):准确度是指测序结果与真实DNA序列的一致性,一般用错误率来衡量。   通量(throughput):通量是指测序平台每次运行可以产生的数据量,一般用Gbp或Tbp来表示。   成本(cost):成本是指进行测序所需的费用,包括仪器、试剂、人工、时间等因素。  2. 技术的选择  “如何选择合适的测序技术”这是一个很重要的问题,因为不同的测序技术有不同的特点和适用范围。一般来说,选择测序技术需要考虑以下几个因素:   测序目的:你想要测定什么样的DNA或RNA?是基因组、转录组、表观遗传组、微生物组还是其他?你想要了解什么样的信息?是序列变异、基因表达、基因调控、基因功能还是其他?   测序需求:你需要多少数据量来达到你的测序目的?你需要多高的准确度和重复性来保证你的测序质量?你需要多长的读长来覆盖你的目标区域?   测序资源:你有多少样品可以进行测序?你的样品质量和数量如何?你有多少时间和预算可以用于测序?  根据这些因素,你可以对比不同的测序技术的优缺点,选择最适合你的测序方案。   如果你想要测定全基因组或全转录组,并且对数据量和成本有较高的要求,那么你可以选择Illumina或Roche 454等二代测序技术,它们可以提供高通量和低成本的测序服务。   如果你想要测定特定的基因或区域,并且对准确度和重复性有较高的要求,那么你可以选择Sanger法等一代测序技术,它们可以提供高准确度和高重复性的测序服务。   如果你想要测定长片段或结构变异,并且对读长和拼接有较高的要求,那么你可以选择Nanopore或PacBio等三代测序技术,它们可以提供超长读长和单分子测序的服务。  3. 概念和原理  测序技术是指获得目的核酸分子(DNA或RNA)碱基排列顺序的技术,它是生命科学研究的基础和核心。测序技术的原理是利用不同的方法对目的核酸分子进行合成、标记、检测和识别,从而确定其碱基序列。  测序技术可以根据其使用的方法和原理分为不同的代数和类型,主要有以下几种:   第一代测序技术:是指最早出现的基于荧光测序原理的测序技术,如Sanger法和Maxam-Gilbert法,它们通过使用特殊的链终止核苷酸或化学降解剂来中断DNA合成反应,并通过凝胶电泳和放射自显影来检测荧光信号,从而确定碱基序列。Sanger法是基于DNA聚合酶在体外DNA复制过程中随机掺入终止链延伸的双脱氧核苷酸(ddNTPs)的原理。这些ddNTPs可以用放射性或荧光标记来检测,从而得到DNA的碱基序列。Sanger法由英国生物化学家弗雷德里克桑格于1977年发明,是第一代DNA测序技术,曾被广泛用于人类基因组计划等大规模的基因组分析。   第二代测序技术:是指基于高通量测序原理的测序技术,如Illumina法、Roche 454法、ABI SOLiD法等,它们通过使用特殊的接头、引物、荧光探针等来对目的核酸分子进行扩增、标记和检测,并通过芯片或微珠等平台来实现大规模并行测序,从而大大提高了测序速度和通量。  o Roche 454技术:这是一种基于焦磷酸测序法的技术,它利用喷雾法将DNA打断成小片段,并在两端加上接头。然后将这些片段结合在微珠上,并在乳液PCR中进行扩增。最后将这些微珠放入一个含有许多小孔的反应板中,每个小孔只容纳一个微珠。在测序过程中,每次加入一种dNTP,并检测每个小孔中是否发生了焦磷酸释放反应,从而确定碱基序列。  o Illumina/Solexa技术:这是一种基于桥式PCR和荧光检测的技术,它也是目前最流行的测序技术之一。它将DNA打断成小片段,并在两端加上接头。然后将这些片段吸附在流动槽(flowcell)的表面,并进行桥式PCR扩增,形成聚集体(cluster)。在测序过程中,每次加入四种带有不同荧光标记的dNTP,并利用激光和相机记录每个聚集体发出的荧光信号,从而确定碱基序列。  o ABI SOLiD技术:这是一种基于连接酶和荧光检测的技术,它与Illumina技术类似,也是将DNA打断成小片段,并在两端加上接头。然后将这些片段结合在微珠上,并在乳液PCR中进行扩增。最后将这些微珠固定在玻璃滑片上,形成聚集体。在测序过程中,每次加入四种带有不同荧光标记的二聚体(如AA,AC,AG,AT等),并利用连接酶将它们连接到模板链上。然后利用激光和相机记录每个聚集体发出的荧光信号,从而确定碱基序列。   第三代测序技术:是指基于单分子实时测序原理的测序技术,可以直接测定单分子的DNA或RNA的测序方法,不需要进行PCR扩增,从而减少错误和偏差,并且可以获得更长的读长(read length)。如Nanopore法、PacBio法、Helicos法等,它们通过使用特殊的微孔、DNA聚合酶、荧光探针等来对单个核酸分子进行直接测序,无需进行扩增或文库构建,并通过电信号或光信号来检测碱基加入的过程,从而获得超长读长和高准确度的碱基序列。  o PacBio公司的单分子实时测序技术(SMRT),它是基于DNA聚合酶在体外DNA复制过程中随机掺入带有荧光标记的dNTPs的原理。这些dNTPs可以用激光和相机检测,从而得到DNA的碱基序列。PacBio的优点是可以测定长达数十kb的读长,以及检测一些碱基修饰情况,如甲基化等。PacBio的缺点是测序错误率较高(约10-15%),主要为随机的插入和缺失错误,但可以通过多次测序和自身校正来提高准确度。  o Oxford Nanopore公司的单分子纳米孔测序技术(Nanopore),它是基于电信号检测原理,当DNA分子穿过纳米孔时会产生电流信号,一般以5个碱基为一组检测电流信号,对电流信号进行解码。Nanopore的优点是可以测定超长的读长,最长可达Mb级别,以及便携性和实时性。Nanopore的缺点是测序错误率也较高(约10-15%),主要为同聚物和串联重复区域的错误,以及反向重复序列对测序质量的影响。  o Helicos公司的真正单分子测序技术(tSMS),它是基于荧光检测原理,将DNA打断成小片段,在每个小片段的末端加上poly-dA,并于玻璃芯片上随机固定多个poly-dT引物。然后逐一加入带有荧光标记和终止子的dNTPs,并利用显微镜记录每个小片段发出的荧光信号,从而确定碱基序列。Helicos的优点是可以避免PCR扩增带来的偏差,以及对样品量和纯度要求低。Helicos的缺点是测序错误率最高(约20-30%),主要为缺失错误,以及同聚物对测序质量的影响。  4. 发展历史  测序技术的发展历史可以追溯到1975年,当时Frederick Sanger提出了链终止法,并用它成功地测定了噬菌体φX174的基因组序列(5375个碱基),这是人类历史上第一个完整的基因组图谱。  1977年,Walter Gilbert提出了链降解法,并用它成功地测定了噬菌体MS2的基因组序列(3569个碱基)。  1980年,Sanger和Gilbert因为在测序技术方面的贡献而共同获得了诺贝尔化学奖。  1986年,Leroy Hood等人发明了第一台自动化荧光测序仪,并用它成功地完成了人类线粒体DNA(16569个碱基)的全长测序。  1990年,人类基因组计划正式启动,目标是在15年内完成人类全基因组(约30亿个碱基)的测定。  1995年,Craig Venter等人利用全基因组随机打断法(Whole Genome Shotgun Method)首次完成了一种自由生活细菌——溶血性链球菌的全基因组测序(180万个碱基)。  1996年,Roche公司收购了454 Life Sciences公司,并开始开发基于焦磷酸测序法(Pyrosequencing)的高通量测序技术。  1998年,ABI公司推出了第一台基于荧光原位合成法(Fluorescence In Situ Sequencing,FISSEQ)的高通量测序仪——ABI 3700 Genetic Analyzer。  2001年,人类基因组计划和Celera Genomics公司分别公布了人类基因组的初步草图,标志着人类基因组计划的完成。  2005年,Solexa公司推出了第一台基于桥式扩增法(Bridge Amplification)和可逆终止法(Reversible Terminator)的高通量测序仪——Solexa 1G Genome Analyzer。  2006年,Illumina公司收购了Solexa公司,并开始开发基于桥式扩增法和可逆终止法的高通量测序技术。  2007年,Roche 454公司推出了第一台基于乳胶珠扩增法(Emulsion PCR)和焦磷酸测序法的高通量测序仪——Roche 454 GS FLX。  2008年,ABI公司推出了第一台基于乳胶珠扩增法和荧光连接法(Ligation Sequencing)的高通量测序仪——ABI SOLiD System。  2009年,Helicos Biosciences公司推出了第一台基于单分子荧光测序法(Single Molecule Fluorescent Sequencing)的单分子测序仪——HeliScope Single Molecule Sequencer。  2010年,Pacific Biosciences公司推出了第一台基于单分子实时测序法(Single Molecule Real-Time Sequencing,SMRT)的单分子测序仪——PacBio RS。  2011年,Ion Torrent公司推出了第一台基于半导体测序法(Semiconductor Sequencing)的高通量测序仪——Ion Torrent PGM。  2012年,Oxford Nanopore Technologies公司推出了第一台基于纳米孔测序法(Nanopore Sequencing)的单分子测序仪——MinION Device。  2015年,BGI公司推出了第一台基于芯片化荧光测序法(Chip-based Fluorescent Sequencing)的高通量测序仪——BGISeq-500。  2017年,10x Genomics公司推出了第一台基于连线染色体构象捕获技术(Linked-Reads Technology)的高通量测序仪——Chromium Genome System。  至此,从第一代到第三代的各种测序技术已经形成了一个多样化、竞争性和互补性的生态系统,为生命科学研究提供了丰富而强大的工具。  2018年到2023年最近5年测序技术的发展:   测序技术的创新和优化:在这段时间内,各种测序技术都在不断地进行创新和优化,以提高测序的速度、准确度、通量、成本效益等方面的性能。例如,Illumina公司推出了NovaSeq系列测序仪,可以实现每天测序6000个人类基因组 PacBio公司推出了Sequel II和Sequel IIe测序仪,可以实现每次测序8Tb的数据和平均读长20kb Oxford Nanopore公司推出了PromethION和GridION测序仪,可以实现每次测序100Tb的数据和平均读长30kb Ion Torrent公司推出了Genexus集成化测序系统,可以实现24小时内完成从样本到报告的全流程 10x Genomics公司推出了Chromium X系列测序仪,可以实现每次测序1.2Tb的数据和平均读长150kb BGI公司推出了DNBSEQ-T7和DNBSEQ-G400测序仪,可以实现每次测序6Tb和400Gb的数据和平均读长100bp。   测序技术的多样化和互补性:在这段时间内,各种测序技术都在不断地扩展其应用范围和领域,以满足不同的研究需求和目标。例如,Illumina公司推出了TruSeq Nano DNA Library Prep Kit,可以实现从低至100ng的DNA样本进行全基因组测序 PacBio公司推出了HiFi Reads技术,可以实现单分子测序的高准确度(99%) Oxford Nanopore公司推出了LamPORE技术,可以实现从RNA直接进行SARS-CoV-2病毒检测 Ion Torrent公司推出了Oncomine Precision Assay,可以实现从肿瘤组织或血液样本进行癌症基因检测 10x Genomics公司推出了Visium Spatial Gene Expression Solution,可以实现从组织切片进行空间转录组测序 华大智造推出DNBelab C系列高通量文库制备试剂盒,自动化文库制备系统,节省人力物力,提高通量,减少操作失误。   测序技术的应用和赋能:在这段时间内,各种测序技术都在不断地应用于各个领域和行业,以促进科学发现和社会进步。例如,在基因组学领域,完成了人类基因组计划第二阶段(HGP-write)的启动、人类细胞图谱计划(Human Cell Atlas)的进展、人类变异图谱计划(Human Variome Project)的更新等重大项目 在转录组学领域,完成了人类脑转录组计划(BRAIN Initiative)的初步结果、人类免疫细胞转录组计划(Human Immunome Project)的部分结果、人类肠道菌群转录组计划(Human Gut Microbiome Project)的部分结果等重要研究 在表观遗传学领域,完成了人类表观组计划(Human Epigenome Project)的部分结果、人类表观组图谱计划(Human Epigenome Atlas)的部分结果、人类表观组变异计划(Human Epigenome Variation Project)的部分结果等关键研究 在微生物组学领域,完成了地球微生物组计划(Earth Microbiome Project)的部分结果、人类口腔微生物组计划(Human Oral Microbiome Project)的部分结果、人类皮肤微生物组计划(Human Skin Microbiome Project)的部分结果等重要研究 在个体化医疗领域,完成了百万人基因组计划(Million Genomes Project)的部分结果、百万人精准医疗计划(Million Precision Medicine Project)的部分结果、百万人癌症基因组计划(Million Cancer Genomes Project)的部分结果等重大项目。  5. 应用领域  o 基因组学:是指研究生物体所有遗传信息及其功能、结构、表达、变异、进化等方面的学科,它依赖于测序技术来获取基因组序列和注释,以及进行基因组比较、基因组变异、基因组编辑等研究。  o 转录组学:是指研究生物体在特定条件下所有转录本的类型、数量、结构、功能和相互作用的学科,它依赖于测序技术来获取转录本序列和表达量,以及进行转录本组装、差异表达分析、可变剪接分析、非编码RNA分析等研究。  o 表观遗传学:是指研究生物体在不改变DNA序列的情况下,通过化学修饰或染色质重塑等方式调控基因表达的学科,它依赖于测序技术来获取DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质可及性等信息,以及进行表观遗传标记分布、表观遗传变异、表观遗传调控等研究。  o 微生物组学:是指研究特定环境或宿主中所有微生物的种类、数量、功能和相互作用的学科,它依赖于测序技术来获取微生物的16S rRNA或全基因组序列,以及进行微生物分类鉴定、微生物群落结构、微生物功能分析等研究。  o 个体化医疗:是指根据个人的基因组、转录组、蛋白质组等信息,为其提供最适合的预防、诊断和治疗方案的医疗模式,它依赖于测序技术来获取个人的遗传变异和表达谱,以及进行个人风险评估、个人药物反应预测、个人靶向治疗选择等应用。  6. 挑战和未来  测序技术虽然已经取得了巨大的进步和成就,但仍然面临着一些挑战和问题,主要包括:   数据量:随着测序技术的发展,测序数据的产生速度远远超过了数据存储和处理的能力,导致数据管理和分析成为一个瓶颈。   数据质量:不同的测序技术有着不同的数据质量特征,如读长、准确度、偏好性等,这些特征会影响数据分析的结果和可靠性。   数据分析:测序数据的分析涉及到多种复杂的算法和工具,如比对、组装、注释、变异检测等,这些算法和工具需要不断地优化和更新,以适应不同的数据类型和需求。   数据存储:测序数据的存储需要占用大量的硬件资源和空间,同时也需要考虑数据的安全性和可访问性。   数据共享:测序数据的共享需要解决数据的标准化、元数据、伦理、法律等方面的问题,同时也需要建立有效的数据交换和利用的机制和平台。  测序技术的未来发展方向和趋势主要包括:   数据集成:通过将不同来源、不同层次、不同类型的测序数据进行整合和融合,以提高数据的信息量和价值。   数据挖掘:通过运用机器学习、人工智能等先进的技术和方法,对测序数据进行深入的分析和挖掘,以发现数据中隐藏的规律和知识。   数据应用:通过将测序数据与其他领域的数据进行关联和对比,以拓展测序数据的应用范围和意义。   数据创新:通过开发新的测序技术和平台,以提高测序数据的质量和效率,以及实现新的测序功能和目标。
  • 电泳冷水机的间接冷却方式
    电泳冷水机是对于电泳涂装、电镀生产线、阳极氧化等都是针对于电镀槽里面的电镀溶液来冷却。电泳冷水机冷却方式有两种,直接冷却与间接冷却。下面讲解下电泳冷水机间接冷却的制冷原理:冷却塔底盆里的水通过水泵输送到冷水机的冷凝器,对冷水机的冷凝器进行降温。再流回冷却塔内喷淋而下时通过冷却塔顶上的风扇对水进行了降温,再流回冷却塔底盆,就这样周而复始的运行。冷水机的冷凝器散热同时里面的冷媒液化,再流入水箱内的蒸发器进行蒸发,而蒸发时要吸收热量,从而就对水箱里的水进行了降温,降温后的水通过水泵输送到热交换器(中间隔开,一边水,一边硫酸,),再通过热传递的过程就对硫酸进行了降温,就这样一个循环过程。田枫冷水机的优势在于安装方便,使用寿命相对比直接冷冻的长,酸碱不易腐蚀冷水机。这种冷水机一般换热器为板换的密闭的。 文章原创:上海田枫实业有限公司 www.tfsye.com上海田枫实业有限公司,专业生产各类制冷设备,包括层析冷柜,冻干机,冷水机,超低温冰箱,恒温槽等,一流的专业,一流的服务,上海田枫是您的最佳选择!
  • 测序技术简史(二)| 爆发式的进步
    p  前面,我们谈到了测序技术经历发展的前两个阶段。双螺旋的发现,让测序成为可能,历经了从“前直读”到“直读”,从手工到自动化的飞跃。本期,我们将带您了解测序技术发展的另外两个阶段,回顾测序技术如何因原理的改变迎来爆发式的突破与增长。/pp span style="color: rgb(255, 0, 0) "strong 阶段3:从“平板”到“毛细管”/strong/span/pp  的确,strong平板凝胶电泳技术/strong在历史上的功绩是十分卓著的。然而,受限于技术原理,在“人类基因组计划”后期已经没有更多的发展改进空间,正如今天的晶体管小型化技术也有无法逾越的物理学限制。/pp  就在此时,strong毛细管电泳技术横空出世/strong。在测序领域,毛细管电泳测序法替代平板电泳测序法是一场真正意义的技术革命,可与汽车替代马车相提并论。直接效果是显而易见的:原本工作进度严重落后的人类基因组计划再度发力,以极快的速度和较高的质量提前两年宣告完成。/pp  strong毛细管电泳测序仪实现了SBS直读式测序技术的规模化、高通量化和全自动化(不再需要人工制胶)。/strong但正如汽车刚出现时,在速度、装载量、灵活性等各方面与马车表现出的差距,ABI公司在上世纪90年代推出第一代自动毛细管测序仪ABI 310时,不但通量没有明显提高,精度低,更在评价测序仪的关键指标“读长”方面,与成熟的平板电泳测序仪有较大差距。因此,尽管有部分人认可毛细管电泳技术的应用前景,但当时似乎看不到在短时间内大幅改进的希望,因此并不被普遍看好。不过,正如许多新生事物一样,尽管毛细管电泳技术在初期有着各种明显缺陷和严重问题,却代表了未来相当长时间内测序仪开发的正确技术方向。/pp  1998年,ABI公司推出ABI3700毛细管电泳测序仪,在读长和准确率等指标上追平了成熟的平板电泳测序仪。最重要的是,它的测序通量提高了数倍,并且克服了平板电泳无法依赖大量手工程序的缺陷,实现了从上样、数据收集到质检、初步分析的全面自动化。从此,一个人可以同时管理十几台运转中的测序仪,只需定时更换DNA模板和毛细管即可。/pp style="text-align: center"img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201909/uepic/610d4a25-4dba-4da4-935e-52d0977e6a00.jpg" title="ABI3700.jpg" alt="ABI3700.jpg"//pp style="text-align: center "span style="font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai "ABI3700/spanbr//pp  作为生命科学研究的核心工具,基因测序仪价格极为昂贵且发展日新月异。因此,对于测序仪技术方向的选择直接决定了一个现代基因组研究中心未来的命运。/pp  20年前,财力雄厚的日本开始大力投入资金,进行测序中心建设。他们选择了当时在读长、精确度等关键参数远超毛细管测序仪的平板测序仪。更具吸引力的是,平板测序仪使用人工灌胶,运行成本还很低,因此选择平板测序仪似乎顺理成章。当时,中国在基因组学方面的研究刚刚起步,经济上十分拮据,但却选择了读长及精确度都较低、价格极为昂贵,但通量提升方面具有很大潜力的毛细管测序仪,并将有限的经费全部投入。中国测序中心领导者的思路是以“大规模效应”省钱,以“高通量”赢得时间,这个策略后来被历史证明极为正确。日本研究中心大量的平板测序仪则很快被淘汰,连机器用的试剂都无法得到持续供应,从此一蹶不振。/pp  strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "阶段4:从初步规模化到大规模并行高通量测序/span/strong/pp  毛细管电泳测序仪实现了DNA测序的高通量和自动化,标志着研究生命体完整基因的基因组时代的到来,为人类基因组计划做出了历史性的贡献。然而,strong到2003年,毛细管电泳测序技术却差不多走到了极限。/strong/pp  如果说平板电泳测序技术的最大问题是无法实现自动化和规模化,那么毛细管电泳测序技术在实现这两点的基础上也存在重大的缺陷。不可避免地,这种技术要遵循“一个样本、一个反应、一条泳道”的规则,每个样本的文库和模板都要单独制备,过程费时费力、成本高、错误率高、成功率低。如果这些步骤实现自动化,那么为节约昂贵的反应试剂,又需要逐个模板进行质控检查,严重阻碍了效率提升。/pp style="text-align: center"img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201909/uepic/3c4e331d-3738-4272-b5ff-9bebdd50c388.jpg" title="毛细管电泳法测序工具.jpg" alt="毛细管电泳法测序工具.jpg"//pp style="text-align: center "span style="font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai "毛细管电泳法测序工具/spanbr//pp  毛细管电泳测序仪的局限还在于:若想进一步提高通量,只能在物理上把毛细管做的更细、并增加毛细管泳道的数量,原理与在芯片上集成晶体管类似。2003年,有测序仪生产公司做过这方面的尝试,将主流毛细管测序仪的毛细管泳道从96道提高到384道,但这个尝试未能如愿。毛细管电泳测序仪走到了末代的平板电泳测序仪依靠物理方法提高测序通量的阶段,证明这种技术已经没有再提升的空间了。/pp  不可否认,毛细管电泳测序技术将一个人的全基因组测序成本从平板电泳时代的数十亿美元降低到3000万美元,实现了技术上的重大飞跃,但这个测序成本仍然十分昂贵,远不能满足基因组学发展的需要。时代呼唤新的测序技术。在这个背景下,大规模并行高通量测序技术(MPH:Massively Parallel High-throughput)问世,是测序技术发展史上影响极为深远的一场革命,因此也被称为下一代测序技术(NGS:Next-Generation Sequencing)。/pp  strong2005年12月,第一台代表大规模并行高通量测序技术的测序仪454 GS20,由美国Life Science公司开发成功,性能十分优异/strong。2006年,Life公司宣布使用454测序仪为DNA双螺旋结构的发现者詹姆斯· 沃森完成了全基因组测序,费用约为200万美元。454采用了基于SBS法基本原理的焦磷酸测序技术,这种新型的酶联级联测序技术,适于对已知的短序列的测序分析,其可重复性和精确性能与Sanger DNA测序法相媲美,而速度却大大的提高。通过检测反应中的焦磷酸信号判断DNA序列,并不直接读取DNA中的碱基。运用类似原理的还有使用半导体原件检测测序反应中氢离子浓度的半导体测序技术。/pp style="text-align: center"img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201909/uepic/e111e4e5-37b9-4d0d-b78c-99d4a5dcc4f0.jpg" title="Life Science 454.jpg" alt="Life Science 454.jpg"//pp style="text-align: center "span style="font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai "Life Science 454/spanbr//pp  大规模并行高通量测序技术(MPH)实现原理有多种,但都有两个共同特点:/pp  strong一是“裸、密”并行,摒弃了“一个模板、一个泳道”,以芯片实现了大规模、多模板并行测序。/strong一张芯片可以集成数亿个模板的高密度分子簇(cluster),每一个分子簇为一个裸露的测序反应,测序通量提升了几个数量级。从样本制备的角度看,更是一场革命:以往毛细管电泳时代“一个样本、万个克隆、万个制备、万个质控”的样本制备形式一去不复返。/pp  strong二是测序通量的提高以牺牲“读长”为代价。/strong相比成熟毛细管电泳测序仪600nt的读长,大规模并行高通量测序仪刚问世时读长仅为100nt,读长短板主要靠生物信息软件算法来弥补,对生物信息处理能力提出了更高的要求。/pp  在大规模并行高通量测序技术中,最早实用化的焦磷酸测序和半导体测序都是基于SBS法(Sanger法),此后出现了对SBS法进行革命性改进的新一代SBS法,其中最具代表性的是美国Illumina公司的循环SBS法(cycle SBS,也称为可逆终止法SBRT:Sequencing By Reversible Termination)和华大智造(MGI)的环化单链DNA+DNA纳米球测序法(cssDNA+DNB:circle single-strand DNA+DNA Nano-Ball),是当前最先进的实用化大规模并行高通量测序技术。/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 282px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201909/uepic/64aedc9d-da76-42fa-ac88-7ca243012c4a.jpg" title="华大智造.jpg" alt="华大智造.jpg" width="600" height="282" border="0" vspace="0"//pp style="text-indent: 2em "a href="https://www.instrument.com.cn/news/20190829/492192.shtml" target="_self" style="color: rgb(255, 0, 0) text-decoration: underline "strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "前情回顾测序技术简史(一) | 从发现双螺旋开始/span/strongstrongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "/span/strong/a/p
  • 探“中国红”国产Sanger测序仪和它背后的故事——“创新100”访德诺杰亿创始人、董事长兼总经理曹健荣
    1975年,英国生物化学家Frederick Sange发明了双脱氧链终止法,也就是一代测序技术,又称为Sanger测序技术。因读长较长、准确率高达99.999%,Sanger测序一直是基因测序的金标准。自从下一代测序技术(NGS)问世以来,更多科技企业倾向于发展通量更高的二代测序仪,在高通量测序仪市场一片百花争春的热闹场景面前,一代测序仪的市场显得有些冷清。中国基因测序仪市场长期被进口品牌所垄断,而相较于高通量测序仪市场,一代测序仪的市场进口垄断之势更为严峻,目前进口的Sanger测序仪占据国内市场90%以上的份额。作为一个涉及国家生物安全的敏感行业,一代测序仪的国产替代显得尤为紧迫。近几年,一些国产一代测序仪企业快速发展起来,并推出具有自主知识产权的Sanger测序仪,德诺杰亿(北京)生物科技有限公司(以下简称“德诺杰亿”)就是这其中的优秀代表。近期,仪器信息网“创新100”项目组走进德诺杰亿,了解企业技术和产品的发展,并与公司创始人、董事长兼总经理曹健荣就公司定位、发展规划和创新企业难点等话题进行了深入交流。曹健荣 德诺杰亿创始人、董事长兼总经理明确定位:做金标准技术德诺杰亿成立于2013年,2016年获国家高新技术企业认定并正式开始运营。八年来,德诺杰亿一步一个脚印,取得硕果累累。公司扎根底层技术研发,获得了90余项专利,成为国家专利试点单位和国家知识产权优势示范企业;近两年,先后获得北京市专精特新中小企业称号、北京市“瞪羚企业”认定、科创中国榜单新锐企业等诸多荣誉。德诺杰亿现已构建基因分析、样本前处理与荧光原位杂交(FISH)三大技术平台,并成功完成两轮融资。企业规模持续壮大,现拥有超过110名员工,实验室总面积超过1万平米。德诺杰亿部分专利展示在德诺杰亿创立之初,正值NGS发展势头最为迅猛之时,问及为什么不跟随热点去发展高通量测序技术,曹健荣这样回答:”我们首先要避开风口,作为一家民营企业,如果不想跟风,就要回归本质,把市场痛点落到实处,扎根在技术和应用的创新上。一代测序技术是测序行业乃至分子检测行业的金标准技术,金标准技术意味着生命周期长,受政策干扰小的特点。此外,这么多年以来国内很少有人做一代测序,事情总要有人做。”双方交流在创立德诺杰亿之前,曹健荣有着二十余年的体外诊断行业从业经历。在体外诊断试剂的方法学中,如PCR、酶联免疫、快检条等都很熟悉,唯独没有接触过FISH技术,而此次创业在Sanger测序平台之外却又偏偏选择同步发展FISH平台。在许多疾病的病理检测中,FISH也被冠以“金标准”的称号,这也表明曹健荣在选择赛道时理念始终如一。事实上,同步发展FISH平台也是曹健荣为企业发展上的“双保险”。她坦言“当时的想法是万一设备失败了,起码诊断试剂拿到批文可以上市销售,活着比什么都重要。”目前,德诺杰亿基于FISH平台用于实体瘤和血液瘤检测的HER2、TOP2A、TERC、ERG、TMPRSS2、ETV1、ETV4基因异常、膀胱癌细胞染色体及基因异常、慢性淋巴细胞白血病染色体及基因异常、骨髓增生异常综合征染色体及基因异常等一大批检测试剂盒以及多种探针等已经获得三类医疗器械注册证和一类医疗器械产品备案证。形成Sanger测序仪产品矩阵 多个应用场景临床当先作为公司的旗舰产品,德诺杰亿已经形成Sanger测序仪产品矩阵,其中重磅产品医疗版单通道、四通道、八通道的U3600/U4000/U8000系列测序仪,已于2023年获得第二类医疗器械产品注册证,自此德诺杰亿跨入少数拥有自主知识产权和医疗器械注册证的Sanger测序仪头部企业行列。此外德诺杰亿还推出了法医版U2000π型法医遗传分析仪和科研版U3600α和U4000αSanger测序仪等产品。车间里一抹靓丽的“中国红”德诺杰亿Sanger测序仪(仪器外观为“中国红”主体配色,开放式平台,市面上大部分商业化试剂盒均可使用。独特设计:U盒一体化耗材设计,集成毛细管、凝胶、阳极缓冲液于一个U盒当中,减少了用户的操作,节约了时间;同时凝胶低温保存系统延长凝胶的寿命,减少耗材浪费。)此外,德诺杰亿还发展了样品前处理产品线,并先后推出产品LunAmple-X16/LunAmple-Dancer全自动核酸提取纯化仪等产品,从而形成了基因分析全流程的解决方案。LunAmple-X16全自动核酸提取纯化仪和LunAmple-Dancer全自动核酸提取纯化仪(独特温控设计模块获发明专利)对于基因测序仪,许多人存在一个误区:认为二代、三代比一代好。事实上,测序技术的“代际”划分不同于手机、电脑等电子产品的代际差别,基因测序的代际区别是技术类型的不同,各类测序技术各有特点,在应用过程中又可以相互补充。一代测序技术有其独具优势的应用场景,德诺杰亿Sanger测序仪的主要应用场景包括医疗临床、公安司法、农业畜牧、食品安全和生物国防等。具体到临床端,根据《全国医疗服务项目技术规范(2023版)》,涉及一代基因测序和电泳医疗服务项目就有59项,包括遗传生育、血液病、感染病、药物代谢、肿瘤伴随等精准诊断。临床医疗是德诺杰亿Sanger测序仪最早切入也是目前拓展最好的应用领域,许多应用场景下,如在单基因或者特定明确的基因导致的遗传疾病检测时,Sanger测序仪在成本和准确率上更有优势,而且后续不需要复杂的生物信息分析,医生可以直接看到结果,更适合医院直接使用。在公安司法领域,身份识别、亲子鉴定、法医DNA比对等检测则是以Sanger测序仪为主要工具。德诺杰亿法医版U2000π型法医遗传分析仪于2021年获得相关司法检验认可,具备了在该系统使用的资质。在农业育种领域,Sanger测序平台是不可或缺的设备。在《“十四五”生物经济发展规划》、2022年中央一号文件等多个政策中,都明确了生物育种的重要性,在该领域,德诺杰亿也早有布局,比如在对国内育种领域占有重要地位的三亚崖州湾科技城与华大合作有种子测序实验室,为来自全国各地的分子育种科学家提供一代测序服务和技术支撑。扎根底层技术 造就未来产品可能 基因测序是一类高壁垒的技术,德诺杰亿能够拿到90多项知识产权绝非易事,这主要归因于公司对底层技术创新的重视和坚持。基因测序技术涉及众多学科交叉,包括光学、机械、电子、流体、化学、物理学、分子生物学以及信息软件等。德诺杰亿自创立之初,秉持着“交叉、融合、创新”的理念,并明确将知识产权作为公司的核心定位,为确保技术定位的准确性,公司在创业初期便进行了全球知识产权的筛查。为汇聚各类技术人才,德诺杰亿在美国设立研发实验室,吸引来自世界各地的技术精英,包括微流控芯片技术专家、软件开发技术专家等,技术交叉使我们积累了大量的问题解决能力和基础实力。经过坚持不懈地研发投入,如今,德诺杰亿已搭建了属于自己的底层技术堡垒,为公司未来的产品拓展奠定了坚实的基础。不得不说,扎根底层技术充分体现了曹健荣的深谋远虑和长远眼光。谈到未来产品规划,曹健荣表示,在技术和产品方面,德诺杰亿的短期目标是研制出更多通道的Sanger测序仪,适用于更多地应用场景。长期目标是提取、扩增、结果分析的一体机,让精准检测下沉到区县一级。国产创新仪器企业之困囿:低价竞争,劣币驱逐良币如今,德诺杰亿的产品得到了行业顶流专家的认可。但是,想要进入广大用户的实验室还存在诸多困难。市场存在的认知偏见就是国外设备比质量、国内设备比价格,唯低价者中标,劣币驱逐良币,品牌价值与创新的力量葬送在混乱的价格战中。在与国产创新仪器企业的交流中了解到,对于他们而言,用户只认进口、不认国产的固有认知一直排在企业发展困难榜的前列。许多国外主流仪器企业已经走过数十甚至上百年的历史,自然在这漫长的过程中积累了强大的技术优势。殊不知,在很多领域,国产自主研发的仪器也已经完全能够满足用户需求,在价格、售后方面甚至更有优势。在做好产品之外,改变用户认知已经成为国产创新仪器企业发展的关键一步。此外,政策对创新的支持也是企业立足和发展的重要一环。拿药品举例,在国外创新药是可以在一定时期内高于仿制药的30%的价格销售,而企业又可以用这一部分资金持续研发投入到新产品的研发中去,长期的积累最终形成一个良性循环。曹健荣认为,在某些方面我们是可以学习并借鉴的。双方合影(从左二至右: 德诺杰亿模块总工程师钱宇,德诺杰亿创始人、董事长曹健荣, 仪器信息网生命科学编辑李兆坤,仪器信息网“创新100”项目负责人韦东裕,仪器信息网营销服务中心邬铭星)后记:创业者故事走访过程中,曹健荣女士聊起了自己的职业经历。大学毕业后被分到北京市科委工作,原本捧着“铁饭碗”的曹健荣在一次涉外项目后离开原单位,开始了第一次创业并正式进入体外诊断行业,从艾滋病检测做起,发展出100多个体外诊断产品,后上市后退出;第二次创业,响应北京市政府号召,做了一家平台型公司,后被并购;这之后,在一次与朋友聊天中,大家一致认为大健康是未来的朝阳产业,出于没有做过设备的不甘,曹健荣再一次挑战自己毅然开启了第三次创业。她想,这个年纪再创业,一定要找到这个行业的痛点、难点和堵点做一些有价值的事情及有价值的产品。如今,曹健荣精力依旧十分饱满,她将自己的工作经验、人生智慧和职业精神融入到新的企业发展中,希望每一个在这里工作的人都能够有工作之外的成长与收获。她说:“按部就班的只是工作,思考与挑战才可以迭代自我。”从她的三次创业中经历可以看到,她是一个敏锐、擅思考又有魄力的创业者和企业家,不断挑战也不忘初心,值得学习。附:“创新100”介绍  秉承“国产科学仪器腾飞行动”宗旨,仪器信息网于2018年启动“国产科学仪器腾飞行动”之“创新100”项目,通过筛选一批具备自主创新能力的中小仪器厂商,借助报道、走访、调研等方式,在企业发展的关键时期“帮一把”。 项目自启动以来,已收到超过300家企业的踊跃申请,通过输出公益性的宣传报道,组织企业研学、参观交流、主题讨论等各类资源对接活动,得到广大科学仪器企业与用户单位的高度关注与一致好评,现已成为中国科学仪器市场颇具影响力的特色活动,对于提升国产仪器品牌影响力,为行业筛选优质仪器企业贡献重要力量。为延续“国产科学仪器腾飞行动”精神,筛选和服务更多国产科学仪器潜力企业,“创新100”将于2024年继续进行,为国产仪器企业输送更多公益资源。  诚邀具备实力、符合条件的创新企业扫码申报“创新100”。  报名通道及活动专题:https://www.instrument.com.cn/zt/chuangxin100-2021
  • 北京市医疗器械检验研究院559.00万元采购离心机,电泳仪,毛细管电泳仪,PCR,大分子作用仪,样品...
    详细信息 [公开]新型冠状病毒核酸检测试剂设备公开招标公告 北京市-通州区 状态:公告 更新时间: 2023-03-23 [公开]新型冠状病毒核酸检测试剂设备公开招标公告 2023-03-23 项目概况 新型冠状病毒核酸检测试剂设备 招标项目的潜在投标人应在北京市政府采购电子交易平台获取招标文件,并于2023-04-13 09:30(北京时间)前递交投标文件。 一、项目基本情况 项目编号:11000022210200032728-XM001 项目名称:新型冠状病毒核酸检测试剂设备 预算金额:559 万元(人民币) 最高限价:559 万元(人民币) 采购需求: 包号 标的名称 是否接受进口产品 涉及进口设备是否须提供制造厂家授权书 采购分包预算金额(万元) 数量 简要技术需求或服务要求 1 多功能冷冻离心机 接受 是 25 1台 1)最大容量:4 x 1000 mL,68×5ml,68×15 mL, 36 × 50 mL;2)最大相对离心力:22,000 x g (14,000 rpm);3)温控范围:-11 ℃ to 40 ℃; 2 全自动基因分析仪 接受 是 150 1台 新型8道全自动毛细管电泳系统,可根据需要方便的升级至24通道 3 高通量测序仪 接受 是 220 1台 高数据通量:每次运行至少可生成可读2500万个片段标签序列,可生成150亿(15G)碱基数据 4 宏基因组分析数据库 不接受 否 40 1套 Web界面,按钮式操作,易用性强,无需掌握Linux命令和编程语言,上手快,门槛低。并配ZLIMS实验室信息管理系统,从样本制备到分析报告,端到端的全流程解决方案。 5 自动聚焦声波基因组剪切仪 接受 是 38 1台 1)超声波传感器频率:≥400k Hz,噪音低;2)超声波波长:≤ 5 mm,处于处理生物大分子的理想波长范围内;3)超声能量可调:可设置的超声能量≥6档,以满足不同样品处理需求 6 荧光定量CR仪 接受 是 86 2台 至少能同时检测FAM、VIC、TAMRA、ROX四种荧光染料的信号 合同履行期限:第一包:冷冻离心机:签订合同后3个月内运至采购方指定地点。 第二包:全自动基因分析仪:签订合同后2个月内运至采购方指定地点。 第三包:通量测序仪:合同签订后90个工作日内运至采购方指定地点。 第四包:宏基因组分析数据库:合同签订后60个工作日内运至采购方指定地点。 第五包:自动聚焦声波基因组剪切仪:合同签订后60个工作日内运至采购方指定地点。 第六包:荧光定量PCR仪:签订合同后7个工作日内运至采购方指定地点。 本项目不接受联合体投标。 二、申请人的资格要求: 1.满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定; 2.落实政府采购政策需满足的资格要求: 2.1 中小企业政策 ◆本项目第1/2/3/4/5/6包不专门面向中小企业预留采购份额。 □本项目专门面向 □中小 □小微企业 采购。即:提供的货物全部由符合政策要求的中小/小微企业制造、服务全部由符合政策要求的中小/小微企业承接。 □本项目预留部分采购项目预算专门面向中小企业采购。对于预留份额,提供的货物由符合政策要求的中小企业制造、服务由符合政策要求的中小企业承接。预留份额通过以下措施进行:__________________。 2.2 其它落实政府采购政策的资格要求(如有): / 3.本项目的特定资格要求: 3.1本项目是否接受分支机构参与投标:□是 ◆否;(仅当项目涉及银行、保险、石油石化、电力、电信等行业有特殊情况的,可以接受分支机构参与) 3.2本项目是否属于政府购买服务: ◆否 □是,公益一类事业单位、使用事业编制且由财政拨款保障的群团组织,不得作为承接主体; 3.3其他特定资格要求:第6包的投标人须具备《医疗器械经营许可证》;涉及医疗器械产品(荧光定量CR仪)须提供《中华人民共和国医疗器械注册证》。 三、获取招标文件 时间:2023-03-23 至 2023-03-30 ,每天上午09:00至11:30,下午13:00至17:00(北京时间,法定节假日除外) 地点:北京市政府采购电子交易平台 方式: 供应商持CA数字认证证书登录北京市政府采购电子交易平台(http://zbcg-bjzc.zhongcy.com/bjczj-portal-site/index.html#/home)获取电子版招标文件。 售价:¥0 元,本公告包含的招标文件售价总和 四、提交投标文件截止时间、开标时间和地点 2023-04-13 09:30(北京时间) 地点:北京国际招标有限公司501会议室(北京市东城区朝阳门北小街71号) 五、公告期限 自本公告发布之日起5个工作日。 六、其他补充事宜 1.本项目需要落实的政府采购政策:《中华人民共和国政府采购法》、《中华人民共和国政府采购法实施条例》、《关于政府采购进口产品管理有关问题的通知》(财办库﹝2008﹞248 号)、《国务院办公厅关于建立政府强制采购节能产品制度的通知》(国办发【2007】51号)、《财政部环保总局关于环境标志产品政府采购实施的意见》(财库〔2006〕90号)、《政府采购促进中小企业发展管理办法》(财库〔2020〕46号)、《关于政府采购支持监狱企业发展有关问题的通知》(财库 [2014]68 号)、《关于促进残疾人就业政府采购政策的通知》(财库【2017】141号)《关于进一步加大政府采购支持中小企业力度的通知》 财库〔2022〕19号《财政部关于在政府采购活动中落实平等对待内外资企业有关政策的通知》及其它相关法律法规。 2. 本项目采用电子化与线下流程结合招标方式,相关操作如下: 2.1办理CA认证证书(北京一证通数字证书),详见北京市政府采购电子交易平台(http://zbcg-bjzc.zhongcy.com/bjczj-portal-site/index.html#/home)查阅“用户指南” 一 “操作指南”一 “市场主体CA办理操作流程指引”,按照程序要求办理。 2.2于北京市政府采购电子交易平台“用户指南”一“操作指南”一“市场主体注册入库操作流程指引”进行自助注册绑定。 2.3招标文件获取方式:供应商按照规定办理CA数字认证证书(北京一证通数字证书)后,自招标公告发布之日起持供应商自身数字证书登录北京市政府采购电子交易平台免费获取电子版招标文件。 2.4未按上述获取方式和期限下载招标文件的投标无效。 2.5证书驱动下载: 2.5.1于北京市政府采购电子交易平台“用户指南”一“工具下载”一 “招标采购系统文件驱动安装包”下载相关驱动。 2.5.2 CA认证证书服务热线010-58511086 2.5.3技术支持服务热线010-86483801 注意:请供应商认真学习北京市政府采购电子交易平台发布的相关操作手册。 七、对本次招标提出询问,请按以下方式联系。 1.采购人信息 名 称:北京市医疗器械检验研究院(北京市医用生物防护装备检验研究中心) 地址:北京市通州区兴光二街7号 联系方式:姜涛,010-57901528 2.采购代理机构信息 名 称:北京国际招标有限公司 地 址:北京市东城区朝阳门北小街71号 联系方式:王筱娜、唐蕊,010-64063443 3.项目联系方式 项目联系人:王筱娜、唐蕊 电 话: 010-64063443 × 扫码打开掌上仪信通App 查看联系方式 基本信息 关键内容:离心机,电泳仪,毛细管电泳仪,PCR,大分子作用仪,样品前处理 开标时间:2023-04-13 09:30 预算金额:559.00万元 采购单位:北京市医疗器械检验研究院 采购联系人:点击查看 采购联系方式:点击查看 招标代理机构:北京国际招标有限公司 代理联系人:点击查看 代理联系方式:点击查看 详细信息 [公开]新型冠状病毒核酸检测试剂设备公开招标公告 北京市-通州区 状态:公告 更新时间: 2023-03-23 [公开]新型冠状病毒核酸检测试剂设备公开招标公告 2023-03-23 项目概况 新型冠状病毒核酸检测试剂设备 招标项目的潜在投标人应在北京市政府采购电子交易平台获取招标文件,并于2023-04-13 09:30(北京时间)前递交投标文件。 一、项目基本情况 项目编号:11000022210200032728-XM001 项目名称:新型冠状病毒核酸检测试剂设备 预算金额:559 万元(人民币) 最高限价:559 万元(人民币) 采购需求: 包号 标的名称 是否接受进口产品 涉及进口设备是否须提供制造厂家授权书 采购分包预算金额(万元) 数量 简要技术需求或服务要求 1 多功能冷冻离心机 接受 是 25 1台 1)最大容量:4 x 1000 mL,68×5ml,68×15 mL, 36 × 50 mL;2)最大相对离心力:22,000 x g (14,000 rpm);3)温控范围:-11 ℃ to 40 ℃; 2 全自动基因分析仪 接受 是 150 1台 新型8道全自动毛细管电泳系统,可根据需要方便的升级至24通道 3 高通量测序仪 接受 是 220 1台 高数据通量:每次运行至少可生成可读2500万个片段标签序列,可生成150亿(15G)碱基数据 4 宏基因组分析数据库 不接受 否 40 1套 Web界面,按钮式操作,易用性强,无需掌握Linux命令和编程语言,上手快,门槛低。并配ZLIMS实验室信息管理系统,从样本制备到分析报告,端到端的全流程解决方案。 5 自动聚焦声波基因组剪切仪 接受 是 38 1台 1)超声波传感器频率:≥400k Hz,噪音低;2)超声波波长:≤ 5 mm,处于处理生物大分子的理想波长范围内;3)超声能量可调:可设置的超声能量≥6档,以满足不同样品处理需求 6 荧光定量CR仪 接受 是 86 2台 至少能同时检测FAM、VIC、TAMRA、ROX四种荧光染料的信号 合同履行期限:第一包:冷冻离心机:签订合同后3个月内运至采购方指定地点。 第二包:全自动基因分析仪:签订合同后2个月内运至采购方指定地点。 第三包:通量测序仪:合同签订后90个工作日内运至采购方指定地点。 第四包:宏基因组分析数据库:合同签订后60个工作日内运至采购方指定地点。 第五包:自动聚焦声波基因组剪切仪:合同签订后60个工作日内运至采购方指定地点。 第六包:荧光定量PCR仪:签订合同后7个工作日内运至采购方指定地点。 本项目不接受联合体投标。 二、申请人的资格要求: 1.满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定; 2.落实政府采购政策需满足的资格要求: 2.1 中小企业政策 ◆本项目第1/2/3/4/5/6包不专门面向中小企业预留采购份额。 □本项目专门面向 □中小 □小微企业 采购。即:提供的货物全部由符合政策要求的中小/小微企业制造、服务全部由符合政策要求的中小/小微企业承接。 □本项目预留部分采购项目预算专门面向中小企业采购。对于预留份额,提供的货物由符合政策要求的中小企业制造、服务由符合政策要求的中小企业承接。预留份额通过以下措施进行:__________________。 2.2 其它落实政府采购政策的资格要求(如有): / 3.本项目的特定资格要求: 3.1本项目是否接受分支机构参与投标:□是 ◆否;(仅当项目涉及银行、保险、石油石化、电力、电信等行业有特殊情况的,可以接受分支机构参与) 3.2本项目是否属于政府购买服务: ◆否 □是,公益一类事业单位、使用事业编制且由财政拨款保障的群团组织,不得作为承接主体; 3.3其他特定资格要求:第6包的投标人须具备《医疗器械经营许可证》;涉及医疗器械产品(荧光定量CR仪)须提供《中华人民共和国医疗器械注册证》。 三、获取招标文件 时间:2023-03-23 至 2023-03-30 ,每天上午09:00至11:30,下午13:00至17:00(北京时间,法定节假日除外) 地点:北京市政府采购电子交易平台 方式: 供应商持CA数字认证证书登录北京市政府采购电子交易平台(http://zbcg-bjzc.zhongcy.com/bjczj-portal-site/index.html#/home)获取电子版招标文件。 售价:¥0 元,本公告包含的招标文件售价总和 四、提交投标文件截止时间、开标时间和地点 2023-04-13 09:30(北京时间) 地点:北京国际招标有限公司501会议室(北京市东城区朝阳门北小街71号) 五、公告期限 自本公告发布之日起5个工作日。 六、其他补充事宜 1.本项目需要落实的政府采购政策:《中华人民共和国政府采购法》、《中华人民共和国政府采购法实施条例》、《关于政府采购进口产品管理有关问题的通知》(财办库﹝2008﹞248 号)、《国务院办公厅关于建立政府强制采购节能产品制度的通知》(国办发【2007】51号)、《财政部环保总局关于环境标志产品政府采购实施的意见》(财库〔2006〕90号)、《政府采购促进中小企业发展管理办法》(财库〔2020〕46号)、《关于政府采购支持监狱企业发展有关问题的通知》(财库 [2014]68 号)、《关于促进残疾人就业政府采购政策的通知》(财库【2017】141号)《关于进一步加大政府采购支持中小企业力度的通知》 财库〔2022〕19号《财政部关于在政府采购活动中落实平等对待内外资企业有关政策的通知》及其它相关法律法规。 2. 本项目采用电子化与线下流程结合招标方式,相关操作如下: 2.1办理CA认证证书(北京一证通数字证书),详见北京市政府采购电子交易平台(http://zbcg-bjzc.zhongcy.com/bjczj-portal-site/index.html#/home)查阅“用户指南” 一 “操作指南”一 “市场主体CA办理操作流程指引”,按照程序要求办理。 2.2于北京市政府采购电子交易平台“用户指南”一“操作指南”一“市场主体注册入库操作流程指引”进行自助注册绑定。 2.3招标文件获取方式:供应商按照规定办理CA数字认证证书(北京一证通数字证书)后,自招标公告发布之日起持供应商自身数字证书登录北京市政府采购电子交易平台免费获取电子版招标文件。 2.4未按上述获取方式和期限下载招标文件的投标无效。 2.5证书驱动下载: 2.5.1于北京市政府采购电子交易平台“用户指南”一“工具下载”一 “招标采购系统文件驱动安装包”下载相关驱动。 2.5.2 CA认证证书服务热线010-58511086 2.5.3技术支持服务热线010-86483801 注意:请供应商认真学习北京市政府采购电子交易平台发布的相关操作手册。 七、对本次招标提出询问,请按以下方式联系。 1.采购人信息 名 称:北京市医疗器械检验研究院(北京市医用生物防护装备检验研究中心) 地址:北京市通州区兴光二街7号 联系方式:姜涛,010-57901528 2.采购代理机构信息 名 称:北京国际招标有限公司 地 址:北京市东城区朝阳门北小街71号 联系方式:王筱娜、唐蕊,010-64063443 3.项目联系方式 项目联系人:王筱娜、唐蕊 电 话: 010-64063443
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