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全基因组关联分析

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全基因组关联分析相关的仪器

  • 日立DS3000紧凑型基因分析仪 上世纪90年代初,三大科学计划之一的 “人类基因组计划”启动,并于2001年完成了人类基因组草图,而这一伟大工程,正是基于“Sanger法”的DNA测序技术。 随着科学技术的不断发展,一代测序受检测效率的限制,无法应对大量基因组测序的需要,因此二代测序、三代测序技术,甚至四代高通量测序技术不断涌现。但一代测序因其极高的准确率,直到今天仍然在科研、法医、疾控、食药及临床领域等广泛使用,也是高通量测序验证过程中的重要环节,因此,被称为基因检测的金标准。制药,食品,科研等研究机构均需要通过测序来进行基因分析,为了满足该需求,日立研发了紧凑型基因分析仪“DS3000”,现已全新上市。 日立DS3000秉承日立高新多年来研究开发的毛细管技术与激光辐射技术,作为小型CE测序仪不仅外形“紧凑”,还实现了“高性能”及“高速处理”,可轻松完成片段与测序分析。此外,本产品还采用了环境友好型设计,通过减少在产品使用时排出的CO2排放量,为客户提供可降低环境负荷的产品。DS3000采用4通道毛细管,一次性可处理32个样本,可同时进行6色荧光检测。支持短串联重复序列分析、微卫星不稳定性检测、突变分析和测序分析等用途。 产品特点:1. 操作简便-结构紧凑&触摸屏设计设备采用GUI的触摸屏显示设计,宽400 mm×长600 mm×高600 mm,结构紧凑,节省空间。触摸屏采用扁平化设计,界面布局直观,加强操作的便捷与实用性。 -卡槽式包装耗材耗材包装采用卡槽式设计,安装简便。-流程高效1. 简化的操作流程,安装方法和步骤说明清晰易懂,无论是初次使用仪器的新手,还是不定期使用仪器的用户,均可轻松完成操作。 2. 配备远程监控系统:DS3000配备远程监控系统,支持“远程设备访问”,可以在Web端监测设备状态,设置检测条件,显示分析结果及生成报告等。进一步提升了操作的便利性,实现高效的工作流程。3. 方便普适,用户可使用任何电脑:可使用用户端网络及电脑输出报告,进行二次解析等。 2. 系统智能-智能耗材管理耗材使用情况实时监控,根据参数,系统能够自动计算出耗材剩余使用次数,提高耗材管理效率。-检测结果智能判断校准检测通过波形及数值表现每道毛细管的信号强度,样本检测根据质量参数设置,自动判断检测结果合格与否,一目了然。 3. 性能优异-创新无泵注胶系统——无需清洗泵,无需排气泡DS3000 采用无泵注胶系统,并成功研发出可移动密封式注射型聚合物,经久耐用,在填充聚合物时无需排气泡,避免了不必要的浪费,同时免除了以往的清洗步骤,有助于缩短维护时间并降低成本。由此可降低用户维修频率,操作性能得到极大提升。 -创新设计光源——使用寿命更长DS3000采用全新设计的激光二极管光源 (LD光源),受模拟脉冲信号控制,DS3000仅在检测时打开光源,与以往光源相比,延长了实际亮灯时间。 日立DS3000基因分析仪作为一款小型的集成化台式DNA分析仪,“紧凑”而“高效”,可以帮助生命科学专家在各种规模实验室进行Sanger测序和DNA片段分析工作。 (此产品仅供科研使用)
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  • 日立DS3000紧凑型基因分析仪 上世纪90年代初,三大科学计划之一的 “人类基因组计划”启动,并于2001年完成了人类基因组草图,而这一伟大工程,正是基于“Sanger法”的DNA测序技术。 随着科学技术的不断发展,一代测序受检测效率的限制,无法应对大量基因组测序的需要,因此二代测序、三代测序技术,甚至四代高通量测序技术不断涌现。但一代测序因其极高的准确率,直到今天仍然在科研、法医、疾控、食药及临床领域等广泛使用,也是高通量测序验证过程中的重要环节,因此,被称为基因检测的金标准。制药,食品,科研等研究机构均需要通过测序来进行基因分析,为了满足该需求,日立研发了紧凑型基因分析仪“DS3000”,现已全新上市。 日立DS3000秉承日立高新多年来研究开发的毛细管技术与激光辐射技术,作为小型CE测序仪不仅外形“紧凑”,还实现了“高性能”及“高速处理”,可轻松完成片段与测序分析。此外,本产品还采用了环境友好型设计,通过减少在产品使用时排出的CO2排放量,为客户提供可降低环境负荷的产品。DS3000采用4通道毛细管,一次性可处理32个样本,可同时进行6色荧光检测。支持短串联重复序列分析、微卫星不稳定性检测、突变分析和测序分析等用途。 产品特点:1. 操作简便-结构紧凑&触摸屏设计设备采用GUI的触摸屏显示设计,宽400 mm×长600 mm×高600 mm,结构紧凑,节省空间。触摸屏采用扁平化设计,界面布局直观,加强操作的便捷与实用性。 -卡槽式包装耗材耗材包装采用卡槽式设计,安装简便。-流程高效1. 简化的操作流程,安装方法和步骤说明清晰易懂,无论是初次使用仪器的新手,还是不定期使用仪器的用户,均可轻松完成操作。 2. 配备远程监控系统:DS3000配备远程监控系统,支持“远程设备访问”,可以在Web端监测设备状态,设置检测条件,显示分析结果及生成报告等。进一步提升了操作的便利性,实现高效的工作流程。3. 方便普适,用户可使用任何电脑:可使用用户端网络及电脑输出报告,进行二次解析等。 2. 系统智能-智能耗材管理耗材使用情况实时监控,根据参数,系统能够自动计算出耗材剩余使用次数,提高耗材管理效率。-检测结果智能判断校准检测通过波形及数值表现每道毛细管的信号强度,样本检测根据质量参数设置,自动判断检测结果合格与否,一目了然。 3. 性能优异-创新无泵注胶系统——无需清洗泵,无需排气泡DS3000 采用无泵注胶系统,并成功研发出可移动密封式注射型聚合物,经久耐用,在填充聚合物时无需排气泡,避免了不必要的浪费,同时免除了以往的清洗步骤,有助于缩短维护时间并降低成本。由此可降低用户维修频率,操作性能得到极大提升。 -创新设计光源——使用寿命更长DS3000采用全新设计的激光二极管光源 (LD光源),受模拟脉冲信号控制,DS3000仅在检测时打开光源,与以往光源相比,延长了实际亮灯时间。 日立DS3000基因分析仪作为一款小型的集成化台式DNA分析仪,“紧凑”而“高效”,可以帮助生命科学专家在各种规模实验室进行Sanger测序和DNA片段分析工作。
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  • SeqStudio基因分析仪专门针对Sanger测序和片段分析应用进行优化 零基础用户即可轻松上手 作为基因分析仪的领导者,我们打造出一款新型的Applied Biosystems&trade SeqStudio&trade 基因分析仪——唯一一款可以在同一块板上同时进行测序和片段分析的产品。该基因分析仪配备集成卡夹系统,简单易用,用户既可远程访问和监控运行,又可浏览数据。这一完全联网的基因分析仪结合简单的卡夹设计,使得实验室的所有研究人员都可轻松分享。 SeqStudio基因分析仪采用最新的触屏技术,使用户能够轻松保持数据连通。该系统非常适合需要简单经济的Sanger测序和片段分析,却又不希望牺牲性能和质量的新老用户。 通用多功能卡夹 — 独创功能,整合了POP-1聚合物、阳极缓冲液、聚合物递送系统和毛细管阵列,使试剂在仪器中的保质期长达四个月。所得结果值得信赖 — 具有Applied Biosystems&trade 基因分析仪一贯的精确度缩短设置时间 — 采用POP-1聚合物和通用卡夹设计,可在同一次运行中同时完成Sanger测序和片段分析反应最大限度利用实验室空间 — 紧凑型仪器,可配置成单机系统或者搭配一台计算机,满足大多数实验室需求通过Thermo Fisher Cloud可随时随地轻松访问、分析和共享数据 — 远程监控运行、在几分钟内分析复杂数据集、安全存储数据、通过云端软件应用程序与同事在线分享数据,以及通过移动设备实时监控运行。综合软件包 — 所购系统内附 Applied Biosystems&trade 测序分析软件、SeqScape&trade 软件、 Variant Reporter&trade 软件、GeneMapper&trade 软件和Minor Variant Finder (MVF)软件。上手快速 – 每个SeqStudio系统都包含一个SmartStart 向导,让您可以在实验室快速上手:此向导涵盖了基本的设置、云端启用和连通、打印机联网、起始试剂评审、软件使用、仪器操作和维护等内容。Sanger测序是测序技术的金标准,具有高精确度、长读取能力,且可灵活支持许多研究领域的不同应用。Sanger测序不仅在DNA测序应用中被广泛认可,同时也可支持RNA测序和表观遗传分析等应用,可确保为癌症及其他遗传疾病研究获得稳定、可靠的标记物检测和定量结果。此外,DNA片段分析还可用于从基因分型到细菌鉴定、从植物筛选到基因表达分析的诸多应用。 从头Sanger测序从头测序指的是为了获得特定生物体的主要基因序列而进行的初始序列分析。 Sanger测序进行靶向测序基因组DNA内的杂合子碱基位置、小片段插入或缺失鉴定常用于定位二倍体生物的突变或多态性;基因重排检测,揭示罕见变异。 质粒测序 亚克隆到质粒中的插入分析 肿瘤学研究保持了检测出肿瘤组织内突变等位基因的金标准质量。 物种鉴定通过“指纹”位点的DNA测序鉴定未知样品所属物种。 新一代测序(NGS)验证我们的基因分析仪拥有超高性能,可进行金标准Sanger测序技术,能够成为验证NGS结果的可靠利器。 CRISPR-Cas9基因组编辑分析验证CRISPR-Cas9编辑事件 人类细胞系鉴定特定基因指纹的高变异短串联重复序列(STRs)分析 Applied Biosystems&trade SNaPshot&trade 基因分型检测单核苷酸多态性(SNPs),帮助理解基因组如何影响生物表型 多重连接依赖性探针扩增技术(MLPA&trade )分析人类拷贝数变异研究由基因座拷贝数变化引起的人类遗传疾病 通过我们成熟的工作流程,生成高质量的Sanger测序数据从DNA模板扩增、PCR纯化、循环测序反应、测序纯化到仪器耗材,我们针对Applied Biosystems&trade 工作流程每一步骤提供了全面的产品。方便使用,有助于提高实验室效率SeqStudio基因分析仪采用卡夹式系统,便于使用和维护。SeqStudio仪器采用多功能卡夹,其中包含毛细管阵列、聚合物存储室和阳极缓冲液 多功能卡夹设计具有以下优势:可在仪器上存储长达四个月可轻松取放内含POP-1聚合物无需重新配置,即可同时进行Sanger测序和片段分析兼容标准96孔板和8孔联管内附4道毛细管陈列带有射频识别(RFID)标签,可追踪进样次数(卡夹)和在仪器上的存放时间(阴极缓冲液存储容器)自动进行运行前校正表1. 服务计划一览AB Maintenance Plan AB Assurance AB Complete 现场响应时间尽量2个工作日*保证2个工作日保证2个工作日安排现场计划维修 √√√远程设备诊断√√√零件、人力和差旅费用√√√优先接通远程服务工程师√√再认证(计划性维护及维修后)√√现场应用科学家故障排查√ *响应时间因地区而异。
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  • 无人值守 您的PCR实验自动完成 自动基因扩增仪 Biometra TRobot II 可与自动化平台整合来实现无人值守的全自动工作流程, 适用于96孔和384孔的样品通量,运行快速、温控精准、运行稳定,三面的开盖方式可匹配各种机械臂实现样品板的轻松取放,加密的数据传输能确保数据的完整性,提供多级用户权限管理,具有断电自动重启、自检等功能,在高通量NGS、大规模群体研究、疾病的全基因组关联研究、高通量分子标记筛选、药物筛选等方面都有很好的应用。 精准温控 温控精准:秉承耶拿公司三十多年的 PCR 研发制造经验,采用先进的Peltier 帕尔贴半导体温控技术,具有超高的温度准确性和均一性,提供快速高效、可靠稳定的 PCR 扩增速度快:运行速度快,不仅节省实验时间,还可提高扩增产物的特异性 型号齐全:有常规通量 96 孔和高通量 384 孔样品槽可选,有快速镀金银槽和常规铝合金槽可选 平整易清洁:样品槽四周平整光滑,无沟槽,极易清洁,不易积灰智能热盖 由于自动化 PCR 仪需要与机械臂配合来实现自动取放样品板,而与人相比,机械臂的灵活性会稍逊一筹,因此与普通 PCR 仪相比,如何保证机械臂能方便安全地取放样品板,是考察自动化 PCR 仪好坏的很重要的方面。 自动开盖:设计合理巧妙的弧形向上开盖方式,可轻松且安全地自动打开和关闭 PCR 热盖 三面开放:热盖打开后,形成完全敞开的空间,显露出完整的样品槽,既可以从仪器正面取放样品板,也可以从仪器左右两个侧面取放样品板,实现和市面上各类自动机械臂的完美兼容使用,方便整合进整个自动化平台 防止蒸发:热盖温度达到设定温度后,模块才会升温,确保样品管上方温度始终高于样品温度。热盖垂直向下施压,整板受力均匀,根据 PCR 板的高低不同可精细调节热盖接触压力,不仅有效防止样品蒸发,还为用户选择 PCR 板提供很大的开放性和灵活性,对耗材没有限制 安全制动:热盖带有安全感应框,碰到阻力会自行中断关盖程序,防止意外发生 经久耐用:无磨损的开关盖方式延长仪器使用寿命,并有助于整个自动化系统的稳定运行兼容多种自动化系统 耶拿公司不仅具有三十多年的 PCR 开发生产历史,还拥有三十多年的自动化工作站研制经验,在自动化系统设计和整合方面提供专业的产品和服务。 安全取板:经过数十轮的 PCR 循环和热盖高压后,样品板往往会紧密贴合在样品槽中,如果机械臂直接去取板,很难轻易取出。耶拿的自动 PCR 仪,设计了专利性的样品板自动抬离装置,取板前可自动将 PCR 板轻缓平稳地抬离样品槽,方便机械臂抓取 PCR 板并将其移出PCR 仪,避免卡板等意外的发生 兼容性好:基于合理的三面开放的开盖方式,智能安全的取板设计,以及低矮的仪器高度,占地面积小,能很好地与各种自动化机器臂配合使用,搭建成全自动 PCR 平台 适用性强:可通过耶拿公司提供的标配软件 TSuite 来独立控制 PCR 仪的自动运行,也可通过预置的驱动来兼容其他的自动化平台TSuite 软件提供自动 PCR 仪的全面功能,如创建程序、控制仪器运行、生成仪器运行状态和操作步骤的详细文档等。加密的数据传输能确保数据的完整性,提供三级用户权限管理功能,符合 GMP 规范各种运行和维修日志文件符合 GMP的法规要求,在发生故障时,日志文件还有助于快速排查故障原因仪器可独立运行,因此可通过 TSuite 软件预先优化好 PCR 程序,再整合入自动化系统,简化实验优化过程PCR 仪上带有仪器运行指示灯,可通过灯的颜色和状态来直观便捷地了解仪器的状态,无需再去查看软件界面,非常方便 耗材开放:可使用全裙边或半裙边的 PCR 板,可使用高缘板或低缘板,可使用封膜、硅胶垫或者塑料盖
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  • 华大智造MGISEQ-200基因测序仪小巧、灵活的桌面型基因测序仪丰富你的日运行能力MGISEQ-200是一款小巧、灵活的桌面型单载片基因测序平台,支持高低两种通量的载片。小载片 (FCS)运行速度快,大载片 (FCL) 通量高,用户可灵活选择,满足不同应用场景下对时间和通量的要求。MGISEQ-200的两种载片搭载3-4种读长,支持开展不同测序应用,包括:低深度全基因组测序、靶向捕获/多重测序、小型基因组测序、RNA测序、全外显子测序等临床应用或科研应用,丰富你的日运行能力。通量更灵活升级版MGISEQ-200通量愈显灵活。其中,大载片(FCL,有效reads数:500M)可满足批量样本集中交付,降低单样成本;小载片(FCS,有效reads数:75-100M)可实现紧急样本快速测序,降低开机成本。速度更快配备优化后的生化反应,MGISEQ-200为测序提速。其中,小载片测序(FCS,SE50)最快仅需6小时。面对ICU样本或突发疫情等情况时,升级版MGISEQ-200的优势更为明显,可在第一时间获取未知致病原检测结果。读长更长MGISEQ-200的大小载片(FCL/FCS)均支持PE150,数据量产出稳定,可以解锁更多应用,包括:靶向捕获/多重测序、RNA测序和WES测序等。质量更高经过结构化大数据训练的软件算法,升级版MGISEQ-200在碱基识别上更准确,配合优化后的生化试剂,能提供更高质量的数据。以人细胞系标准样本NA12878为例,使用MGISEQ-200 PE100读长进行测序,Read1 Q30≥90%,Read2 Q30≥85%以上,Mapping Rate、Duplication Rate、变异检出等性能均表现优秀。适配更多应用,满足更多测序需求从小型基因组测序、低深度全基因组测序,到靶向捕获和多重测序,从临床应用到科研应用,升级版MGISEQ-200测序仪“一机多能”,更有自动化整体解决方案加持,提供了丰富的日运行能力。基于MGISEQ-200测序平台,华大智造提供自动化的整体解决方案,包括:自动化样本制备系统,高通量测序仪和生信分析加速器。整体解决方案基于同一套硬件系统,可拓展多种不同应用,不仅适配华大智造的整体方案,也支持第三方文库制备试剂盒和第三方分析软件。获证情况目前,MGISEQ-200已获中国NMPA、欧盟CE、北美c-TUV-us等多项认证。性能参数MGISEQ-200载片数1载片类型FCSFCL载片流道数1 Lane单载片有效 Reads数量75M-100M500M支持读长*SE100PE100PE150SE50SE100 PE100PE150 * 有效Reads数的最大值根据特定标准文库运行所得,实际应用文库受样本类型、建库方式会有所波动MGISEQ-200读长Reads数量数据产量数据质量Q30 *运行时间 **SE50-FCL500M~25G85%~11hSE100-FCL500M~50G85%~17hPE100-FCL500M~100G85%~47hPE150-FCL500M~150G80%~66hSE100-FCS100M~10G80%~10hPE100-FCS100M~20G85%~30hPE150-FCS75M~23G80%~43h*高于Q30的碱基百分比是特定标准文库通过整个运行平均所得。实际应用表现受样本类型,文库质量, 插入片段长度等因素影响。
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  • 华大智造DNBSEQ-T7基因测序仪全面、灵活的中大型基因组测序仪活跃你的日处理能力DNBSEQ-T7日产出高质量数据1-6 T,广泛适用于全基因组测序、超深度外显子组测序、表观基因组测序、转录组测序和肿瘤Panel等大型测序项目。基于华大智造独有的DNBSEQ&trade 技术,DNBSEQ-T7全面升级生化、流体及光学系统,使测序更加高效多产。超级通量模式:1-6Tb生产级的DNBSEQ-T7通量惊人,单张载片最大有效reads数可达5000M,最大数据量达1.5Tb,四载片连载日产数据量高达6Tb,广泛适用于全基因组测序(60例/天)、超高深度外显子组测序(400例/天)、宏基因组测序(1000例/天)、肿瘤Panel测序(6000例/天)等大型测序项目。超级运行模式:1-4张载片独立运行DNBSEQ-T7拥有4联载片平台,灵活支持1-4张载片独立运行:每张载片在上机后可自动完成清洗和回收,能够在24小时内无缝衔接多轮测序。超级速度模式:SE50~5小时/PE100~20小时/PE150~24小时以新冠病毒基因测序为例,DNBSEQ-T7使用SE50进行新冠病毒测序,5~6个小时可完成一轮测序,如高通量宏基因组测序(100M reads/样本),每轮可检测~128例样本,每天可做4轮检测;再如多重测序筛查(5M reads/样本),每轮可检测~2300例样本,每天可做3轮检测,日检测通量近万。一站式整体解决方案:端到端围绕DNBSEQ-T7,华大智造提供全面的自动化解决方案。在上游的样本前处理方面,可适配华大智造自动化样本制备系统MGISP系列(MGISP-960/MGISP-100);在下游的计算存储方面,华大智造推出了集计算、存储和分析软硬件为一体的“T7伴侣”:ZTRON生信自动化服务平台。在整体的实验室管理方面,华大智造ZLIMS实验室信息管理系统提供端到端的解决方案。产品特点日产能高达6Tb,全天候提供高质量数据满负荷PE150≤24小时4联芯片平台,支持PE150和PE100不同读长并行测序性能参数DNBSEQ-T7性能参数产品型号DNBSEQ-T7芯片数/Run4Lane/芯片1有效reads数/芯片*5000M支持读长PE100PE150* 有效读取的最大数量基于内部标准文库的测序。 实际输出可能因样品类型和库制备方法而异。 DNBSEQ-T7性能表现读长数据产出数据质量Q30 *运行时间 **PE1001~4Tb85%~20hPE1501.5~6Tb80%~24h* Q30以上的基数百分比是整个运行中内部标准文库的平均值。 实际性能受样品类型,文库质量和插入片段长度等因素影响。**运行时间包括芯片上机,测序,生成Cal.文件等。Cal.是由华大智造测序仪basecall软件生成的二进制文件格式。
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  • DNBSEQ-G99:全力释放你的测序速度DNBSEQ-G99是目前全球中小通量测序仪中速度最快的机型之一。基于华大智造核心的DNBSEQTM测序技术,G99对生化、流体、光学、温控等多个核心系统进行了优化和提升,同时内置计算模块,使得测序生信一体化,12小时可完成 PE150测序,适用于小样本量的肿瘤靶向测序、小型全基因组测序、低深度WGS测序、个体识别、16s宏基因组测序等多种应用,数据产出高效且优质。产品特点8 Gb~96 Gb per run满负荷PE150仅需12小时支持多种读长,包括PE50、SE100、PE150、PE300、SE400,测序精准度高,可连续读取12个以上单个重复碱基序列信息适用于小样本量的肿瘤靶向测序、小型全基因组测序、低深度WGS测序、个体识别、16s宏基因组测序等多种应用性能参数单次运行最大载片数流道最大reads数 /载片*支持读长***数据量Q30**测序时间 (DNB-FQ)2180 MSE100/PE508 Gb~16 Gb>90%5 hPE15024 Gb~48 Gb>85%12 hPE30048 Gb~96 Gb>85%30 hSE40032 Gb~64 Gb 75%20 h* 有效 reads 数值根据特定标准文库运行所得,实际应用文库受样本类型、建库方式会有所波动。** 高于 Q30 的碱基百分比及运行时间是特定标准文库通过整个运行平均所得,实际应用表现受样本类型、文库质量、插入片段长度等影响。*** 现有试剂盒支持SE50、PE100读长,同时仪器设有 SE50、PE100 测序模式。方法学应用推荐读长数据量样本数量/RUN1张载片2张载片靶向捕获/多重检测伴随诊断Onco panelPE100/ PE150小panel: ~1 Gb /样本2448遗传病诊断小panel(地贫、耳聋等)PE150地贫: ~0.2 M reads /样本耳聋: ~5 Gb /样本40048008ATOPlex panel(呼吸道、新冠等)PE100/ PE150呼吸道panel: 5 M reads /样本新冠panel: 5 M reads /样本1632WESPE15015 Gb /样本1~22~4甲基化Onco 靶向甲基化PE150~5 Gb /样本48小型基因组测序未知病原宏基因组SE50/ SE100Meta: 20 M reads /样本48细菌、病毒 WGS测序PE100/ PE150单菌: ~1 Gb /样本16~2432~4816S 测序PE300≥0.1 M reads /样本5761152低深度 WGS测序NIPTSE50~10 M reads /样本816PGSSE50转录组测序RNA-SeqSE50/ PE150定量: ~25 M reads /样本转录组: ~6 Gb /样本3468司法DNA特征识别SE400~0.8 M reads /样本96192* 数据量推荐及样本数量仅做预估参考,具体数据量及样本数量需根据实际情况调整。相关产品货号货号产品型号900-000561-00DNBSEQ-G99RS900-000560-00DNBSEQ-G99ARS940-000409-00DNBSEQ-G99RS 高通量测序试剂套装(G99 SM FCL SE100/PE50)940-000410-00DNBSEQ-G99RS 高通量测序试剂套装(G99 SM FCL PE150)940-000520-00DNBSEQ-G99RS 高通量测序试剂套装(G99 SM App-C FCL SE100)940-000413-00DNBSEQ-G99RS 高通量测序试剂套装(G99 SM App-C FCL PE150)940-000415-00DNBSEQ-G99RS 高通量测序试剂套装(G99 SM FCL PE300)940-000417-00DNBSEQ-G99RS 高通量测序试剂套装(G99 SM FCL SE400)940-000624-00DNBSEQ-G99RS 清洗试剂盒(G99 SM FCL)按需自选UPS
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  • timsTOF fleX 实现 MALDI 引导的空间定位组学高灵敏度:timsTOF fleX 空间定位组学方案,结合特征区域 MALDI 成像和 PASEF 组学分析,能从有限样本中获得高鉴定率。空间分辨率:高空间分辨率的 MALDI 源和平台机械设计获得分子分布图,增加组学空间维度信息。多功能:双离子源设计使您在同一个质谱平台上完成分子空间分布和 ESI 多组学鉴定。microGRID -- 精准、可靠的硬件升级,使高空间分辨成像实验唾手可得实现高空间分辨的成像实验并不是一件容易的工作。布鲁克推出了全新 microGRID 技术 -- 整合了 MALDI 机械平台和 smartbeam 3D 激光器的光束定位系统,进一步提升了质谱成像实验的图像质量,可获得 5 μm 的超高空间分辨率。microGRID 是一款适用于所有 timsTOF fleX 系列质谱仪的选配功能模块,将它整合进布鲁克现有的质谱成像工作流程中,展现出了突破极限的超高空间分辨率。该技术与布鲁克的自动一体化的成像数据采集流程 SCiLS™ autopilot 无缝衔接,使它不仅适用于成像专家,也同样适用于新购入成像仪器的用户及常规的成像数据采集应用。该技术与布鲁克的 SCiLS™ Lab 软件配合使用,可实现对于高分辨成像数据的深度挖掘。从 4D-组学到分子成像的无折中解决方案双离子源设计将无标记分子定位与 PASEF LC-MS/MS 鉴定匹配,解析生物样本的分子变化。 建立在 shotgun 蛋白组学标准上的 timsTOF fleX 将布鲁克一流的 4D-组学分析与尖端的 MALDI 成像技术整合于一个平台,包括高频率的 smartbeam 3D 激光器。配置有双离子源的 timsTOF fleX,把持久稳定的 ESI 分析和组织分子空间分布集成于一体,是进行空间定位组学研究的理想平台。在此之前,没有质谱仪能为组学研究者同时提供这两种能力。 ESI 和 MALDI 的切换操作,只需在软件中开启 smartbeam 3D 激光源,仅需几秒即可完成。简单的切换操作意味着从组学深度鉴定和定量流程到组织高清成像的方便转换,又不影响效率和功能,从而发现真正有用的信息。增加 MALDI 成像新维度,挖掘更多信息由 MALDI 和 ESI 产生的离子,经过同一路径从离子源到达探测器,因此 MALDI 工作流程可以利用 timsTOF HT 的主要优势,包括根据分子碰撞截面 ( CCS ) 来进行捕集离子淌度分离( trapped ion mobility separation,TIMS )。调谐和校准可在 ESI 模式下进行,并用于 MALDI 模式,方便了仪器的优化。TIMS 允许根据离子形状分离分子。离子与气流一起进入双 TIMS 装置,在第一个TIMS 分析器通过电场进行累积。实际分离发生在第二个 TIMS 分离器。通过降低电位以时间和空间的方式释放离子。可变扫描速度和淌度范围适应性可对不同种类分子优化,为用户带来更多灵活性。为组学增加空间维度信息将特征区域 MALDI 成像和深度多组学分析结合现在变得容易可行。MALDI 成像适用于类型广泛的分析物,包括代谢物、脂类或聚糖,并与显微工作流程无缝衔接。针对空间定位组学,MALDI 成像可识别特征区域化合物分布。timsTOF fleX 采用双离子源设计,与可靠的高品质消耗品和用户友好软件一起使用,方便了研究工作,节省了研究人员的时间。使用布鲁克 IntelliSlides™ 预制玻片,使 MALDI 成像和空间定位组学流程在 timsTOF fleX 上完全自动化。分离相近质量或同分异构体离子捕集离子淌度谱( TIMS )有助于复杂样品( 如组织切片 )的分析。通过分离近质量或同分异构的代谢物、脂质、肽段或糖苷,以获得分析物的真实空间定位。高质量分辨率无助于这些问题的解决,timsTOF fleX 提供了唯一的机会来区分同分异构体的分布。碰撞横截面( CCS )是 TIMS 给出的测量结果,提供了从另一角度来验证质谱分析结果。CCS 关联软件智能地将空间 MALDI-TIMS 成像数据与多组学结果相匹配,并使鉴定结果与重要的形态学内容相关联。从色谱分离技术到在像素点的原位分析,一切变得触手可得 … … timsTOF fleX 是一台多功能的质谱仪,用于测量样品的分子情况。timsTOF fleX 建立在布鲁克开创性 timsTOF HT 平台上,功能齐全、速度快、灵敏度高的 ESI 质谱,可用于所有 多组学分析。结合了高空间分辨率的 MALDI 源和平台机械专业设计,用于解析分子分布和带来组学分析的空间维度。将蛋白质组学分析转换为空间蛋白质组学,将脂质组学转换为空间脂质组学,将代谢组学转换为空间代谢组学,并获取数据的组织学背景。与其它学科相结合,从你的分析数据中获取更多信息以达到科研目标。为质谱成像初学者量身打造的自动一体化成像数据采集流程 SCiLS™ autopilot我们提供 “ 购入即用 ” 的成像耗材和软件产品,帮您迅速采集数据,并随后挖掘出组织的分子表型信息。我们推出了基于 IntelliSlides 预制载玻片的自动一体化成像数据采集流程,不仅大大减少了对用户输入的操作要求,还能确保所采集数据的高品质和可重现性。我司还推出了预制的 fleXmatrix 基质,高品质的基质可以保证实验效果并简化基质施加过程。作为质谱成像数据处理的 “ 行业金标准 ”,SCiLS™ Lab 软件可以实现原始数据的可视化以及后续的数据统计分析操作。此外,SCiLS™ Lab 可以与 MetaboScape 软件联用,实现了通过数据库检索信息或 LC/MS 实验结果直接对高分辨的 MALDI 成像热图进行快速分子注释的功能。将这种联用机制应用于空间定位组学工作流程中,可实现生物背景信息与整体组学或单细胞组学信息的有效整合。多组学性能和高灵敏度 MALDI 的结合timsTOF fleX 实现 SpatialOMx无论蛋白组学、脂质组学、糖组学还是代谢组学,timsTOF fleX 都是空间定位组学分析的理想平台。使用专利的smartbeam 3D 技术进行快速、无标记的 MALDI 成像,以绘制样品的分子分布图,并鉴定感兴趣的区域,对它们进一步深入分析。由 PASEF 技术支持的 LC-MS/MS 分析可以进行最高水平的鉴定并得到最可靠的结果。肿瘤远比看到的还复杂癌症的微环境是由健康细胞、肿瘤细胞、结缔组织、血管和炎症在不同时间点以不同的比例组合而成。每一种成分都有其独特的化合物分子标记。研究人员对疾病状态的判断在很大程度上依赖于组织病理学的解释,并在生物分子的背景下创建这些图谱,从而在传统的组学和理解疾病之间架起了桥梁。CCS 关联空间多组学发现差异癌细胞和其它疾病状态具有显著的遗传和表观遗传修饰,影响基因组表达层次。无论你观察的是蛋白质组、脂质组还是代谢组,化合物的空间分布都包含了有价值的解释信息。要了解复杂的样品,除了质量和电荷外,还需要有 timsTOF fleX 的离子淌度功能提供无与伦比的分析深度。近质量干扰可被区分,同分异构体可被分离。这有助于组织中近质量脂质的准确定位。原位 MS/MS 以及 PASEF 技术支持的 4D 多组学研究方案使您能够识别更多感兴趣的分析物。SpatialOMx 的自动分子注释工作流程布鲁克的业界领先的应用软件,现在可以直接对组织中的目标分子注释。只需将数据导入到 SCiLS™ Lab 软件,定义感兴趣的区域,并将峰列表数据导出到 MetaboScape。使用 LC-MS/MS 建立的数据库或成分列表对各个峰进行注释,然后导出注释表并送回到 SCiLS™ Lab 进行可视化。从 SCiLS™ Lab 软件中,可以使用通路和熟悉的命名法而不是分子量可视化实验结果,从而缩短从数据到最终结果的时间。
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  • StepOne&trade 实时荧光定量PCR系统即插即用,配备有易于使用的软件,适合初学者及有经验的实时荧光定量PCR仪用户使用► 先进软件和仪器可运行广范围的各种基因组 Assay► 灵敏、长寿命的三色光学LED记录系统,预先校准,可与 FAM&trade /SYBR Green、VIC® /JOE&trade 和 ROX&trade 染料配合使用► 直观且稳定的软件,适合初学者或是经验丰富的用户使用► 简单且灵活的仪器设置和使用► 体积极小,适用于各种实验室环境► LCD触摸屏和USB驱动使配置更加灵活,并可实现无PC操作StepOne&trade 实时荧光定量 PCR 系统是一款 48 孔低通量实时荧光定量PCR 仪,无论是初学者或是经验丰富的用户均适合使用。StepOne&trade 实时荧光定量 PCR 系统配合直观的数据分析和仪器操控软件可进行各种反应设置,收到之后即可使用。StepOne&trade 实时荧光定量 PCR 系统采用基于 LED 的稳定的三色光学系统,可提供精确的实时荧光定量 PCR 结果,适用于各种基因组研究应用领域。StepOne&trade 软件StepOne&trade 实时荧光定量 PCR 系统自带有 StepOne&trade 软件,可在 Windows® XP、Windows Vista® 和 Windows® 7 操作系统上运行,具有仪器控制、数据采集和数据分析能力。最新版本包括:能够采集熔解曲线数据,可用于高分辨率熔解 (HRM) 实验► 可选择以符合 MIQE 标准的实时荧光定量 PCR 数据标记语言 (RDML)格式输出数据► 实验设计向导,帮助您设计和设置实验► 远程监控,通过远程实时查看扩增情况,并在运行完成时通过电子邮件通知此外,StepOne&trade 实时荧光定量 PCR 系统自带的先进软件现包括功能强大的基因表达研究软件包。该软件包可提高基因表达分析的灵活性和准确性。支持多种应用应用领域包括基因表达分析、SNP 基因分型、microRNA 表达、易位分析、基因检测和病毒载量分析。为方便上述应用领域,Life Technologies提供了预先配制、已经过质量测试的即用型 TaqMan® Assay,与 StepOne&trade 系统配合使用,帮助您节省分析优化的精力。将您的 StepOne&trade 系统升级至 StepOnePlus&trade 系统StepOnePlus&trade 实时荧光定量 PCR 系统是 StepOne&trade 系统的简单升级解决方案。您可以立即从三色、48 孔升级成四色、96 孔。在升级过程中,我们可提供 StepOnePlus&trade 仪器供您暂时使用,这样您可以在仪器到货前继续您的研究。StepOne&trade 系统包括:► 预校准的仪器► RNA酶P仪器验证反应板► 仪器操作和分析软件,以及 Primer Express® 引物和探针设计软件► 包括入门指南在内的丰富的文件集,适用于各种主要的实时荧光定量 PCR 应用领域Life Tech新浪微博Life Tech优酷视频
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  • 产品简介聚光科技Gene TOF 3100核酸质谱分析系统是快速、准确、经济、高效的多重基因检测平台,独立自主研发,拥有多项关键专利技术。GeneTOF 3100结合了PCR技术的高灵敏度、芯片技术的高通量、及质谱技术的高精度等优势,搭配完善的自动化体系,为客户提供包含仪器、耗材、试剂、软件在内的综合解决方案,可广泛应用于出生缺陷防控、药物基因组、肿瘤、传染性疾病等相关基因位点的分析。性能优势1) 多重可单孔实现几十个靶标的多重检测分析。2) 准确高分辨质谱检测,可区分仅一个碱基分子量差异,准确性99.5%,是 SNP 突变检测的金标准。3) 经济无需化学发光、荧光或其他任何二级标记,单个靶点检测成本最低的方法。4) 高效单批进样 384 个样本,日最高检测通量超过 3000, 能够满足不同检测量的需求。5) 便捷高度集成自动点样仪进行样品纯化及点样,自动分析结果,实现样本进结果出,无需任何手工操作,无须生物信息学分析。产品特点1)多基因多位点的精准基因检测平台;2)自主知识产权,多项关键专利技术;3)开放式平台体系,支持自建项目;4)提供完整的仪器、软件、基础试剂、耗材和自动化解决方案;5)可广泛应用于SNP分型、基因突变、DNA甲基化、拷贝数变异等的检测。应用领域出生缺陷防控(遗传病筛查):遗传性耳聋、地中海贫血症、脊髓性肌萎缩症(SMA)、G6PD缺乏症等;药物基因组学:心血管、精神类疾病个体化用药,儿童安全用药等;肿瘤精准防治:肿瘤早筛、肿瘤靶向用药指导、靶向治疗耐药监测等;传染性疾病:感染性腹泻、呼吸道多重感染病原体及其耐药性检测等。
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  • 简介流感病毒全基因组分析系统,是一款提供图形操作界面的流感病毒全基因组测序数据自动化分析系统。相较于常规荧光定量PCR技术,全基因组测序技术具有更强的检测灵敏度,为流感病毒的鉴定、变异检测、监测等带来了技术更新。本系统是流感病毒全基因组测序数据的配套分析系统,兼容当前主流二代和三代纳米孔原始测序数据,实现实时快速分析,能够提供流感病毒分型、甲型流感病毒HA和NA基因区段溯源分析、乙型流感两种家系(Victoria和Yamagata)分型分析、变异检测、覆盖度展示以及组装完成的基因组序列。本系统与常规Linux Shell命令行调用多种程序测序数据分析相比,提供从下机数据到结果报告一键式操作,解决了命令行操作难度大、数据结果分析可视化复杂等问题。通过高度优化的集成分析流程与完善的数据库,最快可将分析时间缩短至10分钟内。功能介绍本系统可针对二代及三代纳米孔测序数据进行生物信息学分析,具体功能如下:1.支持单样本和多样本数据导入分析;2.提供从下机数据到分析结果一键式操作;3.提供甲乙丙丁四种流感病毒鉴定和基因组变异检测;4.内置流感数据库,提供序列比较分析,支持自上传样本共同分析,结果以变异比较列表和系统发育树的方式展示;5.提供流感病毒的全基因组覆盖度图和组装完成的一致性序列;6.甲型流感提供亚型鉴定、HA和NA基因溯源分析;7.乙型流感两种家系(Victoria和Yamagata)分型分析,支持疫苗株及其他细分进化树分析8.提供结果数据统计以及图表输出功能;9.提供样本管理系统,支持输入样本的具体信息,包括病案信息、取样信息、临床诊断信息,支持样本信息和数据分析管理关联等;10.支持一键输出可打印的分析报告,支持图形和表格等结果的下载和输出。
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  • 简介新冠病毒全基因组分析系统,由杭州柏熠科技有限公司开发的一款面向于新冠检测一线工作人员的一键式易操作图形界面分析系统。本分析系统同时支持Nanopore、Illumina、MGI、lontorrent以及Pacbio等主流三代、二代高通量测序数据输入,可实现快速简单分析,系统提供新冠病毒变异信息检测、毒株分型溯源、样本管理上传、进化树构建、基因组组装、图表可视化等功能,同时内置新冠基因组及元信息数据库,帮助用户进行本地化毒株溯源分析。功能介绍本系统同时支持Nanopore、Pacbio等三代测序数据和Illumina、MGI、Ion torrent等二代测序数据进行生物信息学分析,具体功能如下:1.支持用户样本临床信息批量上传和管理;2.支持 fast5、fastq 及gz等多种格式的测序数据;3.支持混样Nanopore测序数据拆分分析;4.支持同一任务多个样本同时分析;5.支持从下机数据上传到输出结果报告一键式操作;6.支持一键式生成 PDF 格式分析报告;7.支持IGV查看测序原始数据比对情况,同时也可以查看位点的突变情况;8.新冠全基因组分析结果包含:病毒鉴定、变异分析、毒株的分型和溯源、自定义变异位点比较分析、 自定义进化树构建、基因组覆盖度计算、基因组组装等;9.支持分析数据及结果下载、图表输出等;10.分析系统能够提供国家认可的计算机软件著作权登记证书或其他知识产权证明。
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  • 简介微生物基因组组装及注释分析系统,是由杭州柏熠科技有限公司开发的一款提供图形操作界面的测序数据分析系统。组装模块的提供可以更好的对测序的物种信息进行评估,相较于传统微生物培养和荧光定量PCR技术,全基因测序技术能够高效获得物种基因组信息、变异信息、物种差异等,克服检测周期长、操作繁琐、通量低等问题。本系统兼容三代Nanopore和二代原始测序数据,可实现实时快速分析,提供三代有参组装、无参组装、混合组装、二代单双端组装模式。可以使用户快速得到组装结果、覆盖度、统计信息、耐药和毒力分析、基因注释、MLST等结果。本系统提供从下机数据到结果报告一键式操作,与常规linux shell命令行调用多种程序测序数据分析相比,解决了操作难度大、分析可视化复杂等问题。通过高度优化的集成分析流程与完善的数据库,最终实现一键式图形界面分析,最快分析时间可缩短至10分钟内。功能介绍本系统同时支持Nanopore、Pacbio等三代测序数据和Illumina、MGI、Ion Torrent等二代测序数据进行生物信息学分析,具体功能如下:1.支持主流二代和三代测序下机数据的分析;2.提供从下机数据到分析结果一键式操作;3.支持多个主流组装软件选择,提供无参,有参和混合组装三种组装方式;4.支持多样本和不同格式数据输入;5.提供样本全基因组的覆盖度图和组装完成的一致性序列;6.有参组装提供变异分析;7.支持基因组组装结果注释,提供gff,gbk等注释文件;8.提供耐药元件鉴定、耐药机理和耐药药物鉴定等分析;9.提供毒力元件鉴定、毒力机理等分析;10.支持MLST分析;11.可输入样本的具体信息,包括样本病案信息、取样信息、临床诊断信息;12.提供结果数据做图、统计功能以及图表输出功能;13.提供样本管理系统,支持输入样本的具体信息,包括样本病案信息、取样信息、临床诊断信息,支持样本信息和数据分析管理关联等;14.支持一键输出可打印的分析报告,支持图形和表格等结果的下载和输出;15.分析系统能够提供国家认可的计算机软件著作权登记证书或其他知识产权证明。
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  • 产品名称:基因组分析工作站产地:中国品牌:Microobench型号:Microobench产品简述:原始下机数据与拼接后数据的生信分析关键词:基因组分析工作站、生信分析硬件与软件、生信分析、工作站、分析服务器、生信分析一体机产品详情:Microobench病原微生物基因数据管理与分析工作站由基于国家微生物科学数据中心数据库开发而来的一款针对病原微生物测序数据进行样本管理、分析、监测及预警的生信平台。该平台拥有强大的生信数据库,兼顾易用与专业,内设多种工作流及分析模块,一键即出结果;平台提供一整套本地化基因分析解决方案,可用于收集网络实验室测序数据,分析结果能直接上传国家监测网络数据中心,便于及时发现流行传染病。该平台主要面向各地疾控中心、哨点医院、海关口岸、科研院所等单位,提供专业、简便、精准的病原微生物信息分析解决方案。 产品特点:一键分析:自动生成 分析报告。全中文操作界面:操作简单易上手。2.1+12:国家微生物科学数据中心数据库与公共数据库结合,实现更全分析。本地数据库:无需联网,确保数据安全。4.可视化大屏:实时动态监测,及时性预警分析。病原监测预警特色算法:集成生信管理及中国本土化传播预警特色算法,实时监测预警风险病原。6.样本数据集中管理:适合疾控中心要求的样本、菌毒株、生信分析数据管理流程。支持多种数据:原始下机数据、拼接后数据;二代、三代、二代+三代测序平台混合数据分析模块: 细菌基因组管理分析 病毒基因组管理分析* HIV变异分析与可视化监测 新冠病毒监测预警可视化系统 未知病原数据管理与分析 流感病毒监测预警可视化系统*产品优势:1.提供完整的生物信息学解决方案2.高性能计算,加速数据处理3.用户友好的界面,降低学习曲线4.数据存储和管理,确保数据安全多样的生物信息学工具和分析功能
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  • 产品介绍:声波基因组剪切仪是在传统超声波处理基础上的技术革新,通过球面固态超声换能器将声波以三维方式聚焦到样本区域,聚焦声波能够以不同角度的能量输入获得良好的处理效果,避免传统超声能量的不聚集可能引起的样本处理过度及热损伤。采用等温、旋转离心管及非接触的方式对样品进行打断、匀浆和混合。用干无菌、超微量破碎 隔着离心管能打断染色体。目不产生感染性飞零超声探头与样品不接触避免交叉污染。自动声波聚焦通过控制系统和自动化的冷水机操作,可为样本处理提供高效可控、重复性优良、温度恒定及无污染的处理环境。目前已广泛应用于基因组学蛋白质组学,细胞生物学等研究中。更短的波长-低至3mm波长,与生物样本大小相同数量级,更容易聚焦。更集中的声波-准确聚焦声波至样品区域,减少能量损失,带来更低的功耗。更安静更健康-临床医学级超声频率,处于安全听力范围之外,无噪音,对人体无害。更少的成本-低成本无需特殊耗材,无需专用配件,实验成本几乎为零。基本原理:通过压电转换器,将电信号转变为高频声波信号,产生数百万的分子“空穴”利用“空穴”在几秒内变大、破裂产生的瞬时流体剪切力,通过等温、非接触的方式对样本进行打断、匀浆和混合。应用领域:组织破碎与匀浆、蛋白质提取、蛋白质消解、DBS血卡收集提取、MALDI-TOF样本处理、细胞及亚细胞组分裂解、ccfDNA提取、ChIP染色质剪切、DNA/RNA提取、生物标志物提取、DNA/RNA片段化、FFPE样本核酸提取、配方设计、脂质体制备、纳米颗粒制备、化合物分散/溶解、药物合成与微粉化不同片段化方法的对比一、超声波打断法1、操作简单,耗时短.成本低2、随机片段化,无GC序列偏好3、剪切效果不受DNA浓度影响4、片段化结果集中度高,目的长度片段得率高二、酶切法1、实验要求严格,针对不同样本合适的片段化条件摸索不易,成本较高2、存在序列偏好性3、需要根据样本浓度改变酶浓度,酶活性易受到溶液成分影响4、目标长度片段集中度较低传统探头和非接触式的对比一、传统探头超声波破碎仪1、探头与样品直接接触,有金属离子污染,一次只能处理一个样品,实验周期长。2、对于多个样品,需要重复使用同一探头,容易造成样品交叉污染。3、由于每次探头插入样品的深度不一.每次超声的能量分布也不尽相同,影响实验结果的重复性和准确性。4、由于不能采用封闭系统,在超声过程中产生的气雾或者泡沫会扩散到环境中造成潜在的生物危险。二、非接触式超声波破碎仪1、消除了传统的手持探头,固定探头的繁琐。2、消除了样品交叉污染的危险 能隔着离心管能打断染色体、破碎细胞。3、无气雾浮质产生-增强生物安全性,用于无菌操作。产品优势:1、通量高,一次可同时处理32-64个样品,实验效率高2、无需频繁操作探头,各样品均在单独的全封闭试管中,避免交叉污染3、产品配置丰富0.1ml-15ml多种适配器,适合于不同样品的实验4、超声参数设置灵活,实验步骤标准化,实验重复性好,结果可靠性高5、无需特殊专用耗材,实验成本低6、采用4℃低温水浴超声波,能量分布均匀,超声作用完全,样品完全在低温环境中进行,避免了样品的变性性能特点:仪器配有旋转马达,超声时自动连续旋转离心管适配器,使超声能量分布更均匀无需特殊耗材,操作简单,时间快,通常一个实验可在短时间几分钟内即可完成采用7寸医用级电阻触摸屏触控操作,屏幕实时显示工作参数时间、温度、功率及连续模式和间隙模式显示,操作简单便捷,运行状态倒计时显示微处理器设有密码保护功能,内置程序,可根据样品类型,输入不同的程序,达到实验目的,无需频繁摸索实验条件仪器具有超电流、超电压、超温报警功能,当温度超过设定温度,自动停止超声并报警,保证样品的完整性产品参数:研究领域:组蛋白的修饰研究、染色质表观遗传修饰研究、转录调控分析、药物开发研究、有丝分裂研究DNA损伤与凋亡分析等。1、全血片段对比:2、不同打断时长小的回收得率:3、相同处理时长的样本混合后,琼脂糖凝胶电泳检测结果:
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  • 基因组学应用 欧罗拉自动化液体处理工作站特殊的实验要求,简单的仪器无法满足?定制高通量液体处理工作站,按照您的实验需求配套定制! Aurora 基因组学液体处理工作站OEM 简介 基因组学液体处理工作站为您的核酸提取,核酸纯化,PCR体系构建,下代测序文库构建等基因组学实验项目。Aurora同时也提供OEM整合解决方案,以满足您对于高度自动化的需求。我们充分考虑了OEM过程中的整合流程,特殊应用修改以及系统/软件的兼容性,为您提供相应的技术方案。欧罗拉生物科技有限公司始于1990年,是生命科学、环境科学、药物研发/安全和化学分析研究等实验室自动化方案设计与研发的全球性领 导者。我们提供的技术与服务可以在提高质量、准确度和精确度的同时提高样品处理量。产品包括:自动化液体处理工作站、原子吸收光谱仪、原子荧光光谱仪、离子通道筛选技术-离子通道阅读器和微波消解系统,它们可以在水质检测、学术研究、农业检测、分子检测、环境检测、食品安全、法医法证、公共卫生、畜牧兽医、药物开发等应用领域中提供高销量的样品处理。我们的总部设在加拿大,2007年,Aurora Biomed开设了其亚洲销售和服务中心,以促进向快速增长的亚洲市场的扩张。为了进一步扩大Aurora的市场范围,我们在全球80多个国家建立了积极的经销商网络,为客户提供销售和服务支持。自2003年起,Aurora是每年精密医疗和离子通道年会的主办方。会议旨在将业界和领 先的学术研究人员聚集在一起,分享知识、交流想法,并建立富有成效的合作伙伴关系。该会议每年在加拿大和中国之间轮流召开,吸引世界各地的顶 尖科学家就药物研发和个性化医学展开发人深省的讨论。它使Aurora和社会能够掌握尖 端技术和创新研究的脉搏。欧罗拉生物科技有限公司是生命科学、环境科学、药物研发/安全和化学分析研究等实验室自动化方案设计与研发的全球性厂家。我们提供的技术与服务可以在提高质量、准确度和精确度的同时提高样品处理量,我们致力于提高人类生活质量及环境的可持续性。欧罗拉致力于为各种研究领域的科学家提供自动化液体处理系统,包括:医药、生物技术、农业、食品科学和法医。VERSA系列作为液体处理系统,可以提高处理效率和数据质量,降低重复烦琐工作带来的不稳定性和减少试剂成本。 Aurora 基因组学液体处理工作站OEM 应用领域 OEM领域:**科研机构** 酶免自动化**快速移液**基因组学**生命科学**分子诊断**食品安全**环境监测**实验室前处理 Aurora 基因组学液体处理工作站OEM 特点 快速完成96个样品的转移一吸多喷,快速完成96个样品5块盘的分配基于PC的操作软件,模块化的测试模板保留用户可定义的动作方式 使用一次性移液吸头,或者使用可清洗钢针选配紫外消毒空气过滤防尘外罩前处理后的样品转移具备试剂喷加器,实现样品在线稀释开放系统,兼容各种第三方试剂与耗材 Aurora 基因组学液体处理工作站OEM 产品规格 机械零件组件能与所有类型的实验室设备兼容第三方设备整合OEM整合可以从我们以前的系统集成案例,了解我们作为自动化仪器在自动化工作流程的作用相关模块更多仪器模块配置根据你的实验项目需求推荐,欢迎点击【一键咨询】,【发送留言】后我们会马上联系您 Aurora 基因组学液体处理工作站OEM 原理 我们的目标是根据顾客资金预算和时间要求的基础上,尽力提供短时高xiao,稳定以操作的自动化整合方案 Aurora 基因组学液体处理工作站OEM 应用案例 Aurora用户应用案例: Aurora产品应用报告列表(部分),更多更新欢迎查阅Aurora官网~ **VERSA&trade 1100 GENE在下一代测序(NGS)文库制备自动化的可行性验证** VERSA&trade 10 PCR体系构建工作站在分子诊断上应用**高通量PCR体系构建自动化方案**利用VERSA 110 PCR体系构建工作站进行Hot-start PCR体系构建**利用VERSA 110进行玻片PCR体系自动构建**实时荧光定量PCR体系构建自动化方案**一步实时荧光定量PCR法乙型肝炎病毒诊断试剂盒的自动化方案**利用VERSA 1100工作站以及Aurora试剂盒进行血液基因组提取自动化方案Applications Genomics &bull Automated Isolation of Genomic DNA using the MACHEREY- NAGEL NucleoMag Plant kit by Aurora Biomed’s VERSA 1100 &bull Automated Isolation of Genomic DNA using the MACHEREY-NAGEL NucleoMag Blood 200μL kit by Aurora Biomed’s VERSA 1100 &bull 采用性犯罪试剂盒差异消化方法在VERSA 1100自动化应用 &bull VERSA&trade 1100 GENE在下一代测序(NGS)文库制备自动化的可行性验证 &bull 全血样品中核酸提取应用报告 &bull 植物样品中核酸提取应用报告 &bull Automation of DNA Extraction &bull PCR Setup &bull Automation of Reverse Transcriptase PCR &bull Automation of Real time PCR &bull Automation of RNA Sequencing &bull Automation of Next Generation Sequencing &bull Automation of DNA Microarray &bull Automation of Miniprep &bull Automation of Sanger Sequencing &bull Automation of On-Slide (Amplislide) PCR Setup using VERSA&trade 110 PCR Setup Workstation &bull Food Safety Monitoring using VERSA&trade 110 NAP Workstation &bull Hot-Start PCR using VERSA&trade 110 PCR Workstation &bull DNA Isolation from Saliva (Invitek Forensic DNA Isolation Kit) &bull Nucleic Acid Prep for Avian Flu Viral RNA &bull β-Actin and Whole Genome Amplification (Sigma & Promega kits) &bull Genomic DNA Isolation from Blood (Promega) &bull Automation of Molecular Pathology Applications on the VERSA&trade 10 PCR Setup Workstation &bull Automated System for High Throughput PCR SetupExtraction &bull 高通量固相萃取&气相色谱-质谱联用方法定量检测吸毒者尿液中甲基苯丙胺和苯丙胺 &bull HTS Flux Assay Automation &bull Validation of Automated Liquid Liquid Extraction of 25-hydroxy vitamin D &bull Automation of Sample Preparation and Introduction into NMR Tubes &bull Liquid Liquid Extraction of β-carotene &bull Automation of Protein PurificationGeneral Liquid Handling &bull High-Density Peptide Array Printing &bull Specimen Staining for TEM (Array printing) &bull Automated Slide-Based Assay Setup using VERSA&trade 110 Workstation &bull VERSA&trade Spotter Workstation for Solid-Phase Peptide Synthesis &bull Automated Protein Crystallography Plate Setup using VERSA&trade 110欢迎点击【一键咨询】,【发送留言】后我们会马上联系您,为您的实验或应用需求推荐合适的仪器配置
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  • 基因组学应用 欧罗拉自动化液体处理工作站特殊的实验要求,简单的仪器无法满足?定制高通量液体处理工作站,按照您的实验需求配套定制! Aurora 全自动基因组 欧罗拉自动化液体处理工作站 简介 基因组学液体处理工作站为您的核酸提取,核酸纯化,PCR体系构建,下代测序文库构建等基因组学实验项目。Aurora同时也提供OEM整合解决方案,以满足您对于高度自动化的需求。我们充分考虑了OEM过程中的整合流程,特殊应用修改以及系统/软件的兼容性,为您提供相应的技术方案。欧罗拉生物科技有限公司始于1990年,是生命科学、环境科学、药物研发/安全和化学分析研究等实验室自动化方案设计与研发的全球性领 导者。我们提供的技术与服务可以在提高质量、准确度和精确度的同时提高样品处理量。产品包括:自动化液体处理工作站、原子吸收光谱仪、原子荧光光谱仪、离子通道筛选技术-离子通道阅读器和微波消解系统,它们可以在水质检测、学术研究、农业检测、分子检测、环境检测、食品安全、法医法证、公共卫生、畜牧兽医、药物开发等应用领域中提供高销量的样品处理。我们的总部设在加拿大,2007年,Aurora Biomed开设了其亚洲销售和服务中心,以促进向快速增长的亚洲市场的扩张。为了进一步扩大Aurora的市场范围,我们在全球80多个国家建立了积极的经销商网络,为客户提供销售和服务支持。自2003年起,Aurora是每年精密医疗和离子通道年会的主办方。会议旨在将业界和领 先的学术研究人员聚集在一起,分享知识、交流想法,并建立富有成效的合作伙伴关系。该会议每年在加拿大和中国之间轮流召开,吸引世界各地的顶 尖科学家就药物研发和个性化医学展开发人深省的讨论。它使Aurora和社会能够掌握尖 端技术和创新研究的脉搏。欧罗拉生物科技有限公司是生命科学、环境科学、药物研发/安全和化学分析研究等实验室自动化方案设计与研发的全球性厂家。我们提供的技术与服务可以在提高质量、准确度和精确度的同时提高样品处理量,我们致力于提高人类生活质量及环境的可持续性。欧罗拉致力于为各种研究领域的科学家提供自动化液体处理系统,包括:医药、生物技术、农业、食品科学和法医。VERSA系列作为液体处理系统,可以提高处理效率和数据质量,降低重复烦琐工作带来的不稳定性和减少试剂成本。 Aurora 基因组学液体处理工作站OEM 应用领域 OEM领域:**科研机构** 酶免自动化**快速移液**基因组学**生命科学**分子诊断**食品安全**环境监测**实验室前处理基因组学**NGS文库制备**DNA/RNA提取纯化**DNA/RNA片段长度选择**酶反应体系构建**文库标准化建设与混合**单一/多重RT-PCR体系构建**测序反应体系构建**Oligo合成体系构建**磁珠纯化应用通用液体处理**随机挑选以及样品混合**盘面转移、复制与重排**系列稀释、平行稀释**母液配置和分装 Aurora 基因组学液体处理工作站OEM 特点 性能特点1.核酸提取流程简便快捷,提取通量大,充分满足高通量客户需求。2.配有专用核酸提取试剂盒,亦可兼容市面多种自动化核酸提取试剂盒(磁珠法)。3.采用真空吸取的方式96通道吸废液装置,有效避免废液滴落造成的交叉污染。4.耗材兼容性强,可使用市售大多数机用耗材。5.精确移取各种液体,5 μL体积的液体转移CV 2 %,通道间的CV3 %。人性化特色软件目前已提供全血、血清、植物、组组织和PCR纯化等5个核酸提取纯化试剂盒系列及操作流程。1.方便易懂的图形选择界面,可保存/导入/导出预先设定的动作序列。用户可使用Aurora工程师预存软件程序,也可自定义操作流程。2.灵活控制移液操作,提高效率,节省Tips消耗。3.提供全自动核酸提取的“一键式”操作中文软件,方便国内客户的使用,用户也可以自定义操作流程进行实验。 4.软件同时支持多种液体处理功能,包括Serial Dilution,Reagent Addition,Dilution,Plate Reformatting,Extraction,AmpliGrid,Cherrying Picking,PCR,Normalization,Vacuum Manifold等,用户可根据实际需求进行选配,同时进行相应盘面配件再升级。快速完成96个样品的转移一吸多喷,快速完成96个样品5块盘的分配基于PC的操作软件,模块化的测试模板保留用户可定义的动作方式 使用一次性移液吸头,或者使用可清洗钢针选配紫外消毒空气过滤防尘外罩前处理后的样品转移具备试剂喷加器,实现样品在线稀释开放系统,兼容各种第三方试剂与耗材 Aurora 基因组学液体处理工作站OEM 产品规格 机械零件组件能与所有类型的实验室设备兼容第三方设备整合OEM整合可以从我们以前的系统集成案例,了解我们作为自动化仪器在自动化工作流程的作用相关模块更多仪器模块配置根据你的实验项目需求推荐,欢迎点击【一键咨询】,【发送留言】后我们会马上联系您 Aurora 基因组学液体处理工作站OEM 原理 我们的目标是根据顾客资金预算和时间要求的基础上,尽力提供短时高xiao,稳定以操作的自动化整合方案 Aurora 基因组学液体处理工作站OEM 应用案例 典型应用1.可全自动完成从核酸提取到PCR反应建立的流程。用户只需要将一整板96个样品(全血,血清)都放在震荡器上,机器就会根据设定程序,添加溶液,转移到另一加热震荡器上裂解样品,添加磁珠,洗涤,洗脱,完成DNA提取的全过程。2.自动完成各种稀释和系列稀释工作任务,也能进行浓度归一的稀释操作3.各种常规的液体处理功能,包括盘面重排/复制,随机挑选,1对多分配,多对1汇集等4.配合不同的功能附件和支架结构可进行多种实验,如不同样本的核酸分离提取(DNA、RNA、质粒、病毒等),细胞分离和蛋白分离纯化,PCR反应体系的建立等;5.更多新功能,可根据用户的具体要求进行定向开发。 Aurora用户应用案例: Aurora产品应用报告列表(部分),更多更新欢迎查阅Aurora官网~ **VERSA&trade 1100 GENE在下一代测序(NGS)文库制备自动化的可行性验证** VERSA&trade 10 PCR体系构建工作站在分子诊断上应用**高通量PCR体系构建自动化方案**利用VERSA 110 PCR体系构建工作站进行Hot-start PCR体系构建**利用VERSA 110进行玻片PCR体系自动构建**实时荧光定量PCR体系构建自动化方案**一步实时荧光定量PCR法乙型肝炎病毒诊断试剂盒的自动化方案**利用VERSA 1100工作站以及Aurora试剂盒进行血液基因组提取自动化方案Applications Genomics &bull Automated Isolation of Genomic DNA using the MACHEREY- NAGEL NucleoMag Plant kit by Aurora Biomed’s VERSA 1100 &bull Automated Isolation of Genomic DNA using the MACHEREY-NAGEL NucleoMag Blood 200μL kit by Aurora Biomed’s VERSA 1100 &bull 采用性犯罪试剂盒差异消化方法在VERSA 1100自动化应用 &bull VERSA&trade 1100 GENE在下一代测序(NGS)文库制备自动化的可行性验证 &bull 全血样品中核酸提取应用报告 &bull 植物样品中核酸提取应用报告 &bull Automation of DNA Extraction &bull PCR Setup &bull Automation of Reverse Transcriptase PCR &bull Automation of Real time PCR &bull Automation of RNA Sequencing &bull Automation of Next Generation Sequencing &bull Automation of DNA Microarray &bull Automation of Miniprep &bull Automation of Sanger Sequencing &bull Automation of On-Slide (Amplislide) PCR Setup using VERSA&trade 110 PCR Setup Workstation &bull Food Safety Monitoring using VERSA&trade 110 NAP Workstation &bull Hot-Start PCR using VERSA&trade 110 PCR Workstation &bull DNA Isolation from Saliva (Invitek Forensic DNA Isolation Kit) &bull Nucleic Acid Prep for Avian Flu Viral RNA &bull β-Actin and Whole Genome Amplification (Sigma & Promega kits) &bull Genomic DNA Isolation from Blood (Promega) &bull Automation of Molecular Pathology Applications on the VERSA&trade 10 PCR Setup Workstation &bull Automated System for High Throughput PCR SetupExtraction &bull 高通量固相萃取&气相色谱-质谱联用方法定量检测吸毒者尿液中甲基苯丙胺和苯丙胺 &bull HTS Flux Assay Automation &bull Validation of Automated Liquid Liquid Extraction of 25-hydroxy vitamin D &bull Automation of Sample Preparation and Introduction into NMR Tubes &bull Liquid Liquid Extraction of β-carotene &bull Automation of Protein PurificationGeneral Liquid Handling &bull High-Density Peptide Array Printing &bull Specimen Staining for TEM (Array printing) &bull Automated Slide-Based Assay Setup using VERSA&trade 110 Workstation &bull VERSA&trade Spotter Workstation for Solid-Phase Peptide Synthesis &bull Automated Protein Crystallography Plate Setup using VERSA&trade 110欢迎点击【一键咨询】,【发送留言】后我们会马上联系您,为您的实验或应用需求推荐合适的仪器配置
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  • 高通量声波基因组剪切仪采用等温、非接触的方式对样品进行打断、匀浆和混合。对于每天要处理多个样品或者贵重样品的实验室,高通量声波基因组剪切仪具有处理高通量、参数设置灵活、实验步骤标准化、实验重复性较好、实验效率高、无交叉污染、样本低损耗、无需特殊专用耗材、实验成本低等优势。产品应用:主要用于细菌细胞破碎,蛋白质抽提、二代测序样本 DNA 片段化、免疫共沉淀实验、霉菌孢子破碎、乳化,均质,加速溶解,催化反应主要优势:1.通量高:一次最多可同时处理30个样品,实验效率高2.无需频繁操作探头:各样品均在单独的全封闭试管中,避免交叉污染,不产生感染性飞雾,不需额外插入超声探头3.产品配置丰富,适合于不同样品的实验:适用之样本管型式 0.1ml-5ml、15ml及50ml多种适配器4.采用4℃低温水浴超声波,能量分布均匀,超声作用完全,样品完全在低温环境中进行,避免了样品的变性5.采用7寸医用级电阻触摸屏触控操作,屏幕实时显示工作参数时间、温度、功率及连续模式和间隙模式显示6.仪器配有旋转马达,超声时自动连续旋转离心管适配器,使超声能量分布更均匀,确保样本效果达到一致7.样本破碎方式:利用磁致伸缩共振超声技术破碎样本,多种超声频率同时工作,能量输出均衡, 超声密度均一,非接触处理,确保实验效果一致性好8.操作简便,运行状态倒计时显示;微处理控制器设有密码保护功能,可自由编辑程序及自动记忆设定的程序;仪器具有报警功能,保证样品的完整性在高通量测序样本制备过程中,DNA片段化处理是一个核心步骤。DNA文库的质量和均一性程度都依赖于这一步。因此随机(获取全基因组覆盖的保证)、准确(测序质量和效率的关键)、集中无偏差(提高测序深度的关键)的DNA片段化是保证日常测序工作顺利进行的必要条件。它为研究人员提供了深入理解基因组的工具,并为生物科学和医学研究开辟了新的可能性。实验效果:现针对提取的一管全血DNA样本,投入量分别是200ng加入到0.2ml离心管中,具体实验条件及打断后的2100片段分布图如下。上图为:200ng片段分布图样品:200ng-17min打断测试图样品:200ng-20min打断测试图样品:200ng-23min打断测试图测试结论:通过Qsep100片段分析仪检测,打断的DNA片段在200-400bp区间占比分别是47.7%、49.2%、49.1%;片段平均值分别是290.3bp、287.6bp、283.7bp,说明该仪器打断效果不错,打断片段峰形为单一峰形,较完整。技术参数:主要参数参数范围型号JXDNA-500PICO温控范围2℃~40℃温度读数精确性at 0.1度压缩机功率600W超声频率多频率,频率自适应超声标称功率功率可调:0-100%,步进10%,也可细化至步进1%时间可调总时间可调:0.1s-9999m脉冲间隙时间可调:0.1s-99.9s超声水槽容积15*14*250px 材质304不锈钢换能器采用原装ibidi多频超声换能器 3组冷却系统便携式恒温槽主机(压缩机制冷)超声样品体积搭配不同适配器,超声样品体积可达2ml以上或5ul 以下适用样品型式包括0.1ml、0.65ml、1.5ml及20-50ml离心管,不需使用特殊材质(如玻璃)的耗材,节省实验成本样本处理数量多种适配器可以处理30*0.1ml,20*0.65ml,11*2ml以及5个5ml和4个50ml离心管,适配器材质为316不锈钢材质整机外壳ABS塑料材质开模制造,内置隔音棉噪音等级55db配套防止样品挂壁造成实验失败,提供样品挂壁的辅助设备一套配套离心管开盖工具,可以快速的协助工作人员打开离心管,避免样品开启污染。
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  • 基因组学温控系统 400-860-5168转4187
    组织样品均质器 美国MéCour公司于1999年成立,自成立伊始便全新研发了实验过程精确温控系统,凭借其精确、均匀和稳定的优秀特性,很大程度上取代了传统的以电控为基础的温控方式,现在已经成为实验过程精确温控系统的全球知名品牌,供应生物和制药行业,客户包括诸多业内知名机构。MéCour公司温控系统高效、精确、可靠,适合各种应用条件,用于生物样品试剂盒、药物筛选、基因组/蛋白组和复合存储管理,可与大多数仪器配合使用,帮助实验室提高产出,避免浪费。产品设备型号多样,可放多种形状的容器,如板状和管状容器,也可放各种试剂罐或试剂瓶,可定制,使用方便。 应用领域MéCour实验过程精确温控系统可应用在许多领域,如化学、免疫和生物试剂盒,可转接的设计使其同时适合独立的桌面型应用或配合其他自动化体系使用。需要精确温控的试剂盒都可统一用MéCour实验过程精确温控系统控制,这样就无需单独控制各个试剂板、管或瓶。敏感试剂可保存在某特定温度,试剂罐也可放在平常的地方,方便操作。 主要特点 与诸多知名品牌设备兼容,包括Beckman Coulter, Agilent, Thermo, Perkin Elmer等可单独使用,也可与现有的进样器和自动化设备整合使用另有特制的控温单元可用于进样阀、进样针、色谱柱和多孔板等连接方便,密封性好 技术参数控温范围 -100-300℃温度精度 ±0.1℃
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  • 宏基因组测序IntroductionMetagenomic sequencing extracts and high-throughput sequencing all microbial genomic DNA from environmental samples, and analyzes all microbial genomic information in the sample environment. Metagenome sequencing interprets the diversity and abundance information of microbial population, analyzes the genome and function of microbial population, explores the relationship between microorganism and environment, microorganism and host, and explores and studies new functional genes.1. Content of bioinformatics analysis 1.1 Sequencing quality analysis, statistics and evaluation 1.2 Database comparison1.3 Species abundance analysis1.4 Functional gene annotation1.5 Difference analysis of gene functional abundance1.6 Pathway enrichment analysis1.7 Abundance difference gene and species cluster analysis1.8 PCA analysis2. Sample requirements 2.1 Total amount 5 µ g gDNA2.2 Concentration 100 ng/µ L 2.3 260/280 1.8
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  • MobiNova-M1微生物单细胞基因组测序建库系统墨卓Microbe-seq集成多种液滴微流程操作技术,能在不损失分辨率或广泛物种适用性的基础上,从微生物群落中解析出菌株水平的高质量基因组, 助力微生物研究进入单细胞时代。
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  • 高通量超声波基因组剪切仪又名聚焦超声波剪切仪,声波基因组剪切仪,XM-M220单槽XM-ME220双槽高通量声波基因组剪切仪是在传统超声波处理基础上的技术革新,通过球面固态超声换能器将声波以三维方式聚焦到样本区域,聚焦声波能够以不同角度的能量输入获得良好的处理效果,避免传统超声能量的不聚集可能引起的样本处理过度及热损伤。采用等温、旋转离心管及非接触的方式对样品进行打断,匀浆和混合。用于无菌、超微量破碎,隔着离心管能打断染色体。且不产生感染性飞雾,超声探头与样品不接触,避免交叉污染。自动声波聚焦通过精确的控制系统和自动化的冷水机操作,为样本处理提供高效可控、重复性优良、温度恒定及无污染的处理环境。目前已广泛应用于基因组学、蛋白质组学、细胞生物学等研究中。更短的波长-低至3mm波长,与生物样本大小相同数量级,更容易聚焦。更集中的声波-精确聚焦声波至样品区域,减少能量损失,带来更低的功耗。更安静更健康-临床医学级超声频率,处于安全听力范围之外,无噪音,对人体无害。基本原理:通过压电转换器,将电信号转变为高频声波信号,产生数百万的分子“空穴”,利用“空穴”在几秒内变大、破裂产生的瞬时流体剪切力,通过等温、非接触的方式对样本进行打断、匀浆和混合。应用领域:组织破碎与匀浆、蛋白质提取、蛋白质消解、DBS血卡收集提取、MALDI-TOF样本处理、细胞及亚细胞组分裂解、ccfDNA提取、ChIP染色质剪切、DNA/RNA提取、生物标志物提取、DNA/RNA片段化、FFPE样本核酸提取、配方设计、脂质体制备、纳米颗粒制备、化合物分散/溶解、药物合成与微粉化不同片段化方法的对比:超声波打断法;操作简单,耗时短,成本低;随机片段化,无GC序列偏好;剪切效果不受DNA浓度影响;片段化结果集中度高.目的长度片段得率高。酶切法:实验要求严格,针对不同样本合适的片段化条件摸索不易,成本较高;存在序列偏好性;需要根据样本浓度改变酶浓度,酶活性易受到溶液成分影响;目标长度片段集中度较低。传统探头和非接触式的对比:传统探头超声波破碎仪探头与样品直接接触,有金属离子污染,一次只能处理一个样品,实验周期长。对于多个样品,需要重复使用同一探头,容易造成样品交叉污染。由于每次探头插入样品的深度不一,每次超声的能量分布也不尽相同,影响实验结果的重复性和准确性。由于不能采用封闭系统,在超声过程中产生的气雾或者泡沫会扩散到环境中,造成潜在的生物危险。非接触式超声波破碎仪消除了传统的手持探头,固定探头的繁琐。消除了样品交叉污染的危险 能隔着离心管能打断染色体、破碎细胞。无气雾浮质产生-增强生物安全性.用于无菌操作。主要优势:1.通量高:一次可同时处理30-60个样品,实验效率高2.无需频繁操作探头:各样品均在单独的全封闭试管中,避免交叉污染3.产品配置丰富,适合于不同样品的实验:适用之样本管型式 0.1ml-15ml多种适配器4.超声参数设置灵活,实验步骤标准化,实验重复性好,结果可靠性高5.无需特殊专用耗材,实验成本低6.采用4℃低温水浴超声波,能量分布均匀,超声作用完全,样品完全在低温环境中进行,避免了样品的变性性能特点:1.无需特殊耗材,操作简单,时间快,通常一个实验最短时间只需5分钟2.仪器配有旋转马达,超声时自动连续旋转离心管适配器,使超声能量分布更均匀3.采用7寸医用级电阻触摸屏触控操作,屏幕实时显示工作参数时间、温度、功率及连续模式和间隙模式显示,操作简便,运行状态倒计时显示4.微处理器设有密码保护功能,内置程序,可根据样品类型,输入不同的程序,达到实验目的,无需频繁搜索实验条件5.仪器具有超电流、超电压、超温报警功能,当温度超过设定温度,自动停止超声并报警,保证样品的完整性实验效果:1.gDNA不同起始量打断效果 可对不同起始量的样品体积进行打断,可得到高重复的DNA剪切结果,不同初始样本量均能得到一致性的片段。2.全血片段对比:3.不同投入量和不同超声时长的测试结果:在投入量分别是200ng时,通过Qsep100片段分析仪检测,打断的DNA片段在200-400bp区间占比分别是47.7%、49.2%、49.1% 片段平均值分别是290.3bp、287.6bp、283.7bp,在投入量分别是300ng时,通过Qsep100片段分析仪检测,打断的DNA片段在200-400bp区间占比分别是49.4%、49.2%、49.3% 片段平均值分别是288.0bp、284.3bp、284.2bp,说明该仪器打断效果不错,打断片段峰形为单一峰形,较完整。4.相同处理时长的样本混合后,琼脂糖凝胶电泳检测结果:图2:处理时长相同的样本(8组)均匀混合后电泳检测结果Marker 条带从下往上依次为100bp、200 bp、300bp、400bp(最亮条带)、500bp、600 bp。技术参数:型号XM-M220(单槽)XM-ME220(双槽)超声频率20-400KHz混频超声功能,频率自适应总时间可调0.1s-9999min,脉冲间隙时间可调:0.1s-99.9s超声水槽容积15*14*10cm23*14*10cm进口原装多频超声换能器4组8组超声样品体积2mL以上或5μL以下样本处理数量32*0.1ml,20*0.65ml,11*2ml以及5个5-15ml离心管60*0.1ml,40*0.65ml,22*2ml以及10个5-15ml离心管适配器材质316不锈钢材质噪音等级<55dB冷却系统便携式恒温槽主机(压缩机制冷)温控范围2-40℃温度读数精确性at 0.1℃压缩机功率600W研究领域:组蛋白的修饰研究、染色质表观遗传修饰研究、转录调控分析、药物开发研究、有丝分裂研究DNA损伤与凋亡分析等。
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  • 高通量声波基因组剪切仪采用等温、非接触的方式对样品进行打断、匀浆和混合。对于每天要处理多个样品或者贵重样品的实验室,非接触超声波DNA破碎仪具有处理高通量、参数设置灵活、实验步骤标准化、实验重复性较好、实验效率高、无交叉污染、样本低损耗、无需特殊专用耗材、实验成本低等优势。产品应用:主要用于细菌细胞破碎,蛋白质抽提、二代测序样本 DNA 片段化、免疫共沉淀实验、霉菌孢子破碎、乳化,均质,加速溶解,催化反应主要优势:1.通量高:一次最多可同时处理30个样品,实验效率高2.无需频繁操作探头:各样品均在单独的全封闭试管中,避免交叉污染,不产生感染性飞雾,不需额外插入超声探头3.产品配置丰富,适合于不同样品的实验:适用之样本管型式 0.1ml-5ml、15ml及50ml多种适配器4.采用4℃低温水浴超声波,能量分布均匀,超声作用完全,样品完全在低温环境中进行,避免了样品的变性5.采用7寸医用级电阻触摸屏触控操作,屏幕实时显示工作参数时间、温度、功率及连续模式和间隙模式显示6.仪器配有旋转马达,超声时自动连续旋转离心管适配器,使超声能量分布更均匀,确保样本效果达到一致7.样本破碎方式:利用磁致申缩共振超声技术破碎样本,多种超声频率同时工作,能量输出均衡, 超声密度均一,非接触处理,确保实验效果一致性好8.操作简便,运行状态倒计时显示;微处理控制器设有密码保护功能,可自由编辑程序及自动记忆设定的程序;仪器具有报警功能,保证样品的完整性在高通量测序样本制备过程中,DNA片段化处理是一个核心步骤。DNA文库的质量和均一性程度都依赖于这一步。因此随机(获取全基因组覆盖的保证)、准确(测序质量和效率的关键)、集中无偏差(提高测序深度的关键)的DNA片段化是保证日常测序工作顺利进行的必要条件。它为研究人员提供了深入理解基因组的工具,并为生物科学和医学研究开辟了新的可能性。
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  • 1、软件为中文版本,具有中文界面和操作提示,方便技术人员准确、快捷地对生物信息数据进行比较筛查、分析研究、监测溯源,同时具备中英文双语言切换功能。可构建基于项目导向的多用户关系型数据库,数据库支持文本、数字、日期等格式的字段存储;数据库管理员可针对字段进行权限设置,限制其它用户对数据库字段进行编辑更改;内置高级搜索引擎,可实现样本字段信息及实验数据的快速检索查询等;支持多类型实验数据存储的多数据库系统,支持数据库层级划分,可更直观的展示多样本重复实验;支持Excel、csv、txt、XML等多种数据格式的数据导入及导出。2、指纹数据模块:可用于处理电泳数据(包括凝胶电泳和毛细管电泳)、色谱数据、光谱数据等,实现用户对可变数目串联重复序列(VNTR)、 多位点串联重复序列分析(MLVA)、 基于CECE的异源双链分析(HAD)、金黄色葡萄球菌A蛋白分型(spa-typing)、AFLP标记辅助育种(AFLP-based breeding)等实验进行数据存储与分析。3、特征数据模块:支持自定义各种类型(二进制或连续型)的特征数据,包括生化以及形态学特征数据、酶动力学测试数据、抗生素抗性分析以及基因芯片中的各个基因表达量数据等。根据实验情况用户可以从一到成千上万个特征数据的自定义且特征数据容量的大小不受限制。同时特征数据模块也被用来存储其它实验分析过程中的数据结果,例如在MLVA分析中存储可变数目串联重复序列的个数;MLST中的等位基因数目;抗生素抗性以及HIV抗药性分析中的抗性数据等。可用于处理特征字符数据,包括抗生素敏感性实验数据、生化指标、微阵列芯片数据、酶活测试和代谢活性数据等。*4、序列数据模块:支持EMBL、GenBank等数据库中的数据直接导入;支持FLAT A、FASTA、高通量测序数据等多种类型的序列数据导入;可以直接导入核酸和氨基酸序列;支持Sanger测序数据处理和拼接;支持完整的IUPAC代码一致性命名;支持序列编辑功能;支持SNP检测和分析(结合树状分析和网络推理模块、基因组分析工具模块);强大的自动化批量组装用于高通量序列数据处理;支持BAM和SAM格式的序列分析数据导入;支持交互式探索的环状基因组草图展示;支持多测序数据分析平台的FASTQ格式的序列数据导入,例如Genome Analyzer、MiSeq或 HiSeq (Illumina), SOLiD 平台(Applied Biosystems), Ion Torrent PGM (Life Technologies), PacBio RS (Pacific Biosciences) 以及HeliScope 测序平台 (Helicos BioSciences);支持氨基酸序列及核算序列的BLAST分析;支持Open Reading Frame框架分析功能;支持基于NCBI数据库的在线BLAST分析 支持限制性内切酶位点分析、引物设计、序列比对、突变位点查找等功能。5、分类鉴定模块:以利用监督式学习(朴素贝叶斯、支持向量机等)对数据进行分类、数据库筛选、决策网络构建和菌种分类鉴定等。*6、树状分析及网络推理模块: 能对关系数据库中的多种实验数据进行聚类分析。BioNumerics通过把关系数据库中的各种记录之间,各种实验之间,用多种有效的聚类算法实现多种聚类分析,包括皮尔逊积差相关性分析、余弦相关性分析、Dice、Nei、Li、Jaccard、Jeffrey X、Ochiai相关性分析;支持UPGMA、WPGMA、Furthest Neighbor、Nearest Neighbor、Ward、Centroid、Median等多种聚类分析算法。*7、具有基因组分析工具模块:提供基因组和染色体比对分析、基因注释、wgSNP分析等功能。支持自定义二级分析框架(如cgMLST、rMLST等)的构建。配合表型分析插件,可以获取分离菌的血清型、病毒性和耐药性等数据。支持N个染色体序列的NxN相似性矩阵的比对分析;支持基因组序列注释;支持全基因组的SNP位点提取及数据分析。
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  • Sanger测序和片段分析的创新成果Applied Biosystems? SeqStudio?基因分析仪:? 使用全新的SeqStudio基因分析仪进行测序和片段分析? 直观的运行设置和实时质控结果监控 ? 通过连接功能无缝整合到Thermo Fisher Cloud现有测序应用组合中? 集数款强大的Sanger测序和片段分析应用亮点于一体,包括:- 质粒测序- 肿瘤学研究- 种属鉴定- CRISPR-Cas9基因组编辑分析- 人细胞系鉴定- Applied Biosystems? SNaPshot? 基因分型- 用多重连接探针扩增 (MLPATM) 技术分析人拷贝数变异 (CNV)Applied Biosystems?基因分析仪以可靠性和值得信赖的结果为立足点。作为Applied Biosystems?毛细管电泳 (CE) 基因分析仪产品系列的成员,SeqStudio基因分析仪同样基于这一理念,但同时又追求易用、易维护,易于存取和分享数据。在本应用指南中,我们将介绍先进特性——将Sanger测序和片段分析的可靠性,与远程监控和云应用便利性结合在一起。多功能卡夹这款仪器的易用性在于zuida限度提GAO效率和便利的新型卡夹设计。SeqStudio基因分析仪采用一种含有毛细管阵列、 POP胶以及阳极缓冲液的多功能卡夹。该卡夹可插拔,并可在仪器上存放达四个月之久。每个卡夹上均含有SeqStudio 系统所独有的新型聚合物,无需重新配置即可进行Sanger 测序和片段分析。多达四个毛细管可以处理来自标准96孔板或8联管的样品。卡夹和阴极缓冲液容器均带有射频识别 (RFID) 标签,可跟踪二者各自在仪器上加样(卡夹)和存放的时长(阴极缓冲液)。这一特性使科研人员可以利用同一台仪器,根据需要管理并使用自己的卡夹,进一步提高灵活性。zui后,SeqStudio基因分析仪的维护工作也得到简化。仪器校准工作通过成像和算法工具的先进功能自动化完成。紧凑的仪器设计SeqStudio仪器具有小巧的外形,同时配有机载计算机和一体触摸屏,让您可快速、直观、灵活地进行运行设置。运行软件经过专门配置,可在运行不中断的情况下,在同一块板上设置测序和片段分析反应并在仪器上运行。这一特性开辟了简化分析的全新机会——例如,在同一次CE 运行中,您可将基于测序的位点突变筛选检测与基于片段分析的CNV检测结合在一起。连通体验通过整合无线连接功能,仪器的便利性提升至全新水平,由此可通过联机触摸屏,远程计算机和移动设备APP 操作仪器。用户可使用联机计算机或独立的软件 PlateManager(在Thermo Fisher Connect或单独的计算机上工作的独立软件)来设置运行。通过使用基于网页浏览器的软件,只要能上网,就能随时随地地访问运行设置、反应板图、运行条件和分析设置。加样条件、重新加样和重新调整加样次序可在运行期间调整,从而zui大限度提高从每块板采集优质数据的能力。采集数据后,基于网页浏览器的应用程序组合包(Sanger Quality Check、Sanger Variant Analysis和Next-Generation Confirmation (NGC))可轻松、方便地分析数据。完成运行后,DNA序列变异、序列比对,以及片段分析工作均可立即开展。zui后,云连接允许合作机构在不同地点监控、存取和分享数据信息,快速分析统一数据集。在本应用指南中,我们将演示如何将全新的SeqStudio基因分析仪无缝整合到部分常见的Sanger测序和片段分析应用中。SeqStudio基因分析仪的易用性和数据分析便利性,可为研究人员带来zui大限度的灵活性,使该系统成为基因分析工具包之中不 可少的新利器。质粒测序Sanger测序zui常见应用之一是分析亚克隆到质粒之中的插入片段。Applied Biosystems? BigDye?化学试剂被Sanger 测序广泛使用,是质粒测序工作流程不可分割的一部分。 SeqStudio平台的部分新特性包括,可让质粒测序研究人员获益。该仪器预先加载了针对短 (600 bp) 长读长应用优化的测序模块,还可针对特殊要求进行定制。其配备的可插拔式卡夹可关联单独的项目和用户。基于云的Sanger Quality Check应用程序包含了一套分析测序痕量数据直观工具。zui后,云连接功能支持远程监控、存取和分享测序信息,有助于合作机构快速分析统一数据集。通过pGEM7zf+质粒、M13引物和Applied Biosystems? BigDye? Terminator v3.1化学试剂,测定SeqStudio仪器的质粒测序性能。通过Thermo Fisher Cloud(图3)上的Sanger Quality Check模块分析测序痕量数据,获得分析结果。在本实例中,测序16个孔内的相同质粒,并在SeqStudio基因分析仪上通过4次加样分析。请注意,各样品的痕量数据得分、峰间 (PUP) 值、连续读长 (CRL) 和QV20+(质量值大于20的长度)相似。使用Applied Biosystems? BigDye? Terminator v1.1化学试剂进行的其他序列测序和实验获得了相似结果。这些数据表明,SeqStudio平台可以获得极高质量的质粒测序结果。肿瘤学研究、二代测序验证临床研究人员可采用SeqStudio基因分析仪保证金标准检测质量,验证肿瘤组织中是否存在突变等位基因。SeqStudio 系统通过整合以下工具,简化了Sanger测序工作流程:? 针对提取自福尔马林固定石蜡包埋组织的片段化DNA, SeqStudio基因分析仪预装载了经过优化的运行模块。? 基于云的NGC模块,允许研究人员通过Sanger测序痕量数据,快速验证二代测序 (NGS) .vcf文件发现的变异。? 频率低至5%的等位基因变异,可采用Applied Biosystems ? Minor Variant Finder (MVF) 软件以及SeqStudio仪器生成的Sanger痕量数据检测出来。? Applied Biosystems? BigDye? Direct和BigDye XTerminator?化学试剂提供了单管测序和回收解决方案,简化了Sanger测序工作流程。SeqStudio基因分析仪检测肿瘤样品突变等位基因的性能,可通过分析源自10份不同FFPE肿瘤样品的基因组DNA、测定4种不同热点区域的变异频率来测定。采用Ion Torrent? Oncomine? Oncology Focus Panel进行NGS,通过BigDye Direct/BigDye XTerminator化学试剂和MVF软件进行Sanger 测序,测定突变等位基因的频率。通过与NGS测得的等位基因频率相比较(约9%-70%),SeqStudio基因分析仪测得的频率相关性非常出色。SeqStudio基因分析仪的变异频率分析能力,也可使用含有靶向KRAS和NRAS中常见致瘤突变的Sanger测序引物的 96孔板进行测定。使用SeqStudio精确测定1 ng稀释的FFPE 来源DNA中低频等位基因频率。因此,需要检测罕见等位基因的研究人员可充分信任SeqStudio基因分析仪能够产生FFPE组织精确分析结果。zui后,基于云的NGC应用可以根据扩增子和样品组织整理 Sanger测序数据,并与.vcf文件之中的候选变异序列进行比对,简化了NGS变异数据的验证工作。ZUIda展示NGC APP 在肿瘤学工作流程之中的应用,我们采用Sanger测序,验证通过Oncomine Oncology Focus panel发现的NRAS突变是否存在。 SeqStudio结果证明 NRAS (p.Ala59Thr) 中的突变存在。因此,NGC APP对测序痕量数据有意义部分的集中、快速检验,有助于促进NGS变异验证工作。
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  • 日立DS3000紧凑型基因分析仪 上世纪90年代初,三大科学计划之一的 “人类基因组计划”启动,并于2001年完成了人类基因组草图,而这一伟大工程,正是基于“Sanger法”的DNA测序技术。 随着科学技术的不断发展,一代测序受检测效率的限制,无法应对大量基因组测序的需要,因此二代测序、三代测序技术,甚至四代高通量测序技术不断涌现。但一代测序因其极高的准确率,直到今天仍然在科研、法医、疾控、食药及临床领域等广泛使用,也是高通量测序验证过程中的重要环节,因此,被称为基因检测的金标准。制药,食品,科研等研究机构均需要通过测序来进行基因分析,为了满足该需求,日立研发了紧凑型基因分析仪“DS3000”,现已全新上市。 日立DS3000秉承日立高新多年来研究开发的毛细管技术与激光辐射技术,作为小型CE测序仪不仅外形“紧凑”,还实现了“高性能”及“高速处理”,可轻松完成片段与测序分析。此外,本产品还采用了环境友好型设计,通过减少在产品使用时排出的CO2排放量,为客户提供可降低环境负荷的产品。DS3000采用4通道毛细管,一次性可处理32个样本,可同时进行6色荧光检测。支持短串联重复序列分析、微卫星不稳定性检测、突变分析和测序分析等用途。 产品特点:1. 操作简便-结构紧凑&触摸屏设计设备采用GUI的触摸屏显示设计,宽400 mm×长600 mm×高600 mm,结构紧凑,节省空间。触摸屏采用扁平化设计,界面布局直观,加强操作的便捷与实用性。 -卡槽式包装耗材耗材包装采用卡槽式设计,安装简便。-流程高效1. 简化的操作流程,安装方法和步骤说明清晰易懂,无论是初次使用仪器的新手,还是不定期使用仪器的用户,均可轻松完成操作。 2. 配备远程监控系统:DS3000配备远程监控系统,支持“远程设备访问”,可以在Web端监测设备状态,设置检测条件,显示分析结果及生成报告等。进一步提升了操作的便利性,实现高效的工作流程。3. 方便普适,用户可使用任何电脑:可使用用户端网络及电脑输出报告,进行二次解析等。 2. 系统智能-智能耗材管理耗材使用情况实时监控,根据参数,系统能够自动计算出耗材剩余使用次数,提高耗材管理效率。-检测结果智能判断校准检测通过波形及数值表现每道毛细管的信号强度,样本检测根据质量参数设置,自动判断检测结果合格与否,一目了然。 3. 性能优异-创新无泵注胶系统——无需清洗泵,无需排气泡DS3000 采用无泵注胶系统,并成功研发出可移动密封式注射型聚合物,经久耐用,在填充聚合物时无需排气泡,避免了不必要的浪费,同时免除了以往的清洗步骤,有助于缩短维护时间并降低成本。由此可降低用户维修频率,操作性能得到极大提升。 -创新设计光源——使用寿命更长DS3000采用全新设计的激光二极管光源 (LD光源),受模拟脉冲信号控制,DS3000仅在检测时打开光源,与以往光源相比,延长了实际亮灯时间。 日立DS3000基因分析仪作为一款小型的集成化台式DNA分析仪,“紧凑”而“高效”,可以帮助生命科学专家在各种规模实验室进行Sanger测序和DNA片段分析工作。
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  • 简介分子溯源遗传分析系统,是由杭州柏熠科技有限公司开发的一款面向于微生物测序数据的一键式图形界面分析系统。本分析系统同时支持Nanopore、Pacbio、Illumina、MGI、Ion Torrent等主流三代和二代高通量测序数据输入,可实现快速简单分析。系统提供测序样本统计、基因组覆盖度统计、基因组覆盖深度图展示、变异位点分析、进化树分析及展示、进化热图、最小生成树等分析功能。功能介绍本系统同时支持Nanopore、Pacbio等三代测序数据和Illumina、MGI、Ion Torrent等二代测序数据进行生物信息学分析,具体功能如下:1.支持用户样本临床信息批量上传和管理 2.支持fast5、fastq及fastq.gz等多种格式的测序数据 3.支持同一任务多个样本同时分析 4.支持从下机数据上传到输出结果报告一键式操作 5.支持一键式生成PDF格式分析报告 6.分析系统分析结果包含:样本统计表、多序列联配结果、变异位点统计表、进化树、进化热图、最小生成树 7.支持分析数据及结果下载、图表输出、病人信息关联等 8.分析系统能够提供国家认可的计算机软件著作权登记证书或其他知识产权证明。
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  • 一、概述-- Xenium组织空间原位多组学分析系统这是一台高度自动化、高通量的组织原位分析技术平台,帮助用户实现亚细胞分辨率的靶向基因和蛋白表达原位分析。它在10x Genomics早期收购的ReadCoor和Cartana的基础技术之上做了大量研发和改进。Xenium将单分子RNA和蛋白检测的功能与强大的光学元件、数据采集和解码技术相结合,能够以亚细胞分辨率在整张切片上快速检测大量靶点的组织原位表达水平。该平台可以兼容多种样品类型,包括新鲜冷冻(FF)组织和福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织。Xenium平台拥有一条不断拓展的产品路线图,不断增强核心平台的分析能力和分析物种类,比如一张切片同时检测RNA和蛋白质表达水平。品牌10x Genomics,型号Xenium In Situ,产地新加坡,代理商是斑马鱼(北京)科技有限公司,从组织制备到数据分析,该平台将会得到技术专家团队的全方位支持。二、平台概览 The Xenium In Situ platform有了Chromium和Visium等分析,研究人员能够分别检测单个细胞或整张组织切片的全转录组。在后续研究中,他们可以采用靶向原位分析技术,这不仅能够在组织细胞生物学状态下对细胞进行定位和分型,还能够针对先前从Chromium和Visium数据中获得的信息来详细研究各种具体问题。Xenium平台可帮助科学家展示、定量和分析固定在载玻片上的FF和FFPE组织切片中的基因表达和蛋白丰度。还将提供一系列针对不同组织类型和应用场景的试剂菜单选项,以及添加客户定制靶点的选项,从而实现对目标靶点进行高灵敏度的原位分析。这是一个端对端的完整解决方案,包含一台强大的可实现高通量分析的全自动仪器,提供机载分析功能,可处理图像数据,定位RNA和蛋白信号,并开展二级分析。您也可以轻松地传输数据,使用10x Genomics提供的软件或您选择的第三方软件工具进行分析可视化。三、工作流程概览Xenium工作流程从在Xenium载玻片上制备组织切片开始(图1)。对切片进行处理以暴露出易于杂交的RNA和蛋白质分子,并分别用可环化的DNA探针和带有DNA标签序列的抗体进行杂交标记。DNA探针的两侧带有两个目标RNA特异性的独立杂交的区域。它们还包含基因特异性的标签序列。每对探针末端在与目标RNA区域杂交后会连接产生可酶促扩增的环状DNA探针。这种连接设计确保了每对探针与目标RNA区域杂交的高特异性。蛋白质检测将是该平台未来将拓展的一项功能,它将采用荧光探针杂交标记蛋白的DNA条码序列来检测组织切片中每种标记蛋白的表达水平。每次实验中,可将最多两张载玻片放入Xenium分析仪内。结合在RNA上的扩增后的DNA环状探针与荧光标记的已知短序列探针结合,产生明亮、易于成像且信噪比高的信号。样本经过连续几轮的荧光探针杂交、成像和去除。接着生成每个基因特异性的荧光特征条码,从而实现目标基因的定位和识别。通过荧光探针与抗体上DNA标签序列的杂交可进一步检测蛋白质,并构建出整张组织切片上转录本和蛋白质的全景空间表达图谱。然后,通过细胞核染色,确定细胞核膜位置、形态来推断细胞边界,或通过细胞形态染色来确定细胞边界。最后将细胞边界信息映射到RNA和蛋白表达图像上,并将转录本和蛋白质根据位置坐标分配给每个细胞。四、Xenium平台1.样本制备Xenium工作流程与FF组织和FFPE组织都兼容,首先是在Xenium载玻片制备所需组织的切片。这些切片经过脱蜡和透化等处理,让RNA和蛋白分析物暴露出来。RNA与可环化的DNA探针杂交结合,该探针包含两个与目标RNA特异性杂交的区域以及另一个基因特异性标签序列区域。探针的两端与目标RNA杂交结合,通过连接两端后产生环状DNA探针。如果探针发生非特异杂交或脱靶,则不会发生连接反应,从而抑制非特异性信号并确保高特异性。未来的蛋白检测功能将采用荧光探针杂交标记抗体的DNA标签序列来检测组织切片中每种被标记蛋白的表达水平。DNA探针连接后,环化探针经过酶促扩增,生成每个RNA杂交事件的基因特异性标签序列的多个拷贝。这会产生更强的信号,易于成像分析且信噪比高,这在分析自发荧光背景高的样本(如FFPE组织)时尤其重要。2. Xenium分析仪上的解码流程Xenium分析仪(图2)是全自动的,带有数据并行处理功能,可快速输出数据,帮助用户及时进行数据分析解读。仪器内置成像系统使用高数值孔径(NA)以及带有低噪声传感器的快速区域扫描照相机,可实现约200 nm的像素分辨率。它的视场为600 x 900 μm,Z轴多层光切图像是在整个组织厚度上以0.75 μm的步长逐一获得的。FFPE组织切片的常见厚度通常为5μm,而FF组织切片厚度为10 μm。采集的图像可通过Xenium分析软件进行处理,以实现sub-50 nm定位分辨率的单分子水平检测。此外,该仪器还集成了样本处理、液路和宽场荧光显微镜成像系统。Xenium分析仪一次运行最多可上样两块载玻片,每块玻片的可成像分析区域面积约为12 x 24 mm。这样大小的成像分析面积让科学家能够灵活地在每块载玻片上放置多张切片和多个样本。分析物检测和图像采集分析是在Xenium分析仪上按逐个循环进行的。试剂耗材(包括检测RNA和蛋白质分子的荧光标记探针)在仪器内全自动运行每个循环、孵育、成像和移除。在荧光标记的探针与扩增后的基因特异性标签序列结合后,样本会经历连续几轮的荧光探针杂交、成像和探针移除。对于分析物检测,在此过程的每个循环中,每个标签序列,也就是每个RNA的标记,都以特定的颜色打开或关闭。这会产生每个基因特异性的荧光特征条码。在读取这个打开或关闭的荧光特征条码后,软件可解码出所有目标基因的身份。在仪器结束运行时,系统对数据进行分析整合,并构建整张组织切片上转录本的空间图谱。成像系统使用高数值孔径以及带有低噪声传感器的快速区域扫描照相机,实现高灵敏度和高分辨率的原位分析。3. 基因和蛋白靶向试剂Xenium平台使用靶向试剂组合在亚细胞分辨率水平检测组织原位基因和蛋白表达量。使用组织和应用特异性基因组合,并支持额外客户定制基因选项,将是解决不同类型样本中基因和蛋白表达多样性和差异性的最好策略。商业基因组合试剂是经过大量数据挖掘甄选后构建的,综合了全面的单细胞图谱研究结果以及各个研究领域专家的人工审核和宝贵建议。基因组合10x Genomics正在针对某些组织和应用开发商业试剂的基因组合菜单。这些模块化的组合可分开或组合使用,可以更好的支持各个项目的个性化需求。每个Xenium基因组合预计包含几百个基因,并且可针对每个项目进行定制,目前计划最多可添加50个客户定制基因。商业试剂组合定制基因组合的最初的最大多重检测能力为400个基因。Xenium平台本身是为1,000个基因的多重检测能力而开发的。未来的产品扩展将让Xenium基因组合适用于更多物种、组织和研究应用方向。最终也将有望根据研究人员的需求提供更多客户定制功能。蛋白质组合未来的产品线扩展将增加蛋白质组合,作为Xenium产品线的一部分。4. 软件系统——数据管理和分析Xenium平台包含机载分析功能,能够处理图像数据,定位分析物信号,并开展二级分析,以便将分析的靶点表达信息分配给不同细胞,生成分析物表达谱——细胞矩阵。二级分析使用细胞核和细胞形态信息来鉴定组织切片上的细胞边界。机载分析与仪器运行并行开展,实现最短运转周期。Xenium整体解决方案还将包含基因组合探针设计工具,以便完成上游实验设计和个性化实验定制功能。Xenium解决方案还包含了用于下游分析的数据分析管线和可视化工具,让科学家能够探索和挖掘Xenium数据。这将帮助科学家能够快速获取可分析、解释的组织原位分析数据。Xenium分析仪产生的数据可轻松从仪器中下载、转移出来,并与对应的组织形态和细胞边界等信息结合分析,通过10x Genomics提供的软件进行可视化和进一步分析。此外,数据还可以开放的标准文件格式输出,便于研究人员使用第三方软件和专业研究者开发的高阶工具进行数据分析。5. 技术培训和支持10x产品包括Xenium、Visium CytAssist、Chromium Controller,Chromium X、Chromium™ Next GEM Single Cell 3' GEM, Library & Gel Bead Kit、Visium Spatial for FFPE Gene Expression Kit、Chip G、Feature Barcode Library Kit……斑马鱼(北京)科技有限公司是10x Genomics代理商,负责销售仪器和试剂,具备丰富的单细胞测序和空间转录组实验方面经验,可为用户提供单细胞悬液制备,建库,测序,生信分析等一整套解决方案。在购买Xenium分析仪后,将安排有资质的工程师进行现场安装和培训。培训内容包括样本制备、仪器操作、数据分析。在培训完成后,客户还将获得全方位支持,包括远程技术支持(Technical Support)、现场应用科学家(FAS)、现场服务工程师(FSE)和生物信息学应用(Applied Bioinformatics)团队,覆盖实验工作流程、试剂耗材、仪器和软件的各个方面。6. 基础技术Xenium技术建立在收购ReadCoor和Cartana公司而获得的专利技术基础之上,这两家公司分别由George Church和Mats Nilsson实验室开发并商业化而来,Xenium技术同时融合了10x Genomics自主开发的专利技术。综合以上各种基础技术产生的10x Genomics专有的原位分析技术在灵敏度、特异性和样品通量方面都比原来基础技术提高了数倍。五、代表性的数据以下这些数据集,是使用Xenium分析仪和200基因的人类乳腺癌基因组合从FFPE包埋的人类浸润性乳腺癌组织切片上生成的,并与同一组织块的苏木精和伊红(H&E)染色切片进行比较,H&E染色切片之前由病理学家进行了切片注释,并通过Visium FFPE技术进行了检测和分析。1. Xenium数据使用包含200个基因组合试剂对人类浸润性乳腺癌FFPE组织进行分析。分析后生成了一幅转录本的空间图谱,每个RNA转录本带有x、y和z坐标。通过DAPI染色确定细胞核边界,并通过扩展细胞核边缘来估算细胞边界(图3)。所有RNA转录本被分配到特定细胞中,并生成gene-by-cell矩阵。根据每个细胞的RNA含量和基因组合中的标志物识别细胞类型。例如,ERBB2可用来鉴定肿瘤细胞,而编码核心蛋白聚糖的DCN可用来鉴定基质细胞。淋巴细胞和巨噬细胞可通过特定CD标志物来鉴定。按照分配的细胞类型对不同细胞进行不同色彩标识。这就产生了按细胞类型来区分的细胞空间表达图谱,每个细胞内有分配到该细胞的全部靶向RNA转录本。2. 关联数据比较来自同一乳腺癌FFPE组织块切片的H&E染色结果显示出独特的肿瘤特征。病理学家对该FFPE切片的注释,确定了浸润肿瘤被各种纤维组织、脂肪组织和肿瘤坏死区域环绕。Xenium数据与病理学家注释的浸润癌的特征具有很好的相关性(图4)。接着使用Visium FFPE空间基因表达分析对同一组织切片进行处理,以便将通过Visium数据观察到的空间表达图谱分布与通过Xenium获得的原位表达图谱进行比较。我们发现,使用Visium数据(通过NGS测序得到的数据)和Xenium数据(通过显微镜以亚细胞分辨率检测得到的数据)观察到的基因空间分布之间存在很强的相关性(图4)。综上,这些数据表明,Xenium平台可以很好地重现病理学家注释的H&E染色图像的细胞分型和病理区域注释,并可以高分辨率验证使用Visium平台观察到的基因表达空间分布。六、主要应用场景使用Xenium组织空间原位多组学分析系统,研究人员能够通过亚细胞分辨率的多重RNA和蛋白质表达检测加深对健康和病变组织的了解。主要应用在以下方面:• 绘制阿尔茨海默病的细胞类型图谱(1)• 根据多种细胞类型的多个标志物基因对组织切片进行空间原位解析(2,3)• 对复杂发育过程及背后的细胞转录状态进行时空组学原位解析(4)• 对单细胞测序数据进行组织切片原位验证,原位分析结果可以加深对组织亚结构分子基础的进一步了解(5)以上文献中的数据仅代表原位技术的一般应用,不代表10x Genomics Xenium平台的灵敏度和分辨率。自从收购了Cartana和ReadCoor两家原位测序技术公司以来,10x Genomics投入大量人力物力对上述范例中描述的原位技术进行持续的开发和改进。Xenium分析仪将以上两种基础原位测序技术与10x Genomics专有改进方案相结合,提供了一个分辨率和灵敏度比上述已发表数据更高的全新平台。Xenium还显著改进了原位分析技术的易用性和数据生成时间。七、使用Xenium平台开展原位分析研究的理由Xenium组织空间原位多组学分析系统具有许多技术优势,已成为以亚细胞分辨率分析多重空间基因表达和蛋白质表达的理想产品。该平台的核心是全自动和高通量的Xenium分析仪,可以自动进行探针标记、成像和机载数据分析等全流程功能。• 强大而灵活的核心平台——Xenium是一个强大而灵活的核心平台,适用于各种组织、样本类型和应用。此外,该平台的设计理念是未来可不断增添新功能,包括额外的组织特异性和疾病特异性的基因组合、同一切片上RNA和蛋白质的同时检测,以及同时检测1,000种分析物的多重分析能力。• 起始样本的灵活性——Xenium技术流程可以兼容新鲜冷冻组织(FF)和福尔马林固定石蜡包埋组织(FFPE)样品。• 多重分析和亚细胞分辨率——Xenium平台能够以亚细胞分辨率检测多达400个RNA转录本(初上市时),并有望在未来实现多达1,000个分析物的同时检测。• 具有定制功能的人工审核基因组合——Xenium平台可使用商业试剂的基因组合,这些基因组合是经过大量数据挖掘甄选后构建的,综合了全面的单细胞图谱研究结果以及各个研究领域专家的人工审核和宝贵建议。Xenium基因组合能够增加定制基因集合,这些基因组合在交付后可立即用于Xenium分析。此外,10x Genomics还致力于不断扩展商业试剂供应的Xenium基因组合菜单种类,逐步会包含更多的组织和应用类型。• 轻松易用的流程——Xenium平台是一个轻松易用的完整解决方案,包含制备样本所需的试剂和Xenium分析仪上配合图像采集需要的试剂,以及用于后续数据分析、可视化和数据解读的10x Genomics软件。• 超大通量——Xenium分析仪可在成像区域内开展超高重靶点组织全景分析。每块Xenium载玻片上有一个大的可成像区域(12 x 24 mm),单次运行可同时加载和分析两张切片。单次样品通量由可成像区域内包含的组织切片数量决定。例如,如果组织切片的大小为10 mm x 10 mm,则每块载玻片可容纳两张切片,并且单次运行可同时分析四张切片。仪器运行大约需要两天的时间,每周通量为12张组织切片/周,以此类推,分析样品组织切片越小,单周内可分析的样品数目会显著增加。• 全面的数据分析解决方案——10x Genomics提供数据分析流程用于数据分析和再分析,并提供先进的软件用于数据可视化分析。Xenium分析仪产生的数据可轻松从仪器中转移出来,并与基本组织形态、细胞边界信息等结合用于可视化分析。10x Genomics提供的软件支持进一步高阶分析。数据以行业标准的文件格式提供,让科学家可自由使用他们选择的各类分析工具。• 细胞类型分配——10x Genomics软件将每个检测到的转录本或蛋白质分配给单个细胞,让科学家能够根据他们选择的基因组合对细胞类型进行分子水平注释。• 全面专业的支持资源——10x Genomics提供全面的支持资源,既包括我们的技术支持科学家、现场应用科学家、现场服务工程师和生物信息学应用科学家,他们都接受过Xenium流程、仪器和分析的专业培训,也包括免费提供的视频和技术文档,这些可帮助指导新用户顺利完成Xenium实验流程。• 产品质量认证——10x Genomics的产品开发和制造流程已通过ISO 9001:2015认证。八、斑马鱼(北京)科技有限公司,是10x Genomics公司的官方授权经销商,负责产品的推广销售和技术支持,为您提供技术参数,报价、选型、实验指导、安装培训、售后服务等,更多信息可留言或来电咨询。
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