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基因芯片芯片检测

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基因芯片芯片检测相关的资讯

  • 基因芯片,百姓受益的检测技术
    复杂的医学诊断可以再快些、精准些、费用再低些吗?基因芯片的出现及广泛应用或将解决这个问题。  去年11月,昆明寰基生物芯片开发有限公司基因芯片医学检测中心在云南国家级经济技术开发区海归创业园落成。这是我省首个专业基因芯片医学检测中心,也是国内唯一以基因芯片技术为核心的第三方医学检验机构,设计检测规模达到每年70万份临床标本。这是继去年云南省第一人民医院临床基础医学研究所“基因芯片诊断技术”获卫生部临床应用能力资格认证后,我省第二家计划利用基因芯片进行疾病诊断的机构。  和普通医疗诊断技术相比,基因芯片诊疗技术究竟高明在哪里?它的出现及推广应用对老百姓来说又意味着什么?带着问题,记者走访了昆明寰基生物芯片开发有限公司。  疾病检测  新技术带来的新革命  虽说生物芯片早在20世纪末就成功问世,并应用于药物筛选和实验室研究,但普通人对它还是知之甚少。基因芯片,又被称为DNA芯片或DNA微阵列,是DNA分子杂交技术与基因扩增标记等技术相结合的结晶。简单的说,基因芯片就是在一块特制玻璃片或其他支撑介质上有序的固定许多生物分子探针,然后由一种仪器收集探针捕获的待测样本信号,用计算机分析数据结果。也就是说,原来要在很多个试管中发生的反应,现在被移至一张芯片上同时完成了。和传统的医学检测手段相比,基因芯片的优点也就由此体现。据公司负责人介绍,基因芯片技术具有高通量、高灵敏性和特异性等基本特征,在感染性疾病、遗传性疾病、重症传染病和恶性肿瘤等疾病的临床诊断方面具有独特的优势。因此,基因芯片临床检测试剂盒就具有了检测准确率高、快速且比较稳定等特点。  据介绍,生物芯片的研究始于20世纪80年代中期,自从1996年美国Affymetrix公司成功地制作出世界上首批用于药物筛选和实验室试验用的生物芯片,并开发出了配套的芯片检测系统,此后世界各国在芯片研究方面快速前进,不断有新的突破。中国是世界上较早批准生物芯片进入临床应用的国家之一,到目前为止,国内已有多款基因芯片产品获得不同形式的医疗器械证书。  临床应用  产业化制约的慢发展  进医院,病人最焦虑的莫过于检查或等待检测结果。正常情况下,一项普通检查需时30分钟至1个小时,一项复杂检查结果则需等待一周或半月。而生物芯片呢?因为它对样品的需要量非常少,且一次检测能够对多种病原体感染情况作出判断,因此患者不必多次重复检测 同时,由于基因芯片检测主要是依靠先进的激光扫描读取信号,计算机分析检测结果,整个检测过程仅需花时5小时,大大减少了患者的等待时间。正因如此,其临床应用将以实现节约医疗资源支出、提高临床诊疗水平的目的。  2010年,云南省第一人民医院临床基础医学研究所“基因芯片诊断  术”获卫生部临床应用能力资格认证,成为当时国内第二家、云南省唯一具备“基因芯片诊断技术”临床应用能力的机构。这既标志着基因芯片检测技术能在有效地质量保证体系和监督管理机制下,服务于临床,为遗传病诊断、感染性疾病诊断、个性化治疗方案制定等提供快速、准确的辅助诊疗。也意味着基因芯片从技术到产品再到临床,有着极艰难的推广应用之路。在昆明寰基,记者了解到,虽然基因芯片因其在疾病诊断方面独有的特性,被专家誉为行业的终极产品。但由于一是目前许多传统的检测手段已运用较为成熟,二是基因芯片因产业化进程缓慢难以形成规模导致单价过高。那基因芯片何时才能真正造福于普通人的疾病诊断呢?  合力推进  新思路拓宽的新天地  据统计,目前我国生物芯片企业不少于50家,但获得国家有关部门认证的只有极少数。目前,70%—80%的生物芯片还只是用于科学研究领域,离完全产业化还有一段不短的距离。由于研发成本高,其产品价格也较高。  尽管生物芯片的未来发展之路不平坦,但是有关专家在展望生物芯片的前景时却认为,生物芯片在基因表达谱分析、基因诊断、药物筛选及序列分析等诸多领域已呈现出广阔的应用前景。昆明寰基生物芯片开发有限公司总经理滕仕喜认为,一个基于第三方的医学检测服务体系或将实现造福百姓这一目的。作为国内较早从事生物芯片开发的科技公司,昆明寰基从零起步,在省市两级科技项目经费支撑下,与省内相关科研单位合作,于2006年成功研发出了首个泌尿生殖系统基因检测芯片,到今年6月,公司将推出系列基因检测芯片新产品,并将逐步应用于临床检测。去年1月,公司在经开区投资兴建了基因芯片检测中心和基因芯片生产基地,已成功形成从生物芯片技术理论研究到产品研发再到应用的完整产业链。作为参与国家药监局起草《生物芯片技术标准》的生物芯片研发生产企业,昆明寰基对基因芯片的平民化运用很有信心。  在滕仕喜的设想中,第三方的医学检测服务体系不仅可以最大限度地降低成本,还会最大可能地造福患者。因为具备自有技术支撑的第三方医学检测,服务范围较大医院而言拓宽了很多。通过在各地开设的检测取样点,它的服务触角可延伸至缺乏检测技术和手段的中小医院,既减少了检测费,综合检测费用只需原有的30%。又提高了检测效率及精确度。基于此理念,不久前刚刚成立的昆明寰基生物芯片开发有限公司基因芯片检测中心正在按这个思路开展工作。在不久的将来,患者或将普遍受益于这项新技术和新模式。
  • 基因芯片:春天在哪里
    俞菁(化名)是一名手语翻译,她的妈妈因为小时候一次注射庆大霉素致聋,但她自己的听力得以保持健全。俞菁有一位好姐妹,情况却正好相反,她妈妈听力正常,而她自己在小时候在一次药物注射后变成了听障患者。  去年,她们都参加了北京市的一个高危人群致聋基因筛查,结果两个人都是致聋基因的携带者,只是因为俞菁从小有意识去避免注射一种药物,而她的好姐妹却毫无知情用了这种药,导致了两个人走向了完全不同的人生。  博奥生物市场总监赵智贤告诉记者,“俞菁的妈妈和她的聋人姐妹刚出生时没有出现耳聋,都是在后天被注射了链霉素、庆大霉素等氨基糖甙类药物致聋。”我国每年因迟发性耳聋及药物性耳聋的新增患者可达3万多人,其中60%的是由于致聋基因造成。  事实上,很多医生都知道该类药物会导致基因突变引起的药毒性耳聋,但以往依靠传统基因测序方式需要3天,且耗资昂贵。作为此次北京市致聋基因筛查的承担者,博奥生物采用了一种新的耳聋基因芯片检测技术,“该芯片上涵盖了导致中国人群耳聋最常见的4种基因的9个突变位点,做一次检测只需要5小时,价格几百元。”赵智贤说。  基因在我们身体里已经“神秘地行动”很久了,而不管你了解或不了解,信或不信,它都会导致完全不同的结果甚至人生。人类迫切地希望解码自己的基因,在种种关于未来10大技术趋势的预测中,好几项也都跟基因技术相关。  耳聋芯片是目前基因芯片的一种最普通的应用。所谓的基因检测芯片,其外形与电子芯片一样,但上面排列的不是集成电路,而是基因序列。它把大量已知基因序列的核酸片段识别探针,集成在一块指甲大小的玻璃片或硅片表面,通过与样品进行反应,基因会呈现出不同的表达信号,用计算机技术收集信号数据,分析样品的基因突变情况来诊断遗传性疾病。虽说基因芯片早在20世纪末就成功问世,并应用于药物筛选和实验室研究,但普通人对它还是知之甚少。  “有成千上万个鱼钩的钓杆”  如果说以前的基因检测技术均只有一个“鱼钩”,一次只能钓到一条鱼(一种基因)。那么,基因芯片就好比是一根有成千上万个鱼钩的钓杆,可同时捕捉许多不同的鱼,从而实现对千万个基因的同步检测和鉴定。它具有高效率、高通量、快速简便等特点。赵智贤说,耳聋芯片可以提供从孕前、产前到出生的基因检测,“只需要从母亲的羊水中提取一滴样品,或者一滴血就可以完成整个检测。”它可帮助生育父母及时获知新生命的遗传信息并采取措施,降低新生儿患遗传性疾病。  基因芯片将改变“万人一配方”的用药模式,在个性化配方上,未来西医与中医有可能殊途同归。目前医生为同一类病症的患者开出的基本都是标准化药方,其实人的个体差异直接影响用药效果,用药的多少也应有区别。  人类基因组编码大约有10万个不同的基因,一个基因又有成千上万个位点,“多数慢性病会跟几十个基因中几个或更多突变位点相关。基因芯片可以对基因分类,并尽可能找出相关的位点,发现哪些基因和位点对于预后表达得好,哪些表达得不好,再根据比对结果提供个性化治疗”。一位从事基因检测芯片服务的海归创业者解释道。  “结核病最难治的地方,是其耐药性高。原来查基因耐药需要4~8周的时间,而期间多数治疗都是经验用药,如果产生耐药,不但治不了病,反而会加重病情,延误治疗。结核病检测芯片将检测时间缩短至6个小时,为治疗赢取时机。”赵智贤以具体案例作了实证。  基因芯片给西医带来的最大改变,是它可以检测出患者之间的个体差异,使医生诊断和用药更及时和提高准确性,但这需要建立在大量的科研基础之上,而且基因的筛查要经过时间的推移才能显现出效果来。  尽管当前基因芯片技术尚未完全成熟,但是却挡不住它的商业脚步。在国内一些医院或体检机构,现在可以看到这样的广告:只需一滴血或一份唾液样品,你就可以预知会否患上癌症,将健康掌握在自己手中。在美国,越来越多的零售商开始通过互联网直接面向消费者提供基因诊断测试,他们的口号是不借助医生就可以从基因水平上了解自己的健康状况。这种测试甚至已开始通过互联网瞄准国际市场。  通常,消费者只要付款就能得到一份包括自身的基因、特质及潜在病症的风险等级清单,另外还包括一份针对个人的用药建议以及生活、饮食和环境上的综合健康建议,如节食和运动等。国内的价格在2~3万元不等。  基因芯片的“管”与“放”  那么,这种基因诊断到底有多靠谱?博奥生物从技术角度给出了一套标准。基因芯片技术必须建立在大量已知基因和基因改变与疾病关系的基础上,因此其所检测的疾病相关基因数应该越多越好,而且需要建立一个异常庞大的基因与疾病关联数据库,同时要有一套科学的数学模型。还有,基因检测具有一定的种族针对性,“也就是说如果比对的人群数据库不同,检测的结果也会有差异。” 赵智贤说。  而由4位美国生物伦理学、法律及医学方面的专家组成的研究小组对于该种基因测试是否适用于市场进行了研究。他们表示,基因测试都要通过同一类型的集中数据市场前期调查,许多基因测试公司都给出了长期的预测结果,实际上,要完全了解这些风险与益处需要几十年的时间。  基因芯片三大难题  “基因改变与疾病的关系并不能一一对应,所有基因检测的结果,并非一定就会发生。同样,即使你检测出来携带耳聋基因,也并不意味一定会出现药毒性耳聋。基因芯片还不能完全取代目前临床实验室诊断,”海归的基因检测创业者认为,当前这个阶段应该客观地看待基因芯片技术,但是,“谁也不能否认它的医学参考价值”。  基因芯片的商机不可预估,谁都想抢一把风气之先,“管它是不是萝卜先占个坑”,这使得不管是国际还是国内市场都处在一种鱼龙混杂的阶段。目前我国生物芯片企业不少于50家,但获得国家有关部门认证的只有极少数。某些机构把基因检测的销售业务外包出去之后,出现了一些销售方式上的“变味”,有的甚至变成了传销。另外,美国的研究小组也在《科学》杂志发文表示,美国市场上90%的基因测试都没有通过正式的管理评估。  企业在冒进,而真正的市场化却还远没开始。造成这种现象的原因很复杂,赵智贤认为,目前基因芯片在药监局的审批难,进入物价收费流程难以及进入医保体系难这三大难题,使得其真正迈入市场化商业之路还很远,而在此之前出现一些市场“乱象”并不难理解。  目前的基因芯片价格还是相对昂贵,而且操作复杂、费时,对操作人员的专业素质要求比较高,国内缺乏大量相应的专业基因检测和数据分析人员,这也是推进市场化前要越过的障碍之一。2011年卫生部下发通知,决定将基因芯片诊断技术审批权“下放”到省级卫生主管部门。这意味着今后在临床上,将有越来越多的有资质的临床医生使用该项技术。  如何让基因测试尽早接触市场,加速其产业化,是各国政府共同的心态。海归的基因检测创业者如此分析国内外形势。在这种心态下,是先“管”起来,还是先“放”下去,“一管一放”的力度又该如何把握,并导致不同的行业生态,这对于各国政府都不是一件轻松的事情。
  • 《个体化医学检测微阵列基因芯片技术规范》发布
    p  近日,国家卫计委发布《发感染性疾病相关个体化医学分子检测技术指南》和《个体化医学检测微阵列基因芯片技术规范》,《指南》介绍了感染性疾病相关的个体化医学分子检测应注意的相关问题、技术方法、结果报告与解释、质量保证及临床应用等内容;《规范》旨在对个体化医学检测中采用微阵列基因芯片检测核酸序列以及基因表达进行一般性技术指导,不包括行政审批要求。具体通知如下:/pp style="text-align: center "span style="color: rgb(0, 176, 240) "strong国家卫生计生委办公厅关于印发感染性疾病相关个体化医学分子检测技术指南和个体化医学检测微阵列基因芯片技术规范的通知/strong/spanbr//pp  各省、自治区、直辖市卫生计生委,新疆生产建设兵团卫生局:/pp  为进一步提高感染性疾病相关个体化医学检测,以及微阵列基因芯片技术的规范化水平,我委组织专家制定了《感染性疾病相关个体化医学分子检测技术指南》和《个体化医学检测微阵列基因芯片技术规范》。现印发给你们(可从国家卫生计生委网站医政医管栏目下载),请参照执行。/pp style="text-align: right "  国家卫生计生委办公厅/pp style="text-align: right "  2017年12月1日/pp style="text-align: right "  (信息公开形式:主动公开)/pp  附件1:img src="/admincms/ueditor1/dialogs/attachment/fileTypeImages/icon_doc.gif"/a href="http://img1.17img.cn/17img/files/201712/ueattachment/2c01e790-eab0-4d65-9236-df827346c016.doc"感染性疾病相关个体化医学分子检测技术指南.doc/a/pp  附件2:img src="/admincms/ueditor1/dialogs/attachment/fileTypeImages/icon_doc.gif"/a href="http://img1.17img.cn/17img/files/201712/ueattachment/3cecb3ff-d95b-4dc8-be88-0b5211f53960.docx"个体化医学检测微阵列基因芯片技术规范.docx/a/ppbr//p
  • 引进昂飞基因芯片平台 水母基因建成基因检测安全实验室
    p  近日,开发区企业北京水母科技有限公司微生物及基因检测安全实验室投入使用,主要是对分子生物学核酸样本(基因样本)进行制备和检测。实验室引进Affymetrix(昂飞)基因芯片平台,并配套实验医学领域中仪器设备、试剂、应用软件和实验室全自动液体工作站,实现了从DNA提取、芯片制备到芯片检测的全自动化,实验室将为水母基因的个人基因检测业务提供数据支持。/pp  实验室由高通量基因分型平台、生物信息分析平台、自动化样本处理平台、现代化生物样本库组成。高通量基因分析平台可以满足不同检测需求,具备大批量样本检测能力,实现高效的数据产出率。搭建的生物信息分析平台实现对大数据存储、计算和分析能力,具备精准的分析流程,核心算法具有自主知识产权。自动化样本处理平台则提供准确的数据结果,检测全程自动化,样本处理稳定均一。/pp  水母基因相关负责人介绍,实验室还配套建设低温生物样本库,在零下80摄氏度环境下实现长期保存生物样本的能力,可以对样本进行长期保存,必要时可以对初始样本进行二次检测。样本库实现了大批量、多类型生物样本储存能力。/pp  水母基因已实现对1400个基因检测项目进行检测,掌握国际先进的肠道菌群检测技术,具备国内领先的生物信息分析和解读能力,可提供满足不同人群健康需求的基因体检和个性化健康指导,水母基因微生物及基因检测安全实验室的投入使用有助于加快公司业务处理能力。/pp  成立于2015年8月的北京水母科技有限公司,是一家立足专业消费级基因检测与生物信息分析的互联网高科技企业,致力于结合基因科技、大数据、人工智能、互联网等前沿技术,用数字化的方式解码生命、解析健康,揭示生命数据的价值,现已发展成为国内消费级基因检测行业拥有健康人群DNA数据量最大的企业。/p
  • 基因芯片及其最新进展
    注:最新的测序技术会实现全自动化、实时化、微型化,虽然与传统的芯片技术并不相同,但其理念有共通之处,所以也将其纳入&ldquo 芯片&rdquo 范畴。&mdash &mdash 彭雷  80年代中期,俄罗斯科学院恩格尔哈得分子生物学研究所和美国阿贡国家实验室(ANL)的科学家们最早在文献中提出了用杂交法测定核酸序列(SBH)新技术的想法。当时用的是多聚寡核酸探针。几乎与此同时英国牛津大学生化系的Sourthern等也取得了在载体固定寡核苷酸及杂交法测序的国际专利。  基因芯片利用微电子、微机械、生物化学、分子生物学、新型材料、计算机和统计学等多学科的先进技术,实现了在生命科学研究中样品处理、检测和分析过程的连续化、集成化和微型化。  1997年世界上第一张全基因组芯片&mdash &mdash 含有6166个基因的酵母全基因组芯片在斯坦福大学Brown实验室完成,从而使基因芯片技术在世界上迅速得到应用。  基因芯片技术主要包括四个基本要点:芯片方阵的构建、样品的制备、核酸分子反应和信号的检测。1、芯片制备,先将玻璃片或硅片进行表面处理,然后使核酸片段按顺序排列在芯片上。2、样品制备,可将样品进行生物处理,获取其中的DNA、RNA,并且加以标记,以提高检测的灵敏度。3、生物分子反应,芯片上的生物分子之间的反应是芯片检测的关键一步。通过选择合适的反应条件使样品中的核酸分子与芯片上的核酸分子反应处于最佳状况中,减少错配比率。4、芯片信号检测,常用的芯片信号检测方法是将芯片置入芯片扫描仪中,通过扫描以获得有关生物信息。  基因芯片技术发展的最终目标是将从样品制备、杂交反应到信号检测的整个分析过程集成化以获得微型全分析系统(micro total analytical system)或称缩微芯片实验室(laboratory on a chip)。使用缩微芯片实验室,就可以在一个封闭的系统内以很短的时间完成从原始样品到获取所需分析结果的全套操作。  近年,基因芯片技术在疾病易感基因发现、疾病分子水平诊断、基因功能确认、多靶位同步超高通量药物筛选以及病原体检测等医学与生物学领域得到广泛应用。  一、第一代基因芯片  第一代基因芯片基片可用材料有玻片、硅片、瓷片、聚丙烯膜、硝酸纤维素膜和尼龙膜,其中以玻片最为常用。为保证探针稳定固定于载体表面,需要对载体表面进行多聚赖氨酸修饰、醛基修饰、氨基修饰、巯基修饰、琼脂糖包被或丙烯酰胺硅烷化,使载体形成具有生物特异性的亲和表面。最后将制备好的探针固定到活化基片上,目前有两种方法:原位合成和合成后微点样。根据芯片所使用的标记物不同,相应信号检测方法有放射性核素法、生物素法和荧光染料法,在以玻片为载体的芯片上目前普遍采用荧光法。  相应荧光检测装置有激光共聚焦显微镜、电荷偶合器( charge coup led devices, CCD)、激光扫描荧光显微镜和激光共聚焦扫描仪等。其中的激光共聚焦扫描仪已发展为基因芯片的配套检测系统。经过芯片扫描提取杂交信号之后,在数据分析之前,首先要扣除背景信号,进行数据检查、标化和校正,消除不同实验系统的误差。  对于简单的检测或科学实验,因所需分析基因数量少,故直接观察即可得出结论。若涉及大量基因尤其是进行表达谱分析时,就需要借助专门的分析软件,运用统计学和生物信息学知识进行深入、系统的分析,如主成分分析、分层聚类分析、判别分析和调控网络分析等。  芯片数据分析结束并不表示芯片实验的完成,由于基因芯片获取的信息量大,要对呈数量级增长的实验数据进行有效管理,需要建立起通行的数据储存和交流平台,将各实验室获得的实验结果集中起来形成共享的基因芯片数据库,以便于数据的交流及结果的评估。  典型如SuperArray公司的功能分类基因芯片:  1、引物设计  SYBR Green可与所有的双链DNA反应(包括引物二聚体),为了使扩增反应集中于目的基因,避免非特异性扩增,引物设计成为关键因素。为得到单一特异的扩增产物,避免扩增出序列相似的非特异性产物,采用BLAST或者其他比对方法,检测引物在相应物种(如人,小鼠或大鼠)全基因组中的特异性。为了保证在相同的PCR条件下(特别是统一的退火温度),不同基因均能扩增出相应的特异性产物,对引物的CG值,解链温度(Tm),以及其他化学和物理的特性都进行了优化调整。为了获得高扩增效率,对扩增片段的长度也进行了优化,一般为100到200bp,确保在统一的循环反应的时间范围内,不同基因均能扩增出完整片段。  2、反应体系  为避免非特异性扩增,使用化学修饰的热启动Taq酶,只有经过热激步骤,Taq酶才能发挥扩增活性。同时,反应体系经过优化,可最大限度减少引物二聚体形成,并且保证较难扩增的片段都得到极高的扩增效率。  3、定量结果可靠  在标准的96孔PCR反应仪中进行实时定量PCR实验,为了获得高通量,无法为每个样品单独制备标准曲线。在完全相同的PCR反应条件下,希望表达量不同的多个基因均获得可靠的结果,需要确保每个基因都有较高的扩增效率,从而可采用简单的△△Ct方法计算基因表达量。  其灵敏度高,样品的使用量低,每张芯片使用的总RNA最少可为0.5ng 可观察到的动态线性范围超过105,可以同时检测表达量差异较大的基因 Ct值的平均差异只有0.25个循环,可检测超过两倍的基因表达量变化。因此,第二代功能分类基因芯片是研究特定信号通路或者一组功能相关基因表达量的理想方法。  二、第二代基因芯片  尽管基因芯片技术已经取得了长足的发展,但仍然存在着许多难题和不足。目标分子的标记是重要的限速步骤,如何绕过这一步是人们一直期望解决的问题。其次是检测灵敏度不高,重复性差,无法检测单碱基错配的基因样品。再者,待检测的基因样品必须经过PCR扩增技术的处理以获得足够量的待检测样品,使检测过程相对复杂。我们称具备以上特征的基因芯片技术为第一代基因芯片技术,这些特征充分说明基因芯片技术本身存在着较大的发展空间。  第二代基因芯片包括如下几种:  1. 电极阵列型基因芯片:将微电极在衬底上排成阵列,通过对氧化还原指示剂的电流信号的检测实现基因序列的识别   2. 非标记荧光指示基因芯片:利用荧光分子作为杂交指示剂,在不需对靶基因进行荧光标记的前提下,通过对荧光分子的检测实现基因序列的识别   3. 量子点指示基因芯片:利用量子点作为杂交指示剂,在不需对靶基因进行荧光标记的前提下,通过对量子点的扫描实现基因序列的识别   4. 分子灯塔型基因芯片:利用探针DNA片断的发夹结构,获得单碱基突变检测的能力。  三、第三代基因芯片  目前,众多的第三代基因芯片现在也推向了市场。第三代基因芯片代表了测序的最高水平和未来走向。  1、Illumina微珠基因芯片技术  这是Illumina公司核心技术之一,博奥生物基于Illumina微珠芯片平台,推出SNP分型检测服务以及定制SNP分型检测服务。  它首先用微机电技术在光纤末端或硅片基质上蚀刻出微孔(深度约为3毫米的相同凹槽),将&ldquo 微珠池&ldquo 内的微珠&ldquo 倒&rdquo 入光纤束微孔,每个微孔恰可容纳一个微珠,在范德华力和与微孔壁间流体静力学相互作用下,微珠以&ldquo 无序自组装&rdquo 的方式在微孔内组装成芯片。每种类型的微珠平均有 30 倍左右的重复。  每一个微珠上都偶联有80万左右拷贝数的探针。每一个探针由特异的地址序列(对每种微珠进行解码,29mer)和特异序列(代表不同的检测信息,如SNP 位点序列、基因序列等)组成。用专利的解码技术对芯片上的微珠进行解码,完成对芯片微珠定位信息的收集和确认,也实现芯片生产过程中100%质控。  以四种荧光标记进行16种微珠解码为例,解码过程使用与地址序列互补的且分别标记4种荧光染料的探针进行。把标记4种荧光的不同地址序列探针进行组合,每次杂交后探针清洗下来进行下一轮杂交,通过多轮杂交达到指数型区分能力。  2、Ion Torrent半导体基因芯片  Ion Torrent半导体基因芯片是最新一代的测序技术,它的问世给测序技术的应用带来了激动人心的进展。它采用了半导体技术和简单的化学试剂进行DNA测序,而不是使用光作为媒介。在半导体芯片的微孔中固定DNA链,随后依次掺入ATCG。随着每个碱基的掺入,释放出氢离子,在它们穿过每个孔底部时能被检测到,通过对H+的检测,实时判读碱基。  Ion Torrent个人化操作基因组测序仪(PGMTM)是第一台基于半导体技术的测序仪。与其他测序技术相比,使用该项技术的测序系统更简单、更快速、及更易升级。该测序仪与其他高通量测序仪特征互补,可以迅速完成应急服务项目,缩短服务周期,增加服务效率。  3、实时单分子测序基因芯片  太平洋生物科学公司(PacBio)实时单分子测序基因芯片是直接测由DNA聚合酶将荧光标记的核苷酸掺入互补测序模板。该技术的核心是一个零点启动模式的波导(Zero-mode Wavelength,ZMW)纳米结构的密集排列, 这一排列阵可以进行单个荧光分子的光学审视。  在过去,零点启动模式波导结构被用于从大量高密度的分子中分辨出单一的荧光分子,还没有被用于大量平行分析的操作。为使之用于大量平行分析和数据输出通量(测序数据生成能力),太平洋生物科学公司开发出一种方法,能有效地将零点启动模式波导结构排到表面上,他们采用了电子束光刻技术(Electron beam Lithography)和紫外光电子束光刻技术(Ultraviolet Photo lithography) 以及高度平行的共焦成像系统, 这样可以对零点启动模式纳米结构中的荧光标记分子进行高灵敏度和高分辨率的探测,并采用了一个沉重的稳定平台来确保良好的光学聚焦效果。  4、纳米球基因芯片  全基因组学公司(Complete Genomics)的纳米球基因芯片是以杂交和连接反应为核心的。当通过杂交和连接进行测序的方法出现以后,全基因组学公司推出了新的样品处理方法和纳米阵列平台。基因组DNA首先经过超声处理,再加上一些接头,然后模板环化,酶切。最后产生大约400个碱基的环化的测序片段,每个片段内含有4个明确的接头位点。环化片段用&Phi 29聚合酶扩增2个数量级。一个环化片段所产生的扩增产物称为DNA纳米球(DAN nanoball, DNB)。纳米球被选择性地连接到六甲基二硅氮烷处理的硅芯片上。  5、纳米孔基因芯片技术  另外,还在发展中的纳米孔基因芯片技术是很有潜力的第四代技术。因为这种方法不再需要光学检测和同步的试剂洗脱过程了。  这是一种基于纳米孔(纳米洞)结构的完全不同的测序技术,单个碱基的读取可以靠测定经由纳米级别的孔洞而跨越或透过薄膜的电导率来进行。纳米孔技术可以广泛地归纳为两类:生物类和固态类。  &alpha 溶血素是一种能天然性地连接到细胞膜中继而导致细胞溶解的蛋白质,它第一个被用来做成生物纳米孔模型。第二类纳米孔是以硅及其衍生物进行机械制造而成。 使用这些合成的纳米孔可以降低在膜稳定性和蛋白定位等方面的麻烦,而这些正是牛津纳米孔公司所创立的生物纳米孔系统一直遇到的问题。  例如,Nabsys就发明了一套系统,他们以汇聚的离子束将硅片薄膜打成纳米孔,用于检测与特异性引物进行了杂交的单链DNA穿过纳米孔时的阻断电流变化。 IBM创建了一个更为复杂的系统,能有效地使DNA位移暂停,并在暂停的时候通过隧道电流检测识别每个碱基。  四、基因芯片市场分析  1、国外市场美国illumina公司一家独大  在SNP芯片研究领域,美国illumina公司毫无疑问是霸主,illumina公司凭借自己开发的GoldenGate技术和infinium专利技术一直在SNP芯片领域处于垄断地位。  illumina的全基因组表达谱芯片是目前唯一一种可以达到探针30倍重复的表达谱芯片,其他的芯片都只能达到1-8倍技术重复。因此illumina的全基因组表达谱芯片的重复性是所有芯片中最高的,其重复性R20.996,并且基于第三代基因芯片独特的微珠芯片生产工艺,芯片生产成本较低,信噪比和灵敏度都非常高,其灵敏度&le 1:250,000,芯片检测结果和qPCR相关系数R2=0.97。  因为illumina所占的市场份额越来越多,2012年6月另一基因芯片大厂家Nimblegen公司,正式宣布退出基因芯片市场。  2、国内市场刚刚起步  国内基因芯片制造水平低,相关的企业规模小、投入也少,远达不到国外的水平。所以国内的相关公司均以引进国外基因芯片,提供检测服务为主。不过,随着基因芯片的应用推广,一些公司也开始涉足基因芯片制造。  上市公司达安基因,业务以体外诊断为主,产品主要是试剂盒,但也开始涉足基因芯片制造。达安基因2013年申报的三个专利:一种用于基因检测的电路板 ZL201320244125.X 一种电化学基因芯片 ZL201320244116.0 一种基于基因芯片的检测装置 ZL201320244734.5。  而另一以基因检测服务著称的大企业华大基因,则通过收购国外公司进入基因芯片制造领域。美国上市公司Complete Genomics 公司有自己基因芯片和芯片检测设备。但该公司2011年的业绩只有2000多万美元,其基因测序服务成长大大低于预期,股票跌破发行价,最后被中国华大基因收购。  联川生物在microRNA芯片领域也小有名气,也是唯一一家国产的microRNA芯片,该芯片最大的特点就是更新速度极快,一般新的数据库发表后,第一个将芯片更新到最新版本的就是联川生物。illumina公司于2010年退出了microRNA芯片市场,因illumina公司2006年收购了高通量测序领域NO.1的Solexa公司,成为唯一一家即拥有芯片平台又拥有高通量测序平台的供应商,illumina认为在microRNA领域,高通量测序有不可比拟的技术优势,必然会取代芯片,所以于2010年停产了microRNA芯片。
  • 兰州建生命科技园 将年产6万片基因芯片
    高端“测癌”技术在我省落地开花,建成后,年生产基因芯片6万片  商报讯兰州盐场堡生物医药工程、兰州重离子治癌中心、兰州分离科学研究所总部科研孵化基地……随着这些重大科技项目“落地开花”,兰州正在形成集产学研一体的生命科技产业集群。  第一天进行签约仪式,次日就开始了奠基仪式——兰州分离科学研究所总部科研孵化基地的建设步伐紧锣密鼓。世界一流“测癌”芯片正式在兰安家。昨日上午,兰州市委、市政府督察工作组,前往兰州分离科学研究所进行了工作检查。  高端“测癌”技术我省落地开花  6月27日,兰州分离科学研究所胡之德所长,和德国雷根丝堡大学特别代表瓦伦提尼教授、德国雷根丝堡大学的侯赛因教授、迈克尔教授、塞西莉亚教授出席了“兰州分离科学研究所与德国雷根斯堡肿瘤实验室项目合作签约暨授牌仪式”。胡之德所长表示,项目建成后设计年产CancerGene基因芯片6万片,预计年销售收入12000万元,利润3000万元,上缴税金1994万元。  科研孵化基地包含ABC三座楼  兰州分离科学研究所总部科研孵化基地,坐落在兰州高新技术产业开发区,是集科研、孵化、办公、中试和产业化于一体的高科技项目集群,占地10.86亩,总建筑面积5.8万平方米。总部科研孵化基地共包含A、B、C三座楼。  A座(生物医药孵化大楼):包括中科药源等生物医药在孵企业科研、行政、学术交流、信息和图书馆等,配备18个标准实验室(270平方米) B座(研发与基因检测大楼):包括研究所科研、行政、基因诊断与VIP体检中心、4个标准实验室及1个净化室、微创诊疗及活动中心等 C座(中试中心楼),参照有关国家重点实验室建设要求建设(合成药物方向),包含10个标准实验室、手性制备色谱柱车间、多功能会议中心、动物培养中心及百万级GMP中试车间等。  今后市民花万元可了解“内因”  兰州分离科学研究所常务副所长常青告诉西部商报记者,通过基因检测,人们可以了解自己的“内因”风险,做到有目的、有针对性的预防。“从费用上看,已开展基因检测的这些国家收费普遍比较高。按人民币计算,在日本就需要花16万元。该项目在兰州建成后,将走‘平民化’的路子,最初的费用可能会在1万多元,但最终会在1万元以下。”德国雷根斯堡大学资深教授瓦伦提尼表示,该项目建成后,将打造出一个高质量、低成本的基因组学的科研和技术平台,从测序到生物信息学数据分析到仪器装备自动化、国产化,逐渐形成产学研一体的生物产业链。  延伸阅读  “肿瘤基因芯片诊断试剂盒”是通过检测多种肿瘤单核苷酸变异位点的基因诊断芯片,运用生物芯片技术,采用全基因组扫描的方法,对肿瘤的恶性程度、分子分型和转移情况,以及患者愈后和复发作出判断,筛选肿瘤早期诊断和预测愈后的分子标志物,实现肿瘤的早期诊断和早期治疗,对患者术前、术后的辅助治疗方案及相关药物有效性作出判断,为患者提供有针对性的个体化治疗辅助诊断产品,实现个体化治疗。  相关报道: “分离”科研所兰州建基地
  • 首张基因芯片投产 将进780家三甲医院
    首张基因诊断芯片投产 将进780家三甲医院  长沙生产的生物芯片将帮助医生为患者开出“个性化”处方  一季度全省生物医药行业同比增长40%,长沙国家生物产业基地占一半  本报讯(记者 林俊) 记者昨日从长沙国家生物产业基地获悉,全球首张个体化基因诊断芯片日前在该基地的安信公司进入产业化阶段,在21世纪“生物芯片”的年代,医生将据此开出更精细的“个性化”药方。该项目由中南大学周宏灏院士领衔研发,并已列入我省新型工业化科技重点项目支持。今年预计可实现产值5500万元。  检测结果让患者终身受用  个体化基因诊断芯片是生物芯片的一种。记者看到,其外形也像电子芯片一样,是块小薄片,但上面排列的不是集成电路,而是基因序列。“它将引领一个新的用药时代,”参与开发的中试中心主任肖鹏介绍,目前医生为同一类病症的患者开出的药方基本上是“千人一量,万人一配方”,其实人的个体差异直接影响用药效果,用药的多少也应有区别。利用这种芯片,可以准确地检测出患者之间的个体差异,使医生诊断和用药准确,且检测结果能够让患者终身受用。  目前,利用个体化基因诊断芯片的成果,中南大学湘雅附属第三医院已建立了我国首家根据基因型用药的“湖南省个体化药物治疗咨询中心”,在我国率先启动了基因导向个体化药物治疗,并取得了卓越的临床效果。  基因芯片将进780家三甲医院  安信公司董事长黄庆玺向记者透露,未来几年将逐步铺开对基因芯片的普及运用,首先将以院士工作站的模式在全国各省会城市建立检测中心,然后进入全国780家三甲医院。在诊断基因芯片广泛应用的同时公司还将加快研发进度,加大投入,每年增报5到10个病种的基因芯片。  根据规划,至2010年,将实现40万人份的芯片产能及60万人份的检验中心检测能力,预计实现年产值可达3.2亿元 到2013年,可实现100万人份的芯片产能及360万人份的检验中心检测能力,预计实现年产值14.7亿元。  据省经委统计,今年一季度,全省生物医药行业保持较快增长,实现GDP58.8亿元,同比增长40%,增幅高于省内其他行业。而作为全省惟一的医药开发区,长沙国家生物产业基地一季度累计实现医药产值27.28亿元,占全省医药工业近50%,同比增长35%。据悉,目前园区已有泰尔、丰日等10余家企业筹备上市,且已有相当一部分完成了上市前的准备工作。
  • 北大研发出全球一流基因芯片 速测300余种病毒
    据香港文汇报报道,于常海教授在香港出生,后赴笈美国,在史丹福大学学习和任教。1997年,香港回归祖国,他毅然放弃在美的高薪厚职,回流香港,先在香港科技大学任教,之后赴北京大学从事神经科研究。10年来,他奔波京港,与他的研发团队努力不懈,终于研发出全球一流的基因芯片检测技术,为快速测试各种病毒带来福音。  于常海表示,基因芯片因快捷、简便和低成本,未来产业化后将带来数十亿元的销售收入。香港文汇报记者李昌鸿 摄  组京港百人科研团队  现任北京大学神经科学研究所教授于常海在过去10年,一直从事基因芯片研发,他说,1997年香港爆发禽流感和2003年的非典,许多人丢了性命,令他十分痛心,其中关键是检测技术水平落后,延误了许多人的疾病诊断和治疗。为此,于教授创办了一家公司,在香港和北京组建了100人的研发团队,从事医学基因芯片检测技术。  西方国家早在上世纪90年代已研发出用于医学检测的基因芯片,但价格昂贵,检测耗时也很长,并且需要专业人员才能操作,因此导致基因芯片很难在医学上获得应用。于常海认为,其中最关键技术是检测过程中核酸杂交时间过长,如果能把核酸在极短的时间内杂交成功,检测耗时便可以大幅缩短。  全球申60项技术专利  抱着自己能解决这一难题的信念,于常海和他的研发团队深入学习各种跨学科专业知识,并向各相关专业,如电子、生物学、光学、材料学、化学等专家请教,将各专业技术融入到基因芯片研发中。后来,他还聘请两位诺贝尔奖顾问进行研发指导,共计花了逾亿元投资,研发团队经反复的讨论和实验,不断地寻求突破,不厌其烦默默地研究,并将以往通过昂贵的荧光显示看核酸杂交的方法改用纳米技术放大显现,使成本大幅下降。前后经过长达10年的潜心联合攻关,他们终于研发了全球一流的基因芯片,在全球申请了60项技术专利,为中国人在生物技术研究领域争得了一席之地。  10分钟测病毒利诊断  于教授说,他们研发的基因芯片既便宜、耗时又短且操作简便,在只有1/4大拇指指甲片大小的基因芯片内,存储有300多种病毒、病菌基因 普通的医生将病人带疾病的基因送来检测时,通过与基因芯片中的原有病毒进行比对时,仅需10分钟,便可迅速地判断它是哪一种疾病,较传统检测需要10小时至1天时间快了数十倍,医生因而可快速诊断,并降低病人就医成本。于常海称,该技术因操作简便,即使在偏远的农村和山区,一般的医生都会操作,快速准确的诊断令患者能够快速获得诊治。  10年培养两地新才俊  于常海强调,科学研究是十分严谨的,没有快捷方式,只要自己的研究方向、理念和方法正确,并夜以继日地研究,长期坚持下去,才有机会迈向成功。他认为,目前,转化医学是全球医学发展的方向,只有将高深的医学技术简化普及为平民百姓能接受和使用的技术和产品,才能体现医学研究的价值。  现在最教于常海感到骄傲的是,经过10年的研发,他们培养了一批年轻的内地和香港转化医学人才,在生物科技研究方面积累了丰富的经验,未来可带领新的医学研发人才进行研究,为转化医学作出贡献。
  • 康普森生物获数千万元B+轮融资 做基因芯片检测服务商
    p 近日,北京康普森生物技术有限公司宣布已于今年4月获得数千万元人民币的B+轮战略融资,由浙江浙商产融控股有限公司领投。本次募集的资金主要用于加速新产品研发、布局,市场拓展,检测中心建设等。/pp style="text-align: justify " 此前,康普森生物已完成由凯泰资本独家投资的A轮融资,由沃盈投资领投,凯泰资本、润启资本、民富基金跟投的B轮融资。/pp style="text-align: justify " 康普森生物是一家基因芯片检测服务商,拥有近6年基因芯片检测服务经验。康普森生物服务于各大科研机构、育种企业及个人,业务范围覆盖了动植物分子育种及研究、人类基因组研究及检测、微生物基因组研究等多项技术服务,并为客户提供专业的一站式解决方案。/pp style="text-align: justify " 本轮融资前,康普森生物就拥有丰硕研发业绩。已成功研发出多款商业用育种芯片,拥有海量数据资源。其中,康普森生物研发的猪育种50k芯片“中芯一号”是国内首款自主研发的猪育种芯片,不仅打破了国外的技术垄断,更涵盖了亚洲猪种特异的SNP位点,为更快、更精准地选育出属于我国自己的高品质肉猪提供了极大的助力。/pp style="text-align: justify " 公司拥有自己的实验基地,总面积近20000m2。公司建有标准生物实验室,先后引进国际领先技术平台,拥有全球认可度最高的Illumina公司的IScan基因芯片检测平台和高通量测序平台、Thermo Fisher公司的7G卡式基因芯片检测平台和GeneTitan高通量基因芯片检测平台、Sequenom-核酸质谱分析平台、KASP-基因分型平台、Real Time PCR平台、Seqpad——移动数据分析平台、人类健康基因检测平台以及各种配套设备等。/pp style="text-align: justify " 同时,公司还配备有Beckman FX系列自动化工作站,日检测样本量可达1000个以上,目前已完成项目近2000个,合作客户发表多篇SCI论文。此外,康普森生物分别与北京奶牛中心和中国农业科学院建立企业联合实验室。/pp style="text-align: justify " 康普森生物创始人刘继强先生认为,目前我国农业育种技术对国外依赖性较大,制约着我国农业的发展。国外的技术垄断使得中国人口的粮食问题存在着很大的供应隐患。因此,发展我国自己的分子育种技术,培育出具有“中国芯”的农业品种迫在眉睫。本次由浙商产融领投的资金对我国农业长期、健康的发展具有重大的意义。/ppbr//p
  • 安捷伦科技推出外显子基因芯片,扩展基因表达分析市场
    安捷伦科技推出外显子基因芯片,扩展基因表达分析市场 2010 年 11 月 3 日,北京&mdash &mdash 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)今日宣布推出基于 SurePrint G3 外显子基因芯片的外显子分析解决方案。该解决方案大大扩展了安捷伦基因表达试剂、芯片和生物信息学软件产品的市场。这套全新的系统将于 11 月中旬面世,研究人员使用该系统将能够分析目前已知的选择性表达外显子,从而拥有对RNA 表达的全面认知。 &ldquo 我们不断推出性能强大且经济有效的工具来充实我们的基因表达工作流程,从 RNA 提取试剂盒到数据解析和验证工具一应俱全。&rdquo 安捷伦的基因表达产品经理 Sharoni Jacobs 博士说道,&ldquo 我们去年 12 月推出了低上样量快速扩增标记试剂盒,仅需 10 纳克总 RNA 的起始量。另外,今年 5 月我们推出了第三代 SurePrint G3 基因表达芯片,该产品将编码和非编码 RNA 探针整合在单个芯片上。&rdquo Agilent G3 外显子基因芯片 安捷伦正是利用性能强大、高密度的 SurePrint 平台开发全外显子解决方案,帮助研究人员发现大约 30000 个基因和 100000 多种蛋白质之间的关系。 借助安捷伦 SurePrint G3 外显子芯片,研究人员只需一次实验就可以鉴别出基因水平和外显子水平的表达改变,从而捕捉到微小但至关重要的生物变化。RNA样品使用安捷伦低上样量快速扩增全转录组标记试剂盒进行处理,实现全转录本标记,用于随后的杂交。安捷伦 GeneSpring GX 11.5 生物信息学系统帮助研究人员同时分析基因水平的表达数据和剪切标记,极大地提高了实验室的工作效率。 &ldquo 外显子级芯片的推出标志着我们分析能力的显著提升。与传统的依赖于 3&rsquo 端的芯片相比,我们现在可以更为详细地分析基因组,&rdquo 英国曼彻斯特大学帕特森癌症研究所分子生物学中心主任 Stuart Pepper(早期用户之一)说道,&ldquo 我们己尝试着将这些芯片用于研究项目,初步实验结果表明,得到的数据十分清晰;这些数据有助于对选择性转录本表达的检测和定量。&rdquo 安捷伦的人、小鼠和大鼠外显子芯片目录产品包括 4× 180K(每张玻片四个芯片,每个芯片 180000 种特征序列)和 2× 400K 两种格式,使用户能够在实验成本、通量和覆盖完整度间作出选择。与安捷伦的其他芯片类似,安捷伦也提供定制格式的人、小鼠和大鼠 SurePrint G3 外显子芯片。定制格式包括:8× 60K、4× 180K、2× 400K 和 1× 1M。 与所有安捷伦芯片一样,SurePrint G3 外显子解决方案能够在很宽的动态范围内检测低丰度和高丰度的表达产物,准确反应整体的表达水平,从而保证结果高度可信。 安捷伦提供业内最全面的基因表达解决方案;集高芯片灵敏度,成熟可靠的 qPCR 平台和综合分析软件于一身,有效简化工作流程,确保获得最高质量的结果。关于安捷伦科技 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)是全球领先的测量公司,是化学分析、生命科学、电子和通信领域的技术领导者。公司的 18500 名员工在 100 多个国家为客户服务。2009 财政年度,安捷伦的业务净收入为 45 亿美元。要了解更多安捷伦科技的信息,请访问:www.agilent.com.cn
  • 博奥生物晶芯基因芯片分析系统等产品亮相“十一五”成就展
    仪器信息网讯 2011年3月7日至14日,博奥生物有限公司的晶芯 ArrayCompassTM基因芯片分析系统、晶芯 LuxScanTMDx/HT24高通量微阵列芯片扫描仪、晶芯 ExtractorTM36 核酸快速提取仪及博奥生物晶芯医学产品亮相国家“十一五”重大科技成就展。晶芯ArrayCompassTM基因芯片分析系统  该产品是博奥生物有限公司与Affymetrix公司经过3年的合作,共同推出的基于PEG Strip芯片(原位合成技术)的超高密度微阵列芯片反应与检测一体化系统,可用于高密度、中低通量的表达谱芯片、重测序芯片的分析,为进行此类研究的用户提供了一个高性价比的技术平台。其工业造型更是在2010年获得了具有工业设计“奥斯卡”之称的德国“红点奖”。晶芯LuxScanTMDx/HT24高通量微阵列芯片扫描仪  晶芯 LuxScanTMDx/24高通量微阵列芯片扫描仪是一款具有高通量、高自动化、高灵敏度和高分辨率的芯片扫描仪,可应用于临床检验、食品安全检测和生命科学研究等多个领域。此产品在晶芯LuxScanTM10K微阵列芯片扫描仪优质性能基础上,提高了产品自动化和扫描通量,进一步提高了产品的性价比。晶芯 ExtractorTM36 核酸快速提取仪  晶芯ExtractorTM36核酸快速提取仪适用于批量快速核酸提取,可方便快速地一次性提取36份细菌核酸样品。与配套的晶芯核酸快速提取试剂盒一起使用,可使核酸提取操作稳定可靠、简单快捷。简单两步操作即可完成核酸提取,操作时间在10min左右。博奥生物晶芯医学产品  左为晶芯九项遗传性耳聋基因检测试剂盒(微阵列芯片法),右为晶芯分枝杆菌菌种鉴定试剂盒(DNA微阵列芯片法)。  关于博奥生物有限公司:  博奥生物有限公司暨生物芯片北京国家工程研究中心成立于2000年9月30日,注册资金现为3.765亿元人民币。目前,公司拥有数十项具有自主知识产权,已研制开发出生物芯片(包括基因、蛋白、细胞芯片和芯片实验室等)及相关仪器设备、试剂耗材、软件数据库等四个系列的产品,可以为广大客户和合作伙伴提供先进的高通量生物芯片技术服务和行业应用整体解决方案。
  • 首个H1N1病毒耐药分析基因芯片问世
    本报北京5月17日讯(通讯员郝成涛 何玉玺 记者王学健)近日有媒体称,甲型H1N1流感病毒对“达菲”产生了抵抗能力。如何判断病毒对“达菲”类药物存在抗药性,5月16日,一种专门针对甲型H1N1流感病毒抗药性的基因确证和耐药性分析的基因芯片,在军事医学科学院放射与辐射医学研究所研制成功。这项成果的问世,对药物治疗甲型H1N1流感病人具有重要指导意义。   耐药分析基因芯片早一天面世,就会为治疗赢得宝贵的时间。据专家分析,甲型H1N1流感病毒容易变异,而且变异速度较快,随着“达菲”类药物在治疗人感染甲型H1N1流感病毒中的广泛使用,不排除病毒出现耐药的可能。因此,判断其对抗病毒药物的耐药性是指导临床用药和疫情防控的关键。军事医学科学院放射与辐射医学研究所成功研制的甲型H1N1流感病毒耐药分析基因芯片,是他们继成功研制复合探针实时荧光核酸检测试剂盒之后,又一项应对甲型H1N1流感疫情的重要科技成果。   据主持这项研究的放射与辐射医学研究所研究员王升启介绍,该芯片采用了具有自主知识产权的纳米标记信号放大技术,在准确检测到甲型H1N1流感病毒的同时,可对普通季节性毒株和新流行毒株进行甄别,并能准确检测病毒的耐药性突变位点,从而判断出病毒是否对“达菲”类药物产生耐药性。该芯片的灵敏度是传统方法的10倍以上,在获取样本后3至4小时内可完成检测过程,肉眼可以直接观察结果,不需要借助昂贵的荧光扫描设备,便于实际操作和使用。   据了解,放射与辐射医学研究所是国内最早从事生物芯片研究的单位之一,曾获得国际上第一个基于硅基材料的生物芯片新药证书、第一个乙型肝炎病毒耐药检测基因芯片和第一个HLA分型基因芯片新药证书。
  • 安捷伦科技公司推出新一代人拷贝数变异基因芯片
    安捷伦科技公司推出新一代人拷贝数变异基因芯片,该芯片由WTCCC设计,应用在全球规模最大的CNV研究项目 安捷伦同期推出了标记试剂盒和纯化组件,以提高通量、降低成本2009年4月15日,北京&mdash 安捷伦科技公司(NYSE:A)日前推出了由维康信托病例控制协会(WTCCC)设计的2x105K CNV基因芯片,用于研究人的基因拷贝数变异(CNV)与疾病的相关性。WTCCC主持着全球规模最大的CNV研究项目以及CNV与多种人类常见病之间关系的研究。 &ldquo 这种芯片覆盖了11,000多个前期已鉴定的CNV序列区域,&rdquo 安捷伦基因组学资深市场总监 Chris Grimley说,&ldquo 这是一种经过严格验证、价格合理的CNV相关性研究工具,我们非常高兴可以把它推向市场,提供给广大用户。 2008年8月, WTCCC选择安捷伦为其具有代表意义的CNV研究项目生产芯片;本商业产品就是这次合作的结果。该芯片是安捷伦CNV和类似的基因组杂交(CGH)芯片系列产品的最新扩展, 也是安捷伦增长最快的产品领域。 &ldquo 在过去的几个月里,我们用安捷伦2x105K芯片研究了几种不同疾病的常见结构变异,&rdquo 维康信托桑格研究院(Wellcome Trust Sanger Institute)的Matthew Hurles博士说,&ldquo 初步研究结果证明, 芯片上20-30%的位点在我们的英国人群中都具有双重多态性,通过高质量的芯片数据获得了与变异相关的准确拷贝数值。&rdquo * 顾名思义,安捷伦CNV 2x105K基因芯片,就是每张1 x 3英寸的玻片上有两个芯片,每个芯片包含105,000个探针,安捷伦的60 mer高精确度优化探针,提供了灵敏而精确的拷贝数检测。芯片的设计针对有高置信度CNV区域,使我们能用较少的数据点获得极高的检出率。 新的标记试剂盒为您节省经费、提高效率 安捷伦同期还推出了基因组高通量ULS标记试剂盒,以及基因组DNA 96-孔板纯化组件,使实验流程速度提高了4倍。根据采用芯片类型的不同,每个实验的标记成本最多可降低60%。这种标记试剂盒采用Kreatech的ULS标记技术,为从组织、细胞、血浆或福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样品中分离出的DNA进行Cy-标记,与安捷伦CNV和CGH基因芯片一起使用。这种非酶标法用荧光染料直接标记DNA,为降解样本的标记提供了有效方法。 安捷伦基因组高通量ULS标记试剂盒最多可容纳48个样品,基因组DNA 96孔板纯化组件可以同时对96个反应进行纯化,与单个纯化柱相比,显著的加快了工作流程,为进一步实现流程自动化提供了便利。 &ldquo 我们非常高兴,安捷伦选择了我们的ULS标记和纯化技术,针对96孔板自动操作的高通量应用我们进行了专门设计&rdquo 安捷伦试剂盒的原始设计制造商,Kreatech Diagnostics公司销售与市场副总监 Harald Berninger说。 如需进一步了解新的安捷伦人CNV 2x105K基因芯片、基因组高通量ULS标记试剂盒,以及基因组DNA 96-孔板纯化组件的相关信息,请访问www.opengenomics.com. 关于维康信托 维康信托是1936年按照Henry Wellcome爵士遗嘱成立的一家独立的注册慈善信托基金会。该信托机构是全球第二大的生物医学研究基金会,致力于&ldquo 推动旨在改善人与动物健康的研究&rdquo 。作为英国最大的慈善信托基金会,集中管理着各种投资项目(截止到2005年9月30日,总数为123亿英镑)。在2004-2005年度,该基金会的慈善支出为4.83亿英镑,这其中包括3.44亿英镑的巨额基金资助用于全球范围内的创新性科学与医学研究。 关于安捷伦科技 安捷伦科技(NYSE:A)是全球领先的测量公司,是通讯、电子、生命科学和化学分析领域的技术领导者。公司的19,000 名员工在110多个国家为客户服务。在2008财政年度,安捷伦的业务净收入为58亿美元。要了解安捷伦科技的信息,请访问www.agilent.com 。
  • 我国研发出生缺陷检测芯片 最快明年推出
    9月12日,2010全国妇幼保健热点论坛在广州举行。47岁的中国工程院院士程京欣然接受南方日报专访,畅谈生物芯片的研究进展与前景。他表示,针对广东“地方病”地中海贫血的基因检测芯片,预计明年面世。  一出生就做基因芯片检测,可预防“一针致聋”  从去年以来,程京已经自主研发了遗传性耳聋检测基因芯片、分枝杆菌菌种鉴定基因芯片、结核分枝杆菌耐药检测基因芯片、自身免疫性疾病检测蛋白芯片等4种新型疾病检测产品。目前均进入临床使用,广东省妇幼保健院等多家广东医院已可检测。  程京举例说,中国每年新增4万个遗传性耳聋患者,其中很大部分是药物致聋。像《千手观音》中美丽的聋哑演员邰丽华,就是因为两岁时高烧注射链霉素而失去了听力。“假如邰丽华在刚刚出生时做过基因芯片检测,得知自己是药物性耳聋基因的携带者,只要在今后不使用氨基糖甙类的抗生素药物,就可以避免药物性耳聋的发生。”甚至更早一步,如果她的母亲在怀孕前做检测,确定携带药物性致聋基因,由于这个基因是通过母系遗传的,孩子肯定也会有,可以更早知道,预防“一针致聋”。  与广东合作研制基因检测芯片,减少出生缺陷  近年我国新生儿出生缺陷率持续攀升,广东高达2.7%。程京透露,生物芯片北京国家工程研究中心出生缺陷领域分中心将落户广东省妇幼保健院,将与广东合作研发生物芯片。  广东是地中海贫血高发省份,约有10%—15%人群携带地贫基因。如果夫妇两人均携带地贫基因,所生孩子有1/4的几率是重型地贫患者,给家庭带来沉重负担。省妇幼保健院优生优育遗传与产前诊断中心副主任医师尹爱华透露,目前已和程京院士合作研制地贫基因检测芯片,预计在明年面世,减少新生儿出生缺陷。  据了解,目前地贫基因的试剂盒检测程序麻烦,有20多个步骤是人工操作,容易出现误诊,而且限于技术问题县级医院无法开展。如果地贫基因芯片研制成功,就可大批量做检测,医院一天检测量可从目前的100个标本上升到上万个,而且检测费用会便宜很多。
  • H1N1流感病毒及多亚型流感病毒检测基因芯片面世
    继不久前成功研制出快速检测甲型H1N1流感病毒试剂盒后,中国军事医学科学院军事兽医研究所又研制出一种新型基因芯片,借助这种芯片能在5小时内获得检测结果。  据介绍,使用这种基因芯片能够用来检测1-16种亚型甲型流感病毒,并可以对当前流行的甲型H1N1流感病毒进行特异性检测,还可以对H1、H3、H5、H7、H9亚型流感病毒进行分型检测。该检测方法可同时对12个样品进行快速、灵敏、特异性检测(阳性样品显示特异荧光),并在3.5-5小时内获得检测结果。  军事兽医研究所工作人员表示,与试剂盒检测相比,基因芯片具有用时短、一次性检测样品多等优点,将为中国应对潜在疫情提供有力的技术支持。
  • 卫生部下放基因芯片审批权 产业化商机无限
    这一信息让病患者困扰的一种病不同医生可能有不同答案的担忧得以解决:卫生部日前下发通知,决定将基因芯片诊断技术审批权“下放”到省级卫生主管部门。这意味着今后在临床上,将有越来越多的有资质的临床医生使用该项技术。业内人士分析,此举是卫生部在医药卫生系统推进科技产业化的风向标之一。  据基因科学家介绍,如采用基因芯片技术,对心血管疾病、神经系统疾病、内分泌系统疾病、免疫性疾病、代谢性疾病等早期诊断率将大大提高,而误诊率会大大降低。  基因芯片带来巨大商机  基因芯片技术此前我国需要经过卫生部门的审核,医院才可以把它运用到临床治疗中。  基因芯片专家严新民、郑芳在接受采访时说,疾病的发生发展经历了从基因到蛋白质,再到细胞、组织的变化,最后表现在脏器层面等一系列复杂的过程。传统诊断技术最多能捕捉到蛋白质层面,而基因芯片可以分析到分子层面。  专家表示,迄今为止,国内已有多款基因芯片产品获得不同形式的新药及医疗器械证书,其中部分项目获得国家“863”等重大课题资助。  基因芯片技术的推广必然带来巨大的商机,我国已经有一些依靠基因芯片技术而发展起来的公司。中山大学达安基因股份已成为实力雄厚的上市公司。  产业化需要长线投入  基因诊断需要尖端的设备,从业人员需要有十分专业的技术,因此其收费也非常昂贵。不少医院看准这项技术将带来丰厚的收入,不过,卫生部对基因诊断临床应用有严格的规定。  据介绍,目前获准开展基因芯片诊断技术的医疗机构不仅要求是三级医院,还要有卫生行政部门核准登记的医学检验科诊疗科目,有涉及生物安全的样本采集和处理的相应安全等级的实验室。同时,对相应的仪器设备也有严格的要求。  华南基因组研究中心主任郑文岭坦言,由于基因芯片诊断技术没有前期的管理规范,而在健康保健领域又存在着大量不规范应用的行为,令人没有信服感,至今还未能在临床上大规模应用。  不过,新的规定令以前高高在上的尖端科技“跌落云端”,基因诊断将更快走入寻常百姓家,产业化规模也有望迅速扩大。专家介绍,目前全球提供基因检测的机构有1762家,绝大部分在美国 可以应用基因检测的疾病达到1502种。但目前一半以上的人类基因功能还是未知数。  一滴血验癌症是否靠谱  人们经常会看到这样的广告:只需一滴血,你就可以预知自己是否会患上癌症等疾病。这样的基因诊断是否可信呢?据专家介绍,基因诊断能预知疾病,但其结果并非一定就会发生。  基因改变作为最早期的量变,与疾病的关系并不能一一对应,所有基因检测的结果,仅具有参考价值。比如癌症,基因检测可明确找出一个人是否携带相关的癌症基因,但是癌症发病受环境、遗传等诸多因素影响,有突变基因不代表一定会发病。而从业人员是否接受过完整、规范的培训,是否能准确地操作出检验结果,也很重要。  基因芯片诊断主要适用于那些依靠目前的临床诊断手段仍无法确诊,而病人已有症状或者主观感觉不适者。客观地说,基因芯片并不能完全取代目前临床实验室诊断,而只能视其为补充或扩展。
  • 天津生物芯片公司食品中病原生物芯片检测试剂盒亮相国家“十一五”成就展
    仪器信息网讯 2011年3月7日至14日,天津生物芯片技术有限责任公司的食品中病原生物芯片检测试剂盒亮相国家“十一五”重大科技成就展。食品中病原生物芯片检测试剂盒  图中包括能够同时检测食品中沙门氏菌、致病性大肠杆菌等八种致病菌的基因芯片试剂盒,同时检测甲肝病毒、戊肝病毒等 五种食源性病毒的基因芯片试剂盒。该产品具有完全的自主知识产权,实现了样品中多指标的快速并行检测,食源性致病菌检测时间由4-8天缩短到20hr内,食源性病毒检测时间由1-2天缩短到10-12hr。  关于天津生物芯片技术有限责任公司:  天津生物芯片技术有限责任公司成立于2003年9月,坐落于天津经济技术开发区,注册资金一亿元人民币,总建筑面积4800平方米,其中实验室面积3800平方米,按照国际通行标准建立了完整的公共实验室体系,包括基因组学、功能基因组学、生物信息学和生物芯片4大研究平台,主要从事微生物检测芯片的研发、基因组学和功能基因组学研究。根据客户需要,公司可提供针对不同检测现场、不同检测对象、不同通量、不同类型实验室的微生物检测整体解决方案:包括样品前处理,免疫学检测、分子生物学检测、数据分析等多个方面,相继开发了诊断血清、免疫磁珠、分子生物学检测试剂盒三大类85种产品。
  • 神奇的生物芯片
    p style="text-indent: 2em "strong芯片(Chip)/strong在电子设备中的使用由来已久。众所周知,这类电子芯片由集成电路组成,通过连线和半导体工艺被撮合在一起,不仅形状小巧,还能快速检测、储存或处理大量的数据,已成为手机、电脑、电视、车载多媒体系统等几乎所有电子设备的核心元件,是人类科技史上最成功的发明之一。/pp  strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "“生物化”的电子芯片/span/strong/pp  近年来,在生物学及医学领域,一种更为神奇的生物芯片应运而生(图1)。它们的外表酷似电子芯片,却在普通芯片触及不到的生物学检测及临床治疗方面大显身手。有些种类的芯片甚至可以直接安置在人体内部,收集并检测人体内产生的生理信号,已成为分子生物学研究、疾病预防和治疗过程中常用的利器。美国前总统克林顿曾指出,未来,基因芯片将为我们一生中的疾病预防指点迷津。生物芯片的重要性及其在疾病诊断和治疗方面的地位可见一斑。/pp style="text-align: center"img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201908/uepic/0e890c3d-37cf-4e80-a5c0-861372297e57.jpg" title="1.jpg" alt="1.jpg"//pp style="text-align: center "span style="font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai "图1:形形色色的生物芯片。图片来自网络/span/pp  那么生物芯片究竟是何方神圣?又是怎样造福于人类的呢?从制造工艺的角度来讲,生物芯片可称为电子芯片“生物化”后的产物。与传统芯片(图2A)相比,生物芯片(图2B)仅保留了与之相同的硅底或玻璃底座部分,但在底座之上却不再是集成电路,而是固定核酸、蛋白质(图2C)等生物大分子,或细胞、组织等生物材料。虽然外形相似,但其功能及用途却发生了翻天覆地的变化。/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 453px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201908/uepic/7e49bfd7-caac-4147-bbbb-9dbe30f6388c.jpg" title="2.jpg" alt="2.jpg" width="600" height="453" border="0" vspace="0"//pp  span style="font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai "图2:传统芯片与生物芯片的比较。A、用于电子设备的芯片外形。B、生物芯片外形。C、生物芯片结构示意图。其表面以核酸分子构成的称为基因芯片或DNA芯片,其表面以抗体等蛋白大分子构成的称为蛋白芯片。图片来自网络/span/pp  strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "最先研发的基因芯片/span/strong/pp  最早的生物芯片是以核酸片段为原料制作而成的“基因芯片”(Gene chip),又叫“基因微阵列”(Gene microarray),由美国Affymetrix公司于1996年率先研制并首先将其应用在基因测序方面。近几年,随着芯片技术的发展,蛋白芯片、细胞芯片、组织芯片等相继加入了生物芯片阵营。但迄今为止,基因芯片仍是开发最为成功、应用最为广泛的一类生物芯片。/pp  此类芯片以双链DNA的碱基互补配对属性为工作原理,将大量(通常每平方厘米点阵密度高于400)单链、短片核苷酸(又名探针)固定于支持物上后与样品DNA进行孵育,样品中的DNA一旦与探针形成互补配对,就可以释放出荧光信号,被荧光探测仪所捕捉并转化成电子数据供计算机进一步进行分析。/pp  虽然基因芯片的原理相对简单,但其强大的检测能力却不容置疑。在生物学家、软件工程师及材料学家的合力优化下,目前单个基因芯片可以同时、快速、准确地分析数以千计基因组信息。如今市场以及临床上应用广泛的基因诊断、癌症筛选均需要借助基因芯片完成。除此之外,基因芯片技术还在药物筛选、分子育种、司法鉴定、食品微生物检测、环境监测、国防、航天等许多领域大显身手,为科学家们从事生物类基础研究、临床上进行疾病诊断、治疗和防治,以及医学界筛选新型药物和进行药物基因组学等重要研究提供了核心技术平台。/pp  strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "无可取代的蛋白芯片/span/strong/pp  与基因芯片相比,蛋白芯片的应用虽不如基因芯片广泛,但在肿瘤标志物检测方面,仍具有无可取代的重要地位。蛋白芯片是以蛋白质(主要指抗体)代替DNA固定于芯片表面作为探针,检测蛋白溶液中可以被抗体探针识别的相应蛋白的技术。根据遗传学规律,基因表达的最终结果是相应蛋白表达。因此,在多数情况下,基因表达量的变化也与蛋白表达量成正相关。与基因芯片相比,这种蛋白芯片可供检测的通量、灵敏度虽然稍逊一筹,但抗体对蛋白识别的特异性却远大于DNA进行互补配对的特异性。因此,在诸如一些重要疾病(包括肿瘤)的鉴定,以及蛋白类靶向药物筛选方面,蛋白芯片由于具有基因芯片无法超越的准确性,其推广程度远大于基因芯片。/pp  strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "新奇成员植入式芯片/span/strong/pp  目前,随着生物科技的发展,以及各式各样的科研及诊疗需求,除了基因及蛋白芯片外,生物芯片家族中相继出现了许多更为新奇的成员,如芯片界的新星——植入式芯片。植入式芯片开发的时期较基因及蛋白芯片稍晚,但这并不妨碍它立刻展现出可以进行身份识别或活体检测的巨大优势,在生物类产品林立的今天仍具有广阔的开发潜力。与基因和蛋白芯片相比,这种植入式芯片的原理及使用方法稍显“惊悚”。植入式芯片,顾名思义,是一类需要通过手术、注射等外科手段将芯片植入人体或活体动物内部工作的设备。其测定对象也不再是从组织中提取出的DNA或蛋白质,而是芯片周围组织的生理情况,如神经元活动、血液指标等。除此之外,为了适应这些新的功能,植入式芯片的外形也发生了极大的改变,除了采集信息的核心部分,成品芯片内还增加了电池、天线及信号发射装置,体积却压缩得更为小巧。/pp  最早开发的植入式芯片为一类简单的ID芯片,其芯片仅具有向扫描仪发射预先写入的信息、编号等单一功能,又被称为生物芯片转发器(biochip transponder)。这种ID芯片可以通过注射的方式被植入皮下,自1991年开始由世界各地的动物园陆续推广,主要用于标记并区分受保护的野生动物(相当于家畜身上的耳环、烙印或刺青)。由2000年开始,ID芯片的使用变得更加普及,在欧美等地许多国家都规定在宠物许可证上登记的宠物使用该芯片。这种ID芯片的外观是一枚胶囊状的玻璃管,管内分别含有一个带有数字信息的激光身份编码、一个天线和一个作为电容器的硅晶片。芯片可以通过配套的一次性注射器注入,并通过与之兼容的扫描仪激活并识别,通过向扫描仪发射无线电信号传递信息。/pp  尽管ID芯片在动物中的应用十分普及,但关于ID芯片在人体中的应用仍存有较大争议。事实上,ID芯片技术本身已相当成熟,但在人体植入ID芯片带来的潜在伦理及安全问题是造成ID芯片无法普及的主要障碍。如有人提出在儿童体内植入这种ID芯片,可以方便家人在不慎遗失儿童后快速追踪,但如果此儿童的ID信号被犯罪分子跟踪的话,那么后果将不堪设想。也有人担心,这种提供他人行踪的技术可能会为犯罪分子作案提供便利。/pp  因此,目前在人体中得到推广的主要是几种与疾病探查、治疗有关的植入式芯片。如对糖尿病患者而言,在餐前饭后刺穿手指采血并测量血糖指数是每个人都要忍受的痛苦(图3A和B)。而近年来,血糖芯片的问世已陆续为这些糖尿病患者带来福音。血糖芯片的个头小巧,可一次性植入皮下并长期、多次检测体液中的糖分变化(图3C)。该芯片仅为0.5× 2.0毫米大小,植入这种芯片既不会让患者感到不舒服,也使患者免除了日日采血的痛苦,是一项造福于人类的伟大发明。/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 533px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201908/uepic/cc2f3353-a961-411e-b356-a12b02bb6ea3.jpg" title="3.jpg" alt="3.jpg" width="600" height="533" border="0" vspace="0"//pp  span style="font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai "图3:血糖芯片的工作原理。A和B、传统的穿刺法取血。C、新型血糖芯片的大小。图片来自网络/span/pp  除血糖芯片外,还有另一类脑机芯片得到了科研人员的格外推崇。这类芯片主要通过植入大脑皮层接受脑电波等神经信号,并将脑电波信号上传至电子计算机设备(即脑机接口技术),是一项具有广阔前景并引发人无限遐想的高科技技术。脑机接口的过程非常复杂,其全套技术至今仍处在开发阶段。2016年,俄亥俄州立大学研究人员为一位24岁的全身瘫痪的男孩Ian Burkhart通过手术在大脑皮层内植入了这种脑机芯片,它们能在大脑内采集运动相关的神经信号,并将数据传输到神经辅助装置进行“解码”。计算机会将“解码”后的指令发送给绑在手臂上的电极,通过刺激肌肉来实现手臂运动。通过训练,Ian Burkhart最终得以实现通过芯片传输控制手的抓举和一些日常动作。/pp  生物芯片的发展自上世纪90年代开始起步,如今仍属于生物领域的前沿学科。可以预见,在21世纪,生物芯片的应用及新技术的开发仍然将会给整个生物领域持续带来新的变革。可喜的是,在大多数芯片技术应用方面,我国生物芯片技术的发展都紧跟国际前沿,其产业化水平也有大规模提升。虽然目前我们仍面临众多技术难题,但随着我国科研力量的不断增强,以及产业化的深入,生物芯片产业将有希望成为21世纪最大的产业之一。/p
  • 生物芯片北京国家工程研究中心新疆分中心生物芯片培训班
    生物芯片北京国家工程研究中心新疆分中心生物芯片培训班 主办:生物芯片北京国家工程研究中心新疆分中心协办:生物芯片北京国家工程研究中心   生物芯片技术凭借着显著的优势和巨大的潜力,已经成为在医学、农业、微生物等相关研究领域快速增长的一项重要技术。随着基因组学、蛋白质组学的不断深入研究,生物芯片技术的应用范围不断扩大,已经广泛应用于重大疾病预警、产前诊断、食品安全检测、作物经济性状关联研究(GWAS)、遗传育种;动植物病理学、农作物病虫害防治、种质资源鉴定、转基因作物等领域。  以生物芯片为工具的研究已经渗透到生命科学领域研究中的每个角落,随着研究的不断深入,产生了大量的科研成果,几乎每天都有大量高水平研究文章发表。为了扩大交流,促进科研成果转化,搭建科研成果与成果转化之间的桥梁,由生物芯片北京国家工程研究中心新疆分中心举办&ldquo 生物芯片技术在生命科学领域的应用&rdquo 培训班。本培训班将系统讲解基因芯片的设计、制作以及相关实验操作,旨在为您打造一片属于您的&ldquo 芯&rdquo 天地。  在此次培训班的尾声,2012' 喀纳斯科学与艺术论坛恰在乌鲁木齐举行。此次论坛特邀请了多位院士、科技部领导及三甲医院院长,将围绕新疆特高发疾病等重大科学问题开展学术探讨和合作交流。欢迎各位在8月10日前来观会。培训内容 | 生物芯片技术培训1.1 理论部分:生物芯片技术在生命科学领域中的应用1.2 理论部分:表达谱芯片构建、探针设计、数据分析等基础理论知识讲解2.1 实践部分: 观摩芯片点制过程2.2 实践部分:晶芯表达谱实验整个实验流程(视频)2.3 实践部分: 芯片杂交、清洗、扫描(培训学员模拟杂交、扫描)2.4 实践部分: 数据分析(培训学员亲自对数据进行分析)2.5 实践部分: SAM、Cluster等数据分析软件使用2.6 实践部分:分子功能注释系统(MAS)分析注册方法:申请培训学员填写培训回执表后,发到培训联系人吕国栋邮箱中,进行确认,培训联系人在收到回执表后3天之内给予回复。培训时间:2012年8月7-9日培训地点:新疆医科大学第一附属医院 科技楼4楼 省部共建国家重点实验室培育基地会议室(新疆乌鲁木齐市新市区鲤鱼山路1号)。培训费用:培训费用免费,食宿费用自理。培训规模:20人左右,为保证培训班质量,采取小班模式。请学员自带电脑。培训资料:包括培训讲师幻灯、培训教材、培训学员通讯录、培训证书(生物芯片北京国家研究中心印)、精美礼品一份。注意事项报到时间:2012年8月6日报到地点:新疆医科大学第一附属医院 科技楼7楼生物芯片北京国家工程研究中心新疆分中心。住宿地点:新疆医科大学第一附属医院附近宾馆酒店(仅供参考):1、新疆昆仑宾馆(三星级)地址:乌鲁木齐市新疆维吾尔自治区 友好北路146号电话:0991-51900002、乌鲁木齐宇豪馨怡酒(四星级)地址:乌鲁木齐市新疆维吾尔自治区 新市区新医路359号电话:0991-4328555行车路线:1、火车站(距新疆医科大学第一附属医院8公里左右):(1)、乘出租车到达新疆医科大学第一附属医院(车费大约15元左右)。(2)、乘坐906,52路公交车均可以到达新疆医科大学第一附属医院(车费1元)。2、机 场(距新疆医科大学第一附属医院13公里左右):(1)、乘坐出租车到新疆医科大学第一附属医院(大约21元左右);(2)、从乌鲁木齐地窝堡国际机场535路公交车通往新疆医科大学第一附属医院。联系方式:联系人: 新疆医科大学第一附属医院 生物芯片北京国家工程研究中心新疆分中心 吕国栋电话: 0991-4366042 邮箱:xjmicroarray@163.com客户培训回执表姓名:E-mail:单位:电话:地址:邮编:是否需要帮助预定宾馆(协议宾馆): 是 否备注:如果需要安排宾馆,请注明入住时间:您感兴趣的领域:
  • 松下研发出1小时即可完成检测的基因检测芯片
    松下与比利时微电子研究中心(IMEC)共同开发出了1小时即可完成检测的全自动小型基因检测芯片。该芯片可利用数&mu L血液来检测SNP(Single Nucleotide Polymorphism,单核苷酸多性态)等基因信息。SNP是指不同个体的基因组存在不同种类的碱基,通过检测SNP,可诊断有无遗传病及将来患遗传病的危险率,并可确定与疾病相关的基因。   以前的全自动基因检测装置大都是大型装置,大多采取将检体送到专门的检测机构进行分析的方法。因此,检测结果要等待数天到1周左右的时间才能得知。而此次开发的芯片则不同,包括前处理工序在内只需1个小时即可完成检测,因此在临床现场,医生可当场对患者用药及发病风险做出判断。  此次开发的芯片集成了从微量血液中提取并放大DNA,进行SNP判断的功能。具体而言,在约9cm2的芯片上集成了输送血液及药液的超小型泵、DNA提取及放大部分、高精度滤膜以及高灵敏度传感器等。  为实现该芯片而新开发的必要技术大致有以下三项。  (1)使用导电性聚合物致动器的超小型高压泵  通过在硅基板上层积聚合物薄膜,开发出了可在层积方向大幅伸缩的聚合物致动器,实现了通过移动隔膜来输送液体的隔膜泵。该聚合物致动器可产生最大超过300个大气压的压力,能够在微流路中轻松实现包括向筛选DNA的高精度滤膜注入液体在内的溶液移动。此外还实现了可用电池驱动的低电压(1.5V)工作。  (2)高速PCR技术  进行基因诊断时,需要从DNA上取出含SNP的区域,并使其增至一定数量,一般使用名为PCR(Polymerase Chain Reaction,聚合酶链式反应)的方法来放大DNA,但是,原来的PCR法放大DNA需要2个小时。因此,研究人员使用导热性好的硅基板,优化了隔离周围热量的手段,提高了升降温的温度追随性,同时还实现了通过小液量来引起PCR反应的构造。通过这些措施将放大DNA所需要的时间缩短到了15分钟以内。  (3)高精度、高灵敏度的电化学传感器  以电气方式识别SNP时,需要使用在电极上固定有识别用人造DNA的昂贵的特殊电极。此次凭借新开发的传感器,无需在电极上固定识别用人造DNA,能够以溶解在微量(约0.5&mu L)药液中的状态,电气性地识别SNP。
  • 芯片与测序又掐架了,这次你站哪方?
    p  在高通量检测这个领域里,基因芯片和二代测序这对相爱相杀的cp,原本均是了解基因组结构和功能的绝佳高手,如今为了一争高下,又是闹的不开交。这不,基因芯片仗着自己老大哥的身份,手持一个二维的DNA探针阵列所形成的三维地图,以数以万计的探针做方向标,能按图索骥的找到基因组的特定位置,且结合完整成熟的指控分析手段能快狠准地筛选出所需基因,颇有几分笑傲江湖的气势。/pp  然而,RNA测序技术作为后起之秀,不仅能轻而易举地解读由转录组组成的生命杂志,就连探索新的突变位点以及新基因之事也都不在话下。这锋芒毕露的架势,显然来势汹汹,眼瞅着就要把这些年略显沉寂的芯片老大哥给打压下去,成为高通量领域里独霸一方的势力了。/pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201708/insimg/8c73f0be-2d3e-4e84-9f49-5786741c3761.jpg" title="1_副本.jpg"//pp  至此,进入看戏模式的吃瓜群众—科研者们,虽然表面看的热闹,其实内心深处也颇为纠结,万一哪天真要战队,我该支持谁呢?芯片与测序各有所长,均可大放异彩,到底谁才是笑到最后的那一个呢?/pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201708/insimg/e15996d6-6b43-449b-80c9-97549b40c1b5.jpg" title="2_副本.jpg"//pp  strong芯片vs测序,各领风骚/strong/pp  BMC Genomics 的一篇文章,似乎能为一众心有存疑的科研者们指点迷津。它以9对肺鳞状细胞癌配对样本为材料,分别用Affymetrix HumanTranscriptome Arrays 2.0 (HTA)(最新一代全转录本表达谱芯片)和IlluminaHiSeq 2000检测平台,以测序200 M reads为基础,深入比较了芯片和测序在转录本定量检测和可变剪切方面的情况。/pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201708/insimg/7b5346c1-9428-4175-9c20-e124593c032d.jpg" title="3_副本.jpg"/  /pp  首先,就检测基因覆盖范围而言,芯片和测序均可检测到Ensembl数据库中92%的mRNA和90%的lncRNA,可以说是不相上下,打成平局。/pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201708/insimg/13816e2d-3080-49c0-8bbf-3b5cdc5be00d.jpg" title="4.jpg"//pp  而在正常和肿瘤组织生物学重复比较分析,发现在低表达基因上,RNA-seq检测的样本可变性更大,而芯片则没有表达高低的偏好性,说明HTA芯片的稳定性比RNA-Seq更好。/pp style="text-align: center "img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201708/insimg/3c6e066a-e72f-476c-944f-a1ecce34aba6.jpg" title="5_副本.jpg"//pp  至于灵敏度,依据检测信号分布强度(log2 intensity values),HTA的变化范围在3到13之间,而RNA-seq则在-1到14之间,其动态范围更大,可减少一些漏网之鱼,然而对于一些短片度基因,却是芯片的检测效果更好一些。/pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201708/insimg/16ef249c-4705-4357-b550-d9df76cce92e.jpg" title="6_副本.jpg"//pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201708/insimg/3852ba85-0af6-49fc-a736-c1263830d82e.jpg" title="7_副本.jpg"//pp  而非配对差异分析结果中,在mRNA差异检出数量中,HTA对比RNA-seq分别是6173和4777(3683为共有) 在lncRNA差异检出数量中,HTA对比RNA-seq分别是1219和892(376为共有)。/pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201708/insimg/c059d73f-1a2f-4e0d-8ea0-ce0b5b9685ac.jpg" title="8_副本.jpg"//pp  显然,对同样疾病样本在TCGA上的数据分析比较,差异基因中,无论是mRNA,还是lncRNA,芯片与TCGA吻合的基因数量更多。/pp  另外,欲寻找疾病诊断标记物的小伙伴可要记住了,无论是mRNA或者lncRNA,HTA平台有更多的基因可作为biomarker。/pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201708/insimg/0027ac75-413f-4086-9d72-06770b0795c9.jpg" title="9_副本.jpg"//pp  可变剪切分析是识别基因不同转录本特异性表达的有效手段。其中,RNA-seq可鉴定到23,934个差异exons,HTA鉴定到26,999个差异exons(3698个共有)。Junctions差异鉴定,RNA-seq为7063个,HTA为40,384个(1551个共有)。/pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201708/insimg/65decf29-9cf4-447c-ae58-e0d4e52be113.jpg" title="10_副本.jpg"//pp  综合两者分析显示,只有207个mRNAs的可变剪切结果在两个平台能同时出现。/pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201708/insimg/52dec63a-ad47-4699-9486-235bf5607912.jpg" title="11_副本.jpg"//pp  总体来说,这两种技术各有千秋,各具特色,在应用方面也可以说是平分秋色,各领风骚。简单说来,两者都在为筛选目的基因添砖加瓦,既如此,何不都拿来为我所用呢。更何况,有时强强联手,反而会碰撞出美丽的火花,说不定还会产生翻倍的效果。/pp  strong芯片联手测序之案例分析/strong/pp  于是,有些雷厉风行的研究者就立刻行动起来。这不,Nature Communications的一篇研究肝纤维化(肝内细胞外间质成分ECM积累造成)文章就充分向大家展示了,芯片在与测序联手后,是如何玩转对下游靶基因的筛选,进而完美实现了两手都要抓,两手都要硬的大纲领。/pp  strong1.基因芯片打头阵,筛出肝纤维化相关lncRNA/strong/pp  在构建肝纤维化的小鼠模型后,通过基因芯片筛选共得到了266个lncRNA和1007个mRNA上调,447个lncRNA和519个mRNA下调。基于共表达分析和RT-PCR验证,研究人员筛选到了NONMMUT013861等10个与CCl4诱导肝纤维化相关的lncRNA。而经验证,只有lncRNA—lnc-LFAR1是在肝脏中特异性表达的。/pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201708/insimg/6a54e37f-9cdd-45ac-8821-6273722e6a09.jpg" title="12_副本.jpg"//pp  strong2.RNA-seq送助力,筛选下游靶基因/strong/pp  在肝纤维化过程中,肝星形细胞(HSCs)的激活至关重要。因而,研究者探索了lnc-LFAR1在HSCs中的下游调控基因,即用shRNAs敲降了lnc-LFAR1后,二代测序筛选下游差异变化基因。/pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201708/insimg/5b9b6140-c524-4d0e-b61c-d7f4594a767d.jpg" title="13_副本.jpg"//pp  通过对差异的2023个mRNA的GO与KEGG通路富集,发现主要富集到ECM过程基因和ECM-受体作用通路。显然,在HSCs中,lnc-LFAR1调控了ECM基因。/pp  strong3.基因芯片再出马,体内变化基因跑不了/strong/pp  研究者已然证明了敲降lnc-LFAR1后影响TGFβ诱导的HCs凋亡,为了验证体内基因的相关变化,先在小鼠中shLFAR1干扰其表达,CCl4诱导肝纤维化,基因芯片筛选下游变化mRNA。/pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201708/insimg/f99c5522-83bc-44eb-9423-0a950e38535c.jpg" title="14_副本.jpg"//pp  结果显示,小鼠体内lnc-LFAR1的低表达,使得肝细胞在CCL4诱导下,其下游变化的基因显著减少,只有292个上调,112个下调。GO和KEGG 通路分析也显示,lnc-LFAR1沉默影响的下游基因主要是胶原纤维组织和 TGFβ 受体信号通路,并进一步确定了 lnc-LFAR1的敲降使得CCl4和BDL诱导的肝纤维化会被显著减弱。/pp  至此,芯片与测序的轮番出击,体内外实验的联合轰炸,使得lnc-LFAR1在肝纤维过程发挥作用成为了一件板上钉钉的事儿了。至于下游所发生的具体作用机制,文章中也通过了大量实验对其进行了阐释,并获得以下信号通路图。/pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201708/insimg/1c11d572-d443-4851-8dab-5b3f25f9f4c1.jpg" title="15_副本.jpg"//pp  其中,lnc-LFAR1与磷酸化Smad2/3之间存在正反馈,并会调控胞内notch、炎症和凋亡相关等信号通路,进而调节肝纤维化过程。此时,文章才算讲述了一个完整的故事。显然,故事中测序与芯片无疑为筛选该故事的主角和下游基因的筛选起到了举足轻重的作用。/pp  所以,各位小伙伴们,争议这两个技术孰优孰劣,真的没有意义。毕竟,“黑猫,白猫,能抓老鼠的就是好猫”,既然两只猫都能抓到老鼠,又何必在意它的颜色呢。/pp  至于实际实验操作中,是在两者之间有所取舍,又或是两者结合使用,小编的建议是,选择对的就好。只有两个都用过了,你才会知道谁更适合自己。/p
  • 生物芯片北京国家工程研究中心宁夏分中心生物芯片培训班
    生物芯片北京国家工程研究中心宁夏分中心生物芯片培训班&mdash &mdash 打造一片属于您的&ldquo 芯&rdquo 天地   生物芯片技术凭借着显著的优势和巨大的潜力,已经成为在医学、农业、微生物等相关研究领域快速增长的一项重要技术。随着基因组学、蛋白质组学的不断深入研究,生物芯片技术的应用范围不断扩大,已经广泛应用于重大疾病预警、产前诊断、食品安全检测、作物经济性状关联研究(GWAS)、遗传育种;动植物病理学、农作物病虫害防治、种质资源鉴定、转基因作物等领域。  以生物芯片为工具的研究已经渗透到生命科学领域研究中的每个角落,随着研究的不断深入,产生了大量的科研成果,几乎每天都有大量高水平研究文章发表。为了扩大交流,促进科研成果转化,搭建科研成果与成果转化之间的桥梁,由生物芯片北京国家工程研究中心宁夏分中心举办&ldquo 生物芯片技术在生命科学领域的应用&rdquo 培训班。本培训班将系统讲解基因芯片的设计、制作以及相关实验操作,旨在为您打造一片属于您的&ldquo 芯&rdquo 天地。培训内容:生物芯片技术培训1.1 理论部分:生物芯片技术在生命科学领域中的应用1.2 理论部分:表达谱芯片构建、探针设计、数据分析等基础理论知识讲解2.1 实践部分: 观摩芯片点制过程2.2 实践部分:晶芯表达谱实验整个实验流程(视频)2.3 实践部分: 芯片杂交、清洗、扫描(培训学员模拟杂交、扫描)2.4 实践部分: 数据分析(培训学员亲自对数据进行分析)2.5 实践部分: SAM、Cluster等数据分析软件使用2.6 实践部分:分子功能注释系统(MAS)分析1:注册方法:申请培训学员填写培训回执表后,发到培训联系人于晶晶(yujingjing333@163.com)邮箱中,进行确认,培训联系人在收到回执表后3天之内给予回复。2:培训地点:宁夏医科大学总医院 生物芯片北京国家工程研究中心宁夏分中心实验室(宁夏银川市兴庆区胜利街804号)。3:培训时间:2012年7月25-27日4:培训费用:2000元/人,收费包含培训期间芯片试剂耗材费,实验操作及数据分析培训费,中午工作餐、听课费。住宿费自理。优惠措施:宁夏地区培训学员培训费用:1000元/人。报到时现金缴纳培训费,也可提前转账支付。缴纳培训费账户信息用户名:宁夏医科大学总医院开户行:中国工商银行银川胜利街支行人民币帐号: 2902006919100004647 (请注明缴费用于参加宁夏分中心生物芯片培训班)5:培训班规模:20人左右,为保证培训班质量,采取小班模式。请学员自带电脑。6:培训资料:包括培训讲师幻灯、培训教材、培训学员通讯录、培训证书(生物芯片北京国家研究中心印)、精美礼品一份。7:报到时间:2012年7月24日。(提前转账支付者请在报到时务必携带出示缴费收据证明)  报到地点:宁夏医科大学总医院 生物芯片北京国家工程研究中心宁夏分中心(宁夏银川市兴庆区胜利街804号, 科技楼三楼)。8:住宿地点:宁夏医科大学总医院附近宾馆酒店:1)银川御泉湾温泉假日酒店(四星级)地址:银川市兴庆区胜利南街541号 电话:0951-67348882)银川天豹酒店(三星级)地址:宁夏银川市兴庆区清和南街1352号 电话:0951-78995553)如家快捷酒店(银川南门广场店)地址:银川市兴庆区清河南街345号 电话:0951-60823334)兰花花大酒店延安店地址:银川市兴庆区胜利南街739号 电话:0951-4076588;0951-4076388具体前往报名地点的路线如下: 1)火车站(距宁夏医科大学总医院8公里左右):乘出租车到达宁夏医科大学总医院(大约30元左右)。 2)机场(距宁夏医科大学总医院20公里左右): a:乘坐出租车到宁夏医科大学总医院(大约80元左右);b:从宁夏河东机场乘机场大巴至民航大厦(25元), 再转乘出租车(8元)。 3)12路,23路,302路,37路,38路,3路,中巴5路,15路公交车通往医科大学总医院。9:联系方式:联系人: 宁夏医科大学总医院 生物芯片北京国家工程研究中心宁夏分中心实验室 于晶晶电话: 13895193050邮箱: yujingjing333@163.com备注:宁夏医科大学总医院附近交通示意图:客户培训回执表:姓名:E-mail:单位:电话:地址:邮编:是否需要帮助预定宾馆(协议宾馆): 是 否备注:如果需要安排宾馆,请注明入住时间:您感兴趣的领域: 主办方:生物芯片北京国家工程研究中心分中心宁夏分中心协办方:生物芯片北京国家工程研究中心
  • 松下与IMEC共同开发出SNP基因检测芯片
    松下与比利时IMEC在“IEDM 2010”上公开了两公司正在共同开发的SNP(single nucleotide polymorphism)检测芯片开发成果。SNP检测芯片能够以数μl(微升)的血液为检测对象,对SNP等遗传基因信息进行全自动检测。  此次开发出了“聚合物致动器泵(Polymer Actuator Pump)”和“DNA过滤器”等关键器件。前者起到输送微量血液和DNA溶液的作用。后者的作用则在于从含有被检SNP的DNA溶液中高精度筛选出目标SNP。“向实现硅基板上SNP检测的全自动化迈进了一大步”(松下)。  有助于定制医疗服务的普及  据松下介绍,由于此前的全自动SNP检测装置过于庞大且价格昂贵,因此只能应用在专门检查机构等DNA解析用途,未能在临床一线得到真正普及。检测结果的信息反馈也较慢。临床一线对于能够使用简单装置在短时间内进行SNP检测的需求非常大。  如果此次正在开发的SNP检测芯片能够应用于医疗一线,将有助于推动在普通医院等的临床一线普及根据每个人(患者)的体质选择药品处方等治疗方法的“定制(Tailor-Made)医疗服务”。由于利用数微升血液即可在短时间内检测出SNP,因此有望帮助临床医生在短时间内判断出药物对患者是否有效和疾病有多大的发病风险。  1.5V电压工作,可利用电池驱动  实现此次的微型泵时,通过在硅基板上层积聚合物薄膜,开发出可沿层积方向大幅伸缩的聚合物致动器。由此又开发出通过该致动器移动隔膜(Diaphragm)实现液体输送的聚合物致动器泵。这种微型泵可以产生超过30个大气压的压力。  可以轻松实现包括需要高压的DNA过滤器等的分子筛在内的微流路中的溶液移动。同时由于是在1.5V的低电压下工作,因此能够利用电池驱动。另外由于即使切断驱动电压也可保持加压状态,因此能够把耗电量控制在最小。  另一方面,在实现DNA过滤器时还有效利用了IMEC的最尖端硅微细加工技术。在直径为1μm、高度超过20μm的高纵横比硅圆柱体上实现了以1μm间距规律配置的筛孔结构。当溶液通过这些硅圆柱体群的筛孔时,能够以50对碱基的高精度分离长度不同的SNP检体。  与此次开发相关的专利(包括正在申请之中的专利)在日本有36项,日本以外有23项。
  • 我国生物芯片技术飞速发展 与临床有效接轨
    21世纪的第一个10年是生命科学技术飞速发展的10年,以生物芯片为代表的一大批分子诊断产品日渐成熟,并正在以其巨大的优势和应用潜力成为保障人类健康的重要工具。  在中国工程院医药卫生学部、中国医师协会检验医师分会、中华医学会检验分会等于6月22日~24日在北京召开的“首届中国分子诊断技术大会”上,中国工程院院士、生物芯片北京国家工程研究中心主任程京等40余位知名专家所作的精彩学术报告,为人们展开了一幅我国生物芯片技术发展的绚丽画卷。  技术飞速发展  “我国生物芯片技术的快速发展令人目不暇接,一系列生物芯片的问世为疾病预警和干预、个性化诊断和预后等开辟了广阔的应用前景。”程京教授首先用“目不暇接”这样一个成语形象地表述了我国生物芯片技术发展的速度。  程京在题为《生物芯片诊断技术》的报告中说,随着人类基因组计划的顺利完成,越来越多的基因组和蛋白组信息被人们用于临床诊断,承担这些信息分析任务的各种生物芯片技术不断涌现。在样品制备方面,我国现在可以在芯片上通过各种主动式功能器件,对体液中的各种分子和细胞进行快速有效分离,为下一步生化反应作好准备。在生物芯片上进行基因扩增反应也已实现。在微阵列芯片方面,目前已有单核苷酸多态性(SNP)和突变分析芯片、比较基因组杂交芯片等多种高密度微阵列芯片,它们被用来发现与疾病相关的生物标志物。集成各项功能的芯片实验室也即将步入产业化阶段。  与临床有效接轨  近年来,国家食品药品监督管理局(SFDA)相继批准了遗传性耳聋基因检测芯片、分枝杆菌菌种鉴定基因芯片和结核耐药基因检测芯片等用于临床检验,这标志着分子诊断技术正在成为我国临床检验医学中的一支重要力量。  据解放军总医院耳鼻咽喉头颈外科戴朴教授介绍,在获得全国大规模聋人群体中耳聋基因突变类型和频率信息的基础上,为了发展耳聋基因诊断系统和平台,博奥生物公司和解放军总医院有针对性地选择了9个最常见耳聋基因突变位点,成功研制出基于等位基因特异性PCR通用芯片(ASPUA)平台上的耳聋基因芯片技术和产品。这是目前针对中国聋人群体最有效的检测和筛查工具。通过大规模推广这些致病基因筛查和产前诊断技术,进行遗传咨询和干预,可系统性减少我国耳聋出生缺陷及药物性耳聋的发生,为提高我国出生人口素质作出贡献。  中国工程院院士、中南大学国家重点学科药理学首席教授周宏灏说,基因芯片的发展速度大大超越了人们的预期,个体化用药将借助芯片技术实现由候选基因向全基因组研究的飞跃。中南大学已在国内多个地区将药物基因组学和遗传药理学知识推向临床实践,为安全用药和个体化用药提供有力支持。  关注重大疾病防控  面对越来越多应用于临床检验实践的分子诊断产品,中国检验医师分会会长丛玉隆教授表示,经过不断的临床实践和经验总结,特别是与临床共同开展的循证医学工作,分子诊断技术将在一些疑难疾病的早期发现和百姓健康促进方面发挥重要作用。  中国科学院院士、中山大学肿瘤医院院长曾益新特别强调说,肿瘤是一个涉及多基因、多信号通路的多系统疾病,对肿瘤的早期诊断和对高危人群的预警,对提高肿瘤的治愈率、降低死亡率有着十分重要的意义,分子诊断技术产品对此将发挥重要作用。
  • 中国生物工程杂志生物芯片技术专题研讨班通知
    生物芯片作为我国重点发展的高新技术领域之一,在疾病诊断、药物筛选和新药开发、中药基因组学研究和中药现代化、环境保护及其他等与生命活动有关的研究和应用领域均具有重大应用前景。生物芯片技术将会为疾病检测和诊断、新药开发与药物筛选、分子生物学、农作物优育优选、航空航天、司法鉴定、食品卫生和环境监测等领域带来一场革命,甚至还将改变生命科学研究方式。为帮助生命科学和医学研究与应用领域的专业人员更快、更直接地了解与掌握生物芯片的应用技术、发展现状和未来趋势,中国生物工程杂志社(中国生物工程学会、中国生物技术发展中心、中国科学院文献情报中心主办)特举办“生物芯片技术专题研讨班”。   本期研讨班邀请生物芯片北京国家工程研究中心、军事医学科学院等国内从事生物芯片技术开发与应用的一线专家授课,采用专家讲座为主、辅以引导学员讨论实际案例的学习方式;根据以往研讨班上的意见反馈,特别增加了生物芯片如何与测序技术相结合进行应用的专题。 研讨班主要内容: ◆美国FDA批准的应用于辅佐肿瘤临床治疗的基因芯片应用现状◆世界范围内学术机构和商业公司正在开发的生物芯片类型◆如何把现代测序技术和生物芯片技术进行结合◆生物芯片技术用于微生物的检测,包括:(1)细菌类检测应用型芯片(2)病毒类检测应用型芯片(3)能同时高通量检测多种微生物包括未知病毒的应用型芯片◆在基因组序列不清楚的情况下如何应用生物芯片技术,包括:(1)在DNA水平上筛选不同物种特异的DNA片段用于农作物分子育种或品质保护(2)在RNA水平上发现新功能的基因◆利用蛋白芯片检测小分子化合物◆从基因芯片出发最终筛选到蛋白水平的分子标记物用于疾病的诊断 会议时间、地点:2009年4月11-12日,中国科学院文献情报中心(北京中关村北四环西路33号国家科学图书馆),报到时间:2009年4月10日,报到地点:《中国生物工程杂志》编辑部。 参会办法:参会代表请于4月6日前填写会议回执后Email/邮寄/传真至中国生物工程杂志社会议费每人1200元,在读研究生每人1100元(凭有效证件),食宿统一安排,费用自理。 联系方式:通信地址:北京市海淀区中关村北四环西路33号中国生物工程杂志社(100190)联 系 人:任红梅13641036700电 话:(010)82624544,82626611-6511 传真:(010)82624544电子邮件:renhm@mail.las.ac.cn 生物芯片技术专题研讨班报名回执表(参会代表请于4月6日前Emial/传真/邮寄至中国生物工程杂志社)单位名称 通信地址邮编姓名性别职称电话传真E-mail是否住会 生物芯片技术专题研讨班住宿预定表(会议住地:中科院第一招待所,需住会者请务必于4月6日前回传本表)单位名称联系人电话手机电子邮件代表姓名性别是否需要单人间入住日期离店日期 会议驻地:中科院第一招待所(010-62564642),标准间每天150元。公交线路:913、983、740、696、826、466、641、26、47、320区间、运通113等各路公交车至中关村一街站即到。
  • 宁波大学研发“海上芯片实验室”
    日前,宁波大学教授苏秀榕主持的国家海洋公益性行业科研专项&ldquo 重要海域致病性细菌基因芯片检测技术研究开发与示范&rdquo 项目,成功研发出&ldquo 海上芯片实验室&rdquo ,能直接从海水中快速、高通量检测出多种致病菌,可用于海水养殖场、海水浴场、陆源排污口、港口航道等海洋环境致病菌的实时监控。  该产品由芯片、试剂盒、检测软件、便携式检测仪等部分组成,拥有检测低浓度致病菌能力,检测数据可靠、携带方便。采样后约6~8小时即可完成致病菌的检测和鉴定,并通过网络实时将数据传到岸上实验室分析。目前,该产品正处于业务化示范阶段。
  • 盘点2014年中国十大生物芯片企业
    生物芯片,又称蛋白芯片或基因芯片,它们起源于DNA杂交探针技术与半导体工业技术相结合的结晶。生物芯片技术是近几年才发展起来的高通量检测技术, 它利用微电子、微机械、物理化学技术、计算机技术在固体芯片表面构建的微流体分析单元和系统, 将生命科学研究中不连续的分析过程( 如样品制备、化学反应和分析检测)连续化、集成化、微型化。生物芯片包括 DNA芯片、蛋白芯片及芯片实验室三大领域。  生物芯片技术已成为2l世纪生物医学工程的前沿科技,生物芯片产业也在不断壮大,世界各发达国家迅速纷纷跻身于以生物芯片为核心的各相关产业的研发竞争中。美、英、德、加、俄、意、日等国的重要学术和工业机构,已投入大量资金和人力开展这方面的基础研究和应用开发,并将&ldquo 生物芯片&rdquo 技术列入生物技术中的重点发展领域,形成了一批相关产业。  但是,我国生物芯片研究起步较晚,研究始于1997&mdash &mdash 1998年间,在此之前生物芯片技术在我国还是空白。随着芯片技术和产业发展迅速,我国还是实现了从无到有的阶段性突破,并逐步发展壮大。尤其是&ldquo 十五&rdquo 期间,国家&ldquo 863&rdquo 计划重点组织实施了&ldquo 功能基因组及生物芯片研究&rdquo 重大专项,对生物芯片的系统研发给与了倾斜性支持。  目前,生物芯片产业在我国已初见端倪并初具规模,形成了以北京、上海两个国家工程研究中心为龙头,天津、西安、南京、深圳、哈尔滨等地近多家生物芯片研发机构和多家生物芯片企业蓬勃发展的局面。下面,OFweek电子工程网的小编就来盘点一下2014年我国十大生物芯片企业,以飨读者。  第十名:南京大渊生物技术工程有限责任公司  南京大渊生物技术工程有限责任公司座落于江苏省南京市浦口经济技术开发区,是由大渊国际集团属下的新加坡大渊工程有限公司2000年投资US$1,000,000从事高科技农业的开发应用及基因芯片及制药技术的研发,后因研发技术成熟,正式进入量产阶段,遂于2002年10月由新加坡大渊工程有限公司再投入资金,公司增资为US$2,000,000从事高科技生物芯片,生物芯片识别仪,生物芯片分析仪,相关的检测试剂,耗材,医疗器械,相关抗原、抗体、蛋白等生产与销售业务。  大渊生物技术工程有限责任公司成立伊始便受到国际生物技术界的关注。至今己达成了下列成果:确定并建立了公司的硬件、软件平台,从研发、生产、管理到销售,构成一套完善的生物芯片严密的技术网络 制定了完全的产品标准,在世界上亦属首创 公司根据市场需要,设计出数十种中低密度蛋白芯片,及一系列的核酸杂交芯片,两类交互运用,含盖临床诊断及卫生防疫用所需,另外,并发展出配套的芯片识别仪 公司成功的建立了原料蛋白的供应来源平台,国内国外得到各种优质抗原、抗体的供应,数量多达二百余种,使要设计各种不同用途的芯片,变成一件完全可以实现的事   公司的可见光识别仪经过改善,既能定性,又能定量。除了能阅读分析自产的芯片外,更能阅读分析世界上其它公司的各种类似标记方法的芯片,大大的增加了它的普遍性,并有效的降低成本,售价只有国外同类产品的五分之一,从而使公司可见光识别仪变成世界级的产品。同时公司正在研发第二代芯片识别仪,除了大大改善识别效率之外,还增加了芯片、试剂及检体的自动处理系统,预计2003年7月可以上市。  第九名:深圳益生堂生物企业有限公司  益生堂是于1994年5月在深圳成立的中外合资企业,初期以生产经营蛇系列保健产品为主,现已在保健品、中成药、生物工程等领域取得了长足发展。现益生堂麾下拥有深圳益生堂生物企业有限公司、深圳市益生堂药业有限公司、创益生物科技有限公司、深圳市益生堂医药销售有限公司及保健品、中成药、生物制品三大生产基地。  益生堂公司建立了全国性市场营销网络和完备的销售管理体系,在北京、上海、重庆、成都、长沙、杭州、广州等地设立了七个大区销售分支机构。目前,益生堂公司集技术优势、管理优势、人才优势于一体,在稳固发展保健产品、中药产品的同时,瞄准高科技产品的广阔市场前景,加速研究开发生物芯片产品的技术及应用,壮大企业,服务社会。  第八名:西安联尔科技有限公司  西安联尔科技有限公司是由西安、北京两地公司共同出资成立的合资企业,公司位于西安高新技术产业开发区新区创业研发园,主要从事临床诊断生物芯片及其配套分析仪的研制、开发、生产及销售,是中国最早经&ldquo 国家药品监督管理局&rdquo 核准将生物芯片运用于人体医疗诊断的公司之一,并率先将生物芯片产业化与商业化。  作为一家国际级的高新科技企业,西安联尔拥有目前国际上最先进的仪器、设备和技术,在生物芯片的研究方面具备强大的技术力量,来自全国知名高校及研究所的数十名科研人员组成了高水平的研发队伍,构筑了生物芯片产业化技术平台,包括抗原抗体蛋白制造纯化平台,基因工程菌制造纯化平台,芯片制作生产平台,快速显示标记平台,生物芯片辨识平台等。在这些平台上,我们可以生产任何种类的医疗诊断生物芯片。  目前,公司已开发的产品有:生物微矩阵(芯片)分析系统、幽门螺旋杆菌(HP)检测芯片、呼吸道疾病(RD)检测芯片、性传播疾病(STD)检测芯片、生殖道感染疾病检测芯片、免疫不育疾病检测芯片等、优生优育(TORCH)检测芯片、宫颈病变检测芯片、结核分枝杆菌检测芯片等 正在开发的产品有:变态反应检测芯片、心肌炎相关病毒检测芯片、子宫颈癌预警芯片等。公司并被列为&ldquo 高新技术企业&rdquo ,合作开发的&ldquo 人乳头瘤病毒的研究&rdquo 项目被列入国家&ldquo 863计划&rdquo 。  联尔公司的生物微矩阵(芯片)分析系统,与传统的医疗检验方式相比,具有创新(特异性强,灵敏度高,稳定性强)、快速(只要五分钟)、准确(可定性定量)、价格低廉的特点,并且多种指标可同步检测,极大的减少了病人的痛苦。芯片分析仪,是光、电、机技术和现代生物技术相结合的产物,能够自动判读,自动给出检测结果,同时具有报表输出,病人的文件管理,仪器自校,自动上网等功能,品质稳定,操作方便,价格只及世界其它同类产品的五分之一,极具市场竞争力。  第七名:上海博星基因芯片有限责任公司  上海博星基因芯片有限责任公司是联合基因科技集团旗下的专业芯片公司,是中国最大规模的基因芯片研发、生产和经营企业之一,是一家集高新科技与优质服务于一体的生物芯片公司,博星公司能提供各类生物芯片产品、相关技术服务在内的全套解决方案,产品有各类表达谱芯片,疾病检测芯片,商检芯片等三十几个品种。中国的第一块生物芯片就在博星诞生。  而联合基因科技集团于1997年11月发源于复旦大学,由毛裕民教授、谢毅教授带领复旦大学生命科学学院的一批教师和博士、硕士研究生发起组建。由100万起步,迄今已经形成资产超过40亿,拥有30多家企业(包括两家上市公司)的基因技术企业集团。博星公司于2007年引进全套illumina微珠芯片平台,迄今为止已为国内外上百所高校及科研单位提供了数千张芯片的技术服务。  第六名:陕西超英生物科技有限公司  超英生物成立于2000年7月,至今已经经历十四个年头,是一家以研究、生产、销售生物芯片和基因检测的中美合资高科技生物技术与生物企业信息学企业。投资额3200万元人民币。目前拥有50余人的研究开发和生产管理团队,公司拥有国内一流水平的病理和分子生物学实验室以及全套进口的生产、研发仪器和设备,同时还拥有2000多平方米的实验和研究场所。  公司经过多年的运作已成功建立了国内首家组织芯片技术及产品研发和生产基地,建立了多项技术平台,分别获得&ldquo 十五科技攻关计划西部开发科技行动重大项目&rdquo 、&ldquo 中小企业创新基金项目&rdquo 、&ldquo 国家重点新产品&rdquo 等国家以及省市多项基金的支持。获得国家发明专利4项,获省市科技进步二等奖两项 企业还分别被评为&ldquo 西安市制造业信息化应用示范企业&rdquo 、&ldquo 陕西省引进国外智利示范单位&rdquo 、&ldquo 西安市组织芯片技术工程中心&rdquo ,并顺利通过高新技术企业认证。芯片产品和技术服务占据国内85%的市场份额。自2003年起逐步进军海外市场后,目前,产品已经远销美国、日本、德国等十几个国家及地区,得到了海内外科学家的普遍认可,从而取得了组织芯片技术在中国的领头羊和相对垄断地位。  2005年公司开始着手基因检测研发,并与国际顶尖生物研究机构cybrdi.us基因检测中心建立密切的合作关系,是国内基因检测公司中唯一一家具有跨国权威机构合作背景的检测机构,也是cybrdi.us授权亚太地区唯一以从事基因检测样本处理和检测工作的前沿基地。目前我公司拥有国际先进的基因分型技术平台,一直致力于人类健康与疾病研究。并研发了&ldquo 治未病&rdquo 、&ldquo 儿童天赋基因检测&rdquo &ldquo 高管基因检测&rdquo 三个成熟基因检测项目,取得不俗效果和社会反响。  除了组织芯片产品和基因检测外,公司还研发了原位分析试剂盒、分子生物学试剂、细胞芯片、冰冻组织芯片、糖尿病相关自身抗体检测芯片等一系列的新产品。  第五名:上海裕隆生物科技有限公司  上海裕隆生物科技有限公司由穆海东等留美博士创建于2002年5月,主要从事生物芯片体外诊断产品(包括抗原、抗体、试剂和仪器)的研发、生产、销售和技术服务。申请专利110余项,获得多项国家、省部级奖项。  公司在美国设有中心实验室,设计最先进的技术路线,在上海拥有国际先进装备的研发中心,构建了生物芯片、自动化仪器、生物信息、生物传感器、基因工程、细胞工程、抗体库、蛋白纯化等八大现代生物技术平台,拥有非接触式生物芯片点样仪、液相芯片工作站、蛋白纯化系统等先进设备,形成完善的分子诊断试剂及其原材料和配套仪器研发、中试体系。  公司自主研发了系列蛋白芯片、基因芯片、荧光定量PCR、酶免、金标检测试剂盒和配套自动化反应检测仪器,用于肝炎、肿瘤、心血管疾病等重大疾病的诊断,具有高通量、微型化、集成化、自动化和信息化的特点,灵敏、准确、快捷,代表了目前最先进的检验医学技术。  公司拥有十万级(局部万级)洁净度的生物芯片生产厂房和先进装备的质控平台,按照国际 ISO13485 标准建立生产体系,蛋白芯片产品及配套设备通过国家 SFDA 体外诊断试剂及医疗器械质量体系认证,获得《医疗器械经营企业许可证》《医疗器械生产企业许可证》《医疗器械产品出口销售证明书》。  公司先后承担了免疫诊断试剂国家工程实验室、科技部863计划课题、国家发改委生物芯片高技术产业化示范工程、国家卫生部&ldquo 艾滋病和病毒性肝炎等重大专项&rdquo 、工业和信息产业部&ldquo 产业化专项&rdquo 、信息产业部电子信息发展基金、国家发改委中小企业发展专项资金、国家中小企业创新基金等多项重大项目,位居行业领先地位。  公司的生物芯片和仪器项目还受到国家和地方政府的重视和支持,先后被列入&ldquo 国家高技术产业化专项&rdquo (国家发改委)、&ldquo 国家中小企业创新基金&rdquo (科技部)、&ldquo 国家中小企业发展专项&rdquo (国家发改委)、&ldquo 高新技术成果转化项目&rdquo 、&ldquo 上海市火炬计划&rdquo 等,公司还被认定为&ldquo 上海市高新技术企业&rdquo 。  目前,公司正在积极进行更多高精尖新产品的研究开发以及现有产品的市场开拓,公司规模不断扩大,朝向国际化综合性的生物医药企业集团的目标迈进。  第四名:上海康成生物工程有限公司  康成生物是一家专业提供生命科学前沿研究技术的高科技企业,致力于推广国际尖端分子生物学先进技术在科研中的应用、发展与创新。  康成生物的产品和技术服务涵盖生命科学多个研究领域,包括基因组、表观基因组、转录组和蛋白质组,为广大科研学者构建了多套技术服务平台:【生物芯片技术平台】microRNA芯片、长链非编码RNA芯片、表达谱芯片、DNA甲基化芯片、ChIP-chip、aCGH、蛋白芯片等 【Illumina GA IIx第二代高通量测序平台】microRNA测序、染色质免疫共沉淀测序、DNA甲基化测序、转录组测序等。  康成生命科学实验中心拥有一流的实验设备、经验丰富的实验技术团队和生物信息学工程师团队,以专业的知识与优质的服务为广大学者提供技术服务、创造科研价值。近五年来,康成生物的产品和服务已覆盖中国科学院、香港大学、清华大学、北京大学医学部及附属医院、中山大学医学院及附属医院、上海交通大学医学院附属瑞金医院、复旦大学医学院附属中山医院、华中科技大学同济医学院附属协和医院、Novartis(诺华)、gsk(葛兰素史克)等国内一流科研院所、医疗机构及跨国医药集团,为国内5000多家客户提供技术服务,合作发表的SCI文章约70篇,其中包括国际顶级期刊Nature medicine、Nature genetics、Circulation、Oncogene等,在同行业中处于领先地位!  第三名:天津生物芯片技术有限责任公司  天津生物芯片技术有限责任公司(TBC)成立于2003年9月,由天津中新药业集团股份有限公司,南开大学,天津市创业投资有限公司,天津经济技术开发区国有资产经营公司共同出资组建,主要从事微生物检测芯片的研发、基因组学和功能基因组学研究。公司是&ldquo 十五&rdquo 期间国家863专项资助的五个生物芯片研发基地之一,并且是唯一致力于病原微生物检测生物芯片研发的基地。公司在微生物检测特异分子标识的筛选中拥有一套完整的核心技术,建立了集多学科在内的代表当今世界最先进水平的生物学研发和产业化平台,在世界微生物检测生物芯片技术领域及基因组学、功能基因组学研究领域处于国际领先水平。公司为天津市认定的高新技术企业(证书编号:0412007B5018) 2005年1月,被天津市批准建立天津市功能基因组与生物芯片研究中心 2006年6月,被教育部批准建立微生物功能基因组与检测技术教育部工程研究中心。  天津生物芯片技术有限责任公司坐落于天津经济技术开发区,注册资金一亿元人民币,总建筑面积4800 平方米,其中实验室面积3800 平方米,按照国际通行标准建立了完整的公共实验室体系,包括基因组学、功能基因组学、生物信息学和生物芯片四大研究平台,形成了多学科交叉,开放型现代生物技术研究平台。目前已建立起由108 人组成的具有国际水平的创新团队,现有学科带头人8 人,均具有在国外长期学习和工作的经历。  公司自成立以来,共承担包括天津市科技创新专项资金在内的天津市科技项目13项,建立起产、学、相结合的发展模式,形成了以市场为导向,科技为依托的运行机制,为科研成果产业化建立了平台。公司先后承担了十五、十一五期间&ldquo 863计划&rdquo 、&ldquo 国家科技支撑计划&rdquo 等大量的国家和省部级重大科研项目30余项,已在国际顶级刊物Nature、PNAS等期刊上发表SCI收录论文130余篇,奠定了在生物科技领域国内领先、国际先进的地位。其中最具代表性的是,公司与美国夏威夷大学共同主持了大型国际合作计划&mdash &mdash &ldquo 木瓜基因组计划&rdquo ,研究成果于2008年4月24日在国际最权威、最具影响的英国Nature杂志上以封面文章形式发表。这是天津市科学界首次在Nature杂志上发表封面文章,也是我国科学领域自2000年以来第三次在该杂志发表封面文章。目前,公司已掌握了从编码细菌表面抗原的基因族中筛选DNA特异分子标识的核心技术,建立了国际上规模最大的微生物特异分子标识库,在该领域已达到了国际领先水平,获得了2项美国发明专利和100余项国内发明专利。  技术服务方面,公司依托基因组学等四大研究平台体系和通过大量科研成果在生物技术领域建立起的知名度和影响力,确立了积极开发技术服务市场的策略。服务项目包括基因组学、蛋白组学、生物芯片、生物信息学、微生物鉴定、多克隆抗体定制等6大项共68小项,客户范围覆盖北京、天津、武汉、深圳、昆明、香港等城市和周边地区。  产品开发方面,公司根据客户需要,提供针对不同检测现场、不同检测对象、不同通量、不同类型实验室的微生物检测整体解决方案:包括样品前处理,免疫学检测、分子生物学检测、数据分析等多个方面,相继开发了诊断血清、免疫磁珠、分子生物学检测试剂盒三大类85种产品。  第二名:博奥生物有限公司  博奥生物集团有限公司暨生物芯片北京国家工程研究中心(简称&ldquo 博奥生物&rdquo )于2000年9月30日在国务院、发改委、科技部、教育部、卫生部及北京市领导的关心和支持下,以清华大学为依托、联合华中科技大学、中国医学科学院、军事医学科学院注册成立。其前身为清华大学生物芯片研究与开发中心。注册资本为3.765亿元,拥有65,000平方米的研发、生产、运营和服务设施。2014年,博奥生物由于发展需要,形成3个研究院(转化医学研究院、工程转化研究院、健康科学研究院)、4个子公司(北京博奥晶典生物技术有限公司、北京博奥医学检验所有限公司、博奥颐和健康科学技术(北京)有限公司、博奥木华基因科技有限公司)的集团化运行架构。  作为清华控股成员企业之一,博奥生物致力于为生命科学与集成医疗(包括预测、预防和个体化医疗)领域开发和提供创新性技术产品和服务,集团总部的三个研究院已利用自主创新技术成功开发出生物芯片及相关试剂耗材、仪器设备、软件数据库、生命科学服务、临床检验服务等五个系列数十项具有自主知识产权的产品和服务,其中十余项为国际首创,现有200余项专利获全球授权。其系统化生物芯片和相关仪器设备的研制及应用项目荣获2007年度国家技术发明奖二等奖。2008年,全国生物芯片标准化技术委员会(TC421)在博奥生物宣告成立。博奥生物作为全国生物芯片标准化委员会的主任委员和秘书处承担单位,积极参与并推动我国生物芯片技术的标准化制定工作,一批国家标准和临床诊断行业标准先后获批。2009年5月,中国造血干细胞捐献者资料库样品库(简称&ldquo 中华骨髓库样品库&rdquo )在博奥生物建成。同年,晶芯激光共聚焦扫描仪LuxScanTM10K获科技部组织认定的首批&ldquo 国家自主创新产品&rdquo 称号。2010年1月,博奥生物被国家知识产权局批准为全国企事业知识产权试点单位。2013年9月,博奥生物子公司北京博奥医学检验所有限公司成为国家卫生计生委首批设立的个体化医学检测试点单位,承担着个性化医学检测相关管理办法、技术指南的验证、修订、完善和总结等工作。博奥生物还通过提供各类生物芯片技术服务,已支持临床和科研用户在Science、Cell、Nature Genetics、NatureBiotechnology等国际著名刊物上发表研究论文数百篇。  第一名:上海生物芯片有限公司  随着社会发展和科技的进步,人们对健康保健日益重视,而与健康相关的各种疾病中,大多数与人自身的遗传和生活状态有密切的关系。对于这类疾病,必须从遗传分子水平上加以检测,进而加以控制。生物芯片技术是综合了现代科学技术成果的高通量生物分子水平的检测系统。它不仅为生命科学研究和药物的研发提供了强有力的工具,而且可以应用到现代医疗体系中,服务于人民健康相关的预防、预测和个性化治疗,以及食品与疫情检测等。  在国际生物芯片技术与产业大发展的背景下,上海生物芯片有限公司于2001年8月成立。公司主营业务为生物芯片的技术创新与服务、产品开发、生产与销售,公司致力于生物芯片在生命科学研究、医疗保健、食品安全和药物开发等领域的应用和推广,为人类健康造福。公司由上海创业投资有限公司、中科院上海生命科学研究院等十一家在上海的国内知名大学、研究院、医院和企业共同组建而成。  2003年2月,国家发展与改革委员会批准上海生物芯片有限公司负责建设和运行&ldquo 生物芯片上海国家工程研究中心&rdquo 。生物芯片上海国家工程研究中心建设和发展的目的在于促进中国生物芯片技术的研究和产品开发,推动生物芯片及相关的技术和产业的发展,为行业提供技术平台的支持,培养生物芯片行业的人才,是国家创新体系的一部分,代表行业的发展方向,具有创造自主知识产权的能力,促进相关的产业化进程,体现国家意志,承担国家重大重点的科技攻关任务。同时,它是独立运行的企业,必须建立起独立生存、自我发展、能够在市场上经历风浪抵抗风险的能力。在这个指导思想下制定公司(中心)的发展战略与规划。  公司(中心)以&ldquo 科研创新、市场导向、以人为本&rdquo 为公司的核心价值,以技术和产品研发为引导,以企业化运作为经营机制,以产品、市场、技术的国际化为标准,以建设成为&ldquo 一流的分子生物学检测技术平台、研发和生产系列检测产品&rdquo 为目标,将现代企业制度与创新为指导的科研机制相结合,营造勇于探索、积极创新、努力实践的公司(中心)文化,以努力建设成为国际知名、国内领先的具有生物芯片技术业务特色的生物技术公司。  公司(中心)的发展战略定位为:建立和加强功能基因组和药物基因组研究、转化医学和生物芯片综合技术平台的竞争优势,通过自主经营和资本运作方式,整合技术、资本和人才资源,打造和发展科研与成果的应用转化、分子及健康诊断产品和药物研发的技术服务外包业务三大主营业务,采用&ldquo 联合舰队&rdquo 的经营方式,形成以芯片公司为旗舰,各控股子公司为专业舰,共同组成的联合舰队式的生物医药技术集团公司。  根据公司(中心)发展战略,具体规划形成公司业务的几大模块:以控股子公司上海伯豪生物技术有限公司为主的技术服务和研发外包业务 以中美合资上海英伯肯生物医学公司、华冠公司和芯超公司和南方基因公司共同组成的医学临床用诊断检测产品研发、生产和销售的业务板块。
  • HLA检测的新芯片系统于Invitrogen推出
    Invitrogen(现属于生命科技公司)近日推出最新的自动化芯片系统,用于免疫遗传学检测,包括人白细胞抗原(HLA)的研究。Prodigy™ 系统是一种高级的DNA和蛋白分析工具,能简化并加速组织相容性研究、疫苗和药物开发,以及疾病相关的研究。     Prodigy™ 系统是第一个高通量、序列特异性的寡核苷酸探针系统,能简化HLA检测的复杂性。HLA标志物是细胞表面蛋白,在人类免疫系统中起了重要的调节作用。当身体受到外源蛋白或分子如细菌、病原体和病毒的侵袭时,它们充当了警报的角色。  与市场上的其他系统相比,Prodigy系统有着一些独特的技术改进。它的密度是目前磁珠分析的5倍,而且支持一键式的无人值守自动化,使研究人员能将宝贵的时间花在数据处理或制备更多样品上。Prodigy的内在可扩展性使它能够对500多个分析物进行多重分析,同时提供高分辨率和无以伦比的可靠性。  它的通量也是行业领先的,能在9小时内获得约290个基因型,并包含了集成软件,能简化数据分析和说明。由于具有500多个分析物的分析能力,Prodigy系统还能在未来容纳新的基因型,使它能够与现有设备轻松整合。  Prodigy的工作流程只是简单的5步:(1) 生成工作表 (2) PCR准备与扩增 (3) 将扩增物和试剂加入仪器,按下开始的按钮,然后离开 (4) 仪器自动运行分析,对芯片成像并处理数据 (5) Prodigy HLA分析软件将数据转化成基因型。  Prodigy系统的特征:  用户友好的触摸屏,用于仪器的设定  集成照相机对芯片进行快照,并转移到软件分析  芯片的容量是目前磁珠的5倍  条形码阅读器能识别胶条的批号,便于追踪  每次能运行1-12个胶条,8-96个样品  所有基因座的相同1.5小时扩增策略  体型小巧,占地面积少
  • 走近生物芯片技术——访中国军事医学科学院放射医学研究所马立人教授
    随着人类基因组(测序)计划(Human genome project)的逐步实施以及分子生物学相关学科的迅猛发展,越来越多的动植物、微生物基因组序列得以测定,基因序列数据正在以前所未有的速度迅速增长。然而,怎样去研究如此众多基因在生命过程中所担负的功能就成了全世界生命科学工作者共同的课题。为此,建立新型杂交和测序方法对大量遗传信息进行高效、快速的检测和分析就显得格外重要了。生物芯片技术的兴起大大加速了基因序列的破译,揭开了生物体中巨大遗传语言之谜,揭示了生命本质,生物芯片技术是20世纪末21世纪初生物技术领域迅速升起的一颗的明珠,它的光芒渗透到生命科学的各个领域。那么,该项技术是如何发展的,目前的状况、发展趋势以及与之密切相关的生命科学仪器的发展又是怎样的状况呢?带着这些问题,近日,本网(以下简称:instrument)专程走访了药物分析学学科带头人,军事医学科学院放射医学研究所马立人教授(以下简称:马)。  Instrument:马教授,您好!我们知道您从事了多年的生物芯片方面的工作,编写了国内第一本系统介绍生物芯片技术的书—《生物芯片》,那您先给生物芯片下个定义,好吗?  马:生物芯片的概念来自于计算机芯片,发展至今不过10年左右。最初的芯片技术主要目标是DNA序列的测定,基因表达谱鉴定和基因突变体的检测和分析,所以它又被称为DNA芯片或基因芯片。但目前这一技术已经扩展到免疫反应、受体结合等非核酸领域,以至在阐明疑难杂症机理中都起到了重要作用,所以按现状改称为生物芯片更符合发展趋势。  芯片分析的实质是在面积不大的基片表面上有序地点阵排列了一系列固定于一定位置的可寻址的识别分子。结合或反应在相同条件下进行。反应结果用同位素法、化学荧光法、化学发光法或酶标法显示,然后用精密的扫描仪或CCD摄像技术记录,通过计算机软件分析,综合成可读的IC总信息。芯片分析实际上也是传感器分析的组合,芯片点阵中的每一个单元微点都是传感器的探头,所以传感器技术的精髓往往都被应用于芯片的发展。阵列检测可以大大提高检测效率,减少工作量,增加可比性。所以芯片技术也是传感器技术的发展。  Instrument:生物芯片技术的发展过程是怎样的呢?主要应用在哪些领域?  马:基因表达分析恐怕是生物芯片应用最多的一个方面,细菌、霉菌、植物、哺乳动物等都进行过科学研究。我们知道原计划于2005年才能完成的人类基因计划,由于DNA测序技术和测序效率的迅速提高,于2001年12月就宣布完成框架图和初步分析结果。在阐明人类基因组核酸全序列的前后几年中,有近百种动物、植物及微生物的基因全序列也已经定出。但这些基因序列中,其生物学意义多数是不清楚的。不少公司根据阐明的序列制作基因芯片供应市场,希望通过表达分析来了解其生物意义,但很快就认识到基因仅仅是遗传信息的载体,而生命活动的执行是基因的表达产物-蛋白质,因此蛋白质组计划及蛋白芯片就提高到重要的位置;随着生物芯片技术在病理组织和组织化学方面的应用,又出现了组织芯片,不同的组织做成不同的芯片,比如大脑、前列腺、肝脏等,用于蛋白表达研究、抗体筛选、组织型特异研究及小鼠模式实验研究等;另外,还有一些新原理的生物芯片,如微流路芯片、细胞芯片、多肽芯片、质谱芯片、电芯片等随着生物芯片技术的发展也快速发展起来。  杂交测序是发展DNA芯片技术的初衷,但由于众多的核苷酸的组成各不相同,各有自己的最佳杂交条件,这就使得每一对双链杂合子都是最佳,这样一种条件很难找到,其结果是出现一定数目的假阴性和假阳性杂交结果,引起误导,加之芯片技术自动化程度和成熟程度等方面还有不足,因而生物芯片技术在核酸测序技术中,未能被选为法定方法,真正建功立业的主要技术却是多通道毛细管电泳。但生物芯片技术也有自己的优点,高通量、平行对比分析,可以获取其他方法无法取得的资料,因此它仍是一项先进的高通量分析手段。  近年来,已经证明基因芯片的最佳应用领域是单核苷酸变异多态性的研究、差异表达分析的研究及改变模式,尽量向临床诊断和临床研究靠拢及开拓其他领域的应用。从经济效益来讲,最大的应用领域是制药厂用来开发新药,目的是在基因水平上寻找药物靶标以及查找药物的毒性和副作用,进行独立学研究;在农业和林业上,生物芯片技术也有广阔的应用天地,应用芯片于基因测序将大大加快DNA多肽性的鉴定,从而促进动植物育种和植物新品种的产生;在医学上,芯片研究也广泛被应用于遗传病、肿瘤、炎症等方面的研究。可以说生物芯片的应用目前已经遍及生物、医学研究的各个领域。  Instrument:那您所从事的生物芯片技术和您前面讲的一样吗?  马:我选择的方向和前面说的这些不太一样。前面讲的这些基因芯片是用在基因序列测定,基因组的研究,用的是高密度芯片,要几千个点,几万个点,价格都很昂贵,目前国外已经有很多基因芯片厂商,做的都是高密度芯片,我们不想往这个方向努力,想做一些实际有用的东西应用在临床诊断上。比如引起腹泻、呼吸道传染病的细菌或病毒,用高密度芯片来检测,成本非常昂贵,不是普通人可以接受的,而且也是一种浪费。因此我们想是否可以做一种低密度芯片(100个点以下),既能很好地检测细菌或病毒,指导诊断和治疗又经济实惠呢?实验表明:是完全可以的,而且这种低密度芯片我们已经做好了,并申请了国家专利。  Instrument:请您详细介绍一下低密度生物芯片?都可以用于哪些病的诊断呢?  马:我们做的这个低密度生物芯片分两部分:一是仪器部分,由几个部分组成,首先是手工点样器,点起样来很方便;还有就是杂交仪,杂交仪是为样品里的病菌通过PCR扩增以后与芯片杂交用的;再有一个就是芯片的道,再加上仪器设备工作软件,就组成了工作平台。这个平台是个通用的,在各种疾病的诊断过程中不需要更换。第二部分就是芯片,也是这个整台仪器设备的核心设施。不同的细菌或病毒用不同的芯片,比如:鉴别SARS病毒的芯片和其他呼吸道传染病的芯片不一样,鉴别禽流感的芯片和SARS的又不一样。在实际应用中,通过检测知道病症是哪一种细菌或病毒引起感染,用药就很有针对性了,青酶素敏感的细菌,就用青霉素,时间长了,有抗药性了,再换一种药,这样治疗容易成功,抗生素就会有目的的使用。  低密度芯片主要是想应用在临床诊断上,如消化道、呼吸道、烧伤、血液、肝炎等方面;也可以用在动物上面,来预防动物之间的传染病,比如鸡、猪和宠物等,效果也是非常好的。  Instrument:用于临床诊断的生物芯片技术和传统的诊断相比有什么优势和特色呢?目前的推广程度及国内外的状况是怎样的呢?  马:总体来说,我们做的这个产品有以下几个优点:  1、 用起来比较方便,不同的传染病病毒或细菌用不同的芯片,没有交叉。  2、 灵敏度高。样品经过PCR扩增,再杂交,大大减少了干扰,这个仪器可以做到50个细菌或病毒的检测。现在通过输血传染的病很多,比如肝炎,丙肝就很不好查,有一个潜伏期,刚得了肝炎,没有发病,处于窗口期,还没有产生抗体,按照卫生部的标准,就符合采血标准,实际上有病毒存在,用常规的方法查不出来,但用我们这个芯片办法,就可以查出来。  3、 检测的速度快,整个这个过程从取样到检测完毕只需要半天的时间。扩增需要1个多小时,杂交也要1个多小时,早晨采样中午就可以出结果。而通常的病理检测要培养细菌或病毒这个过程,时间就长了,起码要3-4天才能出结果。芯片技术完全可以代替传统的检测。有的病发病很快,最好当天检查中午出结果,这样就可以及时采取治疗措施。  4、 价格便宜。以前都是在玻璃上做芯片,玻璃的缺陷是目前国产的玻璃片不过关,进口的一张玻璃片很贵,加上做成芯片,成本很高,且灵敏度低。我们做了一个小发明,在膜上做芯片,灵敏度好且价格便宜。  5、 提取任何组织核苷酸的试剂是个通用试剂,这是通过大量的实验找到的,这个试剂既可以溶解组织又可以裂解细菌或病毒,算是我们这项技术的一个特色吧,样品处理和检测的试剂我们都有自己的一套成型的东西。  目前这个产品还没有大范围地推广,主要是因为芯片技术还没有大规模推广。在临床诊断方面,基本处于规划和起步阶段。有的血库希望建立一个能快速检测爱滋病、丙肝、乙肝、梅毒4种病毒的芯片,有些医院也想和我们一起做消化道、呼吸道等方面的芯片。我们做的比较好的是在动物传染病的防治上,主要用在养鸡、养猪厂。因为这种地方一旦有传染病,传播速度非常快,损失很大,所以养殖厂希望每天监控,一旦发现,赶快打疫苗,以便最大限度的减少损失。这个现在我们已经通过了成果鉴定,也在小范围内进行了应用,但要真正大规模还需要农业部的批文。还有一块就是用在宠物身上,也是计划要做。现在养宠物的很多,狗的病有十几种,很难治好,要是能及时发现并赶快打疫苗就可以治好,打疫苗家要查清楚应该打什么疫苗,这就要用到生物芯片技术了。  低密度芯片技术的推广还有很多工作要做,还有很长一段路要走,我们的技术并不比国外的差,我查过国内外相关资料,没有发现国外有做这一块的,我们是最先做低密度芯片的,要真正推广还需要用户、仪器厂商、科研人员大家一起努力。  Instrument:马教授,都说21世纪是生命科学世纪,国内外各大仪器公司分分成立生命科学仪器部,生物芯片技术是生命科学的重要分支,您又是行业内公认的从事生命科学分析的专家,那您那对于生命科学仪器您是如何理解的?如果让您给生命科学仪器做一个分类,您觉得应该怎么分呢?   马:这个问题就比较大了,我只谈一下我自己的看法。生命科学仪器有意义能出结果的有几个方面,一是用于生物工程产品,包括发酵-纯化-测定整个过程中所需要的分析仪器产品;二是用于蛋白质组学、基因组学,主要是用在基因测序上,但这些只是学术上的储备,并不是一个创造财富的工具。还有就是用在临床诊断上的。要是对生命科学仪器分类,我觉得可以从用途上对其分类,可以分为如下三类:  1、临床生化类:主要用于医院,包括洗板机/酶标仪、血气分析仪、微生物自动分析仪、生化分析仪、病毒免疫荧光分析仪、尿液分析仪、电解质分析仪、血球计数器、生理/药理/神经仪器、高压灭菌锅、均质器等;  2、生物工程用设备:主要用于生物制品的研制和生产,包括摇床/振荡器、发酵罐、冷冻干燥机、冰箱、PCR、凝胶电泳仪、生化培养箱、超滤/过滤统、反应器、收集器、低温恒温循环泵等;  3、分子生物学和生物化学类:主要用于科研、教学单位,包括蛋白/肽测序仪、多肽合成仪、DNA测序仪、细胞分析、凝胶成像系统、生物芯片分析系统、基因导入仪、DNA合成仪、紫外观察灯、分子杂交仪、光标记装置、化学发光分析仪、紫外检测仪、菌落计数器等。  Instrument:马教授,请您总体评价一下我国目前生命科学仪器及通用分析仪器行业的现状?  马:生命科学仪器和通用仪器是不能完全分开的,生命仪器的发展在一定程度上也带动了通用分析仪器的发展。总体来讲,我国的分析仪器行业还比较落后。通用仪器,我就简单说一下色谱和光谱。色谱做的多一些,气相色谱相比较而言好一些,北分、上分等分析仪器公司都在做,液相色谱国内也在做,大连依利特、东西电子、上海伍丰等,可以这样说中档的色谱产品目前国内基本都可以做,但高档的还有一些差距;光谱的话,紫外、拉曼还可以,傅立叶变换红外光谱做的还不是太好,做光谱的厂家有北京瑞利、普析通用等,但和软件结合这块还需要进一步做工作。生命科学仪器我们国家做的很少,有一些做发酵罐的,但没有什么品牌,大型仪器我们目前基本做不了,国外在这些方面比我们做的要好的多,投入也大。   在整个采访过程中,马立人教授一直强调“要做实际有用的东西,不做华而不实的,不想当然,做科学研究也要根据中国国情、根据具体情况来做”,笔者被马教授这种做学问的精神深深打动。试问,在这个浮躁的社会里,有多少人做科学研究不过是为了发表论文而做科学研究,笔者虽然只是个小人物,但也和马立人教授一样,希望分析行业内所有从事科研的人员能真正做一些对社会有意义的东西!马立人教授简介:  军事医学科学院放射医学研究所研究员,博士生导师,国内外知名的药物分析学家和生物化学家。  编写的《生物芯片》一书,2000年获国家石油和化学工业局(化工部)第六届优秀图书一等奖。  研制出我国独有的抗辐射药物;从事血制品及血液代用品研究;在基因诊断方面取得突破性进展,并迅速向国内外推广;担任过第三届分析仪器学会副理事长,指导过上海、南京、北京分析仪器厂、江苏电分析仪器厂、北京市新技术应用研究所等国内分析仪器厂研究设计出实用性强的分析仪器及配套试剂,其中自动基因扩增仪、固液相分子杂交仪获国家实用型专利,抗体导向蛇毒溶纤剂及纤维素微孔亲和滤膜获国家专利;先后培养研究生12名,博士研究生11名及博士后7名,多次承担国家重大课题,获包括国家科技进步特等奖在内的国家与军队奖励20项。  担任过国家生物医学分析中心副主任、学委会主任、《分析仪器》杂志副主编,《现代科学仪器》、《色谱》、美国《Drug Development and Industrial Pharmacy》杂志、《国际医疗器械》杂志编委。       马教授联系地址: 北京太平路27号6-甲-201(100850)
  • 新芯片实验室技术让单细胞基因分析更高效
    据美国物理学家组织网近日报道,最近,加拿大英属哥伦比亚大学与英属哥伦比亚癌症研究所、转化与应用基因组学中心合作,开发出一种硅酮材料的芯片实验室技术,能让每个细胞像弹球机里的球一样各就各位,然后进行基因检测。这种“单细胞基因分析”技术使基因检测更加灵敏迅速,有助于肿瘤分析和临床疾病的诊断。本周出版的《美国国家科学院院刊》对该芯片实验室进行了详细介绍。  这种芯片实验室大小跟一个9伏电池相当,能同时分析300个细胞。研究人员设计了一种路线,用液体载运细胞通过显微管道和一个个小阀门,当细胞挨个进入各自的小空位时,它们的RNA就会被提取出来,经过复制用于进一步分析。  标准基因检测要求使用大量细胞,才能得出由上千万不同细胞平均化以后的“综合图像”,这会掩盖细胞的真实属性和它们之间的相互作用。“这就好比用混合水果慕丝来研究草莓和树莓为什么不一样。”领导该研究的高通量生物中心副教授卡尔汉森介绍说,而单细胞分析正在成为基因研究中的黄金手段,因为即使是从同一肿瘤组织中采集的样本,也包含了正常细胞和多种癌细胞类型,而单细胞分析显出极微小的差异。  此外,这种芯片实验室几乎将所有细胞分析过程整合在了一起,不仅能分离细胞,还能用化学试剂将细胞混合起来,通过检测反应过程中的荧光发射获得它们的基因编码。所有这些都能在芯片上完成,不仅操作简单,而且成本效益高。
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