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致病微生物检测

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致病微生物检测相关的资讯

  • CBIFS:生物传感器在食品致病微生物检测中的应用
    仪器信息网讯 2012年3月27-28日,由北京食品学会及北京食品协会联合主办,太平洋国际展览有限公司承办的“第五届中国北京国际食品安全高峰论坛(CBIFS)”在中国国家会议中心召开 。本次高峰论坛旨在为食品行业及食品安全检测部门提供更加广泛的学习和交流机会,针对当前重要的食品安全热点难点问题展开深入探讨,发布最新的食品安全前端技术和应用解决方案。论坛吸引了800余名业内人士参加、60余家企业参展,仪器信息网作为合作媒体亦参加了本次会议。  在“微生物、毒素及致病菌检测”专题研讨会上,军事医学科学院微生物流行病研究所杨瑞馥研究员作了主题为“生物传感器在食品致病微生物检测中的应用”的报告,简要介绍了上转发光技术、国内外上转发光技术研究进展以及该技术在食品致病菌检测中的应用,现对该报告作简要报道:报告人:军事医学科学院微生物流行病研究所 杨瑞馥教授报告题目:生物传感器在食品致病微生物检测中的应用  上转发光技术与金标技术类似,但金标技术不能定量,受环境因素影响大,且检测结果不能长期保存,而上转发光技术正好克服这些缺点。  杨瑞馥研究员等利用上转发光技术,经过多年实验,研制出能进行定量检测的生物传感器,研制历程跨过了纳米颗粒研制、试剂研制、仪器研制到仪器应用几个阶段。  纳米颗粒经由稀土元素烧制,通过活化修饰,再与抗体或抗原结合,利用上转换发光材料在红外光激发下发射可见磷光的特性,通过对免疫层析试纸条上经生物反应而结合上去的上转换发光材料颗粒的含量进行检测,计算出被测样品中特定生物分子的浓度。  该试剂环境耐受性强(耐受 PH3-7的范围),不易猝灭,最突出的特点是自然界没有上转发光,因此使得样本处理变得简单,点样之后就能检测,没有本底干扰。  国外对上转发光技术的研究始于上世纪90年代,但因为没有清楚了解纳米颗粒的特性,控制不好反应效果。因此,杨瑞馥研究员对上转发光技术的研究可说是走在了国际前列。  杨瑞馥研究员等研制的基于上转发光技术的生物传感器通过了可靠性试验,在我国首台航母上得到了安装,也进入了生产线和临床。该生物传感器还可应用于食品致病微生物的检测,已开发相关的微生物类检测试剂十几种,曾在世博会期间被用于食品样品的快速检测,特异性达到100%,检测结果重现性好。
  • 夏日炎炎,食品致病微生物原来可以这么检测
    副溶血性弧菌、志贺氏菌、沙门氏菌和大肠杆菌是食源性疾病暴发的主要致病菌,夏天炎热的天气使食品卫生安全的控制更增加了难度。畜禽肉类制品是食源性非伤寒沙门氏菌病的首要致病食品,水产品是食源性副溶血性弧菌病的最主要致病食品,果汁、畜禽肉和乳制品是导致志贺氏菌感染的最主要致病食品̷̷ 食品致病微生物的挑战日益严峻,检测难题非常棘手,食品企业、第三方检测机构和政府监管部门都急一种新技术,以准确、快速、标准化的高效检微生物。如果你还在用传统的培养基分离培养法检测食品的致病微生物,那你就OUT了。传统法检测致病菌需要3~5天才能得到初步筛选结果,无法满足大工作量和处理突发事件的需要。传统方法培养设备、消毒灭菌设备、洁净室设备等占据了大量实验室资源,实验室管理成本增加。传统方法人为干扰大、存在交叉污染,漏检率高目前的生化方法虽简便,因方法本身的缺陷,导致其准确度无法跟PCR方法媲美,假阳性、假阴性的结果更耗费实验人员的精力。 今天为大家介绍的杜邦BAX?全自动病原微生物快速检测方法,一度被北京奥运会、上海世博会、广州亚运会餐饮检测采用,该方法是迄今全球最易使用的基于定量PCR原理的微生物快速检测系统之一。 杜邦公司作为一家赫赫有名的世界500强企业,一直致力于用创新的理念和先进的技术应对日益严峻的食品安全问题,在微生物检验领域的经验已经超过20年,是全球第一家将分子生物学技术应用于食品安全检测的公司。杜邦?BAX? System全自动病原微生物快速检测系统高灵敏度:检测限为104 cfu/mL,让致病菌无可遁形高特异性:特异性98%高效率:高通量和高并行性,把检测时间缩短到~1天高稳定性和重现性:标准化检测程序内设,结果自动判读 无需核酸抽提即可上机检测, 超简化流程原厂试剂盒检测项目≥ 15种,满足所有致病菌项目检测的需求,让你吃的更放心 BAX操作简单,设计非常贴心、简便,近乎“傻瓜化”的操作,避免了操作者人为误差对结果的影响,因此让你的实验室更符合标准化操作流程,结果更可靠。BAX?系统的使用图示 BAX?系统原厂试剂盒及标准检测法全部通过国际权威机构认证和多国政府检验部门的批准,获得了30个以上国际权威机构的认证认可,并收入中国国标GB/T 4789.36-2008 食品卫生微生物学检验大肠杆菌 O157:H7检测法(唯一被国标收入的分子生物学方法),及行标SN/T 1869-2007 沙门氏菌,大肠杆菌O157:H7,单增李斯特氏菌,阪崎肠杆菌和空肠弯曲杆菌的检测。方法采用AOAC-RI,应急反应检测验证(Emergency Response Validation),可用于公共卫生突发事件的标准检测方法2008年北京奥运会餐饮检测采用的快速方法2010年上海世博会餐饮检测采用的快速方法2011年广州亚运会餐饮检测采用的快速方法美国FDA学生午餐计划餐饮检测采用的快速方法国家疾病预防控制中心食源性疾病监测网进出口检验检疫局出口产品,与国际标准对接使用权威第三方检测中心采用的检测方法(SGS,Silliker,欧陆分析等) 夏日炎炎,选择1台省心可靠的Dupont-Q7 or X5,让你一整个夏天都尽享受舒适、速度与激情,你懂的。。。。。。
  • PCR用于食品中致病微生物快速检测方法新进展
    p 2015年8月26日,成都市食品药品检验研究院组织有关专家对该院与苏州博泰安生物科技有限公司共同承担的项目“多点取样-实时荧光定量PCR技术食品中致病微生物快速检测方法研究”进行技术评价。 本次评价会邀请了国家食品安全风险评估中心首席专家吴永宁、中国检验检疫科学研究院研究员卢行安、国家食品安全风险评估中心副研究员裴晓燕、四川省卫生厅农村卫生管理处处长钟新秋、四川省疾控中心微生物所细菌科科长杨小蓉、成都市疾控中心食环学卫科副科长李晓辉、四川省出入境检验检疫局微生物室主任谭志共七位专家。市检研院院长万渝平、副院长谯斌宗、苏州博泰安生物科技有限公司总经理王伟宏、总经理夏东元、副总经理李红及有关项目组成员参加了此次会议。/pp 项目组主研人员王利娜博士、苏州博泰安生物科技有限公司夏东元博士对项目研究情况做了主体汇报。专家组在听取研究报告汇报、审查相关资料和质询、讨论后,一致认为本项目针对PCR检测方法是否能够区分致病菌状态这一难题进行研究,项目建立的研究方法可以在24小时内完成致病菌的检测,满足食品中致病菌活菌快速检测的需求 此项目研究开发的快速检测方法及其配套的试剂盒,经过5家检验机构验证,效果良好,具有良好的应用价值和推广前景。 最后,专家组一致评价,该项目工作扎实,研究内容系统深入,在致病菌活菌检测方面创新性突出,对于食品的日常监管及企业的在线质量控制有着良好的应用前景与推广价值,建议在后续研究中增加阳性样品的实验数据,尽快将产品推向市场。/pp style="TEXT-ALIGN: center"img title="untitled.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201509/insimg/4e032530-ff27-4a9b-844f-1e4212297c2d.jpg"//p
  • 良润生物:把致病菌检测带入“H”时代
    仪器信息网讯 2014年11月26日,仪器信息网(www.instrument.com.cn)从北京良润生物科技有限公司了解到,该公司今日正式推出&ldquo MicroFast致病菌快速检测系列产品&rdquo 。其中,MicroFast致病菌检测组合将致病菌的检测周期从&ldquo 天&rdquo 缩短到&ldquo 小时&rdquo ,把致病菌检测带入&ldquo H&rdquo 时代。  北京良润生物科技有限公司市场部经理陶文靖告诉仪器信息网(www.instrument.com.cn),此次MicroFast致病菌快速检测系列产品包括MicroFast快速增菌培养基系列、MicroFast致病菌快速检测组合系列,这些产品可以极大的降低实验室人员的工作量,产品的独特性能可在四个重要方面显著提高实验室效率。  一、检测更加快速。MicroFast致病菌快速增菌培养基能够快速增菌,缩短致病菌的增菌时间,而且具有更好的选择性,配合致病菌快速检测卡,能快速检测致病菌。  二、检测更加高效。致病菌快速检测组合,可整体提高实验室检测效率,节省人力。  三、检测更加精准。该系列产品通过测试比对,跟国标培养法的符合度可达到95%以上。  四、产品更多样化。MicroFast致病菌快速检测产品具有不同规格,能满足不同实验室的需求。  据仪器信息网(www.instrument.com.cn)记者从良润生物市场部了解到,此次发布的产品包括有:MicroFast沙门氏菌快速检测组合、沙门氏菌快速增菌培养基、MicroFast大肠杆菌O157快速检测组合、大肠杆菌O157快速增菌培养基等产品。这些新产品可将沙门氏菌检测缩短至24 h,大肠杆菌O157检测缩短至8 h,使实验工作人员工作更高效,帮助实验室管理人员达到全新水平的致病菌检测效率。  据了解,北京良润生物科技有限公司是成立于北京中关村科技园区的高新技术企业,专注于食品中微生物快速检测的研究,相继研发生产了微生物测试片、致病菌快速检测卡、致病菌快速增菌培养基、致病菌快速检测组合等产品,在此基础上,为客户提供食品安全检测的整体解决方案。  推出产品简介:  一、MicroFast沙门氏菌快速检测组合:用于沙门氏菌快速检测。本组合由沙门氏菌快速增菌培养基和快速检测卡组成,可实现样品中沙门氏菌最短24 h检测,检测灵敏度1 CFU/25 g。  二、MicroFast大肠杆菌O157快速检测组合:用于大肠杆菌O157快速检测。本组合由大肠杆菌O157快速增菌培养基和快速检测卡组成,可实现样品中大肠杆菌O157最短8 h检测,检测灵敏度1 CFU/25 g。  三、MicroFast沙门氏菌快速增菌培养基:本产品用于沙门氏菌快速增菌。42 ℃培养24-48 h后用快速方法或培养法检测。  四、MicroFast大肠杆菌O157快速增菌培养基:本产品用于大肠杆菌O157:H7快速增菌。42 ℃培养8-24 h后用快速方法或培养法检测。
  • 高致病性病原微生物实验室污染物排放标准征求意见
    关于征求《高致病性病原微生物实验室污染物排放标准》(二次征求意见稿)意见的函  各有关单位:  为贯彻《中华人民共和国环境保护法》、《中华人民共和国水污染防治法》、《中华人民共和国大气污染防治法》等法律,保护环境,保障人体健康,加强对高致病性病原微生物实验室污染物排放的控制和管理,我部决定制定《高致病性病原微生物实验室污染物排放标准》。该标准曾于2006年8月9日公开征求意见,标准编制单位已根据各单位的意见对该标准进行了修改和完善。按照国家环境保护标准制修订工作管理规定,现再次对该标准征求意见。现将标准二次征求意见稿和有关材料印送给你们,请研究并提出书面意见,于2010年5月10日前反馈我部科技标准司。  联系人:环境保护部科技标准司 滕云  通信地址:北京市西直门内南小街115号  邮政编码:100035  联系电话:(010)66556216  传真:(010)66556213  附件:1.《高致病性病原微生物实验室污染物排放标准》(二次征求意见稿)  2.《高致病性病原微生物实验室污染物排放标准》编制说明(二次征求意见稿)  二○一○年四月十五日
  • 我国食源性致病菌检测存在诸多问题
    仪器信息网讯 &ldquo 我国平均6个半人就有1人次罹患食源性疾病,其中有50%比例是由微生物引起的。&rdquo 6月5日,由中国仪器仪表学会分析仪器分会主办的&ldquo 第二届中国食品与农产品质量安全检测技术国际论坛暨展览会&rdquo 上,上海理工大学医疗器械与食品学院的刘箐在所作 &ldquo 我国食源性致病菌研究、检测若干关键问题的思考&rdquo 报告时引用CDC2003-2005年监测结果。  按照世界卫生组织的定义,凡是通过摄食而进入人体的病原体使人体患上感染性或中毒性的疾病,统称为食源性疾病。  引起食源性疾病的致病菌有沙门氏菌、大肠杆菌、李斯特菌、霍乱弧菌等。2003年席卷全国,并一度引起国人恐慌的SARS病毒最终被怀疑是人食用果子狸而感染致病菌引起的。  近些年来,食源性疾病逐渐引起专家、学者的广泛关注,中国疾病预防控制中心的陈君石院士、刘秀梅教授等在多个场合多次倡议重视微生物引起的食源性疾病。 我国对食源性致病菌的研究和检测也存在许多问题。  对我国食源性致病菌研究、检测中涉及的关键问题,刘箐在报告中进行了总结。他在报告中提到,我国在对食源性致病菌的风险评估中,缺乏代表性的样品量和检测数据,这源于检测手段的匮乏。而我国食源性致病菌标准化快速检测却没有认证体系、评价体系及推广体系,打击或间接抑制了企业、科研工作者的自主研发热情。且我国致病菌的检测标准更新慢,可行性差,食源性致病菌研究的基础&mdash &mdash 基因组学、蛋白组学、毒理学的研究起步较晚都在制约其发展。  尽管有这样那样的问题,但是刘菁对此保持乐观,国家已经开始重视微生物引起的食源性疾病,在2012年,首次制定《食品中致病菌限量》标准。(撰稿:孙立桐)报告人:上海理工大学医疗器械与食品学院 刘箐报告题目:我国食品性致病菌研究、检测若干关键问题的思考会场
  • 小龙虾致病元凶疑是未知生物毒素
    小龙虾究竟是不是造成横纹肌溶解症的罪魁祸首?食用小龙虾到底安不安全呢?央视《每周质量报告》栏目记者展开了深入的调查。  未知毒素五大特征  第一:毒性强  假设龙虾里面含有某种危害因素,含量应该是微小的。而如此微小的量进入人体里面,能够引起横纹肌溶解症,说明它的毒性应该很强。  第二:水溶性差  吃龙虾导致发病的这些人群,大部分都是自己买回来,经过清洗才烹饪的。然而清洗后仍然危害人体,由此推测,其水溶性较低。  第三:耐热  烹制小龙虾时能达100℃高温,但是这种物质仍有危害,说明它耐热。  第四:靶向性强  很多毒物到人体里面,会导致一些共有症状:腹痛、腹泻、恶心、呕吐等。而收治的这么多病人里面,这种消化症状都不明显,而是直奔横纹肌。  第五:小龙虾对毒素有免疫力   小龙虾究竟是不是造成横纹肌溶解症的罪魁祸首?食用小龙虾到底安不安全呢?央视《每周质量报告》栏目记者展开了深入的调查。  专家综合分析认为,导致小龙虾食用者患病的元凶,有毒性强、水溶性差、耐热、靶向性强、小龙虾自体免疫等五大明显特征。  中华急诊医学会中毒学组委员吴建中说,这种物质可能是某种生物毒素,也可能是其他的外源性化学物质。比如,在东南沿海,很多人都吃珊瑚鱼,像虎头斑啊,它的体内会含有一种血卡毒素。不是每个种类的鱼都有,同一种类,也不是每一条鱼都有。毒素通过各种各样的渠道,吸附到鱼体内,最后使饮食者遭殃。  如果真像专家推断的这样,那这种生物毒素是小龙虾体内本来就有的,还是小龙虾的生存环境或者养殖、加工环节出了问题?  有可能是野生虾闯祸  小龙虾学名叫克氏原鳌虾,原产于美国南部路易斯安那州,腐食性动物,属于外来物种。据专家介绍,这种虾适应性和抗病能力都很强。能在水质发黑发愁的阴沟、水塘中生活。  尽管小龙虾这种外来生物在养殖过程中很少发生病害,但并不意味着它不会感染和携带病毒,像同为外来生物的福寿螺,在它的老家南美洲并没有发现携带广州管圆线虫,而传入中国生长数年后,竟然发展成为了广州管圆线虫的中间宿主,成为了传播广州管圆线虫病的主要载体之一。  专家介绍,小龙虾是杂食性的动物,而野生的小龙虾主要以腐败物为食物,这些腐败物本身就是有毒物质,经过小龙虾的代谢后,主要合成物质偏向什么性质,现在还没有相关定论。特别是在污染极为严重的河道,龙虾身体会带有各种外源性毒性物质,这些残留的毒素究竟会对人的健康造成什么样的影响,目前也不得而知。在小龙虾消费的旺季,不排除有人将这类野生虾捕捞进入市场。  毒素或来自养殖水体  龚世圆,华中农业大学博士生导师、教授,我国小龙虾养殖权威专家。龚教授表示,小龙虾如果长期生活在恶劣的环境里,比如水体含有重金属离子或兽用的聚醚酯类的抗生素,小龙虾体内肯定会附吸毒素。  聚醚酯类的抗生素,主要用于鸡球虫病的防治,有严格使用限量要求。在安徽、江苏、湖北、湖南等小龙虾的养殖大省,养殖小龙虾的水域里面是否有农药、兽药甚至是化工原料的残留,更是一个未知数,而这些未知因素,是否也有可能导致某种生物毒素积存在小龙虾身上呢?  不仅在养殖环节存在诸多疑问,记者还发现,在小龙虾的加工环节更是存在诸多隐患。  在北京、长沙、南京等地的一些餐馆,小龙虾的加工和烹调都是露天当街作业。在一家店铺的后厨,记者目击了工人洗虾的全过程。  只见工人把乘小龙虾的水盆放满水以后,就将一个沥水的工具使劲在水里搅和,整个洗虾过程不到一分钟,虾就被捞了出来,随后倒进油锅炸。由于小龙虾的头部、腮部和腹部是主要藏污纳垢的地方,虾不洗干净,很可能给食用它的消费者带来身体健康上的隐患。  滥用增香剂有致癌风险  除了清洗环节不卫生,记者在调查中还发现,一些餐馆、大排档在烹调小龙虾过程中还会添加一些神秘的东西。在一家龙虾十三香调料的专卖店,老板就给我们透露了业内的一些秘密。老板说,配方里就是十三种药材,不是越多越好,因为药跟药有的会相克,混在一块是不可以吃的。  北京的一些餐饮店老板透露,有的餐馆在烹饪小龙虾过程中为了增加汤汁的鲜味和香味,随意添加人工合成香精,这些成分不详的化工合成添加剂,长期食用可能损伤肝脏甚至有致癌风险。  一滴香就是目前一些餐馆普遍使用的一种增香剂。餐饮加工环节的不卫生、不规范,进一步增加了食用小龙虾致病的隐患和风险。
  • “致病菌及生物毒素和非法添加物检测”专题报告会召开
    2012年6月6日,2012中国食品与农产品质量安全检测技术应用国际论坛暨展览会(CFAS 2012)同期召开了五场专题报告,报告之一“致病菌及生物毒素和非法添加物检测”在农业仪器学会常务副理事长蒋士强研究员的主持下准时召开。6位来自科研院校和仪器厂家的报告人作了关于食品安全检测方面的最新仪器、方法开发、研究进展以及实验成果的报告。  专家报告方面:中国科学院大连化学物理研究所的关亚风研究员作了“食品、农产品复杂机制中萃取痕量有毒有害化学残留物技术的进展”的报告。关亚风研究员就检测前处理中微萃取的最新技术和方法做了详细介绍,包括固相微萃取中的搅拌棒固相萃取、薄膜微萃取和集束毛细管微萃取以及液相微萃取中的分散液液微萃取和膜辅助溶剂萃取等,这些都是目前世界上的领先技术。关亚风研究员所在的团队在引入国外这些微萃取最新技术的同时,也自主研发了一些新产品,凭借性能优越得到了相关部门的肯定。可以预期,这些新型微萃取技术及仪器的出现与推广必将会使痕量分析达到前所未有的高度。关亚风研究员在作报告  北京市化学工业研究院的王黎丽作了“色谱分析技术在食品检测中的应用”的报告,介绍了色谱技术在食品安全和环境污染方面的大量的实验方法和检测成果,其中涉及到的仪器有气相色谱、液相色谱、质谱、离子色谱、毛细管电泳、原子荧光、原子吸收、电感耦合等离子体质谱及几种仪器的联合使用。这些方法的开发为其他用户提供了参考和依据。北京市化学工业研究院王黎丽在作报告  西南大学食品科学学院的冉玥做了“超高效液相色普法同时测定柑桔中11种类黄酮物质”的报告。作为一个检测方法的开发,该报告详尽的讲述了实验的设计思路和实验方案以及每一步的实验结果和数据分析,最后运用该方法测定的柠檬、脐橙、南丰蜜桔和砂糖桔四种水果所含的11种物质的含量比较也为这方面的后续研究奠定了基础。 西南大学食品科学学院冉玥在作报告  厂商报告方面:北京金诺美生物技术有限公司、天美(中国)科学仪器有限公司和北京创新通恒科技有限公司依次做了自己公司的一些新产品在食品检测方面的应用。北京金诺美生物技术有限公司的报告题目为“C7型实时荧光定量PCR仪在我国食品与农产品致病菌检验的应用”,主要介绍了公司新研制的实时荧光定量PCR—C7,该产品内部整合了多个单元模块,可同时执行多个扩增程序,提高了检测通量。另外,与之配合的操作软件也更加人性化,使得整个实验快速、简单,满足了广大用户的使用需要。  天美(中国)科学仪器有限公司的报告是“日立液相色谱仪食品安全典型项目多元解决方案”,结合市场上比较关注的黄曲霉毒素,皮革奶和三聚氰胺的问题,展示了用日立液相进行检测的多种方法,其中检测黄曲霉毒素的柱后光照衍生法较为新颖,样品出色谱柱后经光照装置再进荧光检测器,操作简单灵敏度高,亦可同时检测B1、B2、G1、G2、M1、M2六种成分,值得推广。  北京创新通恒科技有限公司的报告以“便携式液相色谱系统的研制及应用”为题,着重介绍了公司新推出的便携式液相色谱系统,他们将液相色谱仪集成一体化,内置标准windows电脑,实现了移动独立操作,并设有网络接口可进行远程操作。目前,该款产品已开发了一些应用,并且公司还在研发配套的固相微萃取设备,以便满足未来一些快速的现场检测的需求。 北京金诺美生物技术有限公司冯江波在作报告天美(中国)科学仪器有限公司石欲容在作报告北京创新通恒科技有限公司张浩在作报告
  • Cell | 从冷冻电镜到发现新致病基因
    纤毛(cilia),又称为鞭毛(flagella),是突起于真核细胞表面的一类重要细胞器,普遍存在于高等生物几乎所有细胞中,在细胞运动,胚胎发育,信号转导等过程中发挥重要作用。部分纤毛能通过水解ATP提供的能量自主运动,称为运动纤毛(motile cilia)。运动纤毛骨架的微管为“9+2”分布,包括周围九根双联微管(doublet microtubule)和中间两根单微管(singlet microtubule)。双联微管内部腔内有几十种蛋白质附着,外部周期性分布有轴丝动力蛋白(axonemal dynein)等复合物,共同维持微管的稳定,介导纤毛的运动。运动纤毛通过规律性的摆动,为细胞运动提供动力,如精子的游动;或者推动细胞表面液体流动,如气管上皮细胞通过纤毛摆动清除粘液和病原体。运动纤毛的生长和运动由几百种蛋白质精密协作来完成,相关的基因突变可引起原发性纤毛运动障碍症(primary ciliary dyskinesia, PCD)。PCD主要表现为先天性呼吸道纤毛粘液清除障碍和慢性呼吸道感染,并常伴随内脏异位和先天性心脏病(胚胎纤毛运动异常),男性不育(精子鞭毛运动异常),先天性脑积水(脑室纤毛运动异常)等。此类遗传病尚无诊断“金标准”,也缺乏有效的治疗手段。基因测序技术筛选已知致病基因的突变是辅助该疾病诊断的重要手段,但仍有近三分之一PCD病例的致病基因未被发现,因此鉴定新的PCD致病基因尤为重要【1】。2021年10月28日,哈佛医学院Alan Brown 实验室联合新加坡国立大学的Sudipto Roy和英国MRC Harwell研究所的Dominic P. Norris实验室(共同一作为桂淼和Hannah Farley, Priyanka Anujan, Jacob R. Anderson)在Cell杂志上发表了题为De novo identification of mammalian ciliary motility proteins using cryo-EM的论文。文章首次从牛气管组织中纯化出运动纤毛双联微管复合物,解析了近原子分辨率的冷冻电镜结构,结合多种不同建模手段,成功鉴定出36种蛋白质并构建了原子模型,进一步通过基因敲除动物实验阐明了两种新鉴定的蛋白Pierce1/Pierce2缺陷导致疾病的分子机理。在之前的研究中,Alan Brown 实验室联合圣路易斯华盛顿大学张锐实验室合作解析了单细胞生物莱茵衣藻的双联微管原子模型【2】。通过比较哺乳动物和衣藻的结构,作者发现其中22种微管腔内蛋白在不同物种中高度保守,但哺乳动物双联微管结构的显著特点在于:1)A微管内存在一种高度稳定的纤维(tektin bundle);2)微管外部轴丝动力蛋白锚定复合物(outer dynein arm-docking complex)由五种蛋白组成而衣藻是三种蛋白;3)两种蛋白Pierce1/Pierce2能穿透微管壁并连接微管内外的复合物。通过结构分析,作者发现Pierce1/Pierce2起到稳定外部轴丝动力蛋白的作用,推测两种蛋白的缺失会导致轴丝动力蛋白的丢失,进而引起纤毛运动障碍。在此基础上,作者构建了这两种基因敲除的斑马鱼和小鼠模型,并发现基因敲除动物存在内脏异位,纤毛运动障碍,轴丝动力蛋白丢失等表型,其中双基因敲除小鼠会导致胚胎早期死亡。基因敲除导致的类似PCD症状表明Pierce1/Pierce2是潜在的致病基因。本文对冷冻电镜技术的未来发展以及对遗传疾病的诊疗都有一定的启发意义。随着AlphaFold2时代的到来,不乏有人认为结构生物学或者冷冻电镜的发展将面临“末日”。诚然,AlphaFold2确实能相对准确地预测单个蛋白或者一些复合物的三维结构,但面对本文这种数百兆道尔顿分子量的、几十种不同蛋白组成的超大复合物结构,还远远无法准确预测。更重要的是,这些复合物直接来源于天然动物组织,在建模之前尚不清楚其蛋白组分,更无法预测其结构。因此这种超大的天然复合物是AlphaFold2的“软肋”,却正是冷冻电镜擅长的领域。事实上,AlphaFold2等结构预测方法的进步能提高超大复合物原子模型构建的效率,而不是取代。此外,蛋白质在细胞内发挥功能时往往会有多种不同构象,结合不同蛋白或者有各种修饰,这些动态结构信息都需要通过冷冻电镜等实验手段来解析。遗传疾病的诊疗方面,以本文涉及到的原发性纤毛运动障碍症PCD为例,它是一种涉及到呼吸道,多种内脏器官和生殖系统等方面的复杂遗传性疾病,传统诊断方法过程繁琐且准确性一般,因而建立该疾病的致病基因库并采用基因测序进行辅助性诊断越来越重要。过去,PCD致病基因的发现主要是基于正向遗传学,即对临床确诊病例进行基因测序,如“大海捞针”般鉴别致病突变,迄今为止,这种方法在过去几十年间共鉴定出约50种PCD致病基因,但其存在“低通量”这一显著问题。而本文通过结构生物学分析,一次性鉴定出几十种运动纤毛骨架蛋白质,并且大部分蛋白质没有详细的功能研究,都可能成为PCD等遗传病的候选基因。如本文一样,通过反向遗传学的方法有目标地建立基因敲除动物模型,研究这些蛋白的功能,能快速丰富PCD遗传病相关基因的数据库,为将来的疾病诊断和基因治疗提供指导。原文链接:https://doi.org/10.1016/j.cell.2021.10.007
  • 融智生物亮相2021年病原检测与传染病监测学术交流大会
    5月29-30日,2021年病原检测与传染病监测学术交流大会在山城重庆隆重启幕。本次会议由中华医学会杂志社、北京协和医学院群医学及公共卫生学院主办,数十位来自疾控、临床的专家分享了在病原检测方面的技术经验,吸引了300余专业观众到场。大会现场融智生物携手战略合作伙伴硕世诊断亮相此次大会,并展出了QuanID微生物质谱系统。目前,更新后的QuanID微生物质谱数据库拥有超过1800属、6600种、44000个菌株的微生物,独有的二级菌库可对基因型相近的难分辨微生物做出准确鉴定。展台另外在此次大会上,融智生物合作单位江西省疾病预防控制中心营养与食品安全所副所长刘道峰博士还进行了主题演讲,报告题目是《质谱技术在沙门氏菌检测与分型领域的应用》。江西省疾病预防控制中心营养与食品安全所副所长 刘道峰博士沙门氏菌是世界上食源性腹泻最常见的病原菌之一。全球每年估计发生13亿因沙门氏菌导致的急性肠胃炎病例,其中300万患者死亡。2016年起,沙门氏菌引起的食源性疾病病例数超过了诺如病毒,成为了我国食源性疾病的“头号元凶”。迄今为止世界上已鉴定出2500多个不同的沙门氏菌血清型,血清型的正确鉴定对确定人和动物沙门氏菌病的感染源和控制减少发病率具有重要意义。为此,许多国家和地区采取了众多措施以正确鉴定来自不同国家和地区、不同动物和外环境的沙门菌血清型。报告重点介绍了基于MALDI-TOF MS技术的“网鱼式”检测方法。该方法操作简单、鉴定速度快、鉴定概率高、结果准确,尤为适合医院、卫生防疫系统。沙门氏菌致病性、毒力、传播途径、耐药性在不同型别间有较大差异,因此,除沙门氏菌的检测外,沙门氏菌的致病菌分型是病原体溯源的关键环节。江西省疾病预防控制中心营养与食品安全所通过扩大采集范围,改变培养条件等,比对核糖体蛋白和非核糖体蛋白,寻找出某些血清型区别于其他沙门氏菌的特征蛋白进行建库,用于鉴定部分沙门氏菌血清型,完善沙门氏菌血清型质谱数据库。目前,共采集了285株不同血清型的沙门氏菌,经过血清型和测序验证,包含28种血清型;已成功鉴别至少三类沙门氏菌(肠炎沙门氏菌、鼠伤寒沙门氏菌、鼠伤寒沙门氏菌变种);已发现若干可以区分沙门氏菌血清型的核糖体蛋白特征峰。沙门氏菌数据库的建立得益于QuanID微生物质谱系统对每个靶孔都进行了大量Shots数的采集,保证了靶孔间质谱图的重复性,尤其是沙门氏菌不同血清型之间的差异更多的是来源于丰度很低的蛋白多肽,只有保证了质谱图的重复性以及对于低丰度蛋白的检测灵敏度才能够实现对于沙门氏菌血清型的鉴定。
  • 北京卫计委回应雾霾中含耐药菌:不代表致病
    日前,有研究机构指出“北京雾霾中发现耐药菌”。对此市卫计委昨天回应称,细菌耐药性的增加不意味着致病性的增加,人体自身具有免疫力,这些细菌大多数对正常人没有致病力。  发表在国际期刊《Microbiome(微生物)》上的一项研究指出,瑞典哥德堡大学的研究人员分析了864个DNA样本,来自人类、动物以及全球环境,目的是寻找与抗生素耐药性细菌相关的基因。其中,他们选取了来自北京的14份空气样本,来寻找作为环境要素之一的空气,是否含有抗生素耐药性的基因。分析结果表明,相比泥土、水等外部环境要素,北京空气中的微生物群落含有的已知抗生素耐药性基因种类最多,平均有64.4种。  因此该研究机构认为,城市空气污染比我们想象中的更致命,因为它携带了耐药性细菌,普通抗生素对此无能为力。研究团队还在文章里指出,他们在北京的空气中发现了针对碳青霉烯类抗生素的耐药性基因,这种抗生素是抗菌活性最强的一类非典型β -内酰胺抗生素,被广泛应用在呼吸系统感染、败血症等病症上,也是治疗严重细菌感染最主要的抗菌药物之一。  昨日,市卫计委回应称,细菌的耐药性和致病性是完全不同的概念,耐药性的增加不意味着致病性的增加。市卫计委专家指出,在生活环境中,有大量的细菌存在,不仅在空气中,在囗腔、鼻腔、呼吸道、胃肠道,都存在细菌或真菌,它们对人体是没害的,大量细菌和人类都是共生共存的关系。专家表示,人体自身具有免疫力,这些细菌大多数对正常人没有致病力,甚至有些细菌是有益的。
  • 朱永官院士实现环境中致病菌毒力基因高通量检测
    近日,中科院生态环境研究中心土壤环境科学与技术实验室朱永官院士团队在环境中致病菌毒力基因高通量检测方面取得新进展,相关研究成果以“VFG-Chip: A high-throughput qPCR microarray for profiling virulence factor genes from the environment”为题发表于环境领域主流期刊Environment International上。环境中的致病菌及其迁移扩散会导致一些人畜共患疾病,进而威胁人体健康和生态安全。致病菌所携带的毒力基因(Virulence factor genes, VFGs)是一种具有微生物性质的新型污染物,具有潜在的健康风险与生态风险。然而,由于缺乏高效可靠的量化工具,目前关于环境中致病菌的毒力组研究仍处于起步阶段。为此,团队基于高通量实时定量PCR技术开发了一种致病菌毒力基因芯片(VFG-Chip),可用于环境中致病菌的毒力组研究。VFG芯片针对环境中4种典型人畜致病菌——肺炎克雷伯氏菌(Klebsiella pneumoniae)、鲍曼不动杆菌(Acinetobacter baumannii)、大肠杆菌(Escherichia coli)和肠道沙门氏菌(Salmonella enterica),覆盖了其中参与编码毒素、粘附因子、分泌系统、免疫逃避/入侵和铁摄取等5种主要功能的96个毒力基因,基于SmartChip高通量实时定量PCR平台,可在2小时内一次性检测42个样品的毒力组,且大于91%的引物扩增效率为90%至110%,具有高效、快速、准确等特点。目前,VFG芯片已成功地应用于城市污水处理系统以及土壤等环境样品毒力组的检测(图1)。VFG芯片为量化环境中致病菌毒力组提供了一种高效可靠的高通量检测手段,未来有望在致病菌毒力组特征及其健康风险与生态风险评估等相关研究中发挥重要作用。团队已为VFG芯片及其应用申请了发明专利。图1 VFG芯片的设计、验证与应用中科院生态环境研究中心博士研究生谢舒婷和丁龙君副研究员为论文共同第一作者,朱永官院士为通讯作者。该研究得到了国家自然科学基金重大项目、中国科学院战略性先导科技专项A、国家重点研发计划和中国科学院青年创新促进会的资助。
  • 汽车内检测到10级致病菌
    近日,英国《每日邮报》援引相关机构的研究结果报道:公厕座便器上每平方英寸(合6.45平方厘米)“潜伏”大约80个细菌,而轿车方向盘、变速杆和后座等部位的同样面积上所检测到的细菌数量接近800个,几乎是公厕座便器的10倍。  汽车真有这么脏吗?根据有关机构的研究表明,车内空气环境质量之恶劣,堪比垃圾填埋场,并且科研人员还在汽车内检测到了10级致病菌中的三甲选手。  中国科学院所属中科理化环境分析研究中心通过气象色谱法、称重法、撞击法、擦拭法等四种实验方法,对车辆的TVOC(总挥发性有机化合物)、可吸入颗粒物、菌落总数和菌种等情况涉及汽车空气状况的物质进行了全面的检测与研究,并最终发布了一份“汽车空气质量检测报告”。  据悉,本次汽车空气质量检测,共检测了50个样品,而这些样品汇集了包括:大众、通用、丰田、本田、马自达等在内的数十个主流汽车品牌旗下的主力车型,至于车辆的使用年限则从1年到15年不等,相对应的行驶里程则在1-27万公里之间。可以说,本次检测的样品基本覆盖了我国当下汽车使用的现状,而由此所获得的结果。应该说,也极具真实性与权威性。  根据检测报告显示,除可吸入颗粒物基本符合国家标准(0.15mg/)外,TVOC、菌落总数情况堪忧。特别是菌落总数方面的情况让人触目惊心。根据《国家室内空气质量标准》,TVOC应0.60mg/,但本次检测的结果,汽车内TVOC超标30%(平均数) 在菌落总数方面,国家标准为1000cfu/,而实际结果为2174.75cfu/(平均值),超标近174.75%。如果与更严格的新加坡标准相比,此次测得的车内空气质量更是超标了近449.5%。此外,研究人员还在某部车内测得了22603cfu/的惊人数据,要知道垃圾填埋场的标准也仅为2500cfu/(新加坡标准)。  在中科理化环境分析研究中心进行的汽车空气质量全面检测中,研究人员不仅检测了可吸入颗粒物、TVOC和菌落总数的数据,并且对车内菌种的情况,进行分析。根据报告显示,研究人员从样本车内检测出,包括:金黄葡萄球菌、大肠杆菌、霉菌、绿脓杆菌和肺炎链球菌在内的多种病菌。此外,研究人员综合各类因素后,认为车内应该还会存在溶血性链球菌、白色念珠菌、沙门氏菌、蜡质芽孢杆菌、节杆菌和感冒病毒等在内的数十种病菌。  在诸多菌类中金黄葡萄球菌、肺炎链球菌和溶血性链球菌这三种病菌应该引起我们的重视。根据细菌的致病性,通常可以将致病细菌封为10个等级,而我们刚刚说到的那三种病菌,在其中恰恰位列三甲。  金黄色葡萄球菌是人类的一种重要病原菌,隶属于葡萄球菌属,可引起局部化脓感染,也可引起肺炎、伪膜性肠炎、心包炎等,甚至败血症、脓毒症等全身感染。并且有“嗜肉菌"的别称。根据统计,在美国由金黄色葡萄球菌肠毒素引起的中毒,占整个细菌性食物中毒的33%,加拿大则更多,占到45%,我国每年发生的此类中毒事件也非常多。  肺炎链球菌简称肺炎球菌,它是引发人类大叶性肺炎的元凶。根据《病原微生物生物实验室生物安全管理条例》中的有关规定,人间传播的微生物名录(待颁布)肺炎链球菌属于三类,也就是最危险的一类。  溶血性链球菌又称沙培林对热,可引起皮肤、皮下组织的化脓性炎症、呼吸道感染、流行性咽炎的爆发性流行以及新生儿败血症、细菌性心内膜炎、猩红热和风湿热、肾小球肾炎等病态反应。  相比TVOC和菌落总数的超标,在专家看来,金黄葡萄球菌、肺炎链球菌和溶血性链球菌的大量存在,是对健康的更大危险,作为位居致病细菌三甲的细菌,它们不仅致病性更强,同时被灭杀的难度也更大。可以说,它们的存在就如同一个个隐形的杀手,对人民的健康造成了直接,但又是相当隐蔽的危险。
  • “便携式多种食源性致病菌同步快速检测设备研发”课题招标
    为提高科技经费的使用效率,保证研究工作的质量,结合课题特点,北京市科学技术委员会决定采取公开招标的方式,择优选取课题承担单位。本次招标工作将遵照《中华人民共和国招标投标法》、中华人民共和国科学技术部《科技项目招标投标管理暂行办法》的要求和相关规定进行。  本次招标活动的招标人是北京市科学技术委员会,招标代理机构是北京科学技术开发交流中心。现请投标人就北京市科学技术委员会“便携式多种食源性致病菌同步快速检测设备的研发”课题进行投标。  现将有关招标事宜公告如下:  一、招标课题名称及编号  招标课题:便携式多种食源性致病菌同步快速检测设备的研发  招标编号:NF201602  二、课题目标  目前,食品中致病菌引起的食源性疾病给食品安全保障和人民身体健康造成危害。传统的食源性致病菌现场快检方法在前处理方面,不能实现现场样品制备 在致病菌快速检测技术方面,存在检验周期长、灵敏度低、大多方法只针对一种致病菌、试剂不能常温保存且保质期短等一系列问题。因此提升食源性致病菌检测的准确性和时效性,对增强食品生产经营企业食品安全质量控制水平,有力促进整个食品产业的健康可持续发展,提升基层监管日常检查、现场控制、应急处置工作效能,保障首都食品质量安全意义重大。  本课题针对食源性致病菌现场快速检验技术的瓶颈,可利用微流控芯片、分子印迹、荧光标记等先进技术,研制手持式检测设备及软件,建立食品中多种食源性致病菌的现场快速同步检测技术,制备集成化、体积小、效率高的现场快检设备,大幅提升检测灵敏度、可靠性和工作效率,为基层一线执法及食品生产经营企业自检提供有效的技术保障。  三、投标人资格  1.在北京地区注册的具有独立法人资格的企业(不包括外商独资和中方股份未超过50%的中外合资企业)   2.资信良好,在最近3年内无不良记录或严重违法违纪行为。  3.投标人在北京市科委的信用评级为C以下(含C)的不具备投标人资格。  4.本课题不接受联合投标。  四、投标须知  1.投标单位应具有食源性微生物检测能力,具备食品安全快速检测技术开发和相关快检设备研发的技术能力,具备10万级以上净化条件的生产车间。  2.投标单位应具有副高级职称以上的专业技术人才和相关工作经验,并了解国内外食品安全相关领域的研究进展。  3.投标单位应具备或可协调相关设备在食品安全监管一线示范应用的能力。  4.前期具备相关研发经验或经历的可优先考虑。  招标人允许投标人与其它机构进行技术合作,共同完成技术研发、应用推广。投标人如与其它机构合作,应在投标方案中明确说明合作内容、方式、技术方案、资金使用等重要内容,投标时必须签订分工明确的合作协议。  五、招标课题研究进度要求  中标人与招标人签订《课题任务书》之日起3年内完成。  六、课题经费  投标报价的币种采用人民币。  投标报价包括投标总报价(投标总报价是投标人自筹资金和招标人资助资金的总和)、自筹资金报价和招标人资助报价。招标人不限定投标报价的上限。但投标人申请招标人资助资金不得超过人民币220万元,投标人自筹资金报价不应低于人民币230万元。  投标人应合理报价,科技经费报价的合理性是评标的标准之一。  投标人申请招标人拨付的科技经费按照《招标文件(下)投标文件格式》中“开标一览表”规定方式报价。  七、招标文件的获取  有意投标者,请按下述时间、地点购买招标文件(请自备U盘),招标文件售出后概不退还。  2016年2月5日起至2016年3月15日止(公休日及节假日除外),每日9时00分至16时30分。  招标文件出售地点:北京市西城区西直门南大街16号科技大楼西楼6层601室(北京科学技术开发交流中心)  八、招标文件售价  招标文件售价人民币200元。  九、投标  接受投标文件的时间:  2016年3月16日9时00分至17时00分(北京时间)   2016年3月17日9时00分至17时00分(北京时间)。  投标文件送达地点:  北京市西城区西直门南大街16号科技大楼西楼6层601室。  十、开标  开标时间:2016年3月18日09时00分(北京时间)。  开标地点:北京市西城区西直门南大街16号科技大楼西楼6层(618会议室)。  十一、联系方式  北京科学技术开发交流中心  联系人:李点睛 杨鸿佼  电话:010-66127010,010-66516155  传真:010-66127010  地址:北京市西城区西直门南大街16号科技大楼西楼6层601室  邮编: 100035  监督电话: 66153445(纪检监察处)  北京科学技术开发交流中心  2016年2月5日
  • 这个基因突变会致癌?揭开致病BRCA突变的神秘面纱
    作者:青岛大学附属医院王晓囡、邢晓明2013年,好莱坞知名女星安吉丽娜朱莉在《纽约时报》发表了一篇名为《My Medical Choice》的文章,讲到自己的母亲与癌症斗争了近十年,于56岁时去世。而她遗传了母亲的BRCA1突变基因,这使她患乳腺癌的几率高达87%,患卵巢癌的几率也达到50%。为了尽可能地降低患癌风险,她决定接受预防性双乳切除术。两年后她又选择预防性的切除了卵巢和输卵管。BRCA1突变真的这么可怕吗?我们一起走进BRCA以及他的家族HRR来一探究竟。01 BRCA基因是什么?BRCA是breast cancer这两个英文单词前两个字母的缩写,研究者于上世纪90年代先后发现了与遗传性乳腺癌有关的基因,分别命名为乳腺癌1号基因、2号基因,英文简称BRCA1/2。实际上,BRCA1/2是两种抑癌基因,通俗的讲也就是对人体有好处的基因,它们翻译出来的蛋白质就像故障工程师一样,兢兢业业的修补受损伤或者有缺陷的基因。哪里有基因的双链断裂,哪里就有他们忙碌的身影。其实人体内不是只有BRCA1/2具有基因修复功能,而是有一个负责基因修复的大家族,被称为HRR(同源重组修复)通路,它包含的基因有:BRCA1,BRCA2,ATM,ATR,BARD1,BLM,BRIP1,CDK12,CHEK1,CHEK2,FANCA,FANCC,FANCD2,FANCE,FANCF,FANCI,FANCL,FANCM,MRE11,NBN,PALB2,RAD50,RAD51,RAD51B,RAD51C,RAD51D,RAD52,RAD54L,RPA1等。BRCA1/2是其中比较关键的两个基因,是HRR通路中的中流砥柱。02 如何检测BRCA1/2基因有没有突变?穿刺或者手术切取的组织都会被送往病理科,由病理科的医生对其进行处理并最终制作成蜡块(由石蜡包裹着的组织块)。进行BRCA1/2检测,首先需要从蜡块中提取DNA或者直接从血液中提取DNA,然后通过生物学技术对DNA中的BRCA1/2基因进行测序。由于BRCA1/2基因没有热点突变,即它的突变不集中于某几个区域上,而是在所有区域都有可能发生,所以需要利用下一代测序技术(Next generation sequencing,NGS)对BRCA1/2基因进行全外显子测序。最后根据测序数据分析可能的BRCA1/2基因突变,判定是否携带BRCA1/2基因的突变。03 有BRCA1/2突变一定得肿瘤吗?当然不是啦。其实BRCA1/2的突变分为5类,只有被归为第五类和第四类的突变才可能导致肿瘤的发生。第五类的突变被称为致病性突变,有99%的可能导致肿瘤的发生,第四类的突变被称为可能致病性的突变,有95%-99%的可能导致肿瘤的发生。那为什么发生这两类突变的BRCA1/2基因就从原来的好基因变成坏基因了呢?这是因为发生了这些突变的BRCA1/2基因在翻译时遇到了麻烦,不能翻译出具有正常功能的BRCA1/2蛋白,导致其丧失修复基因双链断裂的能力,这会影响基因组的稳定性,并引起多种肿瘤的发生。有研究指出,BRCA1/2胚系突变可使女性患卵巢癌的风险提高10-30倍,也增加了人们患乳腺癌、前列腺癌、胰腺癌、黑色素瘤等多种癌症的风险。04 BRCA1/2突变会遗传吗?BRCA1/2突变分为体细胞突变和胚系突变两种类型。体细胞突变是指只有肿瘤细胞发生了突变,而人体其他部位的正常细胞则没有发生突变。这种突变不会遗传给后代。那胚系突变是什么呢?我们都知道每个人都是爸爸妈妈爱的结晶,精子和卵子结合形成受精卵,再经过妈妈十月怀胎的辛苦最终有了我们每一个个体。精子和卵子里有来自爸爸和妈妈的染色体,这两部分染色体汇集到一起就变成了我们自己的染色体。如果爸爸或者妈妈贡献给我们的染色体里含有BRCA1/2的突变,那么我们就遗传了这个突变。我们体内的每一个细胞(每个细胞都是从最初的受精卵分裂来的,都跟受精卵有相同的染色体)里都带有这个突变,我们的后代也有可能带有这个突变,这就是胚系突变。胚系突变是可以遗传的。05 怎么区分BRCA1/2的突变到底是体细胞突变还是胚系突变呢?抽取静脉血3ML,分离其中的白细胞,提取DNA进行检测,如果检测出BRCA1/2的突变,这个突变就是胚系突变。如果血液里没有检测到突变,却在肿瘤组织中检测到了,那这种突变就是体细胞突变。06 有BRCA1/2的致病性或者可能致病性突变应该怎么办?对于携带BRCA1/2胚系突变的正常人来说,可以找专业的医生进行遗传咨询,并加强高风险疾病(女性如乳腺癌、卵巢癌等;男性如前列腺癌、胰腺癌等)的筛查,做到早发现早治疗。或者根据医生的建议并结合自身状况,选择是否像安吉丽娜朱莉一样进行预防性切除术以降低患癌风险。同时建议对有风险的亲属如父母、兄弟姐妹、子女等进行遗传咨询并考虑是否进行基因检测。对携带BRCA1/2胚系突变的肿瘤患者来说,一方面可以做遗传咨询,另一方面可以选择相应的药物进行治疗。而对于BRCA1/2体细胞突变的患者来说,可直接进行药物治疗而不用做遗传咨询。07 PARP抑制剂为什么可以用来治疗具有BRCA1/2的致病性或者可能致病性突变的肿瘤患者?前面我们提到BRCA是修复DNA双链损伤的酶,而PARP则是一种修复DNA单链损伤的酶,它的全称聚腺苷二磷酸核糖聚合酶。PARP抑制剂可以选择性的抑制PARP介导的DNA单链损伤修复途径,使发生损伤的DNA单链进一步转化成DNA双链断裂。这个时候就需要BRCA闪亮登场,而如果BRCA基因发生致病性或者可能致病性的突变,如同前文所述,DNA双链断裂就得不到修复,DNA损伤不断积累,最终就导致了细胞的死亡,这被称为合成致死效应。所以在选择此类药物进行治疗前,一定要先进行基因检测,BRCA基因确实存在致病性或者可以致病性突变才可用药,用药才有效果。此外,上文我们提到BRCA1/2是HRR通路中的核心成员,其实HRR通路中的其他基因如果出现问题,如发生致病性或者可能致病性的突变,同样可以影响基因的稳定性,导致肿瘤的发生。2020年PARP抑制剂奥拉帕利获得美国FDA(美国食品药品监督管理局)批准一项新的适应症,即用于治疗HRR通路基因突变的前列腺癌患者。 了解了BRCA1/2的前世今生,揭开了它的面纱,是不是觉得它也没有那么可怕了呢?可能不是每个人都能像安吉丽娜朱莉那样喊出自己的医学宣言,但是知己知彼,百战不殆,了解它,走进它,干掉它,愿每一位患者都能战胜病魔拥抱健康。
  • 质检总局:输德草莓未发现致病病毒
    针对我国出口冷冻草莓被怀疑造成德国学生肠胃病毒感染事件,国家质检总局11日表示,经过对输德草莓的企业进行样品检测,未发现致病的诺瓦克病毒(Norovirus)。  近日有媒体报道,德国东部学生中出现肠胃病毒感染,怀疑可能是食用了来自中国冷冻草莓所致。国家质检总局对此高度重视,立即要求检验检疫机构对相关生产企业进行调查。  经查,这批冷冻草莓来自山东一家食品出口企业,其生产、加工、储存、运输等环节符合食品安全卫生标准。货物出口前,检验检疫机构对这批货物实施了食品安全风险监控,合格后放行。  10月9日,检验检疫机构已封存这家企业的所有库存产品,并取样送实验室进行病毒检测,未发现诺瓦克病毒。此外,今年这家企业也向其他8个国家出口冷冻草莓,均未发生类似问题。根据目前风险排查和实验室检测分析,无科学证据表明,引发急性胃肠炎的冷冻草莓是在出口前被诺瓦克病毒污染。  据了解,国家质检总局已将有关初步调查情况向欧盟和德方通报,并表示冷冻草莓食物供应链长,涉及生产加工、储藏运输、分销配送、食物配餐等诸多环节,希望德方要逐一进行风险排查,以明确污染环节。中方愿与欧盟和德方加强信息沟通与合作,继续开展进一步调查。  此外,国家质检总局已发出警示通报,要求各地检验检疫机构加强对出口冷冻草莓生产企业的监管。
  • 青奥会食品中致病菌快速检测标准出台
    青奥会即将召开。日前,江苏省卫生和计划生育委员会首次发布《青奥会食品中致病菌快速检测标准》(下面简称《标准》),此标准为江苏省食品安全地方标准。《标准》规定了食品中黄金色葡萄球菌、沙门氏菌、单核细胞增生李斯特氏菌、大肠埃希氏菌O157:H7、副溶血性弧菌的病原菌自动检测系统检测方法和实时荧光PCR检测方法,以及志贺氏菌实时荧光PCR检测方法。据介绍,其他的大型活动可参照此标准执行。  记者获悉,青奥会是大型活动,深海鱼、河豚、鲐鱼、青条鱼、金枪鱼等都禁止进入青奥会的餐桌。 四季豆、豆浆、较大块的肉、肉圆也被列入慎用食品。青奥会期间,餐饮服务单位应按照《中华人民共和国食品安全法》第二十八条规定执行,并禁用、慎用附录A、附录B中所列的食品、原料类别(品种)。禁用食品、原料类别(品种)主要是高风险食品、公告禁止使用的食品添加剂、含有生物毒素的动植物类食品、原料。慎用食品、原料类别(品种)主要是特别需要强调烧熟、煮透的,洗净或消毒的,需控制存放温度和时间的,防止加工过程工具、用具、操作人员手交叉污染的四类食品、原料,如四季豆、豆浆、较大块的肉、肉圆等。  附件一  禁用名单  1.非本单位加工的直接入口食品(不含预包装食品),如熟肉制品、熟制水产制品、凉菜、蛋糕、烧饼、油条等。  2.直接入口的生海产品、淡水产品,如海蜇、海带、海产贝类、深海鱼、虾、蟹及其炝制、酱制、腌制、冰制品等。  3.已死的甲鱼、黄鳝、虾、蟹(不含冰鲜虾、蟹和冷冻虾、蟹)等。  4.生的围边菜、雕花菜、塑胶雕花围边,隔餐剩余饭菜。  5.食品添加剂硝酸盐、亚硝酸盐(亚硝酸钠、亚硝酸钾)。  6.河豚、鲐鱼、青条鱼、金枪鱼、毛蚶、织纹螺、荔枝螺、泥螺、狗肝、鲨鱼肝、鱼胆、野生蘑菇、生(苦)杏仁、枇杷仁、木薯、发芽马铃薯、牲畜甲状腺及其它不明动物的组织、器官和腺体。  7.未经许可的药膳。  附件二  慎用名单  1.需强调烧熟、煮透的:四季豆、扁豆、白果、豆浆、鲜黄花菜、较大块的肉、肉圆以及整鸡、整鸭、整鹅等。  2.需强调洗净或消毒的:即食果蔬、果盘、盘花等。  3.需注意存放温度和时间的:熟肉制品、熟制水产制品、凉菜、沙拉、鲜奶制品、鲜奶油裱花食品、改刀装盘食品、生鲜啤酒、现榨果蔬汁等。  4.需特别注意防止加工过程工具、用具、操作人员手交叉污染的:生禽畜及其内脏、鲜蛋、海产品、淡水产品等。
  • 赤峰市疾病预防控制中心490.22万元采购高压灭菌器,过氧化氢灭菌,微生物检测,超低温冰箱,毛细管电...
    详细信息 赤峰市疾病预防控制中心检验检测设备购置建设项目(第六批)二次招标公告 内蒙古自治区-赤峰市-松山区 状态:公告 更新时间: 2023-02-17 招标文件: 附件1 赤峰市疾病预防控制中心检验检测设备购置建设项目(第六批)二次招标公告 【发布时间:2023/2/17 】 项目概况 检验检测设备购置建设项目(第六批)二次招标项目的潜在投标人应在内蒙古自治区政府采购网获取招标文件,并于 2023年03月13日 09时00分 (北京时间)前递交投标文件。 一、项目基本情况 项目编号:NMGGCG-CFJK-2023-1 项目名称:检验检测设备购置建设项目(第六批)二次 采购方式:公开招标 预算金额:4,902,200.00元 采购需求: 合同包1(多重食源性致病微生物检测系统等): 合同包预算金额:1,408,800.00元 品目号 品目名称 采购标的 数量(单位) 技术规格、参数及要求 品目预算(元) 最高限价(元) 1-1 其他医疗设备 多重食源性致病微生物检测系统 1(套) 详见采购文件 848,000.00 - 1-2 其他医疗设备 全自动细菌鉴定及药敏分析系统 1(套) 详见采购文件 560,800.00 - 本合同包不接受联合体投标 合同履行期限:合同签订后60个日历日内交货 合同包2(显微镜(带精细图像扫描、采集、打印功能)等): 合同包预算金额:981,000.00元 品目号 品目名称 采购标的 数量(单位) 技术规格、参数及要求 品目预算(元) 最高限价(元) 2-1 显微镜 显微镜(带精细图像扫描、采集、打印功能) 1(台) 详见采购文件 949,400.00 - 2-2 其他医疗设备 液氮罐 1(台) 详见采购文件 31,600.00 - 本合同包不接受联合体投标 合同履行期限:合同签订后60个日历日内交货 合同包3(毛细管电泳仪等): 合同包预算金额:1,306,400.00元 品目号 品目名称 采购标的 数量(单位) 技术规格、参数及要求 品目预算(元) 最高限价(元) 3-1 其他医疗设备 高压蒸汽灭菌器 5(台) 详见采购文件 500,000.00 - 3-2 其他医疗设备 生化培养箱 10(台) 详见采购文件 203,000.00 - 3-3 其他医疗设备 CO2培养箱 2(台) 详见采购文件 130,000.00 - 3-4 其他医疗设备 毛细管电泳仪 1(台) 详见采购文件 473,400.00 - 本合同包不接受联合体投标 合同履行期限:合同签订后60个日历日内交货 合同包4(-86℃超低温冰箱等): 合同包预算金额:1,206,000.00元 品目号 品目名称 采购标的 数量(单位) 技术规格、参数及要求 品目预算(元) 最高限价(元) 4-1 其他医疗设备 -86℃超低温冰箱 6(台) 详见采购文件 660,000.00 - 4-2 其他医疗设备 试剂冰箱 15(台) 详见采购文件 396,000.00 - 4-3 其他医疗设备 -40℃医用低温冰箱 5(台) 详见采购文件 150,000.00 - 本合同包不接受联合体投标 合同履行期限:合同签订后60个日历日内交货 二、申请人的资格要求: 1.满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定: (1)具有独立承担民事责任的能力; (2)具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度; (3)具有履行合同所必需的设备和专业技术能力; (4)有依法缴纳税收和社会保障资金的良好记录; (5)参加政府采购活动前三年内,在经营活动中没有重大违法记录; (6)法律、行政法规规定的其他条件。 2.落实政府采购政策需满足的资格要求: 无。 3.本项目的特定资格要求: 合同包1(多重食源性致病微生物检测系统等)特定资格要求如下: (1)投标人具备国家有关部门颁发的与所投设备分类对应的《医疗器械经营许可证》或经营备案凭证;如是生产厂家,还须具备《医疗器械生产许可证》,上述证件均须在有效期内。 投标人需根据所投设备分类提供医疗器械注册证(包括医疗器械产品注册登记表)或医疗器械备案凭证(包括医疗器械备案信息表),所投设备不属于医疗器械的应提供书面声明。 合同包2(显微镜(带精细图像扫描、采集、打印功能)等)特定资格要求如下: (1)投标人具备国家有关部门颁发的与所投设备分类对应的《医疗器械经营许可证》或经营备案凭证;如是生产厂家,还须具备《医疗器械生产许可证》,上述证件均须在有效期内。 投标人需根据所投设备分类提供医疗器械注册证(包括医疗器械产品注册登记表)或医疗器械备案凭证(包括医疗器械备案信息表),所投设备不属于医疗器械的应提供书面声明。 合同包3(毛细管电泳仪等)特定资格要求如下: (1)投标人具备国家有关部门颁发的与所投设备分类对应的《医疗器械经营许可证》或经营备案凭证;如是生产厂家,还须具备《医疗器械生产许可证》,上述证件均须在有效期内。 投标人需根据所投设备分类提供医疗器械注册证(包括医疗器械产品注册登记表)或医疗器械备案凭证(包括医疗器械备案信息表),所投设备不属于医疗器械的应提供书面声明。 合同包4(-86℃超低温冰箱等)特定资格要求如下: (1)投标人具备国家有关部门颁发的与所投设备分类对应的《医疗器械经营许可证》或经营备案凭证;如是生产厂家,还须具备《医疗器械生产许可证》,上述证件均须在有效期内。 投标人需根据所投设备分类提供医疗器械注册证(包括医疗器械产品注册登记表)或医疗器械备案凭证(包括医疗器械备案信息表),所投设备不属于医疗器械的应提供书面声明。 三、获取招标文件 时间: 2023年02月17日 至 2023年02月24日 ,每天上午 00:00:00 至 12:00:00 ,下午 12:00:00 至 23:59:59 (北京时间,法定节假日除外) 地点:内蒙古自治区政府采购网 方式:在线获取。获取采购文件时,需登录“政府采购云平台”,按照“执行交易→应标→项目应标→未参与项目”步骤,填写联系人相关信息确认参与后,即为成功“在线获取”。 售价: 免费获取 四、提交投标文件截止时间、开标时间和地点 2023年03月13日 09时00分00秒 (北京时间) 地点: 内蒙古自治区政府采购网(政府采购云平台) 五、公告期限 自本公告发布之日起5个工作日。 六、其他补充事宜 本项目开标地点:内蒙古自治区赤峰市市辖区赤峰市公共资源交易中心三楼开标三室政采开-3 无 七、对本次招标提出询问,请按以下方式联系。 1.采购人信息 名称:赤峰市疾病预防控制中心 地址:赤峰市松山区玉龙大街70A 联系方式:0476-5891135 2.采购代理机构信息 名称:内蒙古冠成功工程招标代理有限公司 地址:呼和浩特市赛罕区万达广场A座23楼 联系方式:13789413343 3.项目联系方式 项目联系人:内蒙古冠成功工程招标代理有限公司 电话:13789413343 内蒙古冠成功工程招标代理有限公司 2023年02月17日 相关附件: 检验检测设备购置建设项目(第六批)二次招标文件(2023021701).pdf × 扫码打开掌上仪信通App 查看联系方式 基本信息 关键内容:高压灭菌器,过氧化氢灭菌,微生物检测,超低温冰箱,毛细管电泳仪,培养箱,ATP,液氮罐 开标时间:2023-03-13 09:00 预算金额:490.22万元 采购单位:赤峰市疾病预防控制中心 采购联系人:点击查看 采购联系方式:点击查看 招标代理机构:内蒙古冠成功工程招标代理有限公司 代理联系人:点击查看 代理联系方式:点击查看 详细信息 赤峰市疾病预防控制中心检验检测设备购置建设项目(第六批)二次招标公告 内蒙古自治区-赤峰市-松山区 状态:公告 更新时间: 2023-02-17 招标文件: 附件1 赤峰市疾病预防控制中心检验检测设备购置建设项目(第六批)二次招标公告 【发布时间:2023/2/17 】 项目概况 检验检测设备购置建设项目(第六批)二次招标项目的潜在投标人应在内蒙古自治区政府采购网获取招标文件,并于 2023年03月13日 09时00分 (北京时间)前递交投标文件。 一、项目基本情况 项目编号:NMGGCG-CFJK-2023-1 项目名称:检验检测设备购置建设项目(第六批)二次 采购方式:公开招标 预算金额:4,902,200.00元 采购需求: 合同包1(多重食源性致病微生物检测系统等): 合同包预算金额:1,408,800.00元 品目号 品目名称 采购标的 数量(单位) 技术规格、参数及要求 品目预算(元) 最高限价(元) 1-1 其他医疗设备 多重食源性致病微生物检测系统 1(套) 详见采购文件 848,000.00 - 1-2 其他医疗设备 全自动细菌鉴定及药敏分析系统 1(套) 详见采购文件 560,800.00 - 本合同包不接受联合体投标 合同履行期限:合同签订后60个日历日内交货 合同包2(显微镜(带精细图像扫描、采集、打印功能)等): 合同包预算金额:981,000.00元 品目号 品目名称 采购标的 数量(单位) 技术规格、参数及要求 品目预算(元) 最高限价(元) 2-1 显微镜 显微镜(带精细图像扫描、采集、打印功能) 1(台) 详见采购文件 949,400.00 - 2-2 其他医疗设备 液氮罐 1(台) 详见采购文件 31,600.00 - 本合同包不接受联合体投标 合同履行期限:合同签订后60个日历日内交货 合同包3(毛细管电泳仪等): 合同包预算金额:1,306,400.00元 品目号 品目名称 采购标的 数量(单位) 技术规格、参数及要求 品目预算(元) 最高限价(元) 3-1 其他医疗设备 高压蒸汽灭菌器 5(台) 详见采购文件 500,000.00 - 3-2 其他医疗设备 生化培养箱 10(台) 详见采购文件 203,000.00 - 3-3 其他医疗设备 CO2培养箱 2(台) 详见采购文件 130,000.00 - 3-4 其他医疗设备 毛细管电泳仪 1(台) 详见采购文件 473,400.00 - 本合同包不接受联合体投标 合同履行期限:合同签订后60个日历日内交货 合同包4(-86℃超低温冰箱等): 合同包预算金额:1,206,000.00元 品目号 品目名称 采购标的 数量(单位) 技术规格、参数及要求 品目预算(元) 最高限价(元) 4-1 其他医疗设备 -86℃超低温冰箱 6(台) 详见采购文件 660,000.00 - 4-2 其他医疗设备 试剂冰箱 15(台) 详见采购文件 396,000.00 - 4-3 其他医疗设备 -40℃医用低温冰箱 5(台) 详见采购文件 150,000.00 - 本合同包不接受联合体投标 合同履行期限:合同签订后60个日历日内交货 二、申请人的资格要求: 1.满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定: (1)具有独立承担民事责任的能力; (2)具有良好的商业信誉和健全的财务会计制度; (3)具有履行合同所必需的设备和专业技术能力; (4)有依法缴纳税收和社会保障资金的良好记录; (5)参加政府采购活动前三年内,在经营活动中没有重大违法记录; (6)法律、行政法规规定的其他条件。 2.落实政府采购政策需满足的资格要求: 无。 3.本项目的特定资格要求: 合同包1(多重食源性致病微生物检测系统等)特定资格要求如下: (1)投标人具备国家有关部门颁发的与所投设备分类对应的《医疗器械经营许可证》或经营备案凭证;如是生产厂家,还须具备《医疗器械生产许可证》,上述证件均须在有效期内。 投标人需根据所投设备分类提供医疗器械注册证(包括医疗器械产品注册登记表)或医疗器械备案凭证(包括医疗器械备案信息表),所投设备不属于医疗器械的应提供书面声明。 合同包2(显微镜(带精细图像扫描、采集、打印功能)等)特定资格要求如下: (1)投标人具备国家有关部门颁发的与所投设备分类对应的《医疗器械经营许可证》或经营备案凭证;如是生产厂家,还须具备《医疗器械生产许可证》,上述证件均须在有效期内。 投标人需根据所投设备分类提供医疗器械注册证(包括医疗器械产品注册登记表)或医疗器械备案凭证(包括医疗器械备案信息表),所投设备不属于医疗器械的应提供书面声明。 合同包3(毛细管电泳仪等)特定资格要求如下: (1)投标人具备国家有关部门颁发的与所投设备分类对应的《医疗器械经营许可证》或经营备案凭证;如是生产厂家,还须具备《医疗器械生产许可证》,上述证件均须在有效期内。 投标人需根据所投设备分类提供医疗器械注册证(包括医疗器械产品注册登记表)或医疗器械备案凭证(包括医疗器械备案信息表),所投设备不属于医疗器械的应提供书面声明。 合同包4(-86℃超低温冰箱等)特定资格要求如下: (1)投标人具备国家有关部门颁发的与所投设备分类对应的《医疗器械经营许可证》或经营备案凭证;如是生产厂家,还须具备《医疗器械生产许可证》,上述证件均须在有效期内。 投标人需根据所投设备分类提供医疗器械注册证(包括医疗器械产品注册登记表)或医疗器械备案凭证(包括医疗器械备案信息表),所投设备不属于医疗器械的应提供书面声明。 三、获取招标文件 时间: 2023年02月17日 至 2023年02月24日 ,每天上午 00:00:00 至 12:00:00 ,下午 12:00:00 至 23:59:59 (北京时间,法定节假日除外) 地点:内蒙古自治区政府采购网 方式:在线获取。获取采购文件时,需登录“政府采购云平台”,按照“执行交易→应标→项目应标→未参与项目”步骤,填写联系人相关信息确认参与后,即为成功“在线获取”。 售价: 免费获取 四、提交投标文件截止时间、开标时间和地点 2023年03月13日 09时00分00秒 (北京时间) 地点: 内蒙古自治区政府采购网(政府采购云平台) 五、公告期限 自本公告发布之日起5个工作日。 六、其他补充事宜 本项目开标地点:内蒙古自治区赤峰市市辖区赤峰市公共资源交易中心三楼开标三室政采开-3 无 七、对本次招标提出询问,请按以下方式联系。 1.采购人信息 名称:赤峰市疾病预防控制中心 地址:赤峰市松山区玉龙大街70A 联系方式:0476-5891135 2.采购代理机构信息 名称:内蒙古冠成功工程招标代理有限公司 地址:呼和浩特市赛罕区万达广场A座23楼 联系方式:13789413343 3.项目联系方式 项目联系人:内蒙古冠成功工程招标代理有限公司 电话:13789413343 内蒙古冠成功工程招标代理有限公司 2023年02月17日 相关附件: 检验检测设备购置建设项目(第六批)二次招标文件(2023021701).pdf
  • 北京将建18个食源性致病菌监测点
    食物中某些致病菌如果超标也会导致人体耐药。11月12日,记者获悉,市卫生局已向各区县卫生局和食品办等部门印发食品安全风险监测方案,拟在超市、集贸市场等地设立18个监测点,对全市消费量大的2500多件食品开展食源性致病菌的监测,并据此耐药趋势建立耐药图谱库。  市卫生局称,食源性致病菌监测采用常规监测与专项监测相结合形式,常规监测是针对本市居民消费量大、流通广的食品,监测重点为即食食品。根据监测方案,食源性致病菌常规监测包括10类食品12种微生物指标。专项监测中耐药监测包括沙门氏菌和金黄色葡萄球菌,溯源分析包括沙门氏菌、副溶血性弧菌、金黄色葡萄球菌和单增李斯特菌。  抽样地点包括餐饮店、农贸市场、超市、专卖店以及农村地区、城乡结合部的超市、集贸市场、小卖部、小餐饮店和农家院。市卫生局表示,开展食源性致病菌监测的目的在于掌握和分析本市消费量大、流通广泛的食品中主要食源性致病菌的污染状况及其变化趋势,确定危害因素的分布和可能来源 及时发现食品安全隐患 为风险评估、食品安全监督管理和制定微生物食品安全标准提供依据。
  • 烟台海岸带所建立海水致病菌快速电化学检测新方法
    海水中的致病菌包括来自生活污水、城市径流以及海岸沙滩流入的陆源性致病菌及自然海水中致病菌。海水中致病菌的污染不仅威胁人们的健康安全,而且会对水产养殖业带来巨大的危害和损失。因此,发展快速、准确、高灵敏检测海水中主要致病菌的传感器技术受到了广泛关注。近期,中国科学院烟台海岸带研究所海洋环境电化学与传感器技术研究团队和海岸带微型生物生态与应用团队合作,在前期研究工作的基础(analytical chemistry,2012,84,2055-2031)上,进一步发展了一种免标记、免固定化电位型传感器用于海水致病菌的检测。该检测系统以核酸适体作为识别分子,鱼精蛋白作为指示离子,避免了对核酸适体的标记和固定化,从而实现了对致病菌的快速、高效、低成本检测。海水高盐度能够降低核酸适体和靶致病菌的结合能力,并会干扰聚离子选择性电极的电位响应。在实际样品分析中,研究采用了样品在线快速过滤法,有效消除海水基体效应,并通过致病菌富集提高了检测灵敏度,满足了实际海水检测的要求。以单增李斯特菌为例,该检测系统的检出限达到了10 CFU mL-1。该研究成果近期发表在国际化学刊物analytical chemistry上(doi:10.1021/ac502335g)。
  • 新冠病毒不断进化 安捷伦实时细胞分析技术助力病毒致病机制研究
    p style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "span style="text-indent: 2em "新型冠状病毒疫情的蔓延已经给国人的生活带来了严重的影响。从已经获得的数据资料来看,这种病毒的传播能力相比SARS更强,危害范围更广。众多仪器厂商自发行动,为抗击疫情献出自己的力量。当前,仪器厂商推出仪器或试剂盒产品大多是关于疑似病例确诊的核酸检测。而新型冠状病毒以及类似病原体的不断升级进化,临床和科研迫切需要先进、全面的技术平台用于病毒致病机制研究、诊断治疗、药物研发和疫苗研制。/spanbr//pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "strongspan style="color: rgb(0, 112, 192) "仪器信息网:针对此次新型冠状病毒(2019-nCoV)感染肺炎疫情,贵单位推出了什么样的检测仪器、试剂和解决方案?有何特点?/span/strong/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "strong安捷伦/strong:新型冠状病毒以及类似病原体的不断升级进化,临床和科研迫切需要先进、全面的技术平台用于病毒致病机制研究、诊断治疗、药物研发和疫苗研制。Agilent推出的流式细胞仪和xCELLigence RTCA实时监测系统,在保证研究人员安全的同时,不耽误研究进程,从而协助攻关专家,助力病毒研究。/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "xCELLigence RTCA 实时细胞分析技术是一种独特的活细胞检测技术,该技术可实现无标记和持续性的跟踪记录病毒感染细胞过程中CPE(细胞病变效应)的进展,为多种病毒学检测提供异常简易的实验流程,包括但不限于:病毒滴度测定、疫苗研发、中和抗体的检测与定量、抗病毒药物的开发等,可实时电子生物传感检测和多达四个独立的活细胞成像参数,包括1个明场和3个荧光通道。span style="text-indent: 2em "该技术可满足研究人员尽可能少地接触病毒,并可以做到无需研究人员值守的进行病毒研究任务。目前该系统已针对此次新型冠状病毒(2019-nCoV)展开各方面研究支持。/span/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "Agilent多色流式细胞仪,最高可达4激光25色,最高上样速度可达100,000 events/s,具备千余种临床和科研试剂,配套自动多功能数据分析软件NovoExpress,能够同时检测多种免疫细胞的表型、状态和细胞因子以及病毒的生物学特征和病理机制,可检测多种标本如血液、血清、脑脊液、细胞培养液和肺泡灌洗液等,对标本中的细胞类型、细胞器、蛋白质、核酸等成分进行定性定量的检测。/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 199px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202002/uepic/21c14eb1-d0c1-4ee6-a760-3ba1237d913c.jpg" title="Agilent流式细胞仪体积法绝对计数无需绝对计数微球,节省检测成本.png" alt="Agilent流式细胞仪体积法绝对计数无需绝对计数微球,节省检测成本.png" width="600" height="199" border="0" vspace="0"//pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-align: center "Agilent流式细胞仪体积法绝对计数无需绝对计数微球,节省检测成本/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "新型冠状病毒肺炎诊疗方案和指南中提到免疫检查和监测对于易感人群的筛查以及隔离观察、新冠肺炎患者病情监测、判断细胞因子和炎症反应的产生,预警预测细胞因子风暴的重要性。流式细胞术在临床上可用于新冠肺炎患者的免疫细胞和免疫状态的评估,为筛查诊断、用药治疗和预后评估提供精确指导。应用Agilent流式细胞仪进行无成本淋巴细胞亚群的绝对计数,辅助临床客观、准确地评估细胞和体液免疫功能和免疫状态。临床医生通过免疫检测结果判断患者是否需要隔离,调整激素药物剂量以防止过量激素造成的免疫损伤和副作用,并动态监测治疗过程中新冠肺炎患者的免疫评估患者的治疗效果和评估预后。/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "应用Agilent流式细胞仪配套试剂盒软件对新冠肺炎血清细胞因子进行定量检查,细胞因子风暴是导致新冠肺炎患者死亡的重要原因,动态监测细胞因子对细胞因子风暴的预警预测和及时采取相应药物或生物制剂治疗如细胞因子拮抗剂、激素和免疫抑制剂起指导作用。/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "Agilent流式细胞仪检测新冠病毒肺炎患者中性粒细胞CD64感染指数可辅助临床诊断和鉴别诊断患者是否合并细菌感染,中性粒细胞CD64感染指数是诊断细菌感染的一项敏感度高、特异性强的新指标,与细菌感染的严重程度、预后及患者的死亡密切相关,监测CD64感染指数为评估病情、抗菌疗效和预后提供参考。Agilent流式细胞仪配合配套试剂检测新冠肺炎患者的中性粒细胞淋巴细胞亚群、细胞因子和CD64感染指数,可快速、精确、自动地出报告,节省检测成本和时间,为临床监测病情、用药指导、疗效和预后评估提供参考,为脓毒症、细胞因子风暴提供预警预测、免疫治疗指导和个性化治疗方案,同时为研发抗病毒药物和设计疫苗提供理论支持和开发新靶点并为药物和疫苗筛选、药效评估、安全性评估和免疫评价等提供高效、准确、客观、可靠的技术平台。/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 500px height: 266px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202002/uepic/4c6f331b-070b-45a5-aa93-d29c70811635.jpg" title="Agilent流式细胞仪.png" alt="Agilent流式细胞仪.png" width="500" height="266" border="0" vspace="0"//pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em text-align: center "Agilent流式细胞仪/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "span style="color: rgb(0, 112, 192) "strong仪器信息网:目前,贵单位开展了哪些具体工作?给疫情防控带来了哪些具体帮助?/strong/span/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "strong安捷伦/strong:安捷伦从未停止奋斗在对抗疫情、挽救生命、助力科研第一线的步伐,2020年1月27日,大年初三,安捷伦宣布捐赠价值300万元急需的生物仪器设备到临床和科研一线。1月26日(大年初二),多名安捷伦杭州员工自愿放弃与家人团聚的时间,火速赶到公司完成捐赠货物NovoCyte流式细胞仪和实时无标记细胞分析仪的装箱发货,1月27日(大年初三),安捷伦捐赠价值300万元急需的临床与科研设备已经全部运出,并在第一时间完成仪器安装和调试,满足奋斗一线的医护和科研人员的临床样本检测、病毒学研究和抗病毒药物研究的迫切需求。/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "同时,安捷伦有幸向中科院武汉病毒所和中国家疾病预防控制中心病毒所捐赠公司的xCELLigence RTCA系统,协助两家国家重点病毒科研单位用于病毒CPE,抗病毒药物和疫苗的研究,集中力量,快速突破,攻克技术难关,遏制病毒蔓延。xCELLigence RTCA实时监测技术可满足研究人员尽可能少地接触病毒,并可以做到无需研究人员值守的进行病毒研究任务。这在保证研究人员安全的同时,不耽误研究进程,从而协助攻关专家,助力病毒研究。/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "值得一提的是,为了支持广大相关用户工作的正常运转,安捷伦工程师已提前到岗,以确保用户在特殊时期的仪器服务需求,最大限度降低用户因延期复工造成的损失。span style="text-indent: 2em " /span/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "span style="color: rgb(0, 112, 192) "strong仪器信息网:针对疫情防控,后续还将有哪些工作计划?/strong/span/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "strong安捷伦/strong:冠状病毒及类似病原体的不断出现和变异对全球人类健康安全和经济发展造成了严重威胁,作为生命科学、诊断和应用化学市场领域的全球领导者,通过丰富的产品线,安捷伦有义务也有能力,从多方面为战胜疾病、保障人类健康做出贡献。/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "接下来,安捷伦将持续支持病毒一线研究工作,利用领先的细胞技术在病毒致病机制研究、诊断治疗、药物研发和疫苗研制工作方面提供强有力的仪器、试剂和技术支持。/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "安捷伦也将为此次疫情提供质量控制方面提供的多方面的解决方案。无论是针对疫苗的开发,抑或是在核酸与细胞层面对致病机理的研究,都离不开对蛋白与核酸样本的质量控制。安捷伦自动化电泳产品线以及UV-Vis光谱产品等可快速对DNA、RNA,蛋白样本进行分析。安捷伦液相和毛细管电泳可用于疫苗的质控分析,进行纯度及杂质检测,针对新冠肺炎的研究针分夺秒,可大大节省获取结果的时间,同时保障结果的准确性与重现性。另外,安捷伦顶空气相色谱法测定一次性医疗器械产品中各化学物质残留量,如医用口罩,中的环氧乙烷和2_氯乙醇的残留量,为一次性医疗器械生产过程的质量控制保驾护航。/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "此外,针对疫情期间的环境隐患,污染物应急监测,和固废危废检测及其处理相关排放污染物检测等方面等,安捷伦有相应的丰富检测方案,积极配合相关机构进行高效的监测和分析。/pp style="text-indent: 2em margin-top: 10px margin-bottom: 10px line-height: 1.5em "今后,安捷伦将推出更多的临床检测试剂和科研检测技术,并结合安捷伦的多个平台、仪器、软件和专业技能,为临床检测、科学研究、药物和疫苗开发等提出更优更全面的解决方案。赢取此次战役之后,安捷伦期待更多参与并支持国家的公共卫生能力建设,应对公共安全挑战。/p
  • “动物源病原体的发现及其对人类致病性研究”重大项目结题 取得重要进展
    p  2018年1月19日,国家自然科学基金委员会医学科学部组织由中科院院士赵国屏研究员任组长的11位微生物学、病原学、感染病学及免疫学领域专家,对国家自然科学基金重大项目“动物源病原体的发现及其对人类致病性研究”(项目批准号:81290340)进行结题验收。基金委医学科学部孙瑞娟副主任及相关工作人员参加会议。/pp  许多野生动物是重要人类传染病病原体的自然宿主,这些病原体一旦接触并感染人类,可能引起严重疾病,形成重大公共卫生事件。研究发现,人们熟知的艾滋病毒(HIV)来自非洲的黑猩猩和大猩猩 登革病毒(Dengue virus)来自埃及伊蚊和白纹伊蚊 严重急性呼吸道综合症(SARS)也称“非典型肺炎”冠状病毒(SARS-CoV)、中东呼吸综合症冠状病毒(MERS-CoV)、埃博拉病毒(Ebola virus)据证都来自蝙蝠 寨卡病毒(Zika Virus)来自非洲伊蚊等蚊虫 来自禽类、猪、马等的流感病毒也可以导致人类罹患流感等等。对动物尤其是野生动物携带微生物和寄生虫等情况进行基础性、前瞻性调查及相关研究,将会对人类传染病的预警及防控提供可靠的理论指导。国家自然科学基金委员会服务国家重大战略需求,于2012年正式立项重大项目,资助我国优秀的科学家团队对动物源性病原体进行了前沿研究。/pp  重大项目验收会首先听取项目负责人徐建国院士及五个课题负责人石正丽、梁国栋、张永振、曹务春、徐建国研究员对项目及课题结题情况的汇报,在充分交流的基础上,对项目结题情况进行认真评价。专家组认为,项目组经过五年努力,在标本采集、微生物及病原体的发现与鉴定、微生物的进化与致病性等多个方面,取得一批重大研究成果,形成一系列重要论文 研究过程培养了一批高水平专业人才,提升了我国科学家在该领域的学术地位 也支撑了我国相关的重要战略研究和科普宣传,已经并将进一步形成重要的社会影响。具体成果包括:(1)发现和鉴定了一批新的病原体,并在相关技术上取得创新突破。在国际上率先发现和命名了4种新的病原体 在我国首次发现20种新的病原体 发现9种过去认为非致病微生物的致病性 发现已知病原体的新基因型24个、新动物宿主4个,分离和命名了新的细菌10种,利用宏基因组技术发现1640余种新病毒。(2)通过研究病原体与动物宿主关系,提升了对潜在病原体野外宿主谱的认识。发现喜马拉雅旱獭携带已经存在千年的喜马拉雅型蜱传脑炎病毒和喜马拉雅旱獭甲肝病毒。首次揭示了我国蝙蝠、蜱、蚊、喜马拉雅旱獭、秃鹫、广西猕猴等野生动物的病毒谱或细菌谱。(3)前瞻性地提出我国存在潜在新发传染病的风险,主要包括西尼罗病毒、寨卡病毒、SARS样冠状病毒、山羊无形体、艾尔博特埃希菌等的感染。(4)在病原微生物学基础认识上,获得若干具有重要理论意义的创新。主要包括:①获得了SARS病毒可能来源于蝙蝠的更有说服力的证据 ②重新界定无脊椎动物RNA病毒圈,可能会带来病毒分类学的重大变化 ③发现节肢动物可能是RNA病毒进化的“心脏” ④发现RNA病毒从单链进化为双链的新机制等。(5)大量研究成果发表在权威学术期刊及核心期刊上,包括Nature(《自然》),Science(《科学》),New England Journal of Medicine(《新英格兰医学杂志》),Lancet Infectious Diseases(《柳叶刀?传染病》),Nature Medicine(《自然?医学》),Annals of Internal Medicine(《内科学年鉴》),eLife(《e生命》),PNAS(《美国科学院院刊》),PLOS Pathogens(《科学公共图书馆?病原体》)等。(6)培养了一批专门人才,研究成果已获得省部级自然科学一等奖一项、科技进步一等奖一项。部分成果已在中央电视台等国内外重要媒体进行报道。/p
  • 北京理化中心致病菌和环境污染物快速检测方法技术研究项目通过验收
    近日,由北京市理化分析测试中心承担的“致病菌和环境污染物快速检测方法技术研究”项目在北京通过了专家验收。  项目组针对食品和环境中常见的沙门菌、单核细胞增生李斯特菌、金黄色葡萄球菌、肠出血性大肠杆菌等致病菌,将生物学分析方法与生物传感器相结合,建立了分子自马达生物传感器快速检测规范化方法。同时,建立了针对雌激素或类雌激素污染等环境污染物的评价方法,开发了高通量、快速筛选环境内分泌干扰物离体生物测试方法和活体生物分析方法,探讨了吐纳麝香的内分泌干扰效应。
  • 微生物检测说到烂的无菌操作--细节说的明明白白的
    无菌室的工作要尽可能减少交流。不允许在无菌室内谈笑。要尽可能减少在无菌室内走动。沉降菌技术必须按照规定的时间进行使用。工作人员进入无菌室工作之前必须做好前期准备工作。要按照规定穿戴经过特殊处理的服装、并对身体做好清洁、避免对检测品造成污染。在检测样品的提取过程中,工作人员要尽可能远离检测物品。避免检测物品受到细菌污染。检测样品提取之后要进行科学的保存,避免受到污染。提取过程要尽可能加快速度,不能将检测样品在空气中闲置太长的时间避免空气中的细菌对检测样品造成污染。检测样品的提取过程必须严格遵守无菌操作的程序。打开储存样品的时候,要使用浓度为75%的酒精对存在检测样品的器皿瓶口进行消毒,要使用酒精棉球作为消毒的重要工具。器皿的瓶口要进行两次以上的酒精消毒,提取工作完成之后要科学的安放检测样品,并且随时检查储存检测样品的空间,避免检测样品受到污染。食品微生物检验的主要内容与特点1、检验内容目前我国对食品微生物检验的根本要求是安全无毒害。在对食品微生物进行检验时,主要内容包括3点:(1)对食品污染程度的检验,以检验食品样本中菌落总数、大肠菌群总数和霉菌总数为主,这种检验方式,只能对样本的污染程度做出判断,不能说明食品是否存在安全问题。(2)对食品中致病菌的定性检验,即检验食品样本中是否存在某种或多种致病性微生物,常规检验的致病菌主要有金黄色葡萄球菌、沙门氏菌、志贺氏菌、单核细胞增生李斯特氏菌、致泻大肠埃希氏菌、溶血性链球菌、蜡样芽孢杆菌、阪崎肠杆菌及副溶血性弧菌等。(3)对食品中致病菌的定量检验,即检验食品样本中某种或多种致病性微生物存在的量,通过检验结果结合科学数据,对食品样本的危害程度进行分析。2、食品微生物检验的特点(1)食品微生物检验涉及的微生物范围广,种属多。采集食品微生物检验样品比较复杂,要求高。食品微生物检验的研究对象包括:a.经食物传播的病原微生物,他们是人类疾病病原微生物、畜禽疫病的病原微生物和人畜共患传染病病原微生物,这几类微生物可达数百种;b.引起人类食物中毒的微生物及其毒素;c.引起食品腐败变质的微生物;d.食品工业微生物。可以说食品微生物检验接触的微生物类群、种属比其他专业微生物检验为多。(2)食品中待分离细菌数量少、杂菌量多,对检验工作干扰严重。食品微生物检验,其目的菌,如致病性微生物和食品中毒微生物及毒素,主要来源于生产加工、储存运输、销售等过程中污染的,在污染的微生物中,致病性微生物一般数量相对较少,却有大量的非致病性微生物污染,两者之间比较悬殊。(3)食品中微生物检验具有数量观念在GB 4789食品卫生微生物学检验方法中,对某些微生物的数量已经明确规定,除要检测食品污染程度指示菌,如菌落总数、大肠菌群的测定外,还有致病菌如金黄色葡萄球菌、产气荚膜梭菌、蜡样芽胞杆菌都需要菌数计算。诊断食物中毒仅做定性试验是不够的,还需要对致病菌定量检验。随着科技发展,各种致病菌的定量检验必将全面开展。食品微生物检验工作者必须不断摸索、积累,致病菌的定量检验,使其他致病菌的定量检验早日开展。(4)食品微生物检验需要准确性与快速性。食品生产后,为了保持新鲜程度,一般都是尽快的进入市场,转到消费者手中的,这就要求就检验工作尽快获得结果,保证食品的食用安全。另一方面,工厂化大规模生产的食品,每一批次数量较大,采样数量、采样方法和检验方法都直接影响到检验正确性和批量产品的处理,如果检验的结果不准确,将会造成严重的政治影响和经济损失。这一点是食品微生物检验工作必须注意的问题。(5)微生物检验具有一定法律性质。对食品的微生物检验,世界各国均制定有检验法规。作为食品微生物检验人员,在进行食品微生物检验时,均应按规定要求实施,不得任意更换其他方法。无菌操作的重要性所谓无菌,指的是不存在保证生命活动的营养细胞的状态。而无菌操作则是采用无菌的器械进行操作,防止微生物进入无菌范围的技术。在食品微生物检验中,无菌操作是重要的理念,只有采用无菌操作技术,保持食品样本在检验过程中不受到二次污染,才能保证检验结准确的反映出食品样本的卫生状况。在食品检验的各个环节,都有可能有微生物的进入,因此无菌操作技术应贯穿整个检验过程,如果有一个环节没有采用无菌操作,那么其他环节的无菌操作也将没有任何意义。无菌操作的具体应用1、取样食品微生物检验首先是从样本中无菌称取要求检验的质量,取样过程中使用的天平要经过消毒,检验用品如剪刀、药匙要经过170℃/2h 干热灭菌。取样过程严格按照无菌操作进行,才能保证食品样品的原始状态。前处理根据国标要求,取样后要对样品进行前处理。一般而言,称取 25g/ml 样品于盛有225ml无菌稀释液的无菌均质袋中均质,制备成1:10样品匀液进行检验。对于计数样品要,制备10倍系列稀释样品匀液,操作方法参见GB4789.2-2016。整个过程必须严格按照无菌操作进行。3、纯种分离在食品微生物检查过程中,为了更加准确的确定微生物群体,需要将疑似的目标菌从混杂的样品中分离出来,进而得到纯培养物。通常情况下,需要结合不同微生物的具体特性,针对性的选择培养基与培养条件,促进目标微生物的繁殖。或者通过使用某种抑制素,抑制除目标菌以外的杂菌生长,进而将其他杂菌淘汰。接着将培养物接种在固体培养基上形成目标菌的单菌落。这种单菌落还需要进行一定的纯化与鉴定,才能保障分离的菌株为纯菌株。在整个分离纯化过程中,通常需要用接种环把微生物的纯培养物从一个器皿转接到另一个器皿中培养。在这一过程中,如果不能严格按照无菌操作进行,很难保证检验结果的准确性。同时,实验人员应加强自身实验水平与操作能力,确保无菌操作技术熟练、准确。4、革兰氏染色革兰氏染色技术是食品微生物确认鉴定中重要的方法,将疑似的目标菌经过纯化分离后染色,在光学显微镜下观察微生物形态,能初步鉴定微生物是否是所检验的目标菌。革兰氏染色的操作步骤:涂片—初染—媒染—脱色—复染,整个过程中最重要的是涂片,涂片过程中必须严格无菌操作,避免杂菌混入,影响镜检结果。5、空白对照根据《GB4789.2-2016 食品安全国家标准食品微生物学检验菌落总数测定》,将营养琼脂培养基倾入加有1mL空白稀释液灭菌培养皿内作空白对照。空白对照的结果可以说明三个问题:① 检验过程中所使用的检验用品灭菌是否彻底;② 无菌室的空气条件是否达到标准;③ 操作人员的无菌操作技术是否规范。通过空白对照的结果可直接检验出实验器皿、实验条件以及实验人员的操作是否达到无菌操作的要求。只有空白对照结果符合要求,实验结果才是有效的。随着我国经济的快速发展,我国人民的生活水平迅速提高,人门对食品的质量提出了更高的要求,食品微生物检验工作是保证产品质量的重要工作。而无菌操作技术是食品微生物检验工作作的重要环节,研究食品微生物检验过程中的无菌操作枝术。操作人员在进行微生物检验时,一定要树立无菌操作观念,规范无菌操作程序,才能保证检验流程顺利完成。同时,操作人员要根据实际需要,合理运用无菌操作技术,避免在微生物检验中,引入杂菌,影响检验结果的真实性、准确性。
  • 微生物检测| Ebio Reader 3700飞行时间质谱系统在微生物检测中的应用
    基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)是一种软电离生物质谱,具有操作简便、结果高准确性、检测速度快和低成本等优点,目前已成为可靠的微生物快速鉴定技术,在微生物领域有着十分广泛的应用。 东西分析作为国产商品化质谱仪开拓者之一,对质谱仪技术及应用的开拓从未停止脚步。并在质谱仪器研发、生产与应用方面拥有丰富的经验和技术沉淀,2017年,东西分析推出MALDI-TOF 质谱-Ebio ReaderTM 3700M飞行时间质谱系统。Ebio ReaderTM 3700M飞行时间质谱系统Ebio ReaderTM 3700M飞行时间质谱系统是东西分析仪器有限公司开发的一款以MALDI-TOF为平台的多功能生物信息阅仪。它是一款多用途多功能的生物检测平台,既可以用于临床医学检测,也可以用于非临床领域诸如食品安全,非法添加,疾控,工业微生物等检测。 原 理 每种微生物都有独特的蛋白质组成。MALDI-TOF MS正是这样一种基于蛋白质检测的微生物快速鉴定技术。其原理是利用质谱技术将蛋白质按分子量大小排列形成独特的指纹图谱,通过测定某一细菌的蛋白质组成,并将特征峰与数据库中的参考谱图对比,即可对细菌进行准确的鉴定。 由此可见,数据库的种类谱图等成为制约MALDI-TOF MS的重要因素。Ebio ReaderTM 3700M拥有强大数据库,包含有4000余种微生物, 包括多种临床致病菌,能够实现菌种的实时鉴定,无需上网检索鉴定;其搭载的神经网络人工智能算法,可对基因型相近的难辨菌(大肠杆菌和志贺氏菌)进行准确区分。同时具有自建库功能,可根据用户的实际情况建立自己的特有菌种库。 应 用 (一)大肠埃希菌和志贺菌的鉴别大肠埃希菌和志贺菌是具有高度传染性、危害严重的革兰阴性肠道致病菌。这两种菌在菌落形态及生物学特性方面非常相似,常规的临床鉴定方法很容易混淆,即使通过16SrRNA测序也无法准确区分。Ebio ReaderTM 3700M利用具有深度学习分析功能的神经网络人工智能软件,可以实现对大肠埃希氏菌和志贺菌的准确区分鉴定。大肠埃希菌,福氏志贺菌和两种混合菌的指纹图谱人工智能算法准确鉴定难辨菌种(二)菌种鉴定MALDI-TOF MS不仅可以鉴定细菌,还可以用于细菌分型,亚种识别等。样品处理在Eppendorf 管中加入300µl 纯净水,挑取适量(5~10mg)菌体,混匀,再加入900 µl 无水乙醇,混匀后以12000r/min 离心2min,弃去上清液,待管中残留液体彻底干燥后,加入50µl 70% 甲酸,混匀,再加入50µl 乙腈,混匀,同样以12000r/min 离心2min,吸取上清液,与等体积的基质溶液(CHCA)混合,然后涂布于96 孔样品板上,自然晾干后进样。用校准品对仪器进行质量轴校正,随后利用Ebio ReaderTM 3700M质谱仪进行样品检测。仪器条件实验结果Ebio ReaderTM 3700M分析样品的质谱图根据所得图谱与数据库参考谱图匹配程度,软件可以计算得到分值。根据质谱仪鉴定分值,1.7时,结果高度可信。本实验中检测的样品质谱结果得分2.3,表示高属水平鉴定,可能的种水平鉴定。(三)地氯雷他定口服溶液药品中洋葱伯克霍尔德氏菌洋葱伯克霍尔德菌是一种无条件致病菌,可引发包括肺炎、败血症、心内膜炎、伤口感染、脓肿在内的多种感染,死亡率95%,被越来越多的制药企业和药监管理系统所重视。《中国药典》2020版也新增洋葱伯克霍尔德菌检查指标。菌种培养菌悬液制备:在生物安全柜内,将洋葱伯克霍尔德氏菌冻干粉溶于胰酪大豆胨液体培养基中,在32℃的电热恒温培养箱中培养,备用。样品制备1. 菌种阳性对照:在生物安全柜内,将洋葱伯克霍尔德氏菌冻干粉溶于胰酪大豆胨液体培养基中,在32℃的电热恒温培养箱中培养,备用。2. 地氯雷他定口服溶液:取三个批次地氯雷他定口服溶液溶于胰酪大豆胨液体培养基中,置32℃电热恒温培养箱中培养;3. 地氯雷他定口服溶液+菌种培养:取三个批次地氯雷他定口服溶液和已制备的菌悬液溶于胰酪大豆胨液体培养基中,置32℃电热恒温培养箱中培养;蛋白提取量取适量的待测样品,以5000r/min 离心5 min收集沉淀物,加入300µl 纯净水,混匀,再加入900 µl 无水乙醇,混匀后以12000r/min 离心2min,弃去上清液,待管中残留液体彻底干燥后,加入50µl 70% 甲酸,混匀,再加入50µl 乙腈,混匀,以12000r/min 离心2min,吸取上清液。点样移取经上述方法处理后的上清液,与等体积的基质溶液(CHCA)混合,然后涂布于96 孔样品板上,自然晾干后上仪器分析。仪器条件质谱仪器参数如下:正离子模式,检测范围:2000 Da~15000 Da;激光点击数:每图谱 200;激光频率:20 Hz;离子源加速电压:20 kV。每次实验前用校准品对仪器进行质量轴校正。结果Ebio ReaderTM 3700M分析洋葱伯克霍尔德氏菌的质谱图地氯雷他定口服溶液的质谱图地氯雷他定口服溶液+菌的质谱图从口服液质谱图和口服液+菌质谱图对比可知,地氯雷他定口服溶液中不含洋葱伯克霍尔德氏菌。(四)食源性致病菌检测一般所说的致病菌指的是病原微生物中的细菌,常见且危害较为严重的食源性致病菌有鼠伤寒沙门菌、副溶血性弧菌、大肠埃希氏菌、单核细胞增生李斯特氏菌等。基于Ebio ReaderTM 3700M飞行时间质谱系统,东西分析可提供食源性致病菌高通量、高自动化解决方案,高效地为食源性疾病诊断提供有价值的检测结果。伤寒沙门氏菌、大肠埃希氏菌、单核细胞增生李斯特氏菌、副溶血性弧菌质谱图结 论MALDI-TOF MS是一种非常有前景的微生物鉴定方法,它具有很明显的准确性和高效性,尤其在临床使用中,常规微生物鉴定需要经过较长时间的培养,而且过程比较繁琐,费用较为昂贵。但是MALDI-TOF MS短的可以几秒出结果,而且成本较低,可以更多的惠及患者。
  • 第六届微生物检测与控制技术交流会在上海举行
    病原微生物引起的食源性疾病已成为影响食品安全的重要原因之一,是食品安全的重大隐患。如何有效控制微生物污染已成为把控行业健康发展的重要因素。为进一步指导检测相关人员更好的理解和应用最新的食品微生物学检验相关国家标准,加强食品行业微生物检测与控制,中国检验检疫科学研究院与食品伙伴网于2016年7月28日-29日在上海联合举办 “2016第六届食品微生物检测与控制技术交流会”。会场掠影部分发言内容其中辽宁出入境检验检疫局郑老师主讲的“食源性致病菌耐药性检测及溯源研究”得到了广泛关注。目前,抗生素大量无节制滥用日趋严重,人类耐药细菌感染率呈上升趋势,食源性致病菌耐药性问题日益突出。因此,细菌耐药性检测对准确掌握细菌对抗菌药物的耐药动向和耐药性变迁,并指导临床合理用药具有重要的意义。MIC多点接种仪为细菌耐药性实验专用仪器,可以在9秒钟内自动进行并完成接种,打破了传统人工接种模式,采用机械接种,实现接种过程的高自动化,使接种过程简单、快速、准确。(下图为天津恒奥HMI-60&24多点接种仪)我公司展出仪器(全自动菌落计数器、多点接种仪、拍击式均质器等)
  • 美生物公司升级血液检测技术,或有助于阿尔茨海默病早筛早诊
    当地时间4月10日,据行业媒体Fierce Biotech报道,美国生物诊断公司C₂N Diagnostics在2023年阿尔茨海默病与帕金森病及相关神经系统疾病国际会议(AD/PD2023)上展示了两项关于PrecivityAD2血液检测的研究,都显示了该检测方法用于测量大脑中淀粉样蛋白斑块的能力。淀粉样蛋白斑块被认为是阿尔茨海默病发展的标记。AD/PD2023于3月28日至4月1日在瑞典举行,会议聚焦阿尔茨海默病和帕金森病的新研究和新发现。阿尔茨海默病(Alzheimer disease,AD)是一种起病隐匿的进行性发展的神经退行性疾病,临床上表现为记忆障碍、失语、失用、失认、视空间技能损害、执行功能障碍以及人格和行为改变等全面性痴呆症状,病因迄今未明。虽然阿尔茨海默病患者在老年期和老年前期才会出现认知功能减退和行为异常,但相关风险因素在发病之前就开始积累。临床上的共识是,早筛早诊很重要。阿尔茨海默病通常可以通过磁共振成像(MRI)、正电子放射断层造影术(PET)、脑脊液Aβ和Tau蛋白的浓度等手段检测出来,但由于脑脊髓液检测侵入性高,影像学费用昂贵,因此并未在常规临床实践普及。目前全球阿尔茨海默病检测的研究进展主要集中在症状出现之前的血液生物标志物检测,和脑脊液、影像学相比,它具有侵入性低,更经济、扩展性更强等特点,更适合常规临床应用。2020年10月,C₂N Diagnostics推出了PrecivityAD血液检测,使用质谱法测量淀粉样蛋白Aβ42和淀粉样蛋白Aβ40,并寻找阿尔茨海默病的另一个潜在致病因子——载脂蛋白E(ApoE)。C₂N Diagnostics的算法使用患者产生的Aβ42/40比值和ApoE基因型来计算他们的淀粉样蛋白概率评分(APS),表明他们患有阿尔茨海默病或有患上这种疾病的风险。不过还需要后续测试才能做出明确的诊断。此次C₂N Diagnostics报告的两项研究针对的是PrecivityAD血液检测的扩展版本——PrecivityAD2。该检测结合了Aβ42/40比率和另一个比率——p-tau217,即磷酸化tau217/非磷酸化tau217,C₂N Diagnostics将检测结果表示为APS2。C₂N Diagnostics公司表示,纳入tau蛋白检测可以提高该检测方法确定患者脑淀粉样斑块是阳性还是阴性的能力。在美国,几乎每个州都可以通过处方进行一次PrecivityAD检测,但PrecivityAD2检测仍然仅用于研究用途。C₂N Diagnostics根据C₂N Diagnostics于2023年4月4日发布的新闻稿,第一项研究由瑞典斯科讷大学医院(Skåne University Hospital)和隆德大学(Lund University)的神经学家塞巴斯蒂安帕尔姆奎斯特(Sebastian Palmqvist)博士和奥斯卡汉森(Oskar Hansson)博士领导,研究纳入了307名表现出认知障碍症状的瑞典患者,平均年龄为76岁,每位患者都接受了PrecivityAD2测试以及另外两个当前临床应用的阿尔茨海默病筛查方式之一——脑脊液(CSF)分析或淀粉样蛋白PET扫描。与其他测试的结果相比,PrecivityAD2血液测试的APS2结果的AUC(曲线下面积,反映血液中APS2的浓度)达到了94%,而且还有助于改善医生的诊断。C₂N Diagnostics新闻稿称,当APS2结果未被纳入诊断过程时,初级保健医生准确诊断出阿尔茨海默病的概率为60%,过度诊断率为23%,诊断不足的概率为17%。“初级保健医生仅凭护理标准诊断的正确性很低,这突出表明他们完全意识到初级保健中目前可用的阿尔茨海默病诊断工具是不够的。我们所看到的结果表明,诊断工具缺乏的现状可能会随着AD血液测试的出现而发生根本性的变化。”领导这项研究的神经学家帕尔姆奎斯特博士在新闻稿中说,“相比其他CSF生物标志物测试,PrecivityAD2的数据是我见过的血液测试中相关性最高的。”第二项研究将PrecivityAD2测试与其他阿尔茨海默病血液生物标志物测试做了头对头的比较,其针对的是没有认知障碍迹象的个体。该研究由美国威斯康星大学麦迪逊分校(the University of Wisconsin-Madison)阿尔茨海默病研究中心的博士候选人卡莉科迪(Karly Cody)领导。该研究使用几种血液检测来分析281名认知未受损者的阿尔茨海默病风险,发现PrecivityAD2在脑淀粉样蛋白斑块检测中的诊断准确性最高。随后,研究人员进一步研究了使用基于血液的生物标志物来检测血浆生物标志物与认知状态随时间推移的关联,291名认知未受损的个体(平均年龄59岁)接受了血液检查和纵向认知随访(平均8.2年),研究发现PrecivityAD2血液检测中的p-tau217比率升高是认知能力下降的最佳生物标志物。C₂N Diagnostics是一家分子诊断公司,成立于2007年,旨在改变阿尔茨海默病和相关形式的神经变性的早期诊断和早期治疗。该公司由美国华盛顿大学(University of Washington)医学院的大卫霍尔茨曼(David Holtzman)博士和兰德尔贝特曼(Randall Bateman)博士以及美国技术研究和商业化公司LifeTech Research团队共同创立。
  • 低价孜然被曝掺疑似鸡饲料 或含致病细菌(图)
    低价孜然被曝掺疑似“鸡饲料”  近日,有读者向本报报料,称在顺义区顺鑫石门农产品批发市场,有商铺出售疑被染色的孜然。记者调查发现,该店还出售另一种被掺入其他物质的孜然,比正常市场价格便宜一半。业内人士称,该种孜然里可能被掺入了俗称“料子”的人工合成物,其成分与鸡饲料极为接近。   疑被染色的孜然(左)  正常孜然(右)     顺鑫石门农产品批发市场一商铺内,执法人员正在包装疑似被染色的孜然,准备送检。  27日下午,北京顺义区工商局对该店出售的孜然进行查封,并将样品送往相关部门检验。  商户  加该种孜然的肉串牙碜  经营烤羊肉串生意的刘先生回忆,6月21日,他以每斤15元的价格,在顺鑫石门农产品批发市场的一店铺购买了6斤孜然。但回到店里,发现烤出来的羊肉串味道不对。  “我烤了三年羊肉串,味道不对能吃出来。”刘先生说,他发觉烤出来的羊肉串“吃了牙碜”。  刘先生表示,他觉得可能是新买的孜然出了问题,便决定用水洗一下。“一洗就出事了。”刘先生称,洗过孜然的水变成了浑浊的绿色,并出现白色的粉末状沉淀物。为此,他怀疑这种孜然经过了染色和加工。  业内人士  添加成分接近鸡饲料  随后,记者来到这家店铺,发现除了刘先生所买的那种15元一斤的孜然外,该店还出售另一种孜然,每斤只需7.5元,购买需提前预约。用肉眼仔细看这种孜然,可见里面掺有其他物质。该物质呈圆柱状,两头不像普通孜然那样尖,大小与正常孜然相仿,颜色略深。  多名业内人士表示,正规的孜然不会出现泡水变绿和白色沉淀物现象。至于另一种孜然,可能是被掺入了人工合成物。这种合成物业内俗称“料子”,由玉米、麸皮、豆粕等合成,其成分与鸡饲料极为接近。  工商  泡水出现绿色肯定异常  27日下午,接到记者举报后,顺义区工商局食品科负责人与当地仁和工商所执法人员一起,对该店铺进行了现场检查,对店内孜然全部封存,并将样品送往相关部门检验。  现场一位执法负责人表示,目前还不能确定是什么物质导致水变绿,“但孜然泡到水里,出现这种绿色肯定是异常的,具体要等有关部门的检测结果,而另一种劣质孜然,里面的掺杂物肉眼可辨,明显涉嫌掺假。”  劣质、正常孜然浸泡对比  A 疑被染色的孜然  大部分沉在水底,水变成浑浊的绿色,已不透明,刚才略带绿色的孜然完全变成了枯黄色。  B 正常孜然  大部分漂在水面上。水只是变成淡黄色,仍然透明。  ■ 记者调查  6月23日,记者来到顺义区“顺鑫石门农产品批发市场”进行调查。  一进市场内的调料大厅,便能看到过道两侧集中着数十家卖调料的商铺,每一家均有孜然出售,售价均为2元一两,买一斤15元。  【劣质孜然一】 浸泡1小时 瓶底现沉淀  在刘先生举报的该家商铺内,孜然颗粒同样是2元一两,但与市场其他店铺的孜然相比,该店的孜然颜色更绿,棱角不分明,用手指搓一下,明显感觉到有粉末粘手。  记者将在该店购买的孜然(下称A),与其他店内销售的孜然(下称B)进行浸泡对比实验。  取出相同分量的孜然,泡入同样大小的清水瓶中,此时,A大部分沉在了水底,B则大部分漂在水面上。略加搅拌,十秒钟后,浸泡了A的水变成了浑浊的绿色,已不透明,刚才略带绿色的孜然完全变成了枯黄色 而浸泡了B的水只是变成了淡黄色,仍然透明。  静置约1小时后,A的水依旧是绿色,并且底部出现一层乳白色的粉末状沉淀物。  【劣质孜然二】 掺入小颗粒 手捏成粉末  在调查中,该店老板史女士提到,店内还销售一种价格更低的孜然,“里面掺了东西,只要7块5一斤,但放在库里,需要提前一天订货,这种货不敢摆到店里面卖。”  前天,记者联系该店,要求购买5斤“便宜孜然”,店老板表示可以第二天来店内取货。  昨日,记者再次来到该店,老板从店门口堆放的调料角落里拎出来一个塑料袋,“已经称好了,7块5一斤,5斤算你37块钱。”  打开塑料袋,记者发现,这种孜然中掺入了一种肉眼可辨的圆柱状细小颗粒物,大小和颜色均与孜然相似,闻起来也有一种略淡的孜然香气,但用手一捏便成为粉末。放入嘴中咀嚼,没有任何味道。  “我们也不知道掺入的是什么东西,单独卖估计不好卖,你可以把这些东西掺杂在好孜然里面卖就行了。”店老板说,她保证这种东西对人没有危害。  市场内多家店铺经营者表示,的确可以进到价格便宜的劣质孜然,“但现在查得太紧,不敢卖。”  【发帖售假者】 “料子”由玉米麸皮制成  在百度贴吧的“孜然吧”里,有多人专门发帖贩卖造假孜然,并称自己是“专业掺孜然的”。记者谎称要买掺假孜然,根据帖子上留下的电话联系到其中一人。  电话中,该人自称姓王,山东人。王先生说,他们当地管掺入孜然的东西叫“料子”,成分由玉米、麸皮、面团等物制成,做成孜然大小的圆柱形,并染成孜然的颜色。“其实就跟鸡饲料原料差不多,人吃不出味儿来,但是也没有害处。”  “料子一块五一斤,多买可以优惠到一块钱,你买了回去自己掺,掺多掺少自己定。”王先生说。  他同时表示,曾听说有地方对孜然进行二次加工,使劣质孜然看起来品质更好,但他觉得“比较麻烦,懒得学”。  ■ 业内说法  正常孜然收购最低一斤11元  孜然,一种调味品,在我国的主要产地为新疆和甘肃部分地区。  在新疆喀什地区种植了21年孜然的依拉木介绍,孜然的品质分为三种,顶级的孜然为淡绿色,气味浓郁 品质稍次一些的略黄,颗粒较小 而品质最一般的就是普通的土黄色,味道不正,价格也相对便宜,这种孜然在甘肃种得比较多。  “但无论哪一种孜然,泡到水里水都不会变绿,更不会有白色的沉淀物。”依拉木表示,每年7月孜然成熟时,会有人上门收购,“我们卖给这些收购者的孜然都是100%的纯孜然。”  甘肃省民勤县的奥鑫商贸有限公司专门从事孜然的采购与销售工作。该公司聂经理说,由于今年国内孜然种植者减少,导致价格大幅上涨。“现在,新疆孜然收购价约27元一公斤,甘肃孜然收购价约22元一公斤。”  “泡水之后水变绿的孜然,肯定被二次加工过,染点绿色是为了以次充好,掺入白色粉末和人工合成物都是为了增加重量。”聂经理说。  ■ 专家说法  “人工孜然”或含致病细菌  中国农业大学食品学院营养与食品安全系副教授范志红表示,孜然泡水水变成绿色,并且水还不褪色,的确不正常,但具体是什么成分还需要经过相关部门的检测。  范教授同时表示,对于由玉米、麸皮、面团等物制成的“人工孜然”,仅从成分上看,人吃了肯定没有害处。  “但这种类似鸡饲料的东西,在制作中是否经过消毒以及含有多少细菌便不知道了。鸡的肠胃跟人不同,许多细菌鸡吃了没事,但能够使人致病,所以这种东西还是能不吃就别吃。”范教授说。  【采购孜然小贴士】  看 有无明显掺杂,颜色、大小是否一致。  闻 味道是否香醇。  搓 手上是否有粉末残留。  泡 搅拌后,观察水的颜色和浑浊程度。
  • 赛默飞:蛋白质组学技术在病毒感染致病机制的亮点研究
    p style="text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em "strong仪器信息网讯/strong 2020年,新型冠状病毒肺炎在中国和国际的迅速传播引发了全球卫生紧急情况。仪器信息网在密切关注疫情发展态势的同时,也更加关注病毒感染的致病机理等相关研究进展。近年来,组学研究成为生命科学基础研究领域的重点,对于病理、毒理学、药物动力学等具有重要价值,相关高水平学术期刊大量报道了科研人员利用组学技术开展的病毒致病病理学的研究成果,也对于此次疫情的进一步研究具有一定参考意义。/pp style="text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em "基于此,仪器信息网推出了a href="https://www.instrument.com.cn/zt/omics2020" target="_blank"span style="color: rgb(0, 112, 192) "strong“组学技术在病毒感染致病机制中的亮点研究及技术进展”/strong/span/a专题,为广大业内专家及用户介绍基于蛋白组学或代谢组学等多组学技术在病毒感染致病机制中的研究应用及技术进展,增强业界专家与仪器企业之间的信息交流,提供更丰富、更专业的技术文章,谨以此致敬所有奋战在抗疫一线的白衣天使以及幕后深耕的研究学者。/pp style="text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em "从2019年底由SARS-CoV-2引起的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)具有高传染性,新型冠状病毒肺炎在中国武汉的出现及其在中国和国际的迅速传播引发了全球卫生紧急情况。住院患者的总死亡率在2.3%至11%之间。本文介绍了strong基于蛋白组学或代谢组学等多组学技术在病毒感染研究的应用及技术进展/strong。/pp style="text-align: center line-height: 1.75em text-indent: 2em "span style="color: rgb(192, 0, 0) "strong1.靶向蛋白定量方法研究新冠病毒感染蛋白动态变化/strong/span/pp style="text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em "strong1.1 Orbitrap Eclipse高灵敏度平行反应监测靶向定量新冠病毒蛋白/strong/pp style="text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em "最近,研究人员通过使用了赛默飞Orbitrap Eclipse检测SARS-CoV-2病毒蛋白肽段序列,作为潜在的诊断工具,利用easy1200液相和Eclipse质谱使用靶向方法-平行反应监测(PRM)追踪病毒感染Vero细胞样本中几种SARS-CoV-2蛋白的肽段变化。span style="text-indent: 2em "作者最初研究了SARS-CoV-2蛋白PRM实验的检测限,主要是核衣壳(NCAP),这是最丰富的病毒蛋白,因此是比较好的候选测试项目。/spanspan style="text-indent: 2em "Orbitrap Eclipse 的PRM结果显示对该蛋白灵敏度可达到amol级别(大约为0.9pg)。粗略计算表明,这种灵敏度水平应足以检测理论上与约10000个SARS-CoV-2颗粒相对应的蛋白质量。其他SARS-CoV-2蛋白也被发现是PRM靶向方法的良好候选蛋白。/span/pp style="text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em "span style="text-indent: 2em "(参考文献:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.04.23.057810v1)/span/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 417px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202004/uepic/3b037340-0003-46f0-a617-942d85139408.jpg" title="图片 1.png" alt="图片 1.png" width="600" height="417" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em " 图. Orbitrap Eclipse靶向PRM监测SARS-CoV-2病毒蛋白肽段序列/pp style="text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em "此外,作者还进行了整体蛋白质组学分析,在60-90分钟分析时间内,共鉴定出6500种相关蛋白质。这表明蛋白质组学可以用来研究病毒感染宿主细胞的蛋白质组,也是未来新兴的研究工具。/pp style="text-align: center line-height: 1.75em text-indent: 2em "span style="color: rgb(192, 0, 0) "strong2.蛋白质组学研究新冠病毒感染的调控机制研究/strong/span/pp style="text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em "span style="color: rgb(0, 0, 0) "strongspan style="text-indent: 2em "2.1 Orbitrap 高分辨质谱研究病毒宿主相互作用蛋白揭示感染机制/span/strong/span/pp style="text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em "另外一篇研究关于SARS-CoV-2病毒的基因组有29811个核苷酸,编码28-29个蛋白质。它编码的蛋白质之一是蛋白质E,它是一种包膜蛋白,一种有助于形成病毒油泡的结构蛋白。一旦病毒进入细胞,它还将有其他的功能,例如,它附着在蛋白质上,有助于打开和关闭其基因,当E蛋白干扰时,模式可能会改变。span style="text-indent: 2em "据报道,蛋白质E与寄主细胞中的溴多胺蛋白结合,Bromodomain 4(BRD4)是BET亚家族蛋白,通过识别乙酰化组蛋白提供了一个招募平台作用,与非组蛋白靶点相关,除与病毒蛋白复合外,还参与NFKB信号转导、Myc调控。此外,BRD4还与其它bromodomain蛋白存在协同作用,其中一些还可能执行泛素化功能。/span/pp style="text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em "另有一位作者使用QE HFX质谱描述了BRD4相互作用蛋白的分子表型,使用了经BET抑制剂、与BRD4结合的化合物以及可能的其他bromodomain蛋白处理的人类B细胞系蛋白质组。已鉴定的蛋白定位于SARS-CoV-2病毒感染细胞的相互作用重编程途径和复合物中,如下图所示。(A proteomic model of SARS-COV2 infection by comparing the interactomes of BRD4 with BET-inhibition and SARS-COV2 viral proteins – implications for re-purposing approved drugs or ubiquitin-mediated degradation of select candidates)/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 422px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202004/uepic/74611d77-e12d-4700-b696-f209d44d255a.jpg" title="图片 2.png" alt="图片 2.png" width="600" height="422" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: center line-height: 1.75em text-indent: 2em "图.蛋白组学分析SARS-CoV-2病毒感染细胞后BRD4相关互作蛋白/pp style="text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em " strong2.2. Q Exactive HF质谱非标定量技术监控病毒感染细胞实时变化/strong/pp style="text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em "另一篇研究通过使用Q Exactive HF质谱进行鸟枪法蛋白质组学研究,重点是获得SARS-CoV-2感染的相关信息,确定病毒颗粒抗原产生的最佳条件。/pp style="text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em "为了做到这一点,作者用SARS-CoV-2感染Vero E6细胞(MOI 0.01和0.001)。然后他们用LFQ(非标记定量方法)方法在几天内监测感染的实时变化。他们鉴定了3220个Vero细胞蛋白和6个SARS-CoV-2蛋白,其中细胞27388个和病毒94个特异肽段(FDR 1%)。病毒蛋白水平在不同时间点的动态变化表明,SARS-CoV-2蛋白合成在感染后持续增加,在感染第3天左右达到最大值。为了评估MS获得的病毒图谱在多大程度上反映了病毒的产生,作者通过qPCR在同一时间点测量了SARS-CoV-2 RNA分子。他们观察到最丰富的病毒蛋白产量的变化,反映了SARS-CoV-2 RNA分子数量的变化,证实可以使用基于MS的LFQ非标定量监测SARS-CoV-2感染动力学。/pp style="text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em "参考文献:(https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.04.17.046193v1)/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 352px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202004/uepic/edfb0017-9692-44d5-877c-18107180805b.jpg" title="图片 3.png" alt="图片 3.png" width="600" height="352" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: center line-height: 1.75em text-indent: 2em "图. Q Exactive HF质谱进行鸟枪法蛋白质组学研究SARS-CoV-2感染的相关蛋白/pp style="text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em "strong2.3 SILAC和TMT结合多重增强蛋白质动力学方法监控转录组和蛋白质组的变化/strong/pp style="text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em "来自法兰克福大学医学病毒学研究所的Jindrich Cinatl教授和歌德大学医学院的Christian Mü nch教授团队发表的题为“SARS-CoV-2 infected host cell proteomics revealpotential therapy targets” 的最新论文。在本篇工作中,作者建立了感染SARS-CoV-2的Caco-212细胞模型,运用一种新颖的多重增强蛋白质动力学(multiplexed enhanced protein dynamicsme,mePROD)方法进行蛋白质组学分析。能够在高时间分辨率下确定转录组和蛋白质组的变化,加速确证病毒致病性相关的生物途径以及寻找潜在的药物靶标。/pp style="text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em "对感染细胞进行蛋白质组学分析,该策略取决于是否有合适的允许病毒感染的细胞培养模型,以及对蛋白质进行时间感染特征分析的敏感蛋白质组学方法。为了探究潜在的抗病毒药物,作者建立了一个针对SARS-CoV-2高度兼容的细胞模型,在病毒感染24小时后就能迅速见到细胞致病作用(cytopathogeniceffect,CPE)(图1A)。/pp style="text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em "span style="text-indent: 2em "研究人员在病毒感染细胞后的2h、6h、10h和24h,分别用定量PCR技术测量上清液中的病毒RNA拷贝数,发现感染后SARS-CoV-2 RNA数量不断增加(图1B)。这表明病毒在细胞中经历了完整的复制周期,成功建立了功能性的SARS-CoV-2细胞培养模型,该模型可以用于研究细胞中SARS-CoV-2生命周期的不同步骤。/span/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 255px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202004/uepic/74c24851-b71a-4b76-ad3e-48c2c19512b4.jpg" title="图片 4.png" alt="图片 4.png" width="600" height="255" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 323px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202004/uepic/642389b8-9ba3-40e5-a6e4-5384db45b276.jpg" title="图片 5.png" alt="图片 5.png" width="600" height="323" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: center line-height: 1.75em text-indent: 2em "图. SARS-CoV-2 在细胞内快速复制模型。/pp style="text-align: center line-height: 1.75em text-indent: 2em "A, 病毒感染24小时后的细胞形态变化 /pp style="text-align: center line-height: 1.75em text-indent: 2em "B, 细胞上清液中病毒RNA拷贝数的增加/pp style="text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em "为了确定SARS-CoV-2感染的时间分布,如下图所示,作者用SARS-CoV-2单次感染Caco-2细胞后培养2-24小时,并通过mePROD蛋白质组学的方法,即联用新蛋白代谢标记(SILAC)和串联质量标签(TMT)两种标记方法,进行蛋白差异分析。/pp style="text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em "span style="text-indent: 2em "首先,将SARS CoV-2病毒与Caco-2细胞孵育一定时间,在收集样品前两小时,将培养基更换为重标SILAC培养基以标记新合成蛋白质 带有部分SILAC标记的蛋白酶切成肽段,经TMT11plex试剂标记后通过high-pH反相分级,最后借助Easy nLC 1200-Q Exactive HF高分辨质谱平台进行高通量蛋白质组学分析,用以表征宿主和病毒基因表达变化。/span/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 320px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202004/uepic/8ae32504-08dc-4038-a16f-50dfdab799cd.jpg" title="图片 6.png" alt="图片 6.png" width="600" height="320" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: center line-height: 1.75em text-indent: 2em " 图.mePROD蛋白质组学分析流程/pp style="text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em "在三个重复中,我们分别定量到大约4,200种和7,000种蛋白质的相对翻译速率和相对蛋白质水平。主成分分析(PCA)表明,在感染6小时后实验组首次从对照组中分离出来;随着感染时间的延长两组之间的差异越来越大(下图)。/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 455px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202004/uepic/b35166bd-e928-43eb-bf4f-efb68c04e26e.jpg" title="图片 7.png" alt="图片 7.png" width="600" height="455" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: center line-height: 1.75em text-indent: 2em "图.PCA分析结果/pp style="text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em "与SARS-CoV–1病毒类似,许多RNA病毒会降低宿主细胞的蛋白合成;但是实验组与对照组的总体翻译率变化不大,仅在感染10小时后最大降低了23%(下图)。/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 300px height: 486px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202004/uepic/0279f4d2-43c0-4ed1-8af4-000f7abb60d5.jpg" title="图片 8.png" alt="图片 8.png" width="300" height="486" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: center line-height: 1.75em text-indent: 2em "图, 不同时间点的整体翻译速率(N=3)/pp style="text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em "作者将用对所有定量到的病毒蛋白的平均水平作为参照,计算宿主蛋白与其的距离,对最相关的前10%的蛋白进行网络分析。结果显示宿主细胞本身翻译模式的广泛重塑,可能解释了如何避免总体蛋白质合成发生重大变化(如下图所示)。/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 300px height: 408px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202004/uepic/00a705a5-e243-4531-af41-7c8c827accb6.jpg" title="图片 9.png" alt="图片 9.png" width="300" height="408" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: center line-height: 1.75em text-indent: 2em "图.前10%蛋白的通路分析结果/pp style="text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em "在本篇研究中,通过对SARS-CoV-2感染对宿主细胞进行定量蛋白质组分析,确定了由SARS-CoV-19感染调节的宿主细胞通路,并揭示了药物抑制病毒在人体细胞中复制的相关靶通路。感染过程中细胞功能发生了重大调整,SARS-CoV-2重塑了翻译、剪接、碳代谢和核酸代谢等重要细胞代谢途径,并对这些途径相关的小分子抑制剂进行测试。结果揭示了SARS-CoV-2的细胞感染情况,并鉴定出抑制病毒复制的药物,这些结果也将指导开发COVID-19的治疗方案。/pp style="text-align: center line-height: 1.75em text-indent: 2em "span style="color: rgb(192, 0, 0) "strong3.Orbitrap高分辨质谱针对新冠病毒糖蛋白结构研究进展/strong/span/pp style="text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em "strong3.1. Orbitarp Fusion质谱结合冷冻电镜解析SARS-CoV-2 S糖蛋白多糖结构/strong/pp style="text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em "来自CCRC的Robert Woods实验室。通过大量实验生成了在SARS-CoV-2 S糖蛋白上发现的聚糖的三维结构。整个研究基于报道的S蛋白使用赛默飞冷冻电镜cryo_EM 分析3D结构和相关的糖组学数据(利用Orbitarp Fusion 质谱结合分析)。/pp style="text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em "他们进行了分子动力学模拟,以观察多糖的微观异质性对表位暴露的影响。模糊位置为聚糖结构。M9型(绿色),M5型(深黄色),混合型(橙色),复合型(粉色)。/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 300px height: 330px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202004/uepic/def92f5e-20fe-4269-b50d-36aa139f3bf9.jpg" title="图片 10.png" alt="图片 10.png" width="300" height="330" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: center line-height: 1.75em text-indent: 2em "图. SARS-CoV-2 S糖蛋白聚糖结构和多糖微观异质性/pp style="text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em "strong3.2. Orbitrap Fusion Lumos质谱绘制新冠病毒SARS-CoV-2 S蛋白糖基化图谱/strong/pp style="text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em "新型冠状病毒(SARS-CoV-2)中的刺突蛋白(Spike蛋白)是一种高度糖基化的蛋白质,是病毒结合和进入宿主细胞的关键调节因子,也是研发抗体及相关药物的关键靶点。该蛋白的位点特异性N-糖基化修饰(包含糖基化位点以及糖链信息)分析对于了解其功能和药物研发具有重要意义。在中国2020年3月,四川大学华西医院科研团队在生物学预印本bioRxiv在线发表文章“Site-specific N-glycosylation Characterization of Recombinant SARS-CoV-2 Spike Proteins using High-Resolution Mass Spectrometry”针对该蛋白的位点特异性N-糖基化修饰进行深入分析,具体实验流程如下图/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 283px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202004/uepic/0bffa430-0704-4b8e-aa77-7392ed0df0aa.jpg" title="图片 11.png" alt="图片 11.png" width="600" height="283" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: center line-height: 1.75em text-indent: 2em "图.利用orbitrap质谱分析新冠病毒S蛋白N-糖基化流程/pp style="text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em "通过使用Orbitrap Fusion Lumos质谱技术的整合糖蛋白质组学新方法,绘制了新冠病毒SARS-CoV-2重组表达蛋白的所有糖基化修饰位点以及位点特异性的N-糖链组成图谱,如下图所示。/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 816px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202004/uepic/2d19678f-d802-4f1a-9b6e-0b0d883f4334.jpg" title="图片 12.png" alt="图片 12.png" width="600" height="816" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: center line-height: 1.75em text-indent: 2em "图. S糖蛋白位点特异性N糖基化位点修饰谱/pp style="text-align: center line-height: 1.75em text-indent: 2em "span style="color: rgb(192, 0, 0) "strong4.蛋白质组以及代谢多组学研究新冠病毒感染病人血清生物标志物/strong/span/pp style="text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em "strong4.1多组学方法研究新冠肺炎轻重症患者血清中蛋白和代谢物生物标志物/strong/pp style="text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em "西湖大学生命科学学院与合作团队对新冠肺炎患者血液中的蛋白质和代谢物分子进行系统检测,利用多组学方法研究重症患者的血清中存在多种蛋白和代谢物分子变化(Proteomic and Metabolomic Characterization of COVID-19 Patient Sera)span style="text-indent: 2em "并找到了一系列生物标志物,有望为预测轻症患者向重症发展提供导向。a href="https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.04.07.20054585v1" target="_blank"(Proteomic and Metabolomic Characterization of COVID-19 Patient Sera)/a/span/pp style="text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em "实验对99例病毒灭活处理的血清样本进行了安全处理和质谱分析。根据现行临床诊断标准,这些血样被分为对照(健康)组、普通流感组、新冠感染轻症组、新冠感染重症组。运用QE HF质谱对样本的进行蛋白质组和代谢组分析,对血清样本中的蛋白和代谢物的相对浓度进行了广泛全分析,从而揭示了重症患者体内多种独特的分子调控。/pp style="text-align: center line-height: 1.75em text-indent: 2em "具体流程如下图所示/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 211px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202004/uepic/268f6506-b9d2-4d2f-bdad-5f084133fc34.jpg" title="图片 13.png" alt="图片 13.png" width="600" height="211" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: center line-height: 1.75em text-indent: 2em "图.蛋白质组学结合代谢组学围绕新冠肺炎患者队列进行分析流程/pp style="text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em "与对照(健康)组、普通流感组和轻症组相比,新冠肺炎重症患者的样本中出现了93种特有的蛋白表达和204个特征性改变的代谢分子。其中50种蛋白,与患者体内的巨噬细胞、补体系统、血小板脱颗粒有关。研究团队还发现,在新冠病毒感染的重症患者体内,有100多种氨基酸及100多种脂质均出现显著减少。见下图。/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 458px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202004/uepic/0d26783c-de7b-44cf-912b-dca3f55ae057.jpg" title="图片 14.png" alt="图片 14.png" width="600" height="458" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: center line-height: 1.75em text-indent: 2em "图.COVID-19感染后重症患者体内的巨噬细胞、血小板、补体系统的作用通路/pp style="text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em "基于orbitrap质谱技术和机器学习分析方法,短时间内整合蛋白质组、临床、生物、代谢组、计算等多学科数据筛选出重症患者特征性的22个蛋白质和7个代谢物,有望可以辅助现有的诊断分析手段,实现更精准、高效的治疗。/pp style="text-align: justify line-height: 1.75em text-indent: 2em "新型冠状病毒(2019-nCoV)肺炎疫情来势汹汹,牵动着每一个人的心,在这没有硝烟的抗疫战场上,白衣天使和医学研究者就是勇敢的战士。span style="text-indent: 2em "我们整理了基于Orbitrap超高分辨质谱多组学技术在病毒感染致病机制和亮点研究,谨以此文致敬白衣天使和深耕医学研究的学者们,默默付出,勇敢向前,愿望早日完成胜利。/span/ppbr//pp style="text-align: right "投稿来源:赛默飞色谱与质谱/ppbr//ppbr//p
  • 揭秘中国人群肾癌关键致病基因:复旦交大团队发文《自然· 通讯》
    如多数肿瘤一样,肾癌的分子分型是提高肾癌疗效及肾癌精准治疗的关键。美国临床肿瘤蛋白质组学会(Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium, CPTAC)曾公布了103例透明细胞肾癌患者的蛋白质基因组学特征,为欧美国家的肾癌精准治疗提供了依据。但该数据来源于西方肾癌患者,同国内的患者存在差距,该研究并不能满足国内肾癌临床和基础研究中的迫切需求。复旦大学丁琛教授团队、叶定伟教授团队和上海交通大学赵健元教授团队联合对232例本土肾癌患者人群的肾透明细胞癌(Clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)进行了分析 ,综合蛋白组、基因组并结合患者临床病理特征和生存数据,描绘了中国透明细胞肾癌的蛋白质基因表达图谱,揭示了中国人群肾癌关键致病基因变异。为更优的诊疗提供了依据。该工作发表于《自然通讯》1。下图描述了该研究的整体思路和方法。Fig. 1a: Schematic representation of the multiomics analyses of ccRCC, including sample preparation, protein identification, WES, and function verification. 其中WES(全外显子组测序)是关键数据之一。作者在文中特别提到,该工作分别使用了IDT埃德特公司的DNA建库试剂盒(原Swift Biosciences*)、接头、外显子WES panel以及定制探针,并使用到了贝克曼库尔特的SPRIselect (Beckman, B23319)进行了文库的纯化。* 2021年3月,IDT埃德特完成对于Swift Biosciences公司的收购。IDT埃德特公司的相关产品:1. IDT xGen cfDNA & FFPE DNA 建库试剂盒(卓越版)使用该试剂盒可对cfDNA样本或FFPE组织提取的 DNA 样本进行灵敏、准确的变异检测。使用该试剂盒的专用连接法,可使转化率达到最高并抑制接头二聚体形成。在单链连接期间引入特异性分子标签 (UMI) 序列,便于采用多种去重和纠错法。2. 原Swift Accel-NGS 2S Hyb DNA 建库试剂盒(现IDT 2S Hyb DNA 建库试剂盒)利用独特的专利技术,保证样品高效的文库转化率,使得降解样品和低起始量等困难样品(例如FFPE、cfDNA等样品)产出高质量的测序数据。只需≥10 ng cfDNA 或≥ 100 ng gDNA即可进行PCR-free建库流程。独特的5’ 和3’ 修复步骤,针对损伤样品(如物理打断后产生损失)进行修复;对于富含AT/GC的基因组区域覆盖度均一,适用于多种样品类型;优异、高效的文库转化效率使得更多分子进行转化,保持更高的文库复杂度;无需接头稀释,不同起始量也可保持稳定的文库转化效率。3. IDT全外显子捕获试剂盒(xGen Exome Research Panel)IDT全外显子捕获试剂盒(xGen Exome Research Panel)v2由 415,115 条单独合成且经过质控检验的 xGen Lockdown 探针组成。探针组跨越人基因组的 34 Mb 目标区域(19,433 个基因),并且覆盖 39 Mb 的探针空间(即由探针覆盖的基因组区域)。探针组中的所有探针均严格按照 ISO 13485 标准进行生产。探针使用全新的“捕获感知”(capture-aware) 算法进行设计,并进行了专有的脱靶分析,确保实现最完整的设计覆盖度。每条探针均经过质谱法和双定量测量检验,确保探针的质量及在探针库中具有适当的代表性。通过始终如一的深度覆盖,致力于推动临床科学研究。关于贝克曼库尔特的SPRselect:SPRI纯化技术采用顺磁性磁珠、选择性的结合特定大小的核酸,已广泛应用于NGS的纯化及片段筛选等领域,被超200多主流NGS试剂盒推荐,超15,000篇论文引用。相比于传统纯化磁珠,SPRIselect更具备如下优势:1,室温储存。即拿即用、省钱省时:节省昂贵的冰箱空间,更省去大量温度平衡的时间;2,精准的片段筛选,且保证不同批次间稳定性。不论今年或明年,可靠的SPRIselect将始终如一的产出可重复的片筛结果,无需重复测试磁珠比例。如下图所示,不同批次间片筛均值差异不超过2 bp。官方提供片段筛选浓度指引。3,专家首选。已有超40个知名建库试剂盒推荐SPRIselect;超1,000篇论文选用SPRIselect。订购信息参考文献:1,Qu, Y., Feng, J., Wu, X, et. al. A proteogenomic analysis of clear cell renal cell carcinoma in a Chinese population. Nature Communications. (2022). DOI: 10.1038/s41467-022-29577-x
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