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指纹基因分析仪

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指纹基因分析仪相关的论坛

  • 【讨论】快速气相色谱指纹分析仪,你知道多少?

    快速气相色谱指纹分析仪是目前世界上分析速度最快的气相色谱之一,与传统的气谱相比,其最大的优点在于极快速的样品测试过程和简单的数据分析功能。采取resistive heating 对柱温进行控制,它可以提供传统的气相色谱分析,C6-C25石油标样在2分钟内分离完毕;同时采用统计化学计量学的方法来处理数据,大大的降低了数据处理的难度。各种统计分析模型提供了定性、定量的分析方法,为应用气相色谱指纹判断样品品质(如酒类,香精香料等)作判别分析,及产品品质控制,提供有效快捷的方法.快速气相色谱指纹分析仪,你又知道多少呢?1.你使用过这样的气相色谱吗?2.为什么叫指纹分析仪,特殊在哪里?

  • ABI基因分析仪

    ABI基因分析仪是测什么的?它和[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/jp][color=#3333ff]$$PCR[/color][/url]荧光定量有什么区别呢?

  • “非线性化学指纹图谱智能分析仪”——你了解吗?

    “非线性化学指纹图谱智能分析仪”——你了解吗?

    参加第十一届中国国际科学仪器及实验室装备展览会(CISILE 2013)的时候,发现湖南尚泰测控科技有限公司展出了公司的新产品——非线性化学指纹图谱智能分析仪。看了许久,没大明白,请各位不吝赐教!http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2013/05/201305171750_440535_2439370_3.jpg  据该公司相关负责人介绍:  围绕食品和药品的质量安全,国内外广大检测仪器厂家先后开发了许多关于波谱和色谱等类型的检测仪器,这些仪器均基于响应稳态或平衡态的物理和化学体系信号的原理来设计,尽管可用这些仪器测定经过预处理后的部分样本的指纹图谱,但实际应用上还是以样本中特定成分检测分析为主。这些传统的鉴别方法所需时间周期长,分析成本高,程序繁琐,对检测条件要求较高。  湖南尚泰测控科技有限公司在本次展会中推出的“非线性化学指纹图谱智能分析仪”是基于一种全新的指纹图谱技术而制造的新型仪器,其关键技术是一种基于非线性化学反应理论、利用不同化学成分对非线性化学反应的不同影响、通过测定化学反应体系的非平衡信号来获取复杂样品图谱,以实现定性鉴别和定量分析的技术。可应用于食品药品加工、流通及卫生监督、技术监督、工商管理等部门对食品药品原材料、半成品和成品进行真伪鉴别与质量评价,对生产过程进行标准化监控,对终端产品质量进行评价和标识;可对食品药品源进行真伪鉴别和质量优劣评价;也可以用于高校实验室和研究机构非线性化学信息和反应机理研究,以及非线性化学理论与相应高精度分析方法的研究。如下是该公司给出的应用图谱:http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2013/05/201305171757_440536_2439370_3.jpg  据悉,本产品是湖南尚泰测控科技有限公司和中南大学合作开发的。 本产品展出之后引起各方讨论,希望了解这款产品的朋友谈谈这类仪器的应用和发展前景。

  • 非线性化学指纹图谱智能分析仪研制成功

    非线性化学指纹图谱智能分析仪是属于光机电一体化领域的高性能智能化仪器仪表/科学分析检测仪器中特定领域的专用仪器。本项目的关键技术是:一种基于非线性化学反应理论、利用不同化学成分对非线性化学反应的不同影响、通过测定化学反应体系的非平衡信号来获取复杂样品图谱实现定性鉴别和定量分析的技术;智能分析的软硬件设计技术;智能分析的检测条件优化技术。项目产品采用了高性能的精密恒温电极传感系统和微机技术,主要由精密恒温系统、非线性化学反应系统、搅拌系统、配以自行设计制作的精密恒温电极的电位检测系统、数据采集转换系统和微机系统等组成,使得项目产品性能稳定、结构合理、实用简便、快速、准确度高。

  • 【非常有趣】AJHG:基因突变致少数人天生没指纹

    20世纪30年代臭名昭著的劫匪约翰-狄林杰为了不让警方发现犯罪现场的指纹与他的指纹一样,不惜忍受巨大的痛苦,利用硫酸把指纹烧掉。但是对我们来说,没有指纹是一件非常可怕的事情,它会在边界控制和证明身份时造成很多麻烦。科学家目前已经确定可以导致一些人天生没有指纹的基因。http://www.bioon.com/biology/UploadFiles/201109/2011092211413775.jpg皮纹病患者天生没有指纹这种情况被称作皮纹病(adermatoglyphia)或者“入境延期病(Immigration Delay Disease)”,患有这种疾病的人天生手指肚上没有指纹。以色列特拉维夫大学的艾里-斯普雷彻教授获得的最新发现显示,一种基因突变造成这种与众不同的病变。一名瑞士女性试图穿越边境,进入美国,边境控制人员需要收集她的指纹。然而当这位女子告诉他们,她无法满足他们的要求,因为她根本没有指纹时,这些官员感到非常迷惑。这也促使医学界开始注意皮纹病。研究人员对这位女性以及她的另外9名没有指纹的家庭成员进行遗传分析。特拉维夫大学的科学家将存在这种情况的人的基因与没有这种情况的人的基因进行比对,确定基因变异到底发生在哪里。他们发现,SMARCAD1突变影响了指纹的形成。研究发现,没有指纹的人拥有的与皮肤发育有关的这种基因更少。现在科学家将能进一步研究这种基因是如何调控指纹的发展的。与DNA一样,每个人的指纹也是独一无二的,即使是同卵双胞胎也不例外,因此它们也成为破案和国际旅行管理等的重要鉴定工具。它们之所以会被当作确定身份的工具,是因为它们在受精24周后就会发育健全,而且整个一生都不会发生任何改变。目前全球仅有4个记录在案的家庭存在这种情况。斯普雷彻表示,不仅手指上长有带图案的皮肤,手掌、脚趾和足底也长着被称作皮纹的纹路。然而他说:“胚胎发育阶段导致指纹形成和拥有不同图案的因素目前大部分还不得而知。”除了缺少指纹外,这种情况还导致汗腺减少。指纹异常可能也是出现更严重的疾病的一种预警信号。该研究成果发表在《美国人类基因学期刊》上。2009年,一名中国女性通过整形手术改变她的指纹,想利用这种方法非法进入日本。东京警方表示,以前因签证过期被驱逐出日本的林荣(Lin Rong)花了1.5万美元在中国做了这项整形手术。警方认为,这种欺骗行为可能普遍存在,因为中国经纪人进行了大量指纹修改手术。这项手术涉及到摘除拇指和食指上的指纹,然后把它们嫁接到另一只手的手指上。

  • 什么是指纹谱

    “指纹”(fingerprint)作为鉴定起源于19世纪末20世纪初犯罪学和法医学。人的指纹由于生物学上的原因,存在个体的差异。这种差异表现在人身上,体现为指纹具有唯一性的特点,即每个人的指纹(三种基本模式,拱形、环形、和螺纹形)是不一样的,是有特征的。这种特征并不随时间环境的变化而改变,因此,广泛应用于罪犯的识别,特殊证件的制作等。分子生物学告诉我们,人的基因存在共性,即不同生物种群有其特定的DNA组成,同时个体之间存在差异,这种差异在本质上表现为基因的不同,即DNA组成序列的差异。目前DNA分析技术的日益成熟,用DNA鉴别来判断不同人之间的血缘关系应用已十分广泛,如亲子鉴定,尸体身份鉴别,生物种类判别等。其本质的判别同指纹完全一致,不过由于DNA数目的巨大,相同基因序列数目远比不同基因序列的数目大的多,而且作为生物基本组成的基因,由于其稳定性不可能性有很大的差异。因此其判别选择的对象十分重要,应选择特定的变异性相对较大的DNA片断分析,作为特征性的指纹图谱,实际上是在某个点上判别,这个点的判断不影响整体性。在应用于中药的指纹图谱方面,DNA可以作为种属的鉴别,不同植物之间存在的差异性相对较大,鉴别真假较容易,但动物药相对较难,矿物药则不行。其次,可应用于同种植物间,也就是对不同生物隔离的相同类型植物的鉴别,即产地。不过这二种鉴别是对生物学属性的鉴别,虽不受外界过多的干扰,但植物药的次级代谢产物(多为药用部分),更易受环境的影响,二者之间存在不确定因素。因此,我认为DNA作为指纹图谱可应用于种类的鉴别,但植物类别多,研究不够深入。研发成本非常高,在实际的应用方面有相当的距离。不过从长远看,保护我国中药资源,建立基因库,则有其特殊的作用。在中药的分析和研究的过程中发现,植物药是多种化学成分的混合体,其药效不是单一的组份能说明的,是多种活性组份共同起作用的,因此单一活性组份的测定和评价不能说明中药质量的好坏,而且目前很多检测的指标成分不具唯一性,将西药检测的理念完全应用于中药存在以偏盖全,割离整体作用的问题。因此将指纹这一概念引入中药分析,将某一方面有特征性的某种分析来表征中药成分的特性。在这里,指纹这一内涵已发生变化,它不象犯罪学中的指纹强调的个体的“绝对唯一性”,也不是DNA指纹中那种内在的遗传学的特性(它即可以是个体之间的“绝对唯一性”,也可以是种群之间的“唯一性”),而是用一定的方法(如HPLC,GC,TLC,HP[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Yp][color=#3333ff]LC-MS[/color][/url],GC-MS,FTIR,X-ray,UV等),对特定的对象(如中药材,提取物,饮片,注射液等),包括其过程,得到的有特征性的相对稳定的图谱,其可以作为鉴别和质量控制的参照依据。由于中药材的化学成分多是次级代谢产物,易受到产地的环境,气候,耕作等各种因素的影响,不定因素很多,得到有代表性通用的指纹谱实在不易。同时,对相同的对象,采用不同的方法可以得到不同的指纹谱,不能偏废,因为各个方法都有其局限性,只是在实际中某种方法可能更实用,代表性相对强些。总之,我认为在中药范围内,指纹的内涵还需大家共同探讨,其代表性的图谱(图象)应根据具体对象而定,严格的量化是不切实际的,如何模糊识别才是关键。

  • 食品分析仪器分析什么项目

    [font=-apple-system, BlinkMacSystemFont, &][color=#05073b][size=16px]  食品分析仪器分析什么项目,食品分析仪器主要用于对食品中的各种成分、添加剂、污染物等进行检测和分析,以确保食品的质量和安全。具体来说,食品分析仪器可以分析以下项目:  残留物质检测:  农药残留:检测蔬菜水果等食品中的农药残留量,确保食品中农药含量在安全范围内。  兽药残留:检测畜禽肉类食品中的兽药残留,如抗生素、激素等,以保障消费者健康。  重金属:检测食品中的重金属元素,如铅、汞、镉等,这些重金属对人体有害,需严格控制其含量。  营养成分分析:  分析食品中的蛋白质、脂肪、碳水化合物、维生素、矿物质等营养成分的含量,为消费者提供营养信息。  添加剂检测:  检测食品中是否添加了非法或过量的食品添加剂,如防腐剂、色素、香精等,以保障食品的合法性和安全性。  微生物检测:  检测食品中的细菌、霉菌、病毒等微生物的含量,确保食品在加工、储存、运输等过程中未受到微生物污染。  其他有害物质检测:  检测食品中的甲醛、二氧化硫、吊白块等有害化学物质,防止这些物质对人体造成危害。  物理性质分析:  分析食品的硬度、黏度、密度、水分含量等物理性质,以评估食品的品质和储存稳定性。  特定成分筛查:  如三聚氰胺、瘦肉精等特定成分的筛查,这些成分在食品中非法添加会对人体造成严重危害。  转基因成分检测:  检测食品中是否含有转基因成分,以满足消费者对转基因食品的知情权和选择权。  包装材料检测:  检测食品包装材料的成分、安全性以及是否符合相关标准,以确保包装材料不会对食品造成污染。  食品分析仪器在食品生产、加工、储存、运输、销售等各个环节中发挥着重要作用,通过快速、准确的检测和分析,可以及时发现并解决食品安全问题,保障消费者的饮食安全和健康。同时,食品分析仪器也是食品科学研究和技术创新的重要工具,为食品工业的发展提供了有力支持。  需要注意的是,不同类型的食品分析仪器具有不同的检测项目和应用范围,用户应根据实际需求选择合适的仪器进行检测。此外,随着科学技术的不断进步和食品安全标准的不断提高,食品分析仪器的检测项目和应用范围也在不断扩大和完善。[img=,690,690]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2024/07/202407101105331735_1341_6098850_3.jpg!w690x690.jpg[/img][/size][/color][/font]

  • 【盘点】:分析仪器行业的突破

    《科学》杂志盘点了2013年那些领跑科学的十大重要突破。分别为:癌症免疫疗法、大众基因显微手术、脑成像技术、人体胚胎克隆、迷你器官、宇宙射线的来源、太阳能新星、为什么睡觉、微生物与健康、疫苗设计那么各位常常在实验室中的朋友,你们认为2013分析仪器界的突破又有哪些呢?从新的仪器技术到新的试验方法,都可以说说欢迎大家讨论,一起来盘点一下分析仪器界都有哪些突破

  • 便携式全项目水质分析仪功能

    [img=,690,690]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2024/05/202405290946506667_7357_5604214_3.jpg!w690x690.jpg[/img]  便携式全项目水质分析仪,这款科技产品,无疑为我们提供了一种高效、便捷的水质检测手段。它不仅可以对水中的各种成分进行精确的测量,更能为我们提供实时的数据反馈,使得我们可以迅速应对水质问题。  这款分析仪具有多种功能,其最为显著的特点就是其全项目检测能力。无论是常规的pH值、电导率,还是更为复杂的重金属离子、有机物含量等,它都能一一准确测量,让我们对水质的全面情况有清晰的认识。同时,其便携式设计使得我们可以在任何需要的地方进行水质检测,无论是户外的河流湖泊,还是工厂企业的排水口,都能轻松应对。  此外,这款分析仪还具备智能化的特点。它可以根据测量数据自动判断水质状况,对于超出安全范围的水质问题,能够即时发出警报,提醒我们采取相应措施。同时,它还可以与手机等设备进行连接,将检测数据实时传输到我们的手中,让我们可以随时掌握水质情况,便于进行后续的监测和管理。  总的来说,便携式全项目水质分析仪是一款功能强大、便捷实用的水质检测设备。它的出现,无疑为我们的水质监测工作带来了巨大的便利,使得我们可以更好地保护我们的水资源,实现水资源的可持续利用。

  • 【求助】【求助】指纹图谱相关的分析软件

    [color=#8f0197][size=4][font=SimHei][b]【求助】指纹图谱相关的分析软件最近在做一个中药提取物原料和制剂的质量控制方法研究,准备用指纹图谱,查了很多文献才发现,用HPLC测出来的数据,还要经过软件处理,比如:国家药典委员会颁布的中药指纹图谱相似度评价系统2004A版,还有其他公司开发的类似软件等等。哪位朋友有免费的指纹图谱处理软件,共享一下,在此表示衷心的感谢![/b][/font][/size][/color]

  • 食品安全分析仪可以检测什么

    [size=16px]  山东云唐生产的食品安全综合分析仪,采用多功能集成、箱仪一体化设计,以高强度安全防护箱为载体,内部集成多个检测功能,适用于食药监局、卫生部门、高教院校、科研院所、农业农村局、食品深加工企业及检验检疫部门等单位。  食品安全分析仪是一种用于检测食品样品中各种化学、物理和微生物指标的仪器。它可以用于确保食品的质量和安全,防止食品中的有害物质、污染物和微生物对人体健康造成危害。以下是食品安全分析仪可以检测的一些方面:  化学成分分析: 食品安全分析仪可以分析食品样品中的营养成分、添加剂、残留农药、重金属、污染物、食品中的化学反应产物等。  微生物污染: 这类仪器可以检测食品中的细菌、霉菌、病毒等微生物污染。例如,检测食品中的致病菌(如大肠杆菌、沙门氏菌)、霉菌毒素等。  致敏物质: 食品安全分析仪可以检测食品中可能引起过敏反应的物质,如花生、坚果、鸡蛋、牛奶等过敏原。  食品质量评估: 分析仪还可以评估食品的质量特征,如口感、颜色、气味等,以确保食品在储存和运输过程中没有发生质量变化。  食品真实性鉴定: 食品安全分析仪可以用于检测食品的真实性,以防止食品的伪造和欺诈行为。例如,检测酒类、橄榄油等是否掺假。  新型食品成分: 对于新型食品(如基因改良食品、植物提取物等),分析仪可以帮助鉴定其成分和特性。  食品加工过程监控: 在食品生产过程中,分析仪可以监控和控制各种因素,确保产品符合质量和安全标准。[/size]

  • 有哪位小伙伴做过指纹图谱分析呀?

    求助求助本人欲做20个样品的指纹图谱分析,GCMS数据导出后再输入到指纹图谱软件显示格式错误,可是数据格式已经是AIA格式了,还请做过指纹图谱的小伙伴指点迷津

  • 【转帖】中药指纹图谱的构建与解析

    中药是中华民族的宝贵财富,它的疗效已为世人所瞩目。然而众所周知在我国中药材的质量极不稳定,市场也较为混乱。中药的质量问题已成为中药现代化、国际化的一大障碍。 多年以来中药材质量控制基本上是以传统的性状鉴别和显微鉴别确定真伪,以理化鉴别评价优劣。前者属于定性分析且需要鉴定者具有丰富的实践经验,人为影响因素较大,后者只考虑众多复杂成分中的个别“活性成分”,而忽略了中药材诸多成分间的协同作用。随着现代分析技术的发展,把已知的主要或有药效作用的成分,作为指标予以检测控制,比过去有了很大进步.但是从传统中医药理论的观点来看,指标成分的控制难以真正控制中药的质量。国际上已认可用中药指纹图谱来作为控制中药质量的质控模式。用中药指纹图谱监控中药质量,并不要求指纹图谱中的每一个组分都清楚,也不要求对每一个组分都精确测定,但要求图谱具有指纹特征,即要求专属、稳定、实用。中药指纹图谱研究包括中药材或中成药指纹图谱的获得和指纹图谱的分析、应用两方面。本文以近年来国内外在指纹图谱的构建和解析方面的研究为材料,综述了构建和解析指纹图谱的各种方法,并比较了它们的适用范围。 1指纹图谱的构建 目前获得指纹图谱的主要手段是色谱法和光谱法,其中比较常用的有以下几种 1.1 薄层色谱法 薄层色谱法常用于中药中各种成分的鉴定。薄层扫描图谱比目测的层析图谱更为客观准确,具有更好的指纹鉴别意义。运用薄层扫描法已获得了黄连、黄芩等中药的指纹图谱,还获得了高良姜中黄酮类成分的指纹图谱,同时薄层扫描法还可用于成药的分析,如六味地黄丸中各味药的鉴定。但由于薄层板的质量和开放式层析系统等外界因素的影响,会引起一定的实验误差。 1.2 高效液相色谱法 高效液相色谱法是构建指纹图谱的主要方法之一。由于中药成分的复杂性,构建指纹图谱一般采用梯度洗脱,因为逐步提高流动相洗脱能力可获得较多色谱峰,提供更多指纹信息。 配置紫外检测器的高效液相色谱在指纹图谱构建中较为常用,如贾晓斌等采用梯度洗脱制定了复方人参注射液的指纹图谱;赵燕燕等进行白茅根氯仿提取液的指纹图谱研究,由指纹图谱可判定其正伪,但对目前所知的白茅根药材中保肝利尿的主要有效成分葡萄糖和钾盐则无法检测,因此其指纹图谱只能用于定性鉴定其正伪,而不能确定其质量的优劣。应用光电二极管阵列检测器(DAD)构建指纹图谱的研究也较多,如黄芩中黄酮类成分指纹图谱的确定;侯艳鹏等在不同来源旋覆花药材指纹图谱研究中还发现仅比较色谱峰的保留时间是不够的,还需校对峰的紫外光谱是否一致。对于无紫外吸收的中药或其制剂可改用其它检测器,如蒸发光检测器(ELSD)等。如注射用七叶皂甙钠用HPLC分离,用ELSD检测,得到的指纹图谱直观准确地反映了产品质量,但ELSD的使用受样品组分和流动相挥发性的影响。[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Yp][color=#3333ff]液质联用[/color][/url]技术可提供大量信息,符合解决中药复杂体系的要求,已用于指纹图谱的构建中,如桂枝汤A部分指纹图谱的确定及比较;张尊建等采用HPLC-UV-MS法对丹参药材、丹参注射液中间体及丹参注射液进行指纹图谱研究,得到了分离度好的指纹图谱。但由于[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Yp][color=#3333ff]液质联用仪[/color][/url]价格昂贵,推广应用有一定的困难。 液相色谱具有重现性好、稳定性好的优点,适宜于构建指纹图谱。由于药材和成药不能直接进样,需经提取纯化,在考察条件时要避免只对“指标成分”予以考虑,而忽视“非指标成分”,对于中药注射剂应尽量采用直接进样、梯度洗脱,以避免上述偏差。又由于药材中各种成分的吸收波长及对不同检测器的响应不同,在构建指纹图谱也需要加以考察。 1.3 [url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp]气相色谱[/url]法 [url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp]气相色谱[/url]法适合于挥发性药材及制剂的指纹图谱研究。构建指纹图谱时一般使用质量型检测器—氢火焰离子化检测器(FID)。苏薇薇等对中成药乌鸡白凤丸石油醚提取物进行了[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp]气相色谱[/url]分析,获得的指纹图谱可作为乌鸡白凤丸质量评价的标准。钱浩泉等用[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp]气相色谱[/url]法建立了高良姜及其近缘植物挥发油成分的指纹图谱。赵陆华等用挥发油提取器对降香进行提取,用十四醇为内标,建立了降香药材的指纹图谱。在中药复方制剂上,冯毅凡等对华佗再造丸及其主要药味的石油醚提取液进行了[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp]气相色谱[/url]分析,获取其[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp]气相色谱[/url]指纹特征,可作为成药及其原料药真伪鉴别的依据。而GC-MS联用,不仅具有GC的高分离效能,而且兼备了MS鉴定的高灵敏性和准确性。苏薇薇等对45个细辛样品进行了GC-MS分析,经PRIMA法处理,实现了计算机对多种细辛的分类鉴别;魏刚等采用GC-MS法对不同产地广藿香、组织培养广藿香以及超临界提取广藿香、广藿香对照品共21个样品进行主成分分析,并建立了指纹图谱。 1.4毛细管电泳技术 毛细管电泳已用于中草药中生物碱、黄酮/黄酮苷、酚酸、香豆素、醌类、强心苷、葡萄糖异硫氰酸盐等物质的分析。龙虹等报道了金银花、银黄口服液和双黄连的毛细管电泳图谱,均含较多未知峰,指纹特征好;赵霞等以毛细管区带电泳模式,用内标法分析了9种贝母药材中生物碱的含量;王刚力等采用HPCE的MECC分离模式对18个卷柏属植物样品的乙酸乙酯提取物进行测定,建立了18个样品的指纹图谱。由于指纹图谱构建中样品的预处理以获得尽量多的指纹特征为前提,而毛细管电泳可以对大小分子、解离非解离分子同时分析,故适宜中药指纹图谱构建。 1.5红外光谱法 红外光谱法研究指纹图谱可用于药材鉴定,如甘草、延胡索与全叶延胡索、苍耳子与东北苍耳子、粉葛与野葛等药材的鉴别。红外光谱法还用于成药的鉴别,如田进国等对同仁乌鸡白凤丸与消栓再造丸红外指纹图谱的研究,结果两样品都具有独特而稳定的红外指纹图谱,可作为质量控制和真伪鉴别的依据。矿物类中药可直接压片测定其红外光谱,禹余粮有褐铁矿结核和普通褐铁矿两种,两者的化学成分相同,光学性质相似,而其红外光谱有很大区别。红外光谱是由分子的振动—转动跃迁引起的,确定其专属性和特征性有较大困难。 1.6紫外光谱法 紫外光谱是电子光谱,形状变化不大,有时不同的化合物有相似的图谱,专属性差。故紫外光谱法较少应用于指纹图谱的构建中。 1.7分子生物学方法 不同生物体有各自相对稳定的DNA序列,因而可以利用现代分子生物学技术构建DNA指纹图谱。限制性内切酶片段长度多态性(RFLP)技术和随机扩增多态DNA(RAPD)是目前最常用的构建DNA指纹图谱的方法。但RFLP技术繁琐,要求的DNA量大,实验材料必须新鲜,因此其应用受到限制;而RAPD法可以在特异DNA序列尚不清楚的情况下检测DNA的多态性,具有灵敏度高、多态性强的优点,同时分析的是基因型而非表现型,结果不受材料来源、环境因素、样品形态等影响,为干燥药材鉴定提供了更加准确的手段。罗志勇等E361采用RFLP技术,分析了人参、西洋参基因DNA指纹图谱。刘塔斯等采用RAPD方法对3个产地玉竹及其2种混淆品进行分析,准确区分了正品与混淆品。但RAPD法的重复性差等问题引起了许多争议。而且,色谱法与DNA指纹图谱相比其优点在于:不但有特征的体现(各种化学成分的个数和相对位置一保留时间)可作定性鉴别使用,还可体现量的概念。 2指纹图谱的解析 对两张色谱指纹图谱仅靠人们的主观比较很难客观、公正、科学地判断它的相同、相似或不同,往往由于人为的主观误差可能做出不同判断,缺乏科学的评判标准。

  • 元素分析仪主要作用是什么?

    元素分析仪 守护您的爱“可怜天下父母心”,婴儿的大脑发育是由哪些要素决定的呢?是先天的?还是后天的?是按照固定的模式呢?还是有千差万别呢?父母们越来越关心孩子的智力发育,都希望自己的孩子聪明绝顶。但面对失望,父母大多归于没有遗传好的基因,其实大脑的发育是受很多因素影响的,遗传仅仅是一个侧面。我们应该用科学的态度来对待孩子的智力发育,要靠元素分析仪来解答。可以说,元素分析仪是一门高深的学科。而2009(第六届)中国通用分析仪器及实验室装备采购会(红方块科博会)就解开了人们心中的疑问并为广大需求者提供了平台,借此,参加过红方块科博会专业人士表示:微量元素与人体健康的密切关系是当今国际科学界引人瞩目的崭新领域。它们的摄入过量、不足、或缺乏都会不同程度地引起人体生理的异常或发生疾病。微量元素最突出的作用是与生命活力息息相关,仅仅像火柴头那样大小或更少的量就能发挥巨大的生理作用。所谓微量元素,在环境地球化学中,是指仅占地球组成部分的0.01%的60余种元素,它们的含量一般在1×10-8~1×10-88之间。在医学领域,从人体的结构来看,占人体总重量万分之一以下者即为微量元素。 而对这些细小的元素的分析无不依赖于元素分析仪。在红方块科博会上的展出的元素分析仪就备受瞩目,以KRX-BS系列元素分析仪为例,是由光源,光电转换器件,电信号微机处理.运算放大,数字显示,打印结果,几大部分组成。它是将每种元素经过化学试剂处理,发出特定的颜色,按比利定律在仪器上比色,形成信号电压而得出分析结果的,操作十分简单。 元素分析仪宇宙间一切物质都由化学元素组成,人体也不例外。化学元素不仅是组成人体的基本要素,而且在人体生长、发育、疾病、衰老、死亡中起着十分重要的作用。这个世纪是生命科学的世纪,作为医学,长期以来的任务是防病治病。所以元素分析仪是医院、妇幼保健院、卫生防疫站、质检所、环保、高校及科研部门的首选。 相关信息:中国通用分析仪器及实验室设备采购会http://www.hfk99.com/service/expo/detail/758.html中国科学仪器博览会唯一官方网站:www.hfkkj.com2012中国科学仪器博览会http://www.hongfangkuai.com/plus/view.php?aid=2702

  • 【原创】指纹区的基团如何对应分析

    指纹区 1800(1300) cm-1 ~ 900 cm-1区域是C-O、C-N、C-F、C-P、C-S、 P-O、Si-O等单键的伸缩振动和C=S、S=O、P=O等双键的伸缩振动吸收。单键有对应的波数范围吗??应该如何分析呢!!我是新手请大家多多帮忙[em46]

  • 【简讯】指纹检测查明遗留指纹的人是否吸烟和吸毒

    英国科学家近日发明一种新奇的侦察技术,只需对构成指纹的脂肪和皮肤细胞进行化验,便可查明遗留指纹的人是否吸烟和吸毒。 据报道,此技术由英国东英格兰大学和国王大学侦察专家联合开发。他们发现,在指纹上,人们消耗的代谢物堆积在毛孔的汗液里。只要用少量含有金纳米粒子的溶液涂在指纹上,金纳米粒子附着的抗体就能和此代谢物结合起来,要辨别它们通过一种荧光染料标识就可以了。如果此指纹的主人是烟民,荧光就会出现在指纹上。如果在犯罪现场采集到的嫌疑指纹没有存档,此技术可以让警察通过识别他们的生活方式,来大大缩小他们怀疑的对象。 最新的犯罪学研究表明,通过指纹其实可以了解到一个人的许多信息。例如,可以确定他是否吸烟。他们已研制出了一种通过指纹快速识别一个人是否为烟民的技术。据介绍,科学家配制出了一种遇到烟草中所包含的生物碱便会发出辉光的液体。在使用时,只需滴少量液体到指纹上便可迅速得到结果。即使一个人洗手后不久,都能检测出来。 目前,研究人员还在对吸毒人员的指纹进行分析。科学家们希望能够在这部分人的指纹中找到类似的痕迹。通过分析指纹同样可以确定一个人使用的化妆品类型。另外,即使是在刮脸过后5个小时,还是能够通过指纹检测出残留的刮胡膏微粒。 在很多犯罪现场,指纹保存的都不是特别完整,使用传统手段很难获取有关犯罪分子的信息。而这项最新技术的出现将有助于弥补上述缺陷。

  • 【云唐仪器】水产养殖水质分析仪优点

    [img=,690,690]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2024/03/202403220946269470_939_5604214_3.jpg!w690x690.jpg[/img]  水产养殖水质分析仪的优点主要体现在以下几个方面:  一、实时监测与精准数据  水产养殖水质分析仪具备实时监测的功能,能够持续跟踪水体中的关键参数,如pH值、溶解氧、氨氮、亚硝酸盐等。这些数据对于评估水质状况、预测潜在风险至关重要。与传统的水质检测方法相比,分析仪器的使用大大缩短了检测时间,实现了快速响应和及时处理。此外,分析仪器的数据输出具有高度的准确性,减少了人为误差,为养殖者提供了可靠的数据支持。  二、预警与自动化管理  水产养殖水质分析仪的另一大优点是具备预警功能。当水质参数超出安全范围时,仪器会自动发出警报,提醒养殖者及时采取措施。这种预警机制有助于预防水质恶化,减少养殖损失。同时,一些高端的水质分析仪还具备自动化管理功能,能够根据水质数据自动调节养殖环境,如增氧、调节pH等,进一步提高了养殖效率和水质稳定性。  三、节约成本与提高效益  使用水产养殖水质分析仪可以有效地节约成本。传统的水质检测方法通常需要大量的试剂和人力投入,而分析仪器的使用则大大降低了这些成本。此外,通过分析仪器提供的数据,养殖者可以更加精确地调整饲料投喂量、药物使用等,避免了资源的浪费。同时,通过实时监测和预警,养殖者可以及时发现并处理问题,减少了因水质问题导致的养殖损失,从而提高了整体效益。  四、环保与可持续发展  随着环保意识的日益增强,水产养殖行业也面临着越来越严格的环保要求。水产养殖水质分析仪的使用有助于实现环保与可持续发展的目标。通过实时监测和精准调控,养殖者可以最大程度地减少养殖废水的排放,降低对环境的污染。同时,分析仪器的使用还有助于提高养殖效率,减少资源的消耗,推动水产养殖行业的绿色转型。  五、操作简便与易于普及  现代的水产养殖水质分析仪通常具备操作简单、易于普及的特点。养殖者无需具备专业的化学知识或技能,只需按照仪器说明书进行操作即可完成水质的检测和分析。这种普及化的设计使得更多的养殖者能够享受到科技带来的便利,提高了行业的整体水平。  综上所述,水产养殖水质分析仪具有实时监测与精准数据、预警与自动化管理、节约成本与提高效益、环保与可持续发展以及操作简便与易于普及等优点。这些优点使得分析仪器的使用成为现代水产养殖行业不可或缺的一部分,为养殖者提供了有力的支持和保障。随着科技的不断进步和应用领域的拓展,相信未来水产养殖水质分析仪将会发挥更加重要的作用,推动水产养殖行业的持续健康发展。

  • 【求助】指纹图谱聚类分析

    【求助】指纹图谱聚类分析

    具体情况是这样的!我们收集了10批不同产地的药材,然后进行提取,进高效液相,然后得出指纹图谱,算出相似度。然后进行了系统的聚类分析特征峰峰面积数据的标准化: 为了消除不同批次药材含水量和称样量不同对色谱峰面积的影响, 因此将所有批次的峰面积换算成每克干燥品的峰面积。为了消除各指标变化幅度不同对聚类分析结果的影响, 在聚类分析之前要进行数据的标准化处理, 即把每批样品的峰面积数据标准化为均值为0、方差为1 的数值。结果见表2。公式为:http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2011/05/201105151457_294240_2261116_3.jpg其中: xk 表示每批样品中的第k 个峰的峰面积;Σ17j= 1xjk 表示17 批样品第k 个峰的峰面积总和的平均值; sk 表示17 批样品第k 个峰的峰面积的方差。然后把所得数据放到SPSS17.0中,选择分析——分类——系统聚类——打钩了树形图,但是得出的图看不懂,也不知道这样的做法到底正不正确。求各位大虾和童鞋们帮助!

  • cod水质自动分析仪在水质监测中有哪些重要作用

    [b]cod水质自动分析仪[/b]是一种用于在线监测水体中化学需氧量(COD)的自动化仪器。它采用先进的传感器技术和数据处理技术,能够快速、准确地测量水样中的COD值,并将结果输出到计算机进行进一步的数据处理、存储和分析。   [b]cod水质自动分析仪[/b]在水质监测中的重要作用主要体现在以下几个方面:  1、实时监测:它能够实时监测水体中的化学需氧量,为水质监测提供了实时、准确的数据支持。这对于及时发现水质问题,防止水质恶化具有重要意义。  2、自动化操作:采用自动化操作,可以减少人工操作的误差,提高监测数据的准确性。同时,自动化操作也大大提高了监测效率,节省了人力资源。  3、数据分析:不仅可以提供实时监测数据,还可以进行数据分析,帮助研究人员了解水体的污染状况,为水质改善提供科学依据。  4、预警功能:cod水质自动分析仪具有预警功能,当监测到的COD值超过设定的标准时,会及时发出预警,提醒相关人员采取措施,防止水质进一步恶化。  5、环境友好:采用环保设计,对环境影响小。同时,通过监测COD值,可以有效控制水体的污染物排放,保护水环境。  6、广泛应用:广泛应用于环保、水务、科研院所、高校、企业等领域,对于保障水资源安全,保护生态环境具有重要作用。  7、提高公众环保意识:通过监测数据,可以提高公众的环保意识,促进社会的可持续发展。  总的来说,[b]cod水质自动分析仪[/b]在水质监测中起着至关重要的作用。它不仅能够提供准确、实时的监测数据,还能够进行数据分析,预警污染风险,保护水环境,提高公众的环保意识。因此,它是水质监测工作中的重要工具。文章来源:[url]http://www.jslhhk.cn/Article-3618374.html[/url]

  • 【王京宇专家讲座】:4月12日 第四讲:基于无机指纹分析的致病菌检验

    【王京宇专家讲座】:4月12日 第四讲:基于无机指纹分析的致病菌检验

    【专家讲座】:第四讲:基于无机指纹分析的致病菌检验【讲座时间】:2016年04月12日 10:00【主讲人】:王京宇:教授(Ph.D),博士生导师。1982年至2001年先后在原北京医科大学公共卫生学院、加拿大拉瓦尔大学医学研究中心、日本国家研究院从事分析化学及生物化学方面的研究。2001年9月被聘为北京大学公共卫生学院中心实验室主任兼教授。【会议简介】食源性疾病是一个世界性公共安全问题,快速、可靠的常见致病菌检定方法则是解决上述问题的重要途径之一。本课题以化学研究领域的重要分支——金属组学理论为基础,以ICP-MS等仪器为测试工具,检测不同种类细菌中无机元素含量,构建细菌中无机指纹图谱。通过对不同常见致病菌生物无机指纹信号进行系统分析,发掘并提取其无机指纹特征,结合多元统计方法探索应用无机指纹图谱技术对细菌进行分类的可行性。-------------------------------------------------------------------------------1、报名条件:只要您是仪器网注册用户均可报名参加。2、报名截止时间:2016年04月12日 9:304、报名参会:http://www.instrument.com.cn/webinar/meeting/meetingInsidePage/18905、报名及参会咨询:QQ群—171692483http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2017/01/201701191701_668515_2507958_3.jpg

  • 【原创大赛】短柄草全基因组密码子用法分析分析

    【原创大赛】短柄草全基因组密码子用法分析分析

    [align=center]短柄草全基因组密码子用法分析分析[/align]摘要:本研究运用CodonW程序分析了短柄草全基因组的密码子使用特性,并且通过对应分析探讨了若干重要因子对短柄草全基因组序列密码子用法的影响。结果表明短柄草基因组存在高[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp]gc[/url]含量和低[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp]gc[/url]含量的基因,它们在密码子使用上差异较大。Nc-plot曲线表明基因组的密码子组成受到碱基组成的影响;对应分析显示,在DNA水平上发生的核苷酸突变可能是造成短柄草基因组密码子使用偏好的主要因素;同时,基因长度和蛋白质疏水性对密码子的使用也存在一定偏性,但影响程度不大。确定了UUC等27个以G或C碱基结尾的密码子为“最优密码子”,研究结果可为短柄草基因的鉴定、表达、结构、功能等的深入研究提供参考。关键词:同义密码子偏好性,短柄草基因组,对应分析近年来,随着分子生物学的快速发展,许多小基因组的低等生物和高等模式生物的全基因组序列均被测定,为利用生物信息学方法挖掘海量基因组数据提供了便利。密码子是生物体内遗传信息传递的基本环节,是核酸携带信息和蛋白质携带信息间对应的基本规则。在长期进化过程中,任一物种的基因都会逐渐适应宿主的基因组环境,而形成特定的且符合宿主基因组的密码子用法,因此不同生物具有不同的密码子使用模式。以生物基因组数据为基础,研究其密码子使用模式,为深入研究基因的结构、功能和基因组进化,以及指导基因转化等具有重要意义。密码子具有简并性,生物在同义密码子的使用上并不是完全随机的,而是具有一定的偏向性,对有的密码子使用频率高,有的使用频率低,甚至避免使用,这种不均衡使用密码子的现象普遍存在于原核和真核生物中。早在20世纪70年代,人们在研究基因的异源表达时,就已经意识到密码子偏性的重要性[1],随着不同生物基因组数据的获得和各种数据库的构建,更多的研究者对密码子偏性的研究产生了浓厚的兴趣,尤其在分子进化,翻译调控等研究领域,通过对不同物种的密码子使用偏性的大量研究[2~4],发现不同物种的基因在密码子使用上存在着明显的偏性。 短柄草是一种广泛分布于温带地区的禾本科植物,与小麦,大麦和燕麦同属早熟禾亚科,原产于非洲北部,欧洲南部和亚洲中部,包含约10个亚种。该植物为一年生,自花授粉,植株高度15~20cm,生育期70~80d,柄草植株较小,适应性强,不象种植水稻那样需要严格的生长条件。生育期短,籽粒产量较高,一年可以繁殖4~5代,繁殖系数达140左右。未成熟胚和成熟胚愈伤组织诱导率高,农杆菌介导和基因枪介导的转化体系已经建立,胚性愈伤组织分化率90%以上,转化效率最高可达55%左右。基因组小,染色体少,DNA重复序列低,获得突变体容易,突变性状容易显现,具备了模式植物的所有基本特征。加之短柄草基因组序列与黑草麦,小麦,大麦等早熟禾亚科植物高度相似,很多重要农艺性状与温带禾草类植物相似,如株型,穗型,粒型,抗逆性,生长习性和病原菌等,其中麦类作物白粉病菌,条锈病菌和稻类作物瘟病菌都可侵染短柄草植株,引起相应症状[7]。其籽粒不含高分子量麦谷蛋白亚基,低分子量麦谷蛋白亚基也很少,并与小麦一样具有二倍体,四倍体和六倍体,因此短柄草是小麦等基因组庞大的重要农作物理想的模式植物,借此来获得目前小麦等早熟禾类植物中尚缺少的遗传信息和基因共线区,进而对小麦等重要植物进行基因定位,克隆,突变,测序和功能等方面的研究[8]。 目前,在短柄草的生物学、细胞学和遗传学特性方面开展了大量研究,并且其全基因组测序也基本完成[9],为深入研究其密码子用法提供了便利。因此本研究将以短柄草全基因组序列为基础,分析其基因的密码子用法特性和影响密码子使用的因素等,其研究结果将对指导转基因及对基因进行特定分子改造,提高其在短柄草中的表达效率和完善基因预测软件,提高基因预测和基因组注释准确性等均具有重要的参考价值,同时也为深入开展基因结构和功能,分子进化等研究提供理论基础。1.实验材料与方法1.1材料 短柄草全基因组DNA序列来源于短柄草官方数据库(http://www.brachypodium.org/node/8),根据基因组序列的注释信息,获得蛋白编码基因序列,为了减少长度较短的基因变异带来的样本误差,根据国际惯例,去除小于300bp的基因,去除中间不表达的密码子,终止密码子。编写程序提取剩下的蛋白编码基因的CDS(coding sequence)序列。1.2方法用codonw软件计算短柄草全基因组的密码子用法相关参数,主要包括有效密码子数(Effective Number of Codon,ENC)、基因的G+C含量([url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp]gc[/url]%)、[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp]gc[/url]3s%、相对同义密码子使用度(relative synonymous codon usage,RSCU)、氨基酸组分指数(平均亲水性值(gravy))、基因长度即氨基酸数(L_aa)。其中,有效密码子数(Effective Number of Codon,ENC)描述密码子使用偏离随机选择的程度,能反映密码子家族中同义密码子的非均衡性的偏好;其取值范围在20到61之间,即如果每种氨基酸只使用一种密码子则有效密码子数为20,如果各种同义密码子的使用机会完全均等,则有效密码子数为61,数值越小偏性越强。此值是以描述密码子使用偏离随机选择的程度,能反映密码子家族中同义密码子的非均衡性的偏好。基因密码子偏爱程度越大,ENC值越小。RSCU是指对于某种特定的密码子在编码对应氨基酸的同义密码子间的相对频率;[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp]gc[/url]3s%表示同义密码子第三位碱基的G+C的含量。为进一步了解该家族基因密码子使用特征和影响密码子使用的因素,对7个基因的相对同义密码子使用度进行了对应性分析(correspondence of analysis,COA)。2 结果与分析2.1 基因的碱基组成对密码子使用的影响图一 短柄草基因NC值散点图[img=,515,409]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2019/10/201910311236371230_3093_3295053_3.png!w515x409.jpg[/img]2.2短柄草基因密码子使用特性的对应性分析[img=,690,535]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2019/10/201910311237226440_1452_3295053_3.png!w690x535.jpg[/img][img=,690,534]https://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2019/10/201910311237233450_935_3295053_3.png!w690x534.jpg[/img]2.3 确定最优密码子Phe UUU 0.05 (323) 1.23 (19733) Ser UCU 0.22 (990) 1.60 (23834) UUC* 1.95 (13527) 0.77 (12294) UCC* 2.55 (11715) 0.64 (9499) Leu UUA 0.02 ( 93) 0.83 (11755) UCA 0.14 (629) 1.52 (22651) UUG 0.16 (1003) 1.37 (19558) UCG* 1.53 (7023) 0.35 (5159) CUU 0.14 (847) 1.55 (21987) Pro CCU 0.22 (1306) 1.57 (17584) CUC* 3.38 (20676) 0.61 (8661) CCC* 1.35 (7940) 0.47 (5299) CUA 0.07 (452) 0.70 (9983) CCA 0.20 (1184) 1.62 (18078) CUG* 2.23 (13637) 0.94 (13401) CCG* 2.22 (13058) 0.34 (3792) Ile AUU 0.12 (398) 1.41 (21216) Thr ACU 0.10 (401) 1.46 (16515) AUC* 2.76 (9124) 0.70 (10557) ACC* 1.75 (7291) 0.66 (7397) AUA 0.12 (380) 0.89 (13461) ACA 0.12 (509) 1.56 (17636) Met AUG 1.00 (8512) 1.00 (20892) ACG* 2.03 (8478) 0.32 (3563) Val GUU 0.10 (693) 1.67 (23852) Ala [url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp]gc[/url]U 0.14 (1914) 1.65 (26184) GUC* 1.71 (12491) 0.63 (9025) [url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp]gc[/url]C* 1.98 (27398) 0.58 (9131) GUA 0.05 (349) 0.75 (10713) [url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp]gc[/url]A 0.13 (1802) 1.48 (23459) GUG* 2.14 (15605) 0.95 (13562) [url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp]gc[/url]G* 1.75 (24170) 0.29 (4678) Tyr UAU 0.05 (229) 1.28 (14480) Cys UGU 0.06 (194) 1.10 (9360) UAC* 1.95 (8126) 0.72 (8075) U[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp]gc[/url]* 1.94 (6645) 0.90 (7595) TER UAA 0.42 (172) 0.82 (335) TER UGA 1.63 (665) 1.30 (530) UAG 0.94 (384) 0.87 (356) Trp UGG 1.00 (4992) 1.00 (10053) His CAU 0.15 (598) 1.42 (16785) Arg CGU 0.16 (750) 0.85 (6945) CAC* 1.85 (7568) 0.58 (6825) C[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp]gc[/url]* 2.75 (12565) 0.49 (4043) Gln CAA 0.15 (627) 1.05 (20215) CGA 0.11 (500) 0.64 (5273) CAG* 1.85 (7975) 0.95 (18259) CGG* 1.92 (8761) 0.55 (4527) Asn AAU 0.12 (465) 1.31 (26650) Ser AGU 0.05 (235) 1.13 (16754) AAC* 1.88 (7141) 0.69 (13985) A[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp]gc[/url]* 1.52 (7002) 0.77 (11441) Lys AAA 0.11 (552) 0.98 (27077) Arg AGA 0.10 (445) 1.94 (15854) AAG* 1.89 (9406) 1.02 (28423) AGG 0.96 (4387) 1.53 (12516) Asp GAU 0.15 (1344) 1.44 (39136) Gly GGU 0.11 (882) 1.34 (18423) GAC* 1.85 (16539) 0.56 (15322) G[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp]gc[/url]* 2.53 (20795) 0.71 (9826) Glu GAA 0.17 (1437) 1.13 (36292) GGA 0.19 (1522) 1.26 (17423) GAG* 1.83 (15812) 0.87 (27746) GGG* 1.18 (9700) 0.69 (9476) 注:Number of codons in high bias dataset 372333 Number of codons in low bias dataset 915109标注*的密码子是(p 0.01)3 讨论密码子使用偏好是突变偏好、自然选择和遗传漂变等共同作用的结果,与碱基组成、翻译选择压力、基因表达水平、基因长度、蛋白质氨基酸组成、碱基突变频率和模式、mRNA二级结构稳定性等很多因素有关[17]。张晓峰[18]等研究表明,单子叶植物基因组的[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp]gc[/url]含量在同义密码子使用偏性的产生过程中起着决定性的作用,同义密码子使用偏性强烈的基因往往偏爱使用C或G结尾的密码子,且第三位密码子突变往往是密码子偏好性发生变化的决定原因。短柄草基因密码子使用模式的调查表明其中有高含量的[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp]gc[/url],并且[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp]gc[/url]3的含量高于[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp]gc[/url]1和[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp]gc[/url]2。这表明相对于以A和T结尾的密码子而言,这些基因偏好于使用以G或C结尾的密码子。从原核生物到真核生物的基因中,密码子使用偏好是一个被广泛研究的重要进化现象。研究发现,许多因素,比如碱基组成,基因表达水平,蛋白质疏水性等影响着密码子的使用。为了解释密码子使用偏好的起因,也有许多假设被提了出来。其中被广为接受理论是“选择——突变——漂移”模型。该模型认为在对偏好密码子的选择和通过突变-漂移对非偏好密码子的保留之间,同义密码子的使用偏性存在一种平衡。本文的研究结果显示,[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp]gc[/url]3s值与ENC值密切相关,并且基因也位于第一轴线,揭示了碱基组成是影响短柄草基因组中的密码子使用偏好的主要因素。碱基组成是影响短柄草基因密码子使用的主要因素,基因长度和蛋白质的疏水性在短柄草基因密码子使用中也起到了一定的作用,相似的结果在水稻、小麦中被发现[15,19]。本研究发现,在基因长度和[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp]gc[/url]之间存在很强的负相关性。这表明,高[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp]gc[/url]含量的基因越短,密码子偏好就越大。可能的原因是富含AT基因的翻译效率比富含[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp]gc[/url]基因的翻译效率更高,这种效率的差异对长的基因更为重要。通常,全基因组的基因表达值在许多多细胞真核生物中并不能得到,特别是基因表达水平在不同的组织和不同发育阶段不一样时。因此,要定量相当困难。在短柄草基因组中,目前还缺少相当数量的基因表达的准确数据。另外,我们发现[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp]gc[/url]含量特别是在第三个碱基位置的[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp]gc[/url]含量较大的影响着密码子的偏好时,暗示着碱基突变可能是重要因素,同时,碱基突变又受控于翻译选择。所以,尽管基因表达水平影响着密码子的使用,但这影响还是远远小于核苷酸组成对密码子使用的影响。因此,我们没有进一步分析基因表达的影响。通过优化密码子,提高外源基因在微生物、植物、动物中的表达已有不少成功报道,而确定最优密码子可为合理有效进行密码子改造提供可靠信息。本文确定了UUC等27个密码子为短柄草全基因组的最优密码子。分析结果可为指导转基因及对基因进行特定分子改造,提高其在短柄草中的表达效率和完善基因预测软件,提高基因预测和基因组注释准确性等提供重要的参考价值。参考文献[1] Stanley D,Farnden K J F, MacRae E A. 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Plant Physiol, 1985,79(5):867-871 [7] 言普,李桂双.高压对水稻种子细胞膜透性和淀粉酶活性的影响[J]. 浙江大学学报(农业与生命科学版),2007,33(5):174-179[8] Monica M, Sanwo and Darleen A. DeMason. Characteristics of a-Amylase during Germination of Two High-Sugar Sweet Corn Cultivars of Zea mays L[J]. Plant Physiol, 1992,99(8):1184-1192[9] Goldman N , Yang Z. A codon based model of nucleotide substitution for protein coding DNA sequences[J]. Molecular Biology and Evolution,1994,11(9):725-736[10] Schmidt W. Phylogeny reconstruction for protein sequences based on amino acid properties[J]. Mol Evol,1995,41(8) :522-530[11] 时成波, 吕安国.改造稀有密码子提高SEA蛋白表达量[J]. 生物工程学报,2002,18(4):477-480[12] Ghosh T C , Gupta S K, Majumdar S. Studies on codon usage in Entamoeba histolytica[J]. Int J Parasitol,2000,30(6): 715-722[13] Musto H, Cruveiller S. 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  • 【原创大赛】鼢鼠(Eospalax)线粒体基因组测定及注释分析

    【原创大赛】鼢鼠(Eospalax)线粒体基因组测定及注释分析

    [b][/b][align=center]鼢鼠([i]Eospalax[/i])线粒体基因组测定及注释分析[/align][align=center]西安国联质量检测技术股份有限公司[/align][align=center]安平中心:李瑞[/align][b]摘要【[/b]目的】获得鼢鼠线粒体基因组全序列,为线粒体基因组功能标记及进化生物学等研究提供基础资料。【方法】参考鼹型鼠等动物的线粒体基因组序列,设计出可覆盖鼢鼠线粒体基因组的16对引物,采用[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/jp][color=#3333ff]PCR[/color][/url]产物直接测序法测得甘肃鼢鼠线粒体基因组全序列,分析其基因组的特点和基因结构。并结合GenBank中发表的啮齿类动物基因组全序列,探讨啮齿类动物的系统进化关系。【结果】鼢鼠线粒体基因组全长16354bp,其中包括22个tRNA基因、13个蛋白质编码基因、2个rRNA基因和2个D-loop区。碱基组成为33.5%A、24.2 %C、12.3 %G、30.0 %T。【结论】鼢鼠线粒体基因组结构及其信息和其他啮齿类动物的结构一致,线粒体变异保守。研究结果为鼢鼠的低氧适应、系统发育关系等提供了基础资料。[b]关键词 [/b]鼢鼠;线粒体基因组;序列分析 鼢鼠([i]Eospalax[/i])是分布于我国的主要啮齿类动物之一,其体型较小,栖息于洞穴内有挖掘活动,扩散能力强,数量波动大,是生态系统中重要的初级消费者,处于生态系统中的中心位置,草原生态系统中其能流比重很大[sup][/sup]。动物线粒体([color=#333333]Mitochondrion[/color])基因组为双链闭合环状分子[sup][/sup],少数也有线性的,它们具有分子量相对较小、结构简单、缺少重组、母性遗传和进化速率快等特点,已成为动物系统发育与进化、群体遗传学、分子生态学以及疾病机理研究等领域的理想材料[sup][/sup]。甘肃鼢鼠是仅分布于我国西北部的土著物种,其外形似中华鼢鼠,主要分布于甘肃临潭县及其附近地区。目前对线粒体DNA的研究主要在动物分子遗传学、分子生态学、种群遗传结构分析、遗传多样性、物种和品系鉴定、保护遗传学等方面得到了广泛应用[sup][4[/sup][sup],[/sup][sup]5][/sup]1. [b]实验材料和方法[/b]1.1 实验材料鼢鼠:采集于天祝(经度102.84、纬度 37.2)1个群体;鼢鼠解剖采集肝脏及肌肉组织样品,-20℃保存备用。1.2 线粒体DNA的提取用剪刀将肝脏及肌肉材料剪成小块,取0.1cm左右的小块肝脏及肌肉材料,采用常规的SDS/蛋白酶K裂解,酚氯仿提取DNA[sup][/sup],使用琼脂糖凝胶电泳检测其完整性。1.3 引物设计和[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/jp][color=#3333ff]PCR[/color][/url]扩增通过Clustal X1.83比对,寻找相对应保守区域位置,用Primer Premier5.0引物设计软件设计引物,并对每条引物进行评价和修改,最终确定16对引物。以所提取的DNA为模板,用16对引物扩增覆盖整个线粒体基因组。利用引物进行[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/jp][color=#3333ff]PCR[/color][/url]扩增,反应体系总体积为50μL,其中含有6μL [url=https://insevent.instrument.com.cn/t/jp][color=#3333ff]PCR[/color][/url] buffer、3μL MgCl[sub]2[/sub](1.5mmol)、MgCl[sub]2[/sub],2μL dNTPs (100μL mol)、上下游引物各2μL (0.25μL mol)、Taq DNA聚合酶2μL (1U)、总DNA约为2μL (25ng)、去离子水31μL。反应程序为:94℃预变性4 min,94℃变性50s,48-45℃退1min,72℃延伸1 min 30s,循环30次,之后72℃延伸10min,并根据不同引物的退火温度和扩增反应的实际效果进行优化。取 5 μL [url=https://insevent.instrument.com.cn/t/jp][color=#3333ff]PCR[/color][/url]扩增产物,和2 μL DNA marker 2000,进行1.0%琼脂糖凝胶(1×TBE)5V/电泳,用紫外观察[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/jp][color=#3333ff]PCR[/color][/url]产物扩增情况,凝胶成像仪扫描记录结果。1.4 纯化、测序和序列拼接 在[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/jp][color=#3333ff]PCR[/color][/url]产物中加入5 U SAP和2 U ExoⅠ,震荡混匀,37℃保温1 h,然后75℃保温15 min以灭活SAP和ExoⅠ酶,纯化好的模板可以在4℃保存24 h或-20℃长期保存。将纯化后的引物送往上海生工生物技术服务有限公司用ABI-3730序列自动分析仪进行双向测序。利用DNASTAR和测序峰图结果分析软件Chromas 2.22校对测序图,DNAMAN拼接序列。得到甘肃鼢鼠线粒体全基因组全序列。2. [b]结果[/b]2.1 鼢鼠线粒体基因组基因定位2.2.1 鼢鼠线粒体2个rRNA的分析哺乳动物线粒体的rRNA具有高度的保守性,它们的位置固定,12S rRNA位于tRNA-phe 和tRNA-Val之间,16S rRNA位于tRNA-Val和 tRNA-Leu之间,12S rRNA起始位置为68,终止位置为1019,长度为952bp,16S rRNA起始位置为1086,终止位置为2651,长度为1566。同时我们比对了鼢鼠和中华鼢鼠的rRNA基因和蛋白质基因,12S rRNA和16S rRNA的相似性分别为91.0%和87.3%,高于蛋白质编码基因之间的相似性。2.2.3 鼢鼠线粒体基因组结构 除NADH脱氢酶亚基6外均在H链上,虽然鼢鼠染色体数目少、染色体大,但与其它哺乳动物线粒体全基因组相比,它的线粒体基因组的结构与其它哺乳动物是十分相似的。甘肃鼢鼠线粒体基因组结构见图1。[align=center][img=,409,324]http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2017/09/201709081454_02_2904018_3.png[/img][/align]注:ND: NADH脱氢酶亚基(NADH dehydrogenase subunit)、Cox:细胞色素氧化酶亚基(cytochrome oxidase subunit)、Atp:ATP合成酶亚基(ATP synthase F0 subunit)、Cyt b:1个细胞色素b编码基因(cytochrome b)。[align=center][b]图1[/b] 甘肃鼢鼠线粒体基因组结构简图[/align][align=center]Fig.1 The gene organization of [i]Eospalax cansus[/i] mitochondrial genome[/align]3. [b] 讨论[/b] 甘肃鼢鼠线粒体基因组的D-loop区,长度为933bp,比中国地鼠D-loop区(867bp)长。D-loop区对目的基因是不可缺少的,虽然D-loop区不能编码蛋白质但对于遗传信息表达是不可缺少的,在它上面有调控遗传信息表达的核苷酸序列,具有遗传效应的,比如RNA聚合酶结合位点是具有遗传效应的。8只甘肃鼢鼠中有5个单倍型:3只临潭群体共享1个单倍型,2只天祝群体独享单倍型;其余个体均独享单倍型,表明了甘肃鼢鼠线粒体DNA D-loop区碱基变异快、进化快的特性,符合啮齿动物线粒体变异大的现象。随着研究的深入,以线粒体DNA中完整的基因序列或多个基因序列协同而获得遗传信息来探讨物种的系统进化关系,将是以后研究发展的主要方向[sup][/sup]。目前,线粒体DNA已经在许多哺乳类动物的起源进化的研究中取的了重大进展,而对甘肃鼢鼠的起源进化的研究却很少,并且存在着甘肃鼢鼠属于[url=http://baike.baidu.com/view/113192.htm][color=#000000]瞎鼠科[/color][/url]和仓鼠二者之争,因此,为了更好的阐明甘肃鼢鼠的起源,还需要做更多、更深入的研究。

  • 光谱分析仪与元素分析仪对比情况

    一般客户在选购任何检测仪器首先考虑的是检测的精度,性价比和售后服务。机械工业快速发展的今天,只有准确测量钢铁中元素的百分含量。才能使产品达到国家标准。目前钢铁中五大元素已达到读秒水准,称样取样也由原来的定量分析升级成不定量分析,终点颜色由原来的调节换成自动识别。一般钢的五大元素检验整个过程可在几分钟之内完成。可对于有色金属(铜合金、铝合金)的炉前控制非光谱莫属,它的多通道瞬间多点采集的特点保持着光谱分析仪快速的检测出顾客所要检测的元素。仪器的种类很多根据自己企业的需求选择合理的分析仪,华欣元素分析仪广泛的应用于冶炼、铸造、机械、车辆、泵阀、矿石、环保、质检等行业和领域,可以方便快捷的进行原料验收、炉前分析、成品检验等阶段的产品测试。现整理光谱分析仪和ND系列分析仪的对比供客户选择。元素分析仪的优点1.化学分析法是国家实验室所使用的仲裁分析方法,准确度高。2.对于各元素之间的干扰可以用化学试剂屏蔽,做到元素之间互不干扰,曲线可进行非线性回归,确保了检测的准确性。3.取样过程是深入样品中心和多点采集,更具有代表性,特别是对于不均匀性样品和表面处理后的样品可准确检测。4.应用领域广泛,局限性小,可建立标准曲线进行测定,仪器可进行曲线自我检测。5.购买和维护成本低,维护比较简单。碳硫分析仪的缺点1.流程比光谱分析法较多,工作量较大。2.不适用于炉前快速分析。3.对于检测样品会因为取样过程遭到破坏光谱分析仪的优点1.采样方式灵活,对于稀有和贵重金属的检测和分析可以节约取样带来的损耗。2.测试速率高,可设定多通道瞬间多点采集,并通过计算器实时输出。3.对于一些机械零件可以做到无损检测,而不破坏样品,便于进行无损检测。4.分析速度较快,比较适用做炉前分析或现场分析,从而达到快速检测。5.分析结果的准确性是建立在化学分析标样的基础上。光谱分析仪的缺点1.对于非金属和界于金属和非金属之间的元素很难做到准确检测。2.不是原始方法,不能作为仲裁分析方法,检测结果不能做为国家认证依据。3.受各企业产品相对垄断的因素,购买和维护成本都比较高,性价比较低。4.需要大量代表性样品进行化学分析建模,对于小批量样品检测显然不切实际。5.模型需要不断更新,在仪器发生变化或者标准样品发生变化时,模型也要变化。6.建模成本很高,测试成本也就比较大了,当然对于大量样品检测时,测试成本会下降。7.易受光学系统参数等外部或内部因素影响,经常出现曲线非线性问题,对检测结果的准确度影响较大。(选自网络)

  • 【在线分析仪知识普及】说说在线分析仪三…现在的在线分析仪(收集)

    三、现在的在线分析仪(90年代的初期…现在)进入九十年代,新建装置自动化水平也越来越高,对在线分析仪的要求也越来越高,主要变化在三个方面:第一个是数据处理方面:过去的分析仪,只是将分析结果以4…20MA的信号远程传输,在中央控制仪实时显示,操作人员根据显示结果,进行流程调整。而现在,信号传输过去后,输入的是中央数据处理系统。此系统收集所有的温度、压力、流量、物位、阀门定位及分析数据,组成一个物料平衡系统。每一项数据的改变,也就意味着其它数据跟着要改变,以促成一个新的平衡产生。这也就意味着,靠过去的实验室分析的分析结果,在数据上已不能保证它的时效性,没有时效性,分析结果的准确性也就无从谈起。实验室分析结果证明的是过去,在线分析仪分析数据说明的是现在。当然这个现在也是有一定的滞后性的,一般有几分钟。我们缩短的就是滞后时间。第二个方面:分析数据的储存。上一节我说到,中期的分析数据是靠记录仪走纸书面保存的。随着CPU的出现,一些数据显示已经从走纸信号显示发展到数字显示且能储存一周左右的数据啦,可通过软盘,随时下载保存,数据显示开始由书面走进了电子文件显示。分析数据不光能显示,而且可能通过设定高低报警值,来监视数据运行,一旦超限,即可发出声和光报警。发展到如今,分析数据的保存,只要你的硬盘足够大,可无限保存,读取更是不成问题。分析结果的趋势少则查一周,多则查一月,再长,只好调硬盘啦。这对仪器运行判断和流程变化判断都提供了无可比拟的方便。第三方面 仪器更新:仪器信号线也从无屏蔽线变成有屏蔽线,大大降低了信号衰减,分析仪测量数值与中央控制系统上的显示数值基本一致。同时,分析仪器的检测器也在突飞猛进。检测器结构更加紧凑,仪器布局更加合理,小型化趋势也越来越明显。检测器核心材质也发生了很大变化,检测数据更加灵敏,仪器适应性和适应领域也逐步普及。过去一台仪器所占有的空间,现在可以放2台,甚至4台仪器。仪器无论从重量还是体积,都在大幅缩水,而检测性能却呈现数量级式的上升。仪器常规维护量也在大幅下降。例如:过去的电解式微量氧,一个银电极有近30克重,拉直啦,有近十米长,蒸馏水和电解液消耗量大,两到三天就要加液一次,中期的这类仪器,其检测器核心部件…银电极,只有3克左右,网状布局,接触面大,外形只有过去的三分之一,维护保养量不及前者的五分之一;后期的同类仪器,则采用多对电极平衡,仪器测量反应速度快速,偏差小。后期的在线分析仪重在发展仪器的准确、快速、稳定上下了不少功夫。各类仪器都有显著进步,后面咱们分门别类再稍加叙述吧。现在的在线分析仪,广泛应用于石化、化工、炼油、天然气、热电、冶金、化纤、轻工、城市公用工程、环境监测、分析仪器制造、电子、医药生产等多种领域。四、在线分析仪分类

  • 【第四届原创】中药指纹图谱相似度分析之TXT文本导入

    中药指纹图谱相似度分析之TXT文本导入附上药典版《指纹图谱相似度分析》软件,仅供参考学习使用。话说很多同行都无法将高效液相,气相,气质联用跑出来的色谱图导入到指纹图谱相似度分析软件进行分析。目前对谱图相似度分析的软件也只有接下来几个版本:、B版》、药检所版的《中药色谱图分析和数据管理系统》、浙大版的《中药指纹图谱相似度计算软件》及中南版的《相似度分析软件》,在写这边帖子之前,前三个版本我都反复安装试过很多次,第四个一方面需要matlab的只是、另一方我也没有在网上找到资源。最后我选择了使用药典版的《中药色谱指纹图谱相似度评价系统A版》,以下简称(《A系统》)。药典版的《中药色谱指纹图谱相似度评价系统》有A,B版两个版本,即:研究版(2004 A)和检验版(2004 B)。研究版主要用于科学研究工作,具有生成对照图谱功能。检验版侧重于色谱指纹图谱的检验工作,功能简化,不具有生成对照图谱的功能。软件就不详细介绍了,直接进入主题——如何将得到的TXT文件转换成能够导入《A系统》的TXT文件。本系统支持三种格式文件的导入:AIA(*.cdf)文件,文本文件(*.txt)和Scp(*.Scp)格式文件的导入(如图1)。建议采用通用的AIA(*.cdf)格式文件导入(但是我试过导出的AIA依然无法导入,并且AIA文件没办法编辑,也许是能力不够,至今没有找能编辑AIA文件的方法)。注意AIA(*.cdf)文件中应包含样本图谱的峰面积信息,在色谱工作站导出AIA(*.cdf)文件前应现进行积分。否则导出的AIA(*.cdf)文件可能因不包含峰面积信息而无法导入(我用TXT文件试了,没有积分依然可以导入,只是无法匹配,也就是无法进入下一步相似度分析)。文本文件(*.txt)的导入需要采用特殊的格式,可以参考本系统导出的文本文件格式【文后附上标准文本文件格式】。Scp(*.Scp,即Standard Chromatographic Project的简写)是本系统为生成的对照图谱的导入提供的一种特殊的文件格式。我用的是岛津GC-MS跑出来的质谱图试验的,文后附三个版本的分析软件及需要的文档,其他液相气相的没有使用过,也不知道如何导出TXT或者AIA文件,如有知道的,还希望您不吝赐教)第一步,导出text文件,做好准备工作打开GCMSSolution软件,导出你需要处理的图谱(如图2),当然如果要导出AIA文件,也可以如图3那样导出。但是只能导出AIA文件,无法导出TXT文件。 那么如何导出TXT文件呢,莫着急,且看下文 如图4,右键点击*.qgd,在出现的菜单里点击文件转换,是不是发现原来可以转出很多种格式?ASCII文件转换出来的即为TXT文件,其他四种无需多介绍,包括的信息应该都是一样的。 点击“ASCII文件转换”,如下图4,点击输出项目,里面有很多选项,当然相似度软件分析的只用两个就可以了,即“定性峰表”和“色谱图(TIC/MIC)”,可以同时选择两项,这样导出到一个TXT文件里;当然也可以分别选择,导出到两个TXT文件里(如图5)。(个人建议导出到两个TXT文件里) 这样导出的TXT包括了两部分:定性峰表信息(峰序号,保留时间,开始时间,结束时间,Mass,峰面积,峰高,峰面积/峰高等信息)【后文称(积分数据)】和色谱图信息(时间,信号,相对信号三列)【后文称(色谱图数据)】。导出的两个TXT文件,这两部分就分别在一个TXT里,导出的一个TXT文件,那么前面是定性峰表信息,后面是色谱图信息。这样我们需要的TXT文件就导出来了,这样的TXT是无法导入《A系统》的,它会提示提供的信息格式错误。俗话说:万事开头难,那么你也成功了一半了。接下来,就是编辑信息了,使之让《A系统》采纳。第二步,编辑text信息,使之为《A系统》采纳在进行编辑TXT信息之前,还需要这么一个小小的插曲——做一个Excel来提取你所需要的信息。新建一个Excel文件,分别给三个工作表名称改为:色谱图数据,积分数据,我要的数据(如图6)。 将导出的TXT文件分别打开(我是导出的两个文件,这样选择时可以用Ctrl+A快速选择),将色谱图数据全部复制到Excel中的色谱图数据表,积分数据导入到Excel中的积分数据表。那么,到现在,我们需要的数据也都导入到Excel中去了。接下来就是懒人想出来的办法了。 进入第三个工资表,也就是“我要的数据”中,编辑公式,提取有用信息。一般同一批色谱图导入到Excel中的积分数据和色谱图数据前面几列都不会改变的,如图7中的方框部分(○1为色谱图数据表,○2为积分数据表)有用的数据就是色谱图数据中的时间列(即本例中的第一列)和信号列(即本例中的第二列)及积分数据中的峰序号(即本例中的第一列)、保留时间(即本例中的第二列)、峰高(即本例中的第七列)和峰面积(即本例中的第六列)【一共六列】。那么在“我的数据表”中就提取这些信息即可。如图8PS:文后附上例子中的Excel表,熟悉的可以自己编辑,不熟悉的也没关系,看了就能懂。 好了,小插曲结束,继续正题。 首先,新建一个TXT文件,用以存储你提取的有用信息。命名好后(TEST1.txt),分别按照标准文本文件格式的信息输入,及先把指纹图谱采样号数据(即色谱图数据)复制粘贴到TEST1.txt文件中,然后再后面复制粘贴上指纹图谱积分数据(即积分数据)。这样就把TXT文本的信息编辑好了,那么接下来应该做什么呢?导入《A系统》试试,对就是这样的。我们导入进去试试,结果奇怪的事情发生了,怎么会多一条直线呢,如图9。接下来的就是第三部需要解决的问题,最关键也是最简单的一步第三步,删除作怪空格,给图以原貌 将text1.txt打开,发现有图10的四行中文字,它没有错,错就错在图11,也就是它在作怪。是不是发现指纹图谱积分数据那两行都多了很多空格,删除。再导入到《A系统》试试,得到图12的结果是不是发现自己很厉害,祝贺你,成功了。就是这样编辑的。但是图12看起来你可能也会觉得很奇怪,后面那么多空白,没关系,图都能够弄出来,还怕这点小问题吗?重启《A系统》,重新导入,看看图13.恭喜你,可以开始做图谱相似度分析了。因已毕业并未从事相关工作,很少上这个网站了,如有疑问,可进QQ群:336852907,Q群有相关资料*另外,鄙人才疏学浅,非所有问题都能解决请教于人先尊重于人

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