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肽测序仪

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肽测序仪相关的资讯

  • 罗氏关闭454测序业务 454测序仪将逐步淘汰
    据外媒2013年10月15日消息,罗氏公司证实其正在关闭454生命科学测序业务,并裁员约100名。  罗氏在给GenomeWeb的声明邮件中说,&ldquo 454测序仪将在2016年中被逐步淘汰,454位于康涅狄格州布兰福德的工厂也将因此而关闭。&rdquo   裁员100人将在未来三年中实施,&ldquo 对于因此受影响的员工,罗氏致力于寻找具有社会责任的解决方案,&rdquo 它补充说。  直到该业务被关停,罗氏还将提供454仪器、零部件、试剂和耗材的服务和支持。  罗氏表示,&ldquo 测序是一个快速发展的技术,随着测序部门在建立一个多元化潜在测序技术的努力,罗氏致力于引入差异化和竞争力的产品推向市场,并为生命科学和临床应用提供测序产品。&rdquo   罗氏在2007年以1.55亿美元现金和股票从CuraGen收购了454,当时罗氏说,这笔交易将巩固454测序仪的成功,并使其能够用于体外诊断应用。收购454之前,罗氏从2005年开始就是454的独家分销商。  罗氏并没有透露454业务的收入情况,但在最近几年,随着其他测序技术销量的上升,454测序仪已经被推到了研究的边缘市场。最近,较低通量测序仪,如Illumina的MiSeq和Life Technologies的Ion Torrent系统进一步使得454技术变成无关的技术。  在过去的几年里,罗氏已作出努力,以继续参与测序技术发展的下一个浪潮。在2010年,罗氏与IBM和DNA Electronics 结成联盟,并在2012年初敌意收购Illumina,最终收购报价达到67亿美元,不过Illumina拒绝了该收购要约。  在Illumina那碰壁后,罗氏继续尽力抢救测序业务,据报道,在2012年12月,罗氏再次向Illumina&ldquo 求爱&rdquo ,但交易没有成交。  今年早些时候,罗氏宣布,它已经结束了与IBM和DNA Electronics合作,同时表示将停止在半导体测序和纳米孔测序的研发努力,由此导致康涅狄格州布兰福德工厂裁员约60人。  该公司表示,在当时,罗氏将454和NimbleGen产品整合至一个新的测序部门,涵盖了生命科学和临床诊断应用。据罗氏应用科学部负责人、新成立测序部门负责人Dan Zabrowski说,&ldquo 我们完全致力于为我们的生命科学业务服务,这个决定没有对任何业务或客户产生影响,我们继续认为测序将在生命科学和诊领域扮演一个重要的角色。&rdquo   罗氏也没有完全放弃测序市场,上个月,该公司与Pacific Biosciences达成协议,投资高达7500万美元与Pacific Biosciences合作开发以PacBio SMRT技术为基础的诊断产品。  罗氏说,&ldquo 我们看到了这种测序技术巨大的潜力,其提供前所未有的阅读长度、精度、速度,可以开发基于临床诊断应用的未来测序仪。&rdquo (编译:杨娟)
  • 基因检测,一台测序仪并不够
    p  如今,基因组测序的新闻已变得司空见惯,不像几年前,基因组草图甚至能登上杂志的封面。随着测序仪的价格不断下探,你也考虑购入一台。挑来选去,不知哪一台更好。在这一期的《BioTechniques》上,Jeffrey Perkel告诉你,一台也许并不够。/pp  新一代测序仪在上市之初,价格高昂,仅限“土豪”实验室购买。如今,选择多了,价格也便宜了。比如Illumina新近推出的MiniSeq测序仪,售价仅为49,500美元(美国售价),每次运行有望产生7.5 Gb,足以应对靶向测序的应用。在爱丁堡大学,本科生甚至可以选修一门课程,用Illumina的NGS技术来破译细菌基因组。/pp  然而,在第一台NGS仪器上市十年后,序列组装仍然是个挑战。即使是5.2 Mb的脆弱拟杆菌(Bacteroides fragilis)基因组,也给爱丁堡大学的本科生带来不少麻烦,这归因于重复和移动的调控元件。不过,研究人员正在学习通过不同的测序技术,来理清这些区域。/pp  Evan Eichler是华盛顿大学医学院的一名教授,他研究的是传统基因组测序项目往往忽视的基因组区域,比如不稳定的区域。这些区域的两端伴随着长片段重复,在减数分裂的过程中可能没对准,导致插入/缺失,或重复。Eichler表示,目前有证据表明这些区域是基因进化的摇篮,它们甚至在某种程度上解释了人何以为人。同时,这些复杂的区域也与疾病相关。/pp  当今,研究人员在测序人类基因组时,大多采用短读长的Illumina测序技术。这种策略将基因组剪切成数百万个小片段,平行读取,然后在数据分析环节将每个片段与基因组的独特序列比对,并鉴定出相对于人类参考基因组的变化。这些算法目前还不能实现基因组的从头(de novo)组装,因此,无法捕获大规模的结构变异。/pp  不过,其他方法可以做到。Pacific Biosciences和Oxford Nanopore的仪器在原理、速度和价格上有所不同,但它们都带来了比Illumina、Ion Torrent长得多的读取片段。PacBio的平均读长达10 kb,有些甚至超过60 kb Oxford Nanopore的MinION读长要短一些,但也在kb级别。/pp  就每个碱基而言,这些技术比Illumina要贵,“原始”错误率更高,并产生了更少的序列。因此,使用这些技术的研究人员需要开展更多的测序运行。不过,如果他们将长读取和短读取技术相结合,就能解决那些之前无法搞定的区域。/pp  再回到Eichler研究的第17号染色体。17q21.31含有一段900 kb的倒位和许多重复基因,它们往往会在测序过程中丢失或错误组装。不过,Eichler的团队如今结合使用Illumina和PacBio的技术,不仅大大提高了测序质量,也明显降低了测序成本。Eichler认为,这种策略有助于增加我们对人类遗传变异的认识。/pp  最近几个月,PacBio和Illumina都推出了新的测序仪。PacBio的Sequel在去年9月推出,比RS II更小巧、更便宜,但通量大大提高。Illumina的MiniSeq也在1月份上市,有望真正降低新一代测序的门槛。如今的你们,有了更多的选择。/p
  • 国内三代测序服务公司引进美国PacBio公司三台Sequel测序平台
    p style="text-align: center "img width="500" height="362" title="1.jpg" style="width: 500px height: 362px " src="http://img1.17img.cn/17img/images/201601/noimg/624d8c18-130a-4ca9-b8a3-5073ff7943f5.jpg" border="0" vspace="0" hspace="0"//pp  武汉未来组今天正式宣布引进最新的美国三代测序平台Sequel,借助于独家开发的基于“天河二号”平台的a title="" style="color: rgb(255, 0, 0) text-decoration: underline " href="http://www.instrument.com.cn/application/SampleFilter-S01-T000-1-1-1.html" target="_self"span style="color: rgb(255, 0, 0) "三代测序/span/a基因组组装流程,未来组即将提供“一周一个动植物基因组”的特色服务。/pp  2016年1月21日,中国首家三代测序服务公司武汉未来组与美国PacBio公司在中国的独家代理商基因公司顺利签约引进了Sequel测序仪。根据协议,未来组将引进至少3台最新的PacBio公司的三代测序平台Sequel,以满足呈指数增长的三代测序服务需求,从而继续领跑中国三代测序服务市场。这是未来组在采用“天河二号”超级计算机,顺利解决高度复杂动植物基因组组装问题之后,又一次进行技术平台的升级,以实现未来组构建中国最有影响力的三代测序平台的战略目标。/pp  本次引进的三代测序平台,包含3台Sequel测序仪及其附属配套仪器与软硬件,将部署在武汉光谷生物城的未来组生产研发中心,面积超过1000平方米,采用10万级洁净实验室,以确保生产过程中达到最高的环境标准,从而确保最高的测序质量。/pp  与PacBio RS II平台相比,Sequel测序平台虽然体积只有约1/3,测序通量却提高了7倍。目前每台测序仪的通量超过8,000Gb/年,相当于每年大约可以完成100个动植物基因组的测序(按1Gb估算)。目前,武汉未来组已经开始接受新测序平台的服务预定,在优先保证老客户使用的前提下,公司还将优先支持高度复杂的动植物基因组项目、人类基因组测序项目、复杂微生物组测序项目等领域。同时,该Sequel测序平台也将提供给兄弟公司北京希望组用于精准医疗方面的前瞻性科学研究,成为国内首家将三代测序用于医疗健康领域的机构。/pp  strong关于第三代测序技术/strong/pp  第三代测序技术也称为单分子实时测序技术。美国Pacific Biosciences公司是目前唯一正式商业化的第三代测序仪厂商,已在全球范围内为多个基因组学中心提供PacBio RS II测序仪,并于2015年10月推出新产品Sequel测序仪。PacBio测序具有超长读长(平均读长10-15Kb,最长读长可超过40Kb)、无PCR扩增偏差的单分子测序、直接分析碱基修饰等技术优势,已经快速应用于基因组de novo组装、转录组学研究等领域,随着性价比的不断提高,第三代测序技术将在未来的2-3年内快速普及。/pp  strong关于武汉未来组/strong/pp  武汉未来组生物科技有限公司(Nextomics Biosciences)成立于2011年8月8日,总部位于武汉光谷生物城,目前在北京生命科学园和美国洛杉矶设立有分支机构,是中国首家第三代测序服务公司。/pp  武汉未来组通过三代测序生物信息学工具和流程的开发,解决了复杂基因组组装、微生物完成图组装、全长转录组分析、人类基因组变异检测等领域的技术瓶颈,推动了基因组学研究的升级换代,目前已经完成数百个三代测序科研项目,发表了多篇三代测序的科学文献。因为专注于三代测序技术开发和应用推广,武汉未来组已经成为中国三代测序技术应用的领导者。/p
  • 安捷伦科技针对台式测序仪推出靶向序列捕获平台
    安捷伦科技针对台式测序仪推出靶向序列捕获平台 2012 年 2 月 14 日,佛罗里达州马科岛(基因组生物学和技术,AGBT)- 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)推出SureSelect 靶向序列捕获系统,支持台式测序仪的HaloPlex 靶向序列捕获系统。该产品将于明日在基因组生物学技术进展年会上正式亮相。 独特的HaloPlex 技术完美融合了聚合酶链反应系统的速度和特异性以及基于液相杂交体系的可扩展性和捕获片段大小的灵活性。该实验方案无需文库构建,利用单管操作,从而解决了多重 PCR 由于存在交叉杂交问题而使靶向序列数量受限的问题。该方案使样品制备时间缩短到不到一天,适用于 Illumina MiSeq 台式测序仪以及 HiSeq 和 GAIIx 测序仪。 &ldquo 虽然新一代测序技术使全基因组分析成为可能,但是当我们想要在数量庞大的个体中测定少部分基因时,我们通常会遇到如何富集的问题。&rdquo Hubrecht 研究所基因组生物学首席研究员 Edwin Cuppen 说,&ldquo 对于几个到几十个范围的目标基因捕获,当前的杂交捕获技术有其局限性。HaloPlex 技术很好地填补了这个空白,可以帮助我们实现了在单次反应中捕获 2 至 20 个基因的完整编码序列,而且其在目标序列片段的的测序效率超过 90 %。 &ldquo HaloPlex 富集技术与 Ion Torrent 半导体测序技术联用,这种灵活高效的组合非常适用于高通量的小片段靶向基因重测序。&rdquo Cuppen 博士参与了安捷伦针对Ion Torrent 平台推出的 HaloPlex 技术的早期测试项目。 &ldquo HaloPlex只是我们为进一步巩固 SureSelect市场 领先地位而制定雄心勃勃的产品开发项目的一个例子。&rdquo Olle Ericsson 说道。他是 Halo Genomics 创始人,目前在安捷伦担任 DNA 测序市场总监一职。&ldquo 面世后的短短两年时间内,SureSelect 就已被超过200 篇的重要学术论文引用,在研究领域发挥了重要作用。在台式测序和靶向序列捕获技术通往临床研究的道路中,HaloPlex 这一创新技术使安捷伦成为领跑者。 HaloPlex 是一款定制产品,用户使用免费的在线设计向导(Web Design Wizard),在不到 10 分钟时间内就可完成设计,富集数以千计的目标基因组序列。 安捷伦于 2011 年 12 月收购了位于瑞典乌普萨拉的 Halo Genomics,从而获得了该产品。HaloPlex 技术完美补充了 Agilent SureSelect 靶向序列捕获系统。这项新产品如今也受益于安捷伦强大的研发、生产和分销资源。 要了解更多信息,请访问 www.agilent.com/genomics/ngs。 关于安捷伦科技 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)是全球领先的测量公司,同时也是化学分析、生命科学、电子和通信领域的技术领导者。公司的 18,700 名员工为 100 多个国家的客户提供服务。在 2011 财政年度,安捷伦的业务净收入为 66 亿美元。要了解安捷伦科技的信息,请访问:www.agilent.com.cn
  • 元码基因宣布采购30台MiniSeq测序仪
    p  在刚刚结束的JP摩根大会上,Illumina公司发布了新的MiniSeq测序仪,MiniSeq测序仪是桌面式高通量测序系统,集成了簇生成、测序和数据分析功能,操作简单,只需将所需试剂封装在一个盒子里,并进行用量设置,即可保证上百样品灵活高效的测序。MiniSeq测序仪可以远程监控运行,一天之内可以得到结果,内置的数据分析功能可以提供传输、保存、分析和分享数据等一站式服务,非常适合目前的临床检测。因此,为满足“联合精准医学中心”对高通量测序平台的需求,元码基因决定在2016年采购30台此系统。/pp  元码基因在做什么?/pp  元码基因是一家精准医疗系统解决方案提供者,致力于与医院共建“精准医学”、“分子病理”、“分子医学”技术平台和体系,为医生和病人提供完整的精准医疗解决方案,并为转化医学研究提供技术和平台保障。/pp  基于独创的“3M”共建模式,目前元码基因已与5家三级医院建成“联合精准医学中心”,并投入运行 与10家三级医院签订了共建“联合精准医学中心”协议 与超过50家医院建立了合作关系。元码基因计划在2016年内,在全国建成30家“联合精准医学中心”。目前已经建立的技术平台包括:高通量测序、一代测序、qPCR、ddPCR和CTC平台,以及高性能计算和样本库。产品和服务覆盖:肿瘤精准医疗、液态活检、遗传易感性检测等领域。/pp  本次采购将解决目前“联合精准医学中心”的临床和科研对高通量测序平台的需求,加快建立联合中心的步伐,提高合作医院的精准医学基础支撑能力。/pp  何为“3M模式”/pp  3M模式是元码基因与医院建立联合精准医学中心的模式,按照医院需求和联合实验室规模分为Mini Lab、Median Lab、Max Lab, 不同规模的实验室配备不同标准的技术平台和技术人员,并根据样本量和项目等数据,进行实验室的升级。/ppbr//p
  • 我国首台自主研发基因测序仪问世 明年上半年投产
    p  10月18日,在武汉国际会议中心,深圳华因康基因科技有限公司(下称“华因康”)举行了中国第一台自主研发的基因测序仪的产品发布会。据了解,华因康是由基因测序领域领军人物、国家首批“千人计划”、国家特聘专家盛司潼博士创立,该公司成功研制了中国第一台具有自主知识产权、世界水准的医用基因测序仪,打破了国外厂商的长期垄断,被认定为“国家重点新产品”。/pp style="text-align: center "img title="U8155P1190DT20151020143254.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201510/insimg/56150f5e-a86b-4d88-a523-33a5e63c2378.jpg"//pp  对于华因康选择在武汉举行发布会的原因,华因康CEO盛司潼博士表示,华因康已与武汉光谷生物产业园区签订合作协议,建立试剂研发生产的华中基地,建设基因测序服务中心,更好地为武汉市民服务。华因康也十分看重武汉优质的医疗和人才资源,期望这场发布会能够吸引更多武汉医疗机构专家学者的关注与合作。/pp  随着经济基础和科学技术的不断提升,人们对健康水平有了更高的要求。目前,受益于基因科学技术的发展,基因测序成本大幅下降,基因测序技术已经从实验室走进了医院和寻常百姓家。比如,现在很多医院在开展的肿瘤精准个体化用药指导、无创产前检测(NIPT)等,都是属于基因测序的应用范畴。/pp style="text-align: center "img title="U8155P1190DT20151020143318.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201510/insimg/09de8cdd-641d-4df4-a992-14011cf1b92f.jpg"//pp  盛博士还指出,华因康本次发布的HYK-PSTAR-IIA基因测序仪,是中国自主创新的第一台拿到CFDA(中国食品药品监督管理局)医疗器械注册证的基因测序仪,具有快速、灵活、准确等特点,临床使用更简便,不需要复杂的培训就能让任何一个用户轻松上手,并且在保证性能的前提下,尽可能减少测序试剂单次检测成本。同时,基于200多项涵盖试剂供给、测序反应、自动化控制、光学成像、数据处理等5大系统核心专利,HYK-PSTAR-IIA基因测序仪也成为首个通过创新医疗器械特别审批程序的临床精准医疗领域测序仪。/pp  以现有技术做一次DNA检测,拿到报告大约需要一周时间。而华因康测序仪能够将这一时间缩短到半天,并且准确度达到99.9%。用血液、皮肤或头发都能做DNA检测,与传统技术相比,这款测序仪提速的关键在于能够同时采集千万甚至上亿个基因片段。昨天,该公司华中基地签约落户光谷生物城,预计明年上半年可以投产 今后,武汉市民有望在本地医疗机构做快速的DNA检测,根据检测项目的不同,费用从1000多元到数万元不等。该测序仪目前已应用于重大疾病(如癌症)筛查与预防、个性化用药指导、心脑血管疾病筛查、遗传病筛查、健康评估等方向,具有非常广阔的应用和市场前景。/pp  “基因测序在中国的发展才开始不久。”盛博士说,“华因康作为中国唯一拥有自主知识产权的基因测序平台企业,在未来几年间,我们将不断为合作伙伴提供更好的平台产品,共同为中国人民的健康事业而奋斗。”/pp  目前,华因康以深圳为基地,已经在广州、武汉建立了区域检测中心。未来数年内,计划在全国各大城市进行布局,更好地为全国人民服务。/p
  • 新一代基因测序仪器亮相进博!因美纳技术平台曾完成首个新冠病毒基因组序列测序
    2021年,是人类基因组计划草图首次发布的第20个年头,也恰逢中国“十四五”规划的开局之年。过去两年,基因测序技术在全球抗击新冠疫情中的重要作用揭示了生命科学时代的真正到来。与此同时,中国“十四五”规划将生物基因科技发展,公共卫生建设以及健康预防等内容提到了极为重要的位置,基因测序技术和应用均贯穿其中。自因美纳创立之初,公司即通过持续的技术创新不断推动测序成本的下降。如今,因美纳的技术已使测序成本下降了99%。此次进博会上,因美纳展示其主要的测序仪系列产品,让参观者得以了解基因检测的奥秘。图说:因美纳在进博会上展示其主要的测序仪系列产品 新民晚报记者 陶磊 摄(下同)去年,中国科学家向全球第一时间分享的首个新冠病毒基因组序列就是在因美纳的技术平台上完成测序的,为后续的疫情防控、疫苗研发奠定了基础。此次进博会展出的NextSeqTM 550Dx,是因美纳在全球最多国家和地区通过临床注册的中通量新一代测序平台(NGS),迄今为止已在超过40个国家和地区获得临床认证,是一款久经考验的临床测序平台。记者在展台看到,获得2021年红点设计大奖的基因测序平台——NextSeqTM 2000也收获了不少关注。这也是因美纳首个将文库扩增、测序以及快速基因组分析整合在一个平台上的测序仪。图说:参观者有机会获得互动纪念品——基因测序产品模型的盲盒去年进博会前夕,因美纳NextSeq 550Dx获得中国国家药品监督管理局的批准,用于临床人源样本的人类DNA检测诊断,成为因美纳在中国第二款获临床应用批准的测序产品。随着该产品在进博会的成功展出,在不到三个月内,首台NextSeq 550Dx即在上海复旦大学附属华山医院成功安装开机。未来,因美纳计划将包括测序试剂以及测序仪在内的产品逐步推进本土化生产制造。目前,位于上海浦东的因美纳中国生产基地正在积极筹备,预计将于明年第三季度投入生产。
  • 全球首台液相定点基因测序仪问世
    如今,肿瘤靶向治疗和个体化用药正在医学界推广,要开展这类&ldquo 基因治疗&rdquo ,对人体的基因测序必不可少。记者昨天获悉,全球首台液相定点基因测序仪在张江高科技园区问世,这种仪器在癌细胞比例低于20%的样品中,能检测出基因变异,而目前医院使用的基因测序技术,都要求癌细胞数不得低于40%。生物芯片上海国家工程研究中心的专家表示,这一发明具有广阔的医学应用前景。  据研发人员黄新华介绍,基因测序是人类基因组计划的关键技术,有基因检测&ldquo 金标准&rdquo 之称。一般基因测序主要包括三个步骤:PCR扩增,对待检测的DNA进行复制放量;用诺贝尔奖成果&ldquo 末端终止法&rdquo 进行测序反应 对完成反应的基因序列进行毛细管电泳,而后检测DNA中含有的荧光信号,即可获取基因序列的&ldquo 密码&rdquo 。  经过多年研究,黄新华发现,在对特定基因位点的测序中,&ldquo 金标准&rdquo 方法中的第三个步骤 &ldquo 毛细管电泳&rdquo 并不是必需的。如果在第二步&ldquo 末端终止法&rdquo 液体测序反应中,检测荧光信号的反向信号&mdash &mdash 淬灭信号,那么就能破解基因密码,不必让基因序列通过毛细管,接受长达10小时左右的电泳测序。根据这一创新思路,黄新华带队发明一种新型仪器&mdash &mdash 液相定点基因测序仪,并申请了国家发明专利。  与传统基因测序仪相比,这种仪器让基因测序的时间大幅缩短,从原先的十几个小时缩短为几个小时;其测序成本也大幅降低,仅为目前测序仪的1/3。而且,它的测序灵敏度提高了。医院检测肿瘤样品的DNA变异时,通常要求癌细胞数在肿瘤样品中的比例不得低于40%,否则检测结果就可能是&ldquo 假阴性&rdquo 。这种仪器在癌细胞比例低于20%的情况下,将能检测出DNA变异。  对于这项成果,生物芯片上海国家工程研究中心研究员张庆华表示,它在医疗机构有很好的应用前景,适用于肿瘤、糖尿病等重大疾病的基因诊断,为靶向治疗和个体化用药提供准确的基因测序报告。值得一提的是,基因测序仪以及关键试剂一直被美国企业所垄断,液相定点基因测序仪的问世,有望打破这种垄断局面。
  • 瑞典国家电视台:华大智造基因测序仪助力当地抗疫
    瑞典国家电视台:中国先进技术助力瑞典抗疫,源于华大智造“这是我们从中国空运过来的超级测序仪,它的测序通量是其他测序仪的8倍。”自新冠疫情发生以来,最早提出所谓“群体免疫”、反对采取封锁等限制措施的瑞典,日前被该国媒体瑞典国家电视台(SVT)曝出仍存在新冠阳性样本测序率低的问题,加上在英国发现的变异新冠病毒正在这个北欧国家迅速传播,该国对新冠病毒基因测序量提出了更高的要求。值得一提的是,SVT电视台称,被认为是瑞典少数可以进行病毒全基因组测序的专业化实验室所使用的设备,正是来自中国企业——华大智造。华大智造DNBSEQ-T7基因测序仪在当地时间1月30日的一则采访报道中,SVT电视台称,目前瑞典只对1%的新冠阳性样本进行了测序,但瑞典各大区(省)已被要求将测序量增加到10%。瑞典公共卫生局也启动一项调研,以全面了解哪些地区和实验室能够进行突变新冠病毒监测。与丹麦针对25%的新冠阳性样本进行测序相比,瑞典只对新冠阳性样本的1%进行了测序的做法,受到外界指责。SVT电视台记者在采访瑞典国家疫情中心、卡罗林斯卡医学院教授Lars Engstrand时问道:“我们正冒着病毒在看不见的情况下进行着不受控制的突变的风险,是不是因为我们开始大规模测序的时间太晚了?” Lars Engstrand教授则回答说:“今天的步伐的确太慢了,有可能发生我们无法预见的风险。我们必须增加病毒的全基因测序,许多人也有同样的认可。至于究竟可能是10%、20%或30%的阳性样品需要测序,这个要根据实际情况来制定。”该电视台称,目前瑞典只有少数高度专业化的实验室可以进行病毒全基因组测序和监测,卡罗林斯卡大学国家疫情中心的实验室就是其中之一,而该实验室所使用的高通量基因测序仪来自于中国基因测序设备制造企业华大智造。高通量测序能够获取病毒的全部序列,精准鉴定变异,对病毒进行追溯和监测;通过对病毒宿主(人)进行多个组学维度的测序,还可以帮助我们更好地理解发病机制,为临床诊疗和疫苗开发提供重要的参考。对于突然爆发的不明原因的新型传染病,高通量测序作为一种成熟的基因检测技术,在准确性、全面性、周期、通量、易用性、成本等方面达到了很好的均衡,已经成为相关科学研究的基础手段。华大智造超高通量测序仪作为“全球日生产能力最强”的基因测序仪,DNBSEQ-T7自发布就拥有多个“光环”:“首个4联芯片的测序平台”、“满负荷PE150不超过24小时”、“日产数据量高达6T”、“1天最多可完成60例个人全基因组测序”等等,堪称“超级生命计算机”。韩国基因组学中心(KOGIC)等机构在BioRxiv发布了基于DNBSEQ-T7的多平台测序性能对比研究,结果表明:华大智造DNBSEQ测序平台和其他平台在测序质量、覆盖均匀性、GC覆盖度和变异准确性方面均有可比性,且相较之下更具成本优势。DNBSEQ-T7作为科技抗疫利器强力支援病毒研究,监测病毒变异。疫情初期,华大智造前期紧急部署2台DNBSEQ-T7运达武汉,用于应急检测病原。协助新冠肺炎防控以及病毒变异追踪。2020年3月,华大智造与瑞典卡罗琳卡医学院(Karolinska Institutet,KI)宣布在瑞典首都斯德哥尔摩共建万人级别新冠检测多组学检测实验室。华大智造研制的超高通量基因测序仪DNBSEQ-T7先后运抵瑞典,用于支撑病毒研究。伦敦帝国理工学院传染病流行病研究中心,潍坊疾控中心等单位基于DNBSEQ-T7的基因组数据用于对潍坊市28例新冠病毒阳性样本进行测序,基于数据分析建立了流行病学系统模型,对基因组流行病学的研究提供了地域依据。(文源:环球网)文中涉及科学仪器如下DNBSEQ-T7基因测序仪(点击查看参数)在3i生仪社后台回复文字 T7 获取更多
  • 汪建对话郭台铭,华大基因为何让富士康生产测序仪?
    p  基因产业是生物科技的中坚力量,以基因检测为核心的多种分子诊断技术正逐渐渗透于整个“生老病死”过程中。但是,中国基因测序的仪器和耗材供应商基本被Illumina和Life Technologies等少数外资企业的技术、专利垄断。国内的基因测序企业多以第三方测序服务供应商的模式布局中下游,测序实验室是中国基因市场的主要增长份额。如何提升基因产业的制造能力、市场竞争力?是本土众多企业努力的方向。br//pp  3月2日,一篇题为“富士康将为华大基因批量生产仪器设备”的文章引起行业内人关注。一个是“基因测序巨头”,一个是“芯片工厂”,看似风马牛不相及,却要“抱团合作”了,这将给中国基因产业带来哪些变化呢?/pp strong 两位大佬对话:谈“测序巨头”和“芯片工厂”的合作/strong/pp  3月1日,富士康总裁郭台铭向媒体记者透露,富士康已与华大基因达成战略合作。华大基因董事长汪建更进一步称:“华大基因若干仪器设备和产品,将交由富士康批量生产,例如去年年底刚通过生产许可的BGISEQ-50小型台式基因测序仪。”/pp  两大巨头的合作其实早有苗头。根据华大基因官网信息,今年2月19日,郭台铭曾率富士康旗下各大次集团领导、台湾大学台成干细胞治疗中心主任唐季禄等一行到访华大基因,与汪建积极探讨了开展合作的可能和模式。郭台铭希望,富士康的硬件制造、自动化等技术能够帮助华大基因进一步降低成本,加速实现精准医疗全民时代来临。/pp  谈及此次合作,郭台铭强调重在“互补”。“对话”期间,汪建提出一个大目标:让全球的出生缺陷在几年之内都享受到基因的正确的测序 让所有的肿瘤病人享受到精准医疗。如何实现大目标?他表示:“要携手全球各界力量,形成一个全球行动,向疾病宣战!”/pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201703/insimg/1d22433e-c3f5-4e77-9ed4-57025cff0d7c.jpg" title="201703021702078504_副本.jpg"//pp style="text-align: center "富士康总裁郭台铭和华大基因董事长汪建(来源于华大官网)/pp strong 两家企业的软实力:BGISEQ-50、8K/strong/pp  被汪建点名的“BGISEQ-50”是华大基因自主研发的一款高通量测序仪,于2016年11月在第十一届国际基因组学大会首次发布,有着“更专注、更小巧、更精简”特色。/pp  据悉,BGISEQ-50适用于无创产前筛查、植入前胚胎染色体筛查、染色体异常检测、未知病原体快速检测等临床应用以及RNA表达谱测序等科研领域。华大基因执行副总裁、华大智造执行总裁牟峰表示:“BGISEQ-50的诞生,标志着我国已完全具备了自主可控的核心测序技术和能力,将加速推动以基因科技为支撑的生命数字化建设。”/pp  对此与富士康的合作,汪建说:“有了BGISEQ-50,将来人人都可以很轻松地知道自己的基因。未来,这个基因测序仪我们至少需要几十万台,其市场规模不会小于手机。”/pp  而富士康之所以能够吸引华大基因,除了其代工的口碑之外,还包括它的“8K影像技术”在基因研究和精准医疗中的应用潜力。/pp  何为“8K影像技术”?它是指数字影像的清晰度。目前,市面上主流的数字影像分辨率为1920× 1080,是全高清标准(2K)。而“8K”则是指在现有的全高清基础之上将分辨率提高了16倍。借助它,我们可以看到更为细微的影像数据,从而实现更为精准的医疗目的。/pp  “8K影像技术” 是人工智能学习的根本科技。“现在,AI(人工智能)无法在医疗领域大面积使用,就是缺乏细致入微的影像数据,AI无法形成深度学习。”汪建解释道。/pp  strong行业人点评:测序仪工业化量产的新尝试?/strong/pp  在过去,中国制造业水平偏低导致国产化测序仪器很难达到欧美同类水平。我国市场上用于基因测序服务的设备和试剂大多来自于少数几家国外供应商。国内的测序服务业不得不承受比供应商所在国家更高的设备购置和应用费用,测序成本甚至会高于国外服务商的市场报价,这在很大程度上压缩了国内基因测序服务企业的利润空间。/pp  基于此,越来越多的行业人士认识到:基因产业的竞争是一场不折不扣的“上游设备”和“技术优化”的竞争。我国的基因产业要想在世界上掌握更多的话语权,必须加强上游设备、中游产品、下游服务的一体化建设,将基因学科的成果应用于医学健康、农业育种、资源保存等大健康领域。/pp  对于这一跨行业合作,记者采访了前赛默飞全国临床市场战略总监柴映爽,他对此表示:“测序仪要从实验室研发走向工业化量产,得保证产品的批内跟批间的均一性。依靠华大自身来克服生产质控的难关并不容易。富士康虽然没有做过测序仪,但在生产的质控管理应该有很好的经验。上游生产的稳定性提高也有助于降低下游市场的营销和售后服务成本。富士康的8k技术不知道跟测序仪有什么关系,倒是华大测序仪的sCMOS的图像采集和传输的速度不知是否可以提高。”另外,他认为:“长远来说,富士康在中国有接近百万名员工,双方合作紧密的话,这些员工本身就可以使用华大的测序产品或参与到测序项目中去,这种价值链上的变革无疑节约了华大的获客成本。”/pp  若干年后回看华大基因和富士康的合作,或许为改写我国基因测序史添上了浓墨重彩的一笔。/p
  • 华大基因购买49台Life Tech新一代测序仪
    2013年10月21日,华大基因(BGI)表示,其已经购买了37台 Life Technologies新一代测序仪Ion Proton,并且将在今年年底至少再购入12台Ion Proton。  此外,总部设在中国深圳的华大基因表示,它已经与Life Technologies签署了供应和许可协议。  根据一份声明,华大基因将使用Ion Proton用于外显子组和转录组测序,以及异倍体筛查研究。华大基因已经验证了Proton的PI芯片,在2-3小时测序过程中,其可提供8000万读长。  &ldquo 它是灵活的和可负担得起的,所以我们可以快速部署在世界各地的许多卫星实验室,用于所有的应用,&rdquo 华大基因董事王珺(音译)在一份声明中说。 &ldquo Ion Proton速度非常快,使得我们可以在几天,而不是几周,就可以给我们的客户和合作伙伴提供结果。&rdquo   华大基因也是Illumina公司的最大客户,在其深圳和香港的机构运行着超过100台的HiSeq 2000测序仪。今年三月,中国的华大基因研究院以1.18亿美元收购全基因组测序服务提供商Complete Genomics。  就在上个月,另一家中国诊断服务公司iGenomics(广州爱建生物技术有限公司)购买了32台Life Technologies新一代测序仪Ion Proton。(编译:杨娟)
  • 全球装机破1000台!华大智造国产基因测序仪再创新高
    p  2019年1月6日,美国加州,China Focus@JPM Week ,华大智造首席运营官蒋慧博士宣布华大智造国产基因测序仪全球装机量突破1000台,已在全球16个国家获得使用,累计产生的运行数据达20Pb。华大测序仪在全球基因测序行业发挥着越来越重要的作用。/pp style="text-align: center"img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201901/uepic/98fd7a4e-15ae-43f8-8f70-109a464fa2ff.jpg" title="001.jpg" alt="001.jpg"//pp style="text-indent: 2em "韩国LAS实验室主任金东浩博士从事着基因组学研究和基于NGS的临床诊断应用开发,日前,他的实验室安装了华大智造的第1000台测序仪。金博士评价道:“strongMGISEQ-2000测序仪是一个非常棒的选择,我们在MGISEQ-2000平台上进行了DNA和RNA测序,它操作友好、测序精准度高,而且运行成本相对较低。/strong”/pp span style="font-size: 14px " 注:LAS (Life is art of science Co.,Ltd .)是BMS的兄弟公司,是一家致力于韩国基因组研究和基于NGS的临床诊断应用的公司。/span/pp  “最近几周,MGISEQ-2000在中国、俄罗斯、墨西哥、日本等地同步装机。这一突破,离不开全球测序仪用户对我们的支持和信任,也离不开我们的专业团队。”蒋慧表示,“我们目前在全球拥有9个驻点国家、24个驻点城市,1支100人以上队伍,包括技术支持专家、领域应用科学家、售后工程师等高级人才,提供4小时电话响应和2个工作日到场响应的全球化标准服务,充分保证了全球测序仪的常规化运行。”/pp style="text-align: center"img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201901/uepic/0af9b740-17b1-4b46-956a-8d3103f72709.jpg" title="002.jpg" alt="002.jpg" width="384" height="307" style="width: 384px height: 307px "//pp style="text-align: center "span style="color: rgb(127, 127, 127) "华大智造首席运营官蒋慧博士在China Focus@JPM Week上演讲/spanbr//pp  自2015年起,华大先后发布BGISEQ-500、BGISEQ-50、MGISEQ-2000和MGISEQ-200,这四款测序仪涵盖了高中低通量,并且都已经获得NMPA认证,不仅在科研领域开始大规模应用,在临床医学领域也开拓着越来越多的应用。2018年10月,华大智造发布全球最强日生产能力的MGISEQ-T7,单日数据量高达6Tb,每日可完成60例WGS。strong目前华大智造已向全球近260家客户输送了1000台中国制造的基因测序仪。/strong/pp  华大智造一直在探索如何为完美测序提供更好的工具和平台。在测序前处理部分,MGISP系列自动化样本制备系统,能够单次建库8-96例样本,致力于解决手动建库难的问题 在测序后下机数据分析方面,华大智造生信分析加速器MegaBOLT带来15倍以上计算加速,极大降低基因测序分析时间。/pp  如今,华大智造自主研发的测序平台在全球得到越来越多的认可与支持,华大智造将不断突破和创新, 实现更多生命科学领域仪器设备研制,为行业发展提供更好的工具支持, 真正践行“基因科技造福人类”的目标。/p
  • Illumina重磅发布四款最新测序仪器平台
    fieldsetlegendspan style="color: rgb(105, 105, 105) "strong背景/strong/span/legend  span style="color: rgb(105, 105, 105) "strongspan style="font-family: arial, helvetica, sans-serif "2015年1月12日-15日,第33届JP摩根健康投融资大会在美国旧金山举行,往年大会上,各家公司都派出重量级阵营,公布上年度经营业绩,发布最新产品,给市场打入强心剂,以获得投资人的青睐。/span/strong/span/fieldsetp /ppspan style="font-family: arial, helvetica, sans-serif "  JP摩根健康大会开场,重量级公司Illumina发布了4款最新的测序仪器,推出HiSeq X Five系统,HiSeq3000,HiSeq4000,Nexseq550。HiSeq3000/4000采用HiSeq X上的测序芯片,可以低成本开展个人基因组、外显子组测序;而Nexseq550则可以在测序的同时扫描基因芯片。/span/pp style="text-align: center "img style="width: 502px height: 326px " alt="" src="http://img1.17img.cn/17img/old/NewsImags/images/201511310420.jpg"//ppspan style="font-family: arial,helvetica,sans-serif " strong HiSeq X Five/strong/span/ppspan style="font-family: arial,helvetica,sans-serif "  HiSeq X Five是HiSeq X Ten的低版本商业套装,还是同样的测序仪,同样的通量,只是可以5台起打包销售,每台的价格不是X Ten的100万美元,而是120万美元,每个基因组的测序成本涨到了1400美元。这是典型的商业套路,无关技术。对于一次性掏不出1000万美元的客户是个选择,对于追求更高性价比的客户则是个痛苦。还是有钱的人,可以任性!/span/ppspan style="font-family: arial,helvetica,sans-serif "  Illumina官方表示:HiSeq X Five是专注于大规模人全基因组测序。HiSeqX FIVE系统由5台HiSeq X组成,可升级到HiSeq X TEN从而实现1000美金人全基因组测序。/span/pp style="text-align: center "img style="width: 600px height: 181px " alt="" src="http://img1.17img.cn/17img/old/NewsImags/images/2015113104224.jpg"//ppspan style="font-family: arial,helvetica,sans-serif " strong HiSeq 3000/4000/strong/span/ppspan style="font-family: arial,helvetica,sans-serif "  HiSeq3000/4000采用了HiSeq X 系列的Patterned Flowcell,通量提高到每个RUN0.75-1.5Tb,可以开展全基因组、外显子组、转录组等测序,速度是3.5天,2500以前的型号系列还可以销售,但以后会逐渐转向3000\4000系列。/span/ppspan style="font-family: arial,helvetica,sans-serif "  HiSeq 3000和HiSeq 4000在可靠的HiSeq 2500的基础上使用了创新的有序流动槽技术,可提供无可比拟的测序速度和性能。HiSeq 4000系统配备2个流动槽,可为多种应用提供最高的测序通量以及最低的测序成本。配备1个流动槽的HiSeq3000系统具备同样的性能。/span/pp style="text-align: center "img style="width: 600px height: 447px " alt="" src="http://img1.17img.cn/17img/old/NewsImags/images/2015113104236.jpg"//pp strong span style="font-family: arial,helvetica,sans-serif "NextSeq550/span/strong/ppspan style="font-family: arial,helvetica,sans-serif "  NextSeq550在原有高通量测序平台NextSeq 500 的基础上,增加了芯片扫描功能。该系统为用户基于芯片应用转化到测序技术平台上来,搭建了新的桥梁。在临床市场,使用同一系统可以互相补充不同的应用,如细胞遗传学分析和胚胎植入前遗传病筛查等应用。因此这款为临床应用设计的平台可以开展NIPT业务,不过价格比测序仪NextSeq500高了一些。/span/p
  • 中国公司购买32台Life Tech新一代测序仪
    美国时间2013年9月25日,Life Tech公司表示,私人持有的中国诊断服务公司iGenomics(广州爱建生物技术有限公司)已购买17台 Life Tech新一代测序系统Ion Proton,并已同意年底再购买15台Ion Proton。  iGenomics总部位于中国广州,由中山大学达安基因股份有限公司投资入股成立,最初使用测序仪用于异倍体筛查研究,但计划扩大到其他应用。  iGenomics 公司首席执行官黄晟宇(音译)在一份声明中说,&ldquo 我们看到了测序领域巨大的增长,相信Ion Torrent提供的理想技术可以帮助我们迅速扩大,并且无论今天还是未来,帮助我们在这个市场竞争。&rdquo   在过去六个月中,iGenomics已在Proton上进行了超过200 次实验,在PI芯片上,每测一次可以读取8000万数据,一天最多可以测六次。  该公司还与Life Tech签署了一项许可和供应协议。交易的财务细节尚未披露。(编译:杨娟)
  • 南中医高通量测序平台690万仪器采购中标公告
    SJC2011060186南京中医药大学高通量测序平台项目中标公告  江苏省省级行政机关政府采购中心受南京中医药大学委托,就南京中医药大学高通量测序平台进行公开招标采购,按规定程序进行了开标、评标、定标,现就本次招标的中标结果公布如下:  一、项目名称:南京中医药大学高通量测序平台  采购编号: SJC2011060186  二、招标项目简要说明:略。  三、招标公告媒体及日期:2011年07月19日江苏省省级机关政府采购中心网站、《中国财经报》、中国政府采购网站、江苏政府采购网。  四、评标信息:  评标日期: 2011年08月12日  评标地点:江苏省南京市中央路42号江苏省省级行政机关政府采购中心413电子评标室  评标委员会名单:  毕向东、李丽、王书奎、蒋理、华子春、徐斌、梁照林  五、中标信息:  分包1:  中标供应商名称:江苏苏美达仪器设备有限公司  中标供应商地址:南京市长江路198号7楼  中标金额:陆佰捌拾玖万柒仟圆整(¥6,897,000.00)  六、本次招标联系事项:  联系人:赵国文  联系电话:025-83286913  传真电话:025-83286920  联系地址: 南京市中央路42号江苏省省级行政机关政府采购中心  邮政编码: 210008  网址: www.jszfcg.gov.cn
  • 芯像生物推出国产基因测序平台 实现扩增测序一体机小型化、智能化
    3月2日,芯像生物在上海浦东成功举办了国产基因测序平台新品发布会,重磅推出了基于高精度、高性能、高灵敏度显微成像技术的国产基因测序仪——StarSeq ® -100。新平台将从科研和体外诊断两大方面整合NGS解决方案。芯像生物创始人兼CEO严媚博士为新品发布会致开幕词时介绍了芯像生物的企业、产品布局及专利壁垒,并强调了芯像生物“加速实现从科研向临床的应用转化”的企业定位,致力打造低成本、高精度、易解读、检测快的多场景适用产品。严媚博士表示,人类基因组计划至今25年,我们正在经历从科研到临床转化的关键时期;芯像承载的使命,是把昂贵、复杂的科学设备设计成简单、耐用的医疗仪器,改变当前中心化的测序方式,让测序技术更加亲民。芯像生物首席科学家陈更新博士代表芯像生物向大家做了详细的新产品介绍。StarSeq ® -100为国产小型台式NGS基因测序仪,配置高灵敏度光学显微扫描成像系统,拥有灵活开机双载片四通道,可实现一体化文库加载、循环测序及数据生成。 StarSeq® -100具有领先的技术优势:通过半导体先进光电技术和高集成测序系统,实现扩增测序一体机小型化、智能化;自主研发测序化学反应体系高密度测序芯片,实现对主流NGS文库的精准、快速、低成本兼容,并为本地量产供应、GMP流程管理提供快捷、高质量的服务。 StarSeq® -100具有国内外多项自主知识产权,支持包括生殖、病原微生物、肿瘤、遗传病、转录组测序等在内的多种适配场景;其高GC极端复杂文库数据质量等指标与进口品牌相比持平,Dup以及Clean reads等指标优于进口平台。关于芯像生物:上海芯像生物科技有限公司总部位于上海张江, 是一家从事新型体外临床诊断仪器及配套试剂研发、 转化和产业化的高科技公司。公司核心团队由多位欧美海归的业界精英组成,在核心技术研发、 产品化及临床应用等方面有丰富的实战经验,技术背景涵盖半导体芯片、光学设计、电子、微流控、生物生化试剂、生物信息、医学应用等多交叉学科。芯像以半导体芯片技术与体外诊断的技术融合为核心,发挥半导体产业优势,赋能体外诊断技术的创新,目标打造检测结果快速精准、仪器运营低成本高产出、运行流程集成自动与智能化的基因测序平台,推动技术的普及,为人类生命健康护航。深圳分公司坐落粤港澳大湾区发展核心地带,位于河套深港合作区内国际生物医药产业园二期,致力于开发前沿生物传感器相关技术,为新型测序及生物传感器应用提供有力支撑。
  • 290万!七台河市公安局DNA测序仪采购项目
    项目编号:[230901]QTHC[GK]20220029项目名称:DNA测序仪采购方式:公开招标预算金额:2,900,000.00元采购需求:合同包1(DNA测序仪):合同包预算金额:2,900,000.00元品目号品目名称采购标的数量(单位)技术规格、参数及要求品目预算(元)最高限价(元)1-1其他政法、检测专用设备DNA测序仪1(台)详见采购文件2,900,000.00-本合同包不接受联合体投标合同履行期限:自合同签订之日起质保2年
  • 基因测序的云计算平台可能带来的变革与进步
    p  自二代测序的技术问世以来,就一直是研究和临床领域关注的重点。随着整个行业的技术发展,二代测序也带动了整个基因研究的产业链。在二代测序的产业链中,上游做检测,中游做分析,下游做应用。在测序价格持续下降的情况下,中游测序数据的生物信息学分析成为了提高效率最大的瓶颈。/pp  传统的测序数据分析依赖于本地服务器的性能。而可以预见的是不断下降的测序价格将会带来更多海量测序数据的产生,而巨大数量的测序数据无疑会延长获得测序分析结果的时间。目前可能较好的解决方法是通过云计算的方式去做,云计算的优势在于能够通过分布式计算对大数据进行处理,从而极大提升运算效率以及降低成本。/pp  目前国外的云计算平台Seven Bridge已经做的比较成熟,对二代测序数据也能够进行快速分析。缺点是作为典型的pipeline式分析,对用户的要求比较高,对于国内用户群体的使用会有一些障碍。而在国内的云计算平台中,GCBI将于2016年2月底发布新的全基因组测序分析平台,虽然还没有公布具体的信息,但是希望能够体现基本功能的高效率和高可用性。/pp  接下来我们看看在不同的领域,测序的云计算平台可能带来的变革与进步。/pp  strong科研领域/strong/pp  科研研究者一直是测序的重要使用群体,由于测序成本的持续降低及更多的测序服务供应商选择,可以预见的是测序数据的产量与规模大幅度提升。而这部分数据是必然需要分析的,在没有大规模数据分析平台之前,分析的效率受限于本地服务器的规模,数据量越大,分析的时间也越久。而测序的云计算平台将有望突破这个瓶颈,100个样本,1000个样本,分析的时间都仅跟1个样本的分析时间类似,这将极大降低用户的时间成本。预计随着数据分析平台化的出现,科研研究的周期将大大缩短。/pp  strong临床应用领域/strong/pp  在传统的诊疗模式下,临床医生需要各种检查数据以及查体来对病人进行诊断。一旦分子层面的检测在临床进行开展,云计算平台可以通过对同一种疾病临床数据及分子检测数据的收集和快速分析,对特定的病人给出相应的辅助诊断参考,甚至给予相应的用药方案。临床医生在合理应用的情况下,整个诊断的过程将会变得更快速以及更准确。如果未来疾病的发展演变成依据分子水平的变化进行分类,那么诸如GCBI等云计算平台对临床的帮助会更大。/pp  strong个人健康/strong/pp  随着测序技术在医疗领域的应用,市面上已经有不少针对个人健康的检测业务了,检测方法包括个人全基因组测序、定制化基因芯片等等。而这些数据的分析与解读也会随着检测成本的下降变得越来越普遍。当每个人都会去做这样的检测时,云计算平台将有望对这部分数据的快速解读提供可行的解决方案。个人用户将更快速地获取自己的结果报告。/pp  strong合作模式/strong/pp  鉴于生物信息云计算平台的强大功能,有望在平台与科研单位、临床研究者甚至企业之间搭建各种各样的合作模式。科研单位与云平台的合作能加快科研成果的输出,云平台可以帮助科研单位进行成果的转化与应用 临床研究者可以借助云平台进行辅助诊断,云平台通过临床数据的输入不断使诊断模型优化 企业通过云平台可以推广自有产品,云平台也可以给用户提供更多样的供应商选择。/pp  可以预见的是,生物信息云计算平台的强大能力不仅仅会体现在其计算能力上,临床应用,合作转化等方面都可以展现其潜力。就让我们拭目以待看看云计算平台的发展吧。/p
  • 赛纳生物B轮融资1.3亿元 国产高通量基因测序仪平台再迈一步
    p  近日,国产高通量基因测序仪平台厂商赛纳生物科技(北京)有限公司宣布完成B轮融资。继2015年获得通用技术创业投资有限公司及其管理基金的5000万元A轮投资后,赛纳生物B轮再获1.3亿元投资。本轮融资由东方翌睿(上海)基金和中关村发展集团启航基金联合领投,龙磐投资、京工弘元和比邻星创投跟投,A轮主投通用创投继续追加投资。/pp  赛纳生物是国内一家专业从事基因测序仪平台研发及产业化的高科技公司,响应国家精准医疗战略,致力于自主研发创新型基因测序仪及配套芯片和试剂,全面升级基因测序技术在疾病检测、疾病诊断和疾病筛查的临床应用。赛纳生物的核心测序技术来自于美国两院院士、北京大学未来基因诊断高精尖创新中心主任、国际著名科学家谢晓亮教授,和北京大学工学院教授、北大基因诊断高精尖创新中心研究员、曾任国家863计划“新一代测序仪及配套试剂研发”首席专家的黄岩谊教授团队研发的原创性基因测序技术,打造完全自主知识产权的测序技术平台。公司联合创始人兼CEO吴镭博士是美国芝加哥大学博士、麻省理工学院博士后,业内资深科学家和企业家,曾在美国创建AVIVA公司,归国后曾任Fortebio(中国)总裁,领导公司完成实时蛋白检测仪研发和企业并购。/pp  经过团队不断积累和苦心历练,赛纳生物在技术创新、产品研发和人才储备上有了长足的进步。目前,公司已经建立起一支多学科交叉型的高素质专业化团队,拥有各类专业技术员工近百人,其中研发部门博士和硕士学历人才各占1/3以上,仪器工程团队全部来自于国内顶级IVD企业,具有多年临床医学设备开发经验。赛纳生物已完成核心技术--荧光发生Fluorogenic技术和纠错编码ECC技术的研发、验证工作,并成功研制出了初代样机,样机在测序成本、测序精度、测序耗时等方面达到甚至超越国际可比机型。2017年9月,公司得到北京市科委对科技型中小企业促进专项的立项支持。本轮融资将帮助赛纳生物完成临床注册和产品上市。/pp  赛纳生物CEO吴镭博士表示:“自主开发具有高科技、低成本、技术上可以媲美国外同类设备、价格上适应中国市场临床实践和老百姓需求的高端基因测序技术平台是我们的梦想和追求的目标,这个目标与国家创新发展、提升中国智造水平的战略紧密结合。本轮融资成功,也说明这些优秀投资机构对我们实现目标充满信心。我们独有的创新技术,不断壮大的卓越的研发团队,以及各类合作伙伴所提供与嫁接的资源,都是我们成功实现战略目标的有力保障。”/pp  通用技术创业投资有限公司总经理包景明表示:“赛纳生物的测序平台和产品,将推动精准医疗更快更好的普及到中国广阔的临床医疗市场。”/pp  东方翌睿(上海)投资管理有限公司总经理张路表示:“赛纳生物所从事的原创型基因测序仪及配套芯片和试剂的研发,是整个基因测序服务产业链的制高点,技术壁垒高,增值能力强。我们非常看好这一领域,我们的投资目标就是要助力于类似赛纳生物这样的拥有核心专利、核心技术和核心产品的科技型公司加速发展。赛纳生物完全符合我们的期望。”/pp  中关村发展集团总经理助理龙宜彬表示:“未来中关村发展集团布局的核心产业是信息技术产业与大健康产业,集团在服务北京市建设全国科技创新中心的使命驱动下,正在积极布局相关产业链。我们惊喜地看到赛纳生物在短期内取得的研发成果,也切实感受到科学家严谨求实的工作态度和脚踏实地的作风。有北京大学这样的技术支撑和商业领头羊的成功经验指导,我们对赛纳生物的成长、对国家精准医疗的战略落地充满信心。”/pp  龙磐投资执行事务合伙人余治华表示:“赛纳生物的基因测序仪产品在基础构架、试剂、应用算法等各个环节都有自主创新的领先技术,基于新型的发光机制及算法初步形成了可与国际主流基因测序平台竞争的成本及效率优势,期望公司产品尽快推向市场。”/pp  strong关于通用创投/strong/pp  通用技术创业投资有限公司于2012年3月注册成立,以“技术引领创新,资本成就未来”为经营理念,其前身为通用技术集团投资管理有限公司股权投资部。通用创投公司的投资管理团队具有二十年专业投资经验。重点投资医药医疗、信息技术、高端制造等领域。/pp  strong关于东方翌睿/strong/pp  东方翌睿(上海)投资管理有限公司成立于2016年5月,由东方国际集团和上海东方证券资本投资有限公司联合发起设立,聚焦于健康医疗领域的先导性投资布局和战略性产业整合。主要股东包括:东方睿德(上海)投资管理有限公司、东方国际集团上海投资有限公司、东方国际创业股份有限公司、上海新农村建设投资股份有限公司、上海化工研究院有限公司、上海航盈信息科技有限公司。/pp  strong关于中发展启航基金/strong/pp  中关村发展集团成立于2010年4月,是北京市委市政府为进一步加快中关村示范区建设,加大市级统筹力度,运用市场化手段配置创新资源的国有大型企业。中关村发展启航产业投资基金是由中关村发展集团主导设立、倾力打造、独立市场化运作的高科技企业股权投资基金。基金立足于中关村国家自主创新示范区,依托发展集团广泛的政府背景及雄厚的产业资源,重点投资海内外前沿颠覆性的技术项目及有良好产业化发展前景、经济社会效益明显的高科技项目。/pp  strong关于龙磐投资/strong/pp  龙磐投资总部位于北京,是一家专注于中国境内生物医药领域投资机会的人民币风险投资公司。目前龙磐投资在管3只基金,管理总规模超过人民币20亿元,投资阶段覆盖早中期、成长期和成熟期。基金投资专注于技术先进型生物医药企业,重点市场细分包括化药创新药、生物创新药及高端医疗器械。现已投资生物医药企业数十家,投资的在售化药一类新药品种约占国内全部未上市药企化药一类新药品种的一半。龙磐投资可为被投资的中国创新药和创新器械企业提供其所亟需的全方位增值服务。/p
  • 基因测序纳入医保 二胎优生有望普及
    基因检测技术是生命科学和生物技术发展的重大革命。为加快基因检测技术普及惠民,推动重大创新成果产业化,近段时间,湖南省和贵州省相继发布了关于支持基因测序技术应用的政策。  贵州省:《支持基因检测技术应用政策措施(试行)》  日前,贵州省公开发布《支持基因检测技术应用政策措施(试行)》支持政策。政策主要支持以下九个方面:组建网络化基因测序机构体系、支持拓展业务空间、探索纳入医保报销范围、支持基因测序技术研发及产业化、支持人才队伍建设、加大融资支持、落实财税扶持政策、落实政府采购政策、加强组织协调。此次政策提出高龄单独两孩孕产妇出生缺陷基因筛查享受全免费政策。  完善基因检测收费标准体系:高龄单独两孩孕产妇出生缺陷基因筛查享受全免费政策。  为了推动基因测序普及,贵州政策探索多元化付费机制,总结黔西南州兴义市无创产前基因检测、新生儿耳聋基因检测、妇女宫颈癌(HPV)筛查试点经验,探索建立财政补贴、医保报销和个人自付共同承担的基因检测付费机制,适时向全省推广。加快推动治疗药物基因检测、罕见病基因检测按规定纳入医保支付范围。高龄单独两孩孕产妇唐氏综合征等出生缺陷基因筛查享受全免费政策。  支持拓展业务空间:运用基因检测技术开展精准医疗和个体化用药  政策提出支持基层医疗卫生机构将医学检验服务整体外包给具备资质的基因检测机构。鼓励有条件的地区,以政府采购方式推广新生儿遗传性耳聋、唐氏综合征等遗传性疾病基因筛查 采取政府采购和患者自付相结合的方式,开展针对地中海贫血的遗传筛查和产前诊断、高龄产妇无创DNA检测以及肿瘤、心脑血管疾病和感染性疾病等重大疾病的基因检测。依托贵州医科大学肿瘤医院建立精准医学中心,运用基因检测技术开展精准医疗和个体化用药,提高治疗有效性和安全性。  湖南省:《湖南省促进基因检测技术应用若干政策(试行)》  2015年8月28日,湖南省人民政府印发了关于《湖南省促进基因检测技术应用若干政策(试行)》的通知,为加快海南省基因检测技术的发展和普及,提出了12项政策,包括以政府采购的方式开展和推广遗传病基因检测、开展基因检测试点、大力推广个性化医疗、将部分基因检测费用纳入医保等。  根据此政策,湖南将选择一批试点地区开展基因检测技术应用专项行动,针对曾生育智力障碍患儿或夫妇之一系智力障碍患者的对象,且现无存活子女的计划生育特殊家庭,由省政府专项基金和指定有资质的医疗机构共同出资,免费开展“先证者诊断”及产前诊断服务,降低出生缺陷儿的出生概率。  基因测序纳入医保,二胎优生有望普及  二胎政策与基因测序千丝万缕的关联  近日,全面放开二孩的消息一时间炸开了锅,上了各大媒体的头条。关于二胎政策对基因测序领域的影响评估报道也越来越多。生育政策的调整,对于基因行业的从业者来说,特别是国内无创产前基因检测相关项目的企业,这既是一个机遇也是一个挑战。  根据广证恒生研报中的数据,二胎政策将使二代基因测序在优生优育领域的市场规模至少扩增到1.1-1.2倍,约为30亿元;无创产前检测(NIPT)作为二代基因测序应用最成熟的领域,二胎政策使或将使其市场将扩大至约200亿元;胚胎植入前遗传学诊断(PGD),即第三代试管婴儿,其市场扩容所需的三大催化因素是二代基因测序技术、政策放开和市场需求,因此,在具备了各方面条件后PGD市场将有望扩增至100亿元左右。  无创产前检测(NIPT)与二胎优生  进入新世纪,我国人口发展呈现出重大转折性变化。人口总量增长势头明显减弱,劳动年龄人口开始减少,老龄化程度不断加深,家庭养老抚幼功能弱化,少生优生成为社会生育观念的主流。此次二孩政策全面放开,优生依旧会是社会生育观念的主流。如何优生,这里孕妇的产前检测就扮演重要的角色。  无创产前检测(NIPT)在2011年底引入美国和西欧,并迅速商业化应用到中东,南美,南亚、东南亚,以及非洲。无创产前检测在我国正式进入轨道之前也遭遇了不少坎坷。2014年2月国家卫计委紧急叫停了国内无创产前基因检测等项目,然而2014年12月国家卫计委又谨慎的放开了包括遗传病诊断、产前筛查与诊断、植入前胚胎遗传学诊断等项目的试点应用单位,从此正式拉开了二代基因测序用于医学临床相关项目的序幕。  随着研究的深入,无创检测的条件和范围有望不断扩大,延伸至包括微缺失/重复综合征和常见的孟德尔遗传病等。检测染色体非整倍体的商业化进程正在提速,市场规模稳步增加。早期的染色体和其他遗传性异常检测为更好的孕期护理创造了条件,同时可以更为合理的调动有限的医疗资源服务于有遗传异常的新生儿的健康管理成为可能。  近年来,随着环境污染及生育年龄的延后,高龄孕妇越来越多,二胎政策放开后,高龄产妇的数量将会增加。研究显示,高危及高龄孕妇怀有染色体非整倍体与其他染色体疾病的风险显著升高。NIPT临床数据显示,高龄孕妇中三大染色体非整倍体阳性率约1.36%,高风险孕妇中三大染色体非整倍体阳性率约0.94%。无创产前检测的出现,使高龄及高危产妇的的产前诊断进一步优化。  基因测序纳入医保,优生渔翁得利  无创产前检测(NIPT)作为二代基因测序应用最成熟的领域,倘若基因测序纳入医保完全落实,那么二胎优生将渔翁得利。如今在国内,局部省份相继出台政策,贵州发布高龄单独两孩孕产妇唐氏综合征等出生缺陷基因筛查享受全免费政策。湖南省就计划生育特殊家庭免费开展“先证者诊断”及产前诊断服务,降低出生缺陷儿的出生概率。  此次贵州政府特别指出关于新生儿筛查以及高龄产妇产前检测的收费问题。为了完善基因检测收费标准体系,贵州省政府探索建立财政补贴、医保报销和个人自付共同承担的基因检测付费机制,鼓励有条件的地区,以政府采购方式推广新生儿遗传性耳聋、唐氏综合征等遗传性疾病基因筛查 采取政府采购和患者自付相结合的方式,开展针对地中海贫血的遗传筛查和产前诊断、高龄产妇无创DNA检测以及肿瘤、心脑血管疾病和感染性疾病等重大疾病的基因检测。此政策对于当地二胎优生无疑又是一重大利好消息!  备注:本文部分内容参考贵州省人民政府官网、湖南省人民政府官网、生物医学互助平台、健康点。
  • 5家进口+N家国产,单细胞测序平台大盘点!
    2009年,单细胞测序技术问世。2013年被Nature Methods评为年度技术。2015年以来,10X Genomics、Drop-seq、Micro-well、Split-seq等技术的出现。2018年以来,以新格元为代表的国内单细胞平台如雨后春笋般涌现。Fig 0 单细胞平台一览图详细了解厂商和各家产品之前,预告一下“第六届基因测序网络大会”,会议上德运康瑞、墨卓等企业的专家代表将有精彩的分享。马上免费报名吧!报名页面:https://www.instrument.com.cn/webinar/meetings/geneseq2023/一、低通量单细胞平台低通量的单细胞平台主要是基于smart-seq2技术原理开发而来,典型代表有Fluidigm C1™ 单细胞全自动制备系统和WaferGen ICELL8® Single-Cell System两大平台。1、Fluidigm C1™ 单细胞全自动制备系统Fig1.1 富鲁达C1单细胞系统  2012年6月13日,Fluidigm 在日本横滨举行的国际干细胞研究学会 (ISSCR ) 上发布了C1™ 单细胞全自动制备系统,是真正第一个实现商业化的平台。  C1单细胞自动制备系统微流体技术,可以同时捕获多个单细胞(IFC:~96 cells;HT-IFC:~800 cells),在同一张芯片上完成细胞捕获、裂解、逆转录及预扩增的全过程,完成smart-seq全步骤的自动化。2、WaferGen ICELL8® Single-Cell SystemFig1.2 宝生物iCell8单细胞平台  2015年2月份,Wafergen公司开发出ICELL8 Single-Cell System单细胞分选平台,后被TaKaRa公司收购。  利用WaferGen Smart Chip TE平台筛选细胞,5184个反应孔,可进行单细胞RNA测序样本的制备、扩增、表达谱建库测序、生物信息分析,可快速得到样本间的基因表达差异。  每次运行可分离500~1800个细胞; 细胞的捕获效率大约37%; 细胞适用范围为5-100um; 样本通量为8(一枚ICELL8芯片上一次最多可以分析8种细胞样品); 没有整合试剂,使用Takara试剂,需进行试剂优化; 自动成像技术系统:可实现单细胞反应孔可视化; 单细胞挑选软件:只挑选活的单细胞进入后续的处理,从而可以节约反应试剂,缩短数据分析时间。[点评]:虽然低通量测序现在不是市场上的主流,但是由于其实验的精密度是非常高的,已依旧没有被社会淘汰。二、高通量单细胞平台(进口)  2017-2018年,两大商业化的单细胞测序平台(10X Genomics, BD Rhapsody)出现,最终让单细胞测序技术进一步达到更大商业化。1、 Mission bio:专注于高通量单细胞DNA测序的平台Fig2.1 Mission bio Tapestri Single-cell Multi-omics Solution  Tapestri平台基于微液滴的微流控装置,利用油包水体系对细胞进行捕获与封装。封装时,细胞和蛋白酶等会被一起装入微液滴中,每一个微液滴相当于一个微容器。之后,细胞在微液滴中进行裂解、加条形码(barcoding)等步骤,再结合靶向 PCR 扩增技术,对特定的DNA目标序列与蛋白产物进行单细胞水平的建库。建库完成后,即可进行高通量测序和后续的生物信息学分析。• 专注单细胞DNA测序。• 高灵敏度,可检测含量低至0.1%的罕见亚克隆,以及突变的合子型和突-变共发生情况。• 多种检测类型,可检测SNV、InDel及CNV等多种变异类型。• 高通量,每个样本可测量5,000~10,000细胞。• 灵活性强,可定制化设计疾病基因检测靶点及CRISPR靶点 。2、Illumina® Bio-Rad®:基于数字PCR的高通量单细胞平台  2017年1月17日,Illumina公司和Bio-Rad实验室公司在JP摩根健康大会上发布了Illumina® Bio-Rad® Single-Cell Sequencing Solution。Fig2.2 Illumina Bio-Rad Single-Cell Sequencing Solution该系统包含Illumina® Nextseq 500和Bio-Rad® ddSEQ™ Single-Cell Isolator;Bio-Rad最好的液滴分离技术,Droplet Digital™技术,可以对单细胞进行隔离和编制条形码,然后在Illumina的许多主要NGS仪器上进行下游测序。• 可一次性检测8个样本,每个样本可以得到500~10000个细胞。• 捕获效率低,仅为3%,但测序成本相对较低。3、10x Genomics Chromium 高通量单细胞平台(controller/connect/X series)10X面对市场不同的需求推出了三款仪器。最早的这一款就是chromium controller,这款仪器配备了是标准通量和低通用的两款试剂盒。2021年的时候,10X上又推出了chromium X series这款仪器,目前这款仪器也是市场主推的一款。它适配的试剂盒的规格也更丰富。Fig2.3 10x Genomics Chromium 高通量单细胞平台另外10X推出的chromium connect仪器最大特点就是它能够实现从单细胞分离以及到最后NGS文库构建的一个全流程的过程,因此更加适合于一些大通量的实验室。• 每次运行提供8个通道,每个通道可以收集100-10000个细胞。(注:Chip M是16个通道)• 每次细胞分装运行时间为18min左右;• 细胞捕获效率最高可达65%;• doublet比例为0.9%/1000个细胞;• 针对单细胞ATAC分析,线粒体污染率低于2%;4、BD Rhapsody™:基于微孔板法的高通量单细胞分析系统  BD Rhapsody™单细胞分析系统包括BD Rhapsody™扫描仪和BD Rhapsody™ Express单细胞分析系统。BD Rhapsody™ Express 系统配备的专有单细胞捕获技术,以微孔为基础,稳定,能够捕获数百到数千个单细胞并为其打上条形码,分析基因组和蛋白质组信息。BD Rhapsody™扫描仪旨在可视化单个细胞捕获工作流程中的所有步骤,为每个步骤提供详细的分析度量,以便用户在整个工作流程中做出关键决策。Fig 2.4 BD Rhapsody™单细胞分析系统• 单细胞捕获效率:最高可达~80%• 单细胞检测通量:100-40000• 双细胞比例: ~2-3% for 10k cells load; ~8-10% for 40k cells load[点评]:1)10x Genomics仍是主力军,在国内拥有众多代理商和服务商,占据着80%左右的国内科研市场份额。同时该平台近两年注重空间组学平台开发,2022年推出了一系列新产品;10x Chromium X系列产品有多种应用类型,支持低中高3通通量模式,在推广上又与之前的Controller进行联动(增加保修年限),是10x的主力机型。2)BD Rhapsody™平台坚持微流控微孔板的原理,配备有扫描仪,可以实时监测单细胞状态,保证细胞的分离捕获效率;同时其配套有抗体和流式平台,在单细胞实验的组合解决方案上有明显优势(混样、与流式仪器上下互动组合)。3)Mission Bio单细胞平台专注单细胞基因组测序,在血液肿瘤方向深耕多年,接触临床应用时间较早;近些年在逐步增加国内服务商的覆盖,已有多家知名服务商与之合作。4)Bio-Rad与illumina合作推出的单细胞建库平台捕获效率较低,市场占有率及市场声音较低。点击图片即可报名参会,8位嘉宾将带来单细胞测序内容!三、高通量单细胞平台(国产)截止到2022.12.31,国内的单细胞平台共有10个,分为微流控微孔平台(以新格元Matrix系统为代表)和液滴微流控平台(以华大C4系统为代表)。1、新格元Singleron Matrix® 自动化单细胞测序文库构建系统可完成将单细胞悬液分散到微流控芯片的高密度微孔阵列中,并自动完成细胞分离、细胞裂解、细胞标记至mRNA捕获步骤,无需实验人员干预。Fig3.1 Singleron Matrix自动化单细胞测序文库构建系统• 单个样本单张芯片可捕获细胞数量500-30000个 • 每份样本捕获效率最高可达75% • 检测1000个细胞中含有双细胞的比例低于0.2%;[点评]新格元生物是国内首家一站式全方位的单细胞整体解决方案提供商,在产品方面既有单细胞转录组、核转录组、免疫受体等常规产品,同时也有单细胞转录动态监测、单细胞糖基化、单细胞靶向基因检测试剂盒等特色产品,能够给科研者提供更加多样的组学研究选择。是国产单细胞的主要玩家之一。2、华大智造:DNBelab C4高通量单细胞平台DNBelab C4是华大智造推出的基于负压的微流控单细胞技术。小巧轻便(长230mm、宽42mm、高57mm),无需电源,重量不到220g,操作简单,可随时开始单细胞建库。Fig3.2 DNBelab C4 Pocket Single-Cell Lab• 有效捕获细胞数:1000~12000 cells/run;• 细胞直径范围:5µm-25µm ;• 多胞率(Multiplet Rate):8% ;• 捕获效率:30~60% ;3、寻因生物:SeekOne双平台体系(微孔板平台+液滴油包水平台)寻因生物有单细胞标记两大主流技术:油包水法SeekOne® DD和微孔芯片法SeekOne®MM(Microwell & Magnetic Beads)。1)微孔芯片法MM  SeekOne MM(Microwell & Magnetic Beads)高通量单细胞转录组试剂盒基于微孔技术原理,通过微孔芯片SeekOne Chip实现单细胞捕获,并利用核酸修饰的Beads 对不同细胞来源的RNA 进行分子标记,最终构建兼容Illumina及华大智造测序仪的高通量单细胞转录组文库。Fig3.3.1 SeekOne MM平台(手动法)• 单次可放置1-4张芯片,单人操作可同时处理1-4个样本;• 单张芯片微孔数:17w;• 单张芯片捕获细胞数:500-10000 cells;• 捕获率:最高可达60%;• 双胞率: 0.7% / 1000 cells;• 无需其他昂贵硬件配套2)油包水法DD  液滴油包水平台(DD)是寻因生物的主力平台,并基于该平台开发了相应试剂盒,其主要有单细胞3‘转录组试剂盒和单细胞5’免疫受体试剂盒。• 芯片通量:1~8个样本,可以拆卸不会有芯片浪费;• 运行时间:3 min生成15万个油包水液滴;• 单通道细胞捕获:500-12000 Cells;• 双胞率:0.3% / 1000 cells;[点评]寻因生物尽管对外宣称具有MM和DD双平台,但整体推广上仍侧重DD平台,并依托其可拆卸的芯片实现更加灵活的实验安排。目前该公司产品相对较单一,公司在推广上发力比较多,推出了相当多的视频专题进行客户教育,算是不错的行业先行者。4、墨卓生物在过去的2022年中,墨卓生物对外发布了单细胞液滴微流控平台及其试剂盒、微生物高通量单细胞基因组测序产品。其中单细胞液滴平台MobiNova-100引入了光激发分离(Light-CUT专利技术)原理,可以在单细胞核酸捕获阶段将分子标签与微珠进行分离,因此在实验中需要专门的配套设备。Fig4.1 墨卓生物单细胞仪器• 芯片通量:1~4个样本;• 试剂盒种类:目前仅有单细胞3‘转录组试剂盒;• 运行时间:10 min;• 单通道细胞捕获:500-20000;• 双胞率:5% / 10000 cells;此外墨卓生物还推出了MobiMicrobe 微生物高通量单细胞基因组测序解决方案及其仪器产品M1,主要是在菌株水平分析宿主-噬菌体关联信息及转录转移事件。• 样本通量:每次可处理1个样本;• 捕获通量:每个样本可捕获微生物细菌数量≥6000个;• 仪器配套高速相机,能够观测微芯片中微滴发生和融合;• 仪器配有低温存储模块能,可同时放置4个0.2 mL PCR反应管和4个1.5 mL离心管;• 仪器配有扩增模块(96x0.2ml,12x8连管或96孔 PCR板)• 仪器带有自检功能:仪器在开机和运行过程中会自动检测,遇到异常会发出报警提示。5、其他除了以上4个国产单细胞平台之外,在过去的两年中还出现过一些平台公司,他们均采用液滴法来作为技术源头,并处于早期产品阶段,以单细胞转录组、免疫受体等作为主推产品,为客户提供产品或者服务。这些厂家有万乘生物(10K genomics)、百迈克生物、跃真生物(m20 genomics)、德运康瑞、纯迅生物等。总结  截至2022年12月,目前国内市场共有2个低通量进口品牌、4个高通量进口品牌和10个国产品牌,均有各自的公司定位和产品体系以及对应领域解决方案。  纵览2022年国内市场单细胞信息,主要特点有:• 单细胞新平台频出。如墨卓,M20,百迈客均是2022年推出单细胞平台。• 单细胞平台特点突出,各有产品和市场定位,有从单品到一站式解决方法成长的趋势。• 单细胞市场更为成熟。各家单细胞平台对内完善了团队建设,对外加强服务商或产业端的合作。• 空间技术应用。10X主推空间原位,德运康瑞收购先能原位,华大和百迈客主推基于测序的空间技术。• 单细胞多组学,有单细胞平台的厂家基本在或计划开发单细胞多组学(免疫,表观,蛋白,突变,全长)产品矩阵。• 单细胞技术应用方向扩展到动物,植物,微生物。如联川,诺禾推出农口单细胞激励计划,BD联合华南农大推出经济作物单核文库构建方案。(信息来源于生物医学小站)第六届基因测序网络大会进入报名页面:https://www.instrument.com.cn/webinar/meetings/geneseq2023/点击图片报名
  • ​因美纳推出首创产品,可在同一台仪器上实现长读长和短读长测序
    美国加利福尼亚州圣迭戈——2023年3月14日,全球基因测序和芯片技术的领导者因美纳(纳斯达克股票代码:ILMN)宣布,其首款基于新型Illumina Complete Long Read技术的产品现已接受订购。Illumina Complete Long Read Prep, Human,这一高性能、长读长的人类全基因组测序(WGS)分析方法,兼容因美纳NovaSeqTM X Plus、NovaSeqTM X和NovaSeqTM 6000测序系统。该技术首次支持用户在同一台因美纳测序平台上获取长读长和短读长数据。相较其他长读长技术,Illumina Complete Long Reads提供了更简单的工作流程,并且降低了DNA起始量的要求。Macrogen NGS部门负责人HyungIl Lee表示:“Illumina Complete Long Reads相较其他长读长技术更简便。我们可以用低DNA起始量的样本进行长读长文库制备,并且不需要其他技术所需的许多材料和设备。”探索更多最具挑战性的基因组区域一小部分基因组区域受益于更长的读长,可实现针对这些区域的分辨率和定位的提升。通过探索这些难绘制的区域,因美纳长读长数据为推动遗传病检测发展提供了额外的工具。这使得科学界能够通过大规模检测全部基因组变异来推进研究,更好地促进遗传病研究和药物基因组学领域的发现。Illumina Complete Long Read Prep结合了因美纳边合成边测序(SBS)技术和DRAGEN二级分析,可生成高准确度的全基因组测序(WGS)数据。Illumina Complete Long Read Prep, Human测序分析方法的价格包含了短读长和长读长文库制备、测序和云分析。在使用NovaSeqTM X Plus测序平台和单个25B测序流动槽的条件下,这一产品的促销价格为每个全基因组1,350美元,并将于今年晚些时候上市。因美纳首席技术官、研究与产品开发负责人Alex Aravanis表示:“许多长读长测序解决方案一直饱受DNA起始量要求高、工作流程复杂且通量低、结果高度差异化,以及需要专用长读长仪器的困扰。Illumina Complete Long Reads克服了这些痛点及相关成本,可帮助基因组实验室更易获得并简化长读长测序。”率先体验客户分享的数据证实了技术的准确性和灵活性 在2022年9月的因美纳基因组学论坛上,因美纳首席技术官、研究与产品开发负责人Alex Aravanis展示了与PrecisionFDA Truth Challenge v2基准数据集比较获得的Illumina Complete Long Read初步性能数据。使用Illumina Complete Long Reads和DRAGEN分析获得的F1评分为99.87%(精确率和召回率的复合统计数据)。在2023年2月的基因组生物学技术进展大会(AGBT)上,率先体验客户分享的数据证实了Illumina Complete Long Reads具有高准确度和灵活的DNA起始量,并且能够降低成本,简化操作。维康桑格研究所测序研发首席科学经理Michael Quail博士表示:“这项技术的文库制备简便,起始量要求灵活。数据的准确性以及可以在因美纳测序仪上生成的读长和相块给我们留下了深刻的印象。”因美纳计划将这项技术作为长读长应用开发的平台。2023年下半年,因美纳将推出富集检测,这是一种更具经济性、通量更高的靶向解决方案,将专注于已知可从长读长的额外洞察中受益的基因组区域。未来,因美纳将探索全基因组测序(WGS)和非人源样本以外的其他应用。关于因美纳因美纳公司致力于推动和激发基因组学的发展而不断改善人类健康。专注创新使我们成为全球基因测序和芯片技术的领导者,并为全球范围的科研、临床和应用市场客户提供专业服务。我们的产品广泛应用于生命科学、肿瘤学、生殖保健、农业及其他新兴领域。欲了解更多信息,请访问因美纳中国官网或关注因美纳微信公众号。
  • 2020万!武汉大学流式平台和单细胞测序平台采购项目
    一、项目基本情况项目编号:ZB0107-202304-ZCHW0367项目名称:武汉大学流式平台和单细胞测序平台采购项目预算金额:2020.0000000 万元(人民币)最高限价(如有):2020.0000000 万元(人民币)采购需求:本项目分成2个包,投标人可兼投兼中,如投两个包则需分开编制标书 ,本项目接受进口包号包号名称货物名称单位预算(限价)是否接受进口备注01包流式平台高端分选型流式细胞仪1套450万元接受核心产品高端分析型流式细胞仪1套350万元接受02包单细胞测序平台单细胞测序建库系统1套780万元接受核心产品高通量测序仪1套440万元接受合同履行期限:交货期:合同签订后90日内 ,质保期:验收合格后至少1年本项目( 不接受 )联合体投标。二、获取招标文件时间:2023年04月19日 至 2023年04月24日,每天上午8:00至12:00,下午12:00至17:00。(北京时间,法定节假日除外)地点:阳光招采电子招标投标交易平台(网址:https://www.yangguangzhaocai.com/)方式:1.拟参加本项目的投标人须在阳光招采电子交易平台免费注册(网址:https://www.yangguangzhaocai.com ---【新用户注册】,相关操作帮助详见:帮助中心--- 投标人注册操作指南); 2.注册完成后,请于 2023 年 4 月 19 日至 2023 年 4 月 24 日17:00时止(北京时间)登录电子交易平台,点击【投标人】,在【公告信息】---【采购公告】栏下载采购文件,300元/份(包),售后不退。联合体参与响应的,由牵头人注册及下载采购文件。未按规定获取采购文件的,其响应文件将被否决; 3.本项目非全流程电子标,投标人无须办理CA数字证书; 4.在电子交易平台遇到的各类操作问题(登录、注册认证、报名购标、制作及上传标书等问题),请拨打技术支持电话010-21362559(工作日:08:00~18:00;节假日:09:00~12:00,14:00~18:00); 5.企业注册信息审核进度问题咨询电话:027-87272708; 项目具体业务问题请向代理机构联系人咨询(联系方式详见本公告第七条)。售价:¥300.0 元,本公告包含的招标文件售价总和三、对本次招标提出询问,请按以下方式联系。1.采购人信息名 称:武汉大学本级     地址:武汉市武昌区八一路299号        联系方式:吴老师 027-68754589      2.采购代理机构信息名 称:湖北国华项目管理咨询有限公司            地 址:武汉市武昌区中北路109号中铁1818中心10楼            联系方式:杨楚君 王丹萍 王刚 刘晓栋 张靖佶 027-87271918            3.项目联系方式项目联系人:杨楚君 王丹萍 王刚 刘晓栋 张靖佶电 话:  027-87271918
  • 亚洲首台HiSeq X Ten高通量全基因组测序仪落户上海
    云健康 Illumina HiSeq X Ten 全基因组测序、云健康基因科技和云健康生命中心运营启动仪式  1月20日,云健康宣布启动Illumina HiSeq X Ten全基因组测序,同时旗下云健康基因科技和云健康生命中心正式运营。云健康的成立和运营将为中国健康产业带来积极的影响与创新发展模式。  据介绍,作为基因测序平台的世界知名供应商,2014年,Illumina发布HiSeq X Ten高通量全基因组测序技术平台。云健康与Illumina达成战略合作伙伴协议,将亚洲首台用于大健康领域的HiSeq X Ten引入上海,率先推进HiSeq X Ten在健康和临床研究领域内的应用。Illumina HiSeq X Ten作为目前最稳定,最精准的全基因组测序平台,只需要几毫升血液就可以完成全基因组测序,对于探索DNA密码,了解自身遗传背景,研究自身健康状况有着更为先进和科学的指导作用。  Illumina亚太区副总裁Tim Orpin解读了Illumina HiSeq X Ten全基因组测序仪的优势:(一)稀缺性:目前全球仅10余台战略性投放,数量稀少。(二)高通量:目前世界上测序通量最高的平台,整套系统一年能完成1.8万人的全基因组测序。(三)高精度:采用目前世界上被采用最广泛的边合成边测序技术,以及国际/国内专家联合分析测序结果,数据精度通过时间的检验。(四)低成本:作为最科学、最先进的健康评估手段,全基因组测序在很长一段时间因高昂的费用和冗长的时间成本让大众望而却步,但目前全基因组测序成本的下降已经满足大众所能承受的水平。  云健康医疗科技集团合伙人、总裁、国家千人计划特聘专家,金刚博士强调了X Ten技术对未来大健康领域研究和应用的影响:&ldquo X Ten技术使得全基因组测序不再是昂贵的服务。全基因组测序应用即将普及到每一个生命科学研究实验室,即将走进普通百姓的健康评估应用,成为个性化健康管理和疾病治疗研究的主流检测技术。&rdquo   云健康医疗科技集团董事长高宝君表示,云健康产业链由云健康基因科技、云健康生命中心、云健康诊所、云健康大数据、云健康样本库、云健康基因研究院六大平台组成。云健康在技术上拥有三大突出优势:基因检测技术、抗衰老调理技术、抗肿瘤个性化诊治技术。云健康致力于应用国际目前最先进的基因和医疗技术倡导和引领预防医学,预治未病事业的发展,引入全球最先进的Illumina HiSeq X Ten高通量全基因测序仪、德国尖端慢病绿色调养及日本细胞还元工法,整合国内外一流的医疗资源,同时藉由商业地产运营经验,通过多合作、大资源、多渠道,真正联合实现大科学和大产业的全面发展。
  • 高效测序仪问世 1天绘个人完整基因测序
    2012年1月10日,在第30届摩根大通医疗卫生年会上,Life Technologies公司与Illumina公司纷纷以&ldquo 1天内绘制出人类基因组序列&rdquo 为品牌宣言,先后推出了最新的高效测序仪产品。就目前了解情况来看,这两款最新测序仪之间的最大差异主要集中在成本与质量两方面。Ion Proton 基因测序仪  PGM测序平台是Life Technologies公司2010年底推出的首款半导体个人化操作基因组测序仪(Ion Personal Genome Machine,简称:PGM)。而此次,Life Technologies公司隆重推出的Ion Proton测序仪正是PGM测序平台的新一代产品。  Ion Proton测序仪是一台新型台式测序仪,体积如办公室打印机般大小,标价约为14.9万美元。Ion Proton测序仪仅需1天便可完成个人完整基因测序,而费用仅为1000美元,今后人们根据基因资料得到个性化医疗的愿望或将成真。  该公司总裁兼首席执行官Greg Lucier先生表示,Ion Proton第一代芯片技术将使外显子组测序成本降低至500美元,成为外显子组测序工作者的理想选择,预计将于2012年中期对外供应;而Ion Proton第二代芯片产品则主要应用于人类基因组测序领域,大概在6个月后将会向用户提供。目前,贝勒医学院、耶鲁大学医学院和Broad研究院作为Ion Proton Sequencers的第一批用户,已经与Life Technologies分别签署了多张订单。HiSeq 2500基因测序仪  巧合的是,在同一天,Life Technologies公司的竞争对手Illumina公司也推出了最新版本的HiSeq测序仪,该仪器同样能够在1天内绘制出人类基因组序列,但Illumina公司并未透露其成本。此次,Illumina公司推出的HiSeq 2500基因测序仪将HiSeq 2000和MiSeq平台的先进技术进行了有效的整合,并加入了最新概念,可以帮助研究员和临床学者在24小时内对整个基因图谱进行排序。  据了解,Illumina公司的Hiseq 2500标价74万美元,若从69万美元的HiSeq 2000升级就只需花费5万美元。目前,HiSeq 2500测序仪已在一些从事诊断业务的公司得到使用,例如Genomic Health公司、Sequenom公司等。  同时,Illumina公司在内部也已使用该仪器,并在2012年第一季度对外服务,预计在2012年下半年可以将HiSeq 2500商业化,开始向用户发货。而从2012年中期开始,全部新用户和老用户的MiSeq性能都能得到提升。
  • 突破1000台 | 华大智造国产基因测序仪全球装机量再创新高
    导语:2019年1月6日,美国加州,China Focus@JPM Week ,华大智造首席运营官蒋慧博士宣布华大智造国产基因测序仪全球装机量突破1000台,已在全球16个国家获得使用,累计产生的运行数据达20Pb。华大测序仪在全球基因测序行业发挥着越来越重要的作用。韩国LAS实验室主任金东浩博士从事着基因组学研究和基于NGS的临床诊断应用开发,日前,他的实验室安装了华大智造的第1000台测序仪。金博士评价道:“MGISEQ-2000测序仪是一个非常棒的选择,我们在MGISEQ-2000平台上进行了DNA和RNA测序,它操作友好、测序准确度高,而且运行成本相对较低。” 注:LAS (Life is art of science Co.,Ltd .)是BMS的兄弟公司,是一家致力于韩国基因组研究和基于NGS的临床诊断应用的公司。“最近几周,MGISEQ-2000在中国、俄罗斯、墨西哥、日本等地同步装机。这一突破,离不开全球测序仪用户对我们的支持和信任,也离不开我们的专业团队。”蒋慧表示,“我们目前在全球拥有9个驻点国家、24个驻点城市,1支100人以上队伍,包括技术支持专家、领域应用科学家、售后工程师等高级人才,提供4小时电话响应和2个工作日到场响应的全球化标准服务,充分保证了全球测序仪的常规化运行。”华大智造首席运营官蒋慧博士在China Focus@JPM Week上演讲自2015年起,华大先后发布BGISEQ-500、BGISEQ-50、MGISEQ-2000和MGISEQ-200,这四款测序仪涵盖了高中低通量,并且都已经获得NMPA认证,不仅在科研领域开始大规模应用,在临床医学领域也开拓着越来越多的应用。2018年10月,华大智造发布全球最强日生产能力的MGISEQ-T7,单日数据量高达6Tb,每日可完成60例WGS。目前华大智造已向全球近260家客户输送了1000台中国制造的基因测序仪。 华大智造一直在探索如何为完美测序提供更好的工具和平台。在测序前处理部分,MGISP系列自动化样本制备系统,能够单次建库8-96例样本,致力于解决手动建库难的问题;在测序后下机数据分析方面,华大智造生信分析加速器MegaBOLT带来15倍以上计算加速,极大降低基因测序分析时间。 如今,华大智造自主研发的测序平台在全球得到越来越多的认可与支持,华大智造将不断突破和创新, 实现更多生命科学领域仪器设备研制,为行业发展提供更好的工具支持, 真正践行“基因科技造福人类”的目标。
  • 华大基因研究院“挺进”智慧海洋 今年将引入多台更大规格测序仪
    p style="text-align: center "strongimg src="http://img1.17img.cn/17img/images/201803/insimg/d8803bfa-4095-4c97-82fc-f89201e44a3f.jpg" title="NewsDataAction-2.jpeg"//strong/ppstrong  青岛华大基因研究院“挺进”智慧海洋/strong/pp  马氏珠母贝、凡纳滨对虾、斑石鲷、中华白海豚、肺鱼、云纹石斑、双斑东方鲀??这一个个并不为人熟知的海洋生物,已经在中德生态园青岛华大基因研究院的攻关下成功完成基因测序。伴随着9台测序仪的日夜运转,一个个海洋生物奥秘被成功“解密”,青岛华大基因研究院正全力向着智慧海洋“挺进”。/ppstrong  213种海洋生物列入基因测序计划/strong/pp  “作为国家‘海洋强国’战略的重要技术平台,青岛华大基因研究院的定位就是实现对全球重要海洋生物资源的收集和保存,并在未来海洋渔业种质资源育种、海洋药物研究开发、海洋生态保护等方面提供重要技术支撑。”青岛华大基因研究院执行院长刘心向记者表示。/pp  在他的办公室里,记者见到了已经完成基因测序的34种海洋生物名单。这一系列成果来之不易,需要自动化样品处理系统、核酸提取仪、打断仪、封膜机、条码打印机、高速离心机、PCR仪等科研设备的协同努力。更为重要的贡献来自于这里超强的科研队伍,这支山东省最大的高水平基因组学研究团队,目前已经汇聚了198位科研及支撑人员,其中硕士研究生及以上学历工作人员超过71%,博士及以上学历超过30人。/pp  2012至2016年间,华大在全球高质量科研产出排名中位列第十二位,在中国排名榜首。青岛华大基因研究院的科研能力同样“惊艳”。据统计,2017年青岛市科研机构在生命科学领域发表的影响因子超过20分的科研论文共计9篇,而青岛华大基因研究院就占据了5篇之多。/pp  眼下,这支科研队伍将目标投向了更深的海洋。刘心介绍,青岛研究院目前正在测序的海洋生物有38种,另有213种海洋生物已经列入基因测序计划。很显然,要完成这一超大基因测序任务,9台测序仪已经满足不了需求。“今年年中,研究院将新引入5台更大规格测序仪,每台的测算能力相对于目前测序仪机型将有很大提升。”/pp  这些测序仪的测算能力究竟有多强?刘心打了一个比方说:“仅目前的这9台测序仪每年就能产出基因数据150Tb,数据量相当于15万部高清电影。”/ppstrong  打造全球最大的海洋基因库/strong/pp  这一批批海洋生物基因数据,源源不断地汇入了位于中德生态园的国家海洋基因库。这个目前全球唯一在建的集海洋生物资源收集和海洋生命数字化于一体的综合性国家海洋基因库,已然发展成为全球海洋生物资源的超大型、公益性基础研究和支撑技术平台。该平台的建设进一步奠定了青岛“国际海洋研究中心”的地位,并成为海洋生命产业发展的催化剂,为“蓝色经济”国家战略在青岛落地做了最好注脚。/pp  为了保证样本的存储,青岛华大基因研究院研发了国内首套超低温自动化冷库。这一面积为60平方米的冷库,时刻保持着-80℃低温环境。水产养殖区是研究院活体库的核心部分,鱼类、贝类和藻类的养殖展示中心设置在办公楼的1至3层,面积达540平方米,可以养殖各种鱼类、贝类和中型藻类,配备着各类水产养殖监控监测设备,包括机械设备故障报警、水质参数监控报警、水位和压力报警。/pp  2017年是青岛华大基因研究院的开局之年。在刘心看来,这一年最主要的成果包括基因测序稳步开展、科研项目进展顺利、团队建设有声有色,以及应用成果在青岛实现了落地。全国首个具备200万份自动化、可溯源的超低温自动化冷库,可满足5PB的数据存储和7X24X365数据访问能力的海洋生命大数据库,以及山东省最大的基因组测序和DNA合成平台,这些都成为了青岛华大基因研究院第一年打拼出的厚实“家底”。/ppstrong  基因测序的“神秘力量”/strong/pp  与那些珍贵又“高冷”的基因数据相比,基因测序在实际生活中的应用更受人关注。/pp  2017年4月,华大基因与西海岸新区管委合作的“妇女和新生儿基因检测民生项目”启动,西海岸新区成为“全球首个百万级人口城区实现基因检测民生全覆盖”的地区。这一项目内容涵盖孕妇无创产前基因检测、新生儿遗传性耳聋基因检测、新生儿遗传代谢疾病检测、妇女宫颈癌预防(HPV基因)筛查等,通过提早预防、干预和治疗,节省家庭和社会经济负担,按照目前西海岸民生项目成果测算,该项目的公共卫生投入产出比超过1:10。据统计,已累计检测出数百个异常患儿和100多位宫颈癌癌前病变患者,避免了数百个家庭“因病致贫,因病返贫”的悲剧发生。/pp  “未来三到五年,我们希望能在全省范围内逐步推广西海岸新区的精准防病模式,降低已知、可干预的出生缺陷,逐步在更大范围内消灭宫颈癌,将肿瘤患者5年生存率大幅提高。”刘心说。/pp  与此同时,研究院的科研成果在肿瘤疾病用药指导上也有了新突破。“以肺癌为例,针对肺癌的药品很多,通过基因检测,可以检测出哪些药物对该癌症患者能真正起作用,这一应用目前在包括青岛在内的许多城市都已经推开。”刘心告诉记者。此外,病源检测也是应用成果之一,通过基因检测能够查明未知病源,从而为治疗提供精准方案。/pp  国家海洋基因库、海洋产业孵化中心、海洋科研教育中心、青岛华大基因研究院拥有着全球领先的技术平台和科研能力,在一组组海洋生物基因的保存、读取和分析中,在一项项基因测序成果的转化应用中,智慧海洋已经触手可及。/p
  • 吉因加国产测序平台获准RNA预期用途
    近日,国家药品监督管理局(NMPA)官网公开信息显示,已批准吉因加自主品牌国产基因测序仪Gene+Seq-2000和Gene+Seq-200的适用范围变更申请。两款仪器分别于4月14日和4月27日通过审批,新增了“对核糖核酸(RNA)进行测序”的适用范围。在基因检测应用场景不断扩展的今天,单纯的DNA测序无法满足迅猛增长的临床需求,而RNA测序扮演者越发重要的角色,国产测序平台在该领域获批应用,为临床提供了更加丰富的选择,必将更好地支撑起相关产业的发展,推动NGS技术在临床合规落地。 吉因加表示:根据《医疗器械监督管理条例》、《医疗器械注册管理办法》等相关法律法规的要求,应用于临床的医疗器械产品应具备相应的适用范围并获得国家药品监督管理局批准。但是,目前市面上的测序仪大多是“在临床上用于对来源于人体样本的人的脱氧核糖核酸(DNA)进行测序”,例如聚焦生育领域DNA检测、肿瘤DNA检测以及遗传病DNA检测等,不包含人的RNA,也不包含来源于人体样本的病原的DNA和RNA检测等应用,不能够完全满足目前临床合规开展各类基因检测的需求。 本次Gene+Seq-2000和Gene+Seq-200获批 “可用于人体样本的不仅限人的DNA和RNA测序”,可以检测包括肿瘤融合基因、病原RNA、全转录组等多种需求,可以真正实现DNA和RNA基因检测需求的全覆盖。测序仪适用范围/预期用途Gene+Seq-200该产品采用联合探针锚定聚合测序技术,在临床上用于对来源于人体样本的脱氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)进行测序Gene+Seq-2000该产品采用联合探针锚定聚合测序技术,在临床上用于对来源于人体样本的脱氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)进行测序测序仪A该产品用于对来源于福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织的人基因DNA测序测序仪B该产品用于人脱氧核糖核酸(DNA)测序测序仪C该产品基于边合成边测序技术,在临床上用于对来源于人体样本的人的脱氧核糖核酸(DNA)进行测序在临床应用方面,其实已经有较为成熟的RNA应用场景,比如对肿瘤融合基因的检测。DNA测序在检测融合基因时,对于仅发生在RNA或DNA层面融合丰度低的情况,以及对于存在长内含子或重复序列融合的情况均存在局限性,而RNA测序除了能够有效检出这些融合之外,还能发现更多未知融合,为未来的药物研发提供更丰富的信息。目前,已有多项研究证明,将DNA检测与RNA检测相结合,可以实现核心治疗靶点及罕见、有效的融合变异的同时测定,弥补常规检测方法可能出现的漏检、融合基因不明确等不足,有效提高融合基因检出率,更好地帮助医生进行临床诊断及治疗。因此,多项指南都在推荐将DNA检测与RNA检测相结合,以更全面覆盖基因融合/重排,更大程度地提高临床获益。
  • FDA要求因美纳全球召回近1813台测序仪,包含中国市场!
    6月13日,美国FDA官网发布医疗器械召回通知,要求因美纳(illumina)全球召回1813台测序仪,涉及中国市场的产品为illumina REF 20014053 Model: MiSeq Dx。 FDA称这些测序仪存在二级安全问题,即被召回的医疗器械产品可能会引起暂时的或可逆的健康问题,或者有一定机会引起严重的健康问题或死亡。 被召回的测序仪包括:illumina Model NextSeq 550 Dx REF 20005715,数量为799台。illumina REF DX-410-1001 Model: MiSeq Dx;illumina REF 15036706 Model: MiSeq Dx;illumina REF 20014053 Model: MiSeq Dx ,数量为1014台。  此前FDA曾公开警告illumina多款测序仪存在信息安全漏洞。FDA在公开信中详细通告了illumina测序仪软件存在严重缺陷,并进一步指出这个缺陷会导致未经授权的用户可以远程获得测序仪的控制权,修改测序仪的配置、软件以及测序仪网络中的数据,修改或者损坏测序仪的临床诊断结果并提供伪造的假结果。FDA称,正在与illumina合作,并与CISA协调,以识别、沟通和预防与此网络安全漏洞引发的不良事件。 Illumina为全球知名的基因测序企业。根据前瞻研究院的数据显示,illumina占到了全球基因测 序市场83.9%的份额,受FDA警示事件等影响,截止6月13日,跌9.64%,报202.82美元,总市值319亿美元。
  • 中科院建基因组测序平台联盟 减少仪器重复购置
    近日,在中国科学院条件保障与财务局的支持和推动下,中科院基因组测序平台联盟成立大会暨签约仪式在中科院北京基因组研究所召开。条财局副局长曹凝及中科院广州、武汉、上海、昆明及北京各区域中心专家代表和部分研究所代表共计20余人出席会议。  会上,北京基因组所副所长、党委副书记王丽萍首先对各位领导和专家的到来表示欢迎,并向大家介绍了本次测序平台联盟成立的背景及意义。接着,曹凝指出,随着测序仪的更新换代和测序技术的迅猛发展,对相关生命科学研究所在基因测序仪购置、共享以及技术交流等方面提出很多挑战,也出现很多机遇,希望借助测序联盟的成立,统筹规划推进基因组测序平台建设,增强院内技术协同交流,统筹实施&ldquo 十三五&rdquo 规划。  随后,各区域中心代表以及各研究所代表进行了联盟成立签约仪式。  签约仪式完成后,北京基因组所科技处处长吴佳妍汇报了联盟2015年年度工作计划,与会专家代表进行了充分的交流讨论,并给出了建设性意见建议。  该联盟的成立将促进中科院院内各测序平台间的交流和共享,减少仪器设备重复购置,实现资源整合和有效配置,继而提升中科院基因组研究的整体能力。
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