基因甲基化检测

8月8日，国家药监局官网发布医疗器械批准证明文件（准产）待领取信息，文件显示，上海捷诺生物科技有限公司的人ASTN1、DLX1、ITGA4、RXFP3、S0X17、ZNF671基因甲基化检测试剂盒（荧光PCR法）于8月4日获得批准，注册证编号为20223401036。上海捷诺生物科技有限公司（以下简称“捷诺生物”）隶属于中国医药集团有限公司（以下简称“国药集团”）中国生物技术股份有限公司（以下简称“中国生物”），是中国生物旗下专业研发、生产、销售国内外医疗器械和体外诊断试剂的企业。捷诺生物的医学诊断是中国生物规划发展的重点板块之一，也是领衔中国生物混合所有制改革的第一家，旨在以体制机制创新来促进诊断业务的迅速发展。2019年，捷诺生物完成了国药集团内第一个对国外公司股权收并购项目，启动了海外研发中心建设，进一步加快引进国际先进技术，拓宽国际化布局的进程。捷诺生物定位于IVD领域全球领先技术产业化转化平台，产品集中于传染病病原体的多重检测和肿瘤的分子诊断，主要有宫颈癌甲基化检测试剂盒，呼吸道、脑炎/脑膜炎、肠道、中枢神经系统、优生优育生殖道感染单管多重病原体核酸检测试剂盒等，服务于各大临床医院、疾病预防控制中心、检验检疫局等。2020年捷诺生物针对新冠疫情快速响应，迅速投入研究开发，经过设计、优化和试验，成功研制出新型冠状病毒核酸检测试剂盒，第一批取得了国家药品监督管理局颁发的医疗器械注册证，并通过了欧盟CE认证，被列入世界卫生组织（WHO）应急使用采购清单。同时，捷诺与英国牛津大学合作，共同开发的新冠快速核酸检测试剂盒，已获批进入商务部防疫物资出口白名单。

近日,国家卫生健康委临床检验中心 (NCCL) 公布了《2023年全国SDC2基因甲基化检测室间质量评价预研活动结果报告》,华大基因旗下深圳、武汉、天津3地医学检验所均以满分成绩通过。这是5月华大基因深圳、天津医学检验所满分通过全国肿瘤游离DNAEGFR基因突变检测室间质评以来的再次满分认证通过,多次获得国家权威机构组织的充分肯定,证明了华大基因在肿瘤防控领域的专业检测能力。华大基因多家医学检验所满分通过室间质评华大基因十分注重医学检验所的质量管理。从2020年参与室间质评以来,多次以满分高分通过国家级室间质评。此次室间质评是国家卫健委临床检验中心首次针对SDC2基因甲基化检测面向全国医疗机构/临床实验室开展的室间质量评价,通过SDC2基因甲基化检测的定性检测,对临床实验室进行质量评价。华大基因三家医学实验室采用华大基因自主研发的粪便DNA甲基化检测试剂参加本次室间质评,阳性符合率和阴性符合率均为100%,满分通过该项能力验证,这也充分证明了华大基因粪便DNA甲基化检测技术的稳定性与高质量水平。在加速技术创新及完善实验室质量管理体系的同时,华大基因基于粪便DNA甲基化检测技术推出多款基因检测方案,其中,采用荧光定量PCR技术的华常康[gf]ae[/gf]粪便DNA甲基化检测,能够通过检测粪便携带的肠道脱落细胞中的3个肠癌相关基因 (SDC2、ADHFE1、PPP2R5C) 的甲基化水平,从而评估受检者罹患肠癌的风险。此外,华大基因为检测试剂提供配套处理系统,实现低中高通量的结直肠癌防控一站式自动化整体解决方案,为合作伙伴打造疾病检测和肿瘤防控“平急两用”通用型平台。近年来,华大基因始终坚持“防大于治、人人可及”的公共卫生普惠精准防控理念,不断创新技术,推动普惠民生项目。未来,华大基因仍将积极探索新模式、新思路、新技术与新场景,将基因科技赋能精准医学, 为加快实现‘健康中国2030’贡献科技力量。

近日，化学化工学院王家海教授团队开发了基于纳米孔计数器检测甲基化基因的方法，成果以“Nanopore counter for highly sensitive evaluation of DNA methylation and application for in vitro diagnostics”为题发表在国际知名学术期刊Analyst上。1、研究背景 DNA甲基化是一种重要的表观遗传修饰，在维持正常细胞功能、染色体结构、胚胎发育和衰老方面发挥着重要作用。因此，DNA异常的甲基化水平被认为是重要的恶性肿瘤生物标记物之一，开发一种简单而灵敏的DNA甲基化水平检测方法是必要的。固态纳米孔是纳米孔技术中重要的组成部分，其对双链DNA（dsDNA）的检测具有无标记和超高灵敏度的特性。将DNA甲基化程度通过合适的转换机制，变换成特定长度双链DNA的浓度，有助于开发信号读出良好，灵敏度高的甲基化传感器。2、研究内容受此思路启发，王家海教授团队提出了一种过程简单，条件温和的甲基化监测方案——即通过纳米孔计数器对双链的读出能力，结合双限制性内切酶（BstUI/HhaI）消化策略和聚合酶链式反应（PCR）扩增将DNA甲基化转换为PCR扩增物的数量来评估DNA甲基化的程度。相比于传统亚硫酸氢盐转化方法，基于双甲基化敏感内切酶的消化策略结合纳米孔是更好的选择。首先，基于甲基化敏感的核酸内切酶的消化策略可以在更加温和的条件下特异性地消化未甲基化的DNA，这对于开发简单、通用的甲基化检测方法至关重要；此外，基于甲基化敏感的核酸内切酶消化策略的可以将非甲基化的DNA切碎，这可以大大减少背景信号，从而显著简化纳米孔传感器的数据分析，使得信号更加规整、好读。而加入PCR策略，是将信号灵敏度和选择性进一步提升，使其达到临床所需。图1 技术原理图：（a） 双内切酶系统可以消化未甲基化的DNA，但保留甲基化的完整DNA，完整的甲基化DNA可以通过PCR反应扩增并产生大量固定长度的双链DNA扩增子。（b） 通过玻璃纳米孔计数器直接检测PCR扩增子。由于PCR扩增子的规律性，信号是非常均匀、好读出的。3、工作亮点在本工作中，我们根据PCR扩增的效率以及产生信号的信号比优化了PCR产物的长度，使得传感器兼顾灵敏度以及读出信号的方便性。结合PCR技术产生固定长度扩增子后，该传感技术对DNA甲基化的检测达到了1aM以下的检测限，并且具有1aM~100pM之间（109倍）的超宽传感器线性区间：图2 PCR扩增子长度的优化。（a）扩增子的引物的位置。（b）凝胶电泳图，说明经过反应后，只有甲基化SEPT7基因可以保持完整，并成功产生不同长度的产物条带。（c）三种长度的PCR扩增子的易位信号，可以看出随着扩增子长度的增加，信噪比提升。（d） 317、406和806bp扩增子的信号幅度分布直方图，可以看到扩增子越长，信号率下降，传感器灵敏度下降。图3 纳米孔传感器对甲基化DNA的定量测试。（a）甲基化PUC57-SEPT9浓度范围为1 aM至100 pM时的校准曲线。（b）传感器的对数校准曲线。对数校准曲线的分段线性范围为1 aM至100 aM（c）和100 aM至100pM（d）。（e） 传感器在5秒内对不同浓度的甲基化PUC57-SEPT9的易位信号。此外，传感器具备优秀的选择性，能在大量非甲基化的基因中检测出仅有0.01%的甲基化基因。与其他现存技术相比，我们的技术在检测限及监测范围中有足够的优势。图4 传感器对DNA甲基化水平的测试。（a）用不同甲基化水平的DNA测试时的事件率。（b）测量的甲基化水平与实际输入甲基化水平之间的关系。结果显示即使在低至0.01%的浓度水平下也具有良好的一致性。表1 本文结果与其他甲基化检测方法的性能比较方法扩增手段检测范围检测下限fluorescenceOxidation damage base-based amplification100 fM-100 nM34.58fMelectrochemistryElectrochemical strategies for tetrahedral RCA amplification1 fM-1 nM100 aMchemiluminescenceSynergistic in situ assemblies of G-quadruplex DNAzyme nanowires1 aM-100 pM0.565 aMfluorescenceDual endonucleases digestion coupled with RPA-based CRISPR/Cas13a200 aM-20 pM86.4 aMfluorescenceFluorescence nanosensor based on Fe3O4/Au core/shell nanoparticles3.2 fM-800 fM310 aMNanopore（this work）Dual endonucleases digestion combined with PCR-based nanopore1 aM-100 pM0.61 aM4、研究相关 王家海教授为论文第一作者，团队成员陈达奇（广州大学讲师）为论文通讯作者，广州大学为第一通讯单位。文章链接： https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2023/an/d3an00035d

DNA甲基化是哺乳动物基因组中最常见的表观遗传事件之一，即DNA中核苷酸与甲基基团的共价修饰[2]。DNA甲基化与人的生命进程有着密不可分的关系。细胞的增殖与分化、染色体完整性的维护或者X染色体的活性等等都离不开DNA甲基化的控制，DNA甲基化流程在胚胎发育中是无处不在的[1]。如果DNA甲基化进程出现异常，会导致生物体出现各种各样的疾病以及身体的生长缺陷或生理紊乱。DNA与蛋白质之间的相互作用如果出现异常，会影响基因的表达，从而引起人体内肿瘤的发生或者肿瘤的转移，这一切的源头都是DNA甲基化进程出现异常的结果[3]。DNA甲基化酶是肿瘤治疗靶点DNA甲基化酶是一种修饰酶，经常与限制性内切酶一同出现。在真核生物基因组以及原核生物基因组中，普遍存在DNA甲基化酶维持以及催化DNA甲基化过程的现象。DNA甲基化酶被广泛认为是一种治疗靶点以及预测生物甲基化过程的标志物，在单细胞水平上准确灵敏地检测DNA甲基化酶对于肿瘤医学上的临床诊断以及临床治疗甚至是生物学研究有着至关重要的作用。根据甲基化的核苷酸和位置被分为三组，即腺嘌呤的甲基化、胞嘧啶的4-N甲基化和胞嘧啶的5-C甲基化。所有已知的DNA甲基化酶在其甲基化过程中以s-腺苷甲硫氨酸作为甲基供体。最常见的DNA甲基化不仅发生在胞嘧啶嘧啶环5-C位置的CpG位点上，还发生在对称四核苷酸5’-G-A-T-C-3’ 中腺嘌呤环的6-N位置[4,5]。传统DNA甲基化酶检测方法有局限 DNA甲基化酶活性的高灵敏度检测在基因调控、表观遗传修饰、临床诊断和治疗等方面具有重要意义。传统用于检测DNA甲基化酶活性的方法包括高效液相色谱法(HPLC)[6], 聚合酶链反应(PCR)[7]，凝胶电泳[8]，高效毛细管电泳(HPCE)[9]，以及使用同位素标记的s-腺苷甲硫氨酸甲基化检测[10,11]。尽管这些技术在实验室实践中被证明是有用的，但它们具有局限性。例如，大多数技术不仅使用笨重昂贵的设备，而且需要复杂的样品制备和数据分析所需的大量时间。同位素标记等技术是有效的，但它们往往需要费力的样品制备、同位素标记、复杂的设备和大量的DNA，使得它们不适合在医护点使用。所以，DNA甲基化酶活性检测迫切需要简单、便携、高灵敏度和低成本的检测方法。在最近的技术进步中，许多替代的DNA甲基化酶活性测定方法，如放射法、比色法、荧光法、电化学法等已被提出。此外，其中许多与纳米材料或酶结合，以显著提高它们的敏感性。放射法、蛋白质纳米孔等新型检测技术兴起 放射法：同位素标记作为最早检测DNA甲基化酶活性的方法之一，早期广泛应用于检测DNA甲基化酶和DNA甲基化的活性[12,13]。在由DNA甲基化酶催化的甲基化过程中，同位素标记的甲基部分转移到DNA上，从而赋予甲基化的DNA放射性。这种放射性可以很方便地用闪烁计数器或放射自显像仪来检测。可惜的是，放射性试剂的介入是限制这种试验在中央实验室进行的最大缺点。对无辐射DNA甲基化酶活性检测的研究导致了甲基化特异性PCR[14]、HPCE[9]和HPLC等替代品的发展[7,14]，而甲基化特异性PCR被认为是较好的方法。尽管非放射性，上述DNA甲基化酶活性检测需要庞大且通常昂贵的设备，冗长且耗时的样品制备和数据分析，以及繁琐的检测方案，这在临床实践中也比较难以实现全覆盖。比色法：比色法用于DNA甲基化酶活性检测依赖于颜色变化的目视观察或与DNA甲基化酶相关的吸收光谱的光谱测量。它们具有成本低、简单、可移植性和在某些情况下无需仪器的优点。虽然紫外-可见光谱法可以量化DNA，但甲基化和未甲基化DNA在紫外-可见吸收特性上的低灵敏度和不显著差异基本否定了紫外-可见光谱法直接检测DNA甲基化酶活性[15~17]。金纳米粒子：金纳米粒子(AuNPs)由于其表面的等离子体共振吸收的高消光系数且强依赖于粒子间距离，在DNA甲基化酶活性检测的比色法研究中引起了广泛关注。如图1 所示，金纳米粒子表面包覆有双链DNA (ds-DNA)，其中一条链包含DNA甲基化酶识别序列和5’-硫醇末端。在DNA甲基化酶存在的情况下，如图1 B 所示，DNA甲基化酶被共价标记在ds-DNA中碱基环的6-C位置，因为在5-N位置缺乏一个质子阻止了β-消除，甲基化的DNA不能被核酸外切酶 ExoⅠ剪切，因此金纳米粒子仍然均匀地分散在溶液中 [18]。从而实现DNA甲基化酶活性的检测。结果表明，在526 nm处，金纳米粒子聚集物的吸光度与DNA甲基化酶的活性呈2 ~ 32 U / mL的线性关系，检出限为0.5 U / mL。图1. (A)基于ABP的比色生物传感器的示意图(B) DNA甲基化酶的检测机制 荧光法：荧光指吸收激发荧光团的光，以促进电子从基态到激发态，电子迅速地回到激发态的最低能级，然后当电子最终返回基态时，发出波长较长的光。与其他DNA甲基化酶活性测定法相比，荧光法检测DNA甲基化酶活性的优点是检测过程简单，灵敏度高，但其复杂的光学性能限制了其在集中实验室的应用[19~20]。图2. 基于外切酶的靶循环的DNA甲基化酶活性检测原理图电化学法：电化学生物分析技术的发展一直是现代分析化学研究的热点之一。电化学法用于DNA甲基化酶分析包括测量电流、电压、电荷和电阻等电量，以反映DNA甲基化酶的活性。与许多其他类型的DNA甲基化酶活性的检测相比，它们具有低成本、高灵敏度、执行现场监测的能力以及非常适合微型化和集成微制造技术的优点[22~23]。Zhi-Qiang Gao等人在2014年报道了一种简单、高灵敏度的DNA甲基化酶电化学活性测定方法。该方法采用电催化氧化抗坏血酸(AA)的信号放大手段，通过一个螺纹插层N,N -2(3-丙基咪唑)-1,4,5,8-萘二酰亚胺(PIND)电催化氧化还原Os(bpy)2Cl+ (PIND-Os)，包含5’-CCGG-3’ 对称序列的ds-DNA首先固定在金电极上。然后用DNA甲基化酶孵育电极，经过酶催化特定CpG二核苷酸的甲基化，然后用识别5’-CCGG-3’ 序列的限制性内切酶 Hpa II 剪切酶处理电极，从而实现DNA甲基化酶活性检测的目的[24]。图3. DNA甲基化酶活性的检测原理示意图蛋白质纳米孔：蛋白质纳米孔检测技术是在单分子水平上以低成本、无标签和高通量的方式研究生物分子的检测技术。近年来，纳米孔技术正从生物传感的角度进行研究[25]。应用于核酸特征鉴定、化学反应过程的测量、蛋白质分析、疾病相关蛋白状态的检测以及酶动力学的研究等[26]。α-溶血7素是一种蛋白质纳米孔，它自发地插入到脂质双层膜中，形成一个纳米孔[27]。当一个带电分子在外加电势下通过蛋白质纳米孔时，它会引起离子电流的瞬态变化，电流变化事件被记录下来。被分析物可以通过当前电流发生的频率进行量化，特征电流信号则可以揭示被分析物的各种特征[28~30]。该检测方法不需要对DNA探针进行任何化学修饰，既方便又节约成本，减少了样品消耗。 图4. 用于分析DNA甲基化酶活性的纳米孔试验的示意图 在过去的十几年中，DNA甲基化酶活性的检测取得了重大进展。有几种方法有希望可在临床检测，使得该方法在用于癌症诊断、预后和治疗方面显示出了希望。比色法依赖于颜色变化的目视观察或与DNA甲基化酶相关的吸收光谱的光谱测量，具有成本低、简单、可移植性和在某些情况下无需仪器的优点，但是检出限相对较高。荧光法检测DNA甲基化酶活性的检测过程简单，检出限相对理想，但其复杂的光学性能以及昂贵的仪器设备限制了其在生活中的应用。电化学法由于需要构建较复杂的反应电极材料而使得其在临床上受到了一定的限制。蛋白质纳米孔的检测方法不需要对DNA探针进行任何化学修饰，既方便又节约成本，减少了样品消耗，检出限相对较为理想，并且已经成功应用于人类血清样本。这类检测可能最终为常规DNA甲基化酶活性的检测和分子诊断打开大门，为疾病的管理和诊断带来新的前景。 作者：王家海、骆 乐 作者简介：王家海，博士，教授，硕士生导师/博士生导师，广州大学化学化工学院；分析化学专业；主要研究领域为“基于核算纳米结构为信号传导载体的纳米孔传感器”；在核酸探针和仿生纳米孔两方面开展了一系列分子识别的工作，也为将来进一步开展分析化学研究打下了坚实的基础，期间积累了多种前沿分析方法和技术：仿生纳米孔制备和检测；微纳米加工技术；核酸探针人工合成技术。参 考 文 献 [1] 陈晓娟,闫少春,邵国,等.人DNA甲基化转移酶的分类及其功能[J].包头医学院学报,2014,30(04):136-138.[2] Das PM, et al. DNA methylation and cancer[J]. Clin. Oncol. 2004 22: 4632-4642.[3] Jurkowska RZ, et al. Structure and function of mammalian DNA methyltransferases[J]. ChemBioChem 2011 12: 206-222.[4] Lee GE, et al. DNA methyltransferase 1-associated protein (dmap1) is a co-repressor that stimulates DNA methylation globally and locally at sites of double strand break repair[J]. Biol. Chem. 2010 285: 37630-37640.[5] Liu SN, et al. Assay Methods of DNA Methylation and Their Applications in Cancer Diagnosis and Therapy[J]. Chinese J.Anal. Chem. 2011 39: 1451-1458.[6] Boye E, et al. Quantification of dam methyltransferase in Escherichia coli[J]. Bacteriol. 1992 174: 1682-1685.[7] Eads CA, et al. CpG island hypermethylation in human colorectal tumors is not associated with DNA methyltransferase overexpression[J]. Cancer Res. 1999 59: 2302-2306.[8] Bergerat A, et al. Allosteric and catalytic binding of s-adenosylmethionine to escherichia coli DNA adenine methyltransferase monitored by 3H NMR[J]. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1991 88: 6394-6397.[9] Fraga MF, et al. Rapid quantification of DNA methylation by high performance capillary electrophoresis[J]. Electrophoresis 2000 21: 2990-2994.[10] Yokochi T, et al. DMB (dnmt-magnetic beads) assay: measuring DNA methyltransferase activity in vitro[J]. Methods Mol. Biol. 2004 287: 285-296.[11] Adams RLP, et al. Microassay for DNA methyltransferase[J]. Biochem. Bioph. Methods 1991 22: 19-22.[12] Jurkowska RZ, et al. DNA methyltransferase assays[J]. Methods Mol. Biol. 2011 791: 157-177.[13] Pradhan S, et al. Recombinant human DNA (cytosine-5) methyltransferase [J]. Biol. Chem. 1999 274: 33002-33010.[14] Herman JG, et al. Methylation-specific PCR: a novel PCR assay for methylation status of CpG islands[J]. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1996 93: 9821-9826.[15] Kattenhorn, L. M. Korbel, G. A. Kessler, B. M. Spooner, E. Ploegh, H. L. Mol. Cell 2005, 19, 547−557.[16] Mosammaparast, N. Shi, Y. Annu. Rev. Biochem. 2010, 79, 155−179.[17] Barglow, K. T. Cravatt, B. F. Angew. Chem., Int. Ed. 2006, 45, 7408−7411.[18] Wu Z, et al. Activity-based DNA-gold nanoparticle probe as colorimetric biosensor for DNA methyltransferase/glycosylase assay[J]. Anal. Chem. 2013 85: 4376-4383.[19] Zhu, C. Wen, Y. Peng, H. Long, Y. He, Y. Huang, Q. Li, D. Fan, C. Anal. Bioanal. Chem. 2011, 399, 3459−3464.[20] Chen, F. Zhao, Y. Analyst 2013, 138, 284−289.[21] Xing XW, et al. Sensitive detection of DNA methyltransferase activity based on exonuclease-mediated target recycling[J]. Anal. Chem. 2014 86: 11269-11274.[22] Wu, H. Liu, S. Jiang, J. Shen, G. Yu, R. Chem. Commun. 2012, 48, 6280−6282[23] Wang, M. Xu, Z. Chen, L. Yin, H. Ai, S. Anal. Chem. 2012, 84, 9072−9078[24] Deng H, et al. Highly sensitive electrochemical methyltransferase activity assay[J]. Anal. Chem. 2014 86: 2117-2123.[25] Howorka, S. Siwy, Z. Nanopore Analytics: Sensing of Single Molecules. Chem. Soc. Rev. 2009, 38, 2360−2384.[26] Song, L. Hobaugh, M. R. Shustak, C. Cheley, S. Bayley, H. Gouaux, J. E. Structure of Staphylococcal α-Hemolysin, a Heptameric Transmembrane Pore. Science 1996, 274, 1859−1865.[27] Lin, L. Yan, J. Li, J. Small-Molecule Triggered Cascade Enzymatic Catalysis in Hour-Glass Shaped Nanochannel Reactor for Glucose Monitoring. Anal. Chem. 2014, 86, 10546−10551.[28] Li, J. Yan, H. Wang, K. Tan, W. Zhou, X. Anal. Chem. 2007, 79, 1050−1056.[29] Wood, R. J. Maynard-Smith, M. D. Robinson, V. L. Oyston, P. C. F. Titball, R. W. Roach, P. L. PLoS One 2007, 2, e801−e801.[30] Wood, R. J. McKelvie, J. C. Maynard-Smith, M. D. Roach, P. L. Nucleic Acids Res. 2010, 38, e107−e107.[31] Jinghong Li, et al. Nanopore-based, label-free, and real-time monitoring assay for DNA methyltransferase activity and inhibition[J]. Anal. Chem. 2017 89: 13252−13260.

导读在过去的几十年中，糖尿病的发病率在全球范围内显著增长。除了不健康的生活方式外，环境污染物被认为是糖尿病发生的危险因素。多环芳烃 (PAH)是一类含有2-7个芳环的有机化合物，由自然和人类活动产生并广泛存在的污染物。流行病学研究表明，PAHs水平与成人和儿童的肥胖和二型糖尿病相关。厦门大学生命科学学院细胞应激生物学国家重点实验室的研究人员在Ecotoxicology and Environmental Safety上发表了题为《Prenatal exposure to a mixture of PAHs causes the dysfunction of islet cells in adult male mice: Association with type 1 diabetes mellitus》的文章。文中应用naica微滴芯片数字PCR系统对胰岛素编码基因DNA甲基化水平进行量化，揭示了产前暴露于多环芳烃混合物对成年雄性小鼠胰岛细胞功能的不良影响。应用亮点：▶ 使用naica微滴芯片数字PCR系统对胰岛素编码基因启动子甲基化水平进行量化。▶ 在产前暴露于500µg/kg PAHs的小鼠中，胰岛素编码基因启动子的甲基化水平显著升高。▶ 产前暴露于PAHs可能促进I型糖尿病的发病。作者使用8种PAHs的混合物进行了实验，以研究产前PAHs对成年期胰岛细胞功能和质量的影响，同时试图阐明 I型糖尿病发病的环境原因。他们分离了成年雄性小鼠的胰岛，对胰岛素编码基因的启动子DNA甲基化水平进行分析。研究成果：▲图1. 产前暴露于多环芳烃对成年雄性小鼠胰岛素编码基因甲基化水平的影响。(A) 数字PCR结果代表性一维图。(B)胰岛素编码基因启动子甲基化水平。(每个处理三只母鼠, 每只母鼠取一个雄性后代) 。在本研究中，子宫内暴露于500µg/kg PAHs的小鼠胰岛中胰岛素编码基因启动子中的DNA甲基化水平显著增加，同时胰岛素编码基因转录显著下调。▲图2. 不同PAHs浓度对胰岛素编码基因转录水平的影响原文链接如下：https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0147651322005358期刊介绍：Ecotoxicology and Environmental Safety 1977创刊，隶属于爱思唯尔出版集团。是一份多学科交叉期刊，主要研究环境污染对包括人类健康在内的生物体的暴露和影响。最新影响因子为7.129。naica六通道数字PCR系统法国Stilla Technologies公司naica六通道数字PCR系统，源于Crystal微滴芯片式数字PCR技术，自动化微滴生成和扩增，每个样本孔可实现6荧光通道的检测，智能化识别微滴并进行质控，3小时内即可获得至少6个靶标基因的绝对拷贝数浓度。

DNA甲基化(DNA methylation)是指在DNA甲基化转移酶的作用下，在基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶5' 碳位共价键结合一个甲基基团。为DNA化学修饰的一种形式，能够在不改变DNA序列的前提下，改变遗传表现。DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、DNA稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式的改变，从而控制基因表达。Nature上一项新的研究揭示了一种跨染色质调节途径，即NSD1（一种组蛋白甲基转移酶）介导的H3K36me2是在基因间区域招募DNMT3A和维持DNA甲基化所必需的，并将异常的基因间CpG甲基化与人类肿瘤生长和过度发育相关联在一起。作者发现了一个有趣的现象：塔顿布朗拉赫曼综合征(Tatton–Brown–Rahman syndrome, TBRS)是一种儿童过度生长障碍，是由生殖系统DNMT3A（DNA甲基转移酶3A）突变导致的。儿童期巨脑畸形综合征(Sotos syndrome)是由NSD1（组蛋白甲基转移酶）的单倍剂量不足引起的。这两种疾病具有相同的临床特征，这就非常有意思了：这预示着组蛋白修饰和DNA甲基化修饰可能存在机制上的关联性。首先，研究人员通过全基因组分析和ChIP-seq分析方法发现，组蛋白甲基化修饰H3K36me2和H3K36me3的富集区域非常类似，且明显区别于其他组蛋白甲基化修饰如H3K9me3和H3K27me3所划分的区域。而且H3K36me2和H3K36me3水平与CpG甲基化呈正相关，这与之前报道的H3K36me3介导靶向DNMT3B的活性一致。然而，由于这种相互作用仅限于基因小体，染色质水平上的调控机制并不清楚。在进一步的检测和比较全基因组分析，发现H3K36me3在基因体中表现出特征性的富集，而H3K36me2则表现出更为弥散的分布，包括基因区和基因间区。与H3K36me3相比，DNMT3A选择性富集在H3K36me2高水平区域。接下来，就是我们的独家法宝Alpha技术大显身手的时候了。研究人员采用体外高灵敏度、匀相免疫AlphaLISA技术来阐明H3K36me2介导的DNMT3A募集特异性背后的机制。首先GST标记DNMT3A，纯化后将GST-DNMT3A与生物素化的核小体（不同甲基化的H3K36）置于384孔板。依次加入谷胱甘肽受体微珠，链霉亲和素供体微珠。避光反应60min后置于Envision多模式读板仪中对信号进行检测。通过亲和曲线分析可得知，DNMT3A与H3K36me2修饰的核小体的亲和力最高，其次是H3K36me3，但不与其他价态结合。这些结果表明DNMT3A可以识别H3K36两种甲基化状态，但对H3K36me2的亲和力更强。同时，作者也在体外NSD1突变细胞和临床Sotos综合症病人的血样本中验证组蛋白H3K36甲基化与DNA甲基化修饰的相关性，揭示DNMT3A优先选择H3K36二甲基化区域，促进基因间区的DNA甲基化。这一机制在疾病发生过程中有潜在的生物学意义。珀金埃尔默公司一如既往的为用户提供客制化Alpha Assay检测试剂和高品质的检测设备：EnVision多标记微孔板读板仪EnSight多标记微孔板读板仪Victor Nivo多标记微孔板读板仪参考文献Weinberg D N, Papillon-Cavanagh S, Chen H, et al. The histone mark H3K36me2 recruits DNMT3A and shapes the intergenic DNA methylation landscape[J]. Nature, 2019, 573(7773): 281-286.Dor Y, Cedar H. Principles of DNA methylation and their implications for biology and medicine[J]. Lancet. 2018

导读 ：基因调控区的DNA甲基化状态的改变可导致多种癌症的发生。这种表观遗传学改变在生物学上是稳定的，并存在于循环肿瘤DNA（ctDNA）中，使其适合于早期检测和无创动态监测肿瘤负荷。数字PCR技术凭借其较高的灵敏度、精度、准确度以及对抑制剂的耐受度，针对低浓度样本检测时优势显著。文献解读： 法国贝桑松大学医院肿瘤生物学系的研究者在BMC Cancer（IF：3.8）发表了题为The detection of specific hypermethylated WIF1 and NPY genes in circulating DNA by crystal digital PCR&trade is a powerful new tool for colorectal cancer diagnosis and screening的文章。在转移性和II/III期结直肠癌（CRC）患者中，WNT inhibitor因子1（WIF1）和神经肽T（NPY）的甲基化程度较高，作者评估是否可以使用WIF1和NPY的甲基化程度作为一种结直肠癌标志物，该研究建立了一种将亚硫酸氢盐法（bisulfite-将未甲基胞嘧啶转化为尿嘧啶）与数字PCR相结合的方法。 文章相关结果： ▲Bisulfite方法检测甲基化的原理 A、Naica Crystal Miner分析软件给出的 3D点图，用于检测超甲基化WIF1和NPY和参考基因ALB。 B、通过测量在未甲基化DNA的背景下甲基化DNA的系列稀释液获得的标准曲线。为了确定观察到的突变体数量是否显著高于LOB，使用了基于假阳性概率的贝叶斯方法。对于每个结果，通过减去最终的假阳性分区（通过其概率分布加权）来校正阳性分区的数量。当校正后的95％置信区间的下限包括零时，该样本被视为阴性。 3色Naica Crystal Digital PCR检测WIF1和NPY 分别检测了10个来自III期或IV期CRC患者和5个健康个体的血浆样品。来自CRC患者的所有血浆DNA样本的高甲基化WIF1和NPY得分均为阳性，而在健康个体中未检测到高甲基化的WIF1和NPY。通过将WIF1和NPY浓度与ALB参考浓度对比评估，血浆DNA中的高甲基化WIF1比例范围为8％至93％，而高甲基化NPY的比例范围为0.1％至78％。血浆样品中检测到的检测限甲基化WIF1和NPY量分别为5.1和1.2cp/μL。 ※ Concentration of ALB (white bars), hypermethylated WIF1 (black bars) and hypermethylated NPY (hashed bars) in plasma of CRC patients and healthy individuals. 通过上述方法，即经亚硫酸氢盐转化后再进行3色数字PCR方法，能够在每25μL体系中可靠的检测低至25和5个拷贝的高甲基化WIF1和NPY，并且该检测结果可以用作通用的结直肠癌标志物和肿瘤特异性突变的替代物。使用3色Naica Crystal Digital PCR检测WIF1和NPY，结果和理论值一致，未出假阴性和假阳性结果。 该研究的结论是使用naica系统检测结直肠癌（CRC）中特定超甲基化的WIF1和NPY基因可以作为CRC诊断和筛查的强大新工具。研究发现，与邻近非肿瘤组织相比，肿瘤组织中的NPY和WIF1基因显著超甲基化（WIF1的p值0.001 NPY的p值0.001）。此外，研究发现NPY或WIF1在液体活检中的超甲基化具有95.5%的敏感性[95%CI 77–100%]和100%的特异性[95%CI 69–100%]。研究结果表明，NPY和WIF1的超甲基化是CRC的恒定特异性生物标志物，与它们在致癌过程中的潜在作用无关。 ｜欢迎来电垂询｜ naica️ 全自动微滴芯片数字PCR系统申请试用，大家可以拨打电话010-57256059或者官微申请，诚挚邀请您到Stilla数字PCR中国技术示范与服务中心参观，期待与您相见。 艾普拜生物提供多种靶点的数字PCR检测试剂盒和检测assay，欢迎订购和咨询。 个性化定制服务 艾普拜生物数字PCR个性化定制服务覆盖多种检测试剂需求 ( 如鉴定、易位、突变检测、多重突变、高阶多重等 )，更多信息请联系您身边艾普拜生物工作人员或电话联系我们。

中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所研究员黄超兰受邀在蛋白质组学国际期刊Expert Review of Proteomics上发表综述文章。黄超兰与博士彭超(该文第一作者)撰述的The Story of Protein Arginine Methylation: Characterization, Regulation, and Function 于1月5日在线发表在此杂志上。该论文系统地介绍了鉴定不同类型的精氨酸甲基化的技术方法及其发展历程，并对精氨酸甲基化不同类型的writers和erasers的最新进展、生物学功能以及与疾病的紧密联系进行了系统性的总结和展望。　　精氨酸甲基化(Arginine methylation)是蛋白质后修饰中重要的一种，它参与了基因表达的调节、DNA的修复等重要的生命过程，与肿瘤、心血管疾病、病毒感染和自身免疫性疾病等多种疾病密切相关 甲基化水平异常的蛋白质可以作为潜在的生物标志物或药物研究靶点。该综述能使读者加深对精氨酸甲基化蛋白质、后修饰位点、表达水平以及其调控机制的了解，有利于人们进一步探索其在生命过程中的作用，特别是与疾病发生的关系，加快相关药物靶点的研究进程。　　黄超兰研究组一直致力于质谱和基于质谱的蛋白质组学应用于蛋白质研究的难题技术研发，相关技术已经帮助广大科学家解决了众多的科学难题，大力促进了科学研究的发展。该项工作得到了中科院引进杰出技术人才、关键技术人才和国家基金委自然科学基金青年项目等的资助。

安捷伦科技公司推出首款针适用于疾病研究的DNA甲基化靶向序列捕获产品 2012 年 2 月 14 日，佛罗里达州马科岛（基因组生物学和技术，AGBT）- 安捷伦科技公司（纽约证交所：A）推出其靶向序列捕获平台的新成员，SureSelect XT 人甲基化测序系统，适用于表观遗传学研究中 DNA 甲基化位点检测。这是市场上第一款采用靶向序列捕获技术的全面 DNA 甲基化发现系统。安捷伦将于明日在基因组生物学技术进展年会上揭晓该产品的技术细节。 Agilent SureSelect XT 甲基化测序系统基于液相杂交，是可以分析人类基因组中低甲基化与过度甲基化的胞嘧啶位点的独特研究工具。亚硫酸盐测序技术是 DNA 甲基化研究的黄金标准，也是第一种可以全面研究DNA 甲基化的发现系统。Agilent SureSelect XT 甲基化测序系统将市场领先的靶向序列捕获平台 SureSelect 与亚硫酸盐测序结合在一起，挑选了与表观遗传学研究最相关的基因组序列，包含了与多种疾病（例如，癌症、基因组印记疾病、行为和精神障碍等等）相关的区域，实现了前所未有的序列覆盖范围。 &ldquo DNA 甲基化是重要的表观遗传学特征之一。&rdquo 华盛顿大学西北参考表观基因组图谱中心主任 John Stamatoyannopoulos 说，&ldquo 如果拥有一种经济实惠的可以在亚硫酸盐测序过程中智能地检测数百万 CpG 的平台，那么将大大降低成本并大幅扩展基因组规模 DNA 甲基化分析的范围和适用性。&rdquo &ldquo Agilent SureSelect XT 甲基化测序系统涵盖了所有基因组中癌症研究领域关注的甲基化胞嘧啶位点，投入产出比相当好。&rdquo 马克斯普朗克分子遗传学研究所 Michal-Ruth Schweider 医学博士说道。 &ldquo 我们很高兴能为用户提供这种新工具来满足医学界日益增加的需求。&rdquo 安捷伦副总裁基因组学总经理 Robert Schueren 说道。&ldquo 由于异常甲基化是可逆的，因此这种分析方法非常有利于开发新的治疗方法。&rdquo Agilent SureSelect XT 甲基化测序系统使研究人员能够分析超过 370 万个CpG 核苷酸序列位点，研究它们的甲基化状态。该系统针对启动子、经典 的CpG 岛以及最近被关注的位于CpG 岛上下游 2kb范围内的&ldquo shores&rdquo 和&ldquo shelves&rdquo 区域设计。研究表明，许多甲基化变化并不发生在启动子或 CpG 岛，而是发生在 CpG 岛上下游2kb 范围内，也就是 CpG 岛shores区域。除上述区域外，Agilent SureSelect XT 甲基化测序系统的设计还包含了已知的差异性甲基化区域。 与全基因组亚硫酸盐测序相比，Agilent SureSelect XT 甲基化测序系统具有更高的通量和更低的成本。它可以识别限制性内切酶或免疫沉淀法不能检测的区域。因为该产品也属于SureSelect XT 产品系列，安捷伦为用户提供全套工作流程解决方案。并配有适用于文库构建和靶序列捕获的所有必备试剂。 要了解更多信息，请访问 www.agilent.com/genomics/ngs。 关于安捷伦科技 安捷伦科技公司（纽约证交所：A）是全球领先的测量公司，同时也是化学分析、生命科学、电子和通信领域的技术领导者。公司的 18,700 名员工为 100 多个国家的客户提供服务。在 2011 财政年度，安捷伦的业务净收入为 66 亿美元。要了解安捷伦科技的信息，请访问：www.agilent.com.cn

11月10日，《分子细胞》(Molecular Cell)杂志在线发表了题为Cooperative Action between SALL4A and TET Proteins in Stepwise Oxidation of 5-Methylcytosine 的研究文章，报道了在小鼠胚胎干细胞中，SALL4A蛋白与TET家族双加氧酶共同调节增强子上5-甲基胞嘧啶(5mC)的氧化过程。　　哺乳动物DNA的胞嘧啶甲基化修饰被认为是最稳定的表观遗传修饰，在维持性DNA甲基转移酶的作用下，亲代细胞基因组的DNA甲基化信息经过有丝分裂以半保留复制的方式传递给子代细胞。近年来的研究发现，TET家族蛋白能够将5mC逐步氧化成5-羟甲基胞嘧啶(5hmC)、5-醛基胞嘧啶(5fC)和5-羧基胞嘧啶(5caC)，并走向最终的去甲基化。这种动态变化拓展了DNA甲基化所承载的表观遗传信息的可塑性。在基因组上，5mC的氧化受到严格地控制，在某些基因组区域，5hmC会稳定存在，而在别的基因组区域5hmC只是进一步氧化和去甲基化的中间体。这一选择性事件的分子基础尚不明朗。　　该研究利用稳定同位素标记的细胞培养(SILAC)联合亲和纯化与蛋白质定量质谱技术，发现锌指结构域蛋白SALL4A倾向于结合含有5hmC修饰的DNA。SALL4是早期胚胎发育过程中的一个重要基因，它的突变会导致常染色体显性遗传的Duane-radial ray综合症。Sall4基因敲除的小鼠胚胎在围着床期即停止发育，并很快死亡。该研究发现，在小鼠胚胎干细胞中，SALL4A蛋白主要定位于增强子，其与染色质的结合在很大程度上依赖于TET1蛋白。进一步分析基因组上SALL4A结合位点的胞嘧啶修饰状态发现，这些位点上缺乏稳定的5hmC，却富集了进一步氧化的产物5fC和5caC，提示SALL4A可能促进5hmC的进一步氧化。果然，敲除Sall4导致在原先的SALL4A结合位点上积累较高水平的5hmC，因为敲除Sall4降低了TET2的稳定结合，不利于5hmC的进一步氧化。　　这一工作丰富了对TET家族蛋白调控的DNA氧化和去甲基化过程的理解，并提出了5mC的协同性递进氧化概念。促进了对DNA甲基化的动态性及其在胚胎干细胞功能及重编程中作用的理解。　　中国科学院生物物理研究所研究员朱冰和副研究员张珠强为本文的共同通讯作者。朱冰课题组熊俊和张珠强为本文的并列第一作者。同济大学教授高绍荣和博士陈嘉瑜，北京生命科学研究所研究员陈涉、丁小军和许雅丽，中科院生态环境研究中心研究员汪海林和博士黄华，中科院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所研究员徐国良，日本熊本大学教授Ryuichi Nishinakamura也参与了该项研究。该研究得到国家自然科学基金委、科技部、中科院战略性先导专项和美国霍华德?休斯医学研究所国际青年科学家项目的资助。图示：SALL4A促进由TET1和TET2介导的5mC氧化过程

大家好，本周为大家分享一篇发表在Analytical Chemistry上的文章，mNeuCode Empowers Targeted Proteome Analysis of Arginine Dimethylation1，文章的通讯作者是威斯康星大学麦迪逊分校的李灵军教授和国家蛋白质科学中心的常乘、贾辰熙教授。　　蛋白质精氨酸甲基化是一种广泛存在于真核生物中且相对保守的翻译后修饰，参与包括RNA加工、DNA修复、染色体组织、蛋白质折叠和基因表达在内的多种生物学过程。蛋白质精氨酸二甲基化在生物过程和人类疾病中发挥着重要作用，但与此同时，精氨酸二甲基化的相对丰度和化学计量通常很低，并且表现出较宽的动态变化范围，这些问题都给分析带来了巨大的挑战。在这篇文章中，作者设计了一种用于二甲基精氨酸代谢标记的mNeuCode标签，并开发了一个名为NeuCodeFinder的软件工具，用于在MS全扫描中筛选NeuCode信号，从而能够在蛋白质组范围内对蛋白质二甲基化进行靶向LC-MS/MS分析。作者将该方法应用到HeLa细胞精氨酸二甲基化的全蛋白质组分析中，证实了该方法的有效性：在70种蛋白质上鉴定到176个精氨酸二甲基化位点，其中38%是新位点。　　图1 用于细胞培养代谢标记的mNeuCode的化学设计。含有由稳定同位素标记的甲硫氨酸和精氨酸的不同组合的mNeuCode-I(红色)和mNeuCode-II(蓝色)分别用于两组细胞培养。同位素标记的甲硫氨酸经过代谢转化为甲基供体S-腺苷甲硫氨酸(AdoMet ),随后由蛋白质精氨酸甲基转移酶(PRMT)催化转移到精氨酸侧链的甲基上。细胞裂解后，将两种样品混合并制备用于高分辨率LC-MS分析。含有二甲基精氨酸的肽的NeuCode同源物被解析后，将显示出43 mDa的质量差异并作为诊断峰。　　图2 基于mNeuCode的精氨酸二甲基化靶向蛋白质组分析。(A)NeuCodeFinder从高分辨率质谱数据中筛选NeuCode同位素峰对的工作流程。从原始数据文件中提取全扫描质谱。单峰被配对以形成NeuCode等值线簇。最终的NeuCode对列表与提取的离子色谱(XIC)值一起导出。(B)靶向LC-MS/MS分析的工作流程，包括样品制备、富集以及MS1和MS2分析。　　在mNeuCode-I标记组中，使用含有正常L-精氨酸和同位素标记L-蛋氨酸[D3]的培养基 在mNeuCode-Ⅱ标记组中，则使用同位素标记的L-精氨酸[15N4]和L-甲硫氨酸[13C]进行培养(图1)。收集两组全细胞蛋白提取物并等量混合，蛋白经还原烷基化与酶切后，得到的肽段通过StageTip分级分离和HILIC tip富集，以提高样品肽段的识别率。处理的样品先进行LC-MS全扫描，通过作者的自制软件NeuCodeFinder生成包含列表，此包含列表用于辅助进一步的平行反应监测(PRM)模式分析(图2)。　　　　图3 已鉴定的精氨酸甲基化位点的生物信息学分析。(A)鉴定的精氨酸二甲基化位点和(B)精氨酸二甲基化蛋白质。橙色柱表示未报道的精氨酸二甲基化位点或蛋白质。绿色柱表示只有单甲基化是已知的，但是二甲基化还没有报道。(C)韦恩图显示，通过使用胰蛋白酶和镜像胰蛋白酶作为消化试剂，从两组实验中鉴定的精氨酸二甲基化位点。(D)蛋白质上位点数目的分布。每个蛋白质上精氨酸二甲基化位点的数量显示在饼图周围，蛋白质的数量列在饼图中。鉴定的精氨酸-二甲基化蛋白质的(E) GO富集和(F)KEGG途径分析。(G)使用STRING数据库将二甲基化蛋白质映射到蛋白质相互作用网络上。综合得分 0.4。(H)已鉴定的精氨酸二甲基化位点中-6和+6氨基酸残基的序列标志。　　通过对数据结果的分析，最终共鉴定到70种蛋白质上的176个精氨酸二甲基化位点，其中37-38%的精氨酸二甲基化位点是新的修饰位点，29%的精氨酸二甲基化蛋白没有被报道过，这证明了mNeuCode方法的有效性。与常规的鸟枪法蛋白质组学策略所获得的数据相比，mNeuCode方法在鉴定低丰度精氨酸二甲基化肽方面具有独特的优势，并且能够补充许多传统鸟枪法蛋白质组学所无法鉴定到的精氨酸二甲基化位点。对mNeuCode方法鉴定到的精氨酸二甲基化蛋白进行生物信息学分析后，发现这些蛋白质主要与RNA的加工、剪接和稳定性相关，参与了RNA的代谢过程。　　图4 FAM98A上精氨酸二甲基化位点的突变抑制了细胞迁移。(A)通过蛋白质印迹检测FAM98A在HeLa细胞中敲除和重建的效果。用siFAM98A-1和siFAM98-2沉默HeLa细胞，然后用Flag标记的WT或突变的FAM98A质粒重建。Anti-FAM98A显示内源性FAM98A的干扰。Anti-Flag显示外源FAM98A的重建。(B)图像和(C)柱状图显示了HeLa细胞的细胞迁移。　　FAM98A是一种微管相关蛋白，与结直肠癌和非小细胞肺癌的增殖有关。有研究者发现FAM98A是PRMT1的底物，但未能确定确切的甲基化位点。而在作者的研究结果中，成功鉴定到FAM98A上五个新的精氨酸二甲基化位点。为了验证这些二甲基化位点是否参与细胞迁移的调节，作者使用FAM98A敲除和FAM98A WT或突变重建细胞系进行了伤口愈合试验。将HeLa细胞的FAM98A基因敲除后，分别用WT或突变的flag-FAM98A重建FAM98A沉默细胞，其中突变的flag-FAM98A将二甲基化位点R351、R360、R363、R371和R375突变为赖氨酸以抑制甲基化。实验结果显示，当FAM98A基因被敲除时，细胞的迁移能力受到抑制，WT FAM98A的重建挽救了FAM98A敲除导致的细胞迁移缺陷，但是突变型FAM98A的重建却不能挽救。该结果证实了FAM98A上的二甲基化位点在细胞迁移中起到的作用。　　总之，在这篇文章中作者发明了一种mNeuCode方法，并开发了NeuCodeFinder软件，使得能够以全蛋白质组的方式进行精氨酸二甲基化的靶向MS/MS分析。实验结果证明了mNeuCode技术对于精氨酸二甲基化的靶向蛋白质组分析的能力和有效性，并证实HeLa细胞FAM98A上新的精氨酸二甲基化位点在细胞迁移调节中的功能，有助于更好地理解癌症发展的潜在机制，为蛋白质组分析的方法学提供了新的思路。　　撰稿：梁梓欣　　编辑：李惠琳　　文章引用：mNeuCode Empowers Targeted Proteome Analysis of Arginine Dimethylation　　李惠琳课题组网址www.x-mol.com/groups/li_huilin　　参考文献　　Wang, Q., Yan, X., Fu, B., Xu, Y., Li, L., Chang, C., & Jia, C. (2023). mNeuCode Empowers Targeted Proteome Analysis of Arginine Dimethylation. Analytical chemistry

p　　近期，中科普瑞整合IsoTex-BD China单细胞研究联合实验室经过近一年的研发测试和应用，正式投入科研服务应用。/pp style="text-align: center"img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201901/uepic/92a657b0-670f-473c-bf67-1ada9534cb59.jpg" title="1.jpg" alt="1.jpg" width="469" height="310" style="width: 469px height: 310px "//pp style="text-align: center "strongspan style="color: rgb(127, 127, 127) "BD(China)—Sinotech Genomics(中科普瑞)单细胞研究联合实验室/span/strong/pp　　中科普瑞自2018年3月BD(中国)-云泰生物单细胞研究联合实验室成立以来，联合实验室完成了多项技术研发测试，已获得了数百例肿瘤组织的单细胞全转录组测序数据，并针对性设计靶向panel进行验证，完成合作研发项目五十余项。/pp　　单细胞测序技术在2018年继续飞速发展，各类相关技术和应用纷纷上线，与此同时，strong单细胞水平转录组与蛋白质组的检测，也逐渐广泛应用于免疫、癌症和干细胞等研究领域。/strongBD公司旗下的单细胞平台—BD Rhapsody作为单细胞研究应用领域的利器，既可通过单细胞全转录组和靶向转录组测序的整合策略，在单细胞水平构建从新靶标发现到多样本验证的完整研究体系，又可利用其最新的BD® AbSeq assay检测单细胞水平的蛋白表达，实现特异高效的转录组和蛋白组的多组学研究方案。/pp　　strong为了更好地聚焦单细胞肿瘤临床研究应用，中科普瑞携其下属科研服务子公司—上海鲸舟基因推出单细胞研究系统解决方案。/strong立足于BD Rhapsody 单细胞研究平台开展单细胞全转录组和靶向转录组测序服务，并以单细胞肿瘤临床研究为中心，着力进行单细胞甲基化检测等技术研发和应用，进而建立涵盖单细胞甲基化研究、单细胞转录组研究以及单细胞蛋白组研究的立体式系统解决方案，为单细胞研究提供新的解决方案和思路。/pp　　span style="color: rgb(192, 0, 0) "strong聚焦单细胞肿瘤临床研究/strong/span/pp　　肿瘤研究的逐步深入和高通量测序技术的不断精进促使了精准医疗策略的提出。而解析肿瘤组织内细胞的高度异质性，是实现更精确的癌症分型，选择更合理的个体化治疗策略的迫切需求。针对肿瘤组织及其免疫微环境的单细胞转录组测序可以帮助科学家绘制肿瘤组织内细胞的异质性转录组图谱，通过鉴别肿瘤细胞、基质细胞与浸润淋巴细胞的不同细胞亚群，来解析不同细胞亚群生物学功能异同，最终构建肿瘤细胞及免疫微环境的互作网络，并探究肿瘤细胞产生耐药或免疫逃逸等机制。/pp　　中科普瑞单细胞测序平台可利用高通量单细胞转录组测序技术，通过揭示肿瘤发生发展进程中各种细胞亚群转录组的变化与差异，助力科学家开展肿瘤的早期诊断、病情监测及预后判断等方面的研究。strong中科普瑞还与国家大数据中心进行战略合作，结合大数据共享和应用分析，通过单细胞转录组研究整合多组学和临床数据，构建健康与疾病的信息网络数据库，以期为不同遗传背景的患者提供个体化诊断及精准治疗。/strong/pp　　同时，中科普瑞还将利用BD® AbSeq assay这一单细胞蛋白组分析利器，大幅提高客户对其感兴趣的稀有或未知细胞的检测能力，以促进药物治疗反应、细胞治疗等肿瘤免疫学应用研究的进展。/pp　　span style="color: rgb(192, 0, 0) "strong聚焦单细胞甲基化研究/strong/span/pp　　近年来，基于血浆ctDNA甲基化的肿瘤早期诊断、溯源及预后的技术突破，为肿瘤风险筛查和防治提供了新的曙光。DNA甲基化还可用于疾病分型、预后以及用药指导等临床领域。单细胞甲基化检测技术在未来的疾病研究与临床应用中有着光明前景和无限可能，既可从单细胞水平研究DNA甲基化修饰在组织分化、发育过程中的特异性，帮助医生判断转移癌组织的原发病灶，进而明确诊断疾病 还可针对特定肿瘤组织DNA甲基化修饰的异常，进行对应的诊疗指导或药物开发。/pp　　2018年3月以来，中科普瑞作为中国十万人甲基化组计划(表观星图计划)的项目实施方，通过与国内外基因组队列计划联动，建立中国人甲基化基准数据库，为表观遗传领域研究、应用和临床检测等建立基础数据库。表观星图计划除利用甲基化芯片进行甲基化基准数据库的建立外，还将利用BD(China) — Sinotech Genomics(中科普瑞)单细胞研究联合实验室在单细胞研究方面的技术优势，聚焦单细胞甲基化研究，以期为肿瘤的风险筛查和预防提供新的手段。/p

蛋白质精氨酸甲基化修饰是一类由精氨酸甲基转移酶（Arginine methyltransferases, PRMTs）介导的翻译后修饰作用。PRMTs不仅能够通过甲基化修饰组蛋白上特定位点的精氨酸来调控下游靶基因的转录活性，还参与修饰了多种非组蛋白类作用底物，以此来影响RNA剪接、蛋白质翻译、细胞周期等一系列细胞生物学行为。近年来，越来越多的证据表明蛋白质精氨酸甲基化水平的失调与恶性肿瘤的发生、发展密切相关。因此，PRMTs作为潜在的肿瘤治疗靶点，逐渐引起了全球科学家的关注。2021年11月19日，威斯康星大学麦迪逊分校医学院许伟教授团队在Nucleic Acid Research上发表题为BAF155 methylation drives metastasis by hijacking super-enhancers and subverting anti-tumor immunity的研究成果。该研究发现，精氨酸甲基化修饰的BAF155蛋白可以通过操纵增强子、破坏机体的抗肿瘤免疫能力，从而促进恶性肿瘤的转移 。BAF155是染色质重组复合物SWI/SNF的重要亚单位之一。2014年，许伟课题组在Cancer Cell发文，首次证实了PRMT4（又称CARM1）能够通过甲基化修饰BAF155蛋白第1064位精氨酸，起到促进三阴性乳腺癌转移的作用【1】。近日，该课题组以基因编辑的乳腺癌细胞系与小鼠模型为基础，结合多组学技术揭示了me-BAF155促进乳腺癌转移的内在分子机制。超级增强子（Super-enhancers, SEs）是基因组中大量增强子富集的转录调控区域。在转录过程中，通过富集多种转录因子和辅因子（BRD4等）来大幅度激活下游靶基因的转录活性。本研究中，作者采用ChIP-seq技术对me-BAF155的基因组结合位点进行全局定位分析，发现me-BAF155和BRD4在SEs处共定位，以此调节关键癌基因的表达水平。CARM1抑制剂（CARM1i）的处理，能够使得me-BAF155和BRD4从SE上解离，减少SE数量，激活干扰素α/γ通路，增强宿主免疫反应，起到抑制肿瘤生长和转移的治疗效果。最后，作者采用VERSA技术分离循环肿瘤细胞，证实me-BAF155在高转移特性的三阴性乳腺癌患者的循环肿瘤细胞中呈稳定、持续的强阳性表达（图1）。该研究首次揭示了me-BAF155在促进恶性肿瘤转移中具有双重作用：通过招募BRD4激活增强子依赖的癌基因转录活性；通过抑制干扰素α/γ通路以削弱宿主免疫反应。尽管CARM1抑制剂具有较低的细胞毒性，但是在体外依然能够显著抑制三阴性乳腺癌细胞的迁移，在体内显著抑制肿瘤生长和转移。因此，作者提出CARM1抑制剂有望被开发成为单独使用的抗癌药物，或与其他治疗药物（如免疫治疗）联合使用，用于治疗转移性恶性肿瘤。另外，相较于现有的CARM1抑制剂，开发me-BAF155（R1064）靶点特异性的小分子抑制剂，有望产生抑癌效果更好、副作用更少的新型抗肿瘤药物。

近日，中国科学院大连化学物理研究所生物分离分析新材料与新技术研究组研究员叶明亮团队和上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心研究员刘聪团队合作，将硼酸化学引入到甲基化蛋白质组分析方法中，并巧妙利用精氨酸残基上不同修饰基团的位阻差异，实现高效的精氨酸二甲基化肽段富集，显著提高了蛋白质甲基化的分析能力；利用此新方法，系统分析了蛋白质分相过程中精氨酸二甲基化的变化，揭示了此类修饰的发生会降低蛋白质的分相能力。　　蛋白质精氨酸甲基化是一种调控蛋白质功能的重要翻译后修饰，与较多疾病的发生发展相关。研究表明，精氨酸二甲基化会影响一些神经退行性疾病相关蛋白的液-液相分离，以及相分离所驱动的无膜细胞器的产生。然而，受限于目前精氨酸二甲基化蛋白质组分析技术覆盖率不足，这类研究仅聚焦于少数几个蛋白，尚未系统性探究精氨酸甲基化对蛋白质相分离的影响。　　本研究发现，不同甲基化修饰的精氨酸残基在与邻二酮类化合物反应时，由于位阻不同，反应活性差异巨大。合作团队据此设计了一种精氨酸二甲基化肽段的富集方法：先利用环己二酮选择性的封闭无修饰精氨酸残基，随后利用丙酮醛选择性的在二甲基化精氨酸残基上修饰顺式邻二羟基，从而使得硼酸材料可以选择性的富集精氨酸二甲基化肽段。相比传统的免疫亲和富集方法，该方法拥有较强的精氨酸二甲基化肽段富集能力，特别是在鉴定RG/RGG序列上的精氨酸二甲基化位点方面有更高的灵敏度。合作团队将该方法应用于分析蛋白质相分离过程中精氨酸甲基化的变化，发现包括G3BP1，FUS，hnRNPA1、KHDRBS1在内的一些与无膜细胞器或神经退行性疾病相关的蛋白质上的精氨酸二甲基化程度发生了显著变化；系列实验验证发现，精氨酸甲基化会显著降低这些蛋白质的分相能力，且上述蛋白质组分析中鉴定到变化的甲基化位点是调控蛋白质相分离的关键因素。本工作开发了基于化学反应的精氨酸二甲基化蛋白质组分析方法，并利用这一方法揭示了精氨酸二甲基化对蛋白质液-液相分离具有重要的调控作用。　　叶明亮团队致力于蛋白质磷酸化、糖基化、甲基化等翻译后修饰分析新方法的研究，发展了基于可逆酶促化学标记的O-GlcNAc糖肽无痕富集方法，克服了标记基团对糖肽质谱检测的干扰，实现了O-GlcNAc糖基化的高灵敏分析（Angew. Chem. Int. Edit.）；利用不同糖肽的同一肽段骨架具有相似碎裂规律的特点，发展出基于“模式识别”的肽段序列鉴定新方法，实现了谱图拓展，显著提高了N-链接位点特异性糖型的鉴定灵敏度，并可发现未知的糖链及糖链修饰（Nat. Commun.）。　　相关研究成果以Global profiling of arginine dimethylation in regulating protein phase separation by a steric effect-based chemical-enrichment method为题，发表在《美国国家科学院院刊》（PNAS）上。研究工作得到国家重点研发计划、国家自然科学基金、大连化物所创新基金等的支持。

导读自青霉素发现以来，抗生素已经成为人类对抗细菌的最有效武器，挽救了无数人的生命，但随着抗生素使用上的无节制，抗生素耐药性已成为一个重大的全球问题。因此了解微生物对抗生素适应的分子机制成为抗击抗生素耐药性（AMR）的一个重要途径。近日，法国巴斯德研究所的科学家运用转录组测序、naica微滴芯片数字PCR等技术证实VchM（霍乱弧菌特有甲基转移酶）参与应对氨基糖苷类抗生素的应激反应，这表明，DNA甲基化在氨基糖苷类抗生素的耐药机制中也发挥着重要作用，该文章刊载于《PLOS GENETICS》。应用亮点：▶ 运用naica微滴芯片数字PCR系统分析霍乱弧菌操纵子表达情况。▶ VchM缺失会导致生长缺陷，但却可以使霍乱弧菌对氨基糖苷产生应激。▶ VchM直接调节groES-2（伴侣蛋白编码基因）的胞嘧啶甲基化，从而改变其表达情况，影响霍乱弧菌耐药性。氨基糖苷（AGs，如：妥布霉素、链霉素、卡那霉素、庆大霉素和新霉素）是一类针对细菌核糖体小亚基的抗生素，其破坏翻译保真度，增加细胞中错误折叠蛋白质的水平。而本文的研究主要针对霍乱弧菌对其的耐药性机理。科学家们在之前的研究中发现，特定DNA甲基转移酶基因突变（VchM）的霍乱弧菌相比WT具有更强的耐药性，这表明DNA甲基化可能在霍乱弧菌适应AGs中发挥作用。VchM编码一种Orphan m5C DNA甲基转移酶，导致5‘-RCCGGY-3’基序的胞嘧啶甲基化，虽然VchM的缺失会导致生长缺陷，但霍乱弧菌细胞可以在亚致死浓度和致死浓度的抗生素下对氨基糖苷应激。▲图1：霍乱弧菌ΔVchM对亚致死浓度氨基糖苷的敏感性较低。GAs类，TOB（妥布霉素），0.6 μg/ml、GEN（庆大霉素），0.5 μg/ml、NEO（新霉素），2.0 μg/ml；非Gas类，CAM（氯霉素），0.4 μg/ml和CARB（β -内酰胺类西林），2.5 μg/ml对于ΔVchM霍乱弧菌的转录组测序和遗传分析发现，ΔVchM菌株中有4个直接参与蛋白质折叠的基因被上调。包括groEL-1，groEL-2，groES-1，groES-2。通过naica微滴芯片数字PCR系统对基因表达进行验证分析发现，ΔVchM霍乱弧菌中groES-2的表达在不同时期均有较大上调。进一步通过缺失验证表明了groESL-2对ΔVchM的抗生素高耐受性的作用。▲图2：ΔVchM菌株中groESL-2操纵子上调(对数生长期，Exp, OD600 ≈ 0.3；指数生长期，Stat, OD600 ≈ 1.8–2.0)在groESL-2区域观察存在四个VchM甲基化基序存在。进一步对基序分析发现，破坏这些基序会导致groESL-2基因表达增加（如图3）。且基序破环越多，则导致的表达上调更加明显。同时，ΔVchM中的groESL-2基因表达一直高于基序突变，表明还存在其他因素与甲基化协同控制groESL-2表达。这些结果表明，在霍乱杆菌中，一组特定的伴侣蛋白编码基因受DNA胞嘧啶甲基化的控制，将DNA甲基化与伴侣蛋白表达的调节和对抗生素的耐受联系起来。▲图3：在WT中，groESL-2区域的VchM位点突变导致基因表达增加法国巴斯德研究所是世界上最著名的研究所之一，成立130余年来一直走在世界科技前沿，是微生物学、免疫学、传染病学等学科的起源地，曾开发出狂犬病疫苗、天花疫苗、流感疫苗、黄热病疫苗等多个造福人类的疫苗产品，并培养了10名诺贝尔奖生理学或医学奖获得者，实现研究、教育、健康、创新“四位一体”的研究机构。

近日，南京腾辰生物宣布完成数千万元A轮融资，本轮融资由树兰俊杰资本领投，知名个人投资人跟投，探针资本担任独家财务顾问。本轮融资主要用于biomarker专利库和临床样本的进一步积累，加速后续产品管线的研发，着重推进肺结节良恶性判别IVD产品的注册检及后续的医疗器械证申报，以及LDT产品的商业化落地。腾辰生物成立于2018年，专注于针对恶性肿瘤的核酸质谱早筛早诊产品研发。从公司成立之初开始，就着手与国内顶尖医院合作，建立全球高水平的早期癌症样本库。截至目前已经积累了两万余例临床样本，并基于真实世界的临床样本开发原研靶点阵列，布局了一系列分子标志物专利，建立专利护城河。同时，围绕核酸质谱平台优化工艺流程，自研自产基础试剂盒，在提高产品壁垒的同时大大降低检测成本，提升临床可及性及数据稳定性。肿瘤早筛早诊市场规模达千亿，其中分子诊断市场近几年增长迅速。DNA甲基化被认为是极佳的肿瘤体外早诊分子标志物，可以针对包括肺癌、乳腺癌、甲状腺癌、结直肠癌、宫颈癌等一系列恶性肿瘤进行早期检测。尽管目前针对DNA甲基化已经有多款产品上市（适应症包括结直肠癌、宫颈癌等），但大部分的产品所检测的疾病范围尚集中在能够获取肿瘤附近组织样本的类型。而恶性肿瘤早期体外诊断最佳的介质是血液，因为其采样简单且几乎适用于所有癌种，但早期恶性肿瘤患者血液中甲基化信号弱、背景噪音强，想要精准捕捉相应信号的难度极大。目前，针对甲基化的检测主要有三种方式，分别为qPCR、二代测序及定量核酸质谱。其中，qPCR检测相对简单、生信分析要求较低，且相应的仪器在临床端较为普遍，IVD报证先例较多。然而qPCR只适用于检测位点相对较少的产品（1-5个位点最佳），且检测的精密度相对较低，因此不适用于血液样本的检测。而基于NGS做甲基化检测的精密度相对较高，可同时检测成千上万个DNA位点，但其操作相对复杂，生信要求和成本均较高，更适用于位点的筛选。而定量核酸质谱操作相对简单，生信要求低，数据稳定性高，适用于10-100个DNA位点的检测范围，符合血液样本临床检测的应用场景。然而，在应用核酸质谱检测过程中几乎所有步骤的试剂盒均需进口，如何降低检测成本、优化检测流程，且如何选取合适的分子标志物阵列，均为应用该技术平台需要解决的难题。目前，围绕核酸质谱检测平台，腾辰生物共布局了近10条产品管线，覆盖包括肺癌、乳腺癌、甲状腺癌、前列腺癌等恶性肿瘤。其中，肺癌早诊产品已经完成了4000余例临床验证（其中I期肺癌比例大于90%），对于2cm以下的极早期肺癌的灵敏度与特异性均＞80%。与竞品相比，腾辰生物的肺癌早诊产品”菲捷明“拥有采血量低、对样本要求低、成本及终端价格低等优势，目前正在推进商业化落地和准备启动IVD报证工作。随着公司产品研发进度的加快和资源的不断注入、公司管线日益丰富，腾辰生物吸引了一批优秀的人才加入，组建了一支能力卓越、经验丰富的研发、生产及销售团队。腾辰生物创始人，CEO杨蓉西博士表示：我们很高兴连续获得知名专业基金和投资人的认可和支持。腾辰生物拥有十余年的技术积累，具有国际领先的持续原研能力，致力于开发高效稳定低成本的癌症早筛早诊的分子标志物，以及相关的底层技术和检测体系。经过四年的成长，公司团队逐渐完善，临床数据快速积累，市场销售开始布局。未来我们将与合作方携手共进，持续推进研发和注册申报，为临床医生和患者提供优质的肿瘤早筛早诊服务和产品。树兰俊杰资本创始合伙人许迪龙表示：我们很高兴作为领投方参与腾辰生物的A轮融资。树兰俊杰医疗资本扎根产业，深耕医疗领域投资，近年来一直以务实的眼光关注肿瘤早筛早诊赛道，寻找有创业精神，有持续原研能力且最终能落地的项目。腾辰生物坚持原研十余年，积累了30余项发明专利、数千例临床数据和自有的工艺流程，从而建立了很高的技术壁垒。核酸质谱平台的应用在大幅提高数据的精密度和稳定性的同时也大大降低了成本和提高了工作效率。我们对腾辰生物的后续发展充满了期待。探针资本合伙人杨丹宁表示：腾辰生物拥有一流的IVD产品研发和落地能力，围绕核酸质谱快速布局多条产品管线，并建立自己的分子标志物阵列及自研试剂专利壁垒，在研发具有高度差异化、高精准度及特异性的IVD产品同时进一步降低检测成本、增加检测结果稳定性，更加贴近疾病早筛早诊应用场景。公司自创立起，便与国内多家知名医院展开合作，共同推进项目落地，相信未来一定会实现爆发增长。我们非常荣幸参与到腾辰生物此次的融资工作中，并期待公司在CEO的带领下进一步建立研发壁垒、完善产品管线，助力行业更好地发展。关于腾辰生物南京腾辰生物科技有限公司座落于南京市江北新区“南京生物医药谷”，是一家由留德海归博士创办、致力于开发新一代肿瘤及心脑血管等重大疾病体外早诊技术及产品的高科技生物企业。公司在疾病早诊、预后评估、疗效评估和复发监控等方面拥有领先的自主技术，并已获得多家国内一线风投机构的投资。公司已与国内多家三甲医院建立合作，积极筹建肿瘤体外诊断研发基地，进一步提升研发创新能力、丰富大数据积累和完善知识产权布局。公司创始人曾担任德国国家癌症研究中心和德国排名第一的海德堡大学医学院研究员，其研究成果于2016年获得了欧洲知名的Claudia von schilling基金会颁发的乳腺癌研究贡献奖，并在德国有丰富的创业经验并多次获奖，其创立的肿瘤体外诊断体系先后获得了德国国家经济部高科技转化大奖及欧盟创业大赛生物技术类一等奖。关于树兰俊杰资本树兰俊杰资本由树兰医疗集团早期投资人和创始团队共同发起组建，在全球范围内以临床资源服务于医学科技产业转化，通过建设科技投资基金、SATOL生命科技加速器、SATOL全球医学创新创业中心，承办世界生命科技大会、全球医学创新创业大赛，以社群服务、基金投资、科研孵化三项核心业务来推动医学临床、科研、产业一体化发展，助力医学科技人才创新创业，在数字诊疗、生物技术、创新疗法等领域投资了一批优秀的科技企业。关于探针资本探针资本成立于2017年，是一家专注医疗健康与生命科技的精品投行，旗下业务包括财务顾问、直接投资、产业咨询和创新孵化。创始团队来自业内一线私募股权投资机构、财务顾问机构、管理咨询公司和医疗垂直媒体。自成立以来，探针资本每年均完成两位数的私募融资与并购交易，累计交易金额近百亿元人民币。在企业增值服务方面，探针资本团队拥有成熟的产业经验。2020年探针新医疗基金成立，截止目前已投资十余家业内头部公司。

DNA中的5-甲基胞嘧啶（5mC）是生物学领域基本的表观遗传标记，对调节基因表达至关重要。5mC不仅是多个生物学领域的研究重点，而且在临床上，5mC的异常甲基化模式与包括癌症在内的多种疾病的发生发展密切相关，为疾病的早期诊断和监测提供了有效的生物标志物。对5mC位点的精准检测对基础研究和疾病检测的准确性至关重要。尽管亚硫酸氢盐测序（BS-seq）技术在基础研究和临床上应用广泛，但目前用于5mC检测的常规BS-seq方法有明显缺陷：1）反应时间长，限制了其在临床上的快速检测。2）在高GC DNA区域或高度结构化的DNA（例如线粒体DNA），C到U的转化不完全，导致高背景和假阳性。3）DNA降解严重，对微量的样品如cell-free DNA（cfDNA）的检测带来挑战。4）常规BS处理造成非甲基化的区域优先降解，使得甲基化水平被高估。在临床上能用小量样品进行快速而准确地检测5mC一直是DNA表观遗传领域的一项挑战。而用于RNA m5C 检测的BS-seq同样困难重重。RNA的降解问题尤其严重。RNA的二级结构或稳定的RNA（比如tRNA）导致严重的高背景和假阳性。目前还缺乏准确有效的检测m5C的方法。2024年1月2日，芝加哥大学何川团队在 Nature Biotechnology 期刊发表了题为：Ultrafast bisulfite sequencing detection of 5-methylcytosine in DNA and RNA 的研究论文。该研究开发出了对微量DNA和RNA上的5-甲基胞嘧啶修饰进行快速，准确检测的测序方法——Ultrafast Bisulfite Sequencing（简称为UBS-seq）。何川课题组的戴庆博士根据BS-seq的机理以及由于BS反应而造成的DNA降解机制，发现用亚硫酸氢铵盐代替钠盐可以大大提高BS的效率，C能够在几分钟内完全转化为U而5mC保持不变（图1a），并且由于反应的时间大为缩短，DNA的降解也显著降低（图1b）。UBS-seq测序背景噪音比常规BS-seq降低10倍以上，并且UBS-seq整体转化效率更加一致（图1d）。图1：UBS-seq在DNA样品上的的转化效率UBS-seq不仅可以用于微量mESC基因组的测序，还可用于极少量细胞样品，甚至单细胞，在背景噪音和假阳性等方面要比常规BS-seq低得多。研究团队进一步应用UBS-seq来比对早期结直肠癌病人组和对照组的血液中提取的cfDNA 样品，发现明显的甲基化区别。这些结果显示UBS-seq在寻找5mC作为疾病的早期诊断的指标方面具有广泛的应用前景。另外，由于具有快速且能减少DNA的降解而特别适用于小量样品的特点，UBS-seq在从少量样品中检测已知的5mC疾病指标，以及在临床快速诊断和手术中的实时决策方面，具有独特的优势和应用前景。除了快速准确检测DNA中的5mC外，UBS-seq也可以用于快速准确检测RNA中的m5C。m5C广泛存在于多种类型的RNA中，影响细胞功能，并在多种癌症中发挥重要作用。然而，由于缺乏灵敏、准确的定量测序方法，m5C在不同RNA类型上的位置及化学计量一直有争论。与DNA中的5mC相比，mRNA中m5C的修饰位点以及修饰水平要低得多，因此如何避免常规 BS-seq中所产生的假阳性，降低RNA降解从而精准地检测到m5C位点并定量其修饰比例，一直是 RNA BS-seq 的主要挑战。研究人员进一步优化了UBS-seq 的配方，发现在98度下加热9分钟后，rRNA上所有的C位点的未转化率（背景噪音）仅有1%，而两个已知的m5C位点的未转化率（阳性信号）高达95%（图2a）。UBS-seq在rRNA样品上的准确性大大优于几种已发表的m5C BS-seq 方法（图2b）。随后研究团队将UBS-seq应用于具有复杂二级结构的tRNA，检测并且观察到NSUN2修饰位点的修饰比例能响应NSUN2基因的敲除（图2c），进一步验证了BS-seq的有效性和准确性。研究人员用UBS-seq对HeLa和HEK293T的mRNA进行了测序，发现了近两千多具有保守序列模式的位点（图2d）。随着NSUN2基因敲除，绝大多数m5C位点的修饰比例下降（图2e）。当把NSUN2的基因再转入敲除的细胞后，m5C位点的修饰比例又回升了（图2f）。这些结果证明了m5C UBS-seq 方法不仅非常灵敏高效，而且非常准确。为研究m5C的生物功能提供了有力的工具。图2：UBS-seq在RNA样品上的的转化效率，以及不同类型RNA上m5C位点的检测何川教授的团队近年来相继开发出了SAC-seq用于定量检测m6A，BID-seq用于定量检测等测序新方法，极大的促进了表观转录学领域的发展。随着UBS-seq的发表，将会进一步促进m5C的生物功能的研究，并和SAC-seq，BID-seq一起引领RNA表观转录组领域步入新的阶段。

近年来，随着人类基因组学的发展，越来越多的药物基因组生物标记物及其检测方法相继涌现。药物基因组学已成为指导临床个体化用药、评估严重药物不良反应发生风险、指导新药研发和评价新药的重要工具。　　为进一步提高临床实验室开展药物代谢酶和药物靶点基因检测技术，以及肿瘤个体化用药基因检测技术的规范化水平，国家卫生计生委个体化医学检测技术专家委员会，在广泛征求意见的基础上，制定了《药物代谢酶和药物作用靶点基因检测技术指南(试行)》和《肿瘤个体化治疗检测技术指南(试行)》，并于7月29日正式发布。　　《药物代谢酶和药物作用靶点基因检测技术指南(试行)》主要内容包括药物代谢酶和药物作用靶点基因检测分析前、分析中和分析后的质量保证规范，旨在为临床检验实验室进行药物代谢酶和药物靶点基因检测的质量保证提供全过程动态指导。　　目前，美国食品药物管理局已批准在140余种药物的药品标签中增加药物基因组信息，涉及的药物基因组生物标记物达42个。此外，部分行业指南也将部分非FDA批准的生物标记物及其特性(如MGMT基因甲基化)的检测列入疾病的治疗指南。药物反应相关基因及其表达产物的分子检测是实施个体化药物治疗的前提。　　药理学与遗传学结合的关键环节包括药物代谢动力学(PK)和药物效应动力学(PD)两方面。PK主要是定量研究药物在生物体内吸收、分布、代谢和排泄规律，侧重于阐明药物的体内过程 PD主要研究药物对机体的作用、作用规律及作用机制，其内容包括药物与作用靶位之间相互作用所引起的生化、生理学和形态学变化，侧重于解释药物如何与作用靶点发生作用。　　对药物代谢酶和药物靶点基因进行检测可指导临床针对特定的患者选择合适的药物和给药剂量，实现个体化用药，从而提高药物治疗的有效性和安全性，防止严重药物不良反应的发生。　　另外，肿瘤的个体化治疗基因检测已在临床广泛应用，实现肿瘤个体化用药基因检测标准化和规范化，是一项意义重大的紧迫任务，《肿瘤个体化治疗检测技术指南(试行)》则进一步提高了肿瘤个体化用药基因检测技术的规范化水平。　　该指南从诊断项目的科学性、医学实验室检测方法的准入、样本采集至检测报告发出的检测流程、实验室质量保证体系四个方面展开了相关论述，使临床医生能够了解所开展检测项目的临床目的、理解检测结果的临床意义及对治疗的作用 医学实验室为患者或临床医护人员提供及时、准确的检验报告，并为其提供与报告相关的咨询服务。检测技术的标准化和实验室准入及质量保证对临床和医学实验室提出了具体的要求，以最大程度地保证检测结果的准确性。

p　　本榜单不包括已经上市的达安基因、迪安诊断、金域检验、中源协和等企业的基因检测部分，为非上市企业，综合业务收入、净资产、净利润、融资情况、产品线、市场占有率、知名度等各种因素，按照中国资本市场对于新兴高科技医疗行业估值方式给出，span style="color: rgb(255, 0, 0) "strong本次只发布估值在10亿人民币以上企业/strong/span：/ptable style="border-collapse:collapse "tbodytr class="firstRow"td style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="81" valign="top"估值金额 /tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="99" valign="top"公司名称 /tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="420" valign="top"公司介绍 /td/trtrtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="81" valign="top"200亿 /tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="99" valign="top"博奥生物 /tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="420" valign="top"博奥生物集团有限公司于2000年9月30日在国务院、发改委领导大力支持下，以清华大学为依托、联合华中科技大学、中国医学科学院、军事医学科学院注册成立。公司注册资本3.765亿元人民币，总部坐落于北京北部，现拥有研发、生产、运营和服务设施已超过10万平方米。到2016年，博奥生物已迅速发展为囊括五大研究院（健康科学研究院、转化医学研究院、工程转化研究院、转化生物信息研究院、健康技术研究院）、五大子公司（北京博奥晶典生物技术有限公司、北京博奥医学检验所有限公司、博奥颐和健康科学技术（北京）有限公司、东莞博奥木华基因科技有限公司、成都博奥新景医学科技有限公司）的集团化运行架构。/td/trtrtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="81" valign="top"170亿 /tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="99" valign="top"华大基因 /tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="420" valign="top"华大基因成立于1999年，是全球最大的基因组学研发机构。华大基因以“产学研”一体化的创新发展模式引领基因组学的发展，通过遍布全球的分支机构与产业链各方建立广泛的合作，将前沿的多组学科研成果应用于医学健康、农业育种、资源保存等领域，推动基因科技成果转化，实现基因科技造福人类。/td/trtrtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="81" valign="top"100亿 /tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="99" valign="top"贝瑞和康 /tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="420" valign="top"北京贝瑞和康生物技术股份有限公司（以下简称贝瑞和康）成立于2010年5月，是致力于应用高通量基因测序技术，为临床医学疾病筛查和诊断提供“无创式”整体解决方案的研发型生物科技公司，是将基因测序技术实现临床转化的行业领导者。贝瑞和康的研发团队由曾经参与高通量测序仪设计和研发的周代星博士带队，由高通量测序领域和临床基因检测领域内顶尖的实验、研发、生物信息分析专家组成，并与领域内全球知名的研究机构建立了合作关系。贝瑞和康已成为全球领先的高通量测序技术及应用研究中心。公司先后于2011年9月获得中关村高新技术企业认证，2012年12月获得国家高新技术企业认证。/td/trtrtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="81" valign="top"50亿 /tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="99" valign="top"诺禾致源/tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="420" valign="top"诺禾致源创立于2011年3月，专注于开拓生物学、计算机科学和信息技术在动植物研究以及人类健康领域的应用。公司目前已在亚太地区建成大通量基因测序中心，总部位于北京，在天津和美国设有实验基地，并在香港，美国、英国和新加坡设有子公司或合资公司。其业务主要覆盖科技服务、肿瘤基因检测及遗传检测三大领域，其中科技服务业务在国内市场有较高占有率。 /td/trtrtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="81" valign="top"50亿 /tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="99" valign="top"安诺优达/tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="420" valign="top"安诺优达基因科技（北京）有限公司(以下简称安诺优达)总部位于北京，是中国基因组行业的知名企业，国家高新技术企业、国家发改委首批基因检测技术应用示范中心，北京市发改委“精准医疗与基因工程北京市工程实验室”，拥有博士后科研工作站，所属医学检验所是国家卫计委首批高通量测序临床应用试点单位。公司于2012 年成立，专注于新一代基因组学技术在人类医学健康和生命科学研究两大领域的产业化应用。/td/trtrtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="81" valign="top"45亿 /tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="99" valign="top"拓普基因 /tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="420" valign="top"广州拓普医疗科技有限公司简称TOP（拓普），TOP（拓普）由熟悉国际医药及生物科技企业运作的管理团队和生物技术领域的知名科学家共同组建。TOP（拓普）专注于将新一代基因组学技术在人类医学和生命科学研究领域的产业化开发和应用，采用先进的4P健康管理（Preventive预防性，Predictive预测性，Personalized个体化，Participatory参与性）服务模式服务于客户。已经形成了包括染色体异常检测、肿瘤个性化用药指导、肿瘤基因检测以及个人全基因组检测在内的领先产品和市场能力。为医学专家提供全面、及时、持续的临床检测和个人健康信息数字化管理，特别是从基因组层面实现对常见疾病的预测、预警、预防和有效个体化诊断与治疗，共同开创中国个性化健康管理与医疗新时代。/td/trtrtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="81" valign="top"30亿 /tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="99" valign="top"泛生子 /tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="420" valign="top"泛生子基因，世界领先的精准医疗专家，致力于以覆盖癌症全周期诊疗各个环节（风险评估、早期筛查、分子诊断和术后监测等）的健康管理产品，协助医疗专家、科研机构等，为癌症患者、癌症高危人群及健康人群，提供可靠的分子诊疗方案、专业的癌症遗传风险评估。目前，泛生子已建成国际先进的多元化分子检测技术平台及生物信息分析平台，成立了美国北卡、中国北京双研发中心，并在北京、上海、杭州建成了总面积超过8,000平米的临床医学检验中心。未来，泛生子将以专业的市场、产品、医学、科研团队、覆盖中国东、南、西、北四各大区的销售网络，以及自身强大的癌症基因组学基础和高效的临床转化能力，竭力服务中国乃至全球的癌症患者。/td/trtrtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="81" valign="top"30亿 /tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="99" valign="top"明码生物 /tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="420" valign="top"药明康德集团企业明码生物科技是一家运用基因组数据来帮助人类实现更好的健康和精准医疗的基因组信息公司。我们独有的、一体化的、开放的平台包括：CLIA和CAP认证的基因组学中心；能管理和挖掘更多基因组数据的创新数据库构架；可在线下和云端使用的、世界领先的基因组解读和发现系统；用户可以以无与伦比的解析度和效率对海量基因组数据进行线上查询、开展合作的领先的DNA数据库网络；应用基因组学知识来优化药物研发流程的专长；以及改善罕见病诊断、肿瘤靶向治疗和人类健康的不断增长的各类检验和筛查。明码（上海）生物科技有限公司在上海、美国马萨诸塞州的坎布里奇和冰岛雷克雅未克设有办事处，服务遍布世界的公司和健康机构、临床医生和研究人员、个人和群体。/td/trtrtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="81" valign="top"30亿 /tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="99" valign="top"燃石医学 /tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="420" valign="top"燃石医学成立于2014年3月，总部位于北京，其第一家检验所—“广州燃石医学检验所有限公司”坐落于环境优美且富有科研底蕴的广州市国际生物岛上，随后在上海建立了研发中心，总占地面积10000多平方米。燃石医学专注于肿瘤患者个体化治疗指导，以二代测序及医学生物信息学为核心，常规肿瘤分子病理检测为基石，致力于打造肿瘤个体化治疗临床检测服务及科研一站式解决方案。/td/tr/tbody/tabletable style="border-collapse:collapse "tbodytr class="firstRow"td style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="82" valign="top"25亿 /tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="98" valign="top"碳云智能 /tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="420" valign="top"深圳碳云智能科技有限公司成立于2015年10月，围绕消费者的生命大数据、互联网和人工智能创建数字生命的生态系统。公司主要创始团队由全球顶尖生物科技专家组成，在组学技术、移动医疗、医疗服务、生物数据分析、人工智能和数据挖掘等领域有丰富的经验。基于全球专业度最高、指数增长的数字生命网络，我们致力同世界领先的合作伙伴一起，去解读、研究、引导和管理数字生命，提供个性化管理数字生命的产品和服务，创建数字健康新生活。/td/trtrtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="82" valign="top"20亿/tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="98" valign="top"奕真生物 /tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="420" valign="top"作为全球基因检测领域的革新者，奕真生物面向全球市场提供全基因组检测和有针对性的遗传性癌症及生殖健康基因筛查服务。奕真生物成立于2014年，由来自哈佛大学医学院的教授和遗传学先驱乔治· 邱奇 (George Church) 博士和团队共同创立。奕真生物的管理团队拥有十年以上的全基因组测序经验，并曾参加哈佛大学医学院的“个人基因组计划”。2016 年，奕真生物先后被《麻省理工科技评论》杂志评为“2016 年度全球面向消费者基因产品领导企业”，并入选“全球 50 家最聪明的公司”。 /td/trtrtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="82" valign="top"20亿 /tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="98" valign="top"金唯智生物 /tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="420" valign="top"p作为全球领先的基因组研究和基因技术应用的生物技术公司，金唯智拥有雄厚的科研技术力量，以优秀的数据质量，帮助全球科研伙伴加快其科学研究与发现。/pp依靠金唯智始终可靠、高品质的数据专利技术，我们的客户处于制药、生物技术和学术机构以及前沿新兴公司甚至是极其复杂项目的尖端。作为一家全方位服务提供商，金唯智提供Sanger测序、基因合成、分子生物学、高通量测序、生物信息学和GLP标准规范服务。/p/td/trtrtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="82" valign="top"15亿 /tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="98" valign="top"世和基因 /tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="420" valign="top"p世和基因是癌症个体化医疗诊断的先行者，2008年末一批在生物医药领域有突出贡献的北美华人科学家开始致力于高通量全景癌症基因测序的研究。世和基因北美总部坐落在加拿大多伦多，中国总部落户于南京，此外世和在美国斯坦福大学设有生物信息学分部。/pp世和基因的核心团队拥有多名专攻癌症的癌症生物学博士和生物信息学博士及具有丰富企业管理及资本市场经验的高级管理人员，成员均来自北美和中国著名高校，如斯坦福大学、多伦多大学、哥伦比亚大学和北京大学等。世和的科学顾问团队由多位国际顶级肿瘤专家组成，包括来自哈佛大学、麻省理工学院、多伦多大学和中国科学院的专家学者。世和已与国内外多所著名医院以合作方式进行临床诊断以及开展转化医学研究。/p/td/trtrtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="82" valign="top"15亿 /tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="98" valign="top"思路迪 /tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="420" valign="top"p公司于2010年成立，总部位于上海浦江高科技园区。基于三大核心技术优势——全球最大的肿瘤原代细胞库平台、二代测序平台和肿瘤大数据平台，我们开展肿瘤预防、诊断和药物研发三大业务。公司共获得若干国内知名风险投资机构累计4轮数亿元人民币资金的注入。/pp秉承“以患者为中心”的理念，思路迪致力于成为大数据引领的肿瘤精准医疗领域的创新型领导者。通过对肿瘤基因组数据，临床诊疗数据、药物研发数据进行挖掘和运用，使我们能够为客户提供更加精准的医学决策，运用到精准医学的预防、诊疗和新药开发中，从而对患者、肿瘤高危人群、医生等群体提供更有价值的产品和服务。/p/td/trtrtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="82" valign="top"15亿 /tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="98" valign="top"百迈客 /tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="420" valign="top"p北京百迈客生物科技有限公司（Biomarker Technologies），成立于2009年5月，位于首都临空经济区。公司自成立以来，秉承" 生物科技创新，服务社会，造福人民" 的企业使命，致力于" 打造生物科技创新中心，树立生物产业标志企业" 的发展愿景，让生物科技更快，更好的提高人类生活质量。/pp百迈客基于高通量测序和生物信息技术的开发与应用，开展科技服务、医学检测、生物云平台等主体业务。经过多年的发展，业务涵盖全国30多个省、市、自治区。/p/td/trtrtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="82" valign="top"15亿 /tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="98" valign="top"吉因加 /tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="420" valign="top"北京吉因加科技有限公司以基因科技为核心,从事医学健康领域的科学研究、应用开发和产业服务, 是一家集科研、临床检测和健康服务于一体的基因科技公司京吉因加医学检验所专注于肿瘤基因检测领域，按照国际临床基因检测实验室标准搭建，目前已形成基于高通量基因测序技术与生物信息分析的ctDNA精准检测体系，实现了对肿瘤无创、准确、动态的基因分析，为临床提供精准用药、疗效监测、术后复发监测、风险预测和早期检测等服务。/td/trtrtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="82" valign="top"12亿 /tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="98" valign="top"云健康 /tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="420" valign="top"云健康基因科技（上海）有限公司坐落于上海奉贤生物科技园区，是一家行业内领先的专注为健康和临床研究提供全基因组检测和精准健康医疗解决方案的高科技企业。云健康医疗科技集团建立了全球最先进超高通量全基因测序技术平台HiSeq X Ten，提供从基因检测到健康解决方案，致力于倡导和引领预防医学，精准医疗事业的发展，推进中国健康产业的发展，提升大众的健康生活品质，降低疾病风险。/td/trtrtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="82" valign="top"12亿 /tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="98" valign="top"鹍远基因 /tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="420" valign="top"由美国著名科学家高远教授（约翰霍普金斯大学），张鹍教授（加州大学圣地亚哥分校），刘蕊博士（加州大学圣地亚哥分校）等发起组建。高远教授和张鹍教授，师承美国哈佛大学最具著名的遗传学家、生物工程学家、新一代基因测序技术的奠基人George Church教授，紧密科研合作十几年，在各自的研究领域里成为学术领头人。张鹍教授在单细胞测序基因组技术，甲基化研究等方面处于国际领先地位。位于中国上海及美国加州圣地亚哥的鹍远基因公司，在单细胞测序、DNA甲基化测序以及生物信息学方面拥有独有的专利技术；公司主要产品服务包括肿瘤诊断及个性化治疗、无创产前诊断等；公司致力于发展精准医疗，努力为病人提供早期、精准的诊疗信息。/td/trtrtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="82" valign="top"11亿 /tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="98" valign="top"伯豪生物 /tdtd style="border: 1px solid rgb(204, 204, 204) word-break: break-all " width="420" valign="top"p上海伯豪生物技术有限公司是上海生物芯片有限公司/生物芯片上海国家工程研究中心根据国内外研发外包发展的需要，整合旗下系统化技术平台、商业化服务体系、高素质服务团队等资源成立的致力于研发外包服务公司。/pp上海伯豪生物技术有限公司拥有五大微阵列芯片服务平台（SBC、Affymetrix、Agilent、NimbleGen和Illumina芯片平台），三大第二代测序服务平台（ABI SOLiD 5500、Illumina Solexa、和Roche 454测序平台）以及ABI定量PCR、ABI 3730测序等验证服务平台。正在为多达18家跨国制药企业（包括排名前10位的跨国制药企业中的8家）和1133家国内科研机构、医院提供基因表达谱、基因分型、比较基因组学、DNA甲基化、miRNA、生物信息分析等技术服务。/p/td/tr/tbody/tablep　　本榜单涉及的企业为有据可依的，其它可能还有估值超过10亿的企业，单纯以本榜单所涉及企业，估值已经超过800亿，中国整个基因检测行业估值应该已经超过2000亿。未来在行业发展竞争过程中，肯定会有洗牌的过程，胜出的企业最终能否将估值落地，就在于整个行业的市场能够取得超速发展，以及各自的市场占有率。/p

灵敏度92.6％！肝癌检测有了新手段，比传统检测方法灵敏度高了近30%。 日前，由武汉企业自主研发的肝癌基因甲基化检测产品（艾馨甘）完成第三方多中心双盲临床试验，正式进入注册审批阶段。据了解，该产品为全球首个肝癌基因甲基化荧光PCR检测产品，核心检测靶点已申请全球专利。 目前全球有多个已知的肿瘤标志物检测靶点，多数企业倾向于在前人经验的基础上做加法，针对已发现的靶点研发产品，很少有人愿意从零开始，真正去实现标志物的源头性发现。武汉艾米森生命科技有限公司董事长张良禄介绍，此项工作投入产出比很低，甚至有可能空手而归，但总要有人沉下心去做基础研究，不惧啃“硬骨头”，才能向“新”而行。 ■ 肝癌检测新产品 最快今年七八月份上市 我国是肝癌高负担国家。根据2020年全球肿瘤流行病统计数据，中国肝癌发病率在所有恶性肿瘤中排名第四，死亡率排名第二。与此同时，中国肝癌患者五年生存率仅12.1%，显著低于所有恶性肿瘤合计五年相对生存率40.5%。 “早发现对提高患者生存率至关重要，然而现有筛查手段检测效率和准确性不高。”张良禄介绍，目前广泛采用的肝癌筛查方法是超声检查联合甲胎蛋白检测，甲胎蛋白是肿瘤标志物的一种，可检出约60%的肝癌患者，而超声对早期肝癌诊断灵敏度仅47%，即使两种检测手段联合应用，也只能识别63%的早期肝癌。 “从2018年起，我们开始全力研发一款可以与现有技术手段有效互补，甚至能够替代现有筛查手段的检测产品。”张良禄透露，目前，由该公司自主研发的肝癌基因甲基化检测产品（艾馨甘）已完成临床试验，进入注册审批阶段，最快今年7月、8月份即可上市。 他介绍，这款检测试剂可通过分析血液中循环肿瘤DNA的特异性基因甲基化改变，更早、更灵敏、更准确地识别肝癌，在上千例样本中进行的注册临床试验证实，其对肝癌检测灵敏度为92.6%、特异度为95.5%，意味着该产品能够有效地检测出早期肝癌患者，同时减少误报的可能性。 作为临床医生出身的创业者，张良禄坚持“医者情怀可以帮助我们深入了解患者的痛点，从患者角度出发，提供更贴心、更实用的产品和服务”。 ■ 45万条探针“投石问路” 精化出两个优秀“靶点” 肿瘤标志物，是肿瘤产生的有别于正常细胞的物质，存在于患者血液、尿液、组织或其他体液中。从海量数据中筛选出具备高灵敏度和特异性的标志物，是确保肝癌早期检测准确性的关键。 张良禄介绍，人的基因组由大约30亿个碱基对组成，但只有2万多个能被有效识别。艾米森采用甲基化芯片技术，利用45万条探针来覆盖整个人类基因组上与癌症相关的甲基化位点，通过比较肿瘤与正常组织间的差异，初步筛选出数百个“种子选手”。接着，团队对这些“种子选手”进行临床验证，将入围对象从几百个缩小到几十个，再从几十个缩小到几个，最终锁定为两个！ 找到了最理想的两个“靶点”，接下来的难题是如何有效检出它。张良禄介绍，成年人血液总量约为3500—5000毫升，体检只能抽取约10毫升血样，循环肿瘤DNA在其中的含量极低，“好比一撮盐撒进了一缸水，我们要通过取一勺水识别出盐的存在”。 “我们尝试了很多技术革新，通过扩增放大循环肿瘤DNA信号，同时提高提取回收率。有了这些技术铺垫，才能将优秀的靶点转化为优秀的产品。”张良禄说，公司成功研发出循环肿瘤DNA高效提取转化一体化试剂盒，并配套全自动化的设备，不仅确保了检测的稳定，同时大幅度降低了试剂成本和检测成本。 谈及研发初衷，张良禄坦言，当前我国生物医药领域已建立起较完善的产业链，但研发源头创新仍存在短板，制约着医药行业的高质量发展。只有不断加强在生物医学、生物信息学、人工智能和大数据等领域的基础与应用研究，才能为产业发展提供源源不断的原动力，以新质生产力为人民健康与经济社会的可持续发展提供有力支撑。

我国基因检测的临床应用以及产业发展之路何去何从?在采访中，多数专家认为，应借鉴国外的管理模式，加强技术方法研究，并期盼国家给予更多的政策支持。　　借鉴国外模式　　虽然目前全世界都开展了临床基因测序，但对其应用各国或地区都非常慎重，对临床基因测序的监管亦相当重视。　　美国Ariosa诊断公司2月12日获得纽约州颁发的无创产前诊断许可证，可以不受限制地在全美国50个州开展无创产前诊断服务。而此前，该公司已为15万名妇女做了无创产前诊断，所用的方法也同样是采集孕妇的外周静脉血，提取血浆中的游离DNA，通过第二代高通量测序技术来检测胎儿的染色体异常增多症。　　WHO遗传病社区控制合作中心主任、中国优生优育协会副会长、中国医学科学院基础医学研究所医学遗传学系黄尚志研究员谈到，美国对基因测序技术采用了有效兼顾监管和鼓励创新的&ldquo 实验室开发诊断试剂监管模式&rdquo (LDT)。在此模式下，实验室取得临床实验室改进修正案(CLIA)标准相关认证后，检测结果即可用于指导临床诊疗。该管理方式自实施以来，得到了患者、医院、第三方临检中心、保险公司的广泛认可。　　LDT是各个实验室自己建立，并自发在实验室和临床进行验证，遵循质量管理要求而开展的。美国临床病理学会(ASCP)对LDT的定义为：实验室内部研发、验证和使用，以诊断为目的的体外诊断实验。　　著名遗传生物学家、中国科学院院士贺林在撰文中表示，目前美国有近25万个CLIA实验室，由另外一个政府机构CMS管理。美国食品药品管理局(FDA)负责管理公司生产出来的产品，而CMS则负责管理实验室服务。　　据专家介绍，只要是有CLIA执照的实验室，其研发的产品技术等就可以合法进入临床，合理收费。经FDA批准的商业化试剂盒或检测系统，在临床实验室进行了任何方式的修改，也必须遵循所有适用于LDT的管理规则。　　黄尚志认为，我国应该借鉴美国这一管理模式，实现临床实验室的质量保证，这样既能控制风险，也能加速新技术的临床应用。政府不必对应接不暇的每个新应用做出回应 而患者可以根据自己的需要，及时得到新的诊断服务。他呼吁，基因检测应由行业管理，由临检中心、医学遗传学会实行对实验室的质量控制，特别要发挥相关学会、专家的作用。国家可以委托几个有资质的机构，在其经过质量考核后批准其开展相关测序工作。　　期待政策扶持　　2月9日下发的《关于加强临床使用基因测序相关产品和技术管理的通知》中明确，基因测序相关产品应按照《医疗器械监督管理条例》、《医疗器械注册管理办法》、《体外诊断试剂注册管理办法(试行)》的规定申请产品注册。食品药品监管总局鼓励和支持创新医疗器械发展。　　黄尚志表示，&ldquo 鼓励和支持创新医疗器械发展&rdquo 应该更好地落在实处。以检测试剂盒为例，黄尚志谈到，我们做了20多年，包括苯丙酮尿症(PKU)基因分析和产前诊断研究获得了国家科技进步奖，但目前还没有一个&ldquo 准生证&rdquo ，遗传病的产前诊断都是在打&ldquo 擦边球&rdquo 。当前很多单基因遗传病都是罕见病，发生率极低，以此要求生产厂家研发我国自主创新的诊断检测试剂并获得相关证书，可行性极低。&ldquo 以PKU为例，其发病率约为万分之一，以我国每年出生1600万名新生儿计算，只有1600名患儿，加上父母也要检查，一年最多不到6000人。6000份额的检测试剂或试验盒，一个只有一二十元钱，收益低得可想而知。而申报一个新药至少需要二三十万，投入产出比过低，自然也没有哪个厂家愿意去研发不赚钱的具有自主知识产权的相关产品并商业化。而PKU在罕见病中的发病率还属较高者。&rdquo 对于这样的产品，黄尚志建议，国家应在研发、生产和定价等方面给予大力扶持。　　对于记者提出的&ldquo 叫停令&rdquo 是否会推动国产创新测序产品的自主研发，黄尚志回答说，愿望是善良的，实现却比较困难。我国做基因分析已经30多年，如PCR仪国内也有单位做，而随着国外PCR仪的降价，国产品种竞争没有优势，慢慢也就萎缩了。二代测序仪华大基因收购了国外的公司，有了样机但没有产品，也许可以做出来，但性能价格能否得到承认、如果都用它一家的产品是否会形成垄断等这些都是问题。国家要有鼓励措施，特别是要有后期的鼓励政策。　　遗传学家、复旦大学生命科学学院卢大儒教授在其长微博中亦表示，基因检测仪器大多是海外公司花巨资研发，我们一直在购买他们的仪器、试剂用于研究和临床开发，原始的创新很少，这一点上我们要引起高度重视。　　加强技术研究　　对于此次叫停，著名分子诊断专家韩健博士公开的观点是：叫停不是说方法不科学，而是说一些公司的做法令人担忧，存在风险。无创产前诊断的最大问题就是母血中胎儿DNA含量小(平均13%)，而且变化范围宽(2%~35%)。也就是说，有的孕妇血中胎儿DNA比较多，有的则很少。这就给实际操作带来一个很棘手的问题：如何能准确地分析每个孕妇血清中胎儿DNA的含量?　　&ldquo 如果孕妇血中胎儿的DNA浓度低于5%，准确度就有问题。&rdquo 无创产前诊断技术的开拓者、香港中文大学Dennis Lo在有关综述就介绍，如果母血中胎儿DNA占游离DNA总数的10%，那么，多一条21号染色体所带来的&ldquo 多余&rdquo 信号仅仅是胎儿DNA的5%。这么小幅度的增加需要通过非常精确的定量方法才能检测到。　　美国最先做无创产前诊断的公司有独特的定量方法，通过检测甲基化DNA在母血中的比例来矫正其实验误差。而国内公司的定量方法令韩健担心：因为竞争激烈，国内公司提供无创产前诊断的费用都远远低于国外的价格。而国外公司提供的试剂价格是一定的，所以利润空间有限，能把价格降得这么低，就需要把许多患者的标本合并起来一起测序，一次测序混合的标本越多，平均价格就越便宜。可是，混合得越多，检测那5%DNA增幅的敏感性也就越低，假阴性的几率就越大。&ldquo 所以，在技术上，国内和国外比已经走样了，也就更需要通过严格的临床验证来证明这是切实可行的&rdquo 。　　复旦大学生物医学研究院于文强教授强调，在利用基因测序技术避免出生缺陷方面，我们还需要投入更多的研究。比如对唐氏综合征，不仅要关注21对染色体的变异，还要找到更敏感的指标。唐氏综合征的方法准确性很重要，检测必须要由非常专业、标准化的实验室来做，而不是由每个医院来做。而国家要考虑的是如何标准化，只有标准化准确了，测序结果才可能是准确的。如果不是一个标准化的技术，母血中胎儿的DNA只占游离DNA总数5%~10%，测序一放大，操作就会产生偏差。　　于文强说，希望能用表观遗传学的方法，找到导致唐氏综合征的特异物质，它与数量无关，只与质量变化有关。现在在遗传学诊断方面，我们还缺乏一些与疾病一一对应的特异性指标，因此，必须加大技术方法的基础研究工作，这也是我们的研究方向。　　而对于此次&ldquo 叫停令&rdquo 所关注的第二代测序方法，于文强表示，&ldquo 目前对于测序样本制备，我国还没有比国外更好的方法。我们要发展自己的产品，就必须要在测序样本制备的关键技术、方法上有所突破。&rdquo 　　采访中，专家还表示，基因测序技术具有革命性突破的临床意义，应积极开展基因测序的转化研究，开发出更多疾病诊断相关的基因测序项目。

法医DNA检验技术是过绘制人类DNA图谱，进行图谱间比对来实现同一性认定。其主要依据是人类DNA的多态性，包括序列长度多态性和碱基序列多态性两种。根据DNA不同可分为常染色体DNA检测、Y染色体　　该技术是由一系列技术组合形成的技术包，如DNA提取技术、限制性酶切技术、PCR扩增技术、荧光标记技术、DNA杂交技术、凝胶电泳技术、测序技术等。随着这些技术的发生发展，法医DNA检测技术经历了从基于杂交的DNA指纹图谱技术到基于PCR扩增的AFLP、STR检测技术和基于测序的线粒体DNA(mtDNA)检测技术等重大技术革新。　　法医DNA检测技术的进步离不开生物化学、物理学和遗传学的发展。目前已发展到以复合荧光标记多重STR检测、mtDNA检测技术和SNP分析为主导的技术体系。STR检测又分为常染色体STR检测、Y染色体STR检测。这些技术已经成为公安机关侦查破案的利器，在刑侦办案、亲子关系确认、灾难受害者身份识别和证实罪犯等方面发挥着巨大的作用，已经成为法医物证检验的重要组成部分。　　DNA指纹技术　　DNA指纹是应用最早的一种法医DNA技术，属于限制性片段长度多态性标记(RFLPs)，利用特异的限制性内切酶将基因组DNA切割成一系列DNA片段，经电泳分离后，用特异探针显色得到DNA条带。这种技术操作繁琐，周期长，并且需要利用放射性同位素或荧光探针或者银染显色，所以应用局限性较大，并没有大范围普及，目前已经被淘汰。　　AFLP(扩增片段长度多态性分析)　　AFLP分析是基于PCR扩增的法医DNA检测技术，比DNA指纹技术简单、多态性好。根据基因组中可变数目串联重复序列两端保守序列设计引物，扩增这种重复串联序列，有着较好的多态性。但由于有时扩增片段长度差异较大，PCR扩增效率和扩增稳定性不够好，逐渐被STR(短串联重复序列标记)取代，可以说是STR检测技术的较低版本。　　STR检测技术　　随着短串联重复序列(STR)的发现，STR技术很快发展成为法医DNA检测的重要技术。由于STR片段长度相对较短，片段的退火温度较为相似，便于实现多位点多重扩增。STR检测技术进一步完善发展，与荧光标记和现代化遗传分析仪相结合，实现法医DNA检测的全自动化。STR检测技术成为目前法医DNA检测应用最为广泛的技术。并且当前的大型DNA数据库都是采用STR技术建立起来的，而且数据库规模还在迅速增长。全自动高通量的STR检测平台和覆盖全面的STR数据库相结合，使得STR技术在刑侦办案中所向披靡，破获了大量的疑难案件。法医DNA检测技术于相关仪器、检测试剂耗材的同步发展，将是法医学DNA检测技术提供者的两大任务。其中Y染色体STR技术详见“法医Y-DNA检测技术科普”板块。　　mtDNA检测技术　　mtDNA(线粒体DNA)检测是一种序列碱基多态性。该技术对存在于人类细胞的细胞质中的线粒体DNA进行多态性检测。mt是一条闭合环状DNA，在一个生物细胞中存在很多个拷贝，其结构中有高变区域。无母系亲缘关系的个体间多态性较好，且存在一些高变区域。利用高变区域的序列多态性，方便进行个体识别。由于人类mtDNA不发生重组，受精卵形成时线粒体来自母亲提供的卵子，所以遵循母系遗传，适用于母子关系认定。　　由于人体的每个细胞中都含有成千上万个拷贝的mtDNA，相比核DNA只有一个拷贝，mtDNA在检测上灵敏性更高。其闭环结构，具有抵抗降解的能力。可以对古老材料、腐败材料、角化细胞如毛发和指甲等材料进行分析。由于这些材料中核DNA大部分已经降解，mtDNA检测别具优势。　　mtDNA属于一种碱基多态性标记，如果能借助于现代测序技术结合，可以更大的发挥效用。详见“mtDNA检测技术”板块。　　单核苷酸多态性性(SNP)分析技术　　SNP是一种序列多态性，指DNA序列中单个核苷酸变异。由于在同一个碱基位置发生两次突变的概率极低，所以SNP标记通常有两种基因型(少数存在4种基因型)，比较便于结果分析。SNP标记分布非常广泛，数目众多，DNA微少的生物检材料也可以实用。SNP标记的检测既可以通过对目的DNA扩增和测序。微阵列DNA芯片、飞行质谱分析和变性高效液相层析法等非电泳分型技术。相关领域技术方法为法医DNA检测分析奠定了坚实的基础。随着高通量检测仪器的发明，遗传标记数目和数据逐渐完善，数据库信息的深度挖掘和分析，法医DNA检测技术不断地进步。　　我过法医DNA检测技术基本与国际同步，早在上世纪80年代，公安部物证鉴定中心就开始展开DNA指纹技术的研究并应用于办案，然而由于技术繁琐、周期长，没有实现大范围的普及。八五期间，发展了DNA扩增片段长度多态性标记和人类mtDNA测序技术。　　STR技术局限性 突变率相对较高，SNP则低很多　　正在研究的可应用于法医学的遗传标记除SNP以外，还有插入缺失标记、Alu重复序列、DNA甲基化表观遗传学标记等。　　InDel标记同SNP标记一样也是一种二态性遗传标记，于SNP有着近似的自然突变率，显著低于STR。两个等位基因表现为少数碱基的片段长度多态性，可利用复合荧光多重PCR扩增和毛细管电泳分型技术进行检测，因而成为法医DNA鉴定关注的热点。　　Alu重复序列是灵长类动物基因组中的短散在重复序列家族的一员，是一种比较活跃的遗传元件。由于包含限制性内切酶Alu的没切位点，所以成为Alu重复序列。存在于几乎所有基因的内含子中，居于普遍性、多样性和特异性。　　DNA甲基化　　是一种重要的表观遗传标记，可能应用于对同卵双胞胎和连体婴身份识别，作为目前经典遗传标记的有效补充。目前正在研究具有潜在法医学应用价值的DNA甲基化位点，有望依据甲基化的SNP位点进行身份识别。　　以上几种新检测方法，由于还却少系统性研究和成熟的应用体系，目前仅作为常规STR检测技术的补充检验技术，用于弥补STR检验中存在的不足。其中SNP和indel标记更加适合DNA芯片等高通量检验，伴随着二代和三代测序技术的迅速发展及相关标准和体系的建立，其检验时间有望大幅缩短，对应的检测设备将更易于便携，有望成为法医DNA检测的下一代主流技术。

p style="line-height: 1.5em "span style="line-height: 1.5em "　　科技日报北京12月5日电 (记者张梦然)根据英国《自然· 通讯》杂志5日发表的医学研究报告，一项能在10分钟内完成的癌细胞检测技术问世。这项检测通过识别癌细胞和健康细胞之间的DNA(脱氧核糖核酸)差异，快速完成初步诊断。/spanbr//pp style="line-height: 1.5em "　　甲基基团附着到DNA上的过程被称为甲基化，这一过程受到遗传操控。DNA甲基化作为DNA化学修饰的一种形式，能够在不改变DNA序列的前提下，改变遗传表现。在所有“成熟”的人类细胞中，DNA都携带这些修饰。/pp style="line-height: 1.5em "　　而癌细胞与健康细胞的基因组信息具有显著差异。癌细胞是一种变异的细胞，是产生癌症的病源，它与正常细胞最大的不同是有无限增殖、可转化和易转移的特点。基因组的差异也导致在大多数类型的癌细胞中，甲基化水平和模式都存在差异。/pp style="line-height: 1.5em "　　此次，澳大利亚昆士兰大学研究人员马特· 特劳及其同事发现，癌细胞中不同的甲基化情况，会影响DNA的物理和化学性质。在这些特性中，研究人员发现DNA与金纳米粒子的连接尤为紧密，他们利用这一特性开发出了一种癌症检测方法。/pp style="line-height: 1.5em "　　新方法只需极少量来自患者的纯化的基因组DNA，就能在10分钟内完成检测，且检测结果仅靠肉眼就能辨别。研究团队已经在代表不同癌症类型的100多个人类样本——72名癌症患者和31名健康个体——的基因组DNA中测试了这一方法。/pp style="line-height: 1.5em "　　研究人员表示，在目前的阶段，此方法只能检测是否有癌细胞存在，暂时还无法识别其类型或疾病进展。今后应对更多样本进行测试，并在可能的情况下开展更详细的分析研究。/pp style="line-height: 1.5em "　　总编辑圈点/pp style="line-height: 1.5em "　　10分钟凭肉眼就能辨别癌症检测结果，是不是意味着，未来癌症检测就跟化验血型一样简单?检测手段越便捷直接、检测结果越清楚明了，越能为患者接下来的治疗阶段争取宝贵时间。毕竟癌患猛于虎，每个必不可少的环节若都能多争一分、多夺一秒，或许就能拯救宝贵生命于凶险之境。科技改变生活，由此可见一斑!/ppbr//p

导读霍乱弧菌是人类霍乱的病原体，霍乱是一种古老且流行广泛的烈性传染病之一。曾在世界上引起多次大流行，主要表现为剧烈的呕吐，腹泻，失水，死亡率甚高，属于国际检疫传染病。了解霍乱弧菌的复制原理能够帮助人们更系统的探索其感染机制。法国巴斯德研究所及华沙大学细菌遗传学系的科学家们在国际知名杂志Nucleic Acids Research上发表了一篇学术论文，揭示了霍乱弧菌的复制机制。（IF=16.971）应用亮点：▶ 揭示了霍乱弧菌的两条染色体的复制协调机制。▶ 通过naica微滴芯片式数字PCR系统对霍乱弧菌复制的关键调控基因进行定量检测并验证猜想。▶ 该研究发现的霍乱弧菌复制机制可能存在于所有弧菌科物种中，对于其他弧菌复制研究具有参考意义。研究背景：霍乱弧菌是引起霍乱的病原菌，它由两条染色体（Chr1、Chr2）以精心编排的顺序进行复制。研究发现只有在Chr1上的crtS 位点复制后才会触发Chr2启动。本研究提供了关于 crtS 如何触发Chr2复制起始的新思路，对Chr1-Chr2复制协调机制进行了深入探讨。研究成果：❶、crtS（位于Chr1上，启动子结合位点）和39m位点（位于Chr2上，启动子结合位点）通过与启动子RctB竞争结合影响Chr2的复制，crtS的存在降低了RctB与39m的结合。▲crtS 能够抵消39m位点的抑制作用。Chr2复制起点 (ori2)和39m 位点的序列比对。RctB结合位点以绿色（iterons，启动子结合位点）和红色（39m）表示。❷、RctB分为4个结构阈，研究发现其通过相同的DNA结合域与crtS和39m相互作用。进一步研究表明RctB域IV对于ori2（Chr2）起始位点的39m和crtS调节都是不可或缺的，并且RctB域IV的C端对于crtS协调两条染色体的复制至关重要。基于该调控模型，文章使用naica微滴芯片式数字PCR系统（Stilla Technologies）对霍乱弧菌中的（ori1 /ori2）和对照大肠杆菌中的（oriC / pORI2）进行定量，同时使用naica多重数字RT-dPCR (Stilla Technologies) 对来自指数生长培养物 (OD600 0.4) 的霍乱弧菌中的 RctB mRNA 进行了定量并证实了上述猜想的正确性。▲B、 pORI2 相对于大肠杆菌菌株染色体的拷贝数 (CN)，通过在 rctB 中插入终止密码子构建各种 pORI2缺失表达载体。C、在有和没有染色体 crtS 位点 (+/- crtS)的情况下，大肠杆菌中 pORI2 拷贝数的比率。D、Chr2 在非复制型霍乱弧菌中相对于 Chr1 (ori2/ori1) 的拷贝数。在所有突变体中，crtS位点被敲除，RctB结合位点被插入 Chr1 的 attTn7 插入位点（平均值±标准偏差）。最后文章解释了霍乱弧菌的复制机制模型：▲crtS 协调 Chr1 和 Chr2 之间复制的模型。RctB 结合位点以绿色 (iterons)、红色 (39m) 和蓝色 (crtS) 显示。OFF = Chr1：crtS 未被复制。Chr2：与39m位点结合的RctB主要通过红色箭头所示来抑制ori2的复制起始。ON = Chr1：crtS 已复制。RctB与复制的crtS位点的瞬时结合导致与39m位点亲和力降低（蓝色箭头），从而释放ori2。RctB与甲基化iterons的结合导致DNA解旋元件 (DUE) 打开，RctB寡聚化到单链DNA上（绿色箭头）。期刊介绍：Nucleic Acids Research (NAR)：1974年创刊，由牛津大学出版社经过同行评审公开出版的科学期刊。期刊主要发布涉及核酸代谢和/或相互作用的核酸和蛋白质的物理，化学，生化和生物学方面的前沿研究结果。最新影响因子16.971。

德阳站-基层提升项目圆满举办提升基层检测能力项目仍在继续2023年起，“基层医疗机构基因检测能力提升项目”先后在西安、福州、遵义、济南、天津、兰州、德阳等多地开讲，吸引了全国各地近千名检验、临床行业同仁参与学习培训。项目紧贴国家政策及疾病发病趋势，以基层医疗机构检测人员提升需求为导向。培训内容不仅涵盖分子诊断行业新技术、新趋势、新应用，还包含基层人员持续关注的实验室质量控制、药物基因、遗传病检测、感染性疾病诊断等方向。在不断推动优质医学资源下沉的同时，更有效地助力基层医疗水平进步及公卫体系完善，也更全面地守护更多民众生命健康。5月18日，由《中华医学杂志》社有限责任公司、《中华检测医学杂志》编辑委员会主办，德阳市人民医院协办，西安天隆科技支持的“基层医疗机构基因检测能力提升项目”在装备之都四川德阳市隆重召开。本次会议邀请到基层医疗机构基因检测能力提升项目大会主席-中日友好医院检验科主任曹永彤教授以及德阳市人民医院的韩杨云院长进行致辞，四川省内、外在临床、检验、管理领域具有丰富经验的多位知名专家学者进行教学授课。授课内容涵盖：从实验室自动化到PCR实验室质量控制，质谱检测到分子诊断技术在肿瘤早筛、药物基因、遗传病检测、感染性疾病诊断等方向的应用等。全方位的授课内容及应用案例经验分享，吸引了地区医疗机构200多位学员到现场参会学习。专家授课干货分享中日友好医院 曹永彤教授《DNA甲基化检测在胃癌临床诊疗中的应用》曹教授从DNA甲基化检测对肿瘤的诊断、分级及预后评估的重要意义，讲到其在胃癌早诊早治中的应用。曹教授指出，血清学检查在胃炎、胃癌患病风险分层中有一定应用，肿瘤标志物更适于癌症中晚期检测，胃镜检查可以发现早期胃癌，但是依从性不足。因此，对于胃癌早期，采用更早期且灵敏的DNA甲基化检测意义重大，联合其他指标可以提高胃癌检出率。绵阳市中心医院 曾家伟教授《质谱技术在临床检验中的应用》曾教授首先讲述了质谱的原理及应用领域，并指出液相质谱-串联质谱（LC-MS/MS）优势明显，在临床上应用广泛，如遗传代谢病、药物浓度、健康营养、内分泌相关及蛋白多肽类等。关于质谱实验室的硬件要求、人员要求、项目选择、质量控制等，曾教授也进行了细致分享。广元市中心医院 王能勇教授《基因检测实验室自动化》自动化、专业化、系统化、智能化是分子诊断的未来趋势，而严格的质控则是提高分子诊断质量的前提及核心。王教授从分子诊断技术的发展历程、应用领域的拓展，讲到实验室自动化趋势。并就单机自动化（例如POCT、核酸检测工作站等）、级联自动化（流水线组合）、TLA自动化（实验室整体自动化管理）进行了详细介绍，以及对不同设备兼容性、软件数据处理等面临的问题和挑战做了分享及探讨。川北医学院附属医院 方莉教授《个体化用药检测技术及应用进展》方教授从药物基因检测的临床意义、相关政策指南，到多样化的检测技术、质量控制以及个体化医学检测的未来发展等角度进行一一介绍。针对荧光PCR、连接酶技术、PCR-芯片杂交、数字PCR技术、高通量测序技术等技术优缺点进行说明，指出低成本、易操作的检测方案是基层医疗机构可优先考虑的。遂宁市中心医院 林芳教授《脊髓性肌萎缩症的筛查与诊断》遗传病脊髓性肌萎缩症（SMA）的基因检测是优生优育项目的典型代表。林教授通过一例SMA携带者筛查避免患儿出生的案例，详细介绍了SMA的疾病特征、发病机制、基因检测技术及临床意义，并阐述了包括PCR-RFLP、MLPA、qPCR、HRM、NGS、常规一代测序等各种技术的优缺点。林教授指出三级预防对于SMA防控尤为重要，其中，中国妇幼保健协会立项的多中心、大样本“SMA出生缺陷综合防控项目”便是一个不错的尝试。四川省人民医院 钟佳伶教授《PCR实验室的质量控制》PCR实验由于灵敏度极高，因此，对实验质量控制要求更为严苛。钟教授从PCR实验室的质量控制管理要求出发，详细阐述了人、机、料、法、环各个方面的质量管理细节，并结合实验室日常检测中遇到的污染情况、问题分析及相关处置，包括质控失控处理方法等都做了重点分享。这些对基层PCR实验室的质量管理和正常运行具有非常重要的参考价值。德阳市人民医院 宋春娇教授《分子检测技术在感染性疾病诊疗中的应用》分子检测是感染性疾病诊断的重要标准，也是目前血清免疫学检测的有效补充。宋教授针对感染性疾病常用的分子检测技术，如多重PCR技术、等温扩增技术及NGS技术等作了详细介绍，并举例讲述了分子检测在常见感染性疾病中的临床应用，如呼吸道感染、病毒性肝炎、性病、优生优育、肠道感染等，让参会人员更全面地认识和了解到现有分子检测技术在感染性疾病中的应用。德阳市人民医院 何绍平教授《从CNAS实验室认可评审浅谈分子实验室管理》通过CNAS认可表明所在医学实验室和国外医学实验室处在同一管理水平，能被国际认可。何教授从CNAS医学实验室认可简介、分子诊断实验室管理要点及常见不符合项等方面进行介绍，尤其是对实验室申请与建设、质量管理体系、人员、环境设施、试剂耗材、仪器设备、检验过程、POCT管理要求等环节进行了细致介绍。对于即将申请CNAS认可或旨在不断提升实验室管理水平的医学实验室，具有重要指导意义。德阳市人民医院 鄂建飞教授《2023年室间质量评价总结暨2024年工作任务》鄂教授对2023年德阳市的室间质评进行相关总结，分析了参与机构、采用方法、质评结果的相关概况，并布置了2024年的相关任务。鄂教授希望2024年的室间质评合格率不断提升，也期望通过此次会议，能切实提升基层医疗机构人员检验水平，更好地守护民众健康。提升基层检测能力项目仍在继续2023年起，“基层医疗机构基因检测能力提升项目”先后在西安、福州、遵义、济南、天津、兰州、德阳等多地开讲，吸引了全国各地近千名检验、临床行业同仁参与学习培训。项目紧贴国家政策及疾病发病趋势，以基层医疗机构检测人员提升需求为导向。培训内容不仅涵盖分子诊断行业新技术、新趋势、新应用，还包含基层人员持续关注的实验室质量控制、药物基因、遗传病检测、感染性疾病诊断等方向。在不断推动优质医学资源下沉的同时，更有效地助力基层医疗水平进步及公卫体系完善，也更全面地守护更多民众生命健康。今年6月，基层医疗机构基因检测能力提升项目-毕节站、南阳站、西安站也将陆续召开。天隆诚邀各位检验、临床行业的同仁参与，让我们共同携手，同频进步，让分子诊断技术在精准医学时代疾病的诊断和治疗中发挥更大作用，以技术创新推动新质生产力发展，赋能医疗服务体系建设，普惠更多人民群众。

全新设计的 SMRT Cell、计算和新系统架构的重大进步将使 Revio 能够显著提高通量并降低测序成本，同时利用 HiFi 的强大功能实现卓越的准确性和直接甲基化检测。2022年10月25日PacBio宣布推出 Revio 长读长测序系统，这将使客户能够显著扩展他们对 PacBio 闻名于世的 HiFi 测序技术的使用。Revio 旨在为客户提供每年以30倍覆盖率对多达1300个人类全基因组进行测序的能力，每个HiFi人全基因组测序成本不到1000美元。 凭借这种通量和定价，PacBio 相信 Revio 将使 HiFi 测序能够用于人类遗传学、癌症研究、农业基因组学等方面的大型研究。PacBio 总裁兼首席执行官Christian Henry：“我们的客户借助 HiFi 测序改变了基因组学的认知。Revio 将通过增加高通量和可负担性来进一步释放这种力量。我们设计了一个全新的 SMRT Cell，其密度是我们现有 SMRT Cell 8M 的三倍，它具有2500万个 ZMW。Revio 能够同时并行多达4个 SMRT Cell，它总共可以同时提供多达1亿个 ZMW 进行单分子实时测序。结合我们计算方面的重大进步，Revio 将提供更短的运行时间，并将 HiFi 数据通量增加15倍。我期待看到研究人员可以借助 Revio 的强大功能有新的发现。”科学家们已经在 PacBio 的 Sequel IIe 系统上通过 HiFi 测序实现了诸多“第一” ：第一个完整的端粒到端粒人类基因组组装（Nurk 2022），罕见疾病队列中第一个单倍型解析的甲基化组（Cheung 2022）， 首次对长读长结构变异的群体调查（All of Us Research Program）、第一个单细胞水平完整的转录本异构体目录（Al'Khafaji 2021）和第一次完整组装高度复杂的燕麦基因组（European Seed 2020）。Revio 系统使用了相同的开创性 HiFi 试剂 – 产生准确的原始长读长，均匀的测序覆盖，无与伦比的变异检测准确率和组装完整性，以及准确的 DNA 甲基化检测， 这一切都在更大的通量规模上实现。Revio 将是 PacBio 的第一个采用最先进的 NVIDIA GPU 的系统，与 Sequel IIe 相比，Revio 的计算能力提高了20倍。除了提供加速 basecalling来满足 Revio 更高的吞吐量之外，支持 AI 的计算还将集成深度学习算法以检测标准测序库中的 DNA 甲基化，以及 DeepConsensus，一种与 Google Health 开发的深度学习方法，达到提高 HiFi 的产量和测序准确性。与 Sequel IIe 系统相比，Revio 系统将耗材的使用量减少了一半，并在工作流程和便利性方面进行了重大改进。Revio 可以在当下样本测序运行时同时设置后续样本的运行，这为操作员提供了更大的日程安排灵活性，可以在一天中的任何时间加载运行，而不会导致与耗材相关的仪器停机。堪萨斯城儿童慈善中心基因组医学中心主任Tomi Pastinen 医学博士：“在我们的儿童基因组答案 (GA4K) 计划中，HiFi 基因组测序在未解决的罕见疾病样本中显示出超越当代基因分析的真正进步。以更低的成本提高 Revio 系统的吞吐量将加快 GA4K 项目的样本解答速度。”Corteva Agriscience 基因组学技术经理Gina Zastrow-Hayes 博士：“来自 PacBio 的新 Revio 测序系统将成为 Corteva 基因组学工具箱的关键组成部分。长读长测序使鉴定复杂植物基因组的表征成为可能，现在 Revio 的高通量能力将使我们能够将 HiFi 技术更广泛应用到农业生物应用中。”Revio 的美国目录价格为77.9万美元。PacBio 现在正在接受订单，并预计在2023年第一季度开始交付使用。PacBio 还在其网站上发布了一份演示文稿，其中包含有关 Revio 的更多详细信息。有兴趣的人士可以阅读 PacBio 的投资者关系网站上的演示文稿，以及产品信息。

Oxford Nanopore Technologies（“Oxford Nanopore”）推出PromethION 2（“P2”）Solo测序仪，这是全球可及性最高的高通量测序设备，有可能大大提高针对人类遗传学和其他更大数据集的准确、快速和负担得起的测序的可及性。P2 Solo是市场上唯一一款小型、高通量的测序仪，其大小相当于印刷版《指环王》三部曲中的一册。新设备让任何人可以突破基础的DNA分析，能够在一个平台上整合更全面的遗传变异、转录组和表观遗传分析，以推动科学发现并改善生活质量。在PromethION平台已经证实的价值的基础上，该新设备使用任何长度非扩增读长（从20bp到超过4M bp）的高精度纳米孔测序，并从单个测序芯片中捕获完整的生物学信息，包括SNPs、INDELs、结构变异和甲基化。该设备旨在通过为任何人在任何地点提供高通量的实时全基因组测序数据来打开基因组市场：用户可通过全新的P2 Solo设备使用纳米孔测序技术，每年在自己的实验室对多达190-380个人类基因组进行全面测序。如使用 PromethION 48 （“P48”），每年测序的人类基因组数量可提高至约4600-9200个。每张测序芯片包括1-2个基因组。利用Oxford Nanopore提供的独特的“免费盒子”的模式，用户能够在自己的实验室中以不到1000美元的价格使用P2完成全面的人类基因组测序。或当使用P48设备以生产模式运行时，实现约300至600美元的基因组价格（每张测序芯片有1-2个人类基因组，简单的文库制备成本为每个基因组43美元起，设备、甲基化和任何长度片段均无需额外成本）,并还有进一步降低的可能性。 P2 Solo的尺寸和功能与其卓越的准确度相匹配，将最新的R10.4.1测序芯片与最新的试剂盒14相结合，提供测序数据，实现99.6% （Q24）的模态原始读长单链准确度和99.92% （Q31）的单分子双链准确度，运行条件可调节，实现进一步优化并提高了灵活性。在一个小型测试“开发”团队的早期项目中，P2 Solo已经被用于分析癌症研究样本。纳米孔测序结合了可以生成涵盖复杂基因组区域的长测序读长（长达4 Mb）的设备，以及集成的碱基修饰检测（包括DNA/RNA甲基化）和实时结果。这为癌症样本的全面表征提供了一个完整、精简和快速的解决方案。 除了P2 Solod的全新上市，Oxford Nanopore还提供数据分析解决方案EPI2ME的全基因组工作流程。用户只需上传自己的文件，一键点击便可获取小型变异、结构变异和甲基化报告。PromethION 2是Oxford Nanopore的完全即插即用型台式纳米孔测序仪，与P2 Solo为同系列产品，搭载强大的GPU，可运行两个高通量的PromethION测序芯片。您可提前订购，几个月内即可发货。PromethION系列产品通过进一步将可持续发展理念融入产品设计、生产流程和日常运营中，最大限度地减少对环境的负面影响。Oxford Nanopore首席执行官Gordon Sanghera评论道:“我们总是设计产品来重新定义基因组学的可能性，并向更广泛的社区引入重要的科学。今天，我们很激动能够再次重塑未来。凭借世界上可及性最高的高通量测序设备，我们正在打开基因组学市场，让任何人在任何地点都能获得准确度最高的人类规模的基因组数据。P2 Solo设备将进一步推动基因组学研究的民主化，并利用全面的纳米孔数据带来更多的科学发现。这提供了更广泛的基础，让这些发现在癌症、人类遗传学、传染病领域产生现实影响，并重塑我们与环境互动的方式。”

9月27日，广州禾信仪器股份有限公司（股票代码：688622）于北京（BCEIA 2021）以“立足高端质谱，打造质谱实验室综合解决方案”为主题，隆重发布多款新品。来自全国各地累计300+业内专家、客户以线上线下方式参与了发布会，并对禾信此次发布的新品给予了高度的评价与期望！新品发布 开启无限未来健康永远是人们关心的第一话题，体外诊断的发展经历了从细胞形态学诊断、生化诊断、免疫诊断，现在已经进入到分子诊断的时代。核酸质谱技术的出现解决了传统PCR技术灵敏度、准确性、通量低的问题，同时大大降低了高通量测序开展的技术难度和检测时间。但目前核酸质谱市场上，进口仪器占据96%以上。疫情当前，世界形势变幻莫测，与人民健康相关的高端科学技术及核心部件严重依赖进口，随时存在被“卡脖子”风险。禾信仪器全自动核酸质谱检测系统NucMass 2000应运而生。该系统集结多项专利性创新技术，大大提升了核酸检测质谱性能，具备以下特点：1高分辨较市场同类产品提升20%以上，保证最大反应重数2高精度质量精度较市场同类产品提升50%，判型准确率更高3高灵敏可检测到更低拷贝数量的基因片段信息4宽范围超高分辨率使核酸检测质量范围更宽5高稳定连续测量8小时，每次测量结果满足质量精度要求6高重复连续测量10次，质量偏差更小7高通量8小时完成700样本检测8广应用SNP基因分型、indel、拷贝数分析、DNA甲基化分析、多病毒检测等9低成本反应条件均一，试剂通用，无需荧光标记解决方案全自动核酸质谱检测系统+高精度芯片靶板+自动纳升级点样仪产品应用应用场景一：结直肠癌KRAS基因低频突变解密遗传变异与肿瘤发生发展关系的研究，质谱肿瘤基因突变检测分析具有成本低、高通量、高灵敏度和特异性等显著优势。应用场景二：多呼吸道病毒、多亚型同时检测巧妙的整合PCR技术的高灵敏度以及质谱技术的高精确度，开创了检测精确度高、重复性强、具有高度自动化、标准化特征的全新检测时代。可以对微生物、病毒以及其他单倍体生物方便快捷的进行分子分型、物种鉴定、变异物种发现及归类等全面分析。应用场景三：高血压用药指导检测到1%-3%突变等位基因，在个体化用药、耐药及新药筛选等临床项目中，可以尽早检出突变，帮助临床医生改善治疗方案。禾信仪器秉持“锲而不舍，做中国人的质谱仪器”理念，以高端产品与技术创新为立命之本；将持续加大创新投入和精良制造力度，以市场为导向，不断推出符合客户需求的产品，完善医疗诊断产品线，与客户共筑健康未来！

近日，今是科技有限公司（简称 " 今是科技 "）宣布完成由广发信德和万原点基金联合投资的B+ 轮融资。所募集的资金将用于实现 Gseq500 中通量纳米孔基因测序仪的量产工作。今是科技成立于 2017 年，致力于开发并商用基于第四代（纳米孔）基因测序仪的测序全流程自动化解决方案，立志成为基因测序在临床广泛应用的推动者。公司基于 " 边合成边测序 " 技术路线研发的纳米孔测序仪及其配套全流程解决方案，可解决基因测序成本高、操作复杂、效率低，数据质量不佳的痛点，实现 " 让基因测序成为精准医疗的常规手段，提升人类健康水平 " 的公司愿景。公司于 2022 年 12 月发布了其首款中通量纳米孔基因测序仪产品 Gseq500 的 Alpha 机，计划于 2023 年上半年完成 Beta 测试、生产基地建立等量产准备工作，在下半年实现量产和销售，进入商业落地阶段。基于深厚的技术沉积与敏锐的市场洞察，今是科技预计在 2024 年将完成高通量测序仪 Gseq10K 的研发和产业化，解决测序环节的成本、数据质量、效率和适用范围问题，实现从核酸提取直至生信分析的测序全流程自动化，为基因测序行业提供完整、方便、快捷的测序解决方案。万原点基金创始合伙人姜傥教授表示：" 基因测序技术的出现对生命科学和医学发展起到了革命性的作用。自 Sanger's 技术以来，人们在追求测序结果高精度、高通量、长片段和低费用的道路上，持续不懈地努力着，各种创新、突破层出不穷。尤其是纳米孔测序技术，已经被认为是最有望实现上述黄金标准的技术之一。全球范围内相关专利申请高达 8800 件，技术发展呈线性增长趋势。目前纳米孔测序核心专利主要掌握在美、英、中三个国家。凭借技术优势和巨大的市场潜力，中国在这一领域是最有可能引领全球的。今是科技是国内领先的纳米孔测序仪及配套测序芯片研发生产商，其独特的底层测序原理决定了其可以真正实现单碱基信号读取，从而达到更高的测序准确度。超高通量测序芯片设计则保证了更有市场竞争力的测序成本。我们非常看好今是科技纳米孔测序平台未来在国内乃至全球长读长测序领域的市场竞争力和广阔应用前景。期待通过迪安的产业资源加持，助力今是科技未来更健康、更快速地发展。"广发信德李辰博士表示：" 广发信德一直关注和积极布局基因测序技术和上下游相关企业。今是科技采用的基于边合成边测序的蛋白纳米孔技术路线，具有读长长、高通量、测序数据质量高、建库简单等优点，有潜力应用于全基因组测序、全长转录组测序、单细胞测序、宏基因组测序、靶向测序（复杂区域和旁系同源区域）、甲基化测序等领域，我们期待今是科技的蛋白纳米孔测序仪成为下一代生命科学研发和临床应用的重要基础。"

p　　提起a title="" style="color: rgb(0, 112, 192) text-decoration: underline " href="http://www.instrument.com.cn/application/SampleFilter-S01-T000-1-1-1.html" target="_self"span style="color: rgb(0, 112, 192) "strong基因检测/strong/span/a，很多人第一反应就是高大上，在“科学前沿”、“实验室成果”的标签下，似乎离人们生活十分遥远。 然而，基因检测已经走进了我们的生活，众多基因检测公司已经被我们渐渐眼熟。/pp　　strong测序服务综合类(硬件+试剂盒+临床应用)/strong/pp　　华大基因/pp　　厦门基科生物科技有限公司/pp　　深圳华因康基因技有限公司/pp　　上海百傲/pp　　瀚海基因/pp　　北京博奥/pp　　strong测序临床应用服务类/strong/pp　　药明康德/pp　　诺禾致源/pp　　贝瑞和康/pp　　安诺优达/pp　　上海宝藤/pp　　上海伯豪/pp　　解码DNA/pp　　达安基因/pp　　泰州益康/pp　　北京迈基诺/pp　　凡迪生物/pp　　上海天昊生物/pp　　北京诺赛基因组研究中心有限公司/pp　　佰美基因/pp　　赛亚基因科技股份有限公司/pp　　中科金美华基因检测公司/pp　　上海思路迪生物技术有限公司/pp　　北京迪诺基因科技/pp　　维达健基因技术有限公司/pp　　南京世和基因生物技术有限公司/pp　　上海起源生物科技有限公司/pp　　广州燃石生物/pp　　银河基因/pp　　strong基因检测在线B2C类/strong/pp　　爱基因(厦门基科)/pp　　Wegene/pp　　360基因(北京宏图云天)/pp　　genebook(华大)/pp　　sungene(三博基因)/pp　　idna(武汉益基)/pp　　精皮士/pp　　strong测序服务单位 Sequencing providers/strong/pp　　香港中文大学化学病理学系(Department of Chemical Pathology, The Chinese University of Hong Kong), http://www.cpy.cuhk.edu.hk//pp　　上海生物芯片公司/伯豪公司(Shanghai Biochip Company, SBC)http://www.shbiochip.com//pp　　苏州贝斯派生物科技有限公司(原苏州众信,Base Pair Company)http://www.basepair.cn//pp　　北京百迈客(Biomarker Technologies Co., Ltd.)http://www.biomarker.com.cn//pp　　江苏亿康基因公司(Yikong Genomics)http://www.yikongenomics.com//pp　　上海南方基因中心/pp　　上海佰真公司(Shanghia GenomePilot)http://www.genomepilot.com//pp　　上海凡迪生物(Find Bio-tech)http://www.findbiotech.cn//pp　　上海美吉(MajorBio)http://www.majorbio.com//pp　　广州锐博生物/pp　　北京博奥(北京生物芯片公司,captialBio)http://cn.capitalbio.com//pp　　博奥木华，博奥的子公司，原名爱健，http://cn.capitalbio.com/gxba/gcgc/gcjg/jtzgs/23695.shtml/pp　　上海晶能(Genenergy Bio-Technology)http://www.genenergy.cn//pp　　北京大学 Biopic 中心(Biopic center, Peking University)，http://biopic.pku.edu.cn//pp　　上海派森诺(PersonalBio)http://www.personalbio.cn//pp　　上海天昊生物(Geneskies) http://www.geneskies.com//pp　　杭州谷禾生物技术有限公司(沃森,GUHE INFO)http://www.guheinfo.com//pp　　武汉生命之美(ablife)www.ablife.cc/pp　　浙江天科(ZheJiang TianKe)http://www.zjtianke.com//pp　　上海烈冰公司/上海基研生物(NovelBio)http://www.novelbio.com//pp　　上海宝藤生物/上海张江转化医学研发中心(Biotecan)，http://www.biotecan.com//pp　　北京康普森生物技术有限公司(Compass)， http://www.bjkpsbio.com//pp　　生工生物(sangon)，http://www.sangon.com//pp　　赛业生物(cyagen)，www.cyagen.com/pp　　天津市湖滨盘古基因科学发展有限公司(pangugene)，http://www.pangugene.com//pp　　江苏中宜金大分析检测有限公司(zhong yi jin da)，www.zyjdfx.com/pp　　北京爱普益医学检验中心，http://www.ipemed.com//pp　　迪安医学检验所，http://www.dazd.cn//pp　　湘雅医学检验所/pp　　湖南博川基因有限公司，www.mygene23.com/pp　　汇龙森国际企业孵化(北京)有限公司，http://www.huilongsen.com//pp　　鼎晶生物，http://www.topgen.com.cn//pp　　南京世和基因，wwww.geneseeq.com,400-636-2325/pp　　strong专业提供生物信息分析服务的公司/strong/pp　　金维智(Genewiz)，http://www.genewiz.com.cn//pp　　武汉未来组(Nextomics)，www.nextomics.cn/pp　　北京嘉宝仁和有限公司(JBRH)，www.jabrehoo.com/pp　　北京迈基诺基因科技有限公司(MyGenostics)，http://www.mygeno.cn//pp　　广州基迪奥生物(Gene Denovo),http://www.genedenovo.com/pp　　杭州壹基因公司(1gene) ，www.1gene.com.cn/pp　　武汉贝纳基因(BENAGEN)，www.benagen.com/pp　　上海其明信息公司(Gminix)，http://www.gminix.com//pp　　中翰金诺/pp　　上海罗捷信息科技有限公司，www.logicinformatics.com/pp　　上海欧易生物科技有限公司/pp　　绿宇科技/pp　　上海翰宇生物(HanyuBio)，www.hanyubio.com/pp　　杭州联川生物(LC-Bio)，http://www.lc-bio.com//pp　　北京艾比精诺基因科技有限公司/pp　　北京源泉宜科生物科技有限公司， http://www.yqykbiotech.com//pp　　博淼生物科技(北京)有限公司(Bio Miao Biological)，http://www.biomiao.com//pp　　南京迪康金诺生物技术有限公司，http://www.decodegenomics.com//pp　　吴江汇杰生物科技有限公司/南京科维思生物科技有限公司，http://drigen.com//pp　　武汉菲沙基因信息有限公司(frasergen),http://www.frasergen.com//pp　　奇云诺德，http://www.qygenomics.com//pp　　北京市计算中心/pp　　深圳瑞奥康晨生物科技有限公司，生物信息服务，www.reohealth.cn/pp　　杭州米天基因科技有限公司，生物信息服务，http://www.miti-medicine.com//pp　　北京赛洛新生物科技有限公司，生物信息服务，http://www.solutionbio.com.cn//pp　　诺金生物信息软件公司，生物信息服务/pp　　香港明宙/深圳博大威康科技有限公司，生物信息公司，00852-9108296/pp　　艾基泰康，生物信息服务商，www.igenetech.com/pp　　量化健康，生物信息服务，www.quantibio.com/pp　　深圳英马诺生物，生物信息分析，www.imunobio.com/pp　　上海虹舜生物科技有限公司，生物信息分析服务，400-7676-106，www.hongshunbio.com/pp　　上海曼因生物科技有限公司(比特基因)，生物信息分析服务，www.bitgene.cn/pp　　上海丰核信息，课题设计，论文撰写，生物信息分析/pp　　上海生咨，生物信息服务，生物信息培训班，021-57503212，http://www.biorefer.com//pp　　上海英拜生物，生物信息分析/pp　　广州元序公司，生物信息服务商/pp　　艾思博公司，生物信息服务商/pp　　武汉合众卓凡公司，生物信息服务商/pp　　北京华生恒业科技有限公司,生物信息学软件销售商/pp　　北京路思达生物信息科技有限公司，生物信息学软件销售，生物信息学培训/pp　　源资信息科技(上海)有限公司，生物信息学软件销售/pp　　上海康昱盛信息科技有限公司，生物信息学软件销售/pp　　北京华诺时代科技有限公司，生物信息服务商，http://www.honortech.cn//pp　　南京广而生物科技有限公司，生物信息服务商，gergene.com/pp　　武汉数桥科技公司，生物信息服务商，http://www.databridge.cn//pp　　蓝云基因，生物信息服务商，http://www.lanyungene.com//pp　　思博奥科生物信息科技(北京)有限公司，生物信息分析服务公司，www.sysbiomics.com/pp　　深圳市谱元科技有限公司，生物信息分析，http://www.promegene.org//pp　　华点云，云计算、生物信息分析，www.celloud.cn/pp　　上海达今生物科技有限公司，生物信息服务公司/pp　　上海锐翌生物科技有限公司，生物信息服务公司，http://www.realbio.cn//pp　　上海惠研生物科技有限公司，生物信息服务公司，http://www.biogenius.cn//pp　　上海嘉因生物科技有限公司，生物信息服务公司，wwww.rainbow-genome.com/pp　　strong其它测序服务单位, other NGS players/strong/pp　　上海泛亚基因医学科技有限公司、优基因(Genetesting)。有一台ABI3130，一台Qiagen的Pyrosequencing测序仪，1台ABI的定量PCR仪，一台Roche定量PCR仪。021-55228195，http://www.genetesting.cn//pp　　康圣环球/新培晶上海医学检验所有限公司(KindStar Global)，1台HiSeq 2500在武汉，1台MiSeq在上海，1台Ion Proton，2台Ion Torrent PGM，1台NanoString，1台Sequenom。大型医学检验服务商。400-736-166,http://www.kindstar.com.cn//pp　　达安基因临检中心(达瑞)，6台Proton,1台PGM，1台专门做SNP和甲基化的MassARRAY(SEQUENOM)，1台HiSeq,1台MiSeq。拥有：高通量基因测序仪 医疗器械证、无创产前筛查(NIPT)许可证、高通量测序 肿瘤诊断 许可证/pp　　湘雅医学院夏家辉组，1台Hiseq/pp　　心血管疾病国家重点实验室(阜外医院)分子诊断中心(State Key Laboratory of Cardiovascular Diseases)，1台Hiseq，1台MiSeq，1台iScan, 1台ABI Viia7定量PCR仪。010-88396070, http://123.124.148.61/zdsys/Webshowpage/default.aspx/pp　　中科院北京遗传与发育所，1台Hiseq，1台454，2台PGM。010-64806501/pp　　北京市理化分析测试中心(Beijing Center for Physical and Chemical Analysis,BCPCA)，1台Hiseq 2500，1台Miseq。010-58717615. http://www.beijinglab.com.cn//pp　　中科院上海分院, 岳阳路320号，1台Hiseq。/pp　　中科院基因组所，1台Hiseq。1台PacBio? 010-84097710/pp　　中科院遗传发育所，1台Hiseq, 1台Ion Torrent, 1台Roche FLX. 010-64806501/pp　　中科院国家基因研究中心(水稻基因中心)，上海市漕宝路500号，1台Hiseq，021-54971303/pp　　台湾阳明大学基因体研究中心，1台Hiseq, 1台Miseq, 1台454，2台GA。+886-2-2826-7319/pp　　中科院北京基因组所，1台Hiseq, 1台454，010-84097326/pp　　奥拓基因，在杭州有1台Hiseq? 0571-89057085/pp　　复旦大学医学院，1台HiSeq 2500，明道楼5楼/pp　　浙江大学医学院附属第一医院，传染病研究所，1台HiSeq 2500，1台PGM，已购1台MiSeq。/pp　　中科院昆明动物所，遗传资源与进化国家重点实验室(State Key Laboratory of Genetic Resources and Evolution)，1台Hiseq，1台PacBio, 1台Proton，1台PGM. http://www.kiz.ac.cn/gre/gre7/gre72/201401/t20140103_4010506.html/pp　　中科院上海逆境生物中心(Shanghai Center for Plant Stress Biology)，1台Hiseq, 1台Miseq,http://www.psc.ac.cn/cn/index.asp/pp　　中山大学附属肿瘤医院肿瘤防治中心，1台Hiseq/pp　　台州圣庭生物科技有限公司(Shengting), 1台Hiseq 2500，1台MiSeq, 电话：0576-89189685,http://www.shengtinggroup.com//pp　　杭州艾迪康医学检验中心公司，1台NextSeq 500，1台MiSeq，0571-87775500，http://www.adicon.com.cn//pp　　上海海洋大学陈良标组，1台Hiseq, 1台Miseq,/pp　　台湾有劲生物公司，1台Hiseq 2000, 2台Proton。电话：02-26750868/pp　　台湾國家基因體醫學研究中心，1台Hiseq，1台454。电话：02-2782-4066/pp　　尤尼曼诊断技术有限公司，1台Miseq,医学诊断， 4008-213-671，http://com0044.comecn.com//pp　　张宗峰，1台Miseq,/pp　　西安交通大学医学院，1台Miseq/pp　　东方肝胆医院王红阳组，1台Miseq/pp　　资源国际生物，1台Miseq/pp　　北京圣谷同创，30台PGM, 010-58815976/pp　　英骏生物，1台Proton, 1台PGM。一代测序、寡核苷酸合成服务商，Life Tech公司子公司。800-820-8982/pp　　联合基因，1台PGM。健康咨询。021-33721110/pp　　中美泰和，1台PGM，010-52213160/pp　　金域检验，1台PGM，1台NextSeq.大型医学检验服务商。4001-111-120/pp　　赛哲生物，1台PGM。论文图文美化。400-888-4242/pp　　华冠生物，1台PGM。021-51320288-9371/pp　　吉玛生物，1台PGM。shRNA合成服务商领导品牌。021-51320195/pp　　广西柳州CDC，1台PGM/pp　　天津南开大学泰达生物技术学院，1台PGM。1台Affymetrix。/pp　　台湾明欣生物，1台454，1台PGM。02-26557128/pp　　千年基因，韩国Marcrogen在中国的代理商，Marcogen在韩国有30台以上的Hiseq。0755-23067982，http://www.macrogencn.com//pp　　斯克尔基因，有1台iScan。Illumina生物芯片服务商/pp　　北京药用植物所，1台PacBio，联系方式：010-57833028/pp　　武汉生物技术研究院技术平台部, 1台PacBio，1台MiSeq。联系方式：027-68789300/pp　　北京华牛世纪生物技术研究院，1台PacBio/pp　　上海康成。1台Agilent生物芯片仪。Exiqon指定中国服务商，生物芯片服务商，microRNA专家，测序服务商。021-64451989/pp　　上海赛安生物医药科技科技有限公司，电话：021-60733300/pp　　北京诺赛基因组研究中心公司，010-67883332/pp　　广州坤图生物科技有限公司, 个性化医疗 020-89320509/pp　　科诺检验、科贝生物、苏州生物医药创新中心，这三家是同一个实体。主要从事医学检验、产前诊断。0512-69561999/pp　　广州瑞科基因。020-62197097/pp　　吉凯基因，siRNA、慢病毒服务商，1台Affymetrix。800-720-0302/pp　　杭州锐创生物技术有限公司，二代测序，生物芯片，057186971763/pp　　上海敏芯公司。生物信息学服务，代谢组实验。021-31523052/pp　　北京市计算中心。生物信息服务。联系方式：010-59341768/pp　　青岛生物能源与过程研究所徐建构建MPlibrary(Mate Pair library),0532-8066265173./pp　　上海欧孚。建库服务，多种核酸抽提服务。13795382662/pp　　北京毅新兴业。Sequenome质谱服务。联系方式：010-82608397/pp　　凯基生物。025-52880816/pp　　上海阿趣生物，生物信息公司，代谢组。400-664-9912，021-60649912，http://www.biotree.cn//pp　　江苏苏博生物医学科技有限公司，临床检验服务，0510-83595108/pp　　艾博斯./pp　　北京博恒生物，生物信息服务商，010-52839707，www.hr001.cn/pp　　博仕生物医学中心/pp　　博苑生物/pp　　上海丰核信息，课题设计，论文撰写，生物信息分析。4000-331-887/pp　　上海朗通生物/pp　　上海锐金生物医药科技有限公司/pp　　武汉锦奥生物公司，测序试剂代理商，建库服务商，geneocean@qq.com, 18672347711/pp　　上海生咨，生物信息服务，生物信息培训班，021-57503212，http://www.biorefer.com//pp　　翼科/pp　　上海英拜生物，18930963499，生物信息分析/pp　　苏州帕诺米克生物公司，0512-62959105/pp　　凌科生物/微基生物，环境基因组/宏基因组数据分析，021-31171173，www.biolinker.com，(凌科生物), www.tinygene.com，(微基生物)/pp　　上海泉脉生物科技有限公司,二代测序，生物芯片，021-54038325/pp　　拜珐(上海)信息技术有限公司，二代测序，生物芯片，021-34315602/pp　　无锡艾吉因生物信息技术有限公司，自行设计的测序原理和测序机器，0510-85386921, 中国人自主知识产权的产品，特别支持/pp　　深圳华因康基因科技有限公司，自行设计的测序原理和测序仪，0755-26611270, 中国人自主知识产权的产品，特别支持/pp　　华仁康泰(北京)生物技术有限公司，遗传分析，010-57536985，huarenkangtai@126.com/pp　　派利来生物，010-59706036/pp　　上海卓立生物科技有限公司，联华芯片(OneArray)大陆代理商，4006-4008-46/pp　　杭州英睿，0571-88173602/pp　　武汉大众源生，科研服务(基因组分析)，生物信息培训，生物信息平台搭建，027-87297418，www.pubbiotech.com/pp　　天津生物芯片，1台PacBio, 022-66229538/pp　　南京迈达医药科技有限公司，生物芯片服务商，1台Illumian芯片，025-58619118/pp　　江苏泰州伯克利，生物芯片服务商，/pp　　广州元序公司，生物信息服务商/pp　　艾思博公司，生物信息服务商，021-38770863/pp　　武汉合众卓凡公司，生物信息服务商，[url=]13764257302[/url]/pp　　台湾基龙米克斯公司，宠物公司，华大在台湾的测序服务代理商，1台NextSeq，1台MiSeq，1台454，2台PGM，电话：(02)-2696-1658/pp　　台湾力钧生物公司，Talen转基因服务商，二代测序代理商，电话：886-2-25571100/pp　　北京百麦华康科技有限公司，测序服务代理商，010-56189577，www.biomarry.com/pp　　保定方舟/上海方舟公司，个体化医疗服务商，15600045346/pp　　诺金生物信息软件公司，生物信息服务，论文外包服务，023-63118687/pp　　达迈生物，Illumina分销代理商，021-51871699/pp　　仁科生物，Illumina分销代理商，021-34250079/pp　　北京怡美通德,Illumina生物芯片服务商，Illumina分销代理商，010-84409662,www.emtd.com.cn/pp　　香港基因公司，Pacbio三代测序仪代理商，021-51876181/pp　　北京华生恒业科技有限公司,生物信息学软件销售商，010-8260 1104/pp　　北京路思达生物信息科技有限公司，生物信息学软件销售，生物信息学培训，010-82696760/pp　　源资信息科技(上海)有限公司，生物信息学软件销售，021-32504385/pp　　上海康昱盛信息科技有限公司，生物信息学软件销售，021-54975000/pp　　北京鑫诺美迪基因检测技术有限公司，1套Bio-rad digital PCR，010-67810661，http://sinomdgene.com//pp　　微创公司，1套Bio-rad 微滴数字PCR，Droplet digital PCR(DD-PCR)./pp　　吉林中科紫鑫科技有限公司，和于军合作开发基于pyrosequencing的二代测序仪，0435-7210408/pp　　北京吉拓思生物技术有限公司,测序数据分析软件供应商，数据分析服务供应商，建库服务商， 010-82967131/pp　　上海誉准生物科技有限公司，建库服务商/pp　　武汉维达健公司，个体化医疗服务商，用生物芯片检测SNP并给予解读，400-027-3332，http://www.vidagen.com//pp　　国家肿瘤临床医学研究中心肿瘤分子诊断平台(天津肿瘤医院)，于津浦教授组，1台MiSeqDx/pp　　基因科技公司/仪涛公司，Affymetrix生物芯片服务商。021-51876181(销售部)，021-6728000(芯片服务部)/pp　　泽塔生物，400-011-2014,http://www.zetabio.com//pp　　浙江中医药大学，1台HiSeq 2500/pp　　北京智云捷生物技术有限公司，010-58772648 ，http://www.gene-cloud.com.cn//pp　　上海基龙生物科技有限公司，1台PGM，将于2014年第3季度到位1台Miseq, 有一台Raindance公司的ThunderStorm，021-61062185，http://www.bioon.com.cn/show/index_272282.html/pp　　海克维尔基因(北京)研究院，010-61824280， www.hikegene.com，有一台PacBio测序仪/pp　　北京瑞德百奥生物信息科技有限公司,生物信息学分析公司，010-58430943，www.readerbio.com/pp　　上海恒健生物技术有限公司，1台PGM，1台Bio-Rad DDPCR。上海蔡伦路781号8层/pp　　上海源奇生物医药科技有限公司，1台PGM，另外有一台投放在医院的MiSeq,021-37196233/pp　　中国农业大学，国家玉米改良中心，赖锦盛教授组，1台MiSeq，1台PGM/pp　　上海赛优生物科技有限公司，测序服务、生物信息服务。021-54439885。www.saiyoubio.com/pp　　北京英木和生物技术有限公司，测序服务、生物信息服务。010-61199586，13426001100。www.imh-bio.com/pp　　中国科学院古脊椎动物与古人类研究所,010-68351363, 1台MiSeq,/pp　　上海希匹吉生物技术有限公司，1台Ion Torrent PGM，1台Qiagen PyroSequencing Q96测序仪，甲基化测序、SNP分析，荧光定量PCR服务。测序服务、生物信息服务。021-54480369。www.cpgbiotech.com/pp　　中国科学院西双版纳热带植物园，公共技术服务中心，1台MiSeq,0691-8713058，www.xtbg.ac.cn/pp　　广州洪祥生物医药科技有限公司，测序服务、生物信息服务，020-82070665/pp　　北京溯源精微科技有限公司，测序服务、生物信息服务，010-57259450，www.geneway.cn/pp　　上海吉凯基因化学技术有限公司，1台Affymetrix,800-720-0302, www.gnechem.com.cn/pp　　上海邃志生物技术有限公司，1台Sequenom MassArray,1台Affymetrix。400-883-1861，www.babygene.cn/pp　　北京华弈生物公司，生物信息分析，生物信息培训，010-57674188，http://www.hygenomics.com//pp　　成都先导药物开发有限公司，用DNA标记的化合物进行先导化合物的筛选,1台HiSeq 2500,028-85197385，www.hitgen.com/pp　　然钠生物，1台NextSeq 500./pp　　北京奥维森基因科技有限公司,1台MiSeq，生物信息分析公司，400-017-6077，http://www.auwigene.com//pp　　山西国信凯尔生物技术有限公司，1台MiSeq，http://www.sxgt.net/KongG.aspx?CatalogId=61& type=Parent& RearId=61& ktype=sy/pp　　布斯坦科技(北京)有限公司，生物信息学分析服务公司，010-56014401，www.biost.cn/pp　　厦门万基生物科技有限公司，1台Proton，生物信息学分析服务公司,www.vangenes.com/pp　　香港明宙/深圳博大威康科技有限公司，生物信息公司，00852-9108296/pp　　基云惠康，生物信息公司，专注于人全基因组和外显子组数据分析，010-64863376 ，www.genekang.com/pp　　百世嘉(上海)医疗技术有限公司，产前诊断服务公司，021-64862060，www.basetra.com/pp　　上海派航生物科技有限公司，人全基因组生物信息分析服务，021-22812228，http://ph-bio.net//pp　　TAAG Genetics，遗传分析公司、食品检测公司，www.taag.com/pp　　深圳易基因科技有限公司，生物信息服务公司，http://www.e-gene.cn/,0755-28317900/pp　　思路迪埃提斯生物技术(上海)有限公司，3DHTS，1台Nextseq 500.http://www.3dhts.com//pp　　大连医科大学肿瘤干细胞研究院，李志广教授组，1台MiSeq/pp　　广州燃石生物科技有限公司，个性化医疗服务公司，1台NextSeq 500，1台MiSeq，www.brbiotech.com，020-34037871/pp　　华中农业大学，1台HiSeq/pp　　上海达今生物科技有限公司，生物信息服务公司/pp　　上海锐翌生物科技有限公司，生物信息服务公司，021-51001612，http://www.realbio.cn//pp　　上海惠研生物科技有限公司，生物信息服务公司，http://www.biogenius.cn/，400-016-9606/pp　　上海嘉因生物科技有限公司，生物信息服务公司，wwww.rainbow-genome.com, 400-881-9851/pp　　清华大学，1台HiSeq 2500/pp　　广东中医院，1台HiSeq 1500/pp　　中山大学肿瘤防治中心，1台HiSeq 1500/pp　　深圳市瀚海基因生物科技有限公司，1台MiSeq，0755-86714900，http://www.pacgeno.com//pp　　北京四环药业公司，1台MiSeq/pp　　南京药谷，1台MiSeq/pp　　申友生物，1台MiSeq/pp　　北京益普康达医学科技有限公司，儿童罕见病分子检测专业公司，010-53396195，www.careexpress.cn/pp　　所罗门兄弟医学科技(北京)有限公司，肿瘤基因检测公司、靶向治疗咨询公司，400-0077-316，http://www.smtcc.org//pp　　之江生物，1台MiSeq，微生物病原检测，021-34680599，http://www.liferiver.com.cn//pp　　深圳市谱元科技有限公司，生物信息分析，0755-22361766，http://www.promegene.org//pp　　华点云，云计算、生物信息分析，www.celloud.cn/pp　　北京信诺佰世医学检验所，1台MiSeq、1台PGM，遗传病检测，010-80858780，www.sinopath.cn/pp　　思博奥科生物信息科技(北京)有限公司，生物信息分析服务公司，010-68185146，www.sysbiomics.com/pp　　银河基因，基因健康咨询公司，010-57306161，www.yinhejiyin.com/pp　　上海允英医疗科技有限公司，遗传病基因检测，www.yymedicine.com/pp　　上海优英生物科技有限公司，遗传病基因检测/pp　　杭州晶佰生物技术有限公司，1台NextSeq 500, 1台Miseq, 1台HiScan, 医学测序服务，400-077-5911,0571-89936654，http://www.igeneseq.com//pp　　南京广而生物科技有限公司，生物信息服务商，025-86537986，gergene.com/pp　　武汉数桥科技公司，生物信息服务商，027-86644882，http://www.databridge.cn//pp　　蓝云基因，生物信息服务商，http://www.lanyungene.com//pp　　北京华诺时代科技有限公司，生物信息服务商，010-59919045，http://www.honortech.cn//pp　　深圳市海普洛斯生物科技有限公司，1台NextSeq 500，基因检测、健康服务公司，0755-86574950，http://www.haplox.com/pp　　河北省健海生物芯片技术有限公司，1台Illumina iScan生物芯片仪，1台Illumina BeadXpress生物芯片仪，1台Luminex 200，基因检测、健康服务公司，400-660-7557，http://www.genetic-health.com//pp　　上海虹舜生物科技有限公司，生物信息分析服务，400-7676-106，www.hongshunbio.com/pp　　上海曼因生物科技有限公司(比特基因)，生物信息分析服务，www.bitgene.cn/pp　　裕策生物科技有限公司，肿瘤基因信息分析，http://www.yucebio.com/，400-836-8004/pp　　上海捷易生物科技有限公司，二代测序建库服务，www.jeayea.com,400-006-1771/pp　　深圳瑞奥康晨生物科技有限公司，生物信息服务，www.reohealth.cn/pp　　杭州米天基因科技有限公司，生物信息服务，http://www.miti-medicine.com/，0571-87218611/pp　　北京赛洛新生物科技有限公司，生物信息服务，http://www.solutionbio.com.cn/， 4004-1818-77/pp　　广州美格生物科技有限公司，一台MiSeq，http://www.magigen.com/，020-34438810/pp　　广州库基生物科技有限公司，http://www.cookgene.com/，020-84298069/pp　　上海祥音生物科技有限公司，http://www.hzgeno.com/，0571-56077876，实验室地址：杭州市西湖区三墩振华路西城博司7幢701/pp　　艾基泰康，生物信息服务商，010-84097967，www.igenetech.com/pp　　量化健康，一台NextSeq 500，生物信息服务，010-83638068，www.quantibio.com/pp　　深圳英马诺生物，生物信息分析，www.imunobio.com，0755-82636223/pp　　AnchorDx,NGS医学诊断/pp　　strong中国PacBio测序仪中心：/strong/pp　　天津市湖滨盘古基因科学发展有限公司，4台PacBio. http://www.pangugene.com//pp　　北京遗传所，1台PacBio/pp　　北京药植所，1台PacBio/pp　　上海南方基因中心，1台PacBio/pp　　云南动物所，1台PacBio/pp　　武汉邓子新教授实验室，1台PacBio　　/pp　　天津生物芯片中心，1台PacBio/pp　　海克维尔基因(北京)研究院，1台PacBio/pp　　北京华牛世纪生物技术研究院，1台PacBio/pp　　上海交通大学 分析测试中心，1台PacBio/pp　　内蒙古农业大学，1台PacBio/pp　　华大基因，1台PacBio(总共预计买3台)/pp　　strong基因检测重在服务——/strong基因检测服务范围/pp　　基 因检测重在服务，很难单独依靠商品(检测试剂盒、芯片)来建立优势，这与免疫诊断、化学发光有所不同，因为基因检测归根结底都是DNA一级序列的检测，与 二级、三级结构无关，检测原理相对简单，都是通过DNA引物靶定待测序列，然后通过引物延伸来实现序列的测定 相反，样品DNA的提取、建库和捕获的操作 倒是比较繁琐，需要专业的技术人员去操作。上游仪器已然被少数几个公司所垄断，中上游的试剂盒产品并不具有很高的技术壁垒(当然如果能在建库环节和捕获环 节形成明显技术优势，或者是开发出效率更高的工具酶，也是很有发展前景的)，而且高通量基因检测试剂盒的审批存在较大的不确定性(未来可能参照美国 CLIA认证的方式，具有资质的检测机构以LTDs自制试剂的形式使用，但是不通过药监局的审批就无法对外销售)，医院样本量有限，先进入的肯定会占据诸 多优势，NIPT市场已经接近饱和，肿瘤医院的争夺也日趋白热化，所以率先通过服务来抢占市场，这或许是较为稳妥的选择。/pp　　医院是否会自行购置测序仪开展高通量测序?如果医院自己测序，那么临检测序机构势必难以竞争，所以思考这个因素是有必要的。这个问题要分开来看，一方面考虑用户的数量和需求，一方面考虑测序成本。以当前高通量测序用的最广泛的是NIPT和肿瘤诊治为例进行分析：/pp　　在无创产前诊断领域，我国每年的新生儿在1500万人左右，潜在客户基数大，NIPT能够给出明确的诊断结果和对应的防治措施，而且结果关系到下一代的健康，检测价格在2400元左右，受众广泛 此外，NIPT对测序的精度要求不是特别高(目前主要是针对13、18、21号染色体的三体检查)，检测是一个定量的过程，通常采用life ion torrent平台(目前获批的5款仪器里面3家申报的是ion torrent，而且美国已经有机构采用基因芯片来做NIPT)，很多大型医院能够自行开展NIPT服务，第三方测序机构的目标市场应该在中小型医院。/pp　　但是高通量测序在肿瘤领域的应用就不太一样，我国每年新增肿瘤患者在450万人左右，肿瘤panel测序的价格在8千到2万之间，而且现在做肿瘤panel测序的患者主要目的是获得靶向药物用药指导，靶向药物价格比较昂贵(每个月的用药开销在5万左右)，所以目标人群就更加狭窄了 此外，肿瘤检测对测序精度要求比较高，主要针对点突变或者微缺失微重复，对技术平台的要求高，通常采用Illumina Hiseq/next Seq测序仪，仪器设备昂贵，并且开机试剂耗材的花费高(一次开机在15万左右)，如果没有足够的样本量，基本上每次开机都是亏损 并且肿瘤数据的分析比较复杂，需要专门的生物信息学人才和数据库，所以在肿瘤领域(在其他病患更少的领域更是如此)，我们认为高通量测序还是以第三方临检机构为主，目标市场在大型医院。/pp　　strong基因检测公司的发展方向——/strongstrong基因检测是起点而不是终点/strong/pp　　基因检测是起点而不是终点，做基因检测服务的机构，最大的市场还是在医疗诊断领域，除了通过提供服务获得收益外，基因检测机构最大的潜在优势是能够获得特殊患者的组织样本，并且获得基因数据的积累，这对于药物开发是十分便利的条件。正如爱基因的发展模式，以自己的基因检测服务为桥梁，打通患者、医院、CRO企业，测序结果提供用药指导，同时反过来链接下游药物开发和临床试验，形成良好的反馈机制。/p