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细胞凋亡分析

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细胞凋亡分析相关的资讯

  • 细胞坏死与细胞凋亡的区别
    细胞程序性死亡 概念:细胞程序死亡(programmed cell death,PCD)也常常被称为细胞凋亡,是生物体发育过程中普遍存在的,是一个由基因决定的细胞主主动的有序的死亡方式。具体指细胞遇到内、外环境因子刺激时,受基因调控启动的自-杀保护措施,包括一些分子机制的诱导激活和基因编程,通过这种方式去除体内非必需细胞或即将发生特化的细胞。而细胞发生程序性死亡时,就像树叶或花的自然凋落一样,凋亡的细胞散在于正常组织细胞中,无炎症反应,不遗留瘢痕。死亡的细胞碎片很快被巨噬细胞或邻近细胞清除,不影响其他细胞的正常功能。 凋亡细胞的主要特征是(参见表15-2):①染色质聚集、分块、位于核膜上,胞质凝缩,最后核断裂,细胞通过出芽的方式形成许多凋亡小体 ②凋亡小体内有结构完整的细胞器,还有凝缩的染色体,可被邻近细胞吞噬消化,因始终有膜封闭,没有内溶物释放,故不会引起炎症 ③凋亡细胞中仍需要合成一些蛋白质,但是在坏死细胞中ATP和蛋白质合成受阻或终止 ④核酸内切酶活化,导致染色质DNA在核小体连接部位断裂,形成约200bp整数倍的核酸片段,凝胶电泳图谱呈梯状 ⑤凋亡通常是生理性变化,而细胞坏死是病理性变化。理论意义:程序性细胞死亡在生物发育和维持正常生理活动过程中非常重要.在发育过程中,细胞不但要恰当地诞生,而且也要恰当地死亡。例如,人在胚胎阶段是有尾巴的,正因为组成尾巴的细胞恰当地死亡,才使我们在出生后没有尾巴.如果这些细胞没有恰当地死亡,就会出现长尾巴的新生儿.从胚胎、新生儿、婴儿、儿童到青少年,在这一系列人体发育成熟之前的阶段,总体来说细胞诞生得多,死亡得少,所以身体才能发育.发育成熟后,人体内细胞的诞生和死亡处于一个动态平衡阶段,一个成年人体内每天都有上万亿细胞诞生,同时又有上万亿细胞“程序性死亡”.两者处于一种动态平衡中,使人体器官维持合适的细胞数量得以正常运作的,正是“程序性细胞死亡”机制。(又如蝌蚪尾的消失,骨髓和肠的细生物发育过程中及成体组织中正常的细胞凋亡有助于保证细胞只在需要它们的时候和需要它们活的地方存活。这对于多细胞生物个体发育的正常进行,自稳平衡的保持以及抵御外界各种因素的干扰方面都起着非常关键的作用。)实践意义:如果调节细胞“自-杀”的基因出了问题,该死亡的细胞没有死亡,反而继续分裂繁殖,便会导致有问题或恶性细胞不受控制地增长,比如癌症 如果基因错向不该死的细胞发出“自-杀令”,不让之分裂繁殖,使不该死亡的淋巴细胞大批死亡,便破坏了人体的组织或免疫系统,比如艾滋病。控制“程序性细胞死亡”的基因有两类:一类是抑制细胞死亡的 另一类是启动或促进细胞死亡的。两类基因相互作用控制细胞正常死亡。如果能发现所有的调控基因,分析其功能,研究出能发挥或抑制这些基因功能的药物,那么人类就能够敲响癌症和艾滋病的丧钟。当然,这个过程需经过一番艰苦努力,因为线虫只有959个细胞,而人体则有大约1000万亿个细胞。
  • 文献速递|基于细胞外囊泡的新型纳米材料通过 Let-7a 诱导舌鳞癌细胞凋亡
    近日近日,吉林大学动物科学学院实验动物中心王东旭教授课题组与吉林大学口腔医院口腔颌面外科刘炜炜教授课题组在细胞外囊泡与舌鳞状细胞癌关系研究领域取得了新的进展。相关研究成果已发表在国际知名期刊《Frontiers in Bioengineering and Biotechnology》(IF:5.89,JCR 2区)。▲图1|国际知名期刊《Frontiers in Bioengineering and Biotechnology》(IF:5.89,JCR 2区)近年来,针对舌鳞状细胞癌(TSCC)的治疗和诊断已取得了进展,但 5 年生存率仍然很低。治疗TSCC的方法主要为手术、放疗和化疗。在过去几十年中,中医药在癌症研究方面已被广泛应用。例如,从蜂蜜中提取的白杨素可以通过非编码RNA在多种癌细胞中诱导细胞凋亡并抑制增殖。并且,纳米结构也已被广泛研究用于癌症治疗中的药物递送和诊断,例如金纳米粒子 (AuNPs)。细胞外囊泡(EVs)是由细胞释放到细胞外环境中的小囊泡。EVs 由脂质双层膜组成,该膜包裹着小的无细胞器的细胞质,EVs 的摄取特定于细胞类型。但白杨素与金纳米粒子在单独运用时对癌症缺乏特异性,有证据表明,纳米粒子与 EVs结合可作为靶向癌细胞的药物载体。因此,纳米材料与 EVs 结合可以提高癌症治疗的效率。为了探究该方法,王东旭教授与刘炜炜教授团队首先使用白杨素治疗 TSCC 细胞和分离的 EVs-白杨素。然后将四氯金酸(HAuCl4)与 EVs-白杨素一同孵育形成 Au-EVs。在 EVs-Con 和 EVs-chrysin 之间进行转录组测序筛选后,对 let-7a 家族进行了分析。该研究结果表明,Au-EVs 通过TSCC中的 let-7a 诱导细胞凋亡。▲图2 |实验方案示意图文章中,研究 Au-EVs在体内的抗肿瘤作用的实验使用了博鹭腾AniView600多模式动物活体成像系统拍摄观察。在该实验中,首先将SCC9 细胞注射到裸鼠体内。7天后,将Au-EVs注射到肿瘤下方,并在第8天和第15天用近红外光照射裸鼠并进行肿瘤生长分析。结果表明,Au-EVs具备肿瘤靶向性,且荧光强度随时间增加而增加。此外,近红外辐射可以淬灭 Au-EVs 的荧光。在第21天时收集肿瘤,与预期结果相符,Au-EVs 与 NIR 结合显着抑制了肿瘤生长,并且没有改变体内其他器官。这些结果表明,Au-EVs 有效地介导了等离子光热疗法(PPT)并抑制了体内肿瘤的生长。▲图3|注射Au-EVs 后的荧光强度本研究发现,Au-EVs作为一种新型纳米材料,在SCC9 细胞中具有吸收特异性。在经过近红外辐射后,Au-EVs 能够有效增强细胞凋亡。通过RNA-seq,筛选 EVs-chrysin miRNA,Let-7a-3p,并且过表达let-7a-3p会诱导细胞凋亡,此结果表明经NIR 处理的 Au-EV 显著抑制了体内肿瘤的生长。综上所述,本研究结果提供了一种能够提高 AuNPs 靶向性的纳米材料,并且该材料可能与针对 TSCC 的疗法相关。论文链接:doi: 10.3389/fbioe.2021.766380
  • 中国首个针对乙肝治疗的细胞凋亡通路新靶点IAP抑制剂获批临床
    p style="text-align: center "img title="001.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201801/insimg/48582be5-56f8-4909-b2e6-9897a64c3ce4.jpg"//pp  APG-1387临床研究负责人、中国肝炎防治基金会副理事长、2017年亚太肝病研究学会(APASL)主席、中华医学会感染病学分会前任主任委员、南方医科大学南方医院肝病中心主任侯金林教授评论道:“目前临床上用于治疗乙肝的药物能非常有效的抑制病毒复制,但临床治愈率(即HBsAg消失)很低。因此,大多数乙肝患者需要长期使用抗病毒药物。我对APG-1387治疗乙肝的新颖作用机制感到非常兴奋,期待与亚盛在APG-1387的临床试验合作中进一步验证其清除患者体内HBV感染的潜力。”/pp  APG-1387是亚盛医药自主设计开发的、具有全球知识产权的新一代凋亡蛋白抑制因子(IAP)高效特异性抑制剂,主要通过模拟内源性Smac分子降解IAPs来诱导和加速细胞凋亡的进程。由南方医院肝病中心张小勇教授课题组完成的临床前研究发现,慢性乙肝患者肝内IAPs分子表达上调,导致HBV感染的肝细胞发生免疫逃避,不能被特异性T细胞杀伤。APG-1387治疗可有效抑制肝细胞中的IAPs表达,促进病毒特异性T细胞介导的HBV DNA和HBV表面抗原的消除,从而治愈慢性HBV感染。IAP抑制剂用于治疗乙肝病毒感染的优势在于,依靠特异性T细胞的识别能力,能优先杀死感染细胞而不影响健康细胞。/pp  值得关注的是,世界卫生组织在去年发布的《2017年全球肝炎报告》显示,全球感染乙肝或丙肝的人数已超过3.25亿,每年约有134万人因此丧生。在我国,慢性乙肝病毒携带者达到了9000万人左右,慢性乙肝患者有3000万人,得到治疗的仅有200万人,不足总数的1/10。根据研究与咨询公司GlobalData的数据,未来十年,中国仍将是最大的乙肝市场,且将继续保持高增长态势。预计到2020年我国乙肝用药市场规模将达到200亿元,远期将达300亿。而目前市场上并未有完全能治愈乙肝的药物,用药需求巨大。/pp  亚盛医药首席医学官翟一帆博士表示:“APG-1387在中国进入临床开发是我们执行全球开发战略中的关键一步,我们期待这个药能够为迫切需要更有效治疗药物的乙肝患者提供更多的可能性。”/pp  亚盛医药目前也在对APG-1387进行癌症的临床开发。此前,APG-1387在中国和澳大利亚均已完成针对晚期实体瘤的临床I期剂量爬坡试验。去年11月,APG-1387又获得了美国FDA新药临床试验批准,将与肿瘤免疫药物联合用于治疗晚期实体瘤、恶性血液肿瘤。/pp  strong关于APG-1387/strong/pp  APG-1387是亚盛医药设计开发的新型小分子细胞凋亡蛋白抑制因子(IAP)抑制剂。研究结果表明IAP蛋白高度表达可诱导肺癌、头颈部肿瘤、乳腺癌、胃肠癌、黑素瘤和多发性骨髓瘤的发生。亚盛医药正在全球范围内开发APG-1387,已在中国和澳大利亚完成癌症的临床I期剂量爬坡试验。APG-1387也被用于治疗乙型肝炎,临床前研究表明APG-1387可显著降低HBV DNA和HBV表面抗原。/pp strong 关于乙型肝炎/strong/pp  乙型肝炎是一种病毒感染,可以攻击肝脏,并可能引起急性和慢性疾病。乙型肝炎患者和HBV携带者是本病的主要传染源,HBV可通过母婴、血和血液制品、破损的皮肤黏膜及性接触传播。感染HBV后,由于受病毒因素、宿主因素等影响,会出现不同的结局和临床类型,后期可能发展成肝硬化或肝癌。/pp strong 关于亚盛医药/strong/pp  亚盛医药是一家全球领先的处于临床阶段的新药研发企业,致力于在肿瘤、乙肝及与衰老相关的疾病等治疗领域开发创新药物。公司拥有自主研发的蛋白-蛋白相互作用靶向药物设计平台及100多项国际发明专利。公司研发产品管线主要专注细胞凋亡路径关键蛋白的抑制剂,通过抑制BCL-2、IAP或MDM2-p53等,重启肿瘤细胞的凋亡程序 第二代和第三代的针对癌症治疗中出现的激酶突变体的抑制剂 与肿瘤治疗有密切相关性的表观遗传学靶点的抑制剂等。公司现有六个新药项目已进入到中国、美国及澳大利亚的I-II期临床开发阶段,其中包括APG-1252,一个新型、强效的BCL-2/BCL-xL双重抑制剂。/p
  • 施一公课题组利用冷冻电镜获得3.8埃哺乳动物凋亡体Apaf-1三维结构
    p  十一月五日,施一公院士课题组在国际权威刊物《Genes & Development》发表一项最新研究成果,题为“Atomic structure of the apoptosome: mechanism of cytochrome c- and dATP-mediated activation of Apaf-1”。在这项研究中,研究人员通过单粒子的低温EM分析,在3.8埃的原子级分辨率上,确定了一个完整的哺乳动物凋亡体Apaf-1的三维结构。/pp  程序性细胞死亡(细胞凋亡),对于多细胞生物发育和组织动态平衡,是必不可少的。细胞凋亡是由引发剂和效应物caspase的连续激活进行的。效应物caspase的主要功能——比如哺乳动物的caspase-3,是通过对维持生命的蛋白造成众多裂口而杀死细胞。另一方面,引发剂caspase的主要作用,是切割从而激活特异性效应物caspase。/pp  在哺乳动物细胞中,引发剂caspase-9负责caspase-3的激活。引发剂caspase的自动催化激活,主要依赖于一个特定的多蛋白复合物。对于caspase-9来说,这个多蛋白复合物被称为凋亡体,包括凋亡蛋白酶激活因子1(Apaf-1)和细胞色素c(CytC)之间的一个异二聚体的七个拷贝。因为caspase-9对于大多数已知形式的内凋亡是必不可少的,因此,阐明其激活机制,一直是程序性细胞死亡机理研究的中心任务。实现这一目标的第一步,是阐明凋亡体装配的机制。/pp  在正常的哺乳动物细胞中,Apaf-1作为一个ADP结合的自动抑制单体而存在。为了响应各种形式的内在细胞死亡刺激,CytC从线粒体释放到细胞质中,在那里CytC结合单体Apaf-1,并为齐聚反应做好准备。ADP通过dATP或ATP的替换,可导致显著的构象变化,从而使Apaf-1形成一个有活性的heptameric凋亡体。只有激活的凋亡体才能够促进caspase-9的自动催化激活。CytC如何与Apaf-1相互作用?这些相互作用如何促进核苷酸交换和Apaf-1的齐聚反应?凋亡体介导的caspase-9激活的机制是什么?尽管经过了严谨的调查研究,但这些问题一直都是神秘的。/pp  已有研究在9.5和21埃范围的分辨率上,阐明了Apaf-1凋亡体的低温电子显微镜(cryo-EM)结构。这些结构允许单个结构域的布局,但不能解释控制凋亡体功能的特异性相互作用。单体的、ADP结合的Apaf-1的X射线结构,为Apaf-1自动抑制的基础,提供了一个原子的视图。总之,这些结构观测提出了一个推测性模型,可描绘凋亡体的组装。但是,这个模型的EM结构分辨率相对较低,缺乏支持性的生化数据。/pp  在这项研究中,研究人员通过单粒子的低温a href="http://www.instrument.com.cn/zc/1139.html" target="_self" title="" style="color: rgb(0, 112, 192) text-decoration: underline "span style="color: rgb(0, 112, 192) "电子显微镜/span/a(cryo-EM),确定了一个完整的哺乳动物凋亡体的原子结构(3.8埃分辨率)。结构分析连同结构引导的生化表征,揭示了细胞色素c如何通过与WD40重复的特异性相互作用,而解除Apaf-1的自动抑制。与自动抑制的Apaf-1的结构对比,揭示了dATP结合如何触发一系列的构象变化,从而导致凋亡体的形成。总而言之,这些研究结果,阐释了细胞色素c和dATP介导的Apaf-1激活的分子机制。/pp  相关论文连接:/pp  a href="http://genesdev.cshlp.org/content/early/2015/11/05/gad.272278.115" _src="http://genesdev.cshlp.org/content/early/2015/11/05/gad.272278.115"http://genesdev.cshlp.org/content/early/2015/11/05/gad.272278.115/a /pp style="text-align: center "img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201512/noimg/0b1a7156-61ec-4b31-832c-225066c2c525.jpg" title="图.jpg"//p
  • 库尔特 细胞研究不可或缺的细胞体积分析
    生物、药物等许多的研究均需要通过观察细胞体积的变化或细胞数目增减的来判断和评估实验的效果。由于细胞所处环境的改变可促使其自身体积做出相应的变化,以便适应改变后的环境大致新的平衡。由于并不能清晰地知道该种细胞体积变化规律,因此必须检测其体积或细胞数目随条件、时间的变化。  细胞的发育与细胞分裂周期级数递增均需要连续不断的细胞增殖。  在培养液中正在增殖的细胞在其分裂前其体积将增大至原体积的两倍。然而对细胞发育与分裂的速度作如何调整才能保证细胞体积的不变并不明确。因此,测量细胞的体积的变化对了解与控制细胞的发育和周期非常重要。  细胞的死亡  细胞的增殖与细胞的死亡之间需要一个精细的平衡以保持足够的细胞数量。该种平衡容许细胞作最佳的状态调节以适应各样机能变化的需求。细胞死亡有两种清晰的机制,坏死与凋亡。坏死是一个病理生理的机制,包括细胞膨胀以及细胞膜破裂而释出内容物。凋亡则是一个程序式死亡的机制。凋亡的特征之一就是细胞收缩。细胞有缺陷的凋亡与过度凋亡,两者同样会导致严重疾病。  渗透压的补偿  任何种类的细胞都有可能因处于不利环境而死亡。细胞犹如多孔的网筛极易因渗入已溶解于周围环境的化学物而使渗透压受影响。细胞内外环境中该些溶解物颗粒数目的不平衡,将会导致水份透进细胞而使其体积涨大,或者是水份从细胞渗出使其体积收缩。  当细胞或微生物遭遇环境的变化,它们都会尝试通过自身调节来适应新的环境。  细胞平均体积(MCV)的变化  当细胞或微生物遭受环境变化时,它们将通过自身调整以图适应新的环境。一些例子中细胞需要改变自身体积以便达到适合的目标。  由贝克曼库尔特公司出品的Multisizer 3 库尔特细胞特性分析仪是目前最权威的细胞体积、细胞计数的分析仪器,应用文献多不胜数。无可逾越的领先技术更使Multisizer 3 成为分辨率最高的仪器。国外的用户统计表明,Multisizer 3 已成为细胞实验室必备的研究工具。  自华莱士• 库尔特先生发明 库尔特原理 以来,该原理已广泛应用于材料、生物、医学、制药等众多的领域。目前生物领域的细胞计数标准就是库尔特原理。美国材料实验协会ASTM将库尔特原理定为生物细胞计数的标准(ASTM-F2194)。国际血液学标准化委员会亦指定库尔特原理为计算红细胞与白细胞的标准实验室方法 (Clin. lab. Haemat. 1988. 10, 203-212.)。  作为库尔特原理及技术应用的鼻祖,美国贝克曼库尔特公司始终保持着技术领先的优势。† 库尔特计数仪(Coulter Counter)无论在研究还是在质量控制的应用均具有深远的影响力。在权威的研究机构及其发表的学术文献当中,库尔特计数仪均担当着不可或缺的角色。  多年来贝克曼库尔特公司在市场上推出了一系列的库尔特计数仪(Coulter Counter),如:ZM、TA II、Multisizer II等系列型号,为科研与产品控制的实验室颗粒/细胞的检测提供最可靠的分析手段。Multisizer 3 型库尔特颗粒/细胞计数及粒度分析仪为当今所有计数仪、粒度分析仪当中分辨率最高的仪器。  库尔特原理(Coulter Principle)  又称为电感应区技术。  悬浮于弱电解液中的细胞被抽吸而经过一个小孔,因产生外加电压而形成“感应区”。细胞经过小孔时,细胞的体积替代了电解液的相应体积。因相应体积的电解液被替代,小孔感应区产生电压脉冲而导致电阻的改变。脉冲的强度与细胞的体积成比例的关系 。  Multisizer 3 先进的DPP 数码脉冲处理器,使测量过程中的数以百万计的脉冲信号无须经压缩而保存。数据因无损失而能实现再分析功能。DPP的功能使得Multisizer 3 能够实时监测样品在分析过程中的原始变化。  DPP同样可用于检测细胞体积的改变。在许多的生化过程中细胞体积是一个重要的参考因素。如细胞发育、细胞周期、细胞死亡、渗透压的补偿、致病机理和吞噬作用等。Multisizer 3 可以观测细胞粒径与体积从几秒到几小时内的变化。  DPP技术在低温生物学中的应用  这是在冷冻过程中受渗透压影响的细胞,其平均体积(MCV)的分布曲线和20秒内连续的脉冲峰值平均值的变化。  择任意的脉冲群可以将一个粒度分布“分割”成多重的分布。因此,可获得在分析全程中的某一时段的粒度分布。如图示,可获得细胞的平均直径随时间的变化。  使用Beckman Coulter 的Multisizer™ 3 库尔特体积粒度分析仪将能方便而精确地测量细胞平均体积(MCV)的各种变化。
  • Life Tech Tali 成像型多色细胞分析仪 快速细胞分析新技术
    Tali&trade 成像型多色细胞分析仪 快速细胞分析新技术 Tali&trade 成像型多色细胞分析仪能让你随时,简便快速的检测GFP和RFP表达,判断细胞存活率和细胞凋亡。抢先体验 Tali&trade 成像型多色细胞分析仪立即注册,您将最先收到 Tali&trade 成像型多色细胞分析仪的最新资料。 通知我最新产品信息
  • Muse智能触控细胞分析仪新品问世
    默克密理博秉承一贯的创新理念,突破流式研发的思维定式,带来了革命性创新一代Muse&trade 智能触控细胞分析仪。内置Pad版触屏式电脑,结合全面的预置细胞分析常规实验方案,为您开创前所未有的流式操作新体验。您只需动动手指,即可实现包括:细胞计数,细胞活性,细胞周期,细胞凋亡等在内的细胞分析常规实验。分分钟让您体验悦动指尖的细胞分析艺术。 除此之外,默克密理博还将为Muse&trade 平台不断开发更多细胞分析的预置实验方案,近期8个预置实验方案即将推出:涉及Caspase 凋亡通路、线粒体损伤、免疫分型、淋巴细胞活力分析、细胞信号通路、DNA损伤等多个研究应用领域。用户将全部免费获得预置实验方案的软件升级。请欣赏Muse 智能触控细胞分析仪介绍视频申请试用 | 索取MUSE资料 | 询价 更多详情,请点击此处 默克密理博:新流式,新思维 &mdash &mdash 全新的流式平台,全新的学术思维
  • 导致珍贵的干细胞死亡的元凶是谁?
    养过细胞的人都知道优质血清的重要标准之一是内毒的含量。血清由于其复杂的成分是不可代替的,但它也难以控制外界因素的影响内毒素过高会是实验室珍贵的细胞凋零。例如:干细胞体外培养实验,由于干细胞的原始性,它们对内毒素非常敏感,所以,当血清内毒素偏高时,细胞很容易死亡,需要在试用前提早参看该批次《检测报告》,以决定是否入围进行试用。又例如:基因敲除相关的细胞实验,培养的细胞要尽可能保持其原始状态,任何引导细胞衰老或凋亡的试剂,都会让后续的实验结果“失之毫厘,谬以千里”。所以,选择极低内毒素的血清,至关重要。同样,例如:原代培养,杂交瘤融合,细胞转染,难养细胞在体外的增殖(肝细胞,神经细胞,内皮细胞等)....这些细胞的培养都需要内毒素更低的血清,如果内毒素过高,对细胞造成的损害,会大大影响后续实验结果。还有一些细胞,实验室比较常用,经常复苏,培养,冻存,如此,血清会经常作用于细胞;还有的细胞需要培养的时间较长,血清会长时间作用于细胞;还有细胞典藏等项目,都需要使用更低内毒素的血清,以避免内毒素长久对细胞的毒性影响。因此,我们在挑选优质血清的时候内毒素是我们应该优先考量的条件之一。
  • BD推出全新细胞分析仪简化研究流程
    圣何塞市,加利福尼亚州(2011年5月20日)---美国BD公司(Becton,Dickinson and Company)全球三大业务部之一的生物科学事业部于今日正式推出了BD FACSVerseTM流式细胞仪---一款灵活、可靠并具有可升级性的流式细胞分析系统,该系统最高可分析多达10个参数并支持广泛的研究应用。  BD FACSVerseTM 流式细胞仪以及BD FACSuiteTM软件提供高达10参数分析的升级路径  “基于三大核心理念,我们将诸多创新的尖端科技融入到了BD FACSVerseTM系统中,赋予了它彻底的创新性。”BD生物科学事业部细胞分析业务总裁James Glasscock说。“首先,我们想要为研究者打造一款既能满足常规分析实验需要,同时又能兼顾复杂的多激光多色实验在结果精确性和重复性方面严苛要求的单一平台。其次,BD希望简化流式实验的操作流程,以内在的智能化特质赋予系统杰出的易用性。最后,BD希望提供给用户从6参数到10参数的灵活升级方案以最大限度的保护用户的每一分投入,同时配备多种选配模块以满足用户在未来不断提高的研究需求。”  BD FACSVerseTM流式细胞仪配备了全新的BD FACSuiteTM操作软件,现在用户可以自动化实现一些常规操作,例如:以最少的点击次数完成仪器的启动、设置、获取样本、数据分析的全过程。软件包的模块化架构使用户可以同时执行多项任务,并且在获取样本的同时也可同步进行数据分析。据Glasscock介绍,BD FACSuiteTM软件还引入了一项全新的操作范例:以前流式用户不得不每天不厌其烦的进行荧光补偿值的修正,特别是对多色分析实验而言荧光补偿值的修正是必须的,然而时至今日BD FACSuiteTM软件的推出彻底的改写了历史,从此流式用户再也无需每天对荧光补偿值进行反复的校正。BD FACSuiteTM软件使得assays和experiments的设置可以被直接输出并共享到全球任何一台其他的BD FACSVerseTM系统上面使用,最大程度地降低了不同仪器间及用户间的实验差异。  BD FACSVerseTM 流式细胞仪内在的智能性同时还减少了操作误差,提高了实验效率,并将实验流程自动化,最大程度的降低了人为干预的比例。典型特征如下:  基于真空负压的液流系统给予了上样过程最大的灵活性   全新的设置和质控范例概念消除了对标准荧光染料的日常补偿需要   仪器内部各个组件的智能创新特质将仪器操作大大简化并防止人为操作误差的发生   为了全面支持广泛的应用,BD FACSVerseTM系统还提供可选择的BD预置实验,这些实验涵盖了细胞凋亡,细胞周期,细胞增值以及细胞因子检测等诸多重要的研究应用,配合BD专业流式试剂和试剂盒可以获得高重复性的实验结果。该系统还同时支持客户自定义实验设置。研究者可以将他们的实验转换成可重复使用的实验模板,包含相关设置、样本获取和分析工作表以及圈门设置等。不仅如此,用户还可以通过建立报告参数来降低不同用户及实验室间同一应用的数据差异化。  BD FACSVerseTM流式细胞仪提供4色、6色及8色分析三种不同配置,配合前向角散射光和侧向角散射光最高可支持10参数分析。同时考虑到用户的未来升级可能,4色及6色分析配置还可以实现灵活的现场升级。同时BD FACSVerseTM小巧的紧凑的机身设计还非常适合标准实验台的放置要求。
  • Countstar2017北方区细胞荧光分析技术交流活动
    2017年7月17日至20日,Countstar北京办事处的产品经理陆续拜访了黑龙江干细胞存储中心、哈尔滨医科大学肿瘤医院等新老客户。针对当前细胞检测存在操作繁琐,使用成本高等问题,Countstar产品经理携带Countstar全自动细胞荧光分析仪,通过对客户提供的细胞样本进行检测,为大家成功演示了借助荧光检测技术,快速实现细胞转染、凋亡、CD marker等参数的检测过程,准确稳定的实验结果得到了工作人员的肯定。另外,Countstar产品经理们还向客户询问了细胞计数仪的日常使用情况,并为客户提供了常规的维保培训,以此为客户提供更好的使用体验。
  • 加速流式试剂开发:Cytek 收购Tonbo Biosciences细胞分析业务
    2021年11月2日 – Cytek Biosciences, Inc. (Nasdaq: CTKB),细胞分析领域技术领先的生命科技公司,宣布收购Tonbo Biosciences™ 公司细胞分析业务。Tonbo细胞分析业务包括与细胞制备、流式细胞术、分子免疫/PCR和细胞培养等生命科学研究相关的广泛的试剂产品,应用领域覆盖免疫学、细胞凋亡和免疫谱系分析等。 作为光谱流式的优秀代表企业,Cytek开发并推出了其独有的 cFluor试剂家族,除单色试剂外,还包括一系列免疫分析试剂盒,从基础的8色TBMNK试剂,到14色免疫分型,再到25色深度免疫分型。cFluor 试剂是科学家们对全光谱检测和多色分析丰富经验累积的结果转化。Tonbo试剂的加入,对Cytek cFluor 试剂家族将是很好补充,使Cytek能够为广大用户提供更为广泛的流式细胞产品,以满足客户日益增长的细胞和蛋白分析研究需求。“Tonbo的试剂符合最高的质量和性能标准,与我们致力于为细胞分析市场提供全面解决方案的使命不谋而合。” Cytek Biosciences总裁兼首席执行官蒋文斌博士表示:“Cytek一直积极创新及重新定义流式细胞术的可能性,并承诺为我门的广大用户提供最优的全面解决方案,将Tonbo的试剂产品加入到我们现有的全光谱分析(FSP™ )平台中,就是我们履行这一承诺的又一有力举措。” 【短视频活动来袭】赢环球影城门票!仪器测评"小红书"--3分钟短视频挑战赛来袭!点击参赛:https://www.instrument.com.cn/zt/3iyiqiceping
  • 邀请函 | 中国细胞生物学学会细胞死亡研究分会2021年第一届学术年会与您相约桐庐
    中国细胞生物学学会细胞死亡研究分会2021年第一届学术年会将于2021年6月2-5日在浙江桐庐海博大酒店(二楼桐庐会堂A厅)举办,此次大会由中国细胞生物学学会细胞死亡研究分会主办,浙江大学、上海市细胞生物学学会和细胞学会会展部联合承办。北京深蓝云生物科技有限公司将携带相关产品亮相在此次会议,我们将在6号展位恭候您的参观咨询。程序性细胞死亡是生物体最基本的生命活动。越来越多的证据表明程序性细胞死亡的方式具有多样性,以细胞凋亡及程序性细胞坏死为代表的多种细胞死亡方式广泛参与生物体发育和疾病过程,并扮演不同的角色。全面系统的研究多种细胞死亡方式,能够推动对不同细胞死亡方式机制的深入了解,为细胞死亡相关疾病的临床诊治提供重要依据。详情请登录:https://www.cscb.org.cn/meeting/celldeath2021/查看。细胞死亡实时形态学监测全电动化解决方案Revolution正倒置一体电动化智能显微成像系统☑ 电动化智能程序:电动追焦,锁焦,多点样品导航和重访。☑ 高清晰全景图像: 双sCMOS相机,多焦面叠加,多视野整合,多维成像。☑ HYPERSCAN高速:同步无刷直线伺服电机和相机,数秒钟完成全景扫描。☑ 卓越的光学性能:大视野,大景深,多物镜、多荧光立方可选。☑ 一体化机身结构:正倒置一体,全能型显微镜,方便安放和运输。☑ 人性化数据交互:互联网+现场和远程实时共揽、延时摄影和图像分享。细胞死亡信号通路及激活和抑制因子数字PCR解决方案naica全自动微滴芯片数字PCR系统数字PCR技术(Digital PCR)无需标准品和标准曲线即可对起始样品中靶标核酸进行绝对定量。深蓝云展台产品展示naica下一代数字PCR平台naica全自动微滴芯片数字PCR系统,以Sapphire芯片(全自动)或Opal(高通量)芯片为耗材,形成由25,000-30,000个微滴组成的单层二维阵列,该单层微滴阵列形成后直接进行PCR扩增实验。反应完成后对微滴进行三通道成像,从而对起始核酸浓度进行绝对定量。仅需2.5小时即可获取结果。▲ naica微滴芯片数字PCR系统Echo正倒置一体显微镜Echo正倒置一体显微镜兼具正置和倒置显微镜的功能,方便小巧,一机多能,可以非常便利地通过旋转实现正倒置配置的切换;无传统目镜设计,拥有明场,相衬,荧光,偏光等观察方式,可兼容活细胞观察,病理切片,免疫组化,免疫荧光,荧光原位杂交等。▲ Echo正倒置一体显微镜Azure Cielo™ 实时荧光定量PCR系统Azure Cielo™ 实时荧光定量PCR系统来自于美国Azure Biosystems公司,配备高品质温度模块,采用光纤和CMOS的检测系统,高能LED的激发,提供高灵敏和可靠的数据。▲ Azure Cielo™ 实时荧光定量PCR系统深蓝云生物科技将携带相关产品亮相此次大会,恭候您的参观咨询!与您不见不散——展位:6号
  • 250万!京大学宁波海洋药物研究院流式细胞分析仪采购
    北京大学宁波海洋药物研究院流式细胞分析仪采购项目国际招标公告项目编号 : 0762-2141CBNB3017 公布日期 : 2021-12-21宁波中基国际招标有限公司受招标人委托对下列产品及服务进行国际公开竞争性招标,于2021年12月21日在中国国际招标网公告。本次招标采用传统招标方式,现邀请合格投标人参加投标。1. 招标条件项目概况:北京大学宁波海洋药物研究院因发展需要,需采购流式细胞分析仪设备1套。资金到位或资金来源落实情况:项目所需资金已经落实。项目已具备招标条件的说明:项目已具备招标条件。2. 招标内容:招标项目编号:0762-2141CBNB3017招标项目名称:北京大学宁波海洋药物研究院流式细胞分析仪采购项目项目实施地点:中国浙江采购预算:人民币250万元;采购用途:科研交货期:合同签订后接招标人书面通知(或电子邮件形式)送货函发出之日起 60 天内(含国定节假日)完成安装调试并验收合格;交货地点:宁波,北京大学宁波海洋药物研究院指定地点招标产品列表(主要设备):子包号产品名称数量简要技术规格/流式细胞分析仪1套主要用于对细胞的物理或化学性质,如大小、密度、内部结构、DNA、RNA、蛋白质、抗原等进行快速定量分析。该设备主要用于细胞学相关的科研工作,比如:细胞周期检测、细胞凋亡检测、哺乳动物细胞的表面及胞内抗原检测以及可溶性细胞因子检测等。广泛应用于细胞生物学、肿瘤学、肿瘤免疫学、肿瘤药理学、遗传学及临床检验学等。具体详见第八章。3. 投标人资格要求1)投标人是响应招标、已在招标人或招标机构处领购招标文件并参加投标竞争的法人或其他组织。任何未在招标人或招标机构处领购招标文件的法人或其他组织均不得参加投标。2)除非另有规定,凡是来自中华人民共和国或是与中华人民共和国有正常贸易往来的国家或地区(以下简称“合格来源国/地区”)的法人或其他组织均可投标。3)接受委托参与项目前期咨询和招标文件编制的法人或其他组织不得参加受托项目的投标,也不得为该项目的投标人编制投标文件或者提供咨询。4)单位负责人为同一人或者存在控股、管理关系的不同单位,不得参加同一招标项目包投标,共同组成联合体投标的除外。5)只有在法律上和财务上独立、合法运作并独立于招标人和招标机构的供货人才能参加投标。6)近三年内(本项目招标截止期前)被“信用中国”网站列入失信被执行人和重大税收违法案件当事人名单的、被“中国政府采购网”网站列入政府采购严重违法失信 行为记录名单(处罚期限尚未届满的),不得参与本项目。7)如果投标人按照合同提供的货物不是投标人自己制造的,投标人应得到货物制造商或货物制造商的代理商同意其在本次投标中提供该货物的正式授权书。8)投标人须提供其开户银行在开标日前三个月内开具的资信证明原件或该原件的复印件(如资信证明中明确注明复印无效的则必须提供该资信证明原件,招标机构保留审核原件的权利)。9)投标人应当于招标文件载明的投标截止时间前在机电产品招标投标电子交易平台(网址:http://www.chinabidding.com)成功注册。否则,投标人将不能进入招标 程序,由此产生的后果由其自行承担。本项目不接受联合体投标。未领购招标文件不可以参加投标。4. 招标文件的获取招标文件领购开始时间:2021年12月21日,上午:8:30-11:30;下午:13:30-17:00。招标文件领购结束时间:2022年01月05日17:00(北京时间)招标文件领购地点:宁波中基国际招标有限公司(宁波市鄞州区天童南路666号中基大厦19楼前台),李小姐,电话88090098,传真:0574-87425386,电子邮箱:719126619@qq.com。或在线购买,网址:https://dwz.cn/BzVsB93Q。招标文件售价:500元人民币或75美元,售后不退(请勿个人或支付宝汇款)。5. 投标文件的递交投标截止时间(开标时间):2022年01月18日09:00(北京时间)投标文件送达地点:宁波中基国际招标有限公司会议中心(宁波市鄞州区天童南路666号中基大厦1楼)开标地点:宁波中基国际招标有限公司会议中心(宁波市鄞州区天童南路666号中基大厦1楼)6. 投标人在投标前需在中国国际招标网上完成注册。评标结果将在中国国际招标网公示。7. 联系方式招标人:北京大学宁波海洋药物研究院地址:宁波梅山保税港区三创基地二期联系人:王上宁电 话:0574-88090336招标代理机构:宁波中基国际招标有限公司地址:宁波市鄞州区天童南路666号中基大厦19楼联系人:徐军、高书焓、陈超、陈露、林申杰、张龙锋、梁慧强、夏巍联系方式:0574-88090039、880903368. 汇款方式招标代理机构开户银行(人民币):中国工商银行宁波鼓楼支行招标代理机构开户银行(美元):中国工商银行宁波鼓楼支行帐 号(人民币):3901110009200043078帐 号(美元):3901110009814008126帐 号(日元):3901110009827008737帐 号(欧元):3901110009838008695银行地址:中国浙江省宁波市中山西路218号开户名称:宁波中基国际招标有限公司swift代码:ICBKCNBJNBO行号(人民币):25197003
  • 厦门大学杭纬教授课题组LA-ICP-MS技术新进展:实现单细胞质谱成像分析
    近日,厦门大学化学化工学院杭纬教授课题组在单细胞质谱成像研究方面取得进展,相关成果以“Single-Cell Mass Spectrometry Imaging of Multiple Drugs and Nanomaterials at Organelle Level”为题发表于ACS Nano(DOI: 10.1021/acsnano.1c02922)。  探究化学物质在生物组织甚至单细胞内的位置分布是生命科学研究的重要方向之一。特别是随着金属元素组学和元素标记技术的发展,对于元素的分析检测显得愈加重要。电感耦合等离子体质谱(ICP-MS)技术是最常用的元素检测手段之一,通过与激光剥蚀(LA)采样方法的联用,使得这种传统的溶液进样质谱技术具有了原位分析和化学成像的能力。但是,由于衍射极限以及透镜数值孔径等因素的限制,这种激光采样方法的空间分辨能力仍然停留在微米级别,难以应用于单/亚细胞水平上的成像研究。  杭纬课题组首次设计了具有三通结构的样品剥蚀池,从而将微透镜光纤激光采样技术与ICP-MS相结合,搭建了LA-ICP-MS成像平台,该装置可以实现低至400纳米空间分辨率的质谱成像,对生物组织和单细胞内的多种化学物质进行可视化探测,还易于实现可调分辨率的成像模式。以同一片小鼠小肠剖面组织为研究对象,获得了从500纳米至10微米空间分辨率的药物分布成像图片。利用高分辨模式的成像,能够更直观、精准地描绘出小肠组织内微小的细节和药物的分布,从而揭示小肠对药物的吸收和作用机理。  这种高空间分辨率的LA-ICP-MS成像装置也可以在细胞器水平上实现对单细胞的成像分析。课题组将HeLa细胞与金纳米棒、卡铂等药物同时培养,而后将在石英片上贴壁生长的细胞放入样品剥蚀池内进行成像检测。结果表明金纳米棒主要位于细胞的溶酶体内,而金纳米棒上修饰的不同基团会影响细胞对纳米材料的摄取量、细胞的形貌以及活性产生 而卡铂药物被癌细胞摄取后主要分布在细胞核内,通过与核内DNA的相互作用诱导癌细胞凋亡。这种纳米级空间分辨的元素成像有望在生物学与医学等多领域获得应用,在纳米尺度下揭示待测物的化学物质分布。  该工作是在杭纬教授指导下完成的。实验部分主要由该院2017级博士研究生孟一凡(已毕业)完成,高超鸿、陆桥等参与了论文的研究工作。研究工作得到国家自然科学基金(项目批准号:21974116、21521004、22027808)的资助和支持。  论文链接: https://doi.org/10.1021/acsnano.1c02922
  • 一天三篇CNS,Incucyte开启细胞研究新速度
    Incucyte发CNS文章速度又提升了!2024年3月13日,《Nature》和《Cell》分别发表了2篇和1篇研究文章,均应用到了Incucyte。值得指出的是,这些成就并不是个例:2023 一周3篇Nature:Incucyte上演科研帽子戏法!2022一天四篇Nature | Incucyte助力罕见病研究这些里程碑式的成就再次说明了Incucyte因其简单的实验设置和分析、丰富的应用方向使得很多用户对其爱不释手,在体外细胞水平的实验中发挥着重要功能。接下来,就让我们一起来看看这三篇文章。Nature阿尔茨海默病新机制斯坦福大学[1]APOE基因编码的蛋白参与将脂肪滴运送到神经细胞中。APOE 有四种变体,即APOE1、APOE2、APOE3和APOE4,其中APOE4能将最多的脂肪带入脑细胞。本文发现,APOE4/4基因型的阿尔茨海默病患者中,大脑的小胶质细胞会更容易进入一种积累脂滴(LD,lipid droplets)的异常状态(LDAM)。在这种状态下的小胶质细胞受到淀粉样蛋白(Aβ)和其它先天免疫因子刺激后,会激发神经细胞中Tau蛋白的磷酸化和细胞死亡。这项研究揭示了APOE4基因诱发阿尔茨海默病的全新作用机制,并且提供了潜在的治疗策略。研究人员将APOE4/4基因型和APOE3/3基因型iPS细胞分化为小胶质细胞,使用中性脂质荧光染料对小胶质细胞进行Incucyte实时活细胞成像。结果显示,与APOE3/3相比,APOE4/4中LD的积累更大。当用Aβ处理APOE4/4时,LD的积累进一步增加。这说明APOE4 AD风险等位基因的存在加剧了LD积累。在这项研究中,Incucyte不仅可以观察到脂质荧光染料在细胞中聚集的图像,还可以统计实时定量曲线。图1. (b)APOE3/3和APOE4/4 ±Aβ细胞中脂质荧光染料的实时定量曲线;(c)实验终点平均脂斑荧光强度;(e)原代大鼠小胶质细胞未经处理(左)或fAβ处理(右)之后脂质体染料图像;(d)终点数据只需选用合适的染料,Incucyte就能捕捉并记录下细胞的每一种活动。Nature巨噬细胞吞噬机理华盛顿大学医学院[2]在发育过程中以及炎症或组织损伤发生时,巨噬细胞通过吞噬并处理多个凋亡尸体(胞葬作用),以实现组织稳态。本研究发现对于人类和小鼠巨噬细胞,RNA聚合酶Pol II控制的暂停/释放在体外和体内连续吞噬作用中是必需的。有趣的是,阻断Pol II暂停/释放并不妨碍Fc受体介导的吞噬作用、酵母摄取或细菌吞噬作用。巨噬细胞使用Pol II暂停/释放作为一种机制,以迅速改变它们的转录程序,高效处理摄入的凋亡尸体,并进行连续的吞噬作用。作者利用了Incucyte实时活细胞成像分析方法,实时展示了暂停Pol II可以增强巨噬细胞的胞葬作用。利用pH敏感染料标记凋亡的细胞,当凋亡的细胞被巨噬细胞吞噬的时候,会在酸性环境下产生荧光,荧光信号越强吞噬能力越强。在Hoxb8来源的巨噬细胞中通过CRISPR-Cas9技术基因缺失负延长因子NELF-B和NELF-CD,可以破坏Pol II的暂停,使巨噬细胞的胞葬作用的增强;这种增强的胞葬作用对阻断肌动蛋白聚合(加入Cytochalasin D,一种有效的肌动蛋白聚合抑制剂,胞葬作用依赖肌动蛋白介导的质膜重塑)仍然敏感(图2g)。巨噬细胞可以通过不同的表面受体和分子机制进行不同类型的吞噬作用。巨噬细胞的吞噬作用受到Pol II暂停/释放抑制剂flavopiridol影响 而巨噬细胞Fc受体介导的吞噬作用不受暂停/释放抑制剂flavopiridol的影响(图2h)。图2. (g)Incucyte分析检测WT和NELF缺陷巨噬细胞与凋亡Jurkat 细胞共孵育后的胞葬动力学;(h)巨噬细胞吞噬凋亡的细胞和巨噬细胞通过Fc受体介导吞噬处理的胸腺细胞Incucyte实时活细胞成像分析有明场、红、绿3个通道,支持选择多种荧光试剂在不同条件下的使用,从而获得不同条件下的实时动力学曲线。Cell新细胞群的发现加州大学旧金山分校[3]本文发现了一类I型干扰素(IFN-Ⅰ)响应性的小胶质细胞亚群(IRMs),这一类独特的小胶质细胞在大脑皮层的发育和感觉功能中发挥重要作用。作者发现在发育应激时有一种特殊类群的小胶质细胞数量明显增加。进一步研究发现这一类群的细胞在皮层重塑期间高度活跃,可发挥吞噬神经元的作用,而在正常大脑发育过程中罕见。作者通过一系列实验发现这一特殊类群小胶质细胞自身的IFN-Ⅰ信号以及dsRNA信号转导导致其对神经元的吞噬作用,在维持大脑健康中发挥着重要作用。原代小胶质细胞吞噬试验中利用Incucyte实时活细胞成像分析系统来跟踪分析。小鼠原代小胶质细胞进行的体外吞噬试验显示,poly(I:C)处理可加速消化凋亡细胞(图3J和3K),而 Ifnar1 缺失则会降低消化效率(图3L和3M)。这些数据表明,IFN-I 信号增强了小胶质细胞消化能力,这与体内 IRMs 经常同时吞噬和消化多个细胞的观察结果一致。图3. 向小胶质细胞中加入吞噬染料标记的凋亡细胞,每小时采集一次,采集24 小时;使用 Incucyte 活细胞分析软件对图像进行阈值处理,并使用红色通道(溶酶体内的凋亡尸体)的综合强度与小胶质细胞表面积(用明场确定)的归一化值进行分析(G)体外小胶质吞噬作用实验设计;(H)典型的吞噬Incucyte实时分析示意图:前端是吞噬作用,后端是消化作用,用线性相中峰前斜率的线性回归斜率来估计吞噬效率(m1),用峰后斜率来估计消化效率;(I)添加吞噬染料标记的凋亡细胞24小时后WT小胶质细胞培养的代表性图像(左),WT小胶质细胞中添加poly(I:C)(中),Ifnar1缺失的小胶质细胞(右);(J)和(L)代表实时吞噬染料信号强度;(K)和(M)表示小胶质细胞消化速率Incucyte通过连续采集,可以实时显示1天内小胶质细胞发生的吞噬和消化过程(信号先上再下),捕捉细胞每个细节。总而言之,在上述研究中体现出Incucyte实时活细胞分析系统的独特优势:1. 自动检测,提升实验效率满足密集时间点以及长时间监测的需求,一次实验得到大量数据,解放人力,是从事细胞研究不可或缺的工具。2. 分析简便,提升数据质量软件采集及分析模块配合荧光检测试剂,得到高度可靠的数据。实时检测整个细胞死亡/凋亡曲线,在细胞死亡状况较为接近的情况下,仍然在大量数据的前提下得到确切的结论。3. 6板位设计,多实验同步开展内设6个板位,可以分别独立设置检测程序,满足6组不同实验或多人实验同时检测的需求。 -参考文献-[1] Haney MS, Pálovics R, Munson CN, et al. APOE4/4 is linked to damaging lipid droplets in Alzheimer's disease microglia. Nature. 2024 628(8006):154-161. doi:10.1038/s41586-024-07185-7[2] Tufan T, Comertpay G, Villani A, et al. Rapid unleashing of macrophage efferocytic capacity via transcriptional pause release. Nature. Published online March 13, 2024. doi:10.1038/s41586-024-07172-y[3] Caroline C. Escoubas, Leah C. Dorman, Phi T, et al.Type-I-interferon-responsive microglia shape cortical development and behavior,Cell, Published:March 14, 2024DOI:https://doi.org/10.1016/j.cell.2024.02.020
  • 多组分时空分析:走进单细胞的“社会”
    p style="text-indent: 2em "1952年,美国细胞生物学家威尔逊曾提出,“一切生命的关键问题都要到细胞中去寻找答案。”纵观近50年来荣获诺贝尔奖生理学或医学奖和化学奖的重大突破,70多个都与细胞生物学密切相关。/pp style="text-align: center text-indent: 2em "img title="20197282317511500.jpg" style="max-height: 100% max-width: 100% " alt="20197282317511500.jpg" src="https://img1.17img.cn/17img/images/201907/uepic/8e8f4b00-dde2-40b2-8c13-4213c687f8ec.jpg"//pp style="text-align: center text-indent: 0em "span id="_baidu_bookmark_start_182" style="line-height: 0px display: none "?/span研究团队进行相关实验/pp style="text-align: center text-indent: 0em "图片来源于网络/pp style="text-indent: 2em "作为研究细胞生命活动规律的科学,细胞生物学在科学家的显微镜下经历了近180年的历史,但细胞对人类来说依然是“黑箱”一般的存在。如今,研究人员正在尽力通过对单个细胞进行研究来阐明细胞的“天性”。/pp style="text-indent: 2em "自2014年起,在国家自然科学基金重大项目“单细胞多组分时空分析”支持下,中国科学家在有关单细胞生物学的重大科学问题上取得了一系列进展。/pp style="text-indent: 2em "span style="color: rgb(255, 0, 0) "strong没有两个细胞是完全相同的/strong/span/pp style="text-indent: 2em "如果把细胞环境比作一个社会,每个细胞就是一个独立的人。/pp style="text-indent: 2em "在对人类社会的研究中,不仅个体的特征和行为值得关注,研究所处环境中个体之间相互协调或对抗作用等关系以及群体所产生的集体行为,也相当重要。细胞研究亦是如此。/pp style="text-indent: 2em "多年来,通过对细胞的研究,科学家已经对生命体的生长发育、遗传变异、认知与行为、进化与适应性等若干生命科学问题有了较为清晰的认识。不过,在清华大学副教授陆跃翔看来,这些还远远不够。/pp style="text-indent: 2em "“在之前的研究中,科学家探索出细胞新陈代谢、生命运动过程中的各种表征方法,如蛋白表达分析、基因转录检测(反转录PCR)等,这些方法更多的是在大样本的细胞中进行观察与测量后,得到一个平均结果。”陆跃翔解释到。/pp style="text-indent: 2em "然而,没有两个细胞是完全相同的。这些平均结果掩盖了细胞之间微小的差异,这些差异可能在某些关键生命过程如细胞分化、肿瘤的发展过程中起着决定性作用。/pp style="text-indent: 2em "为了获取细胞生理状态和过程中更准确、更全面的信息,科研人员将目光瞄准单个细胞。/pp style="text-indent: 2em "“单细胞内部的生命活动,可以被认为是生物活性分子之间复杂的化学反应的结果,正是这些分子的时空分布、结构、功能及其相互作用方式,决定了细胞增殖、分化、凋亡以及重大疾病发生、发展、迁移等过程。”陆跃翔分析道。/pp style="text-indent: 2em "但是想要研究这些生物活性分子形成的精密复杂的相互作用和调控网络并非易事。它不仅要求科学家了解其化学成分,更要理解它们之间相互作用的复杂过程,以及在细胞内部细胞器中特定位置的作用区域和时空变化。/pp style="text-indent: 2em "strong2014年,国家自然科学基金委员会发布重大项目“单细胞多组分时空分析”申请指南,/strong清华大学化学系教授张新荣组织的研究团队的申请获批。他们凝练出strong荧光探针制备与合成、新型时空分辨成像方法以及在细胞内生物分子相互作用/strong研究等关键科学问题。/pp style="text-indent: 2em "“我们希望发展建立适于单细胞中多种生物活性分子时空分辨的荧光分析新方法,驱动生命科学和基础与临床医学研究进步。”谈及科学目标,张新荣如是说。/pp style="text-indent: 2em "span style="color: rgb(255, 0, 0) "strong新技术带你深入了解“社会”/strong/span/pp style="text-indent: 2em "如何实现这一目标?在张新荣看来,这需要从单细胞中多组分分子的时空信息获取方法出发。为此,项目组将其分为“荧光探针制备与合成”“新型时空分辨成像方法”以及“细胞内生物分子相互作用”三大方向进行攻关。/pp style="text-indent: 2em "strong要了解细胞这个独特的“社会”,首先需要的是一台可以钻进细胞内部获取关键分子信息的“放大镜”。因此,荧光探针制备与合成至关重要。/strong/pp style="text-indent: 2em "针对单细胞中极低含量分子检测问题,山东师范大学教授唐波课题组综合运用共轭聚合物信号放大、无光源激发、光谱红移、核酸杂交链式放大等技术,构建了若干超灵敏的分子与纳米荧光探针,实现了细胞及活体中某些活性分子浓度皮摩尔水平的原位、动态检测。/pp style="text-indent: 2em "同时,细胞中生理过程的发生和发展往往不是一类分子的孤立事件,涉及到多种分子的参与。因此课题组还开发了一系列的两组分、三组分和四组分同时检测的荧光探针,并设计了多模态探针来获取更丰富的成像信息。/pp style="text-indent: 2em "“本项目的一个重要特色工作是时任中国科学院上海应用物理研究所研究员樊春海课题组基于框架核酸构建的多组分分析探针和成像方法。”张新荣介绍,框架核酸是一类人工设计的结构核酸,具有尺寸精确、结构精确、修饰精确的特点,通过精确的化学修饰,可以将多种小分子及大分子探针负载到框架核酸上,实现多组分探针的可控构建。/pp style="text-indent: 2em "不过,实现探针在亚细胞区域内对胞内生物活性分子的精确定位和实时检测可并不那么容易。/pp style="text-indent: 2em "“细胞核内分子密度大且背景荧光特别高,导致人们对单分子的观察非常困难。传统光学显微成像分辨率,不足以解析染色体DNA的构造。”陆跃翔告诉记者,尤其在超高空间分辨率的前提下,要实现持续的动态观察,对荧光探针和成像方法都提出了更大的挑战。/pp style="text-indent: 2em "在活细胞超分辨成像方面,北京大学生物动态光学成像中心研究员孙育杰课题组研发了高性能探针Gmars-Q,使其在光照时进入暗态,从而延长成像时长,比已有最好探针的活细胞超分辨成像时间长一个数量级,这种超高分辨成像技术实现了纳米尺度的活细胞核内动态观测。/pp style="text-indent: 2em "“Gmars-Q的独特机制打开了基于蛋白结构和动力学优化荧光蛋白的设计策略。”德国卡尔斯鲁厄理工学院教授Gerd Ulrich Nienhaus曾对此给予高度评价。/pp style="text-indent: 2em "strong在现代分析化学的发展中,大科学装置的应用也越来越受到科学家的重视。/strong/pp style="text-indent: 2em "依托中国科学院高能物理研究所和中国科学院上海应用物理研究所的两台strong同步辐射光源,/strong樊春海课题组和中国科学院高能物理研究所研究员高学云课题组开展了strong同步辐射X射线细胞成像方法/strong的研究。/pp style="text-indent: 2em "实验团队通过搭建X射线全场三维成像平台,合成了一系列X射线成像探针,发展了细胞成像算法,实现了单细胞的X射线三维成像。为了应对单一技术无法在高分辨率下同时实现细胞的结构与功能定位的挑战,课题组又发展了X射线与超分辨荧光联用技术,实现了在纳米分辨下的细胞结构与功能融合成像的突破。/pp style="text-indent: 2em "已有研究发现DNA不仅有序列信息,还有三维结构信息。基于此,北京大学教授、中国科学院外籍院士谢晓亮课题组通过对sgRNA改造,开发了一种全新的活细胞染色质DNA的多色、稳定标记系统,实现对活细胞内基因位点的长时间连续观察追踪。/pp style="text-indent: 2em "2018年,该重大项目迎来一项重磅突破。谢晓亮课题组在《科学》上发表文章,介绍他们在单细胞水平研究双倍体哺乳动物细胞的基因组结构研究方面取得的成果。利用新发展的Dip-C技术,项目组构建了人源双倍体细胞的具有高空间分辨率的单细胞基因组三维结构。/pp style="text-indent: 2em "“这种结构分型对研究细胞功能有着至关重要的作用,也为唐氏综合症等染色体非整倍体疾病提供了研究和干预手段。”谢晓亮说。/pp style="text-indent: 2em "strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "让基础研究走出实验室/span/strong/pp style="text-indent: 2em "对于细胞“社会”的深层解析,不仅为了阐明各种生命现象与本质,科学家更是希望据此对这些现象和规律加以控制和利用,以达到造福人类的目的。在该重大项目支持下,诸多研究展现出了良好的社会应用前景。/pp style="text-indent: 2em "“许多疾病的研究和治疗最终都必须回归细胞水平。”在张新荣看来,一系列单细胞多组分时空分析技术能够有效加深人们对生命现象的本质理解,也有助于了解疾病机理,进而促进生物医药科学和相关产业的发展。/pp style="text-indent: 2em "strong“项目研发的诊疗一体化功能纳米探针,为相关重大疾病成因、诊断提供表征手段和依据,对疾病的早期预警以及提高疾病治愈率有着重要意义。/strong”张新荣讲道,部分创制的探针已经进行了市场转化,基于探针建立的荧光成像技术也成为国家重大新药创制课题中药效评价的关键技术之一。/pp style="text-indent: 2em "例如,唐波课题组研究的“超高灵敏度—可逆探针”能够在活体水平上示踪炎症发生发展过程中超氧阴离子的浓度水平及动态变化过程,缩短了药物临床试验周期,提高了药物筛选效能。为即将进入临床Ⅱ、Ⅲ期的鼻敏胶囊、咳敏胶囊、结肠炎栓3个中药新品种的作用靶点、药效评价研究提供了技术支撑。/pp style="text-indent: 2em "而基于同步辐射装置的X射线细胞显微成像技术,分辨率很容易达到数十纳米,可以在大视场下实现完整细胞的纳米分辨无损成像,与荧光显微装置相比具有巨大优势,在细胞显微成像方面也展现出了巨大的应用前景。/pp style="text-indent: 2em "然而,对于人类来说,走进细胞“社会”是一个任重而道远的过程。还有无数未知的奥秘等着科学家去探索。/pp style="text-indent: 2em "张新荣表示,该重大项目成果为下一步融合多种分析方法、发展全器官跨尺度高灵敏三维成像提供了基础。/pp style="text-indent: 2em "“通过研发同步辐射X射线相衬—电镜融合成像,有可能在全脑三维微米精度地图引导下选取局部特征区域进行纳米精度的结构解析,大幅降低高精度神经网络解析的盲目性。在特定位点,也可利用荧光分子成像和质谱分子解析,进一步作功能研究。”项目组成员表示,在有关“社会”的探索与发现之旅上,中国科学家一直砥砺前行。/p
  • 死细胞染料超低价现货大促销
    Propidium iodide (PI)和7-aminoactinomycin D (7-AAD)是最常用的死细胞指示剂,可用于荧光显微镜、激光共聚焦、流式细胞仪检测等实验方法。为答谢广大客户对联科的支持和厚爱,联科生物特推出原装进口(Life Technologies)的死细胞染料优惠大酬宾,超低价现货供应PI和7-AAD 死细胞染料。PI通过嵌入碱基与DNA结合,对序列几乎没有偏好性,每4-5个碱基对可结合一个染料。PI也能与RNA结合,通过核酸酶处理可区分RNA和DNA染色。一旦PI与核酸结合,其荧光可增强20-30倍,最大激发光为535nm,最大发射光为617nm。PI为膜不通透性,无法透过活细胞膜,可用于鉴定死细胞或复染及细胞周期检测等。图1 人Jurkat T细胞经Alexa Fluor 488 annexin V和PI染色。人Jurkat T细胞经1 μM camptothecin处理,早期的凋亡细胞磷脂酰丝氨酸(PS)外翻,与Alexa Fluor 488 annexin V(绿色)结合,晚期凋亡细胞和坏死细胞可被PI染色(红色)。7-AAD可与DNA结合,该复合物由488 nm激光激发,最大发射光为647 nm。7-AAD可被活细胞排斥,但也可用于固定破膜的细胞。7-AAD可用于细胞周期检测、死细胞鉴定等实验。7-AAD与DNA的GC区选择性地结合,在多线染色体和染色质中产生不同的带型,用于染色体带型研究。图2 人Jurkat T细胞经10 μM camptothecin处理4h(右图)或未处理(左图),用流式细胞仪进行分析。Camptothecin处理的细胞具有更高比例的凋亡细胞(A)。L=活细胞;D=死细胞。名称 货号 规格 目录价(¥) 促销价(¥) Propidium Iodide - FluoroPure Grade P21493 100 mg 2210 1000 7-Aminoactinomycin D (7-AAD) A1310 1 mg 1916 800 阅读原文:http://www.liankebio.com/ProductCenterShow/articleID/2014070008.html
  • 为细胞分析创造新工具——访清华大学林金明教授
    p  strong仪器信息网讯/strong 细胞是生命体最基本的结构和功能单元。对细胞及其代谢物的分析对于疾病诊断、药物筛选、细胞识别、细胞定量、细胞代谢、细胞生理过程和细胞相互作用等研究具有重大意义。然而由于细胞具有尺寸微小(微米级)、内部待测物含量少等特点,想对细胞进行精准操控,进行高灵敏度检测和高通量分析并非易事。/pp  为此,清华大学林金明教授课题组开始采用微流控芯片系统和质谱系统进行细胞共培养和细胞分析的研究,并于2010年开始陆续发表一系列高水平相关论文,先后在国内外重要学术期刊上发表研究论文100多篇,申请国家发明专利20余项,获得授权发明专利10余项。2016年,林金明教授课题组在自主研发的多通道微流控芯片质谱联用接口的基础上,结合岛津先进的质谱检测仪器,与岛津公司合作,开发了新一代细胞微流控芯片-质谱联用细胞分析系统(Cellent CM-MS,Cell Microfluidics-Mass Spectrometry)。/pp  自2017年9月起,清华大学联合岛津中国在北京、广州、上海、成都、沈阳等地陆续举办了七期 “微流控芯片质谱联用细胞分析讲习会”,将微流控芯片质谱联用技术及其在细胞培养、药物筛选领域的最新研究成果展示给高校、研究所及企业的众多专家学者。2019年10月23-26日,在京召开的第十八届北京分析测试学术报告会暨展览会(BCEIA2019)上,这台Cellent CM-MS系统得到隆重展出。林金明教授作为主席,还于BCEIA2019期间组织召开了“微流控与细胞分析论坛”。/pp  strong关于细胞分析的研究热点,CM-MS用于细胞分析的优势及前景,以及林金明教授接下来的研究兴趣点,/strong请看中国分析测试协会与仪器信息网在BCEIA2019期间的联合采访:/pscript src="https://p.bokecc.com/player?vid=4B85E7AF29849DC79C33DC5901307461&siteid=D9180EE599D5BD46&autoStart=false&width=600&height=490&playerid=5B1BAFA93D12E3DE&playertype=2" type="text/javascript"/scriptp  span style="color: rgb(255, 0, 0) "strong分析化学进入“细胞时代” 亟需新技术与新方法/strong/span/pp  古人云,“真金不怕烈火烧”。早在数千年前,人们已经能够使用试金石以鉴定金的成色,通过火烧的方式来识别金和铜,这是早期的元素分析。可以说分析化学最早是从元素这一阶段开始萌芽。/pp  伴随科学技术的不断发展,分析化学的研究对象开始从元素拓展到小分子、中等分子、大分子及超大分子,与之对应的分析方法不断进步,自上世纪60年代起接连诞生了针对小分子分析的GC-MS方法,针对中等分子进行分析的LC-MS方法,以及针对DNA、蛋白质等大分子及超大分子分析的CE-MS方法。但随着细胞研究重要性的日益显现,仅有这些分析方法还远远不够。/pp  林金明教授解释说:“我们知道人体的组织是由分子构成,但分子最终堆积成了一个个有生命特征的细胞。自1665年英国科学家Hooke首次发现细胞,并创立细胞学说以来,细胞的培养方法100年来一直停留在培养皿的状态,给细胞分析与生命研究带来很大的困难,我一直在想怎么改进它。所以就想到了把细胞在培养皿中的培养方式放到微流控芯片上,再结合质谱分析,既有利于细胞的观察,也更方便细胞代谢物质末端的检测。”/pp  span style="color: rgb(255, 0, 0) "strongCM-MS有望成第四代装置 为细胞分析提供新思路/strong/span/pp  据了解,由清华大学与岛津公司共同研发的CM-MS系统由细胞培养基注入系统、细胞培养芯片系统、代谢物富集分离系统和质谱检测系统四部分组成,能够实现多通道芯片细胞培养、显微观察、细胞代谢富集与分离、高灵敏质谱检测等多种功能。该系统还具备多通道芯片与质谱联用、细胞共培养、细胞形态分析三大特点,有望成为目前最有效的细胞研究手段之一。/pp style="text-align: center"img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201911/uepic/3f819246-72ec-4cca-a8d6-edce1fab49e1.jpg" title="微信图片_20191115144254_副本.jpg" alt="微信图片_20191115144254_副本.jpg"//pp style="text-align: center "span style="font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai "新一代细胞微流控芯片-质谱联用系统/span/pp  有数据显示,细胞生物学诞生以来,全球每年有超过100万人使用培养皿进行细胞研究,一个培养皿看着不到一元钱,但计算下来也是一笔庞大的使用与废弃量。相比传统方法,引入微流控芯片能够实现对溶液、溶剂的精准控制,让细胞的变化过程变得动态、实时、自动化可见。未来在封闭的通路中,除了细胞分析外,还可以开展病毒、细菌等相关研究。林金明教授表示:“可以想象,如果微流控芯片方法可以替代目前用了数百年的传统培养皿方法,对产业而言将是多么大的推动,对科学技术而言也将是一个获取大量数据的重要手段。”/pp  眼下,CM-MS的应用领域主要集中在科研、临床、新药开发、环境有毒有害物质与食品营养物质研究等领域。不过林金明教授表示:“随着仪器性能的不断完善,未来将有可能扩展更多的应用领域。我想芯片质谱未来一定会成为继气相色谱质谱、液相色谱质谱、毛细管电泳质谱之后的第四代装置。所以我们非常幸运,能以中国人研究为主导、通过合作研发方式将微流控芯片质谱联用这一技术推向全中国、推向全世界。”/pp  span style="color: rgb(255, 0, 0) "strong不止于质谱 微流控芯片的多种可能/strong/span/pp  林金明教授在采访中提到:“当然分析化学里面最后的物质检测也十分重要。质谱是一款功能强大的装置,采用不同的能量转化、电子转移或者离子结合等技术,能够把不同分子快速、高效地变成离子,在质谱分析器中得以分离和检测,从而实现多组分的定性定量分析,帮助研究者获得更加准确、丰富的研究结果。然而在开展特定组分或已知物质的分析时,微流控芯片也可与光、电等其他检测技术相搭配”。/pp  “例如电化学就是一个非常好的联用技术,它可以集成在芯片通道上,对特定的关键化合物进行传感,探索细胞从生长到凋亡的生命全过程。当然也可以用荧光,引入其他成像技术。如果能把光谱、色谱、质谱、电化学及其他检测手段都集成上去,未来不仅是细胞,微流控芯片在其他物质的分析检测中也将大有用武之地。除细胞分析之外,微流控芯片有望成为其他研究领域的‘共享平台’。”/pp style="text-align: center"img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201911/uepic/152161d1-5e61-4430-99e8-db641d282d1b.jpg" title="微信图片_20191115144246_副本.jpg" alt="微信图片_20191115144246_副本.jpg"//pp style="text-align: center "span style="font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai "林金明教授在展会期间介绍CM-MS最新成果/span/pp  回到林金明教授的研究兴趣点:“纵观人类的成长过程,不论是诞生或死亡,无一不是从单个细胞开始的。所以整体细胞的培养研究固然关键,但单个细胞的分析探索也同样重要。最近我对单细胞分析及其在整体细胞中的关联性研究产生了非常大的兴趣。”/pp  2018年3月,林金明教授课题组在《德国应用化学》发文,揭示了细胞粘附强度与细胞活性之间的关联,并为单细胞质谱、单细胞电泳、单细胞基因检测等提供了一种新的样品提取方法。单细胞的研究工作如今已成为林金明教授课题组的研究重点:“要研究单细胞损伤及修复机制,观察修复后细胞内部基因、蛋白质等组织机构是否发生变化,这涉及到更为精准、细致的分析过程,更需要与仪器达成默契互动。希望CM-MS系统与细胞培养形成良好呼应,而关于单细胞及其对整体细胞影响的研究,我想在这些方面再加把劲。”/p
  • 流式大咖说|FSC与SSC在流式细胞术中的应用——西南医院马清华副研究员
    仪器信息网特别策划话题:#3i流式大咖说#(点击查看),邀请高校、科研院所、临床、生物技术企业等流式技术研发、应用专家分享技术心得和经验,方便生命科学领域研究人员了解相关技术应用进展、学习仪器使用方法。本期,西南医院西南癌症中心流式平台负责人马清华副研究员带我们了解FSC与SSC在流式细胞术中的应用。FSC与SSC在流式细胞术中的应用作者:西南医院 马清华 副研究员流式细胞术利用细胞大小和粒度定义细胞群特征。细胞大小用前向散射光FSC(Forward Scatter)测量,细胞的粒度用侧向散射光SSC(Side Scatter)测量。FSC收集细胞折射后向前散射的光,所以FSC除了测量细胞大小,还与核质比、膜形貌和其他细胞特征相关;SSC收集垂直于激光束的散射光以及细胞内部颗粒的散射光,所以SSC可以反映细胞复杂性和粒度,如下图。1.细胞亚群的分类 FSC和SSC一般以线性模式运行,范围从0到250000。大细胞具有较高的FSC和SSC值,位于FSC/SSC图的右上部分(如粒细胞)。红细胞等小细胞具有较低的FSC值,由于实验中红细胞已被溶解,其碎片出现在散点图左下角;淋巴细胞是小细胞,颗粒不大,因此FSC和SSC值较低。单核细胞更大,颗粒更大,细胞群在FSC轴上进一步向右移动,在SSC轴上向上移动一点,因此它们的FSC和SSC值更高。顾名思义,粒细胞是颗粒状的,也很大,所以它们有很高的FSC和SSC值。2.判定细胞活性状态 FSC/SSC不仅可以对细胞群进行分类,而且有助于排除细胞碎片和死细胞, 用于细胞活性状态的判定。通常死细胞与细胞碎片的FSC和SSC较低,而凋亡细胞的FSC会变小SSC变大。如下图,通过FSC与SSC判断,A图细胞活性差,基本是死亡细胞与凋亡细胞(P1门内为89.6%);B图中细胞群分为两群,P1门中的细胞群为凋亡及死亡细胞(27%),P2门中的细胞活性状态好。FSC/SSC常被应用于判定分选前及检测时的细胞活性状态、分选后细胞的活性状态以及原代细胞提取的活性状态。FSC/SSC是否能够真实的反应细胞死活状态呢,我们用7AAD对B图的细胞进行分析,从下图可以看出P门中有95.2%的7AAD-细胞,而P1门中有52.5%的7AAD-细胞。虽然P1门中有52.5%的7AAD-细胞,但是从图中可以发现其细胞大部分集中于左下角。这与7AAD的染色原理有很大的关系。7AAD 是经典的核酸染料,判断细胞的活性通常依赖于其插入DNA。7AAD不能穿透完整的细胞膜,但可以通过细胞凋亡过程中形成的膜裂口和孔隙。7AAD可以使任何缺乏完整膜的细胞都能被核染色。但是,在严重受损的细胞后期如细胞凋亡的晚期,只有含有核酸的凋亡小体才能够被7AAD染成阳性,其余的细胞碎片没有或含有低的DNA含量,这部分群体将会成为7AAD-群体事件。所以FSC/SSC可以用于判定活死细胞。3.排除细胞双链体FSC与SSC信号脉冲由信号处理器把脉冲信号高度(Height)、面积(Area)和宽度(Width)定量为一定的数值。这些数据有流式细胞仪的配置计算机工作站进一步分析处理。因此,可以通过面积信号、宽度信号、高度信号对双链体的细胞进行处理。一般用FSC-H/FSC-A、FSC-H/FSC-W以及SSC-H/SSC-W处理双链体细胞。 小结 FSC与SSC是流式细胞术的基本术语。科研工作者充分利用好FSC/SSC,能够轻松的判断分选及检测前细胞活性状态、细胞分选后细胞活性状态、免疫细胞分群等,同时还可以利用FSC/SSC去除细胞中的黏连体细胞。【个人简介】西南医院西南癌症中心流式平台负责人 马清华 副研究员现任西南医院西南癌症中心流式平台负责人,主要从事流式细胞平台的运行管理、用户培训以及流式细胞分选及分析工作。目前,承担省部级课题一项,参与多项国家级课题。以第一或通讯作者发表流式细胞术相关SCI论著2篇,参与多篇高分SCI论著的发表,并参编专著 1 部。(本文编辑:刘立东KOL) 相关推荐:流式大咖说|量化成像分析流式在水生生物研究中应用——中国科学院水生生物研究所高级工程师 汪艳流式大咖说|流式检测中最易忽视的时间参数——首都医科大学中心实验室副主任技师 徐晓雪 流式大咖说|技术干货|如何去黏连?流式新手绕不开的数据处理难题 流式大咖说|流式细胞技术平台发展与使用心得分享中科院分子细胞卓越中心 俞珺璟博士【行业征稿】若您有生命科学、医药、临床等行业相关研究、技术、应用、管理经验等愿意以约稿形式共享,欢迎自荐或引荐投稿联系人:刘编辑word图文投稿邮箱:liuld @instrument.com.cn微信:JaysonXY(备注来意:投稿)
  • 亚低温对细胞的影响
    亚低温对细胞的影响亚低温对细胞的影响,无论是动物实验研究,还是临床实践,绝大多数研究都表明28℃~35℃的亚低温具有积极的作用。(一般哺乳类与禽类细胞在体外培养的适宜温度是37~38℃)探讨亚低温对缺氧缺糖星形胶质细胞活力的影响方法:原代培养大鼠大脑皮层星形胶质细胞,设亚低温组(34℃)和常温组(37℃),同时于缺氧缺糖条件下培养,在相应时间点观察细胞形态,并用台盼兰排染法检测细胞存活率,四甲基偶氮唑盐(MTT)比色法检测细胞活力。结果,亚低温组各项指标均优于常温组(P〈0.01)。结论:亚低温对缺氧/缺糖星形胶质细胞具有保护作用。(参考文献)更有其它研究表示,亚低温可保护脑组织,减轻脑外伤后神经功能障碍,改善预后,已普遍应用于临床;亚低温培养可有效保持肝细胞形态和维持肝细胞功能,有望为临床生物人工肝治疗提供一种较好的肝细胞保存和运输方法;亚低温可以通过抑制细胞凋亡,抑制凋亡相关基因的表达等机制发挥对缺氧缺血性脑损伤的保护作用。如今亚低温的研究和应用已经十分广泛和深入,目前研究得比较多的是在脑复苏和脑损伤、心脏手术方面的应用。这些研究进一步加深了人们对于低温保护作用的理解,并为其在临床上的应用带来新的思路。右图为胰岛细胞培养阶段。胰岛细胞分离制备流程:胰腺切取、器官修剪、胰腺灌注、器官消化、组织收集、组织纯化、胰岛收集、细胞培养、胰岛移植WIGGENS能提供采用帕尔贴制冷套件的全尺寸低温型二氧化碳培养箱,从40L-120L-180L-260L-650-850L多种类型可供选择,温度范围20℃~60℃,为您的神经干细胞、肿瘤细胞等提供均匀稳定的亚低温环境,方便多种细胞培养研究!
  • 正常皮肤细胞中存在大量癌症相关突变的启示
    《科学》杂志发表的一项最新研究显示,正常皮肤存在的癌症相关基因突变数量高的惊人。这一研究结果有助于揭示细胞如何癌变的,表明分析正常组织对于理解癌症起源具有重要意义。研究发现,每个正常面部皮肤细胞都携带着数以千计的突变,主要是因暴露于阳光下导致。来自4位无癌志愿者的样本中,大约25%皮肤细胞携带至少一个癌症相关基因突变。对234份活检样本的基因测序发现有3760个突变,每平方厘米皮肤上就有100多个与癌症相关基因突变。带有突变基因的细胞克隆的细胞群,已长到正常增殖细胞群的两倍,不过这些细胞都未出现癌变。桑格研究所彼得坎贝尔博士认为,基因序列分析技术对理解癌症发生,尤其是从正常细胞向癌症细胞转化的过程十分重要,研究发现某些癌症相关突变确实能促进细胞增殖,如果这种细胞基因突变继续发生,将有可能出现真正的癌变过程。但到底需要多少这种突变,目前仍不清楚。研究发现这些光照音符的突变和皮肤鳞状细胞癌相关,但与黑色素瘤关系不大。样本取自4位年龄在55-73岁的志愿者,都接受过手术切除部分影响视力的眼睑皮肤。由于眼睑暴露于阳光下,这是积累了一生的突变。研究人员估计,被阳光直接照射的皮肤细胞平均每天都会在基因组中出现一个新突变。血液样本分析表明,没有癌症的人基因突变数量很低,只有少部分人血液细胞中携带致癌基因突变。由于阳光照射,皮肤细胞更易发生基因突变,预计每个成年人皮肤中都有成千上万个皮肤癌相关基因突变。这项研究还证明,用正常组织能更好地理解癌症发生的源头。启示:首先,基因突变,哪怕是癌症相关基因突变,不是癌症产生的全部条件。从正常皮肤细胞中发现大量癌症相关基因突变,那么在癌症组织中发生的突变也不一定是导致癌症的所有原因。美国目前倡导的精准医疗,正是针对这些癌症相关突变进行精准治疗,那么其效果不仅不能保证,而且显然会有一些错误的目标。既然正常组织中都存在大量癌症相关突变,那么这些突变如果作为精准打击目标,显然是多余的浪费的。也有一种可能,癌症相关突变也许是细胞生存的策略,一直有一种困惑,癌症细胞相关改变和机体应对损伤的自身保护往往使用同样一套工具,例如癌症细胞不容易发生细胞凋亡,而抗凋亡是许多组织避免损伤的最重要方式。因此所谓癌变,可能是一种适应外界环境付出的一种代价。好比心脏功能,如果组织存在血液灌流不足,需要增加血压,血压增加导致心脏负担增大,于是引起心脏肌肉肥厚,促进了心脏的力量,但是这同时导致心脏自身需要更多能量维持,最终无法维持,导致心脏功能衰竭。
  • 清华大学林金明教授:微流控探针诱导化学质膜穿孔用于单细胞蛋白质递送
    将小分子、核酸、蛋白质和药物导入细胞是监测和了解细胞行为以及生物功能的重要途径。然而,质膜是阻止外源分子进入细胞的生物屏障。因此,如何在保持细胞活力的同时高效地将外源分子递送到细胞中是细胞生物学领域的一个重要课题。为了克服现有大规模细胞内递送方法的弱点,例如细胞活性和递送效率不一致,主要基于膜破坏介导机制的微技术已成为一种有前景的解决方案。利用化学质膜穿孔进行单细胞递送的尚未得到广泛研究。2024年4月26日,清华大学化学系林金明教授团队在《ACS Applied Materials & Interfaces》杂志在线发表了题为“Chemical Plasma Membrane Perforation Generated by a Microfluidic Probe for Single-Cell Intracellular Protein Delivery”的工作。该研究使用微流控探针将含有毛地黄皂苷和货物的溶液精确地作用到单细胞上。毛地黄皂苷与质膜中的胆固醇结合诱导质膜穿孔,货物通过孔进入细胞。碘化丙啶 (0.67 kDa) 和 FITC-葡聚糖 (10、40 和 150 kDa) 可以在3分钟内成功引入单细胞,同时保持细胞活力。两种蛋白质(细胞色素C和亲环素A)被递送进入细胞,并观察到它们在细胞中得生理功能。图1. 微流控探针诱导单细胞化学质膜穿孔首先,利用Comsol Multiphysics软件对微流控探针形成的微区域进行数值模拟。使用荧光素(扩散系数=500 μm2 /s)来指示溶质扩散。结果表明,注入的溶液可以被完全吸出,并且溶质被限制在液滴状微区域内而不会扩散。微区内溶质浓度分布均匀。计算了基质上的剪切应力,低剪切应力不会对细胞造成额外的机械损伤。实验在与模拟相同的条件下进行,使用荧光素显示微流控探针产生的微区域,与浓度分布模拟结果一致。溶液的连续流动使微区中毛地黄皂苷和货物的浓度几乎恒定,有利于维持递送过程的连续性和稳定性。图2. 流体的数值模拟通过微流控探针进行碘化丙啶(PI)的细胞内递送来验证该方法的可行性以及优化递送条件。尝试使用 20-100 μg/mL 毛地黄皂苷将 PI 递送至U87细胞。随着毛地黄皂苷浓度的增加,ts(PI开始进入时间)和tm(PI进入速度最大时间)逐渐减少,表明细胞穿孔加速。当毛地黄皂苷浓度为60 μg/mL时,ts约为20 s,1 min内即可观察到清晰的荧光。此外,还尝试了不同的PI浓度进行细胞内递送,较高的PI浓度也使得PI能够更快地进入细胞。还测试了流速对递送结果的影响。注入流量保持2 μL/min,抽出流量在6~14 μL/min之间调整。当抽吸流速大于8 μL/min时,进入细胞的PI量随着流速的增长而显着增加。图3. 毛地黄皂苷浓度、PI浓度和流速对细胞内递送的影响为了证明该方法的效率和通用性,使用该方法将PI递送至U87、HUVEC和A549细胞。当递送时间为20秒时,三种类型的细胞几乎不发出荧光。随着递送时间逐渐增加,细胞的相对荧光强度显着增加,递送处理50 s后观察到强烈的红色荧光。由于洋地黄皂苷的作用,质膜逐渐透化,PI通过质膜上形成的孔继续进入细胞。还检查了该方法递送大分子的能力,使用不同分子量(10、40和150 kDa)的 FITC-葡聚糖作为货物。FITC-葡聚糖可以在3min内进入细胞,并且FITC-葡聚糖进入的量随着递送时间的增加而增加。图4. PI和FITC-葡聚糖递送的结果在验证了这种方法用于单细胞胞内递送的可行性后,作者尝试了细胞内蛋白质递送。Cyt C ( Mw = 13 kDa) 是线粒体中的一种蛋白质,可将电子转移到呼吸链以维持ATP的产生。当cyt C释放到细胞质中时,它会引发细胞凋亡。由于外源cyt C在正常情况下不能进入细胞,利用微流控探针将cyt C递送至A549中作为抗肿瘤药物以诱导细胞凋亡。对照组和仅用毛地黄皂苷或cyt C处理的细胞之间未观察到caspase-3水平和Hoechst 33342染色结果的显着差异。毛地黄皂苷诱导的质膜穿孔不会引起细胞凋亡。仅用cyt C处理的细胞中caspase-3的水平也没有增加,表明正常情况下cyt C不能穿过质膜进入细胞激活凋亡途径。然而,在进行毛地黄皂苷介导的cyt C递送的细胞中,caspase-3水平显著增加,蓝色荧光显著增强。细胞形态发生明显变化,细胞体积缩小,并形成凋亡小体。这些结果表明,递送的cyt C成功诱导细胞凋亡,并且外源蛋白可以通过微流控探针有效地引入细胞内并发挥作用。图5. Cyt C被递送至A549以诱导细胞凋亡为了进一步探索这种方法在细胞研究中的潜力,作者利用它来研究肿瘤耐药性。CypA (M w = 18 kDa) 是一种广泛存在的细胞内蛋白质,可充当抗氧化剂。最近有报道称CypA通过重塑细胞氧化状态介导结直肠癌耐药。BCNU是一种常用的抗肿瘤药物,其诱导细胞毒性的机制之一是谷胱甘肽还原酶的抑制导致ROS的积累。利用微流控探针将CypA递送到U87中,研究CypA对胶质瘤耐药性的影响。与对照组相比,未经CypA递送的细胞经BCNU处理1小时后ROS水平显着升高,并且细胞形态发生改变。对于递送CypA的细胞,ROS含量显着低于未递送细胞,并且细胞保持正常形态。结果表明,递送的CypA在细胞中具有抗氧化作用,这可能增强U87对BCNU的耐药性。抑制CypA表达可能是治疗神经胶质瘤的潜在方法。图6. CypA对胶质瘤耐药性的影响总结作者开发了一种基于开放式微流控探针的方法,以方便高效地实现单细胞递送。该方法通过使用化学试剂对单个细胞进行质膜穿孔,将最大分子量为150 kDa 的外源货物递送到细胞中。与载体介导或场辅助递送方法相比,该方法不需要对货物进行额外处理,无需物理场辅助的温和递送条件也避免了对货物和细胞的额外损伤。作者展示了使用微流控探针进行cyt C和CypA的细胞内递送,证明了该方法能够研究外源蛋白质对细胞生命活动的影响。未来,各种货物(肽、蛋白质、mRNA、DNA、质粒、细胞器等)可以通过这种方法导入细胞内,调节细胞的生理功能和命运。而且该方法不需要昂贵的设备,操作简单,有望成为单细胞递送的一种理想方法。清华大学化学系林金明教授为该论文的通讯作者,清华大学化学系2022级博士生宋扬为本论文的第一作者。该研究受到国家重点研发计划(No.2022YFC3400700)和国家自然科学基金(No.22034005)的支持。关于林金明教授工学博士,分析化学专业。1984年福州大学毕业,1992年在日本昭和大学国际交流基金的资助下前往该大学药学部从事访问研究。1994年获得日本政府奖学金转入东京都立大学攻读博士学位,1997年3月获得工学博士学位,同年留校任教,2000年入选中国科学院“百人计划”,受聘中科院生态环境研究中心研究员、博士生导师;2001年获得国家杰出青年科学基金,2002年3月底回国工作,2004年入选清华大学“百名人才引进计划”,受聘清华大学化学系教授、博士生导师。2008年受聘教育部长江学者特聘教授,2014年入选英国皇家化学会会士。目前主要从事微流控芯片质谱联用细胞分析、化学发光/荧光免疫分析、复杂样品前处理分析、空气负离子检测与健康评估等研究。已培养博士研究生43名(含联合培养,其中留学生2名)、硕士研究生28名、博士后11名(其中留学生3名)、访问学者10名(其中外国访问学者1名)。
  • 赛默飞2015细胞生物学高级成像及定量分析研讨会圆满召开
    pstrong2015年9月1日,上海/strong——科学服务领域的世界领导者赛默飞世尔科技(以下简称:赛默飞)近日于湖南省张家界市圆满召开“2015细胞生物学高级成像及定量分析研讨会”,来自全国各地多家知名研究机构和企业的约70位用户和代理商代表参会。赛默飞多位国外研究人员也专程前往,与国内专家共同分享相关领域的前沿应用与解决方案。/ppbr//pp首先,赛默飞生命科学仪器销售经理刘育林致欢迎词拉开了本次研讨会的序幕。随后来自赛默飞总部的细胞分析产品经理Scott R. Keefer和细胞分析首席科学家 Richik N. Ghosh分别做了关于全新Thermo ScientificsupTM/sup CellinsightsupTM/sup CX7高内涵筛选仪器和高内涵应用的报告。/ppbr//pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201509/uepic/a52c335d-6604-4d65-9525-04a1b080d7ab.jpg" title="Scott.png"//pp style="text-align: center "赛默飞细胞分析产品经理Scott R. Keefer介绍全新高内涵筛选仪器CX7/ppbr//pp赛默飞细胞分析首席科学家 Richik N. Ghosh深入浅出地介绍了赛默飞在高内涵成像分析领域从试剂到仪器到软件的完整解决方案,并着重讲述了在细胞周期/增殖、细胞形态和表型检测、3D光学层析和组织发色团成像四个方面的应用实例。/ppbr//pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201509/uepic/ec2466b1-d789-4f07-b17a-b5476be1f47f.jpg" title="Richik.png"//pp style="text-align: center "赛默飞细胞分析首席科学家 Richik N. Ghosh为与会者介绍完整解决方案/ppbr//pp在这之后,来自中科院上海生化细胞所、诺华、中科院北京基因组所、东北农业大学和医科院苏州系统医学研究所的几位科学家先后分享了他们对赛默飞细胞成像产品的认知和使用心得,并同与会者展开讨论。/ppbr//pp中科院上海生化与细胞所化学生物学技术平台研究人员做了题为“高级成像及定量分析技术在功能基因组研究和靶向性药物筛选中的应用”的报告,介绍了研究团队在仪器使用、文库申领和技术服务方面的概况,并特别提及平台利用Cellomics高内涵筛选仪器在高级成像细胞分析方面已经应用的部分实例,包括蛋白转位分析、细胞周期分类、细胞计数、细胞凋亡和单细胞追踪,对平台的高通量、高内涵和单细胞分析能力赞赏不已。/ppbr//pp来自中科院北京基因组所的科学家为大家介绍了“高内涵在基因型-细胞表型相关性研究中的应用”,并分享了所内研究团队如何运用Cellomics高内涵筛选系统进行基因型和细胞表型的相关性研究。通过Cellomics专利的自动聚焦和集成的智能微孔板扫描方法,大大提高了细胞群体和表型研究的速度和精确度,为实验的成功提供了充分保障。/ppbr//pp医科院苏州系统医学研究所首席科学家的秦晓峰博士结合自己的科研经历,做了题为“新一代流式细胞术及其前沿应用”的报告,畅谈了Attune声波聚焦技术给流式细胞仪带来的革新,其特点是具有更高的灵敏度、精确度和更快的检测速度,因此在抗体标记免洗和全血分析、稀有细胞分析、易碎易结团和大细胞分析以及不规则细胞分析上具有独特的应用效果。/ppbr//pp为进一步帮助用户了解产品优势和特点,以及最新的技术发展,赛默飞生命科学仪器技术支持左洁博士针对性地做了“颠覆性的成像体验-EVOS智能显微成像分析平台”的介绍,详细展示了EVOS系列智能显微镜的革命性优点,并根据实例展示了一些高级功能,比如自动细胞计数、Z-stacking扫描、图像无缝拼接和活细胞动态监测等。赛默飞生命科学试剂技术支持经理冯彦斌博士则通过 “演绎细胞之多彩-荧光染料在成像实验中的应用进展”的报告,为大家带来了荧光成像领导品牌Molecular Probes系列试剂在成像实验中的众多应用。/ppbr//pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201509/uepic/9c8fb7a3-00a2-4bd7-87bf-fcce72aa18bf.jpg" title="会议现场_01.jpg"//pp style="text-align: center "会场上大家踊跃讨论和交流/ppbr//pp与会代表对现场展示的赛默飞系列仪器表现出浓厚兴趣,详细询问了各款仪器的特点,并针对自身需求展开讨论。经过学习、交流和讨论,与会嘉宾和参会人员纷纷表示,他们对赛默飞在细胞成像和定量分析产品上的强大实力有了更深入的了解,认为赛默飞从仪器到试剂的完整解决方案能够为用户带来突出收益,在实现更优效率和生产力的同时,令研究投入最大化,也期待着能够通过赛默飞的细胞成像平台上获得更好的科研成果。/ppbr//ppstrong更多产品信息,请访问:/strong/ppCellinsightsupTM/sup CX7高内涵筛选仪器/ppa href="http://www.thermofisher.com/cn/zh/home/life-science/cell-analysis/cellular-imaging/high-content-screening/high-content-screening-instruments/cellinsight-cx7.html" _src="http://www.thermofisher.com/cn/zh/home/life-science/cell-analysis/cellular-imaging/high-content-screening/high-content-screening-instruments/cellinsight-cx7.html"www.thermofisher.com/cn/zh/home/life-science/cell-analysis/cellular-imaging/high-content-screening/high-content-screening-instruments/cellinsight-cx7.html/a /ppbr//ppEVOS系列智能显微镜/ppa href="http://www.thermofisher.com/cn/zh/home/life-science/cell-analysis/cellular-imaging/cell-imaging-systems.html" _src="http://www.thermofisher.com/cn/zh/home/life-science/cell-analysis/cellular-imaging/cell-imaging-systems.html"www.thermofisher.com/cn/zh/home/life-science/cell-analysis/cellular-imaging/cell-imaging-systems.html/a /ppbr//ppMolecular Probes系列试剂/ppa href="http://www.thermofisher.com/cn/zh/home/brands/molecular-probes.html" _src="http://www.thermofisher.com/cn/zh/home/brands/molecular-probes.html"www.thermofisher.com/cn/zh/home/brands/molecular-probes.html/a /ppbr//pp---------------------------------------------------------/ppstrong关于赛默飞世尔科技/strong/pp赛默飞世尔科技(纽约证交所代码:TMO)是科学服务领域的世界领导者。公司年销售额170亿美 元,在50个国家拥有约50,000名员工。我们的 使命是帮助客户使世界更健康、更清洁、更安全。我们的产品和服务帮助客户加速生命科学领域的研究、解决在分析领域所遇到的复杂问题与挑战,促进医疗诊断发 展、提高实验室生产力。借助于首要品牌Thermo Scientific、Applied Biosystems、Invitrogen、Fisher Scientific和Unity Lab Services,我们将创新技术、便捷采购方案和实验室运营管理的整体解决方案相结合,为客户、股东和员工创造价值。欲了解更多信息,请浏览公司网站:www.thermofisher.com/ppbr//ppstrong赛默飞世尔科技中国/strong/pp赛 默飞世尔科技进入中国发展已有30多年,在中国的总部设于上海,并在北京、广州、香港、台湾、成都、沈阳、西安、南京、武汉、昆明等地设立了分公 司,员工人数约3700名。我们的产品主要包括分析仪器、实验室设备、试剂、耗材和软件等,提供实验室综合解决方案,为各行各业的客户服务。为 了满足中国市场的需求,现有8家工厂分别在上海、北京和苏州运营。我们在全国共设立了6个应用开发中心,将世界级的前沿技术和产品带给国内客户,并提供应 用开发与培训等多项服务;位于上海的中国创新中心结合国内市场的需求和国外先进技术,研发适合中国的技术和产品;我们拥有遍布全国的维修服务网点和特别成 立的中国技术培训团队,在全国有超过2000名专业人员直接为客户提供服务。我们致力于帮助客户使世界更健康、更清洁、更安全。欲了解更多信息,请登录网 站:www.thermofisher.com/p
  • 中科院分子细胞卓越中心陈铭、赵宏伟:高内涵成像分析系统应用心得
    生命科学研究过程离不开各类科学仪器的帮助,仪器信息网特别策划话题:“生命科学技术平台经验分享”,邀请高校、科研院所公共技术平台的老师分享技术心得和经验,方便生命科学领域研究人员了解相关技术进展,学习仪器使用方法。本篇由中国科学院分子细胞科学卓越创新中心化学生物学技术平台陈铭研究员和高级工程师赵宏伟联合供稿,以下为供稿内容:高内涵成像分析系统,通俗来讲就是自动化成像平台和图像定量分析平台的集成,于20世纪90年代中后期推出第一代产品。高内涵成像分析系统的出现得益于自动化技术的进步,也依赖于计算机辅助的图像自动采集和信息提取能力的提升,其鲜明特点就是图像采集速度快、样品检测通量高、数据分析功能强。高内涵主要应用于高通量药物筛选和功能基因组筛选的细胞表型类实验检测,也适用于中低通量的细胞学研究中实验条件的摸索和优化。本文主要从图像高通量采集和图像批量分析两个方面介绍一下应用心得,并简要介绍一下我们在高内涵使用中遇到的一些思考。1. 自动化成像:图像采集要兼顾成像速度和成像质量的平衡作为高通量检测设备,高内涵的成像速度非常快,现在的技术能在5分钟之内完成一整块384孔板的单通道单视野的高质量图像采集。高内涵的成像对象通常是板底透明的微量多孔板,包括1-1536孔板,其中以96孔板和384孔板的使用最为常见。当然,借助于适配器的使用,也可以实现对培养皿和玻片的观察。根据板底材质的不同,分为PS材质多孔板和玻璃底多孔板,其中板底透明的黑色PS材质微孔板使用较广泛。根据板底厚度的不同,板底厚度大于200 μm的属于厚底板,小于等于200 μm的属于薄底板。薄底板多用于高数值孔径物镜的成像,厚底板适配于长工作距离物镜。同时,由于高数值孔径物镜比较宽,容易与多孔板边缘的裙边相撞,导致多孔板最外面的一圈的孔无法成像,现在也有低裙边的多孔板来兼容高数值孔径物镜的整板成像。此外,出于特定的实验目的,还有一些特殊的板型,也可以在高内涵上进行图像采集,比如适用于3D 类器官培养的U型底多孔板,用于研究细胞迁移能力的Transwell孔板等。区别于一般的荧光显微镜,高内涵属于自动化的倒置荧光显微镜,通常搭配自动化的载物台来驱动多孔板的移动。目前通用的载物台是机械载物台和高精度磁悬浮载物台,可以实现连续时间点成像后稳定的视频输出。由于所有的微孔板的板底都无法保证厚度是绝对一样的,因此高质量图像采集的自动化还依赖于精确自动聚焦技术的发展。常用的聚焦方式包括基于激光的硬件聚焦和基于图像的软件聚焦。基于激光的硬件聚焦是通过光源的反射或折射实现的,利用近红外激光探测微孔板的底部界面作为自动聚焦的参照,特点是速度快、重复性高、光毒性低。我们平台目前使用的高内涵设备的聚焦方式为硬件聚焦,包括双峰探测和单峰探测两种板底探测方式。双峰探测的原理是利用激光探测微孔板板底下表面和空气之间的界面得到第一个探测峰,物镜继续向上移动,激光会探测到微孔板板底上表面和溶液之间的界面得到第二个探测峰,对于样品的聚焦就是在第二个探测界面上加上聚焦高度实现的。这种双峰探测方式可以保证同一个荧光通道的图像都是在样品的同一高度上采集得到,聚焦精确,但同时也相对容易受到一些因素的干扰造成聚焦困难,包括微孔板板底的厚度及均一度,以及溶液的性质和体积等。当使用低倍物镜或检测玻片样品时,双峰探测模式不再适用,只能使用单峰探测方式,即在自动聚焦时只能探测到多孔板板底的下表面和空气之间的界面或者玻片和空气之间的界面。单峰探测模式下,自动聚焦的实现是把单峰界面作为聚焦参照,加上板底厚度或玻片厚度作为理论上的第二个界面从而实现样品的自动聚焦。这种单峰探测方式下聚焦更容易些,但共聚焦成像的精确度会降低。需要特别注意的是硬件聚焦对于板底的洁净程度要求较高,多孔板在进行成像前最好用喷过消毒酒精的无尘纸擦拭,而且要保证物镜镜头洁净无尘,避免因为板底和物镜上的灰尘造成聚焦失败。另外有些自动化微孔板成像设备,还配置了软件聚焦模式。软件聚焦是指机器自动在z轴上拍摄一系列图像,根据算法挑选最大对比度的图像作为样品图像,这种软件聚焦模式速度通常较慢,而且容易因细胞碎片或死细胞等原因导致聚焦不精确。作为显微镜,高内涵的成像模式也包括宽场成像和共聚焦成像。高内涵仪器上宽场成像用途比较广泛,但对于一些信噪比很低的实验或者需要观察亚细胞结构的筛选则必须使用共聚焦成像。为了适配检测通量和检测速度,因此高内涵上的共聚焦只能是转盘共聚焦,有效提高了成像速度的同时但也会导致图像分辨率受一定损失。目前主流的高内涵品牌推出的共聚焦,有较低端的LED光源的单转盘共聚焦,也有激光光源的双转盘共聚焦。由于共聚焦排除了非焦平面的杂散光,到达样品的激发光的光子数量的急剧锐减,微透镜双转盘共聚焦能极大地提高到达样品的光子数量,从而达到比较好的成像效果。高内涵的共聚焦通常搭配水镜使用,与空气镜相比,水镜的透光量是空气镜的4倍以上。另外,目前虽然有的高内涵搭配了油镜,但是油镜并不适用于高通量筛选,进行稳定的大规模自动化实验时还是空气镜和水镜更为适用。作为高通量自动化仪器,高内涵通常会搭配机械臂和多孔板堆栈来提高检测通量。考虑到荧光成像样品最好避光保存,降低荧光淬灭或衰减风险,在使用多孔板堆栈时,条件允许的情况下最好能做适当的避光措施以更好地保护样品的荧光信号。在实际科研应用中,有的实验细胞密度较低,有的实验因为药物处理或siRNA处理导致的细胞毒性问题使部分样品孔内细胞比较稀疏,有的类器官成像实验中样品只存在于孔内的部分区域,对于上述这些情况可以考虑使用低倍物镜进行预扫描,对扫描结果进行简单的图像分析确认精确的检测区域,再对目标区域进行高倍物镜下的正常图像采集。这不仅可以节省大量的检测时间,同时也避免了大量冗余数据的产生。2. 细胞图像分析:标准化、多参数、高通量、无偏差高内涵图像采集速度快和检测通量高的直接结果是会产生海量的图像数据,因此,标准的、无偏差的批量图像分析是必不可少的。同一批次的筛选样品,设置一个通用的图像分析方法,可以稳定的用于所有筛选数据的批量分析。高内涵分析软件能够根据细胞图像提取数百到数千个特征参数,用于定义或区分不同细胞表型,也可以输出所有的特征参数用于实验数据的评价。高内涵的图像分析软件可包含三个难度的分析模式:简单的预设方法模式,灵活的模块化组合模式,以及难度最大的个性化分析方法开发模式。预设方法模式对操作新手比较友好,按照实验类型简单修改后套用即可,比如细胞计数、荧光强度分析、细胞增殖分析、细胞凋亡分析、蛋白核质转位分析、蛋白受体内化分析、Spot分析等等。由于面临的实验需求多种多样,在我们平台的实际科研应用中高内涵图像分析通常采用灵活的模块化组合模式,优化调整不同的模块参数使其更加贴合具体的实验需求。基于这种分析模式,细胞的亚群分析、基于图像的纹理分析、细胞周期分析、Spot分析、神经细胞分化分析、单细胞迁移轨迹追踪分析、微核分析、类器官分析、免疫细胞杀伤分析等实验类型,都已获得很好的分析效果。图像分析主要包括以下步骤:图像的处理、图像分割、特征参数的定量和提取、细胞亚群分类和结果输出。图像分析环节特别具有挑战性的步骤就是图像分割,尤其是对于样品质量比较差或者是没有荧光标记的明场图像而言。对于细胞分布不均匀,细胞核拥挤成团的样品的分割,往往要尝试很多分割方法,包括对图像进行锐化或模糊化处理、通道叠加、调整细胞识别方法的荧光阈值或对比度、优化不同切割方法的参数等,从而获得最好的分割效果。对于分割不理想的图像,可以将细胞区域和背景区域分割,对细胞区域进行整体定量。现在随着机器深度学习技术在高内涵图像分析软件中的应用拓展,软件图像分割能力已得到很大提升。当微孔板上孔内细胞表型的异质性比较大的时候,采用整孔平均值这样的参数定义不同处理之间的差异时,往往信号的窗口比较小。为了增大信号窗口,可以考虑采用将细胞群体划分为不同的亚群,针对不同的亚群进行数据分析,或者是计算某个亚群在群体细胞中的占比。对于荧光图像的分析,多数情况下平均荧光强度(即mean-mean值,每个孔内所有像素点的平均荧光强度)可以反映不同孔之间的差异,但当不同处理导致细胞形态发生变化时,总荧光强度的平均值(即sum-mean,每个孔内所有细胞的总荧光强度的平均值)更能反映真实的孔间差异。对于一些荧光强度比较低的样品,阴性样品和阳性样品的信号窗口不够大的时候, 通过扣除背景信号,也可以提高阴性阳性之间的信号窗口。我们常用的背景信号的计算方法有四种:① 通过平均荧光强度和对比度,反推背景荧光强度;②通过纹理分析,找出没有细胞的区域定义为背景区域,定量该背景区域的荧光值为背景荧光强度;③圈选细胞之外的一圈无细胞区域为背景区域,定量该区域的荧光强度;④制备没有荧光标记的细胞孔,该孔的荧光值作为背景荧光。高内涵分析软件虽然能够对细胞图像提取成百上千个生物学参数,但大多数情况下,简单表型只需要其中一个或几个参数就可以进行数据评价,判断药物处理效果和反映趋势。常用的参数包括:荧光强度、荧光总强度、细胞数量、细胞面积、阳性细胞比例、荧光强度比值等。但是有一些复杂的细胞表型,无法用单个或几个参数进行简单区分,这时候结合软件的机器自学习功能/深度学习功能,利用多参数体系对细胞群体进行分类,可能更容易实现不同表型的区分。3. 高内涵系统使用过程中需注意完善的地方总的来说,高内涵细胞成像和图像分析功能都很强大,但是在实际的使用中也面临着一些问题和挑战。首先,高内涵实验产生的数据量非常庞大,高效安全的数据存储管理非常重要。如果由于配套电脑的硬盘容量跟不上实际实验规模的需求,仪器管理员往往会处于频繁的数据备份和硬盘清理工作中。同时也需要有高速稳定的数据信息传输途径,确保采集好的图像能及时传输到分析软件系统,避免发生数据丢失的情况。其次,图像分析对电脑的运算性能要求比较高,特别是有些类型的图像分析方法步骤复杂,定量参数繁多。比如单细胞实时追踪实验,需要对单个细胞的多个连续时间点进行多参数定量统计,最后的结果输出阶段也需要对单个细胞数据进行呈现,因此对电脑的运算能力很有挑战。如果配置的数据分析电脑性能与这类图像分析的需求不太匹配,往往会导致分析速度过慢甚至容易发生宕机现象。最后,对于实心的类器官样品,目前常见的高内涵系统的激光穿透效率和成像分辨率还不足够理想,重构获得的三维图像可以用于获取体积面积等参数,但还不太能对球体深处内部细胞进行高质量分割,也较难获取准确的蛋白定位信息。相信这也是高内涵成像系统在未来发展提升中会逐渐优化解决的一些要点。本文作者:赵宏伟,化学生物学技术平台,高级工程师陈铭,化学生物学技术平台,平台主任,研究员
  • 会议预告|细胞命运决定与人类疾病国际研讨会
    细胞命运决定是生命个体的生死决定,对所有的生命个体都至关重要。神经细胞的过早衰亡导致神经退化性疾病,肿瘤细胞的死亡逃逸奠定了肿瘤的发生发展。研究细胞的生死决定几乎涵盖了所有的重要生命活动和人类重大疾病。珀金埃尔默可提供从无标记到多标细胞组学智能解决方案,以及从2D到3D的飞跃模拟生理微环境方案。更多信息请关注珀金埃尔默市场开发经理张薇的报告。时间:2019年10月13日13:00–13:15地点: 上海交通大学医学院东院懿德楼报告题目: 在细胞表型3.0时代,助您更深入了解细胞命运为进一步凝练科研方向,聚焦国际前沿科学问题,上海交通大学医学院联合上海交通大学医学院联合细胞分化与凋亡教育部重点实验室、癌基因与相关基因国家重点实验室和《NEJM医学前沿》(《新英格兰医学杂志》中文版),于2019年10月11日-14日,在上海交通大学医学院懿德楼召开“细胞命运决定与人类疾病国际研讨会”。本次研讨会将邀请细胞命运决定国际前沿领域(凋亡,自噬,坏死,衰老及肿瘤代谢)国际顶尖的科学家以及研究人员共聚一堂,旨在探讨细胞命运决定的最前沿、最激动人心的科研方向。会议详情请点击链接:http://www.cfdchina.org关于珀金埃尔默:珀金埃尔默致力于为创建更健康的世界而持续创新。我们为诊断、生命科学、食品及应用市场推出独特的解决方案,助力科学家、研究人员和临床医生解决最棘手的科学和医疗难题。凭借深厚的市场了解和技术专长,我们助力客户更早地获得更准确的洞见。在全球,我们拥有12500名专业技术人员,服务于150多个国家,时刻专注于帮助客户打造更健康的家庭,改善人类生活质量。2018年,珀金埃尔默年营收达到约28亿美元,为标准普尔500指数中的一员,纽交所上市代号1-877-PKI-NYSE。了解更多有关珀金埃尔默的信息,请访问www.perkinelmer.com.cn。
  • 药理学家绘制出心肌细胞表观基因组
    近日研究发现,药理学家已经成功地绘制出心肌细胞的表观基因组。他们希望这一发现引起有关先天性心脏病和慢性心力衰竭的新见解。科学家们在《自然通讯》杂志上发表了相关内容。表观基因组是表观遗传机制的总体,表观遗传机制决定细胞中哪些基因是活跃的,哪些基因是不活跃的。内部或环境条件的变化,如营养、压力、或药物,可以留下表观遗传模式。这样的机制在癌症的发展过程中发挥重要作用,但它对心脏病的意义还不太为人所知。中文名称:人粘膜相关上皮趋化因子(MEC/CCL28)ELISA试剂盒价格96t/48t英文名称:Human mucosae associated epithelia chemokine,MEC ELISAkit中文名称:人B细胞活化因子受体(BAFF-R)ELISA试剂盒价格96t/48t英文名称:Human B cell activation factorr from the tumor necrosis factor family 中文名称:人血管内皮细胞生长因子受体3(VEGFR-3/Flt-4)ELISA试剂盒价格96t/48t英文名称:Human Vascuoar endothelial cell growth factor 中文名称:人血管内皮细胞生长因子受体1(VEGFR-1/Flt1)ELISA试剂盒价格96t/48t英文名称:Human Vascuoar endothelial cell growth factor 中文名称:人血管内皮细胞生长因子D(VEGF-D)ELISA试剂盒价格96t/48t英文名称:Human Vascular Endothelial cell Growth Factor D,VEGF-D 中文名称:人血管内皮细胞生长因子C(VEGF-C)ELISA试剂盒价格96t/48t英文名称:Human Vascular Endothelial cell Growth Factor C,VEGF-C 中文名称:人血管内皮细胞生长因子B(VEGF-B)ELISA试剂盒价格96t/48t英文名称:Human Vascular Endothelial cell Growth Factor B,VEGF-B 中文名称:人血管内皮细胞生长因子(VEGF)ELISA试剂盒价格96t/48t英文名称:Human Vascular Endothelial cell Growth Factor,VEGF ELISAkit 中文名称:人血管内皮细胞粘附分子1(VCAM-1/CD106)ELISA试剂盒价格96t/48t英文名称:Human Vascuolar cell adhesion molecule 1,VCAM-1 中文名称:人可溶性肿瘤坏死因子相关凋亡诱导配体(sTRAIL)ELISA试剂盒价格96t/48t英文名称:Human soluble tumor necrosis factor-related apoptosis 中文名称:人肿瘤坏死因子相关凋亡诱导配体4(TRAIL-R4)ELISA试剂盒价格96t/48t英文名称:Human tumor necrosis factor-related apoptosis-中文名称:人肿瘤坏死因子相关凋亡诱导配体3(TRAIL-R3)ELISA试剂盒价格96t/48t英文名称:Human tumor necrosis factor-related apoptosis-中文名称:人肿瘤坏死因子相关凋亡诱导配体1(TRAIL-R1)ELISA试剂盒价格96t/48t英文名称:Human tumor necrosis factor-related apoptosis-中文名称:人肿瘤坏死因子β(TNF-β)ELISA试剂盒价格96t/48t英文名称:Human Tumor necrosis factor β,TNF-β ELISAkit 中文名称:人肿瘤坏死因子α(TNF-α)ELISA试剂盒价格96t/48t英文名称:Human Tumor necrosis factor α,TNF-α ELISAkit 中文名称:人肿瘤坏死因子可溶性受体Ⅱ(TNFsR-Ⅱ)ELISA试剂盒价格96t/48t英文名称:Human Tumor necrosis factor soluble receptor Ⅱ,TNFsR-Ⅱ 中文名称:人肿瘤坏死因子可溶性受体Ⅰ(TNFsR-Ⅰ)ELISA试剂盒价格96t/48t英文名称:Human Tumor necrosis factor soluble receptor Ⅰ,TNFsR-Ⅰ中文名称:人转化生长因子β1(TGF-β1)ELISA试剂盒价格96t/48t英文名称:Human Transforming Growth factor β1,TGF-β1 ELISAkit 中文名称:人转化生长因子α(TGF-α)ELISA试剂盒价格96t/48t英文名称:Human transforming growth factor α,TGF-α ELISAkit中文名称:人基质细胞衍生因子1β(SDF-1β/CXCL12)ELISA试剂盒价格96t/48t英文名称:Human Stromal cell derived factor 1β,SDF-1β 中文名称:人干细胞因子受体(SCFR)ELISA试剂盒价格96t/48t英文名称:Human Stem Cell Factor Receptor,SCFR ELISAkit 中文名称:人干细胞因子/肥大细胞生长因子(SCF/MGF)ELISA试剂盒价格96t/48t英文名称:Human Stem cell factor/mast cell growth 中文名称:人可溶性CD40配体(sCD40L)ELISA试剂盒价格96t/48t英文名称:Human Soluble Cluster of differentiation 40 ligand,sCD40L ELISAkit 中文名称:人可溶性CD30配体(sCD30L)ELISA试剂盒价格96t/48t英文名称:Human Soluble Cluster of differentiation 30 ligand,sCD30L ELISAkit 中文名称:人正常T细胞表达和分泌因子(RANTES/CCL5)ELISA试剂盒价格96t/48t英文名称:Human regulated on activation in normal T-cell 中文名称:人P选择素(P-Selectin/CD62P/GMP140)ELISA试剂盒价格96t/48t英文名称:Human P-Selectin/CD62P/GMP140 ELISAkit 中文名称:人血血小板衍生生长因子AB(PDGF-AB)ELISA试剂盒价格96t/48t英文名称:Human Platelet-Derived Growth Factor AB,PDGF-AB ELISAkit 中文名称:人神经营养因子4(NT-4)ELISA试剂盒价格96t/48t英文名称:Human Neurotrophin 4,NT-4 ELISAkit 中文名称:人的神经生长因子(NGF)ELISA试剂盒价格96t/48t英文名称:Human Nerve growth factor,NGF ELISAkit 心脏在人出生和发育后起着无可替代的作用。它是胚胎发育形成时的第一个器官,并不断用氧气和营养供应着整个身体所需。心肌细胞的细胞核承担着控制基因表达过程中的中央功能。Ralf Gilsbach博士 和Lutz Hein教授领导的研究小组现在已经开发出一种新颖的方法,他们分离心脏组织中不同类型细胞的心肌细胞的细胞核。科学家们应用下一代DNA测序的方法分离创建高分辨率的DNA甲基化图像的细胞核,该细胞核调整基因活性和所有基因的表观遗传标志一样的最重要的表观遗传机制。这使他们确定在出生过程中打开心脏基因程序的表观遗传开关会引起慢性心脏衰竭。目前研究人员想在微小的组织切片活检中进行表观遗传分析,比如在心导管检查中进行分析
  • 从3D类器官到单细胞——珀金埃尔默邀您参加2020中国细胞生物学会年会
    细胞的3D模型培养能够更好地模拟微环境、细胞间相互作用和体内生物过程。相较于生化检测和2D模型,3D模型可提供更具生理相关性的条件。此外,其形态学和功能分化程度更高,这也赋予了它们更接近体内细胞的特征。如今越来越多的研究人员正在应用3D细胞培养、微组织和类器官技术来填补2D细胞培养与体内动物模型之间的差距。 特别是类器官的研究和使用,类器官(Organoid)是源自干细胞的体外衍生3D细胞聚集体,具有类似器官结构和功能。近年来,3D类器官培养技术逐渐成熟,正在成为药物筛选、个性化治疗和发育研究的重要模型。然而,细胞的3D培养技术面临着诸多挑战:首先,培养一致的、可再现的3D 微组织十分困难,尤其是类器官的培养;此外,大而厚的细胞样品成像难度极高;同时,处理3D细胞实验产生的海量数据则是最为严峻的挑战。针对3D微组织样品,使用传统的冰冻切片染色成像或直接使用共聚焦显微镜进行成像都有很多挑战:冰冻切片成像无法获得立体样品的全部信息,特别是Z轴的细胞位置信息;共聚焦显微镜有较高的光毒性和光漂白,不能对立体样品反复多层的成像,成像的层数有很大限制;此外,这两种拍摄方法获取的大量图片还需借助其他分析软件对其数据进行分析和统计,分析通量很低;最重要的是,这两种方法扫描速度都很慢,通量很低,一个3D微组织的扫描分析时间长达几个小时,极大的限制了3D微组织研究的开展。高内涵细胞成像能够在保持细胞结构和功能完整性的前提下,对细胞和亚细胞层次进行多通道、多靶点的荧光全面扫描,检测细胞形态、生长、分化、迁移、凋亡、代谢途径及信号转导等各个环节,在单一实验中获取大量相关信息。在细胞凋亡、细胞周期、细胞毒作用、受体蛋白转位、蛋白相互作用等方面都有很好的应用,被证明是细胞生物学,癌症研究,病原生物学,药物研发,系统生物学,心血管疾病研究,干细胞研究,神经细胞研究等领域的重要研究工具。PerkinElmer公司提供的高内涵细胞成像分析系统,它采用Nipkow转盘扫描技术配以高灵敏度sCMOS探测器,能够快速捕捉到细胞内发生的生物学过程,更因其降低光漂白和光毒性的特点,配合水浸式高数值孔径物镜,可以实现对活细胞、小型模式生物和3D微组织样品进行高通量的共聚焦高分辨率成像。再结合强大的Harmony分析软件,能够对细胞和亚细胞层面各种复杂的表型进行群体性统计分析研究。该系统在细胞生物学研究领域有着非常广泛的应用。PerkinElmer高内涵系统的3D方案不仅仅局限于3D微组织,包括模式生物、细胞伪足等立体结构都可以通过高内涵系统完成全面的检测和分析: 珀金埃尔默的单细胞ICP-MS技术,基于业界最快的的细胞脉冲信号读取速度(可达100000点每秒),能定量单个细胞中低至阿克级别的金属和纳米颗粒含量,测定细胞群中金属质量分布和含金属细胞的数量,从而评估与量化细胞群的异质程度。适用于人体、动物、植物等各种组织器官细胞的深入研究。例如,含金属药物和纳米颗粒越来越广泛的应用于癌症的治疗和检测,单细胞ICP-MS可进行精细跟踪,掌握病变组织在细胞层面上对药物的吸收和代谢,有助于了解癌症机理和提升治疗水平。两株卵巢癌细胞系A2780( 顺铂敏感型)和A2780/CP70 (顺铂耐药型)随时间变化顺铂摄入量 生物体中的铜含量通过非常有效而复杂的稳态机制得以严格调控,该机制可控制元素的吸收、分布和排出。目前数据得到的细胞铜稳态模型只是一个“骨架” ,用SC-ICP-MS来测量外周血单核细胞(PBMC)中的铜(Cu)含量,对了解稳态机制的失调或失衡可能导致生物体功能异常,并可能与某些疾病(例如炎症、哮喘、衰老过程、癌症等)方面提供了进一步研究的有效手段。外周血单核细胞(PBMC)中铜的含量应用领域举例:3D微组织类器官目前的应用主要集中在肿瘤研究(药筛模型、药筛、肿瘤免疫、个体化医疗)、干细胞和发育生物学、体外模型研究(感染模型、毒性评价)、材料及给药研究等方面:肿瘤研究2019年6月17日,Cell Death and Disease杂志在线发表了钱其军研究组的研究成果Modified CAR T cells targeting membrane proximal epitope of mesothelin enhances the antitumor function against large solid tumor。该工作致力于优化肿瘤CAR T免疫疗法。MSLN(Mesothelin,间皮素)是嵌合抗原受体(CAR)T治疗的诱人抗原,MSLN中的表位选择至关重要。在这项研究中,作者使用修饰的piggyBac转座子构建了两种针对MSLN的I区(meso1 CAR,也称为膜远端区域)或MSLN的III区(meso3 CAR,也称为膜近端区域)的两种类型的CAR系统。其中,meso3 CAR T细胞在激活后表达更高水平的CD107α,并在体外针对表达多种MSLN的癌细胞产生更高水平的白介素2,TNF-α和IFN-γ。之后,作者构建了胃癌和卵巢癌3D肿瘤细胞模型,并用该模型来测试这两种CAR T系统,通过PerkinElmer Opera Phenix高内涵系统完成3D肿瘤 CART杀伤系统的成像和分析,最终证明在3D细胞水平,meso3 CAR T细胞比meso1 CAR T细胞具有更高的杀伤作用。后续的研究中,作者借助PerkinElmer Xenogen IVIS成像系统,在胃癌NSG小鼠模型中进一步进行验证,同样证明与meso1 CAR T细胞相比,meso3 CAR T细胞介导的抗肿瘤反应更强。我们进一步确定meso3 CAR T细胞可以有效地抑制体内大卵巢肿瘤的生长。总体而言,本研究证明meso3 CAR T细胞疗法在治疗MSLN阳性实体瘤方面比meso1 CAR T细胞疗法具有更好的免疫疗法,为实体瘤的免疫治疗提供了新的有效的CAR T疗法。干细胞与发育生物学2018年11月,英国的格拉斯哥大学癌症科学研究所在Nature Communication杂志发表了名为《The Phospholipid PI(3,4)P 2 Is an Apical Identity Determinant》的文章,本文主要以MDCK囊肿为模型,研究了上皮细胞的极化机制,最终发现PI(3,4)P2磷脂酶是决定上皮细胞极化发生的重要分子,并阐明了其调控机制。在本文中,作者首先发现磷酸酯修饰酶PI(3,4)P2的分布在上皮细胞极化的过程中是至关重要的,接下来,他们用PI(3,4)P2的分布作为表型,筛选哪些蛋白的敲除影响其分布。该过程是通过PerkinElmer的Opera Phenix高内涵系统来实现的,作者先通过高内涵系统的预扫描成像功能对微球进行智能的层切式扫描,选取横截面最大的那一层,然后把细胞分区域,分细胞核、细胞质、内侧、外侧和细胞连接处等等,然后计算每个区域的荧光强度。作者使用此方法去分析一些突变过的微球的磷脂酶分布,发现一些重要的上游蛋白(如PIP蛋白)被敲掉后,会发生显著的定位变化。除此以外,作者还利用高内涵系统分析了微球的空腔表型,MDCK囊肿包含多少个空腔直接反映了其功能是否正常,只有极化正常发生的囊肿才能有正常的空腔。同样的,作者使用高内涵预扫描成像功能对所有球做了层切式扫描,选取有空腔的这些层,把它们压到一起,然后通过算法选出空腔,分析其数量。作者也用该方法做了一系列基因的筛选,筛选到几个显著影响空腔形成的基因,并在后续阐明了其调控机制。 体外模型研究——肝损伤模型2018年,王韫芳课题组在新刊Advanced Biosystems杂志上发表封面文章,研究展示一种新型的药物性肝损伤研究模型——LBS微肝球模型(Liver biomatrices scaffolds, LBSs)。该模型在HepaRG细胞的基础上引入天然脱细胞肝脏支架,可进行肝细胞的长期3D培养。在LBS提供的肝组织特异微环境下,新模型具有更高的生理相关性和毒理预测敏感度。作者使用PerkinElmer Operetta CLS 高内涵筛选系统,深入评估了8种抗抑郁药物的肝毒性。结合特定的染料组合,从细胞活力、凋亡、胆汁蓄积、脂肪变、氧化应激和线粒体毒性6个方面检测药物处理对微肝球模型的影响。其中的许多参数都使用了复杂的高内涵分析方法。结果证明LBS微肝球模型能高度特异预测药物肝毒性和协助进一步的毒理机制研究。本研究还用到了PerkinElmer的Engisht多功能成像酶标仪,研究利用Alamar blue法追踪不同培养条件下细胞活力的变化。PerkinElmer提供的分子及细胞水平检测方案贯穿本论文药物肝毒性研究的整个过程。从微肝球模型的细胞增殖、酶活分析,再到3D模型的功能验证和毒理学多指标分析,PerkinElmer均能提供针对性的应用方案。材料及给药研究2019年6月,爱尔兰都柏林大学学院生物与环境科学学院&康威研究所在Small杂志发表名为《A High‐Throughput Automated Confocal Microscopy Platform for Quantitative Phenotyping of Nanoparticle Uptake and Transport in Spheroids》的文章。该研究利用PerkinElmer高内涵Opera Phenix系统,构建了完整的在3D微组织层面研究纳米载体摄取和运输的模型。作者首先进行3D微组织培养和高内涵拍摄的优化,主要研究了培养条件和固定方法对不同浓度的基质胶的影响,并根据该实验结果确定了培养方法、固定方法和基质胶浓度及用量。此外,作者也通过顺式到反式高尔基标记物(GM130、GalT和TGN46)的分布染色考察了高内涵的拍摄质量,证明PerkinElmer高内涵系统确实有极高的分辨率,用来研究纳米颗粒的摄取情况是足够的。接下来,作者通过Harmony软件对层切扫描图片进行重构分析,获取最大亮度投影和3D重构视图,在此基础上定量测量球状体中NP吸收和渗透。最后,作者选择了在纳米颗粒胞吞作用中有功能的蛋白,通过RNAi沉默进行潜在基因筛选,确定该模型可用于评估3D微球NP的摄取和运输过程。 更多详细内容,欢迎您莅临8月4日在中国细胞生物学学会2020年全国学术大会上举办的午餐会,干货报告、午餐礼遇、惊喜礼品等您来参与。点击下方链接完成签到,即可在会议期间至珀金埃尔默展台(T3)领取精美礼品一份。http://suo.im/6tarYZ
  • 连发3篇hiPSC文章,单细胞可视化培养系统颠覆传统,分离效率高达100%!
    人类诱导多能干细胞 (hiPSC) 是通过基因编辑技术(如 CRISPR-Cas9)对已经高度分化的人体细胞进行重新逆分化得到的多能干细胞。传统的hiPSC细胞系构建与培养过程操作复杂、耗材昂贵且费时费力。特别是对于异质编辑细胞池中构建的克隆hiPSC系的培养,受到了传统细胞培养方法的桎梏,很难构建一个高效的hiPSC构建与培养工作流程。此外,现有的单细胞分离和培养方法通常对细胞的处理条件要求苛刻,操作步骤繁琐,无法充分保证单克隆性。为应对hiPSC细胞系构建与培养过程中的诸多挑战,iotaSicences公司采用了以GRID技术为核心的高度自动化的单细胞可视化培养系统isoCell,构建了用于 hiPSC细胞系培养的平台。该平台采用全自动化流程,操作条件温和,对单细胞无损伤,具有高通量、自动化、高成活率等优势,可确保分选出的细胞100%为单细胞。柏林医学大学多能干细胞和类器官研究中心的Harald Stachelscheid团队使用isoCell在Stem Cell Research期刊上发表了三篇构建不同功能的hiPSC细胞系的科研应用文章,展示了isoCell在hiPSC细胞系构建和培养方面的优势。图1 单细胞可视化培养系统isoCell实物图 1. 以isoCell为核心的hiPSC细胞培养平台isoCell系统组成的细胞培养平台是基于GRID技术的高度自动化的实验平台。GRID是指在细胞培养基上采用FC40液体分隔出的网格小室,体积小(耗材少),光学透明度高,可以容纳细胞在内生长,且各个小室之间物质不流通。isoCell系统配备了荧光和成像系统,用于在整个克隆工作流程中记录 GRID 小室的图像(见下图)。图2 GRID实物图 isoCell 可自动执行所有液体处理步骤,包括构建 GRID、将单细胞注射到GRID小室中以及交换培养基和收获单克隆集落,在整个工作流程中自动检测每一个 GRID 小室,并确保每一个单克隆hiPSC细胞系来源于单个细胞。图3 isoCell操作流程图 2. 生成具有 SLC16A2:G401R 或 SLC16A2 敲除的 iPSC系X染色体相关的AHDS综合征的发病特点是由编码甲状腺激素转运蛋白MCT8(单羧酸转运蛋白8)的SLC16A2基因突变引起精神运动发育严重受损。该团队使用CRISPR/Cas9技术(靶向 SLC16A2 的外显子3)将AHDS患者错义变体G401R和新型敲除缺失变体 (F400Sfs*17) 引入男性健康供体的hiPSC系(BIHi001-B)。通过isoCell培育成功地获得了SLC16A2基因敲除的hiPSC单克隆细胞系(BIHi001-B-7)和(BIHi001-B-8),并证明了这些新细胞系在模拟 MCT8 缺陷对人类神经发育的影响方面的实用性。文章以Generation of iPSC lines with SLC16A2:G401R or SLC16A2 knock out为题发表于Stem Cell Research期刊上。图4 WB验证SLC16A2 敲除的hiPSC系无法表达SLC16A2蛋白 3. 生成 THRB-GS(E125G_G126S) 和 THRB-KO 人类 iPSC 系以研究非典型甲状腺激素信号传导THRB是一种依赖甲状腺激素 (TH) 结合来调节基因表达的核受体。相同的受体也可以介导细胞质中信号通路的激活。目前尚无法区分这两种机制中的哪一种是造成 TH 生理效应的原因。该团队结合基因编辑与isoCell的单细胞培养基技术,成功建立了一种在 THRB DNA 结合域中具有两个突变 (E125G_G126S) 的hiPSC 细胞系(BIHi001-B-2/3),该突变消除了THRB的核受体作用,因此可以用该细胞系专门研究THRB的信号通路激活作用。该团队还生成了 THRB 敲除细胞系(BIHi001-B-6)以消除所有 THRB 效应。通过比较WT结果和这两种细胞系,将甲状腺激素的影响归因于潜在的机制。文章以Generation of THRB-GS(E125G_G126S) and THRB-KO human iPSC lines to study noncanonical thyroid hormone signalling为题发表于2024年2月的Stem Cell Research期刊上。图5 基因测序验证BIHi001-B-2/3和BIHi001-B-6细胞系敲除或突变了对应基因 4. 使用 CRISPR-Cas9 生成了两个 BAX/BAK 双敲除人类诱导多能干细胞系 (iPSC)脑缺血损伤很多是由于脑缺血状态下细胞凋亡导致的。Bcl-2基因相关的X 蛋白 (BAX) 和BCL2 拮抗因子(BAK)是 BCL2 家族的两个促凋亡因子,BAX 和BAK是线粒体凋亡的执行基因,与细胞凋亡密切相关。该团队使用 CRISPR-Cas9技术构建了两个 BAX/BAK 双敲除人类诱导多能干细胞BIHi005-A-17和BIHi250-A-1,并通过isoCell培养获得了对应的hiPSC单克隆细胞系。所得细胞系核型正常,具有典型的形态并表达未分化状态的典型标记,并通过基因技术验证了细胞系已敲除BAK基因。在后续的研究中,研究人员就可以将该BAX/BAK 双敲除的hiPSC细胞系广泛应用于脑缺血等细胞凋亡相关领域的发病机制与治疗干预机制研究中。文章以Generation of two human induced pluripotent stem cell lines with BAX and BAK1 double knock-out using CRISPR/Cas9为题发表于2024年4月的Stem Cell Research期刊上。图6 通过基因测序及WB验证BIHi005-A-17和BIHi250-A-1以敲除BAK与BAX基因 5. 结论以isoCell构建的hiPSC细胞培养平台可以对hiPSC细胞进行全自动化且温和地单细胞培养。通过isoCell特有的GRID小室网格技术与可视化分选相结合,可以确保每一个单克隆hiPSC细胞系均来自单个细胞,且节省培养耗材。isoCell的培养条件温和,在以上案例中协助科研人员构建了多个基因改造hiPSC单克隆细胞系,成活率高。 单细胞可视化培养系统isoCell的优势:✔ 全自动化流程✔ 操作条件温和,对单细胞无损伤✔ 全培养、分析流程可追踪✔ 单细胞率高达100%✔ 单克隆细胞系构建成活率高✔ 结构紧凑,体积小,节省耗材单细胞可视化分选培养系统-isoCell已在Cell、Advanced Science、Small Methods、Nature Communications等知名期刊发表多篇文章,如下摘引了近年三篇具有代表性的文献和大家分享。Soitu C, Stovall‐Kurtz N, Deroy C, et al. Jet‐Printing Microfluidic Devices on Demand[J]. Advanced Science, 2020, 7(23): 2001854.Gangoso E, Southgate B, Bradley L, et al. Glioblastomas acquire myeloid-affiliated transcriptional programs via epigenetic immunoediting to elicit immune evasion[J]. Cell, 2021, 184(9): 2454-2470. e26.Deroy C, Nebuloni F, Cook P R, et al. Microfluidics on Standard Petri Dishes for Bioscientists[J]. Small Methods, 2021, 5(11): 2100724.Deroy C, Wheeler J H R, Rumianek A N, et al. Reconfigurable microfluidic circuits for isolating and retrieving cells of interest[J]. ACS Applied Materials & Interfaces, 2022, 14(22): 25209-25219.Oliveira N M, Wheeler J H R, Deroy C, et al. Suicidal chemotaxis in bacteria[J]. Nature Communications, 2022, 13(1): 7608.样机体验:为更好地服务中国科研工作者,Quantum Design 中国也建立了样机演示实验室,将为大家提供为专业的售前、销售、售后技术支持,欢迎各位老师通过拨打电话010-85120280、发送邮件info@qd-china.com、点击此处或扫描下方二维码参观试用!扫描上方二维码/点击此处,即刻咨询/体验! 用户名单用户评价路易莎埃姆斯,研究科学家:The Native Antigen Company(LGC 临床诊断集团旗下公司)“使用 isoCell 进行单细胞克隆工作从一开始就简单可靠,并且已无缝地融入我们的流程中。 该程序对细胞很温和,我们看到非常好的存活率,可以筛选大量克隆。 我们收到的客户服务是优质的。”相关产品1、单细胞可视化分选培养系统—isoCellhttps://www.instrument.com.cn/netshow/SH100980/C551413.htm
  • Cell | 小胶质细胞“互帮互助”拯救帕金森病
    帕金森病(Parkinson’s disease,PD) 和路易体痴呆(dementia with Lewy bodies,DLB)等几种疾病都存在路易体(LB),路易体富含聚集形式的α-突触核蛋白(α-synuclein,α-syn)。α-syn是一种没有明确结构的14kDa蛋白质,主要在神经元中产生,在病理情况下,蛋白质的单体形式逐渐形成寡聚体结构以及不溶性纤维状组装体,以LB的形式累积在细胞内。α-syn的过度表达或突变导致黑质中多巴胺能神经元进行性缺陷和丧失。最近有研究表明α-syn病变可以通过细胞间传播,从而导致疾病进展。胞吐、内吞,摄取携带α-syn或者直接穿透细胞膜是细胞与细胞间传播的可能原因。α-syn的清除率降低伴随蛋白质累积则为治疗相关疾病提供了可能途径。α-syn的有效去除同时可能受到小胶质细胞识别和清除的限制。小胶质细胞是存在于大脑中的主要固有免疫细胞,通过感知周围环境变化、清除细胞碎片和提供神经营养因子,在介导大脑稳态方面发挥至关重要的作用。有证据表明激活的小胶质细胞聚集在α-syn累积部位,但是小胶质细胞中α-syn清除的细胞机制尚不清楚。近日,德国Bonn大学Michael T. Heneka团队在Cell上发表题为Microglia jointly degrade fibrillar alphα-synuclein cargo by distribution through tunneling nanotubes 的文章。本文发现小胶质细胞中α-syn以及线粒体可以通过细胞间膜突起进行传递和降解。作者首先用重组人α-syn纤维处理小胶质细胞,5-15分钟后,作者检测细胞内α-syn单体和纤维状α-syn丰度。分析发现约90%的细胞在五分钟后吞噬α-syn蛋白,15分钟后约98%的细胞吞噬有α-syn纤维,但是单体的吞噬则明显较慢也较少。α-syn的摄取受到吞噬作用抑制剂cytochalasin D的阻碍,表明小胶质细胞具有吞噬α-syn的作用。通过转录组分析发现α-syn的吞噬导致炎症以及凋亡相关通路得到富集。作者还发现了α-syn处理的细胞会导致细胞中对未折叠蛋白反应的相关基因表达上调。于是作者接下来分析小胶质细胞的吸收或者降解功能是否受损。作者首先将小胶质细胞吸收α-syn蛋白15分钟后,再在无α-syn培养基中培养24小时。检测发现约40-50%的α-syn仍未降解。小胶质细胞成像发现小胶质细胞形成一个由F-actin组成的网络装的膜突起结构,膜突起中含有α-syn蛋白,膜突起会与相邻细胞的膜突起相接触。延时成像发现大型α-syn聚合蛋白可以在40-60分钟内传递到另一个细胞中,而较小的α-syn聚合体可以通过更长更薄的膜突起,在3分钟内完成。并且作者发现α-syn优先转移到不含α-syn的细胞,而α-syn可以诱导小胶质细胞间突触的形成。GO分析显示α-syn会诱导Rho信号转导上调。已有研究报道Rho激酶ROCK是细胞骨架的关键调节蛋白。使用ROCK选择性抑制剂Y-27632可以显著促进α-syn从含量高的细胞转移到不含α-syn的细胞中。使用选择性肌球蛋白II抑制剂Blebbistatin也明显增加了α-syn转移率。而CytD抑制F-肌动蛋白周转则损害了α-syn转移。为了探究α-syn转移转移的影响,作者分析了不同时间点细胞转录组变化。在将含有α-syn的小胶质细胞与不含α-syn的小胶质细胞共培养前后,含有α-syn的细胞炎症反应和凋亡通路富集水平下降,细胞与细胞之间粘附通路先上调后下降。而接受α-syn的小胶质细胞转录组无明显变化。进一步分析细胞的变化发现小胶质细胞在转移α-syn的时候,同时也会转移功能完整的线粒体,转移了α-syn之后的细胞导致细胞中ROS的产生减少,可以减少含有α-syn细胞的细胞毒性,降低细胞死亡率。然而携带有LRRK2 G2019S突变的小胶质细胞无法拯救邻近含有α-syn的细胞。研究发现LRRK2 G2019S突变会导致线粒体功能受损,是最常见的导致帕金森病的基因突变。本研究表明小胶质细胞LRRK2突变导致α-syn降解失调可能是一种家族性帕金森的致病机制。最后作者在器官切片培养系统中也验证了以上在小胶质细胞中的发现。作者也利用病人脑组织样本以及病人PBMC分化而来的巨噬/小胶质样细胞进行验证试验。作者发现与健康组对比,病人来源的细胞中α-syn的转移率显著降低,细胞中ROS的产生也明显增加。本研究发现了路易体α-syn聚集和累积的新机制,阐明了小胶质细胞中α-syn以及线粒体通过细胞间膜突起进行传递和降解。LRRK2的突变导致小胶质细胞间传递和降解α-syn功能受损。未来还需研究小胶质细胞和神经元之间是否存在类似的机制。原文链接:https://doi.org/10.1016/j.cell.2021.09.007
  • 我国科学家揭示细胞程序性坏死及免疫稳态调控新机制
    近日,中国科学院上海营养与健康研究所研究员章海兵团队在Cell Death and Differentiation上在线发表题为Caspase-8 auto-cleavage regulates programmed cell death and collaborates with RIPK3/MLKL to prevent lymphopenia的研究成果。该研究揭示了细胞凋亡起始蛋白caspase-8的自我剪切抑制细胞程序性坏死并协同坏死关键蛋白RIPK3/MLKL抑制淋巴细胞减少的免疫缺陷性疾病的发生。   细胞程序性坏死(Necroptosis)是一种由激酶RIPK1/RIPK3的级联磷酸化调控的促炎细胞死亡形式。细胞程序性坏死通过MLKL蛋白聚合在膜上打孔裂解细胞膜,执行细胞死亡并释放损伤相关分子模式(DAMPs)触发炎症反应。已知细胞程序性坏死参与调控系统性炎症反应综合征(SIRS)、系统性红斑狼疮及自身免疫性的淋巴增生综合征(ALPS)等多种疾病。因此,对于细胞程序性坏死机制及其生物学意义的研究对于相关疾病的防治具有重要意义。  Caspase-8是天冬氨酸特异的半胱氨酸蛋白酶,最初被鉴定为细胞凋亡途径的起始蛋白。近几年的研究表明,caspase-8通过剪切RIPK1来抑制细胞程序性坏死。除此之外,caspase-8还参与细胞免疫稳态调控。临床上Caspase-8基因突变的病人会出现免疫缺陷疾病,并伴有免疫系统紊乱,表现为多器官的免疫细胞浸润并出现肉芽肿。研究发现Caspase-8通过其催化活性发挥功能,并且caspase-8的完全激活需要进行自我剪切。因此,探究caspase-8的自我剪切在调控免疫稳态中的作用机制,对于深入了解caspase-8的作用机制及相关临床疾病的治疗具有重要意义。  该研究中,研究人员首先发现在细胞程序性坏死刺激条件下,caspase-8的自我剪切出现诱导性增强,因此推断caspase-8的自我剪切可能参与程序性坏死的调控。通过构建caspase-8自我剪切突变小鼠(Casp8ΔE385/ΔE385)发现,该小鼠可以抵抗细胞凋亡诱导的急性肝损伤,但高度敏感于程序性坏死诱导的全身炎症反应综合征(SIRS),该结果在动物水平证明caspase-8自我剪切可以促进细胞凋亡并抑制程序性坏死。同时,研究人员进一步通过分离原代细胞实验证明caspase-8自我剪切负调控死亡复合体II的形成和稳定,从而抑制细胞程序性坏死的发生。此外,研究人员发现Casp8ΔE385/ΔE385小鼠患有轻微的脾脏肿大及CD8+T淋巴细胞减少性疾病(T cell lymphopenia)。在Casp8ΔE385/ΔE385小鼠中同时敲除坏死关键蛋白RIPK3/MLKL时,Casp8ΔE385/ΔE385Ripk3-/-和Casp8ΔE385/ΔE385Mlkl-/-小鼠出现更为严重的脾脏肿大及淋巴结肿大,其脾脏、淋巴结、外周血以及骨髓中的B细胞和T细胞及其各亚群均出现明显减少,鉴定为淋巴细胞减少的免疫缺陷性疾病(lymphopenia)。研究人员通过减少Casp8ΔE385/ΔE385Ripk3-/-和Casp8ΔE385/ΔE385Mlkl-/-小鼠中另一坏死调控蛋白RIPK1的表达剂量可以逆转上述表型,证明RIPK1在调控淋巴细胞减少疾病中的剂量调控效应。  该研究发现caspase-8通过自我剪切破坏死亡复合体II的稳定性,进而抑制细胞程序性坏死的发生。同时证明了caspase-8通过自我剪切协同坏死调控蛋白RIPK1/RIPK3/MLKL抑制淋巴细胞减少的免疫缺陷性疾病的发生,为免疫系统稳态调控的研究及淋巴细胞减少为特征的免疫缺陷性疾病的治疗提供新思路。  论文链接
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