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临床基因检测

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临床基因检测相关的资讯

  • 基因检测在临床领域的应用整理
    基因检测有什么用途?大体上可以概况为以下五类:1)辅助临床诊断:很多疾病表现出来的症状类似,临床上很难进行鉴别诊断,容易混淆。若是通过基因检测,在基因层面找到致病原因,可以辅助临床医生鉴别诊断甚至纠正临床上的诊断。2)指导治疗:治疗的效果与很多因素相关,排查外在的原因,人与人之间治疗的差异主要受遗传因素的影响。通过基因检测可以帮助实现个体化治疗,提高疗效,减少不良反应的发生。3)携带者筛查:最常见的是唐氏综合征的筛查。此外,针对具有某些单基因遗传病(尤其是隐性遗传病)家族史的高危人群进行相关致病基因的筛查,可以及时发现该家族中致病基因的携带情况,进而分析后代患病的风险,为家属成员提供有效的遗传信息,防止缺陷基因向下一代遗传。4)指导生育:基因检测结果,结合疾病不同的遗传模式可通过遗传咨询进行生育指导。通过产前诊断(自然怀孕后进行)或是试管婴儿结合胚胎植入前筛查或诊断等技术帮助生育健康的宝宝。5)为造血干细胞移植提供精确的配型信息:如地中海贫血、粘多糖贮积症患者、白血病等需要通过移植造血干细胞进行治疗时必须进行HLA分型,评估移植后排斥反应的发生率。编号检测名称包含项目(一)感染性疾病检测类IA人乳头瘤病(HPV)分型基因检测人乳头状瘤病毒(HPV)低危亚型:6,11,42,43,44,61 高危亚型:16,18,26,31,32,33,34,35,39,40,45,51,52,53,54,55,56,57,58,59,,62,66,68,69,70,71,72,73,81,82/MM,82/IS,83,84,89IB泌尿生殖系统感染病原体基因检测沙眼衣原体,解脲支原体,淋球菌,单纯疱疹病毒I/II,生殖支原体,人形支原体,梅毒螺旋体,白色念珠菌,滴虫,加德纳菌,金黄色葡萄球菌,大肠杆菌。ICTORCH-Plus优生5项基因检测巨细胞病毒CMV,单纯疱疹病毒I型,II型HSVI/II,风疹RV,弓形虫TOXIE血源感染性疾病基因检测甲乙丙丁戊庚肝炎病毒、艾滋病毒、梅毒IF呼吸系统感染性病体基因检测肺炎支原体;对嗜肺军团菌;肺炎衣原体;脑膜炎奈瑟菌;肺炎链球菌;流感嗜血杆菌;腺病毒1,2,3,4,5,6,7,21亚型;鲍曼不动杆菌;百日咳杆菌;甲型流感病毒;乙型流感病毒;呼吸道合胞体病毒;副流感病毒1,2,3,4亚型;鼻病毒;偏肺病毒;EB病毒;金黄色葡萄球菌;绿脓杆菌;结核分枝杆菌;白色念珠菌;肺炎克雷伯氏菌。IG消化系统感染性病体基因检测大肠杆菌(O157菌株);大肠杆菌EPEC;沙门氏菌;空肠弯曲菌;李斯特菌;弗氏志贺菌;小肠结肠炎耶尔森菌;柯萨奇病毒;肠道病毒71型;轮状病毒;幽门螺杆菌;金黄色葡萄球菌;绿脓杆菌;白色念珠菌;大肠杆菌;副溶血弧菌。IH感染性真菌基因检测白色念珠菌,光滑念珠菌,近平滑假丝酵母,热带念珠菌,季也蒙假丝酵母,克柔假丝酵母,曲霉菌属,皮肤分节真菌,着色真菌,毛霉菌,根霉菌,申克氏孢子丝菌,糠秕马拉色菌,新型隐球菌,三线镰刀菌(二)病原微生物耐药检测类RA结核分枝杆菌(MDR-TB)检测及基因耐药分析对几种主要抗结核药物—利福平、异烟肼、吡嗪酰胺、乙胺丁醇、链霉素的结核耐药相关基因rpoB、katG、rrs、inhApro等突变情况进行检测。RB乙型肝炎病毒(HBV)检测及基因耐药分析HBV抗乙肝病毒药物拉米夫定、阿德福韦酯、恩替卡韦、替比夫定的相关耐药基因检测RC丙型肝炎病毒(HCV)检测及治疗效果基因检测IL28B基因多态性检测(三)遗传性疾病检测类HA遗传性耳聋基因检测耳聋相关GJB2、GJB3、SLC26A4、12SrRNAHB遗传性眼病基因检测BIGH3相关眼角膜营养不良基因突变检测HCY染色体微缺失基因检测检测15个AZF区域(STSs)HD地中海贫血突变基因检测α大片段缺失、β点突变地中海贫血基因检测HE新生儿遗传代谢疾病检测是一类氨基酸、有机酸、脂肪酸、尿素循环、碳水化合物、类固醇等多种物质代谢疾病HF无创产筛检测胎儿患染色体非整倍性疾病的风险,针对21-三体综合症,18-三体综合症、13-三体综合症进行检测。(四)个性化基因检测类GA心脑血管疾病个体化用药基因检测乙醛脱氢酶ALDH2、药物代谢酶CYP2C19基因检测GB高血压个体化用药基因检测β1受体阻滞药、血管紧张素Ⅱ受体抑制剂、血管紧张素转化酶、钙离子拮抗剂高血压用药相关常见基因型检测。GC溶栓药物体化用药基因检测CYP2C19、CYP4F2、GGCX、CYP2C9、CYP3A4和VKORC1氯吡格雷、华法林药物代谢酶基因的9个多态位点的基因型检测。CD叶酸药物基因检测叶酸代谢酶MTHFR基因检测(五)肿瘤个体化治疗及靶向药物基因检测CA骨肉瘤化学用药指导基因检测ERCC1、XRCC1、GSTP1、MTHFR、MDR1、CDA基因多态性CB胆管癌化学用药指导基因检测ERCC1、XRCC1、GSTP1、DPYD、MTHFR、DPTD、CDA基因多态性CC胃癌化学用药指导基因检测1.ERCC1、XRCC1、GSTP1、DPYP、UGT1A1、MDR1基因多态性2.EGFR、KRAS、BRAF基因多态性CD胃肠道化学用药指导基因检测KIT、PDGFRA基因多态性CE卵巢癌化学用药指导基因检测ERCC1、XRCC1、GSTP1、DPYD、CDA、CYP2D6、UGT1A1、CYP19A1基因多态性CF宫颈癌化学用药指导基因检测ERCC1、XRCC1、GSTP1、DPYD、MTHFR、CDA、UGT1A1、MDR1基因多态性CG头颈癌化学用药指导基因检测1.ERCC1、XRCC1、GSTP1、DPYP、MTHFR、CDA、MDR1基因多态性2.KRAS、BRAF基因多态性CH膀胱癌化学用药指导基因检测ERCC1、XRCC1、GSTP1、DPYD、MTHFR、CDA、MDR1基因多态性CI前列腺癌化学用药指导基因检测ERCC1、XRCC1、GSTP1、CDA、MDR1基因多态性CJ肺癌化学用药指导基因检测1.ERCC1、XRCC1、GSTP1、CDA、UGT1A1、MDR1基因多态性;2.EGFR、KRAS、BRAF基因多态性CK胰腺癌化学用药指导基因检测1.ERCC1、XRCC1、GSTP1、DPYD、MTHFR、CDA、基因多态性;2.EGFR、KRAS基因多态性。CL结肠癌化学用药指导基因检测1.ERCC1、XRCC1、GSTP1、DPYD、MTHFR、UGT1A1,基因多态性;2.KRAS、BRAF基因多态性。CM食管癌化学用药指导基因检测1.ERCC1、XRCC1、GSTP1、DPYD、MTHFR、UGT1A1、MDR1基因多态性;2.EGFR、KRAS、BRAF基因多态性。CN乳腺癌化学用药指导基因检测1.ERCC1、XRCC1、GSTP1、DPYD、MTHFR、UGT1A1、MDR1、CYP19A1,基因多态性。CO肾癌化学用药指导基因检测1.ERCC1、XRCC1、GSTP1、DPYD、MTHFR、UGT1A1、MDR1基因多态性;2.EGFR、KRAS、BRAF基因多态性。
  • 千亿级基因检测市场在招手:肿瘤检测将成下一个临床爆点
    p  很多人知道基因检测,是因为家有孕妈,要做无创产前基因检测(NIPT)来预知胎儿的健康。这个产品使得各大基因测序企业率先试水临床医疗,并走通监管,进入商业化通道。从2011年至今,国内有超过两百万孕妇使用了这项基因检测产品。/pp  当然,基因检测在临床上的应用还有很多,比如新生儿遗传病检测、耳聋基因检测,肿瘤、癌症等个体化治疗基因检测等。只是这些应用如果都想进入临床医疗市场,还需要一定时间来突破。/pp  业内人士认为,基因检测的出现将引领个体医疗革命,基因检测的医疗市场是一块千亿级规模的蛋糕。但基因检测公司需要走通监管,检测成本需要进一步降低,产品能够进入各家医疗机构,普通人对基因检测的认知更深入,满足这些条件,基因产业才能看到光明。/pp strong 无创产前基因检测发展史/strong/pp  NIPT即在孕妇特定孕周期间抽取其5毫升的外周静脉血,利用新一代DNA测序技术对血浆中的胎儿游离DNA片段进行测序,判断腹中胎儿染色体非整倍体疾病(21-三体综合征、18-三体综合征和13-三体综合征)的风险率,目前准确率达99.9%,价格在855元(深圳为全国最低价)--2500元之间。无创产前基因检测的出现让高龄产妇避免了做羊水穿刺带来的0.5%的流产风险。/pp  在NIPT出现之前,国内产前筛查和诊断的方式相对落后,最早通过在孕妇11、13孕周时进行B超筛查,然后进行孕早期和孕中期唐氏筛查,对于唐氏筛查高风险的孕妇则要进行羊水穿刺和产前诊断,随后进行B超排查。这套方式起到积极作用但有其弊端。/pp  华大股份副总赵立见曾在一次分享中指出,血清学筛查大概检出率是66%到83%,同时伴随5%以上的假阳性率,而且有创伤性的产前诊断会带来一定的流产、窒息的风险。/pp  市场似乎一直在等待一种无创的检测方式出现。有研究者设想,能否通过检测孕妇外周血来诊断胎儿的唐氏风险呢?1997年,香港中文大学教授卢煜明证实了孕妇的外周血内存在胎儿的游离DNA,使得通过抽妈妈的血来检测胎儿的患病风险的技术成为可能。/pp  华大基因是国内无创产前基因检测的龙头企业。赵立见介绍说,从2009年到2011年,华大基因在深圳市人民医院、深圳市妇幼保健院和珠海市妇幼保健院共完成了3177例的临床标本的实验。结果显示,这项检测技术的准确率能够达到99%以上,所以华大认为这项检测技术可以逐步应用到临床。/pp  2010年9月9日,华大基因与北京妇产医院签定协议,成为全球第一个将无创产前基因检测技术进行临床应用的医院。/pp  在无创产前基因检测这项产品上,可以说中国企业和世界保持了同步。到今年3月,华大基因的无创产前基因检测样本量突破100万例。国内基因检测公司如贝瑞和康、达安基因(27.180, -0.17, -0.62%)、安诺优达等公司在国内无创产前基因检测市场也占有一定份额。/pp style="text-align: center"img src="http://img1.17img.cn/17img/images/201608/insimg/7573a22b-bcca-4196-80fa-5354d338b1bd.jpg" title="1.png"//pp  strong肿瘤是基因检测市场中最大的一块/strong/pp  如果说普通人通过无创产前基因检测认识了基因检测,但基因检测在临床上的应用绝不限于此,生命的语言正在通过基因检测被逐步破译。/pp  一些基因检测公司以孕前、产前、新生儿、儿童、青少年等完整生命周期的各阶段来进行产品开发和应用。/pp  比如,怀孕前可以做夫妇双方的遗传病基因检测,针对一些有经常性流产史的人也可以对流产组织进行基因检测辅助诊断,新生儿出生后可以做遗传代谢病、遗传性耳聋等儿童期高发遗传病检测,做到防患未然。针对肿瘤基因检测,可以通过抽取8ml外周血检测跟肿瘤相关的508个基因,可以指导个体化用药,以及预测家族遗传性肿瘤的风险,在一些癌症治疗中,基因检测也可起到常规用药指导的作用。/pp  “只是这些检测产品需要经过监管部门审批,和医疗机构合作,才会进入临床使用,而这些检测才刚刚起步。”一位基因检测业内人士说,这也是为什么公众感觉到基因检测离生活有点远的原因之一。/pp  按照现行监管体制,基因检测产品在临床上应用,需要国家食品药品监督管理总局(CFDA)批准,提供基因检测诊断的医疗机构则需要国家卫生计生委批准。目前,只有无创产前基因检测这一个产品具备了这两个要素。/pp  无创产前基因检测曾被监管部门叫停半年。2013年前后,看到无创市场红利,大量检测机构开始设立并和医疗机构合作进行无创产前基因检测,导致检测质量参差不齐,泥沙俱下。2014年2月,国家卫计委和国家食药总局联合发文,叫停了无创产前基因检测技术,要求检测仪器和试剂进行审批,提供基因检测的医疗机构需要批准。/pp  经过企业和监管部门的沟通,2014年6月30日,华大基因的无创产前检测产品率先获得批复,随后,达安基因、博奥生物、贝瑞和康、华因康等公司的高通量测序产品都获得批准。首批109家测序临床应用试点单位也获得批准。/pp  无创产前基因检测只是拉开了基因测序在医疗市场应用的序幕,受出生率下降的限制,市场容量是一定的。所以,各家基因检测公司都在开拓新的临床应用产品。/pp  “临床检测方面,肿瘤被认为是市场中最大的一块,肿瘤风险评估、早筛、复发监控等都可用到基因检测。肿瘤领域有很多创业公司,在试点医院开展服务。”微基因CTO陈钢对第一财经记者说。/pp  中国工程院院士、抗癌协会副理事长程书钧表示,我国肿瘤治疗的病人中晚期患者居多,早期病人比例少,治疗效果当然差,美国肿瘤5年生存率大约在60%到70%,我国肿瘤患者5年生存率大约在30%左右。/pp  如果基因检测在临床医疗上的路径走通,企业面对的将是一个千亿级的市场。以肿瘤相关的基因检测为例,中国每年有300万肿瘤患者,如果每个患者都做一次基因检测用以个性化用药指导,以单价1000元(远高于这个价格)计,每年将有30亿的市场容量,更不用说心脑血管疾病等高发病。/pp  如果上文提到的贯穿整个生命周期的基因检测产品,即从婚姻前遗传病的筛查到怀孕期间无创产前基因检测,到新生儿代谢病的筛查、遗传性耳聋基因筛查,以及到老年病、肿瘤以及感染性疾病的筛查都能获得临床市场认可,走通商业化路径,基因检测公司的发展前景将非常可观。/pp  但现在的问题是,市场上的企业要跨越黎明前的重重黑暗,才能看到光明。/p
  • 分析:临床NGS基因检测产业调查
    近日,市场研究和战略咨询公司DeciBio的研究者们通过对2012年至2015年间1000多篇论文和30篇专家采访进行了综合分析,结果表明:NGS的临床应用正处于快速增长阶段,目前主要应用在肿瘤、罕见疾病和NIPT领域。在肿瘤领域,NGS主要用于能实施靶向疗法的肿瘤(如乳腺癌、肺癌、结直肠癌)中,帮助优化疾病的诊断与治疗。总体来说,NGS临床应用的发展已超过预期,前景非常乐观。见图1。  (图1)30位专家受访者情况  测序仪  对于测序仪产业而言,短期内,Illumina公司在NGS临床应用市场中仍处于主导地位 长期来看,NGS临床市场竞争日趋激烈,处于动态发展之中。纳米孔测序仪的精确性正在快速提高,并将带来颠覆性创新。鉴于其可扩展性,预测纳米孔测序仪的性能将很快能满足临床应用的需要,并有可能突破现有的技术(如边合成边测序技术)。部分受访专家表示对多种新型测序平台感兴趣(图2)。  (图2)  哈佛商学院教授 Clayton Christensen 提出颠覆性创新是一种与主流市场发展趋势背道而驰的创新活动,其颠覆威力极为强大,一般成果的企业都难以适应这类创新带来的挑战。  而纳米孔测序具有潜在的颠覆性创新特征(图3)。  (图3)  临床应用  通过对1285篇临床文献回顾,分析表明NGS不仅仅只应用于肿瘤和NIPT领域,还逐渐涉及病毒、微生物、免疫等研究领域。另外,全基因组测序、全外显子组测序仍是主要的应用手段,而靶向测序的使用份额正逐年大幅增加,见图4。  (图4)  部分专家认为未来5年临床肿瘤NGS检测的数量在一些顶级中心或增涨7倍。见图5。  (图5)  技术挑战  大多数受访专家认为,NGS产业面临的挑战主要集中在上游和下游环节。上游环节包括:提高自动化的样品制备方案。例如,如何从福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)的样品以及液态活检样品中获得高质量的DNA。下游环节包括:提高意义不明突变的分析和报告质量,以及生物信息学解决方案。见图6。  (图6)  行业分工  NGS快速增长的市场吸引了众多公司的参与。但提供测序技术的公司数量依然相对有限。提供样品制备、自动化或生物信息学解决方案的独立公司符合了市场的需求。尽管有多于150家公司提供DNA分析软件包,生物信息学的基础设施和分析工具仍不健全。 见图7。  (图7)
  • 四维杂交技术推动基因检测进入临床时代
    我国科技工作者自主创新研发成功的四维参数系统核酸分子杂交技术,一改传统DNA检测技术检测结果再重复性差的弱点,做到了被测物在不同时间、不同地点、不同操作者以及不同种类反应之间的再重复性,从而实现了临床应用反应体系与实验室检测关键参数的反应体系的一致性。为基因检测技术在临床上真正适用提供了可能。  自1953年发现生物遗传分子脱氧核糖核酸(DNA)的双螺旋结构,提出生物遗传基因的分子机理以来,DNA检测技术就成为当代生命科学研究的重要技术手段。从上世纪八十年代开始,DNA检测技术在生命科学、农业、轻工业、医药、法医、考古等行业得到广泛应用。但由于现有的DNA检测技术采用的是三维参数系统杂交技术,大都是通过基因扩增(PCR)技术进行检测,经常会受到假阳性信号的困扰。使得被测物在同样的检测技术手段下,会因检测时间、检测地点、操作者的不同出现不同的检测结果,检测结果准确度较低。英国《自然》杂志今年发表的一篇论文就指出,依靠现有基因检测技术对人类30亿个对碱基对检测结果编制的人类基因组图谱,其准确率最高不超过85%。  由北京广博世纪基因芯片科技有限公司研发成功的四维参数系统核酸分子杂交技术,突破性的引入了温度因子。被测物在能提供稳定反应微环境的四维参数系统杂交反应试剂处理后,做到了被测物在各种情况下检测数据的一致性。实验表明,相关被测物在冰箱冷冻一年以上,解冻后仍可重复一年前的测试过程和测试结果。  四维杂交技术业经中国医学科学院北京协和医院历时一年多的检测证明,该技术具备理化标准的准确度、溯源性和可靠性。为临床DNA检测提供了坚实可靠的基础,其显著特点,使之既可为实际系统做质量控制,也可以为仪器系统做质量控制和校正,从而实现了DNA检测技术的一次革命。
  • 为什么说临床质谱检测是下一个“基因测序”?
    临床检验技术的发展可谓日新月异,作为检验技术的代表之一,质谱检测平台因其快速、准确、特异的优点,受到越来越多的重视。质谱作为诊断领域的一种新兴技术,由科研逐渐走向临床,业界很多专家认为其和基因测序技术有许多共同点,也意味着质谱很有可能复制基因测序的发展,拥有很大的发展潜力,而目前处于快速发展阶段。据调研报告显示,2021年全球质谱在临床检验应用的市场规模在150亿美元左右,未来行业增速将在20%左右。其中,美国临床质谱检验市场约为55亿美元,占据整体医学检验市场约15%;而中国质谱检验在医学检验市场占比仅为1-2%,渗透率较低,未来市场潜力巨大。根据不同的离子源及质量分析器搭配的不同,质谱分成多种类型,不同类型的分析特性不同,适用于不同的临床领域,比如液相色谱串联质谱(LC-MS)适用于小分子定量分析,包括新生儿筛查、微生物检测、药物浓度监测等;基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF)常用于微生物鉴定;电感耦合等离子体质谱(ICP-MS)适用于微量元素检测等。随着精准医学的发展、多组学研究上的突破,临床质谱迎来了发展机会。2004-2022年,我国陆续涌现出几十家临床质谱创新企业,从产业链角度来看,大致分为上游的仪器/试剂企业,中游的第三方医学检验中心,作为产业链下游的用户端,国内标杆的医院基本都有开展质谱项目,如解放军总医院、复旦大学附属中山医院等质谱检测平台从技术水平、仪器规模、开展项目等都处于领先水平,也发挥着非常大的示范作用,带动了一大批三甲、二甲医院开展质谱检测。此外,随着国产质谱仪器的陆续推出,仪器售价较进口品牌有较大优势,也降低了准入门槛,未来可以预见仪器的成本还将持续下降。不仅如此,质谱的临床应用也得到快速发展,从最初的新生儿筛查、维生素检测,已经扩展到激素、药物浓度监测、遗传性疾病检测以及痕量元素检测等诸多领域,可检测项目已扩展到几百项且,而且还在不断增加。在此背景下,仪器信息网组织召开“临床质谱技术及应用进展”主题网络研讨会(2022年5月19日),就质谱在临床领域的最新技术及应用进展等大家关心的话题共同探讨,为用户、专家和厂商搭建优质、有效的交流平台。本次会议汇集多位来自医院检验科、科研院校的著名质谱专家,聚焦质谱在临床中的热点应用,如质谱技术在激素检测、新生儿疾病筛查、维生素监测、药物浓度监测、微量元素、核酸检测、蛋白快速定量等方面的最新应用进展。点击链接,进入官网了解更多。会议日程:时间主题报告嘉宾9:30-10:00MALDI-TOF质谱在病原体检测领域的应用现状及前景中国医学科学院病原生物学研究所彭俊平 研究员10:00-10:30岛津临床质谱助力疾病早期诊断和精准治疗岛津企业管理(中国)有限公司沈晶晶 应用工程师10:30-11:00临床质谱实验室建设之我见四川大学华西医院CTC中心秦永平 教授11:00-11:30Waters在临床质谱检测中的整体解决方案介绍沃特世科技(北京)有限公司李倩倩 临床应用工程师11:30-12:00质谱技术在心血管疾病领域的应用与进展上海透景生命科技股份有限公司 詹红 高级工程师12:00-14:00午休14:00—14:30常压敞开式电离质谱新方法开发及其在癌症快速筛查与分子诊断中的应用研究复旦大学 宋肖炜 博士14:30—15:00液质联用系统如何实现真正的临床场景化-全自动临床质谱流水线系统成都珂睿科技有限公司 吕辉 市场营销总监15:00—15:30质谱在激素检测领域的应用现状及发展趋势中国医学科学院北京协和医院检验科 禹松林 助理研究员15:30—16:00标准物质及内标在临床质谱中的应用北京曼哈格生物科技有限公司 刘静文 临床质谱事业部工程师16:00-16:30质谱成像空间分辨代谢组学新技术及其临床应用研究进展中国医学科学院药物研究所 贺玖明 研究员16:30-17:00安捷伦LC-MS/MS技术助力临床体外精准诊断安捷伦科技(中国)有限公司 徐聪 LC/MS应用工程师17:00-17:30临床质谱实验室自建方法的过去、现在与未来国家卫生健康委员会临床检验中心张天娇 副研究员点击图片报名参会!
  • 香港中大与华大基因签署临床基因检测合作协议
    2011年8月17日,香港中文大学(以下简称:香港中大)与华大基因在港签订临床基因检测合作协议,该协议以香港中大位于韦尔斯亲王医院的临床基因实验室为基地,合作进行临床基因检测,并开展基因组研究项目。协议在国务院副总理李克强的见证下,由香港中大校长沈祖尧教授及华大基因理事长杨焕明院士签署 香港中大副校长郑振耀教授、香港中大医学院院长霍泰辉教授及副院长吴浩强教授、华大基因科技部负责人杨国华,以及华大基因香港研发中心执行总监王立志等出席了签署仪式。  根据合作协议,香港中大与华大基因将就香港及东南亚地区中多项疾病的成因及治疗进行临床基因检测,并探讨合作开展联合研发项目,推进分子遗传学的研究。检测项目包括单基因疾病检测、人类乳头状病毒(HPV)基因分型、HLA高分辨基因分型检测、新生儿耳聋基因筛查、多基因疾病治疗,以及癌症及多种复杂疾病治疗。此外,双方将进一步探讨成立联合临床基因检测与研发中心,并定期进行合作交流,为&ldquo 香港中文大学──华大基因跨组学创新研究院&rdquo (创新研究院)的学生提供实习机会。  香港中大与华大多年来一直紧密合作,包括2009年成立&ldquo 中.华基因联合研究中心&rdquo ,于肿瘤、大豆及糖尿病三个研究项目开展深入合作,取得可喜的成果。其中的&ldquo 大豆回家&rdquo 项目,在大豆基因组研究中取得重大突破,有关研究成果获遗传学权威学术期刊《自然遗传》(Nature Genetics)刊登为封面故事。  华大基因一直致力于健康领域研究与应用的发展,在各种疾病的预测、预防和治疗展开深入研究,并相继取得良好成果,为广大民众健康带来福利。华大基因目前提供的健康检测服务包括无创产前基因检测、人类乳头状病毒(HPV)基因分型、HLA高分辨基因分型检测、HBV乙肝耐药基因检测、地中海贫血基因检测、单基因病检测。本月初,华大基因与广东省鹤山市政府共同签署&ldquo 共建幸福鹤山&rdquo 框架协议。在框架协议签订的同时,&ldquo 鹤山市10万适龄妇女HPV筛查项目&rdquo 也即时启动。
  • 讲座预告|后基因组时代的临床质谱生物大分子检测
    蛋白质是重要的疾病分子标志物和药物靶标,随着生物质谱技术以及生物信息学的飞速发展,生物大分子及蛋白组学将在后基因组时代独占螯头,开创下一个千亿级蓝海。生物大分子临床质谱(如蛋白组学、核酸检测、质谱成像等)有哪些全新的应用场景?目前已经产生哪些喜人的科研成果?作为蛋白质组学研究的核心工具平台——生物质谱近些年有哪些跨越式进步?展望蛋白组学的下一个阶段,有哪些新的机会?2月25日,在直播间,融智生物董事长、首席技术官周晓光博士将会为您一一解答。时间:2021年2月25日,14:00-14:50主题:后基因组时代的临床质谱生物大分子检测主讲人:周晓光博士 融智生物董事长、首席技术官长按识别二维码报名关于融智生物:融智生物,由资深质谱研发专家创立,是专业致力于生命科学分析仪器设备、耗材及解决方案的研发、生产、销售、服务的国家级高新技术企业,注册资本6000万元。公司在美国波士顿、北京、青岛、深圳和杭州等地布局了研发、生产、应用开发、销售、服务等分中心,与中国农业大学、中国科学院等多家科研机构建立了联合实验室,并承担了多项国家和地方科技创新研发项目。目前已拥有“宽谱定量飞行时间质谱(新一代基质辅助激光解吸飞行时间质谱)”及“微流控芯片核酸快速分析”两大技术平台。扎根国内,放眼国际,成为具有国际竞争力的生物科技企业是融智生物的经营目标,融智生物将持之以恒地为高端生命科学仪器的国产化、国人医疗健康水平的提高做出贡献。
  • 西藏首家临床基因扩增检测实验室通过国家技术验收
    p  日前,记者从自治区人民医院了解到,在中组部医疗人才“组团式”援藏专家的帮助下,该院检验科临床基因扩增检测实验室顺利通过国家卫计委临检中心技术验收,本月21日,国家卫计委临检中心主任陈文祥教授将亲自为实验室颁发技术验收合格证书。这是西藏首家通过国家验收的临床基因扩增检测实验室。目前,该实验室已能开展乙肝病毒DNA检测、人乳头瘤病毒DNA检测,将根据临床需要进一步要开展其他检测。/pp  strong对照技术验收要求/strong/pp  strong提前逐条进行自我核查/strong/pp  随着精准医学和个体化医疗的发展,临床基因扩增检测技术(PCR实验)已成为临床检验领域最热门的技术。该技术对于实验室的技术能力及管理要求极高,临床风险也较高,早在2002年,我国就颁布了《医疗机构临床基因扩增检验实验室管理办法》,并于2010年进行修订,规定,临床机构基因扩增实验室必须经过技术验收,合法开展相关检测业务。/pp  北京协和医院检验科副主任、“组团式”援藏专家邱玲教授介绍,2010年,西藏自治区人民医院就已经开展相关检测,并筹备基因扩增检测实验室验收相关工作。为保证医疗安全,合法开展相关检测业务,2015年10月,在中组部医疗人才“组团式”援藏专家的积极推进和指导下,该院检验科临床基因扩增检测实验室向国家卫计委临检中心正式递交验收申请,并对照技术验收的38条要求逐条进行自我核查,补充了大量性能验证实验、对设备进行校准、进一步完善了人员技术档案等。/pp  strong现场技术验收/strong/ppstrong  实验室达到内地同等水平/strong/pp  据了解,日前,由国家卫计委临检中心主任陈文祥教授和重庆市临检中心主任廖璞教授组成的基因扩增检测实验室技术验收组对该实验室进行了现场验收。通过现场查看实验室布局、环境,核查各类文件及试验记录,审核现场操作过程及现场试验结果等,验收组一致认为,自治区人民医院基因扩增技术实验室已经达到了内地实验室同等水平,并在设备校准、性能验证等方面表现优异。最终,验收组确认实验室的各项管理要素及技术能力,宣布自治区人民医院检验科基因扩增技术实验室顺 利通过现场技术验收。据国家卫计委临检中心获悉,目前专家组已经对整改条款进行确认,正式宣布该实验室通过技术验收,并将于本月21日,由卫计委临检中心 主任陈文祥教授亲自颁发技术验收合格证书。/pp  据介绍,该实验室填补了我区该项领域的空白,对我区合法开展基因扩增检测业务,开展精准医学、个体化医学工作作出了积极贡献。邱玲透露,西藏自治区直属的临床检验中心也已正式获批成立,并挂靠自治区人民医院管理。/pp  strong根据临床需要/strong/ppstrong  将进一步扩大检测范围/strong/pp  自治区人民医院检验科副主任刘治娟介绍,此前,该实验室已开展过乙肝病毒DNA检测、人乳头瘤病毒DNA检测(16型、18型)等检测工作,一周检测标本 70—80个。下一步,该实验室将根据临床需要扩大检测范围,进一步拓展基因扩增检测技术,并增加检测量,合法开展更多临床项目,为传染性疾病、肿瘤及慢性病等疾病进行诊疗服务,如开展丙肝病毒RNA定量检测、沙眼衣原体DNA检测、结核杆菌基因检测等。/pp  相对传统检测方法,PCR检测更快速、更敏感也更精确。刘治娟举例,同样是结核病,如果采用病原学检测,仅结核杆菌培养就需要14天,而采用特定的基因扩增检测技术进行结核杆菌基因检测,一般只需要2小时的时间。/pp  PCR检测如此快速,在进行乙肝病毒检测时,是否还需要进行乙肝两对半检查呢?对此,刘治娟解释,乙肝五项检查的意义在于:检查是否感染乙肝及感染的具体情况,区分大三阳、小三阳,是用来判定是否感染乙肝或粗略估计病毒复制水平的初步检查,侧重于病情的诊断。而乙肝病毒PCR定量检测则为检测诊断提供了新手段,通过此项检测,可以指导选择对症药品,有效避免耐药和盲目用药 同时,可直接正确地测定体内病毒数目,有助于疗效的判定 还可以有效正确检测出乙肝 病毒是否变异,有助及时调整治疗方案,侧重于治疗效果的检验。两项检查都是临床乙肝检查中不可或缺的检查项目,各有各的检查意义,应该区别对待,正确使用。/ppbr//p
  • 世界首台获FDA批准用于临床基因检测的质谱技术平台
    Agena Bioscience(原Sequenom Bioscience)公司MassARRAY 核酸质谱技术平台的临床应用版&ldquo IMPACT Dx&trade 系统&rdquo 于2014年6月16日获得美国FDA认证,可用于临床分子诊断应用,从而成为世界上第一台,也是唯一一台获得FDA临床认证的核酸质谱平台。Agena Bioscience公司,于2014年5月30日收购了Sequenom公司的生命科学部。  同时获得批准的还有以下相关的检查试剂盒:  莱顿第五凝血因子突变检测试剂盒Factor V Leiden Assay   第二凝血因子基因分型检测试剂盒Factor II Genotyping Assay   基于MassARRAY 核酸质谱技术的IMPACT Dx&trade 系统获得FDA认证是核酸质谱技术由科研转向临床检测的重大里程碑,预期其近期亦将获得欧洲CE-IVD认证。IMPACT Dx&trade 系统所具有的超高灵敏度、精确度、准确性、稳定性、性价比的独特优势,将帮助医生造福更多患者。
  • 肺炎疫情检测之临床型基因测序仪一览
    p style="text-align: justify text-indent: 2em "span style="font-size: 16px "span style="color: rgb(89, 89, 89) "近期,仪器信息网对新型冠状病毒检测使用的仪器进行整理供广大用户了解(/spanspan style="text-decoration: underline color: rgb(89, 89, 89) "strongspan style="color: rgb(89, 89, 89) text-decoration: underline "a href="https://www.instrument.com.cn/news/20200131/521082.shtml" target="_blank" style="text-decoration: underline color: rgb(89, 89, 89) font-size: 14px "点击查看:/a/span/strong/span/spana href="https://www.instrument.com.cn/news/20200131/521082.shtml" target="_blank" style="color: rgb(89, 89, 89) font-size: 16px text-decoration: underline "span style="font-size: 16px "strong抗疫仪器清单请收好,新冠病毒检测全知晓/strong/span/aspan style="font-size: 16px "span style="color: rgb(89, 89, 89) font-size: 14px "span style="font-size: 16px text-indent: 2em ")。同时也紧急向各位广大仪器厂商和分析测试有关单位征稿,展示最新的检测仪器、试剂和解决方案给广大用户单位,以全力支援疫情防控工作(点击/spanspan style="font-size: 16px text-indent: 2em text-decoration-line: underline "strong:/strongstrong/strong/span/spanspan style="text-indent: 2em text-decoration-line: underline color: rgb(89, 89, 89) font-size: 14px "a href="https://www.instrument.com.cn/news/20200128/521014.shtml" target="_blank"strong抗击新型冠状病毒:检测仪器、试剂和解决方案/strong/a/spanspan style="text-indent: 2em color: rgb(89, 89, 89) font-size: 14px ")/span/span/pp style="text-align: justify text-indent: 2em "span style="color: rgb(192, 0, 0) "strong基因测序仪用于疑似患者检测/strong/span/pp style="text-indent: 2em "span style="text-align: justify text-indent: 2em "随着新型冠状病毒(2019-nCoV)疫情的不断变化,医务人员对病毒检测及鉴定速度、通量和安全性都有着更高要求。基因测序仪/span高通量基因测序仪被strong用于基因组序列组装,疑似患者检测,变异检测等/strong肺炎防控关键时刻,在助力分析新冠病毒基因组序列等发挥了重要作用。/pp style="text-indent: 2em "span style="text-align: justify text-indent: 2em "为此,仪器信息网整理了几款在国内获得医疗器械许可的“有证”基因测序仪,供广大检测用户参考,希望能够在抗击疫情的过程中能尽一份力量。/span/pp style="text-indent: 2em "span style="text-align: justify text-indent: 2em "/span/pp style="text-align: center"br//pp style="text-indent: 2em "span style="text-align: justify text-indent: 2em "/span/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 252px height: 192px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202002/uepic/27e9cad3-07e8-4bed-9b6b-f8b33d4485ad.jpg" title="000.jpg" alt="000.jpg" width="252" height="192"//pp style="text-align: center text-indent: 0em "a href="https://www.instrument.com.cn/netshow/SH103701/C241668.htm" target="_blank"Illumina的MiSeqTM Dx测序仪(点击查看仪器参数、报价信息)/a/pp style="text-align: justify text-indent: 2em "MiSeq™ Dx基因测序仪是Illumina首款通过中国国家药品监督管理局医疗器械注册批准(2018年8月)的进口基因测序仪,意味着Illumina可以将MiSeq™ Dx基因测序仪推广并销售给中国境内的医院及其他医疗机构进行体外诊断(IVD)检测。MiniSeq测序系统实现一触式的操作,直观的用户界面,快速、简单的流程并采用Illumina成熟、经典的测序技术。不但仪器具有成本优势,而且测序少量样本也具有成本优势。其直观的从样本到答案工作流程能够快速对DNA和RNA相关应用进行测序。MiniSeq有着广泛、灵活的应用,能够让研究人员在不同测序项目间灵活转换,如不同的RNA或DNA样本应用,包括信号通路分析,实体瘤和血液肿瘤的分析及生殖细胞系变异检测。优化的分析流程可适用于不断增加的新应用。/pp style="text-align: justify text-indent: 2em "华大基因继2014年BGISEQ-100,BGISEQ-1000,2016年BGISEQ-500、2017年BGISEQ-50、2018年MGISEQ-2000与MGISEQ-200获得CFDA认证之后,共计拥有6款已经获得医疗器械注册证的基因测序仪。/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 251px height: 208px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202002/uepic/019cfbf7-25cf-4bbd-9dc5-cf64ba7fe310.jpg" title="111.jpg" alt="111.jpg" width="251" height="208"//pp style="text-align: center "a href="https://www.instrument.com.cn/news/20161117/206574.shtml" target="_blank" style="text-indent: 0em "华大智造BGISEQ-50(点击查看相关资讯)/a/pp style="text-align: justify text-indent: 2em "BGISEQ-50是一款更专注、更小巧、更精简的高通量测序平台。该系统沿用了先进的联合探针锚定聚合技术(cPAS)和DNA纳米球(DNB)核心测序技术,采用高精密部件,内置独立的样本加载试剂槽和全自动试剂针穿刺系统,在简约化的结构中自动集成样品加载、测序和分析等多项功能。BGISEQ-50体积小巧,易于安放,不仅全面支持临床领域和科研领域的基础测序应用项目,而且适用范围广泛,突破空间限制,即使在高海拔下的低气压环境中也能正常运行。/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 337px height: 273px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202002/uepic/62d3e0a9-1079-4aef-afbf-408c9b609a8b.jpg" title="222.jpg" alt="222.jpg" width="337" height="273"//pp style="text-align: center "a href="https://www.instrument.com.cn/netshow/C312327.htm" target="_blank" style="text-indent: 0em "华大智造MGISEQ-2000(点击查看参数、报价信息)/a/pp style="text-align: justify text-indent: 2em "华大智造自主研发的MGISEQ-2000是一款桌面型高通量基因测序仪,在2018年6月通过CFDA的审查,获得医疗器械注册证。MGISEQ-2000采用全新的芯片系统,在双芯片独立运行平台的基础上,支持不同规格的芯片,能够实现更全面更灵活的测序体验。平台自带初级数据分析软件,可以自动完成图像分析,并产生有质量打分的碱基序列,适用于科研、医学临床、司法、农业等领域,包括全基因组测序以及肿瘤基因热点突变检测。/pp style="text-align: center"img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202002/uepic/03290285-1ddd-4e6e-ac34-7e40325c2bbc.jpg" title="333.jpg" alt="333.jpg"//pp style="text-align: center "a href="https://www.instrument.com.cn/netshow/C312558.htm" target="_blank" style="text-indent: 0em "华大智造MGISEQ-200(查看参数、报价信息)/a/pp style="text-align: justify text-indent: 2em "MGISEQ-200是华大智造自主研发出的一款桌面型基因测序仪,在2018年6月通过CFDA的审查,获得医疗器械注册证。总重量仅有87KG并且占地面积小,在多样的环境中为您提供稳定而准确的测序,包括高海拔的低压环境和高风浪的海洋环境。适合靶向基因和小型基因组测序、微生物检测等,是基础科研和临床研究的好帮手。在PE100读长模式下满负荷运行不到48小时,平均一天能完成24个肿瘤样本,能在较短时间内完成完整的基因测序流程。/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 364px height: 242px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202002/uepic/993daec3-f3e2-4791-8c31-b123b9484150.jpg" title="444.jpg" alt="444.jpg" width="364" height="242"//pp style="text-align: center "a href="https://www.instrument.com.cn/zc/134.html" target="_blank" style="text-indent: 0em "华大智造BGISEQ-500(点击进入基因测序仪专场)/a/pp style="text-align: justify text-indent: 2em "BGISEQ-500是一款高通量基因测序平台,以联合探针锚定聚合技术(cPAS)及改进的DNA纳米球(DNB)为核心技术支撑。作为一款开放的一站式测序平台,BGISEQ-500具有精准、简易、快速、灵活、可拓等特点,全面覆盖科研、生殖健康、现代农业、病原识别、临床研究等领域的多种应用。/pp style="text-align: justify text-indent: 2em "作为基因组学的核心技术,DNA测序技术是当下应用最广泛的生命科学技术之一。基因测序仪不仅用于科研,也正在成为精准医学的重要工具。基因测序技术不断推陈出新,从1986年第一台商用DNA测序仪的推出,到现在三代测序仪崭露头角,小编在另一篇文章(a href="https://www.instrument.com.cn/news/20190327/482498.shtml" target="_blank"详情可点击查看图集|基因测序仪全家福/a)中梳理历代DNA测序平台共58台,为行业相关从业人员理清思路。附上部分列表:/pp style="text-align: center"img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202002/uepic/e4ae807c-4d71-4a64-a45d-7fca47a91508.jpg" title="555.jpg" alt="555.jpg"//pp style="text-align: center "span style="text-align: justify text-indent: 2em "… … /span/pp style="text-align: justify text-indent: 2em "欲免费查看完整列表,微信关注 3i生仪社,回复“基因列表”即可免费获取。/pp style="text-align: justify text-indent: 2em "可以进入专题查看最新疫情情况以及广大仪器厂商、生物制药企业在疫情中的最新动态!点击下方图片进入:a href="https://www.instrument.com.cn/zt/xxgzbd" _src="https://www.instrument.com.cn/zt/xxgzbd"https://www.instrument.com.cn/zt/xxgzbd/a /pp style="text-align: center "a href="https://www.instrument.com.cn/zt/xxgzbd" target="_blank"img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202002/uepic/0f87b56a-677e-4566-84d3-10493c7a68fd.jpg" title="微信截图_20200201193435.png" alt="微信截图_20200201193435.png"//a/p
  • 测几滴唾液,提前拿到“人生剧本”?医学专家表示商业化基因检测不能作为临床参考,不可盲目相信
    在口腔内取几滴唾液送至检测机构,不出几日就可以收到报告,祖先来源、性格、天赋、易患疾病,甚至代谢能力、皮肤管理方案都可以“一览无余”,还可以根据“天赋指导”为孩子“量身定制”成长计划,提前拿到“人生剧本”……近来,不少人被这样的宣传吸引,花费数百元到数千元不等进行基因检测。这样的商业化基因检测到底靠不靠谱?相关结果有没有科学价值?如果出现纠纷,消费者权益能不能得到保护?记者进行了调查。检测项目五花八门记者查询发现,目前市面上商业化的基因检测项目五花八门,甚至还可以检测出“恋爱人格”“酒精咖啡代谢能力”等,直戳年轻人的好奇心。更有针对青少年儿童“成长天赋”的检测,踩中家长“望子成龙”的焦虑心理。此类商业化的基因检测产品和服务,在互联网平台可以随意购买,价格从几十元到上千元不等,消费者的评价也褒贬不一。有的人表示:“流程方便,出结果快,可以通过报告关注营养和疾病。”“大部分结果比较准,和前阵子在医院检查出的疾病结果一致。”也有消费者吐槽:“我家孩子在三甲医院检测是异卵双胎,这里出报告显示两个孩子数据一模一样,商家是不是压根没有检测?”更多消费者则带着“玩玩看”的心态,“作为礼物送给朋友玩玩,自己玩得也很开心”。市面上基因检测方法也多有不同,有的是收集唾液,有的是拍下手掌和面部照片就行。南京鼓楼医院肿瘤中心主任医师李茹恬告诉记者,在医院,如何来进行基因检测是根据检查项目来确定的:查肿瘤相关基因,优先采集肿瘤组织;如果要测胚胎基因,则要采集胚胎组织,可以是羊水中的胎儿脱落细胞。查患者是何种细菌感染,可以采集人体分泌物,比如痰、脓液等。商家宣传的采集唾液,也是一种方式,口腔上皮细胞作为体细胞,同样含有完整的DNA,而看面部、手掌照片就“不靠谱”了。“从科学角度来讲,某个基因可能与人的某些特征相关,如智力、运动能力等。但这并不代表某一个基因的改变,就一定会导致疾病的发生。”南京医科大学基础医学院生物化学系主任陈园园教授表示,基因并非一切疾病发生的决定性因素,疾病发生过程中还有其他很多因素的影响。检测机构出具的报告,具体检测了哪些基因不得而知,也许有一定的科学依据,但不能作为临床参考,也不可盲目相信。李茹恬介绍,通过基因检测来测定祖先来源,有一定科学根据。例如,2022年诺贝尔生理学或医学奖获得者,斯万特佩博就是通过基因测序来探索生物和人类进化的。但这类技术大多数还处于研究阶段,且除了检测,还需要有准确、大型的数据库和大数据分析的能力,因此,目前尚没有太大的现实应用意义。临床应用审慎严格随着科技发展,基因检测技术在医疗领域发挥了越来越重要的作用,不但可以诊断疾病,还可以对疾病风险作出预测。南京市妇幼保健院遗传医学中心主任医师罗春玉,从事妇产科临床工作已有近30年,现专注遗传咨询、产前筛查及诊断。“我所在的遗传医学中心,做基因检测的情况,常常是生过遗传病患儿的夫妻准备再育、夫妻双方有遗传病或家族史准备生育、怀孕后产前筛查或胎儿超声异常提示增加遗传病风险等。”李茹恬介绍,医院内有多个科室都会涉及基因检测,目的也不尽相同。个体是否携带某些基因,可以用来判断患者适不适合使用某种药物,用药效果、副作用等,也可以帮助判断患者预后。常见的例如肺癌相关的EGFR基因突变、胃肠道间质瘤相关的C-KIT基因突变等,已经成为临床上制定治疗方案和调整用药时必须考虑的基因突变。“在医院内进行的基因检测,都是出于医疗目的,同时严格遵循循证医学的理念,即这项检查已经被临床数据证实患者可以明确获益,才有推广的价值。”商业化基因检测带来的负面效应令人忧虑,由于没有专业医疗机构和医生介入,检测结果值得怀疑,乱象丛生,侵害消费者权益的现象十分普遍。检测公司为了吸引消费者,有的甚至直接宣称检测准确率高达99%。陈园园表示,商业基因检测采集DNA的过程一般由消费者自行操作,实际上提取DNA过程十分严格,不能有任何污染,在提取和运送过程中如果受到污染,也会导致结果的不可靠。“样本保存与运送也是一环。”李茹恬说,通常采集的样本会被保存在保存液中,保存液中含有防止DNA被破坏的物质,邮寄过程中还有可能使用冷藏技术,多项手段一起来保障检测结果的准确性。基因检测技术含量高,检测机构都需要专业的资质,普通市民很难辨别,最好通过正规医疗机构或是有资质的检测机构来进行,以免“踩雷”。此外,陈园园提醒,基因信息属于个人隐私,商业基因检测属于商业行为,我国尚无法律对检测机构的保密义务进行规范,也可能会导致相关的生物安全问题。监管空白亟待填补我国对基因检测等新技术、新产品的应用给予了明确的鼓励,在《国务院办公厅关于印发中国防治慢性病中长期规划(2017—2025年)的通知》中明确写道:支持基因检测等新技术、新产品在慢性病防治领域推广应用。原国家卫计委办公厅以及原国家食药监局办公厅于2014年6月联合发布的《关于加强临床使用基因测序相关产品和技术管理的通知》明确标明了具体的准入标准,同时强调:“在出台管理规范之前,所有医疗机构不允许在临床中应用基因检测技术进行基因测序检查。”但该标准并没有对非临床应用的基因检测进行规定,也就意味着商业化基因检测缺乏明确严格的政策或法律规范。在调查中记者发现,商业基因检测目前尚缺乏权威统一的标准,各检测实验室根据本机构所积累的基因信息库资源,依据各自的算法对受测者基因样本进行分析,因此得出的结果很难有一致性。那么做“基因体检”,从基因角度预测一下是否有某些疾病的易感性,看看将来患病的概率有多少,是否有价值呢?罗春玉告诉记者,一些生育过遗传病患儿的父母经常会问,“我们夫妻都很健康,双方家里几代都没有遗传病啊,为什么孩子得病了?”其实即使“健康”或“正常”的人,平均也都会携带2.8个隐性遗传病的致病基因,而携带同一种隐性遗传病的夫妻,有四分之一概率生育遗传病患儿,为了尽量避免一些严重遗传病患儿出生,对于正常备孕的夫妻或刚怀孕的,可做单基因遗传病携带者筛查。“如果是某种疾病的高危人群或是有特殊的医疗目的,我们才会建议患者做基因检测。如果是健康人群,我们目前还不主张常规通过基因检测去做疾病的预测,意义不大,还徒增心理负担。”李茹恬表示。商业机构售卖的天赋基因检测,在医生们看来是没有明确科学依据的。“我们表现出的所有性状、功能都是由基因决定的,但不管哪一种性状或功能,都是由成千上万个基因决定,即使知道一个人的全部遗传信息,也无法预测其智力以及某个天赋。”罗春玉建议家长,一个人某方面的成功或“天赋异禀”,是多种因素决定的,遗传固然重要,但后天的环境也重要。“教育是没有捷径可言的,不管科技如何发展,这都是亘古不变的道理。”我国目前仅对医疗机构实施的部分基因检测活动进行了相应规范,对商业化基因检测的立法几乎是空白。陈园园建议,希望国家出台更加细化的规范,从检测机构资质、检测标准、生物安全等方面进行严格规范,更好地保护消费者。
  • 250.52万!中宁县中医医院临床基因扩增检测(PCR)实验室设备采购项目
    一、项目基本情况采购计划编号: 2022NCZ(ZW)0000238项目编号: BDGCGL-2022-(ZC)004号项目名称: 中宁县中医医院临床基因扩增检测(PCR)实验室设备采购项目预算金额(元): 2505200.00最高限价(如有): 2505200.00元采购需求:采购标段标的名称数量简要规格描述或项目基本概况预算金额(元)备注中宁县中医医院临床基因扩增检测(PCR)实验室设备采购项目其他医疗设备1采购一批医疗设备,具体内容及详细参数要求详见采购文件。2505200.00数量合计:1预算合计:2505200.00合同履行期限:供货及安装期限15日历天。本项目(是/否)接受联合体投标: 是 否
  • 2014 临床基因测序大格局年
    经过几年的行业演化,2014年已经进入了形成中国行业大格局的时间点了,当然,行业刚开始上升,未知数太多了,只能说大格局。今年如何经营与运作将比以往更显著地影响行业中公司的未来。而一直觊觎中国庞大市场的上游测序硬件厂商,也充分意识到这一难得的机遇。未到半年时间里,行业大动作频频,让基因测序行业甚是精彩。  行业中的企业都在寻找自身的机会与定位,且行且珍惜。  行业里的亲密关系  谈到中国的临床测序,肯定绕不过无创产前基因检测,毕竟这个是目前基因组测序中的成功典范,焦点在此,资源和力量也集中在此。基于孕妇血浆游离胎儿DNA的现象进行开发,国内几家公司已经在全国范围内开展大规模的临床实践了。按照行业分析的结果,市场基本被华大基因(BGI)、贝瑞和康(BERRYGENOMICS)、安诺优达(ANNOROAD)三家公司所占领,后达安基因匆忙加入,不算晚,毕竟是上市公司,凭借现成渠道快速占领市场份额。(下简称华大、贝瑞、安诺和达安),剩下不多的份额由其他公司共享。  华大目前已经成长为全球范围的基因组行业巨头,网上太多报道了,不多说,其科技服务业务正筹备上市。贝瑞和安诺的几位创始人背景比较类似,属于中外合璧,而且都有在华大基因和海外工作留学的经历。华大内部的员工早年曾笑称两个公司为&ldquo 华小&rdquo ,如今两个&ldquo 华小&rdquo 已经不小了。基于这一关系,三个公司之间相当了解对方,员工之间私下交流活跃。华大位于深圳,当地给予了极大的支持,在媒体上的曝光度近年极高,贝瑞则因为与夏家辉等方面的合作让人熟知,而位于北京的安诺则行事低调。在技术上,无论在实验流程、成本控制、算法和数据分析等方面,三家公司的无创产前技术相当,得在研发实力上较量。而达安则属于上市公司杀入新兴业务。不过由于企业自身的DNA缘故,在测序和生物信息技术实力不如前三者。  试点之争  华大基因、贝瑞和康和安诺优达在无创产前检测的商业模式基本一样,通过医院建立几乎唯一的渠道,给孕妇提供服务。达安则借助已有的渠道开展业务,但本质上与三家公司基本无异。  无创产前业务一直囵于灰色状态运行。华大和安诺基于自身的独立医学检验所开展业务,贝瑞和康则更多借助夏家辉院士主办的遗传病医院为牌子销售。担心临床测序,特别无创产前业务的失秩,国家卫计委和药监局在今年春节后叫停了无创产前业务并准备实施临床试点审批。由于申请者众多,各种监管和行政流程也未能在短时间内理顺,因此到目前为止,仍然未有试点批准时间的公布。乐观得看,第三季度试点将落定。按照常理推测,华大、贝瑞和安诺等将会入选。拿到试点资格就拿到船票了吗?这就见仁见智了。  测序仪厂商龙虎斗  华大基因最早展示了它整合产业链的野心,通过收购美国Complete Genomics(CG)公司,获得了美国人的测序仪,但由于种种原因,到目前为止这一机器难以小型桌面化,意味着机器不能往外销售。但这不妨碍华大利用此机器向药监局申请机器和无创产前试剂以及分析软件的批文。由于收购CG后与Illumina关系不佳,CG也不能外销,再考虑多种商业原因,华大和Life Technologies(Life)公司合作,帮助后者的Proton测序仪进行国产化的运作,以国内民企机器身份提交医疗器械申请。这也一定程度反应了华大对自己的CG机器缺乏信心。另一方面,达安也与Life公司走在了一起,成立合资公司,同样走Proton国产化申请的道路。  因此,对Life公司而言,虽然它的测序仪在技术竞争力不如Illumina的机器,但在中国市场运作上却迈出了聪明一步。因地制宜,此种策略可以大大缩短机器和试剂等的cFDA注册时间,并且可借助华大和达安的现成的无创产前技术力量和试剂生产经验快速拿到这一产品的相关批文。一旦拿到合法身份,Life将凭借着时间优势通过合法的方式大量销售机器和试剂,快速占领医院渠道,从而领先Illumina。  如果Illumina未能充分意识到这一策略的重要性,按照美国式思维,那么其很可能丧失中国市场的领先优势。最终Illumina放下傲娇的身段,开始了与贝瑞的合作。通过未公开的协议,估计会走与Life一样的路线申请机器和无创产前检测的批文。时间有多快,只能拭目以待了。  尽管如此,由于Life同时联合华大与达安进行申报和布局,属于双拳出击,明显要比Illumina的单腿走路要有优势。  可见,下游应用公司掌握数据和渠道,再加上时间因素,对测序仪厂商产生了巨大的吸引力和战略价值。到目前为止,华大、贝瑞和达安的策略都比较明显了,都牵手了上游测序厂商。安诺至今为看到公开的相关行动,如果其与任一家测序仪厂商合作,那么对另一家都不是一件好事。不管如何,Life和Illumina两个全球最大的测序仪生产厂家将极有可能成功借助国内应用公司的力量,通过无创产前检测这一先锋业务奠定在中国的临床测序市场的老大地位,由于测序仪是开放平台,可以开展几乎全方位的各种临床测序应用,在医院采购后,就很难短期内被替换掉了。因此,国产测序仪厂商的劣势就很明显了,错失时机无异需要付出更大的代价。  医院的馅饼or陷阱  作为产业链的一环,很多医院一直希望自身能够掌握无创产前检测这一技术,从而不需要通过与临床测序公司合作而直接对孕妇服务。不过,四年的时间已经过去,中国未有任何一家医院能够掌握此项技术。这些医院的妇产专家可能把问题想得过于简单。无创产前检测技术与常规生化检测完全不同,它是分子生物学和生物信息学的结合,光测序不能成事,后面的数据分析几乎没有医院能够独立完成研发。没有一个生物和IT复合人才的团队是不能成事的,光人才配备就得挑战大部分医院现有的人事管理。就算勉强完成研发,成本控制、数据和实验稳定性保证以及样本流程管理也是一个系统工程,并非配备一两个技术人员就能够完成的事情。医院对这一点不要抱有幻想。  因此,当医院听到这些无创产前检测公司提出要赠送测序仪时,别高兴太早,听起来很美好,但这种行为更多是一种商业策略。用不起来,没有真正价值,平添烦恼。如果医院要求这些公司进行全套技术输出,谈何容易,毕竟这些都是他们赖以生存的核心竞争力。因此,医院在这个测序仪投放这一事情上,肯定不能期望短时间内就能拥有技术。  基于目前临床基因检测行业所处的技术阶段和中国医院的实际情况,绝大部分医院应考虑与公司合作,这是最优选择。如果确实要建立医院自身的临床级别的测序和生物信息分析平台,那么待机器高度自动化和集成化后再行动不迟。商业的力量将推动产前基因测序、肿瘤和遗传病等方面的应用走向越来越傻瓜化。这一天不会来的太慢。  篇幅所限,没法说得全面,有时间我会详细分析这一块。  结束语  2014年,监管部门对临床测序的叫停和试点开展,加速了中国特色的基因行业大环境的形成,这个大环境使得上下游整合在极短时间内实现,也将催化测序仪大鳄Illumina和Life在中国市场的主导格局。国内的企业,华大基因、贝瑞和康、安诺优达和达安基因,开始形成行业第一梯队并建立自身的优势。
  • 南宁新增一家甲流临床检测实验室
    南宁市第四人民医院的临床基因扩增检测实验室通过了资格评审,成为了市一级医疗机构中,第三家具备甲流临床检测能力的医院,使南宁市应对甲流的防控能力进一步增强。  据介绍,临床基因扩增检测实验室能针对甲型流感、乙肝、艾滋病等疾病进行分子生物学方面的确切诊断和鉴别。尤其是在目前甲流流行期间,病人样本送到实验室后,6小时以后就能把准确的报告送到临床医生手上。  目前,广西卫生部门正在制定医疗机构开展甲流检测的收费标准,检测工作将在不久后正式在医疗机构中开展。
  • 基因测序深入临床第一步!国家药监局公开征求测序仪临床评价注册意见
    国家药品监督管理局发布通知,公开征求基因测序仪临床评价注册审查指导原则。该指导原则为对基因测序仪的一般要求,意见稿规定临床申报产品需明确基本原理、产品类型、核心部件等结构组成、性能参数要求及软件核心功能算法、适用范围及预期用途、安全性评价等产品评价方面。以下是通知详情:各有关单位:  根据国家药品监督管理局2021年度医疗器械注册技术指导原则制修订计划的有关要求,我中心组织起草了《基因测序仪临床评价注册审查指导原则(征求意见稿)》。经文献汇集、企业调研、专题研讨和专家讨论,形成了征求意见稿。  为使该指导原则更具有科学合理性及实际可操作性,即日起在网上公开征求意见,衷心希望相关领域的专家、学者、管理者及从业人员提出意见或建议,推动指导原则的丰富和完善。  请将意见或建议以电子邮件的形式于2021年10月27日前反馈我中心。  联系人:郑生伟、方丽  电话: 010-86452541;010-86452538  电子邮箱:zhengsw@cmde.org.cn;       fangli@cmde.org.cn  附件:1.基因测序仪临床评价注册审查指导原则(征求意见稿)(下载)     2.《基因测序仪临床评价注册审查指导原则(征求意见稿)》意见反馈表(下载)国家药品监督管理局医疗器械技术审评中心2021年10月13日
  • 高通量PCR临床诊断解决方案发布!多方面助力临床检测
    6月10日,普济生物于上海召开“高通量PCR临床诊断解决方案新品发布会”,会议以“突破边界,智领未来”为主题。此次发布会邀请到全国卫生产业企业管理协会医学检验产业分会宋海波会长为活动致辞,复旦大学附属妇产科医院遗传中心徐晨明主任、上海交通大学附属瑞金医院肿瘤科黎皓主任、复旦大学附属中山医院急诊科宋振举主任进行高通量PCR在不同应用领域的主题分享,以及多位临床诊断领域的专家学者汇聚一堂,就相关诊断技术进行深入讨论和交流,与行业共同分享最新的研究成果和应用经验。发布会现场会议现场,普济生物发布了万重™高通量PCR临床诊断解决方案,以检测信息量多和检测灵敏度高的双重优势,可简便、快速、经济地实现原本需要复杂设备才能完成的临床应用,兼顾时效与成本,支持IVD入院和普及下沉。突破多重检测限制,高通量PCR临床诊断解决方案发布分子诊断是发展最快的IVD细分领域,相比生化诊断、免疫诊断等,分子诊断凭借检测时间短、灵敏度更高、特异性更强等优势,在疫情和政策的双重推动下已成为临床检验重要的发展方向。目前常见的分子诊断技术主要包括PCR(常规PCR、qPCR、dPCR)、基因芯片及NGS等,这些技术平台各有千秋,形成了一种微妙的平衡。其中,PCR以高灵敏度、易于推广、性价比高等优势成为应用最成熟、市场份额最大的技术平台。人们为了解决研究中出现的新需求,不断对PCR技术进行改良,完成了从定性到定量再到精准定量的升级。但检测信息通量有限仍是一大桎梏,制约了其临床应用的范围。对于需要高通量检测的场景,NGS具有高通量和准确率高的优势,但操作繁琐,耗时长且成本高,阻碍了临床渗透率的提高。分子诊断主流技术平台普济生物致力于在保留PCR原有优势的基础上,提高检测信息通量。会议现场,普济生物重磅发布了万重™高通量PCR临床诊断解决方案。全国卫生产业企业管理协会医学检验产业分会宋海波会长为会议致辞,他表示,三年疫情给分子诊断创造了无比广阔的发展空间,中国的体外诊断技术在常规领域已经达到成熟水平,但在一些前沿技术和特殊领域还有待发展。临床迫切需要高质量、高通量的分子诊断产品,普济生物带来的高通量PCR系列解决方案,为未来分子诊断赛道增加了新的想象空间。宋海波会长致辞普济生物联合创始人兼总经理尚午博士对万重™高通量PCR临床诊断解决方案进行现场介绍,基于高通量PCR仪器平台,针对不同症候群开发的多靶标高通量检测试剂盒,搭配自主开发的高通量PCR自动分析算法,万重™高通量PCR临床诊断解决方案可以实现从样本进到结果出,整体不需要复杂的信息分析,就可以快速给临床提供有效的信息。尚午博士现场进行产品介绍复旦大学附属妇产科医院遗传中心徐晨明主任认为,高通量PCR有助于推动精准无创的出生缺陷筛查更广泛地在全国普及。她表示,经过多年综合防治,我国22种重大出生缺陷疾病的发生率已大幅下降。目前由于成本等因素的考量,医保尚未覆盖NIPT等无创筛查项目。普济生物的万重™高通量PCR临床诊断解决方案足够快,足够便宜,精准度高且高通量,可以助推出生缺陷无创筛查的下沉和广泛普及。徐晨明主任线上分享高通量PCR在出生缺陷中的应用上海交通大学附属瑞金医院肿瘤科黎皓主任表示,基因检测是肿瘤精准诊疗的前置条件,万重™高通量PCR临床诊断解决方案集qPCR、dPCR和NGS多种技术平台的优势为一体,靶点“多”,周期“快”,性能“好”,成本“省”,实现从样品到结果的完整解决方案,无需复杂生信分析,可院内自行开展,是更适合临床的解决方案,可广泛用于肿瘤伴随诊断、早筛预后、免疫治疗阶段。黎皓主任分享高通量PCR在肿瘤精准诊疗的应用复旦大学附属中山医院急诊科宋振举主任表示,感染性疾病是全球主要死亡原因之一,其主要特点为病原谱种类繁多但有共性,紧迫程度高且面临全球耐药性问题。目前临床主流的检测方法存在周期长、靶点少、灵敏度差、检测成本高等问题,无法同时满足便捷、快速、全面、精准的普筛需求。普济的高通量PCR检测覆盖靶点全,检测周期短,性能更好,性价比高,可以指导临床合理用药。宋振举主任介绍高通量PCR在重症感染病原精准诊疗的应用发布会当日,普济生物也同步启动了高通量PCR在脓毒症病原体早期诊断价值的全国多中心临床研究项目。未来普济生物还将致力于推动相关指南共识的建立,助力行业发展。基层IVD市场放量,助力复杂检测项目入院和下沉随着国家区域医疗中心建设、分级诊疗、集采等推动,基层诊疗服务能力成为关键词,将带来基层IVD市场的进一步扩大。过去三年,新冠疫情推动了国内分子诊断的快速成熟,遍布各级医院的PCR检测设备和熟练掌握PCR检测技术的临床工作人员,无疑也为高通量PCR临床检测平台在院内实施提供了落地基础。虽然政策和市场环境利好,但入局基层IVD市场并非易事。一方面,基层医疗费用远低于三级医院,叠加DIP/DRGS影响,在有限的费用支撑下,要入局广阔的基层IVD市场,势必需要追求产品质量和成本能力的同步提升。另一方面,当前复杂的检测项目都基于高通量的NGS平台完成,不仅操作复杂、耗时长,且成本较高,影响了高端检测项目的入院和下沉,也推动了NGS院外检测模式的发展。但事实上,这不仅难以保证产品质量,从患者支付角度来说也不利于国家监管。万重™高通量PCR临床诊断解决方案实现了复杂检测工具的简单化,兼具检测速度、灵敏度和性价比等优势,具有良好的卫生经济学价值,可助力IVD入院和普及下沉,为行业各方带来重要价值。这无疑是推动高端分子检测走向基层医疗市场的一大步,相比NGS,高通量PCR更适于在基层临床机构开展,是临床上普适性更强的技术平台,目前已在多个应用领域展现出潜力。临床潜力进一步释放,推动健康精准可及目前,普济生物的万重™高通量PCR临床诊断解决方案作为推动复杂检测工具入院和下沉的有益助力,已覆盖出生缺陷、肿瘤精准诊疗及重症感染三大应用领域。会议现场,专家也对三大领域做了主题分享。 ● 推动肿瘤诊疗关口前移,助力实现“治未病”近年来,分子检测在肿瘤精准诊疗的临床应用迎来快速增长,肿瘤伴随诊断是核心应用。事实上,肿瘤基因检测市场不止伴随诊断,高通量PCR在肿瘤早筛和预后场景同样有巨大潜力。据估计,目前肿瘤伴随诊断市场规模约为50亿元,相比之下肿瘤早筛市场规模高达600亿元,预后市场规模约为240亿元。其中,早筛针对健康人群,预后针对肿瘤患者,都是“治未病”的阶段。主要特征为没有患病组织,只能对血液样本进行检测。其次血液样本的肿瘤DNA非常少,对于检测灵敏度要求很高。最后,检测信息足够多才能达到筛查效果,并且需要多次检测,从而对成本的敏感性也很高。总的来说,肿瘤早筛和预后阶段既要求检测工具覆盖面足够多,又需要高灵敏度,还需控制性价比,高通量PCR能较好地满足这些需求。 ● NIPT需要“去中心化”,高通量PCR可实现临床快速落地在出生缺陷领域,NIPT检测是普济生物重点布局的产品。随着大众对出生缺陷预防意识有所增强,以及产前检测指南的更新,我国NIPT市场渗透率迅速增长。据统计,截至2021年我国NIPT行业市场规模为65亿元,预计2022年增长至85亿元,市场潜力巨大。目前NIPT的解决方案以测序为主,测序成本高且操作复杂,具有明显的“中心化”特征。多个一线城市已将NIPT纳入医保计划,对产前筛查的意识已形成。然而,欠发达地区尚未形成这种意识。NIPT对于检测工具的下沉,也即“去中心化”有着实际的需求。高通量PCR能够助力复杂检测项目的下沉,未来NIPT有望成为高通量PCR在临床快速落地的应用。● 重症感染的检测通量要求极高,高通量PCR优势显著感染是急危重症患者死亡的主要原因之一。在中国,感染性疾病占所有疾病的50%以上,其中脓毒症患者病死率高达50%。重症感染的致病病原有非常多可能性,需要对数十个不同的检测靶标进行检测,对于检测的“多”要求很高,目前只有宏基因组可以实现。同时,重症感染具有时间紧迫性及样本复杂性,对于检测的时效性和灵敏度要求也很高,目前只有高通量PCR才能满足。高通量PCR有望成为重症感染领域更快速、精准、高性价比的解决方案。在分子诊断这一值得长期耕耘的朝阳赛道,突破了检测信号限制的万重™高通量PCR临床诊断解决方案正在覆盖到更多应用领域。未来,普济生物将持续推动技术升级,实现产品在性能和自动化等方面的精益求精,将高通量PCR广泛应用于各级医院、临床检验实验室,真正实现“普济”,惠及更多人群。》》》会议推荐《《《2023年6月28-30日,由仪器信息网举办的第七届PCR技术网络会议(iCPCR 2023)将在线开播,众位PCR技术和仪器研发专家,PCR技术应用专家,前沿科学研究PI等嘉宾将在3i讲堂分享精彩报告。立即报名》》》 参 会 指 南 一、主办单位仪器信息网二、会议时间2023年6月28日-30日三、会议日程第七届PCR前沿技术与应用网络会议(iCPCR 2023)时间专场主题6月28日上午新产品与新技术6月28日下午分子诊断应用6月29日上午药品/生物制品应用6月29日下午农林育种应用6月30日上午动植物疫病应用(上)6月30日下午动植物疫病应用(下)详细日程点击查看:https://www.instrument.com.cn/webinar/meetings/icpcr2023/ 扫码直达报名页面温馨提示1) 报名后,直播前一天助教会统一审核,审核通过后,会发送参会链接给报名手机号。填写不完整或填写内容敷衍将不予审核。2) 通过审核后,会议当天您将收到短信提醒。点击短信链接,输入报名手机号,即可参会。四、会议联系会议内容及报告赞助仪器信息网 刘编辑:13683372576,liuld@instrument.com.cn
  • 基因测序普遍应用仍待临床准入
    只需几毫升外周血,少量体液,甚至是唾液或漱口水,就可以捕捉、测量人体中某些特定的基因片段,预知疾病风险或早期诊断疾病,甚至,发现癌症滋生的蛛丝马迹。作为生物科技前沿,基因测序技术尚未广泛临床应用,就因为安吉丽娜.朱莉、乔布斯等明星的追捧而赚足眼球。  在中国,基因测序技术的投资与应用,今年如同坐上&ldquo 过山车&rdquo ,2月被国家食药总局和国家卫计委以&ldquo 未经审批滥用&rdquo 为由,全面&ldquo 叫停&rdquo 临床使用 其后,国家食药总局又将酝酿多年刚刚出炉&ldquo 创新医疗器械的优先审评审批&rdquo 政策,优先用于基因测序诊断产品,并于7月初宣布,批准华大基因两款基因测序仪及其检测试剂盒注册为医疗器械,允许上市。  就在上个月,国家食药总局明确表示,已与国家卫生计生委达成共识,&ldquo 用于临床基本诊断的基因测序产品,需经食品药品监管部门审批注册,并经卫生计生行政部门批准技术准入后方可使用&rdquo 。  纵观市场,供给一方,已有多家基因测序企业整合优势技术与融资,希望效仿华大基因,快速通过国家创新医疗器械优先审评审批的&ldquo 绿色通道&rdquo ,以抢占医疗服务市场先机 需求一方,仅 &ldquo 无创产前基因检测&rdquo (俗称&ldquo 无创产筛&rdquo )一项,&ldquo 单独二孩&rdquo 政策每年多带来的百余万高龄孕妇,已扩生出数以亿计的市场空间,更遑论公众对患癌风险的恐惧渴望。  但是,在基因与疾病的复杂关系中,基因测序技术如何能更规范地应用于临床,诊断、监测、辅助治疗某种特定疾病,而不会变成忽悠骗钱、甚至挑战伦理的&ldquo 神术&rdquo ?无论是监管部门、行业,还是普通公众,似乎还有很长一段路要走。  7月2日,国家食品药品监督管理总局宣布,已于6月30日批准华大基因两款基因测序仪及其检测试剂盒作为医疗器械注册。这距今年2月4日,国家食药总局和国家卫生计生委联合发文叫停基因测序技术临床应用,还不到5个月。  即使在基因测序技术已因CLIA(临床试验室改进法案)制度已较普遍应用于临床的美国,基因测序诊断产品要获得FDA(美国食品药品管理局)的医疗器械认证,也并不容易,用时一般在两年左右甚至更长。  对此,国家食药总局的官方解释是,基因测序诊断产品,适用于今年3月起试行的《创新医疗器械特别审批程序》。国家食药总局将继续对申请医疗器械注册的其他基因测序仪产品,实施优先审评审批。  然而,利好政策,虽激活了曾因&ldquo 叫停令&rdquo 一度陷入停顿的中国基因测序业界,却也引发一些质疑声音。  7月15日,中科院北京基因组研究所DNA序列测定技术研究开发中心副主任任鲁风教授,在科学网上质疑国家食药总局的审批过于仓促。  此前两天,任鲁风还以公民身份,向国家食药总局提起政务信息公开申请,希望该局详解对二代基因测序诊断产品审批的具体流程。  就在同时,国家食药总局也回复了新京报记者的采访问题,指出获得医疗器械注册只是一个开始,基因测序技术要想正式应用于临床,还须经过卫生计生部门的临床技术准入。  新京报记者了解到,国家卫生计生委将分类审批基因测序技术的临床研究试点。临床研究项目不仅包括此次获批的医疗器械适用征:无创产前基因检测,也包括之前有效性颇受争议的癌症早期风险检测。  释疑1  获医疗器械审批临床即可使用?  国家卫计委  仍将分类评估、准入测序技术临床应用  虽然已有两款二代基因测序仪作为医疗器械审批,但新京报记者获悉,国家卫计委仍将分类审批基因测序技术的临床研究试点。临床研究包括之前有效性颇受争议的癌症早期风险检测。  国家卫生计生委医政医管局7月给新京报的书面采访答复称,3月以来开展的基因测序临床研究试点仍在审批中,正在对各地申报机构进行核实、分类,随后将组织专家进行评估,以确定试点单位,规范、有序开展二代基因测序技术的临床应用。  华大基因技术负责人赵立见向新京报记者介绍,基因测序临床研究试点将分四类审批,包括产前筛查和产前诊断 单基因病检测 此前被夸大宣传、市场滥用的肿瘤早期风险检测和个体化用药 还有试管婴儿前,对胚胎进行遗传病检测。  目前,华大基因、贝瑞和康相关负责人已先后向新京报记者表示,正在协助一些三甲医院,积极接受基因测序技术临床应用或研究的试点审批。  释疑2  基因测序如何规避伦理等风险?  国家食药总局  基因测序仪将作为高风险医疗器械监管  今年2月,两部委在基因测序技术临床应用的&ldquo 叫停令&rdquo 中称,基因测序技术未经审批即广泛应用,缺乏安全性、有效性、伦理风险的评估和监管。  任鲁风等业内人士也曾公开发声,担忧在没有完善技术监管的现状下,&ldquo 无创产前基因检测&rdquo 很容易被应用于胎儿性别鉴定 而随着基因测序技术的临床推广,存放于第三方检测机构的大量基因测序数据一旦泄露,不仅暴露公民个人隐私,也可能造成基因歧视。  国家食药总局医疗器械监管司司长童敏表示,刚刚获批的医疗测序诊断产品,属于《医疗器械管理条例》中的三类医疗器械,即安全风险性较高的医疗器械。国家食药总局将据此对未来基因测序技术及相关诊断产品的临床使用开展监管。  童敏说,针对新获批作为医疗器械临床使用的基因测序诊断产品,国家食药总局正在组织相关的省级食药监管部门,对这种新产品的生产及临床使用情况,进行摸底和例行监督检测。  深圳拟聚拢基因测序企业  7月初,坐落于深圳国际生物谷的华大基因拿到我国首个针对基因测序诊断产品的官方批准文号后,深圳市市长许勤立即召开华大基因发展专题研究会议,部署充分发挥华大基因在全球基因测试分析领域的领军作用,加快新技术、新成果的转化和应用,以深圳国际生物谷为平台,聚集更多的优质创新资源和产业链上下游的优秀企业,打造生物产业高地。  实际上,去年年底公示实施的《深圳国际生物谷总体发展规范(2013-2020)》,即明确要探索有利于生物科技发展的政策法规,争取将生物谷上升为国家战略。  7月8日,深圳市市场与质量监管委员会巡视员王夏娜在北京向媒体介绍,深圳国际生物谷将建立以华大基因为依托的生物聚集地,将成为全球最大的基因诊断平台,生物样品和细胞库。聚集10家以上高水平的医学机构,1到2家以上的特色学院,新建三家以上的国家级研究平台,探索建立中国生物科技联合高等研究院。  &ldquo 毫无疑问,生物技术是继信息技术之后发展潜力和空间最大的,对经济社会影响最深刻的高技术领域,未来深圳将不断完善生物产业,生命健康产业发展规划及政策体系,在各方面提供更具针对性、有效性的服务,支持包括华大基因在内的生物技术企业加快发展,让世界及国内有意落户深圳的生物技术企业,在深圳有长足的发展。&rdquo 王夏娜的一番话,足以显示深圳市聚拢基因测序企业的愿景。  现状  多家基因测序企业&ldquo 追赶&rdquo 申报  7月初,拿到医疗器械&ldquo 准生证&rdquo 的华大基因在京启动&ldquo 千万家庭远离遗传出生缺陷&rdquo 计划,宣布两款获得国家食品药品监管总局注册的基因测序仪BGISEQ-1000和BGISEQ-100,将通过与医院共建联合实验室、第三方检测等形式,在临床大规模推广无创产前基因测序服务。  此前,和华大基因比肩竞争的国内其他基因测序企业也不甘落后,纷纷拿出自家的技术核心款基因测序仪,&ldquo 追赶&rdquo 向国家食药总局申报医疗器械注册。  7月22日,贝瑞和康与美国Illumina公司正式宣布合作,选择使用Illumina新一代基因测序技术作为贝瑞和康向国家食品药品监督管理局(CFDA)提交临床检测项目的注册申请的核心技术平台,在中国提供以高通量测序技术为基础的临床检测业务。&ldquo 叫停令&rdquo 前,在&ldquo 无创产前基因检测&rdquo 临床服务领域,贝瑞和康的市场份额,紧随华大基因。同期,贝瑞和康还高调宣布其自主研发的&ldquo 无创单基因疾病检测&rdquo 技术,称利用特定的引物和独特的扩增方法,能够将血浆中游离的碎片化目标DNA悉数捕捉、富集,对其进行高通量测序,实现单基因病的定性和定量检测。  7月底,另一家成立只有两年的基因测序企业&mdash &mdash 安诺优达CEO梁峻彬也向媒体表示,已就公司拥有的基因测序测序仪、试剂盒及配套软件向国家食药总局申报医疗器械注册 同时,也在携核心技术申请由国家卫计委审批的临床研究试点。  安诺优达和贝瑞和康都位于北京,也是基因组技术出身的三家公司之一。  经过两年的发展,向来低调的安诺优达已获得两轮融资,目前占据国内市场份额10%。在日渐激烈的市场竞争下,安诺优达的定位,除无创产前外,还力图在试管婴儿、不孕不育等生育服务以及肿瘤个体化治疗等领域进行差异化竞争。  上个月,国家食药总局向新京报记者介绍,深圳华因康基因科技公司也已就其生产的基因测序仪产品提出了注册申请。  对于合规申报医疗器械注册的其他基因测序仪产品,国家食药总局也将按照《创新医疗器械特别审批程序(试行)》的要求予以优先审评审批。  前景  基因技术或引发个性化医学革命  从PCR,到基因芯片,到近10年来崛起的高通量基因测序技术,基因检测技术的发展,可谓一边探索性地建立规则,一边又飞跃崛起式地打破规则。  生物医学界已经达成共识,由于基因与人体生老病死之间的密切关系,随着研究的不断深入,在未来10-20年,可能会出现一场个性化医学的革命。&ldquo 这种革命不仅包括疾病的风险监测、早期诊断、干预和治疗,还有助于更多靶向药物的开发,患者可以根据自身状况选择最合适的那种药&rdquo ,基因检测业内人士吴彬介绍,基因技术很早就被寄予厚望,从2003年人类基因组序列图绘制成功至今已经有十余年,但人们对于这项技术的应用仍然处于早期。  &ldquo 基因测序只是健康服务的第一个环节,更重要的是解读与针对性治疗。&rdquo 安诺优达CEO梁峻彬如是理解基因测序带给医疗界的颠覆作用。  深圳市市长许勤还曾公开提出,基因科技不仅是大科学、大数据、大产业,还要有大健康,要让科学发展能够惠及民生,深圳将利用基因检测诊断技术,在未来几年内有效地控制21三体、18三体综合征等一系列致残、致疾等重大的遗传性疾病,就像当年消灭天花和血吸虫病一样。  无创产筛  个人体验  价格没变速度快了  记者采访到一位曾经进行过产前无创筛查的准妈妈,她告诉记者,自己在今年5月份,即孕周16周时进行了基因产前无创产前检查,这位准妈妈介绍,自己在位于顺义的某家医院进行了相关检测,&ldquo 过程很简单,医院的妇产科会代采血,现场完成采血后,与相应的检测机构签订合同并交款,收费为2500元。而且现场只接受POS机刷卡,不接受现金交易。7-10个工作日即可出结果,检测结果出来后,一般会先发短信通知我们,然后会将检测结果快递给我们。如果检测结果发现有问题,检测机构会补偿做羊水穿刺的花费&rdquo 。  至于为何选择产前无创的筛查方式,该女士介绍,&ldquo 我是通过做医生的朋友了解到羊水穿刺有一定的流产率,基因检测的准确率与羊水穿刺相当,而且是一种无创手段。我在两年前生育第一个孩子时也选用了同样的方式,当时是在一家私立医院做的,程序基本是类似的,但当时出结果比较慢,要15个工作日左右,价格与现在差不多,这次生二胎医生建议进行羊水穿刺,而且当时医生也告诉我基因检测已经被叫停了,后来我在一些妈妈群里看到有人讨论说还可以做,就找了相应机构。&rdquo   普及后价格能否更亲民  有望降至1000元以下  北大人民医院产科主任张晓红介绍,使用二代基因测序技术的&ldquo 无创产前基因检测&rdquo ,是准确率较高的产前筛查技术,可以避免多数孕妇接受风险较高的产前诊断(俗称&ldquo 羊水穿刺&rdquo )。但从成本和可及性考虑,医院不推荐每个孕妇直接接受&ldquo 无创产筛&rdquo ,&ldquo 毕竟价格不菲,也不是医保报销项目&rdquo 。张晓红表示,羊水穿刺对孕周有所限制,由于所提取的为胎儿细胞,不宜太晚进行,经验非常丰富的医生每天8个工作小时最多可分析3例,目前北京仅有6家医院可以进行,供需矛盾比较集中。  新京报记者了解到,&ldquo 叫停令&rdquo 前,无创产前基因检测服务的价格由提供底三方检测的测序企业与医院或地方卫生行政部门协定,一般在2000-3000人民币之间。华大基因总裁汪健表示,作为国家批准的医疗器械,二代基因测序诊断产品将广泛应用于临床的无创产前基因检测服务,随着技术的普及,未来两三年内,&ldquo 无创产筛&rdquo 服务的价格,有望降至1000元以内。王夏娜此间表示,产前无创基因检测服务,在深圳已正式纳入生育保险报销范围,以减轻孕产妇家庭的负担。  &ldquo 无创产筛&rdquo ,只是基因测序技术的一个小应用。随着二代基因测序技术的成熟和普及,个人全基因组测序的成本,已从2001年的9500万美元,降至2011年初的2万美元以下。目前,全球多家基因测序研究机构和企业,已加入&ldquo 1000美元一个人类基因组&rdquo 的目标竞赛。业界称,1000美元,接近于做一次核磁共振的费用,是可以被各国医疗保障体系接受的价格。
  • 国内首个全基因组测序临床研究在沪启动
    p  儿童罕见病诊断领域10日率先启动创新型临床研究项目,将系统地评估全基因组测序在不明原因智力落后/发育迟缓、多发畸形等罕见未确诊儿童患者中的应用指征及诊断效果,通过临床表型和基因型关联统计分析我国临床应用和共识,进一步规范和指导全基因组测序在儿科临床应用、实验室的检测及报告,并构建我国儿童遗传疾病检测基因组数据库。/ppbr//pp  项目由中国医师协会医学遗传医师分会、上海交通大学附属新华医院和中南大学湘雅医院共同发起,其中新华医院亦是上海市罕见病诊治中心。/pp  “基因测序已经经历了两个阶段,即一代的基因芯片和二代测序。此次推动的将是真正的全基因组测序。” 这一项目负责人,新华医院儿科专家、上海儿科研究所分子平台负责人余永国教授说,“单基因、全外显子、基因芯片等现行的基因测序方法在临床上仍然无法对一些罕见病做出明确诊断,有患者要耗费3、5年经过7次基因检测才能确诊,而全基因组测序可以检测出此前无法检测的复杂的基因组结构变异等。这一技术如果在临床上的应用,有望大大提高罕见病的诊断。/pp  “为儿童罕见病诊断,提供全基因测序是一件非常严谨的事情。即便是患者材料的审核都非常关键,新华医院目前严格执行相关方案,这些方案都经过医院伦理委员会的严格审批。”余永国介绍,“根据方案,应由临床医生筛查临床资料,由实验室重分析测序数据,由此才能保证实验的科学性和可行性。”/pp  目前阶段,在罕见病诊疗中,诊断更重于治疗。目前全球范围内已确认的罕见病种约6000至7000种,约有80%的罕见病是由遗传缺陷所致,其中一半的罕见病患者在出生时或者儿童期即发病,但大部分罕见病的成因目前尚不明确。/pp  项目将探索通过全基因组测序和数据解读,明确遗传性疾病的发病机制,筛选鉴定疾病诊断的生物标记物和药物靶点,为更精准的个性化治疗方案提供理论基础和研究数据。并以此为基础,建立临床应用标准和共识,指导各医院的儿科临床应用,提高儿科医生诊疗儿童罕见病的整体水平。最终,逐步构建中国儿童遗传疾病检测基因组数据库。/p
  • Life Tech助力基因测序技术更多走入临床
    &mdash &mdash 2011年基因测序技术临床应用学术研讨会在京举行  仪器信息网讯 2011年7月8日,由中华医学会北京分会检验医学分会主办,首都医科大学附属北京同仁医院承办,Life Technologies公司协办的&ldquo 2011年基因测序技术临床应用学术研讨会&rdquo 在北京同仁医院会议室召开,约100余人参加了此次会议。中华医学会北京分会会长金大鹏先生、首都医科大学附属北京同仁医院院长韩德民先生、中华医学会北京分会检验医学分会主任委员郭建先生,以及Life Technologies公司大中华区市场总监Jason LIU先生等参加会议并致辞。研讨会现场韩德民先生 金大鹏先生 郭建先生  此次研讨会以基因测序技术临床应用为主题,就基因测序技术的发展历史及该技术在临床中的实际应用情况等进行了探讨,Life Technologies公司大中国区测序产品经理王博飞先生、江苏省中医院病理科主任医师赖仁胜教授、首都医科大学附属北京同仁医院检验科主任医师鲁辛辛女士分别作了&ldquo 测序技术,从基础研究到临床诊断&rdquo 、&ldquo 综合多技术医学基因平台的实践&mdash &mdash 临床医学基因规范检测应用&rdquo 及&ldquo 微生物基因测序技术的临床应用&rdquo 的报告。Life Technologies 公司大中国区测序产品经理王博飞先生  据王博飞先生介绍,上世纪90年代初,人类基因组计划正式启动,在经过10年时间,2001年初,一个人的基因组草图发表,当时科学家们所用的测序平台就是第一代测序仪,俗称毛细管基因分析仪;2006年,以454公司(现并入Roche公司)模型机为代表的第二代测序仪出现,与第一代测序仪相比,第二代测序仪以&ldquo 边合成边测序&rdquo 为核心思想,从而实现了高通量测序;未来,引领新的应用潮流的第三代测序仪也在陆续研发中,如单分子测序仪等。2010年,Life Technologies公司推出了全新的半导体测序技术Ion Torrent PGMTM,该技术摈弃了前两代测序仪所采用的光学检测技术,而是采用半导体芯片技术,通过密布于芯片上的微反应器孔和感应器来检测基因序列,相比于第二代测序仪,其完成一次测试的时间是2小时,检测通量相对较高。首都医科大学附属北京同仁医院检验科主任医师鲁辛辛女士  鲁辛辛女士在报告中介绍说,&ldquo 第二代测序仪主要有Life Technologies公司SOLID System、Roche公司 454 FLX、Illumina公司 Solexa Genome Analyzer;第三代测序仪则以Helicos公司的单分子测序仪及Complete Genomics公司DNA纳米阵列与组合探针锚定链接测序法为代表。  关于测序仪在临床的应用情况,王博飞先生表示,由于第一代测序仪成熟、稳定,目前应用于临床检测的测序仪基本上全是第一代测序仪,而Life Technologies公司是第一代测序仪的技术引领者,现有仪器3500/3730。而最新推出的基因测序仪Ion Torrent PGMTM由于可以在2小时内完成一次测试,具有更广阔的应用前景。在今年5月德国乃至欧洲爆发的大肠杆菌O104疫情风暴中,Ion Torrent PGMTM被全世界不同实验室选为确定大肠杆菌O104来源平台,在三天时间内完成实验过程,确定了大肠杆菌O104的来源。江苏省中医院病理科主任医师赖仁胜教授  赖仁胜教授在报告中说,上月在美国召开的临床肿瘤学会会议上,会议主席提及&ldquo 现在的肿瘤研究与治疗已经进入&lsquo 基因潮&rsquo 时代&rdquo ,可见基因测序在肿瘤临床方面的热度。同时赖仁胜教授表示,江苏省中医院病理科是国内较早开展基因测序业务的医院,目前病理科拥有3台测序仪,是Kars基因中国区中心实验室。多年来,医院结合基因测序技术在癌症的个性化治疗方面取得了很好的治疗效果。  鲁辛辛女士则介绍了基因测序在临床微生物确定、微量核酸分析、流行株确认及耐药性确认方面的实际应用。Life Technologies 公司大中华区市场总监Jason LIU先生  在研讨会最后的媒体提问环节,笔者问及Ion Torrent PGMTM的推出是否会对Life Technologies前两代测序仪的销售带来冲击时,Jason LIU先生表示,&ldquo 俗话说&lsquo 长江后浪推前浪&rsquo ,新的产品对老的产品永远都有竞争性,在一段时间内,新产品会取代老产品。但是我们也同时相信,老的产品有非常顽强的生命力。特别是如第一代毛细管测序仪,目前Life Technologies该类产品在全球的销售数量远超过10000台,第一代测序仪在科研领域是&lsquo 金标法&rsquo 。第一代测序仪虽然在速度及通量方面不如新产品,但是我们发现第一代测序仪的越来越多地应用于临床。而临床应用与基础科研不同,临床要求准确性与稳定性,而第一代测序仪经过了时间的检验具有这方面的优势。也就是说,第一代测序仪并未消亡与取代,反而在新的领域找到新的生命力。&rdquo
  • 基因测序“开闸”之后 临床解读存在争议
    &ldquo 检测结果让人满意,我得赶紧抽根中华、喝杯茅台压压惊。&rdquo 李先生日前在朋友圈这样写道。  什么检查能让人又抽烟又喝酒?答案是基因检测。  不久前,李先生花了18万元请专业机构解读了自己的基因密码,从抽血到报告出炉,只需要三个星期。  检验报告显示,李先生的&ldquo 吸烟人群肺癌易感性检测&rdquo 结果为&ldquo 野生型&rdquo ,酒精毒性基因检测结果为&ldquo 酒精毒性较小&rdquo ,通俗地说,无论抽烟还是喝酒,他的患癌风险都比较低。  李先生所做的全基因组检测,最近在资本市场、高端体检中心以及临床医疗系统,火爆得一塌糊涂。但对于其是否能用于临床,如何解读,一直存在争议。  近日,有媒体公布了国家卫计委通过的第一批高通[微博]量测序技术临床应用试点单位名单。华大基因董事长汪建此前对《第一财经日报》记者证实,预计会涉及华大等20家医院以及七个临床检测实验室的试点。  这意味着,基因测序将可以真正用于临床,影响重大。  政策一波三折  尽管起步较晚,但我国基因测序近几年却后程发力,发展迅速。  一家涉及基因检测服务的医疗机构总裁金先生对《第一财经日报》记者说,他的医疗科技集团开业短短一个多月,高端客户量就达到了30多人。他们为这些客户提供全基因组的检测及分析并提供后续的健康方案。  或许是步伐迈得太快,让监管层感到了一些隐忧。  2014年2月,食药总局和卫计委一纸通知叫停了临床基因测序,原因是相关产品和技术并没有通过审批。未经审批就做诊疗,算是非法行医,属于严重违法行为。  但仅仅过了4个月,去年6月30日,食药总局就批准了二代基因测序产品上市。其中,华大基因的两款二代基因测序仪和检测试剂盒通过审批。  &ldquo 去年2月被叫停之后,不少院士、专家都呼吁基因测序重新放开,因为在某些领域,基因检测确实有存在的必要。&rdquo 金先生说。  这些必要的领域包括新生儿的全基因组测序、癌症的靶向用药等。  以孕妇产前唐氏综合征筛检为例,有媒体统计,过去3年,中国接受该检测的孕妇已经超过15万人。相较于传统技术,基因测序的准确度比传统的血清测试要高出几十个百分点,达到99%以上。  而一旦叫停,意味着不少可以接受无创诊断的高危产妇,不得不去接受羊水穿刺、脐血等检测方式。这一方法,无论是在测试风险还是后期诊治效果上都远远落后于基因检测方式。  巨大的市场需求、可观的盈利空间让不少拥有基因检测技术的医疗企业、高端诊所和体检中心尝试以&ldquo 非临床途径&rdquo 将基因检测推向市场。  金先生的公司就属于这一性质。&ldquo 我们拥有生命医学检验所以及全科门诊的双重资质。&rdquo 金先生说,像他们这样,避开&ldquo 临床&rdquo 转而运用&ldquo 健康评估&rdquo 的方式间接进行基因检测市场化的企业并不在少数。  价格壁垒待攻  长久以来,大众对于基因测序的想象一直是&ldquo 神秘而昂贵&rdquo 。  单是那一台台检测仪器就价格不菲。目前国内几乎所有的基因检测仪器都靠进口,价格从几千万到上亿元不等。  &ldquo 我们的二代检测仪器购买价格是1.2亿元,单次检测成本约为1000美元,这已经比一代检测仪器成本低了很多。&rdquo 金先生告诉记者。  高昂的检测成本进而转嫁到消费者头上。金先生公司针对高端集团客户收费为5万元左右,单个消费者收费甚至可高达10万元。  慈铭体检公司北京奥亚医院的价目表则显示,该院&ldquo 基因检测&rdquo 体检套餐价高达7.6万元,检测68项基因的价格为3.4万元。  不过,随着技术的发展,价格壁垒并非不可攻破。  汪建此前在接受记者采访时表示,今年华大将推出价格更为亲民的产品,&ldquo 争取将价格降到一两万元&rdquo 。  金先生也认为,未来价格肯定会降低,但不是现在。&ldquo 现在你的价格定得太低,消费者不认可,同行也可能会排挤你&rdquo 。  谁为错误解读买单  李先生对自己的检测报告很满意,但并非所有检测者都这么幸运。  这涉及到基因检测的另一个伦理问题:那些&ldquo 不太幸运&rdquo 的检测者,如果提前得知自己的患癌风险高于常人,生活状态可能完全被打乱。  更何况,在没有监管的情况下,报告解读的准确性难以验证,谁会为错误买单?如何买单?  上海中山医院检验科的一位主任医师告诉记者:&ldquo 从人类基因组密码被破译开始,全基因组测序的检测就不再是难题,真正难的,是你怎样解读基因密码。&rdquo   因此,难以衡量基因检测解读报告的正确与否成为众多科学家不赞成将基因测序商业化的主要原因。  对此,中国科学院北京基因组研究所常务副主任任鲁风认为,制定一个严谨且适应市场需求的行业规范已迫在眉睫。  &ldquo 去年那样将基因测序产品一步叫停的做法是不成熟的,这会对这个正在迅速成长的市场带来伤害。基因测序需要监管。&rdquo 金先生说。
  • 我国细胞和基因疗法注册和临床情况盘点
    细胞治疗一般包含干细胞治疗和免疫细胞治疗。间充质干细胞和造血干细胞是目前临床研究和治疗应用最广泛的干细胞类型,诱导多能干细胞(iPSC)则因其不存在传统干细胞存在的伦理问题,而成为干细胞领域最具前景的干细胞类型之一。CAR-T疗法是当前免疫细胞治疗领域最炙手可热的领域,此外,TCR-T、TIL、NK等免疫细胞疗法也是当前免疫细胞疗法的主要类型。载体介导的基因疗法是目前基因治疗的主要形式,主要包括病毒载体和非病毒载体,广义的基因治疗还包括核酸药物、溶瘤病毒疗法等。本文将重点盘点国内以CAR-T为代表的免疫细胞疗法、以间充质干细胞为代表的干细胞疗法以及基因疗法等临床和注册情况。01 干细胞2004年至今,CDE共承办了62项干细胞药物申请,包括2项进口药品申请和60项国产药品申请,目前已有35项临床申请获得了临床批件或临床默示许可,另有8项申请终止了审批程序或不被批准。从药物注册分类来看,62项干细胞药物申请中共有42项1类新药申请,从2018年至今呈现逐年增长情况,2021年较上一年同比增速超120%,2022年前四个月已有10项1类干细胞药物申请,全年有望以超过50%的增速再创新高。 图1:我国历年1类干细胞药物申请数量 数据来源:CDE从干细胞类型来看,间充质干细胞(包括间充质祖细胞、间充质前体细胞等)共有47项,主要来源包括脐带、胎盘、宫血、脂肪、骨髓、牙髓等;胚胎干细胞、造血干细胞、前体细胞、肌母细胞等其他类型干细胞申请仅15项,包括泽辉生物的人胚干细胞产品CAStem、仙荷医学的支气管基底层细胞产品REGEND001,以及两款基因编辑的干细胞产品——康景生物的CG001和辑因医疗的CRISPR/Cas9 基因修饰BCL11A红系增强子的自体CD34+造血干祖细胞注射液。 从临床试验来看,目前在中国临床试验注册中心登记开展的干细胞相关临床试验多达600余项,而在CDE药物临床试验登记与信息公示平台上登记开展的以药物上市为目的的临床则有20项,其中进度最快的仅推进至临床II期,离推进至上市仍有很长一段距离。表1:以上市为目的登记开展的干细胞药物临床试验数据来源:药物临床试验登记与信息公示平台由研究者发起的干细胞临床研究方面,截至目前我国医学研究登记备案信息系统和卫健委公布的干细胞临床研究备案项目已超100项,批准设立的干细胞临床研究备案机构已达133家(含部队医院)。其中,上海交大附属仁济医院、中山大学附属第三医院分别以6项和5项干细胞临床研究备案项目位居前二,仁济医院备案项目涉及神经系统疾病、骨科疾病和风湿免疫性疾病,中山大学附三医院开展3项针对脊髓损伤的干细胞临床研究,南京大学附属鼓楼医院、郑大一附院、中南大学湘雅医院均以4项干细胞临床研究备案项目并列第三。02 免疫细胞截至2022年5月,全国已有累计131项免疫细胞疗法申请获得CDE受理,其中CAR-T疗法84项、TCR-T疗法8项、TIL疗法4项、CAR-NK疗法2项,其他类型免疫细胞疗法共33项。其中,共有75项免疫细胞治疗产品申请获得临床批件/临床默示许可,包括CAR-T疗法独(56项)、TCR-T疗法(3项)、CAR-NK疗法(1项)、其他免疫细胞治疗(15个)。 图2:我国免疫细胞疗法申请与获批临床情况 数据来源:CDECAR-T领域,我国已上市的瑞基奥仑赛提交的新适应症(成人复发或难治性滤泡淋巴瘤)上市申请被纳入优先审评序列,其以明聚生物申报的用于成人复发难治性套细胞淋巴瘤的JWCAR029也别纳入突破性治疗药物程序。在此之前,已先一步上市的另一款CAR-T产品阿基仑赛的新适应症(复发或难治性惰性非霍奇金淋巴瘤)上市申请也率先被纳入突破性治疗药物程序。从靶点来看,除北恒生物的UCAR-T产品之外,CD19仍是当前扎堆最为严重的赛道,靶向CD19的CAR-T产品共有56个药物申请,其次为BCMA靶点的11个,CD20、CD30、CD70、TGF-β、GPC3、Claudin 18.2、B7-H3等其他单靶点CAR-T疗法。此外,另有4项双靶点CAR-T疗法申请获得CDE受理,分别为赛比曼的CD19/CD20和驯鹿医疗的CD19/CD22双靶点CAR-T疗法。 图3:我国CAR-T疗法靶点分布情况 数据来源:CDE 从临床试验情况来看,目前在CDE药物临床试验登记与信息公示平台上登记开展的CAR-T疗法临床试验共48项。其中,诺华的进口产品CTL019在国内开展的临床试验进度最快,已进入临床Ⅲ期,其他国产1类CAR-T疗法均未进展至Ⅲ期。表2:国内临床阶段CAR-T疗法进展数据来源:药物临床试验登记与信息公示平台其他免疫细胞疗法方面,香雪旗下TAEST16001、TAEST1901和星汉德生物的SCG101三款TCR-T疗法已获得临床默示许可,君赛生物、智瓴生物和沙砾生物各有一款TIL疗法获得CDE受理,国健呈诺的靶向间皮素嵌合抗原受体NK细胞注射液是目前唯一一款进入临床阶段的CAR-NK疗法。03 基因治疗截至2022年5月,国内共有27项基因疗法申请获得CDE受理,其中已有9项申请获得临床批件/临床默示许可,包括诺华的进口腺相关病毒(AAV)基因疗法OAV101注射液。同时,共有6项基因疗法临床试验在CDE药物临床试验登记与信息公示平台登记开展。从载体类型上看,AAV基因疗法(包括重组腺相关病毒)占据主导,共有17项。表3:国内IND阶段的基因治疗产品(除CAR-T)数据来源:火石创造数据库另外,国内目前还有64个溶瘤病毒疗法获得CDE受理,其中已有30项获得临床批件/临床默示许可,主要以疱疹病毒和腺病毒为主要病毒类型,临床进展最快的为达博生物的重组人内皮抑素腺病毒注射液,已进入临床Ⅲ期。
  • 两部委联手叫停基因测序临床应用
    只需一滴血或一点唾液,就能预测罹患多种疾病,如癌症或白血病?日前,国家食药监管总局、国家卫计委联合发出通知,要求在相关准入标准、管理规范出台以前,任何医疗机构不得开展基因测序临床应用;已经开展的,要立即停止。  &ldquo 目前,基因测序相关产品和技术已由实验室研究演变到临床使用,对此,国务院有关部门高度重视。&rdquo 国家食药总局和国家卫计委经过调查研究,正在组织相关领域专家论证。  昨晚,国家食药总局相关负责人坦言,现在基因测序的临床应用多出现于医疗机构和体检中心的高端体检,但其使用的基因测序仪及相关诊断试剂和软件,很多没有经过医疗器械的注册审批。  北京市健康管理协会会长杜兵昨晚表示,基因测序不在北京市卫生行政部门审批准入的医疗技术项目之列,物价部门也没有收费标准。  ■ 释疑 何为&ldquo 基因测序&rdquo 体检?  基因测序,本是一种实验室研究技术手段,近年来因&ldquo 名人效应&rdquo 应用于高端体检、产前诊断等领域,价格不菲。史蒂夫· 乔布斯 苹果公司创始人,2011年患癌去世,曾接受过全基因测序。安吉丽娜· 朱莉 影星,曾通过基因检测,选择手术切除乳腺,以降低患乳腺癌风险。  基因测序最广为人知的,是影星安吉丽娜· 朱莉通过基因检测,选择手术切除乳腺以降低患乳腺癌风险。2011年去世的苹果公司创始人史蒂夫· 乔布斯患癌时,也曾接受过全基因测序。  百度搜索&ldquo 基因体检&rdquo 或&ldquo 基因测序&rdquo ,能看到多家医疗机构、体检中心,甚至公司提供的体检套餐,内容覆盖肿瘤、高血压、糖尿病等基因检测,价格从数百元到数万元不等。  慈铭健康体检管理集团股份有限公司总裁、北京市健康保障协会会长韩小红坦言,如果国家确实下发了&ldquo 叫停&rdquo 的通知,慈铭体检将停止基因体检服务。
  • ASHG年度大会热议基因测序,临床监管体系的构建不容忽视
    p  近年来,基因测序在美国和欧洲已被快速应用到临床领域,但关于临床测序的监管体系仍没有形成。近日,在美国人类遗传学协会(ASHG)年度大会上,临床测序的监管问题再遭热议。参与讨论的成员包括美国及欧洲临床研究人员以及FDA的代表人员等。/pp  strong哥伦比亚大学临床分子遗传学家:扩展基因测序规模,需要卫生保健提供者以及患者的共同努力/strong/pp  哥伦比亚大学临床分子遗传学家Wendy Chung表示,近年来,随着基因测序技术的快速发展,价格越来越低,用于诊断癌症和遗传疾病的基因检测(包括靶向基因检测、外显子测序和全基因组测序)在美国迅速扩张。然而,研究人员仍在探讨基因测序的临床效应及成本效益。/pp  Chung指出,临床研究过程中,在有些情况下会将测序结果反馈给参与者,但临床诊断比较模糊,至少从病人角度来说是这样。公众关注的是测序实验室提供变量注释的有效性,对此,Chung说,变量注释会随时间而改进,因为变异数据收集越多对数据库的构建和纠正越有帮助。同时他强调扩展基因测序规模,需要卫生保健提供者以及患者的共同努力。/pp  strongFDA:强行要求实验室将临床变异存入数据库是一个很有趣的想法/strong/pp  同时,作为精准医疗项目的成员,FDA已经在探索当测序从靶向基因面板拓展至全基因组和外显子时如何对临床测序进行监管。FDA体外诊断及放射保健办公室副主任Liz Mansfield表示,目前FDA正在研究如何以一个更创新的方式来采取不同的监管方式。FDA承认,测序技术在不断地发展,且需要一个监管框架才能让创新继续生长。/pp  为此,FDA去年发表了一份白皮书,并在今年早些时候举行会议讨论测序的监管问题。Mansfield表示,11月中旬将举行两个研讨会,专门讨论NGS分析性能评估的标准方法以及遗传变异临床相关数据库的使用问题,且FDA将在不久发布白皮书附件。Mansfield最后指出,强行要求实验室将临床变异存入数据库是一个很有趣的想法,尽管这种做法在美国是否可能还不明确。/pp  strong欧洲人类遗传协会:科学家对塑造基因检测监管制度应更加积极/strong/pp  根据Cyprus神经学和遗传学研究所带头人 Philippos Patsalis表述,欧洲人类遗传协会一直反对欧盟议会关于体外诊断医疗设备的监管规定。在去年的一份报告中,欧洲人类遗传协会表示该修正案会限制病人和医生进行必要的基因测试。/pp  但欧洲人类遗传协会支持欧盟委员会提出的旨在提高IVDs质量、安全性及可用性的监管制度,其表示对所有基因检测进行强制性遗传咨询会导致过度繁琐及不可行,从而限制基因测序对患者的可用性。/pp  Patsalis表示,直接面向消费者的基因检测在欧洲一直存在争议,人们对医疗监督的缺乏、测序准确性、后续咨询以及隐私保护等方面深表担忧。同时Patsalis呼吁科学家对塑造基因检测的监管应该更加积极主动。/pp  strong爱尔兰国家医学遗传学中心首席科学家:对特殊基因和疾病的现有研究成果不容忽视/strong/pp  爱尔兰国家医学遗传学中心首席科学家David Barton指出,到目前为止,在欧盟关于人类诊断实验室还没有强制的实验室认证。关于LDT的监管,在美国和欧洲已有类似的讨论,尽管关于测序二次结果的问题欧洲采取谨慎的态度而没有采取积极主动的态度。Barton表示,关于在新数据库(如ClinVa)中收集变异信息,对特殊基因和疾病的现有研究成果不容忽视。没有一个人是全基因组专家,但对于个体基因来说有很多专家。/p
  • 基因大数据如何走向临床应用?需克服哪些问题?
    p style="text-align: center " img title="b7003af33a87e950c420af4214385343fbf2b4ed.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201512/insimg/9d9bf8ea-d40a-4f9a-a2e2-7a2e655ed314.jpg"//pp  为了推动基因组研究在临床中的应用,多个国家层面的大规模研究项目已经开启。2014年英国发起了10万人基因组计划,美国和中国也宣布了百万人基因组数据相关计划。许多区域性的大数据计划也在进行中。例如,宾夕法尼亚州的盖辛格健康系统(GeisingerHealth System)和纽约的再生元制药公司合作,计划获取25万人的基因组测序数据。与此同时,世界各地越来越多的医院和服务供应商也开始对那些癌症或罕见遗传病患者进行基因组测序。/pp  海量的数据会给计算分析和存储带来前所未有的压力,有分析估计,基因组学很快就能超过YouTube的数据量。但许多研究者认为,如今的大数据还不够丰富,不具有临床价值。盖辛格基因组医学研究院院长MarcWilliams说,“我不知道100万是否足够,但显然我们需要更多。”/pp  strong变异数据应用到临床的挑战与实践/strong/pp  单核苷酸层面的突变/pp  目前,许多研究机构主要采用外显子组测序,其相对于全基因组而言,可以减少近100倍的数据分析工作量。然而,仍有超过约1.3万个单核苷酸突变被鉴定。这其中大约有2%影响蛋白质的翻译,寻找其中的致病突变是一个艰巨的挑战。/pp  几十年来,研究人员陆续将他们发现的单核苷酸突变信息放入公共资源数据库中,如dbSNP数据库。然而,这些突变信息往往来源于细胞层面、动物模型甚至是理论预测,还不足以用于临床诊断。在许多情况下,这些突变与疾病相关性的证据等级很低。/pp  结构变异/pp  基因组序列的重复或缺失,这类结构变异使临床应用情况更为复杂。现有的测序技术很难检测到结构变异。在全基因组范围内,个体之间存在数百万个变异。其中许多变异位于非编码区,这一区域不编码蛋白但有调节基因活性的作用,仍然是可以致病的。由于非编码区的范围和功能难以界定,即使能够获得其中的变异信息,短期内也无法进行临床解读。/pp  针对这些问题,人们正在努力地去解决。例如,美国国家人类基因组研究所建立了临床基因组资源库,这是一个与疾病相关的突变数据库,里面有可以指导医疗的突变信息和支持证据。GenomicsEngland公司通过建立“临床解读的合作伙伴关系”来推动这方面的进展,即:医生和研究人员合作,建立强大的疾病-基因型关联模型。/pp  大队列的需求明显/pp  一些“恶性”突变通常在进化过程中被淘汰,往往十分罕见,需要大样本量来进行检测。因此,建立有统计学意义的突变与疾病弱相关性模型也需要大量的患者。/pp  冰岛的deCODE Genetics公司将15万人的基因组数据(包括1.5万全基因组序列),与家谱和病史相结合,推断已知的遗传危险因素在全民中的分布情况,包括与乳腺癌、糖尿病和阿尔茨海默病相关的基因突变。正如该公司的首席执行官Ká riStefá nsson所说,“我们建立了1万个有功能缺失突变的冰岛人数据库。我们正投入巨大的精力来弄清楚这些基因缺失对个体有什么影响。”/pp  对于deCODE Genetics公司开展这项工作的成功得益于冰岛人口的基因型同质性,然而,对于其他项目需要更广泛的基因谱。例如,国际千人基因组计划已经编目了一些遗传多样性数据,但大多数数据严重偏向高加索人,使这些数据对临床研究用处减弱。/pp  此外,部分问题也源于参考基因组。第一个参考基因组版本是由几个不同种族的随机捐赠者基因拼凑而成的,但最新的版本GRCh38,整合了更多人类基因组多样性的信息。/pp  strong基因大数据的人才和计算能力/strong/pp  对大规模人群进行基因组或外显子组测序每年产生高达40PB(4千万GB)的数据。相比之下,原始数据存储并不是首要的问题,更大的问题是巨量突变数据的分析。宾夕法尼亚州立大学基因组学研究员Marylyn Ritchie 说,“计算量与人的数量呈线性关系,当变量和组合增多时,计算量就呈指数倍地增加。”如果增加的数据与临床症状或基因表达相关,那么分析会变得更加棘手。来自数千人的巨量数据的处理可能会使目前很多统计分析的工具瘫痪。Ritchie说,“像气象、金融和天文学领域,都在整合不同类型的数据上摸索了很长一段时间,我和谷歌及Facebook的人都交流过,尽管我们的大数据和他们的不同,但我们应该多交流,将他们的经验用于我们的领域中。”/pp  然而,遗憾的是很多有大数据挖掘经验的优秀程序员都被硅谷吸引走了。美国国家卫生研究院的数据科学副主任Philip Bourne认为,科学界的论文评价体系不适合于这些人才。尽管这其中一些人真心想成为基因大数据领域的学者,但却得不到学者的职位。/pp  除了人才,数据处理能力是另一个限制因素。基因大数据通常需要使用成百上千个大内存的CPU进行大规模并行计算。为此,许多团队都开始转向“云端”来存放和分析大量数据。Genomics England公司生物信息学主管TimHubbard说,“人们逐渐有了这种想法:将算法应用到数据中去。” GenomicsEngland的云计算依靠政府的设施,其外部访问被严格控制。对于其他研究机构而言,基因大数据的分析渐渐转向了商业云系统,例如Amazon、Google以及阿里的云服务。/pp  strong如何实现数据的共享与协作/strong/pp  原则上,基于云计算的托管鼓励数据库间的共享和协作。但高度敏感的临床信息及患者同意权和隐私权牵扯到棘手的伦理和法律问题。/pp  在欧盟,会员国间不同的数据处理规则阻碍了合作。与非欧盟国家共享数据需依赖繁琐的机制建立数据保护,与私人组织共享数据需签定限制性的双边协议。为了帮助解决这个问题,全球基因组学与健康联盟(GlobalAlliance for Genomics and Health)制定了《基因组学与健康相关数据责任共享框架》(《Frameworkfor Responsible Sharing of Genomic and Health-Related Data》)。该框架包括隐私和知情同意指南,以及违反规则的组织应该承担的责任和法律后果。/pp  加拿大麦吉尔大学生物伦理学家、该联盟的监管和伦理工作组主席Bartha Knoppers说,“在签署数据传输协议时,如果签署方都同意遵守该框架,他们就省了很多工作。”该框架允许研究组织在保护隐私的情况下分析共享的基因组数据。Knoppers解释,“我们希望在掩盖患者身份的情况下,能将这些数据与临床数据和医疗档案联系起来,否则我们无法实现精准医疗。”/pp  此外,在许多欧洲国家,将基因组学信息纳入电子医疗档案已经变得越来越重要。Hubbard说,“我们的目标是将其整合到标准的全民医保制度中。”英国的“10万人基因组计划”在这方面走在最前端,但其他国家也紧随其后。例如,比利时最近宣布了一项探索医学基因组学的计划。/pp  所有这些国家都受益于这种政府主导的公共医保制度。在美国,情况较为复杂,除了公共医保制度老年和残障健康保险(Medicare)和医疗援助(Medicaid)等外,美国的私人医保制度非常发达,不同的医保公司使用不同的医疗档案系统,这使基因组数据的整合变得困难。2007年,美国国立卫生研究院资助建立了电子化病历与基因组学网络系统(eMERGE),以进行大数据整合与系统管理分析。/pp  strong临床药物基因组学:从数据到诊治/strong/pp  在医疗档案中整合基因组数据主要是为医生对疾病的诊治提供参考,其中一个应用是药物基因组学。临床药物基因组学实施联盟(CPIC)分析了药物和基因的关系,将相关信息存储在 PharmGKB数据库中,并可供临床使用。例如,带有某些突变的人对某种抗凝药响应很差,导致心脏发作风险增加。/pp  如何将基因研究成果用于临床是个耗时耗力的工作。然而, 把基因型和表型信息结合起来可以产生较大的价值。大多数临床相关的基因突变都是通过全基因组关联研究(GWAS)鉴定出来的。研究人员现在可以从医疗档案反向寻找,以确定什么样的临床表现与某种基因突变密切相关。/pp  当然,基因组只是其中的一部分,其他组学也可能成为反映健康状况的晴雨表。/pp  strong最终,需要患者的参与/strong/pp  在研究人员努力整合数据的同时,患者所发挥的作用也开始显现。例如,我们在进行行为、营养、运动、吸烟和饮酒相关的研究时,需要依赖于患者报告的数据。一些可穿戴设备,例如智能手机和FitBits,正在收集运动和心率数据。因为它的收集很容易,这种数据量在不断攀升。/pp  因此,每个人都是大数据的生产者。普通人产生的数据将远远地超过临床中积累的数据。我们需要将这些不同来源的数据整合在一起,用于患者的管理。随着人们对大数据挖掘利用的能力越来越强大,患者会成为最终的赢家!/p
  • 网络课堂|多功能临床质谱检测方法
    近几年,国产MALDI-TOF MS的研发与生产快速起步,新产品接连井喷式发布。MALDI-TOF MS将很有可能成为中国企业掌握最领先的核心技术并引领技术发展的质谱仪器类。 2021年11月11日下午14:00,东西分析项目经理高利艳博士将在第十二届质谱网络会议(iCMS 2021)上为大家带来一场《多功能临床质谱检测方法》的报告,欢迎感兴趣的小伙伴们报名参加。 扫描左侧二维码报名报告内容Ebio Reader 3700是一款多功能的IVD检测平台,被广泛应用于医学微生物鉴定、工业微生物鉴定、医学生物标志物鉴定、蛋白和核酸鉴定、医学SNP检测和食品安全等领域。东西分析利用该平台开发了多种应用。01Ebio Reader 3700拥有强大的微生物数据库,通过与其配套的数据分析软件,对所得的蛋白指纹图谱与数据库种的指纹图谱进行比对检索,从而实现对微生物的鉴定;02利用质谱法体外定量测定血管性血友病因子裂解酶(ADAMTS13/vWF-cp)的活性,实现对血栓性血小板减少性紫癜的早期筛查;03配套相应蛋白芯片,借助独特的蛋白指纹图谱技术,构建病毒类疾病的蛋白指纹图谱,进行检测;04通过检测核酸的单点突变,在基因水平上进行疾病检测,可以同时完成30-40重PCR反应,实现对多种病原体的同时检测。除此之外,我们还在进行利用蛋白指纹图谱的方法对老年痴呆、帕金森等疾病的筛查检测的研究。讲师简介高利艳,博士,毕业于首都师范大学生命科学学院遗传学专业。曾赴默多克大学(Murdoch University)进行学术深造。在国际主流学术期刊上发表论文10余篇。曾获得“2008年国家科技进步一等奖”、2013年和2014年连续两年获得“重要科研进展奖“,“优秀青年奖”。 现担任东西分析MALDI-TOF质谱项目负责人。相关仪器Ebio Reader 3700飞行时间质谱系统
  • 中国首部二代基因测序技术临床应用共识出台
    为医学迈入精准时代安上精准导航仪  中国首部二代基因测序技术临床应用共识出台  规范满足临床诊疗要求的NGS技术标准与应用,提高肿瘤精准诊疗水平  当今,肿瘤诊治已迈入个体化及精准医学的时代,从“一刀切”向“针对每一个病人的具体病情,正确选择并精确地应用适当的治疗方法”发展,这对进一步提高治疗的有效性,降低不必要的药物副作用和节约医疗支出都有着深远的意义。肿瘤的精准医疗是一项系统工程,包括精准诊断、精准治疗、精准管理多个环节,均以精准的肿瘤基因检测为基础。生物技术的进步使得探索具有临床意义的基因异常变得可能等。  据报道,目前我国正在制定“精准医疗”战略规划,这一规划或将被纳入到“十三五”重大科技专项,这预示着在中国,精准医学正驶入高速发展的快车道。在精准医学时代的早期阶段,规范满足临床诊疗要求的二代基因测序技术(NGS)的标准与应用,提高准入门槛,确保这部行业发展“导航仪”的精准性显得尤为重要。基于此,中国临床肿瘤学会(CSCO)肺癌诊疗指南发布会在北京举行,同时出台首部《中国肿瘤驱动基因分析联盟(CAGC)二代测序技术临床应用共识》(下称《共识》),帮助指导基因检测及NGS技术规范合理应用,给我国患者切实带来治疗和生存获益。  “临床肿瘤学实践中,基因检测已成为精准诊治的前提和核心之一。《共识》的出台,将为广大临床医生提供公认规范指导,提高肿瘤诊治的检测质量和结果准确性”,CSCO理事长吴一龙教授表示:“随着高通量的大规模平行测序技术的发展, NGS在开展靶向精准诊治实践与试验研究中有着广阔前景,能更好的帮助临床医生在实际临床患者诊疗中,提升诊断水平,做出合理正确决策,提高患者生存质量。”(上图:吴一龙教授)  “共识”由实验室癌症遗传学家、临床肿瘤学专家、生物信息学专家、病理学家和其他人员组成的专家组起草,包含了NGS的技术应用现状、临床多个瘤种的NGS检测内容、样本处理、测序流程、数据管理、信息学分析、结果报告解释和咨询等多个方面内容的阐述。CSCO计划通过在基因检测方面进行三个步骤全面提升精准医学:形成和发布NGS临床应用共识是第一步的工作,然后是通过一系列标本检测验证共识是否可行、准确,并做相应的修正。第三步是和药物研发公司联合检测,通过大数据分析发现其中某个特别的基因,或完全有可能作为药物治疗的靶点,帮助药物研发公司对此靶点开展研究,这对推动整个行业的发展作用非常重大。  在此基础上,CSCO还计划针对肺癌、乳腺癌、肝癌、胃癌、结直肠癌、包括白血病在内的造血系统等六种恶性实体瘤开展以NGS 技术为主的驱动基因谱分析,提出适合我国临床肿瘤学实践的一系列肿瘤的 NGS检测技术、分析内容、诊治模式的共识、流程、标准和规范。  中国肿瘤驱动基因分析联盟(CAGC)秘书长、广东省人民医院广东省肺癌研究所副所长张绪超教授指出:“准确是NGS体现临床价值的前提。我国之前一直未形成NGS的相关规范。事实上,临床上对NGS的实际需求非常大,仅仅肺癌一年就有超过65万的新发病例。通过‘共识’规范从样本的取得到报告的给出每个环节,高标准、严管理,确保结果准确,应用于患者全程病程管理当中。”(上图:张绪超教授)  这与燃石医学始终致力于用国际前沿生物技术、基因组大数据分析能力为肿瘤患者进行个性化治疗提供更好的指导的愿景不谋而合。燃石医学创始人兼CEO汉雨生表示:“我们很高兴看到‘共识’的出台,随着行业规范化的深入,一些优秀的企业和产品将在大浪淘沙中沉淀下来。作为第一家将NGS肿瘤临床化产品推向市场的公司,我们一直在努力推动基因组技术的临床应用。我们与在测序和芯片技术上全球领先的Illumina公司开展合作,促进更多高品质分子诊断解决方案应用于肿瘤临床领域,使更多患者从中获益。在过去两年中,我们已经与国内110家三甲医院进行合作。我们与全国顶尖的肺癌专家合作,已经产生了大量的临床研究成果及数据,这些成果将为未来肿瘤的精准医疗提供坚实的基础。同时我们与政府相关部门一起推进NGS在肿瘤领域的标准化、普及化。”  据汉雨生透露,2016年燃石医学还将获得几个含金量高的资质证书,而这些证书会有利于燃石医学业务的进一步发展。(上图:燃石医学创始人兼CEO汉雨生)  现场采访实录(一):  主题:肺癌临床治疗前沿趋势与基因检测的可行性  受访人:中国临床肿瘤学会(CSCO)理事长吴一龙教授  精准医学是利用现有技术来检测人类基因,通过基因改变情况使治疗更精准、有效和安全。而这一切的前提是必须利用现有的基因学知识,通过测序方法获取基因学知识。  早在2004年精准医学工作就已开始,但当时并未形成产业,中国NGS之所以大热,一夜间千树万树梨花开,这要追溯到去年初美国奥巴马在国情咨文中提出“精准医学。这股风吹到中国以后,国家科技部、国家卫计委等部门开始重视起来,不断学习、研究精准医学,与此同时,很多市场嗅觉敏感的企业也已有所行动。  美国精准医学的发展路径是先制定标准规范,再开始实践,而我国是测序工作先进行,伴随着各类宣传工作,随后在实践中认识到需要有标准、规范来定义如何去做,应遵循怎样的标准,避免争执。  2015年9月,我们首先成立中国肿瘤驱动基因分析联盟(CAGC),CAGC把制定共识这项工作纳入了联盟起始的第一步。经过几个月的调研,并参照国际上的标准,2016年3月举办了第一次研讨会,邀请了临床肿瘤学、病理学、分子生物学、基因测序专家以及有影响力的检测企业的技术官一起讨制定共识的必要性、可行性,并着手起草共识。经过多次反复讨论,共识出炉。  问:您刚才提及,研讨会上临床肿瘤学、病理学、分子生物学专家一起讨论了NGS领域亟待解决的问题,具体指的是哪些问题?  吴一龙:其中牵涉到了很多问题。首先,基因测序的提取组织究竟是肿瘤组织,还是正常组织?共识明确:组织提取物必须由病理学专家确认是肿瘤组织时才能进行测序。其次,这些送检肿瘤组织中,如何提取出用来做分析的成分?组织提取后送去检测,检测技术是怎样的?其中很复杂,如检测多少个基因,测序深度多少层,此时必须要达成共识。最后,检测报告应该怎样撰写、如何发放?不是所有医生都能看得懂检测报告,很多医生要从头学。  问:在临床应用上,在众多的NGS技术平台中进行选择时,应重点注意哪些方面?  吴一龙:我们今年的共识主要是在技术方面进行了规定作为第一步,如果要检测单个基因是否发生了变异,目前用二代基因测序技术就是“杀鸡用牛刀”。现在针对单个基因检测,我们有很多更便宜的方法来用,国家已经批准了很多。但是,假如想同时检测多个基因,推荐使用NGS。  在讨论共识的过程中,CSCO要求很多NGS检测公司提供检测数据,供CSCO测算和测评。包括燃石医学就提供了相关数据,这些公司对自己的产品是比较自信的,也经得起推敲 也有公司不敢提供,那就要打个问号了。其实,可以从各个方面对此进行监督。  问:二代基因测序技术规范发展起来之后,对后续药物研发和选择有什么帮助?  吴一龙:帮助会非常大,这也是CSCO/CAGC接下来相关工作的第二步和第三步。CSCO计划通过在基因检测方面进行三个步骤全面提升精准医学:形成和发布NGS临床应用共识是第一步的工作,然后是通过一系列标本检测验证共识是否可行、准确,并做相应的修正。第三步是和药物研发公司联合检测,通过大数据分析发现其中某个特别的基因,或完全有可能作为药物治疗的靶点,帮助药物研发公司对此靶点开展研究,这对推动整个行业的发展作用非常重大。  现场采访实录(二):  主题:肺癌临床治疗前沿趋势与基因检测的可行性  受访人:中国肿瘤驱动基因分析联盟秘书长、广东省人民医院广东省肺癌研究所副所长张绪超教授  问:我国NGS发展存在哪些不规范现象?《共识》的出台对NGS规范有什么好处?  张绪超教授:我国之前一直未形成NGS的相关规范。但我国现实临床对NGS的需求非常大,仅肺癌一年就有超过65万新发病例。理论上来讲,分子诊断应该应用于患者全程病程管理当中。此外,NGS是由多个检测技术组成的系统工具,只有每个环节进行质量控制,才能保证临床使用数据是有效的,临床学家才能提出准确的治疗方案,让患者真获益。基于此, CSCO出台《共识》,规定每个特定的NGS测试项目都需要经过严格的技术验证合格后才可以用于临床肿瘤检测,并强烈建议各实验室参加卫计委组织的“NGS相关的室间质量评估项目”来提高检测能力和质量。NGS检测规范具有现实意义,对检测方、患者都有好处。  问:目前,对于预防性检测领域,即癌症早期筛查诊断检测,NGS有何帮助?  张绪超教授:从靶向治疗角度来看,我们还没有办法将靶向治疗推向早期筛查诊断,缺乏相关临床数据。但是,NGS用于早期疾病诊断对患者有一定帮助。早期进行分子分型诊断,帮助患者后续全程管理,可以及早发现患者的基因亚型,对于后续疾病复发、耐药等策略制订都有很大的帮助。当然,需要强调的是不能在早期检测后马上就能用靶向药物。对于NGS的应用一定要明确其应用目的。  问:《共识》从各个环节是怎么规范NGS的?  张绪超教授:在NGS的检测中每个环节都很重要。样本采集、处理也非常重要,这也是《共识》将NGS应用中的样本处理作为一个单独内容进行详细解说的原因。举个例子,一个没有做详细质控评估的样本,如果肿瘤细胞含量只有1%甚至没有,检测结果就不能真正反映肿瘤的分子特征和生物技术特征。因此,我们要求做样本规范,在NGS技术条件下,至少有20%的细胞是肿瘤细胞才有可能探测到临床所需的靶点是否正确。  当然样本评估不仅包括肿瘤细胞含量的多少,还包括不同样本类型应该如何处理等。比如,对于新鲜标本需要做冰冻评估 而对已经做好石蜡包埋标本,需要进一步进行形态学评估。对于不同样本类型,《共识》做了详细界定,这是其中一个重要的内容,也是NGS检测非常重要的环节。  问:目前,对于临床上已确认的可控基因有多少?  张绪超教授:根据瘤种不同,基因也不同。过去十年肺癌发展非常快,2004年发现了有药、靶点以及检测技术的第一个可控基因EGFR。目前,肺癌里面有EGFR、ALK等8个基因必须检测。相信未来还将有更多的基因发现,基因数量会明显上升,如果考虑其他瘤种,基因数量会更多。  问: NGS需求在临床应用方面需要符合什么样的质量?  张绪超教授:《共识》规定了NGS在临床肿瘤诊断中的质量需求,规定每个特定测试项目都要经过严格的技术验证,合格后才可以用于临床肿瘤检测,所有CAGC项目都要满足共识中的NGS评价体系。一个好的NGS分析技术能否真正应用到临床,必须满足三个条件:分析技术满足要求,临床检测能力符合要求,临床应用一定给患者带来好处。再好的技术如果在临床上对患者没有用处,也是无用的。  问:《共识》出台后,对二代基因测序的产业,包括二代测序公司会产生什么样的影响?  张绪超教授:从我们角度来讲,一定是推动而非阻碍,是正确推动方向的作用。这次共识出台,我们邀请了很多NGS公司的技术专家参与进来,他们会意识到只有NGS规范化,整个行业才能正常发展。患者检测量大了,才有更好的发展,这是多方获益的事情。  CAGC下一步的NGS可行性验证和临床试验,会邀请一些好的技术公司参与,向他们传递正确的信息,这些公司也通过这种形式知道哪些是真正对患者带来好处的。所有这些都忠于一个理念,就是患者利益高于一切,能够让患者生命延长,这是我们最关注的核心目标。  现场采访实录(三):  主题:肺癌临床治疗前沿趋势与基因检测的可行性  受访人:燃石医学CEO、创始人汉雨生先生  燃石医学成立于2014年,目前在产品研发、学术推广以及市场教育方面在国内做得都非常领先,公司目前已获得将近2亿元投资。在北上广建立了超过1万平米实验室和GMP生产车间,合作医院有110多家。  和其他医疗子行业发展比较缓慢所不同,精准医疗行业在国家政策支持及引导下,以前所未有的速度高速发展。肿瘤精准医疗行业是新兴的多学科(医学、分子生物学、测序技术、生物信息学)交叉的行业。精准医疗检测先行,精准诊断是精准医疗从发现、监控到治疗等各个步骤中不可或缺的。基于此,燃石医学在医学、生物信息学各方面都汇集了超过200名业内顶尖人才,用强大的资金和人才发展这个行业。  问:燃石参与CSCO/CAGC首部NGS共识指定相关的工作中吗?  汉雨生先生:是的。CSCO理事长吴一龙教授高屋建瓴地设计了此部《共识》,涉及医务人员的想法,还涉及商业公司实际经验和理念。吴教授细心倾听了很多公司的意见,燃石也是其中主要公司成员,提供了自身经验和知识积累。  吴教授推动的《共识》,对测序深度、分析流程,以及实验规范性有了具体的技术标准。燃石医学的除了产品达到世界领先的敏感性和特异性之外,公司还获得很多重量级的认证——今年5月份燃石医学将成为中国第一家拿到肿瘤NGS检测CLIA核心认证的公司。CLIA认证不仅代表燃石的产品达到了国际的标准,而且代表燃石检测的质量可靠性和稳定性达到国际的认可。  问:燃石成立迄今为止我们上市了哪些产品,包括仪器和设备吗?  汉雨生先生:燃石医学的上市产品涉及8个瘤种,21款产品,涉及到基于组织的重要检测、基于血液的重要检测,还包括监控产品。在建库、捕获、生物信息学分析层面等自主研发的部分,燃石医学已申请13个专利。  从产品的研发设计之初,我们就秉持燃石的产品一定要满足临床实际使用和患者最终获益。因此,我们不做大一统的产品,而是根据临床精准检测和治疗的需要,分不同的瘤种和临床治疗不同阶段的需要,开发和推出不同的产品。比如:燃石是唯一一个开发临床NGS临床应用共识所强调的肺癌8个基因的检测产品,我们不让患者过度检测。  问:国内NGS领域存在很多不规范现象,商业化趋势非常明显。燃石作为操作规范的公司,对NGS共识出台帮助规范这个行业有怎样的期待?  汉雨生先生:燃石一直大力支持CSCO/CAGC出台NGS共识。现在国内有200多家NGS公司,有些很好的公司会在大浪淘沙后沉淀下来,但更多的公司其实是鱼目混珠。在精准医疗的行业,最后只会剩下几家经得起时间考验和NGS共识考验而发展起来的NGS公司。在早期行业混乱时,燃石愿意帮助协会或政府来做正本清源的事情,帮助确定怎样的技术是市场上真正需要的、合格的。CSCO目前确立的标准,燃石医学早已达标,但我们志存高远,拥有远高于行业要求的标准。  问:共识中是否有对基因测序第三方检测企业的直接推广和销售的对象、形式进行了规定?那么,我们是不是更推荐由医生建议适合的患者进行检测?  汉雨生先生:从对患者负责的角度来讲,患者、甚至是健康人直接从一个公司购买一款没有经过认证或者没有标准的产品是非常危险的事情。比如现在为数不少的二代测序公司连临检所的资质都没有,就直接向患者出售,甚至有的越过医生直接出售给患者群,这样的做法非常危险。这也是吴一龙院长提及的有70%检测数据匹配不上的重要原因。  问:燃石有参加卫计委组织的室间质评吗?  汉雨生先生:我们每年都会参加,每次都以优秀的成绩通过 之前是比较简单的组织基因检测,随后还会参加更复杂的ctDNA评选。  EGFR的室间质评很早就有,而NGS室间质评去年才开始有。卫生部临检中心也看到NGS需要规范化,从临检中心的角度,第一点是做市场技术摸底,看看哪些公司合格/不合格,或哪些医院合格/不合格。
  • 未来临床检测的大势:“中心化” or “去中心化”?——(下):POCT篇
    p style="text-align: left "strongspan style="font-family: 宋体 font-size: 16px "仪器信息网讯/span/strongspan style="font-family: 宋体 font-size: 16px " 第九届全国临床实验室管理学术会议(NCCLab2017)于6月5日圆满闭幕。三天下来,作为时下最火热的医学概念,“精准医疗”成为本次大会报告中被提及频次最多的名词。/span/pp style="text-indent: 32px "span style="font-family: 宋体 font-size: 16px "质谱(mass spectrometry,MS)技术和现场快速检验( point-of-care testing,POCT)技术作为两种新兴起的临床检测技术,在精准医疗领域均有广泛而重要的应用。因此,大会主委会分别设立主题会场对MS和POCT进行专门讨论,这也使得MS和POCT成为本次大会两个热度最高的主题。MS和POCT分别代表了未来临床检测“中心化”和“去中心化”的两种发展趋势。那么问题来了,“中心化”和“去中心化”,二者究竟谁会成为未来临床检测的大势呢?/span/pp style="text-indent: 32px "span style="font-family: 宋体 font-size: 16px "在上篇文章《未来临床检测的大势:“中心化” or “去中心化”?——(上):MS篇》中,笔者着重介绍了MS在临床检测中的应用。本篇文章中,笔者将着重介绍POCT在临床检测中的应用、存在的问题和发展趋势。/span/pp style="text-indent: 32px "span style="font-family: 宋体 font-size: 16px "国外曾有不少与POCT相关的名词,如 bedside testing(床边检测)、near-patient testing(病人身边检测)、physicians office testing(医师诊所检验)、home use testing(家用检验)、extra-laboratory testing(检验科外的检验)和decentralized testing(分散检验)等。随着这一领域的不断发展,这些名词都已不能概括POCT的含义。/span/pp style="text-indent: 32px "span style="font-family: 宋体 font-size: 16px "POCT/spanspan style="font-family: 宋体 font-size: 16px ",即现场快速检验( point-of-care testing) ,由中国医学装备协会POCT 装备技术专业委员会在多次专家论证基础上统一命名,并将其定义为: 在采样现场进行的、利用便携式分析仪器及配套试剂快速得到检测结果的一种检测方式。POCT不需要专门临床检测服务,便携性和及时性是其最大优点。/span/pp style="text-align: left text-indent: 32px "span style="font-family: 宋体 font-size: 16px "近年来,POCT的快速发展得益于基于分子生物学、细胞生物学和干化学等学科的生物芯片技术的不断突破。从某种意义上说,在现今的临床检测应用中,说生物芯片就是POCT也不为过。生物芯片又分为基因芯片、蛋白质芯片、细胞芯片和芯片实验室。由于当今高新技术的发展和医学科学的进步,以及高效快节奏的工作方式,结合时下最火热的精准医学、个体化诊疗等概念,使得具有实验仪器小型化、操作简单化、报告结果即时化的POCT越来越受到了人们的青睐。/span/pp style="text-indent: 32px "span style="font-family: 宋体 font-size: 16px "目前一些国际巨头如DANAHER、ROCHE、BIOMERIEUX、ABBOTT等纷纷发力POCT,国际上POCT发展呈“去中心化”趋势。在题为《POCT分子诊断的发展趋势》的报告中,卡尤迪生物科技有限公司CEO李响以卡尤迪核心技术“一步法”核酸检测平台(配备实时荧光定量PCR仪)为例,详细讲解了POCT技术的巨大变革。/span/pp style="text-indent: 32px "span style="font-family: 宋体 font-size: 16px "传统PCR方法首先需对样本进行裂解、吸附、漂洗、洗脱等步骤,然后才能加样、上机检测;而“一步法”核酸检测无需前处理,可直接加样、上机检测,全程只需60-90分钟,相较于传统PCR方法动辄3-4个小时,既简化了操作又节省了大量时间。此外,“一步法”核酸检测样本用量少,仅为传统核酸检测方法的1/10./span/pp style="text-align: center "span style="font-family: 宋体 font-size: 16px "/span/pp style="text-align: center "img title="1.png" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201706/insimg/acc8475d-4b60-44f9-b137-e85eb52e1685.jpg"/br//pp style="text-align: center "strongspan style="font-family: 宋体 font-size: 16px "卡尤迪生物科技有限公司CEO李响/span/strong/pp style="text-indent: 32px "span style="font-family: 宋体 font-size: 16px "POCT/spanspan style="font-family: 宋体 font-size: 16px "在临床检测中广泛应用于糖尿病监测、尿液干化学分析、凝血指标检测、心肌标志物检测、肿瘤标志物检测、感染性疾病的衣原体检测、艾滋病病毒的快速筛查、血液化学成分分析等项目,敏感性和特异性优于传统方法,加之其“去中心化”趋势,出色的便携性和及时性,对个性化精准诊疗具有重要意义。/span/pp style="text-indent: 32px "strongspan style="font-family: 宋体 font-size: 16px "问题与展望/span/strong/pp style="text-align: left text-indent: 32px "span style="font-family: 宋体 font-size: 16px "在题为《POCT技术发展现状及在分子诊断中应用》的报告中,同济大学附属医院检验科主任李智教授指出,在许多情况下,POCT处在医疗干预第一线,能够增强医生诊疗效率,提升患者满意度。但是,当前POCT项目有限,并不能从根本解决“TAT”问题,所以目前中心实验室和POCT “共存”对患者诊疗过程具有虎扑协同效应,也是当前POCT发展的特点之一。她认为建立一个有效的POCT管理体系至关重要。/span/pp style="text-align: left text-indent: 32px "span style="font-family: 宋体 font-size: 16px "目前,POCT应用于临床检测仍有许多经济和伦理方面问题,如检测成本较常规检测方法高,不规范使用较为普遍,POCT应用于性别鉴定导致女性胚胎流产,患者基因检测信息泄露等。/span/pp style="text-align: center "span style="font-family: 宋体 font-size: 16px "img title="2.png" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201706/insimg/82e5a637-fb84-4ee1-b409-92159bc99ddc.jpg"//span/pp style="text-align: center "strongspan style="font-family: 宋体 font-size: 16px "同济大学附属医院检验科主任李智教授/span/strong/pp style="text-align: left text-indent: 32px "span style="font-family: 宋体 font-size: 16px "伴随诊断、个体化医疗均为近患者方式,特别适合POCT技术介入。在欧洲,已允许用MDx(分子诊断模型)的POCT方法来确定疾病状态、药物反应与遗传关系,目前尚属早期阶段,虽有所应用,但并不完善。MDxPOCT是针对确定靶标开发药物的重要手段,并能为CDx(肿瘤细胞系异体移植模型)和PDx(病人肿瘤异体移植模型)直接提供更多常规生物标志物检测。李智教授还认为,传染病和癌症检测将成为MDxPOCT新业务主要领域,MDxPOCT技术将推动未来五年内POCT的快速增长。/span/pp style="text-align: left text-indent: 32px "span style="font-family: 宋体 font-size: 16px "综上,MS和POCT均是目前临床检测领域炙手可热的先进技术。不同于POCT的“去中心化”趋势,由于MS仪器设备的高成本,对技术人员、实验环境的高要求,决定了MS临床检测技术将趋向于“中心化”、“平台化”的发展,而且在未来很长的时间里还会保持和加强“中心化”的形态。MS和POCT在临床检测应用领域既有互补,又有竞争,均有极大发展潜力。至于未来,临床检测究竟是会更多地被POCT拉向患者的床边,还是会更多地被MS引至规模化平台检测?你更看好谁呢?/span/pp style="text-align: right text-indent: 32px "span style="font-family: 宋体 font-size: 16px "编辑:李博/spanbr//p
  • 毅新博创携手Biodesix 开发临床质谱VeriStrat检测方案
    p  1月9日,美国Biodesix公司宣布与北京毅新博创生物科技有限公司(Bioyong Technology Company Ltd.)签署一项国际合作协议。双方将合作在大中华区开发并商业化推广一款搭配MALDI质谱的VeriStrat® 测试方法,用于非小细胞肺癌(NSCLC)患者的精确医学诊断,并有望拓展到亚洲其他国家。/pp  Bioyong将在其临床TOF基质辅助激光解吸和电离(MALDI)质谱平台上执行他们的VeriStrat® 测试版本。基于质谱仪分析,两家公司还将合作开发应用于肿瘤学和其他临床领域的检测方法。/pp  双方的合作需要Biodesix将其独有的MALDI方法进行重大技术转让,并在中国市场开发他们的商业测试。 Bioyong将在其领域内对VeriStrat® 测试版本的开发、临床验证、监管批准和商业化进行投资,双方还将携手推进MALDI的临床应用。 为此,Bioyong将在合作期间向Biodesix支付约3800万美元。/pp  有分析数据指出,预计到2020年全球将有85万个新的肺癌病例,中国约占全球新发病例的37%。Biodesix首席执行官David Brunel表示:“癌症是一个全球性问题,患者及其医生都需要基于精确医学的癌症治疗,以及多变量分子和蛋白组学检测提供的全方位生物信息治疗选择。通过与Bioyong合作,我们正朝着使技术可以用于世界上大部分肺癌患者的方向迈出重要一步。”/pp  Bioyong创始人兼董事长马庆伟博士说:“我们很高兴与Biodesix合作,为大中华地区的患者提供VeriStrat® 测试版本,甚至在此基础上实现超越。 Bioyong期待通过在质谱临床应用领域拥有的领导地位,帮助医生做出更明智的治疗决定,为患有肺癌的患者提供更好的康复和预后的可能性。”/pp  strong关于VeriStrat® 测试/strong/pp  Biodesix' VeriStrat® 测试是一种用于非小细胞肺癌患者的预测性和预后性基于血液的蛋白质组学试验。该测试将患者分类为VeriStrat-Good或VeriStrat-Poor,通过表征宿主对肿瘤的反应来评估疾病侵袭性。/pp  strong关于Biodesix/strong/pp  Biodesix是一家分子诊断公司,推动肿瘤学创新性血液检测的开发,以实现精确医学诊断。 Biodesix致力于开发和商业化多变量蛋白质和基因组诊断血液测试,包括GeneStrat® 和VeriStrat® 测试,在72小时内提供结果。该公司正在改变护理标准,为医生提供更好的治疗指导、更准确的预后和增强的疾病监测的诊断测试,以改善患者的预后。在精准医学的最前沿,Biodesix正在开发新的血液检测,以鉴定可能从免疫治疗中获益的患者。除了独立开发新的诊断外,公司还与生物技术和制药公司合作,开发与治疗剂一起使用的伴随诊断。/pp  strong关于Bioyong/strong/pp  北京毅新博创生物科技有限公司成立于2008年,由国家“千人计划”张教授领军,公司拥有PacBio RS II三代测序平台,MassARRAY 核酸质谱平台,Q Exactive蛋白组鉴定质谱平台以及Clin-TOF多肽指纹图谱鉴定平台,专注于优生优育基因检测、个体化医疗基因检测、感染与传染疾病快速检测、疾病多肽标志物检测等方向的研究。2014年6月,毅新博创公司自主研发的飞行时间质谱系统Clin-ToF获得国家食品药品监督管理总局的注册证书,2016年该技术成果通过了中国分析测试协会组织业内专家的鉴定。目前,该产品已先后与北京协和肿瘤医院、301医院,北京大学口腔医院等单位达成合作。/ppbr//p
  • 二代基因测序临床应用开闸 行业将迎爆发期
    2014年2月份被叫停的二代基因测序临床应用,近一年之后终于有了开闸的迹象。  继卫计委医政司发布第一批基因测序临床试点后,1月15日,卫计委妇幼司发布了通知及入选单位名单,这被业界解读为二代基因测序临床放开的信号。根据通知,可以开展NIPT的产前诊断试点单位,全国31个省市地区共有108家机构入选。  昨日(1月21日)全国妇幼卫生监测办公室在回应记者采访时证实,这份文件确实属实,&ldquo 在试点单位中,产前筛查与诊断已经放开,但是医疗机构什么时候开始业务都是不一样的。&rdquo   在不少业内人士看来,此次通知确保医疗机构具备条件开展测序技术临床应用,使得二代基因测序从学术研发扩展至临床,二代测序在今年将出现新的爆发。  108家机构入选试点名单  2014年2月,国家食品药品监督管理局(CFDA)和卫计委联合发布通知,包括产前基因检测在内的所有医疗技术需经食品药品监管部门审批注册,并经卫生计生行政部门批准技术准入方可应用。已经应用的,必须立即停止。  从《国家卫生计生委妇幼司关于产前诊断机构开展高通量基因测序产前筛查与诊断临床应用试点工作的通知》(以下简称《通知》)中可以看到,文件不仅公布了试点医疗机构的名单,同时对于二代基因测序产前筛查与诊断技术规范进行了规定。  《通知》中提到试点内容是:产前筛查与诊断前咨询、适用范围、知情同意书签署、临床资料收集和标本采集要求、检测报告审核使用,检测后临床咨询、高风险孕妇的后续临床服务、追踪随访、信息统计上报以及为规范开展高通量基因测序产前筛查与诊断临床服务工作需要试点的其他相关内容。  &ldquo 这次的《通知》内容比较详细,医疗机构要注意什么、进行哪些步骤、信息上报等都比较详细。&rdquo 全国妇幼卫生监测办公室人士告诉记者,&ldquo 但是究竟什么时候医疗机构能够大量开始业务,各家医疗机构的情况还不同。&rdquo   当然,或许市场重新启动还没那么快。记者致电试点名单上的一家上海医院时,被告知该院利用二代基因测序做产检已停止多日,暂时还没有相关服务提供。  值得一提的是,上述医疗机构开展相关临床应用必须使用国家食药监总局(CFDA)已批准上市的基因测序仪及配套试剂,但是目前上述108家企业并不是每家都有相关设备,可能只有自行购买设备或者与检验机构合作。  行业有望迎来爆发式发展  记者了解到,2014年7月开始,国家食药监总局开始批准基因测序仪及配套试剂上市,包括华大基因和达安基因两家企业的产品。其中,达安基因获批的基因测序仪及配套试剂是公司与LifeTech合作申报的。  据统计,利用无创产前检测,针对30岁以上的高危孕妇100%渗透率,将带来76亿元市场容量 针对全部孕妇50%渗透率,将带来140亿元市场容量。  光大证券研究报告显示,达安基因在全国有8个临床检验中心,过去几年由于尚处于布局和投入期,整体盈利状况不佳。研报预计,自2015年开始,临床检验中心有望逐步为公司贡献利润。就其举措来看,公司采取与大型医院共建实验室以及平台下沉的方式来布局。  业内人士普遍认为,此次政策松绑将大大加速二代基因测序技术爆发,抢占先机的华大基因和达安基因,有望率先分享基因检测的大蛋糕。&ldquo 现在不少公司都在加强基因测序,并且也在密切关注相关的政策,相信未来还有更多公司加入到二代基因测序这个市场来。&rdquo 前述妇幼卫生监测办公室人士告诉记者。  业内人士指出,此前二代基因测序使用仅限于学术科研,临床应用游走在灰色地带,《通知》发布意味着给二代基因测序放闸,行业有望迎来爆发性增长。  基因检测行业并购潮起  从2010年开始,国内基因测序市场逐渐起势,在一些分析机构的预测报告中,中国基因测序市场的规模已从百亿级别攀升至千亿,全球市场更是一块庞大的蛋糕。  但发展至今,中国的基因测序市场主体仍以中小型研究机构和企业为主,这些机构和企业大多停留在科学研究阶段。&rdquo 一位第三方检测服务机构人士告诉记者,&ldquo 即使没有政策限制,面向公众的检测项目也是少之又少,缺乏市场运作经验,但是对这方面的重视度越来越高了。&rdquo   去年下半年,华大基因收购了Illumina的竞争对手美国完整基因公司,随着行业的发展,基因测序行业的并购也日趋频繁。就在10天前,药明康德在官网上称,公司以6500万美元现金收购NextCODE公司,并计划将其与药明康德基因中心合并,成立一家新公司。  &ldquo 从产业链角度来看,上游的仪器设备商们不再满足于硬件销售,也逐渐向基因检测技术的产业化进程伸手分羹。&rdquo 一位检测机构人士告诉记者,&ldquo 下游的企业也希望能拥有相关设备或者与设备商合作,随着个性化医疗的发展,未来相关行业并购机会还会增多。&rdquo
  • 12种KRAS突变检测技术的关键差异的影响及其在临床实践中的相关性
    导读非小细胞肺癌(NSCLC)和大肠癌是常见的恶性肿瘤,随着基因检测技术的不断发展,KRAS基因突变检测技术逐渐被运用到癌症检测和临床治疗。KRAS基因突变检测是目前癌症患者在使用靶向药物治疗前必做的检测项目。根据患者的基因突变情况不同,可以筛选出对靶向治疗敏感和耐药的人群,从而制定更个性化的治疗方案,既节省了大量的医疗资源,又提高了治疗的有效性和合理性。本文对现今分子临床诊断中的最先进的12种KRAS突变检测技术做了一个评估对比,结果显示,不同的KRAS检测方法,相应的灵敏度不同(如图1)表1 中列举每种技术和方法的特点和优势 结论在本研究中可以看到,质谱检测相对于测序检测而言,存在着可以明显读出密码子突变类型的优点。MALDI-TOF方法在KRAS突变检测中具有灵敏度高、准确度高、分辨率高、质量范围广及速度快等特点,在操作上制样简单、可微量化、大规模检测。MALDI-TOF将逐渐成为一种具有潜力的高通量、自动化基因分型的金方法。
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