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光绪平台

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光绪平台相关的资讯

  • 仪器分析揭示光绪死因之谜
    崇陵光绪棺椁。 提取头发样品。 研究人员提取光绪帝衣物样品。 光绪死因报告会现场。  在距今100年前的1908年(光绪三十四年),名义上是清朝皇帝而实际上却被囚禁在瀛台的光绪帝和统治中国近半个世纪之久的慈禧太后几乎同时死去。皇帝死于光绪三十四年十月二十一日酉时(下午五至七时),太后死于十月二十二日未时(下午一至三时),相距不到20个小时。对于光绪帝的死因一直众说纷纭,成百年悬疑。如今,利用现代科技手段,研究人员将谜底一层层揭开……  ■被毒害致死说   据当年接近宫廷的人回忆,光绪帝本身病症不至于死亡,疑被慈禧、袁世凯或李莲英等所谋杀。  其中名医屈桂庭说,光绪死前三天“在床上乱滚”、“向我大叫肚子痛得了不得”,“此系与前病绝少关系”(《诊治光绪帝秘记》)。  根据戴逸先生的研究,提供证言的有长期陪侍光绪的起居注官恽毓鼎,有给光绪帝治病的医生,有内务府大臣增崇的儿子,有光绪帝继承人宣统,有陪侍慈禧的德龄,还有早就预言光绪之死的晚清高官伍廷芳。众口一词,都认为光绪被毒害而死。因此,在距今30年前,历史学界和社会上大多数人都相信此说。  戴逸先生指出:“这许多人所说虽然在细节上有不同和矛盾之处,但都猜测或肯定光绪是被毒害致死的。凶手是谁?多数说是慈禧,也有人说是袁世凯或李莲英。”  ■正常死亡说   20世纪80年代以后,随着对清宫档案大规模整理发掘工作的开展,历史学家、档案学家、医学专家共同合作,仔细收集和研究光绪的脉案和药方,探索其一生的健康情况,却得出了与被毒死说截然相反的结论。  专家们认为光绪一生身体虚弱,百病丛生,久治不愈。详考清宫医案,专家们用现代医学的语言来说,光绪是受肺结核、肝病、心脏病、风湿等慢性病长期折磨,致使身体的免疫力严重缺失,酿成了多系统的疾病,最终造成心肺功能衰竭,合并急性感染而死亡。  1980年,有关部门清理并重新封闭了崇陵,对光绪的遗骨做过简单检测,没有发现外伤痕迹亦无中毒表现,故只能以脉案作分析。光绪之死属于正常死亡,遂成定论。  ■科学研究证实:砷中毒而死   2003年,中央电视台清史纪录片摄制组到易县清西陵采访,得知1980年曾对清光绪帝及隆裕皇后所葬崇陵棺椁(于1938年被盗)进行清理并重新封闭,而光绪及隆裕皇后的头发被移至棺椁外,在清西陵管理处文物库房保存至今。经与北京市公安局法医鉴定中心专家研讨,征得文物部门同意,提取多根光绪帝头发送至中国原子能科学研究院反应堆工程研究室设计所进行测试。  中央电视台清史纪录片摄制组、清西陵文物管理处、中国原子能科学院反应堆工程研究设计所和北京市公安局法医检验鉴定中心四个单位开始共同合作,组成“清光绪帝死因”专题研究课题组,运用最先进的技术,采用最精密的仪器,对光绪遗体的头发、遗骨、衣服以及墓内外环境进行反复的检验和缜密的分析研究。  课题组运用侦查破案的思维方式,根据信息的产生、传递、处理、还原、应用等原理,充分利用“中子活化”、“X射线荧光分析”、“原子荧光光度”、“液相色谱/原子吸收联用”等一系列现代专业技术手段,通过开展综合分析、模拟实验、双向推理、多维论证等多项工作,对西陵保存的光绪头发、衣物、遗骨进行检测和研究。  ■头发中砷含量是健康人的2000多倍   最初,专家们通过核分析方法测定光绪帝的两小缕头发,初步检验发现头发中的砷含量明显高于正常值,是当代健康人的2000多倍,且高含量截段分布异常。  为验证光绪帝的头发砷含量是否异常,研究人员分别提取了隆裕皇后、一清代草料官及当代人的头发样本分别进行同时代、同环境、同性别发砷测试,结果证实,光绪帝的几处头发截段中最高砷含量不仅远远高于当代人样本,也分别是隆裕皇后的261倍和清代草料官的132倍。  为验证光绪帝头发中的异常砷含量是否因长期服用中药雄黄等而导致慢性砷化物中毒所造成,研究人员又将其与当代慢性砷化物中毒的人发砷进行了对比实验,结果显示,光绪帝的头发上最高含砷量是慢性中毒患者最高含量的66倍,且砷分布曲线与慢性砷化物中毒者的砷分布曲线完全不同。由此证实:光绪帝头发中的高含量砷既属异常现象,又非自身服药引起慢性砷化物中毒而成。而光绪帝头发上的大量砷元素的唯一来源,则是光绪帝的尸体。  ■遗骨和衣物均检测出砷   研究人员还对提取的光绪帝的遗骨进行了表面附着物的刮取与检测,结果表明,其中两块遗骨(一块肩胛骨和一块脊骨)表面沾染了大量的砷,说明这些砷确实来源于腐败尸体。  随后,研究人员对光绪帝的随葬衣物进行了砷的分布的检验。光绪帝的送检衣物共有五件,其中四件上衣(或外衣),一条裤子。由于年代已久,五件衣物除龙袍保存状态尚为良好外,其余三件内衣均已严重腐烂。根据尸体腐败对穿着衣物侵蚀由内向外会逐步减轻的一般规律,研究人员依次推定出四件上衣由内到外的穿着顺序。随后依照物质吸附和信息转换还原原理,对接近光绪帝尸体特殊部位的衣物分别取样,进行了砷的分布的检验。  检测数据结果表明:从同一件内衣看,每件衣物的胃区部位、系带和领肩部位的含砷量都高于其他部位;从穿着层次看,里层衣物的含砷量大大高于外层;从尸体的特殊部位看,衣物掉落下来的残渣(胃肠内容物)的砷含量极高。这说明,大量的砷化合物曾存留于光绪帝尸体的胃腹内,并在尸体腐败过程中由里向外侵蚀衣物,由此造成胃腹部位衣物的高含砷。  实验结果表明:光绪帝摄入的砷化物是剧毒的三氧化二砷即砒霜,而其腐败尸体仅沾染在部分衣物和头发上的砒霜总量就已高达约201.5毫克。根据相关研究,人口服砒霜(三氧化二砷)60-200毫克就会中毒死亡。光绪帝摄入体内的砒霜总量明显大于致死量。至此,光绪帝死因终于破解,即:光绪帝系砒霜中毒死亡。  相关链接  ■光绪皇帝   光绪皇帝(1871-1908),即爱新觉罗载湉,庙号德宗,醇亲王之子。1874年同治皇帝驾崩,无嗣,载湉入继为帝,当时年仅4岁,由慈禧太后垂帘听政。光绪十三年(1887年)二月七日起亲政,但朝政大权仍由慈禧太后实际控制。1898年,颁布“明定国是上谕”,开始变法维新。9月21日,慈禧太后发动政变,囚禁光绪帝,戊戌变法失败。  ■谁毒死光绪?   对于光绪被人毒死的说法,下毒者分为慈禧、李莲英、袁世凯等多种说法。有人认为,慈禧不愿意光绪在自己死后重新掌权,派人毒死了光绪。有人说,戊戌变法时袁世凯出卖光绪,怕慈禧死后遭光绪报复,于是贿赂太监下毒。还有一说是太监李莲英下的毒,因为他得悉光绪日记中说慈禧死后将诛袁世凯和他。  (照片除署名外均由清西陵文物管理处提供)
  • 科学仪器测出光绪皇帝死因
    平谷区的北京益谷检测科学研究院,4楼的实验室里陈列着一台无机砷检测仪器。十余年前,它成功检测出光绪皇帝死于砒霜中毒,如今也是检测食品和农产品无机砷含量的主力。  光绪皇帝,即清德宗爱新觉罗载湉(1871年—1908年),其死因一直众说纷纭。北京益谷检测科学研究院理事长、普析通用公司董事长田禾说,2008年,国家和北京市多家单位共同组成“清光绪帝死因”专题研究课题组,对光绪帝和隆裕皇后的头发等进行检测,发现光绪帝的样本中总砷超标数千倍。  “但问题是,总砷又分为有机砷和无机砷。前者广泛存在于海带等食物中,后者才是我们说的砒霜(三氧化二砷)。”田禾说,当时并没有专门仪器去测量无机砷含量,普析通用公司进行紧急技术攻关后,才成功开发出了该仪器,并确认光绪皇帝死于无机砷中毒。  这台机器不但解了历史悬案,从此也为食品、农产品的无机砷含量检测提供了可靠的硬件。
  • 民警写探析光绪死因文章被指错误百出 维权败诉
    发表《光绪死亡原因探析》杂志社登函 称文章错误百出 作者讨名誉权索赔10万元  探析光绪死因起纠纷 民警败诉  东城法院:被告所登声明内容来自作者单位公函内容基本属实 不构成侵权 遂驳回原告诉求  本报讯(记者王巍)今天上午,因发表光绪死因文章而引发的名誉权案一审宣判,东城法院驳回公安局民警包先生索赔10万元的请求。  法院认定,《近代史研究》杂志刊登了包先生《光绪死亡原因探析》一文后,又登函表示该文章错误百出,声明内容基本属实,不构成侵权。  今天上午,包先生并没有亲自到庭,他的一位朋友代为领取判决书。在判决中,最近媒体公布的光绪死因——中毒而死,没有被作为定案的依据。主审法官表示,该案是名誉权案件,并不涉及实际的研究内容。  案情回溯  发文章被指错误多 作者索赔10万  51岁的包先生是北京市公安局海淀分局的干部。他起诉称,自己在2006年时曾应邀参加了北京市公安局法医鉴定中心主办的多家法医学专家参加的“光绪死因推断专家论证会”。  会后,他根据会上材料,经过两年三个月的潜心研究、分析,撰写了《光绪死亡原因探析》一文,发表在中国社会科学院近代史研究所主办的《近代史研究》上。  后来,该刊物刊登了一份声明,称“包先生撰写的文章是采取不正当手段获取数据,与原始数据及分析相较错误较多。”  包先生认为,此声明严重影响了自己在学术研究领域的声誉。现起诉要求中国社会科学院近代史研究所刊登致歉声明,赔偿精神损失费10万元。  中国社会科学院近代史研究所的代理人答辩时称,北京市公安局法医检验鉴定中心在包先生的文章发表后,向近代史研究所发出公函,表示包先生不是光绪之死课题组成员,并要求研究所对涉案文章的不实之处进行澄清。  法院审理  未侵犯名誉权 驳回诉讼请求  法院查明,北京市公安局法医检验鉴定中心在给近代史研究所的公函中声明:该鉴定中心从未授权任何组织和个人公布有关光绪死亡研究的任何数据。  此外,包先生曾在市公安局刑侦总队工作过,为主任科员,但尚未取得调研员职级,包先生也从未参加对光绪死因的研究。  该公函中原文表示包先生“盗窃研究成果并在文章中大量篡改造成的后果,应由他本人负责……”  法院审理后认为,《近代史研究》刊登的“声明”的内容来源有据,且更正内容基本属实。“声明”中未披露包先生隐私亦未捏造事实及使用侮辱、诽谤等语言丑化包先生的人格。  因此,包先生称该“声明”内容侵犯其名誉权不能成立,对其诉讼请求不予支持。  法院判决驳回包先生的全部诉讼请求。  宣判后,包先生的朋友表示将要上诉。
  • 2020万!武汉大学流式平台和单细胞测序平台采购项目
    一、项目基本情况项目编号:ZB0107-202304-ZCHW0367项目名称:武汉大学流式平台和单细胞测序平台采购项目预算金额:2020.0000000 万元(人民币)最高限价(如有):2020.0000000 万元(人民币)采购需求:本项目分成2个包,投标人可兼投兼中,如投两个包则需分开编制标书 ,本项目接受进口包号包号名称货物名称单位预算(限价)是否接受进口备注01包流式平台高端分选型流式细胞仪1套450万元接受核心产品高端分析型流式细胞仪1套350万元接受02包单细胞测序平台单细胞测序建库系统1套780万元接受核心产品高通量测序仪1套440万元接受合同履行期限:交货期:合同签订后90日内 ,质保期:验收合格后至少1年本项目( 不接受 )联合体投标。二、获取招标文件时间:2023年04月19日 至 2023年04月24日,每天上午8:00至12:00,下午12:00至17:00。(北京时间,法定节假日除外)地点:阳光招采电子招标投标交易平台(网址:https://www.yangguangzhaocai.com/)方式:1.拟参加本项目的投标人须在阳光招采电子交易平台免费注册(网址:https://www.yangguangzhaocai.com ---【新用户注册】,相关操作帮助详见:帮助中心--- 投标人注册操作指南); 2.注册完成后,请于 2023 年 4 月 19 日至 2023 年 4 月 24 日17:00时止(北京时间)登录电子交易平台,点击【投标人】,在【公告信息】---【采购公告】栏下载采购文件,300元/份(包),售后不退。联合体参与响应的,由牵头人注册及下载采购文件。未按规定获取采购文件的,其响应文件将被否决; 3.本项目非全流程电子标,投标人无须办理CA数字证书; 4.在电子交易平台遇到的各类操作问题(登录、注册认证、报名购标、制作及上传标书等问题),请拨打技术支持电话010-21362559(工作日:08:00~18:00;节假日:09:00~12:00,14:00~18:00); 5.企业注册信息审核进度问题咨询电话:027-87272708; 项目具体业务问题请向代理机构联系人咨询(联系方式详见本公告第七条)。售价:¥300.0 元,本公告包含的招标文件售价总和三、对本次招标提出询问,请按以下方式联系。1.采购人信息名 称:武汉大学本级     地址:武汉市武昌区八一路299号        联系方式:吴老师 027-68754589      2.采购代理机构信息名 称:湖北国华项目管理咨询有限公司            地 址:武汉市武昌区中北路109号中铁1818中心10楼            联系方式:杨楚君 王丹萍 王刚 刘晓栋 张靖佶 027-87271918            3.项目联系方式项目联系人:杨楚君 王丹萍 王刚 刘晓栋 张靖佶电 话:  027-87271918
  • 国内三代测序服务公司引进美国PacBio公司三台Sequel测序平台
    p style="text-align: center "img width="500" height="362" title="1.jpg" style="width: 500px height: 362px " src="http://img1.17img.cn/17img/images/201601/noimg/624d8c18-130a-4ca9-b8a3-5073ff7943f5.jpg" border="0" vspace="0" hspace="0"//pp  武汉未来组今天正式宣布引进最新的美国三代测序平台Sequel,借助于独家开发的基于“天河二号”平台的a title="" style="color: rgb(255, 0, 0) text-decoration: underline " href="http://www.instrument.com.cn/application/SampleFilter-S01-T000-1-1-1.html" target="_self"span style="color: rgb(255, 0, 0) "三代测序/span/a基因组组装流程,未来组即将提供“一周一个动植物基因组”的特色服务。/pp  2016年1月21日,中国首家三代测序服务公司武汉未来组与美国PacBio公司在中国的独家代理商基因公司顺利签约引进了Sequel测序仪。根据协议,未来组将引进至少3台最新的PacBio公司的三代测序平台Sequel,以满足呈指数增长的三代测序服务需求,从而继续领跑中国三代测序服务市场。这是未来组在采用“天河二号”超级计算机,顺利解决高度复杂动植物基因组组装问题之后,又一次进行技术平台的升级,以实现未来组构建中国最有影响力的三代测序平台的战略目标。/pp  本次引进的三代测序平台,包含3台Sequel测序仪及其附属配套仪器与软硬件,将部署在武汉光谷生物城的未来组生产研发中心,面积超过1000平方米,采用10万级洁净实验室,以确保生产过程中达到最高的环境标准,从而确保最高的测序质量。/pp  与PacBio RS II平台相比,Sequel测序平台虽然体积只有约1/3,测序通量却提高了7倍。目前每台测序仪的通量超过8,000Gb/年,相当于每年大约可以完成100个动植物基因组的测序(按1Gb估算)。目前,武汉未来组已经开始接受新测序平台的服务预定,在优先保证老客户使用的前提下,公司还将优先支持高度复杂的动植物基因组项目、人类基因组测序项目、复杂微生物组测序项目等领域。同时,该Sequel测序平台也将提供给兄弟公司北京希望组用于精准医疗方面的前瞻性科学研究,成为国内首家将三代测序用于医疗健康领域的机构。/pp  strong关于第三代测序技术/strong/pp  第三代测序技术也称为单分子实时测序技术。美国Pacific Biosciences公司是目前唯一正式商业化的第三代测序仪厂商,已在全球范围内为多个基因组学中心提供PacBio RS II测序仪,并于2015年10月推出新产品Sequel测序仪。PacBio测序具有超长读长(平均读长10-15Kb,最长读长可超过40Kb)、无PCR扩增偏差的单分子测序、直接分析碱基修饰等技术优势,已经快速应用于基因组de novo组装、转录组学研究等领域,随着性价比的不断提高,第三代测序技术将在未来的2-3年内快速普及。/pp  strong关于武汉未来组/strong/pp  武汉未来组生物科技有限公司(Nextomics Biosciences)成立于2011年8月8日,总部位于武汉光谷生物城,目前在北京生命科学园和美国洛杉矶设立有分支机构,是中国首家第三代测序服务公司。/pp  武汉未来组通过三代测序生物信息学工具和流程的开发,解决了复杂基因组组装、微生物完成图组装、全长转录组分析、人类基因组变异检测等领域的技术瓶颈,推动了基因组学研究的升级换代,目前已经完成数百个三代测序科研项目,发表了多篇三代测序的科学文献。因为专注于三代测序技术开发和应用推广,武汉未来组已经成为中国三代测序技术应用的领导者。/p
  • 多种单细胞RNA测序平台性能大比拼,七大平台各有所长
    p  自2009年以来,单细胞RNA测序一直是推动生物医学研究进步的重要动力。越来越多的单细胞RNA测序平台被应用于科研和临床。对于大规模的单细胞RNA测序研究来说,一个主要的技术障碍是高通量和灵敏度,还要考虑成本问题。随着低成本、高通量的液滴单细胞RNA测序平台的推出,研究人员在单细胞研究中有了更多的选择,但现有的平台性能如何?科研人员又该如何选择?/pp  为帮助研究人员根据自身需求选择最适合单细胞RNA测序平台。部分国内外科学家对已有平台进行了系统的性能比较,今年4月,生物分子资源设施协会(ABRF)公布了四种单细胞RNA测序平台Fluidigm、WaferGen、10X Chromium Controlle和Illumina/Bio-Rad测序平台的性能差异。11月,中国北京大学黄岩谊研究组、清华大学王建斌研究组等研究人员,联合发表了三种基于液滴的单细胞RNA测序平台10X Genomics Chromium、inDrop和Drop-seq的性能比较结果。两项独立研究结果均显示,没有一种平台可以很好的满足用户的所有需求,各个平台均有优缺点以及各自的应用范围。/ppstrongspan style="color: rgb(0, 112, 192) "研究一:10X Genomics Chromium、inDrop、Drop-seq性能比较/span/strong/pp  img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201812/uepic/9a5662b2-a9e7-410e-a2a7-94d503182763.jpg" title="12.jpg" alt="12.jpg" style="text-align: center "//pp style="text-align: center "span style="color: rgb(127, 127, 127) text-align: center "黄岩谊(左) 王建斌(右)/span/pp style="text-indent: 2em "黄岩谊、王建斌的联合研究成果已发表在Molecular Cell。研究人员利用同一个淋巴母细胞系,对常用的三种基于液滴的超高通量单细胞RNA测序平台10X Genomics Chromium和inDrop、Drop-seq进行了性能比较,每种平台进行2~3个重复检测。同时,他们还开发了可适用于三个分析平台的生物信息分析框架。研究团队表示,研究开始时BioRad的ddSeq平台尚未推出,所以未包括在内。/pp style="text-align: center "  img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201812/uepic/c5b014fc-594b-4ba1-a190-a5cd100b026f.jpg" title="1.jpg" alt="1.jpg" style="text-align: center width: 485px height: 512px " width="485" height="512"//pp style="text-align: center"span style="color: rgb(127, 127, 127) "研究概要/spanbr//pp  研究团队表示,该研究中的单细胞RNA测序平台各有优缺点,并适用于不同应用。strong总体来说,10X Genomics的Chromium系统比Drop-seq或inDrop表现更强大,其技术噪音最小,稳定性最高。/strong/pp  img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201812/uepic/eaf126b2-b5e6-4153-a06e-fe83a0259c2f.jpg" title="0.jpg" alt="0.jpg" style="text-align: center "//pp style="text-align: center "span style="color: rgb(127, 127, 127) "三个平台实验特征示意图及比较/span/pp  该研究发现,基因表达聚类与分析使用的平台有关,表明存在基因水平的系统特异性量化偏差。研究人员仔细分析了每个平台中偏差的来源,strong发现Chromium平台偏爱较短的序列和GC含量较高的序列,而Drop-seq对GC含量较低的基因检测效果较好/strong。/pp  分析结果显示,strong三个平台在重复性方面都是一致的,表明在同一平台上可以合并来自多个实验的检测数据/strong。但比较不同平台产生的数据仍非常有挑战性,为此,研究团队开发了可适用于三个分析平台的数据分析框架,方便数据比较。/pp  img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201812/uepic/7f81f1a2-e4e6-4453-9409-dd9962161c24.jpg" title="4.jpg" alt="4.jpg" style="text-align: center "//pp style="text-align: center "span style="color: rgb(127, 127, 127) "左:各平台检测性能 右:各平台技术噪音/spanbr//pp  在该研究中,就性能而言,strong10X Genomics的灵敏度最高/strong,可在3000个基因中平均捕获17000个转录组 Drot-seq检测到2500个基因的8000个转录组;InDrop可检测到1250个基因的2700个转录组。灵敏度高的一个好处就是可以通过较少的reads获取相同级别的分子标记。此外,10X Genomics平台的噪音也最少。研究人员认为,inDrop平台噪音的一个来源是微珠的易变性,因为研究中出现了两批微珠检测同一样本的结果完全不同的情况。/pp  该研究还意外发现了不同微珠对检测结果的影响。研究中的三个平台都在微珠上附加了条形码。为了确保一个细胞对应一个条形码,微珠和细胞都需要进行稀释。但微珠自身可能会影响稀释效果,进而影响细胞的捕获效率。例如,strong10X Genomics和inDrop都使用水凝胶珠,它们体积大、柔软灵活,流经系统的速度较低,能够避免两个细胞或两个微珠被包裹在一个水滴中,因此只需要较小的稀释就能获得较高的捕获效率/strong。Drop-seq使用的微珠更小更硬,需要更大的稀释度避免微珠成对出现,但这会降低细胞捕获效率。/pp  此外,检测结果表明,10X Genomics微珠的条形码错配较少,另外两个平台有超过一半的细胞条形码出现明显的错配。其中,Drop-seq约10%微珠的条形码出现一个碱基缺失。/pp  转录组检测的试验成本和效率取决于具体场景。为方便研究人员选择合适的单细胞RNA测序平台进行研究,研究团队针对三个平台的表现与特性给出了指导意见。虽然大多数项目的细胞数量相对较多,strong但对于稀少样本,如人类胚胎,需要细胞捕获效率更高的平台,10X Genomics是较为合适的选择/strong。但在三款平台中,10X Genomics的成本最高,定价为125000美元,仅运行单细胞实验的平台为75000美元,估计每个细胞的检测成本为0.50美元。/pp  Drop-seq平台是较便宜的一个选择。Drop-seq平台制造成本为6000美元,购买花费不到30000美元,每个细胞的检测成本为0.10美元。但目前国内使用Drop-seq的成本明显高于国外。由于细胞捕获效率较低,Drop-seq平台适合样本丰富的研究,不太适合用于少量样本和珍贵样本的检测。/pp  strong当低丰度转录组的检测可选择时,选择inDrop更合适/strong。研究团队估计inDrop仪器成本约为50000美元,每个细胞检测成本为0.25美元。InDrop的主要优势是开放系统,用户可以根据自己的需求对其进行调整和定制。研究人员表示,inDrop还没有10X Genomics平台那么强大,但预计它会不断改善。总体来说,这三个平台都能提供令人满意的检测效率。/ppstrongspan style="color: rgb(0, 112, 192) "研究二:Fluidigm、WaferGen、10X Chromium Controller、Illumina/Bio-Rad平台性能比较/span/strong/pp style="text-align: center"img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201812/uepic/0a19edf1-b943-4748-b6ee-dc3ec8f54b18.jpg" title="5.jpg" alt="5.jpg"//pp style="text-indent: 2em "ABRF研究小组针对一组经治疗和未经治疗的乳腺癌细胞系比较了Fluidigm、WaferGen、10X Chromium Controller和Illumina/Bio-Rad测序平台在易用性、成本和时间方面的差异。/pp  在捕获能力方面,strongFluidigm平台具有较低的细胞捕获能力/strong,该平台最高捕获400个细胞。除Fluidigm外,其他平台的捕获能力约为单臂4000个细胞。在捕获效率方面,不同单细胞测序平台的表现不尽相同,如10X Chromium Controller平台的捕获效率为65%,WaferGen平台为30%,而Illumina / BioRad平台的效率仅为3%。但每个单细胞RNA测序平台都可以区分已治疗和未经治疗的癌细胞,只是有些平台更具有特异性,有些平台更加适合处理解决治疗组的相关问题。/pp  就基因检测结果而言,各检测平台在测试条件下具有相似的灵敏度。其中,Fluidigm平台的表现稍好,其他平台则差异不大。此外,研究人员发现这些平台都非常擅长检测低表达的基因。这四种平台也存在一些系统特异性偏差,尤其在GC含量和基因长度方面。这与黄岩谊等人的研究结果相似。/pp  该研究结果显示,不同单细胞RNA测序平台在易用性和周转时间方面也各不相同。根据报告,10X Chromium Controller和Illumina / BioRad平台更易于操作人员使用,但Fluidigm HT则被认为使用较为困难。此外,Fluidigm HT-IFC平台的耗时为12小时,时间最长 Fluidigm 96 IFC、Illumina / BioRad和10X Chromium Controller平台耗时均约为10小时,相比之下,WaferGen仅用7小时。/pp  ABRF研究小组也做了成本分析。Fluidigm HT-IFC方法从细胞捕获到测序需花费2500美元,每个细胞花费在3.13美元到6.25美元之间,96 IFC方法则花费2000美元,即每个细胞20.83美元 Illumina / BioRad每个细胞花费1~4美元 WaferGen每个细胞约花费3美元 10X Chromium Controller每个细胞花费0.15~1.50美元。/pp  由于测序平台的性能各不相同,所以在不同测序试验中选择使用什么平台非常重要。实验人员在选择测序平台时需要根据实际情况考虑多种因素,以选择一种最能满足试验需求的平台。/p
  • 基因测序的云计算平台可能带来的变革与进步
    p  自二代测序的技术问世以来,就一直是研究和临床领域关注的重点。随着整个行业的技术发展,二代测序也带动了整个基因研究的产业链。在二代测序的产业链中,上游做检测,中游做分析,下游做应用。在测序价格持续下降的情况下,中游测序数据的生物信息学分析成为了提高效率最大的瓶颈。/pp  传统的测序数据分析依赖于本地服务器的性能。而可以预见的是不断下降的测序价格将会带来更多海量测序数据的产生,而巨大数量的测序数据无疑会延长获得测序分析结果的时间。目前可能较好的解决方法是通过云计算的方式去做,云计算的优势在于能够通过分布式计算对大数据进行处理,从而极大提升运算效率以及降低成本。/pp  目前国外的云计算平台Seven Bridge已经做的比较成熟,对二代测序数据也能够进行快速分析。缺点是作为典型的pipeline式分析,对用户的要求比较高,对于国内用户群体的使用会有一些障碍。而在国内的云计算平台中,GCBI将于2016年2月底发布新的全基因组测序分析平台,虽然还没有公布具体的信息,但是希望能够体现基本功能的高效率和高可用性。/pp  接下来我们看看在不同的领域,测序的云计算平台可能带来的变革与进步。/pp  strong科研领域/strong/pp  科研研究者一直是测序的重要使用群体,由于测序成本的持续降低及更多的测序服务供应商选择,可以预见的是测序数据的产量与规模大幅度提升。而这部分数据是必然需要分析的,在没有大规模数据分析平台之前,分析的效率受限于本地服务器的规模,数据量越大,分析的时间也越久。而测序的云计算平台将有望突破这个瓶颈,100个样本,1000个样本,分析的时间都仅跟1个样本的分析时间类似,这将极大降低用户的时间成本。预计随着数据分析平台化的出现,科研研究的周期将大大缩短。/pp  strong临床应用领域/strong/pp  在传统的诊疗模式下,临床医生需要各种检查数据以及查体来对病人进行诊断。一旦分子层面的检测在临床进行开展,云计算平台可以通过对同一种疾病临床数据及分子检测数据的收集和快速分析,对特定的病人给出相应的辅助诊断参考,甚至给予相应的用药方案。临床医生在合理应用的情况下,整个诊断的过程将会变得更快速以及更准确。如果未来疾病的发展演变成依据分子水平的变化进行分类,那么诸如GCBI等云计算平台对临床的帮助会更大。/pp  strong个人健康/strong/pp  随着测序技术在医疗领域的应用,市面上已经有不少针对个人健康的检测业务了,检测方法包括个人全基因组测序、定制化基因芯片等等。而这些数据的分析与解读也会随着检测成本的下降变得越来越普遍。当每个人都会去做这样的检测时,云计算平台将有望对这部分数据的快速解读提供可行的解决方案。个人用户将更快速地获取自己的结果报告。/pp  strong合作模式/strong/pp  鉴于生物信息云计算平台的强大功能,有望在平台与科研单位、临床研究者甚至企业之间搭建各种各样的合作模式。科研单位与云平台的合作能加快科研成果的输出,云平台可以帮助科研单位进行成果的转化与应用 临床研究者可以借助云平台进行辅助诊断,云平台通过临床数据的输入不断使诊断模型优化 企业通过云平台可以推广自有产品,云平台也可以给用户提供更多样的供应商选择。/pp  可以预见的是,生物信息云计算平台的强大能力不仅仅会体现在其计算能力上,临床应用,合作转化等方面都可以展现其潜力。就让我们拭目以待看看云计算平台的发展吧。/p
  • 安捷伦科技针对台式测序仪推出靶向序列捕获平台
    安捷伦科技针对台式测序仪推出靶向序列捕获平台 2012 年 2 月 14 日,佛罗里达州马科岛(基因组生物学和技术,AGBT)- 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)推出SureSelect 靶向序列捕获系统,支持台式测序仪的HaloPlex 靶向序列捕获系统。该产品将于明日在基因组生物学技术进展年会上正式亮相。 独特的HaloPlex 技术完美融合了聚合酶链反应系统的速度和特异性以及基于液相杂交体系的可扩展性和捕获片段大小的灵活性。该实验方案无需文库构建,利用单管操作,从而解决了多重 PCR 由于存在交叉杂交问题而使靶向序列数量受限的问题。该方案使样品制备时间缩短到不到一天,适用于 Illumina MiSeq 台式测序仪以及 HiSeq 和 GAIIx 测序仪。 &ldquo 虽然新一代测序技术使全基因组分析成为可能,但是当我们想要在数量庞大的个体中测定少部分基因时,我们通常会遇到如何富集的问题。&rdquo Hubrecht 研究所基因组生物学首席研究员 Edwin Cuppen 说,&ldquo 对于几个到几十个范围的目标基因捕获,当前的杂交捕获技术有其局限性。HaloPlex 技术很好地填补了这个空白,可以帮助我们实现了在单次反应中捕获 2 至 20 个基因的完整编码序列,而且其在目标序列片段的的测序效率超过 90 %。 &ldquo HaloPlex 富集技术与 Ion Torrent 半导体测序技术联用,这种灵活高效的组合非常适用于高通量的小片段靶向基因重测序。&rdquo Cuppen 博士参与了安捷伦针对Ion Torrent 平台推出的 HaloPlex 技术的早期测试项目。 &ldquo HaloPlex只是我们为进一步巩固 SureSelect市场 领先地位而制定雄心勃勃的产品开发项目的一个例子。&rdquo Olle Ericsson 说道。他是 Halo Genomics 创始人,目前在安捷伦担任 DNA 测序市场总监一职。&ldquo 面世后的短短两年时间内,SureSelect 就已被超过200 篇的重要学术论文引用,在研究领域发挥了重要作用。在台式测序和靶向序列捕获技术通往临床研究的道路中,HaloPlex 这一创新技术使安捷伦成为领跑者。 HaloPlex 是一款定制产品,用户使用免费的在线设计向导(Web Design Wizard),在不到 10 分钟时间内就可完成设计,富集数以千计的目标基因组序列。 安捷伦于 2011 年 12 月收购了位于瑞典乌普萨拉的 Halo Genomics,从而获得了该产品。HaloPlex 技术完美补充了 Agilent SureSelect 靶向序列捕获系统。这项新产品如今也受益于安捷伦强大的研发、生产和分销资源。 要了解更多信息,请访问 www.agilent.com/genomics/ngs。 关于安捷伦科技 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)是全球领先的测量公司,同时也是化学分析、生命科学、电子和通信领域的技术领导者。公司的 18,700 名员工为 100 多个国家的客户提供服务。在 2011 财政年度,安捷伦的业务净收入为 66 亿美元。要了解安捷伦科技的信息,请访问:www.agilent.com.cn
  • 5家进口+N家国产,单细胞测序平台大盘点!
    2009年,单细胞测序技术问世。2013年被Nature Methods评为年度技术。2015年以来,10X Genomics、Drop-seq、Micro-well、Split-seq等技术的出现。2018年以来,以新格元为代表的国内单细胞平台如雨后春笋般涌现。Fig 0 单细胞平台一览图详细了解厂商和各家产品之前,预告一下“第六届基因测序网络大会”,会议上德运康瑞、墨卓等企业的专家代表将有精彩的分享。马上免费报名吧!报名页面:https://www.instrument.com.cn/webinar/meetings/geneseq2023/一、低通量单细胞平台低通量的单细胞平台主要是基于smart-seq2技术原理开发而来,典型代表有Fluidigm C1™ 单细胞全自动制备系统和WaferGen ICELL8® Single-Cell System两大平台。1、Fluidigm C1™ 单细胞全自动制备系统Fig1.1 富鲁达C1单细胞系统  2012年6月13日,Fluidigm 在日本横滨举行的国际干细胞研究学会 (ISSCR ) 上发布了C1™ 单细胞全自动制备系统,是真正第一个实现商业化的平台。  C1单细胞自动制备系统微流体技术,可以同时捕获多个单细胞(IFC:~96 cells;HT-IFC:~800 cells),在同一张芯片上完成细胞捕获、裂解、逆转录及预扩增的全过程,完成smart-seq全步骤的自动化。2、WaferGen ICELL8® Single-Cell SystemFig1.2 宝生物iCell8单细胞平台  2015年2月份,Wafergen公司开发出ICELL8 Single-Cell System单细胞分选平台,后被TaKaRa公司收购。  利用WaferGen Smart Chip TE平台筛选细胞,5184个反应孔,可进行单细胞RNA测序样本的制备、扩增、表达谱建库测序、生物信息分析,可快速得到样本间的基因表达差异。  每次运行可分离500~1800个细胞; 细胞的捕获效率大约37%; 细胞适用范围为5-100um; 样本通量为8(一枚ICELL8芯片上一次最多可以分析8种细胞样品); 没有整合试剂,使用Takara试剂,需进行试剂优化; 自动成像技术系统:可实现单细胞反应孔可视化; 单细胞挑选软件:只挑选活的单细胞进入后续的处理,从而可以节约反应试剂,缩短数据分析时间。[点评]:虽然低通量测序现在不是市场上的主流,但是由于其实验的精密度是非常高的,已依旧没有被社会淘汰。二、高通量单细胞平台(进口)  2017-2018年,两大商业化的单细胞测序平台(10X Genomics, BD Rhapsody)出现,最终让单细胞测序技术进一步达到更大商业化。1、 Mission bio:专注于高通量单细胞DNA测序的平台Fig2.1 Mission bio Tapestri Single-cell Multi-omics Solution  Tapestri平台基于微液滴的微流控装置,利用油包水体系对细胞进行捕获与封装。封装时,细胞和蛋白酶等会被一起装入微液滴中,每一个微液滴相当于一个微容器。之后,细胞在微液滴中进行裂解、加条形码(barcoding)等步骤,再结合靶向 PCR 扩增技术,对特定的DNA目标序列与蛋白产物进行单细胞水平的建库。建库完成后,即可进行高通量测序和后续的生物信息学分析。• 专注单细胞DNA测序。• 高灵敏度,可检测含量低至0.1%的罕见亚克隆,以及突变的合子型和突-变共发生情况。• 多种检测类型,可检测SNV、InDel及CNV等多种变异类型。• 高通量,每个样本可测量5,000~10,000细胞。• 灵活性强,可定制化设计疾病基因检测靶点及CRISPR靶点 。2、Illumina® Bio-Rad®:基于数字PCR的高通量单细胞平台  2017年1月17日,Illumina公司和Bio-Rad实验室公司在JP摩根健康大会上发布了Illumina® Bio-Rad® Single-Cell Sequencing Solution。Fig2.2 Illumina Bio-Rad Single-Cell Sequencing Solution该系统包含Illumina® Nextseq 500和Bio-Rad® ddSEQ™ Single-Cell Isolator;Bio-Rad最好的液滴分离技术,Droplet Digital™技术,可以对单细胞进行隔离和编制条形码,然后在Illumina的许多主要NGS仪器上进行下游测序。• 可一次性检测8个样本,每个样本可以得到500~10000个细胞。• 捕获效率低,仅为3%,但测序成本相对较低。3、10x Genomics Chromium 高通量单细胞平台(controller/connect/X series)10X面对市场不同的需求推出了三款仪器。最早的这一款就是chromium controller,这款仪器配备了是标准通量和低通用的两款试剂盒。2021年的时候,10X上又推出了chromium X series这款仪器,目前这款仪器也是市场主推的一款。它适配的试剂盒的规格也更丰富。Fig2.3 10x Genomics Chromium 高通量单细胞平台另外10X推出的chromium connect仪器最大特点就是它能够实现从单细胞分离以及到最后NGS文库构建的一个全流程的过程,因此更加适合于一些大通量的实验室。• 每次运行提供8个通道,每个通道可以收集100-10000个细胞。(注:Chip M是16个通道)• 每次细胞分装运行时间为18min左右;• 细胞捕获效率最高可达65%;• doublet比例为0.9%/1000个细胞;• 针对单细胞ATAC分析,线粒体污染率低于2%;4、BD Rhapsody™:基于微孔板法的高通量单细胞分析系统  BD Rhapsody™单细胞分析系统包括BD Rhapsody™扫描仪和BD Rhapsody™ Express单细胞分析系统。BD Rhapsody™ Express 系统配备的专有单细胞捕获技术,以微孔为基础,稳定,能够捕获数百到数千个单细胞并为其打上条形码,分析基因组和蛋白质组信息。BD Rhapsody™扫描仪旨在可视化单个细胞捕获工作流程中的所有步骤,为每个步骤提供详细的分析度量,以便用户在整个工作流程中做出关键决策。Fig 2.4 BD Rhapsody™单细胞分析系统• 单细胞捕获效率:最高可达~80%• 单细胞检测通量:100-40000• 双细胞比例: ~2-3% for 10k cells load; ~8-10% for 40k cells load[点评]:1)10x Genomics仍是主力军,在国内拥有众多代理商和服务商,占据着80%左右的国内科研市场份额。同时该平台近两年注重空间组学平台开发,2022年推出了一系列新产品;10x Chromium X系列产品有多种应用类型,支持低中高3通通量模式,在推广上又与之前的Controller进行联动(增加保修年限),是10x的主力机型。2)BD Rhapsody™平台坚持微流控微孔板的原理,配备有扫描仪,可以实时监测单细胞状态,保证细胞的分离捕获效率;同时其配套有抗体和流式平台,在单细胞实验的组合解决方案上有明显优势(混样、与流式仪器上下互动组合)。3)Mission Bio单细胞平台专注单细胞基因组测序,在血液肿瘤方向深耕多年,接触临床应用时间较早;近些年在逐步增加国内服务商的覆盖,已有多家知名服务商与之合作。4)Bio-Rad与illumina合作推出的单细胞建库平台捕获效率较低,市场占有率及市场声音较低。点击图片即可报名参会,8位嘉宾将带来单细胞测序内容!三、高通量单细胞平台(国产)截止到2022.12.31,国内的单细胞平台共有10个,分为微流控微孔平台(以新格元Matrix系统为代表)和液滴微流控平台(以华大C4系统为代表)。1、新格元Singleron Matrix® 自动化单细胞测序文库构建系统可完成将单细胞悬液分散到微流控芯片的高密度微孔阵列中,并自动完成细胞分离、细胞裂解、细胞标记至mRNA捕获步骤,无需实验人员干预。Fig3.1 Singleron Matrix自动化单细胞测序文库构建系统• 单个样本单张芯片可捕获细胞数量500-30000个 • 每份样本捕获效率最高可达75% • 检测1000个细胞中含有双细胞的比例低于0.2%;[点评]新格元生物是国内首家一站式全方位的单细胞整体解决方案提供商,在产品方面既有单细胞转录组、核转录组、免疫受体等常规产品,同时也有单细胞转录动态监测、单细胞糖基化、单细胞靶向基因检测试剂盒等特色产品,能够给科研者提供更加多样的组学研究选择。是国产单细胞的主要玩家之一。2、华大智造:DNBelab C4高通量单细胞平台DNBelab C4是华大智造推出的基于负压的微流控单细胞技术。小巧轻便(长230mm、宽42mm、高57mm),无需电源,重量不到220g,操作简单,可随时开始单细胞建库。Fig3.2 DNBelab C4 Pocket Single-Cell Lab• 有效捕获细胞数:1000~12000 cells/run;• 细胞直径范围:5µm-25µm ;• 多胞率(Multiplet Rate):8% ;• 捕获效率:30~60% ;3、寻因生物:SeekOne双平台体系(微孔板平台+液滴油包水平台)寻因生物有单细胞标记两大主流技术:油包水法SeekOne® DD和微孔芯片法SeekOne®MM(Microwell & Magnetic Beads)。1)微孔芯片法MM  SeekOne MM(Microwell & Magnetic Beads)高通量单细胞转录组试剂盒基于微孔技术原理,通过微孔芯片SeekOne Chip实现单细胞捕获,并利用核酸修饰的Beads 对不同细胞来源的RNA 进行分子标记,最终构建兼容Illumina及华大智造测序仪的高通量单细胞转录组文库。Fig3.3.1 SeekOne MM平台(手动法)• 单次可放置1-4张芯片,单人操作可同时处理1-4个样本;• 单张芯片微孔数:17w;• 单张芯片捕获细胞数:500-10000 cells;• 捕获率:最高可达60%;• 双胞率: 0.7% / 1000 cells;• 无需其他昂贵硬件配套2)油包水法DD  液滴油包水平台(DD)是寻因生物的主力平台,并基于该平台开发了相应试剂盒,其主要有单细胞3‘转录组试剂盒和单细胞5’免疫受体试剂盒。• 芯片通量:1~8个样本,可以拆卸不会有芯片浪费;• 运行时间:3 min生成15万个油包水液滴;• 单通道细胞捕获:500-12000 Cells;• 双胞率:0.3% / 1000 cells;[点评]寻因生物尽管对外宣称具有MM和DD双平台,但整体推广上仍侧重DD平台,并依托其可拆卸的芯片实现更加灵活的实验安排。目前该公司产品相对较单一,公司在推广上发力比较多,推出了相当多的视频专题进行客户教育,算是不错的行业先行者。4、墨卓生物在过去的2022年中,墨卓生物对外发布了单细胞液滴微流控平台及其试剂盒、微生物高通量单细胞基因组测序产品。其中单细胞液滴平台MobiNova-100引入了光激发分离(Light-CUT专利技术)原理,可以在单细胞核酸捕获阶段将分子标签与微珠进行分离,因此在实验中需要专门的配套设备。Fig4.1 墨卓生物单细胞仪器• 芯片通量:1~4个样本;• 试剂盒种类:目前仅有单细胞3‘转录组试剂盒;• 运行时间:10 min;• 单通道细胞捕获:500-20000;• 双胞率:5% / 10000 cells;此外墨卓生物还推出了MobiMicrobe 微生物高通量单细胞基因组测序解决方案及其仪器产品M1,主要是在菌株水平分析宿主-噬菌体关联信息及转录转移事件。• 样本通量:每次可处理1个样本;• 捕获通量:每个样本可捕获微生物细菌数量≥6000个;• 仪器配套高速相机,能够观测微芯片中微滴发生和融合;• 仪器配有低温存储模块能,可同时放置4个0.2 mL PCR反应管和4个1.5 mL离心管;• 仪器配有扩增模块(96x0.2ml,12x8连管或96孔 PCR板)• 仪器带有自检功能:仪器在开机和运行过程中会自动检测,遇到异常会发出报警提示。5、其他除了以上4个国产单细胞平台之外,在过去的两年中还出现过一些平台公司,他们均采用液滴法来作为技术源头,并处于早期产品阶段,以单细胞转录组、免疫受体等作为主推产品,为客户提供产品或者服务。这些厂家有万乘生物(10K genomics)、百迈克生物、跃真生物(m20 genomics)、德运康瑞、纯迅生物等。总结  截至2022年12月,目前国内市场共有2个低通量进口品牌、4个高通量进口品牌和10个国产品牌,均有各自的公司定位和产品体系以及对应领域解决方案。  纵览2022年国内市场单细胞信息,主要特点有:• 单细胞新平台频出。如墨卓,M20,百迈客均是2022年推出单细胞平台。• 单细胞平台特点突出,各有产品和市场定位,有从单品到一站式解决方法成长的趋势。• 单细胞市场更为成熟。各家单细胞平台对内完善了团队建设,对外加强服务商或产业端的合作。• 空间技术应用。10X主推空间原位,德运康瑞收购先能原位,华大和百迈客主推基于测序的空间技术。• 单细胞多组学,有单细胞平台的厂家基本在或计划开发单细胞多组学(免疫,表观,蛋白,突变,全长)产品矩阵。• 单细胞技术应用方向扩展到动物,植物,微生物。如联川,诺禾推出农口单细胞激励计划,BD联合华南农大推出经济作物单核文库构建方案。(信息来源于生物医学小站)第六届基因测序网络大会进入报名页面:https://www.instrument.com.cn/webinar/meetings/geneseq2023/点击图片报名
  • 防止仪器重购 须完善共享服务平台
    中央财政近日下拨2014年专项资金30.45亿元,支持259个国家重点实验室的创新与发展,其中,仪器设备购置和升级改造经费8.58亿元。据财政部相关负责人介绍说,他们还同时建立了仪器设备购置与全国科技资源清查结果相衔接的机制,以避免重复购置。  近年来,随着国家经济实力的增强和对科学技术的日益重视,政府在科研方面的投入越来越大,给科研机构、院校等提供的高端仪器采购费用也越来越高。就目前中国的科研人员所使用的大型科学仪器而言,相比国外发达国家毫不逊色,甚至有过之而无不及。不少专家曾经坦言,在科学实验方面,中国已经拥有一流的设备,国外很多仪器公司新研发的设备,连本国的实验室都还没有装备,就已经卖到中国。  问题在于,拥有最新的设备,科研人员却没有将其进行合理的利用,甚至出现了很多科研机构不同实验室重复采购设备的问题。科技部国家科技基础条件平台中心副主任吕先志在日前的某次学术会议上坦言,当前大型科学仪器的利用率与一些发达国家相比,处于中等偏下。  为何会出现大型科学仪器重复采购的问题?原因或许有很多种。目前国家的科研经费投入,很大一部分要求必须花在科研设备上,而不能作为其他用途。这样,可能导致尽管一些机构的科研仪器已经很先进,但限于规定,不得不再度采购类似仪器。当然,大型科研仪器共享平台机制的不彻底,使在同一地区、或者同一系统内的科研人员无法实现资源共享,也是导致科学仪器重复购置的重要原因。  大型科学仪器的重复采购问题,已经成为业内的共识。  笔者以为,要想破解大型科学仪器重复购置的困局,除了国家在科技资源配置方面需要慎重考量之外,进一步完善大型科学仪器共享服务平台的建设,或许应当是重中之重。  多年前,教育部就设立了高等学校仪器设备和优质资源共享系统项目 近年来各地建立的大型科学仪器区域性共享平台也越来越多。然而由于现行科技评价体系的局限,很多科研机构的主管人并不愿意将仪器借给他人,科研人员的职位晋升、资源获取乃至工资待遇,都与其科研成绩紧密地联系在一起,导致其并不愿彻底开放共享。  因此,有关部门应当建立科研共享仪器的奖励和考核机制,对仪器使用率高、管理措施落实好的单位和人员予以支持,进一步完善大型科学仪器共享服务平台。这样,不但可以节约国家在科学仪器采购方面的费用,也可以让高价仪器发挥作用,让真正有需求的科研人员能够以最小的成本,得到最合适的仪器,作出最好的成果,从而让那些&ldquo 养在深闺无人知&rdquo 的闲置科技资源,成为驱动科技创新的强大动力。
  • 吉因加国产测序平台获准RNA预期用途
    近日,国家药品监督管理局(NMPA)官网公开信息显示,已批准吉因加自主品牌国产基因测序仪Gene+Seq-2000和Gene+Seq-200的适用范围变更申请。两款仪器分别于4月14日和4月27日通过审批,新增了“对核糖核酸(RNA)进行测序”的适用范围。在基因检测应用场景不断扩展的今天,单纯的DNA测序无法满足迅猛增长的临床需求,而RNA测序扮演者越发重要的角色,国产测序平台在该领域获批应用,为临床提供了更加丰富的选择,必将更好地支撑起相关产业的发展,推动NGS技术在临床合规落地。 吉因加表示:根据《医疗器械监督管理条例》、《医疗器械注册管理办法》等相关法律法规的要求,应用于临床的医疗器械产品应具备相应的适用范围并获得国家药品监督管理局批准。但是,目前市面上的测序仪大多是“在临床上用于对来源于人体样本的人的脱氧核糖核酸(DNA)进行测序”,例如聚焦生育领域DNA检测、肿瘤DNA检测以及遗传病DNA检测等,不包含人的RNA,也不包含来源于人体样本的病原的DNA和RNA检测等应用,不能够完全满足目前临床合规开展各类基因检测的需求。 本次Gene+Seq-2000和Gene+Seq-200获批 “可用于人体样本的不仅限人的DNA和RNA测序”,可以检测包括肿瘤融合基因、病原RNA、全转录组等多种需求,可以真正实现DNA和RNA基因检测需求的全覆盖。测序仪适用范围/预期用途Gene+Seq-200该产品采用联合探针锚定聚合测序技术,在临床上用于对来源于人体样本的脱氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)进行测序Gene+Seq-2000该产品采用联合探针锚定聚合测序技术,在临床上用于对来源于人体样本的脱氧核糖核酸(DNA)和核糖核酸(RNA)进行测序测序仪A该产品用于对来源于福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织的人基因DNA测序测序仪B该产品用于人脱氧核糖核酸(DNA)测序测序仪C该产品基于边合成边测序技术,在临床上用于对来源于人体样本的人的脱氧核糖核酸(DNA)进行测序在临床应用方面,其实已经有较为成熟的RNA应用场景,比如对肿瘤融合基因的检测。DNA测序在检测融合基因时,对于仅发生在RNA或DNA层面融合丰度低的情况,以及对于存在长内含子或重复序列融合的情况均存在局限性,而RNA测序除了能够有效检出这些融合之外,还能发现更多未知融合,为未来的药物研发提供更丰富的信息。目前,已有多项研究证明,将DNA检测与RNA检测相结合,可以实现核心治疗靶点及罕见、有效的融合变异的同时测定,弥补常规检测方法可能出现的漏检、融合基因不明确等不足,有效提高融合基因检出率,更好地帮助医生进行临床诊断及治疗。因此,多项指南都在推荐将DNA检测与RNA检测相结合,以更全面覆盖基因融合/重排,更大程度地提高临床获益。
  • 南中医高通量测序平台690万仪器采购中标公告
    SJC2011060186南京中医药大学高通量测序平台项目中标公告  江苏省省级行政机关政府采购中心受南京中医药大学委托,就南京中医药大学高通量测序平台进行公开招标采购,按规定程序进行了开标、评标、定标,现就本次招标的中标结果公布如下:  一、项目名称:南京中医药大学高通量测序平台  采购编号: SJC2011060186  二、招标项目简要说明:略。  三、招标公告媒体及日期:2011年07月19日江苏省省级机关政府采购中心网站、《中国财经报》、中国政府采购网站、江苏政府采购网。  四、评标信息:  评标日期: 2011年08月12日  评标地点:江苏省南京市中央路42号江苏省省级行政机关政府采购中心413电子评标室  评标委员会名单:  毕向东、李丽、王书奎、蒋理、华子春、徐斌、梁照林  五、中标信息:  分包1:  中标供应商名称:江苏苏美达仪器设备有限公司  中标供应商地址:南京市长江路198号7楼  中标金额:陆佰捌拾玖万柒仟圆整(¥6,897,000.00)  六、本次招标联系事项:  联系人:赵国文  联系电话:025-83286913  传真电话:025-83286920  联系地址: 南京市中央路42号江苏省省级行政机关政府采购中心  邮政编码: 210008  网址: www.jszfcg.gov.cn
  • 校企赋能,砥砺前行——记月旭科技与中国药科大学共建实验平台
    为提升企业科技创新实力,促进学校内涵式发展,围绕“新工科”建设目标,实现校企联合,资源共享,深化药物制剂国家一流专业建设,共同提高技术创新水平,完善卓越人才培养机制,月旭科技和中国药科大学创新性地提出了共建创新实验平台,并初具雏形,新学期实验室将以崭新的面貌投入到教学与大学生创新科研工作中。中国药科大学是一所历史悠久、在药学界享有盛誉的教育部直属、国家“211工程”和“双一流”建设高校,坐落于钟灵毓秀、虎踞龙蟠的古都南京。学校前身为始建于1936年的国立药学专科学校,是我国历史上第一所由国家创办的药学高等学府。80余年来,学校秉承“精业济群”的校训精神,为推动国家卫生健康事业发展做出了重要贡献。学校致力于构建多学科交叉融合的学科生态体系,以药学、中药学学科为龙头的药学学科群建设始终保持国内外领先水平,获国家科技进步二等奖4项、国家技术发明二等奖1项,获批国家“重大新药创制”科技重大专项项目数稳居全国高校之首。月旭科技是一家集研发、生产、销售和服务为一体,致力为客户提供色谱分离分析技术、产品和整体解决方案的公司,其产品广泛应用于生物医药、食品安全检测、环境监测、精细化工等关系民生并处于快速发展的行业。月旭科技长期致力于成为中国领先的色谱填料、色谱耗材和仪器制造商,色谱分析和分离纯化整体解决方案提供商,色谱实验用品一站式供应商。此次月旭科技与中国药科大学共建实验室,定位为共享创新平台,月旭科技投入一批自行研制或独家代理的仪器产品,包括高效液相色谱、溶出仪、崩解仪、振实密度仪等十套设备,以及月旭科技以色谱柱为代表的实验室消耗品,助力校内外师生企业的教学、科研和检测工作。月旭科技将与中国药科大学在共建实验平台的基础上开展一系列的专题培训、讲座和技能型竞赛,为企业带来更高价值的共享成果,进一步增强产学研联合攻关的优势。共建实验室平台实验室内的月旭色谱耗材实验室内的月旭仪器产品共建实验室外墙目前,共享仪器已经登陆中国药科大学学院预约系统,开放预约和使用。仪器清单:
  • 最新!PacBio发布高精度短读长测序平台Onso
    2022年10月25日 ,测序解决方案开发商PacBio(纳斯达克股票代码:PACB)宣布将对 Onso™ 测序系统进行外部测试。这一创新的台式短读长 DNA 测序平台通过利用 PacBio独特的结合测序(SBB)技术有望达到惊人的准确率水平。PacBio 总裁兼首席执行官 Christian Henry表示:“我们很高兴看到研究人员将如何利用我们期望 Onso 系统提供的突破性测序准确性。Onso 推出后,PacBio 预计将成为市面上唯一一家能够同时提供高精度、原生短读和长读测序技术的公司,这将使我们能够为客户的挑战提供更完整的解决方案。Onso 测序系统旨在提供高度准确的测序读数,支持可扩展、灵活和成本优化的操作,并使客户对他们的科学更有信心。该系统旨在改变基因组学行业的游戏规则,我们很高兴开始向我们的测试合作伙伴提供测试系统。”Onso 测序系统在设计上与目前短读测序仪的丰富产品生态系统相兼容,并支持多样化的文库制备类型、单细胞分析方案、全基因组测序和其他靶向测序应用,如扩增子和杂交捕获Panel。预计每次运行可提供5亿条 reads,并提供200和300个测序循环试剂盒,实现双端和单端测序,每套系统的美国上市价格为25.9万美元。PacBio 首席运营官 Mark Van Oene表示:“我们相信差异化的准确性和工作流程将使科学家们能够通过 Onso 比市场上其他短读测序平台在相同的数据通量下处理更多的样本。Onso 测序系统有望带来数据质量和效率的新标准,可以更好地审视基因组,而无需过度测序和复杂的纠错方法。在肿瘤学研究应用中,我们很高兴能展示 Onso 在研究遗传变异和推进诊断工具发展方面的非凡敏感性和特异性,以改善治疗方案选择和复发监控。”Broad研究所首席基因组学官兼基因组学平台高级主任Stacey Gabriel 博士表示:“我们很高兴看到测序技术领域的持续创新。随着我们继续完善基因组的目标区域,这些区域孕育着可操作的和其他临床相关的变体,提高准确性和调用挑战性变体的能力将特别重要。”Corteva Agriscience 基因组学技术经理Gina Zastrow-Hayes 博士表示:“PacBio 公司新的 Onso 系统的高精确度为农业生物技术带来了新的机遇。我们期待着将该技术引入 Corteva,并将其应用于基因编辑特异性分析等可以从提高准确性中受益的应用。”PacBio 还在其网站上发布了一份演示文稿,提供了关于 Onso系统的更多细节。有兴趣的人士可以阅读 PacBio 的投资者关系网站上的演示文稿,以及产品信息。PacBio 还在其网站上发布了一份演示文稿,提供了关于 Onso系统的更多细节。有兴趣的人士可以阅读 PacBio 的投资者关系网站上的演示文稿,以及产品信息。
  • Illumina重磅发布四款最新测序仪器平台
    fieldsetlegendspan style="color: rgb(105, 105, 105) "strong背景/strong/span/legend  span style="color: rgb(105, 105, 105) "strongspan style="font-family: arial, helvetica, sans-serif "2015年1月12日-15日,第33届JP摩根健康投融资大会在美国旧金山举行,往年大会上,各家公司都派出重量级阵营,公布上年度经营业绩,发布最新产品,给市场打入强心剂,以获得投资人的青睐。/span/strong/span/fieldsetp /ppspan style="font-family: arial, helvetica, sans-serif "  JP摩根健康大会开场,重量级公司Illumina发布了4款最新的测序仪器,推出HiSeq X Five系统,HiSeq3000,HiSeq4000,Nexseq550。HiSeq3000/4000采用HiSeq X上的测序芯片,可以低成本开展个人基因组、外显子组测序;而Nexseq550则可以在测序的同时扫描基因芯片。/span/pp style="text-align: center "img style="width: 502px height: 326px " alt="" src="http://img1.17img.cn/17img/old/NewsImags/images/201511310420.jpg"//ppspan style="font-family: arial,helvetica,sans-serif " strong HiSeq X Five/strong/span/ppspan style="font-family: arial,helvetica,sans-serif "  HiSeq X Five是HiSeq X Ten的低版本商业套装,还是同样的测序仪,同样的通量,只是可以5台起打包销售,每台的价格不是X Ten的100万美元,而是120万美元,每个基因组的测序成本涨到了1400美元。这是典型的商业套路,无关技术。对于一次性掏不出1000万美元的客户是个选择,对于追求更高性价比的客户则是个痛苦。还是有钱的人,可以任性!/span/ppspan style="font-family: arial,helvetica,sans-serif "  Illumina官方表示:HiSeq X Five是专注于大规模人全基因组测序。HiSeqX FIVE系统由5台HiSeq X组成,可升级到HiSeq X TEN从而实现1000美金人全基因组测序。/span/pp style="text-align: center "img style="width: 600px height: 181px " alt="" src="http://img1.17img.cn/17img/old/NewsImags/images/2015113104224.jpg"//ppspan style="font-family: arial,helvetica,sans-serif " strong HiSeq 3000/4000/strong/span/ppspan style="font-family: arial,helvetica,sans-serif "  HiSeq3000/4000采用了HiSeq X 系列的Patterned Flowcell,通量提高到每个RUN0.75-1.5Tb,可以开展全基因组、外显子组、转录组等测序,速度是3.5天,2500以前的型号系列还可以销售,但以后会逐渐转向3000\4000系列。/span/ppspan style="font-family: arial,helvetica,sans-serif "  HiSeq 3000和HiSeq 4000在可靠的HiSeq 2500的基础上使用了创新的有序流动槽技术,可提供无可比拟的测序速度和性能。HiSeq 4000系统配备2个流动槽,可为多种应用提供最高的测序通量以及最低的测序成本。配备1个流动槽的HiSeq3000系统具备同样的性能。/span/pp style="text-align: center "img style="width: 600px height: 447px " alt="" src="http://img1.17img.cn/17img/old/NewsImags/images/2015113104236.jpg"//pp strong span style="font-family: arial,helvetica,sans-serif "NextSeq550/span/strong/ppspan style="font-family: arial,helvetica,sans-serif "  NextSeq550在原有高通量测序平台NextSeq 500 的基础上,增加了芯片扫描功能。该系统为用户基于芯片应用转化到测序技术平台上来,搭建了新的桥梁。在临床市场,使用同一系统可以互相补充不同的应用,如细胞遗传学分析和胚胎植入前遗传病筛查等应用。因此这款为临床应用设计的平台可以开展NIPT业务,不过价格比测序仪NextSeq500高了一些。/span/p
  • 新一代基因测序仪器亮相进博!因美纳技术平台曾完成首个新冠病毒基因组序列测序
    2021年,是人类基因组计划草图首次发布的第20个年头,也恰逢中国“十四五”规划的开局之年。过去两年,基因测序技术在全球抗击新冠疫情中的重要作用揭示了生命科学时代的真正到来。与此同时,中国“十四五”规划将生物基因科技发展,公共卫生建设以及健康预防等内容提到了极为重要的位置,基因测序技术和应用均贯穿其中。自因美纳创立之初,公司即通过持续的技术创新不断推动测序成本的下降。如今,因美纳的技术已使测序成本下降了99%。此次进博会上,因美纳展示其主要的测序仪系列产品,让参观者得以了解基因检测的奥秘。图说:因美纳在进博会上展示其主要的测序仪系列产品 新民晚报记者 陶磊 摄(下同)去年,中国科学家向全球第一时间分享的首个新冠病毒基因组序列就是在因美纳的技术平台上完成测序的,为后续的疫情防控、疫苗研发奠定了基础。此次进博会展出的NextSeqTM 550Dx,是因美纳在全球最多国家和地区通过临床注册的中通量新一代测序平台(NGS),迄今为止已在超过40个国家和地区获得临床认证,是一款久经考验的临床测序平台。记者在展台看到,获得2021年红点设计大奖的基因测序平台——NextSeqTM 2000也收获了不少关注。这也是因美纳首个将文库扩增、测序以及快速基因组分析整合在一个平台上的测序仪。图说:参观者有机会获得互动纪念品——基因测序产品模型的盲盒去年进博会前夕,因美纳NextSeq 550Dx获得中国国家药品监督管理局的批准,用于临床人源样本的人类DNA检测诊断,成为因美纳在中国第二款获临床应用批准的测序产品。随着该产品在进博会的成功展出,在不到三个月内,首台NextSeq 550Dx即在上海复旦大学附属华山医院成功安装开机。未来,因美纳计划将包括测序试剂以及测序仪在内的产品逐步推进本土化生产制造。目前,位于上海浦东的因美纳中国生产基地正在积极筹备,预计将于明年第三季度投入生产。
  • 中国药科大学-月旭科技联合共享创新平台正式揭牌
    2023年3月21日下午,中国药科大学-月旭科技联合共享创新平台,在中国药科大学(江宁校区)药学院正式揭牌落成。出席此次揭牌仪式的领导分别有:中国药科大学药学院党委书记张仕英教授、院长姚和权教授、药剂系党支部书记吴正红教授、祁小乐副教授,月旭科技(上海)股份有限公司(以下简称月旭科技)董事长兼总经理屠炳芳、副总经理任兴发、销售副总经理卢晓伟、仪器事业部总监邵锋伟等。揭牌仪式开始前,张仕英书记首先向到场嘉宾表示了热烈的欢迎。同时对月旭科技方面在联合共享创新平台前期建设的努力和后期的规划表达了充分的认可。同时也表示,希望充分发挥联合共享创新平台的作用,促进人才培养,推进技术创新与发展,全力提升整体行业水平。(张书记发言)姚和权院长向大家介绍了中国药科大学的整体情况,中国药科大学是一所历史悠久、在药学界享有盛誉的教育部直属、国家“211工程”和“双一liu”建设高校,坐落于钟灵毓秀、虎踞龙蟠的古都南京。学校前身为始建于1936年的国立药学专科学校,是我国历史shang第一所由国家创办的药学高等学府。80余年来,学校秉承“精业济群,兴药为民”的校训精神,为推动国家卫生健康事业发展做出了重要贡献。(姚院长发言)随后,月旭科技屠炳芳董事长、任兴发副总经理、卢晓伟销售副总依次发言。屠炳芳董事长首先对月旭科技进行了详细介绍。今年是月旭科技成立的20周年,在这样一个时间节点上,双方共同建立一个开放、创新、共享的联合平台,服务于学校的实验教学和实践创新,对我们来说,具有非凡的意义!(屠总发言)任兴发副总阐述了建立联合共享创新平台的重要作用和后期建设规划,希望通过联合共享创新平台的合作,双方建立更深层次的信任,带来更多的创新成果,从而有效地解决技术领域原始创新和基础研究不足等问题。通过这样的合作方式,双方还可以打造技术创新链条,完善卓yue人才培养机制,实现产业转化和落地,最终提升产业竞争力。月旭科技也将在共建实验平台的基础上开展一系列的专题培训、讲座和技能型竞赛,进一步增强产学研联合发展的优势。(任总发言)卢晓伟销售副总对联合共享创新平台的日常管理和支持计划进行了说明,包括月度定期拜访、技术培训讲座,联合共享创新平台内仪器的定期维护和更新。月旭科技将协助联合共享创新平台的日常建设和应用开展工作,将企业实验室仪器设备的规范化管理与学院的实验室管理模式相结合,每个学期对实验室建设情况进行交流和提升,保障实验室安全有序的运行。(卢总发言)双方发言完毕后,吴正红教授宣布揭牌仪式开始,中国药科大学-月旭科技联合共享创新平台正式落成。(吴教授发言)(姚院长与屠总共同为实验室揭牌)揭牌仪式后,双方参观了联合共享创新平台和中国药科大学校史馆。月旭科技仪器事业部总监邵锋伟对联合共享创新平台内的仪器及月旭科技产品进行了详细的介绍。(联合实验室现场图片)(中国药科大学校史陈列馆)中国药科大学-月旭科技联合共享创新平台的落成,是月旭科技20周年系列活动的一项重要内容。它标志着,月旭科技在产学研联合发展的道路上迈出了更加坚实的一步。平台的建设,有助于提升企业科技创新实力,促进学校内涵式发展,实现校企联合,资源共享,深化药物制剂国家一liu专业建设,共同提高技术创新水平,完善卓yue人才培养机制的重要积极意义。
  • 首个国产中通量纳米孔基因测序平台重磅发布!单次准确率达97%
    8月18日,由中国医疗保健国际交流促进会分子诊断学分会(下称“中国医促会分子诊断学分会)、四川大学疾病分子网络前沿科学中心、齐碳科技共同举办的“READs2023中国纳米孔基因测序大会”在成都举行。会议现场,齐碳科技发布了国内首个商业化中通量纳米孔测序平台QPursue,该平台涵盖QPursue-6k、QPursue-6khex两款新品测序仪及其配套测序芯片QCell-6k。中通量纳米孔基因测序平台由齐碳科技自主研发,搭载单张芯片,设计通量为60Gb,可在微生物群研究、孟德尔遗传病、肿瘤研究、物种鉴定、生物多样性等应用场景提供快速测序支持。据悉,该项目代表着国内纳米孔基因测序技术的最前沿水平,标志着国产纳米孔基因测序仪向中高通量进阶。齐碳科技联合创始人谢丹博士在发布中表示,齐碳此次发布的QPursue平台,通量实现大幅提升,一次性满足用户更高通量且灵活多元的测序需求。其中,QPursue-6k搭载单张芯片,设计通量为60Gb,QPursue-6khex则支持灵活选择1-6张芯片进行测序,可产出360G数据。准确率方面,QPursue中通量测序平台适配今年3月齐碳发布的最新一代K2生化体系,搭载全新算法套件,单次准确率达97%,一致性准确率(70x)达Q50。时隔一年,齐碳再发商业化新品测序仪,从低通量QNome测序平台扩展到中通量测序平台QPursue,展现了齐碳强劲的研发能力和创新能力,使国产纳米孔测序仪的应用广度大幅拓展、用户使用成本进一步降低。
  • 测序黑马10X Genomics正式发售GemCode平台
    10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,引起业界关注。GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补,产生长片段信息(10-100 kb),实现结构变异和单体型等分析。  由于现有技术的局限性,基因组上仍然有不少缺口。现有的测序工具让研究人员能够经济地产生数据,实现SNP的大规模鉴定。然而,对于结构变异这种大片段的DNA改变,我们还是无法轻松检出。  GemCode平台是一套分子条形码和分析系统,由仪器、试剂盒和信息学软件组成。它带来了结构变异、单体型以及其他一些有价值的长片段信息,适用于靶向、外显子组和全基因组测序。这个平台并非单独使用,而是与短读取的测序仪结合使用,能轻松整合到现有的测序流程中。目前,它只与Illumina测序系统兼容。  GemCode技术的核心是对1 ng的DNA进行精确分区,形成皮升(pl)大小的液滴,其中包含分子条形码。凝胶珠(Gel beads)是GemCode技术的核心部分。每个凝胶珠都带有条形码oligo的千万个拷贝。每条oligo包含14 bp的分子条形码以及与Illumina测序兼容的组分。这些凝胶珠在分区之后溶解,释放oligo,启动文库构建。  GemCode仪器利用微流体芯片实现了高通量的液滴导入。在8样品卡盒中上样凝胶珠、GemCode试剂和DNA混合物,以及分区的油。微流体通道的网络形成了&ldquo 双十字&rdquo 交叉。在第一个交叉,凝胶珠与试剂预混液和DNA混合。第二个交叉将反应包裹在油中,形成数千个独立的反应。这些油滴就称为GEM。在每个GEM中,凝胶珠溶解,释放带条形码的oligo,实现后续的DNA priming。后面便是传统的文库构建。  之后,数据分析软件将10X Genomics条形码的独特能力与短读取数据相结合,产生一种强大的新数据类型:Linked-Reads。在比对和变异检出后,新的算法利用条形码将来自同一条基因组DNA分子的短读取连接起来。所产生的读取长度在10-100 kb。  这种Linked-Reads数据让研究人员能够以前所未有的水平检测单体型和结构变异。以25倍的覆盖度进行全基因组测序,就能分辨5 Mb的单体型板块。同时,缺失、重复和重排等具有挑战性的结构变异也能够自信鉴定,从而更准确地了解基因组复杂性。  目前,多个机构已经开始使用GemCode平台,Broad研究院便是其中一个。主管Stacey Gabriel表示,Broad的研究人员都很兴奋。&ldquo 随着GemCode平台的安装,我们将很快提供Linked-Reads,实现结构变异检测和单体型分相等应用,&rdquo 她说。  也许,不久以后我们就能看到有关GemCode的论文发表吧。据悉,GemCode平台的售价约为75,000美元,而耗材成本大约是每个样品500美元。
  • “READs2023中国纳米孔基因测序大会”成功举办 齐碳QPursue中通量测序平台惊艳亮相
    8月18日,以“孔窥万物 洞见未来”为主题的“READs2023中国纳米孔基因测序大会”在四川成都隆重举行。作为我国纳米孔基因测序技术的开拓者,齐碳科技联合院士、行业专家学者,进行多场学术交流与思想碰撞,全面呈现纳米孔测序技术及应用的最新进展,挖掘纳米孔测序技术未来潜力以及其在临床与科研应用端的诸多可能性,共促前沿科技从研究到成果转化的高质量发展。同时,齐碳科技进一步扩充产品矩阵,在会上发布中通量纳米孔测序平台QPursue,涵盖便携式纳米孔测序仪QPursue-6k、桌面式纳米孔基因测序仪QPursue-6khex及配套芯片QCell-6k。其中,QPursue-6k支持单张芯片测序,设计通量60Gb,QPursue-6khex可以灵活选择1-6张芯片进行测序,可产出360Gb数据,满足了更高通量、更灵活的测序需求。得益于测序通量的大幅提升,QPursue中通量纳米孔测序平台极大拓宽了适用范围,在微生物群研究、孟德尔遗传病、肿瘤研究、物种鉴定、生物多样性等应用场景,进一步赋能科研与临床工作。新思想 大咖云集 以前瞻视野把脉行业发展READs2023中国纳米孔测序大会现场“READs2023中国纳米孔基因测序大会”由中国医疗保健国际交流促进会分子诊断学分会、四川大学疾病分子网络前沿科学中心和齐碳科技共同举办,邀请中国科学院、中国疾病预防控制中心、国家生物分析中心、扬州大学、南方科技大学等多领域优秀机构的资深专家学者齐聚一堂,站在基因测序代际变革当下,以前瞻视野把脉新一代测序技术如何释放潜力、惠及人类健康。中疾控病毒所中心实验室主任、中国医促会分子诊断学会主任委员马学军致辞大会主席、中疾控病毒所中心实验室主任、中国医促会分子诊断学会主任委员马学军首先作大会致辞,他表示,当前,基因测序技术已经在疾控、医学、农业、环境科学等多个领域发挥了重要作用,纳米孔测序技术不仅为基因测序带来重要的突破,也为生命科学研究和应用提供了诸多可能性。READs大会将搭建一个汇聚各方智慧和创新的交流平台,共同推动新一代测序技术的进步和多元应用。四川大学华西医院副院长郭应强教授在致辞中表示,基因测序技术是精准医学发展的关键基础,经过近50年发展,目前在病原体研究、感染性疾病的诊断与防治等领域发挥重要作用。希望READs2023通过学术交流探讨,加速前沿技术的应用成果向临床转化,推动精准医学发展。作为大会特邀嘉宾,中国科学院院士、国家生物医学分析中心主任张学敏也对大会充满期待,他认为,新冠疫情让人类意识到,我们仍有许多科学问题未解答,纳米孔测序技术的巨大发展潜力,可能革新甚至颠覆重大疾病的防控方式,期待这项技术和设备的发展能提供突破性的解决办法和技术手段。在学术报告环节,来自病原检测、肿瘤诊治、法医遗传、公共卫生、环境微生物研究等生命科学各个领域的学术大咖,分享了各自基于齐碳纳米孔基因测序平台的最新研究进展。中国科学院微生物研究所研究员胡松年分享纳米孔测序前沿应用人类基因组计划中国部分总工程师、中国科学院微生物研究所研究员胡松年从测序技术的角度,对比了二代、三代测序技术在微生物基因组测序中的应用现状,他表示,基因组相当于是医学里的解剖图,化学里的元素周期表,是基础中的基础。近五年来,几乎所有基因组测序项目都有三代测序的身影,当下完成一个高质量基因组测序已经变得“简单粗暴”——就是以三代测序为主。纳米孔测序作为三代测序最具代表性的测序技术,其边测序边分析、小巧便携的特性,在高质量的微生物基因组测序中,十分具有竞争力。四川大学华西基法学院副研究员王正分享纳米孔测序前沿应用四川大学华西基法学院副研究员王正现场分享了纳米孔测序在法医刑侦领域的最新研究进展。值得一提的是,8月14日,王正所在的四川大学基法学院侯一平教授团队使用齐碳纳米孔测序平台对线粒体基因组进行研究的文章,刊登于法医遗传TOP期刊。此外,在为期一天的学术分享中,扬州大学特聘教授李瑞超、中科院昆明动物所研究员杨兴娄、中疾控病毒所中心实验室副研究员王佶、南方科技大学环境科学与工程学院副研究员夏雨,美因基因总裁黄宇峰等专家,激荡思维,碰撞观点,呈现了一场测序技术与生命科学的思想盛宴。新动能 国内第一个商业化中通量纳米孔测序平台重磅发布大会现场,齐碳科技联合创始人谢丹博士宣布,齐碳科技推出自主研发的中通量纳米孔基因测序平台QPursue,该平台涵盖纳米孔基因测序仪QPursue-6k和QPursue-6khex及其配套芯片QCell-6k。这是齐碳科技继QNome-3841hex后,再次隆重发布商业化纳米孔测序仪,代表着国内纳米孔基因测序技术的最前沿水平,标志着国产纳米孔基因测序仪向中高通量进阶。齐碳科技联合创始人谢丹博士发布QPursue中通量测序平台谢丹博士在发布中表示,此次推出的QPursue中通量纳米孔基因测序平台,是齐碳团队经多年打磨的又一项重磅产品,一次性推出两款机型,希望能满足用户多元、灵活、更高通量的测序需求。齐碳科技自主研发的中通量纳米孔基因测序仪QPersue-6k其中,QPursue-6k搭载1张芯片,设计通量为60Gb,QPursue-6khex可以灵活选择1-6张芯片进行测序,可产出360Gb数据。测序平台通量的提升,最主要得益于配套测序芯片QCell-6k的性能提升。QCell-6k采用密度更高的ASIC电路排布方式,将生物芯片和电路芯片合二为一,单芯片搭载孔数超过6000个,实现通量的大幅提升,同时,测序抗干扰性更强,信噪比更高,测序表现更加稳定。在准确率方面,QPursue中通量测序平台适配齐碳研发的最新一代K2生化体系,搭载全新算法套件,单次准确率达97%,一致性准确率(70x)在Q50以上,通量的大幅提升,加之原本长读长的特性,在大基因组测序的应用场景中,潜力无限。在高通量、高准确率的基础上,QPuesue-6k仍保持小巧便携的特性,仪器长、宽仅为15cm,芯片的装卸方式改为一步卡嵌式,让测序操作更流畅。虽然测序通量有数量级的提升,但配合高效的算法和计算设备,仍然可以实现实时测序,是现场测序和小型实验室的首选。通量的大幅提升,也将为用户带来单位测序成本的大幅度下降,能够满足大型基因组测序对于数据量的需求,极大拓宽了纳米孔测序的适用范围,可在微生物群研究、孟德尔遗传病、肿瘤研究、物种鉴定、生物多样性等应用场景,提供快速、可靠的测序支持。在业界广泛关注的应用表现方面,齐碳使用人类标准基因组、细菌混合标准品(zymo)进行测序,数据结果展示,QPursue中通量测序平台在大型复杂基因组组装及变异检测、微生物群落物种构成分析及宏组装等应用场景的性能得到验证,上述测序结果均达到了预期的结果或指标,这表明QPursue中通量测序平台应用的广泛性和可靠性。在发布会上,谢丹博士还发布了齐碳科技自主研发的小型自动化建库设备QPrenano-100,该设备可实现1-24个任意数量文库的自动化构建,搭配齐碳建库试剂盒、快速建库测序试剂盒等产品,将实现建库全流程自动化运行,大幅解放人力,提高操作效率。QPrenano-100具有体积小巧、精准移液的特征,普通实验台即可摆放,可帮助用户实现高效、全自动化的样本制备。新突破 新一代基因测序技术处于爆发前夜大会现场,齐碳科技联合创始人兼首席科学家白净卫博士分享了纳米孔基因测序的发展现状及未来趋势,从测序技术的代际变革着手,分享了每一代测序技术的原理与特点,以及基于纳米孔基因测序技术的最前沿科学研究成果。齐碳科技联合创始人&首席科学家白净卫博士分享纳米孔测序技术提到纳米孔测序仪的研发,他表示,“纳米孔测序技术的特点是超长读长、小型化、速度快,在开发产品的过程中,我们对自己提出了更高的要求,比如提到速度,不仅仅是测序速度本身,而是从产出数据到分析结果的实时快速;提到操作简单,不仅仅样本处理简单,而是从样本到结果的一键式测序;提到成本,是单位数据成本、设备成本如何进一步降低。”白净卫博士认为,作为创新赋能工具,纳米孔测序技术的时代已经来临。该观点引起参会者的广泛共鸣,以纳米孔基因测序技术为代表的新一代基因测序,正凭借其长读长、实时测序、小巧便携等突出优势已经步入提速发展的新阶段,处于爆发前夜。现场嘉宾还表示,虽然当下市场仍以二代测序为主流,但随着以纳米孔测序技术为代表的新一代测序技术,在市场成熟度、市场拓展等方面均进入加速状态,到达一个拐点之后,必然将迎来爆发式增长。齐碳科技自2016年起便踏入我国纳米孔基因技术无人区,通过持续的技术攻关,2021年底推出国内首款商业化纳米孔基因测序仪QNome-3841,叩开国产纳米孔基因测序仪商业化的大门,成为国产纳米孔测序的引领者。商业化一年多以来,齐碳纳米孔测序平台已在多个领域发挥出重要作用,在病原体研究、动植物疫病防治、司法刑侦、公共卫生防疫等领域服务超200家机构用户,为了让更多用户直观地体验和学习纳米孔测序技术,今年6月,齐碳科技首个客户体验中心在成都正式启用,截至目前,已接待了百余位来自全国各地的用户。快速的商业化布局背后,一方面是齐碳科技扎实的技术积累与持续的创新攻关能力,另一方面则是广阔的市场需求,数据显示,全球基因测序仪及耗材市场在过去数年内年复合增速达20%。预计到2030年,全球基因测序仪及耗材市场将达到245.8亿美元的市场规模,中国基因测序仪及耗材市场将达到303.9亿元的市场规模。未来,齐碳科技将以中通量纳米孔测序平台发布为新的起点,持续深耕产品,不断降低测序成本,提升测序性能,以打造样本进、结果出的一站式纳米孔基因测序解决方案为目标,持续推动纳米孔测序技术的商业应用转化,真正实现人人可及的基因测序,为人类健康保驾护航。
  • 安捷伦靶向序列捕获系统现已支持454 Life Sciences的下一代测序平台
    安捷伦靶向序列捕获系统现已支持 454 Life Sciences 的下一代测序平台 2010年12月15日,北京&mdash &mdash 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)今日宣布其SureSelect靶向序列捕获系统现已支持454 Life Sciences公司的下一代测序平台,借助该系统,用户可以仅测序目标基因组区域而非整个基因组,从而提高效率,节省成本。 安捷伦 SureSelect 平台业务经理 Fred P. Ernani 博士说道:&ldquo SureSelect 靶向序列捕获试剂盒已经过优化和验证,可用于所有三种主要的下一代测序平台。这将推动生命科学界持续快速地采纳我们的靶向序列捕获系统。相应地,我们将继续积极研发新型 SureSelect 产品,帮助客户应对更广泛的重大科学难题。&rdquo 除 454 公司的测序平台之外,安捷伦 SureSelect 靶向序列捕获系统还与 Illumina 公司的基因组分析仪和 HiSeq 平台以及 Life Technologies 公司的 SOLiD 测序仪完全兼容。本年内,有 25 篇涉及各类遗传性疾病研究的出版物使用了 SureSelect 试剂盒。 SureSelect 系列产品包括针对用户指定的基因组区域、人类激酶组、人类 X 染色体以及人全外显子的靶向测序试剂盒。 安捷伦 SureSelect 靶向序列捕获产品系列拥有业内最全面的的靶向序列捕获产品以及针对多种不同测序方法和平台的最优化分析方案。SureSelect 产品能够在单管中实现从不到 200 Kb 到超过 50 Mb序列的靶向序列捕获。 用户使用安捷伦eArray 桌面版或在线版设计工具,可以轻易地设计出靶向任意感兴趣基因组区域的 SureSelect 靶向序列捕获试剂盒。 要了解更多信息,请访问:www.agilent.com/genomics/sureselect 了解eArray:www.agilent.com/genomics/earray关于安捷伦科技 安捷伦科技公司(纽约证交所: A)是全球领先的测量公司,同时也是通信、电子、生命科学和化学分析领域的技术领导者。公司的18500名员工为100多个国家的客户提供服务。在2010财政年度,安捷伦的业务净收入为54亿美元。要了解安捷伦科技的信息,请访问:www.agilent.com.cn。
  • 集成"降噪"功能!德运康瑞自研创新高通量单细胞测序平台发布
    单细胞测序技术以前所未有的分辨率揭示了细胞组成和功能状态的异质性,已广泛应用在肿瘤、免疫、神经和发育生物学等研究领域。但现有的高通量单细胞测序平台还存在一定局限性,基于液滴捕获的方法依赖泊松分布实现细胞-微球配对,存在大量空液滴不可利用,导致试剂浪费和细胞损失;基于微孔捕获策略的平台利用细胞重力沉降随机捕获,存在有限稀释导致的微孔利用率低的问题,且存在微孔交叉污染的可能性;此外组织解离过程中细胞破裂产生游离的mRNA导致背景干扰,掩盖细胞之间真实的异质性。为克服上述问题,德运康瑞自主研发成功打造出一款创新性的高通量单细胞测序平台Well-Paired-Seq。该平台包括自动化单细胞测序文库构建系统DECODER, 芯片试剂盒、反转录与扩增试剂盒、文库构建试剂盒及相关生信分析工具。Well-Paired-Seq基于双孔嵌套式芯片,协同局部准静态流体力学和尺寸排阻原理,实现细胞和编码微球高效精准“配对”,利用准静态流体力学特性有效清洗背景,具有高效的细胞捕获率、细胞/微球配对效率以及游离RNA去除等优势,实现高通量细胞捕获、高灵敏基因检出和单细胞高保真分子解析。Well-Paired-Seq高通量单细胞测序解决方案平台技术优势(1)高通量,单张芯片即可完成1万个细胞捕获和单细胞测序分析;(2)高灵敏,基因检出数量优异,且有效检出稀有细胞类型;(3)高效率, 细胞捕获效率稳定在60%左右,提高样本细胞利用率;(4)高保真,在芯片上直接清洗游离RNA等杂质,降低背景干扰;(5)高质量,专利技术减少微孔交叉污染还原细胞真实分子表达信息。小结Well-Paired-Seq高通量单细胞测序技术基于双孔嵌套式芯片的创新设计,在细胞捕获、细胞/微球配对、游离mRNA去除等方面具有出色的效率,并显著地降低了细胞损失和背景噪音,以较低的双胞率实现了高通量单细胞测序分析,在细胞捕获效率和基因检出数量等多项指标表现稳定并领先行业。德运康瑞始终立足自主创新,此次重磅推出整合硬件设备、捕获芯片、配套试剂盒和生信工具的高通量单细胞测序整体解决方案,为单细胞测序技术推向精准医学应用奉献中国创新智慧。关于德运康瑞苏州德运康瑞生物科技有限公司(http://www.dynamic-biosystems.com/)是一家单细胞与空间多组学技术平台型企业,围绕单细胞富集与检测、单细胞测序、空间多组学技术,满足不同应用场景下的分析需求,公司聚焦挖掘在肿瘤精准医学、优生优育以及药物发现领域的巨大潜力,致力于推动精准医疗向单细胞与空间组学时代迈进,助力生命科学和临床医学,为人类健康事业贡献中国智慧。
  • 月旭科技——浙江中医药大学药学院联合实验平台顺利揭牌
    2023年5月24日,浙江杭州,月旭科技(上海)股份有限公司与浙江中医药大学药学院共建的“联合共享创新实验平台”揭牌仪式,在浙江中医药大学富春校区顺利举行。见证此次历史时刻的领导和专家有来自浙江中医药大学社会合作处处长包利荣、药学院院长秦路平、药学院党委书记谢军、药学院副院长曹岗、药学院副院长谷满仓、药学院教学实验中心副主任盛云杰,月旭科技副总经理任兴发、销售部南区总监王韶青、仪器事业部总监邵锋伟、浙江省一区经理曹炳峰,以及其他师生代表共同参加了揭牌仪式。首先,浙江中医药大学包利荣处长发表致辞,包处长对于月旭科技各位领导的到来表示了欢迎,介绍了浙江中医药大学的历史和基本情况。学校始创于1953年,现有全日制在校生22000余人,是一所拥有中医学、中西医结合、中药学、基础医学、临床医学、药学等多个一级学科的综合性医药大学。自主培养了中国工程院院士、国医大师、国家“wan人ji划”科技创新领jun人才、973计划项目shou席科学家、全国名中医、百千万人才工程guo家级人选等一大批高层次人才。包处长最后预祝平台工作顺利开展,并以此为起点,深化双方合作。随后,月旭科技副总经理任兴发对月旭科技进行了介绍。月旭科技是一家集研发、生产、销售和服务为一体,致力于为客户提供色谱分离分析技术、产品和整体解决方案的公司。月旭的产品应用广泛,特别是生物医药行业和关系民生的其它行业,是月旭科技20年来做的较为成功,积累较多技术及服务经验,产品覆盖率较广的行业。月旭科技一直关心生物医药科研人才的培养,注重与医药类高校之间在产学研方面的合作。此前,月旭科技已经与国内多所zhi名高校建立了联合实验室、重大项目联合攻关研发等合作。此次能够与浙江中医药大学药学院成立联合创新实验平台,必将大大拉近彼此的合作关系与深度。平台的建立必将为科研成果的推出、人才培养、项目攻关起到积极的促进作用。接着,浙江中医药大学药学院谢军书记发言,谢书记肯定了月旭科技是一家有社会责任感的公司,此次与浙江中医药大学药学院建立联合实验室,并捐赠了仪器,将对学校教学和科研起到积极作用,解决人才培养中的实际问题。药学院具有37年办院历史,学院下设中药资源(生药学)、中药药理(药理)、中药制剂与炮制(药剂)、中药化学(药物化学)、中药分析(药物分析)等10个教研室,中药学学科入选浙江省重点建设高校优势特色学科、浙江省yi流学科(A类)、浙江省“重中之重”学科(两轮滚动建设),药理学与毒理学学科于2018年进入ESIquan球前1%,学院获国家科学技术进步奖二等奖3项,国家技术发明奖三等奖1项及浙江省科技进步奖一等奖、浙江省自然科学二等奖等奖励20余项。同期,为助力浙江中医药大学对于中西药制剂在体外进行生物利用度的研究,月旭科技捐赠两套全自动溶出度测试取样系统给药学院,体现了月旭科技公司的高度社会责任感。最后,秦院长和任总共同为月旭科技——浙江中医药大学药学院“联合共享创新实验平台”进行揭牌。共同出席揭牌仪式的专家和领导进行了合影。仪式结束后,曹岗副院长带领大家参观了联合共享创新平台和学校的检测实验室平台。
  • 中科院建基因组测序平台联盟 减少仪器重复购置
    近日,在中国科学院条件保障与财务局的支持和推动下,中科院基因组测序平台联盟成立大会暨签约仪式在中科院北京基因组研究所召开。条财局副局长曹凝及中科院广州、武汉、上海、昆明及北京各区域中心专家代表和部分研究所代表共计20余人出席会议。  会上,北京基因组所副所长、党委副书记王丽萍首先对各位领导和专家的到来表示欢迎,并向大家介绍了本次测序平台联盟成立的背景及意义。接着,曹凝指出,随着测序仪的更新换代和测序技术的迅猛发展,对相关生命科学研究所在基因测序仪购置、共享以及技术交流等方面提出很多挑战,也出现很多机遇,希望借助测序联盟的成立,统筹规划推进基因组测序平台建设,增强院内技术协同交流,统筹实施&ldquo 十三五&rdquo 规划。  随后,各区域中心代表以及各研究所代表进行了联盟成立签约仪式。  签约仪式完成后,北京基因组所科技处处长吴佳妍汇报了联盟2015年年度工作计划,与会专家代表进行了充分的交流讨论,并给出了建设性意见建议。  该联盟的成立将促进中科院院内各测序平台间的交流和共享,减少仪器设备重复购置,实现资源整合和有效配置,继而提升中科院基因组研究的整体能力。
  • 华东理工大学与月旭科技色谱分离纯化技术平台联合实验室落成
    2021年7月22日上午,月旭科技与华东理工大学的色谱分离纯化技术平台联合实验室的揭牌仪式,在启迪漕河泾(中山)科技园紫荆园十号楼隆重举行。出席此次揭牌仪式的领导有华东理工大学教授张维冰、上海市科委基地处副处长张露璐、上海分析仪器产业技术创新战略联盟理事长马兰凤。月旭科技常务副总任兴发、生产副总李崟、市场副总杨慧、新市场营销副总顾皓、研发总监薛昆鹏、应用中心总监陈再洁等。还有恒瑞医药、睿智化学、济川药业、济民可信等客户代表也拨冗前来出席此揭牌仪式。揭牌仪式于上午10时准时开始,首先由月旭科技常务副总任兴发就此次联合实验室的成立的重要意义进行致辞。任兴发先生表示:最近,月旭科技与华东理工大学张维冰教授团队在前期全面合作的基础上,联合申请上海市科委“仪器创新行动项目",并成功得到资助。“色谱分离纯化技术平台"联合实验室作为项目的重要实施与工程化载体,必将进一步加强产学研联合攻关的优势,使月旭科技在色谱分离纯化技术方向的发展上一个新台阶。任兴发先生致辞结束后,与华东理工大学张维冰教授共同揭牌,月旭科技与华东理工大学的色谱分离纯化技术平台联合实验室正式成立。随后,任兴发先生向华东理工大学张维冰教授颁发“月旭科技分离纯化S席技术顾问"聘书。揭牌仪式结束后,张露璐处长及张维冰教授一行对月旭科技上海公司的分离纯化实验室、应用研发中心进行了参观,领导们对公司的硬件设施水平和员工的精神风貌表示了赞赏,也对公司严谨的管理体系表示了高度认可。参观完公司实验室后,嘉宾一行及公司高层领导,汇聚待客室。并以座谈会的形式对公司发展近况企业文化等、以及分离纯化联合实验室做了详细介绍。在座谈会上。各位领导并对以后与高校的全面合作、产业导入、人才在培训、平台建设等多方面的发展方向进行了深入交流。月旭科技与华东理工大学的色谱分离纯化技术平台联合实验室的落成,是月旭科技校企联合的又一重要阶段,同时也是月旭科技在色谱分离纯化整体解决方案业务发展的有力保障。在今后,月旭科技将就色谱分离纯化技术与华东理工大学展开深入合作,充分发挥联合实验室的作用及优势。为学校提供高质量的实践基地,为企业带来更高价值的共享成果,同时也为色谱分离纯化技术的发展贡献一份合力。
  • 赛纳生物B轮融资1.3亿元 国产高通量基因测序仪平台再迈一步
    p  近日,国产高通量基因测序仪平台厂商赛纳生物科技(北京)有限公司宣布完成B轮融资。继2015年获得通用技术创业投资有限公司及其管理基金的5000万元A轮投资后,赛纳生物B轮再获1.3亿元投资。本轮融资由东方翌睿(上海)基金和中关村发展集团启航基金联合领投,龙磐投资、京工弘元和比邻星创投跟投,A轮主投通用创投继续追加投资。/pp  赛纳生物是国内一家专业从事基因测序仪平台研发及产业化的高科技公司,响应国家精准医疗战略,致力于自主研发创新型基因测序仪及配套芯片和试剂,全面升级基因测序技术在疾病检测、疾病诊断和疾病筛查的临床应用。赛纳生物的核心测序技术来自于美国两院院士、北京大学未来基因诊断高精尖创新中心主任、国际著名科学家谢晓亮教授,和北京大学工学院教授、北大基因诊断高精尖创新中心研究员、曾任国家863计划“新一代测序仪及配套试剂研发”首席专家的黄岩谊教授团队研发的原创性基因测序技术,打造完全自主知识产权的测序技术平台。公司联合创始人兼CEO吴镭博士是美国芝加哥大学博士、麻省理工学院博士后,业内资深科学家和企业家,曾在美国创建AVIVA公司,归国后曾任Fortebio(中国)总裁,领导公司完成实时蛋白检测仪研发和企业并购。/pp  经过团队不断积累和苦心历练,赛纳生物在技术创新、产品研发和人才储备上有了长足的进步。目前,公司已经建立起一支多学科交叉型的高素质专业化团队,拥有各类专业技术员工近百人,其中研发部门博士和硕士学历人才各占1/3以上,仪器工程团队全部来自于国内顶级IVD企业,具有多年临床医学设备开发经验。赛纳生物已完成核心技术--荧光发生Fluorogenic技术和纠错编码ECC技术的研发、验证工作,并成功研制出了初代样机,样机在测序成本、测序精度、测序耗时等方面达到甚至超越国际可比机型。2017年9月,公司得到北京市科委对科技型中小企业促进专项的立项支持。本轮融资将帮助赛纳生物完成临床注册和产品上市。/pp  赛纳生物CEO吴镭博士表示:“自主开发具有高科技、低成本、技术上可以媲美国外同类设备、价格上适应中国市场临床实践和老百姓需求的高端基因测序技术平台是我们的梦想和追求的目标,这个目标与国家创新发展、提升中国智造水平的战略紧密结合。本轮融资成功,也说明这些优秀投资机构对我们实现目标充满信心。我们独有的创新技术,不断壮大的卓越的研发团队,以及各类合作伙伴所提供与嫁接的资源,都是我们成功实现战略目标的有力保障。”/pp  通用技术创业投资有限公司总经理包景明表示:“赛纳生物的测序平台和产品,将推动精准医疗更快更好的普及到中国广阔的临床医疗市场。”/pp  东方翌睿(上海)投资管理有限公司总经理张路表示:“赛纳生物所从事的原创型基因测序仪及配套芯片和试剂的研发,是整个基因测序服务产业链的制高点,技术壁垒高,增值能力强。我们非常看好这一领域,我们的投资目标就是要助力于类似赛纳生物这样的拥有核心专利、核心技术和核心产品的科技型公司加速发展。赛纳生物完全符合我们的期望。”/pp  中关村发展集团总经理助理龙宜彬表示:“未来中关村发展集团布局的核心产业是信息技术产业与大健康产业,集团在服务北京市建设全国科技创新中心的使命驱动下,正在积极布局相关产业链。我们惊喜地看到赛纳生物在短期内取得的研发成果,也切实感受到科学家严谨求实的工作态度和脚踏实地的作风。有北京大学这样的技术支撑和商业领头羊的成功经验指导,我们对赛纳生物的成长、对国家精准医疗的战略落地充满信心。”/pp  龙磐投资执行事务合伙人余治华表示:“赛纳生物的基因测序仪产品在基础构架、试剂、应用算法等各个环节都有自主创新的领先技术,基于新型的发光机制及算法初步形成了可与国际主流基因测序平台竞争的成本及效率优势,期望公司产品尽快推向市场。”/pp  strong关于通用创投/strong/pp  通用技术创业投资有限公司于2012年3月注册成立,以“技术引领创新,资本成就未来”为经营理念,其前身为通用技术集团投资管理有限公司股权投资部。通用创投公司的投资管理团队具有二十年专业投资经验。重点投资医药医疗、信息技术、高端制造等领域。/pp  strong关于东方翌睿/strong/pp  东方翌睿(上海)投资管理有限公司成立于2016年5月,由东方国际集团和上海东方证券资本投资有限公司联合发起设立,聚焦于健康医疗领域的先导性投资布局和战略性产业整合。主要股东包括:东方睿德(上海)投资管理有限公司、东方国际集团上海投资有限公司、东方国际创业股份有限公司、上海新农村建设投资股份有限公司、上海化工研究院有限公司、上海航盈信息科技有限公司。/pp  strong关于中发展启航基金/strong/pp  中关村发展集团成立于2010年4月,是北京市委市政府为进一步加快中关村示范区建设,加大市级统筹力度,运用市场化手段配置创新资源的国有大型企业。中关村发展启航产业投资基金是由中关村发展集团主导设立、倾力打造、独立市场化运作的高科技企业股权投资基金。基金立足于中关村国家自主创新示范区,依托发展集团广泛的政府背景及雄厚的产业资源,重点投资海内外前沿颠覆性的技术项目及有良好产业化发展前景、经济社会效益明显的高科技项目。/pp  strong关于龙磐投资/strong/pp  龙磐投资总部位于北京,是一家专注于中国境内生物医药领域投资机会的人民币风险投资公司。目前龙磐投资在管3只基金,管理总规模超过人民币20亿元,投资阶段覆盖早中期、成长期和成熟期。基金投资专注于技术先进型生物医药企业,重点市场细分包括化药创新药、生物创新药及高端医疗器械。现已投资生物医药企业数十家,投资的在售化药一类新药品种约占国内全部未上市药企化药一类新药品种的一半。龙磐投资可为被投资的中国创新药和创新器械企业提供其所亟需的全方位增值服务。/p
  • 芯像生物推出国产基因测序平台 实现扩增测序一体机小型化、智能化
    3月2日,芯像生物在上海浦东成功举办了国产基因测序平台新品发布会,重磅推出了基于高精度、高性能、高灵敏度显微成像技术的国产基因测序仪——StarSeq ® -100。新平台将从科研和体外诊断两大方面整合NGS解决方案。芯像生物创始人兼CEO严媚博士为新品发布会致开幕词时介绍了芯像生物的企业、产品布局及专利壁垒,并强调了芯像生物“加速实现从科研向临床的应用转化”的企业定位,致力打造低成本、高精度、易解读、检测快的多场景适用产品。严媚博士表示,人类基因组计划至今25年,我们正在经历从科研到临床转化的关键时期;芯像承载的使命,是把昂贵、复杂的科学设备设计成简单、耐用的医疗仪器,改变当前中心化的测序方式,让测序技术更加亲民。芯像生物首席科学家陈更新博士代表芯像生物向大家做了详细的新产品介绍。StarSeq ® -100为国产小型台式NGS基因测序仪,配置高灵敏度光学显微扫描成像系统,拥有灵活开机双载片四通道,可实现一体化文库加载、循环测序及数据生成。 StarSeq® -100具有领先的技术优势:通过半导体先进光电技术和高集成测序系统,实现扩增测序一体机小型化、智能化;自主研发测序化学反应体系高密度测序芯片,实现对主流NGS文库的精准、快速、低成本兼容,并为本地量产供应、GMP流程管理提供快捷、高质量的服务。 StarSeq® -100具有国内外多项自主知识产权,支持包括生殖、病原微生物、肿瘤、遗传病、转录组测序等在内的多种适配场景;其高GC极端复杂文库数据质量等指标与进口品牌相比持平,Dup以及Clean reads等指标优于进口平台。关于芯像生物:上海芯像生物科技有限公司总部位于上海张江, 是一家从事新型体外临床诊断仪器及配套试剂研发、 转化和产业化的高科技公司。公司核心团队由多位欧美海归的业界精英组成,在核心技术研发、 产品化及临床应用等方面有丰富的实战经验,技术背景涵盖半导体芯片、光学设计、电子、微流控、生物生化试剂、生物信息、医学应用等多交叉学科。芯像以半导体芯片技术与体外诊断的技术融合为核心,发挥半导体产业优势,赋能体外诊断技术的创新,目标打造检测结果快速精准、仪器运营低成本高产出、运行流程集成自动与智能化的基因测序平台,推动技术的普及,为人类生命健康护航。深圳分公司坐落粤港澳大湾区发展核心地带,位于河套深港合作区内国际生物医药产业园二期,致力于开发前沿生物传感器相关技术,为新型测序及生物传感器应用提供有力支撑。
  • 百迈客与Oxford Nanopore公司合作 并引进Nanopore全测序平台
    p  北京百迈客生物科技有限公司与牛津纳米孔公司(Oxford Nanopore Technologies,简称ONT)达成长期合作,将基于ONT平台进行产品开发与应用,为用户提供更丰富优质服务。/pp style="text-align: center "img width="600" height="400" title="2018.8.9 1-1.jpg" style="width: 433px height: 232px " src="http://img1.17img.cn/17img/images/201808/insimg/f8952d1a-7027-4012-9a8b-0ffa61f67b3f.jpg"//pp  span style="font-size: 12px "百迈客与Oxford Nanopore 商业运营副总裁Richard ,中国区商务负责人Thomas及技术支持Lin与Eva一行合影/span/pp  2018年8月7日,Oxford Nanopore产品中通量最高的PromethION平台已抵达北京百迈客测序实验室。截止目前,百迈客已经拥有Oxford Nanopore的MinION、GridION X5和PromethION全套Nanopore测序仪,投资金额超过3000万人民币。/pp  PromethION作为Oxford Nanopore产品中通量最高的平台,在设计不仅具备了实时、长读长、直接测序等特点,在产量上还可能与市场上最高通量的传统测序仪相匹敌。在2018年初,Oxford Nanopore官方宣布单张PromethION测序芯片的数据产出超过150 Gb。而实际上,使用临床样本、植物样本以及测试样本的用户也能够获得单张芯片100 Gb 的产出。作为Oxford Nanopore的重要合作伙伴,百迈客将基于PromethION/GridION平台为客户提供商业测序服务。/pp style="text-align: center "img width="601" height="277" title="2018.8.9 1-2.jpg" style="width: 434px height: 194px " src="http://img1.17img.cn/17img/images/201808/insimg/4358bf3b-2c29-44a7-8731-56bc8e3faecb.jpg"//pp style="text-align: center "  span style="font-size: 14px "Nanopore MinION 测序仪/span/pp style="text-align: center "span style="font-size: 14px "img width="600" height="449" title="2018.8.9 1-3.jpg" style="width: 429px height: 232px " src="http://img1.17img.cn/17img/images/201808/insimg/e95cf1c6-c9e5-46c5-9c09-d143e16a11cc.jpg"//span/pp style="text-align: center "  span style="font-size: 14px "Nanopore GridION X5测序仪/span/pp style="text-align: center "span style="font-size: 14px "img width="600" height="448" title="2018.8.9 1-4.jpg" style="width: 427px height: 274px " src="http://img1.17img.cn/17img/images/201808/insimg/9dd702ea-7abe-435d-ad99-48d2268334e8.jpg"//span/pp style="text-align: center " span style="font-size: 14px " Nanopore PromethION测序仪/span/pp style="text-align: center " span style="color: rgb(0, 176, 240) font-size: 18px "strong ONT测序/strong/span/pp  ONT测序是基于电信号测序的技术,各平台之间测序原理相同。DNA/RNA上不同碱基化学性质存在差异,所以当单个碱基或DNA分子通过纳米孔通道时,会引起不同电学信号的变化。通过对这些信号进行检测及对应,即可获得相应碱基的类型,完成序列的测定。/pp style="text-align: center "img width="600" height="386" title="2018.8.9 1-5.jpg" style="width: 429px height: 272px " src="http://img1.17img.cn/17img/images/201808/insimg/c17600f4-11c2-4ce5-803e-d7e8a363da13.jpg"//pp style="text-align: center " span style="font-size: 14px " Oxford Nanopore测序原理图1/span/pp  Nanopore的碱基判读是依据其电流信号而产生,因此其判定过程比较复杂。目前Nanopore根据电流的大小及电流大小的变化情况,通过“递归神经网络(Recurrent Neural Network)”的复杂算法对碱基进行判读。/pp style="text-align: center "img width="598" height="283" title="2018.8.9 1-6.png" style="width: 425px height: 192px " src="http://img1.17img.cn/17img/images/201808/insimg/a8944cb9-ce42-4e9d-944e-4d3d894e8923.jpg"//pp style="text-align: center "  span style="font-size: 14px "Oxford Nanopore测序原理图2/span/pp style="text-align: center "  span style="color: rgb(0, 176, 240) "strongspan style="font-size: 18px "Nanopore技术优势分析/span/strong/span/pp  相对于其他测序技术,Oxford Nanopore测序技术的样本处理极其简单,无需DNA聚合酶或者连接酶,也无需dNTPs,因此其测序成本十分低廉,比其他测序技术更有可能实现1000美元基因组目标。理论上Nanopore技术的测序平均读长能够达到几十到上百 Kb,最长读长能达到2 Mb以上级别,能够更好的解决复杂基因组组装,结构变异等一系列问题。基于ONT平台能直接对RNA/DNA进行测序,获得相关材料遗传物质的表观修饰信息,为物种表达调控模式研究提供新的方法。/pp style="text-align: center " /pp style="text-align: center "img width="600" height="344" title="2018.8.9 1-7.jpg" style="width: 459px height: 245px float: none " src="http://img1.17img.cn/17img/images/201808/insimg/108784c9-b2d8-463f-b04f-6fdf481da9f9.jpg"//pp style="text-align: center "img width="598" height="300" title="2018.8.9 1-8.jpg" style="width: 455px height: 237px float: none " src="http://img1.17img.cn/17img/images/201808/insimg/1a6d63d9-f3a5-4414-8cc6-4b988130ef34.jpg"//pp style="text-align: center "  span style="font-size: 14px "Oxford Nanopore各测序平台比较/spanp style="text-align: center "  strongspan style="color: rgb(0, 176, 240) font-size: 18px "百迈客nanopore测序研究进展/span/strong/pp  目前,百迈客已在MinION和GridION X5平台上研发很长时间,无论在测序读长还是在每个Flow cell产出上都取得了阶段性进展。/pp style="text-align: center "img title="2018.8.9 1-9.png" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201808/insimg/2b8daedb-8019-46ad-ba66-001128d64020.jpg"//pp style="text-align: center "  span style="font-size: 14px "Oxford Nanopore平台测序数据统计/span/pp  同时,在基因组拼接上Nanopore也展现了不俗的实力,除了已发表的番茄、檀香及人的基因组测序组装结果,百迈客也对某些物种做了组装。其中某植物基因组大小为1.2 Gb,组装Contig N50为2.58 Mb,最长Contig 为12.72 Mb。经过二代数据纠错后的基因组,Busco 评估完整性为93.54%,Illumina数据回比效率为98.5%。HiC热图评估发现组装连续性极高,综合说明该基因组组装质量很高。/pp /p/p
  • 赛陆医疗:坚持深耕底层技术,推动测序和空间组学平台产业化发展
    基因测序仪是解码生命科学的利器,因其技术壁垒高、开发难度大,市场长期被少数几家跨国企业垄断。近些年,基因测序仪市场格局正在快速发生变化,涌现出许多新企业并纷纷推出自主研发的商品化测序仪。基于此,仪器信息网特别策划“基因测序仪新势力”(点击查看约稿详情)专题,并向测序技术研究专家、测序仪应用专家和基因测序仪企业广泛约稿(投稿邮箱:lizk@instrument.com.cn),充分了解基因测序新企业、新仪器、新技术及新应用进展。本文为深圳赛陆医疗科技有限公司(以下简称“赛陆医疗”)供稿,赛陆医疗是一家年轻的基因测序仪公司,成立仅三年,不久前,刚刚完成数亿元A轮融资。而在成立2年左右的时候就已推出了首款基因测序仪产品Salus Pro 测序仪。无论是融资还是研发,赛陆医疗的步伐都迈得足够快。点击图片了解详情仪器信息网:请您简单介绍一下赛陆医疗。深圳赛陆医疗科技有限公司成立于2020年,主要从事国际领先的基因测序仪和空间组学平台等尖端装备的研发和生产。公司立足自主创新,突破了以往测序产品在通量、成本、分辨率、自动化等方面的瓶颈,打破国外垄断,实现了自主知识产权基础上的全方位国产化,达到世界领先水平。同时,构建了全球首款超分辨空间组学平台,为临床和科研应用提供全面解决方案。公司建立了一支国际化、多层次、多学科交叉的高水平研发和管理团队,十多名海内外名校博士和数十名IVD行业技术精英构成中坚力量。企业总部位于深圳市光明区华南医谷,现已建成仪器、芯片和试剂等覆盖全产业链的研发和生产体系,总面积近一万平方米。仪器信息网:请介绍贵司目前主要产品和解决方案?与同类企业相比,贵司产品的竞争优势是什么?未来还有哪些产品拓展计划?赛陆医疗主要产品分两大版块,一是国产化的高通量基因测序仪、配套试剂和芯片,二是空间转录组芯片和整体解决方案。与同类企业相比,赛陆医疗的产品竞争优势明显。测序仪版块,公司2022年推出的Salus Pro测序仪已实现量产和商用。经三十多家客户使用,得到一致好评,其主要优势在于数据质量高、灵活性强,实现一机多用,能满足客户多场景需求。现已通过欧盟CE-IVDR认证,远销海内外。空间组学版块,公司今年年初推出了空间转录组学整体解决方案,覆盖芯片、生化、测序和生信全流程,能提供全维度多视角组学信息。其优势在于具有亚细胞分辨率,能帮助研究人员在更深层次解释细胞间相互作用、细胞通讯以及功能表达等,将带来肿瘤、胚胎组织发育、病理、免疫等基础研究领域工具变革。在产品拓展方面,公司很快将推出一款新产品——Salus Evo测序仪,这是一款更高通量的测序平台,能够满足更大通量的测序需求。另外,多组学平台也是赛陆的重要发展方向。仪器信息网:贵司产品和解决方案主要面向的应用领域有哪些?能够解决客户哪些问题和痛点?您更看好哪些应用领域的市场前景?目前,Salus Pro测序仪主要应用于科研领域,取得注册证后将拓展到临床领域。该款产品实现了全国产化,并做到一机多用,主要解决了同类型产品国产化水平不高、灵活性不足、应用场景单一等弊端。随着技术进步和成本下降,测序仪在医疗健康、基础研究和消费基因等领域将有更广泛的应用。赛陆空间转录组整体解决方案主要面向胚胎组织发育、神经生物学、病理、免疫等基础研究领域,目前已取得瞩目的科研成果,并进入商业转化阶段。随着技术发展,应用范围不断拓展,研究成果越来越丰富,空间组学技术将在精准医疗领域发挥重要价值。仪器信息网:您如何看待当前中国基因测序仪市场,随着新企业的不断涌现,您认为应该如何进行差异化竞争?近年来,国内基因测序行业不断涌现出新企业和新产品,这充分说明大家非常看好行业发展前景。同时,新企业的进入提高了行业竞争度,也扩大了整体影响力,对行业健康持续发展是有利的。当然,也一定程度上造成了同质化竞争。因此,赢得竞争的关键在于首先确保产品数据的质量,整体性能的稳定性和实用性,其次是在国产化率、效率、成本和便捷性等方面占据优势。仪器信息网:请介绍一下贵司的融资情况以及当前企业发展面临的问题和挑战。赛陆医疗已完成多轮融资。2020年12月,获得真格基金领投的天使轮投资。2021年11月,完成Pre-A1轮融资,由基因领域深度布局和洞见的锲镂投资独家投资。2022年10月,完成超亿元pre-A2轮融资,投资机构包括锲镂投资、国内分子育种龙头企业隆平生物等。2023年12月,完成数亿元A轮融资,由深创投领投,前海母基金和博远资本共同领投,邦勤资本、敦行资本、崖州湾创投跟投。公司当前发展面临的挑战主要有两个,一是进一步拓展国内和海外市场,提高市场占有率,构建稳固的产业生态;二是基因测序和空间组学技术发展迅猛,赛陆必须保持并不断提高创新能力,持续推出新产品,满足客户新需求。仪器信息网:请谈一谈贵司未来 3-5 年的发展规划和布局。第一,深耕技术研发和产品创新,持续推出新的测序仪产品,推动空间组学产品迭代升级,确保领先优势;第二,携手中下游用户和相关机构等,深入开展产学研合作,不断拓展新的应用领域,构建良好产业生态;第三,进一步夯实国内市场,拓展临床应用,全力开拓海外市场,提高市场占份额。
  • 4500万!南京医科大学姑苏学院二代高通量平台测序试剂采购项目
    一、项目基本情况:1、项目编号:JSHC2023-G-001(代理机构内部编号:JSHC-2023070616B1)2、项目名称:二代高通量平台测序试剂3、预算金额:人民币肆仟伍佰万元整(¥45,000,000.00) 最高限价:人民币肆仟伍佰万元整(¥45,000,000.00)4、采购需求:二代高通量平台测序试剂一批5、合同履行期限:详见招标文件。6、本项目不接受联合体投标。7、本项目接受进口产品投标。8、本项目为非专门面向中小企业采购的项目。二、获取招标文件:1、获取时间:2023年8月8日至2023年8月14日2、获取方式:网上报名(1)申领CA证书供应商进入“苏州市公共资源交易中心”―“政府采购(登录)”―“苏州市政府采购管理交易平台”―“供应商”。详见《苏州市政府采购交易管理系统供应商操作手册》(2)登录报名供应商进入“苏州市公共资源交易中心”―“政府采购(登录)”―“苏州市政府采购管理交易平台”―“供应商”。详见《苏州市政府采购交易管理系统供应商操作手册》(3)在网上报名过程中如有疑问,请及时联系:注册咨询:0512-69820846CA办理及咨询:0512-81876166交易系统维护:客服qq:751281184,864274166咨询电话:13914088964(4)依法获取采购文件的方式:报名供应商确认报名后需自行从报名系统里面下载本项目采购文件,报名日期视同为依法获取采购文件日期,投标人需打印、保留“政府采购投标报名确认单”,质疑时与质疑函一并提交。未依照采购公告要求实行网上报名的投标人,视为未参与该项政府采购活动,不具备对该政府采购项目提出质疑的法定权利。代理机构不再收取报名费或资料成本费。(5)网上询问:报名成功的供应商在下载公开招标采购文件后,对采购文件有疑问的,可在“苏州市公共资源交易平台”网上交易系统中进行询问,询问信息不显示询问人的相关资料。代理机构通过网上交易系统收到询问后以网上答复的方式予以解答,询问人通过系统查阅。(6)未依照采购公告要求实行网上报名的供应商,视为未参加该项政府采购活动,不具备对该政府采购项目提出质疑的法定权利,但因供应商资格条件或报名时间设定不符合有关法律法规规定等原因使供应商权益受损的除外。3、售价:无。4、本项目采用网上投标电子评标方式。三、对本次招标提出询问,请按以下方式联系:1、采购人信息名称:南京市医科大学姑苏学院地址:江苏省苏州市姑苏区十梓街458号联系人:吴老师?联系电话:137765664032、采购代理机构信息名称:江苏省华采招标有限公司地址:南京市建邺区嘉陵江东街8号综合体B3栋1单元16层联系方式:025-836033683、项目联系方式项目联系人:刘洁电话:025-83603368
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