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全细胞分析

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全细胞分析相关的资讯

  • 450万!清华大学全光谱流式细胞分析仪采购项目
    一、项目基本情况项目编号:清设招第2022021号项目名称:全光谱流式细胞分析仪预算金额:450.0000000 万元(人民币)采购需求: 包号名称数量是否允许进口产品投标01全光谱流式细胞分析仪1套是设备用途介绍 :主要用于细胞学和微颗粒分析使用,可测量细胞大小,内部颗粒的形状,可检测细胞表面和细胞内抗原,细胞内DNA含量和荧光蛋白表达等。可对群体细胞在单细胞水平上进行分析,在短时间内检测分析大量细胞,并收集、储存和处理数据,进行多参数定量分析。简要技术指标 :1. 光路系统:主机配置488nm、640或637nm、405nm、355nm和561nm五根固态激光器;2. 液流系统:配备高通量自动式上样器;3.全光谱信号检测:每个激光器对应独立的分光模块,对荧光素可检测范围可覆盖365nm - 829nm范围;4.数据处理:可对多色荧光光谱进行拆分,具有更小的扩散误差和更高的精确度合同履行期限:交货时间:合同签订后3个月内本项目( 不接受 )联合体投标。
  • 300万!武汉大学全光谱流式细胞分析仪采购项目
    项目编号:GXTC-A1-22130377项目名称:武汉大学全光谱流式细胞分析仪预算金额:300.0000000 万元(人民币)最高限价(如有):300.0000000 万元(人民币)采购需求:序号货物名称主要功能数量交货期质保期交货地点是否接受进口产品1全光谱流式细胞分析仪测量细胞大小、内部颗粒的性状,还可以检测细胞表面和细胞浆抗原、细胞因子、细胞内DNA、RNA含量等;它可对群体细胞在单细胞水平进行分析,在短时间内检测分析大量细胞,并收集、储存和处理数据,从同一个细胞无需滤光片即可轻松对20多及以上个荧光标志物进行同时检测,全面统计其表达水平。1台合同签订后90日内本项目免费质量保证期要求不低于贰年。免费质量保证期从货物供货、安装、调试正常且经采购人确认验收合格之日起算。武汉大学泰康医学院(基础医学院)接受2配套附件:质控微球1盒合同履行期限:交货期:合同签订后90日内本项目( 不接受 )联合体投标。
  • Cytek全光谱流式细胞仪整体成本分析
    当市场上出现一种新的流式细胞仪时,我们有很多因素可以考虑。每个流式仪提供不同的硬件设计,软件接口和工作流程。为了帮助您做出决定,我们研究了购买、操作和维护不同的流式细胞仪时的考量因素。经过细致的比较,我们对目前可用的流式细胞仪解决方案进行了分类,分为四个性能水平的机器:能完成小于10种颜色 10 - 20种颜色 20 - 30种颜色 超过30种颜色。在每个性能层,我们比较每一种流式细胞仪的成本可分为以下5类:对于每个成本类别,我们比较了Cytek的Northern Lights或者Aurora全光谱流式机器相比于其它机器的性能。使用下面的配色深浅图来表示从低到高的成本消耗:系 / 统 / 成 / 本Cytek的流式细胞仪具有很高的性价比。如果您预算有限,可以选择我们的Northern Lights(NL)全光谱流式系列,该系列有1,2,3激光的配置,最高可以完成24色以上的实验。单激光的NL-1000全光谱流式可以完成9或10色的实验;2激光的NL-2000具有10-20色的性能;3激光的NL-3000能够完成超过20色的实验。1激光的NL系统可以升级到2或3激光系统。如果您的实验需要配更多颜色,可以选择我们的Aurora系列,该系列具有3,4或5激光的配置,最高可以完成30色以上的实验,同样相比市场上的同类产品具有极高的性价比。所以,从系统成本考量方面,Cytek的机器都处于深绿色的低成本区域:实 / 验 / 成 / 本全光谱流式能够使用在其它流式平台上没有办法在一起使用的光谱高度重叠的染料,比如APC和AF647。在一个样本管中使用更多的染料,可以减少样本制备的成本以及在单管样本中获取更多的信息。此外,上样的时间也可以大大缩短,从而使您有更多的时间可以用于结果分析。为了进一步降低实验成本,您可以储存单染管的光谱到Cytek SpectroFlo软件的参考库,只要机器没有大修,下一次实验便可以从参考库中调取单染管的光谱再利用。对于20色以上的实验,其它流式仪需要配置5,6或者7根激光,但Aurora和Northern Lights可以帮助您只使用3激光便能完成24色的实验。如果在3激光Aurora系统中再新增一根UV的激光器,便可以帮您把实验扩展到30色。在30色以上性能的机器中,我们只有很少的机器品牌可以选择,而Aurora机器在实验配色中不需要任何的定制染料,这也能保证整体实验成本的降低。因此,在实验成本这一块,Cytek的Northern Lights和Aurora机器也属于深绿色的低成本区域:维 护 / 和 / 服 务 成 本流式仪上激光器的选择往往对维修服务的成本影响很大,一些激光器(比如UV)相比于其它激光器(比如紫激光)要贵很多。Cytek全光谱流式仪能够使用3激光的系统(405,488,640)成功完成24色实验。在这些系统中没有必要去使用昂贵的UV激光器和UV染料来完成多色实验。更简单的光学配置也意味着更节约的维护成本。此外,每年用户都需要更换鞘液过滤器和上样针来防止堵塞。对于这些配件,Cytek的价格相对于其它品牌的机器要便宜很多。在维护成本这一块,Cytek能够提供低维护成本的机器,使用少量的激光器便能完成复杂的多色实验:空 / 间 / 成 / 本在小于10色水平的机器中,Northern Lights相比于市场上其它的机器尺寸会大一些。而在10-20色水平的机器中,Northern Lights更加小巧和具有竞争力。超过20色水平的话,Cytek的流式仪比其它机器更加小巧,并具有强大的功能。在超过30色水平的机器中,其它机器大多会比Cytek的Aurora大2到3倍,最多重5倍和高2倍。此外,用户还需要花费大量的时间来安装这些大型的机器,并满足其复杂的安装和运行条件。日 / 常 / 运 / 行 / 成 / 本Cytek的全光谱流式仪在日常的实验中无需更换滤光片配置,因而直接便可以进行QC操作。仪器的QC使用SpectroFlo小球,该小球价格相对于其它的QC小球更便宜 。在Aurora和Northern Lights系统上运行QC只需要花费2到3分钟即可完成。并且因为无需更换滤光片,因而不需要像其它机器那样针对不同的滤光片配置完成多种不同的基准QC。此外,鞘液的使用和类型也是一个成本考虑因素。对于Cytek系统,上样过程中每分钟鞘液消耗速率大约为11 mL。您可以使用去离子水或其它不含表面活性剂的鞘液,这样给用户提供了很高的选择灵活性。在每日运行成本这块,Cytek的全光谱流式仪相比其它机器成本更低,特别是相对于其它品牌超过30色水平的机器,其每日消耗和实际培训会增加很多成本。SUMMARY从多方面考虑,Cytek全光谱流式仪解决方案具有以下的优点:1.实现少激光便能完成高复杂度的实验,有效降低维护成本。2.可以选择任何能被机载激光激发的染料,并且能在一个实验中使用光谱高度重叠的染料。3.减少仪器设置时间及每日运行成本。无需进行滤光片更换,操作流程简单,消耗品成本低。4.从每一个多色管中能够获取更多信息。能够储存单染管的光谱从而减少样本制备时间。5.仪器安装需求简单,操作易上手,只需要2天的培训便可学会使用。
  • 220万!华南理工大学全时程动态活细胞成像及功能分析系统项目
    项目编号:GZZJ-ZFG-2023080项目名称:华南理工大学全时程动态活细胞成像及功能分析系统项目预算金额:220.0000000 万元(人民币)最高限价(如有):220.0000000 万元(人民币)采购需求:序号标的名称数量(单位)简要技术需求或服务要求(具体详见采购需求)最高限价万元(人民币)1全时程动态活细胞成像及功能分析系统1套功能:全时程动态活细胞成像及功能分析系统可放置于培养箱中,兼容多种规格尺寸的孔板、培养皿、培养瓶,可在明场及红色、绿色双色荧光通道条件下,对培养的细胞进行实时长时间的自动成像。一次可同时进行多块多孔板的实验,每块多孔板可独立运行,使用不同的物镜和荧光通道,采用不同的时间间隔拍照,用户可通过联网的电脑自定义实验流程和进行远程控制,获取各种格式的图像或动态视频,自动依据相位图、荧光信号分析生成的基于图像应用的图表,以显示细胞的变化及趋势。用途:全时程动态活细胞成像及功能分析系统主要应用于基础研究领域,结合其实时、长时间观察、自动分析的特点,可实时观测多组细胞生长过程,可获得每个时间点的照片、数值、曲线、影像等资料,为细胞生长发育、肿瘤研究、免疫研究、干细胞研究、药物评价、基因编辑与转染效率分析等多种应用提供丰富可靠的数据支持。人民币220万元经政府采购管理部门同意,本项目(全时程动态活细胞成像及功能分析系统)允许采购本国产品或不属于国家法律法规政策明确规定限制的进口产品,具体详见采购需求。本项目采购标的所属行业为:工业合同履行期限:国内供货:在合同签订后(30)天内完成供货、安装和调试并交付用户单位使用;境外供货(可办理免税):办理免税证明后(90)天内。本项目( 不接受 )联合体投标。对本次招标提出询问,请按以下方式联系。1.采购人信息名称:华南理工大学地址:广州市天河区五山路381号联系方式:文老师020-871129622.采购代理机构信息名称:广州中经招标有限公司地址:广州市越秀区寺右一马路18号泰恒大厦14楼1409室联系方式:陈小姐、庄小姐 020-87385151、020-37639369、020-87371812、020-873722963.项目联系方式项目联系人:陈小姐、庄小姐电话:020-87385151
  • 预算360万,清华大学采购全光谱流式细胞分析仪开启招标
    p style="text-indent: 2em text-align: justify margin-top: 15px "日前,清华大学发布公开招标公告,采购一套全光谱流式细胞分析仪,主要用于细胞学和微颗粒分析使用,可测量细胞大小,内部颗粒的形状,可检测细胞表面和细胞内抗原,细胞内DNA含量和荧光蛋白表达等。可对群体细胞在单细胞水平上进行分析,在短时间内检测分析大量细胞,并收集、储存和处理数据,进行多参数定量分析。br//pp style="text-indent: 2em text-align: justify margin-top: 15px "项目名称:清华大学全光谱流式细胞分析仪采购项目/pp style="text-indent: 2em text-align: justify margin-top: 15px "项目编号:清设招第2019028号/pp style="text-indent: 2em text-align: justify margin-top: 15px "项目联系方式:/pp style="text-indent: 2em text-align: justify margin-top: 15px "项目联系人:王慧/pp style="text-indent: 2em text-align: justify margin-top: 15px "项目联系电话:62785713/pp style="text-indent: 2em text-align: justify margin-top: 15px "预算金额:360万元(人民币)/pp style="text-indent: 2em text-align: justify margin-top: 15px "开标时间:2019年05月06日 09:00/pp style="text-indent: 2em text-align: justify margin-top: 15px "开标地点:北京市海淀区清华大学实验室与设备处老环境楼101A会议室/pp style="text-align: center"img src="https://img1.17img.cn/17img/images/201904/uepic/b1df1f2e-0ecf-45bf-8053-c27ad0f653c9.jpg" title="捕1.jpg" alt="捕1.jpg" width="595" height="390" style="width: 595px height: 390px "//ppbr//p
  • 【新品速递】索尼发布旗舰级全光谱流式细胞分析仪ID7000
    p style="text-align: justify text-indent: 2em "span style="color: rgb(112, 48, 160) "strong2019年6月24日,索尼宣布推出旗舰级全光谱流式细胞分析仪ID7000TM,以精简的操作流程实现超过40色荧光的多色流式分析。/strong/span/pp style="text-align: justify text-indent: 2em "span style="color: rgb(112, 48, 160) "strong/strong/span/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 370px height: 286px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201906/uepic/bb64b792-02fb-4082-be5a-d2161c342ba5.jpg" title="微信图片_20190626115355.jpg" alt="微信图片_20190626115355.jpg" width="370" height="286"//pp style="text-align: center "strongSony ID7000/strong/pp style="text-align: justify text-indent: 2em "ID7000搭载索尼创新的全光谱技术,可配备多达span style="color: rgb(112, 48, 160) "strong7个激光和188个检测器/strong/span,允许研究者从混合细胞群体中检测微弱信号和稀有细胞群体,将当今细胞分析技术所能达到的边界大大拓展。/pp style="text-align: justify text-indent: 2em "span style="text-indent: 2em "目前市场上流式细胞分析仪最多可实现同时30色的多色分析,而索尼ID7000的推出一举将此数字大幅度提升至span style="text-indent: 2em color: rgb(112, 48, 160) "strong超过40色/strong/span,而针对每个细胞所能获得的信息量理论值更是提升多达span style="text-indent: 2em color: rgb(112, 48, 160) "strong16,000多倍/strong/span。面对高度异质性的样本ID7000可以全面呈现细胞信息,为研究人员带来深入科学洞见,推动科学研究加速进展。/span/pp style="text-align: justify " 索尼ID7000一项重大突破是将单台流式细胞仪的光学检测器数量提升至188个,这项数字超过当今市场上其他厂家任何一台流式细胞仪产品的3倍以上,其强大的信息收集和处理能力将为研究人员呈现丰富而全面的细胞信息。/pp style="text-align: center "strongspan style="background-color: rgb(255, 192, 0) "主要特征/span/strong/pp style="text-align: justify "span style="color: rgb(112, 48, 160) "strong1. 索尼原创全光谱技术支持超40色荧光信号同时检测/strong/span/pp style="text-align: justify "①7激光188个检测器一次性呈现大量信息。/pp style="text-align: justify "ID7000可配备多达7个激发光,包括深紫外 (320nm), 紫外 (355nm), 紫色 (405nm), 蓝色(488nm), 黄绿色 (561nm),红色 (637nm)及红外 (808nm),用户可根据需求灵活选配3激光到7激光配置。188个检测器覆盖从360nm到920nm光谱范围,更宽的光谱范围可提供更为精确和全面的细胞信息。其中320nm深紫外激光的加入令研究人员更容易检测到微弱的细胞自发荧光信号,同时为市场上即将出现新型荧光素的检测做好准备, 为未来实现更多颜色的超多色流式分析创造先决条件。/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 518px height: 310px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201906/uepic/65cd0952-af73-4116-821d-4da6cdb86a8c.jpg" title="002.jpg" alt="002.jpg" width="518" height="310"//pp style="text-align: justify "②索尼原创的全光谱数据解析算法,提升样本数据处理速度/pp style="text-align: justify "高达188个检测器为用户快速方便地获取关于细胞样本的大量数据,而另一方面索尼通过改进的光谱拆分算法令用户可以快速、高效地处理这些数据,免调补偿的算法令用户摆脱传统流式上数据分析主观性强、操作复杂的困扰。/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 445px height: 411px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201906/uepic/64755aab-09b5-4ef4-82c8-0c330cd6fef5.jpg" title="003.jpg" alt="003.jpg" width="445" height="411"//pp style="text-align: justify "span style="color: rgb(112, 48, 160) "strong2. 大为精简的超多参数分析工作流程/strong/span/pp style="text-align: justify "①光谱参照库(Spectral Reference Library)/pp style="text-align: justify "ID7000内置了一大特色功能,允许用户利用参光谱参照库(Spectral reference library)存储、搜索和选择光谱信息。在传统流式平台上,增加检测颜色的数量通常会带来补偿调节方面的麻烦,给用户增加很多不必要的工作量。而从光谱库中随时调用光谱则大大简化了创建实验、采集和分析数据的难度,在这种情况下实验可以被自动执行,为用户节约很多时间,因而令多色分析实验变得更加精简流畅。/pp style="text-align: justify "② 自发荧光探测器(Autofluorescence Finder)/pp style="text-align: justify "不同样本管之间可能各自含有不同水平的自发荧光,这些水平不一的本底荧光信息给多色流式实验造成不可忽视的障碍,尤其是当要检测的样本量巨大时,而自发荧光探测器功能则能帮助用户识别并扣除多种自发荧光信号所带来的干扰,利用光谱拆分算法为研究者带来更高保真度的数据以及更为精确的视觉化解读。/ppbr//pp style="text-align: justify "span style="color: rgb(112, 48, 160) "strong3. 自动上样器确保高度一致性的检测结果/strong/span/pp style="text-align: justify "全新升级的自动上样器功能进一步提升,低残留、样本搅拌及制冷功能,将细胞损伤降至最低,从而带来长时且稳定的分析效果。br//pp style="text-align: justify "① 整合主动式搅拌功能/pp style="text-align: justify "ID7000整合了上样针主动搅拌的功能,同时支持进程内(in-process)搅拌,使得细胞样本在采样过程中被搅拌而处于悬浮混匀状态从而提升样本检测一致性。此外,自动上样器增加制冷功能,降低了样本检测中的不确定性并阻止样本由于温度变化而降解,更进一步确保了样本检测的一致性。/pp style="text-align: justify "② 软件设计和自动化功能实现无人看管式操作/pp style="text-align: justify "在样本检测中气泡、堵塞及样本体积过少是用户经常遇到的问题,这常常导致仪器报错及检测中断。ID7000优化的软件设计及自动化功能可以自动监控和处理以上情形,从而真正做到无人看管式操作。/pp style="text-align: justify "③ 自动上样器灵活兼容多种上样装置/pp style="text-align: justify "标准及深孔的96孔板和384孔板高通量上样,同时支持24管架(12x75mm 5mL管)/ppbr//ppbr//pp style="text-align: justify "span style="font-size: 12px "i* 本产品仅供研究使用,不可用于临床诊断与治疗。br//i/span/pp style="text-align: justify "span style="font-size: 12px "i* 本产品是Class 1激光产品(JIS标准)。/i/span/pp style="text-align: justify "span style="font-size: 12px "i* ID7000是归属于索尼的商标。/i/span/ppbr//pp style="text-align: center "span style="text-decoration: underline " /spanbr//pp style="text-align: center "strongspan style="text-decoration: underline "更多生命科学仪器新鲜资讯,扫码关注span style="text-decoration: underline color: rgb(192, 0, 0) "【3i生仪社】/span/span/strong/ppstrongspan style="text-decoration: underline "span style="text-decoration: underline color: rgb(192, 0, 0) "/span/span/strong/pp style="text-align: center"img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201906/uepic/50f9ba53-b0d8-499b-84a1-00a917b5f258.jpg" title="新 公号icon.jpg" alt="新 公号icon.jpg"//ppstrongspan style="text-decoration: underline "span style="text-decoration: underline color: rgb(192, 0, 0) "/span/span/strongbr//p
  • 380万!索尼中标清华大学全光谱流式细胞分析仪采购项目
    一、项目编号:清设招第2022021号(招标文件编号:清设招第2022021号)二、项目名称:全光谱流式细胞分析仪三、中标(成交)信息供应商名称:国药(上海)医疗器械实业有限公司供应商地址:中国(上海)自由贸易试验区正定路530号A5库区三层2号仓库中标(成交)金额:380.0000000(万元)四、主要标的信息序号 供应商名称 货物名称 货物品牌 货物型号 货物数量 货物单价(元) 1 国药(上海)医疗器械实业有限公司 全光谱流式细胞分析仪 索尼 LE-ID7000C 1 3800000
  • 441万!厦门大学全光谱光谱拆分细胞分析仪采购项目
    项目编号:XDZB2022-A-029项目名称:厦门大学医学与生命科学学部全光谱光谱拆分细胞分析仪预算金额:441.0000000 万元(人民币)最高限价(如有):441.0000000 万元(人民币)采购需求:详见招标文件合同履行期限:从中华人民共和国境内提供的货物:最长不超过6个月;从中华人民共和国境外提供的货物:外贸合同签订好之后最长不超过6个月(在进出口手续办理好的前提下)本项目( 不接受 )联合体投标。厦门大学医学与生命科学学部全光谱光谱拆分细胞分析仪招标文件.docx
  • 强强联合—“贝克曼与德泉兴业”粒子分析和细胞计数交流会,在京举办
    德泉与贝克曼联手于2019年9月27日在北京经济技术开发区康定街1号1号楼一块垒会议室举办“粒度分析和细胞计数计数交流培训会”,此次培训我们将共同探讨如何对样品颗粒进行精确分析?如何攻克nm颗粒准确性分析存在的技术难点和挑战。用理论结合实操把握,为您提供完美的颗粒表征与颗粒分析解决方案!谨此,我们诚挚地希望各位合作伙伴届时能百忙之中抽出时间出席会议。赠小猪公仔活动微信二维码扫码报名“”,参加北京德泉与贝克曼粒度分析和细胞技术交流会,即可有机会获取您钟情的小猪猪,本次活动赠送共30个,赶紧行动啦!
  • 镁伽CCEasy全自动高通量细胞计数分析仪,为细胞分析保驾护航
    01 两种通量选择CCEasy全自动高通量细胞计数分析仪镁伽CCEasy全自动高通量细胞计数分析仪,以高通量细胞分析技术为核心,兼容台盼蓝、荧光(AO/PI)两种染色方式,能自动化完成细胞计数、活率检测及生长情况分析,实现高效率、高质量、标准化的活细胞在线检测。机型提供24位转盘和96孔板两种选择,支持进行自动化整合,充分满足多领域的细胞分析实验需求。全自动24通量细胞计数分析仪全自动96通量细胞计数分析仪 滑动查看更多 CCEasy的软件系统通过高精度视觉检测系统结合智能主动学习Al算法,能在短时间内对多细胞样本进行高精度识别和计算,为细胞分析和质量控制提供更加可靠的自动化解决方案!02 全流程自动化无需人工介入,让细胞计数分析更智能标准高效全程标准化检测,无需人工介入,兼容24位转盘或96孔板不间断连续测样;无需设置细胞参数,即可准确识别细胞状态和数量。快速灵敏解放双手,预置试剂包,无需人工混合染料与样品;检测耗时短,1min内即可完成单个样品的制备及检测。智能管理多级用户、多级权限管理,支持电子签名、电子记录存档,符合FDA21 Part11要求。降本增效内置可长期持续使用的检测池,无需一次性细胞计数板,帮助客户节省耗材成本。 细胞计数分析仪运行流程 03 数据验证符合GMP规范,细胞质量控制更可靠标准颗粒梯度测试结果通过CCEasy细胞计数分析仪测试多种稀释倍数下标准颗粒的数量,测试数据呈现良好线性趋势,R2高达0.998,表明CCEasy细胞计数仪具有良好的准确性和一致性。以下分别为镁伽CCEasy24通道细胞计数仪测试数据和96通道细胞计数仪测试数据。多细胞样本直径测定通过CCEasy细胞计数仪对多细胞样本的直径进行测试,结果显示,通过24通道和96通道的细胞计数仪测量细胞直径,两台设备测量结果偏差非常小,具有良好的重复性。
  • 单细胞基因测序市场分析
    p  span style="color: rgb(0, 112, 192) "什么叫做单细胞基因测序(Single-Cell Sequencing)?/span/pp  一句话说,就是单个细胞水平上对基因组进行测序。2013年,自然杂志把年度技术授予了单细胞a title="" href="http://www.instrument.com.cn/application/SampleFilter-S01-T000-3-1-1.html" target="_self"span style="color: rgb(255, 0, 0) "基因测序/span/a(Single Cell Sequencing),认为该技术将改变a title="" href="http://www.instrument.com.cn/application/SampleFilter-S01-T000-3-1-1.html" target="_self"span style="color: rgb(255, 0, 0) "生物界和医学界/span/a的许多领域。/pp  span style="color: rgb(0, 112, 192) "我们为什么要进行单细胞基因测序?/span/pp  传统的测序方法,无论是基因芯片或者二代基因测序技术(Next Generation Sequencing,NGS)都需要从超过10万个细胞中提取一大堆(bulk)DNA或者RNA,而提供的信息是一大堆细胞的平均值。但是传统的方法,对于理解人体细胞的多样性有着明显的局限性。/pp  在人体的每一个组织中,比如说,肾脏组织,拥有着大量不同的细胞类型,每一种细胞类型有着独特的起源和功能。每一个细胞的谱系和发展的状态又决定了每个细胞如何和周围的细胞和环境如何反应,把基因测序应用到单个细胞层面,对于我们理解细胞的起源,功能,变异等有着至关重要的作用。/pp  关于二代基因测序已经详细在我们的前期两篇深度报告中进行了介绍,在本篇报告中,我们将详细解读单细胞基因测序,以及该技术对癌症,辅助生殖以及免疫学等领域带来的新的突破。/pp  strong一、单细胞基因测序行业:刚启程,面临引爆点/strong/pp  BCC Research的一项分析报告指出,2014年全球单细胞分析(Single-cell Analysis)的市场达5.4亿美金,预测将从2015年的6.3亿美金增长到2020年的16亿美金,复合增长率达21%。根据GENReports的报告,关于单细胞分析的文章发表在过去的几年也有着爆发性的增长。/pp style="text-align: center "  图2:单细胞分析的文章发表数量/pp style="text-align: center "img title="1.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201603/noimg/006c9fd7-a2cd-46b2-a028-18b51b5ea3cd.jpg"//pp style="text-align: center "  资料来源:GEN,民生证券研究院/pp  其中,传统的单细胞基因组学主要是由基因芯片和PCR主导的,随着二代基因测序的成本以超摩尔定律下降,目前单细胞基因组学逐渐由二代基因测序技术接棒。/pp  和qPCR在90年代的发展一样,目前所有的刺激因素(高度的科研兴趣,生物医药巨头公司的关注等)正在解锁这个市场,单细胞基因测序行业正面临引爆点。/pp strong 二、单细胞基因测序的基本流程:单细胞分离--基因组扩增--测序和分析/strong/pp  单细胞测序,简单地说,主要经过如下的步骤:单细胞的分离--DNA/RNA的提取和扩增(全基因组扩增和全转录组扩增)---测序以及后续的分析和应用。/pp style="text-align: center "  图3:单细胞测序的步骤/pp style="text-align: center "img title="2.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201603/noimg/782ee757-3c06-4a1b-9103-4c7336ac2929.jpg"//pp style="text-align: center "  资料来源:Recent advances and current issues in single-cell/pp style="text-align: center "sequencing of tumors,民生证券研究院/pp  2.1 单细胞的捕捉和分离/pp  单细胞测序的第一步是单细胞的分离和提取,目前的方法主要有如下几种方法:流式细胞术,激光捕获显微切割技术以及微流控技术。/pp style="text-align: center "  图4:单细胞分离的三种方式:流式细胞术,激光捕获显微切割以及微流控技术/pp style="text-align: center "img title="3.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201603/noimg/ea66e087-c9b2-4930-a4d3-50025543fe8b.jpg"//pp style="text-align: center "  资料来源:Technologies for Single-Cell Isolation,民生证券研究院/pp  1)流式细胞术 (Flow Cytometry)/pp  是指通过对于悬浮于流体中的细胞或者其他颗粒进行定量分析和分选的技术。在各种流式细胞仪中,大家主要讨论的是荧光活化细胞分类计FACS(Fluorescence Activated Cell Sorting)系统分离单细胞。定量原理:待测细胞经特异性荧光染料染色后,加入样品管中,经过测量区,由染色后的细胞在激光照射下的荧光产生的电信号来进行定量分析 分选原理:通过流束形成含有细胞的带电液滴来实现的。/pp  2)激光捕获显微切割技术Laser Capture Microdissection(LCM)/pp  LCM技术可以在显微镜直视下快速、准确获取所需的单一细胞亚群,甚至单个细胞,从而成功解决了组织中细胞异质性问题。其基本原理是通过一低能红外激光脉冲激活热塑模-乙烯乙酸乙烯酯(EVA)膜,在直视下选择性地将目标细胞或组织碎片粘到该膜上。/pp  3)微流控技术(Microfluidics)/pp  微流控技术是一种用于精确控制微量液体的技术。微流控芯片是实施该技术的平台,通常通过细微的管道对液体实施操控,微流控对液体的操控尺度, 刚好适合于单细胞样品的处理操作。/pp  2.2 全基因组扩增 (Whole Genome Amplification. WGA)/ 全转录组扩增 (Whole Transcriptome Amplification,WTA):单细胞测序的难点/pp  2.2.1 主要的三种全基因组扩增技术,各有优势/pp  由于在单细胞中的DNA和RNA的数量非常小(几个pg),用传统的测序仪无法检测,所以科学家们必须首先对这些分子进行扩增,同时尽量的减少错误。目前的全基因组扩增技术主要有三种:简并寡核苷酸引物PCR扩增(DOP-PCR),多重置换扩增(MDA) 和基于多次退火和成环的扩增循环(MALBAC)。/pp  1)基于PCR技术的全基因组扩增技术,例如DOP-PCR(简并寡核苷酸引物PCR扩增)/pp  DOP-PCR是一种部分随机引物法, 其引物构成为3& #8242 -ATGTGG-NNNNNN-CCGACTCGAG-5& #8242 ;主要 利用3& #8242 端ATGTGG这6个在人体中分布频率极高的碱基作为引导, 以6个碱基的随机序列来决定特异的扩增起始位点,从而达到扩增整个基因组的目的。/pp  2)多重置换扩增(MDA)/pp  MDA是一种等温的链置换扩增反应, 其使用随机的6碱基引物在多位点和模板链结合, 接着利用 phi29DNA 聚合酶很强的模板结合和置换能力实现对全基因组的扩增。/pp style="text-align: center "  图5:DOP-PCR和MDA全基因组扩增技术简介/pp style="text-align: center "img title="4.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201603/noimg/d9b0aef0-e3b1-4c63-8313-c20796064bb3.jpg"//pp style="text-align: center "  资料来源:Single-cell genome sequencing: current state/pp style="text-align: center "of the science,民生证券研究院/pp  3)MALBAC(Multiple annealing and looping-based amplification cycles)基于多次退火和成环的扩增循环/pp  通过采用特殊引物,使得扩增子的结尾互补而成环,从而达到近乎线性的扩增,该技术是哈佛大学谢晓亮教授团队发明的。/pp style="text-align: center "  图6:MALBAC全基因组扩增的示意图/pp style="text-align: center "img title="5.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201603/noimg/83e2f828-d990-4b9c-afd6-bd692fc52888.jpg"//pp style="text-align: center "  资料来源:Single-cell sequencing by Doug Brutlag,民生证券研究院/pp  表1:三种类型的全基因组扩增方式比较/pp style="text-align: center "img width="600" height="302" title="QQ截图20160302115018.jpg" style="width: 600px height: 302px " src="http://img1.17img.cn/17img/images/201603/noimg/297e4e6e-a134-4101-a297-456cd703c3af.jpg" border="0" vspace="0" hspace="0"//pp style="text-align: center "  资料来源:Single-Cell Sequencing Technologies: Current and Future,/pp style="text-align: center "民生证券研究院/pp  Navin 在研究报告中指出(来源:Cancer genomics: one cell at a time),对于检测CNV(Copy Number Variation)的时候,DOP-PCR以及MALBAC较有优势,另一方面, MDA方法一般用来检测点突变。Gawad et al., (2015)更是指出,三种全基因组扩增技术并没有明显的胜者,具体方法的使用取决于研究的目的。/pp  2.2.2 全转录组扩增/pp  一个哺乳动物的单细胞大约含有10pg的RNA,其中mRNA大约在0.1-0.5pg,并不能满足目前测序平台的要求,所以需要进行全转录组扩增技术。/pp  单细胞中提取的RNA首先经过逆转录出cDNA,然后对逆转录生成的cDNA进行扩增。目前主要的转录组扩增技术主要包括如下几种:传统的PCR,改进的PCR,T7-in vitro 体外转录组扩增以及Phi29聚合酶扩增。/pp  三. 单细胞测序的主要应用:癌症,辅助生殖以及免疫学领域/pp  当单细胞被分离,细胞内的DNA/RNA被提取和扩增后,二代基因测序(Next Generation Sequencing)可以用来进行后续的测序。当把基因测序应用于单个细胞层面,在下游应用领域有着先天独到的优势。/pp  3.1单细胞基因测序技术有助研究癌症起因和治疗/pp  首先谈一下癌症的异质性:中晚期的肿瘤或由一系列的肿瘤克隆组成,每一种克隆有着独立的变异,形态和药物反应。对于肿瘤克隆精准的诊断非常重要,因为一个占据原发性肿瘤5.1%的亚克隆种群在复发的时候可能成为主要的致病因素。/pp style="text-align: center "  图7:肿瘤的异质性/pp style="text-align: center "img title="6.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201603/noimg/88b49609-3a47-4577-ad2a-7e9b36b6a4dc.jpg"//pp style="text-align: center "  资料来源:Illumina,民生证券研究院/pp  实体瘤由一系列不同的细胞组成,包括癌症纤维细胞,内皮细胞,淋巴细胞,巨噬细胞等。同时,实体瘤由多个肿瘤克隆亚种群构成,使得临床样本的分析更加复杂。当多个肿瘤克隆同时存在时,标准方法检测的要么是平均信号要么是主要的克隆群体(并不一定是最致病的)的信号。/pp  而同时,肿瘤的异质性和癌症产生抗药性以及转移密切相关,所以,单细胞测序开始用来检测肿瘤内基因异质性,对于癌症起因以及后续治疗的研究非常关键和重要。/pp  例如,Navin et al.(2011), 利用单细胞基因测序的方法(流式细胞术提取细胞-全基因组扩增-NGS),在某个乳腺癌肿瘤组织中检测了100个乳腺癌细胞的CNVs,覆盖度大约6%,发现了三种完全不一样的克隆亚种群。/pp  除了肿瘤细胞,单细胞基因测序同样可以应用于循环肿瘤细胞(Circulating tumor cells)和外周血播散肿瘤细胞DTC(disseminated tumor cells),该部分内容将在后续的研究报告中深入讨论。/pp  3.2 单细胞基因测序助力辅助生殖/pp  PGS(Pre-implantation Genetic Screening)是胚胎注入前遗传学筛查,主要是通过检测胚胎的23对染色体结构、数目,来分析胚胎是否有遗传物质异常 PGD(Pre-implantation Genetic Diagnosis),主要用于检测胚胎是否携带遗传缺陷的基因,关于PGS/PGD的介绍,请参考我们之前的行业深度《基因+大数据的颠覆:从癌症基因测序到辅助生殖》。/pp  PGD过程中,目前主要有三种方式获得活检材料:1)卵子的第一极体和第二极体 2)培养至第3天胚胎卵裂期的卵裂球细胞(一般取1-2个细胞) 3)培养第5天左右的囊胚细胞。/pp  例如,牛津大学的Dr.Dagan Wells团队,通过对囊胚细胞进行单细胞基因测序,选择健康的胚胎植入。另外,谢晓亮教授团队通过对女方卵细胞极体细胞进行测序,结合胚胎选择,选择正常的胚胎移植。/pp style="text-align: center "  图8:卵母细胞减数分裂产生极体的过程/pp style="text-align: center "img title="7.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201603/noimg/a1c2724b-0f2c-4b27-9eca-d304dccd613c.jpg"//pp style="text-align: center "  资料来源:Genome Analyses of Single Human Oocytes,民生证券研究院/pp style="text-align: center "  (注:其中PB1和PB2是第一极体和第二极体)/pp  3.3 单细胞基因测序打开免疫报多样性研究之门/pp  用单细胞基因测序分析免疫细胞的原因是现存的多样的病原体导致了免疫细胞的高度异质性,传统的检测方法,取样来自一大堆细胞,低估了单个免疫细胞的多样性,所以我们需要更加精确检测单个免疫细胞的遗传物质,从而理解机体复杂的免疫机制。正如开篇提到的Juno收购的单细胞基因测序公司AbVitro致力于T细胞和B细胞的基因测序。/pp  图9展示了对单个T细胞受体基因测序(TCR Sequencing)的流程。TCR & #945 和& #946 mRNA经过逆转录,扩增,重叠延伸,目的基因被选择性地进行PCR扩增以及后续的分析。/pp style="text-align: center "  图9:TCR Sequencing过程/pp style="text-align: center "img title="8.png" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201603/noimg/04e7c357-80bd-4709-89dc-92ee07a28fa9.jpg"//pp style="text-align: center "  资料来源:Pairing of T-cell receptor chains via emulsion PCR,/pp style="text-align: center "Illumina,民生证券研究院/pp  四. 单细胞基因测序未来的发展之路/pp  在目前来看,单细胞基因测序还处在非常初级的阶段,也面临很多技术的挑战,包括:如何高效的分离细胞,全基因组无偏差的扩增,以及下游的数据分析等。但各大生物医药巨头都已经目光锁定了这个方向,除了今年初Juno收购AbVitro(单个T细胞和B细胞进行基因测序),去年八月BD公司收购了单细胞测序公司Cellular Research。Illumina也通过和Clontech合作,推出了单细胞RNA测序服务。/pp  我们认为,未来的基因测序一定朝着更精准,更微观的方向前进,如今,单细胞测序正面临着一场革命,在单个细胞层面让我们在前所未有的水平理解基因组学,表观基因组学和转录组学的多样性。/pp  背景案例:/pp  2016年1月,肿瘤免疫疗法的领头羊公司Juno宣布以1.25亿美金的股票和现金收购波士顿的一家单细胞测序公司:AbVitro Inc.。 AbVitro公司的技术起源于哈佛大学George Church的实验室,AbVitro的技术包括对单个T细胞和B细胞进行基因测序,帮助科学家们理解T细胞受体(T cell receptor & #945 和& #946 链的基因的复杂性。/pp  图:Juno收购AbVitro之后的布局/pp style="text-align: center "img title="9.jpg" src="http://img1.17img.cn/17img/images/201603/noimg/6ef1eca1-dc46-4600-9c6d-d95f77a85f9e.jpg"//p
  • 单细胞电学特性流式分析方法及分析仪器研究取得进展
    近日,中国科学院微电子研究所健康电子中心研究员黄成军、副研究员赵阳团队,在单细胞电学特性流式分析方法及高通量实时分析仪器研究方面取得重要进展。 单细胞电学特性生物传感与分析技术为单细胞生物物理学研究提供了新维度。该技术已被证明在全血分析、肿瘤细胞分型和免疫细胞状态评估方面具有重要的应用潜力。然而,现有的电学检测方法难以实现高通量实时性分析,限制了需要大量系统实验的单细胞电学特性研究的开展。 面该团队提出了快速并行物理拟合求解器,仅需0.62 毫秒即可在线求解出单个细胞膜比电容和细胞质电导率。与传统求解器相比,在不损失准确度的前提下,速度提升了27000倍,且不需要任何数据预采集和预训练过程,进一步实现了基于物理模型信息的实时阻抗流式细胞分析仪(piRT-IFC)(图1)。该技术可在50分钟内实时表征高达100902个单细胞,具有高稳定性、高通量、实时化和全流程自动化等特点。作为示范应用,该团队对药物处理后HL-60中性粒细胞脱粒现象这一典型的快速变化的生物过程进行实时表征分析。与普遍采用的神经网络辅助加速方法对比研究表明,piRT-IFC具有速度快、准确度高和泛化能力强的优势,具备广泛的应用潜力。 相关研究成果以piRT-IFC: Physics-informed real-time impedance flow cytometry for the characterization of cellular intrinsic electrical properties为题,发表在《微系统与纳米工程》(Microsystem and Nanoengineering)上。该研究由微电子所和计算技术研究所合作完成。近年来,该课题组面对单细胞物理特性检测存在敏感机理不明和技术实现困难等关键技术瓶颈,开创性提出了基于微流控技术的“交叉压缩通道”敏感新原理和单细胞电学模型,建立了基于微流控芯片的单细胞电学特性高通量定量检测方法,检测参数包括细胞膜比电容和胞浆电导率,通量比膜片钳等常规方法高10000倍,并进一步研发出实时高通量单细胞电学特性流式分析仪(图2)。仪器入选中国科学院自主研制科学仪器名录,与首都医科大学宣武医院、首都医科大学附属北京胸科医院、计算所等单位合作,成功用于脑卒中动物模型、癌症病人样本、药物模型等领域的多种细胞的分析,为肿瘤/脑卒中等精准诊断、药物筛选等提供了有力工具,并发现了新型标志物,验证了相关药物候选分子的作用、获得授权专利。研究工作得到科学技术部、国家自然科学基金委员会、北京市、中国科学院的支持。阻抗流式细胞分析仪(piRT-IFC)原理样机、核心微流控芯片、设备交互界面、典型结果和自动化实时数据处理流程 图2. 基于微流控芯片技术的单细胞电学特性活体单细胞分析仪(左)及核心微流控芯片(右)
  • Cytek 发布全新台式高维细胞分选仪,助力超高分辨单细胞分析
    仪器信息网讯 6月7日,Cytek Biosciences宣布推出全新的台式高维细胞分选仪- Cytek Aurora CS。全新台式流式细胞分选仪发布,实现超高分辨细胞分析Cytek Aurora CS流式细胞分选系统据了解,该流式细胞分选仪采用Cytek独特的全光谱分析技术(Full Spectrum Profiling, FSP™ ),Aurora CS可在单细胞水平提供超高分辨率的数据结果,帮助科学家和研究人员将复杂实验简单化,轻松解决最具挑战性的细胞分析,如高自发荧光的细胞分析、或关键生物标志物表达水平低的细胞分析等。使用Aurora CS,研究人员可以从微孔板或试管中轻松分选活细胞或其他颗粒,用于下游分析实验,如单细胞RNA测序、蛋白质组学和细胞生物学研究等。Cytek于2017年首次推出了其旗舰级产品-Aurora流式细胞分析系统,Aurora系统利用突破性的Cytek FSP™ 技术,采集来自多个激光器激发的荧光素全光谱信号,轻松分辩单细胞上的多种荧光标记,显著提高了高参数细胞分析的灵敏度,极好的解决了流式检测受技术局限的问题。Aurora CS基于同样的FSP™ 技术,保持了与Aurora一致的优秀特性和强大功能。独特的光学设计和解析方法能让使用者体会到更高的灵活性, 不仅可广泛选择大量新的荧光染料,且无需为每个应用重新设置仪器。先进的光学系统和低噪音电子系统,带来超强灵敏度和卓越分辨率的细胞分析体验,包括分析那些高自发荧光或关键生物标志物表达水平低的细胞。Cytek Aurora分析系统和Aurora CS分选系统,利用Cytek独有的FSP™ 技术,可以检测标记在每个细胞上的多种荧光探针的全光谱信号,在单管样本中,即可完成高度复杂方案(40色方案)的分析和分选,使科学家们能够更深入更完整的了解生物系统。结合FSP™ 技术和高端分选特性,Aurora CS为研究人员提供了一个可应用于多种生物学场景和分选条件的解决方案。搭配SpectroFlo CS软件,在更短的设置时间下,即可轻松实现6路分选、自定义分选、自动液滴延迟和分选液流监控等操作,满足各种科学研究与应用的需求。网络会议预告 点击报名参会
  • 会议通知|细胞生物学前沿技术交流会(流式细胞分析分选技术专场)
    细胞生物学前沿技术交流会(流式细胞分析分选技术专场)通 知近年来,生命科学前沿深入研究和公共健康领域应用的迫切需求都对相关仪器技术、实验方法的迭代更新起到了极大的推动作用,尤其是交叉学科不断融合,促进了包括流式细胞分析分选技术在内的细胞生物学研究手段的快速发展,全光谱流式、质谱流式、成像流式、纳米流式、拉曼流式等创新技术层出不穷,流式细胞技术在生命科学基础研究、医学临床诊断等领域的发展和应用场景越来越广泛,运用方案越来越深入。兹定于2023年4月13-14日在上海召开“细胞生物学前沿技术交流会(流式细胞分析分选技术专场)”。本次会议由中国科学院上海生命科学大型仪器区域中心主办,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心公共技术中心承办,旨在邀请流式前沿领域的技术专家向与会人员详细介绍各类技术的原理、技术特点及应用场景,拓展科研人员在技术方向上的认知,促进这些前沿技术为更多从事科研、研发及检测人员所灵活、高效、高质运用。现将有关事宜通知如下:一、会议时间与地点会议时间:2023年4月13-14日会议地点:上海市徐汇区岳阳路320号新生化大楼312报告厅二、会议内容会议将围绕多种类型、不同技术路线的分选技术(成像型光谱流式细胞分选、空气激发型光谱流式细胞分选、拉曼细胞分选)和分析技术(质谱流式细胞分析、在体流式细胞分析、成像型流式细胞分析、微流控单细胞分析、纳米流式分析)等前沿流式相关技术的技术特点及运用场景展开介绍与讨论交流。为支持国产仪器自主创新,会议还将优先推介国产流式细胞分析分选设备。三、会议日程2023年4月13日时 间内 容报告人主持人09:00-09:05区域中心领导致欢迎辞09:05-09:20相关主管部门领导致辞09:20-09:50高通量流式拉曼细胞分选仪及应用马 波中科院青岛生物能源与过程所研究员张文娟09:50-10:20拉曼分选技术前沿——细胞表型探索新工具李 备中科院长春光机所研究员10:20-10:35茶歇10:35-11:05循环细胞的活体无创光学动态监测魏勋斌北京大学教授张文娟11:05-11:35“图鉴不同,像由心选”BD高速图像光谱流式分选技术钱 璟碧迪医疗器械(上海)有限公司高级产品应用经理11:35-13:30午餐,自由讨论与交流13:30-14:00全光谱流式原理与分选技术的应用冯定龙Cytek华东区高级技术经理边 玮14:00-15:30谱康光谱流式细胞仪技术及应用杨 凡谱康医学应用技术支持15:30-15:45茶歇15:45-16:15空气激发型光谱分选技术用于高活性细胞分选及单细胞分选应用李 凌赛默飞世尔科技(中国)有限公司高级技术应用经理边 玮16:15-16:45全光谱流式前沿技术和应用曾令武索尼生命科学高级市场经理16:45-18:00自由讨论与交流2023年4月14日时 间内 容报告人主持人09:30-10:00纳米尺度生物颗粒的精准表征利器 — 纳米流式检测技术颜晓梅厦门大学特聘教授边 玮10:00-10:30新一代单细胞靶向蛋白质组学平台——Starion星瀚流式质谱系统刘浥坤上海宸安生物科技有限公司高级应用科学家 10:30-10:45茶歇10:45-11:15基于流式光片的斑马鱼高通量三维成像技术研究李 辉中科院苏州医工所研究员边 玮11:15-11:45“功能为王”-单细胞功能高通量深度表征平台开启单细胞多组学研究新篇章朱 凯PhenomeX资深应用科学家 11:45-13:30午餐,自由讨论与交流13:30-14:00新概念柔性流式细胞分选技术及其应用张 萍德国美天旎全国科研应用经理俞珺璟14:00-14:30Namocell 微流控单细胞分选技术的原理和应用陈科立Namocell经理14:30-15:00成像增强型流式细胞分析结合AI图像技术用于细胞表型和形态研究应用李 凌赛默飞世尔科技(中国)有限公司高级技术应用经理15:00-17:00自由讨论与交流四、报名方式本次会议免注册费用。请参会人员扫描下方二维码填写会议回执,并于2023年4月11日中午12点前提交反馈,以便会务组安排相关事宜。五、会议联系方式姜颖文:15721565165,jiangyingwen@sibcb.ac.cn何 钧:13611699686,jun.he@sibcb.ac.cn中国科学院上海生命科学大型仪器区域中心中国科学院分子细胞科学卓越创新中心公共技术中心2023年4月6日
  • 空间代谢组学:单细胞空间代谢流分析新方法
    空间代谢组学:单细胞空间代谢流分析新方法原创 飞飞 赛默飞色谱与质谱中国 关注我们,更多干货和惊喜好礼刘甜生物体内的代谢物和脂质不仅是细胞的关键组成模块,它们在信号传导、表观基因组调控、免疫、炎症和癌症发展中同样具有重要作用和意义。代谢组学分析是我们了解、评估生物体、器官和细胞状态的重要方式。而单细胞技术通过展示组织内部甚至单克隆细胞之间的细胞异质性,将生物学研究推进至新维度。质谱成像(MSI)技术可以从样品中创建特定化合物的图像,这些图像是由样品表面获得的数千个质谱生成的。每个记录的质谱都会为图像贡献一个像素,而每个质谱中的峰都可以生成一个图像。与其他成像方法相比,MSI无需化合物标记,可实现非靶向分析。本次与大家分享的是一篇最新发表于bioRxiv上的有关单细胞空间代谢流分析方法的文章[1]。研究人员基于AP-SMALDI Orbitrap平台开发了一种命名为“13C-SpaceM”的新方法,通过13C标记的葡萄糖示踪葡萄糖依赖性脂肪酸从头合成途径(glucose-dependent de novo lipogenesis)。本方法应用超高分辨率的基质辅助激光解吸/电离实现了单细胞质谱成像,并通过全离子碎裂模式(AIF)模拟了脂肪酸分析前处理过程中的皂化反应,对包括甘油磷脂在内的主要脂质中的脂肪酸部分实现了共同分析。超高灵敏度、高分辨质谱检测器为单细胞内脂肪酸同位素检测提供了准确的定性、定量结果。研究人员通过鼠肝癌细胞的常氧-低氧模型,对检测方法进行了验证,确认方法的有效性。之后应用本方法分别检测了ATP柠檬酸裂解酶基因敲降(ACLY knockdown)鼠肝癌细胞以及携带异柠檬酸脱氢酶(IDH)突变的小鼠胶质瘤脑组织切片,通过比较脂肪酸的同位素丰度变化评估脂肪酸从头合成比例以及外源性脂肪酸摄取的变化。分析结果揭示了在脂肪酸从头合成过程中,乙酰辅酶A池(Acetyl-CoA pool)中存在大量的空间异质性,这表明在微环境适应过程中发生了代谢重编程。01研究背景脂质在生物体生命过程中承担着多种重要作用,多数脂质是由脂肪酸合成而来。成年哺乳动物体内的细胞通常由血液中摄取脂肪酸,而脂肪、肝脏以及癌细胞还可以Acetyl-CoA为底物,从头合成脂肪酸[2]。Acetyl-CoA经过一系列代谢反应,可以生成含有16个碳的饱和脂肪酸棕榈酸(16:0),之后棕榈酸发生碳链延长或去饱和反应生成不同的饱和、不饱和脂肪酸,从而影响脂质组成。而Acetyl-CoA同样有多种来源,除了葡萄糖经由TCA循环生成的柠檬酸在ACLY作用下生成Acetyl-CoA以外,在缺氧环境下,葡萄糖后续代谢产物丙酮酸会转化为乳酸,从而无法合成Acetyl-CoA、进入脂肪酸合成途径。在此情况下,谷氨酰胺可通过还原羧化反应生成柠檬酸,进而合成Acetyl-CoA [3,4] 。另有文献报道,缺氧环境下的癌细胞还可以将乙酸作为脂肪酸合成的前体 [5,6] 。而Acetyl-CoA除了作为脂肪酸合成底物以外,对于蛋白翻译后修饰、基因表达等均有重要作用。通过监控脂肪酸合成和Acetyl-CoA代谢间的互动可以帮助我们深入理解癌细胞的生存状态。02分析方法大气压MALDI成像分析是通过AP-SMALDI5离子源配合Q Exactive plus高分辨质谱仪实现的。激光像素设置为 10×10 µ m,激光衰减器角度设置为33°。质谱在负离子模式下采用一级全扫描和全离子碎裂(AIF)扫描模式。AIF模式的隔离范围为 m/z 600-1000,扫描范围为m/z 100-400,分辨率 140k,最大注入时间500 ms,碰撞能量NC 25%。(图1)图1. 单细胞代谢流质谱成像分析流程(点击查看大图)MALDI分析前后,分别应用显微镜检测,确定细胞影像位置及MALDI消融标记位置。通过检测MALDI的消融标记,将其与细胞影像叠加,并通过应用数学公式进行解卷积,从而整合显微镜图像和MALDI图像。实现了应用MALDI成像质谱检测到的单细胞分子轮廓。(图2)图2. 整合显微镜和MALDI-MS分析结果实现单细胞质谱成像(点击查看大图)03鼠肝癌细胞常氧-低氧模型单细胞成像分析鼠肝癌细胞在添加25 mM的12C-葡萄糖或U-13C-葡萄糖后,用含1mM醋酸、2 mM谷氨酰胺和10%透析胎牛血清的无葡萄糖DMEM细胞培养基培养,在37°C、5% CO2的培养箱中在常氧(20% O2)或低氧(0.5% O2)条件下培养72小时。选择72小时的时间点是为了确保棕榈酸的同位素标记已经达到稳态。(图3)在低氧条件下培养的细胞被表达绿色荧光蛋白(GFP)标记。在共培养实验中,常氧和低氧细胞使用胰酶分离,每种条件下混合10000个细胞,在同一张玻璃片上进行培养,并在固定之前允许其附着3小时。图3. 由稳定同位素标记的13C6-葡萄糖生成细胞质Acetyl-CoA以及后续的脂肪酸和脂质合成途径(点击查看大图)通过质谱一级全扫描分析,质谱成像共检测到64种脂质,包括磷脂酸(PA)、磷脂酰肌醇(PI)、磷脂酰乙醇胺(PE)、磷脂酰丝氨酸(PS)等。具体脂质鉴定结果经过了常规LCMS脂质分析确认。在AIF模式下,检测到了11种含量最高的脂肪酸,相应检测结果同样与常规LCMS分析结果相符。为了验证本方法,研究人员检测了常氧-低氧培养的鼠肝癌细胞混合样本。通过对氨基酸同位素峰的定量分析,发现13C标记的棕榈酸(M0)主要在正常细胞中检出,而缺氧细胞中的棕榈酸以未标记状态(M+0)为主。通过GFP标记结果的对照,证明了本方法可以通过同位素峰分布有效识别不同培养状态的细胞。图4. 在常氧(GFP阴性)和低氧(GFP阳性)条件下的原代鼠肝癌细胞共培养模型的显微镜和质谱成像结果(点击查看大图)图5. 通过GFP标记验证识别不同培养模式细胞的准确性(点击查看大图)04单细胞Acetyl-CoA池标记水平分析研究人员使用了两种表达不重叠的shRNA序列(ACLYkd oligo1和ACLYkd oligo 2)细胞系以及一个对照组细胞系。通过使用1 μg/mL的四环素处理细胞72小时实现了ACLY沉默。质谱成像数据是以10 μm的像素大小获得的,每个细胞的平均面积为550μm2,平均每个细胞有12个像素。通过应用二项式模型计算每个细胞的acetyl-CoA池标记程度p值,从而量化细胞质中acetyl-CoA池中从葡萄糖衍生的同位素标记acetyl-CoA的比例。测试结果与预期相符,ACLYkd细胞中的acetyl-CoA池标记水平低于对照组。值得注意的是,两种ACLYkd细胞之间的差异非常明显。ACLYkd oligo1的结果呈双峰分布,p值的差异明显较大,表明该细胞系存在两个亚群体。其中一个模式显示的p值与对照组相近,说明存在一个“沉默失败”的细胞亚群。ACLYkd oligo1第二个模式具有的p值明显则低于ACLYkd oligo 2,表明ACLYkd oligo 1中还存在一个“强沉默”的亚群,在这些细胞中,沉默效率非常高,导致acetyl-CoA同位素标记比例大幅降低。在ACLYkd oligo 2中,acetyl-CoA池的标记程度以及GFP报告基因强度显示出更均一的分布。M+2峰是最能表现出ACLYkd oligo1细胞中“强沉默”群体的低acetyl-CoA标记表型的质谱峰。M+8峰则为对照组细胞的特征标记峰。M+2和M+8之间的差异可以作为显示异质性的指标,用于展示葡萄糖对细胞质中acetyl-CoA的相对贡献。因此,13C-SpaceM能够检测ACLY敲降细胞中的异质性,并识别不同的亚群体。这种单细胞和空间异质性无法通过整体分析揭示,显示了13C-SpaceM方法的独特优势。图6. 细胞ACLY敲降后acetyl-CoA的同位素标记程度分析(点击查看大图)05肿瘤组学中氨基酸合成异质性的空间组学分析研究人员分析了从横向植入表达突变型异柠檬酸脱氢酶(IDH)和红色荧光蛋白(RFP)的GL261胶质瘤细胞的小鼠大脑组织切片。在采集组织前的48小时,小鼠被喂食未标记的或含有U-13C葡萄糖的液体饮食。首先,研究人员分析了12C-葡萄糖饮食的肿瘤携带小鼠大脑切片中的酯化脂肪酸组成。通过比较质谱TIC与显微镜明场和荧光成像,发现整个大脑(包括肿瘤区域)的质谱离子响应很高(图7a)。测试过程中,肿瘤区域与组织切片的其余部分分别采用10μm和50μm激光分辨率进行分析。对不同脂肪酸的空间分析揭示了在非肿瘤携带的脑半球组织中,脂肪酸丰度存在高度的异质性,我们可以仅根据它们的脂肪酸组成来识别的某些结构,如胼胝体和前连合部,这两个区域都富含油酸(18:1)且棕榈酸(16:0)、硬脂酸(18:0)和花生四烯酸(20:4)的含量低。有趣的是,尽管棕榈酸、油酸、硬脂酸和花生四烯酸在肿瘤和周围的大脑组织中的含量相似,肉豆蔻酸(14:0)和棕榈酸(16:1)在肿瘤组织中则明显增加。与大脑其它部分相比,肿瘤中必需脂肪酸亚麻油酸(18:2)和α/γ亚麻酸(18:3)也明显增高。之后,研究人员分析了喂食含有U-13C葡萄糖饮食的小鼠肿瘤组织,从肿瘤组织中选择性分离出的5种主要从头合成的脂肪酸的同位素分布(图7c)。三种饱和脂肪酸肉豆蔻酸(14:0)、棕榈酸(16:0)和硬脂酸(18:0)的13C摄入丰度较高,同位素分布最大分别可至M+10,M+12和M+14。其中,肉豆蔻酸M+0的强度极低,几乎完全源自脂肪酸从头合成。由于肉豆蔻酸对一些重要信号蛋白的翻译后修饰很重要,这一发现表明胶质瘤可能选择性地上调肉豆蔻酸的合成以促进自身生长。相比之下,两种单不饱和脂肪酸,棕榈酸(16:1)和油酸(18:1)的M+0同位素的相对丰度较高。硬脂酸和油酸的M+2同位素丰度明显增加,表明它们是由未标记的前体(即棕榈酸和棕榈酸)延长形成的。研究人员进一步利用棕榈酸的同位素分布计算acetyl-CoA池中源自葡萄糖的比例,发现肿瘤组织内的该比例同样具有显著的空间异质性(图7d)。图7. 小鼠脑胶质瘤组织内部脂肪酸代谢空间异质性分析(点击查看大图)总结本文作者开发了一种全新的单细胞代谢流成像检测方法,将超高激光分辨率的大气压MALDI与高分辨率、高灵敏度的质谱检测器相结合,对细胞和肿瘤组织内的葡萄糖依赖性脂肪酸从头合成途径实现单细胞层面的空间分析。不仅为单细胞水平空间探测代谢活动提供了新的方法,还为正常和癌症组织中的脂肪酸摄取、合成和修饰分析提供了前所未有的视角。参考文献:1. Buglakova E, Ekelö f M, Schwaiger-Haber M, et al. 13C-SpaceM: Spatial single-cell isotope tracing reveals heterogeneity of de novo fatty acid synthesis in cancer. Preprint. bioRxiv. 2024 2023.08.18.553810. Published 2024 Feb 28. doi:10.1101/2023.08.18.5538102. Rö hrig F, Schulze A. The multifaceted roles of fatty acid synthesis in cancer. Nat Rev Cancer. 2016 16(11):732-749. doi:10.1038/nrc.2016.893. Metallo CM, Gameiro PA, Bell EL, et al. Reductive glutamine metabolism by IDH1 mediates lipogenesis under hypoxia. Nature. 2011 481(7381):380-384. Published 2011 Nov 20. doi:10.1038/nature106024. Wise DR, Ward PS, Shay JE, et al. Hypoxia promotes isocitrate dehydrogenase-dependent carboxylation of α-ketoglutarate to citrate to support cell growth and viability. Proc Natl Acad Sci U S A. 2011 108(49):19611-19616. doi:10.1073/pnas.11177731085. Kamphorst JJ, Chung MK, Fan J, Rabinowitz JD. Quantitative analysis of acetyl-CoA production in hypoxic cancer cells reveals substantial contribution from acetate. Cancer Metab. 2014 2:23. Published 2014 Dec 11. doi:10.1186/2049-3002-2-236. Schug ZT, Peck B, Jones DT, et al. Acetyl-CoA synthetase 2 promotes acetate utilization and maintains cancer cell growth under metabolic stress. Cancer Cell. 2015 27(1):57-71. doi:10.1016/j.ccell.2014.12.002如需合作转载本文,请文末留言。
  • 单细胞分析技术研究呈“井喷”式增长
    学理工的人大概都有这样的感觉,很多规律和现象都可以用理论、公式或算法来描述及推导。只要知道了所有的条件,便能预测结果。反过来,也可以通过现象反推关键的成因。久而久之,我们也习惯并爱上了这样逻辑清晰、条理分明的世界。以至于我们时常因为意外的结果徒然而叹,也为寻找到那孜孜以求的&ldquo 理&rdquo 而欢欣鼓舞。抛开现实里的林林总总,理工男女的生活可以很简单&mdash &mdash 以&ldquo 理&rdquo 立身,有&ldquo 理&rdquo 走遍天下,无&ldquo 理&rdquo 无地容身。这样的准则对某些人来说甚至可以上升到人生哲学的高度&mdash &mdash 直到他们遇上了生物学。  相比数理化,生命科学相当&ldquo 后进&rdquo 。在数理化已经发展到有相当完整的理论体系的今天,生物学,尤其是分子生物学可谓是才刚刚起步。&ldquo 不幸的&rdquo 生物工作者还处于认知的原始积累阶段。我们研究的几乎每一个对象,每一种方法,大概还没有可以宣称已经研究透彻的例子&mdash &mdash 即使对象是简单如病毒这样连生命都算不上的活性大分子。实验不能重复,现象无法解释这样的事在生物实验室里是家常便饭。许多人都遇到过PCR扩增失败,或电泳多出一条带这样的事。多数选择再做一次看看,而不是寻根究底。因为整个系统太复杂、变量太多太多了。     系统的复杂程度太高是一方面,另外一个原因是研究手段的局限(当然还有更多客观原因,非本文主旨所以省略)。微观世界的研究手段的升级依赖于其他科学门类的进步,对手段的依赖必然导致方法论的单调。在分子和细胞生物学领域,许多人习惯用宏观思维去理解微观世界,比如重视群体现象而忽视个体差异,用一群相关的细胞代替一个系统。而对一个复杂的系统用笼统的手段进行研究,得出的结论自然是粗浅的。  虽然没人做过统计,但据估计至少95%以上的现代生物学研究成果是建立在对细胞群体的研究基础上。忽略细胞异质性(Cellular Heterogeneity)的方法固然降低了系统的复杂度,简化了流程。其带来的生物信息不可逆的丢失也是显而易见的。这种平均化的方法必然导致信息的稀释或丢失,在某些情况下甚至会让人得出矛盾的结论。另外,该方法让发现并分离细胞群体中的&ldquo 异类&rdquo 的尝试变得难上加难。如此,只有强信号才有可能被检测到。而这不仅让以往科学家们的努力有了不过是摘取了低处枝条上果实的意味,也让部分成果的准确性打上了问号。  单细胞分析技术正是解决上述问题的方法,其中最引人注目的是单细胞测序技术(Single-Cell Sequencing)。然而,细胞异质的不确定性导致需要同时分析很多单细胞以消除小量样品可能带来的偏差,而这直接和实验可行性挂钩。幸运的是,由于技术的进步和费用的降低,单细胞测序技术近年来已得到迅速推广。通过对单个细胞的逐个测序,信息的精度、深度,以及信息量可获得几何级数的增长,随之带来的是我们对具体对象更加翔实和准确的了解。而且,通过数学方法,高度相关的细胞可以被整合起来当作亚群体处理以部分消除单个细胞的随机异质性,或者按相关性重排以构建全新的不依赖于传统时间轴的图谱。这些新手段已经给我们带来了一些前所未有的认知。那些前沿科学家们所取得的成就,同时也刺激着更多的人加入他们的行列,形成了正反馈。  近年来,单细胞测序逐渐大众化,相关的论文发表数量在2010年后呈指数增长之势,在高品质期刊上发表的单细胞研究成果屡见不鲜。其产生的影响深远,以致Nature Methods将单细胞测序选为2013年度重大技术,并在2014年首刊专述。在后面的文章中我将会挑选几篇有代表性的文章谈谈它们的意义。有意思的是,二代测序技术已经在2007年当选Nature的年度重大技术。单细胞研究的流行无疑让它的使用拓展到了更广阔的领域。  单细胞研究不仅在DNA和RNA测序方面取得了极大的进展,单细胞质谱分析(Mass Cytometry)也正在逐渐得到更多的关注。该技术用带有重金属原子标记的单克隆抗体对细胞表面和细胞内的关键蛋白进行标记,然后依次等离子化细胞,通过质谱分离重金属原子并分析其丰度来获取相应蛋白在各细胞内的表达情况。该技术也叫质谱流式细胞技术,相比荧光流式细胞技术,其主要特点是背景低、通道互扰小,所以可以同时分析更多的蛋白质。如今可用的重金属标记已达35种,这是基于荧光的检测手段无法企及的(最新的荧光流式技术可一次检测16-18种蛋白)。该技术可以一次分析百万量级的单细胞,而且没有理论上限,超出单细胞测序几个数量级。因此可以用来构建非常详细的细胞关联图,尤其适合分析高复杂度的系统,比如血液中的细胞。另一方面,单细胞质谱无法像测序那样对全基因组进行分析,但是由于它是直接对细胞的功能的执行者&mdash &mdash 蛋白质进行解析,跳过了对细胞内各种基因表达调控机制的考量,其意义是非常明显的。  此外,单细胞测序技术让微流控芯片技术(Microfluidics)得到了发展。除了在制备单细胞测序文库方面具有优势以外,该技术在其他领域内的应用也得到了拓展,如在微流控环境中进行细胞培养。该方法可将少数细胞分离到纳升级(nL)的独立单元中分别培养并进行定向引导,然后可以立即利用微流控系统制备测序文库。在干细胞研究以及生物制药领域,该技术应该有着广阔的应用前景。  在单个细胞层面的研究近年来经历了井喷式的增长。然而,其应用主要体现在基础研究中。目前临床上唯一被使用的单细胞检测法是胚胎植入前遗传学诊断(PGD, Preimplantation Genetic Diagnosis)。循环肿瘤细胞(CTCs, Circulating Tumor Cells)虽然在定义上是存在于循环系统中的极少量单个细胞,临床上仍然是先富集然后进行整体分析。对单个CTC进行分析的必要性已有探讨,但开发出相应的技术并在临床上被接受还有一段路要走。
  • 多组分时空分析:走进单细胞的“社会”
    p style="text-indent: 2em "1952年,美国细胞生物学家威尔逊曾提出,“一切生命的关键问题都要到细胞中去寻找答案。”纵观近50年来荣获诺贝尔奖生理学或医学奖和化学奖的重大突破,70多个都与细胞生物学密切相关。/pp style="text-align: center text-indent: 2em "img title="20197282317511500.jpg" style="max-height: 100% max-width: 100% " alt="20197282317511500.jpg" src="https://img1.17img.cn/17img/images/201907/uepic/8e8f4b00-dde2-40b2-8c13-4213c687f8ec.jpg"//pp style="text-align: center text-indent: 0em "span id="_baidu_bookmark_start_182" style="line-height: 0px display: none "?/span研究团队进行相关实验/pp style="text-align: center text-indent: 0em "图片来源于网络/pp style="text-indent: 2em "作为研究细胞生命活动规律的科学,细胞生物学在科学家的显微镜下经历了近180年的历史,但细胞对人类来说依然是“黑箱”一般的存在。如今,研究人员正在尽力通过对单个细胞进行研究来阐明细胞的“天性”。/pp style="text-indent: 2em "自2014年起,在国家自然科学基金重大项目“单细胞多组分时空分析”支持下,中国科学家在有关单细胞生物学的重大科学问题上取得了一系列进展。/pp style="text-indent: 2em "span style="color: rgb(255, 0, 0) "strong没有两个细胞是完全相同的/strong/span/pp style="text-indent: 2em "如果把细胞环境比作一个社会,每个细胞就是一个独立的人。/pp style="text-indent: 2em "在对人类社会的研究中,不仅个体的特征和行为值得关注,研究所处环境中个体之间相互协调或对抗作用等关系以及群体所产生的集体行为,也相当重要。细胞研究亦是如此。/pp style="text-indent: 2em "多年来,通过对细胞的研究,科学家已经对生命体的生长发育、遗传变异、认知与行为、进化与适应性等若干生命科学问题有了较为清晰的认识。不过,在清华大学副教授陆跃翔看来,这些还远远不够。/pp style="text-indent: 2em "“在之前的研究中,科学家探索出细胞新陈代谢、生命运动过程中的各种表征方法,如蛋白表达分析、基因转录检测(反转录PCR)等,这些方法更多的是在大样本的细胞中进行观察与测量后,得到一个平均结果。”陆跃翔解释到。/pp style="text-indent: 2em "然而,没有两个细胞是完全相同的。这些平均结果掩盖了细胞之间微小的差异,这些差异可能在某些关键生命过程如细胞分化、肿瘤的发展过程中起着决定性作用。/pp style="text-indent: 2em "为了获取细胞生理状态和过程中更准确、更全面的信息,科研人员将目光瞄准单个细胞。/pp style="text-indent: 2em "“单细胞内部的生命活动,可以被认为是生物活性分子之间复杂的化学反应的结果,正是这些分子的时空分布、结构、功能及其相互作用方式,决定了细胞增殖、分化、凋亡以及重大疾病发生、发展、迁移等过程。”陆跃翔分析道。/pp style="text-indent: 2em "但是想要研究这些生物活性分子形成的精密复杂的相互作用和调控网络并非易事。它不仅要求科学家了解其化学成分,更要理解它们之间相互作用的复杂过程,以及在细胞内部细胞器中特定位置的作用区域和时空变化。/pp style="text-indent: 2em "strong2014年,国家自然科学基金委员会发布重大项目“单细胞多组分时空分析”申请指南,/strong清华大学化学系教授张新荣组织的研究团队的申请获批。他们凝练出strong荧光探针制备与合成、新型时空分辨成像方法以及在细胞内生物分子相互作用/strong研究等关键科学问题。/pp style="text-indent: 2em "“我们希望发展建立适于单细胞中多种生物活性分子时空分辨的荧光分析新方法,驱动生命科学和基础与临床医学研究进步。”谈及科学目标,张新荣如是说。/pp style="text-indent: 2em "span style="color: rgb(255, 0, 0) "strong新技术带你深入了解“社会”/strong/span/pp style="text-indent: 2em "如何实现这一目标?在张新荣看来,这需要从单细胞中多组分分子的时空信息获取方法出发。为此,项目组将其分为“荧光探针制备与合成”“新型时空分辨成像方法”以及“细胞内生物分子相互作用”三大方向进行攻关。/pp style="text-indent: 2em "strong要了解细胞这个独特的“社会”,首先需要的是一台可以钻进细胞内部获取关键分子信息的“放大镜”。因此,荧光探针制备与合成至关重要。/strong/pp style="text-indent: 2em "针对单细胞中极低含量分子检测问题,山东师范大学教授唐波课题组综合运用共轭聚合物信号放大、无光源激发、光谱红移、核酸杂交链式放大等技术,构建了若干超灵敏的分子与纳米荧光探针,实现了细胞及活体中某些活性分子浓度皮摩尔水平的原位、动态检测。/pp style="text-indent: 2em "同时,细胞中生理过程的发生和发展往往不是一类分子的孤立事件,涉及到多种分子的参与。因此课题组还开发了一系列的两组分、三组分和四组分同时检测的荧光探针,并设计了多模态探针来获取更丰富的成像信息。/pp style="text-indent: 2em "“本项目的一个重要特色工作是时任中国科学院上海应用物理研究所研究员樊春海课题组基于框架核酸构建的多组分分析探针和成像方法。”张新荣介绍,框架核酸是一类人工设计的结构核酸,具有尺寸精确、结构精确、修饰精确的特点,通过精确的化学修饰,可以将多种小分子及大分子探针负载到框架核酸上,实现多组分探针的可控构建。/pp style="text-indent: 2em "不过,实现探针在亚细胞区域内对胞内生物活性分子的精确定位和实时检测可并不那么容易。/pp style="text-indent: 2em "“细胞核内分子密度大且背景荧光特别高,导致人们对单分子的观察非常困难。传统光学显微成像分辨率,不足以解析染色体DNA的构造。”陆跃翔告诉记者,尤其在超高空间分辨率的前提下,要实现持续的动态观察,对荧光探针和成像方法都提出了更大的挑战。/pp style="text-indent: 2em "在活细胞超分辨成像方面,北京大学生物动态光学成像中心研究员孙育杰课题组研发了高性能探针Gmars-Q,使其在光照时进入暗态,从而延长成像时长,比已有最好探针的活细胞超分辨成像时间长一个数量级,这种超高分辨成像技术实现了纳米尺度的活细胞核内动态观测。/pp style="text-indent: 2em "“Gmars-Q的独特机制打开了基于蛋白结构和动力学优化荧光蛋白的设计策略。”德国卡尔斯鲁厄理工学院教授Gerd Ulrich Nienhaus曾对此给予高度评价。/pp style="text-indent: 2em "strong在现代分析化学的发展中,大科学装置的应用也越来越受到科学家的重视。/strong/pp style="text-indent: 2em "依托中国科学院高能物理研究所和中国科学院上海应用物理研究所的两台strong同步辐射光源,/strong樊春海课题组和中国科学院高能物理研究所研究员高学云课题组开展了strong同步辐射X射线细胞成像方法/strong的研究。/pp style="text-indent: 2em "实验团队通过搭建X射线全场三维成像平台,合成了一系列X射线成像探针,发展了细胞成像算法,实现了单细胞的X射线三维成像。为了应对单一技术无法在高分辨率下同时实现细胞的结构与功能定位的挑战,课题组又发展了X射线与超分辨荧光联用技术,实现了在纳米分辨下的细胞结构与功能融合成像的突破。/pp style="text-indent: 2em "已有研究发现DNA不仅有序列信息,还有三维结构信息。基于此,北京大学教授、中国科学院外籍院士谢晓亮课题组通过对sgRNA改造,开发了一种全新的活细胞染色质DNA的多色、稳定标记系统,实现对活细胞内基因位点的长时间连续观察追踪。/pp style="text-indent: 2em "2018年,该重大项目迎来一项重磅突破。谢晓亮课题组在《科学》上发表文章,介绍他们在单细胞水平研究双倍体哺乳动物细胞的基因组结构研究方面取得的成果。利用新发展的Dip-C技术,项目组构建了人源双倍体细胞的具有高空间分辨率的单细胞基因组三维结构。/pp style="text-indent: 2em "“这种结构分型对研究细胞功能有着至关重要的作用,也为唐氏综合症等染色体非整倍体疾病提供了研究和干预手段。”谢晓亮说。/pp style="text-indent: 2em "strongspan style="color: rgb(255, 0, 0) "让基础研究走出实验室/span/strong/pp style="text-indent: 2em "对于细胞“社会”的深层解析,不仅为了阐明各种生命现象与本质,科学家更是希望据此对这些现象和规律加以控制和利用,以达到造福人类的目的。在该重大项目支持下,诸多研究展现出了良好的社会应用前景。/pp style="text-indent: 2em "“许多疾病的研究和治疗最终都必须回归细胞水平。”在张新荣看来,一系列单细胞多组分时空分析技术能够有效加深人们对生命现象的本质理解,也有助于了解疾病机理,进而促进生物医药科学和相关产业的发展。/pp style="text-indent: 2em "strong“项目研发的诊疗一体化功能纳米探针,为相关重大疾病成因、诊断提供表征手段和依据,对疾病的早期预警以及提高疾病治愈率有着重要意义。/strong”张新荣讲道,部分创制的探针已经进行了市场转化,基于探针建立的荧光成像技术也成为国家重大新药创制课题中药效评价的关键技术之一。/pp style="text-indent: 2em "例如,唐波课题组研究的“超高灵敏度—可逆探针”能够在活体水平上示踪炎症发生发展过程中超氧阴离子的浓度水平及动态变化过程,缩短了药物临床试验周期,提高了药物筛选效能。为即将进入临床Ⅱ、Ⅲ期的鼻敏胶囊、咳敏胶囊、结肠炎栓3个中药新品种的作用靶点、药效评价研究提供了技术支撑。/pp style="text-indent: 2em "而基于同步辐射装置的X射线细胞显微成像技术,分辨率很容易达到数十纳米,可以在大视场下实现完整细胞的纳米分辨无损成像,与荧光显微装置相比具有巨大优势,在细胞显微成像方面也展现出了巨大的应用前景。/pp style="text-indent: 2em "然而,对于人类来说,走进细胞“社会”是一个任重而道远的过程。还有无数未知的奥秘等着科学家去探索。/pp style="text-indent: 2em "张新荣表示,该重大项目成果为下一步融合多种分析方法、发展全器官跨尺度高灵敏三维成像提供了基础。/pp style="text-indent: 2em "“通过研发同步辐射X射线相衬—电镜融合成像,有可能在全脑三维微米精度地图引导下选取局部特征区域进行纳米精度的结构解析,大幅降低高精度神经网络解析的盲目性。在特定位点,也可利用荧光分子成像和质谱分子解析,进一步作功能研究。”项目组成员表示,在有关“社会”的探索与发现之旅上,中国科学家一直砥砺前行。/p
  • 北大教授开发单细胞全转录组测序新技术
    2014年4月29日,北京大学生物动态光学成像中心黄岩谊、汤富酬课题组在《美国科学院院刊》(PNAS)上发表题为&ldquo Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing&rdquo 的论文。该研究利用微流控芯片技术实现了高质量单细胞的全转录组测序样品准备,全面提高了单细胞全转录组分析的准确性和可靠性。  细胞是生命活动的基本功能单位,而在生物体内没有任何两个细胞是完全相同的。传统的生命科学与医学研究,绝大多数情况下都是针对混合的大量细胞进行的,无法观察到单个细胞之间细微的差别。近年来不断发展的实验技术,提供了更加定量与客观的证据,表明在许多关键生命过程例如胚胎发育、细胞分化、疾病发生与发展等过程中,特定的单个细胞行为,以及其间的个体化差异与异质性,导致了极其重要甚至是决定性的结果。而之前基于大量细胞平均测量所获得的结果并无法正确反映复杂生物体系的全面真实信息,严重掩盖了独立个体样本的行为以及生命现象中大量存在的随机行为。针对单个细胞的研究,是细胞生命分析技术所追求的极限状态,是对传统技术极大的挑战。  单细胞测序利用新一代的测序技术来分析单个细胞内的基因信息,成为解读单细胞的最佳工具。单细胞全转录组测序是单细胞高通量测序需求量最大的应用,它所测定的是单个细胞内所有基因的表达量,同时还可以测定除了mRNA分子外,其他长非编码RNA(lncRNA)以及小RNA的含量,定量获取单个细胞完整的表达谱。目前采用的新一代测序技术中,绝大多数方法都需要特定的前处理过程,制备&ldquo 测序文库&rdquo 。而针对单细胞样品,已有的方法均存在很多缺陷,导致检测灵敏度不高、基因表达信息丢失严重、技术噪音高、操作失误率高、重复性差。  为了解决这一矛盾,两个课题组合作开发了新的文库制备方法,将最关键的单细胞转录组文库构建步骤集成在一个微流控芯片上,可以同时进行多个样品的操作。这一技术的开发,大大减少了试剂用量,在反应效率得到提升的同时极大地抑制了污染的发生,还减少了操作误差,实现了更高的可靠性和更好的平行性。  通过对几十个细胞的分析表明,这一方法可以有效地消除转录组高度动态特性所带来的测量差异,实现对单细胞异质性的分析和判断。通过多个细胞较低深度的转录组测序,可以获取比同等成本下单个细胞高深度测序更重要的细胞异质性信息,而更好地展现生物体系的复杂性、随机性和动态过程。而通过微流控芯片上的精确细胞操控和主动俘获过程,还可以摆脱其他类似方法中随机俘获的局限性,实现对极其少量细胞的完全俘获和反应前的表型观察,以更好地理解和验证单个细胞的异质性。与已有的技术相比,这一工作展示了目前最好的单细胞转录组测序检测灵敏度和平行性。  黄岩谊博士同时任北京大学工学院教授,汤富酬博士同时任北京大学生命科学学院研究员。黄岩谊组博士后Aaron Streets博士、赵亮博士和研究生张先念为论文的主要作者。这一工作得到了国家科技部973计划、863计划、国家自然科学基金委及霍英东教育基金会的资助。
  • 微生物所开发出新型微滴反应筛选技术及单细胞分析应用
    p style="text-indent: 2em "微生物所strong微生物资源前期开发国家重点实验室/strong杜文斌研究组和黄力研究组共同开发了一种新型的strong微流控界面纳升注射技术/strong(Interfacial Nanoinjection, INJ),该技术可以将传统的生化反应体系微缩在一个纳升体积的油包水微液滴体系中完成。/pp  strongspan style="color: rgb(0, 112, 192) "界面纳升注射(INJ)具有诸多显著优势/span/strong/pp  针对这一技术创新,团队申请了多项中国发明专利和美国专利,并研制了基于INJ技术的小型桌面系统。/pp style="text-align: center"img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201910/uepic/fe470173-c411-4a4f-857f-952adad6e8d5.jpg" title="界面纳升注射(INJ)系统.jpg" alt="界面纳升注射(INJ)系统.jpg"//pp style="text-align: center "界面纳升注射(INJ)系统/pp  该系统和国外同类产品如美国Labcyte公司的Echo超声纳升移液系统、以及美国TTP Labtech公司的mosquito HTS微量筛选系统相比,strong在仪器成本、耗材成本、最小液滴体积、流式细胞仪兼容性、操作的灵活性、以及污染控制等方面,均具有显著优势,/strong适用于各类单细胞微体积反应分析,也可应用于其他微体积反应分析,在微生物培养筛选、合成生物学、药物筛选、蛋白结晶条件筛选等方面均具有应用潜力。/pp  在性能方面,INJ系统通过高精密度的微体积控制实现不同试剂组分的纳升体积分步添加,兼容96和384孔板,可以在预先填装矿物油的孔板上,按照程序设定加入纳升样品或试剂液滴,用于实现高通量筛选。利用低成本探针可以精确加注的最小体积达到1 nL,当加样体积为5 nL时,体积标准偏差小于11 %。加注的液滴通过离心可以沉降到孔板底部并融合,液滴的融合效率最高,达到99%以上。利用多次加注样品、试剂的方法,可以实现多步反应和浓度梯度配置。系统加注的体积精确性、线性和重现性良好。/pp strongspan style="color: rgb(0, 112, 192) " FACS-INJ单细胞分析流程和应用/span/strong/pp style="text-align: center"img style="max-width: 100% max-height: 100% width: 600px height: 281px " src="https://img1.17img.cn/17img/images/201910/uepic/7cc806a5-55aa-475f-a110-69b3c5038b70.jpg" title="杜文斌-流式细胞分选+界面纳升注射技术图示.jpg" alt="杜文斌-流式细胞分选+界面纳升注射技术图示.jpg" width="600" height="281" border="0" vspace="0"//pp style="text-align: center "span style="text-align: center "FACS-INJ单细胞分选分析流程/span/pp  strong单细胞分析是一项变革性技术/strong,在单细胞基因组异质性研究及复杂微生物群落中稀有微生物种群多样性研究等领域应用广泛。然而,如何进一步降低单细胞分析的成本,提高可靠性和效率,仍然面临重大挑战。流式细胞荧光激活细胞分选(FACS)是目前最高效的单细胞分选技术,可实现病毒、细菌、真菌和动物细胞的多参数检测和分选 利用荧光标记,可对不同类型的细胞进行有效的区分,分选成功率高。研究团队将INJ与FACS平台相结合,建立了FACS-INJ单细胞分选分析流程,应用覆盖了单细胞表型分析、基因型分析、基因表达分析以及全基因组扩增测序。/pp  研究团队首先利用FACS-INJ系统实现了strong病原菌微生物单细胞耐药基因的PCR筛查和单细胞药敏表型筛查/strong。经优化,多孔板可预先装载纳升体积的PCR引物或不同浓度的抗生素液滴。PCR筛查体积缩小到500 nL,试剂消耗和成本和常规体系相比降低至原先的1/40,耐药检测的体积控制在200 nL,试剂消耗和成本和常规体系相比降低至原先的1/1000,时间从 12小时缩短至5小时,这对于大幅降低临床病原检测的成本,实现脑脊液、房水等难获取微量样品的耐药基因和表型筛查具有重要意义。/pp  其次,FACS-INJ系统还可用于strong动物细胞的单细胞基因表达分析/strong。以小鼠巨噬细胞RAW264.7在细菌胞外多糖处理前后的炎症反应为例,通过荧光激活流单细胞式分选处理前后的小鼠巨噬细胞,基于一步法反转录实时荧光PCR扩增,在单细胞水平解析了次黄嘌呤鸟嘌呤转磷酸核糖基酶(HPRT)基因(看家基因)和白介素1β(IL-1β)基因(炎症反应)表达水平的变化。/pp  最后,团队与北京大学黄岩谊课题组合作,建立了strong基于FACS-INJ的微生物全基因组扩增测序流程/strong,以获得未培养微生物的全基因组信息。流程包括流式分选微生物单细胞、单细胞裂解、酸碱中和、MDA扩增和建库测序。以热泉来源的古菌硫化叶菌(Sulfolobus sp. A20)菌株为模型,将单细胞扩增的体积优化至360nL,硫化叶菌全基因组覆盖度达到80%以上。在纳升级微液滴中实现西南印度洋未培养单细胞微生物全基因组DNA的MDA扩增与测序,拼接后获得15个单细胞基因组,大小在0.1~3.7Mb大小。该方法获得的微生物基因组污染度较传统的MDA扩增方法显著降低( 5%),显著提高了微生物单细胞基因组数据质量。平台也适用于肿瘤、胚胎等动物细胞的全基因组扩增测序,对肿瘤细胞的单细胞测序的覆盖度达到60-80%。/pp  上述研究工作近期作为特邀论文在线发表在Small上。微生物研究所助理研究员贠娟莉博士、郑小伟博士、徐鹏博士为论文共同第一作者,杜文斌研究员、黄力研究员和北京大学黄岩谊教授为论文共同通讯作者。该研究该研究得到了中国大洋协会大洋十三五重点项目、中科院战略性先导科技专项(B类),中国科学院重点部署项目、中国科学院前沿科学重点研究项目、国家自然科学基金面上项目和优青项目等支持。/pp  论文出处:/pp  Yun, J.L.sup#/sup Zheng, X.W.sup#/sup Xu. P.sup#/sup Zheng, X. Xu, J.Y. Cao, C. Fu, Y.S. Xu, B.X. Dai, X. Wang, Y. Liu, H.T. Yi, Q.L. Zhu, Y.X. Wang, J. Wang, L. Dong, Z.Y. Huang, L.* Huang, Y.Y.* Du, W.B.* Interfacial Nanoinjection-based Nanoliter Single-cell Analysis, Small, 2019, doi:10.1002/smll.201903739./pp  a href="https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/smll.201903739" target="_self" style="text-decoration: underline font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai color: rgb(255, 0, 0) "strongspan style="font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai color: rgb(255, 0, 0) "查看原文戳这里/span/strong/a/pp  strongspan style="font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai "杜文斌/span/strongspan style="font-family: 楷体, 楷体_GB2312, SimKai ",男,中科院微生物研究所研究员。2007年于浙江大学化学系,获博士学位。2007-2011年于美国芝加哥大学化学系从事博士后研究工作。2013年11月加入中科院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室。主要从事微流控芯片技术及新型分析微生物技术与应用研究。已发表论文60余篇,申请中国和美国专利30余项,授权20多项。主持国家优秀青年科学基金项目,国家重点研发计划 “数字诊疗装备研发”项目,中国科学院前沿科学重点研究项目等。/span/p
  • 流式研发快讯|实时阻抗流式细胞分析仪研究取得进展
    实时阻抗流式细胞分析仪(piRT-IFC)研发进展单细胞电学特性生物传感与分析技术为单细胞生物物理学研究提供了新维度。该技术已被证明在全血分析、肿瘤细胞分型和免疫细胞状态评估方面具有重要的应用潜力。然而,现有的电学检测方法难以实现高通量实时性分析,限制了需要大量系统实验的单细胞电学特性研究的开展。 近日,中国科学院微电子研究所健康电子中心研究员黄成军、副研究员赵阳团队,在单细胞电学特性流式分析方法及高通量实时分析仪器研究方面取得重要进展。该团队提出了快速并行物理拟合求解器,仅需0.62 毫秒即可在线求解出单个细胞膜比电容和细胞质电导率。与传统求解器相比,在不损失准确度的前提下,速度提升了27000倍,且不需要任何数据预采集和预训练过程,进一步实现了基于物理模型信息的实时阻抗流式细胞分析仪(piRT-IFC)(图1)。该技术可在50分钟内实时表征高达100902个单细胞,具有高稳定性、高通量、实时化和全流程自动化等特点。作为示范应用,该团队对药物处理后HL-60中性粒细胞脱粒现象这一典型的快速变化的生物过程进行实时表征分析。与普遍采用的神经网络辅助加速方法对比研究表明,piRT-IFC具有速度快、准确度高和泛化能力强的优势,具备广泛的应用潜力。 相关研究成果以piRT-IFC: Physics-informed real-time impedance flow cytometry for the characterization of cellular intrinsic electrical properties为题,发表在《微系统与纳米工程》(Microsystem and Nanoengineering)上。该研究由微电子所和计算技术研究所合作完成。研究工作得到科学技术部、国家自然科学基金委员会、北京市和中国科学院的支持。近年来,该课题组面对单细胞物理特性检测存在敏感机理不明和技术实现困难等关键技术瓶颈,开创性提出了基于微流控技术的“交叉压缩通道”敏感新原理和单细胞电学模型,建立了基于微流控芯片的单细胞电学特性高通量定量检测方法,检测参数包括细胞膜比电容和胞浆电导率,通量比膜片钳等常规方法高10000倍,并进一步研发出实时高通量单细胞电学特性流式分析仪(图2)。仪器入选中国科学院自主研制科学仪器名录,与首都医科大学宣武医院、首都医科大学附属北京胸科医院、计算所等单位合作,成功用于脑卒中动物模型、癌症病人样本、药物模型等领域的多种细胞的分析,为肿瘤/脑卒中等精准诊断、药物筛选等提供了有力工具,并发现了新型标志物,验证了相关药物候选分子的作用、获得授权专利。论文链接 图1. 实时阻抗流式细胞分析仪(piRT-IFC)原理样机、核心微流控芯片、设备交互界面、典型结果和自动化实时数据处理流程 图2. 基于微流控芯片技术的单细胞电学特性活体单细胞分析仪(左)及核心微流控芯片(右)
  • 快讯:伯乐收购单细胞分析公司Celsee
    p  strong仪器信息网讯/strong Bio-Rad(伯乐)周四表示,已经收购了位于密歇根州安娜堡的Celsee,一家提供用于分离、检测和分析单细胞仪器与消耗品的供应商。/pp  收购的财务条款没有披露。/pp  Celsee公司的Genesis系统为科学家提供了一种强大、灵活且可扩展的方式,让他们能够分析和解释细胞行为,并收集以往无法检测的细胞关键信息。此系统可应用在蛋白质组学、免疫监测(替代流式细胞仪)以及新一代测序文库制备。/pp  Genesis系统采用的是一种专利技术。利用重力和Celsingle™ 微量分析玻片,它能够温和地捕获和分离单细胞,同时保持细胞活力和结构完整性,而不用担心微流体或分液装置引起的细胞应激。据介绍,Genesis流程可达到 70%的捕获效率,且灵敏度高于其他的单细胞分析技术,玻片可容纳多达100万个细胞分离微孔。/pp style="text-align: center"img style="max-width:100% max-height:100% " src="https://img1.17img.cn/17img/images/202004/uepic/5e15c56c-a675-4a0a-8ba6-aac1a4fd4028.jpg" title="微信图片_20200410005113_副本.jpg" alt="微信图片_20200410005113_副本.jpg"//pp  Celsee公司目前正卷入10x Genomics的专利诉讼中,后者在美国特拉华州地方法院对Celsee提出专利侵权、不正当竞争、虚假广告及相关索赔。 3月下旬,Celsee提出了答复,并对10x Genomics的第二次修订投诉提出反诉。/pp  同时,总部位于加利福尼亚州赫拉克勒斯的伯乐也参与涉及10x Genomics的多项专利诉讼。/p
  • 复旦大学186.67万元采购流式细胞仪,单细胞分析仪
    详细信息 复旦大学流式细胞分选仪国际公开重新招标公告 上海市-杨浦区 状态:公告 更新时间: 2022-11-12 复旦大学流式细胞分选仪国际公开重新招标公告 2022年11月12日 13:16 公告信息: 采购项目名称 复旦大学流式细胞分选仪 品目 货物/通用设备/仪器仪表/分析仪器/其他分析仪器 采购单位 复旦大学 行政区域 上海市 公告时间 2022年11月12日 13:16 获取招标文件时间 2022年11月12日至2022年11月18日每日上午:9:00 至 11:30 下午:13:30 至 16:00(北京时间,法定节假日除外) 招标文件售价 ¥0 获取招标文件的地点 上海市长寿路285号恒达大厦16楼 开标时间 2022年12月06日 09:00 开标地点 上海市长寿路285号恒达广场10楼开标室 预算金额 ¥186.670000万元(人民币) 联系人及联系方式: 项目联系人 许老师 项目联系电话 86-21-65641327 采购单位 复旦大学 采购单位地址 上海市杨浦区邯郸路220号 采购单位联系方式 许老师 86-21-65641327 代理机构名称 上海市机械设备成套(集团)有限公司 代理机构地址 上海市长寿路285号16楼 代理机构联系方式 张洁玮、沈飏 021-32557719;021-32557775 项目概况 复旦大学流式细胞分选仪 招标项目的潜在投标人应在上海市长寿路285号恒达大厦16楼获取招标文件,并于2022年12月06日 09点00分(北京时间)前递交投标文件。 一、项目基本情况 项目编号:1639-224122240333/02 项目名称:复旦大学流式细胞分选仪 预算金额:186.6700000 万元(人民币) 最高限价(如有):182.9300000 万元(人民币) 采购需求: 序号/ No. 货物名称/ Name of the goods 数量/Quantity 简要技术规格 /Main Technical Data * 交货期 / Delivery schedule 1 流式细胞分选仪 预算金额:人民币186.67万元 最高限价:人民币182.93万元 1套 最大液滴振荡频率:不低于52kHz; 合同签订后3个月货到复旦大学。(空运)/ DPU Fudan University within three months after signing the contact . 合同履行期限:合同签订后3个月货到复旦大学。 本项目( 不接受 )联合体投标。 二、申请人的资格要求: 1.满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定; 2.落实政府采购政策需满足的资格要求: 按商务部的《机电产品国际招标投标实施办法(试行)》等相关规定 3.本项目的特定资格要求:1)来自中华人民共和国或是与中华人民共和国有正常贸易往来的国家或地区(以下简称“合格来源国/地区”)的法人或其他组织 1) The legal persons or other organizations ivited from within the People’s Republic of China (hereinafter abb. as “PRC”) and all countries/areas which have regular trade relations with PRC (hereinafter called “the eligible source countries/areas”)2)投标人应为投标产品的制造商或其合法代理商,代理商投标应提供投标产品的制造商针对本项目的正式授权 2)The bidder shall be the manufacturer of the bidding products ,the agent tender must provide the cast product exclusive authorization letter issued by the producer for the project subject to tender 3) 投标人提供的投标机型应是原产地的全新产品;3) Provide bidders bidding models should be the origin of new products 三、获取招标文件 时间:2022年11月12日 至 2022年11月18日,每天上午9:00至11:30,下午13:30至16:00。(北京时间,法定节假日除外) 地点:上海市长寿路285号恒达大厦16楼 方式:有兴趣的潜在投标人写明申请项目的名称,提供报名单位名称、具体项目联系人的联系方式(姓名、手机、地址及邮箱)发送至邮箱13795281643@163.com,收到邮件回复后,请完整填写《购标书登记表》 售价:¥0.0 元,本公告包含的招标文件售价总和 四、提交投标文件截止时间、开标时间和地点 提交投标文件截止时间:2022年12月06日 09点00分(北京时间) 开标时间:2022年12月06日 09点00分(北京时间) 地点:上海市长寿路285号恒达广场10楼开标室 五、公告期限 自本公告发布之日起5个工作日。 六、其他补充事宜 项目编号:HW2022101907 本项目第一次公告因报名的供应商不足三家,现进行第二次采购 七、对本次招标提出询问,请按以下方式联系。 1.采购人信息 名 称:复旦大学 地址:上海市杨浦区邯郸路220号 联系方式:许老师 86-21-65641327 2.采购代理机构信息 名 称:上海市机械设备成套(集团)有限公司 地 址:上海市长寿路285号16楼 联系方式:张洁玮、沈飏 021-32557719;021-32557775 3.项目联系方式 项目联系人:许老师 电 话: 86-21-65641327 × 扫码打开掌上仪信通App 查看联系方式 基本信息 关键内容:流式细胞仪,单细胞分析仪 开标时间:2022-12-06 09:00 预算金额:186.67万元 采购单位:复旦大学 采购联系人:点击查看 采购联系方式:点击查看 招标代理机构:上海市机械设备成套(集团)有限公司 代理联系人:点击查看 代理联系方式:点击查看 详细信息 复旦大学流式细胞分选仪国际公开重新招标公告 上海市-杨浦区 状态:公告 更新时间: 2022-11-12 复旦大学流式细胞分选仪国际公开重新招标公告 2022年11月12日 13:16 公告信息: 采购项目名称 复旦大学流式细胞分选仪 品目 货物/通用设备/仪器仪表/分析仪器/其他分析仪器 采购单位 复旦大学 行政区域 上海市 公告时间 2022年11月12日 13:16 获取招标文件时间 2022年11月12日至2022年11月18日每日上午:9:00 至 11:30 下午:13:30 至 16:00(北京时间,法定节假日除外) 招标文件售价 ¥0 获取招标文件的地点 上海市长寿路285号恒达大厦16楼 开标时间 2022年12月06日 09:00 开标地点 上海市长寿路285号恒达广场10楼开标室 预算金额 ¥186.670000万元(人民币) 联系人及联系方式: 项目联系人 许老师 项目联系电话 86-21-65641327 采购单位 复旦大学 采购单位地址 上海市杨浦区邯郸路220号 采购单位联系方式 许老师 86-21-65641327 代理机构名称 上海市机械设备成套(集团)有限公司 代理机构地址 上海市长寿路285号16楼 代理机构联系方式 张洁玮、沈飏 021-32557719;021-32557775 项目概况 复旦大学流式细胞分选仪 招标项目的潜在投标人应在上海市长寿路285号恒达大厦16楼获取招标文件,并于2022年12月06日 09点00分(北京时间)前递交投标文件。 一、项目基本情况 项目编号:1639-224122240333/02 项目名称:复旦大学流式细胞分选仪 预算金额:186.6700000 万元(人民币) 最高限价(如有):182.9300000 万元(人民币) 采购需求: 序号/ No. 货物名称/ Name of the goods 数量/Quantity 简要技术规格 /Main Technical Data * 交货期 / Delivery schedule 1 流式细胞分选仪 预算金额:人民币186.67万元 最高限价:人民币182.93万元 1套 最大液滴振荡频率:不低于52kHz; 合同签订后3个月货到复旦大学。(空运)/ DPU Fudan University within three months after signing the contact . 合同履行期限:合同签订后3个月货到复旦大学。 本项目( 不接受 )联合体投标。 二、申请人的资格要求: 1.满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定; 2.落实政府采购政策需满足的资格要求: 按商务部的《机电产品国际招标投标实施办法(试行)》等相关规定 3.本项目的特定资格要求:1)来自中华人民共和国或是与中华人民共和国有正常贸易往来的国家或地区(以下简称“合格来源国/地区”)的法人或其他组织 1) The legal persons or other organizations ivited from within the People’s Republic of China (hereinafter abb. as “PRC”) and all countries/areas which have regular trade relations with PRC (hereinafter called “the eligible source countries/areas”)2)投标人应为投标产品的制造商或其合法代理商,代理商投标应提供投标产品的制造商针对本项目的正式授权 2)The bidder shall be the manufacturer of the bidding products ,the agent tender must provide the cast product exclusive authorization letter issued by the producer for the project subject to tender 3) 投标人提供的投标机型应是原产地的全新产品;3) Provide bidders bidding models should be the origin of new products 三、获取招标文件 时间:2022年11月12日 至 2022年11月18日,每天上午9:00至11:30,下午13:30至16:00。(北京时间,法定节假日除外) 地点:上海市长寿路285号恒达大厦16楼 方式:有兴趣的潜在投标人写明申请项目的名称,提供报名单位名称、具体项目联系人的联系方式(姓名、手机、地址及邮箱)发送至邮箱13795281643@163.com,收到邮件回复后,请完整填写《购标书登记表》 售价:¥0.0 元,本公告包含的招标文件售价总和 四、提交投标文件截止时间、开标时间和地点 提交投标文件截止时间:2022年12月06日 09点00分(北京时间) 开标时间:2022年12月06日 09点00分(北京时间) 地点:上海市长寿路285号恒达广场10楼开标室 五、公告期限 自本公告发布之日起5个工作日。 六、其他补充事宜 项目编号:HW2022101907 本项目第一次公告因报名的供应商不足三家,现进行第二次采购 七、对本次招标提出询问,请按以下方式联系。 1.采购人信息 名 称:复旦大学 地址:上海市杨浦区邯郸路220号 联系方式:许老师 86-21-65641327 2.采购代理机构信息 名 称:上海市机械设备成套(集团)有限公司 地 址:上海市长寿路285号16楼 联系方式:张洁玮、沈飏 021-32557719;021-32557775 3.项目联系方式 项目联系人:许老师 电 话: 86-21-65641327
  • BD推出全新细胞分析仪简化研究流程
    圣何塞市,加利福尼亚州(2011年5月20日)---美国BD公司(Becton,Dickinson and Company)全球三大业务部之一的生物科学事业部于今日正式推出了BD FACSVerseTM流式细胞仪---一款灵活、可靠并具有可升级性的流式细胞分析系统,该系统最高可分析多达10个参数并支持广泛的研究应用。  BD FACSVerseTM 流式细胞仪以及BD FACSuiteTM软件提供高达10参数分析的升级路径  “基于三大核心理念,我们将诸多创新的尖端科技融入到了BD FACSVerseTM系统中,赋予了它彻底的创新性。”BD生物科学事业部细胞分析业务总裁James Glasscock说。“首先,我们想要为研究者打造一款既能满足常规分析实验需要,同时又能兼顾复杂的多激光多色实验在结果精确性和重复性方面严苛要求的单一平台。其次,BD希望简化流式实验的操作流程,以内在的智能化特质赋予系统杰出的易用性。最后,BD希望提供给用户从6参数到10参数的灵活升级方案以最大限度的保护用户的每一分投入,同时配备多种选配模块以满足用户在未来不断提高的研究需求。”  BD FACSVerseTM流式细胞仪配备了全新的BD FACSuiteTM操作软件,现在用户可以自动化实现一些常规操作,例如:以最少的点击次数完成仪器的启动、设置、获取样本、数据分析的全过程。软件包的模块化架构使用户可以同时执行多项任务,并且在获取样本的同时也可同步进行数据分析。据Glasscock介绍,BD FACSuiteTM软件还引入了一项全新的操作范例:以前流式用户不得不每天不厌其烦的进行荧光补偿值的修正,特别是对多色分析实验而言荧光补偿值的修正是必须的,然而时至今日BD FACSuiteTM软件的推出彻底的改写了历史,从此流式用户再也无需每天对荧光补偿值进行反复的校正。BD FACSuiteTM软件使得assays和experiments的设置可以被直接输出并共享到全球任何一台其他的BD FACSVerseTM系统上面使用,最大程度地降低了不同仪器间及用户间的实验差异。  BD FACSVerseTM 流式细胞仪内在的智能性同时还减少了操作误差,提高了实验效率,并将实验流程自动化,最大程度的降低了人为干预的比例。典型特征如下:  基于真空负压的液流系统给予了上样过程最大的灵活性   全新的设置和质控范例概念消除了对标准荧光染料的日常补偿需要   仪器内部各个组件的智能创新特质将仪器操作大大简化并防止人为操作误差的发生   为了全面支持广泛的应用,BD FACSVerseTM系统还提供可选择的BD预置实验,这些实验涵盖了细胞凋亡,细胞周期,细胞增值以及细胞因子检测等诸多重要的研究应用,配合BD专业流式试剂和试剂盒可以获得高重复性的实验结果。该系统还同时支持客户自定义实验设置。研究者可以将他们的实验转换成可重复使用的实验模板,包含相关设置、样本获取和分析工作表以及圈门设置等。不仅如此,用户还可以通过建立报告参数来降低不同用户及实验室间同一应用的数据差异化。  BD FACSVerseTM流式细胞仪提供4色、6色及8色分析三种不同配置,配合前向角散射光和侧向角散射光最高可支持10参数分析。同时考虑到用户的未来升级可能,4色及6色分析配置还可以实现灵活的现场升级。同时BD FACSVerseTM小巧的紧凑的机身设计还非常适合标准实验台的放置要求。
  • 上海交通大学520.00万元采购流式细胞仪,单细胞分析仪
    详细信息 上海交通大学Bio-X研究院流式细胞分选仪器国际招标公开招标公告 上海市 状态:公告 更新时间: 2023-01-24 招标文件: 附件1 上海交通大学Bio-X研究院流式细胞分选仪器国际招标公开招标公告 2023年01月19日 12:21 公告信息: 采购项目名称 上海交通大学Bio-X研究院流式细胞分选仪器 品目 货物/专用设备/医疗设备/临床检验设备 采购单位 上海交通大学 行政区域 上海市 公告时间 2023年01月19日 12:21 获取招标文件时间 2023年01月19日至2023年01月31日每日上午:9:30 至 11:30 下午:13:00 至 16:00(北京时间,法定节假日除外) 招标文件售价 ¥500 获取招标文件的地点 上海市共和新路1301号D座二楼 开标时间 2023年02月09日 13:30 开标地点 上海市共和新路1301号D座二楼会议室 预算金额 ¥520.000000万元(人民币) 联系人及联系方式: 项目联系人 林佳文、吴乾清 项目联系电话 86-21-66271932、86-21-66272327 采购单位 上海交通大学 采购单位地址 上海市东川路800号 采购单位联系方式 陆老师 86-21-54744366 代理机构名称 上海中招招标有限公司 代理机构地址 上海市共和新路1301号D座二楼 代理机构联系方式 林佳文、吴乾清 电话:86-21-66271932、86-21-66272327,13764352603@163.com、18930181850@163.com 附件: 附件1 购买标书登记表(国际标).xlsx 项目概况 上海交通大学Bio-X研究院流式细胞分选仪器 招标项目的潜在投标人应在上海市共和新路1301号D座二楼获取招标文件,并于2023年02月09日 13点30分(北京时间)前递交投标文件。 一、项目基本情况 项目编号:0834-2341SH23A020/02 项目名称:上海交通大学Bio-X研究院流式细胞分选仪器 预算金额:520.0000000 万元(人民币) 最高限价(如有):520.0000000 万元(人民币) 采购需求: 序号 货物名称 数量 简要技术规格 交货期 交货地点 1 流式细胞分选仪器 2台 3.1 ★分选速度:不低于30000细胞/秒,且高速分选时无硬件丢失 (详见第八章) 签订合同后3个月内 关境外货物: CIP上海交通大学指定地点 关境内货物: DDP上海交通大学指定地点 合同履行期限:签订合同后3个月内 本项目( 不接受 )联合体投标。 二、申请人的资格要求: 1.满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定; 2.落实政府采购政策需满足的资格要求: 本项目为机电产品国际招标项目,相关法规与政策均按照《机电产品国际招标投标实施办法(试行)》执行。 3.本项目的特定资格要求:1)具有独立的法人资格,相应的经营范围;2)投标人是专业生产本次所需设备的制造商,或是制造商针对本项目唯一授权的代理商,须提供带有本项目编号且由制造商官方加盖公章的授权函(制造商区域授权函或长期授权函无效);3)投标人提供的投标机型应是原产地的全新产品;4)投标人必须在机电产品招标投标电子交易平台上注册,网址:http://www.chinabidding.com注册成功后还须通过网站的验证;5)不接受联合体投标;6)已购买本招标文件。 三、获取招标文件 时间:2023年01月19日 至 2023年01月31日,每天上午9:30至11:30,下午13:00至16:00。(北京时间,法定节假日除外) 地点:上海市共和新路1301号D座二楼 方式:详见其他补充事宜 售价:¥500.0 元,本公告包含的招标文件售价总和 四、提交投标文件截止时间、开标时间和地点 提交投标文件截止时间:2023年02月09日 13点30分(北京时间) 开标时间:2023年02月09日 13点30分(北京时间) 地点:上海市共和新路1301号D座二楼会议室 五、公告期限 自本公告发布之日起5个工作日。 六、其他补充事宜 有意向的投标人可从2023年1月19日起至2023年1月31日,每天(节假日除外)上午9:30时至下午16:00时(北京时间)至在上海中招招标有限公司购买招标文件,本招标文件每套售价为人民币500元或美元75,标书售后不退。决定参与本项目投标的供应商还须于投标截止时间前完成在上海交通大学数字化采购平台(https://pboffice.sjtu.edu.cn/)上的供应商注册及审核,请尽早办理,以免因资料审核时间而影响项目进度。 因疫情原因,本招标文件不现场发售,有意向购买的投标人将营业执照复印件、法人代表授权书、身份证复印件(以上材料须加盖公章)、汇款底单(须公对公)和开票信息发送至13764352603@163.com、18930181850@163.com,在邮件中注明项目名称、联系人和电话,经招标代理机构审核通过后购买招标文件。(购买标书登记表在附件内请填写好与相关报名资料一并发送至邮箱) 招标机构:上海中招招标有限公司开户银行(人民币):中国民生银行上海分行虹桥支行账号(人民币):0208014210004789摘要:0834-2341SH23A020/02 七、对本次招标提出询问,请按以下方式联系。 1.采购人信息 名 称:上海交通大学 地址:上海市东川路800号 联系方式:陆老师 86-21-54744366 2.采购代理机构信息 名 称:上海中招招标有限公司 地 址:上海市共和新路1301号D座二楼 联系方式:林佳文、吴乾清 电话:86-21-66271932、86-21-66272327,13764352603@163.com、18930181850@163.com 3.项目联系方式 项目联系人:林佳文、吴乾清 电 话: 86-21-66271932、86-21-66272327 × 扫码打开掌上仪信通App 查看联系方式 基本信息 关键内容:流式细胞仪,单细胞分析仪 开标时间:2023-02-09 13:30 预算金额:520.00万元 采购单位:上海交通大学 采购联系人:点击查看 采购联系方式:点击查看 招标代理机构:上海中招招标有限公司 代理联系人:点击查看 代理联系方式:点击查看 详细信息 上海交通大学Bio-X研究院流式细胞分选仪器国际招标公开招标公告 上海市 状态:公告 更新时间: 2023-01-24 招标文件: 附件1 上海交通大学Bio-X研究院流式细胞分选仪器国际招标公开招标公告 2023年01月19日 12:21 公告信息: 采购项目名称 上海交通大学Bio-X研究院流式细胞分选仪器 品目 货物/专用设备/医疗设备/临床检验设备 采购单位 上海交通大学 行政区域 上海市 公告时间 2023年01月19日 12:21 获取招标文件时间 2023年01月19日至2023年01月31日每日上午:9:30 至 11:30 下午:13:00 至 16:00(北京时间,法定节假日除外) 招标文件售价 ¥500 获取招标文件的地点 上海市共和新路1301号D座二楼 开标时间 2023年02月09日 13:30 开标地点 上海市共和新路1301号D座二楼会议室 预算金额 ¥520.000000万元(人民币) 联系人及联系方式: 项目联系人 林佳文、吴乾清 项目联系电话 86-21-66271932、86-21-66272327 采购单位 上海交通大学 采购单位地址 上海市东川路800号 采购单位联系方式 陆老师 86-21-54744366 代理机构名称 上海中招招标有限公司 代理机构地址 上海市共和新路1301号D座二楼 代理机构联系方式 林佳文、吴乾清 电话:86-21-66271932、86-21-66272327,13764352603@163.com、18930181850@163.com 附件: 附件1 购买标书登记表(国际标).xlsx 项目概况 上海交通大学Bio-X研究院流式细胞分选仪器 招标项目的潜在投标人应在上海市共和新路1301号D座二楼获取招标文件,并于2023年02月09日 13点30分(北京时间)前递交投标文件。 一、项目基本情况 项目编号:0834-2341SH23A020/02 项目名称:上海交通大学Bio-X研究院流式细胞分选仪器 预算金额:520.0000000 万元(人民币) 最高限价(如有):520.0000000 万元(人民币) 采购需求: 序号 货物名称 数量 简要技术规格 交货期 交货地点 1 流式细胞分选仪器 2台 3.1 ★分选速度:不低于30000细胞/秒,且高速分选时无硬件丢失 (详见第八章) 签订合同后3个月内 关境外货物: CIP上海交通大学指定地点 关境内货物: DDP上海交通大学指定地点 合同履行期限:签订合同后3个月内 本项目( 不接受 )联合体投标。 二、申请人的资格要求: 1.满足《中华人民共和国政府采购法》第二十二条规定; 2.落实政府采购政策需满足的资格要求: 本项目为机电产品国际招标项目,相关法规与政策均按照《机电产品国际招标投标实施办法(试行)》执行。 3.本项目的特定资格要求:1)具有独立的法人资格,相应的经营范围;2)投标人是专业生产本次所需设备的制造商,或是制造商针对本项目唯一授权的代理商,须提供带有本项目编号且由制造商官方加盖公章的授权函(制造商区域授权函或长期授权函无效);3)投标人提供的投标机型应是原产地的全新产品;4)投标人必须在机电产品招标投标电子交易平台上注册,网址:http://www.chinabidding.com注册成功后还须通过网站的验证;5)不接受联合体投标;6)已购买本招标文件。 三、获取招标文件 时间:2023年01月19日 至 2023年01月31日,每天上午9:30至11:30,下午13:00至16:00。(北京时间,法定节假日除外) 地点:上海市共和新路1301号D座二楼 方式:详见其他补充事宜 售价:¥500.0 元,本公告包含的招标文件售价总和 四、提交投标文件截止时间、开标时间和地点 提交投标文件截止时间:2023年02月09日 13点30分(北京时间) 开标时间:2023年02月09日 13点30分(北京时间) 地点:上海市共和新路1301号D座二楼会议室 五、公告期限 自本公告发布之日起5个工作日。 六、其他补充事宜 有意向的投标人可从2023年1月19日起至2023年1月31日,每天(节假日除外)上午9:30时至下午16:00时(北京时间)至在上海中招招标有限公司购买招标文件,本招标文件每套售价为人民币500元或美元75,标书售后不退。决定参与本项目投标的供应商还须于投标截止时间前完成在上海交通大学数字化采购平台(https://pboffice.sjtu.edu.cn/)上的供应商注册及审核,请尽早办理,以免因资料审核时间而影响项目进度。 因疫情原因,本招标文件不现场发售,有意向购买的投标人将营业执照复印件、法人代表授权书、身份证复印件(以上材料须加盖公章)、汇款底单(须公对公)和开票信息发送至13764352603@163.com、18930181850@163.com,在邮件中注明项目名称、联系人和电话,经招标代理机构审核通过后购买招标文件。(购买标书登记表在附件内请填写好与相关报名资料一并发送至邮箱) 招标机构:上海中招招标有限公司开户银行(人民币):中国民生银行上海分行虹桥支行账号(人民币):0208014210004789摘要:0834-2341SH23A020/02 七、对本次招标提出询问,请按以下方式联系。 1.采购人信息 名 称:上海交通大学 地址:上海市东川路800号 联系方式:陆老师 86-21-54744366 2.采购代理机构信息 名 称:上海中招招标有限公司 地 址:上海市共和新路1301号D座二楼 联系方式:林佳文、吴乾清 电话:86-21-66271932、86-21-66272327,13764352603@163.com、18930181850@163.com 3.项目联系方式 项目联系人:林佳文、吴乾清 电 话: 86-21-66271932、86-21-66272327
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  • iCCA2023报告摘要|单细胞分析技术专题
    全日程更新|8月30日开播!31位嘉宾云聚第六届细胞分析网络会议iCCA2023(点击查看)8月31日,第六届细胞分析网络大会(iCCA2023)特设【单细胞分析技术】专题会场,12位嘉宾在线分享!在线免费向听众开放报名,欢迎报名参会!报名链接: https://www.instrument.com.cn/webinar/meetings/icca2023  (点击报名)分会场设置日期上午下午08月30日类器官与器官芯片08月31日单细胞分析技术(上):微流控/质谱单细胞分析技术(下):测序/代谢组学09月01日细胞治疗产品的CMC质量控制分析细胞成像分析技术iCCA 2023 交流群 精彩报告 速览 微流控芯片质谱联用细胞药物代谢分析方法研究林金明 清华大学 教授【摘要】细胞是生物体结构和功能的基本单位。了解细胞的组成、结构和功能,探索细胞的生命活动,对于人类认知与掌控生物体生命活动的基本规律有着十分重要的意义。微流控芯片技术,结合先进的质谱检测、分子成像、生物信息学等技术,为细胞生物学研究提供了强有力的研究平台,也为改变细胞生物学的研究方式提供了可能。本次讲座将结合我们研究组近期的科研工作,简要介绍微流控芯片质谱联用技术在细胞药物代谢领域的进展和研究成果,探讨微流控芯片技术在中药的代谢分析研究中所面临的挑战和发展方向,为扩大其在生物医学领域的研究和应用提供参考和可能的思路。 基于有源数字微流控的单细胞分选和操控系统马汉彬 中国科学院苏州生物医学工程技术研究所 研究员【摘要】 相对于传统数字微流控,有源矩阵数字微流控基于薄膜半导体技术,其阵列规模、样本体积和操控精度均有指数级提升。该平台能够高效的生成大规模微滴阵列,无需借助微纳结构,便可实现单细胞微滴样本生成,并在二维平面内进行样本的可编程控制。高通量单细胞分泌分析技术研究陆瑶 中国科学院大连化学物理研究所 研究员【摘要】分泌是细胞的基本行为,介导通讯、免疫保护等功能。由于细胞存在异质性,往往只是细胞群中的小部分细胞主导分泌相关功能,群体细胞检测无法分辨这些多功能性细胞,必须发展单细胞分析工具进行相关研究、应用。但传统单细胞分泌分析技术存在检测信息不全面的不足,难以满足研究、应用需求。基于此,我们利用微流控芯片发展单细胞分泌因子多维、动态、互作等创新分析技术,显著提高了当前活体单细胞分泌分析技术检测能力,在药物/疫苗开发、疾病诊断、免疫学研究等领域具有重要的科学意义和十分广阔的应用前景。实时单细胞多模态分析仪的应用丁琳 江苏瑞明生物 高级产品经理【摘要】实时单细胞多模态分析仪的应用案例 (1)助力药物开发和药物载体开发; (2)检测细胞代谢标志物,信号分子和酶活为生物传感器开发提供表征工具。。单细胞结构脂质组学及生物医学应用马潇潇 清华大学 长聘副教授【摘要】单细胞分析是揭示细胞间异质性的关键技术,对基础生物学研究,疾病标志物筛查及新药研发均有重要意义。目前,单细胞脂质组分析仍面临诸多技术挑战。本报告介绍本团队在单细胞结构脂质组技术及应用方面的最新研究进展。单细胞固有电学特性高通量流式分析技术研究赵阳 中国科学院微电子研究所 副研究员【摘要】面对单细胞固有电学特性测不快、传感原理不明等难题,我们提出一种基于交叉压缩通道的检测方法,将检测通量提升了1万倍。并设计了一种基于物理模型快速求解器的实时阻抗流式细胞分析仪(piRT-IFC),实现了“细胞进,结果实时出”的全流程自动化处理能力,并验证其在未知细胞样本上具有相较神经网络加速方法更好的泛化能力。基于单细胞测序的肿瘤免疫研究:从机制到疗效预测胡学达北京百奥智汇科技有限公司 副总裁【摘要】 靶向 CTLA4、PD-1 和 PD-L1 等免疫检查点抑制剂(Immune Checkpoint inhibitor, ICI)的发现和临床应用彻底改变了癌症临床治疗的局面。免疫治疗为抗肿瘤带来突破,但只有部分患者发生响应,建立响应与持久性精准预测体系是目前该领域最关键的科学与临床问题。通过单细胞组学研究ICI治疗过程中肿瘤微环境免疫细胞动态演化规律与互作特征,能够发现具有抗肿瘤特异免疫响应驱动作用的细胞类型与分子标记。我们鉴别了不同患者对PD-1治疗不同耐药机制,寻找在响应或耐药患者中差异富集的细胞类型和特征表达基因,作为克服PD-1单抗耐药的治疗靶点创新智造助力单细胞组学标准化和规模化左亚军 深圳华大智造科技股份有限公司 产品市场中心产品经理【摘要】 创新智造助力单细胞组学标准化和规模化 1. MGI 单细胞组学全流程解决方案 2. 单细胞行业进入湿实验标准化时代 3. DNBelab C系列单细胞新品和应用案例。新一代中通量FISH技术、自动化仪器开发及其在精准诊断中的运用曹罡 深圳理工大学 教授【摘要】生物大分子(蛋白质、DNA、RNA等)在组织、细胞内的精确定位对生命体维持正常功能扮演着重要角色。在单细胞水平高通量的检测生物大分子的原位空间组学新技术对理解生命的重要生理功能及疾病的发生发展有着重要意义。目前从一代测序到高通量基因测序技术和单细胞测序都需要从细胞、组织提取核酸,丢失基因的空间位置与病理、组织学特征等信息,只能获得一个维度的基因序列信息。空间基因原位测序与原位检测技术可以整合基因序列信息与空间位置信息,必将对基因测序与病理诊断有着巨大的推动作用!近年来我们实验室开发了相关的高通量单细胞生物大分子(蛋白质、DNA、RNA等)空间组学和新一代FISH解析技术的开发及其仪器开发。此外,我们也将这些技术运用到肿瘤精准诊断中,以期推动肿瘤的精准治疗。单细胞核酸编码扩增分析赵永席 西安交通大学生命分析化学与仪器研究所 教授【摘要】团队开发的肿瘤类器官精准药物芯片筛选(Tumor Organoid Precision Medicine On-chip Screening Platform, TOPMOS)平台可在短时间内高通量培养出大小可控、均一性高的肿瘤类器官,实现高仿生化模拟体内微环境和高精度模拟体内药代动力学,能与现有常规检测设备匹配,实现多药物多浓度的快速药敏测试。单细胞转录组学解析前列腺管腔干细胞身份属性以及谱系可塑性郭旺昕 深圳湾实验室 博士后(高栋课题组)【摘要】前列腺成体干细胞身份属性的解析对研究前列腺组织的损伤修复和肿瘤起始都具有重要的意义。然而正常前列腺成体干细胞的身份属性存在巨大的争议,是前列腺研究领域悬而未决的重要科学问题。因此,我们利用单细胞转录组测序技术系统分析了35129个正常成年雄性小鼠前列腺细胞,发现前列腺管腔细胞可以分为Luminal-A、Luminal-B和Luminal-C三个细胞亚群。进一步阐述了Luminal-C细胞通过自我更新和分化维持前列腺管腔细胞谱系,证实了Luminal-C细胞可以作为前列腺肿瘤的起始细胞。单细胞测序技术与应用解析崔淼 深圳湾实验室 工程师/测序平台负责人【摘要】近几年来,单细胞测序技术发展迅速,与传统测序方法相比起来,其对解决生物材料的低获取量和生物异质性等问题尤为重要。凭借这一技术,研究者们可在单细胞水平上面研究生物进程和一些疾病的发生发展,包括肿瘤进化和癌变、早期胚胎发育、神经细胞异质性等。本次报告将从多方面逐一介绍单细胞测序技术:包括单细胞测序技术概念及发展历程、单细胞测序技术原理及实验设计、单细胞测序技术操作流程及注意事项、单细胞测序条件选择、单细胞测序技术应用等。温馨提示:1) 报名后,直播前一天助教会统一审核,审核通过后,会发送参会链接给报名手机号。填写不完整或填写内容敷衍将不予审核。2) 通过审核后,会议当天您将收到短信提醒。点击短信链接,输入报名手机号,即可参会。
  • 1490万!中国科学院上海药物研究所全光谱流式细胞分析仪、核磁共振谱仪(配液氦低温探头)等采购项目
    一、项目基本情况1.项目编号:OITC-G240300876项目名称:中国科学院上海药物研究所全光谱流式细胞分析仪采购项目预算金额:520.000000 万元(人民币)采购需求:包号货物名称数量(台/套)是否允许采购进口产品采购预算(人民币)1全光谱流式细胞分析仪1套是 520万元合同履行期限:详见采购需求本项目( 不接受 )联合体投标。2.项目编号:OITC-G240300877项目名称:中国科学院上海药物研究所分选型流式细胞仪采购项目预算金额:320.000000 万元(人民币)采购需求:包号货物名称数量(台/套)是否允许采购进口产品采购预算(人民币)1分选型流式细胞仪1套是 320万元合同履行期限:详见采购需求本项目( 不接受 )联合体投标。3.招标项目编号:0729-244OIT300875招标项目名称:中国科学院上海药物研究所核磁共振谱仪(配液氦低温探头)采购项目预算金额:650.000000 万元(人民币)项目实施地点:中国上海市招标产品列表(主要设备):序号产品名称数量简要技术规格备注1核磁共振谱仪(配液氦低温探头)1详见具体技术参数部分无二、获取招标文件1.时间:2024年05月31日 至 2024年06月07日,每天上午9:00至11:00,下午13:00至17:00。(北京时间,法定节假日除外)地点:www.oitccas.com方式:登录“东方招标”平台www.oitccas.com注册并购买售价:¥600.0 元,本公告包含的招标文件售价总和2.招标文件的获取招标文件领购开始时间:2024-05-28招标文件领购结束时间:2024-06-04是否在线售卖标书:否获取招标文件方式:现场领购招标文件领购地点:有兴趣的投标人可登陆网址(http://www.oitccas.com/东方招标平台)招标文件售价:¥600/$100三、对本次招标提出询问,请按以下方式联系。1.采购人信息名 称:中国科学院上海药物研究所     地址:上海市浦东张江祖冲之路555号        联系方式:崔海音,021-50806092      2.采购代理机构信息名 称:东方国际招标有限责任公司            地 址:北京市海淀区丹棱街1号互联网金融中心20层            联系方式:杨帆 陈小舫 赵倩,021-64318161/010-68290551            3.项目联系方式项目联系人:杨帆 陈小舫 赵倩电 话:  021-64318161/010-68290551
  • 摘要速览|iCCA2023之细胞成像分析技术专场
    全日程更新|8月30日开播!31位嘉宾云聚第六届细胞分析网络会议iCCA2023(点击查看)仪器信息网将于2023年08月30日-09月01日举办第六届细胞分析网络会议(iConference on Cell Analysis,iCCA 2023)。在线免费向听众开放报名,欢迎报名参会!报名链接: https://www.instrument.com.cn/webinar/meetings/icca2023  (点击报名) 分会场设置 日期上午下午08月30日类器官与器官芯片08月31日单细胞分析技术(上):微流控/质谱单细胞分析技术(下):测序/代谢组学09月01日细胞治疗产品的CMC质量控制分析细胞成像分析技术 iCCA 2023 交流群 精彩报告速览 蛋白响应型荧光探针用于超分辨荧光成像和生物传感研究王璐 复旦大学 研究员【摘要】活细胞中实时观测蛋白、代谢物等生物分子是研究生物功能的重要手段。然而,可用于活细胞特异性成像的荧光探针非常稀缺。我们基于罗丹明“开-闭”环独特性质,提出罗丹明染料进化新方法,通过引入磺酰胺结构,成功开发了可快速透膜、蛋白响应型荧光探针,实现活细胞免洗、多色STED超分辨荧光成像;而通过引入烷基胺则可将罗丹明染料进化为自闪烁探针,以实现单分子定位超分辨荧光成像(SMLM)。而通过结合识别蛋白,可构建新一代化学-遗传编码荧光探针,实现活细胞中NADPH等关键代谢分子的实时检测。基于目标锁定机制的三维单分子示踪光学显微成像侯尚国 深圳湾实验室 特聘研究员【摘要】实时三维单颗粒示踪已成为研究动态生物相互作用的强大工具,而单分子示踪由于其高空间和时间分辨率以及高灵敏度,有可能革新生物学动态过程研究方式。我们开发了一系列的实时三维单颗粒、单分子示踪成像方法,其具有高时空分辨率、高成像深度和高灵敏度的优点,为在单分子水平上研究生物分子之间的三维相互作用动态提供了一个有力的工具。结构光照明超分辨荧光显微镜的开发和生物学应用李迪 中国科学院生物物理研究所 正高级工程师【摘要】 针对生物学领域的超微动态观测需求和传统结构光照明超分辨显微镜(SIM)的局限。我们使用掠入射照明取代传统的全内反射照明,成像深度提升10倍达1微米,成像速度近20倍达到684幅/秒;引入深度学习技术改进SIM重建算法,成像时程提升30倍达6万幅。应用上述技术,我们发现了十余种细胞器互作新现象,助力生物学领域发展。细胞膜信号转导的单分子追踪陈忠文 中国科学院生物与化学交叉研究中心 研究员【摘要】 细胞感知外界环境的刺激并做出反应,通过一系列细胞膜受体信号转导过程调节细胞功能。我们通过单细胞和单分子荧光成像,结合人工脂质双层膜技术操纵和观测相关细胞膜受体,研究解释了细胞膜受体的空间分布和团簇态对于信号转导的调控作用。这些工作为细胞受体信号转导的基础研究提供了新的手段,并推动建立了新的生物学模型。温馨提示:1) 报名后,直播前一天助教会统一审核,审核通过后,会发送参会链接给报名手机号。填写不完整或填写内容敷衍将不予审核。2) 通过审核后,会议当天您将收到短信提醒。点击短信链接,输入报名手机号,即可参会。
  • 分子诊断与细胞分析市场热度持续攀升
    20世纪80年代初,曾经有人预言:“21世纪将是生物学的世纪”。这一预言如今已经成为现实,美国《科学》周刊评选的2014年全世界十大科技突破中,一半的成果都来自生命科学领域。  国内生物产业近年成为政策与资金关注的焦点,也给生命科学仪器带来巨大的市场机会。2014年,全球生命科学仪器市场销售额超过400亿美元,并以6%的速度增长。本文就生命科学领域中热度持续攀升的分子诊断和细胞分析的部分仪器市场做一小结,并结合仪器信息网相关仪器专场数据进行分析。  分子诊断—基因测序和PCR  分子诊断是生命科学领域的热点之一,有关机构预测,2019年该市场规模将达723亿元,年均复合增长率高达18.7%,其中分子诊断细分市场年均增速超过20%,而且未来还将维持一段长时间的高速成长周期。同时,相应热点领域发展带动了基因测序仪、PCR仪等分子生物学仪器的采购需求。  (1)基因测序—二胎政策下前景非常广阔  2015年10月29日中共五中全会公报允许普遍二胎,随着二胎政策的全面放开以及我国局部省份将基因检测纳入医保报销并相继发布执行通知,要实现二胎优生,最大的利好当属于基因检测领域。  我国基因测序市场中,产前基因检测市场巨大。截止今年10月底,全国109家医疗机构取得了国家卫计委核准的高通量基因测序产前筛查与诊断临床试点资质,到目前检测人数已经突破5万人次。如以国家规定的3500 元/次的费用计算,按照我国每年2000万左右的新生儿计算,产前基因检测市场能达到700亿元人民币。11月14日,央视《财经周刊》栏目也报道了无创产检基因检测的相关调查结果,预计未来市场规模可破千亿。  根据Markets&Markets的研究报告显示,去年二代基因测序的全球市场规模为25亿美元,预计2020年将达到87亿美元,复合增长率将达23%。对于如此快速的发展市场需求,最近两年不少厂商(特别是国产厂商)相继推出了新的产品,比如华大基因的BGISEQ-500、中科紫鑫的BIGIS、深圳华因康的HYK-PSTAR-IIA、赛默飞的Ion TorrentTM Ion S5TM NGS系统等。  目前,我国CFDA医疗器械注册认证的基因测序仪共有6款,分别是华大基因的BGISEQ-100和BGISEQ-1000、达安基因的DA8600、华因康的HYK-PSTAR-IIA、博奥生物的BioelectronSeq4000和贝瑞和康的NextSeq CN500。  2015年1-10月期间,仪器信息网基因测序仪专场访问量相比2014年同期增长50%,留言量增长近200%,由此可以印证该市场的热度。  (2)PCR仪—2015年全球新品不断  2月,上海研域仪器设备有限公司梯度PCR仪上线。  5月,香港力康HealForce推出集团首款梯度智能PCR仪。  8月份,加州大学教授Luke Lee 博士和他的团队研发出一种超速光电PCR技术——能显著加快PCR反应中DNA变性、退火的速度。  8月,国内“多点取样-实时荧光定量PCR技术”技术得到认可,该技术对于食品的日常监管及企业的在线质量控制有着良好的应用前景与推广价值,产品将尽快推向市场。  10月份,德国耶拿Biometra TAdvanced 96 SG 基因扩增仪新品发布。  有调查显示PCR市场全球有8%的增长趋势,其中,qPCR占有总PCR市场的64%。最新数据显示,全球数字PCR和qPCR市场预计到2019年将达到39.7亿,2014至2019年均复合增长率为7.8%。  目前qPCR仪在国内临床应用方面,国产仪器和进口仪器差距已经越来越小,未来这一市场国产化、自动化将是大趋势,试剂盒厂家为了更加适应二三线医疗市场的需求,也会向这些方面不断调整。  2015年1-10月期间,仪器信息网基因扩增仪专场访问量相比2014年同期增长200%,受关注度大增。  细胞分析—流式细胞仪和荧光显微镜  据了解,干细胞治疗政策的放开、干细胞技术的突破,将对细胞生物学科研进程起到推动作用,同时也将使其研究工具——即细胞生物学仪器市场高速增长。鉴于此,流式细胞仪、显微镜成像等设备未来几年的市场规模和技术进展值得期待。  (1)流式细胞仪—2022年市场将达70亿美元  目前,全球范围内已经有超过100家公司以流式细胞仪或其相关耗材试剂为主营业务,每年的销售额达到30亿美元,仅仅试剂开辟的市场份额就达到了10亿美元/年。预计2020年市场规模将达到65亿美元,2012到2020年间复合年增长率为30.9%,2022年市场将达70亿美元。  随着国家对医疗器械行业政策扶持的加强,未来流式细胞仪市场发展空间巨大 加之,国内流式细胞仪企业技术的提升,原材料成本的下降,预计2016年我国流式细胞仪发展规模将达到7.1亿元,我国流式细胞仪行业前景可期。  2015年1-10月期间,仪器信息网流式细胞仪专场访问量相比2014年同期增长1.2倍,关注度稳步增长。  (2)荧光显微镜—超分辨有新突破  2014年,国内光学显微镜总进口额突破3亿美元,生物领域应用的光学显微镜进口额就超过1亿美元。其中,国内激光共聚焦显微镜市场需求已超过1亿元人民币。相较于全球23亿美元的光学显微镜市场,中国市场还有非常大的上升空间,预计国内光学显微镜市场还将以每年超过30%的增长率扩大规模。同时,从仪器信息网今年10月底之前的荧光显微镜专场留言量同比增长4倍这一现象可以略见该市场的火热程度。  得益于2014年诺贝尔化学奖的结果,中国相关领域的研究人员已开始把目光投向了更加先进的超高分辨率光学显微镜。据了解,中国的一些科研单位,比如浙江大学、中科院苏州医工所等,正在进行超分辨率光学成像技术的研究工作。  可喜的是,今年2月份,我国超分辨率荧光显微镜研制取得新突破,华中科技大学武汉光电国家实验室朱明强教授课题组研发了一种超级荧光分子开关,同时,制作出具有超级光敏感和应用潜力的全光晶体管,这对我国研制新型超分辨率荧光显微镜意义重大。(编辑:史秀明)  (注:本文所引数据来自互联网,仅供读者参考。)
  • 西安交通大学第二附属医院337.00万元采购血球分析仪,流式细胞仪,细胞计数器,微生物检测
    详细信息 西安交通大学第二附属医院临检组试剂采购项目(2标段、4标段、5标段、6标段、9标段)二次公开招标公告 陕西省-西安市-新城区 状态:公告 更新时间: 2022-05-14 西安交通大学第二附属医院临检组试剂采购项目(2标段、4标段、5标段、6标段、9标段)二次公开招标公告 发布时间:20220514 12:31:01 项目概况 西安交通大学第二附属医院临检组试剂采购项目(2标段、4标段、5标段、6标段、9标段)二次的潜在投标人应在线上获取招标文件,并于2022年6月7日 09点30分(北京时间)前递交投标文件。 一、项目基本情况 项目编号:ZDZC2022030401 项目名称:西安交通大学第二附属医院临检组试剂采购项目(2标段、4标段、5标段、6标段、9标段)二次 采购需求:本次采购标的标段划分如下: 标段号 产品组合名称 产品名称 检测方法 使用科室 采购预算(万元/年) 拟中标家数 备注 2标段 全自动血细胞分析流水线HST302 血细胞分析用稀释液 流式细胞计数核酸染色法 医学检验科 300 1家 血细胞分析仪用鞘液 血细胞分析用溶血剂 SULFOLYSER 血细胞分析用溶血剂 4DL 血细胞分析用染色液 4DS 血细胞分析仪用溶血剂 FB 血细胞分析用染色液 RET 血细胞分析用溶血剂 IM 清洁液CLA500A 质控品eCHECK (L1、L2、L3) 血细胞分析仪用校准品 SP1000载玻片 全自动血细胞分析流水线XN9000,XN1500 血细胞分析用稀释液 血细胞分析用稀释液 DFL 血细胞分析用稀释液 DST 血细胞分析用溶血剂 SULFOLYSER 血细胞分析用溶血剂 WNR 血细胞分析用溶血剂 WDF 血细胞分析用溶血剂 WPC 血细胞分析用染色液 WNR 血细胞分析用染色液 WDF 血细胞分析用染色液 WPC 血细胞分析用染色液 RET 血细胞分析用染色液 PLT CLA500A清洁液 血液分析用质控品XN(L1\L2\L3) 血液分析用质控品XN CHECK BF 血液分析仪用校准品XN CAL 血液分析仪用校准品XN CAL PF 血细胞分析用稀释液 DCL310A 血细胞分析用溶血剂 SULFOLYSER SLS211A 血细胞分析用溶血剂 WDF220A 血细胞分析用染色液 WDF810A 血细胞分析用稀释液 DFL310A 血细胞分析用染色液 RET801A XNL CHECK L1/L2/L3 血细胞分析用质控品 手工外周血片染色 瑞士姬姆萨染色液 SP1000i自动推片机子 瑞士姬姆萨染色A液 全自动红细胞沉降率分析仪 红细胞沉降率质控物(液体水平1) 魏式法 红细胞沉降率质控物(液体水平2) 全血炎症指标检测(适用于sysmex流水线) 血清淀粉样蛋白A(SAA)质控品 散射比浊法 血清淀粉样蛋白A(SAA)校准品 血清淀粉样蛋白A(SAA)测定试剂盒 超敏C反应蛋白测定试剂盒 C反应蛋白(CRP)质控品 C反应蛋白(CRP)校准品 样本稀释液 尿干化学+沉渣检测 尿液分析用鞘液 流式细胞计数法 尿液分析用染色液 CR 尿液分析用染色液 SF 尿液分析用稀释液 CR 尿液分析用稀释液 SF 尿液分析用质控品 尿液分析用校准品 尿液分析用试纸条(9项) 尿液分析用试纸条(11项) 尿液分析用质控品(干化学) 尿比重校准品 4标段 FUS3000PLUS尿液分析 尿有形成分分析仪应用试剂稀释液 流式图像计数法 15 1家 尿有形成分分析仪清洗液 有形成分分析校准液 有形成分分析聚焦液(水平2) 有形成分分析质控液(阳性水平3) 有形成分分析质控液(阴性) 尿液分析试纸条 光电比色法 H系列尿液分析仪清洗液(浓缩型) 尿液干化学分析质控物 尿液分析试纸条 九种呼吸道感染病原体的IgM抗体检测试剂 九种呼吸道感染病原体的IgM抗体(嗜肺军团菌、肺炎支原体、肺炎衣原体 、腺病毒 呼吸道合胞病毒、 甲型流感病毒、乙型流感病毒、副流感病毒、Q热立克次体) 间接免疫荧光法 5标段 粪便干化学+有形成分分析) 样本采集管(包含稀释液、清洗液等) 镜检法+胶体金 15 1家 粪便隐血(FOB)多水平非定值质控品 便隐血(FOB)检测试剂 转铁蛋白(Tf)多水平非定值质控品 镜检法 粪便有形成分质控品(蛔虫卵(受精)阳性质控品 粪便有形成分质控品(鞭虫卵阳性质控品) 粪便有形成分质控品(肝吸虫卵阳性质控品) 粪便有形成分质控品(红细胞定值质控品) 粪便有形成分质控品(白细胞阳性质控品) 轮状病毒抗原检测试剂盒(胶体金法) 胶体金法 轮状病毒丶腺病毒抗原检测试剂盒(胶体金法) 转铁蛋白检测试剂盒(胶体金法) 胃幽门螺旋杆菌抗原测试剂盒(胶体金法) 6标段 呼吸道病原体抗原检测5项 甲型/乙型流感病毒抗原检测试剂盒 胶体金法 5 1家 呼吸道合胞病毒抗原检测试剂盒 腺病毒抗原检测试剂盒 肺炎支原体抗原检测试剂盒 肺链尿抗原 肺炎链球菌抗原检测试剂盒 胶体金法 肺炎支原体抗原 肺炎支原体抗原检测试剂盒 支原体培养药敏试剂 支原体(Uu/Mh)分离培养药敏试剂盒 微生物快速培养检验法 支原体(Uu/Mh/Mp)分离鉴定培养基 真菌荧光染液 真菌荧光染液(一步法) 100T/盒 出血热相关抗体快检 汉坦病毒抗体检测 胶体金法 尿胰蛋白酶原 尿胰蛋白酶原 胶体金法 HCG(胶体金) 人绒毛膜促性腺激素诊断试剂盒 胶体金法 嗜肺军团菌抗原 嗜肺军团菌抗原检测 胶体金法 补体因子H检测(免疫层析法) 补体因子H检测试剂盒 免疫层析法 降钙素原测定试剂 降钙素原测定试剂盒 金标法 9标段 全自动精子质量分析 精子检测板 动态图像自动分析 2 1家 精子染色液 备注:各供应商可选择参投一个或多个标段,但必须对所投标段内全部项目内容进行投标报价,不得缺项、漏项。 预算金额:337万元/年。 资金性质:自筹资金。 项目用途:医用。 合同履行期限:2年。 本项目(不接受)联合体投标。 二、供应商资格要求: 1、基本资格条件:符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商条件; 1.1、提供在中华人民共和国境内注册的营业执照(或事业单位法人证书,或社会团体法人登记证书,或执业许可证)、组织机构代码证和税务登记证复印件【如已办理了多证合一,则仅需提供合证后的营业执照】,如供应商为自然人的需提供自然人身份证明。 1.2、提供2020年度的财务报表(至少包括资产负债表、现金流量表和利润表)或具有财务审计资质的单位出具的2020年度财务会计报告或开标日前三个月内基本存款账户银行出具的资信证明(附开户许可证);2021年以后新成立企业提供成立之日至开标前一月的财务报表(至少包括资产负债表、现金流量表和利润表)或开标日前三个月内基本存款账户银行出具的资信证明(附开户许可证)。 1.3、提供2021年以来至少一个月的纳税证明或完税证明(提供增值税、企业所得税至少一种),纳税证明或完税证明上应有代收机构或税务机关的公章或业务专用章。依法免税的供应商应提供相关文件证明。 1.4、提供2021年以来至少一个月的社会保障资金缴存单据或社保机构开具的社会保险参保缴费情况证明。依法不需要缴纳社会保障资金的供应商应提供相关文件证明。 1.5、提供履行合同所必需的设备和专业技术能力的书面声明。 1.6、提供参加政府采购活动前3年内在经营活动中没有重大违法记录的书面声明。 2、落实政府采购政策需满足的资格要求: 本项目非专门面向中小企业采购。 3、特定资格条件: 3.1、供应商应授权合法的人员参加投标全过程,其中法定代表人直接参加投标的,须出具法人身份证,并与营业执照上信息一致;法定代表人授权代表参加投标的,须出具法定代表人授权书及授权代表身份证。 3.2、投标产品纳入医疗器械(或药品)管理的,须提供供应商有效的医疗器械(或药品)经营许可证或经营备案凭证。 3.3、投标产品纳入医疗器械(或药品)管理的,须提供产品有效的医疗器械(或药品)注册证或备案凭证。 3.4、若投标产品为进口,供应商须提供有效的完整授权链的产品授权书(授权期限不足2年的须附能够提供持续供货的声明材料,英文授权须提供中文翻译版;制造商直接参与投标的不提供此项)。若投标产品为国产且纳入医疗器械(或药品)管理的,供应商须提供投标产品制造商有效的营业执照和生产许可证。 3.5、供应商未被列入“信用中国”网站(www.creditchina.gov.cn)以下情形之一:①记录失信被执行人;②重大税收违法案件当事人名单。同时,在中国政府采购网(www.ccgp.gov.cn)“政府采购严重违法失信行为信息记录”中查询没有处于禁止参加政府采购活动的记录名单。 3.6、单位负责人为同一人或者存在直接控股、管理关系的不同供应商,不得参加同一合同项下的政府采购活动。 3.7、本项目不接受联合体投标。 三、获取招标文件 时间:2022年5月16日至2022年5月20日,每天上午9:00至12:00,下午14:00至17:00。(北京时间,法定节假日除外) 地点:线上 方式:1)根据陕西省人民政府《关于加强新型冠状病毒感染的肺炎防控工作的通告》要求,本次招标文件采用线上发售,供应商在文件发售期以内将单位介绍信、经办人身份证、联系电话及电子邮箱等资料加盖单位公章的彩色扫描件发送至邮箱591330045@qq.com,并及时联系采购代理机构确认(联系人:李工18220810739),获取缴费方式。2)招标文件售价人民币300元/标段,售后不退。采购代理机构在收到邮件并确认文件收费到账后,通过邮箱向供应商发售招标文件,请及时查收。3)受疫情影响,本项目投标文件递交截止时间及开标时间和地点可能会变更,具体另行通知。 售价:¥300.0 元,本公告包含的招标文件售价总和。 四、提交投标文件截止时间、开标时间和地点 提交投标文件截止时间:2022年6月7日 09点30分(北京时间) 开标时间:2022年6月7日09点30分(北京时间) 地点:西安市新城区长乐中路38号金花新都汇A座7层会议室 五、公告期限 自本公告发布之日起5个工作日。 六、其他补充事宜 需要落实的政府采购政策:1、《三部门联合发布关于促进残疾人就业政府采购政策的通知》(财库〔2017〕141号);2、《财政部司法部关于政府采购支持监狱企业发展有关问题的通知》(财库〔2014〕68号);3、《关于政府采购优先购买福利性企业产品和服务的意见》(陕民发(2015)1号);4、关于印发《政府采购促进中小企业发展管理办法》的通知财库〔2020〕46号;5、《关于调整优化节能产品、环境标志产品政府采购执行机制的通知》(财库[2019]9号);6、《环境标志产品政府采购实施的意见》(财库[2006]90号);7、《财政部 国务院扶贫办关于运用政府采购政策支持脱贫攻坚的通知》(财库〔2019〕27号)。 七、对本次招标提出询问,请按以下方式联系。 1.采购人信息 名 称:西安交通大学第二附属医院 地址:西安市新城区西五路 联系方式:冯女士 02987679861 2.采购代理机构信息 名 称:正大鹏安建设项目管理有限公司 地 址:西安市新城区长乐中路38号金花新都汇A座12层1201室 联系方式:李工 18220810739,杨工 15902948290 3.项目联系方式 项目联系人:李工 电 话:18220810739 × 扫码打开掌上仪信通App 查看联系方式 基本信息 关键内容:血球分析仪,流式细胞仪,细胞计数器,微生物检测 开标时间:2022-06-07 09:30 预算金额:337.00万元 采购单位:西安交通大学第二附属医院 采购联系人:点击查看 采购联系方式:点击查看 招标代理机构:正大鹏安建设项目管理有限公司 代理联系人:点击查看 代理联系方式:点击查看 详细信息 西安交通大学第二附属医院临检组试剂采购项目(2标段、4标段、5标段、6标段、9标段)二次公开招标公告 陕西省-西安市-新城区 状态:公告 更新时间: 2022-05-14 西安交通大学第二附属医院临检组试剂采购项目(2标段、4标段、5标段、6标段、9标段)二次公开招标公告 发布时间:20220514 12:31:01 项目概况 西安交通大学第二附属医院临检组试剂采购项目(2标段、4标段、5标段、6标段、9标段)二次的潜在投标人应在线上获取招标文件,并于2022年6月7日 09点30分(北京时间)前递交投标文件。 一、项目基本情况 项目编号:ZDZC2022030401 项目名称:西安交通大学第二附属医院临检组试剂采购项目(2标段、4标段、5标段、6标段、9标段)二次 采购需求:本次采购标的标段划分如下: 标段号 产品组合名称 产品名称 检测方法 使用科室 采购预算(万元/年) 拟中标家数 备注 2标段 全自动血细胞分析流水线HST302 血细胞分析用稀释液 流式细胞计数核酸染色法 医学检验科 300 1家 血细胞分析仪用鞘液 血细胞分析用溶血剂 SULFOLYSER 血细胞分析用溶血剂 4DL 血细胞分析用染色液 4DS 血细胞分析仪用溶血剂 FB 血细胞分析用染色液 RET 血细胞分析用溶血剂 IM 清洁液CLA500A 质控品eCHECK (L1、L2、L3) 血细胞分析仪用校准品 SP1000载玻片 全自动血细胞分析流水线XN9000,XN1500 血细胞分析用稀释液 血细胞分析用稀释液 DFL 血细胞分析用稀释液 DST 血细胞分析用溶血剂 SULFOLYSER 血细胞分析用溶血剂 WNR 血细胞分析用溶血剂 WDF 血细胞分析用溶血剂 WPC 血细胞分析用染色液 WNR 血细胞分析用染色液 WDF 血细胞分析用染色液 WPC 血细胞分析用染色液 RET 血细胞分析用染色液 PLT CLA500A清洁液 血液分析用质控品XN(L1\L2\L3) 血液分析用质控品XN CHECK BF 血液分析仪用校准品XN CAL 血液分析仪用校准品XN CAL PF 血细胞分析用稀释液 DCL310A 血细胞分析用溶血剂 SULFOLYSER SLS211A 血细胞分析用溶血剂 WDF220A 血细胞分析用染色液 WDF810A 血细胞分析用稀释液 DFL310A 血细胞分析用染色液 RET801A XNL CHECK L1/L2/L3 血细胞分析用质控品 手工外周血片染色 瑞士姬姆萨染色液 SP1000i自动推片机子 瑞士姬姆萨染色A液 全自动红细胞沉降率分析仪 红细胞沉降率质控物(液体水平1) 魏式法 红细胞沉降率质控物(液体水平2) 全血炎症指标检测(适用于sysmex流水线) 血清淀粉样蛋白A(SAA)质控品 散射比浊法 血清淀粉样蛋白A(SAA)校准品 血清淀粉样蛋白A(SAA)测定试剂盒 超敏C反应蛋白测定试剂盒 C反应蛋白(CRP)质控品 C反应蛋白(CRP)校准品 样本稀释液 尿干化学+沉渣检测 尿液分析用鞘液 流式细胞计数法 尿液分析用染色液 CR 尿液分析用染色液 SF 尿液分析用稀释液 CR 尿液分析用稀释液 SF 尿液分析用质控品 尿液分析用校准品 尿液分析用试纸条(9项) 尿液分析用试纸条(11项) 尿液分析用质控品(干化学) 尿比重校准品 4标段 FUS3000PLUS尿液分析 尿有形成分分析仪应用试剂稀释液 流式图像计数法 15 1家 尿有形成分分析仪清洗液 有形成分分析校准液 有形成分分析聚焦液(水平2) 有形成分分析质控液(阳性水平3) 有形成分分析质控液(阴性) 尿液分析试纸条 光电比色法 H系列尿液分析仪清洗液(浓缩型) 尿液干化学分析质控物 尿液分析试纸条 九种呼吸道感染病原体的IgM抗体检测试剂 九种呼吸道感染病原体的IgM抗体(嗜肺军团菌、肺炎支原体、肺炎衣原体 、腺病毒 呼吸道合胞病毒、 甲型流感病毒、乙型流感病毒、副流感病毒、Q热立克次体) 间接免疫荧光法 5标段 粪便干化学+有形成分分析) 样本采集管(包含稀释液、清洗液等) 镜检法+胶体金 15 1家 粪便隐血(FOB)多水平非定值质控品 便隐血(FOB)检测试剂 转铁蛋白(Tf)多水平非定值质控品 镜检法 粪便有形成分质控品(蛔虫卵(受精)阳性质控品 粪便有形成分质控品(鞭虫卵阳性质控品) 粪便有形成分质控品(肝吸虫卵阳性质控品) 粪便有形成分质控品(红细胞定值质控品) 粪便有形成分质控品(白细胞阳性质控品) 轮状病毒抗原检测试剂盒(胶体金法) 胶体金法 轮状病毒丶腺病毒抗原检测试剂盒(胶体金法) 转铁蛋白检测试剂盒(胶体金法) 胃幽门螺旋杆菌抗原测试剂盒(胶体金法) 6标段 呼吸道病原体抗原检测5项 甲型/乙型流感病毒抗原检测试剂盒 胶体金法 5 1家 呼吸道合胞病毒抗原检测试剂盒 腺病毒抗原检测试剂盒 肺炎支原体抗原检测试剂盒 肺链尿抗原 肺炎链球菌抗原检测试剂盒 胶体金法 肺炎支原体抗原 肺炎支原体抗原检测试剂盒 支原体培养药敏试剂 支原体(Uu/Mh)分离培养药敏试剂盒 微生物快速培养检验法 支原体(Uu/Mh/Mp)分离鉴定培养基 真菌荧光染液 真菌荧光染液(一步法) 100T/盒 出血热相关抗体快检 汉坦病毒抗体检测 胶体金法 尿胰蛋白酶原 尿胰蛋白酶原 胶体金法 HCG(胶体金) 人绒毛膜促性腺激素诊断试剂盒 胶体金法 嗜肺军团菌抗原 嗜肺军团菌抗原检测 胶体金法 补体因子H检测(免疫层析法) 补体因子H检测试剂盒 免疫层析法 降钙素原测定试剂 降钙素原测定试剂盒 金标法 9标段 全自动精子质量分析 精子检测板 动态图像自动分析 2 1家 精子染色液 备注:各供应商可选择参投一个或多个标段,但必须对所投标段内全部项目内容进行投标报价,不得缺项、漏项。 预算金额:337万元/年。 资金性质:自筹资金。 项目用途:医用。 合同履行期限:2年。 本项目(不接受)联合体投标。 二、供应商资格要求: 1、基本资格条件:符合《政府采购法》第二十二条规定的供应商条件; 1.1、提供在中华人民共和国境内注册的营业执照(或事业单位法人证书,或社会团体法人登记证书,或执业许可证)、组织机构代码证和税务登记证复印件【如已办理了多证合一,则仅需提供合证后的营业执照】,如供应商为自然人的需提供自然人身份证明。 1.2、提供2020年度的财务报表(至少包括资产负债表、现金流量表和利润表)或具有财务审计资质的单位出具的2020年度财务会计报告或开标日前三个月内基本存款账户银行出具的资信证明(附开户许可证);2021年以后新成立企业提供成立之日至开标前一月的财务报表(至少包括资产负债表、现金流量表和利润表)或开标日前三个月内基本存款账户银行出具的资信证明(附开户许可证)。 1.3、提供2021年以来至少一个月的纳税证明或完税证明(提供增值税、企业所得税至少一种),纳税证明或完税证明上应有代收机构或税务机关的公章或业务专用章。依法免税的供应商应提供相关文件证明。 1.4、提供2021年以来至少一个月的社会保障资金缴存单据或社保机构开具的社会保险参保缴费情况证明。依法不需要缴纳社会保障资金的供应商应提供相关文件证明。 1.5、提供履行合同所必需的设备和专业技术能力的书面声明。 1.6、提供参加政府采购活动前3年内在经营活动中没有重大违法记录的书面声明。 2、落实政府采购政策需满足的资格要求: 本项目非专门面向中小企业采购。 3、特定资格条件: 3.1、供应商应授权合法的人员参加投标全过程,其中法定代表人直接参加投标的,须出具法人身份证,并与营业执照上信息一致;法定代表人授权代表参加投标的,须出具法定代表人授权书及授权代表身份证。 3.2、投标产品纳入医疗器械(或药品)管理的,须提供供应商有效的医疗器械(或药品)经营许可证或经营备案凭证。 3.3、投标产品纳入医疗器械(或药品)管理的,须提供产品有效的医疗器械(或药品)注册证或备案凭证。 3.4、若投标产品为进口,供应商须提供有效的完整授权链的产品授权书(授权期限不足2年的须附能够提供持续供货的声明材料,英文授权须提供中文翻译版;制造商直接参与投标的不提供此项)。若投标产品为国产且纳入医疗器械(或药品)管理的,供应商须提供投标产品制造商有效的营业执照和生产许可证。 3.5、供应商未被列入“信用中国”网站(www.creditchina.gov.cn)以下情形之一:①记录失信被执行人;②重大税收违法案件当事人名单。同时,在中国政府采购网(www.ccgp.gov.cn)“政府采购严重违法失信行为信息记录”中查询没有处于禁止参加政府采购活动的记录名单。 3.6、单位负责人为同一人或者存在直接控股、管理关系的不同供应商,不得参加同一合同项下的政府采购活动。 3.7、本项目不接受联合体投标。 三、获取招标文件 时间:2022年5月16日至2022年5月20日,每天上午9:00至12:00,下午14:00至17:00。(北京时间,法定节假日除外) 地点:线上 方式:1)根据陕西省人民政府《关于加强新型冠状病毒感染的肺炎防控工作的通告》要求,本次招标文件采用线上发售,供应商在文件发售期以内将单位介绍信、经办人身份证、联系电话及电子邮箱等资料加盖单位公章的彩色扫描件发送至邮箱591330045@qq.com,并及时联系采购代理机构确认(联系人:李工18220810739),获取缴费方式。2)招标文件售价人民币300元/标段,售后不退。采购代理机构在收到邮件并确认文件收费到账后,通过邮箱向供应商发售招标文件,请及时查收。3)受疫情影响,本项目投标文件递交截止时间及开标时间和地点可能会变更,具体另行通知。 售价:¥300.0 元,本公告包含的招标文件售价总和。 四、提交投标文件截止时间、开标时间和地点 提交投标文件截止时间:2022年6月7日 09点30分(北京时间) 开标时间:2022年6月7日09点30分(北京时间) 地点:西安市新城区长乐中路38号金花新都汇A座7层会议室 五、公告期限 自本公告发布之日起5个工作日。 六、其他补充事宜 需要落实的政府采购政策:1、《三部门联合发布关于促进残疾人就业政府采购政策的通知》(财库〔2017〕141号);2、《财政部司法部关于政府采购支持监狱企业发展有关问题的通知》(财库〔2014〕68号);3、《关于政府采购优先购买福利性企业产品和服务的意见》(陕民发(2015)1号);4、关于印发《政府采购促进中小企业发展管理办法》的通知财库〔2020〕46号;5、《关于调整优化节能产品、环境标志产品政府采购执行机制的通知》(财库[2019]9号);6、《环境标志产品政府采购实施的意见》(财库[2006]90号);7、《财政部 国务院扶贫办关于运用政府采购政策支持脱贫攻坚的通知》(财库〔2019〕27号)。 七、对本次招标提出询问,请按以下方式联系。 1.采购人信息 名 称:西安交通大学第二附属医院 地址:西安市新城区西五路 联系方式:冯女士 02987679861 2.采购代理机构信息 名 称:正大鹏安建设项目管理有限公司 地 址:西安市新城区长乐中路38号金花新都汇A座12层1201室 联系方式:李工 18220810739,杨工 15902948290 3.项目联系方式 项目联系人:李工 电 话:18220810739
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