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转录组分析

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  • Nature Communications |PiSPA平台:单细胞蛋白质组分析新工具

    近日,[b]科创中心生物与分子智造研究院分子智造研究所所长方群教授团队[/b]再出新成果!团队[b]开发了“点取式”单细胞蛋白质组分析(PiSPA)工作流程和基于纳升级微流控液滴操控机器人,实现了单细胞的精准捕获、前处理以及自动进样,并首次在单个哺乳动物细胞中实现了高达3000种蛋白质的超高定量深度[/b]。目前,相关研究成果以“ Pick-up single-cell proteomic analysis for quantifying up to 3000 proteins in a Mammalian cell ”为题在国际权威期刊《自然通讯》上发表。[b]这项成果也再次向我们证明了单细胞蛋白质组学在诊疗和预防、药物开发、癌症基因组学等精准医学研究中的应用潜力。[/b][align=center][img=,700,444]https://img1.17img.cn/17img/images/202402/uepic/a2bc5a12-447c-42f5-901c-d7cd2ada8821.jpg[/img][/align][align=center]团队自研的探针式微流控液滴操纵机器人系统[/align][color=#0070c0][b]更强大的单细胞蛋白质组分析工具:PiSPA工作流程[/b][/color]单细胞蛋白质组学技术是近年来生命科学领域研究的热点。因单个细胞中的蛋白质含量极微(仅约0.2 ng)且无法扩增,单细胞蛋白质组分析极具挑战性。目前传统蛋白质组分析技术仅能在每个细胞中鉴定1000种左右的蛋白质,而这在单细胞分析领域显得有些“力不从心”。此外,传统的样本前处理操作大多在微升级反应器中进行,在样品处理和转移的过程中会出现明显的样品损失,这会限制单细胞蛋白质组学的鉴定深度,难以满足生命科学研究的迫切需求。“想要突破单细胞蛋白质组学鉴定深度的障碍,有两种策略。一是在足够小的微反应器中进行样品前处理,利用微尺度效应提高反应效率;二是将所有操作整合在一起,降低样品损失,但这两种策略对技术与设备的要求都很高”,本项成果第一完成人王宇博士解释道,“我们利用微流控技术将商品化的内插管改造为阵列化的纳升级微反应器,解决了纳升级样品反应与自动进样的问题。PiSPA平台可自动完成细胞捕获、样品前处理、色谱分离、质谱检测、数据处理等操作,进一步降低了样品损失。”[align=center][img=,700,303]https://img1.17img.cn/17img/images/202402/uepic/63b80008-6467-4583-b1b7-147e9680c481.jpg[/img][/align][align=center]“点取式”单细胞蛋白质组分析流程示意图[/align][b]PiSPA工作流程使得高精度的液体操控、单细胞的精确处理以及先进的LC-TIMS-QTOF MS技术融为一体,重新定义了单细胞蛋白质组学分析。[/b]“在研究中,我们将该平台应用于三种哺乳动物细胞(HeLa、A549和U2OS细胞)的单细胞蛋白质组分析,以及HeLa细胞迁移过程中的细胞异质性研究中,均实现了超高深度定量分析”,王宇博士说。同时,迁移细胞的单细胞蛋白质组分析也证实了PiSPA平台具有识别细胞迁移关键分子以及有价值靶点的应用潜力。[align=center][img=,700,394]https://img1.17img.cn/17img/images/202402/uepic/b4d136ba-e078-4fc6-b59d-911f8f0abfcc.jpg[/img][/align][align=center]哺乳动物细胞的单细胞蛋白质组分析结果[/align][color=#0070c0][b]单细胞的定量深度:从3000+走向全蛋白质组测序[/b][/color]PiSPA平台集成了基于序控液滴(SODA)技术的自动化液滴操纵机器人,能够在“点取式”操作模式下实现纳升级的细胞分选、多步样品前处理和自动进样操作。相比于其他单细胞分析方法,[b]PiSPA平台的优势主要体现在与成像技术结合,能够灵活地选择任意单个细胞进行分析,目标细胞的捕获指向性强,具有很高的捕获准确性和成功率,并可保留目标细胞的表观和空间信息,显著增加了单细胞分析的信息维度[/b]。其次,PiSPA平台采用针对单细胞样品的“定制化”分析条件,实现了蛋白质鉴定深度的大幅提升,能够为生物医学研究提供更多有效的基础数据。这些优势对推动单细胞蛋白质组分析的实际推广应用具有重要意义。“目前的单细胞定量深度只是一个起点”,方群教授分享道,在该项研究中,可从单个哺乳动物细胞中可定量多达3000种蛋白质,约占人类基因编码蛋白质总数(约20,000种)的15%,其鉴定深度已经达到10年前单细胞转录组测序技术的相近水平。类比单细胞转录组测序技术的发展历史,可以预见当前已处于单细胞蛋白质组分析技术的爆发阶段,随着技术的快速革新,单细胞的定量鉴定深度还将得到史无前例的提升。“这意味着单细胞蛋白质组学技术已进入在广泛的生物医学研究领域中实际应用的阶段。”[align=center][img=,700,315]https://img1.17img.cn/17img/images/202402/uepic/0ff9f496-19a8-4d58-a0de-a5d54a37ad74.jpg[/img][/align][b]团队表示,未来,他们将进一步提高单细胞蛋白质组分析的鉴定深度和通量,以持续推进该技术实用化和应用拓展的水平[/b]。此外,在上述成果基础上,目前团队还在利用iChemFoundry平台的自动化机器人技术和机器视觉技术构建能够完成单细胞蛋白质组分析全部流程操作自动化的分析平台,很快会有新的成果发布,这些都将为人们了解生命活动中细胞异质性的变化带来更有力工具。[来源:浙大杭州科创中心][align=right][/align]

  • 【资料】多组分分析法对各组分定量测定

    在一个波长,一个溶液的总吸光度等于各个成分的吸光度总合。根据这点可以分析混合物的各个组分。 如果有一种混合物,虽然是多组分,但组分吸收带不相重叠,在某波长一种组分的吸收很大,而其它组分在此波长则无吸收,这样就可在此波长采用标准曲线法进行此组分的定量测定。 如果一个多组分混合物,其吸收带虽然相互重叠,但能遵守比耳定律,则可以采用解联立方程式的办法来进行定量。如混合物中含有n个已知组分,则需要在n个适当的波长进行n次测定组分各自在n个波长的摩尔吸光系数。波长的选择应注意使一个组分的吸光系数比其它组分的吸光系数大,这样才能得到较高的准确度。 如果混合物中的几个组分吸收带相互重叠并且不遵守比耳定律,便不能用解联立方程式的办法来解析。此时用分光光度法定量比较困难。Fry采用校正法把混合样品中的五个组分配成不同的溶液,得到一系列校正曲线。在校正曲线的基础上,解析得到了五组分的含量。但方法十分烦琐,使用不便。 如果混合物中含有未知吸收带的组分就更困难了。此时最好先用化学法分离纯化。但也可直接利用分光光度法来分析。Morton利用有杂质存在吸收光谱形状的改变计算混合物中含有杂质时鱼肝油的量。虽然利用分光光度法可以做多组分分析,但方法比较烦琐。 近年来,很多分光光度计设有多组分分析软件。借助于微机来分析计算混合物中多种组分的含量,十分简便、迅速、准确。使得分光光度计在混合物的定量分析中发挥了更大的作用。

  • 【求助】气质分析,组分含量高干扰分析

    刚做[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/bp][color=#3333ff]气质[/color][/url],[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/bp][color=#3333ff]气质[/color][/url]定性分析,二氯甲烷做溶剂,由于组分中四氢萘含量远远高于其他组分,干扰其他组分的分析,怎么办呢

  • 气质联用分析单糖组分

    [color=#444444]请问用[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/bp][color=#3333ff]气质[/color][/url]分析单糖组分的时候,乙酰化结束后,需对样品进行稀释吗?以什么为溶剂进行稀释呢?[/color]

  • 聚烯烃化学组分分析仪简述

    聚烯烃化学组分分析仪简述

    聚烯烃的化学组分信息和分子量信息一样对于我们研究聚烯烃树脂的性能有指导性的意义。但是有些聚合物分子量相似,性能却差别很大,比如两种树脂A和B具有相同的分子量和熔融指数,而A树脂的落镖冲击强度和撕裂强度却比B树脂强50%左右,这是为什么呢?经过化学组分分析仪我们就能很清晰地看出两者的区别所在:http://ng1.17img.cn/bbsfiles/images/2016/01/201601180931_582164_1664_3.jpg A树脂和B树脂的化学组分分布的差别很大,这也就是两者力学性能差别的原因所在。那么既然聚烯烃树脂化学组分分布信息,接下来我会给大家简单介绍一下西班牙Polymer Char 公司的四款化学组分分析:CRYSTAF, TREF,CEF,TGIC。CRYSAF是西班牙最早研发成功的聚烯烃化学组分分析仪,利用聚烯烃树脂组分结晶性能的不同,实现分离后进入相应的检测器,得到对应温度下的聚烯烃的浓度信息,在图上显示为温度浓度曲线,通过计算可以得到对应温度下的化学组分分布信息。TREF是全自动升温淋洗组分分析仪,有两个温度循环单元,降温结晶和升温淋洗,在降温结晶阶段聚合物各级分根据结晶性能的不同依次结晶在TREF柱子上,升温阶段泵提供溶剂连续流经柱子将聚合物洗脱后进检测器,最终也可以得到聚烯烃的化学组分分布信息。CEF是快速全自动升温淋洗分级分析仪,采用的是42位的自动进样器,原理上和TREF的唯一区别是在降温结晶阶段CEF的柱子由溶剂流过,我们也称之为动态的TREF。TGIC是温度梯度交叉色谱,硬件和CEF除了柱子不同外完全相似,所以我们将CEF直接升级为TGIC,当然升级的话需要购买授权和柱子。CEF的柱子的传统的TREF柱,而TGIC采用的石墨柱。TGIC不仅能够获得CEF的结果,同时还能分析可溶物部分的化学组分分布信息,而这个功能是前三款化学组分分析仪所不能实现的。四款聚烯烃化学组分分析仪相似而也有不同,具体的用户可以根据需求咨询购买。

  • 气质联用分析单糖组分

    [color=#444444]请问用[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/bp][color=#3333ff]气质[/color][/url]分析单糖组分的时候,乙酰化结束后,需对样品进行稀释吗?以什么为溶剂进行稀释呢?[/color]

  • 【分享】------紫外可见分光光度计的应用--用多组分分析法对各组分定量

    紫外可见分光光度计的应用--用多组分分析法对各组分定量在一个波长,一个溶液的总吸光度是等于各个成分的吸光度的总和。根据这点就可分析混合物的各个组分。 如果有一种混合物,虽然是多组分,但组分吸收带不相重迭。在某波长一种组分的吸收很大,而其它组分在此波长则无吸收。这样就可在此波长采用上述的标准曲线法进行此组分的定量测定。 如果一个多组分混合物,其吸收带虽然相互重迭,但能遵守比耳定律,则可以采用解联立议程式的办法来进行定量。如混合物中含有n个已知组分,则需在n个适当的波长进行n次组分各自在n个波长的摩尔吸光系数。波长的选择应注意使一个组分的吸光系数比其它组分的吸光系数大,这样才能得到较高的精确度。   如果混合物中的几个组分吸收带相互重迭的并且不遵守比耳定律,便不能用解联立方程式的办法来解析。此时用分光光度法定量比较困难。Fry采用校正法把混合样品中的五个组分配成不同的溶液,得到一系列校正曲线。在校正曲线的基础上,解析得到了五组分的含量。但方法十分繁琐,使用不便。  如果混合物中含有未知吸收带的组分就更困难了。此时最好先用化学法分离纯化。但也可直接利用分光光度法来分析。Morton利用有杂质存在吸收光谱形状的改变计算混合物中含有杂质时鱼肝油的量。虽然利用分光光度法可以作多组分分析,但方法比较繁琐。  近年来,很多分光光度计设有多组分分析附件。借助于微处理机来分析计算混合物中多种组分的含量,十分简便、迅速、准确。使得分光光度法在混合的定量分析中发挥更大的作用。同样,也可用后面介绍的导数光谱法来定量。

  • 【求助】TGA分析橡胶组分的问题

    本人根据GB/T 14837-93提供的方法在用TGA分析橡胶的组分时有一个疑问,550度恒温后为什么要降温到300度呢?能否直接升温到650度呀?请高手指点。谢谢!

  • 【求助】人工煤气组分分析技术求助

    各位老师你们好,最近我要分析人工煤气中的组分,主要包括氧气,氢气,氮气,二氧化碳,甲烷,乙烯,乙烷等组分,需要用热导做的,几根柱子连接,用什么样的柱,具体怎么连接,如何实现反吹,希望得到各位的指点,提供具体的分析方法.谢谢你们的好意!

  • 转炉煤气回收

    转炉煤气回收应用分析仪器哪家生产商的比较好,从稳定性,可靠性给以建议

  • 色谱分析中各组分流出顺序!

    色谱分析中各组分流出顺序气相色谱之所以能够分离复杂混合物,是由于不同的物质在色谱柱上流出的次序有所不同.它的分离的依据:一定温度下,不同组分在两相之间的分配系数K是不同的,即分配系数是色谱分离的依据;分配系数是指组分在固定相中的浓度与在流动相中的浓度的比值,分配系数小的组分,每次分配在流动相中的浓度大,容易较早的流出色谱柱,反之亦然。气相色谱中常用“极性”来说明固定液和被测组分的性质,根据“相似相溶”原理,当固定液和组分的极性相似时,其溶解度就大,分配系数也越大。 “相似相溶”的色谱流出原理:1.在非极性固定液的色谱柱上(非极性色谱柱),被分离的非极性组份基本上按沸点的高低顺序流出,即沸点低的组份先流出来,沸点高的组份后流出来。(分子量较小的组份在色谱柱上保留的时间也较短)(通常,沸点较低的组分,一般在色谱柱中进行分配时,往往在流动相中浓度较大于固定相中的浓度,即分配系数K较小,容易较快的流出色谱柱。)在极性固定液的色谱柱上(极性色谱柱),被分离的极性组份则按极性大小的顺序流出色谱柱,即极性小的组份先流出色谱柱,极性大的组份后流出色谱柱。柱温也是色谱分离的一个重要的影响因素,柱温过高,会使得一些组分在色谱柱中的挥发靠拢,不容易有较好的分离度R;R过低,使得各组分的保留时间延长,并使得色谱峰变宽。所以,“相似相溶”只是一个原则性的说法,在实际的操作分析中还受柱温、组分的极性混合,氢键存在等诸多因素的影响。一时兴起,写上几笔,如有不足,还望纠正。

  • 分析物的组分都不出峰

    [color=#444444]最近进了几个样,但是不知道是不是因为溶剂峰过高过大,分析物的组分都不出峰,本人用的荧光检测器。但是下面那个实时的色谱图(纵坐标变小以后)就会有峰出现,他们说前五分钟出的峰应该是溶剂峰,我参考的文献里组分应该在十几分钟和二十几分钟出峰的(但是都是C18柱他的长度用的150mm×4.6mm,我是250mm×4.6mm,都是5μm),归结一下就是我想知道如果前5分钟出的确实是溶剂峰(太高太大纵坐标有7000多EU甚至14000多EU)以至于其他峰都消失了,这种情况我该怎么办呀[/color]

  • 求助管线结垢组分分析

    最近在对注水管线结垢进行XRD分析,成分较为复杂,化学分析表明垢样主要由铁腐蚀产物和钙盐等组成,XRD谱图经过初步分析主要含铁的氧化物,氢氧化物,碳酸盐,硫化物等等。但也遇到一些困惑,几个主要峰不明确组分:衍射角79度,65度,53读,44度,30度,22度不明确是什么。其中79度像Fe2O3又像FeO,44度峰像是Fe又像是FeOOH,22度也没找到是什么,请大神看看指教,最好能详尽些。谢谢。两个谱图请见附件。

  • FCC汽油详细组分的气质联用分析

    FCC汽油详细组分的气质联用分析,包括碳数分布和族簇,争取能达到下列分析结果:1.碳数及分布;2.异构体及详细结构,如支链烃上的支链个数、支链类型(甲基、乙基等)、支链所处的位置;环或芳烃的环数,支链个数、类型和位置。想达到上述目的,GC需要几根柱子,分别是什么?

  • 天然气全组分的气相色谱分析方法

    天然气是以甲烷为主要成分的天然气体,另外还含有氮气、二氧化碳、C5以下饱和烷烃及少量或微量硫化氢、氢气,有时可能含有少量氦气。根据天然气蕴藏状态,分为构造性天然气、水合天然气、煤矿天然气等三种。而构造性天然气又可分为伴随原油出产的湿性天然气和不含液体成份的干性天然气。目前对天然气的全组分分析的国家标准为:《GB/T 13610-92 天然气的组成分析:[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp][color=#3333ff]气相色谱[/color][/url]法》符合《GB/T 13610-92 天然气的组成分析:[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp][color=#3333ff]气相色谱[/color][/url]法》天燃气分析专用色谱仪(以下简称仪器)是用来分析天然气的组分含量,并快速给出不同燃气的高热值、低热值、密度、相对密度、华白数、燃烧势等特性指数的一种专用仪器,可广泛应用于燃气具生产企业、燃气计量检测部门、科研、环保和配气等行业。 天燃气分析[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp][color=#3333ff]气相色谱仪[/color][/url],采用三载气稳压阀,二路填充柱进样系统,一路毛细柱进样系统,一个热导检测器,一个氢火焰检测器,一个火焰光度检测器,一套燃气分析专用的色谱工作站 可实现对天然气中氧、氮、甲烷、乙烷、二氧化碳、丙烷、异丁烷、正丁烷、正戊烷、异戊烷及C6+以上的烃类成份的一次进样全分析。对于硫化氢分析只需手动进一次天然气样品即可,同时获得硫化氢的含量。 1. 仪器符合GB/T13610-2003《天然气的组成分析[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp][color=#3333ff]气相色谱[/color][/url]法》 2. 仪器符合SH/T0230-92《液化石油气组成测定法(色谱法)》 3. 仪器既可用于液化气、液化气混空气的组分分析,还可以用于以氢气、氮气、甲烷(或丙烷 液化气)为原料气配制的各种燃气的组分分析。 4. 仪器在一次样品分析完成后可通过特有的自定义报表报出被测气组分含量、高热值、低热值等特性指数

  • 天然气全组分的气相色谱分析方法

    天然气是以甲烷为主要成分的天然气体,另外还含有氮气、二氧化碳、C5以下饱和烷烃及少量或微量硫化氢、氢气,有时可能含有少量氦气。根据天然气蕴藏状态,分为构造性天然气、水合天然气、煤矿天然气等三种。而构造性天然气又可分为伴随原油出产的湿性天然气和不含液体成份的干性天然气。目前对天然气的全组分分析的国家标准为:《GB/T 13610-92 天然气的组成分析:[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp][color=#3333ff]气相色谱[/color][/url]法》符合《GB/T 13610-92 天然气的组成分析:[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp][color=#3333ff]气相色谱[/color][/url]法》天燃气分析专用色谱仪(以下简称仪器)是用来分析天然气的组分含量,并快速给出不同燃气的高热值、低热值、密度、相对密度、华白数、燃烧势等特性指数的一种专用仪器,可广泛应用于燃气具生产企业、燃气计量检测部门、科研、环保和配气等行业。 天燃气分析[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp][color=#3333ff]气相色谱仪[/color][/url],采用三载气稳压阀,二路填充柱进样系统,一路毛细柱进样系统,一个热导检测器,一个氢火焰检测器,一个火焰光度检测器,一套燃气分析专用的色谱工作站 可实现对天然气中氧、氮、甲烷、乙烷、二氧化碳、丙烷、异丁烷、正丁烷、正戊烷、异戊烷及C6+以上的烃类成份的一次进样全分析。对于硫化氢分析只需手动进一次天然气样品即可,同时获得硫化氢的含量。 1. 仪器符合GB/T13610-2003《天然气的组成分析[url=https://insevent.instrument.com.cn/t/Mp][color=#3333ff]气相色谱[/color][/url]法》 2. 仪器符合SH/T0230-92《液化石油气组成测定法(色谱法)》 3. 仪器既可用于液化气、液化气混空气的组分分析,还可以用于以氢气、氮气、甲烷(或丙烷 液化气)为原料气配制的各种燃气的组分分析。 4. 仪器在一次样品分析完成后可通过特有的自定义报表报出被测气组分含量、高热值、低热值等特性指数

  • 高效液相色谱组分定性分析方法简述

    [align=center]高效液相色谱组分定性分析方法简述[/align]1、保留时间对照法(1)外标对照法 即在相同的色谱条件下,分别进样品溶液与高纯度的单一组分对照品溶液,这里推荐先进样品溶液,确定系统适应性没有问题了再进对照品溶液,对比两组分的保留时间,一般保留时间相对差异在5%以内,同时绝对误差在0.1min以内的认定为同一个物质,但仍遵守“同一组分保留时间肯定一样,但保留时间一样不一定是同一组分,保留时间不一样的肯定不是同一组分”的原则。(2)标准加入法 即在相同的色谱条件下,将高纯度的对照品加入样品溶液中再上机检测,与相同浓度未加对照品的样品溶液比较,峰高或峰面积应呈等比例增加的,可认定为是同一物质。此法比较适用于组分比较复杂,邻近有干扰组分峰时。上述方法尽量使用柱效高或长柱,峰高尽量小一些,甚至可以小到定量限浓度,一些在高响应下是单个峰的,在低响应时可能是两个峰,所以一定要注意峰形,只要峰形与对照品不一致,就要怀疑不是同一个物质。再严谨一点,还可以改变流动相组成、色谱柱、柱温等,样品中的组分峰应与对照品的组分峰有相同的变化。2、利用检测器选择性进行鉴别(1)DAD检测器波长扫描法 对于配有DAD检测器的还可以对比三维扫描图谱和峰纯度计算进行辅助定性。如果没有配DAD检测器,但有具波长扫描功能的可变波长检测器的,可以使用停泵扫描功能,查看扫描图谱进行鉴别。(2)质谱检测器鉴别法 该方法适用于联用有质谱分析仪的高效液相色谱仪,通过比较碎片峰进行比较鉴别。3、破坏法 将物质进行化学破坏,可以是酸、碱降解,也可以是衍生后再进行检测,看组分峰的变化。当然,此方法不适用于组分复杂的样品。

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